INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 881627 G/A 1 29 27 56 13.2350377192171 14.6777235027979 -1.44268578358084 A:G G A 10 0.543619388992515 0.78876574316985 ENSG00000188976:ENST00000483767:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_881553_881666:NOC2L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 1249187 G/A 1 44 21 65 20.0807468843293 11.4160071688428 8.66473971548652 A:T:G G A 10 0.543619388992515 0.0340180928245869 ENSG00000127054:ENST00000470030:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000323275:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000411962:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000462432:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000478641:exon_1249112_1250550:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000421495:exon_1249112_1249485:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000419704:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532772:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000485710:exon_1249112_1249205:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531377:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527383:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531292:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000467408:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000434694:exon_1249125_1249301:CPSF3L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 1254841 C/G 1 25 19 44 11.4095152751871 10.3287683908578 1.08074688432934 C:G C G 10 0.543619388992515 0.764751764799722 ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1254713_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000434694:exon_1254452_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000488042:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000526332:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000430786:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527719:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000530031:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000525603:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000429572:exon_1254059_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498173:exon_1254061_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000496353:exon_1254077_1256473:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000493534:exon_1254440_1255085:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000534345:exon_1254686_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532952:exon_1254727_1255265:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000490853:exon_1254761_1255223:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531019:exon_1254761_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498476:exon_1254783_1254904:CPSF3L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 1262966 C/T 1 10 6 16 4.56380611007485 3.26171633395509 1.30208977611976 T:C C T 10 0.543619388992515 0.619661436202725 ENSG00000224051:ENST00000464957:exon_1262621_1263374:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262621_1264277:GLTPD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 1263144 G/A 1 16 9 25 7.30208977611976 4.89257450093264 2.40951527518712 A:G G A 10 0.543619388992515 0.423109955424406 ENSG00000224051:ENST00000464957:exon_1262621_1263374:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262621_1264277:GLTPD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 1390875 C/T 0 8 0 8 3.65104488805988 0 3.65104488805988 C C 10 0.543619388992515 0.00950909187424297 ENSG00000215915:ENST00000378785:exon_1390840_1390899:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000435474:exon_1390840_1390899:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000475091:exon_1390840_1390899:ATAD3C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 1421531 C/A 1 5 3 8 2.28190305503742 1.63085816697755 0.65104488805988 A:C C A 10 0.543619388992515 0.734792052639277 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1421162_1421615:ATAD3B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 1425700 T/C 1 16 14 30 7.30208977611976 7.61067144589521 -0.308581669775451 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1425634_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1424584_1426051:ATAD3B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 1430985 C/T 1 47 31 78 21.4498887173518 16.852201058768 4.59768765858383 T:C C T 10 0.543619388992515 0.308611984815376 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1430865_1433228:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1430865_1431581:ATAD3B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 1551927 T/C 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000477990:exon_1551888_1554590:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514363:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000502470:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507082:exon_1551888_1553278:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000463492:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000510793:exon_1551654_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1551690_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1551691_1551994:MIB2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 1562536 G/A 1 6 10 16 2.73828366604491 5.43619388992515 -2.69791022388024 A:G G A 10 0.543619388992515 0.212743822682223 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378708:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000506488:exon_1562217_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514234:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505370:exon_1562454_1562587:MIB2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 1572355 G/A 1 33 2 35 15.060560163247 1.08723877798503 13.973321385262 A:G G A 10 0.543619388992515 3.84446371444464e-07 ENSG00000008128:ENST00000401097:exon_1572259_1572366:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341832:exon_1572259_1572366:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000317673:exon_1572259_1572366:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000407249:exon_1572259_1572366:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000340677:exon_1572259_1572366:CDK11A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 1572358 G/A 1 34 2 36 15.5169407742545 1.08723877798503 14.4297019962695 A:G G A 10 0.543619388992515 2.12068022254572e-07 ENSG00000008128:ENST00000401097:exon_1572259_1572366:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341832:exon_1572259_1572366:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000317673:exon_1572259_1572366:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000407249:exon_1572259_1572366:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000340677:exon_1572259_1572366:CDK11A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 1635004 T/C 1 26 17 43 11.8658958861946 9.24152961287276 2.62436627332185 T:C T C 10 0.543619388992515 0.4479611808858 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000463652:exon_1634915_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000467737:exon_1634915_1635011:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000478901:exon_1634527_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468397:exon_1634915_1635063:CDK11A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 1635749 C/A 1 14 14 28 6.38932855410479 7.61067144589521 -1.22134289179042 A:C C A 10 0.543619388992515 0.706220125728953 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635478_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468397:exon_1635662_1635994:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635662_1636041:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000495016:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468800:exon_1635662_1636094:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000464748:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000489300:exon_1635682_1635783:CDK11A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 1684472 C/T 1 39 17 56 17.7988438292919 9.24152961287276 8.55731421641916 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0225419868950999 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1683910_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000498806:exon_1684414_1684499:NADK HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 1686040 G/T 1 14 51 65 6.38932855410479 27.7245888386183 -21.3352602845135 T:G G T 10 0.543619388992515 1.15514731787609e-07 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000469045:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000480499:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497747:exon_1685983_1686305:NADK;ENSG00000008130:ENST00000477235:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000489538:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497615:exon_1685983_1686335:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497186:exon_1685983_1686137:NADK HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 2125172 G/A 1 87 68 155 39.7051131576512 36.966118451491 2.73899470616017 A:G G A 10 0.543619388992515 0.687321345064484 ENSG00000162585:ENST00000469733:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000428120:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000414253:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378558:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000400919:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000400918:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000359030:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378543:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378546:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000401813:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000487186:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378545:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000476803:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000440825:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000420515:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000449008:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000497675:exon_2124864_2125349:C1orf86 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 3745924 G/A 1 6 6 12 2.73828366604491 3.26171633395509 -0.52343266791018 A:G G A 10 0.543619388992515 0.779998482964206 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3745830_3745937:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3745830_3745937:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000461667:exon_3745830_3745937:KIAA0562 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 3807388 G/A 1 14 13 27 6.38932855410479 7.0670520569027 -0.677723502797906 A:G G A 10 0.543619388992515 0.848121425366976 ENSG00000198912:ENST00000361605:exon_3807133_3807621:C1orf174;ENSG00000198912:ENST00000474140:exon_3807133_3809560:C1orf174;ENSG00000198912:ENST00000486765:exon_3807133_3807621:C1orf174 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 6158562 A/G 1 24 17 41 10.9531346641796 9.24152961287276 1.71160505130688 A:T:G A G 10 0.543619388992515 0.640426017405578 ENSG00000069424:ENST00000378097:exon_6158545_6161253:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378092:exon_6158545_6158634:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000341524:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000352527:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000164247:exon_6158545_6161239:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378083:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000481789:exon_6158545_6158870:KCNAB2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 6272813 C/T 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000158286:ENST00000496676:exon_6272742_6273243:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000492476:exon_6272742_6272896:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000483336:exon_6272798_6272963:RNF207 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 8418644 C/A 1 6 4 10 2.73828366604491 2.17447755597006 0.56380611007485 A:C C A 10 0.543619388992515 0.763129400865595 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8418256_8418976:RERE HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 8418650 T/C 1 5 7 12 2.28190305503742 3.80533572294761 -1.52343266791018 T:C T C 10 0.543619388992515 0.400734857745032 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8418256_8418976:RERE HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 10238770 A/G 1 6 4 10 2.73828366604491 2.17447755597006 0.56380611007485 A:G A G 10 0.543619388992515 0.763129400865595 ENSG00000130939:ENST00000253251:exon_10238702_10238876:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000377157:exon_10238702_10238888:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000343090:exon_10238702_10238876:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000414346:exon_10238702_10238876:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000487244:exon_10238702_10238876:UBE4B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 11140946 C/T 1 24 1 25 10.9531346641796 0.543619388992515 10.4095152751871 T:C C T 10 0.543619388992515 6.69200669051482e-06 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11140821_11140969:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11140821_11140969:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11140821_11140969:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000485606:exon_11140758_11140969:EXOSC10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 12009955 C/T 1 7 8 15 3.19466427705239 4.34895511194012 -1.15429083488773 T:C C T 10 0.543619388992515 0.610096871559822 ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000449038:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12009830_12009963:PLOD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 12034756 C/T 1 27 23 50 12.3222764972021 12.5032459468278 -0.180969449625753 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12034710_12035594:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12034710_12035595:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12034710_12035595:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12034710_12035594:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000481933:exon_12034710_12035593:PLOD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 12164437 C/T 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12164436_12164588:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12164436_12164588:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000417814:exon_12164436_12164588:TNFRSF8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 12198297 T/C 1 4 18 22 1.82552244402994 9.78514900186527 -7.95962655783533 T:C T C 10 0.543619388992515 0.000839607271874147 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12198286_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12198289_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000413146:exon_12198286_12198493:TNFRSF8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 14105298 G/A 1 20 17 37 9.1276122201497 9.24152961287276 -0.113917392723057 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 14109114 A/G 1 7 9 16 3.19466427705239 4.89257450093264 -1.69791022388024 A:G A G 10 0.543619388992515 0.456567971750714 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000470057:exon_14107414_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 15892415 A/C 1 4 7 11 1.82552244402994 3.80533572294761 -1.97981327891767 A:C A C 10 0.543619388992515 0.245254265630413 ENSG00000116138:ENST00000375847:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000375838:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000475133:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000375849:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000483270:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000472665:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000479655:exon_15892313_15892494:DNAJC16 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 15904318 C/T 1 10 2 12 4.56380611007485 1.08723877798503 3.47656733208982 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0776119795169345 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15904180_15904359:AGMAT HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 15905501 G/A 1 5 4 9 2.28190305503742 2.17447755597006 0.107425499067364 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15905354_15905549:AGMAT HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 15909744 C/T 1 4 7 11 1.82552244402994 3.80533572294761 -1.97981327891767 T:C C T 10 0.543619388992515 0.245254265630413 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15909688_15909890:AGMAT HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 15909850 C/G 1 5 9 14 2.28190305503742 4.89257450093264 -2.61067144589521 C:G C G 10 0.543619388992515 0.186393367921189 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15909688_15909890:AGMAT HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 16259813 A/G 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 A:G A G 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 16271260 G/A 1 12 13 25 5.47656733208982 7.0670520569027 -1.59048472481288 A:G G A 10 0.543619388992515 0.552178694254392 ENSG00000116809:ENST00000375743:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375733:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444654:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375729:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000448462:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000492834:exon_16271192_16271334:ZBTB17 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 16525056 G/T 1 8 2 10 3.65104488805988 1.08723877798503 2.56380611007485 T:G G T 10 0.543619388992515 0.122752294666106 ENSG00000142632:ENST00000478117:exon_16524349_16525239:ARHGEF19;ENSG00000142632:ENST00000270747:exon_16524599_16525239:ARHGEF19;ENSG00000142632:ENST00000421561:exon_16524599_16525139:ARHGEF19 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 16577908 G/C 1 17 9 26 7.75847038712724 4.89257450093264 2.86589588619461 C:G G C 10 0.543619388992515 0.32603457135944 ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16573334_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000456164:exon_16577577_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000444116:exon_16577577_16578280:FBXO42 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 17739586 G/A 1 10 15 25 4.56380611007485 8.15429083488773 -3.59048472481288 A:G G A 10 0.543619388992515 0.163785907367559 ENSG00000179051:ENST00000375436:exon_17739569_17739674:RCC2;ENSG00000179051:ENST00000375433:exon_17739569_17739674:RCC2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 19585207 G/A 1 94 97 191 42.8997774347036 52.731080732274 -9.83130329757037 A:G G A 10 0.543619388992515 0.167500213774113 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19585175_19586622:MRTO4;ENSG00000053372:ENST00000479559:exon_19585175_19585233:MRTO4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 19635011 C/T 1 8 11 19 3.65104488805988 5.97981327891767 -2.32876839085779 T:C C T 10 0.543619388992515 0.358321729715676 ENSG00000053371:ENST00000235835:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000424403:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000330072:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000489286:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000492217:exon_19634949_19635136:AKR7A2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 20977000 A/C 1 8 5 13 3.65104488805988 2.71809694496258 0.932947943097304 A:C A C 10 0.543619388992515 0.782457075337367 ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 22109370 G/A 1 4 11 15 1.82552244402994 5.97981327891767 -4.15429083488773 A:G G A 10 0.543619388992515 0.037970342706995 ENSG00000090686:ENST00000400301:exon_22109317_22109688:USP48;ENSG00000090686:ENST00000308271:exon_22109317_22110099:USP48;ENSG00000090686:ENST00000529637:exon_22109317_22109484:USP48;ENSG00000090686:ENST00000421625:exon_22109317_22110099:USP48;ENSG00000090686:ENST00000532737:exon_22109317_22109384:USP48;ENSG00000090686:ENST00000489108:exon_22109317_22109436:USP48 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 24021224 C/T 1 3907 3741 7648 1783.07904720624 2033.680134221 -250.601087014755 A:T:C:G C T 10 0.543619388992515 9.40683374813963e-09 ENSG00000142676:ENST00000374550:exon_24021150_24021281:RPL11;ENSG00000142676:ENST00000482370:exon_24021150_24021281:RPL11;ENSG00000142676:ENST00000443624:exon_24021150_24021885:RPL11;ENSG00000142676:ENST00000458455:exon_24021150_24021281:RPL11 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 24083494 C/T 1 12 23 35 5.47656733208982 12.5032459468278 -7.02667861473803 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0259214967936045 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24083443_24083615:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24083443_24083615:TCEB3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 24200969 T/C 1 15 5 20 6.84570916511227 2.71809694496258 4.1276122201497 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0738358728951699 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 24200983 C/T 1 16 6 22 7.30208977611976 3.26171633395509 4.04037344216467 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0907814525821198 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 24201094 G/C 1 8 2 10 3.65104488805988 1.08723877798503 2.56380611007485 C:G G C 10 0.543619388992515 0.122752294666106 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 24201109 C/T 1 9 2 11 4.10742549906736 1.08723877798503 3.02018672108233 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0765215556444275 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 24201262 A/G 1 4 7 11 1.82552244402994 3.80533572294761 -1.97981327891767 A:C:G A G 10 0.543619388992515 0.245254265630413 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 24201357 A/G 1 5 4 9 2.28190305503742 2.17447755597006 0.107425499067364 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 24201448 C/T 1 7 3 10 3.19466427705239 1.63085816697755 1.56380611007485 T:C C T 10 0.543619388992515 0.3622898906741 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 24201643 G/A 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 A:G G A 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 25570081 T/C 1 35 46 81 15.973321385262 25.0064918936557 -9.03317050839372 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0452405667780923 ENSG00000117616:ENST00000498238:exon_25570041_25571792:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000243189:exon_25570041_25570124:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000473314:exon_25570041_25570715:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000417642:exon_25570041_25571792:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000475766:exon_25570041_25570124:C1orf63 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 26496455 C/T 1 71 77 148 32.4030233815314 41.8586929524237 -9.45566957089223 T:C C T 10 0.543619388992515 0.137206469229408 ENSG00000142684:ENST00000374266:exon_26496362_26496674:ZNF593;ENSG00000142684:ENST00000270812:exon_26496433_26496674:ZNF593 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 26496651 T/C 1 133 139 272 60.6986212639955 75.5630950699596 -14.8644738059641 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0773894712825601 ENSG00000142684:ENST00000374266:exon_26496362_26496674:ZNF593;ENSG00000142684:ENST00000270812:exon_26496433_26496674:ZNF593 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 26609259 C/T 1 14 9 23 6.38932855410479 4.89257450093264 1.49675405317215 T:C C T 10 0.543619388992515 0.676494295864547 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000486658:exon_26609140_26609280:UBXN11 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 26646726 A/G 1 806 687 1493 367.842772472033 373.466520237858 -5.62374776582493 A:T:G A G 10 0.543619388992515 0.775095479361649 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 26646730 A/G 1 807 677 1484 368.29915308304 368.030326347933 0.268826735107666 A:C:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 26786627 G/A 1 9 12 21 4.10742549906736 6.52343266791018 -2.41600716884282 A:G G A 10 0.543619388992515 0.381528981278344 ENSG00000117682:ENST00000434391:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000357049:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374192:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000525682:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000236342:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000526219:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000360009:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374194:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000430232:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000416052:exon_26786528_26786635:DHDDS HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 26887592 T/C 1 20 12 32 9.1276122201497 6.52343266791018 2.60417955223952 A:T:C T C 10 0.543619388992515 0.380669436093374 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000403732:exon_26887536_26887625:RPS6KA1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 27218923 G/T 1 29 2 31 13.2350377192171 1.08723877798503 12.147798941232 T:G G T 10 0.543619388992515 4.17754697446073e-06 ENSG00000198746:ENST00000361720:exon_27218902_27219029:GPATCH3;ENSG00000198746:ENST00000450844:exon_27218902_27219029:GPATCH3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 27676925 G/A 1 19 12 31 8.67123160914221 6.52343266791018 2.14779894123203 A:G G A 10 0.543619388992515 0.475681075974162 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27676880_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27676463_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27675889_27678549:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27675889_27677827:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000496001:exon_27676880_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000485269:exon_27676463_27676976:SYTL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 27679797 A/G 1 15 21 36 6.84570916511227 11.4160071688428 -4.57029800373054 A:G A G 10 0.543619388992515 0.134787015099521 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27677963_27679979:SYTL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 27679954 G/A 1 30 38 68 13.6914183302245 20.6575367817156 -6.96611845149102 A:G G A 10 0.543619388992515 0.112854515136939 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27677963_27679979:SYTL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 27680292 A/G 1 23 18 41 10.4967540531722 9.78514900186527 0.711605051306883 A:G A G 10 0.543619388992515 0.876327576030463 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27680204_27680421:SYTL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 28209305 A/G 1 36 18 54 16.4297019962695 9.78514900186527 6.64455299440419 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0761359850581106 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 28209362 T/C 1 53 13 66 24.1881723833967 7.0670520569027 17.121120326494 T:C T C 10 0.543619388992515 1.73142073528752e-05 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 28209366 A/G 1 55 16 71 25.1009336054117 8.69791022388024 16.4030233815314 A:G A G 10 0.543619388992515 6.76416408976804e-05 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 28861636 G/A 1 8 9 17 3.65104488805988 4.89257450093264 -1.24152961287276 A:G G A 10 0.543619388992515 0.629539446230712 ENSG00000180198:ENST00000398962:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000398958:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373834:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000427469:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000434290:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373833:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000419074:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373832:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000439292:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373831:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000411533:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000430407:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000429051:exon_28861562_28861658:RCC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 29475648 T/G 1 49 63 112 22.3626499393668 34.2480215065284 -11.8853715671617 T:G T G 10 0.543619388992515 0.0287351043313507 ENSG00000116350:ENST00000373795:exon_29474255_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000434636:exon_29475262_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000466448:exon_29475183_29475738:SRSF4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 29529699 T/C 1 3 12 15 1.36914183302245 6.52343266791018 -5.15429083488772 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0087251054224166 ENSG00000116353:ENST00000373791:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000398820:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000373792:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000475773:exon_29529643_29529713:MECR;ENSG00000116353:ENST00000263702:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000478505:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000463412:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000453185:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000489248:exon_29529654_29529745:MECR HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 29542637 A/G 1 9 7 16 4.10742549906736 3.80533572294761 0.302089776119759 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000116353:ENST00000373791:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000398820:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000373792:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000263702:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000473030:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000478505:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000490529:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000463052:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000489248:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000475861:exon_29542513_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000472630:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000474946:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000464915:exon_29542549_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000482610:exon_29542605_29542648:MECR HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 31898234 T/C 1 7 12 19 3.19466427705239 6.52343266791018 -3.32876839085779 T:C T C 10 0.543619388992515 0.166421015470228 ENSG00000168528:ENST00000373710:exon_31898177_31898256:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000487207:exon_31898177_31898256:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000373709:exon_31898177_31898256:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000491976:exon_31898177_31898256:SERINC2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 32096265 A/G 1 40 51 91 18.2552244402994 27.7245888386183 -9.46936439831887 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0576051897040782 ENSG00000162517:ENST00000373703:exon_32095463_32096443:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000461006:exon_32095941_32096333:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000478502:exon_32096050_32096443:PEF1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 33790496 G/A 1 7 3 10 3.19466427705239 1.63085816697755 1.56380611007485 A:G G A 10 0.543619388992515 0.3622898906741 ENSG00000134686:ENST00000431992:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000419414:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000307890:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000361167:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000257118:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000373422:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000373418:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000485928:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000467894:exon_33790290_33790620:PHC2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 35321242 A/C 1 60 50 110 27.3828366604491 27.1809694496258 0.201867210823345 A:C A C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000163866:ENST00000521580:exon_35319391_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000446026:exon_35320651_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000456842:exon_35320770_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000423898:exon_35320950_35321583:C1orf212 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 36225948 T/C 1 20 14 34 9.1276122201497 7.61067144589521 1.51694077425449 T:C T C 10 0.543619388992515 0.731190001700683 ENSG00000092853:ENST00000251195:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000318121:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000373220:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000520551:exon_36225943_36226517:CLSPN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 36642420 T/C 1 31 33 64 14.147798941232 17.939439836753 -3.79164089552096 T:C T C 10 0.543619388992515 0.380348259444671 ENSG00000116871:ENST00000316156:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373150:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373151:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000474796:exon_36642298_36642435:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000309824:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000530975:exon_36642318_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000487131:exon_36642407_36642443:MAP7D1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 36752433 C/T 1 33 16 49 15.060560163247 8.69791022388024 6.36264993936676 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0844534893979851 ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 36820927 G/A 1 2 8 10 0.91276122201497 4.34895511194012 -3.43619388992515 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0512654070160484 ENSG00000196182:ENST00000373129:exon_36820807_36821034:STK40;ENSG00000196182:ENST00000359297:exon_36820807_36821034:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373130:exon_36820807_36821034:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373132:exon_36820807_36821034:STK40;ENSG00000196182:ENST00000425273:exon_36820807_36821034:STK40;ENSG00000196182:ENST00000460417:exon_36820806_36821034:STK40;ENSG00000196182:ENST00000473733:exon_36820854_36821034:STK40;ENSG00000196182:ENST00000482458:exon_36820890_36821034:STK40 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 40961449 T/C 1 6 7 13 2.73828366604491 3.80533572294761 -1.0670520569027 T:C T C 10 0.543619388992515 0.588111803651177 ENSG00000187815:ENST00000372706:exon_40960593_40962015:ZNF642;ENSG00000187815:ENST00000372705:exon_40960593_40961960:ZNF642 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 40980731 G/T 1 8 4 12 3.65104488805988 2.17447755597006 1.47656733208982 T:G G T 10 0.543619388992515 0.564519601476267 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000420209:exon_40980187_40980894:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000418186:exon_40980187_40980888:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000443729:exon_40980187_40980958:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000419161:exon_40980187_40980958:DEM1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 40981230 G/A 1 15 13 28 6.84570916511227 7.0670520569027 -0.221342891790421 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 41463117 G/A 1 6 9 15 2.73828366604491 4.89257450093264 -2.15429083488773 A:G G A 10 0.543619388992515 0.306171249676451 ENSG00000171793:ENST00000372621:exon_41463066_41463198:CTPS;ENSG00000171793:ENST00000372616:exon_41463066_41463198:CTPS;ENSG00000171793:ENST00000480420:exon_41463066_41463198:CTPS;ENSG00000171793:ENST00000463285:exon_41463066_41463198:CTPS;ENSG00000171793:ENST00000486889:exon_41462797_41463198:CTPS HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 41493811 C/T 1 7 8 15 3.19466427705239 4.34895511194012 -1.15429083488773 T:C C T 10 0.543619388992515 0.610096871559822 ENSG00000010803:ENST00000372597:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000372596:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000337495:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000372595:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000326197:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000361191:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000361705:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000397174:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000397171:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000456518:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000402904:exon_41492877_41493991:SCMH1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 43408966 G/A 1 5 4 9 2.28190305503742 2.17447755597006 0.107425499067364 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000415851:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372500:exon_43408897_43408992:SLC2A1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 44447413 G/C 1 3 13 16 1.36914183302245 7.0670520569027 -5.69791022388024 C:G G C 10 0.543619388992515 0.00486583305361617 ENSG00000117411:ENST00000372324:exon_44447361_44447596:B4GALT2;ENSG00000117411:ENST00000497866:exon_44447361_44447595:B4GALT2;ENSG00000117411:ENST00000434555:exon_44447405_44447596:B4GALT2;ENSG00000117411:ENST00000356836:exon_44447361_44447596:B4GALT2;ENSG00000117411:ENST00000309519:exon_44447361_44447596:B4GALT2;ENSG00000117411:ENST00000485678:exon_44447361_44447596:B4GALT2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 44451234 C/T 1 31 25 56 14.147798941232 13.5904847248129 0.557314216419156 T:C C T 10 0.543619388992515 0.894331729045326 ENSG00000117411:ENST00000372324:exon_44451189_44451293:B4GALT2;ENSG00000117411:ENST00000434555:exon_44451189_44451293:B4GALT2;ENSG00000117411:ENST00000356836:exon_44451189_44451293:B4GALT2;ENSG00000117411:ENST00000309519:exon_44451189_44451293:B4GALT2;ENSG00000117411:ENST00000481924:exon_44451189_44451878:B4GALT2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 45797505 C/G 1 10 11 21 4.56380611007485 5.97981327891767 -1.41600716884282 C:G C G 10 0.543619388992515 0.662427114891113 ENSG00000132781:ENST00000372104:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000448481:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000456914:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000354383:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000475516:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000355498:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372098:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000481571:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372110:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372115:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000528332:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000525481:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000532813:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372100:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000450313:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000426432:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000431970:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000467459:exon_45797333_45797544:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000482094:exon_45797333_45797755:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000533178:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000412971:exon_45797406_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000462388:exon_45797419_45797758:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000466231:exon_45797442_45797521:MUTYH HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 46073489 G/A 1 8 4 12 3.65104488805988 2.17447755597006 1.47656733208982 A:G G A 10 0.543619388992515 0.564519601476267 ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000470768:exon_46072993_46073644:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46072993_46074009:NASP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 46078854 A/G 1 51 41 92 23.2754111613817 22.2883949486931 0.987016212688616 A:C:G A G 10 0.543619388992515 0.916727689309572 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 46078884 C/T 1 67 48 115 30.5775009375015 26.0937306716407 4.48377026586077 T:C C T 10 0.543619388992515 0.454100364546297 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 46094027 A/G 1 31 30 61 14.147798941232 16.3085816697755 -2.16078272854342 A:G A G 10 0.543619388992515 0.608584439198094 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46092978_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46093629_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46093900_46094080:GPBP1L1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 46095272 T/C 1 39 31 70 17.7988438292919 16.852201058768 0.946642770523944 T:C T C 10 0.543619388992515 0.904634695228966 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46095248_46095387:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000468724:exon_46095260_46095350:GPBP1L1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 46120353 G/C 1 13 8 21 5.9329479430973 4.34895511194012 1.58399283115718 C:G G C 10 0.543619388992515 0.520202888001635 ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46120215_46120501:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46120215_46120501:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000498128:exon_46120215_46120501:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000496278:exon_46119943_46120501:GPBP1L1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 46654398 G/A 1 31 34 65 14.147798941232 18.4830592257455 -4.33526028451348 A:G G A 10 0.543619388992515 0.319481672057085 ENSG00000085998:ENST00000371984:exon_46654355_46655029:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000371992:exon_46654355_46654652:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000396420:exon_46654355_46655029:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000475642:exon_46654356_46654652:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000371986:exon_46654391_46654652:POMGNT1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 46810530 A/G 1 14 14 28 6.38932855410479 7.61067144589521 -1.22134289179042 A:G A G 10 0.543619388992515 0.706220125728953 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46810454_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46810473_46810634:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000475281:exon_46810473_46811046:NSUN4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 51121198 T/C 1 6 5 11 2.73828366604491 2.71809694496258 0.0201867210823345 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000185104:ENST00000396153:exon_51121114_51121200:FAF1;ENSG00000185104:ENST00000494400:exon_51121114_51121200:FAF1;ENSG00000185104:ENST00000371778:exon_51121114_51121200:FAF1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 52266242 G/A 1 41 32 73 18.7116050513069 17.3958204477605 1.3157846035464 A:G G A 10 0.543619388992515 0.814677718682911 ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000497358:exon_52266228_52266355:NRD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 52290984 T/G 1 3 7 10 1.36914183302245 3.80533572294761 -2.43619388992515 T:G T G 10 0.543619388992515 0.202250323161148 ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000473805:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000475715:exon_52290969_52291054:NRD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 53679229 A/G 1 39 41 80 17.7988438292919 22.2883949486931 -4.48955111940121 A:G A G 10 0.543619388992515 0.315249485417533 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53678936_53679869:CPT2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 53681699 T/G 1 55 41 96 25.1009336054117 22.2883949486931 2.81253865671856 T:G T G 10 0.543619388992515 0.609078158741769 ENSG00000162384:ENST00000294360:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000483739:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000470385:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000478839:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000371480:exon_53681663_53681728:C1orf123 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 54683925 G/A 1 62 53 115 28.2955978824641 28.8118276166033 -0.516229734139234 A:G G A 10 0.543619388992515 0.925723879911986 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 59247993 C/T 1 24 21 45 10.9531346641796 11.4160071688428 -0.462872504663176 T:C C T 10 0.543619388992515 0.882521409587574 ENSG00000177606:ENST00000371222:exon_59246465_59249785:JUN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 62579907 C/T 1 4 8 12 1.82552244402994 4.34895511194012 -2.52343266791018 T:C C T 10 0.543619388992515 0.158970386231855 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62579725_62580597:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62579725_62579922:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62579725_62580582:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000465798:exon_62579762_62579918:INADL HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 64114301 T/C 1 16 17 33 7.30208977611976 9.24152961287276 -1.939439836753 T:C T C 10 0.543619388992515 0.600805537726719 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64114188_64114323:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64114188_64114323:PGM1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 66829262 A/G 1 5 5 10 2.28190305503742 2.71809694496258 -0.436193889925151 A:G A G 10 0.543619388992515 1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 70904800 G/T 1 33 16 49 15.060560163247 8.69791022388024 6.36264993936676 T:G G T 10 0.543619388992515 0.0844534893979851 ENSG00000116761:ENST00000370938:exon_70904784_70905253:CTH;ENSG00000116761:ENST00000411986:exon_70904784_70905252:CTH;ENSG00000116761:ENST00000346806:exon_70904784_70904887:CTH;ENSG00000116761:ENST00000482383:exon_70904784_70904915:CTH HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 71536574 G/C 1 12 14 26 5.47656733208982 7.61067144589521 -2.13410411380539 A:C:G G C 10 0.543619388992515 0.435428586867944 ENSG00000132485:ENST00000370920:exon_71536510_71536679:ZRANB2;ENSG00000132485:ENST00000254821:exon_71536510_71536679:ZRANB2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 75175919 C/T 1 22 25 47 10.0403734421647 13.5904847248129 -3.55011128264821 T:C C T 10 0.543619388992515 0.308984860533905 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75175793_75175931:CRYZ HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 89414921 T/C 1 9 11 20 4.10742549906736 5.97981327891767 -1.8723877798503 T:C T C 10 0.543619388992515 0.502082958548873 ENSG00000137944:ENST00000370491:exon_89414774_89414960:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000446900:exon_89414774_89414960:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000260508:exon_89414774_89414960:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000394677:exon_89414774_89414960:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370485:exon_89414774_89414960:CCBL2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 89426902 G/A 1 15 7 22 6.84570916511227 3.80533572294761 3.04037344216467 A:G G A 10 0.543619388992515 0.207513311530174 ENSG00000137944:ENST00000370491:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000446900:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000260508:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000394677:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370485:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370486:exon_89426850_89426970:CCBL2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 90486412 T/G 1 4 7 11 1.82552244402994 3.80533572294761 -1.97981327891767 T:G T G 10 0.543619388992515 0.245254265630413 ENSG00000162664:ENST00000394590:exon_90486351_90486481:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000394583:exon_90486351_90486481:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000340281:exon_90486351_90486481:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000370447:exon_90486351_90486481:ZNF326 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 93620393 G/A 1 14 15 29 6.38932855410479 8.15429083488773 -1.76496228078294 A:G G A 10 0.543619388992515 0.577774847845697 ENSG00000117500:ENST00000370282:exon_93615299_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000370290:exon_93617415_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000483033:exon_93619753_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000479918:exon_93619789_93620445:TMED5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 93672688 C/T 1 20 15 35 9.1276122201497 8.15429083488773 0.973321385261972 T:C C T 10 0.543619388992515 0.865613010692636 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000455267:exon_93672664_93672955:CCDC18 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 93720070 C/G 1 14 6 20 6.38932855410479 3.26171633395509 3.1276122201497 C:G C G 10 0.543619388992515 0.183302438111269 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93720028_93720171:CCDC18 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 93826178 A/T 1 18 20 38 8.21485099813473 10.8723877798503 -2.65753678171557 A:T A T 10 0.543619388992515 0.418189027913124 ENSG00000117505:ENST00000370272:exon_93826050_93828149:DR1;ENSG00000117505:ENST00000370267:exon_93826050_93826725:DR1;ENSG00000117505:ENST00000481583:exon_93826050_93826492:DR1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 109351501 A/G 1 9 11 20 4.10742549906736 5.97981327891767 -1.8723877798503 A:G A G 10 0.543619388992515 0.502082958548873 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109351405_109352148:STXBP3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 111783982 C/A 1 412 8 420 188.028811735084 4.34895511194012 183.679856623144 A:C C A 10 0.543619388992515 4.48276356340491e-96 ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000472825:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000529459:exon_111783949_111784065:CHI3L2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 111957097 C/G 1 2 6 8 0.91276122201497 3.26171633395509 -2.34895511194012 C:G C G 10 0.543619388992515 0.153435168169122 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 111957245 G/A 1 14 11 25 6.38932855410479 5.97981327891767 0.409515275187124 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 112309123 C/A 1 14 8 22 6.38932855410479 4.34895511194012 2.04037344216467 A:C C A 10 0.543619388992515 0.402824489413891 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 112309331 T/C 1 15 19 34 6.84570916511227 10.3287683908578 -3.48305922574551 T:C T C 10 0.543619388992515 0.234347081094378 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 117617705 A/G 1 8 3 11 3.65104488805988 1.63085816697755 2.02018672108233 A:G A G 10 0.543619388992515 0.364880107001187 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000470935:exon_117617492_117618066:TTF2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 117618067 C/T 1 9 3 12 4.10742549906736 1.63085816697755 2.47656733208982 T:C C T 10 0.543619388992515 0.24567828862345 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000469638:exon_117617917_117618481:TTF2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 117635401 G/A 1 7 5 12 3.19466427705239 2.71809694496258 0.476567332089819 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117635353_117635523:TTF2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 119427467 A/C 1 5 3 8 2.28190305503742 1.63085816697755 0.65104488805988 A:C A C 10 0.543619388992515 0.734792052639277 ENSG00000092607:ENST00000344218:exon_119425666_119428139:TBX15;ENSG00000092607:ENST00000207157:exon_119425669_119428139:TBX15;ENSG00000092607:ENST00000369429:exon_119425670_119428139:TBX15;ENSG00000092607:ENST00000449873:exon_119425670_119428139:TBX15 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 145103928 G/A 1 16 8 24 7.30208977611976 4.34895511194012 2.95313466417964 A:G G A 10 0.543619388992515 0.305769929143739 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 20 20 0 10.8723877798503 -10.8723877798503 C T C 10 0.543619388992515 1.53653942914737e-07 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 12 12 0 6.52343266791018 -6.52343266791018 T G T 10 0.543619388992515 8.16443668609228e-05 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 10 10 0 5.43619388992515 -5.43619388992515 A C A 10 0.543619388992515 0.000391987171875226 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 26 0 26 11.8658958861946 0 11.8658958861946 G G 10 0.543619388992515 1.75506176076974e-07 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 14 14 0 7.61067144589521 -7.61067144589521 C T C 10 0.543619388992515 1.70051550621732e-05 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 53 53 0 28.8118276166033 -28.8118276166033 T C T 10 0.543619388992515 8.79712634319458e-19 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 146751782 A/C 1 8 6 14 3.65104488805988 3.26171633395509 0.38932855410479 A:C A C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146751699_146751864:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146751699_146751864:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146751699_146751864:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146751699_146751864:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000361293:exon_146751699_146751864:CHD1L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 146767149 G/T 1 41 27 68 18.7116050513069 14.6777235027979 4.03388154850898 T:G G T 10 0.543619388992515 0.333661350238626 ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146767112_146767441:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146767112_146767441:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146767112_146767443:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146767112_146767443:CHD1L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 147119273 G/A 1 5 4 9 2.28190305503742 2.17447755597006 0.107425499067364 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000162836:ENST00000460583:exon_147119170_147119368:ACP6;ENSG00000162836:ENST00000369238:exon_147119172_147119368:ACP6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 150199123 G/T 1 37 31 68 16.8860826072769 16.852201058768 0.0338815485089761 T:G G T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000143401:ENST00000314136:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369116:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000421169:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369119:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000436748:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369115:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000533654:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000534220:exon_150198940_150199127:ANP32E HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 150445819 A/G 1 24 11 35 10.9531346641796 5.97981327891767 4.97332138526197 A:G A G 10 0.543619388992515 0.125528210543292 ENSG00000163125:ENST00000492220:exon_150443037_150446032:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000401000:exon_150443037_150449042:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000369068:exon_150443037_150446032:RPRD2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 150727539 G/A 1 7 13 20 3.19466427705239 7.0670520569027 -3.8723877798503 A:T:G G A 10 0.543619388992515 0.114361686412738 ENSG00000163131:ENST00000368985:exon_150727477_150727626:CTSS;ENSG00000163131:ENST00000480760:exon_150727477_150727626:CTSS HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 151315287 G/C 1 14 25 39 6.38932855410479 13.5904847248129 -7.20115617070809 C:G G C 10 0.543619388992515 0.0239562063632675 ENSG00000143390:ENST00000290524:exon_151313116_151315654:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000368870:exon_151314305_151315654:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000452671:exon_151314436_151315654:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000392746:exon_151314723_151315654:RFX5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 151372138 G/A 1 101 76 177 46.094441711756 41.3150735634311 4.77936814832483 A:G G A 10 0.543619388992515 0.497521786243589 ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151372010_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495288:exon_151372036_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495805:exon_151372055_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372063_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151372066_151372203:PSMB4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 151374025 T/C 1 262 249 511 119.571720083961 135.361227859136 -15.7895077751752 T:C T C 10 0.543619388992515 0.168632179799727 ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151374018_151374106:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372457_151374382:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151374018_151374410:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000474100:exon_151373715_151374106:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000466425:exon_151374018_151374106:PSMB4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 153920564 A/G 1 78 69 147 35.5976876585838 37.5097378404835 -1.91205018189972 A:G A G 10 0.543619388992515 0.80394347065598 ENSG00000160741:ENST00000303569:exon_153920145_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368630:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153920154_153920805:CRTC2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 153926078 T/C 1 7 1 8 3.19466427705239 0.543619388992515 2.65104488805988 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0786679847867632 ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000476883:exon_153926014_153926082:CRTC2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 153934820 C/T 1 22 21 43 10.0403734421647 11.4160071688428 -1.37563372667815 T:C:G C T 10 0.543619388992515 0.759961374077371 ENSG00000143570:ENST00000356205:exon_153934696_153934826:SLC39A1;ENSG00000143570:ENST00000368623:exon_153934696_153934826:SLC39A1;ENSG00000143570:ENST00000368621:exon_153934696_153934826:SLC39A1;ENSG00000143570:ENST00000310483:exon_153934696_153934826:SLC39A1;ENSG00000143570:ENST00000429040:exon_153934696_153934826:SLC39A1;ENSG00000143570:ENST00000413622:exon_153934696_153934826:SLC39A1;ENSG00000143570:ENST00000417348:exon_153934696_153934826:SLC39A1;ENSG00000143570:ENST00000461071:exon_153934787_153934826:SLC39A1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 154744807 C/G 1 15 6 21 6.84570916511227 3.26171633395509 3.58399283115718 C:G C G 10 0.543619388992515 0.129808597744933 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 154744852 A/G 1 11 2 13 5.02018672108233 1.08723877798503 3.9329479430973 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0469687507225183 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 154919080 C/T 1 9 8 17 4.10742549906736 4.34895511194012 -0.241529612872756 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000163346:ENST00000368465:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000368463:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000351146:exon_154918455_154919279:PBXIP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 154936318 G/A 1 8 7 15 3.65104488805988 3.80533572294761 -0.154290834887726 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000163348:ENST00000483463:exon_154935995_154936329:PYGO2;ENSG00000160691:ENST00000368445:exon_154934774_154936407:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000448116:exon_154934774_154936407:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368449:exon_154934774_154936407:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368453:exon_154934774_154936407:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368450:exon_154934774_154936407:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368443:exon_154934774_154936407:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000532863:exon_154934774_154936407:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368447:exon_154934775_154936407:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000490667:exon_154935805_154936407:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000444664:exon_154936153_154936844:SHC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 154988957 A/G 1 4 8 12 1.82552244402994 4.34895511194012 -2.52343266791018 A:G A G 10 0.543619388992515 0.158970386231855 ENSG00000160685:ENST00000368426:exon_154988696_154990998:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000417934:exon_154988696_154990998:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000292176:exon_154988696_154989457:ZBTB7B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 155033308 G/A 1 6 6 12 2.73828366604491 3.26171633395509 -0.52343266791018 A:G G A 10 0.543619388992515 0.779998482964206 ENSG00000143537:ENST00000527418:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000529473:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000526491:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000356955:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000449910:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000359280:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000355956:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368410:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000271836:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000461564:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368413:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000531455:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000472434:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000498481:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000461234:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000462116:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000468053:exon_155033239_155033308:ADAM15 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 155735012 T/C 1 9 8 17 4.10742549906736 4.34895511194012 -0.241529612872756 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000116580:ENST00000437809:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000368331:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000271883:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000361040:exon_155734218_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000471341:exon_155734575_155736500:GON4L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 156025096 C/T 1 43 47 90 19.6243662733219 25.5501112826482 -5.92574500932635 T:C C T 10 0.543619388992515 0.244308867498947 ENSG00000116586:ENST00000368305:exon_156025054_156025216:ROBLD3;ENSG00000116586:ENST00000368304:exon_156025054_156025216:ROBLD3;ENSG00000116586:ENST00000489664:exon_156025054_156025784:ROBLD3;ENSG00000116586:ENST00000368302:exon_156025054_156025216:ROBLD3;ENSG00000116586:ENST00000487106:exon_156024876_156025216:ROBLD3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 156105028 T/C 1 86 106 192 39.2487325466437 57.6236552332066 -18.3749226865629 A:T:C T C 10 0.543619388992515 0.0089532592947229 ENSG00000160789:ENST00000368301:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000347559:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000361308:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368300:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000292302:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392355:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368299:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000448611:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368297:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000473598:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392353:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000515824:exon_156104978_156105199:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368298:exon_156104904_156105103:LMNA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 156206121 G/A 1 60 26 86 27.3828366604491 14.1341041138054 13.2487325466437 A:G G A 10 0.543619388992515 0.00462683001203929 ENSG00000160783:ENST00000490491:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368273:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368277:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000497069:exon_156206079_156206274:PMF1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 156263940 T/C 1 3 6 9 1.36914183302245 3.26171633395509 -1.89257450093264 T:C T C 10 0.543619388992515 0.316548245109532 ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000476177:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000497955:exon_156263175_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000368264:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000484214:exon_156263408_156264027:C1orf85 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 156264000 G/A 1 18 12 30 8.21485099813473 6.52343266791018 1.69141833022455 A:G G A 10 0.543619388992515 0.586203203010159 ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000476177:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000497955:exon_156263175_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000368264:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000484214:exon_156263408_156264027:C1orf85 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 156280969 G/A 1 498 270 768 227.277544281728 146.777235027979 80.5003092537484 A:C:G G A 10 0.543619388992515 4.82325437693723e-09 ENSG00000163468:ENST00000443745:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000295688:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368261:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368259:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368258:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368262:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000472765:exon_156280741_156280986:CCT3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 156280971 G/A 1 496 275 771 226.364783059713 149.495331972942 76.8694510867709 A:T:C:G G A 10 0.543619388992515 2.33532665120925e-08 ENSG00000163468:ENST00000443745:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000295688:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368261:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368259:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368258:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368262:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000472765:exon_156280741_156280986:CCT3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 156565834 G/C 1 6 2 8 2.73828366604491 1.08723877798503 1.65104488805988 C:G G C 10 0.543619388992515 0.303950947229235 ENSG00000160818:ENST00000498641:exon_156565509_156565923:GPATCH4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 156706559 A/C,G 0 0 16 16 0 8.69791022388024 -8.69791022388024 C:G A C 10 0.543619388992515 3.5418891689264e-06 ENSG00000143303:ENST00000368218:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000368216:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000476229:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000497515:exon_156706424_156706752:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000481920:exon_156706473_156706694:C1orf66 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 156756499 C/T 1 52 49 101 23.7317917723892 26.6373500606332 -2.90555828824402 T:C C T 10 0.543619388992515 0.617714932956717 ENSG00000143294:ENST00000491853:exon_156756400_156756966:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000353233:exon_156756400_156756966:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000271526:exon_156756400_156756966:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000473387:exon_156756400_156756772:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000368201:exon_156756400_156756966:PRCC HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 158990247 A/G 1 53 48 101 24.1881723833967 26.0937306716407 -1.90555828824402 A:G A G 10 0.543619388992515 0.764622093978003 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_158990131_158990319:IFI16 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 159002377 C/A 1 37 55 92 16.8860826072769 29.8990663945883 -13.0129837873114 A:C C A 10 0.543619388992515 0.0085214917019445 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 159002389 T/A 1 30 44 74 13.6914183302245 23.9192531156707 -10.2278347854461 A:T T A 10 0.543619388992515 0.0192952244923871 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 159024668 A/T 1 325 312 637 148.323698577433 169.609249365665 -21.2855507882321 A:T:C A T 10 0.543619388992515 0.094793929697889 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159024611_159024945:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159024611_159024918:IFI16 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 160062340 G/A 1 18 11 29 8.21485099813473 5.97981327891767 2.23503771921706 A:G G A 10 0.543619388992515 0.459288647607193 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062072_160062485:IGSF8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 160062472 C/T 1 10 7 17 4.56380611007485 3.80533572294761 0.758470387127244 T:C C T 10 0.543619388992515 0.810304562557129 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000358475:exon_160062376_160062485:IGSF8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 160062727 A/G 1 7 4 11 3.19466427705239 2.17447755597006 1.02018672108233 A:G A G 10 0.543619388992515 0.763926340985151 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062714_160063121:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062714_160063121:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000358475:exon_160062714_160063121:IGSF8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 160681508 G/A 1 507 408 915 231.384969780795 221.796710708946 9.58825907184874 A:G G A 10 0.543619388992515 0.528556386096411 ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160681472_160681641:CD48;ENSG00000117091:ENST00000368045:exon_160681472_160681593:CD48 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 161017556 C/T 1 100 74 174 45.6380611007485 40.2278347854461 5.41022631530238 T:C C T 10 0.543619388992515 0.446825800293531 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161016738_161018145:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 161183516 C/T 1 110 69 179 50.2018672108233 37.5097378404835 12.6921293703398 A:T:C C T 10 0.543619388992515 0.0606448524929529 ENSG00000158864:ENST00000367993:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000392179:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000483804:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000465923:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000493849:exon_161183439_161184086:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000468828:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000492153:exon_161183439_161183522:NDUFS2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 161681780 A/G 1 71 36 107 32.4030233815314 19.5702980037305 12.8327253778009 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0148963169249581 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161680998_161682008:FCRLA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 161682975 G/T 1 57 85 142 26.0136948274266 46.2076480643638 -20.1939532369371 T:G G T 10 0.543619388992515 0.000720338954351796 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367949:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000350710:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000349527:exon_161682875_161683242:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367950:exon_161682875_161683495:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161682875_161684142:FCRLA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 165649851 C/G 1 5 5 10 2.28190305503742 2.71809694496258 -0.436193889925151 C:G C G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000143149:ENST00000354775:exon_165649724_165649920:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000491436:exon_165649724_165649872:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000461664:exon_165649724_165649920:ALDH9A1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 168013850 T/C 1 12 22 34 5.47656733208982 11.9596265578353 -6.48305922574551 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0372352524498717 ENSG00000143164:ENST00000367843:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000324705:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000432587:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000312263:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367840:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367839:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000489398:exon_168013823_168013909:DCAF6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 169094216 G/A 1 12 12 24 5.47656733208982 6.52343266791018 -1.04686533582036 A:G G A 10 0.543619388992515 0.686969093177818 ENSG00000143153:ENST00000367816:exon_169094122_169094277:ATP1B1;ENSG00000143153:ENST00000367815:exon_169094122_169094277:ATP1B1;ENSG00000143153:ENST00000367813:exon_169094122_169094277:ATP1B1;ENSG00000143153:ENST00000494797:exon_169094122_169094277:ATP1B1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 169762807 T/G 1 7 9 16 3.19466427705239 4.89257450093264 -1.69791022388024 T:G T G 10 0.543619388992515 0.456567971750714 ENSG00000171806:ENST00000310392:exon_169761670_169763038:C1orf156;ENSG00000171806:ENST00000303469:exon_169761670_169763038:C1orf156;ENSG00000171806:ENST00000454472:exon_169762283_169763038:C1orf156 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 169823718 T/C 1 5 8 13 2.28190305503742 4.34895511194012 -2.0670520569027 T:C T C 10 0.543619388992515 0.276871294907228 ENSG00000000457:ENST00000367772:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367771:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367770:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000423670:exon_169823652_169824105:SCYL3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 170521376 G/A 1 5 6 11 2.28190305503742 3.26171633395509 -0.979813278917665 A:G G A 10 0.543619388992515 0.56306921306608 ENSG00000120370:ENST00000367763:exon_170521156_170522587:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000498166:exon_170521156_170522587:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000464798:exon_170521156_170522974:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000498600:exon_170521156_170522583:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000475113:exon_170521156_170521417:GORAB HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 171483717 A/C 1 71 69 140 32.4030233815314 37.5097378404835 -5.1067144589521 A:C A C 10 0.543619388992515 0.397171769941559 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000476522:exon_171483675_171483769:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000467601:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000463586:exon_171483675_171483769:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171483675_171483784:BAT2L2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 172411496 A/G 1 4 6 10 1.82552244402994 3.26171633395509 -1.43619388992515 A:G A G 10 0.543619388992515 0.528005019910346 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000478184:exon_172411471_172411970:PIGC HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 172411768 T/C 1 11 9 20 5.02018672108233 4.89257450093264 0.127612220149699 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000478184:exon_172411471_172411970:PIGC HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 173457017 C/T 1 101 112 213 46.094441711756 60.8853715671617 -14.7909298554057 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0459250558846289 ENSG00000117592:ENST00000340385:exon_173456874_173457946:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000431633:exon_173456874_173457150:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000470017:exon_173456874_173457154:PRDX6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 173808677 G/A 1 5 6 11 2.28190305503742 3.26171633395509 -0.979813278917665 A:G G A 10 0.543619388992515 0.56306921306608 ENSG00000117593:ENST00000361951:exon_173808505_173808684:DARS2;ENSG00000117593:ENST00000239457:exon_173808505_173808684:DARS2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 180953853 A/G 1 7 5 12 3.19466427705239 2.71809694496258 0.476567332089819 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000135823:ENST00000258301:exon_180953813_180953907:STX6;ENSG00000135823:ENST00000469135:exon_180953813_180953907:STX6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 181058313 G/A 1 9 9 18 4.10742549906736 4.89257450093264 -0.785149001865271 A:G G A 10 0.543619388992515 0.81438018796475 ENSG00000162783:ENST00000367577:exon_181057638_181059977:IER5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 183085755 A/G 1 6 3 9 2.73828366604491 1.63085816697755 1.10742549906736 A:G A G 10 0.543619388992515 0.522625694750698 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183085712_183085810:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000479499:exon_183085712_183085810:LAMC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 183105534 T/C 1 16 10 26 7.30208977611976 5.43619388992515 1.86589588619461 T:C T C 10 0.543619388992515 0.556551766826651 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183105521_183105720:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000495918:exon_183105521_183105720:LAMC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 183105705 G/A 1 18 10 28 8.21485099813473 5.43619388992515 2.77865710820958 A:C:G G A 10 0.543619388992515 0.345225120327408 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183105521_183105720:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000495918:exon_183105521_183105720:LAMC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 183532580 G/T 1 40 33 73 18.2552244402994 17.939439836753 0.315784603546401 T:G G T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000116701:ENST00000367536:exon_183532569_183532720:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000392014:exon_183532569_183532720:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000413720:exon_183532569_183532720:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000418089:exon_183532569_183532720:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000367535:exon_183532569_183532720:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000469280:exon_183532569_183533186:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000420553:exon_183532569_183532720:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000419402:exon_183532569_183532720:NCF2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 183542323 C/T 1 17 16 33 7.75847038712724 8.69791022388024 -0.939439836752997 T:C C T 10 0.543619388992515 0.8616236970739 ENSG00000116701:ENST00000367536:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000392014:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000413720:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000367535:exon_183542320_183542427:NCF2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 183542387 T/C 1 15 17 32 6.84570916511227 9.24152961287276 -2.39582044776048 T:C T C 10 0.543619388992515 0.478525973624179 ENSG00000116701:ENST00000367536:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000392014:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000413720:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000367535:exon_183542320_183542427:NCF2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 183596703 G/A 1 43 51 94 19.6243662733219 27.7245888386183 -8.10022256529641 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0982010566480806 ENSG00000162704:ENST00000462965:exon_183595329_183596729:ARPC5;ENSG00000162704:ENST00000359856:exon_183595352_183596729:ARPC5;ENSG00000162704:ENST00000294742:exon_183595593_183596729:ARPC5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 183599638 C/T 1 38 32 70 17.3424632182844 17.3958204477605 -0.0533572294760525 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000162704:ENST00000367534:exon_183599596_183599772:ARPC5;ENSG00000162704:ENST00000462965:exon_183599596_183599772:ARPC5;ENSG00000162704:ENST00000359856:exon_183599596_183599772:ARPC5;ENSG00000162704:ENST00000294742:exon_183599596_183599772:ARPC5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 185267114 A/G 1 42 39 81 19.1679856623144 21.2011561707081 -2.03317050839372 A:G A G 10 0.543619388992515 0.657193200300683 ENSG00000116679:ENST00000367498:exon_185265520_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000480769:exon_185265520_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000459929:exon_185266147_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000475046:exon_185266903_185267420:IVNS1ABP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 197060124 A/G 1 4 7 11 1.82552244402994 3.80533572294761 -1.97981327891767 A:G A G 10 0.543619388992515 0.245254265630413 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197059980_197060171:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000294732:exon_197059980_197060171:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000445725:exon_197059980_197060171:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367408:exon_197059980_197060171:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197059980_197060171:ASPM HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 197070697 T/C 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 200376749 C/T 1 15 11 26 6.84570916511227 5.97981327891767 0.865895886194608 T:C C T 10 0.543619388992515 0.844786651072894 ENSG00000162702:ENST00000294740:exon_200375827_200378847:ZNF281;ENSG00000162702:ENST00000367353:exon_200375836_200378851:ZNF281;ENSG00000162702:ENST00000367352:exon_200375858_200378580:ZNF281 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 201973565 G/A 1 23 13 36 10.4967540531722 7.0670520569027 3.42970199626946 A:G G A 10 0.543619388992515 0.315724223110252 ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000479531:exon_201973482_201973624:RNPEP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 202304868 T/C 1 10 11 21 4.56380611007485 5.97981327891767 -1.41600716884282 T:C T C 10 0.543619388992515 0.662427114891113 ENSG00000077152:ENST00000367274:exon_202304774_202304946:UBE2T;ENSG00000077152:ENST00000487227:exon_202304774_202304946:UBE2T;ENSG00000077152:ENST00000460852:exon_202304774_202304946:UBE2T HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 203818973 C/A 1 12 12 24 5.47656733208982 6.52343266791018 -1.04686533582036 A:C C A 10 0.543619388992515 0.686969093177818 ENSG00000058673:ENST00000367214:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000367212:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000332127:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000495527:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000367210:exon_203818839_203819154:ZC3H11A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 206905043 C/T 1 17 15 32 7.75847038712724 8.15429083488773 -0.395820447760483 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000162889:ENST00000294981:exon_206904985_206905070:MAPKAPK2;ENSG00000162889:ENST00000367103:exon_206904985_206905070:MAPKAPK2;ENSG00000162889:ENST00000479009:exon_206904633_206905070:MAPKAPK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 207649609 C/T 1 6 6 12 2.73828366604491 3.26171633395509 -0.52343266791018 T:C C T 10 0.543619388992515 0.779998482964206 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207649579_207649764:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207649579_207649764:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207649579_207649764:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207649579_207649764:CR2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 209933331 A/G 1 8 10 18 3.65104488805988 5.43619388992515 -1.78514900186527 A:G A G 10 0.543619388992515 0.480432312528866 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000479796:exon_209933327_209933462:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 209933540 A/G 1 17 11 28 7.75847038712724 5.97981327891767 1.77865710820958 A:G A G 10 0.543619388992515 0.571933164007873 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 209936914 C/T 1 8 5 13 3.65104488805988 2.71809694496258 0.932947943097304 T:C C T 10 0.543619388992515 0.782457075337367 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 209948711 A/C 1 42 38 80 19.1679856623144 20.6575367817156 -1.4895511194012 A:C A C 10 0.543619388992515 0.737965383331439 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209948694_209948940:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367023:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000487271:exon_209948635_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000474496:exon_209948694_209949081:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000477431:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000480569:exon_209948635_209948786:TRAF3IP3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 214811244 C/G 1 9 9 18 4.10742549906736 4.89257450093264 -0.785149001865271 C:G C G 10 0.543619388992515 0.81438018796475 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214811209_214811344:CENPF HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 214813487 A/G 1 15 22 37 6.84570916511227 11.9596265578353 -5.11391739272306 A:G A G 10 0.543619388992515 0.100242321211337 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 214813782 A/G 1 14 26 40 6.38932855410479 14.1341041138054 -7.7447755597006 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0166498874206228 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 214813941 C/G 1 14 12 26 6.38932855410479 6.52343266791018 -0.134104113805391 C:G C G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 214814125 G/A 1 6 8 14 2.73828366604491 4.34895511194012 -1.61067144589521 A:G G A 10 0.543619388992515 0.430135065302382 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 214814733 T/G 1 5 5 10 2.28190305503742 2.71809694496258 -0.436193889925151 T:G T G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 214814778 G/A 1 7 2 9 3.19466427705239 1.08723877798503 2.10742549906736 A:G G A 10 0.543619388992515 0.194613573468504 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 214816297 A/G 1 2 7 9 0.91276122201497 3.80533572294761 -2.89257450093264 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0894121930945724 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 214818945 A/C 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 A:C A C 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 214819328 G/A 1 11 7 18 5.02018672108233 3.80533572294761 1.21485099813473 A:G G A 10 0.543619388992515 0.64123354867373 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 214819587 A/G 1 7 11 18 3.19466427705239 5.97981327891767 -2.78514900186527 A:G A G 10 0.543619388992515 0.237876828195976 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 214819980 C/T 1 7 16 23 3.19466427705239 8.69791022388024 -5.50324594682785 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0339427215578599 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 214820299 A/G 1 16 8 24 7.30208977611976 4.34895511194012 2.95313466417964 A:G A G 10 0.543619388992515 0.305769929143739 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 214820494 G/A 1 19 13 32 8.67123160914221 7.0670520569027 1.60417955223952 A:G G A 10 0.543619388992515 0.599489390025958 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 214820524 T/C 1 17 14 31 7.75847038712724 7.61067144589521 0.147798941232034 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 220154768 C/T 1 26 14 40 11.8658958861946 7.61067144589521 4.2552244402994 T:C C T 10 0.543619388992515 0.205192079787416 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220154720_220154799:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220154720_220154799:EPRS HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 221912361 T/C 1 17 15 32 7.75847038712724 8.15429083488773 -0.395820447760483 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000418487:exon_221912276_221912783:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 221912808 T/C 1 12 18 30 5.47656733208982 9.78514900186527 -4.30858166977545 T:C T C 10 0.543619388992515 0.142151911386108 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 226352498 T/G 1 5 5 10 2.28190305503742 2.71809694496258 -0.436193889925151 T:G T G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000182827:ENST00000366812:exon_226352490_226352630:ACBD3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 226923264 G/A 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 A:G G A 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 227920103 G/A 1 32 36 68 14.6041795522395 19.5702980037305 -4.96611845149102 A:G G A 10 0.543619388992515 0.273131073659703 ENSG00000143740:ENST00000480897:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000480265:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 227920357 C/T 1 26 22 48 11.8658958861946 11.9596265578353 -0.0937306716407225 T:C:G C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000143740:ENST00000480897:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000480265:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 227935444 A/G 1 7 9 16 3.19466427705239 4.89257450093264 -1.69791022388024 A:G A G 10 0.543619388992515 0.456567971750714 ENSG00000143740:ENST00000475930:exon_227935393_227935887:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000470038:exon_227935393_227935816:SNAP47 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 227954677 C/T 1 8 13 21 3.65104488805988 7.0670520569027 -3.41600716884282 T:C C T 10 0.543619388992515 0.187638969949902 ENSG00000143740:ENST00000366760:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000418653:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000478768:exon_227954660_227954784:SNAP47 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 228335125 C/T 1 195 212 407 88.9942191464596 115.247310466413 -26.2530913199536 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0096168358174377 ENSG00000143774:ENST00000366730:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000462807:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000485838:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366726:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000312726:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000492871:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366728:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366727:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000453943:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366723:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366729:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000391865:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366722:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000498092:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000435153:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366721:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000460224:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000472939:exon_228335107_228335146:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000412265:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366719:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366720:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366718:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366715:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470040:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366716:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000485168:exon_228335107_228335188:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000478725:exon_228335107_228335260:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000420445:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000495999:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000486668:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000464858:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470155:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000481341:exon_228335111_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000498115:exon_228335107_228335400:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470740:exon_228335107_228335239:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000465025:exon_228335125_228335245:GUK1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 229730452 G/A 1 6 2 8 2.73828366604491 1.08723877798503 1.65104488805988 A:G G A 10 0.543619388992515 0.303950947229235 ENSG00000135801:ENST00000366676:exon_229728858_229730841:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000258281:exon_229728868_229730841:TAF5L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 231042732 T/A 1 8 5 13 3.65104488805988 2.71809694496258 0.932947943097304 A:T T A 10 0.543619388992515 0.782457075337367 ENSG00000143643:ENST00000366661:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000366662:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000414259:exon_231041990_231042765:TTC13 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 231125863 G/A 0 11 0 11 5.02018672108233 0 5.02018672108233 G G 10 0.543619388992515 0.00140420066475522 ENSG00000173409:ENST00000497753:exon_231125856_231126009:ARV1;ENSG00000173409:ENST00000310256:exon_231125856_231126009:ARV1;ENSG00000173409:ENST00000366658:exon_231125856_231126009:ARV1;ENSG00000173409:ENST00000480519:exon_231125856_231126009:ARV1;ENSG00000173409:ENST00000450711:exon_231125856_231126009:ARV1;ENSG00000173409:ENST00000435927:exon_231125856_231126009:ARV1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 231408091 A/G 1 21 9 30 9.58399283115718 4.89257450093264 4.69141833022455 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0996497823020474 ENSG00000116906:ENST00000366646:exon_231408058_231408137:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000366647:exon_231408058_231408137:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000416000:exon_231408058_231408137:GNPAT HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 233086456 T/C 1 8 11 19 3.65104488805988 5.97981327891767 -2.32876839085779 T:C T C 10 0.543619388992515 0.358321729715676 ENSG00000135778:ENST00000494689:exon_233086351_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000490807:exon_233086360_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366628:exon_233086370_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000496662:exon_233086379_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366627:exon_233086386_233086490:C1orf57 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 234744413 C/A 1 27 23 50 12.3222764972021 12.5032459468278 -0.180969449625753 A:C C A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234744241_234745271:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234744193_234745271:IRF2BP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 234745009 A/G 1 16 20 36 7.30208977611976 10.8723877798503 -3.57029800373054 A:G A G 10 0.543619388992515 0.245449783450856 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234744241_234745271:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234744193_234745271:IRF2BP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 236306271 C/T 1 6 2 8 2.73828366604491 1.08723877798503 1.65104488805988 T:C C T 10 0.543619388992515 0.303950947229235 ENSG00000077585:ENST00000366592:exon_236305832_236306336:GPR137B;ENSG00000077585:ENST00000391852:exon_236305832_236306336:GPR137B;ENSG00000077585:ENST00000366591:exon_236305844_236306336:GPR137B;ENSG00000077585:ENST00000419162:exon_236306068_236306336:GPR137B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 236706862 G/C 1 8 8 16 3.65104488805988 4.34895511194012 -0.697910223880241 C:G G C 10 0.543619388992515 0.804399137481932 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236706842_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236706327_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525789:exon_236706596_236706948:LGALS8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 236721660 T/C 1 10 10 20 4.56380611007485 5.43619388992515 -0.872387779850301 T:C T C 10 0.543619388992515 0.823235579367717 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 242030151 A/G 1 3 6 9 1.36914183302245 3.26171633395509 -1.89257450093264 A:G A G 10 0.543619388992515 0.316548245109532 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242030132_242030357:EXO1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 242035438 G/A 1 5 7 12 2.28190305503742 3.80533572294761 -1.52343266791018 A:G G A 10 0.543619388992515 0.400734857745032 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242035334_242035580:EXO1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 242048674 C/T 1 5 9 14 2.28190305503742 4.89257450093264 -2.61067144589521 T:C C T 10 0.543619388992515 0.186393367921189 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518741:exon_242048659_242048809:EXO1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 1 246707858 A/G 1 12 23 35 5.47656733208982 12.5032459468278 -7.02667861473803 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0259214967936045 ENSG00000162851:ENST00000366514:exon_246707823_246707983:TFB2M HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 1065710 C/T 1 18 18 36 8.21485099813473 9.78514900186527 -1.57029800373054 T:C C T 10 0.543619388992515 0.619279667635144 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1063015_1065876:GTPBP4;ENSG00000148377:ENST00000277517:exon_1064847_1065774:IDI2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 3172145 C/T 1 48 61 109 21.9062693283593 33.1607827285434 -11.2545134001841 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0341556101333625 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3171199_3172175:PFKP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 3178814 T/A 1 102 153 255 46.5508223227635 83.1737665158548 -36.6229441930913 A:T T A 10 0.543619388992515 5.23169099940288e-06 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3178642_3178997:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3178642_3178985:PFKP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 3180227 T/C 0 0 106 106 0 57.6236552332066 -57.6236552332066 C T C 10 0.543619388992515 7.73894318981275e-37 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 3180298 C/T 1 27 23 50 12.3222764972021 12.5032459468278 -0.180969449625753 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 3189380 C/T 1 13 13 26 5.9329479430973 7.0670520569027 -1.13410411380539 T:C C T 10 0.543619388992515 0.696880304708234 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451454:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3189342_3189442:PITRM1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 3191823 C/T 1 15 3 18 6.84570916511227 1.63085816697755 5.21485099813473 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0161696570819875 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3191813_3191945:PITRM1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 5855225 G/A 1 17 9 26 7.75847038712724 4.89257450093264 2.86589588619461 A:G G A 10 0.543619388992515 0.32603457135944 ENSG00000057608:ENST00000380191:exon_5855177_5855512:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000435969:exon_5855177_5855512:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380153:exon_5855177_5855512:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380181:exon_5855177_5855374:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380132:exon_5855177_5855374:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000456041:exon_5855177_5855350:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000418688:exon_5855177_5855392:GDI2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 6002368 T/G 1 7 3 10 3.19466427705239 1.63085816697755 1.56380611007485 T:G T G 10 0.543619388992515 0.3622898906741 ENSG00000134470:ENST00000435171:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397251:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379977:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397253:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000425111:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397248:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000414280:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000534292:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000319465:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532948:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379972:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000528354:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000447291:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379974:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532039:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397250:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379971:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000530685:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397255:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000525219:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397246:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000429135:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000453922:exon_6002358_6002530:IL15RA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 8006798 A/G 1 19 15 34 8.67123160914221 8.15429083488773 0.516940774254488 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000165632:ENST00000344293:exon_8005883_8007705:TAF3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 12071397 G/A 1 126 99 225 57.5039569869431 53.818319510259 3.68563747668411 A:G G A 10 0.543619388992515 0.639931248365102 ENSG00000151461:ENST00000356352:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000357604:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000379172:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313999:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000397053:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313977:exon_12070744_12071523:UPF2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 12209752 T/C 1 69 84 153 31.4902621595165 45.6640286753713 -14.1737665158548 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0229819923260568 ENSG00000065665:ENST00000475268:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000495368:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000165609:ENST00000491614:exon_12207324_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378937:exon_12209575_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378952:exon_12209671_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000476462:exon_12209737_12209810:NUDT5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 12867598 C/G 1 5 4 9 2.28190305503742 2.17447755597006 0.107425499067364 C:G C G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000183049:ENST00000378847:exon_12867572_12867689:CAMK1D;ENSG00000183049:ENST00000378845:exon_12867572_12868142:CAMK1D HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 13151224 G/A 1 13 17 30 5.9329479430973 9.24152961287276 -3.30858166977545 A:G G A 10 0.543619388992515 0.272083540205038 ENSG00000123240:ENST00000263036:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378764:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000396951:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000487935:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000482140:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378757:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000430081:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378752:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378748:exon_13151097_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378747:exon_13151112_13151288:OPTN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 13375906 T/C 1 7 6 13 3.19466427705239 3.26171633395509 -0.0670520569026953 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000086475:ENST00000327347:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000319684:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000378614:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000413411:exon_13375877_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000425947:exon_13375901_13375971:SEPHS1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 13735887 C/A 1 9 6 15 4.10742549906736 3.26171633395509 0.845709165112274 A:C C A 10 0.543619388992515 0.797605664193983 ENSG00000151474:ENST00000492155:exon_13734169_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000342409:exon_13735703_13736039:FRMD4A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 13735947 A/G 1 9 6 15 4.10742549906736 3.26171633395509 0.845709165112274 A:G A G 10 0.543619388992515 0.797605664193983 ENSG00000151474:ENST00000358621:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000378502:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000357447:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000378503:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000264546:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000492155:exon_13734169_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000342409:exon_13735703_13736039:FRMD4A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 27389314 C/T 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 T:C C T 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27389014_27389405:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27389014_27389427:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27389014_27389427:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27389014_27389421:ANKRD26 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 27434483 G/A 1 6 3 9 2.73828366604491 1.63085816697755 1.10742549906736 A:G G A 10 0.543619388992515 0.522625694750698 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27434348_27436597:YME1L1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 27437964 T/C 1 19 17 36 8.67123160914221 9.24152961287276 -0.570298003730541 T:C T C 10 0.543619388992515 0.868500328571537 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000493741:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27437835_27437969:YME1L1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 27475444 T/C 1 14 16 30 6.38932855410479 8.69791022388024 -2.30858166977545 T:C T C 10 0.543619388992515 0.464803618106555 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 27475494 T/C 1 10 17 27 4.56380611007485 9.24152961287276 -4.67772350279791 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0825276323953588 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 30728101 T/C 1 84 108 192 38.3359713246287 58.7108940111916 -20.3749226865629 T:C T C 10 0.543619388992515 0.00366027256534731 ENSG00000107968:ENST00000375328:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000263056:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000415139:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375322:exon_30727845_30728371:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000413724:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375321:exon_30727751_30728203:MAP3K8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 32635834 G/A 1 1 7 8 0.456380611007485 3.80533572294761 -3.34895511194012 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0274430116751054 ENSG00000120616:ENST00000319778:exon_32635691_32636146:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000263062:exon_32635691_32636113:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000480402:exon_32635691_32636146:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000469059:exon_32635691_32636049:EPC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 35302705 C/T 1 11 12 23 5.02018672108233 6.52343266791018 -1.50324594682785 T:C C T 10 0.543619388992515 0.538329676167563 ENSG00000108094:ENST00000374751:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374748:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374746:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374749:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374754:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374742:exon_35302627_35302728:CUL2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 35772402 G/A 1 8 4 12 3.65104488805988 2.17447755597006 1.47656733208982 A:G G A 10 0.543619388992515 0.564519601476267 ENSG00000108100:ENST00000374706:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000490012:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000493157:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000374704:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000265375:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000492478:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000470025:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000456784:exon_35772158_35772406:CCNY HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 45478092 A/G 1 4 6 10 1.82552244402994 3.26171633395509 -1.43619388992515 A:G A G 10 0.543619388992515 0.528005019910346 ENSG00000107551:ENST00000489171:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000334940:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374417:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374414:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000340258:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000427758:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000483709:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000462822:exon_45477973_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000428466:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374411:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000472561:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000465735:exon_45476487_45478111:RASSF4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 49654403 C/T 1 7 2 9 3.19466427705239 1.08723877798503 2.10742549906736 T:C C T 10 0.543619388992515 0.194613573468504 ENSG00000128805:ENST00000249601:exon_49654077_49654662:ARHGAP22;ENSG00000128805:ENST00000374172:exon_49654079_49654662:ARHGAP22;ENSG00000128805:ENST00000374170:exon_49654079_49654662:ARHGAP22;ENSG00000128805:ENST00000477708:exon_49654079_49654662:ARHGAP22;ENSG00000128805:ENST00000417247:exon_49654080_49654662:ARHGAP22;ENSG00000128805:ENST00000374167:exon_49654080_49654662:ARHGAP22;ENSG00000128805:ENST00000422092:exon_49654080_49654662:ARHGAP22;ENSG00000128805:ENST00000435790:exon_49654285_49654662:ARHGAP22;ENSG00000128805:ENST00000417912:exon_49654383_49654662:ARHGAP22 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 52103707 A/G 1 2 7 9 0.91276122201497 3.80533572294761 -2.89257450093264 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0894121930945724 ENSG00000198964:ENST00000361543:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000361781:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000492601:exon_52103252_52104094:SGMS1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 58118630 T/C 1 33 33 66 15.060560163247 17.939439836753 -2.87887967350599 T:C T C 10 0.543619388992515 0.537095585351748 ENSG00000122952:ENST00000373944:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000494312:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000395405:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000318387:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000460654:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000467523:exon_58118566_58118708:ZWINT HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 64565011 G/A 1 5 4 9 2.28190305503742 2.17447755597006 0.107425499067364 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000181915:ENST00000373783:exon_64564516_64568238:ADO HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 64927823 C/G 1 14 15 29 6.38932855410479 8.15429083488773 -1.76496228078294 C:G C G 10 0.543619388992515 0.577774847845697 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64926981_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000467356:exon_64926981_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64926990_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64926990_64927894:JMJD1C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 64945364 G/A 1 7 5 12 3.19466427705239 2.71809694496258 0.476567332089819 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000327520:exon_64945323_64945413:JMJD1C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 64974537 A/T 1 8 10 18 3.65104488805988 5.43619388992515 -1.78514900186527 A:T A T 10 0.543619388992515 0.480432312528866 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64973233_64974911:JMJD1C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 70748784 G/A 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 A:G G A 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000198954:ENST00000361983:exon_70748487_70749014:KIAA1279 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 70892791 C/T 1 13 6 19 5.9329479430973 3.26171633395509 2.67123160914221 T:C C T 10 0.543619388992515 0.255193651557415 ENSG00000122958:ENST00000373382:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000477667:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000263559:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000395098:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000489656:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000490696:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000467852:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000489794:exon_70892654_70892803:VPS26A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 71906150 T/C 1 10 12 22 4.56380611007485 6.52343266791018 -1.95962655783533 T:C T C 10 0.543619388992515 0.521823185288352 ENSG00000156521:ENST00000287078:exon_71905177_71906342:TYSND1;ENSG00000156521:ENST00000335494:exon_71905177_71906412:TYSND1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 73521371 C/T 1 8 6 14 3.65104488805988 3.26171633395509 0.38932855410479 T:C:G C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73521355_73521783:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73521355_73521783:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000481568:exon_73521355_73521701:C10orf54 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 73594175 C/T 1 31 22 53 14.147798941232 11.9596265578353 2.1881723833967 T:C C T 10 0.543619388992515 0.583424400823209 ENSG00000197746:ENST00000394936:exon_73594129_73594262:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000373120:exon_73594129_73594262:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000357471:exon_73594129_73594262:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000394934:exon_73594129_73594262:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000394940:exon_73594129_73594262:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000402059:exon_73594129_73594262:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000394929:exon_73594129_73594262:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000404083:exon_73594129_73594262:PSAP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 73983693 C/A 1 93 95 188 42.4433968236961 51.6438419542889 -9.20044513059283 A:C:G C A 10 0.543619388992515 0.187790395463378 ENSG00000166295:ENST00000299381:exon_73983646_73983814:ANAPC16;ENSG00000166295:ENST00000470481:exon_73982891_73983814:ANAPC16 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 74834651 T/C 1 5 3 8 2.28190305503742 1.63085816697755 0.65104488805988 T:C T C 10 0.543619388992515 0.734792052639277 ENSG00000122884:ENST00000307116:exon_74834566_74834673:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000394890:exon_74834566_74834673:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000412021:exon_74834566_74834679:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000440381:exon_74834566_74834673:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000263556:exon_74834566_74834673:P4HA1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 74886598 C/G 1 6 7 13 2.73828366604491 3.80533572294761 -1.0670520569027 C:G C G 10 0.543619388992515 0.588111803651177 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 74894375 T/C 1 35 40 75 15.973321385262 21.7447755597006 -5.77145417443863 T:C T C 10 0.543619388992515 0.202496865986789 ENSG00000122882:ENST00000494307:exon_74894361_74894512:ECD;ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74893414_74894571:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74894283_74894571:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74894283_74894571:ECD HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 74896664 T/C 1 16 17 33 7.30208977611976 9.24152961287276 -1.939439836753 T:C T C 10 0.543619388992515 0.600805537726719 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74896462_74896676:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74896462_74896676:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74896462_74896676:ECD HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 74897816 C/T 1 15 22 37 6.84570916511227 11.9596265578353 -5.11391739272306 T:C C T 10 0.543619388992515 0.100242321211337 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74897761_74897828:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74897761_74897828:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74897761_74897828:ECD HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 74899134 C/G 1 17 13 30 7.75847038712724 7.0670520569027 0.691418330224549 C:G C G 10 0.543619388992515 0.856142756291466 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74899067_74899253:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74899067_74899253:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74899067_74899253:ECD HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 74916173 T/A 1 15 10 25 6.84570916511227 5.43619388992515 1.40951527518712 A:T T A 10 0.543619388992515 0.689291797690953 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000484976:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000453402:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000413026:exon_74916033_74916211:ECD HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 74923562 C/T 1 4 6 10 1.82552244402994 3.26171633395509 -1.43619388992515 T:C C T 10 0.543619388992515 0.528005019910346 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74923491_74923708:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74923491_74923708:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74923491_74923708:ECD;ENSG00000122882:ENST00000413026:exon_74923491_74923708:ECD HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 75006804 A/G 1 14 5 19 6.38932855410479 2.71809694496258 3.67123160914221 A:G A G 10 0.543619388992515 0.108702133135878 ENSG00000213551:ENST00000372950:exon_75006768_75008620:DNAJC9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 75148116 A/G 1 25 22 47 11.4095152751871 11.9596265578353 -0.550111282648208 A:G A G 10 0.543619388992515 0.88458987872575 ENSG00000138279:ENST00000372921:exon_75148070_75148172:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000372919:exon_75148070_75148172:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000492380:exon_75148070_75148172:ANXA7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 81067295 C/T 1 5 4 9 2.28190305503742 2.17447755597006 0.107425499067364 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000108175:ENST00000334512:exon_81067162_81067328:ZMIZ1;ENSG00000108175:ENST00000360331:exon_81067162_81067328:ZMIZ1;ENSG00000108175:ENST00000446377:exon_81067162_81067328:ZMIZ1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 88730312 T/C 1 5 15 20 2.28190305503742 8.15429083488773 -5.8723877798503 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0117500560715670 ENSG00000148671:ENST00000372013:exon_88730233_88730672:C10orf116;ENSG00000148671:ENST00000372012:exon_88730233_88730487:C10orf116 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 90673024 G/A 1 10 4 14 4.56380611007485 2.17447755597006 2.38932855410479 A:G G A 10 0.543619388992515 0.284272971162492 ENSG00000138134:ENST00000371926:exon_90672858_90673215:STAMBPL1;ENSG00000138134:ENST00000371927:exon_90672858_90673215:STAMBPL1;ENSG00000138134:ENST00000371924:exon_90672858_90673215:STAMBPL1;ENSG00000138134:ENST00000371922:exon_90672113_90673215:STAMBPL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 91066460 T/A 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 A:T T A 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000119922:ENST00000371826:exon_91065719_91069033:IFIT2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 91066769 C/A 1 8 4 12 3.65104488805988 2.17447755597006 1.47656733208982 A:C C A 10 0.543619388992515 0.564519601476267 ENSG00000119922:ENST00000371826:exon_91065719_91069033:IFIT2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 91484780 G/A 1 12 15 27 5.47656733208982 8.15429083488773 -2.67772350279791 A:C:G G A 10 0.543619388992515 0.337227579537784 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91484777_91484915:KIF20B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 91497631 T/A 1 19 17 36 8.67123160914221 9.24152961287276 -0.570298003730541 A:T T A 10 0.543619388992515 0.868500328571537 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 91498127 T/C 1 22 29 51 10.0403734421647 15.7649622807829 -5.72458883861827 T:C T C 10 0.543619388992515 0.122234352851242 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 91498254 A/G 1 15 19 34 6.84570916511227 10.3287683908578 -3.48305922574551 A:G A G 10 0.543619388992515 0.234347081094378 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 91498318 A/G 1 15 12 27 6.84570916511227 6.52343266791018 0.322276497202094 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 91503660 A/G 1 15 11 26 6.84570916511227 5.97981327891767 0.865895886194608 A:G A G 10 0.543619388992515 0.844786651072894 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91503565_91503684:KIF20B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 95279506 A/T 1 6 3 9 2.73828366604491 1.63085816697755 1.10742549906736 A:T A T 10 0.543619388992515 0.522625694750698 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000496302:exon_95279439_95280034:CEP55 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 96313960 A/C 1 7 12 19 3.19466427705239 6.52343266791018 -3.32876839085779 A:C A C 10 0.543619388992515 0.166421015470228 ENSG00000119969:ENST00000419900:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000348459:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000437940:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000371332:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394045:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394044:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394036:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000239026:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000462057:exon_96313881_96314005:HELLS HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 97371146 G/A 1 13 19 32 5.9329479430973 10.3287683908578 -4.39582044776048 A:G G A 10 0.543619388992515 0.154805161124047 ENSG00000059573:ENST00000371224:exon_97371013_97371199:ALDH18A1;ENSG00000059573:ENST00000371221:exon_97371013_97371199:ALDH18A1;ENSG00000059573:ENST00000485428:exon_97371013_97371199:ALDH18A1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 97607165 G/A 1 11 13 24 5.02018672108233 7.0670520569027 -2.04686533582036 A:G G A 10 0.543619388992515 0.419733845613331 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 98380277 C/T 1 3 8 11 1.36914183302245 4.34895511194012 -2.97981327891767 T:C C T 10 0.543619388992515 0.126408424019807 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98380109_98380314:PIK3AP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 102762256 C/T 1 3 7 10 1.36914183302245 3.80533572294761 -2.43619388992515 T:C C T 10 0.543619388992515 0.202250323161148 ENSG00000107816:ENST00000426584:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000489526:exon_102762254_102762934:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000429732:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000481129:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102759233_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000454422:exon_102762254_102762703:LZTS2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 103368654 T/C 1 9 21 30 4.10742549906736 11.4160071688428 -7.30858166977545 T:C T C 10 0.543619388992515 0.00938041575988238 ENSG00000166171:ENST00000370151:exon_103368592_103368694:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370147:exon_103368624_103368694:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370148:exon_103368624_103368659:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000475443:exon_103368624_103368801:DPCD HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 103825747 G/A 1 5 10 15 2.28190305503742 5.43619388992515 -3.15429083488773 A:G G A 10 0.543619388992515 0.122665461935520 ENSG00000166189:ENST00000299238:exon_103825147_103827790:HPS6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 103908080 G/A 1 5 3 8 2.28190305503742 1.63085816697755 0.65104488805988 A:G G A 10 0.543619388992515 0.734792052639277 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 104161967 T/C 1 15 17 32 6.84570916511227 9.24152961287276 -2.39582044776048 T:C T C 10 0.543619388992515 0.478525973624179 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 104163569 G/A 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 A:G G A 10 0.543619388992515 1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 104184081 G/A 1 88 59 147 40.1614937686587 32.0735439505584 8.08794981810028 A:G G A 10 0.543619388992515 0.186187911970483 ENSG00000107874:ENST00000369937:exon_104184021_104184151:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000486762:exon_104184021_104184151:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000477994:exon_104183788_104184151:CUEDC2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 104184953 C/G 1 11 19 30 5.02018672108233 10.3287683908578 -5.30858166977545 C:G C G 10 0.543619388992515 0.0657113717087642 ENSG00000107874:ENST00000369937:exon_104184872_104184955:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000477994:exon_104184872_104184955:CUEDC2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 104849468 G/A 1 11 15 26 5.02018672108233 8.15429083488773 -3.13410411380539 A:G G A 10 0.543619388992515 0.241166155555170 ENSG00000076685:ENST00000343289:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000423468:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369871:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000404739:exon_104847774_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369857:exon_104847942_104849665:NT5C2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 105194086 C/T 1 14 10 24 6.38932855410479 5.43619388992515 0.953134664179639 T:C C T 10 0.543619388992515 0.838302661714442 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105194005_105194107:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000466959:exon_105194005_105194459:PDCD11 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 105205302 A/C 1 45 29 74 20.5371274953368 15.7649622807829 4.77216521455389 A:C A C 10 0.543619388992515 0.294403031242580 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105205135_105206049:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000478543:exon_105205135_105205481:PDCD11 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 105206874 T/C 1 11 12 23 5.02018672108233 6.52343266791018 -1.50324594682785 T:C T C 10 0.543619388992515 0.538329676167563 ENSG00000138172:ENST00000369788:exon_105206543_105207325:CALHM2;ENSG00000138172:ENST00000260743:exon_105206546_105207325:CALHM2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 105362209 T/C 1 6 2 8 2.73828366604491 1.08723877798503 1.65104488805988 T:C T C 10 0.543619388992515 0.303950947229235 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 105763026 C/T 1 4 6 10 1.82552244402994 3.26171633395509 -1.43619388992515 T:C C T 10 0.543619388992515 0.528005019910346 ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105761930_105763285:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105761930_105763285:SLK HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 106022789 C/A 1 120 108 228 54.7656733208982 58.7108940111916 -3.94522069029343 A:C C A 10 0.543619388992515 0.641766204822227 ENSG00000148834:ENST00000493946:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000369713:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000445155:exon_106022737_106022835:GSTO1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 112266771 C/T 1 31 14 45 14.147798941232 7.61067144589521 6.53712749533682 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0526587011729627 ENSG00000138166:ENST00000369583:exon_112266693_112266912:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000476681:exon_112266693_112266864:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000468749:exon_112266693_112266912:DUSP5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 115489152 C/G 1 1 7 8 0.456380611007485 3.80533572294761 -3.34895511194012 C:G C G 10 0.543619388992515 0.0274430116751054 ENSG00000165806:ENST00000369331:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369321:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000345633:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369318:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000442393:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000393012:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369315:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000298700:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000452490:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000487232:exon_115489070_115489262:CASP7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 115905380 A/C 1 5 6 11 2.28190305503742 3.26171633395509 -0.979813278917665 A:C A C 10 0.543619388992515 0.56306921306608 ENSG00000165813:ENST00000369287:exon_115905308_115905520:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000430353:exon_115905308_115905520:C10orf118 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 124610027 G/A 1 1 10 11 0.456380611007485 5.43619388992515 -4.97981327891767 A:G G A 10 0.543619388992515 0.00374821076030008 ENSG00000138161:ENST00000368904:exon_124609940_124610309:CUZD1;ENSG00000213185:ENST00000368898:exon_124609940_124610066:FAM24B;ENSG00000213185:ENST00000368896:exon_124609940_124610036:FAM24B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 127441439 G/A 1 11 4 15 5.02018672108233 2.17447755597006 2.84570916511227 A:G G A 10 0.543619388992515 0.195223530265793 ENSG00000107938:ENST00000419769:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000481600:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000356792:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000368815:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000337623:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000433226:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000450404:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000368812:exon_127441368_127441483:C10orf137 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 127496038 T/A 1 15 15 30 6.84570916511227 8.15429083488773 -1.30858166977545 A:T:G T A 10 0.543619388992515 0.71502599456556 ENSG00000188690:ENST00000368797:exon_127495982_127496056:UROS;ENSG00000188690:ENST00000368781:exon_127495982_127496056:UROS;ENSG00000188690:ENST00000368786:exon_127495982_127496056:UROS;ENSG00000188690:ENST00000465260:exon_127495982_127496056:UROS;ENSG00000188690:ENST00000420761:exon_127495982_127496056:UROS;ENSG00000188690:ENST00000368778:exon_127495982_127496056:UROS;ENSG00000188690:ENST00000368774:exon_127495719_127496056:UROS HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 129903802 A/G 1 30 11 41 13.6914183302245 5.97981327891767 7.71160505130688 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0179378832202236 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 129904560 C/T 1 8 6 14 3.65104488805988 3.26171633395509 0.38932855410479 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 129904917 G/A 1 6 11 17 2.73828366604491 5.97981327891767 -3.24152961287276 A:G G A 10 0.543619388992515 0.144700534072097 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 131506192 C/T 1 37 42 79 16.8860826072769 22.8320143376856 -5.94593173040869 T:C C T 10 0.543619388992515 0.213850524660029 ENSG00000170430:ENST00000306010:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000440826:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000462672:exon_131506159_131506307:MGMT HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 131506283 C/T 1 29 44 73 13.2350377192171 23.9192531156707 -10.6842153964536 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0133975219017924 ENSG00000170430:ENST00000306010:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000440826:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000462672:exon_131506159_131506307:MGMT HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 131959150 C/T 1 29 13 42 13.2350377192171 7.0670520569027 6.16798566231437 T:C C T 10 0.543619388992515 0.063101017290701 ENSG00000108010:ENST00000331244:exon_131959060_131959261:GLRX3;ENSG00000108010:ENST00000368644:exon_131959060_131959261:GLRX3;ENSG00000108010:ENST00000481034:exon_131959060_131959261:GLRX3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 133761285 G/A 1 24 37 61 10.9531346641796 20.1139173927231 -9.16078272854342 A:C:G G A 10 0.543619388992515 0.020512960535694 ENSG00000175470:ENST00000455566:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000482010:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000422256:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000398018:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000490777:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000470416:exon_133761034_133761295:PPP2R2D HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 134145136 A/G 1 19 3 22 8.67123160914221 1.63085816697755 7.04037344216467 A:G A G 10 0.543619388992515 0.00220767028344260 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 134145138 C/G 1 21 3 24 9.58399283115718 1.63085816697755 7.95313466417964 C:G C G 10 0.543619388992515 0.00079524838331329 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 134145153 G/A 1 23 2 25 10.4967540531722 1.08723877798503 9.40951527518712 A:G G A 10 0.543619388992515 6.95159788492534e-05 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 134145166 T/C 1 22 10 32 10.0403734421647 5.43619388992515 4.60417955223952 T:C T C 10 0.543619388992515 0.112455735115385 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 134145288 C/A 1 9 11 20 4.10742549906736 5.97981327891767 -1.8723877798503 A:C C A 10 0.543619388992515 0.502082958548873 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 134145293 G/T 1 9 11 20 4.10742549906736 5.97981327891767 -1.8723877798503 T:G G T 10 0.543619388992515 0.502082958548873 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 134145314 A/G 1 8 7 15 3.65104488805988 3.80533572294761 -0.154290834887726 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 135076523 C/A 1 58 44 102 26.4700754384341 23.9192531156707 2.55082232276346 A:C C A 10 0.543619388992515 0.621067188958751 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 135076596 T/C 1 32 34 66 14.6041795522395 18.4830592257455 -3.87887967350599 T:C T C 10 0.543619388992515 0.387327422785017 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 135082346 A/G 1 9 6 15 4.10742549906736 3.26171633395509 0.845709165112274 A:G A G 10 0.543619388992515 0.797605664193983 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 135085321 C/T 1 8 4 12 3.65104488805988 2.17447755597006 1.47656733208982 T:C C T 10 0.543619388992515 0.564519601476267 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 135085426 A/G 1 12 6 18 5.47656733208982 3.26171633395509 2.21485099813473 A:G A G 10 0.543619388992515 0.349607890938645 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 135097434 A/G 1 14 18 32 6.38932855410479 9.78514900186527 -3.39582044776048 A:G A G 10 0.543619388992515 0.287013533533773 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000417178:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368562:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135097386_135097506:TUBGCP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 135098672 G/A 1 22 12 34 10.0403734421647 6.52343266791018 3.51694077425449 A:G G A 10 0.543619388992515 0.301563583614777 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000417178:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368562:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135098589_135098717:TUBGCP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 135112940 C/T 1 4 8 12 1.82552244402994 4.34895511194012 -2.52343266791018 T:C C T 10 0.543619388992515 0.158970386231855 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000487796:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000470829:exon_135112939_135113107:TUBGCP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 10 135186806 A/G 1 43 37 80 19.6243662733219 20.1139173927231 -0.489551119401202 A:G A G 10 0.543619388992515 0.91121304156056 ENSG00000127884:ENST00000368547:exon_135186750_135187193:ECHS1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 233067 C/T 1 15 17 32 6.84570916511227 9.24152961287276 -2.39582044776048 T:C C T 10 0.543619388992515 0.478525973624179 ENSG00000142082:ENST00000382743:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532837:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525319:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000524564:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532956:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529382:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000531753:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000526854:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529055:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528702:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000530067:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528469:exon_232983_233215:SIRT3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 233212 C/A 1 20 22 42 9.1276122201497 11.9596265578353 -2.83201433768563 A:C C A 10 0.543619388992515 0.439398795997891 ENSG00000142082:ENST00000382743:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532837:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525319:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000524564:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532956:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529382:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000531753:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000526854:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529055:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528702:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000530067:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528469:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525776:exon_233192_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525237:exon_233209_233215:SIRT3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 293188 T/C 1 16 16 32 7.30208977611976 8.69791022388024 -1.39582044776048 T:C T C 10 0.543619388992515 0.723336688146235 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_292886_293502:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_293068_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000476372:exon_293163_293727:ATHL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 419706 T/C 1 11 7 18 5.02018672108233 3.80533572294761 1.21485099813473 T:C T C 10 0.543619388992515 0.64123354867373 ENSG00000185101:ENST00000412024:exon_419582_419729:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000526142:exon_419582_420615:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000534161:exon_419582_419729:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000532094:exon_419582_420860:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000528927:exon_419582_419729:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000332826:exon_419582_419729:ANO9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 488609 G/T 1 5 4 9 2.28190305503742 2.17447755597006 0.107425499067364 T:G G T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000174915:ENST00000308020:exon_488529_488647:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000526878:exon_488529_488647:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000527325:exon_488529_488647:PTDSS2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 499120 G/A 1 57 72 129 26.0136948274266 39.1405960074611 -13.1269011800344 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0215359301272961 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_499015_499999:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529115:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000527485:exon_499031_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529368:exon_499047_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529306:exon_499062_499185:RNH1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 681078 G/C 1 6 5 11 2.73828366604491 2.71809694496258 0.0201867210823345 C:G G C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000177030:ENST00000359958:exon_680963_681089:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000338675:exon_680963_681089:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000527170:exon_680963_681089:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000382409:exon_680963_681089:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000388804:exon_680963_681089:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000530813:exon_680963_681089:DEAF1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 771034 A/G 1 4 8 12 1.82552244402994 4.34895511194012 -2.52343266791018 A:G A G 10 0.543619388992515 0.158970386231855 ENSG00000177225:ENST00000465313:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000319863:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000354286:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000479959:exon_768386_771467:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000524550:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000532320:exon_770550_771426:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000530209:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000534603:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000529966:exon_770993_771212:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000533960:exon_770844_771104:PDDC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 802379 T/C 1 3 7 10 1.36914183302245 3.80533572294761 -2.43619388992515 T:C T C 10 0.543619388992515 0.202250323161148 ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000531286:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_802195_802396:LRDD HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 823809 C/G 1 21 25 46 9.58399283115718 13.5904847248129 -4.00649189365569 C:G C G 10 0.543619388992515 0.240559299595287 ENSG00000177666:ENST00000336615:exon_823694_823855:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000525250:exon_823527_824130:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000529255:exon_823694_824130:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000526083:exon_823648_823855:PNPLA2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 837582 G/A 1 23 48 71 10.4967540531722 26.0937306716407 -15.5969766184686 A:G G A 10 0.543619388992515 0.000286686631962378 ENSG00000177697:ENST00000397420:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000397421:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000436957:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000322008:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000529810:exon_837460_837613:CD151;ENSG00000177697:ENST00000528143:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000530726:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000532045:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000528011:exon_837460_837612:CD151;ENSG00000177697:ENST00000532075:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_837356_837605:POLR2L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 840477 A/G 1 293 272 565 133.719519025193 147.864473805964 -14.144954780771 A:G A G 10 0.543619388992515 0.237170431925645 ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_840262_840480:POLR2L;ENSG00000177700:ENST00000322028:exon_839721_840480:POLR2L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 993817 G/A 0 15 0 15 6.84570916511227 0 6.84570916511227 G G 10 0.543619388992515 0.000114770750949605 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528815:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000529125:exon_993754_993985:AP2A2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 993907 C/G 1 10 3 13 4.56380611007485 1.63085816697755 2.9329479430973 C:G C G 10 0.543619388992515 0.161878475803027 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528815:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528195:exon_993863_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000529125:exon_993754_993985:AP2A2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 1309956 C/T 1 7 14 21 3.19466427705239 7.61067144589521 -4.41600716884282 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0773400567038772 ENSG00000078902:ENST00000317204:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000527886:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000525159:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000263646:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000382211:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000530506:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000530541:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000528719:exon_1309866_1310006:TOLLIP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 1972143 G/A 1 31 26 57 14.147798941232 14.1341041138054 0.013694827426642 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397297:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381514:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397294:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000486931:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000466346:exon_1972140_1972251:MRPL23 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 2943671 G/C 1 9 2 11 4.10742549906736 1.08723877798503 3.02018672108233 C:G G C 10 0.543619388992515 0.0765215556444275 ENSG00000110628:ENST00000347936:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000312221:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449793:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000380574:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000463571:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000441077:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449603:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000495518:exon_2943666_2943786:SLC22A18 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 2993353 T/C 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 T:C T C 10 0.543619388992515 0.482069340371676 ENSG00000205531:ENST00000399624:exon_2993332_2993473:NAP1L4;ENSG00000205531:ENST00000380542:exon_2993332_2993473:NAP1L4;ENSG00000205531:ENST00000526115:exon_2993332_2993473:NAP1L4;ENSG00000205531:ENST00000448187:exon_2993332_2993509:NAP1L4;ENSG00000205531:ENST00000399614:exon_2993332_2993473:NAP1L4;ENSG00000205531:ENST00000430811:exon_2993332_2993473:NAP1L4;ENSG00000205531:ENST00000529361:exon_2993332_2993509:NAP1L4;ENSG00000205531:ENST00000528968:exon_2993332_2993473:NAP1L4;ENSG00000205531:ENST00000530064:exon_2993332_2993473:NAP1L4;ENSG00000205531:ENST00000526842:exon_2993332_2993473:NAP1L4;ENSG00000205531:ENST00000531291:exon_2993332_2993473:NAP1L4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 3028140 G/A 1 23 27 50 10.4967540531722 14.6777235027979 -4.18096944962575 A:G G A 10 0.543619388992515 0.25748999129291 ENSG00000110619:ENST00000380525:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000531387:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397111:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397114:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000484484:exon_3028109_3028240:CARS;ENSG00000110619:ENST00000278224:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000466442:exon_3028109_3030127:CARS;ENSG00000110619:ENST00000470221:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000526890:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000529772:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000401769:exon_3028109_3028189:CARS HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 3733877 A/G 1 10 15 25 4.56380611007485 8.15429083488773 -3.59048472481288 A:G A G 10 0.543619388992515 0.163785907367559 ENSG00000110713:ENST00000324932:exon_3733794_3733958:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000355260:exon_3733794_3733958:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000359171:exon_3733794_3733958:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000397004:exon_3732783_3733958:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000397007:exon_3733065_3733958:NUP98 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 4141132 C/A 1 9 9 18 4.10742549906736 4.89257450093264 -0.785149001865271 A:C C A 10 0.543619388992515 0.81438018796475 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528442:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4141075_4141200:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000526304:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528470:exon_4141075_4141158:RRM1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 4159457 A/G 1 63 62 125 28.7519784934716 33.7044021175359 -4.95242362406438 A:G A G 10 0.543619388992515 0.419154935432314 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4159425_4160100:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4159425_4160106:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4159425_4159676:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4159425_4160105:RRM1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 5664831 C/A 1 14 11 25 6.38932855410479 5.97981327891767 0.409515275187124 A:C C A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000495668:exon_5664374_5665039:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5664374_5665628:TRIM34 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 5686266 G/A 1 8 5 13 3.65104488805988 2.71809694496258 0.932947943097304 A:G G A 10 0.543619388992515 0.782457075337367 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5684787_5686625:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5684788_5686625:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5684788_5686625:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5684794_5686625:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5684847_5686912:TRIM5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 5700340 T/C 1 8 2 10 3.65104488805988 1.08723877798503 2.56380611007485 T:C T C 10 0.543619388992515 0.122752294666106 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000492086:exon_5700304_5700370:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000465634:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700304_5700399:TRIM5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 5701281 G/A 1 10 4 14 4.56380611007485 2.17447755597006 2.38932855410479 A:G G A 10 0.543619388992515 0.284272971162492 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000419850:exon_5701192_5701468:TRIM5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 5730584 T/C 1 34 24 58 15.5169407742545 13.0468653358204 2.47007543843413 T:C T C 10 0.543619388992515 0.598467876800632 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5730283_5732093:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5730283_5732092:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5730283_5730677:TRIM22 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 6340525 A/T 1 6 12 18 2.73828366604491 6.52343266791018 -3.78514900186527 A:T A T 10 0.543619388992515 0.0965748240788784 ENSG00000170955:ENST00000532354:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6340360_6340901:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6340374_6340794:PRKCDBP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 6340706 A/G 1 6 4 10 2.73828366604491 2.17447755597006 0.56380611007485 A:G A G 10 0.543619388992515 0.763129400865595 ENSG00000170955:ENST00000532354:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6340360_6340901:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6340374_6340794:PRKCDBP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 6622218 G/A 1 12 9 21 5.47656733208982 4.89257450093264 0.583992831157184 A:G G A 10 0.543619388992515 0.830589105985654 ENSG00000132275:ENST00000254605:exon_6622156_6622285:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000526352:exon_6622156_6622534:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000533907:exon_6622156_6622832:RRP8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 6622714 G/A 1 10 9 19 4.56380611007485 4.89257450093264 -0.328768390857786 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000132275:ENST00000254605:exon_6622379_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000533907:exon_6622156_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000530762:exon_6622484_6622832:RRP8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 6629665 C/T 1 30 38 68 13.6914183302245 20.6575367817156 -6.96611845149102 T:C C T 10 0.543619388992515 0.112854515136939 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526114:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527121:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526318:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6629496_6629719:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 7686584 A/T 1 16 21 37 7.30208977611976 11.4160071688428 -4.11391739272306 A:T A T 10 0.543619388992515 0.189246906475926 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 8707083 G/A 1 13 5 18 5.9329479430973 2.71809694496258 3.21485099813473 A:G G A 10 0.543619388992515 0.158000448549750 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 8707233 C/T 1 1185 1237 2422 540.81102404387 672.457184183741 -131.646160139871 T:C C T 10 0.543619388992515 8.8453925087484e-08 ENSG00000166441:ENST00000314138:exon_8707225_8711419:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000524496:exon_8707225_8707394:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000534599:exon_8707225_8707392:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000532359:exon_8707225_8707395:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000530022:exon_8707225_8707395:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000526562:exon_8707225_8707395:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000525981:exon_8707225_8707394:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000530913:exon_8707225_8707395:RPL27A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 9754221 C/T 1 8 10 18 3.65104488805988 5.43619388992515 -1.78514900186527 T:C C T 10 0.543619388992515 0.480432312528866 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000524817:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534662:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534562:exon_9754076_9754257:SWAP70 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 13410371 A/G 1 13 17 30 5.9329479430973 9.24152961287276 -3.30858166977545 A:G A G 10 0.543619388992515 0.272083540205038 ENSG00000148925:ENST00000278174:exon_13409548_13410688:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000527102:exon_13409571_13410688:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000530907:exon_13410230_13410688:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000528120:exon_13410249_13410688:BTBD10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 17809639 C/T 1 28 31 59 12.7786571082096 16.852201058768 -4.07354395055839 T:C C T 10 0.543619388992515 0.298326297419912 ENSG00000129158:ENST00000531299:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000531926:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000528369:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000527494:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000528200:exon_17809596_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000524589:exon_17809599_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529440:exon_17809599_17809960:SERGEF HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 17809724 T/C 1 24 35 59 10.9531346641796 19.026678614738 -8.07354395055839 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0369015345132836 ENSG00000129158:ENST00000531299:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000531926:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000528369:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000527494:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000528200:exon_17809596_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000524589:exon_17809599_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529440:exon_17809599_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529151:exon_17809702_17809960:SERGEF HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 18108492 T/C 1 14 7 21 6.38932855410479 3.80533572294761 2.58399283115718 T:C T C 10 0.543619388992515 0.282028637100374 ENSG00000166788:ENST00000524803:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000300013:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000534721:exon_18108413_18108507:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531751:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531581:exon_18108409_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000529318:exon_18108404_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531216:exon_18108413_18108601:SAAL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 33076191 T/C 1 6 8 14 2.73828366604491 4.34895511194012 -1.61067144589521 T:C T C 10 0.543619388992515 0.430135065302382 ENSG00000176148:ENST00000530419:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33076139_33076271:TCP11L1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 33083263 G/A 1 8 4 12 3.65104488805988 2.17447755597006 1.47656733208982 A:C:G G A 10 0.543619388992515 0.564519601476267 ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33083076_33083272:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33083076_33083272:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33083076_33083272:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33083076_33083272:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33083076_33083272:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33083076_33083272:TCP11L1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 33881016 T/C 1 30 19 49 13.6914183302245 10.3287683908578 3.36264993936676 T:C T C 10 0.543619388992515 0.390325827961896 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33880125_33881121:LMO2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 33886294 A/G 1 3 7 10 1.36914183302245 3.80533572294761 -2.43619388992515 A:G A G 10 0.543619388992515 0.202250323161148 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33886148_33886363:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33886148_33886363:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33886148_33886475:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33886148_33886697:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33886148_33886363:LMO2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 43472746 C/T 1 8 9 17 3.65104488805988 4.89257450093264 -1.24152961287276 T:C C T 10 0.543619388992515 0.629539446230712 ENSG00000052841:ENST00000039989:exon_43472732_43472815:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000525135:exon_43472732_43472815:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000525543:exon_43472732_43472815:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000533554:exon_43472732_43472815:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000418561:exon_43472730_43472815:TTC17 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 43913604 G/A 1 6 12 18 2.73828366604491 6.52343266791018 -3.78514900186527 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0965748240788784 ENSG00000166199:ENST00000302708:exon_43913591_43913679:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000529366:exon_43913591_43913679:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000530754:exon_43913591_43913679:ALKBH3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 44104981 C/T 1 5 42 47 2.28190305503742 22.8320143376856 -20.5501112826482 T:C C T 10 0.543619388992515 6.86449772793468e-10 ENSG00000110455:ENST00000448099:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000432284:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000263776:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000527346:exon_44104974_44105127:ACCS HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 44639774 C/T 1 119 136 255 54.3092927098907 73.932236902982 -19.6229441930913 A:T:C:G C T 10 0.543619388992515 0.0141962939031707 ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44639712_44639915:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44639712_44639915:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44639712_44639915:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44639712_44639915:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530601:exon_44639712_44639803:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44639712_44639915:CD82 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 44639932 G/A 1 2 6 8 0.91276122201497 3.26171633395509 -2.34895511194012 A:G G A 10 0.543619388992515 0.153435168169122 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 46403649 G/A 1 9 8 17 4.10742549906736 4.34895511194012 -0.241529612872756 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000110492:ENST00000405308:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000441869:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000490240:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000405994:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000359803:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000533952:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000395569:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000395566:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000481047:exon_46403261_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000405098:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000430827:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000489525:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000407067:exon_46403303_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000395565:exon_46403607_46403683:MDK HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 46782179 G/A 1 7 9 16 3.19466427705239 4.89257450093264 -1.69791022388024 A:G G A 10 0.543619388992515 0.456567971750714 ENSG00000175216:ENST00000529230:exon_46782162_46782334:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000415402:exon_46782162_46782334:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000312055:exon_46782162_46782334:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000378629:exon_46782162_46782334:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000354558:exon_46782162_46782334:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000533413:exon_46782162_46782334:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000527333:exon_46782162_46782200:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000526876:exon_46782162_46782334:CKAP5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 47267079 C/T 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 T:C C T 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000134575:ENST00000256997:exon_47267025_47267123:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000534752:exon_47267025_47267127:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000534448:exon_47267025_47267123:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000527256:exon_47267025_47267123:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000533929:exon_47267025_47267123:ACP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 58978684 G/A 1 6 2 8 2.73828366604491 1.08723877798503 1.65104488805988 A:G G A 10 0.543619388992515 0.303950947229235 ENSG00000197629:ENST00000361050:exon_58975983_58980424:MPEG1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 61089037 T/C 1 6 9 15 2.73828366604491 4.89257450093264 -2.15429083488773 T:C T C 10 0.543619388992515 0.306171249676451 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 61106892 G/C 1 8 13 21 3.65104488805988 7.0670520569027 -3.41600716884282 C:G G C 10 0.543619388992515 0.187638969949902 ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000532173:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529092:exon_61106726_61106998:DAK;ENSG00000149476:ENST00000448123:exon_61106830_61106907:DAK HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 61112802 C/T 1 22 15 37 10.0403734421647 8.15429083488773 1.88608260727694 T:C C T 10 0.543619388992515 0.621589127085329 ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000534084:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000525366:exon_61112786_61113037:DAK;ENSG00000149476:ENST00000524440:exon_61112791_61113037:DAK HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 61113206 G/T 1 22 14 36 10.0403734421647 7.61067144589521 2.42970199626946 T:G G T 10 0.543619388992515 0.504186025758741 ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61113184_61113217:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61113184_61113217:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61113184_61113217:DAK;ENSG00000149476:ENST00000534084:exon_61113184_61113217:DAK;ENSG00000149476:ENST00000525366:exon_61113184_61113217:DAK;ENSG00000149476:ENST00000524440:exon_61113184_61113432:DAK;ENSG00000149476:ENST00000530329:exon_61113184_61113217:DAK HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 61133649 G/A 1 10 11 21 4.56380611007485 5.97981327891767 -1.41600716884282 A:G G A 10 0.543619388992515 0.662427114891113 ENSG00000149483:ENST00000278826:exon_61133517_61133688:TMEM138;ENSG00000149483:ENST00000451389:exon_61133517_61133688:TMEM138 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 61179285 G/A 1 5 5 10 2.28190305503742 2.71809694496258 -0.436193889925151 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000149532:ENST00000340437:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000394888:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000439958:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000477890:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000448745:exon_61179241_61179409:CPSF7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 61913196 G/T 1 3 7 10 1.36914183302245 3.80533572294761 -2.43619388992515 T:G G T 10 0.543619388992515 0.202250323161148 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61913101_61913223:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61913101_61913223:INCENP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 62496519 T/C 1 49 39 88 22.3626499393668 21.2011561707081 1.16149376865867 T:C T C 10 0.543619388992515 0.831234018750144 ENSG00000162222:ENST00000530625:exon_62496295_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000294161:exon_62496295_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000316461:exon_62496011_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000532583:exon_62496295_62496558:TTC9C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 62559385 T/C 1 23 14 37 10.4967540531722 7.61067144589521 2.88608260727694 T:C T C 10 0.543619388992515 0.410190030277952 ENSG00000168569:ENST00000528367:exon_62559151_62559464:TMEM223;ENSG00000168569:ENST00000525631:exon_62559151_62559469:TMEM223;ENSG00000168569:ENST00000307366:exon_62559151_62559493:TMEM223 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 62564009 T/C 1 25 20 45 11.4095152751871 10.8723877798503 0.537127495336822 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000162231:ENST00000294172:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531709:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000532297:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000533048:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000530875:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000533440:exon_62563932_62564035:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531872:exon_62563932_62564039:NXF1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 62575025 A/T 1 48 54 102 21.9062693283593 29.3554470055958 -7.44917767723653 A:T A T 10 0.543619388992515 0.163745992140779 ENSG00000162236:ENST00000377897:exon_62574369_62575138:STX5;ENSG00000162236:ENST00000294179:exon_62574369_62575100:STX5;ENSG00000162236:ENST00000394690:exon_62574397_62575100:STX5;ENSG00000162236:ENST00000492066:exon_62574408_62575100:STX5;ENSG00000162236:ENST00000491231:exon_62574409_62575100:STX5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 62592961 T/C 1 26 26 52 11.8658958861946 14.1341041138054 -2.26820822761078 T:C T C 10 0.543619388992515 0.57860489306347 ENSG00000162236:ENST00000377897:exon_62592895_62593011:STX5;ENSG00000162236:ENST00000294179:exon_62592895_62593011:STX5;ENSG00000162236:ENST00000394690:exon_62592895_62593011:STX5;ENSG00000162236:ENST00000492066:exon_62592895_62593011:STX5;ENSG00000162236:ENST00000491231:exon_62592895_62593011:STX5;ENSG00000162236:ENST00000431400:exon_62592895_62592998:STX5;ENSG00000162236:ENST00000488303:exon_62592959_62593011:STX5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 62602983 A/G 1 54 47 101 24.6445529944042 25.5501112826482 -0.90555828824402 A:G A G 10 0.543619388992515 0.920503730183587 ENSG00000133316:ENST00000311713:exon_62602903_62603004:WDR74;ENSG00000133316:ENST00000529106:exon_62602903_62603004:WDR74;ENSG00000133316:ENST00000525239:exon_62602903_62603004:WDR74;ENSG00000133316:ENST00000278856:exon_62602903_62603004:WDR74;ENSG00000133316:ENST00000525752:exon_62602903_62603004:WDR74 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 62607068 A/G 1 7 7 14 3.19466427705239 3.80533572294761 -0.61067144589521 A:G A G 10 0.543619388992515 0.793044034376695 ENSG00000133316:ENST00000529106:exon_62606979_62607131:WDR74;ENSG00000133316:ENST00000525239:exon_62606979_62607339:WDR74;ENSG00000133316:ENST00000278856:exon_62606979_62607133:WDR74;ENSG00000133316:ENST00000525752:exon_62607013_62607339:WDR74 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 63396818 T/C 1 18 20 38 8.21485099813473 10.8723877798503 -2.65753678171557 T:C T C 10 0.543619388992515 0.418189027913124 ENSG00000184743:ENST00000332645:exon_63391560_63396877:ATL3;ENSG00000184743:ENST00000398868:exon_63391560_63396877:ATL3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 64109118 T/G 1 8 11 19 3.65104488805988 5.97981327891767 -2.32876839085779 T:G T G 10 0.543619388992515 0.358321729715676 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64109078_64109214:CCDC88B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 64138805 T/C 1 17 17 34 7.75847038712724 9.24152961287276 -1.48305922574551 T:C T C 10 0.543619388992515 0.610932827842374 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64138755_64139686:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64138755_64139157:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000530504:exon_64138755_64138813:RPS6KA4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 64138905 T/G 1 11 7 18 5.02018672108233 3.80533572294761 1.21485099813473 T:G T G 10 0.543619388992515 0.64123354867373 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64138755_64139686:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64138755_64139157:RPS6KA4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 64622869 G/C 1 33 31 64 15.060560163247 16.852201058768 -1.79164089552096 C:G G C 10 0.543619388992515 0.707144270335972 ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000484846:exon_64622794_64624135:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421510:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000498472:exon_64622524_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64622794_64622958:EHD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 64645871 A/G 1 32 19 51 14.6041795522395 10.3287683908578 4.27541116138173 A:G A G 10 0.543619388992515 0.261758221847157 ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64645533_64646191:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000466015:exon_64645533_64646013:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000457202:exon_64645533_64645956:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000411683:exon_64645533_64645959:EHD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 64789194 T/C 1 72 69 141 32.8594039925389 37.5097378404835 -4.65033384794462 T:C T C 10 0.543619388992515 0.447500475871078 ENSG00000213465:ENST00000246747:exon_64789193_64789656:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529384:exon_64789193_64789360:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000533729:exon_64789193_64789632:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529254:exon_64788988_64789588:ARL2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 64846569 C/T 1 12 12 24 5.47656733208982 6.52343266791018 -1.04686533582036 T:C C T 10 0.543619388992515 0.686969093177818 ENSG00000146670:ENST00000275517:exon_64844924_64846659:CDCA5;ENSG00000146670:ENST00000524733:exon_64846105_64846659:CDCA5;ENSG00000146670:ENST00000404147:exon_64846560_64847259:CDCA5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 64882789 C/T 1 17 14 31 7.75847038712724 7.61067144589521 0.147798941232034 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000149809:ENST00000526809:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533766:exon_64882786_64882862:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000534371:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000525385:exon_64882786_64882856:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531321:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529292:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529233:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000532328:exon_64882786_64882908:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000527968:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000528802:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526048:exon_64882385_64883070:TM7SF2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 64898226 C/T 1 15 8 23 6.84570916511227 4.34895511194012 2.49675405317215 T:C C T 10 0.543619388992515 0.403068770543004 ENSG00000162298:ENST00000294256:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000377190:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000307289:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000449943:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000526060:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000434219:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000526121:exon_64898200_64898273:SYVN1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 64950970 C/T 1 23 22 45 10.4967540531722 11.9596265578353 -1.46287250466318 T:C C T 10 0.543619388992515 0.657467285964154 ENSG00000014216:ENST00000528396:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000529133:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533820:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530571:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527739:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526966:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533129:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000524773:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530442:exon_64950945_64951139:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000279247:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000259755:exon_64950946_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000528739:exon_64950945_64951053:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527189:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527469:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000534373:exon_64950945_64951014:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526954:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000531068:exon_64950945_64950974:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527699:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533909:exon_64950945_64951052:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527323:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526468:exon_64950807_64951063:CAPN1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 65293714 G/A 1 21 16 37 9.58399283115718 8.69791022388024 0.886082607276943 A:G G A 10 0.543619388992515 0.8693815109076 ENSG00000142186:ENST00000270176:exon_65293595_65293821:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000525364:exon_65293595_65293821:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000420247:exon_65293595_65293821:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000533862:exon_65293595_65293821:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000527630:exon_65293595_65293821:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000349495:exon_65293595_65293821:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000279270:exon_65293595_65293821:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000417543:exon_65293595_65293821:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000524944:exon_65293595_65293821:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000527009:exon_65293595_65293821:SCYL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 65359535 C/G 1 43 55 98 19.6243662733219 29.8990663945883 -10.2747001212665 C:G C G 10 0.543619388992515 0.0422456310929122 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65359447_65359561:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000529099:exon_65359485_65359561:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000529596:exon_65359480_65359561:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533364:exon_65359447_65359561:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000527214:exon_65359279_65359561:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000529056:exon_65359431_65359561:EHBP1L1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 65546522 G/A 0 16 0 16 7.30208977611976 0 7.30208977611976 G G 10 0.543619388992515 6.17145607857373e-05 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 65623519 G/A 1 1130 1358 2488 515.710090438458 738.235130251835 -222.525039813377 A:G G A 10 0.543619388992515 4.71258144968522e-19 ENSG00000172757:ENST00000525451:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530945:exon_65622303_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000308162:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000527344:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531407:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000524553:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534769:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531413:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000532134:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530413:exon_65623406_65623944:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534784:exon_65623428_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000526975:exon_65623445_65623713:CFL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 65629932 T/C 1 5 5 10 2.28190305503742 2.71809694496258 -0.436193889925151 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000533555:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530111:exon_65629915_65630000:MUS81 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 65629934 G/C 1 6 4 10 2.73828366604491 2.17447755597006 0.56380611007485 C:G G C 10 0.543619388992515 0.763129400865595 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000533555:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530111:exon_65629915_65630000:MUS81 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 65631167 C/T 1 13 10 23 5.9329479430973 5.43619388992515 0.496754053172154 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631104_65631372:MUS81 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 65631973 G/A 1 13 14 27 5.9329479430973 7.61067144589521 -1.67772350279791 A:G G A 10 0.543619388992515 0.56531671981011 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65631968_65632084:MUS81 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 65632262 G/T 1 6 20 26 2.73828366604491 10.8723877798503 -8.13410411380539 T:G G T 10 0.543619388992515 0.00141531976939765 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65632191_65632794:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65632191_65632616:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65632215_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65632191_65632286:MUS81 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 65732651 G/A 1 27 15 42 12.3222764972021 8.15429083488773 4.16798566231437 A:G G A 10 0.543619388992515 0.217547410222032 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65732563_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65732522_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000530251:exon_65732522_65732689:SART1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 65733393 C/T 1 64 64 128 29.208359104479 34.791640895521 -5.58328179104193 T:C C T 10 0.543619388992515 0.330211388601786 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65733358_65733457:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65733358_65733457:SART1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 65735174 G/C 1 45 45 90 20.5371274953368 24.4628725046632 -3.92574500932636 C:G G C 10 0.543619388992515 0.459077433395272 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65735150_65735292:SART1;ENSG00000175467:ENST00000417603:exon_65735150_65735292:SART1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 66002865 G/A 1 9 15 24 4.10742549906736 8.15429083488773 -4.04686533582036 A:G G A 10 0.543619388992515 0.104942104447151 ENSG00000175115:ENST00000320580:exon_66002772_66002874:PACS1;ENSG00000175115:ENST00000529757:exon_66002772_66002874:PACS1;ENSG00000175115:ENST00000529795:exon_66002772_66002988:PACS1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 66039256 T/C 1 5 6 11 2.28190305503742 3.26171633395509 -0.979813278917665 T:C T C 10 0.543619388992515 0.56306921306608 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 66254085 G/T 1 5 5 10 2.28190305503742 2.71809694496258 -0.436193889925151 T:G G T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000531354:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532019:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000526515:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000533725:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66254011_66254148:DPP3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 66272142 A/G 1 18 28 46 8.21485099813473 15.2213428917904 -7.00649189365569 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0531270690273237 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66272083_66272245:DPP3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 66272237 G/A 1 57 37 94 26.0136948274266 20.1139173927231 5.89977743470359 A:G G A 10 0.543619388992515 0.254766586858511 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66272083_66272245:DPP3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 66313203 T/C 1 15 21 36 6.84570916511227 11.4160071688428 -4.57029800373054 T:C T C 10 0.543619388992515 0.134787015099521 ENSG00000174165:ENST00000534073:exon_66313194_66313507:ZDHHC24;ENSG00000174165:ENST00000526986:exon_66313194_66313706:ZDHHC24;ENSG00000174165:ENST00000310442:exon_66313194_66313709:ZDHHC24;ENSG00000174165:ENST00000525925:exon_66313194_66313477:ZDHHC24 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 66373305 G/A 1 53 56 109 24.1881723833967 30.4426857835808 -6.25451340018414 A:G G A 10 0.543619388992515 0.248883342471018 ENSG00000173992:ENST00000533244:exon_66373173_66373490:CCS;ENSG00000173992:ENST00000530384:exon_66373173_66373383:CCS;ENSG00000173992:ENST00000530961:exon_66373173_66373469:CCS;ENSG00000173992:ENST00000310190:exon_66373173_66373390:CCS;ENSG00000173992:ENST00000525435:exon_66373173_66373488:CCS HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 66392880 C/T 1 5 9 14 2.28190305503742 4.89257450093264 -2.61067144589521 T:C C T 10 0.543619388992515 0.186393367921189 ENSG00000239306:ENST00000310137:exon_66391685_66393149:RBM14 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 67200812 C/T 1 51 12 63 23.2754111613817 6.52343266791018 16.7519784934716 T:C C T 10 0.543619388992515 1.90628826693032e-05 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67200810_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000526268:exon_67200597_67200918:RPS6KB2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 67200819 C/T 1 48 13 61 21.9062693283593 7.0670520569027 14.8392172714566 T:C C T 10 0.543619388992515 9.42523556253616e-05 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67200810_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000526268:exon_67200597_67200918:RPS6KB2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 67202156 C/T 1 69 59 128 31.4902621595165 32.0735439505584 -0.583281791041927 T:C C T 10 0.543619388992515 0.929497276550757 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67202053_67202872:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000531765:exon_67201848_67202425:RPS6KB2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 67351585 C/G 1 1 9 10 0.456380611007485 4.89257450093264 -4.43619388992515 C:G C G 10 0.543619388992515 0.0073151328052194 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 67395634 C/T 1 24 6 30 10.9531346641796 3.26171633395509 7.69141833022455 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0052205581237408 ENSG00000167799:ENST00000301490:exon_67395409_67395871:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000376693:exon_67395410_67395722:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000534054:exon_67395410_67395871:NUDT8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 67395714 C/T 1 23 18 41 10.4967540531722 9.78514900186527 0.711605051306883 T:C C T 10 0.543619388992515 0.876327576030463 ENSG00000167799:ENST00000301490:exon_67395409_67395871:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000376693:exon_67395410_67395722:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000534054:exon_67395410_67395871:NUDT8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 68030015 C/T 1 20 23 43 9.1276122201497 12.5032459468278 -3.37563372667815 T:C C T 10 0.543619388992515 0.358694441420854 ENSG00000171067:ENST00000304271:exon_68028803_68030386:C11orf24;ENSG00000171067:ENST00000530166:exon_68029931_68030386:C11orf24 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 68030173 C/A 1 17 13 30 7.75847038712724 7.0670520569027 0.691418330224549 A:C C A 10 0.543619388992515 0.856142756291466 ENSG00000171067:ENST00000304271:exon_68028803_68030386:C11orf24;ENSG00000171067:ENST00000530166:exon_68029931_68030386:C11orf24 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 68703959 A/G 1 2 7 9 0.91276122201497 3.80533572294761 -2.89257450093264 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0894121930945724 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68703705_68704559:IGHMBP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 68704264 C/T 1 12 9 21 5.47656733208982 4.89257450093264 0.583992831157184 T:C C T 10 0.543619388992515 0.830589105985654 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68703705_68704559:IGHMBP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 68705674 C/A 1 5 8 13 2.28190305503742 4.34895511194012 -2.0670520569027 A:C C A 10 0.543619388992515 0.276871294907228 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68705650_68705822:IGHMBP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 68846399 A/T 1 5 4 9 2.28190305503742 2.17447755597006 0.107425499067364 A:T A T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000162341:ENST00000294309:exon_68846360_68846488:TPCN2;ENSG00000162341:ENST00000442692:exon_68846360_68846488:TPCN2;ENSG00000162341:ENST00000356782:exon_68846360_68846488:TPCN2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 69488068 C/T 1 4 7 11 1.82552244402994 3.80533572294761 -1.97981327891767 T:C C T 10 0.543619388992515 0.245254265630413 ENSG00000149716:ENST00000376587:exon_69487984_69488089:ORAOV1;ENSG00000149716:ENST00000279147:exon_69487984_69488089:ORAOV1;ENSG00000149716:ENST00000441922:exon_69487984_69488089:ORAOV1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 70279766 C/T 1 8 10 18 3.65104488805988 5.43619388992515 -1.78514900186527 T:C C T 10 0.543619388992515 0.480432312528866 ENSG00000085733:ENST00000346329:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000301843:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000376561:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000393747:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000529736:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000533931:exon_70279731_70279824:CTTN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 71146577 G/A 1 17 35 52 7.75847038712724 19.026678614738 -11.2682082276108 A:G G A 10 0.543619388992515 0.00198134421751045 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 71146691 A/G 1 17 28 45 7.75847038712724 15.2213428917904 -7.46287250466318 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0349940356884023 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 71152461 A/G 1 18 21 39 8.21485099813473 11.4160071688428 -3.20115617070809 A:G A G 10 0.543619388992515 0.336675733684755 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527316:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71152406_71152486:DHCR7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 71155153 A/G 1 7 12 19 3.19466427705239 6.52343266791018 -3.32876839085779 A:G A G 10 0.543619388992515 0.166421015470228 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71155003_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527316:exon_71155039_71155165:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525346:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000531364:exon_71155043_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000529990:exon_71155080_71155299:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527452:exon_71155087_71155261:DHCR7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 71155171 C/T 1 11 12 23 5.02018672108233 6.52343266791018 -1.50324594682785 T:C C T 10 0.543619388992515 0.538329676167563 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71155003_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525346:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000531364:exon_71155043_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000529990:exon_71155080_71155299:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527452:exon_71155087_71155261:DHCR7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 71169547 G/C 1 5 6 11 2.28190305503742 3.26171633395509 -0.979813278917665 C:G G C 10 0.543619388992515 0.56306921306608 ENSG00000172890:ENST00000534634:exon_71169474_71170102:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524709:exon_71169474_71169558:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529120:exon_71169474_71169602:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524949:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000533769:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527538:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525245:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71169474_71169590:NADSYN1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 71185479 T/C 1 6 7 13 2.73828366604491 3.80533572294761 -1.0670520569027 T:C T C 10 0.543619388992515 0.588111803651177 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71185441_71186668:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530534:exon_71185441_71185572:NADSYN1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 71185518 T/C 1 3 7 10 1.36914183302245 3.80533572294761 -2.43619388992515 T:C T C 10 0.543619388992515 0.202250323161148 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71185441_71186668:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530534:exon_71185441_71185572:NADSYN1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 71720030 G/A 1 18 21 39 8.21485099813473 11.4160071688428 -3.20115617070809 A:G G A 10 0.543619388992515 0.336675733684755 ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71720013_71720231:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71720013_71720231:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71720013_71720231:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000351960:exon_71720013_71720231:NUMA1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 73611349 G/C 1 6 3 9 2.73828366604491 1.63085816697755 1.10742549906736 C:G G C 10 0.543619388992515 0.522625694750698 ENSG00000175575:ENST00000310571:exon_73611315_73611465:PAAF1;ENSG00000175575:ENST00000376384:exon_73611315_73611465:PAAF1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 73689104 G/A 1 66 43 109 30.121120326494 23.3756337266781 6.74548659981586 A:G G A 10 0.543619388992515 0.211756666776630 ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73688931_73689141:UCP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 74329615 T/C 1 7 2 9 3.19466427705239 1.08723877798503 2.10742549906736 T:C T C 10 0.543619388992515 0.194613573468504 ENSG00000077514:ENST00000528481:exon_74329582_74329639:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530511:exon_74329582_74329815:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000531615:exon_74329582_74329720:POLD3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 75508258 T/C 1 4 9 13 1.82552244402994 4.89257450093264 -3.0670520569027 T:C T C 10 0.543619388992515 0.100601549808403 ENSG00000062282:ENST00000524706:exon_75508203_75508321:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000228027:exon_75508203_75508377:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000376262:exon_75508203_75508377:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000525612:exon_75508203_75508377:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000532657:exon_75508203_75508377:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000528676:exon_75506182_75508377:DGAT2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 75511572 T/C 1 8 16 24 3.65104488805988 8.69791022388024 -5.04686533582036 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0419613344019655 ENSG00000062282:ENST00000228027:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000376262:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000532657:exon_75511399_75512572:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000528676:exon_75511399_75511677:DGAT2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 75852448 C/T 1 15 16 31 6.84570916511227 8.69791022388024 -1.85220105876797 T:C C T 10 0.543619388992515 0.589591010597541 ENSG00000198382:ENST00000356136:exon_75851755_75854239:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000528420:exon_75851755_75852838:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000533454:exon_75851755_75852544:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000531818:exon_75851755_75853695:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000532130:exon_75851755_75852827:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000525183:exon_75851755_75852704:UVRAG HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 77790655 G/C 1 133 37 170 60.6986212639955 20.1139173927231 40.5847038712724 C:G G C 10 0.543619388992515 1.22568370427586e-10 ENSG00000151366:ENST00000528251:exon_77790625_77790890:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000530054:exon_77790625_77790911:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000281031:exon_77790625_77791265:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000527806:exon_77790625_77790887:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000534029:exon_77790625_77790865:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000525085:exon_77790625_77790865:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000528164:exon_77790625_77790907:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000324742:exon_77790625_77790931:NDUFC2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 77825320 T/C 1 5 3 8 2.28190305503742 1.63085816697755 0.65104488805988 T:C T C 10 0.543619388992515 0.734792052639277 ENSG00000159063:ENST00000299626:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000376156:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000526737:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532306:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000421284:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532440:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000524925:exon_77825312_77825422:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000529139:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525755:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000530454:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525870:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532050:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000527099:exon_77825312_77825438:ALG8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 77924870 C/T 1 2 6 8 0.91276122201497 3.26171633395509 -2.34895511194012 T:C C T 10 0.543619388992515 0.153435168169122 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77924692_77925072:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77924692_77925184:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77924692_77925757:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77924692_77925753:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77924692_77925465:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77924692_77925753:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77924692_77925753:USP35 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 82535963 C/T 1 38 32 70 17.3424632182844 17.3958204477605 -0.0533572294760525 A:T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000137509:ENST00000313010:exon_82534544_82536164:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532767:exon_82535409_82542480:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000393399:exon_82535410_82536164:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532709:exon_82535415_82536164:PRCP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 82973004 C/T 1 25 25 50 11.4095152751871 13.5904847248129 -2.18096944962575 T:C C T 10 0.543619388992515 0.571770159237513 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82970139_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000455220:exon_82972359_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525504:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82972504_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527495:exon_82972772_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82972799_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82972837_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82972838_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82972933_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82972971_82973008:CCDC90B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 82996986 A/C 1 4 6 10 1.82552244402994 3.26171633395509 -1.43619388992515 A:C A C 10 0.543619388992515 0.528005019910346 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82996916_82997450:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82996596_82997394:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82996916_82997397:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82996170_82997041:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82996916_82997253:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82996916_82997398:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82996916_82997022:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82996916_82997021:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000534753:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527025:exon_82996916_82997033:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000528149:exon_82996596_82997128:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526265:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525916:exon_82996596_82997011:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000530253:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526631:exon_82996916_82997021:CCDC90B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 85968623 C/T 1 7 4 11 3.19466427705239 2.17447755597006 1.02018672108233 T:C C T 10 0.543619388992515 0.763926340985151 ENSG00000074266:ENST00000263360:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000528180:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000351625:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000327320:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000525244:exon_85968557_85968638:EED HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 87908448 A/G 1 4 7 11 1.82552244402994 3.80533572294761 -1.97981327891767 A:G A G 10 0.543619388992515 0.245254265630413 ENSG00000123892:ENST00000243662:exon_87908351_87908635:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000531138:exon_87908351_87908601:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000526372:exon_87908406_87908602:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000441495:exon_87908351_87908635:RAB38 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 89935586 G/T 1 15 9 24 6.84570916511227 4.89257450093264 1.95313466417964 T:G G T 10 0.543619388992515 0.539908191437424 ENSG00000110172:ENST00000320585:exon_89934328_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529987:exon_89934612_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000533724:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000457199:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529726:exon_89935117_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000525317:exon_89935575_89935719:CHORDC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 93212161 A/G 1 10 20 30 4.56380611007485 10.8723877798503 -6.30858166977545 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0266378450847347 ENSG00000166002:ENST00000525141:exon_93211638_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000298966:exon_93211638_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000527149:exon_93212107_93212435:C11orf75 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 93212254 C/T 1 15 23 38 6.84570916511227 12.5032459468278 -5.65753678171557 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0736558354204878 ENSG00000166002:ENST00000525141:exon_93211638_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000298966:exon_93211638_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000527149:exon_93212107_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000529714:exon_93212200_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000526869:exon_93212215_93212435:C11orf75 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 93464175 A/C 1 11 9 20 5.02018672108233 4.89257450093264 0.127612220149699 A:C A C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000166012:ENST00000323981:exon_93463114_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000530769:exon_93463843_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000529900:exon_93463833_93464382:TAF1D HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 93469892 G/C 1 56 42 98 25.5573142164192 22.8320143376856 2.72529987873353 C:G G C 10 0.543619388992515 0.613088143517123 ENSG00000166012:ENST00000323981:exon_93469860_93469917:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000526015:exon_93469860_93469917:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000393259:exon_93469860_93469917:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000529794:exon_93469307_93469972:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000527068:exon_93469860_93470405:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000448108:exon_93469860_93469917:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000528734:exon_93469860_93470133:TAF1D HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 95564259 A/G 1 20 24 44 9.1276122201497 13.0468653358204 -3.91925311567066 A:G A G 10 0.543619388992515 0.289392563198595 ENSG00000166037:ENST00000325486:exon_95564190_95565854:CEP57;ENSG00000166037:ENST00000325542:exon_95564190_95565854:CEP57 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 95569326 G/T 1 5 4 9 2.28190305503742 2.17447755597006 0.107425499067364 T:G G T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000087053:ENST00000346299:exon_95569312_95569488:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000393223:exon_95569312_95569488:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000409459:exon_95569312_95569488:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000352297:exon_95569312_95569488:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000444541:exon_95569312_95569488:MTMR2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 95580926 G/A 1 7 5 12 3.19466427705239 2.71809694496258 0.476567332089819 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000087053:ENST00000346299:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000393223:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000409459:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000352297:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000444541:exon_95580878_95581063:MTMR2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 102248377 C/T 1 9 9 18 4.10742549906736 4.89257450093264 -0.785149001865271 T:C C T 10 0.543619388992515 0.81438018796475 ENSG00000110330:ENST00000530675:exon_102248227_102248481:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000533742:exon_102248227_102248422:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000227758:exon_102248227_102248481:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000532672:exon_102248227_102248481:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000531259:exon_102248227_102248481:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000527910:exon_102248227_102248481:BIRC2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 107197606 G/C 1 7 11 18 3.19466427705239 5.97981327891767 -2.78514900186527 C:G G C 10 0.543619388992515 0.237876828195976 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107197071_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107197074_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107197086_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107197523_107197779:CWF19L2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 107299623 A/C 1 14 9 23 6.38932855410479 4.89257450093264 1.49675405317215 A:C A C 10 0.543619388992515 0.676494295864547 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000433523:exon_107299525_107300177:CWF19L2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 108009660 C/A 1 14 30 44 6.38932855410479 16.3085816697755 -9.91925311567066 A:C C A 10 0.543619388992515 0.00356317571294045 ENSG00000075239:ENST00000265838:exon_108009625_108009768:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000531813:exon_108009625_108009768:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000528370:exon_108009625_108009891:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000534773:exon_108009447_108009768:ACAT1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 111754574 A/C 1 57 67 124 26.0136948274266 36.4224990624985 -10.4088042350719 A:C A C 10 0.543619388992515 0.0710023987709982 ENSG00000137720:ENST00000528125:exon_111754495_111754624:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000260276:exon_111754495_111756699:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000530214:exon_111754495_111754798:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000529270:exon_111754495_111754793:C11orf1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 117077034 A/G 1 19 15 34 8.67123160914221 8.15429083488773 0.516940774254488 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117075053_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117075790_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000529458:exon_117076663_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000527037:exon_117076864_117077072:PCSK7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 117163824 C/G 1 5 4 9 2.28190305503742 2.17447755597006 0.107425499067364 C:G C G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000186318:ENST00000313005:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000392937:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000528053:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000510630:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000428381:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000513780:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000445823:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000292095:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000530824:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000530844:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000510915:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000504995:exon_117163787_117163904:BACE1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 117241929 G/C 1 8 8 16 3.65104488805988 4.34895511194012 -0.697910223880241 C:G G C 10 0.543619388992515 0.804399137481932 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117241796_117242182:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117241796_117242182:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000529538:exon_117241796_117242182:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117241796_117242182:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000375253:exon_117241796_117242182:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117241796_117242182:CEP164 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 117869670 A/G 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117869430_117872194:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117869430_117870513:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117869430_117870592:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117869430_117870503:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117869430_117870613:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117869430_117872196:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000525467:exon_117869430_117870174:IL10RA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 118068752 T/C 1 4 6 10 1.82552244402994 3.26171633395509 -1.43619388992515 T:C T C 10 0.543619388992515 0.528005019910346 ENSG00000160593:ENST00000356289:exon_118068713_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000292067:exon_118068713_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000534294:exon_118067450_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000533261:exon_118068713_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000526595:exon_118068683_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000531530:exon_118068713_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000526620:exon_118068713_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000529164:exon_118068324_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000414357:exon_118068683_118068806:AMICA1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 118277770 C/T 1 382 429 811 174.337393404859 233.212717877789 -58.8753244729297 T:C C T 10 0.543619388992515 3.62901967760002e-05 ENSG00000167283:ENST00000300688:exon_118277652_118277812:ATP5L;ENSG00000167283:ENST00000529790:exon_118277652_118277812:ATP5L;ENSG00000167283:ENST00000529770:exon_118277652_118277812:ATP5L;ENSG00000167283:ENST00000524422:exon_118277652_118277812:ATP5L;ENSG00000167283:ENST00000529460:exon_118277652_118277812:ATP5L;ENSG00000167283:ENST00000534385:exon_118277652_118278208:ATP5L;ENSG00000167283:ENST00000527186:exon_118276842_118277812:ATP5L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 118471360 A/G 1 6 4 10 2.73828366604491 2.17447755597006 0.56380611007485 A:G A G 10 0.543619388992515 0.763129400865595 ENSG00000095139:ENST00000392859:exon_118471340_118471708:ARCN1;ENSG00000095139:ENST00000359415:exon_118471340_118473643:ARCN1;ENSG00000095139:ENST00000264028:exon_118471340_118473643:ARCN1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 118471423 T/C 1 3 8 11 1.36914183302245 4.34895511194012 -2.97981327891767 T:C T C 10 0.543619388992515 0.126408424019807 ENSG00000095139:ENST00000392859:exon_118471340_118471708:ARCN1;ENSG00000095139:ENST00000359415:exon_118471340_118473643:ARCN1;ENSG00000095139:ENST00000264028:exon_118471340_118473643:ARCN1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 118890022 C/T 1 42 38 80 19.1679856623144 20.6575367817156 -1.4895511194012 T:C C T 10 0.543619388992515 0.737965383331439 ENSG00000196655:ENST00000533632:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000527680:exon_118889853_118890213:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000447216:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000531290:exon_118889476_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000359005:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000525079:exon_118889853_118890134:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000533012:exon_118889853_118890027:TRAPPC4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 118922200 G/A 1 11 12 23 5.02018672108233 6.52343266791018 -1.50324594682785 A:G G A 10 0.543619388992515 0.538329676167563 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118922150_118922337:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118922150_118922337:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118922150_118922337:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118922150_118922337:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118922150_118922337:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118922150_118922337:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530473:exon_118922150_118922337:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529114:exon_118922150_118922337:HYOU1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 118925341 G/A 1 6 3 9 2.73828366604491 1.63085816697755 1.10742549906736 A:G G A 10 0.543619388992515 0.522625694750698 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530473:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531694:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534233:exon_118925211_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000526656:exon_118925249_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534654:exon_118925280_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531968:exon_118925297_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529683:exon_118925333_118925387:HYOU1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 118947634 C/T 1 7 3 10 3.19466427705239 1.63085816697755 1.56380611007485 T:C C T 10 0.543619388992515 0.3622898906741 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 118949331 C/T 1 14 4 18 6.38932855410479 2.17447755597006 4.21485099813473 T:C C T 10 0.543619388992515 0.057457655308005 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 118949676 C/T 1 23 13 36 10.4967540531722 7.0670520569027 3.42970199626946 T:C C T 10 0.543619388992515 0.315724223110252 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 118952173 A/G 1 46 45 91 20.9935081063443 24.4628725046632 -3.46936439831887 A:G A G 10 0.543619388992515 0.463953415676847 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 118955679 C/T 1 5 7 12 2.28190305503742 3.80533572294761 -1.52343266791018 T:C C T 10 0.543619388992515 0.400734857745032 ENSG00000149397:ENST00000278715:exon_118955587_118955776:HMBS;ENSG00000149397:ENST00000442944:exon_118955624_118955776:HMBS HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 119005132 C/T 1 6 5 11 2.73828366604491 2.71809694496258 0.0201867210823345 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000172273:ENST00000437496:exon_119004794_119005764:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000350777:exon_119004794_119006752:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000527755:exon_119004794_119005764:HINFP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 119052826 C/A 1 7 9 16 3.19466427705239 4.89257450093264 -1.69791022388024 A:C C A 10 0.543619388992515 0.456567971750714 ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000469103:exon_119052803_119053054:NLRX1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 124623492 T/C 1 39 21 60 17.7988438292919 11.4160071688428 6.3828366604491 T:C T C 10 0.543619388992515 0.119364332275878 ENSG00000149564:ENST00000485116:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000417453:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000278927:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000464067:exon_124623095_124623857:ESAM HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 125452313 A/G 1 20 19 39 9.1276122201497 10.3287683908578 -1.20115617070809 A:G A G 10 0.543619388992515 0.749124669510297 ENSG00000149547:ENST00000530985:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000531350:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000534430:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000525737:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527628:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527675:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000278903:exon_125452302_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000343678:exon_125452306_125452315:EI24 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 125479363 G/A 1 12 7 19 5.47656733208982 3.80533572294761 1.67123160914221 A:G G A 10 0.543619388992515 0.496728290141003 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125479329_125479793:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000526726:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531001:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000524639:exon_125479314_125479484:STT3A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 125763746 C/G 1 54 51 105 24.6445529944042 27.7245888386183 -3.08003584421408 C:G C G 10 0.543619388992515 0.557971844781895 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125763381_125764181:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125763382_125764181:PUS3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 125766044 C/A 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 A:C C A 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000534158:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000529801:exon_125765865_125766225:PUS3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 125769354 T/C 1 3 7 10 1.36914183302245 3.80533572294761 -2.43619388992515 T:C T C 10 0.543619388992515 0.202250323161148 ENSG00000198331:ENST00000356438:exon_125769239_125770539:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000425380:exon_125769239_125770543:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000392698:exon_125769239_125770540:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000526028:exon_125769239_125770512:HYLS1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 126174164 C/T 1 50 39 89 22.8190305503742 21.2011561707081 1.61787437966616 T:C C T 10 0.543619388992515 0.75074076599839 ENSG00000255062:ENST00000524964:exon_126174103_126174213:RP11-712L6.5;ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126173647_126174176:DCPS HGDP00222_parsed_pileup.txt . 11 128333503 T/C 1 8 6 14 3.65104488805988 3.26171633395509 0.38932855410479 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000134954:ENST00000345075:exon_128333404_128333518:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000392668:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000319397:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000526145:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000530924:exon_128333404_128333524:ETS1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 4388084 C/G 1 47 41 88 21.4498887173518 22.2883949486931 -0.838506231341324 C:G C G 10 0.543619388992515 0.914887398614008 ENSG00000118971:ENST00000261254:exon_4387926_4388085:CCND2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 4459032 G/A 1 11 6 17 5.02018672108233 3.26171633395509 1.75847038712724 A:T:G G A 10 0.543619388992515 0.470285892368413 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4458985_4459062:C12orf5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 4716513 C/T 1 8 8 16 3.65104488805988 4.34895511194012 -0.697910223880241 T:C C T 10 0.543619388992515 0.804399137481932 ENSG00000010219:ENST00000010132:exon_4716493_4716553:DYRK4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 6500105 T/G 1 7 1 8 3.19466427705239 0.543619388992515 2.65104488805988 T:G T G 10 0.543619388992515 0.0786679847867632 ENSG00000111321:ENST00000228918:exon_6499826_6500733:LTBR HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 6554628 G/A 1 37 101 138 16.8860826072769 54.905558288244 -38.0194756809671 A:G G A 10 0.543619388992515 8.50517707070293e-11 ENSG00000139193:ENST00000266557:exon_6554590_6554721:CD27 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 6566684 G/A 1 20 36 56 9.1276122201497 19.5702980037305 -10.4426857835808 A:G G A 10 0.543619388992515 0.00677799507713919 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6566572_6566910:TAPBPL HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 6666455 T/C 1 138 125 263 62.9805243190329 67.9524236240644 -4.97189930503146 T:C T C 10 0.543619388992515 0.536749714734185 ENSG00000111641:ENST00000322166:exon_6666261_6666808:NOP2;ENSG00000111641:ENST00000382421:exon_6666037_6666808:NOP2;ENSG00000111641:ENST00000399466:exon_6666037_6666808:NOP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 7065635 T/C 1 147 112 259 67.0879498181003 60.8853715671617 6.2025782509386 T:C T C 10 0.543619388992515 0.454608658704095 ENSG00000111679:ENST00000399448:exon_7065582_7065731:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000416215:exon_7065582_7065731:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000447931:exon_7065582_7065731:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000318974:exon_7065582_7065731:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000456013:exon_7065582_7065731:PTPN6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 7090193 A/G 1 4 9 13 1.82552244402994 4.89257450093264 -3.0670520569027 A:G A G 10 0.543619388992515 0.100601549808403 ENSG00000111684:ENST00000261407:exon_7090166_7090344:LPCAT3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 7091918 C/T 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000111684:ENST00000261407:exon_7091837_7091943:LPCAT3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 7249598 T/C 1 3 7 10 1.36914183302245 3.80533572294761 -2.43619388992515 T:C T C 10 0.543619388992515 0.202250323161148 ENSG00000139178:ENST00000266542:exon_7247153_7249759:C1RL;ENSG00000139178:ENST00000396661:exon_7249181_7249759:C1RL HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 7362305 C/T 1 6 6 12 2.73828366604491 3.26171633395509 -0.52343266791018 T:C C T 10 0.543619388992515 0.779998482964206 ENSG00000139197:ENST00000455147:exon_7362279_7362436:PEX5;ENSG00000139197:ENST00000434354:exon_7362279_7362436:PEX5;ENSG00000139197:ENST00000420616:exon_7362279_7362436:PEX5;ENSG00000139197:ENST00000266563:exon_7362279_7362436:PEX5;ENSG00000139197:ENST00000412720:exon_7362279_7362436:PEX5;ENSG00000139197:ENST00000266564:exon_7362279_7362436:PEX5;ENSG00000139197:ENST00000396637:exon_7362279_7362436:PEX5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 9094548 A/G 1 2 6 8 0.91276122201497 3.26171633395509 -2.34895511194012 A:G A G 10 0.543619388992515 0.153435168169122 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 14927825 C/G 1 45 36 81 20.5371274953368 19.5702980037305 0.96682949160628 C:G C G 10 0.543619388992515 0.911292639088943 ENSG00000111332:ENST00000389078:exon_14927349_14927957:H2AFJ HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 15095558 C/G 1 644 630 1274 293.90911348882 342.480215065284 -48.5711015764642 A:T:C:G C G 10 0.543619388992515 0.00636962031880829 ENSG00000111348:ENST00000228945:exon_15094950_15095655:ARHGDIB HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 16189694 T/A 1 14 9 23 6.38932855410479 4.89257450093264 1.49675405317215 A:T T A 10 0.543619388992515 0.676494295864547 ENSG00000023697:ENST00000428559:exon_16189624_16190220:DERA;ENSG00000023697:ENST00000526530:exon_16189624_16190214:DERA;ENSG00000023697:ENST00000025429:exon_16189624_16190209:DERA;ENSG00000023697:ENST00000530274:exon_16189624_16189747:DERA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 21623969 A/G 1 20 32 52 9.1276122201497 17.3958204477605 -8.26820822761078 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0253523521572865 ENSG00000121350:ENST00000240651:exon_21621440_21624176:PYROXD1;ENSG00000004700:ENST00000396093:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000444129:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000421138:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000314748:exon_21623903_21624032:RECQL HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 25242595 C/G 1 30 12 42 13.6914183302245 6.52343266791018 7.16798566231437 C:G C G 10 0.543619388992515 0.0296234816183282 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242548_25242611:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242548_25242611:LRMP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 27064232 C/T 1 24 23 47 10.9531346641796 12.5032459468278 -1.55011128264821 T:C C T 10 0.543619388992515 0.663162229968251 ENSG00000064102:ENST00000261191:exon_27064111_27064250:C12orf11;ENSG00000064102:ENST00000335745:exon_27064111_27064250:C12orf11 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 29502018 T/G 1 9 13 22 4.10742549906736 7.0670520569027 -2.95962655783533 T:G T G 10 0.543619388992515 0.284361051004846 ENSG00000087502:ENST00000360150:exon_29502012_29502110:ERGIC2;ENSG00000087502:ENST00000201023:exon_29502012_29502110:ERGIC2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 32137447 C/T 1 9 10 19 4.10742549906736 5.43619388992515 -1.32876839085779 T:C C T 10 0.543619388992515 0.646867751304706 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 32137512 C/G 1 8 12 20 3.65104488805988 6.52343266791018 -2.8723877798503 C:G C G 10 0.543619388992515 0.261745196981094 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 32481093 G/C 1 4 6 10 1.82552244402994 3.26171633395509 -1.43619388992515 C:G G C 10 0.543619388992515 0.528005019910346 ENSG00000151746:ENST00000457150:exon_32480395_32481489:BICD1;ENSG00000151746:ENST00000281474:exon_32480395_32481489:BICD1;ENSG00000151746:ENST00000395758:exon_32480395_32481489:BICD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 32854366 A/C 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 A:C A C 10 0.543619388992515 0.482069340371676 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32854349_32854496:DNM1L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 32896365 G/C 1 23 33 56 10.4967540531722 17.939439836753 -7.44268578358084 C:G G C 10 0.543619388992515 0.0594280644133409 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32896288_32898584:DNM1L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 32896366 A/T 1 23 32 55 10.4967540531722 17.3958204477605 -6.89906639458833 A:T A T 10 0.543619388992515 0.077610298205832 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32896288_32898584:DNM1L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 32908237 C/A 1 12 11 23 5.47656733208982 5.97981327891767 -0.503245946827846 A:C C A 10 0.543619388992515 0.837610804972755 ENSG00000139131:ENST00000324868:exon_32908030_32908874:YARS2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 32908518 G/A 1 8 12 20 3.65104488805988 6.52343266791018 -2.8723877798503 A:G G A 10 0.543619388992515 0.261745196981094 ENSG00000139131:ENST00000324868:exon_32908030_32908874:YARS2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 48359984 C/T 1 4 6 10 1.82552244402994 3.26171633395509 -1.43619388992515 T:C C T 10 0.543619388992515 0.528005019910346 ENSG00000134291:ENST00000256686:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000434888:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000429772:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000424902:exon_48359872_48360012:TMEM106C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 48527186 C/T 1 5 6 11 2.28190305503742 3.26171633395509 -0.979813278917665 T:C C T 10 0.543619388992515 0.56306921306608 ENSG00000152556:ENST00000340802:exon_48527098_48527263:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000359794:exon_48527098_48527263:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000395233:exon_48527098_48527263:PFKM HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 48539482 T/G 1 52 49 101 23.7317917723892 26.6373500606332 -2.90555828824402 T:G T G 10 0.543619388992515 0.617714932956717 ENSG00000152556:ENST00000340802:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000359794:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000395233:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000312352:exon_48539347_48539488:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000443538:exon_48539347_48539887:PFKM HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 49230035 T/G 1 16 18 34 7.30208977611976 9.78514900186527 -2.48305922574551 T:G T G 10 0.543619388992515 0.396146420883858 ENSG00000174243:ENST00000398375:exon_49229904_49230049:DDX23;ENSG00000174243:ENST00000308025:exon_49229904_49230049:DDX23 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 50571361 C/G 1 10 11 21 4.56380611007485 5.97981327891767 -1.41600716884282 C:G C G 10 0.543619388992515 0.662427114891113 ENSG00000050405:ENST00000394943:exon_50569565_50571852:LIMA1;ENSG00000050405:ENST00000341247:exon_50569565_50571852:LIMA1;ENSG00000050405:ENST00000420992:exon_50569573_50571852:LIMA1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 51442944 G/A 1 5 7 12 2.28190305503742 3.80533572294761 -1.52343266791018 A:G G A 10 0.543619388992515 0.400734857745032 ENSG00000050426:ENST00000262055:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000418425:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000448283:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000380135:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000380123:exon_51442817_51442968:LETMD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 51457854 G/A 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000110925:ENST00000228515:exon_51454990_51458452:CSRNP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 51675246 C/T 1 19 21 40 8.67123160914221 11.4160071688428 -2.7447755597006 T:C C T 10 0.543619388992515 0.428905728981155 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51674823_51675312:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51674823_51675312:BIN2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 51685707 T/C 1 19 8 27 8.67123160914221 4.34895511194012 4.32227649720209 T:C:G T C 10 0.543619388992515 0.121574747598711 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51685375_51686128:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51685375_51686128:BIN2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 52448157 G/A 1 8 8 16 3.65104488805988 4.34895511194012 -0.697910223880241 A:G G A 10 0.543619388992515 0.804399137481932 ENSG00000123358:ENST00000360284:exon_52448111_52448988:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000478250:exon_52448111_52449745:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000394825:exon_52448111_52448988:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000243050:exon_52448111_52448988:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000394824:exon_52448111_52448988:NR4A1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 52639302 G/C 1 5 11 16 2.28190305503742 5.97981327891767 -3.69791022388024 C:G G C 10 0.543619388992515 0.0791368382267459 ENSG00000135480:ENST00000331817:exon_52639196_52639416:KRT7;ENSG00000135480:ENST00000422319:exon_52639196_52639416:KRT7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 53586536 C/T 1 141 64 205 64.3496661520554 34.791640895521 29.5580252565344 T:C C T 10 0.543619388992515 3.14937493119127e-05 ENSG00000139626:ENST00000422257:exon_53586475_53586694:ITGB7;ENSG00000139626:ENST00000267082:exon_53586475_53586694:ITGB7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 53946410 G/A 1 8 1 9 3.65104488805988 0.543619388992515 3.10742549906736 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0455406737348372 ENSG00000170653:ENST00000328463:exon_53946325_53946421:ATF7;ENSG00000170653:ENST00000420353:exon_53946325_53946421:ATF7;ENSG00000170653:ENST00000456903:exon_53946325_53946421:ATF7;ENSG00000170653:ENST00000415113:exon_53946325_53946421:ATF7;ENSG00000170653:ENST00000306727:exon_53946325_53946421:ATF7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 54109659 C/T 1 2 7 9 0.91276122201497 3.80533572294761 -2.89257450093264 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0894121930945724 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54109577_54109831:CALCOCO1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 54905815 C/G 1 8 9 17 3.65104488805988 4.89257450093264 -1.24152961287276 C:G C G 10 0.543619388992515 0.629539446230712 ENSG00000123338:ENST00000293373:exon_54905733_54905889:NCKAP1L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 55355033 C/T 1 17 14 31 7.75847038712724 7.61067144589521 0.147798941232034 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000135426:ENST00000524622:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524923:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000532804:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55354989_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000531122:exon_55354952_55355051:KIAA0748 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 55368368 G/A 1 9 5 14 4.10742549906736 2.71809694496258 1.38932855410479 A:G G A 10 0.543619388992515 0.59447928862092 ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524668:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000533607:exon_55368204_55368391:KIAA0748 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 56500834 A/G 1 66 23 89 30.121120326494 12.5032459468278 17.6178743796662 A:G A G 10 0.543619388992515 0.000164607879320479 ENSG00000170515:ENST00000303305:exon_56500774_56500879:PA2G4;ENSG00000170515:ENST00000417031:exon_56500774_56500879:PA2G4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 56737251 C/A 1 18 17 35 8.21485099813473 9.24152961287276 -1.02667861473803 A:C C A 10 0.543619388992515 0.737552578231163 ENSG00000170581:ENST00000314128:exon_56735384_56737315:STAT2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 57867422 T/C 1 21 29 50 9.58399283115718 15.7649622807829 -6.18096944962575 T:C T C 10 0.543619388992515 0.088730453395017 ENSG00000123329:ENST00000393791:exon_57867386_57867491:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57867386_57867491:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000340423:exon_57867386_57867470:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57867386_57867491:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000430041:exon_57867386_57867491:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000423291:exon_57867386_57867491:ARHGAP9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 57926791 T/G 1 42 31 73 19.1679856623144 16.852201058768 2.3157846035464 T:G T G 10 0.543619388992515 0.639145516432639 ENSG00000175203:ENST00000434715:exon_57926767_57926805:DCTN2;ENSG00000175203:ENST00000354743:exon_57926767_57926805:DCTN2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 58162739 A/G 1 36 32 68 16.4297019962695 17.3958204477605 -0.966118451491024 A:G A G 10 0.543619388992515 0.809189493748792 ENSG00000037897:ENST00000324871:exon_58162254_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000257848:exon_58162365_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000408972:exon_58162368_58162934:METTL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 58176614 T/C 1 14 16 30 6.38932855410479 8.69791022388024 -2.30858166977545 T:C T C 10 0.543619388992515 0.464803618106555 ENSG00000123297:ENST00000454289:exon_58176372_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000323833:exon_58176559_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000417094:exon_58176564_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000434359:exon_58176586_58176660:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000457189:exon_58176601_58176690:TSFM HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 58335626 A/T 1 6 4 10 2.73828366604491 2.17447755597006 0.56380611007485 A:T A T 10 0.543619388992515 0.763129400865595 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58335360_58335671:XRCC6BP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 58350631 C/T 1 20 13 33 9.1276122201497 7.0670520569027 2.060560163247 T:C C T 10 0.543619388992515 0.491087320997542 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58350470_58351051:XRCC6BP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 66546100 A/G 1 7 24 31 3.19466427705239 13.0468653358204 -9.85220105876797 A:G A G 10 0.543619388992515 0.000432964374647838 ENSG00000155957:ENST00000426857:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000358230:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000286424:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000398033:exon_66546051_66546156:TMBIM4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 68052178 G/T 1 7 8 15 3.19466427705239 4.34895511194012 -1.15429083488773 T:G G T 10 0.543619388992515 0.610096871559822 ENSG00000127334:ENST00000344096:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000319833:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000393555:exon_68050886_68056444:DYRK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 69646914 G/A 1 35 43 78 15.973321385262 23.3756337266781 -7.40231234141617 A:G G A 10 0.543619388992515 0.111025667266717 ENSG00000111605:ENST00000435070:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000266679:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000351671:exon_69646831_69646934:CPSF6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 69986788 A/G 1 56 66 122 25.5573142164192 35.878879673506 -10.3215654570868 A:G A G 10 0.543619388992515 0.06882443370901 ENSG00000166226:ENST00000299300:exon_69986756_69986883:CCT2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 69995039 C/A 1 7 7 14 3.19466427705239 3.80533572294761 -0.61067144589521 A:C C A 10 0.543619388992515 0.793044034376695 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 75884254 C/T 1 7 6 13 3.19466427705239 3.26171633395509 -0.0670520569026953 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000139278:ENST00000266659:exon_75884186_75884298:GLIPR1;ENSG00000139278:ENST00000456650:exon_75884186_75884298:GLIPR1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 82752543 T/G 1 6 3 9 2.73828366604491 1.63085816697755 1.10742549906736 T:G T G 10 0.543619388992515 0.522625694750698 ENSG00000127720:ENST00000248306:exon_82752324_82752603:C12orf26 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 82792666 C/T 1 2 7 9 0.91276122201497 3.80533572294761 -2.89257450093264 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0894121930945724 ENSG00000127720:ENST00000248306:exon_82792574_82793173:C12orf26 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 95694394 G/A 1 44 42 86 20.0807468843293 22.8320143376856 -2.7512674533563 A:G G A 10 0.543619388992515 0.588980379274566 ENSG00000028203:ENST00000436874:exon_95693941_95696566:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000261219:exon_95693941_95694944:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000356859:exon_95692870_95694944:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397796:exon_95693941_95694944:VEZT HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 98941637 A/G 1 19 14 33 8.67123160914221 7.61067144589521 1.060560163247 A:G A G 10 0.543619388992515 0.730932452746069 ENSG00000120802:ENST00000343315:exon_98941351_98942897:TMPO;ENSG00000120802:ENST00000261210:exon_98941351_98942897:TMPO;ENSG00000120802:ENST00000393053:exon_98941351_98942897:TMPO HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 99007356 T/C 1 25 31 56 11.4095152751871 16.852201058768 -5.44268578358084 T:C T C 10 0.543619388992515 0.179273053753535 ENSG00000166130:ENST00000342502:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000420861:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000393042:exon_99007183_99008118:IKBIP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 99007623 C/T 1 34 36 70 15.5169407742545 19.5702980037305 -4.05335722947605 T:C C T 10 0.543619388992515 0.339567002385712 ENSG00000166130:ENST00000342502:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000420861:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000393042:exon_99007183_99008118:IKBIP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 99020125 T/C 1 8 10 18 3.65104488805988 5.43619388992515 -1.78514900186527 T:C T C 10 0.543619388992515 0.480432312528866 ENSG00000166130:ENST00000299157:exon_99018036_99020544:IKBIP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 100732327 C/T 1 3 13 16 1.36914183302245 7.0670520569027 -5.69791022388024 T:C C T 10 0.543619388992515 0.00486583305361617 ENSG00000136021:ENST00000360820:exon_100732306_100733912:SCYL2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 102295219 C/T 1 7 2 9 3.19466427705239 1.08723877798503 2.10742549906736 T:C C T 10 0.543619388992515 0.194613573468504 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 105380152 A/C 1 9 6 15 4.10742549906736 3.26171633395509 0.845709165112274 A:C A C 10 0.543619388992515 0.797605664193983 ENSG00000151131:ENST00000280749:exon_105380098_105380245:C12orf45 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 106903321 T/C 1 7 2 9 3.19466427705239 1.08723877798503 2.10742549906736 T:C T C 10 0.543619388992515 0.194613573468504 ENSG00000013503:ENST00000228347:exon_106903198_106903974:POLR3B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 107372277 C/T 1 4 6 10 1.82552244402994 3.26171633395509 -1.43619388992515 T:C C T 10 0.543619388992515 0.528005019910346 ENSG00000120832:ENST00000240050:exon_107371069_107372549:MTERFD3;ENSG00000120832:ENST00000392830:exon_107371069_107372549:MTERFD3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 108127965 A/G 1 8 8 16 3.65104488805988 4.34895511194012 -0.697910223880241 A:G A G 10 0.543619388992515 0.804399137481932 ENSG00000110851:ENST00000228437:exon_108126644_108128299:PRDM4;ENSG00000110851:ENST00000446655:exon_108126644_108128299:PRDM4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 108954862 G/C 1 6 3 9 2.73828366604491 1.63085816697755 1.10742549906736 C:G G C 10 0.543619388992515 0.522625694750698 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108954777_108954944:SART3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 109527945 G/A 1 14 16 30 6.38932855410479 8.69791022388024 -2.30858166977545 A:G G A 10 0.543619388992515 0.464803618106555 ENSG00000189046:ENST00000429722:exon_109527814_109528012:ALKBH2;ENSG00000189046:ENST00000435370:exon_109527814_109528012:ALKBH2;ENSG00000189046:ENST00000343075:exon_109527814_109528012:ALKBH2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 109539799 G/A 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 A:G G A 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000076248:ENST00000242576:exon_109539707_109539804:UNG;ENSG00000076248:ENST00000336865:exon_109539707_109539804:UNG;ENSG00000076248:ENST00000446767:exon_109539707_109539804:UNG HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 109547675 G/T 1 16 12 28 7.30208977611976 6.52343266791018 0.778657108209579 T:G G T 10 0.543619388992515 0.850707367129305 ENSG00000076248:ENST00000242576:exon_109547634_109548798:UNG;ENSG00000076248:ENST00000336865:exon_109547634_109548798:UNG;ENSG00000076248:ENST00000446767:exon_109547634_109548798:UNG HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 109994870 A/T 1 77 68 145 35.1413070475763 36.966118451491 -1.82481140391468 A:T A T 10 0.543619388992515 0.802666480630665 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_109991525_109994941:MMAB HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 110011229 G/T 1 12 4 16 5.47656733208982 2.17447755597006 3.30208977611976 T:G G T 10 0.543619388992515 0.131728801922986 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 110011230 C/T 1 13 4 17 5.9329479430973 2.17447755597006 3.75847038712724 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0875593850290938 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 113348870 G/A 1 112 140 252 51.1146284328383 76.1067144589521 -24.9920860261138 A:T:G G A 10 0.543619388992515 0.00188827774925044 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000445409:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000452357:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000377508:exon_113348856_113349040:OAS1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 113357193 G/A 1 3 11 14 1.36914183302245 5.97981327891767 -4.61067144589521 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0154679504098927 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 113357209 G/A 1 82 13 95 37.4232101026138 7.0670520569027 30.3561580457111 A:G G A 10 0.543619388992515 6.2605104135899e-11 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113357195_113357536:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113357194_113357711:OAS1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 113357237 G/C 1 98 34 132 44.7252998787335 18.4830592257455 26.242240652988 C:G G C 10 0.543619388992515 2.90333478024786e-06 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113357195_113357536:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113357194_113357711:OAS1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 113376320 C/T 1 3 8 11 1.36914183302245 4.34895511194012 -2.97981327891767 T:C C T 10 0.543619388992515 0.126408424019807 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113376157_113376512:OAS3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 113376331 C/A 1 4 9 13 1.82552244402994 4.89257450093264 -3.0670520569027 A:C C A 10 0.543619388992515 0.100601549808403 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113376157_113376512:OAS3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 113376452 C/T 1 7 10 17 3.19466427705239 5.43619388992515 -2.24152961287276 T:C C T 10 0.543619388992515 0.333264703150297 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113376157_113376512:OAS3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 113385918 C/T 1 5 8 13 2.28190305503742 4.34895511194012 -2.0670520569027 T:C C T 10 0.543619388992515 0.276871294907228 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 113532617 A/G 1 7 10 17 3.19466427705239 5.43619388992515 -2.24152961287276 A:G A G 10 0.543619388992515 0.333264703150297 ENSG00000135144:ENST00000257600:exon_113532594_113532752:DTX1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 113532885 C/T 1 9 14 23 4.10742549906736 7.61067144589521 -3.50324594682785 T:C C T 10 0.543619388992515 0.149428656165562 ENSG00000135144:ENST00000257600:exon_113532847_113533008:DTX1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 114282496 C/T 1 6 5 11 2.73828366604491 2.71809694496258 0.0201867210823345 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114282473_114282593:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114282473_114282593:RBM19 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 117217141 T/C 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 T:C T C 10 0.543619388992515 0.482069340371676 ENSG00000135119:ENST00000257575:exon_117217000_117217153:RNFT2;ENSG00000135119:ENST00000407967:exon_117217000_117217153:RNFT2;ENSG00000135119:ENST00000392549:exon_117217000_117217153:RNFT2;ENSG00000135119:ENST00000403793:exon_117217000_117217153:RNFT2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 120436408 G/A 1 1 7 8 0.456380611007485 3.80533572294761 -3.34895511194012 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0274430116751054 ENSG00000135127:ENST00000397558:exon_120436325_120436540:CCDC64;ENSG00000135127:ENST00000446727:exon_120436325_120436540:CCDC64;ENSG00000135127:ENST00000257583:exon_120436325_120436540:CCDC64;ENSG00000135127:ENST00000357093:exon_120436325_120436540:CCDC64 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 120884291 C/T 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 T:C C T 10 0.543619388992515 0.482069340371676 ENSG00000111780:ENST00000229384:exon_120884284_120884364:GATC HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 120884328 C/T 1 6 3 9 2.73828366604491 1.63085816697755 1.10742549906736 T:C C T 10 0.543619388992515 0.522625694750698 ENSG00000111780:ENST00000229384:exon_120884284_120884364:GATC HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 120907332 C/T 1 60 68 128 27.3828366604491 36.966118451491 -9.58328179104192 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0923142367311799 ENSG00000111786:ENST00000229390:exon_120907225_120907464:SRSF9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 120966921 A/G 1 12 11 23 5.47656733208982 5.97981327891767 -0.503245946827846 A:G A G 10 0.543619388992515 0.837610804972755 ENSG00000110871:ENST00000288532:exon_120966743_120966964:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000445328:exon_120966743_120966953:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000302223:exon_120966743_120966953:COQ5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 121176083 G/A 1 25 25 50 11.4095152751871 13.5904847248129 -2.18096944962575 A:G G A 10 0.543619388992515 0.571770159237513 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176083_121176253:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176083_121176253:ACADS HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 121177272 G/C 1 29 31 60 13.2350377192171 16.852201058768 -3.6171633395509 C:G G C 10 0.543619388992515 0.366405392719008 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121177099_121177810:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121177099_121177810:ACADS HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 121471337 G/A 1 8 22 30 3.65104488805988 11.9596265578353 -8.30858166977545 A:G G A 10 0.543619388992515 0.00284008361424314 ENSG00000135114:ENST00000257570:exon_121471264_121471546:OASL;ENSG00000135114:ENST00000339275:exon_121471264_121471546:OASL HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 121840634 T/C 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 T:C T C 10 0.543619388992515 0.740490071859648 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 121878659 C/T 1 11 17 28 5.02018672108233 9.24152961287276 -4.22134289179042 T:C C T 10 0.543619388992515 0.129577832731407 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121878619_121878780:KDM2B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 121880520 G/A 1 9 9 18 4.10742549906736 4.89257450093264 -0.785149001865271 A:G G A 10 0.543619388992515 0.81438018796475 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121879960_121880642:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121879960_121880639:KDM2B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 121881848 G/A 1 6 8 14 2.73828366604491 4.34895511194012 -1.61067144589521 A:G G A 10 0.543619388992515 0.430135065302382 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121881815_121882084:KDM2B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 122079189 C/T 1 26 38 64 11.8658958861946 20.6575367817156 -8.79164089552096 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0323805906946640 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 122079441 T/C 1 58 44 102 26.4700754384341 23.9192531156707 2.55082232276346 T:C T C 10 0.543619388992515 0.621067188958751 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 122353796 A/G 1 31 38 69 14.147798941232 20.6575367817156 -6.50973784048354 A:G A G 10 0.543619388992515 0.118005647290272 ENSG00000110801:ENST00000261817:exon_122353762_122353850:PSMD9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 123466111 C/T 1 3 7 10 1.36914183302245 3.80533572294761 -2.43619388992515 T:C C T 10 0.543619388992515 0.202250323161148 ENSG00000182196:ENST00000392433:exon_123465364_123466426:ARL6IP4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 123799974 A/G 1 7 6 13 3.19466427705239 3.26171633395509 -0.0670520569026953 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123799920_123799991:SBNO1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 123806219 C/T 1 31 28 59 14.147798941232 15.2213428917904 -1.07354395055839 T:C C T 10 0.543619388992515 0.795065129442435 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123806082_123806279:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123806082_123806279:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123806082_123806279:SBNO1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 123810873 G/A 1 12 17 29 5.47656733208982 9.24152961287276 -3.76496228078294 A:G G A 10 0.543619388992515 0.192472286031218 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123810699_123810881:SBNO1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 123950471 G/A 1 78 59 137 35.5976876585838 32.0735439505584 3.52414370802543 A:G G A 10 0.543619388992515 0.60700654915384 ENSG00000184209:ENST00000438124:exon_123950085_123950941:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000526639:exon_123950085_123951483:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000392420:exon_123950085_123950941:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000361485:exon_123950085_123950937:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000412157:exon_123950085_123950936:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000350887:exon_123950085_123950937:SNRNP35 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 124104551 A/G 1 52 43 95 23.7317917723892 23.3756337266781 0.356158045711073 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124104511_124105480:DDX55 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 124821696 C/T 1 13 14 27 5.9329479430973 7.61067144589521 -1.67772350279791 T:C C T 10 0.543619388992515 0.56531671981011 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000440187:exon_124821650_124821726:NCOR2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 124826462 C/T 1 6 12 18 2.73828366604491 6.52343266791018 -3.78514900186527 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0965748240788784 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000453428:exon_124826369_124826601:NCOR2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 125284748 A/G 1 16 14 30 7.30208977611976 7.61067144589521 -0.308581669775451 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125284670_125284788:SCARB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 125299542 C/T 1 21 9 30 9.58399283115718 4.89257450093264 4.69141833022455 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0996497823020474 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125299519_125299660:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125299519_125299660:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125299519_125299660:SCARB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 125434580 C/T 1 14 9 23 6.38932855410479 4.89257450093264 1.49675405317215 T:C C T 10 0.543619388992515 0.676494295864547 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125434532_125434605:DHX37 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 125437019 T/C 1 5 9 14 2.28190305503742 4.89257450093264 -2.61067144589521 T:C T C 10 0.543619388992515 0.186393367921189 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125436944_125437116:DHX37 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 125438516 T/C 1 6 4 10 2.73828366604491 2.17447755597006 0.56380611007485 T:C T C 10 0.543619388992515 0.763129400865595 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125438426_125438542:DHX37 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 125438523 C/T 1 6 2 8 2.73828366604491 1.08723877798503 1.65104488805988 T:C C T 10 0.543619388992515 0.303950947229235 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125438426_125438542:DHX37 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 125449083 G/A 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125448940_125449172:DHX37 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 125561151 A/G 1 6 7 13 2.73828366604491 3.80533572294761 -1.0670520569027 A:G A G 10 0.543619388992515 0.588111803651177 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125561037_125561157:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125561037_125561157:AACS;ENSG00000081760:ENST00000418937:exon_125561037_125561157:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125561037_125561157:AACS HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 129278864 A/G 1 18 18 36 8.21485099813473 9.78514900186527 -1.57029800373054 A:G A G 10 0.543619388992515 0.619279667635144 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129277739_129278901:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129278765_129278901:SLC15A4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 129293346 C/T 1 12 12 24 5.47656733208982 6.52343266791018 -1.04686533582036 T:C C T 10 0.543619388992515 0.686969093177818 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129293333_129293501:SLC15A4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 132625960 G/A 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 A:G G A 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132625820_132625965:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132625820_132625965:DDX51 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 132626425 G/A 1 5 6 11 2.28190305503742 3.26171633395509 -0.979813278917665 A:G G A 10 0.543619388992515 0.56306921306608 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626395_132626501:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626395_132626501:DDX51 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 132626668 T/C 1 7 6 13 3.19466427705239 3.26171633395509 -0.0670520569026953 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626664_132626735:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626664_132626735:DDX51 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 133215785 C/A 1 4 7 11 1.82552244402994 3.80533572294761 -1.97981327891767 A:C C A 10 0.543619388992515 0.245254265630413 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133215711_133215884:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133215711_133215884:POLE;ENSG00000177084:ENST00000434528:exon_133215711_133215884:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133215711_133215884:POLE HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 133310988 T/A 1 12 12 24 5.47656733208982 6.52343266791018 -1.04686533582036 A:T T A 10 0.543619388992515 0.686969093177818 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133310971_133311161:ANKLE2;ENSG00000176915:ENST00000337516:exon_133310971_133311161:ANKLE2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 12 133683261 T/C 1 6 3 9 2.73828366604491 1.63085816697755 1.10742549906736 T:C T C 10 0.543619388992515 0.522625694750698 ENSG00000196387:ENST00000355557:exon_133682096_133684260:ZNF140 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 20220588 A/G 1 100 155 255 45.6380611007485 84.2610052938398 -38.6229441930913 A:G A G 10 0.543619388992515 1.49566371272185e-06 ENSG00000196199:ENST00000361479:exon_20220583_20221431:MPHOSPH8;ENSG00000196199:ENST00000414242:exon_20220583_20221431:MPHOSPH8;ENSG00000196199:ENST00000360754:exon_20220583_20221431:MPHOSPH8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 20224202 G/T 1 48 46 94 21.9062693283593 25.0064918936557 -3.10022256529641 T:G G T 10 0.543619388992515 0.535808030267981 ENSG00000196199:ENST00000361479:exon_20224143_20224400:MPHOSPH8;ENSG00000196199:ENST00000414242:exon_20224143_20224400:MPHOSPH8;ENSG00000196199:ENST00000360754:exon_20224143_20224400:MPHOSPH8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 20356941 T/A 1 42 22 64 19.1679856623144 11.9596265578353 7.20835910447904 A:T T A 10 0.543619388992515 0.0789360593489845 ENSG00000121390:ENST00000471658:exon_20356526_20357057:PSPC1;ENSG00000121390:ENST00000492741:exon_20356526_20357082:PSPC1;ENSG00000121390:ENST00000338910:exon_20356526_20357057:PSPC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 20411701 C/T 1 11 7 18 5.02018672108233 3.80533572294761 1.21485099813473 T:C C T 10 0.543619388992515 0.64123354867373 ENSG00000132950:ENST00000382907:exon_20411593_20411961:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20411605_20411961:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20411605_20411961:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000495534:exon_20411605_20411961:ZMYM5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 21535837 T/G 1 194 3 197 88.5378385354521 1.63085816697755 86.9069803684745 T:C:G T C 10 0.543619388992515 5.72972870480087e-47 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 21751005 G/C 1 6 11 17 2.73828366604491 5.97981327891767 -3.24152961287276 C:G G C 10 0.543619388992515 0.144700534072097 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 22069456 C/T 1 16 11 27 7.30208977611976 5.97981327891767 1.32227649720209 T:C C T 10 0.543619388992515 0.700999748325707 ENSG00000165487:ENST00000479790:exon_22069300_22070299:EFHA1;ENSG00000165487:ENST00000382374:exon_22069300_22069457:EFHA1;ENSG00000165487:ENST00000460488:exon_22069300_22069457:EFHA1;ENSG00000165487:ENST00000478700:exon_22069300_22069457:EFHA1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 23929842 T/C 1 5 3 8 2.28190305503742 1.63085816697755 0.65104488805988 T:C T C 10 0.543619388992515 0.734792052639277 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000455470:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000445163:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000399986:exon_23928658_23930146:SACS HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 25479541 A/C 1 10 5 15 4.56380611007485 2.71809694496258 1.84570916511227 A:C A C 10 0.543619388992515 0.440182309073759 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25479484_25481098:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25479484_25481098:CENPJ HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 25486911 G/T 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 T:G G T 10 0.543619388992515 0.482069340371676 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25486720_25487229:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25486720_25487229:CENPJ HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 28197436 C/T 1 66 69 135 30.121120326494 37.5097378404835 -7.38861751398953 T:C:G C T 10 0.543619388992515 0.226368782275304 ENSG00000186184:ENST00000302979:exon_28197012_28197589:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000399696:exon_28197012_28197583:POLR1D HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 28239940 G/C 1 63 72 135 28.7519784934716 39.1405960074611 -10.3886175139895 C:G G C 10 0.543619388992515 0.0836715037872635 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 28239970 G/A 1 94 96 190 42.8997774347036 52.1874613432814 -9.28768390857785 A:G G A 10 0.543619388992515 0.189936461550944 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 37580139 G/A 1 15 11 26 6.84570916511227 5.97981327891767 0.865895886194608 A:G G A 10 0.543619388992515 0.844786651072894 ENSG00000120699:ENST00000489088:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000389704:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000379809:exon_37580095_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000239893:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000474661:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000490537:exon_37580094_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000488779:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000464235:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000495092:exon_37580057_37580162:EXOSC8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 37583831 G/A 1 24 25 49 10.9531346641796 13.5904847248129 -2.63735006063324 A:G G A 10 0.543619388992515 0.475638131746067 ENSG00000102710:ENST00000490716:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000484078:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000360252:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000483214:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000475892:exon_37583630_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000350612:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000472948:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000356185:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000469488:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000473871:exon_37583634_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000464744:exon_37583754_37583946:FAM48A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 41323397 C/T 1 21 26 47 9.58399283115718 14.1341041138054 -4.55011128264821 T:C C T 10 0.543619388992515 0.190492777774682 ENSG00000102738:ENST00000498078:exon_41323274_41323749:MRPS31;ENSG00000102738:ENST00000323563:exon_41323274_41323417:MRPS31;ENSG00000102738:ENST00000461675:exon_41323274_41323417:MRPS31 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 43462422 A/T 1 20 34 54 9.1276122201497 18.4830592257455 -9.35544700559581 A:T A T 10 0.543619388992515 0.0133037438341538 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43460524_43462638:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43462118_43462638:EPSTI1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 47354101 C/T 1 69 80 149 31.4902621595165 43.4895511194012 -11.9992889598847 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0581933356300304 ENSG00000139684:ENST00000378720:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000378697:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000412582:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000471867:exon_47354070_47354166:ESD;ENSG00000139684:ENST00000495654:exon_47354089_47354168:ESD HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 50205025 T/C 1 3 8 11 1.36914183302245 4.34895511194012 -2.97981327891767 T:C T C 10 0.543619388992515 0.126408424019807 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 76427253 T/G 1 6 13 19 2.73828366604491 7.0670520569027 -4.32876839085779 T:G T G 10 0.543619388992515 0.0633842011056323 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76427228_76427524:LMO7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 99105395 G/A 1 37 20 57 16.8860826072769 10.8723877798503 6.01369482742664 A:G G A 10 0.543619388992515 0.112855113263879 ENSG00000102572:ENST00000397517:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376554:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376547:exon_99104413_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376541:exon_99104414_99105463:STK24 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 99947261 C/T 1 121 167 288 55.2220539319057 90.78443796175 -35.5623840298443 T:C:G C T 10 0.543619388992515 3.18454695543954e-05 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 103418728 A/G 1 12 14 26 5.47656733208982 7.61067144589521 -2.13410411380539 A:G A G 10 0.543619388992515 0.435428586867944 ENSG00000151287:ENST00000376027:exon_103418340_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376019:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376022:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376021:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376032:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376029:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376031:exon_103418467_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000455589:exon_103418467_103418930:C13orf27 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 103419820 T/C 1 10 8 18 4.56380611007485 4.34895511194012 0.214850998134729 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000151287:ENST00000376019:exon_103419623_103419828:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376021:exon_103419623_103419828:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376032:exon_103419623_103419828:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376031:exon_103419623_103419828:C13orf27 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 111176519 G/T 1 5 6 11 2.28190305503742 3.26171633395509 -0.979813278917665 T:G G T 10 0.543619388992515 0.56306921306608 ENSG00000139832:ENST00000267328:exon_111175417_111176544:RAB20 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 111340342 G/A 1 6 11 17 2.73828366604491 5.97981327891767 -3.24152961287276 A:G G A 10 0.543619388992515 0.144700534072097 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111340294_111340365:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000465145:exon_111340294_111340365:CARS2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 111532288 G/A 1 22 13 35 10.0403734421647 7.0670520569027 2.97332138526197 A:G G A 10 0.543619388992515 0.396643109507769 ENSG00000088448:ENST00000267339:exon_111530887_111532459:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000485844:exon_111532115_111532459:ANKRD10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 111563052 C/T 1 5 7 12 2.28190305503742 3.80533572294761 -1.52343266791018 T:C C T 10 0.543619388992515 0.400734857745032 ENSG00000088448:ENST00000267339:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000310847:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000465753:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000489973:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000494859:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000375758:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000460846:exon_111562965_111563117:ANKRD10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 111955465 T/C 1 11 13 24 5.02018672108233 7.0670520569027 -2.04686533582036 T:C T C 10 0.543619388992515 0.419733845613331 ENSG00000102606:ENST00000370623:exon_111955338_111958078:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000218789:exon_111955338_111958078:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375736:exon_111955338_111958078:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426073:exon_111955338_111958084:ARHGEF7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 113897320 C/T 1 7 6 13 3.19466427705239 3.26171633395509 -0.0670520569026953 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113897282_113897474:CUL4A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 113909339 A/G 1 6 10 16 2.73828366604491 5.43619388992515 -2.69791022388024 A:G A G 10 0.543619388992515 0.212743822682223 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000472083:exon_113909267_113909439:CUL4A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 114748709 G/A 1 9 5 14 4.10742549906736 2.71809694496258 1.38932855410479 A:G G A 10 0.543619388992515 0.59447928862092 ENSG00000185989:ENST00000334062:exon_114747194_114748833:RASA3;ENSG00000185989:ENST00000389544:exon_114747201_114748833:RASA3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 115004914 C/T 1 6 5 11 2.73828366604491 2.71809694496258 0.0201867210823345 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115004785_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115004825_115004965:CDC16 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 115004935 T/C 1 5 7 12 2.28190305503742 3.80533572294761 -1.52343266791018 T:C T C 10 0.543619388992515 0.400734857745032 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115004785_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115004825_115004965:CDC16 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 13 115030714 T/C 1 49 57 106 22.3626499393668 30.9863051725734 -8.62365523320659 T:C T C 10 0.543619388992515 0.097831763076485 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000461716:exon_115030368_115030715:CDC16 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 20825965 A/C 1 37 41 78 16.8860826072769 22.2883949486931 -5.40231234141617 A:C A C 10 0.543619388992515 0.255605846637965 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20825555_20826062:PARP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 20925154 T/G 1 155 146 301 70.7389947061602 79.3684307929072 -8.62943608674702 T:G T G 10 0.543619388992515 0.325681775223064 ENSG00000100823:ENST00000442613:exon_20925150_20925925:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000216714:exon_20925150_20925933:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000398030:exon_20925150_20925895:APEX1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 21928338 C/T 1 8 4 12 3.65104488805988 2.17447755597006 1.47656733208982 T:C C T 10 0.543619388992515 0.564519601476267 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 21967438 G/A 1 23 5 28 10.4967540531722 2.71809694496258 7.77865710820958 A:G G A 10 0.543619388992515 0.00362656138093526 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 21967916 A/G 1 30 25 55 13.6914183302245 13.5904847248129 0.100933605411672 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000165819:ENST00000298717:exon_21967908_21967946:METTL3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 23020638 T/C 1 129 103 232 58.8730988199656 55.9927970662291 2.8803017537365 T:C T C 10 0.543619388992515 0.74189487170955 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 23020921 G/C 1 160 90 250 73.0208977611976 48.9257450093264 24.0951527518712 C:G G C 10 0.543619388992515 0.00226128791893182 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 23021039 G/A 1 121 104 225 55.2220539319057 56.5364164552216 -1.31436252331589 A:G G A 10 0.543619388992515 0.893582869720584 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 23044004 C/T 1 250 61 311 114.095152751871 33.1607827285434 80.9343700233278 T:C C T 10 0.543619388992515 1.02892442928456e-21 ENSG00000129562:ENST00000250498:exon_23043959_23044133:DAD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 23240328 T/A 1 267 243 510 121.853623138998 132.099511525181 -10.2458883861827 A:T T A 10 0.543619388992515 0.374107583174894 ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23240227_23240389:OXA1L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 23346025 G/A 1 44 45 89 20.0807468843293 24.4628725046632 -4.38212562033384 A:G G A 10 0.543619388992515 0.394823772245019 ENSG00000197324:ENST00000359591:exon_23345898_23346027:LRP10;ENSG00000197324:ENST00000470660:exon_23345926_23346027:LRP10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 23374435 G/A 1 7 6 13 3.19466427705239 3.26171633395509 -0.0670520569026953 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000307814:exon_23374303_23374455:RBM23 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 23374862 C/T 1 5 7 12 2.28190305503742 3.80533572294761 -1.52343266791018 T:C C T 10 0.543619388992515 0.400734857745032 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000307814:exon_23374815_23374868:RBM23 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 23549285 G/A 1 14 20 34 6.38932855410479 10.8723877798503 -4.48305922574551 A:G G A 10 0.543619388992515 0.167480215376848 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 23549380 G/A 1 12 7 19 5.47656733208982 3.80533572294761 1.67123160914221 A:G G A 10 0.543619388992515 0.496728290141003 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 23549383 G/T 1 7 14 21 3.19466427705239 7.61067144589521 -4.41600716884282 T:G G T 10 0.543619388992515 0.0773400567038772 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 23944505 G/A 1 10 13 23 4.56380611007485 7.0670520569027 -2.50324594682785 A:G G A 10 0.543619388992515 0.304323603467324 ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23944380_23944517:NGDN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 23944514 C/A 1 11 15 26 5.02018672108233 8.15429083488773 -3.13410411380539 A:C C A 10 0.543619388992515 0.241166155555170 ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23944380_23944517:NGDN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 24458162 G/C 1 5 7 12 2.28190305503742 3.80533572294761 -1.52343266791018 C:G G C 10 0.543619388992515 0.400734857745032 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 24458211 A/T 1 6 6 12 2.73828366604491 3.26171633395509 -0.52343266791018 A:T A T 10 0.543619388992515 0.779998482964206 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000382755:exon_24458163_24458284:DHRS4L2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 24617238 C/T 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 T:C C T 10 0.543619388992515 0.482069340371676 ENSG00000092098:ENST00000324103:exon_24617185_24617331:RNF31 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 24901433 C/T 1 11 10 21 5.02018672108233 5.43619388992515 -0.416007168842817 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24900669_24901816:KHNYN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 31355096 C/G 1 12 9 21 5.47656733208982 4.89257450093264 0.583992831157184 C:G C G 10 0.543619388992515 0.830589105985654 ENSG00000100473:ENST00000216361:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000382493:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000460581:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000396618:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000468826:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000475087:exon_31355002_31355518:COCH HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 34985645 G/A 1 25 16 41 11.4095152751871 8.69791022388024 2.71160505130688 A:G G A 10 0.543619388992515 0.435829083735949 ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34985136_34985792:EAPP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 35222732 C/T 1 8 17 25 3.65104488805988 9.24152961287276 -5.59048472481288 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0275713659052772 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35221938_35222910:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35221943_35222910:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35221943_35222910:BAZ1A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 35546373 T/C 1 9 6 15 4.10742549906736 3.26171633395509 0.845709165112274 T:C T C 10 0.543619388992515 0.797605664193983 ENSG00000151327:ENST00000396472:exon_35546356_35546422:FAM177A1;ENSG00000151327:ENST00000382406:exon_35546356_35546422:FAM177A1;ENSG00000151327:ENST00000280987:exon_35546356_35546422:FAM177A1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 35591174 T/C 1 4 11 15 1.82552244402994 5.97981327891767 -4.15429083488773 T:C T C 10 0.543619388992515 0.037970342706995 ENSG00000092020:ENST00000261475:exon_35591108_35591519:PPP2R3C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 35761675 C/G 1 66 60 126 30.121120326494 32.6171633395509 -2.4960430130569 C:G C G 10 0.543619388992515 0.656040600084252 ENSG00000100902:ENST00000261479:exon_35761563_35761758:PSMA6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 35871217 G/A 1 425 507 932 193.961759678181 275.615030219205 -81.6532705410241 A:G G A 10 0.543619388992515 9.32008868602083e-08 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35870717_35871266:NFKBIA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 35873770 G/A 1 109 109 218 49.7454865998159 59.2545134001841 -9.50902680036828 A:G G A 10 0.543619388992515 0.197237080919600 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35873624_35873952:NFKBIA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 45590698 A/G 1 52 60 112 23.7317917723892 32.6171633395509 -8.88537156716169 A:G A G 10 0.543619388992515 0.10649936471723 ENSG00000100442:ENST00000216330:exon_45590688_45590823:FKBP3;ENSG00000100442:ENST00000396062:exon_45590688_45590823:FKBP3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 45696037 T/G 1 11 6 17 5.02018672108233 3.26171633395509 1.75847038712724 T:G T G 10 0.543619388992515 0.470285892368413 ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45695946_45696039:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000454990:exon_45696029_45696039:C14orf106 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 51192659 G/A 1 25 20 45 11.4095152751871 10.8723877798503 0.537127495336822 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51192551_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51192558_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51192558_51192784:NIN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 51204996 C/T 1 36 28 64 16.4297019962695 15.2213428917904 1.20835910447904 T:C C T 10 0.543619388992515 0.802757918721385 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51204858_51205004:NIN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 51223789 C/T 1 2 6 8 0.91276122201497 3.26171633395509 -2.34895511194012 T:C C T 10 0.543619388992515 0.153435168169122 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 51224374 T/G 1 8 3 11 3.65104488805988 1.63085816697755 2.02018672108233 T:G T G 10 0.543619388992515 0.364880107001187 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 51224658 T/A 1 9 1 10 4.10742549906736 0.543619388992515 3.56380611007485 A:T T A 10 0.543619388992515 0.0262377685020201 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 51225132 G/T 1 5 3 8 2.28190305503742 1.63085816697755 0.65104488805988 T:G G T 10 0.543619388992515 0.734792052639277 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 51227051 G/A 1 19 18 37 8.67123160914221 9.78514900186527 -1.11391739272306 A:C:G G A 10 0.543619388992515 0.743430390513204 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51226575_51227077:NIN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 51716188 T/G 1 9 6 15 4.10742549906736 3.26171633395509 0.845709165112274 T:G T G 10 0.543619388992515 0.797605664193983 ENSG00000139921:ENST00000457354:exon_51716186_51716287:TMX1;ENSG00000139921:ENST00000267434:exon_51716186_51716287:TMX1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 51716467 G/A 1 10 10 20 4.56380611007485 5.43619388992515 -0.872387779850301 A:G G A 10 0.543619388992515 0.823235579367717 ENSG00000139921:ENST00000457354:exon_51716411_51716483:TMX1;ENSG00000139921:ENST00000267434:exon_51716411_51716483:TMX1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 55529860 A/G 1 35 21 56 15.973321385262 11.4160071688428 4.55731421641916 A:C:G A G 10 0.543619388992515 0.230616605253677 ENSG00000168175:ENST00000395468:exon_55529336_55530043:MAPK1IP1L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 55604935 C/A 1 23 22 45 10.4967540531722 11.9596265578353 -1.46287250466318 A:C C A 10 0.543619388992515 0.657467285964154 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55604763_55605086:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55603699_55605086:LGALS3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 55605036 A/C 1 25 23 48 11.4095152751871 12.5032459468278 -1.09373067164072 A:C A C 10 0.543619388992515 0.773545262517051 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55604763_55605086:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55603699_55605086:LGALS3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 55611839 A/T 1 273 240 513 124.591906805043 130.468653358204 -5.87674655316023 A:T A T 10 0.543619388992515 0.625939958082072 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55611834_55612147:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55611834_55612126:LGALS3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 55619311 A/G 1 26 20 46 11.8658958861946 10.8723877798503 0.993508106344308 A:G A G 10 0.543619388992515 0.882557726659754 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55619308_55619365:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55619308_55619365:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55619308_55619365:DLGAP5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 55643908 A/G 1 7 9 16 3.19466427705239 4.89257450093264 -1.69791022388024 A:G A G 10 0.543619388992515 0.456567971750714 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55643780_55644054:DLGAP5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 55655692 C/T 1 10 12 22 4.56380611007485 6.52343266791018 -1.95962655783533 T:C C T 10 0.543619388992515 0.521823185288352 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55655660_55655898:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55655660_55655898:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55655660_55655898:DLGAP5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 55818706 T/C 1 7 1 8 3.19466427705239 0.543619388992515 2.65104488805988 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0786679847867632 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 56096731 A/G 1 30 31 61 13.6914183302245 16.852201058768 -3.16078272854342 A:G A G 10 0.543619388992515 0.442241271415172 ENSG00000126777:ENST00000438792:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395314:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000459737:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395308:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395311:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000413890:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000416613:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000356229:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000334975:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395309:exon_56096675_56096815:KTN1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 56146357 G/A 1 19 22 41 8.67123160914221 11.9596265578353 -3.28839494869312 A:G G A 10 0.543619388992515 0.347770423839317 ENSG00000126777:ENST00000438792:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395314:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000459737:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395308:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395311:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000413890:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000416613:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000356229:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000334975:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395309:exon_56146283_56146403:KTN1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 58820568 T/C 1 22 19 41 10.0403734421647 10.3287683908578 -0.288394948693117 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58820376_58820573:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58820376_58820573:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58820376_58820573:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58820376_58820573:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58820376_58820573:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000469635:exon_58820172_58820573:ARID4A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 59797235 A/G 1 10 4 14 4.56380611007485 2.17447755597006 2.38932855410479 A:G A G 10 0.543619388992515 0.284272971162492 ENSG00000100592:ENST00000351081:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000360909:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000358498:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000395125:exon_59797219_59797406:DAAM1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 59797373 G/A 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000100592:ENST00000351081:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000360909:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000358498:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000395125:exon_59797219_59797406:DAAM1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 61924239 G/A 1 7 1 8 3.19466427705239 0.543619388992515 2.65104488805988 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0786679847867632 ENSG00000027075:ENST00000332981:exon_61924224_61924397:PRKCH HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 61924241 A/C 1 7 1 8 3.19466427705239 0.543619388992515 2.65104488805988 A:C A C 10 0.543619388992515 0.0786679847867632 ENSG00000027075:ENST00000332981:exon_61924224_61924397:PRKCH HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 61997226 C/T 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 T:C C T 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000027075:ENST00000332981:exon_61997125_61997313:PRKCH HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 64686125 G/T 1 20 27 47 9.1276122201497 14.6777235027979 -5.55011128264821 T:G G T 10 0.543619388992515 0.109220018803548 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000458046:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000441438:exon_64685926_64686128:SYNE2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 69521345 G/A 1 20 29 49 9.1276122201497 15.7649622807829 -6.63735006063324 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0626378718246914 ENSG00000139990:ENST00000341516:exon_69517638_69522328:DCAF5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 70839735 A/C 1 7 9 16 3.19466427705239 4.89257450093264 -1.69791022388024 A:C A C 10 0.543619388992515 0.456567971750714 ENSG00000213463:ENST00000256366:exon_70833217_70839848:SYNJ2BP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 73958558 C/T 1 12 9 21 5.47656733208982 4.89257450093264 0.583992831157184 T:C C T 10 0.543619388992515 0.830589105985654 ENSG00000255242:ENST00000531973:exon_73957669_73960096:C14orf169 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 73958812 T/C 1 22 19 41 10.0403734421647 10.3287683908578 -0.288394948693117 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000255242:ENST00000531973:exon_73957669_73960096:C14orf169 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 74388908 T/C 1 11 17 28 5.02018672108233 9.24152961287276 -4.22134289179042 T:C T C 10 0.543619388992515 0.129577832731407 ENSG00000119725:ENST00000334521:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000458102:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000442160:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000398139:exon_74388769_74388909:ZNF410 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 74428000 A/T 1 8 3 11 3.65104488805988 1.63085816697755 2.02018672108233 A:T A T 10 0.543619388992515 0.364880107001187 ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74427876_74428078:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74427876_74428078:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74427876_74428078:COQ6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 74428445 G/A 1 16 27 43 7.30208977611976 14.6777235027979 -7.37563372667815 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0310427279004459 ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74428440_74428606:COQ6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 75279395 T/A 1 10 17 27 4.56380611007485 9.24152961287276 -4.67772350279791 A:T T A 10 0.543619388992515 0.0825276323953588 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75279331_75279485:YLPM1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 75367807 C/T 1 7 2 9 3.19466427705239 1.08723877798503 2.10742549906736 T:C C T 10 0.543619388992515 0.194613573468504 ENSG00000119689:ENST00000334220:exon_75367769_75367936:DLST;ENSG00000119689:ENST00000238671:exon_75367769_75367936:DLST;ENSG00000119689:ENST00000334212:exon_75367769_75367936:DLST HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 75483812 T/C 1 12 13 25 5.47656733208982 7.0670520569027 -1.59048472481288 T:C T C 10 0.543619388992515 0.552178694254392 ENSG00000119684:ENST00000238662:exon_75480467_75483904:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000355774:exon_75480467_75483904:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000380968:exon_75480467_75483904:MLH3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 76012864 A/G 1 174 170 344 79.4102263153024 92.4152961287276 -13.0050698134252 A:G A G 10 0.543619388992515 0.159831135493143 ENSG00000156127:ENST00000286639:exon_76012805_76013327:BATF HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 76012939 C/G 1 192 176 368 87.6250773134371 95.6770124626827 -8.05193514924554 C:G C G 10 0.543619388992515 0.40292315274209 ENSG00000156127:ENST00000286639:exon_76012805_76013327:BATF HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 76330181 G/A 1 1 7 8 0.456380611007485 3.80533572294761 -3.34895511194012 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0274430116751054 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000286653:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76330010_76330205:TTLL5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 78197365 C/T 1 26 25 51 11.8658958861946 13.5904847248129 -1.72458883861827 T:C C T 10 0.543619388992515 0.674318506347327 ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78197331_78197472:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78197331_78197472:SNW1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 88477413 C/T 1 11 4 15 5.02018672108233 2.17447755597006 2.84570916511227 T:C C T 10 0.543619388992515 0.195223530265793 ENSG00000140030:ENST00000267549:exon_88476733_88478422:GPR65 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 90429749 A/G 1 10 5 15 4.56380611007485 2.71809694496258 1.84570916511227 A:G A G 10 0.543619388992515 0.440182309073759 ENSG00000042088:ENST00000335725:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393454:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393452:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000357382:exon_90429452_90430017:TDP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 90744672 G/A 1 9 6 15 4.10742549906736 3.26171633395509 0.845709165112274 A:G G A 10 0.543619388992515 0.797605664193983 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90744398_90744805:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90744402_90744805:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90744402_90744805:C14orf102 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 91636395 C/T 1 8 4 12 3.65104488805988 2.17447755597006 1.47656733208982 T:C C T 10 0.543619388992515 0.564519601476267 ENSG00000133943:ENST00000521334:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518871:exon_91636347_91636416:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000457117:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000336843:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000520328:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522170:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000519950:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000521077:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517518:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523894:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000521064:exon_91636347_91636466:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91636385_91636545:C14orf159 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 91681888 G/A 1 38 22 60 17.3424632182844 11.9596265578353 5.3828366604491 A:G G A 10 0.543619388992515 0.194841975428674 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000457117:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000336843:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000520328:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000521077:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91681749_91682137:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522816:exon_91681749_91681900:C14orf159 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 91739108 C/G 1 13 21 34 5.9329479430973 11.4160071688428 -5.48305922574551 C:G C G 10 0.543619388992515 0.0836049102607166 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000427583:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000334448:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000331194:exon_91738969_91739562:CCDC88C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 92441066 C/T 1 3 7 10 1.36914183302245 3.80533572294761 -2.43619388992515 T:C C T 10 0.543619388992515 0.202250323161148 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92440971_92441087:TRIP11 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 92548785 C/T 1 6 3 9 2.73828366604491 1.63085816697755 1.10742549906736 T:C C T 10 0.543619388992515 0.522625694750698 ENSG00000066427:ENST00000429774:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359819:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393289:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359366:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393287:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000502250:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000503767:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000340660:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000532032:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000447800:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000515746:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000506466:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000526872:exon_92548687_92548808:ATXN3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 92588002 T/G 1 227 192 419 103.598398698699 104.374922686563 -0.776523987863797 T:G T G 10 0.543619388992515 0.96090089646593 ENSG00000183648:ENST00000329559:exon_92587986_92588153:NDUFB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 93118038 A/G 1 8 3 11 3.65104488805988 1.63085816697755 2.02018672108233 A:G A G 10 0.543619388992515 0.364880107001187 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 93118668 C/T 1 20 18 38 9.1276122201497 9.78514900186527 -0.657536781715573 T:C C T 10 0.543619388992515 0.871511607485792 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 93170993 C/T 1 104 119 223 47.4635835447784 64.6907072901093 -17.2271237453309 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0221804129812689 ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93170985_93171052:LGMN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 93199080 C/T 1 16 16 32 7.30208977611976 8.69791022388024 -1.39582044776048 T:C C T 10 0.543619388992515 0.723336688146235 ENSG00000100600:ENST00000334864:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93198994_93199160:LGMN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 94417421 G/A 1 8 2 10 3.65104488805988 1.08723877798503 2.56380611007485 A:G G A 10 0.543619388992515 0.122752294666106 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94417345_94417590:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94417345_94417590:ASB2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 94417586 G/A 1 10 3 13 4.56380611007485 1.63085816697755 2.9329479430973 A:G G A 10 0.543619388992515 0.161878475803027 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94417345_94417590:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94417345_94417590:ASB2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 95921741 C/T 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 T:C C T 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95921714_95922061:C14orf49 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 96968898 G/C 1 19 18 37 8.67123160914221 9.78514900186527 -1.11391739272306 C:G G C 10 0.543619388992515 0.743430390513204 ENSG00000090060:ENST00000216277:exon_96968718_96968937:PAPOLA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 100808845 G/A 1 108 65 173 49.2891059888084 35.3352602845135 13.9538457042949 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0390264338653097 ENSG00000140105:ENST00000392882:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000355338:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000358655:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000344102:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000392880:exon_100808735_100808908:WARS HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 100996312 T/C 1 13 9 22 5.9329479430973 4.89257450093264 1.04037344216467 T:C T C 10 0.543619388992515 0.831159081063284 ENSG00000176473:ENST00000402312:exon_100996157_100996625:WDR25;ENSG00000176473:ENST00000335290:exon_100996157_100996640:WDR25 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 102551072 G/A 1 824 709 1533 376.057623470168 385.426146795693 -9.36852332552559 A:T:G G A 10 0.543619388992515 0.64446576588131 ENSG00000080824:ENST00000334701:exon_102551018_102551335:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000216281:exon_102551018_102551335:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000441629:exon_102551018_102551329:HSP90AA1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 102808330 C/T 1 7 10 17 3.19466427705239 5.43619388992515 -2.24152961287276 T:C C T 10 0.543619388992515 0.333264703150297 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102807660_102809044:ZNF839 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 103342049 T/C 1 25 25 50 11.4095152751871 13.5904847248129 -2.18096944962575 T:C T C 10 0.543619388992515 0.571770159237513 ENSG00000131323:ENST00000392745:exon_103341961_103342065:TRAF3;ENSG00000131323:ENST00000347662:exon_103341961_103342065:TRAF3;ENSG00000131323:ENST00000351691:exon_103341961_103342065:TRAF3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 104199356 C/T 1 18 10 28 8.21485099813473 5.43619388992515 2.77865710820958 T:C C T 10 0.543619388992515 0.345225120327408 ENSG00000100711:ENST00000311141:exon_104199320_104199995:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000216602:exon_104199320_104200004:ZFYVE21 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 105180706 A/C,G 0 0 16 16 0 8.69791022388024 -8.69791022388024 C:G A C 10 0.543619388992515 3.5418891689264e-06 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 105477507 G/A 1 29 29 58 13.2350377192171 15.7649622807829 -2.52992456156587 A:G G A 10 0.543619388992515 0.512925431767332 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 105477613 T/C 1 32 34 66 14.6041795522395 18.4830592257455 -3.87887967350599 T:C T C 10 0.543619388992515 0.387327422785017 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105477541_105477953:CDCA4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 14 106174261 C/G 1 6 22 28 2.73828366604491 11.9596265578353 -9.22134289179042 C:G C G 10 0.543619388992515 0.000479396820455764 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 23021238 C/T 1 8 7 15 3.65104488805988 3.80533572294761 -0.154290834887726 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000140157:ENST00000337451:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000359727:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398014:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398013:exon_23021198_23021429:NIPA2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 34159986 T/C 1 6 6 12 2.73828366604491 3.26171633395509 -0.52343266791018 T:C T C 10 0.543619388992515 0.779998482964206 ENSG00000169857:ENST00000306730:exon_34159696_34160056:AVEN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 40488851 G/A 1 10 5 15 4.56380611007485 2.71809694496258 1.84570916511227 A:G G A 10 0.543619388992515 0.440182309073759 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40488746_40488975:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40488746_40488975:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40488746_40488975:BUB1B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 40758337 A/C 1 5 4 9 2.28190305503742 2.17447755597006 0.107425499067364 A:C A C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000140320:ENST00000416165:exon_40758140_40760441:BAHD1;ENSG00000140320:ENST00000339351:exon_40758140_40760426:BAHD1;ENSG00000140320:ENST00000442618:exon_40758140_40760426:BAHD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 40764549 G/A 1 2 7 9 0.91276122201497 3.80533572294761 -2.89257450093264 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0894121930945724 ENSG00000169105:ENST00000306243:exon_40763213_40765351:CHST14 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 41046883 C/A 1 9 3 12 4.10742549906736 1.63085816697755 2.47656733208982 A:C C A 10 0.543619388992515 0.24567828862345 ENSG00000137824:ENST00000260385:exon_41046795_41048049:FAM82A2;ENSG00000137824:ENST00000338376:exon_41046795_41046988:FAM82A2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 41819716 C/T 1 7 5 12 3.19466427705239 2.71809694496258 0.476567332089819 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41819621_41819803:RPAP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 42211486 A/G 1 12 12 24 5.47656733208982 6.52343266791018 -1.04686533582036 A:G A G 10 0.543619388992515 0.686969093177818 ENSG00000103966:ENST00000220325:exon_42211408_42211820:EHD4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 44038899 C/T 1 31 51 82 14.147798941232 27.7245888386183 -13.5767898973862 T:C C T 10 0.543619388992515 0.00367663175631133 ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44038590_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000469684:exon_44038608_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000446523:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000455250:exon_44038810_44038904:PDIA3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 44053617 C/T 1 9 1 10 4.10742549906736 0.543619388992515 3.56380611007485 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0262377685020201 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 44061802 C/T 1 38 32 70 17.3424632182844 17.3958204477605 -0.0533572294760525 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44061716_44061844:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44061716_44061844:PDIA3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 45361180 A/T 1 11 1 12 5.02018672108233 0.543619388992515 4.47656733208982 A:T A T 10 0.543619388992515 0.0086252229198367 ENSG00000140263:ENST00000267814:exon_45361075_45361250:SORD HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 45654327 A/G 1 19 20 39 8.67123160914221 10.8723877798503 -2.20115617070809 A:G A G 10 0.543619388992515 0.522217703040714 ENSG00000171766:ENST00000396659:exon_45653322_45654419:GATM;ENSG00000171766:ENST00000305575:exon_45653322_45654419:GATM;ENSG00000171766:ENST00000432007:exon_45653324_45654419:GATM HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 45981317 G/A 1 18 11 29 8.21485099813473 5.97981327891767 2.23503771921706 A:G G A 10 0.543619388992515 0.459288647607193 ENSG00000137767:ENST00000260324:exon_45981237_45981415:SQRDL HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 55651926 T/C 1 7 4 11 3.19466427705239 2.17447755597006 1.02018672108233 T:C T C 10 0.543619388992515 0.763926340985151 ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55651737_55653142:CCPG1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 59510189 G/A 1 20 14 34 9.1276122201497 7.61067144589521 1.51694077425449 A:G G A 10 0.543619388992515 0.731190001700683 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59510090_59510286:MYO1E HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 63414083 A/C 1 8 13 21 3.65104488805988 7.0670520569027 -3.41600716884282 A:C A C 10 0.543619388992515 0.187638969949902 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63413999_63414427:LACTB;ENSG00000103642:ENST00000413507:exon_63414032_63414427:LACTB HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 63433766 G/A 1 72 55 127 32.8594039925389 29.8990663945883 2.96033759795059 A:G G A 10 0.543619388992515 0.656245926354368 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 64418397 G/A 1 13 9 22 5.9329479430973 4.89257450093264 1.04037344216467 A:T:G G A 10 0.543619388992515 0.831159081063284 ENSG00000028528:ENST00000353874:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000261889:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000380285:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000440389:exon_64418278_64418419:SNX1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 64737225 G/A 1 11 10 21 5.02018672108233 5.43619388992515 -0.416007168842817 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000103671:ENST00000261884:exon_64737205_64737307:TRIP4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 64962630 A/C 1 7 13 20 3.19466427705239 7.0670520569027 -3.8723877798503 A:C A C 10 0.543619388992515 0.114361686412738 ENSG00000180357:ENST00000326648:exon_64962545_64962632:ZNF609 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 65108504 A/T 1 34 17 51 15.5169407742545 9.24152961287276 6.27541116138173 A:T A T 10 0.543619388992515 0.091308858383239 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65107831_65108556:PIF1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 65447288 A/G 1 13 9 22 5.9329479430973 4.89257450093264 1.04037344216467 A:G A G 10 0.543619388992515 0.831159081063284 ENSG00000166855:ENST00000300107:exon_65447120_65447419:CLPX HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 70345626 C/T 1 10 7 17 4.56380611007485 3.80533572294761 0.758470387127244 T:C C T 10 0.543619388992515 0.810304562557129 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70345566_70345713:TLE3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 70346923 C/T 1 1 7 8 0.456380611007485 3.80533572294761 -3.34895511194012 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0274430116751054 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70346777_70347024:TLE3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 70351788 T/C 1 7 6 13 3.19466427705239 3.26171633395509 -0.0670520569026953 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70351749_70351799:TLE3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 74328116 A/G 1 53 50 103 24.1881723833967 27.1809694496258 -2.99279706622905 A:G A G 10 0.543619388992515 0.554768940959451 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 74328206 G/C 1 59 54 113 26.9264560494416 29.3554470055958 -2.4289909561542 C:G G C 10 0.543619388992515 0.705810188230948 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 74703929 T/C 1 24 25 49 10.9531346641796 13.5904847248129 -2.63735006063324 T:C T C 10 0.543619388992515 0.475638131746067 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74703897_74704051:SEMA7A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 75648617 G/A 1 10 4 14 4.56380611007485 2.17447755597006 2.38932855410479 A:G G A 10 0.543619388992515 0.284272971162492 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 75650836 G/A 1 41 33 74 18.7116050513069 17.939439836753 0.772165214553887 A:G G A 10 0.543619388992515 0.907388990574247 ENSG00000140400:ENST00000267978:exon_75650803_75650959:MAN2C1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 75650972 G/A 1 16 2 18 7.30208977611976 1.08723877798503 6.21485099813473 A:G G A 10 0.543619388992515 0.00332486424914457 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 75909803 A/G 1 11 11 22 5.02018672108233 5.97981327891767 -0.959626557835332 A:G A G 10 0.543619388992515 0.676454879931535 ENSG00000169371:ENST00000308588:exon_75909749_75909893:SNUPN;ENSG00000169371:ENST00000371091:exon_75909749_75909893:SNUPN;ENSG00000169371:ENST00000432476:exon_75909749_75909893:SNUPN;ENSG00000169371:ENST00000394932:exon_75909749_75909893:SNUPN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 77322845 C/T 1 5 3 8 2.28190305503742 1.63085816697755 0.65104488805988 T:C C T 10 0.543619388992515 0.734792052639277 ENSG00000140368:ENST00000379595:exon_77322843_77322922:PSTPIP1;ENSG00000140368:ENST00000267939:exon_77322843_77322922:PSTPIP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 77344793 T/A 1 24 44 68 10.9531346641796 23.9192531156707 -12.966118451491 A:T T A 10 0.543619388992515 0.00210904291747068 ENSG00000140391:ENST00000267970:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000346495:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000424443:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000423920:exon_77344727_77344810:TSPAN3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 79277511 A/G 1 6 3 9 2.73828366604491 1.63085816697755 1.10742549906736 A:G A G 10 0.543619388992515 0.522625694750698 ENSG00000058335:ENST00000419573:exon_79277349_79277546:RASGRF1;ENSG00000058335:ENST00000394741:exon_79277349_79277546:RASGRF1;ENSG00000058335:ENST00000261752:exon_79277349_79277546:RASGRF1;ENSG00000058335:ENST00000394745:exon_79277349_79277546:RASGRF1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 80260014 T/C 1 24 89 113 10.9531346641796 48.3821256203338 -37.4289909561542 T:C T C 10 0.543619388992515 7.89352597769917e-13 ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80259979_80260034:BCL2A1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 80263217 C/T 1 241 235 476 109.987727252804 127.750556413241 -17.7628291604372 T:C:G C T 10 0.543619388992515 0.107297726441322 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 80263345 A/C 1 189 163 352 86.2559354804146 88.60996040578 -2.35402492536531 A:C A C 10 0.543619388992515 0.830580805860595 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 80263406 C/T 1 132 116 248 60.242240652988 63.0598491231317 -2.81760847014373 T:C:G C T 10 0.543619388992515 0.75005168168939 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 80472561 C/T 1 24 20 44 10.9531346641796 10.8723877798503 0.0807468843293382 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000103876:ENST00000407106:exon_80472466_80472567:FAH;ENSG00000103876:ENST00000261755:exon_80472466_80472567:FAH HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 85189464 T/G 1 7 4 11 3.19466427705239 2.17447755597006 1.02018672108233 T:G T G 10 0.543619388992515 0.763926340985151 ENSG00000177082:ENST00000434634:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000398528:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000323189:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000419751:exon_85189293_85189579:WDR73 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 89198560 A/G 1 2 8 10 0.91276122201497 4.34895511194012 -3.43619388992515 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0512654070160484 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 89859994 C/A 1 69 68 137 31.4902621595165 36.966118451491 -5.47585629197456 A:C C A 10 0.543619388992515 0.347227909140180 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89859628_89860492:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89859628_89860362:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89859628_89860362:FANCI;ENSG00000140521:ENST00000268124:exon_89859534_89860058:POLG;ENSG00000140521:ENST00000442287:exon_89859551_89860058:POLG;ENSG00000140521:ENST00000530292:exon_89859570_89860058:POLG;ENSG00000140521:ENST00000526671:exon_89859748_89860058:POLG HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 90168693 T/A 1 3 6 9 1.36914183302245 3.26171633395509 -1.89257450093264 A:T T A 10 0.543619388992515 0.316548245109532 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90166854_90169017:C15orf42 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 90623052 T/C 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 T:C T C 10 0.543619388992515 0.482069340371676 ENSG00000140548:ENST00000268154:exon_90622892_90625432:ZNF710 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 93536197 C/T 1 20 8 28 9.1276122201497 4.34895511194012 4.77865710820958 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0870451221452966 ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93536089_93536228:CHD2;ENSG00000173575:ENST00000309818:exon_93536089_93536228:CHD2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 93567864 A/C 1 9 9 18 4.10742549906736 4.89257450093264 -0.785149001865271 A:C A C 10 0.543619388992515 0.81438018796475 ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93567602_93571237:CHD2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 100269680 G/C 1 7 4 11 3.19466427705239 2.17447755597006 1.02018672108233 C:G G C 10 0.543619388992515 0.763926340985151 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 101606889 G/A 1 17 4 21 7.75847038712724 2.17447755597006 5.58399283115718 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0152914892474144 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101606845_101606946:LRRK1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 101606890 C/A 1 16 4 20 7.30208977611976 2.17447755597006 5.1276122201497 A:C C A 10 0.543619388992515 0.0239771016952935 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101606845_101606946:LRRK1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 15 101717680 G/T 1 6 2 8 2.73828366604491 1.08723877798503 1.65104488805988 T:G G T 10 0.543619388992515 0.303950947229235 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 419092 A/G 1 138 122 260 62.9805243190329 66.3215654570868 -3.34104113805391 A:G A G 10 0.543619388992515 0.70885919304561 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 426432 T/C 1 9 9 18 4.10742549906736 4.89257450093264 -0.785149001865271 T:C T C 10 0.543619388992515 0.81438018796475 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000475348:exon_426136_426475:TMEM8A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 427479 T/C 1 7 4 11 3.19466427705239 2.17447755597006 1.02018672108233 T:C T C 10 0.543619388992515 0.763926340985151 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 427516 T/C 1 7 2 9 3.19466427705239 1.08723877798503 2.10742549906736 T:C T C 10 0.543619388992515 0.194613573468504 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 450309 C/T 1 263 202 465 120.028100694969 109.811116576488 10.2169841184805 T:C:G C T 10 0.543619388992515 0.352053890386686 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_450219_450746:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_450219_450734:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_450219_450633:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_450219_450759:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_450219_450506:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_450109_450648:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_450219_450416:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_450219_450749:NME4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 603471 A/G 1 8 14 22 3.65104488805988 7.61067144589521 -3.95962655783533 A:G A G 10 0.543619388992515 0.132255633527639 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_603339_604636:SOLH;ENSG00000103326:ENST00000397687:exon_603339_604634:SOLH HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 715990 G/A 1 10 5 15 4.56380611007485 2.71809694496258 1.84570916511227 A:G G A 10 0.543619388992515 0.440182309073759 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_715950_716124:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_715950_716124:WDR90 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 717523 G/T 1 14 13 27 6.38932855410479 7.0670520569027 -0.677723502797906 T:G G T 10 0.543619388992515 0.848121425366976 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_717432_717829:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_717432_717829:WDR90 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 718514 C/G 1 10 11 21 4.56380611007485 5.97981327891767 -1.41600716884282 C:G C G 10 0.543619388992515 0.662427114891113 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_718488_718569:RHOT2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 720986 G/A 1 19 8 27 8.67123160914221 4.34895511194012 4.32227649720209 A:G G A 10 0.543619388992515 0.121574747598711 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_720892_721000:RHOT2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 722331 C/T 1 21 20 41 9.58399283115718 10.8723877798503 -1.28839494869312 T:C C T 10 0.543619388992515 0.754634353816566 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722254_722384:RHOT2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 722548 A/G 1 13 17 30 5.9329479430973 9.24152961287276 -3.30858166977545 A:G A G 10 0.543619388992515 0.272083540205038 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722489_722566:RHOT2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 723647 C/G 1 24 29 53 10.9531346641796 15.7649622807829 -4.8118276166033 C:G C G 10 0.543619388992515 0.214693743684452 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_723480_724174:RHOT2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 732494 C/T 1 224 189 413 102.229256865677 102.744064519585 -0.514807653908719 T:C C T 10 0.543619388992515 0.960649503456195 ENSG00000103266:ENST00000219548:exon_732364_732753:STUB1;ENSG00000161999:ENST00000412368:exon_731667_732874:JMJD8;ENSG00000161999:ENST00000454700:exon_731676_732874:JMJD8;ENSG00000161999:ENST00000293882:exon_731676_732874:JMJD8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 735895 G/A 1 5 8 13 2.28190305503742 4.34895511194012 -2.0670520569027 A:G G A 10 0.543619388992515 0.276871294907228 ENSG00000127580:ENST00000293883:exon_735869_735990:WDR24;ENSG00000127580:ENST00000248142:exon_735869_735990:WDR24 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 778024 T/C 1 25 10 35 11.4095152751871 5.43619388992515 5.97332138526197 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0603870197274476 ENSG00000103253:ENST00000341413:exon_777965_778029:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389701:exon_777965_778029:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389703:exon_777965_778029:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389702:exon_777965_778029:HAGHL HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 778820 G/A 1 16 15 31 7.30208977611976 8.15429083488773 -0.852201058767967 A:G G A 10 0.543619388992515 0.857393459133153 ENSG00000103253:ENST00000341413:exon_778794_779715:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389701:exon_778794_778868:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389703:exon_778794_778895:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389702:exon_778794_779168:HAGHL HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 780339 A/G 1 30 26 56 13.6914183302245 14.1341041138054 -0.442685783580842 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_779753_780655:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_779771_780655:NARFL HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 781633 G/A 1 3 6 9 1.36914183302245 3.26171633395509 -1.89257450093264 A:G G A 10 0.543619388992515 0.316548245109532 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_781565_781702:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_781565_781702:NARFL HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 784765 C/T 1 3 8 11 1.36914183302245 4.34895511194012 -2.97981327891767 T:C C T 10 0.543619388992515 0.126408424019807 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_784737_784871:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_784737_784871:NARFL HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 847743 C/T 1 42 24 66 19.1679856623144 13.0468653358204 6.12112032649401 T:C C T 10 0.543619388992515 0.139372472377115 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000498439:exon_847694_847751:CHTF18 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 1545448 A/G 1 11 5 16 5.02018672108233 2.71809694496258 2.30208977611976 A:G A G 10 0.543619388992515 0.318708928468121 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1545347_1545624:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1545347_1545624:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1545347_1545624:TELO2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 1555589 A/G 1 20 9 29 9.1276122201497 4.89257450093264 4.23503771921706 A:G A G 10 0.543619388992515 0.136595071190427 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1555411_1555602:TELO2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 1559838 T/C 1 24 17 41 10.9531346641796 9.24152961287276 1.71160505130688 T:C T C 10 0.543619388992515 0.640426017405578 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1559831_1560453:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1559831_1560458:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1559831_1560455:TELO2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 1741869 C/T 1 19 19 38 8.67123160914221 10.3287683908578 -1.65753678171557 T:C C T 10 0.543619388992515 0.627399138344122 ENSG00000206053:ENST00000248098:exon_1741844_1741986:HN1L;ENSG00000206053:ENST00000414325:exon_1741844_1741986:HN1L;ENSG00000206053:ENST00000382711:exon_1741844_1741986:HN1L;ENSG00000206053:ENST00000382710:exon_1741844_1741986:HN1L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 1818503 G/C 1 11 9 20 5.02018672108233 4.89257450093264 0.127612220149699 C:G G C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1818478_1818627:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1818478_1818627:MAPK8IP3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 1820992 T/A 1 77 65 142 35.1413070475763 35.3352602845135 -0.193953236937141 A:T T A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000103024:ENST00000219302:exon_1820882_1820994:NME3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 1836796 C/A 1 24 28 52 10.9531346641796 15.2213428917904 -4.26820822761078 A:C C A 10 0.543619388992515 0.266018078109965 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1836758_1836956:NUBP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 2014283 A/G 1 157 28 185 71.6517559281751 15.2213428917904 56.4304130363847 A:G A G 10 0.543619388992515 1.52122432684833e-18 ENSG00000140988:ENST00000526522:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533186:exon_2014277_2014357:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000532746:exon_2014277_2014368:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533872:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527109:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527871:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000530225:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531065:exon_2013654_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533161:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000343262:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000534461:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531182:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527302:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000526908:exon_2014277_2014539:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 2014424 C/G 1 6 9 15 2.73828366604491 4.89257450093264 -2.15429083488773 C:G C G 10 0.543619388992515 0.306171249676451 ENSG00000140988:ENST00000526908:exon_2014277_2014539:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 2049640 A/G 1 14 20 34 6.38932855410479 10.8723877798503 -4.48305922574551 A:G A G 10 0.543619388992515 0.167480215376848 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 2050192 G/T 1 13 22 35 5.9329479430973 11.9596265578353 -6.02667861473803 T:G G T 10 0.543619388992515 0.0430302363372445 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 2882197 G/T 1 2 11 13 0.91276122201497 5.97981327891767 -5.0670520569027 T:G G T 10 0.543619388992515 0.00905195199405004 ENSG00000162078:ENST00000382280:exon_2881797_2882285:ZG16B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 2946433 C/T 1 32 31 63 14.6041795522395 16.852201058768 -2.24802150652845 T:C C T 10 0.543619388992515 0.613789345087716 ENSG00000162076:ENST00000396958:exon_2946353_2946772:FLYWCH2;ENSG00000162076:ENST00000431751:exon_2946353_2946772:FLYWCH2;ENSG00000162076:ENST00000293981:exon_2946353_2946772:FLYWCH2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 2983483 C/G 1 7 6 13 3.19466427705239 3.26171633395509 -0.0670520569026953 C:G C G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000059122:ENST00000416288:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000253928:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000399667:exon_2983131_2983583:FLYWCH1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 2990062 A/T 1 11 9 20 5.02018672108233 4.89257450093264 0.127612220149699 A:T A T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000059122:ENST00000416288:exon_2990033_2990093:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000253928:exon_2990033_2990093:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000399667:exon_2990033_2990093:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000344592:exon_2990033_2990093:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000445831:exon_2990033_2990093:FLYWCH1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 3073240 G/T 1 47 56 103 21.4498887173518 30.4426857835808 -8.99279706622905 T:G G T 10 0.543619388992515 0.0921761253727438 ENSG00000103145:ENST00000354679:exon_3073234_3073362:HCFC1R1;ENSG00000103145:ENST00000396916:exon_3073234_3073362:HCFC1R1;ENSG00000103145:ENST00000248089:exon_3073234_3073362:HCFC1R1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 3533577 C/G 1 4 7 11 1.82552244402994 3.80533572294761 -1.97981327891767 C:G C G 10 0.543619388992515 0.245254265630413 ENSG00000122390:ENST00000424546:exon_3533363_3533598:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000407558:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000414063:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000360862:exon_3533363_3533598:NAT15 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 3724465 G/C 1 58 53 111 26.4700754384341 28.8118276166033 -2.34175217816917 C:G G C 10 0.543619388992515 0.70336385611978 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3724340_3724495:TRAP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 4496973 T/A 1 9 9 18 4.10742549906736 4.89257450093264 -0.785149001865271 A:T T A 10 0.543619388992515 0.81438018796475 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4496887_4497015:DNAJA3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 4849705 C/T 1 7 16 23 3.19466427705239 8.69791022388024 -5.50324594682785 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0339427215578599 ENSG00000067836:ENST00000322048:exon_4849687_4849782:ROGDI HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 4930100 C/T 1 6 5 11 2.73828366604491 2.71809694496258 0.0201867210823345 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000118900:ENST00000262376:exon_4930084_4932361:UBN1;ENSG00000118900:ENST00000396658:exon_4930084_4932361:UBN1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 5075542 G/A 1 8 4 12 3.65104488805988 2.17447755597006 1.47656733208982 A:G G A 10 0.543619388992515 0.564519601476267 ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5074845_5075686:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5074873_5075686:NAGPA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 5075633 G/A 1 7 2 9 3.19466427705239 1.08723877798503 2.10742549906736 A:G G A 10 0.543619388992515 0.194613573468504 ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5074845_5075686:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5074873_5075686:NAGPA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 5132636 C/T 1 5 4 9 2.28190305503742 2.17447755597006 0.107425499067364 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000033011:ENST00000262374:exon_5132560_5132674:ALG1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 8729124 G/A 1 7 5 12 3.19466427705239 2.71809694496258 0.476567332089819 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8729025_8729169:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8729025_8729169:C16orf68 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 10862964 A/G 1 67 50 117 30.5775009375015 27.1809694496258 3.39653148787574 A:G A G 10 0.543619388992515 0.577963003227722 ENSG00000103274:ENST00000283027:exon_10862904_10863208:NUBP1;ENSG00000103274:ENST00000433392:exon_10862904_10863208:NUBP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 11001743 G/A 1 3 10 13 1.36914183302245 5.43619388992515 -4.0670520569027 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0270623247750657 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 11773132 C/G 1 73 64 137 33.3157846035464 34.791640895521 -1.47585629197456 C:G C G 10 0.543619388992515 0.797739006246808 ENSG00000153066:ENST00000283033:exon_11772943_11773693:TXNDC11;ENSG00000153066:ENST00000356957:exon_11772943_11773693:TXNDC11 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 11781741 G/C 1 11 18 29 5.02018672108233 9.78514900186527 -4.76496228078294 C:G G C 10 0.543619388992515 0.0928937465203734 ENSG00000153066:ENST00000283033:exon_11781713_11781822:TXNDC11;ENSG00000153066:ENST00000356957:exon_11781713_11781822:TXNDC11 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 11940390 T/C 1 160 164 324 73.0208977611976 89.1535797947725 -16.1326820335749 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0744097591364504 ENSG00000171490:ENST00000396503:exon_11940358_11940459:RSL1D1;ENSG00000171490:ENST00000355674:exon_11940358_11940459:RSL1D1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 11969724 G/C 1 22 31 53 10.0403734421647 16.852201058768 -6.8118276166033 C:G G C 10 0.543619388992515 0.0724244847129884 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000420576:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_11969618_11969786:GSPT1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 11981487 G/A 1 12 12 24 5.47656733208982 6.52343266791018 -1.04686533582036 A:G G A 10 0.543619388992515 0.686969093177818 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_11981427_11981607:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_11981427_11981607:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000420576:exon_11981427_11981607:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_11981427_11981607:GSPT1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 12223637 A/G 1 5 4 9 2.28190305503742 2.17447755597006 0.107425499067364 A:G A G 10 0.543619388992515 1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 14742400 T/G 1 16 19 35 7.30208977611976 10.3287683908578 -3.02667861473803 T:G T G 10 0.543619388992515 0.314053048188416 ENSG00000103429:ENST00000261658:exon_14742245_14742449:BFAR HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 15129940 C/T 1 6 8 14 2.73828366604491 4.34895511194012 -1.61067144589521 T:C C T 10 0.543619388992515 0.430135065302382 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000447912:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15129873_15131543:PDXDC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 15166891 T/C 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 T:C T C 10 0.543619388992515 0.482069340371676 ENSG00000085721:ENST00000198767:exon_15166807_15166937:RRN3;ENSG00000085721:ENST00000429751:exon_15166807_15166937:RRN3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 15170452 C/A 1 6 3 9 2.73828366604491 1.63085816697755 1.10742549906736 A:C C A 10 0.543619388992515 0.522625694750698 ENSG00000085721:ENST00000198767:exon_15170415_15170507:RRN3;ENSG00000085721:ENST00000429751:exon_15170415_15170507:RRN3;ENSG00000085721:ENST00000327307:exon_15170355_15170507:RRN3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 15818141 A/C 1 13 10 23 5.9329479430973 5.43619388992515 0.496754053172154 A:C A C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1;ENSG00000133392:ENST00000300036:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000338282:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396320:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396324:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000452625:exon_15818018_15818266:MYH11 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 15818310 G/A 1 21 20 41 9.58399283115718 10.8723877798503 -1.28839494869312 A:G G A 10 0.543619388992515 0.754634353816566 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 19085298 C/T 1 5 8 13 2.28190305503742 4.34895511194012 -2.0670520569027 T:C C T 10 0.543619388992515 0.276871294907228 ENSG00000167186:ENST00000321998:exon_19085243_19085357:COQ7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 19680546 T/C 1 4 8 12 1.82552244402994 4.34895511194012 -2.52343266791018 T:C T C 10 0.543619388992515 0.158970386231855 ENSG00000103544:ENST00000438132:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000251143:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000417362:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000448695:exon_19680482_19680621:C16orf62 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 19725575 G/A 1 51 37 88 23.2754111613817 20.1139173927231 3.16149376865868 A:G G A 10 0.543619388992515 0.522409710575142 ENSG00000103550:ENST00000219837:exon_19725440_19726362:C16orf88;ENSG00000103550:ENST00000420899:exon_19725440_19726359:C16orf88 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 21272591 G/C 1 21 22 43 9.58399283115718 11.9596265578353 -2.37563372667815 C:G G C 10 0.543619388992515 0.540949403548108 ENSG00000103316:ENST00000219599:exon_21272575_21272659:CRYM;ENSG00000103316:ENST00000396023:exon_21272575_21272659:CRYM;ENSG00000103316:ENST00000415987:exon_21272575_21272659:CRYM HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 23489711 C/G 1 10 8 18 4.56380611007485 4.34895511194012 0.214850998134729 C:G C G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000103365:ENST00000309859:exon_23489689_23489822:GGA2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 23677006 A/G 1 12 21 33 5.47656733208982 11.4160071688428 -5.939439836753 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0529525465837689 ENSG00000166847:ENST00000300087:exon_23676947_23677049:DCTN5;ENSG00000166847:ENST00000446651:exon_23676996_23677049:DCTN5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 23701538 A/G 1 77 47 124 35.1413070475763 25.5501112826482 9.59119576492813 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0871969979045376 ENSG00000166851:ENST00000300093:exon_23701181_23701688:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000330792:exon_23701452_23701541:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000425844:exon_23701181_23701688:PLK1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 24166130 T/C 1 7 4 11 3.19466427705239 2.17447755597006 1.02018672108233 T:C T C 10 0.543619388992515 0.763926340985151 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000472066:exon_24166005_24166178:PRKCB HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 24202458 C/T 1 16 9 25 7.30208977611976 4.89257450093264 2.40951527518712 T:C C T 10 0.543619388992515 0.423109955424406 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24202411_24202551:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24202411_24202551:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000466124:exon_24202411_24202909:PRKCB HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 24788645 T/A 1 12 8 20 5.47656733208982 4.34895511194012 1.1276122201497 A:T T A 10 0.543619388992515 0.659998135084761 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395801:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24788569_24788679:TNRC6A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 24801737 G/A 1 8 3 11 3.65104488805988 1.63085816697755 2.02018672108233 A:G G A 10 0.543619388992515 0.364880107001187 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395801:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000352205:exon_24801651_24803138:TNRC6A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 24835168 G/A 1 7 12 19 3.19466427705239 6.52343266791018 -3.32876839085779 A:G G A 10 0.543619388992515 0.166421015470228 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24834753_24836196:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24834753_24837548:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24834753_24837545:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24834753_24837548:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000432286:exon_24834753_24836090:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000450465:exon_24834753_24836107:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000464539:exon_24834753_24836107:TNRC6A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 27238110 C/T 1 60 45 105 27.3828366604491 24.4628725046632 2.91996415578592 T:C C T 10 0.543619388992515 0.624563220037781 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27238041_27238157:NSMCE1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 27356203 A/G 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 A:G A G 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000077238:ENST00000380925:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000449195:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27356190_27356341:IL4R HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 28123226 G/A 1 12 7 19 5.47656733208982 3.80533572294761 1.67123160914221 A:G G A 10 0.543619388992515 0.496728290141003 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28123138_28123327:XPO6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 28145165 T/A 1 14 12 26 6.38932855410479 6.52343266791018 -0.134104113805391 A:T T A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28145162_28145254:XPO6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 28508069 C/T 0 10 0 10 4.56380611007485 0 4.56380611007485 C C 10 0.543619388992515 0.00264596365718521 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 28944700 G/T 1 61 51 112 27.8392172714566 27.7245888386183 0.114628432838316 T:C:G G T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000177455:ENST00000324662:exon_28944555_28944830:CD19 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 29675928 C/T 1 92 94 186 41.9870162126886 51.1002225652964 -9.1132063526078 T:C C T 10 0.543619388992515 0.185704021353527 ENSG00000197471:ENST00000395389:exon_29675016_29676848:SPN;ENSG00000197471:ENST00000436527:exon_29675016_29676114:SPN;ENSG00000197471:ENST00000360121:exon_29675016_29681811:SPN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 29706444 C/T 1 97 89 186 44.268919267726 48.3821256203338 -4.1132063526078 T:C C T 10 0.543619388992515 0.556601154522772 ENSG00000103485:ENST00000449759:exon_29705985_29706465:QPRT;ENSG00000103485:ENST00000395384:exon_29705985_29706520:QPRT HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 29848101 G/A 1 39 24 63 17.7988438292919 13.0468653358204 4.75197849347155 A:G G A 10 0.543619388992515 0.255959046261686 ENSG00000013364:ENST00000357402:exon_29848043_29848279:MVP;ENSG00000013364:ENST00000395353:exon_29848043_29848279:MVP;ENSG00000013364:ENST00000424666:exon_29848043_29848279:MVP;ENSG00000013364:ENST00000452209:exon_29848043_29848279:MVP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 29994922 C/T 1 6 9 15 2.73828366604491 4.89257450093264 -2.15429083488773 T:C C T 10 0.543619388992515 0.306171249676451 ENSG00000149930:ENST00000416441:exon_29994824_29994985:TAOK2;ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29994824_29994985:TAOK2;ENSG00000149930:ENST00000279394:exon_29994824_29994985:TAOK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 29998200 A/G 1 5 3 8 2.28190305503742 1.63085816697755 0.65104488805988 A:G A G 10 0.543619388992515 0.734792052639277 ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29997586_29999719:TAOK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 30408961 C/T 1 11 2 13 5.02018672108233 1.08723877798503 3.9329479430973 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0469687507225183 ENSG00000180035:ENST00000495929:exon_30408651_30410681:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000528032:exon_30408651_30409012:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000524644:exon_30408651_30409001:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000320159:exon_30408651_30411429:ZNF48 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 30536918 C/G 1 23 16 39 10.4967540531722 8.69791022388024 1.79884382929191 C:G C G 10 0.543619388992515 0.631233541180413 ENSG00000169957:ENST00000380412:exon_30535325_30537372:ZNF768 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 30666367 C/T 1 20 21 41 9.1276122201497 11.4160071688428 -2.28839494869312 T:C C T 10 0.543619388992515 0.531709531359411 ENSG00000156858:ENST00000287463:exon_30665950_30666535:PRR14;ENSG00000156858:ENST00000300835:exon_30665950_30666535:PRR14 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 30749536 T/A 1 11 19 30 5.02018672108233 10.3287683908578 -5.30858166977545 A:T T A 10 0.543619388992515 0.0657113717087642 ENSG00000080603:ENST00000262518:exon_30748370_30751450:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000395059:exon_30748370_30751449:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000344771:exon_30748370_30751449:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000380361:exon_30748370_30752028:SRCAP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 50342658 C/T 1 6 5 11 2.73828366604491 2.71809694496258 0.0201867210823345 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000121281:ENST00000394697:exon_50342578_50342703:ADCY7;ENSG00000121281:ENST00000254235:exon_50342578_50342703:ADCY7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 50711334 G/A 1 8 7 15 3.65104488805988 3.80533572294761 -0.154290834887726 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000167208:ENST00000300590:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000423026:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000330943:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000413750:exon_50711308_50711446:SNX20 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 56396486 C/T 1 47 39 86 21.4498887173518 21.2011561707081 0.248732546643705 T:C:G C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000159461:ENST00000290649:exon_56395364_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000492830:exon_56395472_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000314566:exon_56396337_56396528:AMFR HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 57016092 G/A 1 15 6 21 6.84570916511227 3.26171633395509 3.58399283115718 A:G G A 10 0.543619388992515 0.129808597744933 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57016077_57016149:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57016077_57016149:CETP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 57499902 T/C 1 9 4 13 4.10742549906736 2.17447755597006 1.9329479430973 T:C T C 10 0.543619388992515 0.405479662693351 ENSG00000102978:ENST00000219252:exon_57499865_57499933:POLR2C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 58550484 G/A 1 5 4 9 2.28190305503742 2.17447755597006 0.107425499067364 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000103037:ENST00000310682:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000219315:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000427443:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000443717:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000418480:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000422445:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000467320:exon_58550036_58550576:SETD6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 58552959 A/G 1 10 11 21 4.56380611007485 5.97981327891767 -1.41600716884282 A:G A G 10 0.543619388992515 0.662427114891113 ENSG00000103037:ENST00000310682:exon_58552628_58553566:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000394266:exon_58552628_58554431:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000219315:exon_58552628_58553014:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000427443:exon_58552628_58553419:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000443717:exon_58552628_58553001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000422445:exon_58552628_58553407:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000463954:exon_58552628_58552980:SETD6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 58575489 G/A 1 5 8 13 2.28190305503742 4.34895511194012 -2.0670520569027 A:G G A 10 0.543619388992515 0.276871294907228 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58575405_58575524:CNOT1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 58579274 C/T 1 12 9 21 5.47656733208982 4.89257450093264 0.583992831157184 T:C C T 10 0.543619388992515 0.830589105985654 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58579265_58579395:CNOT1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 66977895 C/T 1 32 15 47 14.6041795522395 8.15429083488773 6.44988871735179 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0777937433976906 ENSG00000172831:ENST00000417689:exon_66977742_66978972:CES2;ENSG00000172831:ENST00000317091:exon_66977742_66978999:CES2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 67578257 C/T 1 5 3 8 2.28190305503742 1.63085816697755 0.65104488805988 T:C C T 10 0.543619388992515 0.734792052639277 ENSG00000039523:ENST00000379312:exon_67578202_67578334:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000042381:exon_67578202_67578334:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000422602:exon_67578202_67578334:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000428437:exon_67578202_67578334:FAM65A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 67691668 A/G 1 25 20 45 11.4095152751871 10.8723877798503 0.537127495336822 A:C:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000102977:ENST00000219251:exon_67691665_67691756:ACD;ENSG00000102977:ENST00000393919:exon_67691665_67691756:ACD HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 67694044 C/T 1 23 26 49 10.4967540531722 14.1341041138054 -3.63735006063324 T:C C T 10 0.543619388992515 0.317645841367790 ENSG00000102977:ENST00000219251:exon_67694025_67694713:ACD;ENSG00000102977:ENST00000393919:exon_67694025_67694646:ACD;ENSG00000102977:ENST00000429497:exon_67694025_67694718:ACD HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 67696346 C/T 1 15 13 28 6.84570916511227 7.0670520569027 -0.221342891790421 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000102981:ENST00000458121:exon_67695799_67696680:PARD6A;ENSG00000102981:ENST00000219255:exon_67695796_67696677:PARD6A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 67911517 T/C 1 6 6 12 2.73828366604491 3.26171633395509 -0.52343266791018 T:C T C 10 0.543619388992515 0.779998482964206 ENSG00000038358:ENST00000358933:exon_67911412_67911559:EDC4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 67964203 T/C 1 4 6 10 1.82552244402994 3.26171633395509 -1.43619388992515 T:C T C 10 0.543619388992515 0.528005019910346 ENSG00000141086:ENST00000319955:exon_67964088_67964221:CTRL;ENSG00000141086:ENST00000432773:exon_67963848_67964221:CTRL HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 67969531 A/G 1 156 131 287 71.1953753171676 71.2141399580195 -0.0187646408518276 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969485_67969600:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969452_67969600:PSMB10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 67969930 A/G 1 235 184 419 107.249443586759 100.025967574623 7.22347601213619 A:G A G 10 0.543619388992515 0.492605667408863 ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969866_67970006:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969866_67970215:PSMB10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 68055921 A/G 1 41 49 90 18.7116050513069 26.6373500606332 -7.92574500932636 A:G A G 10 0.543619388992515 0.111985699032745 ENSG00000182810:ENST00000332395:exon_68055174_68057959:DDX28 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 68056829 C/T 1 11 17 28 5.02018672108233 9.24152961287276 -4.22134289179042 T:C C T 10 0.543619388992515 0.129577832731407 ENSG00000182810:ENST00000332395:exon_68055174_68057959:DDX28 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 68072004 A/G 1 3 9 12 1.36914183302245 4.89257450093264 -3.52343266791018 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0466272515626384 ENSG00000167264:ENST00000358896:exon_68071909_68072052:DUS2L;ENSG00000167264:ENST00000432752:exon_68071909_68072052:DUS2L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 68225515 G/A 1 23 22 45 10.4967540531722 11.9596265578353 -1.46287250466318 A:G G A 10 0.543619388992515 0.657467285964154 ENSG00000072736:ENST00000379165:exon_68224671_68226113:NFATC3;ENSG00000072736:ENST00000349223:exon_68224671_68225678:NFATC3;ENSG00000072736:ENST00000346183:exon_68224671_68225678:NFATC3;ENSG00000072736:ENST00000329524:exon_68224671_68225678:NFATC3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 69201050 C/T 1 63 46 109 28.7519784934716 25.0064918936557 3.74548659981586 T:C C T 10 0.543619388992515 0.501762467794902 ENSG00000141076:ENST00000314423:exon_69200978_69201088:CIRH1A;ENSG00000141076:ENST00000352319:exon_69200978_69201088:CIRH1A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 69354963 A/G 1 51 43 94 23.2754111613817 23.3756337266781 -0.100222565296413 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000132612:ENST00000254950:exon_69354954_69355173:VPS4A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 69373414 T/C 1 8 4 12 3.65104488805988 2.17447755597006 1.47656733208982 T:C T C 10 0.543619388992515 0.564519601476267 ENSG00000213380:ENST00000306875:exon_69373079_69373513:COG8;ENSG00000213380:ENST00000401849:exon_69373079_69373460:COG8;ENSG00000132603:ENST00000254940:exon_69373343_69373788:NIP7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 69373723 A/G 1 10 13 23 4.56380611007485 7.0670520569027 -2.50324594682785 A:G A G 10 0.543619388992515 0.304323603467324 ENSG00000132603:ENST00000254940:exon_69373343_69373788:NIP7;ENSG00000132603:ENST00000254941:exon_69373546_69373788:NIP7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 69973297 C/T 1 15 13 28 6.84570916511227 7.0670520569027 -0.221342891790421 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69973244_69973316:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69973244_69973316:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69973244_69973316:WWP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 70395387 C/T 1 11 11 22 5.02018672108233 5.97981327891767 -0.959626557835332 T:C C T 10 0.543619388992515 0.676454879931535 ENSG00000168872:ENST00000302243:exon_70395321_70395413:DDX19A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 70546234 G/A 1 7 3 10 3.19466427705239 1.63085816697755 1.56380611007485 A:G G A 10 0.543619388992515 0.3622898906741 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70546142_70546321:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000393612:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528951:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000534772:exon_70546176_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530160:exon_70546222_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528460:exon_70546226_70546335:COG4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 70569215 A/T 1 5 6 11 2.28190305503742 3.26171633395509 -0.979813278917665 A:T A T 10 0.543619388992515 0.56306921306608 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70569211_70569323:SF3B3;ENSG00000189091:ENST00000310750:exon_70569211_70569245:SF3B3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 70602221 C/T 1 95 76 171 43.3561580457111 41.3150735634311 2.04108448227993 T:C C T 10 0.543619388992515 0.817944151344197 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70602186_70602398:SF3B3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 74425569 C/T 0 16 0 16 7.30208977611976 0 7.30208977611976 C C 10 0.543619388992515 6.17145607857373e-05 ENSG00000196436:ENST00000504746:exon_74425289_74425741:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000429990:exon_74425289_74425978:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000355290:exon_74425289_74426013:NPIPL2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 74490556 G/A 1 46 39 85 20.9935081063443 21.2011561707081 -0.207648064363781 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000090863:ENST00000447066:exon_74490547_74490653:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000205061:exon_74490547_74490653:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000422840:exon_74490547_74490653:GLG1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 74920191 G/A 1 10 6 16 4.56380611007485 3.26171633395509 1.30208977611976 A:G G A 10 0.543619388992515 0.619661436202725 ENSG00000103091:ENST00000262144:exon_74920168_74920294:WDR59;ENSG00000103091:ENST00000205064:exon_74920168_74920294:WDR59 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 75269534 C/T 1 12 10 22 5.47656733208982 5.43619388992515 0.0403734421646691 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75268787_75269884:BCAR1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 75327916 A/G 1 78 48 126 35.5976876585838 26.0937306716407 9.5039569869431 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0901581426758268 ENSG00000153774:ENST00000283882:exon_75327608_75327940:CFDP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 75690279 A/G 1 90 87 177 41.0742549906736 47.2948868423488 -6.22063185167517 A:G A G 10 0.543619388992515 0.365607531605326 ENSG00000166848:ENST00000300086:exon_75690105_75691328:TERF2IP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 77228866 T/C 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 T:C T C 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000103111:ENST00000248248:exon_77228232_77229051:MON1B;ENSG00000103111:ENST00000439557:exon_77228232_77229051:MON1B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 81077873 A/G 1 9 13 22 4.10742549906736 7.0670520569027 -2.95962655783533 A:G A G 10 0.543619388992515 0.284361051004846 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 81077915 T/C 1 13 16 29 5.9329479430973 8.69791022388024 -2.76496228078294 T:C T C 10 0.543619388992515 0.352886594605329 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 81819768 T/C 1 18 10 28 8.21485099813473 5.43619388992515 2.77865710820958 T:C T C 10 0.543619388992515 0.345225120327408 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81819548_81819787:PLCG2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 81888152 A/G 1 9 11 20 4.10742549906736 5.97981327891767 -1.8723877798503 A:G A G 10 0.543619388992515 0.502082958548873 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81888049_81888192:PLCG2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 81929488 C/T 1 27 17 44 12.3222764972021 9.24152961287276 3.08074688432934 T:C C T 10 0.543619388992515 0.368473812682768 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81929412_81929532:PLCG2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 82203742 T/C 1 9 1 10 4.10742549906736 0.543619388992515 3.56380611007485 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0262377685020201 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82203730_82203831:MPHOSPH6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 82203758 C/T 1 8 1 9 3.65104488805988 0.543619388992515 3.10742549906736 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0455406737348372 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82203730_82203831:MPHOSPH6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 82203768 G/T 0 8 0 8 3.65104488805988 0 3.65104488805988 G G 10 0.543619388992515 0.00950909187424297 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82203730_82203831:MPHOSPH6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 84212571 C/A 1 13 25 38 5.9329479430973 13.5904847248129 -7.65753678171557 A:C C A 10 0.543619388992515 0.0142623301157022 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 84212779 G/A 1 11 21 32 5.02018672108233 11.4160071688428 -6.39582044776048 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0317167464694362 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 84212928 G/A 1 32 20 52 14.6041795522395 10.8723877798503 3.73179177238922 A:G G A 10 0.543619388992515 0.331532023811406 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 84213114 C/T 1 17 13 30 7.75847038712724 7.0670520569027 0.691418330224549 T:C C T 10 0.543619388992515 0.856142756291466 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 84213434 A/T 1 5 7 12 2.28190305503742 3.80533572294761 -1.52343266791018 A:T A T 10 0.543619388992515 0.400734857745032 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 84778685 A/G 1 15 28 43 6.84570916511227 15.2213428917904 -8.37563372667815 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0134724277895539 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 84778762 C/T 1 25 14 39 11.4095152751871 7.61067144589521 3.79884382929191 T:C C T 10 0.543619388992515 0.261499610536896 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 84779248 T/G 1 13 8 21 5.9329479430973 4.34895511194012 1.58399283115718 T:G T G 10 0.543619388992515 0.520202888001635 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 84796603 A/G 1 22 20 42 10.0403734421647 10.8723877798503 -0.832014337685633 A:G A G 10 0.543619388992515 0.877230845337008 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84796595_84796694:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84796595_84796694:USP10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 84808824 C/G 1 17 12 29 7.75847038712724 6.52343266791018 1.23503771921706 C:G C G 10 0.543619388992515 0.711765195535752 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84808766_84808831:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84808766_84808831:USP10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 85009970 A/G 1 7 5 12 3.19466427705239 2.71809694496258 0.476567332089819 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000153786:ENST00000313732:exon_85007787_85010125:ZDHHC7;ENSG00000153786:ENST00000344861:exon_85008069_85010125:ZDHHC7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 85706047 A/C 1 9 9 18 4.10742549906736 4.89257450093264 -0.785149001865271 A:C A C 10 0.543619388992515 0.81438018796475 ENSG00000131149:ENST00000405402:exon_85706011_85706960:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000416667:exon_85706011_85709812:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000253458:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000393243:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412862:exon_85706011_85709812:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412692:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000469381:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000438180:exon_85706011_85706499:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000496345:exon_85706011_85706102:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000471070:exon_85706011_85706254:KIAA0182 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 87788864 G/A 1 10 8 18 4.56380611007485 4.34895511194012 0.214850998134729 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87788800_87788898:KLHDC4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 88644005 A/G 1 13 15 28 5.9329479430973 8.15429083488773 -2.22134289179042 A:G A G 10 0.543619388992515 0.450446228617728 ENSG00000158545:ENST00000301011:exon_88643518_88644134:ZC3H18;ENSG00000158545:ENST00000452588:exon_88643518_88644134:ZC3H18;ENSG00000158545:ENST00000289509:exon_88643518_88644134:ZC3H18 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 88871908 A/G 1 14 13 27 6.38932855410479 7.0670520569027 -0.677723502797906 A:G A G 10 0.543619388992515 0.848121425366976 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88871848_88872045:CDT1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 88876059 A/G 1 193 209 402 88.0814579244446 113.616452299436 -25.5349943749911 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0122072498408355 ENSG00000198931:ENST00000378364:exon_88875877_88876248:APRT;ENSG00000198931:ENST00000426324:exon_88875877_88876114:APRT HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 88877004 A/G 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 A:G A G 10 0.543619388992515 0.482069340371676 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 89167395 C/T 0 9 0 9 4.10742549906736 0 4.10742549906736 C C 10 0.543619388992515 0.0050051441416687 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 89167404 T/C 0 9 0 9 4.10742549906736 0 4.10742549906736 T T 10 0.543619388992515 0.0050051441416687 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 89167431 G/C 0 9 0 9 4.10742549906736 0 4.10742549906736 G G 10 0.543619388992515 0.0050051441416687 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 89167443 T/C 0 12 0 12 5.47656733208982 0 5.47656733208982 T T 10 0.543619388992515 0.000747744096111451 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 89167458 C/A 1 11 1 12 5.02018672108233 0.543619388992515 4.47656733208982 A:C C A 10 0.543619388992515 0.0086252229198367 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 89293271 A/C 1 6 2 8 2.73828366604491 1.08723877798503 1.65104488805988 A:C A C 10 0.543619388992515 0.303950947229235 ENSG00000170100:ENST00000433976:exon_89293102_89295363:ZNF778;ENSG00000170100:ENST00000306502:exon_89293102_89295363:ZNF778 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 89294184 G/A 1 5 3 8 2.28190305503742 1.63085816697755 0.65104488805988 A:G G A 10 0.543619388992515 0.734792052639277 ENSG00000170100:ENST00000433976:exon_89293102_89295363:ZNF778;ENSG00000170100:ENST00000306502:exon_89293102_89295363:ZNF778 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 89620328 G/A 1 5 8 13 2.28190305503742 4.34895511194012 -2.0670520569027 A:G G A 10 0.543619388992515 0.276871294907228 ENSG00000197912:ENST00000268704:exon_89620202_89620368:SPG7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 89627460 T/G 1 978 877 1855 446.34023756532 476.754204146436 -30.4139665811154 T:G T G 10 0.543619388992515 0.161969902021071 ENSG00000167526:ENST00000311528:exon_89627348_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000491523:exon_89627348_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000484610:exon_89627348_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000487034:exon_89627348_89627931:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000467736:exon_89627348_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000393099:exon_89627119_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000399461:exon_89627312_89627776:RPL13 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 89627671 C/T 1 2131 2174 4305 972.54708205695 1181.82855166973 -209.281469612777 A:T:C:G C T 10 0.543619388992515 1.71898002623639e-10 ENSG00000167526:ENST00000311528:exon_89627635_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000491523:exon_89627348_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000484610:exon_89627635_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000487034:exon_89627348_89627931:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000467736:exon_89627635_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000393099:exon_89627635_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000399461:exon_89627312_89627776:RPL13 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 89799950 C/T 1 8 8 16 3.65104488805988 4.34895511194012 -0.697910223880241 T:C C T 10 0.543619388992515 0.804399137481932 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89799890_89799965:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89799890_89799965:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89799890_89799965:ZNF276 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 89805914 T/C 1 20 18 38 9.1276122201497 9.78514900186527 -0.657536781715573 T:C T C 10 0.543619388992515 0.871511607485792 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89804384_89807311:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89805886_89805961:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89805886_89805961:FANCA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 89807233 C/G 1 25 23 48 11.4095152751871 12.5032459468278 -1.09373067164072 C:G C G 10 0.543619388992515 0.773545262517051 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89804384_89807311:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89807212_89807274:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89807212_89807274:FANCA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 89809171 C/T 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 T:C C T 10 0.543619388992515 0.482069340371676 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 89815152 G/A 1 6 6 12 2.73828366604491 3.26171633395509 -0.52343266791018 A:G G A 10 0.543619388992515 0.779998482964206 ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89815067_89815175:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89815067_89815175:FANCA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 89965055 G/A 1 15 23 38 6.84570916511227 12.5032459468278 -5.65753678171557 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0736558354204878 ENSG00000141002:ENST00000263346:exon_89964965_89965057:TCF25;ENSG00000141002:ENST00000263347:exon_89964965_89965057:TCF25 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 89967217 T/C 1 7 1 8 3.19466427705239 0.543619388992515 2.65104488805988 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0786679847867632 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 90075226 C/T 1 16 14 30 7.30208977611976 7.61067144589521 -0.308581669775451 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000003249:ENST00000304733:exon_90075192_90075332:DBNDD1;ENSG00000003249:ENST00000002501:exon_90075192_90075332:DBNDD1;ENSG00000003249:ENST00000392973:exon_90075192_90075332:DBNDD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 90103659 G/A 1 5 7 12 2.28190305503742 3.80533572294761 -1.52343266791018 A:G G A 10 0.543619388992515 0.400734857745032 ENSG00000141013:ENST00000268699:exon_90103640_90103807:GAS8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 90106746 C/T 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000141013:ENST00000268699:exon_90106708_90106917:GAS8;ENSG00000222019:ENST00000409873:exon_90106169_90106825:AC133919.6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 16 90109711 A/G 1 6 6 12 2.73828366604491 3.26171633395509 -0.52343266791018 A:G A G 10 0.543619388992515 0.779998482964206 ENSG00000141013:ENST00000268699:exon_90109604_90111383:GAS8;ENSG00000222019:ENST00000517889:exon_90109310_90110397:AC133919.6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 649067 A/G 1 11 14 25 5.02018672108233 7.61067144589521 -2.59048472481288 A:G A G 10 0.543619388992515 0.321033229722111 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 649232 C/T 1 22 19 41 10.0403734421647 10.3287683908578 -0.288394948693117 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 650206 C/T 1 6 10 16 2.73828366604491 5.43619388992515 -2.69791022388024 T:C C T 10 0.543619388992515 0.212743822682223 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4;ENSG00000179409:ENST00000437269:exon_649871_650522:GEMIN4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 650518 G/A 1 8 17 25 3.65104488805988 9.24152961287276 -5.59048472481288 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0275713659052772 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4;ENSG00000179409:ENST00000437269:exon_649871_650522:GEMIN4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 685640 G/T 1 14 20 34 6.38932855410479 10.8723877798503 -4.48305922574551 T:G G T 10 0.543619388992515 0.167480215376848 ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_685482_685691:GLOD4;ENSG00000171861:ENST00000304478:exon_685513_685932:RNMTL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 1373518 T/C 1 16 22 38 7.30208977611976 11.9596265578353 -4.65753678171557 T:C T C 10 0.543619388992515 0.144044752084829 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1373469_1373628:MYO1C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 1373612 C/T 1 26 22 48 11.8658958861946 11.9596265578353 -0.0937306716407225 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1373469_1373628:MYO1C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 1494567 G/A 1 10 10 20 4.56380611007485 5.43619388992515 -0.872387779850301 A:G G A 10 0.543619388992515 0.823235579367717 ENSG00000167703:ENST00000301335:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000382147:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000412517:exon_1494563_1494765:SLC43A2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 1549868 C/G 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 C:G C G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000167705:ENST00000301336:exon_1549444_1549913:RILP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 1636934 A/G 1 6 4 10 2.73828366604491 2.17447755597006 0.56380611007485 A:G A G 10 0.543619388992515 0.763129400865595 ENSG00000167716:ENST00000468539:exon_1636821_1636939:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000418841:exon_1636821_1636973:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 1637074 A/G 1 5 7 12 2.28190305503742 3.80533572294761 -1.52343266791018 A:G A G 10 0.543619388992515 0.400734857745032 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 1637458 G/A 1 6 9 15 2.73828366604491 4.89257450093264 -2.15429083488773 A:G G A 10 0.543619388992515 0.306171249676451 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 1640793 C/T 1 14 8 22 6.38932855410479 4.34895511194012 2.04037344216467 T:C C T 10 0.543619388992515 0.402824489413891 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1640659_1641879:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1640659_1641782:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1640659_1641888:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1640659_1641878:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1640659_1641886:WDR81 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 1703543 G/C 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 C:G G C 10 0.543619388992515 0.482069340371676 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1703151_1704318:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000491788:exon_1703151_1704099:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000495309:exon_1703510_1704011:SMYD4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 2227655 G/T 1 143 139 282 65.2624273740703 75.5630950699596 -10.3006676958892 T:C:G G T 10 0.543619388992515 0.231915671262827 ENSG00000167720:ENST00000344595:exon_2226949_2228554:SRR;ENSG00000167721:ENST00000301364:exon_2225992_2227668:TSR1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 2236404 T/C 1 20 8 28 9.1276122201497 4.34895511194012 4.77865710820958 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0870451221452966 ENSG00000167721:ENST00000301364:exon_2236255_2236418:TSR1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 2573540 C/T 1 9 7 16 4.10742549906736 3.80533572294761 0.302089776119759 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000007168:ENST00000397195:exon_2573457_2573625:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000451360:exon_2573457_2573625:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000397193:exon_2573457_2573625:PAFAH1B1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 2585113 C/T 1 42 42 84 19.1679856623144 22.8320143376856 -3.66402867537126 T:C C T 10 0.543619388992515 0.4444303555635 ENSG00000007168:ENST00000397195:exon_2585023_2588909:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000451360:exon_2585023_2588909:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000006951:exon_2585023_2585201:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000397193:exon_2585023_2588909:PAFAH1B1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 2595704 C/A 1 50 55 105 22.8190305503742 29.8990663945883 -7.08003584421408 A:C C A 10 0.543619388992515 0.171248901264166 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2595655_2595776:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2595655_2595776:KIAA0664 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 2595964 G/A 1 24 23 47 10.9531346641796 12.5032459468278 -1.55011128264821 A:G G A 10 0.543619388992515 0.663162229968251 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2595865_2595990:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2595865_2595990:KIAA0664 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 2600186 G/A 1 16 13 29 7.30208977611976 7.0670520569027 0.235037719217064 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2600013_2600236:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2600013_2600236:KIAA0664 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 3828702 T/C 1 11 9 20 5.02018672108233 4.89257450093264 0.127612220149699 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3827169_3828732:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3827169_3828735:ATP2A3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 3839685 G/A 1 12 5 17 5.47656733208982 2.71809694496258 2.75847038712724 A:G G A 10 0.543619388992515 0.226307172659728 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3839561_3839763:ATP2A3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 3840928 A/G 1 11 14 25 5.02018672108233 7.61067144589521 -2.59048472481288 A:G A G 10 0.543619388992515 0.321033229722111 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3840710_3840930:ATP2A3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 4457571 C/T 1 7 5 12 3.19466427705239 2.71809694496258 0.476567332089819 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4457490_4457573:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4457490_4457573:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000426435:exon_4457490_4457573:MYBBP1A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 4458598 G/C 1 8 4 12 3.65104488805988 2.17447755597006 1.47656733208982 C:G G C 10 0.543619388992515 0.564519601476267 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4458422_4458681:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4458422_4458679:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000426435:exon_4458422_4458681:MYBBP1A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 4575283 A/G 1 168 133 301 76.6719426492575 72.3013787360045 4.37056391325297 A:G A G 10 0.543619388992515 0.643586281697918 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4574986_4576230:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4574986_4576440:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4574986_4576440:PELP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 4577950 C/A 1 36 26 62 16.4297019962695 14.1341041138054 2.29559788246407 A:C C A 10 0.543619388992515 0.611129748459295 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4577855_4577964:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4577805_4577964:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4577805_4577964:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4577805_4577964:PELP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 4586245 G/C 1 7 4 11 3.19466427705239 2.17447755597006 1.02018672108233 C:G G C 10 0.543619388992515 0.763926340985151 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4586098_4586247:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4586098_4586247:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4586098_4586247:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4586098_4586247:PELP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 4622638 C/T 1 13 12 25 5.9329479430973 6.52343266791018 -0.590484724812876 T:C C T 10 0.543619388992515 0.843032485284801 ENSG00000141480:ENST00000381488:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000346341:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000269260:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000412477:exon_4622578_4622715:ARRB2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 4699552 G/A 1 32 21 53 14.6041795522395 11.4160071688428 3.1881723833967 A:G G A 10 0.543619388992515 0.410401314690866 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4699439_4699591:PSMB6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 4701019 C/T 1 131 124 255 59.7858600419805 67.4088042350719 -7.62294419309134 T:C C T 10 0.543619388992515 0.346185233463358 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4700977_4701106:PSMB6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 4797305 G/A 1 11 11 22 5.02018672108233 5.97981327891767 -0.959626557835332 A:G G A 10 0.543619388992515 0.676454879931535 ENSG00000141503:ENST00000355280:exon_4797283_4797388:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000347992:exon_4797283_4797388:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000453408:exon_4797283_4797388:MINK1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 5284698 A/G 1 7 6 13 3.19466427705239 3.26171633395509 -0.0670520569026953 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 5284719 T/C 1 5 5 10 2.28190305503742 2.71809694496258 -0.436193889925151 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 5284770 G/A 1 12 6 18 5.47656733208982 3.26171633395509 2.21485099813473 A:G G A 10 0.543619388992515 0.349607890938645 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 5289580 A/G 1 54 60 114 24.6445529944042 32.6171633395509 -7.97261034514672 A:G A G 10 0.543619388992515 0.158153497966974 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5289346_5289589:NUP88 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 5290033 T/C 1 44 48 92 20.0807468843293 26.0937306716407 -6.01298378731138 T:C T C 10 0.543619388992515 0.211077912404666 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5290028_5290146:NUP88 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 5294976 T/A 1 12 13 25 5.47656733208982 7.0670520569027 -1.59048472481288 A:T T A 10 0.543619388992515 0.552178694254392 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5294881_5294982:NUP88 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 5326089 C/T 1 92 65 157 41.9870162126886 35.3352602845135 6.65175592817513 T:C C T 10 0.543619388992515 0.29849899590658 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 5326145 C/G 1 85 67 152 38.7923519356362 36.4224990624985 2.36985287313771 C:G C G 10 0.543619388992515 0.744877581257103 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 5326162 G/A 1 7 2 9 3.19466427705239 1.08723877798503 2.10742549906736 A:G G A 10 0.543619388992515 0.194613573468504 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 5326178 C/T 1 6 2 8 2.73828366604491 1.08723877798503 1.65104488805988 T:C C T 10 0.543619388992515 0.303950947229235 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 5425077 T/C 1 5 7 12 2.28190305503742 3.80533572294761 -1.52343266791018 T:C T C 10 0.543619388992515 0.400734857745032 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 6661584 T/C 1 5 6 11 2.28190305503742 3.26171633395509 -0.979813278917665 T:C T C 10 0.543619388992515 0.56306921306608 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 6663895 C/G 1 11 13 24 5.02018672108233 7.0670520569027 -2.04686533582036 C:G C G 10 0.543619388992515 0.419733845613331 ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000438512:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6663725_6663920:XAF1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 6942111 G/T 1 5 3 8 2.28190305503742 1.63085816697755 0.65104488805988 T:G G T 10 0.543619388992515 0.734792052639277 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6941471_6942208:SLC16A13 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 6943266 G/A 1 6 5 11 2.73828366604491 2.71809694496258 0.0201867210823345 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6943082_6943438:SLC16A13 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 7127718 T/C 1 7 6 13 3.19466427705239 3.26171633395509 -0.0670520569026953 T:C T C 10 0.543619388992515 1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 7129840 T/C 1 10 4 14 4.56380611007485 2.17447755597006 2.38932855410479 T:C T C 10 0.543619388992515 0.284272971162492 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7129740_7129958:DVL2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 7132556 C/T 1 5 6 11 2.28190305503742 3.26171633395509 -0.979813278917665 T:C C T 10 0.543619388992515 0.56306921306608 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7132454_7132593:DVL2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 7133162 G/A 1 4 10 14 1.82552244402994 5.43619388992515 -3.61067144589521 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0623608135025025 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7133127_7133262:DVL2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 7133609 G/A 1 5 8 13 2.28190305503742 4.34895511194012 -2.0670520569027 A:G G A 10 0.543619388992515 0.276871294907228 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7133604_7133749:DVL2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 7154534 G/A 1 46 33 79 20.9935081063443 17.939439836753 3.05406826959131 A:G G A 10 0.543619388992515 0.500778869488296 ENSG00000175826:ENST00000380825:exon_7154514_7154995:CTDNEP1;ENSG00000175826:ENST00000318988:exon_7154514_7154920:CTDNEP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 7245371 A/G 1 26 17 43 11.8658958861946 9.24152961287276 2.62436627332185 A:G A G 10 0.543619388992515 0.4479611808858 ENSG00000072818:ENST00000158762:exon_7245267_7245386:ACAP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 7293715 C/T 1 11 12 23 5.02018672108233 6.52343266791018 -1.50324594682785 T:C C T 10 0.543619388992515 0.538329676167563 ENSG00000187838:ENST00000324822:exon_7293055_7293760:PLSCR3;ENSG00000187838:ENST00000380658:exon_7293055_7293760:PLSCR3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 7297452 A/G 1 4 7 11 1.82552244402994 3.80533572294761 -1.97981327891767 A:G A G 10 0.543619388992515 0.245254265630413 ENSG00000187838:ENST00000324822:exon_7297423_7297590:PLSCR3;ENSG00000187838:ENST00000380658:exon_7297423_7297590:PLSCR3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 7411770 C/T 1 16 10 26 7.30208977611976 5.43619388992515 1.86589588619461 T:C C T 10 0.543619388992515 0.556551766826651 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7411570_7411794:POLR2A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 7412403 T/C 1 11 5 16 5.02018672108233 2.71809694496258 2.30208977611976 T:C T C 10 0.543619388992515 0.318708928468121 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7412263_7412509:POLR2A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 7460517 G/C 1 10 15 25 4.56380611007485 8.15429083488773 -3.59048472481288 C:G G C 10 0.543619388992515 0.163785907367559 ENSG00000239697:ENST00000293825:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000322272:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462619:exon_7460416_7460549:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462811:exon_7460416_7460891:TNFSF12 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 7460685 G/A 1 19 17 36 8.67123160914221 9.24152961287276 -0.570298003730541 A:G G A 10 0.543619388992515 0.868500328571537 ENSG00000239697:ENST00000293825:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000322272:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462811:exon_7460416_7460891:TNFSF12 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 7462969 A/G 1 10 6 16 4.56380611007485 3.26171633395509 1.30208977611976 A:G A G 10 0.543619388992515 0.619661436202725 ENSG00000239697:ENST00000518220:exon_7462941_7463019:TNFSF12;ENSG00000248871:ENST00000293826:exon_7462941_7463019:TNFSF12-TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000438470:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000436057:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000349228:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000338784:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000396545:exon_7462941_7463019:TNFSF13 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 7484101 C/A 1 5 6 11 2.28190305503742 3.26171633395509 -0.979813278917665 A:C C A 10 0.543619388992515 0.56306921306608 ENSG00000129226:ENST00000250092:exon_7484029_7484101:CD68;ENSG00000129226:ENST00000380498:exon_7484029_7484101:CD68 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 7484812 G/A 1 7 6 13 3.19466427705239 3.26171633395509 -0.0670520569026953 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000129226:ENST00000250092:exon_7484696_7485431:CD68;ENSG00000129226:ENST00000380498:exon_7484696_7485428:CD68 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 7490810 G/A 1 49 72 121 22.3626499393668 39.1405960074611 -16.7779460680943 A:G G A 10 0.543619388992515 0.00249623904127584 ENSG00000129255:ENST00000250124:exon_7490744_7491523:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000449455:exon_7490744_7491504:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000359822:exon_7490744_7491027:MPDU1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 7529902 G/A 1 91 71 162 41.5306356016811 38.5969766184686 2.93365898321257 A:G G A 10 0.543619388992515 0.693494711987834 ENSG00000141504:ENST00000380466:exon_7529552_7529932:SAT2;ENSG00000141504:ENST00000269298:exon_7529556_7529932:SAT2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 7530147 G/C 1 5 6 11 2.28190305503742 3.26171633395509 -0.979813278917665 C:G G C 10 0.543619388992515 0.56306921306608 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 7530271 C/T 1 34 29 63 15.5169407742545 15.7649622807829 -0.248021506528449 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000141504:ENST00000380466:exon_7530261_7530362:SAT2;ENSG00000141504:ENST00000269298:exon_7530261_7530362:SAT2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 7606722 C/G 1 25 16 41 11.4095152751871 8.69791022388024 2.71160505130688 C:G C G 10 0.543619388992515 0.435829083735949 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7606561_7606819:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000534050:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000471973:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498114:exon_7606561_7606820:WRAP53 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 7760397 G/A 1 151 139 290 68.9134722621302 75.5630950699596 -6.64962280782936 A:T:G G A 10 0.543619388992515 0.443857681588586 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760333_7760516:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 7760704 A/G 1 40 35 75 18.2552244402994 19.026678614738 -0.771454174438631 A:G A G 10 0.543619388992515 0.907905231052424 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760701_7760809:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 7808437 G/A 1 5 3 8 2.28190305503742 1.63085816697755 0.65104488805988 A:G G A 10 0.543619388992515 0.734792052639277 ENSG00000170004:ENST00000380358:exon_7808418_7808483:CHD3;ENSG00000170004:ENST00000403047:exon_7808418_7808483:CHD3;ENSG00000170004:ENST00000358181:exon_7808418_7808483:CHD3;ENSG00000170004:ENST00000330494:exon_7808418_7808483:CHD3;ENSG00000170004:ENST00000470531:exon_7808418_7808483:CHD3;ENSG00000170004:ENST00000466233:exon_7808418_7808483:CHD3;ENSG00000170004:ENST00000473376:exon_7808418_7808594:CHD3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 7843053 C/T 1 12 10 22 5.47656733208982 5.43619388992515 0.0403734421646691 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380255:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000419170:exon_7842831_7843067:CNTROB HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 7847955 C/A 1 7 7 14 3.19466427705239 3.80533572294761 -0.61067144589521 A:C C A 10 0.543619388992515 0.793044034376695 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7847794_7847956:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7847794_7847956:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7847794_7847956:CNTROB HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 7849087 C/G 1 4 8 12 1.82552244402994 4.34895511194012 -2.52343266791018 C:G C G 10 0.543619388992515 0.158970386231855 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380255:exon_7849046_7849304:CNTROB HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 7852647 G/A 1 3 11 14 1.36914183302245 5.97981327891767 -4.61067144589521 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0154679504098927 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 8048283 G/A 1 11 7 18 5.02018672108233 3.80533572294761 1.21485099813473 A:G G A 10 0.543619388992515 0.64123354867373 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8048069_8048311:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8047507_8048311:PER1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 8076741 A/G 1 2 6 8 0.91276122201497 3.26171633395509 -2.34895511194012 A:G A G 10 0.543619388992515 0.153435168169122 ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 8076778 C/T 1 7 1 8 3.19466427705239 0.543619388992515 2.65104488805988 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0786679847867632 ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 8076802 T/A 1 7 2 9 3.19466427705239 1.08723877798503 2.10742549906736 A:T T A 10 0.543619388992515 0.194613573468504 ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 8108339 G/A 1 116 89 205 52.9401508768683 48.3821256203338 4.55802525653441 A:G G A 10 0.543619388992515 0.529072766163357 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 8172506 T/G 1 15 14 29 6.84570916511227 7.61067144589521 -0.764962280782936 T:G T G 10 0.543619388992515 0.85290045462467 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8172272_8173809:PFAS HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 8416901 C/T 1 7 6 13 3.19466427705239 3.26171633395509 -0.0670520569026953 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000133026:ENST00000269243:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000360416:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000379980:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000396239:exon_8416856_8416987:MYH10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 9395231 G/A 1 29 40 69 13.2350377192171 21.7447755597006 -8.50973784048354 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0523608023175684 ENSG00000170310:ENST00000306357:exon_9395146_9395238:STX8;ENSG00000170310:ENST00000415554:exon_9395146_9395238:STX8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 9471711 T/G 1 10 9 19 4.56380611007485 4.89257450093264 -0.328768390857786 T:G T G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000170310:ENST00000306357:exon_9471688_9471787:STX8;ENSG00000170310:ENST00000415554:exon_9471688_9471787:STX8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 17394611 G/A 1 5 7 12 2.28190305503742 3.80533572294761 -1.52343266791018 A:G G A 10 0.543619388992515 0.400734857745032 ENSG00000141026:ENST00000268711:exon_17394593_17396535:MED9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 17425631 C/T 1 5 4 9 2.28190305503742 2.17447755597006 0.107425499067364 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000133027:ENST00000255389:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395783:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395782:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000435340:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000448294:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000343219:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395781:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000421096:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000461404:exon_17425594_17425709:PEMT HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 21 0 21 9.58399283115718 0 9.58399283115718 T T 10 0.543619388992515 4.58604857222331e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 17 1 18 7.75847038712724 0.543619388992515 7.21485099813473 T:G G T 10 0.543619388992515 0.00045367702926275 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 19 0 19 8.67123160914221 0 8.67123160914221 C C 10 0.543619388992515 1.73019070492640e-05 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 0 14 0 14 6.38932855410479 0 6.38932855410479 C C 10 0.543619388992515 0.000213852305952750 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 27 0 27 12.3222764972021 0 12.3222764972021 C C 10 0.543619388992515 9.22910975872448e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 21 0 21 9.58399283115718 0 9.58399283115718 C C 10 0.543619388992515 4.58604857222331e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 12 0 12 5.47656733208982 0 5.47656733208982 C C 10 0.543619388992515 0.000747744096111451 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 21 0 21 9.58399283115718 0 9.58399283115718 C C 10 0.543619388992515 4.58604857222331e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 23 0 23 10.4967540531722 0 10.4967540531722 G G 10 0.543619388992515 1.23092952653128e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 47 0 47 21.4498887173518 0 21.4498887173518 G G 10 0.543619388992515 5.17003131867797e-13 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 25628820 T/C 1 7 4 11 3.19466427705239 2.17447755597006 1.02018672108233 T:C T C 10 0.543619388992515 0.763926340985151 ENSG00000109046:ENST00000262394:exon_25628814_25628982:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000427287:exon_25628814_25628982:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000467843:exon_25628814_25628982:WSB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 25958304 G/A 1 96 67 163 43.8125386567186 36.4224990624985 7.39003959422005 A:G G A 10 0.543619388992515 0.271051175064688 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000302228:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000310394:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000313648:exon_25958174_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000448970:exon_25958235_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000467111:exon_25958240_25958330:LGALS9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 25970633 G/A 1 27 27 54 12.3222764972021 14.6777235027979 -2.35544700559581 A:G G A 10 0.543619388992515 0.585336983378677 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25970551_25970646:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25970551_25970646:LGALS9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 25974061 G/T 1 105 149 254 47.9199641557859 80.9992889598847 -33.0793248040988 T:C:G G T 10 0.543619388992515 3.86496044418500e-05 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25974056_25974144:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000302228:exon_25974056_25974144:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000310394:exon_25974056_25974144:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25974056_25974144:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000313648:exon_25974056_25974144:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000467111:exon_25974056_25974144:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000481514:exon_25974056_25974144:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000486774:exon_25974056_25974458:LGALS9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 25974258 T/C 1 5 4 9 2.28190305503742 2.17447755597006 0.107425499067364 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000168961:ENST00000486774:exon_25974056_25974458:LGALS9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 26676135 C/T 1 74 89 163 33.7721652145539 48.3821256203338 -14.60996040578 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0226022843544420 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 26955330 A/C 1 10 4 14 4.56380611007485 2.17447755597006 2.38932855410479 A:C A C 10 0.543619388992515 0.284272971162492 ENSG00000007202:ENST00000389003:exon_26955283_26955577:KIAA0100;ENSG00000007202:ENST00000005905:exon_26955283_26955577:KIAA0100;ENSG00000007202:ENST00000528896:exon_26955283_26955577:KIAA0100 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 27009749 C/T 1 12 9 21 5.47656733208982 4.89257450093264 0.583992831157184 T:C C T 10 0.543619388992515 0.830589105985654 ENSG00000109111:ENST00000314616:exon_27009745_27009874:SUPT6H;ENSG00000109111:ENST00000347486:exon_27009745_27009874:SUPT6H HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 27014396 C/T 1 10 11 21 4.56380611007485 5.97981327891767 -1.41600716884282 A:T:C C T 10 0.543619388992515 0.662427114891113 ENSG00000109111:ENST00000314616:exon_27014322_27014489:SUPT6H HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 27014483 C/A 1 21 11 32 9.58399283115718 5.97981327891767 3.60417955223952 A:C C A 10 0.543619388992515 0.218552910633387 ENSG00000109111:ENST00000314616:exon_27014322_27014489:SUPT6H HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 27075423 C/T 1 53 43 96 24.1881723833967 23.3756337266781 0.812538656718555 T:C C T 10 0.543619388992515 0.91855660826801 ENSG00000076604:ENST00000461195:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000262395:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000473421:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000469529:exon_27075280_27075441:TRAF4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 27185827 C/T 1 38 45 83 17.3424632182844 24.4628725046632 -7.12040928637875 T:C C T 10 0.543619388992515 0.123650138175273 ENSG00000132591:ENST00000254928:exon_27185594_27185842:ERAL1;ENSG00000132591:ENST00000471992:exon_27185594_27185842:ERAL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 27207571 C/T 1 29 25 54 13.2350377192171 13.5904847248129 -0.355447005595813 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000132589:ENST00000394906:exon_27206353_27207617:FLOT2;ENSG00000132589:ENST00000394908:exon_27206353_27207617:FLOT2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 27613677 G/A 1 4 7 11 1.82552244402994 3.80533572294761 -1.97981327891767 A:G G A 10 0.543619388992515 0.245254265630413 ENSG00000108256:ENST00000225388:exon_27613010_27614734:NUFIP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 29646032 G/A 1 11 14 25 5.02018672108233 7.61067144589521 -2.59048472481288 A:G G A 10 0.543619388992515 0.321033229722111 ENSG00000126860:ENST00000462804:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000247270:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000461237:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394756:exon_29644676_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394755:exon_29644676_29646041:EVI2A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 33338995 G/A 1 11 10 21 5.02018672108233 5.43619388992515 -0.416007168842817 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000092871:ENST00000315249:exon_33333009_33339168:RFFL;ENSG00000092871:ENST00000394597:exon_33336131_33339168:RFFL;ENSG00000092871:ENST00000268850:exon_33336131_33339168:RFFL;ENSG00000092871:ENST00000378516:exon_33336131_33339168:RFFL HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 33433487 C/T 1 7 1 8 3.19466427705239 0.543619388992515 2.65104488805988 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0786679847867632 ENSG00000185379:ENST00000345365:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000474236:exon_33433405_33433490:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000360276:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000335858:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000394589:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000489139:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000345766:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000460118:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000494406:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000418935:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000415064:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000339934:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000486323:exon_33433460_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000467861:exon_33433460_33433500:RAD51L3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 34945658 A/G 1 51 57 108 23.2754111613817 30.9863051725734 -7.71089401119162 A:G A G 10 0.543619388992515 0.147586354656619 ENSG00000005955:ENST00000304718:exon_34945638_34946278:GGNBP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 35896123 T/C 1 5 6 11 2.28190305503742 3.26171633395509 -0.979813278917665 T:C T C 10 0.543619388992515 0.56306921306608 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000508220:exon_35896081_35897580:SYNRG HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 36453208 T/C 1 15 19 34 6.84570916511227 10.3287683908578 -3.48305922574551 T:C T C 10 0.543619388992515 0.234347081094378 ENSG00000174100:ENST00000312513:exon_36452990_36453215:MRPL45 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 36474601 A/G 1 13 12 25 5.9329479430973 6.52343266791018 -0.590484724812876 A:G A G 10 0.543619388992515 0.843032485284801 ENSG00000174100:ENST00000312513:exon_36474586_36474634:MRPL45 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 36894839 G/A 1 33 41 74 15.060560163247 22.2883949486931 -7.22783478544611 A:C:G G A 10 0.543619388992515 0.102330153459267 ENSG00000056661:ENST00000360797:exon_36894794_36894848:PCGF2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 37009072 C/T 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 T:C C T 10 0.543619388992515 0.482069340371676 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 37884037 C/G 1 6 2 8 2.73828366604491 1.08723877798503 1.65104488805988 C:G C G 10 0.543619388992515 0.303950947229235 ENSG00000141736:ENST00000406381:exon_37883942_37884915:ERBB2;ENSG00000141736:ENST00000269571:exon_37883942_37884915:ERBB2;ENSG00000141736:ENST00000445658:exon_37883942_37884915:ERBB2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 38146154 T/C 1 97 95 192 44.268919267726 51.6438419542889 -7.37492268656289 T:C:G T C 10 0.543619388992515 0.310507970744353 ENSG00000108344:ENST00000264639:exon_38145992_38146182:PSMD3;ENSG00000108344:ENST00000415039:exon_38145992_38146182:PSMD3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 38175866 G/A 1 55 70 125 25.1009336054117 38.0533572294761 -12.9524236240644 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0244100084042053 ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38175350_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38175350_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000476821:exon_38175350_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38175351_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38175355_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38175361_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000491466:exon_38175398_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000422942:exon_38175756_38175898:MED24 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 38186106 C/T 1 12 7 19 5.47656733208982 3.80533572294761 1.67123160914221 T:C C T 10 0.543619388992515 0.496728290141003 ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38186001_38186112:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38186001_38186112:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38186001_38186112:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38186001_38186112:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38186001_38186112:MED24 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 39983681 G/A 1 28 77 105 12.7786571082096 41.8586929524237 -29.0800358442141 A:G G A 10 0.543619388992515 1.07296699998922e-08 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 39983808 G/C 1 65 6 71 29.6647397154865 3.26171633395509 26.4030233815314 C:G G C 10 0.543619388992515 1.09995374558339e-11 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 39983820 G/A 1 68 7 75 31.033881548509 3.80533572294761 27.2285458255614 A:G G A 10 0.543619388992515 1.63836928373579e-11 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 39983849 G/C 1 83 18 101 37.8795907136212 9.78514900186527 28.094441711756 A:C:G G C 10 0.543619388992515 5.29061227130272e-09 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 40125864 G/A 1 19 25 44 8.67123160914221 13.5904847248129 -4.91925311567066 A:G G A 10 0.543619388992515 0.172563358068996 ENSG00000173786:ENST00000393892:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000310262:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000472031:exon_40125493_40126246:CNP;ENSG00000173786:ENST00000393888:exon_40125493_40127194:CNP;ENSG00000173786:ENST00000486438:exon_40125493_40125980:CNP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 40142302 T/C 1 16 23 39 7.30208977611976 12.5032459468278 -5.20115617070809 T:C T C 10 0.543619388992515 0.108308505462418 ENSG00000168259:ENST00000457167:exon_40142282_40142400:DNAJC7;ENSG00000168259:ENST00000426588:exon_40142282_40142400:DNAJC7;ENSG00000168259:ENST00000316603:exon_40142282_40142400:DNAJC7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 40459737 C/T 1 24 14 38 10.9531346641796 7.61067144589521 3.34246321828443 T:C C T 10 0.543619388992515 0.329492334956756 ENSG00000126561:ENST00000345506:exon_40459611_40459741:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000452307:exon_40459611_40459741:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000468096:exon_40459611_40459741:STAT5A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 40689455 T/C 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 T:C T C 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000108784:ENST00000225927:exon_40689416_40689563:NAGLU;ENSG00000108784:ENST00000377405:exon_40689416_40689563:NAGLU HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 40696233 C/G 1 18 41 59 8.21485099813473 22.2883949486931 -14.0735439505584 C:G C G 10 0.543619388992515 0.000330261362909967 ENSG00000108784:ENST00000225927:exon_40695046_40696464:NAGLU;ENSG00000108784:ENST00000377405:exon_40695046_40696464:NAGLU HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 40714804 C/A 1 2 10 12 0.91276122201497 5.43619388992515 -4.52343266791018 A:C C A 10 0.543619388992515 0.0162707189354310 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40714092_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40714374_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000426807:exon_40714641_40714850:COASY HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 40716520 A/G 1 29 32 61 13.2350377192171 17.3958204477605 -4.16078272854342 A:G A G 10 0.543619388992515 0.305336007161300 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000449624:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40716464_40716595:COASY HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 40719669 C/T 1 8 6 14 3.65104488805988 3.26171633395509 0.38932855410479 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000108788:ENST00000435881:exon_40719637_40719673:MLX;ENSG00000108788:ENST00000346833:exon_40719637_40719673:MLX;ENSG00000108788:ENST00000246912:exon_40719637_40719673:MLX;ENSG00000108788:ENST00000432824:exon_40719637_40719673:MLX HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 40722029 A/G 1 15 14 29 6.84570916511227 7.61067144589521 -0.764962280782936 A:G A G 10 0.543619388992515 0.85290045462467 ENSG00000108788:ENST00000435881:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000346833:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000246912:exon_40722000_40722201:MLX HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 40724977 G/A 1 24 21 45 10.9531346641796 11.4160071688428 -0.462872504663176 A:G G A 10 0.543619388992515 0.882521409587574 ENSG00000108788:ENST00000435881:exon_40723565_40725220:MLX;ENSG00000108788:ENST00000346833:exon_40723565_40725220:MLX;ENSG00000108788:ENST00000246912:exon_40723565_40725220:MLX;ENSG00000131470:ENST00000253789:exon_40724329_40725042:PSMC3IP;ENSG00000131470:ENST00000393795:exon_40724329_40725042:PSMC3IP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 40818451 G/A 1 10 2 12 4.56380611007485 1.08723877798503 3.47656733208982 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0776119795169345 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818341_40818502:TUBG2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 40818699 A/G 1 15 8 23 6.84570916511227 4.34895511194012 2.49675405317215 A:G A G 10 0.543619388992515 0.403068770543004 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818621_40819021:TUBG2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 40931054 T/C 1 81 61 142 36.9668294916063 33.1607827285434 3.80604676306287 T:C T C 10 0.543619388992515 0.555857414464904 ENSG00000131475:ENST00000253794:exon_40930975_40931616:VPS25 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 41606033 G/A 1 15 13 28 6.84570916511227 7.0670520569027 -0.221342891790421 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000175832:ENST00000393664:exon_41605212_41606111:ETV4;ENSG00000175832:ENST00000319349:exon_41605212_41606111:ETV4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 42158310 T/G 1 3 9 12 1.36914183302245 4.89257450093264 -3.52343266791018 T:G T G 10 0.543619388992515 0.0466272515626384 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 42254011 C/G 1 6 6 12 2.73828366604491 3.26171633395509 -0.52343266791018 C:G C G 10 0.543619388992515 0.779998482964206 ENSG00000168597:ENST00000303061:exon_42253354_42255184:C17orf65 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 42287519 C/T 1 57 63 120 26.0136948274266 34.2480215065284 -8.2343266791018 T:C C T 10 0.543619388992515 0.142699455388244 ENSG00000108312:ENST00000343638:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000302904:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000527034:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000533177:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000436088:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000393606:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000526094:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529383:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529373:exon_42287492_42287602:UBTF HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 42398052 A/G 1 60 45 105 27.3828366604491 24.4628725046632 2.91996415578592 A:G A G 10 0.543619388992515 0.624563220037781 ENSG00000013306:ENST00000225308:exon_42397990_42398099:SLC25A39;ENSG00000013306:ENST00000377095:exon_42397990_42398099:SLC25A39 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 42398757 C/A 1 5 3 8 2.28190305503742 1.63085816697755 0.65104488805988 A:C C A 10 0.543619388992515 0.734792052639277 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 42429396 C/T 1 226 213 439 103.142018087692 115.790929855406 -12.6489117677141 T:C C T 10 0.543619388992515 0.231202896011185 ENSG00000030582:ENST00000053867:exon_42429383_42429616:GRN;ENSG00000030582:ENST00000446061:exon_42429383_42429616:GRN;ENSG00000030582:ENST00000393566:exon_42429383_42429616:GRN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 43183028 G/A 1 118 94 212 53.8529120988832 51.1002225652964 2.75268953358681 A:G G A 10 0.543619388992515 0.730600944502043 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43182987_43186377:NMT1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 43226887 A/G 1 26 24 50 11.8658958861946 13.0468653358204 -1.18096944962575 A:G A G 10 0.543619388992515 0.777458612218637 ENSG00000186834:ENST00000332499:exon_43224684_43229468:HEXIM1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 43227214 T/C 1 35 36 71 15.973321385262 19.5702980037305 -3.59697661846857 T:C T C 10 0.543619388992515 0.406289289876309 ENSG00000186834:ENST00000332499:exon_43224684_43229468:HEXIM1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 43311439 G/A 1 13 12 25 5.9329479430973 6.52343266791018 -0.590484724812876 A:G G A 10 0.543619388992515 0.843032485284801 ENSG00000184922:ENST00000328118:exon_43311439_43311567:FMNL1;ENSG00000184922:ENST00000331495:exon_43311439_43311567:FMNL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 43319770 C/T 1 19 17 36 8.67123160914221 9.24152961287276 -0.570298003730541 T:C C T 10 0.543619388992515 0.868500328571537 ENSG00000184922:ENST00000328118:exon_43319708_43319832:FMNL1;ENSG00000184922:ENST00000331495:exon_43319708_43319832:FMNL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 44108906 A/G 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44107334_44109069:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44107334_44109069:KIAA1267 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 44109474 G/A 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 A:G G A 10 0.543619388992515 0.482069340371676 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44109413_44109665:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44109413_44109665:KIAA1267 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 45008570 G/A 1 13 8 21 5.9329479430973 4.34895511194012 1.58399283115718 A:G G A 10 0.543619388992515 0.520202888001635 ENSG00000108433:ENST00000225567:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000393456:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000415811:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000439730:exon_45008465_45008573:GOSR2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 45735975 G/A 1 24 13 37 10.9531346641796 7.0670520569027 3.88608260727694 A:G G A 10 0.543619388992515 0.248142501231300 ENSG00000108424:ENST00000290158:exon_45735874_45736026:KPNB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 45750468 T/C 1 29 25 54 13.2350377192171 13.5904847248129 -0.355447005595813 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000108424:ENST00000290158:exon_45750384_45750531:KPNB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 45822633 C/T 1 12 16 28 5.47656733208982 8.69791022388024 -3.22134289179042 T:C C T 10 0.543619388992515 0.256791478667206 ENSG00000073861:ENST00000177694:exon_45822114_45823485:TBX21 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 46000406 T/C 1 6 9 15 2.73828366604491 4.89257450093264 -2.15429083488773 T:C T C 10 0.543619388992515 0.306171249676451 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_46000328_46000640:SP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 46262171 C/T 1 18 8 26 8.21485099813473 4.34895511194012 3.86589588619461 T:C C T 10 0.543619388992515 0.167695181341599 ENSG00000141293:ENST00000336915:exon_46262085_46262209:SKAP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 46939658 C/G 1 19 26 45 8.67123160914221 14.1341041138054 -5.46287250466318 C:G C G 10 0.543619388992515 0.133636041334022 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000416445:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000507306:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509784:exon_46939638_46939666:CALCOCO2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 47000251 C/T 1 21 12 33 9.58399283115718 6.52343266791018 3.060560163247 T:C C T 10 0.543619388992515 0.300710176067611 ENSG00000159202:ENST00000360943:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000389608:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000405215:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506498:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000504684:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000513342:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506271:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000514948:exon_47000209_47000459:UBE2Z HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 47007963 C/T 1 120 105 225 54.7656733208982 57.0800358442141 -2.31436252331589 T:C C T 10 0.543619388992515 0.789046637628057 ENSG00000159210:ENST00000502492:exon_47006678_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509995:exon_47007733_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000290330:exon_47007736_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000514089:exon_47007743_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000515572:exon_47007750_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000504000:exon_47007752_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509989:exon_47007788_47007974:SNF8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 48437456 C/G 1 6 6 12 2.73828366604491 3.26171633395509 -0.52343266791018 C:G C G 10 0.543619388992515 0.779998482964206 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48437330_48438512:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48437330_48438512:XYLT2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 48539035 T/C 1 3 11 14 1.36914183302245 5.97981327891767 -4.61067144589521 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0154679504098927 ENSG00000167107:ENST00000510410:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000506582:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48539018_48539047:ACSF2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 48549791 C/G 1 6 11 17 2.73828366604491 5.97981327891767 -3.24152961287276 C:G C G 10 0.543619388992515 0.144700534072097 ENSG00000167107:ENST00000510410:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000508245:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000510262:exon_48549789_48549807:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000512119:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000512537:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000503295:exon_48549492_48549940:ACSF2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 49350802 A/C 1 2 8 10 0.91276122201497 4.34895511194012 -3.43619388992515 A:C A C 10 0.543619388992515 0.0512654070160484 ENSG00000011260:ENST00000225298:exon_49350723_49350811:UTP18;ENSG00000011260:ENST00000508506:exon_49350723_49350811:UTP18 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 55027850 T/C 1 9 13 22 4.10742549906736 7.0670520569027 -2.95962655783533 T:C T C 10 0.543619388992515 0.284361051004846 ENSG00000121058:ENST00000240316:exon_55027250_55028357:COIL HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 55079471 T/C 1 23 20 43 10.4967540531722 10.8723877798503 -0.375633726678148 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000121064:ENST00000262288:exon_55079379_55079542:SCPEP1;ENSG00000121064:ENST00000393142:exon_55079379_55079542:SCPEP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 55183792 G/A 1 2 6 8 0.91276122201497 3.26171633395509 -2.34895511194012 A:G G A 10 0.543619388992515 0.153435168169122 ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000314126:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55182818_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55182802_55184539:AKAP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 55183813 A/G 1 5 6 11 2.28190305503742 3.26171633395509 -0.979813278917665 A:G A G 10 0.543619388992515 0.56306921306608 ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000314126:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55182818_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55182802_55184539:AKAP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 57290383 G/A 1 16 11 27 7.30208977611976 5.97981327891767 1.32227649720209 A:G G A 10 0.543619388992515 0.700999748325707 ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57290090_57290962:C17orf71 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 61908556 C/T 1 271 286 557 123.679145583028 155.475145251859 -31.7959996688309 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0073305316328253 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908396_61908586:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908396_61908586:PSMC5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 62007498 A/G 1 96 99 195 43.8125386567186 53.818319510259 -10.0057808535404 A:G A G 10 0.543619388992515 0.151298023273528 ENSG00000007312:ENST00000392795:exon_62007434_62007745:CD79B;ENSG00000007312:ENST00000006750:exon_62007434_62007745:CD79B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 65739627 A/G 1 20 25 45 9.1276122201497 13.5904847248129 -4.46287250466318 A:G A G 10 0.543619388992515 0.2308712664497 ENSG00000130935:ENST00000253247:exon_65739595_65739702:NOL11 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 67081830 T/C 1 5 6 11 2.28190305503742 3.26171633395509 -0.979813278917665 T:C T C 10 0.543619388992515 0.56306921306608 ENSG00000154262:ENST00000284425:exon_67081766_67081857:ABCA6;ENSG00000154262:ENST00000446604:exon_67081766_67081857:ABCA6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 71197439 C/T 1 11 2 13 5.02018672108233 1.08723877798503 3.9329479430973 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0469687507225183 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 73127217 G/C 1 9 13 22 4.10742549906736 7.0670520569027 -2.95962655783533 C:G G C 10 0.543619388992515 0.284361051004846 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 74309953 C/T 1 8 7 15 3.65104488805988 3.80533572294761 -0.154290834887726 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000161542:ENST00000448426:exon_74309902_74309972:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000446526:exon_74309902_74309972:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000324684:exon_74309902_74309972:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000488339:exon_74309902_74309972:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000435555:exon_74309902_74309972:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000472686:exon_74309682_74309972:PRPSAP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 74472998 G/A 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 A:G G A 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74472912_74473106:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74472912_74473106:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74472912_74473106:RHBDF2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 75085434 G/A 1 6 7 13 2.73828366604491 3.80533572294761 -1.0670520569027 A:C:G G A 10 0.543619388992515 0.588111803651177 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 75190962 C/T 1 10 4 14 4.56380611007485 2.17447755597006 2.38932855410479 T:C C T 10 0.543619388992515 0.284272971162492 ENSG00000129657:ENST00000443798:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000430767:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000413679:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000436233:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000392476:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000262775:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000431431:exon_75190759_75190993:SEC14L1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 75494746 A/C 0 33 40 73 15.060560163247 21.7447755597006 -6.6842153964536 A:G A G 10 0.543619388992515 0.127061263195841 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 75495397 T/C 1 160 151 311 73.0208977611976 82.0865277378698 -9.06562997667218 T:C:G T C 10 0.543619388992515 0.306060851685588 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 76121864 A/G 1 4 9 13 1.82552244402994 4.89257450093264 -3.0670520569027 A:G A G 10 0.543619388992515 0.100601549808403 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76121807_76121965:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76121807_76121965:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000306591:exon_76121807_76121965:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76121807_76121965:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000441202:exon_76121807_76121965:TMC6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 76131070 G/A 1 8 7 15 3.65104488805988 3.80533572294761 -0.154290834887726 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000167895:ENST00000318430:exon_76130951_76131090:TMC8;ENSG00000167895:ENST00000439484:exon_76130951_76131090:TMC8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 76134828 C/A 1 7 11 18 3.19466427705239 5.97981327891767 -2.78514900186527 A:C C A 10 0.543619388992515 0.237876828195976 ENSG00000167895:ENST00000301627:exon_76134690_76134885:TMC8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 76170830 C/T 1 112 102 214 51.1146284328383 55.4491776772365 -4.33454924439822 T:C C T 10 0.543619388992515 0.583186766654413 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76170160_76171031:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76170773_76171031:TK1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 76178748 T/C 1 26 16 42 11.8658958861946 8.69791022388024 3.16798566231437 T:C T C 10 0.543619388992515 0.3558608393914 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76178670_76178763:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76178670_76178763:TK1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 76183043 A/G 1 17 16 33 7.75847038712724 8.69791022388024 -0.939439836752997 A:G A G 10 0.543619388992515 0.8616236970739 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76183010_76183314:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76183010_76183111:TK1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 76198587 A/G 1 14 18 32 6.38932855410479 9.78514900186527 -3.39582044776048 A:G A G 10 0.543619388992515 0.287013533533773 ENSG00000183077:ENST00000409257:exon_76198580_76198684:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000481282:exon_76198580_76198684:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000327898:exon_76198580_76198684:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000475701:exon_76198580_76198684:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000424020:exon_76198580_76198684:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000458315:exon_76198580_76198684:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000472544:exon_76198580_76198684:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000484578:exon_76198580_76198684:AFMID HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 76200965 C/T 1 8 4 12 3.65104488805988 2.17447755597006 1.47656733208982 T:C C T 10 0.543619388992515 0.564519601476267 ENSG00000183077:ENST00000409257:exon_76200909_76200981:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000481282:exon_76200909_76201132:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000327898:exon_76200909_76200981:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000472544:exon_76200909_76201162:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000463930:exon_76200909_76200981:AFMID HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 76395430 C/T 1 2 7 9 0.91276122201497 3.80533572294761 -2.89257450093264 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0894121930945724 ENSG00000087157:ENST00000262764:exon_76395429_76395618:PGS1;ENSG00000087157:ENST00000329897:exon_76395429_76395618:PGS1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 76415673 C/A 1 3 6 9 1.36914183302245 3.26171633395509 -1.89257450093264 A:C C A 10 0.543619388992515 0.316548245109532 ENSG00000087157:ENST00000262764:exon_76415627_76415756:PGS1;ENSG00000087157:ENST00000335081:exon_76415627_76415698:PGS1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 76799795 G/A 1 28 13 41 12.7786571082096 7.0670520569027 5.71160505130688 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0846278760997528 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 76799860 T/C 1 13 14 27 5.9329479430973 7.61067144589521 -1.67772350279791 T:C T C 10 0.543619388992515 0.56531671981011 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 76799898 A/G 1 14 16 30 6.38932855410479 8.69791022388024 -2.30858166977545 A:G A G 10 0.543619388992515 0.464803618106555 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 76988785 G/A 1 13 13 26 5.9329479430973 7.0670520569027 -1.13410411380539 A:G G A 10 0.543619388992515 0.696880304708234 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000339300:exon_76987799_76990002:CANT1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 78092063 G/A 1 6 3 9 2.73828366604491 1.63085816697755 1.10742549906736 A:G G A 10 0.543619388992515 0.522625694750698 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78091992_78092156:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78091992_78092156:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78091992_78092156:GAA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 78184393 C/T 1 10 3 13 4.56380611007485 1.63085816697755 2.9329479430973 T:C C T 10 0.543619388992515 0.161878475803027 ENSG00000181523:ENST00000326317:exon_78183079_78184810:SGSH HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 78184679 C/T 1 7 4 11 3.19466427705239 2.17447755597006 1.02018672108233 T:C C T 10 0.543619388992515 0.763926340985151 ENSG00000181523:ENST00000326317:exon_78183079_78184810:SGSH HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 78389478 G/A 1 9 9 18 4.10742549906736 4.89257450093264 -0.785149001865271 A:G G A 10 0.543619388992515 0.81438018796475 ENSG00000173818:ENST00000520537:exon_78389450_78390053:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000522577:exon_78389450_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000518137:exon_78389450_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000520367:exon_78389450_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000523999:exon_78389450_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000519117:exon_78389450_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000323854:exon_78389450_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000397538:exon_78389450_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000521330:exon_78389115_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000522751:exon_78389115_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000520136:exon_78389450_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000520284:exon_78389450_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000523228:exon_78389450_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000523828:exon_78389450_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000522200:exon_78389253_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000520118:exon_78389450_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000521565:exon_78389450_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000521847:exon_78389269_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000521830:exon_78389269_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000518644:exon_78389450_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000523165:exon_78389453_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000517295:exon_78389469_78389621:CTD-2526A2.1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 79163758 G/A 1 10 11 21 4.56380611007485 5.97981327891767 -1.41600716884282 A:G G A 10 0.543619388992515 0.662427114891113 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79163715_79163775:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79163715_79163775:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79163715_79163775:AZI1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 79164707 C/T 1 18 16 34 8.21485099813473 8.69791022388024 -0.483059225745512 T:C C T 10 0.543619388992515 0.86538855776722 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79164707_79164884:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79164707_79164884:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79164707_79164884:AZI1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 79173224 T/C 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79173181_79173349:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79173181_79173349:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79173181_79173349:AZI1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 79220016 T/C 1 27 36 63 12.3222764972021 19.5702980037305 -7.24802150652845 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0763864383400029 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 79226362 G/A 1 14 16 30 6.38932855410479 8.69791022388024 -2.30858166977545 A:G G A 10 0.543619388992515 0.464803618106555 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79225995_79226483:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79225995_79226483:SLC38A10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 79244802 T/C 1 8 11 19 3.65104488805988 5.97981327891767 -2.32876839085779 T:C T C 10 0.543619388992515 0.358321729715676 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79244718_79244824:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79244718_79244824:SLC38A10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 79478007 G/A 1 3364 2979 6343 1535.26437542918 1619.4421598087 -84.177784379523 A:T:C:G G A 10 0.543619388992515 0.0342168878392860 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79477953_79478134:ACTG1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 79618059 C/T 1 9 5 14 4.10742549906736 2.71809694496258 1.38932855410479 T:C C T 10 0.543619388992515 0.59447928862092 ENSG00000185527:ENST00000331056:exon_79617489_79618180:PDE6G;ENSG00000185527:ENST00000374743:exon_79617489_79618180:PDE6G HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 79974731 T/C 1 18 25 43 8.21485099813473 13.5904847248129 -5.37563372667815 T:C T C 10 0.543619388992515 0.125033230003796 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79974676_79974745:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79974676_79974745:ASPSCR1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 79991603 C/T 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000169750:ENST00000306897:exon_79991575_79992077:RAC3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 79991708 C/G 1 5 3 8 2.28190305503742 1.63085816697755 0.65104488805988 C:G C G 10 0.543619388992515 0.734792052639277 ENSG00000169750:ENST00000306897:exon_79991575_79992077:RAC3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 80008392 G/T 1 6 4 10 2.73828366604491 2.17447755597006 0.56380611007485 T:G G T 10 0.543619388992515 0.763129400865595 ENSG00000169733:ENST00000310496:exon_80008278_80008431:RFNG;ENSG00000169733:ENST00000429557:exon_80007879_80008431:RFNG HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 80017902 C/T 1 49 43 92 22.3626499393668 23.3756337266781 -1.01298378731138 T:C C T 10 0.543619388992515 0.835041717000278 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80017824_80017969:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80017824_80017969:DUS1L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 80020812 C/T 1 20 38 58 9.1276122201497 20.6575367817156 -11.5299245615659 T:C C T 10 0.543619388992515 0.00336333062890643 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80020737_80020849:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80020737_80020820:DUS1L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 80042792 C/T 1 7 7 14 3.19466427705239 3.80533572294761 -0.61067144589521 T:C C T 10 0.543619388992515 0.793044034376695 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80042675_80042829:FASN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 80059532 T/G 1 63 47 110 28.7519784934716 25.5501112826482 3.20186721082334 T:G T G 10 0.543619388992515 0.56678352993241 ENSG00000176155:ENST00000445854:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000389641:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392347:exon_80059346_80059742:CCDC57 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 80350331 G/A 1 16 26 42 7.30208977611976 14.1341041138054 -6.83201433768563 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0430717208474633 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80350100_80350410:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80350100_80350410:C17orf101 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 80352234 G/A 1 11 16 27 5.02018672108233 8.69791022388024 -3.67772350279791 A:G G A 10 0.543619388992515 0.178157851272364 ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80352207_80352419:C17orf101 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 80352303 G/A 1 6 4 10 2.73828366604491 2.17447755597006 0.56380611007485 A:G G A 10 0.543619388992515 0.763129400865595 ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80352207_80352419:C17orf101 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 80373377 G/T 1 12 9 21 5.47656733208982 4.89257450093264 0.583992831157184 T:G G T 10 0.543619388992515 0.830589105985654 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80373274_80373503:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80373274_80373503:C17orf101 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 80377690 T/G 1 1 8 9 0.456380611007485 4.34895511194012 -3.89257450093264 T:G T G 10 0.543619388992515 0.0142129240777051 ENSG00000169660:ENST00000337014:exon_80377625_80377759:HEXDC;ENSG00000169660:ENST00000327949:exon_80377665_80377759:HEXDC HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 80391684 A/G 1 5 7 12 2.28190305503742 3.80533572294761 -1.52343266791018 A:G A G 10 0.543619388992515 0.400734857745032 ENSG00000169660:ENST00000337014:exon_80391534_80391698:HEXDC;ENSG00000169660:ENST00000327949:exon_80391534_80391698:HEXDC HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 80401946 A/G 1 14 8 22 6.38932855410479 4.34895511194012 2.04037344216467 A:G A G 10 0.543619388992515 0.402824489413891 ENSG00000178927:ENST00000306645:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000437807:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000434650:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000342572:exon_80401498_80401980:C17orf62 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 80442722 T/C 1 25 19 44 11.4095152751871 10.3287683908578 1.08074688432934 T:C T C 10 0.543619388992515 0.764751764799722 ENSG00000141562:ENST00000390006:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000345415:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000374611:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000309794:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000457415:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000412719:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000412079:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000427631:exon_80442657_80442826:NARF HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 80708601 C/G 1 6 6 12 2.73828366604491 3.26171633395509 -0.52343266791018 C:G C G 10 0.543619388992515 0.779998482964206 ENSG00000167363:ENST00000300784:exon_80708293_80709073:FN3K HGDP00222_parsed_pileup.txt . 17 80887244 T/C 1 28 23 51 12.7786571082096 12.5032459468278 0.275411161381733 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80887238_80887376:TBCD HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 658064 G/C 1 11 4 15 5.02018672108233 2.17447755597006 2.84570916511227 C:G G C 10 0.543619388992515 0.195223530265793 ENSG00000176912:ENST00000323813:exon_657842_658340:C18orf56 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 672836 A/G 1 8 12 20 3.65104488805988 6.52343266791018 -2.8723877798503 A:G A G 10 0.543619388992515 0.261745196981094 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_672557_673076:ENOSF1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 2616457 G/C 1 13 13 26 5.9329479430973 7.0670520569027 -1.13410411380539 C:G G C 10 0.543619388992515 0.696880304708234 ENSG00000080986:ENST00000261597:exon_2616436_2616634:NDC80 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 2892474 G/A 1 2 7 9 0.91276122201497 3.80533572294761 -2.89257450093264 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0894121930945724 ENSG00000132205:ENST00000254528:exon_2890559_2892484:EMILIN2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 12329536 C/G 1 92 115 207 41.9870162126886 62.5162297341392 -20.5292135214506 C:G C G 10 0.543619388992515 0.005132514689344 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 12348285 T/C 1 12 12 24 5.47656733208982 6.52343266791018 -1.04686533582036 T:C T C 10 0.543619388992515 0.686969093177818 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12348272_12348382:AFG3L2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 12351342 C/T 1 16 14 30 7.30208977611976 7.61067144589521 -0.308581669775451 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12351305_12351412:AFG3L2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 12984144 C/A 1 11 19 30 5.02018672108233 10.3287683908578 -5.30858166977545 A:C C A 10 0.543619388992515 0.0657113717087642 ENSG00000085415:ENST00000399892:exon_12984039_12984189:SEH1L;ENSG00000085415:ENST00000262124:exon_12984039_12984189:SEH1L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 13116432 G/T 1 7 2 9 3.19466427705239 1.08723877798503 2.10742549906736 T:G G T 10 0.543619388992515 0.194613573468504 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13116022_13116735:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000508539:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513183:exon_13116403_13116502:CEP192 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 24035675 T/C 1 6 2 8 2.73828366604491 1.08723877798503 1.65104488805988 T:C T C 10 0.543619388992515 0.303950947229235 ENSG00000134504:ENST00000317932:exon_24034874_24035865:KCTD1;ENSG00000134504:ENST00000417602:exon_24034877_24035865:KCTD1;ENSG00000134504:ENST00000408011:exon_24034877_24035865:KCTD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 34398914 C/T 1 7 6 13 3.19466427705239 3.26171633395509 -0.0670520569026953 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000134779:ENST00000334295:exon_34398857_34398936:C18orf10;ENSG00000134779:ENST00000383056:exon_34398857_34398936:C18orf10;ENSG00000134779:ENST00000415958:exon_34398857_34398936:C18orf10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 48458662 G/A 1 7 10 17 3.19466427705239 5.43619388992515 -2.24152961287276 A:G G A 10 0.543619388992515 0.333264703150297 ENSG00000082212:ENST00000321341:exon_48458628_48458730:ME2;ENSG00000082212:ENST00000382927:exon_48458628_48458730:ME2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 48702682 G/A 1 1 7 8 0.456380611007485 3.80533572294761 -3.34895511194012 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0274430116751054 ENSG00000176624:ENST00000406189:exon_48700920_48703946:MEX3C;ENSG00000176624:ENST00000336573:exon_48700922_48703946:MEX3C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 52895531 T/C 1 66 74 140 30.121120326494 40.2278347854461 -10.1067144589521 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0900805111368657 ENSG00000196628:ENST00000354452:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000457482:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000356073:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000398339:exon_52895452_52895592:TCF4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 56202120 G/A 1 13 7 20 5.9329479430973 3.80533572294761 2.1276122201497 A:G G A 10 0.543619388992515 0.377499796690282 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 56202394 C/T 1 3 8 11 1.36914183302245 4.34895511194012 -2.97981327891767 T:C C T 10 0.543619388992515 0.126408424019807 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 56202768 C/A 1 13 3 16 5.9329479430973 1.63085816697755 4.30208977611976 A:C C A 10 0.543619388992515 0.0420383373703011 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 56202982 A/T 1 6 5 11 2.73828366604491 2.71809694496258 0.0201867210823345 A:T A T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 56203074 G/A 1 10 1 11 4.56380611007485 0.543619388992515 4.02018672108233 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0150635935814851 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 56203120 C/T 1 7 1 8 3.19466427705239 0.543619388992515 2.65104488805988 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0786679847867632 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 56203411 G/C 1 12 3 15 5.47656733208982 1.63085816697755 3.84570916511227 C:G G C 10 0.543619388992515 0.0667796098120002 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 56203447 A/G 1 8 2 10 3.65104488805988 1.08723877798503 2.56380611007485 A:G A G 10 0.543619388992515 0.122752294666106 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 56203891 G/T 1 8 4 12 3.65104488805988 2.17447755597006 1.47656733208982 T:G G T 10 0.543619388992515 0.564519601476267 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 56203898 T/G 1 6 4 10 2.73828366604491 2.17447755597006 0.56380611007485 T:G T G 10 0.543619388992515 0.763129400865595 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 56204250 A/C 1 4 7 11 1.82552244402994 3.80533572294761 -1.97981327891767 A:C A C 10 0.543619388992515 0.245254265630413 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 56204644 T/G 1 4 7 11 1.82552244402994 3.80533572294761 -1.97981327891767 T:G T G 10 0.543619388992515 0.245254265630413 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 56204671 A/T 1 7 5 12 3.19466427705239 2.71809694496258 0.476567332089819 A:T A T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 56204932 T/G 1 14 2 16 6.38932855410479 1.08723877798503 5.30208977611976 T:G T G 10 0.543619388992515 0.00978582906041003 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 56204945 C/G 1 14 2 16 6.38932855410479 1.08723877798503 5.30208977611976 C:G C G 10 0.543619388992515 0.00978582906041003 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 56204977 C/T 1 15 1 16 6.84570916511227 0.543619388992515 6.30208977611976 T:C C T 10 0.543619388992515 0.00151366137732717 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 56204991 C/T 1 14 3 17 6.38932855410479 1.63085816697755 4.75847038712724 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0261868123195088 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 56205262 A/C 1 5 8 13 2.28190305503742 4.34895511194012 -2.0670520569027 A:C A C 10 0.543619388992515 0.276871294907228 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 56205481 G/A 1 3 7 10 1.36914183302245 3.80533572294761 -2.43619388992515 A:G G A 10 0.543619388992515 0.202250323161148 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 60985879 T/C 1 44 29 73 20.0807468843293 15.7649622807829 4.3157846035464 T:C T C 10 0.543619388992515 0.347932770951845 ENSG00000171791:ENST00000398117:exon_60985315_60987361:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000333681:exon_60985315_60986185:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000444484:exon_60985187_60986185:BCL2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 61582751 T/G 1 10 8 18 4.56380611007485 4.34895511194012 0.214850998134729 T:G T G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000242550:ENST00000397996:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000418725:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61582736_61582912:SERPINB10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 61585260 T/C 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 T:C T C 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61585199_61585336:SERPINB10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 61587053 G/A 1 9 1 10 4.10742549906736 0.543619388992515 3.56380611007485 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0262377685020201 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61587022_61587139:SERPINB10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 61602495 C/T 1 25 28 53 11.4095152751871 15.2213428917904 -3.8118276166033 T:C C T 10 0.543619388992515 0.334941190303105 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61602072_61603345:SERPINB10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 61650865 G/A 1 3 6 9 1.36914183302245 3.26171633395509 -1.89257450093264 A:G G A 10 0.543619388992515 0.316548245109532 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000397988:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000441827:exon_61650813_61650881:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61650813_61650955:SERPINB8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 61654463 A/G 1 24 14 38 10.9531346641796 7.61067144589521 3.34246321828443 A:G A G 10 0.543619388992515 0.329492334956756 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 67531642 T/C 1 13 4 17 5.9329479430973 2.17447755597006 3.75847038712724 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0875593850290938 ENSG00000150637:ENST00000280200:exon_67528097_67531675:CD226 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 67687860 T/C 1 10 8 18 4.56380611007485 4.34895511194012 0.214850998134729 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000176225:ENST00000255674:exon_67687851_67688053:RTTN;ENSG00000176225:ENST00000454359:exon_67687851_67688053:RTTN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 71928150 C/T 1 71 43 114 32.4030233815314 23.3756337266781 9.02738965485329 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0914270673250655 ENSG00000166347:ENST00000340533:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000494131:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000397914:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000299438:exon_71928150_71928179:CYB5A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 71959075 G/A 1 22 11 33 10.0403734421647 5.97981327891767 4.060560163247 A:G G A 10 0.543619388992515 0.166437704670950 ENSG00000166347:ENST00000340533:exon_71958982_71959251:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000494131:exon_71958982_71959170:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000397914:exon_71958982_71959179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000299438:exon_71958982_71959179:CYB5A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 72168608 G/A 1 26 11 37 11.8658958861946 5.97981327891767 5.88608260727694 A:T:G G A 10 0.543619388992515 0.0681727745213835 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72168564_72168707:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72168564_72168707:CNDP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 72176083 T/C 1 29 33 62 13.2350377192171 17.939439836753 -4.70440211753593 T:C T C 10 0.543619388992515 0.252140101020395 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72176075_72176163:CNDP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 72178161 T/C 1 14 7 21 6.38932855410479 3.80533572294761 2.58399283115718 T:C T C 10 0.543619388992515 0.282028637100374 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72178048_72178248:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72178048_72178248:CNDP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 77171061 T/G 1 6 3 9 2.73828366604491 1.63085816697755 1.10742549906736 T:G T G 10 0.543619388992515 0.522625694750698 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77170400_77171501:NFATC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 77208922 C/T 1 4 7 11 1.82552244402994 3.80533572294761 -1.97981327891767 T:C C T 10 0.543619388992515 0.245254265630413 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77208782_77208984:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77208782_77208984:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77208782_77208984:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77208782_77208984:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77208782_77208984:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77208782_77208984:NFATC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 77474921 G/A 1 7 8 15 3.19466427705239 4.34895511194012 -1.15429083488773 A:G G A 10 0.543619388992515 0.610096871559822 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77474491_77475528:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77474491_77475528:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77474491_77475528:CTDP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 77663940 G/A 1 33 17 50 15.060560163247 9.24152961287276 5.81903055037425 A:G G A 10 0.543619388992515 0.118013467740915 ENSG00000122490:ENST00000397778:exon_77662420_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000409073:exon_77662421_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000466449:exon_77663578_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000351365:exon_77662488_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000357575:exon_77662488_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000474967:exon_77662515_77664183:PQLC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 18 77805949 A/C 1 79 83 162 36.0540682695913 45.1204092863788 -9.06634101678744 A:C A C 10 0.543619388992515 0.156397587928872 ENSG00000101546:ENST00000306735:exon_77805774_77810651:RBFA;ENSG00000101546:ENST00000262197:exon_77805774_77806377:RBFA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 580665 T/C 1 165 110 275 75.302800816235 59.7981327891767 15.5046680270584 T:C:G T C 10 0.543619388992515 0.0608323273256628 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580646_580782:BSG HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 617614 G/A 1 33 40 73 15.060560163247 21.7447755597006 -6.6842153964536 A:G G A 10 0.543619388992515 0.127061263195841 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_617570_617655:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_617570_617655:POLRMT HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 629846 G/A 1 6 7 13 2.73828366604491 3.80533572294761 -1.0670520569027 A:G G A 10 0.543619388992515 0.588111803651177 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_629540_630168:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_629540_630168:POLRMT HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 652238 A/G 1 21 23 44 9.58399283115718 12.5032459468278 -2.91925311567066 A:G A G 10 0.543619388992515 0.449659593661266 ENSG00000070423:ENST00000292363:exon_652233_652296:RNF126;ENSG00000070423:ENST00000340092:exon_652233_652296:RNF126 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 804396 C/T 1 33 37 70 15.060560163247 20.1139173927231 -5.05335722947605 T:C C T 10 0.543619388992515 0.232364464833254 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804292_804438:PTBP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 804642 C/T 1 29 49 78 13.2350377192171 26.6373500606332 -13.4023123414162 A:T:C C T 10 0.543619388992515 0.00289986469503783 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804532_804702:PTBP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 808586 C/G 1 56 51 107 25.5573142164192 27.7245888386183 -2.16727462219911 C:G C G 10 0.543619388992515 0.698528127168042 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000350092:exon_808546_808762:PTBP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 808742 G/T 1 62 51 113 28.2955978824641 27.7245888386183 0.571009043845798 T:G G T 10 0.543619388992515 0.925116026522418 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000350092:exon_808546_808762:PTBP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 872089 A/G 1 32 14 46 14.6041795522395 7.61067144589521 6.99350810634431 A:G A G 10 0.543619388992515 0.03911320405066 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_871926_872118:MED16 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 880066 G/A 1 12 5 17 5.47656733208982 2.71809694496258 2.75847038712724 A:G G A 10 0.543619388992515 0.226307172659728 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_879937_880148:MED16 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 929678 G/A 1 11 10 21 5.02018672108233 5.43619388992515 -0.416007168842817 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_929262_929896:ARID3A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 929753 A/G 1 7 17 24 3.19466427705239 9.24152961287276 -6.04686533582036 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0142285939910005 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_929262_929896:ARID3A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 966891 C/T 1 4 6 10 1.82552244402994 3.26171633395509 -1.43619388992515 T:C C T 10 0.543619388992515 0.528005019910346 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 990238 C/T 1 34 35 69 15.5169407742545 19.026678614738 -3.50973784048354 T:C C T 10 0.543619388992515 0.40060348696425 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_990223_990364:WDR18 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 1010406 G/A 1 59 67 126 26.9264560494416 36.4224990624985 -9.4960430130569 A:G G A 10 0.543619388992515 0.107081892041764 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1009650_1010894:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1009650_1010894:C19orf6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 1011338 C/T 1 9 19 28 4.10742549906736 10.3287683908578 -6.22134289179042 T:C:G C T 10 0.543619388992515 0.0220216214726918 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 1012120 G/A 1 33 30 63 15.060560163247 16.3085816697755 -1.24802150652845 A:G G A 10 0.543619388992515 0.80082355333489 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1012065_1012187:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1012065_1012187:C19orf6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 1014377 A/G 1 14 14 28 6.38932855410479 7.61067144589521 -1.22134289179042 A:G A G 10 0.543619388992515 0.706220125728953 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1014191_1014472:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1014191_1014472:C19orf6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 1036444 G/A 1 72 73 145 32.8594039925389 39.6842153964536 -6.82481140391468 A:G G A 10 0.543619388992515 0.278578706374817 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 1619333 G/A 1 23 16 39 10.4967540531722 8.69791022388024 1.79884382929191 A:G G A 10 0.543619388992515 0.631233541180413 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 1619339 T/C 1 23 16 39 10.4967540531722 8.69791022388024 1.79884382929191 T:C T C 10 0.543619388992515 0.631233541180413 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 1622116 G/A 1 29 8 37 13.2350377192171 4.34895511194012 8.88608260727694 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0043334213009912 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1622053_1622222:TCF3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 1918935 C/G 1 6 6 12 2.73828366604491 3.26171633395509 -0.52343266791018 C:G C G 10 0.543619388992515 0.779998482964206 ENSG00000227500:ENST00000452128:exon_1918888_1920326:SCAMP4;ENSG00000227500:ENST00000316097:exon_1918888_1918989:SCAMP4;ENSG00000227500:ENST00000460767:exon_1918888_1918960:SCAMP4;ENSG00000227500:ENST00000489554:exon_1918888_1918989:SCAMP4;ENSG00000227500:ENST00000414057:exon_1918888_1918989:SCAMP4;ENSG00000227500:ENST00000411971:exon_1918888_1918964:SCAMP4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 1986455 A/G 1 50 54 104 22.8190305503742 29.3554470055958 -6.53641645522157 A:G A G 10 0.543619388992515 0.202149689679002 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 1997363 A/G 1 8 8 16 3.65104488805988 4.34895511194012 -0.697910223880241 A:G A G 10 0.543619388992515 0.804399137481932 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1997343_1997462:BTBD2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 2078176 C/T 1 40 25 65 18.2552244402994 13.5904847248129 4.66473971548652 T:C C T 10 0.543619388992515 0.264221622796656 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 2099250 G/A 1 15 8 23 6.84570916511227 4.34895511194012 2.49675405317215 A:G G A 10 0.543619388992515 0.403068770543004 ENSG00000099840:ENST00000497445:exon_2098435_2099583:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000478879:exon_2098435_2099592:IZUMO4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 2226655 C/A 1 19 14 33 8.67123160914221 7.61067144589521 1.060560163247 A:C C A 10 0.543619388992515 0.730932452746069 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 2226676 G/A 1 19 17 36 8.67123160914221 9.24152961287276 -0.570298003730541 A:G G A 10 0.543619388992515 0.868500328571537 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 2353074 A/G 1 8 10 18 3.65104488805988 5.43619388992515 -1.78514900186527 A:G A G 10 0.543619388992515 0.480432312528866 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2352944_2353207:AC004410.1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 2732986 T/C 1 29 30 59 13.2350377192171 16.3085816697755 -3.07354395055839 T:C T C 10 0.543619388992515 0.43559880327606 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 2762585 A/C 1 10 10 20 4.56380611007485 5.43619388992515 -0.872387779850301 A:C A C 10 0.543619388992515 0.823235579367717 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2762504_2762642:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2762504_2762642:SGTA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 2767192 G/T 1 5 5 10 2.28190305503742 2.71809694496258 -0.436193889925151 T:G G T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2767134_2767218:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2767134_2767218:SGTA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 3162909 C/T 1 12 10 22 5.47656733208982 5.43619388992515 0.0403734421646691 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3162791_3163766:GNA15 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 3179517 C/T 1 25 25 50 11.4095152751871 13.5904847248129 -2.18096944962575 T:C C T 10 0.543619388992515 0.571770159237513 ENSG00000125910:ENST00000246115:exon_3178766_3180329:S1PR4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 3207422 T/C 1 38 25 63 17.3424632182844 13.5904847248129 3.75197849347155 T:C T C 10 0.543619388992515 0.377324365456151 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207389_3207467:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207389_3207467:NCLN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 3207646 A/G 1 53 37 90 24.1881723833967 20.1139173927231 4.07425499067364 A:G A G 10 0.543619388992515 0.399606106599755 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207627_3209572:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207627_3209572:NCLN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 3544971 C/T 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 T:C C T 10 0.543619388992515 1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 4101062 G/T 1 26 30 56 11.8658958861946 16.3085816697755 -4.44268578358084 T:G G T 10 0.543619388992515 0.283106244821696 ENSG00000126934:ENST00000262948:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000394867:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000481271:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000443189:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000465472:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000472395:exon_4100962_4101141:MAP2K2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 4102449 G/A 1 40 51 91 18.2552244402994 27.7245888386183 -9.46936439831887 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0576051897040782 ENSG00000126934:ENST00000262948:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000394867:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000481271:exon_4102374_4103202:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000443189:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000465472:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000472395:exon_4102374_4102502:MAP2K2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 4117528 G/A 1 36 24 60 16.4297019962695 13.0468653358204 3.3828366604491 A:G G A 10 0.543619388992515 0.437429249593008 ENSG00000126934:ENST00000262948:exon_4117417_4117627:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000394867:exon_4117417_4117627:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000443189:exon_4117417_4117627:MAP2K2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 4658047 A/G 1 120 129 249 54.7656733208982 70.1269011800344 -15.3612278591362 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0561545951154664 ENSG00000074842:ENST00000262947:exon_4657566_4658096:C19orf10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 4670313 C/G 1 79 50 129 36.0540682695913 27.1809694496258 8.87309881996556 A:C:G C G 10 0.543619388992515 0.132759663918830 ENSG00000074842:ENST00000262947:exon_4670173_4670415:C19orf10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 4816719 G/A 1 19 25 44 8.67123160914221 13.5904847248129 -4.91925311567066 A:G G A 10 0.543619388992515 0.172563358068996 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1;ENSG00000127666:ENST00000343192:exon_4816494_4817903:TICAM1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 4818378 T/C 1 4 9 13 1.82552244402994 4.89257450093264 -3.0670520569027 T:C T C 10 0.543619388992515 0.100601549808403 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 4852137 C/T 1 18 12 30 8.21485099813473 6.52343266791018 1.69141833022455 T:C C T 10 0.543619388992515 0.586203203010159 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4852028_4852313:PLIN3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 5785449 C/T 1 20 39 59 9.1276122201497 21.2011561707081 -12.0735439505584 T:C C T 10 0.543619388992515 0.00234806962096256 ENSG00000141994:ENST00000320699:exon_5785394_5785522:DUS3L;ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5785394_5785522:DUS3L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 5786815 G/A 1 12 6 18 5.47656733208982 3.26171633395509 2.21485099813473 A:G G A 10 0.543619388992515 0.349607890938645 ENSG00000141994:ENST00000320699:exon_5786760_5786856:DUS3L;ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5786760_5786856:DUS3L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 5789565 T/C 1 13 3 16 5.9329479430973 1.63085816697755 4.30208977611976 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0420383373703011 ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5789218_5789730:DUS3L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 6374813 T/C 1 4 8 12 1.82552244402994 4.34895511194012 -2.52343266791018 T:C T C 10 0.543619388992515 0.158970386231855 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 6380469 C/T 1 110 107 217 50.2018672108233 58.1672746221991 -7.96540741137576 T:C C T 10 0.543619388992515 0.306689796839999 ENSG00000125651:ENST00000394456:exon_6379580_6380496:GTF2F1;ENSG00000125651:ENST00000429701:exon_6379580_6380496:GTF2F1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 6454651 T/C 1 8 5 13 3.65104488805988 2.71809694496258 0.932947943097304 T:C T C 10 0.543619388992515 0.782457075337367 ENSG00000125648:ENST00000264088:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000422102:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000441950:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000301454:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000414491:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000334510:exon_6454570_6454728:SLC25A23 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 6458240 G/C 1 8 2 10 3.65104488805988 1.08723877798503 2.56380611007485 C:G G C 10 0.543619388992515 0.122752294666106 ENSG00000125648:ENST00000264088:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000422102:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000441950:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000301454:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000414491:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000334510:exon_6458209_6458335:SLC25A23 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 6468331 T/C 1 77 51 128 35.1413070475763 27.7245888386183 7.41671820895807 T:C T C 10 0.543619388992515 0.214080631825705 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6468245_6468452:DENND1C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 6477256 G/T 1 6 13 19 2.73828366604491 7.0670520569027 -4.32876839085779 T:G G T 10 0.543619388992515 0.0633842011056323 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6477229_6477294:DENND1C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 6495736 A/G 1 7 4 11 3.19466427705239 2.17447755597006 1.02018672108233 A:G A G 10 0.543619388992515 0.763926340985151 ENSG00000104833:ENST00000264071:exon_6494331_6496232:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000411712:exon_6495175_6495767:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000412858:exon_6495175_6495861:TUBB4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 6772872 G/C 1 10 5 15 4.56380611007485 2.71809694496258 1.84570916511227 C:G G C 10 0.543619388992515 0.440182309073759 ENSG00000141968:ENST00000304076:exon_6772722_6773022:VAV1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 7712193 G/A 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 A:G G A 10 0.543619388992515 0.740490071859648 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 7712277 A/G 1 68 65 133 31.033881548509 35.3352602845135 -4.30137873600451 A:G A G 10 0.543619388992515 0.486521239311518 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7712240_7712397:STXBP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 7712585 T/G 1 7 10 17 3.19466427705239 5.43619388992515 -2.24152961287276 T:G T G 10 0.543619388992515 0.333264703150297 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 7761812 A/G 1 13 14 27 5.9329479430973 7.61067144589521 -1.67772350279791 A:G A G 10 0.543619388992515 0.56531671981011 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 7975586 C/T 1 8 6 14 3.65104488805988 3.26171633395509 0.38932855410479 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000076984:ENST00000397981:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000397983:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000468058:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000397979:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000425613:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000494348:exon_7975145_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000465324:exon_7975581_7975620:MAP2K7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 7977226 G/A 1 9 5 14 4.10742549906736 2.71809694496258 1.38932855410479 A:G G A 10 0.543619388992515 0.59447928862092 ENSG00000076984:ENST00000397981:exon_7977182_7979363:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000397983:exon_7977182_7979363:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000468058:exon_7977182_7977450:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000397979:exon_7977182_7979363:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000425613:exon_7977182_7977316:MAP2K7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 8376431 G/A 1 54 62 116 24.6445529944042 33.7044021175359 -9.05984912313175 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0940689044031899 ENSG00000167774:ENST00000301457:exon_8376234_8376479:NDUFA7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 8386998 T/C 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000233927:ENST00000445365:exon_8386540_8387376:RPS28 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 8503345 G/C 1 4 10 14 1.82552244402994 5.43619388992515 -3.61067144589521 C:G G C 10 0.543619388992515 0.0623608135025025 ENSG00000099785:ENST00000381035:exon_8503272_8503895:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000215555:exon_8503272_8503895:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000393944:exon_8503272_8503895:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000429675:exon_8503272_8503895:MARCH2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 10248546 C/T 0 47 0 47 21.4498887173518 0 21.4498887173518 C C 10 0.543619388992515 5.17003131867797e-13 ENSG00000130816:ENST00000340748:exon_10248508_10248685:DNMT1;ENSG00000130816:ENST00000359526:exon_10248508_10248685:DNMT1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 10394792 G/A 1 12 22 34 5.47656733208982 11.9596265578353 -6.48305922574551 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0372352524498717 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10394709_10394996:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10394709_10394996:ICAM1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 10426628 T/C 1 10 14 24 4.56380611007485 7.61067144589521 -3.04686533582036 T:C T C 10 0.543619388992515 0.225250248056272 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426528_10426685:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426528_10426691:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426528_10426672:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426528_10426682:FDX1L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 10446568 T/C 1 84 78 162 38.3359713246287 42.4023123414162 -4.06634101678744 T:C T C 10 0.543619388992515 0.528999719908348 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10446347_10446652:ICAM3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 10449358 T/C 1 92 71 163 41.9870162126886 38.5969766184686 3.39003959422005 T:C T C 10 0.543619388992515 0.637325686987826 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10449358_10449624:ICAM3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 10449392 A/G 1 105 77 182 47.9199641557859 41.8586929524237 6.06127120336226 A:G A G 10 0.543619388992515 0.373118741389284 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10449358_10449624:ICAM3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 10461586 T/C 1 234 220 454 106.793062975751 119.596265578353 -12.8032026026018 T:C T C 10 0.543619388992515 0.238903083540912 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10461205_10461644:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525976:exon_10461209_10461644:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000530220:exon_10461209_10461644:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10461209_10461644:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10461209_10461644:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000530560:exon_10461424_10461644:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529422:exon_10461464_10461969:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524470:exon_10461529_10461644:TYK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 10467303 G/C 1 14 18 32 6.38932855410479 9.78514900186527 -3.39582044776048 C:G G C 10 0.543619388992515 0.287013533533773 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10467244_10467394:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10467244_10467394:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10467244_10467394:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10467244_10467394:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000534228:exon_10467244_10467760:TYK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 10668383 T/C 1 3 6 9 1.36914183302245 3.26171633395509 -1.89257450093264 T:C T C 10 0.543619388992515 0.316548245109532 ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668228_10668571:KRI1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 10670184 C/G 1 19 13 32 8.67123160914221 7.0670520569027 1.60417955223952 C:G C G 10 0.543619388992515 0.599489390025958 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10670035_10670205:KRI1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 10672493 C/T 1 19 12 31 8.67123160914221 6.52343266791018 2.14779894123203 T:C C T 10 0.543619388992515 0.475681075974162 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000432197:exon_10672467_10672521:KRI1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 10676423 G/A 1 9 7 16 4.10742549906736 3.80533572294761 0.302089776119759 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10676393_10676466:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10676393_10676466:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10676393_10676696:KRI1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 10794630 G/T 1 85 97 182 38.7923519356362 52.731080732274 -13.9387287966377 T:C:G G T 10 0.543619388992515 0.0442451980606777 ENSG00000129351:ENST00000336059:exon_10794593_10794652:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000449870:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000318511:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000420083:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000407004:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000250241:exon_10794593_10794646:ILF3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 10939792 T/C 1 26 20 46 11.8658958861946 10.8723877798503 0.993508106344308 T:C T C 10 0.543619388992515 0.882557726659754 ENSG00000079805:ENST00000389252:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000389253:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000359692:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000314646:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000355667:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000408974:exon_10939712_10939944:DNM2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 11105608 T/C 1 19 35 54 8.67123160914221 19.026678614738 -10.3554470055958 T:C T C 10 0.543619388992515 0.00584851858269186 ENSG00000127616:ENST00000358026:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000421844:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000429416:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000344626:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000444061:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000450717:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000413806:exon_11105504_11105677:SMARCA4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 11169514 C/T 1 42 42 84 19.1679856623144 22.8320143376856 -3.66402867537126 T:C C T 10 0.543619388992515 0.4444303555635 ENSG00000127616:ENST00000358026:exon_11169464_11169565:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000421844:exon_11169464_11169565:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000429416:exon_11169464_11169565:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000344626:exon_11169464_11169565:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000444061:exon_11169464_11169565:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000450717:exon_11169464_11169565:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000413806:exon_11169464_11169565:SMARCA4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 11230881 T/C 1 10 3 13 4.56380611007485 1.63085816697755 2.9329479430973 T:C T C 10 0.543619388992515 0.161878475803027 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11230768_11230909:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11230768_11230909:LDLR HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 11465316 G/C 1 5 11 16 2.28190305503742 5.97981327891767 -3.69791022388024 C:G G C 10 0.543619388992515 0.0791368382267459 ENSG00000183401:ENST00000458408:exon_11465256_11465372:CCDC159;ENSG00000183401:ENST00000427879:exon_11465256_11465374:CCDC159 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 11558275 G/A 1 110 126 236 50.2018672108233 68.4960430130569 -18.2941758022335 A:C:G G A 10 0.543619388992515 0.0185218266360173 ENSG00000130175:ENST00000412601:exon_11558254_11558433:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000252455:exon_11558254_11558412:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000436195:exon_11558254_11558433:PRKCSH HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 11560108 A/G 1 204 161 365 93.1016446455269 87.5227216277949 5.57892301773201 A:G A G 10 0.543619388992515 0.56379607612617 ENSG00000130175:ENST00000412601:exon_11560081_11560243:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000252455:exon_11560081_11560243:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000436195:exon_11560081_11560243:PRKCSH HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 12768948 T/C 1 36 25 61 16.4297019962695 13.5904847248129 2.83921727145658 T:C T C 10 0.543619388992515 0.521331214734057 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12768877_12768955:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12768877_12768955:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12768877_12768955:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000465830:exon_12768877_12768955:MAN2B1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 12989560 G/A 1 38 39 77 17.3424632182844 21.2011561707081 -3.85869295242366 A:G G A 10 0.543619388992515 0.423570389215262 ENSG00000105612:ENST00000222219:exon_12989484_12989648:DNASE2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 13008607 G/T 1 19 17 36 8.67123160914221 9.24152961287276 -0.570298003730541 T:G G T 10 0.543619388992515 0.868500328571537 ENSG00000105607:ENST00000457854:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000222214:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000421816:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000422947:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000426001:exon_13008517_13008677:GCDH HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 13054781 G/T 1 672 673 1345 306.68777059703 365.855848791963 -59.1680781949327 T:C:G G T 10 0.543619388992515 0.00123444172173747 ENSG00000179218:ENST00000316448:exon_13054527_13055304:CALR HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 13249244 A/G 1 14 15 29 6.38932855410479 8.15429083488773 -1.76496228078294 A:C:G A G 10 0.543619388992515 0.577774847845697 ENSG00000160877:ENST00000292431:exon_13248961_13251955:NACC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 13264398 C/T 1 80 74 154 36.5104488805988 40.2278347854461 -3.71738590484732 T:C C T 10 0.543619388992515 0.571668309547766 ENSG00000160888:ENST00000292433:exon_13263758_13265716:IER2;ENSG00000160888:ENST00000393152:exon_13263893_13265716:IER2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 13869942 G/A 1 7 8 15 3.19466427705239 4.34895511194012 -1.15429083488773 A:G G A 10 0.543619388992515 0.610096871559822 ENSG00000104957:ENST00000221554:exon_13869914_13870086:CCDC130 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 13885309 C/T 1 88 93 181 40.1614937686587 50.5566031763039 -10.3951094076452 T:C C T 10 0.543619388992515 0.135436316409279 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885257_13885388:C19orf53 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 13885484 A/G 1 410 422 832 187.116050513069 229.407382154841 -42.2913316417725 A:T:G A G 10 0.543619388992515 0.00344495447890346 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885466_13885521:C19orf53 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 14038791 C/T 1 20 16 36 9.1276122201497 8.69791022388024 0.429701996269458 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14038706_14038843:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14038706_14038843:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000254346:exon_14038706_14038843:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14038706_14038843:CC2D1A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 14065341 T/C 1 5 10 15 2.28190305503742 5.43619388992515 -3.15429083488773 T:C T C 10 0.543619388992515 0.122665461935520 ENSG00000132017:ENST00000254337:exon_14065338_14065473:DCAF15 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 14512489 G/A 1 16 16 32 7.30208977611976 8.69791022388024 -1.39582044776048 A:G G A 10 0.543619388992515 0.723336688146235 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000434474:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000393059:exon_14512465_14512572:CD97 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 14629150 G/A 1 9 15 24 4.10742549906736 8.15429083488773 -4.04686533582036 A:G G A 10 0.543619388992515 0.104942104447151 ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14628951_14629201:DNAJB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 15226970 G/A 1 29 19 48 13.2350377192171 10.3287683908578 2.90626932835928 A:G G A 10 0.543619388992515 0.469468469210257 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 15227030 G/A 1 30 23 53 13.6914183302245 12.5032459468278 1.1881723833967 A:G G A 10 0.543619388992515 0.784027393691847 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 15350594 G/A 1 14 13 27 6.38932855410479 7.0670520569027 -0.677723502797906 A:G G A 10 0.543619388992515 0.848121425366976 ENSG00000141867:ENST00000263377:exon_15350470_15350632:BRD4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 15512193 G/A 1 29 14 43 13.2350377192171 7.61067144589521 5.62436627332185 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0932170163845377 ENSG00000011243:ENST00000397410:exon_15511961_15512414:AKAP8L;ENSG00000011243:ENST00000263378:exon_15511961_15512414:AKAP8L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 15565046 G/A 1 40 24 64 18.2552244402994 13.0468653358204 5.20835910447904 A:G G A 10 0.543619388992515 0.210606864627924 ENSG00000105122:ENST00000343625:exon_15564960_15565078:RASAL3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 16238279 C/T 1 23 24 47 10.4967540531722 13.0468653358204 -2.55011128264821 T:C C T 10 0.543619388992515 0.467701248425099 ENSG00000167461:ENST00000300935:exon_16238247_16238336:RAB8A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 16339715 C/T 1 13 12 25 5.9329479430973 6.52343266791018 -0.590484724812876 T:C C T 10 0.543619388992515 0.843032485284801 ENSG00000072958:ENST00000291439:exon_16339581_16339739:AP1M1;ENSG00000072958:ENST00000444449:exon_16339581_16339739:AP1M1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 16688458 G/A 1 7 5 12 3.19466427705239 2.71809694496258 0.476567332089819 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000141979:ENST00000409035:exon_16687454_16688493:CALR3;ENSG00000105085:ENST00000263390:exon_16685718_16688493:MED26;ENSG00000105085:ENST00000453758:exon_16688416_16688493:MED26 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 17337871 A/G 1 6 5 11 2.73828366604491 2.71809694496258 0.0201867210823345 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 17337882 C/G 1 3 6 9 1.36914183302245 3.26171633395509 -1.89257450093264 C:G C G 10 0.543619388992515 0.316548245109532 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 17339112 G/A 1 11 10 21 5.02018672108233 5.43619388992515 -0.416007168842817 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17339065_17339118:OCEL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 17448961 A/C 1 7 21 28 3.19466427705239 11.4160071688428 -8.22134289179042 A:C A C 10 0.543619388992515 0.00203843649477048 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17448817_17449064:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17448817_17449064:GTPBP3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 17450016 T/C 1 8 30 38 3.65104488805988 16.3085816697755 -12.6575367817156 T:C T C 10 0.543619388992515 5.03479339979748e-05 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17449763_17450075:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17449932_17450075:GTPBP3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 17628587 A/G 1 58 58 116 26.4700754384341 31.5299245615659 -5.05984912313175 A:G A G 10 0.543619388992515 0.352753470964077 ENSG00000130313:ENST00000252603:exon_17628519_17628659:PGLS HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 18192977 G/C 1 5 3 8 2.28190305503742 1.63085816697755 0.65104488805988 C:G G C 10 0.543619388992515 0.734792052639277 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18192960_18193074:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18192960_18193074:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18192960_18193074:IL12RB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 18285944 G/A 1 660 518 1178 301.21120326494 281.594843498123 19.6163597668173 A:T:C:G G A 10 0.543619388992515 0.254141370853153 ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18285850_18286032:IFI30 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 18288069 A/G 1 1111 1116 2227 507.038858829316 606.679238115647 -99.6403792863311 A:T:G A G 10 0.543619388992515 2.50434477005828e-05 ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18287950_18288102:IFI30 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 18304700 A/G 1 27 18 45 12.3222764972021 9.78514900186527 2.53712749533682 A:G A G 10 0.543619388992515 0.459662152449087 ENSG00000254858:ENST00000534421:exon_18304674_18304970:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000417827:exon_18304674_18304828:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000445735:exon_18304674_18304844:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000533807:exon_18304042_18304844:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000532896:exon_18304042_18304844:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000247712:exon_18304674_18304844:AC068499.1;ENSG00000127226:ENST00000534474:exon_18304674_18304833:MPV17L2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 18305824 C/T 1 19 16 35 8.67123160914221 8.69791022388024 -0.0266786147380262 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000254858:ENST00000417827:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000445735:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000533807:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000532896:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000247712:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000127226:ENST00000534474:exon_18305768_18305896:MPV17L2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 18499780 A/G 1 18 3 21 8.21485099813473 1.63085816697755 6.58399283115718 A:G A G 10 0.543619388992515 0.00365887824598056 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18499096_18499986:GDF15 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 19023853 T/C 1 107 75 182 48.8327253778009 40.7714541744386 8.06127120336226 T:C T C 10 0.543619388992515 0.234843019537027 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000351079:exon_19023793_19023855:COPE HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 19105259 G/A 1 29 24 53 13.2350377192171 13.0468653358204 0.188172383396703 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000064607:ENST00000337018:exon_19105175_19105295:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000330854:exon_19105175_19105295:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000456085:exon_19105175_19106089:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000452918:exon_19105175_19105295:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000392342:exon_19105175_19105295:SUGP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 19136541 C/T 1 4 8 12 1.82552244402994 4.34895511194012 -2.52343266791018 T:C C T 10 0.543619388992515 0.158970386231855 ENSG00000064607:ENST00000337018:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000330854:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000452918:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000392342:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000424153:exon_19135428_19137035:SUGP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 19304899 G/C 1 81 76 157 36.9668294916063 41.3150735634311 -4.34824407182486 C:G G C 10 0.543619388992515 0.521773414985794 ENSG00000064490:ENST00000353145:exon_19304748_19304942:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000303088:exon_19304748_19304942:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000456252:exon_19304748_19304942:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000407360:exon_19304748_19304942:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000392324:exon_19304748_19304942:RFXANK HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 19606634 G/A 1 13 11 24 5.9329479430973 5.97981327891767 -0.0468653358203612 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000167491:ENST00000360315:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000252577:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000429563:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000404158:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000358713:exon_19606563_19606694:GATAD2A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 19648346 G/C 1 9 20 29 4.10742549906736 10.8723877798503 -6.76496228078294 C:G G C 10 0.543619388992515 0.014447705406812 ENSG00000250067:ENST00000458210:exon_19648121_19648387:YJEFN3;ENSG00000250067:ENST00000514277:exon_19648121_19648390:YJEFN3;ENSG00000250067:ENST00000436027:exon_19648128_19648393:YJEFN3;ENSG00000250067:ENST00000397179:exon_19648128_19648393:YJEFN3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 19740729 C/G 1 94 90 184 42.8997774347036 48.9257450093264 -6.02596757462277 C:G C G 10 0.543619388992515 0.375579090028666 ENSG00000089639:ENST00000203556:exon_19740288_19741145:GMIP;ENSG00000089639:ENST00000445806:exon_19740288_19741145:GMIP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 30193721 G/A 1 7 4 11 3.19466427705239 2.17447755597006 1.02018672108233 A:G G A 10 0.543619388992515 0.763926340985151 ENSG00000131943:ENST00000323670:exon_30190483_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392276:exon_30192070_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392275:exon_30193248_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392278:exon_30193310_30193884:C19orf12 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 33602757 C/T 1 6 5 11 2.73828366604491 2.71809694496258 0.0201867210823345 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33602630_33602808:GPATCH1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 33605300 A/G 1 7 1 8 3.19466427705239 0.543619388992515 2.65104488805988 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0786679847867632 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33605159_33605325:GPATCH1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 33605312 T/C 0 9 0 9 4.10742549906736 0 4.10742549906736 T T 10 0.543619388992515 0.0050051441416687 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33605159_33605325:GPATCH1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 33608733 C/A 1 10 2 12 4.56380611007485 1.08723877798503 3.47656733208982 A:C C A 10 0.543619388992515 0.0776119795169345 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33608731_33608947:GPATCH1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 35175749 C/G 1 18 10 28 8.21485099813473 5.43619388992515 2.77865710820958 C:G C G 10 0.543619388992515 0.345225120327408 ENSG00000089335:ENST00000457781:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000527499:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505242:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000525595:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000423823:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000221282:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000446502:exon_35175157_35177237:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505365:exon_35175098_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000509196:exon_35175157_35177296:ZNF302 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 35175775 C/T 1 8 14 22 3.65104488805988 7.61067144589521 -3.95962655783533 T:C C T 10 0.543619388992515 0.132255633527639 ENSG00000089335:ENST00000457781:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000527499:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505242:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000525595:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000423823:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000221282:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000446502:exon_35175157_35177237:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505365:exon_35175098_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000509196:exon_35175157_35177296:ZNF302 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 35506729 G/A 1 38 12 50 17.3424632182844 6.52343266791018 10.8190305503742 A:G G A 10 0.543619388992515 0.00250708773011912 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35506728_35506871:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35506728_35506871:GRAMD1A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 35510102 G/C 1 37 33 70 16.8860826072769 17.939439836753 -1.05335722947605 C:G G C 10 0.543619388992515 0.811428769346709 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35510095_35510213:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35510095_35510213:GRAMD1A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 35649281 A/G 1 119 129 248 54.3092927098907 70.1269011800344 -15.8176084701437 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0479976565522551 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35649247_35649303:FXYD5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 35660546 T/C 1 349 303 652 159.276833241612 164.716674864732 -5.4398416231198 A:T:C T C 10 0.543619388992515 0.694254769401018 ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35660469_35660786:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35660469_35660783:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392217:exon_35660469_35660784:FXYD5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 35822884 C/T 1 17 9 26 7.75847038712724 4.89257450093264 2.86589588619461 T:C C T 10 0.543619388992515 0.32603457135944 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 36038390 A/G 1 49 70 119 22.3626499393668 38.0533572294761 -15.6907072901093 A:G A G 10 0.543619388992515 0.00423584884556696 ENSG00000105677:ENST00000392204:exon_36038226_36038397:TMEM147;ENSG00000105677:ENST00000222284:exon_36038226_36038428:TMEM147 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 36109312 C/A 1 8 7 15 3.65104488805988 3.80533572294761 -0.154290834887726 A:C C A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000249115:ENST00000505558:exon_36109304_36109367:HAUS5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 36142187 C/T 1 269 276 545 122.766384361013 150.038951361934 -27.2725670009207 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0201818094094228 ENSG00000126267:ENST00000246554:exon_36142135_36142251:COX6B1;ENSG00000126267:ENST00000392201:exon_36142135_36142251:COX6B1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 36594369 C/T 1 2 9 11 0.91276122201497 4.89257450093264 -3.97981327891767 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0290239734179488 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36594245_36594883:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36594245_36594883:WDR62 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 36595436 A/C 1 5 5 10 2.28190305503742 2.71809694496258 -0.436193889925151 A:C A C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36595420_36595577:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36595420_36595577:WDR62 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 36727365 G/A 1 10 9 19 4.56380611007485 4.89257450093264 -0.328768390857786 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000167635:ENST00000428827:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000456324:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000443387:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000301233:exon_36726561_36729673:ZNF146 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 36940698 A/G 1 6 2 8 2.73828366604491 1.08723877798503 1.65104488805988 A:G A G 10 0.543619388992515 0.303950947229235 ENSG00000186017:ENST00000434377:exon_36936021_36940903:ZNF566;ENSG00000186017:ENST00000454319:exon_36936021_36940903:ZNF566;ENSG00000186017:ENST00000493391:exon_36937923_36940903:ZNF566;ENSG00000186017:ENST00000392170:exon_36938531_36940903:ZNF566;ENSG00000186017:ENST00000424129:exon_36938584_36940903:ZNF566;ENSG00000186017:ENST00000358744:exon_36938584_36940903:ZNF566;ENSG00000186017:ENST00000452939:exon_36940435_36940903:ZNF566;ENSG00000186017:ENST00000427002:exon_36940666_36940903:ZNF566 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 37005298 A/G 1 5 7 12 2.28190305503742 3.80533572294761 -1.52343266791018 A:G A G 10 0.543619388992515 0.400734857745032 ENSG00000254004:ENST00000523638:exon_37001597_37006601:ZNF260 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 37854040 G/A 1 7 5 12 3.19466427705239 2.71809694496258 0.476567332089819 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 37854235 G/T 1 11 13 24 5.02018672108233 7.0670520569027 -2.04686533582036 T:G G T 10 0.543619388992515 0.419733845613331 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 38610504 G/A 1 8 4 12 3.65104488805988 2.17447755597006 1.47656733208982 A:C:G G A 10 0.543619388992515 0.564519601476267 ENSG00000105738:ENST00000222345:exon_38609946_38610522:SIPA1L3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 38652993 C/T 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 T:C C T 10 0.543619388992515 0.482069340371676 ENSG00000105738:ENST00000222345:exon_38652893_38653011:SIPA1L3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 38798086 T/C 1 58 73 131 26.4700754384341 39.6842153964536 -13.2141399580195 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0224315328204641 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38798068_38798161:YIF1B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 38800165 C/T 1 31 23 54 14.147798941232 12.5032459468278 1.64455299440419 T:C C T 10 0.543619388992515 0.684071765211742 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 39191733 C/T 1 33 29 62 15.060560163247 15.7649622807829 -0.704402117535933 T:C C T 10 0.543619388992515 0.898893276753622 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39191642_39191761:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000445727:exon_39191642_39191761:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39191642_39191761:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000495553:exon_39191642_39191761:ACTN4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 39196745 C/T 1 31 13 44 14.147798941232 7.0670520569027 7.08074688432934 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0342131277611841 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000445727:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000495553:exon_39196684_39196771:ACTN4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 39308190 C/T 1 221 195 416 100.860115032654 106.00578085354 -5.14566582088625 T:C C T 10 0.543619388992515 0.622818386402939 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39308091_39308215:ECH1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 39416887 C/T 1 8 5 13 3.65104488805988 2.71809694496258 0.932947943097304 T:C C T 10 0.543619388992515 0.782457075337367 ENSG00000104835:ENST00000448145:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000221431:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000430193:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000455102:exon_39416845_39416940:FBXO17 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 40719076 T/C 1 8 3 11 3.65104488805988 1.63085816697755 2.02018672108233 T:C T C 10 0.543619388992515 0.364880107001187 ENSG00000130758:ENST00000253055:exon_40718983_40719095:MAP3K10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 40739513 A/G 1 34 25 59 15.5169407742545 13.5904847248129 1.92645604944161 A:G A G 10 0.543619388992515 0.695486697839962 ENSG00000105221:ENST00000392038:exon_40736224_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000486368:exon_40738241_40739590:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000483166:exon_40738242_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000476266:exon_40738244_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000358335:exon_40738870_40739596:AKT2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 40882486 C/G 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 C:G C G 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000105223:ENST00000488311:exon_40882174_40882681:PLD3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 40928944 A/G 1 17 18 35 7.75847038712724 9.78514900186527 -2.02667861473803 A:G A G 10 0.543619388992515 0.502501771107115 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 40964312 G/A 1 30 28 58 13.6914183302245 15.2213428917904 -1.52992456156587 A:G G A 10 0.543619388992515 0.694713286551273 ENSG00000090013:ENST00000263368:exon_40964288_40964452:BLVRB HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 41082868 T/C 1 25 21 46 11.4095152751871 11.4160071688428 -0.00649189365569214 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000160410:ENST00000291842:exon_41082757_41082891:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000428635:exon_41082790_41082891:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000418276:exon_41082790_41082891:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000446701:exon_41082790_41082891:SHKBP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 41135475 G/A 1 17 22 39 7.75847038712724 11.9596265578353 -4.20115617070809 A:G G A 10 0.543619388992515 0.199628901265994 ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41135301_41135725:LTBP4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 41211056 T/C 1 8 8 16 3.65104488805988 4.34895511194012 -0.697910223880241 T:C T C 10 0.543619388992515 0.804399137481932 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41211001_41211086:ADCK4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 41263403 A/G 1 103 62 165 47.0072029337709 33.7044021175359 13.302800816235 A:T:G A G 10 0.543619388992515 0.0419199953396744 ENSG00000077312:ENST00000243563:exon_41263237_41263409:SNRPA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 41271104 T/C 1 120 108 228 54.7656733208982 58.7108940111916 -3.94522069029343 T:C T C 10 0.543619388992515 0.641766204822227 ENSG00000077312:ENST00000243563:exon_41270913_41271290:SNRPA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 41307170 G/A 1 31 32 63 14.147798941232 17.3958204477605 -3.24802150652845 A:G G A 10 0.543619388992515 0.448882073699071 ENSG00000171570:ENST00000303961:exon_41306244_41307320:EGLN2;ENSG00000171570:ENST00000406058:exon_41306181_41307320:EGLN2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 41774242 A/G 1 52 32 84 23.7317917723892 17.3958204477605 6.33597132462874 A:G A G 10 0.543619388992515 0.18876205334289 ENSG00000105323:ENST00000352456:exon_41774128_41774250:HNRNPUL1;ENSG00000105323:ENST00000392006:exon_41774128_41774250:HNRNPUL1;ENSG00000105323:ENST00000263367:exon_41774128_41774250:HNRNPUL1;ENSG00000105323:ENST00000378215:exon_41774128_41774250:HNRNPUL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 42463447 C/T 1 28 67 95 12.7786571082096 36.4224990624985 -23.6438419542889 T:C C T 10 0.543619388992515 1.34378022185831e-06 ENSG00000105404:ENST00000222008:exon_42463389_42463528:RABAC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 42703833 A/G 1 8 10 18 3.65104488805988 5.43619388992515 -1.78514900186527 A:G A G 10 0.543619388992515 0.480432312528866 ENSG00000160570:ENST00000403271:exon_42702752_42703981:DEDD2;ENSG00000160570:ENST00000336034:exon_42702752_42703981:DEDD2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 42753283 G/A 1 19 13 32 8.67123160914221 7.0670520569027 1.60417955223952 A:G G A 10 0.543619388992515 0.599489390025958 ENSG00000105722:ENST00000222329:exon_42751717_42753890:ERF HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 42753649 G/C 1 17 8 25 7.75847038712724 4.34895511194012 3.40951527518712 C:G G C 10 0.543619388992515 0.228156583594972 ENSG00000105722:ENST00000222329:exon_42751717_42753890:ERF HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 43979589 G/T 1 5 11 16 2.28190305503742 5.97981327891767 -3.69791022388024 T:G G T 10 0.543619388992515 0.0791368382267459 ENSG00000176531:ENST00000292140:exon_43979255_43979696:PHLDB3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 44055726 T/C 1 12 18 30 5.47656733208982 9.78514900186527 -4.30858166977545 T:C:G T C 10 0.543619388992515 0.142151911386108 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44055723_44055839:XRCC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 44153100 A/G 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 A:G A G 10 0.543619388992515 0.482069340371676 ENSG00000011422:ENST00000340093:exon_44152732_44153295:PLAUR;ENSG00000011422:ENST00000221264:exon_44152732_44153295:PLAUR HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 45490570 A/G 1 11 4 15 5.02018672108233 2.17447755597006 2.84570916511227 A:G A G 10 0.543619388992515 0.195223530265793 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 45490636 T/C 1 9 7 16 4.10742549906736 3.80533572294761 0.302089776119759 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 45571781 T/C 1 7 3 10 3.19466427705239 1.63085816697755 1.56380611007485 T:C T C 10 0.543619388992515 0.3622898906741 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 45854919 T/G 1 25 14 39 11.4095152751871 7.61067144589521 3.79884382929191 T:G T G 10 0.543619388992515 0.261499610536896 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45854853_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45854853_45854979:ERCC2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 45855524 G/A 1 29 26 55 13.2350377192171 14.1341041138054 -0.899066394588328 A:G G A 10 0.543619388992515 0.892501417732836 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45855467_45855610:ERCC2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 46124517 C/T 1 28 20 48 12.7786571082096 10.8723877798503 1.90626932835928 T:C C T 10 0.543619388992515 0.664484784040425 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46124465_46124590:EML2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 46269076 G/A 1 7 6 13 3.19466427705239 3.26171633395509 -0.0670520569026953 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 46319415 G/C 1 87 83 170 39.7051131576512 45.1204092863788 -5.41529612872756 C:G G C 10 0.543619388992515 0.441457833588732 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46319109_46319441:SYMPK HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 46387503 T/C 1 19 20 39 8.67123160914221 10.8723877798503 -2.20115617070809 T:C T C 10 0.543619388992515 0.522217703040714 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 46388379 C/G 1 14 14 28 6.38932855410479 7.61067144589521 -1.22134289179042 C:G C G 10 0.543619388992515 0.706220125728953 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 46518651 A/G 1 12 2 14 5.47656733208982 1.08723877798503 4.38932855410479 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0280930560389015 ENSG00000104983:ENST00000263284:exon_46518603_46518685:CCDC61 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 46518682 G/A 1 12 1 13 5.47656733208982 0.543619388992515 4.9329479430973 A:C:G G A 10 0.543619388992515 0.00492828564317015 ENSG00000104983:ENST00000263284:exon_46518603_46518685:CCDC61 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 46891914 C/T 1 41 43 84 18.7116050513069 23.3756337266781 -4.66402867537126 T:C C T 10 0.543619388992515 0.325350188533361 ENSG00000011485:ENST00000012443:exon_46891810_46891988:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000451918:exon_46891810_46891988:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000478046:exon_46891810_46891988:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000391919:exon_46891810_46891988:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000487483:exon_46891810_46891988:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000486994:exon_46891810_46891988:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000491003:exon_46891810_46891988:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000525507:exon_46891810_46891988:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000527623:exon_46891183_46891988:PPP5C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 47278859 C/G 1 116 109 225 52.9401508768683 59.2545134001841 -6.31436252331589 T:C:G C G 10 0.543619388992515 0.422090319261898 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47278140_47279004:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47278140_47279004:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47278142_47279004:SLC1A5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 47700542 T/C 1 20 25 45 9.1276122201497 13.5904847248129 -4.46287250466318 T:C T C 10 0.543619388992515 0.2308712664497 ENSG00000142230:ENST00000414294:exon_47700490_47700634:SAE1;ENSG00000142230:ENST00000270225:exon_47700490_47700634:SAE1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 48621036 C/G 1 19 26 45 8.67123160914221 14.1341041138054 -5.46287250466318 C:G C G 10 0.543619388992515 0.133636041334022 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48620895_48621038:LIG1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 48715153 T/C 1 5 8 13 2.28190305503742 4.34895511194012 -2.0670520569027 T:C T C 10 0.543619388992515 0.276871294907228 ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48711361_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48711513_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000377461:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518979:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520753:exon_48713744_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000357778:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48714047_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48714409_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520015:exon_48714634_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48714823_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48715084_48715232:CARD8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 48722180 C/T 1 8 8 16 3.65104488805988 4.34895511194012 -0.697910223880241 T:C C T 10 0.543619388992515 0.804399137481932 ENSG00000105483:ENST00000518450:exon_48722128_48722210:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000517510:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48722128_48722269:CARD8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 49377436 G/C 1 114 91 205 52.0273896548533 49.4693643983189 2.55802525653442 T:C:G G C 10 0.543619388992515 0.726618787764665 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 49378994 A/G 1 81 89 170 36.9668294916063 48.3821256203338 -11.4152961287276 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0900305706748592 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 49379167 C/T 1 72 77 149 32.8594039925389 41.8586929524237 -8.99928895988474 T:C C T 10 0.543619388992515 0.139809852045056 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 49379182 G/C 1 85 78 163 38.7923519356362 42.4023123414162 -3.60996040577996 T:C:G G C 10 0.543619388992515 0.582759850937487 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 49469177 A/G 1 28 49 77 12.7786571082096 26.6373500606332 -13.8586929524237 A:G A G 10 0.543619388992515 0.00184599912592311 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 49513273 C/T 1 145 104 249 66.1751885960853 56.5364164552216 9.63877214086376 T:C C T 10 0.543619388992515 0.227260743711224 ENSG00000183207:ENST00000221413:exon_49513230_49513323:RUVBL2;ENSG00000183207:ENST00000413176:exon_49513230_49513428:RUVBL2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 49839015 T/C 1 339 348 687 154.713027131537 189.179547369395 -34.4665202378578 T:C T C 10 0.543619388992515 0.00915839299535244 ENSG00000104894:ENST00000323906:exon_49838971_49839043:CD37;ENSG00000104894:ENST00000391859:exon_49838971_49839043:CD37;ENSG00000104894:ENST00000426897:exon_49838971_49839043:CD37 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 49949589 A/T 1 11 14 25 5.02018672108233 7.61067144589521 -2.59048472481288 A:T:G A T 10 0.543619388992515 0.321033229722111 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49949556_49949680:PIH1D1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 49950298 C/T 1 88 38 126 40.1614937686587 20.6575367817156 19.5039569869431 T:C C T 10 0.543619388992515 0.000453012645923965 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49950281_49950356:PIH1D1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 49950356 C/G 1 69 38 107 31.4902621595165 20.6575367817156 10.8327253778009 C:G C G 10 0.543619388992515 0.0411335108656178 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49950281_49950356:PIH1D1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 49954803 C/T 1 63 52 115 28.7519784934716 28.2682082276108 0.48377026586077 A:T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 49954807 T/G 1 60 54 114 27.3828366604491 29.3554470055958 -1.97261034514672 T:G T G 10 0.543619388992515 0.708194794738551 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 49964968 C/T 1 6 4 10 2.73828366604491 2.17447755597006 0.56380611007485 T:C C T 10 0.543619388992515 0.763129400865595 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49964876_49965057:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49964876_49965057:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000433981:exon_49964876_49965225:ALDH16A1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 49964977 C/G 1 4 6 10 1.82552244402994 3.26171633395509 -1.43619388992515 C:G C G 10 0.543619388992515 0.528005019910346 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49964876_49965057:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49964876_49965057:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000433981:exon_49964876_49965225:ALDH16A1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 49965173 A/T 1 10 2 12 4.56380611007485 1.08723877798503 3.47656733208982 A:T A T 10 0.543619388992515 0.0776119795169345 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49965141_49965293:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000433981:exon_49964876_49965225:ALDH16A1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 49967680 G/A 1 15 9 24 6.84570916511227 4.89257450093264 1.95313466417964 A:G G A 10 0.543619388992515 0.539908191437424 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49967674_49967779:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49967674_49967779:ALDH16A1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 49994470 T/A 1 8 11 19 3.65104488805988 5.97981327891767 -2.32876839085779 A:T T A 10 0.543619388992515 0.358321729715676 ENSG00000142541:ENST00000488946:exon_49993107_49994804:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000472481:exon_49994036_49994485:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476268:exon_49993104_49994523:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000468655:exon_49994297_49994483:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476300:exon_49994297_49994804:RPL13A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 49994476 T/C 1 8 11 19 3.65104488805988 5.97981327891767 -2.32876839085779 T:C T C 10 0.543619388992515 0.358321729715676 ENSG00000142541:ENST00000488946:exon_49993107_49994804:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000472481:exon_49994036_49994485:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476268:exon_49993104_49994523:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000468655:exon_49994297_49994483:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476300:exon_49994297_49994804:RPL13A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 50017724 C/T 1 4 10 14 1.82552244402994 5.43619388992515 -3.61067144589521 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0623608135025025 ENSG00000104870:ENST00000221466:exon_50017468_50017743:FCGRT;ENSG00000104870:ENST00000426395:exon_50017468_50017743:FCGRT;ENSG00000104870:ENST00000415900:exon_50017697_50017743:FCGRT;ENSG00000104870:ENST00000452439:exon_50017468_50017743:FCGRT HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 50140092 G/A 1 14 10 24 6.38932855410479 5.43619388992515 0.953134664179639 A:G G A 10 0.543619388992515 0.838302661714442 ENSG00000126458:ENST00000246792:exon_50140081_50140183:RRAS HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 50312653 C/T 1 7 11 18 3.19466427705239 5.97981327891767 -2.78514900186527 T:C C T 10 0.543619388992515 0.237876828195976 ENSG00000010361:ENST00000525130:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000528094:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000533418:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000529634:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000525370:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000313777:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000377092:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000445575:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000527973:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000529004:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000528043:exon_50312652_50312832:FUZ HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 50383636 T/C 1 29 14 43 13.2350377192171 7.61067144589521 5.62436627332185 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0932170163845377 ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50383536_50383659:TBC1D17 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 50411742 A/G 1 120 122 242 54.7656733208982 66.3215654570868 -11.5558921361886 A:G A G 10 0.543619388992515 0.138213041537428 ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 50412417 G/A 1 40 30 70 18.2552244402994 16.3085816697755 1.94664277052394 A:G G A 10 0.543619388992515 0.719236967075168 ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 50412788 C/T 1 59 57 116 26.9264560494416 30.9863051725734 -4.05984912313174 T:C C T 10 0.543619388992515 0.457305683937788 ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62;ENSG00000161640:ENST00000451973:exon_50412758_50413141:SIGLEC11 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 50435747 T/C 1 100 78 178 45.6380611007485 42.4023123414162 3.23574875933232 T:C T C 10 0.543619388992515 0.652131420925282 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 50863023 A/G 1 5 6 11 2.28190305503742 3.26171633395509 -0.979813278917665 A:G A G 10 0.543619388992515 0.56306921306608 ENSG00000131400:ENST00000253719:exon_50862997_50863119:NAPSA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 50926264 T/C 1 43 33 76 19.6243662733219 17.939439836753 1.68492643656886 T:C T C 10 0.543619388992515 0.730880145339888 ENSG00000142539:ENST00000270632:exon_50926080_50926294:SPIB;ENSG00000142539:ENST00000417618:exon_50926080_50926294:SPIB HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 51323473 C/G 1 62 77 139 28.2955978824641 41.8586929524237 -13.5630950699596 A:T:C:G C G 10 0.543619388992515 0.0215907644231704 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 51323501 A/G 1 61 91 152 27.8392172714566 49.4693643983189 -21.6301471268623 A:G A G 10 0.543619388992515 0.000580647867673414 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 52887904 T/C 1 1 7 8 0.456380611007485 3.80533572294761 -3.34895511194012 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0274430116751054 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 54377408 G/T 1 15 8 23 6.84570916511227 4.34895511194012 2.49675405317215 T:G G T 10 0.543619388992515 0.403068770543004 ENSG00000179820:ENST00000421337:exon_54376782_54377510:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000336967:exon_54376782_54379682:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000391770:exon_54376782_54379691:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000439000:exon_54376782_54377561:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000391771:exon_54376782_54379682:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000391769:exon_54376782_54379689:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000391768:exon_54376782_54377873:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000415619:exon_54377207_54377752:MYADM HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 54611734 A/G 1 3 8 11 1.36914183302245 4.34895511194012 -2.97981327891767 A:G A G 10 0.543619388992515 0.126408424019807 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 54627915 C/T 1 27 22 49 12.3222764972021 11.9596265578353 0.362649939366761 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000105618:ENST00000321030:exon_54627878_54628035:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000445811:exon_54627878_54628033:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000263436:exon_54627878_54628035:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000419967:exon_54627878_54628035:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000445124:exon_54627878_54628009:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000447810:exon_54627878_54627962:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000391755:exon_54627878_54628035:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000466404:exon_54627878_54628035:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000498612:exon_54627878_54628035:PRPF31 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 54634830 C/T 1 80 73 153 36.5104488805988 39.6842153964536 -3.1737665158548 T:C C T 10 0.543619388992515 0.626818678991102 ENSG00000105618:ENST00000321030:exon_54634738_54635140:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000263436:exon_54634769_54634867:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000419967:exon_54634738_54635140:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000391755:exon_54634738_54635140:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000466404:exon_54634738_54635140:PRPF31 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 54711258 T/G 1 47 62 109 21.4498887173518 33.7044021175359 -12.2545134001841 A:T:G T G 10 0.543619388992515 0.020775490615257 ENSG00000170889:ENST00000402367:exon_54710421_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000441429:exon_54710144_54711498:RPS9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 55143491 G/T 1 8 16 24 3.65104488805988 8.69791022388024 -5.04686533582036 T:G G T 10 0.543619388992515 0.0419613344019655 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 55143982 T/C 1 14 15 29 6.38932855410479 8.15429083488773 -1.76496228078294 T:C T C 10 0.543619388992515 0.577774847845697 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143915_55144211:LILRB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 55144623 C/T 1 16 9 25 7.30208977611976 4.89257450093264 2.40951527518712 T:C C T 10 0.543619388992515 0.423109955424406 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000473412:exon_55144577_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000462628:exon_55144594_55144695:LILRB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 55144684 G/A 1 13 4 17 5.9329479430973 2.17447755597006 3.75847038712724 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0875593850290938 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000473412:exon_55144577_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000462628:exon_55144594_55144695:LILRB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 55145093 G/C 1 11 5 16 5.02018672108233 2.71809694496258 2.30208977611976 C:G G C 10 0.543619388992515 0.318708928468121 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000473412:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000462628:exon_55145089_55145139:LILRB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 55176262 A/G 1 12 5 17 5.47656733208982 2.71809694496258 2.75847038712724 A:G A G 10 0.543619388992515 0.226307172659728 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55176250_55176300:LILRB4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 55178162 A/G 1 18 23 41 8.21485099813473 12.5032459468278 -4.28839494869312 A:G A G 10 0.543619388992515 0.2100457186274 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000484241:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000470943:exon_55178145_55178841:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000461262:exon_55178148_55178489:LILRB4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 55179364 A/G 1 28 23 51 12.7786571082096 12.5032459468278 0.275411161381733 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55179324_55181810:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55179324_55179844:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55179324_55179855:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55179324_55179848:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55179324_55179848:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55179324_55179848:LILRB4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 55494651 A/G 0 0 16 16 0 8.69791022388024 -8.69791022388024 G A G 10 0.543619388992515 3.5418891689264e-06 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 55494740 T/C 0 0 12 12 0 6.52343266791018 -6.52343266791018 C T C 10 0.543619388992515 8.16443668609228e-05 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 55494881 C/G 0 0 17 17 0 9.24152961287276 -9.24152961287276 G C G 10 0.543619388992515 1.61644954303542e-06 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 55614923 T/C 1 11 9 20 5.02018672108233 4.89257450093264 0.127612220149699 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55614777_55614936:PPP1R12C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 55858033 G/C 1 5 7 12 2.28190305503742 3.80533572294761 -1.52343266791018 C:G G C 10 0.543619388992515 0.400734857745032 ENSG00000133247:ENST00000255613:exon_55857868_55858055:SUV420H2;ENSG00000133247:ENST00000445196:exon_55857868_55858055:SUV420H2;ENSG00000133247:ENST00000460956:exon_55857868_55858043:SUV420H2;ENSG00000133247:ENST00000474492:exon_55857868_55858055:SUV420H2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 55994240 C/T 1 10 6 16 4.56380611007485 3.26171633395509 1.30208977611976 T:C C T 10 0.543619388992515 0.619661436202725 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 55995272 G/A 1 17 10 27 7.75847038712724 5.43619388992515 2.32227649720209 A:G G A 10 0.543619388992515 0.441804788079756 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 55998262 C/T 1 12 10 22 5.47656733208982 5.43619388992515 0.0403734421646691 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000090971:ENST00000205194:exon_55997775_55998935:NAT14 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 58018618 A/G 1 6 3 9 2.73828366604491 1.63085816697755 1.10742549906736 A:G A G 10 0.543619388992515 0.522625694750698 ENSG00000152439:ENST00000282292:exon_58017726_58019508:ZNF773;ENSG00000152439:ENST00000430084:exon_58017726_58019508:ZNF773 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 58153000 T/C 1 2 8 10 0.91276122201497 4.34895511194012 -3.43619388992515 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0512654070160484 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 58153009 C/T 1 2 8 10 0.91276122201497 4.34895511194012 -3.43619388992515 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0512654070160484 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 58153577 T/C 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 58596449 C/T 1 4 10 14 1.82552244402994 5.43619388992515 -3.61067144589521 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0623608135025025 ENSG00000176293:ENST00000515535:exon_58595587_58597677:ZNF135;ENSG00000121413:ENST00000240727:exon_58595210_58596746:ZSCAN18;ENSG00000121413:ENST00000433686:exon_58595212_58596746:ZSCAN18;ENSG00000121413:ENST00000402070:exon_58595212_58596746:ZSCAN18;ENSG00000121413:ENST00000421612:exon_58595212_58596743:ZSCAN18 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 19 58774071 A/G 1 14 23 37 6.38932855410479 12.5032459468278 -6.11391739272306 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0481174562339039 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000441758:exon_58773743_58774120:ZNF544 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 272203 C/T 1 3 6 9 1.36914183302245 3.26171633395509 -1.89257450093264 T:C C T 10 0.543619388992515 0.316548245109532 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000407983:exon_272037_272557:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000439645:exon_272192_272630:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405364:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405233:exon_272192_273155:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_272192_272305:ACP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 277003 A/G 1 69 74 143 31.4902621595165 40.2278347854461 -8.73757262592965 A:G A G 10 0.543619388992515 0.153665222329971 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000442386:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000484464:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000463831:exon_276980_277085:ACP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 3502709 A/G 1 27 32 59 12.3222764972021 17.3958204477605 -5.07354395055839 A:G A G 10 0.543619388992515 0.193313824440848 ENSG00000182551:ENST00000327435:exon_3501693_3502853:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000382093:exon_3502224_3502853:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000415131:exon_3502432_3502853:ADI1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 3504687 A/G 1 7 8 15 3.19466427705239 4.34895511194012 -1.15429083488773 A:G A G 10 0.543619388992515 0.610096871559822 ENSG00000182551:ENST00000327435:exon_3504585_3504764:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000382093:exon_3504585_3504764:ADI1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 3597974 T/C 1 11 13 24 5.02018672108233 7.0670520569027 -2.04686533582036 T:C T C 10 0.543619388992515 0.419733845613331 ENSG00000171865:ENST00000436842:exon_3597963_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000315212:exon_3597963_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000464986:exon_3597714_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000454734:exon_3597964_3598062:RNASEH1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 6990020 C/T 1 2 6 8 0.91276122201497 3.26171633395509 -2.34895511194012 T:C C T 10 0.543619388992515 0.153435168169122 ENSG00000134326:ENST00000256722:exon_6988447_6990104:CMPK2;ENSG00000134326:ENST00000478738:exon_6988449_6990104:CMPK2;ENSG00000134326:ENST00000491738:exon_6990020_6990104:CMPK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 15735648 T/C 1 8 1 9 3.65104488805988 0.543619388992515 3.10742549906736 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0455406737348372 ENSG00000079785:ENST00000381341:exon_15735614_15735677:DDX1;ENSG00000079785:ENST00000233084:exon_15735614_15735677:DDX1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 18736630 C/T 1 16 11 27 7.30208977611976 5.97981327891767 1.32227649720209 T:C C T 10 0.543619388992515 0.700999748325707 ENSG00000240857:ENST00000381249:exon_18735989_18737074:RDH14;ENSG00000240857:ENST00000468071:exon_18736388_18737074:RDH14 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 25046207 C/T 1 11 6 17 5.02018672108233 3.26171633395509 1.75847038712724 T:C C T 10 0.543619388992515 0.470285892368413 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000485887:exon_25046078_25046232:ADCY3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 25384169 G/A 1 7 2 9 3.19466427705239 1.08723877798503 2.10742549906736 A:G G A 10 0.543619388992515 0.194613573468504 ENSG00000115138:ENST00000380794:exon_25383722_25384621:POMC;ENSG00000115138:ENST00000405623:exon_25383784_25384621:POMC;ENSG00000115138:ENST00000264708:exon_25383854_25384621:POMC;ENSG00000115138:ENST00000395826:exon_25383922_25384621:POMC;ENSG00000115138:ENST00000449220:exon_25384015_25384621:POMC HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 26507789 T/C 1 39 42 81 17.7988438292919 22.8320143376856 -5.03317050839372 T:C T C 10 0.543619388992515 0.266870389729485 ENSG00000138029:ENST00000317799:exon_26507751_26507825:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000405867:exon_26507751_26507825:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000494615:exon_26507751_26507825:HADHB HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 27260469 G/A 1 9 10 19 4.10742549906736 5.43619388992515 -1.32876839085779 A:G G A 10 0.543619388992515 0.646867751304706 ENSG00000119777:ENST00000321326:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000238788:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000404032:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000435172:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000475258:exon_27260429_27260532:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000425720:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000460904:exon_27260429_27260683:TMEM214 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 27293150 G/T 1 8 2 10 3.65104488805988 1.08723877798503 2.56380611007485 T:G G T 10 0.543619388992515 0.122752294666106 ENSG00000084693:ENST00000487078:exon_27292960_27293490:AGBL5;ENSG00000084693:ENST00000360131:exon_27292960_27293488:AGBL5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 27676287 A/T 1 6 2 8 2.73828366604491 1.08723877798503 1.65104488805988 A:T A T 10 0.543619388992515 0.303950947229235 ENSG00000138002:ENST00000260570:exon_27676251_27676380:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000509128:exon_27676251_27676380:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000507184:exon_27676251_27676380:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000425023:exon_27676251_27676380:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000450564:exon_27676251_27676380:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000443889:exon_27676251_27676380:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000475909:exon_27676251_27676380:IFT172 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 29092679 T/C 1 8 14 22 3.65104488805988 7.61067144589521 -3.95962655783533 T:C T C 10 0.543619388992515 0.132255633527639 ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29092445_29093167:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29092445_29093161:TRMT61B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 29092850 G/T 1 7 9 16 3.19466427705239 4.89257450093264 -1.69791022388024 T:G G T 10 0.543619388992515 0.456567971750714 ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29092445_29093167:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29092445_29093161:TRMT61B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 29152456 A/G 1 9 10 19 4.10742549906736 5.43619388992515 -1.32876839085779 A:G A G 10 0.543619388992515 0.646867751304706 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29152445_29152576:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000466067:exon_29152445_29152576:WDR43 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 30381505 T/C 1 28 24 52 12.7786571082096 13.0468653358204 -0.268208227610781 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000119801:ENST00000379520:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000379519:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470653:exon_30381296_30381739:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000261353:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000493029:exon_30381374_30381856:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402003:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000408026:exon_30381485_30382422:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402708:exon_30381485_30382417:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470120:exon_30381485_30381832:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000492439:exon_30381485_30381613:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000495673:exon_30381485_30382004:YPEL5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 32800422 C/G 1 5 4 9 2.28190305503742 2.17447755597006 0.107425499067364 C:G C G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32800223_32800433:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32800223_32800433:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000471232:exon_32800223_32800433:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000470250:exon_32800358_32800433:BIRC6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 32822957 G/A 1 9 3 12 4.10742549906736 1.63085816697755 2.47656733208982 A:G G A 10 0.543619388992515 0.24567828862345 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32822818_32823035:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32822818_32823035:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000471232:exon_32822818_32823035:BIRC6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 32983526 C/T 1 9 15 24 4.10742549906736 8.15429083488773 -4.04686533582036 T:C C T 10 0.543619388992515 0.104942104447151 ENSG00000018699:ENST00000317907:exon_32983359_32983586:TTC27;ENSG00000018699:ENST00000433416:exon_32983359_32983586:TTC27 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 37456032 C/T 1 40 29 69 18.2552244402994 15.7649622807829 2.49026215951646 T:C C T 10 0.543619388992515 0.629159945872898 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37454687_37456179:CEBPZ;ENSG00000115816:ENST00000446769:exon_37455751_37456179:CEBPZ HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 37494591 A/G 1 5 3 8 2.28190305503742 1.63085816697755 0.65104488805988 A:G A G 10 0.543619388992515 0.734792052639277 ENSG00000115825:ENST00000379066:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000234179:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000469275:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000452104:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000443977:exon_37494573_37494679:PRKD3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 38298139 T/C 1 3 6 9 1.36914183302245 3.26171633395509 -1.89257450093264 T:C T C 10 0.543619388992515 0.316548245109532 ENSG00000138061:ENST00000260630:exon_38294652_38298453:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000494864:exon_38297209_38298453:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000407341:exon_38297625_38298453:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000492443:exon_38298130_38298453:CYP1B1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 38298150 A/G 1 3 6 9 1.36914183302245 3.26171633395509 -1.89257450093264 A:G A G 10 0.543619388992515 0.316548245109532 ENSG00000138061:ENST00000260630:exon_38294652_38298453:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000494864:exon_38297209_38298453:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000407341:exon_38297625_38298453:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000492443:exon_38298130_38298453:CYP1B1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 39025555 G/A 1 11 6 17 5.02018672108233 3.26171633395509 1.75847038712724 A:G G A 10 0.543619388992515 0.470285892368413 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39024871_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000423682:exon_39025515_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000452978:exon_39024878_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39025110_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39025422_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000477981:exon_39025494_39025584:DHX57 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 39050141 A/C 1 8 2 10 3.65104488805988 1.08723877798503 2.56380611007485 A:C A C 10 0.543619388992515 0.122752294666106 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000452978:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39050135_39050411:DHX57 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 42990010 C/A 1 11 18 29 5.02018672108233 9.78514900186527 -4.76496228078294 A:C C A 10 0.543619388992515 0.0928937465203734 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 42990101 G/C 1 10 7 17 4.56380611007485 3.80533572294761 0.758470387127244 C:G G C 10 0.543619388992515 0.810304562557129 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 42991200 C/G 1 5 8 13 2.28190305503742 4.34895511194012 -2.0670520569027 C:G C G 10 0.543619388992515 0.276871294907228 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 45640374 C/A 1 6 3 9 2.73828366604491 1.63085816697755 1.10742549906736 A:C C A 10 0.543619388992515 0.522625694750698 ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45640253_45640432:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45640253_45640432:SRBD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 45645512 C/T 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 T:C C T 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45645504_45645680:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45645504_45645680:SRBD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 55771161 A/G 1 28 30 58 12.7786571082096 16.3085816697755 -3.52992456156587 A:G A G 10 0.543619388992515 0.359468749040614 ENSG00000163001:ENST00000339012:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000349456:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000407816:exon_55771161_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000490934:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000481791:exon_55771156_55771505:CCDC104 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 55844445 T/C 1 4 7 11 1.82552244402994 3.80533572294761 -1.97981327891767 T:C T C 10 0.543619388992515 0.245254265630413 ENSG00000138041:ENST00000272313:exon_55844280_55844749:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000407823:exon_55844280_55844758:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000345102:exon_55844280_55844723:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000424063:exon_55844280_55844796:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000477749:exon_55844280_55845113:SMEK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 58316814 A/G 1 9 9 18 4.10742549906736 4.89257450093264 -0.785149001865271 A:G A G 10 0.543619388992515 0.81438018796475 ENSG00000028116:ENST00000435505:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000417641:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000412104:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000423109:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000394539:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000437272:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000340157:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000432057:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000440705:exon_58316766_58316858:VRK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 58388696 A/G 1 11 25 36 5.02018672108233 13.5904847248129 -8.57029800373054 A:G A G 10 0.543619388992515 0.00655798514682788 ENSG00000115392:ENST00000403295:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000233741:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000402135:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000403676:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000449070:exon_58388657_58388773:FANCL HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 61415492 A/G 1 36 28 64 16.4297019962695 15.2213428917904 1.20835910447904 A:G A G 10 0.543619388992515 0.802757918721385 ENSG00000173209:ENST00000403692:exon_61415044_61416060:AHSA2;ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398569:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000263989:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000411912:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000436269:exon_61414685_61415844:USP34 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 61417617 A/G 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 A:G A G 10 0.543619388992515 1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 62054286 C/A 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 A:C C A 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000170264:ENST00000450831:exon_62054239_62054393:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000456262:exon_62054239_62054393:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000418113:exon_62054239_62054393:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000404929:exon_62054239_62054393:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000405894:exon_62054239_62054393:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000478494:exon_62054239_62054393:FAM161A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 65245365 G/A 1 12 4 16 5.47656733208982 2.17447755597006 3.30208977611976 A:G G A 10 0.543619388992515 0.131728801922986 ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65245205_65245399:SLC1A4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 65248271 G/A 1 19 18 37 8.67123160914221 9.78514900186527 -1.11391739272306 A:G G A 10 0.543619388992515 0.743430390513204 ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65248046_65250997:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65248046_65248528:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65248046_65250999:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65248046_65250997:SLC1A4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 65495887 G/A 1 50 55 105 22.8190305503742 29.8990663945883 -7.08003584421408 A:G G A 10 0.543619388992515 0.171248901264166 ENSG00000138071:ENST00000260641:exon_65495698_65498387:ACTR2;ENSG00000138071:ENST00000377982:exon_65495698_65497280:ACTR2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 67631831 G/A 1 9 6 15 4.10742549906736 3.26171633395509 0.845709165112274 A:G G A 10 0.543619388992515 0.797605664193983 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 67637196 G/A 1 19 14 33 8.67123160914221 7.61067144589521 1.060560163247 A:G G A 10 0.543619388992515 0.730932452746069 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67637043_67637677:ETAA1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 68385097 A/G 1 13 14 27 5.9329479430973 7.61067144589521 -1.67772350279791 A:G A G 10 0.543619388992515 0.56531671981011 ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68384928_68385254:PPP3R1;ENSG00000115946:ENST00000263657:exon_68384976_68385273:PNO1;ENSG00000115946:ENST00000430742:exon_68385049_68385273:PNO1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 68388823 A/G 1 19 13 32 8.67123160914221 7.0670520569027 1.60417955223952 A:G A G 10 0.543619388992515 0.599489390025958 ENSG00000115946:ENST00000263657:exon_68388815_68388898:PNO1;ENSG00000115946:ENST00000430742:exon_68388815_68388898:PNO1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 70033584 C/T 1 10 9 19 4.56380611007485 4.89257450093264 -0.328768390857786 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000196975:ENST00000477632:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000394295:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000460439:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000460942:exon_70033517_70033630:ANXA4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 70377653 G/A 1 6 6 12 2.73828366604491 3.26171633395509 -0.52343266791018 A:G G A 10 0.543619388992515 0.779998482964206 ENSG00000115998:ENST00000264434:exon_70377012_70377696:C2orf42;ENSG00000115998:ENST00000420306:exon_70377030_70377696:C2orf42 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 70524577 G/A 1 64 48 112 29.208359104479 26.0937306716407 3.11462843283832 A:G G A 10 0.543619388992515 0.570710177002613 ENSG00000035141:ENST00000037869:exon_70523107_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000460307:exon_70523108_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000450256:exon_70524143_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000430566:exon_70524308_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000438759:exon_70524558_70524609:FAM136A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 71351487 G/A 1 7 6 13 3.19466427705239 3.26171633395509 -0.0670520569026953 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000124370:ENST00000244217:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000466481:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000486135:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000494660:exon_71351477_71351673:MCEE HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 71360144 A/C 1 21 17 38 9.58399283115718 9.24152961287276 0.342463218284429 A:C A C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 71360625 G/T 1 37 24 61 16.8860826072769 13.0468653358204 3.83921727145658 T:G G T 10 0.543619388992515 0.368990241927300 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 71365676 G/A 1 19 20 39 8.67123160914221 10.8723877798503 -2.20115617070809 A:G G A 10 0.543619388992515 0.522217703040714 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71365620_71366343:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 71376999 G/A 1 63 53 116 28.7519784934716 28.8118276166033 -0.0598491231317482 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71376996_71377230:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000493360:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 73828538 G/A 1 7 6 13 3.19466427705239 3.26171633395509 -0.0670520569026953 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73828322_73828563:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73828322_73828563:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73828322_73828563:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000464408:exon_73828322_73828563:ALMS1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 74593928 T/C 1 38 35 73 17.3424632182844 19.026678614738 -1.6842153964536 T:C T C 10 0.543619388992515 0.725289462390817 ENSG00000204843:ENST00000361874:exon_74593910_74594059:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409348:exon_74593910_74594059:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000394003:exon_74593910_74594059:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000393999:exon_74593910_74594059:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000407639:exon_74593910_74594059:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000434055:exon_74593910_74594059:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409438:exon_74593910_74594059:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409240:exon_74593910_74594059:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409868:exon_74593910_74594059:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000466110:exon_74593586_74594059:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409567:exon_74593910_74594059:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000495643:exon_74593910_74594059:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000362071:exon_74593910_74594059:DCTN1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 74688563 C/T 1 56 56 112 25.5573142164192 30.4426857835808 -4.88537156716168 T:C C T 10 0.543619388992515 0.393429199202072 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74688184_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74688185_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000409065:exon_74688196_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74688197_74690139:MOGS HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 74690039 G/A 1 13 8 21 5.9329479430973 4.34895511194012 1.58399283115718 A:G G A 10 0.543619388992515 0.520202888001635 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74688184_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74688185_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000409065:exon_74688196_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74688197_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74689123_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74689902_74690139:MOGS HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 74719816 G/A 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 A:G G A 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000115282:ENST00000489152:exon_74719131_74721686:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000424122:exon_74719773_74719874:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000449459:exon_74719266_74720210:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000464241:exon_74719773_74719874:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000410003:exon_74719266_74721686:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000433490:exon_74719803_74719874:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000491252:exon_74719773_74719874:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000233623:exon_74719773_74719874:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000487623:exon_74719773_74719940:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000414247:exon_74719803_74719874:TTC31 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 75882399 G/A 1 42 37 79 19.1679856623144 20.1139173927231 -0.945931730408688 A:C:G G A 10 0.543619388992515 0.910170924491502 ENSG00000115364:ENST00000393909:exon_75882190_75884986:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000409374:exon_75882190_75882428:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000453233:exon_75882190_75882428:MRPL19 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 85553784 C/T 1 6 7 13 2.73828366604491 3.80533572294761 -1.0670520569027 T:C C T 10 0.543619388992515 0.588111803651177 ENSG00000152291:ENST00000377386:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000282120:exon_85553631_85553927:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000398263:exon_85553631_85553927:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409232:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409015:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000444342:exon_85553631_85554808:TGOLN2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 85554080 G/A 1 10 9 19 4.56380611007485 4.89257450093264 -0.328768390857786 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000152291:ENST00000377386:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409232:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409015:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000444342:exon_85553631_85554808:TGOLN2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 85628983 C/T 1 62 46 108 28.2955978824641 25.0064918936557 3.28910598880837 T:C C T 10 0.543619388992515 0.562859184574348 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000439385:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000449030:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000447219:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000459793:exon_85628908_85629281:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409275:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000415012:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000491267:exon_85628768_85629281:CAPG HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 85843431 C/T 1 8 7 15 3.65104488805988 3.80533572294761 -0.154290834887726 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000168883:ENST00000409268:exon_85843215_85843586:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409025:exon_85843266_85843586:USP39;ENSG00000168883:ENST00000455732:exon_85843275_85843579:USP39;ENSG00000168883:ENST00000452873:exon_85843275_85843435:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409470:exon_85843292_85843586:USP39;ENSG00000168883:ENST00000323701:exon_85843309_85843586:USP39;ENSG00000168883:ENST00000458268:exon_85843310_85843586:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409766:exon_85843317_85843586:USP39;ENSG00000168883:ENST00000493829:exon_85843413_85843586:USP39 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 86756381 T/G 1 21 20 41 9.58399283115718 10.8723877798503 -1.28839494869312 T:G T G 10 0.543619388992515 0.754634353816566 ENSG00000115561:ENST00000263856:exon_86756341_86756520:VPS24;ENSG00000115561:ENST00000439940:exon_86756341_86756520:VPS24;ENSG00000115561:ENST00000450459:exon_86756341_86756520:VPS24;ENSG00000115561:ENST00000409225:exon_86756341_86756520:VPS24;ENSG00000115561:ENST00000393773:exon_86756341_86756520:VPS24;ENSG00000115561:ENST00000409810:exon_86756341_86756520:VPS24;ENSG00000115561:ENST00000486404:exon_86756341_86756520:VPS24;ENSG00000115561:ENST00000466032:exon_86756341_86756520:VPS24;ENSG00000249884:ENST00000440757:exon_86756341_86756520:RP11-269K22.1;ENSG00000249884:ENST00000409384:exon_86756374_86756520:RP11-269K22.1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 89161113 C/G 1 6 2 8 2.73828366604491 1.08723877798503 1.65104488805988 C:G C G 10 0.543619388992515 0.303950947229235 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 96690576 G/A 0 0 9 9 0 4.89257450093264 -4.89257450093264 A G A 10 0.543619388992515 0.000858904086678645 ENSG00000186281:ENST00000486463:exon_96690521_96690591:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000359548:exon_96690521_96690591:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000434632:exon_96690521_96690591:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000453542:exon_96690521_96690591:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000398024:exon_96690521_96690591:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000335448:exon_96690521_96690591:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000377137:exon_96690521_96690591:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000484440:exon_96690521_96690591:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000471757:exon_96690521_96691351:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000482704:exon_96690521_96691351:GPAT2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 96859034 A/G 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 A:G A G 10 0.543619388992515 0.482069340371676 ENSG00000084090:ENST00000337288:exon_96858980_96859090:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000393595:exon_96858980_96859090:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000443962:exon_96858980_96859090:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000495687:exon_96858869_96859090:STARD7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 96861159 C/G 1 3 6 9 1.36914183302245 3.26171633395509 -1.89257450093264 C:G C G 10 0.543619388992515 0.316548245109532 ENSG00000084090:ENST00000337288:exon_96861079_96861287:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000393595:exon_96861079_96861287:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000462501:exon_96861079_96861252:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000443962:exon_96861079_96861287:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000488084:exon_96860941_96861287:STARD7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 96919642 C/T 1 7 4 11 3.19466427705239 2.17447755597006 1.02018672108233 T:C C T 10 0.543619388992515 0.763926340985151 ENSG00000135956:ENST00000258439:exon_96916312_96919853:TMEM127;ENSG00000135956:ENST00000432959:exon_96917398_96919853:TMEM127;ENSG00000135956:ENST00000435268:exon_96919538_96919853:TMEM127 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 98409046 G/A 1 7 3 10 3.19466427705239 1.63085816697755 1.56380611007485 A:G G A 10 0.543619388992515 0.3622898906741 ENSG00000075568:ENST00000186436:exon_98408849_98409447:TMEM131;ENSG00000075568:ENST00000425805:exon_98408849_98409447:TMEM131 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 99778985 T/C 1 5 5 10 2.28190305503742 2.71809694496258 -0.436193889925151 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 99779131 T/C 1 11 11 22 5.02018672108233 5.97981327891767 -0.959626557835332 T:C T C 10 0.543619388992515 0.676454879931535 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 99812070 G/A 1 14 17 31 6.38932855410479 9.24152961287276 -2.85220105876797 A:G G A 10 0.543619388992515 0.368004748961188 ENSG00000241962:ENST00000424491:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000512183:exon_99812036_99814089:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308656:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308644:exon_99812036_99813896:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000509871:exon_99812036_99812286:C2orf15;ENSG00000185414:ENST00000338148:exon_99812036_99814089:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000465432:exon_99812036_99812485:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409841:exon_99812036_99812286:MRPL30 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 99995517 C/T 1 206 208 414 94.0144058675419 113.072832910443 -19.0584270429012 T:C:G C T 10 0.543619388992515 0.060948040655606 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995482_99995589:EIF5B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 99995804 T/C 1 65 66 131 29.6647397154865 35.878879673506 -6.21413995801947 T:C T C 10 0.543619388992515 0.293042566145484 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995781_99995891:EIF5B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 100019496 A/G 1 19 12 31 8.67123160914221 6.52343266791018 2.14779894123203 A:G A G 10 0.543619388992515 0.475681075974162 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465086:exon_100019352_100019893:REV1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 100022772 T/C 1 5 6 11 2.28190305503742 3.26171633395509 -0.979813278917665 T:C T C 10 0.543619388992515 0.56306921306608 ENSG00000135945:ENST00000485487:exon_100022372_100022815:REV1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 100055506 A/G 1 7 5 12 3.19466427705239 2.71809694496258 0.476567332089819 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100055036_100055772:REV1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 101010082 G/C 1 3 9 12 1.36914183302245 4.89257450093264 -3.52343266791018 C:G G C 10 0.543619388992515 0.0466272515626384 ENSG00000115526:ENST00000264249:exon_101008327_101010244:CHST10;ENSG00000115526:ENST00000409701:exon_101009707_101010244:CHST10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 101635538 C/T 1 13 3 16 5.9329479430973 1.63085816697755 4.30208977611976 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0420383373703011 ENSG00000071082:ENST00000409028:exon_101635460_101636078:RPL31 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 109106381 A/G 1 8 5 13 3.65104488805988 2.71809694496258 0.932947943097304 A:G A G 10 0.543619388992515 0.782457075337367 ENSG00000135968:ENST00000409325:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000309863:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000482325:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393318:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393321:exon_109106294_109106591:GCC2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 113331367 G/A 1 13 14 27 5.9329479430973 7.61067144589521 -1.67772350279791 A:G G A 10 0.543619388992515 0.56531671981011 ENSG00000125630:ENST00000263331:exon_113331139_113331392:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000333990:exon_113331139_113331392:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000409894:exon_113331139_113331392:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000448770:exon_113331139_113331392:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000417433:exon_113331139_113331392:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000458012:exon_113331139_113331393:POLR1B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 113940207 T/A 1 10 9 19 4.56380611007485 4.89257450093264 -0.328768390857786 A:T T A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000125637:ENST00000465917:exon_113939923_113940621:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 113940681 T/C 1 4 6 10 1.82552244402994 3.26171633395509 -1.43619388992515 T:C T C 10 0.543619388992515 0.528005019910346 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 113940839 G/C 1 7 12 19 3.19466427705239 6.52343266791018 -3.32876839085779 C:G G C 10 0.543619388992515 0.166421015470228 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 113943470 A/G 1 1 7 8 0.456380611007485 3.80533572294761 -3.34895511194012 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0274430116751054 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113943454_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113942942_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113943239_113943832:PSD4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 113956371 G/C 1 20 13 33 9.1276122201497 7.0670520569027 2.060560163247 C:G G C 10 0.543619388992515 0.491087320997542 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000460725:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000465592:exon_113956317_113956407:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000464559:exon_113956135_113956803:PSD4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 128394955 A/G 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 A:G A G 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000169994:ENST00000428314:exon_128394891_128395303:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000272666:exon_128394891_128395303:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000389524:exon_128394891_128395303:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000409816:exon_128394891_128395303:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000496841:exon_128394891_128395304:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000409090:exon_128394891_128395301:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000491278:exon_128394369_128395300:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000494959:exon_128394891_128395271:MYO7B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 132277686 C/T 1 9 2 11 4.10742549906736 1.08723877798503 3.02018672108233 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0765215556444275 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 135893372 A/G 1 11 11 22 5.02018672108233 5.97981327891767 -0.959626557835332 A:G A G 10 0.543619388992515 0.676454879931535 ENSG00000115839:ENST00000264158:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000442034:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000487003:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 135911422 T/C 1 18 25 43 8.21485099813473 13.5904847248129 -5.37563372667815 T:C T C 10 0.543619388992515 0.125033230003796 ENSG00000115839:ENST00000264158:exon_135911219_135911446:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000442034:exon_135911219_135911446:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000487003:exon_135911219_135911446:RAB3GAP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 136511817 A/G 1 42 28 70 19.1679856623144 15.2213428917904 3.94664277052395 A:G A G 10 0.543619388992515 0.401245614242139 ENSG00000144224:ENST00000272638:exon_136511729_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000416538:exon_136511109_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000470687:exon_136511729_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000490163:exon_136511722_136511847:UBXN4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 160104896 C/A 1 7 6 13 3.19466427705239 3.26171633395509 -0.0670520569026953 A:C C A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160104883_160105023:WDSUB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 160206574 C/T 1 4 7 11 1.82552244402994 3.80533572294761 -1.97981327891767 T:C C T 10 0.543619388992515 0.245254265630413 ENSG00000123636:ENST00000392783:exon_160206219_160206868:BAZ2B;ENSG00000123636:ENST00000392782:exon_160206219_160206868:BAZ2B;ENSG00000123636:ENST00000343439:exon_160206219_160206868:BAZ2B;ENSG00000123636:ENST00000355831:exon_160206219_160206868:BAZ2B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 160604936 G/A 1 9 6 15 4.10742549906736 3.26171633395509 0.845709165112274 A:G G A 10 0.543619388992515 0.797605664193983 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 163124051 C/T 1 104 97 201 47.4635835447784 52.731080732274 -5.26749718749552 T:C C T 10 0.543619388992515 0.479172445375057 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163123989_163124079:IFIH1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 163128824 T/C 1 28 24 52 12.7786571082096 13.0468653358204 -0.268208227610781 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163128736_163128897:IFIH1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 170402752 T/C 1 9 12 21 4.10742549906736 6.52343266791018 -2.41600716884282 T:C T C 10 0.543619388992515 0.381528981278344 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170402728_170403214:FASTKD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 170493863 A/G 1 192 213 405 87.6250773134371 115.790929855406 -28.1658525419686 A:G A G 10 0.543619388992515 0.00518994484760114 ENSG00000138398:ENST00000260970:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000530133:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000409714:exon_170492923_170494221:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000448752:exon_170492923_170494131:PPIG HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 172374120 G/A 0 0 169 169 0 91.871676739735 -91.871676739735 A G A 10 0.543619388992515 2.66866673687579e-58 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 172411273 G/A 1 17 15 32 7.75847038712724 8.15429083488773 -0.395820447760483 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000071967:ENST00000409484:exon_172411034_172412117:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000321348:exon_172411034_172414643:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000375252:exon_172411034_172414156:CYBRD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 174131392 T/C 1 5 14 19 2.28190305503742 7.61067144589521 -5.32876839085779 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0192988139480006 ENSG00000091436:ENST00000409176:exon_174130778_174131511:AC013461.1;ENSG00000091436:ENST00000375213:exon_174130778_174132738:AC013461.1;ENSG00000091436:ENST00000431503:exon_174130778_174131478:AC013461.1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 180810180 C/T 1 43 38 81 19.6243662733219 20.6575367817156 -1.03317050839372 T:C C T 10 0.543619388992515 0.82441327731371 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 180810358 C/T 1 30 27 57 13.6914183302245 14.6777235027979 -0.986305172573358 T:C C T 10 0.543619388992515 0.792156539529109 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000404136:exon_180810348_180810442:CWC22 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 191064753 C/T 1 14 15 29 6.38932855410479 8.15429083488773 -1.76496228078294 T:C C T 10 0.543619388992515 0.577774847845697 ENSG00000187699:ENST00000396974:exon_191064423_191065205:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409545:exon_191064423_191064789:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409870:exon_191064423_191064935:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000340623:exon_191064423_191068210:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000443551:exon_191064423_191064940:C2orf88 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 191184475 A/G 1 3 6 9 1.36914183302245 3.26171633395509 -1.89257450093264 A:G A G 10 0.543619388992515 0.316548245109532 ENSG00000198130:ENST00000392332:exon_191184442_191184616:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000359678:exon_191184442_191184771:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000392331:exon_191184442_191184771:HIBCH HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 201437524 A/C 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 A:C A C 10 0.543619388992515 0.482069340371676 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 207006676 T/C 1 17 16 33 7.75847038712724 8.69791022388024 -0.939439836752997 T:C T C 10 0.543619388992515 0.8616236970739 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207006665_207006793:NDUFS1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 207008762 G/A 1 6 4 10 2.73828366604491 2.17447755597006 0.56380611007485 A:G G A 10 0.543619388992515 0.763129400865595 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207008742_207008856:NDUFS1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 207008763 C/A 1 7 4 11 3.19466427705239 2.17447755597006 1.02018672108233 A:C C A 10 0.543619388992515 0.763926340985151 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207008742_207008856:NDUFS1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 207169731 G/A 0 8 0 8 3.65104488805988 0 3.65104488805988 G G 10 0.543619388992515 0.00950909187424297 ENSG00000204186:ENST00000374423:exon_207169441_207179148:ZDBF2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 208477852 G/A 1 13 8 21 5.9329479430973 4.34895511194012 1.58399283115718 A:G G A 10 0.543619388992515 0.520202888001635 ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208473839_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208476828_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208477447_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208477451_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208477467_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208477567_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208477704_208478167:FAM119A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 208477956 C/T 1 10 8 18 4.56380611007485 4.34895511194012 0.214850998134729 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208473839_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208476828_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208477447_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208477451_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208477467_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208477567_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208477704_208478167:FAM119A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 208478012 G/T 1 11 4 15 5.02018672108233 2.17447755597006 2.84570916511227 T:G G T 10 0.543619388992515 0.195223530265793 ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208473839_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208476828_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208477447_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208477451_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208477467_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208477567_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208477704_208478167:FAM119A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 208478055 A/G 1 10 4 14 4.56380611007485 2.17447755597006 2.38932855410479 A:G A G 10 0.543619388992515 0.284272971162492 ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208473839_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208476828_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208477447_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208477451_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208477467_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208477567_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208477704_208478167:FAM119A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 214182100 A/T 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 A:T A T 10 0.543619388992515 0.482069340371676 ENSG00000144451:ENST00000432529:exon_214181943_214182702:SPAG16 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 216190020 C/G 1 28 33 61 12.7786571082096 17.939439836753 -5.16078272854342 A:C:G C G 10 0.543619388992515 0.199796066123852 ENSG00000138363:ENST00000236959:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000444305:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000488712:exon_216189903_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000443953:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000435675:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000427397:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000413174:exon_216189964_216190052:ATIC HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 217315787 T/C 1 13 13 26 5.9329479430973 7.0670520569027 -1.13410411380539 T:C T C 10 0.543619388992515 0.696880304708234 ENSG00000138375:ENST00000357276:exon_217315569_217315787:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000358207:exon_217315569_217315787:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000392128:exon_217315569_217315787:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000486983:exon_217315569_217316324:SMARCAL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 220072431 C/A 1 4 7 11 1.82552244402994 3.80533572294761 -1.97981327891767 A:C C A 10 0.543619388992515 0.245254265630413 ENSG00000158552:ENST00000409206:exon_220072370_220072501:ZFAND2B;ENSG00000158552:ENST00000409594:exon_220072370_220072501:ZFAND2B;ENSG00000158552:ENST00000289528:exon_220072370_220072501:ZFAND2B;ENSG00000158552:ENST00000444522:exon_220072370_220072501:ZFAND2B;ENSG00000158552:ENST00000422255:exon_220072370_220072501:ZFAND2B;ENSG00000158552:ENST00000476713:exon_220072049_220072498:ZFAND2B;ENSG00000158552:ENST00000409412:exon_220072370_220072501:ZFAND2B;ENSG00000158552:ENST00000409097:exon_220072370_220072501:ZFAND2B;ENSG00000158552:ENST00000409336:exon_220072370_220072501:ZFAND2B;ENSG00000158552:ENST00000409217:exon_220072370_220072501:ZFAND2B;ENSG00000158552:ENST00000468301:exon_220072370_220072496:ZFAND2B;ENSG00000158552:ENST00000409319:exon_220072370_220072501:ZFAND2B;ENSG00000158552:ENST00000489197:exon_220072049_220072740:ZFAND2B;ENSG00000158552:ENST00000448496:exon_220072370_220072496:ZFAND2B;ENSG00000158552:ENST00000464902:exon_220072370_220072501:ZFAND2B;ENSG00000158552:ENST00000469596:exon_220072370_220072501:ZFAND2B;ENSG00000158552:ENST00000475533:exon_220072370_220072501:ZFAND2B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 220366272 C/T 1 26 25 51 11.8658958861946 13.5904847248129 -1.72458883861827 T:C C T 10 0.543619388992515 0.674318506347327 ENSG00000144591:ENST00000313597:exon_220366198_220366301:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000480506:exon_220366198_220366759:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000373917:exon_220366198_220366301:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000358215:exon_220366198_220366301:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000443704:exon_220366198_220366301:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000373908:exon_220366198_220366301:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000455657:exon_220366198_220366301:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000435316:exon_220366198_220366301:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000341142:exon_220366198_220366301:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000481170:exon_220364843_220366759:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000493655:exon_220366198_220366301:GMPPA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 220404648 C/T 1 13 12 25 5.9329479430973 6.52343266791018 -0.590484724812876 T:C C T 10 0.543619388992515 0.843032485284801 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 220404726 G/A 1 13 13 26 5.9329479430973 7.0670520569027 -1.13410411380539 A:G G A 10 0.543619388992515 0.696880304708234 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 220405230 G/A 1 10 11 21 4.56380611007485 5.97981327891767 -1.41600716884282 A:G G A 10 0.543619388992515 0.662427114891113 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 220406722 T/C 1 24 8 32 10.9531346641796 4.34895511194012 6.60417955223952 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0206304284858926 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220406338_220406911:CHPF;ENSG00000123989:ENST00000373891:exon_220406182_220406911:CHPF HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 231036860 C/T 1 6 4 10 2.73828366604491 2.17447755597006 0.56380611007485 T:C C T 10 0.543619388992515 0.763129400865595 ENSG00000135899:ENST00000477068:exon_231036782_231036890:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231036782_231036890:SP110;ENSG00000135899:ENST00000483067:exon_231036782_231037028:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231036782_231036890:SP110 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 231037616 A/G 1 6 6 12 2.73828366604491 3.26171633395509 -0.52343266791018 A:G A G 10 0.543619388992515 0.779998482964206 ENSG00000135899:ENST00000477068:exon_231037560_231038230:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231037560_231037675:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231037560_231037675:SP110 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 231042276 A/G 1 113 133 246 51.5710090438458 72.3013787360045 -20.7303696921587 A:G A G 10 0.543619388992515 0.00861174988848429 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000489597:exon_231042082_231042396:SP110 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 231050715 A/G 1 105 140 245 47.9199641557859 76.1067144589521 -28.1867503031662 A:G A G 10 0.543619388992515 0.000318230365646307 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231050710_231050859:SP110 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 231077110 C/T 1 60 54 114 27.3828366604491 29.3554470055958 -1.97261034514672 A:T:C C T 10 0.543619388992515 0.708194794738551 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077064_231077145:SP110 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 231077676 G/A 1 70 56 126 31.9466427705239 30.4426857835808 1.50395698694311 A:G G A 10 0.543619388992515 0.858142315393531 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000455674:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000462232:exon_231077476_231077742:SP110 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 231077725 A/G 1 86 86 172 39.2487325466437 46.7512674533563 -7.50253490671258 A:G A G 10 0.543619388992515 0.252080838839925 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000455674:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000462232:exon_231077476_231077742:SP110 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 231333763 A/G 1 81 108 189 36.9668294916063 58.7108940111916 -21.7440645195853 A:G A G 10 0.543619388992515 0.00164385357761559 ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000413284:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000452345:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494508:exon_231333547_231333811:SP100 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 231338211 T/G 1 10 8 18 4.56380611007485 4.34895511194012 0.214850998134729 T:G T G 10 0.543619388992515 1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 231407663 C/T 1 7 4 11 3.19466427705239 2.17447755597006 1.02018672108233 T:C C T 10 0.543619388992515 0.763926340985151 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231407551_231407898:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231407551_231410317:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231407551_231408805:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231407551_231407837:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231407551_231408805:SP100 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 232035429 G/A 1 122 113 235 55.6784345429132 61.4289909561542 -5.75055641324104 A:C:G G A 10 0.543619388992515 0.471579901662876 ENSG00000173692:ENST00000308696:exon_232035280_232035435:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000373635:exon_232035280_232035435:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000491229:exon_232035116_232035435:PSMD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 234115337 G/A 1 6 4 10 2.73828366604491 2.17447755597006 0.56380611007485 A:G G A 10 0.543619388992515 0.763129400865595 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 234750542 G/C 1 5 4 9 2.28190305503742 2.17447755597006 0.107425499067364 C:G G C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 234750831 T/C 1 5 6 11 2.28190305503742 3.26171633395509 -0.979813278917665 T:C T C 10 0.543619388992515 0.56306921306608 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000453122:exon_234750762_234750851:HJURP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 238668802 A/G 1 35 36 71 15.973321385262 19.5702980037305 -3.59697661846857 A:G A G 10 0.543619388992515 0.406289289876309 ENSG00000124831:ENST00000308482:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000391999:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000483443:exon_238668707_238668848:LRRFIP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 238671328 A/G 1 112 81 193 51.1146284328383 44.0331705083937 7.0814579244446 A:G A G 10 0.543619388992515 0.312728908762049 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 238672703 C/G 1 99 114 213 45.181680489741 61.9726103451467 -16.7909298554057 C:G C G 10 0.543619388992515 0.0230690380754042 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 239079276 G/A 1 30 26 56 13.6914183302245 14.1341041138054 -0.442685783580842 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000132323:ENST00000254654:exon_239079042_239079317:ILKAP;ENSG00000132323:ENST00000465131:exon_239079043_239079317:ILKAP;ENSG00000132323:ENST00000463129:exon_239079043_239079317:ILKAP;ENSG00000132323:ENST00000450411:exon_239079049_239079665:ILKAP;ENSG00000132323:ENST00000466468:exon_239079050_239079317:ILKAP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 240961728 T/C 1 24 14 38 10.9531346641796 7.61067144589521 3.34246321828443 T:C T C 10 0.543619388992515 0.329492334956756 ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000407129:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000497536:exon_240961589_240961757:NDUFA10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 241500896 C/T 1 6 4 10 2.73828366604491 2.17447755597006 0.56380611007485 T:C C T 10 0.543619388992515 0.763129400865595 ENSG00000188542:ENST00000343217:exon_241500747_241500936:DUSP28;ENSG00000188542:ENST00000405954:exon_241500747_241503431:DUSP28;ENSG00000188542:ENST00000438823:exon_241500747_241500936:DUSP28 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 242035544 G/C 1 36 69 105 16.4297019962695 37.5097378404835 -21.0800358442141 C:G G C 10 0.543619388992515 4.7651983027381e-05 ENSG00000122085:ENST00000241527:exon_242034545_242035853:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000391980:exon_242034981_242035853:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000406593:exon_242035284_242035853:MTERFD2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 242039198 T/C 1 10 13 23 4.56380611007485 7.0670520569027 -2.50324594682785 T:C T C 10 0.543619388992515 0.304323603467324 ENSG00000122085:ENST00000241527:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000495694:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000401626:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000391980:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000424798:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000407095:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000475860:exon_242038583_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000434791:exon_242038814_242039309:MTERFD2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 242065624 A/G 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 242066830 G/A 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 A:G G A 10 0.543619388992515 0.482069340371676 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000459710:exon_242066401_242066866:PASK HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 242173247 G/A 1 130 136 266 59.329479430973 73.932236902982 -14.602757472009 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0744247284731033 ENSG00000115677:ENST00000391975:exon_242173235_242173378:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427183:exon_242173235_242173378:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000391976:exon_242173235_242173378:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000310931:exon_242173235_242173378:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000487169:exon_242173235_242173378:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000470482:exon_242173235_242173378:HDLBP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 242573211 T/C 1 30 23 53 13.6914183302245 12.5032459468278 1.1881723833967 T:C:G T C 10 0.543619388992515 0.784027393691847 ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 242610738 T/C 1 10 18 28 4.56380611007485 9.78514900186527 -5.22134289179042 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0573276456730231 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610727_242610840:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610727_242612014:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610727_242612046:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610727_242610781:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610727_242610984:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242610727_242611332:ATG4B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 242610773 T/A 1 24 27 51 10.9531346641796 14.6777235027979 -3.72458883861827 A:T T A 10 0.543619388992515 0.326304188472272 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610727_242610840:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610727_242612014:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610727_242612046:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610727_242610781:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610727_242610984:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242610727_242611332:ATG4B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 2 242793273 A/G 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000188389:ENST00000334409:exon_242792033_242793449:PDCD1;ENSG00000188389:ENST00000418831:exon_242792849_242793449:PDCD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 259818 G/A 1 6 6 12 2.73828366604491 3.26171633395509 -0.52343266791018 A:G G A 10 0.543619388992515 0.779998482964206 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_259813_259971:C20orf96 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 259969 G/C 1 5 5 10 2.28190305503742 2.71809694496258 -0.436193889925151 C:G G C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_259813_259971:C20orf96 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 278806 C/T 1 9 16 25 4.10742549906736 8.69791022388024 -4.59048472481288 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0725284900623433 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 279483 T/C 1 15 16 31 6.84570916511227 8.69791022388024 -1.85220105876797 T:C T C 10 0.543619388992515 0.589591010597541 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 368905 A/G 1 18 5 23 8.21485099813473 2.71809694496258 5.49675405317215 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0217600136355910 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_368655_368945:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000449710:exon_368655_368945:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_368655_368945:TRIB3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 377226 C/T 1 30 17 47 13.6914183302245 9.24152961287276 4.44988871735179 T:C C T 10 0.543619388992515 0.241232636801573 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_376842_378203:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_376842_378197:TRIB3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 391170 C/T 1 61 51 112 27.8392172714566 27.7245888386183 0.114628432838316 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000125826:ENST00000475269:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400245:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400247:exon_391056_391408:RBCK1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 825678 T/C 1 7 10 17 3.19466427705239 5.43619388992515 -2.24152961287276 T:C T C 10 0.543619388992515 0.333264703150297 ENSG00000125898:ENST00000381941:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000304189:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000381939:exon_825354_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000246100:exon_825351_826922:FAM110A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 1099523 T/G 1 42 35 77 19.1679856623144 19.026678614738 0.14130704757634 T:G T G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000438768:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1099253_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000461847:exon_1099270_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1099295_1099545:PSMF1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 1115919 A/G 1 37 41 78 16.8860826072769 22.2883949486931 -5.40231234141617 A:G A G 10 0.543619388992515 0.255605846637965 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000479715:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000484891:exon_1115483_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000435720:exon_1115821_1115949:PSMF1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 1426393 C/T 1 29 29 58 13.2350377192171 15.7649622807829 -2.52992456156587 T:C C T 10 0.543619388992515 0.512925431767332 ENSG00000088833:ENST00000216879:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000353088:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381658:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000461211:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000476071:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000350991:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381653:exon_1426311_1426794:NSFL1C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 2633936 T/C 1 30 31 61 13.6914183302245 16.852201058768 -3.16078272854342 T:C T C 10 0.543619388992515 0.442241271415172 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2633925_2634039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2633925_2634039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000494697:exon_2633925_2634039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000470143:exon_2633925_2634466:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000469588:exon_2633925_2634039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000445139:exon_2633925_2634039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000460258:exon_2633925_2634039:NOP56 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 2637071 T/C 1 117 123 240 53.3965314878757 66.8651848460793 -13.4686533582036 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0918327991861751 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480992:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000484998:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000415272:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480447:exon_2636805_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000490753:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000471023:exon_2637056_2637195:NOP56 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 3193978 G/A 1 21 40 61 9.58399283115718 21.7447755597006 -12.1607827285434 A:G G A 10 0.543619388992515 0.00192003415200116 ENSG00000125877:ENST00000460676:exon_3193965_3194072:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000380113:exon_3193965_3194029:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000455664:exon_3193965_3194029:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000490838:exon_3193902_3194029:ITPA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 3204084 G/A 1 70 75 145 31.9466427705239 40.7714541744386 -8.82481140391468 A:G G A 10 0.543619388992515 0.156331177586357 ENSG00000125877:ENST00000483354:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000380113:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000455664:exon_3204012_3204504:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000490838:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000460550:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000399838:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000461029:exon_3204012_3204095:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000472295:exon_3204012_3204516:ITPA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 3784080 C/T 1 9 9 18 4.10742549906736 4.89257450093264 -0.785149001865271 T:C C T 10 0.543619388992515 0.81438018796475 ENSG00000101224:ENST00000467519:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000245960:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000439880:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000340833:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000379598:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000344256:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000480816:exon_3784051_3784104:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000495915:exon_3784051_3784080:CDC25B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 3784110 C/T 1 12 8 20 5.47656733208982 4.34895511194012 1.1276122201497 T:C C T 10 0.543619388992515 0.659998135084761 ENSG00000101224:ENST00000467519:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000245960:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000439880:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000340833:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000379598:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000344256:exon_3784051_3784184:CDC25B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 3870124 G/C 1 4 9 13 1.82552244402994 4.89257450093264 -3.0670520569027 C:G G C 10 0.543619388992515 0.100601549808403 ENSG00000125779:ENST00000316562:exon_3869742_3870375:PANK2;ENSG00000125779:ENST00000336066:exon_3870036_3870375:PANK2;ENSG00000125779:ENST00000361370:exon_3870062_3870375:PANK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 5753579 C/T 1 16 8 24 7.30208977611976 4.34895511194012 2.95313466417964 T:C C T 10 0.543619388992515 0.305769929143739 ENSG00000171984:ENST00000378979:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000378971:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000445603:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000442185:exon_5753508_5753689:C20orf196 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 7963041 C/T 1 24 31 55 10.9531346641796 16.852201058768 -5.89906639458833 T:C C T 10 0.543619388992515 0.135879465172919 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7957995_7963268:TMX4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 7980390 C/T 1 12 6 18 5.47656733208982 3.26171633395509 2.21485099813473 T:C C T 10 0.543619388992515 0.349607890938645 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7980379_7980507:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000527925:exon_7980379_7980469:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000462384:exon_7980379_7980507:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000530935:exon_7980379_7980507:TMX4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 10386013 C/A 1 11 9 20 5.02018672108233 4.89257450093264 0.127612220149699 A:C C A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10385428_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10385832_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10385832_10386335:MKKS HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 10386059 G/A 1 13 12 25 5.9329479430973 6.52343266791018 -0.590484724812876 A:G G A 10 0.543619388992515 0.843032485284801 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10385428_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10385832_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10385832_10386335:MKKS HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 10594363 G/A 0 28 0 28 12.7786571082096 0 12.7786571082096 G G 10 0.543619388992515 4.86826373250433e-08 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 17596155 C/A 1 12 9 21 5.47656733208982 4.89257450093264 0.583992831157184 A:C C A 10 0.543619388992515 0.830589105985654 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17596076_17596174:RRBP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 17600357 G/A 1 14 20 34 6.38932855410479 10.8723877798503 -4.48305922574551 A:G G A 10 0.543619388992515 0.167480215376848 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17599241_17600462:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17600278_17600373:RRBP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 17932210 C/T 1 22 55 77 10.0403734421647 29.8990663945883 -19.8586929524237 T:C:G C T 10 0.543619388992515 5.58348578641243e-06 ENSG00000089006:ENST00000377768:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000490175:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000377759:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000483485:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000377739:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000476648:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000431277:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000419004:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000494401:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000474883:exon_17932170_17932239:SNX5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 17943492 A/T 0 12 0 12 5.47656733208982 0 5.47656733208982 A A 10 0.543619388992515 0.000747744096111451 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 17968923 T/C 1 8 5 13 3.65104488805988 2.71809694496258 0.932947943097304 T:C T C 10 0.543619388992515 0.782457075337367 ENSG00000125871:ENST00000377710:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000377709:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000412478:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000467391:exon_17968809_17968941:C20orf72 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 20007512 G/A 1 21 19 40 9.58399283115718 10.3287683908578 -0.744775559700601 A:G G A 10 0.543619388992515 0.874421459357541 ENSG00000173418:ENST00000334982:exon_20007428_20007563:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000484480:exon_20007428_20007563:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000310450:exon_20007428_20007563:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000463154:exon_20007428_20007563:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000480550:exon_20007428_20007563:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000398602:exon_20007428_20007563:NAA20 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 23618427 C/T 1 42 68 110 19.1679856623144 36.966118451491 -17.7981327891767 T:C C T 10 0.543619388992515 0.00075090113766655 ENSG00000101439:ENST00000398411:exon_23618257_23618582:CST3;ENSG00000101439:ENST00000376925:exon_23618257_23618663:CST3;ENSG00000101439:ENST00000398409:exon_23618257_23618569:CST3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 25275617 G/A 1 10 7 17 4.56380611007485 3.80533572294761 0.758470387127244 A:G G A 10 0.543619388992515 0.810304562557129 ENSG00000100997:ENST00000376542:exon_25275379_25275666:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000465694:exon_25275379_25275666:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000376517:exon_25275379_25275666:ABHD12 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 25281502 C/T 1 30 18 48 13.6914183302245 9.78514900186527 3.90626932835928 T:C C T 10 0.543619388992515 0.310747917840862 ENSG00000100997:ENST00000465694:exon_25281335_25281520:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000339157:exon_25280834_25281520:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000526543:exon_25280834_25281520:ABHD12 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 30753270 T/C 1 15 15 30 6.84570916511227 8.15429083488773 -1.30858166977545 T:C T C 10 0.543619388992515 0.71502599456556 ENSG00000101337:ENST00000398022:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000375795:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000421148:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000217315:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000413032:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000495749:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000479591:exon_30753098_30753390:TM9SF4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 31024274 T/C 1 12 18 30 5.47656733208982 9.78514900186527 -4.30858166977545 T:C T C 10 0.543619388992515 0.142151911386108 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 31025163 A/G 1 8 4 12 3.65104488805988 2.17447755597006 1.47656733208982 A:G A G 10 0.543619388992515 0.564519601476267 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 31427635 C/T 1 27 21 48 12.3222764972021 11.4160071688428 0.906269328359278 T:C C T 10 0.543619388992515 0.885081581824893 ENSG00000101367:ENST00000375571:exon_31427541_31427662:MAPRE1;ENSG00000101367:ENST00000414525:exon_31427541_31427662:MAPRE1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 32295541 C/T 1 9 2 11 4.10742549906736 1.08723877798503 3.02018672108233 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0765215556444275 ENSG00000101417:ENST00000409299:exon_32294512_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000344022:exon_32295075_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000217398:exon_32295295_32295775:PXMP4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 32379263 T/C 1 5 4 9 2.28190305503742 2.17447755597006 0.107425499067364 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000131061:ENST00000342427:exon_32378794_32380075:ZNF341;ENSG00000131061:ENST00000375200:exon_32378794_32380075:ZNF341;ENSG00000131061:ENST00000497876:exon_32378794_32380075:ZNF341;ENSG00000131061:ENST00000483118:exon_32378794_32380075:ZNF341;ENSG00000131061:ENST00000493497:exon_32378794_32380075:ZNF341 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 33703607 C/T 1 40 30 70 18.2552244402994 16.3085816697755 1.94664277052394 T:C C T 10 0.543619388992515 0.719236967075168 ENSG00000088298:ENST00000374491:exon_33703160_33703736:EDEM2;ENSG00000088298:ENST00000374492:exon_33703167_33703736:EDEM2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 42089511 T/C 1 150 88 238 68.4570916511227 47.8385062313413 20.6185854197814 T:C T C 10 0.543619388992515 0.00755608591355014 ENSG00000124193:ENST00000244020:exon_42089343_42092245:SRSF6;ENSG00000124193:ENST00000483871:exon_42089343_42092245:SRSF6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 42825929 C/T 1 38 38 76 17.3424632182844 20.6575367817156 -3.31507356343114 T:C C T 10 0.543619388992515 0.490132643412292 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 42826350 A/C 1 21 20 41 9.58399283115718 10.8723877798503 -1.28839494869312 A:C A C 10 0.543619388992515 0.754634353816566 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 42826379 C/T 1 23 16 39 10.4967540531722 8.69791022388024 1.79884382929191 T:C C T 10 0.543619388992515 0.631233541180413 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 44052992 G/A 1 9 16 25 4.10742549906736 8.69791022388024 -4.59048472481288 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0725284900623433 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44052856_44053021:PIGT HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 44511627 C/T 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000168612:ENST00000372523:exon_44511172_44513905:ZSWIM1;ENSG00000168612:ENST00000372520:exon_44511172_44513037:ZSWIM1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 44520579 C/G 1 11 4 15 5.02018672108233 2.17447755597006 2.84570916511227 C:G C G 10 0.543619388992515 0.195223530265793 ENSG00000064601:ENST00000372471:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000372484:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000354880:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000191018:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000419493:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000372459:exon_44520555_44520666:CTSA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 45318042 G/A 1 9 7 16 4.10742549906736 3.80533572294761 0.302089776119759 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45317771_45318418:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45317766_45318079:TP53RK HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 45318069 C/G 1 13 5 18 5.9329479430973 2.71809694496258 3.21485099813473 C:G C G 10 0.543619388992515 0.158000448549750 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45317771_45318418:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45317766_45318079:TP53RK HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 47841660 G/T 1 8 4 12 3.65104488805988 2.17447755597006 1.47656733208982 T:G G T 10 0.543619388992515 0.564519601476267 ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47841650_47841736:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47841650_47841736:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000462328:exon_47841650_47841736:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000493252:exon_47841650_47841736:DDX27 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 47850182 C/T 1 32 34 66 14.6041795522395 18.4830592257455 -3.87887967350599 T:C C T 10 0.543619388992515 0.387327422785017 ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47850105_47850246:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47850105_47852768:DDX27 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 47865509 G/A 1 8 5 13 3.65104488805988 2.71809694496258 0.932947943097304 A:G G A 10 0.543619388992515 0.782457075337367 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 47865784 C/T 1 2 6 8 0.91276122201497 3.26171633395509 -2.34895511194012 T:C C T 10 0.543619388992515 0.153435168169122 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 47871197 G/C 1 13 9 22 5.9329479430973 4.89257450093264 1.04037344216467 C:G G C 10 0.543619388992515 0.831159081063284 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 47872377 C/G 1 6 8 14 2.73828366604491 4.34895511194012 -1.61067144589521 C:G C G 10 0.543619388992515 0.430135065302382 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47872345_47872484:ZNFX1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 47874005 A/G 1 22 26 48 10.0403734421647 14.1341041138054 -4.09373067164072 A:G A G 10 0.543619388992515 0.248996750200525 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000455070:exon_47873954_47874201:ZNFX1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 48522124 T/G 1 13 11 24 5.9329479430973 5.97981327891767 -0.0468653358203612 T:G T G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 48522585 G/A 1 11 9 20 5.02018672108233 4.89257450093264 0.127612220149699 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 49508308 C/A 1 22 24 46 10.0403734421647 13.0468653358204 -3.00649189365569 A:C C A 10 0.543619388992515 0.379101879395436 ENSG00000101126:ENST00000371602:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000349014:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396029:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396032:exon_49506883_49511049:ADNP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 50769183 G/A 1 5 5 10 2.28190305503742 2.71809694496258 -0.436193889925151 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 57289017 C/T 1 11 12 23 5.02018672108233 6.52343266791018 -1.50324594682785 T:C C T 10 0.543619388992515 0.538329676167563 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57288973_57289149:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57288973_57289149:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57288973_57289149:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57288973_57289149:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57288968_57289149:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57287535_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57288476_57289149:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527081:exon_57287877_57289149:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525068:exon_57288787_57289149:NPEPL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 57290347 C/G 1 23 13 36 10.4967540531722 7.0670520569027 3.42970199626946 C:G C G 10 0.543619388992515 0.315724223110252 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57290224_57290466:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57290224_57290689:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57290224_57290606:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57290224_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57290224_57290466:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57287535_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57290224_57291367:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527081:exon_57290224_57290900:NPEPL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 57478807 C/T 1 297 197 494 135.545041469223 107.093019631525 28.4520218376976 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0100453137149479 ENSG00000087460:ENST00000313949:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371075:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000419558:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000472183:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000462499:exon_57478727_57478829:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000482112:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000490374:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467227:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371100:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371102:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464624:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000450130:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000349036:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488546:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000481039:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468895:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467321:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000477931:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000485673:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000470512:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464788:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000469431:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000478585:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000474497:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480975:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480232:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371095:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371085:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000354359:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000265620:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000306090:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371082:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488652:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476935:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468942:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000492907:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487862:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000496934:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476196:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000494081:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487981:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000493958:exon_57478796_57478846:GNAS HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 60572663 C/A 1 3 7 10 1.36914183302245 3.80533572294761 -2.43619388992515 A:C C A 10 0.543619388992515 0.202250323161148 ENSG00000130699:ENST00000474089:exon_60572606_60572725:TAF4;ENSG00000130699:ENST00000252996:exon_60572606_60572725:TAF4;ENSG00000130699:ENST00000436129:exon_60572606_60572725:TAF4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 60713332 A/G 1 205 241 446 93.5580252565344 131.012272747196 -37.4542474906617 A:G A G 10 0.543619388992515 0.000424308146737919 ENSG00000101182:ENST00000370873:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000442551:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000395567:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000484488:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000370861:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000486193:exon_60713227_60713346:PSMA7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 60768497 C/T 1 9 9 18 4.10742549906736 4.89257450093264 -0.785149001865271 T:C C T 10 0.543619388992515 0.81438018796475 ENSG00000101181:ENST00000436421:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000466933:exon_60768472_60769109:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000471352:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000467101:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000370823:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000448254:exon_60768472_60768680:GTPBP5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 61440971 G/A 1 15 15 30 6.84570916511227 8.15429083488773 -1.30858166977545 A:G G A 10 0.543619388992515 0.71502599456556 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370468:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000450048:exon_61440937_61441015:OGFR HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 61443870 C/G 1 48 41 89 21.9062693283593 22.2883949486931 -0.382125620333838 C:G C G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370468:exon_61443582_61444281:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61443582_61444558:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61443582_61444558:OGFR HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 61834695 G/A 1 6 8 14 2.73828366604491 4.34895511194012 -1.61067144589521 A:G G A 10 0.543619388992515 0.430135065302382 ENSG00000149658:ENST00000370339:exon_61833639_61835159:YTHDF1;ENSG00000149658:ENST00000370333:exon_61833639_61835159:YTHDF1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 62191321 A/G 1 21 26 47 9.58399283115718 14.1341041138054 -4.55011128264821 A:G A G 10 0.543619388992515 0.190492777774682 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 62193019 C/T 1 6 11 17 2.73828366604491 5.97981327891767 -3.24152961287276 T:C C T 10 0.543619388992515 0.144700534072097 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 62194030 G/C 1 7 5 12 3.19466427705239 2.71809694496258 0.476567332089819 C:G G C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 62200738 G/A 1 2 7 9 0.91276122201497 3.80533572294761 -2.89257450093264 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0894121930945724 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 62221766 C/T 1 3 8 11 1.36914183302245 4.34895511194012 -2.97981327891767 T:C C T 10 0.543619388992515 0.126408424019807 ENSG00000101216:ENST00000266068:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370069:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370077:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000447518:exon_62221638_62221772:GMEB2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 62326110 A/C 1 9 7 16 4.10742549906736 3.80533572294761 0.302089776119759 A:C A C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62326094_62326331:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62326094_62326327:RTEL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 62331989 T/G 1 24 18 42 10.9531346641796 9.78514900186527 1.16798566231437 T:G T G 10 0.543619388992515 0.758703282863422 ENSG00000101246:ENST00000359715:exon_62331954_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000440854:exon_62329996_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000485858:exon_62331954_62332129:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000217224:exon_62331954_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000324228:exon_62331954_62332054:ARFRP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 62373707 G/T 1 25 15 40 11.4095152751871 8.15429083488773 3.2552244402994 T:G G T 10 0.543619388992515 0.342869522386491 ENSG00000125520:ENST00000266077:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000485897:exon_62373689_62373843:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000493772:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000491109:exon_62373689_62373887:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000473157:exon_62373689_62373717:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000482718:exon_62373483_62373888:SLC2A4RG HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 62560701 C/T 1 14 6 20 6.38932855410479 3.26171633395509 3.1276122201497 T:C C T 10 0.543619388992515 0.183302438111269 ENSG00000101152:ENST00000369911:exon_62560665_62560878:DNAJC5;ENSG00000101152:ENST00000360864:exon_62560665_62560878:DNAJC5;ENSG00000101152:ENST00000470551:exon_62560665_62560878:DNAJC5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 20 62663235 C/T 1 7 3 10 3.19466427705239 1.63085816697755 1.56380611007485 T:C C T 10 0.543619388992515 0.3622898906741 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 21 34883618 T/C 1 21 23 44 9.58399283115718 12.5032459468278 -2.91925311567066 T:C T C 10 0.543619388992515 0.449659593661266 ENSG00000159131:ENST00000414353:exon_34883559_34883664:GART;ENSG00000159131:ENST00000381831:exon_34883559_34883765:GART;ENSG00000159131:ENST00000381815:exon_34883559_34883765:GART;ENSG00000159131:ENST00000381839:exon_34883559_34883765:GART;ENSG00000159131:ENST00000424203:exon_34883559_34883765:GART HGDP00222_parsed_pileup.txt . 21 34897113 C/T 1 21 30 51 9.58399283115718 16.3085816697755 -6.72458883861827 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0674306368333746 ENSG00000159131:ENST00000381831:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000381815:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000381839:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000424203:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000460305:exon_34897076_34897135:GART;ENSG00000159131:ENST00000467575:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000361093:exon_34896316_34897307:GART HGDP00222_parsed_pileup.txt . 21 34924243 T/C 1 12 7 19 5.47656733208982 3.80533572294761 1.67123160914221 T:C T C 10 0.543619388992515 0.496728290141003 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON HGDP00222_parsed_pileup.txt . 21 34925689 G/A 1 14 4 18 6.38932855410479 2.17447755597006 4.21485099813473 A:G G A 10 0.543619388992515 0.057457655308005 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00222_parsed_pileup.txt . 21 34926260 C/T 1 17 25 42 7.75847038712724 13.5904847248129 -5.83201433768563 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0876005389654028 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00222_parsed_pileup.txt . 21 34945721 T/C 1 5 17 22 2.28190305503742 9.24152961287276 -6.95962655783533 T:C T C 10 0.543619388992515 0.00422861146829652 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381692:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000458557:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000457208:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000467616:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000484294:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000473102:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000470533:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000478183:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000465834:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000477419:exon_34945331_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000491794:exon_34945520_34945761:SON HGDP00222_parsed_pileup.txt . 21 37442632 G/C 1 24 13 37 10.9531346641796 7.0670520569027 3.88608260727694 C:G G C 10 0.543619388992515 0.248142501231300 ENSG00000159228:ENST00000466328:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000530908:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000290349:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000439427:exon_37442313_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000399191:exon_37442333_37442702:CBR1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 21 37444973 C/T 1 53 61 114 24.1881723833967 33.1607827285434 -8.97261034514672 T:C C T 10 0.543619388992515 0.109565636553300 ENSG00000159228:ENST00000530908:exon_37444113_37445464:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000290349:exon_37444744_37445464:CBR1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 21 38563725 G/A 1 8 12 20 3.65104488805988 6.52343266791018 -2.8723877798503 A:G G A 10 0.543619388992515 0.261745196981094 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38563635_38563725:TTC3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 21 40552307 A/G 1 21 21 42 9.58399283115718 11.4160071688428 -1.83201433768563 A:G A G 10 0.543619388992515 0.642932391430638 ENSG00000183527:ENST00000331573:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000440607:exon_40552211_40552364:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000411828:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000380900:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000431628:exon_40552211_40552362:PSMG1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 21 40670460 G/C 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 C:G G C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000185658:ENST00000333229:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000342449:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380804:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380800:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380783:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000341322:exon_40668363_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000470108:exon_40670016_40670508:BRWD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 21 42812891 C/T 1 161 114 275 73.4772783722051 61.9726103451467 11.5046680270584 T:C C T 10 0.543619388992515 0.18284287231712 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42812814_42812952:MX1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 21 42817930 G/A 1 279 263 542 127.330190471088 142.971899305031 -15.6417088339432 A:G G A 10 0.543619388992515 0.181466562287198 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000486275:exon_42817927_42818068:MX1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 21 42824661 A/G 1 216 310 526 98.5782119776167 168.52201058768 -69.9437986100629 A:G A G 10 0.543619388992515 1.23905400557831e-09 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000491110:exon_42824548_42824747:MX1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 21 42824733 G/A 1 438 332 770 199.894707621278 180.481637145515 19.4130704757634 A:G G A 10 0.543619388992515 0.169204017810243 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000491110:exon_42824548_42824747:MX1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 21 44324329 G/A 1 35 33 68 15.973321385262 17.939439836753 -1.96611845149102 A:G G A 10 0.543619388992515 0.629088229622655 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 21 45217929 T/C 1 43 28 71 19.6243662733219 15.2213428917904 4.40302338153143 T:C T C 10 0.543619388992515 0.340826110094356 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217788_45217981:RRP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 21 45219524 T/C 1 29 36 65 13.2350377192171 19.5702980037305 -6.33526028451348 T:C T C 10 0.543619388992515 0.134795828016085 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45219451_45219530:RRP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 21 45220483 A/G 1 37 26 63 16.8860826072769 14.1341041138054 2.75197849347155 A:G A G 10 0.543619388992515 0.528553126250886 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45220398_45220495:RRP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 21 45502844 T/G 1 10 8 18 4.56380611007485 4.34895511194012 0.214850998134729 T:G T G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45502669_45503183:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45502669_45503183:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000461889:exon_45502669_45502896:TRAPPC10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 21 45656774 C/T 1 11 4 15 5.02018672108233 2.17447755597006 2.84570916511227 T:C C T 10 0.543619388992515 0.195223530265793 ENSG00000160223:ENST00000407780:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000344330:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400379:exon_45656750_45657100:ICOSLG HGDP00222_parsed_pileup.txt . 21 45732116 C/T 1 30 20 50 13.6914183302245 10.8723877798503 2.81903055037425 T:C C T 10 0.543619388992515 0.479015314324123 ENSG00000141959:ENST00000349048:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000397961:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000496824:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000466134:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000491298:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000403390:exon_45731988_45732177:PFKL HGDP00222_parsed_pileup.txt . 21 45750248 G/A 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 A:G G A 10 0.543619388992515 0.740490071859648 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 21 46191400 G/A 1 13 10 23 5.9329479430973 5.43619388992515 0.496754053172154 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000184787:ENST00000481546:exon_46188955_46191404:UBE2G2;ENSG00000184787:ENST00000345496:exon_46188955_46191404:UBE2G2;ENSG00000184787:ENST00000397904:exon_46188955_46191404:UBE2G2;ENSG00000184787:ENST00000397903:exon_46188956_46191404:UBE2G2;ENSG00000184787:ENST00000497630:exon_46190846_46191404:UBE2G2;ENSG00000184787:ENST00000477954:exon_46190887_46191404:UBE2G2;ENSG00000184787:ENST00000491513:exon_46191194_46191404:UBE2G2;ENSG00000184787:ENST00000330942:exon_46191210_46191404:UBE2G2;ENSG00000184900:ENST00000427597:exon_46191374_46191404:SUMO3;ENSG00000184900:ENST00000457036:exon_46191374_46191404:SUMO3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 21 46271452 C/T 1 12 5 17 5.47656733208982 2.71809694496258 2.75847038712724 T:C C T 10 0.543619388992515 0.226307172659728 ENSG00000183255:ENST00000397887:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000330938:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000445724:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000423073:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000397886:exon_46271322_46271542:PTTG1IP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 21 46311813 A/G 1 20 21 41 9.1276122201497 11.4160071688428 -2.28839494869312 A:G A G 10 0.543619388992515 0.531709531359411 ENSG00000160255:ENST00000475170:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46311724_46311911:ITGB2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 21 46320313 C/T 1 24 20 44 10.9531346641796 10.8723877798503 0.0807468843293382 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000320216:exon_46320235_46320390:ITGB2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 21 46330229 C/T 1 16 17 33 7.30208977611976 9.24152961287276 -1.939439836753 T:C C T 10 0.543619388992515 0.600805537726719 ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46330199_46330287:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46330199_46330287:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46330199_46330287:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46330199_46330287:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46330199_46330287:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46330199_46330287:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46330199_46330330:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46330199_46330287:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000320216:exon_46330199_46330287:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523663:exon_46330199_46330287:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000522931:exon_46330199_46330287:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000517563:exon_46330199_46330287:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000522688:exon_46330199_46330287:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000520389:exon_46330199_46330287:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000524251:exon_46330199_46330330:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000517819:exon_46330199_46330287:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000479849:exon_46330199_46330287:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397846:exon_46330199_46330287:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523126:exon_46330199_46330603:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000521995:exon_46330199_46330287:ITGB2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 21 46951556 A/G 1 5 8 13 2.28190305503742 4.34895511194012 -2.0670520569027 A:G A G 10 0.543619388992515 0.276871294907228 ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000477688:exon_46951332_46952062:SLC19A1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 17589209 C/T 1 5 4 9 2.28190305503742 2.17447755597006 0.107425499067364 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 17590269 C/T 1 4 6 10 1.82552244402994 3.26171633395509 -1.43619388992515 T:C C T 10 0.543619388992515 0.528005019910346 ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 18209920 C/T 1 4 12 16 1.82552244402994 6.52343266791018 -4.69791022388024 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0227629205322148 ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18209443_18211487:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18209443_18211465:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18209443_18213388:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18209443_18210308:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399777:exon_18209443_18211906:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000485631:exon_18209443_18210436:BCL2L13 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 19882984 T/G 1 8 7 15 3.65104488805988 3.80533572294761 -0.154290834887726 T:G T G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000494454:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000474308:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000475995:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19882930_19883104:TXNRD2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 19906511 G/A 1 7 9 16 3.19466427705239 4.89257450093264 -1.69791022388024 A:G G A 10 0.543619388992515 0.456567971750714 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000474308:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496729:exon_19906383_19906527:TXNRD2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 19950235 C/T 1 24 27 51 10.9531346641796 14.6777235027979 -3.72458883861827 T:C C T 10 0.543619388992515 0.326304188472272 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19949756_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000467943:exon_19950050_19950399:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19950070_19950338:COMT HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 19951207 C/G 1 28 22 50 12.7786571082096 11.9596265578353 0.819030550374247 C:G C G 10 0.543619388992515 0.887517166700133 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 19951271 G/A 1 62 65 127 28.2955978824641 35.3352602845135 -7.03966240204942 A:G G A 10 0.543619388992515 0.213600879735769 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000428707:exon_19951222_19951282:COMT HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 20307256 G/A 1 19 22 41 8.67123160914221 11.9596265578353 -3.28839494869312 A:G G A 10 0.543619388992515 0.347770423839317 ENSG00000128185:ENST00000248879:exon_20307162_20307322:DGCR6L;ENSG00000128185:ENST00000405465:exon_20307162_20307309:DGCR6L;ENSG00000128185:ENST00000443409:exon_20307162_20307322:DGCR6L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 21213380 C/T 1 16 25 41 7.30208977611976 13.5904847248129 -6.28839494869312 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0591877380434638 ENSG00000099940:ENST00000215730:exon_21213271_21213635:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000490458:exon_21213369_21213635:SNAP29 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 21213416 A/G 1 19 25 44 8.67123160914221 13.5904847248129 -4.91925311567066 A:G A G 10 0.543619388992515 0.172563358068996 ENSG00000241973:ENST00000449120:exon_21213411_21213705:PI4KA;ENSG00000099940:ENST00000215730:exon_21213271_21213635:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000490458:exon_21213369_21213635:SNAP29 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 21982892 C/T 1 41 36 77 18.7116050513069 19.5702980037305 -0.85869295242366 T:C C T 10 0.543619388992515 0.909041336819487 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21982381_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21982403_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21982411_21983076:YDJC HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 21984205 A/G 1 32 29 61 14.6041795522395 15.7649622807829 -1.16078272854342 A:G A G 10 0.543619388992515 0.797956056400145 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21984140_21984301:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21983597_21984320:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21984140_21984353:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21984140_21984353:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21984140_21984332:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21984140_21984327:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21984140_21984303:YDJC HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 22049783 C/T 1 8 12 20 3.65104488805988 6.52343266791018 -2.8723877798503 T:C C T 10 0.543619388992515 0.261745196981094 ENSG00000100023:ENST00000412327:exon_22049687_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000335025:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000398831:exon_22049683_22050712:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000456792:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000417788:exon_22049683_22052201:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000406385:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000446951:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000462188:exon_22049226_22049785:PPIL2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 24108412 G/A 1 221 185 406 100.860115032654 100.569586963615 0.290528069038899 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000250479:ENST00000476831:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000520222:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000401675:exon_24108315_24108483:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000484558:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000523865:exon_24108315_24108651:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000517886:exon_24108315_24108462:CHCHD10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 24179132 G/A 1 9 34 43 4.10742549906736 18.4830592257455 -14.3756337266781 A:G G A 10 0.543619388992515 9.6709655966711e-06 ENSG00000099958:ENST00000404056:exon_24176690_24179404:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000290730:exon_24176690_24179341:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000464034:exon_24178921_24179149:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000488272:exon_24178921_24179149:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000318109:exon_24178921_24179149:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000476077:exon_24178921_24179341:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000464110:exon_24178954_24179341:DERL3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 24179922 G/C 1 13 4 17 5.9329479430973 2.17447755597006 3.75847038712724 C:G G C 10 0.543619388992515 0.0875593850290938 ENSG00000099958:ENST00000406855:exon_24179846_24180041:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000318109:exon_24179846_24180041:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000476077:exon_24179846_24180041:DERL3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 26860269 G/C 1 9 6 15 4.10742549906736 3.26171633395509 0.845709165112274 C:G G C 10 0.543619388992515 0.797605664193983 ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000312736:exon_26860210_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000422379:exon_26860205_26860792:HPS4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 26890274 C/A 1 13 19 32 5.9329479430973 10.3287683908578 -4.39582044776048 A:C C A 10 0.543619388992515 0.154805161124047 ENSG00000100109:ENST00000492137:exon_26890105_26890585:TFIP11 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 29621128 C/G 1 4 7 11 1.82552244402994 3.80533572294761 -1.97981327891767 C:G C G 10 0.543619388992515 0.245254265630413 ENSG00000186998:ENST00000334018:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429226:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404755:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404820:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000426629:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429415:exon_29621128_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000448676:exon_29621128_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000435194:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000457925:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000484039:exon_29621122_29621205:EMID1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 29727866 C/T 1 19 17 36 8.67123160914221 9.24152961287276 -0.570298003730541 T:C C T 10 0.543619388992515 0.868500328571537 ENSG00000100280:ENST00000482818:exon_29727776_29728310:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000472057:exon_29727776_29727905:AP1B1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 30184950 A/G 1 99 98 197 45.181680489741 53.2747001212665 -8.09301963152546 A:G A G 10 0.543619388992515 0.253133114628653 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30184597_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30184600_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30184605_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30184631_30185173:ASCC2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 30198025 C/T 1 30 26 56 13.6914183302245 14.1341041138054 -0.442685783580842 T:C:G C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30197983_30198197:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30197983_30198197:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30197983_30198197:ASCC2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 30688659 C/T 1 26 30 56 11.8658958861946 16.3085816697755 -4.44268578358084 T:C:G C T 10 0.543619388992515 0.283106244821696 ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30687979_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000467596:exon_30687980_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000462073:exon_30687980_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30687982_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30687997_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30687999_30688840:TBC1D10A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 30689998 G/A 1 11 9 20 5.02018672108233 4.89257450093264 0.127612220149699 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000248751:ENST00000330168:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000434987:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000434291:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000418047:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000447976:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000470854:exon_30689974_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000467596:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000462073:exon_30689640_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000466666:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000437122:exon_30689910_30690099:TBC1D10A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 30700607 T/G 1 6 3 9 2.73828366604491 1.63085816697755 1.10742549906736 T:G T G 10 0.543619388992515 0.522625694750698 ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30700520_30700640:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000393906:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000490449:exon_30700520_30700619:TBC1D10A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 30733111 C/A 1 21 18 39 9.58399283115718 9.78514900186527 -0.201156170708087 A:C C A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000099995:ENST00000439242:exon_30733015_30733169:SF3A1;ENSG00000099995:ENST00000446990:exon_30733015_30733169:SF3A1;ENSG00000099995:ENST00000215793:exon_30733015_30733169:SF3A1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 30975053 C/G 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 C:G C G 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000100029:ENST00000488719:exon_30974824_30976061:PES1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 31018975 T/C 1 8 6 14 3.65104488805988 3.26171633395509 0.38932855410479 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000185339:ENST00000215838:exon_31018955_31019070:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000450638:exon_31018955_31019070:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000405742:exon_31018955_31019070:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000407817:exon_31018955_31019070:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000493542:exon_31018955_31019283:TCN2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 31333631 T/C 1 8 5 13 3.65104488805988 2.71809694496258 0.932947943097304 T:C T C 10 0.543619388992515 0.782457075337367 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31333570_31333698:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31333570_31333698:MORC2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 31737559 A/G 1 5 4 9 2.28190305503742 2.17447755597006 0.107425499067364 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000100105:ENST00000215919:exon_31736663_31737669:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000465287:exon_31736663_31737669:PATZ1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 31838085 G/A 1 28 12 40 12.7786571082096 6.52343266791018 6.2552244402994 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0561312125893684 ENSG00000184708:ENST00000344710:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000495101:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397525:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000330125:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000382180:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397523:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000420671:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000445424:exon_31837789_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000475437:exon_31838021_31838104:EIF4ENIF1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 31859859 A/G 1 8 8 16 3.65104488805988 4.34895511194012 -0.697910223880241 A:G A G 10 0.543619388992515 0.804399137481932 ENSG00000184708:ENST00000397525:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000330125:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000382180:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397523:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000420671:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000423097:exon_31859686_31859953:EIF4ENIF1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 32011225 T/C 1 16 13 29 7.30208977611976 7.0670520569027 0.235037719217064 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000474741:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000476577:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000464333:exon_32010357_32012863:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000357852:exon_32010372_32011265:SFI1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 32352791 G/A 1 104 104 208 47.4635835447784 56.5364164552216 -9.07283291044313 A:G G A 10 0.543619388992515 0.210878470135075 ENSG00000128245:ENST00000248975:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000397492:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000471374:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000427094:exon_32352126_32353589:YWHAH HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 32875190 G/A 1 20 18 38 9.1276122201497 9.78514900186527 -0.657536781715573 A:G G A 10 0.543619388992515 0.871511607485792 ENSG00000100225:ENST00000266087:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000437452:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000425028:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000492535:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000452138:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000444207:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000465418:exon_32874968_32875218:FBXO7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 32887150 C/T 1 44 27 71 20.0807468843293 14.6777235027979 5.40302338153143 T:C C T 10 0.543619388992515 0.233476026068821 ENSG00000100225:ENST00000266087:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000420700:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000437452:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000425028:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000492535:exon_32883732_32889268:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32887073_32887168:FBXO7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 36537775 C/T 1 13 17 30 5.9329479430973 9.24152961287276 -3.30858166977545 T:C C T 10 0.543619388992515 0.272083540205038 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487355:exon_36537576_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487423:exon_36537751_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000426939:exon_36537764_36538106:APOL3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 36661330 G/A 1 19 16 35 8.67123160914221 8.69791022388024 -0.0266786147380262 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000427990:exon_36661197_36661361:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 36661536 C/A 1 40 50 90 18.2552244402994 27.1809694496258 -8.92574500932636 A:C C A 10 0.543619388992515 0.0714819364316835 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 36661566 G/A 1 51 53 104 23.2754111613817 28.8118276166033 -5.53641645522157 A:G G A 10 0.543619388992515 0.280609444068147 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 36661646 G/A 1 46 49 95 20.9935081063443 26.6373500606332 -5.64384195428893 A:G G A 10 0.543619388992515 0.258233478935390 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 36661842 G/A 1 50 48 98 22.8190305503742 26.0937306716407 -3.27470012126647 A:G G A 10 0.543619388992515 0.543412685985136 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 36684354 T/C 1 81 74 155 36.9668294916063 40.2278347854461 -3.26100529383983 T:C T C 10 0.543619388992515 0.628857481167274 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 36684358 C/A 1 82 67 149 37.4232101026138 36.4224990624985 1.00071104011526 A:C C A 10 0.543619388992515 0.93449565590231 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 36698665 G/A 1 9 11 20 4.10742549906736 5.97981327891767 -1.8723877798503 A:G G A 10 0.543619388992515 0.502082958548873 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36698614_36698722:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36698614_36698722:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36698614_36698722:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36698614_36698722:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000473022:exon_36698354_36698722:MYH9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 37271882 T/C 1 4 12 16 1.82552244402994 6.52343266791018 -4.69791022388024 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0227629205322148 ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37271695_37272136:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000336951:exon_37271695_37272114:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37271695_37272136:NCF4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 38164106 C/T 1 7 4 11 3.19466427705239 2.17447755597006 1.02018672108233 T:C C T 10 0.543619388992515 0.763926340985151 ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38164081_38164183:NOL12;ENSG00000100106:ENST00000406386:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000344404:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000403663:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000421615:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000448466:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000443065:exon_38164081_38164183:TRIOBP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 39069181 T/C 1 7 6 13 3.19466427705239 3.26171633395509 -0.0670520569026953 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000100211:ENST00000396811:exon_39069164_39069851:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000216029:exon_39069164_39069859:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000489847:exon_39069164_39069418:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000454616:exon_39069164_39069849:CBY1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 39134207 C/T 1 15 24 39 6.84570916511227 13.0468653358204 -6.20115617070809 T:C C T 10 0.543619388992515 0.05350773262398 ENSG00000100226:ENST00000458073:exon_39133956_39134304:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000489527:exon_39133956_39134300:GTPBP1;ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000455125:exon_39133765_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39134040_39134270:SUN2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 39134715 T/C 1 15 16 31 6.84570916511227 8.69791022388024 -1.85220105876797 A:T:C T C 10 0.543619388992515 0.589591010597541 ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000455125:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000470642:exon_39134592_39134759:SUN2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 39496336 G/T 1 7 2 9 3.19466427705239 1.08723877798503 2.10742549906736 T:G G T 10 0.543619388992515 0.194613573468504 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 41610024 G/A 1 4 7 11 1.82552244402994 3.80533572294761 -1.97981327891767 A:G G A 10 0.543619388992515 0.245254265630413 ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000481902:exon_41609855_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000489136:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000413732:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000450939:exon_41609897_41610030:L3MBTL2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 41613188 C/T 1 7 3 10 3.19466427705239 1.63085816697755 1.56380611007485 T:C C T 10 0.543619388992515 0.3622898906741 ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000481902:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000413732:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41613127_41615540:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000449635:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000450939:exon_41613127_41613206:L3MBTL2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 41626192 C/G 1 26 14 40 11.8658958861946 7.61067144589521 4.2552244402994 A:C:G C G 10 0.543619388992515 0.205192079787416 ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41626143_41627275:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41626143_41626658:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41626143_41627274:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41626143_41627275:L3MBTL2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 41652733 G/A 1 24 14 38 10.9531346641796 7.61067144589521 3.34246321828443 A:G G A 10 0.543619388992515 0.329492334956756 ENSG00000100401:ENST00000405486:exon_41652715_41652828:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000356244:exon_41652715_41652828:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000405383:exon_41652715_41652828:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000455915:exon_41652715_41652828:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000407260:exon_41652715_41652828:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000446258:exon_41652715_41652828:RANGAP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 41726053 G/A 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000100403:ENST00000352645:exon_41726027_41726107:ZC3H7B;ENSG00000100403:ENST00000351589:exon_41726027_41726107:ZC3H7B;ENSG00000100403:ENST00000486331:exon_41726027_41726107:ZC3H7B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 41833116 C/T 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 T:C C T 10 0.543619388992515 0.482069340371676 ENSG00000183864:ENST00000327492:exon_41829496_41833411:TOB2;ENSG00000183864:ENST00000434408:exon_41833046_41833411:TOB2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 41903813 A/C 1 7 7 14 3.19466427705239 3.80533572294761 -0.61067144589521 A:C A C 10 0.543619388992515 0.793044034376695 ENSG00000100412:ENST00000216254:exon_41903795_41904053:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000396512:exon_41903795_41904053:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000471094:exon_41903795_41904053:ACO2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 41911525 C/T 1 19 22 41 8.67123160914221 11.9596265578353 -3.28839494869312 T:C:G C T 10 0.543619388992515 0.347770423839317 ENSG00000100412:ENST00000216254:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000396512:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000478010:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000481310:exon_41911517_41911539:ACO2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 42073134 C/T 1 9 98 107 4.10742549906736 53.2747001212665 -49.1672746221991 T:C C T 10 0.543619388992515 1.23837877021140e-23 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 42276742 G/C 1 28 37 65 12.7786571082096 20.1139173927231 -7.33526028451348 C:G G C 10 0.543619388992515 0.0807520437160744 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42276720_42276996:SREBF2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 42289159 C/T 1 16 22 38 7.30208977611976 11.9596265578353 -4.65753678171557 T:C C T 10 0.543619388992515 0.144044752084829 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42289121_42289289:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42289121_42289289:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42289121_42289289:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42289121_42289289:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000491541:exon_42289121_42289289:SREBF2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 42912029 G/T 1 46 55 101 20.9935081063443 29.8990663945883 -8.90555828824402 T:G G T 10 0.543619388992515 0.0890445287448949 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000416699:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000483303:exon_42912017_42912302:RRP7A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 42912136 G/T 1 92 143 235 41.9870162126886 77.7375726259297 -35.750556413241 T:G G T 10 0.543619388992515 3.88141370928246e-06 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000416699:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000483303:exon_42912017_42912302:RRP7A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 42981890 G/A 1 11 11 22 5.02018672108233 5.97981327891767 -0.959626557835332 A:G G A 10 0.543619388992515 0.676454879931535 ENSG00000100227:ENST00000445215:exon_42979727_42981974:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000348657:exon_42979727_42981974:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000252115:exon_42979727_42981974:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000415122:exon_42979729_42981974:POLDIP3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 43010817 G/A 1 7 6 13 3.19466427705239 3.26171633395509 -0.0670520569026953 A:C:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000100227:ENST00000445215:exon_43010805_43010875:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000348657:exon_43010805_43010937:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000252115:exon_43010805_43010968:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000415122:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000451060:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000339677:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000452567:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000414913:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000454057:exon_43010805_43010866:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000463133:exon_43010805_43010883:POLDIP3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 43024189 G/A 1 27 25 52 12.3222764972021 13.5904847248129 -1.26820822761078 A:G G A 10 0.543619388992515 0.781302286232014 ENSG00000100243:ENST00000352397:exon_43024158_43024287:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000396309:exon_43024158_43024287:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000361740:exon_43024158_43024287:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000396303:exon_43024158_43024287:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000407623:exon_43024158_43024287:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000414587:exon_43024158_43024287:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000407332:exon_43024158_43024287:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000470741:exon_43024158_43024287:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000402438:exon_43024158_43024287:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000438270:exon_43024158_43024287:CYB5R3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 43032742 C/T 1 28 25 53 12.7786571082096 13.5904847248129 -0.811827616603297 T:C C T 10 0.543619388992515 0.890582842770981 ENSG00000100243:ENST00000352397:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000396309:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000361740:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000396303:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000407623:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000414587:exon_43032721_43032825:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000407332:exon_43032721_43032896:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000402438:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000438270:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000466276:exon_43032721_43032852:CYB5R3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 43206950 A/C 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 A:C A C 10 0.543619388992515 0.482069340371676 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000440262:exon_43206819_43206950:ARFGAP3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 43435812 C/T 1 6 2 8 2.73828366604491 1.08723877798503 1.65104488805988 T:C C T 10 0.543619388992515 0.303950947229235 ENSG00000100271:ENST00000343040:exon_43435645_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000439248:exon_43435650_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000266254:exon_43435650_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000331018:exon_43435652_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000443978:exon_43435652_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000440761:exon_43435675_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000438461:exon_43435773_43435911:TTLL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 43558926 A/G 1 115 155 270 52.4837702658608 84.2610052938398 -31.7772350279791 A:G A G 10 0.543619388992515 0.000112938510851957 ENSG00000100300:ENST00000337554:exon_43558809_43559248:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000396265:exon_43558809_43559247:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000361449:exon_43558809_43559247:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000329563:exon_43558809_43559216:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000445018:exon_43558809_43558997:TSPO HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 43572354 C/T 1 10 5 15 4.56380611007485 2.71809694496258 1.84570916511227 T:C C T 10 0.543619388992515 0.440182309073759 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43572326_43572402:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43572326_43572402:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43572326_43572402:TTLL12 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 44368122 A/G 1 5 4 9 2.28190305503742 2.17447755597006 0.107425499067364 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000493161:exon_44368116_44368222:SAMM50 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 44368204 A/G 1 9 7 16 4.10742549906736 3.80533572294761 0.302089776119759 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000493161:exon_44368116_44368222:SAMM50 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 44372632 C/T 1 25 27 52 11.4095152751871 14.6777235027979 -3.26820822761078 T:C C T 10 0.543619388992515 0.404515976803853 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44372630_44372701:SAMM50 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 44489868 T/C 1 48 37 85 21.9062693283593 20.1139173927231 1.79235193563622 T:C T C 10 0.543619388992515 0.74451545121644 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000402876:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000444029:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000477795:exon_44489812_44489897:PARVB HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 44489896 T/C 1 46 36 82 20.9935081063443 19.5702980037305 1.42321010261377 T:C T C 10 0.543619388992515 0.82476600231929 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000402876:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000444029:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000477795:exon_44489812_44489897:PARVB HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 44559768 A/T 1 98 100 198 44.7252998787335 54.3619388992515 -9.63663902051798 A:T A T 10 0.543619388992515 0.175646308146867 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44559738_44559810:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44559738_44559810:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44559738_44559810:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44559738_44559810:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44559738_44559810:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44559738_44559810:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000484345:exon_44559738_44559810:PARVB HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 44586522 C/T 1 17 13 30 7.75847038712724 7.0670520569027 0.691418330224549 T:C C T 10 0.543619388992515 0.856142756291466 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44586431_44586546:PARVG HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 44594584 C/G 1 27 27 54 12.3222764972021 14.6777235027979 -2.35544700559581 C:G C G 10 0.543619388992515 0.585336983378677 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000472551:exon_44594501_44594602:PARVG HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 44602229 A/C 1 69 98 167 31.4902621595165 53.2747001212665 -21.78443796175 A:C A C 10 0.543619388992515 0.000799468264811352 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44602197_44602535:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44602197_44602515:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44602197_44602308:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44602197_44603038:PARVG HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 46704243 C/T 1 7 6 13 3.19466427705239 3.26171633395509 -0.0670520569026953 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46704216_46704840:GTSE1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 46704676 A/G 1 13 5 18 5.9329479430973 2.71809694496258 3.21485099813473 A:C:G A G 10 0.543619388992515 0.158000448549750 ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46704216_46704840:GTSE1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 46709881 G/A 1 6 11 17 2.73828366604491 5.97981327891767 -3.24152961287276 A:G G A 10 0.543619388992515 0.144700534072097 ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46709787_46709910:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46709787_46709910:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46709787_46709910:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46709787_46709910:GTSE1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 46712077 C/T 1 7 10 17 3.19466427705239 5.43619388992515 -2.24152961287276 T:C C T 10 0.543619388992515 0.333264703150297 ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46711929_46712309:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46711929_46712309:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46711929_46712309:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46711929_46712309:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000479645:exon_46711934_46712309:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000466510:exon_46711934_46712309:GTSE1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 46722531 C/T 1 15 6 21 6.84570916511227 3.26171633395509 3.58399283115718 T:C:G C T 10 0.543619388992515 0.129808597744933 ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000479645:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000466510:exon_46722333_46723213:GTSE1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 50356555 T/C 1 12 10 22 5.47656733208982 5.43619388992515 0.0403734421646691 T:C T C 10 0.543619388992515 1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 50356693 T/C 1 81 104 185 36.9668294916063 56.5364164552216 -19.5695869636153 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0049019750019615 ENSG00000198355:ENST00000360612:exon_50356588_50357728:PIM3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 50637597 G/C 1 78 75 153 35.5976876585838 40.7714541744386 -5.17376651585481 T:C:G G C 10 0.543619388992515 0.417654271465819 ENSG00000170638:ENST00000380909:exon_50636774_50637993:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000303434:exon_50636774_50638027:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000463233:exon_50636774_50638024:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395827:exon_50636774_50637904:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395829:exon_50637545_50637998:TRABD HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 50648577 C/T 1 8 1 9 3.65104488805988 0.543619388992515 3.10742549906736 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0455406737348372 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 50658053 A/G 1 5 4 9 2.28190305503742 2.17447755597006 0.107425499067364 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50657717_50658220:TUBGCP6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 50658698 T/A 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 A:T T A 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658621_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50658680_50658845:TUBGCP6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 50684296 T/C 1 16 8 24 7.30208977611976 4.34895511194012 2.95313466417964 T:C T C 10 0.543619388992515 0.305769929143739 ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000477814:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000497952:exon_50684220_50684521:HDAC10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 50688348 A/G 1 11 17 28 5.02018672108233 9.24152961287276 -4.22134289179042 A:G A G 10 0.543619388992515 0.129577832731407 ENSG00000100429:ENST00000216271:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000415993:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000440393:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000429374:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000498366:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000483222:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000448072:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000349505:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000395791:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000496909:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000488270:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000489424:exon_50688288_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000470965:exon_50688297_50688393:HDAC10;ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50688289_50688393:MAPK12 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 50694297 A/G 1 17 6 23 7.75847038712724 3.26171633395509 4.49675405317215 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0627877171688749 ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000496942:exon_50694044_50694628:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000482969:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000497738:exon_50694239_50694582:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50694239_50694310:MAPK12 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 50718980 C/T 1 14 15 29 6.38932855410479 8.15429083488773 -1.76496228078294 T:C C T 10 0.543619388992515 0.577774847845697 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50718918_50719099:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50718918_50719099:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50718918_50719099:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50718918_50719099:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50718918_50719099:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50718918_50719099:PLXNB2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 50719251 A/G 1 18 21 39 8.21485099813473 11.4160071688428 -3.20115617070809 A:G A G 10 0.543619388992515 0.336675733684755 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50719173_50719402:PLXNB2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 50720622 C/T 1 7 12 19 3.19466427705239 6.52343266791018 -3.32876839085779 T:C C T 10 0.543619388992515 0.166421015470228 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50720613_50720742:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50720613_50720742:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50720613_50720991:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50720613_50720742:PLXNB2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 50722134 T/C 1 6 11 17 2.73828366604491 5.97981327891767 -3.24152961287276 T:C T C 10 0.543619388992515 0.144700534072097 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000496720:exon_50722031_50722179:PLXNB2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 51064039 G/C 1 25 18 43 11.4095152751871 9.78514900186527 1.62436627332185 C:G G C 10 0.543619388992515 0.649198121721861 ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51064007_51064109:ARSA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 22 51065361 C/A 1 15 16 31 6.84570916511227 8.69791022388024 -1.85220105876797 A:C C A 10 0.543619388992515 0.589591010597541 ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51065262_51065480:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51065262_51065480:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51065262_51065480:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51065262_51065480:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51065262_51065480:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51065262_51065480:ARSA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 4856234 G/A 1 7 2 9 3.19466427705239 1.08723877798503 2.10742549906736 A:G G A 10 0.543619388992515 0.194613573468504 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000493491:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000463980:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000472205:exon_4856107_4856246:ITPR1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 9426330 A/G 1 32 30 62 14.6041795522395 16.3085816697755 -1.70440211753593 A:G A G 10 0.543619388992515 0.703030303565155 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9426208_9427386:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9426208_9428475:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9426208_9426554:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9426208_9426554:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9426208_9426344:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9426208_9426554:THUMPD3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 9807659 A/T 1 5 5 10 2.28190305503742 2.71809694496258 -0.436193889925151 A:T A T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000114026:ENST00000302036:exon_9807493_9808421:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000457221:exon_9807493_9808421:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000349503:exon_9807493_9808352:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000449570:exon_9807493_9808224:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000302008:exon_9807493_9808421:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000383826:exon_9807493_9807796:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000352937:exon_9807493_9808421:OGG1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 9867625 C/T 1 5 7 12 2.28190305503742 3.80533572294761 -1.52343266791018 T:C C T 10 0.543619388992515 0.400734857745032 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9867484_9867632:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000482269:exon_9867090_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000492440:exon_9867250_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000466245:exon_9867545_9867632:TTLL3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 10028294 G/A 1 25 29 54 11.4095152751871 15.7649622807829 -4.35544700559581 A:G G A 10 0.543619388992515 0.274562342847047 ENSG00000125037:ENST00000245046:exon_10028191_10028804:TMEM111;ENSG00000125037:ENST00000487465:exon_10028191_10028522:TMEM111;ENSG00000125037:ENST00000429759:exon_10028191_10028366:TMEM111;ENSG00000125037:ENST00000470827:exon_10028191_10028586:TMEM111 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 10142949 C/T 1 20 22 42 9.1276122201497 11.9596265578353 -2.83201433768563 T:C C T 10 0.543619388992515 0.439398795997891 ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10142872_10143610:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000470028:exon_10142872_10142966:FANCD2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 10302172 G/A 1 6 7 13 2.73828366604491 3.80533572294761 -1.0670520569027 A:G G A 10 0.543619388992515 0.588111803651177 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 12613866 T/C 1 6 3 9 2.73828366604491 1.63085816697755 1.10742549906736 T:C T C 10 0.543619388992515 0.522625694750698 ENSG00000075975:ENST00000170447:exon_12613568_12613872:MKRN2;ENSG00000075975:ENST00000411987:exon_12613568_12613872:MKRN2;ENSG00000075975:ENST00000448482:exon_12613568_12613872:MKRN2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 12881757 C/T 1 15 17 32 6.84570916511227 9.24152961287276 -2.39582044776048 T:C C T 10 0.543619388992515 0.478525973624179 ENSG00000144713:ENST00000396957:exon_12881641_12881840:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000435983:exon_12881641_12881852:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000396953:exon_12881641_12883028:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000457131:exon_12881641_12881840:RPL32 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 13361287 C/T 1 12 12 24 5.47656733208982 6.52343266791018 -1.04686533582036 T:C C T 10 0.543619388992515 0.686969093177818 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13361263_13361479:NUP210 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 13361391 A/G 1 8 10 18 3.65104488805988 5.43619388992515 -1.78514900186527 A:G A G 10 0.543619388992515 0.480432312528866 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13361263_13361479:NUP210 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 13364876 G/T 1 14 9 23 6.38932855410479 4.89257450093264 1.49675405317215 T:G G T 10 0.543619388992515 0.676494295864547 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13364809_13364932:NUP210 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 13367406 C/T 1 9 10 19 4.10742549906736 5.43619388992515 -1.32876839085779 T:C C T 10 0.543619388992515 0.646867751304706 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13367295_13367431:NUP210 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 13368892 G/A 1 9 7 16 4.10742549906736 3.80533572294761 0.302089776119759 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13368717_13368937:NUP210 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 13407556 T/C 1 2 10 12 0.91276122201497 5.43619388992515 -4.52343266791018 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0162707189354310 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13407446_13407591:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13407446_13407591:NUP210 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 14199887 G/A 1 6 6 12 2.73828366604491 3.26171633395509 -0.52343266791018 A:G G A 10 0.543619388992515 0.779998482964206 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14199511_14200392:XPC HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 16305674 C/G 1 14 10 24 6.38932855410479 5.43619388992515 0.953134664179639 C:G C G 10 0.543619388992515 0.838302661714442 ENSG00000154813:ENST00000488423:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000285082:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000462982:exon_16305662_16305736:DPH3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 16358584 T/C 1 159 164 323 72.5645171501901 89.1535797947725 -16.5890626445824 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0654223017542857 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16357352_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16357363_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16358037_16358739:RFTN1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 16364919 A/C 1 83 83 166 37.8795907136212 45.1204092863788 -7.2408185727575 A:T:C A C 10 0.543619388992515 0.275636885420214 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16364883_16364964:RFTN1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 17131421 C/T 1 5 5 10 2.28190305503742 2.71809694496258 -0.436193889925151 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17131225_17132086:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17131225_17132094:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17131225_17132085:PLCL2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 37366459 C/A 1 46 80 126 20.9935081063443 43.4895511194012 -22.4960430130569 A:C C A 10 0.543619388992515 7.12287417886988e-05 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 37368755 T/A 1 26 36 62 11.8658958861946 19.5702980037305 -7.70440211753593 A:T T A 10 0.543619388992515 0.0556878418933755 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 39185077 G/A 1 10 15 25 4.56380611007485 8.15429083488773 -3.59048472481288 A:G G A 10 0.543619388992515 0.163785907367559 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 39186728 C/T 1 5 3 8 2.28190305503742 1.63085816697755 0.65104488805988 T:C C T 10 0.543619388992515 0.734792052639277 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39186488_39186747:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39186488_39186747:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39186488_39186747:CSRNP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 39449137 T/C 1 48 30 78 21.9062693283593 16.3085816697755 5.59768765858383 T:C T C 10 0.543619388992515 0.213029130759089 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000477325:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000475346:exon_39449112_39449686:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000487876:exon_39449112_39449567:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39449094_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000444512:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39449111_39449277:RPSA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 40498845 C/T 0 0 24 24 0 13.0468653358204 -13.0468653358204 T C T 10 0.543619388992515 6.66580264012096e-09 ENSG00000188846:ENST00000338970:exon_40498783_40498854:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000465325:exon_40498794_40498854:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000396203:exon_40498831_40498965:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000416518:exon_40498845_40498965:RPL14 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 42251329 C/T 1 5 3 8 2.28190305503742 1.63085816697755 0.65104488805988 T:C C T 10 0.543619388992515 0.734792052639277 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42251259_42254115:TRAK1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 42610374 A/G 1 13 8 21 5.9329479430973 4.34895511194012 1.58399283115718 A:G A G 10 0.543619388992515 0.520202888001635 ENSG00000093183:ENST00000423701:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000273156:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000417572:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000449617:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000264454:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456515:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000493107:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000383750:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000450981:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000445388:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000454141:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000416880:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000420163:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456222:exon_42610357_42610565:SEC22C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 42610515 G/A 1 8 2 10 3.65104488805988 1.08723877798503 2.56380611007485 A:G G A 10 0.543619388992515 0.122752294666106 ENSG00000093183:ENST00000423701:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000273156:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000417572:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000449617:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000264454:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456515:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000493107:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000383750:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000450981:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000445388:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000454141:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000416880:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000420163:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456222:exon_42610357_42610565:SEC22C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 43591327 G/A 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 A:G G A 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000160746:ENST00000292246:exon_43591212_43591340:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000350459:exon_43591212_43591340:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000396091:exon_43591212_43591340:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000414522:exon_43591212_43591340:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000451430:exon_43591212_43591340:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000448045:exon_43591212_43591340:ANO10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 45052775 G/C 1 75 55 130 34.2285458255614 29.8990663945883 4.32947943097304 C:G G C 10 0.543619388992515 0.48165236521061 ENSG00000075914:ENST00000461361:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000265564:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000468667:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000491476:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000486727:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000459856:exon_45052725_45052885:EXOSC7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 47045739 C/G 1 18 15 33 8.21485099813473 8.15429083488773 0.0605601632470023 C:G C G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000441027:exon_47045662_47045883:NBEAL2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 47125385 G/A 1 6 5 11 2.73828366604491 2.71809694496258 0.0201867210823345 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000492397:exon_47125210_47125436:SETD2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 47452786 G/A 1 16 9 25 7.30208977611976 4.89257450093264 2.40951527518712 A:G G A 10 0.543619388992515 0.423109955424406 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 47956424 C/T 1 12 23 35 5.47656733208982 12.5032459468278 -7.02667861473803 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0259214967936045 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47956307_47956429:MAP4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 47958037 G/T 1 6 13 19 2.73828366604491 7.0670520569027 -4.32876839085779 T:G G T 10 0.543619388992515 0.0633842011056323 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47957441_47958664:MAP4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 48474249 A/G 1 13 14 27 5.9329479430973 7.61067144589521 -1.67772350279791 A:G A G 10 0.543619388992515 0.56531671981011 ENSG00000164051:ENST00000447018:exon_48473574_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395694:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000412398:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395696:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000296441:exon_48473587_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000442740:exon_48473605_48474576:CCDC51 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 48508567 C/T 1 145 25 170 66.1751885960853 13.5904847248129 52.5847038712724 T:C C T 10 0.543619388992515 1.28121372810477e-17 ENSG00000213689:ENST00000395677:exon_48506886_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000296443:exon_48508029_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000433541:exon_48508139_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000444177:exon_48508067_48509042:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000456089:exon_48508464_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000492235:exon_48508177_48508832:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000422277:exon_48507673_48509041:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000436480:exon_48507673_48509041:TREX1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 48508585 C/T 1 98 52 150 44.7252998787335 28.2682082276108 16.4570916511227 T:C C T 10 0.543619388992515 0.00680929639106821 ENSG00000213689:ENST00000395677:exon_48506886_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000296443:exon_48508029_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000433541:exon_48508139_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000444177:exon_48508067_48509042:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000456089:exon_48508464_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000492235:exon_48508177_48508832:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000422277:exon_48507673_48509041:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000436480:exon_48507673_48509041:TREX1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 52237970 C/T 1 22 36 58 10.0403734421647 19.5702980037305 -9.52992456156587 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0168904233486695 ENSG00000023330:ENST00000469224:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000394965:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000441729:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000442476:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000310271:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000484952:exon_52237879_52238028:ALAS1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 52256697 C/T 1 17 9 26 7.75847038712724 4.89257450093264 2.86589588619461 T:C C T 10 0.543619388992515 0.32603457135944 ENSG00000239732:ENST00000360658:exon_52255096_52258328:TLR9;ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52255097_52258328:RP11-330H6.5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 52263967 G/A 1 32 38 70 14.6041795522395 20.6575367817156 -6.05335722947605 A:G G A 10 0.543619388992515 0.151601126835123 ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52263936_52264086:RP11-330H6.5;ENSG00000247596:ENST00000305533:exon_52263936_52264086:TWF2;ENSG00000247596:ENST00000499914:exon_52263936_52264086:TWF2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 52283001 C/G 1 7 6 13 3.19466427705239 3.26171633395509 -0.0670520569026953 C:G C G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000164088:ENST00000457454:exon_52282972_52283079:PPM1M;ENSG00000164088:ENST00000467471:exon_52282972_52283079:PPM1M;ENSG00000164088:ENST00000296487:exon_52282972_52283079:PPM1M;ENSG00000164088:ENST00000409502:exon_52282972_52283079:PPM1M;ENSG00000164088:ENST00000323588:exon_52282972_52283079:PPM1M;ENSG00000164088:ENST00000489606:exon_52282972_52283079:PPM1M;ENSG00000164088:ENST00000482724:exon_52282972_52283079:PPM1M;ENSG00000164088:ENST00000443681:exon_52282977_52283079:PPM1M HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 52643685 T/C 1 4 6 10 1.82552244402994 3.26171633395509 -1.43619388992515 T:C T C 10 0.543619388992515 0.528005019910346 ENSG00000163939:ENST00000356770:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000394830:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296302:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000337303:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000412587:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409057:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000410007:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296303:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409114:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409767:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000423351:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000446103:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000480064:exon_52643102_52643971:PBRM1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 52720080 A/C 1 11 6 17 5.02018672108233 3.26171633395509 1.75847038712724 A:C A C 10 0.543619388992515 0.470285892368413 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468146:exon_52720021_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52720032_52720218:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468885:exon_52720046_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000462550:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000492349:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52720065_52720121:GNL3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 52721305 G/A 1 57 57 114 26.0136948274266 30.9863051725734 -4.97261034514671 A:G G A 10 0.543619388992515 0.349256126727294 ENSG00000163938:ENST00000479230:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468146:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000462550:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000492349:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000474423:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000460073:exon_52721262_52721399:GNL3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 52727257 G/A 1 133 101 234 60.6986212639955 54.905558288244 5.79306297575148 A:G G A 10 0.543619388992515 0.470686923706093 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000497356:exon_52727186_52727560:GNL3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 52874446 C/T 1 5 4 9 2.28190305503742 2.17447755597006 0.107425499067364 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000213533:ENST00000355083:exon_52870772_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000477591:exon_52874234_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000464769:exon_52874310_52874626:TMEM110 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 53905308 T/C 1 28 20 48 12.7786571082096 10.8723877798503 1.90626932835928 T:C T C 10 0.543619388992515 0.664484784040425 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000486794:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000495993:exon_53905185_53905523:ACTR8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 53906513 G/A 1 5 9 14 2.28190305503742 4.89257450093264 -2.61067144589521 A:G G A 10 0.543619388992515 0.186393367921189 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000486794:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000495993:exon_53906411_53906551:ACTR8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 56601044 G/A 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000180376:ENST00000436465:exon_56600978_56601081:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000422222:exon_56600978_56601081:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000394672:exon_56600978_56601081:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000326595:exon_56600978_56601081:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000434467:exon_56600978_56601081:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000471681:exon_56600978_56601081:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000341455:exon_56600978_56601081:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000442522:exon_56600978_56601081:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000484623:exon_56600978_56601081:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000482673:exon_56600978_56601081:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000494672:exon_56600811_56601081:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000484441:exon_56600979_56601081:CCDC66 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 56657197 T/C 1 27 21 48 12.3222764972021 11.4160071688428 0.906269328359278 T:C T C 10 0.543619388992515 0.885081581824893 ENSG00000163946:ENST00000459993:exon_56654161_56657594:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000431842:exon_56654573_56657594:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000493960:exon_56656766_56657871:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000355628:exon_56656887_56657594:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000447900:exon_56656974_56657594:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000296313:exon_56657065_56657594:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000485156:exon_56657145_56657871:C3orf63 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 56763525 A/G 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 A:G A G 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56761449_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56762260_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56763015_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56763049_56763650:ARHGEF3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 56766435 C/G 1 2 6 8 0.91276122201497 3.26171633395509 -2.34895511194012 C:G C G 10 0.543619388992515 0.153435168169122 ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000495373:exon_56765621_56766452:ARHGEF3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 66419942 A/G 1 9 7 16 4.10742549906736 3.80533572294761 0.302089776119759 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66419902_66419966:SLC25A26 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 66430811 T/G 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 T:G T G 10 0.543619388992515 0.482069340371676 ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66430541_66431377:SLC25A26;ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66429221_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66429221_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66429222_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66429222_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66430649_66430913:LRIG1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 69096614 G/A 1 5 6 11 2.28190305503742 3.26171633395509 -0.979813278917665 A:G G A 10 0.543619388992515 0.56306921306608 ENSG00000144747:ENST00000398559:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000356248:exon_69096500_69097284:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000488010:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000438636:exon_69096509_69097713:TMF1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 69151152 C/A 1 15 26 41 6.84570916511227 14.1341041138054 -7.28839494869312 A:C C A 10 0.543619388992515 0.0273620113100088 ENSG00000144746:ENST00000273258:exon_69150990_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000435015:exon_69151060_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000412089:exon_69151110_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000484921:exon_69150990_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000470936:exon_69150990_69151381:ARL6IP5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 73111998 C/T 1 6 3 9 2.73828366604491 1.63085816697755 1.10742549906736 T:C C T 10 0.543619388992515 0.522625694750698 ENSG00000255423:ENST00000533473:exon_73110810_73112488:AC103559.1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 93755580 G/A 1 3 7 10 1.36914183302245 3.80533572294761 -2.43619388992515 A:G G A 10 0.543619388992515 0.202250323161148 ENSG00000169379:ENST00000303097:exon_93755396_93755598:ARL13B;ENSG00000169379:ENST00000394222:exon_93755396_93755598:ARL13B;ENSG00000169379:ENST00000471138:exon_93755396_93755598:ARL13B;ENSG00000169379:ENST00000460371:exon_93755396_93755598:ARL13B;ENSG00000169379:ENST00000335438:exon_93755396_93755598:ARL13B;ENSG00000169379:ENST00000486562:exon_93755396_93755598:ARL13B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 98304467 T/C 1 7 4 11 3.19466427705239 2.17447755597006 1.02018672108233 T:C T C 10 0.543619388992515 0.763926340985151 ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98304285_98304503:CPOX;ENSG00000080819:ENST00000510489:exon_98304285_98304706:CPOX HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 99886662 G/A 1 13 12 25 5.9329479430973 6.52343266791018 -0.590484724812876 A:G G A 10 0.543619388992515 0.843032485284801 ENSG00000184220:ENST00000421999:exon_99886582_99886684:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000491299:exon_99886582_99886684:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000489081:exon_99886582_99886684:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000478909:exon_99886582_99886684:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000497345:exon_99886582_99886684:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000479555:exon_99886582_99886684:C3orf26 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 100287764 T/C 1 5 4 9 2.28190305503742 2.17447755597006 0.107425499067364 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000181458:ENST00000323523:exon_100287666_100287811:TMEM45A;ENSG00000181458:ENST00000403410:exon_100287666_100287811:TMEM45A;ENSG00000181458:ENST00000485260:exon_100287666_100287811:TMEM45A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 100467018 T/C 1 45 29 74 20.5371274953368 15.7649622807829 4.77216521455389 T:C T C 10 0.543619388992515 0.294403031242580 ENSG00000114354:ENST00000418917:exon_100466993_100467786:TFG;ENSG00000114354:ENST00000490574:exon_100466993_100467771:TFG;ENSG00000114354:ENST00000240851:exon_100466993_100467810:TFG;ENSG00000114354:ENST00000406587:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000443578:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000476228:exon_100466993_100467808:TFG;ENSG00000114354:ENST00000481203:exon_100466993_100467807:TFG HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 107778346 G/A 1 22 12 34 10.0403734421647 6.52343266791018 3.51694077425449 A:G G A 10 0.543619388992515 0.301563583614777 ENSG00000196776:ENST00000398260:exon_107778299_107778391:CD47;ENSG00000196776:ENST00000355354:exon_107778299_107778391:CD47;ENSG00000196776:ENST00000398257:exon_107778299_107778391:CD47;ENSG00000196776:ENST00000517766:exon_107778299_107778379:CD47;ENSG00000196776:ENST00000361309:exon_107778299_107778391:CD47 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 108279578 T/C 1 4 7 11 1.82552244402994 3.80533572294761 -1.97981327891767 T:C T C 10 0.543619388992515 0.245254265630413 ENSG00000163507:ENST00000491772:exon_108279496_108279688:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000295746:exon_108279496_108279688:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000481530:exon_108279496_108279688:KIAA1524 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 108373022 G/A 1 10 8 18 4.56380611007485 4.34895511194012 0.214850998134729 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000198919:ENST00000361582:exon_108372992_108373157:DZIP3;ENSG00000198919:ENST00000495008:exon_108372992_108373157:DZIP3;ENSG00000198919:ENST00000463306:exon_108372992_108373157:DZIP3;ENSG00000198919:ENST00000437062:exon_108372992_108373157:DZIP3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 111710398 A/G 1 8 5 13 3.65104488805988 2.71809694496258 0.932947943097304 A:G A G 10 0.543619388992515 0.782457075337367 ENSG00000144827:ENST00000491580:exon_111710224_111711118:ABHD10;ENSG00000144827:ENST00000273359:exon_111710224_111712210:ABHD10;ENSG00000144827:ENST00000493784:exon_111710224_111710823:ABHD10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 111710528 T/C 1 12 6 18 5.47656733208982 3.26171633395509 2.21485099813473 T:C T C 10 0.543619388992515 0.349607890938645 ENSG00000144827:ENST00000491580:exon_111710224_111711118:ABHD10;ENSG00000144827:ENST00000273359:exon_111710224_111712210:ABHD10;ENSG00000144827:ENST00000493784:exon_111710224_111710823:ABHD10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 113286405 C/T 1 3 6 9 1.36914183302245 3.26171633395509 -1.89257450093264 T:C C T 10 0.543619388992515 0.316548245109532 ENSG00000072858:ENST00000264852:exon_113286387_113286557:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000393830:exon_113286387_113286557:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000491730:exon_113286387_113286557:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000483946:exon_113286387_113286763:SIDT1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 113442303 T/C 1 3 6 9 1.36914183302245 3.26171633395509 -1.89257450093264 T:C T C 10 0.543619388992515 0.316548245109532 ENSG00000121579:ENST00000240922:exon_113442269_113442388:NAA50;ENSG00000121579:ENST00000497525:exon_113442269_113442388:NAA50;ENSG00000121579:ENST00000493454:exon_113442269_113442388:NAA50;ENSG00000121579:ENST00000481432:exon_113442269_113442388:NAA50;ENSG00000121579:ENST00000493900:exon_113442269_113442388:NAA50 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 119133554 G/A 1 6 5 11 2.73828366604491 2.71809694496258 0.0201867210823345 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119132703_119139561:ARHGAP31 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 119263680 C/T 1 45 37 82 20.5371274953368 20.1139173927231 0.423210102613766 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000121594:ENST00000264246:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000383669:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000383668:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000478182:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000463729:exon_119263190_119263714:CD80 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 119305169 G/A 1 7 5 12 3.19466427705239 2.71809694496258 0.476567332089819 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000481816:exon_119305132_119305210:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000471850:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000485496:exon_119305132_119305386:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119305132_119305492:ADPRH HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 121353254 T/C 1 103 85 188 47.0072029337709 46.2076480643638 0.799554869407167 T:C T C 10 0.543619388992515 0.941699871174955 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121353054_121353265:HCLS1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 121354583 G/A 1 108 85 193 49.2891059888084 46.2076480643638 3.08145792444459 A:G G A 10 0.543619388992515 0.665419329523845 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121354582_121354651:HCLS1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 121383297 G/A 1 64 62 126 29.208359104479 33.7044021175359 -4.4960430130569 A:G G A 10 0.543619388992515 0.422637612480031 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121382046_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121382050_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121382948_121383461:GOLGB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 121414000 G/A 1 8 9 17 3.65104488805988 4.89257450093264 -1.24152961287276 A:G G A 10 0.543619388992515 0.629539446230712 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 121414061 C/T 1 10 12 22 4.56380611007485 6.52343266791018 -1.95962655783533 T:C C T 10 0.543619388992515 0.521823185288352 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 121415720 T/C 1 9 9 18 4.10742549906736 4.89257450093264 -0.785149001865271 T:C T C 10 0.543619388992515 0.81438018796475 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 121416623 G/C 1 2 7 9 0.91276122201497 3.80533572294761 -2.89257450093264 C:G G C 10 0.543619388992515 0.0894121930945724 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000426235:exon_121415847_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000489400:exon_121415874_121417776:GOLGB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 121500699 C/T 1 6 25 31 2.73828366604491 13.5904847248129 -10.852201058768 T:C C T 10 0.543619388992515 8.97423514858441e-05 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121500590_121500721:IQCB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 121554147 G/A 1 4 16 20 1.82552244402994 8.69791022388024 -6.8723877798503 A:G G A 10 0.543619388992515 0.00261066431398132 ENSG00000145088:ENST00000490434:exon_121554030_121554238:EAF2;ENSG00000145088:ENST00000465664:exon_121554056_121554238:EAF2;ENSG00000145088:ENST00000273668:exon_121554062_121554238:EAF2;ENSG00000145088:ENST00000451944:exon_121554084_121554238:EAF2;ENSG00000145088:ENST00000490477:exon_121554124_121554238:EAF2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 121712051 A/C 1 3 6 9 1.36914183302245 3.26171633395509 -1.89257450093264 A:C A C 10 0.543619388992515 0.316548245109532 ENSG00000145103:ENST00000273691:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000344209:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000393631:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000462014:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000460554:exon_121711996_121712798:ILDR1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 122152573 C/T 1 6 2 8 2.73828366604491 1.08723877798503 1.65104488805988 T:C C T 10 0.543619388992515 0.303950947229235 ENSG00000114030:ENST00000344337:exon_122152508_122152635:KPNA1;ENSG00000114030:ENST00000470904:exon_122152508_122152635:KPNA1;ENSG00000114030:ENST00000466923:exon_122152508_122152635:KPNA1;ENSG00000114030:ENST00000485027:exon_122152508_122152635:KPNA1;ENSG00000114030:ENST00000494339:exon_122152508_122152635:KPNA1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 122259606 T/C 1 19 26 45 8.67123160914221 14.1341041138054 -5.46287250466318 T:C T C 10 0.543619388992515 0.133636041334022 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000492382:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000489652:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122259319_122259699:PARP9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 122274757 G/C 1 10 17 27 4.56380611007485 9.24152961287276 -4.67772350279791 C:G G C 10 0.543619388992515 0.0825276323953588 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000466126:exon_122274711_122274968:PARP9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 122354037 A/G 1 20 24 44 9.1276122201497 13.0468653358204 -3.91925311567066 A:G A G 10 0.543619388992515 0.289392563198595 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122353867_122354041:PARP15 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 122354792 G/A 1 18 26 44 8.21485099813473 14.1341041138054 -5.91925311567066 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0949240344220402 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122354658_122354886:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 122864436 G/A 1 12 3 15 5.47656733208982 1.63085816697755 3.84570916511227 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0667796098120002 ENSG00000065485:ENST00000489923:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000472319:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000467157:exon_122863354_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000485208:exon_122864369_122864439:PDIA5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 124802677 A/G 1 40 39 79 18.2552244402994 21.2011561707081 -2.94593173040869 A:G A G 10 0.543619388992515 0.57255257148455 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 124802881 A/G 1 44 16 60 20.0807468843293 8.69791022388024 11.3828366604491 A:G A G 10 0.543619388992515 0.00396550338423287 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124802734_124802893:SLC12A8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 124802888 C/T 1 46 17 63 20.9935081063443 9.24152961287276 11.7519784934716 T:C C T 10 0.543619388992515 0.00331846377586623 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124802734_124802893:SLC12A8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 125648343 G/A 1 4 6 10 1.82552244402994 3.26171633395509 -1.43619388992515 A:G G A 10 0.543619388992515 0.528005019910346 ENSG00000189366:ENST00000340333:exon_125648118_125648410:ALG1L;ENSG00000189366:ENST00000437882:exon_125648118_125648410:ALG1L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 125648356 T/C 1 6 3 9 2.73828366604491 1.63085816697755 1.10742549906736 T:C T C 10 0.543619388992515 0.522625694750698 ENSG00000189366:ENST00000340333:exon_125648118_125648410:ALG1L;ENSG00000189366:ENST00000437882:exon_125648118_125648410:ALG1L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 127800071 A/G 1 103 103 206 47.0072029337709 55.9927970662291 -8.9855941324581 A:G A G 10 0.543619388992515 0.209029933872556 ENSG00000175792:ENST00000322623:exon_127799803_127800252:RUVBL1;ENSG00000175792:ENST00000417360:exon_127799807_127800252:RUVBL1;ENSG00000175792:ENST00000478892:exon_127800025_127800252:RUVBL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 128344786 G/A 1 84 64 148 38.3359713246287 34.791640895521 3.54433042910777 A:C:G G A 10 0.543619388992515 0.564969168093889 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128344717_128344855:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128344717_128344855:RPN1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 128356852 C/T 1 36 23 59 16.4297019962695 12.5032459468278 3.92645604944161 T:C C T 10 0.543619388992515 0.36057596812105 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000495462:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000479113:exon_128356663_128356948:RPN1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 128627933 C/T 1 7 12 19 3.19466427705239 6.52343266791018 -3.32876839085779 T:C C T 10 0.543619388992515 0.166421015470228 ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511526:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000508971:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511325:exon_128627816_128627942:ACAD9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 130718472 G/A 1 27 15 42 12.3222764972021 8.15429083488773 4.16798566231437 A:G G A 10 0.543619388992515 0.217547410222032 ENSG00000017260:ENST00000504381:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000505330:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000507488:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000510168:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000508532:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000513801:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000504948:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000328560:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000533801:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000428331:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000393221:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000422190:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000359644:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000347421:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000504612:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000514654:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000507194:exon_130718362_130718503:ATP2C1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 133341988 T/C 1 6 7 13 2.73828366604491 3.80533572294761 -1.0670520569027 T:C T C 10 0.543619388992515 0.588111803651177 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133341935_133342037:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000513818:exon_133341935_133342037:TOPBP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 138347988 T/C 1 15 12 27 6.84570916511227 6.52343266791018 0.322276497202094 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000158234:ENST00000470889:exon_138347949_138349981:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000338446:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000360570:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000311126:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393035:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000491175:exon_138347949_138348174:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393034:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393036:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000464668:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000479848:exon_138347949_138347993:FAIM HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 139097902 A/G 1 8 5 13 3.65104488805988 2.71809694496258 0.932947943097304 A:G A G 10 0.543619388992515 0.782457075337367 ENSG00000184432:ENST00000333188:exon_139097889_139098015:COPB2;ENSG00000184432:ENST00000507777:exon_139097889_139098015:COPB2;ENSG00000184432:ENST00000510181:exon_139097889_139098015:COPB2;ENSG00000184432:ENST00000515006:exon_139097889_139098015:COPB2;ENSG00000184432:ENST00000512153:exon_139097889_139098015:COPB2;ENSG00000184432:ENST00000513274:exon_139097889_139098015:COPB2;ENSG00000184432:ENST00000512242:exon_139097898_139098015:COPB2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 142168304 G/A 1 11 17 28 5.02018672108233 9.24152961287276 -4.22134289179042 A:G G A 10 0.543619388992515 0.129577832731407 ENSG00000175054:ENST00000504521:exon_142168077_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000350721:exon_142168079_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000515810:exon_142168079_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000513291:exon_142168080_142172075:ATR;ENSG00000175054:ENST00000383101:exon_142168080_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000515107:exon_142168160_142168444:ATR HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 142178144 C/T 1 8 9 17 3.65104488805988 4.89257450093264 -1.24152961287276 T:C C T 10 0.543619388992515 0.629539446230712 ENSG00000175054:ENST00000350721:exon_142178069_142178225:ATR;ENSG00000175054:ENST00000513291:exon_142178069_142178225:ATR;ENSG00000175054:ENST00000383101:exon_142178069_142178225:ATR HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 146234909 G/A 1 19 25 44 8.67123160914221 13.5904847248129 -4.91925311567066 A:G G A 10 0.543619388992515 0.172563358068996 ENSG00000188313:ENST00000342435:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000493432:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000448205:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000463777:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000487389:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000468985:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000448787:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000488253:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000489775:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000483300:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000484560:exon_146234810_146235181:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000478267:exon_146234690_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000470496:exon_146234799_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000462666:exon_146234876_146234954:PLSCR1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 148704081 G/A 0 10 0 10 4.56380611007485 0 4.56380611007485 G G 10 0.543619388992515 0.00264596365718521 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 149678534 C/T 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000082996:ENST00000392894:exon_149678527_149679926:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000344229:exon_149678527_149679909:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000491086:exon_149678527_149678803:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467977:exon_149678527_149678552:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000474348:exon_149678527_149678620:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467996:exon_149678527_149678537:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000361785:exon_149678527_149679913:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000482083:exon_149678527_149678672:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000468289:exon_149678527_149679161:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000493238:exon_149678527_149679161:RNF13 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 150280445 C/G 1 6 10 16 2.73828366604491 5.43619388992515 -2.69791022388024 C:G C G 10 0.543619388992515 0.212743822682223 ENSG00000144895:ENST00000487799:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000460851:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000474505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000406576:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000482093:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000469331:exon_150280329_150280695:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000273435:exon_150280344_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000490505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000462221:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000477551:exon_150280329_150280447:EIF2A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 154033066 G/A 1 21 26 47 9.58399283115718 14.1341041138054 -4.55011128264821 A:G G A 10 0.543619388992515 0.190492777774682 ENSG00000174953:ENST00000496811:exon_154032835_154033069:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000308361:exon_154032835_154033069:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000329463:exon_154032835_154033069:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000481941:exon_154032835_154033069:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000491011:exon_154032440_154033069:DHX36 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 155632314 A/G 1 28 30 58 12.7786571082096 16.3085816697755 -3.52992456156587 A:G A G 10 0.543619388992515 0.359468749040614 ENSG00000163655:ENST00000496455:exon_155632208_155632359:GMPS;ENSG00000163655:ENST00000295920:exon_155632208_155632359:GMPS HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 156266774 C/T 1 53 61 114 24.1881723833967 33.1607827285434 -8.97261034514672 T:C C T 10 0.543619388992515 0.109565636553300 ENSG00000114850:ENST00000265044:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467789:exon_156266655_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000476217:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000498205:exon_156266694_156266888:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000478842:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000464138:exon_156266594_156266786:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000463503:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000496050:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467733:exon_156266694_156266792:SSR3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 170825920 G/A 1 6 2 8 2.73828366604491 1.08723877798503 1.65104488805988 A:G G A 10 0.543619388992515 0.303950947229235 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170825854_170825951:TNIK HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 178952020 C/T 1 11 13 24 5.02018672108233 7.0670520569027 -2.04686533582036 T:C:G C T 10 0.543619388992515 0.419733845613331 ENSG00000121879:ENST00000263967:exon_178951882_178957881:PIK3CA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 179298999 C/T 1 21 12 33 9.58399283115718 6.52343266791018 3.060560163247 T:C C T 10 0.543619388992515 0.300710176067611 ENSG00000136518:ENST00000429709:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000450518:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000392662:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000259034:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000484312:exon_179298952_179299008:ACTL6A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 179306775 C/T 1 47 36 83 21.4498887173518 19.5702980037305 1.87959071362125 T:C C T 10 0.543619388992515 0.741361356586442 ENSG00000136522:ENST00000476781:exon_179306073_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000259038:exon_179306243_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000451938:exon_179306257_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000392659:exon_179306619_179306783:MRPL47 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 179322385 A/C 1 45 32 77 20.5371274953368 17.3958204477605 3.14130704757634 A:C A C 10 0.543619388992515 0.494475017115887 ENSG00000136522:ENST00000476781:exon_179322315_179322442:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000259038:exon_179322315_179322428:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000451938:exon_179322315_179322434:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000392659:exon_179322315_179322437:MRPL47 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 182871962 C/T 1 12 11 23 5.47656733208982 5.97981327891767 -0.503245946827846 T:C C T 10 0.543619388992515 0.837610804972755 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000476015:exon_182871689_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000470251:exon_182871728_182872179:LAMP3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 183882114 G/A 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 A:G G A 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000161202:ENST00000313143:exon_183882055_183882176:DVL3;ENSG00000161202:ENST00000435708:exon_183882055_183882176:DVL3;ENSG00000161202:ENST00000431765:exon_183882055_183882176:DVL3;ENSG00000161202:ENST00000462665:exon_183882055_183882176:DVL3;ENSG00000161202:ENST00000423300:exon_183882055_183882176:DVL3;ENSG00000161202:ENST00000478247:exon_183882055_183882176:DVL3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 183976103 C/T 1 10 12 22 4.56380611007485 6.52343266791018 -1.95962655783533 T:C C T 10 0.543619388992515 0.521823185288352 ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183976076_183977373:ECE2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 184019681 G/A 1 22 15 37 10.0403734421647 8.15429083488773 1.88608260727694 A:T:G G A 10 0.543619388992515 0.621589127085329 ENSG00000175166:ENST00000310118:exon_184019635_184019859:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000459910:exon_184019559_184019723:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000487475:exon_184019325_184019849:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000433010:exon_184019635_184019852:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000445558:exon_184019582_184019859:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000435761:exon_184019646_184019859:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000439383:exon_184019635_184019859:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000463602:exon_184019559_184019859:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000485937:exon_184019510_184019859:PSMD2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 184026703 C/T 1 118 83 201 53.8529120988832 45.1204092863788 8.73250281250447 T:C C T 10 0.543619388992515 0.229014565991085 ENSG00000175166:ENST00000310118:exon_184026496_184026842:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000435761:exon_184026496_184026788:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000439383:exon_184026496_184026836:PSMD2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 184039666 A/G 1 21 12 33 9.58399283115718 6.52343266791018 3.060560163247 A:G A G 10 0.543619388992515 0.300710176067611 ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000450424:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000421110:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000413967:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000426123:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000444861:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000457456:exon_184039070_184039815:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184039070_184039891:EIF4G1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 184046470 C/T 1 43 35 78 19.6243662733219 19.026678614738 0.597687658583826 T:C:G C T 10 0.543619388992515 0.910057831062716 ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382362:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000422614:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000460829:exon_184045905_184046923:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000475721:exon_184046404_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000464548:exon_184046457_184046544:EIF4G1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 185135448 G/A 0 606 4 610 276.566650270536 2.17447755597006 274.392172714566 T:G G T 10 0.543619388992515 1.95102735551063e-152 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 186301703 A/G 1 73 76 149 33.3157846035464 41.3150735634311 -7.99928895988474 A:G A G 10 0.543619388992515 0.189445338432361 ENSG00000090520:ENST00000439351:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000265028:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000495390:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000418776:exon_186301654_186301765:DNAJB11 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 186509517 G/A 1 53 44 97 24.1881723833967 23.9192531156707 0.268919267726037 A:C:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000163918:ENST00000433496:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000479307:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000392481:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000296273:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000417876:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000494047:exon_186509112_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000460408:exon_186509479_186509639:RFC4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 193374964 T/C 1 9 11 20 4.10742549906736 5.97981327891767 -1.8723877798503 T:C T C 10 0.543619388992515 0.502082958548873 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000482865:exon_193374869_193375021:OPA1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 196281208 T/C 1 11 24 35 5.02018672108233 13.0468653358204 -8.02667861473803 T:C T C 10 0.543619388992515 0.00985141699521246 ENSG00000185798:ENST00000332629:exon_196281056_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000429115:exon_196281059_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000433160:exon_196281065_196281678:WDR53 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 196454939 C/T 1 14 11 25 6.38932855410479 5.97981327891767 0.409515275187124 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000163964:ENST00000426755:exon_196454794_196455007:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000392391:exon_196454794_196455007:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000314118:exon_196454794_196455007:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000296333:exon_196454794_196455007:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000453218:exon_196454794_196455007:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000421265:exon_196454794_196455222:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000415832:exon_196454794_196455007:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000451319:exon_196454794_196454981:PIGX HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 196742290 T/C 1 5 3 8 2.28190305503742 1.63085816697755 0.65104488805988 T:C T C 10 0.543619388992515 0.734792052639277 ENSG00000163975:ENST00000296350:exon_196742236_196742387:MFI2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 196746629 T/C 1 8 6 14 3.65104488805988 3.26171633395509 0.38932855410479 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000163975:ENST00000296351:exon_196745824_196746672:MFI2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 3 197597044 C/T 1 6 2 8 2.73828366604491 1.08723877798503 1.65104488805988 T:C C T 10 0.543619388992515 0.303950947229235 ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000461674:exon_197597031_197597047:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000452660:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000433298:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000471667:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000483442:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000473177:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000428136:exon_197597031_197597149:LRCH3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 663908 A/G 1 5 5 10 2.28190305503742 2.71809694496258 -0.436193889925151 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000133256:ENST00000255622:exon_663838_664571:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000496514:exon_663835_664542:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000429163:exon_663835_664022:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000471824:exon_663835_663982:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000461490:exon_663835_664103:PDE6B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 1729953 G/A 1 54 42 96 24.6445529944042 22.8320143376856 1.81253865671856 A:G G A 10 0.543619388992515 0.759009257849265 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000467746:exon_1729435_1729959:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000458173:exon_1729435_1730121:TACC3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 1729988 G/A 1 53 47 100 24.1881723833967 25.5501112826482 -1.36193889925151 A:G G A 10 0.543619388992515 0.841033598627381 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000458173:exon_1729435_1730121:TACC3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 1730299 A/G 1 52 45 97 23.7317917723892 24.4628725046632 -0.731080732273959 A:G A G 10 0.543619388992515 0.91896984783906 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1730131_1730514:TACC3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 1732978 G/A 1 27 24 51 12.3222764972021 13.0468653358204 -0.724588838618267 A:G G A 10 0.543619388992515 0.888623560548513 ENSG00000013810:ENST00000485989:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1732899_1733028:TACC3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 1824020 C/T 1 6 8 14 2.73828366604491 4.34895511194012 -1.61067144589521 T:C C T 10 0.543619388992515 0.430135065302382 ENSG00000168924:ENST00000302787:exon_1823908_1824039:LETM1;ENSG00000168924:ENST00000510940:exon_1823908_1824369:LETM1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 2743999 A/G 1 84 79 163 38.3359713246287 42.9459317304087 -4.60996040577995 A:G A G 10 0.543619388992515 0.479957427773655 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 2744087 G/A 1 58 67 125 26.4700754384341 36.4224990624985 -9.95242362406438 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0876196379960563 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 2831383 T/G 1 8 4 12 3.65104488805988 2.17447755597006 1.47656733208982 T:G T G 10 0.543619388992515 0.564519601476267 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2831220_2831461:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000505941:exon_2831220_2831532:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510204:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515802:exon_2831220_2831874:SH3BP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 3231661 G/A 1 8 10 18 3.65104488805988 5.43619388992515 -1.78514900186527 A:G G A 10 0.543619388992515 0.480432312528866 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000513806:exon_3231614_3231769:HTT HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 3514695 A/G 1 80 78 158 36.5104488805988 42.4023123414162 -5.89186346081738 A:G A G 10 0.543619388992515 0.379778462744689 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 3519762 A/G 1 47 31 78 21.4498887173518 16.852201058768 4.59768765858383 A:T:G A G 10 0.543619388992515 0.308611984815376 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000515119:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000509198:exon_3519388_3519919:LRPAP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 4861974 C/T 1 7 1 8 3.19466427705239 0.543619388992515 2.65104488805988 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0786679847867632 ENSG00000163132:ENST00000382723:exon_4861393_4862095:MSX1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 4864876 C/T 1 3 11 14 1.36914183302245 5.97981327891767 -4.61067144589521 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0154679504098927 ENSG00000163132:ENST00000382723:exon_4864428_4865663:MSX1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 6865521 C/T 1 4 7 11 1.82552244402994 3.80533572294761 -1.97981327891767 T:C C T 10 0.543619388992515 0.245254265630413 ENSG00000170871:ENST00000425103:exon_6862628_6865910:KIAA0232;ENSG00000170871:ENST00000307659:exon_6862628_6865910:KIAA0232 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 8229713 A/G 1 3 6 9 1.36914183302245 3.26171633395509 -1.89257450093264 A:G A G 10 0.543619388992515 0.316548245109532 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 8229879 G/A 1 4 8 12 1.82552244402994 4.34895511194012 -2.52343266791018 A:G G A 10 0.543619388992515 0.158970386231855 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 8230070 T/C 1 8 6 14 3.65104488805988 3.26171633395509 0.38932855410479 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 8230235 T/C 1 4 11 15 1.82552244402994 5.97981327891767 -4.15429083488773 T:C T C 10 0.543619388992515 0.037970342706995 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 10099340 T/C 1 46 77 123 20.9935081063443 41.8586929524237 -20.8651848460794 T:C T C 10 0.543619388992515 0.000184673076600998 ENSG00000071127:ENST00000499869:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000439733:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000382452:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000400001:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000508079:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000264785:exon_10099334_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000505851:exon_10099336_10099515:WDR1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 10515142 C/T 1 9 4 13 4.10742549906736 2.17447755597006 1.9329479430973 T:C C T 10 0.543619388992515 0.405479662693351 ENSG00000109684:ENST00000226951:exon_10515088_10515221:CLNK;ENSG00000109684:ENST00000515667:exon_10515088_10515221:CLNK;ENSG00000109684:ENST00000429087:exon_10515088_10515221:CLNK;ENSG00000109684:ENST00000442825:exon_10515088_10515221:CLNK HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 17503433 C/T 1 13 17 30 5.9329479430973 9.24152961287276 -3.30858166977545 T:C C T 10 0.543619388992515 0.272083540205038 ENSG00000151552:ENST00000513615:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000507439:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000281243:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000428702:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000508623:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000514300:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000505710:exon_17503342_17503482:QDPR HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 17586703 T/C 1 84 77 161 38.3359713246287 41.8586929524237 -3.52272162779492 T:C T C 10 0.543619388992515 0.580761114195551 ENSG00000002549:ENST00000226299:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000509583:exon_17586595_17587079:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000508014:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000513105:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000504614:exon_17586595_17586759:LAP3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 37836302 T/C 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 T:C T C 10 0.543619388992515 0.482069340371676 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000515668:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000505986:exon_37836240_37836346:PGM2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 38138856 G/A 1 56 51 107 25.5573142164192 27.7245888386183 -2.16727462219911 A:G G A 10 0.543619388992515 0.698528127168042 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38138756_38139240:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38138756_38140794:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38138756_38139240:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000510573:exon_38138756_38139364:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000401554:exon_38138756_38139165:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000407365:exon_38138756_38140796:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000406664:exon_38138756_38139248:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000405444:exon_38138756_38139023:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000492180:exon_38138756_38138870:TBC1D1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 38774785 A/G 1 65 55 120 29.6647397154865 29.8990663945883 -0.234326679101805 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 38775040 A/G 1 42 21 63 19.1679856623144 11.4160071688428 7.75197849347155 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0573992355728228 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 38776107 T/G 1 6 4 10 2.73828366604491 2.17447755597006 0.56380611007485 T:G T G 10 0.543619388992515 0.763129400865595 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 38776180 C/A 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 A:C C A 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 38776491 T/G 1 26 27 53 11.8658958861946 14.6777235027979 -2.8118276166033 T:G T G 10 0.543619388992515 0.491278279013814 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 38776725 C/A 1 29 24 53 13.2350377192171 13.0468653358204 0.188172383396703 A:C C A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 38777059 C/T 1 18 22 40 8.21485099813473 11.9596265578353 -3.7447755597006 T:C C T 10 0.543619388992515 0.267571943451769 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000502321:exon_38776887_38777176:TLR10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 38777173 A/T 1 16 9 25 7.30208977611976 4.89257450093264 2.40951527518712 A:T A T 10 0.543619388992515 0.423109955424406 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000502321:exon_38776887_38777176:TLR10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 38777236 T/G 1 13 17 30 5.9329479430973 9.24152961287276 -3.30858166977545 T:G T G 10 0.543619388992515 0.272083540205038 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 38798255 G/A 1 30 12 42 13.6914183302245 6.52343266791018 7.16798566231437 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0296234816183282 ENSG00000174125:ENST00000308979:exon_38797880_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000502213:exon_38797904_38800519:TLR1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 38798485 C/T 1 17 11 28 7.75847038712724 5.97981327891767 1.77865710820958 T:C C T 10 0.543619388992515 0.571933164007873 ENSG00000174125:ENST00000308979:exon_38797880_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000502213:exon_38797904_38800519:TLR1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 38828827 C/A 1 5 13 18 2.28190305503742 7.0670520569027 -4.78514900186527 A:C C A 10 0.543619388992515 0.0313264584533007 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000440845:exon_38828704_38829000:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 39116911 T/C 1 7 6 13 3.19466427705239 3.26171633395509 -0.0670520569026953 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000109790:ENST00000261425:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000508137:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000504108:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000381930:exon_39116779_39117952:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000261426:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000359687:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000515612:exon_39116779_39116950:KLHL5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 39302029 T/C 1 8 9 17 3.65104488805988 4.89257450093264 -1.24152961287276 T:C T C 10 0.543619388992515 0.629539446230712 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000505077:exon_39301936_39302034:RFC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 39458051 A/G 1 46 3 49 20.9935081063443 1.63085816697755 19.3626499393668 A:G A G 10 0.543619388992515 2.17183983430846e-09 ENSG00000163682:ENST00000295955:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503277:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000449470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000508595:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000514842:exon_39458026_39459301:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503040:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000504470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000511075:exon_39457431_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000437992:exon_39457948_39458158:RPL9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 54011576 T/C 1 11 5 16 5.02018672108233 2.71809694496258 2.30208977611976 T:C T C 10 0.543619388992515 0.318708928468121 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54011500_54011749:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54011500_54011749:SCFD2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 57797414 C/T 1 10 4 14 4.56380611007485 2.17447755597006 2.38932855410479 T:C C T 10 0.543619388992515 0.284272971162492 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 57843114 C/G 1 12 8 20 5.47656733208982 4.34895511194012 1.1276122201497 C:G C G 10 0.543619388992515 0.659998135084761 ENSG00000084092:ENST00000264230:exon_57842608_57844989:C4orf14 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 57876955 G/A 1 11 15 26 5.02018672108233 8.15429083488773 -3.13410411380539 A:G G A 10 0.543619388992515 0.241166155555170 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57876914_57877053:POLR2B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 57881715 G/A 1 6 16 22 2.73828366604491 8.69791022388024 -5.95962655783533 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0165046240874664 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57881668_57881824:POLR2B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 57889677 C/T 1 29 36 65 13.2350377192171 19.5702980037305 -6.33526028451348 T:C C T 10 0.543619388992515 0.134795828016085 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000464918:exon_57889393_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000484821:exon_57889657_57889917:POLR2B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 68374597 C/T 1 7 2 9 3.19466427705239 1.08723877798503 2.10742549906736 T:C C T 10 0.543619388992515 0.194613573468504 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000507196:exon_68374532_68374637:CENPC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 68442968 A/G 1 22 14 36 10.0403734421647 7.61067144589521 2.42970199626946 A:G A G 10 0.543619388992515 0.504186025758741 ENSG00000035720:ENST00000265404:exon_68442921_68442977:STAP1;ENSG00000035720:ENST00000396225:exon_68442921_68442977:STAP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 68447040 C/T 1 18 15 33 8.21485099813473 8.15429083488773 0.0605601632470023 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000035720:ENST00000265404:exon_68447023_68447189:STAP1;ENSG00000035720:ENST00000396225:exon_68447023_68447189:STAP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 73942678 C/T 1 19 22 41 8.67123160914221 11.9596265578353 -3.28839494869312 T:C C T 10 0.543619388992515 0.347770423839317 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73942657_73942821:ANKRD17 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 76720885 T/C 1 12 8 20 5.47656733208982 4.34895511194012 1.1276122201497 T:C T C 10 0.543619388992515 0.659998135084761 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76720775_76720885:USO1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 76722353 G/A 1 18 15 33 8.21485099813473 8.15429083488773 0.0605601632470023 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76722232_76722353:USO1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 76878688 G/A 1 34 23 57 15.5169407742545 12.5032459468278 3.01369482742664 A:G G A 10 0.543619388992515 0.506529114325473 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76878671_76878861:SDAD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 76881233 G/T 1 21 22 43 9.58399283115718 11.9596265578353 -2.37563372667815 T:G G T 10 0.543619388992515 0.540949403548108 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76881219_76881345:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76881219_76881345:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76881219_76881345:SDAD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 77057341 T/G 1 7 4 11 3.19466427705239 2.17447755597006 1.02018672108233 T:G T G 10 0.543619388992515 0.763926340985151 ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514307:exon_77057341_77057565:NUP54 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 84191031 A/G 1 6 12 18 2.73828366604491 6.52343266791018 -3.78514900186527 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0965748240788784 ENSG00000173085:ENST00000311469:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000503915:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000439031:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000311461:exon_84191013_84191146:COQ2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 84374480 C/T 1 7 12 19 3.19466427705239 6.52343266791018 -3.32876839085779 T:C C T 10 0.543619388992515 0.166421015470228 ENSG00000163312:ENST00000508591:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000295488:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000510985:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000422434:exon_84374384_84375098:HELQ HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 99997557 G/A 1 35 39 74 15.973321385262 21.2011561707081 -5.22783478544611 A:G G A 10 0.543619388992515 0.243825180334770 ENSG00000197894:ENST00000296412:exon_99997443_99997703:ADH5;ENSG00000197894:ENST00000512621:exon_99997443_99997703:ADH5;ENSG00000197894:ENST00000512659:exon_99997443_99997703:ADH5;ENSG00000197894:ENST00000508511:exon_99996376_99997703:ADH5;ENSG00000197894:ENST00000503130:exon_99997443_99997703:ADH5;ENSG00000197894:ENST00000502590:exon_99997543_99997703:ADH5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 103555992 A/G 1 5 6 11 2.28190305503742 3.26171633395509 -0.979813278917665 A:G A G 10 0.543619388992515 0.56306921306608 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103555945_103556202:MANBA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 104061993 C/G 1 12 11 23 5.47656733208982 5.97981327891767 -0.503245946827846 C:G C G 10 0.543619388992515 0.837610804972755 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061971_104062261:CENPE HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 104062223 C/T 1 12 9 21 5.47656733208982 4.89257450093264 0.583992831157184 T:C C T 10 0.543619388992515 0.830589105985654 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061971_104062261:CENPE HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 104082349 C/T 1 19 19 38 8.67123160914221 10.3287683908578 -1.65753678171557 T:C C T 10 0.543619388992515 0.627399138344122 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000503705:exon_104082243_104082408:CENPE HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 106395181 G/A 1 12 14 26 5.47656733208982 7.61067144589521 -2.13410411380539 A:G G A 10 0.543619388992515 0.435428586867944 ENSG00000138777:ENST00000341695:exon_106395051_106395238:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000380004:exon_106395051_106395227:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000348706:exon_106395051_106395221:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000351450:exon_106395051_106395224:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000354147:exon_106395051_106395207:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000432483:exon_106395051_106395207:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000357415:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000510015:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000509426:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000508518:exon_106395051_106395197:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000514209:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000457404:exon_106395051_106395219:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000502833:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000504028:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000513649:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000499847:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000502610:exon_106395051_106395189:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000505713:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000310267:exon_106395051_106395216:PPA2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 108566204 T/C 1 13 16 29 5.9329479430973 8.69791022388024 -2.76496228078294 T:C T C 10 0.543619388992515 0.352886594605329 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108565958_108566226:PAPSS1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 110603784 T/C 1 25 22 47 11.4095152751871 11.9596265578353 -0.550111282648208 T:C T C 10 0.543619388992515 0.88458987872575 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110603738_110603898:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000472310:exon_110603738_110604350:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110603738_110603898:CCDC109B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 110605744 A/T 1 176 168 344 80.3229875373173 91.3280573507425 -11.0050698134252 A:T A T 10 0.543619388992515 0.234329808777567 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000494604:exon_110605596_110606523:CCDC109B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 110605767 A/G 1 184 175 359 83.9740324253772 95.1333930736901 -11.1593606483129 A:C:G A G 10 0.543619388992515 0.244015045296262 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000494604:exon_110605596_110606523:CCDC109B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 113199075 A/G 1 69 51 120 31.4902621595165 27.7245888386183 3.76567332089819 A:G A G 10 0.543619388992515 0.521907345246245 ENSG00000145365:ENST00000361717:exon_113196783_113199590:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000438746:exon_113197177_113199342:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000500655:exon_113198915_113199590:TIFA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 113362316 A/G 1 7 3 10 3.19466427705239 1.63085816697755 1.56380611007485 A:G A G 10 0.543619388992515 0.3622898906741 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 113565835 G/A 1 110 118 228 50.2018672108233 64.1470879011168 -13.9452206902934 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0724306221675617 ENSG00000174720:ENST00000344442:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000512589:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000509061:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000509622:exon_113565824_113565924:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000508577:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000513553:exon_113565824_113565855:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000505034:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000324052:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000505216:exon_113565824_113565924:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000507443:exon_113565460_113566027:LARP7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 113568544 G/A 1 163 118 281 74.39003959422 64.1470879011168 10.2429516931033 A:T:G G A 10 0.543619388992515 0.231244270153976 ENSG00000174720:ENST00000344442:exon_113568355_113568705:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000509061:exon_113568355_113568705:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000509622:exon_113568355_113568705:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000505034:exon_113568355_113568605:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000324052:exon_113568355_113568705:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000511529:exon_113568367_113568705:LARP7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 128811117 G/C 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 C:G G C 10 0.543619388992515 0.482069340371676 ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128811021_128811391:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128811021_128811391:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507249:exon_128811021_128811391:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128811021_128811391:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000510605:exon_128811021_128811391:PLK4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 130023759 A/T 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 A:T A T 10 0.543619388992515 0.482069340371676 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502360:exon_130023757_130024192:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508622:exon_130023757_130023946:C4orf33 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 130030652 A/G 1 6 4 10 2.73828366604491 2.17447755597006 0.56380611007485 A:G A G 10 0.543619388992515 0.763129400865595 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130030628_130031121:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130030628_130030691:C4orf33 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 144135718 G/A 1 5 3 8 2.28190305503742 1.63085816697755 0.65104488805988 A:G G A 10 0.543619388992515 0.734792052639277 ENSG00000170185:ENST00000510377:exon_144134734_144136730:USP38;ENSG00000170185:ENST00000307017:exon_144134734_144136096:USP38;ENSG00000170185:ENST00000511739:exon_144134734_144136096:USP38 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 144442735 C/T 1 6 6 12 2.73828366604491 3.26171633395509 -0.52343266791018 T:C C T 10 0.543619388992515 0.779998482964206 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 154276856 A/G 1 6 4 10 2.73828366604491 2.17447755597006 0.56380611007485 A:G A G 10 0.543619388992515 0.763129400865595 ENSG00000121211:ENST00000240488:exon_154276806_154276863:MND1;ENSG00000121211:ENST00000503967:exon_154276806_154276961:MND1;ENSG00000121211:ENST00000509752:exon_154276806_154276863:MND1;ENSG00000121211:ENST00000508731:exon_154276806_154276863:MND1;ENSG00000121211:ENST00000504860:exon_154276806_154276863:MND1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 159630924 A/G 1 23 23 46 10.4967540531722 12.5032459468278 -2.00649189365569 A:G A G 10 0.543619388992515 0.55783325783331 ENSG00000171497:ENST00000307720:exon_159630286_159630976:PPID;ENSG00000171497:ENST00000512699:exon_159630913_159630976:PPID HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 159631991 G/T 1 19 16 35 8.67123160914221 8.69791022388024 -0.0266786147380262 T:G G T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000171497:ENST00000307720:exon_159631914_159632000:PPID;ENSG00000171497:ENST00000512699:exon_159631914_159632000:PPID HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 164435265 A/C 1 28 44 72 12.7786571082096 23.9192531156707 -11.1405960074611 A:C:G A C 10 0.543619388992515 0.00911133342456891 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164435226_164435310:C4orf43 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 164440581 T/C 1 38 40 78 17.3424632182844 21.7447755597006 -4.40231234141617 T:C T C 10 0.543619388992515 0.363331239351616 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164440486_164440872:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164440486_164441691:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164440486_164440871:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164440486_164440615:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000503148:exon_164440486_164440710:C4orf43 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 170678993 T/C 1 12 15 27 5.47656733208982 8.15429083488773 -2.67772350279791 T:C T C 10 0.543619388992515 0.337227579537784 ENSG00000056050:ENST00000393381:exon_170678981_170679104:C4orf27;ENSG00000056050:ENST00000506125:exon_170678981_170679055:C4orf27 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 185615764 C/A 1 9 6 15 4.10742549906736 3.26171633395509 0.845709165112274 A:C C A 10 0.543619388992515 0.797605664193983 ENSG00000164306:ENST00000314970:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000515774:exon_185615676_185616117:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000503752:exon_185615676_185616070:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512834:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000509002:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512658:exon_185615676_185615912:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000510864:exon_185615676_185616106:CCDC111 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 185615768 T/G 1 9 6 15 4.10742549906736 3.26171633395509 0.845709165112274 T:G T G 10 0.543619388992515 0.797605664193983 ENSG00000164306:ENST00000314970:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000515774:exon_185615676_185616117:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000503752:exon_185615676_185616070:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512834:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000509002:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512658:exon_185615676_185615912:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000510864:exon_185615676_185616106:CCDC111 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 185634144 T/C 1 11 6 17 5.02018672108233 3.26171633395509 1.75847038712724 T:C T C 10 0.543619388992515 0.470285892368413 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185634098_185634167:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185634098_185634167:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000506535:exon_185634098_185634167:MLF1IP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 185637699 A/G 1 8 6 14 3.65104488805988 3.26171633395509 0.38932855410479 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185637551_185637787:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185637551_185637787:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000514781:exon_185637551_185637787:MLF1IP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 186111639 T/C 1 6 5 11 2.73828366604491 2.71809694496258 0.0201867210823345 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 186272721 A/G 1 7 3 10 3.19466427705239 1.63085816697755 1.56380611007485 A:G A G 10 0.543619388992515 0.3622898906741 ENSG00000109762:ENST00000504273:exon_186272599_186272763:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000264694:exon_186272599_186272763:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000264693:exon_186272599_186272763:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000393554:exon_186272599_186272763:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000504959:exon_186272599_186272763:SNX25 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 186320880 A/G 1 18 34 52 8.21485099813473 18.4830592257455 -10.2682082276108 A:G A G 10 0.543619388992515 0.00502155234065204 ENSG00000186352:ENST00000335174:exon_186320724_186320927:ANKRD37;ENSG00000186352:ENST00000511393:exon_186320724_186321782:ANKRD37;ENSG00000186352:ENST00000506424:exon_186320724_186320897:ANKRD37;ENSG00000109775:ENST00000514247:exon_186320694_186321632:UFSP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 186320890 G/A 1 39 20 59 17.7988438292919 10.8723877798503 6.92645604944161 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0885169044364682 ENSG00000186352:ENST00000335174:exon_186320724_186320927:ANKRD37;ENSG00000186352:ENST00000511393:exon_186320724_186321782:ANKRD37;ENSG00000186352:ENST00000506424:exon_186320724_186320897:ANKRD37;ENSG00000109775:ENST00000514247:exon_186320694_186321632:UFSP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 4 186320906 C/G 1 22 43 65 10.0403734421647 23.3756337266781 -13.3352602845135 A:C:G C G 10 0.543619388992515 0.00107159828187151 ENSG00000186352:ENST00000335174:exon_186320724_186320927:ANKRD37;ENSG00000186352:ENST00000511393:exon_186320724_186321782:ANKRD37;ENSG00000109775:ENST00000514247:exon_186320694_186321632:UFSP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 434722 G/C 1 5 12 17 2.28190305503742 6.52343266791018 -4.24152961287276 C:G G C 10 0.543619388992515 0.0501724473446373 ENSG00000063438:ENST00000505113:exon_433968_434972:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_433968_435008:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_433968_435225:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000507048:exon_433968_435224:AHRR HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 442571 A/C 1 6 16 22 2.73828366604491 8.69791022388024 -5.95962655783533 A:C A C 10 0.543619388992515 0.0165046240874664 ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 479905 A/C 1 8 12 20 3.65104488805988 6.52343266791018 -2.8723877798503 A:C A C 10 0.543619388992515 0.261745196981094 ENSG00000066230:ENST00000507407:exon_479752_480080:SLC9A3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 1338078 C/T 1 14 18 32 6.38932855410479 9.78514900186527 -3.39582044776048 T:C C T 10 0.543619388992515 0.287013533533773 ENSG00000049656:ENST00000320895:exon_1338019_1338097:CLPTM1L;ENSG00000049656:ENST00000507807:exon_1338019_1338097:CLPTM1L;ENSG00000049656:ENST00000320927:exon_1338019_1338097:CLPTM1L;ENSG00000049656:ENST00000511786:exon_1338019_1338433:CLPTM1L;ENSG00000049656:ENST00000513491:exon_1338019_1338097:CLPTM1L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 1466919 G/A 1 11 17 28 5.02018672108233 9.24152961287276 -4.22134289179042 A:G G A 10 0.543619388992515 0.129577832731407 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 1494909 C/T 1 10 9 19 4.56380611007485 4.89257450093264 -0.328768390857786 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000514484:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000507282:exon_1494815_1495043:LPCAT1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 6604787 C/T 1 31 29 60 14.147798941232 15.7649622807829 -1.6171633395509 T:C C T 10 0.543619388992515 0.698884102878218 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6604718_6604995:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000514127:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000502932:exon_6604718_6604821:NSUN2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 6605532 C/A 1 10 2 12 4.56380611007485 1.08723877798503 3.47656733208982 A:C C A 10 0.543619388992515 0.0776119795169345 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 7897191 C/T 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 T:C C T 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508354:exon_7897178_7897213:MTRR HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 7897283 G/A 1 4 7 11 1.82552244402994 3.80533572294761 -1.97981327891767 A:G G A 10 0.543619388992515 0.245254265630413 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7897178_7897360:MTRR HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 14681687 C/T 1 5 3 8 2.28190305503742 1.63085816697755 0.65104488805988 T:C C T 10 0.543619388992515 0.734792052639277 ENSG00000154124:ENST00000503023:exon_14681573_14681716:FAM105B;ENSG00000154124:ENST00000284274:exon_14681573_14681716:FAM105B;ENSG00000154124:ENST00000514913:exon_14681573_14681733:FAM105B;ENSG00000154124:ENST00000506417:exon_14681659_14681716:FAM105B;ENSG00000154124:ENST00000508678:exon_14681685_14681733:FAM105B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 43294192 C/T 1 20 19 39 9.1276122201497 10.3287683908578 -1.20115617070809 T:C C T 10 0.543619388992515 0.749124669510297 ENSG00000112972:ENST00000325110:exon_43294158_43294264:HMGCS1;ENSG00000112972:ENST00000433297:exon_43294158_43294264:HMGCS1;ENSG00000112972:ENST00000508319:exon_43293836_43294264:HMGCS1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 44809162 G/C 1 22 20 42 10.0403734421647 10.8723877798503 -0.832014337685633 C:G G C 10 0.543619388992515 0.877230845337008 ENSG00000112996:ENST00000507110:exon_44809027_44809665:MRPS30 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 52856504 G/C 1 4 12 16 1.82552244402994 6.52343266791018 -4.69791022388024 C:G G C 10 0.543619388992515 0.0227629205322148 ENSG00000164258:ENST00000507026:exon_52856463_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000502423:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000296684:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506974:exon_52856477_52856590:NDUFS4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 54603822 T/C 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 T:C T C 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000039123:ENST00000230640:exon_54603588_54603975:SKIV2L2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 64064943 G/A 1 8 11 19 3.65104488805988 5.97981327891767 -2.32876839085779 A:G G A 10 0.543619388992515 0.358321729715676 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64064757_64065015:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64064773_64065015:CWC27 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 64097145 C/G 1 30 13 43 13.6914183302245 7.0670520569027 6.62436627332185 C:G C G 10 0.543619388992515 0.0466493111491185 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000506168:exon_64097129_64097159:CWC27 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 64267595 T/C 1 19 20 39 8.67123160914221 10.8723877798503 -2.20115617070809 T:C T C 10 0.543619388992515 0.522217703040714 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64267530_64267639:CWC27 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 64273018 G/A 1 35 17 52 15.973321385262 9.24152961287276 6.73179177238922 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0700611839311282 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64272962_64273065:CWC27 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 65118738 C/T 1 9 5 14 4.10742549906736 2.71809694496258 1.38932855410479 T:C C T 10 0.543619388992515 0.59447928862092 ENSG00000123213:ENST00000380985:exon_65118609_65125111:NLN;ENSG00000123213:ENST00000340159:exon_65118609_65125111:NLN;ENSG00000123213:ENST00000502464:exon_65118609_65125111:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506799:exon_65118609_65119153:NLN;ENSG00000123213:ENST00000511299:exon_65118609_65119156:NLN;ENSG00000123213:ENST00000515595:exon_65118609_65119065:NLN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 68419054 A/T 1 10 10 20 4.56380611007485 5.43619388992515 -0.872387779850301 A:T A T 10 0.543619388992515 0.823235579367717 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68419026_68419339:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68419026_68419366:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68419026_68419247:SLC30A5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 68463014 G/T 1 16 17 33 7.30208977611976 9.24152961287276 -1.939439836753 T:G G T 10 0.543619388992515 0.600805537726719 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68462837_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68462913_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68462962_68463110:CCNB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 68471247 G/A 1 50 41 91 22.8190305503742 22.2883949486931 0.53063560168113 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000505500:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000507798:exon_68471224_68471364:CCNB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 68695940 T/G 1 9 8 17 4.10742549906736 4.34895511194012 -0.241529612872756 T:C:G T G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000152942:ENST00000361732:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000509734:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354868:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000521422:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354312:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000345306:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000305138:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000282891:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000358030:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000380774:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000513214:exon_68695876_68695996:RAD17 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 68709884 G/A 1 36 23 59 16.4297019962695 12.5032459468278 3.92645604944161 A:G G A 10 0.543619388992515 0.36057596812105 ENSG00000152942:ENST00000361732:exon_68709858_68710628:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000509734:exon_68709858_68710628:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354868:exon_68709858_68710628:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000521422:exon_68709858_68710187:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000504177:exon_68709858_68710320:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354312:exon_68709858_68710628:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000345306:exon_68709858_68710628:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000305138:exon_68709858_68710628:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000282891:exon_68709858_68710187:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000358030:exon_68709858_68710626:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000380774:exon_68709858_68710128:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000513214:exon_68709858_68710082:RAD17 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 70806457 G/A 1 9 11 20 4.10742549906736 5.97981327891767 -1.8723877798503 A:G G A 10 0.543619388992515 0.502082958548873 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 70806649 T/A 1 15 5 20 6.84570916511227 2.71809694496258 4.1276122201497 A:T T A 10 0.543619388992515 0.0738358728951699 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 72182857 A/G 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 A:G A G 10 0.543619388992515 1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 76343999 T/C 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 T:C T C 10 0.543619388992515 0.482069340371676 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76343986_76344097:AGGF1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 76734084 C/T 1 5 6 11 2.28190305503742 3.26171633395509 -0.979813278917665 T:C C T 10 0.543619388992515 0.56306921306608 ENSG00000164253:ENST00000296679:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000502528:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000414719:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000515253:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507029:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511630:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507654:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000509701:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511791:exon_76734083_76734186:WDR41 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 77335015 G/T 1 13 9 22 5.9329479430973 4.89257450093264 1.04037344216467 T:G G T 10 0.543619388992515 0.831159081063284 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77334867_77335098:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77334867_77335098:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000523204:exon_77334867_77335098:AP3B1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 80600619 C/G 1 40 36 76 18.2552244402994 19.5702980037305 -1.31507356343115 C:G C G 10 0.543619388992515 0.818141369113245 ENSG00000131732:ENST00000254037:exon_80597422_80600960:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000407610:exon_80600560_80600960:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000380199:exon_80600560_80600960:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000438268:exon_80600560_80600960:ZCCHC9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 86695274 A/G 1 14 21 35 6.38932855410479 11.4160071688428 -5.02667861473803 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0924113762908225 ENSG00000134480:ENST00000505587:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000510921:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000508855:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000256897:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000504878:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000511207:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000504115:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000448765:exon_86695211_86695322:CCNH HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 89703641 C/G 1 18 14 32 8.21485099813473 7.61067144589521 0.604179552239518 C:G C G 10 0.543619388992515 0.861156564790452 ENSG00000153140:ENST00000283122:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522083:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522864:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000518458:exon_89703516_89703647:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522565:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522842:exon_89703516_89703651:CETN3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 94050487 T/A 1 7 1 8 3.19466427705239 0.543619388992515 2.65104488805988 A:T T A 10 0.543619388992515 0.0786679847867632 ENSG00000175471:ENST00000514040:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000515393:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312202:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000429576:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000505078:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312216:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000395933:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000508509:exon_94050482_94050591:MCTP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 95234350 A/G 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 A:G A G 10 0.543619388992515 0.482069340371676 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 96086334 G/C 1 24 21 45 10.9531346641796 11.4160071688428 -0.462872504663176 C:G G C 10 0.543619388992515 0.882521409587574 ENSG00000153113:ENST00000338252:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508830:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395812:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000359176:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000325674:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395813:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510756:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512355:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508608:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000341926:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000361634:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511049:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000309190:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510156:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000509903:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511782:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000504465:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000513666:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000348386:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510500:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000437034:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508579:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000515663:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000283095:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000484552:exon_96086291_96086386:CAST HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 96112083 T/G 1 10 7 17 4.56380611007485 3.80533572294761 0.758470387127244 T:G T G 10 0.543619388992515 0.810304562557129 ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96110188_96112255:ERAP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 96232142 T/A 1 7 1 8 3.19466427705239 0.543619388992515 2.65104488805988 A:T T A 10 0.543619388992515 0.0786679847867632 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96232107_96232208:ERAP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 96245343 C/T 1 30 2 32 13.6914183302245 1.08723877798503 12.6041795522395 T:C C T 10 0.543619388992515 2.29993097009998e-06 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 96245439 C/T 1 37 8 45 16.8860826072769 4.34895511194012 12.5371274953368 T:C C T 10 0.543619388992515 0.000129305527431068 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 96249115 C/T 1 24 3 27 10.9531346641796 1.63085816697755 9.3222764972021 T:C C T 10 0.543619388992515 0.000291200120322569 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000512869:exon_96249042_96249161:ERAP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 96498783 G/A 1 18 10 28 8.21485099813473 5.43619388992515 2.77865710820958 A:G G A 10 0.543619388992515 0.345225120327408 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96496571_96498929:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000511293:exon_96498640_96498929:RIOK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 96503523 C/T 1 21 15 36 9.58399283115718 8.15429083488773 1.42970199626946 T:C C T 10 0.543619388992515 0.738621611718841 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96503171_96503695:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96502450_96503695:RIOK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 102345546 A/C 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 A:C A C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000145730:ENST00000438793:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000529394:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000346918:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000345721:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000348126:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000304400:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000274392:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000379787:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000455264:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000379799:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000510006:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000515456:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000504691:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000504456:exon_102345455_102345570:PAM HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 110819753 G/C 1 14 1 15 6.38932855410479 0.543619388992515 5.84570916511227 C:G G C 10 0.543619388992515 0.00275719306748059 ENSG00000152495:ENST00000512453:exon_110819724_110820283:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000282356:exon_110819724_110830584:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000515231:exon_110819724_110820464:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000509645:exon_110819724_110821293:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000510858:exon_110819724_110820296:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000512890:exon_110819724_110820230:CAMK4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 111066697 T/C 1 12 8 20 5.47656733208982 4.34895511194012 1.1276122201497 T:C T C 10 0.543619388992515 0.659998135084761 ENSG00000134986:ENST00000379671:exon_111064509_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000257435:exon_111064993_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000450857:exon_111065000_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000447165:exon_111065000_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000446294:exon_111065013_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000395634:exon_111065681_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000515855:exon_111066214_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000507742:exon_111066339_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000509979:exon_111066355_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000450761:exon_111066388_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000419114:exon_111066401_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000509427:exon_111066421_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000453526:exon_111066444_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000455559:exon_111066503_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000508870:exon_111066565_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000513100:exon_111066629_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000504018:exon_111066651_111066743:C5orf13 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 112929013 T/A 1 8 9 17 3.65104488805988 4.89257450093264 -1.24152961287276 A:T T A 10 0.543619388992515 0.629539446230712 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000512600:exon_112927693_112930982:YTHDC2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 118691784 T/C 1 27 20 47 12.3222764972021 10.8723877798503 1.44988871735179 T:C T C 10 0.543619388992515 0.770084256277516 ENSG00000145779:ENST00000504771:exon_118690009_118691816:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000503646:exon_118691718_118691816:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000415806:exon_118691730_118691816:TNFAIP8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 118728953 G/C 1 51 42 93 23.2754111613817 22.8320143376856 0.443396823696101 C:G G C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000145779:ENST00000274456:exon_118728511_118729089:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000513374:exon_118728511_118729438:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000504771:exon_118728511_118730293:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000503646:exon_118728511_118730293:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000504642:exon_118728511_118729141:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000415806:exon_118728511_118730294:TNFAIP8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 118861713 A/G 1 6 9 15 2.73828366604491 4.89257450093264 -2.15429083488773 A:G A G 10 0.543619388992515 0.306171249676451 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000518349:exon_118861612_118861719:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000507353:exon_118861431_118861718:HSD17B4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 126887569 G/A 1 3 6 9 1.36914183302245 3.26171633395509 -1.89257450093264 A:G G A 10 0.543619388992515 0.316548245109532 ENSG00000164244:ENST00000296666:exon_126887399_126890781:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000442138:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000330542:exon_126887399_126887569:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000420037:exon_126887399_126887570:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000337087:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000513427:exon_126887399_126888148:PRRC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 128430757 T/C 1 6 9 15 2.73828366604491 4.89257450093264 -2.15429083488773 T:C T C 10 0.543619388992515 0.306171249676451 ENSG00000066583:ENST00000506986:exon_128430529_128430768:ISOC1;ENSG00000066583:ENST00000173527:exon_128430444_128430768:ISOC1;ENSG00000066583:ENST00000513879:exon_128430530_128430768:ISOC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 131944338 C/T 1 53 47 100 24.1881723833967 25.5501112826482 -1.36193889925151 T:C C T 10 0.543619388992515 0.841033598627381 ENSG00000113522:ENST00000533482:exon_131944307_131944417:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000265335:exon_131944307_131944417:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000378810:exon_131944307_131944417:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000378823:exon_131944307_131944417:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000423956:exon_131944307_131944417:RAD50 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 132334252 A/G 1 8 6 14 3.65104488805988 3.26171633395509 0.38932855410479 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000155329:ENST00000324170:exon_132332677_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000355372:exon_132332688_132334524:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000509437:exon_132333792_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000513848:exon_132333904_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000513541:exon_132334100_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000508080:exon_132334105_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000509008:exon_132334220_132334542:ZCCHC10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 132437531 C/T 1 89 96 185 40.6178743796662 52.1874613432814 -11.5695869636153 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0899733066885152 ENSG00000170606:ENST00000304858:exon_132437451_132437570:HSPA4;ENSG00000170606:ENST00000514825:exon_132437288_132437570:HSPA4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 133956668 G/A 1 5 8 13 2.28190305503742 4.34895511194012 -2.0670520569027 A:G G A 10 0.543619388992515 0.276871294907228 ENSG00000152700:ENST00000402673:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000507419:exon_133956623_133956691:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000394992:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000282606:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000439578:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000503318:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000505758:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000502286:exon_133956623_133956742:SAR1B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 137088805 C/T 1 372 344 716 169.773587294784 187.005069813425 -17.2314825186408 T:C C T 10 0.543619388992515 0.202174940455647 ENSG00000177733:ENST00000314940:exon_137087075_137090039:HNRNPA0 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 138386706 G/A 1 4 12 16 1.82552244402994 6.52343266791018 -4.69791022388024 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0227629205322148 ENSG00000120725:ENST00000394817:exon_138386627_138386735:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000265195:exon_138386627_138386735:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509534:exon_138386627_138386735:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000503732:exon_138386627_138386735:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000508639:exon_138386627_138386735:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000513453:exon_138386627_138386735:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000507002:exon_138386635_138386735:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505830:exon_138386639_138386735:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505353:exon_138386696_138386735:SIL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 138456815 T/C 1 7 2 9 3.19466427705239 1.08723877798503 2.10742549906736 T:C T C 10 0.543619388992515 0.194613573468504 ENSG00000120725:ENST00000394817:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000265195:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509534:exon_138456724_138456859:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000508639:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000513453:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000507002:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505830:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505353:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000504666:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509400:exon_138456724_138456862:SIL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 139936760 G/T 1 41 36 77 18.7116050513069 19.5702980037305 -0.85869295242366 T:G G T 10 0.543619388992515 0.909041336819487 ENSG00000213523:ENST00000336283:exon_139936732_139936857:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000523259:exon_139936732_139937031:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000520427:exon_139936732_139936917:SRA1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 139940233 G/A 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 A:G G A 10 0.543619388992515 0.482069340371676 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000509914:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000467078:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000356738:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000354402:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000357560:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000412920:exon_139940224_139940339:APBB3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 139941228 A/G 1 5 5 10 2.28190305503742 2.71809694496258 -0.436193889925151 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000509914:exon_139941172_139941286:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000358580:exon_139941172_139941286:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000467078:exon_139941172_139941286:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000356738:exon_139941172_139941307:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000354402:exon_139941172_139941307:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000357560:exon_139941172_139941286:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000412920:exon_139941172_139941286:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511201:exon_139941172_139941292:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000504872:exon_139941172_139941434:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000506289:exon_139941172_139941286:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000508496:exon_139941172_139941310:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511463:exon_139941228_139941580:APBB3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 140041960 T/G 1 67 70 137 30.5775009375015 38.0533572294761 -7.47585629197457 T:G T G 10 0.543619388992515 0.229742139524355 ENSG00000113141:ENST00000417647:exon_140041887_140042063:IK;ENSG00000113141:ENST00000261812:exon_140041887_140042063:IK;ENSG00000113141:ENST00000515592:exon_140041764_140042064:IK;ENSG00000113141:ENST00000518969:exon_140041887_140042012:IK HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 140048209 T/C 1 6 3 9 2.73828366604491 1.63085816697755 1.10742549906736 T:C T C 10 0.543619388992515 0.522625694750698 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000403979:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140048197_140048376:WDR55 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 141014494 T/C 1 12 13 25 5.47656733208982 7.0670520569027 -1.59048472481288 T:C T C 10 0.543619388992515 0.552178694254392 ENSG00000171720:ENST00000469550:exon_141014378_141014731:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000305264:exon_141014378_141014520:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000523353:exon_141014460_141014520:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000495485:exon_141014378_141014520:HDAC3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 141019110 C/A 1 2 12 14 0.91276122201497 6.52343266791018 -5.61067144589521 A:C C A 10 0.543619388992515 0.00269305441648846 ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000517794:exon_141019031_141019196:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520465:exon_141018875_141019410:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 141309824 G/A 1 10 8 18 4.56380611007485 4.34895511194012 0.214850998134729 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000081791:ENST00000432126:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000194118:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000508751:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000502729:exon_141309812_141309839:KIAA0141 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 148748023 C/A 1 3 7 10 1.36914183302245 3.80533572294761 -2.43619388992515 A:C C A 10 0.543619388992515 0.202250323161148 ENSG00000145882:ENST00000274569:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000511945:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000505669:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000503240:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000514349:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000507621:exon_148747556_148749216:PCYOX1L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 149772280 C/G 1 26 38 64 11.8658958861946 20.6575367817156 -8.79164089552096 C:G C G 10 0.543619388992515 0.0323805906946640 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149771520_149774479:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000506630:exon_149772268_149772454:TCOF1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 149772320 G/A 1 39 29 68 17.7988438292919 15.7649622807829 2.03388154850897 A:G G A 10 0.543619388992515 0.715252054992206 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149771520_149774479:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000506630:exon_149772268_149772454:TCOF1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 149776232 C/T 1 75 53 128 34.2285458255614 28.8118276166033 5.41671820895807 T:C C T 10 0.543619388992515 0.375094741673501 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149775845_149776405:TCOF1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 150436503 G/C 1 72 59 131 32.8594039925389 32.0735439505584 0.785860041980527 C:G G C 10 0.543619388992515 0.930225304448828 ENSG00000145901:ENST00000520931:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000389378:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000315050:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523338:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000417127:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522226:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000519339:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521591:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000518977:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000524280:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523200:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522100:exon_150436327_150436518:TNIP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 150518988 G/A 1 68 45 113 31.033881548509 24.4628725046632 6.5710090438458 A:G G A 10 0.543619388992515 0.221079704971248 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517486:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000519644:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517677:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521749:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517757:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000520378:exon_150518239_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523164:exon_150518914_150519008:ANXA6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 150646888 T/C 1 25 13 38 11.4095152751871 7.0670520569027 4.34246321828443 T:C T C 10 0.543619388992515 0.192710268682436 ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150646857_150650001:GM2A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 153372525 G/A 1 3 6 9 1.36914183302245 3.26171633395509 -1.89257450093264 A:G G A 10 0.543619388992515 0.316548245109532 ENSG00000055147:ENST00000351797:exon_153369688_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000522858:exon_153371263_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000442256:exon_153371271_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000435178:exon_153371271_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520667:exon_153372059_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000433795:exon_153372066_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518914:exon_153372248_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518946:exon_153372274_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520313:exon_153372515_153372670:FAM114A2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 156747669 A/G 1 16 12 28 7.30208977611976 6.52343266791018 0.778657108209579 A:G A G 10 0.543619388992515 0.850707367129305 ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156747663_156747810:CYFIP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 159835658 A/G 1 13 14 27 5.9329479430973 7.61067144589521 -1.67772350279791 A:G A G 10 0.543619388992515 0.56531671981011 ENSG00000164609:ENST00000297151:exon_159835657_159835704:SLU7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 159840935 T/A 1 19 19 38 8.67123160914221 10.3287683908578 -1.65753678171557 A:T T A 10 0.543619388992515 0.627399138344122 ENSG00000164609:ENST00000297151:exon_159840906_159840986:SLU7;ENSG00000164609:ENST00000521826:exon_159840906_159840986:SLU7;ENSG00000164609:ENST00000521190:exon_159840809_159840986:SLU7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 167919691 A/G 1 15 17 32 6.84570916511227 9.24152961287276 -2.39582044776048 A:G A G 10 0.543619388992515 0.478525973624179 ENSG00000113643:ENST00000231572:exon_167919664_167919852:RARS;ENSG00000113643:ENST00000524082:exon_167919664_167920192:RARS;ENSG00000113643:ENST00000521329:exon_167919664_167919852:RARS;ENSG00000113643:ENST00000522834:exon_167919664_167919796:RARS;ENSG00000113643:ENST00000521939:exon_167919664_167919852:RARS;ENSG00000113643:ENST00000520013:exon_167919664_167919852:RARS;ENSG00000113643:ENST00000519346:exon_167919664_167919852:RARS HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 167943827 G/A 1 53 38 91 24.1881723833967 20.6575367817156 3.53063560168113 A:G G A 10 0.543619388992515 0.528014932445597 ENSG00000113643:ENST00000231572:exon_167943783_167943955:RARS;ENSG00000113643:ENST00000520013:exon_167943783_167943955:RARS HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 169127097 C/A 1 8 6 14 3.65104488805988 3.26171633395509 0.38932855410479 A:C C A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169127018_169127143:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169127018_169127143:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169127018_169127143:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523684:exon_169127018_169127143:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519223:exon_169127018_169127143:DOCK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 169129422 A/G 1 9 7 16 4.10742549906736 3.80533572294761 0.302089776119759 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523684:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519223:exon_169129307_169129627:DOCK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 169267784 G/A 1 12 10 22 5.47656733208982 5.43619388992515 0.0403734421646691 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520836:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520181:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519628:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169267761_169267856:DOCK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 169454941 C/G 1 18 17 35 8.21485099813473 9.24152961287276 -1.02667861473803 C:G C G 10 0.543619388992515 0.737552578231163 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000433448:exon_169454867_169454952:DOCK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 169461547 C/T 1 22 33 55 10.0403734421647 17.939439836753 -7.89906639458833 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0414232383349756 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169461403_169461559:DOCK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 169504743 T/C 1 31 25 56 14.147798941232 13.5904847248129 0.557314216419156 T:C T C 10 0.543619388992515 0.894331729045326 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520450:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519868:exon_169504714_169504841:DOCK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 171481667 G/A 1 30 29 59 13.6914183302245 15.7649622807829 -2.07354395055839 A:G G A 10 0.543619388992515 0.603352502377924 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171481573_171481698:STK10;ENSG00000072786:ENST00000520476:exon_171481573_171481698:STK10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 171533629 A/G 1 11 6 17 5.02018672108233 3.26171633395509 1.75847038712724 A:G A G 10 0.543619388992515 0.470285892368413 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 171533656 C/T 1 12 6 18 5.47656733208982 3.26171633395509 2.21485099813473 T:C C T 10 0.543619388992515 0.349607890938645 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 171533782 T/C 1 7 8 15 3.19466427705239 4.34895511194012 -1.15429083488773 T:C T C 10 0.543619388992515 0.610096871559822 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000519710:exon_171533666_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000521322:exon_171533714_171534038:STK10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 172745245 C/T 1 6 10 16 2.73828366604491 5.43619388992515 -2.69791022388024 T:C C T 10 0.543619388992515 0.212743822682223 ENSG00000113739:ENST00000265087:exon_172741716_172745252:STC2;ENSG00000113739:ENST00000520593:exon_172745181_172745252:STC2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 174936038 A/G 1 11 20 31 5.02018672108233 10.8723877798503 -5.85220105876797 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0459129869713492 ENSG00000164466:ENST00000507017:exon_174936035_174936205:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174936035_174936205:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502393:exon_174936035_174936205:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000513725:exon_174936035_174936205:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000506963:exon_174936035_174936205:SFXN1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 174948943 C/T 1 7 3 10 3.19466427705239 1.63085816697755 1.56380611007485 T:C C T 10 0.543619388992515 0.3622898906741 ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174948922_174948971:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000507823:exon_174948922_174948971:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000421887:exon_174948889_174948971:SFXN1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 176402401 G/A 1 18 11 29 8.21485099813473 5.97981327891767 2.23503771921706 A:G G A 10 0.543619388992515 0.459288647607193 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000509236:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000417486:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000515488:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000507513:exon_176402397_176402481:UIMC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 176916516 C/T 1 8 7 15 3.65104488805988 3.80533572294761 -0.154290834887726 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000196923:ENST00000493815:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000359895:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000356618:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355841:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000460994:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000486828:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393551:exon_176916394_176916628:PDLIM7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 176940384 G/A 1 45 35 80 20.5371274953368 19.026678614738 1.51044888059879 A:G G A 10 0.543619388992515 0.82257250455125 ENSG00000183258:ENST00000330503:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507955:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000505081:exon_176940354_176940848:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000503078:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507900:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000504807:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000512027:exon_176940003_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000511040:exon_176940354_176940485:DDX41 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 177031348 T/C 1 8 8 16 3.65104488805988 4.34895511194012 -0.697910223880241 T:C T C 10 0.543619388992515 0.804399137481932 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000502420:exon_177031280_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000510761:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505468:exon_177031067_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000507061:exon_177031313_177031542:B4GALT7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 177035964 T/C 1 8 10 18 3.65104488805988 5.43619388992515 -1.78514900186527 T:C T C 10 0.543619388992515 0.480432312528866 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505145:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000515353:exon_177034366_177036015:B4GALT7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 177565255 C/T 1 5 3 8 2.28190305503742 1.63085816697755 0.65104488805988 T:C C T 10 0.543619388992515 0.734792052639277 ENSG00000145916:ENST00000313386:exon_177565109_177565259:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000515098:exon_177565109_177565259:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000507575:exon_177565109_177565259:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000502814:exon_177565109_177565259:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000512663:exon_177565109_177565397:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000507457:exon_177565109_177565259:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000508647:exon_177565109_177565259:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000512811:exon_177565109_177565259:RMND5B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 177569969 C/G 1 4 11 15 1.82552244402994 5.97981327891767 -4.15429083488773 C:G C G 10 0.543619388992515 0.037970342706995 ENSG00000145916:ENST00000313386:exon_177569853_177569993:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000515098:exon_177569853_177569993:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000507575:exon_177569584_177569993:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000512663:exon_177569853_177569977:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000507457:exon_177569853_177569993:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000512811:exon_177569853_177569993:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000515360:exon_177569853_177569993:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000513162:exon_177568673_177569993:RMND5B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 177574561 T/C 1 26 17 43 11.8658958861946 9.24152961287276 2.62436627332185 T:C T C 10 0.543619388992515 0.4479611808858 ENSG00000145916:ENST00000313386:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000515098:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000507575:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000515360:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000513162:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000507937:exon_177572971_177574636:RMND5B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 179260153 C/T 1 100 82 182 45.6380611007485 44.5767898973862 1.06127120336226 T:C C T 10 0.543619388992515 0.882049847565984 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 179260213 G/A 1 166 138 304 75.7591814272425 75.0194756809671 0.739705746275419 A:G G A 10 0.543619388992515 0.954128622952274 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 179264731 T/C 1 16 43 59 7.30208977611976 23.3756337266781 -16.0735439505584 T:C T C 10 0.543619388992515 3.36039408002126e-05 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179263436_179265078:SQSTM1;ENSG00000161010:ENST00000376931:exon_179264266_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523267:exon_179264274_179264879:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523084:exon_179264276_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000292586:exon_179264276_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376929:exon_179264277_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521299:exon_179264527_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521333:exon_179264693_179264811:C5orf45 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 179264915 G/T 1 13 13 26 5.9329479430973 7.0670520569027 -1.13410411380539 T:G G T 10 0.543619388992515 0.696880304708234 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179263436_179265078:SQSTM1;ENSG00000161010:ENST00000518950:exon_179264760_179265255:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 179290845 T/G 1 11 13 24 5.02018672108233 7.0670520569027 -2.04686533582036 T:G T G 10 0.543619388992515 0.419733845613331 ENSG00000197226:ENST00000518085:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179289738_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520794:exon_179289743_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000524222:exon_179290404_179291128:TBC1D9B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 5 180651383 C/T 1 8 8 16 3.65104488805988 4.34895511194012 -0.697910223880241 T:C C T 10 0.543619388992515 0.804399137481932 ENSG00000146063:ENST00000351937:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000315073:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000508930:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000438174:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000503114:exon_180651058_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515223:exon_180651166_180651812:TRIM41 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 45 25 70 20.5371274953368 13.5904847248129 6.94664277052395 A:G G A 10 0.543619388992515 0.118213628049705 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 401509 C/T 1 30 26 56 13.6914183302245 14.1341041138054 -0.442685783580842 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000137265:ENST00000380956:exon_401424_401777:IRF4;ENSG00000137265:ENST00000412334:exon_401424_401777:IRF4;ENSG00000137265:ENST00000493114:exon_401424_401777:IRF4;ENSG00000137265:ENST00000443871:exon_401424_401777:IRF4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 2784571 G/A 1 8 12 20 3.65104488805988 6.52343266791018 -2.8723877798503 A:G G A 10 0.543619388992515 0.261745196981094 ENSG00000124535:ENST00000380773:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380771:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380769:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380764:exon_2784558_2784637:WRNIP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 4116262 G/A 1 61 33 94 27.8392172714566 17.939439836753 9.89977743470359 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0486066773697847 ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4115923_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4115927_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4115934_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4115936_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000478266:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4115941_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4115942_4116263:PECI HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 4133855 C/T 1 18 16 34 8.21485099813473 8.69791022388024 -0.483059225745512 T:C C T 10 0.543619388992515 0.86538855776722 ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000478266:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4133783_4134016:PECI;ENSG00000198721:ENST00000495548:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000489086:exon_4133783_4133935:PECI HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 4998963 A/G 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 A:G A G 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000124787:ENST00000380051:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000319533:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000380053:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000464646:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000468105:exon_4998922_4999075:RPP40 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 8413890 A/G 1 7 5 12 3.19466427705239 2.71809694496258 0.476567332089819 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000124786:ENST00000379660:exon_8413301_8413932:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000437942:exon_8413303_8413932:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000413108:exon_8413303_8413932:SLC35B3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 12296255 G/T 1 4 9 13 1.82552244402994 4.89257450093264 -3.0670520569027 T:C:G G T 10 0.543619388992515 0.100601549808403 ENSG00000078401:ENST00000379375:exon_12296195_12297427:EDN1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 13794147 C/T 1 16 33 49 7.30208977611976 17.939439836753 -10.6373500606332 T:C C T 10 0.543619388992515 0.00245537276353574 ENSG00000050393:ENST00000379170:exon_13794126_13794179:CCDC90A;ENSG00000050393:ENST00000488770:exon_13794126_13794179:CCDC90A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 14131804 G/A 1 26 25 51 11.8658958861946 13.5904847248129 -1.72458883861827 A:G G A 10 0.543619388992515 0.674318506347327 ENSG00000112149:ENST00000379153:exon_14131751_14131979:CD83 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 17629616 G/A 1 8 5 13 3.65104488805988 2.71809694496258 0.932947943097304 A:G G A 10 0.543619388992515 0.782457075337367 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17628886_17629770:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17628886_17629770:NUP153 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 18237661 C/T 1 29 40 69 13.2350377192171 21.7447755597006 -8.50973784048354 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0523608023175684 ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000507591:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515770:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000512145:exon_18237281_18237747:DEK HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 18264210 G/A 1 25 21 46 11.4095152751871 11.4160071688428 -0.00649189365569214 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515742:exon_18264074_18264439:DEK HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 24403455 C/T 1 5 3 8 2.28190305503742 1.63085816697755 0.65104488805988 T:C C T 10 0.543619388992515 0.734792052639277 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24403153_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24403153_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24403420_24403464:MRS2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 24418348 G/A 1 9 11 20 4.10742549906736 5.97981327891767 -1.8723877798503 A:G G A 10 0.543619388992515 0.502082958548873 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24418312_24418395:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24418312_24418464:MRS2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 24418786 T/C 1 7 8 15 3.19466427705239 4.34895511194012 -1.15429083488773 T:C T C 10 0.543619388992515 0.610096871559822 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24418689_24419469:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24418689_24418791:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24418689_24418789:MRS2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 24653376 G/A 1 8 2 10 3.65104488805988 1.08723877798503 2.56380611007485 A:G G A 10 0.543619388992515 0.122752294666106 ENSG00000111802:ENST00000378198:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000478507:exon_24653211_24653381:TDP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 24698215 G/A 1 28 30 58 12.7786571082096 16.3085816697755 -3.52992456156587 A:G G A 10 0.543619388992515 0.359468749040614 ENSG00000112304:ENST00000230048:exon_24698111_24698295:ACOT13;ENSG00000112304:ENST00000476436:exon_24698111_24698295:ACOT13 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 26124634 C/T 1 15 15 30 6.84570916511227 8.15429083488773 -1.30858166977545 T:C C T 10 0.543619388992515 0.71502599456556 ENSG00000180573:ENST00000377791:exon_26124373_26124969:HIST1H2AC;ENSG00000180573:ENST00000314088:exon_26124418_26124977:HIST1H2AC HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 29523676 C/G 1 15 10 25 6.84570916511227 5.43619388992515 1.40951527518712 C:G C G 10 0.543619388992515 0.689291797690953 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 29523952 A/G 1 11 19 30 5.02018672108233 10.3287683908578 -5.30858166977545 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0657113717087642 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 29691303 G/A 1 128 189 317 58.4167182089581 102.744064519585 -44.3273463106273 A:G G A 10 0.543619388992515 6.18054729039711e-07 ENSG00000204642:ENST00000376861:exon_29691083_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000414333:exon_29691056_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000334668:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000462777:exon_29691169_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29691185_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000482257:exon_29691211_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29691219_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000434407:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000433607:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000486194:exon_29691281_29691704:HLA-F HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 29691713 A/C 1 8 9 17 3.65104488805988 4.89257450093264 -1.24152961287276 A:C A C 10 0.543619388992515 0.629539446230712 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 29691744 C/G 1 7 9 16 3.19466427705239 4.89257450093264 -1.69791022388024 C:G C G 10 0.543619388992515 0.456567971750714 ENSG00000204642:ENST00000485513:exon_29691717_29692225:HLA-F HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 29693969 C/T 1 12 8 20 5.47656733208982 4.34895511194012 1.1276122201497 T:C C T 10 0.543619388992515 0.659998135084761 ENSG00000204642:ENST00000484704:exon_29693788_29694303:HLA-F HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 29694680 A/C 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 A:C A C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 29694681 A/T 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 A:T A T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 29910402 G/A 1 605 25 630 276.110269659528 13.5904847248129 262.519784934716 A:G G A 10 0.543619388992515 1.50735059281232e-124 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910181_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910022_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910278_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910287_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29910325_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910326_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910329_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910331_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910331_29910403:HLA-A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 29912297 A/G 1 6 67 73 2.73828366604491 36.4224990624985 -33.6842153964536 A:G A G 10 0.543619388992515 7.3861577489784e-17 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 29912386 G/C 1 1 127 128 0.456380611007485 69.0396624020494 -68.5832817910419 C:G G C 10 0.543619388992515 3.80098886462422e-42 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 30154199 T/C 1 14 14 28 6.38932855410479 7.61067144589521 -1.22134289179042 T:C T C 10 0.543619388992515 0.706220125728953 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000480999:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30152234_30154335:TRIM26 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 30457732 T/C 1 445 403 848 203.089371898331 219.078613763984 -15.9892418656528 T:C:G T C 10 0.543619388992515 0.270243639734664 ENSG00000204592:ENST00000447104:exon_30457503_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30457503_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30457289_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30457316_30457772:HLA-E HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 30458064 G/A 1 320 290 610 146.041795522395 157.649622807829 -11.6078272854342 A:G G A 10 0.543619388992515 0.350101612102824 ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30458017_30458292:HLA-E HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 30521137 G/A 1 23 12 35 10.4967540531722 6.52343266791018 3.97332138526197 A:G G A 10 0.543619388992515 0.234537150439523 ENSG00000204590:ENST00000376621:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000429126:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000426875:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000376602:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430946:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430441:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000433809:exon_30521137_30521334:GNL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 30521323 G/A 1 23 29 52 10.4967540531722 15.7649622807829 -5.26820822761078 A:G G A 10 0.543619388992515 0.164015986689102 ENSG00000204590:ENST00000376621:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000429126:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000426875:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000376602:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430946:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430441:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000433809:exon_30521137_30521334:GNL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 30522586 C/T 1 14 21 35 6.38932855410479 11.4160071688428 -5.02667861473803 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0924113762908225 ENSG00000204590:ENST00000376621:exon_30522541_30522692:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000429126:exon_30522541_30522692:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000426875:exon_30522541_30522692:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430946:exon_30522541_30522692:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430441:exon_30522541_30522692:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000433809:exon_30522541_30522692:GNL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 30530245 T/C 1 6 3 9 2.73828366604491 1.63085816697755 1.10742549906736 T:C T C 10 0.543619388992515 0.522625694750698 ENSG00000204576:ENST00000376560:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000376557:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000481741:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000498336:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000470703:exon_30530166_30531500:PRR3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 30624241 T/C 1 19 23 42 8.67123160914221 12.5032459468278 -3.83201433768563 T:C T C 10 0.543619388992515 0.278531739956119 ENSG00000204560:ENST00000376442:exon_30624168_30624286:DHX16;ENSG00000204560:ENST00000376437:exon_30624168_30624286:DHX16 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 30652872 G/A 1 31 30 61 14.147798941232 16.3085816697755 -2.16078272854342 A:C:G G A 10 0.543619388992515 0.608584439198094 ENSG00000146112:ENST00000274853:exon_30652185_30655672:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000399199:exon_30652185_30653823:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000376424:exon_30652794_30653795:KIAA1949 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 30671229 C/T 1 17 24 41 7.75847038712724 13.0468653358204 -5.28839494869312 T:C:G C T 10 0.543619388992515 0.116581574973377 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671195_30671314:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671195_30671314:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671195_30671314:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000422104:exon_30671195_30671314:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000489540:exon_30671195_30671858:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671195_30671314:MDC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 30867106 C/T 1 8 4 12 3.65104488805988 2.17447755597006 1.47656733208982 T:C C T 10 0.543619388992515 0.564519601476267 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30866933_30867931:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30866933_30867617:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30866933_30867930:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30866933_30867209:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30866933_30867195:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30866665_30867181:DDR1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 30877760 A/C 1 8 4 12 3.65104488805988 2.17447755597006 1.47656733208982 A:C A C 10 0.543619388992515 0.564519601476267 ENSG00000213780:ENST00000259895:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000376316:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000453897:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000487746:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30877709_30877840:VARS2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 30889389 T/C 1 18 6 24 8.21485099813473 3.26171633395509 4.95313466417964 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0628689329213679 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30889366_30889468:VARS2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 30890483 G/T 1 13 11 24 5.9329479430973 5.97981327891767 -0.0468653358203612 T:G G T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000477052:exon_30890360_30890551:VARS2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 30892322 C/T 1 5 13 18 2.28190305503742 7.0670520569027 -4.78514900186527 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0313264584533007 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30892131_30892341:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30891130_30892337:VARS2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 30893127 G/A 1 15 7 22 6.84570916511227 3.80533572294761 3.04037344216467 A:G G A 10 0.543619388992515 0.207513311530174 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893051_30893162:VARS2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 30893428 G/A 1 7 26 33 3.19466427705239 14.1341041138054 -10.939439836753 A:G G A 10 0.543619388992515 0.000149185651390394 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30893321_30893451:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893321_30893496:VARS2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 31110391 G/C 1 27 58 85 12.3222764972021 31.5299245615659 -19.2076480643638 C:G G C 10 0.543619388992515 4.24225892151084e-05 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31110221_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31110238_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31110297_31110493:CCHCR1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 31112484 C/T 1 14 25 39 6.38932855410479 13.5904847248129 -7.20115617070809 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0239562063632675 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112464_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31112406_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112297_31112850:CCHCR1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 31116210 G/A 1 6 9 15 2.73828366604491 4.89257450093264 -2.15429083488773 A:G G A 10 0.543619388992515 0.306171249676451 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 31116502 C/T 1 26 11 37 11.8658958861946 5.97981327891767 5.88608260727694 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0681727745213835 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116395_31116505:CCHCR1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 31118511 T/G 1 14 9 23 6.38932855410479 4.89257450093264 1.49675405317215 T:G T G 10 0.543619388992515 0.676494295864547 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 31118898 A/T 1 13 12 25 5.9329479430973 6.52343266791018 -0.590484724812876 A:T:G A T 10 0.543619388992515 0.843032485284801 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118732_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31118644_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000505392:exon_31118662_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31118752_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31118847_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31118869_31118899:CCHCR1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 31122315 G/C 1 13 11 24 5.9329479430973 5.97981327891767 -0.0468653358203612 C:G G C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 31122564 C/G 1 4 7 11 1.82552244402994 3.80533572294761 -1.97981327891767 C:G C G 10 0.543619388992515 0.245254265630413 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31122333_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31122349_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31122371_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31122388_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31122460_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000428174:exon_31122505_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507226:exon_31122519_31122576:CCHCR1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 31124849 C/T 1 14 5 19 6.38932855410479 2.71809694496258 3.67123160914221 T:C C T 10 0.543619388992515 0.108702133135878 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000480060:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000505392:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31124508_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000428174:exon_31124508_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507226:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000475684:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000488920:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507892:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000506831:exon_31124800_31125568:CCHCR1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 31129707 C/T 1 4 16 20 1.82552244402994 8.69791022388024 -6.8723877798503 T:C C T 10 0.543619388992515 0.00261066431398132 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 31239378 T/G 1 83 1 84 37.8795907136212 0.543619388992515 37.3359713246287 T:G T G 10 0.543619388992515 6.04912320645144e-21 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 31239430 C/T 0 86 0 86 39.2487325466437 0 39.2487325466437 C C 10 0.543619388992515 1.80912927288915e-23 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 31239449 C/G 1 86 10 96 39.2487325466437 5.43619388992515 33.8125386567186 C:G C G 10 0.543619388992515 1.13519617617449e-13 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 31239501 G/T 1 23 23 46 10.4967540531722 12.5032459468278 -2.00649189365569 T:G G T 10 0.543619388992515 0.55783325783331 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 31239821 G/T 0 20 0 20 9.1276122201497 0 9.1276122201497 G G 10 0.543619388992515 8.89457275793503e-06 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239776_31239882:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239776_31239850:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239776_31239846:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31239776_31239867:HLA-C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 31431820 C/T 1 9 7 16 4.10742549906736 3.80533572294761 0.302089776119759 T:C C T 10 0.543619388992515 1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 31431874 G/T 1 6 8 14 2.73828366604491 4.34895511194012 -1.61067144589521 T:G G T 10 0.543619388992515 0.430135065302382 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 31557640 C/T 1 11 22 33 5.02018672108233 11.9596265578353 -6.939439836753 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0216816304424271 ENSG00000204475:ENST00000495600:exon_31557559_31557676:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000491161:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000340027:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376073:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376072:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376071:exon_31557559_31557676:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000478506:exon_31557614_31557903:NCR3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 31593388 C/T 1 10 3 13 4.56380611007485 1.63085816697755 2.9329479430973 T:C C T 10 0.543619388992515 0.161878475803027 ENSG00000204469:ENST00000414096:exon_31593237_31593388:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31593237_31593388:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000469577:exon_31593237_31593388:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31593237_31593388:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31593237_31593388:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31593237_31593388:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31593237_31593388:BAT2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 31598523 C/T 1 10 5 15 4.56380611007485 2.71809694496258 1.84570916511227 T:C C T 10 0.543619388992515 0.440182309073759 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31598368_31598578:BAT2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 31602967 G/A 1 67 61 128 30.5775009375015 33.1607827285434 -2.58328179104193 A:G G A 10 0.543619388992515 0.658180462035542 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000484787:exon_31602909_31603093:BAT2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 31603770 A/G 1 108 118 226 49.2891059888084 64.1470879011168 -14.8579819123084 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0526188463685860 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603137_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603359_31603826:BAT2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 31604010 C/G 1 94 118 212 42.8997774347036 64.1470879011168 -21.2473104664132 A:C:G C G 10 0.543619388992515 0.00371805868251865 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603986_31604027:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603986_31604196:BAT2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 31604591 C/T 1 91 80 171 41.5306356016811 43.4895511194012 -1.95891551772007 T:C C T 10 0.543619388992515 0.759581019922752 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31604510_31604913:BAT2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 31605199 G/C 1 28 16 44 12.7786571082096 8.69791022388024 4.08074688432934 C:G G C 10 0.543619388992515 0.229754947352774 ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 31609272 T/C 1 5 3 8 2.28190305503742 1.63085816697755 0.65104488805988 T:C T C 10 0.543619388992515 0.734792052639277 ENSG00000204463:ENST00000462875:exon_31608602_31609369:BAT3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 31610686 A/G 1 15 22 37 6.84570916511227 11.9596265578353 -5.11391739272306 A:G A G 10 0.543619388992515 0.100242321211337 ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000470875:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000465348:exon_31610461_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000438149:exon_31610609_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000436214:exon_31610647_31610892:BAT3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 31630241 C/T 1 38 41 79 17.3424632182844 22.2883949486931 -4.94593173040869 T:C:G C T 10 0.543619388992515 0.309393817905945 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 31632134 C/A 1 20 22 42 9.1276122201497 11.9596265578353 -2.83201433768563 A:C C A 10 0.543619388992515 0.439398795997891 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000440842:exon_31631660_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000458083:exon_31631762_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000445768:exon_31631800_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000432291:exon_31631935_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000456540:exon_31631987_31632354:BAT4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 31639979 C/T 1 16 14 30 7.30208977611976 7.61067144589521 -0.308581669775451 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31639641_31641323:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31639641_31640059:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409691:exon_31639641_31641323:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375864:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375875:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000519488:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000530877:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409525:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000483905:exon_31639641_31641323:LY6G5B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 31655438 G/A 1 19 5 24 8.67123160914221 2.71809694496258 5.95313466417964 A:C:G G A 10 0.543619388992515 0.0220930656910312 ENSG00000204427:ENST00000395952:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000468205:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000475742:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000492084:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000375842:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000495769:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000440843:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000490209:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000474007:exon_31655352_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000471644:exon_31655430_31655517:BAT5;ENSG00000204422:ENST00000461287:exon_31655419_31655517:XXbac-BPG32J3.20 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 32088854 G/C 1 33 29 62 15.060560163247 15.7649622807829 -0.704402117535933 C:G G C 10 0.543619388992515 0.898893276753622 ENSG00000213676:ENST00000375203:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000375201:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000433846:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000495579:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000485314:exon_32088766_32088901:ATF6B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 32605284 G/A 1 704 49 753 321.291950149269 26.6373500606332 294.654600088636 A:G G A 10 0.543619388992515 4.78223713518785e-126 ENSG00000196735:ENST00000422863:exon_32605198_32605308:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 32605295 C/T 1 730 66 796 333.157846035464 35.878879673506 297.278966361958 T:C C T 10 0.543619388992515 1.04614814015016e-118 ENSG00000196735:ENST00000422863:exon_32605198_32605308:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 32605309 A/G 1 719 73 792 328.137659314382 39.6842153964536 288.453443917928 A:G A G 10 0.543619388992515 3.50814829814105e-111 ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 32627988 A/G 1 1300 1 1301 593.29479430973 0.543619388992515 592.751174920738 A:G A G 10 0.543619388992515 0 ENSG00000179344:ENST00000487676:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399082:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399079:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000374943:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000434651:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399084:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000460185:exon_32627663_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000484729:exon_32627884_32628026:HLA-DQB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 32627991 C/T 0 1337 0 1337 610.180876917007 0 610.180876917007 C C 10 0.543619388992515 0 ENSG00000179344:ENST00000487676:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399082:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399079:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000374943:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000434651:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399084:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000460185:exon_32627663_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000484729:exon_32627884_32628026:HLA-DQB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 32628001 T/C 0 1384 0 1384 631.630765634359 0 631.630765634359 T T 10 0.543619388992515 0 ENSG00000179344:ENST00000487676:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399082:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399079:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000374943:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000434651:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399084:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000460185:exon_32627663_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000484729:exon_32627884_32628026:HLA-DQB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 32628045 C/G 1 35 14 49 15.973321385262 7.61067144589521 8.36264993936676 C:G C G 10 0.543619388992515 0.0208383858974813 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 32629155 C/A 1 1054 75 1129 481.025164001889 40.7714541744386 440.253709827451 A:T:C:G C A 10 0.543619388992515 1.68347990309766e-186 ENSG00000179344:ENST00000487676:exon_32629124_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000374943:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000434651:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399084:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000484729:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 32634369 C/A 0 115 0 115 52.4837702658608 0 52.4837702658608 C C 10 0.543619388992515 6.16336977275282e-31 ENSG00000179344:ENST00000487676:exon_32634276_32634415:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399082:exon_32634276_32634429:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399079:exon_32634276_32634441:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000374943:exon_32634276_32634461:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000434651:exon_32634276_32634471:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399084:exon_32634276_32634447:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000484729:exon_32634276_32634415:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000529407:exon_32634276_32634431:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000447884:exon_32634334_32634434:HLA-DQB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 32783086 A/G 1 16 18 34 7.30208977611976 9.78514900186527 -2.48305922574551 A:G A G 10 0.543619388992515 0.396146420883858 ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32782821_32783090:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32782821_32783090:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000447394:exon_32782821_32783090:HLA-DOB HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 32800412 C/T 1 11 21 32 5.02018672108233 11.4160071688428 -6.39582044776048 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0317167464694362 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800404_32800510:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800404_32800601:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 32814975 T/C 1 120 92 212 54.7656733208982 50.0129837873114 4.75268953358681 T:C T C 10 0.543619388992515 0.535346528455292 ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000487296:exon_32814845_32815452:TAP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 32818774 T/C 1 71 62 133 32.4030233815314 33.7044021175359 -1.3013787360045 T:C T C 10 0.543619388992515 0.861929195781976 ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32818721_32818926:TAP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 32825090 G/A 1 204 211 415 93.1016446455269 114.703691077421 -21.6020464318937 A:T:G G A 10 0.543619388992515 0.0341275995880736 ENSG00000240065:ENST00000395330:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000414474:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000464863:exon_32823915_32825911:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000374859:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000453265:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000467593:exon_32825040_32825171:PSMB9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 32904981 G/A 1 126 101 227 57.5039569869431 54.905558288244 2.59839869869908 A:G G A 10 0.543619388992515 0.739552430629138 ENSG00000242574:ENST00000438510:exon_32904949_32905216:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000414017:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000440643:exon_32904949_32905233:HLA-DMB HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 32944094 G/C 1 30 22 52 13.6914183302245 11.9596265578353 1.73179177238922 C:G G C 10 0.543619388992515 0.677749238021479 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000456339:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000464592:exon_32944027_32944241:BRD2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 32948426 C/T 1 226 205 431 103.142018087692 111.441974743466 -8.29995665577398 T:C C T 10 0.543619388992515 0.439233342598334 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32948359_32949281:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32948359_32949281:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000469132:exon_32948359_32949063:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482838:exon_32948359_32948543:BRD2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 33036505 G/C 1 541 300 841 246.901910555049 163.085816697755 83.8160938572948 C:G G C 10 0.543619388992515 5.41695436360063e-09 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33035437_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036475_33036581:HLA-DPA1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 33036971 C/T 1 580 31 611 264.700754384341 16.852201058768 247.848553325573 T:C C T 10 0.543619388992515 1.42070114275854e-112 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 33036999 T/C 1 714 64 778 325.855756259344 34.791640895521 291.064115363823 T:C T C 10 0.543619388992515 1.82172260609128e-116 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 33037419 G/A 1 1366 176 1542 623.415914636224 95.6770124626827 527.738902173542 A:G G A 10 0.543619388992515 1.11142486764494e-185 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 33037424 T/C 1 1309 166 1475 597.402219808798 90.2408185727575 507.16140123604 T:C:G T C 10 0.543619388992515 1.30973164024884e-179 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 33037522 T/C 1 424 47 471 193.505379067174 25.5501112826482 167.955267784525 T:C T C 10 0.543619388992515 1.67926835954065e-63 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 33037557 C/T 1 448 1 449 204.458513731353 0.543619388992515 203.914894342361 T:C C T 10 0.543619388992515 6.42094132654893e-117 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 33037560 G/A 0 454 0 454 207.196797397398 0 207.196797397398 G G 10 0.543619388992515 7.05524941325278e-121 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 33037579 A/T 0 510 1 511 232.754111613817 0.543619388992515 232.210492224825 A:G A G 10 0.543619388992515 4.54703671155635e-133 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 33048640 A/G 1 625 25 650 285.237881879678 13.5904847248129 271.647397154865 A:G A G 10 0.543619388992515 1.79680366443955e-129 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000469120:exon_33048449_33049009:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000488575:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000471184:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33048220_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33048466_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 33052950 T/C 1 375 80 455 171.142729127807 43.4895511194012 127.653178008406 T:C T C 10 0.543619388992515 1.99872677705869e-36 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 33052958 C/T 1 408 110 518 186.203289291054 59.7981327891767 126.405156501877 T:C:G C T 10 0.543619388992515 7.84871713587324e-31 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 33052986 T/C 1 343 113 456 156.538549575567 61.4289909561542 95.1095586194131 A:T:C:G T C 10 0.543619388992515 4.85956990122764e-20 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 33163451 G/A 1 18 14 32 8.21485099813473 7.61067144589521 0.604179552239518 A:G G A 10 0.543619388992515 0.861156564790452 ENSG00000204231:ENST00000374685:exon_33163347_33163479:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000374680:exon_33163347_33163479:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000483281:exon_33163347_33163479:RXRB HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 33179689 C/T 1 18 22 40 8.21485099813473 11.9596265578353 -3.7447755597006 T:C C T 10 0.543619388992515 0.267571943451769 ENSG00000204227:ENST00000374656:exon_33179506_33179779:RING1;ENSG00000204227:ENST00000478431:exon_33179506_33179779:RING1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 33254665 A/G 1 41 33 74 18.7116050513069 17.939439836753 0.772165214553887 A:G A G 10 0.543619388992515 0.907388990574247 ENSG00000227057:ENST00000374617:exon_33254572_33254671:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000489905:exon_33254572_33254671:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000444176:exon_33254572_33254671:WDR46 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 33256397 G/A 1 30 34 64 13.6914183302245 18.4830592257455 -4.79164089552096 A:G G A 10 0.543619388992515 0.259087094100695 ENSG00000227057:ENST00000374617:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000444176:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000477718:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000468157:exon_33256341_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000481025:exon_33256391_33256471:WDR46 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 33288271 A/G 1 36 43 79 16.4297019962695 23.3756337266781 -6.94593173040869 A:G A G 10 0.543619388992515 0.141562556713112 ENSG00000204209:ENST00000266000:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000374542:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000468536:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000477162:exon_33288157_33288368:DAXX HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 33359716 G/C 1 10 7 17 4.56380611007485 3.80533572294761 0.758470387127244 C:G G C 10 0.543619388992515 0.810304562557129 ENSG00000237649:ENST00000428849:exon_33359313_33359774:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000453530:exon_33359313_33359774:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000450504:exon_33359638_33359774:KIFC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 33660597 C/T 1 7 7 14 3.19466427705239 3.80533572294761 -0.61067144589521 T:C C T 10 0.543619388992515 0.793044034376695 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33660505_33660670:ITPR3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 35260530 C/T 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 T:C C T 10 0.543619388992515 0.482069340371676 ENSG00000065029:ENST00000229405:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000373953:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000339411:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000440666:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000479226:exon_35260100_35260564:ZNF76 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 35391787 C/T 1 7 2 9 3.19466427705239 1.08723877798503 2.10742549906736 T:C C T 10 0.543619388992515 0.194613573468504 ENSG00000112033:ENST00000360694:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000418635:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000444397:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000311565:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000337400:exon_35391723_35391925:PPARD HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 35803192 C/A 1 5 5 10 2.28190305503742 2.71809694496258 -0.436193889925151 A:C C A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000096063:ENST00000373825:exon_35800743_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000361690:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000423325:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000346162:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000373822:exon_35800811_35803265:SRPK1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 36713263 A/G 1 6 5 11 2.73828366604491 2.71809694496258 0.0201867210823345 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000124772:ENST00000459703:exon_36713165_36713292:CPNE5;ENSG00000124772:ENST00000244751:exon_36713165_36713292:CPNE5;ENSG00000124772:ENST00000493411:exon_36713164_36713292:CPNE5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 36824399 C/T 1 18 7 25 8.21485099813473 3.80533572294761 4.40951527518712 T:C C T 10 0.543619388992515 0.106606427873001 ENSG00000137168:ENST00000373699:exon_36824362_36824430:PPIL1;ENSG00000137168:ENST00000483552:exon_36824362_36824430:PPIL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 36882353 A/G 1 6 4 10 2.73828366604491 2.17447755597006 0.56380611007485 A:G A G 10 0.543619388992515 0.763129400865595 ENSG00000198663:ENST00000359359:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000480824:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000355190:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000373685:exon_36882330_36882469:C6orf89 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 36887476 C/T 1 11 11 22 5.02018672108233 5.97981327891767 -0.959626557835332 T:C C T 10 0.543619388992515 0.676454879931535 ENSG00000198663:ENST00000359359:exon_36887354_36887477:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000355190:exon_36887354_36887477:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000373685:exon_36887354_36887477:C6orf89 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 36936697 T/C 1 88 67 155 40.1614937686587 36.4224990624985 3.73899470616016 T:C T C 10 0.543619388992515 0.573062349924878 ENSG00000137409:ENST00000373616:exon_36935917_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373627:exon_36935917_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373565:exon_36935918_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373550:exon_36936513_36936727:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000337855:exon_36936513_36936725:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000471737:exon_36936536_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000418541:exon_36936688_36936750:MTCH1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 37349033 G/A 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000112130:ENST00000373479:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000394443:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000229866:exon_37348926_37349130:RNF8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 41652514 C/T 1 122 130 252 55.6784345429132 70.670520569027 -14.9920860261138 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0664636211041838 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 41652604 T/C 1 128 123 251 58.4167182089581 66.8651848460793 -8.44846663712127 T:C T C 10 0.543619388992515 0.310682182316332 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 41889409 C/T 1 12 4 16 5.47656733208982 2.17447755597006 3.30208977611976 T:C C T 10 0.543619388992515 0.131728801922986 ENSG00000112578:ENST00000230340:exon_41888926_41889568:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000494032:exon_41889268_41889568:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000489290:exon_41889272_41889568:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000475702:exon_41889288_41889568:BYSL HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 41895150 G/A 1 7 15 22 3.19466427705239 8.15429083488773 -4.95962655783533 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0515624427767768 ENSG00000112578:ENST00000230340:exon_41895112_41895274:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000494032:exon_41895112_41895382:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000489290:exon_41895112_41895274:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000475702:exon_41895112_41895274:BYSL HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 41900406 C/T 1 41 37 78 18.7116050513069 20.1139173927231 -1.40231234141617 T:C C T 10 0.543619388992515 0.8203634671944 ENSG00000112578:ENST00000230340:exon_41900099_41900784:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000372996:exon_41900099_41900734:BYSL HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 42986252 C/T 1 26 12 38 11.8658958861946 6.52343266791018 5.34246321828443 T:C C T 10 0.543619388992515 0.102639887064788 ENSG00000124702:ENST00000326974:exon_42986081_42986294:KLHDC3;ENSG00000124702:ENST00000432243:exon_42986081_42986294:KLHDC3;ENSG00000124702:ENST00000394096:exon_42986081_42986294:KLHDC3;ENSG00000124702:ENST00000332245:exon_42986081_42986294:KLHDC3;ENSG00000124702:ENST00000244670:exon_42986081_42986294:KLHDC3;ENSG00000124702:ENST00000426116:exon_42986081_42986294:KLHDC3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 43193684 G/A 1 11 10 21 5.02018672108233 5.43619388992515 -0.416007168842817 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000112667:ENST00000393987:exon_43193373_43193881:C6orf108 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 43484488 C/T 1 29 23 52 13.2350377192171 12.5032459468278 0.731791772389217 T:C C T 10 0.543619388992515 0.889868230441134 ENSG00000137207:ENST00000372422:exon_43484465_43484728:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000510102:exon_43484465_43484723:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000259737:exon_43484465_43484694:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000504851:exon_43484465_43484720:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000506469:exon_43484465_43484679:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000509315:exon_43484465_43484678:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000490447:exon_43484465_43484710:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000503972:exon_43484465_43484691:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000460547:exon_43484465_43484671:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000455768:exon_43484465_43484657:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000416380:exon_43484465_43484680:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000460903:exon_43484465_43484697:YIPF3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 43496662 A/C 1 10 5 15 4.56380611007485 2.71809694496258 1.84570916511227 A:C A C 10 0.543619388992515 0.440182309073759 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000436943:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372250:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000398835:exon_43496566_43496663:XPO5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 44081510 C/T 1 144 48 192 65.7188079850778 26.0937306716407 39.6250773134371 A:T:C C T 10 0.543619388992515 4.28239876153125e-09 ENSG00000180992:ENST00000372014:exon_44081194_44081946:MRPL14 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 44081519 A/G 1 152 53 205 69.3698528731377 28.8118276166033 40.5580252565344 A:G A G 10 0.543619388992515 6.06282410609291e-09 ENSG00000180992:ENST00000372014:exon_44081194_44081946:MRPL14 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 44198312 G/A 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000112759:ENST00000393844:exon_44198305_44198402:SLC29A1;ENSG00000112759:ENST00000427851:exon_44198305_44198402:SLC29A1;ENSG00000112759:ENST00000313248:exon_44198305_44198402:SLC29A1;ENSG00000112759:ENST00000371755:exon_44198305_44198402:SLC29A1;ENSG00000112759:ENST00000371740:exon_44198305_44198402:SLC29A1;ENSG00000112759:ENST00000371731:exon_44198305_44198402:SLC29A1;ENSG00000112759:ENST00000393841:exon_44198305_44198402:SLC29A1;ENSG00000112759:ENST00000371724:exon_44198305_44198402:SLC29A1;ENSG00000112759:ENST00000371713:exon_44198305_44198402:SLC29A1;ENSG00000112759:ENST00000371708:exon_44198305_44198402:SLC29A1;ENSG00000112759:ENST00000472176:exon_44198305_44198402:SLC29A1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 44269193 C/T 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 T:C C T 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000124608:ENST00000244571:exon_44269118_44269201:AARS2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 47576899 C/T 1 7 3 10 3.19466427705239 1.63085816697755 1.56380611007485 T:C C T 10 0.543619388992515 0.3622898906741 ENSG00000198087:ENST00000359314:exon_47576859_47577040:CD2AP;ENSG00000198087:ENST00000486693:exon_47576859_47577249:CD2AP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 52129484 C/T 1 102 98 200 46.5508223227635 53.2747001212665 -6.72387779850301 T:C C T 10 0.543619388992515 0.356447918646356 ENSG00000112118:ENST00000229854:exon_52128807_52129584:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000419835:exon_52128812_52129584:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000340349:exon_52128812_52129584:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000421471:exon_52129419_52129584:MCM3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 53363559 T/C 1 11 8 19 5.02018672108233 4.34895511194012 0.671231609142214 T:C T C 10 0.543619388992515 0.821160846510767 ENSG00000001084:ENST00000229416:exon_53362139_53363765:GCLC;ENSG00000001084:ENST00000509541:exon_53362139_53363765:GCLC;ENSG00000001084:ENST00000515580:exon_53362940_53363765:GCLC HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 9 9 0 4.89257450093264 -4.89257450093264 A G A 10 0.543619388992515 0.000858904086678645 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 70407465 A/T 1 9 7 16 4.10742549906736 3.80533572294761 0.302089776119759 A:T A T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000168216:ENST00000370577:exon_70407455_70407533:LMBRD1;ENSG00000168216:ENST00000370570:exon_70407455_70407533:LMBRD1;ENSG00000168216:ENST00000472827:exon_70407455_70407533:LMBRD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 71289189 A/G 1 7 9 16 3.19466427705239 4.89257450093264 -1.69791022388024 A:G A G 10 0.543619388992515 0.456567971750714 ENSG00000154079:ENST00000370474:exon_71289117_71289269:C6orf57 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 71377711 C/T 1 3 6 9 1.36914183302245 3.26171633395509 -1.89257450093264 T:C C T 10 0.543619388992515 0.316548245109532 ENSG00000112305:ENST00000370452:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000316999:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370442:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000422334:exon_71377659_71377844:SMAP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 71546702 C/T 1 9 10 19 4.10742549906736 5.43619388992515 -1.32876839085779 T:C C T 10 0.543619388992515 0.646867751304706 ENSG00000112305:ENST00000370452:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000316999:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370442:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000420229:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000439432:exon_71546644_71546731:SMAP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 74135016 C/T 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74133432_74135301:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74134940_74135250:C6orf150 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 74521947 C/T 1 6 2 8 2.73828366604491 1.08723877798503 1.65104488805988 T:C C T 10 0.543619388992515 0.303950947229235 ENSG00000156535:ENST00000422508:exon_74521928_74521993:CD109;ENSG00000156535:ENST00000287097:exon_74521928_74521993:CD109 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 74533192 T/G 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 T:G T G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000156535:ENST00000422508:exon_74533182_74538040:CD109;ENSG00000156535:ENST00000287097:exon_74533182_74534789:CD109 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 83880167 C/T 1 12 7 19 5.47656733208982 3.80533572294761 1.67123160914221 T:C C T 10 0.543619388992515 0.496728290141003 ENSG00000083097:ENST00000484282:exon_83880008_83881069:DOPEY1;ENSG00000013375:ENST00000504780:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000513973:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000512866:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000369731:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000283977:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000416472:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000506587:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000509219:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000503356:exon_83880092_83880197:PGM3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 87969737 C/T 1 35 33 68 15.973321385262 17.939439836753 -1.96611845149102 T:C C T 10 0.543619388992515 0.629088229622655 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 87970301 C/G 1 83 96 179 37.8795907136212 52.1874613432814 -14.3078706296602 C:G C G 10 0.543619388992515 0.0354514986421488 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000496806:exon_87969793_87970363:ZNF292 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 89793894 G/C 1 37 45 82 16.8860826072769 24.4628725046632 -7.57678989738623 C:G G C 10 0.543619388992515 0.0971843166474442 ENSG00000146278:ENST00000369472:exon_89793472_89794064:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000336032:exon_89793472_89794879:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000354922:exon_89793472_89793916:PNRC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 90039670 G/C 1 104 98 202 47.4635835447784 53.2747001212665 -5.81111657648804 C:G G C 10 0.543619388992515 0.437384381617227 ENSG00000241519:ENST00000361333:exon_90039279_90039676:UBE2J1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 90347511 T/C 1 28 22 50 12.7786571082096 11.9596265578353 0.819030550374247 T:C T C 10 0.543619388992515 0.887517166700133 ENSG00000083099:ENST00000520897:exon_90347461_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000412237:exon_90347461_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000523793:exon_90347461_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000520441:exon_90347444_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000523377:exon_90347461_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000517396:exon_90347444_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000524153:exon_90347461_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000520318:exon_90347444_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000521961:exon_90347444_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000523075:exon_90347461_90347601:LYRM2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 99323424 C/T 1 5 4 9 2.28190305503742 2.17447755597006 0.107425499067364 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000112234:ENST00000369244:exon_99323291_99323603:FBXL4;ENSG00000112234:ENST00000229971:exon_99323291_99323603:FBXL4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 99825348 T/C 1 6 3 9 2.73828366604491 1.63085816697755 1.10742549906736 T:C T C 10 0.543619388992515 0.522625694750698 ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000479163:exon_99825262_99825361:COQ3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 106999822 G/A 1 21 4 25 9.58399283115718 2.17447755597006 7.40951527518712 A:G G A 10 0.543619388992515 0.00237843867791310 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000457437:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000285105:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000487681:exon_106999727_107000189:AIM1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 107113715 G/A 1 21 15 36 9.58399283115718 8.15429083488773 1.42970199626946 A:G G A 10 0.543619388992515 0.738621611718841 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107113657_107116292:QRSL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 109770869 G/A 1 18 21 39 8.21485099813473 11.4160071688428 -3.20115617070809 A:G G A 10 0.543619388992515 0.336675733684755 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109770860_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109770860_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109770860_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109768276_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109770860_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000433205:exon_109770860_109770986:MICAL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 110146497 G/A 1 21 13 34 9.58399283115718 7.0670520569027 2.51694077425449 A:G G A 10 0.543619388992515 0.491642927963046 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110146291_110146631:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110146291_110146634:FIG4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 111288941 T/C 1 208 187 395 94.9271670895569 101.6568257416 -6.72965865204344 T:C T C 10 0.543619388992515 0.511600184100034 ENSG00000155115:ENST00000329970:exon_111288713_111289093:GTF3C6;ENSG00000155115:ENST00000480191:exon_111288713_111289093:GTF3C6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 127608633 C/T 1 8 7 15 3.65104488805988 3.80533572294761 -0.154290834887726 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000118518:ENST00000368314:exon_127607761_127609703:RNF146;ENSG00000118518:ENST00000356799:exon_127607761_127609712:RNF146;ENSG00000118518:ENST00000309649:exon_127607761_127609502:RNF146;ENSG00000118518:ENST00000433349:exon_127607761_127609502:RNF146 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 133135886 A/G 1 502 323 825 229.103066725757 175.589062644582 53.5140040811751 A:G A G 10 0.543619388992515 0.000181462161632387 ENSG00000112306:ENST00000230050:exon_133135871_133135921:RPS12;ENSG00000112306:ENST00000484616:exon_133135871_133135921:RPS12 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 133138010 T/C 1 4 10 14 1.82552244402994 5.43619388992515 -3.61067144589521 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0623608135025025 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 134308187 T/G 1 14 12 26 6.38932855410479 6.52343266791018 -0.134104113805391 T:G T G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000028839:ENST00000237264:exon_134308099_134308637:TBPL1;ENSG00000028839:ENST00000477527:exon_134308099_134308637:TBPL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 100 0 100 45.6380611007485 0 45.6380611007485 T T 10 0.543619388992515 4.08461314076148e-27 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 108 0 108 49.2891059888084 0 49.2891059888084 A A 10 0.543619388992515 2.76098358332113e-29 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 109 0 109 49.7454865998159 0 49.7454865998159 A A 10 0.543619388992515 1.48835290118539e-29 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 23 0 23 10.4967540531722 0 10.4967540531722 G G 10 0.543619388992515 1.23092952653128e-06 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 1 26 1 27 11.8658958861946 0.543619388992515 11.3222764972021 T:C T C 10 0.543619388992515 2.02354208106373e-06 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 137519238 A/G 1 98 82 180 44.7252998787335 44.5767898973862 0.148509981347289 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000027697:ENST00000367739:exon_137518621_137519776:IFNGR1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 143816859 C/T 1 30 49 79 13.6914183302245 26.6373500606332 -12.9459317304087 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0044550703872803 ENSG00000001036:ENST00000341946:exon_143815949_143816984:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000002165:exon_143816614_143816984:FUCA2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 149953981 C/T 1 10 2 12 4.56380611007485 1.08723877798503 3.47656733208982 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0776119795169345 ENSG00000186625:ENST00000335647:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000335643:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000367411:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000444282:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000420200:exon_149953895_149954052:KATNA1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 150114745 G/A 1 23 22 45 10.4967540531722 11.9596265578353 -1.46287250466318 A:G G A 10 0.543619388992515 0.657467285964154 ENSG00000120265:ENST00000367384:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000484601:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000367378:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000464889:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000367380:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000486585:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000495487:exon_150114685_150114768:PCMT1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 151726300 G/C 1 25 36 61 11.4095152751871 19.5702980037305 -8.16078272854342 C:G G C 10 0.543619388992515 0.0396868261895606 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000336451:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151725990_151726402:RMND1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 153296541 G/C 1 12 9 21 5.47656733208982 4.89257450093264 0.583992831157184 C:G G C 10 0.543619388992515 0.830589105985654 ENSG00000112029:ENST00000229758:exon_153296042_153296756:FBXO5;ENSG00000112029:ENST00000367241:exon_153296042_153296756:FBXO5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 155606325 C/T 1 8 5 13 3.65104488805988 2.71809694496258 0.932947943097304 T:C C T 10 0.543619388992515 0.782457075337367 ENSG00000029639:ENST00000367166:exon_155606292_155606411:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000468889:exon_155606292_155606411:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000495806:exon_155606292_155606333:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000489874:exon_155606292_155606411:TFB1M HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 158330765 G/A 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 A:G G A 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000130340:ENST00000392185:exon_158330697_158330822:SNX9;ENSG00000130340:ENST00000252631:exon_158330697_158330822:SNX9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 159065758 C/G 1 12 10 22 5.47656733208982 5.43619388992515 0.0403734421646691 C:G C G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000146425:ENST00000367089:exon_159065714_159065771:DYNLT1;ENSG00000146425:ENST00000367085:exon_159065714_159065770:DYNLT1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 159178345 C/T 1 7 3 10 3.19466427705239 1.63085816697755 1.56380611007485 T:C C T 10 0.543619388992515 0.3622898906741 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159178243_159178413:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159178243_159178413:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159178243_159178413:SYTL3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 159184462 A/G 1 8 11 19 3.65104488805988 5.97981327891767 -2.32876839085779 A:G A G 10 0.543619388992515 0.358321729715676 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159184336_159184541:SYTL3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 159185563 T/A 1 23 32 55 10.4967540531722 17.3958204477605 -6.89906639458833 A:T T A 10 0.543619388992515 0.077610298205832 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159185527_159185754:SYTL3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 160198395 G/A 1 53 56 109 24.1881723833967 30.4426857835808 -6.25451340018414 A:G G A 10 0.543619388992515 0.248883342471018 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 160505207 A/G 1 8 2 10 3.65104488805988 1.08723877798503 2.56380611007485 A:G A G 10 0.543619388992515 0.122752294666106 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160504982_160505216:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160504982_160505216:IGF2R HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 160517481 C/T 1 16 8 24 7.30208977611976 4.34895511194012 2.95313466417964 T:C C T 10 0.543619388992515 0.305769929143739 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000475584:exon_160517479_160517657:IGF2R HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 167344583 A/G 1 381 520 901 173.881012793852 282.682082276108 -108.801069482256 A:T:C:G A G 10 0.543619388992515 3.99647895316234e-13 ENSG00000026297:ENST00000366855:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000508775:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000421787:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000510083:exon_167344532_167346537:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000428859:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000476238:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000028008:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000478180:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000467705:exon_167344532_167344606:RNASET2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 170176647 C/T 1 12 6 18 5.47656733208982 3.26171633395509 2.21485099813473 T:C C T 10 0.543619388992515 0.349607890938645 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170176551_170176769:C6orf70 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 170176648 A/G 1 13 6 19 5.9329479430973 3.26171633395509 2.67123160914221 A:C:G A G 10 0.543619388992515 0.255193651557415 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170176551_170176769:C6orf70 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 6 170862300 G/C 1 58 53 111 26.4700754384341 28.8118276166033 -2.34175217816917 C:G G C 10 0.543619388992515 0.70336385611978 ENSG00000008018:ENST00000262193:exon_170862218_170862429:PSMB1;ENSG00000008018:ENST00000392093:exon_170862218_170862417:PSMB1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 814788 G/A 1 6 5 11 2.73828366604491 2.71809694496258 0.0201867210823345 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_814643_814799:HEATR2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 1131356 T/C 1 5 6 11 2.28190305503742 3.26171633395509 -0.979813278917665 T:C T C 10 0.543619388992515 0.56306921306608 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000413368:exon_1131043_1131585:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 1131394 G/A 1 6 6 12 2.73828366604491 3.26171633395509 -0.52343266791018 A:G G A 10 0.543619388992515 0.779998482964206 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000413368:exon_1131043_1131585:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER;ENSG00000164850:ENST00000354575:exon_1131365_1132285:GPER HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 1132153 G/A 1 16 7 23 7.30208977611976 3.80533572294761 3.49675405317215 A:G G A 10 0.543619388992515 0.208238984756367 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER;ENSG00000164850:ENST00000354575:exon_1131365_1132285:GPER HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 2289636 C/T 1 114 91 205 52.0273896548533 49.4693643983189 2.55802525653442 T:C C T 10 0.543619388992515 0.726618787764665 ENSG00000106268:ENST00000356714:exon_2289492_2289637:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397049:exon_2289492_2289637:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000447457:exon_2289492_2289637:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397047:exon_2289492_2289637:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397046:exon_2289492_2289637:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397048:exon_2289492_2289637:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000449983:exon_2289492_2289637:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000343985:exon_2289492_2289637:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000339737:exon_2289492_2289637:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000431585:exon_2289492_2289637:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000487426:exon_2289492_2289637:NUDT1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 2394991 C/T 1 17 57 74 7.75847038712724 30.9863051725734 -23.2278347854461 T:C C T 10 0.543619388992515 5.61423383927444e-08 ENSG00000106263:ENST00000431643:exon_2394869_2395055:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000360876:exon_2394501_2395055:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000413917:exon_2394869_2395055:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000397011:exon_2394517_2395055:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000314800:exon_2394557_2395055:EIF3B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 2577781 T/C 1 60 58 118 27.3828366604491 31.5299245615659 -4.14708790111678 T:C T C 10 0.543619388992515 0.460642245964245 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 2578181 C/T 1 36 27 63 16.4297019962695 14.6777235027979 1.75197849347155 T:C C T 10 0.543619388992515 0.70544742643406 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 2578237 T/C 1 34 22 56 15.5169407742545 11.9596265578353 3.55731421641916 T:C T C 10 0.543619388992515 0.351680881764286 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 2578246 C/T 1 21 36 57 9.58399283115718 19.5702980037305 -9.98630517257336 T:C C T 10 0.543619388992515 0.010872061855632 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 2578371 G/A 1 21 16 37 9.58399283115718 8.69791022388024 0.886082607276943 A:G G A 10 0.543619388992515 0.8693815109076 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 2582907 C/T 1 7 3 10 3.19466427705239 1.63085816697755 1.56380611007485 T:C C T 10 0.543619388992515 0.3622898906741 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2582838_2582957:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2581754_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2581352_2583886:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000421712:exon_2582838_2582957:C7orf27 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 2946461 T/C 1 38 26 64 17.3424632182844 14.1341041138054 3.20835910447904 T:C T C 10 0.543619388992515 0.453292644974958 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2945775_2946476:CARD11 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 5347746 C/T 1 8 10 18 3.65104488805988 5.43619388992515 -1.78514900186527 T:C C T 10 0.543619388992515 0.480432312528866 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5346426_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5346431_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5346431_5347943:TNRC18 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 5569327 G/A 1 19 14 33 8.67123160914221 7.61067144589521 1.060560163247 A:G G A 10 0.543619388992515 0.730932452746069 ENSG00000075624:ENST00000484841:exon_5569166_5569364:ACTB HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 6026942 G/T 1 9 5 14 4.10742549906736 2.71809694496258 1.38932855410479 T:G G T 10 0.543619388992515 0.59447928862092 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 6505901 T/C 1 43 36 79 19.6243662733219 19.5702980037305 0.0540682695913119 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000136240:ENST00000258739:exon_6505702_6505954:KDELR2;ENSG00000136240:ENST00000454368:exon_6505702_6505954:KDELR2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 6621277 G/A 1 9 8 17 4.10742549906736 4.34895511194012 -0.241529612872756 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000136247:ENST00000405731:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396707:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396713:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000335965:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000493944:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396709:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000474097:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000483589:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396706:exon_6621238_6621311:ZDHHC4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 6647738 T/C 1 7 5 12 3.19466427705239 2.71809694496258 0.476567332089819 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000146576:ENST00000344417:exon_6647591_6648357:C7orf26;ENSG00000146576:ENST00000359073:exon_6647591_6648355:C7orf26 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 12728489 A/G 1 19 5 24 8.67123160914221 2.71809694496258 5.95313466417964 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0220930656910312 ENSG00000122644:ENST00000396662:exon_12727791_12728804:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000356797:exon_12727791_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396664:exon_12727794_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396663:exon_12727791_12730559:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000404894:exon_12727794_12728539:ARL4A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 20180717 C/G 1 5 3 8 2.28190305503742 1.63085816697755 0.65104488805988 C:G C G 10 0.543619388992515 0.734792052639277 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20176020_20180781:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20180248_20180781:MACC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 24756951 C/T 1 23 5 28 10.4967540531722 2.71809694496258 7.77865710820958 T:C C T 10 0.543619388992515 0.00362656138093526 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000446822:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24756088_24756993:DFNA5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 24758753 C/T 1 18 7 25 8.21485099813473 3.80533572294761 4.40951527518712 T:C C T 10 0.543619388992515 0.106606427873001 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000414428:exon_24758694_24758837:DFNA5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 24758795 T/C 1 21 6 27 9.58399283115718 3.26171633395509 6.32227649720209 T:C T C 10 0.543619388992515 0.01885027700023 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000414428:exon_24758694_24758837:DFNA5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 24758818 G/T 1 26 10 36 11.8658958861946 5.43619388992515 6.42970199626946 T:C:G G T 10 0.543619388992515 0.0431650777815565 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000414428:exon_24758694_24758837:DFNA5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 30544360 G/A 1 22 13 35 10.0403734421647 7.0670520569027 2.97332138526197 A:G G A 10 0.543619388992515 0.396643109507769 ENSG00000006625:ENST00000275428:exon_30544185_30544460:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000440082:exon_30544185_30544445:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000005374:exon_30544185_30544418:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409144:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000447901:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409390:exon_30544185_30544415:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409436:exon_30544185_30544432:GGCT HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 30634630 G/C 1 14 12 26 6.38932855410479 6.52343266791018 -0.134104113805391 C:G G C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30634297_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000454308:exon_30634457_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000478124:exon_30634500_30634759:GARS HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 32909182 G/A 1 4 6 10 1.82552244402994 3.26171633395509 -1.43619388992515 A:G G A 10 0.543619388992515 0.528005019910346 ENSG00000170852:ENST00000304056:exon_32907784_32910492:KBTBD2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 42949773 C/T 1 7 1 8 3.19466427705239 0.543619388992515 2.65104488805988 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0786679847867632 ENSG00000106588:ENST00000442788:exon_42948872_42950520:PSMA2;ENSG00000136197:ENST00000350427:exon_42948872_42950520:C7orf25;ENSG00000136197:ENST00000447342:exon_42948874_42950515:C7orf25;ENSG00000136197:ENST00000431882:exon_42949052_42950520:C7orf25;ENSG00000136197:ENST00000438029:exon_42949221_42950520:C7orf25 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 43622806 T/C 1 23 28 51 10.4967540531722 15.2213428917904 -4.72458883861827 T:C T C 10 0.543619388992515 0.206546254432490 ENSG00000164543:ENST00000319357:exon_43622664_43623048:STK17A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 43647879 C/T 1 22 27 49 10.0403734421647 14.6777235027979 -4.63735006063324 T:C C T 10 0.543619388992515 0.198472724571718 ENSG00000164543:ENST00000462448:exon_43647855_43647999:STK17A;ENSG00000164543:ENST00000319357:exon_43647855_43647999:STK17A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 43664198 A/G 1 41 35 76 18.7116050513069 19.026678614738 -0.315073563431145 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000164543:ENST00000319357:exon_43664117_43666385:STK17A;ENSG00000164543:ENST00000474211:exon_43664117_43664783:STK17A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 43846603 A/G 1 144 118 262 65.7188079850778 64.1470879011168 1.57172008396105 A:G A G 10 0.543619388992515 0.852697773908981 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43846576_43846938:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43846576_43846939:BLVRA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 43916491 G/A 1 23 14 37 10.4967540531722 7.61067144589521 2.88608260727694 A:G G A 10 0.543619388992515 0.410190030277952 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 43916727 T/G 1 10 18 28 4.56380611007485 9.78514900186527 -5.22134289179042 T:G T G 10 0.543619388992515 0.0573276456730231 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 43917013 G/A 1 13 4 17 5.9329479430973 2.17447755597006 3.75847038712724 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0875593850290938 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 44099664 T/C 1 57 52 109 26.0136948274266 28.2682082276108 -2.25451340018414 T:C T C 10 0.543619388992515 0.700935296191054 ENSG00000136279:ENST00000441840:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000448521:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000456905:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000440166:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000490734:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000498733:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452943:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000429716:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000468694:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000494774:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000411855:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000497184:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000432854:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000449997:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452661:exon_44099647_44099752:DBNL HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 44112873 G/T 1 11 12 23 5.02018672108233 6.52343266791018 -1.50324594682785 T:C:G G T 10 0.543619388992515 0.538329676167563 ENSG00000122678:ENST00000335195:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000242248:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000435068:exon_44111849_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000395831:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000458246:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000430942:exon_44111861_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000467607:exon_44112817_44112976:POLM HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 44747514 C/T 1 42 39 81 19.1679856623144 21.2011561707081 -2.03317050839372 T:C C T 10 0.543619388992515 0.657193200300683 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 44747578 G/A 1 39 35 74 17.7988438292919 19.026678614738 -1.22783478544612 A:G G A 10 0.543619388992515 0.815909143309475 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 44747589 C/T 1 41 33 74 18.7116050513069 17.939439836753 0.772165214553887 T:C C T 10 0.543619388992515 0.907388990574247 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 44840864 G/A 1 8 8 16 3.65104488805988 4.34895511194012 -0.697910223880241 A:G G A 10 0.543619388992515 0.804399137481932 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 45004063 T/C 1 116 121 237 52.9401508768683 65.7779460680943 -12.8377951912261 T:C T C 10 0.543619388992515 0.102938269755163 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45004014_45004118:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45004014_45004118:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45004014_45004118:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45004014_45004118:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45004014_45004118:MYO1G HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 45009325 G/A 1 53 51 104 24.1881723833967 27.7245888386183 -3.53641645522157 A:G G A 10 0.543619388992515 0.492498680005986 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009304_45009474:MYO1G HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 45009341 A/G 1 64 60 124 29.208359104479 32.6171633395509 -3.40880423507187 A:G A G 10 0.543619388992515 0.588779893776967 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009304_45009474:MYO1G HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 45009723 G/A 1 69 54 123 31.4902621595165 29.3554470055958 2.13481515392065 A:G G A 10 0.543619388992515 0.718201399632119 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009639_45009753:MYO1G HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 45104131 G/A 1 23 10 33 10.4967540531722 5.43619388992515 5.060560163247 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0825656317999555 ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000478582:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000482714:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000492883:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000472223:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000476594:exon_45104062_45104221:CCM2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 45113170 G/A 1 44 47 91 20.0807468843293 25.5501112826482 -5.46936439831887 A:G G A 10 0.543619388992515 0.292606025534439 ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000481194:exon_45109425_45114007:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000477605:exon_45113059_45113170:CCM2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 45139919 A/C 1 81 63 144 36.9668294916063 34.2480215065284 2.71880798507784 A:C A C 10 0.543619388992515 0.676340953119452 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45139741_45140025:TBRG4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 45140914 C/T 1 62 46 108 28.2955978824641 25.0064918936557 3.28910598880837 T:C C T 10 0.543619388992515 0.562859184574348 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45140857_45140971:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45140857_45140971:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45140857_45140971:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45140857_45140971:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45140857_45140971:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45140857_45140971:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45140857_45140971:TBRG4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 55540707 G/A 1 6 10 16 2.73828366604491 5.43619388992515 -2.69791022388024 A:G G A 10 0.543619388992515 0.212743822682223 ENSG00000154978:ENST00000285279:exon_55538306_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000428648:exon_55538307_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000433959:exon_55538307_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000428097:exon_55539630_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000418904:exon_55539896_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000454227:exon_55540402_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000453256:exon_55540447_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000427700:exon_55540470_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000455023:exon_55540578_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000414113:exon_55540610_55540738:VOPP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 56126360 T/C 1 70 75 145 31.9466427705239 40.7714541744386 -8.82481140391468 T:C T C 10 0.543619388992515 0.156331177586357 ENSG00000146731:ENST00000275603:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000335503:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000482776:exon_56126313_56126703:CCT6A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 65425894 A/G 1 60 82 142 27.3828366604491 44.5767898973862 -17.1939532369371 A:G A G 10 0.543619388992515 0.00409781089001271 ENSG00000169919:ENST00000304895:exon_65425671_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000466883:exon_65425675_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000345660:exon_65425675_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000447929:exon_65425685_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000430730:exon_65425685_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000421103:exon_65425688_65426050:GUSB HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 65429359 G/A 1 32 28 60 14.6041795522395 15.2213428917904 -0.617163339550903 A:G G A 10 0.543619388992515 0.89741748652155 ENSG00000169919:ENST00000304895:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000466883:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000345660:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000447929:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000430730:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000421103:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000461622:exon_65429133_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000462371:exon_65429317_65429445:GUSB HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 65842545 T/C 1 7 8 15 3.19466427705239 4.34895511194012 -1.15429083488773 T:C T C 10 0.543619388992515 0.610096871559822 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 66785137 C/A 1 7 10 17 3.19466427705239 5.43619388992515 -2.24152961287276 A:C C A 10 0.543619388992515 0.333264703150297 ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66785090_66786513:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66785090_66785250:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66785090_66785384:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66785090_66785395:STAG3L4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 72717933 C/T 1 55 31 86 25.1009336054117 16.852201058768 8.2487325466437 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0831324282258452 ENSG00000130305:ENST00000428206:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000471461:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000438747:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000252594:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000446455:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000310326:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000478977:exon_72717928_72718033:NSUN5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 73097654 C/T 1 16 18 34 7.30208977611976 9.78514900186527 -2.48305922574551 T:C C T 10 0.543619388992515 0.396146420883858 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30;ENSG00000071462:ENST00000464615:exon_73097355_73097713:WBSCR22 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 73097948 G/C 1 9 16 25 4.10742549906736 8.69791022388024 -4.59048472481288 C:G G C 10 0.543619388992515 0.0725284900623433 ENSG00000071462:ENST00000265758:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000420399:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000457629:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000423166:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421304:exon_73097899_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000432522:exon_73097901_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421744:exon_73097903_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000478670:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000496153:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000441822:exon_73097931_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000428163:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000436944:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000463307:exon_73097939_73098003:WBSCR22 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 75609677 A/G 1 9 11 20 4.10742549906736 5.97981327891767 -1.8723877798503 A:G A G 10 0.543619388992515 0.502082958548873 ENSG00000127948:ENST00000453773:exon_75609657_75609711:POR;ENSG00000127948:ENST00000439963:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000448410:exon_75609657_75610056:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000412521:exon_75609657_75609729:POR;ENSG00000127948:ENST00000414186:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000432753:exon_75609657_75609789:POR;ENSG00000127948:ENST00000412064:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75609657_75610040:POR;ENSG00000127948:ENST00000426184:exon_75609657_75609757:POR;ENSG00000127948:ENST00000475509:exon_75609657_75609678:POR HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 75615006 C/T 1 11 19 30 5.02018672108233 10.3287683908578 -5.30858166977545 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0657113717087642 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75614897_75615031:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000496888:exon_75614897_75615063:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75614888_75615167:POR HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 75959188 G/A 1 12 9 21 5.47656733208982 4.89257450093264 0.583992831157184 A:G G A 10 0.543619388992515 0.830589105985654 ENSG00000170027:ENST00000307630:exon_75956116_75959550:YWHAG;ENSG00000170027:ENST00000453207:exon_75958894_75959235:YWHAG HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 76111835 G/A 1 5 6 11 2.28190305503742 3.26171633395509 -0.979813278917665 A:G G A 10 0.543619388992515 0.56306921306608 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000423646:exon_76111825_76111976:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000429179:exon_76111825_76111880:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000472426:exon_76111825_76111932:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 76112060 C/T 1 9 7 16 4.10742549906736 3.80533572294761 0.302089776119759 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 91630620 G/T 1 64 60 124 29.208359104479 32.6171633395509 -3.40880423507187 T:G G T 10 0.543619388992515 0.588779893776967 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493453:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394565:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91630162_91632549:AKAP9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 91641928 A/G 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 A:G A G 10 0.543619388992515 0.482069340371676 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91641743_91641956:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493453:exon_91641743_91641956:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394565:exon_91641743_91641956:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91641743_91641956:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91641743_91641956:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91641743_91641956:AKAP9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 91691601 C/T 1 6 9 15 2.73828366604491 4.89257450093264 -2.15429083488773 A:T:C C T 10 0.543619388992515 0.306171249676451 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000491695:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000265737:exon_91691588_91691800:AKAP9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 91712698 A/G 1 12 17 29 5.47656733208982 9.24152961287276 -3.76496228078294 A:G A G 10 0.543619388992515 0.192472286031218 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91712484_91713009:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91712484_91712969:AKAP9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 91713972 C/T 1 3 10 13 1.36914183302245 5.43619388992515 -4.0670520569027 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0270623247750657 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000435423:exon_91713954_91714017:AKAP9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 91715662 C/T 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 T:C C T 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000435423:exon_91715542_91715730:AKAP9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 91726927 A/C 1 7 3 10 3.19466427705239 1.63085816697755 1.56380611007485 A:C A C 10 0.543619388992515 0.3622898906741 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487258:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487692:exon_91726900_91727108:AKAP9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 91743150 A/G 1 16 34 50 7.30208977611976 18.4830592257455 -11.1809694496258 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0016414198340905 ENSG00000001630:ENST00000003100:exon_91741465_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000450723:exon_91742726_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000422867:exon_91742899_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000482924:exon_91743008_91743157:CYP51A1;ENSG00000240720:ENST00000422722:exon_91741473_91743157:AC000120.8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 91842554 T/C 1 8 4 12 3.65104488805988 2.17447755597006 1.47656733208982 T:C T C 10 0.543619388992515 0.564519601476267 ENSG00000001631:ENST00000312763:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394507:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000340022:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000486261:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000475770:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394505:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000412043:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394503:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000415227:exon_91842509_91842715:KRIT1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 92760502 G/A 1 34 39 73 15.5169407742545 21.2011561707081 -5.6842153964536 A:G G A 10 0.543619388992515 0.196953178754685 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 97488569 A/T 1 26 12 38 11.8658958861946 6.52343266791018 5.34246321828443 A:T A T 10 0.543619388992515 0.102639887064788 ENSG00000070669:ENST00000394309:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000454046:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000437628:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000394308:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000175506:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000422745:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000455086:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000444334:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000442734:exon_97488554_97488710:ASNS HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 97922851 C/T 1 11 9 20 5.02018672108233 4.89257450093264 0.127612220149699 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97920963_97922908:BAIAP2L1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 99654600 A/G 1 3 9 12 1.36914183302245 4.89257450093264 -3.52343266791018 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0466272515626384 ENSG00000166529:ENST00000292450:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000456748:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000438937:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000477297:exon_99654534_99655028:ZSCAN21 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 99693078 G/A 1 132 108 240 60.242240652988 58.7108940111916 1.53134664179639 A:G G A 10 0.543619388992515 0.89692227463921 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000491245:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000493352:exon_99693010_99693287:MCM7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 99704796 A/T 1 37 26 63 16.8860826072769 14.1341041138054 2.75197849347155 A:T:G A T 10 0.543619388992515 0.528553126250886 ENSG00000221838:ENST00000433787:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000429084:exon_99704281_99704800:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000359593:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000455152:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 99704827 A/G 1 40 23 63 18.2552244402994 12.5032459468278 5.75197849347155 A:G A G 10 0.543619388992515 0.164576309784229 ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 99747130 G/A 1 90 66 156 41.0742549906736 35.878879673506 5.19537531716765 A:G G A 10 0.543619388992515 0.422336493525366 ENSG00000188186:ENST00000341942:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000460732:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000474831:exon_99747122_99747188:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000494136:exon_99747122_99747510:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000441173:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000468582:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000488241:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000473459:exon_99746980_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000466498:exon_99746982_99747202:C7orf59 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 99757612 G/A 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 A:G G A 10 0.543619388992515 0.482069340371676 ENSG00000197093:ENST00000426974:exon_99756866_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000413800:exon_99756867_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000495882:exon_99756867_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000360039:exon_99756868_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000423751:exon_99757269_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000411994:exon_99757439_99758582:GAL3ST4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 100064719 A/G 1 84 80 164 38.3359713246287 43.4895511194012 -5.15357979477247 A:G A G 10 0.543619388992515 0.433755357744313 ENSG00000166925:ENST00000300181:exon_100064142_100064791:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000423266:exon_100064146_100064791:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000393991:exon_100064161_100064791:TSC22D4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 100176362 C/T 1 17 20 37 7.75847038712724 10.8723877798503 -3.11391739272306 T:C C T 10 0.543619388992515 0.325428602187333 ENSG00000077454:ENST00000310300:exon_100176273_100176409:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000467201:exon_100175445_100178496:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000422462:exon_100176273_100176409:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000438884:exon_100176273_100176409:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000497245:exon_100176273_100176409:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000487697:exon_100176273_100176362:LRCH4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 100468284 A/G 1 58 58 116 26.4700754384341 31.5299245615659 -5.05984912313175 A:G A G 10 0.543619388992515 0.352753470964077 ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100468196_100469343:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000417475:exon_100468196_100468297:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100467992_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000463125:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000429658:exon_100468196_100468365:TRIP6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 100486036 C/T 1 24 22 46 10.9531346641796 11.9596265578353 -1.00649189365569 T:C C T 10 0.543619388992515 0.769568210551042 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 100486110 C/T 1 128 122 250 58.4167182089581 66.3215654570868 -7.90484724812876 T:C C T 10 0.543619388992515 0.340964119030465 ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000448764:exon_100486095_100486277:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000342198:exon_100486095_100486120:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000445337:exon_100486095_100486281:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000477529:exon_100486095_100486285:SRRT HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 100487830 C/T 1 3 8 11 1.36914183302245 4.34895511194012 -2.97981327891767 T:C C T 10 0.543619388992515 0.126408424019807 ENSG00000087085:ENST00000241069:exon_100487615_100487956:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000419336:exon_100487615_100487956:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000428317:exon_100487615_100487956:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000302913:exon_100487616_100488709:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000447483:exon_100487616_100487956:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000412389:exon_100487618_100487956:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000357451:exon_100487756_100487866:ACHE HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 100490077 G/A 1 5 4 9 2.28190305503742 2.17447755597006 0.107425499067364 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000087085:ENST00000241069:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000419336:exon_100489955_100490175:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000428317:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000302913:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000447483:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000412389:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000357451:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000442452:exon_100489955_100490264:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000411582:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000422451:exon_100489955_100490439:ACHE HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 100490797 G/T 1 7 3 10 3.19466427705239 1.63085816697755 1.56380611007485 T:G G T 10 0.543619388992515 0.3622898906741 ENSG00000087085:ENST00000241069:exon_100490786_100491873:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000419336:exon_100490786_100491873:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000428317:exon_100490786_100491873:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000302913:exon_100490786_100491873:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000447483:exon_100490786_100491873:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000412389:exon_100490786_100492009:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000357451:exon_100490786_100491873:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000426415:exon_100490786_100491854:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000454485:exon_100490786_100491854:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000440755:exon_100490786_100491854:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000430554:exon_100490786_100491854:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000442452:exon_100490786_100491525:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000411582:exon_100490786_100491876:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000422451:exon_100490786_100491873:ACHE HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 100731084 G/A 1 14 10 24 6.38932855410479 5.43619388992515 0.953134664179639 A:G G A 10 0.543619388992515 0.838302661714442 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56;ENSG00000169871:ENST00000412507:exon_100730593_100731409:TRIM56 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 100732321 C/T 1 16 13 29 7.30208977611976 7.0670520569027 0.235037719217064 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 102114090 T/C 1 111 85 196 50.6582478218308 46.2076480643638 4.45059975746705 T:C T C 10 0.543619388992515 0.566365774572895 ENSG00000005075:ENST00000292614:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000306744:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000393794:exon_102113910_102114131:POLR2J HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 104717517 C/T 1 42 42 84 19.1679856623144 22.8320143376856 -3.66402867537126 T:C C T 10 0.543619388992515 0.4444303555635 ENSG00000005483:ENST00000311117:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334884:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000393656:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000351043:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334877:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000257745:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334914:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000478990:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000476671:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000482560:exon_104717410_104717640:MLL5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 104746038 A/G 1 9 12 21 4.10742549906736 6.52343266791018 -2.41600716884282 A:G A G 10 0.543619388992515 0.381528981278344 ENSG00000005483:ENST00000311117:exon_104745886_104746140:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334884:exon_104745886_104746140:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000393656:exon_104745886_104746140:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000351043:exon_104745886_104746140:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334877:exon_104745886_104746140:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000257745:exon_104745886_104746140:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334914:exon_104745886_104746140:MLL5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 104752798 G/A 1 10 10 20 4.56380611007485 5.43619388992515 -0.872387779850301 A:G G A 10 0.543619388992515 0.823235579367717 ENSG00000005483:ENST00000311117:exon_104752272_104754532:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334884:exon_104752272_104754808:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000351043:exon_104752272_104754808:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334877:exon_104752272_104754808:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000257745:exon_104752272_104754531:MLL5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 107218033 T/C 1 9 6 15 4.10742549906736 3.26171633395509 0.845709165112274 T:C T C 10 0.543619388992515 0.797605664193983 ENSG00000105865:ENST00000422290:exon_107217758_107218460:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000265720:exon_107217758_107218906:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000431839:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000406564:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000402620:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000443233:exon_107217758_107218295:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000436411:exon_107217758_107218750:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000485825:exon_107217758_107218101:DUS4L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 108212353 G/A 1 4 8 12 1.82552244402994 4.34895511194012 -2.52343266791018 A:G G A 10 0.543619388992515 0.158970386231855 ENSG00000128590:ENST00000249356:exon_108212161_108212387:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000491582:exon_108212161_108212507:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000465725:exon_108212159_108212387:DNAJB9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 112112279 G/A 1 9 9 18 4.10742549906736 4.89257450093264 -0.785149001865271 A:G G A 10 0.543619388992515 0.81438018796475 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000421296:exon_112112274_112112299:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000489994:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000470441:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000462155:exon_112112274_112112402:IFRD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 115897392 G/C 1 14 12 26 6.38932855410479 6.52343266791018 -0.134104113805391 C:G G C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000135269:ENST00000358204:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000492891:exon_115897348_115897722:TES;ENSG00000135269:ENST00000257721:exon_115897348_115898835:TES;ENSG00000135269:ENST00000393481:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000496912:exon_115897348_115897630:TES HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 116528240 C/T 1 6 2 8 2.73828366604491 1.08723877798503 1.65104488805988 T:C C T 10 0.543619388992515 0.303950947229235 ENSG00000198898:ENST00000464223:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000484325:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000361183:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000458284:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426419:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000449080:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000490693:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426421:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000461878:exon_116528181_116528753:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000417431:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000464669:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000393463:exon_116528181_116528244:CAPZA2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 116557939 C/T 1 19 16 35 8.67123160914221 8.69791022388024 -0.0266786147380262 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000198898:ENST00000361183:exon_116557781_116559315:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000458284:exon_116557781_116559312:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426419:exon_116557781_116559312:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426421:exon_116557781_116558242:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000393463:exon_116557781_116559312:CAPZA2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 128034629 C/T 1 26 31 57 11.8658958861946 16.852201058768 -4.98630517257336 T:C C T 10 0.543619388992515 0.186946686642276 ENSG00000106348:ENST00000469328:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000484496:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000419067:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000338791:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000496200:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000354269:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000348127:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000378717:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000416064:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000343214:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000470772:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000480861:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000460045:exon_128034510_128035052:IMPDH1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 128607384 G/A 1 23 21 44 10.4967540531722 11.4160071688428 -0.919253115670662 A:G G A 10 0.543619388992515 0.879941950408693 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128607334_128607446:TNPO3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 128612552 C/T 1 10 8 18 4.56380611007485 4.34895511194012 0.214850998134729 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128612480_128612636:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128612480_128612636:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128612480_128612636:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128612480_128612636:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128612480_128612636:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128612480_128612636:TNPO3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 128614990 G/A 1 10 7 17 4.56380611007485 3.80533572294761 0.758470387127244 A:G G A 10 0.543619388992515 0.810304562557129 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128614922_128615016:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128614922_128615016:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128614922_128615016:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128614922_128615016:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128614922_128615016:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128614922_128615016:TNPO3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 128622325 T/C 1 5 5 10 2.28190305503742 2.71809694496258 -0.436193889925151 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128622302_128622378:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128622302_128622378:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128622302_128622378:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128622302_128622378:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128622302_128622378:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128622302_128622378:TNPO3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 129663496 C/T 1 8 5 13 3.65104488805988 2.71809694496258 0.932947943097304 T:C C T 10 0.543619388992515 0.782457075337367 ENSG00000091732:ENST00000358303:exon_129663351_129663563:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000467642:exon_129663351_129663563:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000311873:exon_129663351_129663563:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000481503:exon_129663351_129663563:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000435129:exon_129663351_129663563:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000477578:exon_129663404_129663563:ZC3HC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 129664312 T/C 1 11 11 22 5.02018672108233 5.97981327891767 -0.959626557835332 T:C T C 10 0.543619388992515 0.676454879931535 ENSG00000091732:ENST00000358303:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000360708:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000467642:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000311873:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000435129:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000477578:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000471022:exon_129664103_129664346:ZC3HC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 131347009 T/C 0 199 1 200 90.8197415904895 0.543619388992515 90.276122201497 T:G T G 10 0.543619388992515 2.92508956647876e-51 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 133749164 G/A 1 7 6 13 3.19466427705239 3.26171633395509 -0.0670520569026953 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133749044_133750512:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000459626:exon_133749044_133749211:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000466000:exon_133749044_133749363:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000468932:exon_133749071_133749339:EXOC4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 133979552 C/T 1 5 3 8 2.28190305503742 1.63085816697755 0.65104488805988 T:C C T 10 0.543619388992515 0.734792052639277 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 138761034 G/C 1 6 3 9 2.73828366604491 1.63085816697755 1.10742549906736 C:G G C 10 0.543619388992515 0.522625694750698 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000471652:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000460845:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 139026152 T/G 1 23 20 43 10.4967540531722 10.8723877798503 -0.375633726678148 T:G T G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000164898:ENST00000297534:exon_139025878_139026268:C7orf55 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 139102490 A/G 1 6 8 14 2.73828366604491 4.34895511194012 -1.61067144589521 A:G A G 10 0.543619388992515 0.430135065302382 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 0 87 0 87 39.7051131576512 0 39.7051131576512 T T 10 0.543619388992515 9.77093863329022e-24 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 143884103 G/A 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000213214:ENST00000378115:exon_143883176_143885488:ARHGEF35 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 148700849 C/T 1 137 195 332 62.5241437080254 106.00578085354 -43.481637145515 T:C C T 10 0.543619388992515 1.92190193373368e-06 ENSG00000155660:ENST00000286091:exon_148700154_148701301:PDIA4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 148979323 C/T 1 6 2 8 2.73828366604491 1.08723877798503 1.65104488805988 T:C C T 10 0.543619388992515 0.303950947229235 ENSG00000204946:ENST00000434415:exon_148978596_148982082:ZNF783 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 149152906 G/A 1 8 3 11 3.65104488805988 1.63085816697755 2.02018672108233 A:G G A 10 0.543619388992515 0.364880107001187 ENSG00000196453:ENST00000247930:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000314683:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000440594:exon_149152268_149153128:ZNF777 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 149430746 A/G 1 18 2 20 8.21485099813473 1.08723877798503 7.1276122201497 A:G A G 10 0.543619388992515 0.00111198573074275 ENSG00000133619:ENST00000466546:exon_149430295_149431660:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000479560:exon_149430295_149431664:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000319551:exon_149430295_149431664:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000485033:exon_149430295_149431660:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000255992:exon_149430295_149431136:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000496259:exon_149430295_149431660:KRBA1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 150027802 C/T 1 2 7 9 0.91276122201497 3.80533572294761 -2.89257450093264 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0894121930945724 ENSG00000188707:ENST00000343855:exon_150027401_150029808:C7orf29 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 150034184 T/C 1 11 11 22 5.02018672108233 5.97981327891767 -0.959626557835332 T:C T C 10 0.543619388992515 0.676454879931535 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 150034378 A/G 1 11 14 25 5.02018672108233 7.61067144589521 -2.59048472481288 A:G A G 10 0.543619388992515 0.321033229722111 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 150068371 T/C 1 15 8 23 6.84570916511227 4.34895511194012 2.49675405317215 T:C T C 10 0.543619388992515 0.403068770543004 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000522266:exon_150068317_150068481:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 150068605 G/A 1 12 9 21 5.47656733208982 4.89257450093264 0.583992831157184 A:G G A 10 0.543619388992515 0.830589105985654 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 150068620 C/T 1 12 8 20 5.47656733208982 4.34895511194012 1.1276122201497 T:C C T 10 0.543619388992515 0.659998135084761 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 150068933 T/C 1 17 24 41 7.75847038712724 13.0468653358204 -5.28839494869312 T:C T C 10 0.543619388992515 0.116581574973377 ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 150094851 A/G 1 14 14 28 6.38932855410479 7.61067144589521 -1.22134289179042 A:G A G 10 0.543619388992515 0.706220125728953 ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 150094853 G/A 1 14 14 28 6.38932855410479 7.61067144589521 -1.22134289179042 A:G G A 10 0.543619388992515 0.706220125728953 ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 150389677 G/C 1 8 15 23 3.65104488805988 8.15429083488773 -4.50324594682785 C:G G C 10 0.543619388992515 0.0918106689649997 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 150733025 T/A 1 10 4 14 4.56380611007485 2.17447755597006 2.38932855410479 A:T T A 10 0.543619388992515 0.284272971162492 ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482309:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000470645:exon_150732668_150733257:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000466514:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477719:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477092:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000491920:exon_150732969_150733054:ABCB8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 150768786 G/A 1 16 7 23 7.30208977611976 3.80533572294761 3.49675405317215 A:G G A 10 0.543619388992515 0.208238984756367 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000493040:exon_150768564_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000460010:exon_150768752_150769223:SLC4A2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 150773807 A/T 1 110 97 207 50.2018672108233 52.731080732274 -2.52921352145061 A:T:G A T 10 0.543619388992515 0.727755979856778 ENSG00000164896:ENST00000483105:exon_150773679_150773888:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000489884:exon_150773711_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000465272:exon_150773713_150774114:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000467237:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000353841:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297532:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482571:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297530:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000460980:exon_150773716_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000469237:exon_150773725_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482806:exon_150773733_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000483953:exon_150773742_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000466855:exon_150773803_150773919:FASTK HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 150916228 G/A 1 17 17 34 7.75847038712724 9.24152961287276 -1.48305922574551 A:G G A 10 0.543619388992515 0.610932827842374 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000473874:exon_150916150_150916245:ABCF2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 150931268 C/G 1 12 10 22 5.47656733208982 5.43619388992515 0.0403734421646691 C:G C G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150931172_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150929585_150931360:CHPF2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 150934975 C/G 1 37 44 81 16.8860826072769 23.9192531156707 -7.03317050839372 C:G C G 10 0.543619388992515 0.119775319969942 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150934460_150935905:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150934460_150935359:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150934460_150935908:CHPF2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 154738409 T/C 1 16 14 30 7.30208977611976 7.61067144589521 -0.308581669775451 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000214106:ENST00000411526:exon_154738350_154738546:AC093726.6;ENSG00000214106:ENST00000449486:exon_154738303_154738501:AC093726.6;ENSG00000157212:ENST00000404141:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000457196:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000464717:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000397192:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000323199:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000357094:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000473219:exon_154738389_154738523:PAXIP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 156742965 G/C 1 6 5 11 2.73828366604491 2.71809694496258 0.0201867210823345 C:G G C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156742417_156743418:NOM1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 156761818 G/A 1 8 3 11 3.65104488805988 1.63085816697755 2.02018672108233 A:G G A 10 0.543619388992515 0.364880107001187 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000485661:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156761449_156761890:NOM1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 156762224 G/C 1 11 12 23 5.02018672108233 6.52343266791018 -1.50324594682785 C:G G C 10 0.543619388992515 0.538329676167563 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 156762248 G/A 1 15 15 30 6.84570916511227 8.15429083488773 -1.30858166977545 A:G G A 10 0.543619388992515 0.71502599456556 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 7 158672619 A/G 1 8 6 14 3.65104488805988 3.26171633395509 0.38932855410479 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000126870:ENST00000407559:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000308978:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000444851:exon_158672471_158672680:WDR60 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 623556 C/T 1 76 44 120 34.6849264365689 23.9192531156707 10.7656733208982 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0540500244825177 ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000522893:exon_623289_623657:ERICH1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 623593 G/A 1 69 48 117 31.4902621595165 26.0937306716407 5.39653148787574 A:G G A 10 0.543619388992515 0.353577520717452 ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000522893:exon_623289_623657:ERICH1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 6302183 G/C 1 5 3 8 2.28190305503742 1.63085816697755 0.65104488805988 C:G G C 10 0.543619388992515 0.734792052639277 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 6500544 C/T 1 6 5 11 2.73828366604491 2.71809694496258 0.0201867210823345 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6500515_6501144:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6500515_6506026:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6500515_6500891:MCPH1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 8176221 C/T 1 14 18 32 6.38932855410479 9.78514900186527 -3.39582044776048 T:C C T 10 0.543619388992515 0.287013533533773 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 8176554 C/T 1 19 12 31 8.67123160914221 6.52343266791018 2.14779894123203 T:C C T 10 0.543619388992515 0.475681075974162 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 8234077 G/C 1 8 2 10 3.65104488805988 1.08723877798503 2.56380611007485 C:G G C 10 0.543619388992515 0.122752294666106 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 8234113 G/A 1 3 7 10 1.36914183302245 3.80533572294761 -2.43619388992515 A:G G A 10 0.543619388992515 0.202250323161148 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 9627791 A/G 1 2 7 9 0.91276122201497 3.80533572294761 -2.89257450093264 A:G A G 10 0.543619388992515 0.0894121930945724 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 10623289 A/G 1 30 26 56 13.6914183302245 14.1341041138054 -0.442685783580842 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10622473_10623426:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10622669_10623426:PINX1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 11406593 T/C 1 12 19 31 5.47656733208982 10.3287683908578 -4.85220105876797 T:C T C 10 0.543619388992515 0.103558097379365 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000533828:exon_11406533_11406612:BLK HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 11418773 C/T 1 5 5 10 2.28190305503742 2.71809694496258 -0.436193889925151 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000136573:ENST00000526097:exon_11417842_11418961:BLK HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 11640784 A/G 1 7 5 12 3.19466427705239 2.71809694496258 0.476567332089819 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528113:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528323:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000524741:exon_11640121_11640908:NEIL2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 11643803 C/T 1 12 18 30 5.47656733208982 9.78514900186527 -4.30858166977545 T:C C T 10 0.543619388992515 0.142151911386108 ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11643472_11644849:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528323:exon_11643472_11643883:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11643472_11644855:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000524741:exon_11643472_11644165:NEIL2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 11660362 T/C 1 54 33 87 24.6445529944042 17.939439836753 6.70511315765119 T:C T C 10 0.543619388992515 0.162328579695217 ENSG00000079459:ENST00000530337:exon_11660268_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11660120_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11660152_11660419:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11660248_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11660250_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11660250_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529464:exon_11660255_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11660275_11660419:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525571:exon_11660277_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000527045:exon_11660293_11660440:FDFT1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 11666337 A/G 1 51 40 91 23.2754111613817 21.7447755597006 1.53063560168113 A:G A G 10 0.543619388992515 0.833451246226011 ENSG00000079459:ENST00000530337:exon_11666303_11666400:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11666303_11666400:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11666303_11666400:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11666303_11666400:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11666303_11666400:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11666303_11666400:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11666303_11666400:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11665926_11666400:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000531733:exon_11665999_11666400:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000531249:exon_11666019_11666400:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000532266:exon_11666300_11666400:FDFT1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 11706581 T/G 1 6 2 8 2.73828366604491 1.08723877798503 1.65104488805988 T:G T G 10 0.543619388992515 0.303950947229235 ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532409:exon_11706555_11707087:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533110:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534636:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533572:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530296:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525076:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526195:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527243:exon_11706570_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534149:exon_11706571_11706673:CTSB HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 17142065 C/T 1 4 5 9 1.82552244402994 2.71809694496258 -0.892574500932636 T:C C T 10 0.543619388992515 0.740490071859648 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521976:exon_17141982_17142125:VPS37A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 17819572 C/T 1 4 7 11 1.82552244402994 3.80533572294761 -1.97981327891767 T:C C T 10 0.543619388992515 0.245254265630413 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517836:exon_17819543_17819722:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518762:exon_17819543_17819683:PCM1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 17916388 C/T 1 12 8 20 5.47656733208982 4.34895511194012 1.1276122201497 T:C C T 10 0.543619388992515 0.659998135084761 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17916344_17916400:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17916344_17916400:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17916344_17916400:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17916344_17916400:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17916344_17916400:ASAH1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 17927327 T/C 1 12 11 23 5.47656733208982 5.97981327891767 -0.503245946827846 T:C T C 10 0.543619388992515 0.837610804972755 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17927301_17927387:ASAH1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 17928811 C/T 1 15 11 26 6.84570916511227 5.97981327891767 0.865895886194608 T:C C T 10 0.543619388992515 0.844786651072894 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17928809_17928899:ASAH1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 22428708 A/G 0 0 10 10 0 5.43619388992515 -5.43619388992515 G A G 10 0.543619388992515 0.000391987171875226 ENSG00000120896:ENST00000240123:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000434297:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000517535:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000428103:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000523965:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000521554:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000443610:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000523348:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000517962:exon_22428457_22428734:SORBS3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 22526559 G/A 1 9 8 17 4.10742549906736 4.34895511194012 -0.241529612872756 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000147439:ENST00000276416:exon_22526557_22526633:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519513:exon_22526557_22526626:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519335:exon_22526557_22526592:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000522687:exon_22526557_22526638:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000520292:exon_22526557_22526635:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000518366:exon_22526557_22526604:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000522268:exon_22526557_22526661:BIN3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 22880162 G/C 1 15 13 28 6.84570916511227 7.0670520569027 -0.221342891790421 C:G G C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000120889:ENST00000523752:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22879824_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22879987_22880497:TNFRSF10B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 22926313 G/A 1 6 4 10 2.73828366604491 2.17447755597006 0.56380611007485 A:G G A 10 0.543619388992515 0.763129400865595 ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22926264_22926692:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22926264_22926534:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22926264_22926544:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000519028:exon_22926264_22926535:TNFRSF10B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 23429329 T/C 1 10 12 22 4.56380611007485 6.52343266791018 -1.95962655783533 T:C T C 10 0.543619388992515 0.521823185288352 ENSG00000147454:ENST00000519973:exon_23428848_23432976:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000290075:exon_23428848_23429716:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518881:exon_23428848_23429734:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523930:exon_23428988_23429371:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523883:exon_23428848_23429716:SLC25A37 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 25364331 G/A 1 10 18 28 4.56380611007485 9.78514900186527 -5.22134289179042 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0573276456730231 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 26240646 A/G 1 7 8 15 3.19466427705239 4.34895511194012 -1.15429083488773 A:G A G 10 0.543619388992515 0.610096871559822 ENSG00000104765:ENST00000380629:exon_26240414_26240746:BNIP3L;ENSG00000104765:ENST00000520077:exon_26240570_26240746:BNIP3L HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 27255080 A/G 1 7 10 17 3.19466427705239 5.43619388992515 -2.24152961287276 A:G A G 10 0.543619388992515 0.333264703150297 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 27255128 T/C 1 6 5 11 2.73828366604491 2.71809694496258 0.0201867210823345 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 27255146 G/A 1 5 3 8 2.28190305503742 1.63085816697755 0.65104488805988 A:G G A 10 0.543619388992515 0.734792052639277 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 27255263 A/G 1 12 7 19 5.47656733208982 3.80533572294761 1.67123160914221 A:G A G 10 0.543619388992515 0.496728290141003 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 27301725 C/G 1 33 23 56 15.060560163247 12.5032459468278 2.55731421641916 C:G C G 10 0.543619388992515 0.506254514410056 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27301723_27301788:PTK2B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 27308585 A/C 1 27 46 73 12.3222764972021 25.0064918936557 -12.6842153964536 A:C A C 10 0.543619388992515 0.00317144451572948 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27308560_27308595:PTK2B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 27311703 T/C 1 42 37 79 19.1679856623144 20.1139173927231 -0.945931730408688 T:C T C 10 0.543619388992515 0.910170924491502 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000482543:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27311548_27312128:PTK2B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 27315876 A/G 1 108 49 157 49.2891059888084 26.6373500606332 22.6517559281751 A:G A G 10 0.543619388992515 0.000286633137563402 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 27315900 A/G 1 112 58 170 51.1146284328383 31.5299245615659 19.5847038712724 A:G A G 10 0.543619388992515 0.00260498754601995 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 27667969 C/G 1 11 10 21 5.02018672108233 5.43619388992515 -0.416007168842817 C:G C G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27667137_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27667718_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000524266:exon_27667811_27668018:PBK HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 37635649 A/G 1 17 12 29 7.75847038712724 6.52343266791018 1.23503771921706 A:G A G 10 0.543619388992515 0.711765195535752 ENSG00000147471:ENST00000328195:exon_37635491_37637283:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000437582:exon_37635491_37637285:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000521494:exon_37635491_37635880:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000517377:exon_37635491_37635918:PROSC HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 38677932 A/G 1 6 8 14 2.73828366604491 4.34895511194012 -1.61067144589521 A:G A G 10 0.543619388992515 0.430135065302382 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520340:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518415:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522904:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520973:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38677348_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521866:exon_38677439_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38677850_38678153:TACC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 38695996 T/C 1 4 7 11 1.82552244402994 3.80533572294761 -1.97981327891767 T:C T C 10 0.543619388992515 0.245254265630413 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520340:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518415:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522752:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000330691:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000348567:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000523239:exon_38695988_38696025:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000276520:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520973:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38695988_38696028:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521866:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520611:exon_38695988_38696064:TACC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 41525914 C/T 1 5 3 8 2.28190305503742 1.63085816697755 0.65104488805988 T:C C T 10 0.543619388992515 0.734792052639277 ENSG00000029534:ENST00000347528:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000289734:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396945:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000379758:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396942:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000352337:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000439911:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000520299:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000265709:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000524227:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000415018:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000518061:exon_41525859_41526082:ANK1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 42178268 C/T 1 11 11 22 5.02018672108233 5.97981327891767 -0.959626557835332 T:C C T 10 0.543619388992515 0.676454879931535 ENSG00000104365:ENST00000520810:exon_42178253_42178362:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000416505:exon_42178253_42178362:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000517890:exon_42178253_42178362:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000523105:exon_42178253_42178362:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000520835:exon_42178253_42178362:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000518679:exon_42178253_42178362:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000342222:exon_42178253_42178362:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000520201:exon_42176788_42178362:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000521661:exon_42178253_42178362:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000520655:exon_42178253_42178362:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000523517:exon_42178253_42178362:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000519938:exon_42178224_42179463:IKBKB HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 48697705 C/T 1 10 14 24 4.56380611007485 7.61067144589521 -3.04686533582036 T:C C T 10 0.543619388992515 0.225250248056272 ENSG00000121031:ENST00000338368:exon_48697674_48697878:AC103686.1;ENSG00000121031:ENST00000314191:exon_48697674_48697878:AC103686.1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 53555069 A/G 1 17 23 40 7.75847038712724 12.5032459468278 -4.7447755597006 A:G A G 10 0.543619388992515 0.153447284140676 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53554911_53555151:RB1CC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 56985814 T/C 1 2611 3445 6056 1191.60977534054 1872.76879507921 -681.159019738671 T:C:G T C 10 0.543619388992515 8.92758681534097e-69 ENSG00000008988:ENST00000519807:exon_56985676_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000427539:exon_56985676_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000009589:exon_56985506_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000524349:exon_56985601_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000520490:exon_56985613_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000521262:exon_56985613_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000520627:exon_56985613_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000523936:exon_56985632_56986327:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000519606:exon_56985634_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000521289:exon_56985686_56985831:RPS20 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 56986417 A/G 1 10 9 19 4.56380611007485 4.89257450093264 -0.328768390857786 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000008988:ENST00000521289:exon_56986254_56986718:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000519369:exon_56986021_56986718:RPS20 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 61707572 T/C 1 32 30 62 14.6041795522395 16.3085816697755 -1.70440211753593 T:C T C 10 0.543619388992515 0.703030303565155 ENSG00000171316:ENST00000307121:exon_61707545_61707686:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000423902:exon_61707545_61707686:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000453098:exon_61707545_61707686:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000525508:exon_61707545_61707686:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000527900:exon_61707545_61707686:CHD7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 65493429 T/G 1 5 13 18 2.28190305503742 7.0670520569027 -4.78514900186527 T:G T G 10 0.543619388992515 0.0313264584533007 ENSG00000180828:ENST00000321870:exon_65492814_65496181:BHLHE22 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 66525548 T/C 1 6 2 8 2.73828366604491 1.08723877798503 1.65104488805988 T:C T C 10 0.543619388992515 0.303950947229235 ENSG00000104442:ENST00000276569:exon_66525479_66525668:ARMC1;ENSG00000104442:ENST00000518908:exon_66525479_66525668:ARMC1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 68105772 T/G 1 6 10 16 2.73828366604491 5.43619388992515 -2.69791022388024 T:G T G 10 0.543619388992515 0.212743822682223 ENSG00000104218:ENST00000262210:exon_68105699_68105837:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000389042:exon_68105699_68105837:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000412460:exon_68105699_68105837:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000519668:exon_68105699_68105837:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000521324:exon_68105699_68105812:CSPP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 87570665 A/C 1 14 9 23 6.38932855410479 4.89257450093264 1.49675405317215 A:C A C 10 0.543619388992515 0.676494295864547 ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87570516_87573726:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87570516_87573726:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517490:exon_87570516_87573639:CPNE3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 90784979 T/C 1 3 9 12 1.36914183302245 4.89257450093264 -3.52343266791018 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0466272515626384 ENSG00000104312:ENST00000220751:exon_90784895_90785056:RIPK2;ENSG00000104312:ENST00000522965:exon_90784895_90785056:RIPK2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 95877787 T/C 1 6 6 12 2.73828366604491 3.26171633395509 -0.52343266791018 T:C T C 10 0.543619388992515 0.779998482964206 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520315:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000517918:exon_95877734_95877918:INTS8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 95888307 C/T 1 17 8 25 7.75847038712724 4.34895511194012 3.40951527518712 T:C C T 10 0.543619388992515 0.228156583594972 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000521155:exon_95888302_95888370:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523998:exon_95888179_95888513:INTS8 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 100904241 G/A 1 314 317 631 143.30351185635 172.327346310627 -29.023834454277 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0226611984013085 ENSG00000164919:ENST00000522934:exon_100904136_100904280:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520517:exon_100904136_100904280:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520468:exon_100904136_100904280:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000297564:exon_100904136_100904275:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520271:exon_100904136_100904280:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000517682:exon_100904136_100904280:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000524245:exon_100904136_100904280:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000522940:exon_100904136_100904280:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000518171:exon_100904136_100904280:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000523016:exon_100904136_100904280:COX6C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 101252680 T/C 1 7 6 13 3.19466427705239 3.26171633395509 -0.0670520569026953 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101252631_101252999:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101252631_101252999:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000519424:exon_101252631_101252743:SPAG1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 101253184 G/A 1 10 7 17 4.56380611007485 3.80533572294761 0.758470387127244 A:G G A 10 0.543619388992515 0.810304562557129 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101253119_101254130:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101253119_101254130:SPAG1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 104432545 A/G 1 22 13 35 10.0403734421647 7.0670520569027 2.97332138526197 A:G A G 10 0.543619388992515 0.396643109507769 ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521716:exon_104432492_104432876:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521971:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000388778:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000519682:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000518554:exon_104432492_104432691:DCAF13 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 110301998 T/C 1 8 6 14 3.65104488805988 3.26171633395509 0.38932855410479 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000521439:exon_110301980_110302162:NUDCD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 110539186 G/A 1 6 12 18 2.73828366604491 6.52343266791018 -3.78514900186527 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0965748240788784 ENSG00000205038:ENST00000378402:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000426474:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000526472:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000534623:exon_110539013_110539256:PKHD1L1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 110542337 T/C 1 6 3 9 2.73828366604491 1.63085816697755 1.10742549906736 T:C T C 10 0.543619388992515 0.522625694750698 ENSG00000205038:ENST00000378402:exon_110542309_110542559:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000426474:exon_110542309_110543500:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000526472:exon_110542309_110542489:PKHD1L1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 117864217 A/G 1 9 10 19 4.10742549906736 5.43619388992515 -1.32876839085779 A:G A G 10 0.543619388992515 0.646867751304706 ENSG00000164754:ENST00000297338:exon_117864187_117864335:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000523986:exon_117862857_117864491:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000518055:exon_117864187_117864490:RAD21 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 120744349 T/C 1 10 6 16 4.56380611007485 3.26171633395509 1.30208977611976 T:C T C 10 0.543619388992515 0.619661436202725 ENSG00000064313:ENST00000378164:exon_120743015_120744426:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000529653:exon_120744055_120744426:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000526969:exon_120744302_120744426:TAF2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 123966085 G/A 1 10 8 18 4.56380611007485 4.34895511194012 0.214850998134729 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000520211:exon_123965567_123966268:ZHX2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 135521970 G/A 1 31 34 65 14.147798941232 18.4830592257455 -4.33526028451348 A:G G A 10 0.543619388992515 0.319481672057085 ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135521952_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000518408:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000521673:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000522723:exon_135521944_135521992:ZFAT HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 135524797 G/T 1 23 23 46 10.4967540531722 12.5032459468278 -2.00649189365569 T:G G T 10 0.543619388992515 0.55783325783331 ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000518408:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135524718_135524844:ZFAT HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 142200467 G/A 1 9 5 14 4.10742549906736 2.71809694496258 1.38932855410479 A:G G A 10 0.543619388992515 0.59447928862092 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520571:exon_142200383_142200723:DENND3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 142204326 C/G 1 14 21 35 6.38932855410479 11.4160071688428 -5.02667861473803 A:T:C:G C G 10 0.543619388992515 0.0924113762908225 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 144102747 C/T 1 377 391 768 172.055490349822 212.555181096073 -40.4996907462516 T:C:G C T 10 0.543619388992515 0.00373031781399825 ENSG00000160932:ENST00000517503:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000292494:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000429120:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000521699:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000520531:exon_144102731_144103057:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000520466:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000521003:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000522971:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000519611:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000519546:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000523847:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000522024:exon_144102731_144102850:LY6E HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 144620183 T/C 1 6 13 19 2.73828366604491 7.0670520569027 -4.32876839085779 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0633842011056323 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 144874957 G/A 1 32 30 62 14.6041795522395 16.3085816697755 -1.70440211753593 A:G G A 10 0.543619388992515 0.703030303565155 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144874878_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144874878_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144874655_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000525051:exon_144874878_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000526832:exon_144874655_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144874878_144875037:SCRIB HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 145058986 A/G 1 17 22 39 7.75847038712724 11.9596265578353 -4.20115617070809 A:G A G 10 0.543619388992515 0.199628901265994 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313059:exon_145058896_145059496:PARP10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 145060112 G/A 1 10 3 13 4.56380611007485 1.63085816697755 2.9329479430973 A:G G A 10 0.543619388992515 0.161878475803027 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000533665:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000526985:exon_145059660_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525879:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528625:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525486:exon_145059886_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531537:exon_145059892_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529842:exon_145059893_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528914:exon_145059918_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528136:exon_145059939_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529311:exon_145060005_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528580:exon_145060017_145060401:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000530478:exon_145060059_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000532311:exon_145060076_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531707:exon_145060082_145060143:PARP10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 145139325 G/C 1 49 17 66 22.3626499393668 9.24152961287276 13.121120326494 C:G G C 10 0.543619388992515 0.00117225166507167 ENSG00000197858:ENST00000355091:exon_145139316_145139512:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000525087:exon_145139316_145139513:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000530633:exon_145139316_145139488:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000361036:exon_145139316_145139512:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000528073:exon_145139316_145139422:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000527144:exon_145139316_145139512:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000526233:exon_145139316_145139512:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000527653:exon_145139031_145139512:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000529638:exon_145139316_145139512:GPAA1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 145153851 C/T 1 71 61 132 32.4030233815314 33.1607827285434 -0.757759347011984 T:C:G C T 10 0.543619388992515 0.930460058168444 ENSG00000179526:ENST00000532536:exon_145153536_145153897:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000398712:exon_145153769_145153897:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000359551:exon_145153769_145153897:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000361077:exon_145153769_145153897:SHARPIN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 145153852 G/A 1 64 70 134 29.208359104479 38.0533572294761 -8.84499812499702 A:C:G G A 10 0.543619388992515 0.140251371312588 ENSG00000179526:ENST00000532536:exon_145153536_145153897:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000398712:exon_145153769_145153897:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000359551:exon_145153769_145153897:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000361077:exon_145153769_145153897:SHARPIN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 145161591 G/A 1 3 10 13 1.36914183302245 5.43619388992515 -4.0670520569027 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0270623247750657 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 145619735 C/T 1 41 31 72 18.7116050513069 16.852201058768 1.85940399253892 T:C C T 10 0.543619388992515 0.723171463662198 ENSG00000071894:ENST00000349769:exon_145619594_145619770:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000526271:exon_145619449_145619770:CPSF1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 145737816 C/T 1 17 15 32 7.75847038712724 8.15429083488773 -0.395820447760483 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145737775_145737944:RECQL4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 145747920 T/G 1 6 3 9 2.73828366604491 1.63085816697755 1.10742549906736 T:G T G 10 0.543619388992515 0.522625694750698 ENSG00000160959:ENST00000292524:exon_145746295_145750557:LRRC14;ENSG00000177021:ENST00000343593:exon_145747773_145748793:AC084125.1;ENSG00000254402:ENST00000529415:exon_145747788_145748793:LRRC24;ENSG00000254402:ENST00000533758:exon_145747823_145748793:LRRC24 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 8 146156098 G/A 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146155744_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146155771_146157976:ZNF16 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 2811505 G/A 1 37 25 62 16.8860826072769 13.5904847248129 3.29559788246407 A:G G A 10 0.543619388992515 0.445415418184369 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2811361_2811583:KIAA0020 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 2828765 C/G 1 22 26 48 10.0403734421647 14.1341041138054 -4.09373067164072 C:G C G 10 0.543619388992515 0.248996750200525 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2828675_2828778:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000469168:exon_2828475_2828778:KIAA0020 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 4860300 A/G 1 22 29 51 10.0403734421647 15.7649622807829 -5.72458883861827 A:G A G 10 0.543619388992515 0.122234352851242 ENSG00000120158:ENST00000381750:exon_4860125_4861064:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000381730:exon_4860125_4860472:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000448872:exon_4860125_4861064:RCL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 5969249 A/G 1 11 15 26 5.02018672108233 8.15429083488773 -3.13410411380539 A:G A G 10 0.543619388992515 0.241166155555170 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 6506038 C/T 1 8 4 12 3.65104488805988 2.17447755597006 1.47656733208982 T:C C T 10 0.543619388992515 0.564519601476267 ENSG00000147854:ENST00000468435:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000276893:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000485617:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000492853:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000481243:exon_6506033_6506112:UHRF2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 6533010 C/G 1 19 17 36 8.67123160914221 9.24152961287276 -0.570298003730541 C:G C G 10 0.543619388992515 0.868500328571537 ENSG00000178445:ENST00000321612:exon_6532464_6533160:GLDC;ENSG00000178445:ENST00000477960:exon_6532899_6533160:GLDC HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 7174673 G/A 1 6 10 16 2.73828366604491 5.43619388992515 -2.69791022388024 A:G G A 10 0.543619388992515 0.212743822682223 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7174553_7175647:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7174553_7175648:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7174553_7175647:KDM4C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 7477141 G/C 0 13 0 13 5.9329479430973 0 5.9329479430973 G G 10 0.543619388992515 0.000399365633856559 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 15474122 G/A 1 155 100 255 70.7389947061602 54.3619388992515 16.3770558069087 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0440675662493705 ENSG00000164985:ENST00000380733:exon_15474007_15474235:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000380738:exon_15474007_15474235:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000380715:exon_15474007_15474235:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000380716:exon_15474007_15474235:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000397519:exon_15474007_15474235:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000495873:exon_15474007_15474199:PSIP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 32542204 A/G 1 27 25 52 12.3222764972021 13.5904847248129 -1.26820822761078 A:G A G 10 0.543619388992515 0.781302286232014 ENSG00000197579:ENST00000360538:exon_32540542_32544324:TOPORS;ENSG00000197579:ENST00000379858:exon_32540824_32544324:TOPORS HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 33971740 A/G 1 6 5 11 2.73828366604491 2.71809694496258 0.0201867210823345 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000421278:exon_33971649_33971752:UBAP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 34107505 C/T 1 5 4 9 2.28190305503742 2.17447755597006 0.107425499067364 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000198876:ENST00000361264:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396989:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396990:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000450964:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000463286:exon_34107359_34107563:DCAF12 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 35650458 G/A 1 7 2 9 3.19466427705239 1.08723877798503 2.10742549906736 A:G G A 10 0.543619388992515 0.194613573468504 ENSG00000137078:ENST00000486859:exon_35650354_35650467:SIT1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 35662251 T/C 1 4 12 16 1.82552244402994 6.52343266791018 -4.69791022388024 T:C T C 10 0.543619388992515 0.0227629205322148 ENSG00000137135:ENST00000490638:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000490970:exon_35662176_35662264:C9orf100 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 37357033 G/A 1 91 63 154 41.5306356016811 34.2480215065284 7.28261409515269 A:G G A 10 0.543619388992515 0.257722744596504 ENSG00000147905:ENST00000336755:exon_37356832_37358146:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000461038:exon_37356832_37358146:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000497924:exon_37356832_37357156:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000481507:exon_37356832_37357387:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000496099:exon_37356832_37357162:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000470185:exon_37356832_37357081:ZCCHC7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 37429814 A/G 1 93 74 167 42.4433968236961 40.2278347854461 2.21556203824998 A:G A G 10 0.543619388992515 0.756425002200039 ENSG00000137106:ENST00000318158:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000377824:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000460882:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000491488:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000497693:exon_37427703_37432135:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000480596:exon_37428535_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000438860:exon_37428535_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000494290:exon_37428992_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000482603:exon_37429783_37429833:GRHPR HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 37492679 G/T 1 8 6 14 3.65104488805988 3.26171633395509 0.38932855410479 T:G G T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000421959:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37492654_37492712:POLR1E HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 37493588 C/T 1 6 6 12 2.73828366604491 3.26171633395509 -0.52343266791018 T:C C T 10 0.543619388992515 0.779998482964206 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37493556_37493700:POLR1E HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 37500895 T/C 1 20 10 30 9.1276122201497 5.43619388992515 3.69141833022455 T:C T C 10 0.543619388992515 0.201985223150375 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37500837_37500918:POLR1E HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 37503087 G/A 1 46 27 73 20.9935081063443 14.6777235027979 6.3157846035464 A:G G A 10 0.543619388992515 0.158550882982894 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37503040_37503694:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37503040_37503693:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37503040_37503694:POLR1E HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 37782111 C/T 1 26 15 41 11.8658958861946 8.15429083488773 3.71160505130688 T:C C T 10 0.543619388992515 0.274594263934226 ENSG00000107371:ENST00000327304:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000489414:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000482614:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000465860:exon_37781801_37782134:EXOSC3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 37886429 G/A 0 22 0 22 10.0403734421647 0 10.0403734421647 G G 10 0.543619388992515 2.37204166055457e-06 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 37888101 C/T 1 3 7 10 1.36914183302245 3.80533572294761 -2.43619388992515 T:C C T 10 0.543619388992515 0.202250323161148 ENSG00000122696:ENST00000377716:exon_37887601_37888589:MCART1;ENSG00000122696:ENST00000242275:exon_37887648_37888589:MCART1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 71843023 C/A 1 7 3 10 3.19466427705239 1.63085816697755 1.56380611007485 A:C C A 10 0.543619388992515 0.3622898906741 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71842897_71843030:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71842897_71843030:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71842897_71843030:TJP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 71851877 G/A 1 12 11 23 5.47656733208982 5.97981327891767 -0.503245946827846 A:G G A 10 0.543619388992515 0.837610804972755 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71851865_71852052:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71851865_71852052:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71851865_71852052:TJP2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 77684690 A/C 1 5 4 9 2.28190305503742 2.17447755597006 0.107425499067364 A:C A C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000106733:ENST00000376811:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000361092:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000494066:exon_77683912_77684958:C9orf95 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 77752510 C/T 1 15 17 32 6.84570916511227 9.24152961287276 -2.39582044776048 T:C C T 10 0.543619388992515 0.478525973624179 ENSG00000134996:ENST00000346234:exon_77752454_77752532:OSTF1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 77761642 T/C 1 17 23 40 7.75847038712724 12.5032459468278 -4.7447755597006 T:C T C 10 0.543619388992515 0.153447284140676 ENSG00000134996:ENST00000346234:exon_77761599_77762181:OSTF1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 86278817 C/A 1 21 20 41 9.58399283115718 10.8723877798503 -1.28839494869312 A:C C A 10 0.543619388992515 0.754634353816566 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000527373:exon_86278790_86278958:UBQLN1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 93641151 T/C 1 6 5 11 2.73828366604491 2.71809694496258 0.0201867210823345 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 96212813 C/T 1 2 6 8 0.91276122201497 3.26171633395509 -2.34895511194012 T:C C T 10 0.543619388992515 0.153435168169122 ENSG00000188938:ENST00000479094:exon_96212761_96212881:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000423591:exon_96212761_96212881:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000375412:exon_96212761_96212881:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000375409:exon_96212761_96212881:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000523407:exon_96212757_96212881:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000520403:exon_96212757_96212869:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000520470:exon_96212761_96212881:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000483149:exon_96212761_96212881:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000483056:exon_96212761_96212881:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000476484:exon_96212761_96212881:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000428152:exon_96212761_96212869:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000428378:exon_96212761_96212881:FAM120AOS HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 99250463 C/T 1 8 7 15 3.65104488805988 3.80533572294761 -0.154290834887726 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000130956:ENST00000375251:exon_99250371_99250556:HABP4;ENSG00000130956:ENST00000375249:exon_99250371_99250556:HABP4;ENSG00000130956:ENST00000466976:exon_99250371_99250556:HABP4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 103064530 G/A 1 20 14 34 9.1276122201497 7.61067144589521 1.51694077425449 A:G G A 10 0.543619388992515 0.731190001700683 ENSG00000136891:ENST00000374902:exon_103064366_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000477648:exon_103064368_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000444730:exon_103064372_103064586:TEX10 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 113006420 A/G 1 226 269 495 103.142018087692 146.233615638987 -43.091597551295 A:G A G 10 0.543619388992515 0.000121043773411355 ENSG00000136810:ENST00000374517:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000374515:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000487892:exon_113006299_113006499:TXN HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 114411891 C/T 1 1 7 8 0.456380611007485 3.80533572294761 -3.34895511194012 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0274430116751054 ENSG00000059769:ENST00000313525:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000463589:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000447096:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000436202:exon_114411733_114412203:DNAJC25 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 114804173 G/A 1 8 9 17 3.65104488805988 4.89257450093264 -1.24152961287276 A:G G A 10 0.543619388992515 0.629539446230712 ENSG00000106868:ENST00000355396:exon_114804147_114804240:SUSD1;ENSG00000106868:ENST00000374270:exon_114804147_114804240:SUSD1;ENSG00000106868:ENST00000374263:exon_114804147_114804240:SUSD1;ENSG00000106868:ENST00000374264:exon_114804147_114804240:SUSD1;ENSG00000106868:ENST00000475283:exon_114804147_114804240:SUSD1;ENSG00000106868:ENST00000441934:exon_114804149_114804231:SUSD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 117103973 A/G 1 18 20 38 8.21485099813473 10.8723877798503 -2.65753678171557 A:G A G 10 0.543619388992515 0.418189027913124 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117103813_117104005:AKNA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 117110046 C/T 1 5 6 11 2.28190305503742 3.26171633395509 -0.979813278917665 T:C C T 10 0.543619388992515 0.56306921306608 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117110004_117110180:AKNA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 125920376 G/A 1 4 7 11 1.82552244402994 3.80533572294761 -1.97981327891767 A:G G A 10 0.543619388992515 0.245254265630413 ENSG00000165209:ENST00000447404:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000348403:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000360998:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000407982:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000373638:exon_125920291_125920402:STRBP HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 127177161 A/G 1 59 57 116 26.9264560494416 30.9863051725734 -4.05984912313174 A:G A G 10 0.543619388992515 0.457305683937788 ENSG00000136930:ENST00000259457:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000498485:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000441097:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000466951:exon_127177121_127177214:PSMB7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 130504070 G/A 1 6 16 22 2.73828366604491 8.69791022388024 -5.95962655783533 A:G G A 10 0.543619388992515 0.0165046240874664 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000420366:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373274:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130504067_130504238:SH2D3C HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 130941259 G/T 1 11 14 25 5.02018672108233 7.61067144589521 -2.59048472481288 T:G G T 10 0.543619388992515 0.321033229722111 ENSG00000148337:ENST00000393608:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325721:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372941:exon_130941245_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372938:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000415526:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325669:exon_130941241_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000475471:exon_130940648_130941288:CIZ1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 131027963 A/G 1 6 6 12 2.73828366604491 3.26171633395509 -0.52343266791018 A:G A G 10 0.543619388992515 0.779998482964206 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000450617:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000490257:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000468488:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000458730:exon_131027864_131027970:GOLGA2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 131285955 A/G 1 3 5 8 1.36914183302245 2.71809694496258 -1.34895511194012 A:G A G 10 0.543619388992515 0.482069340371676 ENSG00000119392:ENST00000309971:exon_131285871_131286125:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000372770:exon_131285871_131286125:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000494417:exon_131285927_131286125:GLE1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 131360750 C/T 1 7 2 9 3.19466427705239 1.08723877798503 2.10742549906736 T:C C T 10 0.543619388992515 0.194613573468504 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000475367:exon_131360679_131360783:SPTAN1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 131379967 C/T 1 21 29 50 9.58399283115718 15.7649622807829 -6.18096944962575 T:C C T 10 0.543619388992515 0.088730453395017 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131379919_131380039:SPTAN1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 131397479 G/A 1 28 21 49 12.7786571082096 11.4160071688428 1.36264993936676 A:G G A 10 0.543619388992515 0.774891177596959 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000483181:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131397458_131397538:WDR34 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 131398636 C/T 1 7 17 24 3.19466427705239 9.24152961287276 -6.04686533582036 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0142285939910005 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000473486:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131398197_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131398363_131398717:WDR34 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 131403096 A/G 1 19 16 35 8.67123160914221 8.69791022388024 -0.0266786147380262 A:G A G 10 0.543619388992515 1 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131402970_131403218:WDR34 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 131909736 C/T 1 22 6 28 10.0403734421647 3.26171633395509 6.77865710820958 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0123799099188825 ENSG00000119383:ENST00000358994:exon_131909666_131911223:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000393370:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000524946:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000337738:exon_131909666_131911223:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000348141:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000405725:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000347048:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000357197:exon_131909666_131911224:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000355007:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000423100:exon_131909666_131910277:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000414510:exon_131909666_131910566:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000419582:exon_131909666_131910236:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000432651:exon_131909666_131910285:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000435132:exon_131909666_131910051:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000434095:exon_131909666_131910274:PPP2R4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 132400480 G/A 1 15 13 28 6.84570916511227 7.0670520569027 -0.221342891790421 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000148331:ENST00000277458:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000277459:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000450050:exon_132399173_132400736:ASB6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 132569442 G/A 1 5 3 8 2.28190305503742 1.63085816697755 0.65104488805988 A:G G A 10 0.543619388992515 0.734792052639277 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 132585058 G/A 1 10 12 22 4.56380611007485 6.52343266791018 -1.95962655783533 A:G G A 10 0.543619388992515 0.521823185288352 ENSG00000136827:ENST00000437532:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000427355:exon_132585004_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000351698:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000473604:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000473084:exon_132583655_132585125:TOR1A HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 132590431 C/G 1 78 34 112 35.5976876585838 18.4830592257455 17.1146284328383 C:G C G 10 0.543619388992515 0.00117874582158830 ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132589565_132590531:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132589569_132590531:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132590247_132590531:C9orf78 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 132591509 A/G 1 49 40 89 22.3626499393668 21.7447755597006 0.617874379666159 A:G A G 10 0.543619388992515 0.915680659726273 ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132591484_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132591484_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461762:exon_132590707_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000480023:exon_132590721_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132591507_132591560:C9orf78 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 132597021 C/T 1 18 21 39 8.21485099813473 11.4160071688428 -3.20115617070809 A:T:C C T 10 0.543619388992515 0.336675733684755 ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132596991_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136878:ENST00000491053:exon_132596977_132597357:USP20 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 132720770 A/G 1 28 27 55 12.7786571082096 14.6777235027979 -1.89906639458833 A:G A G 10 0.543619388992515 0.685105767173079 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132720770_132720832:FNBP1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 133761001 A/G 1 4 8 12 1.82552244402994 4.34895511194012 -2.52343266791018 A:G A G 10 0.543619388992515 0.158970386231855 ENSG00000097007:ENST00000372348:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000438426:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000318560:exon_133759356_133763062:ABL1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 135275618 A/C 1 31 23 54 14.147798941232 12.5032459468278 1.64455299440419 A:C A C 10 0.543619388992515 0.684071765211742 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135275422_135275645:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135275422_135275645:TTF1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 135470176 C/G 1 10 15 25 4.56380611007485 8.15429083488773 -3.59048472481288 C:G C G 10 0.543619388992515 0.163785907367559 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135469676_135470499:DDX31 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 135470414 T/C 1 7 7 14 3.19466427705239 3.80533572294761 -0.61067144589521 T:C T C 10 0.543619388992515 0.793044034376695 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135469676_135470499:DDX31 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 136218830 G/C 1 34 27 61 15.5169407742545 14.6777235027979 0.839217271456581 C:G G C 10 0.543619388992515 0.898006539965049 ENSG00000148290:ENST00000371974:exon_136218610_136218837:SURF1;ENSG00000148290:ENST00000495952:exon_136218730_136218837:SURF1;ENSG00000148290:ENST00000437995:exon_136218768_136218837:SURF1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 137313523 C/T 1 25 20 45 11.4095152751871 10.8723877798503 0.537127495336822 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000186350:ENST00000481739:exon_137313522_137313651:RXRA;ENSG00000186350:ENST00000356384:exon_137313522_137313651:RXRA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 139256495 G/T 1 7 56 63 3.19466427705239 30.4426857835808 -27.2480215065284 T:G G T 10 0.543619388992515 1.24740594872865e-12 ENSG00000213221:ENST00000371739:exon_139253932_139256632:DNLZ;ENSG00000213221:ENST00000371738:exon_139256352_139256632:DNLZ;ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139256355_139256632:CARD9 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 139270876 G/A 1 28 32 60 12.7786571082096 17.3958204477605 -4.6171633395509 A:G G A 10 0.543619388992515 0.245260540494563 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139270801_139270933:SNAPC4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 139272058 A/G 1 31 28 59 14.147798941232 15.2213428917904 -1.07354395055839 A:G A G 10 0.543619388992515 0.795065129442435 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 139273288 C/T 1 13 7 20 5.9329479430973 3.80533572294761 2.1276122201497 T:C C T 10 0.543619388992515 0.377499796690282 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 139273402 C/T 1 13 6 19 5.9329479430973 3.26171633395509 2.67123160914221 T:C C T 10 0.543619388992515 0.255193651557415 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 139275204 A/C 1 2 6 8 0.91276122201497 3.26171633395509 -2.34895511194012 A:C A C 10 0.543619388992515 0.153435168169122 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139275192_139275302:SNAPC4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 139275294 G/C 1 4 4 8 1.82552244402994 2.17447755597006 -0.34895511194012 C:G G C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139275192_139275302:SNAPC4 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 139301960 G/A 1 6 4 10 2.73828366604491 2.17447755597006 0.56380611007485 A:G G A 10 0.543619388992515 0.763129400865595 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000468963:exon_139301469_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371723:exon_139301597_139302013:SDCCAG3 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 139311471 C/T 1 33 33 66 15.060560163247 17.939439836753 -2.87887967350599 T:C C T 10 0.543619388992515 0.537095585351748 ENSG00000165688:ENST00000399219:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000371717:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000462616:exon_139310519_139311666:PMPCA HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 139744524 C/T 1 179 144 323 81.6921293703398 78.2811920149222 3.41093735541763 T:C C T 10 0.543619388992515 0.73761279020795 ENSG00000054148:ENST00000371661:exon_139744465_139744589:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000492540:exon_139744465_139745012:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000247665:exon_139744465_139744589:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000462205:exon_139744465_139744589:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000497413:exon_139744465_139744589:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000463215:exon_139744231_139744589:PHPT1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 139820363 A/G 1 13 15 28 5.9329479430973 8.15429083488773 -2.22134289179042 A:G A G 10 0.543619388992515 0.450446228617728 ENSG00000127191:ENST00000247668:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000359662:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000432785:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000371645:exon_139820135_139821059:TRAF2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 139820421 G/A 1 19 17 36 8.67123160914221 9.24152961287276 -0.570298003730541 A:G G A 10 0.543619388992515 0.868500328571537 ENSG00000127191:ENST00000247668:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000359662:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000432785:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000371645:exon_139820135_139821059:TRAF2 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 139836694 C/T 1 18 17 35 8.21485099813473 9.24152961287276 -1.02667861473803 T:C C T 10 0.543619388992515 0.737552578231163 ENSG00000159069:ENST00000325285:exon_139836498_139836918:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000459905:exon_139836552_139836918:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000483559:exon_139836498_139837147:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000487794:exon_139836207_139836918:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000433269:exon_139836498_139836918:FBXW5 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 140002989 T/C 1 33 28 61 15.060560163247 15.2213428917904 -0.160782728543417 T:C T C 10 0.543619388992515 1 ENSG00000177239:ENST00000371589:exon_140002840_140003635:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000474902:exon_140002840_140003633:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000392853:exon_140001983_140003635:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000480100:exon_140002840_140003633:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000475449:exon_140002983_140003529:MAN1B1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 140006425 C/G 1 131 132 263 59.7858600419805 71.757759347012 -11.9718993050315 C:G C G 10 0.543619388992515 0.154403760649574 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006393_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000488415:exon_140006360_140006481:DPP7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 140006491 C/T 1 15 10 25 6.84570916511227 5.43619388992515 1.40951527518712 T:C C T 10 0.543619388992515 0.689291797690953 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 140008750 G/C 1 33 24 57 15.060560163247 13.0468653358204 2.01369482742664 C:G G C 10 0.543619388992515 0.690348311619601 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000472306:exon_140008695_140008830:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000485456:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000478597:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000497375:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473703:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000491807:exon_140008695_140009028:DPP7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 140008934 A/G 1 7 11 18 3.19466427705239 5.97981327891767 -2.78514900186527 A:G A G 10 0.543619388992515 0.237876828195976 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140008915_140009165:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140008915_140008944:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000472306:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000485456:exon_140008915_140009170:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000478597:exon_140008915_140009178:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000497375:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473703:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000491807:exon_140008695_140009028:DPP7 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 140150427 G/T 1 8 6 14 3.65104488805988 3.26171633395509 0.38932855410479 T:G G T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000188986:ENST00000343053:exon_140150359_140150522:COBRA1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . 9 140446806 C/T 1 192 184 376 87.6250773134371 100.025967574623 -12.4008902611857 T:C C T 10 0.543619388992515 0.214029402068563 ENSG00000182154:ENST00000371443:exon_140446526_140447007:MRPL41 HGDP00222_parsed_pileup.txt . X 207362 C/T 1 9 8 17 4.10742549906736 4.34895511194012 -0.241529612872756 T:C C T 10 0.543619388992515 1 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000484611:exon_207315_207459:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000430923:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000415337:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000447472:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000448477:exon_207315_207424:PLCXD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . X 215944 G/T 1 19 23 42 8.67123160914221 12.5032459468278 -3.83201433768563 T:G G T 10 0.543619388992515 0.278531739956119 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_215764_220020:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_215764_216059:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_215764_220023:PLCXD1 HGDP00222_parsed_pileup.txt . X 229542 G/A 1 5 8 13 2.28190305503742 4.34895511194012 -2.0670520569027 A:G G A 10 0.543619388992515 0.276871294907228 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_228086_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_229433_229591:GTPBP6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . X 295069 A/G 1 15 14 29 6.84570916511227 7.61067144589521 -0.764962280782936 A:G A G 10 0.543619388992515 0.85290045462467 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00222_parsed_pileup.txt . X 295132 T/C 1 8 9 17 3.65104488805988 4.89257450093264 -1.24152961287276 T:C T C 10 0.543619388992515 0.629539446230712 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00222_parsed_pileup.txt . X 295231 A/G 1 14 18 32 6.38932855410479 9.78514900186527 -3.39582044776048 A:G A G 10 0.543619388992515 0.287013533533773 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00222_parsed_pileup.txt . X 1467404 A/C 1 15 15 30 6.84570916511227 8.15429083488773 -1.30858166977545 A:C A C 10 0.543619388992515 0.71502599456556 ENSG00000185291:ENST00000331035:exon_1467324_1467438:IL3RA HGDP00222_parsed_pileup.txt . X 1508583 T/C 1 366 274 640 167.035303628739 148.951712583949 18.0835910447904 A:T:C T C 10 0.543619388992515 0.153338239335821 ENSG00000169100:ENST00000381401:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000475167:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000484026:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000447786:exon_1508256_1508620:SLC25A6 HGDP00222_parsed_pileup.txt . X 1531648 C/T 1 75 60 135 34.2285458255614 32.6171633395509 1.61138248601046 T:C:G C T 10 0.543619388992515 0.796155510740446 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1531625_1531747:ASMTL HGDP00222_parsed_pileup.txt . X 1537881 C/T 1 31 42 73 14.147798941232 22.8320143376856 -8.6842153964536 T:C C T 10 0.543619388992515 0.0456901486874411 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL HGDP00222_parsed_pileup.txt . X 1546792 G/A 1 47 39 86 21.4498887173518 21.2011561707081 0.248732546643705 A:G G A 10 0.543619388992515 1 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP00222_parsed_pileup.txt . X 1546876 A/G 1 72 42 114 32.8594039925389 22.8320143376856 10.0273896548533 A:G A G 10 0.543619388992515 0.060559677703053 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP00222_parsed_pileup.txt . X 1554649 T/C 1 11 11 22 5.02018672108233 5.97981327891767 -0.959626557835332 T:C T C 10 0.543619388992515 0.676454879931535 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1554587_1554651:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1554587_1554651:ASMTL HGDP00222_parsed_pileup.txt . X 2139079 A/T 1 50 54 104 22.8190305503742 29.3554470055958 -6.53641645522157 A:T A T 10 0.543619388992515 0.202149689679002 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2137557_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2138809_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2138809_2139270:DHRSX HGDP00222_parsed_pileup.txt . X 2139200 T/C 1 26 18 44 11.8658958861946 9.78514900186527 2.08074688432934 T:C T C 10 0.543619388992515 0.549245304793763 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2137557_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2138809_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2138809_2139270:DHRSX