INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 880953 G/A 1 21 17 38 9.61070718490508 9.21990370745779 0.390803477447285 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000188976:ENST00000483767:exon_880898_881033:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_880898_881033:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_880898_881033:NOC2L HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 881918 G/A 1 9 17 26 4.11887450781646 9.21990370745779 -5.10102919964133 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0499098137026017 ENSG00000188976:ENST00000483767:exon_881782_882440:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_881782_881925:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_881782_881925:NOC2L HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 990280 C/T 1 12 18 30 5.49183267708862 9.76225098436707 -4.27041830727846 T:C C T 10 0.542347276909282 0.142655256190731 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_990204_991496:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_990204_991492:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000461111:exon_990204_991492:AGRN HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 1190523 C/T 1 226 248 474 103.429515418502 134.502124673502 -31.0726092549996 T:C:G C T 10 0.542347276909282 0.00487174153549932 ENSG00000160087:ENST00000450390:exon_1189289_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000347370:exon_1189294_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000349431:exon_1189850_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000339385:exon_1190304_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000348298:exon_1190304_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000400929:exon_1190365_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000464036:exon_1190428_1190867:UBE2J2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 1226889 G/A 1 2 7 9 0.915305446181436 3.79643093836497 -2.88112549218354 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0896908680114052 ENSG00000162572:ENST00000338555:exon_1226634_1227404:SCNN1D;ENSG00000162572:ENST00000325425:exon_1226634_1227404:SCNN1D;ENSG00000162572:ENST00000400928:exon_1226634_1227409:SCNN1D;ENSG00000162572:ENST00000379110:exon_1226634_1226990:SCNN1D HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 1254841 C/G 1 11 8 19 5.0341799539979 4.33877821527426 0.695401738723643 C:G C G 10 0.542347276909282 0.820870277915036 ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1254713_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000434694:exon_1254452_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000488042:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000526332:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000430786:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527719:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000530031:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000525603:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000429572:exon_1254059_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498173:exon_1254061_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000496353:exon_1254077_1256473:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000493534:exon_1254440_1255085:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000534345:exon_1254686_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532952:exon_1254727_1255265:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000490853:exon_1254761_1255223:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531019:exon_1254761_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498476:exon_1254783_1254904:CPSF3L HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 1262966 C/T 1 6 5 11 2.74591633854431 2.71173638454641 0.0341799539978984 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000224051:ENST00000464957:exon_1262621_1263374:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262621_1264277:GLTPD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 1263144 G/A 1 10 5 15 4.57652723090718 2.71173638454641 1.86479084636077 A:G G A 10 0.542347276909282 0.439852308753891 ENSG00000224051:ENST00000464957:exon_1262621_1263374:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262621_1264277:GLTPD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 1310074 C/G 1 7 11 18 3.20356906163503 5.9658200460021 -2.76225098436708 C:G C G 10 0.542347276909282 0.238484579075496 ENSG00000175756:ENST00000489799:exon_1309624_1310170:AURKAIP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 1342612 G/C 1 187 183 370 85.5810592179643 99.2495516743986 -13.6684924564343 C:G G C 10 0.542347276909282 0.159048966950432 ENSG00000242485:ENST00000344843:exon_1342511_1342693:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000487659:exon_1342511_1342648:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000482352:exon_1342511_1342670:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000477686:exon_1342511_1342615:MRPL20 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 1404016 G/A 1 9 26 35 4.11887450781646 14.1010291996413 -9.98215469182487 A:G G A 10 0.542347276909282 0.00096283029897039 ENSG00000215915:ENST00000378785:exon_1403764_1405538:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000435474:exon_1403764_1405538:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000484537:exon_1403764_1404043:ATAD3C HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 1425700 T/C 1 8 8 16 3.66122178472574 4.33877821527426 -0.677556430548512 T:C T C 10 0.542347276909282 0.804712000972457 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1425634_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1424584_1426051:ATAD3B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 1479333 A/G 1 43 37 80 19.6790670929009 20.0668492456434 -0.387782152742556 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000160075:ENST00000291386:exon_1479249_1479367:SSU72;ENSG00000160075:ENST00000378726:exon_1479249_1479367:SSU72 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 1635004 T/C 1 22 17 39 10.0683599079958 9.21990370745779 0.848456200538003 T:C T C 10 0.542347276909282 0.872832597023446 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000463652:exon_1634915_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000467737:exon_1634915_1635011:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000478901:exon_1634527_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468397:exon_1634915_1635063:CDK11A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 1635749 C/A 1 24 8 32 10.9836653541772 4.33877821527426 6.64488713890298 A:C C A 10 0.542347276909282 0.0204353019678369 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635478_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468397:exon_1635662_1635994:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635662_1636041:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000495016:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468800:exon_1635662_1636094:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000464748:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000489300:exon_1635682_1635783:CDK11A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 1685804 T/A 1 13 15 28 5.94948540017933 8.13520915363923 -2.18572375345989 A:T T A 10 0.542347276909282 0.451161706159783 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1685723_1685822:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1685723_1685822:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1685723_1685822:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1685723_1685822:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1685723_1685822:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1685723_1685822:NADK;ENSG00000008130:ENST00000498806:exon_1685723_1685822:NADK;ENSG00000008130:ENST00000469045:exon_1685723_1685822:NADK;ENSG00000008130:ENST00000480499:exon_1685602_1685822:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497747:exon_1685723_1685822:NADK;ENSG00000008130:ENST00000477235:exon_1685723_1685822:NADK;ENSG00000008130:ENST00000489538:exon_1685723_1685822:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497615:exon_1685642_1685822:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497186:exon_1685782_1685822:NADK HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 2121118 C/T 1 49 27 76 22.4249834314452 14.6433764765506 7.78160695489457 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0839040990524596 ENSG00000162585:ENST00000378543:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378546:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000401813:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000487186:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378545:exon_2120990_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000476803:exon_2121008_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000440825:exon_2121019_2121220:C1orf86 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 2337194 C/T 1 6 3 9 2.74591633854431 1.62704183072785 1.11887450781646 T:C C T 10 0.542347276909282 0.521783447682374 ENSG00000157911:ENST00000288774:exon_2336236_2337273:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000447513:exon_2336258_2337273:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000507596:exon_2336277_2337267:PEX10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 2441358 T/C 1 3 5 8 1.37295816927215 2.71173638454641 -1.33877821527426 T:C T C 10 0.542347276909282 0.482450044879903 ENSG00000157881:ENST00000378466:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000425477:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000435556:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000505228:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000502512:exon_2441232_2441369:PANK4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 2488153 A/G 1 15 15 30 6.86479084636077 8.13520915363923 -1.27041830727846 A:G A G 10 0.542347276909282 0.715325388496919 ENSG00000157873:ENST00000426449:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000434817:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000435221:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000451778:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000409119:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000423768:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000442392:exon_2487844_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000482074:exon_2487845_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000496064:exon_2487996_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2488010_2488172:TNFRSF14 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 2494330 G/A 1 115 157 272 52.6300631554326 85.1485224747573 -32.5184593193247 A:G G A 10 0.542347276909282 9.18303742733436e-05 ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000475523:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2492933_2495188:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000466750:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000427661:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463835:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000482602:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000480305:exon_2494304_2494335:TNFRSF14 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 3548832 G/C 1 7 7 14 3.20356906163503 3.79643093836497 -0.592861876729947 C:G G C 10 0.542347276909282 0.793466098764131 ENSG00000116213:ENST00000270708:exon_3548777_3548902:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378322:exon_3548777_3548902:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378317:exon_3548777_3548902:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378320:exon_3548777_3548902:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000471223:exon_3548450_3553662:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000424367:exon_3548777_3548902:WDR8 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 3703710 G/A 1 4 7 11 1.83061089236287 3.79643093836497 -1.9658200460021 A:G G A 10 0.542347276909282 0.364977036425421 ENSG00000130764:ENST00000378251:exon_3703413_3703874:LRRC47 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 6158562 A/G 1 10 11 21 4.57652723090718 5.9658200460021 -1.38929281509492 A:G A G 10 0.542347276909282 0.662591228630952 ENSG00000069424:ENST00000378097:exon_6158545_6161253:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378092:exon_6158545_6158634:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000341524:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000352527:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000164247:exon_6158545_6161239:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378083:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000481789:exon_6158545_6158870:KCNAB2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 9416346 C/T 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 T:C C T 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000171621:ENST00000328089:exon_9415802_9416644:SPSB1;ENSG00000171621:ENST00000450402:exon_9415802_9416556:SPSB1;ENSG00000171621:ENST00000357898:exon_9415802_9416644:SPSB1;ENSG00000171621:ENST00000377399:exon_9415766_9416644:SPSB1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 10460485 T/C 1 13 11 24 5.94948540017933 5.9658200460021 -0.0163346458227673 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000142657:ENST00000491493:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000377062:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000477958:exon_10460433_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000465632:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10460450_10460629:PGD HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 10473196 C/T 1 19 28 47 8.69540173872364 15.1857237534599 -6.49032201473625 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0778317348978458 ENSG00000142657:ENST00000490057:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000483936:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000493288:exon_10472891_10473308:PGD HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 10511544 C/T 1 8 12 20 3.66122178472574 6.50816732291138 -2.84694553818564 T:C C T 10 0.542347276909282 0.262141543180323 ENSG00000175279:ENST00000320498:exon_10511434_10512210:APITD1;ENSG00000175279:ENST00000336114:exon_10511434_10511716:APITD1;ENSG00000251503:ENST00000400900:exon_10511434_10512210:APITD1;ENSG00000251503:ENST00000470413:exon_10511434_10511716:APITD1;ENSG00000251503:ENST00000465026:exon_10511434_10511716:APITD1;ENSG00000241563:ENST00000377049:exon_10511434_10511959:CORT HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 11132217 G/A 1 25 19 44 11.441318077268 10.3045982612764 1.13671981599159 A:G G A 10 0.542347276909282 0.764291164151949 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000469634:exon_11130957_11133083:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000478271:exon_11132144_11132452:EXOSC10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 11141187 C/G 1 4 14 18 1.83061089236287 7.59286187672995 -5.76225098436707 C:G C G 10 0.542347276909282 0.00798066719892284 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11141139_11141295:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11141139_11141295:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11141139_11141274:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000485606:exon_11141139_11141295:EXOSC10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 11708736 T/C 1 4 10 14 1.83061089236287 5.42347276909282 -3.59286187672995 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0629725562793592 ENSG00000116661:ENST00000354287:exon_11708424_11708885:FBXO2;ENSG00000116661:ENST00000376779:exon_11708450_11708885:FBXO2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 11728894 G/A 1 8 4 12 3.66122178472574 2.16938910763713 1.49183267708862 A:G G A 10 0.542347276909282 0.564494489181351 ENSG00000116663:ENST00000376749:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000376753:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000474239:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000449067:exon_11728753_11729001:FBXO6 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 16258299 C/G 1 9 11 20 4.11887450781646 5.9658200460021 -1.84694553818564 C:G C G 10 0.542347276909282 0.502409545778718 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 16258756 T/A 1 14 13 27 6.40713812327005 7.05051459982067 -0.643376476550613 A:T T A 10 0.542347276909282 0.848385483773945 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 16265904 T/A 1 6 9 15 2.74591633854431 4.88112549218354 -2.13520915363923 A:T T A 10 0.542347276909282 0.307109737553343 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16265791_16266955:SPEN;ENSG00000065526:ENST00000487496:exon_16265791_16266039:SPEN HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 16271260 G/A 1 2 11 13 0.915305446181436 5.9658200460021 -5.05051459982067 A:G G A 10 0.542347276909282 0.00907015594284308 ENSG00000116809:ENST00000375743:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375733:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444654:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375729:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000448462:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000492834:exon_16271192_16271334:ZBTB17 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 16577794 C/T 1 33 52 85 15.1025398619937 28.2020583992827 -13.099518537289 T:C C T 10 0.542347276909282 0.00458063888332305 ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16573334_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000456164:exon_16577577_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000444116:exon_16577577_16578280:FBXO42 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 16577908 G/C 1 26 23 49 11.8989708003587 12.4739873689135 -0.575016568554817 C:G G C 10 0.542347276909282 0.886853759357875 ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16573334_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000456164:exon_16577577_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000444116:exon_16577577_16578280:FBXO42 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 17312743 C/T 1 13 26 39 5.94948540017933 14.1010291996413 -8.151543799462 T:C:G C T 10 0.542347276909282 0.00983223999659724 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17312454_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17312476_17312853:ATP13A2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 17313343 G/A 1 4 10 14 1.83061089236287 5.42347276909282 -3.59286187672995 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0629725562793592 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17312958_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17313300_17313451:ATP13A2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 17313654 C/T 1 5 4 9 2.28826361545359 2.16938910763713 0.118874507816462 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17313541_17313764:ATP13A2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 17314942 G/A 1 9 3 12 4.11887450781646 1.62704183072785 2.49183267708862 A:G G A 10 0.542347276909282 0.245685043790611 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17314817_17314969:ATP13A2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 19411129 A/G 1 18 30 48 8.23774901563293 16.2704183072785 -8.03266929164553 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0287014539459831 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19410998_19411192:UBR4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 19413261 T/A 1 10 17 27 4.57652723090718 9.21990370745779 -4.64337647655061 A:T T A 10 0.542347276909282 0.0831397106267912 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19413173_19413315:UBR4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 19415304 C/T 1 9 9 18 4.11887450781646 4.88112549218354 -0.762250984367075 T:C C T 10 0.542347276909282 0.814595397980852 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19415253_19415471:UBR4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 20977221 A/T 1 15 7 22 6.86479084636077 3.79643093836497 3.0683599079958 A:T A T 10 0.542347276909282 0.206521843816922 ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 20978832 T/C 1 326 287 613 149.194787727574 155.653668472964 -6.45888074538985 T:C:G T C 10 0.542347276909282 0.62670165798999 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20978270_20979021:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20978685_20979021:DDOST HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 20982631 G/A 1 14 12 26 6.40713812327005 6.50816732291138 -0.101029199641331 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000486473:exon_20982594_20982680:DDOST HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 25291010 A/T 1 72 67 139 32.9509960625317 36.3372675529219 -3.38627149039019 A:T A T 10 0.542347276909282 0.609710419739702 ENSG00000020633:ENST00000399916:exon_25291005_25291501:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000428150:exon_25291005_25291501:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000338888:exon_25291005_25291159:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000479341:exon_25291005_25291070:RUNX3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 25558970 T/C 1 14 13 27 6.40713812327005 7.05051459982067 -0.643376476550613 T:C T C 10 0.542347276909282 0.848385483773945 ENSG00000117614:ENST00000236273:exon_25558935_25558984:SYF2;ENSG00000117614:ENST00000354361:exon_25558935_25558977:SYF2;ENSG00000117614:ENST00000476231:exon_25558935_25558993:SYF2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 25667037 C/T 1 28 13 41 12.8142762465401 7.05051459982067 5.76376164671944 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0842733161956652 ENSG00000183726:ENST00000374358:exon_25666965_25667070:TMEM50A;ENSG00000183726:ENST00000498135:exon_25666965_25667070:TMEM50A;ENSG00000183726:ENST00000480937:exon_25666965_25667070:TMEM50A;ENSG00000183726:ENST00000468704:exon_25666965_25667070:TMEM50A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 26887592 T/C 1 4 4 8 1.83061089236287 2.16938910763713 -0.338778215274256 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000403732:exon_26887536_26887625:RPS6KA1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 26900621 C/G 1 22 14 36 10.0683599079958 7.59286187672995 2.47549803126585 C:G C G 10 0.542347276909282 0.504094569816844 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26900570_26901516:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26900570_26900688:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26900570_26900922:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26900570_26901521:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26900570_26900767:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26900570_26901520:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000438977:exon_26900570_26900688:RPS6KA1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 26900708 G/A 1 16 7 23 7.32244356945149 3.79643093836497 3.52601263108651 A:G G A 10 0.542347276909282 0.149662035595442 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26900570_26901516:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26900570_26900922:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26900570_26901521:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26900570_26900767:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26900570_26901520:RPS6KA1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 26900920 A/T 1 66 45 111 30.2050797239874 24.4056274609177 5.7994522630697 A:T A T 10 0.542347276909282 0.295122620285333 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26900570_26901516:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26900868_26900934:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26900570_26900922:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26900570_26901521:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26900570_26901520:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000438977:exon_26900868_26901225:RPS6KA1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 28562676 A/G 1 580 490 1070 265.438579392616 265.750165685548 -0.311586292931679 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000130770:ENST00000497986:exon_28562620_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000417632:exon_28562644_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000335514:exon_28562644_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000468425:exon_28562653_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562665_28562781:ATPIF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 28564252 A/G 1 18 16 34 8.23774901563293 8.67755643054851 -0.439807414915586 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562872_28564609:ATPIF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 28564279 A/G 1 56 14 70 25.6285524930802 7.59286187672995 18.0356906163503 A:G A G 10 0.542347276909282 1.02068214768915e-05 ENSG00000130770:ENST00000497986:exon_28564272_28564616:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562872_28564609:ATPIF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 31215364 T/C 1 25 29 54 11.441318077268 15.7280710303692 -4.28675295310123 T:C T C 10 0.542347276909282 0.275048574132333 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000424259:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000464569:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000476492:exon_31214536_31215396:LAPTM5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 31409634 A/G 1 15 11 26 6.86479084636077 5.9658200460021 0.898970800358668 A:G A G 10 0.542347276909282 0.844693076966731 ENSG00000134644:ENST00000424085:exon_31409490_31409682:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000257075:exon_31409490_31409682:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373747:exon_31409490_31409682:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373749:exon_31409490_31409682:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000423018:exon_31409490_31409682:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000525843:exon_31409490_31409682:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000426105:exon_31409490_31409682:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000498419:exon_31409490_31409682:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000440538:exon_31409490_31409682:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373741:exon_31409490_31409682:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373742:exon_31409490_31409682:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000530669:exon_31409490_31409682:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000529846:exon_31409569_31409682:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000525997:exon_31409571_31409682:PUM1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 31905884 G/A 1 5 5 10 2.28826361545359 2.71173638454641 -0.42347276909282 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000168528:ENST00000373710:exon_31905814_31906032:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000373709:exon_31905814_31906032:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000491976:exon_31905814_31906032:SERINC2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 32096265 A/G 1 39 54 93 17.848456200538 29.2867529531012 -11.4382967525632 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0215587289336749 ENSG00000162517:ENST00000373703:exon_32095463_32096443:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000461006:exon_32095941_32096333:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000478502:exon_32096050_32096443:PEF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 32667609 C/T 1 82 67 149 37.5275232934389 36.3372675529219 1.19025574051698 T:C C T 10 0.542347276909282 0.869671425876746 ENSG00000160050:ENST00000373602:exon_32667514_32667700:CCDC28B;ENSG00000160050:ENST00000469003:exon_32667514_32667700:CCDC28B;ENSG00000160050:ENST00000421922:exon_32667514_32667700:CCDC28B;ENSG00000160050:ENST00000461819:exon_32667514_32667700:CCDC28B;ENSG00000160050:ENST00000483009:exon_32667297_32667700:CCDC28B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 36225948 T/C 1 37 30 67 16.9331507543566 16.2704183072785 0.66273244707811 T:C T C 10 0.542347276909282 0.902949371744463 ENSG00000092853:ENST00000251195:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000318121:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000373220:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000520551:exon_36225943_36226517:CLSPN HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 36752433 C/T 1 15 12 27 6.86479084636077 6.50816732291138 0.356623523449387 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 36807481 C/T 1 9 8 17 4.11887450781646 4.33877821527426 -0.219903707457793 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000196182:ENST00000373129:exon_36805225_36807574:STK40;ENSG00000196182:ENST00000359297:exon_36805225_36809049:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373130:exon_36805225_36807574:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373132:exon_36805225_36807574:STK40 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 37948912 C/T 1 20 25 45 9.15305446181436 13.558681922732 -4.40562746091769 T:C C T 10 0.542347276909282 0.231079815860213 ENSG00000163874:ENST00000373087:exon_37948338_37949978:ZC3H12A;ENSG00000163874:ENST00000373082:exon_37948338_37949817:ZC3H12A;ENSG00000163874:ENST00000492829:exon_37948035_37949976:ZC3H12A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 38329999 C/G 1 3 6 9 1.37295816927215 3.25408366145569 -1.88112549218354 C:G C G 10 0.542347276909282 0.31687860521519 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38329984_38330095:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38329984_38330095:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38329984_38330095:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38329984_38330095:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38329984_38330095:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000487328:exon_38329984_38330521:INPP5B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 38423853 G/C 1 118 91 209 54.0030213247047 49.3536021987447 4.64941912596007 A:C:G G C 10 0.542347276909282 0.53279794264289 ENSG00000183431:ENST00000373019:exon_38422647_38423935:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000448721:exon_38423631_38423935:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000487062:exon_38423735_38423935:SF3A3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 40027464 G/A 1 11 2 13 5.0341799539979 1.08469455381856 3.94948540017933 A:G G A 10 0.542347276909282 0.04696746291402 ENSG00000090621:ENST00000482028:exon_40027357_40027682:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000468476:exon_40026488_40027875:PABPC4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 40773149 T/C 1 6 4 10 2.74591633854431 2.16938910763713 0.57652723090718 T:C T C 10 0.542347276909282 0.762606887543924 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40773118_40773171:COL9A2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 41976320 G/A 1 24 29 53 10.9836653541772 15.7280710303692 -4.74440567619194 A:G G A 10 0.542347276909282 0.215272429211187 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 43215930 C/T 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 T:C C T 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000117385:ENST00000460031:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000236040:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000495874:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000296388:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000431412:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000481465:exon_43215572_43216007:LEPRE1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 43851797 G/A 1 24 15 39 10.9836653541772 8.13520915363923 2.848456200538 A:G G A 10 0.542347276909282 0.422843209090647 ENSG00000159479:ENST00000290663:exon_43851649_43851897:MED8;ENSG00000159479:ENST00000362029:exon_43851649_43851897:MED8;ENSG00000159479:ENST00000372457:exon_43851649_43851897:MED8;ENSG00000159479:ENST00000372455:exon_43851649_43851897:MED8;ENSG00000159479:ENST00000460803:exon_43851344_43851897:MED8;ENSG00000159479:ENST00000473560:exon_43851649_43852341:MED8 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 44437441 C/T 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 T:C C T 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000132768:ENST00000255108:exon_44437059_44437742:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000524776:exon_44437059_44437742:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000495421:exon_44437059_44437742:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000412950:exon_44437059_44437742:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000459879:exon_44437332_44437742:DPH2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 44461822 C/T 1 7 2 9 3.20356906163503 1.08469455381856 2.11887450781646 T:C C T 10 0.542347276909282 0.193758782140484 ENSG00000159214:ENST00000486064:exon_44461610_44462196:CCDC24;ENSG00000159214:ENST00000372318:exon_44461610_44462200:CCDC24;ENSG00000159214:ENST00000442705:exon_44461610_44462196:CCDC24;ENSG00000159214:ENST00000463846:exon_44461614_44462200:CCDC24;ENSG00000159214:ENST00000490563:exon_44461610_44462200:CCDC24;ENSG00000159214:ENST00000490064:exon_44461610_44461827:CCDC24;ENSG00000159214:ENST00000486504:exon_44461610_44461951:CCDC24 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 45793885 A/G 1 36 19 55 16.4754980312659 10.3045982612764 6.17089976998949 A:G A G 10 0.542347276909282 0.104942847279722 ENSG00000186603:ENST00000334815:exon_45792545_45794347:HPDL HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 45796881 G/A 1 14 13 27 6.40713812327005 7.05051459982067 -0.643376476550613 A:G G A 10 0.542347276909282 0.848385483773945 ENSG00000132781:ENST00000529984:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000485271:exon_45796854_45796942:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372104:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000448481:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000456914:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000354383:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000475516:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000355498:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372098:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000481571:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372110:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372115:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000528332:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000525481:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000532813:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372100:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000488731:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000450313:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000426432:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000431970:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000467459:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000482094:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000529892:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000533178:exon_45796854_45797006:MUTYH HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 45796899 C/G 1 12 12 24 5.49183267708862 6.50816732291138 -1.01633464582277 A:C:G C G 10 0.542347276909282 0.68769230574635 ENSG00000132781:ENST00000529984:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000485271:exon_45796854_45796942:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372104:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000448481:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000456914:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000354383:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000475516:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000355498:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372098:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000481571:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372110:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372115:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000528332:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000525481:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000532813:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372100:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000488731:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000450313:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000426432:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000431970:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000467459:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000482094:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000529892:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000533178:exon_45796854_45797006:MUTYH HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 46049849 G/C 1 9 5 14 4.11887450781646 2.71173638454641 1.40713812327005 C:G G C 10 0.542347276909282 0.594287862477072 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46049780_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46049661_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000464190:exon_46049713_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528084:exon_46049714_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46049714_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530840:exon_46049717_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531532:exon_46049717_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000529333:exon_46049717_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527470:exon_46049717_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46049717_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46049717_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46049717_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46049730_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000534101:exon_46049732_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46049732_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000470768:exon_46049733_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46049735_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46049737_46049877:NASP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 46073597 A/G 1 9 10 19 4.11887450781646 5.42347276909282 -1.30459826127636 A:G A G 10 0.542347276909282 0.647186647042385 ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000470768:exon_46072993_46073644:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46072993_46074009:NASP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 46082330 C/T 1 176 185 361 80.5468792639664 100.334246228217 -19.7873669642508 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0393037103851789 ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46082298_46082375:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46082298_46082375:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46082298_46082375:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46082298_46082375:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46082298_46082375:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46082298_46082375:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46082298_46082375:NASP;ENSG00000132780:ENST00000534450:exon_46082298_46082375:NASP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 46095272 T/C 1 36 54 90 16.4754980312659 29.2867529531012 -12.8112549218354 T:C T C 10 0.542347276909282 0.00790111212837162 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46095248_46095387:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000468724:exon_46095260_46095350:GPBP1L1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 46159001 G/A 1 18 16 34 8.23774901563293 8.67755643054851 -0.439807414915586 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000159596:ENST00000372025:exon_46158876_46160115:TMEM69;ENSG00000159596:ENST00000496366:exon_46158876_46159517:TMEM69 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 46159244 A/G 1 44 59 103 20.1367198159916 31.9984893376476 -11.861769521656 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0225463310082423 ENSG00000159596:ENST00000372025:exon_46158876_46160115:TMEM69;ENSG00000159596:ENST00000496366:exon_46158876_46159517:TMEM69 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 46498375 A/G 1 5 4 9 2.28826361545359 2.16938910763713 0.118874507816462 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46498268_46498390:MAST2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 46743900 C/T 1 56 48 104 25.6285524930802 26.0326692916455 -0.404116798565322 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000085999:ENST00000442598:exon_46743744_46744145:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000371975:exon_46743744_46744144:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000488942:exon_46743744_46744111:RAD54L HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 46746164 C/T 1 35 26 61 16.0178453081751 14.1010291996413 1.9168161085338 T:C C T 10 0.542347276909282 0.700343294134838 ENSG00000132128:ENST00000496156:exon_46746068_46746232:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000343304:exon_46746068_46746232:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000472710:exon_46746068_46746232:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000254454:exon_46746068_46746232:LRRC41 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 46810530 A/G 1 3 6 9 1.37295816927215 3.25408366145569 -1.88112549218354 A:G A G 10 0.542347276909282 0.31687860521519 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46810454_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46810473_46810634:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000475281:exon_46810473_46811046:NSUN4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 46827456 A/G 1 72 74 146 32.9509960625317 40.1336984912869 -7.18270242875516 A:G A G 10 0.542347276909282 0.245359608832500 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46827242_46827863:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46827242_46827862:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46827242_46830824:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46827242_46827862:NSUN4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 52264064 A/G 1 32 23 55 14.644887138903 12.4739873689135 2.17089976998949 A:G A G 10 0.542347276909282 0.590519860067713 ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000497358:exon_52263921_52264083:NRD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 52498370 C/T 1 29 27 56 13.2719289696308 14.6433764765506 -1.37144750691979 T:C C T 10 0.542347276909282 0.788865394374162 ENSG00000198841:ENST00000371614:exon_52497775_52499488:KTI12 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 52498861 A/T 1 15 21 36 6.86479084636077 11.3892928150949 -4.52450196873415 A:T A T 10 0.542347276909282 0.135760652463050 ENSG00000198841:ENST00000371614:exon_52497775_52499488:KTI12 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 53153432 T/C 1 11 12 23 5.0341799539979 6.50816732291138 -1.47398736891348 T:C T C 10 0.542347276909282 0.539417094228368 ENSG00000162377:ENST00000371538:exon_53152508_53153840:C1orf163;ENSG00000162377:ENST00000486918:exon_53153234_53153840:C1orf163 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 54681920 G/C 1 106 100 206 48.5111886476161 54.2347276909282 -5.72353904331209 C:G G C 10 0.542347276909282 0.442124905248 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000329505:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000398219:exon_54681814_54682017:MRPL37 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 54683856 C/G 1 376 327 703 172.07742388211 177.347559549335 -5.27013566722525 C:G C G 10 0.542347276909282 0.705102976747728 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 55197320 G/A 1 6 6 12 2.74591633854431 3.25408366145569 -0.508167322911383 A:G G A 10 0.542347276909282 0.780543886765314 ENSG00000184313:ENST00000425300:exon_55197159_55197373:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000460155:exon_55197159_55197373:C1orf175;ENSG00000243725:ENST00000371281:exon_55197159_55197373:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000371284:exon_55197159_55197373:TTC4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 58971831 G/A 1 10 4 14 4.57652723090718 2.16938910763713 2.40713812327005 A:G G A 10 0.542347276909282 0.284052688317237 ENSG00000173406:ENST00000485760:exon_58971732_58971881:DAB1;ENSG00000162600:ENST00000467509:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000460671:exon_58971732_58971871:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_58971732_58971881:OMA1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 59002221 T/C 0 8 0 8 3.66122178472574 0 3.66122178472574 T T 10 0.542347276909282 0.00940985022554938 ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000469854:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000456980:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000467063:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000419242:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000426139:exon_59002185_59002413:OMA1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 64097432 C/T 1 6 2 8 2.74591633854431 1.08469455381856 1.66122178472574 T:C C T 10 0.542347276909282 0.303100337321114 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64097328_64097453:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64097328_64097453:PGM1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 66829262 A/G 1 28 13 41 12.8142762465401 7.05051459982067 5.76376164671944 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0842733161956652 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 70904800 G/T 1 20 22 42 9.15305446181436 11.9316400920042 -2.77858563018984 T:G G T 10 0.542347276909282 0.439879400645286 ENSG00000116761:ENST00000370938:exon_70904784_70905253:CTH;ENSG00000116761:ENST00000411986:exon_70904784_70905252:CTH;ENSG00000116761:ENST00000346806:exon_70904784_70904887:CTH;ENSG00000116761:ENST00000482383:exon_70904784_70904915:CTH HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 71538191 A/G 1 79 88 167 36.1545651241667 47.7265603680168 -11.5719952438501 A:G A G 10 0.542347276909282 0.074390578809724 ENSG00000132485:ENST00000370920:exon_71538155_71538231:ZRANB2;ENSG00000132485:ENST00000254821:exon_71538155_71538231:ZRANB2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 75175886 T/C 1 4 7 11 1.83061089236287 3.79643093836497 -1.9658200460021 T:C T C 10 0.542347276909282 0.364977036425421 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75175793_75175931:CRYZ HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 75214441 A/G 1 20 14 34 9.15305446181436 7.59286187672995 1.56019258508441 A:G A G 10 0.542347276909282 0.611056361968544 ENSG00000162623:ENST00000370867:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000457880:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000479111:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000483990:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000485401:exon_75214325_75214506:TYW3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 76257892 A/T 1 6 15 21 2.74591633854431 8.13520915363923 -5.38929281509492 A:T A T 10 0.542347276909282 0.0262982606723561 ENSG00000137955:ENST00000496055:exon_76257866_76257991:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000319942:exon_76257866_76257991:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000370824:exon_76257866_76257991:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000485459:exon_76257866_76257939:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000470201:exon_76257866_76257971:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000471759:exon_76257866_76257991:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000491266:exon_76257866_76257987:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000461653:exon_76257866_76257935:RABGGTB HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 78178976 T/A 1 13 7 20 5.94948540017933 3.79643093836497 2.15305446181436 A:T T A 10 0.542347276909282 0.376633018290733 ENSG00000077254:ENST00000477949:exon_78178885_78179193:USP33 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 79093818 A/G 1 29 39 68 13.2719289696308 21.151543799462 -7.87961482983117 A:C:G A G 10 0.542347276909282 0.0672351640669756 ENSG00000137959:ENST00000452835:exon_79093591_79093892:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79091355_79094684:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79093670_79094078:IFI44L HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 79095581 T/C 1 61 131 192 27.9168161085338 71.0474932751159 -43.1306771665821 T:C T C 10 0.542347276909282 4.03443723130067e-10 ENSG00000137959:ENST00000476521:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000462041:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000474002:exon_79095320_79095600:IFI44L HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 79115905 T/C 1 26 20 46 11.8989708003587 10.8469455381856 1.05202526217303 T:C T C 10 0.542347276909282 0.769968503499919 ENSG00000137965:ENST00000370747:exon_79115871_79116337:IFI44;ENSG00000137965:ENST00000467790:exon_79115871_79116337:IFI44 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 84944989 A/G 1 46 36 82 21.052025262173 19.5245019687341 1.52752329343888 A:G A G 10 0.542347276909282 0.824744606492177 ENSG00000117133:ENST00000370656:exon_84944942_84945192:RPF1;ENSG00000117133:ENST00000370654:exon_84944950_84945192:RPF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 86818572 T/C 1 14 18 32 6.40713812327005 9.76225098436707 -3.35511286109702 T:C T C 10 0.542347276909282 0.287366108849038 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86818542_86818667:ODF2L HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 86820267 C/T 1 21 19 40 9.61070718490508 10.3045982612764 -0.693891076371278 A:T:C C T 10 0.542347276909282 0.874602009607347 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000476054:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000473792:exon_86820213_86820375:ODF2L HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 87190040 T/C 1 39 31 70 17.848456200538 16.8127655841877 1.03569061635026 T:C T C 10 0.542347276909282 0.904630375153063 ENSG00000097033:ENST00000212369:exon_87189996_87190088:SH3GLB1;ENSG00000097033:ENST00000482504:exon_87189996_87190088:SH3GLB1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 89318969 T/A 1 68 75 143 31.1203851701688 40.6760457681961 -9.55566059802732 A:T:G T A 10 0.542347276909282 0.111440315308040 ENSG00000137947:ENST00000370500:exon_89318615_89319029:GTF2B;ENSG00000137947:ENST00000448623:exon_89318907_89319029:GTF2B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 89579941 T/C 1 26 16 42 11.8989708003587 8.67755643054851 3.22141436981016 T:C T C 10 0.542347276909282 0.355131411459120 ENSG00000162645:ENST00000464839:exon_89579699_89579979:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000370466:exon_89579699_89579979:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000463660:exon_89579699_89579979:GBP2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 89582690 G/C 1 24 11 35 10.9836653541772 5.9658200460021 5.01784530817513 C:G G C 10 0.542347276909282 0.0927293859275427 ENSG00000162645:ENST00000464839:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000370466:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000463660:exon_89582675_89582917:GBP2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 90486412 T/G 1 2 7 9 0.915305446181436 3.79643093836497 -2.88112549218354 T:G T G 10 0.542347276909282 0.0896908680114052 ENSG00000162664:ENST00000394590:exon_90486351_90486481:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000394583:exon_90486351_90486481:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000340281:exon_90486351_90486481:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000370447:exon_90486351_90486481:ZNF326 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 92262874 T/C 1 3 6 9 1.37295816927215 3.25408366145569 -1.88112549218354 T:C T C 10 0.542347276909282 0.31687860521519 ENSG00000069702:ENST00000212355:exon_92262844_92263028:TGFBR3;ENSG00000069702:ENST00000533089:exon_92262844_92263028:TGFBR3;ENSG00000069702:ENST00000370399:exon_92262844_92263028:TGFBR3;ENSG00000069702:ENST00000525962:exon_92262844_92263028:TGFBR3;ENSG00000069702:ENST00000532540:exon_92262844_92263028:TGFBR3;ENSG00000069702:ENST00000465892:exon_92262844_92263028:TGFBR3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 94341267 A/G 1 69 65 134 31.5780378932595 35.2525729991033 -3.67453510584378 A:G A G 10 0.542347276909282 0.544578709188593 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341201_94341339:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341222_94341339:DNTTIP2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 94343023 A/G 1 29 47 76 13.2719289696308 25.4903220147363 -12.2183930451054 A:G A G 10 0.542347276909282 0.00552543368930687 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000496672:exon_94342315_94343045:DNTTIP2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 94343233 T/C 1 17 23 40 7.78009629254221 12.4739873689135 -4.69389107637128 T:C T C 10 0.542347276909282 0.154108657035198 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000528680:exon_94343029_94343439:DNTTIP2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 100575933 G/A 1 11 12 23 5.0341799539979 6.50816732291138 -1.47398736891348 A:G G A 10 0.542347276909282 0.539417094228368 ENSG00000156876:ENST00000287482:exon_100575848_100576039:SASS6;ENSG00000156876:ENST00000462159:exon_100575848_100576039:SASS6 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 110134777 G/A 1 28 20 48 12.8142762465401 10.8469455381856 1.96733070835447 A:G G A 10 0.542347276909282 0.664385857539612 ENSG00000065135:ENST00000369851:exon_110134665_110134877:GNAI3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 111957245 G/A 1 5 8 13 2.28826361545359 4.33877821527426 -2.05051459982067 A:G G A 10 0.542347276909282 0.278020697313787 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 112308953 T/C 1 6 10 16 2.74591633854431 5.42347276909282 -2.67755643054851 T:C T C 10 0.542347276909282 0.213548421391003 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 112308972 G/A 1 7 9 16 3.20356906163503 4.88112549218354 -1.67755643054851 A:G G A 10 0.542347276909282 0.457321849303075 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 113456546 A/T 1 5 9 14 2.28826361545359 4.88112549218354 -2.59286187672995 A:T A T 10 0.542347276909282 0.187369064466614 ENSG00000155380:ENST00000369626:exon_113454469_113456787:SLC16A1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 114438951 A/G 1 5 4 9 2.28826361545359 2.16938910763713 0.118874507816462 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000134262:ENST00000369567:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369569:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000256658:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369566:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479285:exon_114437678_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000462591:exon_114438880_114440561:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479801:exon_114438667_114439087:AP4B1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 114505000 G/A 1 7 2 9 3.20356906163503 1.08469455381856 2.11887450781646 A:G G A 10 0.542347276909282 0.193758782140484 ENSG00000163349:ENST00000426820:exon_114504939_114505060:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000468363:exon_114504939_114505060:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369559:exon_114504939_114505060:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369554:exon_114504939_114505060:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000443627:exon_114504939_114505060:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000411639:exon_114504939_114505060:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369555:exon_114504939_114505060:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369558:exon_114504939_114505060:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369561:exon_114504939_114505060:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000340480:exon_114504939_114505060:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369553:exon_114504939_114505060:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000406344:exon_114504939_114505060:HIPK1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 27 0 27 12.3566235234494 0 12.3566235234494 G G 10 0.542347276909282 8.94495552252289e-08 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 14 14 0 7.59286187672995 -7.59286187672995 C T C 10 0.542347276909282 1.76809139846448e-05 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 31 31 0 16.8127655841877 -16.8127655841877 T C T 10 0.542347276909282 2.99652272175883e-11 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 147119273 G/A 1 14 13 27 6.40713812327005 7.05051459982067 -0.643376476550613 A:G G A 10 0.542347276909282 0.848385483773945 ENSG00000162836:ENST00000460583:exon_147119170_147119368:ACP6;ENSG00000162836:ENST00000369238:exon_147119172_147119368:ACP6 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 150199123 G/T 1 47 34 81 21.5096779852637 18.4398074149156 3.06987057034816 T:G G T 10 0.542347276909282 0.50597772887401 ENSG00000143401:ENST00000314136:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369116:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000421169:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369119:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000436748:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369115:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000533654:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000534220:exon_150198940_150199127:ANP32E HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 150445819 A/G 1 63 33 96 28.8321215547152 17.8974601380063 10.9346614167089 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0309336455296554 ENSG00000163125:ENST00000492220:exon_150443037_150446032:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000401000:exon_150443037_150449042:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000369068:exon_150443037_150446032:RPRD2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 152770533 G/A 0 8 0 8 3.66122178472574 0 3.66122178472574 G G 10 0.542347276909282 0.00940985022554938 ENSG00000172155:ENST00000326233:exon_152770249_152771396:LCE1D HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 152882610 A/G 1 7 5 12 3.20356906163503 2.71173638454641 0.491832677088616 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000163207:ENST00000368764:exon_152882255_152884362:IVL;ENSG00000163207:ENST00000392667:exon_152882255_152884361:IVL HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 152883608 G/A 1 13 7 20 5.94948540017933 3.79643093836497 2.15305446181436 A:G G A 10 0.542347276909282 0.376633018290733 ENSG00000163207:ENST00000368764:exon_152882255_152884362:IVL;ENSG00000163207:ENST00000392667:exon_152882255_152884361:IVL HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 152883680 A/G 1 25 14 39 11.441318077268 7.59286187672995 3.848456200538 A:G A G 10 0.542347276909282 0.261107302213051 ENSG00000163207:ENST00000368764:exon_152882255_152884362:IVL;ENSG00000163207:ENST00000392667:exon_152882255_152884361:IVL HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 152883711 G/C 1 17 18 35 7.78009629254221 9.76225098436707 -1.98215469182487 C:G G C 10 0.542347276909282 0.503608661828194 ENSG00000163207:ENST00000368764:exon_152882255_152884362:IVL;ENSG00000163207:ENST00000392667:exon_152882255_152884361:IVL HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 153516185 G/A 1 230 255 485 105.260126310865 138.298555611867 -33.0384293010018 A:G G A 10 0.542347276909282 0.00301566424081462 ENSG00000196154:ENST00000368715:exon_153516089_153516399:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000481009:exon_153516089_153516399:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000354332:exon_153516089_153516399:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000468373:exon_153516089_153516415:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000368716:exon_153516089_153516399:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000368714:exon_153516097_153516399:S100A4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 153517172 T/C 1 174 215 389 79.6315738177849 116.604664535496 -36.9730907177107 T:C T C 10 0.542347276909282 0.000195821030062706 ENSG00000196154:ENST00000368715:exon_153517130_153517285:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000481009:exon_153517130_153517573:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000354332:exon_153517130_153517285:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000468373:exon_153517130_153517285:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000368716:exon_153517130_153517285:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000368714:exon_153517130_153517285:S100A4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 153533898 A/G 1 5 6 11 2.28826361545359 3.25408366145569 -0.965820046002102 A:G A G 10 0.542347276909282 0.564156977749346 ENSG00000196754:ENST00000368708:exon_153533584_153534067:S100A2;ENSG00000196754:ENST00000368711:exon_153533596_153534067:S100A2;ENSG00000196754:ENST00000487430:exon_153533816_153534067:S100A2;ENSG00000196754:ENST00000497140:exon_153533816_153534067:S100A2;ENSG00000196754:ENST00000368710:exon_153533816_153534067:S100A2;ENSG00000196754:ENST00000368709:exon_153533819_153534067:S100A2;ENSG00000196754:ENST00000368707:exon_153533825_153534067:S100A2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 153534027 C/T 1 7 4 11 3.20356906163503 2.16938910763713 1.0341799539979 T:C C T 10 0.542347276909282 0.763959235154452 ENSG00000196754:ENST00000368708:exon_153533584_153534067:S100A2;ENSG00000196754:ENST00000368711:exon_153533596_153534067:S100A2;ENSG00000196754:ENST00000487430:exon_153533816_153534067:S100A2;ENSG00000196754:ENST00000497140:exon_153533816_153534067:S100A2;ENSG00000196754:ENST00000368710:exon_153533816_153534067:S100A2;ENSG00000196754:ENST00000368709:exon_153533819_153534067:S100A2;ENSG00000196754:ENST00000368707:exon_153533825_153534067:S100A2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 153920564 A/G 1 59 39 98 27.0015106623524 21.151543799462 5.84996686289037 A:G A G 10 0.542347276909282 0.264968206024384 ENSG00000160741:ENST00000303569:exon_153920145_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368630:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153920154_153920805:CRTC2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 154580458 C/A 1 5 6 11 2.28826361545359 3.25408366145569 -0.965820046002102 A:C C A 10 0.542347276909282 0.564156977749346 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 155165855 A/G 1 8 10 18 3.66122178472574 5.42347276909282 -1.76225098436708 A:G A G 10 0.542347276909282 0.48096710956808 ENSG00000169231:ENST00000498500:exon_155165778_155166233:THBS3;ENSG00000169231:ENST00000487250:exon_155165778_155165917:THBS3;ENSG00000169231:ENST00000368378:exon_155165778_155165917:THBS3;ENSG00000169231:ENST00000457183:exon_155165778_155165917:THBS3;ENSG00000169231:ENST00000469769:exon_155165778_155165917:THBS3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 156025096 C/T 1 33 42 75 15.1025398619937 22.7785856301898 -7.67604576819615 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0823224609493542 ENSG00000116586:ENST00000368305:exon_156025054_156025216:ROBLD3;ENSG00000116586:ENST00000368304:exon_156025054_156025216:ROBLD3;ENSG00000116586:ENST00000489664:exon_156025054_156025784:ROBLD3;ENSG00000116586:ENST00000368302:exon_156025054_156025216:ROBLD3;ENSG00000116586:ENST00000487106:exon_156024876_156025216:ROBLD3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 156105028 T/C 1 67 69 136 30.6627324470781 37.4219621067405 -6.75922965966235 T:C T C 10 0.542347276909282 0.263490360760788 ENSG00000160789:ENST00000368301:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000347559:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000361308:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368300:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000292302:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392355:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368299:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000448611:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368297:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000473598:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392353:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000515824:exon_156104978_156105199:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368298:exon_156104904_156105103:LMNA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 156106185 T/C 1 370 357 727 169.331507543566 193.617977856614 -24.286470313048 A:T:C:G T C 10 0.542347276909282 0.07395889142224 ENSG00000160789:ENST00000368301:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000347559:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000361308:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368300:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000292302:exon_156106005_156106188:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368299:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000448611:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368297:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000473598:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392353:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368298:exon_156106005_156107058:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000498722:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000508500:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000459904:exon_156106084_156106819:LMNA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 156106863 C/T 1 4 7 11 1.83061089236287 3.79643093836497 -1.9658200460021 T:C C T 10 0.542347276909282 0.364977036425421 ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156106712_156107023:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368298:exon_156106005_156107058:LMNA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 156146640 G/A 1 51 70 121 23.3402888776266 37.9643093836497 -14.6240205060231 A:G G A 10 0.542347276909282 0.00807968315222502 ENSG00000196189:ENST00000355014:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368285:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368284:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368283:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368286:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368282:exon_156146196_156147543:SEMA4A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 156693135 C/T 1 21 21 42 9.61070718490508 11.3892928150949 -1.77858563018984 T:C C T 10 0.542347276909282 0.643271405293632 ENSG00000143319:ENST00000313146:exon_156691683_156693254:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000472824:exon_156691687_156693254:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000368219:exon_156692395_156693254:ISG20L2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 158813819 A/G 1 37 46 83 16.9331507543566 24.947974737827 -8.0148239834704 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0790488485218472 ENSG00000163563:ENST00000368141:exon_158813745_158813912:MNDA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 158990247 A/G 1 50 65 115 22.8826361545359 35.2525729991033 -12.3699368445674 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0243328786816064 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_158990131_158990319:IFI16 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 159002377 C/A 1 68 62 130 31.1203851701688 33.6255311683755 -2.50514599820665 A:C C A 10 0.542347276909282 0.661034724351583 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 159002389 T/A 1 56 50 106 25.6285524930802 27.1173638454641 -1.48881135238389 A:T T A 10 0.542347276909282 0.771041003837503 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 159024668 A/T 1 455 427 882 208.231989006277 231.582287240263 -23.3502982339867 A:T A T 10 0.542347276909282 0.120034493138759 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159024611_159024945:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159024611_159024918:IFI16 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 160062472 C/T 1 3 13 16 1.37295816927215 7.05051459982067 -5.67755643054851 T:C C T 10 0.542347276909282 0.00496189924505069 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000358475:exon_160062376_160062485:IGSF8 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 160062727 A/G 1 3 9 12 1.37295816927215 4.88112549218354 -3.50816732291138 A:G A G 10 0.542347276909282 0.077659883252704 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062714_160063121:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062714_160063121:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000358475:exon_160062714_160063121:IGSF8 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 160654786 G/A 1 395 458 853 180.772825620834 248.395052824451 -67.6222272036175 A:C:G G A 10 0.542347276909282 3.95672368442959e-06 ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160654677_160654979:CD48;ENSG00000117091:ENST00000368045:exon_160653309_160654979:CD48 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 161017556 C/T 1 74 87 161 33.8663015087131 47.1842130911075 -13.3179115823944 T:C C T 10 0.542347276909282 0.039498184397819 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161016738_161018145:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 161019040 G/C 1 46 45 91 21.052025262173 24.4056274609177 -3.35360219874466 T:C:G G C 10 0.542347276909282 0.528214742980313 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161018779_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368017:exon_161018962_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000490279:exon_161018580_161019124:ARHGAP30 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 161021212 C/T 1 13 15 28 5.94948540017933 8.13520915363923 -2.18572375345989 T:C C T 10 0.542347276909282 0.451161706159783 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161021104_161021505:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161021104_161021505:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161021104_161021505:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368017:exon_161021104_161021505:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161021104_161021505:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000490279:exon_161021104_161021505:ARHGAP30 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 161172233 C/A 1 21 5 26 9.61070718490508 2.71173638454641 6.89897080035867 A:C C A 10 0.542347276909282 0.00908664022421799 ENSG00000158864:ENST00000479948:exon_161171937_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000496133:exon_161171937_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000367993:exon_161171937_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000496553:exon_161171836_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000467295:exon_161172139_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000475570:exon_161172162_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000478866:exon_161172166_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000392179:exon_161172169_161172270:NDUFS2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 161182208 C/G 1 51 60 111 23.3402888776266 32.5408366145569 -9.2005477369303 C:G C G 10 0.542347276909282 0.086451584666736 ENSG00000158864:ENST00000367993:exon_161182141_161182270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000392179:exon_161182141_161182270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000483804:exon_161182141_161182270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000480762:exon_161182141_161182270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000465923:exon_161182141_161182270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000493849:exon_161182141_161182270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000468828:exon_161182141_161182270:NDUFS2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 161681780 A/G 1 38 49 87 17.3908034774473 26.5750165685548 -9.18421309110753 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0527237045607916 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161680998_161682008:FCRLA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 161695639 G/T 1 95 85 180 43.4770086936182 46.099518537289 -2.62250984367076 T:G G T 10 0.542347276909282 0.708848246133514 ENSG00000162746:ENST00000367948:exon_161695611_161695877:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367946:exon_161695611_161695877:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367945:exon_161695611_161695877:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000336830:exon_161695611_161695877:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367944:exon_161695611_161695877:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000392158:exon_161695611_161695877:FCRLB HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 166826773 C/T 1 2 8 10 0.915305446181436 4.33877821527426 -3.42347276909282 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0514322924239131 ENSG00000152382:ENST00000467021:exon_166825747_166826956:TADA1;ENSG00000152382:ENST00000367874:exon_166825747_166826956:TADA1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 168208308 T/C 1 14 2 16 6.40713812327005 1.08469455381856 5.32244356945149 T:C T C 10 0.542347276909282 0.00974971955567542 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 169670868 C/T 1 5 4 9 2.28826361545359 2.16938910763713 0.118874507816462 T:C C T 10 0.542347276909282 1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 170521376 G/A 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 A:G G A 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000120370:ENST00000367763:exon_170521156_170522587:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000498166:exon_170521156_170522587:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000464798:exon_170521156_170522974:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000498600:exon_170521156_170522583:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000475113:exon_170521156_170521417:GORAB HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 172410967 G/A 1 71 47 118 32.493343339441 25.4903220147363 7.00302132470473 A:G G A 10 0.542347276909282 0.229575338868431 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 172411496 A/G 1 19 18 37 8.69540173872364 9.76225098436707 -1.06684924564343 A:G A G 10 0.542347276909282 0.743955797066987 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000478184:exon_172411471_172411970:PIGC HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 173907812 C/T 1 3 5 8 1.37295816927215 2.71173638454641 -1.33877821527426 T:C C T 10 0.542347276909282 0.482450044879903 ENSG00000135870:ENST00000367696:exon_173900352_173908009:RC3H1;ENSG00000135870:ENST00000258349:exon_173900352_173908009:RC3H1;ENSG00000135870:ENST00000367694:exon_173907549_173908012:RC3H1;ENSG00000135870:ENST00000479099:exon_173907714_173908009:RC3H1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 174969271 C/T 1 16 17 33 7.32244356945149 9.21990370745779 -1.89746013800631 T:C C T 10 0.542347276909282 0.600966066666739 ENSG00000116161:ENST00000426793:exon_174969225_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000367679:exon_174968869_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000483307:exon_174969081_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000473925:exon_174969091_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000450101:exon_174969204_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000392063:exon_174969204_174969331:CACYBP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 174983922 C/T 1 80 88 168 36.6122178472574 47.7265603680168 -11.1143425207594 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0887400521120419 ENSG00000120333:ENST00000498253:exon_174983809_174983960:MRPS14;ENSG00000120333:ENST00000476371:exon_174982094_174983987:MRPS14;ENSG00000120333:ENST00000367677:exon_174983381_174983987:MRPS14 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 182569445 G/A 1 110 80 190 50.341799539979 43.3877821527426 6.95401738723643 A:T:G G A 10 0.542347276909282 0.343929314169497 ENSG00000143333:ENST00000367558:exon_182567758_182569648:RGS16 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 183105705 G/A 1 9 8 17 4.11887450781646 4.33877821527426 -0.219903707457793 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183105521_183105720:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000495918:exon_183105521_183105720:LAMC1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 184023529 A/C 1 9 6 15 4.11887450781646 3.25408366145569 0.864790846360771 A:C A C 10 0.542347276909282 0.797455423618976 ENSG00000198860:ENST00000361641:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000485209:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000533373:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000367518:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000423085:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000462677:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000457455:exon_184023495_184023569:TSEN15 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 185267114 A/G 1 67 90 157 30.6627324470781 48.8112549218354 -18.1485224747573 A:G A G 10 0.542347276909282 0.00387573914152033 ENSG00000116679:ENST00000367498:exon_185265520_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000480769:exon_185265520_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000459929:exon_185266147_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000475046:exon_185266903_185267420:IVNS1ABP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 186321242 C/T 1 41 37 78 18.7637616467194 20.0668492456434 -1.30308759892399 T:C C T 10 0.542347276909282 0.82049783355502 ENSG00000047410:ENST00000367478:exon_186321108_186321242:TPR;ENSG00000047410:ENST00000491783:exon_186321108_186321242:TPR;ENSG00000047410:ENST00000469463:exon_186321084_186321242:TPR;ENSG00000047410:ENST00000474852:exon_186321147_186321242:TPR HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 193053762 C/T 1 188 121 309 86.038711941055 65.6240205060231 20.4146914350319 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0222351499429111 ENSG00000116747:ENST00000400968:exon_193053709_193054011:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000432079:exon_193053709_193060349:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000460715:exon_193053709_193054365:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000400969:exon_193053709_193053787:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000416058:exon_193053709_193053861:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000367446:exon_193053709_193055115:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000367443:exon_193053709_193053787:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000367445:exon_193053709_193053828:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000367444:exon_193053709_193053787:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000367441:exon_193053709_193053996:TROVE2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 197070442 G/T 1 10 11 21 4.57652723090718 5.9658200460021 -1.38929281509492 T:G G T 10 0.542347276909282 0.662591228630952 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000445725:exon_197069561_197070645:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 197070697 T/C 1 27 11 38 12.3566235234494 5.9658200460021 6.39080347744728 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0493819837260616 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 197070707 G/A 1 24 11 35 10.9836653541772 5.9658200460021 5.01784530817513 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0927293859275427 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 206648378 G/A 1 20 16 36 9.15305446181436 8.67755643054851 0.475498031265849 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000143466:ENST00000463979:exon_206648208_206648471:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000476449:exon_206648298_206648478:IKBKE HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 206669465 C/T 1 11 5 16 5.0341799539979 2.71173638454641 2.32244356945149 T:C C T 10 0.542347276909282 0.318264889784535 ENSG00000143466:ENST00000367120:exon_206669445_206670223:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000462698:exon_206669445_206670220:IKBKE HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 206776460 G/A 1 10 5 15 4.57652723090718 2.71173638454641 1.86479084636077 A:G G A 10 0.542347276909282 0.439852308753891 ENSG00000143486:ENST00000271764:exon_206776305_206776558:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000367111:exon_206776305_206776558:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000437518:exon_206776305_206776558:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000461334:exon_206776437_206776558:LGTN HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 209948711 A/C 1 38 36 74 17.3908034774473 19.5245019687341 -2.13369849128686 A:C A C 10 0.542347276909282 0.641989345493053 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209948694_209948940:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367023:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000487271:exon_209948635_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000474496:exon_209948694_209949081:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000477431:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000480569:exon_209948635_209948786:TRAF3IP3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 212274413 A/C 1 17 15 32 7.78009629254221 8.13520915363923 -0.355112861097022 A:C A C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000143476:ENST00000366991:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000420235:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000475419:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000496442:exon_212273988_212274426:DTL HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 212619339 T/C 1 193 204 397 88.3269755565086 110.638844489494 -22.3118689329849 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0265829299828849 ENSG00000117691:ENST00000366988:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000479589:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000473900:exon_212619172_212619714:NENF HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 212911836 T/C 1 18 8 26 8.23774901563293 4.33877821527426 3.89897080035867 T:C T C 10 0.542347276909282 0.167493351067612 ENSG00000117697:ENST00000366977:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366975:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000422588:exon_212910933_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366976:exon_212911825_212912028:NSL1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 212985592 G/A 1 8 8 16 3.66122178472574 4.33877821527426 -0.677556430548512 A:G G A 10 0.542347276909282 0.804712000972457 ENSG00000203705:ENST00000532324:exon_212985569_212985670:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000366974:exon_212985590_212985670:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000526641:exon_212985590_212985670:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000531963:exon_212985569_212985670:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000533650:exon_212985590_212985624:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000525574:exon_212985590_212985670:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000527693:exon_212985590_212985670:TATDN3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 212988540 G/C 1 16 10 26 7.32244356945149 5.42347276909282 1.89897080035867 C:G G C 10 0.542347276909282 0.556319503760722 ENSG00000203705:ENST00000532324:exon_212988355_212988939:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000366974:exon_212988355_212989968:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000526641:exon_212988355_212988757:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000531963:exon_212988389_212988939:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000366973:exon_212988355_212989959:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000526997:exon_212988355_212988567:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000525574:exon_212988355_212989968:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000527693:exon_212988355_212989186:TATDN3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 213068595 C/T 1 13 4 17 5.94948540017933 2.16938910763713 3.78009629254221 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0872415563926971 ENSG00000162769:ENST00000366971:exon_213068558_213072705:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000419102:exon_213068558_213068676:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000483790:exon_213068558_213068736:FLVCR1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 214787130 G/A 1 8 3 11 3.66122178472574 1.62704183072785 2.0341799539979 A:G G A 10 0.542347276909282 0.244923170028471 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214787057_214787259:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000464322:exon_214787057_214787259:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000495259:exon_214787057_214787236:CENPF HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 214814571 C/T 1 3 7 10 1.37295816927215 3.79643093836497 -2.42347276909282 T:C C T 10 0.542347276909282 0.202477940149527 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 214820099 A/G 1 14 12 26 6.40713812327005 6.50816732291138 -0.101029199641331 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 214826196 G/A 1 9 4 13 4.11887450781646 2.16938910763713 1.94948540017933 A:G G A 10 0.542347276909282 0.405355588189296 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214826171_214826332:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000391896:exon_214826171_214826332:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000467765:exon_214826171_214826332:CENPF HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 214830617 A/G 1 18 18 36 8.23774901563293 9.76225098436707 -1.52450196873415 A:G A G 10 0.542347276909282 0.620104822842998 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214830276_214830752:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000469862:exon_214830276_214830753:CENPF HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 214837110 C/G 1 65 71 136 29.7474270008967 38.506656660559 -8.75922965966235 C:G C G 10 0.542347276909282 0.143490349342768 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214836934_214837931:CENPF HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 221912361 T/C 1 8 11 19 3.66122178472574 5.9658200460021 -2.30459826127636 T:C T C 10 0.542347276909282 0.358812996838560 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000418487:exon_221912276_221912783:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 221912808 T/C 1 2 6 8 0.915305446181436 3.25408366145569 -2.33877821527426 T:C T C 10 0.542347276909282 0.153857012176102 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 224377724 C/T 1 17 11 28 7.78009629254221 5.9658200460021 1.81427624654011 T:C C T 10 0.542347276909282 0.571534969620231 ENSG00000143753:ENST00000415210:exon_224377279_224378021:DEGS1;ENSG00000143753:ENST00000323699:exon_224377279_224378021:DEGS1;ENSG00000143753:ENST00000391877:exon_224377279_224378021:DEGS1;ENSG00000143753:ENST00000465848:exon_224377279_224377754:DEGS1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 224377745 G/A 1 15 12 27 6.86479084636077 6.50816732291138 0.356623523449387 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000143753:ENST00000415210:exon_224377279_224378021:DEGS1;ENSG00000143753:ENST00000323699:exon_224377279_224378021:DEGS1;ENSG00000143753:ENST00000391877:exon_224377279_224378021:DEGS1;ENSG00000143753:ENST00000465848:exon_224377279_224377754:DEGS1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 225600169 C/T 1 7 11 18 3.20356906163503 5.9658200460021 -2.76225098436708 T:C C T 10 0.542347276909282 0.238484579075496 ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225600156_225600347:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225600156_225600347:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225600156_225600347:LBR HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 226108200 C/T 1 49 42 91 22.4249834314452 22.7785856301898 -0.353602198744657 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000143811:ENST00000343818:exon_226107578_226108320:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000478402:exon_226107578_226108320:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000316940:exon_226107608_226108320:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000316918:exon_226108155_226108313:PYCR2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 226352498 T/G 1 34 14 48 15.5601925850844 7.59286187672995 7.96733070835447 T:G T G 10 0.542347276909282 0.0208131512362684 ENSG00000182827:ENST00000366812:exon_226352490_226352630:ACBD3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 226550829 T/C 1 27 62 89 12.3566235234494 33.6255311683755 -21.2689076449261 T:C T C 10 0.542347276909282 5.92448591168931e-06 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226550800_226550861:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000490921:exon_226550800_226550861:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000463968:exon_226550800_226550861:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000468608:exon_226550800_226550861:PARP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 226573364 A/G 1 72 56 128 32.9509960625317 30.3714475069198 2.57954855561191 A:G A G 10 0.542347276909282 0.658604515578531 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226573205_226573381:PARP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 227920061 T/G 1 82 78 160 37.5275232934389 42.303087598924 -4.77556430548512 T:G T G 10 0.542347276909282 0.47548466564823 ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 227935444 A/G 1 7 3 10 3.20356906163503 1.62704183072785 1.57652723090718 A:G A G 10 0.542347276909282 0.361234487774673 ENSG00000143740:ENST00000475930:exon_227935393_227935887:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000470038:exon_227935393_227935816:SNAP47 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 231408091 A/G 1 15 9 24 6.86479084636077 4.88112549218354 1.98366535417723 A:G A G 10 0.542347276909282 0.539851636806923 ENSG00000116906:ENST00000366646:exon_231408058_231408137:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000366647:exon_231408058_231408137:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000416000:exon_231408058_231408137:GNPAT HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 234743237 G/A 1 85 86 171 38.900481462711 46.6418658141982 -7.74138435148721 A:G G A 10 0.542347276909282 0.249869548620533 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234740015_234743598:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234740015_234743598:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000491430:exon_234742977_234743598:IRF2BP2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 235324298 T/C 1 22 26 48 10.0683599079958 14.1010291996413 -4.03266929164553 T:C T C 10 0.542347276909282 0.250108440780858 ENSG00000188739:ENST00000408888:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000366606:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000450703:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000400947:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000447801:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000474086:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000476261:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000468751:exon_235324208_235324486:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000429912:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000486751:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000485019:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000054267:ENST00000474953:exon_235324208_235324382:ARID4B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 235383188 A/G 1 53 63 116 24.2555943238081 34.1678784452848 -9.91228412147671 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0762278378430593 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235383108_235383283:ARID4B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 235392546 T/C 1 41 33 74 18.7637616467194 17.8974601380063 0.866301508713132 T:C T C 10 0.542347276909282 0.907303129260006 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000418304:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000466653:exon_235391626_235392700:ARID4B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 241712134 C/T 1 9 7 16 4.11887450781646 3.79643093836497 0.322443569451489 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000117009:ENST00000366559:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366558:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000484628:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000480967:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000484229:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366557:exon_241712129_241712198:KMO HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 242042301 G/A 1 17 1 18 7.78009629254221 0.542347276909282 7.23774901563293 A:C:G G A 10 0.542347276909282 0.000450795960599752 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 1 247322298 G/T 1 3 6 9 1.37295816927215 3.25408366145569 -1.88112549218354 T:G G T 10 0.542347276909282 0.31687860521519 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 1065457 T/A 1 26 14 40 11.8989708003587 7.59286187672995 4.30610892362872 A:T T A 10 0.542347276909282 0.204730326402250 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1063015_1065876:GTPBP4;ENSG00000148377:ENST00000277517:exon_1064847_1065774:IDI2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 3150898 C/T 1 13 13 26 5.94948540017933 7.05051459982067 -1.10102919964133 T:C C T 10 0.542347276909282 0.697454295170068 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000468050:exon_3150893_3150985:PFKP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 3150973 C/T 1 28 18 46 12.8142762465401 9.76225098436707 3.05202526217303 T:C C T 10 0.542347276909282 0.379573650737279 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000468050:exon_3150893_3150985:PFKP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 3172121 C/T 1 51 35 86 23.3402888776266 18.9821546918249 4.35813418580175 T:C C T 10 0.542347276909282 0.387057905243417 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3172011_3172133:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3171199_3172175:PFKP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 3180227 T/C 1 119 111 230 54.4606740477954 60.2005477369303 -5.73987368913485 T:C T C 10 0.542347276909282 0.466923266428408 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 3180298 C/T 1 86 44 130 39.3581341858018 23.8632801840084 15.4948540017933 T:C C T 10 0.542347276909282 0.00629698215750444 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 3180316 T/C 1 78 44 122 35.696912401076 23.8632801840084 11.8336322170676 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0362592624479142 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 3189380 C/T 1 6 9 15 2.74591633854431 4.88112549218354 -2.13520915363923 T:C C T 10 0.542347276909282 0.307109737553343 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451454:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3189342_3189442:PITRM1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 6001696 C/T 1 10 8 18 4.57652723090718 4.33877821527426 0.237749015632924 T:C C T 10 0.542347276909282 1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 6002368 T/G 1 3 5 8 1.37295816927215 2.71173638454641 -1.33877821527426 T:G T G 10 0.542347276909282 0.482450044879903 ENSG00000134470:ENST00000435171:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397251:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379977:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397253:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000425111:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397248:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000414280:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000534292:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000319465:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532948:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379972:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000528354:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000447291:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379974:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532039:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397250:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379971:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000530685:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397255:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000525219:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397246:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000429135:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000453922:exon_6002358_6002530:IL15RA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 11797500 G/A 1 9 1 10 4.11887450781646 0.542347276909282 3.57652723090718 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0259607145887505 ENSG00000134463:ENST00000379215:exon_11797407_11797607:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000496136:exon_11797407_11797607:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000428613:exon_11797407_11797607:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000420401:exon_11797407_11797580:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000422887:exon_11797407_11797607:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000495787:exon_11797344_11797729:ECHDC3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 12046546 T/C 1 3 8 11 1.37295816927215 4.33877821527426 -2.9658200460021 T:C T C 10 0.542347276909282 0.126534045746447 ENSG00000151461:ENST00000356352:exon_12046529_12046726:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000357604:exon_12046529_12046726:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000379172:exon_12046529_12046726:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313999:exon_12046529_12046726:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000397053:exon_12046529_12046726:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313977:exon_12046529_12046726:UPF2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 12055986 A/G 1 6 7 13 2.74591633854431 3.79643093836497 -1.05051459982067 A:G A G 10 0.542347276909282 0.588981693424056 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 12149939 C/T 1 10 1 11 4.57652723090718 0.542347276909282 4.0341799539979 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0148672965279524 ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12149908_12150014:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000448829:exon_12149908_12150014:DHTKD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 12209752 T/C 1 60 75 135 27.4591633854431 40.6760457681961 -13.2168823827531 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0245613943072034 ENSG00000065665:ENST00000475268:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000495368:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000165609:ENST00000491614:exon_12207324_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378937:exon_12209575_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378952:exon_12209671_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000476462:exon_12209737_12209810:NUDT5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 12228298 C/T 1 5 21 26 2.28826361545359 11.3892928150949 -9.10102919964133 T:C C T 10 0.542347276909282 0.000504789877241826 ENSG00000165609:ENST00000491614:exon_12228228_12228331:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378929:exon_12228228_12228331:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378937:exon_12228228_12228331:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378952:exon_12228228_12228331:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378940:exon_12228228_12228331:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378927:exon_12228228_12228331:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000444732:exon_12228228_12228331:NUDT5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 13653653 A/G 1 4 11 15 1.83061089236287 5.9658200460021 -4.13520915363923 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0383920942670258 ENSG00000165630:ENST00000378572:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000417658:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000378544:exon_13653615_13653683:PRPF18 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 16556710 T/C 1 2 13 15 0.915305446181436 7.05051459982067 -6.13520915363923 T:C T C 10 0.542347276909282 0.00144844333229881 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 22048407 A/C 1 109 84 193 49.8841468168883 45.5571712603797 4.32697555650859 A:C A C 10 0.542347276909282 0.563600775417634 ENSG00000136770:ENST00000376980:exon_22048099_22048547:DNAJC1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 24790393 A/G 1 22 4 26 10.0683599079958 2.16938910763713 7.89897080035867 A:G A G 10 0.542347276909282 0.00143995780171722 ENSG00000120549:ENST00000376462:exon_24790308_24790474:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376456:exon_24790308_24790474:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376452:exon_24790308_24790474:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000447159:exon_24790308_24790474:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000458595:exon_24790308_24790474:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000323059:exon_24790308_24790474:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000450158:exon_24790308_24790474:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000442879:exon_24790308_24790474:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376454:exon_24790308_24790474:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000430453:exon_24790308_24790474:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000438429:exon_24790308_24790474:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000307544:exon_24790308_24790474:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000396445:exon_24790308_24790474:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376451:exon_24790308_24790474:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000396446:exon_24790308_24790474:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000460373:exon_24790308_24790474:KIAA1217 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 24790491 G/T 1 8 2 10 3.66122178472574 1.08469455381856 2.57652723090718 T:G G T 10 0.542347276909282 0.121983479725832 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 24790492 C/T 1 8 2 10 3.66122178472574 1.08469455381856 2.57652723090718 T:C C T 10 0.542347276909282 0.121983479725832 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 24810663 C/A 1 10 6 16 4.57652723090718 3.25408366145569 1.32244356945149 A:C C A 10 0.542347276909282 0.619321847116393 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 24813454 G/A 1 20 13 33 9.15305446181436 7.05051459982067 2.10253986199369 A:G G A 10 0.542347276909282 0.490163488744307 ENSG00000120549:ENST00000376462:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376456:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376452:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000447159:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000458595:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000323059:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000450158:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000442879:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376454:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000430453:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000438429:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000307544:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000396445:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376451:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000396446:exon_24813252_24813693:KIAA1217 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 24833137 C/T 1 6 4 10 2.74591633854431 2.16938910763713 0.57652723090718 T:C C T 10 0.542347276909282 0.762606887543924 ENSG00000120549:ENST00000442879:exon_24831812_24833410:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376454:exon_24831812_24833410:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376451:exon_24831812_24833410:KIAA1217 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 27303605 A/T 1 11 12 23 5.0341799539979 6.50816732291138 -1.47398736891348 A:T A T 10 0.542347276909282 0.539417094228368 ENSG00000107890:ENST00000445828:exon_27303423_27303608:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27303423_27303640:ANKRD26 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 27317840 C/T 1 9 15 24 4.11887450781646 8.13520915363923 -4.01633464582277 T:C C T 10 0.542347276909282 0.105846506377141 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27317781_27317874:ANKRD26 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 27434483 G/A 1 5 8 13 2.28826361545359 4.33877821527426 -2.05051459982067 A:G G A 10 0.542347276909282 0.278020697313787 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27434348_27436597:YME1L1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 27459670 C/T 1 3 7 10 1.37295816927215 3.79643093836497 -2.42347276909282 T:C C T 10 0.542347276909282 0.202477940149527 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27458873_27460012:MASTL HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 27459746 C/G 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 C:G C G 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27458873_27460012:MASTL HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 27475444 T/C 1 14 15 29 6.40713812327005 8.13520915363923 -1.72807103036918 T:C T C 10 0.542347276909282 0.578282955018896 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 27475494 T/C 1 11 20 31 5.0341799539979 10.8469455381856 -5.81276558418774 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0461711318532332 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 30637995 C/G 1 5 6 11 2.28826361545359 3.25408366145569 -0.965820046002102 C:G C G 10 0.542347276909282 0.564156977749346 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 32635834 G/A 1 25 7 32 11.441318077268 3.79643093836497 7.64488713890298 A:C:G G A 10 0.542347276909282 0.0071126642619554 ENSG00000120616:ENST00000319778:exon_32635691_32636146:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000263062:exon_32635691_32636113:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000480402:exon_32635691_32636146:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000469059:exon_32635691_32636049:EPC1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 32856746 A/C 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 A:C A C 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000216937:ENST00000324147:exon_32856598_32856819:CCDC7;ENSG00000216937:ENST00000476558:exon_32856598_32856819:CCDC7;ENSG00000216937:ENST00000277657:exon_32856598_32856819:CCDC7;ENSG00000216937:ENST00000362006:exon_32856598_32856819:CCDC7;ENSG00000216937:ENST00000496320:exon_32856598_32856819:CCDC7;ENSG00000216937:ENST00000435402:exon_32856598_32856819:CCDC7;ENSG00000150076:ENST00000302316:exon_32856651_32856819:C10orf68;ENSG00000150076:ENST00000375037:exon_32856651_32856819:C10orf68;ENSG00000150076:ENST00000375025:exon_32856651_32856819:C10orf68 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 43319197 G/A 1 35 40 75 16.0178453081751 21.6938910763713 -5.67604576819615 A:G G A 10 0.542347276909282 0.203194282374228 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43319057_43319232:BMS1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 43883342 T/A 1 18 16 34 8.23774901563293 8.67755643054851 -0.439807414915586 A:T T A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000169813:ENST00000357065:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000356053:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000443950:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000337970:exon_43881470_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000477108:exon_43883037_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000498176:exon_43883091_43883384:HNRNPF HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 50678369 T/C 1 5 5 10 2.28826361545359 2.71173638454641 -0.42347276909282 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50678228_50678935:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000374129:exon_50678228_50678935:ERCC6 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 58118630 T/C 1 30 20 50 13.7295816927215 10.8469455381856 2.8826361545359 T:C T C 10 0.542347276909282 0.478692151302255 ENSG00000122952:ENST00000373944:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000494312:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000395405:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000318387:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000460654:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000467523:exon_58118566_58118708:ZWINT HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 64927823 C/G 1 22 39 61 10.0683599079958 21.151543799462 -11.0831838914662 C:G C G 10 0.542347276909282 0.00462179344530391 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64926981_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000467356:exon_64926981_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64926990_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64926990_64927894:JMJD1C HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 65225450 C/T 1 3 9 12 1.37295816927215 4.88112549218354 -3.50816732291138 T:C C T 10 0.542347276909282 0.077659883252704 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_65225255_65225641:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_65225255_65225722:JMJD1C HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 70105560 G/A 0 0 9 9 0 4.88112549218354 -4.88112549218354 A G A 10 0.542347276909282 0.000880692823267724 ENSG00000204130:ENST00000466493:exon_70105459_70105668:RUFY2;ENSG00000204130:ENST00000466187:exon_70103183_70105668:RUFY2;ENSG00000204130:ENST00000388768:exon_70103266_70105668:RUFY2;ENSG00000204130:ENST00000265865:exon_70104902_70105668:RUFY2;ENSG00000204130:ENST00000473398:exon_70105490_70105668:RUFY2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 70531217 C/T 1 3 6 9 1.37295816927215 3.25408366145569 -1.88112549218354 T:C C T 10 0.542347276909282 0.31687860521519 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 70856852 G/A 1 71 93 164 32.493343339441 50.4382967525632 -17.9449534131222 A:G G A 10 0.542347276909282 0.00592800820353723 ENSG00000122862:ENST00000242465:exon_70856840_70856987:SRGN HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 70863705 C/T 1 175 175 350 80.0892265408757 94.9107734591243 -14.8215469182487 A:T:C C T 10 0.542347276909282 0.119711349568522 ENSG00000122862:ENST00000462445:exon_70863627_70864297:SRGN;ENSG00000122862:ENST00000242465:exon_70863627_70864567:SRGN HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 70892791 C/T 1 7 2 9 3.20356906163503 1.08469455381856 2.11887450781646 T:C C T 10 0.542347276909282 0.193758782140484 ENSG00000122958:ENST00000373382:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000477667:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000263559:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000395098:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000489656:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000490696:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000467852:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000489794:exon_70892654_70892803:VPS26A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 72179746 C/T 1 7 4 11 3.20356906163503 2.16938910763713 1.0341799539979 T:C C T 10 0.542347276909282 0.763959235154452 ENSG00000148730:ENST00000373218:exon_72179670_72179855:EIF4EBP2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 72358577 G/A 1 6 2 8 2.74591633854431 1.08469455381856 1.66122178472574 A:G G A 10 0.542347276909282 0.303100337321114 ENSG00000180644:ENST00000373209:exon_72357104_72358937:PRF1;ENSG00000180644:ENST00000441259:exon_72357105_72358937:PRF1;ENSG00000180644:ENST00000318971:exon_72357105_72358937:PRF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 81928983 A/G 1 40 39 79 18.3061089236287 21.151543799462 -2.84543487583328 A:G A G 10 0.542347276909282 0.572767538989527 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81928725_81929114:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81928725_81929114:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81928725_81929114:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81928725_81929114:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81928725_81929114:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81928725_81929114:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81928915_81929026:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81928725_81929114:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000445524:exon_81928725_81929114:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000437799:exon_81928836_81929114:ANXA11 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 85912032 C/T 1 311 334 645 142.329996881213 181.1439904877 -38.8139936064869 T:C C T 10 0.542347276909282 0.00232389766773456 ENSG00000165678:ENST00000372134:exon_85912020_85913001:GHITM;ENSG00000165678:ENST00000339736:exon_85912020_85912927:GHITM;ENSG00000165678:ENST00000436406:exon_85912020_85912930:GHITM HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 86273249 T/C 1 11 5 16 5.0341799539979 2.71173638454641 2.32244356945149 T:C T C 10 0.542347276909282 0.318264889784535 ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86273205_86278276:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86273205_86278273:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000494144:exon_86273205_86274161:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000493409:exon_86273205_86273417:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000498300:exon_86273205_86273458:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000466105:exon_86273205_86273452:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000480006:exon_86273205_86273626:FAM190B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 88730312 T/C 1 8 5 13 3.66122178472574 2.71173638454641 0.949485400179334 T:C T C 10 0.542347276909282 0.782391509721688 ENSG00000148671:ENST00000372013:exon_88730233_88730672:C10orf116;ENSG00000148671:ENST00000372012:exon_88730233_88730487:C10orf116 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 91479211 G/T 1 33 19 52 15.1025398619937 10.3045982612764 4.79794160071734 T:G G T 10 0.542347276909282 0.210808691388161 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91479176_91479463:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91479176_91479463:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91479176_91479463:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91479176_91479463:KIF20B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 91487649 A/T 1 16 18 34 7.32244356945149 9.76225098436707 -2.43980741491559 A:T A T 10 0.542347276909282 0.491743950057185 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000439656:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91487613_91487653:KIF20B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 91488979 A/T 1 33 46 79 15.1025398619937 24.947974737827 -9.84543487583328 A:T A T 10 0.542347276909282 0.0313946824511289 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91488885_91489004:KIF20B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 91522548 A/G 1 18 4 22 8.23774901563293 2.16938910763713 6.0683599079958 A:G A G 10 0.542347276909282 0.00955490376201924 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91522395_91522592:KIF20B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 96313960 A/C 1 23 15 38 10.5260126310865 8.13520915363923 2.39080347744729 A:C A C 10 0.542347276909282 0.515909691263228 ENSG00000119969:ENST00000419900:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000348459:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000437940:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000371332:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394045:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394044:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394036:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000239026:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000462057:exon_96313881_96314005:HELLS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 96997670 A/G 1 1829 1815 3644 837.046830532923 984.360307590347 -147.313477057423 A:T:G A G 10 0.542347276909282 1.00917177287544e-06 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_96997329_96997868:PDLIM1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 96997820 A/G 1 938 963 1901 429.278254259094 522.280427663639 -93.002173404545 A:G A G 10 0.542347276909282 2.03147857359871e-05 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_96997329_96997868:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000492511:exon_96997697_96997868:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000477757:exon_96997767_96997868:PDLIM1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 97990583 A/G 1 11 9 20 5.0341799539979 4.88112549218354 0.153054461814361 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000095585:ENST00000413476:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393894:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000428924:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000427367:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000224337:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000371176:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393889:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000467799:exon_97990550_97990590:BLNK HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 99125949 C/T 1 14 15 29 6.40713812327005 8.13520915363923 -1.72807103036918 T:C C T 10 0.542347276909282 0.578282955018896 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99125647_99125990:RRP12 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 99129230 T/C 1 8 4 12 3.66122178472574 2.16938910763713 1.49183267708862 T:C T C 10 0.542347276909282 0.564494489181351 ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99129182_99129339:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99129182_99129339:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99129182_99129339:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99129182_99129339:RRP12 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 99130549 C/T 1 1 8 9 0.457652723090718 4.33877821527426 -3.88112549218354 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0143335108091899 ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99130473_99130553:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99130473_99130553:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99130473_99130553:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99130473_99130553:RRP12 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 99205731 A/G 1 6 4 10 2.74591633854431 2.16938910763713 0.57652723090718 A:G A G 10 0.542347276909282 0.762606887543924 ENSG00000171311:ENST00000464440:exon_99205712_99205751:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370902:exon_99205712_99205774:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370886:exon_99205712_99205743:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370885:exon_99205712_99205750:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370884:exon_99205712_99205774:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000485122:exon_99205712_99205742:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000476234:exon_99205712_99205763:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000489158:exon_99205712_99205763:EXOSC1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 99218456 C/T 1 127 86 213 58.1218958325212 46.6418658141982 11.4800300183229 T:C C T 10 0.542347276909282 0.130121173234138 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99218081_99218476:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99218081_99218476:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99218081_99218476:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000444411:exon_99218081_99218476:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99218081_99218476:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99218081_99218476:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000485400:exon_99218083_99218476:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99218083_99218476:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99218083_99218476:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99218083_99218476:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99218083_99218476:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99218083_99218476:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99218083_99218476:MMS19 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 100147060 A/G 1 3 6 9 1.37295816927215 3.25408366145569 -1.88112549218354 A:G A G 10 0.542347276909282 0.31687860521519 ENSG00000119943:ENST00000370575:exon_100146958_100147064:PYROXD2;ENSG00000119943:ENST00000483923:exon_100146958_100147064:PYROXD2;ENSG00000119943:ENST00000464808:exon_100146958_100147064:PYROXD2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 104160959 C/T 1 260 282 542 118.989708003587 152.941932088418 -33.9522240848308 T:C C T 10 0.542347276909282 0.00383507137035905 ENSG00000077150:ENST00000454143:exon_104160937_104161088:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000428099:exon_104160937_104161088:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000369966:exon_104160937_104161088:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000336486:exon_104160937_104161088:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000189444:exon_104160937_104161088:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000473400:exon_104160704_104161026:NFKB2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 104436641 C/T 1 63 29 92 28.8321215547152 15.7280710303692 13.1040505243461 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0063323086458789 ENSG00000138175:ENST00000260746:exon_104436315_104436698:ARL3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 105205302 A/C 1 56 43 99 25.6285524930802 23.3209329070991 2.30761958598109 A:C A C 10 0.542347276909282 0.687136435706324 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105205135_105206049:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000478543:exon_105205135_105205481:PDCD11 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 105206874 T/C 1 11 3 14 5.0341799539979 1.62704183072785 3.40713812327005 A:T:C T C 10 0.542347276909282 0.104636621208515 ENSG00000138172:ENST00000369788:exon_105206543_105207325:CALHM2;ENSG00000138172:ENST00000260743:exon_105206546_105207325:CALHM2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 105763026 C/T 1 48 52 100 21.9673307083545 28.2020583992827 -6.2347276909282 T:C C T 10 0.542347276909282 0.228832638960554 ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105761930_105763285:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105761930_105763285:SLK HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 105777941 A/G 1 5 4 9 2.28826361545359 2.16938910763713 0.118874507816462 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105777918_105778047:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105777918_105778047:SLK;ENSG00000065613:ENST00000474260:exon_105777918_105778047:SLK HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 112641053 A/G 1 13 8 21 5.94948540017933 4.33877821527426 1.61070718490508 A:G A G 10 0.542347276909282 0.519340658548302 ENSG00000150593:ENST00000280154:exon_112640991_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000445683:exon_112640991_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000393104:exon_112640991_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000467574:exon_112640991_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000483670:exon_112640991_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000444997:exon_112641033_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000492932:exon_112640991_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000452838:exon_112640991_112641293:PDCD4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 115910928 G/T 1 18 12 30 8.23774901563293 6.50816732291138 1.72958169272154 T:G G T 10 0.542347276909282 0.585648203652596 ENSG00000165813:ENST00000369287:exon_115910851_115910979:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000430353:exon_115910851_115910979:C10orf118 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 115922774 G/A 1 6 10 16 2.74591633854431 5.42347276909282 -2.67755643054851 A:G G A 10 0.542347276909282 0.213548421391003 ENSG00000165813:ENST00000369287:exon_115922396_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000430353:exon_115922396_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000369286:exon_115921367_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000369285:exon_115921367_115923088:C10orf118 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 119043554 C/T 1 6 4 10 2.74591633854431 2.16938910763713 0.57652723090718 T:C C T 10 0.542347276909282 0.762606887543924 ENSG00000165650:ENST00000334464:exon_119040000_119044982:PDZD8 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 120828969 A/G 1 6 6 12 2.74591633854431 3.25408366145569 -0.508167322911383 A:G A G 10 0.542347276909282 0.780543886765314 ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120828958_120829166:EIF3A;ENSG00000107581:ENST00000486248:exon_120828958_120828985:EIF3A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 123549691 T/G 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 T:G T G 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000423243:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000485281:exon_123549684_123549741:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000470613:exon_123549378_123549804:ATE1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 124753755 G/A 1 5 4 9 2.28826361545359 2.16938910763713 0.118874507816462 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000095574:ENST00000368886:exon_124750322_124754239:IKZF5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 126172863 A/G 1 8 5 13 3.66122178472574 2.71173638454641 0.949485400179334 A:G A G 10 0.542347276909282 0.782391509721688 ENSG00000107902:ENST00000392757:exon_126172708_126172895:LHPP;ENSG00000107902:ENST00000368842:exon_126172708_126172895:LHPP;ENSG00000107902:ENST00000368839:exon_126172708_126172895:LHPP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 129899543 C/T 1 232 154 386 106.175431757047 83.5214806440294 22.6539511130172 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0214666220859223 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 129899578 T/C 1 256 194 450 117.159097111224 105.215371720401 11.9437253908231 T:C:G T C 10 0.542347276909282 0.276528483155722 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 129899778 G/C 1 251 208 459 114.87083349577 112.808233597131 2.06259989863958 C:G G C 10 0.542347276909282 0.851537688047724 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129899748_129899889:MKI67 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 129901393 T/C 1 81 41 122 37.0698705703482 22.2362383532806 14.8336322170676 T:C T C 10 0.542347276909282 0.00815709439207707 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 129901722 G/A 1 32 16 48 14.644887138903 8.67755643054851 5.96733070835447 A:G G A 10 0.542347276909282 0.110104468968604 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 129901825 T/C 1 32 32 64 14.644887138903 17.355112861097 -2.71022572219405 T:C T C 10 0.542347276909282 0.531631695139263 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 129901946 T/G 1 26 27 53 11.8989708003587 14.6433764765506 -2.74440567619195 T:G T G 10 0.542347276909282 0.491789285167506 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 129902158 C/T 1 22 27 49 10.0683599079958 14.6433764765506 -4.57501656855482 T:C C T 10 0.542347276909282 0.199439528998939 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 129902281 G/A 1 21 22 43 9.61070718490508 11.9316400920042 -2.32093290709912 A:G G A 10 0.542347276909282 0.541277433980749 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 129903016 T/C 1 6 8 14 2.74591633854431 4.33877821527426 -1.59286187672995 T:C T C 10 0.542347276909282 0.431117415726890 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 129905429 C/T 1 3 5 8 1.37295816927215 2.71173638454641 -1.33877821527426 T:C C T 10 0.542347276909282 0.482450044879903 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 129906364 G/A 1 8 6 14 3.66122178472574 3.25408366145569 0.407138123270053 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 129906468 C/T 1 14 7 21 6.40713812327005 3.79643093836497 2.61070718490508 T:C C T 10 0.542347276909282 0.281064205206453 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 129907544 G/C 1 12 36 48 5.49183267708862 19.5245019687341 -14.0326692916455 C:G G C 10 0.542347276909282 5.8807593250577e-05 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 129913960 A/T 1 5 6 11 2.28826361545359 3.25408366145569 -0.965820046002102 A:T A T 10 0.542347276909282 0.564156977749346 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129913192_129914271:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000478293:exon_129913774_129914271:MKI67 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 133761285 G/A 1 26 12 38 11.8989708003587 6.50816732291138 5.39080347744729 A:G G A 10 0.542347276909282 0.102469098563473 ENSG00000175470:ENST00000455566:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000482010:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000422256:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000398018:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000490777:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000470416:exon_133761034_133761295:PPP2R2D HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 133769482 G/C 1 50 52 102 22.8826361545359 28.2020583992827 -5.31942224474676 C:G G C 10 0.542347276909282 0.320576957408141 ENSG00000175470:ENST00000455566:exon_133769188_133773331:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000482010:exon_133769188_133770059:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000422256:exon_133769188_133770037:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000398018:exon_133769188_133770051:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000490777:exon_133769188_133769746:PPP2R2D HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 135184126 G/A 1 42 20 62 19.2214143698102 10.8469455381856 8.37446883162452 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0406095694639275 ENSG00000127884:ENST00000368547:exon_135184064_135184261:ECHS1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 135204950 C/G 1 54 67 121 24.7132470468988 36.3372675529219 -11.6240205060231 C:G C G 10 0.542347276909282 0.0359081446627531 ENSG00000148832:ENST00000368542:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368538:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000278060:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000357296:exon_135204816_135205158:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000356306:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000483211:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000476834:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000529585:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000480071:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368544:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368535:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368534:exon_135204866_135204999:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000530555:exon_135204816_135205167:PAOX HGDP00213_parsed_pileup.txt . 10 135205009 C/G 1 31 40 71 14.1872344158123 21.6938910763713 -7.50665666055902 C:G C G 10 0.542347276909282 0.07527162105148 ENSG00000148832:ENST00000368542:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368538:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000278060:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000357296:exon_135204816_135205158:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000356306:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000483211:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000476834:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000529585:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000480071:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368544:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368535:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000530555:exon_135204816_135205167:PAOX HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 499120 G/A 1 82 77 159 37.5275232934389 41.7607403220147 -4.23321702857584 A:G G A 10 0.542347276909282 0.524702968360137 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_499015_499999:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529115:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000527485:exon_499031_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529368:exon_499047_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529306:exon_499062_499185:RNH1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 1874404 C/T 1 184 157 341 84.2081010486921 85.1485224747573 -0.940421426065157 A:T:C C T 10 0.542347276909282 0.956668023900836 ENSG00000130592:ENST00000311604:exon_1874200_1874427:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381788:exon_1874200_1874427:LSP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 1902768 G/A 1 104 121 225 47.5958832014347 65.6240205060231 -18.0281373045884 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0189905930567411 ENSG00000130592:ENST00000311604:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381788:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000421485:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000446808:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381775:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381758:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000405957:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000451814:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000457279:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000429923:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000406638:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000418975:exon_1902662_1902782:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000417766:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381768:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000472974:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000432093:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000485341:exon_1902662_1902826:LSP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 1974029 G/A 1 246 262 508 112.582569880317 142.094986550232 -29.5124166699152 A:G G A 10 0.542347276909282 0.009736875001314 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397297:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381514:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397294:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000466346:exon_1974012_1974552:MRPL23 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 1977552 G/A 1 875 724 1599 400.446132704378 392.65942848232 7.78670422205812 A:C:G G A 10 0.542347276909282 0.706602350288211 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1977486_1977825:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1977486_1977678:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000484918:exon_1977486_1977576:MRPL23 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 2417836 G/A 1 7 2 9 3.20356906163503 1.08469455381856 2.11887450781646 A:G G A 10 0.542347276909282 0.193758782140484 ENSG00000110651:ENST00000531840:exon_2416202_2418626:CD81;ENSG00000110651:ENST00000481386:exon_2417543_2417944:CD81 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 2424275 G/A 1 56 50 106 25.6285524930802 27.1173638454641 -1.48881135238389 A:G G A 10 0.542347276909282 0.771041003837503 ENSG00000184281:ENST00000380996:exon_2424075_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000333256:exon_2423841_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000380992:exon_2424075_2424379:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000437110:exon_2423841_2424473:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000451491:exon_2424075_2424379:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000440813:exon_2424075_2424678:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000496468:exon_2423841_2424437:TSSC4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 2943671 G/C 1 10 2 12 4.57652723090718 1.08469455381856 3.49183267708862 C:G G C 10 0.542347276909282 0.0467512693233193 ENSG00000110628:ENST00000347936:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000312221:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449793:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000380574:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000463571:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000441077:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449603:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000495518:exon_2943666_2943786:SLC22A18 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 4159457 A/G 1 136 121 257 62.2407703403377 65.6240205060231 -3.38325016568546 A:G A G 10 0.542347276909282 0.707288246058967 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4159425_4160100:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4159425_4160106:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4159425_4159676:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4159425_4160105:RRM1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 5701001 C/T 1 8 6 14 3.66122178472574 3.25408366145569 0.407138123270053 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5700991_5701037:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700991_5701087:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000465634:exon_5700991_5701063:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700991_5701161:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 5717762 T/C 1 28 28 56 12.8142762465401 15.1857237534599 -2.37144750691979 T:C T C 10 0.542347276909282 0.59214463302432 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000460454:exon_5717397_5718243:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5717722_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5717732_5717885:TRIM22 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 5718517 G/A 1 49 54 103 22.4249834314452 29.2867529531012 -6.86176952165604 A:G G A 10 0.542347276909282 0.198478117409253 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5718478_5718573:TRIM22 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 5719649 T/C 1 30 34 64 13.7295816927215 18.4398074149156 -4.71022572219405 T:C T C 10 0.542347276909282 0.259744235974797 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5719545_5719706:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 5719667 T/C 1 43 42 85 19.6790670929009 22.7785856301898 -3.09951853728897 T:C T C 10 0.542347276909282 0.515210235233243 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5719545_5719706:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 5719750 G/C 1 82 65 147 37.5275232934389 35.2525729991033 2.27495029433555 C:G G C 10 0.542347276909282 0.7409306281438 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5719710_5719775:TRIM22 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 8933064 G/A 1 25 20 45 11.441318077268 10.8469455381856 0.594372539082311 A:G G A 10 0.542347276909282 0.882326551535792 ENSG00000166452:ENST00000299576:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000309377:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000309357:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000426510:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000529876:exon_8932736_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000525005:exon_8932739_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000524577:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000534506:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000396648:exon_8932885_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000534147:exon_8932990_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000529942:exon_8933012_8933218:C11orf17 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 9462003 G/A 1 4 9 13 1.83061089236287 4.88112549218354 -3.05051459982067 A:G G A 10 0.542347276909282 0.101447871356357 ENSG00000205339:ENST00000379719:exon_9462002_9462208:IPO7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 11292700 G/C 1 16 6 22 7.32244356945149 3.25408366145569 4.0683599079958 C:G G C 10 0.542347276909282 0.0901117450756771 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11292423_11292837:GALNTL4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 11977573 T/C 1 115 107 222 52.6300631554326 58.0311586292932 -5.4010954738606 T:C T C 10 0.542347276909282 0.50067998385276 ENSG00000170242:ENST00000339865:exon_11977548_11980870:USP47;ENSG00000170242:ENST00000527733:exon_11977548_11977968:USP47;ENSG00000170242:ENST00000399455:exon_11977548_11980870:USP47;ENSG00000170242:ENST00000305481:exon_11977548_11980701:USP47;ENSG00000170242:ENST00000529813:exon_11977548_11978492:USP47 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 13729639 G/A 1 15 8 23 6.86479084636077 4.33877821527426 2.52601263108651 A:G G A 10 0.542347276909282 0.403120043211592 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 13729640 A/T 1 15 8 23 6.86479084636077 4.33877821527426 2.52601263108651 A:T A T 10 0.542347276909282 0.403120043211592 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 14632570 A/C 1 6 8 14 2.74591633854431 4.33877821527426 -1.59286187672995 A:C A C 10 0.542347276909282 0.431117415726890 ENSG00000129084:ENST00000418988:exon_14632512_14632697:PSMA1;ENSG00000129084:ENST00000525472:exon_14632536_14632697:PSMA1;ENSG00000129084:ENST00000528018:exon_14632400_14632697:PSMA1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 18108492 T/C 1 30 23 53 13.7295816927215 12.4739873689135 1.25559432380805 T:C T C 10 0.542347276909282 0.783725890048815 ENSG00000166788:ENST00000524803:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000300013:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000534721:exon_18108413_18108507:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531751:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531581:exon_18108409_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000529318:exon_18108404_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531216:exon_18108413_18108601:SAAL1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 44104981 C/T 1 14 15 29 6.40713812327005 8.13520915363923 -1.72807103036918 T:C C T 10 0.542347276909282 0.578282955018896 ENSG00000110455:ENST00000448099:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000432284:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000263776:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000527346:exon_44104974_44105127:ACCS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 47185680 G/A 1 1 7 8 0.457652723090718 3.79643093836497 -3.33877821527426 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0276538394311292 ENSG00000149179:ENST00000378618:exon_47185644_47185936:C11orf49 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 47188411 C/T 1 9 12 21 4.11887450781646 6.50816732291138 -2.38929281509492 T:C C T 10 0.542347276909282 0.381797653241551 ENSG00000149182:ENST00000524782:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000426335:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000319543:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000419701:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000455951:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000395449:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000533243:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000527776:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000526342:exon_47188311_47188437:ARFGAP2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 47259668 T/C 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 T:C T C 10 0.542347276909282 0.734324137601319 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 47260319 A/G 1 6 3 9 2.74591633854431 1.62704183072785 1.11887450781646 A:G A G 10 0.542347276909282 0.521783447682374 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 47440758 G/A 1 6 5 11 2.74591633854431 2.71173638454641 0.0341799539978984 A:G G A 10 0.542347276909282 1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 47644269 C/T 1 93 87 180 42.5617032474368 47.1842130911075 -4.62250984367076 A:T:C C T 10 0.542347276909282 0.501455740287931 ENSG00000109919:ENST00000302503:exon_47644253_47644328:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000534074:exon_47644253_47644328:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000531669:exon_47644253_47644328:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000525649:exon_47644253_47644328:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000530428:exon_47644263_47644328:MTCH2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 57069375 A/G 1 5 8 13 2.28826361545359 4.33877821527426 -2.05051459982067 A:G A G 10 0.542347276909282 0.278020697313787 ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57069281_57069417:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57069281_57069417:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000427750:exon_57069281_57069417:TNKS1BP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 57069568 T/C 1 5 9 14 2.28826361545359 4.88112549218354 -2.59286187672995 T:C T C 10 0.542347276909282 0.187369064466614 ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57069548_57069698:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57069548_57069698:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000427750:exon_57069548_57069698:TNKS1BP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 57070089 C/T 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 T:C C T 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57069933_57070299:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57069933_57070299:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000427750:exon_57069933_57070953:TNKS1BP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 57076895 T/C 1 6 6 12 2.74591633854431 3.25408366145569 -0.508167322911383 T:C T C 10 0.542347276909282 0.780543886765314 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57076366_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57076369_57078030:TNKS1BP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 57099661 T/C 1 55 48 103 25.1708997699895 26.0326692916455 -0.86176952165604 T:C T C 10 0.542347276909282 0.92130294064085 ENSG00000149136:ENST00000278412:exon_57099626_57099754:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000293880:exon_57099626_57099754:SSRP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 58318619 C/G 1 4 9 13 1.83061089236287 4.88112549218354 -3.05051459982067 C:G C G 10 0.542347276909282 0.101447871356357 ENSG00000110031:ENST00000530561:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000395074:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528954:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000263845:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000412226:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528489:exon_58318538_58318705:LPXN HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 58919813 A/G 1 45 70 115 20.5943725390823 37.9643093836497 -17.3699368445674 A:G A G 10 0.542347276909282 0.00137090659322594 ENSG00000166801:ENST00000528737:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000435774:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000423534:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000420244:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000361723:exon_58919223_58922509:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000440740:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000533703:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000531147:exon_58919223_58922509:FAM111A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 58978940 C/T 1 5 4 9 2.28826361545359 2.16938910763713 0.118874507816462 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000197629:ENST00000361050:exon_58975983_58980424:MPEG1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 60230531 C/T 1 53 70 123 24.2555943238081 37.9643093836497 -13.7087150598417 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0143966197343439 ENSG00000156738:ENST00000345732:exon_60230475_60230594:MS4A1;ENSG00000156738:ENST00000527101:exon_60230475_60230594:MS4A1;ENSG00000156738:ENST00000532073:exon_60230475_60230594:MS4A1;ENSG00000156738:ENST00000534668:exon_60230475_60230594:MS4A1;ENSG00000156738:ENST00000534503:exon_60230475_60230594:MS4A1;ENSG00000156738:ENST00000533306:exon_60230475_60230594:MS4A1;ENSG00000156738:ENST00000389939:exon_60230475_60230594:MS4A1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 60610065 G/A 1 29 16 45 13.2719289696308 8.67755643054851 4.59437253908231 A:G G A 10 0.542347276909282 0.180962002510825 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60610019_60610098:CCDC86 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 60666341 G/A 1 46 37 83 21.052025262173 20.0668492456434 0.985176016529596 A:G G A 10 0.542347276909282 0.912374973342646 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60666334_60666403:PRPF19 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 60704213 C/T 1 2 10 12 0.915305446181436 5.42347276909282 -4.50816732291138 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0163150519946599 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 61089037 T/C 1 27 29 56 12.3566235234494 15.7280710303692 -3.37144750691979 T:C T C 10 0.542347276909282 0.421395792485082 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 61112802 C/T 1 8 15 23 3.66122178472574 8.13520915363923 -4.47398736891348 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0919008529328443 ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000534084:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000525366:exon_61112786_61113037:DAK;ENSG00000149476:ENST00000524440:exon_61112791_61113037:DAK HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 61133649 G/A 1 8 8 16 3.66122178472574 4.33877821527426 -0.677556430548512 A:G G A 10 0.542347276909282 0.804712000972457 ENSG00000149483:ENST00000278826:exon_61133517_61133688:TMEM138;ENSG00000149483:ENST00000451389:exon_61133517_61133688:TMEM138 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 61179285 G/A 1 9 5 14 4.11887450781646 2.71173638454641 1.40713812327005 A:G G A 10 0.542347276909282 0.594287862477072 ENSG00000149532:ENST00000340437:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000394888:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000439958:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000477890:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000448745:exon_61179241_61179409:CPSF7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 61913196 G/T 1 13 13 26 5.94948540017933 7.05051459982067 -1.10102919964133 T:G G T 10 0.542347276909282 0.697454295170068 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61913101_61913223:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61913101_61913223:INCENP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 62564009 T/C 1 14 13 27 6.40713812327005 7.05051459982067 -0.643376476550613 T:C T C 10 0.542347276909282 0.848385483773945 ENSG00000162231:ENST00000294172:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531709:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000532297:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000533048:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000530875:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000533440:exon_62563932_62564035:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531872:exon_62563932_62564039:NXF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 62649407 A/G 1 64 8 72 29.289774277806 4.33877821527426 24.9509960625317 A:G A G 10 0.542347276909282 3.15758501926364e-10 ENSG00000168003:ENST00000377891:exon_62649365_62649538:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377892:exon_62649365_62649538:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377889:exon_62649365_62649538:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377890:exon_62649365_62649538:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000338663:exon_62649365_62649538:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000422606:exon_62649365_62649538:SLC3A2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 62649427 A/G 1 47 6 53 21.5096779852637 3.25408366145569 18.2555943238081 A:G A G 10 0.542347276909282 1.04836314658637e-07 ENSG00000168003:ENST00000377891:exon_62649365_62649538:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377892:exon_62649365_62649538:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377889:exon_62649365_62649538:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377890:exon_62649365_62649538:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000338663:exon_62649365_62649538:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000422606:exon_62649365_62649538:SLC3A2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 62652779 C/T 1 112 128 240 51.2571049861604 69.4204514443881 -18.1633464582277 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0196419426909862 ENSG00000168003:ENST00000377891:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377892:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377889:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377890:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000338663:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000422606:exon_62652649_62652829:SLC3A2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 64846569 C/T 1 7 7 14 3.20356906163503 3.79643093836497 -0.592861876729947 T:C C T 10 0.542347276909282 0.793466098764131 ENSG00000146670:ENST00000275517:exon_64844924_64846659:CDCA5;ENSG00000146670:ENST00000524733:exon_64846105_64846659:CDCA5;ENSG00000146670:ENST00000404147:exon_64846560_64847259:CDCA5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 65266850 G/C 1 4198 3570 7768 1921.22613153483 1936.17977856614 -14.9536470313026 A:T:C:G G C 10 0.542347276909282 0.741234169524017 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 65270589 C/T 1 222 142 364 101.598904526139 77.013313321118 24.5855912050214 T:C C T 10 0.542347276909282 0.00990703547098783 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 65272220 A/G 1 75 88 163 34.3239542318039 47.7265603680168 -13.402606136213 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0406693260873273 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 65417434 G/A 1 73 28 101 33.4086487856224 15.1857237534599 18.2229250321625 A:G G A 10 0.542347276909282 0.00028216698504981 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000531339:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000529725:exon_65417421_65417522:SIPA1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 65733393 C/T 1 42 45 87 19.2214143698102 24.4056274609177 -5.18421309110753 T:C C T 10 0.542347276909282 0.282786803074286 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65733358_65733457:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65733358_65733457:SART1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 65746136 G/T 1 295 209 504 135.007553311762 113.35058087404 21.6569724377219 T:G G T 10 0.542347276909282 0.0545683510257168 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65746071_65746160:SART1;ENSG00000175467:ENST00000417603:exon_65746071_65746160:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529580:exon_65746071_65746160:SART1;ENSG00000175467:ENST00000528137:exon_65745958_65746160:SART1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 65766092 C/T 1 15 23 38 6.86479084636077 12.4739873689135 -5.60919652255272 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0742715631388934 ENSG00000175376:ENST00000526451:exon_65764016_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000312234:exon_65764016_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000525767:exon_65765860_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000529964:exon_65765904_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000533544:exon_65765964_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000527249:exon_65766038_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000529973:exon_65766085_65766214:EIF1AD HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 66055685 G/A 1 16 17 33 7.32244356945149 9.21990370745779 -1.89746013800631 A:C:G G A 10 0.542347276909282 0.600966066666739 ENSG00000174851:ENST00000359461:exon_66055552_66055763:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000376901:exon_66055552_66055763:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000376904:exon_66055552_66055763:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000431556:exon_66055552_66055763:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000528575:exon_66055552_66055763:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000376899:exon_66055552_66055763:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000474986:exon_66055552_66055763:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000534374:exon_66055405_66055763:YIF1A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 66105194 G/A 1 143 114 257 65.4443394019727 61.8275895676581 3.61674983431454 A:G G A 10 0.542347276909282 0.661749749217674 ENSG00000174744:ENST00000425825:exon_66104804_66105278:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000524699:exon_66104810_66105360:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000359957:exon_66104810_66105360:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000530238:exon_66104840_66105360:BRMS1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 66109033 T/C 1 30 20 50 13.7295816927215 10.8469455381856 2.8826361545359 T:C T C 10 0.542347276909282 0.478692151302255 ENSG00000174744:ENST00000425825:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000524699:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000359957:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000530238:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000394043:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000527375:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000530756:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000534617:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000525127:exon_66109004_66109094:BRMS1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 66204668 T/C 1 60 51 111 27.4591633854431 27.6597111223734 -0.2005477369303 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000174547:ENST00000310999:exon_66204575_66204734:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000430466:exon_66204575_66204734:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000524576:exon_66204575_66204734:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000528272:exon_66204575_66204693:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000534488:exon_66204575_66204734:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000329819:exon_66204575_66204734:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000394025:exon_66204575_66204734:MRPL11 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 66272142 A/G 1 12 27 39 5.49183267708862 14.6433764765506 -9.151543799462 A:G A G 10 0.542347276909282 0.00358190410901919 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66272083_66272245:DPP3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 66272237 G/A 1 75 43 118 34.3239542318039 23.3209329070991 11.0030213247047 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0424487566252121 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66272083_66272245:DPP3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 66313203 T/C 1 15 22 37 6.86479084636077 11.9316400920042 -5.06684924564343 T:C T C 10 0.542347276909282 0.101028719372345 ENSG00000174165:ENST00000534073:exon_66313194_66313507:ZDHHC24;ENSG00000174165:ENST00000526986:exon_66313194_66313706:ZDHHC24;ENSG00000174165:ENST00000310442:exon_66313194_66313709:ZDHHC24;ENSG00000174165:ENST00000525925:exon_66313194_66313477:ZDHHC24 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 66373305 G/A 1 79 59 138 36.1545651241667 31.9984893376476 4.15607578651909 A:G G A 10 0.542347276909282 0.495354770141095 ENSG00000173992:ENST00000533244:exon_66373173_66373490:CCS;ENSG00000173992:ENST00000530384:exon_66373173_66373383:CCS;ENSG00000173992:ENST00000530961:exon_66373173_66373469:CCS;ENSG00000173992:ENST00000310190:exon_66373173_66373390:CCS;ENSG00000173992:ENST00000525435:exon_66373173_66373488:CCS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 66392880 C/T 1 20 12 32 9.15305446181436 6.50816732291138 2.64488713890298 T:C C T 10 0.542347276909282 0.379770381851715 ENSG00000239306:ENST00000310137:exon_66391685_66393149:RBM14 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 67200819 C/T 1 43 25 68 19.6790670929009 13.558681922732 6.12038517016883 T:C C T 10 0.542347276909282 0.145424857286254 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67200810_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000526268:exon_67200597_67200918:RPS6KB2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 67202156 C/T 1 103 83 186 47.138230478344 45.0148239834704 2.12340649487355 T:C C T 10 0.542347276909282 0.769002191445073 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67202053_67202872:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000531765:exon_67201848_67202425:RPS6KB2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 67205978 G/A 1 6 2 8 2.74591633854431 1.08469455381856 1.66122178472574 A:G G A 10 0.542347276909282 0.303100337321114 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 67352689 A/G 1 867 739 1606 396.784910919653 400.794637635959 -4.00972671630683 A:C:G A G 10 0.542347276909282 0.841257145315612 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67351605_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67352509_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67352266_67352712:GSTP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 67353579 C/T 1 710 608 1318 324.93343339441 329.747144360843 -4.81371096643363 A:T:C:G C T 10 0.542347276909282 0.803533759003184 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67353575_67353682:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67353575_67353682:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67353575_67353682:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67353575_67353682:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000495996:exon_67353575_67353744:GSTP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 67353844 C/T 1 19 9 28 8.69540173872364 4.88112549218354 3.81427624654011 T:C C T 10 0.542347276909282 0.184609363681342 ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 67353970 T/C 1 1198 1275 2473 548.26796226268 691.492778059335 -143.224815796654 T:C T C 10 0.542347276909282 8.52215411365582e-09 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67353860_67354131:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67353860_67354121:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67353860_67354125:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67353860_67354120:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67353860_67354075:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67353860_67354040:GSTP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 67395714 C/T 1 44 37 81 20.1367198159916 20.0668492456434 0.0698705703481615 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000167799:ENST00000301490:exon_67395409_67395871:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000376693:exon_67395410_67395722:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000534054:exon_67395410_67395871:NUDT8 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 68705674 C/A 1 5 7 12 2.28826361545359 3.79643093836497 -1.50816732291138 A:C C A 10 0.542347276909282 0.401951173845371 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68705650_68705822:IGHMBP2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 71146577 G/A 1 27 36 63 12.3566235234494 19.5245019687341 -7.16787844528476 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0768996806930656 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 71169547 G/C 1 4 5 9 1.83061089236287 2.71173638454641 -0.881125492183538 C:G G C 10 0.542347276909282 0.74064055507759 ENSG00000172890:ENST00000534634:exon_71169474_71170102:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524709:exon_71169474_71169558:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529120:exon_71169474_71169602:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524949:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000533769:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527538:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525245:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71169474_71169590:NADSYN1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 71192439 C/A 1 6 7 13 2.74591633854431 3.79643093836497 -1.05051459982067 A:C C A 10 0.542347276909282 0.588981693424056 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71192402_71192450:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71192402_71192450:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527852:exon_71192402_71192450:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529840:exon_71192402_71192450:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530055:exon_71192402_71192450:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000526039:exon_71192402_71192450:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527227:exon_71191801_71192476:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000531236:exon_71191857_71193071:NADSYN1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 71193059 G/A 1 7 17 24 3.20356906163503 9.21990370745779 -6.01633464582277 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0221255226304937 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71192969_71193071:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71192969_71193071:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527852:exon_71192969_71193071:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529840:exon_71192969_71193071:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530055:exon_71192969_71193071:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000526039:exon_71193047_71193071:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000531236:exon_71191857_71193071:NADSYN1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 72005689 T/A 1 12 17 29 5.49183267708862 9.21990370745779 -3.72807103036918 A:T T A 10 0.542347276909282 0.193116423162613 ENSG00000162129:ENST00000294053:exon_72005664_72005737:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000340729:exon_72005664_72005737:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000437826:exon_72005664_72005737:CLPB HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 74329615 T/C 1 4 4 8 1.83061089236287 2.16938910763713 -0.338778215274256 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000077514:ENST00000528481:exon_74329582_74329639:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530511:exon_74329582_74329815:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000531615:exon_74329582_74329720:POLD3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 74554374 T/C 1 6 13 19 2.74591633854431 7.05051459982067 -4.30459826127636 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0637140752803058 ENSG00000166435:ENST00000340360:exon_74551275_74554498:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000321448:exon_74551955_74554498:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000398418:exon_74551956_74554498:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000344880:exon_74551956_74554498:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000531849:exon_74551976_74555004:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000531449:exon_74554013_74554498:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000527087:exon_74554013_74554498:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000431210:exon_74554015_74555328:XRRA1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 75277992 C/T 1 6 2 8 2.74591633854431 1.08469455381856 1.66122178472574 T:C C T 10 0.542347276909282 0.303100337321114 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75277764_75278016:SERPINH1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 75282882 G/A 1 10 15 25 4.57652723090718 8.13520915363923 -3.55868192273205 A:G G A 10 0.542347276909282 0.164774412676723 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75282826_75283827:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75282826_75283825:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75282826_75283827:SERPINH1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 75511572 T/C 1 4 7 11 1.83061089236287 3.79643093836497 -1.9658200460021 T:C T C 10 0.542347276909282 0.364977036425421 ENSG00000062282:ENST00000228027:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000376262:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000532657:exon_75511399_75512572:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000528676:exon_75511399_75511677:DGAT2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 75852448 C/T 1 10 9 19 4.57652723090718 4.88112549218354 -0.304598261276357 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000198382:ENST00000356136:exon_75851755_75854239:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000528420:exon_75851755_75852838:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000533454:exon_75851755_75852544:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000531818:exon_75851755_75853695:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000532130:exon_75851755_75852827:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000525183:exon_75851755_75852704:UVRAG HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 77790655 G/C 1 156 78 234 71.393824802152 42.303087598924 29.090737203228 C:G G C 10 0.542347276909282 0.000132339168907801 ENSG00000151366:ENST00000528251:exon_77790625_77790890:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000530054:exon_77790625_77790911:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000281031:exon_77790625_77791265:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000527806:exon_77790625_77790887:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000534029:exon_77790625_77790865:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000525085:exon_77790625_77790865:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000528164:exon_77790625_77790907:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000324742:exon_77790625_77790931:NDUFC2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 82973004 C/T 1 31 25 56 14.1872344158123 13.558681922732 0.62855249308021 T:C C T 10 0.542347276909282 0.894110993024419 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82970139_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000455220:exon_82972359_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525504:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82972504_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527495:exon_82972772_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82972799_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82972837_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82972838_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82972933_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82972971_82973008:CCDC90B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 93517874 C/G 1 3 7 10 1.37295816927215 3.79643093836497 -2.42347276909282 C:G C G 10 0.542347276909282 0.202477940149527 ENSG00000042429:ENST00000251871:exon_93517393_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000530819:exon_93517448_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533359:exon_93517528_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533133:exon_93517577_93517929:MED17 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 93517886 G/C 1 2 9 11 0.915305446181436 4.88112549218354 -3.9658200460021 C:G G C 10 0.542347276909282 0.029114908365116 ENSG00000042429:ENST00000251871:exon_93517393_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000530819:exon_93517448_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533359:exon_93517528_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533133:exon_93517577_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000427225:exon_93517884_93517929:MED17 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 95562327 G/A 1 6 4 10 2.74591633854431 2.16938910763713 0.57652723090718 A:G G A 10 0.542347276909282 0.762606887543924 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 95564259 A/G 1 39 32 71 17.848456200538 17.355112861097 0.49334333944098 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000166037:ENST00000325486:exon_95564190_95565854:CEP57;ENSG00000166037:ENST00000325542:exon_95564190_95565854:CEP57 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 96117520 C/T 1 67 35 102 30.6627324470781 18.9821546918249 11.6805777552532 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0220289194572810 ENSG00000149231:ENST00000278520:exon_96117126_96117925:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000423339:exon_96117126_96118154:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000530106:exon_96117126_96117933:CCDC82 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 102207851 G/A 1 12 20 32 5.49183267708862 10.8469455381856 -5.35511286109702 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0747490790463334 ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102207640_102208465:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102207640_102210134:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532609:exon_102207640_102208162:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000527336:exon_102207640_102208022:BIRC3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 108009660 C/A 1 17 23 40 7.78009629254221 12.4739873689135 -4.69389107637128 A:C C A 10 0.542347276909282 0.154108657035198 ENSG00000075239:ENST00000265838:exon_108009625_108009768:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000531813:exon_108009625_108009768:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000528370:exon_108009625_108009891:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000534773:exon_108009447_108009768:ACAT1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 117163765 C/A 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 A:C C A 10 0.542347276909282 0.734324137601319 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 118940957 C/G 1 4 4 8 1.83061089236287 2.16938910763713 -0.338778215274256 C:G C G 10 0.542347276909282 1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 118949331 C/T 1 11 6 17 5.0341799539979 3.25408366145569 1.78009629254221 T:C C T 10 0.542347276909282 0.469764943646273 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 118952173 A/G 1 55 45 100 25.1708997699895 24.4056274609177 0.765272309071804 A:G A G 10 0.542347276909282 0.920245108221474 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 118986972 C/T 1 2 7 9 0.915305446181436 3.79643093836497 -2.88112549218354 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0896908680114052 ENSG00000172375:ENST00000336702:exon_118986755_118989252:C2CD2L;ENSG00000172375:ENST00000425549:exon_118986755_118987826:C2CD2L;ENSG00000172375:ENST00000525598:exon_118984790_118987831:C2CD2L;ENSG00000172375:ENST00000528586:exon_118986735_118987831:C2CD2L HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 119005132 C/T 1 8 10 18 3.66122178472574 5.42347276909282 -1.76225098436708 T:C C T 10 0.542347276909282 0.48096710956808 ENSG00000172273:ENST00000437496:exon_119004794_119005764:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000350777:exon_119004794_119006752:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000527755:exon_119004794_119005764:HINFP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 119050765 C/G 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 C:G C G 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000481860:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000469103:exon_119050402_119050997:NLRX1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 122928622 A/G 1 2431 2187 4618 1112.55376983354 1186.1134946006 -73.5597247670642 A:T:C:G A G 10 0.542347276909282 0.0299378123022038 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928204_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122928205_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122928206_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122928409_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122928487_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122928587_122928627:HSPA8 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 125351472 A/T 1 6 3 9 2.74591633854431 1.62704183072785 1.11887450781646 A:T A T 10 0.542347276909282 0.521783447682374 ENSG00000149557:ENST00000527350:exon_125351430_125351493:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000278919:exon_125351430_125351529:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000392709:exon_125351430_125351529:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000533294:exon_125351430_125351652:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000532981:exon_125351430_125351529:FEZ1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 125452313 A/G 1 27 25 52 12.3566235234494 13.558681922732 -1.20205839928266 A:G A G 10 0.542347276909282 0.7815943033559 ENSG00000149547:ENST00000530985:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000531350:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000534430:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000525737:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527628:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527675:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000278903:exon_125452302_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000343678:exon_125452306_125452315:EI24 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 125479363 G/A 1 4 6 10 1.83061089236287 3.25408366145569 -1.42347276909282 A:G G A 10 0.542347276909282 0.528168739719971 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125479329_125479793:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000526726:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531001:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000524639:exon_125479314_125479484:STT3A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 125488404 C/T 1 37 45 82 16.9331507543566 24.4056274609177 -7.47247670656112 T:C C T 10 0.542347276909282 0.120210969883783 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125488268_125488456:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125488268_125488456:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125488268_125488456:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000525946:exon_125488268_125488456:STT3A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 11 125763746 C/G 1 145 130 275 66.3596448481541 70.5051459982067 -4.14550115005254 T:C:G C G 10 0.542347276909282 0.628600758203496 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125763381_125764181:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125763382_125764181:PUS3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 863517 G/A 1 2 12 14 0.915305446181436 6.50816732291138 -5.59286187672995 A:G G A 10 0.542347276909282 0.00501156360424229 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 939302 A/G 1 11 4 15 5.0341799539979 2.16938910763713 2.86479084636077 A:G A G 10 0.542347276909282 0.194935449270639 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_939169_939326:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_939169_939326:WNK1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 2968169 A/G 1 22 12 34 10.0683599079958 6.50816732291138 3.56019258508441 A:G A G 10 0.542347276909282 0.233634307665704 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2966852_2968829:FOXM1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 2973615 T/C 1 5 7 12 2.28826361545359 3.79643093836497 -1.50816732291138 T:C T C 10 0.542347276909282 0.401951173845371 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2973486_2973661:FOXM1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 2997397 G/A 1 16 16 32 7.32244356945149 8.67755643054851 -1.35511286109702 A:G G A 10 0.542347276909282 0.723509721345873 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 4716513 C/T 1 12 19 31 5.49183267708862 10.3045982612764 -4.81276558418774 T:C C T 10 0.542347276909282 0.103930414272294 ENSG00000010219:ENST00000010132:exon_4716493_4716553:DYRK4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 6560573 G/T 1 614 522 1136 280.998771977701 283.105278546645 -2.10650656894433 A:T:G G T 10 0.542347276909282 0.905218553372207 ENSG00000139193:ENST00000266557:exon_6560434_6560884:CD27 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 6562293 C/T 0 9 0 9 4.11887450781646 0 4.11887450781646 C C 10 0.542347276909282 0.00494042305172222 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562233_6562463:TAPBPL HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 6647109 T/C 1 7878 10 7888 3605.38815250868 5.42347276909282 3599.96467973958 T:C:G T C 10 0.542347276909282 4.94065645841247e-324 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646750_6647162:GAPDH HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 7053362 A/G 1 20 22 42 9.15305446181436 11.9316400920042 -2.77858563018984 A:G A G 10 0.542347276909282 0.439879400645286 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 9822387 C/G 1 14 4 18 6.40713812327005 2.16938910763713 4.23774901563293 C:G C G 10 0.542347276909282 0.0571650073775404 ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9822313_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9822324_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9822325_9822391:CLEC2D HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 9833524 C/G 1 2 8 10 0.915305446181436 4.33877821527426 -3.42347276909282 C:G C G 10 0.542347276909282 0.0514322924239131 ENSG00000069493:ENST00000479410:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000487752:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000444971:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000430909:exon_9833521_9833629:CLEC2D HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 9906067 T/C 1 11 27 38 5.0341799539979 14.6433764765506 -9.60919652255271 T:C T C 10 0.542347276909282 0.00183936002508822 ENSG00000110848:ENST00000228434:exon_9905082_9906185:CD69 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 16189694 T/A 1 24 26 50 10.9836653541772 14.1010291996413 -3.1173638454641 A:T T A 10 0.542347276909282 0.396970879853752 ENSG00000023697:ENST00000428559:exon_16189624_16190220:DERA;ENSG00000023697:ENST00000526530:exon_16189624_16190214:DERA;ENSG00000023697:ENST00000025429:exon_16189624_16190209:DERA;ENSG00000023697:ENST00000530274:exon_16189624_16189747:DERA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 22213786 C/T 1 10 25 35 4.57652723090718 13.558681922732 -8.98215469182487 T:C C T 10 0.542347276909282 0.00330716990897713 ENSG00000111726:ENST00000229329:exon_22213766_22213860:CMAS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 25243115 G/C 1 20 25 45 9.15305446181436 13.558681922732 -4.40562746091769 T:C:G G C 10 0.542347276909282 0.231079815860213 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242991_25243131:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242991_25243131:LRMP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 25362777 A/G 1 5 6 11 2.28826361545359 3.25408366145569 -0.965820046002102 A:G A G 10 0.542347276909282 0.564156977749346 ENSG00000133703:ENST00000311936:exon_25358182_25362845:KRAS;ENSG00000133703:ENST00000256078:exon_25358182_25362845:KRAS;ENSG00000133703:ENST00000406761:exon_25362729_25362845:KRAS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 27064232 C/T 1 32 42 74 14.644887138903 22.7785856301898 -8.13369849128686 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0621953800616606 ENSG00000064102:ENST00000261191:exon_27064111_27064250:C12orf11;ENSG00000064102:ENST00000335745:exon_27064111_27064250:C12orf11 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 27788021 G/A 1 7 3 10 3.20356906163503 1.62704183072785 1.57652723090718 A:G G A 10 0.542347276909282 0.361234487774673 ENSG00000110841:ENST00000318304:exon_27787843_27788048:PPFIBP1;ENSG00000110841:ENST00000228425:exon_27787843_27788048:PPFIBP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 27799008 T/G 1 7 5 12 3.20356906163503 2.71173638454641 0.491832677088616 T:G T G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000110841:ENST00000318304:exon_27798995_27799081:PPFIBP1;ENSG00000110841:ENST00000228425:exon_27798995_27799081:PPFIBP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 27867727 G/A 1 11 18 29 5.0341799539979 9.76225098436707 -4.72807103036918 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0933969228684003 ENSG00000061794:ENST00000081029:exon_27867713_27867753:MRPS35;ENSG00000061794:ENST00000321446:exon_27867713_27867753:MRPS35 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 31944691 A/C 0 14 0 14 6.40713812327005 0 6.40713812327005 A A 10 0.542347276909282 0.000208176314900326 ENSG00000188375:ENST00000340398:exon_31944119_31945175:H3F3C HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 32137565 G/A 1 18 16 34 8.23774901563293 8.67755643054851 -0.439807414915586 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 32137852 C/G 1 53 66 119 24.2555943238081 35.7949202760126 -11.5393259522046 C:G C G 10 0.542347276909282 0.0346071753468115 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 46321514 A/T 1 13 10 23 5.94948540017933 5.42347276909282 0.526012631086514 A:T A T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 46322449 C/T 1 3 10 13 1.37295816927215 5.42347276909282 -4.05051459982067 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0274591906741084 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 48539482 T/G 1 113 82 195 51.7147577092511 44.4724767065611 7.24228100269001 T:G T G 10 0.542347276909282 0.314730949127494 ENSG00000152556:ENST00000340802:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000359794:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000395233:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000312352:exon_48539347_48539488:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000443538:exon_48539347_48539887:PFKM HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 49048738 G/T 1 13 11 24 5.94948540017933 5.9658200460021 -0.0163346458227673 T:G G T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000139620:ENST00000420613:exon_49048724_49048843:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000324947:exon_49048724_49048843:C12orf41 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 49086963 G/A 1 6 6 12 2.74591633854431 3.25408366145569 -0.508167322911383 A:G G A 10 0.542347276909282 0.780543886765314 ENSG00000129315:ENST00000261900:exon_49086752_49088219:CCNT1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 51681903 T/C 1 13 8 21 5.94948540017933 4.33877821527426 1.61070718490508 T:C T C 10 0.542347276909282 0.519340658548302 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51681892_51681972:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51681892_51681972:BIN2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 51685831 T/C 1 12 15 27 5.49183267708862 8.13520915363923 -2.64337647655061 T:C T C 10 0.542347276909282 0.338111874902775 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51685375_51686128:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51685375_51686128:BIN2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 52639302 G/C 1 6 5 11 2.74591633854431 2.71173638454641 0.0341799539978984 C:G G C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000135480:ENST00000331817:exon_52639196_52639416:KRT7;ENSG00000135480:ENST00000422319:exon_52639196_52639416:KRT7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 54109733 A/G 1 9 6 15 4.11887450781646 3.25408366145569 0.864790846360771 A:G A G 10 0.542347276909282 0.797455423618976 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54109577_54109831:CALCOCO1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 54651471 A/G 1 16 21 37 7.32244356945149 11.3892928150949 -4.06684924564343 A:G A G 10 0.542347276909282 0.190239624971338 ENSG00000094916:ENST00000439541:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000454593:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000209875:exon_54651298_54651476:CBX5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 57869582 T/C 1 4 4 8 1.83061089236287 2.16938910763713 -0.338778215274256 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57869559_57869714:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57869559_57869714:ARHGAP9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 57870155 A/C 1 13 12 25 5.94948540017933 6.50816732291138 -0.558681922732049 A:C A C 10 0.542347276909282 0.843374430640417 ENSG00000123329:ENST00000393791:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000340423:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000430041:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000423291:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000424809:exon_57870147_57870237:ARHGAP9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 58335626 A/T 1 8 2 10 3.66122178472574 1.08469455381856 2.57652723090718 A:T A T 10 0.542347276909282 0.121983479725832 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58335360_58335671:XRCC6BP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 58350631 C/T 1 19 11 30 8.69540173872364 5.9658200460021 2.72958169272154 T:C C T 10 0.542347276909282 0.36272120696967 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58350470_58351051:XRCC6BP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 66546100 A/G 1 5 16 21 2.28826361545359 8.67755643054851 -6.38929281509492 A:G A G 10 0.542347276909282 0.00714546386707924 ENSG00000155957:ENST00000426857:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000358230:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000286424:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000398033:exon_66546051_66546156:TMBIM4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 69646914 G/A 1 10 8 18 4.57652723090718 4.33877821527426 0.237749015632924 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000111605:ENST00000435070:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000266679:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000351671:exon_69646831_69646934:CPSF6 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 69980028 G/A 1 9 5 14 4.11887450781646 2.71173638454641 1.40713812327005 A:G G A 10 0.542347276909282 0.594287862477072 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 69980141 G/C 1 7 7 14 3.20356906163503 3.79643093836497 -0.592861876729947 C:G G C 10 0.542347276909282 0.793466098764131 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 75884254 C/T 1 3 9 12 1.37295816927215 4.88112549218354 -3.50816732291138 T:C C T 10 0.542347276909282 0.077659883252704 ENSG00000139278:ENST00000266659:exon_75884186_75884298:GLIPR1;ENSG00000139278:ENST00000456650:exon_75884186_75884298:GLIPR1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 75900588 A/G 1 15 18 33 6.86479084636077 9.76225098436707 -2.8974601380063 A:G A G 10 0.542347276909282 0.382814318248809 ENSG00000111615:ENST00000229214:exon_75900562_75900696:KRR1;ENSG00000111615:ENST00000438169:exon_75900562_75900696:KRR1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 76453966 G/A 1 278 209 487 127.22745701922 113.35058087404 13.8768761451797 A:T:C:G G A 10 0.542347276909282 0.219481937499859 ENSG00000187109:ENST00000393263:exon_76453918_76454059:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000261182:exon_76453918_76454059:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000431879:exon_76453918_76454059:NAP1L1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 88440676 G/C 1 6 2 8 2.74591633854431 1.08469455381856 1.66122178472574 C:G G C 10 0.542347276909282 0.303100337321114 ENSG00000133641:ENST00000356891:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000453037:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000332476:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000413893:exon_88440584_88440753:C12orf29 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 93155535 G/A 1 4 4 8 1.83061089236287 2.16938910763713 -0.338778215274256 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000187510:ENST00000344636:exon_93155528_93155607:PLEKHG7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 93196422 T/G 1 25 22 47 11.441318077268 11.9316400920042 -0.490322014736252 T:G T G 10 0.542347276909282 0.884873383383394 ENSG00000102189:ENST00000322349:exon_93196180_93196510:EEA1;ENSG00000102189:ENST00000418984:exon_93196180_93196510:EEA1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 94244065 G/A 1 2 9 11 0.915305446181436 4.88112549218354 -3.9658200460021 A:G G A 10 0.542347276909282 0.029114908365116 ENSG00000169372:ENST00000332896:exon_94243746_94244527:CRADD HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 95879734 C/T 1 142 132 274 64.986686678882 71.5898405520252 -6.60315387314326 T:C C T 10 0.542347276909282 0.431080759795911 ENSG00000111142:ENST00000261220:exon_95879655_95879757:METAP2;ENSG00000111142:ENST00000323666:exon_95879655_95879757:METAP2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 97303522 A/G 1 7 5 12 3.20356906163503 2.71173638454641 0.491832677088616 A:G A G 10 0.542347276909282 1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 101776996 G/C 1 4 11 15 1.83061089236287 5.9658200460021 -4.13520915363923 C:G G C 10 0.542347276909282 0.0383920942670258 ENSG00000120800:ENST00000261637:exon_101776819_101777091:UTP20 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 102117589 C/T 1 21 6 27 9.61070718490508 3.25408366145569 6.35662352344939 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0187993970521193 ENSG00000111666:ENST00000229266:exon_102117500_102117625:CHPT1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 102154900 A/G 1 8 1 9 3.66122178472574 0.542347276909282 3.11887450781646 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0451652676161667 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 102158763 T/C 1 6 5 11 2.74591633854431 2.71173638454641 0.0341799539978984 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000111670:ENST00000299314:exon_102157980_102159082:GNPTAB HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 102295218 T/C 1 12 36 48 5.49183267708862 19.5245019687341 -14.0326692916455 T:C T C 10 0.542347276909282 5.8807593250577e-05 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 102295219 C/T 1 12 36 48 5.49183267708862 19.5245019687341 -14.0326692916455 T:C C T 10 0.542347276909282 5.8807593250577e-05 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 104373600 G/A 1 7 15 22 3.20356906163503 8.13520915363923 -4.9316400920042 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0516994523292217 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 104851112 T/C 1 31 17 48 14.1872344158123 9.21990370745779 4.96733070835447 T:C T C 10 0.542347276909282 0.191822381117455 ENSG00000171310:ENST00000303694:exon_104851048_104851307:CHST11 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 107372277 C/T 1 14 12 26 6.40713812327005 6.50816732291138 -0.101029199641331 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000120832:ENST00000240050:exon_107371069_107372549:MTERFD3;ENSG00000120832:ENST00000392830:exon_107371069_107372549:MTERFD3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 108918146 C/T 1 18 16 34 8.23774901563293 8.67755643054851 -0.439807414915586 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108918093_108918283:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108918093_108918283:SART3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 108923950 A/G 1 55 53 108 25.1708997699895 28.7444056761919 -3.57350590620245 A:G A G 10 0.542347276909282 0.500425361011926 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108923919_108924087:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108923919_108924087:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108923919_108924087:SART3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 110011229 G/T 1 4 6 10 1.83061089236287 3.25408366145569 -1.42347276909282 T:G G T 10 0.542347276909282 0.528168739719971 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 110011230 C/T 1 4 6 10 1.83061089236287 3.25408366145569 -1.42347276909282 T:C C T 10 0.542347276909282 0.528168739719971 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 110341933 A/G 1 2 7 9 0.915305446181436 3.79643093836497 -2.88112549218354 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0896908680114052 ENSG00000139437:ENST00000405876:exon_110341742_110341952:TCHP;ENSG00000139437:ENST00000312777:exon_110341742_110341952:TCHP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 110386611 G/A 1 8 11 19 3.66122178472574 5.9658200460021 -2.30459826127636 A:G G A 10 0.542347276909282 0.358812996838560 ENSG00000139436:ENST00000320063:exon_110385871_110386651:GIT2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 110922929 G/T 1 8 10 18 3.66122178472574 5.42347276909282 -1.76225098436708 T:G G T 10 0.542347276909282 0.48096710956808 ENSG00000204856:ENST00000377673:exon_110922883_110923004:C12orf24 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 111160003 G/A 1 12 15 27 5.49183267708862 8.13520915363923 -2.64337647655061 A:G G A 10 0.542347276909282 0.338111874902775 ENSG00000186298:ENST00000335007:exon_111159940_111160074:PPP1CC;ENSG00000186298:ENST00000340766:exon_111159940_111160074:PPP1CC HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 113348870 G/A 1 83 59 142 37.9851760165296 31.9984893376476 5.98668667888196 A:G G A 10 0.542347276909282 0.354269961623339 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000445409:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000452357:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000377508:exon_113348856_113349040:OAS1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 113357209 G/A 1 129 5 134 59.0372012787026 2.71173638454641 56.3254648941562 A:G G A 10 0.542347276909282 4.84290040284743e-28 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113357195_113357536:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113357194_113357711:OAS1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 113357237 G/C 1 132 14 146 60.4101594479748 7.59286187672995 52.8172975712448 C:G G C 10 0.542347276909282 2.64705920613528e-21 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113357195_113357536:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113357194_113357711:OAS1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 113612569 A/G 1 15 12 27 6.86479084636077 6.50816732291138 0.356623523449387 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000123064:ENST00000314045:exon_113612445_113612576:DDX54;ENSG00000123064:ENST00000306014:exon_113612445_113612576:DDX54 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 114261053 G/A 1 11 16 27 5.0341799539979 8.67755643054851 -3.64337647655061 A:G G A 10 0.542347276909282 0.178982717344082 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114259863_114261126:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114261014_114261126:RBM19 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 114282496 C/T 1 3 14 17 1.37295816927215 7.59286187672995 -6.21990370745779 T:C C T 10 0.542347276909282 0.00274384713470439 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114282473_114282593:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114282473_114282593:RBM19 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 120156141 G/A 1 2 7 9 0.915305446181436 3.79643093836497 -2.88112549218354 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0896908680114052 ENSG00000122966:ENST00000261833:exon_120156050_120156214:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392521:exon_120156050_120156214:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392520:exon_120156050_120156214:CIT HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 120172173 G/A 1 10 1 11 4.57652723090718 0.542347276909282 4.0341799539979 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0148672965279524 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 120960057 C/T 1 11 8 19 5.0341799539979 4.33877821527426 0.695401738723643 T:C C T 10 0.542347276909282 0.820870277915036 ENSG00000110871:ENST00000288532:exon_120960017_120960166:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000445328:exon_120960017_120960166:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000302223:exon_120960017_120960166:COQ5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 120995332 G/A 1 12 10 22 5.49183267708862 5.42347276909282 0.0683599079957968 A:G G A 10 0.542347276909282 1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 121017171 A/G 1 103 86 189 47.138230478344 46.6418658141982 0.496364664145709 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000167272:ENST00000357500:exon_121016849_121017215:POP5;ENSG00000167272:ENST00000341039:exon_121016849_121017215:POP5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 121471337 G/A 1 6 23 29 2.74591633854431 12.4739873689135 -9.72807103036918 A:G G A 10 0.542347276909282 0.000285007932729454 ENSG00000135114:ENST00000257570:exon_121471264_121471546:OASL;ENSG00000135114:ENST00000339275:exon_121471264_121471546:OASL HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 121712077 T/A 1 5 9 14 2.28826361545359 4.88112549218354 -2.59286187672995 A:T T A 10 0.542347276909282 0.187369064466614 ENSG00000110931:ENST00000347034:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000324774:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392474:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000337174:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000446440:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000402834:exon_121711859_121712329:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000404169:exon_121711859_121712329:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000412367:exon_121711859_121712329:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000360452:exon_121711859_121712329:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392473:exon_121711859_121712388:CAMKK2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 121712301 C/T 1 9 9 18 4.11887450781646 4.88112549218354 -0.762250984367075 T:C C T 10 0.542347276909282 0.814595397980852 ENSG00000110931:ENST00000347034:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000324774:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392474:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000337174:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000446440:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000402834:exon_121711859_121712329:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000404169:exon_121711859_121712329:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000412367:exon_121711859_121712329:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000360452:exon_121711859_121712329:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392473:exon_121711859_121712388:CAMKK2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 122353796 A/G 1 30 31 61 13.7295816927215 16.8127655841877 -3.0831838914662 A:G A G 10 0.542347276909282 0.443149572084502 ENSG00000110801:ENST00000261817:exon_122353762_122353850:PSMD9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 122617989 A/G 1 4 8 12 1.83061089236287 4.33877821527426 -2.50816732291138 A:G A G 10 0.542347276909282 0.160074351563904 ENSG00000175727:ENST00000319080:exon_122617895_122618534:MLXIP;ENSG00000175727:ENST00000377037:exon_122617982_122618077:MLXIP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 123105143 C/T 1 15 19 34 6.86479084636077 10.3045982612764 -3.43980741491559 T:C C T 10 0.542347276909282 0.301698280689680 ENSG00000184445:ENST00000333479:exon_123105026_123105155:KNTC1;ENSG00000184445:ENST00000450485:exon_123105026_123105155:KNTC1;ENSG00000196917:ENST00000356987:exon_123104824_123105249:GPR81 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 123738265 G/A 1 9 8 17 4.11887450781646 4.33877821527426 -0.219903707457793 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000130921:ENST00000253233:exon_123738194_123738503:C12orf65;ENSG00000130921:ENST00000425637:exon_123738194_123739580:C12orf65;ENSG00000130921:ENST00000366329:exon_123738194_123738503:C12orf65 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 125299542 C/T 1 3 5 8 1.37295816927215 2.71173638454641 -1.33877821527426 T:C C T 10 0.542347276909282 0.482450044879903 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125299519_125299660:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125299519_125299660:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125299519_125299660:SCARB1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 125438516 T/C 1 12 1 13 5.49183267708862 0.542347276909282 4.94948540017934 T:C T C 10 0.542347276909282 0.00483815174817428 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125438426_125438542:DHX37 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 125438523 C/T 0 13 0 13 5.94948540017933 0 5.94948540017933 C C 10 0.542347276909282 0.000389876386677721 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125438426_125438542:DHX37 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 125438549 A/G 1 12 2 14 5.49183267708862 1.08469455381856 4.40713812327005 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0280662060891375 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 125441359 T/C 1 7 14 21 3.20356906163503 7.59286187672995 -4.38929281509492 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0775652070792625 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125441237_125441425:DHX37 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 129278864 A/G 1 22 24 46 10.0683599079958 13.0163346458228 -2.94797473782697 A:G A G 10 0.542347276909282 0.459753799231128 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129277739_129278901:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129278765_129278901:SLC15A4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 129293346 C/T 1 2 10 12 0.915305446181436 5.42347276909282 -4.50816732291138 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0163150519946599 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129293333_129293501:SLC15A4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 129299446 A/G 1 5 4 9 2.28826361545359 2.16938910763713 0.118874507816462 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129299320_129299615:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129299320_129299615:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129299320_129299615:SLC15A4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 132241162 A/G 1 76 38 114 34.7816069548946 20.6091965225527 14.1724104323419 A:G A G 10 0.542347276909282 0.00828667940360376 ENSG00000061936:ENST00000261674:exon_132241018_132241189:SFSWAP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 132416813 G/A 1 7 16 23 3.20356906163503 8.67755643054851 -5.47398736891349 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0340167794938018 ENSG00000177192:ENST00000443358:exon_132416720_132416857:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000440818:exon_132416720_132416857:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000376649:exon_132416720_132416857:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000322060:exon_132416720_132416857:PUS1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 132624252 G/A 1 16 5 21 7.32244356945149 2.71173638454641 4.61070718490508 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0491891543814399 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132624180_132624314:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132624180_132624314:DDX51 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 132625027 G/A 1 6 11 17 2.74591633854431 5.9658200460021 -3.21990370745779 A:G G A 10 0.542347276909282 0.145336942608811 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132624968_132625084:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132624968_132625084:DDX51 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 132635581 C/T 1 55 32 87 25.1708997699895 17.355112861097 7.81578690889247 T:C C T 10 0.542347276909282 0.106275689636696 ENSG00000184967:ENST00000330579:exon_132635526_132635586:NOC4L HGDP00213_parsed_pileup.txt . 12 133683261 T/C 1 6 11 17 2.74591633854431 5.9658200460021 -3.21990370745779 T:C T C 10 0.542347276909282 0.145336942608811 ENSG00000196387:ENST00000355557:exon_133682096_133684260:ZNF140 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 20224202 G/T 1 69 53 122 31.5780378932595 28.7444056761919 2.8336322170676 T:G G T 10 0.542347276909282 0.650006111897987 ENSG00000196199:ENST00000361479:exon_20224143_20224400:MPHOSPH8;ENSG00000196199:ENST00000414242:exon_20224143_20224400:MPHOSPH8;ENSG00000196199:ENST00000360754:exon_20224143_20224400:MPHOSPH8 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 20224387 A/G 1 96 104 200 43.9346614167089 56.4041167985653 -12.4694553818564 A:G A G 10 0.542347276909282 0.08827946803636 ENSG00000196199:ENST00000361479:exon_20224143_20224400:MPHOSPH8;ENSG00000196199:ENST00000414242:exon_20224143_20224400:MPHOSPH8;ENSG00000196199:ENST00000360754:exon_20224143_20224400:MPHOSPH8 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 20356941 T/A 1 7 7 14 3.20356906163503 3.79643093836497 -0.592861876729947 A:T T A 10 0.542347276909282 0.793466098764131 ENSG00000121390:ENST00000471658:exon_20356526_20357057:PSPC1;ENSG00000121390:ENST00000492741:exon_20356526_20357082:PSPC1;ENSG00000121390:ENST00000338910:exon_20356526_20357057:PSPC1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 20411701 C/T 1 9 6 15 4.11887450781646 3.25408366145569 0.864790846360771 T:C C T 10 0.542347276909282 0.797455423618976 ENSG00000132950:ENST00000382907:exon_20411593_20411961:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20411605_20411961:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20411605_20411961:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000495534:exon_20411605_20411961:ZMYM5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 20425911 C/A 1 10 5 15 4.57652723090718 2.71173638454641 1.86479084636077 A:C C A 10 0.542347276909282 0.439852308753891 ENSG00000132950:ENST00000382909:exon_20425495_20425936:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000337963:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382907:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20425495_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000495534:exon_20425495_20426330:ZMYM5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 20425948 T/C 1 11 5 16 5.0341799539979 2.71173638454641 2.32244356945149 T:C T C 10 0.542347276909282 0.318264889784535 ENSG00000132950:ENST00000337963:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382907:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20425495_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000495534:exon_20425495_20426330:ZMYM5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 21535837 T/G 0 181 1 182 82.83514287942 0.542347276909282 82.2927956025107 T:C T C 10 0.542347276909282 1.06518111258574e-46 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 23928671 C/T 1 22 21 43 10.0683599079958 11.3892928150949 -1.32093290709912 T:C C T 10 0.542347276909282 0.76014492686778 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000455470:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000423156:exon_23928658_23929622:SACS;ENSG00000151835:ENST00000445163:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000399986:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000476776:exon_23928658_23929029:SACS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 24876752 T/C 1 13 1 14 5.94948540017933 0.542347276909282 5.40713812327005 T:C T C 10 0.542347276909282 0.00275197731978385 ENSG00000182957:ENST00000466831:exon_24876736_24881210:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000382095:exon_24876736_24881210:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000424834:exon_24876736_24881207:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000382108:exon_24876736_24881204:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000438694:exon_24876736_24881204:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000434675:exon_24876736_24877259:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000399949:exon_24876736_24878042:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000409126:exon_24876736_24877344:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000343003:exon_24876736_24881204:SPATA13 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 25876011 G/A 1 2 6 8 0.915305446181436 3.25408366145569 -2.33877821527426 A:G G A 10 0.542347276909282 0.153857012176102 ENSG00000139496:ENST00000381736:exon_25875662_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000313619:exon_25875666_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381745:exon_25875666_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000481980:exon_25875694_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000490231:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000480187:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000460326:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000465068:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000466694:exon_25875769_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000463407:exon_25875769_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381718:exon_25875771_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000495460:exon_25875783_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381747:exon_25875785_25876018:NUPL1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 26788114 A/G 1 6 3 9 2.74591633854431 1.62704183072785 1.11887450781646 A:G A G 10 0.542347276909282 0.521783447682374 ENSG00000127870:ENST00000346166:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381588:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000399762:exon_26786906_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381570:exon_26786912_26789729:RNF6 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 28009920 G/C 1 58 57 115 26.5438579392616 30.9137947838291 -4.36993684456743 C:G G C 10 0.542347276909282 0.454250903433172 ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28009570_28009958:GTF3A;ENSG00000122033:ENST00000381116:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000381120:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000405591:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000431572:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000461838:exon_28009821_28010030:MTIF3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 28239970 G/A 1 204 161 365 93.3611555105065 87.3179115823944 6.04324392811208 A:C:G G A 10 0.542347276909282 0.529057612678882 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 28239999 A/G 1 193 161 354 88.3269755565086 87.3179115823944 1.00906397411418 A:G A G 10 0.542347276909282 0.957470163878517 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 32906980 A/G 1 19 9 28 8.69540173872364 4.88112549218354 3.81427624654011 A:G A G 10 0.542347276909282 0.184609363681342 ENSG00000139618:ENST00000380152:exon_32906409_32907524:BRCA2;ENSG00000139618:ENST00000530893:exon_32906409_32907428:BRCA2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 32953550 G/A 1 6 3 9 2.74591633854431 1.62704183072785 1.11887450781646 A:G G A 10 0.542347276909282 0.521783447682374 ENSG00000139618:ENST00000380152:exon_32953454_32953652:BRCA2;ENSG00000139618:ENST00000528762:exon_32953454_32953632:BRCA2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 41331026 C/G 1 51 35 86 23.3402888776266 18.9821546918249 4.35813418580175 C:G C G 10 0.542347276909282 0.387057905243417 ENSG00000102738:ENST00000323563:exon_41331009_41331149:MRPS31 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 43462352 T/C 1 31 39 70 14.1872344158123 21.151543799462 -6.96430938364974 T:C T C 10 0.542347276909282 0.118263437557728 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43460524_43462638:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43462118_43462638:EPSTI1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 43469157 G/A 1 17 20 37 7.78009629254221 10.8469455381856 -3.06684924564343 A:G G A 10 0.542347276909282 0.326486828880185 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000398762:exon_43469145_43469244:EPSTI1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 43469211 G/A 1 9 5 14 4.11887450781646 2.71173638454641 1.40713812327005 A:G G A 10 0.542347276909282 0.594287862477072 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000398762:exon_43469145_43469244:EPSTI1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 43639845 A/C 1 11 31 42 5.0341799539979 16.8127655841877 -11.7785856301898 A:C A C 10 0.542347276909282 0.000284948937408334 ENSG00000120675:ENST00000379221:exon_43639822_43639873:DNAJC15;ENSG00000120675:ENST00000474320:exon_43639822_43639873:DNAJC15 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 46541673 T/A 1 28 34 62 12.8142762465401 18.4398074149156 -5.62553116837548 A:T T A 10 0.542347276909282 0.162106848114142 ENSG00000123200:ENST00000242848:exon_46541639_46542163:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000378921:exon_46541639_46542163:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000282007:exon_46541639_46542163:ZC3H13 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 46562935 A/G 1 67 66 133 30.6627324470781 35.7949202760126 -5.13218782893451 A:G A G 10 0.542347276909282 0.385047311383188 ENSG00000123200:ENST00000242848:exon_46562922_46563232:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000378921:exon_46562922_46563232:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000282007:exon_46562922_46563232:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000431251:exon_46562922_46563232:ZC3H13 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 47354101 C/T 1 96 111 207 43.9346614167089 60.2005477369303 -16.2658863202214 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0254619473390874 ENSG00000139684:ENST00000378720:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000378697:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000412582:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000471867:exon_47354070_47354166:ESD;ENSG00000139684:ENST00000495654:exon_47354089_47354168:ESD HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 50057097 G/A 1 4 4 8 1.83061089236287 2.16938910763713 -0.338778215274256 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50056873_50057098:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50056873_50057098:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50056873_50057098:SETDB2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 50204975 C/T 1 4 5 9 1.83061089236287 2.71173638454641 -0.881125492183538 T:C C T 10 0.542347276909282 0.74064055507759 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 50205025 T/C 1 9 3 12 4.11887450781646 1.62704183072785 2.49183267708862 T:C T C 10 0.542347276909282 0.245685043790611 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 52603194 G/T 1 6 15 21 2.74591633854431 8.13520915363923 -5.38929281509492 T:G G T 10 0.542347276909282 0.0262982606723561 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 52603775 C/T 1 22 17 39 10.0683599079958 9.21990370745779 0.848456200538003 T:C C T 10 0.542347276909282 0.872832597023446 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 60240961 C/T 1 12 12 24 5.49183267708862 6.50816732291138 -1.01633464582277 T:C C T 10 0.542347276909282 0.68769230574635 ENSG00000139734:ENST00000400324:exon_60239717_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400329:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400330:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000413168:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400327:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400326:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000377908:exon_60240718_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400319:exon_60240718_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400320:exon_60240718_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000470420:exon_60240875_60240980:DIAPH3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 73329358 G/A 1 10 7 17 4.57652723090718 3.79643093836497 0.780096292542206 A:G G A 10 0.542347276909282 0.810080070348479 ENSG00000136122:ENST00000377815:exon_73329289_73330328:C13orf34;ENSG00000136122:ENST00000390667:exon_73329289_73330318:C13orf34 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 76395464 C/T 1 8 2 10 3.66122178472574 1.08469455381856 2.57652723090718 T:C C T 10 0.542347276909282 0.121983479725832 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377499:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000447038:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000532377:exon_76395313_76395649:LMO7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 99947261 C/T 1 105 228 333 48.0535359245254 123.655179135316 -75.6016432107909 T:C C T 10 0.542347276909282 7.74654893355523e-17 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 111290880 G/A 1 10 12 22 4.57652723090718 6.50816732291138 -1.9316400920042 A:G G A 10 0.542347276909282 0.521952741110209 ENSG00000213995:ENST00000458711:exon_111290725_111291452:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111290725_111290892:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111290725_111292340:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111290589_111292340:CARKD HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 111319754 T/C 1 20 38 58 9.15305446181436 20.6091965225527 -11.4561420607384 T:C T C 10 0.542347276909282 0.00338556870744141 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111319687_111319820:CARS2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 111340342 G/A 1 6 11 17 2.74591633854431 5.9658200460021 -3.21990370745779 A:G G A 10 0.542347276909282 0.145336942608811 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111340294_111340365:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000465145:exon_111340294_111340365:CARS2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 111995104 G/A 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 A:G G A 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000153495:ENST00000497241:exon_111995103_111995278:C13orf16;ENSG00000153495:ENST00000283547:exon_111995103_111995278:C13orf16 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 113909339 A/G 1 4 6 10 1.83061089236287 3.25408366145569 -1.42347276909282 A:G A G 10 0.542347276909282 0.528168739719971 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000472083:exon_113909267_113909439:CUL4A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 115030714 T/C 1 87 93 180 39.8157869088925 50.4382967525632 -10.6225098436708 T:C T C 10 0.542347276909282 0.116512744467854 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000461716:exon_115030368_115030715:CDC16 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 13 115047305 G/A 1 7 7 14 3.20356906163503 3.79643093836497 -0.592861876729947 A:G G A 10 0.542347276909282 0.793466098764131 ENSG00000169062:ENST00000375299:exon_115047059_115047321:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000492270:exon_115047078_115047321:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000351487:exon_115047103_115047321:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000484246:exon_115047120_115047321:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000480362:exon_115047195_115047321:UPF3A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 20779823 C/T 1 97 138 235 44.3923141397997 74.8439242134809 -30.4516100736813 T:C C T 10 0.542347276909282 7.91268719019202e-05 ENSG00000100814:ENST00000398160:exon_20779529_20779911:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000437553:exon_20779530_20779911:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000358932:exon_20779530_20779911:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000353689:exon_20779530_20779911:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398169:exon_20779571_20779911:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398163:exon_20779588_20779911:CCNB1IP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 20916958 T/C 1 26 28 54 11.8989708003587 15.1857237534599 -3.28675295310123 T:C T C 10 0.542347276909282 0.413327902255613 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20916892_20916970:OSGEP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 20920250 T/C 1 7 13 20 3.20356906163503 7.05051459982067 -3.84694553818564 T:C T C 10 0.542347276909282 0.114700571816750 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20920133_20920308:OSGEP;ENSG00000092094:ENST00000488532:exon_20920133_20920308:OSGEP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 20940606 G/A 1 25 12 37 11.441318077268 6.50816732291138 4.93315075435657 A:G G A 10 0.542347276909282 0.136601960679292 ENSG00000198805:ENST00000361505:exon_20940467_20940636:PNP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 20940626 C/T 1 22 12 34 10.0683599079958 6.50816732291138 3.56019258508441 T:C C T 10 0.542347276909282 0.233634307665704 ENSG00000198805:ENST00000361505:exon_20940467_20940636:PNP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 23020921 G/C 1 144 159 303 65.9019921250634 86.2332170285758 -20.3312249035124 C:G G C 10 0.542347276909282 0.0209775484035818 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 23021039 G/A 1 240 233 473 109.836653541772 126.366915519863 -16.5302619780904 A:G G A 10 0.542347276909282 0.128057999834558 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 23044002 G/T 1 376 400 776 172.07742388211 216.938910763713 -44.8614868816028 T:G G T 10 0.542347276909282 0.00133112381078471 ENSG00000129562:ENST00000250498:exon_23043959_23044133:DAD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 23239749 T/A 1 117 103 220 53.545368601614 55.861769521656 -2.31640092004204 A:T T A 10 0.542347276909282 0.786768079316187 ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23239670_23239834:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000473744:exon_23239402_23239772:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000442110:exon_23239670_23239749:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23239670_23239834:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23239402_23239834:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23239670_23239834:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23239402_23239834:OXA1L HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 23240328 T/A 1 251 221 472 114.87083349577 119.858748196951 -4.98791470118108 A:T T A 10 0.542347276909282 0.644479086675561 ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23240227_23240389:OXA1L HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 23299135 G/T 1 49 59 108 22.4249834314452 31.9984893376476 -9.57350590620245 T:G G T 10 0.542347276909282 0.0669665535677711 ENSG00000172590:ENST00000355151:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000311892:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000448164:exon_23299092_23299157:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397496:exon_23299092_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000432849:exon_23299103_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000382894:exon_23299113_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397505:exon_23299119_23299149:MRPL52 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 23371055 G/C 1 6 18 24 2.74591633854431 9.76225098436707 -7.01633464582277 C:G G C 10 0.542347276909282 0.0064021921616704 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23371023_23371092:RBM23 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 23394218 T/C 1 12 4 16 5.49183267708862 2.16938910763713 3.32244356945149 T:C T C 10 0.542347276909282 0.131409431801654 ENSG00000100462:ENST00000324366:exon_23394088_23394249:PRMT5;ENSG00000100462:ENST00000397441:exon_23394088_23394249:PRMT5;ENSG00000100462:ENST00000397440:exon_23394088_23394249:PRMT5;ENSG00000100462:ENST00000216350:exon_23394088_23394249:PRMT5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 24458162 G/C 1 9 11 20 4.11887450781646 5.9658200460021 -1.84694553818564 C:G G C 10 0.542347276909282 0.502409545778718 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 24569476 G/A 1 9 5 14 4.11887450781646 2.71173638454641 1.40713812327005 A:G G A 10 0.542347276909282 0.594287862477072 ENSG00000100889:ENST00000396973:exon_24569204_24569758:PCK2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 24679877 C/T 1 66 65 131 30.2050797239874 35.2525729991033 -5.04749327511594 T:C C T 10 0.542347276909282 0.381922038280728 ENSG00000254692:ENST00000530611:exon_24679860_24679974:RP11-468E2.1;ENSG00000254505:ENST00000347519:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000530996:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533523:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533011:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000524955:exon_24679860_24680067:CHMP4A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 24736027 G/A 1 58 38 96 26.5438579392616 20.6091965225527 5.93466141670893 A:G G A 10 0.542347276909282 0.259816173544174 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24735982_24736095:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24735982_24736095:RABGGTA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 24736961 T/C 1 26 19 45 11.8989708003587 10.3045982612764 1.59437253908231 T:C T C 10 0.542347276909282 0.656863946107823 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24736866_24736982:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24736866_24736982:RABGGTA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 31647241 G/A 1 28 53 81 12.8142762465401 28.7444056761919 -15.9301294296518 A:G G A 10 0.542347276909282 0.000474770972234748 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31647226_31647460:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31647226_31647460:HECTD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 31647439 T/C 1 4 17 21 1.83061089236287 9.21990370745779 -7.38929281509492 T:C T C 10 0.542347276909282 0.00150836909407789 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31647226_31647460:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31647226_31647460:HECTD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 35222732 C/T 1 11 9 20 5.0341799539979 4.88112549218354 0.153054461814361 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35221938_35222910:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35221943_35222910:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35221943_35222910:BAZ1A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 35263983 T/C 1 75 70 145 34.3239542318039 37.9643093836497 -3.64035515184589 A:T:C T C 10 0.542347276909282 0.560321433687338 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35263955_35264093:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35263955_35264093:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35263955_35264093:BAZ1A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 35761675 C/G 1 27 16 43 12.3566235234494 8.67755643054851 3.67906709290087 C:G C G 10 0.542347276909282 0.286590186062466 ENSG00000100902:ENST00000261479:exon_35761563_35761758:PSMA6 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 39648629 C/T 1 98 105 203 44.8499668628904 56.9464640754746 -12.0964972125842 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0911893700130035 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39648528_39648666:PNN HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 39818145 G/A 1 21 20 41 9.61070718490508 10.8469455381856 -1.23623835328056 A:G G A 10 0.542347276909282 0.754927261952634 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 45696037 T/G 1 30 27 57 13.7295816927215 14.6433764765506 -0.913794783829074 T:G T G 10 0.542347276909282 0.894405450596562 ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45695946_45696039:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000454990:exon_45696029_45696039:C14orf106 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 45711594 T/C 1 4 5 9 1.83061089236287 2.71173638454641 -0.881125492183538 T:C T C 10 0.542347276909282 0.74064055507759 ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45711237_45711721:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000454990:exon_45711237_45711721:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000453142:exon_45711237_45711683:C14orf106 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 50065717 G/C 1 15 10 25 6.86479084636077 5.42347276909282 1.44131807726795 C:G G C 10 0.542347276909282 0.689180230225522 ENSG00000165501:ENST00000361579:exon_50065415_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000318317:exon_50065479_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50065672_50065921:PPIL5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 50088595 T/C 1 19 22 41 8.69540173872364 11.9316400920042 -3.23623835328056 T:C T C 10 0.542347276909282 0.348394795219911 ENSG00000168282:ENST00000305386:exon_50087489_50090198:MGAT2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 50092471 T/C 1 4 5 9 1.83061089236287 2.71173638454641 -0.881125492183538 T:C T C 10 0.542347276909282 0.74064055507759 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50091892_50092766:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50091892_50092766:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50091907_50092766:C14orf104 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 50100386 T/C 1 31 35 66 14.1872344158123 18.9821546918249 -4.79492027601261 T:C T C 10 0.542347276909282 0.266534432871542 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50100005_50101948:C14orf104 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 51204996 C/T 1 29 15 44 13.2719289696308 8.13520915363923 5.13671981599159 T:C C T 10 0.542347276909282 0.131794666385203 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51204858_51205004:NIN HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 55255673 C/T 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 T:C C T 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000020577:ENST00000305831:exon_55255634_55255730:SAMD4A;ENSG00000020577:ENST00000357634:exon_55255634_55255845:SAMD4A;ENSG00000020577:ENST00000251091:exon_55255634_55255730:SAMD4A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 55408294 C/T 1 10 13 23 4.57652723090718 7.05051459982067 -2.47398736891349 T:C C T 10 0.542347276909282 0.305637991913675 ENSG00000198554:ENST00000360586:exon_55405668_55408408:WDHD1;ENSG00000198554:ENST00000359167:exon_55406942_55408408:WDHD1;ENSG00000198554:ENST00000475379:exon_55407989_55408408:WDHD1;ENSG00000198554:ENST00000421192:exon_55408208_55408408:WDHD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 55604935 C/A 1 50 46 96 22.8826361545359 24.947974737827 -2.06533858329107 A:C C A 10 0.542347276909282 0.683197873289097 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55604763_55605086:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55603699_55605086:LGALS3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 55605036 A/C 1 58 98 156 26.5438579392616 53.1500331371096 -26.606175197848 A:T:C A C 10 0.542347276909282 2.48336394667547e-05 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55604763_55605086:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55603699_55605086:LGALS3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 55619311 A/G 1 35 30 65 16.0178453081751 16.2704183072785 -0.252572999103329 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55619308_55619365:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55619308_55619365:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55619308_55619365:DLGAP5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 55864146 G/A 1 4 4 8 1.83061089236287 2.16938910763713 -0.338778215274256 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000126775:ENST00000247178:exon_55864090_55864152:ATG14 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 59797373 G/A 1 9 3 12 4.11887450781646 1.62704183072785 2.49183267708862 A:G G A 10 0.542347276909282 0.245685043790611 ENSG00000100592:ENST00000351081:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000360909:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000358498:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000395125:exon_59797219_59797406:DAAM1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 59939804 G/A 1 7 4 11 3.20356906163503 2.16938910763713 1.0341799539979 A:G G A 10 0.542347276909282 0.763959235154452 ENSG00000126790:ENST00000247194:exon_59939335_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000463432:exon_59939579_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000532049:exon_59939583_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000478430:exon_59939585_59939808:C14orf149 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 60611648 C/T 1 65 29 94 29.7474270008967 15.7280710303692 14.0193559705275 T:C C T 10 0.542347276909282 0.00363975861484997 ENSG00000100612:ENST00000216500:exon_60610838_60611731:DHRS7;ENSG00000100612:ENST00000360557:exon_60611502_60611731:DHRS7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 62207557 C/T 1 24 15 39 10.9836653541772 8.13520915363923 2.848456200538 T:C C T 10 0.542347276909282 0.422843209090647 ENSG00000100644:ENST00000337138:exon_62207473_62207906:HIF1A;ENSG00000100644:ENST00000394997:exon_62207473_62207906:HIF1A;ENSG00000100644:ENST00000323441:exon_62207473_62207906:HIF1A;ENSG00000100644:ENST00000394988:exon_62207473_62207906:HIF1A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 64676098 A/G 1 8 10 18 3.66122178472574 5.42347276909282 -1.76225098436708 A:G A G 10 0.542347276909282 0.48096710956808 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 72945012 T/C 1 3 6 9 1.37295816927215 3.25408366145569 -1.88112549218354 T:C T C 10 0.542347276909282 0.31687860521519 ENSG00000182732:ENST00000402788:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000404301:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000343854:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000434263:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000453330:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000407322:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000406236:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000355512:exon_72944976_72945037:RGS6 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 73440864 C/T 1 5 4 9 2.28826361545359 2.16938910763713 0.118874507816462 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000165861:ENST00000394207:exon_73440788_73440901:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000318876:exon_73440788_73440901:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000446254:exon_73440788_73440901:ZFYVE1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 73581011 A/G 1 96 115 211 43.9346614167089 62.3699368445674 -18.4352754278585 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0126957166371855 ENSG00000119707:ENST00000261973:exon_73580994_73581041:RBM25;ENSG00000119707:ENST00000527432:exon_73580994_73581041:RBM25;ENSG00000119707:ENST00000532683:exon_73580994_73581041:RBM25;ENSG00000119707:ENST00000528081:exon_73580994_73581041:RBM25;ENSG00000119707:ENST00000532483:exon_73580994_73581041:RBM25;ENSG00000119707:ENST00000527449:exon_73580994_73581041:RBM25 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 73958812 T/C 1 4 9 13 1.83061089236287 4.88112549218354 -3.05051459982067 T:C T C 10 0.542347276909282 0.101447871356357 ENSG00000255242:ENST00000531973:exon_73957669_73960096:C14orf169 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 74061968 T/C 1 4 11 15 1.83061089236287 5.9658200460021 -4.13520915363923 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0383920942670258 ENSG00000177465:ENST00000326303:exon_74061753_74062468:ACOT4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 74428445 G/A 1 19 32 51 8.69540173872364 17.355112861097 -8.65971112237338 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0166534387977008 ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74428440_74428606:COQ6 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 76368544 T/C 1 6 6 12 2.74591633854431 3.25408366145569 -0.508167322911383 T:C T C 10 0.542347276909282 0.780543886765314 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76368485_76368567:TTLL5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 76638358 A/G 1 11 13 24 5.0341799539979 7.05051459982067 -2.01633464582277 A:G A G 10 0.542347276909282 0.420883833529693 ENSG00000089916:ENST00000261530:exon_76638186_76638362:C14orf118;ENSG00000089916:ENST00000312858:exon_76638186_76638362:C14orf118;ENSG00000089916:ENST00000425830:exon_76638186_76638362:C14orf118;ENSG00000089916:ENST00000336993:exon_76638186_76638362:C14orf118 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 77794283 T/C 1 8 8 16 3.66122178472574 4.33877821527426 -0.677556430548512 T:C T C 10 0.542347276909282 0.804712000972457 ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77794255_77794380:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77794255_77794380:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77794255_77794380:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393741:exon_77794123_77794380:GSTZ1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 77926011 C/T 1 17 25 42 7.78009629254221 13.558681922732 -5.77858563018984 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0879915933267989 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77925959_77926149:AHSA1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 77928525 A/G 1 26 17 43 11.8989708003587 9.21990370745779 2.67906709290087 A:G A G 10 0.542347276909282 0.447163044941599 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77928503_77928585:AHSA1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 77935520 G/A 1 182 165 347 83.2927956025107 89.4873006900315 -6.19450508752085 A:G G A 10 0.542347276909282 0.518176115510266 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77935420_77935807:AHSA1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 88477882 A/C 1 36 39 75 16.4754980312659 21.151543799462 -4.67604576819615 A:C A C 10 0.542347276909282 0.298040679431944 ENSG00000140030:ENST00000267549:exon_88476733_88478422:GPR65 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 90398907 G/A 1 6 14 20 2.74591633854431 7.59286187672995 -4.84694553818564 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0412071576928407 ENSG00000140025:ENST00000316738:exon_90398870_90398971:C14orf143 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 91883129 G/A 1 3 8 11 1.37295816927215 4.33877821527426 -2.9658200460021 A:G G A 10 0.542347276909282 0.126534045746447 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91883082_91883182:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000389856:exon_91883082_91883182:CCDC88C HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 92441066 C/T 1 4 9 13 1.83061089236287 4.88112549218354 -3.05051459982067 T:C C T 10 0.542347276909282 0.101447871356357 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92440971_92441087:TRIP11 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 92505915 T/A 1 4 6 10 1.83061089236287 3.25408366145569 -1.42347276909282 A:T T A 10 0.542347276909282 0.528168739719971 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92505891_92506817:TRIP11 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 92588002 T/G 1 277 216 493 126.769804296129 117.147011812405 9.62279248372398 A:T:C:G T G 10 0.542347276909282 0.390791990829799 ENSG00000183648:ENST00000329559:exon_92587986_92588153:NDUFB1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 93118668 C/T 1 5 4 9 2.28826361545359 2.16938910763713 0.118874507816462 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 93118669 G/A 1 4 5 9 1.83061089236287 2.71173638454641 -0.881125492183538 A:G G A 10 0.542347276909282 0.74064055507759 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 93171026 G/A 1 317 207 524 145.075913219758 112.265886320221 32.8100268995362 A:G G A 10 0.542347276909282 0.00433219853057536 ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93170985_93171052:LGMN HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 94847415 A/G 1 38 7 45 17.3908034774473 3.79643093836497 13.5943725390823 A:G A G 10 0.542347276909282 3.10931499647793e-05 ENSG00000197249:ENST00000440909:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000355814:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000449399:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000437397:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000426226:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000437074:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000448140:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000448921:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000393087:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000489769:exon_94846988_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000393088:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000404814:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000402629:exon_94847208_94847478:SERPINA1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 94929541 G/A 1 9 6 15 4.11887450781646 3.25408366145569 0.864790846360771 A:G G A 10 0.542347276909282 0.797455423618976 ENSG00000170054:ENST00000448305:exon_94929060_94929633:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000298845:exon_94929060_94929633:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000337425:exon_94929060_94929633:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000424550:exon_94929060_94929633:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000380365:exon_94929060_94929633:SERPINA9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 94933709 C/T 1 4 6 10 1.83061089236287 3.25408366145569 -1.42347276909282 T:C C T 10 0.542347276909282 0.528168739719971 ENSG00000170054:ENST00000448305:exon_94933446_94933719:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000298845:exon_94933446_94933719:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000337425:exon_94933446_94933719:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000424550:exon_94933446_94933719:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000380365:exon_94933446_94933719:SERPINA9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 95660242 A/G 1 4 4 8 1.83061089236287 2.16938910763713 -0.338778215274256 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000165959:ENST00000298912:exon_95660186_95660256:CLMN HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 100808845 G/A 1 62 40 102 28.3744688316245 21.6938910763713 6.68057775525324 A:G G A 10 0.542347276909282 0.197173089426120 ENSG00000140105:ENST00000392882:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000355338:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000358655:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000344102:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000392880:exon_100808735_100808908:WARS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 100996312 T/C 1 9 10 19 4.11887450781646 5.42347276909282 -1.30459826127636 T:C T C 10 0.542347276909282 0.647186647042385 ENSG00000176473:ENST00000402312:exon_100996157_100996625:WDR25;ENSG00000176473:ENST00000335290:exon_100996157_100996640:WDR25 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 102514227 T/C 1 25 17 42 11.441318077268 9.21990370745779 2.22141436981016 T:C T C 10 0.542347276909282 0.538057243001954 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102514154_102514365:DYNC1H1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 102549873 G/A 0 9 0 9 4.11887450781646 0 4.11887450781646 G G 10 0.542347276909282 0.00494042305172222 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 102550803 G/A 1 1144 1085 2229 523.554715215781 588.446795446571 -64.8920802307895 A:T:G G A 10 0.542347276909282 0.00609186984067096 ENSG00000080824:ENST00000334701:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000216281:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000441629:exon_102550736_102550901:HSP90AA1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 102808157 G/A 1 9 7 16 4.11887450781646 3.79643093836497 0.322443569451489 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102807660_102809044:ZNF839 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 102808330 C/T 1 20 16 36 9.15305446181436 8.67755643054851 0.475498031265849 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102807660_102809044:ZNF839 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 102814945 G/A 1 168 124 292 76.8856574792406 67.251062336751 9.63459514248967 A:G G A 10 0.542347276909282 0.264928855531443 ENSG00000100865:ENST00000216756:exon_102814623_102815096:CINP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 104029449 G/A 1 8 11 19 3.66122178472574 5.9658200460021 -2.30459826127636 A:G G A 10 0.542347276909282 0.358812996838560 ENSG00000126214:ENST00000409074:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000472726:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000247618:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000445352:exon_104029300_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000440963:exon_104029302_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000458117:exon_104029316_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000489117:exon_104029390_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000495778:exon_104029414_104029461:C14orf153 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 104129058 T/C 1 18 19 37 8.23774901563293 10.3045982612764 -2.06684924564343 T:C T C 10 0.542347276909282 0.513383845121619 ENSG00000126214:ENST00000445352:exon_104129039_104129264:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000452929:exon_104129039_104129264:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000334553:exon_104129039_104129264:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000380038:exon_104129039_104129264:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000443396:exon_104129039_104129264:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000348520:exon_104129039_104129264:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000246489:exon_104129039_104129264:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000347839:exon_104129039_104129264:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000389744:exon_104129039_104129264:C14orf153 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 104199356 C/T 1 10 10 20 4.57652723090718 5.42347276909282 -0.84694553818564 T:C C T 10 0.542347276909282 0.823362696388551 ENSG00000100711:ENST00000311141:exon_104199320_104199995:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000216602:exon_104199320_104200004:ZFYVE21 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 105180706 A/C,G 0 0 12 12 0 6.50816732291138 -6.50816732291138 C:G A G 10 0.542347276909282 8.44175239555995e-05 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 105222037 C/T 1 30 34 64 13.7295816927215 18.4398074149156 -4.71022572219405 T:C C T 10 0.542347276909282 0.259744235974797 ENSG00000184990:ENST00000329967:exon_105221967_105222161:SIVA1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 105239894 C/T 1 4 8 12 1.83061089236287 4.33877821527426 -2.50816732291138 T:C C T 10 0.542347276909282 0.160074351563904 ENSG00000142208:ENST00000349310:exon_105239792_105239917:AKT1;ENSG00000142208:ENST00000407796:exon_105239792_105239917:AKT1;ENSG00000142208:ENST00000402615:exon_105239792_105239917:AKT1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 105478102 G/A 1 9 10 19 4.11887450781646 5.42347276909282 -1.30459826127636 A:G G A 10 0.542347276909282 0.647186647042385 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105478072_105478240:CDCA4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 105954705 C/T 1 474 415 889 216.927390745 225.074119917352 -8.14672917235168 T:C C T 10 0.542347276909282 0.590299233358889 ENSG00000213145:ENST00000496700:exon_105952654_105954725:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000409393:exon_105954668_105954725:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000392531:exon_105954668_105954725:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000330233:exon_105954668_105954725:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000460900:exon_105953534_105954853:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000461556:exon_105954668_105954725:CRIP1;ENSG00000185347:ENST00000477724:exon_105954668_105954725:C14orf80 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 106091329 G/C 0 13 0 13 5.94948540017933 0 5.94948540017933 G G 10 0.542347276909282 0.000389876386677721 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 106208537 C/T 1 2136 698 2834 977.546216521774 378.558399282679 598.987817239095 A:T:C:G C T 10 0.542347276909282 1.58816680053513e-119 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 14 106471268 A/G 0 10 0 10 4.57652723090718 0 4.57652723090718 A A 10 0.542347276909282 0.00260483510316352 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 34651983 T/C 1 4 6 10 1.83061089236287 3.25408366145569 -1.42347276909282 T:C T C 10 0.542347276909282 0.528168739719971 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 34656461 C/T 1 8 4 12 3.66122178472574 2.16938910763713 1.49183267708862 T:C C T 10 0.542347276909282 0.564494489181351 ENSG00000176454:ENST00000314891:exon_34656395_34656507:LPCAT4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 40488851 G/A 1 6 7 13 2.74591633854431 3.79643093836497 -1.05051459982067 A:G G A 10 0.542347276909282 0.588981693424056 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40488746_40488975:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40488746_40488975:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40488746_40488975:BUB1B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 41149161 G/C 1 3 5 8 1.37295816927215 2.71173638454641 -1.33877821527426 C:G G C 10 0.542347276909282 0.482450044879903 ENSG00000166145:ENST00000344051:exon_41148968_41150405:SPINT1;ENSG00000166145:ENST00000431806:exon_41148968_41149852:SPINT1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 41634587 A/G 1 9 3 12 4.11887450781646 1.62704183072785 2.49183267708862 A:G A G 10 0.542347276909282 0.245685043790611 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 41634588 C/A 1 9 3 12 4.11887450781646 1.62704183072785 2.49183267708862 A:C C A 10 0.542347276909282 0.245685043790611 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 41672384 A/G 1 32 34 66 14.644887138903 18.4398074149156 -3.79492027601261 A:G A G 10 0.542347276909282 0.387752686555035 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41672291_41673245:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41672291_41673245:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450592:exon_41672291_41673245:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41672291_41673245:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41672291_41673245:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41672291_41673245:NUSAP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 41679685 G/C 1 8 11 19 3.66122178472574 5.9658200460021 -2.30459826127636 C:G G C 10 0.542347276909282 0.358812996838560 ENSG00000137806:ENST00000260361:exon_41679547_41679791:NDUFAF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 41689166 C/A 1 27 8 35 12.3566235234494 4.33877821527426 8.01784530817513 A:C C A 10 0.542347276909282 0.00633763486789335 ENSG00000137806:ENST00000260361:exon_41688685_41689338:NDUFAF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 41689232 C/T 1 22 7 29 10.0683599079958 3.79643093836497 6.27192896963082 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0239821485188231 ENSG00000137806:ENST00000260361:exon_41688685_41689338:NDUFAF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 43653322 G/A 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 A:G G A 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000140265:ENST00000396976:exon_43650370_43654139:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000396972:exon_43650370_43654139:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000267817:exon_43650370_43654139:ZSCAN29 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 43707808 A/T 1 8 12 20 3.66122178472574 6.50816732291138 -2.84694553818564 A:T A T 10 0.542347276909282 0.262141543180323 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000476454:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000434561:exon_43707792_43708007:TP53BP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 44038899 C/T 1 9 20 29 4.11887450781646 10.8469455381856 -6.72807103036918 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0146238207161224 ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44038590_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000469684:exon_44038608_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000446523:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000455250:exon_44038810_44038904:PDIA3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 44053617 C/T 1 12 9 21 5.49183267708862 4.88112549218354 0.610707184905079 T:C C T 10 0.542347276909282 0.83023905970592 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 44061802 C/T 1 75 67 142 34.3239542318039 36.3372675529219 -2.01331332111804 A:T:C C T 10 0.542347276909282 0.737046103730634 ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44061716_44061844:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44061716_44061844:PDIA3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 44120559 T/G 1 1 10 11 0.457652723090718 5.42347276909282 -4.9658200460021 T:G T G 10 0.542347276909282 0.00378312149267267 ENSG00000092470:ENST00000263795:exon_44120163_44120564:WDR76;ENSG00000092470:ENST00000381246:exon_44120163_44120564:WDR76;ENSG00000092470:ENST00000452115:exon_44120273_44120564:WDR76 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 44856873 G/A 1 8 6 14 3.66122178472574 3.25408366145569 0.407138123270053 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000104133:ENST00000261866:exon_44856745_44856896:SPG11 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 45047573 C/T 1 15 4 19 6.86479084636077 2.16938910763713 4.69540173872364 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0370384104182015 ENSG00000185880:ENST00000329464:exon_45047098_45047574:TRIM69 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 45654327 A/G 1 31 20 51 14.1872344158123 10.8469455381856 3.34028887762662 A:G A G 10 0.542347276909282 0.40002317468713 ENSG00000171766:ENST00000396659:exon_45653322_45654419:GATM;ENSG00000171766:ENST00000305575:exon_45653322_45654419:GATM;ENSG00000171766:ENST00000432007:exon_45653324_45654419:GATM HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 45661678 T/A 1 6 6 12 2.74591633854431 3.25408366145569 -0.508167322911383 A:T T A 10 0.542347276909282 0.780543886765314 ENSG00000171766:ENST00000396659:exon_45661524_45661719:GATM;ENSG00000171766:ENST00000305575:exon_45661524_45661719:GATM;ENSG00000171766:ENST00000432007:exon_45661524_45661719:GATM HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 50782703 A/G 1 18 12 30 8.23774901563293 6.50816732291138 1.72958169272154 A:G A G 10 0.542347276909282 0.585648203652596 ENSG00000138592:ENST00000396444:exon_50782460_50782722:USP8;ENSG00000138592:ENST00000307179:exon_50782460_50782722:USP8;ENSG00000138592:ENST00000433963:exon_50782460_50782722:USP8;ENSG00000138592:ENST00000425032:exon_50782460_50782722:USP8 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 52246665 G/A 1 3 7 10 1.37295816927215 3.79643093836497 -2.42347276909282 A:G G A 10 0.542347276909282 0.202477940149527 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 52611451 A/G 1 7 3 10 3.20356906163503 1.62704183072785 1.57652723090718 A:G A G 10 0.542347276909282 0.361234487774673 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52611257_52611539:MYO5A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 55632859 G/T 1 4 4 8 1.83061089236287 2.16938910763713 -0.338778215274256 T:G G T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000069943:ENST00000164305:exon_55632810_55633021:PIGB HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 59180748 A/G 1 58 51 109 26.5438579392616 27.6597111223734 -1.11585318311174 A:G A G 10 0.542347276909282 0.847973955031306 ENSG00000137776:ENST00000380516:exon_59180584_59180754:SLTM;ENSG00000137776:ENST00000432750:exon_59180584_59180754:SLTM;ENSG00000137776:ENST00000492526:exon_59180584_59180754:SLTM HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 59453384 T/C 1 9 5 14 4.11887450781646 2.71173638454641 1.40713812327005 T:C T C 10 0.542347276909282 0.594287862477072 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59453272_59453429:MYO1E HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 59510189 G/A 1 30 52 82 13.7295816927215 28.2020583992827 -14.4724767065611 A:G G A 10 0.542347276909282 0.00174411052066322 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59510090_59510286:MYO1E HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 59516875 C/T 1 1 7 8 0.457652723090718 3.79643093836497 -3.33877821527426 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0276538394311292 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 64455123 G/T 1 69 93 162 31.5780378932595 50.4382967525632 -18.8602588593037 T:G G T 10 0.542347276909282 0.00341924149252077 ENSG00000166794:ENST00000300026:exon_64455051_64455404:PPIB HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 64737225 G/A 1 7 11 18 3.20356906163503 5.9658200460021 -2.76225098436708 A:G G A 10 0.542347276909282 0.238484579075496 ENSG00000103671:ENST00000261884:exon_64737205_64737307:TRIP4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 74328116 A/G 1 56 44 100 25.6285524930802 23.8632801840084 1.7652723090718 A:G A G 10 0.542347276909282 0.763873006264707 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 74328141 G/T 1 52 44 96 23.7979416007173 23.8632801840084 -0.0653385832910693 T:G G T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 75189930 A/G 1 39 52 91 17.848456200538 28.2020583992827 -10.3536021987447 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0348917823612142 ENSG00000178802:ENST00000352410:exon_75189853_75191798:MPI;ENSG00000178802:ENST00000323744:exon_75189853_75190569:MPI HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 75650836 G/A 1 23 37 60 10.5260126310865 20.0668492456434 -9.54083661455692 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0189159012270650 ENSG00000140400:ENST00000267978:exon_75650803_75650959:MAN2C1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 75650972 G/A 1 12 1 13 5.49183267708862 0.542347276909282 4.94948540017934 A:G G A 10 0.542347276909282 0.00483815174817428 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 75932129 G/T 1 74 72 146 33.8663015087131 39.0490039374683 -5.18270242875516 T:G G T 10 0.542347276909282 0.406805018232111 ENSG00000177971:ENST00000314852:exon_75931426_75932609:IMP3;ENSG00000177971:ENST00000403490:exon_75931690_75932552:IMP3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 77344793 T/A 1 33 42 75 15.1025398619937 22.7785856301898 -7.67604576819615 A:T T A 10 0.542347276909282 0.0823224609493542 ENSG00000140391:ENST00000267970:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000346495:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000424443:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000423920:exon_77344727_77344810:TSPAN3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 79051759 G/A 1 13 1 14 5.94948540017933 0.542347276909282 5.40713812327005 A:G G A 10 0.542347276909282 0.00275197731978385 ENSG00000136378:ENST00000258883:exon_79051546_79051920:ADAMTS7;ENSG00000136378:ENST00000388820:exon_79051546_79051920:ADAMTS7;ENSG00000136378:ENST00000438137:exon_79051546_79051920:ADAMTS7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 80191343 G/A 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 A:G G A 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000136371:ENST00000478497:exon_80191189_80191467:MTHFS;ENSG00000136371:ENST00000485386:exon_80191246_80191467:MTHFS;ENSG00000180953:ENST00000322484:exon_80191185_80191467:ST20;ENSG00000180953:ENST00000417278:exon_80191185_80191467:ST20 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 80260014 T/C 1 39 92 131 17.848456200538 49.8959494756539 -32.0474932751159 T:C T C 10 0.542347276909282 1.84853334426743e-08 ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80259979_80260034:BCL2A1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 80263217 C/T 1 543 497 1040 248.50542863826 269.546596623913 -21.0411679856533 T:C:G C T 10 0.542347276909282 0.191332391957582 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 80263345 A/C 1 253 266 519 115.786138941952 144.264375657869 -28.4782367159173 A:C:G A C 10 0.542347276909282 0.0135492791899963 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 80263406 C/T 1 284 285 569 129.973373357764 154.568973919145 -24.5956005613814 T:C:G C T 10 0.542347276909282 0.0392753632246575 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 81592802 A/G 1 32 18 50 14.644887138903 9.76225098436707 4.8826361545359 A:C:G A G 10 0.542347276909282 0.201321104286056 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81591721_81592816:IL16 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 82443939 G/A 1 13 21 34 5.94948540017933 11.3892928150949 -5.43980741491559 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0837374833762076 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 83499766 G/A 1 10 3 13 4.57652723090718 1.62704183072785 2.94948540017933 A:G G A 10 0.542347276909282 0.161807814900871 ENSG00000156232:ENST00000286760:exon_83499351_83499831:WHAMM;ENSG00000156232:ENST00000234505:exon_83499351_83499831:WHAMM HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 86284342 C/T 1 35 51 86 16.0178453081751 27.6597111223734 -11.6418658141983 A:T:C C T 10 0.542347276909282 0.0126902719860531 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86284277_86284726:AKAP13 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 89195526 A/G 1 664 600 1264 303.881408132237 325.408366145569 -21.5269580133324 A:C:G A G 10 0.542347276909282 0.224947378648818 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89195341_89195541:ISG20 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 89738576 C/T 1 2 6 8 0.915305446181436 3.25408366145569 -2.33877821527426 T:C C T 10 0.542347276909282 0.153857012176102 ENSG00000140526:ENST00000352732:exon_89738458_89745591:ABHD2;ENSG00000140526:ENST00000355100:exon_89738458_89745591:ABHD2;ENSG00000140526:ENST00000415713:exon_89738458_89740195:ABHD2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 91486305 C/T 1 13 11 24 5.94948540017933 5.9658200460021 -0.0163346458227673 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000140553:ENST00000394275:exon_91486142_91486312:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000418476:exon_91486142_91486312:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000268159:exon_91486142_91486312:UNC45A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 91489919 A/G 1 8 4 12 3.66122178472574 2.16938910763713 1.49183267708862 A:G A G 10 0.542347276909282 0.564494489181351 ENSG00000140553:ENST00000394275:exon_91489844_91490144:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000418476:exon_91489844_91490144:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000268159:exon_91489844_91490144:UNC45A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 91513674 T/C 1 6 3 9 2.74591633854431 1.62704183072785 1.11887450781646 T:C T C 10 0.542347276909282 0.521783447682374 ENSG00000198901:ENST00000417173:exon_91513634_91513744:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000394249:exon_91513634_91513744:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361188:exon_91513634_91513744:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000442656:exon_91513634_91513744:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361919:exon_91513634_91513744:PRC1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 91525197 C/T 1 8 8 16 3.66122178472574 4.33877821527426 -0.677556430548512 T:C C T 10 0.542347276909282 0.804712000972457 ENSG00000198901:ENST00000417173:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000394249:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361188:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000442656:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361919:exon_91524978_91525211:PRC1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 91543761 C/T 1 7 16 23 3.20356906163503 8.67755643054851 -5.47398736891349 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0340167794938018 ENSG00000184056:ENST00000333371:exon_91543720_91543821:VPS33B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 93536197 C/T 1 35 34 69 16.0178453081751 18.4398074149156 -2.42196210674046 T:C C T 10 0.542347276909282 0.629225839198943 ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93536089_93536228:CHD2;ENSG00000173575:ENST00000309818:exon_93536089_93536228:CHD2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 100269680 G/C 1 4 6 10 1.83061089236287 3.25408366145569 -1.42347276909282 C:G G C 10 0.542347276909282 0.528168739719971 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 101109677 C/A 1 18 21 39 8.23774901563293 11.3892928150949 -3.151543799462 A:C C A 10 0.542347276909282 0.337517542043525 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 101109794 C/G 1 26 13 39 11.8989708003587 7.05051459982067 4.848456200538 C:G C G 10 0.542347276909282 0.147682975007312 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 101109893 C/A 1 18 29 47 8.23774901563293 15.7280710303692 -7.49032201473625 A:C C A 10 0.542347276909282 0.0392513243773936 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 101110096 T/C 1 3 8 11 1.37295816927215 4.33877821527426 -2.9658200460021 T:C T C 10 0.542347276909282 0.126534045746447 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 101110265 T/A 1 10 2 12 4.57652723090718 1.08469455381856 3.49183267708862 A:T T A 10 0.542347276909282 0.0467512693233193 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 101110302 C/G 1 12 2 14 5.49183267708862 1.08469455381856 4.40713812327005 C:G C G 10 0.542347276909282 0.0280662060891375 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 15 101464915 T/C 1 4 5 9 1.83061089236287 2.71173638454641 -0.881125492183538 T:C T C 10 0.542347276909282 0.74064055507759 ENSG00000154237:ENST00000532029:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000534045:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000527698:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101464777_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101464808_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101464808_101464934:LRRK1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 419092 A/G 1 190 122 312 86.9540173872364 66.1663677829324 20.787649604304 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0197078850698280 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 426432 T/C 1 1 7 8 0.457652723090718 3.79643093836497 -3.33877821527426 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0276538394311292 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000475348:exon_426136_426475:TMEM8A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 716287 C/A 1 4 4 8 1.83061089236287 2.16938910763713 -0.338778215274256 A:C C A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_716220_716350:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_716220_716350:WDR90 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 717544 G/C 1 13 12 25 5.94948540017933 6.50816732291138 -0.558681922732049 C:G G C 10 0.542347276909282 0.843374430640417 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_717432_717829:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_717432_717829:WDR90 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 847743 C/T 1 45 51 96 20.5943725390823 27.6597111223734 -7.06533858329107 T:C C T 10 0.542347276909282 0.152704713133015 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000498439:exon_847694_847751:CHTF18 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 1555589 A/G 1 8 10 18 3.66122178472574 5.42347276909282 -1.76225098436708 A:G A G 10 0.542347276909282 0.48096710956808 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1555411_1555602:TELO2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 1559838 T/C 1 17 14 31 7.78009629254221 7.59286187672995 0.187234415812259 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1559831_1560453:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1559831_1560458:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1559831_1560455:TELO2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 1836796 C/A 1 18 12 30 8.23774901563293 6.50816732291138 1.72958169272154 A:C C A 10 0.542347276909282 0.585648203652596 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1836758_1836956:NUBP2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 1867190 C/T 1 18 16 34 8.23774901563293 8.67755643054851 -0.439807414915586 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000063854:ENST00000397356:exon_1867169_1867272:HAGH;ENSG00000063854:ENST00000397353:exon_1867169_1867272:HAGH;ENSG00000063854:ENST00000262303:exon_1867169_1867272:HAGH;ENSG00000063854:ENST00000455446:exon_1867169_1867272:HAGH HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 2014591 C/T 1 220 57 277 100.683599079958 30.9137947838291 69.7698042961289 T:C C T 10 0.542347276909282 3.20864400868481e-18 ENSG00000140988:ENST00000526522:exon_2014450_2014804:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527109:exon_2014450_2014631:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527871:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000530225:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531065:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533161:exon_2014450_2014814:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000343262:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000529806:exon_2014450_2014813:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531182:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527302:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 2025206 A/C 1 9 9 18 4.11887450781646 4.88112549218354 -0.762250984367075 A:C A C 10 0.542347276909282 0.814595397980852 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025188_2025263:TBL3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 2025604 G/C 1 17 13 30 7.78009629254221 7.05051459982067 0.729581692721541 C:G G C 10 0.542347276909282 0.855929101923727 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025530_2025711:TBL3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 2025678 C/A 1 11 8 19 5.0341799539979 4.33877821527426 0.695401738723643 A:C C A 10 0.542347276909282 0.820870277915036 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025530_2025711:TBL3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 2028402 A/C 1 120 123 243 54.9183267708862 66.7087150598417 -11.7903882889555 A:T:C A C 10 0.542347276909282 0.138629555638854 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2028314_2028472:TBL3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 2313343 C/T 1 19 15 34 8.69540173872364 8.13520915363923 0.560192585084414 T:C C T 10 0.542347276909282 0.865483625465611 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 2815953 G/A 1 7 8 15 3.20356906163503 4.33877821527426 -1.13520915363923 A:G G A 10 0.542347276909282 0.610766925411102 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 2821573 C/T 1 7 7 14 3.20356906163503 3.79643093836497 -0.592861876729947 T:C C T 10 0.542347276909282 0.793466098764131 ENSG00000103363:ENST00000409906:exon_2821415_2822103:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000262306:exon_2821415_2821605:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000409477:exon_2821416_2822103:TCEB2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 2946433 C/T 1 40 25 65 18.3061089236287 13.558681922732 4.74742700089667 T:C C T 10 0.542347276909282 0.263541621059207 ENSG00000162076:ENST00000396958:exon_2946353_2946772:FLYWCH2;ENSG00000162076:ENST00000431751:exon_2946353_2946772:FLYWCH2;ENSG00000162076:ENST00000293981:exon_2946353_2946772:FLYWCH2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 3708193 G/A 1 64 102 166 29.289774277806 55.3194222447468 -26.0296479669408 A:G G A 10 0.542347276909282 6.27618327437241e-05 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3708038_3708231:TRAP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 3724465 G/C 1 47 46 93 21.5096779852637 24.947974737827 -3.43829675256323 C:G G C 10 0.542347276909282 0.53257934530964 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3724340_3724495:TRAP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 3727574 A/G 1 8 9 17 3.66122178472574 4.88112549218354 -1.21990370745779 A:G A G 10 0.542347276909282 0.630026415722873 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3727499_3727659:TRAP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 4748825 C/T 1 3 7 10 1.37295816927215 3.79643093836497 -2.42347276909282 T:C C T 10 0.542347276909282 0.202477940149527 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4748801_4748942:ANKS3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 4855279 A/G 1 7 7 14 3.20356906163503 3.79643093836497 -0.592861876729947 A:G A G 10 0.542347276909282 0.793466098764131 ENSG00000140632:ENST00000321919:exon_4853204_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000441951:exon_4855102_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000436648:exon_4855102_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000381983:exon_4855102_4855311:GLYR1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 5075633 G/A 1 8 1 9 3.66122178472574 0.542347276909282 3.11887450781646 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0451652676161667 ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5074845_5075686:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5074873_5075686:NAGPA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 5132636 C/T 1 4 6 10 1.83061089236287 3.25408366145569 -1.42347276909282 T:C C T 10 0.542347276909282 0.528168739719971 ENSG00000033011:ENST00000262374:exon_5132560_5132674:ALG1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 5139217 C/G 1 4 4 8 1.83061089236287 2.16938910763713 -0.338778215274256 C:G C G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5139108_5139257:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5139108_5139257:FAM86A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 8952382 A/C 1 14 20 34 6.40713812327005 10.8469455381856 -4.43980741491559 A:C A C 10 0.542347276909282 0.167626111650877 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 11260440 A/G 1 9 2 11 4.11887450781646 1.08469455381856 3.0341799539979 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0758810958623422 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 11444572 A/C 1 14 17 31 6.40713812327005 9.21990370745779 -2.81276558418774 A:C A C 10 0.542347276909282 0.368449960718003 ENSG00000175643:ENST00000381820:exon_11444499_11445585:C16orf75;ENSG00000175643:ENST00000312499:exon_11444499_11445619:C16orf75 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 11852354 A/C 1 10 10 20 4.57652723090718 5.42347276909282 -0.84694553818564 A:C A C 10 0.542347276909282 0.823362696388551 ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11852287_11852395:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11852287_11852395:ZC3H7A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 11873158 T/C 1 4 5 9 1.83061089236287 2.71173638454641 -0.881125492183538 T:C T C 10 0.542347276909282 0.74064055507759 ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11873022_11873219:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11873022_11873219:ZC3H7A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 11876203 T/C 1 35 19 54 16.0178453081751 10.3045982612764 5.71324704689877 T:C T C 10 0.542347276909282 0.133533637566248 ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11876143_11876244:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11876143_11876408:ZC3H7A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 11940390 T/C 1 280 279 559 128.142762465401 151.31489025769 -23.1721277922886 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0508633690233309 ENSG00000171490:ENST00000396503:exon_11940358_11940459:RSL1D1;ENSG00000171490:ENST00000355674:exon_11940358_11940459:RSL1D1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 11969724 G/C 1 13 18 31 5.94948540017933 9.76225098436707 -3.81276558418774 C:G G C 10 0.542347276909282 0.207120527242227 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000420576:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_11969618_11969786:GSPT1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 12662328 C/G 1 3 19 22 1.37295816927215 10.3045982612764 -8.9316400920042 C:G C G 10 0.542347276909282 0.000127061237929006 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 12662420 C/T 1 3 13 16 1.37295816927215 7.05051459982067 -5.67755643054851 T:C C T 10 0.542347276909282 0.00496189924505069 ENSG00000048471:ENST00000306030:exon_12662363_12668145:SNX29 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 14540827 G/A 1 10 9 19 4.57652723090718 4.88112549218354 -0.304598261276357 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000140694:ENST00000420015:exon_14540745_14540938:PARN;ENSG00000140694:ENST00000437198:exon_14540745_14540938:PARN;ENSG00000140694:ENST00000341484:exon_14540745_14540938:PARN HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 15116625 G/T 1 16 17 33 7.32244356945149 9.21990370745779 -1.89746013800631 T:G G T 10 0.542347276909282 0.600966066666739 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 15122812 C/G 0 0 24 24 0 13.0163346458228 -13.0163346458228 G C G 10 0.542347276909282 7.12631835079422e-09 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15122735_15122823:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15122735_15122823:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000447912:exon_15122735_15122823:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15122735_15122823:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15122735_15123657:PDXDC1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 15129970 A/G 1 5 9 14 2.28826361545359 4.88112549218354 -2.59286187672995 A:G A G 10 0.542347276909282 0.187369064466614 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000447912:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15129873_15131543:PDXDC1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 15131962 A/G 1 81 45 126 37.0698705703482 24.4056274609177 12.6642431094305 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0252309519807894 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15131710_15132067:NTAN1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 15131974 G/T 1 76 42 118 34.7816069548946 22.7785856301898 12.0030213247047 T:G G T 10 0.542347276909282 0.0267460473563299 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15131710_15132067:NTAN1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 15133889 T/G 1 9 5 14 4.11887450781646 2.71173638454641 1.40713812327005 T:G T G 10 0.542347276909282 0.594287862477072 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15133826_15133923:NTAN1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 15718591 G/A 1 7 2 9 3.20356906163503 1.08469455381856 2.11887450781646 A:G G A 10 0.542347276909282 0.193758782140484 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 15818141 A/C 1 11 8 19 5.0341799539979 4.33877821527426 0.695401738723643 A:C A C 10 0.542347276909282 0.820870277915036 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1;ENSG00000133392:ENST00000300036:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000338282:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396320:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396324:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000452625:exon_15818018_15818266:MYH11 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 15818310 G/A 1 22 18 40 10.0683599079958 9.76225098436707 0.306108923628722 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 19725410 G/A 1 4 4 8 1.83061089236287 2.16938910763713 -0.338778215274256 A:G G A 10 0.542347276909282 1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 19726275 C/T 1 112 96 208 51.2571049861604 52.0653385832911 -0.808233597130645 T:C C T 10 0.542347276909282 0.944555460747335 ENSG00000103550:ENST00000219837:exon_19725440_19726362:C16orf88;ENSG00000103550:ENST00000420899:exon_19725440_19726359:C16orf88 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 21272591 G/C 1 17 4 21 7.78009629254221 2.16938910763713 5.61070718490508 C:G G C 10 0.542347276909282 0.0151240372692118 ENSG00000103316:ENST00000219599:exon_21272575_21272659:CRYM;ENSG00000103316:ENST00000396023:exon_21272575_21272659:CRYM;ENSG00000103316:ENST00000415987:exon_21272575_21272659:CRYM HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 23360199 T/C 1 6 10 16 2.74591633854431 5.42347276909282 -2.67755643054851 T:C T C 10 0.542347276909282 0.213548421391003 ENSG00000168447:ENST00000343070:exon_23359913_23360231:SCNN1B;ENSG00000168447:ENST00000307331:exon_23359913_23360231:SCNN1B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 24231449 C/T 1 55 127 182 25.1708997699895 68.8781041674788 -43.7072043974893 T:C C T 10 0.542347276909282 7.2359273578484e-11 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24231282_24231932:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24225979_24231932:PRKCB HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 27238110 C/T 1 57 44 101 26.0862052161709 23.8632801840084 2.22292503216252 T:C C T 10 0.542347276909282 0.690348965111274 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27238041_27238157:NSMCE1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 27356203 A/G 1 8 7 15 3.66122178472574 3.79643093836497 -0.135209153639229 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000077238:ENST00000380925:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000449195:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27356190_27356341:IL4R HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 28509768 C/T 1 4 6 10 1.83061089236287 3.25408366145569 -1.42347276909282 T:C C T 10 0.542347276909282 0.528168739719971 ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28509757_28509963:AC138894.1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 29675928 C/T 1 57 53 110 26.0862052161709 28.7444056761919 -2.65820046002102 A:T:C C T 10 0.542347276909282 0.633091128591205 ENSG00000197471:ENST00000395389:exon_29675016_29676848:SPN;ENSG00000197471:ENST00000436527:exon_29675016_29676114:SPN;ENSG00000197471:ENST00000360121:exon_29675016_29681811:SPN HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 29816512 G/C 1 12 9 21 5.49183267708862 4.88112549218354 0.610707184905079 C:G G C 10 0.542347276909282 0.83023905970592 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 29827794 C/T 1 6 4 10 2.74591633854431 2.16938910763713 0.57652723090718 T:C C T 10 0.542347276909282 0.762606887543924 ENSG00000185928:ENST00000320330:exon_29827285_29828328:C16orf53 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 30093779 C/G 1 10 9 19 4.57652723090718 4.88112549218354 -0.304598261276357 C:G C G 10 0.542347276909282 1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 30198151 A/G 1 335 341 676 153.313662235391 184.940421426065 -31.6267591906746 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0150131767754536 ENSG00000102879:ENST00000219150:exon_30198137_30198266:CORO1A;ENSG00000102879:ENST00000440463:exon_30198137_30198316:CORO1A;ENSG00000102879:ENST00000421578:exon_30198137_30198266:CORO1A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 30393660 G/A 1 38 37 75 17.3908034774473 20.0668492456434 -2.67604576819615 A:G G A 10 0.542347276909282 0.563433209970834 ENSG00000180096:ENST00000321367:exon_30393596_30393686:SEPT1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 30408765 C/T 1 7 3 10 3.20356906163503 1.62704183072785 1.57652723090718 T:C C T 10 0.542347276909282 0.361234487774673 ENSG00000180035:ENST00000495929:exon_30408651_30410681:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000528032:exon_30408651_30409012:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000524644:exon_30408651_30409001:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000320159:exon_30408651_30411429:ZNF48 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 31193942 C/A 1 55 56 111 25.1708997699895 30.3714475069198 -5.2005477369303 A:C C A 10 0.542347276909282 0.341464168210514 ENSG00000089280:ENST00000254108:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000433338:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000394533:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000380244:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000487045:exon_31193834_31194283:FUS;ENSG00000089280:ENST00000491029:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000354711:exon_31193834_31193985:FUS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 50827518 C/T 1 22 22 44 10.0683599079958 11.9316400920042 -1.86328018400841 T:C C T 10 0.542347276909282 0.650533514356862 ENSG00000083799:ENST00000427738:exon_50827457_50827575:CYLD;ENSG00000083799:ENST00000311559:exon_50827457_50827575:CYLD;ENSG00000083799:ENST00000398568:exon_50827457_50827575:CYLD HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 58054099 C/G 1 11 8 19 5.0341799539979 4.33877821527426 0.695401738723643 C:G C G 10 0.542347276909282 0.820870277915036 ENSG00000103005:ENST00000219281:exon_58054045_58055522:C16orf57 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 58552671 A/G 1 7 8 15 3.20356906163503 4.33877821527426 -1.13520915363923 A:G A G 10 0.542347276909282 0.610766925411102 ENSG00000103037:ENST00000310682:exon_58552628_58553566:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000394266:exon_58552628_58554431:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000219315:exon_58552628_58553014:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000427443:exon_58552628_58553419:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000447443:exon_58552628_58552776:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000443717:exon_58552628_58553001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000422445:exon_58552628_58553407:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000463954:exon_58552628_58552980:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000491587:exon_58552628_58552802:SETD6 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 58552921 G/A 1 5 7 12 2.28826361545359 3.79643093836497 -1.50816732291138 A:G G A 10 0.542347276909282 0.401951173845371 ENSG00000103037:ENST00000310682:exon_58552628_58553566:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000394266:exon_58552628_58554431:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000219315:exon_58552628_58553014:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000427443:exon_58552628_58553419:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000443717:exon_58552628_58553001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000422445:exon_58552628_58553407:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000463954:exon_58552628_58552980:SETD6 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 67265360 C/A 1 13 13 26 5.94948540017933 7.05051459982067 -1.10102919964133 A:C C A 10 0.542347276909282 0.697454295170068 ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67265333_67265452:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67265333_67265452:FHOD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 67691668 A/G 1 29 51 80 13.2719289696308 27.6597111223734 -14.3877821527426 A:G A G 10 0.542347276909282 0.00153153007465432 ENSG00000102977:ENST00000219251:exon_67691665_67691756:ACD;ENSG00000102977:ENST00000393919:exon_67691665_67691756:ACD HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 68389772 C/T 1 42 38 80 19.2214143698102 20.6091965225527 -1.38778215274256 T:C C T 10 0.542347276909282 0.82262807086211 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68389626_68389786:PRMT7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 69354963 A/G 1 7 4 11 3.20356906163503 2.16938910763713 1.0341799539979 A:G A G 10 0.542347276909282 0.763959235154452 ENSG00000132612:ENST00000254950:exon_69354954_69355173:VPS4A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 69364443 A/G 1 11 5 16 5.0341799539979 2.71173638454641 2.32244356945149 A:G A G 10 0.542347276909282 0.318264889784535 ENSG00000213380:ENST00000288022:exon_69363900_69364498:COG8 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 69373414 T/C 1 16 6 22 7.32244356945149 3.25408366145569 4.0683599079958 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0901117450756771 ENSG00000213380:ENST00000306875:exon_69373079_69373513:COG8;ENSG00000213380:ENST00000401849:exon_69373079_69373460:COG8;ENSG00000132603:ENST00000254940:exon_69373343_69373788:NIP7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 69400801 C/T 1 19 12 31 8.69540173872364 6.50816732291138 2.18723441581226 T:C C T 10 0.542347276909282 0.4749364742224 ENSG00000132604:ENST00000254942:exon_69400710_69401102:TERF2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 70303580 G/A 1 8 4 12 3.66122178472574 2.16938910763713 1.49183267708862 A:G G A 10 0.542347276909282 0.564494489181351 ENSG00000090861:ENST00000261772:exon_70303521_70303666:AARS;ENSG00000090861:ENST00000418685:exon_70303521_70303666:AARS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 70395387 C/T 1 8 12 20 3.66122178472574 6.50816732291138 -2.84694553818564 T:C C T 10 0.542347276909282 0.262141543180323 ENSG00000168872:ENST00000302243:exon_70395321_70395413:DDX19A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 70515355 C/T 1 20 24 44 9.15305446181436 13.0163346458228 -3.86328018400841 A:T:C C T 10 0.542347276909282 0.289704153344107 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000526700:exon_70515262_70515390:COG4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 70602221 C/T 1 26 21 47 11.8989708003587 11.3892928150949 0.509677985263748 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70602186_70602398:SF3B3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 70726795 C/A 1 3 10 13 1.37295816927215 5.42347276909282 -4.05051459982067 A:C C A 10 0.542347276909282 0.0274591906741084 ENSG00000103043:ENST00000261776:exon_70726724_70726874:VAC14 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 72130815 C/A 1 3 6 9 1.37295816927215 3.25408366145569 -1.88112549218354 A:C C A 10 0.542347276909282 0.31687860521519 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130721_72130908:DHX38 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 72139184 C/A 1 5 4 9 2.28826361545359 2.16938910763713 0.118874507816462 A:C C A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72139131_72139247:DHX38 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 74425569 C/T 1 49 1 50 22.4249834314452 0.542347276909282 21.8826361545359 T:C C T 10 0.542347276909282 2.6008895118487e-12 ENSG00000196436:ENST00000504746:exon_74425289_74425741:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000429990:exon_74425289_74425978:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000355290:exon_74425289_74426013:NPIPL2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 74670458 C/T 1 4 5 9 1.83061089236287 2.71173638454641 -0.881125492183538 T:C C T 10 0.542347276909282 0.74064055507759 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74670244_74670475:RFWD3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 74949759 A/T 1 8 6 14 3.66122178472574 3.25408366145569 0.407138123270053 A:T A T 10 0.542347276909282 1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 75327916 A/G 1 87 68 155 39.8157869088925 36.8796148298312 2.93617207906129 A:G A G 10 0.542347276909282 0.687077510056341 ENSG00000153774:ENST00000283882:exon_75327608_75327940:CFDP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 75661803 G/C 1 139 146 285 63.6137285096098 79.1827024287552 -15.5689739191454 C:G G C 10 0.542347276909282 0.06551399790614 ENSG00000065427:ENST00000302445:exon_75661622_75661891:KARS;ENSG00000065427:ENST00000319410:exon_75661622_75661891:KARS;ENSG00000065427:ENST00000378668:exon_75661628_75661891:KARS;ENSG00000065427:ENST00000393395:exon_75661628_75661891:KARS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 75681756 C/A 1 16 12 28 7.32244356945149 6.50816732291138 0.814276246540105 A:C C A 10 0.542347276909282 0.850551515853368 ENSG00000166848:ENST00000300086:exon_75681684_75682450:TERF2IP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 81971403 T/C 1 38 38 76 17.3908034774473 20.6091965225527 -3.21839304510543 T:C T C 10 0.542347276909282 0.490668887530449 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81971363_81971508:PLCG2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 84691044 C/T 1 5 6 11 2.28826361545359 3.25408366145569 -0.965820046002102 T:C C T 10 0.542347276909282 0.564156977749346 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84690477_84691550:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84690477_84691519:KLHL36 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 84695280 A/G 1 15 8 23 6.86479084636077 4.33877821527426 2.52601263108651 A:G A G 10 0.542347276909282 0.403120043211592 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84695184_84701292:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84695184_84695915:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000426441:exon_84695184_84695915:KLHL36 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 84695490 C/T 1 43 44 87 19.6790670929009 23.8632801840084 -4.18421309110753 T:C C T 10 0.542347276909282 0.390347207933614 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84695184_84701292:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84695184_84695915:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000426441:exon_84695184_84695915:KLHL36 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 84778690 C/T 1 8 1 9 3.66122178472574 0.542347276909282 3.11887450781646 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0451652676161667 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 84778697 G/C 0 8 0 8 3.66122178472574 0 3.66122178472574 G G 10 0.542347276909282 0.00940985022554938 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 84778762 C/T 1 1 8 9 0.457652723090718 4.33877821527426 -3.88112549218354 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0143335108091899 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 84779248 T/G 1 14 5 19 6.40713812327005 2.71173638454641 3.69540173872364 T:G T G 10 0.542347276909282 0.108184345891269 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 84808824 C/G 1 6 14 20 2.74591633854431 7.59286187672995 -4.84694553818564 C:G C G 10 0.542347276909282 0.0412071576928407 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84808766_84808831:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84808766_84808831:USP10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 85711860 C/T 1 75 53 128 34.3239542318039 28.7444056761919 5.57954855561191 T:C C T 10 0.542347276909282 0.330716769869202 ENSG00000131153:ENST00000253462:exon_85709804_85711943:GINS2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 88724347 G/T 1 14 28 42 6.40713812327005 15.1857237534599 -8.77858563018984 T:G G T 10 0.542347276909282 0.00792457878008016 ENSG00000167508:ENST00000301012:exon_88724323_88724437:MVD;ENSG00000167508:ENST00000378400:exon_88724323_88724437:MVD HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 88779132 C/T 1 7 7 14 3.20356906163503 3.79643093836497 -0.592861876729947 T:C C T 10 0.542347276909282 0.793466098764131 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779030_88779313:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779030_88779313:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779030_88779313:CTU2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 88779753 C/T 1 7 13 20 3.20356906163503 7.05051459982067 -3.84694553818564 T:C C T 10 0.542347276909282 0.114700571816750 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779720_88779855:CTU2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 88780090 G/A 1 7 7 14 3.20356906163503 3.79643093836497 -0.592861876729947 A:G G A 10 0.542347276909282 0.793466098764131 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780055_88780186:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780055_88780186:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780055_88780186:CTU2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 88781614 G/C 1 32 24 56 14.644887138903 13.0163346458228 1.62855249308021 C:G G C 10 0.542347276909282 0.689584209193921 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000103335:ENST00000301015:exon_88781588_88782262:FAM38A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 88874555 G/C 1 107 95 202 48.9688413707068 51.5229913063818 -2.55414993567496 A:C:G G C 10 0.542347276909282 0.724562639514259 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88874523_88875665:CDT1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 89348606 A/G 1 98 100 198 44.8499668628904 54.2347276909282 -9.38476082803783 A:G A G 10 0.542347276909282 0.199119399254419 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 89350038 G/A 1 308 252 560 140.957038711941 136.671513781139 4.2855249308021 A:G G A 10 0.542347276909282 0.734490689891824 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 89350178 G/A 1 295 296 591 135.007553311762 160.534793965147 -25.5272406533856 A:T:G G A 10 0.542347276909282 0.0353161913554838 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11;ENSG00000167522:ENST00000330736:exon_89350139_89351806:ANKRD11 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 89351930 C/T 1 73 84 157 33.4086487856224 45.5571712603797 -12.1485224747573 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0546193474905451 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11;ENSG00000167522:ENST00000378332:exon_89351789_89352057:ANKRD11;ENSG00000167522:ENST00000378330:exon_89351848_89351967:ANKRD11 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 89628073 G/A 1 4004 2891 6895 1832.44150325523 1567.92597754473 264.515525710501 A:T:C:G G A 10 0.542347276909282 1.46930589510864e-10 ENSG00000167526:ENST00000311528:exon_89627986_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000491523:exon_89627986_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000484610:exon_89627635_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000467736:exon_89627986_89628118:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000393099:exon_89627986_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000399461:exon_89627986_89628159:RPL13 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 89764549 G/A 1 4 9 13 1.83061089236287 4.88112549218354 -3.05051459982067 A:G G A 10 0.542347276909282 0.101447871356357 ENSG00000158792:ENST00000289805:exon_89762751_89764713:SPATA2L HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 89805914 T/C 1 14 16 30 6.40713812327005 8.67755643054851 -2.27041830727846 T:C T C 10 0.542347276909282 0.465308468559495 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89804384_89807311:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89805886_89805961:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89805886_89805961:FANCA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 89805977 G/A 1 5 6 11 2.28826361545359 3.25408366145569 -0.965820046002102 A:G G A 10 0.542347276909282 0.564156977749346 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89804384_89807311:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89804384_89807333:ZNF276 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 89807233 C/G 1 81 49 130 37.0698705703482 26.5750165685548 10.4948540017933 C:G C G 10 0.542347276909282 0.0651494081022206 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89804384_89807311:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89807212_89807274:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89807212_89807274:FANCA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 89809171 C/T 1 18 12 30 8.23774901563293 6.50816732291138 1.72958169272154 T:C C T 10 0.542347276909282 0.585648203652596 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 89809319 T/C 1 12 12 24 5.49183267708862 6.50816732291138 -1.01633464582277 T:C T C 10 0.542347276909282 0.68769230574635 ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89809208_89809346:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89809208_89809346:FANCA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 89857935 G/A 1 9 3 12 4.11887450781646 1.62704183072785 2.49183267708862 A:G G A 10 0.542347276909282 0.245685043790611 ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89857811_89857944:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89857811_89857944:FANCA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 89857964 T/C 1 2 8 10 0.915305446181436 4.33877821527426 -3.42347276909282 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0514322924239131 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 89954138 G/C 1 2 6 8 0.915305446181436 3.25408366145569 -2.33877821527426 C:G G C 10 0.542347276909282 0.153857012176102 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 89964952 A/G 1 3 6 9 1.37295816927215 3.25408366145569 -1.88112549218354 A:G A G 10 0.542347276909282 0.31687860521519 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 89965055 G/A 1 10 13 23 4.57652723090718 7.05051459982067 -2.47398736891349 A:G G A 10 0.542347276909282 0.305637991913675 ENSG00000141002:ENST00000263346:exon_89964965_89965057:TCF25;ENSG00000141002:ENST00000263347:exon_89964965_89965057:TCF25 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 16 89967217 T/C 1 26 1 27 11.8989708003587 0.542347276909282 11.3566235234494 T:C T C 10 0.542347276909282 1.95061764608838e-06 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 644841 C/A 1 17 18 35 7.78009629254221 9.76225098436707 -1.98215469182487 A:C C A 10 0.542347276909282 0.503608661828194 ENSG00000167695:ENST00000301324:exon_644541_646074:FAM57A;ENSG00000167695:ENST00000308278:exon_644541_646074:FAM57A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 648186 G/A 1 125 130 255 57.2065903863398 70.5051459982067 -13.2985556118669 A:C:G G A 10 0.542347276909282 0.102160458220087 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 649232 C/T 1 11 16 27 5.0341799539979 8.67755643054851 -3.64337647655061 T:C C T 10 0.542347276909282 0.178982717344082 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 649547 G/C 1 5 9 14 2.28826361545359 4.88112549218354 -2.59286187672995 C:G G C 10 0.542347276909282 0.187369064466614 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 649984 G/A 1 1 7 8 0.457652723090718 3.79643093836497 -3.33877821527426 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0276538394311292 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4;ENSG00000179409:ENST00000437269:exon_649871_650522:GEMIN4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 663467 T/A 1 69 23 92 31.5780378932595 12.4739873689135 19.1040505243461 A:T:C T A 10 0.542347276909282 5.59101817789388e-05 ENSG00000167699:ENST00000301329:exon_662550_663478:GLOD4;ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_662692_663478:GLOD4;ENSG00000167699:ENST00000301328:exon_662692_663478:GLOD4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 663468 G/T 1 72 23 95 32.9509960625317 12.4739873689135 20.4770086936182 T:G G T 10 0.542347276909282 1.86742809467653e-05 ENSG00000167699:ENST00000301329:exon_662550_663478:GLOD4;ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_662692_663478:GLOD4;ENSG00000167699:ENST00000301328:exon_662692_663478:GLOD4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 685640 G/T 1 10 10 20 4.57652723090718 5.42347276909282 -0.84694553818564 T:G G T 10 0.542347276909282 0.823362696388551 ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_685482_685691:GLOD4;ENSG00000171861:ENST00000304478:exon_685513_685932:RNMTL1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 695061 G/A 1 47 21 68 21.5096779852637 11.3892928150949 10.1203851701688 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0146492453197725 ENSG00000171861:ENST00000304478:exon_694774_695749:RNMTL1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 695062 T/A 1 47 22 69 21.5096779852637 11.9316400920042 9.57803789325954 A:T T A 10 0.542347276909282 0.0215926535260979 ENSG00000171861:ENST00000304478:exon_694774_695749:RNMTL1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 1373518 T/C 1 4 7 11 1.83061089236287 3.79643093836497 -1.9658200460021 T:C T C 10 0.542347276909282 0.364977036425421 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1373469_1373628:MYO1C HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 1424948 A/G 1 9 7 16 4.11887450781646 3.79643093836497 0.322443569451489 A:G A G 10 0.542347276909282 1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 1637458 G/A 1 2 7 9 0.915305446181436 3.79643093836497 -2.88112549218354 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0896908680114052 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 2595704 C/A 0 28 0 28 12.8142762465401 0 12.8142762465401 C C 10 0.542347276909282 4.69742197157002e-08 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2595655_2595776:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2595655_2595776:KIAA0664 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 2595964 G/A 1 13 14 27 5.94948540017933 7.59286187672995 -1.64337647655061 A:G G A 10 0.542347276909282 0.566010220622583 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2595865_2595990:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2595865_2595990:KIAA0664 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 3567049 A/G 0 15 0 15 6.86479084636077 0 6.86479084636077 A A 10 0.542347276909282 0.000111406380382167 ENSG00000213977:ENST00000225525:exon_3566196_3567179:TAX1BP3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 3577146 C/T 1 38 41 79 17.3908034774473 22.2362383532806 -4.84543487583328 T:C C T 10 0.542347276909282 0.30969076602019 ENSG00000083454:ENST00000225328:exon_3576521_3577171:P2RX5;ENSG00000083454:ENST00000345901:exon_3576524_3577171:P2RX5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 3828702 T/C 1 9 8 17 4.11887450781646 4.33877821527426 -0.219903707457793 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3827169_3828732:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3827169_3828735:ATP2A3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 4391132 C/T 1 8 1 9 3.66122178472574 0.542347276909282 3.11887450781646 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0451652676161667 ENSG00000182557:ENST00000355530:exon_4391101_4391498:SPNS3;ENSG00000182557:ENST00000333476:exon_4391101_4391498:SPNS3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 4391153 A/G 1 8 3 11 3.66122178472574 1.62704183072785 2.0341799539979 A:G A G 10 0.542347276909282 0.244923170028471 ENSG00000182557:ENST00000355530:exon_4391101_4391498:SPNS3;ENSG00000182557:ENST00000333476:exon_4391101_4391498:SPNS3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 4391201 A/G 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 A:G A G 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000182557:ENST00000355530:exon_4391101_4391498:SPNS3;ENSG00000182557:ENST00000333476:exon_4391101_4391498:SPNS3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 4574751 T/A 1 109 89 198 49.8841468168883 48.2689076449261 1.61523917196217 A:T T A 10 0.542347276909282 0.83094379806707 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4574680_4574826:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4574680_4574826:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4574680_4574826:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4574680_4574826:PELP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 4576620 C/T 1 38 26 64 17.3908034774473 14.1010291996413 3.28977427780595 T:C C T 10 0.542347276909282 0.452726449704875 ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4576545_4576751:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4576545_4576751:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4576545_4576751:PELP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 4622638 C/T 1 8 7 15 3.66122178472574 3.79643093836497 -0.135209153639229 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000141480:ENST00000381488:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000346341:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000269260:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000412477:exon_4622578_4622715:ARRB2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 4699552 G/A 1 28 23 51 12.8142762465401 12.4739873689135 0.34028887762662 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4699439_4699591:PSMB6 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 4849284 G/A 1 2900 2971 5871 1327.19289696308 1611.31375969748 -284.120862734394 A:T:C:G G A 10 0.542347276909282 1.17829053253211e-13 ENSG00000108518:ENST00000225655:exon_4848947_4849292:PFN1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 4926882 A/G 1 22 8 30 10.0683599079958 4.33877821527426 5.72958169272154 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0429243755278058 ENSG00000129250:ENST00000320785:exon_4926763_4931696:KIF1C HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 5042894 T/C 0 8 0 8 3.66122178472574 0 3.66122178472574 T T 10 0.542347276909282 0.00940985022554938 ENSG00000129204:ENST00000304328:exon_5042550_5042969:USP6;ENSG00000129204:ENST00000332776:exon_5042550_5042969:USP6;ENSG00000129204:ENST00000250066:exon_5042550_5042969:USP6;ENSG00000129204:ENST00000250067:exon_5042550_5042969:USP6 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 5126689 G/A 1 6 13 19 2.74591633854431 7.05051459982067 -4.30459826127636 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0637140752803058 ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 5284698 A/G 0 9 0 9 4.11887450781646 0 4.11887450781646 A A 10 0.542347276909282 0.00494042305172222 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 5284719 T/C 1 10 2 12 4.57652723090718 1.08469455381856 3.49183267708862 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0467512693233193 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 5284770 G/A 1 16 2 18 7.32244356945149 1.08469455381856 6.23774901563292 A:G G A 10 0.542347276909282 0.00329969573510897 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 5289580 A/G 1 201 176 377 91.9881973412343 95.4531207360336 -3.4649233947993 A:G A G 10 0.542347276909282 0.717890694524655 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5289346_5289589:NUP88 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 5290033 T/C 1 167 114 281 76.4280047561499 61.8275895676581 14.6004151884918 T:C T C 10 0.542347276909282 0.082686730701749 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5290028_5290146:NUP88 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 5294976 T/A 1 16 6 22 7.32244356945149 3.25408366145569 4.0683599079958 A:T T A 10 0.542347276909282 0.0901117450756771 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5294881_5294982:NUP88 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 5326162 G/A 1 7 3 10 3.20356906163503 1.62704183072785 1.57652723090718 A:G G A 10 0.542347276909282 0.361234487774673 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 5418107 G/A 1 35 32 67 16.0178453081751 17.355112861097 -1.33726755292189 A:G G A 10 0.542347276909282 0.806588718825887 ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5417439_5418393:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5417439_5418393:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5417439_5418393:NLRP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 5418799 G/A 1 19 30 49 8.69540173872364 16.2704183072785 -7.57501656855482 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0318522934494204 ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5418793_5418837:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5418793_5418837:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5418793_5418837:NLRP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 5424886 G/A 1 12 5 17 5.49183267708862 2.71173638454641 2.78009629254221 A:G G A 10 0.542347276909282 0.225793255539929 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 5425077 T/C 1 7 7 14 3.20356906163503 3.79643093836497 -0.592861876729947 T:C T C 10 0.542347276909282 0.793466098764131 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 5437186 C/T 1 9 13 22 4.11887450781646 7.05051459982067 -2.9316400920042 T:C C T 10 0.542347276909282 0.284538813785442 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 5440197 T/C 1 12 3 15 5.49183267708862 1.62704183072785 3.86479084636077 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0666375844661501 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5440171_5440260:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5440171_5440260:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5440171_5440260:NLRP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 6663894 G/A 1 5 14 19 2.28826361545359 7.59286187672995 -5.30459826127636 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0194717206900939 ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000438512:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6663725_6663920:XAF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 6663895 C/G 1 5 14 19 2.28826361545359 7.59286187672995 -5.30459826127636 C:G C G 10 0.542347276909282 0.0194717206900939 ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000438512:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6663725_6663920:XAF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 6919093 T/C 1 134 91 225 61.3254648941562 49.3536021987447 11.9718626954116 A:T:C T C 10 0.542347276909282 0.123646562205088 ENSG00000161939:ENST00000439424:exon_6919093_6919194:C17orf49;ENSG00000161939:ENST00000293804:exon_6919093_6919194:C17orf49 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 7128200 C/T 1 474 420 894 216.927390745 227.785856301898 -10.8584655568981 T:C C T 10 0.542347276909282 0.480916836709618 ENSG00000072778:ENST00000356839:exon_7128128_7128203:ACADVL;ENSG00000072778:ENST00000322910:exon_7128128_7128203:ACADVL;ENSG00000072778:ENST00000350303:exon_7128128_7128203:ACADVL HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 7155861 G/A 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 A:G G A 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000170291:ENST00000354429:exon_7155745_7155915:C17orf81;ENSG00000170291:ENST00000396627:exon_7155745_7155915:C17orf81;ENSG00000170291:ENST00000396628:exon_7155551_7155915:C17orf81;ENSG00000170291:ENST00000356683:exon_7155745_7155915:C17orf81 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 7217463 T/C 1 17 9 26 7.78009629254221 4.88112549218354 2.89897080035867 T:C T C 10 0.542347276909282 0.325771542254625 ENSG00000132522:ENST00000380728:exon_7217399_7217478:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7217399_7217478:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000389167:exon_7217399_7217478:GPS2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 7254315 G/A 1 253 248 501 115.786138941952 134.502124673502 -18.7159857315503 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0971220307368104 ENSG00000072818:ENST00000158762:exon_7254269_7254318:ACAP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 7293715 C/T 1 11 12 23 5.0341799539979 6.50816732291138 -1.47398736891348 T:C C T 10 0.542347276909282 0.539417094228368 ENSG00000187838:ENST00000324822:exon_7293055_7293760:PLSCR3;ENSG00000187838:ENST00000380658:exon_7293055_7293760:PLSCR3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 7460517 G/C 1 10 8 18 4.57652723090718 4.33877821527426 0.237749015632924 C:G G C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000239697:ENST00000293825:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000322272:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462619:exon_7460416_7460549:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462811:exon_7460416_7460891:TNFSF12 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 7460685 G/A 1 16 11 27 7.32244356945149 5.9658200460021 1.35662352344939 A:C:G G A 10 0.542347276909282 0.70076477773491 ENSG00000239697:ENST00000293825:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000322272:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462811:exon_7460416_7460891:TNFSF12 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 7484101 C/A 1 7 3 10 3.20356906163503 1.62704183072785 1.57652723090718 A:C C A 10 0.542347276909282 0.361234487774673 ENSG00000129226:ENST00000250092:exon_7484029_7484101:CD68;ENSG00000129226:ENST00000380498:exon_7484029_7484101:CD68 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 7484812 G/A 1 7 12 19 3.20356906163503 6.50816732291138 -3.30459826127636 A:G G A 10 0.542347276909282 0.166892980214950 ENSG00000129226:ENST00000250092:exon_7484696_7485431:CD68;ENSG00000129226:ENST00000380498:exon_7484696_7485428:CD68 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 7490810 G/A 1 73 70 143 33.4086487856224 37.9643093836497 -4.55566059802732 A:G G A 10 0.542347276909282 0.45122602267217 ENSG00000129255:ENST00000250124:exon_7490744_7491523:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000449455:exon_7490744_7491504:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000359822:exon_7490744_7491027:MPDU1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 7529902 G/A 1 186 175 361 85.1234064948735 94.9107734591243 -9.78736696425079 A:T:G G A 10 0.542347276909282 0.315656188330297 ENSG00000141504:ENST00000380466:exon_7529552_7529932:SAT2;ENSG00000141504:ENST00000269298:exon_7529556_7529932:SAT2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 7530147 G/C 1 9 6 15 4.11887450781646 3.25408366145569 0.864790846360771 C:G G C 10 0.542347276909282 0.797455423618976 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 7530271 C/T 1 61 62 123 27.9168161085338 33.6255311683755 -5.70871505984168 T:C C T 10 0.542347276909282 0.320076789852053 ENSG00000141504:ENST00000380466:exon_7530261_7530362:SAT2;ENSG00000141504:ENST00000269298:exon_7530261_7530362:SAT2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 7579472 G/C 1 5 6 11 2.28826361545359 3.25408366145569 -0.965820046002102 C:G G C 10 0.542347276909282 0.564156977749346 ENSG00000141510:ENST00000413465:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000269305:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000455263:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000420246:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000445888:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000419024:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000359597:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000505014:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000414315:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000508793:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000503591:exon_7579312_7579590:TP53 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 7592560 C/T 1 2 7 9 0.915305446181436 3.79643093836497 -2.88112549218354 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0896908680114052 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7592542_7592640:WRAP53 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 7606722 C/G 1 51 16 67 23.3402888776266 8.67755643054851 14.6627324470781 C:G C G 10 0.542347276909282 0.000309615356070671 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7606561_7606819:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000534050:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000471973:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498114:exon_7606561_7606820:WRAP53 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 7851579 C/T 1 17 30 47 7.78009629254221 16.2704183072785 -8.49032201473625 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0181928346362445 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7851475_7851645:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7851475_7851645:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7851475_7851645:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380255:exon_7851475_7851645:CNTROB HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 8076855 T/C 1 16 8 24 7.32244356945149 4.33877821527426 2.98366535417723 T:C T C 10 0.542347276909282 0.305726818365886 ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 8416901 C/T 1 13 12 25 5.94948540017933 6.50816732291138 -0.558681922732049 T:C C T 10 0.542347276909282 0.843374430640417 ENSG00000133026:ENST00000269243:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000360416:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000379980:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000396239:exon_8416856_8416987:MYH10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 10614442 A/G 1 126 65 191 57.6642431094305 35.2525729991033 22.4116701103271 A:G A G 10 0.542347276909282 0.00106042644210682 ENSG00000170222:ENST00000379774:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000468843:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000401658:exon_10614151_10614548:C17orf48 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 15611495 T/C 1 7 10 17 3.20356906163503 5.42347276909282 -2.21990370745779 T:C T C 10 0.542347276909282 0.333980909060167 ENSG00000187607:ENST00000421016:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000412988:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000472486:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000464847:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000439334:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395894:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395893:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000481540:exon_15611469_15611738:ZNF286A;ENSG00000255104:ENST00000413242:exon_15611469_15611561:AC005324.8-001 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 16325968 A/G 1 19 13 32 8.69540173872364 7.05051459982067 1.64488713890298 A:G A G 10 0.542347276909282 0.598786076058789 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 16326005 A/C 1 8 12 20 3.66122178472574 6.50816732291138 -2.84694553818564 A:C A C 10 0.542347276909282 0.262141543180323 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 16336992 C/G 1 20 33 53 9.15305446181436 17.8974601380063 -8.74440567619195 C:G C G 10 0.542347276909282 0.0186215295818633 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16336888_16337012:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16336888_16337012:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000475513:exon_16336546_16337012:TRPV2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 16344601 G/C 1 5 6 11 2.28826361545359 3.25408366145569 -0.965820046002102 C:G G C 10 0.542347276909282 0.564156977749346 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 17168164 G/A 1 4 8 12 1.83061089236287 4.33877821527426 -2.50816732291138 A:G G A 10 0.542347276909282 0.160074351563904 ENSG00000141030:ENST00000268717:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000486810:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000417352:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000439936:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000492672:exon_17168116_17168295:COPS3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 17409560 C/T 1 8 15 23 3.66122178472574 8.13520915363923 -4.47398736891348 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0919008529328443 ENSG00000133027:ENST00000255389:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395783:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395782:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000490392:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000484838:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000435340:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000448294:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000343219:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395781:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000477595:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000482906:exon_17409541_17409615:PEMT HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 19578873 A/T 1 9 12 21 4.11887450781646 6.50816732291138 -2.38929281509492 A:T A T 10 0.542347276909282 0.381797653241551 ENSG00000072210:ENST00000176643:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000395575:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000339618:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000472059:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000476965:exon_19578871_19579060:ALDH3A2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 20163529 A/G 1 3 5 8 1.37295816927215 2.71173638454641 -1.33877821527426 A:G A G 10 0.542347276909282 0.482450044879903 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20163505_20163607:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20163505_20163607:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20163505_20163607:SPECC1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 10 0 10 4.57652723090718 0 4.57652723090718 T T 10 0.542347276909282 0.00260483510316352 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 9 0 9 4.11887450781646 0 4.11887450781646 G G 10 0.542347276909282 0.00494042305172222 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 21203941 G/A 0 9 0 9 4.11887450781646 0 4.11887450781646 G G 10 0.542347276909282 0.00494042305172222 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 8 0 8 3.66122178472574 0 3.66122178472574 C C 10 0.542347276909282 0.00940985022554938 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 21203964 C/G 0 10 0 10 4.57652723090718 0 4.57652723090718 C C 10 0.542347276909282 0.00260483510316352 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 0 9 0 9 4.11887450781646 0 4.11887450781646 C C 10 0.542347276909282 0.00494042305172222 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 11 0 11 5.0341799539979 0 5.0341799539979 C C 10 0.542347276909282 0.00137858896068463 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 12 0 12 5.49183267708862 0 5.49183267708862 G G 10 0.542347276909282 0.000732051414485148 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 35 0 35 16.0178453081751 0 16.0178453081751 G G 10 0.542347276909282 5.56690540573316e-10 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 25628820 T/C 1 6 8 14 2.74591633854431 4.33877821527426 -1.59286187672995 T:C T C 10 0.542347276909282 0.431117415726890 ENSG00000109046:ENST00000262394:exon_25628814_25628982:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000427287:exon_25628814_25628982:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000467843:exon_25628814_25628982:WSB1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 25958304 G/A 1 55 23 78 25.1708997699895 12.4739873689135 12.696912401076 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0042449955488031 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000302228:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000310394:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000313648:exon_25958174_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000448970:exon_25958235_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000467111:exon_25958240_25958330:LGALS9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 25970633 G/A 1 4 15 19 1.83061089236287 8.13520915363923 -6.30459826127636 A:G G A 10 0.542347276909282 0.00462020640915075 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25970551_25970646:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25970551_25970646:LGALS9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 26646283 C/T 1 10 5 15 4.57652723090718 2.71173638454641 1.86479084636077 T:C C T 10 0.542347276909282 0.439852308753891 ENSG00000109084:ENST00000226230:exon_26646161_26646391:TMEM97;ENSG00000109084:ENST00000336687:exon_26646250_26646391:TMEM97 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 26676135 C/T 1 41 37 78 18.7637616467194 20.0668492456434 -1.30308759892399 T:C C T 10 0.542347276909282 0.82049783355502 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 27004703 C/A 1 1 7 8 0.457652723090718 3.79643093836497 -3.33877821527426 A:C C A 10 0.542347276909282 0.0276538394311292 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 27207571 C/T 1 18 14 32 8.23774901563293 7.59286187672995 0.644887138902978 T:C C T 10 0.542347276909282 0.860889064928433 ENSG00000132589:ENST00000394906:exon_27206353_27207617:FLOT2;ENSG00000132589:ENST00000394908:exon_27206353_27207617:FLOT2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 29161845 G/A 1 15 9 24 6.86479084636077 4.88112549218354 1.98366535417723 A:G G A 10 0.542347276909282 0.539851636806923 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29161166_29163066:ATAD5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 29162173 T/C 1 17 19 36 7.78009629254221 10.3045982612764 -2.52450196873415 A:T:C T C 10 0.542347276909282 0.408381967904926 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29161166_29163066:ATAD5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 29226228 T/C 1 10 8 18 4.57652723090718 4.33877821527426 0.237749015632924 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000172171:ENST00000306049:exon_29226001_29226624:C17orf42 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 29226630 T/A 1 4 6 10 1.83061089236287 3.25408366145569 -1.42347276909282 A:T T A 10 0.542347276909282 0.528168739719971 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 29646032 G/A 1 15 18 33 6.86479084636077 9.76225098436707 -2.8974601380063 A:G G A 10 0.542347276909282 0.382814318248809 ENSG00000126860:ENST00000462804:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000247270:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000461237:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394756:exon_29644676_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394755:exon_29644676_29646041:EVI2A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 33592591 C/T 1 7 1 8 3.20356906163503 0.542347276909282 2.66122178472574 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0781860486215706 ENSG00000166750:ENST00000299977:exon_33592091_33594739:SLFN5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 33592621 C/T 1 2 8 10 0.915305446181436 4.33877821527426 -3.42347276909282 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0514322924239131 ENSG00000166750:ENST00000299977:exon_33592091_33594739:SLFN5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 38179492 A/G 1 3 9 12 1.37295816927215 4.88112549218354 -3.50816732291138 A:G A G 10 0.542347276909282 0.077659883252704 ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000492176:exon_38179384_38179760:MED24 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 38457151 G/A 1 27 16 43 12.3566235234494 8.67755643054851 3.67906709290087 A:G G A 10 0.542347276909282 0.286590186062466 ENSG00000094804:ENST00000209728:exon_38457080_38457282:CDC6 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 38991003 T/C 1 31 17 48 14.1872344158123 9.21990370745779 4.96733070835447 T:C T C 10 0.542347276909282 0.191822381117455 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 38991032 T/A 1 26 18 44 11.8989708003587 9.76225098436707 2.13671981599159 A:T:C:G T A 10 0.542347276909282 0.548448149130135 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 38991082 C/T 1 30 21 51 13.7295816927215 11.3892928150949 2.34028887762662 T:C C T 10 0.542347276909282 0.57504044380526 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 39983808 G/C 1 44 4 48 20.1367198159916 2.16938910763713 17.9673307083545 C:G G C 10 0.542347276909282 3.35568739247562e-08 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 39983820 G/A 1 47 8 55 21.5096779852637 4.33877821527426 17.1708997699895 A:G G A 10 0.542347276909282 1.86532325302925e-06 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 39983849 G/C 1 62 14 76 28.3744688316245 7.59286187672995 20.7816069548946 T:C:G G C 10 0.542347276909282 7.56641214757452e-07 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 39987130 T/C 1 9 3 12 4.11887450781646 1.62704183072785 2.49183267708862 T:C T C 10 0.542347276909282 0.245685043790611 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000521789:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000486304:exon_39987053_39987132:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000460893:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000481693:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000475053:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000495317:exon_39987053_39987142:NT5C3L HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 40125741 G/A 1 38 31 69 17.3908034774473 16.8127655841877 0.578037893259545 A:G G A 10 0.542347276909282 0.904540717241537 ENSG00000173786:ENST00000393892:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000310262:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000472031:exon_40125493_40126246:CNP;ENSG00000173786:ENST00000393888:exon_40125493_40127194:CNP;ENSG00000173786:ENST00000486438:exon_40125493_40125980:CNP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 41245237 A/G 1 7 4 11 3.20356906163503 2.16938910763713 1.0341799539979 A:G A G 10 0.542347276909282 0.763959235154452 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 41245466 G/A 1 25 33 58 11.441318077268 17.8974601380063 -6.45614206073835 A:G G A 10 0.542347276909282 0.113012022461587 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 41291953 C/G 1 11 3 14 5.0341799539979 1.62704183072785 3.40713812327005 C:G C G 10 0.542347276909282 0.104636621208515 ENSG00000198496:ENST00000460115:exon_41291833_41292300:NBR2;ENSG00000198496:ENST00000356906:exon_41291833_41292350:NBR2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 41352643 C/T 1 13 8 21 5.94948540017933 4.33877821527426 1.61070718490508 T:C C T 10 0.542347276909282 0.519340658548302 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 42156042 G/A 1 2 7 9 0.915305446181436 3.79643093836497 -2.88112549218354 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0896908680114052 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 42158310 T/G 1 8 8 16 3.66122178472574 4.33877821527426 -0.677556430548512 T:G T G 10 0.542347276909282 0.804712000972457 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 42254011 C/G 1 9 4 13 4.11887450781646 2.16938910763713 1.94948540017933 C:G C G 10 0.542347276909282 0.405355588189296 ENSG00000168597:ENST00000303061:exon_42253354_42255184:C17orf65 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 42254281 A/G 1 7 1 8 3.20356906163503 0.542347276909282 2.66122178472574 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0781860486215706 ENSG00000161664:ENST00000293414:exon_42254106_42254598:ASB16;ENSG00000168597:ENST00000303061:exon_42253354_42255184:C17orf65 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 42287519 C/T 1 17 25 42 7.78009629254221 13.558681922732 -5.77858563018984 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0879915933267989 ENSG00000108312:ENST00000343638:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000302904:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000527034:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000533177:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000436088:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000393606:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000526094:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529383:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529373:exon_42287492_42287602:UBTF HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 43175906 C/T 1 47 35 82 21.5096779852637 18.9821546918249 2.52752329343888 T:C C T 10 0.542347276909282 0.657794172003887 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43175750_43175920:NMT1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 43176804 C/T 1 49 50 99 22.4249834314452 27.1173638454641 -4.69238041401891 T:C C T 10 0.542347276909282 0.364794101885203 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43176773_43176881:NMT1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 43216472 A/G 1 7 4 11 3.20356906163503 2.16938910763713 1.0341799539979 A:G A G 10 0.542347276909282 0.763959235154452 ENSG00000181513:ENST00000431281:exon_43216388_43216527:ACBD4;ENSG00000181513:ENST00000321854:exon_43216388_43216527:ACBD4;ENSG00000181513:ENST00000428033:exon_43216388_43216527:ACBD4;ENSG00000181513:ENST00000398322:exon_43216388_43216527:ACBD4;ENSG00000181513:ENST00000376955:exon_43216388_43216527:ACBD4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 43226887 A/G 1 44 32 76 20.1367198159916 17.355112861097 2.78160695489457 A:G A G 10 0.542347276909282 0.565833991237223 ENSG00000186834:ENST00000332499:exon_43224684_43229468:HEXIM1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 43227214 T/C 1 48 31 79 21.9673307083545 16.8127655841877 5.15456512416673 T:C T C 10 0.542347276909282 0.260349526700394 ENSG00000186834:ENST00000332499:exon_43224684_43229468:HEXIM1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 43311620 A/G 1 41 39 80 18.7637616467194 21.151543799462 -2.38778215274256 A:G A G 10 0.542347276909282 0.653864850424345 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 43319770 C/T 1 5 7 12 2.28826361545359 3.79643093836497 -1.50816732291138 T:C:G C T 10 0.542347276909282 0.401951173845371 ENSG00000184922:ENST00000328118:exon_43319708_43319832:FMNL1;ENSG00000184922:ENST00000331495:exon_43319708_43319832:FMNL1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 45915766 T/C 1 44 42 86 20.1367198159916 22.7785856301898 -2.64186581419825 T:C T C 10 0.542347276909282 0.589569652646474 ENSG00000141295:ENST00000290216:exon_45915636_45915816:SCRN2;ENSG00000141295:ENST00000407215:exon_45915049_45915816:SCRN2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 46103760 A/G 1 10 9 19 4.57652723090718 4.88112549218354 -0.304598261276357 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000005243:ENST00000006101:exon_46103535_46103841:COPZ2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 46926615 G/A 1 20 23 43 9.15305446181436 12.4739873689135 -3.32093290709913 A:G G A 10 0.542347276909282 0.359101549766075 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509415:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000513119:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000505071:exon_46926614_46926631:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000502761:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000514962:exon_46926614_46926739:CALCOCO2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 47778793 C/T 1 13 22 35 5.94948540017933 11.9316400920042 -5.98215469182487 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0604498744451935 ENSG00000121073:ENST00000240333:exon_47778305_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000504260:exon_47778649_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000415270:exon_47778682_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000502406:exon_47778683_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000508749:exon_47778690_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000507477:exon_47778690_47780373:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000507773:exon_47778701_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000376622:exon_47778701_47778872:SLC35B1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 47788755 G/A 1 17 15 32 7.78009629254221 8.13520915363923 -0.355112861097022 A:T:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000121104:ENST00000240364:exon_47787694_47788917:FAM117A;ENSG00000121104:ENST00000513602:exon_47788357_47788917:FAM117A;ENSG00000121104:ENST00000503573:exon_47788707_47788917:FAM117A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 48216664 C/T 1 10 17 27 4.57652723090718 9.21990370745779 -4.64337647655061 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0831397106267912 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 48437456 C/G 1 30 22 52 13.7295816927215 11.9316400920042 1.79794160071734 C:G C G 10 0.542347276909282 0.677383505986462 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48437330_48438512:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48437330_48438512:XYLT2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 48549791 C/G 1 7 10 17 3.20356906163503 5.42347276909282 -2.21990370745779 C:G C G 10 0.542347276909282 0.333980909060167 ENSG00000167107:ENST00000510410:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000508245:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000510262:exon_48549789_48549807:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000512119:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000512537:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000503295:exon_48549492_48549940:ACSF2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 48560883 A/G 1 8 7 15 3.66122178472574 3.79643093836497 -0.135209153639229 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000136444:ENST00000509398:exon_48560701_48560896:RSAD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 49239036 C/A 1 7 1 8 3.20356906163503 0.542347276909282 2.66122178472574 A:C C A 10 0.542347276909282 0.0781860486215706 ENSG00000239672:ENST00000511355:exon_49238459_49239789:NME1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 49350802 A/C 1 4 5 9 1.83061089236287 2.71173638454641 -0.881125492183538 A:C A C 10 0.542347276909282 0.74064055507759 ENSG00000011260:ENST00000225298:exon_49350723_49350811:UTP18;ENSG00000011260:ENST00000508506:exon_49350723_49350811:UTP18 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 53042208 A/G 1 3 10 13 1.37295816927215 5.42347276909282 -4.05051459982067 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0274591906741084 ENSG00000166260:ENST00000299335:exon_53042058_53042213:COX11 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 55027850 T/C 1 42 49 91 19.2214143698102 26.5750165685548 -7.35360219874466 T:C T C 10 0.542347276909282 0.140501550256406 ENSG00000121058:ENST00000240316:exon_55027250_55028357:COIL HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 61901197 T/A 1 13 22 35 5.94948540017933 11.9316400920042 -5.98215469182487 A:T T A 10 0.542347276909282 0.0604498744451935 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61901177_61901312:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61901177_61901312:FTSJ3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 61903445 G/C 1 2 7 9 0.915305446181436 3.79643093836497 -2.88112549218354 C:G G C 10 0.542347276909282 0.0896908680114052 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61903416_61903495:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61903416_61903495:FTSJ3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 61908271 C/T 1 306 251 557 140.04173326576 136.12916650423 3.91256676152994 T:C C T 10 0.542347276909282 0.765999406040209 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908169_61908295:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908169_61908295:PSMC5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 65341976 A/G 1 6 2 8 2.74591633854431 1.08469455381856 1.66122178472574 A:G A G 10 0.542347276909282 0.303100337321114 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 65739627 A/G 1 15 25 40 6.86479084636077 13.558681922732 -6.69389107637128 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0388026762931657 ENSG00000130935:ENST00000253247:exon_65739595_65739702:NOL11 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 66246416 A/G 1 8 8 16 3.66122178472574 4.33877821527426 -0.677556430548512 A:G A G 10 0.542347276909282 0.804712000972457 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392721:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66246329_66246611:AMZ2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 70120551 A/C 1 4 5 9 1.83061089236287 2.71173638454641 -0.881125492183538 A:C A C 10 0.542347276909282 0.74064055507759 ENSG00000125398:ENST00000245479:exon_70119684_70122561:SOX9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 72859078 A/G 1 12 10 22 5.49183267708862 5.42347276909282 0.0683599079957968 A:G A G 10 0.542347276909282 1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 72862593 C/T 1 15 4 19 6.86479084636077 2.16938910763713 4.69540173872364 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0370384104182015 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72862568_72862690:FDXR HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 74307737 T/C 1 3 9 12 1.37295816927215 4.88112549218354 -3.50816732291138 T:C T C 10 0.542347276909282 0.077659883252704 ENSG00000161542:ENST00000448426:exon_74306868_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000446526:exon_74307014_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000324684:exon_74307015_74307781:PRPSAP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 74475975 C/A 0 0 11 11 0 5.9658200460021 -5.9658200460021 A C A 10 0.542347276909282 0.000184457602230558 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74475815_74476023:RHBDF2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 75494746 A/G 1 4 8 12 1.83061089236287 4.33877821527426 -2.50816732291138 A:G A G 10 0.542347276909282 0.160074351563904 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 75494780 A/T 1 18 9 27 8.23774901563293 4.88112549218354 3.35662352344939 A:T A T 10 0.542347276909282 0.247012259156511 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 76115353 T/C 1 30 26 56 13.7295816927215 14.1010291996413 -0.371447506919791 T:C T C 10 0.542347276909282 1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 76167047 C/T 1 52 105 157 23.7979416007173 56.9464640754746 -33.1485224747573 A:T:C C T 10 0.542347276909282 1.28733354051396e-07 ENSG00000108639:ENST00000225777:exon_76166898_76167135:SYNGR2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 76178748 T/C 1 14 19 33 6.40713812327005 10.3045982612764 -3.8974601380063 T:C T C 10 0.542347276909282 0.220951345401981 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76178670_76178763:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76178670_76178763:TK1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 76183043 A/G 1 8 12 20 3.66122178472574 6.50816732291138 -2.84694553818564 A:G A G 10 0.542347276909282 0.262141543180323 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76183010_76183314:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76183010_76183111:TK1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 76425176 G/A 1 7 1 8 3.20356906163503 0.542347276909282 2.66122178472574 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0781860486215706 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 76989782 G/A 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 A:G G A 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000339300:exon_76987799_76990002:CANT1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 78109870 G/A 1 107 51 158 48.9688413707068 27.6597111223734 21.3091302483334 A:G G A 10 0.542347276909282 0.000746468807590419 ENSG00000141543:ENST00000269349:exon_78109803_78109930:EIF4A3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 78113832 G/A 1 17 12 29 7.78009629254221 6.50816732291138 1.27192896963082 A:G G A 10 0.542347276909282 0.71141507189304 ENSG00000141543:ENST00000269349:exon_78113807_78113939:EIF4A3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 79166384 C/T 1 8 2 10 3.66122178472574 1.08469455381856 2.57652723090718 T:C C T 10 0.542347276909282 0.121983479725832 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79166276_79166393:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79166276_79166393:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79166276_79166393:AZI1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 79220016 T/C 1 50 49 99 22.8826361545359 26.5750165685548 -3.69238041401891 T:C T C 10 0.542347276909282 0.48098580455155 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 79220224 G/C 1 22 21 43 10.0683599079958 11.3892928150949 -1.32093290709912 C:G G C 10 0.542347276909282 0.76014492686778 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 79226362 G/A 1 14 10 24 6.40713812327005 5.42347276909282 0.983665354177233 A:G G A 10 0.542347276909282 0.838276464959483 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79225995_79226483:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79225995_79226483:SLC38A10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 79244802 T/C 1 1 8 9 0.457652723090718 4.33877821527426 -3.88112549218354 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0143335108091899 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79244718_79244824:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79244718_79244824:SLC38A10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 79479058 G/A 1 679 561 1240 310.746198978598 304.256822346107 6.48937663249035 A:G G A 10 0.542347276909282 0.7323623075436 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79478929_79479168:ACTG1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 79508400 T/C 1 8 9 17 3.66122178472574 4.88112549218354 -1.21990370745779 T:C T C 10 0.542347276909282 0.630026415722873 ENSG00000185504:ENST00000361039:exon_79508335_79508421:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79508335_79508421:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79508335_79508421:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79508335_79508421:C17orf70 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 79511135 A/G 1 5 10 15 2.28826361545359 5.42347276909282 -3.13520915363923 A:G A G 10 0.542347276909282 0.123431676383676 ENSG00000185504:ENST00000361039:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79511030_79511146:C17orf70 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 79514129 G/A 1 7 4 11 3.20356906163503 2.16938910763713 1.0341799539979 A:G G A 10 0.542347276909282 0.763959235154452 ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79513935_79515054:C17orf70 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 79632363 C/T 1 204 135 339 93.3611555105065 73.2168823827531 20.1442731277534 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0291864261453401 ENSG00000204237:ENST00000374741:exon_79632067_79632614:C17orf90 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 79632532 G/A 1 87 45 132 39.8157869088925 24.4056274609177 15.4101594479748 A:T:G G A 10 0.542347276909282 0.00852529904060928 ENSG00000204237:ENST00000374741:exon_79632067_79632614:C17orf90 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 79637367 C/G 1 13 6 19 5.94948540017933 3.25408366145569 2.69540173872364 C:G C G 10 0.542347276909282 0.254452857534199 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79637255_79637483:CCDC137 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 79662067 A/G 1 4 5 9 1.83061089236287 2.71173638454641 -0.881125492183538 A:G A G 10 0.542347276909282 0.74064055507759 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79661954_79662097:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79661954_79662097:HGS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 79663880 T/C 1 17 17 34 7.78009629254221 9.21990370745779 -1.43980741491559 T:C T C 10 0.542347276909282 0.731243314790062 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79663854_79664028:HGS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 79663931 T/C 1 19 6 25 8.69540173872364 3.25408366145569 5.44131807726795 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0425098974641258 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79663854_79664028:HGS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 79668135 G/T 1 79 43 122 36.1545651241667 23.3209329070991 12.8336322170676 T:G G T 10 0.542347276909282 0.0227572931474963 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79668075_79668161:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79668075_79668161:HGS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 79671714 T/C 1 346 306 652 158.347842189388 165.95826673424 -7.61042454485184 T:C T C 10 0.542347276909282 0.555666045602021 ENSG00000183093:ENST00000333676:exon_79671663_79671746:MRPL12;ENSG00000183093:ENST00000332396:exon_79671663_79671746:MRPL12 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 79801977 C/T 1 5 4 9 2.28826361545359 2.16938910763713 0.118874507816462 T:C C T 10 0.542347276909282 1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 79803101 A/G 1 249 297 546 113.955528049589 161.077141242057 -47.1216131924679 A:G A G 10 0.542347276909282 6.23840553217101e-05 ENSG00000185624:ENST00000331483:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000450722:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000436463:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000415593:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000473021:exon_79803020_79803332:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000476482:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000439918:exon_79803043_79803106:P4HB HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 79890818 C/T 1 148 120 268 67.7326030174263 65.0816732291138 2.65092978831244 T:C C T 10 0.542347276909282 0.759535163740967 ENSG00000183010:ENST00000337943:exon_79890269_79890839:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000432920:exon_79890269_79891252:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000405481:exon_79890269_79891252:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000329875:exon_79890269_79891252:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000403172:exon_79890269_79891252:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000402252:exon_79890756_79890839:PYCR1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 79974731 T/C 1 46 47 93 21.052025262173 25.4903220147363 -4.43829675256323 T:C T C 10 0.542347276909282 0.405227468793647 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79974676_79974745:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79974676_79974745:ASPSCR1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 79993919 C/T 1 131 124 255 59.9525067248841 67.251062336751 -7.2985556118669 T:C C T 10 0.542347276909282 0.379066335008951 ENSG00000169738:ENST00000306869:exon_79993757_79993939:DCXR HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 80006957 A/C 1 3 5 8 1.37295816927215 2.71173638454641 -1.33877821527426 A:C A C 10 0.542347276909282 0.482450044879903 ENSG00000169733:ENST00000310496:exon_80006907_80006992:RFNG HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 80014861 T/G 1 7 4 11 3.20356906163503 2.16938910763713 1.0341799539979 T:G T G 10 0.542347276909282 0.763959235154452 ENSG00000169727:ENST00000392357:exon_80014505_80015346:GPS1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 80059596 T/C 1 162 126 288 74.1397411406963 68.3357568905695 5.80398425012679 T:C T C 10 0.542347276909282 0.515582808327294 ENSG00000176155:ENST00000445854:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000389641:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392347:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392345:exon_80059566_80059742:CCDC57 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 80373452 C/T 1 5 6 11 2.28826361545359 3.25408366145569 -0.965820046002102 T:C C T 10 0.542347276909282 0.564156977749346 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80373274_80373503:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80373274_80373503:C17orf101 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 80543901 C/T 1 9 9 18 4.11887450781646 4.88112549218354 -0.762250984367075 T:C C T 10 0.542347276909282 0.814595397980852 ENSG00000141568:ENST00000473637:exon_80543780_80544076:FOXK2;ENSG00000141568:ENST00000335255:exon_80543780_80544076:FOXK2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 80544018 C/T 1 16 7 23 7.32244356945149 3.79643093836497 3.52601263108651 T:C C T 10 0.542347276909282 0.149662035595442 ENSG00000141568:ENST00000473637:exon_80543780_80544076:FOXK2;ENSG00000141568:ENST00000335255:exon_80543780_80544076:FOXK2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 17 80588763 T/G 1 7 9 16 3.20356906163503 4.88112549218354 -1.67755643054851 T:G T G 10 0.542347276909282 0.457321849303075 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 18 658064 G/C 1 20 3 23 9.15305446181436 1.62704183072785 7.52601263108651 C:G G C 10 0.542347276909282 0.00130187441309406 ENSG00000176912:ENST00000323813:exon_657842_658340:C18orf56 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 18 673016 C/T 1 108 129 237 49.4264940937975 69.9627987212974 -20.5363046274998 T:C C T 10 0.542347276909282 0.00897327802867003 ENSG00000176890:ENST00000323274:exon_672860_673578:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323250:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323224:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_672557_673076:ENOSF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 18 706558 C/T 1 10 3 13 4.57652723090718 1.62704183072785 2.94948540017933 T:C C T 10 0.542347276909282 0.161807814900871 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_706470_706578:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000251101:exon_706470_706578:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000319815:exon_706470_706578:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000340116:exon_706470_706578:ENOSF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 18 2595443 G/T 1 16 22 38 7.32244356945149 11.9316400920042 -4.60919652255271 T:G G T 10 0.542347276909282 0.144869193049485 ENSG00000080986:ENST00000261597:exon_2595415_2595620:NDC80 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 18 9255982 A/G 1 792 746 1538 362.460956687849 404.591068574324 -42.1301118864757 A:G A G 10 0.542347276909282 0.031584764136794 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 18 19154143 G/A 1 9 6 15 4.11887450781646 3.25408366145569 0.864790846360771 A:G G A 10 0.542347276909282 0.797455423618976 ENSG00000141446:ENST00000269214:exon_19153275_19155391:ESCO1;ENSG00000141446:ENST00000383276:exon_19153275_19155391:ESCO1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 18 21739725 T/C 1 11 17 28 5.0341799539979 9.21990370745779 -4.1857237534599 T:C T C 10 0.542347276909282 0.130236846363553 ENSG00000154040:ENST00000399496:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000399478:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000463087:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000486759:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000327201:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000399499:exon_21739436_21740033:CABYR HGDP00213_parsed_pileup.txt . 18 24035675 T/C 1 6 9 15 2.74591633854431 4.88112549218354 -2.13520915363923 T:C T C 10 0.542347276909282 0.307109737553343 ENSG00000134504:ENST00000317932:exon_24034874_24035865:KCTD1;ENSG00000134504:ENST00000417602:exon_24034877_24035865:KCTD1;ENSG00000134504:ENST00000408011:exon_24034877_24035865:KCTD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 18 33048554 C/T 1 20 28 48 9.15305446181436 15.1857237534599 -6.03266929164553 T:C C T 10 0.542347276909282 0.083888065866295 ENSG00000153391:ENST00000441607:exon_33048293_33048706:INO80C;ENSG00000153391:ENST00000334598:exon_33048297_33048706:INO80C HGDP00213_parsed_pileup.txt . 18 33718326 A/C 1 11 5 16 5.0341799539979 2.71173638454641 2.32244356945149 A:C A C 10 0.542347276909282 0.318264889784535 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33718233_33718389:ELP2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 18 33750046 C/T 1 41 41 82 18.7637616467194 22.2362383532806 -3.47247670656112 T:C C T 10 0.542347276909282 0.44076197313575 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33750026_33750159:ELP2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 18 44392443 T/C 1 5 10 15 2.28826361545359 5.42347276909282 -3.13520915363923 T:C T C 10 0.542347276909282 0.123431676383676 ENSG00000078043:ENST00000398654:exon_44392060_44392575:PIAS2;ENSG00000078043:ENST00000262161:exon_44392060_44392575:PIAS2;ENSG00000078043:ENST00000398651:exon_44392060_44392575:PIAS2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 18 47810351 A/G 1 36 44 80 16.4754980312659 23.8632801840084 -7.38778215274256 A:G A G 10 0.542347276909282 0.115735098512283 ENSG00000154832:ENST00000285106:exon_47810264_47810471:CXXC1;ENSG00000154832:ENST00000412036:exon_47810264_47810471:CXXC1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 18 51820805 G/A 1 23 16 39 10.5260126310865 8.67755643054851 1.848456200538 A:G G A 10 0.542347276909282 0.630927267973794 ENSG00000101751:ENST00000406285:exon_51820019_51824602:POLI;ENSG00000101751:ENST00000217800:exon_51820019_51821101:POLI HGDP00213_parsed_pileup.txt . 18 60985879 T/C 1 95 101 196 43.4770086936182 54.7770749678375 -11.3000662742193 T:C T C 10 0.542347276909282 0.114676488321230 ENSG00000171791:ENST00000398117:exon_60985315_60987361:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000333681:exon_60985315_60986185:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000444484:exon_60985187_60986185:BCL2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 18 61600384 C/T 1 2 14 16 0.915305446181436 7.59286187672995 -6.67755643054851 T:C C T 10 0.542347276909282 0.000754032857360445 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61600282_61600437:SERPINB10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 18 61602495 C/T 1 5 19 24 2.28826361545359 10.3045982612764 -8.01633464582277 T:C C T 10 0.542347276909282 0.00148570667340797 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61602072_61603345:SERPINB10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 18 61654463 A/G 1 27 35 62 12.3566235234494 18.9821546918249 -6.62553116837548 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0982267235156682 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 18 71928150 C/T 1 83 61 144 37.9851760165296 33.0831838914662 4.90199212506339 T:C C T 10 0.542347276909282 0.451846248506596 ENSG00000166347:ENST00000340533:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000494131:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000397914:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000299438:exon_71928150_71928179:CYB5A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 18 71959075 G/A 1 9 10 19 4.11887450781646 5.42347276909282 -1.30459826127636 A:G G A 10 0.542347276909282 0.647186647042385 ENSG00000166347:ENST00000340533:exon_71958982_71959251:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000494131:exon_71958982_71959170:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000397914:exon_71958982_71959179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000299438:exon_71958982_71959179:CYB5A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 18 77473127 C/T 1 6 3 9 2.74591633854431 1.62704183072785 1.11887450781646 T:C C T 10 0.542347276909282 0.521783447682374 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77472972_77473138:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77472972_77473138:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77472972_77473138:CTDP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 18 77477873 G/A 1 6 4 10 2.74591633854431 2.16938910763713 0.57652723090718 A:G G A 10 0.542347276909282 0.762606887543924 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77477810_77478016:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77477810_77478016:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77477810_77478016:CTDP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 18 77664150 G/A 1 56 37 93 25.6285524930802 20.0668492456434 5.56170324743678 A:G G A 10 0.542347276909282 0.254360638464633 ENSG00000122490:ENST00000397778:exon_77662420_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000409073:exon_77662421_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000466449:exon_77663578_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000351365:exon_77662488_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000357575:exon_77662488_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000474967:exon_77662515_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000469369:exon_77664052_77664183:PQLC1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 18 77805778 C/G 1 41 28 69 18.7637616467194 15.1857237534599 3.57803789325954 C:G C G 10 0.542347276909282 0.40068068760165 ENSG00000101546:ENST00000306735:exon_77805774_77810651:RBFA;ENSG00000101546:ENST00000262197:exon_77805774_77806377:RBFA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 18 77805856 A/C 1 39 47 86 17.848456200538 25.4903220147363 -7.64186581419825 A:C A C 10 0.542347276909282 0.104971668173452 ENSG00000101546:ENST00000306735:exon_77805774_77810651:RBFA;ENSG00000101546:ENST00000262197:exon_77805774_77806377:RBFA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 281360 C/T 1 60 2 62 27.4591633854431 1.08469455381856 26.3744688316245 T:C C T 10 0.542347276909282 6.15385109405897e-14 ENSG00000141934:ENST00000269812:exon_281048_281537:PPAP2C;ENSG00000141934:ENST00000327790:exon_281048_281537:PPAP2C;ENSG00000141934:ENST00000434325:exon_281048_281537:PPAP2C HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 532066 C/T 1 7 10 17 3.20356906163503 5.42347276909282 -2.21990370745779 T:C C T 10 0.542347276909282 0.333980909060167 ENSG00000099804:ENST00000215574:exon_531733_532108:CDC34 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 579519 C/T 1 49 28 77 22.4249834314452 15.1857237534599 7.23925967798529 T:C C T 10 0.542347276909282 0.109381380967713 ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000396012:exon_579500_579656:BSG HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 581428 C/T 1 335 300 635 153.313662235391 162.704183072785 -9.39052083739404 T:C C T 10 0.542347276909282 0.47347995508735 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_581315_581591:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_581315_581591:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_581315_581591:BSG HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 880081 G/A 1 4 4 8 1.83061089236287 2.16938910763713 -0.338778215274256 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_879937_880148:MED16 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 885818 A/G 1 6 11 17 2.74591633854431 5.9658200460021 -3.21990370745779 A:G A G 10 0.542347276909282 0.145336942608811 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_885770_886201:MED16 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 920642 T/A 1 21 10 31 9.61070718490508 5.42347276909282 4.18723441581226 A:T T A 10 0.542347276909282 0.150930870651492 ENSG00000116014:ENST00000234371:exon_920290_921014:KISS1R HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 929741 C/T 1 8 1 9 3.66122178472574 0.542347276909282 3.11887450781646 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0451652676161667 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_929262_929896:ARID3A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 966891 C/T 1 20 9 29 9.15305446181436 4.88112549218354 4.27192896963082 T:C C T 10 0.542347276909282 0.136155663592109 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 1036456 C/G 1 22 16 38 10.0683599079958 8.67755643054851 1.39080347744729 C:G C G 10 0.542347276909282 0.74549658093784 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 1036468 A/G 1 21 16 37 9.61070718490508 8.67755643054851 0.933150754356568 A:G A G 10 0.542347276909282 0.869320975572831 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 1037941 G/T 1 60 22 82 27.4591633854431 11.9316400920042 15.5275232934389 T:G G T 10 0.542347276909282 0.000529687892590055 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1037624_1039060:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1037624_1039060:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1037624_1039060:CNN2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 1064193 G/A 1 9 9 18 4.11887450781646 4.88112549218354 -0.762250984367075 A:G G A 10 0.542347276909282 0.814595397980852 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000531478:exon_1064051_1064252:ABCA7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 1080311 G/C 1 8 9 17 3.66122178472574 4.88112549218354 -1.21990370745779 C:G G C 10 0.542347276909282 0.630026415722873 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1080254_1080378:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1080254_1080378:HMHA1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 1081617 A/G 1 16 17 33 7.32244356945149 9.21990370745779 -1.89746013800631 A:G A G 10 0.542347276909282 0.600966066666739 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1081549_1081737:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1081549_1081737:HMHA1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 1085966 A/G 1 76 62 138 34.7816069548946 33.6255311683755 1.15607578651909 A:T:G A G 10 0.542347276909282 0.864697371416325 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1085659_1086627:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1085659_1086627:HMHA1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 1095336 C/T 1 22 20 42 10.0683599079958 10.8469455381856 -0.778585630189843 T:C C T 10 0.542347276909282 0.877353318587752 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 1106477 G/C 1 18 16 34 8.23774901563293 8.67755643054851 -0.439807414915586 C:G G C 10 0.542347276909282 1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 1256998 C/T 1 6 8 14 2.74591633854431 4.33877821527426 -1.59286187672995 T:C C T 10 0.542347276909282 0.431117415726890 ENSG00000167470:ENST00000300952:exon_1256994_1259139:MIDN;ENSG00000167470:ENST00000395622:exon_1256994_1259078:MIDN HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 1269837 C/T 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 T:C C T 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000235103:ENST00000436371:exon_1269824_1270259:C19orf23 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 1622116 G/A 1 8 5 13 3.66122178472574 2.71173638454641 0.949485400179334 A:G G A 10 0.542347276909282 0.782391509721688 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1622053_1622222:TCF3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 1854557 A/G 1 4 4 8 1.83061089236287 2.16938910763713 -0.338778215274256 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000129911:ENST00000250916:exon_1852398_1854759:KLF16 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 1912934 T/C 1 22 13 35 10.0683599079958 7.05051459982067 3.01784530817513 T:C T C 10 0.542347276909282 0.396656660808413 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 1912986 C/T 1 26 14 40 11.8989708003587 7.59286187672995 4.30610892362872 T:C C T 10 0.542347276909282 0.204730326402250 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 1986520 G/A 1 26 19 45 11.8989708003587 10.3045982612764 1.59437253908231 A:G G A 10 0.542347276909282 0.656863946107823 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 2039568 G/C 1 54 62 116 24.7132470468988 33.6255311683755 -8.91228412147671 C:G G C 10 0.542347276909282 0.112809765364093 ENSG00000099875:ENST00000250896:exon_2037481_2039855:MKNK2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 2078221 G/C 1 21 17 38 9.61070718490508 9.21990370745779 0.390803477447285 C:G G C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 2078409 A/G 1 19 27 46 8.69540173872364 14.6433764765506 -5.94797473782697 A:G A G 10 0.542347276909282 0.102558958128501 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 2078488 T/C 1 26 22 48 11.8989708003587 11.9316400920042 -0.0326692916455347 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 2097322 T/C 1 21 1 22 9.61070718490508 0.542347276909282 9.0683599079958 T:C T C 10 0.542347276909282 3.98569022347569e-05 ENSG00000099840:ENST00000395307:exon_2097251_2097331:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000481489:exon_2097251_2097494:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000497445:exon_2097251_2097331:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000478879:exon_2097251_2097331:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000300960:exon_2097251_2097331:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000395296:exon_2097251_2097331:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000498554:exon_2097251_2097494:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000395301:exon_2097251_2097331:IZUMO4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 2110746 G/A 1 40 28 68 18.3061089236287 15.1857237534599 3.12038517016883 A:G G A 10 0.542347276909282 0.467754907414127 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2110706_2110895:AP3D1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 2116649 A/G 1 10 11 21 4.57652723090718 5.9658200460021 -1.38929281509492 A:G A G 10 0.542347276909282 0.662591228630952 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2116604_2116745:AP3D1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 2226676 G/A 1 29 29 58 13.2719289696308 15.7280710303692 -2.45614206073835 A:G G A 10 0.542347276909282 0.598488072558664 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 2226772 G/C 1 40 31 71 18.3061089236287 16.8127655841877 1.49334333944098 C:G G C 10 0.542347276909282 0.811931391762081 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 2278755 C/T 1 5 4 9 2.28826361545359 2.16938910763713 0.118874507816462 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000188305:ENST00000342063:exon_2278583_2279112:C19orf35 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 2353148 T/C 1 12 13 25 5.49183267708862 7.05051459982067 -1.55868192273205 T:C T C 10 0.542347276909282 0.55306538240066 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2352944_2353207:AC004410.1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 2433890 A/G 1 16 7 23 7.32244356945149 3.79643093836497 3.52601263108651 A:G A G 10 0.542347276909282 0.149662035595442 ENSG00000176619:ENST00000532465:exon_2433824_2433897:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000325327:exon_2433824_2434103:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000490554:exon_2433824_2434103:LMNB2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 2732741 G/A 1 117 88 205 53.545368601614 47.7265603680168 5.8188082335972 A:G G A 10 0.542347276909282 0.440959478770686 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 2767192 G/T 1 3 8 11 1.37295816927215 4.33877821527426 -2.9658200460021 T:G G T 10 0.542347276909282 0.126534045746447 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2767134_2767218:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2767134_2767218:SGTA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 2917612 T/C 1 3 6 9 1.37295816927215 3.25408366145569 -1.88112549218354 T:C T C 10 0.542347276909282 0.31687860521519 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 2933480 C/T 1 6 7 13 2.74591633854431 3.79643093836497 -1.05051459982067 T:C C T 10 0.542347276909282 0.588981693424056 ENSG00000175691:ENST00000314531:exon_2933217_2934813:ZNF77 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 3155902 G/A 1 3 8 11 1.37295816927215 4.33877821527426 -2.9658200460021 A:G G A 10 0.542347276909282 0.126534045746447 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3155821_3155950:GNA15 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 3162909 C/T 1 15 8 23 6.86479084636077 4.33877821527426 2.52601263108651 T:C C T 10 0.542347276909282 0.403120043211592 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3162791_3163766:GNA15 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 3752515 G/A 1 29 49 78 13.2719289696308 26.5750165685548 -13.303087598924 A:G G A 10 0.542347276909282 0.00294055229918466 ENSG00000011132:ENST00000439726:exon_3752506_3752718:APBA3;ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3752506_3752718:APBA3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 3753769 C/T 1 17 4 21 7.78009629254221 2.16938910763713 5.61070718490508 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0151240372692118 ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3753763_3753924:APBA3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 3753874 G/A 1 6 4 10 2.74591633854431 2.16938910763713 0.57652723090718 A:G G A 10 0.542347276909282 0.762606887543924 ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3753763_3753924:APBA3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 3762698 C/T 1 2 6 8 0.915305446181436 3.25408366145569 -2.33877821527426 T:C C T 10 0.542347276909282 0.153857012176102 ENSG00000183617:ENST00000330133:exon_3762665_3762816:MRPL54 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 3767265 C/T 1 156 185 341 71.393824802152 100.334246228217 -28.9404214260652 T:C:G C T 10 0.542347276909282 0.00190891606632373 ENSG00000183617:ENST00000330133:exon_3767259_3767562:MRPL54 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 3977486 A/G 1 1329 1412 2741 608.220468987564 765.794354995906 -157.573886008342 A:T:G A G 10 0.542347276909282 1.69099835233909e-09 ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3977426_3977608:EEF2;ENSG00000167658:ENST00000445244:exon_3977426_3977608:EEF2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 3979408 A/G 1 604 598 1202 276.422244746794 324.323671591751 -47.9014268449569 A:G A G 10 0.542347276909282 0.00593854109775989 ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3979327_3979434:EEF2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 3982967 G/A 1 87 85 172 39.8157869088925 46.099518537289 -6.2837316283965 A:G G A 10 0.542347276909282 0.358691002820338 ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3982805_3983016:EEF2;ENSG00000167658:ENST00000445244:exon_3982805_3983016:EEF2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 3983184 A/G 1 77 73 150 35.2392596779853 39.5913512143776 -4.35209153639229 A:G A G 10 0.542347276909282 0.512310817802139 ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3983108_3983289:EEF2;ENSG00000167658:ENST00000445244:exon_3983108_3983289:EEF2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 4101062 G/T 1 21 23 44 9.61070718490508 12.4739873689135 -2.86328018400841 T:G G T 10 0.542347276909282 0.449933168300866 ENSG00000126934:ENST00000262948:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000394867:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000481271:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000443189:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000465472:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000472395:exon_4100962_4101141:MAP2K2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 4102449 G/A 1 37 33 70 16.9331507543566 17.8974601380063 -0.964309383649738 A:G G A 10 0.542347276909282 0.811896830910218 ENSG00000126934:ENST00000262948:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000394867:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000481271:exon_4102374_4103202:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000443189:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000465472:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000472395:exon_4102374_4102502:MAP2K2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 4117528 G/A 1 18 25 43 8.23774901563293 13.558681922732 -5.32093290709912 A:G G A 10 0.542347276909282 0.125397734889384 ENSG00000126934:ENST00000262948:exon_4117417_4117627:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000394867:exon_4117417_4117627:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000443189:exon_4117417_4117627:MAP2K2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 4325433 G/A 1 12 13 25 5.49183267708862 7.05051459982067 -1.55868192273205 A:G G A 10 0.542347276909282 0.55306538240066 ENSG00000178078:ENST00000424810:exon_4325393_4325542:STAP2;ENSG00000178078:ENST00000314714:exon_4325393_4325542:STAP2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 4816241 G/A 1 90 78 168 41.1887450781646 42.303087598924 -1.11434252075937 A:G G A 10 0.542347276909282 0.87716162418067 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 4852137 C/T 1 9 9 18 4.11887450781646 4.88112549218354 -0.762250984367075 T:C C T 10 0.542347276909282 0.814595397980852 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4852028_4852313:PLIN3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 5693616 C/T 1 148 175 323 67.7326030174263 94.9107734591243 -27.1781704416981 A:T:C:G C T 10 0.542347276909282 0.00253843412642223 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5693563_5693780:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5693563_5693780:LONP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 5696146 G/A 1 46 31 77 21.052025262173 16.8127655841877 4.23925967798529 A:G G A 10 0.542347276909282 0.361347528887095 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5696065_5696181:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5696065_5696181:LONP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 6468331 T/C 1 52 68 120 23.7979416007173 36.8796148298312 -13.0816732291138 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0172406836939864 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6468245_6468452:DENND1C HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 6477256 G/T 1 8 6 14 3.66122178472574 3.25408366145569 0.407138123270053 T:G G T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6477229_6477294:DENND1C HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 6586268 G/A 1 1649 1567 3216 754.669340376594 849.858182916845 -95.1888425402508 A:C:G G A 10 0.542347276909282 0.00077102515511479 ENSG00000125726:ENST00000423145:exon_6586165_6586416:CD70;ENSG00000125726:ENST00000245903:exon_6585867_6586416:CD70 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 6744909 C/T 1 25 11 36 11.441318077268 5.9658200460021 5.47549803126585 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0929934687279627 ENSG00000125733:ENST00000313285:exon_6744811_6745005:TRIP10;ENSG00000125733:ENST00000394404:exon_6744811_6745005:TRIP10;ENSG00000125733:ENST00000481339:exon_6744811_6745005:TRIP10;ENSG00000125733:ENST00000313244:exon_6744811_6745005:TRIP10;ENSG00000125733:ENST00000475024:exon_6744811_6745005:TRIP10;ENSG00000125733:ENST00000420690:exon_6744811_6745005:TRIP10;ENSG00000125733:ENST00000462140:exon_6744811_6745211:TRIP10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 7622226 G/A 1 6 4 10 2.74591633854431 2.16938910763713 0.57652723090718 A:G G A 10 0.542347276909282 0.762606887543924 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 7685843 G/A 1 37 30 67 16.9331507543566 16.2704183072785 0.66273244707811 A:G G A 10 0.542347276909282 0.902949371744463 ENSG00000076924:ENST00000358368:exon_7685732_7685922:XAB2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 7703605 C/T 1 21 19 40 9.61070718490508 10.3045982612764 -0.693891076371278 T:C C T 10 0.542347276909282 0.874602009607347 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 7711221 T/C 1 100 82 182 45.7652723090718 44.4724767065611 1.29279560251068 T:C T C 10 0.542347276909282 0.881855617999904 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7711135_7711230:STXBP2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 7712193 G/A 1 4 13 17 1.83061089236287 7.05051459982067 -5.21990370745779 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0136420100114285 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 7712425 G/C 1 21 10 31 9.61070718490508 5.42347276909282 4.18723441581226 C:G G C 10 0.542347276909282 0.150930870651492 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 7977268 G/T 1 8 2 10 3.66122178472574 1.08469455381856 2.57652723090718 T:G G T 10 0.542347276909282 0.121983479725832 ENSG00000076984:ENST00000397981:exon_7977182_7979363:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000397983:exon_7977182_7979363:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000468058:exon_7977182_7977450:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000397979:exon_7977182_7979363:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000425613:exon_7977182_7977316:MAP2K7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 7986638 C/G 1 6 9 15 2.74591633854431 4.88112549218354 -2.13520915363923 C:G C G 10 0.542347276909282 0.307109737553343 ENSG00000104976:ENST00000221573:exon_7986590_7986658:SNAPC2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 8326641 C/T 1 22 15 37 10.0683599079958 8.13520915363923 1.93315075435657 T:C C T 10 0.542347276909282 0.621431572939367 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326572_8326728:LASS4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 8326904 G/A 1 47 48 95 21.5096779852637 26.0326692916455 -4.52299130638179 A:G G A 10 0.542347276909282 0.356155418817615 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 8367424 G/A 1 55 59 114 25.1708997699895 31.9984893376476 -6.82758956765814 A:G G A 10 0.542347276909282 0.221735892297932 ENSG00000167775:ENST00000323539:exon_8367011_8367489:CD320;ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8367011_8367489:CD320 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 8370080 C/T 1 10 11 21 4.57652723090718 5.9658200460021 -1.38929281509492 T:C C T 10 0.542347276909282 0.662591228630952 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 8373152 T/C 1 7 8 15 3.20356906163503 4.33877821527426 -1.13520915363923 T:C T C 10 0.542347276909282 0.610766925411102 ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8373033_8373239:CD320 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 9721401 A/T 1 18 18 36 8.23774901563293 9.76225098436707 -1.52450196873415 A:T A T 10 0.542347276909282 0.620104822842998 ENSG00000171469:ENST00000354661:exon_9718003_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000302851:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000424629:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000326044:exon_9720432_9722012:ZNF561 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 10218524 C/G 1 47 29 76 21.5096779852637 15.7280710303692 5.78160695489457 C:G C G 10 0.542347276909282 0.205764073287727 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000130810:ENST00000253107:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000342696:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000393793:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000446223:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000430370:exon_10218480_10218530:PPAN HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 10221151 C/G 1 16 8 24 7.32244356945149 4.33877821527426 2.98366535417723 C:G C G 10 0.542347276909282 0.305726818365886 ENSG00000130810:ENST00000486482:exon_10221134_10221290:PPAN HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 10224526 C/T 1 8 18 26 3.66122178472574 9.76225098436707 -6.10102919964133 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0181570333225897 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 10225777 A/G 1 626 618 1244 286.490604654789 335.170617129936 -48.6800124751468 A:G A G 10 0.542347276909282 0.00576823356080025 ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11;ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10225690_10225805:EIF3G HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 10226256 A/G 1 307 306 613 140.49938598885 165.95826673424 -25.4588807453898 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0425997513921987 ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10226155_10226261:EIF3G HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 10334663 T/G 1 6 4 10 2.74591633854431 2.16938910763713 0.57652723090718 T:G T G 10 0.542347276909282 0.762606887543924 ENSG00000175898:ENST00000317726:exon_10332109_10335623:S1PR2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 10394792 G/A 1 5 10 15 2.28826361545359 5.42347276909282 -3.13520915363923 A:G G A 10 0.542347276909282 0.123431676383676 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10394709_10394996:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10394709_10394996:ICAM1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 10794413 A/G 1 24 18 42 10.9836653541772 9.76225098436707 1.22141436981016 A:G A G 10 0.542347276909282 0.75833543349177 ENSG00000129351:ENST00000336059:exon_10794312_10794465:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000449870:exon_10794312_10794465:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000318511:exon_10794312_10794465:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000420083:exon_10794312_10794465:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000407004:exon_10794312_10794465:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000250241:exon_10794312_10794465:ILF3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 10939792 T/C 1 9 10 19 4.11887450781646 5.42347276909282 -1.30459826127636 T:C T C 10 0.542347276909282 0.647186647042385 ENSG00000079805:ENST00000389252:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000389253:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000359692:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000314646:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000355667:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000408974:exon_10939712_10939944:DNM2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 11105608 T/C 1 50 62 112 22.8826361545359 33.6255311683755 -10.7428950138396 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0462260928134945 ENSG00000127616:ENST00000358026:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000421844:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000429416:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000344626:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000444061:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000450717:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000413806:exon_11105504_11105677:SMARCA4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 11113651 T/C 1 7 8 15 3.20356906163503 4.33877821527426 -1.13520915363923 T:C T C 10 0.542347276909282 0.610766925411102 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 11113997 G/T 1 6 2 8 2.74591633854431 1.08469455381856 1.66122178472574 T:G G T 10 0.542347276909282 0.303100337321114 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 11145691 C/T 1 14 35 49 6.40713812327005 18.9821546918249 -12.5750165685548 T:C C T 10 0.542347276909282 0.000446901700414452 ENSG00000127616:ENST00000358026:exon_11145590_11145808:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000421844:exon_11145590_11145808:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000429416:exon_11145590_11145808:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000344626:exon_11145590_11145808:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000444061:exon_11145590_11145808:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000450717:exon_11145590_11145808:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000413806:exon_11145590_11145808:SMARCA4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 11218226 G/A 1 39 22 61 17.848456200538 11.9316400920042 5.9168161085338 A:G G A 10 0.542347276909282 0.157061658788123 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 11221457 G/C 1 8 10 18 3.66122178472574 5.42347276909282 -1.76225098436708 C:G G C 10 0.542347276909282 0.48096710956808 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 11227602 C/T 1 4 4 8 1.83061089236287 2.16938910763713 -0.338778215274256 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11227535_11227674:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11227535_11227674:LDLR HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 12772090 C/T 1 14 21 35 6.40713812327005 11.3892928150949 -4.98215469182487 T:C C T 10 0.542347276909282 0.125585934947518 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000462144:exon_12771711_12772190:MAN2B1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 12772165 G/A 1 8 8 16 3.66122178472574 4.33877821527426 -0.677556430548512 A:G G A 10 0.542347276909282 0.804712000972457 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000462144:exon_12771711_12772190:MAN2B1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 13264398 C/T 1 106 96 202 48.5111886476161 52.0653385832911 -3.55414993567496 T:C C T 10 0.542347276909282 0.621777924839774 ENSG00000160888:ENST00000292433:exon_13263758_13265716:IER2;ENSG00000160888:ENST00000393152:exon_13263893_13265716:IER2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 13885309 C/T 1 92 62 154 42.1040505243461 33.6255311683755 8.47851935597058 T:C C T 10 0.542347276909282 0.195515936987729 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885257_13885388:C19orf53 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 13885484 A/G 1 287 305 592 131.346331527036 165.415919457331 -34.0695879302949 A:T:G A G 10 0.542347276909282 0.00502818242334536 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885466_13885521:C19orf53 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 14030689 T/C 1 4 9 13 1.83061089236287 4.88112549218354 -3.05051459982067 T:C T C 10 0.542347276909282 0.101447871356357 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000397486:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14030631_14030764:CC2D1A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 14231243 C/T 1 40 12 52 18.3061089236287 6.50816732291138 11.7979416007173 T:C C T 10 0.542347276909282 0.00114813755078611 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 14231325 C/G 1 16 9 25 7.32244356945149 4.88112549218354 2.44131807726795 C:G C G 10 0.542347276909282 0.422950604085886 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 14231330 A/G 1 15 9 24 6.86479084636077 4.88112549218354 1.98366535417723 A:G A G 10 0.542347276909282 0.539851636806923 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 14512489 G/A 1 6 7 13 2.74591633854431 3.79643093836497 -1.05051459982067 A:G G A 10 0.542347276909282 0.588981693424056 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000434474:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000393059:exon_14512465_14512572:CD97 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 14582468 G/A 1 212 188 400 97.0223772952322 101.961288058945 -4.9389107637128 A:G G A 10 0.542347276909282 0.651593765976091 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14582393_14582671:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14582393_14582678:PKN1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 14589378 C/T 1 10 25 35 4.57652723090718 13.558681922732 -8.98215469182487 T:C C T 10 0.542347276909282 0.00330716990897713 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14588574_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14588574_14589379:GIPC1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 14590236 C/T 1 9 13 22 4.11887450781646 7.05051459982067 -2.9316400920042 T:C C T 10 0.542347276909282 0.284538813785442 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14590224_14590336:GIPC1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 14626911 A/G 1 28 20 48 12.8142762465401 10.8469455381856 1.96733070835447 A:G A G 10 0.542347276909282 0.664385857539612 ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14625582_14626982:DNAJB1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 14682804 G/C 1 83 68 151 37.9851760165296 36.8796148298312 1.10556118669842 C:G G C 10 0.542347276909282 0.870639769100775 ENSG00000099795:ENST00000215565:exon_14682701_14682886:NDUFB7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 14705499 G/A 1 7 5 12 3.20356906163503 2.71173638454641 0.491832677088616 A:G G A 10 0.542347276909282 1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 15226970 G/A 1 23 21 44 10.5260126310865 11.3892928150949 -0.863280184008406 A:G G A 10 0.542347276909282 0.880008851298633 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 15227030 G/A 1 18 17 35 8.23774901563293 9.21990370745779 -0.982154691824869 A:G G A 10 0.542347276909282 0.738201449686261 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 15229993 A/G 1 8 4 12 3.66122178472574 2.16938910763713 1.49183267708862 A:G A G 10 0.542347276909282 0.564494489181351 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15229977_15230113:ILVBL HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 15350594 G/A 1 9 6 15 4.11887450781646 3.25408366145569 0.864790846360771 A:G G A 10 0.542347276909282 0.797455423618976 ENSG00000141867:ENST00000263377:exon_15350470_15350632:BRD4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 17163661 C/T 1 52 36 88 23.7979416007173 19.5245019687341 4.27343963198319 T:C C T 10 0.542347276909282 0.392901264790325 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17163635_17163776:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17163635_17163776:HAUS8 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 17170885 C/T 1 5 8 13 2.28826361545359 4.33877821527426 -2.05051459982067 T:C C T 10 0.542347276909282 0.278020697313787 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17170807_17170899:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17170807_17170902:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000335009:exon_17170807_17170902:HAUS8 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 17212992 C/T 1 18 16 34 8.23774901563293 8.67755643054851 -0.439807414915586 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17212466_17213367:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17212466_17213367:MYO9B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 17306031 T/C 1 14 9 23 6.40713812327005 4.88112549218354 1.52601263108652 T:C T C 10 0.542347276909282 0.676515370948775 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 17316782 T/C 1 8 6 14 3.66122178472574 3.25408366145569 0.407138123270053 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17316769_17316961:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17316769_17316961:MYO9B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 17317955 A/G 1 9 2 11 4.11887450781646 1.08469455381856 3.0341799539979 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0758810958623422 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17317922_17318053:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17317922_17318053:MYO9B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 17448961 A/C 1 5 14 19 2.28826361545359 7.59286187672995 -5.30459826127636 A:C A C 10 0.542347276909282 0.0194717206900939 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17448817_17449064:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17448817_17449064:GTPBP3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 17450016 T/C 1 5 21 26 2.28826361545359 11.3892928150949 -9.10102919964133 T:C T C 10 0.542347276909282 0.000504789877241826 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17449763_17450075:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17449932_17450075:GTPBP3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 17531450 G/A 1 7 1 8 3.20356906163503 0.542347276909282 2.66122178472574 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0781860486215706 ENSG00000141971:ENST00000528997:exon_17531347_17531855:FAM125A;ENSG00000141971:ENST00000528732:exon_17531122_17531529:FAM125A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 17533126 A/G 1 3 9 12 1.37295816927215 4.88112549218354 -3.50816732291138 A:G A G 10 0.542347276909282 0.077659883252704 ENSG00000141971:ENST00000524382:exon_17533094_17533267:FAM125A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 17622614 C/T 1 44 21 65 20.1367198159916 11.3892928150949 8.74742700089667 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0338064553053791 ENSG00000130313:ENST00000252603:exon_17622432_17622769:PGLS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 17628587 A/G 1 107 116 223 48.9688413707068 62.9122841214767 -13.9434427507699 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0693545095921587 ENSG00000130313:ENST00000252603:exon_17628519_17628659:PGLS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 17837090 C/T 1 11 18 29 5.0341799539979 9.76225098436707 -4.72807103036918 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0933969228684003 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 17837512 G/A 1 16 16 32 7.32244356945149 8.67755643054851 -1.35511286109702 A:G G A 10 0.542347276909282 0.723509721345873 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 18170384 G/A 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 A:G G A 10 0.542347276909282 0.734324137601319 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 18186575 G/A 1 6 2 8 2.74591633854431 1.08469455381856 1.66122178472574 A:G G A 10 0.542347276909282 0.303100337321114 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18186559_18186678:IL12RB1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 18279638 T/C 1 4 6 10 1.83061089236287 3.25408366145569 -1.42347276909282 T:C T C 10 0.542347276909282 0.528168739719971 ENSG00000105647:ENST00000222254:exon_18279536_18279706:PIK3R2;ENSG00000105647:ENST00000426902:exon_18279536_18279706:PIK3R2;ENSG00000105647:ENST00000464016:exon_18279285_18279649:PIK3R2;ENSG00000105647:ENST00000470732:exon_18279308_18279706:PIK3R2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 18285944 G/A 1 306 294 600 140.04173326576 159.450099411329 -19.4083661455692 A:T:G G A 10 0.542347276909282 0.119418746353500 ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18285850_18286032:IFI30 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 18304700 A/G 1 7 9 16 3.20356906163503 4.88112549218354 -1.67755643054851 A:G A G 10 0.542347276909282 0.457321849303075 ENSG00000254858:ENST00000534421:exon_18304674_18304970:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000417827:exon_18304674_18304828:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000445735:exon_18304674_18304844:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000533807:exon_18304042_18304844:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000532896:exon_18304042_18304844:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000247712:exon_18304674_18304844:AC068499.1;ENSG00000127226:ENST00000534474:exon_18304674_18304833:MPV17L2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 18306867 C/G 1 18 20 38 8.23774901563293 10.8469455381856 -2.60919652255271 C:G C G 10 0.542347276909282 0.419093306201868 ENSG00000254858:ENST00000417827:exon_18306809_18307552:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000445735:exon_18306809_18307552:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000533807:exon_18306809_18307552:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000532896:exon_18306809_18307552:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000247712:exon_18306809_18307552:AC068499.1;ENSG00000127226:ENST00000534474:exon_18306809_18307552:MPV17L2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 18499238 G/T 1 1 7 8 0.457652723090718 3.79643093836497 -3.33877821527426 T:G G T 10 0.542347276909282 0.0276538394311292 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18499096_18499986:GDF15 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 18499780 A/G 1 5 9 14 2.28826361545359 4.88112549218354 -2.59286187672995 A:G A G 10 0.542347276909282 0.187369064466614 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18499096_18499986:GDF15 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 19023853 T/C 1 59 82 141 27.0015106623524 44.4724767065611 -17.4709660442088 T:C T C 10 0.542347276909282 0.00390308278635597 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000351079:exon_19023793_19023855:COPE HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 19737686 C/T 1 3 5 8 1.37295816927215 2.71173638454641 -1.33877821527426 T:C C T 10 0.542347276909282 0.482450044879903 ENSG00000064547:ENST00000407877:exon_19737352_19738093:LPAR2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 23542697 G/C 1 37 20 57 16.9331507543566 10.8469455381856 6.08620521617093 C:G G C 10 0.542347276909282 0.112091845124198 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 33137322 A/G 0 0 8 8 0 4.33877821527426 -4.33877821527426 G A G 10 0.542347276909282 0.00192436924076413 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 33370070 A/G 1 15 4 19 6.86479084636077 2.16938910763713 4.69540173872364 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0370384104182015 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33369908_33370284:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33369908_33370284:CCDC123 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 33370084 T/A 1 13 4 17 5.94948540017933 2.16938910763713 3.78009629254221 A:T T A 10 0.542347276909282 0.0872415563926971 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33369908_33370284:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33369908_33370284:CCDC123 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 33378696 T/C 0 10 0 10 4.57652723090718 0 4.57652723090718 T T 10 0.542347276909282 0.00260483510316352 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33378658_33378747:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33378658_33378747:CCDC123 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 33467357 G/A 1 4 6 10 1.83061089236287 3.25408366145569 -1.42347276909282 A:G G A 10 0.542347276909282 0.528168739719971 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 33467576 G/A 1 9 5 14 4.11887450781646 2.71173638454641 1.40713812327005 A:G G A 10 0.542347276909282 0.594287862477072 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 33605312 T/C 1 4 4 8 1.83061089236287 2.16938910763713 -0.338778215274256 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33605159_33605325:GPATCH1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 33608733 C/A 1 4 4 8 1.83061089236287 2.16938910763713 -0.338778215274256 A:C C A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33608731_33608947:GPATCH1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 33878198 A/G 1 24 30 54 10.9836653541772 16.2704183072785 -5.28675295310122 A:G A G 10 0.542347276909282 0.172054228004589 ENSG00000124299:ENST00000397032:exon_33877865_33878387:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000436370:exon_33877865_33878387:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000244137:exon_33877865_33878387:PEPD HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 33878837 G/A 1 12 17 29 5.49183267708862 9.21990370745779 -3.72807103036918 A:G G A 10 0.542347276909282 0.193116423162613 ENSG00000124299:ENST00000397032:exon_33878796_33878987:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000436370:exon_33878796_33878987:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000244137:exon_33878796_33878987:PEPD HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 35175749 C/G 1 10 6 16 4.57652723090718 3.25408366145569 1.32244356945149 C:G C G 10 0.542347276909282 0.619321847116393 ENSG00000089335:ENST00000457781:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000527499:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505242:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000525595:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000423823:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000221282:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000446502:exon_35175157_35177237:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505365:exon_35175098_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000509196:exon_35175157_35177296:ZNF302 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 35233027 C/T 1 4 4 8 1.83061089236287 2.16938910763713 -0.338778215274256 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000197841:ENST00000392232:exon_35231516_35233777:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000448715:exon_35231516_35233777:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000425140:exon_35231516_35233774:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000492450:exon_35231516_35233091:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000459757:exon_35231516_35233091:ZNF181 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 35501051 T/C 1 12 6 18 5.49183267708862 3.25408366145569 2.23774901563293 T:C T C 10 0.542347276909282 0.348947731183792 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35500996_35501099:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35500996_35501099:GRAMD1A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 35504627 C/A 1 3 6 9 1.37295816927215 3.25408366145569 -1.88112549218354 A:C C A 10 0.542347276909282 0.31687860521519 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 35649281 A/G 1 124 107 231 56.748937663249 58.0311586292932 -1.28222096604414 A:G A G 10 0.542347276909282 0.894997149490954 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35649247_35649303:FXYD5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 35660450 T/C 1 4 4 8 1.83061089236287 2.16938910763713 -0.338778215274256 T:C T C 10 0.542347276909282 1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 35660546 T/C 1 508 375 883 232.487583330085 203.380228840981 29.107354489104 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0501386913984368 ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35660469_35660786:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35660469_35660783:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392217:exon_35660469_35660784:FXYD5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 35770056 G/A 1 12 5 17 5.49183267708862 2.71173638454641 2.78009629254221 A:G G A 10 0.542347276909282 0.225793255539929 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 36038390 A/G 1 76 100 176 34.7816069548946 54.2347276909282 -19.4531207360336 A:T:G A G 10 0.542347276909282 0.00392241132547276 ENSG00000105677:ENST00000392204:exon_36038226_36038397:TMEM147;ENSG00000105677:ENST00000222284:exon_36038226_36038428:TMEM147 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 36230174 T/C 1 155 89 244 70.9361720790613 48.2689076449261 22.6672644341352 T:C T C 10 0.542347276909282 0.00376688012081107 ENSG00000126246:ENST00000246532:exon_36230153_36230527:TMEM149;ENSG00000126246:ENST00000344990:exon_36230153_36230527:TMEM149 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 36590329 T/C 1 8 7 15 3.66122178472574 3.79643093836497 -0.135209153639229 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36590301_36590519:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36590301_36590519:WDR62 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 36594659 A/T 1 16 8 24 7.32244356945149 4.33877821527426 2.98366535417723 A:T A T 10 0.542347276909282 0.305726818365886 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36594245_36594883:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36594245_36594883:WDR62 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 36595436 A/C 1 15 15 30 6.86479084636077 8.13520915363923 -1.27041830727846 A:C A C 10 0.542347276909282 0.715325388496919 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36595420_36595577:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36595420_36595577:WDR62 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 36605647 T/C 1 2 11 13 0.915305446181436 5.9658200460021 -5.05051459982067 T:C T C 10 0.542347276909282 0.00907015594284308 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 37441111 C/T 1 6 5 11 2.74591633854431 2.71173638454641 0.0341799539978984 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000198453:ENST00000333987:exon_37440414_37441990:ZNF568;ENSG00000198453:ENST00000415168:exon_37440414_37443645:ZNF568 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 38610504 G/A 1 17 3 20 7.78009629254221 1.62704183072785 6.15305446181436 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0059711282347174 ENSG00000105738:ENST00000222345:exon_38609946_38610522:SIPA1L3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 38798086 T/C 1 203 182 385 92.9035027874158 98.7072043974893 -5.80370161007356 T:C T C 10 0.542347276909282 0.573789175576032 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38798068_38798161:YIF1B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 38800165 C/T 1 13 22 35 5.94948540017933 11.9316400920042 -5.98215469182487 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0604498744451935 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 38872778 C/T 1 152 113 265 69.5632139097891 61.2852422907489 8.27797161904028 T:C C T 10 0.542347276909282 0.324159625122546 ENSG00000099341:ENST00000215071:exon_38872757_38872868:PSMD8;ENSG00000099341:ENST00000404323:exon_38872757_38872868:PSMD8 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 39086604 T/C 1 80 66 146 36.6122178472574 35.7949202760126 0.817297571244829 T:C T C 10 0.542347276909282 0.933887259365998 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39086579_39086641:MAP4K1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 39100594 G/A 1 15 23 38 6.86479084636077 12.4739873689135 -5.60919652255272 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0742715631388934 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39100549_39100665:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39100549_39100665:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39100549_39100665:MAP4K1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 39100688 G/A 1 33 16 49 15.1025398619937 8.67755643054851 6.42498343144518 A:G G A 10 0.542347276909282 0.084350861465307 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 39306529 C/T 1 555 567 1122 253.997261315349 307.510906007563 -53.5136446922144 T:C:G C T 10 0.542347276909282 0.00148259672936169 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39306497_39306647:ECH1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 39308190 C/T 1 237 203 440 108.4636953725 110.096497212584 -1.63280184008407 T:C C T 10 0.542347276909282 0.885942794659942 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39308091_39308215:ECH1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 39416887 C/T 1 4 9 13 1.83061089236287 4.88112549218354 -3.05051459982067 T:C C T 10 0.542347276909282 0.101447871356357 ENSG00000104835:ENST00000448145:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000221431:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000430193:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000455102:exon_39416845_39416940:FBXO17 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 40030654 G/C 1 8 6 14 3.66122178472574 3.25408366145569 0.407138123270053 C:G G C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000176396:ENST00000390658:exon_40028890_40030870:EID2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 40480501 C/T 1 71 54 125 32.493343339441 29.2867529531012 3.20659038633976 T:C C T 10 0.542347276909282 0.590996346034449 ENSG00000013275:ENST00000157812:exon_40480431_40480540:PSMC4;ENSG00000013275:ENST00000455878:exon_40480431_40480540:PSMC4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 40486606 T/C 1 156 185 341 71.393824802152 100.334246228217 -28.9404214260652 T:C T C 10 0.542347276909282 0.00190891606632373 ENSG00000013275:ENST00000157812:exon_40486569_40486624:PSMC4;ENSG00000013275:ENST00000455878:exon_40486569_40486624:PSMC4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 40739513 A/G 1 14 7 21 6.40713812327005 3.79643093836497 2.61070718490508 A:G A G 10 0.542347276909282 0.281064205206453 ENSG00000105221:ENST00000392038:exon_40736224_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000486368:exon_40738241_40739590:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000483166:exon_40738242_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000476266:exon_40738244_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000358335:exon_40738870_40739596:AKT2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 40929363 T/C 1 15 18 33 6.86479084636077 9.76225098436707 -2.8974601380063 T:C T C 10 0.542347276909282 0.382814318248809 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 40929390 C/T 1 20 12 32 9.15305446181436 6.50816732291138 2.64488713890298 T:C C T 10 0.542347276909282 0.379770381851715 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 40947448 A/G 1 16 9 25 7.32244356945149 4.88112549218354 2.44131807726795 A:G A G 10 0.542347276909282 0.422950604085886 ENSG00000167565:ENST00000322354:exon_40946749_40947993:SERTAD3;ENSG00000167565:ENST00000392028:exon_40946749_40947993:SERTAD3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 41096189 A/G 1 38 28 66 17.3908034774473 15.1857237534599 2.20507972398739 A:G A G 10 0.542347276909282 0.62271290280854 ENSG00000160410:ENST00000291842:exon_41096150_41096328:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000428635:exon_41096150_41096328:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000446701:exon_41096150_41096328:SHKBP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 41135475 G/A 1 50 40 90 22.8826361545359 21.6938910763713 1.18874507816462 A:G G A 10 0.542347276909282 0.83303640596069 ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41135301_41135725:LTBP4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 41265515 G/A 1 143 86 229 65.4443394019727 46.6418658141982 18.8024735877744 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0139751747868745 ENSG00000077312:ENST00000243563:exon_41265336_41265515:SNRPA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 41889748 T/C 1 25 15 40 11.441318077268 8.13520915363923 3.30610892362872 T:C T C 10 0.542347276909282 0.342352799716956 ENSG00000142046:ENST00000392002:exon_41889620_41889985:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000356385:exon_41889466_41889985:TMEM91 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 41903220 G/A 1 14 10 24 6.40713812327005 5.42347276909282 0.983665354177233 A:G G A 10 0.542347276909282 0.838276464959483 ENSG00000077348:ENST00000221233:exon_41903086_41903256:EXOSC5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 41916549 C/A 1 16 1 17 7.32244356945149 0.542347276909282 6.78009629254221 A:C C A 10 0.542347276909282 0.000825858559606364 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41916542_41916721:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000378196:exon_41916542_41916721:BCKDHA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 41928652 C/T 1 36 17 53 16.4754980312659 9.21990370745779 7.25559432380806 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0530593463619499 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41928534_41928675:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41928534_41928675:BCKDHA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 41930396 A/G 1 136 38 174 62.2407703403377 20.6091965225527 41.6315738177849 A:T:G A G 10 0.542347276909282 7.11250453064673e-11 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41930343_41930909:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41930343_41930906:BCKDHA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 41939297 C/G 1 8 8 16 3.66122178472574 4.33877821527426 -0.677556430548512 C:G C G 10 0.542347276909282 0.804712000972457 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41939177_41939339:ATP5SL HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 41944237 T/C 1 5 5 10 2.28826361545359 2.71173638454641 -0.42347276909282 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000301183:exon_41944123_41944319:ATP5SL HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 42626699 C/T 1 5 11 16 2.28826361545359 5.9658200460021 -3.67755643054851 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0797029297830089 ENSG00000028277:ENST00000389341:exon_42626663_42626728:POU2F2;ENSG00000028277:ENST00000342301:exon_42626663_42626728:POU2F2;ENSG00000028277:ENST00000292077:exon_42626663_42626728:POU2F2;ENSG00000028277:ENST00000533720:exon_42626663_42626728:POU2F2;ENSG00000028277:ENST00000526816:exon_42626663_42626728:POU2F2;ENSG00000028277:ENST00000529067:exon_42626663_42626728:POU2F2;ENSG00000028277:ENST00000534559:exon_42626663_42626728:POU2F2;ENSG00000028277:ENST00000529952:exon_42626663_42626728:POU2F2;ENSG00000028277:ENST00000530982:exon_42626663_42626732:POU2F2;ENSG00000028277:ENST00000531773:exon_42626663_42626728:POU2F2;ENSG00000028277:ENST00000524801:exon_42626663_42626728:POU2F2;ENSG00000028277:ENST00000532176:exon_42626663_42626728:POU2F2;ENSG00000028277:ENST00000526933:exon_42626663_42626732:POU2F2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 42738768 G/A 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 A:G G A 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000105723:ENST00000222330:exon_42738700_42738830:GSK3A;ENSG00000105723:ENST00000398249:exon_42738700_42738830:GSK3A;ENSG00000105723:ENST00000453535:exon_42738700_42738830:GSK3A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 44055726 T/C 1 9 15 24 4.11887450781646 8.13520915363923 -4.01633464582277 T:C T C 10 0.542347276909282 0.105846506377141 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44055723_44055839:XRCC1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 44057227 T/C 1 23 8 31 10.5260126310865 4.33877821527426 6.18723441581226 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0297457848466276 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44057134_44057243:XRCC1;ENSG00000073050:ENST00000458471:exon_44057134_44057243:XRCC1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 44501518 G/A 0 0 8 8 0 4.33877821527426 -4.33877821527426 A G A 10 0.542347276909282 0.00192436924076413 ENSG00000204920:ENST00000270014:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000407951:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000425747:exon_44500245_44502477:ZNF155 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 44611420 A/G 1 1 10 11 0.457652723090718 5.42347276909282 -4.9658200460021 A:G A G 10 0.542347276909282 0.00378312149267267 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 44612005 A/G 1 20 9 29 9.15305446181436 4.88112549218354 4.27192896963082 A:G A G 10 0.542347276909282 0.136155663592109 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 44612014 A/T 1 21 6 27 9.61070718490508 3.25408366145569 6.35662352344939 A:T A T 10 0.542347276909282 0.0187993970521193 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 44612231 A/G 1 24 11 35 10.9836653541772 5.9658200460021 5.01784530817513 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0927293859275427 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 45395714 T/C 1 29 18 47 13.2719289696308 9.76225098436707 3.50967798526375 T:C T C 10 0.542347276909282 0.379957013347406 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45395650_45395717:TOMM40 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 45396144 C/T 1 23 20 43 10.5260126310865 10.8469455381856 -0.320932907099126 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45396094_45396186:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45396094_45396186:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45396094_45396186:TOMM40 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 45574113 T/G 1 51 40 91 23.3402888776266 21.6938910763713 1.64639780125534 T:G T G 10 0.542347276909282 0.7533049852287 ENSG00000104859:ENST00000221455:exon_45574061_45574214:CLASRP;ENSG00000104859:ENST00000391953:exon_45574061_45574213:CLASRP;ENSG00000104859:ENST00000391952:exon_45574061_45574213:CLASRP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 45854919 T/G 1 25 13 38 11.441318077268 7.05051459982067 4.39080347744729 T:G T G 10 0.542347276909282 0.192457442943711 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45854853_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45854853_45854979:ERCC2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 45855524 G/A 1 32 26 58 14.644887138903 14.1010291996413 0.543857939261645 A:G G A 10 0.542347276909282 0.896189380795362 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45855467_45855610:ERCC2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 45912736 C/A 1 22 27 49 10.0683599079958 14.6433764765506 -4.57501656855482 A:C C A 10 0.542347276909282 0.199439528998939 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 45923653 A/G 1 27 32 59 12.3566235234494 17.355112861097 -4.99848933764764 A:G A G 10 0.542347276909282 0.194432236688200 ENSG00000012061:ENST00000300853:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000340192:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000428893:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000013807:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000391935:exon_45923582_45923685:ERCC1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 46057081 A/G 1 7 2 9 3.20356906163503 1.08469455381856 2.11887450781646 A:G A G 10 0.542347276909282 0.193758782140484 ENSG00000125741:ENST00000263275:exon_46052412_46057169:OPA3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 46319415 G/C 1 158 146 304 72.3091302483334 79.1827024287552 -6.87357218042172 T:C:G G C 10 0.542347276909282 0.454361726683061 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46319109_46319441:SYMPK HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 46878989 G/A 1 9 3 12 4.11887450781646 1.62704183072785 2.49183267708862 A:G G A 10 0.542347276909282 0.245685043790611 ENSG00000011485:ENST00000012443:exon_46878861_46879008:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000451918:exon_46878861_46879008:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000478046:exon_46878861_46879008:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000391919:exon_46878861_46879008:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000467902:exon_46878860_46879008:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000527193:exon_46878884_46879008:PPP5C HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 47124714 T/G 1 2 8 10 0.915305446181436 4.33877821527426 -3.42347276909282 T:G T G 10 0.542347276909282 0.0514322924239131 ENSG00000160013:ENST00000291294:exon_47123726_47124929:PTGIR HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 47137459 C/T 1 12 23 35 5.49183267708862 12.4739873689135 -6.98215469182487 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0259748967784608 ENSG00000167414:ENST00000300873:exon_47137333_47137461:GNG8 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 47195041 G/A 1 14 19 33 6.40713812327005 10.3045982612764 -3.8974601380063 A:G G A 10 0.542347276909282 0.220951345401981 ENSG00000105287:ENST00000454760:exon_47194992_47195064:PRKD2;ENSG00000105287:ENST00000449438:exon_47194992_47195064:PRKD2;ENSG00000105287:ENST00000433867:exon_47194992_47195064:PRKD2;ENSG00000105287:ENST00000291281:exon_47194992_47195064:PRKD2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 47258674 C/T 1 18 2 20 8.23774901563293 1.08469455381856 7.15305446181436 T:C C T 10 0.542347276909282 0.00109810920439079 ENSG00000181027:ENST00000391909:exon_47258669_47261832:FKRP;ENSG00000181027:ENST00000318584:exon_47258669_47261832:FKRP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 47278859 C/G 1 74 102 176 33.8663015087131 55.3194222447468 -21.4531207360336 C:G C G 10 0.542347276909282 0.00142002099483857 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47278140_47279004:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47278140_47279004:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47278142_47279004:SLC1A5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 47769839 A/G 1 8 6 14 3.66122178472574 3.25408366145569 0.407138123270053 A:G A G 10 0.542347276909282 1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 47770015 A/C 1 33 19 52 15.1025398619937 10.3045982612764 4.79794160071734 A:C A C 10 0.542347276909282 0.210808691388161 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47769868_47770049:CCDC9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 47774772 T/C 1 46 30 76 21.052025262173 16.2704183072785 4.78160695489457 T:C T C 10 0.542347276909282 0.300883619238672 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47774531_47775208:CCDC9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 47978671 G/A 1 29 22 51 13.2719289696308 11.9316400920042 1.34028887762662 A:G G A 10 0.542347276909282 0.779324597027643 ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47978400_47978801:KPTN HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 47980153 G/A 1 7 11 18 3.20356906163503 5.9658200460021 -2.76225098436708 A:G G A 10 0.542347276909282 0.238484579075496 ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47980060_47980195:KPTN HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 48205725 T/C 1 12 7 19 5.49183267708862 3.79643093836497 1.69540173872364 T:C T C 10 0.542347276909282 0.496030351825327 ENSG00000063169:ENST00000396720:exon_48204585_48206534:GLTSCR1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 48255804 A/G 1 311 301 612 142.329996881213 163.246530349694 -20.9165334684806 A:C:G A G 10 0.542347276909282 0.0961768331343878 ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48255769_48255864:GLTSCR2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 48949286 G/T 1 4 7 11 1.83061089236287 3.79643093836497 -1.9658200460021 T:G G T 10 0.542347276909282 0.364977036425421 ENSG00000105447:ENST00000253237:exon_48949062_48949449:GRWD1;ENSG00000105447:ENST00000430343:exon_48949251_48949449:GRWD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 49132634 G/A 1 7 5 12 3.20356906163503 2.71173638454641 0.491832677088616 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000063176:ENST00000406269:exon_49131938_49133661:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000245222:exon_49131938_49133661:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000340932:exon_49132118_49133030:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000443164:exon_49131938_49132983:SPHK2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 49376584 G/A 1 15 18 33 6.86479084636077 9.76225098436707 -2.8974601380063 A:G G A 10 0.542347276909282 0.382814318248809 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 49377319 A/G 1 86 93 179 39.3581341858018 50.4382967525632 -11.0801625667615 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0992648218259782 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 49377424 G/A 1 115 90 205 52.6300631554326 48.8112549218354 3.8188082335972 A:G G A 10 0.542347276909282 0.623932863511095 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 49377436 G/C 1 125 85 210 57.2065903863398 46.099518537289 11.1070718490508 C:G G C 10 0.542347276909282 0.127991456693553 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 49377873 G/A 1 216 218 434 98.8529881875951 118.231706366223 -19.3787181786284 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0670492108065542 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 49377918 G/T 1 194 202 396 88.7846282795993 109.554149935675 -20.7695216560757 A:T:G G T 10 0.542347276909282 0.0385877247473055 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 49378994 A/G 1 201 202 403 91.9881973412343 109.554149935675 -17.5659525944406 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0803138325167658 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 49379167 C/T 1 266 241 507 121.735624342131 130.705693735137 -8.97006939300596 T:C C T 10 0.542347276909282 0.422863949899889 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 49379182 G/C 1 301 251 552 137.753469650306 136.12916650423 1.62430314607636 A:C:G G C 10 0.542347276909282 0.89811028412804 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 49407660 G/A 1 20 8 28 9.15305446181436 4.33877821527426 4.8142762465401 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0867776635097732 ENSG00000104805:ENST00000405315:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000407032:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000452087:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000443560:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000411700:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000451312:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000263273:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000424608:exon_49407604_49407711:NUCB1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 49468844 C/A 1 2187 2110 4297 1000.8865053994 1144.35275427859 -143.466248879185 A:T:C:G C A 10 0.542347276909282 1.18609226929215e-05 ENSG00000087086:ENST00000331825:exon_49468566_49468866:FTL HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 49469087 T/C 1 1920 2286 4206 878.693228334179 1239.80587501462 -361.11264668044 A:T:C T C 10 0.542347276909282 8.16361735437198e-29 ENSG00000087086:ENST00000331825:exon_49469027_49469173:FTL HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 49507487 A/G 1 2 13 15 0.915305446181436 7.05051459982067 -6.13520915363923 A:G A G 10 0.542347276909282 0.00144844333229881 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 49841203 G/A 1 370 287 657 169.331507543566 155.653668472964 13.6778390706017 A:G G A 10 0.542347276909282 0.290605260000889 ENSG00000104894:ENST00000323906:exon_49841182_49841286:CD37;ENSG00000104894:ENST00000426897:exon_49841182_49841286:CD37 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 49983673 C/T 1 10 12 22 4.57652723090718 6.50816732291138 -1.9316400920042 T:C C T 10 0.542347276909282 0.521952741110209 ENSG00000090554:ENST00000204637:exon_49983555_49983733:FLT3LG;ENSG00000090554:ENST00000436815:exon_49983555_49983733:FLT3LG HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 49994470 T/A 1 6 3 9 2.74591633854431 1.62704183072785 1.11887450781646 A:T T A 10 0.542347276909282 0.521783447682374 ENSG00000142541:ENST00000488946:exon_49993107_49994804:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000472481:exon_49994036_49994485:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476268:exon_49993104_49994523:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000468655:exon_49994297_49994483:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476300:exon_49994297_49994804:RPL13A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 50045878 C/T 1 2 6 8 0.915305446181436 3.25408366145569 -2.33877821527426 T:C C T 10 0.542347276909282 0.153857012176102 ENSG00000142552:ENST00000270645:exon_50045810_50046009:RCN3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 50187159 C/T 1 5 10 15 2.28826361545359 5.42347276909282 -3.13520915363923 T:C C T 10 0.542347276909282 0.123431676383676 ENSG00000126457:ENST00000529650:exon_50186892_50187326:PRMT1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 50189818 G/C 1 2 6 8 0.915305446181436 3.25408366145569 -2.33877821527426 C:G G C 10 0.542347276909282 0.153857012176102 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 50386140 C/T 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 T:C C T 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50386021_50386149:TBC1D17 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 50399352 G/A 1 11 4 15 5.0341799539979 2.16938910763713 2.86479084636077 A:G G A 10 0.542347276909282 0.194935449270639 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 50862768 C/T 1 17 10 27 7.78009629254221 5.42347276909282 2.35662352344939 T:C C T 10 0.542347276909282 0.441442400372166 ENSG00000131400:ENST00000253719:exon_50862760_50862904:NAPSA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 50863023 A/G 1 5 11 16 2.28826361545359 5.9658200460021 -3.67755643054851 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0797029297830089 ENSG00000131400:ENST00000253719:exon_50862997_50863119:NAPSA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 50926264 T/C 1 20 14 34 9.15305446181436 7.59286187672995 1.56019258508441 A:T:C T C 10 0.542347276909282 0.611056361968544 ENSG00000142539:ENST00000270632:exon_50926080_50926294:SPIB;ENSG00000142539:ENST00000417618:exon_50926080_50926294:SPIB HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 50967686 G/A 1 15 3 18 6.86479084636077 1.62704183072785 5.23774901563292 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0160615772044385 ENSG00000086967:ENST00000357701:exon_50967603_50967789:MYBPC2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 51323232 T/C 1 115 141 256 52.6300631554326 76.4709660442088 -23.8409028887762 T:C:G T C 10 0.542347276909282 0.00313405846635538 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323155_51323291:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323155_51323291:KLK1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 51323473 C/G 1 96 83 179 43.9346614167089 45.0148239834704 -1.08016256676147 C:G C G 10 0.542347276909282 0.880985855653472 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 51323501 A/G 1 108 88 196 49.4264940937975 47.7265603680168 1.69993372578073 A:G A G 10 0.542347276909282 0.82998876829319 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 51850290 G/A 1 116 126 242 53.0877158785233 68.3357568905695 -15.2480410120462 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0528455752441748 ENSG00000105379:ENST00000309244:exon_51850154_51850312:ETFB;ENSG00000105379:ENST00000354232:exon_51850154_51850312:ETFB HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 53577419 G/C 1 6 2 8 2.74591633854431 1.08469455381856 1.66122178472574 C:G G C 10 0.542347276909282 0.303100337321114 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000355147:exon_53577393_53577521:ZNF160 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 53959804 T/C 1 6 3 9 2.74591633854431 1.62704183072785 1.11887450781646 T:C T C 10 0.542347276909282 0.521783447682374 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 54080144 A/G 0 0 28 28 0 15.1857237534599 -15.1857237534599 G A G 10 0.542347276909282 3.12614719332408e-10 ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000514022:exon_54079951_54080314:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000505949:exon_54079951_54080346:ZNF331 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 54711329 C/T 1 2764 2931 5695 1264.95212662274 1589.61986862111 -324.667741998361 T:C:G C T 10 0.542347276909282 7.09631922432526e-18 ENSG00000170889:ENST00000302907:exon_54711266_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000436445:exon_54711266_54711390:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000391752:exon_54711266_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000402367:exon_54710421_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000445961:exon_54711266_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000391751:exon_54711266_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000495002:exon_54711266_54711512:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000391753:exon_54711266_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000441429:exon_54710144_54711498:RPS9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 54848684 G/A 1 9 13 22 4.11887450781646 7.05051459982067 -2.9316400920042 A:G G A 10 0.542347276909282 0.284538813785442 ENSG00000239961:ENST00000291759:exon_54848671_54848967:LILRA4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 55176262 A/G 1 9 4 13 4.11887450781646 2.16938910763713 1.94948540017933 A:G A G 10 0.542347276909282 0.405355588189296 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55176250_55176300:LILRB4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 55178162 A/G 1 19 20 39 8.69540173872364 10.8469455381856 -2.151543799462 A:G A G 10 0.542347276909282 0.522925829957413 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000484241:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000470943:exon_55178145_55178841:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000461262:exon_55178148_55178489:LILRB4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 58018618 A/G 1 16 3 19 7.32244356945149 1.62704183072785 5.69540173872364 A:G A G 10 0.542347276909282 0.00982461460867373 ENSG00000152439:ENST00000282292:exon_58017726_58019508:ZNF773;ENSG00000152439:ENST00000430084:exon_58017726_58019508:ZNF773 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 58231807 A/G 1 10 4 14 4.57652723090718 2.16938910763713 2.40713812327005 A:G A G 10 0.542347276909282 0.284052688317237 ENSG00000083814:ENST00000317398:exon_58231120_58233065:ZNF671;ENSG00000083814:ENST00000335820:exon_58231782_58231850:ZNF671 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 58453342 T/C 1 4 5 9 1.83061089236287 2.71173638454641 -0.881125492183538 T:C T C 10 0.542347276909282 0.74064055507759 ENSG00000152454:ENST00000282308:exon_58452206_58454015:ZNF256 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 59010593 A/G 1 10 3 13 4.57652723090718 1.62704183072785 2.94948540017933 A:T:G A G 10 0.542347276909282 0.161807814900871 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 19 59059729 G/A 1 104 95 199 47.5958832014347 51.5229913063818 -3.92710810494712 A:G G A 10 0.542347276909282 0.618590949180071 ENSG00000130726:ENST00000341753:exon_59059661_59059775:TRIM28;ENSG00000130726:ENST00000253024:exon_59059661_59059775:TRIM28 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 277003 A/G 1 78 75 153 35.696912401076 40.6760457681961 -4.97913336712014 A:G A G 10 0.542347276909282 0.418689156128288 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000442386:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000484464:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000463831:exon_276980_277085:ACP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 277314 G/A 1 162 139 301 74.1397411406963 75.3862714903902 -1.24653034969388 A:G G A 10 0.542347276909282 0.907946980996656 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_277227_278283:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_277227_278283:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_277227_277506:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_277227_277503:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_277227_277375:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000484464:exon_277227_277369:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000463831:exon_277227_277506:ACP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 3392075 T/C 1 8 12 20 3.66122178472574 6.50816732291138 -2.84694553818564 T:C T C 10 0.542347276909282 0.262141543180323 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 3481531 T/C 1 16 15 31 7.32244356945149 8.13520915363923 -0.812765584187741 T:C T C 10 0.542347276909282 0.857515868420013 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3481466_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3481463_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3481466_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3481463_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3481466_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000473348:exon_3481466_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000461577:exon_3481466_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000489032:exon_3481466_3481872:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000437733:exon_3481466_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469400:exon_3481466_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000452495:exon_3481486_3481566:TTC15 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 3627648 G/C 1 4 6 10 1.83061089236287 3.25408366145569 -1.42347276909282 C:G G C 10 0.542347276909282 0.528168739719971 ENSG00000171863:ENST00000481006:exon_3623407_3628508:RPS7;ENSG00000171863:ENST00000472966:exon_3627409_3627850:RPS7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 8822266 C/T 1 17 12 29 7.78009629254221 6.50816732291138 1.27192896963082 T:C C T 10 0.542347276909282 0.71141507189304 ENSG00000115738:ENST00000234091:exon_8821984_8822643:ID2;ENSG00000115738:ENST00000396290:exon_8822113_8822643:ID2;ENSG00000115738:ENST00000331129:exon_8822186_8822643:ID2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 10262920 T/G 1 10 8 18 4.57652723090718 4.33877821527426 0.237749015632924 T:G T G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000171848:ENST00000304567:exon_10262455_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000360566:exon_10262455_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000459969:exon_10262839_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000461327:exon_10262866_10263184:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000498343:exon_10262866_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000463887:exon_10262866_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000491447:exon_10262879_10263024:RRM2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 15747393 C/T 1 5 4 9 2.28826361545359 2.16938910763713 0.118874507816462 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000079785:ENST00000381341:exon_15747299_15747437:DDX1;ENSG00000079785:ENST00000233084:exon_15747299_15747437:DDX1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 20240668 C/A 1 16 12 28 7.32244356945149 6.50816732291138 0.814276246540105 A:C C A 10 0.542347276909282 0.850551515853368 ENSG00000068697:ENST00000175091:exon_20240652_20240772:LAPTM4A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 24426534 A/G 1 6 4 10 2.74591633854431 2.16938910763713 0.57652723090718 A:G A G 10 0.542347276909282 0.762606887543924 ENSG00000198399:ENST00000478720:exon_24425733_24427287:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24425733_24426652:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24425733_24426652:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24425735_24426652:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24425735_24426652:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24425735_24426652:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24425735_24426652:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000427234:exon_24426151_24426652:ITSN2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 24521493 C/T 1 10 9 19 4.57652723090718 4.88112549218354 -0.304598261276357 T:C C T 10 0.542347276909282 1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 26414438 A/G 1 243 268 511 111.209611711044 145.349070211688 -34.1394585006431 A:T:G A G 10 0.542347276909282 0.00252231261415139 ENSG00000084754:ENST00000380649:exon_26414352_26414497:HADHA;ENSG00000084754:ENST00000492433:exon_26414204_26414497:HADHA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 27462076 C/T 1 7 12 19 3.20356906163503 6.50816732291138 -3.30459826127636 T:C C T 10 0.542347276909282 0.166892980214950 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27461910_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27461910_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000456311:exon_27461986_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000487239:exon_27462020_27462100:CAD HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 27466368 C/T 1 74 69 143 33.8663015087131 37.4219621067405 -3.55566059802732 T:C C T 10 0.542347276909282 0.557941902674565 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27466284_27466660:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27466284_27466653:CAD;ENSG00000084774:ENST00000428460:exon_27466284_27466458:CAD HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 27550967 A/G 1 11 12 23 5.0341799539979 6.50816732291138 -1.47398736891348 A:G A G 10 0.542347276909282 0.539417094228368 ENSG00000115207:ENST00000359541:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000457098:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000264720:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000452160:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000495298:exon_27550904_27551357:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000454704:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000415683:exon_27550904_27551056:GTF3C2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 27667297 A/G 1 3 6 9 1.37295816927215 3.25408366145569 -1.88112549218354 A:G A G 10 0.542347276909282 0.31687860521519 ENSG00000138002:ENST00000260570:exon_27667238_27667388:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000509128:exon_27667244_27667388:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000507184:exon_27667265_27667388:IFT172 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 29152456 A/G 1 16 9 25 7.32244356945149 4.88112549218354 2.44131807726795 A:G A G 10 0.542347276909282 0.422950604085886 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29152445_29152576:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000466067:exon_29152445_29152576:WDR43 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 29169612 T/C 1 145 162 307 66.3596448481541 87.8602588593037 -21.5006140111496 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0160019950788871 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29169466_29171088:WDR43 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 32800422 C/G 1 8 7 15 3.66122178472574 3.79643093836497 -0.135209153639229 C:G C G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32800223_32800433:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32800223_32800433:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000471232:exon_32800223_32800433:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000470250:exon_32800358_32800433:BIRC6 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 32983526 C/T 1 6 2 8 2.74591633854431 1.08469455381856 1.66122178472574 T:C C T 10 0.542347276909282 0.303100337321114 ENSG00000018699:ENST00000317907:exon_32983359_32983586:TTC27;ENSG00000018699:ENST00000433416:exon_32983359_32983586:TTC27 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 36810586 T/C 1 4 5 9 1.83061089236287 2.71173638454641 -0.881125492183538 T:C T C 10 0.542347276909282 0.74064055507759 ENSG00000171055:ENST00000305852:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000413938:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000379245:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000405912:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000451623:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000464964:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000357996:exon_36810496_36810612:FEZ2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 37319156 A/C 1 31 36 67 14.1872344158123 19.5245019687341 -5.33726755292189 A:C A C 10 0.542347276909282 0.220136685004510 ENSG00000152133:ENST00000409774:exon_37319059_37319179:CCDC75;ENSG00000152133:ENST00000379187:exon_37319059_37319179:CCDC75;ENSG00000152133:ENST00000281932:exon_37319059_37319179:CCDC75;ENSG00000152133:ENST00000473067:exon_37319059_37319179:CCDC75;ENSG00000152133:ENST00000379184:exon_37319059_37319179:CCDC75 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 37323427 A/G 1 12 14 26 5.49183267708862 7.59286187672995 -2.10102919964133 A:G A G 10 0.542347276909282 0.436359538530528 ENSG00000152133:ENST00000409774:exon_37323351_37326387:CCDC75;ENSG00000152133:ENST00000379187:exon_37323351_37323738:CCDC75;ENSG00000152133:ENST00000281932:exon_37323351_37326387:CCDC75;ENSG00000152133:ENST00000379184:exon_37323351_37323738:CCDC75 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 37438993 G/A 1 126 71 197 57.6642431094305 38.506656660559 19.1575864488715 A:G G A 10 0.542347276909282 0.00648000192498526 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37438986_37439182:CEBPZ;ENSG00000115816:ENST00000489306:exon_37438986_37439251:CEBPZ HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 37458711 G/A 1 20 14 34 9.15305446181436 7.59286187672995 1.56019258508441 A:G G A 10 0.542347276909282 0.611056361968544 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37458555_37458856:CEBPZ HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 42990336 T/G 1 7 9 16 3.20356906163503 4.88112549218354 -1.67755643054851 T:G T G 10 0.542347276909282 0.457321849303075 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 44036913 T/C 1 11 7 18 5.0341799539979 3.79643093836497 1.23774901563292 T:C T C 10 0.542347276909282 0.640760652032418 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 45640374 C/A 1 6 3 9 2.74591633854431 1.62704183072785 1.11887450781646 A:C C A 10 0.542347276909282 0.521783447682374 ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45640253_45640432:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45640253_45640432:SRBD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 45645512 C/T 1 9 4 13 4.11887450781646 2.16938910763713 1.94948540017933 T:C C T 10 0.542347276909282 0.405355588189296 ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45645504_45645680:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45645504_45645680:SRBD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 47301029 A/G 1 12 13 25 5.49183267708862 7.05051459982067 -1.55868192273205 A:G A G 10 0.542347276909282 0.55306538240066 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47300841_47301187:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47300841_47302463:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47300841_47301062:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47300841_47303276:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47300841_47302696:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47300841_47302463:TTC7A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 47707970 T/C 1 31 27 58 14.1872344158123 14.6433764765506 -0.456142060738355 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000095002:ENST00000233146:exon_47707835_47708010:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000394794:exon_47707835_47708010:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000406134:exon_47707835_47708010:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000419559:exon_47707835_47708010:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000432737:exon_47707835_47708010:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000453755:exon_47707835_47708010:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000448533:exon_47707835_47708010:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000394792:exon_47707835_47708010:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000413880:exon_47707835_47708010:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000461394:exon_47707936_47708010:MSH2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 54035508 G/C 1 5 4 9 2.28826361545359 2.16938910763713 0.118874507816462 C:G G C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000068912:ENST00000405123:exon_54035436_54035597:ERLEC1;ENSG00000068912:ENST00000185150:exon_54035436_54035597:ERLEC1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 54886347 G/A 1 8 6 14 3.66122178472574 3.25408366145569 0.407138123270053 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000496323:exon_54886291_54886403:SPTBN1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 55277226 C/T 1 5 11 16 2.28826361545359 5.9658200460021 -3.67755643054851 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0797029297830089 ENSG00000115310:ENST00000337526:exon_55276881_55277680:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000317610:exon_55276881_55277680:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000357732:exon_55276881_55277680:RTN4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 58316814 A/G 1 7 6 13 3.20356906163503 3.25408366145569 -0.0505145998206653 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000028116:ENST00000435505:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000417641:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000412104:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000423109:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000394539:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000437272:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000340157:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000432057:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000440705:exon_58316766_58316858:VRK2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 58388696 A/G 1 20 25 45 9.15305446181436 13.558681922732 -4.40562746091769 A:G A G 10 0.542347276909282 0.231079815860213 ENSG00000115392:ENST00000403295:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000233741:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000402135:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000403676:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000449070:exon_58388657_58388773:FANCL HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 61175312 T/C 1 6 5 11 2.74591633854431 2.71173638454641 0.0341799539978984 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000162927:ENST00000316752:exon_61175178_61175320:PUS10;ENSG00000162927:ENST00000407787:exon_61175178_61175320:PUS10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 61415492 A/G 1 39 38 77 17.848456200538 20.6091965225527 -2.76074032201471 A:C:G A G 10 0.542347276909282 0.568103082046756 ENSG00000173209:ENST00000403692:exon_61415044_61416060:AHSA2;ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398569:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000263989:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000411912:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000436269:exon_61414685_61415844:USP34 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 61450454 A/G 1 6 4 10 2.74591633854431 2.16938910763713 0.57652723090718 A:G A G 10 0.542347276909282 0.762606887543924 ENSG00000115464:ENST00000487547:exon_61450383_61450796:USP34 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 62100380 G/T 1 88 75 163 40.2734396319832 40.6760457681961 -0.40260613621296 T:G G T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000115484:ENST00000394440:exon_62100332_62100428:CCT4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 65245365 G/A 1 5 11 16 2.28826361545359 5.9658200460021 -3.67755643054851 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0797029297830089 ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65245205_65245399:SLC1A4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 65248271 G/A 1 13 11 24 5.94948540017933 5.9658200460021 -0.0163346458227673 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65248046_65250997:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65248046_65248528:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65248046_65250999:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65248046_65250997:SLC1A4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 65298839 A/G 1 11 13 24 5.0341799539979 7.05051459982067 -2.01633464582277 A:G A G 10 0.542347276909282 0.420883833529693 ENSG00000011523:ENST00000475851:exon_65298588_65298978:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000260569:exon_65298588_65299703:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000497039:exon_65297863_65299703:CEP68 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 65299766 T/C 1 9 6 15 4.11887450781646 3.25408366145569 0.864790846360771 T:C T C 10 0.542347276909282 0.797455423618976 ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 67632214 C/T 1 3 5 8 1.37295816927215 2.71173638454641 -1.33877821527426 T:C C T 10 0.542347276909282 0.482450044879903 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1;ENSG00000143971:ENST00000462772:exon_67632129_67632467:ETAA1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 68385097 A/G 1 3 8 11 1.37295816927215 4.33877821527426 -2.9658200460021 A:G A G 10 0.542347276909282 0.126534045746447 ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68384928_68385254:PPP3R1;ENSG00000115946:ENST00000263657:exon_68384976_68385273:PNO1;ENSG00000115946:ENST00000430742:exon_68385049_68385273:PNO1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 68622952 G/C 1 12 16 28 5.49183267708862 8.67755643054851 -3.18572375345989 C:G G C 10 0.542347276909282 0.257570341314235 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 70524577 G/A 1 51 60 111 23.3402888776266 32.5408366145569 -9.2005477369303 A:G G A 10 0.542347276909282 0.086451584666736 ENSG00000035141:ENST00000037869:exon_70523107_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000460307:exon_70523108_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000450256:exon_70524143_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000430566:exon_70524308_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000438759:exon_70524558_70524609:FAM136A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 71299785 A/G 1 29 18 47 13.2719289696308 9.76225098436707 3.50967798526375 A:G A G 10 0.542347276909282 0.379957013347406 ENSG00000124357:ENST00000434004:exon_71299771_71299875:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000455662:exon_71299771_71299881:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000244204:exon_71299771_71299881:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000531934:exon_71299771_71299881:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000455197:exon_71299771_71299881:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000418807:exon_71299771_71299881:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443872:exon_71299771_71299881:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443938:exon_71299771_71299881:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000484984:exon_71299771_71300261:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000493102:exon_71299771_71299881:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000450272:exon_71299771_71299881:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000475709:exon_71299771_71299881:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000533981:exon_71299771_71299820:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000472519:exon_71299771_71300724:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000489309:exon_71299771_71300724:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000428360:exon_71299709_71299870:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524736:exon_71299771_71299881:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000479854:exon_71299771_71299881:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000529236:exon_71299771_71299881:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000478659:exon_71299415_71299881:NAGK HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 71304738 G/A 1 127 96 223 58.1218958325212 52.0653385832911 6.05655724923012 A:G G A 10 0.542347276909282 0.420976056709998 ENSG00000124357:ENST00000455662:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000244204:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000418807:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443872:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443938:exon_71304700_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000450272:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000475709:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000472519:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000489309:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524736:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524537:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000490998:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000468601:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000498022:exon_71304661_71304766:NAGK HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 71305456 C/T 1 140 109 249 64.0713812327005 59.1158531831117 4.95552804958879 A:T:C C T 10 0.542347276909282 0.567150512477494 ENSG00000124357:ENST00000455662:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000244204:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000418807:exon_71305448_71306935:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443872:exon_71305448_71305715:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443938:exon_71305448_71305771:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000450272:exon_71305448_71305743:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000475709:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000472519:exon_71305448_71305750:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000489309:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524537:exon_71305448_71305763:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000490998:exon_71305448_71305769:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000468601:exon_71305448_71305484:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000498022:exon_71305448_71305765:NAGK HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 71654175 G/A 1 25 32 57 11.441318077268 17.355112861097 -5.91379478382907 A:G G A 10 0.542347276909282 0.143067207242883 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71653980_71654544:ZNF638 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 73461483 C/A 1 16 35 51 7.32244356945149 18.9821546918249 -11.6597111223734 A:C C A 10 0.542347276909282 0.0011197753295889 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73461366_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000461290:exon_73461397_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000464397:exon_73461435_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000399032:exon_73461436_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73461436_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000480489:exon_73461437_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409924:exon_73461437_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73461448_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000473786:exon_73461464_73461512:CCT7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 73478461 A/T 1 235 209 444 107.548389926319 113.35058087404 -5.8021909477212 A:T A T 10 0.542347276909282 0.600424299134737 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73478354_73478560:CCT7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 74690039 G/A 1 16 4 20 7.32244356945149 2.16938910763713 5.15305446181436 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0237668853151301 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74688184_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74688185_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000409065:exon_74688196_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74688197_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74689123_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74689902_74690139:MOGS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 74690378 C/T 1 22 11 33 10.0683599079958 5.9658200460021 4.1025398619937 T:C C T 10 0.542347276909282 0.165584194737827 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74690317_74690773:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000489655:exon_74690317_74690764:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000414701:exon_74690317_74690513:MOGS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 74699778 C/A 1 282 194 476 129.058067911582 105.215371720401 23.8426961911818 A:C C A 10 0.542347276909282 0.0305211679578136 ENSG00000204822:ENST00000258105:exon_74699696_74700449:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000409710:exon_74699696_74699814:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000468875:exon_74699696_74699791:MRPL53;ENSG00000135637:ENST00000454193:exon_74699696_74699923:CCDC142 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 85273416 C/T 1 10 8 18 4.57652723090718 4.33877821527426 0.237749015632924 T:C C T 10 0.542347276909282 1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 85786074 G/A 1 25 27 52 11.441318077268 14.6433764765506 -3.20205839928266 A:G G A 10 0.542347276909282 0.405182333655243 ENSG00000115486:ENST00000233838:exon_85786040_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000430215:exon_85786040_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000423570:exon_85786069_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000428479:exon_85786040_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000421496:exon_85786069_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000481541:exon_85785707_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000496962:exon_85785848_85786198:GGCX HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 86831051 C/A 1 29 30 59 13.2719289696308 16.2704183072785 -2.99848933764764 A:C C A 10 0.542347276909282 0.436715417387203 ENSG00000239305:ENST00000237455:exon_86830516_86832541:RNF103;ENSG00000239305:ENST00000472030:exon_86830523_86832541:RNF103 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 88327576 T/C 1 87 114 201 39.8157869088925 61.8275895676581 -22.0118026587657 T:C T C 10 0.542347276909282 0.00225484052053141 ENSG00000172086:ENST00000347055:exon_88326724_88328104:KRCC1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 89157083 C/G 1 3562 4240 7802 1630.15899964914 2299.55245409536 -669.393454446218 A:T:C:G C G 10 0.542347276909282 5.46902261820195e-52 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 89160049 T/C 0 16 0 16 7.32244356945149 0 7.32244356945149 T T 10 0.542347276909282 5.97356225483807e-05 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 89160056 A/G 0 15 0 15 6.86479084636077 0 6.86479084636077 A A 10 0.542347276909282 0.000111406380382167 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 89160076 T/C 0 14 0 14 6.40713812327005 0 6.40713812327005 T T 10 0.542347276909282 0.000208176314900326 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 89160080 G/A 1 11 119 130 5.0341799539979 64.5393259522045 -59.5051459982067 A:G G A 10 0.542347276909282 1.57268639842458e-28 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 89160134 T/A 1 5 62 67 2.28826361545359 33.6255311683755 -31.3372675529219 A:T:G T A 10 0.542347276909282 5.26128306061797e-16 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 89160742 C/T 1 1803 9 1812 825.147859732565 4.88112549218354 820.266734240381 T:C C T 10 0.542347276909282 0 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 97749730 G/T 1 49 42 91 22.4249834314452 22.7785856301898 -0.353602198744657 T:G G T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000144199:ENST00000443258:exon_97749685_97749772:FAHD2B;ENSG00000144199:ENST00000467292:exon_97749685_97749772:FAHD2B;ENSG00000144199:ENST00000483000:exon_97749685_97749772:FAHD2B;ENSG00000144199:ENST00000414820:exon_97749685_97749772:FAHD2B;ENSG00000144199:ENST00000272610:exon_97749685_97749772:FAHD2B;ENSG00000144199:ENST00000474849:exon_97749627_97750014:FAHD2B;ENSG00000144199:ENST00000463096:exon_97749667_97749772:FAHD2B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 99778985 T/C 1 13 5 18 5.94948540017933 2.71173638454641 3.23774901563292 T:C T C 10 0.542347276909282 0.157464330321861 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 99779131 T/C 1 20 12 32 9.15305446181436 6.50816732291138 2.64488713890298 T:C T C 10 0.542347276909282 0.379770381851715 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 99804642 T/C 1 9 13 22 4.11887450781646 7.05051459982067 -2.9316400920042 T:C T C 10 0.542347276909282 0.284538813785442 ENSG00000241962:ENST00000424491:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000512183:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308656:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308644:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000509871:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000185414:ENST00000410042:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000338148:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000473743:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000449429:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409145:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409841:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000476721:exon_99804640_99804720:MRPL30 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 99812070 G/A 1 14 10 24 6.40713812327005 5.42347276909282 0.983665354177233 A:G G A 10 0.542347276909282 0.838276464959483 ENSG00000241962:ENST00000424491:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000512183:exon_99812036_99814089:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308656:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308644:exon_99812036_99813896:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000509871:exon_99812036_99812286:C2orf15;ENSG00000185414:ENST00000338148:exon_99812036_99814089:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000465432:exon_99812036_99812485:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409841:exon_99812036_99812286:MRPL30 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 99995804 T/C 1 85 93 178 38.900481462711 50.4382967525632 -11.5378152898522 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0840587417923255 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995781_99995891:EIF5B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 100019496 A/G 1 29 15 44 13.2719289696308 8.13520915363923 5.13671981599159 A:G A G 10 0.542347276909282 0.131794666385203 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465086:exon_100019352_100019893:REV1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 100022772 T/C 1 17 21 38 7.78009629254221 11.3892928150949 -3.60919652255271 T:C T C 10 0.542347276909282 0.257482687908739 ENSG00000135945:ENST00000485487:exon_100022372_100022815:REV1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 100055506 A/G 1 16 18 34 7.32244356945149 9.76225098436707 -2.43980741491559 A:G A G 10 0.542347276909282 0.491743950057185 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100055036_100055772:REV1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 101635538 C/T 1 38 5 43 17.3908034774473 2.71173638454641 14.6790670929009 T:C C T 10 0.542347276909282 3.55249685629839e-06 ENSG00000071082:ENST00000409028:exon_101635460_101636078:RPL31 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 101874442 C/T 1 8 5 13 3.66122178472574 2.71173638454641 0.949485400179334 T:C C T 10 0.542347276909282 0.782391509721688 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 105665808 C/T 1 15 6 21 6.86479084636077 3.25408366145569 3.61070718490508 T:C C T 10 0.542347276909282 0.129075031311654 ENSG00000135972:ENST00000258455:exon_105665629_105665808:MRPS9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 105705507 C/T 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 T:C C T 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000135972:ENST00000258455:exon_105705442_105705527:MRPS9;ENSG00000135972:ENST00000413583:exon_105705476_105705527:MRPS9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 105713697 A/G 1 59 62 121 27.0015106623524 33.6255311683755 -6.62402050602312 A:C:G A G 10 0.542347276909282 0.236423608788971 ENSG00000135972:ENST00000258455:exon_105713613_105713782:MRPS9;ENSG00000135972:ENST00000413583:exon_105713613_105713746:MRPS9;ENSG00000135972:ENST00000472220:exon_105713613_105713782:MRPS9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 109086814 A/G 1 15 9 24 6.86479084636077 4.88112549218354 1.98366535417723 A:G A G 10 0.542347276909282 0.539851636806923 ENSG00000135968:ENST00000435553:exon_109086107_109087128:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000409325:exon_109086107_109088572:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000309863:exon_109086107_109088572:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000482325:exon_109086107_109088572:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000409896:exon_109086107_109088572:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393318:exon_109086107_109088572:GCC2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 109405384 A/G 1 5 6 11 2.28826361545359 3.25408366145569 -0.965820046002102 A:G A G 10 0.542347276909282 0.564156977749346 ENSG00000163006:ENST00000412964:exon_109405308_109405422:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000409529:exon_109405308_109405422:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000295124:exon_109405308_109405422:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000470608:exon_109405308_109405422:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000447782:exon_109405308_109405422:CCDC138 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 113956371 G/C 1 9 5 14 4.11887450781646 2.71173638454641 1.40713812327005 C:G G C 10 0.542347276909282 0.594287862477072 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000460725:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000465592:exon_113956317_113956407:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000464559:exon_113956135_113956803:PSD4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 118575215 C/G 1 275 209 484 125.854498849947 113.35058087404 12.5039179759075 T:C:G C G 10 0.542347276909282 0.273567321554676 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118575020_118575304:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000474694:exon_118575020_118575304:DDX18 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 118583940 C/T 1 12 9 21 5.49183267708862 4.88112549218354 0.610707184905079 T:C C T 10 0.542347276909282 0.83023905970592 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118583845_118583958:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000415038:exon_118583845_118583958:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000476149:exon_118583845_118587042:DDX18 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 120078778 T/C 1 4 5 9 1.83061089236287 2.71173638454641 -0.881125492183538 T:C T C 10 0.542347276909282 0.74064055507759 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000414534:exon_120078745_120078780:C2orf76 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 121043650 C/T 1 4 10 14 1.83061089236287 5.42347276909282 -3.59286187672995 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0629725562793592 ENSG00000144118:ENST00000447591:exon_121043450_121043658:RALB;ENSG00000144118:ENST00000272519:exon_121043450_121043658:RALB;ENSG00000144118:ENST00000420510:exon_121043450_121043658:RALB;ENSG00000144118:ENST00000431732:exon_121043450_121043658:RALB;ENSG00000144118:ENST00000470417:exon_121043643_121043658:RALB;ENSG00000144118:ENST00000412383:exon_121043450_121043658:RALB;ENSG00000144118:ENST00000449649:exon_121043450_121043658:RALB;ENSG00000144118:ENST00000404963:exon_121043450_121043658:RALB HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 127826533 A/G 1 6 10 16 2.74591633854431 5.42347276909282 -2.67755643054851 A:G A G 10 0.542347276909282 0.213548421391003 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127826500_127826607:BIN1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 128939817 G/A 1 3 11 14 1.37295816927215 5.9658200460021 -4.59286187672995 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0157225713748629 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128939704_128939864:UGGT1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 136511817 A/G 1 81 82 163 37.0698705703482 44.4724767065611 -7.40260613621297 A:G A G 10 0.542347276909282 0.271078316513201 ENSG00000144224:ENST00000272638:exon_136511729_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000416538:exon_136511109_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000470687:exon_136511729_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000490163:exon_136511722_136511847:UBXN4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 152132130 A/G 1 52 53 105 23.7979416007173 28.7444056761919 -4.94646407547461 A:G A G 10 0.542347276909282 0.378141011108561 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152131998_152132184:NMI HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 152139416 G/A 1 6 5 11 2.74591633854431 2.71173638454641 0.0341799539978984 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000491771:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000414946:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000477072:exon_152139285_152139468:NMI HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 163124051 C/T 1 156 139 295 71.393824802152 75.3862714903902 -3.99244668823819 T:C C T 10 0.542347276909282 0.640743198295044 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163123989_163124079:IFIH1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 163128824 T/C 1 51 35 86 23.3402888776266 18.9821546918249 4.35813418580175 T:C T C 10 0.542347276909282 0.387057905243417 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163128736_163128897:IFIH1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 171822576 C/T 1 48 69 117 21.9673307083545 37.4219621067405 -15.454631398386 T:C C T 10 0.542347276909282 0.00516276171842461 ENSG00000115806:ENST00000234160:exon_171822300_171823639:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000424423:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000442798:exon_171822300_171823133:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000452526:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000486498:exon_171822300_171823111:GORASP2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 171850329 T/G 1 43 48 91 19.6790670929009 26.0326692916455 -6.35360219874466 T:G T G 10 0.542347276909282 0.206679231291418 ENSG00000198586:ENST00000431350:exon_171847333_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000360843:exon_171847333_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000442919:exon_171847333_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000359766:exon_171850202_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000356075:exon_171850007_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000521943:exon_171850017_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000434911:exon_171850237_171850466:TLK1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 175436940 G/A 1 42 42 84 19.2214143698102 22.7785856301898 -3.55717126037968 A:G G A 10 0.542347276909282 0.445362006207999 ENSG00000115935:ENST00000392547:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000392548:exon_175436873_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000272746:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000359761:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000392546:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000409891:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000418906:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000409415:exon_175435897_175437174:WIPF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 184025875 G/T 1 4 5 9 1.83061089236287 2.71173638454641 -0.881125492183538 T:G G T 10 0.542347276909282 0.74064055507759 ENSG00000163002:ENST00000409798:exon_184025782_184026166:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000295119:exon_184025782_184026408:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000374930:exon_184025782_184025972:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000479162:exon_184024216_184026408:NUP35 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 184025876 A/T 1 4 5 9 1.83061089236287 2.71173638454641 -0.881125492183538 A:T A T 10 0.542347276909282 0.74064055507759 ENSG00000163002:ENST00000409798:exon_184025782_184026166:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000295119:exon_184025782_184026408:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000374930:exon_184025782_184025972:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000479162:exon_184024216_184026408:NUP35 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 197004439 A/G 1 5 6 11 2.28826361545359 3.25408366145569 -0.965820046002102 A:G A G 10 0.542347276909282 0.564156977749346 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197004344_197004523:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197004344_197004523:STK17B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 197021276 T/C 1 7 3 10 3.20356906163503 1.62704183072785 1.57652723090718 T:C T C 10 0.542347276909282 0.361234487774673 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197021163_197021375:STK17B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 197021372 T/A 1 4 4 8 1.83061089236287 2.16938910763713 -0.338778215274256 A:T T A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000420683:exon_197021296_197021375:STK17B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 198257036 A/G 1 138 157 295 63.1560757865191 85.1485224747573 -21.9924466882382 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0118569106104671 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198256698_198257185:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000479532:exon_198256979_198257185:SF3B1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 198266828 G/T 1 6 6 12 2.74591633854431 3.25408366145569 -0.508167322911383 T:G G T 10 0.542347276909282 0.780543886765314 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198266709_198266854:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000462613:exon_198266746_198266854:SF3B1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 198362018 T/C 1 60 70 130 27.4591633854431 37.9643093836497 -10.5051459982067 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0779221655164201 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000486181:exon_198361864_198362231:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198361615_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198361892_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198362009_198362116:HSPD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 201354935 C/G 1 5 10 15 2.28826361545359 5.42347276909282 -3.13520915363923 C:G C G 10 0.542347276909282 0.123431676383676 ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201353675_201355339:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201353681_201355339:KCTD18 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 208440072 C/G 1 3 5 8 1.37295816927215 2.71173638454641 -1.33877821527426 C:G C G 10 0.542347276909282 0.482450044879903 ENSG00000118260:ENST00000430624:exon_208439996_208440178:CREB1;ENSG00000118260:ENST00000236996:exon_208439996_208440178:CREB1;ENSG00000118260:ENST00000432329:exon_208439996_208440178:CREB1;ENSG00000118260:ENST00000353267:exon_208439996_208440178:CREB1;ENSG00000118260:ENST00000448277:exon_208439996_208440178:CREB1;ENSG00000118260:ENST00000418081:exon_208439996_208440178:CREB1;ENSG00000118260:ENST00000455757:exon_208440010_208440178:CREB1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 208477852 G/A 1 8 8 16 3.66122178472574 4.33877821527426 -0.677556430548512 A:G G A 10 0.542347276909282 0.804712000972457 ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208473839_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208476828_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208477447_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208477451_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208477467_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208477567_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208477704_208478167:FAM119A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 208477956 C/T 1 11 5 16 5.0341799539979 2.71173638454641 2.32244356945149 T:C C T 10 0.542347276909282 0.318264889784535 ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208473839_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208476828_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208477447_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208477451_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208477467_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208477567_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208477704_208478167:FAM119A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 208489101 C/A 1 5 4 9 2.28826361545359 2.16938910763713 0.118874507816462 A:C C A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000144401:ENST00000432416:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000458426:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000425132:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000461419:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208488953_208489275:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208488953_208489124:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208488953_208489290:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000471128:exon_208488953_208489128:FAM119A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 216190020 C/G 1 12 14 26 5.49183267708862 7.59286187672995 -2.10102919964133 C:G C G 10 0.542347276909282 0.436359538530528 ENSG00000138363:ENST00000236959:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000444305:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000488712:exon_216189903_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000443953:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000435675:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000427397:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000413174:exon_216189964_216190052:ATIC HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 216191533 C/T 1 6 5 11 2.74591633854431 2.71173638454641 0.0341799539978984 T:C C T 10 0.542347276909282 1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 219103580 A/G 1 1 7 8 0.457652723090718 3.79643093836497 -3.33877821527426 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0276538394311292 ENSG00000163466:ENST00000465395:exon_219103387_219103918:ARPC2;ENSG00000163466:ENST00000472753:exon_219103387_219103740:ARPC2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 219941063 G/A 1 29 13 42 13.2719289696308 7.05051459982067 6.22141436981016 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0627520101470707 ENSG00000187736:ENST00000409720:exon_219940039_219941167:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000356853:exon_219940043_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000418099:exon_219940051_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000494211:exon_219941014_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000426304:exon_219941025_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000491159:exon_219941040_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000415353:exon_219941042_219941167:NHEJ1;ENSG00000213901:ENST00000498327:exon_219940051_219941177:SLC23A3;ENSG00000213901:ENST00000318673:exon_219940695_219941177:SLC23A3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 220037666 A/G 1 39 27 66 17.848456200538 14.6433764765506 3.20507972398739 A:G A G 10 0.542347276909282 0.46029656772739 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220037616_220037850:C2orf24 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 220037756 A/G 1 54 21 75 24.7132470468988 11.3892928150949 13.3239542318039 A:G A G 10 0.542347276909282 0.00235832755382938 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220037616_220037850:C2orf24 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 220046975 C/A 1 8 10 18 3.66122178472574 5.42347276909282 -1.76225098436708 A:C C A 10 0.542347276909282 0.48096710956808 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220046735_220047030:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220046735_220047030:FAM134A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 220047393 C/T 1 20 19 39 9.15305446181436 10.3045982612764 -1.151543799462 T:C C T 10 0.542347276909282 0.749531471891698 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220047136_220048522:FAM134A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 220087441 T/C 1 5 4 9 2.28826361545359 2.16938910763713 0.118874507816462 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000198925:ENST00000446716:exon_220087367_220087460:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409033:exon_220087367_220087615:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000396761:exon_220087367_220087615:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409618:exon_220087367_220087615:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000361242:exon_220087367_220087615:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409422:exon_220087367_220087615:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000429920:exon_220087367_220087615:ATG9A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 220100787 C/T 1 76 61 137 34.7816069548946 33.0831838914662 1.69842306342837 T:C C T 10 0.542347276909282 0.797452331022908 ENSG00000163516:ENST00000323348:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000466238:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000409849:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000477479:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000463792:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000419723:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000410034:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000460966:exon_220100732_220101373:ANKZF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 220252511 G/C 1 8 6 14 3.66122178472574 3.25408366145569 0.407138123270053 C:G G C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000123992:ENST00000273075:exon_220252481_220252737:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373963:exon_220252481_220252651:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373966:exon_220252298_220252654:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000337010:exon_220252481_220252633:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000521459:exon_220252481_220252556:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000460963:exon_220252481_220252514:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000322176:exon_220252481_220252629:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000520694:exon_220252298_220252518:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000523527:exon_220252481_220252540:DNPEP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 220404648 C/T 1 22 31 53 10.0683599079958 16.8127655841877 -6.74440567619194 T:C C T 10 0.542347276909282 0.072822565323539 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 220404726 G/A 1 14 20 34 6.40713812327005 10.8469455381856 -4.43980741491559 A:G G A 10 0.542347276909282 0.167626111650877 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 220405230 G/A 1 8 2 10 3.66122178472574 1.08469455381856 2.57652723090718 A:G G A 10 0.542347276909282 0.121983479725832 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 220406722 T/C 1 13 6 19 5.94948540017933 3.25408366145569 2.69540173872364 T:C T C 10 0.542347276909282 0.254452857534199 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220406338_220406911:CHPF;ENSG00000123989:ENST00000373891:exon_220406182_220406911:CHPF HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 228197238 G/A 1 34 22 56 15.5601925850844 11.9316400920042 3.62855249308021 A:G G A 10 0.542347276909282 0.350701536733021 ENSG00000168958:ENST00000304593:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000476924:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000353339:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000354503:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000530359:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000531278:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409565:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000452930:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409616:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000460756:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000337110:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000470090:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000534203:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000524634:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000349901:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392059:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392058:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000436791:exon_228197135_228197304:MFF HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 231042276 A/G 1 120 120 240 54.9183267708862 65.0816732291138 -10.1633464582277 A:C:G A G 10 0.542347276909282 0.195364673624379 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000489597:exon_231042082_231042396:SP110 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 231072709 C/T 1 105 88 193 48.0535359245254 47.7265603680168 0.326975556508579 A:T:C:G C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000490880:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231072706_231072774:SP110 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 231248261 C/T 1 2 6 8 0.915305446181436 3.25408366145569 -2.33877821527426 T:C C T 10 0.542347276909282 0.153857012176102 ENSG00000079263:ENST00000486687:exon_231248225_231248290:SP140;ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000483728:exon_231248225_231248290:SP140L HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 231333763 A/G 1 95 78 173 43.4770086936182 42.303087598924 1.17392109469422 A:G A G 10 0.542347276909282 0.878953871939822 ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000413284:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000452345:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494508:exon_231333547_231333811:SP100 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 231338211 T/G 1 7 8 15 3.20356906163503 4.33877821527426 -1.13520915363923 T:G T G 10 0.542347276909282 0.610766925411102 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 232035429 G/A 1 105 118 223 48.0535359245254 63.9969786752953 -15.9434427507699 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0369834877032516 ENSG00000173692:ENST00000308696:exon_232035280_232035435:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000373635:exon_232035280_232035435:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000491229:exon_232035116_232035435:PSMD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 234113057 G/A 1 16 11 27 7.32244356945149 5.9658200460021 1.35662352344939 A:G G A 10 0.542347276909282 0.70076477773491 ENSG00000168918:ENST00000359570:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000450745:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000455936:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000415617:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000445964:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000435188:exon_234112772_234113363:INPP5D HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 234113301 C/T 1 21 20 41 9.61070718490508 10.8469455381856 -1.23623835328056 T:C C T 10 0.542347276909282 0.754927261952634 ENSG00000168918:ENST00000359570:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000450745:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000455936:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000415617:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000445964:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000435188:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000491070:exon_234113288_234113760:INPP5D HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 234750542 G/C 1 4 10 14 1.83061089236287 5.42347276909282 -3.59286187672995 C:G G C 10 0.542347276909282 0.0629725562793592 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 234750831 T/C 1 4 5 9 1.83061089236287 2.71173638454641 -0.881125492183538 T:C T C 10 0.542347276909282 0.74064055507759 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000453122:exon_234750762_234750851:HJURP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 238483671 G/A 1 13 2 15 5.94948540017933 1.08469455381856 4.86479084636077 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0166080221519623 ENSG00000124839:ENST00000264601:exon_238482965_238483771:RAB17;ENSG00000124839:ENST00000392001:exon_238482965_238483771:RAB17;ENSG00000124839:ENST00000477149:exon_238482969_238483771:RAB17;ENSG00000124839:ENST00000414278:exon_238482998_238483771:RAB17;ENSG00000124839:ENST00000466244:exon_238483333_238483771:RAB17;ENSG00000124839:ENST00000409822:exon_238483381_238483771:RAB17 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 238483729 A/G 1 9 1 10 4.11887450781646 0.542347276909282 3.57652723090718 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0259607145887505 ENSG00000124839:ENST00000264601:exon_238482965_238483771:RAB17;ENSG00000124839:ENST00000392001:exon_238482965_238483771:RAB17;ENSG00000124839:ENST00000477149:exon_238482969_238483771:RAB17;ENSG00000124839:ENST00000414278:exon_238482998_238483771:RAB17;ENSG00000124839:ENST00000466244:exon_238483333_238483771:RAB17;ENSG00000124839:ENST00000409822:exon_238483381_238483771:RAB17 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 238999883 T/C 1 6 4 10 2.74591633854431 2.16938910763713 0.57652723090718 T:C T C 10 0.542347276909282 0.762606887543924 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238999859_238999895:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238999859_239003163:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238999859_238999928:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238999859_239000724:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238999859_239000114:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000440143:exon_238999859_239000164:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000433750:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000463433:exon_238999859_238999895:SCLY HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 241500896 C/T 1 6 6 12 2.74591633854431 3.25408366145569 -0.508167322911383 T:C C T 10 0.542347276909282 0.780543886765314 ENSG00000188542:ENST00000343217:exon_241500747_241500936:DUSP28;ENSG00000188542:ENST00000405954:exon_241500747_241503431:DUSP28;ENSG00000188542:ENST00000438823:exon_241500747_241500936:DUSP28 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 242572846 A/G 1 33 35 68 15.1025398619937 18.9821546918249 -3.87961482983118 A:T:G A G 10 0.542347276909282 0.394509568216906 ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 242618050 A/G 1 19 32 51 8.69540173872364 17.355112861097 -8.65971112237338 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0166534387977008 ENSG00000168393:ENST00000305784:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000400770:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000472618:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000445261:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000432348:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000420144:exon_242617867_242618064:DTYMK HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 242674803 G/A 1 6 3 9 2.74591633854431 1.62704183072785 1.11887450781646 A:G G A 10 0.542347276909282 0.521783447682374 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000400769:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000342518:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000463932:exon_242674547_242674931:D2HGDH HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 242690675 G/A 1 4 6 10 1.83061089236287 3.25408366145569 -1.42347276909282 A:G G A 10 0.542347276909282 0.528168739719971 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000454048:exon_242690661_242690794:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000432449:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000496252:exon_242690661_242690804:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242690661_242690803:D2HGDH HGDP00213_parsed_pileup.txt . 2 242793273 A/G 1 11 4 15 5.0341799539979 2.16938910763713 2.86479084636077 A:G A G 10 0.542347276909282 0.194935449270639 ENSG00000188389:ENST00000334409:exon_242792033_242793449:PDCD1;ENSG00000188389:ENST00000418831:exon_242792849_242793449:PDCD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 259818 G/A 1 4 7 11 1.83061089236287 3.79643093836497 -1.9658200460021 A:G G A 10 0.542347276909282 0.364977036425421 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_259813_259971:C20orf96 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 259969 G/C 1 8 9 17 3.66122178472574 4.88112549218354 -1.21990370745779 C:G G C 10 0.542347276909282 0.630026415722873 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_259813_259971:C20orf96 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 279483 T/C 1 8 7 15 3.66122178472574 3.79643093836497 -0.135209153639229 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 1426393 C/T 1 38 48 86 17.3908034774473 26.0326692916455 -8.64186581419825 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0660042935597286 ENSG00000088833:ENST00000216879:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000353088:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381658:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000461211:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000476071:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000350991:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381653:exon_1426311_1426794:NSFL1C HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 2636218 C/A 1 7 1 8 3.20356906163503 0.542347276909282 2.66122178472574 A:C C A 10 0.542347276909282 0.0781860486215706 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 2638579 T/C 1 1090 1024 2114 498.841468168883 555.363611555105 -56.5221433862221 A:T:C T C 10 0.542347276909282 0.0144770731332437 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000462630:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467857:exon_2638575_2639039:NOP56 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 3204084 G/A 1 142 123 265 64.986686678882 66.7087150598417 -1.72202838095971 A:G G A 10 0.542347276909282 0.853370066541603 ENSG00000125877:ENST00000483354:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000380113:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000455664:exon_3204012_3204504:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000490838:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000460550:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000399838:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000461029:exon_3204012_3204095:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000472295:exon_3204012_3204516:ITPA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 10386013 C/A 1 45 31 76 20.5943725390823 16.8127655841877 3.78160695489457 A:C C A 10 0.542347276909282 0.421278719829051 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10385428_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10385832_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10385832_10386335:MKKS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 10386059 G/A 1 46 29 75 21.052025262173 15.7280710303692 5.32395423180385 A:G G A 10 0.542347276909282 0.246826976097477 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10385428_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10385832_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10385832_10386335:MKKS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 10620275 G/A 1 6 6 12 2.74591633854431 3.25408366145569 -0.508167322911383 A:G G A 10 0.542347276909282 0.780543886765314 ENSG00000101384:ENST00000254958:exon_10618332_10620603:JAG1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 10639385 A/G 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 A:G A G 10 0.542347276909282 0.734324137601319 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 13747441 A/G 1 65 61 126 29.7474270008967 33.0831838914662 -3.33575689056953 A:G A G 10 0.542347276909282 0.591910913971183 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13747424_13747571:ESF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 17602375 G/A 1 24 21 45 10.9836653541772 11.3892928150949 -0.405627460917687 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17602335_17602418:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17602335_17602418:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17602335_17602418:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17602335_17602418:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17602335_17602418:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17602335_17602418:RRBP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 17932210 C/T 1 41 28 69 18.7637616467194 15.1857237534599 3.57803789325954 T:C C T 10 0.542347276909282 0.40068068760165 ENSG00000089006:ENST00000377768:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000490175:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000377759:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000483485:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000377739:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000476648:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000431277:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000419004:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000494401:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000474883:exon_17932170_17932239:SNX5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 17943492 A/T 1 10 5 15 4.57652723090718 2.71173638454641 1.86479084636077 A:T A T 10 0.542347276909282 0.439852308753891 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 17968923 T/C 1 6 4 10 2.74591633854431 2.16938910763713 0.57652723090718 T:C T C 10 0.542347276909282 0.762606887543924 ENSG00000125871:ENST00000377710:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000377709:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000412478:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000467391:exon_17968809_17968941:C20orf72 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 25282967 C/T 1 7 11 18 3.20356906163503 5.9658200460021 -2.76225098436708 T:C C T 10 0.542347276909282 0.238484579075496 ENSG00000100997:ENST00000376542:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000376517:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000339157:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000526543:exon_25282855_25282982:ABHD12 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 30729488 T/C 1 4 7 11 1.83061089236287 3.79643093836497 -1.9658200460021 T:C T C 10 0.542347276909282 0.364977036425421 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 32264949 G/A 1 13 3 16 5.94948540017933 1.62704183072785 4.32244356945149 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0418964267698885 ENSG00000101412:ENST00000343380:exon_32264911_32265136:E2F1;ENSG00000101412:ENST00000402461:exon_32264911_32265136:E2F1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 32295541 C/T 1 10 7 17 4.57652723090718 3.79643093836497 0.780096292542206 T:C C T 10 0.542347276909282 0.810080070348479 ENSG00000101417:ENST00000409299:exon_32294512_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000344022:exon_32295075_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000217398:exon_32295295_32295775:PXMP4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 35176566 G/A 1 12 4 16 5.49183267708862 2.16938910763713 3.32244356945149 A:G G A 10 0.542347276909282 0.131409431801654 ENSG00000101335:ENST00000279022:exon_35176435_35176596:MYL9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 35852309 G/A 1 35 31 66 16.0178453081751 16.8127655841877 -0.794920276012611 A:G G A 10 0.542347276909282 0.90188188606106 ENSG00000118705:ENST00000237530:exon_35852281_35852372:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373622:exon_35852281_35852372:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000338768:exon_35852281_35852372:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373628:exon_35852281_35852372:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373623:exon_35852281_35852372:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000397161:exon_35852281_35852372:RPN2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 42088708 G/A 1 28 25 53 12.8142762465401 13.558681922732 -0.744405676191944 A:G G A 10 0.542347276909282 0.890707227028334 ENSG00000124193:ENST00000244020:exon_42088673_42088881:SRSF6;ENSG00000124193:ENST00000483871:exon_42088673_42088881:SRSF6 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 43530234 A/C 1 74 45 119 33.8663015087131 24.4056274609177 9.46067404779545 A:C A C 10 0.542347276909282 0.0973111410960548 ENSG00000166913:ENST00000353703:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000479421:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000372839:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000428262:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000445830:exon_43530172_43530397:YWHAB HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 43566787 A/G 1 8 7 15 3.66122178472574 3.79643093836497 -0.135209153639229 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000101104:ENST00000255136:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000421240:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372821:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217073:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000476056:exon_43566686_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372824:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372819:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217075:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000479873:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372826:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000474208:exon_43566743_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000489068:exon_43566686_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372822:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000482486:exon_43566484_43566832:PABPC1L HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 44054349 T/C 1 15 16 31 6.86479084636077 8.67755643054851 -1.81276558418774 T:C T C 10 0.542347276909282 0.589921512957966 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44054214_44054884:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44054214_44054882:PIGT HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 45315786 C/T 1 19 11 30 8.69540173872364 5.9658200460021 2.72958169272154 T:C C T 10 0.542347276909282 0.36272120696967 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45313004_45315870:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45314173_45315870:TP53RK HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 45801319 T/A 1 3 6 9 1.37295816927215 3.25408366145569 -1.88112549218354 A:T T A 10 0.542347276909282 0.31687860521519 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 45853037 A/G 1 14 24 38 6.40713812327005 13.0163346458228 -6.60919652255271 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0345304930831179 ENSG00000101040:ENST00000360911:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000311275:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000458360:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000467200:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000262975:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000471951:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000352431:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000396281:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000355972:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000461685:exon_45852970_45853209:ZMYND8 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 47249170 G/A 1 5 4 9 2.28826361545359 2.16938910763713 0.118874507816462 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47249034_47249177:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47248815_47249177:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47249034_47249177:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47248815_47249177:PREX1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 47841660 G/T 1 8 2 10 3.66122178472574 1.08469455381856 2.57652723090718 T:G G T 10 0.542347276909282 0.121983479725832 ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47841650_47841736:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47841650_47841736:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000462328:exon_47841650_47841736:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000493252:exon_47841650_47841736:DDX27 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 47871197 G/C 1 19 21 40 8.69540173872364 11.3892928150949 -2.69389107637128 C:G G C 10 0.542347276909282 0.429596769190731 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 47874005 A/G 1 60 56 116 27.4591633854431 30.3714475069198 -2.91228412147671 A:G A G 10 0.542347276909282 0.641475050318344 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000455070:exon_47873954_47874201:ZNFX1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 48491207 G/A 1 5 8 13 2.28826361545359 4.33877821527426 -2.05051459982067 A:G G A 10 0.542347276909282 0.278020697313787 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 48522124 T/G 1 20 14 34 9.15305446181436 7.59286187672995 1.56019258508441 T:G T G 10 0.542347276909282 0.611056361968544 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 48522330 G/A 1 13 6 19 5.94948540017933 3.25408366145569 2.69540173872364 A:G G A 10 0.542347276909282 0.254452857534199 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 48522530 G/A 1 9 6 15 4.11887450781646 3.25408366145569 0.864790846360771 A:G G A 10 0.542347276909282 0.797455423618976 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 52674615 A/G 1 9 4 13 4.11887450781646 2.16938910763713 1.94948540017933 A:G A G 10 0.542347276909282 0.405355588189296 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 55088404 A/G 1 13 24 37 5.94948540017933 13.0163346458228 -7.06684924564343 A:C:G A G 10 0.542347276909282 0.0211452115562712 ENSG00000022277:ENST00000023939:exon_55088371_55088484:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000395881:exon_55088371_55088484:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000357348:exon_55088371_55088484:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000435342:exon_55088371_55088484:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000449062:exon_55088371_55088484:C20orf43 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 56179586 G/A 1 15 14 29 6.86479084636077 7.59286187672995 -0.728071030369177 A:G G A 10 0.542347276909282 0.853091476622548 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56178902_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56178902_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56178906_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56179111_56179825:ZBP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 56185209 G/A 1 14 8 22 6.40713812327005 4.33877821527426 2.0683599079958 A:G G A 10 0.542347276909282 0.401761216392069 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000357677:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000343535:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000453793:exon_56185205_56185321:ZBP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 57478807 C/T 1 76 75 151 34.7816069548946 40.6760457681961 -5.89443881330158 T:C C T 10 0.542347276909282 0.369054884198826 ENSG00000087460:ENST00000313949:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371075:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000419558:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000472183:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000462499:exon_57478727_57478829:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000482112:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000490374:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467227:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371100:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371102:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464624:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000450130:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000349036:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488546:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000481039:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468895:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467321:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000477931:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000485673:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000470512:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464788:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000469431:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000478585:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000474497:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480975:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480232:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371095:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371085:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000354359:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000265620:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000306090:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371082:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488652:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476935:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468942:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000492907:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487862:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000496934:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476196:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000494081:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487981:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000493958:exon_57478796_57478846:GNAS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 57571763 A/G 1 60 27 87 27.4591633854431 14.6433764765506 12.8157869088925 A:G A G 10 0.542347276909282 0.00681616421312345 ENSG00000101160:ENST00000217131:exon_57571694_57571856:CTSZ HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 57610059 C/A 1 17 18 35 7.78009629254221 9.76225098436707 -1.98215469182487 A:C C A 10 0.542347276909282 0.503608661828194 ENSG00000101166:ENST00000355937:exon_57608200_57610181:SLMO2;ENSG00000101166:ENST00000371033:exon_57609689_57610181:SLMO2;ENSG00000101166:ENST00000463057:exon_57609964_57610181:SLMO2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 60713311 G/A 1 245 262 507 112.124917157226 142.094986550232 -29.970069393006 A:G G A 10 0.542347276909282 0.00848213789102582 ENSG00000101182:ENST00000370873:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000442551:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000395567:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000484488:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000370861:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000486193:exon_60713227_60713346:PSMA7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 60883273 A/C 1 6 4 10 2.74591633854431 2.16938910763713 0.57652723090718 A:C A C 10 0.542347276909282 0.762606887543924 ENSG00000130702:ENST00000492698:exon_60883011_60883502:LAMA5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 60962943 T/C 1 3981 3473 7454 1821.91549062415 1883.57209270594 -61.6566020817877 A:T:C T C 10 0.542347276909282 0.152783072460987 ENSG00000171858:ENST00000317311:exon_60962899_60962970:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370592:exon_60962899_60963171:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000492356:exon_60962899_60962970:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000343986:exon_60962899_60962970:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000450116:exon_60962899_60963057:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370562:exon_60962667_60963576:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000337102:exon_60962900_60962970:RPS21 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 61440971 G/A 1 3 6 9 1.37295816927215 3.25408366145569 -1.88112549218354 A:G G A 10 0.542347276909282 0.31687860521519 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370468:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000450048:exon_61440937_61441015:OGFR HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 61443716 G/A 1 19 22 41 8.69540173872364 11.9316400920042 -3.23623835328056 A:G G A 10 0.542347276909282 0.348394795219911 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370468:exon_61443582_61444281:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61443582_61444558:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61443582_61444558:OGFR HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 61467800 A/G 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 A:G A G 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000092758:ENST00000472880:exon_61467273_61468011:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000469802:exon_61467539_61467884:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000467819:exon_61467771_61467884:COL9A3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 61468571 T/C 1 5 28 33 2.28826361545359 15.1857237534599 -12.8974601380063 T:C T C 10 0.542347276909282 4.73916616861548e-06 ENSG00000092758:ENST00000343916:exon_61468435_61468617:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000466192:exon_61468435_61468617:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000462700:exon_61468435_61468617:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000467819:exon_61468435_61468617:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000466532:exon_61468274_61468617:COL9A3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 61869826 C/T 1 4 9 13 1.83061089236287 4.88112549218354 -3.05051459982067 T:C C T 10 0.542347276909282 0.101447871356357 ENSG00000101197:ENST00000342412:exon_61869748_61869829:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000217169:exon_61869748_61869829:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000370327:exon_61869748_61869829:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000395306:exon_61869554_61869829:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000426135:exon_61869560_61869829:BIRC7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 61870634 A/G 1 7 5 12 3.20356906163503 2.71173638454641 0.491832677088616 A:G A G 10 0.542347276909282 1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 61870727 G/C 1 15 9 24 6.86479084636077 4.88112549218354 1.98366535417723 C:G G C 10 0.542347276909282 0.539851636806923 ENSG00000101197:ENST00000217169:exon_61870710_61870962:BIRC7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 62126185 A/G 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 A:G A G 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000101210:ENST00000298049:exon_62126158_62126454:EEF1A2;ENSG00000101210:ENST00000217182:exon_62126158_62126454:EEF1A2;ENSG00000101210:ENST00000449908:exon_62126158_62126454:EEF1A2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 62191937 G/A 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 A:G G A 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 62221766 C/T 1 3 5 8 1.37295816927215 2.71173638454641 -1.33877821527426 T:C C T 10 0.542347276909282 0.482450044879903 ENSG00000101216:ENST00000266068:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370069:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370077:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000447518:exon_62221638_62221772:GMEB2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 62326110 A/C 1 3 5 8 1.37295816927215 2.71173638454641 -1.33877821527426 A:C A C 10 0.542347276909282 0.482450044879903 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62326094_62326331:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62326094_62326327:RTEL1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 62328829 C/G 1 7 4 11 3.20356906163503 2.16938910763713 1.0341799539979 C:G C G 10 0.542347276909282 0.763959235154452 ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62328681_62328875:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62328681_62328875:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62328681_62328875:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62328681_62328875:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62328681_62328875:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62328681_62328875:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000369993:exon_62328681_62328875:RTEL1;ENSG00000243509:ENST00000369996:exon_62328681_62328875:TNFRSF6B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 62331989 T/G 1 9 12 21 4.11887450781646 6.50816732291138 -2.38929281509492 T:G T G 10 0.542347276909282 0.381797653241551 ENSG00000101246:ENST00000359715:exon_62331954_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000440854:exon_62329996_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000485858:exon_62331954_62332129:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000217224:exon_62331954_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000324228:exon_62331954_62332054:ARFRP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 62366478 A/G 1 12 3 15 5.49183267708862 1.62704183072785 3.86479084636077 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0666375844661501 ENSG00000197114:ENST00000478385:exon_62366057_62366537:ZGPAT HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 62373707 G/T 1 6 9 15 2.74591633854431 4.88112549218354 -2.13520915363923 T:G G T 10 0.542347276909282 0.307109737553343 ENSG00000125520:ENST00000266077:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000485897:exon_62373689_62373843:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000493772:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000491109:exon_62373689_62373887:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000473157:exon_62373689_62373717:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000482718:exon_62373483_62373888:SLC2A4RG HGDP00213_parsed_pileup.txt . 20 62607160 C/T 1 5 9 14 2.28826361545359 4.88112549218354 -2.59286187672995 T:C C T 10 0.542347276909282 0.187369064466614 ENSG00000130590:ENST00000369886:exon_62607045_62607185:SAMD10;ENSG00000130590:ENST00000498830:exon_62607045_62607185:SAMD10;ENSG00000130590:ENST00000478694:exon_62607045_62607185:SAMD10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 21 19169218 G/C 1 13 2 15 5.94948540017933 1.08469455381856 4.86479084636077 C:G G C 10 0.542347276909282 0.0166080221519623 ENSG00000154642:ENST00000284881:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400559:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400558:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000405964:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000493464:exon_19169040_19169435:C21orf91 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 21 26965148 G/A 1 34 24 58 15.5601925850844 13.0163346458228 2.54385793926165 A:G G A 10 0.542347276909282 0.513826588990262 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26965124_26965277:MRPL39 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 21 26965205 T/C 1 41 42 83 18.7637616467194 22.7785856301898 -4.0148239834704 T:C T C 10 0.542347276909282 0.380633286154300 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26965124_26965277:MRPL39 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 21 26969703 T/C 1 6 15 21 2.74591633854431 8.13520915363923 -5.38929281509492 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0262982606723561 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26969614_26969726:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26969614_26969726:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26969614_26969726:MRPL39 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 21 33032064 C/T 1 84 57 141 38.4428287396203 30.9137947838291 7.52903395579125 T:C C T 10 0.542347276909282 0.2062634032736 ENSG00000142168:ENST00000270142:exon_33031935_33032154:SOD1;ENSG00000142168:ENST00000389995:exon_33031979_33032097:SOD1;ENSG00000142168:ENST00000476106:exon_33032006_33032154:SOD1;ENSG00000142168:ENST00000470944:exon_33032022_33033021:SOD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 21 34614250 T/C 1 4 5 9 1.83061089236287 2.71173638454641 -0.881125492183538 T:C T C 10 0.542347276909282 0.74064055507759 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 21 34787312 A/G 1 7 23 30 3.20356906163503 12.4739873689135 -9.27041830727846 A:G A G 10 0.542347276909282 0.000748987140716503 ENSG00000159128:ENST00000290219:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000439213:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000381995:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000405436:exon_34787195_34787327:IFNGR2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 21 34897113 C/T 1 25 29 54 11.441318077268 15.7280710303692 -4.28675295310123 T:C C T 10 0.542347276909282 0.275048574132333 ENSG00000159131:ENST00000381831:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000381815:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000381839:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000424203:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000460305:exon_34897076_34897135:GART;ENSG00000159131:ENST00000467575:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000361093:exon_34896316_34897307:GART HGDP00213_parsed_pileup.txt . 21 34926260 C/T 1 28 19 47 12.8142762465401 10.3045982612764 2.50967798526375 T:C C T 10 0.542347276909282 0.558641348182906 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00213_parsed_pileup.txt . 21 34927501 T/C 1 6 8 14 2.74591633854431 4.33877821527426 -1.59286187672995 T:C T C 10 0.542347276909282 0.431117415726890 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000421541:exon_34927355_34927697:SON HGDP00213_parsed_pileup.txt . 21 35281393 A/G 1 255 211 466 116.701444388133 114.435275427858 2.2661689602746 A:G A G 10 0.542347276909282 0.852544874274767 ENSG00000249209:ENST00000429238:exon_35281386_35281515:AP000304.12;ENSG00000241837:ENST00000491703:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000290299:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000418933:exon_35281386_35281399:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000495005:exon_35281118_35281515:ATP5O HGDP00213_parsed_pileup.txt . 21 35284683 A/G 1 87 80 167 39.8157869088925 43.3877821527426 -3.57199524385009 A:G A G 10 0.542347276909282 0.587506527847485 ENSG00000241837:ENST00000431254:exon_35284593_35284703:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000491703:exon_35284593_35284703:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000290299:exon_35284593_35284703:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000495005:exon_35284593_35284703:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000496044:exon_35284671_35284703:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000484627:exon_35284671_35284703:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000487374:exon_35284682_35284703:ATP5O HGDP00213_parsed_pileup.txt . 21 38525356 T/C 1 27 23 50 12.3566235234494 12.4739873689135 -0.1173638454641 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000182670:ENST00000418766:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000485402:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000438055:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000414818:exon_38525251_38525577:TTC3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 21 38563639 C/T 1 25 38 63 11.441318077268 20.6091965225527 -9.16787844528476 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0226560049517745 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38563635_38563725:TTC3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 21 38568009 G/C 1 47 32 79 21.5096779852637 17.355112861097 4.15456512416672 C:G G C 10 0.542347276909282 0.368168814174179 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 21 44323461 G/A 1 11 8 19 5.0341799539979 4.33877821527426 0.695401738723643 A:G G A 10 0.542347276909282 0.820870277915036 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 21 45107562 T/C 1 18 20 38 8.23774901563293 10.8469455381856 -2.60919652255271 T:C T C 10 0.542347276909282 0.419093306201868 ENSG00000160208:ENST00000340648:exon_45107397_45108121:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000446602:exon_45107397_45108121:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000470886:exon_45107397_45108121:RRP1B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 21 45217559 T/C 1 48 48 96 21.9673307083545 26.0326692916455 -4.06533858329107 T:C T C 10 0.542347276909282 0.414234758119069 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000483896:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217512_45217576:RRP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 21 45503121 G/A 1 21 19 40 9.61070718490508 10.3045982612764 -0.693891076371278 A:G G A 10 0.542347276909282 0.874602009607347 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45502669_45503183:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45502669_45503183:TRAPPC10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 21 45540919 A/G 1 13 5 18 5.94948540017933 2.71173638454641 3.23774901563292 A:G A G 10 0.542347276909282 0.157464330321861 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45540833_45540983:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45540833_45542238:PWP2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 21 45544594 T/C 1 13 11 24 5.94948540017933 5.9658200460021 -0.0163346458227673 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45544461_45544608:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45544461_45546000:PWP2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 21 45553596 T/C 1 9 13 22 4.11887450781646 7.05051459982067 -2.9316400920042 T:C T C 10 0.542347276909282 0.284538813785442 ENSG00000160221:ENST00000291577:exon_45553487_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000495007:exon_45553498_45554036:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000427803:exon_45553500_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000493883:exon_45553521_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000480786:exon_45553556_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000348499:exon_45553562_45553720:C21orf33 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 21 45732116 C/T 1 9 6 15 4.11887450781646 3.25408366145569 0.864790846360771 T:C C T 10 0.542347276909282 0.797455423618976 ENSG00000141959:ENST00000349048:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000397961:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000496824:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000466134:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000491298:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000403390:exon_45731988_45732177:PFKL HGDP00213_parsed_pileup.txt . 21 46363607 G/A 0 0 18 18 0 9.76225098436707 -9.76225098436707 A G A 10 0.542347276909282 7.75619848955272e-07 ENSG00000160256:ENST00000291634:exon_46363599_46363752:C21orf70;ENSG00000160256:ENST00000397826:exon_46363599_46363707:C21orf70;ENSG00000160256:ENST00000458015:exon_46363599_46363707:C21orf70 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 21 47666744 G/T 1 4 11 15 1.83061089236287 5.9658200460021 -4.13520915363923 T:G G T 10 0.542347276909282 0.0383920942670258 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47666542_47666800:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47666221_47666800:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47666542_47666800:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000467026:exon_47666542_47666800:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47666542_47666800:MCM3AP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 21 48063476 C/G 1 18 25 43 8.23774901563293 13.558681922732 -5.32093290709912 C:G C G 10 0.542347276909282 0.125397734889384 ENSG00000160310:ENST00000355680:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397638:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397637:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000334494:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397628:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000458387:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000291705:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397634:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000451211:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000440086:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000482508:exon_48063198_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000481861:exon_48063447_48063551:PRMT2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 17590180 G/A 1 7 10 17 3.20356906163503 5.42347276909282 -2.21990370745779 A:G G A 10 0.542347276909282 0.333980909060167 ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 17662793 A/G 1 4 6 10 1.83061089236287 3.25408366145569 -1.42347276909282 A:G A G 10 0.542347276909282 0.528168739719971 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000449907:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000330232:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17662710_17662912:CECR1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 18171776 G/A 1 7 6 13 3.20356906163503 3.25408366145569 -0.0505145998206653 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000099968:ENST00000399782:exon_18171752_18171908:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18171752_18171908:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000464649:exon_18171752_18171908:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000493680:exon_18171752_18171908:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18171752_18171908:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18171752_18171908:BCL2L13 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 19950235 C/T 1 29 7 36 13.2719289696308 3.79643093836497 9.47549803126585 T:C C T 10 0.542347276909282 0.00128728396763989 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19949756_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000467943:exon_19950050_19950399:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19950070_19950338:COMT HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 19951207 C/G 1 31 23 54 14.1872344158123 12.4739873689135 1.71324704689877 A:C:G C G 10 0.542347276909282 0.68357970267703 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 19951271 G/A 1 60 62 122 27.4591633854431 33.6255311683755 -6.1663677829324 A:G G A 10 0.542347276909282 0.276240882657776 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000428707:exon_19951222_19951282:COMT HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 19951804 G/A 1 109 109 218 49.8841468168883 59.1158531831117 -9.23170636622346 A:G G A 10 0.542347276909282 0.221304128896687 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951691_19953168:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951633_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951691_19951823:COMT;ENSG00000093010:ENST00000428707:exon_19951691_19951822:COMT HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 21213380 C/T 1 26 11 37 11.8989708003587 5.9658200460021 5.93315075435657 T:C C T 10 0.542347276909282 0.068111302575731 ENSG00000099940:ENST00000215730:exon_21213271_21213635:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000490458:exon_21213369_21213635:SNAP29 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 21213416 A/G 1 32 18 50 14.644887138903 9.76225098436707 4.8826361545359 A:G A G 10 0.542347276909282 0.201321104286056 ENSG00000241973:ENST00000449120:exon_21213411_21213705:PI4KA;ENSG00000099940:ENST00000215730:exon_21213271_21213635:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000490458:exon_21213369_21213635:SNAP29 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 22049783 C/T 1 16 6 22 7.32244356945149 3.25408366145569 4.0683599079958 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0901117450756771 ENSG00000100023:ENST00000412327:exon_22049687_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000335025:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000398831:exon_22049683_22050712:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000456792:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000417788:exon_22049683_22052201:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000406385:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000446951:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000462188:exon_22049226_22049785:PPIL2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 24108288 C/G 1 7 7 14 3.20356906163503 3.79643093836497 -0.592861876729947 C:G C G 10 0.542347276909282 0.793466098764131 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 24108412 G/A 1 361 365 726 165.212633035749 197.956756071888 -32.7441230361387 A:T:C:G G A 10 0.542347276909282 0.0154415476612479 ENSG00000250479:ENST00000476831:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000520222:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000401675:exon_24108315_24108483:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000484558:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000523865:exon_24108315_24108651:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000517886:exon_24108315_24108462:CHCHD10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 29727866 C/T 1 8 3 11 3.66122178472574 1.62704183072785 2.0341799539979 T:C C T 10 0.542347276909282 0.244923170028471 ENSG00000100280:ENST00000482818:exon_29727776_29728310:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000472057:exon_29727776_29727905:AP1B1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 30163526 A/G 1 456 472 928 208.689641729367 255.987914701181 -47.2982729718137 A:G A G 10 0.542347276909282 0.00194398494464931 ENSG00000184076:ENST00000330029:exon_30163358_30163537:UQCR10;ENSG00000184076:ENST00000401406:exon_30163363_30163596:UQCR10;ENSG00000184076:ENST00000332801:exon_30163440_30163537:UQCR10;ENSG00000184076:ENST00000406782:exon_30163388_30163558:UQCR10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 30200761 C/G 1 9 5 14 4.11887450781646 2.71173638454641 1.40713812327005 C:G C G 10 0.542347276909282 0.594287862477072 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30200627_30200819:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30200627_30200813:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30200627_30200819:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30200627_30200819:ASCC2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 30218270 T/C 1 7 8 15 3.20356906163503 4.33877821527426 -1.13520915363923 T:C T C 10 0.542347276909282 0.610766925411102 ENSG00000100325:ENST00000465667:exon_30218131_30218453:ASCC2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 30823196 T/C 1 4 41 45 1.83061089236287 22.2362383532806 -20.4056274609177 T:C T C 10 0.542347276909282 2.11945052533843e-10 ENSG00000249590:ENST00000439838:exon_30823158_30823390:RP4-539M6.19;ENSG00000242114:ENST00000266263:exon_30823158_30823390:MTFP1;ENSG00000242114:ENST00000412752:exon_30823109_30823390:MTFP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 31838085 G/A 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 A:G G A 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000184708:ENST00000344710:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000495101:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397525:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000330125:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000382180:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397523:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000420671:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000445424:exon_31837789_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000475437:exon_31838021_31838104:EIF4ENIF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 31976299 T/C 1 6 4 10 2.74591633854431 2.16938910763713 0.57652723090718 T:C T C 10 0.542347276909282 0.762606887543924 ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_31976258_31976350:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_31976258_31976350:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_31976258_31976350:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_31976258_31976350:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_31976258_31976350:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_31976258_31976350:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_31976258_31976350:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000484806:exon_31976258_31976350:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_31976258_31976350:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000467357:exon_31976074_31976350:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000417682:exon_31976258_31976350:SFI1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 32011225 T/C 1 18 23 41 8.23774901563293 12.4739873689135 -4.23623835328056 T:C T C 10 0.542347276909282 0.210661036540014 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000474741:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000476577:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000464333:exon_32010357_32012863:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000357852:exon_32010372_32011265:SFI1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 32352791 G/A 1 43 40 83 19.6790670929009 21.6938910763713 -2.0148239834704 A:G G A 10 0.542347276909282 0.661248564644758 ENSG00000128245:ENST00000248975:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000397492:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000471374:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000427094:exon_32352126_32353589:YWHAH HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 32795641 C/T 1 10 11 21 4.57652723090718 5.9658200460021 -1.38929281509492 T:C C T 10 0.542347276909282 0.662591228630952 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000498434:exon_32795590_32795972:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000476619:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000485373:exon_32795590_32795746:C22orf28 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 32875190 G/A 1 7 8 15 3.20356906163503 4.33877821527426 -1.13520915363923 A:G G A 10 0.542347276909282 0.610766925411102 ENSG00000100225:ENST00000266087:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000437452:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000425028:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000492535:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000452138:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000444207:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000465418:exon_32874968_32875218:FBXO7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 32887150 C/T 1 26 23 49 11.8989708003587 12.4739873689135 -0.575016568554817 T:C C T 10 0.542347276909282 0.886853759357875 ENSG00000100225:ENST00000266087:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000420700:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000437452:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000425028:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000492535:exon_32883732_32889268:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32887073_32887168:FBXO7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 36684354 T/C 1 23 21 44 10.5260126310865 11.3892928150949 -0.863280184008406 T:C T C 10 0.542347276909282 0.880008851298633 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 36684358 C/A 1 21 19 40 9.61070718490508 10.3045982612764 -0.693891076371278 A:C C A 10 0.542347276909282 0.874602009607347 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 37695256 T/C 1 6 5 11 2.74591633854431 2.71173638454641 0.0341799539978984 T:C T C 10 0.542347276909282 1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 38212762 A/G 1 33 20 53 15.1025398619937 10.8469455381856 4.25559432380805 A:G A G 10 0.542347276909282 0.271247065978836 ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38212574_38212904:GCAT HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 38273749 T/C 1 311 349 660 142.329996881213 189.279199641339 -46.9492027601261 T:C:G T C 10 0.542347276909282 0.000274416764433721 ENSG00000100129:ENST00000412331:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000262832:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000381683:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000433002:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000425539:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000477256:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000406934:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000482600:exon_38273681_38274178:EIF3L HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 39496336 G/T 0 12 0 12 5.49183267708862 0 5.49183267708862 G G 10 0.542347276909282 0.000732051414485148 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 39496412 G/C 1 14 2 16 6.40713812327005 1.08469455381856 5.32244356945149 C:G G C 10 0.542347276909282 0.00974971955567542 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 39498038 G/C 1 23 23 46 10.5260126310865 12.4739873689135 -1.94797473782697 C:G G C 10 0.542347276909282 0.657569845063233 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497923_39498053:APOBEC3H HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 39709009 G/A 1 7 14 21 3.20356906163503 7.59286187672995 -4.38929281509492 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0775652070792625 ENSG00000100316:ENST00000473638:exon_39708889_39709315:RPL3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 39917515 A/C 1 238 276 514 108.921348095591 149.687848426962 -40.7665003313709 A:C A C 10 0.542347276909282 0.000329832342028461 ENSG00000128272:ENST00000404241:exon_39917359_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000337304:exon_39916569_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000396680:exon_39917359_39917676:ATF4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 41833116 C/T 1 6 4 10 2.74591633854431 2.16938910763713 0.57652723090718 T:C C T 10 0.542347276909282 0.762606887543924 ENSG00000183864:ENST00000327492:exon_41829496_41833411:TOB2;ENSG00000183864:ENST00000434408:exon_41833046_41833411:TOB2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 41903813 A/C 1 8 3 11 3.66122178472574 1.62704183072785 2.0341799539979 A:C A C 10 0.542347276909282 0.244923170028471 ENSG00000100412:ENST00000216254:exon_41903795_41904053:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000396512:exon_41903795_41904053:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000471094:exon_41903795_41904053:ACO2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 42059768 G/T 1 540 519 1059 247.132470468988 281.478236715917 -34.3457662469296 A:T:C:G G T 10 0.542347276909282 0.0359428722999686 ENSG00000196419:ENST00000360079:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402580:exon_42059626_42060044:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000428575:exon_42059626_42060042:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000359308:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405878:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402409:exon_42059645_42060010:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405506:exon_42059626_42060038:XRCC6 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 42073134 C/T 1 23 154 177 10.5260126310865 83.5214806440294 -72.9954680129429 T:C C T 10 0.542347276909282 3.82512799184724e-30 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 42221846 C/T 1 4 6 10 1.83061089236287 3.25408366145569 -1.42347276909282 T:C C T 10 0.542347276909282 0.528168739719971 ENSG00000100147:ENST00000402061:exon_42221702_42221897:CCDC134;ENSG00000100147:ENST00000255784:exon_42221702_42222303:CCDC134 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 42276742 G/C 1 47 58 105 21.5096779852637 31.4561420607384 -9.94646407547461 C:G G C 10 0.542347276909282 0.0622512534329596 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42276720_42276996:SREBF2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 42912029 G/T 1 46 45 91 21.052025262173 24.4056274609177 -3.35360219874466 T:G G T 10 0.542347276909282 0.528214742980313 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000416699:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000483303:exon_42912017_42912302:RRP7A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 43529314 G/C 1 52 40 92 23.7979416007173 21.6938910763713 2.10405052434606 C:G G C 10 0.542347276909282 0.677044913982895 ENSG00000100294:ENST00000327555:exon_43528886_43529492:MCAT;ENSG00000100294:ENST00000290429:exon_43528889_43529492:MCAT HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 44372632 C/T 1 22 14 36 10.0683599079958 7.59286187672995 2.47549803126585 T:C C T 10 0.542347276909282 0.504094569816844 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44372630_44372701:SAMM50 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 44379822 T/C 1 22 20 42 10.0683599079958 10.8469455381856 -0.778585630189843 T:C T C 10 0.542347276909282 0.877353318587752 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44379813_44379880:SAMM50 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 44379838 A/G 1 24 24 48 10.9836653541772 13.0163346458228 -2.03266929164553 A:G A G 10 0.542347276909282 0.565727619436899 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44379813_44379880:SAMM50 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 45683246 C/T 1 4 5 9 1.83061089236287 2.71173638454641 -0.881125492183538 T:C C T 10 0.542347276909282 0.74064055507759 ENSG00000100373:ENST00000216211:exon_45683053_45683332:UPK3A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 45685002 A/G 1 3 5 8 1.37295816927215 2.71173638454641 -1.33877821527426 A:G A G 10 0.542347276909282 0.482450044879903 ENSG00000100373:ENST00000216211:exon_45684942_45685024:UPK3A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 45691594 A/G 1 6 5 11 2.74591633854431 2.71173638454641 0.0341799539978984 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000100373:ENST00000216211:exon_45691441_45691755:UPK3A;ENSG00000100373:ENST00000396082:exon_45691441_45691703:UPK3A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 45723807 G/C 1 7 25 32 3.20356906163503 13.558681922732 -10.355112861097 C:G G C 10 0.542347276909282 0.000261278766600894 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000442334:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405673:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000477714:exon_45723723_45724122:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000427777:exon_45723723_45723841:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45723723_45723944:FAM118A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 45723842 G/A 1 5 25 30 2.28826361545359 13.558681922732 -11.2704183072785 A:G G A 10 0.542347276909282 2.94191715674504e-05 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000442334:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405673:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000477714:exon_45723723_45724122:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45723723_45723944:FAM118A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 45723854 C/G 1 25 6 31 11.441318077268 3.25408366145569 8.18723441581226 C:G C G 10 0.542347276909282 0.00332301538618772 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000442334:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405673:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000477714:exon_45723723_45724122:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45723723_45723944:FAM118A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 45728370 G/A 1 4 5 9 1.83061089236287 2.71173638454641 -0.881125492183538 A:G G A 10 0.542347276909282 0.74064055507759 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000459849:exon_45728306_45728572:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000476754:exon_45728306_45728536:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000487732:exon_45728306_45728591:FAM118A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 45749966 G/C 1 6 2 8 2.74591633854431 1.08469455381856 1.66122178472574 C:G G C 10 0.542347276909282 0.303100337321114 ENSG00000077935:ENST00000357450:exon_45749858_45750012:SMC1B;ENSG00000077935:ENST00000404845:exon_45749858_45750012:SMC1B;ENSG00000077935:ENST00000404354:exon_45749858_45750012:SMC1B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 46719141 C/T 1 4 5 9 1.83061089236287 2.71173638454641 -0.881125492183538 T:C C T 10 0.542347276909282 0.74064055507759 ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46719087_46719159:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46719087_46719159:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46719087_46719159:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46719087_46719159:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000479645:exon_46719087_46719159:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000466510:exon_46719087_46719159:GTSE1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 46725350 T/C 1 12 7 19 5.49183267708862 3.79643093836497 1.69540173872364 T:C T C 10 0.542347276909282 0.496030351825327 ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46725255_46725464:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46725255_46725464:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46725255_46725464:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46725255_46725464:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000491863:exon_46724820_46725464:GTSE1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 50356555 T/C 1 4 12 16 1.83061089236287 6.50816732291138 -4.67755643054851 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0230424394536266 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 50356693 T/C 1 118 107 225 54.0030213247047 58.0311586292932 -4.02813730458845 T:C T C 10 0.542347276909282 0.593187557287997 ENSG00000198355:ENST00000360612:exon_50356588_50357728:PIM3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 50635848 C/G 1 5 7 12 2.28826361545359 3.79643093836497 -1.50816732291138 C:G C G 10 0.542347276909282 0.401951173845371 ENSG00000170638:ENST00000472677:exon_50635322_50636615:TRABD HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 50637597 G/C 1 253 219 472 115.786138941952 118.774053643133 -2.98791470118108 A:C:G G C 10 0.542347276909282 0.781885533455807 ENSG00000170638:ENST00000380909:exon_50636774_50637993:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000303434:exon_50636774_50638027:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000463233:exon_50636774_50638024:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395827:exon_50636774_50637904:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395829:exon_50637545_50637998:TRABD HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 50658424 T/C 1 4 11 15 1.83061089236287 5.9658200460021 -4.13520915363923 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0383920942670258 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50658386_50658444:TUBGCP6 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 50714320 C/T 1 52 46 98 23.7979416007173 24.947974737827 -1.15003313710963 T:C C T 10 0.542347276909282 0.839757095366136 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50714318_50714392:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50714318_50714392:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50714318_50714392:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479818:exon_50714318_50714392:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50714318_50714392:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50714318_50714392:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50714318_50714392:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50714318_50714392:PLXNB2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 50716167 G/A 1 7 20 27 3.20356906163503 10.8469455381856 -7.64337647655061 A:G G A 10 0.542347276909282 0.00343866158222716 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479818:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50716020_50716167:PLXNB2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 50719251 A/G 1 6 8 14 2.74591633854431 4.33877821527426 -1.59286187672995 A:G A G 10 0.542347276909282 0.431117415726890 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50719173_50719402:PLXNB2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 50877166 G/C 1 15 22 37 6.86479084636077 11.9316400920042 -5.06684924564343 C:G G C 10 0.542347276909282 0.101028719372345 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50877028_50877191:PPP6R2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 50879447 T/G 1 36 38 74 16.4754980312659 20.6091965225527 -4.13369849128686 T:G T G 10 0.542347276909282 0.352182487746956 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50879230_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50879230_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000473283:exon_50879251_50879503:PPP6R2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 50885775 A/G 1 35 39 74 16.0178453081751 21.151543799462 -5.13369849128687 A:G A G 10 0.542347276909282 0.244648168214429 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000418590:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000470434:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000473724:exon_50885751_50886038:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50885751_50885882:SBF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 50941985 T/C 1 21 37 58 9.61070718490508 20.0668492456434 -10.4561420607384 T:C T C 10 0.542347276909282 0.00785214755520081 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50941380_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50941426_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50941690_50942128:LMF2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 50944128 G/A 1 7 3 10 3.20356906163503 1.62704183072785 1.57652723090718 A:G G A 10 0.542347276909282 0.361234487774673 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 50962208 T/G 1 197 166 363 90.1575864488715 90.0296479669408 0.127938481930642 T:G T G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 50962782 C/G 1 96 79 175 43.9346614167089 42.8454348758333 1.08922654087566 C:G C G 10 0.542347276909282 0.87973469159855 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000439934:exon_50962431_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000423348:exon_50962431_50962853:SCO2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 50964236 G/A 1 274 235 509 125.396846126857 127.451610073681 -2.05476394682452 A:T:G G A 10 0.542347276909282 0.85888442158553 ENSG00000025708:ENST00000395680:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395681:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000252029:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000487577:exon_50964184_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395678:exon_50964185_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000476284:exon_50964186_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000425169:exon_50964214_50964347:TYMP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 50964255 C/T 1 288 363 651 131.803984250127 196.872061518069 -65.0680772679426 T:C:G C T 10 0.542347276909282 3.59015708401463e-07 ENSG00000025708:ENST00000395680:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395681:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000252029:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000487577:exon_50964184_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395678:exon_50964185_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000476284:exon_50964186_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000425169:exon_50964214_50964347:TYMP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 22 50964862 G/A 1 166 191 357 75.9703520330592 103.588329889673 -27.6179778566137 A:G G A 10 0.542347276909282 0.00346552965894054 ENSG00000130489:ENST00000423348:exon_50964675_50964868:SCO2;ENSG00000025708:ENST00000395680:exon_50964675_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395681:exon_50964675_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000252029:exon_50964675_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000487577:exon_50964675_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395678:exon_50964675_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000476284:exon_50964430_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000425169:exon_50964675_50964905:TYMP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 9406836 T/C 1 10 2 12 4.57652723090718 1.08469455381856 3.49183267708862 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0467512693233193 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000417036:exon_9406700_9406874:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000419437:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9406705_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9406700_9407004:THUMPD3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 9422210 T/C 1 2 7 9 0.915305446181436 3.79643093836497 -2.88112549218354 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0896908680114052 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000441127:exon_9422187_9422316:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000461636:exon_9422187_9422572:THUMPD3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 9425911 G/A 1 23 21 44 10.5260126310865 11.3892928150949 -0.863280184008406 A:G G A 10 0.542347276909282 0.880008851298633 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000484006:exon_9425896_9426060:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9425896_9426019:THUMPD3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 9425944 G/C 1 30 28 58 13.7295816927215 15.1857237534599 -1.45614206073835 C:G G C 10 0.542347276909282 0.792389469955544 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000484006:exon_9425896_9426060:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9425896_9426019:THUMPD3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 9426224 G/A 1 51 59 110 23.3402888776266 31.9984893376476 -8.65820046002102 A:G G A 10 0.542347276909282 0.104071750657157 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9426208_9427386:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9426208_9428475:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9426208_9426554:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9426208_9426554:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9426208_9426344:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9426208_9426554:THUMPD3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 9426330 A/G 1 61 54 115 27.9168161085338 29.2867529531012 -1.36993684456743 A:G A G 10 0.542347276909282 0.851645245573152 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9426208_9427386:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9426208_9428475:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9426208_9426554:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9426208_9426554:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9426208_9426344:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9426208_9426554:THUMPD3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 9870857 G/A 1 6 10 16 2.74591633854431 5.42347276909282 -2.67755643054851 A:G G A 10 0.542347276909282 0.213548421391003 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9870644_9871079:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000431204:exon_9870644_9870936:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9870363_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000466245:exon_9870644_9871019:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9870847_9871079:TTLL3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 9871030 T/G 1 15 6 21 6.86479084636077 3.25408366145569 3.61070718490508 T:G T G 10 0.542347276909282 0.129075031311654 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9870644_9871079:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9870363_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9870847_9871079:TTLL3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 11400019 T/C 1 8 4 12 3.66122178472574 2.16938910763713 1.49183267708862 T:C T C 10 0.542347276909282 0.564494489181351 ENSG00000197548:ENST00000442589:exon_11399892_11400086:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354449:exon_11399892_11400086:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000446450:exon_11399892_11400086:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354956:exon_11399892_11400086:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000424071:exon_11399892_11400084:ATG7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 11596348 C/T 1 19 23 42 8.69540173872364 12.4739873689135 -3.77858563018984 T:C C T 10 0.542347276909282 0.279058424314116 ENSG00000197548:ENST00000442589:exon_11596285_11599132:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354449:exon_11596285_11599139:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000446450:exon_11596285_11596462:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354956:exon_11596285_11596557:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000466605:exon_11596285_11596349:ATG7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 13361287 C/T 1 4 13 17 1.83061089236287 7.05051459982067 -5.21990370745779 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0136420100114285 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13361263_13361479:NUP210 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 14187449 G/T 1 21 27 48 9.61070718490508 14.6433764765506 -5.03266929164553 T:G G T 10 0.542347276909282 0.15018026892156 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14186647_14187659:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14186650_14187659:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14187229_14187659:XPC HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 16305674 C/G 1 4 4 8 1.83061089236287 2.16938910763713 -0.338778215274256 C:G C G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000154813:ENST00000488423:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000285082:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000462982:exon_16305662_16305736:DPH3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 16358584 T/C 1 23 27 50 10.5260126310865 14.6433764765506 -4.1173638454641 T:C T C 10 0.542347276909282 0.258396994702408 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16357352_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16357363_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16358037_16358739:RFTN1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 16364919 A/C 1 12 17 29 5.49183267708862 9.21990370745779 -3.72807103036918 A:C A C 10 0.542347276909282 0.193116423162613 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16364883_16364964:RFTN1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 16535229 C/T 1 5 5 10 2.28826361545359 2.71173638454641 -0.42347276909282 T:C C T 10 0.542347276909282 1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 20216210 G/A 1 90 74 164 41.1887450781646 40.1336984912869 1.05504658687776 A:G G A 10 0.542347276909282 0.87586997163655 ENSG00000129810:ENST00000263753:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000509679:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000522131:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000533388:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000421451:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000482867:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412997:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412868:exon_20215741_20216547:SGOL1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 33905566 C/T 1 8 12 20 3.66122178472574 6.50816732291138 -2.84694553818564 T:C C T 10 0.542347276909282 0.262141543180323 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000465122:exon_33905498_33905609:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000489869:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33905388_33905621:PDCD6IP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 33907945 A/G 1 47 29 76 21.5096779852637 15.7280710303692 5.78160695489457 A:G A G 10 0.542347276909282 0.205764073287727 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33907843_33907960:PDCD6IP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 38047680 G/A 1 3 5 8 1.37295816927215 2.71173638454641 -1.33877821527426 A:G G A 10 0.542347276909282 0.482450044879903 ENSG00000136059:ENST00000283713:exon_38047672_38047743:VILL;ENSG00000136059:ENST00000383759:exon_38047672_38047743:VILL;ENSG00000136059:ENST00000356246:exon_38047672_38047743:VILL;ENSG00000136059:ENST00000465644:exon_38047672_38047743:VILL;ENSG00000136059:ENST00000486616:exon_38047672_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000488209:exon_38047672_38047695:VILL HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 38047954 G/C 1 11 11 22 5.0341799539979 5.9658200460021 -0.931640092004203 C:G G C 10 0.542347276909282 0.831206129894235 ENSG00000136059:ENST00000283713:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000383759:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000356246:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000465644:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000486616:exon_38047672_38048191:VILL HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 42251329 C/T 1 8 6 14 3.66122178472574 3.25408366145569 0.407138123270053 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42251259_42254115:TRAK1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 44986836 T/C 1 10 10 20 4.57652723090718 5.42347276909282 -0.84694553818564 T:C T C 10 0.542347276909282 0.823362696388551 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 45637439 T/C 1 2 7 9 0.915305446181436 3.79643093836497 -2.88112549218354 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0896908680114052 ENSG00000144791:ENST00000440097:exon_45635816_45637779:LIMD1;ENSG00000144791:ENST00000273317:exon_45636351_45637779:LIMD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 47049615 G/A 1 32 20 52 14.644887138903 10.8469455381856 3.79794160071734 A:G G A 10 0.542347276909282 0.330977893529084 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47049560_47049676:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47049560_47049676:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47049560_47049676:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47049560_47049676:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47049560_47049676:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000476095:exon_47049560_47049676:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000477412:exon_47049560_47049676:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000469349:exon_47049253_47049676:NBEAL2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 47712202 T/C 1 13 13 26 5.94948540017933 7.05051459982067 -1.10102919964133 T:C T C 10 0.542347276909282 0.697454295170068 ENSG00000173473:ENST00000254480:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000425518:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000483847:exon_47711840_47712207:SMARCC1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 48636507 G/T 1 154 168 322 70.4785193559706 91.1143425207594 -20.6358231647888 T:G G T 10 0.542347276909282 0.0218255558200078 ENSG00000010256:ENST00000471189:exon_48636435_48636625:UQCRC1;ENSG00000010256:ENST00000203407:exon_48636436_48636625:UQCRC1;ENSG00000010256:ENST00000480561:exon_48636467_48637143:UQCRC1;ENSG00000010256:ENST00000415995:exon_48636487_48636625:UQCRC1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 49094436 C/A 1 3 8 11 1.37295816927215 4.33877821527426 -2.9658200460021 A:C C A 10 0.542347276909282 0.126534045746447 ENSG00000198218:ENST00000395443:exon_49094295_49095323:QRICH1;ENSG00000198218:ENST00000357496:exon_49094295_49095323:QRICH1;ENSG00000198218:ENST00000424300:exon_49094295_49095323:QRICH1;ENSG00000198218:ENST00000479449:exon_49094295_49094476:QRICH1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 49149058 C/T 1 6 4 10 2.74591633854431 2.16938910763713 0.57652723090718 T:C C T 10 0.542347276909282 0.762606887543924 ENSG00000172046:ENST00000398896:exon_49148933_49149246:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398898:exon_49148933_49149246:USP19;ENSG00000172046:ENST00000417901:exon_49148933_49149246:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398909:exon_49148933_49149246:USP19;ENSG00000172046:ENST00000423450:exon_49148933_49149246:USP19;ENSG00000172046:ENST00000425298:exon_49148933_49149246:USP19;ENSG00000172046:ENST00000453664:exon_49148933_49149246:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398892:exon_49148933_49149246:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398888:exon_49148933_49149246:USP19;ENSG00000172046:ENST00000434032:exon_49148933_49149246:USP19 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 49314110 T/C 1 8 7 15 3.66122178472574 3.79643093836497 -0.135209153639229 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000188315:ENST00000343010:exon_49313860_49315342:C3orf62;ENSG00000188315:ENST00000424960:exon_49314009_49314275:C3orf62;ENSG00000188315:ENST00000436325:exon_49313860_49314274:C3orf62 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 49343175 G/A 1 3 9 12 1.37295816927215 4.88112549218354 -3.50816732291138 A:G G A 10 0.542347276909282 0.077659883252704 ENSG00000114316:ENST00000351842:exon_49343148_49343321:USP4;ENSG00000114316:ENST00000265560:exon_49343148_49343321:USP4;ENSG00000114316:ENST00000485450:exon_49343148_49343321:USP4;ENSG00000114316:ENST00000431357:exon_49343148_49343321:USP4;ENSG00000114316:ENST00000486549:exon_49343148_49343321:USP4;ENSG00000114316:ENST00000488520:exon_49343148_49343321:USP4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 51979526 G/C 1 6 2 8 2.74591633854431 1.08469455381856 1.66122178472574 C:G G C 10 0.542347276909282 0.303100337321114 ENSG00000041880:ENST00000417220:exon_51979511_51979660:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000408970:exon_51979511_51979660:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000431474:exon_51979511_51979660:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000447362:exon_51979511_51979660:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000398755:exon_51979511_51979660:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000471971:exon_51979511_51979660:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000498510:exon_51979511_51979644:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000475782:exon_51979511_51979660:PARP3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 52255392 G/A 1 80 42 122 36.6122178472574 22.7785856301898 13.8336322170676 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0138432320218464 ENSG00000239732:ENST00000360658:exon_52255096_52258328:TLR9;ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52255097_52258328:RP11-330H6.5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 52265215 G/A 1 33 29 62 15.1025398619937 15.7280710303692 -0.625531168375483 A:G G A 10 0.542347276909282 0.899066776370729 ENSG00000247596:ENST00000305533:exon_52265143_52265247:TWF2;ENSG00000247596:ENST00000499914:exon_52265143_52265247:TWF2;ENSG00000247596:ENST00000472755:exon_52265143_52265247:TWF2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 52643685 T/C 1 6 7 13 2.74591633854431 3.79643093836497 -1.05051459982067 T:C T C 10 0.542347276909282 0.588981693424056 ENSG00000163939:ENST00000356770:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000394830:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296302:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000337303:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000412587:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409057:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000410007:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296303:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409114:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409767:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000423351:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000446103:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000480064:exon_52643102_52643971:PBRM1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 52721305 G/A 1 38 52 90 17.3908034774473 28.2020583992827 -10.8112549218354 A:G G A 10 0.542347276909282 0.02591071029815 ENSG00000163938:ENST00000479230:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468146:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000462550:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000492349:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000474423:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000460073:exon_52721262_52721399:GNL3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 52727257 G/A 1 143 98 241 65.4443394019727 53.1500331371096 12.2943062648631 A:G G A 10 0.542347276909282 0.120726434511608 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000497356:exon_52727186_52727560:GNL3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 53220215 G/A 1 20 27 47 9.15305446181436 14.6433764765506 -5.49032201473625 A:G G A 10 0.542347276909282 0.142385879517402 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53220183_53220356:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53220183_53220356:PRKCD HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 53222761 C/T 1 31 27 58 14.1872344158123 14.6433764765506 -0.456142060738355 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53222736_53222874:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53222736_53222874:PRKCD HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 53259850 C/T 1 489 365 854 223.792181591361 197.956756071888 25.8354255194732 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0798206639360547 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53258723_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53259767_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53259655_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53259668_53262165:TKT;ENSG00000163931:ENST00000461139:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53259675_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53259718_53259947:TKT HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 53264485 A/G 1 186 142 328 85.1234064948735 77.013313321118 8.11009317375552 A:G A G 10 0.542347276909282 0.375816086166938 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000461139:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53264473_53264637:TKT HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 53269046 T/C 1 77 57 134 35.2392596779853 30.9137947838291 4.32546489415622 T:C T C 10 0.542347276909282 0.488364528290183 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53268999_53269080:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53268999_53269209:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53268999_53269132:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000472528:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000466765:exon_53268999_53269176:TKT;ENSG00000163931:ENST00000487660:exon_53268868_53269190:TKT HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 53269163 G/A 1 20 9 29 9.15305446181436 4.88112549218354 4.27192896963082 A:G G A 10 0.542347276909282 0.136155663592109 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53268999_53269209:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000472528:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000466765:exon_53268999_53269176:TKT;ENSG00000163931:ENST00000487660:exon_53268868_53269190:TKT HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 53321631 A/C 1 68 53 121 31.1203851701688 28.7444056761919 2.37597949397688 A:C A C 10 0.542347276909282 0.715432218756277 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 53905308 T/C 1 24 32 56 10.9836653541772 17.355112861097 -6.37144750691979 T:C T C 10 0.542347276909282 0.106875872035851 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000486794:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000495993:exon_53905185_53905523:ACTR8 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 56627048 A/G 1 4 6 10 1.83061089236287 3.25408366145569 -1.42347276909282 A:G A G 10 0.542347276909282 0.528168739719971 ENSG00000180376:ENST00000436465:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000394672:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000326595:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000471681:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000341455:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000484623:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000494672:exon_56626998_56627089:CCDC66 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 58154327 C/T 1 9 14 23 4.11887450781646 7.59286187672995 -3.47398736891348 T:C C T 10 0.542347276909282 0.208319722118852 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58154167_58155520:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000484981:exon_58154167_58154385:FLNB HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 58414382 C/T 1 3 6 9 1.37295816927215 3.25408366145569 -1.88112549218354 T:C C T 10 0.542347276909282 0.31687860521519 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 58416535 C/T 1 17 8 25 7.78009629254221 4.33877821527426 3.44131807726795 T:C C T 10 0.542347276909282 0.228024617118762 ENSG00000168291:ENST00000302746:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000383714:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000469364:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000479945:exon_58416384_58417520:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000474765:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000461692:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000480626:exon_58416384_58416669:PDHB HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 63981635 C/T 1 10 23 33 4.57652723090718 12.4739873689135 -7.89746013800631 T:C C T 10 0.542347276909282 0.00785106508655347 ENSG00000163635:ENST00000474112:exon_63981181_63982312:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000398590:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000295900:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000487717:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000484332:exon_63981181_63982159:ATXN7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 66419883 T/C 0 8 0 8 3.66122178472574 0 3.66122178472574 T T 10 0.542347276909282 0.00940985022554938 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 66419956 C/T 1 21 4 25 9.61070718490508 2.16938910763713 7.44131807726795 T:C C T 10 0.542347276909282 0.00232732979740786 ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66419902_66419966:SLC25A26 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 67426281 T/C 1 5 4 9 2.28826361545359 2.16938910763713 0.118874507816462 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000172340:ENST00000307227:exon_67425143_67426283:SUCLG2;ENSG00000172340:ENST00000460567:exon_67425143_67426283:SUCLG2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 69082708 C/G 1 19 17 36 8.69540173872364 9.21990370745779 -0.524501968734151 C:G C G 10 0.542347276909282 0.868805076651766 ENSG00000144747:ENST00000398559:exon_69082699_69082855:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000356248:exon_69082699_69082855:TMF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 72799703 C/T 1 8 2 10 3.66122178472574 1.08469455381856 2.57652723090718 T:C C T 10 0.542347276909282 0.121983479725832 ENSG00000144736:ENST00000468371:exon_72798428_72799987:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000325599:exon_72798430_72799987:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000444040:exon_72798430_72799987:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000463369:exon_72799110_72799987:SHQ1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 98250986 C/T 1 62 31 93 28.3744688316245 16.8127655841877 11.5617032474368 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0165915169220818 ENSG00000154165:ENST00000284311:exon_98250855_98251994:GPR15 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 112184927 A/G 1 54 44 98 24.7132470468988 23.8632801840084 0.849966862890366 A:G A G 10 0.542347276909282 0.919376766479063 ENSG00000186265:ENST00000334529:exon_112182815_112185230:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000474965:exon_112184773_112185230:BTLA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 112185025 G/A 1 57 53 110 26.0862052161709 28.7444056761919 -2.65820046002102 A:G G A 10 0.542347276909282 0.633091128591205 ENSG00000186265:ENST00000334529:exon_112182815_112185230:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000474965:exon_112184773_112185230:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000383680:exon_112184955_112185230:BTLA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 112724713 C/T 1 12 17 29 5.49183267708862 9.21990370745779 -3.72807103036918 T:C C T 10 0.542347276909282 0.193116423162613 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112721287_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000412848:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112723764_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112723764_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112723801_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112723811_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112724023_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112724090_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112724090_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112724169_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112724328_112724851:C3orf17 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 121351257 C/T 1 167 167 334 76.4280047561499 90.5719952438501 -14.1439904877002 T:C C T 10 0.542347276909282 0.124284023123457 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121351253_121351410:HCLS1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 121351338 C/T 1 107 98 205 48.9688413707068 53.1500331371096 -4.1811917664028 A:T:C C T 10 0.542347276909282 0.575360024593839 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121351253_121351410:HCLS1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 121353254 T/C 1 65 80 145 29.7474270008967 43.3877821527426 -13.6403551518459 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0243907183436771 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121353054_121353265:HCLS1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 121363680 C/T 1 45 42 87 20.5943725390823 22.7785856301898 -2.18421309110753 T:C C T 10 0.542347276909282 0.667698130738827 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121363665_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121363665_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121363665_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121363665_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000464274:exon_121363665_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000487290:exon_121363665_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000481314:exon_121363077_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000497391:exon_121363665_121363775:HCLS1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 121413637 G/A 1 53 55 108 24.2555943238081 29.8291002300105 -5.57350590620245 A:G G A 10 0.542347276909282 0.28948154092168 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 121415610 G/A 1 30 22 52 13.7295816927215 11.9316400920042 1.79794160071734 A:G G A 10 0.542347276909282 0.677383505986462 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 121500699 C/T 1 13 8 21 5.94948540017933 4.33877821527426 1.61070718490508 T:C C T 10 0.542347276909282 0.519340658548302 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121500590_121500721:IQCB1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 121507231 A/T 1 5 5 10 2.28826361545359 2.71173638454641 -0.42347276909282 A:T A T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121507131_121507279:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121507131_121507279:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121507131_121507279:IQCB1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 122259606 T/C 1 20 24 44 9.15305446181436 13.0163346458228 -3.86328018400841 T:C T C 10 0.542347276909282 0.289704153344107 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000492382:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000489652:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122259319_122259699:PARP9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 122274757 G/C 1 5 12 17 2.28826361545359 6.50816732291138 -4.21990370745779 C:G G C 10 0.542347276909282 0.0505700971879753 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000466126:exon_122274711_122274968:PARP9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 122354037 A/G 1 24 27 51 10.9836653541772 14.6433764765506 -3.65971112237338 A:G A G 10 0.542347276909282 0.327107472725238 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122353867_122354041:PARP15 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 122354716 C/T 1 14 19 33 6.40713812327005 10.3045982612764 -3.8974601380063 T:C C T 10 0.542347276909282 0.220951345401981 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122354658_122354886:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 124456742 G/C 1 24 12 36 10.9836653541772 6.50816732291138 4.47549803126585 C:G G C 10 0.542347276909282 0.180079071452856 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124456415_124457290:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000498715:exon_124456415_124457218:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124456639_124457086:UMPS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 124462808 C/T 1 63 62 125 28.8321215547152 33.6255311683755 -4.79340961366024 T:C C T 10 0.542347276909282 0.419481068483989 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124462762_124464040:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000474588:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124462762_124463138:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000495751:exon_124462762_124462917:UMPS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 124515308 A/G 1 13 11 24 5.94948540017933 5.9658200460021 -0.0163346458227673 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000082781:ENST00000296181:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000481591:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000488466:exon_124515235_124515664:ITGB5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 124515498 T/C 1 9 9 18 4.11887450781646 4.88112549218354 -0.762250984367075 T:C T C 10 0.542347276909282 0.814595397980852 ENSG00000082781:ENST00000296181:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000481591:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000488466:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000474838:exon_124515387_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000496703:exon_124515438_124515664:ITGB5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 124515646 A/C 1 3 9 12 1.37295816927215 4.88112549218354 -3.50816732291138 A:C A C 10 0.542347276909282 0.077659883252704 ENSG00000082781:ENST00000296181:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000481591:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000488466:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000474838:exon_124515387_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000496703:exon_124515438_124515664:ITGB5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 124951821 C/T 1 28 22 50 12.8142762465401 11.9316400920042 0.882636154535902 T:C C T 10 0.542347276909282 0.887431119266639 ENSG00000163848:ENST00000360647:exon_124944405_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000484491:exon_124950920_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000492394:exon_124950923_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000485866:exon_124951172_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000497929:exon_124951185_124952783:ZNF148 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 125648343 G/A 1 2 6 8 0.915305446181436 3.25408366145569 -2.33877821527426 A:G G A 10 0.542347276909282 0.153857012176102 ENSG00000189366:ENST00000340333:exon_125648118_125648410:ALG1L;ENSG00000189366:ENST00000437882:exon_125648118_125648410:ALG1L HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 125726062 T/C 1 6 2 8 2.74591633854431 1.08469455381856 1.66122178472574 T:C T C 10 0.542347276909282 0.303100337321114 ENSG00000114544:ENST00000360370:exon_125725198_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000346785:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000383598:exon_125725201_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000512557:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000506102:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000458524:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315891:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000508835:exon_125725699_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315921:exon_125725916_125726068:SLC41A3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 127292589 G/A 1 12 16 28 5.49183267708862 8.67755643054851 -3.18572375345989 A:G G A 10 0.542347276909282 0.257570341314235 ENSG00000163870:ENST00000296210:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000450633:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000355552:exon_127291930_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000393400:exon_127291936_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000483868:exon_127291974_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000489960:exon_127291989_127292631:TPRA1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 127323830 C/T 1 4 6 10 1.83061089236287 3.25408366145569 -1.42347276909282 T:C C T 10 0.542347276909282 0.528168739719971 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468659:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127323739_127323999:MCM2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 127783698 A/T 1 2 8 10 0.915305446181436 4.33877821527426 -3.42347276909282 A:T A T 10 0.542347276909282 0.0514322924239131 ENSG00000175792:ENST00000472125:exon_127783625_127784063:RUVBL1;ENSG00000175792:ENST00000464873:exon_127783628_127784063:RUVBL1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 127800071 A/G 1 159 113 272 72.7667829714242 61.2852422907489 11.4815406806753 A:G A G 10 0.542347276909282 0.180543679934587 ENSG00000175792:ENST00000322623:exon_127799803_127800252:RUVBL1;ENSG00000175792:ENST00000417360:exon_127799807_127800252:RUVBL1;ENSG00000175792:ENST00000478892:exon_127800025_127800252:RUVBL1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 127872506 C/T 1 11 10 21 5.0341799539979 5.42347276909282 -0.389292815094922 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000175792:ENST00000464873:exon_127872046_127872757:RUVBL1;ENSG00000132394:ENST00000254730:exon_127872297_127872666:EEFSEC;ENSG00000132394:ENST00000483457:exon_127872344_127872666:EEFSEC HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 149459341 A/G 1 9 19 28 4.11887450781646 10.3045982612764 -6.18572375345989 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0222808503891633 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149456257_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149459177_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149459213_149459505:COMMD2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 149700519 T/C 0 30 0 30 13.7295816927215 0 13.7295816927215 T T 10 0.542347276909282 1.30671873931300e-08 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 150262318 C/T 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 T:C C T 10 0.542347276909282 0.734324137601319 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 171087469 G/A 1 17 32 49 7.78009629254221 17.355112861097 -9.57501656855482 A:G G A 10 0.542347276909282 0.00637725005855283 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000465393:exon_171087409_171087474:TNIK HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 174951756 T/C 1 3 106 109 1.37295816927215 57.4888113523839 -56.1158531831117 T:C T C 10 0.542347276909282 3.56492089830342e-32 ENSG00000177694:ENST00000454872:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000485853:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000473253:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000316366:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000489299:exon_174951721_174951994:NAALADL2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 178546026 T/C 1 12 1 13 5.49183267708862 0.542347276909282 4.94948540017934 T:C T C 10 0.542347276909282 0.00483815174817428 ENSG00000197584:ENST00000437510:exon_178545966_178546150:KCNMB2;ENSG00000197584:ENST00000420517:exon_178545966_178546161:KCNMB2;ENSG00000197584:ENST00000452583:exon_178545966_178546161:KCNMB2;ENSG00000197584:ENST00000432997:exon_178545966_178546161:KCNMB2;ENSG00000197584:ENST00000455865:exon_178545966_178546038:KCNMB2;ENSG00000197584:ENST00000422927:exon_178545966_178546054:KCNMB2;ENSG00000197584:ENST00000358316:exon_178545966_178546161:KCNMB2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 178560581 A/C 1 40 14 54 18.3061089236287 7.59286187672995 10.7132470468988 A:C A C 10 0.542347276909282 0.00376551624539291 ENSG00000197584:ENST00000420517:exon_178560441_178560929:KCNMB2;ENSG00000197584:ENST00000452583:exon_178560441_178560929:KCNMB2;ENSG00000197584:ENST00000432997:exon_178560441_178562217:KCNMB2;ENSG00000197584:ENST00000358316:exon_178560441_178562205:KCNMB2;ENSG00000197584:ENST00000457763:exon_178560441_178560725:KCNMB2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 178976777 C/T 1 3 6 9 1.37295816927215 3.25408366145569 -1.88112549218354 T:C C T 10 0.542347276909282 0.31687860521519 ENSG00000171121:ENST00000392686:exon_178976736_178977679:KCNMB3;ENSG00000171121:ENST00000485523:exon_178976736_178976996:KCNMB3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 178978078 T/G 1 14 16 30 6.40713812327005 8.67755643054851 -2.27041830727846 T:G T G 10 0.542347276909282 0.465308468559495 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 182755209 T/G 1 20 26 46 9.15305446181436 14.1010291996413 -4.94797473782697 T:G T G 10 0.542347276909282 0.182330412733671 ENSG00000078070:ENST00000265594:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000492597:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000497830:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000392616:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000495767:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000476176:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000448585:exon_182755202_182755222:MCCC1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 182871962 C/T 1 3 5 8 1.37295816927215 2.71173638454641 -1.33877821527426 T:C C T 10 0.542347276909282 0.482450044879903 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000476015:exon_182871689_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000470251:exon_182871728_182872179:LAMP3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 183976103 C/T 1 26 26 52 11.8989708003587 14.1010291996413 -2.20205839928266 T:C C T 10 0.542347276909282 0.5791321029781 ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183976076_183977373:ECE2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 184020542 G/T 1 4 4 8 1.83061089236287 2.16938910763713 -0.338778215274256 T:G G T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000175166:ENST00000310118:exon_184020467_184020611:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000445558:exon_184020467_184020563:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000435761:exon_184020467_184020611:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000439383:exon_184020467_184020611:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000485937:exon_184020467_184020560:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000491149:exon_184020467_184020611:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000460628:exon_184020528_184020611:PSMD2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 184026703 C/T 1 153 134 287 70.0208666328799 72.6745351058438 -2.65366847296393 T:C C T 10 0.542347276909282 0.76727932389502 ENSG00000175166:ENST00000310118:exon_184026496_184026842:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000435761:exon_184026496_184026788:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000439383:exon_184026496_184026836:PSMD2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 184429414 C/A 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 A:C C A 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000177383:ENST00000317897:exon_184428156_184429836:MAGEF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 185135448 G/A 1 1481 6 1487 677.783682897353 3.25408366145569 674.529599235898 A:T:G G T 10 0.542347276909282 0 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 186301703 A/G 1 41 49 90 18.7637616467194 26.5750165685548 -7.81125492183538 A:G A G 10 0.542347276909282 0.112296564077482 ENSG00000090520:ENST00000439351:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000265028:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000495390:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000418776:exon_186301654_186301765:DNAJB11 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 193374964 T/C 1 5 9 14 2.28826361545359 4.88112549218354 -2.59286187672995 T:C T C 10 0.542347276909282 0.187369064466614 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000482865:exon_193374869_193375021:OPA1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 195453064 T/G 1 5 4 9 2.28826361545359 2.16938910763713 0.118874507816462 T:G T G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000176945:ENST00000447234:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000320736:exon_195452544_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000436408:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000445522:exon_195451098_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000381954:exon_195452544_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000498018:exon_195453052_195453443:MUC20 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 195453205 G/A 1 12 3 15 5.49183267708862 1.62704183072785 3.86479084636077 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0666375844661501 ENSG00000176945:ENST00000447234:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000320736:exon_195452544_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000436408:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000445522:exon_195451098_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000381954:exon_195452544_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000498018:exon_195453052_195453443:MUC20 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 195456561 C/G 1 10 9 19 4.57652723090718 4.88112549218354 -0.304598261276357 C:G C G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000176945:ENST00000447234:exon_195456519_195456610:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000320736:exon_195456519_195456610:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000436408:exon_195456519_195456610:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000445522:exon_195456519_195456610:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000381954:exon_195456519_195456610:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000498018:exon_195456519_195456993:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000423938:exon_195456519_195456610:MUC20 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 195778972 C/T 1 10 30 40 4.57652723090718 16.2704183072785 -11.6938910763713 T:C C T 10 0.542347276909282 0.000205729180433127 ENSG00000072274:ENST00000360110:exon_195776155_195779055:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000420415:exon_195776155_195779055:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000392396:exon_195776347_195779055:TFRC HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 196381434 C/T 1 6 10 16 2.74591633854431 5.42347276909282 -2.67755643054851 T:C C T 10 0.542347276909282 0.213548421391003 ENSG00000174004:ENST00000328557:exon_196381398_196381518:LRRC33;ENSG00000174004:ENST00000461791:exon_196381398_196381864:LRRC33;ENSG00000163964:ENST00000426755:exon_196381398_196381518:PIGX HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 196386964 C/G 1 15 8 23 6.86479084636077 4.33877821527426 2.52601263108651 C:G C G 10 0.542347276909282 0.403120043211592 ENSG00000174004:ENST00000328557:exon_196386623_196388875:LRRC33 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 3 196460680 C/T 1 6 4 10 2.74591633854431 2.16938910763713 0.57652723090718 T:C C T 10 0.542347276909282 0.762606887543924 ENSG00000163964:ENST00000392391:exon_196460630_196462878:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000314118:exon_196460630_196462855:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000296333:exon_196460630_196460773:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000453218:exon_196460630_196460911:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000415832:exon_196460630_196461160:PIGX HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 87113 T/C 0 0 17 17 0 9.21990370745779 -9.21990370745779 C T C 10 0.542347276909282 1.69477817965813e-06 ENSG00000197701:ENST00000339368:exon_85622_88099:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000507368:exon_85622_87412:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000512065:exon_85622_87410:ZNF595 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 517461 T/C 1 6 4 10 2.74591633854431 2.16938910763713 0.57652723090718 T:C T C 10 0.542347276909282 0.762606887543924 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508562:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511247:exon_517309_517702:PIGG HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 520853 G/A 1 8 7 15 3.66122178472574 3.79643093836497 -0.135209153639229 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508669:exon_520828_521329:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503261:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000510235:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_520739_521019:PIGG HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 533001 T/C 1 17 9 26 7.78009629254221 4.88112549218354 2.89897080035867 T:C T C 10 0.542347276909282 0.325771542254625 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_532942_533314:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_532942_533154:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513239:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513192:exon_532942_533314:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508144:exon_532942_533985:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000515237:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000505800:exon_532942_533312:PIGG HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 666212 T/G 1 5 4 9 2.28826361545359 2.16938910763713 0.118874507816462 T:G T G 10 0.542347276909282 1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 759883 G/A 1 2 12 14 0.915305446181436 6.50816732291138 -5.59286187672995 A:G G A 10 0.542347276909282 0.00501156360424229 ENSG00000185619:ENST00000362003:exon_759820_764428:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000505655:exon_759820_764428:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000521023:exon_759820_764428:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000470161:exon_759820_760396:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000430644:exon_759823_760387:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000440452:exon_759820_760193:PCGF3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 843695 A/G 1 112 120 232 51.2571049861604 65.0816732291138 -13.8245682429534 A:T:G A G 10 0.542347276909282 0.0750833646173655 ENSG00000178950:ENST00000502799:exon_843680_845461:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504668:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_843680_844197:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511345:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_843680_843856:GAK HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 860192 A/G 1 6 6 12 2.74591633854431 3.25408366145569 -0.508167322911383 A:G A G 10 0.542347276909282 0.780543886765314 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000510799:exon_860152_860289:GAK HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 860796 C/T 1 20 17 37 9.15305446181436 9.21990370745779 -0.066849245643434 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_860744_861220:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_860744_861220:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_860744_861220:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_860744_861220:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_860744_861071:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_860744_860950:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_860744_861220:GAK;ENSG00000178950:ENST00000510799:exon_860744_861006:GAK HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 946226 T/C 1 4 6 10 1.83061089236287 3.25408366145569 -1.42347276909282 T:C T C 10 0.542347276909282 0.528168739719971 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514453:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515492:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000452360:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000509508:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515876:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515740:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000508204:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000510493:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504180:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505148:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000506669:exon_946199_946238:TMEM175 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 1165130 G/T 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 T:G G T 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000159674:ENST00000290902:exon_1165051_1165274:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000431380:exon_1165051_1165274:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000507466:exon_1165051_1165413:SPON2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 1737502 C/T 1 26 15 41 11.8989708003587 8.13520915363923 3.76376164671944 T:C C T 10 0.542347276909282 0.273984565750839 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1737458_1737554:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1737458_1737561:TACC3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 1746229 G/T 1 2 6 8 0.915305446181436 3.25408366145569 -2.33877821527426 T:G G T 10 0.542347276909282 0.153857012176102 ENSG00000013810:ENST00000484264:exon_1746166_1746351:TACC3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 2233709 A/G 1 4 6 10 1.83061089236287 3.25408366145569 -1.42347276909282 A:G A G 10 0.542347276909282 0.528168739719971 ENSG00000130997:ENST00000506518:exon_2233672_2233870:POLN;ENSG00000214367:ENST00000243706:exon_2230076_2233887:HAUS3;ENSG00000214367:ENST00000443786:exon_2233568_2233887:HAUS3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 2743999 A/G 1 100 111 211 45.7652723090718 60.2005477369303 -14.4352754278585 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0527958716970372 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 2744087 G/A 1 90 88 178 41.1887450781646 47.7265603680168 -6.53781528985219 A:T:G G A 10 0.542347276909282 0.329150827695018 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 2933271 G/A 1 21 21 42 9.61070718490508 11.3892928150949 -1.77858563018984 A:G G A 10 0.542347276909282 0.643271405293632 ENSG00000109736:ENST00000508276:exon_2933102_2933663:MFSD10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 2943361 T/C 1 8 13 21 3.66122178472574 7.05051459982067 -3.38929281509492 T:C T C 10 0.542347276909282 0.187922995573266 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000507120:exon_2943309_2943443:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2943309_2943456:NOP14 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 2951804 A/G 1 13 7 20 5.94948540017933 3.79643093836497 2.15305446181436 A:G A G 10 0.542347276909282 0.376633018290733 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2951661_2951940:NOP14 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 3215835 T/C 1 6 5 11 2.74591633854431 2.71173638454641 0.0341799539978984 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3215685_3215862:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3215685_3215862:HTT HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 4276475 C/T 1 170 197 367 77.8009629254221 106.842413551129 -29.0414506257065 T:C C T 10 0.542347276909282 0.00277574840172979 ENSG00000145220:ENST00000343470:exon_4276094_4276496:LYAR;ENSG00000145220:ENST00000452476:exon_4276094_4276496:LYAR HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 4861974 C/T 1 4 14 18 1.83061089236287 7.59286187672995 -5.76225098436707 T:C C T 10 0.542347276909282 0.00798066719892284 ENSG00000163132:ENST00000382723:exon_4861393_4862095:MSX1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 6304087 A/G 1 11 2 13 5.0341799539979 1.08469455381856 3.94948540017933 A:G A G 10 0.542347276909282 0.04696746291402 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 6304242 T/C 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 T:C T C 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 8242499 G/A 1 96 34 130 43.9346614167089 18.4398074149156 25.4948540017933 A:G G A 10 0.542347276909282 5.53981400568945e-06 ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8242425_8242830:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8242425_8242818:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502350:exon_8242425_8242818:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502559:exon_8242425_8242818:SH3TC1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 8375342 G/A 1 16 14 30 7.32244356945149 7.59286187672995 -0.270418307278459 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000087008:ENST00000512411:exon_8375288_8375542:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000515797:exon_8375288_8375355:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000356406:exon_8375288_8375355:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000503233:exon_8375288_8375355:ACOX3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 13604182 T/C 1 7 4 11 3.20356906163503 2.16938910763713 1.0341799539979 T:C T C 10 0.542347276909282 0.763959235154452 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 13604418 G/C 1 6 8 14 2.74591633854431 4.33877821527426 -1.59286187672995 C:G G C 10 0.542347276909282 0.431117415726890 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 13615174 G/A 1 108 88 196 49.4264940937975 47.7265603680168 1.69993372578073 A:G G A 10 0.542347276909282 0.82998876829319 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13615136_13615285:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13615136_13615285:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000482713:exon_13615130_13615285:BOD1L HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 25417109 T/A 1 6 9 15 2.74591633854431 4.88112549218354 -2.13520915363923 A:T:C T A 10 0.542347276909282 0.307109737553343 ENSG00000053900:ENST00000315368:exon_25417088_25417162:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000510092:exon_25417088_25417162:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000504256:exon_25417088_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000515848:exon_25417088_25417162:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000506973:exon_25416774_25418220:ANAPC4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 25419283 T/C 1 9 24 33 4.11887450781646 13.0163346458228 -8.8974601380063 T:C T C 10 0.542347276909282 0.00246144506104428 ENSG00000053900:ENST00000315368:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000510092:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000504256:exon_25417088_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000515848:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000506973:exon_25419238_25420119:ANAPC4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 25760693 A/G 1 8 3 11 3.66122178472574 1.62704183072785 2.0341799539979 A:G A G 10 0.542347276909282 0.244923170028471 ENSG00000091490:ENST00000513416:exon_25760563_25761599:SEL1L3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 38774785 A/G 1 86 78 164 39.3581341858018 42.303087598924 -2.94495341312224 A:G A G 10 0.542347276909282 0.69529699221724 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 38775040 A/G 1 26 24 50 11.8989708003587 13.0163346458228 -1.1173638454641 A:G A G 10 0.542347276909282 0.77785155586525 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 38776491 T/G 1 61 58 119 27.9168161085338 31.4561420607384 -3.53932595220455 T:G T G 10 0.542347276909282 0.521003349419348 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 38776725 C/A 1 55 62 117 25.1708997699895 33.6255311683755 -8.45463139838599 A:C C A 10 0.542347276909282 0.137327208110421 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 38777059 C/T 1 25 30 55 11.441318077268 16.2704183072785 -4.82910023001051 T:C C T 10 0.542347276909282 0.223273432233755 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000502321:exon_38776887_38777176:TLR10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 38777173 A/T 1 15 14 29 6.86479084636077 7.59286187672995 -0.728071030369177 A:T A T 10 0.542347276909282 0.853091476622548 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000502321:exon_38776887_38777176:TLR10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 38777236 T/G 1 9 15 24 4.11887450781646 8.13520915363923 -4.01633464582277 T:G T G 10 0.542347276909282 0.105846506377141 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 38828828 G/A 1 13 3 16 5.94948540017933 1.62704183072785 4.32244356945149 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0418964267698885 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000440845:exon_38828704_38829000:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 39000569 C/T 1 9 4 13 4.11887450781646 2.16938910763713 1.94948540017933 T:C C T 10 0.542347276909282 0.405355588189296 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 39302029 T/C 1 7 5 12 3.20356906163503 2.71173638454641 0.491832677088616 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000505077:exon_39301936_39302034:RFC1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 39458051 A/G 1 215 3 218 98.3953354645044 1.62704183072785 96.7682936337765 A:G A G 10 0.542347276909282 1.49618045439514e-52 ENSG00000163682:ENST00000295955:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503277:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000449470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000508595:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000514842:exon_39458026_39459301:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503040:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000504470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000511075:exon_39457431_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000437992:exon_39457948_39458158:RPL9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 54011526 A/G 1 7 12 19 3.20356906163503 6.50816732291138 -3.30459826127636 A:G A G 10 0.542347276909282 0.166892980214950 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54011500_54011749:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54011500_54011749:SCFD2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 56756531 T/C 1 12 2 14 5.49183267708862 1.08469455381856 4.40713812327005 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0280662060891375 ENSG00000090989:ENST00000381295:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000346134:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000349598:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000511971:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000509302:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000504321:exon_56756389_56756552:EXOC1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 57204777 A/C 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 A:C A C 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57204771_57204957:AASDH HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 57211352 T/C 1 10 3 13 4.57652723090718 1.62704183072785 2.94948540017933 T:C T C 10 0.542347276909282 0.161807814900871 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57211293_57211456:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57211293_57211456:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57211293_57211456:AASDH HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 57357683 T/C 1 86 100 186 39.3581341858018 54.2347276909282 -14.8765935051264 A:T:C:G T C 10 0.542347276909282 0.0325955292049643 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57357597_57357734:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57357597_57357734:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000505314:exon_57357597_57357731:SRP72 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 73964174 G/A 1 92 80 172 42.1040505243461 43.3877821527426 -1.2837316283965 A:T:G G A 10 0.542347276909282 0.878458601177094 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73963790_73964237:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73963790_73964237:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73963790_73964237:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73963790_73964237:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000513908:exon_73963790_73964237:ANKRD17 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 75937971 C/T 1 9 3 12 4.11887450781646 1.62704183072785 2.49183267708862 T:C C T 10 0.542347276909282 0.245685043790611 ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 75938179 G/A 1 4 5 9 1.83061089236287 2.71173638454641 -0.881125492183538 A:G G A 10 0.542347276909282 0.74064055507759 ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 75938236 A/G 1 5 4 9 2.28826361545359 2.16938910763713 0.118874507816462 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 76877285 C/G 1 63 45 108 28.8321215547152 24.4056274609177 4.42649409379755 C:G C G 10 0.542347276909282 0.440007590084303 ENSG00000198301:ENST00000502543:exon_76877128_76877289:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76877128_76877289:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76877128_76877289:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76877128_76877289:SDAD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 76878688 G/A 1 43 27 70 19.6790670929009 14.6433764765506 5.03569061635026 A:G G A 10 0.542347276909282 0.23323730001676 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76878671_76878861:SDAD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 76881233 G/T 1 37 44 81 16.9331507543566 23.8632801840084 -6.93012942965184 T:G G T 10 0.542347276909282 0.146715504303923 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76881219_76881345:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76881219_76881345:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76881219_76881345:SDAD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 78806415 C/T 1 125 88 213 57.2065903863398 47.7265603680168 9.48003001832294 T:C C T 10 0.542347276909282 0.215700952902987 ENSG00000169288:ENST00000315567:exon_78806410_78806493:MRPL1;ENSG00000169288:ENST00000511521:exon_78806410_78806472:MRPL1;ENSG00000169288:ENST00000502384:exon_78806410_78806493:MRPL1;ENSG00000169288:ENST00000506674:exon_78806410_78806493:MRPL1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 83381295 C/T 1 8 3 11 3.66122178472574 1.62704183072785 2.0341799539979 T:C C T 10 0.542347276909282 0.244923170028471 ENSG00000145293:ENST00000273920:exon_83381134_83382244:ENOPH1;ENSG00000145293:ENST00000509635:exon_83381134_83382208:ENOPH1;ENSG00000145293:ENST00000505846:exon_83381134_83382240:ENOPH1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 84191031 A/G 1 4 7 11 1.83061089236287 3.79643093836497 -1.9658200460021 A:G A G 10 0.542347276909282 0.364977036425421 ENSG00000173085:ENST00000311469:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000503915:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000439031:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000311461:exon_84191013_84191146:COQ2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 88258483 T/C 1 4 8 12 1.83061089236287 4.33877821527426 -2.50816732291138 T:C T C 10 0.542347276909282 0.160074351563904 ENSG00000198189:ENST00000358290:exon_88257762_88258518:HSD17B11;ENSG00000198189:ENST00000507518:exon_88258102_88258518:HSD17B11;ENSG00000198189:ENST00000512344:exon_88258201_88258518:HSD17B11;ENSG00000198189:ENST00000502576:exon_88258364_88258518:HSD17B11;ENSG00000198189:ENST00000507286:exon_88258427_88258518:HSD17B11 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 100871381 C/G 1 98 103 201 44.8499668628904 55.861769521656 -11.0118026587657 C:G C G 10 0.542347276909282 0.120016040998876 ENSG00000164032:ENST00000511348:exon_100871325_100871512:H2AFZ;ENSG00000164032:ENST00000511203:exon_100870430_100871456:H2AFZ;ENSG00000164032:ENST00000296417:exon_100871325_100871545:H2AFZ;ENSG00000164032:ENST00000511319:exon_100870820_100871425:H2AFZ;ENSG00000164032:ENST00000527366:exon_100871325_100871411:H2AFZ HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 103225513 T/C 1 5 4 9 2.28826361545359 2.16938910763713 0.118874507816462 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000138821:ENST00000424970:exon_103225474_103225638:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000356736:exon_103225474_103225638:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000394833:exon_103225474_103225638:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000512337:exon_103225474_103225645:SLC39A8 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 103555992 A/G 1 7 5 12 3.20356906163503 2.71173638454641 0.491832677088616 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103555945_103556202:MANBA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 103789810 C/A 1 9 18 27 4.11887450781646 9.76225098436707 -5.64337647655061 A:C C A 10 0.542347276909282 0.0335573060443152 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 104044197 G/C 1 11 20 31 5.0341799539979 10.8469455381856 -5.81276558418774 C:G G C 10 0.542347276909282 0.0461711318532332 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104044028_104044246:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104044028_104044246:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104044028_104044246:CENPE HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 104061993 C/G 1 35 39 74 16.0178453081751 21.151543799462 -5.13369849128687 C:G C G 10 0.542347276909282 0.244648168214429 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061971_104062261:CENPE HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 104062223 C/T 1 28 26 54 12.8142762465401 14.1010291996413 -1.28675295310123 T:C C T 10 0.542347276909282 0.78526647999174 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061971_104062261:CENPE HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 104082349 C/T 1 45 48 93 20.5943725390823 26.0326692916455 -5.43829675256322 T:C C T 10 0.542347276909282 0.297986460661561 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000503705:exon_104082243_104082408:CENPE HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 108931039 T/C 1 27 13 40 12.3566235234494 7.05051459982067 5.30610892362872 T:C T C 10 0.542347276909282 0.112120367806756 ENSG00000138796:ENST00000403312:exon_108930915_108931043:HADH;ENSG00000138796:ENST00000351726:exon_108930915_108931043:HADH;ENSG00000138796:ENST00000309522:exon_108930915_108931043:HADH;ENSG00000138796:ENST00000505878:exon_108930915_108931043:HADH;ENSG00000138796:ENST00000454409:exon_108930915_108931043:HADH HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 110605744 A/T 1 93 90 183 42.5617032474368 48.8112549218354 -6.2495516743986 A:T A T 10 0.542347276909282 0.373615874788065 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000494604:exon_110605596_110606523:CCDC109B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 113199075 A/G 1 39 32 71 17.848456200538 17.355112861097 0.49334333944098 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000145365:ENST00000361717:exon_113196783_113199590:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000438746:exon_113197177_113199342:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000500655:exon_113198915_113199590:TIFA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 113350415 C/T 1 7 2 9 3.20356906163503 1.08469455381856 2.11887450781646 T:C C T 10 0.542347276909282 0.193758782140484 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 113565835 G/A 1 197 185 382 90.1575864488715 100.334246228217 -10.1766597793457 A:C:G G A 10 0.542347276909282 0.30464438734582 ENSG00000174720:ENST00000344442:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000512589:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000509061:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000509622:exon_113565824_113565924:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000508577:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000513553:exon_113565824_113565855:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000505034:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000324052:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000505216:exon_113565824_113565924:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000507443:exon_113565460_113566027:LARP7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 113568544 G/A 1 339 321 660 155.144273127753 174.09347588788 -18.9492027601261 A:G G A 10 0.542347276909282 0.148284948974370 ENSG00000174720:ENST00000344442:exon_113568355_113568705:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000509061:exon_113568355_113568705:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000509622:exon_113568355_113568705:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000505034:exon_113568355_113568605:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000324052:exon_113568355_113568705:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000511529:exon_113568367_113568705:LARP7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 119736796 A/C 1 19 22 41 8.69540173872364 11.9316400920042 -3.23623835328056 A:C A C 10 0.542347276909282 0.348394795219911 ENSG00000150961:ENST00000280551:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000379735:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000429811:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000419654:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000514561:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000509818:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000506622:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000503683:exon_119736782_119736881:SEC24D HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 123280860 T/C 1 6 11 17 2.74591633854431 5.9658200460021 -3.21990370745779 T:C T C 10 0.542347276909282 0.145336942608811 ENSG00000138688:ENST00000264501:exon_123280712_123280877:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000388738:exon_123280712_123280877:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000431755:exon_123280712_123280877:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000438707:exon_123280712_123280877:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000306802:exon_123280712_123280877:KIAA1109 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 123838758 A/G 1 3 5 8 1.37295816927215 2.71173638454641 -1.33877821527426 A:G A G 10 0.542347276909282 0.482450044879903 ENSG00000170917:ENST00000512116:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000304430:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000339154:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000503370:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000394344:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000513517:exon_123838656_123843752:NUDT6 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 151199080 G/A 1 7 3 10 3.20356906163503 1.62704183072785 1.57652723090718 A:G G A 10 0.542347276909282 0.361234487774673 ENSG00000198589:ENST00000510413:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000357115:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000503716:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000515096:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000509835:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000510157:exon_151199005_151199156:LRBA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 154548809 G/C 1 19 19 38 8.69540173872364 10.3045982612764 -1.60919652255271 C:G G C 10 0.542347276909282 0.628056780896392 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154548757_154548839:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154548757_154548839:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154548757_154548839:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154548757_154548839:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154548757_154548839:KIAA0922 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 155459194 A/T 1 29 22 51 13.2719289696308 11.9316400920042 1.34028887762662 A:T:G A T 10 0.542347276909282 0.779324597027643 ENSG00000171566:ENST00000499023:exon_155459121_155459260:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000393905:exon_155459121_155459260:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000506627:exon_155459121_155459234:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000503251:exon_155459121_155459260:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000302078:exon_155459121_155459260:PLRG1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 155461113 T/C 1 20 11 31 9.15305446181436 5.9658200460021 3.18723441581226 T:C T C 10 0.542347276909282 0.282836459056174 ENSG00000171566:ENST00000499023:exon_155461103_155461205:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000393905:exon_155461103_155461205:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000506627:exon_155461103_155461205:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000302078:exon_155461103_155461205:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000507125:exon_155461103_155461424:PLRG1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 156273768 T/C 1 16 15 31 7.32244356945149 8.13520915363923 -0.812765584187741 T:C T C 10 0.542347276909282 0.857515868420013 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156273748_156273880:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156273748_156273880:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000503466:exon_156273748_156273838:MAP9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 156274377 T/C 1 40 24 64 18.3061089236287 13.0163346458228 5.28977427780595 T:C T C 10 0.542347276909282 0.210068779793067 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156274331_156274492:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156274331_156274492:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156274331_156274492:MAP9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 156276289 C/T 1 10 9 19 4.57652723090718 4.88112549218354 -0.304598261276357 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156276223_156276312:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156276223_156276312:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156276223_156276312:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000433024:exon_156276223_156276312:MAP9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 170652863 C/T 1 26 31 57 11.8989708003587 16.8127655841877 -4.91379478382907 T:C C T 10 0.542347276909282 0.231309577558533 ENSG00000056050:ENST00000393381:exon_170652855_170653027:C4orf27;ENSG00000056050:ENST00000515204:exon_170652855_170653169:C4orf27 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 177243366 G/T 1 25 8 33 11.441318077268 4.33877821527426 7.1025398619937 T:G G T 10 0.542347276909282 0.0139288382829193 ENSG00000129128:ENST00000264597:exon_177243321_177243396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000503362:exon_177243321_177243394:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000507678:exon_177241142_177243394:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000513139:exon_177243321_177243394:SPCS3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 186379735 T/C 1 9 21 30 4.11887450781646 11.3892928150949 -7.27041830727846 T:C T C 10 0.542347276909282 0.00949693917693303 ENSG00000168491:ENST00000307588:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000393540:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000510617:exon_186379280_186381392:CCDC110 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 186379899 G/C 1 16 9 25 7.32244356945149 4.88112549218354 2.44131807726795 C:G G C 10 0.542347276909282 0.422950604085886 ENSG00000168491:ENST00000307588:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000393540:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000510617:exon_186379280_186381392:CCDC110 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 186380243 A/C 1 14 8 22 6.40713812327005 4.33877821527426 2.0683599079958 A:C A C 10 0.542347276909282 0.401761216392069 ENSG00000168491:ENST00000307588:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000393540:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000510617:exon_186379280_186381392:CCDC110 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 186380295 A/G 1 2 9 11 0.915305446181436 4.88112549218354 -3.9658200460021 A:G A G 10 0.542347276909282 0.029114908365116 ENSG00000168491:ENST00000307588:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000393540:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000510617:exon_186379280_186381392:CCDC110 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 186380515 G/A 1 7 2 9 3.20356906163503 1.08469455381856 2.11887450781646 A:G G A 10 0.542347276909282 0.193758782140484 ENSG00000168491:ENST00000307588:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000393540:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000510617:exon_186379280_186381392:CCDC110 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 190862155 T/G 1 50 18 68 22.8826361545359 9.76225098436707 13.1203851701688 T:G T G 10 0.542347276909282 0.00140350983010122 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 4 190862182 C/T 1 50 23 73 22.8826361545359 12.4739873689135 10.4086487856224 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0181937309982865 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000514482:exon_190862179_190862226:FRG1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 434981 G/C 1 12 5 17 5.49183267708862 2.71173638454641 2.78009629254221 C:G G C 10 0.542347276909282 0.225793255539929 ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_433968_435008:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_433968_435225:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000507048:exon_433968_435224:AHRR HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 442571 A/C 1 15 11 26 6.86479084636077 5.9658200460021 0.898970800358668 A:C A C 10 0.542347276909282 0.844693076966731 ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 31409252 A/G 1 6 12 18 2.74591633854431 6.50816732291138 -3.76225098436707 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0970462749287574 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000509067:exon_31408843_31409266:DROSHA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 33461355 G/A 1 29 22 51 13.2719289696308 11.9316400920042 1.34028887762662 A:G G A 10 0.542347276909282 0.779324597027643 ENSG00000113407:ENST00000502553:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000265112:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000414361:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000508361:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000455217:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000507716:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509731:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509410:exon_33461263_33461400:TARS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 37341352 T/C 1 3 6 9 1.37295816927215 3.25408366145569 -1.88112549218354 T:C T C 10 0.542347276909282 0.31687860521519 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 43294192 C/T 1 37 26 63 16.9331507543566 14.1010291996413 2.83212155471524 T:C C T 10 0.542347276909282 0.52812258868969 ENSG00000112972:ENST00000325110:exon_43294158_43294264:HMGCS1;ENSG00000112972:ENST00000433297:exon_43294158_43294264:HMGCS1;ENSG00000112972:ENST00000508319:exon_43293836_43294264:HMGCS1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 44809162 G/C 1 19 8 27 8.69540173872364 4.33877821527426 4.35662352344939 C:G G C 10 0.542347276909282 0.121327794483047 ENSG00000112996:ENST00000507110:exon_44809027_44809665:MRPS30 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 54603822 T/C 1 9 16 25 4.11887450781646 8.67755643054851 -4.55868192273205 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0732239441857569 ENSG00000039123:ENST00000230640:exon_54603588_54603975:SKIV2L2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 56526783 G/A 1 14 3 17 6.40713812327005 1.62704183072785 4.78009629254221 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0260585776941118 ENSG00000062194:ENST00000424459:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000454432:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000514387:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000506184:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000511209:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000264779:exon_56526673_56526796:GPBP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 60241142 G/A 1 27 19 46 12.3566235234494 10.3045982612764 2.05202526217303 A:G G A 10 0.542347276909282 0.558420083294424 ENSG00000164182:ENST00000296597:exon_60240956_60241209:NDUFAF2;ENSG00000164182:ENST00000511107:exon_60241034_60241255:NDUFAF2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 64097145 C/G 1 49 64 113 22.4249834314452 34.710225722194 -12.2852422907489 C:G C G 10 0.542347276909282 0.0231771248350735 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000506168:exon_64097129_64097159:CWC27 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 65108215 A/G 1 10 8 18 4.57652723090718 4.33877821527426 0.237749015632924 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000123213:ENST00000380985:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000340159:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000502464:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506799:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000511299:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000509935:exon_65108082_65108218:NLN HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 66478626 T/C 1 18 33 51 8.23774901563293 17.8974601380063 -9.65971112237338 T:C T C 10 0.542347276909282 0.00734598317262432 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 66478729 A/G 1 9 4 13 4.11887450781646 2.16938910763713 1.94948540017933 A:G A G 10 0.542347276909282 0.405355588189296 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 68651610 C/T 1 15 16 31 6.86479084636077 8.67755643054851 -1.81276558418774 T:C C T 10 0.542347276909282 0.589921512957966 ENSG00000085231:ENST00000380822:exon_68651476_68651621:TAF9;ENSG00000085231:ENST00000380818:exon_68651476_68651621:TAF9;ENSG00000085231:ENST00000512561:exon_68651476_68651621:TAF9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 74063154 C/G 1 224 189 413 102.514209972321 102.503635335854 0.0105746364665436 C:G C G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000164347:ENST00000296805:exon_74062763_74063196:GFM2;ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74062817_74063188:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000514918:exon_74063073_74063188:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000513356:exon_74063088_74063188:NSA2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 74069863 A/G 1 211 220 431 96.5647245721415 119.316400920042 -22.7516763479005 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0295382716581827 ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74069693_74069885:NSA2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 74893802 C/A 1 3 8 11 1.37295816927215 4.33877821527426 -2.9658200460021 A:C C A 10 0.542347276909282 0.126534045746447 ENSG00000122008:ENST00000241436:exon_74893759_74896969:POLK;ENSG00000122008:ENST00000352007:exon_74893759_74895646:POLK;ENSG00000122008:ENST00000380481:exon_74893759_74895646:POLK;ENSG00000122008:ENST00000503479:exon_74893759_74893865:POLK;ENSG00000122008:ENST00000506928:exon_74893759_74894927:POLK;ENSG00000122008:ENST00000510815:exon_74893759_74893992:POLK;ENSG00000122008:ENST00000514141:exon_74893759_74895659:POLK;ENSG00000122008:ENST00000504026:exon_74893759_74893843:POLK;ENSG00000122008:ENST00000511527:exon_74893759_74893839:POLK;ENSG00000122008:ENST00000505975:exon_74893759_74893843:POLK;ENSG00000122008:ENST00000508526:exon_74893759_74893843:POLK;ENSG00000122008:ENST00000509126:exon_74893759_74893843:POLK;ENSG00000122008:ENST00000505069:exon_74893572_74893865:POLK;ENSG00000122008:ENST00000502567:exon_74893759_74893813:POLK HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 80604430 C/T 1 49 43 92 22.4249834314452 23.3209329070991 -0.895949475653939 A:T:C C T 10 0.542347276909282 0.916747122575888 ENSG00000131732:ENST00000507402:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000254037:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000407610:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000506458:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000380199:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000438268:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000504502:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000505860:exon_80604226_80604530:ZCCHC9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 81549240 C/A 1 10 5 15 4.57652723090718 2.71173638454641 1.86479084636077 A:C C A 10 0.542347276909282 0.439852308753891 ENSG00000152348:ENST00000282185:exon_81549133_81549248:ATG10;ENSG00000152348:ENST00000458350:exon_81549133_81549248:ATG10;ENSG00000152348:ENST00000504770:exon_81549133_81549250:ATG10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 81571896 A/G 1 3402 4596 7998 1556.93456395462 2492.62808467506 -935.693520720437 A:C:G A G 10 0.542347276909282 1.61177681393884e-97 ENSG00000186468:ENST00000296674:exon_81569177_81572074:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000510019:exon_81571240_81571953:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000507980:exon_81571697_81572337:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000512346:exon_81571879_81571953:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000504293:exon_81571879_81572074:RPS23 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 86695274 A/G 1 24 22 46 10.9836653541772 11.9316400920042 -0.94797473782697 A:G A G 10 0.542347276909282 0.88257143121608 ENSG00000134480:ENST00000505587:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000510921:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000508855:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000256897:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000504878:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000511207:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000504115:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000448765:exon_86695211_86695322:CCNH HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 89703641 C/G 1 31 18 49 14.1872344158123 9.76225098436707 4.42498343144518 C:G C G 10 0.542347276909282 0.251318622112457 ENSG00000153140:ENST00000283122:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522083:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522864:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000518458:exon_89703516_89703647:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522565:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522842:exon_89703516_89703651:CETN3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 94050447 C/T 1 10 4 14 4.57652723090718 2.16938910763713 2.40713812327005 T:C C T 10 0.542347276909282 0.284052688317237 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 94050487 T/A 1 16 7 23 7.32244356945149 3.79643093836497 3.52601263108651 A:T T A 10 0.542347276909282 0.149662035595442 ENSG00000175471:ENST00000514040:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000515393:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312202:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000429576:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000505078:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312216:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000395933:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000508509:exon_94050482_94050591:MCTP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 94230358 C/T 1 5 7 12 2.28826361545359 3.79643093836497 -1.50816732291138 T:C C T 10 0.542347276909282 0.401951173845371 ENSG00000175471:ENST00000515393:exon_94230354_94230540:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312202:exon_94230354_94230540:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000429576:exon_94230354_94230540:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000505078:exon_94230354_94230540:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312216:exon_94230354_94230540:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000395933:exon_94230354_94230540:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000508509:exon_94230354_94230540:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000512425:exon_94230354_94230540:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000505208:exon_94230354_94230540:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000415885:exon_94230354_94230540:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000506568:exon_94230354_94230540:MCTP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 94939193 A/G 1 6 3 9 2.74591633854431 1.62704183072785 1.11887450781646 A:G A G 10 0.542347276909282 0.521783447682374 ENSG00000164291:ENST00000380009:exon_94938941_94940768:ARSK;ENSG00000164291:ENST00000513814:exon_94938941_94939384:ARSK;ENSG00000164291:ENST00000504873:exon_94938941_94939384:ARSK HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 95152313 A/G 1 58 80 138 26.5438579392616 43.3877821527426 -16.8439242134809 A:G A G 10 0.542347276909282 0.00466511613010391 ENSG00000173221:ENST00000508780:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507605:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000237858:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000379979:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507412:exon_95152211_95155206:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000505427:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000512469:exon_95152114_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000448201:exon_95152217_95152329:GLRX HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 95234035 G/A 1 26 10 36 11.8989708003587 5.42347276909282 6.47549803126585 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0431779947315417 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000431061:exon_95233944_95234298:ELL2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 96076487 G/A 0 26 0 26 11.8989708003587 0 11.8989708003587 G G 10 0.542347276909282 1.70852657096778e-07 ENSG00000153113:ENST00000508830:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395812:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000359176:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395813:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000421689:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510756:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512355:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512620:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508608:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000341926:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000361634:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511049:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000309190:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510156:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511782:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000504465:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000513666:exon_96076449_96076487:CAST HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 96086334 G/C 1 11 20 31 5.0341799539979 10.8469455381856 -5.81276558418774 C:G G C 10 0.542347276909282 0.0461711318532332 ENSG00000153113:ENST00000338252:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508830:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395812:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000359176:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000325674:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395813:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510756:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512355:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508608:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000341926:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000361634:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511049:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000309190:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510156:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000509903:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511782:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000504465:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000513666:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000348386:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510500:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000437034:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508579:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000515663:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000283095:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000484552:exon_96086291_96086386:CAST HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 96112083 T/G 1 22 27 49 10.0683599079958 14.6433764765506 -4.57501656855482 T:G T G 10 0.542347276909282 0.199439528998939 ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96110188_96112255:ERAP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 96498783 G/A 1 23 12 35 10.5260126310865 6.50816732291138 4.01784530817513 A:T:G G A 10 0.542347276909282 0.180063230064116 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96496571_96498929:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000511293:exon_96498640_96498929:RIOK2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 96503523 C/T 1 28 18 46 12.8142762465401 9.76225098436707 3.05202526217303 T:C C T 10 0.542347276909282 0.379573650737279 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96503171_96503695:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96502450_96503695:RIOK2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 112238039 A/C 1 8 3 11 3.66122178472574 1.62704183072785 2.0341799539979 A:C A C 10 0.542347276909282 0.244923170028471 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 112257908 T/C 1 14 12 26 6.40713812327005 6.50816732291138 -0.101029199641331 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000129625:ENST00000379638:exon_112257770_112258236:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000513339:exon_112257770_112257924:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000511865:exon_112257770_112257927:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000504247:exon_112257770_112257986:REEP5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 118691784 T/C 1 16 4 20 7.32244356945149 2.16938910763713 5.15305446181436 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0237668853151301 ENSG00000145779:ENST00000504771:exon_118690009_118691816:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000503646:exon_118691718_118691816:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000415806:exon_118691730_118691816:TNFAIP8 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 118728953 G/C 1 34 25 59 15.5601925850844 13.558681922732 2.00151066235236 C:G G C 10 0.542347276909282 0.695435876322914 ENSG00000145779:ENST00000274456:exon_118728511_118729089:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000513374:exon_118728511_118729438:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000504771:exon_118728511_118730293:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000503646:exon_118728511_118730293:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000504642:exon_118728511_118729141:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000415806:exon_118728511_118730294:TNFAIP8 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 123979280 G/A 1 4 6 10 1.83061089236287 3.25408366145569 -1.42347276909282 A:G G A 10 0.542347276909282 0.528168739719971 ENSG00000168916:ENST00000513985:exon_123979204_123979376:ZNF608;ENSG00000168916:ENST00000504926:exon_123979204_123979376:ZNF608;ENSG00000168916:ENST00000306315:exon_123979204_123979376:ZNF608;ENSG00000168916:ENST00000395398:exon_123979204_123979376:ZNF608;ENSG00000168916:ENST00000505686:exon_123979204_123979376:ZNF608;ENSG00000168916:ENST00000503896:exon_123979204_123979376:ZNF608 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 132228133 A/G 1 5 5 10 2.28826361545359 2.71173638454641 -0.42347276909282 A:G A G 10 0.542347276909282 1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 132334252 A/G 1 21 12 33 9.61070718490508 6.50816732291138 3.1025398619937 A:G A G 10 0.542347276909282 0.299703811718499 ENSG00000155329:ENST00000324170:exon_132332677_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000355372:exon_132332688_132334524:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000509437:exon_132333792_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000513848:exon_132333904_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000513541:exon_132334100_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000508080:exon_132334105_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000509008:exon_132334220_132334542:ZCCHC10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 137902339 T/C 1 31 27 58 14.1872344158123 14.6433764765506 -0.456142060738355 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000113013:ENST00000297185:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000501917:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000507097:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000523929:exon_137902315_137902400:HSPA9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 138386706 G/A 1 16 10 26 7.32244356945149 5.42347276909282 1.89897080035867 A:G G A 10 0.542347276909282 0.556319503760722 ENSG00000120725:ENST00000394817:exon_138386627_138386735:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000265195:exon_138386627_138386735:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509534:exon_138386627_138386735:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000503732:exon_138386627_138386735:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000508639:exon_138386627_138386735:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000513453:exon_138386627_138386735:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000507002:exon_138386635_138386735:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505830:exon_138386639_138386735:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505353:exon_138386696_138386735:SIL1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 139936760 G/T 1 37 14 51 16.9331507543566 7.59286187672995 9.34028887762662 T:G G T 10 0.542347276909282 0.0107131970315596 ENSG00000213523:ENST00000336283:exon_139936732_139936857:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000523259:exon_139936732_139937031:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000520427:exon_139936732_139936917:SRA1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 140077623 A/G 1 16 9 25 7.32244356945149 4.88112549218354 2.44131807726795 A:G A G 10 0.542347276909282 0.422950604085886 ENSG00000112855:ENST00000230771:exon_140077517_140077663:HARS2;ENSG00000112855:ENST00000435019:exon_140077517_140077663:HARS2;ENSG00000112855:ENST00000412045:exon_140077517_140077663:HARS2;ENSG00000112855:ENST00000432671:exon_140077517_140077663:HARS2;ENSG00000112855:ENST00000437649:exon_140077517_140077663:HARS2;ENSG00000112855:ENST00000419246:exon_140077517_140077663:HARS2;ENSG00000112855:ENST00000508522:exon_140077517_140077663:HARS2;ENSG00000112855:ENST00000448069:exon_140077517_140077663:HARS2;ENSG00000112855:ENST00000427675:exon_140077517_140077663:HARS2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 141309824 G/A 1 10 2 12 4.57652723090718 1.08469455381856 3.49183267708862 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0467512693233193 ENSG00000081791:ENST00000432126:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000194118:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000508751:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000502729:exon_141309812_141309839:KIAA0141 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 148892695 A/G 1 5 8 13 2.28826361545359 4.33877821527426 -2.05051459982067 A:G A G 10 0.542347276909282 0.278020697313787 ENSG00000113712:ENST00000261798:exon_148892633_148892772:CSNK1A1;ENSG00000113712:ENST00000377843:exon_148892633_148892772:CSNK1A1;ENSG00000113712:ENST00000504676:exon_148892633_148892772:CSNK1A1;ENSG00000113712:ENST00000515435:exon_148892633_148892772:CSNK1A1;ENSG00000113712:ENST00000515768:exon_148892633_148892772:CSNK1A1;ENSG00000113712:ENST00000322237:exon_148892633_148892772:CSNK1A1;ENSG00000113712:ENST00000503350:exon_148892633_148892720:CSNK1A1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 149776232 C/T 1 129 131 260 59.0372012787026 71.0474932751159 -12.0102919964133 A:T:C C T 10 0.542347276909282 0.135767406303272 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149775845_149776405:TCOF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 150489390 A/G 1 148 122 270 67.7326030174263 66.1663677829324 1.56623523449387 A:T:G A G 10 0.542347276909282 0.85489925766484 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150489314_150489407:ANXA6 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 150647012 A/G 1 8 6 14 3.66122178472574 3.25408366145569 0.407138123270053 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150646857_150650001:GM2A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 154346259 A/G 1 133 91 224 60.8678121710655 49.3536021987447 11.5142099723208 A:G A G 10 0.542347276909282 0.123630134744529 ENSG00000082515:ENST00000523037:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000265229:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000439747:exon_154346246_154346526:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000522038:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000342738:exon_154346246_154346528:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000519059:exon_154346246_154346453:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000520040:exon_154346246_154346505:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000518364:exon_154346246_154346531:MRPL22 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 154346296 G/A 1 118 76 194 54.0030213247047 41.2183930451054 12.7846282795993 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0714979973858341 ENSG00000082515:ENST00000523037:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000265229:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000439747:exon_154346246_154346526:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000522038:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000342738:exon_154346246_154346528:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000519059:exon_154346246_154346453:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000520040:exon_154346246_154346505:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000518364:exon_154346246_154346531:MRPL22 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 157164962 T/C 1 27 15 42 12.3566235234494 8.13520915363923 4.22141436981016 T:C T C 10 0.542347276909282 0.216872778488999 ENSG00000113272:ENST00000231198:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000521655:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000448153:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000523575:exon_157164918_157165002:THG1L HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 159437621 C/G 1 45 44 89 20.5943725390823 23.8632801840084 -3.2689076449261 C:G C G 10 0.542347276909282 0.523860941569351 ENSG00000113312:ENST00000231238:exon_159437507_159437865:TTC1;ENSG00000113312:ENST00000522793:exon_159437507_159437865:TTC1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 159659273 C/T 1 7 4 11 3.20356906163503 2.16938910763713 1.0341799539979 T:C C T 10 0.542347276909282 0.763959235154452 ENSG00000170231:ENST00000393980:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000310650:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000393982:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000523955:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000402432:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000521362:exon_159659042_159659280:FABP6 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 159835658 A/G 1 12 19 31 5.49183267708862 10.3045982612764 -4.81276558418774 A:G A G 10 0.542347276909282 0.103930414272294 ENSG00000164609:ENST00000297151:exon_159835657_159835704:SLU7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 162940999 A/G 1 5 13 18 2.28826361545359 7.05051459982067 -4.76225098436708 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0315938653261495 ENSG00000038274:ENST00000280969:exon_162940848_162941000:MAT2B;ENSG00000038274:ENST00000415433:exon_162940848_162941000:MAT2B;ENSG00000038274:ENST00000321757:exon_162940848_162941000:MAT2B;ENSG00000038274:ENST00000421814:exon_162940848_162941000:MAT2B;ENSG00000038274:ENST00000518095:exon_162940848_162941000:MAT2B;ENSG00000038274:ENST00000523606:exon_162940848_162941000:MAT2B;ENSG00000038274:ENST00000520449:exon_162940848_162941000:MAT2B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 167943827 G/A 1 25 32 57 11.441318077268 17.355112861097 -5.91379478382907 A:G G A 10 0.542347276909282 0.143067207242883 ENSG00000113643:ENST00000231572:exon_167943783_167943955:RARS;ENSG00000113643:ENST00000520013:exon_167943783_167943955:RARS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 169454941 C/G 1 6 6 12 2.74591633854431 3.25408366145569 -0.508167322911383 C:G C G 10 0.542347276909282 0.780543886765314 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000433448:exon_169454867_169454952:DOCK2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 169461547 C/T 1 7 3 10 3.20356906163503 1.62704183072785 1.57652723090718 T:C C T 10 0.542347276909282 0.361234487774673 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169461403_169461559:DOCK2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 169675739 A/G 1 4 9 13 1.83061089236287 4.88112549218354 -3.05051459982067 A:G A G 10 0.542347276909282 0.101447871356357 ENSG00000043462:ENST00000046794:exon_169673241_169675823:LCP2;ENSG00000043462:ENST00000520322:exon_169674576_169675823:LCP2;ENSG00000043462:ENST00000521416:exon_169675304_169675823:LCP2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 174937193 C/T 1 7 1 8 3.20356906163503 0.542347276909282 2.66122178472574 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0781860486215706 ENSG00000164466:ENST00000507017:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502393:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000507823:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000513725:exon_174937112_174937315:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000506963:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502865:exon_174937112_174937210:SFXN1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 174953743 G/A 1 13 12 25 5.94948540017933 6.50816732291138 -0.558681922732049 A:G G A 10 0.542347276909282 0.843374430640417 ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174953641_174956745:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000421887:exon_174953641_174953886:SFXN1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 176402401 G/A 1 16 6 22 7.32244356945149 3.25408366145569 4.0683599079958 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0901117450756771 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000509236:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000417486:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000515488:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000507513:exon_176402397_176402481:UIMC1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 176636882 C/T 1 4 4 8 1.83061089236287 2.16938910763713 -0.338778215274256 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 176733116 A/G 1 321 363 684 146.90652411212 196.872061518069 -49.9655374059489 A:G A G 10 0.542347276909282 0.00014187134534005 ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176732501_176734196:MXD3;ENSG00000169230:ENST00000303204:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000511309:exon_176732872_176733148:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000510797:exon_176733099_176733154:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000504594:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503216:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503853:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000510701:exon_176733099_176733164:PRELID1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 176733616 T/C 1 384 474 858 175.738645666836 257.072609255 -81.3339635881639 A:T:C T C 10 0.542347276909282 3.1606455651812e-08 ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176732501_176734196:MXD3;ENSG00000169230:ENST00000303204:exon_176733423_176733960:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000504594:exon_176733423_176733670:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503216:exon_176733456_176733950:PRELID1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 176734855 G/C 1 17 20 37 7.78009629254221 10.8469455381856 -3.06684924564343 C:G G C 10 0.542347276909282 0.326486828880185 ENSG00000213347:ENST00000503473:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000509339:exon_176734782_176735063:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000423571:exon_176733818_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000439742:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000503782:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000303165:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000513063:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000513169:exon_176734814_176734965:MXD3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 176830627 G/A 1 6 4 10 2.74591633854431 2.16938910763713 0.57652723090718 A:G G A 10 0.542347276909282 0.762606887543924 ENSG00000131187:ENST00000502854:exon_176830482_176831091:F12;ENSG00000131187:ENST00000504406:exon_176830255_176830751:F12;ENSG00000131187:ENST00000510358:exon_176830482_176831473:F12 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 176915143 C/T 1 17 6 23 7.78009629254221 3.25408366145569 4.52601263108652 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0622023356426425 ENSG00000196923:ENST00000493815:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000359895:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000356618:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355841:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000460994:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000486828:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393551:exon_176914898_176915249:PDLIM7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 176916516 C/T 1 7 1 8 3.20356906163503 0.542347276909282 2.66122178472574 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0781860486215706 ENSG00000196923:ENST00000493815:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000359895:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000356618:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355841:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000460994:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000486828:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393551:exon_176916394_176916628:PDLIM7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 176940384 G/A 1 34 40 74 15.5601925850844 21.6938910763713 -6.13369849128687 A:G G A 10 0.542347276909282 0.162457030778369 ENSG00000183258:ENST00000330503:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507955:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000505081:exon_176940354_176940848:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000503078:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507900:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000504807:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000512027:exon_176940003_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000511040:exon_176940354_176940485:DDX41 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 177035964 T/C 1 13 10 23 5.94948540017933 5.42347276909282 0.526012631086514 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505145:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000515353:exon_177034366_177036015:B4GALT7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 177482694 T/C 1 3658 2 3660 1674.09366106585 1.08469455381856 1673.00896651203 A:T:C T A 10 0.542347276909282 4.94065645841247e-324 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 177483184 A/G 0 20 0 20 9.15305446181436 0 9.15305446181436 A A 10 0.542347276909282 8.86058264866239e-06 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 177574561 T/C 1 14 19 33 6.40713812327005 10.3045982612764 -3.8974601380063 T:C T C 10 0.542347276909282 0.220951345401981 ENSG00000145916:ENST00000313386:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000515098:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000507575:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000515360:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000513162:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000507937:exon_177572971_177574636:RMND5B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 179036433 G/A 1 35 27 62 16.0178453081751 14.6433764765506 1.37446883162452 A:G G A 10 0.542347276909282 0.799210894815237 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179036377_179037027:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179036377_179036520:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179036377_179037019:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179036377_179037012:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179036377_179037013:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000503583:exon_179036377_179036473:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000508797:exon_179036377_179036971:RUFY1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 179036457 G/C 1 37 35 72 16.9331507543566 18.9821546918249 -2.0490039374683 C:G G C 10 0.542347276909282 0.638020533537903 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179036377_179037027:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179036377_179036520:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179036377_179037019:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179036377_179037012:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179036377_179037013:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000503583:exon_179036377_179036473:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000508797:exon_179036377_179036971:RUFY1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 179252184 A/G 1 62 61 123 28.3744688316245 33.0831838914662 -4.70871505984168 A:G A G 10 0.542347276909282 0.416006316317648 ENSG00000161011:ENST00000514093:exon_179252146_179252226:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179252146_179252226:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179252146_179252226:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179252146_179252226:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179252146_179252226:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179252146_179252226:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179252146_179252226:SQSTM1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 179260153 C/T 1 69 59 128 31.5780378932595 31.9984893376476 -0.420451444388092 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 180218668 A/G 1 29 16 45 13.2719289696308 8.67755643054851 4.59437253908231 A:G A G 10 0.542347276909282 0.180962002510825 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 180486785 G/C 1 3 6 9 1.37295816927215 3.25408366145569 -1.88112549218354 C:G G C 10 0.542347276909282 0.31687860521519 ENSG00000165810:ENST00000327705:exon_180486237_180488523:BTNL9;ENSG00000165810:ENST00000376842:exon_180486237_180488518:BTNL9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 5 180661980 T/C 1 15 23 38 6.86479084636077 12.4739873689135 -5.60919652255272 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0742715631388934 ENSG00000146063:ENST00000351937:exon_180661932_180661995:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000315073:exon_180661174_180662809:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000508930:exon_180661174_180662806:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000503114:exon_180661932_180661995:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515223:exon_180657744_180662803:TRIM41 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 41 90 131 18.7637616467194 48.8112549218354 -30.0474932751159 A:G G A 10 0.542347276909282 1.46101848859064e-07 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 1742794 A/G 1 18 22 40 8.23774901563293 11.9316400920042 -3.69389107637128 A:G A G 10 0.542347276909282 0.268310970639398 ENSG00000112699:ENST00000530927:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000380815:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000380805:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000531690:exon_1742702_1742820:GMDS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 2784571 G/A 1 8 8 16 3.66122178472574 4.33877821527426 -0.677556430548512 A:G G A 10 0.542347276909282 0.804712000972457 ENSG00000124535:ENST00000380773:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380771:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380769:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380764:exon_2784558_2784637:WRNIP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 3152822 C/G 1 22 17 39 10.0683599079958 9.21990370745779 0.848456200538003 C:G C G 10 0.542347276909282 0.872832597023446 ENSG00000137274:ENST00000424847:exon_3152722_3152903:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000430655:exon_3152722_3153429:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000380375:exon_3152722_3153428:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000380368:exon_3152722_3153428:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000433912:exon_3152722_3152879:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000380379:exon_3152722_3153812:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000490918:exon_3152722_3153296:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000423798:exon_3152772_3153262:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000464040:exon_3152722_3153280:BPHL HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 4031998 A/G 1 224 199 423 102.514209972321 107.927108104947 -5.41289813262627 A:G A G 10 0.542347276909282 0.625625004612652 ENSG00000112739:ENST00000480058:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000337659:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000489943:exon_4031793_4032335:PRPF4B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 4995464 C/T 1 6 9 15 2.74591633854431 4.88112549218354 -2.13520915363923 T:C C T 10 0.542347276909282 0.307109737553343 ENSG00000124787:ENST00000380051:exon_4994966_4995510:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000319533:exon_4995281_4995510:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000380053:exon_4995283_4995510:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000464646:exon_4995312_4995510:RPP40 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 5260936 A/C 1 29 23 52 13.2719289696308 12.4739873689135 0.797941600717337 A:C A C 10 0.542347276909282 0.88973539923271 ENSG00000214113:ENST00000468929:exon_5260881_5260975:LYRM4;ENSG00000214113:ENST00000330636:exon_5260881_5261172:LYRM4;ENSG00000214113:ENST00000464010:exon_5260881_5260966:LYRM4;ENSG00000214113:ENST00000480566:exon_5260881_5260975:LYRM4;ENSG00000214113:ENST00000455814:exon_5260881_5260954:LYRM4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 7231843 G/A 1 11 12 23 5.0341799539979 6.50816732291138 -1.47398736891348 A:G G A 10 0.542347276909282 0.539417094228368 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000334984:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7230073_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000397521:exon_7231813_7232140:RREB1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 15663118 T/C 1 3 7 10 1.37295816927215 3.79643093836497 -2.42347276909282 T:C T C 10 0.542347276909282 0.202477940149527 ENSG00000047579:ENST00000344537:exon_15663045_15663273:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000510395:exon_15663045_15663238:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000355917:exon_15663045_15663271:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000397306:exon_15663045_15663271:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000515875:exon_15663045_15663261:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000513680:exon_15663045_15663289:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000511762:exon_15663045_15663251:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000338950:exon_15663045_15663206:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000506844:exon_15663045_15663151:DTNBP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 16145325 A/G 1 19 25 44 8.69540173872364 13.558681922732 -4.86328018400841 A:G A G 10 0.542347276909282 0.172865368975943 ENSG00000007944:ENST00000356840:exon_16145128_16145548:MYLIP;ENSG00000007944:ENST00000349606:exon_16145128_16145548:MYLIP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 16306751 G/A 1 5 4 9 2.28826361545359 2.16938910763713 0.118874507816462 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000124788:ENST00000244769:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000436367:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000450222:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000379065:exon_16306534_16307090:ATXN1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 18237661 C/T 1 80 62 142 36.6122178472574 33.6255311683755 2.98668667888196 T:C C T 10 0.542347276909282 0.673836665748848 ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000507591:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515770:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000512145:exon_18237281_18237747:DEK HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 18264210 G/A 1 56 27 83 25.6285524930802 14.6433764765506 10.9851760165296 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0154205762636811 ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515742:exon_18264074_18264439:DEK HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 18264658 G/A 1 46 22 68 21.052025262173 11.9316400920042 9.12038517016883 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0283109576949788 ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18264616_18265054:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18264616_18264799:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18264616_18264766:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18264616_18264772:DEK;ENSG00000124795:ENST00000503715:exon_18264616_18264772:DEK HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 21201493 G/A 1 8 3 11 3.66122178472574 1.62704183072785 2.0341799539979 A:G G A 10 0.542347276909282 0.244923170028471 ENSG00000145996:ENST00000274695:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000397216:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378624:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378610:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000476517:exon_21201341_21201505:CDKAL1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 26045737 C/G 1 2 20 22 0.915305446181436 10.8469455381856 -9.9316400920042 C:G C G 10 0.542347276909282 1.33849802503144e-05 ENSG00000196532:ENST00000360577:exon_26045612_26047022:HIST1H3C HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 26045929 T/C 1 4 42 46 1.83061089236287 22.7785856301898 -20.947974737827 T:C T C 10 0.542347276909282 1.08342912970589e-10 ENSG00000196532:ENST00000360577:exon_26045612_26047022:HIST1H3C HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 26056549 A/G 1 1163 823 1986 532.250116954505 446.351808896339 85.898308058166 A:T:G A G 10 0.542347276909282 0.000106602623716526 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 26056578 T/G 1 2202 794 2996 1007.75129624576 430.62373786597 577.127558379791 T:C:G T G 10 0.542347276909282 2.73567651201768e-104 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 26056604 G/A 1 2090 1945 4035 956.494191259601 1054.86545358855 -98.3712623289528 A:T:C:G G A 10 0.542347276909282 0.00195379667172065 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 26104171 G/A 1 21 5 26 9.61070718490508 2.71173638454641 6.89897080035867 A:C:G G A 10 0.542347276909282 0.00908664022421799 ENSG00000197061:ENST00000377803:exon_26104104_26104518:HIST1H4C HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 26123812 C/T 1 16 27 43 7.32244356945149 14.6433764765506 -7.32093290709913 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0312361259837623 ENSG00000180596:ENST00000314332:exon_26123743_26124154:HIST1H2BC;ENSG00000180596:ENST00000396984:exon_26123584_26124154:HIST1H2BC HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 26197493 C/A 1 19 14 33 8.69540173872364 7.59286187672995 1.1025398619937 A:C C A 10 0.542347276909282 0.73037350485381 ENSG00000197409:ENST00000377831:exon_26197012_26197497:HIST1H3D HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 26199222 G/A 1 1 11 12 0.457652723090718 5.9658200460021 -5.50816732291138 A:G G A 10 0.542347276909282 0.00193253235378465 ENSG00000197409:ENST00000377831:exon_26199087_26199464:HIST1H3D;ENSG00000196866:ENST00000341023:exon_26199079_26199471:HIST1H2AD HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 26216656 T/C 1 16 10 26 7.32244356945149 5.42347276909282 1.89897080035867 T:C T C 10 0.542347276909282 0.556319503760722 ENSG00000187990:ENST00000339812:exon_26216491_26216871:HIST1H2BG HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 26234883 A/G 1 14 13 27 6.40713812327005 7.05051459982067 -0.643376476550613 A:G A G 10 0.542347276909282 0.848385483773945 ENSG00000124575:ENST00000244534:exon_26234440_26235216:HIST1H1D HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 26234952 A/G 1 7 3 10 3.20356906163503 1.62704183072785 1.57652723090718 A:G A G 10 0.542347276909282 0.361234487774673 ENSG00000124575:ENST00000244534:exon_26234440_26235216:HIST1H1D HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 26235051 G/A 1 5 4 9 2.28826361545359 2.16938910763713 0.118874507816462 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000124575:ENST00000244534:exon_26234440_26235216:HIST1H1D HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 26370605 T/C 1 20 23 43 9.15305446181436 12.4739873689135 -3.32093290709913 T:C T C 10 0.542347276909282 0.359101549766075 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 26370707 T/C 1 14 10 24 6.40713812327005 5.42347276909282 0.983665354177233 T:C T C 10 0.542347276909282 0.838276464959483 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 26370748 G/A 1 19 19 38 8.69540173872364 10.3045982612764 -1.60919652255271 A:G G A 10 0.542347276909282 0.628056780896392 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000531055:exon_26370719_26370831:BTN3A2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 26545632 G/A 1 27 26 53 12.3566235234494 14.1010291996413 -1.74440567619195 A:G G A 10 0.542347276909282 0.68011083904378 ENSG00000182952:ENST00000328219:exon_26545355_26547160:HMGN4;ENSG00000182952:ENST00000377575:exon_26545355_26546482:HMGN4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 26598188 A/G 1 11 12 23 5.0341799539979 6.50816732291138 -1.47398736891348 A:G A G 10 0.542347276909282 0.539417094228368 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26598142_26598338:ABT1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 27775674 A/G 1 4 6 10 1.83061089236287 3.25408366145569 -1.42347276909282 A:G A G 10 0.542347276909282 0.528168739719971 ENSG00000185130:ENST00000377401:exon_27775257_27775709:HIST1H2BL HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 27925827 A/G 1 21 29 50 9.61070718490508 15.7280710303692 -6.1173638454641 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0893778270677213 ENSG00000124657:ENST00000244623:exon_27925019_27925960:OR2B6 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 29523676 C/G 1 26 22 48 11.8989708003587 11.9316400920042 -0.0326692916455347 C:G C G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 29693938 G/A 1 6 8 14 2.74591633854431 4.33877821527426 -1.59286187672995 A:G G A 10 0.542347276909282 0.431117415726890 ENSG00000204642:ENST00000484704:exon_29693788_29694303:HLA-F HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 29693969 C/T 1 12 6 18 5.49183267708862 3.25408366145569 2.23774901563293 T:C C T 10 0.542347276909282 0.348947731183792 ENSG00000204642:ENST00000484704:exon_29693788_29694303:HLA-F HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 29910801 C/A 0 363 0 363 166.127938481931 0 166.127938481931 C C 10 0.542347276909282 3.89641176244484e-97 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 29912315 A/C 0 75 0 75 34.3239542318039 0 34.3239542318039 A A 10 0.542347276909282 1.58076689382175e-20 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 30032495 A/G 1 38 56 94 17.3908034774473 30.3714475069198 -12.9806440294725 A:G A G 10 0.542347276909282 0.00929258680976198 ENSG00000066379:ENST00000471008:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000332435:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376782:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000359374:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376785:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000463141:exon_30032450_30032686:ZNRD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 30036471 C/A 1 12 5 17 5.49183267708862 2.71173638454641 2.78009629254221 A:C C A 10 0.542347276909282 0.225793255539929 ENSG00000204619:ENST00000376773:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376772:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376769:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376765:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376763:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376758:exon_30035983_30036475:PPP1R11 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 30314566 T/G 1 66 49 115 30.2050797239874 26.5750165685548 3.63006315543257 T:G T G 10 0.542347276909282 0.513781444970254 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 30314567 C/A 1 66 45 111 30.2050797239874 24.4056274609177 5.7994522630697 A:C:G C A 10 0.542347276909282 0.295122620285333 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 30458064 G/A 1 225 230 455 102.971862695412 124.739873689135 -21.7680109937233 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0429951214120340 ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30458017_30458292:HLA-E HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 30890483 G/T 1 3 15 18 1.37295816927215 8.13520915363923 -6.76225098436707 T:G G T 10 0.542347276909282 0.00150412319370035 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000477052:exon_30890360_30890551:VARS2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 30891144 C/T 1 18 7 25 8.23774901563293 3.79643093836497 4.44131807726795 T:C C T 10 0.542347276909282 0.106537487560771 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30891130_30891282:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30891130_30891282:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30891130_30891282:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30891130_30891282:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30891130_30891282:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000477052:exon_30891130_30891282:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30891130_30892337:VARS2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 30892322 C/T 1 5 7 12 2.28826361545359 3.79643093836497 -1.50816732291138 T:C C T 10 0.542347276909282 0.401951173845371 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30892131_30892341:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30891130_30892337:VARS2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 30893428 G/A 1 14 26 40 6.40713812327005 14.1010291996413 -7.69389107637128 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0168562735376343 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30893321_30893451:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893321_30893496:VARS2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 30893941 G/A 1 127 61 188 58.1218958325212 33.0831838914662 25.038711941055 A:G G A 10 0.542347276909282 0.000236326110442259 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893886_30894236:VARS2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31110391 G/C 1 82 102 184 37.5275232934389 55.3194222447468 -17.7918989513079 C:G G C 10 0.542347276909282 0.00947482454266228 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31110221_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31110238_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31110297_31110493:CCHCR1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31111180 T/C 1 58 41 99 26.5438579392616 22.2362383532806 4.30761958598108 T:C T C 10 0.542347276909282 0.42031725660395 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509859:exon_31110915_31111190:CCHCR1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31112484 C/T 1 38 27 65 17.3908034774473 14.6433764765506 2.74742700089667 T:C C T 10 0.542347276909282 0.535045337658822 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112464_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31112406_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112297_31112850:CCHCR1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31113030 A/G 1 37 20 57 16.9331507543566 10.8469455381856 6.08620521617093 A:G A G 10 0.542347276909282 0.112091845124198 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31113052 G/A 1 35 15 50 16.0178453081751 8.13520915363923 7.8826361545359 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0322539064613644 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31116210 G/A 1 12 8 20 5.49183267708862 4.33877821527426 1.15305446181436 A:G G A 10 0.542347276909282 0.659404286191217 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31116246 G/A 1 5 13 18 2.28826361545359 7.05051459982067 -4.76225098436708 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0315938653261495 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31118565 C/G 1 5 4 9 2.28826361545359 2.16938910763713 0.118874507816462 C:G C G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31118522_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31118525_31118637:CCHCR1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31118898 A/T 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 A:T A T 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118732_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31118644_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000505392:exon_31118662_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31118752_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31118847_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31118869_31118899:CCHCR1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31122564 C/G 1 8 5 13 3.66122178472574 2.71173638454641 0.949485400179334 C:G C G 10 0.542347276909282 0.782391509721688 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31122333_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31122349_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31122371_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31122388_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31122460_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000428174:exon_31122505_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507226:exon_31122519_31122576:CCHCR1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31129642 A/C 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 A:C A C 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31129707 C/T 1 8 4 12 3.66122178472574 2.16938910763713 1.49183267708862 T:C C T 10 0.542347276909282 0.564494489181351 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31130502 T/C 1 9 19 28 4.11887450781646 10.3045982612764 -6.18572375345989 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0222808503891633 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31130254_31130784:TCF19 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31132956 G/C 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 C:G G C 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000204531:ENST00000461332:exon_31132905_31133069:POU5F1;ENSG00000204531:ENST00000441888:exon_31132905_31133063:POU5F1;ENSG00000204531:ENST00000512818:exon_31132905_31133063:POU5F1;ENSG00000204531:ENST00000513407:exon_31132905_31133063:POU5F1;ENSG00000204531:ENST00000259915:exon_31132905_31133063:POU5F1;ENSG00000204531:ENST00000471529:exon_31132905_31133063:POU5F1;ENSG00000204531:ENST00000448657:exon_31132905_31133063:POU5F1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31170528 A/G 1 6 2 8 2.74591633854431 1.08469455381856 1.66122178472574 A:G A G 10 0.542347276909282 0.303100337321114 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31237124 T/C 1 61 20 81 27.9168161085338 10.8469455381856 17.0698705703482 T:C T C 10 0.542347276909282 0.000122702382802152 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31237162 C/G 1 55 19 74 25.1708997699895 10.3045982612764 14.8663015087131 C:G C G 10 0.542347276909282 0.000427398097125281 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31239376 C/T 0 91 0 91 41.6463978012553 0 41.6463978012553 C C 10 0.542347276909282 6.86278356989929e-25 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31239378 T/G 0 93 0 93 42.5617032474368 0 42.5617032474368 T T 10 0.542347276909282 3.54915927906212e-25 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31239430 C/T 1 81 1 82 37.0698705703482 0.542347276909282 36.5275232934389 T:C C T 10 0.542347276909282 2.1231692043598e-20 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31239821 G/T 0 27 0 27 12.3566235234494 0 12.3566235234494 G G 10 0.542347276909282 8.94495552252289e-08 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239776_31239882:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239776_31239850:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239776_31239846:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31239776_31239867:HLA-C HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31322402 C/T 1 30 8 38 13.7295816927215 4.33877821527426 9.39080347744729 T:C C T 10 0.542347276909282 0.00284386524047558 ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31322459 T/C 1 43 1 44 19.6790670929009 0.542347276909282 19.1367198159916 T:C T C 10 0.542347276909282 1.04645128687743e-10 ENSG00000234745:ENST00000497377:exon_31322410_31322853:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31322911 C/T 1 2047 832 2879 936.8151241667 451.232934388523 485.582189778177 A:T:C:G C T 10 0.542347276909282 1.50978841535075e-76 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31322899_31323000:HLA-B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31540784 C/A 1 48 41 89 21.9673307083545 22.2362383532806 -0.268907644926095 A:C C A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540705_31540810:LTA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31548451 A/G 1 123 172 295 56.2912849401583 93.2837316283965 -36.9924466882382 A:G A G 10 0.542347276909282 1.82443201939591e-05 ENSG00000227507:ENST00000483972:exon_31548302_31548940:LTB;ENSG00000227507:ENST00000429299:exon_31548332_31548940:LTB;ENSG00000227507:ENST00000446745:exon_31548332_31548940:LTB;ENSG00000227507:ENST00000482429:exon_31548401_31548940:LTB HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31556922 C/T 1 1 16 17 0.457652723090718 8.67755643054851 -8.21990370745779 T:C C T 10 0.542347276909282 6.6226931125509e-05 ENSG00000204475:ENST00000495600:exon_31556672_31557008:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000491161:exon_31556672_31557008:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000340027:exon_31556672_31556953:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376073:exon_31556672_31557008:NCR3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31601344 T/C 1 6 4 10 2.74591633854431 2.16938910763713 0.57652723090718 T:C T C 10 0.542347276909282 0.762606887543924 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31601156_31601424:BAT2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31601711 C/T 1 9 5 14 4.11887450781646 2.71173638454641 1.40713812327005 T:C C T 10 0.542347276909282 0.594287862477072 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31601636_31601766:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31601636_31601766:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31601636_31601766:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31601636_31601766:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31601636_31601766:BAT2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31604010 C/G 1 57 39 96 26.0862052161709 21.151543799462 4.93466141670893 C:G C G 10 0.542347276909282 0.356743504098697 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603986_31604027:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603986_31604196:BAT2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31605199 G/C 1 23 39 62 10.5260126310865 21.151543799462 -10.6255311683755 C:G G C 10 0.542347276909282 0.0072991891623691 ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31610686 A/G 1 24 22 46 10.9836653541772 11.9316400920042 -0.94797473782697 A:G A G 10 0.542347276909282 0.88257143121608 ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000470875:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000465348:exon_31610461_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000438149:exon_31610609_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000436214:exon_31610647_31610892:BAT3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31627523 C/T 1 8 7 15 3.66122178472574 3.79643093836497 -0.135209153639229 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000204439:ENST00000375911:exon_31626075_31628549:C6orf47 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31729359 A/G 1 6 4 10 2.74591633854431 2.16938910763713 0.57652723090718 A:G A G 10 0.542347276909282 0.762606887543924 ENSG00000204410:ENST00000375755:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000534153:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375750:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528100:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375742:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395817:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000383401:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375703:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375740:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528640:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375696:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000423982:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000463144:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395853:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000431848:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000484309:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000429846:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000491552:exon_31729249_31729392:MSH5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31938072 T/C 1 5 12 17 2.28826361545359 6.50816732291138 -4.21990370745779 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0505700971879753 ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 31938107 A/G 1 4 6 10 1.83061089236287 3.25408366145569 -1.42347276909282 A:G A G 10 0.542347276909282 0.528168739719971 ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 32089142 G/T 1 3 5 8 1.37295816927215 2.71173638454641 -1.33877821527426 T:G G T 10 0.542347276909282 0.482450044879903 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 32407709 C/A 1 40 70 110 18.3061089236287 37.9643093836497 -19.658200460021 A:C C A 10 0.542347276909282 0.000240917286573672 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32407619_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32407647_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000462200:exon_32407649_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32407655_32407809:HLA-DRA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 32411035 A/C 1 765 917 1682 350.104333164399 497.332452925812 -147.228119761412 A:T:C A C 10 0.542347276909282 6.65515727269179e-13 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32410962_32411243:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32410962_32411122:HLA-DRA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 32411646 T/G 1 780 1096 1876 356.96912401076 594.412615492573 -237.443491481813 T:G T G 10 0.542347276909282 5.21645288950851e-28 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32411533_32411698:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32411533_32411698:HLA-DRA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 32796793 G/A 1 17 10 27 7.78009629254221 5.42347276909282 2.35662352344939 A:T:G G A 10 0.542347276909282 0.441442400372166 ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32793192_32796811:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32796683_32796811:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32796721_32796811:TAP2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 32818774 T/C 1 18 13 31 8.23774901563293 7.05051459982067 1.18723441581226 T:C T C 10 0.542347276909282 0.721251361519701 ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32818721_32818926:TAP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 32825090 G/A 1 164 119 283 75.0550465868778 64.5393259522045 10.5157206346732 A:G G A 10 0.542347276909282 0.232742718826473 ENSG00000240065:ENST00000395330:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000414474:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000464863:exon_32823915_32825911:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000374859:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000453265:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000467593:exon_32825040_32825171:PSMB9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 32916555 G/A 1 115 152 267 52.6300631554326 82.4367860902109 -29.8067229347783 A:G G A 10 0.542347276909282 0.000278366962318072 ENSG00000204257:ENST00000480785:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000395305:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000395303:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000477541:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000374843:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000532100:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000341486:exon_32916391_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000473725:exon_32916518_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000464392:exon_32916548_32916645:HLA-DMA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 32917042 A/C 1 1 10 11 0.457652723090718 5.42347276909282 -4.9658200460021 A:C A C 10 0.542347276909282 0.00378312149267267 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 32917544 C/T 1 223 184 407 102.05655724923 99.7918989513079 2.26465829792224 T:C C T 10 0.542347276909282 0.842361312260803 ENSG00000204257:ENST00000395305:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000395303:exon_32917388_32917564:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000477541:exon_32917388_32918580:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000374843:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000532100:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000341486:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000464392:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000456800:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000422832:exon_32917434_32917666:HLA-DMA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 32944746 G/A 1 4 5 9 1.83061089236287 2.71173638454641 -0.881125492183538 A:G G A 10 0.542347276909282 0.74064055507759 ENSG00000204256:ENST00000464592:exon_32944339_32945347:BRD2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 32946133 T/C 1 217 290 507 99.3106409106858 157.280710303692 -57.970069393006 A:T:C T C 10 0.542347276909282 2.67759008852651e-07 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000463639:exon_32945903_32946578:BRD2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 33052981 C/A 1 368 400 768 168.416202097384 216.938910763713 -48.5227086663286 A:C C A 10 0.542347276909282 0.000500051149553561 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 33173842 G/A 1 3 9 12 1.37295816927215 4.88112549218354 -3.50816732291138 A:G G A 10 0.542347276909282 0.077659883252704 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 33256653 G/A 1 13 11 24 5.94948540017933 5.9658200460021 -0.0163346458227673 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000227057:ENST00000374617:exon_33256581_33256790:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000444176:exon_33256581_33256664:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000477718:exon_33256581_33256790:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000468157:exon_33256581_33256790:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000481025:exon_33256581_33256789:WDR46 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 33660597 C/T 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 T:C C T 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33660505_33660670:ITPR3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 33740382 G/A 1 8 8 16 3.66122178472574 4.33877821527426 -0.677556430548512 A:G G A 10 0.542347276909282 0.804712000972457 ENSG00000161904:ENST00000506578:exon_33738979_33740552:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000293760:exon_33738979_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000511171:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000374196:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000450389:exon_33739474_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000421671:exon_33739209_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000508327:exon_33740102_33740555:LEMD2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 36936771 A/G 1 14 7 21 6.40713812327005 3.79643093836497 2.61070718490508 A:G A G 10 0.542347276909282 0.281064205206453 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 37348920 C/T 1 7 2 9 3.20356906163503 1.08469455381856 2.11887450781646 T:C C T 10 0.542347276909282 0.193758782140484 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 38650588 T/A 1 10 9 19 4.57652723090718 4.88112549218354 -0.304598261276357 A:T T A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000124767:ENST00000470973:exon_38650584_38650991:GLO1;ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38650584_38650651:GLO1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 38650628 T/G 1 7 12 19 3.20356906163503 6.50816732291138 -3.30459826127636 T:G T G 10 0.542347276909282 0.166892980214950 ENSG00000124767:ENST00000470973:exon_38650584_38650991:GLO1;ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38650584_38650651:GLO1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 41903798 C/A 1 4 10 14 1.83061089236287 5.42347276909282 -3.59286187672995 A:C C A 10 0.542347276909282 0.0629725562793592 ENSG00000112576:ENST00000372991:exon_41902671_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511642:exon_41902672_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372987:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000414200:exon_41902723_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000510503:exon_41903173_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511686:exon_41903634_41903845:CCND3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 42200436 G/A 1 4 10 14 1.83061089236287 5.42347276909282 -3.59286187672995 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0629725562793592 ENSG00000124496:ENST00000372922:exon_42200419_42200630:TRERF1;ENSG00000124496:ENST00000372917:exon_42200419_42200666:TRERF1;ENSG00000124496:ENST00000340840:exon_42200419_42200666:TRERF1;ENSG00000124496:ENST00000354325:exon_42200419_42200630:TRERF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 42532102 C/T 1 7 9 16 3.20356906163503 4.88112549218354 -1.67755643054851 T:C C T 10 0.542347276909282 0.457321849303075 ENSG00000024048:ENST00000372903:exon_42531800_42532135:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372899:exon_42531800_42532135:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372901:exon_42531800_42532135:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372883:exon_42532058_42532135:UBR2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 42658941 G/T 1 10 16 26 4.57652723090718 8.67755643054851 -4.10102919964133 T:G G T 10 0.542347276909282 0.117943741083141 ENSG00000024048:ENST00000372899:exon_42658770_42661242:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372901:exon_42658770_42661242:UBR2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 44081718 G/A 1 295 208 503 135.007553311762 112.808233597131 22.1993197146312 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0489259428847705 ENSG00000180992:ENST00000372014:exon_44081194_44081946:MRPL14 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 44221404 G/C 1 4075 3846 7921 1864.93484659468 2085.8676269931 -220.932780398422 A:T:C:G G C 10 0.542347276909282 6.55861873212128e-07 ENSG00000096384:ENST00000371646:exon_44221226_44221620:HSP90AB1;ENSG00000096384:ENST00000353801:exon_44221226_44221620:HSP90AB1;ENSG00000096384:ENST00000371554:exon_44221226_44221620:HSP90AB1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 44223010 G/T 1 24 17 41 10.9836653541772 9.21990370745779 1.76376164671944 T:G G T 10 0.542347276909282 0.639977479089852 ENSG00000157593:ENST00000495706:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393810:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393812:exon_44221843_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000341553:exon_44222931_44223381:SLC35B2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 49439805 G/A 1 16 7 23 7.32244356945149 3.79643093836497 3.52601263108651 A:G G A 10 0.542347276909282 0.149662035595442 ENSG00000031691:ENST00000335783:exon_49439776_49439896:CENPQ;ENSG00000031691:ENST00000371200:exon_49439776_49439896:CENPQ HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 56917538 G/A 1 5 4 9 2.28826361545359 2.16938910763713 0.118874507816462 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000168116:ENST00000370733:exon_56917484_56920023:KIAA1586;ENSG00000168116:ENST00000488682:exon_56917484_56917844:KIAA1586 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 70407465 A/T 1 14 11 25 6.40713812327005 5.9658200460021 0.441318077267951 A:T A T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000168216:ENST00000370577:exon_70407455_70407533:LMBRD1;ENSG00000168216:ENST00000370570:exon_70407455_70407533:LMBRD1;ENSG00000168216:ENST00000472827:exon_70407455_70407533:LMBRD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 74161801 G/T 1 5 5 10 2.28826361545359 2.71173638454641 -0.42347276909282 T:G G T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000164430:ENST00000370318:exon_74161248_74161982:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74161248_74161999:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74161248_74161999:C6orf150 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 74533192 T/G 1 9 1 10 4.11887450781646 0.542347276909282 3.57652723090718 T:G T G 10 0.542347276909282 0.0259607145887505 ENSG00000156535:ENST00000422508:exon_74533182_74538040:CD109;ENSG00000156535:ENST00000287097:exon_74533182_74534789:CD109 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 80749972 A/C 1 5 7 12 2.28826361545359 3.79643093836497 -1.50816732291138 A:C A C 10 0.542347276909282 0.401951173845371 ENSG00000112742:ENST00000509894:exon_80749913_80749997:TTK;ENSG00000112742:ENST00000230510:exon_80749913_80749997:TTK;ENSG00000112742:ENST00000369798:exon_80749913_80749997:TTK;ENSG00000112742:ENST00000504590:exon_80749913_80749988:TTK HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 87969737 C/T 1 107 125 232 48.9688413707068 67.7934096136602 -18.8245682429534 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0146330205150656 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 87970301 C/G 1 378 391 769 172.992729328291 212.057785271529 -39.0650559432378 A:T:C:G C G 10 0.542347276909282 0.00529079205916477 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000496806:exon_87969793_87970363:ZNF292 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 89793894 G/C 1 71 72 143 32.493343339441 39.0490039374683 -6.55566059802732 A:C:G G C 10 0.542347276909282 0.276380564077735 ENSG00000146278:ENST00000369472:exon_89793472_89794064:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000336032:exon_89793472_89794879:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000354922:exon_89793472_89793916:PNRC1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 90039670 G/C 1 177 215 392 81.0045319870571 116.604664535496 -35.6001325484385 C:G G C 10 0.542347276909282 0.000374866930037860 ENSG00000241519:ENST00000361333:exon_90039279_90039676:UBE2J1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 90371202 G/A 1 12 9 21 5.49183267708862 4.88112549218354 0.610707184905079 A:G G A 10 0.542347276909282 0.83023905970592 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90371150_90371297:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90371150_90371297:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90371150_90371297:MDN1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 97339078 A/G 1 61 66 127 27.9168161085338 35.7949202760126 -7.87810416747881 A:T:C:G A G 10 0.542347276909282 0.181445282443959 ENSG00000123545:ENST00000316149:exon_97337189_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000478382:exon_97338888_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000489477:exon_97339027_97339267:NDUFAF4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 100964147 G/C 1 3 5 8 1.37295816927215 2.71173638454641 -1.33877821527426 C:G G C 10 0.542347276909282 0.482450044879903 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100964056_100964203:ASCC3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 101296389 G/A 1 11 2 13 5.0341799539979 1.08469455381856 3.94948540017933 A:G G A 10 0.542347276909282 0.04696746291402 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_101296024_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000324696:exon_101296024_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000522650:exon_101296024_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000468245:exon_101295880_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000324723:exon_101296296_101296583:ASCC3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 106999822 G/A 1 4 4 8 1.83061089236287 2.16938910763713 -0.338778215274256 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000457437:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000285105:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000487681:exon_106999727_107000189:AIM1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 107113715 G/A 1 27 32 59 12.3566235234494 17.355112861097 -4.99848933764764 A:G G A 10 0.542347276909282 0.194432236688200 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107113657_107116292:QRSL1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 109764535 G/T 1 20 21 41 9.15305446181436 11.3892928150949 -2.23623835328056 T:G G T 10 0.542347276909282 0.532225132268824 ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109764470_109764623:SMPD2;ENSG00000135587:ENST00000458487:exon_109764470_109764623:SMPD2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 109767930 G/T 1 32 7 39 14.644887138903 3.79643093836497 10.848456200538 T:G G T 10 0.542347276909282 0.000540757217926959 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 109767931 C/T 1 33 7 40 15.1025398619937 3.79643093836497 11.3061089236287 T:C C T 10 0.542347276909282 0.000339215730898762 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 109768295 G/A 1 22 9 31 10.0683599079958 4.88112549218354 5.18723441581226 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0714886311914403 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109768276_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109768276_109768432:MICAL1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 109786980 T/C 1 9 7 16 4.11887450781646 3.79643093836497 0.322443569451489 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000112365:ENST00000230122:exon_109783797_109787777:ZBTB24 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 116599665 T/C 1 4 9 13 1.83061089236287 4.88112549218354 -3.05051459982067 T:C T C 10 0.542347276909282 0.101447871356357 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 116600774 C/G 1 3 8 11 1.37295816927215 4.33877821527426 -2.9658200460021 C:G C G 10 0.542347276909282 0.126534045746447 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 116600810 G/A 1 7 6 13 3.20356906163503 3.25408366145569 -0.0505145998206653 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 126661502 G/T 1 82 63 145 37.5275232934389 34.1678784452848 3.35964484815411 T:G G T 10 0.542347276909282 0.617330470582278 ENSG00000203760:ENST00000368326:exon_126661320_126661545:CENPW;ENSG00000203760:ENST00000368325:exon_126661320_126661590:CENPW;ENSG00000203760:ENST00000368328:exon_126661320_126661545:CENPW HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 129939958 T/A 1 7 6 13 3.20356906163503 3.25408366145569 -0.0505145998206653 A:T T A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000146376:ENST00000368149:exon_129939832_129939997:ARHGAP18;ENSG00000146376:ENST00000275189:exon_129939832_129939997:ARHGAP18 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 133138600 G/A 1 21 24 45 9.61070718490508 13.0163346458228 -3.40562746091769 A:G G A 10 0.542347276909282 0.369625257455188 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 135287533 A/G 1 18 7 25 8.23774901563293 3.79643093836497 4.44131807726795 A:G A G 10 0.542347276909282 0.106537487560771 ENSG00000112339:ENST00000367837:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000445176:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000367824:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000527005:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000527578:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000415177:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000367826:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000533274:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000526100:exon_135287467_135287611:HBS1L HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 483 1 484 221.046265252817 0.542347276909282 220.503917975908 A:T T A 10 0.542347276909282 1.56434338819330e-126 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 569 0 569 260.404399438619 0 260.404399438619 A A 10 0.542347276909282 7.09963979465163e-152 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 569 0 569 260.404399438619 0 260.404399438619 A A 10 0.542347276909282 7.09963979465163e-152 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 136597449 G/C 1 289 1 290 132.261636973218 0.542347276909282 131.719289696308 A:C:G G A 10 0.542347276909282 2.56882770228878e-75 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 35 0 35 16.0178453081751 0 16.0178453081751 G G 10 0.542347276909282 5.56690540573316e-10 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 33 0 33 15.1025398619937 0 15.1025398619937 T T 10 0.542347276909282 1.95448717466855e-09 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 143382110 T/C 1 9 9 18 4.11887450781646 4.88112549218354 -0.762250984367075 T:C T C 10 0.542347276909282 0.814595397980852 ENSG00000146416:ENST00000367601:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000419072:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000447498:exon_143381990_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000357847:exon_143382013_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000344492:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367598:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367596:exon_143382038_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000275235:exon_143382038_143382203:AIG1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 151686905 C/T 1 4 7 11 1.83061089236287 3.79643093836497 -1.9658200460021 T:C C T 10 0.542347276909282 0.364977036425421 ENSG00000181472:ENST00000325144:exon_151685252_151688027:ZBTB2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 151726300 G/C 1 53 39 92 24.2555943238081 21.151543799462 3.10405052434606 C:G G C 10 0.542347276909282 0.532032118478611 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000336451:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151725990_151726402:RMND1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 151789868 G/A 1 7 6 13 3.20356906163503 3.25408366145569 -0.0505145998206653 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000146476:ENST00000367294:exon_151789478_151791236:C6orf211 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 155606325 C/T 1 9 10 19 4.11887450781646 5.42347276909282 -1.30459826127636 T:C C T 10 0.542347276909282 0.647186647042385 ENSG00000029639:ENST00000367166:exon_155606292_155606411:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000468889:exon_155606292_155606411:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000495806:exon_155606292_155606333:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000489874:exon_155606292_155606411:TFB1M HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 159178345 C/T 1 5 4 9 2.28826361545359 2.16938910763713 0.118874507816462 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159178243_159178413:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159178243_159178413:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159178243_159178413:SYTL3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 6 167343141 G/A 1 1264 843 2107 578.473041986668 457.198754434525 121.274287552143 A:T:C:G G A 10 0.542347276909282 1.04879699713963e-07 ENSG00000026297:ENST00000366855:exon_167342992_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000508775:exon_167342992_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000421787:exon_167343004_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000510083:exon_167343006_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000428859:exon_167343013_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000476238:exon_167343028_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000028008:exon_167343033_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000478180:exon_167343086_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000467705:exon_167343121_167343279:RNASET2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 1132456 C/T 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 T:C C T 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 1195215 A/C 1 17 15 32 7.78009629254221 8.13520915363923 -0.355112861097022 A:C:G A C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000178381:ENST00000401903:exon_1195089_1195220:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000316495:exon_1195089_1195220:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000397083:exon_1195089_1195220:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000471448:exon_1195089_1195313:ZFAND2A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 1976457 C/T 1 25 19 44 11.441318077268 10.3045982612764 1.13671981599159 T:C C T 10 0.542347276909282 0.764291164151949 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000450235:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000437877:exon_1976323_1976533:MAD1L1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 2257612 G/A 1 13 13 26 5.94948540017933 7.05051459982067 -1.10102919964133 A:G G A 10 0.542347276909282 0.697454295170068 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000469871:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000445959:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000429625:exon_2257597_2257678:MAD1L1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 2289636 C/T 1 195 157 352 89.24228100269 85.1485224747573 4.09375852793275 T:C C T 10 0.542347276909282 0.669107828380737 ENSG00000106268:ENST00000356714:exon_2289492_2289637:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397049:exon_2289492_2289637:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000447457:exon_2289492_2289637:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397047:exon_2289492_2289637:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397046:exon_2289492_2289637:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397048:exon_2289492_2289637:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000449983:exon_2289492_2289637:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000343985:exon_2289492_2289637:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000339737:exon_2289492_2289637:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000431585:exon_2289492_2289637:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000487426:exon_2289492_2289637:NUDT1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 2957005 T/C 1 7 3 10 3.20356906163503 1.62704183072785 1.57652723090718 T:C T C 10 0.542347276909282 0.361234487774673 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2956924_2957019:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000480332:exon_2956924_2957019:CARD11 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 4825307 T/A 1 5 5 10 2.28826361545359 2.71173638454641 -0.42347276909282 A:T T A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4825153_4825315:KIAA0415 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 4825314 C/T 1 5 5 10 2.28826361545359 2.71173638454641 -0.42347276909282 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4825153_4825315:KIAA0415 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 5528883 G/A 0 0 11 11 0 5.9658200460021 -5.9658200460021 A G A 10 0.542347276909282 0.000184457602230558 ENSG00000155034:ENST00000458142:exon_5528809_5529843:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000312577:exon_5528880_5528927:FBXL18 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 5569327 G/A 1 6 6 12 2.74591633854431 3.25408366145569 -0.508167322911383 A:G G A 10 0.542347276909282 0.780543886765314 ENSG00000075624:ENST00000484841:exon_5569166_5569364:ACTB HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 5781203 T/G 1 4 7 11 1.83061089236287 3.79643093836497 -1.9658200460021 T:G T G 10 0.542347276909282 0.364977036425421 ENSG00000011275:ENST00000425013:exon_5780604_5781275:RNF216;ENSG00000011275:ENST00000447067:exon_5781141_5781275:RNF216;ENSG00000011275:ENST00000389902:exon_5780604_5781446:RNF216;ENSG00000011275:ENST00000389900:exon_5780604_5781275:RNF216 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 6155166 G/T 1 8 9 17 3.66122178472574 4.88112549218354 -1.21990370745779 T:G G T 10 0.542347276909282 0.630026415722873 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 6647738 T/C 1 16 11 27 7.32244356945149 5.9658200460021 1.35662352344939 T:C T C 10 0.542347276909282 0.70076477773491 ENSG00000146576:ENST00000344417:exon_6647591_6648357:C7orf26;ENSG00000146576:ENST00000359073:exon_6647591_6648355:C7orf26 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 7613039 C/T 1 5 5 10 2.28826361545359 2.71173638454641 -0.42347276909282 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000164654:ENST00000340080:exon_7612067_7613400:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000405785:exon_7612067_7613400:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000434746:exon_7612067_7613400:MIOS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 7646687 A/G 1 58 59 117 26.5438579392616 31.9984893376476 -5.45463139838599 A:G A G 10 0.542347276909282 0.353535853295917 ENSG00000164654:ENST00000340080:exon_7646627_7647127:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000405785:exon_7646627_7646854:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000493227:exon_7646627_7648556:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000479694:exon_7646627_7648560:MIOS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 20201395 G/C 1 2 11 13 0.915305446181436 5.9658200460021 -5.05051459982067 C:G G C 10 0.542347276909282 0.00907015594284308 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20201371_20201493:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20201371_20201493:MACC1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 24756951 C/T 1 4 7 11 1.83061089236287 3.79643093836497 -1.9658200460021 T:C C T 10 0.542347276909282 0.364977036425421 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000446822:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24756088_24756993:DFNA5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 30634630 G/C 1 5 6 11 2.28826361545359 3.25408366145569 -0.965820046002102 C:G G C 10 0.542347276909282 0.564156977749346 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30634297_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000454308:exon_30634457_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000478124:exon_30634500_30634759:GARS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 30634661 C/G 1 6 4 10 2.74591633854431 2.16938910763713 0.57652723090718 C:G C G 10 0.542347276909282 0.762606887543924 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30634297_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000454308:exon_30634457_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000478124:exon_30634500_30634759:GARS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 32909182 G/A 1 5 13 18 2.28826361545359 7.05051459982067 -4.76225098436708 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0315938653261495 ENSG00000170852:ENST00000304056:exon_32907784_32910492:KBTBD2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 43622806 T/C 1 24 21 45 10.9836653541772 11.3892928150949 -0.405627460917687 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000164543:ENST00000319357:exon_43622664_43623048:STK17A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 43846603 A/G 1 205 195 400 93.8188082335972 105.75771899731 -11.9389107637128 A:G A G 10 0.542347276909282 0.248407356108890 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43846576_43846938:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43846576_43846939:BLVRA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 44606098 C/T 1 76 63 139 34.7816069548946 34.1678784452848 0.613728509609807 T:C C T 10 0.542347276909282 0.93238074546379 ENSG00000136271:ENST00000258772:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000446987:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000421223:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000479602:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000485367:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000467318:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000433257:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000431640:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000448192:exon_44605737_44606123:DDX56 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 44620836 C/A 1 3 9 12 1.37295816927215 4.88112549218354 -3.50816732291138 A:C C A 10 0.542347276909282 0.077659883252704 ENSG00000158604:ENST00000457408:exon_44620692_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000419520:exon_44620692_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000481238:exon_44619496_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000477639:exon_44619503_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000444131:exon_44620692_44620838:TMED4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 44839429 C/T 1 26 30 56 11.8989708003587 16.2704183072785 -4.37144750691979 T:C C T 10 0.542347276909282 0.283378385925138 ENSG00000196262:ENST00000468812:exon_44839301_44839473:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000451562:exon_44839301_44839610:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000355968:exon_44839301_44839473:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000489459:exon_44839301_44839473:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000415933:exon_44839301_44839473:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000494484:exon_44838991_44839473:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000480603:exon_44839301_44839473:PPIA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 55540707 G/A 1 12 19 31 5.49183267708862 10.3045982612764 -4.81276558418774 A:G G A 10 0.542347276909282 0.103930414272294 ENSG00000154978:ENST00000285279:exon_55538306_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000428648:exon_55538307_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000433959:exon_55538307_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000428097:exon_55539630_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000418904:exon_55539896_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000454227:exon_55540402_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000453256:exon_55540447_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000427700:exon_55540470_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000455023:exon_55540578_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000414113:exon_55540610_55540738:VOPP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 55840888 A/C 1 14 20 34 6.40713812327005 10.8469455381856 -4.43980741491559 A:C A C 10 0.542347276909282 0.167626111650877 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 56125757 A/G 1 24 26 50 10.9836653541772 14.1010291996413 -3.1173638454641 A:G A G 10 0.542347276909282 0.396970879853752 ENSG00000146731:ENST00000275603:exon_56125686_56125796:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000335503:exon_56125686_56125796:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000482776:exon_56125686_56125796:CCT6A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 56126360 T/C 1 55 69 124 25.1708997699895 37.4219621067405 -12.251062336751 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0303210008137754 ENSG00000146731:ENST00000275603:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000335503:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000482776:exon_56126313_56126703:CCT6A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 56149939 G/A 1 6 3 9 2.74591633854431 1.62704183072785 1.11887450781646 A:G G A 10 0.542347276909282 0.521783447682374 ENSG00000164776:ENST00000297373:exon_56149856_56149946:PHKG1;ENSG00000164776:ENST00000432123:exon_56149856_56149946:PHKG1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 64291976 G/A 1 7 2 9 3.20356906163503 1.08469455381856 2.11887450781646 A:G G A 10 0.542347276909282 0.193758782140484 ENSG00000197008:ENST00000307355:exon_64291829_64292580:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000494380:exon_64291829_64292181:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440155:exon_64291829_64292620:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440598:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000437743:exon_64291829_64294042:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000359735:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000430838:exon_64291829_64294054:ZNF138 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 64864607 G/A 1 3 9 12 1.37295816927215 4.88112549218354 -3.50816732291138 A:G G A 10 0.542347276909282 0.077659883252704 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 64864800 A/G 1 2 25 27 0.915305446181436 13.558681922732 -12.6433764765506 A:G A G 10 0.542347276909282 4.26165214893905e-07 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 72717933 C/T 1 60 45 105 27.4591633854431 24.4056274609177 3.05353592452539 A:T:C C T 10 0.542347276909282 0.558727639186782 ENSG00000130305:ENST00000428206:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000471461:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000438747:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000252594:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000446455:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000310326:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000478977:exon_72717928_72718033:NSUN5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 73097654 C/T 1 29 23 52 13.2719289696308 12.4739873689135 0.797941600717337 T:C C T 10 0.542347276909282 0.88973539923271 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30;ENSG00000071462:ENST00000464615:exon_73097355_73097713:WBSCR22 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 73097948 G/C 1 14 14 28 6.40713812327005 7.59286187672995 -1.18572375345989 C:G G C 10 0.542347276909282 0.706653005826908 ENSG00000071462:ENST00000265758:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000420399:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000457629:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000423166:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421304:exon_73097899_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000432522:exon_73097901_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421744:exon_73097903_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000478670:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000496153:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000441822:exon_73097931_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000428163:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000436944:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000463307:exon_73097939_73098003:WBSCR22 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 73249165 T/A 0 24 0 24 10.9836653541772 0 10.9836653541772 T T 10 0.542347276909282 6.29239231416346e-07 ENSG00000165171:ENST00000297873:exon_73248920_73249332:WBSCR27;ENSG00000165171:ENST00000434654:exon_73248926_73249332:WBSCR27 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 73249299 G/C 1 12 1 13 5.49183267708862 0.542347276909282 4.94948540017934 C:G G C 10 0.542347276909282 0.00483815174817428 ENSG00000165171:ENST00000297873:exon_73248920_73249332:WBSCR27;ENSG00000165171:ENST00000434654:exon_73248926_73249332:WBSCR27;ENSG00000165171:ENST00000458679:exon_73249245_73249410:WBSCR27 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 75615006 C/T 1 32 9 41 14.644887138903 4.88112549218354 9.76376164671944 T:C C T 10 0.542347276909282 0.00247254487170113 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75614897_75615031:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000496888:exon_75614897_75615063:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75614888_75615167:POR HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 75615287 G/A 1 25 42 67 11.441318077268 22.7785856301898 -11.3372675529219 A:G G A 10 0.542347276909282 0.00662297632702734 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75615241_75615386:POR HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 75630274 T/C 1 21 15 36 9.61070718490508 8.13520915363923 1.47549803126585 T:C T C 10 0.542347276909282 0.738561386845267 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000438695:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75630208_75630320:STYXL1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 75659815 T/C 1 4 5 9 1.83061089236287 2.71173638454641 -0.881125492183538 T:C T C 10 0.542347276909282 0.74064055507759 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000441791:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000474328:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000460184:exon_75659739_75659842:STYXL1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 76111835 G/A 1 3 9 12 1.37295816927215 4.88112549218354 -3.50816732291138 A:G G A 10 0.542347276909282 0.077659883252704 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000423646:exon_76111825_76111976:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000429179:exon_76111825_76111880:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000472426:exon_76111825_76111932:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 76112060 C/T 1 5 7 12 2.28826361545359 3.79643093836497 -1.50816732291138 T:C C T 10 0.542347276909282 0.401951173845371 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 90014408 G/A 1 31 14 45 14.1872344158123 7.59286187672995 6.59437253908231 A:G G A 10 0.542347276909282 0.052198471292467 ENSG00000105793:ENST00000257659:exon_90014206_90015204:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_90014206_90020769:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_90014206_90020327:GTPBP10;ENSG00000157224:ENST00000422604:exon_90014206_90014552:CLDN12;ENSG00000157224:ENST00000416322:exon_90014206_90014552:CLDN12 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 91503228 C/T 1 11 7 18 5.0341799539979 3.79643093836497 1.23774901563292 T:C C T 10 0.542347276909282 0.640760652032418 ENSG00000127989:ENST00000419292:exon_91500243_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000351870:exon_91502205_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000406735:exon_91502636_91504078:MTERF HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 91630620 G/T 1 180 231 411 82.3774901563292 125.282220966044 -42.9047308097149 T:G G T 10 0.542347276909282 2.43785734553751e-05 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493453:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394565:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91630162_91632549:AKAP9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 91691601 C/T 1 19 10 29 8.69540173872364 5.42347276909282 3.27192896963082 T:C C T 10 0.542347276909282 0.265279241936785 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000491695:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000265737:exon_91691588_91691800:AKAP9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 91712698 A/G 1 24 22 46 10.9836653541772 11.9316400920042 -0.94797473782697 A:G A G 10 0.542347276909282 0.88257143121608 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91712484_91713009:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91712484_91712969:AKAP9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 91713972 C/T 1 13 16 29 5.94948540017933 8.67755643054851 -2.72807103036918 T:C C T 10 0.542347276909282 0.353551198756424 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000435423:exon_91713954_91714017:AKAP9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 91726927 A/C 1 8 24 32 3.66122178472574 13.0163346458228 -9.35511286109702 A:C A C 10 0.542347276909282 0.00109287373754581 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487258:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487692:exon_91726900_91727108:AKAP9 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 91743150 A/G 1 10 11 21 4.57652723090718 5.9658200460021 -1.38929281509492 A:G A G 10 0.542347276909282 0.662591228630952 ENSG00000001630:ENST00000003100:exon_91741465_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000450723:exon_91742726_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000422867:exon_91742899_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000482924:exon_91743008_91743157:CYP51A1;ENSG00000240720:ENST00000422722:exon_91741473_91743157:AC000120.8 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 92028039 C/A 1 10 22 32 4.57652723090718 11.9316400920042 -7.35511286109702 A:C C A 10 0.542347276909282 0.0119455872967321 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 92085828 G/A 1 12 9 21 5.49183267708862 4.88112549218354 0.610707184905079 A:G G A 10 0.542347276909282 0.83023905970592 ENSG00000157259:ENST00000287957:exon_92085686_92088150:GATAD1;ENSG00000157259:ENST00000493878:exon_92085686_92086475:GATAD1;ENSG00000157259:ENST00000465247:exon_92085686_92085851:GATAD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 93551428 C/T 1 10 9 19 4.57652723090718 4.88112549218354 -0.304598261276357 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000127920:ENST00000248564:exon_93551011_93551545:GNG11 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 97488569 A/T 1 8 10 18 3.66122178472574 5.42347276909282 -1.76225098436708 A:T A T 10 0.542347276909282 0.48096710956808 ENSG00000070669:ENST00000394309:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000454046:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000437628:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000394308:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000175506:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000422745:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000455086:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000444334:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000442734:exon_97488554_97488710:ASNS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 97922851 C/T 1 31 27 58 14.1872344158123 14.6433764765506 -0.456142060738355 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97920963_97922908:BAIAP2L1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 97933601 C/T 1 18 25 43 8.23774901563293 13.558681922732 -5.32093290709912 T:C C T 10 0.542347276909282 0.125397734889384 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97933508_97933688:BAIAP2L1;ENSG00000006453:ENST00000480580:exon_97933508_97933677:BAIAP2L1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 98645517 G/A 1 6 3 9 2.74591633854431 1.62704183072785 1.11887450781646 A:G G A 10 0.542347276909282 0.521783447682374 ENSG00000198742:ENST00000468960:exon_98645278_98645710:SMURF1;ENSG00000198742:ENST00000482799:exon_98645278_98645863:SMURF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 98984399 C/T 1 90 106 196 41.1887450781646 57.4888113523839 -16.3000662742193 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0216233049080655 ENSG00000241685:ENST00000441989:exon_98984308_98984412:ARPC1A;ENSG00000241685:ENST00000432884:exon_98984308_98984412:ARPC1A;ENSG00000241685:ENST00000508211:exon_98984308_98984412:ARPC1A;ENSG00000130429:ENST00000443222:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000414376:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000252725:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000484600:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000455009:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000484375:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000418347:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000417330:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000431816:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000427217:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000458033:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000451682:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000451694:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000474880:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000445924:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000432343:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000493403:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000461486:exon_98984375_98984437:ARPC1B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 99693078 G/A 1 208 121 329 95.1917664028693 65.6240205060231 29.5677458968462 A:G G A 10 0.542347276909282 0.00107344585030155 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000491245:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000493352:exon_99693010_99693287:MCM7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 99696797 T/C 1 26 42 68 11.8989708003587 22.7785856301898 -10.8796148298312 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0101229351142029 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99696646_99697026:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000343023:exon_99696646_99696826:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99696646_99697026:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99696646_99696826:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99696646_99696826:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000477372:exon_99696646_99696968:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000463722:exon_99696646_99697376:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000425308:exon_99696646_99696826:MCM7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 99746548 C/T 1 3 15 18 1.37295816927215 8.13520915363923 -6.76225098436707 T:C C T 10 0.542347276909282 0.00150412319370035 ENSG00000188186:ENST00000341942:exon_99746530_99746598:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000474141:exon_99746535_99746598:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000460732:exon_99746536_99746598:C7orf59 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 99752566 G/A 1 16 17 33 7.32244356945149 9.21990370745779 -1.89746013800631 A:G G A 10 0.542347276909282 0.600966066666739 ENSG00000146826:ENST00000394035:exon_99752043_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000457641:exon_99752043_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000419037:exon_99752043_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000316937:exon_99752043_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000448720:exon_99752047_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000456769:exon_99752047_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000470260:exon_99752098_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000419841:exon_99752447_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000275726:exon_99752489_99752758:C7orf43 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 99817585 G/T 1 12 7 19 5.49183267708862 3.79643093836497 1.69540173872364 T:G G T 10 0.542347276909282 0.496030351825327 ENSG00000066923:ENST00000451963:exon_99816240_99817651:STAG3;ENSG00000213413:ENST00000317271:exon_99817336_99817651:PVRIG HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 99817859 A/G 1 15 4 19 6.86479084636077 2.16938910763713 4.69540173872364 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0370384104182015 ENSG00000066923:ENST00000451963:exon_99817737_99818296:STAG3;ENSG00000213413:ENST00000317271:exon_99817737_99818087:PVRIG HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 99821685 C/T 1 23 17 40 10.5260126310865 9.21990370745779 1.30610892362872 T:C C T 10 0.542347276909282 0.752078834321884 ENSG00000160844:ENST00000436886:exon_99821505_99821698:GATS;ENSG00000160844:ENST00000292369:exon_99821505_99821698:GATS;ENSG00000160844:ENST00000435519:exon_99821505_99821698:GATS;ENSG00000160844:ENST00000328453:exon_99821505_99821698:GATS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 99917416 G/A 1 6 8 14 2.74591633854431 4.33877821527426 -1.59286187672995 A:G G A 10 0.542347276909282 0.431117415726890 ENSG00000214300:ENST00000332397:exon_99917188_99917431:SPDYE3;ENSG00000214300:ENST00000380765:exon_99917188_99917431:SPDYE3;ENSG00000214300:ENST00000437326:exon_99917188_99917431:SPDYE3;ENSG00000214300:ENST00000489778:exon_99917188_99917431:SPDYE3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 100028484 T/C 1 6 6 12 2.74591633854431 3.25408366145569 -0.508167322911383 T:C T C 10 0.542347276909282 0.780543886765314 ENSG00000146834:ENST00000414441:exon_100028238_100029312:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000425355:exon_100027901_100029312:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000310512:exon_100027254_100029312:MEPCE HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 100064719 A/G 1 134 129 263 61.3254648941562 69.9627987212974 -8.63733382714116 A:G A G 10 0.542347276909282 0.293174758932381 ENSG00000166925:ENST00000300181:exon_100064142_100064791:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000423266:exon_100064146_100064791:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000393991:exon_100064161_100064791:TSC22D4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 100072031 T/C 1 40 49 89 18.3061089236287 26.5750165685548 -8.2689076449261 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0885353925673046 ENSG00000166925:ENST00000496728:exon_100071897_100072063:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000300181:exon_100071897_100072063:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000393991:exon_100071897_100072063:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000493217:exon_100071411_100072063:TSC22D4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 100175473 T/C 1 20 23 43 9.15305446181436 12.4739873689135 -3.32093290709913 T:C T C 10 0.542347276909282 0.359101549766075 ENSG00000077454:ENST00000485071:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000310300:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000467201:exon_100175445_100178496:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000422462:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000438884:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000497245:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000498539:exon_100175445_100175507:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000487697:exon_100175469_100176134:LRCH4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 100466441 G/A 1 22 30 52 10.0683599079958 16.2704183072785 -6.20205839928266 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0950466959121273 ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000417475:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000437505:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000463125:exon_100465918_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000429658:exon_100466433_100466488:TRIP6 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 100875772 T/G 1 6 15 21 2.74591633854431 8.13520915363923 -5.38929281509492 T:G T G 10 0.542347276909282 0.0262982606723561 ENSG00000106404:ENST00000308344:exon_100875373_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000401528:exon_100875373_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000305064:exon_100875374_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000433833:exon_100875686_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000414035:exon_100875769_100875796:CLDN15 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 102108532 G/A 1 7 2 9 3.20356906163503 1.08469455381856 2.11887450781646 A:G G A 10 0.542347276909282 0.193758782140484 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102108509_102108634:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000463739:exon_102108509_102108634:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102108166_102109509:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000485808:exon_102108509_102108634:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000485417:exon_102108509_102108634:LRWD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 102113226 C/T 1 28 30 58 12.8142762465401 16.2704183072785 -3.45614206073835 T:C C T 10 0.542347276909282 0.429376462103722 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102113139_102113251:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102110189_102113613:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000488689:exon_102113139_102113251:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000468175:exon_102113139_102113251:LRWD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 102114087 C/T 1 40 39 79 18.3061089236287 21.151543799462 -2.84543487583328 T:C C T 10 0.542347276909282 0.572767538989527 ENSG00000005075:ENST00000292614:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000306744:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000393794:exon_102113910_102114131:POLR2J HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 106826381 C/T 1 4 5 9 1.83061089236287 2.71173638454641 -0.881125492183538 T:C C T 10 0.542347276909282 0.74064055507759 ENSG00000105856:ENST00000468410:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000222574:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000485846:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000463202:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000417005:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000498408:exon_106826246_106826387:HBP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 107218033 T/C 1 7 6 13 3.20356906163503 3.25408366145569 -0.0505145998206653 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000105865:ENST00000422290:exon_107217758_107218460:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000265720:exon_107217758_107218906:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000431839:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000406564:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000402620:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000443233:exon_107217758_107218295:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000436411:exon_107217758_107218750:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000485825:exon_107217758_107218101:DUS4L HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 107559722 A/T 1 38 42 80 17.3908034774473 22.7785856301898 -5.38778215274256 A:T A T 10 0.542347276909282 0.261787072452247 ENSG00000091140:ENST00000205402:exon_107559639_107560360:DLD;ENSG00000091140:ENST00000415325:exon_107559639_107560038:DLD;ENSG00000091140:ENST00000417551:exon_107559639_107559828:DLD;ENSG00000091140:ENST00000440410:exon_107559639_107560158:DLD;ENSG00000091140:ENST00000437604:exon_107559639_107560100:DLD HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 112112279 G/A 1 4 11 15 1.83061089236287 5.9658200460021 -4.13520915363923 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0383920942670258 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000421296:exon_112112274_112112299:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000489994:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000470441:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000462155:exon_112112274_112112402:IFRD1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 116557939 C/T 1 10 16 26 4.57652723090718 8.67755643054851 -4.10102919964133 T:C C T 10 0.542347276909282 0.117943741083141 ENSG00000198898:ENST00000361183:exon_116557781_116559315:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000458284:exon_116557781_116559312:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426419:exon_116557781_116559312:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426421:exon_116557781_116558242:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000393463:exon_116557781_116559312:CAPZA2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 128034629 C/T 1 15 12 27 6.86479084636077 6.50816732291138 0.356623523449387 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000106348:ENST00000469328:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000484496:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000419067:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000338791:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000496200:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000354269:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000348127:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000378717:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000416064:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000343214:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000470772:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000480861:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000460045:exon_128034510_128035052:IMPDH1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 128140982 T/C 1 13 3 16 5.94948540017933 1.62704183072785 4.32244356945149 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0418964267698885 ENSG00000165055:ENST00000262432:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000482555:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000480046:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000481392:exon_128140957_128141022:METTL2B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 133749118 C/T 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 T:C C T 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133749044_133750512:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000459626:exon_133749044_133749211:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000466000:exon_133749044_133749363:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000468932:exon_133749071_133749339:EXOC4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 133979545 A/T 1 6 2 8 2.74591633854431 1.08469455381856 1.66122178472574 A:T:G A T 10 0.542347276909282 0.303100337321114 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 133979552 C/T 1 9 1 10 4.11887450781646 0.542347276909282 3.57652723090718 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0259607145887505 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 133979578 A/G 1 7 1 8 3.20356906163503 0.542347276909282 2.66122178472574 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0781860486215706 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 134871775 C/T 1 14 6 20 6.40713812327005 3.25408366145569 3.15305446181436 T:C C T 10 0.542347276909282 0.182540373289044 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134871724_134871861:WDR91 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 135322853 T/C 1 5 6 11 2.28826361545359 3.25408366145569 -0.965820046002102 T:C T C 10 0.542347276909282 0.564156977749346 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 135329690 T/C 1 18 28 46 8.23774901563293 15.1857237534599 -6.94797473782697 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0532225686140429 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000477620:exon_135329643_135329726:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000461255:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000490439:exon_135329647_135329766:NUP205 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 139724358 G/A 1 5 13 18 2.28826361545359 7.05051459982067 -4.76225098436708 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0315938653261495 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 141352547 T/G 1 4 6 10 1.83061089236287 3.25408366145569 -1.42347276909282 T:G T G 10 0.542347276909282 0.528168739719971 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 0 111 0 111 50.7994522630697 0 50.7994522630697 T T 10 0.542347276909282 3.45179979811084e-30 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 150034184 T/C 1 6 7 13 2.74591633854431 3.79643093836497 -1.05051459982067 T:C T C 10 0.542347276909282 0.588981693424056 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 150034378 A/G 1 7 17 24 3.20356906163503 9.21990370745779 -6.01633464582277 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0221255226304937 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 150439500 C/T 1 5 4 9 2.28826361545359 2.16938910763713 0.118874507816462 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000493304:exon_150439271_150439605:GIMAP5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 150440043 C/T 1 7 4 11 3.20356906163503 2.16938910763713 1.0341799539979 T:C C T 10 0.542347276909282 0.763959235154452 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 150768786 G/A 1 8 9 17 3.66122178472574 4.88112549218354 -1.21990370745779 A:G G A 10 0.542347276909282 0.630026415722873 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000493040:exon_150768564_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000460010:exon_150768752_150769223:SLC4A2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 150773807 A/T 1 197 154 351 90.1575864488715 83.5214806440294 6.63610580484203 A:T:C:G A T 10 0.542347276909282 0.486633255523197 ENSG00000164896:ENST00000483105:exon_150773679_150773888:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000489884:exon_150773711_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000465272:exon_150773713_150774114:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000467237:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000353841:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297532:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482571:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297530:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000460980:exon_150773716_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000469237:exon_150773725_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482806:exon_150773733_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000483953:exon_150773742_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000466855:exon_150773803_150773919:FASTK HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 150912750 G/T 1 4 6 10 1.83061089236287 3.25408366145569 -1.42347276909282 T:G G T 10 0.542347276909282 0.528168739719971 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150912690_150912818:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150912690_150912818:ABCF2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 150912786 T/C 1 7 6 13 3.20356906163503 3.25408366145569 -0.0505145998206653 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150912690_150912818:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150912690_150912818:ABCF2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 150935430 G/C 1 92 66 158 42.1040505243461 35.7949202760126 6.30913024833345 C:G G C 10 0.542347276909282 0.33832006045974 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150934460_150935905:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150934460_150935908:CHPF2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 151860230 G/C 1 24 36 60 10.9836653541772 19.5245019687341 -8.54083661455692 C:G G C 10 0.542347276909282 0.0280127503925929 ENSG00000055609:ENST00000360104:exon_151859202_151860911:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000262189:exon_151859202_151860911:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000355193:exon_151859202_151860911:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000424877:exon_151859202_151860419:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000473186:exon_151859202_151860911:MLL3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 154738409 T/C 1 15 20 35 6.86479084636077 10.8469455381856 -3.98215469182487 T:C T C 10 0.542347276909282 0.234575139612008 ENSG00000214106:ENST00000411526:exon_154738350_154738546:AC093726.6;ENSG00000214106:ENST00000449486:exon_154738303_154738501:AC093726.6;ENSG00000157212:ENST00000404141:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000457196:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000464717:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000397192:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000323199:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000357094:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000473219:exon_154738389_154738523:PAXIP1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 156762224 G/C 1 8 10 18 3.66122178472574 5.42347276909282 -1.76225098436708 C:G G C 10 0.542347276909282 0.48096710956808 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 156762248 G/A 1 9 13 22 4.11887450781646 7.05051459982067 -2.9316400920042 A:G G A 10 0.542347276909282 0.284538813785442 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 7 158672619 A/G 1 32 16 48 14.644887138903 8.67755643054851 5.96733070835447 A:C:G A G 10 0.542347276909282 0.110104468968604 ENSG00000126870:ENST00000407559:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000308978:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000444851:exon_158672471_158672680:WDR60 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 1514031 C/T 1 31 60 91 14.1872344158123 32.5408366145569 -18.3536021987447 T:C C T 10 0.542347276909282 0.000129171178096270 ENSG00000198010:ENST00000421627:exon_1513849_1514060:DLGAP2;ENSG00000198010:ENST00000356067:exon_1513849_1514060:DLGAP2;ENSG00000198010:ENST00000357934:exon_1513849_1514060:DLGAP2;ENSG00000198010:ENST00000520901:exon_1513849_1514060:DLGAP2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 6389889 C/A,G 0 0 10 10 0 5.42347276909282 -5.42347276909282 A:G C A 10 0.542347276909282 0.000403051468774926 ENSG00000091879:ENST00000325203:exon_6389853_6390008:ANGPT2;ENSG00000091879:ENST00000415216:exon_6389853_6390008:ANGPT2;ENSG00000091879:ENST00000523120:exon_6389853_6390008:ANGPT2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 6500544 C/T 1 7 6 13 3.20356906163503 3.25408366145569 -0.0505145998206653 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6500515_6501144:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6500515_6506026:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6500515_6500891:MCPH1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 11414237 T/C 1 19 19 38 8.69540173872364 10.3045982612764 -1.60919652255271 T:C T C 10 0.542347276909282 0.628056780896392 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000526778:exon_11414167_11414297:BLK;ENSG00000136573:ENST00000525206:exon_11414166_11414346:BLK HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 18080001 G/A 1 3 9 12 1.37295816927215 4.88112549218354 -3.50816732291138 A:G G A 10 0.542347276909282 0.077659883252704 ENSG00000171428:ENST00000517441:exon_18079551_18080263:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000307719:exon_18079551_18081198:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000518029:exon_18079551_18081198:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000517492:exon_18079551_18081198:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000520546:exon_18079286_18080731:NAT1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 18080015 G/A 1 3 9 12 1.37295816927215 4.88112549218354 -3.50816732291138 A:G G A 10 0.542347276909282 0.077659883252704 ENSG00000171428:ENST00000517441:exon_18079551_18080263:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000307719:exon_18079551_18081198:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000518029:exon_18079551_18081198:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000517492:exon_18079551_18081198:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000520546:exon_18079286_18080731:NAT1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 18080196 T/G 1 12 12 24 5.49183267708862 6.50816732291138 -1.01633464582277 T:G T G 10 0.542347276909282 0.68769230574635 ENSG00000171428:ENST00000517441:exon_18079551_18080263:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000307719:exon_18079551_18081198:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000518029:exon_18079551_18081198:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000517492:exon_18079551_18081198:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000520546:exon_18079286_18080731:NAT1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 21862551 A/G 1 13 9 22 5.94948540017933 4.88112549218354 1.0683599079958 A:G A G 10 0.542347276909282 0.67582301669418 ENSG00000130227:ENST00000434536:exon_21862506_21864095:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000252512:exon_21862506_21864096:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000433566:exon_21862506_21864095:XPO7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 22880162 G/C 1 9 10 19 4.11887450781646 5.42347276909282 -1.30459826127636 C:G G C 10 0.542347276909282 0.647186647042385 ENSG00000120889:ENST00000523752:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22879824_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22879987_22880497:TNFRSF10B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 23021346 G/A 1 6 2 8 2.74591633854431 1.08469455381856 1.66122178472574 A:G G A 10 0.542347276909282 0.303100337321114 ENSG00000173530:ENST00000312584:exon_23021299_23021543:TNFRSF10D HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 23291835 T/C 1 10 14 24 4.57652723090718 7.59286187672995 -3.01633464582277 T:C T C 10 0.542347276909282 0.226423130762452 ENSG00000197217:ENST00000518471:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000356206:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000521321:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000522255:exon_23291830_23292251:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000523958:exon_23291606_23291991:ENTPD4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 23429329 T/C 1 11 22 33 5.0341799539979 11.9316400920042 -6.8974601380063 T:C T C 10 0.542347276909282 0.0217922062251891 ENSG00000147454:ENST00000519973:exon_23428848_23432976:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000290075:exon_23428848_23429716:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518881:exon_23428848_23429734:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523930:exon_23428988_23429371:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523883:exon_23428848_23429716:SLC25A37 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 27293865 C/T 1 5 4 9 2.28826361545359 2.16938910763713 0.118874507816462 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27293768_27293865:PTK2B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 27301725 C/G 1 22 26 48 10.0683599079958 14.1010291996413 -4.03266929164553 C:G C G 10 0.542347276909282 0.250108440780858 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27301723_27301788:PTK2B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 27308585 A/C 1 28 23 51 12.8142762465401 12.4739873689135 0.34028887762662 A:C A C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27308560_27308595:PTK2B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 27311689 A/G 1 34 18 52 15.5601925850844 9.76225098436707 5.79794160071734 A:G A G 10 0.542347276909282 0.125611770244634 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000482543:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27311548_27312128:PTK2B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 27637696 A/G 1 5 5 10 2.28826361545359 2.71173638454641 -0.42347276909282 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000171320:ENST00000305188:exon_27637691_27637784:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000397418:exon_27637691_27637784:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000523910:exon_27637691_27637721:ESCO2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 27667969 C/G 1 11 5 16 5.0341799539979 2.71173638454641 2.32244356945149 C:G C G 10 0.542347276909282 0.318264889784535 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27667137_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27667718_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000524266:exon_27667811_27668018:PBK HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 28304769 C/T 1 6 3 9 2.74591633854431 1.62704183072785 1.11887450781646 T:C C T 10 0.542347276909282 0.521783447682374 ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000380254:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000346498:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000518734:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000520481:exon_28304480_28304790:FBXO16 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 29197672 A/G 1 50 39 89 22.8826361545359 21.151543799462 1.7310923550739 A:G A G 10 0.542347276909282 0.750338419370886 ENSG00000120875:ENST00000240100:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000404690:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000240101:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000462477:exon_29197615_29197760:DUSP4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 29961951 C/T 1 47 34 81 21.5096779852637 18.4398074149156 3.06987057034816 T:C C T 10 0.542347276909282 0.50597772887401 ENSG00000104660:ENST00000321250:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000397339:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000518001:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000520682:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000442880:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000523116:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000532394:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000520739:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000518192:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000519466:exon_29961816_29962002:LEPROTL1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 33371055 C/T 1 45 27 72 20.5943725390823 14.6433764765506 5.9509960625317 T:C C T 10 0.542347276909282 0.192932880277871 ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33370600_33371119:C8orf41 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 38280674 G/A 1 2 7 9 0.915305446181436 3.79643093836497 -2.88112549218354 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0896908680114052 ENSG00000077782:ENST00000397103:exon_38280543_38280693:FGFR1;ENSG00000077782:ENST00000464163:exon_38280262_38280693:FGFR1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 38458696 T/C 1 29 1 30 13.2719289696308 0.542347276909282 12.7295816927215 T:C T C 10 0.542347276909282 3.23278056674178e-07 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 38848850 C/T 1 29 29 58 13.2719289696308 15.7280710303692 -2.45614206073835 T:C C T 10 0.542347276909282 0.598488072558664 ENSG00000169490:ENST00000456845:exon_38846327_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000456397:exon_38846327_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000412303:exon_38846327_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000397070:exon_38848324_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000316221:exon_38848324_38849064:TM2D2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 53537316 A/G 1 10 10 20 4.57652723090718 5.42347276909282 -0.84694553818564 A:C:G A G 10 0.542347276909282 0.823362696388551 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000519912:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53537277_53537347:RB1CC1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 53555069 A/G 1 41 35 76 18.7637616467194 18.9821546918249 -0.218393045105433 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53554911_53555151:RB1CC1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 56699252 G/A 1 45 45 90 20.5943725390823 24.4056274609177 -3.81125492183538 A:C:G G A 10 0.542347276909282 0.459399360862342 ENSG00000137574:ENST00000260129:exon_56698797_56699619:TGS1;ENSG00000137574:ENST00000523948:exon_56698797_56699619:TGS1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 56985814 T/C 1 3510 4370 7880 1606.36105804842 2370.05760009356 -763.696542045142 T:C:G T C 10 0.542347276909282 1.66915716246748e-66 ENSG00000008988:ENST00000519807:exon_56985676_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000427539:exon_56985676_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000009589:exon_56985506_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000524349:exon_56985601_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000520490:exon_56985613_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000521262:exon_56985613_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000520627:exon_56985613_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000523936:exon_56985632_56986327:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000519606:exon_56985634_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000521289:exon_56985686_56985831:RPS20 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 67592152 T/C 1 10 6 16 4.57652723090718 3.25408366145569 1.32244356945149 T:C T C 10 0.542347276909282 0.619321847116393 ENSG00000104205:ENST00000520044:exon_67591956_67592259:SGK3;ENSG00000104205:ENST00000519289:exon_67591956_67592259:SGK3;ENSG00000213865:ENST00000521113:exon_67591956_67592259:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000519561:exon_67591956_67593393:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000390159:exon_67591956_67593235:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000396609:exon_67591956_67592259:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000518860:exon_67591774_67592259:C8orf44 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 72754980 T/A 1 34 42 76 15.5601925850844 22.7785856301898 -7.21839304510543 A:T T A 10 0.542347276909282 0.107106365240654 ENSG00000178860:ENST00000325509:exon_72753784_72754982:MSC;ENSG00000178860:ENST00000518440:exon_72754584_72754982:MSC;ENSG00000178860:ENST00000521739:exon_72754655_72754982:MSC HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 87497176 G/A 1 4 6 10 1.83061089236287 3.25408366145569 -1.42347276909282 A:G G A 10 0.542347276909282 0.528168739719971 ENSG00000176623:ENST00000519789:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519639:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523911:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000520719:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000518390:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000524172:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87496920_87497190:FAM82B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 87519315 T/G 1 4 8 12 1.83061089236287 4.33877821527426 -2.50816732291138 T:G T G 10 0.542347276909282 0.160074351563904 ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523911:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519966:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000430676:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000524172:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523370:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000521045:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000518772:exon_87519224_87519341:FAM82B HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 87540872 G/A 1 5 11 16 2.28826361545359 5.9658200460021 -3.67755643054851 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0797029297830089 ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87540754_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000523072:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000523001:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517771:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000523469:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000522240:exon_87540764_87540905:CPNE3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 87567193 C/T 1 6 6 12 2.74591633854431 3.25408366145569 -0.508167322911383 T:C C T 10 0.542347276909282 0.780543886765314 ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87567079_87567212:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87567079_87567212:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517354:exon_87567079_87567207:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517490:exon_87567079_87567212:CPNE3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 87570665 A/C 1 10 6 16 4.57652723090718 3.25408366145569 1.32244356945149 A:C A C 10 0.542347276909282 0.619321847116393 ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87570516_87573726:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87570516_87573726:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517490:exon_87570516_87573639:CPNE3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 90967711 A/G 1 8 7 15 3.66122178472574 3.79643093836497 -0.135209153639229 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90967511_90967783:NBN HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 95888307 C/T 1 23 9 32 10.5260126310865 4.88112549218354 5.64488713890298 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0509937664561399 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000521155:exon_95888302_95888370:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523998:exon_95888179_95888513:INTS8 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 120818483 G/A 1 41 32 73 18.7637616467194 17.355112861097 1.40864878562241 A:G G A 10 0.542347276909282 0.814549110415542 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 124448804 T/A 1 5 4 9 2.28826361545359 2.16938910763713 0.118874507816462 A:T T A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124448693_124448841:WDYHV1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 124449466 C/T 1 6 4 10 2.74591633854431 2.16938910763713 0.57652723090718 T:C C T 10 0.542347276909282 0.762606887543924 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000518125:exon_124449450_124449574:WDYHV1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 133844508 C/T 1 13 12 25 5.94948540017933 6.50816732291138 -0.558681922732049 T:C C T 10 0.542347276909282 0.843374430640417 ENSG00000129292:ENST00000395386:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000220847:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000395390:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000460236:exon_133844480_133844644:PHF20L1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 135521970 G/A 1 22 16 38 10.0683599079958 8.67755643054851 1.39080347744729 A:G G A 10 0.542347276909282 0.74549658093784 ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135521952_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000518408:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000521673:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000522723:exon_135521944_135521992:ZFAT HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 144358302 C/T 1 7 2 9 3.20356906163503 1.08469455381856 2.11887450781646 T:C C T 10 0.542347276909282 0.193758782140484 ENSG00000181638:ENST00000522452:exon_144358067_144358573:ZFP41;ENSG00000250571:ENST00000522479:exon_144358067_144358351:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000517530:exon_144358173_144358581:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000522033:exon_144358067_144358340:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 144403449 G/A 1 9 4 13 4.11887450781646 2.16938910763713 1.94948540017933 A:G G A 10 0.542347276909282 0.405355588189296 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144403371_144403556:TOP1MT HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 144403485 G/C 1 5 5 10 2.28826361545359 2.71173638454641 -0.42347276909282 C:G G C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144403371_144403556:TOP1MT HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 144406705 C/T 1 4 6 10 1.83061089236287 3.25408366145569 -1.42347276909282 T:C C T 10 0.542347276909282 0.528168739719971 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522041:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519591:exon_144406655_144406799:TOP1MT HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 144642854 G/A 1 15 11 26 6.86479084636077 5.9658200460021 0.898970800358668 A:G G A 10 0.542347276909282 0.844693076966731 ENSG00000104518:ENST00000526406:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533348:exon_144642773_144642856:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533063:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000262580:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531184:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000534018:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144641947_144643593:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000528475:exon_144642210_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526469:exon_144642798_144643593:GSDMD HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 144657600 G/A 1 51 6 57 23.3402888776266 3.25408366145569 20.0862052161709 A:G G A 10 0.542347276909282 1.29788838897943e-08 ENSG00000147813:ENST00000460623:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144657593_144657695:NAPRT1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 144657801 G/A 1 2 18 20 0.915305446181436 9.76225098436707 -8.84694553818564 A:G G A 10 0.542347276909282 5.22074227177881e-05 ENSG00000147813:ENST00000460623:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144657770_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144657793_144657872:NAPRT1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 144671956 G/A 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 A:G G A 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526710:exon_144671351_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531281:exon_144671481_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532596:exon_144671681_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524883:exon_144671710_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531670:exon_144671715_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528519:exon_144671780_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529832:exon_144671814_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530306:exon_144671865_144672251:EEF1D HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 144681714 G/A 1 5 6 11 2.28826361545359 3.25408366145569 -0.965820046002102 A:G G A 10 0.542347276909282 0.564156977749346 ENSG00000179886:ENST00000504548:exon_144680005_144682485:TIGD5;ENSG00000179886:ENST00000321385:exon_144680075_144682075:TIGD5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 144681777 G/T 1 10 3 13 4.57652723090718 1.62704183072785 2.94948540017933 T:G G T 10 0.542347276909282 0.161807814900871 ENSG00000179886:ENST00000504548:exon_144680005_144682485:TIGD5;ENSG00000179886:ENST00000321385:exon_144680075_144682075:TIGD5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 144697041 A/G 1 4 11 15 1.83061089236287 5.9658200460021 -4.13520915363923 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0383920942670258 ENSG00000104522:ENST00000529064:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000531473:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000425753:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000360125:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000529048:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000532308:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000533817:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000530474:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000525274:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000433984:exon_144696810_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000527549:exon_144696817_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000526290:exon_144696991_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000527006:exon_144697033_144697085:TSTA3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 144776713 A/C 1 6 2 8 2.74591633854431 1.08469455381856 1.66122178472574 A:C A C 10 0.542347276909282 0.303100337321114 ENSG00000181135:ENST00000454097:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000418203:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000533031:exon_144775841_144777526:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000358656:exon_144775841_144777555:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532486:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527561:exon_144775841_144776869:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532158:exon_144775841_144777527:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532205:exon_144775841_144777550:ZNF707 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 144874957 G/A 1 17 25 42 7.78009629254221 13.558681922732 -5.77858563018984 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0879915933267989 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144874878_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144874878_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144874655_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000525051:exon_144874878_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000526832:exon_144874655_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144874878_144875037:SCRIB HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 144990528 A/G 1 10 6 16 4.57652723090718 3.25408366145569 1.32244356945149 A:G A G 10 0.542347276909282 0.619321847116393 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 144997656 C/T 1 7 2 9 3.20356906163503 1.08469455381856 2.11887450781646 T:C C T 10 0.542347276909282 0.193758782140484 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 144998169 C/T 1 3 5 8 1.37295816927215 2.71173638454641 -1.33877821527426 T:C C T 10 0.542347276909282 0.482450044879903 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 144998190 A/G 1 5 7 12 2.28826361545359 3.79643093836497 -1.50816732291138 A:G A G 10 0.542347276909282 0.401951173845371 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 145057868 A/G 1 23 21 44 10.5260126310865 11.3892928150949 -0.863280184008406 A:G A G 10 0.542347276909282 0.880008851298633 ENSG00000178685:ENST00000526007:exon_145057335_145058526:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145057480_145057979:PARP10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 145058986 A/G 1 7 5 12 3.20356906163503 2.71173638454641 0.491832677088616 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313059:exon_145058896_145059496:PARP10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 145060112 G/A 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 A:G G A 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000533665:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000526985:exon_145059660_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525879:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528625:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525486:exon_145059886_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531537:exon_145059892_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529842:exon_145059893_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528914:exon_145059918_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528136:exon_145059939_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529311:exon_145060005_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528580:exon_145060017_145060401:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000530478:exon_145060059_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000532311:exon_145060076_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531707:exon_145060082_145060143:PARP10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 145737816 C/T 1 17 18 35 7.78009629254221 9.76225098436707 -1.98215469182487 T:C C T 10 0.542347276909282 0.503608661828194 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145737775_145737944:RECQL4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 146068322 C/T 1 23 43 66 10.5260126310865 23.3209329070991 -12.7949202760126 T:C C T 10 0.542347276909282 0.00184130686562721 ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 8 146076708 C/T 1 15 9 24 6.86479084636077 4.88112549218354 1.98366535417723 T:C C T 10 0.542347276909282 0.539851636806923 ENSG00000170619:ENST00000402718:exon_146075559_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000450361:exon_146075573_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000305103:exon_146075604_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000529143:exon_146076210_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000533270:exon_146076211_146076780:COMMD5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 312124 T/C 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 T:C T C 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000107099:ENST00000524396:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000427010:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000454469:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382341:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000478380:exon_311954_312941:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000474772:exon_311958_312166:DOCK8 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 2039983 A/C 1 10 8 18 4.57652723090718 4.33877821527426 0.237749015632924 A:C A C 10 0.542347276909282 1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 2811505 G/A 1 31 26 57 14.1872344158123 14.1010291996413 0.0862052161709279 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2811361_2811583:KIAA0020 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 2828765 C/G 1 16 21 37 7.32244356945149 11.3892928150949 -4.06684924564343 T:C:G C G 10 0.542347276909282 0.190239624971338 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2828675_2828778:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000469168:exon_2828475_2828778:KIAA0020 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 4860300 A/G 1 38 23 61 17.3908034774473 12.4739873689135 4.9168161085338 A:G A G 10 0.542347276909282 0.247431913194437 ENSG00000120158:ENST00000381750:exon_4860125_4861064:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000381730:exon_4860125_4860472:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000448872:exon_4860125_4861064:RCL1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 6506038 C/T 1 6 6 12 2.74591633854431 3.25408366145569 -0.508167322911383 T:C C T 10 0.542347276909282 0.780543886765314 ENSG00000147854:ENST00000468435:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000276893:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000485617:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000492853:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000481243:exon_6506033_6506112:UHRF2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 15459821 A/C 1 5 6 11 2.28826361545359 3.25408366145569 -0.965820046002102 A:C A C 10 0.542347276909282 0.564156977749346 ENSG00000164975:ENST00000380821:exon_15459717_15464132:SNAPC3;ENSG00000164975:ENST00000467062:exon_15459717_15460311:SNAPC3;ENSG00000164975:ENST00000380807:exon_15459717_15460311:SNAPC3;ENSG00000164975:ENST00000490969:exon_15459717_15460311:SNAPC3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 19376258 G/C 1 1 8 9 0.457652723090718 4.33877821527426 -3.88112549218354 C:G G C 10 0.542347276909282 0.0143335108091899 ENSG00000137154:ENST00000380394:exon_19375713_19376386:RPS6;ENSG00000137154:ENST00000498815:exon_19376253_19376386:RPS6 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 32541439 C/T 1 46 30 76 21.052025262173 16.2704183072785 4.78160695489457 T:C C T 10 0.542347276909282 0.300883619238672 ENSG00000197579:ENST00000360538:exon_32540542_32544324:TOPORS;ENSG00000197579:ENST00000379858:exon_32540824_32544324:TOPORS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 32541532 A/G 1 49 33 82 22.4249834314452 17.8974601380063 4.52752329343888 A:G A G 10 0.542347276909282 0.375370239913452 ENSG00000197579:ENST00000360538:exon_32540542_32544324:TOPORS;ENSG00000197579:ENST00000379858:exon_32540824_32544324:TOPORS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 33264540 C/G 0 0 55 55 0 29.8291002300105 -29.8291002300105 G C G 10 0.542347276909282 2.13541748606417e-19 ENSG00000107262:ENST00000379700:exon_33264222_33264737:AL161445.1;ENSG00000107262:ENST00000379707:exon_33264222_33264675:AL161445.1;ENSG00000107262:ENST00000379704:exon_33264222_33264761:AL161445.1;ENSG00000107262:ENST00000473781:exon_33264204_33264557:AL161445.1;ENSG00000107262:ENST00000488499:exon_33264274_33264668:AL161445.1;ENSG00000254882:ENST00000472232:exon_33264222_33264672:BAG1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 33971740 A/G 1 7 11 18 3.20356906163503 5.9658200460021 -2.76225098436708 A:G A G 10 0.542347276909282 0.238484579075496 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000421278:exon_33971649_33971752:UBAP2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 34637690 T/G 1 3 5 8 1.37295816927215 2.71173638454641 -1.33877821527426 T:G T G 10 0.542347276909282 0.482450044879903 ENSG00000147955:ENST00000277010:exon_34637544_34637768:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000378892:exon_34637217_34637729:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000353468:exon_34637544_34637741:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000442847:exon_34637604_34637694:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000360710:exon_34637604_34637694:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000477726:exon_34637544_34637806:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000461426:exon_34637217_34637793:SIGMAR1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 35650859 G/A 1 16 7 23 7.32244356945149 3.79643093836497 3.52601263108651 A:G G A 10 0.542347276909282 0.149662035595442 ENSG00000137078:ENST00000259608:exon_35650751_35650937:SIT1;ENSG00000137078:ENST00000474403:exon_35650751_35650907:SIT1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 36191149 T/C 1 106 108 214 48.5111886476161 58.5735059062025 -10.0623172585863 T:C T C 10 0.542347276909282 0.170594830120097 ENSG00000122705:ENST00000433436:exon_36190892_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000345519:exon_36190920_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000464497:exon_36190928_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000470744:exon_36190929_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000242285:exon_36190934_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000396603:exon_36190960_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000466396:exon_36190960_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000462562:exon_36190990_36191270:CLTA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 36674842 C/T 1 7 4 11 3.20356906163503 2.16938910763713 1.0341799539979 T:C C T 10 0.542347276909282 0.763959235154452 ENSG00000165304:ENST00000298048:exon_36674831_36674934:MELK HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 36840623 G/A 1 12 4 16 5.49183267708862 2.16938910763713 3.32244356945149 A:G G A 10 0.542347276909282 0.131409431801654 ENSG00000196092:ENST00000358127:exon_36833272_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377853:exon_36840169_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377840:exon_36840169_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377852:exon_36840169_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000523241:exon_36840169_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000520154:exon_36840169_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000520281:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000446742:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000522003:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000523145:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000523493:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000414447:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377847:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377849:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000524340:exon_36840555_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000522932:exon_36840555_36840633:PAX5 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 37126523 C/T 1 17 12 29 7.78009629254221 6.50816732291138 1.27192896963082 T:C C T 10 0.542347276909282 0.71141507189304 ENSG00000147905:ENST00000336755:exon_37126309_37126939:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000322831:exon_37126309_37126939:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000461038:exon_37126309_37126939:ZCCHC7 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 75775235 A/G 1 5 8 13 2.28826361545359 4.33877821527426 -2.05051459982067 A:G A G 10 0.542347276909282 0.278020697313787 ENSG00000135046:ENST00000257497:exon_75775179_75775292:ANXA1;ENSG00000135046:ENST00000456643:exon_75775179_75775292:ANXA1;ENSG00000135046:ENST00000415424:exon_75775179_75775254:ANXA1;ENSG00000135046:ENST00000376912:exon_75775179_75775292:ANXA1;ENSG00000135046:ENST00000376911:exon_75775179_75775292:ANXA1;ENSG00000135046:ENST00000495713:exon_75775179_75775292:ANXA1;ENSG00000135046:ENST00000489109:exon_75775201_75775292:ANXA1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 77563087 C/T 1 6 3 9 2.74591633854431 1.62704183072785 1.11887450781646 T:C C T 10 0.542347276909282 0.521783447682374 ENSG00000135045:ENST00000376854:exon_77561497_77563122:C9orf40 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 77752510 C/T 1 14 9 23 6.40713812327005 4.88112549218354 1.52601263108652 T:C C T 10 0.542347276909282 0.676515370948775 ENSG00000134996:ENST00000346234:exon_77752454_77752532:OSTF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 79986057 A/G 1 5 10 15 2.28826361545359 5.42347276909282 -3.13520915363923 A:G A G 10 0.542347276909282 0.123431676383676 ENSG00000197969:ENST00000360280:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376646:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376636:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000355766:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376634:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000423463:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000357409:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000477107:exon_79985942_79986065:VPS13A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 86278817 C/A 1 8 17 25 3.66122178472574 9.21990370745779 -5.55868192273205 A:C C A 10 0.542347276909282 0.0279651333996617 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000527373:exon_86278790_86278958:UBQLN1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 93637015 C/T 1 5 13 18 2.28826361545359 7.05051459982067 -4.76225098436708 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0315938653261495 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93636954_93637131:SYK HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 93639973 G/C 1 1 7 8 0.457652723090718 3.79643093836497 -3.33877821527426 C:G G C 10 0.542347276909282 0.0276538394311292 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93639853_93640062:SYK HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 93641175 C/T 1 10 6 16 4.57652723090718 3.25408366145569 1.32244356945149 T:C C T 10 0.542347276909282 0.619321847116393 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 93641199 T/C 1 14 7 21 6.40713812327005 3.79643093836497 2.61070718490508 T:C T C 10 0.542347276909282 0.281064205206453 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 95840256 A/G 0 8 0 8 3.66122178472574 0 3.66122178472574 A A 10 0.542347276909282 0.00940985022554938 ENSG00000157303:ENST00000375472:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000465709:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000375469:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000471462:exon_95840125_95840275:SUSD3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 97063628 G/C 1 5 3 8 2.28826361545359 1.62704183072785 0.661221784725744 C:G G C 10 0.542347276909282 0.734324137601319 ENSG00000175787:ENST00000395395:exon_97062097_97063736:ZNF169;ENSG00000175787:ENST00000340911:exon_97061730_97063736:ZNF169 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 100459578 T/C 1 6 7 13 2.74591633854431 3.79643093836497 -1.05051459982067 T:C T C 10 0.542347276909282 0.588981693424056 ENSG00000136936:ENST00000375128:exon_100459403_100459639:XPA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 100823084 T/C 1 22 31 53 10.0683599079958 16.8127655841877 -6.74440567619194 T:C T C 10 0.542347276909282 0.072822565323539 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 103060213 T/G 0 0 10 10 0 5.42347276909282 -5.42347276909282 G T G 10 0.542347276909282 0.000403051468774926 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 103064530 G/A 1 12 13 25 5.49183267708862 7.05051459982067 -1.55868192273205 A:G G A 10 0.542347276909282 0.55306538240066 ENSG00000136891:ENST00000374902:exon_103064366_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000477648:exon_103064368_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000444730:exon_103064372_103064586:TEX10 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 104324545 G/A 1 11 10 21 5.0341799539979 5.42347276909282 -0.389292815094922 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000155827:ENST00000389120:exon_104324528_104325622:RNF20 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 107515214 G/A 1 7 1 8 3.20356906163503 0.542347276909282 2.66122178472574 A:G G A 10 0.542347276909282 0.0781860486215706 ENSG00000136783:ENST00000374767:exon_107515187_107515345:NIPSNAP3A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 113018755 T/C 1 194 272 466 88.7846282795993 147.518459319325 -58.7338310397254 T:C:G T C 10 0.542347276909282 5.94717424837742e-08 ENSG00000136810:ENST00000374517:exon_113018692_113018920:TXN HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 114411945 G/T 1 7 4 11 3.20356906163503 2.16938910763713 1.0341799539979 T:G G T 10 0.542347276909282 0.763959235154452 ENSG00000059769:ENST00000313525:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000463589:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000447096:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000436202:exon_114411733_114412203:DNAJC25 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 116132334 C/T 1 11 13 24 5.0341799539979 7.05051459982067 -2.01633464582277 T:C C T 10 0.542347276909282 0.420883833529693 ENSG00000119411:ENST00000374183:exon_116131896_116133513:BSPRY;ENSG00000119411:ENST00000462085:exon_116131896_116133513:BSPRY HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 117103973 A/G 1 9 8 17 4.11887450781646 4.33877821527426 -0.219903707457793 A:G A G 10 0.542347276909282 1 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117103813_117104005:AKNA HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 119187839 C/T 1 15 11 26 6.86479084636077 5.9658200460021 0.898970800358668 T:C C T 10 0.542347276909282 0.844693076966731 ENSG00000148219:ENST00000288520:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000341734:exon_119187507_119187905:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000373986:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000361209:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000313400:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000373996:exon_119187507_119188367:ASTN2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 123632045 A/G 1 49 62 111 22.4249834314452 33.6255311683755 -11.2005477369303 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0359729558714226 ENSG00000119403:ENST00000312189:exon_123631865_123632223:PHF19 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 123688217 G/A 1 20 8 28 9.15305446181436 4.33877821527426 4.8142762465401 A:C:G G A 10 0.542347276909282 0.0867776635097732 ENSG00000056558:ENST00000373887:exon_123688214_123688579:TRAF1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 123929770 C/T 1 10 7 17 4.57652723090718 3.79643093836497 0.780096292542206 T:C C T 10 0.542347276909282 0.810080070348479 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373845:exon_123929767_123929955:CEP110 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 124094800 T/C 1 7 5 12 3.20356906163503 2.71173638454641 0.491832677088616 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000148180:ENST00000373823:exon_124094712_124095121:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394353:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000436847:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000449733:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000412819:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373808:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394352:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000341272:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373818:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373806:exon_124094712_124094940:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373805:exon_124094712_124095016:GSN;ENSG00000148180:ENST00000477553:exon_124094712_124094867:GSN HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 124914613 C/T 1 16 16 32 7.32244356945149 8.67755643054851 -1.35511286109702 T:C C T 10 0.542347276909282 0.723509721345873 ENSG00000119421:ENST00000373768:exon_124914524_124914687:NDUFA8 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 125895238 C/T 1 19 16 35 8.69540173872364 8.67755643054851 0.0178453081751311 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000165209:ENST00000478973:exon_125895124_125895247:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000471564:exon_125895124_125895246:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000496533:exon_125895124_125895247:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000447404:exon_125895124_125895247:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000348403:exon_125895124_125895247:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000360998:exon_125895124_125895247:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000407982:exon_125895124_125895247:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000373638:exon_125895124_125895247:STRBP HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 129595895 T/C 1 11 9 20 5.0341799539979 4.88112549218354 0.153054461814361 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000169155:ENST00000449886:exon_129594766_129600489:ZBTB43;ENSG00000169155:ENST00000373464:exon_129594766_129600489:ZBTB43;ENSG00000169155:ENST00000373457:exon_129593688_129599382:ZBTB43 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 130504070 G/A 1 9 7 16 4.11887450781646 3.79643093836497 0.322443569451489 A:G G A 10 0.542347276909282 1 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000420366:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373274:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130504067_130504238:SH2D3C HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 131027963 A/G 1 5 8 13 2.28826361545359 4.33877821527426 -2.05051459982067 A:G A G 10 0.542347276909282 0.278020697313787 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000450617:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000490257:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000468488:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000458730:exon_131027864_131027970:GOLGA2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 131085196 G/A 1 24 24 48 10.9836653541772 13.0163346458228 -2.03266929164553 A:G G A 10 0.542347276909282 0.565727619436899 ENSG00000167113:ENST00000300452:exon_131084815_131085207:COQ4;ENSG00000167113:ENST00000372875:exon_131085131_131085207:COQ4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 132580901 C/G 1 8 8 16 3.66122178472574 4.33877821527426 -0.677556430548512 C:G C G 10 0.542347276909282 0.804712000972457 ENSG00000136827:ENST00000437532:exon_132580799_132580926:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000427355:exon_132580799_132580926:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000351698:exon_132580799_132580926:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000474192:exon_132580632_132580926:TOR1A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 134136248 G/A 1 30 23 53 13.7295816927215 12.4739873689135 1.25559432380805 A:G G A 10 0.542347276909282 0.783725890048815 ENSG00000126882:ENST00000247295:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000372269:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000372271:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000464831:exon_134136176_134136737:FAM78A HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 136199466 G/A 1 23 15 38 10.5260126310865 8.13520915363923 2.39080347744729 A:G G A 10 0.542347276909282 0.515909691263228 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136199384_136199596:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136199384_136199775:SURF6 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 136199503 G/A 1 16 12 28 7.32244356945149 6.50816732291138 0.814276246540105 A:T:G G A 10 0.542347276909282 0.850551515853368 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136199384_136199596:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136199384_136199775:SURF6 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 136227260 A/G 1 61 38 99 27.9168161085338 20.6091965225527 7.30761958598109 A:G A G 10 0.542347276909282 0.157915848108685 ENSG00000148291:ENST00000371964:exon_136227141_136227310:SURF2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 137711997 G/C 0 45 0 45 20.5943725390823 0 20.5943725390823 G G 10 0.542347276909282 1.86817051627932e-12 ENSG00000130635:ENST00000371817:exon_137711962_137712069:COL5A1;ENSG00000130635:ENST00000355306:exon_137711962_137712069:COL5A1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 138395969 A/G 1 190 224 414 86.9540173872364 121.485790027679 -34.5317726404427 A:G A G 10 0.542347276909282 0.000776626713708125 ENSG00000122140:ENST00000371785:exon_138395388_138396519:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000241600:exon_138395388_138396516:MRPS2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 139273402 C/T 1 9 5 14 4.11887450781646 2.71173638454641 1.40713812327005 T:C C T 10 0.542347276909282 0.594287862477072 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 139351869 C/G 1 4 12 16 1.83061089236287 6.50816732291138 -4.67755643054851 C:G C G 10 0.542347276909282 0.0230424394536266 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 139943112 A/G 1 11 3 14 5.0341799539979 1.62704183072785 3.40713812327005 A:G A G 10 0.542347276909282 0.104636621208515 ENSG00000054179:ENST00000355097:exon_139942550_139943312:ENTPD2;ENSG00000054179:ENST00000460614:exon_139942559_139943312:ENTPD2;ENSG00000054179:ENST00000312665:exon_139943049_139943312:ENTPD2 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 140262424 C/T 1 4 10 14 1.83061089236287 5.42347276909282 -3.59286187672995 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0629725562793592 ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000490886:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000479452:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487613:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000460390:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000475006:exon_140262017_140262441:EXD3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 140262426 C/T 1 10 3 13 4.57652723090718 1.62704183072785 2.94948540017933 T:C C T 10 0.542347276909282 0.161807814900871 ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000490886:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000479452:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487613:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000460390:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000475006:exon_140262017_140262441:EXD3 HGDP00213_parsed_pileup.txt . 9 140638461 T/C 1 18 10 28 8.23774901563293 5.42347276909282 2.81427624654011 T:C T C 10 0.542347276909282 0.344745275485237 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000495657:exon_140638354_140638471:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000478940:exon_140638354_140638542:EHMT1 HGDP00213_parsed_pileup.txt . X 1497644 G/C 1 22 22 44 10.0683599079958 11.9316400920042 -1.86328018400841 C:G G C 10 0.542347276909282 0.650533514356862 ENSG00000185291:ENST00000331035:exon_1497552_1497657:IL3RA;ENSG00000185291:ENST00000381469:exon_1497552_1497657:IL3RA HGDP00213_parsed_pileup.txt . X 1508324 G/A 1 629 562 1191 287.863562824062 304.799169623016 -16.9356067989548 A:T:G G A 10 0.542347276909282 0.337224592742438 ENSG00000169100:ENST00000381401:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000475167:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000484026:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000447786:exon_1508256_1508620:SLC25A6 HGDP00213_parsed_pileup.txt . X 1508583 T/C 1 240 174 414 109.836653541772 94.3684261822151 15.4682273595573 T:C T C 10 0.542347276909282 0.138849554475400 ENSG00000169100:ENST00000381401:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000475167:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000484026:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000447786:exon_1508256_1508620:SLC25A6 HGDP00213_parsed_pileup.txt . X 1537002 C/G 1 37 36 73 16.9331507543566 19.5245019687341 -2.59135121437758 C:G C G 10 0.542347276909282 0.558765180671457 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1536866_1537009:ASMTL HGDP00213_parsed_pileup.txt . X 1537881 C/T 1 33 28 61 15.1025398619937 15.1857237534599 -0.0831838914662004 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL HGDP00213_parsed_pileup.txt . X 1537953 C/T 1 26 26 52 11.8989708003587 14.1010291996413 -2.20205839928266 T:C C T 10 0.542347276909282 0.5791321029781 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL HGDP00213_parsed_pileup.txt . X 1540706 A/G 1 42 30 72 19.2214143698102 16.2704183072785 2.9509960625317 A:G A G 10 0.542347276909282 0.554641990250926 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1540551_1540735:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1540551_1540735:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1540551_1540735:ASMTL HGDP00213_parsed_pileup.txt . X 1546792 G/A 1 26 30 56 11.8989708003587 16.2704183072785 -4.37144750691979 A:G G A 10 0.542347276909282 0.283378385925138 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP00213_parsed_pileup.txt . X 1546842 A/G 1 33 22 55 15.1025398619937 11.9316400920042 3.17089976998949 A:G A G 10 0.542347276909282 0.419277912397625 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP00213_parsed_pileup.txt . X 1546876 A/G 1 17 31 48 7.78009629254221 16.8127655841877 -9.03266929164553 A:G A G 10 0.542347276909282 0.0129377204840328 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP00213_parsed_pileup.txt . X 1713021 C/T 1 6 5 11 2.74591633854431 2.71173638454641 0.0341799539978984 T:C C T 10 0.542347276909282 1 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000381261:exon_1712337_1713117:AKAP17A HGDP00213_parsed_pileup.txt . X 1719897 C/G 1 5 10 15 2.28826361545359 5.42347276909282 -3.13520915363923 C:G C G 10 0.542347276909282 0.123431676383676 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1719552_1721407:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1719552_1721395:AKAP17A HGDP00213_parsed_pileup.txt . X 2139200 T/C 1 27 23 50 12.3566235234494 12.4739873689135 -0.1173638454641 T:C T C 10 0.542347276909282 1 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2137557_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2138809_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2138809_2139270:DHRSX HGDP00213_parsed_pileup.txt . X 2632482 C/T 1 41 49 90 18.7637616467194 26.5750165685548 -7.81125492183538 T:C C T 10 0.542347276909282 0.112296564077482 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381184:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000398818:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000449611:exon_2632463_2632495:CD99 HGDP00213_parsed_pileup.txt . X 2644302 C/T 1 37 48 85 16.9331507543566 26.0326692916455 -9.09951853728897 T:C C T 10 0.542347276909282 0.0503412362192849 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381184:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000398818:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000449611:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000482293:exon_2644301_2644404:CD99;ENSG00000002586:ENST00000482405:exon_2644301_2644414:CD99 HGDP00213_parsed_pileup.txt . X 54837340 C/T 0 29 0 29 13.2719289696308 0 13.2719289696308 C C 10 0.542347276909282 2.47408634370819e-08 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000463787:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54837254_54837563:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54837254_54837562:MAGED2