INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 881918 G/A 1 16 12 28 7.84644313835923 6.11516764623058 1.73127549212866 A:G G A 10 0.509597303852548 0.57358810064514 ENSG00000188976:ENST00000483767:exon_881782_882440:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_881782_881925:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_881782_881925:NOC2L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 949510 C/T 1 1036 797 1833 508.05719320876 406.149051170481 101.90814203828 T:C:G C T 10 0.509597303852548 2.06441332241561e-06 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 949608 G/A 1 1165 1314 2479 571.319141011782 669.610857262248 -98.2917162504664 A:G G A 10 0.509597303852548 8.18145196433298e-05 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 990380 C/T 1 27 20 47 13.2408727959812 10.191946077051 3.04892671893024 T:C C T 10 0.509597303852548 0.385820933338602 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_990204_991496:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_990204_991492:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000461111:exon_990204_991492:AGRN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 1390875 C/T 0 8 0 8 3.92322156917962 0 3.92322156917962 C C 10 0.509597303852548 0.00789316895639457 ENSG00000215915:ENST00000378785:exon_1390840_1390899:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000435474:exon_1390840_1390899:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000475091:exon_1390840_1390899:ATAD3C HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 1421531 C/A 1 8 6 14 3.92322156917962 3.05758382311529 0.865637746064328 A:C C A 10 0.509597303852548 0.79106698341654 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1421162_1421615:ATAD3B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 1425700 T/C 1 19 30 49 9.31765122680159 15.2879191155764 -5.97026788877485 T:C T C 10 0.509597303852548 0.115115283838738 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1425634_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1424584_1426051:ATAD3B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 1430985 C/T 1 47 36 83 23.0489267189302 18.3455029386917 4.70342378023852 A:T:C C T 10 0.509597303852548 0.324210069256305 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1430865_1433228:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1430865_1431581:ATAD3B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 1551927 T/C 1 6 2 8 2.94241617688471 1.0191946077051 1.92322156917962 T:C T C 10 0.509597303852548 0.289787629707581 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000477990:exon_1551888_1554590:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514363:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000502470:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507082:exon_1551888_1553278:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000463492:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000510793:exon_1551654_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1551690_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1551691_1551994:MIB2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 1635004 T/C 1 27 22 49 13.2408727959812 11.2111406847561 2.02973211122515 T:C T C 10 0.509597303852548 0.571671773493327 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000463652:exon_1634915_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000467737:exon_1634915_1635011:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000478901:exon_1634527_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468397:exon_1634915_1635063:CDK11A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 1635749 C/A 1 18 15 33 8.82724853065414 7.64395955778822 1.18328897286592 A:C C A 10 0.509597303852548 0.729929523562816 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635478_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468397:exon_1635662_1635994:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635662_1636041:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000495016:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468800:exon_1635662_1636094:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000464748:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000489300:exon_1635682_1635783:CDK11A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 1686040 G/T 1 32 23 55 15.6928862767185 11.7207379886086 3.97214828810986 T:G G T 10 0.509597303852548 0.345259603907093 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000469045:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000480499:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497747:exon_1685983_1686305:NADK;ENSG00000008130:ENST00000477235:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000489538:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497615:exon_1685983_1686335:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497186:exon_1685983_1686137:NADK HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 2337194 C/T 1 9 8 17 4.41362426532707 4.07677843082038 0.336845834506684 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000157911:ENST00000288774:exon_2336236_2337273:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000447513:exon_2336258_2337273:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000507596:exon_2336277_2337267:PEX10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 2340200 T/C 1 8 3 11 3.92322156917962 1.52879191155764 2.39442965762197 T:C T C 10 0.509597303852548 0.227512016275758 ENSG00000157911:ENST00000288774:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000447513:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000507596:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000510434:exon_2339895_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000508384:exon_2339969_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000515760:exon_2340022_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000502666:exon_2340043_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000504111:exon_2340074_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000514502:exon_2340194_2340297:PEX10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 3745924 G/A 1 3 8 11 1.47120808844236 4.07677843082038 -2.60557034237803 A:G G A 10 0.509597303852548 0.139008716253398 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3745830_3745937:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3745830_3745937:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000461667:exon_3745830_3745937:KIAA0562 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 6649277 T/C 1 22 29 51 10.7888593152439 14.7783218117239 -3.98946249647995 T:C T C 10 0.509597303852548 0.326950536712825 ENSG00000204859:ENST00000377674:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000482360:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000498342:exon_6648120_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000466941:exon_6648976_6649340:ZBTB48 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 6659505 G/A 1 9 2 11 4.41362426532707 1.0191946077051 3.39442965762197 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0659641183816961 ENSG00000162413:ENST00000377658:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000377663:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000467612:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000496707:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000463043:exon_6659107_6659512:KLHL21 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 6693097 A/G 1 16 10 26 7.84644313835923 5.09597303852548 2.75047009983375 A:G A G 10 0.509597303852548 0.329269094926831 ENSG00000041988:ENST00000054650:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000307896:exon_6692856_6693428:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000400912:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000484669:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000487819:exon_6692856_6693181:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000472925:exon_6692451_6693111:THAP3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 6694574 G/A 1 30 40 70 14.7120808844236 20.3838921541019 -5.67181126967836 A:G G A 10 0.509597303852548 0.189461788123054 ENSG00000041988:ENST00000377627:exon_6694080_6695646:THAP3;ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000451196:exon_6694228_6694844:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000465508:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6694228_6695760:DNAJC11 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 10460485 T/C 1 12 11 23 5.88483235376942 5.60557034237803 0.279262011391396 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000142657:ENST00000491493:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000377062:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000477958:exon_10460433_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000465632:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10460450_10460629:PGD HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 10473196 C/T 1 14 23 37 6.86563774606433 11.7207379886086 -4.85510024254427 T:C C T 10 0.509597303852548 0.138293675848893 ENSG00000142657:ENST00000490057:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000483936:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000493288:exon_10472891_10473308:PGD HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 11087524 G/A 1 13 6 19 6.37523504991688 3.05758382311529 3.31765122680159 A:G G A 10 0.509597303852548 0.168554935531064 ENSG00000009724:ENST00000400897:exon_11086580_11087705:MASP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 11090916 C/A 1 5 5 10 2.45201348073726 2.54798651926274 -0.0959730385254796 A:C C A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000009724:ENST00000400897:exon_11090805_11090939:MASP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 11132217 G/A 1 24 20 44 11.7696647075388 10.191946077051 1.57771863048789 A:G G A 10 0.509597303852548 0.654233691502169 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000469634:exon_11130957_11133083:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000478271:exon_11132144_11132452:EXOSC10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 11141187 C/G 1 11 7 18 5.39442965762197 3.56718112696784 1.82724853065414 C:G C G 10 0.509597303852548 0.482156564682581 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11141139_11141295:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11141139_11141295:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11141139_11141274:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000485606:exon_11141139_11141295:EXOSC10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 11728894 G/A 1 6 4 10 2.94241617688471 2.03838921541019 0.90402696147452 A:G G A 10 0.509597303852548 0.75435926131823 ENSG00000116663:ENST00000376749:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000376753:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000474239:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000449067:exon_11728753_11729001:FBXO6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 12082926 A/G 1 5 12 17 2.45201348073726 6.11516764623058 -3.66315416549332 A:G A G 10 0.509597303852548 0.090883178805902 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12082921_12082974:MIIP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 12157288 T/C 1 6 6 12 2.94241617688471 3.05758382311529 -0.115167646230576 T:C T C 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 12195594 G/T 1 2 6 8 0.980805392294904 3.05758382311529 -2.07677843082038 T:G G T 10 0.509597303852548 0.171857042968518 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 12198297 T/C 1 11 16 27 5.39442965762197 8.15355686164077 -2.7591272040188 T:C T C 10 0.509597303852548 0.337959274816801 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12198286_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12198289_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000413146:exon_12198286_12198493:TNFRSF8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 15892415 A/C 1 7 1 8 3.43281887303216 0.509597303852548 2.92322156917962 A:C A C 10 0.509597303852548 0.0707155477569663 ENSG00000116138:ENST00000375847:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000375838:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000475133:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000375849:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000483270:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000472665:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000479655:exon_15892313_15892494:DNAJC16 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 15904318 C/T 1 14 5 19 6.86563774606433 2.54798651926274 4.31765122680159 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0644836423988429 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15904180_15904359:AGMAT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 15905501 G/A 1 6 5 11 2.94241617688471 2.54798651926274 0.394429657621972 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15905354_15905549:AGMAT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 15911349 G/A 1 3 8 11 1.47120808844236 4.07677843082038 -2.60557034237803 A:G G A 10 0.509597303852548 0.139008716253398 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15911191_15911605:AGMAT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 15959977 C/T 1 1 7 8 0.490402696147452 3.56718112696784 -3.07677843082038 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0357022765843499 ENSG00000197312:ENST00000480945:exon_15959934_15960060:DDI2;ENSG00000197312:ENST00000486680:exon_15959934_15960801:DDI2;ENSG00000197312:ENST00000320153:exon_15959934_15960060:DDI2;ENSG00000197312:ENST00000483899:exon_15959934_15960060:DDI2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 15986547 T/C 1 5 13 18 2.45201348073726 6.62476495008312 -4.17275146934586 T:C T C 10 0.509597303852548 0.059364647228317 ENSG00000197312:ENST00000480945:exon_15986332_15995539:DDI2;ENSG00000197312:ENST00000320153:exon_15986332_15987552:DDI2;ENSG00000215695:ENST00000345034:exon_15986364_15988217:RSC1A1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 16042766 T/C 1 5 7 12 2.45201348073726 3.56718112696784 -1.11516764623058 T:C T C 10 0.509597303852548 0.574428486272357 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16042732_16042838:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16042732_16042838:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16042732_16042838:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000462455:exon_16042732_16042838:PLEKHM2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 16056364 G/A 1 10 8 18 4.90402696147452 4.07677843082038 0.827248530654137 A:G G A 10 0.509597303852548 0.815143514661865 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000477849:exon_16056340_16056424:PLEKHM2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 16247460 C/T 1 6 10 16 2.94241617688471 5.09597303852548 -2.15355686164077 T:C C T 10 0.509597303852548 0.324290953365588 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16247365_16247478:SPEN;ENSG00000065526:ENST00000375753:exon_16247365_16247478:SPEN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 16255936 G/A 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 16256007 T/C 1 4 9 13 1.96161078458981 4.58637573467293 -2.62476495008312 T:C T C 10 0.509597303852548 0.172159462736175 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 16259143 G/A 1 5 11 16 2.45201348073726 5.60557034237803 -3.15355686164077 A:G G A 10 0.509597303852548 0.136896620322009 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 16259813 A/G 1 17 8 25 8.33684583450668 4.07677843082038 4.2600674036863 A:G A G 10 0.509597303852548 0.109366962829306 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 16272250 A/G 1 10 4 14 4.90402696147452 2.03838921541019 2.86563774606433 A:G A G 10 0.509597303852548 0.180690507474734 ENSG00000116809:ENST00000375743:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375733:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444654:exon_16272210_16272339:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375729:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000448462:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000492834:exon_16272210_16272579:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000490899:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000464719:exon_16272216_16272335:ZBTB17 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 17314702 C/T 1 12 3 15 5.88483235376942 1.52879191155764 4.35604044221178 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0356477356687783 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17314633_17314729:ATP13A2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 19411129 A/G 1 34 23 57 16.6736916690134 11.7207379886086 4.95295368040477 A:G A G 10 0.509597303852548 0.232912303539314 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19410998_19411192:UBR4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 19433449 A/G 1 11 7 18 5.39442965762197 3.56718112696784 1.82724853065414 A:G A G 10 0.509597303852548 0.482156564682581 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000494503:exon_19433331_19433460:UBR4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 19561618 T/C 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 T:C T C 10 0.509597303852548 0.74955201040747 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 19583636 C/T 1 31 21 52 15.202483580571 10.7015433809035 4.50094019966751 T:C C T 10 0.509597303852548 0.267008741114759 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19583558_19583639:MRTO4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 19584004 G/A 1 28 46 74 13.7312754921287 23.4414759772172 -9.71020048508855 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0268547637162471 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19583948_19584015:MRTO4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 19584030 G/A 1 4 15 19 1.96161078458981 7.64395955778822 -5.68234877319841 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0105208101247097 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 19584035 G/A 1 15 4 19 7.35604044221178 2.03838921541019 5.31765122680159 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0196199845247410 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 19585207 G/A 1 87 92 179 42.6650345648283 46.8829519544344 -4.21791738960609 A:G G A 10 0.509597303852548 0.550254390198436 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19585175_19586622:MRTO4;ENSG00000053372:ENST00000479559:exon_19585175_19585233:MRTO4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 19585280 G/A 1 73 66 139 35.799396818764 33.6334220542682 2.16597476449583 A:T:G G A 10 0.509597303852548 0.73492313328535 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19585175_19586622:MRTO4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 20827216 C/T 1 2 7 9 0.980805392294904 3.56718112696784 -2.58637573467293 T:C C T 10 0.509597303852548 0.103145007117103 ENSG00000090432:ENST00000264198:exon_20825943_20827912:MUL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 20977221 A/T 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 A:T A T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 20978832 T/C 1 205 238 443 100.532552710228 121.284158316906 -20.7516056066788 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0513193076209517 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20978270_20979021:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20978685_20979021:DDOST HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 20981908 G/A 1 13 15 28 6.37523504991688 7.64395955778822 -1.26872450787134 A:G G A 10 0.509597303852548 0.707126514476892 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 22109370 G/A 1 20 9 29 9.80805392294904 4.58637573467293 5.22167818827611 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0628036817076372 ENSG00000090686:ENST00000400301:exon_22109317_22109688:USP48;ENSG00000090686:ENST00000308271:exon_22109317_22110099:USP48;ENSG00000090686:ENST00000529637:exon_22109317_22109484:USP48;ENSG00000090686:ENST00000421625:exon_22109317_22110099:USP48;ENSG00000090686:ENST00000532737:exon_22109317_22109384:USP48;ENSG00000090686:ENST00000489108:exon_22109317_22109436:USP48 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 23419855 T/C 1 9 7 16 4.41362426532707 3.56718112696784 0.846443138359232 T:C T C 10 0.509597303852548 0.80419746365061 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 23836364 A/G 1 4 12 16 1.96161078458981 6.11516764623058 -4.15355686164077 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0453868150142898 ENSG00000007968:ENST00000361729:exon_23832922_23836640:E2F2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 24083494 C/T 1 26 20 46 12.7504700998338 10.191946077051 2.55852402278279 T:C C T 10 0.509597303852548 0.465195778344218 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24083443_24083615:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24083443_24083615:TCEB3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 24200969 T/C 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 24200983 C/T 1 10 4 14 4.90402696147452 2.03838921541019 2.86563774606433 T:C C T 10 0.509597303852548 0.180690507474734 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 24201094 G/C 1 6 14 20 2.94241617688471 7.13436225393567 -4.19194607705096 C:G G C 10 0.509597303852548 0.0737108731541632 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 24201109 C/T 1 7 12 19 3.43281887303216 6.11516764623058 -2.68234877319841 T:C C T 10 0.509597303852548 0.255561328037084 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 24201262 A/G 1 6 8 14 2.94241617688471 4.07677843082038 -1.13436225393567 A:G A G 10 0.509597303852548 0.601095068648336 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 24201357 A/G 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 A:G A G 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 24201448 C/T 1 4 12 16 1.96161078458981 6.11516764623058 -4.15355686164077 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0453868150142898 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 24201643 G/A 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 25228739 G/A 1 49 34 83 24.0297321112251 17.3263083309866 6.70342378023852 A:G G A 10 0.509597303852548 0.153989428303171 ENSG00000020633:ENST00000399916:exon_25226002_25229157:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000428150:exon_25226002_25229157:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000308873:exon_25226009_25229157:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000338888:exon_25227520_25229157:RUNX3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 25291010 A/T 1 48 62 110 23.5393294150777 31.595032838858 -8.05570342378028 A:T A T 10 0.509597303852548 0.12802687553214 ENSG00000020633:ENST00000399916:exon_25291005_25291501:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000428150:exon_25291005_25291501:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000338888:exon_25291005_25291159:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000479341:exon_25291005_25291070:RUNX3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 25572984 T/G 1 15 4 19 7.35604044221178 2.03838921541019 5.31765122680159 T:G T G 10 0.509597303852548 0.0196199845247410 ENSG00000117616:ENST00000498238:exon_25572935_25573520:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000243189:exon_25572935_25573520:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000473314:exon_25572935_25573520:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000417642:exon_25572935_25573022:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000475766:exon_25572935_25573026:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000431849:exon_25572935_25573520:C1orf63 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 26786627 G/A 1 14 8 22 6.86563774606433 4.07677843082038 2.78885931524394 A:G G A 10 0.509597303852548 0.288242782553056 ENSG00000117682:ENST00000434391:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000357049:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374192:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000525682:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000236342:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000526219:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000360009:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374194:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000430232:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000416052:exon_26786528_26786635:DHDDS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 27676925 G/A 1 16 15 31 7.84644313835923 7.64395955778822 0.202483580571013 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27676880_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27676463_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27675889_27678549:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27675889_27677827:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000496001:exon_27676880_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000485269:exon_27676463_27676976:SYTL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 27679797 A/G 1 27 35 62 13.2408727959812 17.8359056348392 -4.59503283885797 A:G A G 10 0.509597303852548 0.255204258532305 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27677963_27679979:SYTL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 27680292 A/G 1 45 16 61 22.0681213266353 8.15355686164077 13.9145644649946 A:G A G 10 0.509597303852548 0.000442966446868408 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27680204_27680421:SYTL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 28206588 T/C 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 T:C T C 10 0.509597303852548 0.335037018547339 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 28206592 C/T 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 T:C C T 10 0.509597303852548 0.541646560898822 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 29069443 G/A 1 20 23 43 9.80805392294904 11.7207379886086 -1.91268406565956 A:G G A 10 0.509597303852548 0.647870895498899 ENSG00000198492:ENST00000373812:exon_29068915_29070498:YTHDF2;ENSG00000198492:ENST00000478283:exon_29068915_29070498:YTHDF2;ENSG00000198492:ENST00000496288:exon_29068915_29069514:YTHDF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 29475648 T/G 1 54 58 112 26.4817455919624 29.5566436234478 -3.07489803148538 T:G T G 10 0.509597303852548 0.572063500767098 ENSG00000116350:ENST00000373795:exon_29474255_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000434636:exon_29475262_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000466448:exon_29475183_29475738:SRSF4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 31215364 T/C 1 59 65 124 28.9337590726997 33.1238247504156 -4.19006567771595 T:C T C 10 0.509597303852548 0.473211805640585 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000424259:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000464569:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000476492:exon_31214536_31215396:LAPTM5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 32669468 C/T 1 6 2 8 2.94241617688471 1.0191946077051 1.92322156917962 T:C C T 10 0.509597303852548 0.289787629707581 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 35320690 T/G 1 17 30 47 8.33684583450668 15.2879191155764 -6.95107328106976 T:G T G 10 0.509597303852548 0.0567418680655312 ENSG00000163866:ENST00000521580:exon_35319391_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000446026:exon_35320651_35321583:C1orf212 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 35652770 C/G 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 C:G C G 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 35658492 C/T 1 42 29 71 20.596913238193 14.7783218117239 5.81859142646909 T:C C T 10 0.509597303852548 0.191724241443628 ENSG00000116560:ENST00000357214:exon_35657823_35658749:SFPQ HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 35900615 A/G 1 14 12 26 6.86563774606433 6.11516764623058 0.750470099833752 A:G A G 10 0.509597303852548 0.845759645675331 ENSG00000142687:ENST00000325722:exon_35899091_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373258:exon_35899092_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373266:exon_35899706_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000426982:exon_35900566_35900682:KIAA0319L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 36752152 C/T 1 21 13 34 10.2984566190965 6.62476495008312 3.67369166901337 T:C C T 10 0.509597303852548 0.232402178431562 ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 36787888 G/A 1 10 3 13 4.90402696147452 1.52879191155764 3.37523504991688 A:T:G G A 10 0.509597303852548 0.0930569697494132 ENSG00000142694:ENST00000270824:exon_36787632_36788326:FAM176B;ENSG00000142694:ENST00000490466:exon_36787882_36788326:FAM176B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 36807481 C/T 1 13 6 19 6.37523504991688 3.05758382311529 3.31765122680159 T:C C T 10 0.509597303852548 0.168554935531064 ENSG00000196182:ENST00000373129:exon_36805225_36807574:STK40;ENSG00000196182:ENST00000359297:exon_36805225_36809049:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373130:exon_36805225_36807574:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373132:exon_36805225_36807574:STK40 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 38149076 G/A 1 2 6 8 0.980805392294904 3.05758382311529 -2.07677843082038 A:G G A 10 0.509597303852548 0.171857042968518 ENSG00000116922:ENST00000358011:exon_38148991_38149109:C1orf109;ENSG00000116922:ENST00000494120:exon_38148991_38149148:C1orf109;ENSG00000116922:ENST00000464178:exon_38148991_38149113:C1orf109;ENSG00000116922:ENST00000464085:exon_38148991_38149109:C1orf109;ENSG00000116922:ENST00000491981:exon_38148991_38149109:C1orf109 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 38329999 C/G 1 14 6 20 6.86563774606433 3.05758382311529 3.80805392294904 C:G C G 10 0.509597303852548 0.116652704888565 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38329984_38330095:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38329984_38330095:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38329984_38330095:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38329984_38330095:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38329984_38330095:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000487328:exon_38329984_38330521:INPP5B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 38423853 G/C 1 97 100 197 47.5690615263028 50.9597303852548 -3.39066885895195 C:G G C 10 0.509597303852548 0.669110813256035 ENSG00000183431:ENST00000373019:exon_38422647_38423935:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000448721:exon_38423631_38423935:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000487062:exon_38423735_38423935:SF3A3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 39311617 T/G 1 14 20 34 6.86563774606433 10.191946077051 -3.32630833098663 T:G T G 10 0.509597303852548 0.304159847215698 ENSG00000116954:ENST00000373001:exon_39311611_39311759:RRAGC;ENSG00000116954:ENST00000474456:exon_39311611_39313746:RRAGC;ENSG00000116954:ENST00000411897:exon_39311611_39311759:RRAGC;ENSG00000116954:ENST00000493015:exon_39311611_39311759:RRAGC HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 39748921 G/A 1 10 7 17 4.90402696147452 3.56718112696784 1.33684583450668 A:G G A 10 0.509597303852548 0.630150764673374 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39748861_39748973:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39748861_39748973:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39748861_39748973:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000524432:exon_39748861_39748973:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000404645:exon_39748861_39748973:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000496804:exon_39748861_39748973:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000530262:exon_39748861_39748973:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39748861_39748973:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000485063:exon_39748798_39748973:MACF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 39799912 C/T 1 2 9 11 0.980805392294904 4.58637573467293 -3.60557034237803 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0353083305106556 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39796875_39802325:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39796810_39802325:MACF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 39838174 T/C 1 10 13 23 4.90402696147452 6.62476495008312 -1.7207379886086 T:C T C 10 0.509597303852548 0.53508614923685 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39838151_39838268:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39838151_39838268:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39838151_39838268:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39838151_39838268:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000476350:exon_39838151_39839145:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39838151_39838268:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39838151_39838268:MACF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 39908506 G/A 1 2 9 11 0.980805392294904 4.58637573467293 -3.60557034237803 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0353083305106556 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39908386_39908583:MACF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 39914363 G/C 1 6 6 12 2.94241617688471 3.05758382311529 -0.115167646230576 C:G G C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39914266_39914435:MACF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 39929240 T/C 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 T:C T C 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 40881041 C/G 1 42 35 77 20.596913238193 17.8359056348392 2.76100760335381 C:G C G 10 0.509597303852548 0.569641086287163 ENSG00000084070:ENST00000435168:exon_40880944_40881053:SMAP2;ENSG00000084070:ENST00000372718:exon_40880944_40881053:SMAP2;ENSG00000084070:ENST00000372708:exon_40880944_40881053:SMAP2;ENSG00000084070:ENST00000487871:exon_40880944_40881041:SMAP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 40980731 G/T 1 6 7 13 2.94241617688471 3.56718112696784 -0.624764950083124 T:G G T 10 0.509597303852548 0.786978111840725 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000420209:exon_40980187_40980894:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000418186:exon_40980187_40980888:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000443729:exon_40980187_40980958:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000419161:exon_40980187_40980958:DEM1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 41979156 A/G 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 A:G A G 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41978487_41979421:HIVEP3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 43131653 G/A 1 13 19 32 6.37523504991688 9.68234877319841 -3.30711372328154 A:G G A 10 0.509597303852548 0.289691482989316 ENSG00000171960:ENST00000304979:exon_43131651_43131738:PPIH;ENSG00000171960:ENST00000372550:exon_43131651_43131738:PPIH;ENSG00000171960:ENST00000440068:exon_43131651_43131738:PPIH;ENSG00000171960:ENST00000455203:exon_43131651_43131738:PPIH;ENSG00000171960:ENST00000461351:exon_43131651_43131738:PPIH HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 43395635 C/T 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 T:C C T 10 0.509597303852548 0.335037018547339 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43395544_43395706:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43395544_43395706:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43395544_43395646:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000439722:exon_43395544_43395706:SLC2A1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 43396414 G/A 1 2 9 11 0.980805392294904 4.58637573467293 -3.60557034237803 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0353083305106556 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43396297_43396537:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43396297_43396537:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000475162:exon_43396297_43396537:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000439722:exon_43396297_43396611:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372500:exon_43395990_43396537:SLC2A1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 43408966 G/A 1 7 1 8 3.43281887303216 0.509597303852548 2.92322156917962 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0707155477569663 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000415851:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372500:exon_43408897_43408992:SLC2A1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 43632536 C/T 1 118 120 238 57.8675181453993 61.1516764623058 -3.28415831690642 T:C:G C T 10 0.509597303852548 0.697469686560974 ENSG00000117395:ENST00000236051:exon_43632497_43632590:EBNA1BP2;ENSG00000117395:ENST00000431635:exon_43632497_43632590:EBNA1BP2;ENSG00000117395:ENST00000463906:exon_43632497_43632590:EBNA1BP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 43636484 C/G 1 43 50 93 21.0873159343404 25.4798651926274 -4.39254925828696 C:G C G 10 0.509597303852548 0.406937667287109 ENSG00000117395:ENST00000236051:exon_43636427_43636550:EBNA1BP2;ENSG00000117395:ENST00000463906:exon_43636427_43636792:EBNA1BP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 45269333 A/G 1 8 4 12 3.92322156917962 2.03838921541019 1.88483235376942 A:G A G 10 0.509597303852548 0.388763190446408 ENSG00000173846:ENST00000372201:exon_45269272_45269363:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000465443:exon_45269272_45269363:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000492398:exon_45269272_45269363:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000461358:exon_45269272_45269696:PLK3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 45469155 C/T 1 19 14 33 9.31765122680159 7.13436225393567 2.18328897286592 T:C C T 10 0.509597303852548 0.489512959476332 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000372168:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486132:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45468220_45469248:HECTD3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 45469586 G/A 1 9 11 20 4.41362426532707 5.60557034237803 -1.19194607705096 A:G G A 10 0.509597303852548 0.658614646611609 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000372168:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486132:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486296:exon_45469527_45469608:HECTD3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 45471592 G/T 1 9 3 12 4.41362426532707 1.52879191155764 2.88483235376942 T:G G T 10 0.509597303852548 0.146886429190433 ENSG00000126107:ENST00000466423:exon_45471466_45471788:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000487488:exon_45471317_45471788:HECTD3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 45479709 A/G 1 16 19 35 7.84644313835923 9.68234877319841 -1.83590563483918 A:G A G 10 0.509597303852548 0.613168616066627 ENSG00000126088:ENST00000246337:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000491300:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000434478:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000494399:exon_45479581_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000372135:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460334:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000462688:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000490385:exon_45479581_45479892:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460906:exon_45479247_45479792:UROD;ENSG00000126088:ENST00000469548:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000486699:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000478467:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000496439:exon_45479266_45479810:UROD HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 45797505 C/G 1 8 5 13 3.92322156917962 2.54798651926274 1.37523504991688 C:G C G 10 0.509597303852548 0.581979954468297 ENSG00000132781:ENST00000372104:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000448481:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000456914:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000354383:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000475516:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000355498:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372098:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000481571:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372110:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372115:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000528332:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000525481:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000532813:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372100:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000450313:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000426432:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000431970:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000467459:exon_45797333_45797544:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000482094:exon_45797333_45797755:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000533178:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000412971:exon_45797406_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000462388:exon_45797419_45797758:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000466231:exon_45797442_45797521:MUTYH HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 46078854 A/G 1 38 22 60 18.6353024536032 11.2111406847561 7.42416176884712 A:C:G A G 10 0.509597303852548 0.0698089004150027 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 46078884 C/T 1 34 34 68 16.6736916690134 17.3263083309866 -0.652616661973262 T:C C T 10 0.509597303852548 0.903897906452372 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 46094027 A/G 1 44 60 104 21.5777186304879 30.5758382311529 -8.99811960066499 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0949819161175493 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46092978_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46093629_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46093900_46094080:GPBP1L1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 46095272 T/C 1 55 63 118 26.9721482881099 32.1046301427105 -5.13248185460066 T:C T C 10 0.509597303852548 0.358295965798541 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46095248_46095387:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000468724:exon_46095260_46095350:GPBP1L1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 46120458 G/A 1 9 7 16 4.41362426532707 3.56718112696784 0.846443138359232 A:G G A 10 0.509597303852548 0.80419746365061 ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46120215_46120501:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46120215_46120501:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000498128:exon_46120215_46120501:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000496278:exon_46119943_46120501:GPBP1L1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 46498375 A/G 1 5 11 16 2.45201348073726 5.60557034237803 -3.15355686164077 A:G A G 10 0.509597303852548 0.136896620322009 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46498268_46498390:MAST2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 46500613 T/C 1 19 19 38 9.31765122680159 9.68234877319841 -0.364697546396823 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46500210_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46500501_46501738:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46500499_46501794:MAST2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 46500744 G/C 1 14 16 30 6.86563774606433 8.15355686164077 -1.28791911557644 C:G G C 10 0.509597303852548 0.71637122408149 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46500210_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46500501_46501738:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46500499_46501794:MAST2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 46521517 G/A 1 3 7 10 1.47120808844236 3.56718112696784 -2.09597303852548 A:G G A 10 0.509597303852548 0.218348598150516 ENSG00000117461:ENST00000372006:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000262741:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000340332:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000420542:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000488808:exon_46521467_46523106:PIK3R3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 46521559 A/T 1 2 13 15 0.980805392294904 6.62476495008312 -5.64395955778822 A:T A T 10 0.509597303852548 0.00359219056269937 ENSG00000117461:ENST00000372006:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000262741:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000340332:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000420542:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000488808:exon_46521467_46523106:PIK3R3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 46743900 C/T 1 23 27 50 11.2792620113914 13.7591272040188 -2.4798651926274 T:C C T 10 0.509597303852548 0.57199244838827 ENSG00000085999:ENST00000442598:exon_46743744_46744145:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000371975:exon_46743744_46744144:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000488942:exon_46743744_46744111:RAD54L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 46746164 C/T 1 15 16 31 7.35604044221178 8.15355686164077 -0.797516419428987 T:C C T 10 0.509597303852548 0.85815003034519 ENSG00000132128:ENST00000496156:exon_46746068_46746232:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000343304:exon_46746068_46746232:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000472710:exon_46746068_46746232:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000254454:exon_46746068_46746232:LRRC41 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 46810530 A/G 1 7 6 13 3.43281887303216 3.05758382311529 0.375235049916876 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46810454_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46810473_46810634:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000475281:exon_46810473_46811046:NSUN4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 46827456 A/G 1 57 43 100 27.9529536804048 21.9126840656596 6.0402696147452 A:G A G 10 0.509597303852548 0.231898228413810 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46827242_46827863:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46827242_46827862:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46827242_46830824:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46827242_46827862:NSUN4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 51121198 T/C 1 8 9 17 3.92322156917962 4.58637573467293 -0.663154165493316 T:C T C 10 0.509597303852548 0.811525826845625 ENSG00000185104:ENST00000396153:exon_51121114_51121200:FAF1;ENSG00000185104:ENST00000494400:exon_51121114_51121200:FAF1;ENSG00000185104:ENST00000371778:exon_51121114_51121200:FAF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 51873951 G/A 1 11 12 23 5.39442965762197 6.11516764623058 -0.720737988608604 A:G G A 10 0.509597303852548 0.836390489019417 ENSG00000085832:ENST00000371733:exon_51873807_51874004:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000396122:exon_51873807_51874004:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000493793:exon_51873807_51874004:EPS15 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 52264064 A/G 1 24 22 46 11.7696647075388 11.2111406847561 0.558524022782793 A:G A G 10 0.509597303852548 0.88398339195127 ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000497358:exon_52263921_52264083:NRD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 52498370 C/T 1 16 9 25 7.84644313835923 4.58637573467293 3.2600674036863 T:C C T 10 0.509597303852548 0.231674186241233 ENSG00000198841:ENST00000371614:exon_52497775_52499488:KTI12 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 52882406 A/G 1 32 34 66 15.6928862767185 17.3263083309866 -1.63342205426817 A:G A G 10 0.509597303852548 0.71323255299954 ENSG00000134748:ENST00000257181:exon_52882320_52883992:PRPF38A;ENSG00000134748:ENST00000474048:exon_52882320_52882694:PRPF38A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 52991983 A/G 1 1 7 8 0.490402696147452 3.56718112696784 -3.07677843082038 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0357022765843499 ENSG00000134744:ENST00000257177:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371544:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000433200:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000528642:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000395916:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000473856:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000355809:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000470626:exon_52991692_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000524582:exon_52991722_52992045:ZCCHC11 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 53153432 T/C 1 12 18 30 5.88483235376942 9.17275146934586 -3.28791911557644 T:C T C 10 0.509597303852548 0.274372180357671 ENSG00000162377:ENST00000371538:exon_53152508_53153840:C1orf163;ENSG00000162377:ENST00000486918:exon_53153234_53153840:C1orf163 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 53387379 G/C 1 9 6 15 4.41362426532707 3.05758382311529 1.35604044221178 C:G G C 10 0.509597303852548 0.608250593906015 ENSG00000121310:ENST00000460612:exon_53387225_53387434:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000358358:exon_53387225_53387398:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000476477:exon_53387225_53387446:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000467988:exon_53387225_53387390:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000495920:exon_53387225_53387386:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000474789:exon_53387225_53387393:ECHDC2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 54681920 G/C 1 47 72 119 23.0489267189302 36.6910058773835 -13.6420791584532 C:G G C 10 0.509597303852548 0.0131805336115893 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000329505:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000398219:exon_54681814_54682017:MRPL37 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 54683856 C/G 1 163 144 307 79.9356394720347 73.3820117547669 6.55362771726777 C:G C G 10 0.509597303852548 0.458693877350101 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 55319902 A/G 1 6 4 10 2.94241617688471 2.03838921541019 0.90402696147452 A:G A G 10 0.509597303852548 0.75435926131823 ENSG00000116133:ENST00000371269:exon_55319710_55319907:DHCR24 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 59147926 T/C 1 14 9 23 6.86563774606433 4.58637573467293 2.2792620113914 T:C T C 10 0.509597303852548 0.406879858723006 ENSG00000162601:ENST00000472487:exon_59147457_59148217:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000493821:exon_59147457_59148217:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000401044:exon_59147457_59148217:MYSM1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 59148118 A/T 1 2 11 13 0.980805392294904 5.60557034237803 -4.62476495008312 A:T A T 10 0.509597303852548 0.0114798061912099 ENSG00000162601:ENST00000472487:exon_59147457_59148217:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000493821:exon_59147457_59148217:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000401044:exon_59147457_59148217:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000466774:exon_59148081_59148217:MYSM1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 64097432 C/T 1 1 7 8 0.490402696147452 3.56718112696784 -3.07677843082038 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0357022765843499 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64097328_64097453:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64097328_64097453:PGM1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 64114301 T/C 1 14 15 29 6.86563774606433 7.64395955778822 -0.778321811723892 T:C T C 10 0.509597303852548 0.8535202569064 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64114188_64114323:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64114188_64114323:PGM1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 68942605 A/G 1 8 2 10 3.92322156917962 1.0191946077051 2.90402696147452 A:G A G 10 0.509597303852548 0.110022635989167 ENSG00000024526:ENST00000456315:exon_68939835_68942752:DEPDC1;ENSG00000024526:ENST00000370966:exon_68939835_68942752:DEPDC1;ENSG00000024526:ENST00000443267:exon_68939837_68942752:DEPDC1;ENSG00000024526:ENST00000370962:exon_68939837_68942752:DEPDC1;ENSG00000024526:ENST00000488146:exon_68941257_68942752:DEPDC1;ENSG00000024526:ENST00000489862:exon_68942580_68942752:DEPDC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 78177432 C/T 1 10 20 30 4.90402696147452 10.191946077051 -5.28791911557644 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0668760308425303 ENSG00000077254:ENST00000370794:exon_78177432_78177540:USP33;ENSG00000077254:ENST00000481579:exon_78177432_78177540:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370793:exon_78177432_78177540:USP33;ENSG00000077254:ENST00000357428:exon_78177432_78177540:USP33;ENSG00000077254:ENST00000477949:exon_78177187_78177540:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370792:exon_78177337_78177540:USP33;ENSG00000077254:ENST00000527390:exon_78177350_78177540:USP33 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 79093818 A/G 1 38 78 116 18.6353024536032 39.7485897004987 -21.1132872468956 A:T:G A G 10 0.509597303852548 8.52289725272006e-05 ENSG00000137959:ENST00000452835:exon_79093591_79093892:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79091355_79094684:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79093670_79094078:IFI44L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 79094081 T/A 1 29 21 50 14.2216781882761 10.7015433809035 3.5201348073726 A:T T A 10 0.509597303852548 0.326695624004240 ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79091355_79094684:IFI44L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 79095581 T/C 1 55 93 148 26.9721482881099 47.392549258287 -20.4204009701771 T:C T C 10 0.509597303852548 0.000943851296928346 ENSG00000137959:ENST00000476521:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000462041:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000474002:exon_79095320_79095600:IFI44L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 84944975 C/T 1 16 17 33 7.84644313835923 8.66315416549332 -0.816711027134083 T:C C T 10 0.509597303852548 0.862372813357438 ENSG00000117133:ENST00000370656:exon_84944942_84945192:RPF1;ENSG00000117133:ENST00000370654:exon_84944950_84945192:RPF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 84944989 A/G 1 17 21 38 8.33684583450668 10.7015433809035 -2.36469754639682 A:G A G 10 0.509597303852548 0.517252281448455 ENSG00000117133:ENST00000370656:exon_84944942_84945192:RPF1;ENSG00000117133:ENST00000370654:exon_84944950_84945192:RPF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 85113203 T/C 1 11 12 23 5.39442965762197 6.11516764623058 -0.720737988608604 T:C T C 10 0.509597303852548 0.836390489019417 ENSG00000117155:ENST00000342203:exon_85109390_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000437941:exon_85109599_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000481102:exon_85113022_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000476905:exon_85113024_85113290:SSX2IP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 85113229 A/G 1 9 9 18 4.41362426532707 4.58637573467293 -0.172751469345863 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000117155:ENST00000342203:exon_85109390_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000437941:exon_85109599_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000481102:exon_85113022_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000476905:exon_85113024_85113290:SSX2IP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 85724328 C/T 1 2 12 14 0.980805392294904 6.11516764623058 -5.13436225393567 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0064484390483877 ENSG00000162642:ENST00000294661:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000471115:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000493514:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000344356:exon_85724207_85724405:C1orf52 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 89426902 G/A 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 A:G G A 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000137944:ENST00000370491:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000446900:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000260508:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000394677:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370485:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370486:exon_89426850_89426970:CCBL2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 89474818 A/G 1 8 5 13 3.92322156917962 2.54798651926274 1.37523504991688 A:G A G 10 0.509597303852548 0.581979954468297 ENSG00000117226:ENST00000370482:exon_89474630_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000489444:exon_89474630_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000370481:exon_89474630_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000461384:exon_89474527_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000445969:exon_89474618_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000493594:exon_89474782_89474823:GBP3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 89522646 G/C 1 10 1 11 4.90402696147452 0.509597303852548 4.39442965762197 C:G G C 10 0.509597303852548 0.0118772360206333 ENSG00000117228:ENST00000422952:exon_89522537_89522728:GBP1;ENSG00000117228:ENST00000370473:exon_89522537_89522817:GBP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 93620308 T/C 1 17 16 33 8.33684583450668 8.15355686164077 0.183288972865917 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000117500:ENST00000370282:exon_93615299_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000370290:exon_93617415_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000483033:exon_93619753_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000479918:exon_93619789_93620445:TMED5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 93620393 G/A 1 17 11 28 8.33684583450668 5.60557034237803 2.73127549212866 A:G G A 10 0.509597303852548 0.347429568613864 ENSG00000117500:ENST00000370282:exon_93615299_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000370290:exon_93617415_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000483033:exon_93619753_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000479918:exon_93619789_93620445:TMED5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 93646433 T/C 1 7 5 12 3.43281887303216 2.54798651926274 0.884832353769424 T:C T C 10 0.509597303852548 0.774912283175237 ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93646281_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93646326_93646439:CCDC18 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 93672688 C/T 1 17 15 32 8.33684583450668 7.64395955778822 0.692886276718465 T:C C T 10 0.509597303852548 0.860872784865693 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000455267:exon_93672664_93672955:CCDC18 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 94341267 A/G 1 38 28 66 18.6353024536032 14.2687245078713 4.36657794573183 A:G A G 10 0.509597303852548 0.324982796775689 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341201_94341339:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341222_94341339:DNTTIP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 94342564 C/A 1 49 43 92 24.0297321112251 21.9126840656596 2.11704804556559 A:C C A 10 0.509597303852548 0.677844386426046 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000496672:exon_94342315_94343045:DNTTIP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 94343023 A/G 1 23 19 42 11.2792620113914 9.68234877319841 1.59691323819299 A:G A G 10 0.509597303852548 0.646542574908432 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000496672:exon_94342315_94343045:DNTTIP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 94343233 T/C 1 12 15 27 5.88483235376942 7.64395955778822 -1.7591272040188 T:C T C 10 0.509597303852548 0.56601930423381 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000528680:exon_94343029_94343439:DNTTIP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 94344716 C/T 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94344633_94344762:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94344633_94344718:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94344104_94345474:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000528680:exon_94344633_94344720:DNTTIP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 109242392 A/G 1 422 430 852 206.949937774225 219.126840656596 -12.1769028823709 A:G A G 10 0.509597303852548 0.410986059857366 ENSG00000134186:ENST00000370025:exon_109241784_109244425:PRPF38B;ENSG00000134186:ENST00000370021:exon_109241784_109244425:PRPF38B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 110596569 G/A 1 22 14 36 10.7888593152439 7.13436225393567 3.65449706130827 A:G G A 10 0.509597303852548 0.246114197831200 ENSG00000143093:ENST00000369796:exon_110596287_110597261:FAM40A;ENSG00000143093:ENST00000369795:exon_110596287_110597263:FAM40A;ENSG00000143093:ENST00000485775:exon_110596287_110597263:FAM40A;ENSG00000143093:ENST00000473429:exon_110596287_110597424:FAM40A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 110882444 A/G 1 8 4 12 3.92322156917962 2.03838921541019 1.88483235376942 A:G A G 10 0.509597303852548 0.388763190446408 ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110881128_110884890:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110882058_110884890:RBM15 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 111778325 C/T 1 26 10 36 12.7504700998338 5.09597303852548 7.65449706130827 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0118644651223810 ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000528451:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000486561:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000474304:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000477185:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000467038:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497587:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111778261_111778385:CHI3L2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 111783982 C/T 1 24 29 53 11.7696647075388 14.7783218117239 -3.00865710418504 T:C C T 10 0.509597303852548 0.414112115940141 ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000472825:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000529459:exon_111783949_111784065:CHI3L2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 112269872 G/A 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 A:G G A 10 0.509597303852548 0.335037018547339 ENSG00000197852:ENST00000357260:exon_112264686_112270426:C1orf183;ENSG00000197852:ENST00000444059:exon_112269128_112270426:C1orf183 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 113239382 G/A 1 12 2 14 5.88483235376942 1.0191946077051 4.86563774606433 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0131607574589523 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113239361_113239468:MOV10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 113241052 T/C 1 14 14 28 6.86563774606433 7.13436225393567 -0.268724507871344 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113240909_113241411:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113240909_113242432:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000482545:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000471160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113240930_113241100:MOV10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 113243048 C/T 1 87 54 141 42.6650345648283 27.5182544080376 15.1467801567907 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0113795386757433 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113243038_113243368:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113243038_113243367:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113243038_113243348:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113243038_113243332:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000495374:exon_113243038_113243344:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000494319:exon_113242841_113243347:MOV10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 117617705 A/G 1 21 19 40 10.2984566190965 9.68234877319841 0.616107845898082 A:G A G 10 0.509597303852548 0.875549899947125 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000470935:exon_117617492_117618066:TTF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 117618067 C/T 1 8 10 18 3.92322156917962 5.09597303852548 -1.17275146934586 T:C C T 10 0.509597303852548 0.642260839788311 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000469638:exon_117617917_117618481:TTF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 118165691 C/G 1 1 7 8 0.490402696147452 3.56718112696784 -3.07677843082038 C:G C G 10 0.509597303852548 0.0357022765843499 ENSG00000183508:ENST00000369448:exon_118165464_118170994:FAM46C HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 144906508 C/T 1 6 2 8 2.94241617688471 1.0191946077051 1.92322156917962 T:C C T 10 0.509597303852548 0.289787629707581 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144906421_144906537:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144906421_144906537:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144906421_144906537:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144906421_144906537:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144906421_144906537:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144906421_144906537:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144906421_144906537:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144906421_144906537:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144906421_144906537:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144906421_144906537:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144906421_144906537:PDE4DIP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 145103928 G/A 1 8 6 14 3.92322156917962 3.05758382311529 0.865637746064328 A:G G A 10 0.509597303852548 0.79106698341654 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 10 10 0 5.09597303852548 -5.09597303852548 C T C 10 0.509597303852548 0.000804504526384197 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 23 23 0 11.7207379886086 -11.7207379886086 T G T 10 0.509597303852548 7.63335624912713e-08 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 1 1 18 19 0.490402696147452 9.17275146934586 -8.68234877319841 A:C C A 10 0.509597303852548 3.01144989010355e-05 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 1 28 1 29 13.7312754921287 0.509597303852548 13.2216781882761 A:G G A 10 0.509597303852548 1.26512854299411e-07 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 16 16 0 8.15355686164077 -8.15355686164077 C T C 10 0.509597303852548 1.11903993927250e-05 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 49 49 0 24.9702678887749 -24.9702678887749 T C T 10 0.509597303852548 6.87210221259738e-16 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 145112501 C/T 0 61 0 61 29.9145644649946 0 29.9145644649946 C C 10 0.509597303852548 1.51606351752946e-18 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 146759320 C/G 1 19 30 49 9.31765122680159 15.2879191155764 -5.97026788877485 C:G C G 10 0.509597303852548 0.115115283838738 ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146759314_146759412:CHD1L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 147119273 G/A 0 8 0 8 3.92322156917962 0 3.92322156917962 G G 10 0.509597303852548 0.00789316895639457 ENSG00000162836:ENST00000460583:exon_147119170_147119368:ACP6;ENSG00000162836:ENST00000369238:exon_147119172_147119368:ACP6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 150727539 G/A 1 8 11 19 3.92322156917962 5.60557034237803 -1.68234877319841 A:G G A 10 0.509597303852548 0.496599009223979 ENSG00000163131:ENST00000368985:exon_150727477_150727626:CTSS;ENSG00000163131:ENST00000480760:exon_150727477_150727626:CTSS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 151239051 T/C 1 227 268 495 111.321412025472 136.572077432483 -25.2506654070113 A:T:C T C 10 0.509597303852548 0.0245322788874927 ENSG00000159352:ENST00000368884:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000368881:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000426273:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000418119:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000476855:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000445776:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000427779:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000470396:exon_151238996_151239201:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000453615:exon_151239020_151239063:PSMD4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 151288172 G/A 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 A:G G A 10 0.509597303852548 0.5085374516326 ENSG00000143393:ENST00000368874:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368875:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000271657:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368873:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000392756:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000414081:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368872:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000438243:exon_151288116_151288985:PI4KB HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 151372138 G/A 1 60 25 85 29.4241617688471 12.7399325963137 16.6842291725334 A:G G A 10 0.509597303852548 0.000298419570967324 ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151372010_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495288:exon_151372036_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495805:exon_151372055_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372063_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151372066_151372203:PSMB4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 151377407 A/C 1 30 23 53 14.7120808844236 11.7207379886086 2.99134289581496 A:C A C 10 0.509597303852548 0.492509024542069 ENSG00000143442:ENST00000392723:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000358476:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000271715:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000361398:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000368863:exon_151375201_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000409503:exon_151376700_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000531094:exon_151376975_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000491586:exon_151377278_151378940:POGZ HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 153745128 G/C 1 22 17 39 10.7888593152439 8.66315416549332 2.12570514975063 C:G G C 10 0.509597303852548 0.52539752156904 ENSG00000143624:ENST00000318967:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000428986:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000456435:exon_153744816_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000435409:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000481797:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000512605:exon_153744816_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000476843:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000503133:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000368670:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000368669:exon_153744816_153745187:INTS3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 154218698 G/A 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 A:G G A 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000143569:ENST00000343815:exon_154218680_154218851:UBAP2L;ENSG00000143569:ENST00000271877:exon_154218680_154218851:UBAP2L;ENSG00000143569:ENST00000428931:exon_154218680_154218851:UBAP2L;ENSG00000143569:ENST00000368505:exon_154218680_154218851:UBAP2L;ENSG00000143569:ENST00000433006:exon_154218680_154218851:UBAP2L;ENSG00000143569:ENST00000456955:exon_154218680_154218851:UBAP2L;ENSG00000143569:ENST00000368504:exon_154218680_154218855:UBAP2L;ENSG00000143569:ENST00000361546:exon_154218680_154218851:UBAP2L;ENSG00000143569:ENST00000466173:exon_154218680_154218851:UBAP2L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 154245917 T/C 1 51 56 107 25.0105375035201 28.5374490157427 -3.52691151222264 T:C T C 10 0.509597303852548 0.50041791876638 ENSG00000143575:ENST00000328703:exon_154245812_154246074:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000483970:exon_154245812_154246074:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000447768:exon_154245812_154246010:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000531435:exon_154245812_154246437:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000477780:exon_154245812_154246437:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000453365:exon_154245812_154246010:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000435087:exon_154245812_154246010:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000471326:exon_154245344_154246074:HAX1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 154561925 C/T 1 19 13 32 9.31765122680159 6.62476495008312 2.69288627671846 T:C C T 10 0.509597303852548 0.379910721936069 ENSG00000160710:ENST00000292205:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000443129:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000420505:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000392506:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368474:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368471:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000529168:exon_154561845_154561938:ADAR HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 154573967 T/C 1 28 52 80 13.7312754921287 26.4990598003325 -12.7677843082038 T:C T C 10 0.509597303852548 0.00492848679251458 ENSG00000160710:ENST00000292205:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000443129:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000420505:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000392506:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368474:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368471:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000529168:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000463920:exon_154572653_154574724:ADAR HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 154744807 C/G 1 11 13 24 5.39442965762197 6.62476495008312 -1.23033529246115 C:G C G 10 0.509597303852548 0.68560789583581 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 154744852 A/G 1 7 7 14 3.43281887303216 3.56718112696784 -0.134362253935672 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 154917551 C/T 1 34 26 60 16.6736916690134 13.2495299001662 3.42416176884712 T:C C T 10 0.509597303852548 0.438868269230126 ENSG00000163346:ENST00000368465:exon_154916552_154917593:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000368463:exon_154916556_154917593:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000351146:exon_154916918_154917593:PBXIP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 154988957 A/G 1 2 7 9 0.980805392294904 3.56718112696784 -2.58637573467293 A:G A G 10 0.509597303852548 0.103145007117103 ENSG00000160685:ENST00000368426:exon_154988696_154990998:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000417934:exon_154988696_154990998:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000292176:exon_154988696_154989457:ZBTB7B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 155145392 G/A 1 5 12 17 2.45201348073726 6.11516764623058 -3.66315416549332 A:G G A 10 0.509597303852548 0.090883178805902 ENSG00000163463:ENST00000487350:exon_155145214_155145714:KRTCAP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 155735012 T/C 1 10 22 32 4.90402696147452 11.2111406847561 -6.30711372328153 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0326425137283316 ENSG00000116580:ENST00000437809:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000368331:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000271883:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000361040:exon_155734218_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000471341:exon_155734575_155736500:GON4L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 155931368 G/A 1 6 4 10 2.94241617688471 2.03838921541019 0.90402696147452 A:G G A 10 0.509597303852548 0.75435926131823 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 156025096 C/T 1 26 24 50 12.7504700998338 12.2303352924612 0.5201348073726 T:C C T 10 0.509597303852548 0.888754414932705 ENSG00000116586:ENST00000368305:exon_156025054_156025216:ROBLD3;ENSG00000116586:ENST00000368304:exon_156025054_156025216:ROBLD3;ENSG00000116586:ENST00000489664:exon_156025054_156025784:ROBLD3;ENSG00000116586:ENST00000368302:exon_156025054_156025216:ROBLD3;ENSG00000116586:ENST00000487106:exon_156024876_156025216:ROBLD3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 156169610 A/G 1 5 5 10 2.45201348073726 2.54798651926274 -0.0959730385254796 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000160785:ENST00000469537:exon_156165996_156170263:SLC25A44 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 156202173 A/G 1 33 32 65 16.1832889728659 16.3071137232815 -0.123824750415618 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000160783:ENST00000490491:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368279:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000466489:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368277:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368276:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000320139:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000497069:exon_156202111_156202216:PMF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 156206158 C/T 1 39 44 83 19.1257051497506 22.4222813695121 -3.29657621976148 T:C C T 10 0.509597303852548 0.510717218834396 ENSG00000160783:ENST00000490491:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368279:exon_156206140_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368273:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368277:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368276:exon_156206140_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000497069:exon_156206079_156206274:PMF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 156213921 C/T 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 T:C C T 10 0.509597303852548 0.335037018547339 ENSG00000160781:ENST00000292291:exon_156213206_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000492619:exon_156213206_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000360733:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000335852:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000356983:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000368271:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000340183:exon_156213213_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000491107:exon_156213213_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000368270:exon_156213214_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000468632:exon_156213214_156214194:PAQR6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 156290656 T/C 1 59 62 121 28.9337590726997 31.595032838858 -2.66127376615831 T:C T C 10 0.509597303852548 0.650141767678431 ENSG00000163468:ENST00000443745:exon_156290630_156290816:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000295688:exon_156290630_156290816:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368261:exon_156290630_156290816:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368259:exon_156290630_156290816:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368258:exon_156290630_156290816:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000480049:exon_156290630_156290816:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368262:exon_156290630_156290816:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000472765:exon_156290630_156290816:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000413555:exon_156290630_156290816:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000496684:exon_156290630_156290816:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000533194:exon_156290630_156290816:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000463132:exon_156290630_156290816:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000490221:exon_156290631_156290816:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000446905:exon_156290631_156290816:CCT3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 156446242 C/A 1 6 2 8 2.94241617688471 1.0191946077051 1.92322156917962 A:C C A 10 0.509597303852548 0.289787629707581 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 156446903 T/C 1 8 8 16 3.92322156917962 4.07677843082038 -0.153556861640768 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000353795:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000340875:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000454816:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000493077:exon_156446721_156446994:MEF2D HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 156450740 G/A 1 4 16 20 1.96161078458981 8.15355686164077 -6.19194607705096 A:G G A 10 0.509597303852548 0.00632201168593267 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 156565834 G/C 1 10 14 24 4.90402696147452 7.13436225393567 -2.23033529246115 C:G G C 10 0.509597303852548 0.417388759331184 ENSG00000160818:ENST00000498641:exon_156565509_156565923:GPATCH4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 156706559 A/C,G 0 0 11 11 0 5.60557034237803 -5.60557034237803 C:G A C 10 0.509597303852548 0.00039453118880164 ENSG00000143303:ENST00000368218:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000368216:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000476229:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000497515:exon_156706424_156706752:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000481920:exon_156706473_156706694:C1orf66 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 156760887 C/A 1 10 7 17 4.90402696147452 3.56718112696784 1.33684583450668 A:C C A 10 0.509597303852548 0.630150764673374 ENSG00000143294:ENST00000368201:exon_156760859_156760954:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000454659:exon_156760859_156760954:PRCC HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 156907081 T/C 1 1 8 9 0.490402696147452 4.07677843082038 -3.58637573467293 A:T:C T C 10 0.509597303852548 0.0193004967410206 ENSG00000132694:ENST00000368194:exon_156907041_156907288:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000413909:exon_156907041_156907288:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000487682:exon_156907041_156907288:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000361409:exon_156907041_156907288:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000315174:exon_156907041_156907288:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000492592:exon_156907041_156907288:ARHGEF11 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 157517127 C/T 1 10 5 15 4.90402696147452 2.54798651926274 2.35604044221178 T:C C T 10 0.509597303852548 0.303107408657847 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 158813819 A/G 1 8 2 10 3.92322156917962 1.0191946077051 2.90402696147452 A:G A G 10 0.509597303852548 0.110022635989167 ENSG00000163563:ENST00000368141:exon_158813745_158813912:MNDA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 158986477 G/C 1 65 79 144 31.8761752495844 40.2581870043513 -8.38201175476691 C:G G C 10 0.509597303852548 0.182224826511099 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000447473:exon_158986323_158986482:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158986323_158986490:IFI16 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 158990247 A/G 1 61 38 99 29.9145644649946 19.3646975463968 10.5498669185978 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0349756085329831 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_158990131_158990319:IFI16 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 159002301 T/C 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:C T C 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 159002377 C/A 1 33 49 82 16.1832889728659 24.9702678887749 -8.78697891590894 A:C C A 10 0.509597303852548 0.0600514258568331 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 159002389 T/A 1 32 33 65 15.6928862767185 16.8167110271341 -1.12382475041562 A:T T A 10 0.509597303852548 0.805065594757379 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 159021445 A/G 1 10 2 12 4.90402696147452 1.0191946077051 3.88483235376942 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0389900147787838 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 159024668 A/T 1 198 239 437 97.0997338371955 121.793755620759 -24.6940217835635 A:T A T 10 0.509597303852548 0.0190078744244328 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159024611_159024945:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159024611_159024918:IFI16 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 160303416 G/A 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 A:G G A 10 0.509597303852548 0.541646560898822 ENSG00000122218:ENST00000368069:exon_160303393_160303469:COPA;ENSG00000122218:ENST00000241704:exon_160303393_160303469:COPA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 160654786 G/A 1 511 397 908 250.595777731348 202.310129629462 48.2856481018864 A:G G A 10 0.509597303852548 0.00142820632286354 ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160654677_160654979:CD48;ENSG00000117091:ENST00000368045:exon_160653309_160654979:CD48 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 160681508 G/A 1 305 298 603 149.572822324973 151.859996548059 -2.28717422308642 A:G G A 10 0.509597303852548 0.870614212731494 ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160681472_160681641:CD48;ENSG00000117091:ENST00000368045:exon_160681472_160681593:CD48 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 160719843 A/C 1 24 44 68 11.7696647075388 22.4222813695121 -10.6526166619733 A:C A C 10 0.509597303852548 0.0106243907634059 ENSG00000026751:ENST00000466792:exon_160719611_160719856:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000368043:exon_160719611_160719883:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000368042:exon_160719611_160719883:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000435517:exon_160719611_160719922:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000458602:exon_160719611_160719883:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000458104:exon_160719611_160719883:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000359331:exon_160719611_160719883:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000495334:exon_160719611_160719883:SLAMF7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 160793442 A/G 1 14 4 18 6.86563774606433 2.03838921541019 4.82724853065414 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0314262102810835 ENSG00000122224:ENST00000341032:exon_160793416_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368041:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368040:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000263285:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000392203:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368037:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368036:exon_160793419_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368035:exon_160793297_160793586:LY9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 160793560 A/G 1 16 5 21 7.84644313835923 2.54798651926274 5.29845661909649 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0271764298858529 ENSG00000122224:ENST00000341032:exon_160793416_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368041:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368040:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000263285:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000392203:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368037:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368036:exon_160793419_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368035:exon_160793297_160793586:LY9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 161013121 C/T 1 9 8 17 4.41362426532707 4.07677843082038 0.336845834506684 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000158773:ENST00000368020:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000368021:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000442467:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000435396:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000368019:exon_161013058_161013149:USF1;ENSG00000158773:ENST00000473969:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000531842:exon_161013058_161013132:USF1;ENSG00000158773:ENST00000496363:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000491629:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000534633:exon_161013043_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000529476:exon_161013058_161013150:USF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 161018670 T/C 1 218 51 269 106.907787760145 25.9894624964799 80.9183252636646 T:C T C 10 0.509597303852548 1.65847555149579e-24 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000490279:exon_161018580_161019124:ARHGAP30 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 161019040 G/C 1 52 36 88 25.5009401996675 18.3455029386917 7.15543726097578 C:G G C 10 0.509597303852548 0.136141203438133 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161018779_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368017:exon_161018962_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000490279:exon_161018580_161019124:ARHGAP30 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 161020997 C/T 1 12 3 15 5.88483235376942 1.52879191155764 4.35604044221178 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0356477356687783 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 161143312 T/C 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 T:C T C 10 0.509597303852548 0.74955201040747 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 161681780 A/G 1 21 10 31 10.2984566190965 5.09597303852548 5.20248358057101 A:G A G 10 0.509597303852548 0.072354079459393 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161680998_161682008:FCRLA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 161683136 G/A 1 32 61 93 15.6928862767185 31.0854355350054 -15.392549258287 A:G G A 10 0.509597303852548 0.00171618064479925 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367949:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000350710:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000349527:exon_161682875_161683242:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367950:exon_161682875_161683495:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161682875_161684142:FCRLA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 163313539 C/T 1 14 8 22 6.86563774606433 4.07677843082038 2.78885931524394 T:C C T 10 0.509597303852548 0.288242782553056 ENSG00000143228:ENST00000524800:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000367900:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000271452:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000497990:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527439:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527120:exon_163313523_163313613:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000531529:exon_163313523_163313605:NUF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 165651355 G/A 1 4 7 11 1.96161078458981 3.56718112696784 -1.60557034237803 A:G G A 10 0.509597303852548 0.379319216476062 ENSG00000143149:ENST00000354775:exon_165651344_165651478:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000461664:exon_165651344_165651478:ALDH9A1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 166039898 C/G 1 9 6 15 4.41362426532707 3.05758382311529 1.35604044221178 C:G C G 10 0.509597303852548 0.608250593906015 ENSG00000188859:ENST00000435676:exon_166039069_166040000:FAM78B;ENSG00000188859:ENST00000456900:exon_166039072_166040000:FAM78B;ENSG00000188859:ENST00000441649:exon_166038749_166040000:FAM78B;ENSG00000188859:ENST00000354422:exon_166039256_166040000:FAM78B;ENSG00000188859:ENST00000338353:exon_166039257_166040000:FAM78B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 166818566 A/G 1 8 4 12 3.92322156917962 2.03838921541019 1.88483235376942 A:G A G 10 0.509597303852548 0.388763190446408 ENSG00000143157:ENST00000367876:exon_166818175_166819660:POGK;ENSG00000143157:ENST00000367875:exon_166818175_166823710:POGK HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 166826773 C/T 1 5 5 10 2.45201348073726 2.54798651926274 -0.0959730385254796 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000152382:ENST00000467021:exon_166825747_166826956:TADA1;ENSG00000152382:ENST00000367874:exon_166825747_166826956:TADA1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 169102050 T/C 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000143156:ENST00000530739:exon_169101769_169102055:NME7;ENSG00000143156:ENST00000493481:exon_169101769_169102055:NME7;ENSG00000143156:ENST00000472647:exon_169101769_169102055:NME7;ENSG00000143156:ENST00000367811:exon_169101769_169102055:NME7;ENSG00000143156:ENST00000525440:exon_169101775_169102055:NME7;ENSG00000143156:ENST00000392104:exon_169102023_169102055:NME7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 169676486 A/G 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 A:G A G 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169676483_169676590:SELL;ENSG00000188404:ENST00000463108:exon_169676483_169676590:SELL;ENSG00000188404:ENST00000479657:exon_169676483_169676590:SELL;ENSG00000188404:ENST00000466340:exon_169676483_169676590:SELL HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 169677709 A/G 1 11 20 31 5.39442965762197 10.191946077051 -4.79751641942899 A:G A G 10 0.509597303852548 0.105337580740766 ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000463108:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000479657:exon_169677558_169677781:SELL;ENSG00000188404:ENST00000466340:exon_169677558_169677944:SELL HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 169823660 C/T 1 13 11 24 6.37523504991688 5.60557034237803 0.769664707538849 T:C C T 10 0.509597303852548 0.839530909399512 ENSG00000000457:ENST00000367772:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367771:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367770:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000423670:exon_169823652_169824105:SCYL3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 170521376 G/A 1 13 14 27 6.37523504991688 7.13436225393567 -0.759127204018796 A:G G A 10 0.509597303852548 0.848413381775282 ENSG00000120370:ENST00000367763:exon_170521156_170522587:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000498166:exon_170521156_170522587:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000464798:exon_170521156_170522974:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000498600:exon_170521156_170522583:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000475113:exon_170521156_170521417:GORAB HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 171483717 A/C 1 68 70 138 33.3473833380267 35.6718112696784 -2.32442793165162 A:C A C 10 0.509597303852548 0.733671382907996 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000476522:exon_171483675_171483769:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000467601:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000463586:exon_171483675_171483769:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171483675_171483784:BAT2L2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 171509327 G/A 1 61 50 111 29.9145644649946 25.4798651926274 4.43469927236717 A:G G A 10 0.509597303852548 0.447765446646282 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171509110_171511368:BAT2L2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 171511039 C/G 1 36 33 69 17.6544970613083 16.8167110271341 0.83778603417419 C:G C G 10 0.509597303852548 0.904356409444093 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000412837:exon_171509400_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000495585:exon_171510969_171511368:BAT2L2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 171514731 C/G 1 19 11 30 9.31765122680159 5.60557034237803 3.71208088442356 C:G C G 10 0.509597303852548 0.202978653761744 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000412837:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000495585:exon_171514618_171514826:BAT2L2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 171556165 G/C 1 8 9 17 3.92322156917962 4.58637573467293 -0.663154165493316 C:G G C 10 0.509597303852548 0.811525826845625 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000412837:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000495585:exon_171556142_171556360:BAT2L2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 172410967 G/A 1 31 22 53 15.202483580571 11.2111406847561 3.99134289581496 A:G G A 10 0.509597303852548 0.336279197306881 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 172411768 T/C 1 10 2 12 4.90402696147452 1.0191946077051 3.88483235376942 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0389900147787838 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000478184:exon_172411471_172411970:PIGC HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 173457017 C/T 1 131 129 260 64.2427531953162 65.7380521969787 -1.49529900166247 T:C C T 10 0.509597303852548 0.852696702855683 ENSG00000117592:ENST00000340385:exon_173456874_173457946:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000431633:exon_173456874_173457150:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000470017:exon_173456874_173457154:PRDX6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 174969271 C/T 1 29 30 59 14.2216781882761 15.2879191155764 -1.06624092730033 T:C C T 10 0.509597303852548 0.796014296514277 ENSG00000116161:ENST00000426793:exon_174969225_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000367679:exon_174968869_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000483307:exon_174969081_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000473925:exon_174969091_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000450101:exon_174969204_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000392063:exon_174969204_174969331:CACYBP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 179320578 A/G 1 5 8 13 2.45201348073726 4.07677843082038 -1.62476495008312 A:G A G 10 0.509597303852548 0.415960200620574 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179320452_179320597:SOAT1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 180953853 A/G 1 4 9 13 1.96161078458981 4.58637573467293 -2.62476495008312 A:G A G 10 0.509597303852548 0.172159462736175 ENSG00000135823:ENST00000258301:exon_180953813_180953907:STX6;ENSG00000135823:ENST00000469135:exon_180953813_180953907:STX6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 182844020 C/T 1 11 13 24 5.39442965762197 6.62476495008312 -1.23033529246115 T:C C T 10 0.509597303852548 0.68560789583581 ENSG00000135829:ENST00000367549:exon_182843989_182844089:DHX9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 182845346 C/T 1 12 3 15 5.88483235376942 1.52879191155764 4.35604044221178 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0356477356687783 ENSG00000135829:ENST00000367549:exon_182845185_182845398:DHX9;ENSG00000135829:ENST00000490519:exon_182845264_182845398:DHX9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 183542387 T/C 1 11 12 23 5.39442965762197 6.11516764623058 -0.720737988608604 T:C T C 10 0.509597303852548 0.836390489019417 ENSG00000116701:ENST00000367536:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000392014:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000413720:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000367535:exon_183542320_183542427:NCF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 184023529 A/C 1 3 15 18 1.47120808844236 7.64395955778822 -6.17275146934586 A:C A C 10 0.509597303852548 0.00382128179029387 ENSG00000198860:ENST00000361641:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000485209:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000533373:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000367518:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000423085:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000462677:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000457455:exon_184023495_184023569:TSEN15 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 184663581 T/C 0 0 9 9 0 4.58637573467293 -4.58637573467293 C T C 10 0.509597303852548 0.00164049776378534 ENSG00000116406:ENST00000439962:exon_184663178_184663606:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000318130:exon_184659637_184663606:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000367512:exon_184663197_184663606:EDEM3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 186291512 T/C 1 12 20 32 5.88483235376942 10.191946077051 -4.30711372328154 T:C T C 10 0.509597303852548 0.157097521585642 ENSG00000047410:ENST00000367478:exon_186291450_186291544:TPR;ENSG00000047410:ENST00000467810:exon_186291450_186291544:TPR HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 186301447 T/C 1 13 13 26 6.37523504991688 6.62476495008312 -0.249529900166248 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000047410:ENST00000367478:exon_186301327_186301475:TPR HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 197070697 T/C 1 11 9 20 5.39442965762197 4.58637573467293 0.808053922949041 T:C T C 10 0.509597303852548 0.824451040790607 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 197070707 G/A 1 11 6 17 5.39442965762197 3.05758382311529 2.33684583450668 A:G G A 10 0.509597303852548 0.333835168817674 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 198723432 T/G 1 5 19 24 2.45201348073726 9.68234877319841 -7.23033529246115 T:G T G 10 0.509597303852548 0.00354205807110143 ENSG00000081237:ENST00000367366:exon_198723398_198723533:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000352140:exon_198723398_198723533:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367376:exon_198723398_198723533:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000442510:exon_198723398_198723533:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000271610:exon_198723398_198723533:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000348564:exon_198723398_198723533:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367372:exon_198723398_198723533:PTPRC HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 200522566 G/C 1 6 5 11 2.94241617688471 2.54798651926274 0.394429657621972 C:G G C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200520628_200522895:KIF14 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 200635550 T/C 1 6 7 13 2.94241617688471 3.56718112696784 -0.624764950083124 T:C T C 10 0.509597303852548 0.786978111840725 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000436897:exon_200635387_200635879:DDX59 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 200635560 T/C 1 7 7 14 3.43281887303216 3.56718112696784 -0.134362253935672 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000436897:exon_200635387_200635879:DDX59 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 201112981 A/G 1 8 19 27 3.92322156917962 9.68234877319841 -5.7591272040188 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0330692141736325 ENSG00000116857:ENST00000367334:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367332:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367330:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367329:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367333:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000472411:exon_201112948_201114796:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000263947:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000421960:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000485839:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000495205:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000497582:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000455367:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000435310:exon_201112948_201113079:TMEM9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 201969082 G/A 1 26 16 42 12.7504700998338 8.15355686164077 4.59691323819298 A:G G A 10 0.509597303852548 0.167409420746269 ENSG00000176393:ENST00000481780:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492587:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000447312:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000478617:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492849:exon_201969030_201969143:RNPEP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 201973565 G/A 1 17 23 40 8.33684583450668 11.7207379886086 -3.38389215410192 A:G G A 10 0.509597303852548 0.343111839960725 ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000479531:exon_201973482_201973624:RNPEP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 202304868 T/C 1 14 8 22 6.86563774606433 4.07677843082038 2.78885931524394 T:C T C 10 0.509597303852548 0.288242782553056 ENSG00000077152:ENST00000367274:exon_202304774_202304946:UBE2T;ENSG00000077152:ENST00000487227:exon_202304774_202304946:UBE2T;ENSG00000077152:ENST00000460852:exon_202304774_202304946:UBE2T HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 204378775 T/C 1 18 1 19 8.82724853065414 0.509597303852548 8.31765122680159 T:C T C 10 0.509597303852548 8.01634106618484e-05 ENSG00000158615:ENST00000367188:exon_204378620_204380919:PPP1R15B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 206239403 C/T 1 12 14 26 5.88483235376942 7.13436225393567 -1.24952990016625 T:C C T 10 0.509597303852548 0.69693063211367 ENSG00000196533:ENST00000331555:exon_206238872_206239579:C1orf186;ENSG00000196533:ENST00000421280:exon_206238872_206239579:C1orf186 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 206239415 C/T 1 11 9 20 5.39442965762197 4.58637573467293 0.808053922949041 T:C C T 10 0.509597303852548 0.824451040790607 ENSG00000196533:ENST00000331555:exon_206238872_206239579:C1orf186;ENSG00000196533:ENST00000421280:exon_206238872_206239579:C1orf186 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 206239574 T/C 1 9 7 16 4.41362426532707 3.56718112696784 0.846443138359232 T:C T C 10 0.509597303852548 0.80419746365061 ENSG00000196533:ENST00000331555:exon_206238872_206239579:C1orf186;ENSG00000196533:ENST00000421280:exon_206238872_206239579:C1orf186 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 206647742 A/G 1 8 1 9 3.92322156917962 0.509597303852548 3.41362426532707 A:G A G 10 0.509597303852548 0.039373498903222 ENSG00000143466:ENST00000367120:exon_206647674_206647814:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000463979:exon_206647674_206647814:IKBKE HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 206647787 T/C 1 14 2 16 6.86563774606433 1.0191946077051 5.84644313835923 T:C T C 10 0.509597303852548 0.00428504868507501 ENSG00000143466:ENST00000367120:exon_206647674_206647814:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000463979:exon_206647674_206647814:IKBKE HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 206648378 G/A 1 16 4 20 7.84644313835923 2.03838921541019 5.80805392294904 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0121181551128578 ENSG00000143466:ENST00000463979:exon_206648208_206648471:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000476449:exon_206648298_206648478:IKBKE HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 207087435 C/T 1 38 49 87 18.6353024536032 24.9702678887749 -6.33496543517168 T:C C T 10 0.509597303852548 0.198162089888945 ENSG00000162894:ENST00000420007:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000367091:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000463473:exon_207087207_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000525793:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000529560:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000533312:exon_207086977_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000530505:exon_207087146_207087439:FAIM3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 207269919 C/T 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 T:C C T 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000123843:ENST00000367078:exon_207269867_207269960:C4BPB;ENSG00000123843:ENST00000391924:exon_207269867_207269960:C4BPB;ENSG00000123843:ENST00000452902:exon_207269867_207269960:C4BPB;ENSG00000123843:ENST00000243611:exon_207269867_207269960:C4BPB;ENSG00000123843:ENST00000367076:exon_207269867_207269960:C4BPB;ENSG00000123843:ENST00000391923:exon_207269867_207269960:C4BPB;ENSG00000123843:ENST00000469326:exon_207268279_207269960:C4BPB HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 212273639 C/T 1 2 8 10 0.980805392294904 4.07677843082038 -3.09597303852548 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0608033640885815 ENSG00000143476:ENST00000366991:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000420235:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000475419:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000489149:exon_212273594_212274042:DTL;ENSG00000143476:ENST00000463791:exon_212273594_212273768:DTL HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 212526288 C/T 1 6 5 11 2.94241617688471 2.54798651926274 0.394429657621972 T:C C T 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 214787130 G/A 1 10 6 16 4.90402696147452 3.05758382311529 1.84644313835923 A:G G A 10 0.509597303852548 0.45584747299355 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214787057_214787259:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000464322:exon_214787057_214787259:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000495259:exon_214787057_214787236:CENPF HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 214814571 C/T 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 T:C C T 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 214818549 G/A 1 14 8 22 6.86563774606433 4.07677843082038 2.78885931524394 A:G G A 10 0.509597303852548 0.288242782553056 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 214820099 A/G 1 3 17 20 1.47120808844236 8.66315416549332 -7.19194607705096 A:G A G 10 0.509597303852548 0.00124848268995766 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 214826196 G/A 1 12 7 19 5.88483235376942 3.56718112696784 2.31765122680159 A:G G A 10 0.509597303852548 0.360981209646244 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214826171_214826332:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000391896:exon_214826171_214826332:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000467765:exon_214826171_214826332:CENPF HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 214830617 A/G 1 17 32 49 8.33684583450668 16.3071137232815 -7.97026788877485 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0310337336798062 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214830276_214830752:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000469862:exon_214830276_214830753:CENPF HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 214837110 C/G 1 35 27 62 17.1640943651608 13.7591272040188 3.40496716114203 C:G C G 10 0.509597303852548 0.446399599162764 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214836934_214837931:CENPF HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 220154768 C/T 1 10 14 24 4.90402696147452 7.13436225393567 -2.23033529246115 T:C C T 10 0.509597303852548 0.417388759331184 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220154720_220154799:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220154720_220154799:EPRS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 220321023 A/G 1 93 115 208 45.607450741713 58.603689943043 -12.99623920133 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0827131966449965 ENSG00000067704:ENST00000366922:exon_220320835_220321380:IARS2;ENSG00000067704:ENST00000302637:exon_220320835_220321380:IARS2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 221912361 T/C 1 16 17 33 7.84644313835923 8.66315416549332 -0.816711027134083 T:C T C 10 0.509597303852548 0.862372813357438 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000418487:exon_221912276_221912783:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 221912808 T/C 1 9 10 19 4.41362426532707 5.09597303852548 -0.682348773198411 T:C T C 10 0.509597303852548 0.821015503596854 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 225600169 C/T 1 3 11 14 1.47120808844236 5.60557034237803 -4.13436225393567 T:C C T 10 0.509597303852548 0.032165591851746 ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225600156_225600347:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225600156_225600347:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225600156_225600347:LBR HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 225609884 A/G 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 A:G A G 10 0.509597303852548 0.5085374516326 ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225609779_225609979:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225609779_225609979:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225609813_225609979:LBR;ENSG00000143815:ENST00000425080:exon_225609779_225609979:LBR;ENSG00000143815:ENST00000488632:exon_225609779_225610129:LBR HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 225611661 C/T 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 T:C C T 10 0.509597303852548 0.5085374516326 ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000425080:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000421383:exon_225611623_225611791:LBR HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 226352498 T/G 1 14 21 35 6.86563774606433 10.7015433809035 -3.83590563483918 T:G T G 10 0.509597303852548 0.236898592095749 ENSG00000182827:ENST00000366812:exon_226352490_226352630:ACBD3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 226555302 A/G 1 29 31 60 14.2216781882761 15.797516419429 -1.57583823115288 A:G A G 10 0.509597303852548 0.700454135496898 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226555181_226555309:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000490921:exon_226553655_226555309:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000498787:exon_226555181_226555309:PARP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 226570840 T/C 1 13 22 35 6.37523504991688 11.2111406847561 -4.83590563483918 T:C T C 10 0.509597303852548 0.127506116178141 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226570737_226570884:PARP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 226573364 A/G 1 27 14 41 13.2408727959812 7.13436225393567 6.10651054204553 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0614983909815177 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226573205_226573381:PARP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 226589958 G/A 1 19 10 29 9.31765122680159 5.09597303852548 4.22167818827611 A:G G A 10 0.509597303852548 0.138134151696757 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226589684_226590080:PARP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 226595647 C/G 1 15 7 22 7.35604044221178 3.56718112696784 3.78885931524394 C:G C G 10 0.509597303852548 0.135372910326039 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226595511_226595774:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226595511_226595776:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226595511_226595717:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226595511_226595683:PARP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 227075813 A/G 1 6 4 10 2.94241617688471 2.03838921541019 0.90402696147452 A:G A G 10 0.509597303852548 0.75435926131823 ENSG00000143801:ENST00000366783:exon_227075792_227075859:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000340188:exon_227075792_227075859:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000422240:exon_227075792_227075859:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000460775:exon_227075792_227075859:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000366782:exon_227075792_227075859:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000391872:exon_227075792_227075859:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000496965:exon_227075792_227075859:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000472139:exon_227075792_227075859:PSEN2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 228289843 C/T 1 13 19 32 6.37523504991688 9.68234877319841 -3.30711372328154 T:C C T 10 0.509597303852548 0.289691482989316 ENSG00000143793:ENST00000469781:exon_228289040_228290261:C1orf35;ENSG00000143793:ENST00000272139:exon_228289781_228289866:C1orf35;ENSG00000143793:ENST00000485896:exon_228289781_228290083:C1orf35;ENSG00000143793:ENST00000472617:exon_228289781_228289866:C1orf35;ENSG00000143793:ENST00000492757:exon_228289781_228289866:C1orf35;ENSG00000143793:ENST00000465199:exon_228289757_228289866:C1orf35 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 228295582 T/C 1 5 5 10 2.45201348073726 2.54798651926274 -0.0959730385254796 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000162910:ENST00000465268:exon_228295369_228295976:MRPL55 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 229730452 G/A 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 A:G G A 10 0.509597303852548 0.499988077920146 ENSG00000135801:ENST00000366676:exon_229728858_229730841:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000258281:exon_229728868_229730841:TAF5L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 229738170 T/G 1 4 9 13 1.96161078458981 4.58637573467293 -2.62476495008312 T:G T G 10 0.509597303852548 0.172159462736175 ENSG00000135801:ENST00000366676:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000258281:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000366675:exon_229734941_229738666:TAF5L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 229738236 G/A 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 A:G G A 10 0.509597303852548 0.335037018547339 ENSG00000135801:ENST00000366676:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000258281:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000366675:exon_229734941_229738666:TAF5L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 230415148 G/A 1 13 21 34 6.37523504991688 10.7015433809035 -4.32630833098663 A:G G A 10 0.509597303852548 0.169813328863776 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230415049_230417870:GALNT2;ENSG00000143641:ENST00000485438:exon_230415049_230417866:GALNT2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 231408091 A/G 1 14 10 24 6.86563774606433 5.09597303852548 1.76966470753885 A:G A G 10 0.509597303852548 0.543061903146082 ENSG00000116906:ENST00000366646:exon_231408058_231408137:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000366647:exon_231408058_231408137:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000416000:exon_231408058_231408137:GNPAT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 234529519 C/T 1 7 9 16 3.43281887303216 4.58637573467293 -1.15355686164077 T:C C T 10 0.509597303852548 0.623338489505478 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 234529540 G/A 1 8 4 12 3.92322156917962 2.03838921541019 1.88483235376942 A:G G A 10 0.509597303852548 0.388763190446408 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 234529552 C/T 1 11 2 13 5.39442965762197 1.0191946077051 4.37523504991688 T:C C T 10 0.509597303852548 0.022769928287595 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 234529570 G/A 1 12 6 18 5.88483235376942 3.05758382311529 2.82724853065414 A:G G A 10 0.509597303852548 0.239448825994552 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 234565176 C/T 1 7 2 9 3.43281887303216 1.0191946077051 2.41362426532707 T:C C T 10 0.509597303852548 0.180412718745071 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234565162_234565423:TARBP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 234743237 G/A 1 46 60 106 22.5585240227828 30.5758382311529 -8.01731420837008 A:G G A 10 0.509597303852548 0.121311260164862 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234740015_234743598:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234740015_234743598:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000491430:exon_234742977_234743598:IRF2BP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 234744480 G/A 1 16 11 27 7.84644313835923 5.60557034237803 2.2408727959812 A:G G A 10 0.509597303852548 0.444354653770125 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234744241_234745271:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234744193_234745271:IRF2BP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 234745009 A/G 0 0 14 14 0 7.13436225393567 -7.13436225393567 G A G 10 0.509597303852548 4.65307324254661e-05 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234744241_234745271:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234744193_234745271:IRF2BP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 235383188 A/G 1 42 53 95 20.596913238193 27.008657104185 -6.41174386599206 A:G A G 10 0.509597303852548 0.218035452218143 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235383108_235383283:ARID4B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 235392546 T/C 1 12 14 26 5.88483235376942 7.13436225393567 -1.24952990016625 T:C T C 10 0.509597303852548 0.69693063211367 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000418304:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000466653:exon_235391626_235392700:ARID4B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 236381825 G/C 1 8 3 11 3.92322156917962 1.52879191155764 2.39442965762197 C:G G C 10 0.509597303852548 0.227512016275758 ENSG00000086619:ENST00000354619:exon_236378855_236381876:ERO1LB HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 236700823 T/C 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 T:C T C 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 236706862 G/C 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 C:G G C 10 0.509597303852548 0.5085374516326 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236706842_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236706327_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525789:exon_236706596_236706948:LGALS8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 236708224 A/C 1 2 8 10 0.980805392294904 4.07677843082038 -3.09597303852548 A:C A C 10 0.509597303852548 0.0608033640885815 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 236711323 T/C 1 9 12 21 4.41362426532707 6.11516764623058 -1.70154338090351 T:C T C 10 0.509597303852548 0.516968964003046 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236711312_236711581:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236711312_236711583:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236711312_236712563:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236711312_236714310:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236711312_236712302:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236711312_236712096:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236711312_236711580:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236711312_236711595:LGALS8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 236716959 C/T 1 30 17 47 14.7120808844236 8.66315416549332 6.04892671893024 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0815247064483054 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236716881_236717039:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236716881_236717039:HEATR1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 236717926 T/C 1 17 17 34 8.33684583450668 8.66315416549332 -0.326308330986631 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236717898_236718052:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236717898_236718052:HEATR1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 236718620 T/C 1 17 19 36 8.33684583450668 9.68234877319841 -1.34550293869173 T:C T C 10 0.509597303852548 0.739665034365435 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236718596_236718764:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236718596_236718764:HEATR1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 236719193 A/G 1 17 9 26 8.33684583450668 4.58637573467293 3.75047009983375 A:G A G 10 0.509597303852548 0.170677368312735 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 236721610 G/A 1 12 14 26 5.88483235376942 7.13436225393567 -1.24952990016625 A:G G A 10 0.509597303852548 0.69693063211367 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 236721660 T/C 1 9 9 18 4.41362426532707 4.58637573467293 -0.172751469345863 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 236746443 C/T 1 12 5 17 5.88483235376942 2.54798651926274 3.33684583450668 T:C C T 10 0.509597303852548 0.144715116186652 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236746313_236746496:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236746313_236746496:HEATR1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 236748505 T/C 1 2 6 8 0.980805392294904 3.05758382311529 -2.07677843082038 T:C T C 10 0.509597303852548 0.171857042968518 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236748325_236748516:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236748325_236748516:HEATR1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 241667523 C/T 1 41 55 96 20.1065105420455 28.0278517118901 -7.92134116984461 T:C C T 10 0.509597303852548 0.125321455563233 ENSG00000091483:ENST00000366560:exon_241667342_241667545:FH HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 245861571 C/T 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245861408_245861610:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245861408_245861610:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245861408_245861610:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245861408_245861610:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245861408_245861610:KIF26B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 246021941 T/C 1 8 8 16 3.92322156917962 4.07677843082038 -0.153556861640768 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000185420:ENST00000366516:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000366517:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000490107:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000483072:exon_246021798_246021949:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000470510:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000388985:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000493441:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000488153:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000492487:exon_246021800_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000391836:exon_246021864_246021972:SMYD3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 247006051 G/C 1 6 10 16 2.94241617688471 5.09597303852548 -2.15355686164077 C:G G C 10 0.509597303852548 0.324290953365588 ENSG00000153207:ENST00000366508:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000326225:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000428671:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000361182:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000391829:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000498601:exon_247005996_247006078:AHCTF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 1 247322298 G/T 1 2 6 8 0.980805392294904 3.05758382311529 -2.07677843082038 T:G G T 10 0.509597303852548 0.171857042968518 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 1046712 G/A 1 16 10 26 7.84644313835923 5.09597303852548 2.75047009983375 A:G G A 10 0.509597303852548 0.329269094926831 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1046617_1046808:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000491635:exon_1046617_1046808:GTPBP4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 1065710 C/T 1 13 20 33 6.37523504991688 10.191946077051 -3.81671102713408 A:T:C C T 10 0.509597303852548 0.223291634962574 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1063015_1065876:GTPBP4;ENSG00000148377:ENST00000277517:exon_1064847_1065774:IDI2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 3150973 C/T 1 12 15 27 5.88483235376942 7.64395955778822 -1.7591272040188 T:C C T 10 0.509597303852548 0.56601930423381 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000468050:exon_3150893_3150985:PFKP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 3172121 C/T 1 38 29 67 18.6353024536032 14.7783218117239 3.85698064187929 T:C C T 10 0.509597303852548 0.392848446806983 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3172011_3172133:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3171199_3172175:PFKP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 3172145 C/T 1 46 40 86 22.5585240227828 20.3838921541019 2.17463186868088 T:C C T 10 0.509597303852548 0.667230979893314 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3171199_3172175:PFKP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 3178814 T/A 1 168 107 275 82.3876529527719 54.5269115122226 27.8607414405493 A:T T A 10 0.509597303852548 0.000877463496605117 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3178642_3178997:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3178642_3178985:PFKP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 3180316 T/C 1 42 39 81 20.596913238193 19.8742948502494 0.722618387943616 T:C T C 10 0.509597303852548 0.911780477790881 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 3191823 C/T 1 7 2 9 3.43281887303216 1.0191946077051 2.41362426532707 T:C C T 10 0.509597303852548 0.180412718745071 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3191813_3191945:PITRM1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 3200292 G/A 1 7 3 10 3.43281887303216 1.52879191155764 1.90402696147452 A:G G A 10 0.509597303852548 0.344656245175514 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000430362:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3200232_3200345:PITRM1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 3202065 T/C 1 10 5 15 4.90402696147452 2.54798651926274 2.35604044221178 T:C T C 10 0.509597303852548 0.303107408657847 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3202040_3202128:PITRM1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 5773034 A/G 1 5 5 10 2.45201348073726 2.54798651926274 -0.0959730385254796 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5772450_5773166:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000380270:exon_5772625_5773166:C10orf18 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 5781969 A/T 1 7 4 11 3.43281887303216 2.03838921541019 1.39442965762197 A:T A T 10 0.509597303852548 0.549658645750086 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5781581_5782460:C10orf18 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 5790616 A/G 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 A:G A G 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5788142_5791990:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000442808:exon_5788794_5791990:C10orf18 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 5920121 T/C 1 7 13 20 3.43281887303216 6.62476495008312 -3.19194607705096 T:C T C 10 0.509597303852548 0.182296042530127 ENSG00000134461:ENST00000380094:exon_5920060_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000463862:exon_5920025_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000380092:exon_5920050_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000437663:exon_5920053_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000191063:exon_5920085_5920250:ANKRD16 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 5925971 C/A 1 4 7 11 1.96161078458981 3.56718112696784 -1.60557034237803 A:C C A 10 0.509597303852548 0.379319216476062 ENSG00000134461:ENST00000380094:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000463862:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000380092:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000437663:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000191063:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000492368:exon_5925932_5926040:ANKRD16 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 5995052 C/T 1 13 7 20 6.37523504991688 3.56718112696784 2.80805392294904 T:C C T 10 0.509597303852548 0.264944792438562 ENSG00000134470:ENST00000397251:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379977:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397253:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000425111:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397248:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000414280:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000534292:exon_5994349_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000319465:exon_5994349_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532948:exon_5994356_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379972:exon_5994356_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000528354:exon_5994756_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000447291:exon_5994784_5995289:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379974:exon_5994861_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532039:exon_5995008_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397250:exon_5995014_5995169:IL15RA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 11299735 A/T 1 14 16 30 6.86563774606433 8.15355686164077 -1.28791911557644 A:T A T 10 0.509597303852548 0.71637122408149 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11299701_11299835:CELF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 11805204 A/C 1 6 4 10 2.94241617688471 2.03838921541019 0.90402696147452 A:C A C 10 0.509597303852548 0.75435926131823 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 11805539 T/C 1 5 5 10 2.45201348073726 2.54798651926274 -0.0959730385254796 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000134463:ENST00000379215:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000496136:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000428613:exon_11805223_11806069:ECHDC3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 12123666 C/T 1 2 7 9 0.980805392294904 3.56718112696784 -2.58637573467293 T:C C T 10 0.509597303852548 0.103145007117103 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 12123667 A/C 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 A:C A C 10 0.509597303852548 0.5085374516326 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 12131081 T/G 1 3 7 10 1.47120808844236 3.56718112696784 -2.09597303852548 T:G T G 10 0.509597303852548 0.218348598150516 ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12130985_12131254:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000437298:exon_12130985_12131254:DHTKD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 12209752 T/C 1 73 50 123 35.799396818764 25.4798651926274 10.3195316261366 T:C T C 10 0.509597303852548 0.070998251498346 ENSG00000065665:ENST00000475268:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000495368:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000165609:ENST00000491614:exon_12207324_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378937:exon_12209575_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378952:exon_12209671_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000476462:exon_12209737_12209810:NUDT5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 12292286 C/G 1 5 10 15 2.45201348073726 5.09597303852548 -2.64395955778822 C:G C G 10 0.509597303852548 0.20250907335495 ENSG00000151465:ENST00000497963:exon_12291580_12292318:CDC123 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 12292344 A/G 1 86 109 195 42.1746318686809 55.5461061199277 -13.3714742512469 A:G A G 10 0.509597303852548 0.06233699145596 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 12867598 C/G 1 7 2 9 3.43281887303216 1.0191946077051 2.41362426532707 C:G C G 10 0.509597303852548 0.180412718745071 ENSG00000183049:ENST00000378847:exon_12867572_12867689:CAMK1D;ENSG00000183049:ENST00000378845:exon_12867572_12868142:CAMK1D HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 13378273 G/C 1 2 7 9 0.980805392294904 3.56718112696784 -2.58637573467293 C:G G C 10 0.509597303852548 0.103145007117103 ENSG00000086475:ENST00000327347:exon_13378243_13378350:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000319684:exon_13378243_13378350:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000378614:exon_13378243_13378350:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000413411:exon_13378243_13378350:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000425947:exon_13378243_13378350:SEPHS1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 15145361 G/A 1 44 63 107 21.5777186304879 32.1046301427105 -10.5269115122226 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0426801764650023 ENSG00000152464:ENST00000378203:exon_15145304_15146250:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378201:exon_15145304_15145714:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378202:exon_15145304_15146254:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378197:exon_15145304_15146256:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000441850:exon_15145304_15145819:RPP38;ENSG00000152465:ENST00000466201:exon_15144583_15145682:NMT2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 21827796 G/A 1 8 4 12 3.92322156917962 2.03838921541019 1.88483235376942 A:G G A 10 0.509597303852548 0.388763190446408 ENSG00000078403:ENST00000377100:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377072:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000307729:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377091:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000471315:exon_21827762_21827893:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000446906:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000495130:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377059:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000396529:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000476557:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000430455:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000462999:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000480415:exon_21827762_21827841:MLLT10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 23003226 A/G 1 10 6 16 4.90402696147452 3.05758382311529 1.84644313835923 A:G A G 10 0.509597303852548 0.45584747299355 ENSG00000150867:ENST00000323883:exon_23003112_23003503:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376573:exon_23003112_23003484:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376565:exon_23003112_23003503:PIP4K2A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 25313818 C/T 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 T:C C T 10 0.509597303852548 0.335037018547339 ENSG00000185875:ENST00000524413:exon_25312105_25315593:THNSL1;ENSG00000185875:ENST00000376356:exon_25312105_25315593:THNSL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 27400861 G/A 1 39 44 83 19.1257051497506 22.4222813695121 -3.29657621976148 A:G G A 10 0.509597303852548 0.510717218834396 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27399383_27401049:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27399383_27401049:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27399383_27401049:YME1L1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 27459670 C/T 1 9 14 23 4.41362426532707 7.13436225393567 -2.7207379886086 T:C C T 10 0.509597303852548 0.300102693070699 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27458873_27460012:MASTL HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 27475444 T/C 1 18 24 42 8.82724853065414 12.2303352924612 -3.40308676180702 T:C T C 10 0.509597303852548 0.354800763745429 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 27475494 T/C 1 10 17 27 4.90402696147452 8.66315416549332 -3.7591272040188 T:C T C 10 0.509597303852548 0.17860911307817 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 32635834 G/A 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 A:G G A 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000120616:ENST00000319778:exon_32635691_32636146:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000263062:exon_32635691_32636113:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000480402:exon_32635691_32636146:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000469059:exon_32635691_32636049:EPC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 34620220 C/T 1 37 11 48 18.1448997574557 5.60557034237803 12.5393294150777 T:C C T 10 0.509597303852548 0.000250012138326154 ENSG00000148498:ENST00000374789:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374788:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000346874:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374794:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000350537:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374790:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000466092:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374776:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374773:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000340077:exon_34620045_34620272:PARD3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 43319164 C/T 1 21 29 50 10.2984566190965 14.7783218117239 -4.4798651926274 T:C C T 10 0.509597303852548 0.257609870313266 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43319057_43319232:BMS1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 43319197 G/A 1 37 33 70 18.1448997574557 16.8167110271341 1.32818873032164 A:T:G G A 10 0.509597303852548 0.811420580881412 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43319057_43319232:BMS1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 43678796 C/T 1 7 5 12 3.43281887303216 2.54798651926274 0.884832353769424 T:C C T 10 0.509597303852548 0.774912283175237 ENSG00000169826:ENST00000374466:exon_43678698_43680756:CSGALNACT2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 43883342 T/A 1 48 44 92 23.5393294150777 22.4222813695121 1.11704804556559 A:T T A 10 0.509597303852548 0.835480689357331 ENSG00000169813:ENST00000357065:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000356053:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000443950:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000337970:exon_43881470_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000477108:exon_43883037_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000498176:exon_43883091_43883384:HNRNPF HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 45924256 T/C 1 2 7 9 0.980805392294904 3.56718112696784 -2.58637573467293 T:C T C 10 0.509597303852548 0.103145007117103 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 50740600 C/T 1 8 5 13 3.92322156917962 2.54798651926274 1.37523504991688 T:C C T 10 0.509597303852548 0.581979954468297 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000447839:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000515869:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000342592:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000462247:exon_50740589_50741024:ERCC6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 53458047 A/G 1 19 10 29 9.31765122680159 5.09597303852548 4.22167818827611 A:G A G 10 0.509597303852548 0.138134151696757 ENSG00000177613:ENST00000331173:exon_53455247_53459355:CSTF2T HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 53458998 A/G 1 13 5 18 6.37523504991688 2.54798651926274 3.82724853065414 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0973482612827023 ENSG00000177613:ENST00000331173:exon_53455247_53459355:CSTF2T HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 58118630 T/C 1 36 16 52 17.6544970613083 8.15355686164077 9.50094019966751 T:C T C 10 0.509597303852548 0.00837106678950092 ENSG00000122952:ENST00000373944:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000494312:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000395405:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000318387:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000460654:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000467523:exon_58118566_58118708:ZWINT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 63851877 G/A 1 11 3 14 5.39442965762197 1.52879191155764 3.86563774606433 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0580035546592849 ENSG00000150347:ENST00000279873:exon_63850621_63856703:ARID5B;ENSG00000150347:ENST00000309334:exon_63850621_63852823:ARID5B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 64927823 C/G 1 34 18 52 16.6736916690134 9.17275146934586 7.50094019966751 C:G C G 10 0.509597303852548 0.0382678051800752 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64926981_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000467356:exon_64926981_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64926990_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64926990_64927894:JMJD1C HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 70856852 G/A 1 129 171 300 63.2619478030213 87.1411389587857 -23.8791911557644 A:G G A 10 0.509597303852548 0.00655674571984557 ENSG00000122862:ENST00000242465:exon_70856840_70856987:SRGN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 70960193 A/G 1 13 5 18 6.37523504991688 2.54798651926274 3.82724853065414 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0973482612827023 ENSG00000156502:ENST00000359655:exon_70960036_70960255:SUPV3L1;ENSG00000156502:ENST00000395093:exon_70960036_70960255:SUPV3L1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 71160828 C/T 1 16 27 43 7.84644313835923 13.7591272040188 -5.91268406565956 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0923441108831123 ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71160747_71161638:HK1;ENSG00000156515:ENST00000470050:exon_71160747_71160874:HK1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 71160897 C/T 1 22 21 43 10.7888593152439 10.7015433809035 0.0873159343404382 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71160747_71161638:HK1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 71969062 G/A 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 A:G G A 10 0.509597303852548 0.74955201040747 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 74894526 A/C 1 48 41 89 23.5393294150777 20.8934894579545 2.64583995712323 A:C A C 10 0.509597303852548 0.597377227982769 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74893414_74894571:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74894283_74894571:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74894283_74894571:ECD HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 75865065 G/A 1 8 5 13 3.92322156917962 2.54798651926274 1.37523504991688 A:G G A 10 0.509597303852548 0.581979954468297 ENSG00000035403:ENST00000372755:exon_75864809_75865111:VCL;ENSG00000035403:ENST00000211998:exon_75864809_75865111:VCL;ENSG00000035403:ENST00000436396:exon_75864809_75865111:VCL;ENSG00000035403:ENST00000472585:exon_75864686_75865111:VCL HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 76990646 G/A 1 12 8 20 5.88483235376942 4.07677843082038 1.80805392294904 A:G G A 10 0.509597303852548 0.505035835457766 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 81926718 A/G 1 36 46 82 17.6544970613083 23.4414759772172 -5.78697891590893 A:G A G 10 0.509597303852548 0.224647694935102 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000481805:exon_81926155_81926740:ANXA11 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 86273249 T/C 1 4 7 11 1.96161078458981 3.56718112696784 -1.60557034237803 T:C T C 10 0.509597303852548 0.379319216476062 ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86273205_86278276:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86273205_86278273:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000494144:exon_86273205_86274161:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000493409:exon_86273205_86273417:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000498300:exon_86273205_86273458:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000466105:exon_86273205_86273452:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000480006:exon_86273205_86273626:FAM190B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 88277457 C/T 1 13 8 21 6.37523504991688 4.07677843082038 2.29845661909649 T:C C T 10 0.509597303852548 0.385166903646358 ENSG00000062650:ENST00000342368:exon_88277328_88277848:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000298767:exon_88277328_88277848:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000372076:exon_88277328_88277848:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000420749:exon_88277328_88277848:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000263070:exon_88277328_88277848:WAPAL HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 88730312 T/C 1 20 5 25 9.80805392294904 2.54798651926274 7.2600674036863 T:C T C 10 0.509597303852548 0.00424129263104532 ENSG00000148671:ENST00000372013:exon_88730233_88730672:C10orf116;ENSG00000148671:ENST00000372012:exon_88730233_88730487:C10orf116 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 90771829 T/C 1 31 19 50 15.202483580571 9.68234877319841 5.5201348073726 T:C T C 10 0.509597303852548 0.122310845329014 ENSG00000026103:ENST00000371875:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355740:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000352159:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000484444:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000357339:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000479522:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000488877:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000492756:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355279:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000313771:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000494799:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000487314:exon_90771756_90771838:FAS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 91162677 C/T 1 19 6 25 9.31765122680159 3.05758382311529 6.2600674036863 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0150776702699848 ENSG00000185745:ENST00000371804:exon_91162038_91163745:IFIT1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 91178000 C/T 1 19 12 31 9.31765122680159 6.11516764623058 3.20248358057101 T:C C T 10 0.509597303852548 0.283797204409808 ENSG00000152778:ENST00000371795:exon_91176962_91180758:IFIT5;ENSG00000152778:ENST00000416601:exon_91177575_91178576:IFIT5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 95279506 A/T 1 8 8 16 3.92322156917962 4.07677843082038 -0.153556861640768 A:T A T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000496302:exon_95279439_95280034:CEP55 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 95454681 G/C 1 18 10 28 8.82724853065414 5.09597303852548 3.73127549212866 C:G G C 10 0.509597303852548 0.187200729145019 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95454618_95454694:FRA10AC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 95458141 A/G 1 22 8 30 10.7888593152439 4.07677843082038 6.71208088442356 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0167006595176935 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95458058_95458153:FRA10AC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 95459817 C/T 1 22 5 27 10.7888593152439 2.54798651926274 8.24087279598121 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00159215671522188 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95459787_95459863:FRA10AC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 96114640 T/C 1 13 3 16 6.37523504991688 1.52879191155764 4.84644313835923 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0216395245326523 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 96313960 A/C 1 17 25 42 8.33684583450668 12.7399325963137 -4.40308676180702 A:C A C 10 0.509597303852548 0.216686654277843 ENSG00000119969:ENST00000419900:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000348459:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000437940:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000371332:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394045:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394044:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394036:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000239026:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000462057:exon_96313881_96314005:HELLS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 97605057 C/G 1 14 22 36 6.86563774606433 11.2111406847561 -4.34550293869173 C:G C G 10 0.509597303852548 0.182126458291279 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 97607165 G/A 1 13 23 36 6.37523504991688 11.7207379886086 -5.34550293869173 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0945874232227755 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 97990583 A/G 1 18 27 45 8.82724853065414 13.7591272040188 -4.93187867336466 A:G A G 10 0.509597303852548 0.179079133275381 ENSG00000095585:ENST00000413476:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393894:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000428924:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000427367:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000224337:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000371176:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393889:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000467799:exon_97990550_97990590:BLNK HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 99219885 G/A 1 8 6 14 3.92322156917962 3.05758382311529 0.865637746064328 A:G G A 10 0.509597303852548 0.79106698341654 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000485400:exon_99219119_99220076:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99219830_99219989:MMS19 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 99220707 C/T 1 5 6 11 2.45201348073726 3.05758382311529 -0.605570342378028 T:C C T 10 0.509597303852548 0.770507260060939 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99220664_99221123:MMS19 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 99504630 G/T 1 10 4 14 4.90402696147452 2.03838921541019 2.86563774606433 T:G G T 10 0.509597303852548 0.180690507474734 ENSG00000155256:ENST00000393677:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000370610:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000370613:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000337540:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000497994:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000356257:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000453958:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000359980:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000423811:exon_99504486_99504672:ZFYVE27 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 99969475 A/C 1 12 2 14 5.88483235376942 1.0191946077051 4.86563774606433 A:C A C 10 0.509597303852548 0.0131607574589523 ENSG00000166024:ENST00000298999:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000314594:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000370584:exon_99967858_99969656:C10orf28 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 99969568 A/G 1 1 9 10 0.490402696147452 4.58637573467293 -4.09597303852548 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0103454948738643 ENSG00000166024:ENST00000298999:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000314594:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000370584:exon_99967858_99969656:C10orf28 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 101502968 A/G 1 5 21 26 2.45201348073726 10.7015433809035 -8.24952990016625 A:G A G 10 0.509597303852548 0.00128195047478603 ENSG00000119929:ENST00000493385:exon_101502910_101503080:CUTC;ENSG00000119929:ENST00000370476:exon_101502910_101503119:CUTC;ENSG00000119929:ENST00000471520:exon_101502910_101503119:CUTC;ENSG00000119929:ENST00000370472:exon_101502910_101503119:CUTC HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 102006625 G/A 1 9 2 11 4.41362426532707 1.0191946077051 3.39442965762197 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0659641183816961 ENSG00000095485:ENST00000472872:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000468709:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000354105:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000338048:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000482452:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000370379:exon_102006552_102006668:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000466955:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000496796:exon_102006552_102006692:CWF19L1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 102247408 C/A 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 A:C C A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000075826:ENST00000370345:exon_102246399_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000485800:exon_102246403_102247855:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000492667:exon_102246404_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000479697:exon_102246404_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000462434:exon_102246405_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000469546:exon_102246542_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000482456:exon_102246681_102247552:SEC31B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 102247526 G/C 1 2 6 8 0.980805392294904 3.05758382311529 -2.07677843082038 C:G G C 10 0.509597303852548 0.171857042968518 ENSG00000075826:ENST00000370345:exon_102246399_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000485800:exon_102246403_102247855:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000492667:exon_102246404_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000479697:exon_102246404_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000462434:exon_102246405_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000469546:exon_102246542_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000482456:exon_102246681_102247552:SEC31B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 102746503 C/T 1 72 43 115 35.3089941226165 21.9126840656596 13.396310056957 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0149616378722122 ENSG00000055950:ENST00000370236:exon_102746444_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000493646:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000318364:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000477279:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000487059:exon_102746345_102746953:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000338931:exon_102746376_102746576:MRPL43 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 102766574 A/G 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102766242_102767593:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102766242_102766586:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102766242_102767593:LZTS2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 102766862 C/T 1 8 13 21 3.92322156917962 6.62476495008312 -2.70154338090351 T:C C T 10 0.509597303852548 0.278772582952036 ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102766242_102767593:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102766242_102767593:LZTS2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 105657363 C/G 1 9 6 15 4.41362426532707 3.05758382311529 1.35604044221178 C:G C G 10 0.509597303852548 0.608250593906015 ENSG00000107960:ENST00000224950:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000369764:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000466828:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000472951:exon_105657306_105657477:OBFC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 112266771 C/T 1 59 18 77 28.9337590726997 9.17275146934586 19.7610076033538 T:C C T 10 0.509597303852548 5.60295962992651e-06 ENSG00000138166:ENST00000369583:exon_112266693_112266912:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000476681:exon_112266693_112266864:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000468749:exon_112266693_112266912:DUSP5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 120933360 A/G 1 10 5 15 4.90402696147452 2.54798651926274 2.35604044221178 A:G A G 10 0.509597303852548 0.303107408657847 ENSG00000165672:ENST00000356951:exon_120933249_120933384:PRDX3;ENSG00000165672:ENST00000298510:exon_120933249_120933384:PRDX3;ENSG00000165672:ENST00000463322:exon_120933257_120933384:PRDX3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 122649482 A/G 1 8 3 11 3.92322156917962 1.52879191155764 2.39442965762197 A:G A G 10 0.509597303852548 0.227512016275758 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122649407_122649521:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122649407_122649521:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122649407_122649521:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000478567:exon_122649407_122649521:WDR11 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 122665459 C/G 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 C:G C G 10 0.509597303852548 0.5085374516326 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000415501:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122665388_122666367:WDR11 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 129900854 G/A 1 108 88 196 52.9634911839248 44.8445627390242 8.1189284449006 A:G G A 10 0.509597303852548 0.253672719461379 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129900843_129901392:MKI67 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 129903802 A/G 1 28 37 65 13.7312754921287 18.8551002425443 -5.12382475041562 A:G A G 10 0.509597303852548 0.216400361536403 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 133761285 G/A 1 9 7 16 4.41362426532707 3.56718112696784 0.846443138359232 A:G G A 10 0.509597303852548 0.80419746365061 ENSG00000175470:ENST00000455566:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000482010:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000422256:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000398018:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000490777:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000470416:exon_133761034_133761295:PPP2R2D HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 135076523 C/A 1 53 89 142 25.991342895815 45.3541600428768 -19.3628171470618 A:C C A 10 0.509597303852548 0.00134637695226278 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 135076596 T/C 1 39 52 91 19.1257051497506 26.4990598003325 -7.37335465058187 T:C T C 10 0.509597303852548 0.141853949225458 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 135076758 T/C 1 11 4 15 5.39442965762197 2.03838921541019 3.35604044221178 T:C T C 10 0.509597303852548 0.119482056883178 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 135082346 A/G 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 A:G A G 10 0.509597303852548 0.499988077920146 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 135085426 A/G 1 11 6 17 5.39442965762197 3.05758382311529 2.33684583450668 A:G A G 10 0.509597303852548 0.333835168817674 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 135097434 A/G 1 12 5 17 5.88483235376942 2.54798651926274 3.33684583450668 A:G A G 10 0.509597303852548 0.144715116186652 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000417178:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368562:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135097386_135097506:TUBGCP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 135098672 G/A 1 5 13 18 2.45201348073726 6.62476495008312 -4.17275146934586 A:G G A 10 0.509597303852548 0.059364647228317 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000417178:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368562:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135098589_135098717:TUBGCP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 10 135112940 C/T 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 T:C C T 10 0.509597303852548 0.499988077920146 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000487796:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000470829:exon_135112939_135113107:TUBGCP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 233067 C/T 1 5 8 13 2.45201348073726 4.07677843082038 -1.62476495008312 T:C C T 10 0.509597303852548 0.415960200620574 ENSG00000142082:ENST00000382743:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532837:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525319:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000524564:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532956:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529382:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000531753:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000526854:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529055:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528702:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000530067:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528469:exon_232983_233215:SIRT3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 233212 C/A 1 7 13 20 3.43281887303216 6.62476495008312 -3.19194607705096 A:C C A 10 0.509597303852548 0.182296042530127 ENSG00000142082:ENST00000382743:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532837:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525319:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000524564:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532956:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529382:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000531753:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000526854:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529055:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528702:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000530067:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528469:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525776:exon_233192_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525237:exon_233209_233215:SIRT3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 290891 T/C 1 17 8 25 8.33684583450668 4.07677843082038 4.2600674036863 T:C T C 10 0.509597303852548 0.109366962829306 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_290678_292095:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_290658_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_290678_291113:ATHL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 290918 G/A 1 12 9 21 5.88483235376942 4.58637573467293 1.29845661909649 A:G G A 10 0.509597303852548 0.664861077872976 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_290678_292095:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_290658_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_290678_291113:ATHL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 294119 C/T 1 95 68 163 46.5882561340079 34.6526166619733 11.9356394720347 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0712592710157023 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000476372:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000397660:exon_294099_294196:ATHL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 294375 C/T 1 76 49 125 37.2706049072064 24.9702678887749 12.3003370184315 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0314815485011446 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_294267_294478:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_294267_294478:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_294267_294478:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_294267_294478:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_294267_294478:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000476372:exon_294267_294478:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000397660:exon_294321_294478:ATHL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 308180 A/G 1 19 12 31 9.31765122680159 6.11516764623058 3.20248358057101 A:G A G 10 0.509597303852548 0.283797204409808 ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_308163_308438:IFITM2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 309127 A/G 1 115 114 229 56.396310056957 58.0940926391905 -1.69778258223349 A:G A G 10 0.509597303852548 0.842994570885515 ENSG00000185201:ENST00000533141:exon_309013_309230:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_309013_309395:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000443559:exon_309063_309252:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000327366:exon_309063_309272:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000527146:exon_309013_309392:IFITM2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 499120 G/A 1 34 45 79 16.6736916690134 22.9318786733647 -6.25818700435129 A:G G A 10 0.509597303852548 0.177151871446995 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_499015_499999:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529115:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000527485:exon_499031_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529368:exon_499047_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529306:exon_499062_499185:RNH1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 562219 C/G 1 9 10 19 4.41362426532707 5.09597303852548 -0.682348773198411 A:C:G C G 10 0.509597303852548 0.821015503596854 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_562084_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000524468:exon_562079_562456:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_562079_562776:RASSF7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 598481 G/T 1 4 7 11 1.96161078458981 3.56718112696784 -1.60557034237803 T:G G T 10 0.509597303852548 0.379319216476062 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_598373_598502:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_598373_598502:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_598373_598502:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_598373_598502:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_598373_598502:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_598373_598502:PHRF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 612967 A/G 1 14 14 28 6.86563774606433 7.13436225393567 -0.268724507871344 A:G A G 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 613165 G/C 1 26 4 30 12.7504700998338 2.03838921541019 10.7120808844236 C:G G C 10 0.509597303852548 6.46667066955474e-05 ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 613192 A/G 1 22 3 25 10.7888593152439 1.52879191155764 9.2600674036863 A:G A G 10 0.509597303852548 0.000166600671010493 ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 613208 T/C 1 135 141 276 66.204363979906 71.8532198432093 -5.64885586330324 T:C T C 10 0.509597303852548 0.508248144611543 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_613206_613595:IRF7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 613297 T/G 1 123 167 290 60.3195316261366 85.1027497433755 -24.7832181172389 T:G T G 10 0.509597303852548 0.00394037110614952 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_613206_613595:IRF7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 614318 T/C 1 58 67 125 28.4433563765522 34.1430193581207 -5.6996629815685 T:C T C 10 0.509597303852548 0.325770479875149 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000534109:exon_614203_614534:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000525750:exon_613785_614397:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000527160:exon_614009_614534:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532096:exon_614090_614399:IRF7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 615010 G/T 1 12 7 19 5.88483235376942 3.56718112696784 2.31765122680159 T:G G T 10 0.509597303852548 0.360981209646244 ENSG00000185507:ENST00000533190:exon_614783_615259:IRF7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 615011 A/T 1 12 7 19 5.88483235376942 3.56718112696784 2.31765122680159 A:T A T 10 0.509597303852548 0.360981209646244 ENSG00000185507:ENST00000533190:exon_614783_615259:IRF7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 771034 A/G 1 15 4 19 7.35604044221178 2.03838921541019 5.31765122680159 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0196199845247410 ENSG00000177225:ENST00000465313:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000319863:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000354286:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000479959:exon_768386_771467:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000524550:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000532320:exon_770550_771426:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000530209:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000534603:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000529966:exon_770993_771212:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000533960:exon_770844_771104:PDDC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 837582 G/A 1 21 30 51 10.2984566190965 15.2879191155764 -4.98946249647995 A:G G A 10 0.509597303852548 0.207070401095891 ENSG00000177697:ENST00000397420:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000397421:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000436957:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000322008:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000529810:exon_837460_837613:CD151;ENSG00000177697:ENST00000528143:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000530726:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000532045:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000528011:exon_837460_837612:CD151;ENSG00000177697:ENST00000532075:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_837356_837605:POLR2L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 840363 C/T 1 114 108 222 55.9059073608095 55.0365088160752 0.869398544734345 T:C C T 10 0.509597303852548 0.946509329386907 ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_840262_840480:POLR2L;ENSG00000177700:ENST00000322028:exon_839721_840480:POLR2L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 840477 A/G 1 322 239 561 157.90966815948 121.793755620759 36.1159125387206 A:G A G 10 0.509597303852548 0.00234463588850454 ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_840262_840480:POLR2L;ENSG00000177700:ENST00000322028:exon_839721_840480:POLR2L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 1011490 G/A 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000417081:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000329626:exon_1010967_1011602:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_1010548_1012239:AP2A2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 1309956 C/T 1 8 3 11 3.92322156917962 1.52879191155764 2.39442965762197 T:C C T 10 0.509597303852548 0.227512016275758 ENSG00000078902:ENST00000317204:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000527886:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000525159:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000263646:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000382211:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000530506:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000530541:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000528719:exon_1309866_1310006:TOLLIP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 1780205 A/G 1 14 6 20 6.86563774606433 3.05758382311529 3.80805392294904 A:T:G A G 10 0.509597303852548 0.116652704888565 ENSG00000250644:ENST00000427721:exon_1780199_1780281:RP11-295K3.1;ENSG00000117984:ENST00000236671:exon_1780199_1780317:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000407742:exon_1780199_1780317:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000433655:exon_1780199_1780317:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000438213:exon_1780199_1780317:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000367196:exon_1780199_1780317:CTSD HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 1780867 G/A 1 3 12 15 1.47120808844236 6.11516764623058 -4.64395955778822 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0191890404390731 ENSG00000117984:ENST00000236671:exon_1780746_1780869:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000407742:exon_1780746_1780869:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000433655:exon_1780746_1780869:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000438213:exon_1780746_1780869:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000367196:exon_1780746_1780869:CTSD HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 1782594 G/A 1 7 1 8 3.43281887303216 0.509597303852548 2.92322156917962 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0707155477569663 ENSG00000117984:ENST00000236671:exon_1782539_1782698:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000407742:exon_1782539_1782698:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000433655:exon_1782539_1782698:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000438213:exon_1782539_1782770:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000367196:exon_1782539_1782698:CTSD HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 1959707 C/T 1 10 2 12 4.90402696147452 1.0191946077051 3.88483235376942 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0389900147787838 ENSG00000130595:ENST00000278317:exon_1959668_1959936:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000381549:exon_1959668_1959935:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000381561:exon_1959668_1959935:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000397309:exon_1959668_1959935:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000381548:exon_1959668_1959935:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000360603:exon_1959668_1959935:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000381589:exon_1959668_1959936:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000381579:exon_1959668_1959936:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000381557:exon_1959668_1959931:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000381563:exon_1959668_1959722:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000344578:exon_1959668_1959722:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000381558:exon_1959668_1959936:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000397301:exon_1959668_1959722:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000397304:exon_1959668_1959722:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000446240:exon_1959668_1959722:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000473100:exon_1959668_1959932:TNNT3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 1972143 G/A 1 8 11 19 3.92322156917962 5.60557034237803 -1.68234877319841 A:G G A 10 0.509597303852548 0.496599009223979 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397297:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381514:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397294:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000486931:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000466346:exon_1972140_1972251:MRPL23 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 1972205 G/A 1 16 32 48 7.84644313835923 16.3071137232815 -8.4606705849223 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0199301693664495 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397297:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381514:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397294:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000486931:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000466346:exon_1972140_1972251:MRPL23 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 3022455 C/T 1 110 114 224 53.9442965762197 58.0940926391905 -4.14979606297075 A:T:C C T 10 0.509597303852548 0.593394905239814 ENSG00000110619:ENST00000380525:exon_3022152_3022478:CARS;ENSG00000110619:ENST00000531387:exon_3022152_3022478:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397111:exon_3022152_3022478:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397114:exon_3022152_3022478:CARS;ENSG00000110619:ENST00000484484:exon_3022159_3022478:CARS;ENSG00000110619:ENST00000278224:exon_3022159_3022478:CARS;ENSG00000110619:ENST00000466442:exon_3022160_3022478:CARS;ENSG00000110619:ENST00000470221:exon_3022160_3022478:CARS;ENSG00000110619:ENST00000526890:exon_3022160_3022478:CARS;ENSG00000110619:ENST00000529772:exon_3022160_3022478:CARS;ENSG00000110619:ENST00000401769:exon_3022160_3022478:CARS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 3028140 G/A 1 19 36 55 9.31765122680159 18.3455029386917 -9.02785171189014 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0153014283826437 ENSG00000110619:ENST00000380525:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000531387:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397111:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397114:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000484484:exon_3028109_3028240:CARS;ENSG00000110619:ENST00000278224:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000466442:exon_3028109_3030127:CARS;ENSG00000110619:ENST00000470221:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000526890:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000529772:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000401769:exon_3028109_3028189:CARS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 3381369 G/C 1 20 18 38 9.80805392294904 9.17275146934586 0.635302453603177 C:G G C 10 0.509597303852548 0.87231182720855 ENSG00000005801:ENST00000354599:exon_3379157_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000399602:exon_3379996_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000429541:exon_3380175_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000005082:exon_3380224_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000526601:exon_3380347_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000343338:exon_3381174_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000438262:exon_3381227_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000528410:exon_3381269_3381795:ZNF195 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 4411241 C/T 1 16 15 31 7.84644313835923 7.64395955778822 0.202483580571013 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000132109:ENST00000254436:exon_4411232_4411688:TRIM21 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 5688940 C/T 1 6 6 12 2.94241617688471 3.05758382311529 -0.115167646230576 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5688919_5688941:TRIM5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 5701001 C/T 1 18 4 22 8.82724853065414 2.03838921541019 6.78885931524395 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00449436713361922 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5700991_5701037:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700991_5701087:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000465634:exon_5700991_5701063:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700991_5701161:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 5701409 G/C 1 7 12 19 3.43281887303216 6.11516764623058 -2.68234877319841 C:G G C 10 0.509597303852548 0.255561328037084 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000419850:exon_5701192_5701468:TRIM5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 5717762 T/C 1 58 45 103 28.4433563765522 22.9318786733647 5.51147770318756 T:C T C 10 0.509597303852548 0.280550071384800 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000460454:exon_5717397_5718243:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5717722_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5717732_5717885:TRIM22 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 5718517 G/A 1 68 52 120 33.3473833380267 26.4990598003325 6.84832353769424 A:G G A 10 0.509597303852548 0.235308330374295 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5718478_5718573:TRIM22 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 5719750 G/C 1 84 98 182 41.193826476386 49.9405357775497 -8.74670930116373 C:G G C 10 0.509597303852548 0.207728384448912 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5719710_5719775:TRIM22 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 6340706 A/G 1 3 8 11 1.47120808844236 4.07677843082038 -2.60557034237803 A:G A G 10 0.509597303852548 0.139008716253398 ENSG00000170955:ENST00000532354:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6340360_6340901:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6340374_6340794:PRKCDBP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 6341684 C/G 1 12 9 21 5.88483235376942 4.58637573467293 1.29845661909649 C:G C G 10 0.509597303852548 0.664861077872976 ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6341323_6341877:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6341323_6341762:PRKCDBP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 6341748 C/T 1 8 1 9 3.92322156917962 0.509597303852548 3.41362426532707 T:C C T 10 0.509597303852548 0.039373498903222 ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6341323_6341877:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6341323_6341762:PRKCDBP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 6415463 G/A 1 5 9 14 2.45201348073726 4.58637573467293 -2.13436225393567 A:G G A 10 0.509597303852548 0.293559675506127 ENSG00000166311:ENST00000299397:exon_6415428_6416225:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000356761:exon_6415428_6416225:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000342245:exon_6415428_6416225:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000534405:exon_6415428_6416221:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000527275:exon_6415428_6416008:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000533123:exon_6415428_6416228:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000531303:exon_6415408_6416008:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000526280:exon_6415428_6416228:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000531336:exon_6415126_6415603:SMPD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 6622714 G/A 1 12 5 17 5.88483235376942 2.54798651926274 3.33684583450668 A:G G A 10 0.509597303852548 0.144715116186652 ENSG00000132275:ENST00000254605:exon_6622379_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000533907:exon_6622156_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000530762:exon_6622484_6622832:RRP8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 8414229 G/T 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 T:G G T 10 0.509597303852548 0.499988077920146 ENSG00000130413:ENST00000473980:exon_8413418_8414257:STK33;ENSG00000130413:ENST00000486305:exon_8413418_8414257:STK33;ENSG00000130413:ENST00000447869:exon_8413418_8414257:STK33;ENSG00000130413:ENST00000315204:exon_8413418_8414257:STK33;ENSG00000130413:ENST00000396672:exon_8413418_8414257:STK33;ENSG00000130413:ENST00000358872:exon_8413418_8414257:STK33;ENSG00000130413:ENST00000396673:exon_8413418_8414257:STK33;ENSG00000130413:ENST00000444064:exon_8413426_8414257:STK33;ENSG00000130413:ENST00000534493:exon_8413734_8414257:STK33 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 8933064 G/A 1 15 30 45 7.35604044221178 15.2879191155764 -7.93187867336466 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0242530205680764 ENSG00000166452:ENST00000299576:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000309377:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000309357:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000426510:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000529876:exon_8932736_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000525005:exon_8932739_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000524577:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000534506:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000396648:exon_8932885_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000534147:exon_8932990_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000529942:exon_8933012_8933218:C11orf17 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 8977830 A/G 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 A:G A G 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000175348:ENST00000309134:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000534025:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000525069:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000528117:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000530136:exon_8977737_8977845:TMEM9B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 9749554 T/G 1 7 4 11 3.43281887303216 2.03838921541019 1.39442965762197 T:G T G 10 0.509597303852548 0.549658645750086 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 9749645 A/C 1 6 8 14 2.94241617688471 4.07677843082038 -1.13436225393567 A:C A C 10 0.509597303852548 0.601095068648336 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000524817:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534662:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534562:exon_9749600_9749746:SWAP70 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 9754221 C/T 1 7 11 18 3.43281887303216 5.60557034237803 -2.17275146934586 T:C C T 10 0.509597303852548 0.351502463188979 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000524817:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534662:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534562:exon_9754076_9754257:SWAP70 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 9769562 C/G 1 26 34 60 12.7504700998338 17.3263083309866 -4.57583823115288 C:G C G 10 0.509597303852548 0.247727743437852 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9769405_9769603:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9769405_9769603:SWAP70 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 18555901 C/G 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 C:G C G 10 0.509597303852548 0.5085374516326 ENSG00000151116:ENST00000396197:exon_18555877_18556000:UEVLD;ENSG00000151116:ENST00000379387:exon_18555877_18556000:UEVLD HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 27362359 T/G 1 31 6 37 15.202483580571 3.05758382311529 12.1448997574557 T:G T G 10 0.509597303852548 4.59614156987878e-05 ENSG00000109881:ENST00000529615:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000343895:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000328697:exon_27362243_27362384:CCDC34 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 32124978 T/C 1 15 4 19 7.35604044221178 2.03838921541019 5.31765122680159 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0196199845247410 ENSG00000049449:ENST00000532942:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000054950:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000533898:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000532474:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000527337:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000531345:exon_32123541_32125026:RCN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 32955122 A/G 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000060749:ENST00000399302:exon_32953289_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000078652:exon_32954638_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000428421:exon_32953289_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000527788:exon_32954638_32956981:QSER1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 33106616 C/T 1 12 15 27 5.88483235376942 7.64395955778822 -1.7591272040188 T:C C T 10 0.509597303852548 0.56601930423381 ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33106496_33106666:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33106496_33106744:TCP11L1;ENSG00000176102:ENST00000528865:exon_33106578_33106835:CSTF3;ENSG00000176102:ENST00000323959:exon_33106130_33106835:CSTF3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 33880896 T/A 1 12 2 14 5.88483235376942 1.0191946077051 4.86563774606433 A:T T A 10 0.509597303852548 0.0131607574589523 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33880125_33881121:LMO2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 34909926 T/G 1 19 10 29 9.31765122680159 5.09597303852548 4.22167818827611 T:G T G 10 0.509597303852548 0.138134151696757 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34909840_34909975:APIP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 34910397 C/T 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 T:C C T 10 0.509597303852548 0.541646560898822 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34910299_34910416:APIP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 34937813 G/A 1 8 5 13 3.92322156917962 2.54798651926274 1.37523504991688 A:G G A 10 0.509597303852548 0.581979954468297 ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34937775_34938046:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34937775_34937939:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34937775_34937898:APIP;ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34937677_34938033:PDHX HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 34938265 C/T 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 T:C C T 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34938119_34938362:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000430469:exon_34938179_34938362:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000533262:exon_34938188_34938362:PDHX HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 34991727 T/C 1 6 4 10 2.94241617688471 2.03838921541019 0.90402696147452 T:C T C 10 0.509597303852548 0.75435926131823 ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34991686_34991833:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34991686_34991833:PDHX HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 35201842 C/T 1 27 31 58 13.2408727959812 15.797516419429 -2.55664362344778 T:C C T 10 0.509597303852548 0.514490241124361 ENSG00000026508:ENST00000263398:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000360158:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437706:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000449691:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000423360:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433354:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437835:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000415148:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528086:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000428726:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433892:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000434472:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000352818:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000442151:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000525211:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526669:exon_35201821_35201876:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526000:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000279452:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000527889:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531118:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528455:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531873:exon_35201826_35201954:CD44 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 43702530 A/G 1 14 12 26 6.86563774606433 6.11516764623058 0.750470099833752 A:G A G 10 0.509597303852548 0.845759645675331 ENSG00000149084:ENST00000531185:exon_43702259_43702537:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000278353:exon_43702259_43702537:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000395700:exon_43702331_43702537:HSD17B12 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 44104981 C/T 1 3 40 43 1.47120808844236 20.3838921541019 -18.9126840656596 T:C C T 10 0.509597303852548 9.60814758894996e-10 ENSG00000110455:ENST00000448099:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000432284:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000263776:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000527346:exon_44104974_44105127:ACCS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 44636839 C/T 1 39 65 104 19.1257051497506 33.1238247504156 -13.998119600665 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00778824144058072 ENSG00000085117:ENST00000526958:exon_44636822_44636845:CD82;ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530601:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44636822_44636923:CD82 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 47266414 G/A 0 9 0 9 4.41362426532707 0 4.41362426532707 G G 10 0.509597303852548 0.00395812771304115 ENSG00000134575:ENST00000256997:exon_47266286_47266418:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000529444:exon_47266286_47266418:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000534448:exon_47266286_47266418:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000527256:exon_47266286_47266418:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000531004:exon_47266286_47266418:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000533929:exon_47266286_47266418:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000525230:exon_47266286_47266511:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000531547:exon_47266286_47266418:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000529663:exon_47266286_47266418:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000524769:exon_47266286_47266929:ACP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 47436600 T/C 1 6 6 12 2.94241617688471 3.05758382311529 -0.115167646230576 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000165915:ENST00000362021:exon_47436590_47436710:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000524928:exon_47435148_47438045:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000528979:exon_47436328_47436646:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000524886:exon_47436413_47436710:SLC39A13 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 47444122 T/C 1 4 7 11 1.96161078458981 3.56718112696784 -1.60557034237803 T:C T C 10 0.509597303852548 0.379319216476062 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 47640429 G/C 1 19 27 46 9.31765122680159 13.7591272040188 -4.44147597721721 C:G G C 10 0.509597303852548 0.237841793834140 ENSG00000109919:ENST00000302503:exon_47638868_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000534074:exon_47640256_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000531669:exon_47640262_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000525649:exon_47640391_47640471:MTCH2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 47657101 C/T 1 30 11 41 14.7120808844236 5.60557034237803 9.10651054204553 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00461166153035136 ENSG00000109919:ENST00000302503:exon_47657097_47657123:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000525649:exon_47657097_47657123:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000530558:exon_47657097_47657123:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000533571:exon_47657097_47657123:MTCH2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 57463500 T/C 0 8 0 8 3.92322156917962 0 3.92322156917962 T T 10 0.509597303852548 0.00789316895639457 ENSG00000156599:ENST00000527985:exon_57463392_57463515:ZDHHC5;ENSG00000156599:ENST00000287169:exon_57463392_57463515:ZDHHC5;ENSG00000156599:ENST00000529480:exon_57463392_57463515:ZDHHC5;ENSG00000156599:ENST00000529447:exon_57463392_57463515:ZDHHC5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 58318619 C/G 1 14 13 27 6.86563774606433 6.62476495008312 0.240872795981204 C:G C G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000110031:ENST00000530561:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000395074:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528954:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000263845:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000412226:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528489:exon_58318538_58318705:LPXN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 58378424 A/G 1 18 16 34 8.82724853065414 8.15355686164077 0.673691669013369 A:G A G 10 0.509597303852548 0.865014513214598 ENSG00000186660:ENST00000316059:exon_58378423_58378527:ZFP91;ENSG00000186660:ENST00000389918:exon_58378423_58378527:ZFP91;ENSG00000255073:ENST00000389919:exon_58378423_58378527:AP001350.3;ENSG00000255073:ENST00000422974:exon_58378423_58378527:AP001350.3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 58919813 A/G 1 19 24 43 9.31765122680159 12.2303352924612 -2.91268406565956 A:G A G 10 0.509597303852548 0.44621154544352 ENSG00000166801:ENST00000528737:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000435774:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000423534:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000420244:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000361723:exon_58919223_58922509:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000440740:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000533703:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000531147:exon_58919223_58922509:FAM111A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 61213555 C/T 1 47 28 75 23.0489267189302 14.2687245078713 8.7802022110589 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0491645298601951 ENSG00000167985:ENST00000301761:exon_61213413_61214225:SDHAF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 63396818 T/C 1 32 23 55 15.6928862767185 11.7207379886086 3.97214828810986 T:C T C 10 0.509597303852548 0.345259603907093 ENSG00000184743:ENST00000332645:exon_63391560_63396877:ATL3;ENSG00000184743:ENST00000398868:exon_63391560_63396877:ATL3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 63585804 C/A 1 4 16 20 1.96161078458981 8.15355686164077 -6.19194607705096 A:C C A 10 0.509597303852548 0.00632201168593267 ENSG00000168005:ENST00000294244:exon_63585688_63585837:C11orf84 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 63970625 G/A 1 31 41 72 15.202483580571 20.8934894579545 -5.69100587738345 A:G G A 10 0.509597303852548 0.195574585480347 ENSG00000168439:ENST00000358794:exon_63970597_63970700:STIP1;ENSG00000168439:ENST00000305218:exon_63970597_63970700:STIP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 63979162 C/T 1 52 40 92 25.5009401996675 20.3838921541019 5.11704804556559 T:C C T 10 0.509597303852548 0.298611463689559 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63979117_63979219:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63979117_63979219:FERMT3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 63990505 C/G 1 16 9 25 7.84644313835923 4.58637573467293 3.2600674036863 C:G C G 10 0.509597303852548 0.231674186241233 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 64110668 G/A 1 8 7 15 3.92322156917962 3.56718112696784 0.35604044221178 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64110651_64110797:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64110651_64110797:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64110651_64110797:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64110651_64110797:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494566:exon_64110651_64110802:CCDC88B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 64110683 G/C 1 8 6 14 3.92322156917962 3.05758382311529 0.865637746064328 C:G G C 10 0.509597303852548 0.79106698341654 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64110651_64110797:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64110651_64110797:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64110651_64110797:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64110651_64110797:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494566:exon_64110651_64110802:CCDC88B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 64124515 T/C 1 247 183 430 121.129465948421 93.2563066050163 27.8731593434044 T:C:G T C 10 0.509597303852548 0.00791237342566497 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64124511_64124996:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64124511_64125006:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64124511_64125005:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64124511_64124996:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64124511_64124958:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000359902:exon_64124511_64124997:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000443542:exon_64124511_64125005:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000491320:exon_64124511_64125002:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000479965:exon_64122666_64125000:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000473405:exon_64124511_64124842:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000472524:exon_64124511_64125003:CCDC88B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 64138805 T/C 1 15 9 24 7.35604044221178 4.58637573467293 2.76966470753885 T:C T C 10 0.509597303852548 0.30960696984938 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64138755_64139686:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64138755_64139157:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000530504:exon_64138755_64138813:RPS6KA4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 64138905 T/G 1 8 2 10 3.92322156917962 1.0191946077051 2.90402696147452 T:G T G 10 0.509597303852548 0.110022635989167 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64138755_64139686:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64138755_64139157:RPS6KA4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 64496357 G/T 1 3 14 17 1.47120808844236 7.13436225393567 -5.66315416549332 T:G G T 10 0.509597303852548 0.00660613427908658 ENSG00000068831:ENST00000464324:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000377494:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000421556:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000394432:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000377497:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000354024:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000488071:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000437237:exon_64496335_64496514:RASGRP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 64572602 G/A 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 A:G G A 10 0.509597303852548 0.541646560898822 ENSG00000133895:ENST00000377321:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377326:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000312049:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000315422:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000448517:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000449150:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000337652:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394376:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394373:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000443283:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394374:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000417021:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377313:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000478548:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000487019:exon_64572598_64572670:MEN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 64622869 G/C 1 38 48 86 18.6353024536032 24.4606705849223 -5.82536813131913 C:G G C 10 0.509597303852548 0.235605411261856 ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000484846:exon_64622794_64624135:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421510:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000498472:exon_64622524_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64622794_64622958:EHD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 64645871 A/G 1 12 21 33 5.88483235376942 10.7015433809035 -4.81671102713408 A:G A G 10 0.509597303852548 0.116511284590118 ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64645533_64646191:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000466015:exon_64645533_64646013:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000457202:exon_64645533_64645956:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000411683:exon_64645533_64645959:EHD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 64789194 T/C 1 57 42 99 27.9529536804048 21.403086761807 6.54986691859775 T:C T C 10 0.509597303852548 0.192874925898249 ENSG00000213465:ENST00000246747:exon_64789193_64789656:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529384:exon_64789193_64789360:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000533729:exon_64789193_64789632:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529254:exon_64788988_64789588:ARL2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 64799998 T/C 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 T:C T C 10 0.509597303852548 0.499988077920146 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000529673:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000534637:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000524831:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000525648:exon_64799903_64800023:SNX15 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 64807235 C/T 1 4 8 12 1.96161078458981 4.07677843082038 -2.11516764623058 T:C C T 10 0.509597303852548 0.258556419599671 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64807158_64808042:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64807158_64808044:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64807158_64807264:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64807158_64808042:SNX15 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 64846569 C/T 1 8 3 11 3.92322156917962 1.52879191155764 2.39442965762197 T:C C T 10 0.509597303852548 0.227512016275758 ENSG00000146670:ENST00000275517:exon_64844924_64846659:CDCA5;ENSG00000146670:ENST00000524733:exon_64846105_64846659:CDCA5;ENSG00000146670:ENST00000404147:exon_64846560_64847259:CDCA5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 64854812 G/A 1 16 8 24 7.84644313835923 4.07677843082038 3.76966470753885 A:G G A 10 0.509597303852548 0.153397563257600 ENSG00000162300:ENST00000294258:exon_64854788_64854905:ZFPL1;ENSG00000162300:ENST00000530744:exon_64854788_64854882:ZFPL1;ENSG00000162300:ENST00000528123:exon_64854788_64854888:ZFPL1;ENSG00000187066:ENST00000528029:exon_64852451_64856579:AP003068.6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 64882441 G/A 1 3 7 10 1.47120808844236 3.56718112696784 -2.09597303852548 A:G G A 10 0.509597303852548 0.218348598150516 ENSG00000149809:ENST00000526809:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533766:exon_64882185_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000534371:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000525385:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000345348:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531321:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529292:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526085:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000524690:exon_64882385_64882507:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531029:exon_64882385_64882476:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529233:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000532328:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000527968:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000528802:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526048:exon_64882385_64883070:TM7SF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 64883547 G/A 1 35 30 65 17.1640943651608 15.2879191155764 1.87617524958438 A:G G A 10 0.509597303852548 0.71022708212433 ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64883365_64883828:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64883365_64883856:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000345348:exon_64883365_64883707:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529292:exon_64883365_64883745:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64883365_64883702:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526048:exon_64883365_64883681:TM7SF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 64884663 C/T 1 2 7 9 0.980805392294904 3.56718112696784 -2.58637573467293 T:C C T 10 0.509597303852548 0.103145007117103 ENSG00000174276:ENST00000310597:exon_64883876_64885170:ZNHIT2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 64888955 A/G 1 20 21 41 9.80805392294904 10.7015433809035 -0.893489457954466 A:G A G 10 0.509597303852548 0.87618110221447 ENSG00000149806:ENST00000531357:exon_64888106_64889589:FAU;ENSG00000149806:ENST00000529259:exon_64888169_64889116:FAU;ENSG00000149806:ENST00000434372:exon_64888755_64889116:FAU HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 65348725 G/A 1 7 9 16 3.43281887303216 4.58637573467293 -1.15355686164077 A:G G A 10 0.509597303852548 0.623338489505478 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65348682_65348844:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533237:exon_65348682_65348844:EHBP1L1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 65408583 C/T 1 7 11 18 3.43281887303216 5.60557034237803 -2.17275146934586 T:C C T 10 0.509597303852548 0.351502463188979 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65408302_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000533361:exon_65408302_65408700:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65408302_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65408272_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65408272_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65408300_65409071:SIPA1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 65417434 G/A 1 24 30 54 11.7696647075388 15.2879191155764 -3.51825440803759 A:G G A 10 0.509597303852548 0.344807714813655 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000531339:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000529725:exon_65417421_65417522:SIPA1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 65623519 G/A 1 796 950 1746 390.360546133372 484.117438659921 -93.7568925265488 A:T:C:G G A 10 0.509597303852548 7.4739336674205e-06 ENSG00000172757:ENST00000525451:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530945:exon_65622303_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000308162:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000527344:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531407:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000524553:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534769:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531413:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000532134:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530413:exon_65623406_65623944:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534784:exon_65623428_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000526975:exon_65623445_65623713:CFL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 65631167 C/T 1 6 5 11 2.94241617688471 2.54798651926274 0.394429657621972 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631104_65631372:MUS81 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 65631973 G/A 1 12 8 20 5.88483235376942 4.07677843082038 1.80805392294904 A:G G A 10 0.509597303852548 0.505035835457766 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65631968_65632084:MUS81 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 65632262 G/T 1 13 17 30 6.37523504991688 8.66315416549332 -2.28791911557644 T:G G T 10 0.509597303852548 0.466982464669341 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65632191_65632794:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65632191_65632616:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65632215_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65632191_65632286:MUS81 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 65824472 C/T 1 8 1 9 3.92322156917962 0.509597303852548 3.41362426532707 T:C C T 10 0.509597303852548 0.039373498903222 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 65826704 G/A 1 79 85 164 38.7418129956487 43.3157708274666 -4.57395783181787 A:G G A 10 0.509597303852548 0.483155606169349 ENSG00000087365:ENST00000528302:exon_65826672_65826809:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000322535:exon_65826672_65826809:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000355456:exon_65826672_65826809:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000529994:exon_65826672_65826809:SF3B2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 66031660 C/T 1 8 6 14 3.92322156917962 3.05758382311529 0.865637746064328 T:C C T 10 0.509597303852548 0.79106698341654 ENSG00000174996:ENST00000417856:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000414181:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394067:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000316924:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000421552:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000452607:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000454322:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394066:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394065:exon_66031517_66031690:KLC2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 66033430 C/T 1 23 10 33 11.2792620113914 5.09597303852548 6.18328897286592 T:C:G C T 10 0.509597303852548 0.0361794478937317 ENSG00000174996:ENST00000417856:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000414181:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394067:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000316924:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000421552:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000452607:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000454322:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394066:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394065:exon_66033325_66033483:KLC2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 66056457 G/A 1 5 9 14 2.45201348073726 4.58637573467293 -2.13436225393567 A:G G A 10 0.509597303852548 0.293559675506127 ENSG00000174851:ENST00000471387:exon_66056426_66056599:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000359461:exon_66056426_66056616:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000376901:exon_66056426_66056641:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000376904:exon_66056426_66056620:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000484814:exon_66056426_66056599:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000431556:exon_66056426_66056478:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000528575:exon_66056426_66056508:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000376899:exon_66056426_66056614:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000474986:exon_66056426_66056608:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000534374:exon_66056426_66056606:YIF1A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 66105194 G/A 1 53 57 110 25.991342895815 29.0470463195952 -3.05570342378028 A:G G A 10 0.509597303852548 0.568728668262649 ENSG00000174744:ENST00000425825:exon_66104804_66105278:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000524699:exon_66104810_66105360:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000359957:exon_66104810_66105360:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000530238:exon_66104840_66105360:BRMS1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 67351585 C/G 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 C:G C G 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 67352256 C/A 1 8 7 15 3.92322156917962 3.56718112696784 0.35604044221178 A:C C A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67351605_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000489040:exon_67352156_67352535:GSTP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 67352689 A/G 1 402 414 816 197.141883851276 210.973283794955 -13.8313999436791 A:G A G 10 0.509597303852548 0.344509686218922 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67351605_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67352509_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67352266_67352712:GSTP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 67353844 C/T 1 34 19 53 16.6736916690134 9.68234877319841 6.99134289581496 T:C:G C T 10 0.509597303852548 0.0730934568195473 ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 67353970 T/C 1 725 688 1413 355.541954706903 350.602945050553 4.93900965634975 T:C T C 10 0.509597303852548 0.810752633438562 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67353860_67354131:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67353860_67354121:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67353860_67354125:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67353860_67354120:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67353860_67354075:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67353860_67354040:GSTP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 71193052 C/T 0 17 0 17 8.33684583450668 0 8.33684583450668 C C 10 0.509597303852548 1.60282985018015e-05 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71192969_71193071:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71192969_71193071:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527852:exon_71192969_71193071:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529840:exon_71192969_71193071:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530055:exon_71192969_71193071:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000526039:exon_71193047_71193071:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000531236:exon_71191857_71193071:NADSYN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 72408657 C/T 1 10 7 17 4.90402696147452 3.56718112696784 1.33684583450668 T:C C T 10 0.509597303852548 0.630150764673374 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72408643_72408694:ARAP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 72415329 G/A 1 9 2 11 4.41362426532707 1.0191946077051 3.39442965762197 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0659641183816961 ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000340247:exon_72415197_72415379:ARAP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 74329615 T/C 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 T:C T C 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000077514:ENST00000528481:exon_74329582_74329639:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530511:exon_74329582_74329815:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000531615:exon_74329582_74329720:POLD3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 77412851 A/G 1 19 35 54 9.31765122680159 17.8359056348392 -8.51825440803759 A:T:G A G 10 0.509597303852548 0.0209506440170370 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77411766_77414578:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000526324:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000528095:exon_77412164_77413540:RSF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 77553638 T/C 1 10 13 23 4.90402696147452 6.62476495008312 -1.7207379886086 T:C T C 10 0.509597303852548 0.53508614923685 ENSG00000087884:ENST00000532481:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526164:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000527134:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000304716:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77553525_77553674:C11orf67 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 77583376 G/A 1 7 5 12 3.43281887303216 2.54798651926274 0.884832353769424 A:G G A 10 0.509597303852548 0.774912283175237 ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77583221_77583407:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77583221_77583397:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77583221_77583400:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77583221_77583398:C11orf67 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 77924870 C/T 1 10 2 12 4.90402696147452 1.0191946077051 3.88483235376942 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0389900147787838 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77924692_77925072:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77924692_77925184:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77924692_77925757:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77924692_77925753:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77924692_77925465:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77924692_77925753:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77924692_77925753:USP35 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 82535963 C/T 1 19 25 44 9.31765122680159 12.7399325963137 -3.42228136951211 T:C C T 10 0.509597303852548 0.365923893678605 ENSG00000137509:ENST00000313010:exon_82534544_82536164:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532767:exon_82535409_82542480:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000393399:exon_82535410_82536164:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532709:exon_82535415_82536164:PRCP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 82644904 G/A 1 9 2 11 4.41362426532707 1.0191946077051 3.39442965762197 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0659641183816961 ENSG00000165490:ENST00000528759:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000533655:exon_82642774_82645701:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000329143:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000430323:exon_82642774_82645697:C11orf82 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 82693216 A/G 1 5 10 15 2.45201348073726 5.09597303852548 -2.64395955778822 A:G A G 10 0.509597303852548 0.20250907335495 ENSG00000137502:ENST00000533486:exon_82684175_82693457:RAB30;ENSG00000137502:ENST00000534141:exon_82690310_82693457:RAB30;ENSG00000137502:ENST00000457539:exon_82692479_82693457:RAB30;ENSG00000137502:ENST00000260056:exon_82692832_82693457:RAB30;ENSG00000137502:ENST00000533014:exon_82693131_82693457:RAB30;ENSG00000137502:ENST00000527633:exon_82693199_82693457:RAB30 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 85374993 C/T 1 13 4 17 6.37523504991688 2.03838921541019 4.33684583450668 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0497378911148666 ENSG00000137504:ENST00000490820:exon_85374568_85376146:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000528561:exon_85374568_85375148:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000260058:exon_85374859_85375697:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000527529:exon_85374859_85375148:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000525639:exon_85374859_85376146:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000398294:exon_85374859_85375269:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000527447:exon_85372110_85376146:CREBZF HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 85968623 C/T 1 4 8 12 1.96161078458981 4.07677843082038 -2.11516764623058 T:C C T 10 0.509597303852548 0.258556419599671 ENSG00000074266:ENST00000263360:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000528180:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000351625:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000327320:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000525244:exon_85968557_85968638:EED HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 88027209 T/C 1 130 143 273 63.7523504991688 72.8724144509144 -9.1200639517456 T:C T C 10 0.509597303852548 0.276350029311947 ENSG00000109861:ENST00000227266:exon_88026778_88027676:CTSC;ENSG00000109861:ENST00000533897:exon_88026956_88027676:CTSC HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 88027393 A/C 1 62 62 124 30.404967161142 31.595032838858 -1.19006567771595 A:C A C 10 0.509597303852548 0.857733129094086 ENSG00000109861:ENST00000227266:exon_88026778_88027676:CTSC;ENSG00000109861:ENST00000533897:exon_88026956_88027676:CTSC HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 93212161 A/G 1 11 13 24 5.39442965762197 6.62476495008312 -1.23033529246115 A:G A G 10 0.509597303852548 0.68560789583581 ENSG00000166002:ENST00000525141:exon_93211638_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000298966:exon_93211638_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000527149:exon_93212107_93212435:C11orf75 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 93212254 C/T 1 9 5 14 4.41362426532707 2.54798651926274 1.86563774606433 T:C C T 10 0.509597303852548 0.425164682757114 ENSG00000166002:ENST00000525141:exon_93211638_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000298966:exon_93211638_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000527149:exon_93212107_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000529714:exon_93212200_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000526869:exon_93212215_93212435:C11orf75 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 94231257 C/G 1 5 10 15 2.45201348073726 5.09597303852548 -2.64395955778822 C:G C G 10 0.509597303852548 0.20250907335495 ENSG00000168876:ENST00000302755:exon_94231237_94232737:ANKRD49 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 95512060 A/G 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000077458:ENST00000358780:exon_95511986_95512121:FAM76B;ENSG00000077458:ENST00000398187:exon_95511986_95512121:FAM76B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 95564259 A/G 1 17 32 49 8.33684583450668 16.3071137232815 -7.97026788877485 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0310337336798062 ENSG00000166037:ENST00000325486:exon_95564190_95565854:CEP57;ENSG00000166037:ENST00000325542:exon_95564190_95565854:CEP57 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 96116444 T/C 1 3 7 10 1.47120808844236 3.56718112696784 -2.09597303852548 T:C T C 10 0.509597303852548 0.218348598150516 ENSG00000149231:ENST00000278520:exon_96116433_96116637:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000423339:exon_96116433_96116637:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000530106:exon_96113701_96116637:CCDC82 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 96117520 C/T 1 39 20 59 19.1257051497506 10.191946077051 8.93375907269967 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0260227042364888 ENSG00000149231:ENST00000278520:exon_96117126_96117925:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000423339:exon_96117126_96118154:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000530106:exon_96117126_96117933:CCDC82 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 102272277 G/T 1 12 6 18 5.88483235376942 3.05758382311529 2.82724853065414 T:G G T 10 0.509597303852548 0.239448825994552 ENSG00000152558:ENST00000361236:exon_102272270_102272423:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000398136:exon_102272270_102272423:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000532161:exon_102272270_102272423:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000528969:exon_102272270_102272423:TMEM123 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 102272839 C/A 1 5 7 12 2.45201348073726 3.56718112696784 -1.11516764623058 A:C C A 10 0.509597303852548 0.574428486272357 ENSG00000152558:ENST00000361236:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000398136:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000532161:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000528969:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000529492:exon_102272475_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000525577:exon_102272656_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000531103:exon_102272765_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000526676:exon_102272830_102272937:TMEM123 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 110007518 A/T 1 17 12 29 8.33684583450668 6.11516764623058 2.22167818827611 A:T A T 10 0.509597303852548 0.460675176807091 ENSG00000149289:ENST00000278590:exon_110007388_110008139:ZC3H12C;ENSG00000149289:ENST00000528673:exon_110007388_110008139:ZC3H12C;ENSG00000149289:ENST00000453089:exon_110006579_110008139:ZC3H12C HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 111753245 C/T 1 23 29 52 11.2792620113914 14.7783218117239 -3.49905980033249 T:C C T 10 0.509597303852548 0.336171381818905 ENSG00000137720:ENST00000528125:exon_111753092_111753322:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000260276:exon_111753092_111753322:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000530214:exon_111753092_111753322:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000530799:exon_111753092_111753322:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000529270:exon_111753092_111753322:C11orf1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 111754574 A/C 1 57 38 95 27.9529536804048 19.3646975463968 8.58825613400794 A:C A C 10 0.509597303852548 0.0816180007373652 ENSG00000137720:ENST00000528125:exon_111754495_111754624:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000260276:exon_111754495_111756699:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000530214:exon_111754495_111754798:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000529270:exon_111754495_111754793:C11orf1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 117077034 A/G 1 16 16 32 7.84644313835923 8.15355686164077 -0.307113723281535 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117075053_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117075790_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000529458:exon_117076663_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000527037:exon_117076864_117077072:PCSK7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 117222592 G/A 1 15 12 27 7.35604044221178 6.11516764623058 1.2408727959812 A:G G A 10 0.509597303852548 0.702536459516712 ENSG00000110274:ENST00000525734:exon_117222506_117222658:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533153:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000525416:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000527324:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000527609:exon_117222506_117222675:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533570:exon_117222506_117222676:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000529538:exon_117222506_117222704:CEP164 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 117261488 C/G 1 2 7 9 0.980805392294904 3.56718112696784 -2.58637573467293 C:G C G 10 0.509597303852548 0.103145007117103 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 117691386 G/A 1 41 28 69 20.1065105420455 14.2687245078713 5.83778603417419 A:G G A 10 0.509597303852548 0.185298726095345 ENSG00000137731:ENST00000532119:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000528014:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000292079:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000260287:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000534383:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000533281:exon_117691275_117691411:FXYD2;ENSG00000254844:ENST00000531850:exon_117691176_117691436:RP11-728F11.3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 117864047 A/G 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 A:G A G 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534335:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530178:exon_117863723_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000532009:exon_117863773_117864125:IL10RA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 117864063 A/G 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 A:G A G 10 0.509597303852548 0.499988077920146 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534335:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530178:exon_117863723_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000532009:exon_117863773_117864125:IL10RA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 117869670 A/G 1 9 7 16 4.41362426532707 3.56718112696784 0.846443138359232 A:G A G 10 0.509597303852548 0.80419746365061 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117869430_117872194:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117869430_117870513:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117869430_117870592:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117869430_117870503:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117869430_117870613:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117869430_117872196:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000525467:exon_117869430_117870174:IL10RA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 118359161 G/A 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 A:G G A 10 0.509597303852548 0.74955201040747 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 118471423 T/C 1 13 1 14 6.37523504991688 0.509597303852548 5.86563774606433 T:C T C 10 0.509597303852548 0.00187619055158314 ENSG00000095139:ENST00000392859:exon_118471340_118471708:ARCN1;ENSG00000095139:ENST00000359415:exon_118471340_118473643:ARCN1;ENSG00000095139:ENST00000264028:exon_118471340_118473643:ARCN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 118828942 A/G 1 5 8 13 2.45201348073726 4.07677843082038 -1.62476495008312 A:G A G 10 0.509597303852548 0.415960200620574 ENSG00000110375:ENST00000534788:exon_118828807_118829264:UPK2;ENSG00000110375:ENST00000264031:exon_118828807_118829269:UPK2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 118886117 C/T 1 50 55 105 24.5201348073726 28.0278517118901 -3.50771690451754 T:C C T 10 0.509597303852548 0.496547873684101 ENSG00000186166:ENST00000334418:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000526463:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000532132:exon_118885998_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000527356:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000533787:exon_118886017_118886138:CCDC84 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 118886656 G/A 1 13 19 32 6.37523504991688 9.68234877319841 -3.30711372328154 A:G G A 10 0.509597303852548 0.289691482989316 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 118890022 C/T 1 15 25 40 7.35604044221178 12.7399325963137 -5.38389215410192 T:C C T 10 0.509597303852548 0.112887744228325 ENSG00000196655:ENST00000533632:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000527680:exon_118889853_118890213:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000447216:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000531290:exon_118889476_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000359005:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000525079:exon_118889853_118890134:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000533012:exon_118889853_118890027:TRAPPC4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 118895686 C/T 1 21 14 35 10.2984566190965 7.13436225393567 3.16409436516082 T:C C T 10 0.509597303852548 0.313632943537772 ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118895567_118896164:TRAPPC4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 118925935 G/A 1 12 3 15 5.88483235376942 1.52879191155764 4.35604044221178 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0356477356687783 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000526571:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000528069:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530473:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531694:exon_118925897_118926130:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534233:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000526656:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534654:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531968:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529683:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532421:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000533381:exon_118925735_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530467:exon_118925867_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000527038:exon_118925896_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529174:exon_118925914_118926051:HYOU1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 118948729 C/T 1 6 8 14 2.94241617688471 4.07677843082038 -1.13436225393567 T:C C T 10 0.509597303852548 0.601095068648336 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 118952173 A/G 1 49 38 87 24.0297321112251 19.3646975463968 4.66503456482832 A:G A G 10 0.509597303852548 0.335836512470552 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 118967758 T/C 1 21 23 44 10.2984566190965 11.7207379886086 -1.42228136951211 T:C T C 10 0.509597303852548 0.763439588932285 ENSG00000172269:ENST00000409993:exon_118967213_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000354202:exon_118967217_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000392834:exon_118967220_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000461999:exon_118967221_118969197:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000481084:exon_118967221_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000414373:exon_118967259_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000442480:exon_118967668_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000432443:exon_118967708_118968007:DPAGT1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 118986972 C/T 1 8 10 18 3.92322156917962 5.09597303852548 -1.17275146934586 T:C C T 10 0.509597303852548 0.642260839788311 ENSG00000172375:ENST00000336702:exon_118986755_118989252:C2CD2L;ENSG00000172375:ENST00000425549:exon_118986755_118987826:C2CD2L;ENSG00000172375:ENST00000525598:exon_118984790_118987831:C2CD2L;ENSG00000172375:ENST00000528586:exon_118986735_118987831:C2CD2L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 119052826 C/A 1 8 6 14 3.92322156917962 3.05758382311529 0.865637746064328 A:C C A 10 0.509597303852548 0.79106698341654 ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000469103:exon_119052803_119053054:NLRX1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 123596703 A/C 1 2 6 8 0.980805392294904 3.05758382311529 -2.07677843082038 A:C A C 10 0.509597303852548 0.171857042968518 ENSG00000166261:ENST00000336139:exon_123594885_123597699:ZNF202;ENSG00000166261:ENST00000530393:exon_123595488_123597699:ZNF202;ENSG00000166261:ENST00000529691:exon_123595488_123597699:ZNF202 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 124623492 T/C 1 38 5 43 18.6353024536032 2.54798651926274 16.0873159343404 T:C T C 10 0.509597303852548 3.00346396741794e-07 ENSG00000149564:ENST00000485116:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000417453:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000278927:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000464067:exon_124623095_124623857:ESAM HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 125763746 C/G 1 58 40 98 28.4433563765522 20.3838921541019 8.0594642224503 C:G C G 10 0.509597303852548 0.106894546647714 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125763381_125764181:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125763382_125764181:PUS3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 125766044 C/A 1 7 1 8 3.43281887303216 0.509597303852548 2.92322156917962 A:C C A 10 0.509597303852548 0.0707155477569663 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000534158:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000529801:exon_125765865_125766225:PUS3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 126162843 C/T 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000150455:ENST00000392679:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000279992:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000438974:exon_126162372_126163012:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392678:exon_126162372_126163139:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392680:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000479770:exon_126162372_126162950:TIRAP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 126174164 C/T 1 43 39 82 21.0873159343404 19.8742948502494 1.21302108409107 T:C:G C T 10 0.509597303852548 0.825701737994377 ENSG00000255062:ENST00000524964:exon_126174103_126174213:RP11-712L6.5;ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126173647_126174176:DCPS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 128333503 T/C 1 15 15 30 7.35604044221178 7.64395955778822 -0.28791911557644 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000134954:ENST00000345075:exon_128333404_128333518:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000392668:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000319397:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000526145:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000530924:exon_128333404_128333524:ETS1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 11 134047243 T/C 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000151503:ENST00000534532:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000281189:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000534548:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000525964:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000530396:exon_134047114_134047970:NCAPD3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 863152 G/A 1 16 8 24 7.84644313835923 4.07677843082038 3.76966470753885 A:G G A 10 0.509597303852548 0.153397563257600 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_862089_863490:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_862225_863490:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000447667:exon_862225_863490:WNK1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 863517 G/A 1 3 7 10 1.47120808844236 3.56718112696784 -2.09597303852548 A:G G A 10 0.509597303852548 0.218348598150516 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 939302 A/G 1 10 11 21 4.90402696147452 5.60557034237803 -0.701543380903507 A:G A G 10 0.509597303852548 0.82921410886802 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_939169_939326:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_939169_939326:WNK1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 968489 T/C 1 11 11 22 5.39442965762197 5.60557034237803 -0.211140684756055 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_968411_968630:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_968411_968630:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_968411_968630:WNK1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 990912 A/C 1 7 8 15 3.43281887303216 4.07677843082038 -0.64395955778822 A:C A C 10 0.509597303852548 0.800365558868668 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_990858_990955:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_990858_990955:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_990858_990955:WNK1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 994014 C/T 1 12 4 16 5.88483235376942 2.03838921541019 3.84644313835923 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0776723690771564 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_993815_995250:WNK1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 2973547 G/T 1 8 11 19 3.92322156917962 5.60557034237803 -1.68234877319841 T:G G T 10 0.509597303852548 0.496599009223979 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2973486_2973661:FOXM1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 2997397 G/A 1 17 31 48 8.33684583450668 15.797516419429 -7.4606705849223 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0421493673009866 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 4388084 C/G 1 46 82 128 22.5585240227828 41.7869789159089 -19.2284548931261 C:G C G 10 0.509597303852548 0.000730835832079458 ENSG00000118971:ENST00000261254:exon_4387926_4388085:CCND2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 4461485 G/A 1 7 20 27 3.43281887303216 10.191946077051 -6.7591272040188 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0112938782184977 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4461426_4469188:C12orf5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 4716513 C/T 1 13 10 23 6.37523504991688 5.09597303852548 1.2792620113914 T:C C T 10 0.509597303852548 0.678943531012238 ENSG00000010219:ENST00000010132:exon_4716493_4716553:DYRK4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 6562753 A/G 1 14 6 20 6.86563774606433 3.05758382311529 3.80805392294904 A:G A G 10 0.509597303852548 0.116652704888565 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 6562810 A/G 1 11 9 20 5.39442965762197 4.58637573467293 0.808053922949041 A:G A G 10 0.509597303852548 0.824451040790607 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 6567907 C/T 1 18 10 28 8.82724853065414 5.09597303852548 3.73127549212866 T:C C T 10 0.509597303852548 0.187200729145019 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6567811_6568113:TAPBPL HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 6572048 A/G 1 49 34 83 24.0297321112251 17.3263083309866 6.70342378023852 A:G A G 10 0.509597303852548 0.153989428303171 ENSG00000139190:ENST00000396943:exon_6571406_6573652:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000361716:exon_6571406_6574107:VAMP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 6626623 G/A 1 13 4 17 6.37523504991688 2.03838921541019 4.33684583450668 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0497378911148666 ENSG00000010292:ENST00000382457:exon_6626531_6626665:NCAPD2;ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6626531_6626665:NCAPD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 6631169 C/A 1 7 8 15 3.43281887303216 4.07677843082038 -0.64395955778822 A:C C A 10 0.509597303852548 0.800365558868668 ENSG00000010292:ENST00000382457:exon_6630964_6631203:NCAPD2;ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6630964_6631203:NCAPD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 6635274 G/A 1 10 10 20 4.90402696147452 5.09597303852548 -0.191946077050959 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000010292:ENST00000382457:exon_6635234_6635366:NCAPD2;ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6635234_6635366:NCAPD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 6637941 C/T 1 14 23 37 6.86563774606433 11.7207379886086 -4.85510024254427 T:C C T 10 0.509597303852548 0.138293675848893 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6637845_6638022:NCAPD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 6638116 C/T 1 12 12 24 5.88483235376942 6.11516764623058 -0.230335292461152 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6638111_6638205:NCAPD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 6638666 C/T 1 1 8 9 0.490402696147452 4.07677843082038 -3.58637573467293 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0193004967410206 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 6643991 C/G 1 1525 1917 3442 747.864111624864 976.898031485335 -229.03391986047 A:C:G C G 10 0.509597303852548 6.08431237583053e-15 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000496049:exon_6643976_6644307:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000450282:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000448046:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000492719:exon_6643976_6644157:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6643920_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6643920_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6643958_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6643985_6644027:GAPDH HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 6787622 C/T 1 11 7 18 5.39442965762197 3.56718112696784 1.82724853065414 T:C C T 10 0.509597303852548 0.482156564682581 ENSG00000126746:ENST00000319770:exon_6787293_6787626:ZNF384;ENSG00000126746:ENST00000361959:exon_6787293_6787626:ZNF384;ENSG00000126746:ENST00000396795:exon_6787293_6787626:ZNF384;ENSG00000126746:ENST00000436774:exon_6787293_6787626:ZNF384;ENSG00000126746:ENST00000396799:exon_6787293_6787626:ZNF384;ENSG00000126746:ENST00000417772:exon_6787293_6787626:ZNF384;ENSG00000126746:ENST00000396801:exon_6787293_6787626:ZNF384 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 7023123 A/G 1 12 10 22 5.88483235376942 5.09597303852548 0.788859315243944 A:G A G 10 0.509597303852548 0.832492277049863 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000382257:exon_7023055_7023405:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7023055_7023358:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000428946:exon_7023055_7023393:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000323702:exon_7023055_7023392:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000436789:exon_7023055_7023132:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000429740:exon_7023055_7023235:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000472633:exon_7023055_7023392:LRRC23 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 7045116 C/T 1 12 4 16 5.88483235376942 2.03838921541019 3.84644313835923 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0776723690771564 ENSG00000111676:ENST00000356654:exon_7044710_7046724:ATN1;ENSG00000111676:ENST00000396684:exon_7044710_7046724:ATN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 7046077 G/A 1 5 6 11 2.45201348073726 3.05758382311529 -0.605570342378028 A:G G A 10 0.509597303852548 0.770507260060939 ENSG00000111676:ENST00000356654:exon_7044710_7046724:ATN1;ENSG00000111676:ENST00000396684:exon_7044710_7046724:ATN1;ENSG00000111676:ENST00000229279:exon_7045754_7046724:ATN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 8074192 G/A 0 9 0 9 4.41362426532707 0 4.41362426532707 G G 10 0.509597303852548 0.00395812771304115 ENSG00000059804:ENST00000075120:exon_8071826_8074227:SLC2A3;ENSG00000059804:ENST00000486749:exon_8071827_8074227:SLC2A3;ENSG00000059804:ENST00000469295:exon_8073667_8074227:SLC2A3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 9822387 C/G 1 34 47 81 16.6736916690134 23.9510732810698 -7.27738161205638 C:G C G 10 0.509597303852548 0.119651752605749 ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9822313_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9822324_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9822325_9822391:CLEC2D HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 9833628 C/T 1 60 91 151 29.4241617688471 46.3733546505819 -16.9491928817347 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00703424862766566 ENSG00000069493:ENST00000479410:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000487752:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000444971:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000430909:exon_9833521_9833629:CLEC2D HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 14577892 A/T 1 15 3 18 7.35604044221178 1.52879191155764 5.82724853065414 A:T A T 10 0.509597303852548 0.00772749127530149 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14576843_14578407:ATF7IP;ENSG00000171681:ENST00000396279:exon_14576850_14578391:ATF7IP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 14587301 A/G 1 4 16 20 1.96161078458981 8.15355686164077 -6.19194607705096 A:G A G 10 0.509597303852548 0.00632201168593267 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14587271_14587357:ATF7IP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 14649196 A/G 1 5 8 13 2.45201348073726 4.07677843082038 -1.62476495008312 A:G A G 10 0.509597303852548 0.415960200620574 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14649165_14649277:ATF7IP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 21623122 T/G 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 T:G T G 10 0.509597303852548 0.335037018547339 ENSG00000121350:ENST00000240651:exon_21621440_21624176:PYROXD1;ENSG00000004700:ENST00000396093:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000444129:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000421138:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000314748:exon_21622697_21623280:RECQL HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 25242595 C/G 1 11 12 23 5.39442965762197 6.11516764623058 -0.720737988608604 C:G C G 10 0.509597303852548 0.836390489019417 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242548_25242611:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242548_25242611:LRMP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 25243115 G/C 1 25 24 49 12.2600674036863 12.2303352924612 0.0297321112251474 C:G G C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242991_25243131:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242991_25243131:LRMP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 26732987 G/A 1 6 2 8 2.94241617688471 1.0191946077051 1.92322156917962 A:G G A 10 0.509597303852548 0.289787629707581 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26732960_26733088:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26732960_26733088:ITPR2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 26784850 G/A 1 4 7 11 1.96161078458981 3.56718112696784 -1.60557034237803 A:G G A 10 0.509597303852548 0.379319216476062 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26784799_26784992:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26784799_26784992:ITPR2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 26810777 T/C 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 T:C T C 10 0.509597303852548 0.335037018547339 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26810640_26810825:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26810640_26810825:ITPR2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 26811045 T/C 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 T:C T C 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26810944_26811063:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26810944_26811063:ITPR2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 31249861 C/G 1 5 7 12 2.45201348073726 3.56718112696784 -1.11516764623058 C:G C G 10 0.509597303852548 0.574428486272357 ENSG00000013573:ENST00000407793:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000228264:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000350437:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000404673:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000251758:exon_31249793_31249924:DDX11 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 31944821 C/T 0 12 0 12 5.88483235376942 0 5.88483235376942 C C 10 0.509597303852548 0.000500187409481343 ENSG00000188375:ENST00000340398:exon_31944119_31945175:H3F3C HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 32134815 G/A 1 6 15 21 2.94241617688471 7.64395955778822 -4.70154338090351 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0488618216026571 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 32135186 T/A 1 7 2 9 3.43281887303216 1.0191946077051 2.41362426532707 A:T T A 10 0.509597303852548 0.180412718745071 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 32137565 G/A 1 13 17 30 6.37523504991688 8.66315416549332 -2.28791911557644 A:G G A 10 0.509597303852548 0.466982464669341 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 32137852 C/G 1 39 32 71 19.1257051497506 16.3071137232815 2.81859142646909 C:G C G 10 0.509597303852548 0.553557864075036 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 39735348 C/A 1 12 7 19 5.88483235376942 3.56718112696784 2.31765122680159 A:C C A 10 0.509597303852548 0.360981209646244 ENSG00000139116:ENST00000341813:exon_39735307_39735424:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000395670:exon_39735307_39735424:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000361418:exon_39735307_39735424:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000361961:exon_39735307_39735424:KIF21A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 42554505 A/G 1 37 46 83 18.1448997574557 23.4414759772172 -5.29657621976148 A:G A G 10 0.509597303852548 0.272630314596244 ENSG00000015153:ENST00000327791:exon_42550906_42554628:YAF2;ENSG00000015153:ENST00000380790:exon_42550906_42554628:YAF2;ENSG00000015153:ENST00000442791:exon_42552837_42554628:YAF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 44148259 T/C 1 3 7 10 1.47120808844236 3.56718112696784 -2.09597303852548 T:C T C 10 0.509597303852548 0.218348598150516 ENSG00000129317:ENST00000416848:exon_44148139_44149064:PUS7L;ENSG00000129317:ENST00000344862:exon_44148139_44149064:PUS7L;ENSG00000129317:ENST00000431332:exon_44148139_44149064:PUS7L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 44180295 G/A 1 6 5 11 2.94241617688471 2.54798651926274 0.394429657621972 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000198001:ENST00000448290:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000431837:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000440781:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000356669:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000446056:exon_44180202_44180360:IRAK4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 46321482 G/C 1 4 15 19 1.96161078458981 7.64395955778822 -5.68234877319841 C:G G C 10 0.509597303852548 0.0105208101247097 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 46322449 C/T 1 7 10 17 3.43281887303216 5.09597303852548 -1.66315416549332 T:C C T 10 0.509597303852548 0.473469847150149 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 48272895 A/G 0 9 0 9 4.41362426532707 0 4.41362426532707 A A 10 0.509597303852548 0.00395812771304115 ENSG00000111424:ENST00000395324:exon_48272751_48272898:VDR;ENSG00000111424:ENST00000229022:exon_48272751_48272898:VDR HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 49230035 T/G 1 9 12 21 4.41362426532707 6.11516764623058 -1.70154338090351 T:G T G 10 0.509597303852548 0.516968964003046 ENSG00000174243:ENST00000398375:exon_49229904_49230049:DDX23;ENSG00000174243:ENST00000308025:exon_49229904_49230049:DDX23 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 49255798 G/C 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 C:G G C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000172602:ENST00000309739:exon_49255792_49255901:RND1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 49445028 G/A 1 1 7 8 0.490402696147452 3.56718112696784 -3.07677843082038 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0357022765843499 ENSG00000167548:ENST00000301067:exon_49444669_49446207:MLL2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 49952668 G/A 1 40 49 89 19.6161078458981 24.9702678887749 -5.35416004287677 A:G G A 10 0.509597303852548 0.289217718205954 ENSG00000187778:ENST00000343810:exon_49952626_49952753:MCRS1;ENSG00000187778:ENST00000357123:exon_49952626_49952753:MCRS1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 49960551 C/A 1 10 9 19 4.90402696147452 4.58637573467293 0.317651226801589 A:C C A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000187778:ENST00000343810:exon_49960505_49960624:MCRS1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 50152193 G/A 1 35 52 87 17.1640943651608 26.4990598003325 -9.33496543517168 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0531135474360631 ENSG00000139644:ENST00000267115:exon_50152166_50152263:TMBIM6;ENSG00000139644:ENST00000395006:exon_50152166_50152263:TMBIM6;ENSG00000139644:ENST00000423828:exon_50152166_50152263:TMBIM6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 50156640 T/C 1 3 8 11 1.47120808844236 4.07677843082038 -2.60557034237803 T:C T C 10 0.509597303852548 0.139008716253398 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 50232169 A/T 1 6 4 10 2.94241617688471 2.03838921541019 0.90402696147452 A:T A T 10 0.509597303852548 0.75435926131823 ENSG00000186666:ENST00000333924:exon_50231560_50232798:BCDIN3D HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 51213433 A/G 1 8 24 32 3.92322156917962 12.2303352924612 -8.30711372328154 A:G A G 10 0.509597303852548 0.00401659230362303 ENSG00000123268:ENST00000262053:exon_51213418_51214907:ATF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 53586939 C/G 1 33 45 78 16.1832889728659 22.9318786733647 -6.74858970049874 T:C:G C G 10 0.509597303852548 0.141096685085405 ENSG00000139626:ENST00000422257:exon_53586924_53587147:ITGB7;ENSG00000139626:ENST00000267082:exon_53586924_53587147:ITGB7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 53587468 T/G 1 7 5 12 3.43281887303216 2.54798651926274 0.884832353769424 T:G T G 10 0.509597303852548 0.774912283175237 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 53647373 T/C 1 6 6 12 2.94241617688471 3.05758382311529 -0.115167646230576 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000182544:ENST00000328704:exon_53646602_53647536:MFSD5;ENSG00000182544:ENST00000329548:exon_53646602_53648188:MFSD5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 53682326 G/A 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 A:G G A 10 0.509597303852548 0.499988077920146 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682322_53682483:ESPL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 54675113 G/A 1 13 24 37 6.37523504991688 12.2303352924612 -5.85510024254428 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0693661041241979 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 54905815 C/G 1 7 5 12 3.43281887303216 2.54798651926274 0.884832353769424 C:G C G 10 0.509597303852548 0.774912283175237 ENSG00000123338:ENST00000293373:exon_54905733_54905889:NCKAP1L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 56182846 G/C 1 3 8 11 1.47120808844236 4.07677843082038 -2.60557034237803 C:G G C 10 0.509597303852548 0.139008716253398 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 56510637 A/G 1 123 128 251 60.3195316261366 65.2284548931261 -4.90892326698954 A:T:G A G 10 0.509597303852548 0.570021151067678 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 56814653 G/A 1 6 7 13 2.94241617688471 3.56718112696784 -0.624764950083124 A:G G A 10 0.509597303852548 0.786978111840725 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56814597_56814665:TIMELESS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 56994170 C/T 1 6 8 14 2.94241617688471 4.07677843082038 -1.13436225393567 T:C C T 10 0.509597303852548 0.601095068648336 ENSG00000076108:ENST00000379441:exon_56993985_56994274:BAZ2A;ENSG00000076108:ENST00000179765:exon_56993985_56994274:BAZ2A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 57006998 T/C 1 6 5 11 2.94241617688471 2.54798651926274 0.394429657621972 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000076108:ENST00000379441:exon_57006799_57007017:BAZ2A;ENSG00000076108:ENST00000179765:exon_57006799_57007017:BAZ2A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 57106660 A/T 1 2165 2131 4296 1061.72183715923 1085.95185450978 -24.2300173505459 A:T A T 10 0.509597303852548 0.463900793902082 ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57106570_57106692:NACA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 57114100 A/G 1 6 2 8 2.94241617688471 1.0191946077051 1.92322156917962 A:G A G 10 0.509597303852548 0.289787629707581 ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57109655_57115243:NACA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 57627717 G/A 1 8 6 14 3.92322156917962 3.05758382311529 0.865637746064328 A:G G A 10 0.509597303852548 0.79106698341654 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 57870155 A/C 1 9 3 12 4.41362426532707 1.52879191155764 2.88483235376942 A:C A C 10 0.509597303852548 0.146886429190433 ENSG00000123329:ENST00000393791:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000340423:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000430041:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000423291:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000424809:exon_57870147_57870237:ARHGAP9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 58162739 A/G 1 48 42 90 23.5393294150777 21.403086761807 2.13624265327068 A:G A G 10 0.509597303852548 0.674415042716379 ENSG00000037897:ENST00000324871:exon_58162254_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000257848:exon_58162365_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000408972:exon_58162368_58162934:METTL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 58176614 T/C 1 10 12 22 4.90402696147452 6.11516764623058 -1.21114068475606 T:C T C 10 0.509597303852548 0.672933556012192 ENSG00000123297:ENST00000454289:exon_58176372_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000323833:exon_58176559_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000417094:exon_58176564_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000434359:exon_58176586_58176660:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000457189:exon_58176601_58176690:TSFM HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 58350631 C/T 1 14 7 21 6.86563774606433 3.56718112696784 3.29845661909649 T:C C T 10 0.509597303852548 0.190961954772227 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58350470_58351051:XRCC6BP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 62785663 T/C 1 15 9 24 7.35604044221178 4.58637573467293 2.76966470753885 T:C T C 10 0.509597303852548 0.30960696984938 ENSG00000135655:ENST00000353364:exon_62785596_62785666:USP15;ENSG00000135655:ENST00000280377:exon_62785596_62785666:USP15;ENSG00000135655:ENST00000393654:exon_62785596_62785666:USP15 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 66546100 A/G 1 13 24 37 6.37523504991688 12.2303352924612 -5.85510024254428 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0693661041241979 ENSG00000155957:ENST00000426857:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000358230:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000286424:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000398033:exon_66546051_66546156:TMBIM4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 67706466 G/A 1 96 129 225 47.0786588301554 65.7380521969787 -18.6593933668233 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0135456191739009 ENSG00000111530:ENST00000299218:exon_67706386_67708388:CAND1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 69646914 G/A 1 12 14 26 5.88483235376942 7.13436225393567 -1.24952990016625 A:G G A 10 0.509597303852548 0.69693063211367 ENSG00000111605:ENST00000435070:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000266679:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000351671:exon_69646831_69646934:CPSF6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 72008421 T/C 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 T:C T C 10 0.509597303852548 0.5085374516326 ENSG00000133858:ENST00000378743:exon_72008315_72008480:ZFC3H1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 72013832 A/G 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000133858:ENST00000378743:exon_72013706_72013904:ZFC3H1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 72164395 C/T 1 7 18 25 3.43281887303216 9.17275146934586 -5.7399325963137 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0266232370800167 ENSG00000080371:ENST00000261263:exon_72164372_72164479:RAB21 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 75884254 C/T 1 6 2 8 2.94241617688471 1.0191946077051 1.92322156917962 T:C C T 10 0.509597303852548 0.289787629707581 ENSG00000139278:ENST00000266659:exon_75884186_75884298:GLIPR1;ENSG00000139278:ENST00000456650:exon_75884186_75884298:GLIPR1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 75900588 A/G 1 12 15 27 5.88483235376942 7.64395955778822 -1.7591272040188 A:G A G 10 0.509597303852548 0.56601930423381 ENSG00000111615:ENST00000229214:exon_75900562_75900696:KRR1;ENSG00000111615:ENST00000438169:exon_75900562_75900696:KRR1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 75900702 G/A 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 A:G G A 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 80190650 C/G 1 41 54 95 20.1065105420455 27.5182544080376 -7.41174386599206 C:G C G 10 0.509597303852548 0.150504511015087 ENSG00000058272:ENST00000261207:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000341878:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000312727:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000360825:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000450142:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000437004:exon_80190562_80190730:PPP1R12A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 88440676 G/C 1 3 10 13 1.47120808844236 5.09597303852548 -3.62476495008312 C:G G C 10 0.509597303852548 0.0532191285007243 ENSG00000133641:ENST00000356891:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000453037:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000332476:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000413893:exon_88440584_88440753:C12orf29 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 93202801 C/T 1 11 7 18 5.39442965762197 3.56718112696784 1.82724853065414 T:C C T 10 0.509597303852548 0.482156564682581 ENSG00000102189:ENST00000322349:exon_93202793_93202932:EEA1;ENSG00000102189:ENST00000418984:exon_93202793_93202932:EEA1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 96653501 C/T 1 4 7 11 1.96161078458981 3.56718112696784 -1.60557034237803 T:C C T 10 0.509597303852548 0.379319216476062 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 101723239 T/C 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 T:C T C 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 101776996 G/C 1 8 9 17 3.92322156917962 4.58637573467293 -0.663154165493316 C:G G C 10 0.509597303852548 0.811525826845625 ENSG00000120800:ENST00000261637:exon_101776819_101777091:UTP20 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 104327979 C/T 1 144 126 270 70.6179882452331 64.209260285421 6.40872795981205 T:C C T 10 0.509597303852548 0.465223851983425 ENSG00000166598:ENST00000299767:exon_104327734_104328065:HSP90B1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 104341015 T/C 1 17 13 30 8.33684583450668 6.62476495008312 1.71208088442356 T:C T C 10 0.509597303852548 0.586755581141905 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 104341398 T/A 1 17 10 27 8.33684583450668 5.09597303852548 3.2408727959812 A:T T A 10 0.509597303852548 0.250147773222066 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 106633424 G/A 1 10 9 19 4.90402696147452 4.58637573467293 0.317651226801589 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000136026:ENST00000258512:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000437873:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000378026:exon_106631659_106634127:CKAP4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 106633569 C/T 1 3 14 17 1.47120808844236 7.13436225393567 -5.66315416549332 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00660613427908658 ENSG00000136026:ENST00000258512:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000437873:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000378026:exon_106631659_106634127:CKAP4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 107372277 C/T 1 14 12 26 6.86563774606433 6.11516764623058 0.750470099833752 T:C C T 10 0.509597303852548 0.845759645675331 ENSG00000120832:ENST00000240050:exon_107371069_107372549:MTERFD3;ENSG00000120832:ENST00000392830:exon_107371069_107372549:MTERFD3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 108096769 G/C 1 10 12 22 4.90402696147452 6.11516764623058 -1.21114068475606 C:G G C 10 0.509597303852548 0.672933556012192 ENSG00000136045:ENST00000412830:exon_108096712_108096808:PWP1;ENSG00000136045:ENST00000258531:exon_108096712_108096808:PWP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 109017264 T/C 1 8 9 17 3.92322156917962 4.58637573467293 -0.663154165493316 T:C T C 10 0.509597303852548 0.811525826845625 ENSG00000110876:ENST00000388962:exon_109015686_109017663:SELPLG;ENSG00000110876:ENST00000228463:exon_109016768_109018088:SELPLG HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 109017266 G/A 1 6 9 15 2.94241617688471 4.58637573467293 -1.64395955778822 A:G G A 10 0.509597303852548 0.446901967950042 ENSG00000110876:ENST00000388962:exon_109015686_109017663:SELPLG;ENSG00000110876:ENST00000228463:exon_109016768_109018088:SELPLG HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 109198847 G/A 1 8 1 9 3.92322156917962 0.509597303852548 3.41362426532707 A:G G A 10 0.509597303852548 0.039373498903222 ENSG00000084112:ENST00000326495:exon_109198832_109198960:SSH1;ENSG00000084112:ENST00000360239:exon_109198832_109198960:SSH1;ENSG00000084112:ENST00000303438:exon_109198832_109198960:SSH1;ENSG00000084112:ENST00000326470:exon_109198832_109198960:SSH1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 110922929 G/T 1 11 5 16 5.39442965762197 2.54798651926274 2.84644313835923 T:G G T 10 0.509597303852548 0.211463370056425 ENSG00000204856:ENST00000377673:exon_110922883_110923004:C12orf24 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 111160003 G/A 1 21 22 43 10.2984566190965 11.2111406847561 -0.912684065659562 A:G G A 10 0.509597303852548 0.879039750242234 ENSG00000186298:ENST00000335007:exon_111159940_111160074:PPP1CC;ENSG00000186298:ENST00000340766:exon_111159940_111160074:PPP1CC HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 113348870 G/A 1 70 75 145 34.3281887303216 38.2197977889411 -3.89160905861946 A:G G A 10 0.509597303852548 0.561158369903234 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000445409:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000452357:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000377508:exon_113348856_113349040:OAS1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 113357202 C/T 0 74 0 74 36.2897995149115 0 36.2897995149115 C C 10 0.509597303852548 2.28791446820792e-22 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113357195_113357536:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113357194_113357711:OAS1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 113357209 G/A 1 68 3 71 33.3473833380267 1.52879191155764 31.8185914264691 A:G G A 10 0.509597303852548 9.42340862097335e-17 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113357195_113357536:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113357194_113357711:OAS1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 113357237 G/C 1 64 11 75 31.3857725534369 5.60557034237803 25.7802022110589 C:G G C 10 0.509597303852548 7.3849090380955e-10 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113357195_113357536:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113357194_113357711:OAS1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 113376320 C/T 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 T:C C T 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113376157_113376512:OAS3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 113376331 C/A 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 A:C C A 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113376157_113376512:OAS3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 113385918 C/T 1 8 12 20 3.92322156917962 6.11516764623058 -2.19194607705096 T:C C T 10 0.509597303852548 0.375790350036073 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 113425154 C/G 1 20 8 28 9.80805392294904 4.07677843082038 5.73127549212866 C:G C G 10 0.509597303852548 0.036637852081938 ENSG00000111335:ENST00000449768:exon_113424843_113426607:OAS2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 113435450 A/T 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 A:T A T 10 0.509597303852548 0.499988077920146 ENSG00000111335:ENST00000342315:exon_113435325_113435560:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000392583:exon_113435325_113435560:OAS2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 114261053 G/A 1 7 13 20 3.43281887303216 6.62476495008312 -3.19194607705096 A:G G A 10 0.509597303852548 0.182296042530127 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114259863_114261126:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114261014_114261126:RBM19 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 114282496 C/T 1 4 11 15 1.96161078458981 5.60557034237803 -3.64395955778822 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0719657820440228 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114282473_114282593:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114282473_114282593:RBM19 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 114377885 G/C 1 5 6 11 2.45201348073726 3.05758382311529 -0.605570342378028 C:G G C 10 0.509597303852548 0.770507260060939 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114377765_114377965:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114377765_114377965:RBM19 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 118682751 C/T 1 7 1 8 3.43281887303216 0.509597303852548 2.92322156917962 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0707155477569663 ENSG00000135090:ENST00000392533:exon_118682699_118682770:TAOK3;ENSG00000135090:ENST00000359811:exon_118682699_118682770:TAOK3;ENSG00000135090:ENST00000419821:exon_118682699_118682770:TAOK3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 120589064 G/C 1 13 3 16 6.37523504991688 1.52879191155764 4.84644313835923 C:G G C 10 0.509597303852548 0.0216395245326523 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120588949_120589195:GCN1L1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 120589160 A/G 1 9 7 16 4.41362426532707 3.56718112696784 0.846443138359232 A:G A G 10 0.509597303852548 0.80419746365061 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120588949_120589195:GCN1L1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 120608031 A/G 1 10 3 13 4.90402696147452 1.52879191155764 3.37523504991688 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0930569697494132 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120607973_120608125:GCN1L1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 120613565 T/C 1 6 5 11 2.94241617688471 2.54798651926274 0.394429657621972 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120613549_120613677:GCN1L1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 120636549 C/A 1 59 9 68 28.9337590726997 4.58637573467293 24.3473833380267 A:C C A 10 0.509597303852548 9.6870141926481e-10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 120649681 C/T 1 3 8 11 1.47120808844236 4.07677843082038 -2.60557034237803 T:C C T 10 0.509597303852548 0.139008716253398 ENSG00000089159:ENST00000424649:exon_120648251_120650383:PXN;ENSG00000089159:ENST00000228307:exon_120648251_120650383:PXN;ENSG00000089159:ENST00000267257:exon_120648251_120650383:PXN;ENSG00000089159:ENST00000458477:exon_120648251_120650383:PXN;ENSG00000089159:ENST00000397506:exon_120648251_120650383:PXN;ENSG00000089159:ENST00000323871:exon_120648254_120650383:PXN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 120650421 C/T 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 T:C C T 10 0.509597303852548 0.335037018547339 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 120907332 C/T 1 18 46 64 8.82724853065414 23.4414759772172 -14.6142274465631 T:C C T 10 0.509597303852548 0.000246468754474519 ENSG00000111786:ENST00000229390:exon_120907225_120907464:SRSF9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 120995332 G/A 1 8 1 9 3.92322156917962 0.509597303852548 3.41362426532707 A:G G A 10 0.509597303852548 0.039373498903222 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 121013496 G/C 1 4 10 14 1.96161078458981 5.09597303852548 -3.13436225393567 C:G G C 10 0.509597303852548 0.112312460825055 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 121174899 T/C 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 T:C T C 10 0.509597303852548 0.541646560898822 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121174789_121174938:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121174789_121174938:ACADS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 121176402 G/A 1 6 7 13 2.94241617688471 3.56718112696784 -0.624764950083124 A:C:G G A 10 0.509597303852548 0.786978111840725 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176336_121176473:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176336_121176473:ACADS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 121176679 C/T 1 8 10 18 3.92322156917962 5.09597303852548 -1.17275146934586 T:C C T 10 0.509597303852548 0.642260839788311 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176623_121176718:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176623_121176718:ACADS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 123057792 A/G 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000184445:ENST00000333479:exon_123057689_123057832:KNTC1;ENSG00000184445:ENST00000450485:exon_123057689_123057832:KNTC1;ENSG00000184445:ENST00000436959:exon_123057689_123057832:KNTC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 123466111 C/T 1 11 22 33 5.39442965762197 11.2111406847561 -5.81671102713408 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0543105580393728 ENSG00000182196:ENST00000392433:exon_123465364_123466426:ARL6IP4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 123738494 C/T 1 25 25 50 12.2600674036863 12.7399325963137 -0.4798651926274 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000130921:ENST00000253233:exon_123738194_123738503:C12orf65;ENSG00000130921:ENST00000425637:exon_123738194_123739580:C12orf65;ENSG00000130921:ENST00000366329:exon_123738194_123738503:C12orf65 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 123794104 G/T 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 T:G G T 10 0.509597303852548 0.5085374516326 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123794036_123794130:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123794036_123794130:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123794036_123794130:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123794036_123794130:SBNO1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 123799938 C/T 1 8 6 14 3.92322156917962 3.05758382311529 0.865637746064328 T:C C T 10 0.509597303852548 0.79106698341654 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123799920_123799991:SBNO1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 123810873 G/A 1 21 6 27 10.2984566190965 3.05758382311529 7.2408727959812 A:G G A 10 0.509597303852548 0.00616438485076692 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123810699_123810881:SBNO1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 123812295 T/C 1 6 4 10 2.94241617688471 2.03838921541019 0.90402696147452 T:C T C 10 0.509597303852548 0.75435926131823 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123812254_123812359:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123812254_123812359:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123812254_123812359:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123812254_123812359:SBNO1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 124104551 A/G 1 118 106 224 57.8675181453993 54.0173142083701 3.85020393702925 A:G A G 10 0.509597303852548 0.640105292253792 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124104511_124105480:DDX55 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 124826598 T/C 1 9 7 16 4.41362426532707 3.56718112696784 0.846443138359232 T:C T C 10 0.509597303852548 0.80419746365061 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000453428:exon_124826369_124826601:NCOR2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 124957627 C/T 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000420698:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000448008:exon_124957498_124957677:NCOR2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 125284748 A/G 1 14 19 33 6.86563774606433 9.68234877319841 -2.81671102713408 A:G A G 10 0.509597303852548 0.385224101277236 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125284670_125284788:SCARB1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 125434716 G/A 1 14 8 22 6.86563774606433 4.07677843082038 2.78885931524394 A:G G A 10 0.509597303852548 0.288242782553056 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125434695_125434789:DHX37 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 125561151 A/G 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125561037_125561157:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125561037_125561157:AACS;ENSG00000081760:ENST00000418937:exon_125561037_125561157:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125561037_125561157:AACS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 132624252 G/A 1 13 12 25 6.37523504991688 6.11516764623058 0.2600674036863 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132624180_132624314:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132624180_132624314:DDX51 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 132626425 G/A 1 7 9 16 3.43281887303216 4.58637573467293 -1.15355686164077 A:G G A 10 0.509597303852548 0.623338489505478 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626395_132626501:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626395_132626501:DDX51 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 132626668 T/C 1 3 7 10 1.47120808844236 3.56718112696784 -2.09597303852548 T:C T C 10 0.509597303852548 0.218348598150516 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626664_132626735:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626664_132626735:DDX51 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 132627365 G/A 1 7 4 11 3.43281887303216 2.03838921541019 1.39442965762197 A:G G A 10 0.509597303852548 0.549658645750086 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132627273_132627423:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132627273_132627423:DDX51 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 132635581 C/T 1 23 9 32 11.2792620113914 4.58637573467293 6.69288627671847 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0207827504678314 ENSG00000184967:ENST00000330579:exon_132635526_132635586:NOC4L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 132636281 A/G 1 2 48 50 0.980805392294904 24.4606705849223 -23.4798651926274 A:G A G 10 0.509597303852548 5.76505443304575e-13 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 133272590 G/A 1 23 4 27 11.2792620113914 2.03838921541019 9.24087279598121 A:G G A 10 0.509597303852548 0.000330845584449162 ENSG00000176894:ENST00000317479:exon_133272470_133272632:PGAM5;ENSG00000176894:ENST00000428960:exon_133272470_133272632:PGAM5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 133357412 T/C 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 T:C T C 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133357384_133357500:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133357384_133357500:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133357384_133357500:GOLGA3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 12 133378440 C/T 1 8 5 13 3.92322156917962 2.54798651926274 1.37523504991688 T:C C T 10 0.509597303852548 0.581979954468297 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133378353_133378555:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133378353_133378555:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133378353_133378555:GOLGA3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 20356941 T/A 1 19 23 42 9.31765122680159 11.7207379886086 -2.40308676180701 A:T T A 10 0.509597303852548 0.537695416205615 ENSG00000121390:ENST00000471658:exon_20356526_20357057:PSPC1;ENSG00000121390:ENST00000492741:exon_20356526_20357082:PSPC1;ENSG00000121390:ENST00000338910:exon_20356526_20357057:PSPC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 21535837 T/G 1 158 2 160 77.4836259912974 1.0191946077051 76.4644313835923 T:C:G T G 10 0.509597303852548 1.94637758766384e-43 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 21742311 C/T 0 45 0 45 22.0681213266353 0 22.0681213266353 C C 10 0.509597303852548 7.87500190775318e-14 ENSG00000165480:ENST00000298260:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000314759:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000400018:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000465471:exon_21742127_21742538:SKA3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 25000617 C/G 1 50 61 111 24.5201348073726 31.0854355350054 -6.56530072763283 C:G C G 10 0.509597303852548 0.218506787948944 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25000604_25000736:PARP4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 25009297 G/T 1 13 14 27 6.37523504991688 7.13436225393567 -0.759127204018796 T:G G T 10 0.509597303852548 0.848413381775282 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 25009441 C/G 1 10 8 18 4.90402696147452 4.07677843082038 0.827248530654137 C:G C G 10 0.509597303852548 0.815143514661865 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 25009485 C/G 1 15 5 20 7.35604044221178 2.54798651926274 4.80805392294904 C:G C G 10 0.509597303852548 0.0421254727603905 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 25466955 T/C 1 13 12 25 6.37523504991688 6.11516764623058 0.2600674036863 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000418179:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25466781_25467005:CENPJ HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 25480145 G/A 0 8 0 8 3.92322156917962 0 3.92322156917962 G G 10 0.509597303852548 0.00789316895639457 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25479484_25481098:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25479484_25481098:CENPJ HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 25876011 G/A 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 A:G G A 10 0.509597303852548 0.499988077920146 ENSG00000139496:ENST00000381736:exon_25875662_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000313619:exon_25875666_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381745:exon_25875666_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000481980:exon_25875694_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000490231:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000480187:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000460326:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000465068:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000466694:exon_25875769_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000463407:exon_25875769_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381718:exon_25875771_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000495460:exon_25875783_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381747:exon_25875785_25876018:NUPL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 28009920 G/C 1 60 31 91 29.4241617688471 15.797516419429 13.6266453494181 C:G G C 10 0.509597303852548 0.00449084457365294 ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28009570_28009958:GTF3A;ENSG00000122033:ENST00000381116:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000381120:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000405591:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000431572:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000461838:exon_28009821_28010030:MTIF3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 37580139 G/A 1 29 17 46 14.2216781882761 8.66315416549332 5.55852402278279 A:G G A 10 0.509597303852548 0.106726615242147 ENSG00000120699:ENST00000489088:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000389704:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000379809:exon_37580095_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000239893:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000474661:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000490537:exon_37580094_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000488779:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000464235:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000495092:exon_37580057_37580162:EXOSC8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 37583831 G/A 1 22 24 46 10.7888593152439 12.2303352924612 -1.44147597721721 A:G G A 10 0.509597303852548 0.768449067137812 ENSG00000102710:ENST00000490716:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000484078:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000360252:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000483214:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000475892:exon_37583630_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000350612:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000472948:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000356185:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000469488:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000473871:exon_37583634_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000464744:exon_37583754_37583946:FAM48A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 39622075 T/C 1 8 3 11 3.92322156917962 1.52879191155764 2.39442965762197 T:C T C 10 0.509597303852548 0.227512016275758 ENSG00000188811:ENST00000470258:exon_39621811_39624246:NHLRC3;ENSG00000188811:ENST00000379600:exon_39621811_39624246:NHLRC3;ENSG00000188811:ENST00000379599:exon_39621811_39624246:NHLRC3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 41515286 T/A 1 9 3 12 4.41362426532707 1.52879191155764 2.88483235376942 A:T T A 10 0.509597303852548 0.146886429190433 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41515057_41515506:ELF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 41517985 A/G 1 9 10 19 4.41362426532707 5.09597303852548 -0.682348773198411 A:G A G 10 0.509597303852548 0.821015503596854 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41517978_41518061:ELF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 41533052 T/C 1 12 3 15 5.88483235376942 1.52879191155764 4.35604044221178 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0356477356687783 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41532972_41533152:ELF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 41834744 C/T 1 10 12 22 4.90402696147452 6.11516764623058 -1.21114068475606 T:C C T 10 0.509597303852548 0.672933556012192 ENSG00000120662:ENST00000430347:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379480:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379477:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000486236:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000452359:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000497679:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000239852:exon_41834629_41835051:MTRF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 42877379 T/C 1 11 7 18 5.39442965762197 3.56718112696784 1.82724853065414 T:C T C 10 0.509597303852548 0.482156564682581 ENSG00000023516:ENST00000025301:exon_42873499_42877999:AKAP11 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 43597865 A/G 1 16 6 22 7.84644313835923 3.05758382311529 4.78885931524394 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0534231591030593 ENSG00000120675:ENST00000379221:exon_43597339_43597870:DNAJC15;ENSG00000120675:ENST00000474320:exon_43597339_43597870:DNAJC15 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 44543675 G/A 0 9 0 9 4.41362426532707 0 4.41362426532707 G G 10 0.509597303852548 0.00395812771304115 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 47308109 A/G 1 5 5 10 2.45201348073726 2.54798651926274 -0.0959730385254796 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000136141:ENST00000311191:exon_47308056_47308133:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000258643:exon_47308056_47308133:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389798:exon_47308056_47308133:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389797:exon_47308056_47308133:LRCH1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 49776080 A/G 0 0 8 8 0 4.07677843082038 -4.07677843082038 G A G 10 0.509597303852548 0.00334520543356084 ENSG00000102531:ENST00000492622:exon_49775936_49776102:FNDC3A;ENSG00000102531:ENST00000484074:exon_49775936_49776102:FNDC3A;ENSG00000102531:ENST00000337156:exon_49775936_49776102:FNDC3A;ENSG00000102531:ENST00000398316:exon_49775936_49776102:FNDC3A;ENSG00000102531:ENST00000497644:exon_49775936_49776102:FNDC3A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 51519581 G/A 1 18 21 39 8.82724853065414 10.7015433809035 -1.87429485024937 A:G G A 10 0.509597303852548 0.631713408514061 ENSG00000136104:ENST00000336617:exon_51519563_51519668:RNASEH2B;ENSG00000136104:ENST00000422660:exon_51519563_51519668:RNASEH2B;ENSG00000136104:ENST00000495244:exon_51519563_51519668:RNASEH2B;ENSG00000136104:ENST00000459681:exon_51519563_51519650:RNASEH2B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 52343391 C/T 1 3 7 10 1.47120808844236 3.56718112696784 -2.09597303852548 T:C C T 10 0.509597303852548 0.218348598150516 ENSG00000102796:ENST00000444610:exon_52343292_52343429:DHRS12;ENSG00000102796:ENST00000218981:exon_52342131_52343429:DHRS12;ENSG00000102796:ENST00000469957:exon_52343292_52343429:DHRS12 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 52603775 C/T 1 12 21 33 5.88483235376942 10.7015433809035 -4.81671102713408 T:C C T 10 0.509597303852548 0.116511284590118 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 60240961 C/T 1 6 2 8 2.94241617688471 1.0191946077051 1.92322156917962 T:C C T 10 0.509597303852548 0.289787629707581 ENSG00000139734:ENST00000400324:exon_60239717_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400329:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400330:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000413168:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400327:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400326:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000377908:exon_60240718_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400319:exon_60240718_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400320:exon_60240718_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000470420:exon_60240875_60240980:DIAPH3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 77751892 C/T 1 6 9 15 2.94241617688471 4.58637573467293 -1.64395955778822 T:C C T 10 0.509597303852548 0.446901967950042 ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77751883_77752089:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77751883_77752089:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000360084:exon_77751883_77752089:MYCBP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 96489397 C/T 1 3 7 10 1.47120808844236 3.56718112696784 -2.09597303852548 T:C C T 10 0.509597303852548 0.218348598150516 ENSG00000102595:ENST00000376747:exon_96489340_96489456:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000376722:exon_96489340_96489456:UGGT2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 99100547 T/C 1 7 15 22 3.43281887303216 7.64395955778822 -4.21114068475606 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0881542987232215 ENSG00000152767:ENST00000376586:exon_99100490_99102016:FARP1;ENSG00000152767:ENST00000319562:exon_99100490_99102023:FARP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 99105395 G/A 1 19 19 38 9.31765122680159 9.68234877319841 -0.364697546396823 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000102572:ENST00000397517:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376554:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376547:exon_99104413_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376541:exon_99104414_99105463:STK24 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 99947261 C/T 1 23 42 65 11.2792620113914 21.403086761807 -10.1238247504156 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0129072134511496 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 99948178 C/A 1 3 8 11 1.47120808844236 4.07677843082038 -2.60557034237803 A:C C A 10 0.509597303852548 0.139008716253398 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 111298392 A/G 1 24 21 45 11.7696647075388 10.7015433809035 1.06812132663534 A:G A G 10 0.509597303852548 0.767881263708305 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111298314_111298420:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000487253:exon_111298314_111298643:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000480437:exon_111298314_111298625:CARS2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 111319754 T/C 1 13 22 35 6.37523504991688 11.2111406847561 -4.83590563483918 T:C T C 10 0.509597303852548 0.127506116178141 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111319687_111319820:CARS2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 13 111563052 C/T 1 5 17 22 2.45201348073726 8.66315416549332 -6.21114068475605 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00946087211552678 ENSG00000088448:ENST00000267339:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000310847:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000465753:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000489973:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000494859:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000375758:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000460846:exon_111562965_111563117:ANKRD10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 20852770 G/T 1 7 2 9 3.43281887303216 1.0191946077051 2.41362426532707 T:G G T 10 0.509597303852548 0.180412718745071 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20852759_20852872:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20852759_20852872:TEP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 20871973 T/C 1 6 2 8 2.94241617688471 1.0191946077051 1.92322156917962 T:C T C 10 0.509597303852548 0.289787629707581 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20871882_20872043:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20871882_20872043:TEP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 20916249 T/C 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:C T C 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 20916958 T/C 1 23 33 56 11.2792620113914 16.8167110271341 -5.53744901574269 T:C T C 10 0.509597303852548 0.143839548167973 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20916892_20916970:OSGEP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 20920250 T/C 1 5 7 12 2.45201348073726 3.56718112696784 -1.11516764623058 T:C T C 10 0.509597303852548 0.574428486272357 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20920133_20920308:OSGEP;ENSG00000092094:ENST00000488532:exon_20920133_20920308:OSGEP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 21831419 C/T 1 20 12 32 9.80805392294904 6.11516764623058 3.69288627671846 T:C C T 10 0.509597303852548 0.218035323997103 ENSG00000092201:ENST00000216297:exon_21831392_21831487:SUPT16H HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 21936855 T/G 1 6 8 14 2.94241617688471 4.07677843082038 -1.13436225393567 T:G T G 10 0.509597303852548 0.601095068648336 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21936829_21936911:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21936829_21936911:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21936829_21936867:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21936829_21936867:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000461909:exon_21936829_21936911:RAB2B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 21960816 T/C 1 16 20 36 7.84644313835923 10.191946077051 -2.34550293869173 T:C T C 10 0.509597303852548 0.505991398330782 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 21960969 G/A 1 22 17 39 10.7888593152439 8.66315416549332 2.12570514975063 A:G G A 10 0.509597303852548 0.52539752156904 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 21967916 A/G 1 27 33 60 13.2408727959812 16.8167110271341 -3.57583823115288 A:G A G 10 0.509597303852548 0.368966618500701 ENSG00000165819:ENST00000298717:exon_21967908_21967946:METTL3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 23020921 G/C 1 115 106 221 56.396310056957 54.0173142083701 2.3789958485869 A:C:G G C 10 0.509597303852548 0.78794294162319 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 24424367 G/A 1 10 1 11 4.90402696147452 0.509597303852548 4.39442965762197 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0118772360206333 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24424244_24424421:DHRS4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 24587667 C/T 1 7 1 8 3.43281887303216 0.509597303852548 2.92322156917962 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0707155477569663 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 24615435 T/C 1 361 343 704 177.03537330923 174.791875221424 2.24349808780622 A:T:C T C 10 0.509597303852548 0.880184205864238 ENSG00000100911:ENST00000216802:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000429021:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000396881:exon_24615417_24615449:PSME2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 24617238 C/T 1 8 4 12 3.92322156917962 2.03838921541019 1.88483235376942 T:C:G C T 10 0.509597303852548 0.388763190446408 ENSG00000092098:ENST00000324103:exon_24617185_24617331:RNF31 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 24642348 C/T 1 24 13 37 11.7696647075388 6.62476495008312 5.14489975745572 T:C C T 10 0.509597303852548 0.101163301622562 ENSG00000100918:ENST00000311457:exon_24642335_24642407:REC8;ENSG00000100918:ENST00000447460:exon_24642335_24642407:REC8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 24647814 T/C 1 52 26 78 25.5009401996675 13.2495299001662 12.2514102995013 T:C T C 10 0.509597303852548 0.00627275718650945 ENSG00000100918:ENST00000311457:exon_24647812_24647878:REC8;ENSG00000100918:ENST00000447460:exon_24647812_24647878:REC8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 24647957 C/T 1 8 8 16 3.92322156917962 4.07677843082038 -0.153556861640768 T:C C T 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 24653965 C/T 1 3 7 10 1.47120808844236 3.56718112696784 -2.09597303852548 T:C C T 10 0.509597303852548 0.218348598150516 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653856_24653969:IPO4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 24654489 T/C 1 6 5 11 2.94241617688471 2.54798651926274 0.394429657621972 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24654389_24654518:IPO4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 24679877 C/T 1 79 53 132 38.7418129956487 27.008657104185 11.7331558914637 T:C C T 10 0.509597303852548 0.045073154937138 ENSG00000254692:ENST00000530611:exon_24679860_24679974:RP11-468E2.1;ENSG00000254505:ENST00000347519:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000530996:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533523:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533011:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000524955:exon_24679860_24680067:CHMP4A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 24775579 C/T 1 7 12 19 3.43281887303216 6.11516764623058 -2.68234877319841 T:C C T 10 0.509597303852548 0.255561328037084 ENSG00000196943:ENST00000267425:exon_24774144_24778330:C14orf21 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 24845841 T/C 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 T:C T C 10 0.509597303852548 0.335037018547339 ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24845500_24848810:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24845500_24846084:NFATC4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 31359024 A/T 1 41 28 69 20.1065105420455 14.2687245078713 5.83778603417419 A:T A T 10 0.509597303852548 0.185298726095345 ENSG00000100473:ENST00000216361:exon_31358822_31359822:COCH;ENSG00000100473:ENST00000382493:exon_31358822_31359822:COCH;ENSG00000100473:ENST00000460581:exon_31358822_31359822:COCH;ENSG00000100473:ENST00000396618:exon_31358822_31359824:COCH;ENSG00000100473:ENST00000468826:exon_31358822_31359347:COCH HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 31647439 T/C 1 8 7 15 3.92322156917962 3.56718112696784 0.35604044221178 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31647226_31647460:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31647226_31647460:HECTD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 35222732 C/T 1 9 18 27 4.41362426532707 9.17275146934586 -4.7591272040188 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0826307828551837 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35221938_35222910:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35221943_35222910:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35221943_35222910:BAZ1A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 35242828 G/A 1 7 1 8 3.43281887303216 0.509597303852548 2.92322156917962 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0707155477569663 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35242778_35242932:BAZ1A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 35735967 A/G 1 8 8 16 3.92322156917962 4.07677843082038 -0.153556861640768 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000100890:ENST00000321130:exon_35735933_35736081:KIAA0391;ENSG00000100890:ENST00000250377:exon_35735933_35736081:KIAA0391 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 35871217 G/A 1 492 564 1056 241.278126504546 287.412879372837 -46.1347528682906 A:T:G G A 10 0.509597303852548 0.00461975847398133 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35870717_35871266:NFKBIA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 39644498 G/A 1 7 6 13 3.43281887303216 3.05758382311529 0.375235049916876 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39644425_39644596:PNN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 39648629 C/T 1 160 190 350 78.4644313835923 96.8234877319841 -18.3590563483918 T:C C T 10 0.509597303852548 0.054147741013247 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39648528_39648666:PNN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 39818028 A/G 1 13 11 24 6.37523504991688 5.60557034237803 0.769664707538849 A:G A G 10 0.509597303852548 0.839530909399512 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 45693648 G/A 1 19 18 37 9.31765122680159 9.17275146934586 0.144899757455725 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45693121_45693949:C14orf106 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 50585248 C/T 1 1 10 11 0.490402696147452 5.09597303852548 -4.60557034237803 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00550610186118297 ENSG00000100485:ENST00000216373:exon_50583847_50585571:SOS2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 50778816 A/C 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 A:C A C 10 0.509597303852548 0.541646560898822 ENSG00000087299:ENST00000261699:exon_50778729_50778886:L2HGDH;ENSG00000087299:ENST00000267436:exon_50778729_50778947:L2HGDH HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 51202311 G/C 1 31 15 46 15.202483580571 7.64395955778822 7.55852402278279 C:G G C 10 0.509597303852548 0.0271454832660880 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51202234_51202335:NIN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 55004449 G/A 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 A:G G A 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000100532:ENST00000216420:exon_55004440_55004547:CGRRF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 56103882 A/G 1 5 6 11 2.45201348073726 3.05758382311529 -0.605570342378028 A:G A G 10 0.509597303852548 0.770507260060939 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 57938124 C/T 1 5 13 18 2.45201348073726 6.62476495008312 -4.17275146934586 T:C C T 10 0.509597303852548 0.059364647228317 ENSG00000100557:ENST00000216445:exon_57936019_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000534126:exon_57937973_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000530417:exon_57937973_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000534528:exon_57937973_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000422976:exon_57937973_57938308:C14orf105 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 58831142 A/G 1 21 23 44 10.2984566190965 11.7207379886086 -1.42228136951211 A:G A G 10 0.509597303852548 0.763439588932285 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58830888_58832018:ARID4A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 58838668 A/G 1 4 11 15 1.96161078458981 5.60557034237803 -3.64395955778822 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0719657820440228 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58838604_58840451:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58838604_58839012:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58838604_58838944:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000466065:exon_58838604_58838678:ARID4A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 59797235 A/G 1 7 2 9 3.43281887303216 1.0191946077051 2.41362426532707 A:G A G 10 0.509597303852548 0.180412718745071 ENSG00000100592:ENST00000351081:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000360909:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000358498:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000395125:exon_59797219_59797406:DAAM1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 64676098 A/G 1 6 2 8 2.94241617688471 1.0191946077051 1.92322156917962 A:G A G 10 0.509597303852548 0.289787629707581 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 64882380 A/G 1 10 5 15 4.90402696147452 2.54798651926274 2.35604044221178 A:G A G 10 0.509597303852548 0.303107408657847 ENSG00000100714:ENST00000216605:exon_64882357_64882457:MTHFD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 66136163 C/A 1 7 9 16 3.43281887303216 4.58637573467293 -1.15355686164077 A:C C A 10 0.509597303852548 0.623338489505478 ENSG00000033170:ENST00000360689:exon_66135961_66136198:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000342677:exon_66135961_66136198:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394586:exon_66135961_66136198:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394585:exon_66135961_66136198:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000358307:exon_66135961_66136198:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394581:exon_66135961_66136198:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000417683:exon_66136133_66136198:FUT8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 69259662 C/A 1 9 3 12 4.41362426532707 1.52879191155764 2.88483235376942 A:C C A 10 0.509597303852548 0.146886429190433 ENSG00000185650:ENST00000439696:exon_69259599_69259785:ZFP36L1;ENSG00000185650:ENST00000336440:exon_69259599_69261453:ZFP36L1;ENSG00000185650:ENST00000435246:exon_69259599_69261453:ZFP36L1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 69521345 G/A 1 18 19 37 8.82724853065414 9.68234877319841 -0.855100242544275 A:G G A 10 0.509597303852548 0.869812937617846 ENSG00000139990:ENST00000341516:exon_69517638_69522328:DCAF5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 70839735 A/C 1 8 9 17 3.92322156917962 4.58637573467293 -0.663154165493316 A:C A C 10 0.509597303852548 0.811525826845625 ENSG00000213463:ENST00000256366:exon_70833217_70839848:SYNJ2BP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 72945012 T/C 1 2 7 9 0.980805392294904 3.56718112696784 -2.58637573467293 T:C T C 10 0.509597303852548 0.103145007117103 ENSG00000182732:ENST00000402788:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000404301:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000343854:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000434263:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000453330:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000407322:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000406236:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000355512:exon_72944976_72945037:RGS6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 73425462 G/A 1 6 5 11 2.94241617688471 2.54798651926274 0.394429657621972 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000119599:ENST00000358377:exon_73425320_73425829:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000353777:exon_73425320_73426300:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509320:exon_73425320_73425829:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000394234:exon_73425320_73426411:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509153:exon_73425320_73425654:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000340355:exon_73425320_73426356:DCAF4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 73739369 G/A 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000100767:ENST00000340738:exon_73739203_73741345:PAPLN;ENSG00000100767:ENST00000216658:exon_73739203_73741345:PAPLN;ENSG00000100767:ENST00000427855:exon_73739203_73741345:PAPLN;ENSG00000100767:ENST00000381166:exon_73739203_73741345:PAPLN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 74036216 A/G 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 A:G A G 10 0.509597303852548 0.5085374516326 ENSG00000119673:ENST00000238651:exon_74035772_74036587:ACOT2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 74196686 T/C 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 T:C T C 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74196343_74196688:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74196343_74196688:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74196343_74196688:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000451078:exon_74196343_74196688:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74196343_74196688:C14orf43 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 74206481 T/C 1 11 9 20 5.39442965762197 4.58637573467293 0.808053922949041 T:C T C 10 0.509597303852548 0.824451040790607 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74205263_74206958:C14orf43 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 74388908 T/C 1 4 8 12 1.96161078458981 4.07677843082038 -2.11516764623058 T:C T C 10 0.509597303852548 0.258556419599671 ENSG00000119725:ENST00000334521:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000458102:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000442160:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000398139:exon_74388769_74388909:ZNF410 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 74759006 C/T 1 4 7 11 1.96161078458981 3.56718112696784 -1.60557034237803 T:C C T 10 0.509597303852548 0.379319216476062 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481935:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000474270:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000496015:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000469672:exon_74758990_74759079:ABCD4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 74766352 A/G 1 7 1 8 3.43281887303216 0.509597303852548 2.92322156917962 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0707155477569663 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74766251_74766378:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74766251_74766378:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000469672:exon_74766251_74766378:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000477803:exon_74766251_74766378:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000493427:exon_74765764_74766378:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000493752:exon_74765881_74766378:ABCD4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 75245368 C/T 1 5 5 10 2.45201348073726 2.54798651926274 -0.0959730385254796 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75245150_75245386:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75245150_75245386:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75245150_75245386:YLPM1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 75248669 G/T 1 6 19 25 2.94241617688471 9.68234877319841 -6.7399325963137 T:G G T 10 0.509597303852548 0.00833470432006042 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75248037_75249028:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75248626_75249028:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75248626_75249028:YLPM1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 75483812 T/C 1 7 11 18 3.43281887303216 5.60557034237803 -2.17275146934586 T:C T C 10 0.509597303852548 0.351502463188979 ENSG00000119684:ENST00000238662:exon_75480467_75483904:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000355774:exon_75480467_75483904:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000380968:exon_75480467_75483904:MLH3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 75590822 G/A 1 6 5 11 2.94241617688471 2.54798651926274 0.394429657621972 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000119638:ENST00000238616:exon_75590749_75590926:NEK9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 75590846 A/T 1 6 5 11 2.94241617688471 2.54798651926274 0.394429657621972 A:T A T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000119638:ENST00000238616:exon_75590749_75590926:NEK9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 76368544 T/C 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 T:C T C 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76368485_76368567:TTLL5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 76638238 C/T 1 8 6 14 3.92322156917962 3.05758382311529 0.865637746064328 T:C C T 10 0.509597303852548 0.79106698341654 ENSG00000089916:ENST00000261530:exon_76638186_76638362:C14orf118;ENSG00000089916:ENST00000312858:exon_76638186_76638362:C14orf118;ENSG00000089916:ENST00000425830:exon_76638186_76638362:C14orf118;ENSG00000089916:ENST00000336993:exon_76638186_76638362:C14orf118 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 77935520 G/A 1 70 103 173 34.3281887303216 52.4885222968124 -18.1603335664908 A:G G A 10 0.509597303852548 0.00610302822231621 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77935420_77935807:AHSA1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 78177183 C/A 1 92 83 175 45.1170480455656 42.2965762197615 2.82047182580411 A:C C A 10 0.509597303852548 0.705634648266991 ENSG00000119705:ENST00000238688:exon_78177181_78177239:C14orf156 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 78184566 C/A 1 44 57 101 21.5777186304879 29.0470463195952 -7.46932768910735 A:C C A 10 0.509597303852548 0.163206979004165 ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78183946_78184629:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78183946_78184629:SNW1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 78197365 C/T 1 33 19 52 16.1832889728659 9.68234877319841 6.50094019966751 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0730756181217857 ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78197331_78197472:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78197331_78197472:SNW1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 88477413 C/T 1 12 9 21 5.88483235376942 4.58637573467293 1.29845661909649 T:C C T 10 0.509597303852548 0.664861077872976 ENSG00000140030:ENST00000267549:exon_88476733_88478422:GPR65 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 88477882 A/C 1 13 15 28 6.37523504991688 7.64395955778822 -1.26872450787134 A:C A C 10 0.509597303852548 0.707126514476892 ENSG00000140030:ENST00000267549:exon_88476733_88478422:GPR65 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 90744672 G/A 1 6 7 13 2.94241617688471 3.56718112696784 -0.624764950083124 A:G G A 10 0.509597303852548 0.786978111840725 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90744398_90744805:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90744402_90744805:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90744402_90744805:C14orf102 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 90745422 T/C 1 5 7 12 2.45201348073726 3.56718112696784 -1.11516764623058 T:C T C 10 0.509597303852548 0.574428486272357 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90745406_90745477:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90745406_90745477:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90745406_90745477:C14orf102 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 91671124 G/A 1 9 6 15 4.41362426532707 3.05758382311529 1.35604044221178 A:G G A 10 0.509597303852548 0.608250593906015 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91671050_91671211:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522816:exon_91671050_91671169:C14orf159 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 91739081 A/G 1 24 19 43 11.7696647075388 9.68234877319841 2.08731593434044 A:G A G 10 0.509597303852548 0.545592103781001 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000427583:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000334448:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000331194:exon_91738969_91739562:CCDC88C HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 93118668 C/T 1 7 8 15 3.43281887303216 4.07677843082038 -0.64395955778822 T:C C T 10 0.509597303852548 0.800365558868668 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 93118674 G/A 1 8 9 17 3.92322156917962 4.58637573467293 -0.663154165493316 A:G G A 10 0.509597303852548 0.811525826845625 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 93151396 G/A 1 8 8 16 3.92322156917962 4.07677843082038 -0.153556861640768 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93151332_93151495:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93151332_93151576:RIN3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 93176157 C/T 1 95 90 185 46.5882561340079 45.8637573467293 0.724498787278627 T:C C T 10 0.509597303852548 0.941457974999208 ENSG00000100600:ENST00000334864:exon_93176017_93176217:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93176017_93176217:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93176017_93176217:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93176017_93176217:LGMN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 93263982 C/G 1 3 9 12 1.47120808844236 4.58637573467293 -3.11516764623058 C:G C G 10 0.509597303852548 0.0867517050925024 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93263753_93264326:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93263753_93264326:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93263783_93264012:GOLGA5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 93275841 A/G 1 7 5 12 3.43281887303216 2.54798651926274 0.884832353769424 A:G A G 10 0.509597303852548 0.774912283175237 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93275645_93275864:GOLGA5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 93708759 A/C 1 8 8 16 3.92322156917962 4.07677843082038 -0.153556861640768 A:C A C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000011114:ENST00000355125:exon_93703896_93709434:BTBD7;ENSG00000011114:ENST00000334746:exon_93703896_93709434:BTBD7;ENSG00000011114:ENST00000442779:exon_93703896_93709434:BTBD7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 95923670 A/C 1 2 9 11 0.980805392294904 4.58637573467293 -3.60557034237803 A:C A C 10 0.509597303852548 0.0353083305106556 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95923514_95923675:C14orf49 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 96178688 C/T 1 56 24 80 27.4625509842573 12.2303352924612 15.2322156917962 T:C C T 10 0.509597303852548 0.000705801414204399 ENSG00000100721:ENST00000216612:exon_96178557_96178733:TCL1A;ENSG00000100721:ENST00000402399:exon_96178557_96178733:TCL1A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 102548151 A/G 1 403 401 804 197.632286547423 204.348518844872 -6.71623229744856 A:G A G 10 0.509597303852548 0.64663961605053 ENSG00000080824:ENST00000334701:exon_102547073_102548158:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000216281:exon_102547073_102548158:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000441629:exon_102547386_102548158:HSP90AA1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 102550803 G/A 1 271 278 549 132.89913065596 141.668050471008 -8.76891981504883 A:T:G G A 10 0.509597303852548 0.46815014104601 ENSG00000080824:ENST00000334701:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000216281:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000441629:exon_102550736_102550901:HSP90AA1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 103931879 A/G 1 8 3 11 3.92322156917962 1.52879191155764 2.39442965762197 A:G A G 10 0.509597303852548 0.227512016275758 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 103986255 C/T 1 30 3 33 14.7120808844236 1.52879191155764 13.1832889728659 T:C C T 10 0.509597303852548 1.58698635218240e-06 ENSG00000166165:ENST00000348956:exon_103985996_103986379:CKB;ENSG00000166165:ENST00000428256:exon_103985996_103986379:CKB HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 104027557 C/T 0 8 0 8 3.92322156917962 0 3.92322156917962 C C 10 0.509597303852548 0.00789316895639457 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 104165753 G/A 1 13 5 18 6.37523504991688 2.54798651926274 3.82724853065414 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0973482612827023 ENSG00000126215:ENST00000445556:exon_104165701_104165913:XRCC3;ENSG00000126215:ENST00000352127:exon_104165701_104165913:XRCC3;ENSG00000126215:ENST00000440302:exon_104165701_104165913:XRCC3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 104167075 C/T 1 6 9 15 2.94241617688471 4.58637573467293 -1.64395955778822 T:C C T 10 0.509597303852548 0.446901967950042 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 105179194 T/C 1 5 5 10 2.45201348073726 2.54798651926274 -0.0959730385254796 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000480763:exon_105179170_105179270:INF2;ENSG00000203485:ENST00000477497:exon_105179050_105179329:INF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 105180565 T/C 1 14 14 28 6.86563774606433 7.13436225393567 -0.268724507871344 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 105180706 A/C 1 6 4 10 2.94241617688471 2.03838921541019 0.90402696147452 A:C A C 10 0.509597303852548 0.75435926131823 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 105222037 C/T 1 32 45 77 15.6928862767185 22.9318786733647 -7.23899239664619 T:C C T 10 0.509597303852548 0.110575770257711 ENSG00000184990:ENST00000329967:exon_105221967_105222161:SIVA1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 105239894 C/T 1 8 12 20 3.92322156917962 6.11516764623058 -2.19194607705096 T:C C T 10 0.509597303852548 0.375790350036073 ENSG00000142208:ENST00000349310:exon_105239792_105239917:AKT1;ENSG00000142208:ENST00000407796:exon_105239792_105239917:AKT1;ENSG00000142208:ENST00000402615:exon_105239792_105239917:AKT1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 105936506 C/T 1 167 1 168 81.8972502566245 0.509597303852548 81.3876529527719 T:C C T 10 0.509597303852548 1.21824323638316e-47 ENSG00000182979:ENST00000414153:exon_105936402_105937020:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000331320:exon_105936402_105937066:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000406191:exon_105936402_105937066:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000405646:exon_105936402_105937066:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000438610:exon_105936402_105936575:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000434050:exon_105936402_105937066:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000426567:exon_105936402_105936544:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000481206:exon_105936402_105936567:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000494981:exon_105936402_105936634:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000481635:exon_105936402_105936575:MTA1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 106369534 A/G 1 5 13 18 2.45201348073726 6.62476495008312 -4.17275146934586 A:G A G 10 0.509597303852548 0.059364647228317 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 106382687 C/T 1 9 10 19 4.41362426532707 5.09597303852548 -0.682348773198411 T:C C T 10 0.509597303852548 0.821015503596854 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 106385332 G/C 1 7 14 21 3.43281887303216 7.13436225393567 -3.70154338090351 C:G G C 10 0.509597303852548 0.127785584592044 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 106791131 A/G 0 328 0 328 160.852084336364 0 160.852084336364 A A 10 0.509597303852548 1.11909024202296e-96 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 107170005 T/C 1 3 17 20 1.47120808844236 8.66315416549332 -7.19194607705096 T:C T C 10 0.509597303852548 0.00124848268995766 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 14 107170077 C/T 0 12 0 12 5.88483235376942 0 5.88483235376942 C C 10 0.509597303852548 0.000500187409481343 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 31197564 G/A 1 1 7 8 0.490402696147452 3.56718112696784 -3.07677843082038 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0357022765843499 ENSG00000198690:ENST00000362065:exon_31196715_31198100:FAN1;ENSG00000198690:ENST00000441675:exon_31196715_31198100:FAN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 31229420 T/C 1 8 4 12 3.92322156917962 2.03838921541019 1.88483235376942 T:C T C 10 0.509597303852548 0.388763190446408 ENSG00000198690:ENST00000362065:exon_31229322_31229462:FAN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 40328665 G/A 1 597 633 1230 292.770409600029 322.575093338663 -29.804683738634 A:T:G G A 10 0.509597303852548 0.0924332390455318 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40327891_40328701:SRP14 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 40330518 T/G 1 158 141 299 77.4836259912974 71.8532198432093 5.63040614808816 T:G T G 10 0.509597303852548 0.525069195221007 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40330483_40330595:SRP14 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 40477831 G/A 1 6 8 14 2.94241617688471 4.07677843082038 -1.13436225393567 A:G G A 10 0.509597303852548 0.601095068648336 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40477752_40477843:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40477752_40477843:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40477752_40477843:BUB1B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 40488851 G/A 1 5 7 12 2.45201348073726 3.56718112696784 -1.11516764623058 A:G G A 10 0.509597303852548 0.574428486272357 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40488746_40488975:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40488746_40488975:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40488746_40488975:BUB1B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 40758337 A/C 1 7 4 11 3.43281887303216 2.03838921541019 1.39442965762197 A:C A C 10 0.509597303852548 0.549658645750086 ENSG00000140320:ENST00000416165:exon_40758140_40760441:BAHD1;ENSG00000140320:ENST00000339351:exon_40758140_40760426:BAHD1;ENSG00000140320:ENST00000442618:exon_40758140_40760426:BAHD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 40849408 C/T 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:C C T 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 40855210 T/A 1 21 10 31 10.2984566190965 5.09597303852548 5.20248358057101 A:T T A 10 0.509597303852548 0.072354079459393 ENSG00000128891:ENST00000358005:exon_40854971_40855226:C15orf57;ENSG00000128891:ENST00000416810:exon_40854971_40855226:C15orf57;ENSG00000128891:ENST00000360470:exon_40854971_40855226:C15orf57 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 41105926 T/G 1 15 10 25 7.35604044221178 5.09597303852548 2.2600674036863 T:G T G 10 0.509597303852548 0.4265061452616 ENSG00000166140:ENST00000355341:exon_41105911_41106009:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000299173:exon_41105911_41106009:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000336455:exon_41105911_41106009:ZFYVE19 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 41272405 C/T 1 12 2 14 5.88483235376942 1.0191946077051 4.86563774606433 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0131607574589523 ENSG00000128908:ENST00000361937:exon_41271078_41272638:INO80 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 41384354 G/A 1 5 5 10 2.45201348073726 2.54798651926274 -0.0959730385254796 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000128908:ENST00000361937:exon_41384225_41384380:INO80;ENSG00000128908:ENST00000401393:exon_41384225_41384380:INO80;ENSG00000128908:ENST00000263793:exon_41384225_41384380:INO80 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 41634587 A/G 1 16 4 20 7.84644313835923 2.03838921541019 5.80805392294904 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0121181551128578 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 41634588 C/A 1 16 4 20 7.84644313835923 2.03838921541019 5.80805392294904 A:C C A 10 0.509597303852548 0.0121181551128578 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 41672384 A/G 1 43 50 93 21.0873159343404 25.4798651926274 -4.39254925828696 A:G A G 10 0.509597303852548 0.406937667287109 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41672291_41673245:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41672291_41673245:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450592:exon_41672291_41673245:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41672291_41673245:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41672291_41673245:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41672291_41673245:NUSAP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 41679685 G/C 1 7 11 18 3.43281887303216 5.60557034237803 -2.17275146934586 C:G G C 10 0.509597303852548 0.351502463188979 ENSG00000137806:ENST00000260361:exon_41679547_41679791:NDUFAF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 41689166 C/A 1 19 7 26 9.31765122680159 3.56718112696784 5.75047009983375 A:C C A 10 0.509597303852548 0.0297151623558314 ENSG00000137806:ENST00000260361:exon_41688685_41689338:NDUFAF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 41689232 C/T 1 10 5 15 4.90402696147452 2.54798651926274 2.35604044221178 T:C C T 10 0.509597303852548 0.303107408657847 ENSG00000137806:ENST00000260361:exon_41688685_41689338:NDUFAF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 42129021 C/T 1 9 2 11 4.41362426532707 1.0191946077051 3.39442965762197 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0659641183816961 ENSG00000243789:ENST00000397299:exon_42128979_42129138:JMJD7;ENSG00000243789:ENST00000335032:exon_42128979_42129138:JMJD7;ENSG00000243789:ENST00000408047:exon_42128979_42129138:JMJD7;ENSG00000243789:ENST00000405106:exon_42128979_42129138:JMJD7;ENSG00000243789:ENST00000478178:exon_42128979_42129138:JMJD7;ENSG00000168970:ENST00000490848:exon_42128673_42129138:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000491746:exon_42128979_42129138:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000487292:exon_42128983_42129138:JMJD7-PLA2G4B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 42211486 A/G 1 5 8 13 2.45201348073726 4.07677843082038 -1.62476495008312 A:G A G 10 0.509597303852548 0.415960200620574 ENSG00000103966:ENST00000220325:exon_42211408_42211820:EHD4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 43237572 T/C 1 1 13 14 0.490402696147452 6.62476495008312 -6.13436225393567 T:C T C 10 0.509597303852548 0.000803107178863216 ENSG00000159459:ENST00000290650:exon_43235095_43237668:UBR1;ENSG00000159459:ENST00000382177:exon_43235106_43237668:UBR1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 43653322 G/A 1 10 10 20 4.90402696147452 5.09597303852548 -0.191946077050959 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000140265:ENST00000396976:exon_43650370_43654139:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000396972:exon_43650370_43654139:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000267817:exon_43650370_43654139:ZSCAN29 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 45654327 A/G 1 21 36 57 10.2984566190965 18.3455029386917 -8.04704631959523 A:G A G 10 0.509597303852548 0.034441956088979 ENSG00000171766:ENST00000396659:exon_45653322_45654419:GATM;ENSG00000171766:ENST00000305575:exon_45653322_45654419:GATM;ENSG00000171766:ENST00000432007:exon_45653324_45654419:GATM HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 45661678 T/A 1 9 11 20 4.41362426532707 5.60557034237803 -1.19194607705096 A:T T A 10 0.509597303852548 0.658614646611609 ENSG00000171766:ENST00000396659:exon_45661524_45661719:GATM;ENSG00000171766:ENST00000305575:exon_45661524_45661719:GATM;ENSG00000171766:ENST00000432007:exon_45661524_45661719:GATM HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 52611451 A/G 1 7 5 12 3.43281887303216 2.54798651926274 0.884832353769424 A:G A G 10 0.509597303852548 0.774912283175237 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52611257_52611539:MYO5A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 55653031 A/G 1 13 8 21 6.37523504991688 4.07677843082038 2.29845661909649 A:G A G 10 0.509597303852548 0.385166903646358 ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55651737_55653142:CCPG1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 63433766 G/A 1 42 24 66 20.596913238193 12.2303352924612 8.36657794573183 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0481465193651973 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 63548787 G/A 1 7 7 14 3.43281887303216 3.56718112696784 -0.134362253935672 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000166128:ENST00000321437:exon_63548704_63548793:RAB8B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 64418397 G/A 1 6 8 14 2.94241617688471 4.07677843082038 -1.13436225393567 A:G G A 10 0.509597303852548 0.601095068648336 ENSG00000028528:ENST00000353874:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000261889:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000380285:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000440389:exon_64418278_64418419:SNX1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 64448365 C/T 1 34 17 51 16.6736916690134 8.66315416549332 8.01053750352005 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0254119951304897 ENSG00000157734:ENST00000325881:exon_64446586_64449680:SNX22 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 64737225 G/A 1 5 5 10 2.45201348073726 2.54798651926274 -0.0959730385254796 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000103671:ENST00000261884:exon_64737205_64737307:TRIP4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 64962630 A/C 1 8 2 10 3.92322156917962 1.0191946077051 2.90402696147452 A:C A C 10 0.509597303852548 0.110022635989167 ENSG00000180357:ENST00000326648:exon_64962545_64962632:ZNF609 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 65042560 G/A 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 A:G G A 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000166831:ENST00000300069:exon_65042542_65042580:RBPMS2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 65108479 T/C 1 27 27 54 13.2408727959812 13.7591272040188 -0.518254408037592 T:C T C 10 0.509597303852548 0.892776086034544 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65107831_65108556:PIF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 65114484 G/A 1 9 9 18 4.41362426532707 4.58637573467293 -0.172751469345863 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65114465_65114590:PIF1;ENSG00000140451:ENST00000333425:exon_65114465_65114590:PIF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 65236843 T/C 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 T:C T C 10 0.509597303852548 0.541646560898822 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 65236875 T/C 1 2 6 8 0.980805392294904 3.05758382311529 -2.07677843082038 T:C T C 10 0.509597303852548 0.171857042968518 ENSG00000166839:ENST00000380230:exon_65236849_65236944:ANKDD1A;ENSG00000166839:ENST00000395720:exon_65236849_65236944:ANKDD1A;ENSG00000166839:ENST00000487867:exon_65236849_65236944:ANKDD1A;ENSG00000166839:ENST00000319580:exon_65236849_65236944:ANKDD1A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 65739303 C/A 1 23 26 49 11.2792620113914 13.2495299001662 -1.97026788877485 A:C C A 10 0.509597303852548 0.668631032653623 ENSG00000074603:ENST00000341861:exon_65734801_65739344:DPP8;ENSG00000074603:ENST00000358939:exon_65738955_65739344:DPP8;ENSG00000074603:ENST00000300141:exon_65738957_65739344:DPP8;ENSG00000074603:ENST00000321147:exon_65738959_65739344:DPP8;ENSG00000074603:ENST00000321118:exon_65738975_65739344:DPP8;ENSG00000074603:ENST00000339244:exon_65738975_65739344:DPP8;ENSG00000074603:ENST00000395652:exon_65738975_65739344:DPP8;ENSG00000074603:ENST00000445674:exon_65738975_65739344:DPP8;ENSG00000074603:ENST00000449834:exon_65738975_65739344:DPP8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 65871698 G/T 1 42 34 76 20.596913238193 17.3263083309866 3.27060490720635 T:G G T 10 0.509597303852548 0.492115252916719 ENSG00000138614:ENST00000395644:exon_65871095_65871997:C15orf44;ENSG00000138614:ENST00000420799:exon_65871120_65871997:C15orf44;ENSG00000138614:ENST00000442903:exon_65871120_65871997:C15orf44;ENSG00000138614:ENST00000313182:exon_65871120_65871997:C15orf44;ENSG00000138614:ENST00000431261:exon_65871403_65871997:C15orf44 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 65885818 G/A 1 10 5 15 4.90402696147452 2.54798651926274 2.35604044221178 A:G G A 10 0.509597303852548 0.303107408657847 ENSG00000138614:ENST00000395644:exon_65885766_65885910:C15orf44;ENSG00000138614:ENST00000420799:exon_65885766_65885910:C15orf44;ENSG00000138614:ENST00000442903:exon_65885766_65885910:C15orf44;ENSG00000138614:ENST00000313182:exon_65885766_65885910:C15orf44;ENSG00000138614:ENST00000431261:exon_65885766_65885910:C15orf44 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 68492028 G/A 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 A:G G A 10 0.509597303852548 0.5085374516326 ENSG00000129007:ENST00000354678:exon_68491879_68492300:CALML4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 69728530 A/C 1 4 7 11 1.96161078458981 3.56718112696784 -1.60557034237803 A:C A C 10 0.509597303852548 0.379319216476062 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69728477_69728600:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69728477_69728600:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69728477_69728600:KIF23 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 70351788 T/C 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 T:C T C 10 0.509597303852548 0.335037018547339 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70351749_70351799:TLE3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 74328116 A/G 1 27 31 58 13.2408727959812 15.797516419429 -2.55664362344778 A:G A G 10 0.509597303852548 0.514490241124361 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 74328141 G/T 1 32 31 63 15.6928862767185 15.797516419429 -0.104630142710523 T:G G T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 75093389 C/T 1 95 75 170 46.5882561340079 38.2197977889411 8.36845834506684 T:C C T 10 0.509597303852548 0.219670871430522 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75093353_75093443:CSK HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 75130093 T/C 0 25 0 25 12.2600674036863 0 12.2600674036863 T T 10 0.509597303852548 6.62956186315736e-08 ENSG00000140474:ENST00000440863:exon_75130092_75130139:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000418051:exon_75130092_75130139:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000268074:exon_75130092_75130139:ULK3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 75131661 A/G 1 8 3 11 3.92322156917962 1.52879191155764 2.39442965762197 A:G A G 10 0.509597303852548 0.227512016275758 ENSG00000140474:ENST00000440863:exon_75131609_75131714:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000418051:exon_75131609_75131714:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000268074:exon_75131609_75131714:ULK3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 75188506 C/T 1 20 6 26 9.80805392294904 3.05758382311529 6.75047009983375 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00968491002783083 ENSG00000178802:ENST00000352410:exon_75188493_75188666:MPI;ENSG00000178802:ENST00000323744:exon_75188493_75188666:MPI;ENSG00000178802:ENST00000379693:exon_75188493_75188842:MPI HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 75499995 T/G 1 19 16 35 9.31765122680159 8.15355686164077 1.16409436516082 T:G T G 10 0.509597303852548 0.737528220139496 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 75651981 G/A 1 13 23 36 6.37523504991688 11.7207379886086 -5.34550293869173 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0945874232227755 ENSG00000140400:ENST00000267978:exon_75651961_75652116:MAN2C1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 75909803 A/G 1 2 6 8 0.980805392294904 3.05758382311529 -2.07677843082038 A:G A G 10 0.509597303852548 0.171857042968518 ENSG00000169371:ENST00000308588:exon_75909749_75909893:SNUPN;ENSG00000169371:ENST00000371091:exon_75909749_75909893:SNUPN;ENSG00000169371:ENST00000432476:exon_75909749_75909893:SNUPN;ENSG00000169371:ENST00000394932:exon_75909749_75909893:SNUPN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 75932125 C/T 1 37 30 67 18.1448997574557 15.2879191155764 2.85698064187929 T:C C T 10 0.509597303852548 0.541826805989660 ENSG00000177971:ENST00000314852:exon_75931426_75932609:IMP3;ENSG00000177971:ENST00000403490:exon_75931690_75932552:IMP3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 76578762 G/A 1 33 19 52 16.1832889728659 9.68234877319841 6.50094019966751 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0730756181217857 ENSG00000140374:ENST00000267950:exon_76578712_76578822:ETFA;ENSG00000140374:ENST00000433983:exon_76578712_76578822:ETFA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 77344793 T/A 1 14 25 39 6.86563774606433 12.7399325963137 -5.87429485024937 A:T T A 10 0.509597303852548 0.0770081977945943 ENSG00000140391:ENST00000267970:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000346495:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000424443:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000423920:exon_77344727_77344810:TSPAN3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 79215311 A/C 1 19 4 23 9.31765122680159 2.03838921541019 7.2792620113914 A:C A C 10 0.509597303852548 0.00270334921888426 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 79237247 C/G 1 19 32 51 9.31765122680159 16.3071137232815 -6.98946249647995 C:G C G 10 0.509597303852548 0.0675966385793698 ENSG00000103811:ENST00000220166:exon_79237233_79237433:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000394758:exon_79237233_79237260:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000444399:exon_79237233_79237256:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000525807:exon_79237233_79237404:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000533777:exon_79237233_79237388:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529861:exon_79237120_79237436:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534038:exon_79237233_79237388:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000530010:exon_79237233_79237340:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534268:exon_79236880_79237363:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528436:exon_79237233_79237384:CTSH HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 80137560 T/C 1 33 18 51 16.1832889728659 9.17275146934586 7.01053750352005 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0509860445241617 ENSG00000136371:ENST00000258874:exon_80137318_80137784:MTHFS;ENSG00000136371:ENST00000479961:exon_80137537_80137784:MTHFS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 80260014 T/C 1 25 56 81 12.2600674036863 28.5374490157427 -16.2773816120564 T:C T C 10 0.509597303852548 0.000324072317474759 ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80259979_80260034:BCL2A1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 80263217 C/T 1 223 281 504 109.359801240882 143.196842382566 -33.8370411416842 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00280348758023131 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 80263345 A/C 1 151 148 299 74.0508071182653 75.4204009701771 -1.36959385191184 A:C A C 10 0.509597303852548 0.907936980899109 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 80263406 C/T 1 148 143 291 72.5795990298229 72.8724144509144 -0.292815421091461 T:C:G C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 81592802 A/G 1 29 16 45 14.2216781882761 8.15355686164077 6.06812132663534 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0748116201016395 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81591721_81592816:IL16 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 85326285 C/A 1 8 6 14 3.92322156917962 3.05758382311529 0.865637746064328 A:C C A 10 0.509597303852548 0.79106698341654 ENSG00000166716:ENST00000299927:exon_85325885_85328126:ZNF592 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 86122916 T/C 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 T:C T C 10 0.509597303852548 0.499988077920146 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 86124555 G/A 1 5 8 13 2.45201348073726 4.07677843082038 -1.62476495008312 A:G G A 10 0.509597303852548 0.415960200620574 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 86273745 A/C 1 13 27 40 6.37523504991688 13.7591272040188 -7.38389215410192 A:C A C 10 0.509597303852548 0.0256814371088453 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86273744_86273938:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86273744_86273938:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86273744_86273938:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86273744_86273938:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86273744_86273938:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86273744_86273938:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86273744_86273938:AKAP13 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 86287910 C/T 1 21 35 56 10.2984566190965 17.8359056348392 -7.53744901574269 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0456881148248195 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86287859_86289400:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86287859_86292586:AKAP13 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 89836228 G/C 1 7 4 11 3.43281887303216 2.03838921541019 1.39442965762197 C:G G C 10 0.509597303852548 0.549658645750086 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89836173_89836294:FANCI HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 89858602 T/C 1 43 63 106 21.0873159343404 32.1046301427105 -11.0173142083701 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0328739889636290 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89858513_89858620:FANCI HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 89860786 A/C 1 16 16 32 7.84644313835923 8.15355686164077 -0.307113723281535 A:C A C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000140521:ENST00000526671:exon_89860607_89861059:POLG HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 90168693 T/A 1 6 2 8 2.94241617688471 1.0191946077051 1.92322156917962 A:T T A 10 0.509597303852548 0.289787629707581 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90166854_90169017:C15orf42 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 90170237 C/T 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 T:C C T 10 0.509597303852548 0.335037018547339 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90170187_90171250:C15orf42 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 91083353 G/A 1 9 7 16 4.41362426532707 3.56718112696784 0.846443138359232 A:G G A 10 0.509597303852548 0.80419746365061 ENSG00000140577:ENST00000437186:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000268184:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000420329:exon_91083271_91083369:CRTC3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 93510603 A/G 1 12 3 15 5.88483235376942 1.52879191155764 4.35604044221178 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0356477356687783 ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93510555_93510743:CHD2;ENSG00000173575:ENST00000309818:exon_93510555_93510743:CHD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 93521604 A/G 1 10 4 14 4.90402696147452 2.03838921541019 2.86563774606433 A:G A G 10 0.509597303852548 0.180690507474734 ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93521464_93521613:CHD2;ENSG00000173575:ENST00000309818:exon_93521464_93521613:CHD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 101110302 C/G 1 12 3 15 5.88483235376942 1.52879191155764 4.35604044221178 C:G C G 10 0.509597303852548 0.0356477356687783 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 101464915 T/C 1 4 8 12 1.96161078458981 4.07677843082038 -2.11516764623058 T:C T C 10 0.509597303852548 0.258556419599671 ENSG00000154237:ENST00000532029:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000534045:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000527698:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101464777_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101464808_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101464808_101464934:LRRK1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 101598314 C/T 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 T:C C T 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525395:exon_101598195_101598346:LRRK1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 15 101606261 C/T 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101605557_101606410:LRRK1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 129654 C/T 1 51 39 90 25.0105375035201 19.8742948502494 5.13624265327068 T:C C T 10 0.509597303852548 0.293171417658982 ENSG00000103152:ENST00000436333:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000397817:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000356432:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000428050:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000475280:exon_129424_129843:MPG;ENSG00000103152:ENST00000219431:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000397818:exon_129424_129699:MPG HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 312249 G/C 0 0 8 8 0 4.07677843082038 -4.07677843082038 C G C 10 0.509597303852548 0.00334520543356084 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 396627 G/A 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 A:G G A 10 0.509597303852548 0.5085374516326 ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_396148_397106:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_396148_397106:AXIN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 419092 A/G 1 75 82 157 36.7802022110589 41.7869789159089 -5.00677670485003 A:G A G 10 0.509597303852548 0.426212855937117 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 424277 G/A 1 14 2 16 6.86563774606433 1.0191946077051 5.84644313835923 A:G G A 10 0.509597303852548 0.00428504868507501 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000424078:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000448854:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000467452:exon_424221_424399:TMEM8A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 426432 T/C 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 T:C T C 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000475348:exon_426136_426475:TMEM8A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 427479 T/C 1 7 2 9 3.43281887303216 1.0191946077051 2.41362426532707 T:C T C 10 0.509597303852548 0.180412718745071 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 427784 G/A 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 A:G G A 10 0.509597303852548 0.499988077920146 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427671_427848:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427671_427805:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427671_427807:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427671_427848:TMEM8A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 427820 C/T 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427671_427848:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427671_427848:TMEM8A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 449659 G/A 1 35 42 77 17.1640943651608 21.403086761807 -4.23899239664619 A:G G A 10 0.509597303852548 0.362743824380221 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000444498:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000420816:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000426167:exon_449627_449739:NME4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 450309 C/T 1 90 135 225 44.1362426532707 68.795636020094 -24.6593933668233 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00105577397935837 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_450219_450746:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_450219_450734:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_450219_450633:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_450219_450759:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_450219_450506:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_450109_450648:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_450219_450416:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_450219_450749:NME4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 602313 C/A 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 A:C C A 10 0.509597303852548 0.541646560898822 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_602301_602530:SOLH HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 603471 A/G 1 16 18 34 7.84644313835923 9.17275146934586 -1.32630833098663 A:G A G 10 0.509597303852548 0.732538342631527 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_603339_604636:SOLH;ENSG00000103326:ENST00000397687:exon_603339_604634:SOLH HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 711905 A/G 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 A:G A G 10 0.509597303852548 0.499988077920146 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_711891_712059:WDR90 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 715990 G/A 1 10 14 24 4.90402696147452 7.13436225393567 -2.23033529246115 A:G G A 10 0.509597303852548 0.417388759331184 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_715950_716124:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_715950_716124:WDR90 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 717523 G/T 1 20 23 43 9.80805392294904 11.7207379886086 -1.91268406565956 A:T:G G T 10 0.509597303852548 0.647870895498899 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_717432_717829:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_717432_717829:WDR90 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 718514 C/G 1 8 3 11 3.92322156917962 1.52879191155764 2.39442965762197 C:G C G 10 0.509597303852548 0.227512016275758 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_718488_718569:RHOT2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 720986 G/A 1 2 17 19 0.980805392294904 8.66315416549332 -7.68234877319841 A:G G A 10 0.509597303852548 0.000323859628970817 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_720892_721000:RHOT2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 722331 C/T 1 11 11 22 5.39442965762197 5.60557034237803 -0.211140684756055 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722254_722384:RHOT2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 722548 A/G 1 17 15 32 8.33684583450668 7.64395955778822 0.692886276718465 A:G A G 10 0.509597303852548 0.860872784865693 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722489_722566:RHOT2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 723647 C/G 1 29 37 66 14.2216781882761 18.8551002425443 -4.63342205426817 C:G C G 10 0.509597303852548 0.269606578305821 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_723480_724174:RHOT2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 1364365 A/G 1 50 56 106 24.5201348073726 28.5374490157427 -4.01731420837009 A:G A G 10 0.509597303852548 0.439146304471723 ENSG00000103275:ENST00000325437:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000355803:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397514:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397515:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000443007:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000473256:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000406620:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000403747:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000402301:exon_1364294_1364377:UBE2I HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 1374818 A/G 1 105 133 238 51.4922830954825 67.7764414123889 -16.2841583169064 A:G A G 10 0.509597303852548 0.037875540339 ENSG00000103275:ENST00000325437:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000355803:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397514:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397515:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000406620:exon_1374731_1375351:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000403747:exon_1374731_1375215:UBE2I HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 1555589 A/G 1 12 14 26 5.88483235376942 7.13436225393567 -1.24952990016625 A:G A G 10 0.509597303852548 0.69693063211367 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1555411_1555602:TELO2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 1559838 T/C 1 27 17 44 13.2408727959812 8.66315416549332 4.57771863048789 T:C T C 10 0.509597303852548 0.177659167692261 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1559831_1560453:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1559831_1560458:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1559831_1560455:TELO2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 1756379 G/A 1 1 7 8 0.490402696147452 3.56718112696784 -3.07677843082038 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0357022765843499 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1756194_1756658:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1756221_1756658:MAPK8IP3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 1838640 T/C 1 38 42 80 18.6353024536032 21.403086761807 -2.76778430820384 T:C T C 10 0.509597303852548 0.576832986765689 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1838570_1839192:NUBP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 1877494 T/C 1 13 13 26 6.37523504991688 6.62476495008312 -0.249529900166248 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000180185:ENST00000382668:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000382666:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000427358:exon_1877231_1878009:FAHD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 2014283 A/G 1 88 66 154 43.1554372609758 33.6334220542682 9.52201520670761 A:G A G 10 0.509597303852548 0.126543544859417 ENSG00000140988:ENST00000526522:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533186:exon_2014277_2014357:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000532746:exon_2014277_2014368:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533872:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527109:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527871:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000530225:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531065:exon_2013654_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533161:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000343262:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000534461:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531182:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527302:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000526908:exon_2014277_2014539:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 2014591 C/T 1 358 202 560 175.564165220788 102.938655378215 72.6255098425731 T:C C T 10 0.509597303852548 7.22283657165298e-10 ENSG00000140988:ENST00000526522:exon_2014450_2014804:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527109:exon_2014450_2014631:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527871:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000530225:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531065:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533161:exon_2014450_2014814:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000343262:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000529806:exon_2014450_2014813:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531182:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527302:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 2025206 A/C 1 1 9 10 0.490402696147452 4.58637573467293 -4.09597303852548 A:C A C 10 0.509597303852548 0.0103454948738643 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025188_2025263:TBL3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 2025604 G/C 1 10 12 22 4.90402696147452 6.11516764623058 -1.21114068475606 C:G G C 10 0.509597303852548 0.672933556012192 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025530_2025711:TBL3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 2026871 C/T 1 33 30 63 16.1832889728659 15.2879191155764 0.895369857289477 A:T:C C T 10 0.509597303852548 0.899896416766328 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2026815_2026962:TBL3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 2028402 A/C 1 32 23 55 15.6928862767185 11.7207379886086 3.97214828810986 A:C A C 10 0.509597303852548 0.345259603907093 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2028314_2028472:TBL3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 2036048 T/C 1 42 61 103 20.596913238193 31.0854355350054 -10.4885222968124 T:C T C 10 0.509597303852548 0.048192571705261 ENSG00000127554:ENST00000248114:exon_2035867_2037746:GFER;ENSG00000127554:ENST00000425414:exon_2035867_2037746:GFER HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 2048796 C/T 1 19 21 40 9.31765122680159 10.7015433809035 -1.38389215410192 T:C C T 10 0.509597303852548 0.752386910002544 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2048703_2048853:ZNF598 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 2049640 A/G 1 14 23 37 6.86563774606433 11.7207379886086 -4.85510024254427 A:G A G 10 0.509597303852548 0.138293675848893 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 2049728 C/T 1 24 20 44 11.7696647075388 10.191946077051 1.57771863048789 T:C C T 10 0.509597303852548 0.654233691502169 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 2049849 T/C 1 11 27 38 5.39442965762197 13.7591272040188 -8.36469754639682 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0085983933104339 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 2050192 G/T 1 11 25 36 5.39442965762197 12.7399325963137 -7.34550293869173 T:G G T 10 0.509597303852548 0.0185027107725486 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 2125834 T/C 1 9 11 20 4.41362426532707 5.60557034237803 -1.19194607705096 T:C T C 10 0.509597303852548 0.658614646611609 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2125800_2125893:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2125800_2125893:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2125800_2125893:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2125800_2125893:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2125800_2125893:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2125800_2125893:TSC2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 2134438 C/T 1 7 10 17 3.43281887303216 5.09597303852548 -1.66315416549332 T:C C T 10 0.509597303852548 0.473469847150149 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2134229_2134716:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2134229_2134716:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2134229_2134716:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2134229_2134716:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2134229_2134716:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2134229_2134716:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000497886:exon_2134229_2134716:TSC2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 2138269 T/C 1 45 38 83 22.0681213266353 19.3646975463968 2.70342378023852 T:C T C 10 0.509597303852548 0.584168791049695 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000497886:exon_2138228_2138326:TSC2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 2138584 G/C 1 19 25 44 9.31765122680159 12.7399325963137 -3.42228136951211 C:G G C 10 0.509597303852548 0.365923893678605 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2138447_2138713:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2138447_2138703:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2138447_2138712:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2138447_2138712:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2138447_2138713:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2138447_2138721:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000497886:exon_2138447_2138712:TSC2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 2140010 A/G 1 2 9 11 0.980805392294904 4.58637573467293 -3.60557034237803 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0353083305106556 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000306101:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000472577:exon_2139528_2140195:PKD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 2140321 G/A 1 6 7 13 2.94241617688471 3.56718112696784 -0.624764950083124 A:G G A 10 0.509597303852548 0.786978111840725 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000306101:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000472577:exon_2140286_2140591:PKD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 2140554 G/A 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000306101:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000472577:exon_2140286_2140591:PKD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 2257105 C/G 1 9 27 36 4.41362426532707 13.7591272040188 -9.34550293869173 C:G C G 10 0.509597303852548 0.00224353545847144 ENSG00000167965:ENST00000382450:exon_2257036_2257111:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000301724:exon_2257036_2257111:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000397124:exon_2257036_2257111:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000301725:exon_2257036_2257111:MLST8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 2285357 C/T 1 45 47 92 22.0681213266353 23.9510732810698 -1.88295195443441 T:C C T 10 0.509597303852548 0.754667159797982 ENSG00000167967:ENST00000301727:exon_2285217_2285743:E4F1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 2296927 G/A 1 20 12 32 9.80805392294904 6.11516764623058 3.69288627671846 A:G G A 10 0.509597303852548 0.218035323997103 ENSG00000167969:ENST00000301729:exon_2296860_2296987:DCI HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 2812890 A/G 1 60 35 95 29.4241617688471 17.8359056348392 11.5882561340079 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0181963118066793 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 2812939 C/A 1 55 37 92 26.9721482881099 18.8551002425443 8.11704804556559 A:C C A 10 0.509597303852548 0.0957602642647465 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 2814162 G/A 1 44 37 81 21.5777186304879 18.8551002425443 2.72261838794362 A:G G A 10 0.509597303852548 0.579483371837542 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 2815237 A/C 1 50 58 108 24.5201348073726 29.5566436234478 -5.03650881607518 A:C A C 10 0.509597303852548 0.337728273234102 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 2821573 C/T 1 10 4 14 4.90402696147452 2.03838921541019 2.86563774606433 T:C C T 10 0.509597303852548 0.180690507474734 ENSG00000103363:ENST00000409906:exon_2821415_2822103:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000262306:exon_2821415_2821605:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000409477:exon_2821416_2822103:TCEB2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 2882197 G/T 1 7 6 13 3.43281887303216 3.05758382311529 0.375235049916876 T:G G T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000162078:ENST00000382280:exon_2881797_2882285:ZG16B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 2946433 C/T 1 15 13 28 7.35604044221178 6.62476495008312 0.731275492128656 T:C C T 10 0.509597303852548 0.85132302744545 ENSG00000162076:ENST00000396958:exon_2946353_2946772:FLYWCH2;ENSG00000162076:ENST00000431751:exon_2946353_2946772:FLYWCH2;ENSG00000162076:ENST00000293981:exon_2946353_2946772:FLYWCH2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 3073240 G/T 1 65 61 126 31.8761752495844 31.0854355350054 0.790739714578955 T:G G T 10 0.509597303852548 0.929100109644852 ENSG00000103145:ENST00000354679:exon_3073234_3073362:HCFC1R1;ENSG00000103145:ENST00000396916:exon_3073234_3073362:HCFC1R1;ENSG00000103145:ENST00000248089:exon_3073234_3073362:HCFC1R1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 3106994 A/T 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 A:T A T 10 0.509597303852548 0.5085374516326 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 3274286 G/T 1 20 5 25 9.80805392294904 2.54798651926274 7.2600674036863 T:G G T 10 0.509597303852548 0.00424129263104532 ENSG00000010539:ENST00000396870:exon_3272325_3274613:ZNF200;ENSG00000010539:ENST00000396868:exon_3272325_3274613:ZNF200;ENSG00000010539:ENST00000396871:exon_3272325_3274610:ZNF200;ENSG00000010539:ENST00000414144:exon_3272325_3274610:ZNF200;ENSG00000010539:ENST00000438090:exon_3272325_3274610:ZNF200;ENSG00000010539:ENST00000431561:exon_3272325_3274613:ZNF200;ENSG00000010539:ENST00000008311:exon_3272350_3274613:ZNF200;ENSG00000010539:ENST00000453093:exon_3273892_3274610:ZNF200 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 3586230 C/T 1 1 11 12 0.490402696147452 5.60557034237803 -5.11516764623058 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00291281177067002 ENSG00000103351:ENST00000341633:exon_3586122_3586581:CLUAP1;ENSG00000103351:ENST00000417763:exon_3586122_3586581:CLUAP1;ENSG00000103351:ENST00000445795:exon_3586122_3587669:CLUAP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 4445327 C/T 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 T:C C T 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4445290_4445340:CORO7;ENSG00000103426:ENST00000423908:exon_4445290_4445340:CORO7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 4484396 A/T 1 7 10 17 3.43281887303216 5.09597303852548 -1.66315416549332 A:T A T 10 0.509597303852548 0.473469847150149 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4484385_4484518:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4484385_4484518:DNAJA3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 4496973 T/A 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 A:T T A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4496887_4497015:DNAJA3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 4511752 T/C 1 63 29 92 30.8953698572895 14.7783218117239 16.1170480455656 T:C T C 10 0.509597303852548 0.000781686265637361 ENSG00000153406:ENST00000283429:exon_4511695_4511960:NMRAL1;ENSG00000153406:ENST00000404295:exon_4511696_4511960:NMRAL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 4519439 G/A 1 5 15 20 2.45201348073726 7.64395955778822 -5.19194607705096 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0242764341264256 ENSG00000153406:ENST00000283429:exon_4519228_4519466:NMRAL1;ENSG00000153406:ENST00000404295:exon_4519228_4519466:NMRAL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 4524155 C/G 1 11 12 23 5.39442965762197 6.11516764623058 -0.720737988608604 C:G C G 10 0.509597303852548 0.836390489019417 ENSG00000153406:ENST00000283429:exon_4524094_4524167:NMRAL1;ENSG00000153406:ENST00000404295:exon_4524094_4524167:NMRAL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 4556911 G/A 1 17 14 31 8.33684583450668 7.13436225393567 1.20248358057101 A:G G A 10 0.509597303852548 0.721643013841661 ENSG00000103415:ENST00000406590:exon_4556896_4557013:HMOX2;ENSG00000103415:ENST00000458134:exon_4556896_4557013:HMOX2;ENSG00000103415:ENST00000219700:exon_4556896_4557013:HMOX2;ENSG00000103415:ENST00000398595:exon_4556896_4557013:HMOX2;ENSG00000103415:ENST00000414777:exon_4556896_4557013:HMOX2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 4723451 A/G 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 A:G A G 10 0.509597303852548 0.726965250907 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 5128001 C/T 1 8 10 18 3.92322156917962 5.09597303852548 -1.17275146934586 T:C C T 10 0.509597303852548 0.642260839788311 ENSG00000033011:ENST00000262374:exon_5127908_5128018:ALG1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 5139217 C/G 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 C:G C G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5139108_5139257:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5139108_5139257:FAM86A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 8719643 G/A 1 5 11 16 2.45201348073726 5.60557034237803 -3.15355686164077 A:G G A 10 0.509597303852548 0.136896620322009 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8719353_8719655:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8719353_8719655:C16orf68 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 8722629 G/C 1 11 5 16 5.39442965762197 2.54798651926274 2.84644313835923 C:G G C 10 0.509597303852548 0.211463370056425 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8722587_8722967:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8722587_8722967:C16orf68 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 8729156 C/T 1 7 3 10 3.43281887303216 1.52879191155764 1.90402696147452 T:C C T 10 0.509597303852548 0.344656245175514 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8729025_8729169:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8729025_8729169:C16orf68 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 8736414 G/A 1 6 4 10 2.94241617688471 2.03838921541019 0.90402696147452 A:G G A 10 0.509597303852548 0.75435926131823 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8736320_8736422:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8736320_8736422:C16orf68 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 8953081 C/G 1 21 27 48 10.2984566190965 13.7591272040188 -3.4606705849223 C:G C G 10 0.509597303852548 0.386637630597588 ENSG00000153048:ENST00000396593:exon_8953028_8953192:CARHSP1;ENSG00000153048:ENST00000311052:exon_8953028_8953192:CARHSP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 11001743 G/A 1 2 8 10 0.980805392294904 4.07677843082038 -3.09597303852548 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0608033640885815 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 11017058 G/A 1 9 3 12 4.41362426532707 1.52879191155764 2.88483235376942 A:G G A 10 0.509597303852548 0.146886429190433 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 11220026 G/A 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 A:G G A 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000038532:ENST00000409552:exon_11219836_11220201:CLEC16A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 11769948 C/T 1 9 6 15 4.41362426532707 3.05758382311529 1.35604044221178 T:C C T 10 0.509597303852548 0.608250593906015 ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 11769963 C/T 1 10 7 17 4.90402696147452 3.56718112696784 1.33684583450668 T:C C T 10 0.509597303852548 0.630150764673374 ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 12162969 A/G 1 10 4 14 4.90402696147452 2.03838921541019 2.86563774606433 A:G A G 10 0.509597303852548 0.180690507474734 ENSG00000048471:ENST00000306030:exon_12162914_12162989:SNX29;ENSG00000048471:ENST00000323433:exon_12162914_12162989:SNX29 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 12662420 C/T 1 3 9 12 1.47120808844236 4.58637573467293 -3.11516764623058 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0867517050925024 ENSG00000048471:ENST00000306030:exon_12662363_12668145:SNX29 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 14742400 T/G 1 28 16 44 13.7312754921287 8.15355686164077 5.57771863048789 T:G T G 10 0.509597303852548 0.0988292439335619 ENSG00000103429:ENST00000261658:exon_14742245_14742449:BFAR HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 15141311 G/A 1 8 4 12 3.92322156917962 2.03838921541019 1.88483235376942 A:G G A 10 0.509597303852548 0.388763190446408 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15141299_15141407:NTAN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 15718591 G/A 1 8 7 15 3.92322156917962 3.56718112696784 0.35604044221178 A:G G A 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 15790607 C/T 1 13 13 26 6.37523504991688 6.62476495008312 -0.249529900166248 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15790566_15790717:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396353:exon_15790566_15790717:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15790566_15790717:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15790566_15790717:NDE1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 19726275 C/T 1 48 57 105 23.5393294150777 29.0470463195952 -5.50771690451754 T:C C T 10 0.509597303852548 0.285072370874893 ENSG00000103550:ENST00000219837:exon_19725440_19726362:C16orf88;ENSG00000103550:ENST00000420899:exon_19725440_19726359:C16orf88 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 21994411 G/A 1 349 295 644 171.150540955461 150.331204636502 20.8193363189591 A:G G A 10 0.509597303852548 0.106073729393875 ENSG00000140740:ENST00000268379:exon_21994409_21994981:UQCRC2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 24105669 G/A 1 7 2 9 3.43281887303216 1.0191946077051 2.41362426532707 A:G G A 10 0.509597303852548 0.180412718745071 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 24231248 C/T 1 22 18 40 10.7888593152439 9.17275146934586 1.61610784589808 T:C C T 10 0.509597303852548 0.638327353489123 ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24225979_24231932:PRKCB HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 24583406 A/G 1 206 175 381 101.022955406375 89.1795281741959 11.8434272321792 A:G A G 10 0.509597303852548 0.238604931170379 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 27374709 G/A 1 5 5 10 2.45201348073726 2.54798651926274 -0.0959730385254796 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 28145165 T/A 1 7 6 13 3.43281887303216 3.05758382311529 0.375235049916876 A:T T A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28145162_28145254:XPO6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 28507644 C/G 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 C:G C G 10 0.509597303852548 0.541646560898822 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 28602991 A/G 1 6 7 13 2.94241617688471 3.56718112696784 -0.624764950083124 A:G A G 10 0.509597303852548 0.786978111840725 ENSG00000176476:ENST00000317058:exon_28602911_28603111:CCDC101 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 28603012 A/G 1 11 13 24 5.39442965762197 6.62476495008312 -1.23033529246115 A:G A G 10 0.509597303852548 0.68560789583581 ENSG00000176476:ENST00000317058:exon_28602911_28603111:CCDC101 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 29999225 G/A 1 6 12 18 2.94241617688471 6.11516764623058 -3.17275146934586 A:G G A 10 0.509597303852548 0.160250844303470 ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29997586_29999719:TAOK2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 30365581 C/T 1 30 5 35 14.7120808844236 2.54798651926274 12.1640943651608 T:C C T 10 0.509597303852548 2.49045998741582e-05 ENSG00000169217:ENST00000305596:exon_30365505_30365643:CD2BP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 31092075 G/A 1 2 7 9 0.980805392294904 3.56718112696784 -2.58637573467293 A:G G A 10 0.509597303852548 0.103145007117103 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 31095171 C/T 1 7 1 8 3.43281887303216 0.509597303852548 2.92322156917962 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0707155477569663 ENSG00000151006:ENST00000486499:exon_31094758_31096581:PRSS53 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 31121793 G/A 1 14 14 28 6.86563774606433 7.13436225393567 -0.268724507871344 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000103507:ENST00000394951:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000219794:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000394950:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000287507:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000394952:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000441132:exon_31121722_31121801:BCKDK HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 31193942 C/A 1 75 56 131 36.7802022110589 28.5374490157427 8.24275319531621 A:T:C C A 10 0.509597303852548 0.162239686833936 ENSG00000089280:ENST00000254108:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000433338:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000394533:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000380244:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000487045:exon_31193834_31194283:FUS;ENSG00000089280:ENST00000491029:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000354711:exon_31193834_31193985:FUS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 53262964 C/T 1 19 24 43 9.31765122680159 12.2303352924612 -2.91268406565956 T:C C T 10 0.509597303852548 0.44621154544352 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53262895_53263012:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53262895_53263012:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53262895_53263012:CHD9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 56396486 C/T 1 32 40 72 15.6928862767185 20.3838921541019 -4.69100587738345 T:C C T 10 0.509597303852548 0.289920758851664 ENSG00000159461:ENST00000290649:exon_56395364_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000492830:exon_56395472_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000314566:exon_56396337_56396528:AMFR HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 56504724 G/C 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 C:G G C 10 0.509597303852548 0.5085374516326 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 56873495 C/T 1 35 21 56 17.1640943651608 10.7015433809035 6.46255098425731 T:C C T 10 0.509597303852548 0.107934423195249 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56873433_56873516:NUP93 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 57016092 G/A 1 6 5 11 2.94241617688471 2.54798651926274 0.394429657621972 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57016077_57016149:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57016077_57016149:CETP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 57180158 C/A 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 A:C C A 10 0.509597303852548 0.499988077920146 ENSG00000140848:ENST00000290776:exon_57179997_57180233:CPNE2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 58552959 A/G 1 20 16 36 9.80805392294904 8.15355686164077 1.65449706130827 A:G A G 10 0.509597303852548 0.620063372429449 ENSG00000103037:ENST00000310682:exon_58552628_58553566:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000394266:exon_58552628_58554431:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000219315:exon_58552628_58553014:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000427443:exon_58552628_58553419:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000443717:exon_58552628_58553001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000422445:exon_58552628_58553407:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000463954:exon_58552628_58552980:SETD6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 66886559 G/A 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 A:G G A 10 0.509597303852548 0.74955201040747 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 66886581 A/G 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 A:G A G 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 67575652 G/A 1 6 16 22 2.94241617688471 8.15355686164077 -5.21114068475606 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0319564464561853 ENSG00000039523:ENST00000379312:exon_67575556_67575685:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000042381:exon_67575556_67575685:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000422602:exon_67575556_67575685:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000428437:exon_67575556_67575685:FAM65A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 67696365 G/A 1 12 16 28 5.88483235376942 8.15355686164077 -2.26872450787134 A:G G A 10 0.509597303852548 0.451842745687014 ENSG00000102981:ENST00000458121:exon_67695799_67696680:PARD6A;ENSG00000102981:ENST00000219255:exon_67695796_67696677:PARD6A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 67865073 G/A 1 2 8 10 0.980805392294904 4.07677843082038 -3.09597303852548 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0608033640885815 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 67911517 T/C 1 9 7 16 4.41362426532707 3.56718112696784 0.846443138359232 T:C T C 10 0.509597303852548 0.80419746365061 ENSG00000038358:ENST00000358933:exon_67911412_67911559:EDC4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 67964203 T/C 1 7 18 25 3.43281887303216 9.17275146934586 -5.7399325963137 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0266232370800167 ENSG00000141086:ENST00000319955:exon_67964088_67964221:CTRL;ENSG00000141086:ENST00000432773:exon_67963848_67964221:CTRL HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 67969531 A/G 1 82 66 148 40.2130210840911 33.6334220542682 6.5795990298229 A:G A G 10 0.509597303852548 0.286309534478916 ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969485_67969600:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969452_67969600:PSMB10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 67969930 A/G 1 125 115 240 61.3003370184315 58.603689943043 2.69664707538849 A:G A G 10 0.509597303852548 0.747115591130474 ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969866_67970006:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969866_67970215:PSMB10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 67973953 G/A 1 11 13 24 5.39442965762197 6.62476495008312 -1.23033529246115 A:G G A 10 0.509597303852548 0.68560789583581 ENSG00000213398:ENST00000264005:exon_67973653_67974381:LCAT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 67979423 G/T 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:G G T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000124067:ENST00000338335:exon_67979272_67979456:SLC12A4;ENSG00000124067:ENST00000422611:exon_67979272_67979456:SLC12A4;ENSG00000124067:ENST00000316341:exon_67979272_67979456:SLC12A4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 68288983 T/G 0 0 8 8 0 4.07677843082038 -4.07677843082038 G T G 10 0.509597303852548 0.00334520543356084 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 68390697 C/T 1 18 35 53 8.82724853065414 17.8359056348392 -9.00865710418504 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0186472919998404 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68390604_68390700:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68390604_68390700:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68390604_68390700:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68390604_68390700:PRMT7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 69745145 G/A 1 23 28 51 11.2792620113914 14.2687245078713 -2.98946249647995 A:G G A 10 0.509597303852548 0.484142817719778 ENSG00000181019:ENST00000320623:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379047:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379046:exon_69743307_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000439109:exon_69744745_69745184:NQO1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 69752373 C/T 1 6 20 26 2.94241617688471 10.191946077051 -7.24952990016625 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00521785357936451 ENSG00000181019:ENST00000320623:exon_69752273_69752437:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379047:exon_69752273_69752437:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379046:exon_69752273_69752437:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000439109:exon_69752273_69752437:NQO1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 69782855 C/T 1 49 48 97 24.0297321112251 24.4606705849223 -0.430938473697157 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000141101:ENST00000268802:exon_69782821_69783021:NOB1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 69973825 G/A 1 10 13 23 4.90402696147452 6.62476495008312 -1.7207379886086 A:G G A 10 0.509597303852548 0.53508614923685 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69973744_69975644:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69973744_69975643:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69973744_69975643:WWP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 70303580 G/A 1 19 8 27 9.31765122680159 4.07677843082038 5.2408727959812 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0533977336476133 ENSG00000090861:ENST00000261772:exon_70303521_70303666:AARS;ENSG00000090861:ENST00000418685:exon_70303521_70303666:AARS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 70395387 C/T 1 11 12 23 5.39442965762197 6.11516764623058 -0.720737988608604 T:C C T 10 0.509597303852548 0.836390489019417 ENSG00000168872:ENST00000302243:exon_70395321_70395413:DDX19A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 70422231 C/T 1 7 3 10 3.43281887303216 1.52879191155764 1.90402696147452 T:C C T 10 0.509597303852548 0.344656245175514 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 70515355 C/T 1 7 9 16 3.43281887303216 4.58637573467293 -1.15355686164077 T:C C T 10 0.509597303852548 0.623338489505478 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000526700:exon_70515262_70515390:COG4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 70569215 A/T 1 5 11 16 2.45201348073726 5.60557034237803 -3.15355686164077 A:T A T 10 0.509597303852548 0.136896620322009 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70569211_70569323:SF3B3;ENSG00000189091:ENST00000310750:exon_70569211_70569245:SF3B3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 70602221 C/T 1 55 50 105 26.9721482881099 25.4798651926274 1.49228309548246 T:C C T 10 0.509597303852548 0.845342865704488 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70602186_70602398:SF3B3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 71773190 G/T 1 6 5 11 2.94241617688471 2.54798651926274 0.394429657621972 T:G G T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000166747:ENST00000299980:exon_71773137_71773244:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000423132:exon_71773137_71773244:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000393512:exon_71773137_71773244:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000425422:exon_71773137_71773244:AP1G1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 74425569 C/T 0 34 0 34 16.6736916690134 0 16.6736916690134 C C 10 0.509597303852548 1.41218036960609e-10 ENSG00000196436:ENST00000504746:exon_74425289_74425741:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000429990:exon_74425289_74425978:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000355290:exon_74425289_74426013:NPIPL2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 74678318 C/T 1 10 4 14 4.90402696147452 2.03838921541019 2.86563774606433 T:C C T 10 0.509597303852548 0.180690507474734 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74678260_74678351:RFWD3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 77228866 T/C 1 7 4 11 3.43281887303216 2.03838921541019 1.39442965762197 T:C T C 10 0.509597303852548 0.549658645750086 ENSG00000103111:ENST00000248248:exon_77228232_77229051:MON1B;ENSG00000103111:ENST00000439557:exon_77228232_77229051:MON1B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 81010073 C/T 1 84 82 166 41.193826476386 41.7869789159089 -0.59315243952296 T:C C T 10 0.509597303852548 0.938270736321569 ENSG00000103121:ENST00000219400:exon_81009699_81010076:C16orf61;ENSG00000103121:ENST00000486645:exon_81009699_81010076:C16orf61 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 81056441 T/G 1 9 9 18 4.41362426532707 4.58637573467293 -0.172751469345863 T:G T G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000166451:ENST00000299572:exon_81056360_81056490:CENPN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 81076821 T/C 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 T:C T C 10 0.509597303852548 0.5085374516326 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 81077204 T/A 1 8 1 9 3.92322156917962 0.509597303852548 3.41362426532707 A:T T A 10 0.509597303852548 0.039373498903222 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 81077915 T/C 1 15 20 35 7.35604044221178 10.191946077051 -2.83590563483918 T:C T C 10 0.509597303852548 0.398957144138432 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 81124275 G/A 1 3 11 14 1.47120808844236 5.60557034237803 -4.13436225393567 A:G G A 10 0.509597303852548 0.032165591851746 ENSG00000140905:ENST00000315467:exon_81124206_81124285:GCSH HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 81737573 C/T 1 8 3 11 3.92322156917962 1.52879191155764 2.39442965762197 T:C C T 10 0.509597303852548 0.227512016275758 ENSG00000153815:ENST00000398040:exon_81737544_81737690:AC099480.1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 81914583 C/T 1 7 1 8 3.43281887303216 0.509597303852548 2.92322156917962 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0707155477569663 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 81941319 C/T 1 30 30 60 14.7120808844236 15.2879191155764 -0.575838231152879 T:C C T 10 0.509597303852548 0.89797945097203 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81941290_81941379:PLCG2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 81971403 T/C 1 32 22 54 15.6928862767185 11.2111406847561 4.48174559196241 T:C T C 10 0.509597303852548 0.276102663149457 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81971363_81971508:PLCG2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 82182286 C/G 1 6 5 11 2.94241617688471 2.54798651926274 0.394429657621972 C:G C G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82181767_82182468:MPHOSPH6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 82182354 G/A 1 9 1 10 4.41362426532707 0.509597303852548 3.90402696147452 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0217112146317356 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82181767_82182468:MPHOSPH6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 84212571 C/A 1 27 43 70 13.2408727959812 21.9126840656596 -8.67181126967836 A:C:G C A 10 0.509597303852548 0.0420059830933967 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 84623783 G/A 1 16 20 36 7.84644313835923 10.191946077051 -2.34550293869173 A:G G A 10 0.509597303852548 0.505991398330782 ENSG00000103187:ENST00000262428:exon_84623711_84623868:COTL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 84695280 A/G 1 2 9 11 0.980805392294904 4.58637573467293 -3.60557034237803 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0353083305106556 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84695184_84701292:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84695184_84695915:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000426441:exon_84695184_84695915:KLHL36 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 84695490 C/T 1 24 14 38 11.7696647075388 7.13436225393567 4.63530245360318 T:C C T 10 0.509597303852548 0.146103733908914 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84695184_84701292:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84695184_84695915:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000426441:exon_84695184_84695915:KLHL36 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 84778690 C/T 1 22 2 24 10.7888593152439 1.0191946077051 9.76966470753885 T:C C T 10 0.509597303852548 3.84384415872403e-05 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 84778697 G/C 1 22 1 23 10.7888593152439 0.509597303852548 10.2792620113914 C:G G C 10 0.509597303852548 6.17112243290294e-06 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 84792371 C/G 1 11 5 16 5.39442965762197 2.54798651926274 2.84644313835923 C:G C G 10 0.509597303852548 0.211463370056425 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84792322_84792413:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84792322_84792413:USP10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 84796603 A/G 1 12 29 41 5.88483235376942 14.7783218117239 -8.89348945795447 A:G A G 10 0.509597303852548 0.00718389998302855 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84796595_84796694:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84796595_84796694:USP10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 85704584 A/G 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000131149:ENST00000496345:exon_85704234_85704704:KIAA0182 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 85706047 A/C 1 15 1 16 7.35604044221178 0.509597303852548 6.84644313835923 A:C A C 10 0.509597303852548 0.000536406887693070 ENSG00000131149:ENST00000405402:exon_85706011_85706960:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000416667:exon_85706011_85709812:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000253458:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000393243:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412862:exon_85706011_85709812:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412692:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000469381:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000438180:exon_85706011_85706499:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000496345:exon_85706011_85706102:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000471070:exon_85706011_85706254:KIAA0182 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 85711769 G/A 1 66 85 151 32.3665779457318 43.3157708274666 -10.9491928817347 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0870749942926345 ENSG00000131153:ENST00000253462:exon_85709804_85711943:GINS2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 85711860 C/T 1 56 59 115 27.4625509842573 30.0662409273003 -2.60368994304302 T:C C T 10 0.509597303852548 0.642030907346356 ENSG00000131153:ENST00000253462:exon_85709804_85711943:GINS2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 87788864 G/A 1 16 2 18 7.84644313835923 1.0191946077051 6.82724853065414 A:G G A 10 0.509597303852548 0.00135714812921251 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87788800_87788898:KLHDC4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 88713236 A/G 1 256 291 547 125.543090213748 148.292815421091 -22.7497252073437 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0542593347040094 ENSG00000051523:ENST00000261623:exon_88713163_88713246:CYBA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 88724347 G/T 1 8 13 21 3.92322156917962 6.62476495008312 -2.70154338090351 T:G G T 10 0.509597303852548 0.278772582952036 ENSG00000167508:ENST00000301012:exon_88724323_88724437:MVD;ENSG00000167508:ENST00000378400:exon_88724323_88724437:MVD HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 88779739 A/G 1 8 13 21 3.92322156917962 6.62476495008312 -2.70154338090351 A:G A G 10 0.509597303852548 0.278772582952036 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779720_88779855:CTU2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 88781040 A/G 1 32 22 54 15.6928862767185 11.2111406847561 4.48174559196241 A:G A G 10 0.509597303852548 0.276102663149457 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780995_88781145:CTU2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 88781225 T/C 1 7 2 9 3.43281887303216 1.0191946077051 2.41362426532707 T:C T C 10 0.509597303852548 0.180412718745071 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 88781614 G/C 1 9 12 21 4.41362426532707 6.11516764623058 -1.70154338090351 C:G G C 10 0.509597303852548 0.516968964003046 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000103335:ENST00000301015:exon_88781588_88782262:FAM38A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 88870972 C/T 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 T:C C T 10 0.509597303852548 0.499988077920146 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88870953_88871075:CDT1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 89167395 C/T 1 9 2 11 4.41362426532707 1.0191946077051 3.39442965762197 A:T:C C T 10 0.509597303852548 0.0659641183816961 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 89167404 T/C 1 11 2 13 5.39442965762197 1.0191946077051 4.37523504991688 T:C T C 10 0.509597303852548 0.022769928287595 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 89167431 G/C 0 10 0 10 4.90402696147452 0 4.90402696147452 G G 10 0.509597303852548 0.00198556249985287 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 89167443 T/C 0 10 0 10 4.90402696147452 0 4.90402696147452 T T 10 0.509597303852548 0.00198556249985287 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 89167458 C/A 1 10 2 12 4.90402696147452 1.0191946077051 3.88483235376942 A:C C A 10 0.509597303852548 0.0389900147787838 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 89180883 G/A 1 7 11 18 3.43281887303216 5.60557034237803 -2.17275146934586 A:G G A 10 0.509597303852548 0.351502463188979 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000378345:exon_89180747_89180895:ACSF3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 89199651 G/A 1 22 16 38 10.7888593152439 8.15355686164077 2.63530245360318 A:G G A 10 0.509597303852548 0.420962778880953 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89199544_89199670:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89199544_89199670:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89199544_89199670:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000378345:exon_89199544_89199670:ACSF3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 89350038 G/A 1 121 99 220 59.3387262338417 50.4501330814022 8.88859315243945 A:G G A 10 0.509597303852548 0.251652988786965 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 89350178 G/A 1 166 163 329 81.406847560477 83.0643605279653 -1.65751296748829 A:G G A 10 0.509597303852548 0.868728547028532 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11;ENSG00000167522:ENST00000330736:exon_89350139_89351806:ANKRD11 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 89760652 C/T 1 5 12 17 2.45201348073726 6.11516764623058 -3.66315416549332 T:C C T 10 0.509597303852548 0.090883178805902 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 89805261 A/G 1 18 13 31 8.82724853065414 6.62476495008312 2.20248358057101 A:G A G 10 0.509597303852548 0.475671813036224 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89804384_89807311:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89804384_89807333:ZNF276 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 16 89869761 T/C 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 T:C T C 10 0.509597303852548 0.499988077920146 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 293138 G/A 1 11 4 15 5.39442965762197 2.03838921541019 3.35604044221178 A:G G A 10 0.509597303852548 0.119482056883178 ENSG00000183688:ENST00000329099:exon_289769_293285:FAM101B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 293274 A/G 1 6 2 8 2.94241617688471 1.0191946077051 1.92322156917962 A:G A G 10 0.509597303852548 0.289787629707581 ENSG00000183688:ENST00000329099:exon_289769_293285:FAM101B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 505129 A/C 1 6 2 8 2.94241617688471 1.0191946077051 1.92322156917962 A:C A C 10 0.509597303852548 0.289787629707581 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_505035_505136:VPS53 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 648157 G/A 1 36 50 86 17.6544970613083 25.4798651926274 -7.82536813131913 A:G G A 10 0.509597303852548 0.105405245148662 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 648186 G/A 1 58 29 87 28.4433563765522 14.7783218117239 13.6650345648283 A:G G A 10 0.509597303852548 0.00362050915674805 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 649505 T/A 1 12 7 19 5.88483235376942 3.56718112696784 2.31765122680159 A:T T A 10 0.509597303852548 0.360981209646244 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 649547 G/C 1 5 8 13 2.45201348073726 4.07677843082038 -1.62476495008312 C:G G C 10 0.509597303852548 0.415960200620574 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 961900 G/A 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 A:G G A 10 0.509597303852548 0.74955201040747 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 1554770 A/G 1 79 111 190 38.7418129956487 56.5653007276328 -17.8234877319841 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0109332876883275 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1554708_1554847:PRPF8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 1578939 C/T 1 9 7 16 4.41362426532707 3.56718112696784 0.846443138359232 T:C C T 10 0.509597303852548 0.80419746365061 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1578914_1579106:PRPF8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 1580929 G/C 1 6 6 12 2.94241617688471 3.05758382311529 -0.115167646230576 C:G G C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1580859_1580988:PRPF8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 1584324 A/G 1 4 7 11 1.96161078458981 3.56718112696784 -1.60557034237803 A:G A G 10 0.509597303852548 0.379319216476062 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1584223_1584348:PRPF8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 1585130 A/G 1 5 13 18 2.45201348073726 6.62476495008312 -4.17275146934586 A:G A G 10 0.509597303852548 0.059364647228317 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1585114_1585332:PRPF8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 1704296 C/A 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 A:C C A 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1703151_1704318:SMYD4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 1782957 C/T 1 8 17 25 3.92322156917962 8.66315416549332 -4.7399325963137 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0712304919866847 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1782854_1782993:RPA1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 1792174 G/A 1 1 8 9 0.490402696147452 4.07677843082038 -3.58637573467293 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0193004967410206 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 1940232 A/G 1 9 2 11 4.41362426532707 1.0191946077051 3.39442965762197 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0659641183816961 ENSG00000108963:ENST00000263083:exon_1940129_1940250:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000442776:exon_1940129_1940250:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000417873:exon_1940129_1940250:DPH1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 1943888 T/C 1 11 7 18 5.39442965762197 3.56718112696784 1.82724853065414 A:T:C T C 10 0.509597303852548 0.482156564682581 ENSG00000108963:ENST00000263083:exon_1943799_1943899:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000442776:exon_1943799_1943899:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000417873:exon_1943799_1943899:DPH1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 2203025 T/G 1 11 2 13 5.39442965762197 1.0191946077051 4.37523504991688 T:G T G 10 0.509597303852548 0.022769928287595 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 2203175 C/G 1 8 14 22 3.92322156917962 7.13436225393567 -3.21114068475606 C:G C G 10 0.509597303852548 0.203042661312835 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 2203453 A/G 1 21 17 38 10.2984566190965 8.66315416549332 1.63530245360318 A:G A G 10 0.509597303852548 0.629525463794102 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 2595964 G/A 1 17 22 39 8.33684583450668 11.2111406847561 -2.87429485024937 A:G G A 10 0.509597303852548 0.423972506582077 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2595865_2595990:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2595865_2595990:KIAA0664 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 3568012 A/G 1 10 4 14 4.90402696147452 2.03838921541019 2.86563774606433 A:G A G 10 0.509597303852548 0.180690507474734 ENSG00000213977:ENST00000225525:exon_3567973_3568092:TAX1BP3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 3577146 C/T 1 55 58 113 26.9721482881099 29.5566436234478 -2.58449533533792 T:C C T 10 0.509597303852548 0.639208313968047 ENSG00000083454:ENST00000225328:exon_3576521_3577171:P2RX5;ENSG00000083454:ENST00000345901:exon_3576524_3577171:P2RX5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 3839685 G/A 1 17 8 25 8.33684583450668 4.07677843082038 4.2600674036863 A:G G A 10 0.509597303852548 0.109366962829306 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3839561_3839763:ATP2A3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 3840928 A/G 1 12 10 22 5.88483235376942 5.09597303852548 0.788859315243944 A:G A G 10 0.509597303852548 0.832492277049863 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3840710_3840930:ATP2A3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 3845927 A/G 1 5 6 11 2.45201348073726 3.05758382311529 -0.605570342378028 A:G A G 10 0.509597303852548 0.770507260060939 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3845900_3846025:ATP2A3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 3848013 A/C 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 A:C A C 10 0.509597303852548 0.335037018547339 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3847998_3848100:ATP2A3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 4442995 G/A 1 77 76 153 37.7610076033538 38.7293950927936 -0.968387489439841 A:G G A 10 0.509597303852548 0.93558868252508 ENSG00000183018:ENST00000329078:exon_4440748_4443228:SPNS2;ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4442734_4443262:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4442199_4443262:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000426435:exon_4442938_4443122:MYBBP1A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 4701019 C/T 1 66 121 187 32.3665779457318 61.6612737661583 -29.2946958204265 T:C C T 10 0.509597303852548 1.93392978518312e-05 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4700977_4701106:PSMB6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 4863410 A/G 1 13 3 16 6.37523504991688 1.52879191155764 4.84644313835923 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0216395245326523 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 5126674 A/G 1 12 13 25 5.88483235376942 6.62476495008312 -0.7399325963137 A:G A G 10 0.509597303852548 0.84274112322754 ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 5126689 G/A 1 10 9 19 4.90402696147452 4.58637573467293 0.317651226801589 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 5280440 T/C 1 7 17 24 3.43281887303216 8.66315416549332 -5.23033529246115 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0401930404020513 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5280411_5280600:RABEP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 5284698 A/G 1 11 9 20 5.39442965762197 4.58637573467293 0.808053922949041 A:G A G 10 0.509597303852548 0.824451040790607 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 5284719 T/C 1 11 10 21 5.39442965762197 5.09597303852548 0.298456619096493 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 5284770 G/A 1 12 9 21 5.88483235376942 4.58637573467293 1.29845661909649 A:G G A 10 0.509597303852548 0.664861077872976 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 5289580 A/G 1 83 99 182 40.7034237802385 50.4501330814022 -9.74670930116373 A:G A G 10 0.509597303852548 0.159042761793966 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5289346_5289589:NUP88 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 5290033 T/C 1 61 71 132 29.9145644649946 36.1814085735309 -6.26684410853634 T:C T C 10 0.509597303852548 0.29653220016816 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5290028_5290146:NUP88 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 5294976 T/A 1 11 12 23 5.39442965762197 6.11516764623058 -0.720737988608604 A:T T A 10 0.509597303852548 0.836390489019417 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5294881_5294982:NUP88 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 5308377 C/T 1 10 27 37 4.90402696147452 13.7591272040188 -8.85510024254427 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00454871901211557 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5308377_5308563:NUP88 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 5326089 C/T 1 44 64 108 21.5777186304879 32.6142274465631 -11.0365088160752 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0344787014759485 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 5326145 C/G 1 51 70 121 25.0105375035201 35.6718112696784 -10.6612737661583 C:G C G 10 0.509597303852548 0.0562290721090788 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 5326162 G/A 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 A:G G A 10 0.509597303852548 0.726965250907 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 5326178 C/T 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 T:C C T 10 0.509597303852548 0.726965250907 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 5336791 G/T 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 T:G G T 10 0.509597303852548 0.499988077920146 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 5425077 T/C 1 8 15 23 3.92322156917962 7.64395955778822 -3.7207379886086 T:C T C 10 0.509597303852548 0.145402204219230 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 5436263 C/T 1 6 10 16 2.94241617688471 5.09597303852548 -2.15355686164077 T:C C T 10 0.509597303852548 0.324290953365588 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5436142_5436304:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5436142_5436304:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5436142_5436304:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5436142_5436304:NLRP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 6531552 A/C 1 2 8 10 0.980805392294904 4.07677843082038 -3.09597303852548 A:C A C 10 0.509597303852548 0.0608033640885815 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6531437_6532061:KIAA0753 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 6663895 C/G 1 5 8 13 2.45201348073726 4.07677843082038 -1.62476495008312 C:G C G 10 0.509597303852548 0.415960200620574 ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000438512:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6663725_6663920:XAF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 6942111 G/T 1 8 1 9 3.92322156917962 0.509597303852548 3.41362426532707 T:G G T 10 0.509597303852548 0.039373498903222 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6941471_6942208:SLC16A13 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 7127718 T/C 1 7 7 14 3.43281887303216 3.56718112696784 -0.134362253935672 T:C T C 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 7129840 T/C 1 7 8 15 3.43281887303216 4.07677843082038 -0.64395955778822 T:C T C 10 0.509597303852548 0.800365558868668 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7129740_7129958:DVL2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 7154534 G/A 1 35 27 62 17.1640943651608 13.7591272040188 3.40496716114203 A:G G A 10 0.509597303852548 0.446399599162764 ENSG00000175826:ENST00000380825:exon_7154514_7154995:CTDNEP1;ENSG00000175826:ENST00000318988:exon_7154514_7154920:CTDNEP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 7214824 C/T 1 35 8 43 17.1640943651608 4.07677843082038 13.0873159343404 T:C C T 10 0.509597303852548 4.7555451681286e-05 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 7217463 T/C 1 29 27 56 14.2216781882761 13.7591272040188 0.462550984257312 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000132522:ENST00000380728:exon_7217399_7217478:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7217399_7217478:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000389167:exon_7217399_7217478:GPS2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 7221385 G/A 1 16 12 28 7.84644313835923 6.11516764623058 1.73127549212866 A:G G A 10 0.509597303852548 0.57358810064514 ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7221384_7221491:GPS2;ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7221384_7221491:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7221384_7221491:NEURL4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 7225205 C/T 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 T:C C T 10 0.509597303852548 0.5085374516326 ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7225184_7225329:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7225184_7225329:NEURL4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 7251605 G/C 1 6 6 12 2.94241617688471 3.05758382311529 -0.115167646230576 C:G G C 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 7399866 G/A 1 6 6 12 2.94241617688471 3.05758382311529 -0.115167646230576 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7399759_7399932:POLR2A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 7411770 C/T 1 9 10 19 4.41362426532707 5.09597303852548 -0.682348773198411 T:C C T 10 0.509597303852548 0.821015503596854 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7411570_7411794:POLR2A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 7460517 G/C 1 3 8 11 1.47120808844236 4.07677843082038 -2.60557034237803 C:G G C 10 0.509597303852548 0.139008716253398 ENSG00000239697:ENST00000293825:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000322272:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462619:exon_7460416_7460549:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462811:exon_7460416_7460891:TNFSF12 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 7460685 G/A 1 7 5 12 3.43281887303216 2.54798651926274 0.884832353769424 A:G G A 10 0.509597303852548 0.774912283175237 ENSG00000239697:ENST00000293825:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000322272:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462811:exon_7460416_7460891:TNFSF12 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 7754993 G/A 1 9 14 23 4.41362426532707 7.13436225393567 -2.7207379886086 A:G G A 10 0.509597303852548 0.300102693070699 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7754966_7755114:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7754966_7755114:KDM6B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 7760397 G/A 1 104 117 221 51.001880399335 59.6228845507481 -8.6210041514131 A:G G A 10 0.509597303852548 0.253270057451018 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760333_7760516:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 7760704 A/G 1 42 52 94 20.596913238193 26.4990598003325 -5.90214656213951 A:G A G 10 0.509597303852548 0.256439980946571 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760701_7760809:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 7794202 C/G 0 9 0 9 4.41362426532707 0 4.41362426532707 C C 10 0.509597303852548 0.00395812771304115 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 7843053 C/T 1 9 3 12 4.41362426532707 1.52879191155764 2.88483235376942 T:C C T 10 0.509597303852548 0.146886429190433 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380255:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000419170:exon_7842831_7843067:CNTROB HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 7847955 C/A 1 8 16 24 3.92322156917962 8.15355686164077 -4.23033529246115 A:C C A 10 0.509597303852548 0.102508753648658 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7847794_7847956:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7847794_7847956:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7847794_7847956:CNTROB HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 7849087 C/G 1 5 14 19 2.45201348073726 7.13436225393567 -4.68234877319841 C:G C G 10 0.509597303852548 0.0382143139030486 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380255:exon_7849046_7849304:CNTROB HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 8048169 T/C 1 7 4 11 3.43281887303216 2.03838921541019 1.39442965762197 T:C T C 10 0.509597303852548 0.549658645750086 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8048069_8048311:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8047507_8048311:PER1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 8048283 G/A 1 10 9 19 4.90402696147452 4.58637573467293 0.317651226801589 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8048069_8048311:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8047507_8048311:PER1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 8064779 C/G 1 9 2 11 4.41362426532707 1.0191946077051 3.39442965762197 C:G C G 10 0.509597303852548 0.0659641183816961 ENSG00000220205:ENST00000404970:exon_8063724_8064842:VAMP2;ENSG00000220205:ENST00000481878:exon_8064637_8064842:VAMP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 8076778 C/T 1 6 8 14 2.94241617688471 4.07677843082038 -1.13436225393567 T:C C T 10 0.509597303852548 0.601095068648336 ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 8076802 T/A 1 9 4 13 4.41362426532707 2.03838921541019 2.37523504991688 A:T T A 10 0.509597303852548 0.268002712932727 ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 8108339 G/A 1 101 58 159 49.5306723108927 29.5566436234478 19.9740286874449 A:G G A 10 0.509597303852548 0.00188563880030783 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 8110940 G/A 1 17 26 43 8.33684583450668 13.2495299001662 -4.91268406565956 A:G G A 10 0.509597303852548 0.169252590387033 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8110889_8110943:AURKB HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 8809075 G/A 1 9 9 18 4.41362426532707 4.58637573467293 -0.172751469345863 A:G G A 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 9471711 T/G 1 7 9 16 3.43281887303216 4.58637573467293 -1.15355686164077 T:G T G 10 0.509597303852548 0.623338489505478 ENSG00000170310:ENST00000306357:exon_9471688_9471787:STX8;ENSG00000170310:ENST00000415554:exon_9471688_9471787:STX8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 10536018 G/A 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 A:G G A 10 0.509597303852548 0.335037018547339 ENSG00000109063:ENST00000226209:exon_10535793_10536101:MYH3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 12899902 C/T 1 16 13 29 7.84644313835923 6.62476495008312 1.22167818827611 T:C C T 10 0.509597303852548 0.712557853061201 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000424152:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000480891:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000487229:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000465825:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000491478:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000492559:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000457438:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000407336:exon_12899735_12900002:ELAC2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 16342833 T/C 1 11 14 25 5.39442965762197 7.13436225393567 -1.7399325963137 T:C T C 10 0.509597303852548 0.551336393725987 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 16344600 T/C 1 30 19 49 14.7120808844236 9.68234877319841 5.02973211122515 T:C T C 10 0.509597303852548 0.156104343429479 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 16842991 G/A 1 155 123 278 76.0124179028551 62.6804683738634 13.3319495289917 A:C:G G A 10 0.509597303852548 0.118757513810116 ENSG00000240505:ENST00000437538:exon_16842970_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 16855878 C/T 1 45 36 81 22.0681213266353 18.3455029386917 3.72261838794362 T:C C T 10 0.509597303852548 0.437725311817616 ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16855760_16855897:TNFRSF13B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 17168164 G/A 1 20 13 33 9.80805392294904 6.62476495008312 3.18328897286592 A:G G A 10 0.509597303852548 0.299151178485349 ENSG00000141030:ENST00000268717:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000486810:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000417352:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000439936:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000492672:exon_17168116_17168295:COPS3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 17394611 G/A 1 1 11 12 0.490402696147452 5.60557034237803 -5.11516764623058 A:G G A 10 0.509597303852548 0.00291281177067002 ENSG00000141026:ENST00000268711:exon_17394593_17396535:MED9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 17409560 C/T 1 10 17 27 4.90402696147452 8.66315416549332 -3.7591272040188 T:C C T 10 0.509597303852548 0.17860911307817 ENSG00000133027:ENST00000255389:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395783:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395782:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000490392:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000484838:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000435340:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000448294:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000343219:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395781:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000477595:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000482906:exon_17409541_17409615:PEMT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 17707105 T/C 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 T:C T C 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17707070_17707163:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17707070_17707355:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17707070_17707433:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17707070_17707355:RAI1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 17750907 G/A 1 5 7 12 2.45201348073726 3.56718112696784 -1.11516764623058 A:G G A 10 0.509597303852548 0.574428486272357 ENSG00000175662:ENST00000379504:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000318094:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000478943:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000395739:exon_17750663_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000486413:exon_17750866_17751097:TOM1L2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 17997209 G/A 1 14 5 19 6.86563774606433 2.54798651926274 4.31765122680159 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0644836423988429 ENSG00000108591:ENST00000395726:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000225729:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000473213:exon_17997127_17997594:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000467099:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000496428:exon_17997127_17997282:DRG2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 18181430 C/G 1 4 7 11 1.96161078458981 3.56718112696784 -1.60557034237803 C:G C G 10 0.509597303852548 0.379319216476062 ENSG00000177302:ENST00000321105:exon_18180989_18181671:TOP3A;ENSG00000177302:ENST00000469739:exon_18180989_18181671:TOP3A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 18193941 G/A 1 8 2 10 3.92322156917962 1.0191946077051 2.90402696147452 A:G G A 10 0.509597303852548 0.110022635989167 ENSG00000177302:ENST00000321105:exon_18193871_18194000:TOP3A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 18220770 G/A 1 1 9 10 0.490402696147452 4.58637573467293 -4.09597303852548 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0103454948738643 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 18232096 G/A 1 6 10 16 2.94241617688471 5.09597303852548 -2.15355686164077 A:G G A 10 0.509597303852548 0.324290953365588 ENSG00000176974:ENST00000316694:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395684:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000352886:exon_18231195_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000354098:exon_18231842_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395685:exon_18231871_18232233:SHMT1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 18775900 A/G 1 12 15 27 5.88483235376942 7.64395955778822 -1.7591272040188 A:G A G 10 0.509597303852548 0.56601930423381 ENSG00000141127:ENST00000441887:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000395656:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000414602:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000492129:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000487101:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000432893:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000455992:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000412418:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000478622:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000419284:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000268835:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000422237:exon_18775896_18775962:PRPSAP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 19812541 T/C 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19812494_19812589:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19812494_19812589:AKAP10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 19861458 C/T 1 6 6 12 2.94241617688471 3.05758382311529 -0.115167646230576 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19861327_19861884:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19861327_19861884:AKAP10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 13 0 13 6.37523504991688 0 6.37523504991688 T T 10 0.509597303852548 0.000251180398742274 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 21203907 T/C 0 13 0 13 6.37523504991688 0 6.37523504991688 T T 10 0.509597303852548 0.000251180398742274 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 18 0 18 8.82724853065414 0 8.82724853065414 G G 10 0.509597303852548 8.06264149467218e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 21203941 G/A 0 18 0 18 8.82724853065414 0 8.82724853065414 G G 10 0.509597303852548 8.06264149467218e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 18 0 18 8.82724853065414 0 8.82724853065414 C C 10 0.509597303852548 8.06264149467218e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 17 0 17 8.33684583450668 0 8.33684583450668 C C 10 0.509597303852548 1.60282985018015e-05 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 11 0 11 5.39442965762197 0 5.39442965762197 C C 10 0.509597303852548 0.000996395147774831 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 9 0 9 4.41362426532707 0 4.41362426532707 C C 10 0.509597303852548 0.00395812771304115 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 15 0 15 7.35604044221178 0 7.35604044221178 C C 10 0.509597303852548 6.34076538537087e-05 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 16 0 16 7.84644313835923 0 7.84644313835923 G G 10 0.509597303852548 3.18743715977512e-05 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 20 0 20 9.80805392294904 0 9.80805392294904 G G 10 0.509597303852548 2.0421254696666e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 25621352 C/T 1 9 7 16 4.41362426532707 3.56718112696784 0.846443138359232 T:C C T 10 0.509597303852548 0.80419746365061 ENSG00000109046:ENST00000262394:exon_25621106_25621461:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000427287:exon_25621106_25621461:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000467843:exon_25621139_25621461:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000348811:exon_25621157_25621461:WSB1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 25628820 T/C 1 7 12 19 3.43281887303216 6.11516764623058 -2.68234877319841 T:C T C 10 0.509597303852548 0.255561328037084 ENSG00000109046:ENST00000262394:exon_25628814_25628982:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000427287:exon_25628814_25628982:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000467843:exon_25628814_25628982:WSB1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 25630388 T/C 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000109046:ENST00000487603:exon_25629461_25630661:WSB1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 25909850 G/T 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:G G T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000141068:ENST00000268763:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000319524:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398982:exon_25909672_25910131:KSR1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 27004703 C/A 1 5 10 15 2.45201348073726 5.09597303852548 -2.64395955778822 A:C C A 10 0.509597303852548 0.20250907335495 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 27207571 C/T 1 22 18 40 10.7888593152439 9.17275146934586 1.61610784589808 T:C C T 10 0.509597303852548 0.638327353489123 ENSG00000132589:ENST00000394906:exon_27206353_27207617:FLOT2;ENSG00000132589:ENST00000394908:exon_27206353_27207617:FLOT2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 27239630 C/T 1 7 3 10 3.43281887303216 1.52879191155764 1.90402696147452 T:C C T 10 0.509597303852548 0.344656245175514 ENSG00000109118:ENST00000332830:exon_27239500_27240295:PHF12;ENSG00000109118:ENST00000378879:exon_27239500_27240295:PHF12;ENSG00000109118:ENST00000268756:exon_27239162_27240295:PHF12 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 27422053 C/T 1 8 11 19 3.92322156917962 5.60557034237803 -1.68234877319841 T:C C T 10 0.509597303852548 0.496599009223979 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530557:exon_27421954_27422077:MYO18A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 27438469 G/A 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27438442_27438601:MYO18A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 27869968 G/A 1 2 6 8 0.980805392294904 3.05758382311529 -2.07677843082038 A:G G A 10 0.509597303852548 0.171857042968518 ENSG00000160551:ENST00000261716:exon_27869579_27871502:TAOK1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 29096006 C/T 1 18 9 27 8.82724853065414 4.58637573467293 4.2408727959812 T:C C T 10 0.509597303852548 0.123930071307246 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 29111368 A/G 1 5 5 10 2.45201348073726 2.54798651926274 -0.0959730385254796 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29109726_29111461:CRLF3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 29162212 T/G 1 7 11 18 3.43281887303216 5.60557034237803 -2.17275146934586 T:G T G 10 0.509597303852548 0.351502463188979 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29161166_29163066:ATAD5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 29226630 T/A 1 8 6 14 3.92322156917962 3.05758382311529 0.865637746064328 A:T T A 10 0.509597303852548 0.79106698341654 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 30179173 G/A 1 25 28 53 12.2600674036863 14.2687245078713 -2.00865710418504 A:G G A 10 0.509597303852548 0.586329056784484 ENSG00000172301:ENST00000302362:exon_30178883_30179327:C17orf79;ENSG00000172301:ENST00000378634:exon_30178890_30179327:C17orf79;ENSG00000172301:ENST00000496655:exon_30178890_30179327:C17orf79 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 30696292 C/T 1 29 18 47 14.2216781882761 9.17275146934586 5.04892671893024 T:C C T 10 0.509597303852548 0.147329690521114 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 30696296 G/A 1 27 18 45 13.2408727959812 9.17275146934586 4.06812132663534 A:G G A 10 0.509597303852548 0.236566394451442 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 33460367 G/A 1 9 20 29 4.41362426532707 10.191946077051 -5.77832181172389 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0398860759032628 ENSG00000073536:ENST00000442241:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000360831:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000262335:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000436188:exon_33460358_33460517:NLE1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 33460431 C/T 1 3 21 24 1.47120808844236 10.7015433809035 -9.23033529246115 T:C C T 10 0.509597303852548 0.000123454644860267 ENSG00000073536:ENST00000442241:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000360831:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000262335:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000436188:exon_33460358_33460517:NLE1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 33460516 A/G 1 8 21 29 3.92322156917962 10.7015433809035 -6.77832181172389 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0146569662932321 ENSG00000073536:ENST00000442241:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000360831:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000262335:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000436188:exon_33460358_33460517:NLE1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 33592591 C/T 1 13 13 26 6.37523504991688 6.62476495008312 -0.249529900166248 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000166750:ENST00000299977:exon_33592091_33594739:SLFN5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 33592621 C/T 1 9 11 20 4.41362426532707 5.60557034237803 -1.19194607705096 T:C C T 10 0.509597303852548 0.658614646611609 ENSG00000166750:ENST00000299977:exon_33592091_33594739:SLFN5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 33749546 A/G 1 5 7 12 2.45201348073726 3.56718112696784 -1.11516764623058 A:G A G 10 0.509597303852548 0.574428486272357 ENSG00000172123:ENST00000394562:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000452764:exon_33749009_33750089:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000304905:exon_33749009_33750087:SLFN12 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 33768199 G/A 1 9 7 16 4.41362426532707 3.56718112696784 0.846443138359232 A:G G A 10 0.509597303852548 0.80419746365061 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000360502:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33764562_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33766003_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000534689:exon_33766499_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33766517_33768385:SLFN13 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 33768383 T/A 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 A:T T A 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000360502:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33764562_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33766003_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000534689:exon_33766499_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33766517_33768385:SLFN13 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 33772550 C/T 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33771634_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33771634_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33772392_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33771634_33773029:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000524511:exon_33772381_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000531588:exon_33772467_33772712:SLFN13 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 34050697 C/T 1 28 24 52 13.7312754921287 12.2303352924612 1.5009401996675 T:C C T 10 0.509597303852548 0.781796593682747 ENSG00000006125:ENST00000451640:exon_34050644_34053434:AP2B1;ENSG00000006125:ENST00000262325:exon_34050644_34053434:AP2B1;ENSG00000006125:ENST00000312678:exon_34050644_34053434:AP2B1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 34854280 G/A 1 7 22 29 3.43281887303216 11.2111406847561 -7.77832181172389 A:G G A 10 0.509597303852548 0.00460447909285059 ENSG00000141140:ENST00000431794:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000268852:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000378326:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000415126:exon_34854110_34854403:MYO19 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 34942595 G/A 1 46 71 117 22.5585240227828 36.1814085735309 -13.6228845507481 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0124347147727210 ENSG00000005955:ENST00000304718:exon_34942480_34942628:GGNBP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 35902225 C/G 1 8 17 25 3.92322156917962 8.66315416549332 -4.7399325963137 C:G C G 10 0.509597303852548 0.0712304919866847 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000421408:exon_35900728_35902529:SYNRG HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 35984410 T/C 1 7 8 15 3.43281887303216 4.07677843082038 -0.64395955778822 T:C T C 10 0.509597303852548 0.800365558868668 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35984390_35984480:DDX52 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 36894839 G/A 1 21 30 51 10.2984566190965 15.2879191155764 -4.98946249647995 A:G G A 10 0.509597303852548 0.207070401095891 ENSG00000056661:ENST00000360797:exon_36894794_36894848:PCGF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 37009072 C/T 1 7 11 18 3.43281887303216 5.60557034237803 -2.17275146934586 T:C C T 10 0.509597303852548 0.351502463188979 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 37074932 C/T 1 14 5 19 6.86563774606433 2.54798651926274 4.31765122680159 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0644836423988429 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37074858_37078023:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37074858_37078023:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37074858_37075031:LASP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 37359216 C/T 1 20 2 22 9.80805392294904 1.0191946077051 8.78885931524395 T:C C T 10 0.509597303852548 0.000128064074996166 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 37814080 G/A 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 A:G G A 10 0.509597303852548 0.541646560898822 ENSG00000131748:ENST00000336308:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000394250:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000488876:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000484773:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000443521:exon_37814028_37814105:STARD3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 38062196 G/A 1 13 7 20 6.37523504991688 3.56718112696784 2.80805392294904 A:G G A 10 0.509597303852548 0.264944792438562 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 38062217 C/T 1 19 12 31 9.31765122680159 6.11516764623058 3.20248358057101 T:C C T 10 0.509597303852548 0.283797204409808 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 38153554 G/C 1 7 1 8 3.43281887303216 0.509597303852548 2.92322156917962 C:G G C 10 0.509597303852548 0.0707155477569663 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 38179492 A/G 1 9 12 21 4.41362426532707 6.11516764623058 -1.70154338090351 A:G A G 10 0.509597303852548 0.516968964003046 ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000492176:exon_38179384_38179760:MED24 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 38991032 T/A 1 30 2 32 14.7120808844236 1.0191946077051 13.6928862767185 A:T T A 10 0.509597303852548 2.81478222309833e-07 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 38991052 T/G 1 23 2 25 11.2792620113914 1.0191946077051 10.2600674036863 T:G T G 10 0.509597303852548 2.09617739386149e-05 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 38991053 T/A 1 23 1 24 11.2792620113914 0.509597303852548 10.7696647075388 A:T T A 10 0.509597303852548 3.23772978250864e-06 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 39912145 T/A 0 20 0 20 9.80805392294904 0 9.80805392294904 T T 10 0.509597303852548 2.0421254696666e-06 ENSG00000173801:ENST00000393930:exon_39911982_39912147:JUP;ENSG00000173801:ENST00000310706:exon_39911982_39912147:JUP;ENSG00000173801:ENST00000393931:exon_39910856_39912147:JUP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 40125864 G/A 1 16 11 27 7.84644313835923 5.60557034237803 2.2408727959812 A:G G A 10 0.509597303852548 0.444354653770125 ENSG00000173786:ENST00000393892:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000310262:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000472031:exon_40125493_40126246:CNP;ENSG00000173786:ENST00000393888:exon_40125493_40127194:CNP;ENSG00000173786:ENST00000486438:exon_40125493_40125980:CNP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 40689374 C/T 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:C C T 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 40714804 C/A 1 9 7 16 4.41362426532707 3.56718112696784 0.846443138359232 A:C C A 10 0.509597303852548 0.80419746365061 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40714092_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40714374_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000426807:exon_40714641_40714850:COASY HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 40716520 A/G 1 12 12 24 5.88483235376942 6.11516764623058 -0.230335292461152 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000449624:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40716464_40716595:COASY HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 40722029 A/G 1 15 29 44 7.35604044221178 14.7783218117239 -7.42228136951211 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0336238054548642 ENSG00000108788:ENST00000435881:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000346833:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000246912:exon_40722000_40722201:MLX HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 40722162 G/A 1 19 12 31 9.31765122680159 6.11516764623058 3.20248358057101 A:G G A 10 0.509597303852548 0.283797204409808 ENSG00000108788:ENST00000435881:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000346833:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000246912:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000429573:exon_40722115_40722201:MLX HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 40818451 G/A 1 13 12 25 6.37523504991688 6.11516764623058 0.2600674036863 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818341_40818502:TUBG2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 40818699 A/G 1 14 16 30 6.86563774606433 8.15355686164077 -1.28791911557644 A:G A G 10 0.509597303852548 0.71637122408149 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818621_40819021:TUBG2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 40832132 C/T 1 19 12 31 9.31765122680159 6.11516764623058 3.20248358057101 T:C C T 10 0.509597303852548 0.283797204409808 ENSG00000184451:ENST00000332438:exon_40830907_40832635:CCR10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 40835922 A/C 1 3 8 11 1.47120808844236 4.07677843082038 -2.60557034237803 A:C A C 10 0.509597303852548 0.139008716253398 ENSG00000108797:ENST00000264638:exon_40835839_40835940:CNTNAP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 42152103 G/A 1 8 5 13 3.92322156917962 2.54798651926274 1.37523504991688 A:G G A 10 0.509597303852548 0.581979954468297 ENSG00000141349:ENST00000269097:exon_42152048_42152138:G6PC3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 42158310 T/G 1 11 4 15 5.39442965762197 2.03838921541019 3.35604044221178 T:G T G 10 0.509597303852548 0.119482056883178 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 42254011 C/G 1 10 5 15 4.90402696147452 2.54798651926274 2.35604044221178 C:G C G 10 0.509597303852548 0.303107408657847 ENSG00000168597:ENST00000303061:exon_42253354_42255184:C17orf65 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 42254281 A/G 1 9 7 16 4.41362426532707 3.56718112696784 0.846443138359232 A:G A G 10 0.509597303852548 0.80419746365061 ENSG00000161664:ENST00000293414:exon_42254106_42254598:ASB16;ENSG00000168597:ENST00000303061:exon_42253354_42255184:C17orf65 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 42287519 C/T 1 39 49 88 19.1257051497506 24.9702678887749 -5.84456273902422 A:T:C C T 10 0.509597303852548 0.240946582858148 ENSG00000108312:ENST00000343638:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000302904:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000527034:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000533177:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000436088:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000393606:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000526094:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529383:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529373:exon_42287492_42287602:UBTF HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 43111688 G/A 1 7 7 14 3.43281887303216 3.56718112696784 -0.134362253935672 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000172992:ENST00000452796:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000342350:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000310604:exon_43111555_43111758:DCAKD HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 43176804 C/T 1 21 36 57 10.2984566190965 18.3455029386917 -8.04704631959523 T:C C T 10 0.509597303852548 0.034441956088979 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43176773_43176881:NMT1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 43183028 G/A 1 53 52 105 25.991342895815 26.4990598003325 -0.50771690451754 A:G G A 10 0.509597303852548 0.922646161758031 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43182987_43186377:NMT1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 43226887 A/G 1 43 24 67 21.0873159343404 12.2303352924612 8.85698064187929 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0370895498125671 ENSG00000186834:ENST00000332499:exon_43224684_43229468:HEXIM1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 43227214 T/C 1 40 21 61 19.6161078458981 10.7015433809035 8.91456446499457 T:C:G T C 10 0.509597303852548 0.0286720980049869 ENSG00000186834:ENST00000332499:exon_43224684_43229468:HEXIM1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 45885756 C/T 1 8 16 24 3.92322156917962 8.15355686164077 -4.23033529246115 T:C C T 10 0.509597303852548 0.102508753648658 ENSG00000006025:ENST00000007414:exon_45884733_45885765:OSBPL7;ENSG00000006025:ENST00000392507:exon_45884733_45885765:OSBPL7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 45904420 C/T 1 11 10 21 5.39442965762197 5.09597303852548 0.298456619096493 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000159111:ENST00000351111:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000290208:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000414011:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000421763:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000466016:exon_45904261_45904570:MRPL10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 46000406 T/C 1 10 3 13 4.90402696147452 1.52879191155764 3.37523504991688 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0930569697494132 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_46000328_46000640:SP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 46103760 A/G 1 5 6 11 2.45201348073726 3.05758382311529 -0.605570342378028 A:G A G 10 0.509597303852548 0.770507260060939 ENSG00000005243:ENST00000006101:exon_46103535_46103841:COPZ2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 46136133 G/C 1 30 33 63 14.7120808844236 16.8167110271341 -2.10463014271052 C:G G C 10 0.509597303852548 0.61625008931384 ENSG00000082641:ENST00000362042:exon_46135657_46138906:NFE2L1;ENSG00000082641:ENST00000361665:exon_46135657_46138906:NFE2L1;ENSG00000082641:ENST00000357480:exon_46135657_46138906:NFE2L1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 46198876 G/C 1 14 33 47 6.86563774606433 16.8167110271341 -9.95107328106976 C:G G C 10 0.509597303852548 0.00501121401639435 ENSG00000002919:ENST00000393405:exon_46198597_46200105:SNX11;ENSG00000002919:ENST00000359238:exon_46198597_46200105:SNX11;ENSG00000002919:ENST00000439357:exon_46198597_46200105:SNX11;ENSG00000002919:ENST00000452859:exon_46198597_46200105:SNX11 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 46262171 C/T 1 16 6 22 7.84644313835923 3.05758382311529 4.78885931524394 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0534231591030593 ENSG00000141293:ENST00000336915:exon_46262085_46262209:SKAP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 46998572 G/A 1 11 2 13 5.39442965762197 1.0191946077051 4.37523504991688 A:G G A 10 0.509597303852548 0.022769928287595 ENSG00000159202:ENST00000360943:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000389608:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000508468:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000405215:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506498:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000504684:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000513342:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506271:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000514948:exon_46998564_46998634:UBE2Z HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 47018293 C/T 1 30 25 55 14.7120808844236 12.7399325963137 1.97214828810986 T:C C T 10 0.509597303852548 0.68617842290427 ENSG00000159210:ENST00000502492:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509995:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000290330:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000507302:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000514929:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000510558:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000512243:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000515174:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000510195:exon_47018286_47018424:SNF8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 48226811 C/T 1 19 8 27 9.31765122680159 4.07677843082038 5.2408727959812 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0533977336476133 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 48437456 C/G 1 22 18 40 10.7888593152439 9.17275146934586 1.61610784589808 C:G C G 10 0.509597303852548 0.638327353489123 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48437330_48438512:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48437330_48438512:XYLT2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 48549791 C/G 1 5 6 11 2.45201348073726 3.05758382311529 -0.605570342378028 C:G C G 10 0.509597303852548 0.770507260060939 ENSG00000167107:ENST00000510410:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000508245:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000510262:exon_48549789_48549807:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000512119:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000512537:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000503295:exon_48549492_48549940:ACSF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 54969229 C/T 1 9 8 17 4.41362426532707 4.07677843082038 0.336845834506684 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000121060:ENST00000316881:exon_54965270_54969590:TRIM25 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 54978794 G/A 1 9 5 14 4.41362426532707 2.54798651926274 1.86563774606433 A:G G A 10 0.509597303852548 0.425164682757114 ENSG00000121060:ENST00000316881:exon_54978780_54978939:TRIM25 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 55183792 G/A 1 8 3 11 3.92322156917962 1.52879191155764 2.39442965762197 A:G G A 10 0.509597303852548 0.227512016275758 ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000314126:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55182818_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55182802_55184539:AKAP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 55183813 A/G 1 10 3 13 4.90402696147452 1.52879191155764 3.37523504991688 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0930569697494132 ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000314126:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55182818_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55182802_55184539:AKAP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 57290383 G/A 1 3 7 10 1.47120808844236 3.56718112696784 -2.09597303852548 A:G G A 10 0.509597303852548 0.218348598150516 ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57290090_57290962:C17orf71 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 61908556 C/T 1 191 176 367 93.6669149641633 89.6891254780484 3.9777894861149 T:C C T 10 0.509597303852548 0.714820086662205 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908396_61908586:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908396_61908586:PSMC5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 63189687 C/T 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 T:C C T 10 0.509597303852548 0.335037018547339 ENSG00000108370:ENST00000262406:exon_63189661_63189774:RGS9;ENSG00000108370:ENST00000449996:exon_63189661_63189774:RGS9;ENSG00000108370:ENST00000443584:exon_63189661_63189774:RGS9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 65362552 T/A 1 21 8 29 10.2984566190965 4.07677843082038 6.22167818827611 A:T T A 10 0.509597303852548 0.0248632287503733 ENSG00000197170:ENST00000356126:exon_65362528_65362743:PSMD12;ENSG00000197170:ENST00000357146:exon_65362528_65362721:PSMD12 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 65739627 A/G 1 22 24 46 10.7888593152439 12.2303352924612 -1.44147597721721 A:G A G 10 0.509597303852548 0.768449067137812 ENSG00000130935:ENST00000253247:exon_65739595_65739702:NOL11 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 66270000 C/T 1 2 7 9 0.980805392294904 3.56718112696784 -2.58637573467293 T:C C T 10 0.509597303852548 0.103145007117103 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 71197439 C/T 1 9 4 13 4.41362426532707 2.03838921541019 2.37523504991688 T:C C T 10 0.509597303852548 0.268002712932727 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 71197748 G/A 1 7 10 17 3.43281887303216 5.09597303852548 -1.66315416549332 A:G G A 10 0.509597303852548 0.473469847150149 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 72758160 C/T 1 13 22 35 6.37523504991688 11.2111406847561 -4.83590563483918 T:C C T 10 0.509597303852548 0.127506116178141 ENSG00000109062:ENST00000262613:exon_72758151_72758312:SLC9A3R1;ENSG00000109062:ENST00000413388:exon_72758151_72758312:SLC9A3R1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 72860400 G/A 1 28 28 56 13.7312754921287 14.2687245078713 -0.537449015742688 A:G G A 10 0.509597303852548 0.894595153207523 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72860270_72860469:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72860270_72860469:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72860270_72860469:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000420580:exon_72860270_72860469:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72860018_72860469:FDXR HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 72860654 G/A 1 21 25 46 10.2984566190965 12.7399325963137 -2.44147597721721 A:G G A 10 0.509597303852548 0.555804684089105 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000420580:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72860602_72860686:FDXR HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 73016621 C/T 1 32 31 63 15.6928862767185 15.797516419429 -0.104630142710523 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000167862:ENST00000301585:exon_73016583_73016752:ICT1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 73127217 G/C 1 10 12 22 4.90402696147452 6.11516764623058 -1.21114068475606 C:G G C 10 0.509597303852548 0.672933556012192 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 73269676 C/T 1 25 31 56 12.2600674036863 15.797516419429 -3.53744901574269 T:C C T 10 0.509597303852548 0.353141746826669 ENSG00000125454:ENST00000375261:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000402418:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000416858:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000442286:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000320362:exon_73269062_73269720:SLC25A19 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 73518203 G/C 1 12 17 29 5.88483235376942 8.66315416549332 -2.77832181172389 C:G G C 10 0.509597303852548 0.354840351239223 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73517786_73518414:TSEN54 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 73520359 C/G 1 15 18 33 7.35604044221178 9.17275146934586 -1.81671102713408 C:G C G 10 0.509597303852548 0.60280598239357 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73520343_73520820:TSEN54 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 73627539 T/C 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 T:C T C 10 0.509597303852548 0.499988077920146 ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73627530_73627748:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73627530_73627748:RECQL5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 74056413 C/T 1 18 6 24 8.82724853065414 3.05758382311529 5.76966470753885 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0232420567134879 ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74056389_74056471:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74056389_74056471:SRP68 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 74077497 G/C 1 52 62 114 25.5009401996675 31.595032838858 -6.09409263919047 C:G G C 10 0.509597303852548 0.262216703344125 ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 74383601 C/T 1 5 5 10 2.45201348073726 2.54798651926274 -0.0959730385254796 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000176170:ENST00000323374:exon_74382887_74383941:SPHK1;ENSG00000176170:ENST00000392496:exon_74382887_74383941:SPHK1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 74387284 C/T 1 6 11 17 2.94241617688471 5.60557034237803 -2.66315416549332 T:C C T 10 0.509597303852548 0.23022658599833 ENSG00000175931:ENST00000319380:exon_74385614_74387694:UBE2O HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 74475318 C/T 1 15 8 23 7.35604044221178 4.07677843082038 3.2792620113914 T:C C T 10 0.509597303852548 0.211976090729517 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74475164_74475359:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74475164_74475359:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74475164_74475936:RHBDF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 74475931 C/T 1 11 21 32 5.39442965762197 10.7015433809035 -5.30711372328153 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0760908430506436 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74475815_74476023:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74475815_74475936:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74475164_74475936:RHBDF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 74475975 C/A 1 8 7 15 3.92322156917962 3.56718112696784 0.35604044221178 A:C C A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74475815_74476023:RHBDF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 74477620 C/T 1 12 19 31 5.88483235376942 9.68234877319841 -3.79751641942899 T:C C T 10 0.509597303852548 0.209059512080527 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74477457_74477627:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74477457_74477627:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74477457_74477791:RHBDF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 76134828 C/A 1 8 23 31 3.92322156917962 11.7207379886086 -7.79751641942899 A:C C A 10 0.509597303852548 0.00623969328849814 ENSG00000167895:ENST00000301627:exon_76134690_76134885:TMC8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 76166939 C/G 1 35 41 76 17.1640943651608 20.8934894579545 -3.72939509279365 C:G C G 10 0.509597303852548 0.422945141293871 ENSG00000108639:ENST00000225777:exon_76166898_76167135:SYNGR2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 76178748 T/C 1 10 19 29 4.90402696147452 9.68234877319841 -4.77832181172389 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0940253795712215 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76178670_76178763:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76178670_76178763:TK1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 76178751 C/T 1 11 16 27 5.39442965762197 8.15355686164077 -2.7591272040188 T:C C T 10 0.509597303852548 0.337959274816801 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76178670_76178763:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76178670_76178763:TK1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 76395430 C/T 1 11 1 12 5.39442965762197 0.509597303852548 4.88483235376942 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00645468026900321 ENSG00000087157:ENST00000262764:exon_76395429_76395618:PGS1;ENSG00000087157:ENST00000329897:exon_76395429_76395618:PGS1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 76817090 C/T 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 T:C C T 10 0.509597303852548 0.499988077920146 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76817073_76817143:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76817073_76817143:USP36 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 78113832 G/A 1 17 10 27 8.33684583450668 5.09597303852548 3.2408727959812 A:G G A 10 0.509597303852548 0.250147773222066 ENSG00000141543:ENST00000269349:exon_78113807_78113939:EIF4A3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 78338302 C/T 1 4 7 11 1.96161078458981 3.56718112696784 -1.60557034237803 T:C C T 10 0.509597303852548 0.379319216476062 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78338233_78338353:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78338233_78338353:RNF213 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 79165171 G/A 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 A:G G A 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 79170576 C/T 1 3 12 15 1.47120808844236 6.11516764623058 -4.64395955778822 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0191890404390731 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79170501_79170626:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79170501_79170626:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79170501_79170626:AZI1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 79202956 T/C 1 14 8 22 6.86563774606433 4.07677843082038 2.78885931524394 T:C T C 10 0.509597303852548 0.288242782553056 ENSG00000167302:ENST00000300714:exon_79202079_79203276:C17orf56;ENSG00000167302:ENST00000374769:exon_79202079_79203276:C17orf56 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 79205736 G/A 1 2 8 10 0.980805392294904 4.07677843082038 -3.09597303852548 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0608033640885815 ENSG00000167302:ENST00000300714:exon_79205647_79205821:C17orf56;ENSG00000167302:ENST00000374769:exon_79205647_79205821:C17orf56 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 79220224 G/C 1 18 32 50 8.82724853065414 16.3071137232815 -7.4798651926274 C:G G C 10 0.509597303852548 0.0465815628457282 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 79244802 T/C 1 8 7 15 3.92322156917962 3.56718112696784 0.35604044221178 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79244718_79244824:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79244718_79244824:SLC38A10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 79478007 G/A 1 2280 1864 4144 1118.11814721619 949.889374381149 168.228772835041 A:T:G G A 10 0.509597303852548 1.75917485087547e-07 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79477953_79478134:ACTG1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 79478019 G/A 1 2197 1782 3979 1077.41472343595 908.102395465241 169.312327970712 A:T:G G A 10 0.509597303852548 8.21182032397622e-08 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79477953_79478134:ACTG1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 79478916 G/T 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 T:G G T 10 0.509597303852548 0.541646560898822 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 79514129 G/A 1 9 6 15 4.41362426532707 3.05758382311529 1.35604044221178 A:G G A 10 0.509597303852548 0.608250593906015 ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79513935_79515054:C17orf70 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 79526402 G/C 1 4 13 17 1.96161078458981 6.62476495008312 -4.66315416549332 C:G G C 10 0.509597303852548 0.0282229117175602 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79523915_79526442:NPLOC4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 79571637 C/G 1 6 5 11 2.94241617688471 2.54798651926274 0.394429657621972 C:G C G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79571574_79571753:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79571574_79571753:NPLOC4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 79596811 C/T 1 7 7 14 3.43281887303216 3.56718112696784 -0.134362253935672 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79596751_79596831:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79596751_79596831:NPLOC4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 79803101 A/G 1 272 295 567 133.389533352107 150.331204636502 -16.9416712843947 A:G A G 10 0.509597303852548 0.165655845834907 ENSG00000185624:ENST00000331483:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000450722:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000436463:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000415593:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000473021:exon_79803020_79803332:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000476482:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000439918:exon_79803043_79803106:P4HB HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 79803433 G/A 1 18 13 31 8.82724853065414 6.62476495008312 2.20248358057101 A:G G A 10 0.509597303852548 0.475671813036224 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 79805003 A/G 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 A:G A G 10 0.509597303852548 0.335037018547339 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 79805134 G/A 1 118 133 251 57.8675181453993 67.7764414123889 -9.90892326698954 A:G G A 10 0.509597303852548 0.230297304920070 ENSG00000185624:ENST00000331483:exon_79805119_79805223:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000450722:exon_79805119_79805223:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000436463:exon_79805119_79805223:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000415593:exon_79805119_79805203:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000439918:exon_79805119_79805206:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000478034:exon_79805119_79805223:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000472244:exon_79805119_79805223:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000484286:exon_79805119_79805724:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000477607:exon_79805119_79805223:P4HB HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 79954544 T/A 1 10 13 23 4.90402696147452 6.62476495008312 -1.7207379886086 A:T T A 10 0.509597303852548 0.53508614923685 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79954296_79954722:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79954296_79954722:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000344865:exon_79954296_79954722:ASPSCR1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 80017898 G/A 1 48 44 92 23.5393294150777 22.4222813695121 1.11704804556559 A:G G A 10 0.509597303852548 0.835480689357331 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80017824_80017969:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80017824_80017969:DUS1L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 80401946 A/G 1 15 16 31 7.35604044221178 8.15355686164077 -0.797516419428987 A:G A G 10 0.509597303852548 0.85815003034519 ENSG00000178927:ENST00000306645:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000437807:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000434650:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000342572:exon_80401498_80401980:C17orf62 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 80442683 T/G 1 10 6 16 4.90402696147452 3.05758382311529 1.84644313835923 T:G T G 10 0.509597303852548 0.45584747299355 ENSG00000141562:ENST00000427631:exon_80442657_80442826:NARF HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 80442722 T/C 1 22 17 39 10.7888593152439 8.66315416549332 2.12570514975063 T:C T C 10 0.509597303852548 0.52539752156904 ENSG00000141562:ENST00000390006:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000345415:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000374611:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000309794:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000457415:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000412719:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000412079:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000427631:exon_80442657_80442826:NARF HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 80863857 T/C 1 7 1 8 3.43281887303216 0.509597303852548 2.92322156917962 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0707155477569663 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000397466:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80863812_80863929:TBCD HGDP00232_parsed_pileup.txt . 17 80887244 T/C 1 24 10 34 11.7696647075388 5.09597303852548 6.67369166901337 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0251858294473323 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80887238_80887376:TBCD HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 166819 T/C 0 12 0 12 5.88483235376942 0 5.88483235376942 T T 10 0.509597303852548 0.000500187409481343 ENSG00000101557:ENST00000400266:exon_166787_166819:USP14;ENSG00000101557:ENST00000261601:exon_166787_166819:USP14;ENSG00000101557:ENST00000383589:exon_166787_166819:USP14 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 658064 G/C 1 11 2 13 5.39442965762197 1.0191946077051 4.37523504991688 C:G G C 10 0.509597303852548 0.022769928287595 ENSG00000176912:ENST00000323813:exon_657842_658340:C18orf56 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 673016 C/T 1 149 170 319 73.0700017259704 86.6315416549332 -13.5615399289628 T:C C T 10 0.509597303852548 0.130866829437289 ENSG00000176890:ENST00000323274:exon_672860_673578:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323250:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323224:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_672557_673076:ENOSF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 2616457 G/C 1 11 10 21 5.39442965762197 5.09597303852548 0.298456619096493 C:G G C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000080986:ENST00000261597:exon_2616436_2616634:NDC80 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 9256197 A/G 1 182 184 366 89.2532906988363 93.7659039088688 -4.51261321003255 A:G A G 10 0.509597303852548 0.638459987410111 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 9257059 G/A 1 58 40 98 28.4433563765522 20.3838921541019 8.0594642224503 A:G G A 10 0.509597303852548 0.106894546647714 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 13056333 C/T 1 9 5 14 4.41362426532707 2.54798651926274 1.86563774606433 T:C C T 10 0.509597303852548 0.425164682757114 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13055779_13056697:CEP192 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 14105016 C/A 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 A:C C A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000175322:ENST00000309305:exon_14104724_14106408:ZNF519 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 21109250 T/C 1 16 8 24 7.84644313835923 4.07677843082038 3.76966470753885 T:C T C 10 0.509597303852548 0.153397563257600 ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21109143_21109262:C18orf8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 21109269 T/C 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:C T C 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 29410907 T/C 1 13 6 19 6.37523504991688 3.05758382311529 3.31765122680159 T:C T C 10 0.509597303852548 0.168554935531064 ENSG00000153339:ENST00000283351:exon_29409136_29410952:TRAPPC8;ENSG00000153339:ENST00000451747:exon_29409137_29410952:TRAPPC8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 32887510 T/C 1 6 11 17 2.94241617688471 5.60557034237803 -2.66315416549332 T:C T C 10 0.509597303852548 0.23022658599833 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 43497710 A/G 1 3 7 10 1.47120808844236 3.56718112696784 -2.09597303852548 A:G A G 10 0.509597303852548 0.218348598150516 ENSG00000152223:ENST00000282041:exon_43497644_43497784:KIAA1632 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 43796356 G/A 1 6 2 8 2.94241617688471 1.0191946077051 1.92322156917962 A:G G A 10 0.509597303852548 0.289787629707581 ENSG00000152242:ENST00000282059:exon_43795777_43796561:C18orf25;ENSG00000152242:ENST00000321319:exon_43795777_43796561:C18orf25 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 47318683 A/T 1 17 36 53 8.33684583450668 18.3455029386917 -10.008657104185 A:T A T 10 0.509597303852548 0.0084055888804625 ENSG00000167315:ENST00000285093:exon_47318522_47318697:ACAA2;ENSG00000167315:ENST00000398549:exon_47318522_47318697:ACAA2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 47352955 T/G 1 7 1 8 3.43281887303216 0.509597303852548 2.92322156917962 T:G T G 10 0.509597303852548 0.0707155477569663 ENSG00000167306:ENST00000285039:exon_47349101_47352993:MYO5B;ENSG00000167306:ENST00000324581:exon_47349101_47352993:MYO5B;ENSG00000167306:ENST00000356732:exon_47349101_47352993:MYO5B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 47809871 G/T 1 22 10 32 10.7888593152439 5.09597303852548 5.69288627671847 T:G G T 10 0.509597303852548 0.0514429223546154 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 47811374 G/A 1 26 23 49 12.7504700998338 11.7207379886086 1.02973211122515 A:G G A 10 0.509597303852548 0.777426826571203 ENSG00000154832:ENST00000285106:exon_47811372_47811617:CXXC1;ENSG00000154832:ENST00000412036:exon_47811372_47811617:CXXC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 47812587 C/T 1 25 17 42 12.2600674036863 8.66315416549332 3.59691323819298 T:C C T 10 0.509597303852548 0.283681362094397 ENSG00000154832:ENST00000285106:exon_47812392_47812627:CXXC1;ENSG00000154832:ENST00000412036:exon_47812392_47812627:CXXC1;ENSG00000154832:ENST00000445672:exon_47812392_47812627:CXXC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 55268866 C/T 1 36 27 63 17.6544970613083 13.7591272040188 3.89536985728948 T:C C T 10 0.509597303852548 0.378075331939798 ENSG00000134440:ENST00000256854:exon_55267896_55269015:NARS;ENSG00000134440:ENST00000423481:exon_55267896_55269015:NARS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 55711867 C/T 1 2 7 9 0.980805392294904 3.56718112696784 -2.58637573467293 T:C C T 10 0.509597303852548 0.103145007117103 ENSG00000049759:ENST00000256830:exon_55711619_55711940:NEDD4L;ENSG00000049759:ENST00000400345:exon_55711619_55711940:NEDD4L;ENSG00000049759:ENST00000382850:exon_55711619_55711940:NEDD4L;ENSG00000049759:ENST00000356462:exon_55711619_55711940:NEDD4L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 56202768 C/A 1 2 7 9 0.980805392294904 3.56718112696784 -2.58637573467293 A:C C A 10 0.509597303852548 0.103145007117103 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 56204644 T/G 1 6 6 12 2.94241617688471 3.05758382311529 -0.115167646230576 T:G T G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 56204671 A/T 1 6 11 17 2.94241617688471 5.60557034237803 -2.66315416549332 A:T A T 10 0.509597303852548 0.23022658599833 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 56204932 T/G 1 9 1 10 4.41362426532707 0.509597303852548 3.90402696147452 T:G T G 10 0.509597303852548 0.0217112146317356 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 56204945 C/G 1 9 1 10 4.41362426532707 0.509597303852548 3.90402696147452 C:G C G 10 0.509597303852548 0.0217112146317356 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 56204977 C/T 0 11 0 11 5.39442965762197 0 5.39442965762197 C C 10 0.509597303852548 0.000996395147774831 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 56204991 C/T 0 11 0 11 5.39442965762197 0 5.39442965762197 C C 10 0.509597303852548 0.000996395147774831 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 56205481 G/A 1 9 9 18 4.41362426532707 4.58637573467293 -0.172751469345863 A:G G A 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 56367823 A/G 1 6 12 18 2.94241617688471 6.11516764623058 -3.17275146934586 A:G A G 10 0.509597303852548 0.160250844303470 ENSG00000172175:ENST00000348428:exon_56367673_56367823:MALT1;ENSG00000172175:ENST00000345724:exon_56367673_56367823:MALT1;ENSG00000172175:ENST00000446453:exon_56367673_56367823:MALT1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 56414592 T/C 1 5 7 12 2.45201348073726 3.56718112696784 -1.11516764623058 T:C T C 10 0.509597303852548 0.574428486272357 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 60985773 C/T 1 39 31 70 19.1257051497506 15.797516419429 3.32818873032164 T:C C T 10 0.509597303852548 0.473880242378713 ENSG00000171791:ENST00000398117:exon_60985315_60987361:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000333681:exon_60985315_60986185:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000444484:exon_60985187_60986185:BCL2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 60985879 T/C 1 46 35 81 22.5585240227828 17.8359056348392 4.72261838794362 A:T:C T C 10 0.509597303852548 0.318188819768341 ENSG00000171791:ENST00000398117:exon_60985315_60987361:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000333681:exon_60985315_60986185:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000444484:exon_60985187_60986185:BCL2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 61654297 A/G 1 29 17 46 14.2216781882761 8.66315416549332 5.55852402278279 A:G A G 10 0.509597303852548 0.106726615242147 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 67531642 T/C 1 9 14 23 4.41362426532707 7.13436225393567 -2.7207379886086 T:C T C 10 0.509597303852548 0.300102693070699 ENSG00000150637:ENST00000280200:exon_67528097_67531675:CD226 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 67687860 T/C 1 4 9 13 1.96161078458981 4.58637573467293 -2.62476495008312 T:C T C 10 0.509597303852548 0.172159462736175 ENSG00000176225:ENST00000255674:exon_67687851_67688053:RTTN;ENSG00000176225:ENST00000454359:exon_67687851_67688053:RTTN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 72344553 G/A 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000215421:ENST00000299687:exon_72342919_72347662:ZNF407;ENSG00000215421:ENST00000309902:exon_72342919_72347662:ZNF407 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 18 77473127 C/T 1 7 13 20 3.43281887303216 6.62476495008312 -3.19194607705096 T:C C T 10 0.509597303852548 0.182296042530127 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77472972_77473138:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77472972_77473138:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77472972_77473138:CTDP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 281360 C/T 1 1 11 12 0.490402696147452 5.60557034237803 -5.11516764623058 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00291281177067002 ENSG00000141934:ENST00000269812:exon_281048_281537:PPAP2C;ENSG00000141934:ENST00000327790:exon_281048_281537:PPAP2C;ENSG00000141934:ENST00000434325:exon_281048_281537:PPAP2C HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 619021 G/C 1 13 1 14 6.37523504991688 0.509597303852548 5.86563774606433 C:G G C 10 0.509597303852548 0.00187619055158314 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_618997_619110:POLRMT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 804396 C/T 1 17 16 33 8.33684583450668 8.15355686164077 0.183288972865917 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804292_804438:PTBP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 804642 C/T 1 35 35 70 17.1640943651608 17.8359056348392 -0.671811269678358 T:C C T 10 0.509597303852548 0.905228330237093 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804532_804702:PTBP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 808586 C/G 1 23 28 51 11.2792620113914 14.2687245078713 -2.98946249647995 C:G C G 10 0.509597303852548 0.484142817719778 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000350092:exon_808546_808762:PTBP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 808742 G/T 1 36 30 66 17.6544970613083 15.2879191155764 2.36657794573183 T:G G T 10 0.509597303852548 0.622950255605574 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000350092:exon_808546_808762:PTBP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 885818 A/G 1 13 7 20 6.37523504991688 3.56718112696784 2.80805392294904 A:G A G 10 0.509597303852548 0.264944792438562 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_885770_886201:MED16 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 929678 G/A 1 6 10 16 2.94241617688471 5.09597303852548 -2.15355686164077 A:G G A 10 0.509597303852548 0.324290953365588 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_929262_929896:ARID3A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 966891 C/T 1 8 11 19 3.92322156917962 5.60557034237803 -1.68234877319841 A:T:C C T 10 0.509597303852548 0.496599009223979 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 990819 G/A 1 7 2 9 3.43281887303216 1.0191946077051 2.41362426532707 A:G G A 10 0.509597303852548 0.180412718745071 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 1012120 G/A 1 43 64 107 21.0873159343404 32.6142274465631 -11.5269115122226 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0263384139928029 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1012065_1012187:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1012065_1012187:C19orf6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 1014377 A/G 1 24 29 53 11.7696647075388 14.7783218117239 -3.00865710418504 A:G A G 10 0.509597303852548 0.414112115940141 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1014191_1014472:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1014191_1014472:C19orf6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 1014398 A/G 1 23 33 56 11.2792620113914 16.8167110271341 -5.53744901574269 A:G A G 10 0.509597303852548 0.143839548167973 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1014191_1014472:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1014191_1014472:C19orf6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 1061804 T/C 1 9 3 12 4.41362426532707 1.52879191155764 2.88483235376942 T:C T C 10 0.509597303852548 0.146886429190433 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1061781_1061887:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1061781_1061887:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1061781_1061887:ABCA7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 1064193 G/A 1 12 8 20 5.88483235376942 4.07677843082038 1.80805392294904 A:G G A 10 0.509597303852548 0.505035835457766 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000531478:exon_1064051_1064252:ABCA7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 1068734 T/C 1 12 8 20 5.88483235376942 4.07677843082038 1.80805392294904 T:C T C 10 0.509597303852548 0.505035835457766 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 1068738 G/A 1 15 8 23 7.35604044221178 4.07677843082038 3.2792620113914 A:G G A 10 0.509597303852548 0.211976090729517 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 1074000 A/T 1 25 12 37 12.2600674036863 6.11516764623058 6.14489975745572 A:T A T 10 0.509597303852548 0.0485225464687564 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1073947_1074013:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1073947_1074013:HMHA1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 1077985 A/G 1 31 32 63 15.202483580571 16.3071137232815 -1.10463014271052 A:G A G 10 0.509597303852548 0.802179073744826 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1077856_1078044:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1077856_1078044:HMHA1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 1080189 G/C 1 2 6 8 0.980805392294904 3.05758382311529 -2.07677843082038 C:G G C 10 0.509597303852548 0.171857042968518 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 1080311 G/C 1 34 30 64 16.6736916690134 15.2879191155764 1.38577255343693 C:G G C 10 0.509597303852548 0.802884501176405 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1080254_1080378:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1080254_1080378:HMHA1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 1109213 A/G 1 3 7 10 1.47120808844236 3.56718112696784 -2.09597303852548 A:G A G 10 0.509597303852548 0.218348598150516 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 1110829 G/A 1 10 8 18 4.90402696147452 4.07677843082038 0.827248530654137 A:G G A 10 0.509597303852548 0.815143514661865 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1110744_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1110744_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1110711_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1110744_1110887:SBNO2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 1256998 C/T 1 7 5 12 3.43281887303216 2.54798651926274 0.884832353769424 T:C C T 10 0.509597303852548 0.774912283175237 ENSG00000167470:ENST00000300952:exon_1256994_1259139:MIDN;ENSG00000167470:ENST00000395622:exon_1256994_1259078:MIDN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 1278861 C/T 1 100 110 210 49.0402696147452 56.0557034237803 -7.01543380903508 T:C C T 10 0.509597303852548 0.334972947470102 ENSG00000228300:ENST00000409293:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000492647:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000513897:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000518332:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000530634:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000469144:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000485191:exon_1278776_1279221:C19orf24;ENSG00000226593:ENST00000416408:exon_1278776_1279242:AC004258.1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 1388538 C/T 1 13 19 32 6.37523504991688 9.68234877319841 -3.30711372328154 T:C C T 10 0.509597303852548 0.289691482989316 ENSG00000115286:ENST00000313408:exon_1388524_1388937:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000233627:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000450862:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000414651:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000382445:exon_1388524_1388592:NDUFS7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 1854557 A/G 1 4 7 11 1.96161078458981 3.56718112696784 -1.60557034237803 A:G A G 10 0.509597303852548 0.379319216476062 ENSG00000129911:ENST00000250916:exon_1852398_1854759:KLF16 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 1986455 A/G 1 40 24 64 19.6161078458981 12.2303352924612 7.38577255343693 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0793703288948364 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 1997363 A/G 1 6 8 14 2.94241617688471 4.07677843082038 -1.13436225393567 A:G A G 10 0.509597303852548 0.601095068648336 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1997343_1997462:BTBD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 2041032 T/C 1 17 23 40 8.33684583450668 11.7207379886086 -3.38389215410192 T:C T C 10 0.509597303852548 0.343111839960725 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 2078221 G/C 1 17 27 44 8.33684583450668 13.7591272040188 -5.42228136951211 C:G G C 10 0.509597303852548 0.130769326647198 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 2098015 T/C 1 3 11 14 1.47120808844236 5.60557034237803 -4.13436225393567 T:C T C 10 0.509597303852548 0.032165591851746 ENSG00000099840:ENST00000498554:exon_2097928_2098126:IZUMO4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 2110746 G/A 1 21 30 51 10.2984566190965 15.2879191155764 -4.98946249647995 A:G G A 10 0.509597303852548 0.207070401095891 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2110706_2110895:AP3D1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 2223327 G/A 1 12 7 19 5.88483235376942 3.56718112696784 2.31765122680159 A:G G A 10 0.509597303852548 0.360981209646244 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2223280_2223485:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2223280_2223485:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000440640:exon_2223280_2223485:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2223280_2223485:DOT1L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 2226772 G/C 1 24 21 45 11.7696647075388 10.7015433809035 1.06812132663534 C:G G C 10 0.509597303852548 0.767881263708305 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 2252460 G/A 0 21 0 21 10.2984566190965 0 10.2984566190965 G G 10 0.509597303852548 1.02823835487937e-06 ENSG00000167476:ENST00000300961:exon_2252252_2252795:JSRP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 2353150 C/A 1 16 21 37 7.84644313835923 10.7015433809035 -2.85510024254427 A:C C A 10 0.509597303852548 0.411846256659366 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2352944_2353207:AC004410.1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 2433890 A/G 1 15 12 27 7.35604044221178 6.11516764623058 1.2408727959812 A:G A G 10 0.509597303852548 0.702536459516712 ENSG00000176619:ENST00000532465:exon_2433824_2433897:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000325327:exon_2433824_2434103:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000490554:exon_2433824_2434103:LMNB2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 2732986 T/C 1 21 28 49 10.2984566190965 14.2687245078713 -3.97026788877485 T:C T C 10 0.509597303852548 0.317252331732064 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 2733250 C/T 1 19 23 42 9.31765122680159 11.7207379886086 -2.40308676180701 T:C C T 10 0.509597303852548 0.537695416205615 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 2762585 A/C 1 7 13 20 3.43281887303216 6.62476495008312 -3.19194607705096 A:C A C 10 0.509597303852548 0.182296042530127 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2762504_2762642:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2762504_2762642:SGTA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 2767192 G/T 1 4 11 15 1.96161078458981 5.60557034237803 -3.64395955778822 T:G G T 10 0.509597303852548 0.0719657820440228 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2767134_2767218:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2767134_2767218:SGTA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 2917287 C/A 1 6 6 12 2.94241617688471 3.05758382311529 -0.115167646230576 A:C C A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 2933480 C/T 1 7 19 26 3.43281887303216 9.68234877319841 -6.24952990016625 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0174328786803016 ENSG00000175691:ENST00000314531:exon_2933217_2934813:ZNF77 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 3162909 C/T 1 8 3 11 3.92322156917962 1.52879191155764 2.39442965762197 T:C C T 10 0.509597303852548 0.227512016275758 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3162791_3163766:GNA15 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 3207422 T/C 1 40 40 80 19.6161078458981 20.3838921541019 -0.767784308203836 T:C T C 10 0.509597303852548 0.911164444047933 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207389_3207467:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207389_3207467:NCLN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 3207646 A/G 1 41 55 96 20.1065105420455 28.0278517118901 -7.92134116984461 A:G A G 10 0.509597303852548 0.125321455563233 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207627_3209572:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207627_3209572:NCLN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 3534842 G/A 1 15 9 24 7.35604044221178 4.58637573467293 2.76966470753885 A:G G A 10 0.509597303852548 0.30960696984938 ENSG00000105325:ENST00000441788:exon_3534793_3536755:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000395095:exon_3534793_3538325:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000221926:exon_3534793_3538325:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000313639:exon_3534793_3538325:FZR1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 3752874 A/G 1 7 7 14 3.43281887303216 3.56718112696784 -0.134362253935672 A:T:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000011132:ENST00000439726:exon_3752818_3753060:APBA3;ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3752818_3752988:APBA3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 3767265 C/T 1 129 126 255 63.2619478030213 64.209260285421 -0.947312482399731 T:C C T 10 0.509597303852548 0.950075006376259 ENSG00000183617:ENST00000330133:exon_3767259_3767562:MRPL54 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 4102449 G/A 1 30 28 58 14.7120808844236 14.2687245078713 0.443356376552217 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000126934:ENST00000262948:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000394867:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000481271:exon_4102374_4103202:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000443189:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000465472:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000472395:exon_4102374_4102502:MAP2K2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 4236996 G/A 1 180 135 315 88.2724853065414 68.795636020094 19.4768492864474 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0320738083526524 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 4237067 A/G 1 165 134 299 80.9164448643296 68.2860387162414 12.6304061480881 A:G A G 10 0.509597303852548 0.148415641984178 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 4251069 T/C 1 10 15 25 4.90402696147452 7.64395955778822 -2.7399325963137 T:C T C 10 0.509597303852548 0.319768319837023 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4251024_4251168:CCDC94 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 4254375 C/T 1 11 18 29 5.39442965762197 9.17275146934586 -3.77832181172389 T:C C T 10 0.509597303852548 0.194173323063005 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4254352_4254486:CCDC94 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 4325433 G/A 1 14 9 23 6.86563774606433 4.58637573467293 2.2792620113914 A:G G A 10 0.509597303852548 0.406879858723006 ENSG00000178078:ENST00000424810:exon_4325393_4325542:STAP2;ENSG00000178078:ENST00000314714:exon_4325393_4325542:STAP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 4352959 A/G 1 3 11 14 1.47120808844236 5.60557034237803 -4.13436225393567 A:G A G 10 0.509597303852548 0.032165591851746 ENSG00000008382:ENST00000359935:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262966:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262967:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000429880:exon_4352894_4353026:MPND HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 4357555 A/G 1 10 20 30 4.90402696147452 10.191946077051 -5.28791911557644 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0668760308425303 ENSG00000008382:ENST00000359935:exon_4357512_4357582:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262966:exon_4357512_4357582:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262967:exon_4357512_4357582:MPND;ENSG00000008382:ENST00000429880:exon_4357512_4357582:MPND HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 4362691 G/C 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 C:G G C 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000141985:ENST00000417295:exon_4362609_4362733:SH3GL1;ENSG00000141985:ENST00000269886:exon_4362609_4362733:SH3GL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 4454000 G/A 1 6 5 11 2.94241617688471 2.54798651926274 0.394429657621972 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4453927_4454090:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4453927_4454090:UBXN6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 4818378 T/C 1 7 9 16 3.43281887303216 4.58637573467293 -1.15355686164077 T:C T C 10 0.509597303852548 0.623338489505478 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 4847868 G/A 1 9 5 14 4.41362426532707 2.54798651926274 1.86563774606433 A:G G A 10 0.509597303852548 0.425164682757114 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4847703_4847902:PLIN3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 4852137 C/T 1 6 10 16 2.94241617688471 5.09597303852548 -2.15355686164077 T:C C T 10 0.509597303852548 0.324290953365588 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4852028_4852313:PLIN3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 4929473 A/G 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 A:G A G 10 0.509597303852548 0.5085374516326 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4929234_4929488:UHRF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 4950770 C/T 1 5 9 14 2.45201348073726 4.58637573467293 -2.13436225393567 T:C C T 10 0.509597303852548 0.293559675506127 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4950623_4950785:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4950623_4950785:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4950623_4950785:UHRF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 5211612 A/G 1 1 7 8 0.490402696147452 3.56718112696784 -3.07677843082038 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0357022765843499 ENSG00000105426:ENST00000355005:exon_5211601_5211779:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000262963:exon_5211601_5211779:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000348075:exon_5211601_5211779:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000355322:exon_5211601_5211779:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000356037:exon_5211601_5211779:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000357368:exon_5211601_5211779:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000353284:exon_5211601_5211779:PTPRS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 5273571 T/G 1 4 8 12 1.96161078458981 4.07677843082038 -2.11516764623058 T:G T G 10 0.509597303852548 0.258556419599671 ENSG00000105426:ENST00000355005:exon_5273453_5273594:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000262963:exon_5273453_5273594:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000348075:exon_5273453_5273594:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000355322:exon_5273453_5273594:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000356037:exon_5273453_5273594:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000357368:exon_5273453_5273594:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000353284:exon_5273453_5273594:PTPRS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 5711930 C/T 1 19 12 31 9.31765122680159 6.11516764623058 3.20248358057101 T:C C T 10 0.509597303852548 0.283797204409808 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5711782_5712013:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5711782_5712013:LONP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 5783634 T/C 1 6 6 12 2.94241617688471 3.05758382311529 -0.115167646230576 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000212123:ENST00000390672:exon_5782971_5784610:PRR22;ENSG00000212123:ENST00000419421:exon_5782971_5784064:PRR22 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 5786815 G/A 1 20 11 31 9.80805392294904 5.60557034237803 4.20248358057101 A:G G A 10 0.509597303852548 0.151935358615599 ENSG00000141994:ENST00000320699:exon_5786760_5786856:DUS3L;ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5786760_5786856:DUS3L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 5789565 T/C 1 6 2 8 2.94241617688471 1.0191946077051 1.92322156917962 T:C T C 10 0.509597303852548 0.289787629707581 ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5789218_5789730:DUS3L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 5914605 A/G 1 6 6 12 2.94241617688471 3.05758382311529 -0.115167646230576 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000105519:ENST00000394521:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000222125:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000452990:exon_5914574_5914751:CAPS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 5914625 G/A 1 9 6 15 4.41362426532707 3.05758382311529 1.35604044221178 A:G G A 10 0.509597303852548 0.608250593906015 ENSG00000105519:ENST00000394521:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000222125:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000452990:exon_5914574_5914751:CAPS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 5917616 G/A 1 16 20 36 7.84644313835923 10.191946077051 -2.34550293869173 A:G G A 10 0.509597303852548 0.505991398330782 ENSG00000031823:ENST00000034275:exon_5916154_5917664:RANBP3;ENSG00000031823:ENST00000340578:exon_5916154_5917664:RANBP3;ENSG00000031823:ENST00000439268:exon_5916154_5917664:RANBP3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 6535080 T/C 1 23 35 58 11.2792620113914 17.8359056348392 -6.55664362344778 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0890543108198446 ENSG00000125657:ENST00000245817:exon_6534611_6535939:TNFSF9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 7166388 G/A 0 0 12 12 0 6.11516764623058 -6.11516764623058 A G A 10 0.509597303852548 0.000193479158702583 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7166165_7166415:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7166165_7166415:INSR HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 7532252 G/C 1 7 4 11 3.43281887303216 2.03838921541019 1.39442965762197 C:G G C 10 0.509597303852548 0.549658645750086 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7532100_7532570:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7532100_7532570:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7532100_7532570:ARHGEF18 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 7712193 G/A 1 29 13 42 14.2216781882761 6.62476495008312 7.59691323819298 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0204533602390234 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 7712277 A/G 1 64 37 101 31.3857725534369 18.8551002425443 12.5306723108927 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0128331431886877 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7712240_7712397:STXBP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 7712585 T/G 1 16 14 30 7.84644313835923 7.13436225393567 0.71208088442356 T:G T G 10 0.509597303852548 0.856331878111825 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 7747445 G/A 1 393 478 871 192.728259585949 243.587511241518 -50.8592516555693 A:C:G G A 10 0.509597303852548 0.000612117585371556 ENSG00000181029:ENST00000452406:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000317378:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000426877:exon_7747128_7747748:TRAPPC5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 7755056 G/A 1 260 297 557 127.504700998338 151.350399244207 -23.8456982458692 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0463129466737005 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7755045_7755151:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7755045_7755151:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7755045_7755151:FCER2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 7755285 A/G 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 A:G A G 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 7761812 A/G 1 21 35 56 10.2984566190965 17.8359056348392 -7.53744901574269 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0456881148248195 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 8028544 A/G 1 44 68 112 21.5777186304879 34.6526166619733 -13.0748980314854 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0139648105136729 ENSG00000066044:ENST00000351593:exon_8023458_8028691:ELAVL1;ENSG00000066044:ENST00000407627:exon_8023458_8028691:ELAVL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 8468337 C/T 1 47 54 101 23.0489267189302 27.5182544080376 -4.46932768910735 T:C C T 10 0.509597303852548 0.426078910881669 ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 9721383 G/A 1 8 16 24 3.92322156917962 8.15355686164077 -4.23033529246115 A:G G A 10 0.509597303852548 0.102508753648658 ENSG00000171469:ENST00000354661:exon_9718003_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000302851:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000424629:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000326044:exon_9720432_9722012:ZNF561 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 10218408 G/A 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 A:G G A 10 0.509597303852548 0.335037018547339 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 10220714 C/T 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 T:C C T 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000130810:ENST00000468881:exon_10220638_10220922:PPAN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 10224548 G/A 1 27 32 59 13.2408727959812 16.3071137232815 -3.06624092730033 A:G G A 10 0.509597303852548 0.437709396331254 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 10224580 T/C 1 31 28 59 15.202483580571 14.2687245078713 0.933759072699669 T:C T C 10 0.509597303852548 0.896564176067468 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 10265593 G/T 1 10 9 19 4.90402696147452 4.58637573467293 0.317651226801589 T:G G T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000130816:ENST00000340748:exon_10265581_10265732:DNMT1;ENSG00000130816:ENST00000359526:exon_10265581_10265732:DNMT1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 10394792 G/A 1 13 21 34 6.37523504991688 10.7015433809035 -4.32630833098663 A:G G A 10 0.509597303852548 0.169813328863776 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10394709_10394996:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10394709_10394996:ICAM1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 10395683 A/G 1 32 27 59 15.6928862767185 13.7591272040188 1.93375907269967 A:G A G 10 0.509597303852548 0.696474509801775 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000423829:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000444336:exon_10395605_10395685:ICAM1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 10426628 T/C 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426528_10426685:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426528_10426691:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426528_10426672:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426528_10426682:FDX1L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 10449392 A/G 1 56 48 104 27.4625509842573 24.4606705849223 3.00188039933501 A:G A G 10 0.509597303852548 0.624079504029413 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10449358_10449624:ICAM3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 10463118 G/C 1 122 122 244 59.8291289299891 62.1708710700109 -2.34174214002171 C:G G C 10 0.509597303852548 0.797956676209785 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10463110_10463227:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525976:exon_10463110_10463168:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10463110_10463227:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10463110_10463227:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000527481:exon_10463110_10463227:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10463110_10463227:TYK2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 10464687 A/G 1 17 25 42 8.33684583450668 12.7399325963137 -4.40308676180702 A:G A G 10 0.509597303852548 0.216686654277843 ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10464204_10464754:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10464587_10464910:TYK2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 10475652 C/A 1 10 6 16 4.90402696147452 3.05758382311529 1.84644313835923 A:C C A 10 0.509597303852548 0.45584747299355 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10475527_10475724:TYK2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 10577843 C/A 1 5 8 13 2.45201348073726 4.07677843082038 -1.62476495008312 A:C C A 10 0.509597303852548 0.415960200620574 ENSG00000065989:ENST00000380702:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000352831:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000293683:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000440014:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000419866:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000344979:exon_10577563_10580305:PDE4A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 10600442 G/C 1 19 11 30 9.31765122680159 5.60557034237803 3.71208088442356 C:G G C 10 0.509597303852548 0.202978653761744 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10600324_10600529:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10600324_10600529:KEAP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 10668383 T/C 1 3 12 15 1.47120808844236 6.11516764623058 -4.64395955778822 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0191890404390731 ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668228_10668571:KRI1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 10668673 A/G 1 35 11 46 17.1640943651608 5.60557034237803 11.5585240227828 A:G A G 10 0.509597303852548 0.000592498840551203 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10668648_10668736:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668648_10668736:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10668648_10668736:KRI1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 10670184 C/G 1 17 13 30 8.33684583450668 6.62476495008312 1.71208088442356 C:G C G 10 0.509597303852548 0.586755581141905 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10670035_10670205:KRI1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 10672493 C/T 1 11 3 14 5.39442965762197 1.52879191155764 3.86563774606433 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0580035546592849 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000432197:exon_10672467_10672521:KRI1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 11218226 G/A 1 6 6 12 2.94241617688471 3.05758382311529 -0.115167646230576 A:G G A 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 11461486 G/T 1 22 18 40 10.7888593152439 9.17275146934586 1.61610784589808 T:G G T 10 0.509597303852548 0.638327353489123 ENSG00000183401:ENST00000458408:exon_11461484_11461679:CCDC159;ENSG00000183401:ENST00000418014:exon_11461484_11461791:CCDC159;ENSG00000183401:ENST00000427879:exon_11461484_11461679:CCDC159 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 11465316 G/C 1 9 15 24 4.41362426532707 7.64395955778822 -3.23033529246115 C:G G C 10 0.509597303852548 0.222545600682288 ENSG00000183401:ENST00000458408:exon_11465256_11465372:CCDC159;ENSG00000183401:ENST00000427879:exon_11465256_11465374:CCDC159 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 11465533 C/T 1 7 8 15 3.43281887303216 4.07677843082038 -0.64395955778822 T:C C T 10 0.509597303852548 0.800365558868668 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 11558275 G/A 1 78 52 130 38.2514102995013 26.4990598003325 11.7523504991688 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0434099919155087 ENSG00000130175:ENST00000412601:exon_11558254_11558433:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000252455:exon_11558254_11558412:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000436195:exon_11558254_11558433:PRKCSH HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 11942362 A/G 0 8 0 8 3.92322156917962 0 3.92322156917962 A A 10 0.509597303852548 0.00789316895639457 ENSG00000171295:ENST00000304060:exon_11942183_11946016:ZNF440;ENSG00000171295:ENST00000457526:exon_11942183_11942516:ZNF440;ENSG00000171295:ENST00000427505:exon_11942183_11942798:ZNF440;ENSG00000171295:ENST00000414255:exon_11942183_11942493:ZNF440 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 11942615 A/C 1 7 2 9 3.43281887303216 1.0191946077051 2.41362426532707 A:C A C 10 0.509597303852548 0.180412718745071 ENSG00000171295:ENST00000304060:exon_11942183_11946016:ZNF440;ENSG00000171295:ENST00000427505:exon_11942183_11942798:ZNF440 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 13008607 G/T 1 12 17 29 5.88483235376942 8.66315416549332 -2.77832181172389 T:G G T 10 0.509597303852548 0.354840351239223 ENSG00000105607:ENST00000457854:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000222214:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000421816:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000422947:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000426001:exon_13008517_13008677:GCDH HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 13010520 A/G 1 28 22 50 13.7312754921287 11.2111406847561 2.5201348073726 A:G A G 10 0.509597303852548 0.483938592631476 ENSG00000105607:ENST00000457854:exon_13010514_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000222214:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000421816:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000422947:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000426001:exon_13010282_13010782:GCDH HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 13035006 G/A 1 61 37 98 29.9145644649946 18.8551002425443 11.0594642224503 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0263074702261532 ENSG00000179115:ENST00000314606:exon_13034965_13035079:FARSA;ENSG00000179115:ENST00000423140:exon_13034965_13035079:FARSA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 13220676 G/A 1 5 6 11 2.45201348073726 3.05758382311529 -0.605570342378028 A:G G A 10 0.509597303852548 0.770507260060939 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 13883099 A/G 1 12 18 30 5.88483235376942 9.17275146934586 -3.28791911557644 A:G A G 10 0.509597303852548 0.274372180357671 ENSG00000037757:ENST00000040663:exon_13882935_13885096:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000319545:exon_13882935_13883361:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000445479:exon_13882935_13883361:MRI1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 13885309 C/T 1 75 80 155 36.7802022110589 40.7677843082038 -3.98758209714494 T:C C T 10 0.509597303852548 0.574015241623187 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885257_13885388:C19orf53 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 13885484 A/G 1 349 327 676 171.150540955461 166.638318359783 4.51222259567757 A:G A G 10 0.509597303852548 0.729397358819786 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885466_13885521:C19orf53 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 14038791 C/T 1 9 12 21 4.41362426532707 6.11516764623058 -1.70154338090351 T:C C T 10 0.509597303852548 0.516968964003046 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14038706_14038843:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14038706_14038843:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000254346:exon_14038706_14038843:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14038706_14038843:CC2D1A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 14065341 T/C 1 2 7 9 0.980805392294904 3.56718112696784 -2.58637573467293 T:C T C 10 0.509597303852548 0.103145007117103 ENSG00000132017:ENST00000254337:exon_14065338_14065473:DCAF15 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 14143151 G/C 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 C:G G C 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 14153248 G/A 1 5 5 10 2.45201348073726 2.54798651926274 -0.0959730385254796 A:G G A 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 14231256 T/C 1 9 15 24 4.41362426532707 7.64395955778822 -3.23033529246115 T:C T C 10 0.509597303852548 0.222545600682288 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 14508964 T/C 1 6 7 13 2.94241617688471 3.56718112696784 -0.624764950083124 T:C T C 10 0.509597303852548 0.786978111840725 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 14578354 C/G 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 C:G C G 10 0.509597303852548 0.335037018547339 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 14590236 C/T 1 8 1 9 3.92322156917962 0.509597303852548 3.41362426532707 T:C C T 10 0.509597303852548 0.039373498903222 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14590224_14590336:GIPC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 14629138 C/T 1 9 4 13 4.41362426532707 2.03838921541019 2.37523504991688 T:C C T 10 0.509597303852548 0.268002712932727 ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14628951_14629201:DNAJB1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 14705499 G/A 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 A:G G A 10 0.509597303852548 0.335037018547339 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 14705509 T/C 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:C T C 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 14705574 T/C 1 7 7 14 3.43281887303216 3.56718112696784 -0.134362253935672 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000187912:ENST00000397439:exon_14705571_14705612:CLEC17A;ENSG00000187912:ENST00000417570:exon_14705571_14705612:CLEC17A;ENSG00000187912:ENST00000339847:exon_14705571_14705612:CLEC17A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 15226970 G/A 1 28 21 49 13.7312754921287 10.7015433809035 3.02973211122515 A:G G A 10 0.509597303852548 0.395882530200224 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 15350594 G/A 1 22 11 33 10.7888593152439 5.60557034237803 5.18328897286592 A:G G A 10 0.509597303852548 0.081969871276383 ENSG00000141867:ENST00000263377:exon_15350470_15350632:BRD4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 16238279 C/T 1 13 14 27 6.37523504991688 7.13436225393567 -0.759127204018796 T:C C T 10 0.509597303852548 0.848413381775282 ENSG00000167461:ENST00000300935:exon_16238247_16238336:RAB8A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 16612011 T/C 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 T:C T C 10 0.509597303852548 0.335037018547339 ENSG00000105072:ENST00000221671:exon_16611603_16612362:C19orf44 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 16631322 T/C 1 2 8 10 0.980805392294904 4.07677843082038 -3.09597303852548 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0608033640885815 ENSG00000105072:ENST00000221671:exon_16630905_16632163:C19orf44 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 16664679 G/A 1 8 7 15 3.92322156917962 3.56718112696784 0.35604044221178 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000141979:ENST00000409035:exon_16664581_16664720:CALR3;ENSG00000127526:ENST00000436494:exon_16660650_16664720:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000409648:exon_16661661_16664720:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000248069:exon_16662584_16664720:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000421082:exon_16664628_16664720:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000469055:exon_16664660_16664720:SLC35E1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 16677289 C/A 1 7 5 12 3.43281887303216 2.54798651926274 0.884832353769424 A:T:C C A 10 0.509597303852548 0.774912283175237 ENSG00000127526:ENST00000488894:exon_16676039_16677468:SLC35E1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 16797240 A/G 0 0 9 9 0 4.58637573467293 -4.58637573467293 G A G 10 0.509597303852548 0.00164049776378534 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 17170885 C/T 1 6 7 13 2.94241617688471 3.56718112696784 -0.624764950083124 T:C C T 10 0.509597303852548 0.786978111840725 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17170807_17170899:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17170807_17170902:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000335009:exon_17170807_17170902:HAUS8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 17301880 T/C 1 7 6 13 3.43281887303216 3.05758382311529 0.375235049916876 T:C T C 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 17305440 T/C 1 12 13 25 5.88483235376942 6.62476495008312 -0.7399325963137 T:C T C 10 0.509597303852548 0.84274112322754 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 17306031 T/C 1 31 20 51 15.202483580571 10.191946077051 5.01053750352005 T:C T C 10 0.509597303852548 0.164706485778680 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 17312992 C/T 1 7 19 26 3.43281887303216 9.68234877319841 -6.24952990016625 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0174328786803016 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17312939_17313112:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17312939_17313112:MYO9B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 17316782 T/C 1 11 21 32 5.39442965762197 10.7015433809035 -5.30711372328153 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0760908430506436 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17316769_17316961:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17316769_17316961:MYO9B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 17317955 A/G 1 14 17 31 6.86563774606433 8.66315416549332 -1.79751641942899 A:G A G 10 0.509597303852548 0.591582382658235 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17317922_17318053:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17317922_17318053:MYO9B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 17321487 A/G 1 9 9 18 4.41362426532707 4.58637573467293 -0.172751469345863 A:G A G 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 17337871 A/G 1 7 6 13 3.43281887303216 3.05758382311529 0.375235049916876 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 17337882 C/G 1 7 7 14 3.43281887303216 3.56718112696784 -0.134362253935672 C:G C G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 17339112 G/A 1 14 16 30 6.86563774606433 8.15355686164077 -1.28791911557644 A:G G A 10 0.509597303852548 0.71637122408149 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17339065_17339118:OCEL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 17389648 C/T 1 12 18 30 5.88483235376942 9.17275146934586 -3.28791911557644 T:C C T 10 0.509597303852548 0.274372180357671 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 17389704 G/A 1 65 62 127 31.8761752495844 31.595032838858 0.281142410726407 A:C:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000105393:ENST00000447614:exon_17389654_17390162:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000359435:exon_17389654_17390162:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000300965:exon_17389654_17390144:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000442848:exon_17389654_17390144:C19orf62 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 17397244 C/T 1 2 7 9 0.980805392294904 3.56718112696784 -2.58637573467293 T:C C T 10 0.509597303852548 0.103145007117103 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17397189_17397361:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000433424:exon_17397189_17398454:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17397189_17398454:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17397189_17398454:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17397189_17398454:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17397189_17398455:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17397189_17398455:ANKLE1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 17651370 A/G 0 8 0 8 3.92322156917962 0 3.92322156917962 A A 10 0.509597303852548 0.00789316895639457 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000300971:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000435646:exon_17651201_17651391:FAM129C HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 17660300 G/A 1 7 3 10 3.43281887303216 1.52879191155764 1.90402696147452 A:G G A 10 0.509597303852548 0.344656245175514 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17660253_17660494:FAM129C HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 17972889 C/T 1 16 10 26 7.84644313835923 5.09597303852548 2.75047009983375 T:C C T 10 0.509597303852548 0.329269094926831 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 17973573 G/A 1 13 5 18 6.37523504991688 2.54798651926274 3.82724853065414 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0973482612827023 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 18284651 G/T 1 78 78 156 38.2514102995013 39.7485897004987 -1.49717940099748 T:G G T 10 0.509597303852548 0.810819312539987 ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18284579_18284783:IFI30 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 18288069 A/G 1 452 408 860 221.662018658648 207.91569997184 13.7463186868087 A:G A G 10 0.509597303852548 0.357205479938472 ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18287950_18288102:IFI30 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 18679379 C/G 1 29 29 58 14.2216781882761 14.7783218117239 -0.556643623447783 C:G C G 10 0.509597303852548 0.89632737016623 ENSG00000105700:ENST00000222307:exon_18679212_18680176:C19orf50 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 18684563 C/T 1 31 2 33 15.202483580571 1.0191946077051 14.1832889728659 T:C C T 10 0.509597303852548 1.50927409322576e-07 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 18685964 G/T 1 2665 2624 5289 1306.92318523296 1337.18332530909 -30.2601400761262 T:C:G G T 10 0.509597303852548 0.409285861937434 ENSG00000221983:ENST00000430157:exon_18685867_18688269:UBA52;ENSG00000221983:ENST00000442744:exon_18685867_18688269:UBA52 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 19023853 T/C 1 59 59 118 28.9337590726997 30.0662409273003 -1.13248185460066 T:C T C 10 0.509597303852548 0.854307958684894 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000351079:exon_19023793_19023855:COPE HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 19136541 C/T 1 8 12 20 3.92322156917962 6.11516764623058 -2.19194607705096 T:C C T 10 0.509597303852548 0.375790350036073 ENSG00000064607:ENST00000337018:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000330854:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000452918:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000392342:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000424153:exon_19135428_19137035:SUGP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 19230868 A/G 1 23 16 39 11.2792620113914 8.15355686164077 3.12570514975063 A:G A G 10 0.509597303852548 0.340263204985614 ENSG00000064545:ENST00000450333:exon_19230429_19230992:TMEM161A;ENSG00000064545:ENST00000162044:exon_19230429_19230992:TMEM161A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 19387855 G/A 1 12 19 31 5.88483235376942 9.68234877319841 -3.79751641942899 A:G G A 10 0.509597303852548 0.209059512080527 ENSG00000105705:ENST00000247001:exon_19387756_19387885:SUGP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 19606634 G/A 1 13 15 28 6.37523504991688 7.64395955778822 -1.26872450787134 A:G G A 10 0.509597303852548 0.707126514476892 ENSG00000167491:ENST00000360315:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000252577:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000429563:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000404158:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000358713:exon_19606563_19606694:GATAD2A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 21132279 G/A 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 A:G G A 10 0.509597303852548 0.5085374516326 ENSG00000105750:ENST00000328178:exon_21131550_21133501:ZNF85;ENSG00000105750:ENST00000345030:exon_21131550_21133108:ZNF85 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 23837145 A/G 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 A:G A G 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000197372:ENST00000359788:exon_23835708_23837508:ZNF675 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 30165639 C/T 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 T:C C T 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000166289:ENST00000299373:exon_30164731_30166364:PLEKHF1;ENSG00000166289:ENST00000436066:exon_30164731_30166364:PLEKHF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 30193721 G/A 1 7 4 11 3.43281887303216 2.03838921541019 1.39442965762197 A:G G A 10 0.509597303852548 0.549658645750086 ENSG00000131943:ENST00000323670:exon_30190483_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392276:exon_30192070_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392275:exon_30193248_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392278:exon_30193310_30193884:C19orf12 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 33370084 T/A 1 3 10 13 1.47120808844236 5.09597303852548 -3.62476495008312 A:T T A 10 0.509597303852548 0.0532191285007243 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33369908_33370284:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33369908_33370284:CCDC123 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 33370161 A/C 1 9 11 20 4.41362426532707 5.60557034237803 -1.19194607705096 A:C A C 10 0.509597303852548 0.658614646611609 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33369908_33370284:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33369908_33370284:CCDC123 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 33467357 G/A 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 A:G G A 10 0.509597303852548 0.5085374516326 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 33467576 G/A 1 10 6 16 4.90402696147452 3.05758382311529 1.84644313835923 A:G G A 10 0.509597303852548 0.45584747299355 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 34872382 G/A 1 60 98 158 29.4241617688471 49.9405357775497 -20.5163740087026 A:G G A 10 0.509597303852548 0.00138139903168736 ENSG00000105220:ENST00000415930:exon_34872371_34872424:GPI;ENSG00000105220:ENST00000356487:exon_34872371_34872424:GPI;ENSG00000105220:ENST00000414931:exon_34872371_34872424:GPI HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 34959979 A/G 1 80 56 136 39.2322156917962 28.5374490157427 10.6947666760535 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0716891668556453 ENSG00000126261:ENST00000246548:exon_34959945_34960795:UBA2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 35175749 C/G 1 6 6 12 2.94241617688471 3.05758382311529 -0.115167646230576 C:G C G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000089335:ENST00000457781:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000527499:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505242:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000525595:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000423823:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000221282:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000446502:exon_35175157_35177237:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505365:exon_35175098_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000509196:exon_35175157_35177296:ZNF302 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 35648365 T/G 1 46 56 102 22.5585240227828 28.5374490157427 -5.97892499295989 T:G T G 10 0.509597303852548 0.275926725755244 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35648324_35648404:FXYD5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 35649281 A/G 1 73 76 149 35.799396818764 38.7293950927936 -2.92999827402965 A:G A G 10 0.509597303852548 0.682188492333988 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35649247_35649303:FXYD5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 35757250 G/A 1 11 5 16 5.39442965762197 2.54798651926274 2.84644313835923 A:G G A 10 0.509597303852548 0.211463370056425 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 35769561 T/G 1 7 2 9 3.43281887303216 1.0191946077051 2.41362426532707 T:G T G 10 0.509597303852548 0.180412718745071 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 35770064 C/T 1 8 5 13 3.92322156917962 2.54798651926274 1.37523504991688 T:C C T 10 0.509597303852548 0.581979954468297 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 35770174 A/G 1 81 56 137 39.7226183879436 28.5374490157427 11.1851693722009 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0600888664021463 ENSG00000105698:ENST00000222305:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000434131:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000343550:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000379134:exon_35770070_35770718:USF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 36727365 G/A 1 16 11 27 7.84644313835923 5.60557034237803 2.2408727959812 A:G G A 10 0.509597303852548 0.444354653770125 ENSG00000167635:ENST00000428827:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000456324:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000443387:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000301233:exon_36726561_36729673:ZNF146 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 37004938 T/C 1 7 2 9 3.43281887303216 1.0191946077051 2.41362426532707 T:C T C 10 0.509597303852548 0.180412718745071 ENSG00000254004:ENST00000523638:exon_37001597_37006601:ZNF260 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 37038092 T/C 1 10 8 18 4.90402696147452 4.07677843082038 0.827248530654137 T:C T C 10 0.509597303852548 0.815143514661865 ENSG00000186020:ENST00000396897:exon_37034518_37039224:ZNF529;ENSG00000186020:ENST00000334116:exon_37034518_37039224:ZNF529 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 37118439 C/T 1 7 3 10 3.43281887303216 1.52879191155764 1.90402696147452 T:C C T 10 0.509597303852548 0.344656245175514 ENSG00000161298:ENST00000423582:exon_37117032_37118894:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000292928:exon_37117032_37119499:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000441040:exon_37117035_37118452:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000439428:exon_37117032_37119469:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000435416:exon_37117035_37119172:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000455093:exon_37117032_37119498:ZNF382 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 37129665 C/T 1 12 7 19 5.88483235376942 3.56718112696784 2.31765122680159 T:C C T 10 0.509597303852548 0.360981209646244 ENSG00000197808:ENST00000360357:exon_37128283_37130945:ZNF461;ENSG00000197808:ENST00000396893:exon_37128283_37130945:ZNF461;ENSG00000197808:ENST00000396892:exon_37129591_37129890:ZNF461 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 37210805 C/T 1 4 8 12 1.96161078458981 4.07677843082038 -2.11516764623058 T:C C T 10 0.509597303852548 0.258556419599671 ENSG00000189042:ENST00000360729:exon_37209850_37212223:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000392163:exon_37209850_37211363:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000423498:exon_37209850_37212223:ZNF567 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 37854235 G/T 1 27 20 47 13.2408727959812 10.191946077051 3.04892671893024 T:G G T 10 0.509597303852548 0.385820933338602 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 38652993 C/T 1 9 13 22 4.41362426532707 6.62476495008312 -2.21114068475606 T:C C T 10 0.509597303852548 0.397626927679795 ENSG00000105738:ENST00000222345:exon_38652893_38653011:SIPA1L3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 39002725 A/G 0 0 8 8 0 4.07677843082038 -4.07677843082038 G A G 10 0.509597303852548 0.00334520543356084 ENSG00000196218:ENST00000360985:exon_39002712_39002772:RYR1;ENSG00000196218:ENST00000355481:exon_39002712_39002772:RYR1;ENSG00000196218:ENST00000359596:exon_39002712_39002772:RYR1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 39196736 G/A 1 19 3 22 9.31765122680159 1.52879191155764 7.78885931524395 A:G G A 10 0.509597303852548 0.000894193714959592 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000445727:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000495553:exon_39196684_39196771:ACTN4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 39196745 C/T 1 6 21 27 2.94241617688471 10.7015433809035 -7.7591272040188 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00323758495067262 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000445727:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000495553:exon_39196684_39196771:ACTN4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 39219780 T/C 1 81 101 182 39.7226183879436 51.4693276891073 -11.7467093011637 T:C T C 10 0.509597303852548 0.08810530701702 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000424234:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000440400:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000497637:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000477174:exon_39219636_39219794:ACTN4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 39308190 C/T 1 137 135 272 67.1851693722009 68.795636020094 -1.61046664789305 T:C C T 10 0.509597303852548 0.85582720204488 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39308091_39308215:ECH1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 39322087 T/G 1 56 54 110 27.4625509842573 27.5182544080376 -0.0557034237802796 T:G T G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39321949_39322156:ECH1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 39329517 C/T 1 17 6 23 8.33684583450668 3.05758382311529 5.2792620113914 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0354442183704842 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 39408688 C/G 1 6 4 10 2.94241617688471 2.03838921541019 0.90402696147452 C:G C G 10 0.509597303852548 0.75435926131823 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 39913634 G/A 1 8 6 14 3.92322156917962 3.05758382311529 0.865637746064328 A:G G A 10 0.509597303852548 0.79106698341654 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39913372_39914293:PLEKHG2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 39914748 G/A 1 32 12 44 15.6928862767185 6.11516764623058 9.57771863048789 A:G G A 10 0.509597303852548 0.00392825182152441 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 39915637 G/A 1 29 25 54 14.2216781882761 12.7399325963137 1.48174559196241 A:G G A 10 0.509597303852548 0.785769218507803 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 39915758 C/G 1 36 39 75 17.6544970613083 19.8742948502494 -2.2197977889411 C:G C G 10 0.509597303852548 0.64504647447975 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 39924129 T/C 1 41 35 76 20.1065105420455 17.8359056348392 2.27060490720635 T:C T C 10 0.509597303852548 0.647074867145141 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 39926509 A/C 1 2078 1730 3808 1019.05680259441 881.603335664908 137.453466929497 A:T:C A C 10 0.509597303852548 8.25363473069263e-06 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 39926521 G/A 1 2033 1678 3711 996.98868126777 855.104275864575 141.884405403194 A:C:G G A 10 0.509597303852548 3.34207682974404e-06 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 41096189 A/G 1 15 46 61 7.35604044221178 23.4414759772172 -16.0854355350054 A:G A G 10 0.509597303852548 3.12360546579789e-05 ENSG00000160410:ENST00000291842:exon_41096150_41096328:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000428635:exon_41096150_41096328:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000446701:exon_41096150_41096328:SHKBP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 41119829 C/T 1 2 6 8 0.980805392294904 3.05758382311529 -2.07677843082038 T:C C T 10 0.509597303852548 0.171857042968518 ENSG00000090006:ENST00000204005:exon_41119822_41119944:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000308370:exon_41119822_41119944:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000396819:exon_41119822_41119944:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41119770_41119944:LTBP4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 41128309 C/T 1 2 7 9 0.980805392294904 3.56718112696784 -2.58637573467293 T:C C T 10 0.509597303852548 0.103145007117103 ENSG00000090006:ENST00000204005:exon_41128306_41128572:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000308370:exon_41128306_41128572:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000396819:exon_41128306_41128572:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41128306_41128572:LTBP4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 42373298 G/A 1 2 6 8 0.980805392294904 3.05758382311529 -2.07677843082038 A:G G A 10 0.509597303852548 0.171857042968518 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 42392310 C/T 1 8 2 10 3.92322156917962 1.0191946077051 2.90402696147452 T:C C T 10 0.509597303852548 0.110022635989167 ENSG00000076928:ENST00000391981:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000347545:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000354532:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000316079:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000337665:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000378152:exon_42392263_42392349:ARHGEF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 42463447 C/T 1 20 25 45 9.80805392294904 12.7399325963137 -2.93187867336466 T:C C T 10 0.509597303852548 0.456441561990723 ENSG00000105404:ENST00000222008:exon_42463389_42463528:RABAC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 42703833 A/G 1 7 6 13 3.43281887303216 3.05758382311529 0.375235049916876 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000160570:ENST00000403271:exon_42702752_42703981:DEDD2;ENSG00000160570:ENST00000336034:exon_42702752_42703981:DEDD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 42728836 T/C 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 T:C T C 10 0.509597303852548 0.541646560898822 ENSG00000167625:ENST00000301215:exon_42728539_42732353:ZNF526 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 42753283 G/A 1 12 10 22 5.88483235376942 5.09597303852548 0.788859315243944 A:G G A 10 0.509597303852548 0.832492277049863 ENSG00000105722:ENST00000222329:exon_42751717_42753890:ERF HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 43979589 G/T 1 12 4 16 5.88483235376942 2.03838921541019 3.84644313835923 T:G G T 10 0.509597303852548 0.0776723690771564 ENSG00000176531:ENST00000292140:exon_43979255_43979696:PHLDB3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 43982213 G/A 1 6 6 12 2.94241617688471 3.05758382311529 -0.115167646230576 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000176531:ENST00000292140:exon_43982199_43982284:PHLDB3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 44057227 T/C 1 23 5 28 11.2792620113914 2.54798651926274 8.73127549212866 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0009653171385893 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44057134_44057243:XRCC1;ENSG00000073050:ENST00000458471:exon_44057134_44057243:XRCC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 44417575 A/G 1 14 5 19 6.86563774606433 2.54798651926274 4.31765122680159 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0644836423988429 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 44418077 C/T 1 5 7 12 2.45201348073726 3.56718112696784 -1.11516764623058 T:C C T 10 0.509597303852548 0.574428486272357 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44417970_44418263:ZNF45 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 44418343 C/T 1 12 7 19 5.88483235376942 3.56718112696784 2.31765122680159 T:C C T 10 0.509597303852548 0.360981209646244 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 44418544 A/G 1 5 9 14 2.45201348073726 4.58637573467293 -2.13436225393567 A:G A G 10 0.509597303852548 0.293559675506127 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 44418680 G/C 1 11 8 19 5.39442965762197 4.07677843082038 1.31765122680159 C:G G C 10 0.509597303852548 0.648772677857544 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 44418693 T/C 1 9 8 17 4.41362426532707 4.07677843082038 0.336845834506684 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 44611420 A/G 1 10 10 20 4.90402696147452 5.09597303852548 -0.191946077050959 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 44611957 T/C 1 8 23 31 3.92322156917962 11.7207379886086 -7.79751641942899 T:C T C 10 0.509597303852548 0.00623969328849814 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 44612005 A/G 1 28 9 37 13.7312754921287 4.58637573467293 9.14489975745573 A:G A G 10 0.509597303852548 0.00273241227668398 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 44612014 A/T 1 26 16 42 12.7504700998338 8.15355686164077 4.59691323819298 A:T A T 10 0.509597303852548 0.167409420746269 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 44612231 A/G 1 25 24 49 12.2600674036863 12.2303352924612 0.0297321112251474 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 44981375 T/C 1 5 7 12 2.45201348073726 3.56718112696784 -1.11516764623058 T:C T C 10 0.509597303852548 0.574428486272357 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 45525489 G/A 1 10 9 19 4.90402696147452 4.58637573467293 0.317651226801589 A:G G A 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 45573276 G/A 1 5 6 11 2.45201348073726 3.05758382311529 -0.605570342378028 A:G G A 10 0.509597303852548 0.770507260060939 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 45912002 A/C 1 33 26 59 16.1832889728659 13.2495299001662 2.93375907269967 A:C A C 10 0.509597303852548 0.515439272674561 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 45912343 A/G 1 30 32 62 14.7120808844236 16.3071137232815 -1.59503283885797 A:G A G 10 0.509597303852548 0.704894639574074 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 45912406 G/A 1 31 17 48 15.202483580571 8.66315416549332 6.5393294150777 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0617043623280964 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 45912736 C/A 1 18 18 36 8.82724853065414 9.17275146934586 -0.345502938691727 A:C C A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 46024584 T/G 1 22 27 49 10.7888593152439 13.7591272040188 -2.97026788877485 T:C:G T G 10 0.509597303852548 0.475366415499282 ENSG00000125753:ENST00000245932:exon_46024580_46024664:VASP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 46026970 T/A 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 A:T T A 10 0.509597303852548 0.541646560898822 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 46129930 G/C 1 10 3 13 4.90402696147452 1.52879191155764 3.37523504991688 C:G G C 10 0.509597303852548 0.0930569697494132 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 46129999 C/A 1 9 12 21 4.41362426532707 6.11516764623058 -1.70154338090351 A:C C A 10 0.509597303852548 0.516968964003046 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46129963_46130097:EML2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 46191722 T/A 1 498 395 893 244.220542681431 201.290935021756 42.9296076596747 A:T T A 10 0.509597303852548 0.00441594061963902 ENSG00000125743:ENST00000342669:exon_46191645_46191824:SNRPD2;ENSG00000125743:ENST00000391932:exon_46191645_46191823:SNRPD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 46269076 G/A 1 7 2 9 3.43281887303216 1.0191946077051 2.41362426532707 A:G G A 10 0.509597303852548 0.180412718745071 ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 46329438 G/A 1 1 7 8 0.490402696147452 3.56718112696784 -3.07677843082038 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0357022765843499 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 46341824 C/T 1 11 12 23 5.39442965762197 6.11516764623058 -0.720737988608604 T:C C T 10 0.509597303852548 0.836390489019417 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46341719_46341873:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46341719_46341873:SYMPK HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 46352122 A/G 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 A:G A G 10 0.509597303852548 0.541646560898822 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46352008_46352134:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46352008_46352134:SYMPK HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 46878989 G/A 1 4 9 13 1.96161078458981 4.58637573467293 -2.62476495008312 A:G G A 10 0.509597303852548 0.172159462736175 ENSG00000011485:ENST00000012443:exon_46878861_46879008:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000451918:exon_46878861_46879008:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000478046:exon_46878861_46879008:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000391919:exon_46878861_46879008:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000467902:exon_46878860_46879008:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000527193:exon_46878884_46879008:PPP5C HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 47278859 C/G 1 147 144 291 72.0891963336754 73.3820117547669 -1.29281542109146 C:G C G 10 0.509597303852548 0.906702321798804 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47278140_47279004:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47278140_47279004:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47278142_47279004:SLC1A5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 47282162 G/A 1 36 34 70 17.6544970613083 17.3263083309866 0.328188730321642 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47281932_47282165:SLC1A5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 47287405 T/C 1 4 10 14 1.96161078458981 5.09597303852548 -3.13436225393567 T:C T C 10 0.509597303852548 0.112312460825055 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 47768128 G/C 1 6 9 15 2.94241617688471 4.58637573467293 -1.64395955778822 C:G G C 10 0.509597303852548 0.446901967950042 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47768030_47768203:CCDC9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 47774772 T/C 1 13 5 18 6.37523504991688 2.54798651926274 3.82724853065414 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0973482612827023 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47774531_47775208:CCDC9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 47883086 T/G 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:G T G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47882967_47883242:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000257252:exon_47882967_47883242:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000466298:exon_47882967_47883242:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000486327:exon_47882967_47883242:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000460681:exon_47882967_47883242:DHX34 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 47980153 G/A 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 A:G G A 10 0.509597303852548 0.541646560898822 ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47980060_47980195:KPTN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 48255804 A/G 1 158 143 301 77.4836259912974 72.8724144509144 4.61121154038305 A:G A G 10 0.509597303852548 0.60432020943778 ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48255769_48255864:GLTSCR2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 48551546 A/T 1 5 20 25 2.45201348073726 10.191946077051 -7.7399325963137 A:T A T 10 0.509597303852548 0.00213922592441092 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48551104_48551645:PLA2G4C HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 48571072 T/G 1 3 7 10 1.47120808844236 3.56718112696784 -2.09597303852548 T:G T G 10 0.509597303852548 0.218348598150516 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48571048_48571143:PLA2G4C HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 48601454 T/C 1 11 4 15 5.39442965762197 2.03838921541019 3.35604044221178 T:C T C 10 0.509597303852548 0.119482056883178 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48601396_48601516:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48601364_48601516:PLA2G4C HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 48621036 C/G 1 23 13 36 11.2792620113914 6.62476495008312 4.65449706130827 C:G C G 10 0.509597303852548 0.135060967788654 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48620895_48621038:LIG1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 48654553 G/T 1 4 12 16 1.96161078458981 6.11516764623058 -4.15355686164077 T:G G T 10 0.509597303852548 0.0453868150142898 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48654489_48654596:LIG1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 48722180 C/T 1 11 7 18 5.39442965762197 3.56718112696784 1.82724853065414 T:C C T 10 0.509597303852548 0.482156564682581 ENSG00000105483:ENST00000518450:exon_48722128_48722210:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000517510:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48722128_48722269:CARD8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 48836673 G/T 1 8 4 12 3.92322156917962 2.03838921541019 1.88483235376942 T:G G T 10 0.509597303852548 0.388763190446408 ENSG00000161558:ENST00000435956:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000377431:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000436660:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000293261:exon_48835613_48836690:TMEM143 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 49303070 G/C 1 21 16 37 10.2984566190965 8.15355686164077 2.14489975745573 C:G G C 10 0.509597303852548 0.514267137921046 ENSG00000105552:ENST00000316273:exon_49302932_49303095:BCAT2;ENSG00000105552:ENST00000402551:exon_49302932_49303095:BCAT2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 49376582 G/A 1 15 23 38 7.35604044221178 11.7207379886086 -4.36469754639682 A:G G A 10 0.509597303852548 0.194038298354076 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 49377086 T/C 1 117 99 216 57.3771154492519 50.4501330814022 6.92698236784964 T:C T C 10 0.509597303852548 0.376387191459592 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 49377242 G/C 1 112 131 243 54.9251019685146 66.7572468046838 -11.8321448361692 A:C:G G C 10 0.509597303852548 0.139947411089852 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 49377319 A/G 1 98 115 213 48.0594642224503 58.603689943043 -10.5442257205927 A:G A G 10 0.509597303852548 0.150719759726280 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 49377436 G/C 1 97 106 203 47.5690615263028 54.0173142083701 -6.44825268206724 C:G G C 10 0.509597303852548 0.399635998600449 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 49378994 A/G 1 77 70 147 37.7610076033538 35.6718112696784 2.08919633367545 A:G A G 10 0.509597303852548 0.74214120854432 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 49379167 C/T 1 90 81 171 44.1362426532707 41.2773816120564 2.8588610412143 T:C C T 10 0.509597303852548 0.702336070687019 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 49379182 G/C 1 86 66 152 42.1746318686809 33.6334220542682 8.54120981441271 C:G G C 10 0.509597303852548 0.168840346053749 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 49459104 A/G 1 11 4 15 5.39442965762197 2.03838921541019 3.35604044221178 A:G A G 10 0.509597303852548 0.119482056883178 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 49469087 T/C 1 587 852 1439 287.866382638554 434.176902882371 -146.310520243817 T:C T C 10 0.509597303852548 1.12874197903452e-14 ENSG00000087086:ENST00000331825:exon_49469027_49469173:FTL HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 49485548 G/A 1 12 4 16 5.88483235376942 2.03838921541019 3.84644313835923 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0776723690771564 ENSG00000104812:ENST00000323798:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000263276:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000484289:exon_49485512_49485632:GYS1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 49949589 A/T 1 9 11 20 4.41362426532707 5.60557034237803 -1.19194607705096 A:T A T 10 0.509597303852548 0.658614646611609 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49949556_49949680:PIH1D1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 49949652 G/A 1 43 29 72 21.0873159343404 14.7783218117239 6.30899412261655 A:G G A 10 0.509597303852548 0.157181521427225 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49949556_49949680:PIH1D1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 49962986 C/G 1 7 3 10 3.43281887303216 1.52879191155764 1.90402696147452 C:G C G 10 0.509597303852548 0.344656245175514 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49962927_49963105:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49962927_49963105:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000433981:exon_49962927_49963105:ALDH16A1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 49967680 G/A 1 7 8 15 3.43281887303216 4.07677843082038 -0.64395955778822 A:G G A 10 0.509597303852548 0.800365558868668 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49967674_49967779:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49967674_49967779:ALDH16A1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 49967981 T/G 1 7 5 12 3.43281887303216 2.54798651926274 0.884832353769424 T:G T G 10 0.509597303852548 0.774912283175237 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49967889_49968019:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49967889_49968019:ALDH16A1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 49969085 C/T 1 10 7 17 4.90402696147452 3.56718112696784 1.33684583450668 T:C C T 10 0.509597303852548 0.630150764673374 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49968995_49969162:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49968995_49969162:ALDH16A1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 50138877 C/T 1 10 9 19 4.90402696147452 4.58637573467293 0.317651226801589 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000126458:ENST00000246792:exon_50138552_50138917:RRAS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 50140092 G/A 1 5 8 13 2.45201348073726 4.07677843082038 -1.62476495008312 A:G G A 10 0.509597303852548 0.415960200620574 ENSG00000126458:ENST00000246792:exon_50140081_50140183:RRAS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 50187111 C/G 1 3 9 12 1.47120808844236 4.58637573467293 -3.11516764623058 C:G C G 10 0.509597303852548 0.0867517050925024 ENSG00000126457:ENST00000529650:exon_50186892_50187326:PRMT1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 50360989 A/G 1 38 44 82 18.6353024536032 22.4222813695121 -3.78697891590893 A:G A G 10 0.509597303852548 0.440088191190969 ENSG00000104960:ENST00000221557:exon_50360950_50361039:PTOV1;ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50360950_50361039:PTOV1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 50412417 G/A 1 30 24 54 14.7120808844236 12.2303352924612 2.48174559196241 A:G G A 10 0.509597303852548 0.586576190491404 ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 50435747 T/C 1 66 54 120 32.3665779457318 27.5182544080376 4.84832353769424 T:C T C 10 0.509597303852548 0.411533422325842 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 50496183 C/T 1 5 6 11 2.45201348073726 3.05758382311529 -0.605570342378028 T:C C T 10 0.509597303852548 0.770507260060939 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50496117_50496209:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50496117_50496209:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50496117_50496209:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50496117_50496209:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000424804:exon_50496117_50496209:VRK3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 50926264 T/C 1 13 6 19 6.37523504991688 3.05758382311529 3.31765122680159 T:C T C 10 0.509597303852548 0.168554935531064 ENSG00000142539:ENST00000270632:exon_50926080_50926294:SPIB;ENSG00000142539:ENST00000417618:exon_50926080_50926294:SPIB HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 50983930 C/T 1 14 13 27 6.86563774606433 6.62476495008312 0.240872795981204 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000161671:ENST00000430752:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376920:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000334976:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376918:exon_50983838_50984019:C19orf63 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 51301395 C/T 1 203 210 413 99.5517473179328 107.015433809035 -7.46368649110231 T:C C T 10 0.509597303852548 0.490857277451299 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 51301456 G/A 1 217 244 461 106.417385063997 124.341742140022 -17.9243570760246 A:T:G G A 10 0.509597303852548 0.102919194460326 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 51323232 T/C 1 53 56 109 25.991342895815 28.5374490157427 -2.54610611992773 T:C T C 10 0.509597303852548 0.633371136557904 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323155_51323291:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323155_51323291:KLK1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 51323473 C/G 1 20 26 46 9.80805392294904 13.2495299001662 -3.44147597721721 C:G C G 10 0.509597303852548 0.376523433232549 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 51323501 A/G 1 22 28 50 10.7888593152439 14.2687245078713 -3.4798651926274 A:G A G 10 0.509597303852548 0.396301180523762 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 53453777 C/T 1 3 8 11 1.47120808844236 4.07677843082038 -2.60557034237803 T:C C T 10 0.509597303852548 0.139008716253398 ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 53571306 T/C 1 2 12 14 0.980805392294904 6.11516764623058 -5.13436225393567 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0064484390483877 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53569867_53573515:ZNF160 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 54080144 A/G 0 9 0 9 4.41362426532707 0 4.41362426532707 A A 10 0.509597303852548 0.00395812771304115 ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000514022:exon_54079951_54080314:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000505949:exon_54079951_54080346:ZNF331 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 54656709 A/T 1 10 8 18 4.90402696147452 4.07677843082038 0.827248530654137 A:T A T 10 0.509597303852548 0.815143514661865 ENSG00000088038:ENST00000221232:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000358389:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000411507:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000445408:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000482247:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000406403:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000447684:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000457463:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000496327:exon_54656604_54656736:CNOT3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 54722209 T/C 1 8 2 10 3.92322156917962 1.0191946077051 2.90402696147452 T:C T C 10 0.509597303852548 0.110022635989167 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 54722250 T/C 1 9 2 11 4.41362426532707 1.0191946077051 3.39442965762197 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0659641183816961 ENSG00000204577:ENST00000391750:exon_54722230_54722282:LILRB3;ENSG00000204577:ENST00000424807:exon_54722230_54722282:LILRB3;ENSG00000204577:ENST00000440558:exon_54722230_54722282:LILRB3;ENSG00000204577:ENST00000414379:exon_54722230_54722282:LILRB3;ENSG00000204577:ENST00000346401:exon_54722230_54722282:LILRB3;ENSG00000204577:ENST00000407860:exon_54722230_54722282:LILRB3;ENSG00000204577:ENST00000270464:exon_54722230_54722282:LILRB3;ENSG00000204577:ENST00000245620:exon_54722230_54722282:LILRB3;ENSG00000204577:ENST00000469273:exon_54722230_54722282:LILRB3;ENSG00000244482:ENST00000419410:exon_54722230_54722282:LILRA6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 54962467 G/A 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 A:G G A 10 0.509597303852548 0.541646560898822 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376514:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000443957:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54962467_54962559:LENG8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 54965860 G/A 1 5 9 14 2.45201348073726 4.58637573467293 -2.13436225393567 A:G G A 10 0.509597303852548 0.293559675506127 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54965609_54965861:LENG8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 54966579 C/G 1 11 13 24 5.39442965762197 6.62476495008312 -1.23033529246115 C:G C G 10 0.509597303852548 0.68560789583581 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54966543_54966622:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54966543_54966746:LENG8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 55512137 C/A 0 0 11 11 0 5.60557034237803 -5.60557034237803 A C A 10 0.509597303852548 0.00039453118880164 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 55614923 T/C 1 9 6 15 4.41362426532707 3.05758382311529 1.35604044221178 T:C T C 10 0.509597303852548 0.608250593906015 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55614777_55614936:PPP1R12C HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 55739689 G/A 1 3 10 13 1.47120808844236 5.09597303852548 -3.62476495008312 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0532191285007243 ENSG00000180089:ENST00000327042:exon_55739559_55739805:TMEM86B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 55964720 G/A 1 126 112 238 61.790739714579 57.0748980314854 4.71584168309358 A:G G A 10 0.509597303852548 0.559936305567992 ENSG00000063241:ENST00000438389:exon_55964345_55964755:ISOC2;ENSG00000063241:ENST00000085068:exon_55964345_55964755:ISOC2;ENSG00000063241:ENST00000425675:exon_55964345_55964755:ISOC2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 55995272 G/A 1 4 9 13 1.96161078458981 4.58637573467293 -2.62476495008312 A:G G A 10 0.509597303852548 0.172159462736175 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 56153868 G/A 1 16 19 35 7.84644313835923 9.68234877319841 -1.83590563483918 A:G G A 10 0.509597303852548 0.613168616066627 ENSG00000213015:ENST00000325333:exon_56153863_56154835:ZNF580 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 56162776 C/T 1 8 15 23 3.92322156917962 7.64395955778822 -3.7207379886086 T:C C T 10 0.509597303852548 0.145402204219230 ENSG00000173581:ENST00000308964:exon_56162649_56162861:CCDC106 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 56180968 C/T 1 69 51 120 33.8377860341742 25.9894624964799 7.84832353769424 T:C C T 10 0.509597303852548 0.170737985698353 ENSG00000063244:ENST00000450554:exon_56180810_56181058:U2AF2;ENSG00000063244:ENST00000308924:exon_56180810_56181058:U2AF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 56185250 G/A 1 9 4 13 4.41362426532707 2.03838921541019 2.37523504991688 A:G G A 10 0.509597303852548 0.268002712932727 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 56392920 C/T 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000160505:ENST00000301295:exon_56392836_56393218:NLRP4;ENSG00000160505:ENST00000346986:exon_56392836_56393218:NLRP4;ENSG00000160505:ENST00000419009:exon_56392836_56393218:NLRP4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 57931553 C/T 1 3 11 14 1.47120808844236 5.60557034237803 -4.13436225393567 T:C C T 10 0.509597303852548 0.032165591851746 ENSG00000186272:ENST00000307658:exon_57931003_57933307:ZNF17;ENSG00000186272:ENST00000449441:exon_57931003_57933307:ZNF17 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 57956828 T/G 1 6 6 12 2.94241617688471 3.05758382311529 -0.115167646230576 T:G T G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000186230:ENST00000380830:exon_57954659_57957191:ZNF749;ENSG00000186230:ENST00000334181:exon_57954659_57956853:ZNF749 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 58453342 T/C 1 14 3 17 6.86563774606433 1.52879191155764 5.33684583450668 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0129938732765864 ENSG00000152454:ENST00000282308:exon_58452206_58454015:ZNF256 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 58718247 T/C 1 7 5 12 3.43281887303216 2.54798651926274 0.884832353769424 T:C T C 10 0.509597303852548 0.774912283175237 ENSG00000171606:ENST00000326804:exon_58718087_58718568:ZNF274;ENSG00000171606:ENST00000424679:exon_58718087_58718361:ZNF274;ENSG00000171606:ENST00000345813:exon_58718087_58718361:ZNF274 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 58774071 A/G 1 19 26 45 9.31765122680159 13.2495299001662 -3.93187867336466 A:G A G 10 0.509597303852548 0.296654374164976 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000441758:exon_58773743_58774120:ZNF544 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 58928786 A/G 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 A:G A G 10 0.509597303852548 0.541646560898822 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000354635:exon_58928309_58929110:ZNF584 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 19 58991900 G/A 1 5 7 12 2.45201348073726 3.56718112696784 -1.11516764623058 A:G G A 10 0.509597303852548 0.574428486272357 ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58991543_58992591:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58991543_58992591:ZNF446 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 3392075 T/C 1 11 7 18 5.39442965762197 3.56718112696784 1.82724853065414 T:C T C 10 0.509597303852548 0.482156564682581 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 8871342 C/A 1 6 9 15 2.94241617688471 4.58637573467293 -1.64395955778822 A:C C A 10 0.509597303852548 0.446901967950042 ENSG00000134313:ENST00000256707:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000427284:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000418530:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000473731:exon_8869059_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000488729:exon_8870331_8872112:KIDINS220 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 10262920 T/G 1 31 28 59 15.202483580571 14.2687245078713 0.933759072699669 T:G T G 10 0.509597303852548 0.896564176067468 ENSG00000171848:ENST00000304567:exon_10262455_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000360566:exon_10262455_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000459969:exon_10262839_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000461327:exon_10262866_10263184:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000498343:exon_10262866_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000463887:exon_10262866_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000491447:exon_10262879_10263024:RRM2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 15614404 T/C 0 0 9 9 0 4.58637573467293 -4.58637573467293 C T C 10 0.509597303852548 0.00164049776378534 ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15614191_15614448:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15614191_15614448:NBAS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 17946243 A/G 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 A:G A G 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000178295:ENST00000317402:exon_17946164_17946340:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000381254:exon_17946164_17946340:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000534669:exon_17946164_17946411:GEN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 20240668 C/A 1 8 9 17 3.92322156917962 4.58637573467293 -0.663154165493316 A:C C A 10 0.509597303852548 0.811525826845625 ENSG00000068697:ENST00000175091:exon_20240652_20240772:LAPTM4A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 24431184 C/T 1 4 7 11 1.96161078458981 3.56718112696784 -1.60557034237803 T:C C T 10 0.509597303852548 0.379319216476062 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000427234:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000449392:exon_24431106_24431185:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000479575:exon_24431106_24431188:ITSN2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 24432839 A/G 1 5 5 10 2.45201348073726 2.54798651926274 -0.0959730385254796 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000479575:exon_24432687_24433198:ITSN2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 24524958 C/T 1 6 11 17 2.94241617688471 5.60557034237803 -2.66315416549332 T:C C T 10 0.509597303852548 0.23022658599833 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000406921:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000449230:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000412011:exon_24524834_24524971:ITSN2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 25047408 A/G 1 1 7 8 0.490402696147452 3.56718112696784 -3.07677843082038 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0357022765843499 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 25141538 A/G 1 9 7 16 4.41362426532707 3.56718112696784 0.846443138359232 A:G A G 10 0.509597303852548 0.80419746365061 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25141182_25142708:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25141182_25142055:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25141182_25142055:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000435135:exon_25141182_25142053:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000438445:exon_25141521_25142053:ADCY3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 27260469 G/A 1 8 9 17 3.92322156917962 4.58637573467293 -0.663154165493316 A:G G A 10 0.509597303852548 0.811525826845625 ENSG00000119777:ENST00000321326:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000238788:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000404032:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000435172:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000475258:exon_27260429_27260532:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000425720:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000460904:exon_27260429_27260683:TMEM214 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 27290525 A/G 1 11 2 13 5.39442965762197 1.0191946077051 4.37523504991688 A:T:G A G 10 0.509597303852548 0.022769928287595 ENSG00000084693:ENST00000441931:exon_27290362_27290703:AGBL5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 27293150 G/T 1 9 7 16 4.41362426532707 3.56718112696784 0.846443138359232 T:G G T 10 0.509597303852548 0.80419746365061 ENSG00000084693:ENST00000487078:exon_27292960_27293490:AGBL5;ENSG00000084693:ENST00000360131:exon_27292960_27293488:AGBL5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 27355991 G/T 1 18 10 28 8.82724853065414 5.09597303852548 3.73127549212866 T:G G T 10 0.509597303852548 0.187200729145019 ENSG00000138073:ENST00000468045:exon_27355985_27357497:PREB;ENSG00000138073:ENST00000260643:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000444452:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000406567:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000474802:exon_27355985_27356589:PREB HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 27424636 G/A 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 A:G G A 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000138074:ENST00000461757:exon_27423866_27424942:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000310574:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000488743:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000408041:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000461319:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000481751:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000492069:exon_27424580_27424715:SLC5A6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 27435374 G/A 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 A:G G A 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000138074:ENST00000428518:exon_27435331_27435390:SLC5A6;ENSG00000138085:ENST00000405489:exon_27435238_27435475:C2orf28 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 27438615 G/C 1 74 82 156 36.2897995149115 41.7869789159089 -5.49717940099748 C:G G C 10 0.509597303852548 0.379946671917592 ENSG00000138085:ENST00000380171:exon_27438500_27438621:C2orf28;ENSG00000138085:ENST00000405489:exon_27438500_27438621:C2orf28 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 27460968 A/G 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 A:G A G 10 0.509597303852548 0.541646560898822 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000458503:exon_27460924_27461046:CAD HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 27462076 C/T 1 8 2 10 3.92322156917962 1.0191946077051 2.90402696147452 T:C C T 10 0.509597303852548 0.110022635989167 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27461910_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27461910_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000456311:exon_27461986_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000487239:exon_27462020_27462100:CAD HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 27464814 C/T 1 8 20 28 3.92322156917962 10.191946077051 -6.26872450787134 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0221347498805815 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27464779_27464991:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27464779_27464991:CAD;ENSG00000084774:ENST00000456311:exon_27464779_27464819:CAD;ENSG00000084774:ENST00000428460:exon_27464789_27464991:CAD HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 27550967 A/G 1 16 7 23 7.84644313835923 3.56718112696784 4.2792620113914 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0945178807775167 ENSG00000115207:ENST00000359541:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000457098:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000264720:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000452160:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000495298:exon_27550904_27551357:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000454704:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000415683:exon_27550904_27551056:GTF3C2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 27667297 A/G 1 4 8 12 1.96161078458981 4.07677843082038 -2.11516764623058 A:G A G 10 0.509597303852548 0.258556419599671 ENSG00000138002:ENST00000260570:exon_27667238_27667388:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000509128:exon_27667244_27667388:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000507184:exon_27667265_27667388:IFT172 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 27838058 C/A 1 12 1 13 5.88483235376942 0.509597303852548 5.37523504991688 A:C C A 10 0.509597303852548 0.00348827153835016 ENSG00000243943:ENST00000416005:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000379717:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000355467:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000505973:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000413371:exon_27838035_27838136:ZNF512 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 27887034 C/A 1 11 3 14 5.39442965762197 1.52879191155764 3.86563774606433 A:C C A 10 0.509597303852548 0.0580035546592849 ENSG00000163798:ENST00000326019:exon_27886338_27887444:SLC4A1AP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 32800422 C/G 1 4 7 11 1.96161078458981 3.56718112696784 -1.60557034237803 C:G C G 10 0.509597303852548 0.379319216476062 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32800223_32800433:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32800223_32800433:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000471232:exon_32800223_32800433:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000470250:exon_32800358_32800433:BIRC6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 37438993 G/A 1 76 50 126 37.2706049072064 25.4798651926274 11.790739714579 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0401333453971443 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37438986_37439182:CEBPZ;ENSG00000115816:ENST00000489306:exon_37438986_37439251:CEBPZ HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 37458668 G/A 1 10 12 22 4.90402696147452 6.11516764623058 -1.21114068475606 A:C:G G A 10 0.509597303852548 0.672933556012192 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37458555_37458856:CEBPZ HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 37458711 G/A 1 6 6 12 2.94241617688471 3.05758382311529 -0.115167646230576 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37458555_37458856:CEBPZ HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 42515437 A/G 1 8 9 17 3.92322156917962 4.58637573467293 -0.663154165493316 A:G A G 10 0.509597303852548 0.811525826845625 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000440432:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000480320:exon_42515367_42517053:EML4;ENSG00000143924:ENST00000406175:exon_42515367_42515462:EML4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 42530331 C/A 1 5 5 10 2.45201348073726 2.54798651926274 -0.0959730385254796 A:C C A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42530244_42530369:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42530244_42530369:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42530244_42530369:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42530244_42530369:EML4;ENSG00000143924:ENST00000440432:exon_42530244_42530369:EML4;ENSG00000143924:ENST00000406175:exon_42530244_42530369:EML4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 42557145 G/A 1 44 40 84 21.5777186304879 20.3838921541019 1.19382647638597 A:G G A 10 0.509597303852548 0.827790995211609 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42556874_42559688:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42556874_42559688:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42556874_42557884:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42556874_42558014:EML4;ENSG00000143924:ENST00000440432:exon_42556874_42557423:EML4;ENSG00000143924:ENST00000406175:exon_42556874_42559688:EML4;ENSG00000143924:ENST00000453191:exon_42556874_42557423:EML4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 42990010 C/A 1 19 29 48 9.31765122680159 14.7783218117239 -5.4606705849223 A:C C A 10 0.509597303852548 0.148103264755484 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 42990101 G/C 1 9 19 28 4.41362426532707 9.68234877319841 -5.26872450787134 C:G G C 10 0.509597303852548 0.0577645390368908 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 42990336 T/G 1 8 16 24 3.92322156917962 8.15355686164077 -4.23033529246115 T:G T G 10 0.509597303852548 0.102508753648658 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 42990522 C/T 1 4 11 15 1.96161078458981 5.60557034237803 -3.64395955778822 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0719657820440228 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 43452183 A/G 1 7 3 10 3.43281887303216 1.52879191155764 1.90402696147452 A:G A G 10 0.509597303852548 0.344656245175514 ENSG00000152518:ENST00000282388:exon_43449541_43452891:ZFP36L2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 43452618 C/T 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 T:C C T 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000152518:ENST00000282388:exon_43449541_43452891:ZFP36L2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 43506979 C/T 1 9 2 11 4.41362426532707 1.0191946077051 3.39442965762197 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0659641183816961 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43506904_43507035:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43506904_43507035:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43506904_43507035:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43506904_43507035:THADA;ENSG00000115970:ENST00000407351:exon_43506904_43507035:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43506904_43507035:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43506904_43507035:THADA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 44028013 A/T 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 A:T A T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44027980_44028056:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44027980_44028056:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000330811:exon_44027980_44028056:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000489222:exon_44027980_44028056:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000378587:exon_44027980_44028056:DYNC2LI1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 44123759 G/A 1 8 4 12 3.92322156917962 2.03838921541019 1.88483235376942 A:G G A 10 0.509597303852548 0.388763190446408 ENSG00000138095:ENST00000472420:exon_44123376_44123847:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000483489:exon_44123583_44123847:LRPPRC HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 45640374 C/A 1 9 6 15 4.41362426532707 3.05758382311529 1.35604044221178 A:C C A 10 0.509597303852548 0.608250593906015 ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45640253_45640432:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45640253_45640432:SRBD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 48018081 A/G 1 6 8 14 2.94241617688471 4.07677843082038 -1.13436225393567 A:G A G 10 0.509597303852548 0.601095068648336 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48018066_48018262:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000445503:exon_48018066_48018262:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000446255:exon_48018066_48018262:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000455383:exon_48018066_48018262:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000420813:exon_48018066_48018262:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000411819:exon_48018066_48018262:MSH6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 48023115 T/C 1 7 9 16 3.43281887303216 4.58637573467293 -1.15355686164077 T:C T C 10 0.509597303852548 0.623338489505478 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000446255:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000456246:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000455383:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000420813:exon_48023033_48023175:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000411819:exon_48023033_48023202:MSH6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 48030838 A/T 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 A:T A T 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 54081548 C/T 1 1 9 10 0.490402696147452 4.58637573467293 -4.09597303852548 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0103454948738643 ENSG00000119737:ENST00000394705:exon_54080050_54082002:GPR75 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 54858511 C/T 1 34 28 62 16.6736916690134 14.2687245078713 2.40496716114203 T:C C T 10 0.509597303852548 0.611876130589046 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54857992_54858748:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54857992_54858748:SPTBN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 54858664 C/T 1 12 8 20 5.88483235376942 4.07677843082038 1.80805392294904 T:C C T 10 0.509597303852548 0.505035835457766 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54857992_54858748:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54857992_54858748:SPTBN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 54886347 G/A 1 15 19 34 7.35604044221178 9.68234877319841 -2.32630833098663 A:G G A 10 0.509597303852548 0.493928626130665 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000496323:exon_54886291_54886403:SPTBN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 55470115 C/T 1 28 9 37 13.7312754921287 4.58637573467293 9.14489975745573 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00273241227668398 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000418823:exon_55470076_55470216:MTIF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 55490819 G/T 1 6 5 11 2.94241617688471 2.54798651926274 0.394429657621972 T:G G T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55490776_55491006:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000417741:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000446660:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000366137:exon_55490777_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000441307:exon_55490783_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000404297:exon_55490784_55491001:MTIF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 55844445 T/C 1 12 17 29 5.88483235376942 8.66315416549332 -2.77832181172389 T:C T C 10 0.509597303852548 0.354840351239223 ENSG00000138041:ENST00000272313:exon_55844280_55844749:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000407823:exon_55844280_55844758:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000345102:exon_55844280_55844723:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000424063:exon_55844280_55844796:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000477749:exon_55844280_55845113:SMEK2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 58276070 T/C 1 26 13 39 12.7504700998338 6.62476495008312 6.12570514975063 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0549519324410866 ENSG00000028116:ENST00000435505:exon_58275962_58276102:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000417641:exon_58275962_58276102:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000412104:exon_58275962_58276102:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000423109:exon_58275962_58276102:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000394539:exon_58275962_58276102:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000437272:exon_58275962_58276102:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000340157:exon_58275962_58276102:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000432057:exon_58275962_58276102:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000440705:exon_58276016_58276102:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000428021:exon_58275962_58276102:VRK2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 61149107 A/G 1 7 7 14 3.43281887303216 3.56718112696784 -0.134362253935672 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000162924:ENST00000295025:exon_61148898_61150645:REL;ENSG00000162924:ENST00000394479:exon_61148898_61150119:REL;ENSG00000162924:ENST00000423882:exon_61148898_61150178:REL HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 62067433 T/C 1 3 8 11 1.47120808844236 4.07677843082038 -2.60557034237803 T:C T C 10 0.509597303852548 0.139008716253398 ENSG00000170264:ENST00000450831:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000456262:exon_62066556_62067660:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000418113:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000404929:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000405894:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000307507:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000478822:exon_62066556_62067716:FAM161A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 62099260 C/T 1 225 246 471 110.340606633177 125.360936747727 -15.0203301145501 T:C C T 10 0.509597303852548 0.167133365181302 ENSG00000115484:ENST00000394440:exon_62099217_62099451:CCT4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 62100380 G/T 1 78 52 130 38.2514102995013 26.4990598003325 11.7523504991688 T:G G T 10 0.509597303852548 0.0434099919155087 ENSG00000115484:ENST00000394440:exon_62100332_62100428:CCT4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 64327544 G/T 1 2 11 13 0.980805392294904 5.60557034237803 -4.62476495008312 T:G G T 10 0.509597303852548 0.0114798061912099 ENSG00000197329:ENST00000358912:exon_64327532_64327633:PELI1;ENSG00000197329:ENST00000466177:exon_64327532_64327633:PELI1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 64327592 T/C 1 3 7 10 1.47120808844236 3.56718112696784 -2.09597303852548 T:C T C 10 0.509597303852548 0.218348598150516 ENSG00000197329:ENST00000358912:exon_64327532_64327633:PELI1;ENSG00000197329:ENST00000466177:exon_64327532_64327633:PELI1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 64685451 A/G 1 7 5 12 3.43281887303216 2.54798651926274 0.884832353769424 A:G A G 10 0.509597303852548 0.774912283175237 ENSG00000119862:ENST00000462737:exon_64685419_64685574:AC008074.1;ENSG00000119862:ENST00000238875:exon_64685419_64688515:AC008074.1;ENSG00000119862:ENST00000420552:exon_64685419_64685546:AC008074.1;ENSG00000119862:ENST00000409537:exon_64685419_64688515:AC008074.1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 65245365 G/A 1 5 13 18 2.45201348073726 6.62476495008312 -4.17275146934586 A:G G A 10 0.509597303852548 0.059364647228317 ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65245205_65245399:SLC1A4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 65495887 G/A 1 27 47 74 13.2408727959812 23.9510732810698 -10.7102004850885 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0143026036172156 ENSG00000138071:ENST00000260641:exon_65495698_65498387:ACTR2;ENSG00000138071:ENST00000377982:exon_65495698_65497280:ACTR2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 68607947 G/T 1 34 12 46 16.6736916690134 6.11516764623058 10.5585240227828 T:G G T 10 0.509597303852548 0.00178832916636422 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68607855_68608036:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68607855_68608036:PLEK HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 68613710 G/A 1 8 4 12 3.92322156917962 2.03838921541019 1.88483235376942 A:G G A 10 0.509597303852548 0.388763190446408 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68613634_68613818:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68613634_68613818:PLEK HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 68622952 G/C 1 65 57 122 31.8761752495844 29.0470463195952 2.82912892998915 C:G G C 10 0.509597303852548 0.651071481802997 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 69659126 A/T 1 11 11 22 5.39442965762197 5.60557034237803 -0.211140684756055 A:T A T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000169599:ENST00000410022:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000471185:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000303698:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000394305:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000404290:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000450796:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000484177:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000419370:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000438184:exon_69659034_69659137:NFU1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 70033584 C/T 1 7 6 13 3.43281887303216 3.05758382311529 0.375235049916876 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000196975:ENST00000477632:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000394295:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000460439:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000460942:exon_70033517_70033630:ANXA4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 70315448 A/T 1 300 298 598 147.120808844236 151.859996548059 -4.73918770382369 A:T A T 10 0.509597303852548 0.712885981831759 ENSG00000169564:ENST00000303577:exon_70314585_70316332:PCBP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 71304738 G/A 1 101 38 139 49.5306723108927 19.3646975463968 30.1659747644958 A:G G A 10 0.509597303852548 2.38602977415089e-07 ENSG00000124357:ENST00000455662:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000244204:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000418807:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443872:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443938:exon_71304700_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000450272:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000475709:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000472519:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000489309:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524736:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524537:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000490998:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000468601:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000498022:exon_71304661_71304766:NAGK HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 71305456 C/T 1 156 87 243 76.5028205990025 44.3349654351717 32.1678551638308 T:C C T 10 0.509597303852548 3.68479731513941e-05 ENSG00000124357:ENST00000455662:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000244204:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000418807:exon_71305448_71306935:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443872:exon_71305448_71305715:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443938:exon_71305448_71305771:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000450272:exon_71305448_71305743:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000475709:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000472519:exon_71305448_71305750:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000489309:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524537:exon_71305448_71305763:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000490998:exon_71305448_71305769:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000468601:exon_71305448_71305484:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000498022:exon_71305448_71305765:NAGK HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 71351487 G/A 1 11 10 21 5.39442965762197 5.09597303852548 0.298456619096493 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000124370:ENST00000244217:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000466481:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000486135:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000494660:exon_71351477_71351673:MCEE HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 71376471 G/A 1 60 52 112 29.4241617688471 26.4990598003325 2.92510196851462 A:G G A 10 0.509597303852548 0.636779380358512 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71376353_71376583:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71376353_71376583:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000493360:exon_71375236_71376583:MPHOSPH10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 73461483 C/A 1 24 56 80 11.7696647075388 28.5374490157427 -16.7677843082038 A:C C A 10 0.509597303852548 0.000187909046911683 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73461366_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000461290:exon_73461397_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000464397:exon_73461435_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000399032:exon_73461436_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73461436_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000480489:exon_73461437_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409924:exon_73461437_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73461448_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000473786:exon_73461464_73461512:CCT7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 73478461 A/T 1 116 138 254 56.8867127531044 70.3244279316516 -13.4377151785472 A:T A T 10 0.509597303852548 0.102567980634784 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73478354_73478560:CCT7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 75113572 G/A 1 6 2 8 2.94241617688471 1.0191946077051 1.92322156917962 A:G G A 10 0.509597303852548 0.289787629707581 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 75113657 C/T 1 7 2 9 3.43281887303216 1.0191946077051 2.41362426532707 T:C C T 10 0.509597303852548 0.180412718745071 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75113617_75113800:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75113617_75113800:HK2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 75874015 C/G 1 9 15 24 4.41362426532707 7.64395955778822 -3.23033529246115 C:G C G 10 0.509597303852548 0.222545600682288 ENSG00000115364:ENST00000493686:exon_75873909_75874036:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000393909:exon_75873909_75874036:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000358788:exon_75873920_75874035:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000409374:exon_75873929_75874036:MRPL19 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 75882399 G/A 1 48 35 83 23.5393294150777 17.8359056348392 5.70342378023852 A:G G A 10 0.509597303852548 0.227999719064218 ENSG00000115364:ENST00000393909:exon_75882190_75884986:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000409374:exon_75882190_75882428:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000453233:exon_75882190_75882428:MRPL19 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 75893111 T/G 1 11 9 20 5.39442965762197 4.58637573467293 0.808053922949041 T:G T G 10 0.509597303852548 0.824451040790607 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75893055_75893179:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75893055_75893179:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75893055_75893179:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000427862:exon_75893055_75893179:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75893055_75893179:C2orf3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 75907351 T/C 1 8 3 11 3.92322156917962 1.52879191155764 2.39442965762197 T:C T C 10 0.509597303852548 0.227512016275758 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75907319_75907440:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75907319_75907440:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75907319_75907440:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75907319_75907440:C2orf3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 85622059 T/C 1 18 16 34 8.82724853065414 8.15355686164077 0.673691669013369 T:C T C 10 0.509597303852548 0.865014513214598 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85621871_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000453973:exon_85621876_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85621890_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85621951_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85622016_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000471064:exon_85622018_85622081:CAPG HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 85769711 C/G 1 59 47 106 28.9337590726997 23.9510732810698 4.98268579162992 C:G C G 10 0.509597303852548 0.382042774958113 ENSG00000168906:ENST00000306434:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000424323:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000481412:exon_85769278_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000409017:exon_85769688_85769870:MAT2A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 85769975 A/G 1 11 11 22 5.39442965762197 5.60557034237803 -0.211140684756055 A:G A G 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 85806266 C/T 1 218 137 355 106.907787760145 69.8148306277991 37.0929571323455 T:C C T 10 0.509597303852548 8.19158775017602e-05 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85806132_85806290:VAMP8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 85808737 A/G 1 197 150 347 96.609331141048 76.4395955778822 20.1697355631658 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0316926257390479 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 85808871 C/T 1 187 144 331 91.7053041795735 73.3820117547669 18.3232924248066 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0476810437922824 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 85818886 C/T 1 31 28 59 15.202483580571 14.2687245078713 0.933759072699669 T:C C T 10 0.509597303852548 0.896564176067468 ENSG00000168899:ENST00000306384:exon_85818848_85818985:VAMP5;ENSG00000168899:ENST00000462451:exon_85818720_85818987:VAMP5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 85820027 A/G 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 A:G A G 10 0.509597303852548 0.726965250907 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 85824039 G/A 1 213 201 414 104.455774279407 102.429058074362 2.02671620504513 A:G G A 10 0.509597303852548 0.844323372723937 ENSG00000168894:ENST00000461845:exon_85823642_85824139:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000441634:exon_85823945_85824054:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000306368:exon_85823945_85824054:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000443647:exon_85823980_85824054:RNF181 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 86371883 T/C 1 93 42 135 45.607450741713 21.403086761807 24.204363979906 T:C T C 10 0.509597303852548 3.03394913723815e-05 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86371059_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86371059_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86371063_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86371063_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86371063_86372004:IMMT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 86400824 G/A 1 15 27 42 7.35604044221178 13.7591272040188 -6.40308676180702 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0628546812133534 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86400773_86400885:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000398211:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409258:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000486633:exon_86400631_86400884:IMMT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 86433240 C/T 1 39 39 78 19.1257051497506 19.8742948502494 -0.748589700498741 T:C C T 10 0.509597303852548 0.910063032631546 ENSG00000132313:ENST00000254644:exon_86433229_86433418:MRPL35;ENSG00000132313:ENST00000337109:exon_86433229_86433418:MRPL35;ENSG00000132313:ENST00000409180:exon_86433229_86433418:MRPL35 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 86831751 G/C 1 12 10 22 5.88483235376942 5.09597303852548 0.788859315243944 C:G G C 10 0.509597303852548 0.832492277049863 ENSG00000239305:ENST00000237455:exon_86830516_86832541:RNF103;ENSG00000239305:ENST00000472030:exon_86830523_86832541:RNF103;ENSG00000239305:ENST00000477307:exon_86831723_86832541:RNF103 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 87303060 C/G 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 C:G C G 10 0.509597303852548 0.5085374516326 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 88895123 T/C 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88894987_88895181:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88894987_88895181:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000415570:exon_88894987_88895181:EIF2AK3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 89185371 T/G 1 995 1 996 487.950682666715 0.509597303852548 487.441085362862 T:G T G 10 0.509597303852548 4.37599211557221e-289 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 89185461 G/C 0 597 4 601 292.770409600029 2.03838921541019 290.732020384619 A:T:G G T 10 0.509597303852548 9.14341576412163e-167 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 95775761 G/A 1 27 25 52 13.2408727959812 12.7399325963137 0.500940199667504 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000144029:ENST00000272418:exon_95775661_95775786:MRPS5;ENSG00000144029:ENST00000345084:exon_95775661_95775786:MRPS5;ENSG00000144029:ENST00000475895:exon_95775661_95775786:MRPS5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 95780861 G/C 1 11 13 24 5.39442965762197 6.62476495008312 -1.23033529246115 C:G G C 10 0.509597303852548 0.68560789583581 ENSG00000144029:ENST00000272418:exon_95780811_95780948:MRPS5;ENSG00000144029:ENST00000345084:exon_95780811_95780948:MRPS5;ENSG00000144029:ENST00000475895:exon_95780811_95780948:MRPS5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 97749512 T/C 1 17 27 44 8.33684583450668 13.7591272040188 -5.42228136951211 T:C T C 10 0.509597303852548 0.130769326647198 ENSG00000144199:ENST00000414820:exon_97749320_97749554:FAHD2B;ENSG00000144199:ENST00000272610:exon_97749320_97749554:FAHD2B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 101635538 C/T 1 36 1 37 17.6544970613083 0.509597303852548 17.1448997574557 T:C C T 10 0.509597303852548 6.7833445500494e-10 ENSG00000071082:ENST00000409028:exon_101635460_101636078:RPL31 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 105977761 G/A 1 5 12 17 2.45201348073726 6.11516764623058 -3.66315416549332 A:G G A 10 0.509597303852548 0.090883178805902 ENSG00000115641:ENST00000409177:exon_105974169_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000344213:exon_105977269_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000393353:exon_105977283_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000530340:exon_105977283_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000393352:exon_105977283_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000322142:exon_105977285_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000336660:exon_105977285_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000358129:exon_105977287_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000409807:exon_105977314_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000408995:exon_105977318_105977891:FHL2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 109356978 G/C 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 C:G G C 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000153201:ENST00000283195:exon_109356945_109357137:RANBP2;ENSG00000153201:ENST00000409491:exon_109356945_109357137:RANBP2;ENSG00000153201:ENST00000469184:exon_109356945_109357137:RANBP2;ENSG00000153201:ENST00000437168:exon_109356945_109357137:RANBP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 113956371 G/C 1 20 5 25 9.80805392294904 2.54798651926274 7.2600674036863 A:C:G G C 10 0.509597303852548 0.00424129263104532 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000460725:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000465592:exon_113956317_113956407:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000464559:exon_113956135_113956803:PSD4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 118583940 C/T 1 13 8 21 6.37523504991688 4.07677843082038 2.29845661909649 T:C C T 10 0.509597303852548 0.385166903646358 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118583845_118583958:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000415038:exon_118583845_118583958:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000476149:exon_118583845_118587042:DDX18 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 120060082 T/C 1 12 6 18 5.88483235376942 3.05758382311529 2.82724853065414 T:C T C 10 0.509597303852548 0.239448825994552 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120059801_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120059804_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120060020_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120060020_120060124:C2orf76 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 120078778 T/C 1 6 5 11 2.94241617688471 2.54798651926274 0.394429657621972 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000414534:exon_120078745_120078780:C2orf76 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 120439230 C/G 1 8 7 15 3.92322156917962 3.56718112696784 0.35604044221178 C:G C G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000144120:ENST00000401466:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000424086:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000272521:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000415646:exon_120439135_120439242:TMEM177 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 127453664 A/C 1 111 110 221 54.4346992723672 56.0557034237803 -1.6210041514131 A:C A C 10 0.509597303852548 0.840294239764306 ENSG00000136732:ENST00000259254:exon_127453522_127454246:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000409836:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000356887:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000464053:exon_127453522_127454243:GYPC HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 128934400 T/C 1 11 6 17 5.39442965762197 3.05758382311529 2.33684583450668 T:C T C 10 0.509597303852548 0.333835168817674 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128934388_128934472:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128934388_128934472:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128934388_128934472:UGGT1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 128939817 G/A 1 11 6 17 5.39442965762197 3.05758382311529 2.33684583450668 A:G G A 10 0.509597303852548 0.333835168817674 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128939704_128939864:UGGT1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 132277686 C/T 1 9 9 18 4.41362426532707 4.58637573467293 -0.172751469345863 T:C C T 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 135911422 T/C 1 13 10 23 6.37523504991688 5.09597303852548 1.2792620113914 T:C T C 10 0.509597303852548 0.678943531012238 ENSG00000115839:ENST00000264158:exon_135911219_135911446:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000442034:exon_135911219_135911446:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000487003:exon_135911219_135911446:RAB3GAP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 136511842 C/A 1 64 61 125 31.3857725534369 31.0854355350054 0.300337018431502 A:C C A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000144224:ENST00000272638:exon_136511729_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000416538:exon_136511109_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000470687:exon_136511729_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000490163:exon_136511722_136511847:UBXN4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 136530157 G/A 1 22 27 49 10.7888593152439 13.7591272040188 -2.97026788877485 A:G G A 10 0.509597303852548 0.475366415499282 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 136598357 A/G 1 141 126 267 69.1467801567907 64.209260285421 4.9375198713697 A:G A G 10 0.509597303852548 0.581804191345229 ENSG00000076003:ENST00000264156:exon_136597196_136598521:MCM6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 136623717 C/T 1 4 9 13 1.96161078458981 4.58637573467293 -2.62476495008312 T:C C T 10 0.509597303852548 0.172159462736175 ENSG00000076003:ENST00000264156:exon_136623702_136623847:MCM6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 136624155 G/A 1 3 8 11 1.47120808844236 4.07677843082038 -2.60557034237803 A:G G A 10 0.509597303852548 0.139008716253398 ENSG00000076003:ENST00000264156:exon_136624133_136624298:MCM6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 150432976 C/T 1 41 33 74 20.1065105420455 16.8167110271341 3.28979951491145 T:C C T 10 0.509597303852548 0.486238262958499 ENSG00000168288:ENST00000303319:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000428879:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000422782:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000436114:exon_150432951_150432992:MMADHC HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 160604452 C/T 1 3 7 10 1.47120808844236 3.56718112696784 -2.09597303852548 T:C C T 10 0.509597303852548 0.218348598150516 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000473749:exon_160604316_160604637:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 160604514 C/T 1 7 3 10 3.43281887303216 1.52879191155764 1.90402696147452 T:C C T 10 0.509597303852548 0.344656245175514 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000473749:exon_160604316_160604637:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 160673526 A/G 1 7 21 28 3.43281887303216 10.7015433809035 -7.26872450787134 A:G A G 10 0.509597303852548 0.00724459166608223 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160673317_160673543:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160673317_160673543:RP11-357L2.1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 160697305 C/A 1 10 14 24 4.90402696147452 7.13436225393567 -2.23033529246115 A:C C A 10 0.509597303852548 0.417388759331184 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160697240_160697466:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160697240_160697466:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160697240_160697466:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160697240_160697466:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160697240_160697466:RP11-357L2.1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 160697447 C/T 1 19 11 30 9.31765122680159 5.60557034237803 3.71208088442356 T:C C T 10 0.509597303852548 0.202978653761744 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160697240_160697466:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160697240_160697466:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160697240_160697466:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160697240_160697466:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160697240_160697466:RP11-357L2.1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 160714906 T/C 1 5 12 17 2.45201348073726 6.11516764623058 -3.66315416549332 T:C T C 10 0.509597303852548 0.090883178805902 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160714873_160714987:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160714873_160714987:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160714873_160714987:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160714873_160714987:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160714873_160714987:RP11-357L2.1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 160721357 C/T 1 10 7 17 4.90402696147452 3.56718112696784 1.33684583450668 T:C C T 10 0.509597303852548 0.630150764673374 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160721350_160721431:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160721350_160721431:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160721350_160721431:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160721350_160721431:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160721350_160721431:RP11-357L2.1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 160729005 C/T 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 T:C C T 10 0.509597303852548 0.335037018547339 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160728962_160729104:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160728962_160729104:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160728962_160729104:LY75;ENSG00000054219:ENST00000484559:exon_160728330_160729104:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160728962_160729104:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160728962_160729104:RP11-357L2.1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 163124051 C/T 1 100 83 183 49.0402696147452 42.2965762197615 6.74369339498372 T:C C T 10 0.509597303852548 0.336852192964770 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163123989_163124079:IFIH1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 163128824 T/C 1 27 28 55 13.2408727959812 14.2687245078713 -1.02785171189014 T:C T C 10 0.509597303852548 0.789257176432031 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163128736_163128897:IFIH1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 170489738 T/G 1 144 27 171 70.6179882452331 13.7591272040188 56.8588610412143 T:G T G 10 0.509597303852548 1.01581407516835e-19 ENSG00000138398:ENST00000260970:exon_170489670_170489757:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000530133:exon_170489670_170489757:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000433207:exon_170489670_170489757:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000409714:exon_170489670_170489757:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000462903:exon_170489670_170490076:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000448752:exon_170489670_170489757:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000482772:exon_170489670_170489757:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000466142:exon_170489670_170489757:PPIG HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 170493103 T/A 1 369 359 728 180.95859487841 182.945432083065 -1.98683720465493 A:T T A 10 0.509597303852548 0.911461476048923 ENSG00000138398:ENST00000260970:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000530133:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000433207:exon_170492923_170493251:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000409714:exon_170492923_170494221:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000448752:exon_170492923_170494131:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000482772:exon_170492923_170493324:PPIG HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 171910313 C/T 1 12 9 21 5.88483235376942 4.58637573467293 1.29845661909649 T:C C T 10 0.509597303852548 0.664861077872976 ENSG00000198586:ENST00000431350:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000360843:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000442919:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000359766:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000521943:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000434911:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000409443:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000478683:exon_171910271_171911639:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000486857:exon_171910227_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000453628:exon_171910292_171910363:TLK1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 172411273 G/A 1 19 6 25 9.31765122680159 3.05758382311529 6.2600674036863 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0150776702699848 ENSG00000071967:ENST00000409484:exon_172411034_172412117:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000321348:exon_172411034_172414643:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000375252:exon_172411034_172414156:CYBRD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 172725301 A/G 1 2 12 14 0.980805392294904 6.11516764623058 -5.13436225393567 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0064484390483877 ENSG00000115840:ENST00000422440:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000392592:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000263812:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000426896:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000475360:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000472748:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000484227:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000464063:exon_172725191_172725333:SLC25A12 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 174820750 T/C 1 9 2 11 4.41362426532707 1.0191946077051 3.39442965762197 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0659641183816961 ENSG00000172845:ENST00000310015:exon_174819601_174820960:SP3;ENSG00000172845:ENST00000416195:exon_174819601_174820960:SP3;ENSG00000172845:ENST00000418194:exon_174819601_174820960:SP3;ENSG00000172845:ENST00000455789:exon_174819601_174820960:SP3;ENSG00000172845:ENST00000462904:exon_174820545_174820956:SP3;ENSG00000172845:ENST00000475175:exon_174820658_174820960:SP3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 180810180 C/T 1 58 58 116 28.4433563765522 29.5566436234478 -1.11328724689557 T:C C T 10 0.509597303852548 0.853113756824345 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 180810264 A/T 1 58 67 125 28.4433563765522 34.1430193581207 -5.6996629815685 A:T A T 10 0.509597303852548 0.325770479875149 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 183622547 T/G 1 8 9 17 3.92322156917962 4.58637573467293 -0.663154165493316 T:G T G 10 0.509597303852548 0.811525826845625 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183622419_183622552:DNAJC10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 183627504 A/G 1 11 18 29 5.39442965762197 9.17275146934586 -3.77832181172389 A:G A G 10 0.509597303852548 0.194173323063005 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183627409_183627528:DNAJC10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 197629320 A/G 1 26 18 44 12.7504700998338 9.17275146934586 3.57771863048789 A:G A G 10 0.509597303852548 0.295130034544513 ENSG00000119041:ENST00000263956:exon_197627756_197629409:GTF3C3;ENSG00000119041:ENST00000481098:exon_197629303_197629409:GTF3C3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 198363504 A/G 1 17 23 40 8.33684583450668 11.7207379886086 -3.38389215410192 A:G A G 10 0.509597303852548 0.343111839960725 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198363446_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000439605:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000418022:exon_198363398_198363574:HSPD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 201355106 G/A 1 18 6 24 8.82724853065414 3.05758382311529 5.76966470753885 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0232420567134879 ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201353675_201355339:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201353681_201355339:KCTD18 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 201436555 A/G 1 11 4 15 5.39442965762197 2.03838921541019 3.35604044221178 A:G A G 10 0.509597303852548 0.119482056883178 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 202149589 G/C 1 7 3 10 3.43281887303216 1.52879191155764 1.90402696147452 C:G G C 10 0.509597303852548 0.344656245175514 ENSG00000064012:ENST00000392263:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000392264:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000303385:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000392266:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000264274:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000392259:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000432109:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000264275:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000358485:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000339403:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000323492:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000444430:exon_202149539_202150040:CASP8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 202245244 A/G 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 A:G A G 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000115993:ENST00000332624:exon_202241930_202245941:TRAK2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 203130632 G/C 1 11 8 19 5.39442965762197 4.07677843082038 1.31765122680159 C:G G C 10 0.509597303852548 0.648772677857544 ENSG00000055044:ENST00000264279:exon_203130439_203130709:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000426814:exon_203130459_203130709:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000488403:exon_203130459_203130709:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000492740:exon_203130488_203130709:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000472050:exon_203130488_203130709:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000467734:exon_203130502_203130709:NOP58 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 203152355 G/A 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 A:G G A 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 207026131 G/A 1 44 31 75 21.5777186304879 15.797516419429 5.7802022110589 A:G G A 10 0.509597303852548 0.204244914278151 ENSG00000114942:ENST00000236957:exon_207026070_207026196:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000392221:exon_207026070_207026196:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000392222:exon_207026070_207026196:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000445505:exon_207026070_207026196:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000429769:exon_207026070_207026196:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000415904:exon_207026045_207026191:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000435123:exon_207026070_207026178:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000455150:exon_207026070_207026196:EEF1B2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 215645464 C/G 1 2 7 9 0.980805392294904 3.56718112696784 -2.58637573467293 C:G C G 10 0.509597303852548 0.103145007117103 ENSG00000138376:ENST00000260947:exon_215645284_215646233:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000449967:exon_215645284_215646233:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000455743:exon_215645284_215646233:BARD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 215645545 C/G 1 9 2 11 4.41362426532707 1.0191946077051 3.39442965762197 C:G C G 10 0.509597303852548 0.0659641183816961 ENSG00000138376:ENST00000260947:exon_215645284_215646233:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000449967:exon_215645284_215646233:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000455743:exon_215645284_215646233:BARD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 216809602 G/A 1 21 19 40 10.2984566190965 9.68234877319841 0.616107845898082 A:G G A 10 0.509597303852548 0.875549899947125 ENSG00000118242:ENST00000423087:exon_216808990_216809720:MREG;ENSG00000118242:ENST00000263268:exon_216809213_216809720:MREG HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 218940418 C/T 0 0 8 8 0 4.07677843082038 -4.07677843082038 T C T 10 0.509597303852548 0.00334520543356084 ENSG00000188282:ENST00000457754:exon_218939816_218940463:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000344321:exon_218939816_218940463:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000374155:exon_218939816_218940463:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000463872:exon_218939816_218940443:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000441828:exon_218939816_218940463:RUFY4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 219941063 G/A 1 8 3 11 3.92322156917962 1.52879191155764 2.39442965762197 A:G G A 10 0.509597303852548 0.227512016275758 ENSG00000187736:ENST00000409720:exon_219940039_219941167:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000356853:exon_219940043_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000418099:exon_219940051_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000494211:exon_219941014_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000426304:exon_219941025_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000491159:exon_219941040_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000415353:exon_219941042_219941167:NHEJ1;ENSG00000213901:ENST00000498327:exon_219940051_219941177:SLC23A3;ENSG00000213901:ENST00000318673:exon_219940695_219941177:SLC23A3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 220037444 G/A 1 31 23 54 15.202483580571 11.7207379886086 3.48174559196241 A:G G A 10 0.509597303852548 0.414399523707575 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 220046840 G/A 1 9 10 19 4.41362426532707 5.09597303852548 -0.682348773198411 A:G G A 10 0.509597303852548 0.821015503596854 ENSG00000144567:ENST00000458520:exon_220046735_220046842:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220046735_220047030:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220046735_220047030:FAM134A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 220079137 C/A 1 9 1 10 4.41362426532707 0.509597303852548 3.90402696147452 A:C C A 10 0.509597303852548 0.0217112146317356 ENSG00000115657:ENST00000265316:exon_220079111_220079220:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000497882:exon_220078843_220080607:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000295750:exon_220079111_220079220:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000439002:exon_220079111_220079220:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000427013:exon_220079111_220079220:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000448398:exon_220079111_220079220:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000494639:exon_220079111_220079405:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000496984:exon_220079111_220079220:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000492953:exon_220079111_220079220:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000417678:exon_220079111_220079220:ABCB6;ENSG00000198925:ENST00000446716:exon_220079111_220079220:ATG9A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 220100787 C/T 1 19 24 43 9.31765122680159 12.2303352924612 -2.91268406565956 T:C C T 10 0.509597303852548 0.44621154544352 ENSG00000163516:ENST00000323348:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000466238:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000409849:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000477479:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000463792:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000419723:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000410034:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000460966:exon_220100732_220101373:ANKZF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 220250237 G/A 1 6 14 20 2.94241617688471 7.13436225393567 -4.19194607705096 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0737108731541632 ENSG00000123992:ENST00000273075:exon_220250146_220250253:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373972:exon_220250146_220250253:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000523282:exon_220250146_220250253:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373963:exon_220250146_220250253:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373966:exon_220250146_220250253:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000337010:exon_220250146_220250253:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000429013:exon_220250146_220250253:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000460963:exon_220249308_220250253:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000522421:exon_220249876_220250253:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000322176:exon_220250153_220250253:DNPEP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 220473480 G/A 1 3 10 13 1.47120808844236 5.09597303852548 -3.62476495008312 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0532191285007243 ENSG00000144589:ENST00000456909:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000426736:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000475396:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000473899:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000254493:ENST00000295641:exon_220473305_220473510:STK11IP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 224743373 C/T 1 1 10 11 0.490402696147452 5.09597303852548 -4.60557034237803 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00550610186118297 ENSG00000085449:ENST00000462702:exon_224743246_224743405:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000233055:exon_224740064_224743447:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000352510:exon_224740065_224743447:WDFY1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 225346646 T/C 1 35 42 77 17.1640943651608 21.403086761807 -4.23899239664619 T:C T C 10 0.509597303852548 0.362743824380221 ENSG00000036257:ENST00000264414:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000344951:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409096:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409777:exon_225346609_225346795:CUL3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 225362478 C/T 1 14 15 29 6.86563774606433 7.64395955778822 -0.778321811723892 T:C C T 10 0.509597303852548 0.8535202569064 ENSG00000036257:ENST00000264414:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000344951:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409096:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409777:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000451538:exon_225362470_225362536:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000487558:exon_225362470_225362566:CUL3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 225365056 A/G 1 10 1 11 4.90402696147452 0.509597303852548 4.39442965762197 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0118772360206333 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 225750861 C/T 1 2 6 8 0.980805392294904 3.05758382311529 -2.07677843082038 T:C C T 10 0.509597303852548 0.171857042968518 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225750780_225750902:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225750780_225750902:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225750780_225750902:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000492369:exon_225750780_225750902:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000471810:exon_225750798_225750902:DOCK10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 230632268 G/A 1 113 123 236 55.4155046646621 62.6804683738634 -7.26496370920132 A:G G A 10 0.509597303852548 0.362277898763272 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230631930_230632466:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389045:exon_230632157_230632466:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230632157_230632466:TRIP12 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 230678598 C/T 1 6 4 10 2.94241617688471 2.03838921541019 0.90402696147452 T:C C T 10 0.509597303852548 0.75435926131823 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230678586_230678747:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389045:exon_230678586_230678747:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230678586_230678747:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000479037:exon_230678586_230678747:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000477441:exon_230678586_230678747:TRIP12 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 231072709 C/T 1 45 33 78 22.0681213266353 16.8167110271341 5.25141029950126 T:C C T 10 0.509597303852548 0.258081022016279 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000490880:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231072706_231072774:SP110 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 231159001 G/C 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 C:G G C 10 0.509597303852548 0.541646560898822 ENSG00000079263:ENST00000350136:exon_231158986_231159033:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392045:exon_231158986_231159033:SP140;ENSG00000079263:ENST00000417495:exon_231158986_231159033:SP140;ENSG00000079263:ENST00000343805:exon_231158986_231159033:SP140;ENSG00000079263:ENST00000420434:exon_231158986_231159033:SP140 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 231258150 C/T 1 4 12 16 1.96161078458981 6.11516764623058 -4.15355686164077 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0453868150142898 ENSG00000079263:ENST00000486687:exon_231258129_231258176:SP140;ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000483728:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000496870:exon_231258129_231258176:SP140L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 231333763 A/G 1 80 79 159 39.2322156917962 40.2581870043513 -1.02597131255513 A:G A G 10 0.509597303852548 0.874354542787158 ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000413284:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000452345:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494508:exon_231333547_231333811:SP100 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 231338211 T/G 1 15 17 32 7.35604044221178 8.66315416549332 -1.30711372328154 T:G T G 10 0.509597303852548 0.724804338583044 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 231407663 C/T 1 9 10 19 4.41362426532707 5.09597303852548 -0.682348773198411 T:C C T 10 0.509597303852548 0.821015503596854 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231407551_231407898:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231407551_231410317:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231407551_231408805:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231407551_231407837:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231407551_231408805:SP100 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 231683334 C/T 1 7 12 19 3.43281887303216 6.11516764623058 -2.68234877319841 T:C C T 10 0.509597303852548 0.255561328037084 ENSG00000135932:ENST00000258418:exon_231683231_231685790:CAB39;ENSG00000135932:ENST00000409788:exon_231683231_231683465:CAB39;ENSG00000135932:ENST00000410084:exon_231683231_231683419:CAB39 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 231774844 G/A 1 6 2 8 2.94241617688471 1.0191946077051 1.92322156917962 A:G G A 10 0.509597303852548 0.289787629707581 ENSG00000135898:ENST00000444078:exon_231774337_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392040:exon_231772043_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392039:exon_231774581_231775811:GPR55 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 232320581 T/G 1 10 20 30 4.90402696147452 10.191946077051 -5.28791911557644 T:G T G 10 0.509597303852548 0.0668760308425303 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 232325349 C/A 1 11 4 15 5.39442965762197 2.03838921541019 3.35604044221178 A:C C A 10 0.509597303852548 0.119482056883178 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 232326801 A/T 1 8 8 16 3.92322156917962 4.07677843082038 -0.153556861640768 A:T A T 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 233410294 C/T 1 7 1 8 3.43281887303216 0.509597303852548 2.92322156917962 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0707155477569663 ENSG00000196811:ENST00000389494:exon_233410253_233411113:CHRNG;ENSG00000196811:ENST00000389492:exon_233410253_233410426:CHRNG HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 234113057 G/A 1 17 17 34 8.33684583450668 8.66315416549332 -0.326308330986631 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000168918:ENST00000359570:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000450745:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000455936:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000415617:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000445964:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000435188:exon_234112772_234113363:INPP5D HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 234749722 T/G 1 33 21 54 16.1832889728659 10.7015433809035 5.48174559196241 T:G T G 10 0.509597303852548 0.172938274158707 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 234750542 G/C 1 9 10 19 4.41362426532707 5.09597303852548 -0.682348773198411 C:G G C 10 0.509597303852548 0.821015503596854 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 234750831 T/C 1 9 1 10 4.41362426532707 0.509597303852548 3.90402696147452 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0217112146317356 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000453122:exon_234750762_234750851:HJURP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 238668802 A/G 1 34 28 62 16.6736916690134 14.2687245078713 2.40496716114203 A:G A G 10 0.509597303852548 0.611876130589046 ENSG00000124831:ENST00000308482:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000391999:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000483443:exon_238668707_238668848:LRRFIP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 238671328 A/G 1 98 83 181 48.0594642224503 42.2965762197615 5.76288800268881 A:G A G 10 0.509597303852548 0.413866907972235 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 238672691 A/G 1 114 114 228 55.9059073608095 58.0940926391905 -2.18818527838094 A:G A G 10 0.509597303852548 0.791276874047986 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 238672703 C/G 1 106 116 222 51.9826857916299 59.1132872468956 -7.13060145526565 C:G C G 10 0.509597303852548 0.347916887595123 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 240946766 T/C 1 29 17 46 14.2216781882761 8.66315416549332 5.55852402278279 T:C T C 10 0.509597303852548 0.106726615242147 ENSG00000130414:ENST00000419408:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000476216:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000422018:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000444548:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000448880:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240946733_240946787:NDUFA10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 240961728 T/C 1 5 11 16 2.45201348073726 5.60557034237803 -3.15355686164077 T:C T C 10 0.509597303852548 0.136896620322009 ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000407129:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000497536:exon_240961589_240961757:NDUFA10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 241516096 C/T 1 10 6 16 4.90402696147452 3.05758382311529 1.84644313835923 T:C C T 10 0.509597303852548 0.45584747299355 ENSG00000142327:ENST00000451363:exon_241515952_241516144:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000270357:exon_241515952_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000486058:exon_241515952_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000481757:exon_241513530_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000493398:exon_241515952_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000464550:exon_241515952_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000471657:exon_241515952_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000437406:exon_241515985_241516182:RNPEPL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 241536126 A/G 1 7 7 14 3.43281887303216 3.56718112696784 -0.134362253935672 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241536098_241536359:CAPN10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 241537421 G/A 1 10 7 17 4.90402696147452 3.56718112696784 1.33684583450668 A:G G A 10 0.509597303852548 0.630150764673374 ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000352879:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000357048:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000416591:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000354082:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000391983:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000493058:exon_241537305_241537504:CAPN10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 242054718 G/A 1 8 5 13 3.92322156917962 2.54798651926274 1.37523504991688 A:G G A 10 0.509597303852548 0.581979954468297 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242054703_242054828:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242054703_242054828:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242054703_242054828:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242054703_242054828:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242054703_242054828:PASK HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 242065601 C/T 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 T:C C T 10 0.509597303852548 0.499988077920146 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 242066314 T/C 1 16 11 27 7.84644313835923 5.60557034237803 2.2408727959812 T:C T C 10 0.509597303852548 0.444354653770125 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 242573211 T/C 1 30 20 50 14.7120808844236 10.191946077051 4.5201348073726 T:C T C 10 0.509597303852548 0.206794590580175 ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 242610172 A/G 1 28 20 48 13.7312754921287 10.191946077051 3.5393294150777 A:G A G 10 0.509597303852548 0.316608527010543 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242609976_242610197:ATG4B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 242610773 T/A 1 31 22 53 15.202483580571 11.2111406847561 3.99134289581496 A:T T A 10 0.509597303852548 0.336279197306881 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610727_242610840:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610727_242612014:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610727_242612046:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610727_242610781:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610727_242610984:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242610727_242611332:ATG4B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 242618050 A/G 1 57 31 88 27.9529536804048 15.797516419429 12.1554372609758 A:G A G 10 0.509597303852548 0.01028656251147 ENSG00000168393:ENST00000305784:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000400770:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000472618:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000445261:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000432348:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000420144:exon_242617867_242618064:DTYMK HGDP00232_parsed_pileup.txt . 2 242707101 A/G 1 1 7 8 0.490402696147452 3.56718112696784 -3.07677843082038 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0357022765843499 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 259818 G/A 1 7 7 14 3.43281887303216 3.56718112696784 -0.134362253935672 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_259813_259971:C20orf96 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 371972 T/C 1 13 6 19 6.37523504991688 3.05758382311529 3.31765122680159 T:C T C 10 0.509597303852548 0.168554935531064 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000449710:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_371931_372223:TRIB3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 377226 C/T 1 10 22 32 4.90402696147452 11.2111406847561 -6.30711372328153 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0326425137283316 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_376842_378203:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_376842_378197:TRIB3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 2634851 C/T 1 3 11 14 1.47120808844236 5.60557034237803 -4.13436225393567 T:C C T 10 0.509597303852548 0.032165591851746 ENSG00000101361:ENST00000494697:exon_2634822_2634954:NOP56 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 2635504 T/C 1 27 36 63 13.2408727959812 18.3455029386917 -5.10463014271052 T:C T C 10 0.509597303852548 0.209487369401404 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2635395_2635593:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2635395_2635593:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000494697:exon_2635395_2635593:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000469588:exon_2635395_2635593:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000445139:exon_2635395_2635593:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000460258:exon_2635395_2635593:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000496775:exon_2635395_2635593:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480992:exon_2635435_2635593:NOP56 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 2638579 T/C 1 923 916 1839 452.641688544098 466.791130328934 -14.1494417848357 A:T:C T C 10 0.509597303852548 0.513787898625509 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000462630:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467857:exon_2638575_2639039:NOP56 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 2638727 G/A 1 823 797 1620 403.601418929353 406.149051170481 -2.5476322411277 A:G G A 10 0.509597303852548 0.901147002811061 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000462630:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467857:exon_2638575_2639039:NOP56 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 2816327 A/G 1 52 68 120 25.5009401996675 34.6526166619733 -9.15167646230576 A:G A G 10 0.509597303852548 0.100569201579822 ENSG00000132635:ENST00000356872:exon_2815960_2816355:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000360652:exon_2815960_2816355:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000474714:exon_2815960_2816355:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000478539:exon_2815960_2816355:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000487501:exon_2815960_2816355:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000434800:exon_2815971_2816355:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000436952:exon_2815971_2816355:FAM113A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 2816376 A/G 1 5 5 10 2.45201348073726 2.54798651926274 -0.0959730385254796 A:G A G 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 2818801 T/C 1 3 7 10 1.47120808844236 3.56718112696784 -2.09597303852548 T:C T C 10 0.509597303852548 0.218348598150516 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 2969015 C/G 1 9 7 16 4.41362426532707 3.56718112696784 0.846443138359232 C:G C G 10 0.509597303852548 0.80419746365061 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2968984_2969120:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000455631:exon_2968984_2969120:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_2968984_2969120:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_2968984_2969120:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_2968984_2969120:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_2968984_2969120:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_2968984_2969120:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_2968984_2969120:PTPRA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 3128578 A/C 1 4 8 12 1.96161078458981 4.07677843082038 -2.11516764623058 A:C A C 10 0.509597303852548 0.258556419599671 ENSG00000215251:ENST00000380266:exon_3127165_3129906:FASTKD5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 3193842 C/A 1 11 9 20 5.39442965762197 4.58637573467293 0.808053922949041 A:C C A 10 0.509597303852548 0.824451040790607 ENSG00000125877:ENST00000483354:exon_3193815_3193872:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000460676:exon_3193815_3193872:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000380113:exon_3193815_3193872:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000455664:exon_3193815_3193872:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000460550:exon_3193815_3193872:ITPA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 3193978 G/A 1 18 6 24 8.82724853065414 3.05758382311529 5.76966470753885 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0232420567134879 ENSG00000125877:ENST00000460676:exon_3193965_3194072:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000380113:exon_3193965_3194029:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000455664:exon_3193965_3194029:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000490838:exon_3193902_3194029:ITPA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 5166418 G/A 1 10 4 14 4.90402696147452 2.03838921541019 2.86563774606433 A:G G A 10 0.509597303852548 0.180690507474734 ENSG00000101290:ENST00000460006:exon_5166404_5166472:CDS2;ENSG00000101290:ENST00000379062:exon_5166404_5166472:CDS2;ENSG00000101290:ENST00000450570:exon_5166404_5166472:CDS2;ENSG00000101290:ENST00000468817:exon_5166404_5166472:CDS2;ENSG00000101290:ENST00000379070:exon_5166404_5166472:CDS2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 5559143 G/A 1 7 10 17 3.43281887303216 5.09597303852548 -1.66315416549332 A:G G A 10 0.509597303852548 0.473469847150149 ENSG00000125772:ENST00000378992:exon_5559026_5559257:GPCPD1;ENSG00000125772:ENST00000379019:exon_5559026_5559257:GPCPD1;ENSG00000125772:ENST00000481038:exon_5559026_5559257:GPCPD1;ENSG00000125772:ENST00000481690:exon_5559026_5559257:GPCPD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 5844121 C/T 1 4 8 12 1.96161078458981 4.07677843082038 -2.11516764623058 T:C:G C T 10 0.509597303852548 0.258556419599671 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 5844122 A/G 1 4 8 12 1.96161078458981 4.07677843082038 -2.11516764623058 A:G A G 10 0.509597303852548 0.258556419599671 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 7963041 C/T 1 24 35 59 11.7696647075388 17.8359056348392 -6.06624092730033 T:C C T 10 0.509597303852548 0.119748060442106 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7957995_7963268:TMX4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 13695680 C/T 1 62 68 130 30.404967161142 34.6526166619733 -4.24764950083124 T:C C T 10 0.509597303852548 0.483364623553676 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13694969_13695814:ESF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 13747441 A/G 1 28 57 85 13.7312754921287 29.0470463195952 -15.3157708274666 A:G A G 10 0.509597303852548 0.00102689887965855 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13747424_13747571:ESF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 17596155 C/A 1 5 10 15 2.45201348073726 5.09597303852548 -2.64395955778822 A:C C A 10 0.509597303852548 0.20250907335495 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17596076_17596174:RRBP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 17600357 G/A 1 23 12 35 11.2792620113914 6.11516764623058 5.16409436516082 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0915890377944762 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17599241_17600462:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17600278_17600373:RRBP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 25276297 G/A 1 5 6 11 2.45201348073726 3.05758382311529 -0.605570342378028 A:G G A 10 0.509597303852548 0.770507260060939 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25276240_25276306:PYGB;ENSG00000100994:ENST00000428458:exon_25276240_25276306:PYGB;ENSG00000100994:ENST00000471359:exon_25276240_25276306:PYGB HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 25282944 A/G 1 6 10 16 2.94241617688471 5.09597303852548 -2.15355686164077 A:G A G 10 0.509597303852548 0.324290953365588 ENSG00000100997:ENST00000376542:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000376517:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000339157:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000526543:exon_25282855_25282982:ABHD12 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 30381758 G/C 1 12 26 38 5.88483235376942 13.2495299001662 -7.36469754639682 C:G G C 10 0.509597303852548 0.0219844127777369 ENSG00000088325:ENST00000300403:exon_30381651_30381827:TPX2;ENSG00000088325:ENST00000340513:exon_30381651_30381827:TPX2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 30753270 T/C 1 12 15 27 5.88483235376942 7.64395955778822 -1.7591272040188 T:C T C 10 0.509597303852548 0.56601930423381 ENSG00000101337:ENST00000398022:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000375795:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000421148:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000217315:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000413032:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000495749:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000479591:exon_30753098_30753390:TM9SF4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 32883308 G/A 1 6 8 14 2.94241617688471 4.07677843082038 -1.13436225393567 A:G G A 10 0.509597303852548 0.601095068648336 ENSG00000101444:ENST00000217426:exon_32883201_32883391:AHCY;ENSG00000101444:ENST00000480653:exon_32883201_32883391:AHCY;ENSG00000101444:ENST00000468908:exon_32883201_32883391:AHCY;ENSG00000101444:ENST00000473516:exon_32883235_32883391:AHCY HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 33764554 A/G 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 A:G A G 10 0.509597303852548 0.499988077920146 ENSG00000101000:ENST00000374477:exon_33764501_33765165:PROCR;ENSG00000101000:ENST00000216968:exon_33764501_33765164:PROCR HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 33867924 G/A 0 19 0 19 9.31765122680159 0 9.31765122680159 G G 10 0.509597303852548 4.05704320760684e-06 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 33872311 G/C 1 16 2 18 7.84644313835923 1.0191946077051 6.82724853065414 C:G G C 10 0.509597303852548 0.00135714812921251 ENSG00000242372:ENST00000440766:exon_33872184_33872326:EIF6;ENSG00000242372:ENST00000374436:exon_33872184_33872518:EIF6;ENSG00000242372:ENST00000462894:exon_33872184_33872505:EIF6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 34218673 G/C 1 35 4 39 17.1640943651608 2.03838921541019 15.1257051497506 C:G G C 10 0.509597303852548 3.94606272715914e-07 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34218361_34218956:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34218663_34218717:CPNE1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 34218674 G/A 1 37 5 42 18.1448997574557 2.54798651926274 15.596913238193 A:G G A 10 0.509597303852548 5.27233863513942e-07 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34218361_34218956:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34218663_34218717:CPNE1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 34219496 T/C 1 48 23 71 23.5393294150777 11.7207379886086 11.8185914264691 T:C T C 10 0.509597303852548 0.00597157207825953 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000412056:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000486021:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414664:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000416778:exon_34219416_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439806:exon_34219434_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439669:exon_34219481_34219500:CPNE1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 34243017 C/T 1 7 15 22 3.43281887303216 7.64395955778822 -4.21114068475606 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0881542987232215 ENSG00000244462:ENST00000374114:exon_34236847_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000359646:exon_34238064_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000374104:exon_34238248_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000424458:exon_34242372_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000431148:exon_34242815_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000435161:exon_34242843_34243266:RBM12 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 34502107 G/A 1 15 12 27 7.35604044221178 6.11516764623058 1.2408727959812 A:G G A 10 0.509597303852548 0.702536459516712 ENSG00000025293:ENST00000374012:exon_34501955_34502119:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000439301:exon_34501955_34502119:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000373994:exon_34501955_34502119:PHF20 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 35661258 T/G 1 9 7 16 4.41362426532707 3.56718112696784 0.846443138359232 T:G T G 10 0.509597303852548 0.80419746365061 ENSG00000080839:ENST00000373664:exon_35661068_35661279:RBL1;ENSG00000080839:ENST00000344359:exon_35661068_35661279:RBL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 35865054 C/T 1 186 156 342 91.2149014834261 79.4971794009975 11.7177220824286 T:C C T 10 0.509597303852548 0.213686132754089 ENSG00000118705:ENST00000237530:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373622:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000338768:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373628:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000397161:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000437329:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000470352:exon_35864983_35865112:RPN2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 36634618 C/T 1 8 5 13 3.92322156917962 2.54798651926274 1.37523504991688 T:C C T 10 0.509597303852548 0.581979954468297 ENSG00000101407:ENST00000373448:exon_36634599_36634799:TTI1;ENSG00000101407:ENST00000373447:exon_36634599_36634799:TTI1;ENSG00000101407:ENST00000449821:exon_36634599_36634799:TTI1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 36668874 G/A 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 A:G G A 10 0.509597303852548 0.541646560898822 ENSG00000101413:ENST00000373433:exon_36668837_36668966:RPRD1B;ENSG00000101413:ENST00000495457:exon_36668837_36668966:RPRD1B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 36718059 G/A 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 A:G G A 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 37396120 A/G 1 9 11 20 4.41362426532707 5.60557034237803 -1.19194607705096 A:G A G 10 0.509597303852548 0.658614646611609 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37396107_37396239:ACTR5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 37400490 G/A 1 25 10 35 12.2600674036863 5.09597303852548 7.16409436516082 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0173648467491578 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37400202_37400834:ACTR5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 37400506 C/T 1 25 13 38 12.2600674036863 6.62476495008312 5.63530245360318 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0749480494555229 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37400202_37400834:ACTR5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 42089511 T/C 1 121 98 219 59.3387262338417 49.9405357775497 9.39819045629199 T:C T C 10 0.509597303852548 0.223739015531946 ENSG00000124193:ENST00000244020:exon_42089343_42092245:SRSF6;ENSG00000124193:ENST00000483871:exon_42089343_42092245:SRSF6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 42826105 T/G 1 36 39 75 17.6544970613083 19.8742948502494 -2.2197977889411 T:G T G 10 0.509597303852548 0.64504647447975 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 43566787 A/G 1 6 10 16 2.94241617688471 5.09597303852548 -2.15355686164077 A:G A G 10 0.509597303852548 0.324290953365588 ENSG00000101104:ENST00000255136:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000421240:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372821:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217073:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000476056:exon_43566686_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372824:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372819:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217075:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000479873:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372826:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000474208:exon_43566743_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000489068:exon_43566686_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372822:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000482486:exon_43566484_43566832:PABPC1L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 44052992 G/A 1 13 8 21 6.37523504991688 4.07677843082038 2.29845661909649 A:G G A 10 0.509597303852548 0.385166903646358 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44052856_44053021:PIGT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 44469120 C/T 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:C C T 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 44578844 C/G 1 7 1 8 3.43281887303216 0.509597303852548 2.92322156917962 C:G C G 10 0.509597303852548 0.0707155477569663 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 44581348 G/A 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 A:G G A 10 0.509597303852548 0.541646560898822 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44581237_44581348:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000243961:exon_44581237_44581348:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44581237_44581348:ZNF335 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 44691350 T/G 1 9 10 19 4.41362426532707 5.09597303852548 -0.682348773198411 T:G T G 10 0.509597303852548 0.821015503596854 ENSG00000124160:ENST00000290231:exon_44689624_44691528:NCOA5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 45853037 A/G 1 18 21 39 8.82724853065414 10.7015433809035 -1.87429485024937 A:G A G 10 0.509597303852548 0.631713408514061 ENSG00000101040:ENST00000360911:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000311275:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000458360:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000467200:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000262975:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000471951:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000352431:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000396281:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000355972:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000461685:exon_45852970_45853209:ZMYND8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 45874947 C/T 1 6 13 19 2.94241617688471 6.62476495008312 -3.68234877319841 T:C C T 10 0.509597303852548 0.109568590849031 ENSG00000101040:ENST00000360911:exon_45874752_45875261:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000311275:exon_45874752_45875261:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000458360:exon_45874752_45875261:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000467200:exon_45874752_45875261:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000262975:exon_45874752_45875261:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000471951:exon_45874752_45875261:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000352431:exon_45874752_45875261:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000446994:exon_45874837_45875261:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000396281:exon_45874752_45875261:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000355972:exon_45874752_45875261:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000461685:exon_45874752_45875261:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000468376:exon_45874752_45875261:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000372023:exon_45874752_45875261:ZMYND8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 46268493 A/G 1 10 15 25 4.90402696147452 7.64395955778822 -2.7399325963137 A:G A G 10 0.509597303852548 0.319768319837023 ENSG00000124151:ENST00000372004:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000341724:exon_46268366_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000340189:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371998:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371997:exon_46268366_46268566:NCOA3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 48522734 A/C 1 9 8 17 4.41362426532707 4.07677843082038 0.336845834506684 A:C A C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 49196284 C/T 1 7 8 15 3.43281887303216 4.07677843082038 -0.64395955778822 T:C C T 10 0.509597303852548 0.800365558868668 ENSG00000196396:ENST00000371621:exon_49196240_49196463:PTPN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 56179586 G/A 1 8 15 23 3.92322156917962 7.64395955778822 -3.7207379886086 A:G G A 10 0.509597303852548 0.145402204219230 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56178902_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56178902_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56178906_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56179111_56179825:ZBP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 56185303 G/A 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000357677:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000343535:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000453793:exon_56185205_56185321:ZBP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 56189985 C/G 1 5 11 16 2.45201348073726 5.60557034237803 -3.15355686164077 C:G C G 10 0.509597303852548 0.136896620322009 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56189943_56190116:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56189943_56190116:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56189943_56190116:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56189943_56190116:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000357677:exon_56189943_56190116:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000343535:exon_56189943_56190116:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000480037:exon_56189943_56190116:ZBP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 56190634 C/T 1 6 2 8 2.94241617688471 1.0191946077051 1.92322156917962 T:C C T 10 0.509597303852548 0.289787629707581 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56190568_56193137:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000357677:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000343535:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000480037:exon_56190568_56191524:ZBP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 57478807 C/T 1 126 117 243 61.790739714579 59.6228845507481 2.16785516383084 T:C C T 10 0.509597303852548 0.797704425242481 ENSG00000087460:ENST00000313949:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371075:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000419558:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000472183:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000462499:exon_57478727_57478829:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000482112:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000490374:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467227:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371100:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371102:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464624:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000450130:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000349036:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488546:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000481039:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468895:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467321:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000477931:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000485673:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000470512:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464788:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000469431:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000478585:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000474497:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480975:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480232:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371095:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371085:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000354359:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000265620:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000306090:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371082:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488652:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476935:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468942:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000492907:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487862:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000496934:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476196:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000494081:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487981:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000493958:exon_57478796_57478846:GNAS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 57564695 C/T 1 12 4 16 5.88483235376942 2.03838921541019 3.84644313835923 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0776723690771564 ENSG00000101158:ENST00000344018:exon_57564543_57564695:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000482747:exon_57563969_57564695:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000460601:exon_57564543_57564695:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000477741:exon_57564543_57564695:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000474543:exon_57564543_57564695:TH1L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 57571763 A/G 1 32 60 92 15.6928862767185 30.5758382311529 -14.8829519544344 A:G A G 10 0.509597303852548 0.00232016475302586 ENSG00000101160:ENST00000217131:exon_57571694_57571856:CTSZ HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 57572839 G/T 1 10 9 19 4.90402696147452 4.58637573467293 0.317651226801589 T:G G T 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 60962943 T/C 1 3992 3635 7627 1957.68756302063 1852.38619950401 105.301363516616 A:T:C T C 10 0.509597303852548 0.0161661002251618 ENSG00000171858:ENST00000317311:exon_60962899_60962970:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370592:exon_60962899_60963171:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000492356:exon_60962899_60962970:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000343986:exon_60962899_60962970:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000450116:exon_60962899_60963057:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370562:exon_60962667_60963576:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000337102:exon_60962900_60962970:RPS21 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 60963494 C/T 1 55 23 78 26.9721482881099 11.7207379886086 15.2514102995013 T:C C T 10 0.509597303852548 0.000596095796981959 ENSG00000171858:ENST00000492356:exon_60963365_60963575:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370562:exon_60962667_60963576:RPS21 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 61303271 G/A 1 27 11 38 13.2408727959812 5.60557034237803 7.63530245360318 A:T:G G A 10 0.509597303852548 0.0145085035936770 ENSG00000101187:ENST00000370512:exon_61303102_61303647:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000217159:exon_61303102_61303647:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000497209:exon_61303102_61303645:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000370507:exon_61303102_61303645:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000342674:exon_61303220_61303363:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000466961:exon_61303102_61303506:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000451793:exon_61303102_61303645:SLCO4A1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 61439696 C/G 1 5 9 14 2.45201348073726 4.58637573467293 -2.13436225393567 C:G C G 10 0.509597303852548 0.293559675506127 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 61443716 G/A 1 23 16 39 11.2792620113914 8.15355686164077 3.12570514975063 A:G G A 10 0.509597303852548 0.340263204985614 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370468:exon_61443582_61444281:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61443582_61444558:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61443582_61444558:OGFR HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 61468571 T/C 1 3 7 10 1.47120808844236 3.56718112696784 -2.09597303852548 T:C T C 10 0.509597303852548 0.218348598150516 ENSG00000092758:ENST00000343916:exon_61468435_61468617:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000466192:exon_61468435_61468617:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000462700:exon_61468435_61468617:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000467819:exon_61468435_61468617:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000466532:exon_61468274_61468617:COL9A3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 61869826 C/T 1 2 7 9 0.980805392294904 3.56718112696784 -2.58637573467293 T:C C T 10 0.509597303852548 0.103145007117103 ENSG00000101197:ENST00000342412:exon_61869748_61869829:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000217169:exon_61869748_61869829:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000370327:exon_61869748_61869829:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000395306:exon_61869554_61869829:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000426135:exon_61869560_61869829:BIRC7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 62191321 A/G 1 7 7 14 3.43281887303216 3.56718112696784 -0.134362253935672 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 62193019 C/T 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 T:C C T 10 0.509597303852548 0.335037018547339 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 62200576 G/A 0 10 0 10 4.90402696147452 0 4.90402696147452 G G 10 0.509597303852548 0.00198556249985287 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 62200860 A/G 1 7 4 11 3.43281887303216 2.03838921541019 1.39442965762197 A:G A G 10 0.509597303852548 0.549658645750086 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 62200929 G/A 0 0 10 10 0 5.09597303852548 -5.09597303852548 A G A 10 0.509597303852548 0.000804504526384197 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 62236148 T/C 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 T:C T C 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000101216:ENST00000266068:exon_62236096_62236193:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370069:exon_62236096_62236255:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370077:exon_62236096_62236193:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000447518:exon_62236096_62236193:GMEB2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 62321189 C/T 1 12 1 13 5.88483235376942 0.509597303852548 5.37523504991688 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00348827153835016 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000425905:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62321103_62321563:RTEL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 62595547 C/T 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 T:C C T 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000196700:ENST00000369888:exon_62595424_62595570:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000217130:exon_62595424_62595570:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000450537:exon_62595424_62595570:ZNF512B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 62663235 C/T 1 6 7 13 2.94241617688471 3.56718112696784 -0.624764950083124 T:C C T 10 0.509597303852548 0.786978111840725 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 62664365 C/T 1 39 85 124 19.1257051497506 43.3157708274666 -24.1900656777159 T:C C T 10 0.509597303852548 1.32765922293748e-05 ENSG00000101161:ENST00000266079:exon_62664194_62664453:PRPF6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 20 62703490 C/T 1 8 6 14 3.92322156917962 3.05758382311529 0.865637746064328 T:C C T 10 0.509597303852548 0.79106698341654 ENSG00000171703:ENST00000461072:exon_62703223_62703699:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000475236:exon_62703223_62703699:TCEA2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 15918577 G/C 1 7 3 10 3.43281887303216 1.52879191155764 1.90402696147452 C:G G C 10 0.509597303852548 0.344656245175514 ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15918526_15918664:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400564:exon_15918526_15918662:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000493640:exon_15918526_15918634:SAMSN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 19169155 G/C 1 6 14 20 2.94241617688471 7.13436225393567 -4.19194607705096 C:G G C 10 0.509597303852548 0.0737108731541632 ENSG00000154642:ENST00000284881:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400559:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400558:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000405964:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000493464:exon_19169040_19169435:C21orf91 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 30714776 T/C 1 2 12 14 0.980805392294904 6.11516764623058 -5.13436225393567 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0064484390483877 ENSG00000156273:ENST00000286800:exon_30714720_30718469:BACH1;ENSG00000156273:ENST00000399921:exon_30714720_30718469:BACH1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 33068962 T/C 1 7 2 9 3.43281887303216 1.0191946077051 2.41362426532707 T:C T C 10 0.509597303852548 0.180412718745071 ENSG00000156304:ENST00000435228:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000419806:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000434667:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000286835:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000399804:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000467731:exon_33068882_33069049:SFRS15 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 34614255 T/G 1 21 17 38 10.2984566190965 8.66315416549332 1.63530245360318 T:G T G 10 0.509597303852548 0.629525463794102 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 34617213 T/C 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 T:C T C 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 34715699 G/C 1 11 2 13 5.39442965762197 1.0191946077051 4.37523504991688 C:G G C 10 0.509597303852548 0.022769928287595 ENSG00000142166:ENST00000270139:exon_34715574_34715728:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000442357:exon_34715574_34715728:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000416947:exon_34715574_34715728:IFNAR1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 34787312 A/G 1 21 21 42 10.2984566190965 10.7015433809035 -0.403086761807014 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000159128:ENST00000290219:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000439213:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000381995:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000405436:exon_34787195_34787327:IFNGR2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 34883618 T/C 1 26 9 35 12.7504700998338 4.58637573467293 8.16409436516082 T:C T C 10 0.509597303852548 0.00630458694419982 ENSG00000159131:ENST00000414353:exon_34883559_34883664:GART;ENSG00000159131:ENST00000381831:exon_34883559_34883765:GART;ENSG00000159131:ENST00000381815:exon_34883559_34883765:GART;ENSG00000159131:ENST00000381839:exon_34883559_34883765:GART;ENSG00000159131:ENST00000424203:exon_34883559_34883765:GART HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 34924243 T/C 1 12 17 29 5.88483235376942 8.66315416549332 -2.77832181172389 T:C T C 10 0.509597303852548 0.354840351239223 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 34925689 G/A 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 A:G G A 10 0.509597303852548 0.541646560898822 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 34957045 A/G 1 8 5 13 3.92322156917962 2.54798651926274 1.37523504991688 A:G A G 10 0.509597303852548 0.581979954468297 ENSG00000159147:ENST00000453626:exon_34956896_34957074:DONSON;ENSG00000159147:ENST00000303071:exon_34956896_34957074:DONSON;ENSG00000159147:ENST00000417871:exon_34956896_34957074:DONSON;ENSG00000159147:ENST00000444517:exon_34956896_34957074:DONSON;ENSG00000159147:ENST00000442660:exon_34956896_34957074:DONSON;ENSG00000159147:ENST00000437395:exon_34956896_34957074:DONSON;ENSG00000159147:ENST00000432378:exon_34956896_34957074:DONSON;ENSG00000159147:ENST00000440810:exon_34956896_34957074:DONSON;ENSG00000249209:ENST00000429238:exon_34956993_34957074:AP000304.12 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 35281421 T/C 1 176 217 393 86.3108745219516 110.582614936003 -24.2717404140514 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0153701212443301 ENSG00000249209:ENST00000429238:exon_35281386_35281515:AP000304.12;ENSG00000241837:ENST00000491703:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000290299:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000495005:exon_35281118_35281515:ATP5O HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 38525356 T/C 1 8 10 18 3.92322156917962 5.09597303852548 -1.17275146934586 T:C T C 10 0.509597303852548 0.642260839788311 ENSG00000182670:ENST00000418766:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000485402:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000438055:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000414818:exon_38525251_38525577:TTC3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 38563725 G/A 1 10 19 29 4.90402696147452 9.68234877319841 -4.77832181172389 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0940253795712215 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38563635_38563725:TTC3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 38568009 G/C 1 22 17 39 10.7888593152439 8.66315416549332 2.12570514975063 C:G G C 10 0.509597303852548 0.52539752156904 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 38568308 C/T 1 6 9 15 2.94241617688471 4.58637573467293 -1.64395955778822 T:C C T 10 0.509597303852548 0.446901967950042 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 38600537 G/A 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 A:G G A 10 0.509597303852548 0.5085374516326 ENSG00000157538:ENST00000471543:exon_38600524_38600597:DSCR3;ENSG00000157538:ENST00000309117:exon_38600524_38600674:DSCR3;ENSG00000157538:ENST00000399000:exon_38600524_38600674:DSCR3;ENSG00000157538:ENST00000497493:exon_38600524_38601784:DSCR3;ENSG00000157538:ENST00000288304:exon_38600524_38600642:DSCR3;ENSG00000157538:ENST00000399001:exon_38600524_38600674:DSCR3;ENSG00000157538:ENST00000476950:exon_38600524_38600674:DSCR3;ENSG00000157538:ENST00000488368:exon_38600524_38600674:DSCR3;ENSG00000157538:ENST00000398998:exon_38600524_38600674:DSCR3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 40552307 A/G 1 32 22 54 15.6928862767185 11.2111406847561 4.48174559196241 A:G A G 10 0.509597303852548 0.276102663149457 ENSG00000183527:ENST00000331573:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000440607:exon_40552211_40552364:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000411828:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000380900:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000431628:exon_40552211_40552362:PSMG1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 40571246 A/G 1 5 8 13 2.45201348073726 4.07677843082038 -1.62476495008312 A:G A G 10 0.509597303852548 0.415960200620574 ENSG00000185658:ENST00000333229:exon_40570689_40571588:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000446924:exon_40570689_40571588:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000342449:exon_40570689_40571588:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380804:exon_40570689_40571588:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380800:exon_40570689_40571588:BRWD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 43413651 T/C 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 T:C T C 10 0.509597303852548 0.499988077920146 ENSG00000173276:ENST00000398505:exon_43412602_43414217:ZNF295;ENSG00000173276:ENST00000310826:exon_43406940_43414217:ZNF295;ENSG00000173276:ENST00000416434:exon_43412602_43414217:ZNF295;ENSG00000173276:ENST00000398499:exon_43408746_43414217:ZNF295;ENSG00000173276:ENST00000398511:exon_43408746_43414217:ZNF295 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 43892875 G/A 0 10 0 10 4.90402696147452 0 4.90402696147452 G G 10 0.509597303852548 0.00198556249985287 ENSG00000160188:ENST00000291536:exon_43892596_43892980:RSPH1;ENSG00000160188:ENST00000493019:exon_43892596_43892980:RSPH1;ENSG00000160188:ENST00000398352:exon_43892807_43892980:RSPH1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 44283574 C/T 1 7 1 8 3.43281887303216 0.509597303852548 2.92322156917962 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0707155477569663 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44283550_44283706:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44283550_44283706:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44283550_44283706:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44283550_44283706:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000479429:exon_44283550_44283706:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000463902:exon_44283550_44283706:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000470658:exon_44283550_44283706:WDR4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 44283638 T/C 1 8 3 11 3.92322156917962 1.52879191155764 2.39442965762197 T:C T C 10 0.509597303852548 0.227512016275758 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44283550_44283706:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44283550_44283706:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44283550_44283706:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44283550_44283706:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000479429:exon_44283550_44283706:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000463902:exon_44283550_44283706:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000470658:exon_44283550_44283706:WDR4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 44323720 C/T 1 25 9 34 12.2600674036863 4.58637573467293 7.67369166901337 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0094646611741878 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 45209559 C/T 1 16 11 27 7.84644313835923 5.60557034237803 2.2408727959812 T:C C T 10 0.509597303852548 0.444354653770125 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45209394_45209643:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000475534:exon_45209394_45209576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000483896:exon_45209440_45209643:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45209446_45209643:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45209457_45209643:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000492638:exon_45209458_45209643:RRP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 45217450 C/T 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 T:C C T 10 0.509597303852548 0.5085374516326 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 45217559 T/C 1 29 34 63 14.2216781882761 17.3263083309866 -3.10463014271052 T:C T C 10 0.509597303852548 0.452021708472514 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000483896:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217512_45217576:RRP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 45217929 T/C 1 13 31 44 6.37523504991688 15.797516419429 -9.42228136951211 T:C T C 10 0.509597303852548 0.00600024426799346 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217788_45217981:RRP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 45219524 T/C 1 21 29 50 10.2984566190965 14.7783218117239 -4.4798651926274 T:C T C 10 0.509597303852548 0.257609870313266 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45219451_45219530:RRP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 45503121 G/A 1 12 3 15 5.88483235376942 1.52879191155764 4.35604044221178 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0356477356687783 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45502669_45503183:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45502669_45503183:TRAPPC10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 45506819 T/C 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 T:C T C 10 0.509597303852548 0.499988077920146 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45506683_45506841:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45506683_45506841:TRAPPC10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 45523416 C/T 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 T:C C T 10 0.509597303852548 0.541646560898822 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45523174_45526433:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45523174_45524614:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000459741:exon_45523174_45526433:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000468864:exon_45523174_45524932:TRAPPC10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 45538647 T/C 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 T:C T C 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45538644_45538714:PWP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 45540919 A/G 1 14 9 23 6.86563774606433 4.58637573467293 2.2792620113914 A:G A G 10 0.509597303852548 0.406879858723006 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45540833_45540983:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45540833_45542238:PWP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 45540976 C/T 1 8 16 24 3.92322156917962 8.15355686164077 -4.23033529246115 T:C C T 10 0.509597303852548 0.102508753648658 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45540833_45540983:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45540833_45542238:PWP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 45547913 C/A 1 12 12 24 5.88483235376942 6.11516764623058 -0.230335292461152 A:C C A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45547813_45548031:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000494310:exon_45547813_45548031:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000476948:exon_45547680_45548031:PWP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 45553596 T/C 1 10 14 24 4.90402696147452 7.13436225393567 -2.23033529246115 A:T:C T C 10 0.509597303852548 0.417388759331184 ENSG00000160221:ENST00000291577:exon_45553487_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000495007:exon_45553498_45554036:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000427803:exon_45553500_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000493883:exon_45553521_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000480786:exon_45553556_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000348499:exon_45553562_45553720:C21orf33 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 45564766 C/G 1 37 33 70 18.1448997574557 16.8167110271341 1.32818873032164 C:G C G 10 0.509597303852548 0.811420580881412 ENSG00000160221:ENST00000291577:exon_45564703_45565605:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000495007:exon_45564702_45564894:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000348499:exon_45564703_45565605:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000449622:exon_45564702_45565605:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000419699:exon_45564703_45564798:C21orf33 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 46308729 C/T 1 26 44 70 12.7504700998338 22.4222813695121 -9.67181126967836 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0228821378415587 ENSG00000160255:ENST00000475170:exon_46308608_46308810:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46308608_46308810:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46308608_46308810:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46308608_46308810:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46308608_46308810:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46308608_46308810:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46308608_46308810:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46308608_46308810:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46308608_46308810:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000479202:exon_46308608_46309046:ITGB2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 46313442 G/T 1 9 19 28 4.41362426532707 9.68234877319841 -5.26872450787134 T:G G T 10 0.509597303852548 0.0577645390368908 ENSG00000160255:ENST00000475170:exon_46313319_46313942:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46312832_46314975:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46313319_46313459:ITGB2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 46314899 T/C 1 21 8 29 10.2984566190965 4.07677843082038 6.22167818827611 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0248632287503733 ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46314886_46314975:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46314886_46314975:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46314886_46314975:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46312832_46314975:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46314886_46314975:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46314886_46314975:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46314886_46314975:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46314886_46314975:ITGB2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 46320313 C/T 1 15 10 25 7.35604044221178 5.09597303852548 2.2600674036863 T:C C T 10 0.509597303852548 0.4265061452616 ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000320216:exon_46320235_46320390:ITGB2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 46330674 C/A 1 7 8 15 3.43281887303216 4.07677843082038 -0.64395955778822 A:C C A 10 0.509597303852548 0.800365558868668 ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46330640_46330741:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523663:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000522931:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000517563:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000522688:exon_46330515_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000520389:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000524251:exon_46330515_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000517819:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397846:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000521995:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000518033:exon_46330236_46330700:ITGB2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 47614443 A/G 1 12 6 18 5.88483235376942 3.05758382311529 2.82724853065414 A:T:G A G 10 0.509597303852548 0.239448825994552 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000419093:exon_47614405_47614494:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47614405_47614575:LSS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 47614469 A/C 1 7 5 12 3.43281887303216 2.54798651926274 0.884832353769424 A:C A C 10 0.509597303852548 0.774912283175237 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000419093:exon_47614405_47614494:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47614405_47614575:LSS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 47686044 T/C 1 7 4 11 3.43281887303216 2.03838921541019 1.39442965762197 T:C T C 10 0.509597303852548 0.549658645750086 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47685839_47686080:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47685839_47686080:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47685839_47686866:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47685839_47686080:MCM3AP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 47851753 A/G 1 13 3 16 6.37523504991688 1.52879191155764 4.84644313835923 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0216395245326523 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47851443_47851892:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000482575:exon_47851443_47851949:PCNT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 47851796 G/A 1 11 8 19 5.39442965762197 4.07677843082038 1.31765122680159 A:G G A 10 0.509597303852548 0.648772677857544 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47851443_47851892:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000482575:exon_47851443_47851949:PCNT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 47855876 A/G 1 10 3 13 4.90402696147452 1.52879191155764 3.37523504991688 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0930569697494132 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47855817_47856061:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47855817_47856061:PCNT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 21 48064347 G/A 1 22 16 38 10.7888593152439 8.15355686164077 2.63530245360318 A:G G A 10 0.509597303852548 0.420962778880953 ENSG00000160310:ENST00000355680:exon_48064218_48064400:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397638:exon_48064218_48064400:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397637:exon_48064218_48064400:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000334494:exon_48064218_48064400:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397628:exon_48064218_48064400:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000458387:exon_48064218_48064400:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000291705:exon_48064218_48064400:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397634:exon_48064218_48064400:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000451211:exon_48064218_48064400:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000440086:exon_48064218_48064400:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000482508:exon_48064218_48064400:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000481861:exon_48064218_48064400:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000455177:exon_48064255_48064400:PRMT2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 17669306 T/C 1 4 7 11 1.96161078458981 3.56718112696784 -1.60557034237803 T:C T C 10 0.509597303852548 0.379319216476062 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000449907:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000330232:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000469063:exon_17669229_17669617:CECR1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 18111431 T/C 1 8 1 9 3.92322156917962 0.509597303852548 3.41362426532707 T:C T C 10 0.509597303852548 0.039373498903222 ENSG00000131100:ENST00000253413:exon_18111369_18111584:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399796:exon_18111369_18111513:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399798:exon_18111369_18111515:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000413576:exon_18111369_18111499:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000478963:exon_18111369_18111514:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000460085:exon_18111369_18111515:ATP6V1E1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 19776406 G/A 1 11 10 21 5.39442965762197 5.09597303852548 0.298456619096493 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000185838:ENST00000329517:exon_19770747_19776483:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000403325:exon_19775938_19776483:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000460402:exon_19775987_19776483:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000451413:exon_19776227_19776483:GNB1L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 19789541 A/C 1 42 28 70 20.596913238193 14.2687245078713 6.32818873032164 A:C A C 10 0.509597303852548 0.151264941740745 ENSG00000185838:ENST00000329517:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000403325:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000460402:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000451413:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000481086:exon_19789522_19789739:GNB1L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 19907099 C/A 1 7 2 9 3.43281887303216 1.0191946077051 2.41362426532707 A:C C A 10 0.509597303852548 0.180412718745071 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496729:exon_19907066_19907122:TXNRD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 19907118 G/A 1 7 3 10 3.43281887303216 1.52879191155764 1.90402696147452 A:G G A 10 0.509597303852548 0.344656245175514 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496729:exon_19907066_19907122:TXNRD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 20100409 C/T 1 1 10 11 0.490402696147452 5.09597303852548 -4.60557034237803 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00550610186118297 ENSG00000099899:ENST00000487668:exon_20099851_20100530:TRMT2A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 20113777 T/C 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 T:C T C 10 0.509597303852548 0.74955201040747 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 20131115 C/T 1 7 2 9 3.43281887303216 1.0191946077051 2.41362426532707 T:C C T 10 0.509597303852548 0.180412718745071 ENSG00000099904:ENST00000334554:exon_20130279_20131279:ZDHHC8;ENSG00000099904:ENST00000320602:exon_20130279_20131279:ZDHHC8;ENSG00000099904:ENST00000405930:exon_20130279_20131279:ZDHHC8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 20800835 A/G 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 A:G A G 10 0.509597303852548 0.5085374516326 ENSG00000099910:ENST00000429594:exon_20800730_20800907:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000328879:exon_20800730_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000399308:exon_20800766_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000451094:exon_20800772_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000440659:exon_20800730_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000417168:exon_20800771_20800963:KLHL22 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 20937201 C/T 1 8 6 14 3.92322156917962 3.05758382311529 0.865637746064328 T:C C T 10 0.509597303852548 0.79106698341654 ENSG00000099917:ENST00000433831:exon_20937127_20937254:MED15;ENSG00000099917:ENST00000437399:exon_20937127_20937254:MED15;ENSG00000099917:ENST00000425759:exon_20937127_20937254:MED15;ENSG00000099917:ENST00000292733:exon_20937127_20937254:MED15;ENSG00000099917:ENST00000263205:exon_20937127_20937254:MED15;ENSG00000099917:ENST00000406969:exon_20937127_20937254:MED15;ENSG00000099917:ENST00000382974:exon_20937127_20937254:MED15;ENSG00000099917:ENST00000492381:exon_20937127_20937254:MED15;ENSG00000099917:ENST00000478831:exon_20937127_20937254:MED15;ENSG00000099917:ENST00000489651:exon_20937127_20937254:MED15;ENSG00000099917:ENST00000473244:exon_20937127_20937254:MED15;ENSG00000099917:ENST00000493216:exon_20936381_20937534:MED15 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 20940085 G/A 1 24 16 40 11.7696647075388 8.15355686164077 3.61610784589808 A:G G A 10 0.509597303852548 0.271718331794593 ENSG00000099917:ENST00000433831:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000437399:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000425759:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000292733:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000263205:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000406969:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000382974:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000492381:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000489651:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000473244:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000493216:exon_20937617_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000461076:exon_20939388_20940090:MED15 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 21984205 A/G 1 13 12 25 6.37523504991688 6.11516764623058 0.2600674036863 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21984140_21984301:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21983597_21984320:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21984140_21984353:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21984140_21984353:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21984140_21984332:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21984140_21984327:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21984140_21984303:YDJC HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 22048862 C/T 1 5 8 13 2.45201348073726 4.07677843082038 -1.62476495008312 T:C C T 10 0.509597303852548 0.415960200620574 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 22049783 C/T 1 17 11 28 8.33684583450668 5.60557034237803 2.73127549212866 T:C C T 10 0.509597303852548 0.347429568613864 ENSG00000100023:ENST00000412327:exon_22049687_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000335025:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000398831:exon_22049683_22050712:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000456792:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000417788:exon_22049683_22052201:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000406385:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000446951:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000462188:exon_22049226_22049785:PPIL2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 23154586 A/T 0 0 197 197 0 100.390668858952 -100.390668858952 T A T 10 0.509597303852548 1.09373293675926e-61 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 23264785 C/A 0 13 0 13 6.37523504991688 0 6.37523504991688 C C 10 0.509597303852548 0.000251180398742274 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 23615946 G/A 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 A:G G A 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23615821_23615961:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23615821_23615961:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23615821_23615961:BCR;ENSG00000186716:ENST00000290956:exon_23615893_23615961:BCR;ENSG00000186716:ENST00000334149:exon_23615821_23615961:BCR;ENSG00000186716:ENST00000427791:exon_23615821_23615961:BCR HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 24108288 C/G 1 10 3 13 4.90402696147452 1.52879191155764 3.37523504991688 C:G C G 10 0.509597303852548 0.0930569697494132 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 24108412 G/A 1 122 92 214 59.8291289299891 46.8829519544344 12.9461769755547 A:G G A 10 0.509597303852548 0.08717044977955 ENSG00000250479:ENST00000476831:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000520222:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000401675:exon_24108315_24108483:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000484558:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000523865:exon_24108315_24108651:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000517886:exon_24108315_24108462:CHCHD10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 24167513 G/A 1 73 44 117 35.799396818764 22.4222813695121 13.3771154492519 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0158684814753262 ENSG00000099956:ENST00000344921:exon_24167412_24167602:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000263121:exon_24167412_24167602:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000407422:exon_24167412_24167602:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000407082:exon_24167412_24167602:SMARCB1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 24179132 G/A 1 24 21 45 11.7696647075388 10.7015433809035 1.06812132663534 A:G G A 10 0.509597303852548 0.767881263708305 ENSG00000099958:ENST00000404056:exon_24176690_24179404:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000290730:exon_24176690_24179341:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000464034:exon_24178921_24179149:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000488272:exon_24178921_24179149:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000318109:exon_24178921_24179149:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000476077:exon_24178921_24179341:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000464110:exon_24178954_24179341:DERL3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 24564477 C/T 1 7 2 9 3.43281887303216 1.0191946077051 2.41362426532707 T:C C T 10 0.509597303852548 0.180412718745071 ENSG00000099991:ENST00000263119:exon_24564415_24564489:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000405822:exon_24564415_24564489:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000398319:exon_24564415_24564489:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000403176:exon_24564415_24564489:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000337989:exon_24564415_24564489:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000485008:exon_24564415_24564489:CABIN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 25753231 G/A 1 8 6 14 3.92322156917962 3.05758382311529 0.865637746064328 A:G G A 10 0.509597303852548 0.79106698341654 ENSG00000100068:ENST00000467672:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402859:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000444995:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402785:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000474163:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000484509:exon_25753222_25753773:LRP5L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 26860269 G/C 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 C:G G C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000312736:exon_26860210_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000422379:exon_26860205_26860792:HPS4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 29196306 G/A 1 54 76 130 26.4817455919624 38.7293950927936 -12.2476495008312 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0350443790679952 ENSG00000100219:ENST00000216037:exon_29196286_29196585:XBP1;ENSG00000100219:ENST00000403532:exon_29196286_29196546:XBP1;ENSG00000100219:ENST00000344347:exon_29196286_29196544:XBP1;ENSG00000100219:ENST00000415306:exon_29196286_29196535:XBP1;ENSG00000100219:ENST00000482720:exon_29196286_29196557:XBP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 29621128 C/G 1 4 11 15 1.96161078458981 5.60557034237803 -3.64395955778822 C:G C G 10 0.509597303852548 0.0719657820440228 ENSG00000186998:ENST00000334018:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429226:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404755:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404820:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000426629:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429415:exon_29621128_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000448676:exon_29621128_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000435194:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000457925:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000484039:exon_29621122_29621205:EMID1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 29656389 G/T 1 39 22 61 19.1257051497506 11.2111406847561 7.91456446499457 T:G G T 10 0.509597303852548 0.0539000051193566 ENSG00000100263:ENST00000216085:exon_29656315_29656602:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000413137:exon_29656315_29656602:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000439641:exon_29656315_29656602:RHBDD3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 30367014 A/T 1 1 7 8 0.490402696147452 3.56718112696784 -3.07677843082038 A:T A T 10 0.509597303852548 0.0357022765843499 ENSG00000100330:ENST00000401950:exon_30366965_30367051:MTMR3;ENSG00000100330:ENST00000333027:exon_30366965_30367051:MTMR3;ENSG00000100330:ENST00000495098:exon_30366965_30367051:MTMR3;ENSG00000100330:ENST00000445401:exon_30366965_30367051:MTMR3;ENSG00000100330:ENST00000351488:exon_30366965_30367051:MTMR3;ENSG00000100330:ENST00000415511:exon_30366965_30367051:MTMR3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 30688659 C/T 1 35 37 72 17.1640943651608 18.8551002425443 -1.69100587738345 T:C C T 10 0.509597303852548 0.724553574276555 ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30687979_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000467596:exon_30687980_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000462073:exon_30687980_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30687982_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30687997_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30687999_30688840:TBC1D10A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 30700607 T/G 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 T:G T G 10 0.509597303852548 0.335037018547339 ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30700520_30700640:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000393906:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000490449:exon_30700520_30700619:TBC1D10A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 30733111 C/A 1 10 14 24 4.90402696147452 7.13436225393567 -2.23033529246115 A:C C A 10 0.509597303852548 0.417388759331184 ENSG00000099995:ENST00000439242:exon_30733015_30733169:SF3A1;ENSG00000099995:ENST00000446990:exon_30733015_30733169:SF3A1;ENSG00000099995:ENST00000215793:exon_30733015_30733169:SF3A1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 31333631 T/C 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 T:C T C 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31333570_31333698:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31333570_31333698:MORC2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 31673111 A/G 1 5 8 13 2.45201348073726 4.07677843082038 -1.62476495008312 A:G A G 10 0.509597303852548 0.415960200620574 ENSG00000182541:ENST00000436394:exon_31672775_31673126:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000406516:exon_31672775_31673624:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000340552:exon_31672775_31673624:LIMK2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 31673116 A/G 1 4 7 11 1.96161078458981 3.56718112696784 -1.60557034237803 A:G A G 10 0.509597303852548 0.379319216476062 ENSG00000182541:ENST00000436394:exon_31672775_31673126:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000406516:exon_31672775_31673624:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000340552:exon_31672775_31673624:LIMK2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 31722886 T/G 1 2 6 8 0.980805392294904 3.05758382311529 -2.07677843082038 T:G T G 10 0.509597303852548 0.171857042968518 ENSG00000100105:ENST00000266269:exon_31721790_31723295:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000405309:exon_31721795_31723295:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000351933:exon_31721795_31723295:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000440325:exon_31721795_31723295:PATZ1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 31838085 G/A 1 9 8 17 4.41362426532707 4.07677843082038 0.336845834506684 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000184708:ENST00000344710:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000495101:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397525:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000330125:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000382180:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397523:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000420671:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000445424:exon_31837789_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000475437:exon_31838021_31838104:EIF4ENIF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 32352791 G/A 1 70 87 157 34.3281887303216 44.3349654351717 -10.00677670485 A:G G A 10 0.509597303852548 0.111191271239675 ENSG00000128245:ENST00000248975:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000397492:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000471374:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000427094:exon_32352126_32353589:YWHAH HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 32795641 C/T 1 16 24 40 7.84644313835923 12.2303352924612 -4.38389215410192 T:C C T 10 0.509597303852548 0.205555161089742 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000498434:exon_32795590_32795972:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000476619:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000485373:exon_32795590_32795746:C22orf28 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 35742925 T/G 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:G T G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35742923_35742962:TOM1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 35743124 G/C 1 3 11 14 1.47120808844236 5.60557034237803 -4.13436225393567 C:G G C 10 0.509597303852548 0.032165591851746 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35743048_35743966:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35743048_35743952:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35743048_35743974:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35743048_35743976:TOM1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 35802661 C/G 1 22 18 40 10.7888593152439 9.17275146934586 1.61610784589808 C:G C G 10 0.509597303852548 0.638327353489123 ENSG00000100297:ENST00000216122:exon_35802546_35802718:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000447561:exon_35802546_35802718:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000444582:exon_35802546_35802718:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000382011:exon_35802546_35802718:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000455261:exon_35802546_35802718:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000416905:exon_35802546_35802718:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000444778:exon_35802546_35802718:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000426383:exon_35802546_35802718:MCM5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 35815880 G/A 1 84 62 146 41.193826476386 31.595032838858 9.598793637528 A:G G A 10 0.509597303852548 0.116284565453285 ENSG00000100297:ENST00000216122:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000447561:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000382011:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000455261:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000426383:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000493076:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000402457:exon_35815877_35816005:MCM5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 36537500 A/T 1 12 17 29 5.88483235376942 8.66315416549332 -2.77832181172389 A:T A T 10 0.509597303852548 0.354840351239223 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 36537725 G/A 1 15 11 26 7.35604044221178 5.60557034237803 1.75047009983375 A:G G A 10 0.509597303852548 0.559102122990831 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487355:exon_36537576_36538106:APOL3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 36682706 C/T 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 T:C C T 10 0.509597303852548 0.335037018547339 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 36682707 G/A 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 A:G G A 10 0.509597303852548 0.5085374516326 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 36684354 T/C 1 52 55 107 25.5009401996675 28.0278517118901 -2.52691151222264 T:C T C 10 0.509597303852548 0.630351619650284 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 36684358 C/A 1 56 51 107 27.4625509842573 25.9894624964799 1.47308848777736 A:C C A 10 0.509597303852548 0.846777756412644 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 36700175 A/G 1 16 25 41 7.84644313835923 12.7399325963137 -4.89348945795447 A:G A G 10 0.509597303852548 0.159176692811636 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36700041_36700201:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36700041_36700201:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36700041_36700201:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36700041_36700201:MYH9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 36907098 T/C 1 6 7 13 2.94241617688471 3.56718112696784 -0.624764950083124 T:C T C 10 0.509597303852548 0.786978111840725 ENSG00000100353:ENST00000478547:exon_36906903_36907215:EIF3D HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 36912630 A/G 1 109 118 227 53.4538938800723 60.1324818546007 -6.67858797452839 A:G A G 10 0.509597303852548 0.388595199611393 ENSG00000100353:ENST00000397177:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000216190:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000405442:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000426531:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000458572:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000462794:exon_36912110_36912654:EIF3D HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 36913495 T/C 1 10 5 15 4.90402696147452 2.54798651926274 2.35604044221178 T:C T C 10 0.509597303852548 0.303107408657847 ENSG00000100353:ENST00000458572:exon_36913348_36913540:EIF3D HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 36922052 T/C 1 63 40 103 30.8953698572895 20.3838921541019 10.5114777031876 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0388634140386151 ENSG00000100353:ENST00000397177:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000216190:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000405442:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000455547:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000457241:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000432675:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000402116:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000496875:exon_36921711_36922178:EIF3D HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 36922205 C/T 1 6 5 11 2.94241617688471 2.54798651926274 0.394429657621972 T:C C T 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 37622815 A/G 1 99 115 214 48.5498669185978 58.603689943043 -10.0538230244453 A:G A G 10 0.509597303852548 0.172132388807601 ENSG00000128340:ENST00000249071:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000417990:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000406508:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000481215:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000405484:exon_37622713_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000458421:exon_37622713_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000441619:exon_37622793_37622843:RAC2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 37622884 C/G 0 11 0 11 5.39442965762197 0 5.39442965762197 C C 10 0.509597303852548 0.000996395147774831 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 37622888 G/T 0 12 0 12 5.88483235376942 0 5.88483235376942 G G 10 0.509597303852548 0.000500187409481343 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 37622890 G/C 0 12 0 12 5.88483235376942 0 5.88483235376942 G G 10 0.509597303852548 0.000500187409481343 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 37637653 G/C 1 101 89 190 49.5306723108927 45.3541600428768 4.17651226801588 C:G G C 10 0.509597303852548 0.56215329141135 ENSG00000128340:ENST00000249071:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000417990:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000406508:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000405484:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000458421:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000441619:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000469532:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000401529:exon_37637627_37637698:RAC2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 38010165 G/A 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000100083:ENST00000423024:exon_38010140_38010281:GGA1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 38039128 A/G 1 8 14 22 3.92322156917962 7.13436225393567 -3.21114068475606 A:G A G 10 0.509597303852548 0.203042661312835 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38039105_38039181:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38039105_38039181:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000336738:exon_38039105_38039181:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38039105_38039181:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38039105_38039181:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38039105_38039181:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000495174:exon_38039105_38039181:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38039105_38039181:SH3BP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 38039708 T/C 1 17 10 27 8.33684583450668 5.09597303852548 3.2408727959812 T:C T C 10 0.509597303852548 0.250147773222066 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000336738:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000495174:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000471650:exon_38039462_38039795:SH3BP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 38046718 A/G 1 21 24 45 10.2984566190965 12.2303352924612 -1.93187867336466 A:G A G 10 0.509597303852548 0.655207440574795 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000466097:exon_38046549_38046785:SH3BP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 38710133 G/T 1 9 11 20 4.41362426532707 5.60557034237803 -1.19194607705096 T:G G T 10 0.509597303852548 0.658614646611609 ENSG00000213923:ENST00000359867:exon_38710087_38710174:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000396832:exon_38710087_38710174:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000402865:exon_38710087_38710174:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000400206:exon_38710087_38710174:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000403904:exon_38710087_38710174:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000438038:exon_38710087_38710173:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000413574:exon_38710087_38710174:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000405675:exon_38710087_38710174:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000398519:exon_38710087_38710174:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000430335:exon_38710087_38710174:CSNK1E HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 39414224 A/G 1 7 1 8 3.43281887303216 0.509597303852548 2.92322156917962 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0707155477569663 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 39440149 C/T 1 12 12 24 5.88483235376942 6.11516764623058 -0.230335292461152 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000128394:ENST00000381565:exon_39440088_39440428:APOBEC3F HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 39445554 G/A 1 2 7 9 0.980805392294904 3.56718112696784 -2.58637573467293 A:G G A 10 0.509597303852548 0.103145007117103 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39445430_39445586:APOBEC3F;ENSG00000128394:ENST00000476513:exon_39445430_39445586:APOBEC3F HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 39448711 C/A 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 A:C C A 10 0.509597303852548 0.335037018547339 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 39448750 T/C 1 7 6 13 3.43281887303216 3.05758382311529 0.375235049916876 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 39477123 T/C 1 27 20 47 13.2408727959812 10.191946077051 3.04892671893024 T:C T C 10 0.509597303852548 0.385820933338602 ENSG00000239713:ENST00000407997:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000480000:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000461827:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000486357:exon_39476938_39477199:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000494150:exon_39475667_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000481958:exon_39476640_39477232:APOBEC3G HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 39496336 G/T 1 9 1 10 4.41362426532707 0.509597303852548 3.90402696147452 T:G G T 10 0.509597303852548 0.0217112146317356 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 39496412 G/C 1 11 10 21 5.39442965762197 5.09597303852548 0.298456619096493 C:G G C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 39498038 G/C 1 20 13 33 9.80805392294904 6.62476495008312 3.18328897286592 C:G G C 10 0.509597303852548 0.299151178485349 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497923_39498053:APOBEC3H HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 39711351 A/G 1 4 7 11 1.96161078458981 3.56718112696784 -1.60557034237803 A:G A G 10 0.509597303852548 0.379319216476062 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 42610099 T/C 1 8 5 13 3.92322156917962 2.54798651926274 1.37523504991688 T:C T C 10 0.509597303852548 0.581979954468297 ENSG00000100207:ENST00000359486:exon_42605657_42611448:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000335626:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000396348:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000418801:exon_42605657_42611445:TCF20 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 42912029 G/T 1 23 22 45 11.2792620113914 11.2111406847561 0.0681213266353424 T:G G T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000416699:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000483303:exon_42912017_42912302:RRP7A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 42912136 G/T 1 70 27 97 34.3281887303216 13.7591272040188 20.5690615263028 T:G G T 10 0.509597303852548 2.52425095812965e-05 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000416699:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000483303:exon_42912017_42912302:RRP7A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 43089055 G/C 1 18 18 36 8.82724853065414 9.17275146934586 -0.345502938691727 C:G G C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 43195147 A/G 1 9 7 16 4.41362426532707 3.56718112696784 0.846443138359232 A:G A G 10 0.509597303852548 0.80419746365061 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000429508:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000452960:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000456251:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000440262:exon_43195045_43195166:ARFGAP3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 43206950 A/C 1 6 9 15 2.94241617688471 4.58637573467293 -1.64395955778822 A:C A C 10 0.509597303852548 0.446901967950042 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000440262:exon_43206819_43206950:ARFGAP3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 43289473 G/A 1 5 7 12 2.45201348073726 3.56718112696784 -1.11516764623058 A:G G A 10 0.509597303852548 0.574428486272357 ENSG00000100266:ENST00000496919:exon_43289463_43289560:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000473715:exon_43289463_43289560:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000263246:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000337959:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000407585:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000403744:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000402229:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000436831:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000453643:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000418133:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000422336:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000445706:exon_43289463_43289619:PACSIN2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 43558926 A/G 1 74 48 122 36.2897995149115 24.4606705849223 11.8291289299891 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0369290223181325 ENSG00000100300:ENST00000337554:exon_43558809_43559248:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000396265:exon_43558809_43559247:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000361449:exon_43558809_43559247:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000329563:exon_43558809_43559216:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000445018:exon_43558809_43558997:TSPO HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 43576904 G/A 1 3 7 10 1.47120808844236 3.56718112696784 -2.09597303852548 A:G G A 10 0.509597303852548 0.218348598150516 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43576748_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43576748_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000357017:exon_43576762_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43576748_43576946:TTLL12 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 44368122 A/G 1 7 2 9 3.43281887303216 1.0191946077051 2.41362426532707 A:G A G 10 0.509597303852548 0.180412718745071 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000493161:exon_44368116_44368222:SAMM50 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 44372632 C/T 1 5 15 20 2.45201348073726 7.64395955778822 -5.19194607705096 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0242764341264256 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44372630_44372701:SAMM50 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 44586522 C/T 1 6 5 11 2.94241617688471 2.54798651926274 0.394429657621972 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44586431_44586546:PARVG HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 44594584 C/G 1 12 15 27 5.88483235376942 7.64395955778822 -1.7591272040188 C:G C G 10 0.509597303852548 0.56601930423381 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000472551:exon_44594501_44594602:PARVG HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 45132704 T/C 1 16 11 27 7.84644313835923 5.60557034237803 2.2408727959812 T:C T C 10 0.509597303852548 0.444354653770125 ENSG00000186654:ENST00000432186:exon_45132652_45132789:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000492475:exon_45132652_45132754:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000006251:exon_45132652_45133560:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000404016:exon_45132652_45133545:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000403581:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396141:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000336985:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000431834:exon_45132652_45133321:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000418332:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396139:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000432916:exon_45132652_45133542:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000477331:exon_45132652_45133095:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000455389:exon_45132652_45133512:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000495017:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000475850:exon_45132652_45133561:PRR5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 45132785 T/C 1 11 10 21 5.39442965762197 5.09597303852548 0.298456619096493 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000186654:ENST00000432186:exon_45132652_45132789:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000006251:exon_45132652_45133560:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000404016:exon_45132652_45133545:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000403581:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396141:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000336985:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000431834:exon_45132652_45133321:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000418332:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396139:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000432916:exon_45132652_45133542:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000477331:exon_45132652_45133095:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000455389:exon_45132652_45133512:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000495017:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000475850:exon_45132652_45133561:PRR5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 50187853 C/T 1 1 7 8 0.490402696147452 3.56718112696784 -3.07677843082038 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0357022765843499 ENSG00000100425:ENST00000404034:exon_50187682_50187942:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000216267:exon_50187682_50187942:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000404760:exon_50187682_50187942:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000438393:exon_50187682_50187942:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000342989:exon_50187682_50187942:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000457780:exon_50187682_50187942:BRD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 50301476 T/C 1 2 7 9 0.980805392294904 3.56718112696784 -2.58637573467293 T:C T C 10 0.509597303852548 0.103145007117103 ENSG00000182858:ENST00000330817:exon_50301369_50301592:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000332276:exon_50301369_50301592:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000486602:exon_50301369_50301566:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000492791:exon_50301369_50301592:ALG12 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 50313438 T/C 1 7 5 12 3.43281887303216 2.54798651926274 0.884832353769424 T:C T C 10 0.509597303852548 0.774912283175237 ENSG00000184164:ENST00000450207:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000457871:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000482956:exon_50313378_50313488:CRELD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 50317989 C/T 1 12 7 19 5.88483235376942 3.56718112696784 2.31765122680159 T:C C T 10 0.509597303852548 0.360981209646244 ENSG00000184164:ENST00000487969:exon_50316858_50319205:CRELD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 50354819 C/A 1 15 8 23 7.35604044221178 4.07677843082038 3.2792620113914 A:C C A 10 0.509597303852548 0.211976090729517 ENSG00000198355:ENST00000360612:exon_50354773_50354882:PIM3;ENSG00000198355:ENST00000467480:exon_50354416_50354882:PIM3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 50356302 C/T 1 9 4 13 4.41362426532707 2.03838921541019 2.37523504991688 T:C C T 10 0.509597303852548 0.268002712932727 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 50635848 C/G 0 8 0 8 3.92322156917962 0 3.92322156917962 C C 10 0.509597303852548 0.00789316895639457 ENSG00000170638:ENST00000472677:exon_50635322_50636615:TRABD HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 50648577 C/T 1 7 7 14 3.43281887303216 3.56718112696784 -0.134362253935672 T:C C T 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 50658424 T/C 1 16 12 28 7.84644313835923 6.11516764623058 1.73127549212866 T:C T C 10 0.509597303852548 0.57358810064514 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50658386_50658444:TUBGCP6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 50658698 T/A 1 13 8 21 6.37523504991688 4.07677843082038 2.29845661909649 A:T:G T A 10 0.509597303852548 0.385166903646358 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658621_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50658680_50658845:TUBGCP6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 50682865 G/A 1 8 6 14 3.92322156917962 3.05758382311529 0.865637746064328 A:G G A 10 0.509597303852548 0.79106698341654 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50682148_50682993:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50682148_50683421:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50682148_50683400:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50682148_50683400:TUBGCP6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 50684312 G/A 1 25 13 38 12.2600674036863 6.62476495008312 5.63530245360318 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0749480494555229 ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000477814:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000497952:exon_50684220_50684521:HDAC10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 50694065 C/T 1 20 19 39 9.80805392294904 9.68234877319841 0.12570514975063 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50694044_50694123:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50694044_50694123:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50694044_50694123:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50694044_50694123:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50694044_50694123:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50694044_50694123:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50694044_50694123:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000496942:exon_50694044_50694628:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000482969:exon_50694044_50694123:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000497738:exon_50694044_50694123:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50694044_50694123:MAPK12 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 50752150 C/T 1 20 11 31 9.80805392294904 5.60557034237803 4.20248358057101 T:C C T 10 0.509597303852548 0.151935358615599 ENSG00000205593:ENST00000413817:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000380836:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000495607:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000411673:exon_50752064_50752153:FAM116B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 50878196 G/A 1 6 22 28 2.94241617688471 11.2111406847561 -8.26872450787134 A:G G A 10 0.509597303852548 0.00199230933874844 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50878127_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50878127_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000473283:exon_50878182_50878478:PPP6R2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 50882590 G/A 1 8 5 13 3.92322156917962 2.54798651926274 1.37523504991688 A:G G A 10 0.509597303852548 0.581979954468297 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 50882671 G/T 1 57 55 112 27.9529536804048 28.0278517118901 -0.0748980314853753 T:G G T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50882632_50883514:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50882628_50882803:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50882628_50882803:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50882628_50883514:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50882628_50882820:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50882628_50882819:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50882628_50882800:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000470046:exon_50882628_50882807:PPP6R2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 50885775 A/G 1 66 57 123 32.3665779457318 29.0470463195952 3.3195316261366 A:G A G 10 0.509597303852548 0.588835014514651 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000418590:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000470434:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000473724:exon_50885751_50886038:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50885751_50885882:SBF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 50901009 C/T 1 9 4 13 4.41362426532707 2.03838921541019 2.37523504991688 T:C C T 10 0.509597303852548 0.268002712932727 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000356279:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50900988_50901146:SBF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 50941985 T/C 1 37 32 69 18.1448997574557 16.3071137232815 1.83778603417419 T:C T C 10 0.509597303852548 0.718449730524954 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50941380_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50941426_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50941690_50942128:LMF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 50942121 C/T 1 25 30 55 12.2600674036863 15.2879191155764 -3.02785171189014 T:C C T 10 0.509597303852548 0.422285803903168 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50941380_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50941426_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50941690_50942128:LMF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 50943004 C/A 0 9 0 9 4.41362426532707 0 4.41362426532707 C C 10 0.509597303852548 0.00395812771304115 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50942988_50943081:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50942769_50943156:LMF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 50943010 G/A 0 9 0 9 4.41362426532707 0 4.41362426532707 G G 10 0.509597303852548 0.00395812771304115 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50942988_50943081:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50942769_50943156:LMF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 50943232 G/A 1 27 8 35 13.2408727959812 4.07677843082038 9.16409436516082 A:G G A 10 0.509597303852548 0.00200172167599129 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50943231_50943413:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50943231_50943413:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50943231_50943413:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50943231_50943413:LMF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 50944128 G/A 1 9 5 14 4.41362426532707 2.54798651926274 1.86563774606433 A:G G A 10 0.509597303852548 0.425164682757114 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 50962208 T/G 1 104 102 206 51.001880399335 51.9789249929599 -0.977044593624889 T:G T G 10 0.509597303852548 0.94446602026034 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 50962782 C/G 1 43 57 100 21.0873159343404 29.0470463195952 -7.9597303852548 C:G C G 10 0.509597303852548 0.133149350538258 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000439934:exon_50962431_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000423348:exon_50962431_50962853:SCO2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 50964236 G/A 1 128 114 242 62.7715451068739 58.0940926391905 4.67745246768339 A:G G A 10 0.509597303852548 0.563269430198239 ENSG00000025708:ENST00000395680:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395681:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000252029:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000487577:exon_50964184_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395678:exon_50964185_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000476284:exon_50964186_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000425169:exon_50964214_50964347:TYMP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 50964255 C/T 1 131 149 280 64.2427531953162 75.9299982740296 -11.6872450787134 T:C C T 10 0.509597303852548 0.169382475515030 ENSG00000025708:ENST00000395680:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395681:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000252029:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000487577:exon_50964184_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395678:exon_50964185_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000476284:exon_50964186_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000425169:exon_50964214_50964347:TYMP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 51009953 C/T 1 33 26 59 16.1832889728659 13.2495299001662 2.93375907269967 T:C C T 10 0.509597303852548 0.515439272674561 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000440709:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000497224:exon_51009587_51009968:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51009804_51009968:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51009804_51009962:CTA-384D8.32 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 22 51018579 A/G 1 6 7 13 2.94241617688471 3.56718112696784 -0.624764950083124 A:G A G 10 0.509597303852548 0.786978111840725 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 3189279 A/G 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 A:G A G 10 0.509597303852548 0.5085374516326 ENSG00000072756:ENST00000251607:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000473275:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000280591:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000434583:exon_3189134_3189387:TRNT1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 4829732 A/G 1 7 8 15 3.43281887303216 4.07677843082038 -0.64395955778822 A:G A G 10 0.509597303852548 0.800365558868668 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4829631_4829823:ITPR1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 9787527 C/T 1 10 10 20 4.90402696147452 5.09597303852548 -0.191946077050959 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000156983:ENST00000433861:exon_9787496_9787614:BRPF1;ENSG00000156983:ENST00000424362:exon_9787496_9787614:BRPF1;ENSG00000156983:ENST00000383829:exon_9787496_9787614:BRPF1;ENSG00000156983:ENST00000302054:exon_9787496_9787614:BRPF1;ENSG00000156983:ENST00000457855:exon_9787496_9787614:BRPF1;ENSG00000156983:ENST00000497565:exon_9787257_9787614:BRPF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 9867625 C/T 1 14 8 22 6.86563774606433 4.07677843082038 2.78885931524394 T:C C T 10 0.509597303852548 0.288242782553056 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9867484_9867632:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000482269:exon_9867090_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000492440:exon_9867250_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000466245:exon_9867545_9867632:TTLL3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 9870857 G/A 1 20 22 42 9.80805392294904 11.2111406847561 -1.40308676180701 A:G G A 10 0.509597303852548 0.758098365926897 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9870644_9871079:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000431204:exon_9870644_9870936:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9870363_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000466245:exon_9870644_9871019:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9870847_9871079:TTLL3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 9871030 T/G 1 23 22 45 11.2792620113914 11.2111406847561 0.0681213266353424 T:G T G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9870644_9871079:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9870363_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9870847_9871079:TTLL3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 9874914 C/T 1 4 7 11 1.96161078458981 3.56718112696784 -1.60557034237803 T:C C T 10 0.509597303852548 0.379319216476062 ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9874788_9874929:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9874788_9874929:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9874788_9874929:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9874788_9874929:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9874788_9874957:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9874788_9874929:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9874788_9874929:TTLL3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 9934605 T/C 1 50 21 71 24.5201348073726 10.7015433809035 13.8185914264691 T:C T C 10 0.509597303852548 0.00119810563080651 ENSG00000171135:ENST00000307768:exon_9934599_9936033:JAGN1;ENSG00000171135:ENST00000489724:exon_9934493_9934655:JAGN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 9991101 C/G 1 8 7 15 3.92322156917962 3.56718112696784 0.35604044221178 C:G C G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 9991163 A/G 1 7 7 14 3.43281887303216 3.56718112696784 -0.134362253935672 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 9991388 G/C 1 11 7 18 5.39442965762197 3.56718112696784 1.82724853065414 C:G G C 10 0.509597303852548 0.482156564682581 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 10138069 T/G 1 7 8 15 3.43281887303216 4.07677843082038 -0.64395955778822 T:G T G 10 0.509597303852548 0.800365558868668 ENSG00000144554:ENST00000287647:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000470028:exon_10138010_10138156:FANCD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 10290952 G/A 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 A:G G A 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10290879_10291298:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10290879_10291298:TATDN2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 10302045 C/T 1 13 8 21 6.37523504991688 4.07677843082038 2.29845661909649 T:C C T 10 0.509597303852548 0.385166903646358 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 11596302 T/C 1 11 7 18 5.39442965762197 3.56718112696784 1.82724853065414 T:C T C 10 0.509597303852548 0.482156564682581 ENSG00000197548:ENST00000442589:exon_11596285_11599132:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354449:exon_11596285_11599139:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000446450:exon_11596285_11596462:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354956:exon_11596285_11596557:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000466605:exon_11596285_11596349:ATG7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 13361287 C/T 1 8 13 21 3.92322156917962 6.62476495008312 -2.70154338090351 T:C C T 10 0.509597303852548 0.278772582952036 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13361263_13361479:NUP210 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 13364876 G/T 1 7 4 11 3.43281887303216 2.03838921541019 1.39442965762197 T:G G T 10 0.509597303852548 0.549658645750086 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13364809_13364932:NUP210 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 13367406 C/T 1 11 3 14 5.39442965762197 1.52879191155764 3.86563774606433 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0580035546592849 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13367295_13367431:NUP210 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 14199908 C/T 1 6 5 11 2.94241617688471 2.54798651926274 0.394429657621972 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14199511_14200392:XPC HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 15115478 C/T 1 9 3 12 4.41362426532707 1.52879191155764 2.88483235376942 T:C C T 10 0.509597303852548 0.146886429190433 ENSG00000131381:ENST00000253699:exon_15111580_15116437:ZFYVE20;ENSG00000131381:ENST00000476527:exon_15115112_15116437:ZFYVE20 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 15719049 T/C 1 2 8 10 0.980805392294904 4.07677843082038 -3.09597303852548 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0608033640885815 ENSG00000206560:ENST00000399451:exon_15718987_15719069:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383777:exon_15718987_15719069:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383776:exon_15718987_15719069:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000412318:exon_15718987_15719069:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000497037:exon_15718987_15719069:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000479043:exon_15718987_15719113:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000451422:exon_15719043_15719069:ANKRD28 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 15753641 A/G 1 2 8 10 0.980805392294904 4.07677843082038 -3.09597303852548 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0608033640885815 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 16419309 C/T 1 21 32 53 10.2984566190965 16.3071137232815 -6.00865710418504 T:C C T 10 0.509597303852548 0.101398859046746 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16419225_16419609:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16419225_16419609:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000451036:exon_16419226_16419609:RFTN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 20216519 T/A 1 10 9 19 4.90402696147452 4.58637573467293 0.317651226801589 A:T T A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000129810:ENST00000419233:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000263753:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000515745:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000509679:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000523325:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000522131:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000533388:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000534034:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000383774:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000425061:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000443724:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000472533:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000421451:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000482867:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412997:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000437051:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412868:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000417364:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000456624:exon_20216214_20216547:SGOL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 23848835 A/C 1 7 4 11 3.43281887303216 2.03838921541019 1.39442965762197 A:C A C 10 0.509597303852548 0.549658645750086 ENSG00000170142:ENST00000306627:exon_23848728_23848912:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000484048:exon_23848728_23849379:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000346855:exon_23848728_23848912:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000495141:exon_23848728_23848912:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000481622:exon_23848728_23848912:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000442670:exon_23848580_23848912:UBE2E1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 23934772 G/A 1 9 11 20 4.41362426532707 5.60557034237803 -1.19194607705096 A:G G A 10 0.509597303852548 0.658614646611609 ENSG00000197885:ENST00000388759:exon_23933151_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000443659:exon_23933552_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000421515:exon_23933555_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000425478:exon_23933572_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000418853:exon_23933574_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000437230:exon_23933588_23934824:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000412028:exon_23933798_23934824:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000415901:exon_23933801_23934824:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000416026:exon_23934556_23934828:NKIRAS1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 33038747 C/G 1 7 5 12 3.43281887303216 2.54798651926274 0.884832353769424 C:G C G 10 0.509597303852548 0.774912283175237 ENSG00000170266:ENST00000399402:exon_33038112_33038836:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000307363:exon_33038112_33038836:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000307377:exon_33038221_33038836:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000445488:exon_33038226_33038836:GLB1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 33434831 G/A 1 5 6 11 2.45201348073726 3.05758382311529 -0.605570342378028 A:G G A 10 0.509597303852548 0.770507260060939 ENSG00000153560:ENST00000283629:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000492136:exon_33429830_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000447368:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000466441:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000283628:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000486388:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000464787:exon_33434804_33434946:UBP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 33905566 C/T 1 15 14 29 7.35604044221178 7.13436225393567 0.221678188276108 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000465122:exon_33905498_33905609:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000489869:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33905388_33905621:PDCD6IP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 33907945 A/G 1 50 39 89 24.5201348073726 19.8742948502494 4.64583995712323 A:G A G 10 0.509597303852548 0.341451386817814 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33907843_33907960:PDCD6IP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 37107470 G/A 1 7 4 11 3.43281887303216 2.03838921541019 1.39442965762197 A:G G A 10 0.509597303852548 0.549658645750086 ENSG00000093167:ENST00000496479:exon_37107301_37110254:LRRFIP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 37367628 A/G 1 37 44 81 18.1448997574557 22.4222813695121 -4.27738161205638 A:G A G 10 0.509597303852548 0.374631208335388 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 38047954 G/C 1 12 15 27 5.88483235376942 7.64395955778822 -1.7591272040188 C:G G C 10 0.509597303852548 0.56601930423381 ENSG00000136059:ENST00000283713:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000383759:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000356246:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000465644:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000486616:exon_38047672_38048191:VILL HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 38170810 C/G 1 16 10 26 7.84644313835923 5.09597303852548 2.75047009983375 C:G C G 10 0.509597303852548 0.329269094926831 ENSG00000060971:ENST00000333167:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000411549:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000444607:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000469559:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000358122:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000480865:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000450296:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000452171:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000440176:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000423611:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000447223:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000418880:exon_38170781_38170879:ACAA1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 39180099 T/C 1 8 2 10 3.92322156917962 1.0191946077051 2.90402696147452 T:C T C 10 0.509597303852548 0.110022635989167 ENSG00000168026:ENST00000301819:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000431162:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000430597:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000440121:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000472866:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000493856:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000460460:exon_39180047_39180394:TTC21A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 39184959 C/T 1 8 1 9 3.92322156917962 0.509597303852548 3.41362426532707 T:C C T 10 0.509597303852548 0.039373498903222 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 39449137 T/C 1 21 11 32 10.2984566190965 5.60557034237803 4.69288627671847 A:T:C T C 10 0.509597303852548 0.112275379386696 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000477325:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000475346:exon_39449112_39449686:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000487876:exon_39449112_39449567:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39449094_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000444512:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39449111_39449277:RPSA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 39450065 C/T 1 21 18 39 10.2984566190965 9.17275146934586 1.12570514975063 T:C C T 10 0.509597303852548 0.751008063056674 ENSG00000168028:ENST00000490490:exon_39449695_39450215:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000478027:exon_39450028_39450215:RPSA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 39453160 G/A 1 161 222 383 78.9548340797398 113.130601455266 -34.1757673755259 A:T:G G A 10 0.509597303852548 0.000498699483947036 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000478027:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000495394:exon_39451750_39453268:RPSA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 40498845 C/T 1 7 5 12 3.43281887303216 2.54798651926274 0.884832353769424 T:C C T 10 0.509597303852548 0.774912283175237 ENSG00000188846:ENST00000338970:exon_40498783_40498854:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000465325:exon_40498794_40498854:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000396203:exon_40498831_40498965:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000416518:exon_40498845_40498965:RPL14 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 42251263 C/T 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42251259_42254115:TRAK1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 42610374 A/G 1 7 3 10 3.43281887303216 1.52879191155764 1.90402696147452 A:G A G 10 0.509597303852548 0.344656245175514 ENSG00000093183:ENST00000423701:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000273156:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000417572:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000449617:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000264454:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456515:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000493107:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000383750:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000450981:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000445388:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000454141:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000416880:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000420163:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456222:exon_42610357_42610565:SEC22C HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 42679497 C/T 1 91 70 161 44.6266453494181 35.6718112696784 8.95483407973978 T:C C T 10 0.509597303852548 0.180068338197292 ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000468735:exon_42678360_42679718:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000465584:exon_42678360_42679711:NKTR HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 42679777 T/G 1 97 102 199 47.5690615263028 51.9789249929599 -4.40986346665705 T:C:G T G 10 0.509597303852548 0.570707947140723 ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 44884647 C/A 1 10 5 15 4.90402696147452 2.54798651926274 2.35604044221178 A:C C A 10 0.509597303852548 0.303107408657847 ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000422209:exon_44884615_44884726:KIF15 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 45637253 C/T 1 8 11 19 3.92322156917962 5.60557034237803 -1.68234877319841 T:C C T 10 0.509597303852548 0.496599009223979 ENSG00000144791:ENST00000440097:exon_45635816_45637779:LIMD1;ENSG00000144791:ENST00000273317:exon_45636351_45637779:LIMD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 45637439 T/C 1 7 12 19 3.43281887303216 6.11516764623058 -2.68234877319841 T:C T C 10 0.509597303852548 0.255561328037084 ENSG00000144791:ENST00000440097:exon_45635816_45637779:LIMD1;ENSG00000144791:ENST00000273317:exon_45636351_45637779:LIMD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 46965111 C/T 0 132 0 132 64.7331558914637 0 64.7331558914637 C C 10 0.509597303852548 4.22440637038001e-39 ENSG00000160799:ENST00000425441:exon_46965097_46965158:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000292314:exon_46965097_46965158:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000488069:exon_46964533_46965158:CCDC12 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 47048744 C/T 1 32 32 64 15.6928862767185 16.3071137232815 -0.614227446563071 T:C C T 10 0.509597303852548 0.901066635400032 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47048731_47048840:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47048731_47048840:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47048731_47048840:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47048731_47048840:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47048731_47048840:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000476095:exon_47048541_47048840:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000461036:exon_47048731_47049187:NBEAL2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 47454399 G/A,C 0 0 46 46 0 23.4414759772172 -23.4414759772172 A:C G A 10 0.509597303852548 5.82681276260883e-15 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47454196_47454925:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47454196_47454931:PTPN23 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 48309828 C/G 1 5 11 16 2.45201348073726 5.60557034237803 -3.15355686164077 C:G C G 10 0.509597303852548 0.136896620322009 ENSG00000164048:ENST00000354698:exon_48309405_48312477:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000448461:exon_48309405_48312459:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000457782:exon_48309408_48312480:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000296437:exon_48309408_48310234:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000431517:exon_48309408_48310276:ZNF589 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 48725707 C/T 1 39 49 88 19.1257051497506 24.9702678887749 -5.84456273902422 T:C C T 10 0.509597303852548 0.240946582858148 ENSG00000068745:ENST00000328631:exon_48725436_48726206:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000395507:exon_48725437_48726206:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000395509:exon_48725437_48726206:IP6K2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 48727112 G/A 1 8 8 16 3.92322156917962 4.07677843082038 -0.153556861640768 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000068745:ENST00000328631:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000395507:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000395509:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000479914:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000491686:exon_48727043_48727146:IP6K2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 49064110 A/G 1 8 3 11 3.92322156917962 1.52879191155764 2.39442965762197 A:G A G 10 0.509597303852548 0.227512016275758 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 49067904 T/C 1 74 69 143 36.2897995149115 35.1622139658258 1.12758554908564 T:C T C 10 0.509597303852548 0.86749256182678 ENSG00000198218:ENST00000395443:exon_49067140_49068077:QRICH1;ENSG00000198218:ENST00000498392:exon_49067364_49068077:QRICH1;ENSG00000198218:ENST00000357496:exon_49067365_49068077:QRICH1;ENSG00000198218:ENST00000424300:exon_49067645_49068077:QRICH1;ENSG00000198218:ENST00000489642:exon_49067808_49068077:QRICH1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 49135961 C/G 1 8 12 20 3.92322156917962 6.11516764623058 -2.19194607705096 C:G C G 10 0.509597303852548 0.375790350036073 ENSG00000172053:ENST00000494984:exon_49135786_49136125:QARS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 49141116 G/A 1 2 8 10 0.980805392294904 4.07677843082038 -3.09597303852548 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0608033640885815 ENSG00000172053:ENST00000306125:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000430182:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000414533:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000464962:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000494838:exon_49141064_49141301:QARS;ENSG00000172053:ENST00000452739:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000482261:exon_49140778_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000470619:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000479495:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000418549:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000417025:exon_49141064_49141139:QARS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 49714225 T/C 1 16 13 29 7.84644313835923 6.62476495008312 1.22167818827611 T:C T C 10 0.509597303852548 0.712557853061201 ENSG00000164062:ENST00000296456:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000449966:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000446089:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000442186:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000438011:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000463995:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000447436:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000457042:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000447541:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000482301:exon_49714210_49714250:APEH HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 49721532 G/A 1 10 11 21 4.90402696147452 5.60557034237803 -0.701543380903507 A:T:G G A 10 0.509597303852548 0.82921410886802 ENSG00000173531:ENST00000448220:exon_49721380_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000449682:exon_49721380_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000383728:exon_49721381_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000479115:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000492329:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000428801:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000488350:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000493836:exon_49721482_49721622:MST1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 49721798 C/A 1 15 24 39 7.35604044221178 12.2303352924612 -4.87429485024937 A:C C A 10 0.509597303852548 0.148854665686179 ENSG00000173531:ENST00000448220:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000449682:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000383728:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000479115:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000492329:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000428801:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000488350:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000493836:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000484144:exon_49721758_49721886:MST1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 49751585 C/T 1 1 7 8 0.490402696147452 3.56718112696784 -3.07677843082038 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0357022765843499 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000389066:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000469978:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000433785:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000444689:exon_49751523_49751607:RNF123 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 49758764 A/G 1 28 38 66 13.7312754921287 19.3646975463968 -5.63342205426817 A:G A G 10 0.509597303852548 0.176931348671192 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000433785:exon_49758618_49758959:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000498376:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000173540:ENST00000480687:exon_49754277_49759316:GMPPB;ENSG00000173540:ENST00000308375:exon_49757357_49759580:GMPPB HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 49760431 G/C 1 11 14 25 5.39442965762197 7.13436225393567 -1.7399325963137 C:G G C 10 0.509597303852548 0.551336393725987 ENSG00000173540:ENST00000480687:exon_49760405_49760547:GMPPB;ENSG00000173540:ENST00000308375:exon_49760405_49760547:GMPPB;ENSG00000173540:ENST00000308388:exon_49760405_49760547:GMPPB;ENSG00000173540:ENST00000481959:exon_49760165_49760547:GMPPB;ENSG00000173540:ENST00000495627:exon_49760425_49760735:GMPPB HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 49847623 A/G 1 8 9 17 3.92322156917962 4.58637573467293 -0.663154165493316 A:G A G 10 0.509597303852548 0.811525826845625 ENSG00000182179:ENST00000473992:exon_49847411_49847783:UBA7;ENSG00000182179:ENST00000489826:exon_49847412_49847861:UBA7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 50103917 G/A 1 55 87 142 26.9721482881099 44.3349654351717 -17.3628171470618 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0041703431909369 ENSG00000004534:ENST00000442092:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000266022:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000443081:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000419610:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000422955:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000454079:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000434592:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000421682:exon_50103825_50103935:RBM6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 50114515 C/T 1 57 42 99 27.9529536804048 21.403086761807 6.54986691859775 T:C C T 10 0.509597303852548 0.192874925898249 ENSG00000004534:ENST00000442092:exon_50114441_50114682:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000266022:exon_50114441_50114683:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000443081:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000419610:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000422955:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000454079:exon_50114441_50114680:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000421682:exon_50114441_50114682:RBM6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 50144951 T/C 1 9 9 18 4.41362426532707 4.58637573467293 -0.172751469345863 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000003756:ENST00000347869:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464087:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000395174:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000496179:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000474818:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000494360:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000441812:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000489437:exon_50144914_50145002:RBM5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 50153356 T/C 1 48 35 83 23.5393294150777 17.8359056348392 5.70342378023852 T:C T C 10 0.509597303852548 0.227999719064218 ENSG00000003756:ENST00000347869:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464087:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000475128:exon_50153339_50153376:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000475590:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000492430:exon_50153339_50153613:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000479275:exon_50153339_50153664:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464988:exon_50153339_50153413:RBM5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 52237970 C/T 1 8 12 20 3.92322156917962 6.11516764623058 -2.19194607705096 T:C C T 10 0.509597303852548 0.375790350036073 ENSG00000023330:ENST00000469224:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000394965:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000441729:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000442476:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000310271:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000484952:exon_52237879_52238028:ALAS1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 52256697 C/T 1 5 6 11 2.45201348073726 3.05758382311529 -0.605570342378028 T:C C T 10 0.509597303852548 0.770507260060939 ENSG00000239732:ENST00000360658:exon_52255096_52258328:TLR9;ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52255097_52258328:RP11-330H6.5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 52325759 A/G 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 A:G A G 10 0.509597303852548 0.499988077920146 ENSG00000168237:ENST00000489173:exon_52324976_52325938:GLYCTK HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 52558904 A/T 1 1 7 8 0.490402696147452 3.56718112696784 -3.07677843082038 A:T A T 10 0.509597303852548 0.0357022765843499 ENSG00000168268:ENST00000469616:exon_52558833_52559076:NT5DC2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 52643685 T/C 1 7 5 12 3.43281887303216 2.54798651926274 0.884832353769424 T:C T C 10 0.509597303852548 0.774912283175237 ENSG00000163939:ENST00000356770:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000394830:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296302:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000337303:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000412587:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409057:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000410007:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296303:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409114:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409767:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000423351:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000446103:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000480064:exon_52643102_52643971:PBRM1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 52720080 A/C 1 5 9 14 2.45201348073726 4.58637573467293 -2.13436225393567 A:C A C 10 0.509597303852548 0.293559675506127 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468146:exon_52720021_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52720032_52720218:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468885:exon_52720046_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000462550:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000492349:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52720065_52720121:GNL3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 52721305 G/A 1 60 51 111 29.4241617688471 25.9894624964799 3.43469927236717 A:G G A 10 0.509597303852548 0.569186444621593 ENSG00000163938:ENST00000479230:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468146:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000462550:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000492349:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000474423:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000460073:exon_52721262_52721399:GNL3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 52727257 G/A 1 144 120 264 70.6179882452331 61.1516764623058 9.46631178292733 A:G G A 10 0.509597303852548 0.267821547668280 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000497356:exon_52727186_52727560:GNL3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 52874446 C/T 1 5 5 10 2.45201348073726 2.54798651926274 -0.0959730385254796 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000213533:ENST00000355083:exon_52870772_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000477591:exon_52874234_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000464769:exon_52874310_52874626:TMEM110 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 53213657 T/C 1 11 11 22 5.39442965762197 5.60557034237803 -0.211140684756055 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000163932:ENST00000478843:exon_53213593_53213710:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53213593_53213792:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53213593_53213792:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000487897:exon_53213593_53213792:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000464818:exon_53213593_53213792:PRKCD HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 53259850 C/T 1 185 194 379 90.7244987872786 98.8618769473943 -8.13737816011569 T:C C T 10 0.509597303852548 0.41141241503871 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53258723_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53259767_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53259655_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53259668_53262165:TKT;ENSG00000163931:ENST00000461139:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53259675_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53259718_53259947:TKT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 53260710 G/A 1 5 6 11 2.45201348073726 3.05758382311529 -0.605570342378028 A:G G A 10 0.509597303852548 0.770507260060939 ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53259668_53262165:TKT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 53260716 C/T 1 5 6 11 2.45201348073726 3.05758382311529 -0.605570342378028 T:C C T 10 0.509597303852548 0.770507260060939 ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53259668_53262165:TKT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 53260903 G/C 1 4 7 11 1.96161078458981 3.56718112696784 -1.60557034237803 C:G G C 10 0.509597303852548 0.379319216476062 ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53259668_53262165:TKT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 53264485 A/G 1 71 76 147 34.8185914264691 38.7293950927936 -3.91080366632455 A:G A G 10 0.509597303852548 0.563814608313567 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000461139:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53264473_53264637:TKT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 53267155 G/A 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 A:G G A 10 0.509597303852548 0.5085374516326 ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000466765:exon_53266776_53267290:TKT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 53267342 G/A 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000494523:exon_53267172_53269035:TKT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 53269046 T/C 1 57 45 102 27.9529536804048 22.9318786733647 5.02107500704011 T:C T C 10 0.509597303852548 0.324254176825306 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53268999_53269080:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53268999_53269209:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53268999_53269132:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000472528:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000466765:exon_53268999_53269176:TKT;ENSG00000163931:ENST00000487660:exon_53268868_53269190:TKT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 53269163 G/A 1 15 18 33 7.35604044221178 9.17275146934586 -1.81671102713408 A:G G A 10 0.509597303852548 0.60280598239357 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53268999_53269209:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000472528:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000466765:exon_53268999_53269176:TKT;ENSG00000163931:ENST00000487660:exon_53268868_53269190:TKT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 53321631 A/C 1 33 33 66 16.1832889728659 16.8167110271341 -0.633422054268166 A:C A C 10 0.509597303852548 0.902512003149881 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 56597954 C/T 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 T:C C T 10 0.509597303852548 0.499988077920146 ENSG00000180376:ENST00000436465:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000422222:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000439445:exon_56597934_56598167:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000460838:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000394672:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000326595:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000459746:exon_56597680_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000472582:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000434467:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000471681:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000341455:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000422788:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000442522:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000469966:exon_56597712_56598184:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000473322:exon_56597544_56598153:CCDC66 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 56658871 T/C 1 2 14 16 0.980805392294904 7.13436225393567 -6.15355686164077 T:C T C 10 0.509597303852548 0.00198643151343658 ENSG00000163946:ENST00000459993:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000431842:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000493960:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000355628:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000447900:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000296313:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000487036:exon_56658863_56659034:C3orf63 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 57882601 C/T 1 6 4 10 2.94241617688471 2.03838921541019 0.90402696147452 T:C C T 10 0.509597303852548 0.75435926131823 ENSG00000163681:ENST00000295951:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000295952:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000416870:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000383718:exon_57882600_57887872:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000428312:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000449503:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000416658:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000442599:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000459654:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000472546:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000417128:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000438794:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000495364:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000494088:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000461354:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000466255:exon_57882600_57882659:SLMAP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 72799703 C/T 1 4 7 11 1.96161078458981 3.56718112696784 -1.60557034237803 T:C C T 10 0.509597303852548 0.379319216476062 ENSG00000144736:ENST00000468371:exon_72798428_72799987:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000325599:exon_72798430_72799987:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000444040:exon_72798430_72799987:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000463369:exon_72799110_72799987:SHQ1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 73111368 T/C 1 3 7 10 1.47120808844236 3.56718112696784 -2.09597303852548 T:C T C 10 0.509597303852548 0.218348598150516 ENSG00000255423:ENST00000533473:exon_73110810_73112488:AC103559.1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 73111809 A/G 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 A:G A G 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000255423:ENST00000533473:exon_73110810_73112488:AC103559.1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 73111973 A/G 1 5 7 12 2.45201348073726 3.56718112696784 -1.11516764623058 A:G A G 10 0.509597303852548 0.574428486272357 ENSG00000255423:ENST00000533473:exon_73110810_73112488:AC103559.1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 73111998 C/T 1 8 6 14 3.92322156917962 3.05758382311529 0.865637746064328 T:C C T 10 0.509597303852548 0.79106698341654 ENSG00000255423:ENST00000533473:exon_73110810_73112488:AC103559.1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 93845062 A/G 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 A:G A G 10 0.509597303852548 0.541646560898822 ENSG00000178694:ENST00000314622:exon_93845055_93847389:NSUN3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 97664725 C/T 1 4 9 13 1.96161078458981 4.58637573467293 -2.62476495008312 T:C C T 10 0.509597303852548 0.172159462736175 ENSG00000170854:ENST00000442492:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000333396:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000394198:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000506682:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000360258:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503517:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503097:exon_97664182_97664731:MINA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 98250986 C/T 1 54 65 119 26.4817455919624 33.1238247504156 -6.64207915845321 T:C C T 10 0.509597303852548 0.234132104369914 ENSG00000154165:ENST00000284311:exon_98250855_98251994:GPR15 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 98307630 C/T 1 1 7 8 0.490402696147452 3.56718112696784 -3.07677843082038 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0357022765843499 ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98307557_98307698:CPOX HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 101177848 T/G 1 7 2 9 3.43281887303216 1.0191946077051 2.41362426532707 T:G T G 10 0.509597303852548 0.180412718745071 ENSG00000138468:ENST00000394095:exon_101177799_101177896:SENP7;ENSG00000138468:ENST00000394094:exon_101177799_101177896:SENP7;ENSG00000138468:ENST00000314261:exon_101177799_101177896:SENP7;ENSG00000138468:ENST00000394091:exon_101177799_101177896:SENP7;ENSG00000138468:ENST00000358203:exon_101177799_101177896:SENP7;ENSG00000138468:ENST00000348610:exon_101177799_101177896:SENP7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 108373022 G/A 1 14 8 22 6.86563774606433 4.07677843082038 2.78885931524394 A:G G A 10 0.509597303852548 0.288242782553056 ENSG00000198919:ENST00000361582:exon_108372992_108373157:DZIP3;ENSG00000198919:ENST00000495008:exon_108372992_108373157:DZIP3;ENSG00000198919:ENST00000463306:exon_108372992_108373157:DZIP3;ENSG00000198919:ENST00000437062:exon_108372992_108373157:DZIP3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 112710133 T/A 1 7 6 13 3.43281887303216 3.05758382311529 0.375235049916876 A:T T A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000163607:ENST00000383678:exon_112709765_112710182:GTPBP8;ENSG00000163607:ENST00000383677:exon_112709832_112710182:GTPBP8;ENSG00000163607:ENST00000471627:exon_112709832_112710259:GTPBP8;ENSG00000163607:ENST00000295864:exon_112709834_112710182:GTPBP8;ENSG00000163607:ENST00000485330:exon_112709838_112710182:GTPBP8;ENSG00000163607:ENST00000305485:exon_112709847_112710194:GTPBP8;ENSG00000163607:ENST00000488781:exon_112709856_112710182:GTPBP8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 112727184 A/T 1 8 10 18 3.92322156917962 5.09597303852548 -1.17275146934586 A:T A T 10 0.509597303852548 0.642260839788311 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000412848:exon_112727106_112727195:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112727018_112727647:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000461381:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000482229:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472762:exon_112727018_112727277:C3orf17 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 113755502 T/C 1 5 5 10 2.45201348073726 2.54798651926274 -0.0959730385254796 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000163617:ENST00000295878:exon_113755455_113755633:KIAA1407;ENSG00000163617:ENST00000460813:exon_113755455_113755633:KIAA1407;ENSG00000163617:ENST00000481358:exon_113755455_113755633:KIAA1407;ENSG00000163617:ENST00000491000:exon_113755455_113755633:KIAA1407;ENSG00000163617:ENST00000483766:exon_113755455_113755633:KIAA1407;ENSG00000163617:ENST00000463695:exon_113755455_113755633:KIAA1407 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 119133554 G/A 1 11 3 14 5.39442965762197 1.52879191155764 3.86563774606433 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0580035546592849 ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119132703_119139561:ARHGAP31 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 119196166 T/C 1 1 8 9 0.490402696147452 4.07677843082038 -3.58637573467293 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0193004967410206 ENSG00000163389:ENST00000295588:exon_119196160_119196295:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000419577:exon_119196160_119196295:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000497447:exon_119196160_119196295:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000486607:exon_119196160_119196295:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000476573:exon_119196160_119196295:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000460339:exon_119196160_119196254:POGLUT1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 119305169 G/A 1 7 1 8 3.43281887303216 0.509597303852548 2.92322156917962 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0707155477569663 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000481816:exon_119305132_119305210:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000471850:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000485496:exon_119305132_119305386:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119305132_119305492:ADPRH HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 119327653 T/C 1 24 8 32 11.7696647075388 4.07677843082038 7.69288627671846 T:C T C 10 0.509597303852548 0.007326525779398 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119327617_119327794:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119327617_119327794:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119327617_119327746:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119327617_119327794:PLA1A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 119331874 C/T 1 6 8 14 2.94241617688471 4.07677843082038 -1.13436225393567 T:C C T 10 0.509597303852548 0.601095068648336 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000475963:exon_119331864_119331965:PLA1A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 119331892 C/G 1 8 7 15 3.92322156917962 3.56718112696784 0.35604044221178 C:G C G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000475963:exon_119331864_119331965:PLA1A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 121208176 T/C 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 T:C T C 10 0.509597303852548 0.541646560898822 ENSG00000051341:ENST00000393672:exon_121206149_121209255:POLQ;ENSG00000051341:ENST00000264233:exon_121206149_121209255:POLQ HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 121351257 C/T 1 149 85 234 73.0700017259704 43.3157708274666 29.7542308985038 T:C C T 10 0.509597303852548 0.000106305431250190 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121351253_121351410:HCLS1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 121351338 C/T 1 100 55 155 49.0402696147452 28.0278517118901 21.0124179028551 T:C C T 10 0.509597303852548 0.000714316525298462 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121351253_121351410:HCLS1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 121353254 T/C 1 60 54 114 29.4241617688471 27.5182544080376 1.90590736080953 T:C T C 10 0.509597303852548 0.778876432746131 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121353054_121353265:HCLS1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 121363680 C/T 1 46 44 90 22.5585240227828 22.4222813695121 0.136242653270685 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121363665_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121363665_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121363665_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121363665_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000464274:exon_121363665_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000487290:exon_121363665_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000481314:exon_121363077_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000497391:exon_121363665_121363775:HCLS1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 121415610 G/A 1 18 17 35 8.82724853065414 8.66315416549332 0.164094365160821 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 121435621 T/C 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 T:C T C 10 0.509597303852548 0.499988077920146 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000426235:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000489400:exon_121435584_121435986:GOLGB1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 121435624 C/T 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 T:C C T 10 0.509597303852548 0.499988077920146 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000426235:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000489400:exon_121435584_121435986:GOLGB1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 121500699 C/T 1 27 29 56 13.2408727959812 14.7783218117239 -1.53744901574269 T:C C T 10 0.509597303852548 0.690960442575641 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121500590_121500721:IQCB1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 121507231 A/T 1 11 8 19 5.39442965762197 4.07677843082038 1.31765122680159 A:T A T 10 0.509597303852548 0.648772677857544 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121507131_121507279:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121507131_121507279:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121507131_121507279:IQCB1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 121712051 A/C 1 11 6 17 5.39442965762197 3.05758382311529 2.33684583450668 A:C A C 10 0.509597303852548 0.333835168817674 ENSG00000145103:ENST00000273691:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000344209:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000393631:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000462014:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000460554:exon_121711996_121712798:ILDR1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 121825197 G/A 1 14 20 34 6.86563774606433 10.191946077051 -3.32630833098663 A:G G A 10 0.509597303852548 0.304159847215698 ENSG00000114013:ENST00000469710:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000493101:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000330540:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000383662:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000264468:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000393627:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000478741:exon_121825045_121825347:CD86 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 122259606 T/C 1 17 24 41 8.33684583450668 12.2303352924612 -3.89348945795447 T:C T C 10 0.509597303852548 0.274283303387366 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000492382:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000489652:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122259319_122259699:PARP9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 122274757 G/C 1 6 6 12 2.94241617688471 3.05758382311529 -0.115167646230576 C:G G C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000466126:exon_122274711_122274968:PARP9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 122354037 A/G 1 46 55 101 22.5585240227828 28.0278517118901 -5.46932768910735 A:G A G 10 0.509597303852548 0.319642916761354 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122353867_122354041:PARP15 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 122354716 C/T 1 43 53 96 21.0873159343404 27.008657104185 -5.92134116984461 T:C C T 10 0.509597303852548 0.261433608924415 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122354658_122354886:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 122419083 C/A 1 17 13 30 8.33684583450668 6.62476495008312 1.71208088442356 A:C C A 10 0.509597303852548 0.586755581141905 ENSG00000173193:ENST00000474629:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000398162:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000310290:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000460683:exon_122418237_122420482:PARP14 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 122419292 A/G 1 27 21 48 13.2408727959812 10.7015433809035 2.5393294150777 A:G A G 10 0.509597303852548 0.47480831290325 ENSG00000173193:ENST00000474629:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000398162:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000310290:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000460683:exon_122418237_122420482:PARP14 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 122439062 C/T 1 8 1 9 3.92322156917962 0.509597303852548 3.41362426532707 T:C C T 10 0.509597303852548 0.039373498903222 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 122459477 A/G 1 13 7 20 6.37523504991688 3.56718112696784 2.80805392294904 A:G A G 10 0.509597303852548 0.264944792438562 ENSG00000169087:ENST00000383659:exon_122458846_122459722:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000471534:exon_122458850_122459722:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000306103:exon_122458850_122459722:HSPBAP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 122864436 G/A 1 12 4 16 5.88483235376942 2.03838921541019 3.84644313835923 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0776723690771564 ENSG00000065485:ENST00000489923:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000472319:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000467157:exon_122863354_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000485208:exon_122864369_122864439:PDIA5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 123634046 G/A 1 11 20 31 5.39442965762197 10.191946077051 -4.79751641942899 A:G G A 10 0.509597303852548 0.105337580740766 ENSG00000175455:ENST00000310351:exon_123632300_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000485727:exon_123632564_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409657:exon_123632572_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000489746:exon_123632574_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000433542:exon_123633166_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409697:exon_123633469_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000488653:exon_123633469_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000483247:exon_123633509_123634136:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000419247:exon_123634046_123634136:CCDC14 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 123665902 T/G 1 10 2 12 4.90402696147452 1.0191946077051 3.88483235376942 T:G T G 10 0.509597303852548 0.0389900147787838 ENSG00000175455:ENST00000310351:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000485727:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409657:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000495381:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000489746:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000433542:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409697:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000488653:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000426152:exon_123665651_123665904:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000435910:exon_123665860_123666166:CCDC14 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 124627024 T/G 1 6 6 12 2.94241617688471 3.05758382311529 -0.115167646230576 T:G T G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000173702:ENST00000311075:exon_124626994_124627195:MUC13 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 124646594 A/G 1 10 4 14 4.90402696147452 2.03838921541019 2.86563774606433 A:G A G 10 0.509597303852548 0.180690507474734 ENSG00000173702:ENST00000311075:exon_124646379_124646837:MUC13;ENSG00000173702:ENST00000490147:exon_124646379_124646618:MUC13 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 124802677 A/G 1 30 19 49 14.7120808844236 9.68234877319841 5.02973211122515 A:G A G 10 0.509597303852548 0.156104343429479 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 124802881 A/G 1 34 25 59 16.6736916690134 12.7399325963137 3.93375907269967 A:G A G 10 0.509597303852548 0.362253615416065 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124802734_124802893:SLC12A8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 124802888 C/T 1 30 26 56 14.7120808844236 13.2495299001662 1.46255098425731 T:C C T 10 0.509597303852548 0.789537843443067 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124802734_124802893:SLC12A8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 124951821 C/T 1 9 19 28 4.41362426532707 9.68234877319841 -5.26872450787134 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0577645390368908 ENSG00000163848:ENST00000360647:exon_124944405_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000484491:exon_124950920_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000492394:exon_124950923_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000485866:exon_124951172_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000497929:exon_124951185_124952783:ZNF148 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 125726048 G/C 1 14 9 23 6.86563774606433 4.58637573467293 2.2792620113914 C:G G C 10 0.509597303852548 0.406879858723006 ENSG00000114544:ENST00000360370:exon_125725198_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000346785:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000383598:exon_125725201_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000512557:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000506102:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000458524:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315891:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000508835:exon_125725699_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315921:exon_125725916_125726068:SLC41A3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 125726062 T/C 1 13 8 21 6.37523504991688 4.07677843082038 2.29845661909649 T:C T C 10 0.509597303852548 0.385166903646358 ENSG00000114544:ENST00000360370:exon_125725198_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000346785:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000383598:exon_125725201_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000512557:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000506102:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000458524:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315891:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000508835:exon_125725699_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315921:exon_125725916_125726068:SLC41A3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 127323830 C/T 1 8 14 22 3.92322156917962 7.13436225393567 -3.21114068475606 T:C C T 10 0.509597303852548 0.203042661312835 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468659:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127323739_127323999:MCM2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 128622934 A/C 1 5 9 14 2.45201348073726 4.58637573467293 -2.13436225393567 A:C A C 10 0.509597303852548 0.293559675506127 ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128622905_128622975:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128622905_128622975:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505192:exon_128622905_128622975:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128622905_128622975:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128622905_128622975:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511526:exon_128622905_128622975:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000508971:exon_128622905_128622975:ACAD9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 132277866 G/A 1 15 12 27 7.35604044221178 6.11516764623058 1.2408727959812 A:G G A 10 0.509597303852548 0.702536459516712 ENSG00000240303:ENST00000496418:exon_132276982_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000355458:exon_132276982_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000264990:exon_132276988_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000485198:exon_132277316_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000469042:exon_132277668_132277929:ACAD11;ENSG00000113971:ENST00000471702:exon_132276986_132277929:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393156:exon_132276986_132277929:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393144:exon_132276986_132277929:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000326682:exon_132276986_132277929:NPHP3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 134225969 T/C 1 2 6 8 0.980805392294904 3.05758382311529 -2.07677843082038 T:C T C 10 0.509597303852548 0.171857042968518 ENSG00000182923:ENST00000332047:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000354446:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000511574:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000413794:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000438820:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000337090:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000383229:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000504013:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000512894:exon_134225951_134226095:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000513612:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000427599:exon_134225951_134226128:CEP63 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 140695259 C/T 1 22 14 36 10.7888593152439 7.13436225393567 3.65449706130827 T:C C T 10 0.509597303852548 0.246114197831200 ENSG00000114120:ENST00000446041:exon_140695105_140698775:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000324194:exon_140695102_140695492:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000502594:exon_140695102_140695325:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000453248:exon_140695102_140695323:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000511757:exon_140695102_140695489:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000514629:exon_140695102_140695305:SLC25A36 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 141163045 T/C 1 5 6 11 2.45201348073726 3.05758382311529 -0.605570342378028 T:C T C 10 0.509597303852548 0.770507260060939 ENSG00000177311:ENST00000509883:exon_141161231_141163543:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000514251:exon_141161231_141168634:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000321464:exon_141161231_141168623:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000441582:exon_141161231_141164842:ZBTB38 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 148704081 G/A 0 8 0 8 3.92322156917962 0 3.92322156917962 G G 10 0.509597303852548 0.00789316895639457 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 149459413 C/T 1 9 10 19 4.41362426532707 5.09597303852548 -0.682348773198411 T:C C T 10 0.509597303852548 0.821015503596854 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149456257_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149459177_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149459213_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000483708:exon_149459362_149459505:COMMD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 149700519 T/C 0 43 0 43 21.0873159343404 0 21.0873159343404 T T 10 0.509597303852548 3.06898658469171e-13 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 154018887 G/C 1 27 25 52 13.2408727959812 12.7399325963137 0.500940199667504 C:G G C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000174953:ENST00000496811:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000308361:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000329463:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000481941:exon_154018776_154018916:DHX36 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 154042141 T/G 1 13 15 28 6.37523504991688 7.64395955778822 -1.26872450787134 T:G T G 10 0.509597303852548 0.707126514476892 ENSG00000174953:ENST00000496811:exon_154041963_154042286:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000308361:exon_154041963_154042249:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000329463:exon_154041963_154042205:DHX36 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 156266774 C/T 1 69 66 135 33.8377860341742 33.6334220542682 0.20436397990602 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000114850:ENST00000265044:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467789:exon_156266655_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000476217:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000498205:exon_156266694_156266888:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000478842:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000464138:exon_156266594_156266786:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000463503:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000496050:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467733:exon_156266694_156266792:SSR3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 158388780 T/C 1 5 9 14 2.45201348073726 4.58637573467293 -2.13436225393567 T:C T C 10 0.509597303852548 0.293559675506127 ENSG00000079257:ENST00000264265:exon_158388746_158388808:LXN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 158409262 C/T 1 23 26 49 11.2792620113914 13.2495299001662 -1.97026788877485 T:C C T 10 0.509597303852548 0.668631032653623 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158409125_158410364:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158409125_158410358:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000472383:exon_158409125_158409688:GFM1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 160132136 A/G 1 16 11 27 7.84644313835923 5.60557034237803 2.2408727959812 A:G A G 10 0.509597303852548 0.444354653770125 ENSG00000113810:ENST00000462668:exon_160131811_160132305:SMC4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 172224303 A/G 1 16 13 29 7.84644313835923 6.62476495008312 1.22167818827611 A:G A G 10 0.509597303852548 0.712557853061201 ENSG00000121858:ENST00000241261:exon_172223298_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000420541:exon_172223452_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000382750:exon_172224300_172224709:TNFSF10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 174951784 G/C 1 21 9 30 10.2984566190965 4.58637573467293 5.71208088442356 C:G G C 10 0.509597303852548 0.0439092236266261 ENSG00000177694:ENST00000454872:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000485853:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000473253:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000316366:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000489299:exon_174951721_174951994:NAALADL2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 180325487 T/C 1 3 9 12 1.47120808844236 4.58637573467293 -3.11516764623058 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0867517050925024 ENSG00000163728:ENST00000296015:exon_180325436_180325553:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000412756:exon_180325436_180328762:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000465065:exon_180325436_180328762:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000470669:exon_180325436_180326059:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000382584:exon_180325436_180325553:TTC14 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 180328027 C/G 1 73 45 118 35.799396818764 22.9318786733647 12.8675181453993 C:G C G 10 0.509597303852548 0.0209805224674021 ENSG00000163728:ENST00000296015:exon_180327418_180328766:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000412756:exon_180325436_180328762:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000465065:exon_180325436_180328762:TTC14 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 183558402 C/G 1 36 32 68 17.6544970613083 16.3071137232815 1.34738333802674 C:G C G 10 0.509597303852548 0.808695548810437 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000311101:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000450375:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000417784:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000418450:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000435888:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000449306:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183558358_183558428:PARL HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 183560195 A/G 1 14 13 27 6.86563774606433 6.62476495008312 0.240872795981204 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183560086_183560235:PARL HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 183899832 C/T 1 39 48 87 19.1257051497506 24.4606705849223 -5.33496543517168 T:C C T 10 0.509597303852548 0.283797087238211 ENSG00000161203:ENST00000382456:exon_183899700_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000411763:exon_183899700_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000292807:exon_183899700_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000439647:exon_183899700_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000432591:exon_183899700_183899842:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000461733:exon_183899700_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000476434:exon_183899700_183899868:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000463935:exon_183899700_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000480260:exon_183899407_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000442686:exon_183899803_183899835:AP2M1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 183901281 G/A 1 53 84 137 25.991342895815 42.806173523614 -16.8148306277991 A:G G A 10 0.509597303852548 0.00464948769707844 ENSG00000161203:ENST00000382456:exon_183901270_183901879:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000411763:exon_183901270_183901450:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000292807:exon_183901270_183901879:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000439647:exon_183901270_183901836:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000461733:exon_183901270_183901853:AP2M1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 183904049 A/G 1 1 10 11 0.490402696147452 5.09597303852548 -4.60557034237803 A:G A G 10 0.509597303852548 0.00550610186118297 ENSG00000161204:ENST00000429586:exon_183903811_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000421340:exon_183903883_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000485921:exon_183903892_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000463685:exon_183903948_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000478288:exon_183903949_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000292808:exon_183903962_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000473311:exon_183903964_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000481116:exon_183903979_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000498136:exon_183903984_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000466416:exon_183903987_183904068:ABCF3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 183908761 C/T 0 8 0 8 3.92322156917962 0 3.92322156917962 C C 10 0.509597303852548 0.00789316895639457 ENSG00000161204:ENST00000466742:exon_183907618_183908831:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000480562:exon_183908652_183908831:ABCF3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 185135448 G/A 1 1252 5 1257 613.98417557661 2.54798651926274 611.436189057347 A:T:C:G G T 10 0.509597303852548 0 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 187088612 C/T 1 5 7 12 2.45201348073726 3.56718112696784 -1.11516764623058 T:C C T 10 0.509597303852548 0.574428486272357 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 187088926 G/A 1 7 8 15 3.43281887303216 4.07677843082038 -0.64395955778822 A:G G A 10 0.509597303852548 0.800365558868668 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 194369579 C/A 1 3 13 16 1.47120808844236 6.62476495008312 -5.15355686164077 A:C C A 10 0.509597303852548 0.0113166855000510 ENSG00000041802:ENST00000460584:exon_194369410_194369748:LSG1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 194369580 C/A 1 3 13 16 1.47120808844236 6.62476495008312 -5.15355686164077 A:C C A 10 0.509597303852548 0.0113166855000510 ENSG00000041802:ENST00000460584:exon_194369410_194369748:LSG1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 195594805 A/G 1 12 8 20 5.88483235376942 4.07677843082038 1.80805392294904 A:G A G 10 0.509597303852548 0.505035835457766 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 195594950 G/A 1 17 14 31 8.33684583450668 7.13436225393567 1.20248358057101 A:G G A 10 0.509597303852548 0.721643013841661 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 195595054 C/T 1 5 8 13 2.45201348073726 4.07677843082038 -1.62476495008312 T:C C T 10 0.509597303852548 0.415960200620574 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000495247:exon_195594955_195595168:TNK2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 195595405 G/A 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 A:G G A 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000495247:exon_195595404_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000464041:exon_195595088_195597076:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000439230:exon_195595094_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000481865:exon_195595096_195597076:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000424563:exon_195595227_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000478623:exon_195595377_195595580:TNK2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 195615376 A/G 1 6 4 10 2.94241617688471 2.03838921541019 0.90402696147452 A:G A G 10 0.509597303852548 0.75435926131823 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000464041:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000439230:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000316664:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000438207:exon_195615297_195615455:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000468819:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000447060:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000433111:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000427576:exon_195615297_195615477:TNK2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 196460680 C/T 1 11 7 18 5.39442965762197 3.56718112696784 1.82724853065414 T:C C T 10 0.509597303852548 0.482156564682581 ENSG00000163964:ENST00000392391:exon_196460630_196462878:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000314118:exon_196460630_196462855:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000296333:exon_196460630_196460773:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000453218:exon_196460630_196460911:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000415832:exon_196460630_196461160:PIGX HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 196613075 C/T 1 5 5 10 2.45201348073726 2.54798651926274 -0.0959730385254796 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000119231:ENST00000323460:exon_196612022_196613565:SENP5;ENSG00000119231:ENST00000445299:exon_196612022_196613565:SENP5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 3 197241286 G/C 1 1 11 12 0.490402696147452 5.60557034237803 -5.11516764623058 C:G G C 10 0.509597303852548 0.00291281177067002 ENSG00000161267:ENST00000392378:exon_197241135_197241287:BDH1;ENSG00000161267:ENST00000358186:exon_197241135_197241287:BDH1;ENSG00000161267:ENST00000392379:exon_197241135_197241287:BDH1;ENSG00000161267:ENST00000441275:exon_197241135_197241287:BDH1;ENSG00000161267:ENST00000479425:exon_197241135_197241287:BDH1;ENSG00000161267:ENST00000446746:exon_197241135_197241287:BDH1;ENSG00000161267:ENST00000477015:exon_197241135_197241287:BDH1;ENSG00000161267:ENST00000434143:exon_197241134_197241287:BDH1;ENSG00000161267:ENST00000483920:exon_197241134_197241287:BDH1;ENSG00000161267:ENST00000432819:exon_197241137_197241287:BDH1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 843720 T/C 1 55 45 100 26.9721482881099 22.9318786733647 4.0402696147452 T:C T C 10 0.509597303852548 0.425783958510611 ENSG00000178950:ENST00000502799:exon_843680_845461:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504668:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_843680_844197:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511345:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_843680_843856:GAK HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 882643 G/A 1 6 5 11 2.94241617688471 2.54798651926274 0.394429657621972 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_882635_882758:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_882635_882758:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_882635_882758:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504435:exon_879571_882758:GAK HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 946226 T/C 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 T:C T C 10 0.509597303852548 0.499988077920146 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514453:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515492:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000452360:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000509508:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515876:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515740:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000508204:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000510493:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504180:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505148:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000506669:exon_946199_946238:TMEM175 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 951947 T/C 1 15 13 28 7.35604044221178 6.62476495008312 0.731275492128656 T:C T C 10 0.509597303852548 0.85132302744545 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515740:exon_951612_952363:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000508204:exon_951612_952297:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505148:exon_951612_952427:TMEM175 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 1701317 G/A 1 37 33 70 18.1448997574557 16.8167110271341 1.32818873032164 A:G G A 10 0.509597303852548 0.811420580881412 ENSG00000163950:ENST00000429429:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000489418:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000460392:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000318386:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000483348:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000488267:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000480936:exon_1701291_1701428:SLBP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 1729953 G/A 1 33 25 58 16.1832889728659 12.7399325963137 3.44335637655222 A:G G A 10 0.509597303852548 0.431038070833625 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000467746:exon_1729435_1729959:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000458173:exon_1729435_1730121:TACC3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 1729988 G/A 1 29 32 61 14.2216781882761 16.3071137232815 -2.08543553500543 A:G G A 10 0.509597303852548 0.610766064803753 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000458173:exon_1729435_1730121:TACC3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 1730299 A/G 1 42 40 82 20.596913238193 20.3838921541019 0.213021084091068 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1730131_1730514:TACC3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 1732978 G/A 1 16 22 38 7.84644313835923 11.2111406847561 -3.36469754639682 A:G G A 10 0.509597303852548 0.330810533968778 ENSG00000013810:ENST00000485989:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1732899_1733028:TACC3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 1737502 C/T 1 12 14 26 5.88483235376942 7.13436225393567 -1.24952990016625 T:C C T 10 0.509597303852548 0.69693063211367 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1737458_1737554:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1737458_1737561:TACC3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 1746229 G/T 1 7 9 16 3.43281887303216 4.58637573467293 -1.15355686164077 T:G G T 10 0.509597303852548 0.623338489505478 ENSG00000013810:ENST00000484264:exon_1746166_1746351:TACC3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 1834666 T/C 1 17 8 25 8.33684583450668 4.07677843082038 4.2600674036863 T:C T C 10 0.509597303852548 0.109366962829306 ENSG00000168924:ENST00000302787:exon_1834471_1834674:LETM1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 1843324 C/T 1 2 10 12 0.980805392294904 5.09597303852548 -4.11516764623058 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0202434865629143 ENSG00000168924:ENST00000302787:exon_1843074_1843524:LETM1;ENSG00000168924:ENST00000505551:exon_1843074_1843524:LETM1;ENSG00000168924:ENST00000466175:exon_1843074_1843524:LETM1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 2702117 C/G 1 27 35 62 13.2408727959812 17.8359056348392 -4.59503283885797 C:G C G 10 0.509597303852548 0.255204258532305 ENSG00000125386:ENST00000324666:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000382839:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000512465:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000502458:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000513898:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000505311:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000513350:exon_2701407_2702228:FAM193A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 2743999 A/G 1 103 117 220 50.5114777031876 59.6228845507481 -9.11140684756055 A:G A G 10 0.509597303852548 0.225368444445929 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 2744087 G/A 1 58 78 136 28.4433563765522 39.7485897004987 -11.3052333239465 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0589277081120987 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 2746285 A/C 1 13 9 22 6.37523504991688 4.58637573467293 1.78885931524394 A:C A C 10 0.509597303852548 0.525168411892237 ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2746114_2746590:TNIP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 3215835 T/C 1 5 10 15 2.45201348073726 5.09597303852548 -2.64395955778822 T:C T C 10 0.509597303852548 0.20250907335495 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3215685_3215862:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3215685_3215862:HTT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 3240667 C/T 1 14 21 35 6.86563774606433 10.7015433809035 -3.83590563483918 T:C C T 10 0.509597303852548 0.236898592095749 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3240545_3240705:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3240545_3240705:HTT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 3240740 T/C 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:C T C 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 3514689 T/C 1 63 36 99 30.8953698572895 18.3455029386917 12.5498669185978 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0119182423680231 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 3514695 A/G 1 63 28 91 30.8953698572895 14.2687245078713 16.6266453494181 A:G A G 10 0.509597303852548 0.000488512406577417 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 3516559 C/T 1 38 16 54 18.6353024536032 8.15355686164077 10.4817455919624 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00595089832095958 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3516479_3516655:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3516479_3516655:LRPAP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 3526645 C/T 1 23 20 43 11.2792620113914 10.191946077051 1.08731593434044 A:T:C C T 10 0.509597303852548 0.762635616704978 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3526634_3526778:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3526634_3526778:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000515119:exon_3526634_3526873:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000509198:exon_3526634_3526778:LRPAP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 4276475 C/T 1 131 109 240 64.2427531953162 55.5461061199277 8.69664707538848 T:C C T 10 0.509597303852548 0.272750365660107 ENSG00000145220:ENST00000343470:exon_4276094_4276496:LYAR;ENSG00000145220:ENST00000452476:exon_4276094_4276496:LYAR HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 4304337 C/T 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 T:C C T 10 0.509597303852548 0.499988077920146 ENSG00000168826:ENST00000355834:exon_4303716_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000515012:exon_4303716_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000337872:exon_4303716_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000503703:exon_4304038_4304818:ZBTB49 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 5749904 T/C 1 4 7 11 1.96161078458981 3.56718112696784 -1.60557034237803 T:C T C 10 0.509597303852548 0.379319216476062 ENSG00000072840:ENST00000264956:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072840:ENST00000509451:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072832:ENST00000506216:exon_5749811_5750039:CRMP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 5800494 G/A 1 2 6 8 0.980805392294904 3.05758382311529 -2.07677843082038 A:G G A 10 0.509597303852548 0.171857042968518 ENSG00000072840:ENST00000264956:exon_5800313_5800519:EVC;ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5800313_5800519:EVC;ENSG00000072840:ENST00000515113:exon_5800313_5800519:EVC HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 5830414 T/C 1 18 9 27 8.82724853065414 4.58637573467293 4.2408727959812 T:C T C 10 0.509597303852548 0.123930071307246 ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5830246_5830772:EVC HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 6303844 G/A 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 6304087 A/G 1 7 3 10 3.43281887303216 1.52879191155764 1.90402696147452 A:G A G 10 0.509597303852548 0.344656245175514 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 6594947 A/C 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 A:C A C 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6594900_6595077:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6594900_6595011:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6594900_6595077:MAN2B2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 6711290 C/T 1 18 27 45 8.82724853065414 13.7591272040188 -4.93187867336466 T:C C T 10 0.509597303852548 0.179079133275381 ENSG00000178988:ENST00000500563:exon_6709428_6711554:MRFAP1L1;ENSG00000178988:ENST00000320848:exon_6710958_6711607:MRFAP1L1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 8229713 A/G 1 10 2 12 4.90402696147452 1.0191946077051 3.88483235376942 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0389900147787838 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 8229850 C/T 1 6 4 10 2.94241617688471 2.03838921541019 0.90402696147452 T:C C T 10 0.509597303852548 0.75435926131823 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 8375342 G/A 1 8 6 14 3.92322156917962 3.05758382311529 0.865637746064328 A:G G A 10 0.509597303852548 0.79106698341654 ENSG00000087008:ENST00000512411:exon_8375288_8375542:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000515797:exon_8375288_8375355:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000356406:exon_8375288_8375355:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000503233:exon_8375288_8375355:ACOX3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 10099340 T/C 1 21 23 44 10.2984566190965 11.7207379886086 -1.42228136951211 A:T:C T C 10 0.509597303852548 0.763439588932285 ENSG00000071127:ENST00000499869:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000439733:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000382452:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000400001:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000508079:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000264785:exon_10099334_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000505851:exon_10099336_10099515:WDR1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 13606576 A/T 1 50 55 105 24.5201348073726 28.0278517118901 -3.50771690451754 A:T:G A T 10 0.509597303852548 0.496547873684101 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 15835844 A/C 1 10 3 13 4.90402696147452 1.52879191155764 3.37523504991688 A:C A C 10 0.509597303852548 0.0930569697494132 ENSG00000004468:ENST00000502843:exon_15835840_15835925:CD38;ENSG00000004468:ENST00000226279:exon_15835840_15835925:CD38;ENSG00000004468:ENST00000510674:exon_15835840_15835925:CD38 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 17586703 T/C 1 50 37 87 24.5201348073726 18.8551002425443 5.66503456482832 T:C T C 10 0.509597303852548 0.239260058477991 ENSG00000002549:ENST00000226299:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000509583:exon_17586595_17587079:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000508014:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000513105:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000504614:exon_17586595_17586759:LAP3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 17829990 G/C 1 4 8 12 1.96161078458981 4.07677843082038 -2.11516764623058 C:G G C 10 0.509597303852548 0.258556419599671 ENSG00000109805:ENST00000251496:exon_17829901_17830011:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000514176:exon_17829901_17830011:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000510063:exon_17829901_17830011:NCAPG HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 22389797 A/C 1 7 11 18 3.43281887303216 5.60557034237803 -2.17275146934586 A:C A C 10 0.509597303852548 0.351502463188979 ENSG00000152990:ENST00000334304:exon_22389007_22390570:GPR125;ENSG00000152990:ENST00000499527:exon_22389023_22390570:GPR125;ENSG00000152990:ENST00000282943:exon_22389331_22390570:GPR125 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 22390167 C/T 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000152990:ENST00000334304:exon_22389007_22390570:GPR125;ENSG00000152990:ENST00000499527:exon_22389023_22390570:GPR125;ENSG00000152990:ENST00000282943:exon_22389331_22390570:GPR125 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 25125703 C/G 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 C:G C G 10 0.509597303852548 0.541646560898822 ENSG00000109618:ENST00000382103:exon_25121636_25125847:SEPSECS;ENSG00000109618:ENST00000302922:exon_25122624_25125847:SEPSECS;ENSG00000109618:ENST00000358971:exon_25123877_25125847:SEPSECS;ENSG00000109618:ENST00000514585:exon_25125472_25125847:SEPSECS;ENSG00000109618:ENST00000503150:exon_25125703_25125847:SEPSECS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 25253995 C/T 1 8 10 18 3.92322156917962 5.09597303852548 -1.17275146934586 T:C C T 10 0.509597303852548 0.642260839788311 ENSG00000038210:ENST00000512921:exon_25253943_25254097:PI4K2B;ENSG00000038210:ENST00000264864:exon_25253943_25254097:PI4K2B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 25417109 T/A 1 4 11 15 1.96161078458981 5.60557034237803 -3.64395955778822 A:T T A 10 0.509597303852548 0.0719657820440228 ENSG00000053900:ENST00000315368:exon_25417088_25417162:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000510092:exon_25417088_25417162:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000504256:exon_25417088_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000515848:exon_25417088_25417162:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000506973:exon_25416774_25418220:ANAPC4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 41259633 C/A 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 A:C C A 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000154277:ENST00000514924:exon_41259626_41259754:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000503431:exon_41259626_41259754:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000284440:exon_41259626_41259754:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000381760:exon_41259132_41259754:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000512419:exon_41259626_41259754:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000381762:exon_41259626_41259754:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000505232:exon_41259626_41259754:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000504818:exon_41259391_41259754:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000508768:exon_41259626_41259754:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000512788:exon_41259626_41259754:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000472501:exon_41259132_41259754:UCHL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 48147309 T/C 1 7 2 9 3.43281887303216 1.0191946077051 2.41362426532707 T:C T C 10 0.509597303852548 0.180412718745071 ENSG00000135605:ENST00000381501:exon_48147096_48147312:TEC;ENSG00000135605:ENST00000506752:exon_48147096_48147312:TEC;ENSG00000135605:ENST00000505452:exon_48147096_48147312:TEC;ENSG00000135605:ENST00000511471:exon_48147095_48147312:TEC HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 53751932 C/T 1 7 8 15 3.43281887303216 4.07677843082038 -0.64395955778822 T:C C T 10 0.509597303852548 0.800365558868668 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_53751914_53752033:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_53751914_53752033:SCFD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 54011526 A/G 1 10 9 19 4.90402696147452 4.58637573467293 0.317651226801589 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54011500_54011749:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54011500_54011749:SCFD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 54011603 C/T 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 T:C C T 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54011500_54011749:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54011500_54011749:SCFD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 54232110 G/A 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 A:G G A 10 0.509597303852548 0.335037018547339 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54231271_54232242:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54231271_54232228:SCFD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 56756531 T/C 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 T:C T C 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000090989:ENST00000381295:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000346134:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000349598:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000511971:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000509302:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000504321:exon_56756389_56756552:EXOC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 57273840 C/G 1 11 8 19 5.39442965762197 4.07677843082038 1.31765122680159 C:G C G 10 0.509597303852548 0.648772677857544 ENSG00000128059:ENST00000264220:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000507648:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000510643:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000507724:exon_57273816_57273882:PPAT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 57797414 C/T 1 12 1 13 5.88483235376942 0.509597303852548 5.37523504991688 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00348827153835016 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 57876955 G/A 1 7 3 10 3.43281887303216 1.52879191155764 1.90402696147452 A:G G A 10 0.509597303852548 0.344656245175514 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57876914_57877053:POLR2B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 57881715 G/A 1 7 4 11 3.43281887303216 2.03838921541019 1.39442965762197 A:G G A 10 0.509597303852548 0.549658645750086 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57881668_57881824:POLR2B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 57889677 C/T 1 26 22 48 12.7504700998338 11.2111406847561 1.5393294150777 T:C C T 10 0.509597303852548 0.668250675958453 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000464918:exon_57889393_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000484821:exon_57889657_57889917:POLR2B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 68374597 C/T 1 6 6 12 2.94241617688471 3.05758382311529 -0.115167646230576 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000507196:exon_68374532_68374637:CENPC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 68380215 G/A 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 A:G G A 10 0.509597303852548 0.335037018547339 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68379792_68380405:CENPC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 68442968 A/G 1 24 15 39 11.7696647075388 7.64395955778822 4.12570514975063 A:G A G 10 0.509597303852548 0.202821066135949 ENSG00000035720:ENST00000265404:exon_68442921_68442977:STAP1;ENSG00000035720:ENST00000396225:exon_68442921_68442977:STAP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 69433714 C/T 1 7 9 16 3.43281887303216 4.58637573467293 -1.15355686164077 T:C C T 10 0.509597303852548 0.623338489505478 ENSG00000197888:ENST00000317746:exon_69433479_69434245:UGT2B17 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 69512847 T/G 0 34 0 34 16.6736916690134 0 16.6736916690134 T T 10 0.509597303852548 1.41218036960609e-10 ENSG00000196620:ENST00000338206:exon_69512348_69513101:UGT2B15 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 73942678 C/T 1 18 24 42 8.82724853065414 12.2303352924612 -3.40308676180702 T:C C T 10 0.509597303852548 0.354800763745429 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73942657_73942821:ANKRD17 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 73956736 G/A 1 16 11 27 7.84644313835923 5.60557034237803 2.2408727959812 A:G G A 10 0.509597303852548 0.444354653770125 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73956384_73958017:ANKRD17 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 76722353 G/A 1 21 29 50 10.2984566190965 14.7783218117239 -4.4798651926274 A:G G A 10 0.509597303852548 0.257609870313266 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76722232_76722353:USO1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 76878688 G/A 1 27 23 50 13.2408727959812 11.7207379886086 1.5201348073726 A:T:G G A 10 0.509597303852548 0.674662898852891 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76878671_76878861:SDAD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 76878716 G/C 1 35 40 75 17.1640943651608 20.3838921541019 -3.2197977889411 C:G G C 10 0.509597303852548 0.489454790991458 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76878671_76878861:SDAD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 77871016 T/G 1 3 8 11 1.47120808844236 4.07677843082038 -2.60557034237803 T:G T G 10 0.509597303852548 0.139008716253398 ENSG00000138758:ENST00000264893:exon_77870856_77871083:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000502584:exon_77870904_77871083:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000510641:exon_77870919_77871083:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000505788:exon_77870962_77871083:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000512575:exon_77870989_77871083:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000510515:exon_77870990_77871083:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000504637:exon_77871015_77871083:SEPT11 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 84374480 C/T 1 10 9 19 4.90402696147452 4.58637573467293 0.317651226801589 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000163312:ENST00000508591:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000295488:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000510985:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000422434:exon_84374384_84375098:HELQ HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 100784980 C/T 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000070190:ENST00000296414:exon_100784927_100785012:DAPP1;ENSG00000070190:ENST00000512369:exon_100784927_100785012:DAPP1;ENSG00000070190:ENST00000507994:exon_100784927_100785443:DAPP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 103514658 T/C 1 7 8 15 3.43281887303216 4.07677843082038 -0.64395955778822 T:C T C 10 0.509597303852548 0.800365558868668 ENSG00000109320:ENST00000226574:exon_103514582_103514725:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000394820:exon_103514582_103514725:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000505458:exon_103514582_103514725:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000508584:exon_103514582_103514725:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000504044:exon_103514406_103514725:NFKB1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 103555992 A/G 1 19 3 22 9.31765122680159 1.52879191155764 7.78885931524395 A:G A G 10 0.509597303852548 0.000894193714959592 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103555945_103556202:MANBA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 104061993 C/G 1 5 7 12 2.45201348073726 3.56718112696784 -1.11516764623058 C:G C G 10 0.509597303852548 0.574428486272357 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061971_104062261:CENPE HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 104062223 C/T 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061971_104062261:CENPE HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 104082349 C/T 1 18 8 26 8.82724853065414 4.07677843082038 4.75047009983375 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0769085128674909 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000503705:exon_104082243_104082408:CENPE HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 106155216 A/G 0 9 0 9 4.41362426532707 0 4.41362426532707 A A 10 0.509597303852548 0.00395812771304115 ENSG00000168769:ENST00000305737:exon_106155054_106163928:TET2;ENSG00000168769:ENST00000513237:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000265149:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000380013:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000394764:exon_106155054_106163928:TET2;ENSG00000168769:ENST00000413648:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000514870:exon_106155054_106155429:TET2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 107249244 C/G 1 61 66 127 29.9145644649946 33.6334220542682 -3.71885758927359 C:G C G 10 0.509597303852548 0.535070038628489 ENSG00000164022:ENST00000510207:exon_107249233_107249400:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000442366:exon_107249233_107249400:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000358008:exon_107249233_107249400:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000394701:exon_107249233_107249400:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000432345:exon_107249233_107249400:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000394699:exon_107249233_107249400:AIMP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 110603784 T/C 1 16 21 37 7.84644313835923 10.7015433809035 -2.85510024254427 T:C T C 10 0.509597303852548 0.411846256659366 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110603738_110603898:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000472310:exon_110603738_110604350:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110603738_110603898:CCDC109B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 110605744 A/T 1 120 172 292 58.8483235376942 87.6507362626382 -28.802412724944 A:T A T 10 0.509597303852548 0.000823109564601688 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000494604:exon_110605596_110606523:CCDC109B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 110638810 C/T 1 6 2 8 2.94241617688471 1.0191946077051 1.92322156917962 T:C:G C T 10 0.509597303852548 0.289787629707581 ENSG00000123739:ENST00000243501:exon_110638704_110638869:PLA2G12A;ENSG00000123739:ENST00000502283:exon_110638704_110638869:PLA2G12A;ENSG00000123739:ENST00000507961:exon_110638704_110638869:PLA2G12A;ENSG00000123739:ENST00000502772:exon_110638704_110638869:PLA2G12A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 119736796 A/C 1 12 14 26 5.88483235376942 7.13436225393567 -1.24952990016625 A:C A C 10 0.509597303852548 0.69693063211367 ENSG00000150961:ENST00000280551:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000379735:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000429811:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000419654:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000514561:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000509818:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000506622:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000503683:exon_119736782_119736881:SEC24D HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 129012638 A/G 1 11 9 20 5.39442965762197 4.58637573467293 0.808053922949041 A:G A G 10 0.509597303852548 0.824451040790607 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000394288:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000432347:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129012502_129012667:LARP1B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 144135718 G/A 1 5 6 11 2.45201348073726 3.05758382311529 -0.605570342378028 A:G G A 10 0.509597303852548 0.770507260060939 ENSG00000170185:ENST00000510377:exon_144134734_144136730:USP38;ENSG00000170185:ENST00000307017:exon_144134734_144136096:USP38;ENSG00000170185:ENST00000511739:exon_144134734_144136096:USP38 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 156273768 T/C 1 4 10 14 1.96161078458981 5.09597303852548 -3.13436225393567 T:C T C 10 0.509597303852548 0.112312460825055 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156273748_156273880:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156273748_156273880:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000503466:exon_156273748_156273838:MAP9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 159636487 G/A 1 10 11 21 4.90402696147452 5.60557034237803 -0.701543380903507 A:G G A 10 0.509597303852548 0.82921410886802 ENSG00000171497:ENST00000307720:exon_159636449_159636555:PPID;ENSG00000171497:ENST00000512699:exon_159636449_159636555:PPID HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 160277276 C/T 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000109756:ENST00000264431:exon_160277005_160277310:RAPGEF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 164415930 C/T 1 28 34 62 13.7312754921287 17.3263083309866 -3.59503283885797 T:C C T 10 0.509597303852548 0.376486731131879 ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164415613_164415956:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164415819_164415956:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164415820_164415988:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164415820_164415988:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164415840_164415956:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164415860_164415956:C4orf43 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 164435265 A/C 1 27 28 55 13.2408727959812 14.2687245078713 -1.02785171189014 A:C A C 10 0.509597303852548 0.789257176432031 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164435226_164435310:C4orf43 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 164440581 T/C 1 31 28 59 15.202483580571 14.2687245078713 0.933759072699669 T:C T C 10 0.509597303852548 0.896564176067468 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164440486_164440872:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164440486_164441691:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164440486_164440871:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164440486_164440615:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000503148:exon_164440486_164440710:C4orf43 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 170601172 A/G 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 A:G A G 10 0.509597303852548 0.726965250907 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 170663235 C/T 0 10 0 10 4.90402696147452 0 4.90402696147452 C C 10 0.509597303852548 0.00198556249985287 ENSG00000056050:ENST00000393381:exon_170663108_170663258:C4orf27 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 170678993 T/C 1 11 10 21 5.39442965762197 5.09597303852548 0.298456619096493 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000056050:ENST00000393381:exon_170678981_170679104:C4orf27;ENSG00000056050:ENST00000506125:exon_170678981_170679055:C4orf27 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 174090004 G/A 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 A:G G A 10 0.509597303852548 0.541646560898822 ENSG00000109586:ENST00000265000:exon_174089904_174090112:GALNT7;ENSG00000109586:ENST00000512285:exon_174089962_174090112:GALNT7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 177249533 A/G 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000129128:ENST00000264597:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000503362:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000507678:exon_177249349_177249557:SPCS3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 183815688 A/G 1 8 12 20 3.92322156917962 6.11516764623058 -2.19194607705096 A:G A G 10 0.509597303852548 0.375790350036073 ENSG00000129187:ENST00000500813:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000357067:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000312820:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000452807:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000438320:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507543:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507631:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510370:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000503182:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510307:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000512766:exon_183815646_183815758:DCTD HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 185615764 C/A 1 15 19 34 7.35604044221178 9.68234877319841 -2.32630833098663 A:C C A 10 0.509597303852548 0.493928626130665 ENSG00000164306:ENST00000314970:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000515774:exon_185615676_185616117:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000503752:exon_185615676_185616070:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512834:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000509002:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512658:exon_185615676_185615912:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000510864:exon_185615676_185616106:CCDC111 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 185615768 T/G 1 15 20 35 7.35604044221178 10.191946077051 -2.83590563483918 T:G T G 10 0.509597303852548 0.398957144138432 ENSG00000164306:ENST00000314970:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000515774:exon_185615676_185616117:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000503752:exon_185615676_185616070:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512834:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000509002:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512658:exon_185615676_185615912:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000510864:exon_185615676_185616106:CCDC111 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 185634144 T/C 1 19 14 33 9.31765122680159 7.13436225393567 2.18328897286592 T:C T C 10 0.509597303852548 0.489512959476332 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185634098_185634167:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185634098_185634167:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000506535:exon_185634098_185634167:MLF1IP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 185637699 A/G 1 20 14 34 9.80805392294904 7.13436225393567 2.67369166901337 A:G A G 10 0.509597303852548 0.394506892847901 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185637551_185637787:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185637551_185637787:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000514781:exon_185637551_185637787:MLF1IP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 185650154 G/A 1 5 6 11 2.45201348073726 3.05758382311529 -0.605570342378028 A:G G A 10 0.509597303852548 0.770507260060939 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185650072_185650189:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185650072_185650189:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000514781:exon_185650072_185650189:MLF1IP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 186111639 T/C 1 11 9 20 5.39442965762197 4.58637573467293 0.808053922949041 T:C T C 10 0.509597303852548 0.824451040790607 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 186112208 G/T 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 T:G G T 10 0.509597303852548 0.541646560898822 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000503223:exon_186111922_186112366:KIAA1430 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 186294198 C/T 1 5 8 13 2.45201348073726 4.07677843082038 -1.62476495008312 T:C C T 10 0.509597303852548 0.415960200620574 ENSG00000109771:ENST00000362004:exon_186294010_186294233:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000328559:exon_186294010_186294233:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000510776:exon_186294010_186294233:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000505916:exon_186294010_186294233:LRP2BP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 4 186299260 A/G 1 14 33 47 6.86563774606433 16.8167110271341 -9.95107328106976 A:G A G 10 0.509597303852548 0.00501121401639435 ENSG00000109771:ENST00000362004:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000328559:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000510776:exon_186298063_186300172:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000505916:exon_186299235_186299361:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000511404:exon_186299235_186299361:LRP2BP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 223646 A/T 1 10 2 12 4.90402696147452 1.0191946077051 3.88483235376942 A:T A T 10 0.509597303852548 0.0389900147787838 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_223597_223683:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_223597_223683:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000506138:exon_223597_223683:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000502379:exon_223597_223683:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_223597_223683:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_223597_223683:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_223597_223683:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509632:exon_223597_223683:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_223597_223683:SDHA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 1063998 G/A 0 0 9 9 0 4.58637573467293 -4.58637573467293 A G A 10 0.509597303852548 0.00164049776378534 ENSG00000113504:ENST00000422688:exon_1063959_1064090:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000264930:exon_1063959_1064090:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000513223:exon_1063959_1064090:SLC12A7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 10250443 T/C 1 6 4 10 2.94241617688471 2.03838921541019 0.90402696147452 T:C T C 10 0.509597303852548 0.75435926131823 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10250033_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10250328_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000511700:exon_10250355_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000513114:exon_10250406_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10250416_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000508451:exon_10250421_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000423695:exon_10250431_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000510326:exon_10250431_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000512975:exon_10250431_10250557:CCT5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 10254817 A/G 1 21 17 38 10.2984566190965 8.66315416549332 1.63530245360318 A:G A G 10 0.509597303852548 0.629525463794102 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503026:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000513114:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10254786_10254835:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000508451:exon_10254786_10255142:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515676:exon_10254786_10254950:CCT5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 10256161 T/C 1 20 17 37 9.80805392294904 8.66315416549332 1.14489975745573 T:C T C 10 0.509597303852548 0.74452953067463 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503026:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000511700:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503454:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515676:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000506600:exon_10256067_10256265:CCT5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 10262740 C/A 1 9 3 12 4.41362426532707 1.52879191155764 2.88483235376942 A:C C A 10 0.509597303852548 0.146886429190433 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 14420027 A/C 1 1 8 9 0.490402696147452 4.07677843082038 -3.58637573467293 A:C A C 10 0.509597303852548 0.0193004967410206 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000515144:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000509354:exon_14419887_14420295:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512979:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000507714:exon_14419923_14420130:TRIO HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 33998768 C/A 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 A:C C A 10 0.509597303852548 0.5085374516326 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_33998746_33998887:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000426255:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000512079:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382068:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000082196:ENST00000382079:exon_33998746_33998932:C1QTNF3;ENSG00000082196:ENST00000441713:exon_33998746_33998932:C1QTNF3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 43039793 T/C 1 7 4 11 3.43281887303216 2.03838921541019 1.39442965762197 T:C T C 10 0.509597303852548 0.549658645750086 ENSG00000177721:ENST00000314890:exon_43039335_43041453:C5orf39 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 43297144 A/G 1 1 16 17 0.490402696147452 8.15355686164077 -7.66315416549332 A:G A G 10 0.509597303852548 0.000112972453614421 ENSG00000112972:ENST00000325110:exon_43297104_43297268:HMGCS1;ENSG00000112972:ENST00000433297:exon_43297104_43297268:HMGCS1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 43613046 A/G 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000112992:ENST00000505678:exon_43613010_43613239:NNT;ENSG00000112992:ENST00000512422:exon_43613010_43613239:NNT;ENSG00000112992:ENST00000264663:exon_43613010_43613239:NNT;ENSG00000112992:ENST00000344920:exon_43613010_43613239:NNT;ENSG00000112992:ENST00000512996:exon_43613010_43613239:NNT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 43653243 C/T 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 T:C C T 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000112992:ENST00000264663:exon_43653120_43653315:NNT;ENSG00000112992:ENST00000344920:exon_43653120_43653315:NNT;ENSG00000112992:ENST00000512996:exon_43653120_43653315:NNT;ENSG00000112992:ENST00000513390:exon_43653120_43653682:NNT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 44809162 G/C 1 12 4 16 5.88483235376942 2.03838921541019 3.84644313835923 C:G G C 10 0.509597303852548 0.0776723690771564 ENSG00000112996:ENST00000507110:exon_44809027_44809665:MRPS30 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 52942197 A/G 1 54 57 111 26.4817455919624 29.0470463195952 -2.56530072763283 A:G A G 10 0.509597303852548 0.636322524390072 ENSG00000164258:ENST00000507026:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000502423:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000296684:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506974:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506765:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000509443:exon_52942025_52942235:NDUFS4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 54674296 A/G 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 A:G A G 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000039123:ENST00000230640:exon_54674142_54674314:SKIV2L2;ENSG00000039123:ENST00000506750:exon_54674142_54674314:SKIV2L2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 56526783 G/A 1 11 15 26 5.39442965762197 7.64395955778822 -2.24952990016625 A:G G A 10 0.509597303852548 0.435378718300164 ENSG00000062194:ENST00000424459:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000454432:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000514387:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000506184:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000511209:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000264779:exon_56526673_56526796:GPBP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 56531795 G/A 1 20 24 44 9.80805392294904 12.2303352924612 -2.42228136951211 A:G G A 10 0.509597303852548 0.547013405244822 ENSG00000062194:ENST00000424459:exon_56531793_56531859:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000454432:exon_56531793_56531859:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000514387:exon_56531793_56531859:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000506184:exon_56531793_56531859:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000511209:exon_56531793_56531859:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000264779:exon_56531793_56531859:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000513732:exon_56531793_56531859:GPBP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 60241142 G/A 1 22 22 44 10.7888593152439 11.2111406847561 -0.42228136951211 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000164182:ENST00000296597:exon_60240956_60241209:NDUFAF2;ENSG00000164182:ENST00000511107:exon_60241034_60241255:NDUFAF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 64064943 G/A 1 8 1 9 3.92322156917962 0.509597303852548 3.41362426532707 A:G G A 10 0.509597303852548 0.039373498903222 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64064757_64065015:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64064773_64065015:CWC27 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 64273018 G/A 1 18 17 35 8.82724853065414 8.66315416549332 0.164094365160821 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64272962_64273065:CWC27 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 64956563 A/G 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000113597:ENST00000399438:exon_64956526_64956724:C5orf44;ENSG00000113597:ENST00000512009:exon_64956526_64960211:C5orf44;ENSG00000113597:ENST00000438419:exon_64956526_64956724:C5orf44;ENSG00000113597:ENST00000231526:exon_64956526_64956724:C5orf44;ENSG00000113597:ENST00000505553:exon_64956526_64956724:C5orf44;ENSG00000113597:ENST00000504243:exon_64956526_64956640:C5orf44;ENSG00000113597:ENST00000520525:exon_64956526_64956914:C5orf44;ENSG00000113597:ENST00000509234:exon_64956526_64956724:C5orf44 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 68419054 A/T 1 11 7 18 5.39442965762197 3.56718112696784 1.82724853065414 A:T A T 10 0.509597303852548 0.482156564682581 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68419026_68419339:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68419026_68419366:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68419026_68419247:SLC30A5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 68463014 G/T 1 10 3 13 4.90402696147452 1.52879191155764 3.37523504991688 T:G G T 10 0.509597303852548 0.0930569697494132 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68462837_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68462913_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68462962_68463110:CCNB1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 68531253 C/T 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 T:C C T 10 0.509597303852548 0.5085374516326 ENSG00000134058:ENST00000506563:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512687:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000256443:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515391:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512985:exon_68531221_68531322:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515180:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000506789:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000510106:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000514676:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000504147:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000508726:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000502604:exon_68530944_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000513629:exon_68530970_68531280:CDK7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 70805438 C/G 1 6 7 13 2.94241617688471 3.56718112696784 -0.624764950083124 C:G C G 10 0.509597303852548 0.786978111840725 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 72874907 A/C 0 9 0 9 4.41362426532707 0 4.41362426532707 A A 10 0.509597303852548 0.00395812771304115 ENSG00000164338:ENST00000296792:exon_72874842_72874975:UTP15;ENSG00000164338:ENST00000509005:exon_72874842_72874975:UTP15;ENSG00000164338:ENST00000508491:exon_72874842_72874975:UTP15 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 74877266 C/T 1 6 4 10 2.94241617688471 2.03838921541019 0.90402696147452 T:C C T 10 0.509597303852548 0.75435926131823 ENSG00000122008:ENST00000241436:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000352007:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000380481:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000425306:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000503479:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000506928:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000510815:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000515295:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000508867:exon_74877034_74878790:POLK;ENSG00000122008:ENST00000514141:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000504026:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000511527:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000505975:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000508526:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000509126:exon_74877034_74877273:POLK HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 77784738 A/G 1 5 6 11 2.45201348073726 3.05758382311529 -0.605570342378028 A:G A G 10 0.509597303852548 0.770507260060939 ENSG00000145685:ENST00000274345:exon_77781038_77784976:LHFPL2;ENSG00000145685:ENST00000380345:exon_77781040_77784976:LHFPL2;ENSG00000145685:ENST00000515007:exon_77781054_77784976:LHFPL2;ENSG00000145685:ENST00000502722:exon_77784635_77784976:LHFPL2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 81549240 C/A 1 7 1 8 3.43281887303216 0.509597303852548 2.92322156917962 A:C C A 10 0.509597303852548 0.0707155477569663 ENSG00000152348:ENST00000282185:exon_81549133_81549248:ATG10;ENSG00000152348:ENST00000458350:exon_81549133_81549248:ATG10;ENSG00000152348:ENST00000504770:exon_81549133_81549250:ATG10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 81572184 G/C 1 7 4 11 3.43281887303216 2.03838921541019 1.39442965762197 C:G G C 10 0.509597303852548 0.549658645750086 ENSG00000152348:ENST00000514253:exon_81571964_81572241:ATG10;ENSG00000186468:ENST00000507980:exon_81571697_81572337:RPS23 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 82648977 T/G 1 16 9 25 7.84644313835923 4.58637573467293 3.2600674036863 T:G T G 10 0.509597303852548 0.231674186241233 ENSG00000152422:ENST00000282268:exon_82648950_82649577:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000338635:exon_82648944_82649530:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000396027:exon_82648950_82649530:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000511817:exon_82648944_82649606:XRCC4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 82808072 C/T 0 0 10 10 0 5.09597303852548 -5.09597303852548 T C T 10 0.509597303852548 0.000804504526384197 ENSG00000038427:ENST00000265077:exon_82807922_82808215:VCAN;ENSG00000038427:ENST00000348134:exon_82807922_82808215:VCAN;ENSG00000038427:ENST00000342785:exon_82807922_82808215:VCAN;ENSG00000038427:ENST00000343200:exon_82807922_82808215:VCAN;ENSG00000038427:ENST00000421036:exon_82807922_82808215:VCAN;ENSG00000038427:ENST00000512590:exon_82807922_82808215:VCAN;ENSG00000038427:ENST00000513960:exon_82807922_82808215:VCAN;ENSG00000038427:ENST00000513984:exon_82807922_82808759:VCAN;ENSG00000038427:ENST00000502527:exon_82807922_82808215:VCAN;ENSG00000038427:ENST00000515397:exon_82807921_82808215:VCAN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 89703641 C/G 1 17 14 31 8.33684583450668 7.13436225393567 1.20248358057101 C:G C G 10 0.509597303852548 0.721643013841661 ENSG00000153140:ENST00000283122:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522083:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522864:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000518458:exon_89703516_89703647:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522565:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522842:exon_89703516_89703651:CETN3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 96129512 A/G 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 A:G A G 10 0.509597303852548 0.335037018547339 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96129506_96129660:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96129506_96129660:ERAP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 96139595 G/A 1 10 4 14 4.90402696147452 2.03838921541019 2.86563774606433 A:G G A 10 0.509597303852548 0.180690507474734 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507154:exon_96139243_96139642:ERAP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 96363459 A/G 1 11 12 23 5.39442965762197 6.11516764623058 -0.720737988608604 A:G A G 10 0.509597303852548 0.836390489019417 ENSG00000113441:ENST00000231368:exon_96363437_96363518:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000489981:exon_96363437_96363518:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000417755:exon_96363437_96363518:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000379870:exon_96363437_96363518:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000395770:exon_96363437_96363518:LNPEP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 96503378 T/C 1 14 26 40 6.86563774606433 13.2495299001662 -6.38389215410192 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0565356406526156 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96503171_96503695:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000511012:exon_96503171_96503423:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96502450_96503695:RIOK2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 102345546 A/C 1 9 3 12 4.41362426532707 1.52879191155764 2.88483235376942 A:C A C 10 0.509597303852548 0.146886429190433 ENSG00000145730:ENST00000438793:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000529394:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000346918:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000345721:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000348126:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000304400:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000274392:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000379787:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000455264:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000379799:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000510006:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000515456:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000504691:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000504456:exon_102345455_102345570:PAM HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 110096939 G/A 1 7 9 16 3.43281887303216 4.58637573467293 -1.15355686164077 A:G G A 10 0.509597303852548 0.623338489505478 ENSG00000164209:ENST00000513807:exon_110096904_110097967:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000355943:exon_110096904_110098484:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000514046:exon_110096904_110098787:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000509442:exon_110096904_110097147:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000504098:exon_110096904_110098484:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000502462:exon_110096904_110097355:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000513706:exon_110096904_110100857:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000509432:exon_110096904_110097913:SLC25A46 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 110819753 G/C 1 14 8 22 6.86563774606433 4.07677843082038 2.78885931524394 C:G G C 10 0.509597303852548 0.288242782553056 ENSG00000152495:ENST00000512453:exon_110819724_110820283:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000282356:exon_110819724_110830584:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000515231:exon_110819724_110820464:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000509645:exon_110819724_110821293:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000510858:exon_110819724_110820296:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000512890:exon_110819724_110820230:CAMK4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 112178795 G/A 1 8 6 14 3.92322156917962 3.05758382311529 0.865637746064328 A:G G A 10 0.509597303852548 0.79106698341654 ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 112929013 T/A 1 13 10 23 6.37523504991688 5.09597303852548 1.2792620113914 A:T T A 10 0.509597303852548 0.678943531012238 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000512600:exon_112927693_112930982:YTHDC2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 115428334 G/T 1 13 4 17 6.37523504991688 2.03838921541019 4.33684583450668 T:G G T 10 0.509597303852548 0.0497378911148666 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115428242_115428392:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000506589:exon_115428242_115428397:COMMD10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 115469773 C/T 1 9 5 14 4.41362426532707 2.54798651926274 1.86563774606433 T:C C T 10 0.509597303852548 0.425164682757114 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115469765_115469875:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115469765_115469875:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115469765_115469875:COMMD10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 118861713 A/G 1 9 8 17 4.41362426532707 4.07677843082038 0.336845834506684 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000518349:exon_118861612_118861719:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000507353:exon_118861431_118861718:HSD17B4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 122682334 C/T 1 4 8 12 1.96161078458981 4.07677843082038 -2.11516764623058 T:C C T 10 0.509597303852548 0.258556419599671 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122680697_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122681952_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122682094_122682447:CEP120 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 126147503 T/C 1 32 28 60 15.6928862767185 14.2687245078713 1.42416176884712 T:C T C 10 0.509597303852548 0.796529037102532 ENSG00000113368:ENST00000460265:exon_126147465_126147590:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000261366:exon_126147465_126147590:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000504788:exon_126147465_126147590:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000472034:exon_126147465_126147590:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000395354:exon_126147465_126147590:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000494185:exon_126147405_126147590:LMNB1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 126887569 G/A 1 18 6 24 8.82724853065414 3.05758382311529 5.76966470753885 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0232420567134879 ENSG00000164244:ENST00000296666:exon_126887399_126890781:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000442138:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000330542:exon_126887399_126887569:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000420037:exon_126887399_126887570:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000337087:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000513427:exon_126887399_126888148:PRRC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 131819977 C/T 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 T:C C T 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 131821866 T/G 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:G T G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000459982:exon_131821815_131822378:IRF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 131822055 T/C 1 8 20 28 3.92322156917962 10.191946077051 -6.26872450787134 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0221347498805815 ENSG00000125347:ENST00000245414:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000405885:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000459982:exon_131821815_131822378:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000458069:exon_131822033_131822065:IRF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 137088805 C/T 1 331 344 675 162.323292424807 175.301472525276 -12.9781801004699 T:C C T 10 0.509597303852548 0.335839519907763 ENSG00000177733:ENST00000314940:exon_137087075_137090039:HNRNPA0 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 137717213 G/A 1 6 7 13 2.94241617688471 3.56718112696784 -0.624764950083124 A:G G A 10 0.509597303852548 0.786978111840725 ENSG00000120733:ENST00000314358:exon_137717205_137717279:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000510866:exon_137717205_137717279:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000512928:exon_137717205_137717437:KDM3B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 137892170 G/A 1 244 224 468 119.658257859978 114.149796062971 5.50846179700754 A:C:G G A 10 0.509597303852548 0.64388736448543 ENSG00000113013:ENST00000297185:exon_137892141_137892281:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000524109:exon_137892141_137892281:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000512328:exon_137892141_137892262:HSPA9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 138266546 G/A 1 19 17 36 9.31765122680159 8.66315416549332 0.654497061308273 A:G G A 10 0.509597303852548 0.868812461697783 ENSG00000044115:ENST00000521724:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000302763:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000518825:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000355078:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000521387:exon_138266519_138266763:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000520520:exon_138266519_138266624:CTNNA1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 138456815 T/C 1 10 10 20 4.90402696147452 5.09597303852548 -0.191946077050959 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000120725:ENST00000394817:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000265195:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509534:exon_138456724_138456859:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000508639:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000513453:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000507002:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505830:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505353:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000504666:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509400:exon_138456724_138456862:SIL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 138773090 A/G 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 A:G A G 10 0.509597303852548 0.499988077920146 ENSG00000170464:ENST00000302060:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000507405:exon_138773061_138773249:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000506870:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515581:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515277:exon_138773061_138773247:DNAJC18 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 143200053 C/T 1 10 5 15 4.90402696147452 2.54798651926274 2.35604044221178 T:C C T 10 0.509597303852548 0.303107408657847 ENSG00000158497:ENST00000289448:exon_143200045_143200284:HMHB1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 149776232 C/T 1 80 80 160 39.2322156917962 40.7677843082038 -1.53556861640767 T:C C T 10 0.509597303852548 0.813055171935942 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149775845_149776405:TCOF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 149907533 T/G 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 T:G T G 10 0.509597303852548 0.335037018547339 ENSG00000070614:ENST00000523767:exon_149907366_149907860:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000261797:exon_149907366_149907860:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000424060:exon_149907366_149907860:NDST1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 150029536 C/T 1 1 9 10 0.490402696147452 4.58637573467293 -4.09597303852548 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0103454948738643 ENSG00000171992:ENST00000394243:exon_150027506_150033794:SYNPO;ENSG00000171992:ENST00000522122:exon_150027506_150031896:SYNPO;ENSG00000171992:ENST00000314840:exon_150027506_150031896:SYNPO;ENSG00000171992:ENST00000307662:exon_150027506_150029865:SYNPO;ENSG00000171992:ENST00000519664:exon_150027506_150031899:SYNPO HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 150425467 G/A 1 64 52 116 31.3857725534369 26.4990598003325 4.88671275310443 A:G G A 10 0.509597303852548 0.403500251527523 ENSG00000145901:ENST00000520931:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000389378:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000315050:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523338:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000417127:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522226:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000519339:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521591:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000518977:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000524280:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523200:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521782:exon_150425422_150425922:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522100:exon_150425427_150425511:TNIP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 150436422 C/T 1 16 24 40 7.84644313835923 12.2303352924612 -4.38389215410192 T:C C T 10 0.509597303852548 0.205555161089742 ENSG00000145901:ENST00000520931:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000389378:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000315050:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523338:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000417127:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522226:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000519339:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521591:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000518977:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000524280:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523200:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522100:exon_150436327_150436518:TNIP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 150489352 G/A 1 135 173 308 66.204363979906 88.1603335664908 -21.9559695865848 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0141316155027528 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150489314_150489407:ANXA6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 150489390 A/G 1 172 150 322 84.3492637373618 76.4395955778822 7.90966815947955 A:G A G 10 0.509597303852548 0.403179608328097 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150489314_150489407:ANXA6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 150518988 G/A 1 32 22 54 15.6928862767185 11.2111406847561 4.48174559196241 A:G G A 10 0.509597303852548 0.276102663149457 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517486:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000519644:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517677:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521749:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517757:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000520378:exon_150518239_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523164:exon_150518914_150519008:ANXA6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 150578574 A/G 1 8 6 14 3.92322156917962 3.05758382311529 0.865637746064328 A:G A G 10 0.509597303852548 0.79106698341654 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000524344:exon_150578403_150578645:CCDC69 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 156747669 A/G 1 18 5 23 8.82724853065414 2.54798651926274 6.2792620113914 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0109420316266651 ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156747663_156747810:CYFIP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 157164962 T/C 1 16 15 31 7.84644313835923 7.64395955778822 0.202483580571013 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000113272:ENST00000231198:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000521655:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000448153:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000523575:exon_157164918_157165002:THG1L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 162940999 A/G 1 20 8 28 9.80805392294904 4.07677843082038 5.73127549212866 A:G A G 10 0.509597303852548 0.036637852081938 ENSG00000038274:ENST00000280969:exon_162940848_162941000:MAT2B;ENSG00000038274:ENST00000415433:exon_162940848_162941000:MAT2B;ENSG00000038274:ENST00000321757:exon_162940848_162941000:MAT2B;ENSG00000038274:ENST00000421814:exon_162940848_162941000:MAT2B;ENSG00000038274:ENST00000518095:exon_162940848_162941000:MAT2B;ENSG00000038274:ENST00000523606:exon_162940848_162941000:MAT2B;ENSG00000038274:ENST00000520449:exon_162940848_162941000:MAT2B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 167943827 G/A 1 37 34 71 18.1448997574557 17.3263083309866 0.818591426469094 A:G G A 10 0.509597303852548 0.905719541477745 ENSG00000113643:ENST00000231572:exon_167943783_167943955:RARS;ENSG00000113643:ENST00000520013:exon_167943783_167943955:RARS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 169127097 C/A 1 12 7 19 5.88483235376942 3.56718112696784 2.31765122680159 A:C C A 10 0.509597303852548 0.360981209646244 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169127018_169127143:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169127018_169127143:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169127018_169127143:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523684:exon_169127018_169127143:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519223:exon_169127018_169127143:DOCK2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 169267784 G/A 1 5 6 11 2.45201348073726 3.05758382311529 -0.605570342378028 A:G G A 10 0.509597303852548 0.770507260060939 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520836:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520181:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519628:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169267761_169267856:DOCK2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 169504743 T/C 1 23 21 44 11.2792620113914 10.7015433809035 0.57771863048789 T:C T C 10 0.509597303852548 0.881361534784246 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520450:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519868:exon_169504714_169504841:DOCK2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 171520436 T/C 1 14 19 33 6.86563774606433 9.68234877319841 -2.81671102713408 T:C T C 10 0.509597303852548 0.385224101277236 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171520416_171520964:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517775:exon_171520416_171520581:STK10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 171523547 G/A 1 7 11 18 3.43281887303216 5.60557034237803 -2.17275146934586 A:G G A 10 0.509597303852548 0.351502463188979 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171523430_171523564:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171523442_171523564:STK10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 175772208 C/T 1 1 11 12 0.490402696147452 5.60557034237803 -5.11516764623058 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00291281177067002 ENSG00000170085:ENST00000345702:exon_175772186_175772988:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000430704:exon_175772186_175772569:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000443967:exon_175772186_175772994:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000341199:exon_175772186_175772992:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000420396:exon_175772186_175772988:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000332772:exon_175772186_175772992:C5orf25 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 176378574 G/T 1 6 5 11 2.94241617688471 2.54798651926274 0.394429657621972 T:G G T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176378475_176378578:UIMC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 176382995 G/A 1 10 5 15 4.90402696147452 2.54798651926274 2.35604044221178 A:G G A 10 0.509597303852548 0.303107408657847 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176382960_176383036:UIMC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 176402401 G/A 1 8 7 15 3.92322156917962 3.56718112696784 0.35604044221178 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000509236:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000417486:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000515488:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000507513:exon_176402397_176402481:UIMC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 176636882 C/T 1 6 8 14 2.94241617688471 4.07677843082038 -1.13436225393567 T:C C T 10 0.509597303852548 0.601095068648336 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 176721119 G/A 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 A:G G A 10 0.509597303852548 0.499988077920146 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176720833_176727216:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176720833_176722763:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176720833_176727211:NSD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 176863519 G/C 1 29 47 76 14.2216781882761 23.9510732810698 -9.72939509279365 C:G G C 10 0.509597303852548 0.0289238881944391 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000507633:exon_176863394_176863686:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176863394_176863531:GRK6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 176917897 C/T 1 6 7 13 2.94241617688471 3.56718112696784 -0.624764950083124 T:C C T 10 0.509597303852548 0.786978111840725 ENSG00000196923:ENST00000493815:exon_176917871_176917907:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000359895:exon_176917871_176917907:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000356618:exon_176917871_176917907:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355841:exon_176917871_176917907:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000460994:exon_176917871_176917907:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000486828:exon_176917871_176917907:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393551:exon_176917871_176917907:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000505074:exon_176917871_176917907:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355572:exon_176917871_176917907:PDLIM7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 177482694 T/C 0 1897 0 1897 930.293914591716 0 930.293914591716 T T 10 0.509597303852548 0 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 177483184 A/G 1 10 6 16 4.90402696147452 3.05758382311529 1.84644313835923 A:G A G 10 0.509597303852548 0.45584747299355 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 178986987 C/T 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 T:C C T 10 0.509597303852548 0.335037018547339 ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_178986693_178987199:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000503514:exon_178986742_178987199:RUFY1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 179036357 G/A 1 8 2 10 3.92322156917962 1.0191946077051 2.90402696147452 A:G G A 10 0.509597303852548 0.110022635989167 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 179045142 G/A 1 2 12 14 0.980805392294904 6.11516764623058 -5.13436225393567 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0064484390483877 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 179260009 G/A 1 7 2 9 3.43281887303216 1.0191946077051 2.41362426532707 A:G G A 10 0.509597303852548 0.180412718745071 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 179260153 C/T 1 79 87 166 38.7418129956487 44.3349654351717 -5.59315243952297 T:C C T 10 0.509597303852548 0.394121715392606 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 179260213 G/A 1 96 118 214 47.0786588301554 60.1324818546007 -13.0538230244453 A:T:G G A 10 0.509597303852548 0.0757610917122768 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 179264731 T/C 1 32 57 89 15.6928862767185 29.0470463195952 -13.3541600428768 T:C:G T C 10 0.509597303852548 0.00556448937896116 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179263436_179265078:SQSTM1;ENSG00000161010:ENST00000376931:exon_179264266_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523267:exon_179264274_179264879:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523084:exon_179264276_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000292586:exon_179264276_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376929:exon_179264277_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521299:exon_179264527_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521333:exon_179264693_179264811:C5orf45 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 179264915 G/T 1 14 41 55 6.86563774606433 20.8934894579545 -14.0278517118901 T:G G T 10 0.509597303852548 0.000202632734955911 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179263436_179265078:SQSTM1;ENSG00000161010:ENST00000518950:exon_179264760_179265255:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 180669136 C/T 1 26 27 53 12.7504700998338 13.7591272040188 -1.00865710418504 T:C C T 10 0.509597303852548 0.785625642893916 ENSG00000204628:ENST00000513060:exon_180668492_180669345:GNB2L1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 180669370 A/G 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 A:G A G 10 0.509597303852548 0.541646560898822 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 5 180687212 C/T 1 2 9 11 0.980805392294904 4.58637573467293 -3.60557034237803 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0353083305106556 ENSG00000183718:ENST00000327767:exon_180687002_180688119:TRIM52;ENSG00000183718:ENST00000510796:exon_180687002_180687258:TRIM52;ENSG00000183718:ENST00000503005:exon_180687002_180687325:TRIM52;ENSG00000183718:ENST00000514805:exon_180687002_180688082:TRIM52 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 61 46 107 29.9145644649946 23.4414759772172 6.47308848777737 A:G G A 10 0.509597303852548 0.245812647370989 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 3077041 C/T 1 2 6 8 0.980805392294904 3.05758382311529 -2.07677843082038 T:C C T 10 0.509597303852548 0.171857042968518 ENSG00000137275:ENST00000490396:exon_3076998_3077054:RIPK1;ENSG00000137275:ENST00000259808:exon_3076998_3077221:RIPK1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 4031998 A/G 1 118 129 247 57.8675181453993 65.7380521969787 -7.87053405157935 A:G A G 10 0.509597303852548 0.339852453752793 ENSG00000112739:ENST00000480058:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000337659:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000489943:exon_4031793_4032335:PRPF4B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 4116262 G/A 1 40 18 58 19.6161078458981 9.17275146934586 10.4433563765522 A:G G A 10 0.509597303852548 0.00805701821148136 ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4115923_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4115927_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4115934_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4115936_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000478266:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4115941_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4115942_4116263:PECI HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 4998963 A/G 1 1 9 10 0.490402696147452 4.58637573467293 -4.09597303852548 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0103454948738643 ENSG00000124787:ENST00000380051:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000319533:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000380053:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000464646:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000468105:exon_4998922_4999075:RPP40 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 7246998 G/A 1 8 8 16 3.92322156917962 4.07677843082038 -0.153556861640768 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7246998_7247099:RREB1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 7247248 T/C 1 10 4 14 4.90402696147452 2.03838921541019 2.86563774606433 T:C T C 10 0.509597303852548 0.180690507474734 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7247244_7247454:RREB1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 11213832 T/C 1 12 8 20 5.88483235376942 4.07677843082038 1.80805392294904 A:T:C T C 10 0.509597303852548 0.505035835457766 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000379433:exon_11213514_11213960:NEDD9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 12122773 T/C 1 5 11 16 2.45201348073726 5.60557034237803 -3.15355686164077 T:C T C 10 0.509597303852548 0.136896620322009 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 12123249 A/G 1 12 13 25 5.88483235376942 6.62476495008312 -0.7399325963137 A:G A G 10 0.509597303852548 0.84274112322754 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 13487174 C/T 1 6 2 8 2.94241617688471 1.0191946077051 1.92322156917962 T:C C T 10 0.509597303852548 0.289787629707581 ENSG00000145990:ENST00000379287:exon_13486870_13487787:GFOD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 16306866 G/A 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000124788:ENST00000244769:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000436367:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000450222:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000379065:exon_16306534_16307090:ATXN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 26027433 G/A 1 8 15 23 3.92322156917962 7.64395955778822 -3.7207379886086 A:G G A 10 0.509597303852548 0.145402204219230 ENSG00000124529:ENST00000377364:exon_26027124_26027480:HIST1H4B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 26056145 G/A 1 654 768 1422 320.723363280434 391.370729358757 -70.6473660783233 A:G G A 10 0.509597303852548 0.000182655531315815 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 26189312 C/G 1 11 7 18 5.39442965762197 3.56718112696784 1.82724853065414 T:C:G C G 10 0.509597303852548 0.482156564682581 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 26189313 C/G 1 11 8 19 5.39442965762197 4.07677843082038 1.31765122680159 C:G C G 10 0.509597303852548 0.648772677857544 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 26197481 C/G 1 23 24 47 11.2792620113914 12.2303352924612 -0.951073281069755 C:G C G 10 0.509597303852548 0.884219904950155 ENSG00000197409:ENST00000377831:exon_26197012_26197497:HIST1H3D HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 26197493 C/A 1 21 15 36 10.2984566190965 7.64395955778822 2.65449706130827 A:C C A 10 0.509597303852548 0.408159187526974 ENSG00000197409:ENST00000377831:exon_26197012_26197497:HIST1H3D HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 26199454 C/T 1 24 28 52 11.7696647075388 14.2687245078713 -2.4990598003325 T:C C T 10 0.509597303852548 0.492388148089286 ENSG00000197409:ENST00000377831:exon_26199087_26199464:HIST1H3D;ENSG00000196866:ENST00000341023:exon_26199079_26199471:HIST1H2AD HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 26199822 A/G 1 14 10 24 6.86563774606433 5.09597303852548 1.76966470753885 A:G A G 10 0.509597303852548 0.543061903146082 ENSG00000197846:ENST00000359985:exon_26199748_26200942:HIST1H2BF HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 26205052 G/A 1 15 24 39 7.35604044221178 12.2303352924612 -4.87429485024937 A:G G A 10 0.509597303852548 0.148854665686179 ENSG00000198518:ENST00000360441:exon_26204858_26206266:HIST1H4E HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 26216584 C/T 1 41 41 82 20.1065105420455 20.8934894579545 -0.786978915908932 T:C C T 10 0.509597303852548 0.912227921082761 ENSG00000187990:ENST00000339812:exon_26216491_26216871:HIST1H2BG HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 26234883 A/G 1 21 19 40 10.2984566190965 9.68234877319841 0.616107845898082 A:G A G 10 0.509597303852548 0.875549899947125 ENSG00000124575:ENST00000244534:exon_26234440_26235216:HIST1H1D HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 26234952 A/G 1 17 33 50 8.33684583450668 16.8167110271341 -8.4798651926274 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0226562631205398 ENSG00000124575:ENST00000244534:exon_26234440_26235216:HIST1H1D HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 26240752 C/T 1 1 9 10 0.490402696147452 4.58637573467293 -4.09597303852548 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0103454948738643 ENSG00000198327:ENST00000377745:exon_26240561_26240976:HIST1H4F HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 26393021 G/A 1 20 29 49 9.80805392294904 14.7783218117239 -4.97026788877485 A:G G A 10 0.509597303852548 0.197985290064302 ENSG00000124508:ENST00000356709:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000352867:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000482536:exon_26392603_26393235:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000432533:exon_26392450_26393236:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000416795:exon_26392603_26394220:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000495632:exon_26391031_26394197:BTN2A2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 26468319 C/T 1 12 9 21 5.88483235376942 4.58637573467293 1.29845661909649 T:C C T 10 0.509597303852548 0.664861077872976 ENSG00000112763:ENST00000377600:exon_26468176_26469830:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000312541:exon_26468176_26469865:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000429381:exon_26467947_26469865:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000265424:exon_26468176_26468635:BTN2A1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 27806769 C/T 1 8 6 14 3.92322156917962 3.05758382311529 0.865637746064328 T:C C T 10 0.509597303852548 0.79106698341654 ENSG00000233822:ENST00000396980:exon_27805538_27807260:HIST1H2BN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 28269663 A/G 1 5 9 14 2.45201348073726 4.58637573467293 -2.13436225393567 A:G A G 10 0.509597303852548 0.293559675506127 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28268501_28270326:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28268501_28270325:PGBD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 28270047 C/G 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 C:G C G 10 0.509597303852548 0.335037018547339 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28268501_28270326:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28268501_28270325:PGBD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 29691303 G/A 1 132 216 348 64.7331558914637 110.07301763215 -45.3398617406867 A:G G A 10 0.509597303852548 1.23258235478656e-06 ENSG00000204642:ENST00000376861:exon_29691083_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000414333:exon_29691056_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000334668:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000462777:exon_29691169_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29691185_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000482257:exon_29691211_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29691219_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000434407:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000433607:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000486194:exon_29691281_29691704:HLA-F HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 29691713 A/C 1 8 15 23 3.92322156917962 7.64395955778822 -3.7207379886086 A:C A C 10 0.509597303852548 0.145402204219230 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 29691744 C/G 1 11 16 27 5.39442965762197 8.15355686164077 -2.7591272040188 C:G C G 10 0.509597303852548 0.337959274816801 ENSG00000204642:ENST00000485513:exon_29691717_29692225:HLA-F HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 29693938 G/A 1 37 37 74 18.1448997574557 18.8551002425443 -0.710200485088549 A:G G A 10 0.509597303852548 0.90773690199986 ENSG00000204642:ENST00000484704:exon_29693788_29694303:HLA-F HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 29694680 A/C 1 9 6 15 4.41362426532707 3.05758382311529 1.35604044221178 A:C A C 10 0.509597303852548 0.608250593906015 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 29694681 A/T 1 9 7 16 4.41362426532707 3.56718112696784 0.846443138359232 A:T A T 10 0.509597303852548 0.80419746365061 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 29695713 C/T 1 10 6 16 4.90402696147452 3.05758382311529 1.84644313835923 T:C C T 10 0.509597303852548 0.45584747299355 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 29695854 G/A 1 8 4 12 3.92322156917962 2.03838921541019 1.88483235376942 A:G G A 10 0.509597303852548 0.388763190446408 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29695734_29695883:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000475996:exon_29695734_29697128:HLA-F HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 29910402 G/A 1 19 9 28 9.31765122680159 4.58637573467293 4.73127549212866 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0887797058418166 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910181_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910022_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910278_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910287_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29910325_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910326_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910329_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910331_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910331_29910403:HLA-A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 29911003 G/A 1 8 1 9 3.92322156917962 0.509597303852548 3.41362426532707 A:G G A 10 0.509597303852548 0.039373498903222 ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 29911360 A/G 1 7 13 20 3.43281887303216 6.62476495008312 -3.19194607705096 A:G A G 10 0.509597303852548 0.182296042530127 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 29912297 A/G 1 3 51 54 1.47120808844236 25.9894624964799 -24.5182544080376 A:G A G 10 0.509597303852548 7.87317957934347e-13 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 29912315 A/C 0 107 0 107 52.4730884877774 0 52.4730884877774 A A 10 0.509597303852548 4.79052340350831e-32 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 29912386 G/C 1 2 167 169 0.980805392294904 85.1027497433755 -84.1219443510806 C:G G C 10 0.509597303852548 8.1650628770006e-49 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 30032495 A/G 1 31 51 82 15.202483580571 25.9894624964799 -10.7869789159089 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0199538563307112 ENSG00000066379:ENST00000471008:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000332435:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376782:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000359374:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376785:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000463141:exon_30032450_30032686:ZNRD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 30036471 C/A 1 13 13 26 6.37523504991688 6.62476495008312 -0.249529900166248 A:C C A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000204619:ENST00000376773:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376772:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376769:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376765:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376763:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376758:exon_30035983_30036475:PPP1R11 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 30164497 G/A 1 7 9 16 3.43281887303216 4.58637573467293 -1.15355686164077 A:G G A 10 0.509597303852548 0.623338489505478 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000416596:exon_30164313_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000420345:exon_30164356_30164523:TRIM26 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 30309508 T/C 1 6 9 15 2.94241617688471 4.58637573467293 -1.64395955778822 T:C T C 10 0.509597303852548 0.446901967950042 ENSG00000204599:ENST00000396551:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376656:exon_30309489_30311505:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396548:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376659:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396547:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30309489_30309673:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30309489_30309673:XXbac-BPG283O16.8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 30313340 G/C 1 62 66 128 30.404967161142 33.6334220542682 -3.22845489312614 T:C:G G C 10 0.509597303852548 0.596384710739096 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30313268_30313350:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30313268_30313350:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30313244_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000466327:exon_30313268_30313706:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30313075_30314334:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30313075_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30313268_30313350:RPP21 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 30314566 T/G 1 40 37 77 19.6161078458981 18.8551002425443 0.761007603353807 T:G T G 10 0.509597303852548 0.9094941802503 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 30314567 C/A 1 40 37 77 19.6161078458981 18.8551002425443 0.761007603353807 A:C C A 10 0.509597303852548 0.9094941802503 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 30458064 G/A 1 184 167 351 90.2340960911312 85.1027497433755 5.13134634775567 A:G G A 10 0.509597303852548 0.59380134162409 ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30458017_30458292:HLA-E HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 30530203 A/G 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 A:G A G 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000204576:ENST00000376560:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000376557:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000481741:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000498336:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000470703:exon_30530166_30531500:PRR3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 30618867 T/C 1 6 2 8 2.94241617688471 1.0191946077051 1.92322156917962 T:C T C 10 0.509597303852548 0.289787629707581 ENSG00000204564:ENST00000488383:exon_30618771_30618877:C6orf136;ENSG00000204564:ENST00000487873:exon_30618771_30618877:C6orf136 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 30652872 G/A 1 30 23 53 14.7120808844236 11.7207379886086 2.99134289581496 A:G G A 10 0.509597303852548 0.492509024542069 ENSG00000146112:ENST00000274853:exon_30652185_30655672:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000399199:exon_30652185_30653823:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000376424:exon_30652794_30653795:KIAA1949 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 30668352 G/A 1 36 19 55 17.6544970613083 9.68234877319841 7.97214828810986 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0420908202950721 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30667584_30668409:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30667585_30668409:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30667585_30668409:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000422104:exon_30667585_30668409:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000489540:exon_30668092_30668409:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30668172_30668409:MDC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 30695920 C/T 1 256 219 475 125.543090213748 111.601809543708 13.9412806700397 T:C C T 10 0.509597303852548 0.215283072879093 ENSG00000137312:ENST00000376389:exon_30695486_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000487376:exon_30695486_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000376385:exon_30695486_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000456573:exon_30695513_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000432446:exon_30695513_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000422641:exon_30695513_30695922:FLOT1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 30708944 T/A 1 7 4 11 3.43281887303216 2.03838921541019 1.39442965762197 A:T T A 10 0.509597303852548 0.549658645750086 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 30867106 C/T 1 2 6 8 0.980805392294904 3.05758382311529 -2.07677843082038 T:C C T 10 0.509597303852548 0.171857042968518 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30866933_30867931:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30866933_30867617:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30866933_30867930:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30866933_30867209:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30866933_30867195:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30866665_30867181:DDR1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 30877760 A/C 1 8 9 17 3.92322156917962 4.58637573467293 -0.663154165493316 A:C A C 10 0.509597303852548 0.811525826845625 ENSG00000213780:ENST00000259895:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000376316:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000453897:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000487746:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30877709_30877840:VARS2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 30889389 T/C 1 14 9 23 6.86563774606433 4.58637573467293 2.2792620113914 A:T:C T C 10 0.509597303852548 0.406879858723006 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30889366_30889468:VARS2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 30890483 G/T 1 15 11 26 7.35604044221178 5.60557034237803 1.75047009983375 T:G G T 10 0.509597303852548 0.559102122990831 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000477052:exon_30890360_30890551:VARS2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 30892322 C/T 1 4 11 15 1.96161078458981 5.60557034237803 -3.64395955778822 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0719657820440228 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30892131_30892341:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30891130_30892337:VARS2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 30893127 G/A 1 8 6 14 3.92322156917962 3.05758382311529 0.865637746064328 A:G G A 10 0.509597303852548 0.79106698341654 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893051_30893162:VARS2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 30893428 G/A 1 10 14 24 4.90402696147452 7.13436225393567 -2.23033529246115 A:G G A 10 0.509597303852548 0.417388759331184 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30893321_30893451:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893321_30893496:VARS2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 31110786 T/A 1 29 49 78 14.2216781882761 24.9702678887749 -10.7485897004987 A:T T A 10 0.509597303852548 0.0170280260640339 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31110740_31110869:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31110740_31110869:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31110740_31110911:CCHCR1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 31116220 G/A 1 3 8 11 1.47120808844236 4.07677843082038 -2.60557034237803 A:G G A 10 0.509597303852548 0.139008716253398 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 31116246 G/A 0 8 0 8 3.92322156917962 0 3.92322156917962 G G 10 0.509597303852548 0.00789316895639457 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 31122330 G/A 1 11 9 20 5.39442965762197 4.58637573467293 0.808053922949041 A:G G A 10 0.509597303852548 0.824451040790607 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 31122473 G/A 1 10 4 14 4.90402696147452 2.03838921541019 2.86563774606433 A:G G A 10 0.509597303852548 0.180690507474734 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31122333_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31122349_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31122371_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31122388_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31122460_31122576:CCHCR1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 31130529 C/T 1 29 25 54 14.2216781882761 12.7399325963137 1.48174559196241 T:C C T 10 0.509597303852548 0.785769218507803 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31130254_31130784:TCF19 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 31239417 C/T 1 43 3 46 21.0873159343404 1.52879191155764 19.5585240227828 T:C C T 10 0.509597303852548 6.01244948992084e-10 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 31239518 C/T 1 22 63 85 10.7888593152439 32.1046301427105 -21.3157708274666 T:C C T 10 0.509597303852548 3.38108872067079e-06 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 31431757 A/G 1 18 16 34 8.82724853065414 8.15355686164077 0.673691669013369 A:G A G 10 0.509597303852548 0.865014513214598 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 31431874 G/T 1 16 5 21 7.84644313835923 2.54798651926274 5.29845661909649 T:G G T 10 0.509597303852548 0.0271764298858529 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 31525448 C/T 1 11 10 21 5.39442965762197 5.09597303852548 0.298456619096493 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000204498:ENST00000376146:exon_31525405_31525626:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000376148:exon_31525405_31525626:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000376145:exon_31525405_31525581:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000496233:exon_31525405_31525482:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000473655:exon_31525405_31525736:NFKBIL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 31540784 C/A 1 20 33 53 9.80805392294904 16.8167110271341 -7.00865710418504 A:C C A 10 0.509597303852548 0.0556396041617888 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540705_31540810:LTA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 31592064 C/T 1 11 17 28 5.39442965762197 8.66315416549332 -3.26872450787134 T:C C T 10 0.509597303852548 0.258128018543538 ENSG00000204469:ENST00000414096:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000469577:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31592038_31592137:BAT2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 31598489 A/G 1 12 10 22 5.88483235376942 5.09597303852548 0.788859315243944 A:G A G 10 0.509597303852548 0.832492277049863 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31598368_31598578:BAT2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 31602967 G/A 1 30 18 48 14.7120808844236 9.17275146934586 5.5393294150777 A:G G A 10 0.509597303852548 0.114558613315320 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000484787:exon_31602909_31603093:BAT2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 31603770 A/G 1 59 59 118 28.9337590726997 30.0662409273003 -1.13248185460066 A:G A G 10 0.509597303852548 0.854307958684894 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603137_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603359_31603826:BAT2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 31604591 C/T 1 52 57 109 25.5009401996675 29.0470463195952 -3.54610611992773 T:C C T 10 0.509597303852548 0.504206729400958 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31604510_31604913:BAT2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 31605199 G/C 1 34 30 64 16.6736916690134 15.2879191155764 1.38577255343693 C:G G C 10 0.509597303852548 0.802884501176405 ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 31609272 T/C 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 T:C T C 10 0.509597303852548 0.499988077920146 ENSG00000204463:ENST00000462875:exon_31608602_31609369:BAT3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 31610686 A/G 1 12 15 27 5.88483235376942 7.64395955778822 -1.7591272040188 A:G A G 10 0.509597303852548 0.56601930423381 ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000470875:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000465348:exon_31610461_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000438149:exon_31610609_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000436214:exon_31610647_31610892:BAT3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 31630241 C/T 1 17 28 45 8.33684583450668 14.2687245078713 -5.93187867336466 T:C:G C T 10 0.509597303852548 0.0999851065483281 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 31630318 C/G 1 24 13 37 11.7696647075388 6.62476495008312 5.14489975745572 C:G C G 10 0.509597303852548 0.101163301622562 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 31632134 C/A 1 25 19 44 12.2600674036863 9.68234877319841 2.57771863048789 A:C C A 10 0.509597303852548 0.455057447346693 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000440842:exon_31631660_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000458083:exon_31631762_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000445768:exon_31631800_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000432291:exon_31631935_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000456540:exon_31631987_31632354:BAT4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 31639979 C/T 1 45 41 86 22.0681213266353 20.8934894579545 1.17463186868088 T:C C T 10 0.509597303852548 0.829809758507512 ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31639641_31641323:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31639641_31640059:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409691:exon_31639641_31641323:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375864:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375875:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000519488:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000530877:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409525:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000483905:exon_31639641_31641323:LY6G5B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 31655438 G/A 1 15 23 38 7.35604044221178 11.7207379886086 -4.36469754639682 A:G G A 10 0.509597303852548 0.194038298354076 ENSG00000204427:ENST00000395952:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000468205:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000475742:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000492084:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000375842:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000495769:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000440843:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000490209:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000474007:exon_31655352_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000471644:exon_31655430_31655517:BAT5;ENSG00000204422:ENST00000461287:exon_31655419_31655517:XXbac-BPG32J3.20 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 31729359 A/G 1 10 8 18 4.90402696147452 4.07677843082038 0.827248530654137 A:G A G 10 0.509597303852548 0.815143514661865 ENSG00000204410:ENST00000375755:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000534153:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375750:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528100:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375742:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395817:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000383401:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375703:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375740:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528640:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375696:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000423982:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000463144:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395853:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000431848:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000484309:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000429846:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000491552:exon_31729249_31729392:MSH5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 31731881 C/T 1 23 47 70 11.2792620113914 23.9510732810698 -12.6718112696784 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00263576726709335 ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000476085:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000228727:ENST00000433778:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000415669:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000425424:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000494299:exon_31731397_31731936:C6orf26 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 31745464 G/A 0 12 0 12 5.88483235376942 0 5.88483235376942 G G 10 0.509597303852548 0.000500187409481343 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 31807489 C/T 1 23 6 29 11.2792620113914 3.05758382311529 8.22167818827611 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00243630463112457 ENSG00000204387:ENST00000375640:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375641:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375639:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375638:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375635:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375642:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395789:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375633:exon_31807320_31807541:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395788:exon_31807320_31807541:C6orf48 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 31936679 C/T 1 31 27 58 15.202483580571 13.7591272040188 1.44335637655222 T:C:G C T 10 0.509597303852548 0.793119432550113 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31936400_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000484835:exon_31936463_31936763:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000483553:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000471818:exon_31936678_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000485349:exon_31936648_31937185:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000491994:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000470453:exon_31936648_31936866:SKIV2L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 31938107 A/G 1 14 9 23 6.86563774606433 4.58637573467293 2.2792620113914 A:G A G 10 0.509597303852548 0.406879858723006 ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 32150474 C/G 1 21 17 38 10.2984566190965 8.66315416549332 1.63530245360318 C:G C G 10 0.509597303852548 0.629525463794102 ENSG00000204305:ENST00000488669:exon_32150345_32150708:AGER;ENSG00000204305:ENST00000473619:exon_32150345_32150708:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375067:exon_32150316_32150475:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375055:exon_32150345_32150475:AGER;ENSG00000204305:ENST00000484849:exon_32150345_32150475:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375076:exon_32150345_32150475:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375065:exon_32150345_32150475:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375070:exon_32150345_32150475:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375069:exon_32150345_32150475:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375059:exon_32150345_32150475:AGER;ENSG00000204305:ENST00000438221:exon_32150345_32150475:AGER HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 32157639 C/T 1 10 2 12 4.90402696147452 1.0191946077051 3.88483235376942 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0389900147787838 ENSG00000204304:ENST00000375050:exon_32157472_32157963:PBX2;ENSG00000204304:ENST00000478678:exon_32157472_32157719:PBX2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 32407709 C/A 1 61 82 143 29.9145644649946 41.7869789159089 -11.8724144509144 A:C C A 10 0.509597303852548 0.0540664315289739 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32407619_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32407647_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000462200:exon_32407649_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32407655_32407809:HLA-DRA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 32410210 T/C 1 8 5 13 3.92322156917962 2.54798651926274 1.37523504991688 T:C T C 10 0.509597303852548 0.581979954468297 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 32410215 T/C 1 8 5 13 3.92322156917962 2.54798651926274 1.37523504991688 T:C T C 10 0.509597303852548 0.581979954468297 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 32411035 A/C 1 795 835 1630 389.870143437224 425.513748716878 -35.6436052796532 A:C:G A C 10 0.509597303852548 0.0786067966529082 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32410962_32411243:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32410962_32411122:HLA-DRA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 32411523 T/C 1 9 13 22 4.41362426532707 6.62476495008312 -2.21114068475606 T:C T C 10 0.509597303852548 0.397626927679795 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 32411646 T/G 1 1530 1701 3231 750.316125105602 866.825013853184 -116.508888747583 A:T:C:G T G 10 0.509597303852548 4.42862441496477e-05 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32411533_32411698:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32411533_32411698:HLA-DRA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 32781554 G/A 1 19 11 30 9.31765122680159 5.60557034237803 3.71208088442356 A:G G A 10 0.509597303852548 0.202978653761744 ENSG00000241106:ENST00000488325:exon_32781500_32781610:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32781500_32781610:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32781500_32782378:HLA-DOB;ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32781544_32781610:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32781544_32781610:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 32782149 G/A 1 19 8 27 9.31765122680159 4.07677843082038 5.2408727959812 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0533977336476133 ENSG00000241106:ENST00000488325:exon_32782097_32782378:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32782097_32782378:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32781500_32782378:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000447394:exon_32782147_32782369:HLA-DOB;ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32782097_32782378:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32782097_32782378:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 32800412 C/T 1 20 18 38 9.80805392294904 9.17275146934586 0.635302453603177 T:C C T 10 0.509597303852548 0.87231182720855 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800404_32800510:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800404_32800601:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 32814975 T/C 1 89 110 199 43.6458399571232 56.0557034237803 -12.4098634666571 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0885970157712667 ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000487296:exon_32814845_32815452:TAP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 32818774 T/C 1 44 39 83 21.5777186304879 19.8742948502494 1.70342378023852 T:C T C 10 0.509597303852548 0.742671538577065 ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32818721_32818926:TAP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 32826233 A/G 1 138 171 309 67.6755720683484 87.1411389587857 -19.4655668904373 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0304432552527725 ENSG00000240065:ENST00000395330:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000464863:exon_32826141_32826677:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000374859:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000453265:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000395333:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000467593:exon_32826141_32826499:PSMB9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 32904981 G/A 1 29 59 88 14.2216781882761 30.0662409273003 -15.8445627390242 A:G G A 10 0.509597303852548 0.000852620084310765 ENSG00000242574:ENST00000438510:exon_32904949_32905216:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000414017:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000440643:exon_32904949_32905233:HLA-DMB HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 32943229 T/C 1 10 15 25 4.90402696147452 7.64395955778822 -2.7399325963137 T:C T C 10 0.509597303852548 0.319768319837023 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32943161_32943298:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000456339:exon_32943161_32943298:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32943161_32943298:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32943161_32943298:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32943161_32943298:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32943161_32943298:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32943161_32943298:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32943161_32943298:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32943161_32943298:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32943161_32943298:BRD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 32944746 G/A 1 24 17 41 11.7696647075388 8.66315416549332 3.10651054204553 A:G G A 10 0.509597303852548 0.352536861579851 ENSG00000204256:ENST00000464592:exon_32944339_32945347:BRD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 32946133 T/C 1 145 163 308 71.1083909413805 83.0643605279653 -11.9559695865848 A:T:C T C 10 0.509597303852548 0.189847956380448 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000463639:exon_32945903_32946578:BRD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 32948287 T/G 0 14 0 14 6.86563774606433 0 6.86563774606433 T T 10 0.509597303852548 0.000126179617754516 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 32948288 T/C 0 14 0 14 6.86563774606433 0 6.86563774606433 T T 10 0.509597303852548 0.000126179617754516 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 32948296 G/C 0 12 0 12 5.88483235376942 0 5.88483235376942 G G 10 0.509597303852548 0.000500187409481343 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 32974551 G/T 1 11 1 12 5.39442965762197 0.509597303852548 4.88483235376942 T:G G T 10 0.509597303852548 0.00645468026900321 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32971955_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32971959_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32973372_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000490305:exon_32974384_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32974523_32974618:HLA-DOA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 33048640 A/G 1 230 114 344 112.792620113914 58.0940926391905 54.6985274747235 A:G A G 10 0.509597303852548 3.10075821582374e-09 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000469120:exon_33048449_33049009:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000488575:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000471184:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33048220_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33048466_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 33169895 C/G 1 29 20 49 14.2216781882761 10.191946077051 4.02973211122515 C:G C G 10 0.509597303852548 0.257153024618282 ENSG00000112473:ENST00000444757:exon_33169849_33169902:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000374675:exon_33169849_33169902:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000374677:exon_33169849_33169902:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000496894:exon_33169849_33169899:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000467504:exon_33169849_33169902:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000445037:exon_33169849_33169902:SLC39A7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 33385887 A/G 1 9 8 17 4.41362426532707 4.07677843082038 0.336845834506684 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000112514:ENST00000374500:exon_33385864_33386094:CUTA;ENSG00000112514:ENST00000440279:exon_33385646_33386065:CUTA;ENSG00000112514:ENST00000374485:exon_33385864_33386065:CUTA;ENSG00000112514:ENST00000488034:exon_33385736_33385899:CUTA;ENSG00000112514:ENST00000374484:exon_33385864_33385919:CUTA;ENSG00000112514:ENST00000492510:exon_33385864_33385964:CUTA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 33630472 G/A 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 A:G G A 10 0.509597303852548 0.499988077920146 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 33636907 C/T 1 6 4 10 2.94241617688471 2.03838921541019 0.90402696147452 T:C C T 10 0.509597303852548 0.75435926131823 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33636751_33636933:ITPR3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 33740381 C/G 1 25 13 38 12.2600674036863 6.62476495008312 5.63530245360318 C:G C G 10 0.509597303852548 0.0749480494555229 ENSG00000161904:ENST00000506578:exon_33738979_33740552:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000293760:exon_33738979_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000511171:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000374196:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000450389:exon_33739474_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000421671:exon_33739209_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000508327:exon_33740102_33740555:LEMD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 33740382 G/A 1 12 24 36 5.88483235376942 12.2303352924612 -6.34550293869173 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0442366930770262 ENSG00000161904:ENST00000506578:exon_33738979_33740552:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000293760:exon_33738979_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000511171:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000374196:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000450389:exon_33739474_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000421671:exon_33739209_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000508327:exon_33740102_33740555:LEMD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 33740592 C/T 1 7 11 18 3.43281887303216 5.60557034237803 -2.17275146934586 T:C C T 10 0.509597303852548 0.351502463188979 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 34214322 C/G 1 20 18 38 9.80805392294904 9.17275146934586 0.635302453603177 C:G C G 10 0.509597303852548 0.87231182720855 ENSG00000186577:ENST00000476320:exon_34214157_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000335352:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000394990:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000481533:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000413013:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000463083:exon_34214226_34215269:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000468145:exon_34214262_34214645:C6orf1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 35803192 C/A 1 15 4 19 7.35604044221178 2.03838921541019 5.31765122680159 A:C C A 10 0.509597303852548 0.0196199845247410 ENSG00000096063:ENST00000373825:exon_35800743_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000361690:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000423325:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000346162:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000373822:exon_35800811_35803265:SRPK1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 36936697 T/C 1 58 83 141 28.4433563765522 42.2965762197615 -13.8532198432093 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0226591746667374 ENSG00000137409:ENST00000373616:exon_36935917_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373627:exon_36935917_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373565:exon_36935918_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373550:exon_36936513_36936727:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000337855:exon_36936513_36936725:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000471737:exon_36936536_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000418541:exon_36936688_36936750:MTCH1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 36979583 C/T 1 11 15 26 5.39442965762197 7.64395955778822 -2.24952990016625 T:C C T 10 0.509597303852548 0.435378718300164 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36979482_36979630:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000459781:exon_36979482_36979809:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36979482_36979630:FGD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 36995163 G/T 1 1 8 9 0.490402696147452 4.07677843082038 -3.58637573467293 T:G G T 10 0.509597303852548 0.0193004967410206 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 37348920 C/T 1 6 4 10 2.94241617688471 2.03838921541019 0.90402696147452 T:C C T 10 0.509597303852548 0.75435926131823 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 37349033 G/A 1 13 9 22 6.37523504991688 4.58637573467293 1.78885931524394 A:G G A 10 0.509597303852548 0.525168411892237 ENSG00000112130:ENST00000373479:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000394443:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000229866:exon_37348926_37349130:RNF8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 37349066 G/A 1 11 11 22 5.39442965762197 5.60557034237803 -0.211140684756055 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000112130:ENST00000373479:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000394443:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000229866:exon_37348926_37349130:RNF8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 38650628 T/G 1 20 17 37 9.80805392294904 8.66315416549332 1.14489975745573 T:G T G 10 0.509597303852548 0.74452953067463 ENSG00000124767:ENST00000470973:exon_38650584_38650991:GLO1;ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38650584_38650651:GLO1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 39864730 C/T 1 6 2 8 2.94241617688471 1.0191946077051 1.92322156917962 T:C C T 10 0.509597303852548 0.289787629707581 ENSG00000146122:ENST00000274867:exon_39864588_39864756:DAAM2;ENSG00000146122:ENST00000398904:exon_39864588_39864756:DAAM2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 41900406 C/T 1 35 37 72 17.1640943651608 18.8551002425443 -1.69100587738345 T:C C T 10 0.509597303852548 0.724553574276555 ENSG00000112578:ENST00000230340:exon_41900099_41900784:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000372996:exon_41900099_41900734:BYSL HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 41903782 A/C 1 19 12 31 9.31765122680159 6.11516764623058 3.20248358057101 A:C A C 10 0.509597303852548 0.283797204409808 ENSG00000112576:ENST00000372991:exon_41902671_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511642:exon_41902672_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372987:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000414200:exon_41902723_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000510503:exon_41903173_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511686:exon_41903634_41903845:CCND3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 43273604 A/G 1 17 6 23 8.33684583450668 3.05758382311529 5.2792620113914 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0354442183704842 ENSG00000146215:ENST00000372569:exon_43273210_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000451294:exon_43273251_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000477866:exon_43273455_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000274990:exon_43273563_43273862:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000449267:exon_43273563_43273862:CRIP3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 43323852 C/A 1 8 15 23 3.92322156917962 7.64395955778822 -3.7207379886086 A:C C A 10 0.509597303852548 0.145402204219230 ENSG00000171467:ENST00000318149:exon_43322402_43323883:ZNF318;ENSG00000171467:ENST00000361428:exon_43322402_43323883:ZNF318 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 43412865 T/C 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 T:C T C 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000124574:ENST00000372530:exon_43412863_43413052:ABCC10;ENSG00000124574:ENST00000244533:exon_43412863_43413052:ABCC10;ENSG00000124574:ENST00000463024:exon_43412863_43413052:ABCC10;ENSG00000124574:ENST00000372512:exon_43412838_43413052:ABCC10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 43490441 G/A 1 60 73 133 29.4241617688471 37.200603181236 -7.77644141238888 A:G G A 10 0.509597303852548 0.193421700563863 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43490069_43491743:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43490072_43491743:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455854:exon_43490075_43491743:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000436943:exon_43490422_43490478:XPO5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 43492578 G/A 1 39 34 73 19.1257051497506 17.3263083309866 1.799396818764 A:G G A 10 0.509597303852548 0.726031333695416 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455854:exon_43492569_43494363:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000488195:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000486936:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455285:exon_43492569_43492706:XPO5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 43496662 A/C 1 8 19 27 3.92322156917962 9.68234877319841 -5.7591272040188 A:C A C 10 0.509597303852548 0.0330692141736325 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000436943:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372250:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000398835:exon_43496566_43496663:XPO5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 43535018 C/T 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 T:C C T 10 0.509597303852548 0.541646560898822 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43534906_43535091:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43534906_43535091:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000436943:exon_43534906_43535091:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372252:exon_43534906_43535091:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43534906_43535091:XPO5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 43604167 A/G 1 8 3 11 3.92322156917962 1.52879191155764 2.39442965762197 A:G A G 10 0.509597303852548 0.227512016275758 ENSG00000124688:ENST00000451025:exon_43604118_43604383:MAD2L1BP;ENSG00000124688:ENST00000372173:exon_43604118_43604383:MAD2L1BP;ENSG00000124688:ENST00000372171:exon_43604118_43604383:MAD2L1BP;ENSG00000124688:ENST00000426254:exon_43604118_43604383:MAD2L1BP;ENSG00000124688:ENST00000508232:exon_43604118_43604610:MAD2L1BP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 44081510 C/T 1 108 59 167 52.9634911839248 30.0662409273003 22.8972502566245 T:C C T 10 0.509597303852548 0.000460928633743099 ENSG00000180992:ENST00000372014:exon_44081194_44081946:MRPL14 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 44115169 G/A 1 9 1 10 4.41362426532707 0.509597303852548 3.90402696147452 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0217112146317356 ENSG00000137216:ENST00000259746:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000323267:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000534326:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000456124:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000371915:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000371893:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000497371:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000525873:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000533121:exon_44115114_44115237:TMEM63B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 49403282 T/C 1 4 8 12 1.96161078458981 4.07677843082038 -2.11516764623058 T:C T C 10 0.509597303852548 0.258556419599671 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49403169_49403336:MUT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 49412433 C/T 1 8 7 15 3.92322156917962 3.56718112696784 0.35604044221178 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49412352_49412467:MUT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 53159090 G/T 1 14 15 29 6.86563774606433 7.64395955778822 -0.778321811723892 T:G G T 10 0.509597303852548 0.8535202569064 ENSG00000012660:ENST00000370913:exon_53158886_53159289:ELOVL5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 56470299 G/C 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 C:G G C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56468635_56474142:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56468635_56474142:DST;ENSG00000151914:ENST00000446842:exon_56468569_56474142:DST;ENSG00000151914:ENST00000439203:exon_56468635_56474142:DST HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 56505175 T/A 1 6 11 17 2.94241617688471 5.60557034237803 -2.66315416549332 A:T T A 10 0.509597303852548 0.23022658599833 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56504941_56505403:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56504941_56505403:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56504941_56505403:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56504941_56505403:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56504941_56505403:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56504941_56505403:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56504941_56505403:DST;ENSG00000151914:ENST00000446842:exon_56504941_56505403:DST;ENSG00000151914:ENST00000439203:exon_56504941_56505403:DST;ENSG00000151914:ENST00000520645:exon_56504941_56505403:DST;ENSG00000151914:ENST00000370765:exon_56504941_56505403:DST;ENSG00000151914:ENST00000281662:exon_56504941_56505403:DST;ENSG00000151914:ENST00000518935:exon_56504941_56505403:DST;ENSG00000151914:ENST00000523967:exon_56504941_56505403:DST;ENSG00000151914:ENST00000521104:exon_56504941_56505403:DST HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 74135016 C/T 1 20 21 41 9.80805392294904 10.7015433809035 -0.893489457954466 T:C C T 10 0.509597303852548 0.87618110221447 ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74133432_74135301:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74134940_74135250:C6orf150 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 74161762 G/T 1 7 4 11 3.43281887303216 2.03838921541019 1.39442965762197 T:G G T 10 0.509597303852548 0.549658645750086 ENSG00000164430:ENST00000370318:exon_74161248_74161982:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74161248_74161999:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74161248_74161999:C6orf150 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 74228049 A/G 1 43 47 90 21.0873159343404 23.9510732810698 -2.86375734672932 A:G A G 10 0.509597303852548 0.598475095810835 ENSG00000156508:ENST00000490569:exon_74227753_74228333:EEF1A1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 74229258 G/T 1 10 6 16 4.90402696147452 3.05758382311529 1.84644313835923 T:G G T 10 0.509597303852548 0.45584747299355 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 74229792 A/G 1 23 10 33 11.2792620113914 5.09597303852548 6.18328897286592 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0361794478937317 ENSG00000156508:ENST00000316292:exon_74229606_74230741:EEF1A1;ENSG00000156508:ENST00000456206:exon_74229606_74230741:EEF1A1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 79657391 G/A 1 6 7 13 2.94241617688471 3.56718112696784 -0.624764950083124 A:G G A 10 0.509597303852548 0.786978111840725 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79657340_79657492:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79657340_79657492:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79657340_79657492:PHIP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 79675701 A/G 1 6 9 15 2.94241617688471 4.58637573467293 -1.64395955778822 A:G A G 10 0.509597303852548 0.446901967950042 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79675662_79675773:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79675662_79675773:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79675662_79675773:PHIP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 79679577 A/G 1 14 5 19 6.86563774606433 2.54798651926274 4.31765122680159 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0644836423988429 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79679552_79679634:PHIP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 80749972 A/C 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 A:C A C 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000112742:ENST00000509894:exon_80749913_80749997:TTK;ENSG00000112742:ENST00000230510:exon_80749913_80749997:TTK;ENSG00000112742:ENST00000369798:exon_80749913_80749997:TTK;ENSG00000112742:ENST00000504590:exon_80749913_80749988:TTK HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 87965528 T/C 1 6 2 8 2.94241617688471 1.0191946077051 1.92322156917962 T:C T C 10 0.509597303852548 0.289787629707581 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 87967636 A/G 1 12 17 29 5.88483235376942 8.66315416549332 -2.77832181172389 A:G A G 10 0.509597303852548 0.354840351239223 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 87970650 G/A 1 68 63 131 33.3473833380267 32.1046301427105 1.24275319531622 A:G G A 10 0.509597303852548 0.861491893736302 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 88046800 G/A 1 3 7 10 1.47120808844236 3.56718112696784 -2.09597303852548 A:G G A 10 0.509597303852548 0.218348598150516 ENSG00000111850:ENST00000392863:exon_88046727_88046884:C6orf162;ENSG00000111850:ENST00000229570:exon_88046727_88046884:C6orf162 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 88239266 T/C 1 11 15 26 5.39442965762197 7.64395955778822 -2.24952990016625 T:C T C 10 0.509597303852548 0.435378718300164 ENSG00000146282:ENST00000369536:exon_88239260_88239366:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000392851:exon_88239260_88239366:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000369523:exon_88239260_88239366:RARS2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 88240570 C/T 1 8 6 14 3.92322156917962 3.05758382311529 0.865637746064328 T:C C T 10 0.509597303852548 0.79106698341654 ENSG00000146282:ENST00000369536:exon_88240502_88240660:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000392851:exon_88240502_88240660:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000369523:exon_88240502_88240660:RARS2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 89793894 G/C 1 38 38 76 18.6353024536032 19.3646975463968 -0.729395092793645 C:G G C 10 0.509597303852548 0.90892136177576 ENSG00000146278:ENST00000369472:exon_89793472_89794064:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000336032:exon_89793472_89794879:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000354922:exon_89793472_89793916:PNRC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 90039670 G/C 1 195 168 363 95.6285257487531 85.6123470472281 10.0161787015251 C:G G C 10 0.509597303852548 0.294381336859495 ENSG00000241519:ENST00000361333:exon_90039279_90039676:UBE2J1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 90347511 T/C 1 24 35 59 11.7696647075388 17.8359056348392 -6.06624092730033 T:C T C 10 0.509597303852548 0.119748060442106 ENSG00000083099:ENST00000520897:exon_90347461_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000412237:exon_90347461_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000523793:exon_90347461_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000520441:exon_90347444_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000523377:exon_90347461_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000517396:exon_90347444_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000524153:exon_90347461_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000520318:exon_90347444_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000521961:exon_90347444_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000523075:exon_90347461_90347601:LYRM2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 90390443 C/A 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 A:C C A 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90390308_90390470:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90390308_90390470:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90390308_90390470:MDN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 96999725 C/T 1 5 5 10 2.45201348073726 2.54798651926274 -0.0959730385254796 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000014123:ENST00000369278:exon_96999714_96999799:KIAA0776 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 97339078 A/G 1 67 31 98 32.8569806418793 15.797516419429 17.0594642224503 A:G A G 10 0.509597303852548 0.000548896359266525 ENSG00000123545:ENST00000316149:exon_97337189_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000478382:exon_97338888_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000489477:exon_97339027_97339267:NDUFAF4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 97345567 G/A 1 18 8 26 8.82724853065414 4.07677843082038 4.75047009983375 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0769085128674909 ENSG00000123545:ENST00000316149:exon_97345542_97345757:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000489477:exon_97345542_97345750:NDUFAF4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 99825348 T/C 1 7 4 11 3.43281887303216 2.03838921541019 1.39442965762197 T:C T C 10 0.509597303852548 0.549658645750086 ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000479163:exon_99825262_99825361:COQ3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 101296389 G/A 1 9 7 16 4.41362426532707 3.56718112696784 0.846443138359232 A:G G A 10 0.509597303852548 0.80419746365061 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_101296024_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000324696:exon_101296024_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000522650:exon_101296024_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000468245:exon_101295880_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000324723:exon_101296296_101296583:ASCC3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 107006347 T/C 1 10 1 11 4.90402696147452 0.509597303852548 4.39442965762197 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0118772360206333 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 109762332 C/T 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000185250:ENST00000440797:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000185250:ENST00000521072:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000185250:ENST00000368958:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109761966_109762374:SMPD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 109764051 G/A 1 9 20 29 4.41362426532707 10.191946077051 -5.77832181172389 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0398860759032628 ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109763955_109764087:SMPD2;ENSG00000135587:ENST00000458487:exon_109763774_109764087:SMPD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 109767931 C/T 1 36 13 49 17.6544970613083 6.62476495008312 11.0297321112251 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00154023414270399 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 109775366 C/T 1 5 5 10 2.45201348073726 2.54798651926274 -0.0959730385254796 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109775142_109775442:MICAL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 116574455 G/A 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 A:G G A 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000187189:ENST00000420283:exon_116571151_116575261:TSPYL4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 116600774 C/G 1 2 10 12 0.980805392294904 5.09597303852548 -4.11516764623058 C:G C G 10 0.509597303852548 0.0202434865629143 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 116600810 G/A 1 3 10 13 1.47120808844236 5.09597303852548 -3.62476495008312 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0532191285007243 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 118320595 C/A 0 880 0 880 431.554372609758 0 431.554372609758 C C 10 0.509597303852548 2.31590312861344e-258 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 122766138 G/A 1 8 9 17 3.92322156917962 4.58637573467293 -0.663154165493316 A:G G A 10 0.509597303852548 0.811525826845625 ENSG00000111897:ENST00000339697:exon_122764496_122766324:SERINC1;ENSG00000111897:ENST00000368454:exon_122764499_122766324:SERINC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 133135886 A/G 1 835 478 1313 409.486251283122 243.587511241518 165.898740041604 A:G A G 10 0.509597303852548 3.20719717202635e-20 ENSG00000112306:ENST00000230050:exon_133135871_133135921:RPS12;ENSG00000112306:ENST00000484616:exon_133135871_133135921:RPS12 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 133138010 T/C 1 26 20 46 12.7504700998338 10.191946077051 2.55852402278279 T:C T C 10 0.509597303852548 0.465195778344218 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 135287533 A/G 1 18 21 39 8.82724853065414 10.7015433809035 -1.87429485024937 A:G A G 10 0.509597303852548 0.631713408514061 ENSG00000112339:ENST00000367837:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000445176:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000367824:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000527005:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000527578:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000415177:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000367826:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000533274:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000526100:exon_135287467_135287611:HBS1L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 147 0 147 72.0891963336754 0 72.0891963336754 T T 10 0.509597303852548 1.4160298295773e-43 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 170 0 170 83.3684583450668 0 83.3684583450668 A A 10 0.509597303852548 2.13292737644449e-50 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 151 0 151 74.0508071182653 0 74.0508071182653 A A 10 0.509597303852548 9.1484521614693e-45 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 28 0 28 13.7312754921287 0 13.7312754921287 G G 10 0.509597303852548 8.50905399421039e-09 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 27 0 27 13.2408727959812 0 13.2408727959812 T T 10 0.509597303852548 1.68638989741855e-08 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 137113137 G/A 1 8 8 16 3.92322156917962 4.07677843082038 -0.153556861640768 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_137112848_137113656:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_137112848_137113656:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_137112848_137113656:MAP3K5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 137519127 C/T 1 58 31 89 28.4433563765522 15.797516419429 12.6458399571232 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00784384087205335 ENSG00000027697:ENST00000367739:exon_137518621_137519776:IFNGR1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 143749633 C/G 1 12 4 16 5.88483235376942 2.03838921541019 3.84644313835923 C:G C G 10 0.509597303852548 0.0776723690771564 ENSG00000189007:ENST00000367594:exon_143747078_143749643:ADAT2;ENSG00000189007:ENST00000237283:exon_143748126_143749643:ADAT2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 143825104 G/T 1 10 10 20 4.90402696147452 5.09597303852548 -0.191946077050959 T:G G T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000001036:ENST00000002165:exon_143825050_143825389:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000438118:exon_143825050_143825389:FUCA2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 150004779 A/G 1 7 8 15 3.43281887303216 4.07677843082038 -0.64395955778822 A:G A G 10 0.509597303852548 0.800365558868668 ENSG00000131023:ENST00000253339:exon_150004215_150005728:LATS1;ENSG00000131023:ENST00000441107:exon_150004215_150005728:LATS1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 150114745 G/A 1 32 27 59 15.6928862767185 13.7591272040188 1.93375907269967 A:G G A 10 0.509597303852548 0.696474509801775 ENSG00000120265:ENST00000367384:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000484601:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000367378:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000464889:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000367380:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000486585:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000495487:exon_150114685_150114768:PCMT1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 151726300 G/C 1 24 39 63 11.7696647075388 19.8742948502494 -8.10463014271052 C:G G C 10 0.509597303852548 0.0439924292249546 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000336451:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151725990_151726402:RMND1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 153296386 T/C 1 11 22 33 5.39442965762197 11.2111406847561 -5.81671102713408 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0543105580393728 ENSG00000112029:ENST00000229758:exon_153296042_153296756:FBXO5;ENSG00000112029:ENST00000367241:exon_153296042_153296756:FBXO5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 155635585 A/C 1 3 10 13 1.47120808844236 5.09597303852548 -3.62476495008312 A:C A C 10 0.509597303852548 0.0532191285007243 ENSG00000029639:ENST00000367166:exon_155635430_155635618:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000470239:exon_155635430_155635618:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000475849:exon_155635430_155635627:TFB1M HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 158330765 G/A 1 6 4 10 2.94241617688471 2.03838921541019 0.90402696147452 A:G G A 10 0.509597303852548 0.75435926131823 ENSG00000130340:ENST00000392185:exon_158330697_158330822:SNX9;ENSG00000130340:ENST00000252631:exon_158330697_158330822:SNX9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 158927651 A/G 1 7 5 12 3.43281887303216 2.54798651926274 0.884832353769424 A:G A G 10 0.509597303852548 0.774912283175237 ENSG00000130338:ENST00000367097:exon_158927610_158932860:TULP4;ENSG00000130338:ENST00000367094:exon_158927610_158929408:TULP4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 159065758 C/G 1 6 9 15 2.94241617688471 4.58637573467293 -1.64395955778822 C:G C G 10 0.509597303852548 0.446901967950042 ENSG00000146425:ENST00000367089:exon_159065714_159065771:DYNLT1;ENSG00000146425:ENST00000367085:exon_159065714_159065770:DYNLT1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 159184462 A/G 1 13 10 23 6.37523504991688 5.09597303852548 1.2792620113914 A:G A G 10 0.509597303852548 0.678943531012238 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159184336_159184541:SYTL3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 159185563 T/A 1 26 21 47 12.7504700998338 10.7015433809035 2.04892671893024 A:T T A 10 0.509597303852548 0.563469395970219 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159185527_159185754:SYTL3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 159188128 A/G 1 8 10 18 3.92322156917962 5.09597303852548 -1.17275146934586 A:G A G 10 0.509597303852548 0.642260839788311 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 160103644 C/T 1 16 21 37 7.84644313835923 10.7015433809035 -2.85510024254427 T:C C T 10 0.509597303852548 0.411846256659366 ENSG00000112096:ENST00000367055:exon_160103506_160103670:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000444946:exon_160103506_160103670:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000367054:exon_160103506_160103670:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000337404:exon_160103172_160103670:SOD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 160113872 A/G 1 7 3 10 3.43281887303216 1.52879191155764 1.90402696147452 A:G A G 10 0.509597303852548 0.344656245175514 ENSG00000112096:ENST00000367055:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000444946:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000367054:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000337404:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000452684:exon_160112027_160113895:SOD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 160174456 T/G 1 10 4 14 4.90402696147452 2.03838921541019 2.86563774606433 T:G T G 10 0.509597303852548 0.180690507474734 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 160196343 A/G 1 20 52 72 9.80805392294904 26.4990598003325 -16.6910058773835 A:G A G 10 0.509597303852548 8.00785438642032e-05 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160196202_160196345:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160196318_160197304:ACAT2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 160198359 C/T 1 35 30 65 17.1640943651608 15.2879191155764 1.87617524958438 T:C C T 10 0.509597303852548 0.71022708212433 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 160198395 G/A 1 31 39 70 15.202483580571 19.8742948502494 -4.67181126967836 A:G G A 10 0.509597303852548 0.283313665161989 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 160505207 A/G 1 7 1 8 3.43281887303216 0.509597303852548 2.92322156917962 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0707155477569663 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160504982_160505216:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160504982_160505216:IGF2R HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 160517481 C/T 1 13 13 26 6.37523504991688 6.62476495008312 -0.249529900166248 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000475584:exon_160517479_160517657:IGF2R HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 166736362 C/T 1 47 86 133 23.0489267189302 43.8253681313191 -20.7764414123889 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00034486389543258 ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166736345_166736374:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166736345_166738083:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000479490:exon_166736345_166738176:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166736345_166736374:SFT2D1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 167344583 A/G 1 403 634 1037 197.632286547423 323.084690642515 -125.452404095092 A:C:G A G 10 0.509597303852548 6.1046137638606e-15 ENSG00000026297:ENST00000366855:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000508775:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000421787:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000510083:exon_167344532_167346537:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000428859:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000476238:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000028008:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000478180:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000467705:exon_167344532_167344606:RNASET2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 170058439 C/T 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 T:C C T 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000184465:ENST00000423258:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000401031:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000333572:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000443144:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000420344:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000448612:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000441385:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000467418:exon_170058372_170058454:WDR27 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 170068086 C/T 1 2 6 8 0.980805392294904 3.05758382311529 -2.07677843082038 T:C C T 10 0.509597303852548 0.171857042968518 ENSG00000184465:ENST00000401031:exon_170068078_170068191:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000333572:exon_170068078_170068281:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000448612:exon_170068078_170068281:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000496752:exon_170068078_170068191:WDR27 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 170162537 C/T 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 T:C C T 10 0.509597303852548 0.499988077920146 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170162525_170162627:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366772:exon_170162525_170162627:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170162525_170162627:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392094:exon_170162525_170162627:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000418781:exon_170162525_170162627:C6orf70 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 170176146 G/A 1 12 23 35 5.88483235376942 11.7207379886086 -5.83590563483918 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0617860885782364 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366772:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392094:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000418781:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000492738:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170175974_170176161:C6orf70 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 170862300 G/C 1 35 43 78 17.1640943651608 21.9126840656596 -4.74858970049874 C:G G C 10 0.509597303852548 0.308821329654474 ENSG00000008018:ENST00000262193:exon_170862218_170862429:PSMB1;ENSG00000008018:ENST00000392093:exon_170862218_170862417:PSMB1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 6 170892100 T/C 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000071994:ENST00000443345:exon_170890836_170892276:PDCD2;ENSG00000071994:ENST00000453163:exon_170890836_170892276:PDCD2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 925717 G/A 1 12 15 27 5.88483235376942 7.64395955778822 -1.7591272040188 A:G G A 10 0.509597303852548 0.56601930423381 ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_925693_925771:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_925693_925771:GET4;ENSG00000239857:ENST00000412734:exon_925693_925771:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_923180_925771:GET4;ENSG00000239857:ENST00000441491:exon_925693_925771:GET4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 1938001 G/A 1 17 20 37 8.33684583450668 10.191946077051 -1.85510024254427 A:G G A 10 0.509597303852548 0.622775146253723 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_1937836_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_1937836_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_1937836_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_1937848_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_1937836_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_1937836_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000450235:exon_1937836_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000437877:exon_1937836_1938026:MAD1L1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 2577781 T/C 1 61 70 131 29.9145644649946 35.6718112696784 -5.75724680468378 T:C T C 10 0.509597303852548 0.336862155670959 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 2578181 C/T 1 32 28 60 15.6928862767185 14.2687245078713 1.42416176884712 T:C C T 10 0.509597303852548 0.796529037102532 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 2578237 T/C 1 19 30 49 9.31765122680159 15.2879191155764 -5.97026788877485 T:C T C 10 0.509597303852548 0.115115283838738 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 2578371 G/A 1 13 11 24 6.37523504991688 5.60557034237803 0.769664707538849 A:G G A 10 0.509597303852548 0.839530909399512 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 2946461 T/C 1 34 29 63 16.6736916690134 14.7783218117239 1.89536985728948 T:C T C 10 0.509597303852548 0.705846014796739 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2945775_2946476:CARD11 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 2969680 G/A 1 5 5 10 2.45201348073726 2.54798651926274 -0.0959730385254796 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2969626_2969708:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000355508:exon_2969626_2969694:CARD11 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 5353344 G/A 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 A:G G A 10 0.509597303852548 0.5085374516326 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5352134_5353490:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5352134_5353494:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000328270:exon_5352742_5353494:TNRC18 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 5399044 C/G 1 15 11 26 7.35604044221178 5.60557034237803 1.75047009983375 A:C:G C G 10 0.509597303852548 0.559102122990831 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000440081:exon_5399029_5399200:TNRC18 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 5427517 G/A 1 2 6 8 0.980805392294904 3.05758382311529 -2.07677843082038 A:G G A 10 0.509597303852548 0.171857042968518 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000413081:exon_5427303_5427660:TNRC18 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 5541657 G/A 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 A:G G A 10 0.509597303852548 0.499988077920146 ENSG00000155034:ENST00000415009:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000382368:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000312577:exon_5540119_5541662:FBXL18 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 5568366 A/G 1 63 53 116 30.8953698572895 27.008657104185 3.88671275310443 A:G A G 10 0.509597303852548 0.515941817857652 ENSG00000075624:ENST00000462494:exon_5567912_5569031:ACTB HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 5569327 G/A 1 28 30 58 13.7312754921287 15.2879191155764 -1.55664362344778 A:G G A 10 0.509597303852548 0.695814529291075 ENSG00000075624:ENST00000484841:exon_5569166_5569364:ACTB HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 5643145 T/C 1 40 39 79 19.6161078458981 19.8742948502494 -0.258187004351289 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000075618:ENST00000382361:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000340250:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000444748:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000447103:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000405801:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000473330:exon_5643127_5643248:FSCN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 6026942 G/T 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 T:G G T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 6048973 C/A 1 8 20 28 3.92322156917962 10.191946077051 -6.26872450787134 A:C C A 10 0.509597303852548 0.0221347498805815 ENSG00000106305:ENST00000223029:exon_6048876_6049129:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000400479:exon_6048886_6049009:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000415999:exon_6048921_6049129:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000395236:exon_6048947_6049129:AIMP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 6066450 T/C 1 23 21 44 11.2792620113914 10.7015433809035 0.57771863048789 T:C T C 10 0.509597303852548 0.881361534784246 ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6066359_6066592:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000490523:exon_6066359_6066592:EIF2AK1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 6066461 T/C 1 18 12 30 8.82724853065414 6.11516764623058 2.71208088442356 T:C T C 10 0.509597303852548 0.364260749962821 ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6066359_6066592:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000490523:exon_6066359_6066592:EIF2AK1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 6189780 T/C 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 T:C T C 10 0.509597303852548 0.335037018547339 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6189214_6189933:USP42 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 6193464 T/G 1 2 7 9 0.980805392294904 3.56718112696784 -2.58637573467293 T:G T G 10 0.509597303852548 0.103145007117103 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193387_6193513:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 6370144 G/A 1 9 5 14 4.41362426532707 2.54798651926274 1.86563774606433 A:G G A 10 0.509597303852548 0.425164682757114 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 6647738 T/C 1 9 5 14 4.41362426532707 2.54798651926274 1.86563774606433 T:C T C 10 0.509597303852548 0.425164682757114 ENSG00000146576:ENST00000344417:exon_6647591_6648357:C7orf26;ENSG00000146576:ENST00000359073:exon_6647591_6648355:C7orf26 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 6777218 T/C 1 6 5 11 2.94241617688471 2.54798651926274 0.394429657621972 T:C T C 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 8008970 C/G 1 12 8 20 5.88483235376942 4.07677843082038 1.80805392294904 C:G C G 10 0.509597303852548 0.505035835457766 ENSG00000106415:ENST00000456919:exon_8008423_8009438:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000223145:exon_8008425_8009438:GLCCI1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 20180717 C/G 1 4 8 12 1.96161078458981 4.07677843082038 -2.11516764623058 C:G C G 10 0.509597303852548 0.258556419599671 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20176020_20180781:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20180248_20180781:MACC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 20198440 G/A 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 A:G G A 10 0.509597303852548 0.5085374516326 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20197827_20199868:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20197827_20199868:MACC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 21940823 A/G 1 42 20 62 20.596913238193 10.191946077051 10.404967161142 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0104914433185163 ENSG00000105877:ENST00000409508:exon_21940625_21941186:DNAH11;ENSG00000105877:ENST00000328843:exon_21940625_21941457:DNAH11;ENSG00000105877:ENST00000424253:exon_21940625_21941457:DNAH11;ENSG00000164649:ENST00000356195:exon_21940518_21941970:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000488845:exon_21940519_21941970:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000406877:exon_21940519_21941970:CDCA7L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 24742436 T/C 1 7 19 26 3.43281887303216 9.68234877319841 -6.24952990016625 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0174328786803016 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000479636:exon_24742379_24745656:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000430096:exon_24742046_24742452:DFNA5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 24846502 G/A 1 14 13 27 6.86563774606433 6.62476495008312 0.240872795981204 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000070882:ENST00000313367:exon_24846395_24846521:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000353930:exon_24846395_24846521:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000352860:exon_24846395_24846521:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409863:exon_24846395_24846521:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000396431:exon_24846395_24846521:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409452:exon_24846395_24846521:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409759:exon_24846395_24846521:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409555:exon_24846395_24846521:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000396429:exon_24846395_24846521:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409069:exon_24846395_24846521:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000486214:exon_24846395_24846521:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000459987:exon_24846439_24846521:OSBPL3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 30544360 G/A 1 14 19 33 6.86563774606433 9.68234877319841 -2.81671102713408 A:G G A 10 0.509597303852548 0.385224101277236 ENSG00000006625:ENST00000275428:exon_30544185_30544460:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000440082:exon_30544185_30544445:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000005374:exon_30544185_30544418:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409144:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000447901:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409390:exon_30544185_30544415:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409436:exon_30544185_30544432:GGCT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 30673345 C/T 1 9 14 23 4.41362426532707 7.13436225393567 -2.7207379886086 T:C C T 10 0.509597303852548 0.300102693070699 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 32529936 G/C 1 26 29 55 12.7504700998338 14.7783218117239 -2.02785171189014 C:G G C 10 0.509597303852548 0.592850879369721 ENSG00000106355:ENST00000450169:exon_32529932_32530030:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000223084:exon_32529637_32530475:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000410044:exon_32529743_32529973:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409987:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409782:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000480956:exon_32529932_32529983:LSM5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 32613020 A/G 1 10 9 19 4.90402696147452 4.58637573467293 0.317651226801589 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32612811_32613030:AVL9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 32623477 C/G 1 7 9 16 3.43281887303216 4.58637573467293 -1.15355686164077 C:G C G 10 0.509597303852548 0.623338489505478 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32623404_32628333:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32623404_32625778:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32623404_32623519:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32623404_32628323:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000470500:exon_32623404_32623779:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000467779:exon_32623404_32623818:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000497020:exon_32623404_32623714:AVL9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 37298800 C/T 1 9 13 22 4.41362426532707 6.62476495008312 -2.21114068475606 T:C C T 10 0.509597303852548 0.397626927679795 ENSG00000155849:ENST00000361912:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000310758:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442573:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442504:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000474832:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000448602:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455119:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455879:exon_37298786_37298955:ELMO1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 43916491 G/A 1 17 23 40 8.33684583450668 11.7207379886086 -3.38389215410192 A:G G A 10 0.509597303852548 0.343111839960725 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 43916727 T/G 1 11 11 22 5.39442965762197 5.60557034237803 -0.211140684756055 T:G T G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 43917013 G/A 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 A:G G A 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 44099664 T/C 1 45 32 77 22.0681213266353 16.3071137232815 5.76100760335381 T:C T C 10 0.509597303852548 0.210342242204428 ENSG00000136279:ENST00000441840:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000448521:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000456905:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000440166:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000490734:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000498733:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452943:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000429716:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000468694:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000494774:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000411855:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000497184:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000432854:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000449997:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452661:exon_44099647_44099752:DBNL HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 44104788 A/C 1 15 7 22 7.35604044221178 3.56718112696784 3.78885931524394 A:C A C 10 0.509597303852548 0.135372910326039 ENSG00000136279:ENST00000432854:exon_44100376_44109055:DBNL;ENSG00000164708:ENST00000297283:exon_44104715_44105186:PGAM2;ENSG00000164708:ENST00000425387:exon_44104715_44104789:PGAM2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 44112873 G/T 1 10 19 29 4.90402696147452 9.68234877319841 -4.77832181172389 T:G G T 10 0.509597303852548 0.0940253795712215 ENSG00000122678:ENST00000335195:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000242248:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000435068:exon_44111849_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000395831:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000458246:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000430942:exon_44111861_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000467607:exon_44112817_44112976:POLM HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 44747499 G/A 1 18 25 43 8.82724853065414 12.7399325963137 -3.91268406565956 A:G G A 10 0.509597303852548 0.285704123071608 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 44747514 C/T 1 20 13 33 9.80805392294904 6.62476495008312 3.18328897286592 T:C:G C T 10 0.509597303852548 0.299151178485349 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 44747578 G/A 1 17 8 25 8.33684583450668 4.07677843082038 4.2600674036863 A:G G A 10 0.509597303852548 0.109366962829306 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 44747589 C/T 1 20 9 29 9.80805392294904 4.58637573467293 5.22167818827611 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0628036817076372 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 44800176 G/T 1 11 27 38 5.39442965762197 13.7591272040188 -8.36469754639682 T:G G T 10 0.509597303852548 0.0085983933104339 ENSG00000122515:ENST00000413916:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000439149:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000309315:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000441627:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000433667:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000265346:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000414051:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000478045:exon_44799333_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000463056:exon_44799550_44800192:ZMIZ2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 44836314 A/G 1 13 17 30 6.37523504991688 8.66315416549332 -2.28791911557644 A:G A G 10 0.509597303852548 0.466982464669341 ENSG00000196262:ENST00000468812:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000481437:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000451562:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000355968:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000489459:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000479021:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000415933:exon_44836281_44836392:PPIA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 45005795 G/A 1 60 58 118 29.4241617688471 29.5566436234478 -0.132481854600663 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45005672_45006437:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45005672_45005879:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45005672_45006437:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45005672_45005879:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45005672_45005879:MYO1G HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 45139892 G/A 1 42 63 105 20.596913238193 32.1046301427105 -11.5077169045175 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0249911094843796 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45139741_45140025:TBRG4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 64166802 G/T 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 T:G G T 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000196247:ENST00000360117:exon_64166702_64166957:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000344930:exon_64166702_64171404:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000423627:exon_64166702_64171399:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000395391:exon_64166702_64171401:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000395385:exon_64166701_64167219:ZNF107 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 64291987 G/A 1 6 6 12 2.94241617688471 3.05758382311529 -0.115167646230576 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000197008:ENST00000307355:exon_64291829_64292580:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000494380:exon_64291829_64292181:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440155:exon_64291829_64292620:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440598:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000437743:exon_64291829_64294042:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000359735:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000430838:exon_64291829_64294054:ZNF138 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 64864607 G/A 1 8 11 19 3.92322156917962 5.60557034237803 -1.68234877319841 A:G G A 10 0.509597303852548 0.496599009223979 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 64864800 A/G 1 9 18 27 4.41362426532707 9.17275146934586 -4.7591272040188 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0826307828551837 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 65842545 T/C 1 3 7 10 1.47120808844236 3.56718112696784 -2.09597303852548 T:C T C 10 0.509597303852548 0.218348598150516 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 66774604 G/C 1 5 5 10 2.45201348073726 2.54798651926274 -0.0959730385254796 C:G G C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000472361:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000495164:exon_66774551_66774705:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66774551_66774702:STAG3L4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 73097238 G/A 1 21 5 26 10.2984566190965 2.54798651926274 7.75047009983375 A:G G A 10 0.509597303852548 0.00260820741200967 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 73097654 C/T 1 11 3 14 5.39442965762197 1.52879191155764 3.86563774606433 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0580035546592849 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30;ENSG00000071462:ENST00000464615:exon_73097355_73097713:WBSCR22 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 73151220 G/C 1 5 9 14 2.45201348073726 4.58637573467293 -2.13436225393567 C:G G C 10 0.509597303852548 0.293559675506127 ENSG00000106077:ENST00000462381:exon_73151187_73151440:ABHD11 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 73731906 C/T 1 12 12 24 5.88483235376942 6.11516764623058 -0.230335292461152 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73731810_73731997:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73731810_73731997:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73731877_73731997:CLIP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 73753250 T/C 1 5 5 10 2.45201348073726 2.54798651926274 -0.0959730385254796 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73752778_73753334:CLIP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 76111835 G/A 1 5 6 11 2.45201348073726 3.05758382311529 -0.605570342378028 A:G G A 10 0.509597303852548 0.770507260060939 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000423646:exon_76111825_76111976:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000429179:exon_76111825_76111880:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000472426:exon_76111825_76111932:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 77423574 G/A 1 11 21 32 5.39442965762197 10.7015433809035 -5.30711372328153 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0760908430506436 ENSG00000135211:ENST00000257663:exon_77423045_77423740:TMEM60 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 89982132 T/C 1 7 7 14 3.43281887303216 3.56718112696784 -0.134362253935672 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000105793:ENST00000426366:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000421719:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000450619:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000453512:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000493392:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000257659:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000417207:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000477972:exon_89982130_89982546:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000439832:exon_89982130_89982323:GTPBP10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 91503228 C/T 1 11 15 26 5.39442965762197 7.64395955778822 -2.24952990016625 T:C C T 10 0.509597303852548 0.435378718300164 ENSG00000127989:ENST00000419292:exon_91500243_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000351870:exon_91502205_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000406735:exon_91502636_91504078:MTERF HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 91842554 T/C 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 T:C T C 10 0.509597303852548 0.5085374516326 ENSG00000001631:ENST00000312763:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394507:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000340022:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000486261:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000475770:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394505:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000412043:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394503:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000415227:exon_91842509_91842715:KRIT1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 92028039 C/A 1 13 13 26 6.37523504991688 6.62476495008312 -0.249529900166248 A:C C A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 92733975 G/A 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 A:G G A 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000205413:ENST00000379958:exon_92728829_92735418:SAMD9;ENSG00000205413:ENST00000446617:exon_92731562_92735418:SAMD9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 92734051 C/T 1 8 2 10 3.92322156917962 1.0191946077051 2.90402696147452 T:C C T 10 0.509597303852548 0.110022635989167 ENSG00000205413:ENST00000379958:exon_92728829_92735418:SAMD9;ENSG00000205413:ENST00000446617:exon_92731562_92735418:SAMD9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 92760502 G/A 1 31 26 57 15.202483580571 13.2495299001662 1.95295368040476 A:G G A 10 0.509597303852548 0.691451397422002 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 92764489 C/T 1 8 3 11 3.92322156917962 1.52879191155764 2.39442965762197 T:C C T 10 0.509597303852548 0.227512016275758 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 97933601 C/T 1 12 13 25 5.88483235376942 6.62476495008312 -0.7399325963137 T:C C T 10 0.509597303852548 0.84274112322754 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97933508_97933688:BAIAP2L1;ENSG00000006453:ENST00000480580:exon_97933508_97933677:BAIAP2L1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 98556962 C/T 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:C C T 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 99500899 T/C 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 T:C T C 10 0.509597303852548 0.335037018547339 ENSG00000146833:ENST00000447480:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000349062:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000355947:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000354241:exon_99500841_99500938:TRIM4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 99500911 A/G 1 3 7 10 1.47120808844236 3.56718112696784 -2.09597303852548 A:G A G 10 0.509597303852548 0.218348598150516 ENSG00000146833:ENST00000447480:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000349062:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000355947:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000354241:exon_99500841_99500938:TRIM4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 99654689 G/A 1 5 5 10 2.45201348073726 2.54798651926274 -0.0959730385254796 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000166529:ENST00000292450:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000456748:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000438937:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000477297:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000379635:exon_99654630_99654872:ZSCAN21 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 99693078 G/A 1 75 68 143 36.7802022110589 34.6526166619733 2.12758554908564 A:G G A 10 0.509597303852548 0.738601646424959 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000491245:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000493352:exon_99693010_99693287:MCM7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 99696797 T/C 1 43 33 76 21.0873159343404 16.8167110271341 4.27060490720635 A:T:C T C 10 0.509597303852548 0.359502710332191 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99696646_99697026:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000343023:exon_99696646_99696826:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99696646_99697026:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99696646_99696826:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99696646_99696826:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000477372:exon_99696646_99696968:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000463722:exon_99696646_99697376:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000425308:exon_99696646_99696826:MCM7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 99997454 C/T 1 13 10 23 6.37523504991688 5.09597303852548 1.2792620113914 T:C C T 10 0.509597303852548 0.678943531012238 ENSG00000085514:ENST00000198536:exon_99997408_99997719:PILRA;ENSG00000085514:ENST00000453419:exon_99997446_99997719:PILRA;ENSG00000085514:ENST00000394000:exon_99997408_99997651:PILRA;ENSG00000085514:ENST00000350573:exon_99997408_99997719:PILRA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 100028757 G/T 1 3 13 16 1.47120808844236 6.62476495008312 -5.15355686164077 T:G G T 10 0.509597303852548 0.0113166855000510 ENSG00000146834:ENST00000497759:exon_100028653_100029202:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000414441:exon_100028238_100029312:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000470297:exon_100028653_100029027:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000479201:exon_100028653_100029105:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000425355:exon_100027901_100029312:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000310512:exon_100027254_100029312:MEPCE HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 100304864 C/A 1 57 44 101 27.9529536804048 22.4222813695121 5.53067231089265 A:C C A 10 0.509597303852548 0.275695948162450 ENSG00000172336:ENST00000303151:exon_100304444_100305118:POP7;ENSG00000172336:ENST00000457480:exon_100304444_100304865:POP7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 100468284 A/G 1 19 11 30 9.31765122680159 5.60557034237803 3.71208088442356 A:G A G 10 0.509597303852548 0.202978653761744 ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100468196_100469343:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000417475:exon_100468196_100468297:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100467992_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000463125:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000429658:exon_100468196_100468365:TRIP6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 100468398 T/C 1 6 6 12 2.94241617688471 3.05758382311529 -0.115167646230576 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100468196_100469343:TRIP6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 100482026 T/C 1 52 35 87 25.5009401996675 17.8359056348392 7.66503456482832 T:C T C 10 0.509597303852548 0.108117147717885 ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000474896:exon_100481989_100482173:SRRT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 100482339 C/T 1 6 2 8 2.94241617688471 1.0191946077051 1.92322156917962 T:C C T 10 0.509597303852548 0.289787629707581 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 100482537 C/T 1 5 15 20 2.45201348073726 7.64395955778822 -5.19194607705096 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0242764341264256 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 100486110 C/T 1 164 96 260 80.4260421681821 48.9213411698446 31.5047009983375 T:C C T 10 0.509597303852548 8.86582651208052e-05 ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000448764:exon_100486095_100486277:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000342198:exon_100486095_100486120:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000445337:exon_100486095_100486281:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000477529:exon_100486095_100486285:SRRT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 106826381 C/T 1 4 7 11 1.96161078458981 3.56718112696784 -1.60557034237803 T:C C T 10 0.509597303852548 0.379319216476062 ENSG00000105856:ENST00000468410:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000222574:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000485846:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000463202:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000417005:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000498408:exon_106826246_106826387:HBP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 107559722 A/T 1 15 15 30 7.35604044221178 7.64395955778822 -0.28791911557644 A:T A T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000091140:ENST00000205402:exon_107559639_107560360:DLD;ENSG00000091140:ENST00000415325:exon_107559639_107560038:DLD;ENSG00000091140:ENST00000417551:exon_107559639_107559828:DLD;ENSG00000091140:ENST00000440410:exon_107559639_107560158:DLD;ENSG00000091140:ENST00000437604:exon_107559639_107560100:DLD HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 115897392 G/C 1 24 15 39 11.7696647075388 7.64395955778822 4.12570514975063 C:G G C 10 0.509597303852548 0.202821066135949 ENSG00000135269:ENST00000358204:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000492891:exon_115897348_115897722:TES;ENSG00000135269:ENST00000257721:exon_115897348_115898835:TES;ENSG00000135269:ENST00000393481:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000496912:exon_115897348_115897630:TES HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 117825681 A/G 1 9 5 14 4.41362426532707 2.54798651926274 1.86563774606433 A:G A G 10 0.509597303852548 0.425164682757114 ENSG00000128534:ENST00000422760:exon_117824210_117825748:NAA38 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 128505628 G/A 1 161 165 326 78.9548340797398 84.0835551356704 -5.12872105593065 A:G G A 10 0.509597303852548 0.579985322756119 ENSG00000128524:ENST00000249289:exon_128505431_128505897:ATP6V1F;ENSG00000128524:ENST00000492758:exon_128505431_128505898:ATP6V1F HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 128588610 T/G 1 7 4 11 3.43281887303216 2.03838921541019 1.39442965762197 T:G T G 10 0.509597303852548 0.549658645750086 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 129474828 C/T 1 8 2 10 3.92322156917962 1.0191946077051 2.90402696147452 T:C C T 10 0.509597303852548 0.110022635989167 ENSG00000186591:ENST00000355621:exon_129470572_129474901:UBE2H;ENSG00000186591:ENST00000473814:exon_129474777_129474901:UBE2H;ENSG00000186591:ENST00000496698:exon_129474781_129474901:UBE2H;ENSG00000186591:ENST00000483368:exon_129474818_129474901:UBE2H HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 133979545 A/T 1 10 1 11 4.90402696147452 0.509597303852548 4.39442965762197 A:T A T 10 0.509597303852548 0.0118772360206333 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 133979552 C/T 1 9 3 12 4.41362426532707 1.52879191155764 2.88483235376942 T:C C T 10 0.509597303852548 0.146886429190433 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 133979578 A/G 1 12 2 14 5.88483235376942 1.0191946077051 4.86563774606433 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0131607574589523 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 135322853 T/C 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:C T C 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 135329690 T/C 1 7 16 23 3.43281887303216 8.15355686164077 -4.7207379886086 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0599280698536108 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000477620:exon_135329643_135329726:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000461255:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000490439:exon_135329647_135329766:NUP205 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 138732497 G/A 1 2 8 10 0.980805392294904 4.07677843082038 -3.09597303852548 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0608033640885815 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 141439003 C/T 1 7 3 10 3.43281887303216 1.52879191155764 1.90402696147452 T:C C T 10 0.509597303852548 0.344656245175514 ENSG00000106028:ENST00000496622:exon_141438924_141441490:SSBP1;ENSG00000106028:ENST00000461433:exon_141438924_141440514:SSBP1;ENSG00000106028:ENST00000468267:exon_141438924_141439556:SSBP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 0 43 0 43 21.0873159343404 0 21.0873159343404 T T 10 0.509597303852548 3.06898658469171e-13 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 150068371 T/C 1 13 5 18 6.37523504991688 2.54798651926274 3.82724853065414 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0973482612827023 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000522266:exon_150068317_150068481:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 150068933 T/C 1 19 18 37 9.31765122680159 9.17275146934586 0.144899757455725 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 150093701 A/C 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 A:C A C 10 0.509597303852548 0.541646560898822 ENSG00000196456:ENST00000478789:exon_150093601_150094003:ZNF775;ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775;ENSG00000196456:ENST00000490973:exon_150093601_150094067:ZNF775 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 150094853 G/A 1 5 5 10 2.45201348073726 2.54798651926274 -0.0959730385254796 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 150439500 C/T 1 5 9 14 2.45201348073726 4.58637573467293 -2.13436225393567 T:C C T 10 0.509597303852548 0.293559675506127 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000493304:exon_150439271_150439605:GIMAP5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 150915948 C/T 1 13 14 27 6.37523504991688 7.13436225393567 -0.759127204018796 T:C C T 10 0.509597303852548 0.848413381775282 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150915840_150915959:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150915840_150915959:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000473874:exon_150915840_150915959:ABCF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 150916228 G/A 1 12 19 31 5.88483235376942 9.68234877319841 -3.79751641942899 A:G G A 10 0.509597303852548 0.209059512080527 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000473874:exon_150916150_150916245:ABCF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 150931268 C/G 1 10 18 28 4.90402696147452 9.17275146934586 -4.26872450787134 C:G C G 10 0.509597303852548 0.130491538408604 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150931172_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150929585_150931360:CHPF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 150934975 C/G 1 57 50 107 27.9529536804048 25.4798651926274 2.47308848777736 C:G C G 10 0.509597303852548 0.69912884169541 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150934460_150935905:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150934460_150935359:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150934460_150935908:CHPF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 151873293 G/A 1 6 9 15 2.94241617688471 4.58637573467293 -1.64395955778822 A:G G A 10 0.509597303852548 0.446901967950042 ENSG00000055609:ENST00000360104:exon_151873276_151875053:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000262189:exon_151873276_151875095:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000355193:exon_151873276_151875095:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000473186:exon_151873276_151875095:MLL3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 156761818 G/A 1 5 5 10 2.45201348073726 2.54798651926274 -0.0959730385254796 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000485661:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156761449_156761890:NOM1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 156762224 G/C 1 5 11 16 2.45201348073726 5.60557034237803 -3.15355686164077 C:G G C 10 0.509597303852548 0.136896620322009 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 156762248 G/A 1 4 10 14 1.96161078458981 5.09597303852548 -3.13436225393567 A:G G A 10 0.509597303852548 0.112312460825055 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 158526880 G/A 1 8 26 34 3.92322156917962 13.2495299001662 -9.32630833098663 A:C:G G A 10 0.509597303852548 0.00162444913087065 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158523686_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158523689_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158523689_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158526140_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158526302_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158526304_158526943:ESYT2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 158528254 G/A 1 21 4 25 10.2984566190965 2.03838921541019 8.2600674036863 A:G G A 10 0.509597303852548 0.000957457429822103 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158528194_158528299:ESYT2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 158528269 C/G 1 23 4 27 11.2792620113914 2.03838921541019 9.24087279598121 C:G C G 10 0.509597303852548 0.000330845584449162 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158528194_158528299:ESYT2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 7 158536334 G/A 1 6 2 8 2.94241617688471 1.0191946077051 1.92322156917962 A:G G A 10 0.509597303852548 0.289787629707581 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 6389889 C/G 1 8 3 11 3.92322156917962 1.52879191155764 2.39442965762197 C:G C G 10 0.509597303852548 0.227512016275758 ENSG00000091879:ENST00000325203:exon_6389853_6390008:ANGPT2;ENSG00000091879:ENST00000415216:exon_6389853_6390008:ANGPT2;ENSG00000091879:ENST00000523120:exon_6389853_6390008:ANGPT2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 6390027 A/G 0 0 11 11 0 5.60557034237803 -5.60557034237803 G A G 10 0.509597303852548 0.00039453118880164 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 8176221 C/T 1 9 3 12 4.41362426532707 1.52879191155764 2.88483235376942 T:C C T 10 0.509597303852548 0.146886429190433 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 10623289 A/G 1 26 30 56 12.7504700998338 15.2879191155764 -2.53744901574269 A:G A G 10 0.509597303852548 0.507432587520343 ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10622473_10623426:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10622669_10623426:PINX1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 10689212 C/T 1 11 11 22 5.39442965762197 5.60557034237803 -0.211140684756055 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000254093:ENST00000354846:exon_10689175_10689253:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10689175_10689253:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10689175_10689253:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000524114:exon_10689175_10689253:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000523559:exon_10689175_10689253:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000517607:exon_10689175_10689253:PINX1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 11418773 C/T 1 19 15 34 9.31765122680159 7.64395955778822 1.67369166901337 T:C C T 10 0.509597303852548 0.609853977205676 ENSG00000136573:ENST00000526097:exon_11417842_11418961:BLK HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 11643803 C/T 1 11 7 18 5.39442965762197 3.56718112696784 1.82724853065414 T:C C T 10 0.509597303852548 0.482156564682581 ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11643472_11644849:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528323:exon_11643472_11643883:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11643472_11644855:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000524741:exon_11643472_11644165:NEIL2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 17819572 C/T 1 5 7 12 2.45201348073726 3.56718112696784 -1.11516764623058 T:C C T 10 0.509597303852548 0.574428486272357 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517836:exon_17819543_17819722:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518762:exon_17819543_17819683:PCM1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 17927327 T/C 1 19 35 54 9.31765122680159 17.8359056348392 -8.51825440803759 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0209506440170370 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17927301_17927387:ASAH1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 17928811 C/T 1 7 17 24 3.43281887303216 8.66315416549332 -5.23033529246115 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0401930404020513 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17928809_17928899:ASAH1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 20073976 C/A 1 7 1 8 3.43281887303216 0.509597303852548 2.92322156917962 A:C C A 10 0.509597303852548 0.0707155477569663 ENSG00000147416:ENST00000276390:exon_20073924_20074006:ATP6V1B2;ENSG00000147416:ENST00000523482:exon_20070293_20074835:ATP6V1B2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 21965113 T/C 1 6 10 16 2.94241617688471 5.09597303852548 -2.15355686164077 T:C T C 10 0.509597303852548 0.324290953365588 ENSG00000173566:ENST00000522405:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000309188:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000521807:exon_21964385_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000420897:exon_21964454_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000522379:exon_21965024_21965406:NUDT18 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 22471824 G/A 1 10 13 23 4.90402696147452 6.62476495008312 -1.7207379886086 A:G G A 10 0.509597303852548 0.53508614923685 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000522599:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521020:exon_22471398_22471827:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 22481449 A/G 1 23 20 43 11.2792620113914 10.191946077051 1.08731593434044 A:G A G 10 0.509597303852548 0.762635616704978 ENSG00000147439:ENST00000276416:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000520489:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519513:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000399977:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519335:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519863:exon_22481428_22481562:BIN3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 22926313 G/A 1 8 3 11 3.92322156917962 1.52879191155764 2.39442965762197 A:G G A 10 0.509597303852548 0.227512016275758 ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22926264_22926692:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22926264_22926534:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22926264_22926544:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000519028:exon_22926264_22926535:TNFRSF10B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 27667969 C/G 1 14 10 24 6.86563774606433 5.09597303852548 1.76966470753885 C:G C G 10 0.509597303852548 0.543061903146082 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27667137_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27667718_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000524266:exon_27667811_27668018:PBK HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 28206275 G/C 1 6 6 12 2.94241617688471 3.05758382311529 -0.115167646230576 C:G G C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000186918:ENST00000344423:exon_28203102_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000520535:exon_28205795_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523202:exon_28206046_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523095:exon_28206076_28206347:ZNF395;ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28205804_28206347:FBXO16 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 28385321 G/A 1 5 11 16 2.45201348073726 5.60557034237803 -3.15355686164077 A:G G A 10 0.509597303852548 0.136896620322009 ENSG00000104290:ENST00000240093:exon_28384664_28385681:FZD3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 31024638 C/T 1 4 11 15 1.96161078458981 5.60557034237803 -3.64395955778822 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0719657820440228 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_31024538_31024746:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_31024538_31024746:WRN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 31024654 T/C 1 13 4 17 6.37523504991688 2.03838921541019 4.33684583450668 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0497378911148666 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_31024538_31024746:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_31024538_31024746:WRN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 31030535 C/T 1 20 27 47 9.80805392294904 13.7591272040188 -3.95107328106976 T:C C T 10 0.509597303852548 0.307161754235866 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_31030511_31031285:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_31030511_31031279:WRN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 33356074 A/G 1 8 19 27 3.92322156917962 9.68234877319841 -5.7591272040188 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0330692141736325 ENSG00000198042:ENST00000360128:exon_33355950_33358687:MAK16;ENSG00000198042:ENST00000518389:exon_33355950_33356164:MAK16 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 33369994 A/G 1 5 6 11 2.45201348073726 3.05758382311529 -0.605570342378028 A:G A G 10 0.509597303852548 0.770507260060939 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 37635649 A/G 1 17 4 21 8.33684583450668 2.03838921541019 6.29845661909649 A:G A G 10 0.509597303852548 0.00741244424629679 ENSG00000147471:ENST00000328195:exon_37635491_37637283:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000437582:exon_37635491_37637285:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000521494:exon_37635491_37635880:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000517377:exon_37635491_37635918:PROSC HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 38122161 G/C 1 6 7 13 2.94241617688471 3.56718112696784 -0.624764950083124 C:G G C 10 0.509597303852548 0.786978111840725 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 48802991 T/C 1 6 4 10 2.94241617688471 2.03838921541019 0.90402696147452 T:C T C 10 0.509597303852548 0.75435926131823 ENSG00000121031:ENST00000338368:exon_48802818_48803041:AC103686.1;ENSG00000121031:ENST00000314191:exon_48802818_48803041:AC103686.1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 48878772 C/T 1 8 24 32 3.92322156917962 12.2303352924612 -8.30711372328154 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00401659230362303 ENSG00000104738:ENST00000523944:exon_48878747_48878967:MCM4;ENSG00000104738:ENST00000429229:exon_48878747_48878967:MCM4;ENSG00000104738:ENST00000262105:exon_48878747_48878967:MCM4;ENSG00000104738:ENST00000396826:exon_48878747_48878967:MCM4;ENSG00000104738:ENST00000519138:exon_48878747_48878880:MCM4;ENSG00000104738:ENST00000520637:exon_48878747_48878835:MCM4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 48882392 A/G 1 39 21 60 19.1257051497506 10.7015433809035 8.42416176884712 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0379685629523333 ENSG00000104738:ENST00000523944:exon_48882358_48882617:MCM4;ENSG00000104738:ENST00000429229:exon_48882358_48882617:MCM4;ENSG00000104738:ENST00000262105:exon_48882358_48882617:MCM4;ENSG00000104738:ENST00000396826:exon_48882358_48882617:MCM4;ENSG00000104738:ENST00000520637:exon_48882358_48882617:MCM4;ENSG00000104738:ENST00000518680:exon_48882358_48882617:MCM4;ENSG00000104738:ENST00000517709:exon_48882246_48882617:MCM4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 56711713 A/G 1 2 6 8 0.980805392294904 3.05758382311529 -2.07677843082038 A:G A G 10 0.509597303852548 0.171857042968518 ENSG00000137574:ENST00000260129:exon_56711473_56711779:TGS1;ENSG00000137574:ENST00000523948:exon_56711473_56711779:TGS1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 56723557 T/G 1 9 5 14 4.41362426532707 2.54798651926274 1.86563774606433 T:G T G 10 0.509597303852548 0.425164682757114 ENSG00000137574:ENST00000260129:exon_56723440_56723656:TGS1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 56985814 T/C 1 3544 4293 7837 1737.98715514657 2187.70122543899 -449.714070292418 A:T:C T C 10 0.509597303852548 3.09342985435241e-24 ENSG00000008988:ENST00000519807:exon_56985676_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000427539:exon_56985676_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000009589:exon_56985506_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000524349:exon_56985601_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000520490:exon_56985613_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000521262:exon_56985613_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000520627:exon_56985613_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000523936:exon_56985632_56986327:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000519606:exon_56985634_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000521289:exon_56985686_56985831:RPS20 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 56986417 A/G 1 14 20 34 6.86563774606433 10.191946077051 -3.32630833098663 A:G A G 10 0.509597303852548 0.304159847215698 ENSG00000008988:ENST00000521289:exon_56986254_56986718:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000519369:exon_56986021_56986718:RPS20 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 67592152 T/C 1 4 7 11 1.96161078458981 3.56718112696784 -1.60557034237803 T:C T C 10 0.509597303852548 0.379319216476062 ENSG00000104205:ENST00000520044:exon_67591956_67592259:SGK3;ENSG00000104205:ENST00000519289:exon_67591956_67592259:SGK3;ENSG00000213865:ENST00000521113:exon_67591956_67592259:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000519561:exon_67591956_67593393:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000390159:exon_67591956_67593235:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000396609:exon_67591956_67592259:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000518860:exon_67591774_67592259:C8orf44 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 70744812 G/A 1 2 6 8 0.980805392294904 3.05758382311529 -2.07677843082038 A:G G A 10 0.509597303852548 0.171857042968518 ENSG00000137571:ENST00000260126:exon_70744002_70745404:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000524945:exon_70744002_70745625:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000526750:exon_70744002_70745404:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000530307:exon_70744002_70744950:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000532388:exon_70744002_70745404:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000528658:exon_70744002_70745404:SLCO5A1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 74888616 G/C 1 2 11 13 0.980805392294904 5.60557034237803 -4.62476495008312 C:G G C 10 0.509597303852548 0.0114798061912099 ENSG00000175606:ENST00000523794:exon_74888540_74888726:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74888430_74888726:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000517439:exon_74888442_74888726:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74888444_74888726:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000517614:exon_74888454_74888726:TMEM70 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 74893821 A/G 1 93 61 154 45.607450741713 31.0854355350054 14.5220152067076 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0194777009143396 ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 74893850 C/G 1 43 38 81 21.0873159343404 19.3646975463968 1.72261838794362 C:G C G 10 0.509597303852548 0.739576729657288 ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 81897091 C/T 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 T:C C T 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000076641:ENST00000220597:exon_81897011_81897612:PAG1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 81897200 C/T 1 7 12 19 3.43281887303216 6.11516764623058 -2.68234877319841 T:C C T 10 0.509597303852548 0.255561328037084 ENSG00000076641:ENST00000220597:exon_81897011_81897612:PAG1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 87519315 T/G 1 5 12 17 2.45201348073726 6.11516764623058 -3.66315416549332 T:G T G 10 0.509597303852548 0.090883178805902 ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523911:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519966:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000430676:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000524172:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523370:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000521045:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000518772:exon_87519224_87519341:FAM82B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 87567193 C/T 1 4 7 11 1.96161078458981 3.56718112696784 -1.60557034237803 T:C C T 10 0.509597303852548 0.379319216476062 ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87567079_87567212:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87567079_87567212:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517354:exon_87567079_87567207:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517490:exon_87567079_87567212:CPNE3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 87570665 A/C 1 6 4 10 2.94241617688471 2.03838921541019 0.90402696147452 A:C A C 10 0.509597303852548 0.75435926131823 ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87570516_87573726:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87570516_87573726:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517490:exon_87570516_87573639:CPNE3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 90967711 A/G 1 17 8 25 8.33684583450668 4.07677843082038 4.2600674036863 A:G A G 10 0.509597303852548 0.109366962829306 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90967511_90967783:NBN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 90990479 C/G 1 5 5 10 2.45201348073726 2.54798651926274 -0.0959730385254796 C:G C G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000452387:exon_90990448_90990542:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517772:exon_90990448_90990551:NBN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 95419698 A/G 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000197275:ENST00000336148:exon_95419667_95419948:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000517506:exon_95419667_95419948:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000463267:exon_95419667_95419948:RAD54B HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 95877787 T/C 1 6 4 10 2.94241617688471 2.03838921541019 0.90402696147452 T:C T C 10 0.509597303852548 0.75435926131823 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520315:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000517918:exon_95877734_95877918:INTS8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 95888307 C/T 1 23 14 37 11.2792620113914 7.13436225393567 4.14489975745573 T:C C T 10 0.509597303852548 0.190749990775807 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000521155:exon_95888302_95888370:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523998:exon_95888179_95888513:INTS8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 98735171 C/G 1 67 80 147 32.8569806418793 40.7677843082038 -7.91080366632455 C:G C G 10 0.509597303852548 0.215843543645783 ENSG00000147649:ENST00000336273:exon_98735107_98735263:MTDH;ENSG00000147649:ENST00000519934:exon_98735107_98735263:MTDH;ENSG00000147649:ENST00000519293:exon_98735107_98735263:MTDH;ENSG00000147649:ENST00000521933:exon_98735107_98735263:MTDH HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 99057150 C/A 1 7 17 24 3.43281887303216 8.66315416549332 -5.23033529246115 A:C C A 10 0.509597303852548 0.0401930404020513 ENSG00000156482:ENST00000518850:exon_99057055_99057316:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000520998:exon_99056661_99057316:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521112:exon_99057096_99057627:RPL30 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 99057526 G/A 1 8 11 19 3.92322156917962 5.60557034237803 -1.68234877319841 A:G G A 10 0.509597303852548 0.496599009223979 ENSG00000156482:ENST00000517489:exon_99057171_99057627:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521112:exon_99057096_99057627:RPL30 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 101206391 G/A 1 7 4 11 3.43281887303216 2.03838921541019 1.39442965762197 A:G G A 10 0.509597303852548 0.549658645750086 ENSG00000104450:ENST00000520643:exon_101206340_101206908:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101206340_101206496:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000520508:exon_101206340_101206912:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101206340_101206496:SPAG1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 101206531 G/A 1 8 6 14 3.92322156917962 3.05758382311529 0.865637746064328 A:G G A 10 0.509597303852548 0.79106698341654 ENSG00000104450:ENST00000520643:exon_101206340_101206908:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000520508:exon_101206340_101206912:SPAG1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 101253184 G/A 1 14 6 20 6.86563774606433 3.05758382311529 3.80805392294904 A:G G A 10 0.509597303852548 0.116652704888565 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101253119_101254130:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101253119_101254130:SPAG1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 117783914 A/C 1 41 44 85 20.1065105420455 22.4222813695121 -2.31577082746658 A:C A C 10 0.509597303852548 0.664812795793059 ENSG00000147679:ENST00000309822:exon_117783695_117786923:UTP23;ENSG00000147679:ENST00000521974:exon_117783695_117784022:UTP23 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 117783975 C/T 1 49 45 94 24.0297321112251 22.9318786733647 1.09785343786049 T:C C T 10 0.509597303852548 0.837253707818035 ENSG00000147679:ENST00000309822:exon_117783695_117786923:UTP23;ENSG00000147679:ENST00000521974:exon_117783695_117784022:UTP23 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 124027628 T/C 1 63 46 109 30.8953698572895 23.4414759772172 7.45389388007227 T:C T C 10 0.509597303852548 0.179610036788345 ENSG00000136986:ENST00000259512:exon_124025458_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000524119:exon_124026389_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000405944:exon_124026389_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000419562:exon_124027405_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000427265:exon_124027445_124027825:DERL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 124448736 A/G 1 11 3 14 5.39442965762197 1.52879191155764 3.86563774606433 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0580035546592849 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124448693_124448841:WDYHV1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 124448804 T/A 1 16 6 22 7.84644313835923 3.05758382311529 4.78885931524394 A:T T A 10 0.509597303852548 0.0534231591030593 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124448693_124448841:WDYHV1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 124449466 C/T 1 13 7 20 6.37523504991688 3.56718112696784 2.80805392294904 T:C C T 10 0.509597303852548 0.264944792438562 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000518125:exon_124449450_124449574:WDYHV1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 124525483 C/T 1 6 2 8 2.94241617688471 1.0191946077051 1.92322156917962 T:C C T 10 0.509597303852548 0.289787629707581 ENSG00000156804:ENST00000517956:exon_124525438_124525622:FBXO32;ENSG00000156804:ENST00000287396:exon_124525438_124525622:FBXO32 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 125463937 G/C 1 8 4 12 3.92322156917962 2.03838921541019 1.88483235376942 C:G G C 10 0.509597303852548 0.388763190446408 ENSG00000183665:ENST00000328599:exon_125463048_125465262:TRMT12 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 125499363 G/A 1 11 5 16 5.39442965762197 2.54798651926274 2.84644313835923 A:G G A 10 0.509597303852548 0.211463370056425 ENSG00000170881:ENST00000303545:exon_125498072_125500155:RNF139 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 125528135 G/A 1 15 10 25 7.35604044221178 5.09597303852548 2.2600674036863 A:G G A 10 0.509597303852548 0.4265061452616 ENSG00000147687:ENST00000276692:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523214:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519548:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000522810:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000517678:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519776:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000521546:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000521973:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000520321:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000522310:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519232:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000520938:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523888:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523152:exon_125528128_125528271:TATDN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 126194525 C/T 1 9 9 18 4.41362426532707 4.58637573467293 -0.172751469345863 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000156831:ENST00000520866:exon_126194345_126194614:NSMCE2;ENSG00000156831:ENST00000519010:exon_126194345_126194761:NSMCE2;ENSG00000156831:ENST00000519712:exon_126194345_126194672:NSMCE2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 129021179 G/A 1 10 13 23 4.90402696147452 6.62476495008312 -1.7207379886086 A:G G A 10 0.509597303852548 0.53508614923685 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 141263015 G/A 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000520857:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000521667:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000520532:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000518839:exon_141262876_141263028:TRAPPC9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 142154291 G/A 1 7 3 10 3.43281887303216 1.52879191155764 1.90402696147452 A:G G A 10 0.509597303852548 0.344656245175514 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523058:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523015:exon_142154013_142154358:DENND3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 142170884 C/T 1 8 7 15 3.92322156917962 3.56718112696784 0.35604044221178 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142170731_142170886:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142170731_142170886:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142170731_142170886:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521477:exon_142170731_142170886:DENND3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 142176507 T/C 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 T:C T C 10 0.509597303852548 0.726965250907 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 142200467 G/A 1 21 15 36 10.2984566190965 7.64395955778822 2.65449706130827 A:G G A 10 0.509597303852548 0.408159187526974 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520571:exon_142200383_142200723:DENND3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 144358302 C/T 1 5 10 15 2.45201348073726 5.09597303852548 -2.64395955778822 T:C C T 10 0.509597303852548 0.20250907335495 ENSG00000181638:ENST00000522452:exon_144358067_144358573:ZFP41;ENSG00000250571:ENST00000522479:exon_144358067_144358351:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000517530:exon_144358173_144358581:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000522033:exon_144358067_144358340:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 144358381 G/A 1 12 15 27 5.88483235376942 7.64395955778822 -1.7591272040188 A:G G A 10 0.509597303852548 0.56601930423381 ENSG00000181638:ENST00000522452:exon_144358067_144358573:ZFP41;ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000517530:exon_144358173_144358581:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 144392368 G/A 1 30 18 48 14.7120808844236 9.17275146934586 5.5393294150777 A:G G A 10 0.509597303852548 0.114558613315320 ENSG00000184428:ENST00000519977:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000517857:exon_144392238_144392673:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144391892_144392387:TOP1MT HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 144620183 T/C 1 6 2 8 2.94241617688471 1.0191946077051 1.92322156917962 T:C T C 10 0.509597303852548 0.289787629707581 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 144620342 T/C 1 7 3 10 3.43281887303216 1.52879191155764 1.90402696147452 T:C T C 10 0.509597303852548 0.344656245175514 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 144621084 T/G 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:G T G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 144644141 C/T 1 27 30 57 13.2408727959812 15.2879191155764 -2.04704631959524 T:C C T 10 0.509597303852548 0.599084225516797 ENSG00000104518:ENST00000526406:exon_144644129_144644301:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533063:exon_144644129_144644301:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000262580:exon_144644129_144644301:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531184:exon_144644129_144644301:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144644129_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000528475:exon_144643912_144644691:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526469:exon_144644129_144644301:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000534602:exon_144644129_144644301:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531173:exon_144644129_144644301:GSDMD HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 144671244 C/G 1 9 2 11 4.41362426532707 1.0191946077051 3.39442965762197 C:G C G 10 0.509597303852548 0.0659641183816961 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530616:exon_144671161_144671392:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000525223:exon_144670998_144671486:EEF1D HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 144671956 G/A 1 6 8 14 2.94241617688471 4.07677843082038 -1.13436225393567 A:G G A 10 0.509597303852548 0.601095068648336 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526710:exon_144671351_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531281:exon_144671481_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532596:exon_144671681_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524883:exon_144671710_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531670:exon_144671715_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528519:exon_144671780_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529832:exon_144671814_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530306:exon_144671865_144672251:EEF1D HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 144681714 G/A 1 4 7 11 1.96161078458981 3.56718112696784 -1.60557034237803 A:G G A 10 0.509597303852548 0.379319216476062 ENSG00000179886:ENST00000504548:exon_144680005_144682485:TIGD5;ENSG00000179886:ENST00000321385:exon_144680075_144682075:TIGD5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 144687092 T/C 1 19 19 38 9.31765122680159 9.68234877319841 -0.364697546396823 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144686083_144688052:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144686083_144688052:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144687077_144687127:PYCRL HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 144776713 A/C 1 11 7 18 5.39442965762197 3.56718112696784 1.82724853065414 A:C A C 10 0.509597303852548 0.482156564682581 ENSG00000181135:ENST00000454097:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000418203:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000533031:exon_144775841_144777526:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000358656:exon_144775841_144777555:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532486:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527561:exon_144775841_144776869:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532158:exon_144775841_144777527:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532205:exon_144775841_144777550:ZNF707 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 144893084 G/A 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144893076_144893242:SCRIB HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 144994581 G/A 1 10 5 15 4.90402696147452 2.54798651926274 2.35604044221178 A:G G A 10 0.509597303852548 0.303107408657847 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 145058037 A/G 1 16 4 20 7.84644313835923 2.03838921541019 5.80805392294904 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0121181551128578 ENSG00000178685:ENST00000526007:exon_145057335_145058526:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528963:exon_145058010_145058272:PARP10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 145058986 A/G 1 11 11 22 5.39442965762197 5.60557034237803 -0.211140684756055 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313059:exon_145058896_145059496:PARP10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 145060112 G/A 1 22 17 39 10.7888593152439 8.66315416549332 2.12570514975063 A:G G A 10 0.509597303852548 0.52539752156904 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000533665:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000526985:exon_145059660_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525879:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528625:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525486:exon_145059886_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531537:exon_145059892_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529842:exon_145059893_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528914:exon_145059918_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528136:exon_145059939_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529311:exon_145060005_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528580:exon_145060017_145060401:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000530478:exon_145060059_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000532311:exon_145060076_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531707:exon_145060082_145060143:PARP10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 145066853 C/T 1 8 8 16 3.92322156917962 4.07677843082038 -0.153556861640768 T:C C T 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 145737514 G/A 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 A:G G A 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 145737816 C/T 1 25 23 48 12.2600674036863 11.7207379886086 0.539329415077697 T:C C T 10 0.509597303852548 0.886442258454695 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145737775_145737944:RECQL4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 145741702 C/G 1 8 2 10 3.92322156917962 1.0191946077051 2.90402696147452 C:G C G 10 0.509597303852548 0.110022635989167 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 145741765 G/A 1 12 3 15 5.88483235376942 1.52879191155764 4.35604044221178 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0356477356687783 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 145747920 T/G 1 5 7 12 2.45201348073726 3.56718112696784 -1.11516764623058 T:G T G 10 0.509597303852548 0.574428486272357 ENSG00000160959:ENST00000292524:exon_145746295_145750557:LRRC14;ENSG00000177021:ENST00000343593:exon_145747773_145748793:AC084125.1;ENSG00000254402:ENST00000529415:exon_145747788_145748793:LRRC24;ENSG00000254402:ENST00000533758:exon_145747823_145748793:LRRC24 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 146068322 C/T 1 37 63 100 18.1448997574557 32.1046301427105 -13.9597303852548 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00663012679466776 ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 146068594 T/C 1 9 19 28 4.41362426532707 9.68234877319841 -5.26872450787134 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0577645390368908 ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 8 146076708 C/T 1 8 16 24 3.92322156917962 8.15355686164077 -4.23033529246115 T:C C T 10 0.509597303852548 0.102508753648658 ENSG00000170619:ENST00000402718:exon_146075559_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000450361:exon_146075573_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000305103:exon_146075604_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000529143:exon_146076210_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000533270:exon_146076211_146076780:COMMD5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 312124 T/C 1 8 4 12 3.92322156917962 2.03838921541019 1.88483235376942 T:C T C 10 0.509597303852548 0.388763190446408 ENSG00000107099:ENST00000524396:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000427010:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000454469:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382341:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000478380:exon_311954_312941:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000474772:exon_311958_312166:DOCK8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 312134 G/A 1 4 10 14 1.96161078458981 5.09597303852548 -3.13436225393567 A:G G A 10 0.509597303852548 0.112312460825055 ENSG00000107099:ENST00000524396:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000427010:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000454469:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382341:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000478380:exon_311954_312941:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000474772:exon_311958_312166:DOCK8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 2191309 C/G 1 31 9 40 15.202483580571 4.58637573467293 10.6161078458981 C:G C G 10 0.509597303852548 0.000739795008938185 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000302401:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382186:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000417599:exon_2191266_2191428:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382185:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382183:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000324954:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382182:exon_2191266_2191408:SMARCA2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 2828742 C/A 1 20 12 32 9.80805392294904 6.11516764623058 3.69288627671846 A:C C A 10 0.509597303852548 0.218035323997103 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2828675_2828778:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000469168:exon_2828475_2828778:KIAA0020 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 2828765 C/G 1 21 11 32 10.2984566190965 5.60557034237803 4.69288627671847 C:G C G 10 0.509597303852548 0.112275379386696 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2828675_2828778:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000469168:exon_2828475_2828778:KIAA0020 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 2838470 C/T 1 30 24 54 14.7120808844236 12.2303352924612 2.48174559196241 T:C C T 10 0.509597303852548 0.586576190491404 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2838426_2838517:KIAA0020 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 4860300 A/G 1 40 41 81 19.6161078458981 20.8934894579545 -1.27738161205638 A:G A G 10 0.509597303852548 0.824473355320579 ENSG00000120158:ENST00000381750:exon_4860125_4861064:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000381730:exon_4860125_4860472:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000448872:exon_4860125_4861064:RCL1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 5920886 G/A 1 8 16 24 3.92322156917962 8.15355686164077 -4.23033529246115 A:G G A 10 0.509597303852548 0.102508753648658 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5919008_5923309:KIAA2026;ENSG00000183354:ENST00000381461:exon_5919022_5923309:KIAA2026 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 5921844 G/A 1 6 8 14 2.94241617688471 4.07677843082038 -1.13436225393567 A:G G A 10 0.509597303852548 0.601095068648336 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5919008_5923309:KIAA2026;ENSG00000183354:ENST00000381461:exon_5919022_5923309:KIAA2026 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 5969249 A/G 1 12 23 35 5.88483235376942 11.7207379886086 -5.83590563483918 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0617860885782364 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 6012734 A/C 1 8 6 14 3.92322156917962 3.05758382311529 0.865637746064328 A:C A C 10 0.509597303852548 0.79106698341654 ENSG00000137040:ENST00000259569:exon_6011020_6015618:RANBP6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 6506038 C/T 1 16 8 24 7.84644313835923 4.07677843082038 3.76966470753885 T:C C T 10 0.509597303852548 0.153397563257600 ENSG00000147854:ENST00000468435:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000276893:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000485617:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000492853:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000481243:exon_6506033_6506112:UHRF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 7174673 G/A 1 19 18 37 9.31765122680159 9.17275146934586 0.144899757455725 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7174553_7175647:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7174553_7175648:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7174553_7175647:KDM4C HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 7477141 G/C 1 61 1 62 29.9145644649946 0.509597303852548 29.404967161142 C:G G C 10 0.509597303852548 4.70241233647941e-17 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 20988426 A/G 1 18 14 32 8.82724853065414 7.13436225393567 1.69288627671846 A:G A G 10 0.509597303852548 0.598793215879279 ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20988331_20988428:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20988331_20988428:KIAA1797 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 32450187 T/C 1 6 5 11 2.94241617688471 2.54798651926274 0.394429657621972 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32449996_32450834:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32449996_32450834:ACO1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 32541532 A/G 1 17 19 36 8.33684583450668 9.68234877319841 -1.34550293869173 A:G A G 10 0.509597303852548 0.739665034365435 ENSG00000197579:ENST00000360538:exon_32540542_32544324:TOPORS;ENSG00000197579:ENST00000379858:exon_32540824_32544324:TOPORS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 32542204 A/G 1 23 27 50 11.2792620113914 13.7591272040188 -2.4798651926274 A:G A G 10 0.509597303852548 0.57199244838827 ENSG00000197579:ENST00000360538:exon_32540542_32544324:TOPORS;ENSG00000197579:ENST00000379858:exon_32540824_32544324:TOPORS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 33062128 G/A 1 11 3 14 5.39442965762197 1.52879191155764 3.86563774606433 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0580035546592849 ENSG00000122692:ENST00000397149:exon_33062047_33062175:SMU1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 33817964 C/T 1 6 8 14 2.94241617688471 4.07677843082038 -1.13436225393567 T:C C T 10 0.509597303852548 0.601095068648336 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 35650208 C/T 1 16 21 37 7.84644313835923 10.7015433809035 -2.85510024254427 T:C C T 10 0.509597303852548 0.411846256659366 ENSG00000137078:ENST00000259608:exon_35650181_35650242:SIT1;ENSG00000137078:ENST00000486859:exon_35650181_35650242:SIT1;ENSG00000137078:ENST00000474403:exon_35650181_35650242:SIT1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 35662251 T/C 1 8 6 14 3.92322156917962 3.05758382311529 0.865637746064328 T:C T C 10 0.509597303852548 0.79106698341654 ENSG00000137135:ENST00000490638:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000490970:exon_35662176_35662264:C9orf100 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 35705759 G/A 1 19 14 33 9.31765122680159 7.13436225393567 2.18328897286592 A:G G A 10 0.509597303852548 0.489512959476332 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35705747_35705848:TLN1;ENSG00000137076:ENST00000486788:exon_35705747_35705848:TLN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 35712003 G/A 1 6 2 8 2.94241617688471 1.0191946077051 1.92322156917962 A:G G A 10 0.509597303852548 0.289787629707581 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35712002_35712121:TLN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 35736496 G/A 1 41 41 82 20.1065105420455 20.8934894579545 -0.786978915908932 A:G G A 10 0.509597303852548 0.912227921082761 ENSG00000107175:ENST00000353704:exon_35736389_35737001:CREB3;ENSG00000107175:ENST00000486056:exon_35736389_35736857:CREB3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 37492679 G/T 1 7 7 14 3.43281887303216 3.56718112696784 -0.134362253935672 T:G G T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000421959:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37492654_37492712:POLR1E HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 37493588 C/T 1 6 6 12 2.94241617688471 3.05758382311529 -0.115167646230576 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37493556_37493700:POLR1E HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 37500895 T/C 1 16 7 23 7.84644313835923 3.56718112696784 4.2792620113914 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0945178807775167 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37500837_37500918:POLR1E HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 37503087 G/A 1 31 22 53 15.202483580571 11.2111406847561 3.99134289581496 A:G G A 10 0.509597303852548 0.336279197306881 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37503040_37503694:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37503040_37503693:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37503040_37503694:POLR1E HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 37592452 G/A 1 150 129 279 73.5604044221178 65.7380521969787 7.82235222513911 A:G G A 10 0.509597303852548 0.36922829481527 ENSG00000175768:ENST00000321301:exon_37592409_37592568:TOMM5;ENSG00000175768:ENST00000377773:exon_37592307_37592594:TOMM5;ENSG00000175768:ENST00000401811:exon_37592250_37592636:TOMM5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 37886429 G/A 1 16 5 21 7.84644313835923 2.54798651926274 5.29845661909649 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0271764298858529 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 37888101 C/T 1 11 9 20 5.39442965762197 4.58637573467293 0.808053922949041 T:C C T 10 0.509597303852548 0.824451040790607 ENSG00000122696:ENST00000377716:exon_37887601_37888589:MCART1;ENSG00000122696:ENST00000242275:exon_37887648_37888589:MCART1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 38395928 C/T 1 6 4 10 2.94241617688471 2.03838921541019 0.90402696147452 T:C C T 10 0.509597303852548 0.75435926131823 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 38396002 C/T 1 11 5 16 5.39442965762197 2.54798651926274 2.84644313835923 T:C C T 10 0.509597303852548 0.211463370056425 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 38396065 G/T 1 5 13 18 2.45201348073726 6.62476495008312 -4.17275146934586 T:G G T 10 0.509597303852548 0.059364647228317 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 77563087 C/T 1 3 6 9 1.47120808844236 3.05758382311529 -1.58637573467293 T:C C T 10 0.509597303852548 0.335037018547339 ENSG00000135045:ENST00000376854:exon_77561497_77563122:C9orf40 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 80879149 C/T 0 8 0 8 3.92322156917962 0 3.92322156917962 C C 10 0.509597303852548 0.00789316895639457 ENSG00000148019:ENST00000415085:exon_80879066_80879232:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000277082:exon_80879066_80879232:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000415759:exon_80879066_80879232:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376597:exon_80879066_80879232:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376598:exon_80879066_80879232:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000487108:exon_80879066_80879149:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000459817:exon_80879066_80879232:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000498582:exon_80878967_80879232:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000424347:exon_80879123_80879232:CEP78 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 86258685 A/C 1 17 30 47 8.33684583450668 15.2879191155764 -6.95107328106976 A:C A C 10 0.509597303852548 0.0567418680655312 ENSG00000148057:ENST00000533522:exon_86258344_86259045:C9orf103;ENSG00000148057:ENST00000277124:exon_86258344_86259045:C9orf103;ENSG00000148057:ENST00000405990:exon_86258344_86259038:C9orf103;ENSG00000148057:ENST00000376419:exon_86258344_86258819:C9orf103;ENSG00000148057:ENST00000454393:exon_86258344_86259038:C9orf103 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 86278817 C/A 1 23 19 42 11.2792620113914 9.68234877319841 1.59691323819299 A:C C A 10 0.509597303852548 0.646542574908432 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000527373:exon_86278790_86278958:UBQLN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 86278913 C/T 1 25 23 48 12.2600674036863 11.7207379886086 0.539329415077697 T:C C T 10 0.509597303852548 0.886442258454695 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000527373:exon_86278790_86278958:UBQLN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 88636887 G/A 1 4 8 12 1.96161078458981 4.07677843082038 -2.11516764623058 A:G G A 10 0.509597303852548 0.258556419599671 ENSG00000135040:ENST00000361671:exon_88636816_88637213:NAA35 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 94985637 T/C 1 58 61 119 28.4433563765522 31.0854355350054 -2.64207915845321 T:C T C 10 0.509597303852548 0.6474955185985 ENSG00000196305:ENST00000375643:exon_94985628_94985771:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375660:exon_94985628_94985771:IARS;ENSG00000196305:ENST00000443024:exon_94985628_94985771:IARS;ENSG00000196305:ENST00000447699:exon_94985628_94985771:IARS;ENSG00000196305:ENST00000451588:exon_94985628_94985711:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375629:exon_94985628_94985771:IARS;ENSG00000196305:ENST00000421189:exon_94985628_94985771:IARS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 98766861 G/T 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:G G T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000182150:ENST00000479391:exon_98766802_98767137:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000407474:exon_98766802_98766983:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000320486:exon_98766802_98766983:C9orf102 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 99521494 C/T 1 1 8 9 0.490402696147452 4.07677843082038 -3.58637573467293 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0193004967410206 ENSG00000081386:ENST00000375231:exon_99518147_99522759:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000223428:exon_99518147_99522759:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000449952:exon_99520366_99522759:ZNF510 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 100459578 T/C 1 14 2 16 6.86563774606433 1.0191946077051 5.84644313835923 T:C T C 10 0.509597303852548 0.00428504868507501 ENSG00000136936:ENST00000375128:exon_100459403_100459639:XPA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 100819070 T/G 1 11 16 27 5.39442965762197 8.15355686164077 -2.7591272040188 T:G T G 10 0.509597303852548 0.337959274816801 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100819050_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100819052_100819222:NANS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 100819192 C/T 1 19 26 45 9.31765122680159 13.2495299001662 -3.93187867336466 T:C C T 10 0.509597303852548 0.296654374164976 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100819050_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100819052_100819222:NANS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 100823084 T/C 1 30 29 59 14.7120808844236 14.7783218117239 -0.0662409273003313 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 103054951 T/C 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 T:C T C 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000119509:ENST00000262457:exon_103054608_103055325:INVS HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 103064530 G/A 1 12 21 33 5.88483235376942 10.7015433809035 -4.81671102713408 A:G G A 10 0.509597303852548 0.116511284590118 ENSG00000136891:ENST00000374902:exon_103064366_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000477648:exon_103064368_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000444730:exon_103064372_103064586:TEX10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 103204577 C/G 1 7 12 19 3.43281887303216 6.11516764623058 -2.68234877319841 C:G C G 10 0.509597303852548 0.255561328037084 ENSG00000066697:ENST00000395067:exon_103204188_103204638:C9orf30;ENSG00000066697:ENST00000398977:exon_103204188_103204623:C9orf30;ENSG00000066697:ENST00000374885:exon_103204188_103204638:C9orf30;ENSG00000066697:ENST00000374886:exon_103204188_103204638:C9orf30;ENSG00000066697:ENST00000374887:exon_103204185_103204638:C9orf30;ENSG00000066697:ENST00000489377:exon_103204431_103204638:C9orf30;ENSG00000251349:ENST00000502978:exon_103204553_103204638:RP11-61P7.3;ENSG00000241697:ENST00000334943:exon_103204560_103204638:TMEFF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 111641825 G/A 1 6 5 11 2.94241617688471 2.54798651926274 0.394429657621972 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000467959:exon_111641741_111641837:IKBKAP HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 113006420 A/G 1 225 281 506 110.340606633177 143.196842382566 -32.8562357493893 A:G A G 10 0.509597303852548 0.00381146012209994 ENSG00000136810:ENST00000374517:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000374515:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000487892:exon_113006299_113006499:TXN HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 114174415 T/C 1 7 3 10 3.43281887303216 1.52879191155764 1.90402696147452 T:C T C 10 0.509597303852548 0.344656245175514 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114174294_114174428:KIAA0368 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 114982463 T/C 1 17 16 33 8.33684583450668 8.15355686164077 0.183288972865917 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 114982549 C/T 1 17 16 33 8.33684583450668 8.15355686164077 0.183288972865917 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 115931703 G/A 1 11 11 22 5.39442965762197 5.60557034237803 -0.211140684756055 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 116044998 A/G 1 7 6 13 3.43281887303216 3.05758382311529 0.375235049916876 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000136875:ENST00000374199:exon_116044926_116045013:PRPF4;ENSG00000136875:ENST00000374198:exon_116044926_116045013:PRPF4;ENSG00000136875:ENST00000488937:exon_116044926_116045456:PRPF4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 116136198 C/T 1 1 16 17 0.490402696147452 8.15355686164077 -7.66315416549332 T:C C T 10 0.509597303852548 0.000112972453614421 ENSG00000119431:ENST00000238379:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000374180:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000485934:exon_116136168_116136809:HDHD3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 117103973 A/G 1 13 3 16 6.37523504991688 1.52879191155764 4.84644313835923 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0216395245326523 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117103813_117104005:AKNA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 117110046 C/T 1 8 12 20 3.92322156917962 6.11516764623058 -2.19194607705096 T:C C T 10 0.509597303852548 0.375790350036073 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117110004_117110180:AKNA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 117122202 C/T 1 3 5 8 1.47120808844236 2.54798651926274 -1.07677843082038 T:C C T 10 0.509597303852548 0.499988077920146 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117122176_117122342:AKNA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 117124731 G/A 1 8 6 14 3.92322156917962 3.05758382311529 0.865637746064328 A:G G A 10 0.509597303852548 0.79106698341654 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117124686_117124813:AKNA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 123220829 A/G 1 6 2 8 2.94241617688471 1.0191946077051 1.92322156917962 A:G A G 10 0.509597303852548 0.289787629707581 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 123291036 C/G 1 9 6 15 4.41362426532707 3.05758382311529 1.35604044221178 C:G C G 10 0.509597303852548 0.608250593906015 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000482047:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000472883:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000481266:exon_123291022_123291051:CDK5RAP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 123301346 T/G 1 8 14 22 3.92322156917962 7.13436225393567 -3.21114068475606 T:G T G 10 0.509597303852548 0.203042661312835 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123301315_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000472883:exon_123301319_123301398:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000481266:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 123538346 G/T 1 7 2 9 3.43281887303216 1.0191946077051 2.41362426532707 T:G G T 10 0.509597303852548 0.180412718745071 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 123850770 G/A 0 0 9 9 0 4.58637573467293 -4.58637573467293 A G A 10 0.509597303852548 0.00164049776378534 ENSG00000119397:ENST00000373865:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000414114:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123850574_123850821:CEP110 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 123929770 C/T 1 13 18 31 6.37523504991688 9.17275146934586 -2.79751641942899 T:C C T 10 0.509597303852548 0.370554158920584 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373845:exon_123929767_123929955:CEP110 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 124914613 C/T 1 15 30 45 7.35604044221178 15.2879191155764 -7.93187867336466 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0242530205680764 ENSG00000119421:ENST00000373768:exon_124914524_124914687:NDUFA8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 125652757 G/A 1 9 16 25 4.41362426532707 8.15355686164077 -3.7399325963137 A:G G A 10 0.509597303852548 0.162351937808012 ENSG00000056586:ENST00000373670:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000498479:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000357244:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000442575:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373663:exon_125652591_125652829:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000423239:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373665:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000335387:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000478216:exon_125652449_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000471874:exon_125652450_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000437215:exon_125652517_125652824:RC3H2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 126144759 G/A 1 5 3 8 2.45201348073726 1.52879191155764 0.923221569179616 A:G G A 10 0.509597303852548 0.726965250907 ENSG00000119522:ENST00000373624:exon_126141933_126144904:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000473039:exon_126141933_126144904:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394219:exon_126141933_126144904:DENND1A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 130242166 A/G 1 7 8 15 3.43281887303216 4.07677843082038 -0.64395955778822 A:G A G 10 0.509597303852548 0.800365558868668 ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000498513:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000483302:exon_130242118_130242257:LRSAM1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 130536717 G/A 1 9 3 12 4.41362426532707 1.52879191155764 2.88483235376942 A:G G A 10 0.509597303852548 0.146886429190433 ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130536534_130536746:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130536269_130536746:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000468969:exon_130536631_130536746:SH2D3C HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 130698029 G/C 1 40 39 79 19.6161078458981 19.8742948502494 -0.258187004351289 T:C:G G C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 130698043 A/G 1 41 32 73 20.1065105420455 16.3071137232815 3.799396818764 A:G A G 10 0.509597303852548 0.413272857267064 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 130943027 C/T 1 7 5 12 3.43281887303216 2.54798651926274 0.884832353769424 T:C C T 10 0.509597303852548 0.774912283175237 ENSG00000148337:ENST00000372954:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000393608:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325721:exon_130943000_130943078:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000357558:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372948:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372941:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000277465:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372938:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000415526:exon_130943000_130943078:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000476727:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325669:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000476239:exon_130943000_130943077:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000488559:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000467178:exon_130943000_130943078:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000494497:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000491954:exon_130943000_130943078:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000469029:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000498156:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000324544:exon_130943000_130943093:CIZ1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 131022826 C/T 1 3 8 11 1.47120808844236 4.07677843082038 -2.60557034237803 T:C C T 10 0.509597303852548 0.139008716253398 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131022744_131023081:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131022744_131023081:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000486411:exon_131022744_131023270:GOLGA2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 131360750 C/T 1 2 8 10 0.980805392294904 4.07677843082038 -3.09597303852548 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0608033640885815 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000475367:exon_131360679_131360783:SPTAN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 131379967 C/T 1 12 11 23 5.88483235376942 5.60557034237803 0.279262011391396 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131379919_131380039:SPTAN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 131379998 C/A 1 21 10 31 10.2984566190965 5.09597303852548 5.20248358057101 A:C C A 10 0.509597303852548 0.072354079459393 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131379919_131380039:SPTAN1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 131397479 G/A 1 17 19 36 8.33684583450668 9.68234877319841 -1.34550293869173 A:G G A 10 0.509597303852548 0.739665034365435 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000483181:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131397458_131397538:WDR34 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 131398636 C/T 1 7 11 18 3.43281887303216 5.60557034237803 -2.17275146934586 T:C C T 10 0.509597303852548 0.351502463188979 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000473486:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131398197_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131398363_131398717:WDR34 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 131403096 A/G 1 4 5 9 1.96161078458981 2.54798651926274 -0.586375734672932 A:G A G 10 0.509597303852548 0.74955201040747 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131402970_131403218:WDR34 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 131454120 C/T 1 9 2 11 4.41362426532707 1.0191946077051 3.39442965762197 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0659641183816961 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 131455903 C/T 1 6 5 11 2.94241617688471 2.54798651926274 0.394429657621972 T:C C T 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 131584631 C/T 1 54 40 94 26.4817455919624 20.3838921541019 6.09785343786049 T:C C T 10 0.509597303852548 0.217145055490708 ENSG00000167136:ENST00000372642:exon_131584607_131584956:ENDOG;ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131581930_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131584346_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131584370_131585112:C9orf114 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 131909736 C/T 1 6 16 22 2.94241617688471 8.15355686164077 -5.21114068475606 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0319564464561853 ENSG00000119383:ENST00000358994:exon_131909666_131911223:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000393370:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000524946:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000337738:exon_131909666_131911223:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000348141:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000405725:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000347048:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000357197:exon_131909666_131911224:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000355007:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000423100:exon_131909666_131910277:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000414510:exon_131909666_131910566:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000419582:exon_131909666_131910236:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000432651:exon_131909666_131910285:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000435132:exon_131909666_131910051:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000434095:exon_131909666_131910274:PPP2R4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 132397658 G/A 1 33 35 68 16.1832889728659 17.8359056348392 -1.65261666197326 A:G G A 10 0.509597303852548 0.717153935889898 ENSG00000148335:ENST00000372486:exon_132397487_132398209:METTL11A;ENSG00000148335:ENST00000372483:exon_132397487_132398209:METTL11A;ENSG00000148335:ENST00000482347:exon_132397487_132398209:METTL11A;ENSG00000148335:ENST00000372481:exon_132397487_132397752:METTL11A;ENSG00000148335:ENST00000372480:exon_132397487_132397771:METTL11A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 132400480 G/A 1 9 13 22 4.41362426532707 6.62476495008312 -2.21114068475606 A:G G A 10 0.509597303852548 0.397626927679795 ENSG00000148331:ENST00000277458:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000277459:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000450050:exon_132399173_132400736:ASB6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 132580901 C/G 1 26 22 48 12.7504700998338 11.2111406847561 1.5393294150777 C:G C G 10 0.509597303852548 0.668250675958453 ENSG00000136827:ENST00000437532:exon_132580799_132580926:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000427355:exon_132580799_132580926:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000351698:exon_132580799_132580926:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000474192:exon_132580632_132580926:TOR1A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 132585058 G/A 1 12 11 23 5.88483235376942 5.60557034237803 0.279262011391396 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000136827:ENST00000437532:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000427355:exon_132585004_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000351698:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000473604:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000473084:exon_132583655_132585125:TOR1A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 132590431 C/G 1 60 35 95 29.4241617688471 17.8359056348392 11.5882561340079 C:G C G 10 0.509597303852548 0.0181963118066793 ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132589565_132590531:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132589569_132590531:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132590247_132590531:C9orf78 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 132591509 A/G 1 64 28 92 31.3857725534369 14.2687245078713 17.1170480455656 A:G A G 10 0.509597303852548 0.000351018631551754 ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132591484_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132591484_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461762:exon_132590707_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000480023:exon_132590721_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132591507_132591560:C9orf78 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 132597021 C/T 1 21 12 33 10.2984566190965 6.11516764623058 4.18328897286592 T:C C T 10 0.509597303852548 0.165310018579743 ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132596991_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136878:ENST00000491053:exon_132596977_132597357:USP20 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 132637712 G/A 1 2 9 11 0.980805392294904 4.58637573467293 -3.60557034237803 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0353083305106556 ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000474895:exon_132637589_132637758:USP20 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 132662786 C/T 1 27 51 78 13.2408727959812 25.9894624964799 -12.7485897004987 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0044023867597577 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000443566:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000478129:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000462766:exon_132662705_132662812:FNBP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 132720770 A/G 1 29 32 61 14.2216781882761 16.3071137232815 -2.08543553500543 A:G A G 10 0.509597303852548 0.610766064803753 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132720770_132720832:FNBP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 134334588 A/G 1 6 6 12 2.94241617688471 3.05758382311529 -0.115167646230576 A:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134334551_134334743:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134334551_134334743:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134334551_134334743:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134334551_134334743:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134334551_134334743:BAT2L1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 135139901 T/C 1 25 15 40 12.2600674036863 7.64395955778822 4.61610784589808 T:C T C 10 0.509597303852548 0.156889555696853 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000477049:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135136827_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135136827_135140372:SETX HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 135144795 G/A 1 16 5 21 7.84644313835923 2.54798651926274 5.29845661909649 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0271764298858529 ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135144790_135144876:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135144790_135144876:SETX HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 135273607 C/G 1 5 6 11 2.45201348073726 3.05758382311529 -0.605570342378028 C:G C G 10 0.509597303852548 0.770507260060939 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135273528_135273713:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135273528_135273713:TTF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 135277341 C/A 1 46 40 86 22.5585240227828 20.3838921541019 2.17463186868088 A:C C A 10 0.509597303852548 0.667230979893314 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135276842_135278215:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135276842_135278215:TTF1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 135786904 A/G 1 6 4 10 2.94241617688471 2.03838921541019 0.90402696147452 A:G A G 10 0.509597303852548 0.75435926131823 ENSG00000165699:ENST00000298552:exon_135786840_135786955:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000440111:exon_135786840_135786955:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000493467:exon_135786840_135786955:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000424271:exon_135786387_135786955:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000403810:exon_135786596_135786955:TSC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 135933122 C/T 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 T:C C T 10 0.509597303852548 1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 136199466 G/A 1 28 10 38 13.7312754921287 5.09597303852548 8.63530245360318 A:G G A 10 0.509597303852548 0.00540091780287788 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136199384_136199596:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136199384_136199775:SURF6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 136199503 G/A 1 21 8 29 10.2984566190965 4.07677843082038 6.22167818827611 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0248632287503733 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136199384_136199596:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136199384_136199775:SURF6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 136227260 A/G 1 48 25 73 23.5393294150777 12.7399325963137 10.799396818764 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0134981562212564 ENSG00000148291:ENST00000371964:exon_136227141_136227310:SURF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 136228000 T/G 1 44 26 70 21.5777186304879 13.2495299001662 8.32818873032164 T:G T G 10 0.509597303852548 0.0552053800702707 ENSG00000148291:ENST00000371964:exon_136227932_136228045:SURF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 136338580 G/A 1 7 4 11 3.43281887303216 2.03838921541019 1.39442965762197 A:G G A 10 0.509597303852548 0.549658645750086 ENSG00000160326:ENST00000485978:exon_136338537_136339210:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000371899:exon_136338537_136338722:SLC2A6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 136633606 G/A 1 21 13 34 10.2984566190965 6.62476495008312 3.67369166901337 A:G G A 10 0.509597303852548 0.232402178431562 ENSG00000160293:ENST00000371850:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000371851:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000406606:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000343203:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000325440:exon_136633564_136633718:VAV2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 136643994 T/C 0 0 9 9 0 4.58637573467293 -4.58637573467293 C T C 10 0.509597303852548 0.00164049776378534 ENSG00000160293:ENST00000371850:exon_136643884_136644011:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000371851:exon_136643884_136644011:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000406606:exon_136643884_136644011:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000343203:exon_136643884_136644011:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000325440:exon_136643884_136644011:VAV2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 136662928 A/G 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 A:G A G 10 0.509597303852548 0.5085374516326 ENSG00000160293:ENST00000371850:exon_136662832_136662931:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000371851:exon_136662832_136662931:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000406606:exon_136662832_136662931:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000343203:exon_136662832_136662931:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000325440:exon_136662832_136662931:VAV2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 137005023 C/T 1 5 4 9 2.45201348073726 2.03838921541019 0.413624265327068 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000196363:ENST00000358625:exon_137004942_137005080:WDR5;ENSG00000196363:ENST00000425041:exon_137004914_137005080:WDR5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 138395969 A/G 1 88 87 175 43.1554372609758 44.3349654351717 -1.17952817419589 A:G A G 10 0.509597303852548 0.879994268132311 ENSG00000122140:ENST00000371785:exon_138395388_138396519:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000241600:exon_138395388_138396516:MRPS2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 139256468 C/G 1 15 18 33 7.35604044221178 9.17275146934586 -1.81671102713408 C:G C G 10 0.509597303852548 0.60280598239357 ENSG00000213221:ENST00000371739:exon_139253932_139256632:DNLZ;ENSG00000213221:ENST00000371738:exon_139256352_139256632:DNLZ;ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139256355_139256632:CARD9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 139256541 C/T 1 10 7 17 4.90402696147452 3.56718112696784 1.33684583450668 T:C C T 10 0.509597303852548 0.630150764673374 ENSG00000213221:ENST00000371739:exon_139253932_139256632:DNLZ;ENSG00000213221:ENST00000371738:exon_139256352_139256632:DNLZ;ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139256355_139256632:CARD9 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 139270975 C/T 1 13 4 17 6.37523504991688 2.03838921541019 4.33684583450668 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0497378911148666 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 139272058 A/G 1 20 19 39 9.80805392294904 9.68234877319841 0.12570514975063 A:C:G A G 10 0.509597303852548 1 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 139272502 T/C 1 7 9 16 3.43281887303216 4.58637573467293 -1.15355686164077 T:C T C 10 0.509597303852548 0.623338489505478 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 139273288 C/T 1 7 9 16 3.43281887303216 4.58637573467293 -1.15355686164077 T:C C T 10 0.509597303852548 0.623338489505478 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 139273402 C/T 1 8 13 21 3.92322156917962 6.62476495008312 -2.70154338090351 T:C C T 10 0.509597303852548 0.278772582952036 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 139275204 A/C 1 7 8 15 3.43281887303216 4.07677843082038 -0.64395955778822 A:C A C 10 0.509597303852548 0.800365558868668 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139275192_139275302:SNAPC4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 139275294 G/C 1 7 4 11 3.43281887303216 2.03838921541019 1.39442965762197 C:G G C 10 0.509597303852548 0.549658645750086 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139275192_139275302:SNAPC4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 139289825 A/G 1 6 3 9 2.94241617688471 1.52879191155764 1.41362426532707 A:G A G 10 0.509597303852548 0.5085374516326 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139289750_139289875:SNAPC4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 139298580 C/T 1 16 11 27 7.84644313835923 5.60557034237803 2.2408727959812 T:C C T 10 0.509597303852548 0.444354653770125 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 139298593 A/G 1 22 8 30 10.7888593152439 4.07677843082038 6.71208088442356 A:G A G 10 0.509597303852548 0.0167006595176935 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 139299637 C/T 1 13 12 25 6.37523504991688 6.11516764623058 0.2600674036863 T:C C T 10 0.509597303852548 1 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139299543_139299800:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139299570_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139299570_139299654:SDCCAG3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 139306467 C/T 1 14 15 29 6.86563774606433 7.64395955778822 -0.778321811723892 T:C C T 10 0.509597303852548 0.8535202569064 ENSG00000165688:ENST00000371720:exon_139306449_139306651:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000446975:exon_139306449_139306651:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000399219:exon_139306449_139306651:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000371717:exon_139306449_139306651:PMPCA HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 139324740 C/T 1 12 6 18 5.88483235376942 3.05758382311529 2.82724853065414 T:C C T 10 0.509597303852548 0.239448825994552 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139324729_139324865:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139324729_139324865:INPP5E HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 139371234 G/A 1 2 7 9 0.980805392294904 3.56718112696784 -2.58637573467293 A:G G A 10 0.509597303852548 0.103145007117103 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 139571992 C/T 0 9 0 9 4.41362426532707 0 4.41362426532707 C C 10 0.509597303852548 0.00395812771304115 ENSG00000169692:ENST00000371694:exon_139571875_139572008:AGPAT2;ENSG00000169692:ENST00000371696:exon_139571875_139572008:AGPAT2;ENSG00000169692:ENST00000470861:exon_139571479_139572008:AGPAT2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 139621168 G/A 1 14 21 35 6.86563774606433 10.7015433809035 -3.83590563483918 A:G G A 10 0.509597303852548 0.236898592095749 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 139717981 G/A 1 11 7 18 5.39442965762197 3.56718112696784 1.82724853065414 A:G G A 10 0.509597303852548 0.482156564682581 ENSG00000196642:ENST00000471502:exon_139717977_139718111:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371673:exon_139717977_139718111:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371675:exon_139717977_139718111:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139717977_139718111:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000432842:exon_139717977_139718111:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000455983:exon_139717977_139718111:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371671:exon_139717977_139718111:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139717977_139718111:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139717977_139718111:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000357466:exon_139717977_139718111:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139717977_139718111:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000436380:exon_139717978_139718111:C9orf86 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 139731969 C/T 1 15 12 27 7.35604044221178 6.11516764623058 1.2408727959812 T:C:G C T 10 0.509597303852548 0.702536459516712 ENSG00000196642:ENST00000371673:exon_139731798_139732068:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371675:exon_139731798_139732068:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000357466:exon_139731798_139732067:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000461992:exon_139731798_139732042:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000435930:exon_139729623_139732114:C9orf86 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 139732331 G/C 1 20 19 39 9.80805392294904 9.68234877319841 0.12570514975063 C:G G C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139732314_139732467:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139732314_139732432:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139732314_139732467:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139732314_139732467:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000435930:exon_139732314_139732467:C9orf86 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 139744524 C/T 1 117 115 232 57.3771154492519 58.603689943043 -1.22657449379113 T:C C T 10 0.509597303852548 0.895612767789578 ENSG00000054148:ENST00000371661:exon_139744465_139744589:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000492540:exon_139744465_139745012:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000247665:exon_139744465_139744589:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000462205:exon_139744465_139744589:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000497413:exon_139744465_139744589:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000463215:exon_139744231_139744589:PHPT1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 139820421 G/A 1 22 22 44 10.7888593152439 11.2111406847561 -0.42228136951211 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000127191:ENST00000247668:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000359662:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000432785:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000371645:exon_139820135_139821059:TRAF2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 139837212 C/T 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 T:C C T 10 0.509597303852548 0.541646560898822 ENSG00000159069:ENST00000459905:exon_139836999_139837395:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000480818:exon_139836999_139837395:FBXW5 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 139975195 C/T 1 4 6 10 1.96161078458981 3.05758382311529 -1.09597303852548 T:C C T 10 0.509597303852548 0.541646560898822 ENSG00000197355:ENST00000409858:exon_139975141_139975326:UAP1L1;ENSG00000197355:ENST00000360271:exon_139975141_139975326:UAP1L1;ENSG00000197355:ENST00000474787:exon_139973708_139975326:UAP1L1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 140006202 G/A 1 153 301 454 75.0316125105602 153.388788459617 -78.3571759490568 A:G G A 10 0.509597303852548 1.43072651941757e-13 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000470766:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006142_140006206:DPP7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 140006491 C/T 1 23 17 40 11.2792620113914 8.66315416549332 2.61610784589808 T:C C T 10 0.509597303852548 0.433000386361701 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 140008934 A/G 1 10 8 18 4.90402696147452 4.07677843082038 0.827248530654137 A:G A G 10 0.509597303852548 0.815143514661865 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140008915_140009165:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140008915_140008944:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000472306:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000485456:exon_140008915_140009170:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000478597:exon_140008915_140009178:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000497375:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473703:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000491807:exon_140008695_140009028:DPP7 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 140077639 G/A 1 5 5 10 2.45201348073726 2.54798651926274 -0.0959730385254796 A:G G A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000176248:ENST00000323927:exon_140077577_140077694:ANAPC2;ENSG00000176248:ENST00000459740:exon_140077577_140077694:ANAPC2;ENSG00000176248:ENST00000455910:exon_140077577_140077694:ANAPC2;ENSG00000176248:ENST00000471131:exon_140077577_140078066:ANAPC2;ENSG00000176248:ENST00000495611:exon_140077577_140077694:ANAPC2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 140079522 G/A 1 7 9 16 3.43281887303216 4.58637573467293 -1.15355686164077 A:G G A 10 0.509597303852548 0.623338489505478 ENSG00000176248:ENST00000323927:exon_140079365_140079539:ANAPC2;ENSG00000176248:ENST00000455910:exon_140079365_140079539:ANAPC2;ENSG00000176248:ENST00000495611:exon_140079365_140079539:ANAPC2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 140108857 T/C 1 4 4 8 1.96161078458981 2.03838921541019 -0.0767784308203838 T:C T C 10 0.509597303852548 1 ENSG00000188566:ENST00000458322:exon_140108656_140108865:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000427047:exon_140108656_140108865:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000371521:exon_140108656_140108865:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000344894:exon_140108656_140108865:NDOR1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 140109292 G/A 1 3 7 10 1.47120808844236 3.56718112696784 -2.09597303852548 A:G G A 10 0.509597303852548 0.218348598150516 ENSG00000188566:ENST00000458322:exon_140109250_140109470:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000427047:exon_140109250_140109470:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000371521:exon_140109250_140109470:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000344894:exon_140109250_140109470:NDOR1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 140115257 C/A 1 17 11 28 8.33684583450668 5.60557034237803 2.73127549212866 A:C C A 10 0.509597303852548 0.347429568613864 ENSG00000212864:ENST00000392827:exon_140114707_140115760:RNF208;ENSG00000212864:ENST00000391553:exon_140114707_140115775:RNF208 HGDP00232_parsed_pileup.txt . 9 140881314 A/C 1 7 1 8 3.43281887303216 0.509597303852548 2.92322156917962 A:C A C 10 0.509597303852548 0.0707155477569663 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 295069 A/G 1 11 8 19 5.39442965762197 4.07677843082038 1.31765122680159 A:G A G 10 0.509597303852548 0.648772677857544 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 295097 C/T 1 13 7 20 6.37523504991688 3.56718112696784 2.80805392294904 T:C C T 10 0.509597303852548 0.264944792438562 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 295132 T/C 1 9 3 12 4.41362426532707 1.52879191155764 2.88483235376942 T:C T C 10 0.509597303852548 0.146886429190433 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 295231 A/G 1 12 9 21 5.88483235376942 4.58637573467293 1.29845661909649 A:G A G 10 0.509597303852548 0.664861077872976 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 1471138 G/T 1 24 18 42 11.7696647075388 9.17275146934586 2.59691323819298 T:G G T 10 0.509597303852548 0.444344194227123 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 1508324 G/A 1 370 272 642 181.448997574557 138.610466647893 42.8385309266642 A:G G A 10 0.509597303852548 0.000780535911026188 ENSG00000169100:ENST00000381401:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000475167:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000484026:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000447786:exon_1508256_1508620:SLC25A6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 1508583 T/C 1 220 172 392 107.888593152439 87.6507362626382 20.2378568898012 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0432472429889917 ENSG00000169100:ENST00000381401:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000475167:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000484026:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000447786:exon_1508256_1508620:SLC25A6 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 1537881 C/T 1 10 8 18 4.90402696147452 4.07677843082038 0.827248530654137 T:C C T 10 0.509597303852548 0.815143514661865 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 1546792 G/A 1 20 15 35 9.80805392294904 7.64395955778822 2.16409436516082 A:G G A 10 0.509597303852548 0.502338825261407 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 1546876 A/G 1 24 8 32 11.7696647075388 4.07677843082038 7.69288627671846 A:G A G 10 0.509597303852548 0.007326525779398 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 1712364 G/A 1 2 6 8 0.980805392294904 3.05758382311529 -2.07677843082038 A:G G A 10 0.509597303852548 0.171857042968518 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000381261:exon_1712337_1713117:AKAP17A HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 1713021 C/T 1 3 7 10 1.47120808844236 3.56718112696784 -2.09597303852548 T:C C T 10 0.509597303852548 0.218348598150516 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000381261:exon_1712337_1713117:AKAP17A HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 1720422 C/T 1 42 42 84 20.596913238193 21.403086761807 -0.806173523614028 A:T:C C T 10 0.509597303852548 0.91325560510669 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1719552_1721407:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1719552_1721395:AKAP17A HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 2632482 C/T 1 22 49 71 10.7888593152439 24.9702678887749 -14.1814085735309 T:C C T 10 0.509597303852548 0.000798887264560015 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381184:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000398818:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000449611:exon_2632463_2632495:CD99 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 3592725 G/A 1 2 6 8 0.980805392294904 3.05758382311529 -2.07677843082038 A:G G A 10 0.509597303852548 0.171857042968518 ENSG00000183943:ENST00000262848:exon_3592639_3592807:PRKX HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 13397397 C/T 0 192 0 192 94.1573176603108 0 94.1573176603108 C C 10 0.509597303852548 6.90527700589455e-57 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 15415583 C/T 1 33 3 36 16.1832889728659 1.52879191155764 14.6544970613083 T:C C T 10 0.509597303852548 2.64684249594893e-07 ENSG00000087842:ENST00000380420:exon_15415571_15415653:PIR;ENSG00000087842:ENST00000380421:exon_15415571_15415653:PIR;ENSG00000087842:ENST00000492432:exon_15415571_15415653:PIR;ENSG00000087842:ENST00000484433:exon_15415571_15415653:PIR HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 16836767 C/T 1 12 1 13 5.88483235376942 0.509597303852548 5.37523504991688 T:C C T 10 0.509597303852548 0.00348827153835016 ENSG00000086712:ENST00000380122:exon_16836697_16837000:TXLNG HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 16859628 G/A 1 5 8 13 2.45201348073726 4.07677843082038 -1.62476495008312 A:G G A 10 0.509597303852548 0.415960200620574 ENSG00000086712:ENST00000380122:exon_16859551_16862642:TXLNG;ENSG00000086712:ENST00000398155:exon_16859551_16860296:TXLNG;ENSG00000086712:ENST00000485153:exon_16859551_16862642:TXLNG HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 19555842 C/T 1 271 19 290 132.89913065596 9.68234877319841 123.216781882761 T:C C T 10 0.509597303852548 2.04889520925588e-56 ENSG00000147010:ENST00000379702:exon_19555835_19555898:SH3KBP1;ENSG00000147010:ENST00000397821:exon_19555835_19555898:SH3KBP1;ENSG00000147010:ENST00000379716:exon_19555835_19555898:SH3KBP1;ENSG00000147010:ENST00000397804:exon_19555835_19555898:SH3KBP1;ENSG00000147010:ENST00000379698:exon_19555835_19555898:SH3KBP1;ENSG00000147010:ENST00000379726:exon_19555835_19555898:SH3KBP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 24228590 T/A 1 7 6 13 3.43281887303216 3.05758382311529 0.375235049916876 A:T T A 10 0.509597303852548 1 ENSG00000005889:ENST00000379177:exon_24228310_24234206:ZFX;ENSG00000005889:ENST00000304543:exon_24228310_24229817:ZFX;ENSG00000005889:ENST00000379188:exon_24228310_24232628:ZFX;ENSG00000005889:ENST00000338565:exon_24228310_24230103:ZFX HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 37701048 G/A 0 0 12 12 0 6.11516764623058 -6.11516764623058 A G A 10 0.509597303852548 0.000193479158702583 ENSG00000165169:ENST00000378581:exon_37701035_37701158:DYNLT3;ENSG00000165169:ENST00000378578:exon_37701035_37701158:DYNLT3;ENSG00000165169:ENST00000432389:exon_37701035_37701158:DYNLT3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 39911657 C/A 0 11 0 11 5.39442965762197 0 5.39442965762197 C C 10 0.509597303852548 0.000996395147774831 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 47444985 T/C 1 85 24 109 41.6842291725334 12.2303352924612 29.4538938800723 T:C T C 10 0.509597303852548 7.51208963786543e-09 ENSG00000102265:ENST00000218388:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377018:exon_47444335_47445482:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000456754:exon_47444604_47445422:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377017:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377013:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000445623:exon_47444741_47445066:TIMP1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 53641647 T/C 1 4 12 16 1.96161078458981 6.11516764623058 -4.15355686164077 T:C T C 10 0.509597303852548 0.0453868150142898 ENSG00000086758:ENST00000342160:exon_53641495_53641706:HUWE1;ENSG00000086758:ENST00000262854:exon_53641495_53641706:HUWE1;ENSG00000086758:ENST00000276009:exon_53641495_53641706:HUWE1;ENSG00000086758:ENST00000375220:exon_53641495_53641706:HUWE1;ENSG00000086758:ENST00000218328:exon_53641495_53641706:HUWE1;ENSG00000086758:ENST00000396323:exon_53641495_53641706:HUWE1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 54836239 A/G 0 0 10 10 0 5.09597303852548 -5.09597303852548 G A G 10 0.509597303852548 0.000804504526384197 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375062:exon_54836155_54836241:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54836155_54836250:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000441374:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000454156:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54836155_54836251:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375060:exon_54836155_54836241:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000485483:exon_54836155_54836565:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54836216_54836251:MAGED2 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 55479299 G/A 1 31 4 35 15.202483580571 2.03838921541019 13.1640943651608 A:G G A 10 0.509597303852548 3.92602371159209e-06 ENSG00000187601:ENST00000342972:exon_55478538_55479998:MAGEH1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 70282764 G/A 0 8 0 8 3.92322156917962 0 3.92322156917962 G G 10 0.509597303852548 0.00789316895639457 ENSG00000147164:ENST00000374281:exon_70282704_70282799:SNX12;ENSG00000147164:ENST00000483560:exon_70282704_70282781:SNX12;ENSG00000147164:ENST00000374274:exon_70282704_70282799:SNX12;ENSG00000147164:ENST00000490561:exon_70282694_70282799:SNX12;ENSG00000147164:ENST00000465030:exon_70282704_70282799:SNX12;ENSG00000147164:ENST00000276105:exon_70282704_70282799:SNX12 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 71493691 C/T 1 950 2411 3361 465.882561340079 1228.63909958849 -762.756538248414 A:T:C C T 10 0.509597303852548 3.94092912371239e-157 ENSG00000198034:ENST00000316084:exon_71493651_71493822:RPS4X;ENSG00000198034:ENST00000486733:exon_71493651_71495000:RPS4X HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 71549512 G/C 1 1 16 17 0.490402696147452 8.15355686164077 -7.66315416549332 C:G G C 10 0.509597303852548 0.000112972453614421 ENSG00000147099:ENST00000373573:exon_71549366_71549926:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373583:exon_71549366_71549559:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373589:exon_71549366_71549926:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000429103:exon_71549367_71549926:HDAC8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 71791912 C/T 1 11 3 14 5.39442965762197 1.52879191155764 3.86563774606433 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0580035546592849 ENSG00000147099:ENST00000373573:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373583:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373589:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000429103:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373568:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000436675:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000415409:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000440442:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000412342:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373571:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000439122:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373560:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373559:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373561:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000478743:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000421523:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373556:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373554:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000340176:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000444609:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000486704:exon_71791796_71791959:HDAC8 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 73043817 T/C 1 70 360 430 34.3281887303216 183.455029386917 -149.126840656596 T:C T C 10 0.509597303852548 1.22802879704264e-50 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 73066439 T/C 1 12 70 82 5.88483235376942 35.6718112696784 -29.7869789159089 T:C T C 10 0.509597303852548 8.26186519313018e-12 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 73068573 T/C 1 70 13 83 34.3281887303216 6.62476495008312 27.7034237802385 T:C T C 10 0.509597303852548 3.13255244158005e-10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 78216024 A/C 1 48 12 60 23.5393294150777 6.11516764623058 17.4241617688471 A:C A C 10 0.509597303852548 6.2669777873937e-06 ENSG00000078589:ENST00000171757:exon_78216005_78217451:P2RY10;ENSG00000078589:ENST00000475374:exon_78216005_78216577:P2RY10;ENSG00000078589:ENST00000461541:exon_78216005_78216368:P2RY10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 78426988 T/C 0 0 10 10 0 5.09597303852548 -5.09597303852548 C T C 10 0.509597303852548 0.000804504526384197 ENSG00000147138:ENST00000276077:exon_78426469_78427726:GPR174 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 100880857 G/A 1 3 17 20 1.47120808844236 8.66315416549332 -7.19194607705096 A:G G A 10 0.509597303852548 0.00124848268995766 ENSG00000102401:ENST00000341189:exon_100879824_100882833:ARMCX3;ENSG00000102401:ENST00000471229:exon_100879824_100881474:ARMCX3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 102842041 T/C 1 125 18 143 61.3003370184315 9.17275146934586 52.1275855490856 T:C T C 10 0.509597303852548 4.41726868026711e-20 ENSG00000133142:ENST00000372629:exon_102841577_102842446:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000414064:exon_102841578_102842653:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000468024:exon_102841577_102842446:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000472484:exon_102841577_102842657:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000415568:exon_102841582_102842430:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000472745:exon_102841577_102842622:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000494801:exon_102841582_102842454:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000452632:exon_102841878_102842251:TCEAL4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 106885667 C/T 0 0 18 18 0 9.17275146934586 -9.17275146934586 T C T 10 0.509597303852548 2.69123291298471e-06 ENSG00000147224:ENST00000372428:exon_106885596_106885720:PRPS1;ENSG00000147224:ENST00000372435:exon_106885596_106885720:PRPS1;ENSG00000147224:ENST00000372418:exon_106885596_106885720:PRPS1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 117527020 C/T 1 10 1 11 4.90402696147452 0.509597303852548 4.39442965762197 T:C C T 10 0.509597303852548 0.0118772360206333 ENSG00000131725:ENST00000435384:exon_117526595_117527234:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000254029:exon_117526595_117527234:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000371822:exon_117526595_117527234:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000371825:exon_117526595_117527234:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000534809:exon_117526595_117527234:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000493448:exon_117526595_117527178:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000446173:exon_117526592_117527238:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000371848:exon_117526711_117527234:WDR44 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 119760629 A/T 1 1 14 15 0.490402696147452 7.13436225393567 -6.64395955778822 A:T A T 10 0.509597303852548 0.000419086690708236 ENSG00000171155:ENST00000304661:exon_119759648_119761026:C1GALT1C1;ENSG00000171155:ENST00000371313:exon_119759786_119761026:C1GALT1C1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 129058882 T/C 0 0 29 29 0 14.7783218117239 -14.7783218117239 C T C 10 0.509597303852548 1.06177532050196e-09 ENSG00000156697:ENST00000425117:exon_129058771_129059171:UTP14A;ENSG00000156697:ENST00000371051:exon_129058771_129059171:UTP14A;ENSG00000156697:ENST00000394422:exon_129058771_129059171:UTP14A;ENSG00000156697:ENST00000427972:exon_129058771_129058886:UTP14A;ENSG00000156697:ENST00000371042:exon_129058771_129059171:UTP14A HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 129063293 C/A 1 1 14 15 0.490402696147452 7.13436225393567 -6.64395955778822 A:C C A 10 0.509597303852548 0.000419086690708236 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 129306030 G/T 1 2 14 16 0.980805392294904 7.13436225393567 -6.15355686164077 T:G G T 10 0.509597303852548 0.00198643151343658 ENSG00000134594:ENST00000257017:exon_129305623_129306294:RAB33A HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 153175295 C/A 0 0 79 79 0 40.2581870043513 -40.2581870043513 A C A 10 0.509597303852548 3.57828630355649e-25 ENSG00000089820:ENST00000393721:exon_153175195_153175378:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000370028:exon_153175195_153175378:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000420383:exon_153175195_153175378:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000350060:exon_153175195_153175378:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000494397:exon_153175195_153175378:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000370016:exon_153175195_153175378:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000470209:exon_153175195_153175378:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000494302:exon_153175195_153175378:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000404127:exon_153175195_153175378:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000454164:exon_153175195_153175378:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000467421:exon_153175195_153175378:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000442172:exon_153175195_153175378:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000461739:exon_153175273_153175378:ARHGAP4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 153176254 A/G 1 4 58 62 1.96161078458981 29.5566436234478 -27.595032838858 A:G A G 10 0.509597303852548 7.03497884439913e-14 ENSG00000089820:ENST00000393721:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000370028:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000420383:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000350060:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000494397:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000370016:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000470209:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000494302:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000404127:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000454164:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000467421:exon_153176154_153176325:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000442172:exon_153176154_153176288:ARHGAP4 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 153195393 G/A 1 9 60 69 4.41362426532707 30.5758382311529 -26.1622139658258 A:G G A 10 0.509597303852548 4.72180930960155e-11 ENSG00000102030:ENST00000464845:exon_153194695_153195676:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000482485:exon_153195280_153195676:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000370015:exon_153195367_153195760:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000393712:exon_153195374_153195756:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000370009:exon_153195377_153195676:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000466877:exon_153195379_153195676:NAA10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 153196345 G/A 1 3 22 25 1.47120808844236 11.2111406847561 -9.7399325963137 A:G G A 10 0.509597303852548 6.83392458719241e-05 ENSG00000102030:ENST00000482485:exon_153196216_153196893:NAA10 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 153215839 G/A 1 14 5 19 6.86563774606433 2.54798651926274 4.31765122680159 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0644836423988429 ENSG00000172534:ENST00000310441:exon_153215694_153215994:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000444191:exon_153215694_153215994:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000369984:exon_153215694_153215994:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000354233:exon_153215694_153215994:HCFC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 153219665 C/T 0 0 9 9 0 4.58637573467293 -4.58637573467293 T C T 10 0.509597303852548 0.00164049776378534 ENSG00000172534:ENST00000310441:exon_153219517_153220993:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000369984:exon_153219517_153220993:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000354233:exon_153219517_153220993:HCFC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 153222835 G/C 0 0 9 9 0 4.58637573467293 -4.58637573467293 C G C 10 0.509597303852548 0.00164049776378534 ENSG00000172534:ENST00000310441:exon_153222765_153222984:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000369984:exon_153222765_153222984:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000354233:exon_153222765_153222984:HCFC1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 153248248 G/A 0 0 12 12 0 6.11516764623058 -6.11516764623058 A G A 10 0.509597303852548 0.000193479158702583 ENSG00000177854:ENST00000369982:exon_153247301_153248646:TMEM187 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 153278829 G/A 0 24 0 24 11.7696647075388 0 11.7696647075388 G G 10 0.509597303852548 1.31504135948026e-07 ENSG00000184216:ENST00000369980:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369974:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369973:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000444254:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000443220:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000467236:exon_153278787_153278884:IRAK1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 153284192 A/G 0 8 0 8 3.92322156917962 0 3.92322156917962 A A 10 0.509597303852548 0.00789316895639457 ENSG00000184216:ENST00000369980:exon_153284050_153284238:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369974:exon_153284050_153284238:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000393682:exon_153284050_153284238:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369973:exon_153284050_153284238:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000393687:exon_153284050_153284238:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000429936:exon_153284050_153284238:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000463031:exon_153284050_153284396:IRAK1 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 153577719 G/A 0 17 0 17 8.33684583450668 0 8.33684583450668 G G 10 0.509597303852548 1.60282985018015e-05 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 153579448 A/G 1 5 18 23 2.45201348073726 9.17275146934586 -6.7207379886086 A:G A G 10 0.509597303852548 0.00581548871731848 ENSG00000196924:ENST00000490936:exon_153578399_153580064:FLNA HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 153706264 C/G 1 6 63 69 2.94241617688471 32.1046301427105 -29.1622139658258 C:G C G 10 0.509597303852548 1.36981564458454e-13 ENSG00000196976:ENST00000407062:exon_153706028_153706750:LAGE3;ENSG00000196976:ENST00000357360:exon_153706108_153706397:LAGE3 HGDP00232_parsed_pileup.txt . X 153760654 G/A 1 5 15 20 2.45201348073726 7.64395955778822 -5.19194607705096 A:G G A 10 0.509597303852548 0.0242764341264256 ENSG00000160211:ENST00000393562:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000291567:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000442162:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000434882:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000393564:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000369620:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000490651:exon_153760601_153760677:G6PD