INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 1147422 C/T 1 16 26 42 6.82768831967664 14.9050064805255 -8.07731816084882 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0181578482539854 ENSG00000186827:ENST00000379236:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000497869:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000379234:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000453580:exon_1147399_1147518:TNFRSF4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 1158631 A/G 1 62 71 133 26.457292238747 40.7021330814349 -14.2448408426879 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0139575370911977 ENSG00000078808:ENST00000360001:exon_1158624_1158737:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000465727:exon_1158624_1158737:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000263741:exon_1158624_1158737:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000403997:exon_1158624_1158737:SDF4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 1247494 T/C 1 83 66 149 35.4186331583226 37.8357856813339 -2.4171525230113 A:T:C T C 10 0.57326948002021 0.74055539119381 ENSG00000127054:ENST00000470030:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000497304:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000323275:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000411962:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000462432:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000478641:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000421495:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000419704:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532772:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000485710:exon_1247460_1247527:CPSF3L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 1249187 G/A 1 53 50 103 22.6167175589289 28.6634740010105 -6.04675644208163 A:G G A 10 0.57326948002021 0.233361414212573 ENSG00000127054:ENST00000470030:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000323275:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000411962:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000462432:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000478641:exon_1249112_1250550:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000421495:exon_1249112_1249485:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000419704:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532772:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000485710:exon_1249112_1249205:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531377:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527383:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531292:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000467408:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000434694:exon_1249125_1249301:CPSF3L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 1342612 G/C 1 142 164 306 60.5957338371302 94.0161947233144 -33.4204608861843 C:G G C 10 0.57326948002021 0.000130605092486245 ENSG00000242485:ENST00000344843:exon_1342511_1342693:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000487659:exon_1342511_1342648:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000482352:exon_1342511_1342670:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000477686:exon_1342511_1342615:MRPL20 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 1403814 C/T 1 11 21 32 4.69403571977769 12.0386590804244 -7.34462336064672 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0114063207896947 ENSG00000215915:ENST00000378785:exon_1403764_1405538:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000435474:exon_1403764_1405538:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000484537:exon_1403764_1404043:ATAD3C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 1404001 G/T 1 9 12 21 3.84057467981811 6.87923376024252 -3.03865908042441 T:G G T 10 0.57326948002021 0.192086447359513 ENSG00000215915:ENST00000378785:exon_1403764_1405538:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000435474:exon_1403764_1405538:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000484537:exon_1403764_1404043:ATAD3C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 1421531 C/A 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 A:C C A 10 0.57326948002021 0.741310101183539 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1421162_1421615:ATAD3B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 1425700 T/C 1 9 16 25 3.84057467981811 9.17231168032336 -5.33173700050525 T:C T C 10 0.57326948002021 0.041544107781009 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1425634_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1424584_1426051:ATAD3B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 1430985 C/T 1 35 31 66 14.9355681992926 17.7713538806265 -2.83578568133387 T:C C T 10 0.57326948002021 0.534232384294383 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1430865_1433228:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1430865_1431581:ATAD3B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 1564072 G/A 1 14 29 43 5.97422727971706 16.6248149205861 -10.650587640869 A:G G A 10 0.57326948002021 0.00168814129960739 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1563653_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378708:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000506488:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514234:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000473511:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000464570:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000483015:exon_1563869_1564102:MIB2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 1684472 C/T 1 36 31 67 15.3622987192724 17.7713538806265 -2.40905516135408 T:C C T 10 0.57326948002021 0.621602355681206 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1683910_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000498806:exon_1684414_1684499:NADK HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 2125172 G/A 1 40 45 85 17.0692207991916 25.7971266009095 -8.72790580171785 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0621519917958855 ENSG00000162585:ENST00000469733:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000428120:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000414253:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378558:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000400919:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000400918:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000359030:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378543:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378546:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000401813:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000487186:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378545:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000476803:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000440825:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000420515:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000449008:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000497675:exon_2124864_2125349:C1orf86 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 2452569 T/C 1 4 6 10 1.70692207991916 3.43961688012126 -1.7326948002021 T:C T C 10 0.57326948002021 0.342315301618549 ENSG00000157881:ENST00000378466:exon_2452540_2452754:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000425477:exon_2452540_2452754:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000486396:exon_2452540_2452754:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000502770:exon_2452540_2453380:PANK4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 2488153 A/G 1 37 26 63 15.7890292392522 14.9050064805255 0.884022758726767 A:G A G 10 0.57326948002021 0.898891753074218 ENSG00000157873:ENST00000426449:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000434817:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000435221:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000451778:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000409119:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000423768:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000442392:exon_2487844_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000482074:exon_2487845_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000496064:exon_2487996_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2488010_2488172:TNFRSF14 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 3703698 A/G 1 17 13 30 7.25441883965643 7.45250324026273 -0.198084400606302 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000130764:ENST00000378251:exon_3703413_3703874:LRRC47 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 6641060 G/C 1 4 6 10 1.70692207991916 3.43961688012126 -1.7326948002021 C:G G C 10 0.57326948002021 0.342315301618549 ENSG00000204859:ENST00000319084:exon_6640601_6641359:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000435905:exon_6640601_6641359:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000377674:exon_6640601_6641359:ZBTB48 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 6649228 T/G 1 23 41 64 9.81480195953517 23.5040486808286 -13.6892467212934 T:G T G 10 0.57326948002021 0.000864186853525707 ENSG00000204859:ENST00000377674:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000482360:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000498342:exon_6648120_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000466941:exon_6648976_6649340:ZBTB48 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 6693097 A/G 1 10 17 27 4.2673051997979 9.74558116034357 -5.47827596054567 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0495781269238746 ENSG00000041988:ENST00000054650:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000307896:exon_6692856_6693428:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000400912:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000484669:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000487819:exon_6692856_6693181:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000472925:exon_6692451_6693111:THAP3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 6694574 G/A 1 28 28 56 11.9484545594341 16.0515454405659 -4.10309088113176 A:C:G G A 10 0.57326948002021 0.281806043624587 ENSG00000041988:ENST00000377627:exon_6694080_6695646:THAP3;ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000451196:exon_6694228_6694844:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000465508:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6694228_6695760:DNAJC11 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 10460485 T/C 1 12 22 34 5.12076623975748 12.6119285604446 -7.49116232068714 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0139624638107415 ENSG00000142657:ENST00000491493:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000377062:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000477958:exon_10460433_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000465632:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10460450_10460629:PGD HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 10473196 C/T 1 42 38 80 17.9226818391512 21.784240240768 -3.8615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.429064782375541 ENSG00000142657:ENST00000490057:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000483936:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000493288:exon_10472891_10473308:PGD HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 10690051 G/T 1 19 20 39 8.10787987961601 11.4653896004042 -3.35750972078819 T:G G T 10 0.57326948002021 0.331619302492795 ENSG00000142655:ENST00000356607:exon_10689588_10690815:PEX14 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 11087524 G/A 1 13 4 17 5.54749675973727 2.29307792008084 3.25441883965643 A:G G A 10 0.57326948002021 0.142310709307259 ENSG00000009724:ENST00000400897:exon_11086580_11087705:MASP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 11132217 G/A 1 27 28 55 11.5217240394543 16.0515454405659 -4.52982140111155 A:G G A 10 0.57326948002021 0.222688631217463 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000469634:exon_11130957_11133083:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000478271:exon_11132144_11132452:EXOSC10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 11141187 C/G 1 15 13 28 6.40095779969685 7.45250324026273 -1.05154544056588 C:G C G 10 0.57326948002021 0.705949684866759 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11141139_11141295:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11141139_11141295:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11141139_11141274:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000485606:exon_11141139_11141295:EXOSC10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 11708736 T/C 1 9 10 19 3.84057467981811 5.7326948002021 -1.89212012038399 T:C T C 10 0.57326948002021 0.487623161721597 ENSG00000116661:ENST00000354287:exon_11708424_11708885:FBXO2;ENSG00000116661:ENST00000376779:exon_11708450_11708885:FBXO2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 11718390 G/A 1 6 4 10 2.56038311987874 2.29307792008084 0.267305199797899 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000132879:ENST00000251546:exon_11718324_11718421:FBXO44;ENSG00000132879:ENST00000425796:exon_11718324_11718421:FBXO44;ENSG00000132879:ENST00000376770:exon_11718324_11718450:FBXO44;ENSG00000132879:ENST00000376768:exon_11718324_11718421:FBXO44;ENSG00000132879:ENST00000251547:exon_11718324_11718450:FBXO44;ENSG00000132879:ENST00000376762:exon_11718324_11718421:FBXO44;ENSG00000132879:ENST00000376760:exon_11718324_11718421:FBXO44;ENSG00000132879:ENST00000475435:exon_11718324_11718421:FBXO44 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 12009955 C/T 1 3 7 10 1.28019155993937 4.01288636014147 -2.7326948002021 T:C C T 10 0.57326948002021 0.109775478323748 ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000449038:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12009830_12009963:PLOD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 12082926 A/G 1 11 5 16 4.69403571977769 2.86634740010105 1.82768831967664 A:G A G 10 0.57326948002021 0.452437779938541 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12082921_12082974:MIIP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 14105049 C/A 1 21 10 31 8.96134091957559 5.7326948002021 3.22864611937349 A:C C A 10 0.57326948002021 0.278826346756747 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000470057:exon_14104913_14105152:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000407521:exon_14104913_14105127:PRDM2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 14105382 T/C 1 19 23 42 8.10787987961601 13.1851980404648 -5.07731816084882 T:C T C 10 0.57326948002021 0.120661493153583 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 14105946 T/C 1 7 7 14 2.98711363985853 4.01288636014147 -1.02577272028294 T:C T C 10 0.57326948002021 0.5990458397462 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 14107135 C/G 1 7 3 10 2.98711363985853 1.71980844006063 1.2673051997979 C:G C G 10 0.57326948002021 0.532053210294076 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 14108988 A/G 1 24 17 41 10.241532479515 9.74558116034357 0.495951319171388 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000470057:exon_14107414_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 14109114 A/G 1 16 20 36 6.82768831967664 11.4653896004042 -4.63770128072756 A:G A G 10 0.57326948002021 0.130768035009174 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000470057:exon_14107414_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 17312730 C/T 1 7 13 20 2.98711363985853 7.45250324026273 -4.4653896004042 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0677059243274011 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17312454_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17312476_17312853:ATP13A2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 17314702 C/T 1 6 7 13 2.56038311987874 4.01288636014147 -1.45250324026273 T:C C T 10 0.57326948002021 0.418185809776403 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17314633_17314729:ATP13A2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 19584004 G/A 1 79 41 120 33.7117110784034 23.5040486808286 10.2076623975748 A:G G A 10 0.57326948002021 0.06483111140932 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19583948_19584015:MRTO4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 19585207 G/A 1 95 62 157 40.53939939808 35.542707761253 4.99669163682702 A:G G A 10 0.57326948002021 0.467882279951786 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19585175_19586622:MRTO4;ENSG00000053372:ENST00000479559:exon_19585175_19585233:MRTO4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 19950062 T/C 1 139 237 376 59.3155422771908 135.86486676479 -76.549324487599 T:C T C 10 0.57326948002021 2.296757089063e-15 ENSG00000173436:ENST00000486890:exon_19949968_19950284:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000322753:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000467029:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000481464:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000498642:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000485362:exon_19949968_19950077:C1orf151 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 20009737 G/A 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 A:G G A 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000162542:ENST00000294543:exon_20008706_20009937:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000489814:exon_20008735_20009937:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375122:exon_20008754_20009937:TMCO4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 20977000 A/C 1 9 6 15 3.84057467981811 3.43961688012126 0.400957799696849 A:C A C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 20982631 G/A 1 31 23 54 13.2286461193735 13.1851980404648 0.0434480789086571 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000486473:exon_20982594_20982680:DDOST HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 21573855 G/A 1 5 9 14 2.13365259989895 5.15942532018189 -3.02577272028294 A:G G A 10 0.57326948002021 0.112496331869413 ENSG00000117298:ENST00000415912:exon_21573714_21573856:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000374894:exon_21573714_21573856:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000357071:exon_21573714_21573856:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000374893:exon_21573714_21573856:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000436918:exon_21573714_21573856:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000264205:exon_21573714_21573856:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000526194:exon_21573714_21573856:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000528294:exon_21573714_21573856:ECE1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 23419261 G/A 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 A:G G A 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 23419855 T/C 1 12 13 25 5.12076623975748 7.45250324026273 -2.33173700050525 T:C T C 10 0.57326948002021 0.419590889375568 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 23885498 T/C 1 35 24 59 14.9355681992926 13.758467520485 1.17710067880761 T:C T C 10 0.57326948002021 0.793711281046369 ENSG00000117318:ENST00000374561:exon_23885426_23885510:ID3;ENSG00000117318:ENST00000463312:exon_23885426_23885566:ID3;ENSG00000117318:ENST00000486541:exon_23884936_23885510:ID3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 24077451 C/T 1 17 7 24 7.25441883965643 4.01288636014147 3.24153247951496 T:C C T 10 0.57326948002021 0.218150853833645 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24077335_24078520:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24077335_24078520:TCEB3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 26496651 T/C 1 144 134 278 61.4491948770898 76.8181103227082 -15.3689154456184 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0687597879016393 ENSG00000142684:ENST00000374266:exon_26496362_26496674:ZNF593;ENSG00000142684:ENST00000270812:exon_26496433_26496674:ZNF593 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 26786627 G/A 1 6 4 10 2.56038311987874 2.29307792008084 0.267305199797899 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000117682:ENST00000434391:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000357049:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374192:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000525682:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000236342:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000526219:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000360009:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374194:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000430232:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000416052:exon_26786528_26786635:DHDDS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 26887592 T/C 1 14 15 29 5.97422727971706 8.59904220030315 -2.62481492058609 T:C T C 10 0.57326948002021 0.351504521856456 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000403732:exon_26887536_26887625:RPS6KA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 27210721 T/C 1 20 21 41 8.5346103995958 12.0386590804244 -3.50404868082861 T:C T C 10 0.57326948002021 0.273648441106036 ENSG00000142751:ENST00000374135:exon_27210651_27210781:GPN2;ENSG00000142751:ENST00000374133:exon_27210651_27210781:GPN2;ENSG00000142751:ENST00000374131:exon_27210651_27210781:GPN2;ENSG00000142751:ENST00000477418:exon_27210651_27210781:GPN2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 27426796 T/C 1 4 8 12 1.70692207991916 4.58615584016168 -2.87923376024252 T:C T C 10 0.57326948002021 0.141786607964141 ENSG00000090020:ENST00000263980:exon_27425306_27427135:SLC9A1;ENSG00000090020:ENST00000374089:exon_27425306_27427135:SLC9A1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 27427041 T/C 1 3 9 12 1.28019155993937 5.15942532018189 -3.87923376024252 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0369288562011821 ENSG00000090020:ENST00000263980:exon_27425306_27427135:SLC9A1;ENSG00000090020:ENST00000374089:exon_27425306_27427135:SLC9A1;ENSG00000090020:ENST00000447808:exon_27426836_27427135:SLC9A1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 27680292 A/G 1 44 26 70 18.7761428791108 14.9050064805255 3.8711363985853 A:G A G 10 0.57326948002021 0.398257128436557 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27680204_27680421:SYTL1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 27736478 T/C 1 13 6 19 5.54749675973727 3.43961688012126 2.10787987961601 T:C T C 10 0.57326948002021 0.363933046022059 ENSG00000158195:ENST00000430629:exon_27736186_27736700:WASF2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 28209305 A/G 1 45 10 55 19.2028733990905 5.7326948002021 13.4701785988884 A:G A G 10 0.57326948002021 0.000177083334105685 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 28209362 T/C 1 46 11 57 19.6296039190703 6.30596428022231 13.323639638848 T:C T C 10 0.57326948002021 0.000250014652400884 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 28209366 A/G 1 46 10 56 19.6296039190703 5.7326948002021 13.8969091188682 A:G A G 10 0.57326948002021 0.000116728566075828 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 28861636 G/A 1 6 7 13 2.56038311987874 4.01288636014147 -1.45250324026273 A:G G A 10 0.57326948002021 0.418185809776403 ENSG00000180198:ENST00000398962:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000398958:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373834:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000427469:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000434290:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373833:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000419074:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373832:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000439292:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373831:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000411533:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000430407:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000429051:exon_28861562_28861658:RCC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 28887860 G/A 1 30 28 58 12.8019155993937 16.0515454405659 -3.24962984117218 A:G G A 10 0.57326948002021 0.426569337269883 ENSG00000180098:ENST00000373830:exon_28887858_28887910:TRNAU1AP;ENSG00000180098:ENST00000495995:exon_28887858_28887910:TRNAU1AP;ENSG00000180098:ENST00000480930:exon_28887858_28887910:TRNAU1AP;ENSG00000180098:ENST00000491577:exon_28887145_28887910:TRNAU1AP;ENSG00000180098:ENST00000495215:exon_28887858_28887910:TRNAU1AP;ENSG00000180098:ENST00000464093:exon_28887145_28887910:TRNAU1AP;ENSG00000180098:ENST00000484775:exon_28887858_28887910:TRNAU1AP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 31206637 C/T 1 358 388 746 152.769526152765 222.428558247841 -69.6590320950767 T:C C T 10 0.57326948002021 3.05439258062907e-07 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31205316_31206764:LAPTM5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 31208042 C/T 1 264 242 506 112.656857274665 138.731214164891 -26.0743568902263 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0194671260772372 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31208020_31208112:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000424259:exon_31208020_31208112:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000464569:exon_31208020_31208112:LAPTM5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 31426815 A/G 1 3 6 9 1.28019155993937 3.43961688012126 -2.15942532018189 A:G A G 10 0.57326948002021 0.183674374674640 ENSG00000134644:ENST00000424085:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000257075:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373747:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373749:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000423018:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000525843:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000426105:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000498419:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000440538:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373741:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373742:exon_31426561_31426828:PUM1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 32096265 A/G 1 52 49 101 22.1899870389491 28.0902045209903 -5.90021748204121 A:G A G 10 0.57326948002021 0.268420822112409 ENSG00000162517:ENST00000373703:exon_32095463_32096443:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000461006:exon_32095941_32096333:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000478502:exon_32096050_32096443:PEF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 32557486 A/G 1 7 12 19 2.98711363985853 6.87923376024252 -3.89212012038399 A:G A G 10 0.57326948002021 0.102154620750249 ENSG00000121775:ENST00000487305:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000336294:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000456834:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000373633:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000373634:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000441402:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000472503:exon_32557276_32557610:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000468135:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000427288:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000476968:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000498613:exon_32557276_32557612:TMEM39B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 32694819 A/G 1 4 6 10 1.70692207991916 3.43961688012126 -1.7326948002021 A:G A G 10 0.57326948002021 0.342315301618549 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 32696628 A/C 1 9 5 14 3.84057467981811 2.86634740010105 0.974227279717059 A:C A C 10 0.57326948002021 0.788481610276296 ENSG00000084623:ENST00000474371:exon_32696528_32696655:EIF3I HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 33099637 A/G 1 46 49 95 19.6296039190703 28.0902045209903 -8.46060060191995 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0964739630807004 ENSG00000176261:ENST00000468695:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000373506:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000473294:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000478041:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000436661:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000498691:exon_33099552_33099662:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000373501:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000476493:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000465588:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000483138:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000479075:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000473383:exon_33099552_33100123:ZBTB8OS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 33790496 G/A 1 11 14 25 4.69403571977769 8.02577272028294 -3.33173700050525 A:G G A 10 0.57326948002021 0.224888309077082 ENSG00000134686:ENST00000431992:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000419414:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000307890:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000361167:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000257118:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000373422:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000373418:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000485928:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000467894:exon_33790290_33790620:PHC2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 35321242 A/C 1 40 47 87 17.0692207991916 26.9436655609499 -9.87444476175828 A:C A C 10 0.57326948002021 0.0389388603530878 ENSG00000163866:ENST00000521580:exon_35319391_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000446026:exon_35320651_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000456842:exon_35320770_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000423898:exon_35320950_35321583:C1orf212 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 36752152 C/T 1 26 30 56 11.0949935194745 17.1980844006063 -6.10309088113176 T:C C T 10 0.57326948002021 0.106009600963409 ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 36787888 G/A 1 16 18 34 6.82768831967664 10.3188506403638 -3.49116232068714 A:G G A 10 0.57326948002021 0.230426739072596 ENSG00000142694:ENST00000270824:exon_36787632_36788326:FAM176B;ENSG00000142694:ENST00000490466:exon_36787882_36788326:FAM176B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 38148765 A/G 1 2 11 13 0.85346103995958 6.30596428022231 -5.45250324026273 A:G A G 10 0.57326948002021 0.00319980416353301 ENSG00000116922:ENST00000358011:exon_38147242_38148832:C1orf109;ENSG00000116922:ENST00000494120:exon_38147242_38148832:C1orf109;ENSG00000116922:ENST00000464178:exon_38148408_38148832:C1orf109 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 38423853 G/C 1 105 96 201 44.8067045978779 55.0338700819402 -10.2271654840622 C:G G C 10 0.57326948002021 0.153907302501560 ENSG00000183431:ENST00000373019:exon_38422647_38423935:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000448721:exon_38423631_38423935:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000487062:exon_38423735_38423935:SF3A3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 39311617 T/G 1 19 17 36 8.10787987961601 9.74558116034357 -1.63770128072756 T:G T G 10 0.57326948002021 0.615519905971095 ENSG00000116954:ENST00000373001:exon_39311611_39311759:RRAGC;ENSG00000116954:ENST00000474456:exon_39311611_39313746:RRAGC;ENSG00000116954:ENST00000411897:exon_39311611_39311759:RRAGC;ENSG00000116954:ENST00000493015:exon_39311611_39311759:RRAGC HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 39797055 A/G 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 A:G A G 10 0.57326948002021 0.741310101183539 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39796875_39802325:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39796810_39802325:MACF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 39854243 G/A 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 A:G G A 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39852859_39854330:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39852859_39854330:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39852859_39854330:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39852859_39854330:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39852859_39854330:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39852859_39854330:MACF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 39917888 C/A 1 2 8 10 0.85346103995958 4.58615584016168 -3.7326948002021 A:C C A 10 0.57326948002021 0.0229850767056374 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39917828_39918022:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39917828_39918022:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39917828_39918022:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39917828_39918022:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39917828_39918022:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39917828_39918022:MACF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 42880516 T/C 1 20 17 37 8.5346103995958 9.74558116034357 -1.21097076074777 T:C T C 10 0.57326948002021 0.740714372974236 ENSG00000177181:ENST00000431473:exon_42880155_42880850:RIMKLA;ENSG00000177181:ENST00000372570:exon_42880155_42880830:RIMKLA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 43395635 C/T 1 2 6 8 0.85346103995958 3.43961688012126 -2.58615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0801462458318362 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43395544_43395706:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43395544_43395706:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43395544_43395646:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000439722:exon_43395544_43395706:SLC2A1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 43408966 G/A 1 3 6 9 1.28019155993937 3.43961688012126 -2.15942532018189 A:G G A 10 0.57326948002021 0.183674374674640 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000415851:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372500:exon_43408897_43408992:SLC2A1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 43824865 C/T 1 19 23 42 8.10787987961601 13.1851980404648 -5.07731816084882 T:C C T 10 0.57326948002021 0.120661493153583 ENSG00000117399:ENST00000310955:exon_43824838_43825067:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000437896:exon_43824838_43825067:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000372462:exon_43824684_43825067:CDC20 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 44137257 C/A 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 A:C C A 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000066135:ENST00000372396:exon_44137176_44137546:KDM4A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 45241254 A/G 1 13 7 20 5.54749675973727 4.01288636014147 1.5346103995958 A:G A G 10 0.57326948002021 0.652301753764728 ENSG00000142937:ENST00000396651:exon_45241109_45241272:RPS8;ENSG00000142937:ENST00000372209:exon_45241245_45241272:RPS8;ENSG00000142937:ENST00000470475:exon_45241250_45241272:RPS8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 46073489 G/A 1 5 7 12 2.13365259989895 4.01288636014147 -1.87923376024252 A:G G A 10 0.57326948002021 0.382460042999359 ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000470768:exon_46072993_46073644:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46072993_46074009:NASP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 46078854 A/G 1 61 41 102 26.0305617187672 23.5040486808286 2.52651303793858 A:G A G 10 0.57326948002021 0.689070951998081 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 46078884 C/T 1 71 44 115 30.2978669185651 25.2238571208892 5.07400979767584 T:C C T 10 0.57326948002021 0.347803536770742 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 46086077 C/T 1 3 5 8 1.28019155993937 2.86634740010105 -1.58615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.29890034016204 ENSG00000159588:ENST00000372044:exon_46085716_46086105:CCDC17;ENSG00000159588:ENST00000482416:exon_46085716_46086105:CCDC17;ENSG00000159588:ENST00000491755:exon_46085716_46086105:CCDC17;ENSG00000159588:ENST00000421127:exon_46085717_46086105:CCDC17;ENSG00000159588:ENST00000343901:exon_46085717_46086105:CCDC17;ENSG00000159588:ENST00000446027:exon_46085717_46086105:CCDC17;ENSG00000159588:ENST00000528266:exon_46085783_46086105:CCDC17;ENSG00000159588:ENST00000445048:exon_46085895_46086105:CCDC17;ENSG00000159588:ENST00000479529:exon_46086025_46086105:CCDC17 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 46094027 A/G 1 48 51 99 20.4830649590299 29.2367434810307 -8.7536785220008 A:C:G A G 10 0.57326948002021 0.0839644473523713 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46092978_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46093629_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46093900_46094080:GPBP1L1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 46095272 T/C 1 59 56 115 25.1771006788076 32.1030908811318 -6.92599020232416 T:C T C 10 0.57326948002021 0.220201754191397 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46095248_46095387:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000468724:exon_46095260_46095350:GPBP1L1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 46498375 A/G 1 10 5 15 4.2673051997979 2.86634740010105 1.40095779969685 A:G A G 10 0.57326948002021 0.604487754064262 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46498268_46498390:MAST2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 46743900 C/T 1 29 20 49 12.3751850794139 11.4653896004042 0.909795479009707 T:C C T 10 0.57326948002021 0.885476415673921 ENSG00000085999:ENST00000442598:exon_46743744_46744145:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000371975:exon_46743744_46744144:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000488942:exon_46743744_46744111:RAD54L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 46746164 C/T 1 22 16 38 9.38807143955538 9.17231168032336 0.215759759232018 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000132128:ENST00000496156:exon_46746068_46746232:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000343304:exon_46746068_46746232:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000472710:exon_46746068_46746232:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000254454:exon_46746068_46746232:LRRC41 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 46810530 A/G 1 4 10 14 1.70692207991916 5.7326948002021 -4.02577272028294 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0543340383697456 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46810454_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46810473_46810634:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000475281:exon_46810473_46811046:NSUN4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 46827456 A/G 1 15 20 35 6.40095779969685 11.4653896004042 -5.06443180070735 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0894470662968279 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46827242_46827863:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46827242_46827862:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46827242_46830824:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46827242_46827862:NSUN4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 51121198 T/C 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 T:C T C 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000185104:ENST00000396153:exon_51121114_51121200:FAF1;ENSG00000185104:ENST00000494400:exon_51121114_51121200:FAF1;ENSG00000185104:ENST00000371778:exon_51121114_51121200:FAF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 52253381 T/G 1 1 7 8 0.42673051997979 4.01288636014147 -3.58615584016168 T:G T G 10 0.57326948002021 0.0245816827973848 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 52882406 A/G 1 41 37 78 17.4959513191714 21.2109707607478 -3.71501944157638 A:G A G 10 0.57326948002021 0.423750968025464 ENSG00000134748:ENST00000257181:exon_52882320_52883992:PRPF38A;ENSG00000134748:ENST00000474048:exon_52882320_52882694:PRPF38A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 53153432 T/C 1 19 24 43 8.10787987961601 13.758467520485 -5.65058764086903 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0905137487212382 ENSG00000162377:ENST00000371538:exon_53152508_53153840:C1orf163;ENSG00000162377:ENST00000486918:exon_53153234_53153840:C1orf163 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 53387379 G/C 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 C:G G C 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000121310:ENST00000460612:exon_53387225_53387434:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000358358:exon_53387225_53387398:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000476477:exon_53387225_53387446:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000467988:exon_53387225_53387390:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000495920:exon_53387225_53387386:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000474789:exon_53387225_53387393:ECHDC2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 53679155 G/A 1 28 37 65 11.9484545594341 21.2109707607478 -9.26251620131365 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0236042426216957 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53678936_53679869:CPT2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 55541174 A/G 1 1 8 9 0.42673051997979 4.58615584016168 -4.15942532018189 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0061424649460709 ENSG00000162402:ENST00000294383:exon_55541130_55541196:USP24;ENSG00000162402:ENST00000407756:exon_55541130_55541196:USP24 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 64097432 C/T 1 7 8 15 2.98711363985853 4.58615584016168 -1.59904220030315 T:C C T 10 0.57326948002021 0.441591135560738 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64097328_64097453:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64097328_64097453:PGM1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 75172001 T/A 1 27 23 50 11.5217240394543 13.1851980404648 -1.6634740010105 A:T T A 10 0.57326948002021 0.66928969982904 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75171170_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75171170_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000492102:exon_75171172_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75171174_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75171656_75172141:CRYZ HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 75175886 T/C 1 7 7 14 2.98711363985853 4.01288636014147 -1.02577272028294 T:C T C 10 0.57326948002021 0.5990458397462 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75175793_75175931:CRYZ HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 78184325 A/G 1 5 4 9 2.13365259989895 2.29307792008084 -0.15942532018189 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000077254:ENST00000370794:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000481579:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370793:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000357428:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370792:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000527390:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000498328:exon_78184281_78184397:USP33;ENSG00000077254:ENST00000461986:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000531637:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000462192:exon_78184281_78184326:USP33 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 79093818 A/G 1 8 15 23 3.41384415983832 8.59904220030315 -5.18519804046483 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0346361608026516 ENSG00000137959:ENST00000452835:exon_79093591_79093892:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79091355_79094684:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79093670_79094078:IFI44L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 79094081 T/A 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 A:T T A 10 0.57326948002021 0.741310101183539 ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79091355_79094684:IFI44L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 79095526 G/A 1 25 41 66 10.6682629994947 23.5040486808286 -12.8357856813339 A:G G A 10 0.57326948002021 0.00171040280149887 ENSG00000137959:ENST00000476521:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000462041:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000474002:exon_79095320_79095600:IFI44L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 79102726 C/T 1 13 12 25 5.54749675973727 6.87923376024252 -1.33173700050525 T:C C T 10 0.57326948002021 0.686966178648469 ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79102717_79102846:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000494910:exon_79102377_79102888:IFI44L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 85113229 A/G 1 3 5 8 1.28019155993937 2.86634740010105 -1.58615584016168 A:G A G 10 0.57326948002021 0.29890034016204 ENSG00000117155:ENST00000342203:exon_85109390_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000437941:exon_85109599_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000481102:exon_85113022_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000476905:exon_85113024_85113290:SSX2IP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 85724283 C/T 1 7 3 10 2.98711363985853 1.71980844006063 1.2673051997979 T:C C T 10 0.57326948002021 0.532053210294076 ENSG00000162642:ENST00000294661:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000471115:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000493514:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000344356:exon_85724207_85724405:C1orf52 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 86818572 T/C 1 17 17 34 7.25441883965643 9.74558116034357 -2.49116232068714 T:C T C 10 0.57326948002021 0.392022589767345 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86818542_86818667:ODF2L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 86820267 C/T 1 23 8 31 9.81480195953517 4.58615584016168 5.22864611937349 T:C C T 10 0.57326948002021 0.068882636971294 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000476054:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000473792:exon_86820213_86820375:ODF2L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 89426902 G/A 1 9 5 14 3.84057467981811 2.86634740010105 0.974227279717059 A:G G A 10 0.57326948002021 0.788481610276296 ENSG00000137944:ENST00000370491:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000446900:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000260508:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000394677:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370485:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370486:exon_89426850_89426970:CCBL2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 89579941 T/C 1 9 6 15 3.84057467981811 3.43961688012126 0.400957799696849 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000162645:ENST00000464839:exon_89579699_89579979:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000370466:exon_89579699_89579979:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000463660:exon_89579699_89579979:GBP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 89582690 G/C 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 C:G G C 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000162645:ENST00000464839:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000370466:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000463660:exon_89582675_89582917:GBP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 90486412 T/G 1 3 5 8 1.28019155993937 2.86634740010105 -1.58615584016168 T:G T G 10 0.57326948002021 0.29890034016204 ENSG00000162664:ENST00000394590:exon_90486351_90486481:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000394583:exon_90486351_90486481:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000340281:exon_90486351_90486481:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000370447:exon_90486351_90486481:ZNF326 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 93620393 G/A 1 14 8 22 5.97422727971706 4.58615584016168 1.38807143955538 A:G G A 10 0.57326948002021 0.668312643486638 ENSG00000117500:ENST00000370282:exon_93615299_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000370290:exon_93617415_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000483033:exon_93619753_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000479918:exon_93619789_93620445:TMED5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 93646433 T/C 1 5 4 9 2.13365259989895 2.29307792008084 -0.15942532018189 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93646281_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93646326_93646439:CCDC18 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 93672688 C/T 1 23 14 37 9.81480195953517 8.02577272028294 1.78902923925223 T:C C T 10 0.57326948002021 0.620118304579096 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000455267:exon_93672664_93672955:CCDC18 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 93720070 C/G 1 15 11 26 6.40095779969685 6.30596428022231 0.0949935194745386 A:C:G C G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93720028_93720171:CCDC18 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 94341267 A/G 1 47 28 75 20.0563344390501 16.0515454405659 4.00478899848424 A:G A G 10 0.57326948002021 0.414032065260627 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341201_94341339:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341222_94341339:DNTTIP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 100575933 G/A 1 9 5 14 3.84057467981811 2.86634740010105 0.974227279717059 A:G G A 10 0.57326948002021 0.788481610276296 ENSG00000156876:ENST00000287482:exon_100575848_100576039:SASS6;ENSG00000156876:ENST00000462159:exon_100575848_100576039:SASS6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 109479978 G/T 1 8 9 17 3.41384415983832 5.15942532018189 -1.74558116034357 T:G G T 10 0.57326948002021 0.464916768474155 ENSG00000121940:ENST00000356970:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000423586:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369969:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000415331:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369968:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369971:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369970:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000348264:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000302500:exon_109479699_109480040:CLCC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 110888948 G/A 1 89 85 174 37.9790162782013 48.7279058017179 -10.7488895235165 A:G G A 10 0.57326948002021 0.107484548075856 ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110888930_110889299:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110888930_110889299:RBM15 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 110950277 G/A 1 36 34 70 15.3622987192724 19.4911623206871 -4.1288636014147 A:G G A 10 0.57326948002021 0.335165589117822 ENSG00000134248:ENST00000483260:exon_110950208_110950290:HBXIP;ENSG00000134248:ENST00000474861:exon_110949655_110950293:HBXIP;ENSG00000134248:ENST00000464240:exon_110948940_110950316:HBXIP;ENSG00000134248:ENST00000369775:exon_110950208_110950560:HBXIP;ENSG00000134248:ENST00000256644:exon_110950208_110950564:HBXIP;ENSG00000134248:ENST00000531779:exon_110950208_110950286:HBXIP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 111730901 C/T 1 21 14 35 8.96134091957559 8.02577272028294 0.935568199292648 T:C C T 10 0.57326948002021 0.864764591021419 ENSG00000162777:ENST00000468692:exon_111730753_111730992:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000357640:exon_111730753_111730992:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000369752:exon_111730753_111730992:DENND2D HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 111783982 C/T 1 150 90 240 64.0095779969685 51.5942532018189 12.4153247951496 T:C C T 10 0.57326948002021 0.117154744572029 ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000472825:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000529459:exon_111783949_111784065:CHI3L2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 111957097 C/G 1 10 5 15 4.2673051997979 2.86634740010105 1.40095779969685 C:G C G 10 0.57326948002021 0.604487754064262 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 113237171 A/G 1 4 6 10 1.70692207991916 3.43961688012126 -1.7326948002021 A:G A G 10 0.57326948002021 0.342315301618549 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000479858:exon_113237075_113237206:MOV10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 113239382 G/A 1 11 9 20 4.69403571977769 5.15942532018189 -0.465389600404201 A:G G A 10 0.57326948002021 0.825497110151158 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113239361_113239468:MOV10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 113241052 T/C 1 25 19 44 10.6682629994947 10.892120120384 -0.223857120889242 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113240909_113241411:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113240909_113242432:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000482545:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000471160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113240930_113241100:MOV10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 113243048 C/T 1 65 47 112 27.7374837986863 26.9436655609499 0.793818237736474 T:C C T 10 0.57326948002021 0.924059167149162 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113243038_113243368:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113243038_113243367:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113243038_113243348:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113243038_113243332:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000495374:exon_113243038_113243344:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000494319:exon_113242841_113243347:MOV10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 117633188 A/G 1 5 4 9 2.13365259989895 2.29307792008084 -0.15942532018189 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117633154_117633245:TTF2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 118495153 T/G 1 8 9 17 3.41384415983832 5.15942532018189 -1.74558116034357 T:G T G 10 0.57326948002021 0.464916768474155 ENSG00000065183:ENST00000349139:exon_118495151_118495285:WDR3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 120285546 G/A 1 14 25 39 5.97422727971706 14.3317370005053 -8.35750972078819 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0088832284714853 ENSG00000092621:ENST00000369409:exon_120285430_120285667:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000369407:exon_120285430_120285667:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000482968:exon_120285430_120285667:PHGDH HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 145103928 G/A 1 10 8 18 4.2673051997979 4.58615584016168 -0.318850640363781 A:G G A 10 0.57326948002021 1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 17 17 0 9.74558116034357 -9.74558116034357 C T C 10 0.57326948002021 5.15956376124829e-07 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 20 20 0 11.4653896004042 -11.4653896004042 T G T 10 0.57326948002021 4.00935118640406e-08 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 22 22 0 12.6119285604446 -12.6119285604446 A C A 10 0.57326948002021 7.30098587829786e-09 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 1 27 1 28 11.5217240394543 0.57326948002021 10.9484545594341 A:G G A 10 0.57326948002021 7.06608176054633e-06 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 25 25 0 14.3317370005053 -14.3317370005053 C T C 10 0.57326948002021 5.67338979565023e-10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 33 33 0 18.9178928406669 -18.9178928406669 T C T 10 0.57326948002021 6.2383862789208e-13 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 146759320 C/G 1 18 29 47 7.68114935963622 16.6248149205861 -8.94366556094987 C:G C G 10 0.57326948002021 0.0114058024246542 ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146759314_146759412:CHD1L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 150130983 G/T 1 12 8 20 5.12076623975748 4.58615584016168 0.534610399595799 T:C:G G T 10 0.57326948002021 1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 150199123 G/T 1 32 34 66 13.6553766393533 19.4911623206871 -5.83578568133386 T:G G T 10 0.57326948002021 0.170783754580607 ENSG00000143401:ENST00000314136:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369116:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000421169:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369119:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000436748:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369115:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000533654:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000534220:exon_150198940_150199127:ANP32E HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 150445819 A/G 1 28 21 49 11.9484545594341 12.0386590804244 -0.0902045209902926 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000163125:ENST00000492220:exon_150443037_150446032:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000401000:exon_150443037_150449042:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000369068:exon_150443037_150446032:RPRD2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 150471157 T/A 1 8 3 11 3.41384415983832 1.71980844006063 1.69403571977769 A:T T A 10 0.57326948002021 0.372574328023575 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 150727539 G/A 1 9 12 21 3.84057467981811 6.87923376024252 -3.03865908042441 A:G G A 10 0.57326948002021 0.192086447359513 ENSG00000163131:ENST00000368985:exon_150727477_150727626:CTSS;ENSG00000163131:ENST00000480760:exon_150727477_150727626:CTSS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 151315287 G/C 1 24 22 46 10.241532479515 12.6119285604446 -2.37039608092966 C:G G C 10 0.57326948002021 0.551532028814459 ENSG00000143390:ENST00000290524:exon_151313116_151315654:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000368870:exon_151314305_151315654:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000452671:exon_151314436_151315654:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000392746:exon_151314723_151315654:RFX5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 151825991 G/T 1 6 8 14 2.56038311987874 4.58615584016168 -2.02577272028294 T:G G T 10 0.57326948002021 0.291858897104158 ENSG00000196407:ENST00000368817:exon_151825919_151826173:THEM5;ENSG00000196407:ENST00000368818:exon_151825919_151826173:THEM5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 153920564 A/G 1 63 31 94 26.8840227587268 17.7713538806265 9.11266887810025 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0607229129156382 ENSG00000160741:ENST00000303569:exon_153920145_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368630:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153920154_153920805:CRTC2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 153926078 T/C 1 8 7 15 3.41384415983832 4.01288636014147 -0.599042200303151 T:C T C 10 0.57326948002021 0.7979049378473 ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000476883:exon_153926014_153926082:CRTC2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 154919080 C/T 1 14 10 24 5.97422727971706 5.7326948002021 0.241532479514959 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000163346:ENST00000368465:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000368463:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000351146:exon_154918455_154919279:PBXIP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 156450719 G/A 1 7 1 8 2.98711363985853 0.57326948002021 2.41384415983832 A:G G A 10 0.57326948002021 0.149609550462636 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 156450740 G/A 1 3 7 10 1.28019155993937 4.01288636014147 -2.7326948002021 A:G G A 10 0.57326948002021 0.109775478323748 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 156565834 G/C 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 C:G G C 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000160818:ENST00000498641:exon_156565509_156565923:GPATCH4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 156706559 A/C,G 0 0 21 21 0 12.0386590804244 -12.0386590804244 C:G A G 10 0.57326948002021 1.71091251655579e-08 ENSG00000143303:ENST00000368218:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000368216:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000476229:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000497515:exon_156706424_156706752:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000481920:exon_156706473_156706694:C1orf66 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 156760887 C/A 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 A:C C A 10 0.57326948002021 0.741310101183539 ENSG00000143294:ENST00000368201:exon_156760859_156760954:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000454659:exon_156760859_156760954:PRCC HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 158813819 A/G 1 5 6 11 2.13365259989895 3.43961688012126 -1.30596428022231 A:G A G 10 0.57326948002021 0.545300564874909 ENSG00000163563:ENST00000368141:exon_158813745_158813912:MNDA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 158986477 G/C 1 91 87 178 38.8324773181609 49.8744447617583 -11.0419674435974 T:C:G G C 10 0.57326948002021 0.0960061240033404 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000447473:exon_158986323_158986482:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158986323_158986490:IFI16 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 158990247 A/G 1 58 63 121 24.7503701588278 36.1159772412732 -11.3656070824454 A:C:G A G 10 0.57326948002021 0.0428181031793632 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_158990131_158990319:IFI16 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 159002377 C/A 1 41 48 89 17.4959513191714 27.5169350409701 -10.0209837217987 A:C C A 10 0.57326948002021 0.0411173603711888 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 159002389 T/A 1 38 38 76 16.215759759232 21.784240240768 -5.56848048153596 A:T T A 10 0.57326948002021 0.203669764918432 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 159024668 A/T 1 421 447 868 179.653548911492 256.251457569034 -76.5979086575423 A:T:G A T 10 0.57326948002021 1.73258884161133e-07 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159024611_159024945:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159024611_159024918:IFI16 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 160000380 T/C 1 9 3 12 3.84057467981811 1.71980844006063 2.12076623975748 T:C T C 10 0.57326948002021 0.256104231229550 ENSG00000143315:ENST00000368090:exon_159997462_160001783:PIGM HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 160616703 G/T 1 29 32 61 12.3751850794139 18.3446233606467 -5.96943828123281 T:G G T 10 0.57326948002021 0.153871039720380 ENSG00000117090:ENST00000302035:exon_160616660_160617085:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000235739:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000497223:exon_160616660_160616869:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000392208:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000355199:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000494463:exon_160616660_160616811:SLAMF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 160654786 G/A 1 573 476 1049 244.51658794842 272.87627248962 -28.3596845412003 A:T:G G A 10 0.57326948002021 0.080442339227995 ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160654677_160654979:CD48;ENSG00000117091:ENST00000368045:exon_160653309_160654979:CD48 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 161013121 C/T 1 11 17 28 4.69403571977769 9.74558116034357 -5.05154544056588 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0579356370275021 ENSG00000158773:ENST00000368020:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000368021:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000442467:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000435396:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000368019:exon_161013058_161013149:USF1;ENSG00000158773:ENST00000473969:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000531842:exon_161013058_161013132:USF1;ENSG00000158773:ENST00000496363:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000491629:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000534633:exon_161013043_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000529476:exon_161013058_161013150:USF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 161019040 G/C 1 44 56 100 18.7761428791108 32.1030908811318 -13.326948002021 C:G G C 10 0.57326948002021 0.00833906225166908 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161018779_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368017:exon_161018962_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000490279:exon_161018580_161019124:ARHGAP30 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 161088583 T/G 1 6 11 17 2.56038311987874 6.30596428022231 -3.74558116034357 T:G T G 10 0.57326948002021 0.0853131245996917 ENSG00000158793:ENST00000368009:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000392190:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000453609:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000486962:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000492411:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000368008:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000478277:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000496861:exon_161088010_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000491497:exon_161088171_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000485594:exon_161088576_161088671:NIT1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 161094190 A/G 1 8 15 23 3.41384415983832 8.59904220030315 -5.18519804046483 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0346361608026516 ENSG00000158793:ENST00000368008:exon_161093931_161095235:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000479728:exon_161093931_161094601:NIT1;ENSG00000158796:ENST00000368006:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000392188:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000458050:exon_161094130_161094252:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000368005:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000464113:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000473679:exon_161094130_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000490843:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000463227:exon_161093928_161094316:DEDD HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 161172233 C/A 1 24 22 46 10.241532479515 12.6119285604446 -2.37039608092966 A:C C A 10 0.57326948002021 0.551532028814459 ENSG00000158864:ENST00000479948:exon_161171937_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000496133:exon_161171937_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000367993:exon_161171937_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000496553:exon_161171836_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000467295:exon_161172139_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000475570:exon_161172162_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000478866:exon_161172166_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000392179:exon_161172169_161172270:NDUFS2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 161695639 G/T 1 3 11 14 1.28019155993937 6.30596428022231 -5.02577272028294 T:G G T 10 0.57326948002021 0.0118102507890714 ENSG00000162746:ENST00000367948:exon_161695611_161695877:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367946:exon_161695611_161695877:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367945:exon_161695611_161695877:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000336830:exon_161695611_161695877:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367944:exon_161695611_161695877:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000392158:exon_161695611_161695877:FCRLB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 161721707 C/T 1 6 7 13 2.56038311987874 4.01288636014147 -1.45250324026273 T:C C T 10 0.57326948002021 0.418185809776403 ENSG00000081721:ENST00000367943:exon_161721656_161721774:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000464004:exon_161721656_161721774:DUSP12 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 161722204 C/T 1 13 17 30 5.54749675973727 9.74558116034357 -4.1980844006063 T:C C T 10 0.57326948002021 0.140525503500616 ENSG00000081721:ENST00000484291:exon_161722158_161722254:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000367943:exon_161722158_161722254:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000464004:exon_161722158_161722254:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000463365:exon_161722189_161722254:DUSP12 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 163313539 C/T 1 12 12 24 5.12076623975748 6.87923376024252 -1.75846752048504 T:C C T 10 0.57326948002021 0.537756757259522 ENSG00000143228:ENST00000524800:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000367900:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000271452:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000497990:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527439:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527120:exon_163313523_163313613:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000531529:exon_163313523_163313605:NUF2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 165648710 G/A 1 5 6 11 2.13365259989895 3.43961688012126 -1.30596428022231 A:G G A 10 0.57326948002021 0.545300564874909 ENSG00000143149:ENST00000354775:exon_165648679_165648819:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000491436:exon_165648679_165648819:ALDH9A1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 168013850 T/C 1 11 10 21 4.69403571977769 5.7326948002021 -1.03865908042441 T:C T C 10 0.57326948002021 0.66464815614549 ENSG00000143164:ENST00000367843:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000324705:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000432587:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000312263:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367840:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367839:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000489398:exon_168013823_168013909:DCAF6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 169345868 A/G 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 A:G A G 10 0.57326948002021 0.741310101183539 ENSG00000117475:ENST00000367808:exon_169345778_169346217:BLZF1;ENSG00000117475:ENST00000329281:exon_169345778_169346217:BLZF1;ENSG00000117475:ENST00000367807:exon_169345778_169346621:BLZF1;ENSG00000117475:ENST00000420531:exon_169345778_169346132:BLZF1;ENSG00000117475:ENST00000426663:exon_169345778_169346217:BLZF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 169677709 A/G 1 3 14 17 1.28019155993937 8.02577272028294 -6.74558116034357 A:G A G 10 0.57326948002021 0.00106756090444914 ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000463108:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000479657:exon_169677558_169677781:SELL;ENSG00000188404:ENST00000466340:exon_169677558_169677944:SELL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 169773317 G/A 1 10 3 13 4.2673051997979 1.71980844006063 2.54749675973727 A:G G A 10 0.57326948002021 0.173621486623774 ENSG00000000460:ENST00000498289:exon_169773253_169773381:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000472795:exon_169773216_169773521:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000496973:exon_169773253_169773488:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000481744:exon_169773216_169773381:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000359326:exon_169773216_169773381:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000459772:exon_169773253_169773381:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000466580:exon_169773253_169773381:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000456684:exon_169773216_169773381:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000286031:exon_169773216_169773381:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000413811:exon_169773216_169773381:C1orf112 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 170521376 G/A 1 6 9 15 2.56038311987874 5.15942532018189 -2.59904220030315 A:G G A 10 0.57326948002021 0.198144643439766 ENSG00000120370:ENST00000367763:exon_170521156_170522587:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000498166:exon_170521156_170522587:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000464798:exon_170521156_170522974:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000498600:exon_170521156_170522583:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000475113:exon_170521156_170521417:GORAB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 171509327 G/A 1 47 28 75 20.0563344390501 16.0515454405659 4.00478899848424 A:G G A 10 0.57326948002021 0.414032065260627 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171509110_171511368:BAT2L2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 171511039 C/G 1 22 18 40 9.38807143955538 10.3188506403638 -0.930779200808402 C:G C G 10 0.57326948002021 0.752637915758264 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000412837:exon_171509400_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000495585:exon_171510969_171511368:BAT2L2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 171514731 C/G 1 14 15 29 5.97422727971706 8.59904220030315 -2.62481492058609 C:G C G 10 0.57326948002021 0.351504521856456 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000412837:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000495585:exon_171514618_171514826:BAT2L2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 171556165 G/C 1 17 14 31 7.25441883965643 8.02577272028294 -0.771353880626512 C:G G C 10 0.57326948002021 0.856498190226456 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000412837:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000495585:exon_171556142_171556360:BAT2L2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 171557600 A/G 1 14 10 24 5.97422727971706 5.7326948002021 0.241532479514959 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171557518_171557644:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171557518_171557644:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171557518_171557644:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171557518_171557644:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171557518_171557644:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171557518_171557644:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171557518_171557644:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000412837:exon_171557518_171557644:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000495585:exon_171557518_171557644:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000498596:exon_171557518_171557644:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000492811:exon_171557518_171557644:BAT2L2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 172410967 G/A 1 28 25 53 11.9484545594341 14.3317370005053 -2.38328244107113 A:G G A 10 0.57326948002021 0.579006058463278 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 174969271 C/T 1 49 66 115 20.9097954790097 37.8357856813339 -16.9259902023242 T:C C T 10 0.57326948002021 0.00175864303069579 ENSG00000116161:ENST00000426793:exon_174969225_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000367679:exon_174968869_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000483307:exon_174969081_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000473925:exon_174969091_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000450101:exon_174969204_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000392063:exon_174969204_174969331:CACYBP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 179055020 C/T 1 23 18 41 9.81480195953517 10.3188506403638 -0.504048680828612 T:C C T 10 0.57326948002021 0.875869234765251 ENSG00000186283:ENST00000367627:exon_179054763_179055028:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000483887:exon_179054763_179055028:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000352445:exon_179054763_179055028:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000447595:exon_179054507_179055028:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000495145:exon_179054933_179055028:TOR3A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 179310262 C/T 1 10 4 14 4.2673051997979 2.29307792008084 1.97422727971706 T:C C T 10 0.57326948002021 0.419102837465114 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179310163_179310445:SOAT1;ENSG00000057252:ENST00000426956:exon_179310163_179310445:SOAT1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 180159657 C/T 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000116260:ENST00000392029:exon_180159568_180159715:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367602:exon_180159568_180159715:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367600:exon_180159568_180159715:QSOX1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 180471306 A/G 1 40 34 74 17.0692207991916 19.4911623206871 -2.42194152149554 A:G A G 10 0.57326948002021 0.638577374629933 ENSG00000135847:ENST00000367595:exon_180471180_180472089:ACBD6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 181018236 A/G 1 4 6 10 1.70692207991916 3.43961688012126 -1.7326948002021 A:G A G 10 0.57326948002021 0.342315301618549 ENSG00000153029:ENST00000486453:exon_181018188_181018833:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000434571:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367578:exon_181018188_181018448:MR1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 182845346 C/T 1 10 4 14 4.2673051997979 2.29307792008084 1.97422727971706 T:C C T 10 0.57326948002021 0.419102837465114 ENSG00000135829:ENST00000367549:exon_182845185_182845398:DHX9;ENSG00000135829:ENST00000490519:exon_182845264_182845398:DHX9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 183105705 G/A 1 7 8 15 2.98711363985853 4.58615584016168 -1.59904220030315 A:G G A 10 0.57326948002021 0.441591135560738 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183105521_183105720:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000495918:exon_183105521_183105720:LAMC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 183596703 G/A 1 34 33 67 14.5088376793129 18.9178928406669 -4.40905516135407 A:G G A 10 0.57326948002021 0.323131245788723 ENSG00000162704:ENST00000462965:exon_183595329_183596729:ARPC5;ENSG00000162704:ENST00000359856:exon_183595352_183596729:ARPC5;ENSG00000162704:ENST00000294742:exon_183595593_183596729:ARPC5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 183599638 C/T 1 28 22 50 11.9484545594341 12.6119285604446 -0.663474001010503 T:C C T 10 0.57326948002021 0.886805386833341 ENSG00000162704:ENST00000367534:exon_183599596_183599772:ARPC5;ENSG00000162704:ENST00000462965:exon_183599596_183599772:ARPC5;ENSG00000162704:ENST00000359856:exon_183599596_183599772:ARPC5;ENSG00000162704:ENST00000294742:exon_183599596_183599772:ARPC5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 184023529 A/C 1 7 3 10 2.98711363985853 1.71980844006063 1.2673051997979 A:C A C 10 0.57326948002021 0.532053210294076 ENSG00000198860:ENST00000361641:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000485209:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000533373:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000367518:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000423085:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000462677:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000457455:exon_184023495_184023569:TSEN15 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 186321242 C/T 1 9 12 21 3.84057467981811 6.87923376024252 -3.03865908042441 T:C C T 10 0.57326948002021 0.192086447359513 ENSG00000047410:ENST00000367478:exon_186321108_186321242:TPR;ENSG00000047410:ENST00000491783:exon_186321108_186321242:TPR;ENSG00000047410:ENST00000469463:exon_186321084_186321242:TPR;ENSG00000047410:ENST00000474852:exon_186321147_186321242:TPR HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 197060077 T/G 1 6 4 10 2.56038311987874 2.29307792008084 0.267305199797899 T:G T G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197059980_197060171:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000294732:exon_197059980_197060171:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000445725:exon_197059980_197060171:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367408:exon_197059980_197060171:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197059980_197060171:ASPM HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 197070776 C/T 1 7 7 14 2.98711363985853 4.01288636014147 -1.02577272028294 T:C C T 10 0.57326948002021 0.5990458397462 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 197070815 T/C 1 8 5 13 3.41384415983832 2.86634740010105 0.547496759737269 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 201969082 G/A 1 15 18 33 6.40095779969685 10.3188506403638 -3.91789284066693 A:G G A 10 0.57326948002021 0.217368410121292 ENSG00000176393:ENST00000481780:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492587:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000447312:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000478617:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492849:exon_201969030_201969143:RNPEP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 202304868 T/C 1 18 9 27 7.68114935963622 5.15942532018189 2.52172403945433 T:C T C 10 0.57326948002021 0.437000269366422 ENSG00000077152:ENST00000367274:exon_202304774_202304946:UBE2T;ENSG00000077152:ENST00000487227:exon_202304774_202304946:UBE2T;ENSG00000077152:ENST00000460852:exon_202304774_202304946:UBE2T HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 205589574 C/T 1 4 8 12 1.70692207991916 4.58615584016168 -2.87923376024252 T:C C T 10 0.57326948002021 0.141786607964141 ENSG00000158711:ENST00000357992:exon_205589094_205589966:ELK4;ENSG00000158711:ENST00000289703:exon_205588396_205589966:ELK4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 207653364 A/G 1 9 8 17 3.84057467981811 4.58615584016168 -0.745581160343571 A:G A G 10 0.57326948002021 0.807894812450834 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207653323_207653398:CR2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 207653395 C/A 1 9 9 18 3.84057467981811 5.15942532018189 -1.31885064036378 A:C C A 10 0.57326948002021 0.635341898612975 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207653323_207653398:CR2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 209933331 A/G 1 10 6 16 4.2673051997979 3.43961688012126 0.827688319676639 A:G A G 10 0.57326948002021 0.802879700667955 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000479796:exon_209933327_209933462:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 209933540 A/G 1 16 16 32 6.82768831967664 9.17231168032336 -2.34462336064672 A:G A G 10 0.57326948002021 0.475465289868101 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 209936914 C/T 1 14 8 22 5.97422727971706 4.58615584016168 1.38807143955538 A:T:C C T 10 0.57326948002021 0.668312643486638 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 209950760 C/G 1 29 32 61 12.3751850794139 18.3446233606467 -5.96943828123281 C:G C G 10 0.57326948002021 0.153871039720380 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367023:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000474496:exon_209950697_209950766:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000477431:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000488702:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 212788567 C/T 1 10 4 14 4.2673051997979 2.29307792008084 1.97422727971706 T:C C T 10 0.57326948002021 0.419102837465114 ENSG00000162772:ENST00000366981:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366987:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000426071:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000391902:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000341491:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000465155:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366985:exon_212788494_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000464547:exon_212788364_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366983:exon_212788364_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000336937:exon_212788490_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366984:exon_212788490_212788603:ATF3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 212911836 T/C 1 9 5 14 3.84057467981811 2.86634740010105 0.974227279717059 T:C T C 10 0.57326948002021 0.788481610276296 ENSG00000117697:ENST00000366977:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366975:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000422588:exon_212910933_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366976:exon_212911825_212912028:NSL1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 213068595 C/T 1 10 13 23 4.2673051997979 7.45250324026273 -3.18519804046483 T:C C T 10 0.57326948002021 0.207996353000423 ENSG00000162769:ENST00000366971:exon_213068558_213072705:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000419102:exon_213068558_213068676:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000483790:exon_213068558_213068736:FLVCR1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 214811244 C/G 1 9 10 19 3.84057467981811 5.7326948002021 -1.89212012038399 C:G C G 10 0.57326948002021 0.487623161721597 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214811209_214811344:CENPF HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 214813487 A/G 1 13 22 35 5.54749675973727 12.6119285604446 -7.06443180070735 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0248251591121944 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 214813782 A/G 1 11 16 27 4.69403571977769 9.17231168032336 -4.47827596054567 A:G A G 10 0.57326948002021 0.117847361849525 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 214813941 C/G 1 12 11 23 5.12076623975748 6.30596428022231 -1.18519804046483 C:G C G 10 0.57326948002021 0.67579941697981 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 214814125 G/A 1 5 10 15 2.13365259989895 5.7326948002021 -3.59904220030315 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0702450866322387 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 214814582 G/A 1 5 4 9 2.13365259989895 2.29307792008084 -0.15942532018189 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 214814778 G/A 1 6 4 10 2.56038311987874 2.29307792008084 0.267305199797899 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 214814925 C/T 1 7 1 8 2.98711363985853 0.57326948002021 2.41384415983832 T:C C T 10 0.57326948002021 0.149609550462636 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 214814995 C/T 1 11 6 17 4.69403571977769 3.43961688012126 1.25441883965643 T:C C T 10 0.57326948002021 0.629145660806696 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 214818548 C/T 1 7 3 10 2.98711363985853 1.71980844006063 1.2673051997979 T:C C T 10 0.57326948002021 0.532053210294076 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 214818846 A/G 1 7 5 12 2.98711363985853 2.86634740010105 0.120766239757479 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 214818945 A/C 1 7 5 12 2.98711363985853 2.86634740010105 0.120766239757479 A:C A C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 214819044 C/T 1 7 10 17 2.98711363985853 5.7326948002021 -2.74558116034357 T:C C T 10 0.57326948002021 0.221546928311467 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 214819328 G/A 1 7 5 12 2.98711363985853 2.86634740010105 0.120766239757479 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 214819587 A/G 1 13 10 23 5.54749675973727 5.7326948002021 -0.185198040464831 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 214819980 C/T 1 8 5 13 3.41384415983832 2.86634740010105 0.547496759737269 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 214820299 A/G 1 12 9 21 5.12076623975748 5.15942532018189 -0.0386590804244111 A:C:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 214820494 G/A 1 16 15 31 6.82768831967664 8.59904220030315 -1.77135388062651 A:G G A 10 0.57326948002021 0.587256026041615 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 214820524 T/C 1 18 18 36 7.68114935963622 10.3188506403638 -2.63770128072756 T:C T C 10 0.57326948002021 0.402265706696478 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 214826196 G/A 1 13 17 30 5.54749675973727 9.74558116034357 -4.1980844006063 A:G G A 10 0.57326948002021 0.140525503500616 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214826171_214826332:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000391896:exon_214826171_214826332:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000467765:exon_214826171_214826332:CENPF HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 215793834 G/A 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 A:G G A 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000136636:ENST00000259154:exon_215793399_215795073:KCTD3;ENSG00000136636:ENST00000444044:exon_215793399_215795147:KCTD3;ENSG00000136636:ENST00000495537:exon_215793399_215795073:KCTD3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 220197625 G/T 1 7 8 15 2.98711363985853 4.58615584016168 -1.59904220030315 T:G G T 10 0.57326948002021 0.441591135560738 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220197606_220197798:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220197606_220197798:EPRS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 222827619 G/A 1 9 14 23 3.84057467981811 8.02577272028294 -4.18519804046483 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0922104210502733 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222827585_222827640:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222827585_222827640:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222827585_222827640:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222827585_222827640:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000340535:exon_222827585_222827640:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000284471:exon_222827585_222827640:MIA3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 225611661 C/T 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000425080:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000421383:exon_225611623_225611791:LBR HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 226555302 A/G 1 53 53 106 22.6167175589289 30.3832824410711 -7.76656488214226 A:G A G 10 0.57326948002021 0.140743444043544 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226555181_226555309:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000490921:exon_226553655_226555309:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000498787:exon_226555181_226555309:PARP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 226570840 T/C 1 42 36 78 17.9226818391512 20.6377012807276 -2.71501944157638 T:C T C 10 0.57326948002021 0.567839657741228 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226570737_226570884:PARP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 226573364 A/G 1 46 46 92 19.6296039190703 26.3703960809297 -6.74079216185932 A:G A G 10 0.57326948002021 0.170772358177835 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226573205_226573381:PARP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 226589958 G/A 1 32 46 78 13.6553766393533 26.3703960809297 -12.7150194415764 A:G G A 10 0.57326948002021 0.00408319317674392 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226589684_226590080:PARP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 226595647 C/G 1 14 19 33 5.97422727971706 10.892120120384 -4.91789284066693 C:G C G 10 0.57326948002021 0.111857154160159 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226595511_226595774:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226595511_226595776:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226595511_226595717:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226595511_226595683:PARP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 226595659 A/G 1 11 17 28 4.69403571977769 9.74558116034357 -5.05154544056588 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0579356370275021 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226595511_226595774:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226595511_226595776:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226595511_226595717:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226595511_226595683:PARP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 226923264 G/A 1 11 14 25 4.69403571977769 8.02577272028294 -3.33173700050525 A:G G A 10 0.57326948002021 0.224888309077082 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 226923396 G/A 1 7 4 11 2.98711363985853 2.29307792008084 0.694035719777689 A:G G A 10 0.57326948002021 0.767959695054619 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 226924196 C/T 1 9 3 12 3.84057467981811 1.71980844006063 2.12076623975748 T:C C T 10 0.57326948002021 0.256104231229550 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 226925167 G/A 1 6 4 10 2.56038311987874 2.29307792008084 0.267305199797899 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 227920061 T/G 1 41 20 61 17.4959513191714 11.4653896004042 6.03056171876719 T:G T G 10 0.57326948002021 0.12252963264091 ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 227920103 G/A 1 40 16 56 17.0692207991916 9.17231168032336 7.89690911886824 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0417562355778491 ENSG00000143740:ENST00000480897:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000480265:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 227922918 A/C 1 5 10 15 2.13365259989895 5.7326948002021 -3.59904220030315 A:C A C 10 0.57326948002021 0.0702450866322387 ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227922697_227923200:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227922713_227923112:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227922713_227923090:JMJD4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 227935444 A/G 1 9 11 20 3.84057467981811 6.30596428022231 -2.4653896004042 A:G A G 10 0.57326948002021 0.269322135581906 ENSG00000143740:ENST00000475930:exon_227935393_227935887:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000470038:exon_227935393_227935816:SNAP47 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 230829139 A/G 1 14 12 26 5.97422727971706 6.87923376024252 -0.905006480525461 A:G A G 10 0.57326948002021 0.843311627285244 ENSG00000135775:ENST00000366669:exon_230829038_230829728:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366668:exon_230829038_230829728:COG2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 231042732 T/A 1 4 7 11 1.70692207991916 4.01288636014147 -2.30596428022231 A:T T A 10 0.57326948002021 0.223014268684580 ENSG00000143643:ENST00000366661:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000366662:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000414259:exon_231041990_231042765:TTC13 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 231408091 A/G 1 15 17 32 6.40095779969685 9.74558116034357 -3.34462336064672 A:G A G 10 0.57326948002021 0.283704858668405 ENSG00000116906:ENST00000366646:exon_231408058_231408137:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000366647:exon_231408058_231408137:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000416000:exon_231408058_231408137:GNPAT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 233091463 T/A 1 12 2 14 5.12076623975748 1.14653896004042 3.97422727971706 A:T T A 10 0.57326948002021 0.0326866049956063 ENSG00000135778:ENST00000490807:exon_233091303_233091465:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366628:exon_233091303_233091465:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366627:exon_233091303_233091465:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000479125:exon_233091303_233091465:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000487953:exon_233091404_233091465:C1orf57 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 234509972 A/G 1 6 4 10 2.56038311987874 2.29307792008084 0.267305199797899 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000168275:ENST00000366612:exon_234509447_234510135:C1orf31 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 234541801 A/G 1 7 7 14 2.98711363985853 4.01288636014147 -1.02577272028294 A:G A G 10 0.57326948002021 0.5990458397462 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234541649_234541845:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234541649_234543701:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234541649_234542126:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000481183:exon_234541649_234541845:TARBP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 234744413 C/A 1 17 15 32 7.25441883965643 8.59904220030315 -1.34462336064672 A:C C A 10 0.57326948002021 0.721478695176765 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234744241_234745271:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234744193_234745271:IRF2BP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 235383188 A/G 1 36 33 69 15.3622987192724 18.9178928406669 -3.55559412139449 A:G A G 10 0.57326948002021 0.396481755845054 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235383108_235383283:ARID4B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 235392546 T/C 1 19 23 42 8.10787987961601 13.1851980404648 -5.07731816084882 T:C T C 10 0.57326948002021 0.120661493153583 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000418304:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000466653:exon_235391626_235392700:ARID4B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 236700807 T/A 1 13 4 17 5.54749675973727 2.29307792008084 3.25441883965643 A:T T A 10 0.57326948002021 0.142310709307259 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 236700823 T/C 1 13 5 18 5.54749675973727 2.86634740010105 2.68114935963622 T:C T C 10 0.57326948002021 0.239362005539774 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 236700857 C/T 1 10 1 11 4.2673051997979 0.57326948002021 3.69403571977769 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0300213135924451 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 236702374 G/A 1 7 5 12 2.98711363985853 2.86634740010105 0.120766239757479 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236702260_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 236706862 G/C 1 6 9 15 2.56038311987874 5.15942532018189 -2.59904220030315 C:G G C 10 0.57326948002021 0.198144643439766 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236706842_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236706327_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525789:exon_236706596_236706948:LGALS8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 236711323 T/C 1 26 19 45 11.0949935194745 10.892120120384 0.202873399090548 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236711312_236711581:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236711312_236711583:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236711312_236712563:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236711312_236714310:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236711312_236712302:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236711312_236712096:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236711312_236711580:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236711312_236711595:LGALS8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 236716959 C/T 1 11 14 25 4.69403571977769 8.02577272028294 -3.33173700050525 T:C C T 10 0.57326948002021 0.224888309077082 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236716881_236717039:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236716881_236717039:HEATR1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 236717926 T/C 1 15 9 24 6.40095779969685 5.15942532018189 1.24153247951496 T:C T C 10 0.57326948002021 0.683372620411482 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236717898_236718052:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236717898_236718052:HEATR1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 236718620 T/C 1 24 17 41 10.241532479515 9.74558116034357 0.495951319171388 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236718596_236718764:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236718596_236718764:HEATR1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 236719135 T/C 1 13 12 25 5.54749675973727 6.87923376024252 -1.33173700050525 T:C T C 10 0.57326948002021 0.686966178648469 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 236719193 A/G 1 15 14 29 6.40095779969685 8.02577272028294 -1.62481492058609 A:G A G 10 0.57326948002021 0.57654103737025 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 236721610 G/A 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 A:G G A 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 236721660 T/C 1 3 7 10 1.28019155993937 4.01288636014147 -2.7326948002021 T:C T C 10 0.57326948002021 0.109775478323748 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 242045275 C/T 1 6 10 16 2.56038311987874 5.7326948002021 -3.17231168032336 T:C C T 10 0.57326948002021 0.131350999414970 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242045218_242045319:EXO1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 242045283 T/A 1 10 6 16 4.2673051997979 3.43961688012126 0.827688319676639 A:T T A 10 0.57326948002021 0.802879700667955 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242045218_242045319:EXO1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 1 246707858 A/G 1 30 14 44 12.8019155993937 8.02577272028294 4.77614287911076 A:C:G A G 10 0.57326948002021 0.17065784005239 ENSG00000162851:ENST00000366514:exon_246707823_246707983:TFB2M HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 1046712 G/A 1 16 12 28 6.82768831967664 6.87923376024252 -0.0515454405658815 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1046617_1046808:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000491635:exon_1046617_1046808:GTPBP4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 1060218 G/A 1 58 71 129 24.7503701588278 40.7021330814349 -15.9517629226071 A:G G A 10 0.57326948002021 0.00559873333818591 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1060187_1060252:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000483839:exon_1060193_1060252:GTPBP4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 1061767 G/A 1 31 29 60 13.2286461193735 16.6248149205861 -3.3961688012126 A:G G A 10 0.57326948002021 0.433829723969839 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1061693_1061836:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000483839:exon_1061693_1061836:GTPBP4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 3150973 C/T 1 25 15 40 10.6682629994947 8.59904220030315 2.0692207991916 T:C C T 10 0.57326948002021 0.528168155974156 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000468050:exon_3150893_3150985:PFKP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 3172145 C/T 1 41 38 79 17.4959513191714 21.784240240768 -4.28828892159659 T:C C T 10 0.57326948002021 0.363233470249402 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3171199_3172175:PFKP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 3178814 T/A 1 83 150 233 35.4186331583226 85.9904220030315 -50.5717888447089 A:T T A 10 0.57326948002021 2.90968000731402e-11 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3178642_3178997:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3178642_3178985:PFKP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 3178815 G/C 1 151 83 234 64.4363085169483 47.5813668416774 16.8549416752709 C:G G C 10 0.57326948002021 0.0289857550220898 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3178642_3178997:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3178642_3178985:PFKP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 3180227 T/C 0 0 116 116 0 66.4992596823444 -66.4992596823444 C T C 10 0.57326948002021 1.25265008345810e-43 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 3189380 C/T 1 26 12 38 11.0949935194745 6.87923376024252 4.21575975923202 T:C C T 10 0.57326948002021 0.191147804652921 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451454:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3189342_3189442:PITRM1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 3191823 C/T 1 14 14 28 5.97422727971706 8.02577272028294 -2.05154544056588 T:C C T 10 0.57326948002021 0.450176838712125 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3191813_3191945:PITRM1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 3197856 C/G 1 9 2 11 3.84057467981811 1.14653896004042 2.69403571977769 C:G C G 10 0.57326948002021 0.131175688856066 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000430362:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3197783_3197921:PITRM1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 8006798 A/G 1 10 6 16 4.2673051997979 3.43961688012126 0.827688319676639 A:G A G 10 0.57326948002021 0.802879700667955 ENSG00000165632:ENST00000344293:exon_8005883_8007705:TAF3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 11356160 C/T 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 T:C C T 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11356102_11356233:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11356102_11356221:CELF2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 12131218 C/T 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 T:C C T 10 0.57326948002021 0.741310101183539 ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12130985_12131254:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000437298:exon_12130985_12131254:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000415935:exon_12131174_12131254:DHTKD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 12149939 C/T 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12149908_12150014:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000448829:exon_12149908_12150014:DHTKD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 12209752 T/C 1 89 107 196 37.9790162782013 61.3398343621625 -23.3608180839612 A:T:C T C 10 0.57326948002021 0.00086120862769017 ENSG00000065665:ENST00000475268:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000495368:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000165609:ENST00000491614:exon_12207324_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378937:exon_12209575_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378952:exon_12209671_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000476462:exon_12209737_12209810:NUDT5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 12228298 C/T 1 24 22 46 10.241532479515 12.6119285604446 -2.37039608092966 T:C C T 10 0.57326948002021 0.551532028814459 ENSG00000165609:ENST00000491614:exon_12228228_12228331:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378929:exon_12228228_12228331:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378937:exon_12228228_12228331:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378952:exon_12228228_12228331:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378940:exon_12228228_12228331:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378927:exon_12228228_12228331:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000444732:exon_12228228_12228331:NUDT5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 13151224 G/A 1 16 18 34 6.82768831967664 10.3188506403638 -3.49116232068714 A:G G A 10 0.57326948002021 0.230426739072596 ENSG00000123240:ENST00000263036:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378764:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000396951:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000487935:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000482140:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378757:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000430081:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378752:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378748:exon_13151097_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378747:exon_13151112_13151288:OPTN HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 13375906 T/C 1 10 7 17 4.2673051997979 4.01288636014147 0.254418839656429 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000086475:ENST00000327347:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000319684:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000378614:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000413411:exon_13375877_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000425947:exon_13375901_13375971:SEPHS1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 22839628 T/C 1 14 17 31 5.97422727971706 9.74558116034357 -3.77135388062651 T:C T C 10 0.57326948002021 0.204011615668564 ENSG00000150867:ENST00000323883:exon_22839588_22839701:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376573:exon_22839588_22839701:PIP4K2A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 25313818 C/T 1 9 5 14 3.84057467981811 2.86634740010105 0.974227279717059 T:C C T 10 0.57326948002021 0.788481610276296 ENSG00000185875:ENST00000524413:exon_25312105_25315593:THNSL1;ENSG00000185875:ENST00000376356:exon_25312105_25315593:THNSL1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 27400861 G/A 1 70 79 149 29.8711363985853 45.2882889215966 -15.4171525230113 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0127326835127914 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27399383_27401049:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27399383_27401049:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27399383_27401049:YME1L1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 27475444 T/C 1 25 18 43 10.6682629994947 10.3188506403638 0.349412359130968 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 27475494 T/C 1 24 24 48 10.241532479515 13.758467520485 -3.51693504097008 A:T:C T C 10 0.57326948002021 0.310834366076995 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 30728101 T/C 1 164 236 400 69.9838052766856 135.29159728477 -65.307792008084 T:C T C 10 0.57326948002021 6.70345760977203e-11 ENSG00000107968:ENST00000375328:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000263056:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000415139:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375322:exon_30727845_30728371:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000413724:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375321:exon_30727751_30728203:MAP3K8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 32304440 T/C 1 7 10 17 2.98711363985853 5.7326948002021 -2.74558116034357 T:C T C 10 0.57326948002021 0.221546928311467 ENSG00000170759:ENST00000302418:exon_32304437_32304587:KIF5B;ENSG00000170759:ENST00000403329:exon_32304437_32304587:KIF5B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 35302705 C/T 1 13 12 25 5.54749675973727 6.87923376024252 -1.33173700050525 T:C C T 10 0.57326948002021 0.686966178648469 ENSG00000108094:ENST00000374751:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374748:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374746:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374749:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374754:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374742:exon_35302627_35302728:CUL2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 43315693 G/A 1 19 21 40 8.10787987961601 12.0386590804244 -3.9307792008084 A:G G A 10 0.57326948002021 0.262881037202777 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43315684_43315872:BMS1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 43319197 G/A 1 32 54 86 13.6553766393533 30.9565519210913 -17.3011752817381 A:G G A 10 0.57326948002021 0.000187584818730592 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43319057_43319232:BMS1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 43883342 T/A 1 39 40 79 16.6424902792118 22.9307792008084 -6.2882889215966 A:T T A 10 0.57326948002021 0.172238731002053 ENSG00000169813:ENST00000357065:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000356053:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000443950:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000337970:exon_43881470_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000477108:exon_43883037_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000498176:exon_43883091_43883384:HNRNPF HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 44112245 G/A 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000198298:ENST00000361807:exon_44111739_44113351:ZNF485;ENSG00000198298:ENST00000374437:exon_44111739_44113351:ZNF485;ENSG00000198298:ENST00000374435:exon_44111739_44113351:ZNF485 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 63829539 C/T 1 15 11 26 6.40095779969685 6.30596428022231 0.0949935194745386 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000150347:ENST00000279873:exon_63829459_63829556:ARID5B;ENSG00000150347:ENST00000309334:exon_63829459_63829556:ARID5B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 64565011 G/A 1 5 5 10 2.13365259989895 2.86634740010105 -0.732694800202101 A:G G A 10 0.57326948002021 0.752834960365011 ENSG00000181915:ENST00000373783:exon_64564516_64568238:ADO HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 64952834 C/T 1 5 8 13 2.13365259989895 4.58615584016168 -2.45250324026273 T:C C T 10 0.57326948002021 0.261241293669647 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64952698_64952911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64952698_64952857:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64952698_64952911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000327520:exon_64952698_64952911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000497922:exon_64952698_64953097:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000490669:exon_64952699_64952911:JMJD1C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 70679637 A/T 1 6 9 15 2.56038311987874 5.15942532018189 -2.59904220030315 A:T A T 10 0.57326948002021 0.198144643439766 ENSG00000107625:ENST00000373585:exon_70679588_70679737:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000494889:exon_70679588_70679737:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000460470:exon_70679588_70679737:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000466265:exon_70679610_70679737:DDX50 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 70700944 A/G 1 27 29 56 11.5217240394543 16.6248149205861 -5.10309088113176 A:G A G 10 0.57326948002021 0.178271258277448 ENSG00000107625:ENST00000373585:exon_70700816_70700950:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000466265:exon_70700816_70700950:DDX50 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 71874683 G/A 1 36 58 94 15.3622987192724 33.2496298411722 -17.8873311218997 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0002327328010371 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 71874734 G/A 1 27 43 70 11.5217240394543 24.650587640869 -13.1288636014147 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0022718556910516 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 71874784 C/T 1 11 18 29 4.69403571977769 10.3188506403638 -5.62481492058609 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0392889833415210 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 71876382 C/T 1 47 42 89 20.0563344390501 24.0773181608488 -4.0209837217987 T:C C T 10 0.57326948002021 0.393325293320041 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71876378_71876539:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71876378_71876530:AIFM2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 71974300 A/T 1 9 23 32 3.84057467981811 13.1851980404648 -9.34462336064672 A:T A T 10 0.57326948002021 0.00104342009326488 ENSG00000180817:ENST00000373232:exon_71974256_71974342:PPA1;ENSG00000180817:ENST00000373230:exon_71974256_71974342:PPA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 74894375 T/C 1 47 59 106 20.0563344390501 33.8228993211924 -13.7665648821423 T:C T C 10 0.57326948002021 0.00784826688556383 ENSG00000122882:ENST00000494307:exon_74894361_74894512:ECD;ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74893414_74894571:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74894283_74894571:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74894283_74894571:ECD HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 74896664 T/C 1 20 19 39 8.5346103995958 10.892120120384 -2.35750972078819 T:C T C 10 0.57326948002021 0.517909441520215 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74896462_74896676:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74896462_74896676:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74896462_74896676:ECD HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 74897816 C/T 1 19 15 34 8.10787987961601 8.59904220030315 -0.491162320687142 T:C C T 10 0.57326948002021 0.864181187644753 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74897761_74897828:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74897761_74897828:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74897761_74897828:ECD HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 74899134 C/G 1 19 13 32 8.10787987961601 7.45250324026273 0.655376639353278 C:G C G 10 0.57326948002021 0.860030624222388 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74899067_74899253:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74899067_74899253:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74899067_74899253:ECD HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 74916173 T/A 1 7 7 14 2.98711363985853 4.01288636014147 -1.02577272028294 A:T T A 10 0.57326948002021 0.5990458397462 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000484976:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000453402:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000413026:exon_74916033_74916211:ECD HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 74923562 C/T 1 12 6 18 5.12076623975748 3.43961688012126 1.68114935963622 T:C C T 10 0.57326948002021 0.482786461758876 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74923491_74923708:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74923491_74923708:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74923491_74923708:ECD;ENSG00000122882:ENST00000413026:exon_74923491_74923708:ECD HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 75006804 A/G 1 8 11 19 3.41384415983832 6.30596428022231 -2.89212012038399 A:G A G 10 0.57326948002021 0.245610170938846 ENSG00000213551:ENST00000372950:exon_75006768_75008620:DNAJC9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 75148116 A/G 1 23 14 37 9.81480195953517 8.02577272028294 1.78902923925223 A:G A G 10 0.57326948002021 0.620118304579096 ENSG00000138279:ENST00000372921:exon_75148070_75148172:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000372919:exon_75148070_75148172:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000492380:exon_75148070_75148172:ANXA7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 75558867 G/A 1 8 8 16 3.41384415983832 4.58615584016168 -1.17231168032336 A:G G A 10 0.57326948002021 0.617511810756066 ENSG00000214655:ENST00000412131:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000436194:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000414462:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000398706:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000433366:exon_75558760_75559669:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000492395:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000412198:exon_75558760_75559248:KIAA0913 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 75562161 C/A 1 28 23 51 11.9484545594341 13.1851980404648 -1.23674348103071 A:C C A 10 0.57326948002021 0.777708752732904 ENSG00000166507:ENST00000309979:exon_75561669_75562334:NDST2;ENSG00000166507:ENST00000299641:exon_75561669_75562334:NDST2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 81926718 A/G 1 73 101 174 31.1513279585247 57.9002174820412 -26.7488895235165 A:G A G 10 0.57326948002021 5.94683086137959e-05 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000481805:exon_81926155_81926740:ANXA11 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 90762938 G/A 1 8 2 10 3.41384415983832 1.14653896004042 2.2673051997979 A:G G A 10 0.57326948002021 0.205360643158888 ENSG00000026103:ENST00000371875:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355740:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000352159:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000484444:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000357339:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000494410:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000479522:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000488877:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000492756:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355279:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000460510:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000477270:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000313771:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000466081:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000371857:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000494799:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000487314:exon_90762786_90762951:FAS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 91479211 G/T 1 10 13 23 4.2673051997979 7.45250324026273 -3.18519804046483 T:G G T 10 0.57326948002021 0.207996353000423 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91479176_91479463:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91479176_91479463:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91479176_91479463:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91479176_91479463:KIF20B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 91484780 G/A 1 19 10 29 8.10787987961601 5.7326948002021 2.37518507941391 A:G G A 10 0.57326948002021 0.454314630634957 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91484777_91484915:KIF20B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 91497631 T/A 1 8 22 30 3.41384415983832 12.6119285604446 -9.1980844006063 A:T T A 10 0.57326948002021 0.00124456215519714 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 91498254 A/G 1 12 13 25 5.12076623975748 7.45250324026273 -2.33173700050525 A:G A G 10 0.57326948002021 0.419590889375568 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 91498318 A/G 1 16 14 30 6.82768831967664 8.02577272028294 -1.1980844006063 A:G A G 10 0.57326948002021 0.713630396278199 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 91503660 A/G 1 12 13 25 5.12076623975748 7.45250324026273 -2.33173700050525 A:G A G 10 0.57326948002021 0.419590889375568 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91503565_91503684:KIF20B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 91522548 A/G 1 6 6 12 2.56038311987874 3.43961688012126 -0.879233760242521 A:G A G 10 0.57326948002021 0.771962928640395 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91522395_91522592:KIF20B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 95259979 C/G 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 C:G C G 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95259797_95259991:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95259797_95259991:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95259797_95259991:CEP55 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 95279506 A/T 1 10 5 15 4.2673051997979 2.86634740010105 1.40095779969685 A:T A T 10 0.57326948002021 0.604487754064262 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000496302:exon_95279439_95280034:CEP55 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 95454681 G/C 1 38 23 61 16.215759759232 13.1851980404648 3.03056171876719 C:G G C 10 0.57326948002021 0.517829808157771 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95454618_95454694:FRA10AC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 95458141 A/G 1 40 17 57 17.0692207991916 9.74558116034357 7.32363963884803 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0600898334095655 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95458058_95458153:FRA10AC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 96313960 A/C 1 10 9 19 4.2673051997979 5.15942532018189 -0.892120120383991 A:C A C 10 0.57326948002021 0.817360355716801 ENSG00000119969:ENST00000419900:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000348459:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000437940:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000371332:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394045:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394044:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394036:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000239026:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000462057:exon_96313881_96314005:HELLS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 97023630 T/C 1 228 225 453 97.2945585553921 128.985633004547 -31.6910744491551 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0027533038386264 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_97023621_97023820:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000477757:exon_97023621_97023820:PDLIM1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 97388162 G/A 1 9 9 18 3.84057467981811 5.15942532018189 -1.31885064036378 A:G G A 10 0.57326948002021 0.635341898612975 ENSG00000059573:ENST00000371224:exon_97388125_97388249:ALDH18A1;ENSG00000059573:ENST00000371221:exon_97388125_97388249:ALDH18A1;ENSG00000059573:ENST00000489386:exon_97388125_97388249:ALDH18A1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 97604406 A/G 1 8 3 11 3.41384415983832 1.71980844006063 1.69403571977769 A:G A G 10 0.57326948002021 0.372574328023575 ENSG00000138185:ENST00000490659:exon_97604233_97604604:ENTPD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 97605057 C/G 1 6 9 15 2.56038311987874 5.15942532018189 -2.59904220030315 C:G C G 10 0.57326948002021 0.198144643439766 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 97990583 A/G 1 14 26 40 5.97422727971706 14.9050064805255 -8.9307792008084 A:G A G 10 0.57326948002021 0.00591972612799279 ENSG00000095585:ENST00000413476:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393894:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000428924:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000427367:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000224337:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000371176:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393889:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000467799:exon_97990550_97990590:BLNK HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 101502968 A/G 1 20 29 49 8.5346103995958 16.6248149205861 -8.09020452099029 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0210373755083941 ENSG00000119929:ENST00000493385:exon_101502910_101503080:CUTC;ENSG00000119929:ENST00000370476:exon_101502910_101503119:CUTC;ENSG00000119929:ENST00000471520:exon_101502910_101503119:CUTC;ENSG00000119929:ENST00000370472:exon_101502910_101503119:CUTC HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 103340056 G/A 1 6 7 13 2.56038311987874 4.01288636014147 -1.45250324026273 A:G G A 10 0.57326948002021 0.418185809776403 ENSG00000166171:ENST00000470165:exon_103339817_103340065:DPCD;ENSG00000166169:ENST00000299206:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370174:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370169:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000339310:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370172:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370168:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000463515:exon_103340005_103341982:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370162:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000436284:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370158:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000456836:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000416979:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370164:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370157:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000415897:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000485369:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000429502:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000470140:exon_103340009_103340173:POLL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 103340144 A/G 1 4 8 12 1.70692207991916 4.58615584016168 -2.87923376024252 A:G A G 10 0.57326948002021 0.141786607964141 ENSG00000166169:ENST00000299206:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370174:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370169:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000339310:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370172:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370168:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000463515:exon_103340005_103341982:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370162:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000436284:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370158:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000456836:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000416979:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370164:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370157:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000415897:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000485369:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000429502:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000470140:exon_103340009_103340173:POLL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 103361088 C/T 1 8 9 17 3.41384415983832 5.15942532018189 -1.74558116034357 T:C C T 10 0.57326948002021 0.464916768474155 ENSG00000166171:ENST00000370151:exon_103360960_103361093:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370147:exon_103360960_103361093:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370148:exon_103360960_103361093:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370149:exon_103360960_103361093:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000434727:exon_103360960_103361093:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000475443:exon_103360960_103361093:DPCD HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 103368654 T/C 1 10 17 27 4.2673051997979 9.74558116034357 -5.47827596054567 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0495781269238746 ENSG00000166171:ENST00000370151:exon_103368592_103368694:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370147:exon_103368624_103368694:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370148:exon_103368624_103368659:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000475443:exon_103368624_103368801:DPCD HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 104140350 G/A 1 14 15 29 5.97422727971706 8.59904220030315 -2.62481492058609 A:G G A 10 0.57326948002021 0.351504521856456 ENSG00000107862:ENST00000369983:exon_104140263_104140443:GBF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 104436641 C/T 1 34 26 60 14.5088376793129 14.9050064805255 -0.396168801212603 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000138175:ENST00000260746:exon_104436315_104436698:ARL3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 104849468 G/A 1 14 7 21 5.97422727971706 4.01288636014147 1.96134091957559 A:G G A 10 0.57326948002021 0.509441892718872 ENSG00000076685:ENST00000343289:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000423468:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369871:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000404739:exon_104847774_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369857:exon_104847942_104849665:NT5C2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 115485285 T/C 1 3 6 9 1.28019155993937 3.43961688012126 -2.15942532018189 T:C T C 10 0.57326948002021 0.183674374674640 ENSG00000165806:ENST00000429617:exon_115485121_115485296:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369321:exon_115485121_115485296:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000345633:exon_115485121_115485296:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369318:exon_115485121_115485296:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000442393:exon_115485285_115485296:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369315:exon_115485121_115485296:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000298700:exon_115485121_115485296:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000452490:exon_115485121_115485296:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000487232:exon_115485121_115485296:CASP7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 120631889 C/T 1 52 1 53 22.1899870389491 0.57326948002021 21.6167175589289 T:C C T 10 0.57326948002021 1.00235891998161e-11 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 120933324 G/A 1 13 8 21 5.54749675973727 4.58615584016168 0.961340919575589 A:G G A 10 0.57326948002021 0.826246679179264 ENSG00000165672:ENST00000356951:exon_120933249_120933384:PRDX3;ENSG00000165672:ENST00000298510:exon_120933249_120933384:PRDX3;ENSG00000165672:ENST00000463322:exon_120933257_120933384:PRDX3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 121596498 C/T 1 23 18 41 9.81480195953517 10.3188506403638 -0.504048680828612 T:C C T 10 0.57326948002021 0.875869234765251 ENSG00000197771:ENST00000360003:exon_121596408_121596541:C10orf119;ENSG00000197771:ENST00000369077:exon_121596408_121596541:C10orf119;ENSG00000197771:ENST00000466047:exon_121596408_121596541:C10orf119 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 121685559 G/A 1 8 4 12 3.41384415983832 2.29307792008084 1.12076623975748 A:G G A 10 0.57326948002021 0.573925568669172 ENSG00000107651:ENST00000369075:exon_121685548_121685739:SEC23IP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 121693246 A/G 1 10 11 21 4.2673051997979 6.30596428022231 -2.03865908042441 A:G A G 10 0.57326948002021 0.385389697267756 ENSG00000107651:ENST00000369075:exon_121693198_121693299:SEC23IP;ENSG00000107651:ENST00000475542:exon_121693198_121693282:SEC23IP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 122663585 G/A 1 7 4 11 2.98711363985853 2.29307792008084 0.694035719777689 A:G G A 10 0.57326948002021 0.767959695054619 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000415501:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122663559_122663654:WDR11 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 123670505 G/A 1 9 5 14 3.84057467981811 2.86634740010105 0.974227279717059 A:G G A 10 0.57326948002021 0.788481610276296 ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123670421_123670666:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123670421_123670666:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123670421_123670666:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000423243:exon_123670421_123670666:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000455628:exon_123670421_123670666:ATE1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 124742792 G/A 1 8 2 10 3.41384415983832 1.14653896004042 2.2673051997979 A:G G A 10 0.57326948002021 0.205360643158888 ENSG00000179988:ENST00000465232:exon_124742788_124743030:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000368887:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000405485:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000406217:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483455:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000497219:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000493461:exon_124742788_124745763:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483755:exon_124742788_124742986:PSTK HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 126089434 G/A 1 9 10 19 3.84057467981811 5.7326948002021 -1.89212012038399 A:G G A 10 0.57326948002021 0.487623161721597 ENSG00000065154:ENST00000368845:exon_126089409_126089553:OAT;ENSG00000065154:ENST00000471127:exon_126089409_126089553:OAT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 126172863 A/G 1 3 8 11 1.28019155993937 4.58615584016168 -3.30596428022231 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0642027293927821 ENSG00000107902:ENST00000392757:exon_126172708_126172895:LHPP;ENSG00000107902:ENST00000368842:exon_126172708_126172895:LHPP;ENSG00000107902:ENST00000368839:exon_126172708_126172895:LHPP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 126480381 C/T 1 8 2 10 3.41384415983832 1.14653896004042 2.2673051997979 T:C C T 10 0.57326948002021 0.205360643158888 ENSG00000203791:ENST00000466270:exon_126480293_126480437:METTL10;ENSG00000203791:ENST00000368837:exon_126480293_126480407:METTL10;ENSG00000203791:ENST00000368836:exon_126480293_126480439:METTL10;ENSG00000203791:ENST00000464099:exon_126480293_126480437:METTL10;ENSG00000203791:ENST00000358960:exon_126480293_126480407:METTL10;ENSG00000203791:ENST00000426050:exon_126480293_126480407:METTL10;ENSG00000203791:ENST00000483542:exon_126480293_126480446:METTL10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 127530325 T/C 1 15 13 28 6.40095779969685 7.45250324026273 -1.05154544056588 T:C T C 10 0.57326948002021 0.705949684866759 ENSG00000107949:ENST00000299130:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000107949:ENST00000429863:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000089876:ENST00000368721:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284690:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284688:exon_127530312_127530503:DHX32 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 131506192 C/T 1 57 31 88 24.323639638848 17.7713538806265 6.55228575822152 T:C C T 10 0.57326948002021 0.162996751418035 ENSG00000170430:ENST00000306010:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000440826:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000462672:exon_131506159_131506307:MGMT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 131506283 C/T 1 38 22 60 16.215759759232 12.6119285604446 3.6038311987874 T:C C T 10 0.57326948002021 0.364296052503765 ENSG00000170430:ENST00000306010:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000440826:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000462672:exon_131506159_131506307:MGMT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 133761285 G/A 1 36 22 58 15.3622987192724 12.6119285604446 2.75037015882782 A:G G A 10 0.57326948002021 0.508636405380874 ENSG00000175470:ENST00000455566:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000482010:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000422256:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000398018:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000490777:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000470416:exon_133761034_133761295:PPP2R2D HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 133769482 G/C 1 54 65 119 23.0434480789087 37.2625162013137 -14.219068122405 C:G G C 10 0.57326948002021 0.00933871519510697 ENSG00000175470:ENST00000455566:exon_133769188_133773331:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000482010:exon_133769188_133770059:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000422256:exon_133769188_133770037:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000398018:exon_133769188_133770051:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000490777:exon_133769188_133769746:PPP2R2D HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 134145136 A/G 1 22 3 25 9.38807143955538 1.71980844006063 7.66826299949475 A:G A G 10 0.57326948002021 0.00178158268659696 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 134145138 C/G 1 21 3 24 8.96134091957559 1.71980844006063 7.24153247951496 C:G C G 10 0.57326948002021 0.00294997956356510 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 134145153 G/A 0 19 0 19 8.10787987961601 0 8.10787987961601 G G 10 0.57326948002021 2.81261925897944e-05 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 134145166 T/C 1 17 1 18 7.25441883965643 0.57326948002021 6.68114935963622 T:C T C 10 0.57326948002021 0.00114577621103584 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 134145293 G/T 1 16 7 23 6.82768831967664 4.01288636014147 2.81480195953517 T:G G T 10 0.57326948002021 0.293949418892179 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 134145314 A/G 1 4 10 14 1.70692207991916 5.7326948002021 -4.02577272028294 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0543340383697456 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 10 135233032 C/T 1 11 28 39 4.69403571977769 16.0515454405659 -11.3575097207882 T:C:G C T 10 0.57326948002021 0.000283274265716463 ENSG00000254536:ENST00000468317:exon_135232984_135233096:RP11-108K14.8;ENSG00000148824:ENST00000477902:exon_135232984_135233096:MTG1;ENSG00000148824:ENST00000317502:exon_135232984_135233096:MTG1;ENSG00000148824:ENST00000432508:exon_135232984_135233096:MTG1;ENSG00000148824:ENST00000460848:exon_135232984_135233096:MTG1;ENSG00000148824:ENST00000473735:exon_135232984_135233096:MTG1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 293126 C/T 1 1 12 13 0.42673051997979 6.87923376024252 -6.45250324026273 T:C C T 10 0.57326948002021 0.000287295249188175 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_292886_293502:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_293068_293235:ATHL1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 294119 C/T 1 21 48 69 8.96134091957559 27.5169350409701 -18.5555941213945 T:C C T 10 0.57326948002021 7.80855790761025e-06 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000476372:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000397660:exon_294099_294196:ATHL1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 294375 C/T 1 35 37 72 14.9355681992926 21.2109707607478 -6.27540256145512 T:C C T 10 0.57326948002021 0.152740170590231 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_294267_294478:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_294267_294478:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_294267_294478:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_294267_294478:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_294267_294478:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000476372:exon_294267_294478:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000397660:exon_294321_294478:ATHL1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 500540 G/A 1 25 39 64 10.6682629994947 22.3575097207882 -11.6892467212934 A:G G A 10 0.57326948002021 0.00353086573743816 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_500484_500738:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529115:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000527485:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529368:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529306:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000524780:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000531149:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000531223:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000528713:exon_499897_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000526013:exon_500486_500655:RNH1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 680979 G/A 1 13 7 20 5.54749675973727 4.01288636014147 1.5346103995958 A:G G A 10 0.57326948002021 0.652301753764728 ENSG00000177030:ENST00000359958:exon_680963_681089:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000338675:exon_680963_681089:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000527170:exon_680963_681089:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000382409:exon_680963_681089:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000388804:exon_680963_681089:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000525904:exon_680963_681045:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000530813:exon_680963_681089:DEAF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 763350 C/G 1 154 140 294 65.7165000768877 80.2577272028294 -14.5412271259418 C:G C G 10 0.57326948002021 0.0875833667377668 ENSG00000177156:ENST00000319006:exon_763344_763519:TALDO1;ENSG00000177156:ENST00000528070:exon_763344_763520:TALDO1;ENSG00000177156:ENST00000528097:exon_763344_763519:TALDO1;ENSG00000177156:ENST00000530440:exon_763344_763519:TALDO1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 771034 A/G 1 32 21 53 13.6553766393533 12.0386590804244 1.61671755892887 A:G A G 10 0.57326948002021 0.679726746950893 ENSG00000177225:ENST00000465313:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000319863:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000354286:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000479959:exon_768386_771467:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000524550:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000532320:exon_770550_771426:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000530209:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000534603:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000529966:exon_770993_771212:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000533960:exon_770844_771104:PDDC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 793588 G/A 1 8 3 11 3.41384415983832 1.71980844006063 1.69403571977769 A:G G A 10 0.57326948002021 0.372574328023575 ENSG00000177542:ENST00000320230:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000531214:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000481290:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000531437:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000529351:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000533385:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000526152:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000528606:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000527734:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000527723:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000531514:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000528936:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000456706:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000532484:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000524891:exon_793478_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000529066:exon_793587_793619:SLC25A22 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 823809 C/G 1 28 29 57 11.9484545594341 16.6248149205861 -4.67636036115197 C:G C G 10 0.57326948002021 0.229154444163492 ENSG00000177666:ENST00000336615:exon_823694_823855:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000525250:exon_823527_824130:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000529255:exon_823694_824130:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000526083:exon_823648_823855:PNPLA2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 824789 T/C 1 27 17 44 11.5217240394543 9.74558116034357 1.77614287911076 T:C T C 10 0.57326948002021 0.649272581743253 ENSG00000177666:ENST00000336615:exon_824523_825573:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000525250:exon_824523_825219:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000529255:exon_824523_825218:PNPLA2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 824805 C/T 1 36 23 59 15.3622987192724 13.1851980404648 2.17710067880761 T:C C T 10 0.57326948002021 0.600827257182185 ENSG00000177666:ENST00000336615:exon_824523_825573:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000525250:exon_824523_825219:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000529255:exon_824523_825218:PNPLA2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 837582 G/A 1 40 53 93 17.0692207991916 30.3832824410711 -13.3140616418795 A:G G A 10 0.57326948002021 0.00620569892760417 ENSG00000177697:ENST00000397420:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000397421:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000436957:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000322008:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000529810:exon_837460_837613:CD151;ENSG00000177697:ENST00000528143:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000530726:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000532045:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000528011:exon_837460_837612:CD151;ENSG00000177697:ENST00000532075:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_837356_837605:POLR2L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 840477 A/G 1 223 188 411 95.1609059554932 107.774662243799 -12.6137562883063 A:G A G 10 0.57326948002021 0.212756680989991 ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_840262_840480:POLR2L;ENSG00000177700:ENST00000322028:exon_839721_840480:POLR2L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 985547 C/T 1 4 8 12 1.70692207991916 4.58615584016168 -2.87923376024252 T:C C T 10 0.57326948002021 0.141786607964141 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000417081:exon_985435_985586:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_985435_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000329626:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000534328:exon_985435_985597:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_985435_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528815:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527007:exon_983146_987654:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527917:exon_985384_985582:AP2A2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 1311474 G/A 1 26 15 41 11.0949935194745 8.59904220030315 2.49595131917139 A:G G A 10 0.57326948002021 0.528258555322996 ENSG00000078902:ENST00000317204:exon_1311457_1311639:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000527886:exon_1311457_1311639:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000263646:exon_1311457_1311639:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000382211:exon_1311457_1311639:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000530506:exon_1311457_1311639:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000530541:exon_1311457_1311639:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000528719:exon_1311457_1311639:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000527746:exon_1311325_1311639:TOLLIP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 1775350 C/T 0 24 0 24 10.241532479515 0 10.241532479515 C C 10 0.57326948002021 2.29355090872990e-06 ENSG00000250644:ENST00000427721:exon_1775224_1775368:RP11-295K3.1;ENSG00000117984:ENST00000236671:exon_1775224_1775368:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000407742:exon_1775224_1775368:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000433655:exon_1775224_1775361:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000429746:exon_1775224_1775485:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000497544:exon_1775035_1775368:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000438213:exon_1775254_1775368:CTSD HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 1780205 A/G 1 19 18 37 8.10787987961601 10.3188506403638 -2.21097076074777 A:G A G 10 0.57326948002021 0.507854734300884 ENSG00000250644:ENST00000427721:exon_1780199_1780281:RP11-295K3.1;ENSG00000117984:ENST00000236671:exon_1780199_1780317:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000407742:exon_1780199_1780317:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000433655:exon_1780199_1780317:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000438213:exon_1780199_1780317:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000367196:exon_1780199_1780317:CTSD HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 1780867 G/A 1 14 14 28 5.97422727971706 8.02577272028294 -2.05154544056588 A:G G A 10 0.57326948002021 0.450176838712125 ENSG00000117984:ENST00000236671:exon_1780746_1780869:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000407742:exon_1780746_1780869:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000433655:exon_1780746_1780869:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000438213:exon_1780746_1780869:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000367196:exon_1780746_1780869:CTSD HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 1782594 G/A 1 11 9 20 4.69403571977769 5.15942532018189 -0.465389600404201 A:G G A 10 0.57326948002021 0.825497110151158 ENSG00000117984:ENST00000236671:exon_1782539_1782698:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000407742:exon_1782539_1782698:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000433655:exon_1782539_1782698:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000438213:exon_1782539_1782770:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000367196:exon_1782539_1782698:CTSD HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 1977552 G/A 1 226 226 452 96.4410975154325 129.558902484567 -33.117804969135 A:G G A 10 0.57326948002021 0.00196333280256777 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1977486_1977825:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1977486_1977678:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000484918:exon_1977486_1977576:MRPL23 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 3028140 G/A 1 58 55 113 24.7503701588278 31.5298214011116 -6.77945124228374 A:G G A 10 0.57326948002021 0.216421873219583 ENSG00000110619:ENST00000380525:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000531387:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397111:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397114:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000484484:exon_3028109_3028240:CARS;ENSG00000110619:ENST00000278224:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000466442:exon_3028109_3030127:CARS;ENSG00000110619:ENST00000470221:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000526890:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000529772:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000401769:exon_3028109_3028189:CARS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 3381369 G/C 1 14 13 27 5.97422727971706 7.45250324026273 -1.47827596054567 C:G G C 10 0.57326948002021 0.566216117859316 ENSG00000005801:ENST00000354599:exon_3379157_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000399602:exon_3379996_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000429541:exon_3380175_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000005082:exon_3380224_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000526601:exon_3380347_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000343338:exon_3381174_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000438262:exon_3381227_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000528410:exon_3381269_3381795:ZNF195 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 3381843 A/G 1 8 4 12 3.41384415983832 2.29307792008084 1.12076623975748 A:G A G 10 0.57326948002021 0.573925568669172 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 4103524 A/G 1 3 7 10 1.28019155993937 4.01288636014147 -2.7326948002021 A:G A G 10 0.57326948002021 0.109775478323748 ENSG00000167323:ENST00000300737:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000527651:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533977:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000526596:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533343:exon_4103435_4103581:STIM1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 4141132 C/A 1 8 6 14 3.41384415983832 3.43961688012126 -0.0257727202829408 A:C C A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528442:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4141075_4141200:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000526304:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528470:exon_4141075_4141158:RRM1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 4159457 A/G 1 79 60 139 33.7117110784034 34.3961688012126 -0.684457722809199 A:G A G 10 0.57326948002021 0.93176535754648 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4159425_4160100:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4159425_4160106:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4159425_4159676:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4159425_4160105:RRM1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 5664831 C/A 1 10 4 14 4.2673051997979 2.29307792008084 1.97422727971706 A:C C A 10 0.57326948002021 0.419102837465114 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000495668:exon_5664374_5665039:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5664374_5665628:TRIM34 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 5719667 T/C 1 37 31 68 15.7890292392522 17.7713538806265 -1.98232464137429 T:C T C 10 0.57326948002021 0.626255050956474 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5719545_5719706:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 6415690 G/A 1 10 11 21 4.2673051997979 6.30596428022231 -2.03865908042441 A:G G A 10 0.57326948002021 0.385389697267756 ENSG00000166311:ENST00000299397:exon_6415428_6416225:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000356761:exon_6415428_6416225:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000342245:exon_6415428_6416225:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000534405:exon_6415428_6416221:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000527275:exon_6415428_6416008:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000533123:exon_6415428_6416228:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000531303:exon_6415408_6416008:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000526280:exon_6415428_6416228:SMPD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 9304939 T/C 1 7 1 8 2.98711363985853 0.57326948002021 2.41384415983832 T:C T C 10 0.57326948002021 0.149609550462636 ENSG00000166471:ENST00000299596:exon_9304918_9305140:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000524543:exon_9302201_9305140:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000429086:exon_9304918_9305140:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000528080:exon_9302218_9305140:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000533867:exon_9304686_9305140:TMEM41B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 9549142 G/A 1 17 10 27 7.25441883965643 5.7326948002021 1.52172403945433 A:G G A 10 0.57326948002021 0.697977533739461 ENSG00000166478:ENST00000396604:exon_9549077_9549601:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000396602:exon_9549077_9550071:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000530463:exon_9549077_9549160:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000396597:exon_9549077_9549193:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000299606:exon_9549077_9549828:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000532305:exon_9549077_9549499:ZNF143 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 10555589 A/G 1 9 8 17 3.84057467981811 4.58615584016168 -0.745581160343571 A:G A G 10 0.57326948002021 0.807894812450834 ENSG00000110315:ENST00000265981:exon_10555563_10555752:RNF141;ENSG00000110315:ENST00000528665:exon_10555563_10555752:RNF141;ENSG00000110315:ENST00000533412:exon_10555563_10555752:RNF141;ENSG00000110315:ENST00000530156:exon_10555563_10555752:RNF141 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 11976691 T/C 1 27 42 69 11.5217240394543 24.0773181608488 -12.5555941213945 T:C T C 10 0.57326948002021 0.00319038123196414 ENSG00000170242:ENST00000339865:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000527733:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000399455:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000305481:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000529813:exon_11976581_11976711:USP47 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 11977573 T/C 1 51 38 89 21.7632565189693 21.784240240768 -0.0209837217986966 T:C:G T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000170242:ENST00000339865:exon_11977548_11980870:USP47;ENSG00000170242:ENST00000527733:exon_11977548_11977968:USP47;ENSG00000170242:ENST00000399455:exon_11977548_11980870:USP47;ENSG00000170242:ENST00000305481:exon_11977548_11980701:USP47;ENSG00000170242:ENST00000529813:exon_11977548_11978492:USP47 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 13729639 G/A 1 2 6 8 0.85346103995958 3.43961688012126 -2.58615584016168 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0801462458318362 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 13729640 A/T 1 2 6 8 0.85346103995958 3.43961688012126 -2.58615584016168 A:T A T 10 0.57326948002021 0.0801462458318362 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 17351683 C/G 1 36 14 50 15.3622987192724 8.02577272028294 7.3365259989895 C:G C G 10 0.57326948002021 0.0443605971712303 ENSG00000070081:ENST00000532658:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000533773:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000405119:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000323688:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000529010:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000458064:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000527580:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000531242:exon_17351674_17351844:NUCB2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 18108512 T/C 1 5 5 10 2.13365259989895 2.86634740010105 -0.732694800202101 T:C T C 10 0.57326948002021 0.752834960365011 ENSG00000166788:ENST00000524803:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000300013:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531751:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531581:exon_18108409_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000529318:exon_18108404_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531216:exon_18108413_18108601:SAAL1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 27362359 T/G 1 17 17 34 7.25441883965643 9.74558116034357 -2.49116232068714 T:G T G 10 0.57326948002021 0.392022589767345 ENSG00000109881:ENST00000529615:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000343895:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000328697:exon_27362243_27362384:CCDC34 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 32124978 T/C 1 3 5 8 1.28019155993937 2.86634740010105 -1.58615584016168 T:C T C 10 0.57326948002021 0.29890034016204 ENSG00000049449:ENST00000532942:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000054950:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000533898:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000532474:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000527337:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000531345:exon_32123541_32125026:RCN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 32874926 G/A 1 3 5 8 1.28019155993937 2.86634740010105 -1.58615584016168 A:G G A 10 0.57326948002021 0.29890034016204 ENSG00000135378:ENST00000257836:exon_32874842_32879669:PRRG4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 33880896 T/A 1 91 83 174 38.8324773181609 47.5813668416774 -8.74888952351655 A:T:C T A 10 0.57326948002021 0.192711759494108 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33880125_33881121:LMO2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 33881016 T/C 1 69 64 133 29.4444058786055 36.6892467212934 -7.24484084268794 T:C T C 10 0.57326948002021 0.219908754133973 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33880125_33881121:LMO2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 33886294 A/G 1 11 9 20 4.69403571977769 5.15942532018189 -0.465389600404201 A:G A G 10 0.57326948002021 0.825497110151158 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33886148_33886363:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33886148_33886363:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33886148_33886475:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33886148_33886697:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33886148_33886363:LMO2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 34482908 C/T 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 T:C C T 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000121691:ENST00000241052:exon_34482798_34482936:CAT;ENSG00000121691:ENST00000530343:exon_34482280_34482936:CAT;ENSG00000121691:ENST00000525707:exon_34482750_34482936:CAT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 34909926 T/G 1 20 17 37 8.5346103995958 9.74558116034357 -1.21097076074777 T:G T G 10 0.57326948002021 0.740714372974236 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34909840_34909975:APIP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 34916657 C/T 1 6 9 15 2.56038311987874 5.15942532018189 -2.59904220030315 T:C C T 10 0.57326948002021 0.198144643439766 ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34916557_34916657:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34916557_34916657:APIP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 35201842 C/T 1 64 59 123 27.3107532787066 33.8228993211924 -6.51214604248584 T:C C T 10 0.57326948002021 0.237437518603266 ENSG00000026508:ENST00000263398:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000360158:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437706:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000449691:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000423360:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433354:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437835:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000415148:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528086:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000428726:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433892:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000434472:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000352818:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000442151:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000525211:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526669:exon_35201821_35201876:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526000:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000279452:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000527889:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531118:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528455:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531873:exon_35201826_35201954:CD44 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 44636839 C/T 1 71 59 130 30.2978669185651 33.8228993211924 -3.52503240262731 T:C C T 10 0.57326948002021 0.536054130223782 ENSG00000085117:ENST00000526958:exon_44636822_44636845:CD82;ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530601:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44636822_44636923:CD82 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 45832509 A/G 1 4 8 12 1.70692207991916 4.58615584016168 -2.87923376024252 A:G A G 10 0.57326948002021 0.141786607964141 ENSG00000181830:ENST00000442528:exon_45832327_45833109:SLC35C1;ENSG00000181830:ENST00000456334:exon_45832327_45834561:SLC35C1;ENSG00000181830:ENST00000530670:exon_45832327_45832642:SLC35C1;ENSG00000181830:ENST00000314134:exon_45832327_45834566:SLC35C1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 47493773 G/A 1 15 5 20 6.40095779969685 2.86634740010105 3.5346103995958 A:G G A 10 0.57326948002021 0.119776766604918 ENSG00000149187:ENST00000395292:exon_47493743_47493909:CELF1;ENSG00000149187:ENST00000422993:exon_47493743_47493909:CELF1;ENSG00000149187:ENST00000358597:exon_47493743_47493909:CELF1;ENSG00000149187:ENST00000395290:exon_47493743_47493909:CELF1;ENSG00000149187:ENST00000361904:exon_47493743_47493909:CELF1;ENSG00000149187:ENST00000310513:exon_47493743_47493909:CELF1;ENSG00000149187:ENST00000531165:exon_47493743_47493909:CELF1;ENSG00000149187:ENST00000532048:exon_47493743_47493909:CELF1;ENSG00000149187:ENST00000524648:exon_47493743_47493908:CELF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 47640429 G/C 1 52 76 128 22.1899870389491 43.568480481536 -21.3784934425869 C:G G C 10 0.57326948002021 0.000158835029687476 ENSG00000109919:ENST00000302503:exon_47638868_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000534074:exon_47640256_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000531669:exon_47640262_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000525649:exon_47640391_47640471:MTCH2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 57069375 A/G 1 17 6 23 7.25441883965643 3.43961688012126 3.81480195953517 A:G A G 10 0.57326948002021 0.139756598539207 ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57069281_57069417:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57069281_57069417:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000427750:exon_57069281_57069417:TNKS1BP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 57069568 T/C 1 14 6 20 5.97422727971706 3.43961688012126 2.5346103995958 T:C T C 10 0.57326948002021 0.36622341140112 ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57069548_57069698:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57069548_57069698:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000427750:exon_57069548_57069698:TNKS1BP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 57070089 C/T 1 16 6 22 6.82768831967664 3.43961688012126 3.38807143955538 T:C C T 10 0.57326948002021 0.195585685750270 ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57069933_57070299:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57069933_57070299:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000427750:exon_57069933_57070953:TNKS1BP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 57076895 T/C 1 17 17 34 7.25441883965643 9.74558116034357 -2.49116232068714 T:C T C 10 0.57326948002021 0.392022589767345 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57076366_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57076369_57078030:TNKS1BP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 57080352 G/A 1 7 9 16 2.98711363985853 5.15942532018189 -2.17231168032336 A:G G A 10 0.57326948002021 0.316607002067173 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 57099661 T/C 1 70 78 148 29.8711363985853 44.7150194415764 -14.8438830429911 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0157381835115344 ENSG00000149136:ENST00000278412:exon_57099626_57099754:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000293880:exon_57099626_57099754:SSRP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 57102096 A/G 1 26 11 37 11.0949935194745 6.30596428022231 4.78902923925223 A:G A G 10 0.57326948002021 0.134690392026005 ENSG00000149136:ENST00000278412:exon_57101937_57102122:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000293880:exon_57101937_57102122:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000526696:exon_57101937_57102122:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000529002:exon_57101937_57102122:SSRP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 57193653 A/G 1 4 13 17 1.70692207991916 7.45250324026273 -5.74558116034357 A:T:G A G 10 0.57326948002021 0.00605416471738995 ENSG00000134802:ENST00000395123:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000395124:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000352187:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000428603:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529554:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533524:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000530005:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000528098:exon_57193462_57193952:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000442654:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000525474:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529112:exon_57193462_57193789:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000526125:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000528187:exon_57193462_57193789:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529494:exon_57193462_57193789:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533245:exon_57193462_57193845:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533235:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000524863:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000532795:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533051:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529896:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000526621:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000530316:exon_57193513_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529748:exon_57193580_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000532278:exon_57193641_57193825:SLC43A3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 60230531 C/T 1 129 115 244 55.0482370773929 65.9259902023242 -10.8777531249313 T:C:G C T 10 0.57326948002021 0.174018812516902 ENSG00000156738:ENST00000345732:exon_60230475_60230594:MS4A1;ENSG00000156738:ENST00000527101:exon_60230475_60230594:MS4A1;ENSG00000156738:ENST00000532073:exon_60230475_60230594:MS4A1;ENSG00000156738:ENST00000534668:exon_60230475_60230594:MS4A1;ENSG00000156738:ENST00000534503:exon_60230475_60230594:MS4A1;ENSG00000156738:ENST00000533306:exon_60230475_60230594:MS4A1;ENSG00000156738:ENST00000389939:exon_60230475_60230594:MS4A1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 60610065 G/A 1 8 9 17 3.41384415983832 5.15942532018189 -1.74558116034357 A:G G A 10 0.57326948002021 0.464916768474155 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60610019_60610098:CCDC86 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 61914369 C/T 1 17 7 24 7.25441883965643 4.01288636014147 3.24153247951496 T:C C T 10 0.57326948002021 0.218150853833645 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61914130_61914374:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61914130_61914374:INCENP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 62334908 G/C 1 893 392 1285 381.070354341952 224.721636167922 156.34871817403 A:T:C:G G C 10 0.57326948002021 3.31628048201789e-19 ENSG00000254772:ENST00000329251:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000525340:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000378019:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000524420:exon_62334871_62335000:EEF1G HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 62358893 T/C 1 7 7 14 2.98711363985853 4.01288636014147 -1.02577272028294 T:C T C 10 0.57326948002021 0.5990458397462 ENSG00000149016:ENST00000308436:exon_62358876_62359016:TUT1;ENSG00000149016:ENST00000476907:exon_62358876_62359649:TUT1;ENSG00000149016:ENST00000278279:exon_62358876_62358995:TUT1;ENSG00000149016:ENST00000478537:exon_62358876_62358995:TUT1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 62370155 G/A 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 A:G G A 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000149499:ENST00000439994:exon_62369690_62370251:EML3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 62374413 C/T 1 3 5 8 1.28019155993937 2.86634740010105 -1.58615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.29890034016204 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 62378801 T/C 1 8 11 19 3.41384415983832 6.30596428022231 -2.89212012038399 T:C T C 10 0.57326948002021 0.245610170938846 ENSG00000149499:ENST00000394773:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000394776:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000278845:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494176:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000529309:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494448:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466886:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466671:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000419857:exon_62378584_62378816:EML3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 62430659 T/A 1 7 4 11 2.98711363985853 2.29307792008084 0.694035719777689 A:T T A 10 0.57326948002021 0.767959695054619 ENSG00000162194:ENST00000525675:exon_62430587_62430805:C11orf48 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 62439569 G/A 1 96 128 224 40.9661299180598 73.3784934425869 -32.4123635245271 A:G G A 10 0.57326948002021 1.40268303105757e-05 ENSG00000204922:ENST00000531323:exon_62439425_62441049:C11orf83;ENSG00000204922:ENST00000377953:exon_62439425_62439848:C11orf83 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 62458275 T/C 1 28 36 64 11.9484545594341 20.6377012807276 -8.68924672129344 T:C T C 10 0.57326948002021 0.031527440049262 ENSG00000168000:ENST00000405837:exon_62458259_62458345:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000433053:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000403734:exon_62458259_62458345:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000470529:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000278893:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000360796:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000463679:exon_62458259_62458814:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000403550:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000407022:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000301781:exon_62458259_62458345:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000421906:exon_62458259_62458339:BSCL2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 62496519 T/C 1 19 30 49 8.10787987961601 17.1980844006063 -9.09020452099029 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0132197421501634 ENSG00000162222:ENST00000530625:exon_62496295_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000294161:exon_62496295_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000316461:exon_62496011_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000532583:exon_62496295_62496558:TTC9C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 62505764 C/T 1 29 30 59 12.3751850794139 17.1980844006063 -4.82289932119239 T:C C T 10 0.57326948002021 0.236199377046639 ENSG00000162222:ENST00000316461:exon_62505760_62506108:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000532583:exon_62505760_62506075:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000532276:exon_62505760_62505962:TTC9C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 62564009 T/C 1 20 15 35 8.5346103995958 8.59904220030315 -0.0644318007073519 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000162231:ENST00000294172:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531709:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000532297:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000533048:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000530875:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000533440:exon_62563932_62564035:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531872:exon_62563932_62564039:NXF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 63767186 A/G 1 5 15 20 2.13365259989895 8.59904220030315 -6.4653896004042 A:G A G 10 0.57326948002021 0.00525878294849911 ENSG00000133315:ENST00000255681:exon_63767114_63767235:MACROD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 63994230 G/T 1 36 29 65 15.3622987192724 16.6248149205861 -1.26251620131365 T:G G T 10 0.57326948002021 0.80236763074031 ENSG00000149761:ENST00000441250:exon_63994107_63994604:NUDT22;ENSG00000149761:ENST00000428347:exon_63994107_63994604:NUDT22;ENSG00000149761:ENST00000279206:exon_63994107_63994604:NUDT22 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 64109118 T/G 1 8 6 14 3.41384415983832 3.43961688012126 -0.0257727202829408 T:G T G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64109078_64109214:CCDC88B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 64111794 G/A 1 26 19 45 11.0949935194745 10.892120120384 0.202873399090548 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494566:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000492980:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64111646_64112629:CCDC88B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 64119681 C/T 1 19 25 44 8.10787987961601 14.3317370005053 -6.22385712088924 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0671672204757469 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64119602_64119858:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64119602_64119858:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64119602_64119858:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64119602_64119858:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000359902:exon_64119602_64119858:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000443542:exon_64119602_64119858:CCDC88B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 64124515 T/C 1 153 160 313 65.2897695569079 91.7231168032336 -26.4333472463258 T:C T C 10 0.57326948002021 0.00291224643801076 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64124511_64124996:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64124511_64125006:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64124511_64125005:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64124511_64124996:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64124511_64124958:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000359902:exon_64124511_64124997:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000443542:exon_64124511_64125005:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000491320:exon_64124511_64125002:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000479965:exon_64122666_64125000:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000473405:exon_64124511_64124842:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000472524:exon_64124511_64125003:CCDC88B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 64138805 T/C 1 12 9 21 5.12076623975748 5.15942532018189 -0.0386590804244111 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64138755_64139686:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64138755_64139157:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000530504:exon_64138755_64138813:RPS6KA4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 64577147 G/A 1 6 8 14 2.56038311987874 4.58615584016168 -2.02577272028294 A:G G A 10 0.57326948002021 0.291858897104158 ENSG00000133895:ENST00000377316:exon_64577137_64577957:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377321:exon_64577137_64577604:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377326:exon_64577137_64578080:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000312049:exon_64577137_64577604:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000315422:exon_64577137_64577604:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000448517:exon_64577137_64577581:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000449150:exon_64577122_64577604:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000337652:exon_64577122_64577604:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394376:exon_64577122_64577604:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394373:exon_64577122_64577604:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000443283:exon_64577122_64577604:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394374:exon_64577122_64577604:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000417021:exon_64577137_64577581:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377313:exon_64577122_64577604:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000440873:exon_64577137_64577604:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000450708:exon_64577137_64577604:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000413626:exon_64577137_64577604:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000429702:exon_64577142_64577604:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000424912:exon_64577142_64577604:MEN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 64789222 C/T 1 76 59 135 32.431519518464 33.8228993211924 -1.39137980272836 T:C C T 10 0.57326948002021 0.861934747152428 ENSG00000213465:ENST00000246747:exon_64789193_64789656:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529384:exon_64789193_64789360:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000533729:exon_64789193_64789632:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529254:exon_64788988_64789588:ARL2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 64806270 C/T 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 T:C C T 10 0.57326948002021 0.741310101183539 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64806044_64806301:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64806044_64806301:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64802992_64806301:SNX15 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 64877197 C/T 1 83 74 157 35.4186331583226 42.4219415214955 -7.00330836317298 T:C C T 10 0.57326948002021 0.259864190001103 ENSG00000149823:ENST00000279281:exon_64877177_64877395:C11orf2;ENSG00000149823:ENST00000527646:exon_64877177_64877395:C11orf2;ENSG00000149823:ENST00000531146:exon_64877177_64877329:C11orf2;ENSG00000149823:ENST00000533827:exon_64877177_64877395:C11orf2;ENSG00000149823:ENST00000534591:exon_64877177_64878075:C11orf2;ENSG00000149823:ENST00000526856:exon_64877177_64877395:C11orf2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 64880743 C/T 1 6 10 16 2.56038311987874 5.7326948002021 -3.17231168032336 T:C C T 10 0.57326948002021 0.131350999414970 ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000524986:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533766:exon_64880283_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000525385:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000345348:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529414:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000524690:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530892:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531029:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000527851:exon_64880211_64881066:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000534667:exon_64880686_64880886:TM7SF2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 64882789 C/T 1 14 5 19 5.97422727971706 2.86634740010105 3.10787987961601 T:C C T 10 0.57326948002021 0.170278135204151 ENSG00000149809:ENST00000526809:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533766:exon_64882786_64882862:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000534371:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000525385:exon_64882786_64882856:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531321:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529292:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529233:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000532328:exon_64882786_64882908:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000527968:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000528802:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526048:exon_64882385_64883070:TM7SF2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 64884052 G/A 1 33 10 43 14.0821071593331 5.7326948002021 8.34941235913097 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0126858185187038 ENSG00000174276:ENST00000310597:exon_64883876_64885170:ZNHIT2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 64893365 T/A 1 18 12 30 7.68114935963622 6.87923376024252 0.801915599393698 A:T T A 10 0.57326948002021 0.854651896908109 ENSG00000149792:ENST00000524482:exon_64893198_64894828:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000528529:exon_64893198_64893774:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000534078:exon_64893198_64893476:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000526319:exon_64893198_64893414:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000279242:exon_64893198_64894843:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000533943:exon_64893198_64893650:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000532671:exon_64893198_64894835:MRPL49 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 65273760 C/T 1 428 422 850 182.64066255135 241.919720568529 -59.2790580171786 T:C C T 10 0.57326948002021 4.84128665106841e-05 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 65348725 G/A 1 13 9 22 5.54749675973727 5.15942532018189 0.388071439555379 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65348682_65348844:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533237:exon_65348682_65348844:EHBP1L1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 65349063 G/A 1 11 13 24 4.69403571977769 7.45250324026273 -2.75846752048504 A:G G A 10 0.57326948002021 0.303503076139145 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533237:exon_65349010_65349487:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 65349756 T/G 1 14 9 23 5.97422727971706 5.15942532018189 0.814801959535169 T:G T G 10 0.57326948002021 0.834555320864254 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 65404018 G/A 1 15 12 27 6.40095779969685 6.87923376024252 -0.478275960545671 A:G G A 10 0.57326948002021 0.84842088295701 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65403862_65404160:PCNXL3;ENSG00000197136:ENST00000439247:exon_65403862_65404160:PCNXL3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 65412467 G/A 1 6 11 17 2.56038311987874 6.30596428022231 -3.74558116034357 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0853131245996917 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65412426_65412600:SIPA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 65417434 G/A 1 40 41 81 17.0692207991916 23.5040486808286 -6.43482788163701 A:T:G G A 10 0.57326948002021 0.177297792911061 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000531339:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000529725:exon_65417421_65417522:SIPA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 65826704 G/A 1 97 69 166 41.3928604380396 39.5555941213945 1.83726631664513 A:G G A 10 0.57326948002021 0.814111912651262 ENSG00000087365:ENST00000528302:exon_65826672_65826809:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000322535:exon_65826672_65826809:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000355456:exon_65826672_65826809:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000529994:exon_65826672_65826809:SF3B2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 66055685 G/A 1 22 13 35 9.38807143955538 7.45250324026273 1.93556819929265 A:G G A 10 0.57326948002021 0.609163402904419 ENSG00000174851:ENST00000359461:exon_66055552_66055763:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000376901:exon_66055552_66055763:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000376904:exon_66055552_66055763:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000431556:exon_66055552_66055763:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000528575:exon_66055552_66055763:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000376899:exon_66055552_66055763:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000474986:exon_66055552_66055763:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000534374:exon_66055405_66055763:YIF1A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 66109033 T/C 1 35 26 61 14.9355681992926 14.9050064805255 0.0305617187671867 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000174744:ENST00000425825:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000524699:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000359957:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000530238:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000394043:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000527375:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000530756:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000534617:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000525127:exon_66109004_66109094:BRMS1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 66373305 G/A 1 40 33 73 17.0692207991916 18.9178928406669 -1.84867204147533 A:C:G G A 10 0.57326948002021 0.722915272747017 ENSG00000173992:ENST00000533244:exon_66373173_66373490:CCS;ENSG00000173992:ENST00000530384:exon_66373173_66373383:CCS;ENSG00000173992:ENST00000530961:exon_66373173_66373469:CCS;ENSG00000173992:ENST00000310190:exon_66373173_66373390:CCS;ENSG00000173992:ENST00000525435:exon_66373173_66373488:CCS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 66392880 C/T 1 10 10 20 4.2673051997979 5.7326948002021 -1.4653896004042 T:C C T 10 0.57326948002021 0.508038948022547 ENSG00000239306:ENST00000310137:exon_66391685_66393149:RBM14 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 67200819 C/T 1 29 18 47 12.3751850794139 10.3188506403638 2.05633443905013 T:C C T 10 0.57326948002021 0.65864682043396 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67200810_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000526268:exon_67200597_67200918:RPS6KB2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 67202156 C/T 1 54 51 105 23.0434480789087 29.2367434810307 -6.19329540212206 T:C C T 10 0.57326948002021 0.236933874312292 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67202053_67202872:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000531765:exon_67201848_67202425:RPS6KB2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 67205978 G/A 1 11 3 14 4.69403571977769 1.71980844006063 2.97422727971706 A:G G A 10 0.57326948002021 0.174656120913287 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 67352689 A/G 1 522 522 1044 222.75333142945 299.24666857055 -76.4933371410993 A:G A G 10 0.57326948002021 1.91863084280917e-06 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67351605_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67352509_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67352266_67352712:GSTP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 67353579 C/T 1 524 527 1051 223.60679246941 302.113015970651 -78.5062235012408 A:T:C:G C T 10 0.57326948002021 1.28467112723163e-06 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67353575_67353682:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67353575_67353682:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67353575_67353682:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67353575_67353682:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000495996:exon_67353575_67353744:GSTP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 67353844 C/T 1 18 27 45 7.68114935963622 15.4782759605457 -7.79712660090945 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0230841672052596 ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 67353970 T/C 1 1254 1493 2747 535.120072054657 855.891333670174 -320.771261615517 A:T:C:G T C 10 0.57326948002021 1.09868398258494e-34 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67353860_67354131:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67353860_67354121:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67353860_67354125:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67353860_67354120:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67353860_67354075:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67353860_67354040:GSTP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 67395714 C/T 1 23 33 56 9.81480195953517 18.9178928406669 -9.10309088113176 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0150758212849247 ENSG00000167799:ENST00000301490:exon_67395409_67395871:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000376693:exon_67395410_67395722:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000534054:exon_67395410_67395871:NUDT8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 67810297 C/T 1 5 8 13 2.13365259989895 4.58615584016168 -2.45250324026273 T:C C T 10 0.57326948002021 0.261241293669647 ENSG00000110719:ENST00000265686:exon_67810110_67810330:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000534673:exon_67810110_67810330:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000524598:exon_67810110_67810330:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000529657:exon_67810110_67810330:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000533947:exon_67810110_67810330:TCIRG1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 68855363 G/A 1 3 12 15 1.28019155993937 6.87923376024252 -5.59904220030315 A:G G A 10 0.57326948002021 0.00660991964323905 ENSG00000162341:ENST00000294309:exon_68855343_68858072:TPCN2;ENSG00000162341:ENST00000442692:exon_68855343_68858072:TPCN2;ENSG00000162341:ENST00000356782:exon_68855343_68858072:TPCN2;ENSG00000162341:ENST00000450354:exon_68855343_68858072:TPCN2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 71146691 A/G 1 11 11 22 4.69403571977769 6.30596428022231 -1.61192856044462 A:G A G 10 0.57326948002021 0.522736284345544 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 71152461 A/G 1 13 3 16 5.54749675973727 1.71980844006063 3.82768831967664 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0744376636268041 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527316:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71152406_71152486:DHCR7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 71155129 G/A 0 10 0 10 4.2673051997979 0 4.2673051997979 G G 10 0.57326948002021 0.0067236069534815 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71155003_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527316:exon_71155039_71155165:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525346:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000531364:exon_71155043_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000529990:exon_71155080_71155299:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527452:exon_71155087_71155261:DHCR7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 71185479 T/C 1 13 3 16 5.54749675973727 1.71980844006063 3.82768831967664 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0744376636268041 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71185441_71186668:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530534:exon_71185441_71185572:NADSYN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 71185518 T/C 1 5 6 11 2.13365259989895 3.43961688012126 -1.30596428022231 T:C T C 10 0.57326948002021 0.545300564874909 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71185441_71186668:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530534:exon_71185441_71185572:NADSYN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 71196660 C/T 1 33 21 54 14.0821071593331 12.0386590804244 2.04344807890866 T:C C T 10 0.57326948002021 0.680189995638535 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71196588_71196694:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71196588_71196694:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529840:exon_71196588_71196694:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530055:exon_71196588_71196694:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000526039:exon_71196588_71196694:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000531236:exon_71195358_71196694:NADSYN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 71942104 C/T 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71942037_71942233:INPPL1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 71943960 C/A 0 10 0 10 4.2673051997979 0 4.2673051997979 C C 10 0.57326948002021 0.0067236069534815 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71943919_71944018:INPPL1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 71943961 C/A 0 10 0 10 4.2673051997979 0 4.2673051997979 C C 10 0.57326948002021 0.0067236069534815 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71943919_71944018:INPPL1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 72408055 G/C 1 26 35 61 11.0949935194745 20.0644318007074 -8.96943828123282 C:G G C 10 0.57326948002021 0.0269466259636554 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72407594_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72408028_72408240:ARAP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 72415329 G/A 1 4 6 10 1.70692207991916 3.43961688012126 -1.7326948002021 A:G G A 10 0.57326948002021 0.342315301618549 ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000340247:exon_72415197_72415379:ARAP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 72539994 C/T 1 35 38 73 14.9355681992926 21.784240240768 -6.84867204147533 A:T:C C T 10 0.57326948002021 0.123569711815539 ENSG00000168010:ENST00000321297:exon_72539928_72540029:ATG16L2;ENSG00000168010:ENST00000435507:exon_72539928_72540029:ATG16L2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 73611349 G/C 1 9 1 10 3.84057467981811 0.57326948002021 3.2673051997979 C:G G C 10 0.57326948002021 0.051520419622225 ENSG00000175575:ENST00000310571:exon_73611315_73611465:PAAF1;ENSG00000175575:ENST00000376384:exon_73611315_73611465:PAAF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 75152243 C/T 1 6 7 13 2.56038311987874 4.01288636014147 -1.45250324026273 T:C C T 10 0.57326948002021 0.418185809776403 ENSG00000158555:ENST00000526177:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000527820:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000533784:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000529721:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000336898:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000533805:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000376282:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000443415:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000443276:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000534322:exon_75152208_75152355:GDPD5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 75277992 C/T 1 7 2 9 2.98711363985853 1.14653896004042 1.84057467981811 T:C C T 10 0.57326948002021 0.31706387914541 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75277764_75278016:SERPINH1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 75852448 C/T 1 23 12 35 9.81480195953517 6.87923376024252 2.93556819929265 T:C C T 10 0.57326948002021 0.393538494097529 ENSG00000198382:ENST00000356136:exon_75851755_75854239:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000528420:exon_75851755_75852838:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000533454:exon_75851755_75852544:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000531818:exon_75851755_75853695:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000532130:exon_75851755_75852827:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000525183:exon_75851755_75852704:UVRAG HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 77378388 T/C 1 25 16 41 10.6682629994947 9.17231168032336 1.49595131917139 T:C T C 10 0.57326948002021 0.752668569481282 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77371041_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77377275_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77377275_77378536:RSF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 77378505 A/G 1 20 14 34 8.5346103995958 8.02577272028294 0.508837679312858 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77371041_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77377275_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77377275_77378536:RSF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 77409568 T/C 1 10 6 16 4.2673051997979 3.43961688012126 0.827688319676639 T:C T C 10 0.57326948002021 0.802879700667955 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000531026:exon_77409532_77409573:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000526324:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000531768:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000532556:exon_77409532_77409738:RSF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 77553638 T/C 1 13 12 25 5.54749675973727 6.87923376024252 -1.33173700050525 T:C T C 10 0.57326948002021 0.686966178648469 ENSG00000087884:ENST00000532481:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526164:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000527134:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000304716:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77553525_77553674:C11orf67 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 77583266 G/A 1 13 9 22 5.54749675973727 5.15942532018189 0.388071439555379 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77583221_77583407:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77583221_77583397:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77583221_77583400:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77583221_77583398:C11orf67 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 77825320 T/C 1 6 5 11 2.56038311987874 2.86634740010105 -0.305964280222311 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000159063:ENST00000299626:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000376156:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000526737:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532306:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000421284:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532440:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000524925:exon_77825312_77825422:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000529139:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525755:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000530454:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525870:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532050:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000527099:exon_77825312_77825438:ALG8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 77924870 C/T 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77924692_77925072:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77924692_77925184:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77924692_77925757:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77924692_77925753:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77924692_77925465:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77924692_77925753:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77924692_77925753:USP35 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 82535963 C/T 1 13 18 31 5.54749675973727 10.3188506403638 -4.77135388062651 T:C C T 10 0.57326948002021 0.101679461535614 ENSG00000137509:ENST00000313010:exon_82534544_82536164:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532767:exon_82535409_82542480:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000393399:exon_82535410_82536164:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532709:exon_82535415_82536164:PRCP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 82996986 A/C 1 4 8 12 1.70692207991916 4.58615584016168 -2.87923376024252 A:C A C 10 0.57326948002021 0.141786607964141 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82996916_82997450:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82996596_82997394:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82996916_82997397:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82996170_82997041:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82996916_82997253:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82996916_82997398:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82996916_82997022:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82996916_82997021:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000534753:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527025:exon_82996916_82997033:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000528149:exon_82996596_82997128:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526265:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525916:exon_82996596_82997011:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000530253:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526631:exon_82996916_82997021:CCDC90B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 85692181 A/C 1 7 1 8 2.98711363985853 0.57326948002021 2.41384415983832 A:C A C 10 0.57326948002021 0.149609550462636 ENSG00000073921:ENST00000341783:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000349405:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532317:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526033:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000447890:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000454118:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000530692:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393346:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000529760:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000528398:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532603:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000356360:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000529016:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526961:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393343:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000530542:exon_85692172_85692271:PICALM HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 85968623 C/T 1 4 8 12 1.70692207991916 4.58615584016168 -2.87923376024252 T:C C T 10 0.57326948002021 0.141786607964141 ENSG00000074266:ENST00000263360:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000528180:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000351625:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000327320:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000525244:exon_85968557_85968638:EED HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 93464175 A/C 1 10 7 17 4.2673051997979 4.01288636014147 0.254418839656429 A:C A C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000166012:ENST00000323981:exon_93463114_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000530769:exon_93463843_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000529900:exon_93463833_93464382:TAF1D HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 93517874 C/G 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 C:G C G 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000042429:ENST00000251871:exon_93517393_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000530819:exon_93517448_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533359:exon_93517528_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533133:exon_93517577_93517929:MED17 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 93913036 A/G 0 8 0 8 3.41384415983832 0 3.41384415983832 A A 10 0.57326948002021 0.0127642064234436 ENSG00000110218:ENST00000227638:exon_93912768_93913423:PANX1;ENSG00000110218:ENST00000436171:exon_93912768_93913423:PANX1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 94231257 C/G 1 7 13 20 2.98711363985853 7.45250324026273 -4.4653896004042 C:G C G 10 0.57326948002021 0.0677059243274011 ENSG00000168876:ENST00000302755:exon_94231237_94232737:ANKRD49 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 95564259 A/G 1 27 28 55 11.5217240394543 16.0515454405659 -4.52982140111155 A:G A G 10 0.57326948002021 0.222688631217463 ENSG00000166037:ENST00000325486:exon_95564190_95565854:CEP57;ENSG00000166037:ENST00000325542:exon_95564190_95565854:CEP57 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 95580926 G/A 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 A:G G A 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000087053:ENST00000346299:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000393223:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000409459:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000352297:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000444541:exon_95580878_95581063:MTMR2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 96116444 T/C 1 4 14 18 1.70692207991916 8.02577272028294 -6.31885064036378 T:C T C 10 0.57326948002021 0.00334013975936446 ENSG00000149231:ENST00000278520:exon_96116433_96116637:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000423339:exon_96116433_96116637:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000530106:exon_96113701_96116637:CCDC82 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 102207851 G/A 1 25 21 46 10.6682629994947 12.0386590804244 -1.37039608092966 A:G G A 10 0.57326948002021 0.766010444052857 ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102207640_102208465:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102207640_102210134:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532609:exon_102207640_102208162:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000527336:exon_102207640_102208022:BIRC3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 108236070 C/T 1 7 4 11 2.98711363985853 2.29307792008084 0.694035719777689 T:C C T 10 0.57326948002021 0.767959695054619 ENSG00000149311:ENST00000278616:exon_108236052_108239826:ATM;ENSG00000149311:ENST00000299392:exon_108236052_108239826:ATM;ENSG00000149311:ENST00000452508:exon_108236052_108239829:ATM;ENSG00000149311:ENST00000524792:exon_108236052_108236761:ATM;ENSG00000149311:ENST00000525178:exon_108236052_108236456:ATM;ENSG00000149311:ENST00000527181:exon_108236052_108236465:ATM HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 110118364 A/C 1 3 5 8 1.28019155993937 2.86634740010105 -1.58615584016168 A:C A C 10 0.57326948002021 0.29890034016204 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 111754574 A/C 1 92 96 188 39.2592078381407 55.0338700819402 -15.7746622437995 A:C A C 10 0.57326948002021 0.0221317440434169 ENSG00000137720:ENST00000528125:exon_111754495_111754624:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000260276:exon_111754495_111756699:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000530214:exon_111754495_111754798:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000529270:exon_111754495_111754793:C11orf1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 111953419 A/C 1 33 22 55 14.0821071593331 12.6119285604446 1.47017859888845 A:C A C 10 0.57326948002021 0.785497723948572 ENSG00000150776:ENST00000420986:exon_111953192_111954858:C11orf57;ENSG00000150776:ENST00000393048:exon_111953189_111955872:C11orf57;ENSG00000150776:ENST00000532163:exon_111953189_111955874:C11orf57;ENSG00000150776:ENST00000280352:exon_111953192_111955874:C11orf57;ENSG00000150776:ENST00000524989:exon_111953189_111953669:C11orf57;ENSG00000150776:ENST00000393047:exon_111953189_111955874:C11orf57;ENSG00000150776:ENST00000525785:exon_111953189_111953546:C11orf57 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 116728630 G/C 1 5 4 9 2.13365259989895 2.29307792008084 -0.15942532018189 C:G G C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000160584:ENST00000488337:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000445177:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375300:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000292055:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375288:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000465421:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000415541:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000446921:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000480468:exon_116727630_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000434315:exon_116728473_116729415:SIK3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 116728646 C/T 1 4 6 10 1.70692207991916 3.43961688012126 -1.7326948002021 T:C C T 10 0.57326948002021 0.342315301618549 ENSG00000160584:ENST00000488337:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000445177:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375300:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000292055:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375288:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000465421:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000415541:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000446921:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000480468:exon_116727630_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000434315:exon_116728473_116729415:SIK3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 117691386 G/A 1 21 8 29 8.96134091957559 4.58615584016168 4.37518507941391 A:G G A 10 0.57326948002021 0.132203909869783 ENSG00000137731:ENST00000532119:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000528014:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000292079:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000260287:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000534383:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000533281:exon_117691275_117691411:FXYD2;ENSG00000254844:ENST00000531850:exon_117691176_117691436:RP11-728F11.3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 118968207 C/T 1 5 4 9 2.13365259989895 2.29307792008084 -0.15942532018189 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000172269:ENST00000409993:exon_118968174_118968261:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000354202:exon_118968174_118968261:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000392834:exon_118968174_118968261:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000461999:exon_118967221_118969197:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000481084:exon_118968174_118968261:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000442480:exon_118968174_118968261:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000432443:exon_118968174_118968261:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000525456:exon_118967973_118968261:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000524658:exon_118968047_118968261:DPAGT1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 119206375 G/A 1 7 7 14 2.98711363985853 4.01288636014147 -1.02577272028294 A:G G A 10 0.57326948002021 0.5990458397462 ENSG00000173456:ENST00000311413:exon_119205237_119208021:RNF26 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 124623492 T/C 1 11 8 19 4.69403571977769 4.58615584016168 0.107879879616009 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000149564:ENST00000485116:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000417453:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000278927:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000464067:exon_124623095_124623857:ESAM HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 124637228 G/A 1 5 5 10 2.13365259989895 2.86634740010105 -0.732694800202101 A:G G A 10 0.57326948002021 0.752834960365011 ENSG00000120458:ENST00000239614:exon_124636394_124637924:C11orf61;ENSG00000120458:ENST00000374979:exon_124636412_124637924:C11orf61;ENSG00000120458:ENST00000526629:exon_124636424_124637924:C11orf61 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 125351472 A/T 1 7 4 11 2.98711363985853 2.29307792008084 0.694035719777689 A:T A T 10 0.57326948002021 0.767959695054619 ENSG00000149557:ENST00000527350:exon_125351430_125351493:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000278919:exon_125351430_125351529:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000392709:exon_125351430_125351529:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000533294:exon_125351430_125351652:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000532981:exon_125351430_125351529:FEZ1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 125452313 A/G 1 17 4 21 7.25441883965643 2.29307792008084 4.96134091957559 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0285982528102983 ENSG00000149547:ENST00000530985:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000531350:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000534430:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000525737:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527628:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527675:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000278903:exon_125452302_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000343678:exon_125452306_125452315:EI24 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 125479363 G/A 1 6 11 17 2.56038311987874 6.30596428022231 -3.74558116034357 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0853131245996917 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125479329_125479793:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000526726:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531001:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000524639:exon_125479314_125479484:STT3A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 125525195 A/G 1 11 3 14 4.69403571977769 1.71980844006063 2.97422727971706 A:G A G 10 0.57326948002021 0.174656120913287 ENSG00000149554:ENST00000438015:exon_125525120_125525640:CHEK1;ENSG00000149554:ENST00000427383:exon_125525120_125525371:CHEK1;ENSG00000149554:ENST00000428830:exon_125525120_125525242:CHEK1;ENSG00000149554:ENST00000532449:exon_125525120_125525605:CHEK1;ENSG00000149554:ENST00000534070:exon_125525120_125527031:CHEK1;ENSG00000149554:ENST00000524737:exon_125525120_125525242:CHEK1;ENSG00000149554:ENST00000278916:exon_125525120_125525608:CHEK1;ENSG00000149554:ENST00000528276:exon_125525120_125525481:CHEK1;ENSG00000149554:ENST00000498122:exon_125525120_125525242:CHEK1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 125763746 C/G 1 34 42 76 14.5088376793129 24.0773181608488 -9.56848048153596 C:G C G 10 0.57326948002021 0.0278466134992008 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125763381_125764181:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125763382_125764181:PUS3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 126174038 C/T 1 14 27 41 5.97422727971706 15.4782759605457 -9.50404868082861 T:C C T 10 0.57326948002021 0.00391815140604236 ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126173647_126174176:DCPS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 134038924 G/C 1 4 6 10 1.70692207991916 3.43961688012126 -1.7326948002021 C:G G C 10 0.57326948002021 0.342315301618549 ENSG00000151503:ENST00000534532:exon_134038812_134038949:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000281189:exon_134038812_134038949:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000534548:exon_134038812_134038949:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000525964:exon_134038812_134038949:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000530396:exon_134038812_134038949:NCAPD3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 134118302 G/T 1 32 32 64 13.6553766393533 18.3446233606467 -4.68924672129344 T:G G T 10 0.57326948002021 0.256277368402754 ENSG00000151500:ENST00000392595:exon_134118173_134118378:THYN1;ENSG00000151500:ENST00000341541:exon_134118173_134118378:THYN1;ENSG00000151500:ENST00000392594:exon_134118173_134118378:THYN1;ENSG00000151500:ENST00000352327:exon_134118182_134118378:THYN1;ENSG00000151500:ENST00000534274:exon_134118217_134118303:THYN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 11 134244123 C/G 1 5 5 10 2.13365259989895 2.86634740010105 -0.732694800202101 C:G C G 10 0.57326948002021 0.752834960365011 ENSG00000149328:ENST00000339772:exon_134244039_134244150:GLB1L2;ENSG00000149328:ENST00000389881:exon_134244039_134244150:GLB1L2;ENSG00000149328:ENST00000525089:exon_134244039_134244150:GLB1L2;ENSG00000149328:ENST00000529077:exon_134244039_134244150:GLB1L2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 968489 T/C 1 7 9 16 2.98711363985853 5.15942532018189 -2.17231168032336 T:C T C 10 0.57326948002021 0.316607002067173 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_968411_968630:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_968411_968630:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_968411_968630:WNK1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 1025694 C/A 1 5 4 9 2.13365259989895 2.29307792008084 -0.15942532018189 A:C C A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000002016:ENST00000481052:exon_1025510_1025698:RAD52;ENSG00000002016:ENST00000461568:exon_1025510_1025701:RAD52;ENSG00000002016:ENST00000463750:exon_1025510_1025986:RAD52 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 2908280 A/C 1 26 17 43 11.0949935194745 9.74558116034357 1.34941235913097 A:C A C 10 0.57326948002021 0.758764486576614 ENSG00000004478:ENST00000001008:exon_2908254_2908410:FKBP4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 2921992 A/T 1 3 7 10 1.28019155993937 4.01288636014147 -2.7326948002021 A:T A T 10 0.57326948002021 0.109775478323748 ENSG00000111203:ENST00000228799:exon_2921788_2922022:ITFG2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 2968169 A/G 1 18 19 37 7.68114935963622 10.892120120384 -3.21097076074777 A:G A G 10 0.57326948002021 0.320135722246241 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2966852_2968829:FOXM1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 6554628 G/A 1 54 65 119 23.0434480789087 37.2625162013137 -14.219068122405 A:G G A 10 0.57326948002021 0.00933871519510697 ENSG00000139193:ENST00000266557:exon_6554590_6554721:CD27 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 6562285 C/T 1 4 11 15 1.70692207991916 6.30596428022231 -4.59904220030315 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0192066748704768 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562233_6562463:TAPBPL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 6562293 C/T 1 4 12 16 1.70692207991916 6.87923376024252 -5.17231168032336 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0108544448583934 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562233_6562463:TAPBPL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 6562752 C/T 1 7 7 14 2.98711363985853 4.01288636014147 -1.02577272028294 T:C C T 10 0.57326948002021 0.5990458397462 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 6562753 A/G 1 7 7 14 2.98711363985853 4.01288636014147 -1.02577272028294 A:G A G 10 0.57326948002021 0.5990458397462 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 6562823 C/T 1 7 2 9 2.98711363985853 1.14653896004042 1.84057467981811 T:C C T 10 0.57326948002021 0.31706387914541 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 6562836 G/A 1 7 4 11 2.98711363985853 2.29307792008084 0.694035719777689 A:G G A 10 0.57326948002021 0.767959695054619 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 6567787 T/C 1 7 1 8 2.98711363985853 0.57326948002021 2.41384415983832 T:C T C 10 0.57326948002021 0.149609550462636 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 6572048 A/G 1 54 42 96 23.0434480789087 24.0773181608488 -1.03387008194017 A:G A G 10 0.57326948002021 0.83716660834926 ENSG00000139190:ENST00000396943:exon_6571406_6573652:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000361716:exon_6571406_6574107:VAMP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 6575044 G/T 1 15 11 26 6.40095779969685 6.30596428022231 0.0949935194745386 T:G G T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000139190:ENST00000400911:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000396943:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000361716:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000355479:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000396308:exon_6575008_6575166:VAMP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 6631169 C/A 1 16 11 27 6.82768831967664 6.30596428022231 0.521724039454329 A:C C A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000010292:ENST00000382457:exon_6630964_6631203:NCAPD2;ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6630964_6631203:NCAPD2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 6637845 T/C 1 37 41 78 15.7890292392522 23.5040486808286 -7.71501944157638 T:C T C 10 0.57326948002021 0.085952919447352 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6637845_6638022:NCAPD2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 6638116 C/T 1 34 47 81 14.5088376793129 26.9436655609499 -12.434827881637 T:C C T 10 0.57326948002021 0.00668401138739683 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6638111_6638205:NCAPD2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 6639088 A/G 1 40 57 97 17.0692207991916 32.676360361152 -15.6071395619604 A:G A G 10 0.57326948002021 0.00191580443231437 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6638941_6639124:NCAPD2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 6647109 T/C 1 7900 12 7912 3371.17110784034 6.87923376024252 3364.2918740801 A:T:C:G T C 10 0.57326948002021 4.94065645841247e-324 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646750_6647162:GAPDH HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 7022085 T/A 1 10 2 12 4.2673051997979 1.14653896004042 3.12076623975748 A:T T A 10 0.57326948002021 0.0830011205774995 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7021894_7022191:LRRC23 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 7023123 A/G 1 10 17 27 4.2673051997979 9.74558116034357 -5.47827596054567 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0495781269238746 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000382257:exon_7023055_7023405:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7023055_7023358:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000428946:exon_7023055_7023393:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000323702:exon_7023055_7023392:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000436789:exon_7023055_7023132:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000429740:exon_7023055_7023235:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000472633:exon_7023055_7023392:LRRC23 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 12630346 G/A 1 5 5 10 2.13365259989895 2.86634740010105 -0.732694800202101 A:G G A 10 0.57326948002021 0.752834960365011 ENSG00000111266:ENST00000228862:exon_12628831_12630949:DUSP16;ENSG00000111266:ENST00000298573:exon_12628831_12630949:DUSP16 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 12871099 T/G 1 6 6 12 2.56038311987874 3.43961688012126 -0.879233760242521 T:C:G T G 10 0.57326948002021 0.771962928640395 ENSG00000111276:ENST00000228872:exon_12870397_12871248:CDKN1B;ENSG00000111276:ENST00000396340:exon_12870756_12871248:CDKN1B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 14927821 C/T 1 48 48 96 20.4830649590299 27.5169350409701 -7.03387008194017 T:C C T 10 0.57326948002021 0.149889128782597 ENSG00000111332:ENST00000389078:exon_14927349_14927957:H2AFJ HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 16189694 T/A 1 19 15 34 8.10787987961601 8.59904220030315 -0.491162320687142 A:T T A 10 0.57326948002021 0.864181187644753 ENSG00000023697:ENST00000428559:exon_16189624_16190220:DERA;ENSG00000023697:ENST00000526530:exon_16189624_16190214:DERA;ENSG00000023697:ENST00000025429:exon_16189624_16190209:DERA;ENSG00000023697:ENST00000530274:exon_16189624_16189747:DERA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 22213786 C/T 1 26 31 57 11.0949935194745 17.7713538806265 -6.67636036115197 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0819270359817158 ENSG00000111726:ENST00000229329:exon_22213766_22213860:CMAS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 22814023 A/G 1 6 6 12 2.56038311987874 3.43961688012126 -0.879233760242521 A:G A G 10 0.57326948002021 0.771962928640395 ENSG00000139163:ENST00000381409:exon_22813997_22814139:ETNK1;ENSG00000139163:ENST00000266517:exon_22813997_22814139:ETNK1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 25243115 G/C 1 20 51 71 8.5346103995958 29.2367434810307 -20.7021330814349 C:G G C 10 0.57326948002021 8.44016735884991e-07 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242991_25243131:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242991_25243131:LRMP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 28605426 G/A 1 23 35 58 9.81480195953517 20.0644318007074 -10.2496298411722 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0076421315854855 ENSG00000123106:ENST00000381259:exon_28605411_28605587:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000381256:exon_28605411_28605587:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000306172:exon_28605411_28605587:CCDC91 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 31604928 G/C 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 C:G G C 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000170456:ENST00000389082:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000306833:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000354285:exon_31604874_31605410:DENND5B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 46320421 G/A 1 42 54 96 17.9226818391512 30.9565519210913 -13.0338700819402 A:G G A 10 0.57326948002021 0.00952475441054894 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 46321514 A/T 1 16 17 33 6.82768831967664 9.74558116034357 -2.91789284066693 A:T A T 10 0.57326948002021 0.379144670868010 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 49333799 G/A 1 49 38 87 20.9097954790097 21.784240240768 -0.874444761758273 A:G G A 10 0.57326948002021 0.91377424621206 ENSG00000134287:ENST00000256682:exon_49333780_49333890:ARF3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 49334762 G/C 1 34 32 66 14.5088376793129 18.3446233606467 -3.83578568133386 C:G G C 10 0.57326948002021 0.384001983252916 ENSG00000134287:ENST00000256682:exon_49334731_49334971:ARF3;ENSG00000134287:ENST00000447318:exon_49334731_49334971:ARF3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 51442944 G/A 1 3 13 16 1.28019155993937 7.45250324026273 -6.17231168032336 A:G G A 10 0.57326948002021 0.00368721831415700 ENSG00000050426:ENST00000262055:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000418425:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000448283:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000380135:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000380123:exon_51442817_51442968:LETMD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 52448157 G/A 1 13 3 16 5.54749675973727 1.71980844006063 3.82768831967664 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0744376636268041 ENSG00000123358:ENST00000360284:exon_52448111_52448988:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000478250:exon_52448111_52449745:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000394825:exon_52448111_52448988:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000243050:exon_52448111_52448988:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000394824:exon_52448111_52448988:NR4A1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 52467406 A/G 1 35 26 61 14.9355681992926 14.9050064805255 0.0305617187671867 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000123395:ENST00000433776:exon_52467359_52467686:C12orf44;ENSG00000123395:ENST00000336854:exon_52467359_52467686:C12orf44 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 52470979 C/T 1 61 49 110 26.0305617187672 28.0902045209903 -2.0596428022231 T:C C T 10 0.57326948002021 0.700722657565893 ENSG00000123395:ENST00000433776:exon_52470570_52471278:C12orf44;ENSG00000123395:ENST00000336854:exon_52470570_52471278:C12orf44 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 53682326 G/A 1 3 7 10 1.28019155993937 4.01288636014147 -2.7326948002021 A:G G A 10 0.57326948002021 0.109775478323748 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682322_53682483:ESPL1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 54109659 C/T 1 6 5 11 2.56038311987874 2.86634740010105 -0.305964280222311 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54109577_54109831:CALCOCO1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 55355033 C/T 1 16 14 30 6.82768831967664 8.02577272028294 -1.1980844006063 T:C C T 10 0.57326948002021 0.713630396278199 ENSG00000135426:ENST00000524622:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524923:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000532804:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55354989_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000531122:exon_55354952_55355051:KIAA0748 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 56151291 T/C 1 68 64 132 29.0176753586257 36.6892467212934 -7.67157136266773 T:C T C 10 0.57326948002021 0.187259363143505 ENSG00000205323:ENST00000444631:exon_56151167_56151337:SARNP;ENSG00000205323:ENST00000336133:exon_56151058_56151337:SARNP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 56215851 G/A 1 9 11 20 3.84057467981811 6.30596428022231 -2.4653896004042 A:G G A 10 0.57326948002021 0.269322135581906 ENSG00000135392:ENST00000317269:exon_56214744_56215971:DNAJC14;ENSG00000135392:ENST00000317287:exon_56215781_56215891:DNAJC14 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 56383751 G/A 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 A:G G A 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000111540:ENST00000360299:exon_56383731_56383882:RAB5B;ENSG00000111540:ENST00000448789:exon_56383731_56383882:RAB5B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 56435929 C/G 1 3 5 8 1.28019155993937 2.86634740010105 -1.58615584016168 C:G C G 10 0.57326948002021 0.29890034016204 ENSG00000197728:ENST00000356464:exon_56435686_56435953:RPS26 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 56711371 C/T 1 5 10 15 2.13365259989895 5.7326948002021 -3.59904220030315 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0702450866322387 ENSG00000135473:ENST00000425394:exon_56710718_56711427:PAN2;ENSG00000135473:ENST00000379495:exon_56710721_56711427:PAN2;ENSG00000135473:ENST00000257931:exon_56710721_56711427:PAN2;ENSG00000135473:ENST00000440411:exon_56710721_56711427:PAN2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 57637593 G/A 1 30 33 63 12.8019155993937 18.9178928406669 -6.11597724127323 A:G G A 10 0.57326948002021 0.127360960865171 ENSG00000185482:ENST00000332782:exon_57637242_57637693:STAC3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 57649840 C/T 1 8 6 14 3.41384415983832 3.43961688012126 -0.0257727202829408 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000179912:ENST00000347140:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000429355:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000393811:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000402412:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000358907:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000403821:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000418182:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000438036:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000413953:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000441731:exon_57649773_57649857:R3HDM2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 64202890 C/G 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 C:G C G 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000118600:ENST00000261234:exon_64202455_64203300:TMEM5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 66546100 A/G 1 11 19 30 4.69403571977769 10.892120120384 -6.1980844006063 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0263036852376071 ENSG00000155957:ENST00000426857:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000358230:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000286424:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000398033:exon_66546051_66546156:TMBIM4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 69113184 C/T 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000111581:ENST00000229179:exon_69113121_69113211:NUP107;ENSG00000111581:ENST00000378905:exon_69113121_69113211:NUP107 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 69783937 T/C 1 23 19 42 9.81480195953517 10.892120120384 -1.07731816084882 T:C T C 10 0.57326948002021 0.756852995556134 ENSG00000127337:ENST00000247843:exon_69783927_69784575:YEATS4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 69986788 A/G 1 51 62 113 21.7632565189693 35.542707761253 -13.7794512422837 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0100449861396192 ENSG00000166226:ENST00000299300:exon_69986756_69986883:CCT2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 69995039 C/A 1 13 16 29 5.54749675973727 9.17231168032336 -3.62481492058609 A:C C A 10 0.57326948002021 0.191464076020977 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 72037921 T/C 1 25 27 52 10.6682629994947 15.4782759605457 -4.81001296105092 T:C T C 10 0.57326948002021 0.206986722362691 ENSG00000133858:ENST00000378743:exon_72037875_72038098:ZFC3H1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 72307616 A/G 1 6 4 10 2.56038311987874 2.29307792008084 0.267305199797899 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000121749:ENST00000319106:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000393309:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000485960:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000462788:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000407399:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000483828:exon_72307606_72307713:TBC1D15 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 76453966 G/A 1 279 214 493 119.057815074361 122.679668724325 -3.62185364996355 A:G G A 10 0.57326948002021 0.750078177776154 ENSG00000187109:ENST00000393263:exon_76453918_76454059:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000261182:exon_76453918_76454059:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000431879:exon_76453918_76454059:NAP1L1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 80190650 C/G 1 46 31 77 19.6296039190703 17.7713538806265 1.85825003844382 C:G C G 10 0.57326948002021 0.730170839568053 ENSG00000058272:ENST00000261207:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000341878:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000312727:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000360825:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000450142:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000437004:exon_80190562_80190730:PPP1R12A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 88505633 A/G 1 6 6 12 2.56038311987874 3.43961688012126 -0.879233760242521 A:G A G 10 0.57326948002021 0.771962928640395 ENSG00000198707:ENST00000309041:exon_88505471_88505635:CEP290;ENSG00000198707:ENST00000397838:exon_88505471_88505635:CEP290 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 90028901 T/C 1 9 23 32 3.84057467981811 13.1851980404648 -9.34462336064672 T:C T C 10 0.57326948002021 0.00104342009326488 ENSG00000070961:ENST00000428670:exon_90028774_90029028:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000261173:exon_90028774_90029028:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000348959:exon_90028774_90029028:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000359142:exon_90028774_90029028:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000393164:exon_90028774_90029028:ATP2B1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 95694394 G/A 1 87 52 139 37.1255552382417 29.8100129610509 7.3155422771908 A:G G A 10 0.57326948002021 0.23016379217241 ENSG00000028203:ENST00000436874:exon_95693941_95696566:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000261219:exon_95693941_95694944:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000356859:exon_95692870_95694944:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397796:exon_95693941_95694944:VEZT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 102295218 T/C 1 8 13 21 3.41384415983832 7.45250324026273 -4.03865908042441 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0812407434582742 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 104341398 T/A 1 4 9 13 1.70692207991916 5.15942532018189 -3.45250324026273 A:T T A 10 0.57326948002021 0.088426240843314 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 104373600 G/A 1 7 4 11 2.98711363985853 2.29307792008084 0.694035719777689 A:G G A 10 0.57326948002021 0.767959695054619 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 106903321 T/C 1 2 9 11 0.85346103995958 5.15942532018189 -4.30596428022231 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0120270282768556 ENSG00000013503:ENST00000228347:exon_106903198_106903974:POLR3B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 107372277 C/T 1 8 7 15 3.41384415983832 4.01288636014147 -0.599042200303151 T:C C T 10 0.57326948002021 0.7979049378473 ENSG00000120832:ENST00000240050:exon_107371069_107372549:MTERFD3;ENSG00000120832:ENST00000392830:exon_107371069_107372549:MTERFD3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 108127965 A/G 1 8 11 19 3.41384415983832 6.30596428022231 -2.89212012038399 A:G A G 10 0.57326948002021 0.245610170938846 ENSG00000110851:ENST00000228437:exon_108126644_108128299:PRDM4;ENSG00000110851:ENST00000446655:exon_108126644_108128299:PRDM4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 109889549 G/A 1 8 3 11 3.41384415983832 1.71980844006063 1.69403571977769 A:G G A 10 0.57326948002021 0.372574328023575 ENSG00000110906:ENST00000228495:exon_109886460_109889618:KCTD10;ENSG00000110906:ENST00000440541:exon_109886460_109889618:KCTD10;ENSG00000110906:ENST00000424763:exon_109886460_109889618:KCTD10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 110011229 G/T 1 7 7 14 2.98711363985853 4.01288636014147 -1.02577272028294 T:G G T 10 0.57326948002021 0.5990458397462 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 110011230 C/T 1 7 7 14 2.98711363985853 4.01288636014147 -1.02577272028294 T:C C T 10 0.57326948002021 0.5990458397462 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 110019338 C/T 1 4 9 13 1.70692207991916 5.15942532018189 -3.45250324026273 T:C C T 10 0.57326948002021 0.088426240843314 ENSG00000110921:ENST00000392727:exon_110019200_110019355:MVK;ENSG00000110921:ENST00000447878:exon_110019200_110019355:MVK;ENSG00000110921:ENST00000228510:exon_110019200_110019355:MVK HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 110780107 G/A 1 6 5 11 2.56038311987874 2.86634740010105 -0.305964280222311 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000174437:ENST00000308664:exon_110780033_110780253:ATP2A2;ENSG00000174437:ENST00000377685:exon_110780033_110780253:ATP2A2;ENSG00000174437:ENST00000313432:exon_110780033_110780253:ATP2A2;ENSG00000174437:ENST00000395494:exon_110780033_110780253:ATP2A2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 112191641 G/A 1 5 5 10 2.13365259989895 2.86634740010105 -0.732694800202101 A:G G A 10 0.57326948002021 0.752834960365011 ENSG00000111271:ENST00000455480:exon_112191576_112191719:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000313698:exon_112191576_112191719:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000512792:exon_112191511_112191719:ACAD10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 112460147 T/G 1 158 150 308 67.4234221568068 85.9904220030315 -18.5669998462247 T:G T G 10 0.57326948002021 0.0331488716182856 ENSG00000089248:ENST00000261735:exon_112459954_112461024:ERP29;ENSG00000089248:ENST00000455836:exon_112459954_112461024:ERP29 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 112477055 T/C 1 3 8 11 1.28019155993937 4.58615584016168 -3.30596428022231 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0642027293927821 ENSG00000111300:ENST00000261745:exon_112477033_112477143:NAA25 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 113348870 G/A 1 59 57 116 25.1771006788076 32.676360361152 -7.49925968234437 A:G G A 10 0.57326948002021 0.160492283054399 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000445409:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000452357:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000377508:exon_113348856_113349040:OAS1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 113357193 G/A 1 2 11 13 0.85346103995958 6.30596428022231 -5.45250324026273 A:G G A 10 0.57326948002021 0.00319980416353301 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 113357209 G/A 1 60 10 70 25.6038311987874 5.7326948002021 19.8711363985853 A:G G A 10 0.57326948002021 6.24831741145596e-07 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113357195_113357536:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113357194_113357711:OAS1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 113357237 G/C 1 55 12 67 23.4701785988884 6.87923376024252 16.5909448386459 C:G G C 10 0.57326948002021 3.1170423359083e-05 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113357195_113357536:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113357194_113357711:OAS1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 113435450 A/T 1 8 5 13 3.41384415983832 2.86634740010105 0.547496759737269 A:T A T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000111335:ENST00000342315:exon_113435325_113435560:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000392583:exon_113435325_113435560:OAS2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 113448288 A/G 1 28 28 56 11.9484545594341 16.0515454405659 -4.10309088113176 A:G A G 10 0.57326948002021 0.281806043624587 ENSG00000111335:ENST00000342315:exon_113448179_113449528:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000392583:exon_113446892_113448503:OAS2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 114282496 C/T 1 14 16 30 5.97422727971706 9.17231168032336 -3.1980844006063 T:C C T 10 0.57326948002021 0.269877834954907 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114282473_114282593:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114282473_114282593:RBM19 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 114377885 G/C 1 16 8 24 6.82768831967664 4.58615584016168 2.24153247951496 C:G G C 10 0.57326948002021 0.413539465644685 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114377765_114377965:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114377765_114377965:RBM19 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 116408538 A/G 1 7 4 11 2.98711363985853 2.29307792008084 0.694035719777689 A:G A G 10 0.57326948002021 0.767959695054619 ENSG00000123066:ENST00000281928:exon_116408399_116408575:MED13L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 117476896 C/A 1 84 124 208 35.8453636783024 71.0854155225061 -35.2400518442037 A:C C A 10 0.57326948002021 1.06685284371315e-06 ENSG00000088992:ENST00000470612:exon_117476728_117477015:TESC;ENSG00000088992:ENST00000335209:exon_117476729_117477015:TESC;ENSG00000088992:ENST00000392545:exon_117476729_117477015:TESC HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 120436408 G/A 1 3 6 9 1.28019155993937 3.43961688012126 -2.15942532018189 A:G G A 10 0.57326948002021 0.183674374674640 ENSG00000135127:ENST00000397558:exon_120436325_120436540:CCDC64;ENSG00000135127:ENST00000446727:exon_120436325_120436540:CCDC64;ENSG00000135127:ENST00000257583:exon_120436325_120436540:CCDC64;ENSG00000135127:ENST00000357093:exon_120436325_120436540:CCDC64 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 120578714 C/T 1 7 4 11 2.98711363985853 2.29307792008084 0.694035719777689 T:C C T 10 0.57326948002021 0.767959695054619 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120578663_120578827:GCN1L1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 120966921 A/G 1 10 10 20 4.2673051997979 5.7326948002021 -1.4653896004042 A:G A G 10 0.57326948002021 0.508038948022547 ENSG00000110871:ENST00000288532:exon_120966743_120966964:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000445328:exon_120966743_120966953:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000302223:exon_120966743_120966953:COQ5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 121017171 A/G 1 47 39 86 20.0563344390501 22.3575097207882 -2.30117528173807 A:G A G 10 0.57326948002021 0.663160336155519 ENSG00000167272:ENST00000357500:exon_121016849_121017215:POP5;ENSG00000167272:ENST00000341039:exon_121016849_121017215:POP5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 121174899 T/C 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 T:C T C 10 0.57326948002021 0.741310101183539 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121174789_121174938:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121174789_121174938:ACADS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 121176083 G/A 1 15 17 32 6.40095779969685 9.74558116034357 -3.34462336064672 A:G G A 10 0.57326948002021 0.283704858668405 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176083_121176253:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176083_121176253:ACADS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 121176679 C/T 1 14 6 20 5.97422727971706 3.43961688012126 2.5346103995958 T:C C T 10 0.57326948002021 0.36622341140112 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176623_121176718:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176623_121176718:ACADS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 121177272 G/C 1 26 24 50 11.0949935194745 13.758467520485 -2.6634740010105 C:G G C 10 0.57326948002021 0.476380378672828 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121177099_121177810:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121177099_121177810:ACADS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 121442241 C/T 1 8 5 13 3.41384415983832 2.86634740010105 0.547496759737269 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000157895:ENST00000288757:exon_121440848_121442292:C12orf43;ENSG00000157895:ENST00000445832:exon_121440848_121442295:C12orf43 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 121458400 C/T 1 12 14 26 5.12076623975748 8.02577272028294 -2.90500648052546 T:C C T 10 0.57326948002021 0.3215675945048 ENSG00000135114:ENST00000257570:exon_121458121_121458861:OASL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 122231573 C/T 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 T:C C T 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000139725:ENST00000267205:exon_122231402_122231594:RHOF HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 122353796 A/G 1 22 22 44 9.38807143955538 12.6119285604446 -3.22385712088924 A:G A G 10 0.57326948002021 0.361684849446788 ENSG00000110801:ENST00000261817:exon_122353762_122353850:PSMD9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 122812503 G/C 1 25 23 48 10.6682629994947 13.1851980404648 -2.51693504097008 C:G G C 10 0.57326948002021 0.469311949283943 ENSG00000130779:ENST00000361654:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000358808:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000302528:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000392458:exon_122812494_122812709:CLIP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 123105143 C/T 1 26 16 42 11.0949935194745 9.17231168032336 1.92268183915118 A:T:C C T 10 0.57326948002021 0.64063792575317 ENSG00000184445:ENST00000333479:exon_123105026_123105155:KNTC1;ENSG00000184445:ENST00000450485:exon_123105026_123105155:KNTC1;ENSG00000196917:ENST00000356987:exon_123104824_123105249:GPR81 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 123345736 C/G 1 14 6 20 5.97422727971706 3.43961688012126 2.5346103995958 C:G C G 10 0.57326948002021 0.36622341140112 ENSG00000130787:ENST00000253083:exon_123345678_123345739:HIP1R HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 124104049 A/G 1 35 26 61 14.9355681992926 14.9050064805255 0.0305617187671867 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124103979_124104271:DDX55 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 124104686 G/A 1 33 39 72 14.0821071593331 22.3575097207882 -8.27540256145513 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0562320443746855 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124104511_124105480:DDX55 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 124144395 A/G 1 5 7 12 2.13365259989895 4.01288636014147 -1.87923376024252 A:G A G 10 0.57326948002021 0.382460042999359 ENSG00000111358:ENST00000228955:exon_124144342_124144477:GTF2H3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 124427306 T/A 1 9 9 18 3.84057467981811 5.15942532018189 -1.31885064036378 A:T T A 10 0.57326948002021 0.635341898612975 ENSG00000119242:ENST00000238156:exon_124427291_124427332:CCDC92 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 124856618 A/G 1 12 10 22 5.12076623975748 5.7326948002021 -0.611928560444621 A:G A G 10 0.57326948002021 0.831433502359143 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124856568_124857156:NCOR2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 124857033 C/T 1 7 4 11 2.98711363985853 2.29307792008084 0.694035719777689 T:C C T 10 0.57326948002021 0.767959695054619 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000448614:exon_124857006_124857156:NCOR2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 125434580 C/T 1 9 6 15 3.84057467981811 3.43961688012126 0.400957799696849 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125434532_125434605:DHX37 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 125453437 G/A 1 3 7 10 1.28019155993937 4.01288636014147 -2.7326948002021 A:G G A 10 0.57326948002021 0.109775478323748 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125453413_125453514:DHX37 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 129299385 G/A 1 10 8 18 4.2673051997979 4.58615584016168 -0.318850640363781 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129299320_129299615:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129299320_129299615:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129299320_129299615:SLC15A4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 129299446 A/G 1 8 12 20 3.41384415983832 6.87923376024252 -3.4653896004042 A:G A G 10 0.57326948002021 0.173354231238589 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129299320_129299615:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129299320_129299615:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129299320_129299615:SLC15A4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 132416813 G/A 1 10 9 19 4.2673051997979 5.15942532018189 -0.892120120383991 A:G G A 10 0.57326948002021 0.817360355716801 ENSG00000177192:ENST00000443358:exon_132416720_132416857:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000440818:exon_132416720_132416857:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000376649:exon_132416720_132416857:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000322060:exon_132416720_132416857:PUS1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 132561987 C/T 1 12 6 18 5.12076623975748 3.43961688012126 1.68114935963622 T:C C T 10 0.57326948002021 0.482786461758876 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132561946_132565005:EP400 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 132626425 G/A 1 6 4 10 2.56038311987874 2.29307792008084 0.267305199797899 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626395_132626501:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626395_132626501:DDX51 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 132626668 T/C 1 3 7 10 1.28019155993937 4.01288636014147 -2.7326948002021 T:C T C 10 0.57326948002021 0.109775478323748 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626664_132626735:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626664_132626735:DDX51 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 132636937 G/A 1 26 26 52 11.0949935194745 14.9050064805255 -3.81001296105092 A:G G A 10 0.57326948002021 0.326772290650383 ENSG00000184967:ENST00000330579:exon_132636827_132636986:NOC4L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 133208979 T/C 1 9 12 21 3.84057467981811 6.87923376024252 -3.03865908042441 T:C T C 10 0.57326948002021 0.192086447359513 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000434528:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133208901_133209094:POLE HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 133212582 G/A 1 8 6 14 3.41384415983832 3.43961688012126 -0.0257727202829408 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133212478_133212610:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133212478_133212610:POLE;ENSG00000177084:ENST00000434528:exon_133212478_133212610:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133212478_133212610:POLE HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 133272470 G/T 1 11 6 17 4.69403571977769 3.43961688012126 1.25441883965643 T:G G T 10 0.57326948002021 0.629145660806696 ENSG00000176894:ENST00000317479:exon_133272470_133272632:PGAM5;ENSG00000176894:ENST00000428960:exon_133272470_133272632:PGAM5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 133294333 C/T 1 5 7 12 2.13365259989895 4.01288636014147 -1.87923376024252 T:C C T 10 0.57326948002021 0.382460042999359 ENSG00000176894:ENST00000454808:exon_133294296_133294384:PGAM5;ENSG00000176894:ENST00000317555:exon_133294296_133294384:PGAM5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 133306589 C/T 1 34 25 59 14.5088376793129 14.3317370005053 0.177100678807607 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133306265_133306856:ANKLE2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 133306710 C/T 1 30 17 47 12.8019155993937 9.74558116034357 3.05633443905013 T:C C T 10 0.57326948002021 0.381533111996689 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133306265_133306856:ANKLE2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 133331364 G/A 1 7 10 17 2.98711363985853 5.7326948002021 -2.74558116034357 A:G G A 10 0.57326948002021 0.221546928311467 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133331261_133331719:ANKLE2;ENSG00000176915:ENST00000337516:exon_133331261_133331719:ANKLE2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 133331537 G/A 1 8 6 14 3.41384415983832 3.43961688012126 -0.0257727202829408 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133331261_133331719:ANKLE2;ENSG00000176915:ENST00000337516:exon_133331261_133331719:ANKLE2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 133378440 C/T 1 8 4 12 3.41384415983832 2.29307792008084 1.12076623975748 T:C C T 10 0.57326948002021 0.573925568669172 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133378353_133378555:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133378353_133378555:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133378353_133378555:GOLGA3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 133393323 C/T 1 2 9 11 0.85346103995958 5.15942532018189 -4.30596428022231 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0120270282768556 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133393246_133393398:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133393126_133393398:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133393126_133393398:GOLGA3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 133435716 T/G 1 6 4 10 2.56038311987874 2.29307792008084 0.267305199797899 T:G T G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000072609:ENST00000443047:exon_133435654_133435813:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000315585:exon_133435654_133435813:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000450056:exon_133435654_133435813:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000266880:exon_133435654_133435813:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000432561:exon_133435654_133435813:CHFR HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 133683261 T/C 1 13 7 20 5.54749675973727 4.01288636014147 1.5346103995958 T:C T C 10 0.57326948002021 0.652301753764728 ENSG00000196387:ENST00000355557:exon_133682096_133684260:ZNF140 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 12 133768553 A/T 1 3 5 8 1.28019155993937 2.86634740010105 -1.58615584016168 A:T A T 10 0.57326948002021 0.29890034016204 ENSG00000090612:ENST00000416488:exon_133768494_133768589:ZNF268;ENSG00000090612:ENST00000228289:exon_133768494_133768589:ZNF268 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 21063524 A/G 1 10 11 21 4.2673051997979 6.30596428022231 -2.03865908042441 A:G A G 10 0.57326948002021 0.385389697267756 ENSG00000165475:ENST00000298248:exon_21063509_21063635:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000382812:exon_21063509_21063635:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000480748:exon_21063509_21063575:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000421925:exon_21063509_21063635:CRYL1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 21535837 T/G 1 181 5 186 77.238224116342 2.86634740010105 74.3718767162409 A:T:C:G T C 10 0.57326948002021 7.10083946353819e-37 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 23905711 A/G 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 25000617 C/G 1 60 65 125 25.6038311987874 37.2625162013137 -11.6586850025263 C:G C G 10 0.57326948002021 0.0375526482013546 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25000604_25000736:PARP4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 25009297 G/T 1 18 16 34 7.68114935963622 9.17231168032336 -1.49116232068714 T:G G T 10 0.57326948002021 0.60774078808005 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 25009441 C/G 1 24 15 39 10.241532479515 8.59904220030315 1.64249027921181 C:G C G 10 0.57326948002021 0.630966343038844 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 25009485 C/G 1 11 11 22 4.69403571977769 6.30596428022231 -1.61192856044462 C:G C G 10 0.57326948002021 0.522736284345544 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 25466955 T/C 1 3 5 8 1.28019155993937 2.86634740010105 -1.58615584016168 T:C T C 10 0.57326948002021 0.29890034016204 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000418179:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25466781_25467005:CENPJ HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 26788114 A/G 1 18 14 32 7.68114935963622 8.02577272028294 -0.344623360646722 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000127870:ENST00000346166:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381588:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000399762:exon_26786906_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381570:exon_26786912_26789729:RNF6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 28009920 G/C 1 51 45 96 21.7632565189693 25.7971266009095 -4.03387008194017 C:G G C 10 0.57326948002021 0.410897529179235 ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28009570_28009958:GTF3A;ENSG00000122033:ENST00000381116:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000381120:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000405591:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000431572:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000461838:exon_28009821_28010030:MTIF3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 28239940 G/C 1 96 83 179 40.9661299180598 47.5813668416774 -6.6152369236176 C:G G C 10 0.57326948002021 0.326572131504082 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 28239970 G/A 1 123 110 233 52.4878539575142 63.0596428022231 -10.5717888447089 A:T:C:G G A 10 0.57326948002021 0.164735773958556 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 31036642 C/G 1 5 8 13 2.13365259989895 4.58615584016168 -2.45250324026273 C:G C G 10 0.57326948002021 0.261241293669647 ENSG00000189403:ENST00000490788:exon_31036483_31036849:HMGB1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 33017043 T/C 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 T:C T C 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000139617:ENST00000380121:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000510912:exon_33016525_33017553:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000503296:exon_33016525_33018261:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000357505:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000244754:ENST00000504114:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000399396:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000509076:exon_33016525_33018261:N4BP2L2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 41515182 T/C 1 7 1 8 2.98711363985853 0.57326948002021 2.41384415983832 T:C T C 10 0.57326948002021 0.149609550462636 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41515057_41515506:ELF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 43639845 A/C 1 21 25 46 8.96134091957559 14.3317370005053 -5.37039608092966 A:C A C 10 0.57326948002021 0.135352387078508 ENSG00000120675:ENST00000379221:exon_43639822_43639873:DNAJC15;ENSG00000120675:ENST00000474320:exon_43639822_43639873:DNAJC15 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 45841502 G/A 1 27 20 47 11.5217240394543 11.4653896004042 0.0563344390501275 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000188342:ENST00000340473:exon_45841368_45841511:GTF2F2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 46541673 T/A 1 25 1 26 10.6682629994947 0.57326948002021 10.0949935194745 A:T T A 10 0.57326948002021 1.22931929144201e-05 ENSG00000123200:ENST00000242848:exon_46541639_46542163:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000378921:exon_46541639_46542163:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000282007:exon_46541639_46542163:ZC3H13 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 46562935 A/G 1 10 5 15 4.2673051997979 2.86634740010105 1.40095779969685 A:G A G 10 0.57326948002021 0.604487754064262 ENSG00000123200:ENST00000242848:exon_46562922_46563232:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000378921:exon_46562922_46563232:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000282007:exon_46562922_46563232:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000431251:exon_46562922_46563232:ZC3H13 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 50080847 A/G 1 1 11 12 0.42673051997979 6.30596428022231 -5.87923376024252 A:G A G 10 0.57326948002021 0.000624264011460467 ENSG00000136147:ENST00000482487:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000496623:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000467763:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000485919:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000442195:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50080771_50080892:PHF11 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 50102810 G/A 1 102 75 177 43.5265130379386 42.9952110015158 0.531302036422815 A:C:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50102647_50103123:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50102647_50103111:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000426879:exon_50102647_50102844:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50102647_50103117:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000486276:exon_50102647_50103112:PHF11 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 52603775 C/T 1 7 13 20 2.98711363985853 7.45250324026273 -4.4653896004042 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0677059243274011 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 73329358 G/A 1 18 17 35 7.68114935963622 9.74558116034357 -2.06443180070735 A:G G A 10 0.57326948002021 0.498226006157124 ENSG00000136122:ENST00000377815:exon_73329289_73330328:C13orf34;ENSG00000136122:ENST00000390667:exon_73329289_73330318:C13orf34 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 73343039 C/T 1 11 8 19 4.69403571977769 4.58615584016168 0.107879879616009 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73342923_73343050:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73342923_73343050:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73342923_73343050:DIS3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 73350079 T/C 1 5 5 10 2.13365259989895 2.86634740010105 -0.732694800202101 T:C T C 10 0.57326948002021 0.752834960365011 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73350063_73350230:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73350063_73350230:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73350063_73350230:DIS3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 77825329 C/A 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 A:C C A 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77825286_77825490:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77825286_77825490:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000360084:exon_77825286_77825490:MYCBP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 96239805 G/A 0 0 16 16 0 9.17231168032336 -9.17231168032336 A G A 10 0.57326948002021 1.20909180845388e-06 ENSG00000134874:ENST00000347108:exon_96239793_96239983:DZIP1;ENSG00000134874:ENST00000361156:exon_96239793_96239983:DZIP1;ENSG00000134874:ENST00000376825:exon_96239793_96239983:DZIP1;ENSG00000134874:ENST00000361396:exon_96239793_96239983:DZIP1;ENSG00000134874:ENST00000376829:exon_96239793_96239983:DZIP1;ENSG00000134874:ENST00000485031:exon_96239793_96240387:DZIP1;ENSG00000134874:ENST00000479518:exon_96239793_96239928:DZIP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 99948097 A/G 1 5 10 15 2.13365259989895 5.7326948002021 -3.59904220030315 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0702450866322387 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 99948178 C/A 1 3 14 17 1.28019155993937 8.02577272028294 -6.74558116034357 A:C C A 10 0.57326948002021 0.00106756090444914 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 103528002 G/C 1 91 104 195 38.8324773181609 59.6200259221018 -20.787548603941 C:G G C 10 0.57326948002021 0.00293517926046276 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103527657_103528345:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375954:exon_103527657_103528333:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472247:exon_103527657_103528242:ERCC5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 111279844 G/A 1 4 7 11 1.70692207991916 4.01288636014147 -2.30596428022231 A:G G A 10 0.57326948002021 0.223014268684580 ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111279786_111279899:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000424185:exon_111279786_111279894:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000397191:exon_111279786_111279894:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111279786_111279894:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000439607:exon_111279786_111279894:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111279786_111279894:CARKD HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 111290880 G/A 1 16 11 27 6.82768831967664 6.30596428022231 0.521724039454329 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000213995:ENST00000458711:exon_111290725_111291452:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111290725_111290892:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111290725_111292340:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111290589_111292340:CARKD HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 111298392 A/G 1 48 44 92 20.4830649590299 25.2238571208892 -4.74079216185932 A:G A G 10 0.57326948002021 0.343313173381194 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111298314_111298420:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000487253:exon_111298314_111298643:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000480437:exon_111298314_111298625:CARS2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 111371958 G/A 1 43 22 65 18.349412359131 12.6119285604446 5.73748379868634 A:G G A 10 0.57326948002021 0.168388609544614 ENSG00000153487:ENST00000338450:exon_111371576_111372522:ING1;ENSG00000153487:ENST00000333219:exon_111371576_111373421:ING1;ENSG00000153487:ENST00000375775:exon_111371576_111372522:ING1;ENSG00000153487:ENST00000375777:exon_111371576_111373420:ING1;ENSG00000153487:ENST00000375774:exon_111371576_111373418:ING1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 111532288 G/A 1 31 25 56 13.2286461193735 14.3317370005053 -1.10309088113176 A:G G A 10 0.57326948002021 0.788079451579218 ENSG00000088448:ENST00000267339:exon_111530887_111532459:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000485844:exon_111532115_111532459:ANKRD10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 111932967 G/A 1 10 7 17 4.2673051997979 4.01288636014147 0.254418839656429 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000102606:ENST00000317133:exon_111932885_111933024:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375741:exon_111932885_111933024:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375739:exon_111932885_111933024:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000370623:exon_111932885_111933024:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000469877:exon_111932885_111933024:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000466143:exon_111932885_111933024:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000218789:exon_111932885_111933024:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375737:exon_111932885_111933024:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375736:exon_111932885_111933024:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426073:exon_111932885_111933024:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375723:exon_111932885_111933024:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000478679:exon_111932885_111933024:ARHGEF7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 113965127 G/A 1 10 15 25 4.2673051997979 8.59904220030315 -4.33173700050525 A:G G A 10 0.57326948002021 0.104461185238695 ENSG00000185896:ENST00000332556:exon_113965024_113965182:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000472564:exon_113965024_113965182:LAMP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 13 114542858 G/A 1 9 9 18 3.84057467981811 5.15942532018189 -1.31885064036378 A:G G A 10 0.57326948002021 0.635341898612975 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 20825965 A/C 1 31 38 69 13.2286461193735 21.784240240768 -8.55559412139449 A:C A C 10 0.57326948002021 0.0390573912344121 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20825555_20826062:PARP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 20837033 T/C 1 6 4 10 2.56038311987874 2.29307792008084 0.267305199797899 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20836957_20837061:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20836957_20837061:TEP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 20916249 T/C 1 3 7 10 1.28019155993937 4.01288636014147 -2.7326948002021 T:C T C 10 0.57326948002021 0.109775478323748 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 20916958 T/C 1 25 30 55 10.6682629994947 17.1980844006063 -6.52982140111155 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0778353513261329 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20916892_20916970:OSGEP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 21831419 C/T 1 10 11 21 4.2673051997979 6.30596428022231 -2.03865908042441 T:C C T 10 0.57326948002021 0.385389697267756 ENSG00000092201:ENST00000216297:exon_21831392_21831487:SUPT16H HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 23020638 T/C 1 114 72 186 48.6472792776961 41.2754025614551 7.37187671624093 T:C T C 10 0.57326948002021 0.299520295907303 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 23020921 G/C 1 166 101 267 70.8372663166451 57.9002174820412 12.9370488346039 C:G G C 10 0.57326948002021 0.121783354178689 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 23021039 G/A 1 98 90 188 41.8195909580194 51.5942532018189 -9.77466224379948 A:G G A 10 0.57326948002021 0.161244163484218 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 23236524 C/T 1 8 11 19 3.41384415983832 6.30596428022231 -2.89212012038399 T:C C T 10 0.57326948002021 0.245610170938846 ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000483939:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000473744:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000431881:exon_23236457_23236623:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23236491_23236618:OXA1L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 23242828 T/C 1 5 23 28 2.13365259989895 13.1851980404648 -11.0515454405659 T:C T C 10 0.57326948002021 2.60241668107585e-05 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000404278:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23242447_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23242462_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23242462_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23242499_23242925:SLC7A7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 23299135 G/T 1 59 41 100 25.1771006788076 23.5040486808286 1.67305199797899 T:G G T 10 0.57326948002021 0.762584973861218 ENSG00000172590:ENST00000355151:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000311892:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000448164:exon_23299092_23299157:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397496:exon_23299092_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000432849:exon_23299103_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000382894:exon_23299113_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397505:exon_23299119_23299149:MRPL52 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 23299286 T/C 1 84 67 151 35.8453636783024 38.4090551613541 -2.56369148305172 T:C T C 10 0.57326948002021 0.681498899881551 ENSG00000172590:ENST00000355151:exon_23299259_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000311892:exon_23299259_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000448164:exon_23299259_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397496:exon_23299092_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000432849:exon_23299262_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000382894:exon_23299259_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397505:exon_23299262_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000461594:exon_23299138_23299319:MRPL52 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 23302585 T/A 1 11 7 18 4.69403571977769 4.01288636014147 0.681149359636219 A:T T A 10 0.57326948002021 0.81555142020924 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 23374435 G/A 1 5 4 9 2.13365259989895 2.29307792008084 -0.15942532018189 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000307814:exon_23374303_23374455:RBM23 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 23374862 C/T 1 7 3 10 2.98711363985853 1.71980844006063 1.2673051997979 T:C C T 10 0.57326948002021 0.532053210294076 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000307814:exon_23374815_23374868:RBM23 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 23549319 A/G 1 7 10 17 2.98711363985853 5.7326948002021 -2.74558116034357 A:G A G 10 0.57326948002021 0.221546928311467 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 23549785 T/C 1 13 24 37 5.54749675973727 13.758467520485 -8.21097076074777 T:C T C 10 0.57326948002021 0.00747403677127028 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 24647814 T/C 1 12 26 38 5.12076623975748 14.9050064805255 -9.78424024076798 T:C T C 10 0.57326948002021 0.00160646036184174 ENSG00000100918:ENST00000311457:exon_24647812_24647878:REC8;ENSG00000100918:ENST00000447460:exon_24647812_24647878:REC8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 24653523 G/C 1 11 18 29 4.69403571977769 10.3188506403638 -5.62481492058609 C:G G C 10 0.57326948002021 0.0392889833415210 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653504_24653624:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653504_24653624:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653504_24653624:IPO4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 24653954 G/A 1 7 3 10 2.98711363985853 1.71980844006063 1.2673051997979 A:G G A 10 0.57326948002021 0.532053210294076 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653856_24653969:IPO4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 24654489 T/C 1 4 8 12 1.70692207991916 4.58615584016168 -2.87923376024252 T:C T C 10 0.57326948002021 0.141786607964141 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24654389_24654518:IPO4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 24662177 C/T 1 9 9 18 3.84057467981811 5.15942532018189 -1.31885064036378 T:C C T 10 0.57326948002021 0.635341898612975 ENSG00000100926:ENST00000261789:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000528669:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000529332:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000524835:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000396854:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000531406:exon_24661854_24662319:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000528895:exon_24661919_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000530563:exon_24661937_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000530468:exon_24662049_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000525592:exon_24662094_24662475:TM9SF1;ENSG00000254692:ENST00000530611:exon_24661854_24662475:RP11-468E2.1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 24682610 C/T 1 12 4 16 5.12076623975748 2.29307792008084 2.82768831967664 T:C C T 10 0.57326948002021 0.207382237471198 ENSG00000213920:ENST00000528804:exon_24681945_24683805:MDP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 24707879 T/C 1 39 23 62 16.6424902792118 13.1851980404648 3.45729223874697 T:C T C 10 0.57326948002021 0.441473853878381 ENSG00000100938:ENST00000355299:exon_24707795_24708445:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000421944:exon_24707795_24708445:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000420554:exon_24707795_24708445:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000399440:exon_24707795_24708445:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000348719:exon_24707452_24707984:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000456667:exon_24707795_24708445:GMPR2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 24760764 G/A 1 31 7 38 13.2286461193735 4.01288636014147 9.21575975923202 A:G G A 10 0.57326948002021 0.00265664958430986 ENSG00000157379:ENST00000288111:exon_24760762_24760831:DHRS1;ENSG00000157379:ENST00000396813:exon_24760762_24760831:DHRS1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 24805463 G/T 1 11 9 20 4.69403571977769 5.15942532018189 -0.465389600404201 T:G G T 10 0.57326948002021 0.825497110151158 ENSG00000129465:ENST00000216274:exon_24805227_24805601:RIPK3;ENSG00000129465:ENST00000382557:exon_24805228_24805601:RIPK3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 24901433 C/T 1 6 6 12 2.56038311987874 3.43961688012126 -0.879233760242521 T:C C T 10 0.57326948002021 0.771962928640395 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24900669_24901816:KHNYN HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 31578762 C/T 1 3 8 11 1.28019155993937 4.58615584016168 -3.30596428022231 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0642027293927821 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000399321:exon_31578603_31578806:HECTD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 34985506 G/C 1 27 27 54 11.5217240394543 15.4782759605457 -3.95655192109134 C:G G C 10 0.57326948002021 0.275375955279130 ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34985136_34985792:EAPP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 34985645 G/A 1 29 19 48 12.3751850794139 10.892120120384 1.48306495902992 A:T:G G A 10 0.57326948002021 0.770826541704848 ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34985136_34985792:EAPP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 34985658 C/T 1 26 18 44 11.0949935194745 10.3188506403638 0.776142879110758 T:C C T 10 0.57326948002021 0.87956576134095 ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34985136_34985792:EAPP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 34993982 G/C 1 8 4 12 3.41384415983832 2.29307792008084 1.12076623975748 C:G G C 10 0.57326948002021 0.573925568669172 ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34993903_34994013:EAPP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 34993984 C/T 1 8 4 12 3.41384415983832 2.29307792008084 1.12076623975748 T:C C T 10 0.57326948002021 0.573925568669172 ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34993903_34994013:EAPP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 35062312 C/T 1 5 8 13 2.13365259989895 4.58615584016168 -2.45250324026273 T:C C T 10 0.57326948002021 0.261241293669647 ENSG00000129515:ENST00000396526:exon_35062251_35062356:SNX6;ENSG00000129515:ENST00000396534:exon_35062251_35062356:SNX6;ENSG00000129515:ENST00000355110:exon_35062251_35062356:SNX6;ENSG00000129515:ENST00000362031:exon_35062251_35062356:SNX6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 35263983 T/C 1 18 28 46 7.68114935963622 16.0515454405659 -8.37039608092966 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0162881538735588 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35263955_35264093:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35263955_35264093:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35263955_35264093:BAZ1A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 35487929 A/G 1 36 33 69 15.3622987192724 18.9178928406669 -3.55559412139449 A:G A G 10 0.57326948002021 0.396481755845054 ENSG00000100883:ENST00000216774:exon_35487898_35487971:SRP54 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 35591174 T/C 1 15 25 40 6.40095779969685 14.3317370005053 -7.9307792008084 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0154797979969365 ENSG00000092020:ENST00000261475:exon_35591108_35591519:PPP2R3C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 35592538 C/G 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 C:G C G 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000100890:ENST00000321130:exon_35592158_35593437:KIAA0391;ENSG00000100890:ENST00000250377:exon_35592158_35593437:KIAA0391 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 35735960 A/G 1 10 11 21 4.2673051997979 6.30596428022231 -2.03865908042441 A:G A G 10 0.57326948002021 0.385389697267756 ENSG00000100890:ENST00000321130:exon_35735933_35736081:KIAA0391;ENSG00000100890:ENST00000250377:exon_35735933_35736081:KIAA0391 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 35761675 C/G 1 47 54 101 20.0563344390501 30.9565519210913 -10.9002174820412 C:G C G 10 0.57326948002021 0.0341775755040491 ENSG00000100902:ENST00000261479:exon_35761563_35761758:PSMA6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 35782253 A/G 1 78 69 147 33.2849805584236 39.5555941213945 -6.27061356297088 A:G A G 10 0.57326948002021 0.317239470510480 ENSG00000100902:ENST00000261479:exon_35782087_35782265:PSMA6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 39644498 G/A 1 11 12 23 4.69403571977769 6.87923376024252 -2.18519804046483 A:G G A 10 0.57326948002021 0.402290518448411 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39644425_39644596:PNN HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 39818028 A/G 1 15 8 23 6.40095779969685 4.58615584016168 1.81480195953517 A:G A G 10 0.57326948002021 0.530254060134089 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 39818145 G/A 1 17 17 34 7.25441883965643 9.74558116034357 -2.49116232068714 A:G G A 10 0.57326948002021 0.392022589767345 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 51238051 A/G 1 7 5 12 2.98711363985853 2.86634740010105 0.120766239757479 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51238050_51238186:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51238050_51238186:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51238050_51238186:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51238050_51238186:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51238050_51238186:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51238050_51238186:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51238050_51238186:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51238050_51238186:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51238050_51238186:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51238050_51238186:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453401:exon_51238050_51238186:NIN HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 51716467 G/A 1 8 8 16 3.41384415983832 4.58615584016168 -1.17231168032336 A:G G A 10 0.57326948002021 0.617511810756066 ENSG00000139921:ENST00000457354:exon_51716411_51716483:TMX1;ENSG00000139921:ENST00000267434:exon_51716411_51716483:TMX1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 54416926 A/C 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 A:C A C 10 0.57326948002021 0.741310101183539 ENSG00000125378:ENST00000245451:exon_54416454_54417606:BMP4;ENSG00000125378:ENST00000417573:exon_54416457_54417606:BMP4;ENSG00000125378:ENST00000395600:exon_54416457_54417606:BMP4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 55604935 C/A 1 47 14 61 20.0563344390501 8.02577272028294 12.0305617187672 A:C C A 10 0.57326948002021 0.00171008436100024 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55604763_55605086:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55603699_55605086:LGALS3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 55605036 A/C 1 45 26 71 19.2028733990905 14.9050064805255 4.29786691856509 A:C A C 10 0.57326948002021 0.338052179531086 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55604763_55605086:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55603699_55605086:LGALS3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 55619311 A/G 1 19 38 57 8.10787987961601 21.784240240768 -13.676360361152 A:G A G 10 0.57326948002021 0.000394155440849934 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55619308_55619365:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55619308_55619365:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55619308_55619365:DLGAP5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 55818517 T/A 1 3 5 8 1.28019155993937 2.86634740010105 -1.58615584016168 A:T T A 10 0.57326948002021 0.29890034016204 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 55818706 T/C 1 6 6 12 2.56038311987874 3.43961688012126 -0.879233760242521 T:C T C 10 0.57326948002021 0.771962928640395 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 55836335 C/T 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000126775:ENST00000247178:exon_55833110_55836643:ATG14 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 58831645 G/A 1 10 10 20 4.2673051997979 5.7326948002021 -1.4653896004042 A:G G A 10 0.57326948002021 0.508038948022547 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58830888_58832018:ARID4A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 58838668 A/G 1 5 4 9 2.13365259989895 2.29307792008084 -0.15942532018189 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58838604_58840451:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58838604_58839012:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58838604_58838944:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000466065:exon_58838604_58838678:ARID4A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 59939727 T/C 1 13 6 19 5.54749675973727 3.43961688012126 2.10787987961601 T:C T C 10 0.57326948002021 0.363933046022059 ENSG00000126790:ENST00000247194:exon_59939335_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000463432:exon_59939579_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000532049:exon_59939583_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000478430:exon_59939585_59939808:C14orf149 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 60611648 C/T 1 50 31 81 21.3365259989895 17.7713538806265 3.56517211836298 T:C C T 10 0.57326948002021 0.434665975792506 ENSG00000100612:ENST00000216500:exon_60610838_60611731:DHRS7;ENSG00000100612:ENST00000360557:exon_60611502_60611731:DHRS7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 64908845 G/A 1 68 52 120 29.0176753586257 29.8100129610509 -0.792337602425206 A:G G A 10 0.57326948002021 0.926541946058197 ENSG00000100714:ENST00000216605:exon_64908772_64908883:MTHFD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 68117421 T/C 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 T:C T C 10 0.57326948002021 0.509627549256674 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 68118132 C/T 1 77 84 161 32.8582500384438 48.1546363216976 -15.2963862832538 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0166657955417322 ENSG00000081181:ENST00000261783:exon_68117432_68118437:ARG2;ENSG00000100568:ENST00000216456:exon_68117869_68118198:VTI1B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 69521345 G/A 1 15 17 32 6.40095779969685 9.74558116034357 -3.34462336064672 A:G G A 10 0.57326948002021 0.283704858668405 ENSG00000139990:ENST00000341516:exon_69517638_69522328:DCAF5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 73422350 T/G 1 7 2 9 2.98711363985853 1.14653896004042 1.84057467981811 T:G T G 10 0.57326948002021 0.31706387914541 ENSG00000119599:ENST00000358377:exon_73422231_73422404:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000353777:exon_73422231_73422404:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509320:exon_73422231_73422404:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000394234:exon_73422231_73422404:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509153:exon_73422231_73422404:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000340355:exon_73422231_73422404:DCAF4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 74203789 G/A 1 7 3 10 2.98711363985853 1.71980844006063 1.2673051997979 A:G G A 10 0.57326948002021 0.532053210294076 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000451078:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74203701_74204000:C14orf43 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 74205368 G/A 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 A:G G A 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000451078:exon_74205263_74206177:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74205263_74206958:C14orf43 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 74205878 C/T 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000451078:exon_74205263_74206177:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74205263_74206958:C14orf43 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 74428445 G/A 1 19 23 42 8.10787987961601 13.1851980404648 -5.07731816084882 A:G G A 10 0.57326948002021 0.120661493153583 ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74428440_74428606:COQ6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 75904660 A/G 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 A:G A G 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000140044:ENST00000419727:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000437176:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000435893:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000267569:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000413024:exon_75904601_75904824:JDP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 76330181 G/A 1 10 4 14 4.2673051997979 2.29307792008084 1.97422727971706 A:G G A 10 0.57326948002021 0.419102837465114 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000286653:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76330010_76330205:TTLL5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 76368544 T/C 1 3 5 8 1.28019155993937 2.86634740010105 -1.58615584016168 T:C T C 10 0.57326948002021 0.29890034016204 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76368485_76368567:TTLL5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 77926011 C/T 1 32 31 63 13.6553766393533 17.7713538806265 -4.11597724127324 T:C C T 10 0.57326948002021 0.309930166069859 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77925959_77926149:AHSA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 77935520 G/A 1 95 108 203 40.53939939808 61.9131038421827 -21.3737044441026 A:G G A 10 0.57326948002021 0.00280992871301201 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77935420_77935807:AHSA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 77978621 A/C 1 15 19 34 6.40095779969685 10.892120120384 -4.49116232068714 A:C A C 10 0.57326948002021 0.122729190657319 ENSG00000100596:ENST00000216484:exon_77973272_77978746:SPTLC2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 78174473 A/C 1 44 74 118 18.7761428791108 42.4219415214955 -23.6457986423848 A:C A C 10 0.57326948002021 1.47230713305843e-05 ENSG00000119705:ENST00000238688:exon_78174425_78174551:C14orf156 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 90398907 G/A 1 4 12 16 1.70692207991916 6.87923376024252 -5.17231168032336 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0108544448583934 ENSG00000140025:ENST00000316738:exon_90398870_90398971:C14orf143 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 92441066 C/T 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92440971_92441087:TRIP11 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 92548785 C/T 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000066427:ENST00000429774:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359819:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393289:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359366:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393287:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000502250:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000503767:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000340660:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000532032:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000447800:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000515746:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000506466:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000526872:exon_92548687_92548808:ATXN3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 92588002 T/G 1 290 222 512 123.751850794139 127.265824564487 -3.51397377034755 T:G T G 10 0.57326948002021 0.75467654707919 ENSG00000183648:ENST00000329559:exon_92587986_92588153:NDUFB1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 93118668 C/T 1 3 7 10 1.28019155993937 4.01288636014147 -2.7326948002021 T:C C T 10 0.57326948002021 0.109775478323748 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 93172903 C/T 1 88 86 174 37.5522857582215 49.3011752817381 -11.7488895235166 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0778644635638921 ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93172828_93172998:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93172828_93172998:LGMN HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 93412743 G/A 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 A:G G A 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000100605:ENST00000354313:exon_93412676_93412838:ITPK1;ENSG00000100605:ENST00000405174:exon_93412676_93412838:ITPK1;ENSG00000100605:ENST00000267615:exon_93412676_93412838:ITPK1;ENSG00000100605:ENST00000311458:exon_93412676_93412838:ITPK1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 94405871 G/C 1 5 4 9 2.13365259989895 2.29307792008084 -0.15942532018189 C:G G C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94405454_94406018:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94405454_94406018:ASB2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 94546047 G/C 1 62 73 135 26.457292238747 41.8486720414753 -15.3913798027284 C:G G C 10 0.57326948002021 0.00883573997537776 ENSG00000089737:ENST00000423579:exon_94545625_94546088:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94545371_94546093:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94545706_94546088:DDX24 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 96010424 G/A 1 72 44 116 30.7245974385449 25.2238571208892 5.50074031765563 A:C:G G A 10 0.57326948002021 0.347964317976204 ENSG00000182512:ENST00000331334:exon_96010284_96011055:GLRX5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 97321689 C/T 1 22 27 49 9.38807143955538 15.4782759605457 -6.09020452099029 T:C C T 10 0.57326948002021 0.084144882521353 ENSG00000100749:ENST00000216639:exon_97321561_97321693:VRK1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 100609972 G/A 1 7 12 19 2.98711363985853 6.87923376024252 -3.89212012038399 A:G G A 10 0.57326948002021 0.102154620750249 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 100759046 C/A 1 13 15 28 5.54749675973727 8.59904220030315 -3.05154544056588 A:C C A 10 0.57326948002021 0.256818512999306 ENSG00000197119:ENST00000359232:exon_100757448_100759369:SLC25A29;ENSG00000197119:ENST00000392908:exon_100757448_100759369:SLC25A29 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 100996312 T/C 1 9 12 21 3.84057467981811 6.87923376024252 -3.03865908042441 T:C T C 10 0.57326948002021 0.192086447359513 ENSG00000176473:ENST00000402312:exon_100996157_100996625:WDR25;ENSG00000176473:ENST00000335290:exon_100996157_100996640:WDR25 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 102504838 C/T 1 8 5 13 3.41384415983832 2.86634740010105 0.547496759737269 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102504797_102504943:DYNC1H1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 102514227 T/C 1 14 24 38 5.97422727971706 13.758467520485 -7.78424024076798 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0132271482547016 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102514154_102514365:DYNC1H1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 102792489 G/A 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 A:G G A 10 0.57326948002021 0.741310101183539 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102792322_102793224:ZNF839 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 102808330 C/T 1 13 11 24 5.54749675973727 6.30596428022231 -0.758467520485041 T:C C T 10 0.57326948002021 0.83740962540527 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102807660_102809044:ZNF839 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 102815042 C/T 1 50 61 111 21.3365259989895 34.9694382812328 -13.6329122822433 A:T:C C T 10 0.57326948002021 0.00953699607022612 ENSG00000100865:ENST00000216756:exon_102814623_102815096:CINP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 102825773 G/C 1 37 29 66 15.7890292392522 16.6248149205861 -0.835785681333862 C:G G C 10 0.57326948002021 0.901110121814328 ENSG00000100865:ENST00000216756:exon_102825756_102825924:CINP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 104129058 T/C 1 20 10 30 8.5346103995958 5.7326948002021 2.8019155993937 T:C T C 10 0.57326948002021 0.358284681355315 ENSG00000126214:ENST00000445352:exon_104129039_104129264:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000452929:exon_104129039_104129264:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000334553:exon_104129039_104129264:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000380038:exon_104129039_104129264:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000443396:exon_104129039_104129264:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000348520:exon_104129039_104129264:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000246489:exon_104129039_104129264:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000347839:exon_104129039_104129264:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000389744:exon_104129039_104129264:C14orf153 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 105179194 T/C 1 12 7 19 5.12076623975748 4.01288636014147 1.10787987961601 T:C T C 10 0.57326948002021 0.651195141393552 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000480763:exon_105179170_105179270:INF2;ENSG00000203485:ENST00000477497:exon_105179050_105179329:INF2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 105180706 A/G 1 17 8 25 7.25441883965643 4.58615584016168 2.66826299949475 A:G A G 10 0.57326948002021 0.317653755834644 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 105180785 C/T 1 15 10 25 6.40095779969685 5.7326948002021 0.668262999494749 T:C C T 10 0.57326948002021 0.842313011148823 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 105477507 G/A 1 22 22 44 9.38807143955538 12.6119285604446 -3.22385712088924 A:G G A 10 0.57326948002021 0.361684849446788 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 105477613 T/C 1 18 18 36 7.68114935963622 10.3188506403638 -2.63770128072756 T:C T C 10 0.57326948002021 0.402265706696478 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105477541_105477953:CDCA4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 105478102 G/A 1 36 35 71 15.3622987192724 20.0644318007074 -4.70213308143492 A:G G A 10 0.57326948002021 0.280986396649668 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105478072_105478240:CDCA4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 105930406 G/A 1 18 15 33 7.68114935963622 8.59904220030315 -0.917892840666932 A:G G A 10 0.57326948002021 0.860635492003374 ENSG00000182979:ENST00000435036:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000414153:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000331320:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000406191:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000405646:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000438610:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000434050:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000490198:exon_105930369_105930484:MTA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 106091329 G/C 1 3855 2 3857 1645.04615452209 1.14653896004042 1643.89961556205 T:C:G G T 10 0.57326948002021 4.94065645841247e-324 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 106091504 A/G 0 1035 1 1036 441.666088179083 0.57326948002021 441.092818699062 A:T A T 10 0.57326948002021 4.05472701253753e-248 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 106091555 C/T 1 689 2 691 294.017328266075 1.14653896004042 292.870789306035 A:T:C C A 10 0.57326948002021 1.54973281099111e-162 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 106091697 T/C 1 1111 14 1125 474.097607697547 8.02577272028294 466.071834977264 T:C:G T C 10 0.57326948002021 1.54607547026647e-242 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 106092152 G/A 1 1419 1 1420 605.530607851322 0.57326948002021 604.957338371302 A:T:C:G G A 10 0.57326948002021 0 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 106092383 C/G 1 1 290 291 0.42673051997979 166.248149205861 -165.821418685881 C:G C G 10 0.57326948002021 9.28828963967643e-106 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 14 106174261 C/G 0 40 0 40 17.0692207991916 0 17.0692207991916 C C 10 0.57326948002021 2.56805942704590e-10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 23052632 T/C 1 5 5 10 2.13365259989895 2.86634740010105 -0.732694800202101 T:C T C 10 0.57326948002021 0.752834960365011 ENSG00000170113:ENST00000337435:exon_23052595_23052755:NIPA1;ENSG00000170113:ENST00000437912:exon_23052595_23052755:NIPA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 34651983 T/C 1 12 5 17 5.12076623975748 2.86634740010105 2.25441883965643 T:C T C 10 0.57326948002021 0.331859417462969 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 40313141 C/T 1 10 4 14 4.2673051997979 2.29307792008084 1.97422727971706 T:C C T 10 0.57326948002021 0.419102837465114 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40313100_40313228:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40313100_40313228:EIF2AK4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 40328665 G/A 1 402 300 702 171.545669031876 171.980844006063 -0.435174974187476 A:C:G G A 10 0.57326948002021 0.969589206518718 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40327891_40328701:SRP14 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 40330564 C/T 1 145 57 202 61.8759253970695 32.676360361152 29.1995650359176 T:C C T 10 0.57326948002021 2.45887766737574e-05 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40330483_40330595:SRP14 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 40849408 C/T 1 6 8 14 2.56038311987874 4.58615584016168 -2.02577272028294 T:C C T 10 0.57326948002021 0.291858897104158 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 41634587 A/G 1 18 3 21 7.68114935963622 1.71980844006063 5.96134091957559 A:G A G 10 0.57326948002021 0.00766076294259929 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 41634588 C/A 1 18 3 21 7.68114935963622 1.71980844006063 5.96134091957559 A:C C A 10 0.57326948002021 0.00766076294259929 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 41829230 A/G 1 2 6 8 0.85346103995958 3.43961688012126 -2.58615584016168 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0801462458318362 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41829143_41829399:RPAP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 42139642 C/T 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 T:C C T 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000168970:ENST00000490848:exon_42139535_42139721:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000382448:exon_42139535_42139721:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000491746:exon_42139535_42139721:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000487292:exon_42139535_42139721:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000458483:exon_42139535_42139721:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000243708:ENST00000452633:exon_42139535_42139721:PLA2G4B;ENSG00000243708:ENST00000483748:exon_42139535_42139721:PLA2G4B;ENSG00000243708:ENST00000484140:exon_42139535_42139721:PLA2G4B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 42211486 A/G 1 7 4 11 2.98711363985853 2.29307792008084 0.694035719777689 A:G A G 10 0.57326948002021 0.767959695054619 ENSG00000103966:ENST00000220325:exon_42211408_42211820:EHD4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 42734320 C/T 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000103994:ENST00000263805:exon_42734271_42734612:ZFP106;ENSG00000103994:ENST00000434903:exon_42734271_42734612:ZFP106 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 42820589 G/A 1 25 24 49 10.6682629994947 13.758467520485 -3.09020452099029 A:G G A 10 0.57326948002021 0.388825125727597 ENSG00000092531:ENST00000249647:exon_42820460_42820618:SNAP23 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 43017426 T/G 1 7 3 10 2.98711363985853 1.71980844006063 1.2673051997979 T:G T G 10 0.57326948002021 0.532053210294076 ENSG00000140326:ENST00000267892:exon_43017342_43017449:CDAN1;ENSG00000140326:ENST00000356231:exon_43017342_43017449:CDAN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 43020983 G/A 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 A:G G A 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000140326:ENST00000267892:exon_43020850_43021008:CDAN1;ENSG00000140326:ENST00000356231:exon_43020850_43021008:CDAN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 43237572 T/C 1 4 7 11 1.70692207991916 4.01288636014147 -2.30596428022231 T:C T C 10 0.57326948002021 0.223014268684580 ENSG00000159459:ENST00000290650:exon_43235095_43237668:UBR1;ENSG00000159459:ENST00000382177:exon_43235106_43237668:UBR1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 43632549 T/C 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 T:C T C 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000168803:ENST00000428046:exon_43632463_43632550:ADAL;ENSG00000168803:ENST00000422466:exon_43632463_43632550:ADAL;ENSG00000168803:ENST00000389651:exon_43632463_43632550:ADAL;ENSG00000168803:ENST00000305605:exon_43632463_43632550:ADAL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 43653322 G/A 1 15 4 19 6.40095779969685 2.29307792008084 4.10787987961601 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0647708307520217 ENSG00000140265:ENST00000396976:exon_43650370_43654139:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000396972:exon_43650370_43654139:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000267817:exon_43650370_43654139:ZSCAN29 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 43653649 G/A 1 4 7 11 1.70692207991916 4.01288636014147 -2.30596428022231 A:G G A 10 0.57326948002021 0.223014268684580 ENSG00000140265:ENST00000396976:exon_43650370_43654139:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000396972:exon_43650370_43654139:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000267817:exon_43650370_43654139:ZSCAN29 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 43707808 A/T 1 14 9 23 5.97422727971706 5.15942532018189 0.814801959535169 A:T A T 10 0.57326948002021 0.834555320864254 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000476454:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000434561:exon_43707792_43708007:TP53BP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 44038899 C/T 1 10 40 50 4.2673051997979 22.9307792008084 -18.6634740010105 T:C C T 10 0.57326948002021 1.42733564203574e-07 ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44038590_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000469684:exon_44038608_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000446523:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000455250:exon_44038810_44038904:PDIA3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 44061802 C/T 1 24 43 67 10.241532479515 24.650587640869 -14.4090551613541 T:C C T 10 0.57326948002021 0.00046881839091383 ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44061716_44061844:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44061716_44061844:PDIA3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 45361180 A/T 1 9 5 14 3.84057467981811 2.86634740010105 0.974227279717059 A:T A T 10 0.57326948002021 0.788481610276296 ENSG00000140263:ENST00000267814:exon_45361075_45361250:SORD HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 45654327 A/G 1 16 22 38 6.82768831967664 12.6119285604446 -5.78424024076798 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0705026941920413 ENSG00000171766:ENST00000396659:exon_45653322_45654419:GATM;ENSG00000171766:ENST00000305575:exon_45653322_45654419:GATM;ENSG00000171766:ENST00000432007:exon_45653324_45654419:GATM HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 45981317 G/A 1 17 12 29 7.25441883965643 6.87923376024252 0.375185079413908 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000137767:ENST00000260324:exon_45981237_45981415:SQRDL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 49620200 C/T 1 14 14 28 5.97422727971706 8.02577272028294 -2.05154544056588 T:C C T 10 0.57326948002021 0.450176838712125 ENSG00000156958:ENST00000327171:exon_49620149_49622002:GALK2;ENSG00000156958:ENST00000396509:exon_49620149_49622002:GALK2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 51018547 C/T 1 3 7 10 1.28019155993937 4.01288636014147 -2.7326948002021 A:T:C C T 10 0.57326948002021 0.109775478323748 ENSG00000138600:ENST00000261854:exon_51018518_51018574:AC012100.1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 52357227 C/T 1 12 11 23 5.12076623975748 6.30596428022231 -1.18519804046483 T:C C T 10 0.57326948002021 0.67579941697981 ENSG00000069956:ENST00000261845:exon_52356099_52358462:MAPK6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 55653031 A/G 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 A:G A G 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55651737_55653142:CCPG1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 59453236 C/T 1 3 5 8 1.28019155993937 2.86634740010105 -1.58615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.29890034016204 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 59453384 T/C 1 17 15 32 7.25441883965643 8.59904220030315 -1.34462336064672 T:C T C 10 0.57326948002021 0.721478695176765 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59453272_59453429:MYO1E HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 59510189 G/A 1 17 18 35 7.25441883965643 10.3188506403638 -3.06443180070735 A:G G A 10 0.57326948002021 0.309302325896262 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59510090_59510286:MYO1E HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 63414083 A/C 1 6 4 10 2.56038311987874 2.29307792008084 0.267305199797899 A:C A C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63413999_63414427:LACTB;ENSG00000103642:ENST00000413507:exon_63414032_63414427:LACTB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 63433766 G/A 1 60 49 109 25.6038311987874 28.0902045209903 -2.48637332220289 A:G G A 10 0.57326948002021 0.629738783990085 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 63433785 G/A 1 56 52 108 23.8969091188682 29.8100129610509 -5.91310384218269 A:G G A 10 0.57326948002021 0.284534153685111 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 63548787 G/A 1 2 6 8 0.85346103995958 3.43961688012126 -2.58615584016168 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0801462458318362 ENSG00000166128:ENST00000321437:exon_63548704_63548793:RAB8B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 63597857 T/G 1 7 7 14 2.98711363985853 4.01288636014147 -1.02577272028294 T:G T G 10 0.57326948002021 0.5990458397462 ENSG00000138613:ENST00000380343:exon_63597813_63601324:APH1B;ENSG00000138613:ENST00000261879:exon_63597813_63601325:APH1B;ENSG00000138613:ENST00000380340:exon_63597813_63598754:APH1B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 64418397 G/A 1 15 6 21 6.40095779969685 3.43961688012126 2.96134091957559 A:G G A 10 0.57326948002021 0.269857208962559 ENSG00000028528:ENST00000353874:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000261889:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000380285:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000440389:exon_64418278_64418419:SNX1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 64429101 C/T 1 34 23 57 14.5088376793129 13.1851980404648 1.32363963884803 T:C C T 10 0.57326948002021 0.789567206916115 ENSG00000028528:ENST00000353874:exon_64429060_64429131:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000261889:exon_64429060_64429131:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000380285:exon_64429060_64429131:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000440389:exon_64429060_64429131:SNX1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 64448365 C/T 1 15 5 20 6.40095779969685 2.86634740010105 3.5346103995958 T:C C T 10 0.57326948002021 0.119776766604918 ENSG00000157734:ENST00000325881:exon_64446586_64449680:SNX22 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 64737225 G/A 1 11 8 19 4.69403571977769 4.58615584016168 0.107879879616009 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000103671:ENST00000261884:exon_64737205_64737307:TRIP4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 65108479 T/C 1 39 24 63 16.6424902792118 13.758467520485 2.88402275872676 T:C T C 10 0.57326948002021 0.524966195802666 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65107831_65108556:PIF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 65113493 G/A 1 5 5 10 2.13365259989895 2.86634740010105 -0.732694800202101 A:G G A 10 0.57326948002021 0.752834960365011 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 65114484 G/A 1 10 13 23 4.2673051997979 7.45250324026273 -3.18519804046483 A:G G A 10 0.57326948002021 0.207996353000423 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65114465_65114590:PIF1;ENSG00000140451:ENST00000333425:exon_65114465_65114590:PIF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 65153690 G/A 1 5 4 9 2.13365259989895 2.29307792008084 -0.15942532018189 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000249240:ENST00000502574:exon_65153676_65153774:AC069368.3;ENSG00000249240:ENST00000437723:exon_65153676_65153774:AC069368.3;ENSG00000241839:ENST00000323544:exon_65153676_65153774:PLEKHO2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 65551666 G/A 1 9 4 13 3.84057467981811 2.29307792008084 1.54749675973727 A:G G A 10 0.57326948002021 0.576729970937834 ENSG00000138617:ENST00000261888:exon_65550432_65551883:PARP16;ENSG00000138617:ENST00000444347:exon_65550438_65551880:PARP16;ENSG00000138617:ENST00000432843:exon_65550438_65551880:PARP16 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 68492028 G/A 1 7 6 13 2.98711363985853 3.43961688012126 -0.452503240262731 A:G G A 10 0.57326948002021 0.787569123349065 ENSG00000129007:ENST00000354678:exon_68491879_68492300:CALML4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 69739269 C/T 1 24 25 49 10.241532479515 14.3317370005053 -4.09020452099029 T:C C T 10 0.57326948002021 0.250287713615529 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69739210_69739280:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69739210_69739280:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69739210_69739280:KIF23 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 71634028 C/T 0 126 0 126 53.7680455174535 0 53.7680455174535 C C 10 0.57326948002021 4.5619756760904e-31 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 74328116 A/G 1 32 27 59 13.6553766393533 15.4782759605457 -1.82289932119239 A:G A G 10 0.57326948002021 0.693403888411906 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 74328141 G/T 1 40 38 78 17.0692207991916 21.784240240768 -4.71501944157638 A:T:G G T 10 0.57326948002021 0.303563632975536 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 74703929 T/C 1 22 16 38 9.38807143955538 9.17231168032336 0.215759759232018 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74703897_74704051:SEMA7A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 75093389 C/T 1 176 172 348 75.104571516443 98.6023505634761 -23.4977790470331 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0125634121137374 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75093353_75093443:CSK HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 75130093 T/C 1 14 2 16 5.97422727971706 1.14653896004042 4.82768831967664 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0199016024025769 ENSG00000140474:ENST00000440863:exon_75130092_75130139:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000418051:exon_75130092_75130139:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000268074:exon_75130092_75130139:ULK3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 75131661 A/G 1 3 7 10 1.28019155993937 4.01288636014147 -2.7326948002021 A:G A G 10 0.57326948002021 0.109775478323748 ENSG00000140474:ENST00000440863:exon_75131609_75131714:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000418051:exon_75131609_75131714:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000268074:exon_75131609_75131714:ULK3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 75131959 A/G 1 4 9 13 1.70692207991916 5.15942532018189 -3.45250324026273 A:G A G 10 0.57326948002021 0.088426240843314 ENSG00000140474:ENST00000440863:exon_75131899_75132054:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000418051:exon_75131899_75132054:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000268074:exon_75131899_75132054:ULK3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 75188506 C/T 1 17 15 32 7.25441883965643 8.59904220030315 -1.34462336064672 T:C C T 10 0.57326948002021 0.721478695176765 ENSG00000178802:ENST00000352410:exon_75188493_75188666:MPI;ENSG00000178802:ENST00000323744:exon_75188493_75188666:MPI;ENSG00000178802:ENST00000379693:exon_75188493_75188842:MPI HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 75499995 T/G 1 16 14 30 6.82768831967664 8.02577272028294 -1.1980844006063 T:G T G 10 0.57326948002021 0.713630396278199 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 75631983 G/A 1 14 11 25 5.97422727971706 6.30596428022231 -0.331737000505251 A:G G A 10 0.57326948002021 1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 75909803 A/G 1 23 12 35 9.81480195953517 6.87923376024252 2.93556819929265 A:G A G 10 0.57326948002021 0.393538494097529 ENSG00000169371:ENST00000308588:exon_75909749_75909893:SNUPN;ENSG00000169371:ENST00000371091:exon_75909749_75909893:SNUPN;ENSG00000169371:ENST00000432476:exon_75909749_75909893:SNUPN;ENSG00000169371:ENST00000394932:exon_75909749_75909893:SNUPN HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 75932129 G/T 1 32 35 67 13.6553766393533 20.0644318007074 -6.40905516135408 T:G G T 10 0.57326948002021 0.137748221752818 ENSG00000177971:ENST00000314852:exon_75931426_75932609:IMP3;ENSG00000177971:ENST00000403490:exon_75931690_75932552:IMP3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 77344793 T/A 1 11 18 29 4.69403571977769 10.3188506403638 -5.62481492058609 A:T T A 10 0.57326948002021 0.0392889833415210 ENSG00000140391:ENST00000267970:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000346495:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000424443:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000423920:exon_77344727_77344810:TSPAN3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 79187225 A/G 1 11 58 69 4.69403571977769 33.2496298411722 -28.5555941213945 A:G A G 10 0.57326948002021 2.13008287200857e-12 ENSG00000185787:ENST00000379535:exon_79187162_79187246:MORF4L1;ENSG00000185787:ENST00000426013:exon_79187162_79187246:MORF4L1;ENSG00000185787:ENST00000331268:exon_79187162_79187246:MORF4L1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 80191343 G/A 1 4 7 11 1.70692207991916 4.01288636014147 -2.30596428022231 A:G G A 10 0.57326948002021 0.223014268684580 ENSG00000136371:ENST00000478497:exon_80191189_80191467:MTHFS;ENSG00000136371:ENST00000485386:exon_80191246_80191467:MTHFS;ENSG00000180953:ENST00000322484:exon_80191185_80191467:ST20;ENSG00000180953:ENST00000417278:exon_80191185_80191467:ST20 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 82444437 A/G 1 7 12 19 2.98711363985853 6.87923376024252 -3.89212012038399 A:G A G 10 0.57326948002021 0.102154620750249 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 83680287 A/G 1 6 9 15 2.56038311987874 5.15942532018189 -2.59904220030315 A:G A G 10 0.57326948002021 0.198144643439766 ENSG00000169609:ENST00000514272:exon_83680238_83680356:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000510873:exon_83680238_83680343:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000512638:exon_83680238_83680301:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000513601:exon_83680249_83680391:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000304177:exon_83680249_83680358:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000508990:exon_83680238_83680337:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000505341:exon_83678989_83680346:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000506912:exon_83680238_83680362:C15orf40 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 86125304 C/T 1 9 3 12 3.84057467981811 1.71980844006063 2.12076623975748 T:C C T 10 0.57326948002021 0.256104231229550 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 86278309 G/A 1 6 9 15 2.56038311987874 5.15942532018189 -2.59904220030315 A:G G A 10 0.57326948002021 0.198144643439766 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86278223_86278381:AKAP13 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 86284342 C/T 1 11 25 36 4.69403571977769 14.3317370005053 -9.63770128072756 T:C C T 10 0.57326948002021 0.00194706319934127 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86284277_86284726:AKAP13 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 89836228 G/C 1 12 7 19 5.12076623975748 4.01288636014147 1.10787987961601 C:G G C 10 0.57326948002021 0.651195141393552 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89836173_89836294:FANCI HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 89858602 T/C 1 38 57 95 16.215759759232 32.676360361152 -16.46060060192 T:C T C 10 0.57326948002021 0.000820527684610123 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89858513_89858620:FANCI HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 89860786 A/C 1 6 4 10 2.56038311987874 2.29307792008084 0.267305199797899 A:C A C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000140521:ENST00000526671:exon_89860607_89861059:POLG HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 89861826 T/C 1 28 22 50 11.9484545594341 12.6119285604446 -0.663474001010503 T:C T C 10 0.57326948002021 0.886805386833341 ENSG00000140521:ENST00000268124:exon_89861772_89861980:POLG;ENSG00000140521:ENST00000442287:exon_89861772_89861980:POLG;ENSG00000140521:ENST00000530292:exon_89861772_89861980:POLG HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 90617539 C/T 1 7 2 9 2.98711363985853 1.14653896004042 1.84057467981811 T:C C T 10 0.57326948002021 0.31706387914541 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 90774259 G/C 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 C:G G C 10 0.57326948002021 0.509627549256674 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 90814664 C/T 1 39 35 74 16.6424902792118 20.0644318007074 -3.42194152149555 T:C C T 10 0.57326948002021 0.480964188669524 ENSG00000182768:ENST00000331497:exon_90814420_90816463:NGRN;ENSG00000182768:ENST00000379095:exon_90814420_90815440:NGRN HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 91424574 G/C 1 15 24 39 6.40095779969685 13.758467520485 -7.35750972078819 C:G G C 10 0.57326948002021 0.0224180488499317 ENSG00000140564:ENST00000268171:exon_91424516_91426688:FURIN HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 91499986 G/T 1 2 6 8 0.85346103995958 3.43961688012126 -2.58615584016168 T:G G T 10 0.57326948002021 0.0801462458318362 ENSG00000166965:ENST00000394258:exon_91499842_91500130:RCCD1;ENSG00000166965:ENST00000300233:exon_91499840_91500130:RCCD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 91513674 T/C 1 15 11 26 6.40095779969685 6.30596428022231 0.0949935194745386 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000198901:ENST00000417173:exon_91513634_91513744:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000394249:exon_91513634_91513744:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361188:exon_91513634_91513744:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000442656:exon_91513634_91513744:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361919:exon_91513634_91513744:PRC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 91525048 C/G 1 7 6 13 2.98711363985853 3.43961688012126 -0.452503240262731 C:G C G 10 0.57326948002021 0.787569123349065 ENSG00000198901:ENST00000417173:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000394249:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361188:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000442656:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361919:exon_91524978_91525211:PRC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 91525197 C/T 1 9 8 17 3.84057467981811 4.58615584016168 -0.745581160343571 T:C C T 10 0.57326948002021 0.807894812450834 ENSG00000198901:ENST00000417173:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000394249:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361188:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000442656:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361919:exon_91524978_91525211:PRC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 15 91543761 C/T 1 14 12 26 5.97422727971706 6.87923376024252 -0.905006480525461 T:C C T 10 0.57326948002021 0.843311627285244 ENSG00000184056:ENST00000333371:exon_91543720_91543821:VPS33B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 133233 C/G 1 146 84 230 62.3026559170493 48.1546363216976 14.1480195953517 C:G C G 10 0.57326948002021 0.0620041407079451 ENSG00000103152:ENST00000436333:exon_133051_133255:MPG;ENSG00000103152:ENST00000397817:exon_133051_133255:MPG;ENSG00000103152:ENST00000356432:exon_133051_133255:MPG;ENSG00000103152:ENST00000428050:exon_133051_133255:MPG;ENSG00000103152:ENST00000219431:exon_133051_133255:MPG;ENSG00000103152:ENST00000397818:exon_133051_133255:MPG HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 347184 A/G 1 12 11 23 5.12076623975748 6.30596428022231 -1.18519804046483 A:G A G 10 0.57326948002021 0.67579941697981 ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000461023:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000421566:exon_347056_347226:AXIN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 348222 C/T 1 8 8 16 3.41384415983832 4.58615584016168 -1.17231168032336 T:C C T 10 0.57326948002021 0.617511810756066 ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_347722_348251:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000461023:exon_347722_348251:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_347722_348251:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000421566:exon_347722_348251:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000481769:exon_347844_348251:AXIN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 396264 A/G 1 2 9 11 0.85346103995958 5.15942532018189 -4.30596428022231 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0120270282768556 ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_396148_397106:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000461023:exon_396148_396322:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_396148_397106:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000421566:exon_396148_396444:AXIN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 419092 A/G 1 128 102 230 54.6215065574131 58.4734869620614 -3.85198040464832 A:G A G 10 0.57326948002021 0.640886979436696 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 424277 G/A 1 13 8 21 5.54749675973727 4.58615584016168 0.961340919575589 A:G G A 10 0.57326948002021 0.826246679179264 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000424078:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000448854:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000467452:exon_424221_424399:TMEM8A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 425351 T/C 1 8 7 15 3.41384415983832 4.01288636014147 -0.599042200303151 T:C T C 10 0.57326948002021 0.7979049378473 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_425345_425435:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_425345_425435:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_425345_425435:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000475348:exon_425345_425435:TMEM8A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 427479 T/C 1 5 6 11 2.13365259989895 3.43961688012126 -1.30596428022231 T:C T C 10 0.57326948002021 0.545300564874909 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 427516 T/C 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 T:C T C 10 0.57326948002021 0.741310101183539 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 427784 G/A 1 8 2 10 3.41384415983832 1.14653896004042 2.2673051997979 A:G G A 10 0.57326948002021 0.205360643158888 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427671_427848:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427671_427805:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427671_427807:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427671_427848:TMEM8A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 427820 C/T 1 7 1 8 2.98711363985853 0.57326948002021 2.41384415983832 T:C C T 10 0.57326948002021 0.149609550462636 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427671_427848:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427671_427848:TMEM8A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 449345 G/C 1 1 12 13 0.42673051997979 6.87923376024252 -6.45250324026273 C:G G C 10 0.57326948002021 0.000287295249188175 ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000426167:exon_449295_449480:NME4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 449659 G/A 1 82 76 158 34.9919026383428 43.568480481536 -8.57657784319318 A:G G A 10 0.57326948002021 0.172206869804045 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000444498:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000420816:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000426167:exon_449627_449739:NME4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 450309 C/T 1 138 100 238 58.888811757211 57.326948002021 1.56186375519001 T:C C T 10 0.57326948002021 0.895764222334457 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_450219_450746:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_450219_450734:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_450219_450633:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_450219_450759:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_450219_450506:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_450109_450648:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_450219_450416:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_450219_450749:NME4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 570557 T/C 1 6 8 14 2.56038311987874 4.58615584016168 -2.02577272028294 T:C T C 10 0.57326948002021 0.291858897104158 ENSG00000090565:ENST00000262305:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000457159:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000434585:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000450428:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000448401:exon_570459_570599:RAB11FIP3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 602313 C/A 1 6 5 11 2.56038311987874 2.86634740010105 -0.305964280222311 A:C C A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_602301_602530:SOLH HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 772061 C/T 1 8 9 17 3.41384415983832 5.15942532018189 -1.74558116034357 T:C C T 10 0.57326948002021 0.464916768474155 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 772141 G/C 1 5 4 9 2.13365259989895 2.29307792008084 -0.15942532018189 C:G G C 10 0.57326948002021 1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 774193 G/T 1 21 12 33 8.96134091957559 6.87923376024252 2.08210715933307 T:G G T 10 0.57326948002021 0.488134134702606 ENSG00000162004:ENST00000463539:exon_774106_774205:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000485091:exon_774106_774205:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000293889:exon_774106_774205:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482878:exon_772582_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000478979:exon_772583_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000345165:exon_774106_774205:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000479742:exon_774106_774205:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000481804:exon_774106_775880:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000466708:exon_774106_774205:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482152:exon_774106_774205:CCDC78 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 774520 C/T 1 15 11 26 6.40095779969685 6.30596428022231 0.0949935194745386 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000162004:ENST00000463539:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482878:exon_772582_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000478979:exon_772583_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000479742:exon_774322_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000481804:exon_774106_775880:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000466708:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482152:exon_774322_774635:CCDC78 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 774692 A/G 1 5 7 12 2.13365259989895 4.01288636014147 -1.87923376024252 A:G A G 10 0.57326948002021 0.382460042999359 ENSG00000162004:ENST00000463539:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000485091:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000293889:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482878:exon_772582_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000478979:exon_772583_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000345165:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000479742:exon_774322_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000481804:exon_774106_775880:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000466708:exon_774322_774806:CCDC78 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 778024 T/C 1 26 25 51 11.0949935194745 14.3317370005053 -3.23674348103071 T:C T C 10 0.57326948002021 0.396657800675249 ENSG00000103253:ENST00000341413:exon_777965_778029:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389701:exon_777965_778029:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389703:exon_777965_778029:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389702:exon_777965_778029:HAGHL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 778820 G/A 1 24 29 53 10.241532479515 16.6248149205861 -6.38328244107113 A:G G A 10 0.57326948002021 0.094810474389374 ENSG00000103253:ENST00000341413:exon_778794_779715:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389701:exon_778794_778868:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389703:exon_778794_778895:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389702:exon_778794_779168:HAGHL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 780339 A/G 1 22 31 53 9.38807143955538 17.7713538806265 -8.38328244107113 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0254767658282822 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_779753_780655:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_779771_780655:NARFL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 781633 G/A 1 4 7 11 1.70692207991916 4.01288636014147 -2.30596428022231 A:G G A 10 0.57326948002021 0.223014268684580 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_781565_781702:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_781565_781702:NARFL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 784765 C/T 1 7 8 15 2.98711363985853 4.58615584016168 -1.59904220030315 T:C C T 10 0.57326948002021 0.441591135560738 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_784737_784871:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_784737_784871:NARFL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 1374818 A/G 1 138 130 268 58.888811757211 74.5250324026273 -15.6362206454163 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0556389694531402 ENSG00000103275:ENST00000325437:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000355803:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397514:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397515:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000406620:exon_1374731_1375351:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000403747:exon_1374731_1375215:UBE2I HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 1397815 C/T 1 7 4 11 2.98711363985853 2.29307792008084 0.694035719777689 T:C C T 10 0.57326948002021 0.767959695054619 ENSG00000007516:ENST00000397488:exon_1397702_1397822:BAIAP3;ENSG00000007516:ENST00000324385:exon_1397702_1397822:BAIAP3;ENSG00000007516:ENST00000397489:exon_1397702_1397822:BAIAP3;ENSG00000007516:ENST00000426824:exon_1397702_1397822:BAIAP3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 1544301 G/C 1 7 1 8 2.98711363985853 0.57326948002021 2.41384415983832 C:G G C 10 0.57326948002021 0.149609550462636 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1544247_1544617:TELO2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 1544302 A/G 1 7 1 8 2.98711363985853 0.57326948002021 2.41384415983832 A:G A G 10 0.57326948002021 0.149609550462636 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1544247_1544617:TELO2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 1545448 A/G 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1545347_1545624:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1545347_1545624:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1545347_1545624:TELO2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 2014424 C/G 1 3 9 12 1.28019155993937 5.15942532018189 -3.87923376024252 C:G C G 10 0.57326948002021 0.0369288562011821 ENSG00000140988:ENST00000526908:exon_2014277_2014539:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 2014591 C/T 1 614 142 756 262.012539267591 81.4042661628698 180.608273104721 T:C:G C T 10 0.57326948002021 5.30600799597244e-44 ENSG00000140988:ENST00000526522:exon_2014450_2014804:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527109:exon_2014450_2014631:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527871:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000530225:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531065:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533161:exon_2014450_2014814:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000343262:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000529806:exon_2014450_2014813:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531182:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527302:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 2025206 A/C 1 11 7 18 4.69403571977769 4.01288636014147 0.681149359636219 A:C A C 10 0.57326948002021 0.81555142020924 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025188_2025263:TBL3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 2025604 G/C 1 12 9 21 5.12076623975748 5.15942532018189 -0.0386590804244111 C:G G C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025530_2025711:TBL3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 2025678 C/A 1 8 10 18 3.41384415983832 5.7326948002021 -2.31885064036378 A:C C A 10 0.57326948002021 0.34156534419122 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025530_2025711:TBL3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 2028402 A/C 1 48 44 92 20.4830649590299 25.2238571208892 -4.74079216185932 A:C A C 10 0.57326948002021 0.343313173381194 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2028314_2028472:TBL3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 2036048 T/C 1 86 63 149 36.6988247182619 36.1159772412732 0.582847476988697 T:C T C 10 0.57326948002021 0.934246439258167 ENSG00000127554:ENST00000248114:exon_2035867_2037746:GFER;ENSG00000127554:ENST00000425414:exon_2035867_2037746:GFER HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 2049527 G/A 1 15 9 24 6.40095779969685 5.15942532018189 1.24153247951496 A:G G A 10 0.57326948002021 0.683372620411482 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 2134438 C/T 1 10 10 20 4.2673051997979 5.7326948002021 -1.4653896004042 T:C C T 10 0.57326948002021 0.508038948022547 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2134229_2134716:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2134229_2134716:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2134229_2134716:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2134229_2134716:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2134229_2134716:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2134229_2134716:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000497886:exon_2134229_2134716:TSC2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 2138269 T/C 1 36 38 74 15.3622987192724 21.784240240768 -6.42194152149554 T:C T C 10 0.57326948002021 0.157998861967742 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000497886:exon_2138228_2138326:TSC2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 2138584 G/C 1 34 35 69 14.5088376793129 20.0644318007074 -5.5555941213945 C:G G C 10 0.57326948002021 0.182417777238012 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2138447_2138713:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2138447_2138703:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2138447_2138712:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2138447_2138712:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2138447_2138713:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2138447_2138721:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000497886:exon_2138447_2138712:TSC2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 2140010 A/G 1 7 6 13 2.98711363985853 3.43961688012126 -0.452503240262731 A:G A G 10 0.57326948002021 0.787569123349065 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000306101:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000472577:exon_2139528_2140195:PKD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 2140321 G/A 1 2 6 8 0.85346103995958 3.43961688012126 -2.58615584016168 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0801462458318362 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000306101:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000472577:exon_2140286_2140591:PKD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 2821573 C/T 1 12 13 25 5.12076623975748 7.45250324026273 -2.33173700050525 T:C C T 10 0.57326948002021 0.419590889375568 ENSG00000103363:ENST00000409906:exon_2821415_2822103:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000262306:exon_2821415_2821605:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000409477:exon_2821416_2822103:TCEB2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 3533577 C/G 1 8 8 16 3.41384415983832 4.58615584016168 -1.17231168032336 C:G C G 10 0.57326948002021 0.617511810756066 ENSG00000122390:ENST00000424546:exon_3533363_3533598:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000407558:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000414063:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000360862:exon_3533363_3533598:NAT15 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 4445327 C/T 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 T:C C T 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4445290_4445340:CORO7;ENSG00000103426:ENST00000423908:exon_4445290_4445340:CORO7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 4476089 T/C 1 13 7 20 5.54749675973727 4.01288636014147 1.5346103995958 T:C T C 10 0.57326948002021 0.652301753764728 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4475806_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4475858_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4475882_4476093:DNAJA3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 4484396 A/T 1 14 5 19 5.97422727971706 2.86634740010105 3.10787987961601 A:T A T 10 0.57326948002021 0.170278135204151 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4484385_4484518:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4484385_4484518:DNAJA3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 4496973 T/A 1 5 5 10 2.13365259989895 2.86634740010105 -0.732694800202101 A:T T A 10 0.57326948002021 0.752834960365011 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4496887_4497015:DNAJA3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 4748825 C/T 1 8 8 16 3.41384415983832 4.58615584016168 -1.17231168032336 T:C C T 10 0.57326948002021 0.617511810756066 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4748801_4748942:ANKS3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 4855279 A/G 1 25 41 66 10.6682629994947 23.5040486808286 -12.8357856813339 A:G A G 10 0.57326948002021 0.00171040280149887 ENSG00000140632:ENST00000321919:exon_4853204_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000441951:exon_4855102_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000436648:exon_4855102_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000381983:exon_4855102_4855311:GLYR1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 5075542 G/A 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 A:G G A 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5074845_5075686:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5074873_5075686:NAGPA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 5075633 G/A 1 7 2 9 2.98711363985853 1.14653896004042 1.84057467981811 A:G G A 10 0.57326948002021 0.31706387914541 ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5074845_5075686:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5074873_5075686:NAGPA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 8722629 G/C 1 11 10 21 4.69403571977769 5.7326948002021 -1.03865908042441 C:G G C 10 0.57326948002021 0.66464815614549 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8722587_8722967:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8722587_8722967:C16orf68 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 8729124 G/A 1 6 11 17 2.56038311987874 6.30596428022231 -3.74558116034357 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0853131245996917 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8729025_8729169:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8729025_8729169:C16orf68 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 10775855 G/A 1 6 5 11 2.56038311987874 2.86634740010105 -0.305964280222311 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000153060:ENST00000283025:exon_10775850_10775993:TEKT5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 10851854 C/T 1 22 19 41 9.38807143955538 10.892120120384 -1.50404868082861 T:C C T 10 0.57326948002021 0.639273685314282 ENSG00000103274:ENST00000283027:exon_10851730_10851884:NUBP1;ENSG00000103274:ENST00000433392:exon_10851730_10851884:NUBP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 11000848 G/C 1 8 5 13 3.41384415983832 2.86634740010105 0.547496759737269 C:G G C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 11001770 G/T 1 7 5 12 2.98711363985853 2.86634740010105 0.120766239757479 T:G G T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 11002904 G/A 1 9 10 19 3.84057467981811 5.7326948002021 -1.89212012038399 A:G G A 10 0.57326948002021 0.487623161721597 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11002886_11003044:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_11002840_11003044:CIITA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 11017058 G/A 1 9 3 12 3.84057467981811 1.71980844006063 2.12076623975748 A:G G A 10 0.57326948002021 0.256104231229550 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 11444572 A/C 1 7 15 22 2.98711363985853 8.59904220030315 -5.61192856044462 A:C A C 10 0.57326948002021 0.017849705176637 ENSG00000175643:ENST00000381820:exon_11444499_11445585:C16orf75;ENSG00000175643:ENST00000312499:exon_11444499_11445619:C16orf75 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 11647492 T/C 1 16 19 35 6.82768831967664 10.892120120384 -4.06443180070735 T:C T C 10 0.57326948002021 0.174793597467876 ENSG00000189067:ENST00000339430:exon_11647389_11647545:LITAF;ENSG00000189067:ENST00000413364:exon_11647389_11647545:LITAF;ENSG00000189067:ENST00000381810:exon_11647389_11647545:LITAF;ENSG00000189067:ENST00000405528:exon_11647389_11647545:LITAF HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 11852354 A/C 1 17 19 36 7.25441883965643 10.892120120384 -3.63770128072756 A:C A C 10 0.57326948002021 0.240483957267864 ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11852287_11852395:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11852287_11852395:ZC3H7A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 15116625 G/T 1 12 6 18 5.12076623975748 3.43961688012126 1.68114935963622 T:G G T 10 0.57326948002021 0.482786461758876 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 15129970 A/G 1 11 12 23 4.69403571977769 6.87923376024252 -2.18519804046483 A:G A G 10 0.57326948002021 0.402290518448411 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000447912:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15129873_15131543:PDXDC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 15131962 A/G 1 62 36 98 26.457292238747 20.6377012807276 5.81959095801941 A:G A G 10 0.57326948002021 0.261664032342893 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15131710_15132067:NTAN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 15131974 G/T 1 57 33 90 24.323639638848 18.9178928406669 5.4057467981811 T:G G T 10 0.57326948002021 0.286720673787656 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15131710_15132067:NTAN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 15133889 T/G 1 16 12 28 6.82768831967664 6.87923376024252 -0.0515454405658815 T:G T G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15133826_15133923:NTAN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 16228242 G/A 1 7 4 11 2.98711363985853 2.29307792008084 0.694035719777689 A:G G A 10 0.57326948002021 0.767959695054619 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16228207_16228365:ABCC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 18878120 T/C 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 T:C T C 10 0.57326948002021 0.730571677019219 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 19085298 C/T 1 9 7 16 3.84057467981811 4.01288636014147 -0.172311680323361 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000167186:ENST00000321998:exon_19085243_19085357:COQ7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 19726275 C/T 1 58 54 112 24.7503701588278 30.9565519210913 -6.20618176226353 T:C C T 10 0.57326948002021 0.252089591543327 ENSG00000103550:ENST00000219837:exon_19725440_19726362:C16orf88;ENSG00000103550:ENST00000420899:exon_19725440_19726359:C16orf88 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 21272591 G/C 1 8 4 12 3.41384415983832 2.29307792008084 1.12076623975748 C:G G C 10 0.57326948002021 0.573925568669172 ENSG00000103316:ENST00000219599:exon_21272575_21272659:CRYM;ENSG00000103316:ENST00000396023:exon_21272575_21272659:CRYM;ENSG00000103316:ENST00000415987:exon_21272575_21272659:CRYM HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 21994411 G/A 1 393 355 748 167.705094352057 203.510665407175 -35.8055710551171 A:G G A 10 0.57326948002021 0.00865152689115515 ENSG00000140740:ENST00000268379:exon_21994409_21994981:UQCRC2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 23677006 A/G 1 19 16 35 8.10787987961601 9.17231168032336 -1.06443180070735 A:G A G 10 0.57326948002021 0.73499662446166 ENSG00000166847:ENST00000300087:exon_23676947_23677049:DCTN5;ENSG00000166847:ENST00000446651:exon_23676996_23677049:DCTN5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 23701538 A/G 1 83 73 156 35.4186331583226 41.8486720414753 -6.43003888315277 A:G A G 10 0.57326948002021 0.331414908883966 ENSG00000166851:ENST00000300093:exon_23701181_23701688:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000330792:exon_23701452_23701541:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000425844:exon_23701181_23701688:PLK1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 24166130 T/C 1 5 5 10 2.13365259989895 2.86634740010105 -0.732694800202101 T:C T C 10 0.57326948002021 0.752834960365011 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000472066:exon_24166005_24166178:PRKCB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 24202458 C/T 1 19 6 25 8.10787987961601 3.43961688012126 4.66826299949475 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0689572231619998 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24202411_24202551:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24202411_24202551:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000466124:exon_24202411_24202909:PRKCB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 24582299 C/G 1 41 33 74 17.4959513191714 18.9178928406669 -1.42194152149554 C:G C G 10 0.57326948002021 0.81436371598221 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 24788645 T/A 1 5 13 18 2.13365259989895 7.45250324026273 -5.31885064036378 A:T T A 10 0.57326948002021 0.0153851573106349 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395801:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24788569_24788679:TNRC6A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 24801737 G/A 1 7 3 10 2.98711363985853 1.71980844006063 1.2673051997979 A:G G A 10 0.57326948002021 0.532053210294076 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395801:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000352205:exon_24801651_24803138:TNRC6A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 24835168 G/A 1 8 5 13 3.41384415983832 2.86634740010105 0.547496759737269 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24834753_24836196:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24834753_24837548:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24834753_24837545:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24834753_24837548:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000432286:exon_24834753_24836090:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000450465:exon_24834753_24836107:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000464539:exon_24834753_24836107:TNRC6A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 27238099 C/T 1 36 39 75 15.3622987192724 22.3575097207882 -6.99521100151576 T:C C T 10 0.57326948002021 0.103839969653086 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27238041_27238157:NSMCE1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 27238110 C/T 1 41 39 80 17.4959513191714 22.3575097207882 -4.8615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.309090958199126 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27238041_27238157:NSMCE1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 28508048 A/G 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 A:G A G 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 28846840 T/G 1 4 9 13 1.70692207991916 5.15942532018189 -3.45250324026273 T:G T G 10 0.57326948002021 0.088426240843314 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 28846866 G/A 1 7 7 14 2.98711363985853 4.01288636014147 -1.02577272028294 A:G G A 10 0.57326948002021 0.5990458397462 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 28847246 T/C 1 9 4 13 3.84057467981811 2.29307792008084 1.54749675973727 T:C T C 10 0.57326948002021 0.576729970937834 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 28883241 A/G 1 10 13 23 4.2673051997979 7.45250324026273 -3.18519804046483 A:G A G 10 0.57326948002021 0.207996353000423 ENSG00000178188:ENST00000359285:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000395532:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000322610:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000337120:exon_28883101_28883304:SH2B1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 28915527 G/A 1 5 6 11 2.13365259989895 3.43961688012126 -1.30596428022231 A:G G A 10 0.57326948002021 0.545300564874909 ENSG00000196296:ENST00000357084:exon_28915501_28915787:ATP2A1;ENSG00000196296:ENST00000395503:exon_28915501_28915787:ATP2A1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 28944396 C/G 1 30 28 58 12.8019155993937 16.0515454405659 -3.24962984117218 C:G C G 10 0.57326948002021 0.426569337269883 ENSG00000177455:ENST00000324662:exon_28944232_28944435:CD19 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 29821295 C/T 1 11 8 19 4.69403571977769 4.58615584016168 0.107879879616009 T:C C T 10 0.57326948002021 1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 30198151 A/G 1 515 512 1027 219.766217789592 293.513973770348 -73.7477559807557 A:G A G 10 0.57326948002021 3.97011022834946e-06 ENSG00000102879:ENST00000219150:exon_30198137_30198266:CORO1A;ENSG00000102879:ENST00000440463:exon_30198137_30198316:CORO1A;ENSG00000102879:ENST00000421578:exon_30198137_30198266:CORO1A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 30376486 T/C 1 6 8 14 2.56038311987874 4.58615584016168 -2.02577272028294 T:C T C 10 0.57326948002021 0.291858897104158 ENSG00000169221:ENST00000305663:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000409939:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000478158:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000490703:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000464644:exon_30376426_30376533:TBC1D10B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 30393660 G/A 1 64 61 125 27.3107532787066 34.9694382812328 -7.65868500252625 A:G G A 10 0.57326948002021 0.175426745741954 ENSG00000180096:ENST00000321367:exon_30393596_30393686:SEPT1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 30536918 C/G 1 26 22 48 11.0949935194745 12.6119285604446 -1.51693504097008 C:G C G 10 0.57326948002021 0.664264739740934 ENSG00000169957:ENST00000380412:exon_30535325_30537372:ZNF768 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 31475864 C/T 1 6 5 11 2.56038311987874 2.86634740010105 -0.305964280222311 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000140691:ENST00000408912:exon_31475715_31476208:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000268314:exon_31475715_31476208:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000457010:exon_31475715_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000412665:exon_31475715_31476208:ARMC5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 56855496 C/G 1 9 6 15 3.84057467981811 3.43961688012126 0.400957799696849 A:T:C:G C G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56855416_56855505:NUP93 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 56873495 C/T 1 28 35 63 11.9484545594341 20.0644318007074 -8.11597724127324 T:C C T 10 0.57326948002021 0.041804488695023 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56873433_56873516:NUP93 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 57016092 G/A 1 43 42 85 18.349412359131 24.0773181608488 -5.72790580171786 A:G G A 10 0.57326948002021 0.228123857777031 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57016077_57016149:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57016077_57016149:CETP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 57085465 C/T 1 7 5 12 2.98711363985853 2.86634740010105 0.120766239757479 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57085450_57085533:NLRC5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 57111232 C/T 1 7 6 13 2.98711363985853 3.43961688012126 -0.452503240262731 T:C C T 10 0.57326948002021 0.787569123349065 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57111208_57111291:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57111208_57111291:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57111208_57111291:NLRC5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 57180158 C/A 1 4 7 11 1.70692207991916 4.01288636014147 -2.30596428022231 A:C C A 10 0.57326948002021 0.223014268684580 ENSG00000140848:ENST00000290776:exon_57179997_57180233:CPNE2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 57392733 A/C 1 59 64 123 25.1771006788076 36.6892467212934 -11.5121460424858 A:C A C 10 0.57326948002021 0.0444668441544852 ENSG00000102962:ENST00000219235:exon_57392684_57392801:CCL22 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 57486807 G/A 1 11 8 19 4.69403571977769 4.58615584016168 0.107879879616009 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000088682:ENST00000433906:exon_57486713_57486848:COQ9;ENSG00000088682:ENST00000262507:exon_57486713_57486848:COQ9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 57499902 T/C 1 10 7 17 4.2673051997979 4.01288636014147 0.254418839656429 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000102978:ENST00000219252:exon_57499865_57499933:POLR2C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 57789053 C/G 1 7 7 14 2.98711363985853 4.01288636014147 -1.02577272028294 C:G C G 10 0.57326948002021 0.5990458397462 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57789031_57789150:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57789031_57789150:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57789031_57789150:KATNB1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 58552921 G/A 1 16 14 30 6.82768831967664 8.02577272028294 -1.1980844006063 A:C:G G A 10 0.57326948002021 0.713630396278199 ENSG00000103037:ENST00000310682:exon_58552628_58553566:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000394266:exon_58552628_58554431:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000219315:exon_58552628_58553014:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000427443:exon_58552628_58553419:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000443717:exon_58552628_58553001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000422445:exon_58552628_58553407:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000463954:exon_58552628_58552980:SETD6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 58552959 A/G 1 12 11 23 5.12076623975748 6.30596428022231 -1.18519804046483 A:G A G 10 0.57326948002021 0.67579941697981 ENSG00000103037:ENST00000310682:exon_58552628_58553566:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000394266:exon_58552628_58554431:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000219315:exon_58552628_58553014:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000427443:exon_58552628_58553419:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000443717:exon_58552628_58553001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000422445:exon_58552628_58553407:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000463954:exon_58552628_58552980:SETD6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 58575489 G/A 1 6 4 10 2.56038311987874 2.29307792008084 0.267305199797899 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58575405_58575524:CNOT1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 58752466 C/T 1 3 9 12 1.28019155993937 5.15942532018189 -3.87923376024252 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0369288562011821 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58752431_58752592:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58752431_58752592:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58752431_58752588:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000496461:exon_58752121_58752592:GOT2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 67237622 G/A 1 27 14 41 11.5217240394543 8.02577272028294 3.49595131917139 A:G G A 10 0.57326948002021 0.343612955457967 ENSG00000102890:ENST00000360833:exon_67237568_67237932:ELMO3;ENSG00000102890:ENST00000393997:exon_67237568_67237932:ELMO3;ENSG00000102890:ENST00000477898:exon_67237568_67237932:ELMO3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 67304654 G/A 1 7 3 10 2.98711363985853 1.71980844006063 1.2673051997979 A:G G A 10 0.57326948002021 0.532053210294076 ENSG00000135740:ENST00000299798:exon_67304641_67306093:SLC9A5;ENSG00000135740:ENST00000360183:exon_67304641_67304969:SLC9A5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 67691668 A/G 1 48 23 71 20.4830649590299 13.1851980404648 7.29786691856509 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0926840024855443 ENSG00000102977:ENST00000219251:exon_67691665_67691756:ACD;ENSG00000102977:ENST00000393919:exon_67691665_67691756:ACD HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 67979423 G/T 1 6 12 18 2.56038311987874 6.87923376024252 -4.31885064036378 T:G G T 10 0.57326948002021 0.0544603635560848 ENSG00000124067:ENST00000338335:exon_67979272_67979456:SLC12A4;ENSG00000124067:ENST00000422611:exon_67979272_67979456:SLC12A4;ENSG00000124067:ENST00000316341:exon_67979272_67979456:SLC12A4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 68337948 T/C 1 15 11 26 6.40095779969685 6.30596428022231 0.0949935194745386 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000103061:ENST00000263997:exon_68337929_68338135:SLC7A6OS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 68389772 C/T 1 20 19 39 8.5346103995958 10.892120120384 -2.35750972078819 T:C C T 10 0.57326948002021 0.517909441520215 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68389626_68389786:PRMT7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 69368906 C/T 1 7 5 12 2.98711363985853 2.86634740010105 0.120766239757479 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000213380:ENST00000306875:exon_69368424_69369251:COG8;ENSG00000213380:ENST00000401849:exon_69368424_69369251:COG8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 69373723 A/G 1 7 6 13 2.98711363985853 3.43961688012126 -0.452503240262731 A:G A G 10 0.57326948002021 0.787569123349065 ENSG00000132603:ENST00000254940:exon_69373343_69373788:NIP7;ENSG00000132603:ENST00000254941:exon_69373546_69373788:NIP7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 69748869 G/A 1 6 6 12 2.56038311987874 3.43961688012126 -0.879233760242521 A:G G A 10 0.57326948002021 0.771962928640395 ENSG00000181019:ENST00000320623:exon_69748867_69748980:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379047:exon_69748867_69748980:NQO1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 69782135 T/C 1 93 73 166 39.6859383581205 41.8486720414753 -2.16273368335487 T:C T C 10 0.57326948002021 0.753941563074078 ENSG00000141101:ENST00000268802:exon_69782135_69782232:NOB1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 69782855 C/T 1 70 74 144 29.8711363985853 42.4219415214955 -12.5508051229102 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0354283918687571 ENSG00000141101:ENST00000268802:exon_69782821_69783021:NOB1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 69970329 A/G 1 7 2 9 2.98711363985853 1.14653896004042 1.84057467981811 A:G A G 10 0.57326948002021 0.31706387914541 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69970215_69970355:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69970215_69970355:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69970215_69970355:WWP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 69973297 C/T 1 5 11 16 2.13365259989895 6.30596428022231 -4.17231168032336 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0430098754235704 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69973244_69973316:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69973244_69973316:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69973244_69973316:WWP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 69973825 G/A 1 6 9 15 2.56038311987874 5.15942532018189 -2.59904220030315 A:G G A 10 0.57326948002021 0.198144643439766 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69973744_69975644:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69973744_69975643:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69973744_69975643:WWP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 72142248 C/T 1 19 28 47 8.10787987961601 16.0515454405659 -7.94366556094987 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0259313907053511 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72142126_72142281:DHX38;ENSG00000140829:ENST00000427670:exon_72142126_72142281:DHX38 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 74425569 C/T 0 16 0 16 6.82768831967664 0 6.82768831967664 C C 10 0.57326948002021 0.000163261124922487 ENSG00000196436:ENST00000504746:exon_74425289_74425741:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000429990:exon_74425289_74425978:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000355290:exon_74425289_74426013:NPIPL2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 75675609 T/C 1 51 49 100 21.7632565189693 28.0902045209903 -6.32694800202101 T:C T C 10 0.57326948002021 0.225045957314991 ENSG00000065427:ENST00000302445:exon_75675462_75675621:KARS;ENSG00000065427:ENST00000319410:exon_75675462_75675621:KARS;ENSG00000065427:ENST00000378668:exon_75675462_75675621:KARS;ENSG00000065427:ENST00000393395:exon_75675462_75675621:KARS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 81819768 T/C 1 30 19 49 12.8019155993937 10.892120120384 1.90979547900971 T:C:G T C 10 0.57326948002021 0.665568283639579 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81819548_81819787:PLCG2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 82203758 C/T 1 10 6 16 4.2673051997979 3.43961688012126 0.827688319676639 T:C C T 10 0.57326948002021 0.802879700667955 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82203730_82203831:MPHOSPH6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 84212571 C/A 1 36 22 58 15.3622987192724 12.6119285604446 2.75037015882782 A:C C A 10 0.57326948002021 0.508636405380874 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 84213114 C/T 1 16 9 25 6.82768831967664 5.15942532018189 1.66826299949475 T:C C T 10 0.57326948002021 0.550023905237784 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 84213434 A/T 1 14 10 24 5.97422727971706 5.7326948002021 0.241532479514959 A:T A T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 84691044 C/T 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 T:C C T 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84690477_84691550:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84690477_84691519:KLHL36 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 84778762 C/T 1 12 19 31 5.12076623975748 10.892120120384 -5.77135388062651 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0448672635242156 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 84779248 T/G 1 6 9 15 2.56038311987874 5.15942532018189 -2.59904220030315 T:G T G 10 0.57326948002021 0.198144643439766 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 88713236 A/G 1 297 327 624 126.738964433998 187.459119966609 -60.7201555326111 A:G A G 10 0.57326948002021 1.11561393985152e-06 ENSG00000051523:ENST00000261623:exon_88713163_88713246:CYBA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 88713473 G/A 1 7 9 16 2.98711363985853 5.15942532018189 -2.17231168032336 A:G G A 10 0.57326948002021 0.316607002067173 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 88713501 A/G 1 7 6 13 2.98711363985853 3.43961688012126 -0.452503240262731 A:G A G 10 0.57326948002021 0.787569123349065 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 88763958 G/A 1 13 5 18 5.54749675973727 2.86634740010105 2.68114935963622 A:G G A 10 0.57326948002021 0.239362005539774 ENSG00000158717:ENST00000312838:exon_88762903_88764041:RNF166 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 88767769 G/C 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 C:G G C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000158717:ENST00000312838:exon_88767670_88767826:RNF166 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 88779739 A/G 1 6 9 15 2.56038311987874 5.15942532018189 -2.59904220030315 A:G A G 10 0.57326948002021 0.198144643439766 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779720_88779855:CTU2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 88781614 G/C 1 20 13 33 8.5346103995958 7.45250324026273 1.08210715933307 C:G G C 10 0.57326948002021 0.729231242088354 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000103335:ENST00000301015:exon_88781588_88782262:FAM38A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 89178613 C/T 1 17 18 35 7.25441883965643 10.3188506403638 -3.06443180070735 T:C C T 10 0.57326948002021 0.309302325896262 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89178500_89178654:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89178500_89178654:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89178500_89178654:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000378345:exon_89178500_89178654:ACSF3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 89294059 G/A 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 A:G G A 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000170100:ENST00000433976:exon_89293102_89295363:ZNF778;ENSG00000170100:ENST00000306502:exon_89293102_89295363:ZNF778 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 89350038 G/A 1 62 38 100 26.457292238747 21.784240240768 4.67305199797899 A:G G A 10 0.57326948002021 0.364365868504323 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 16 89760652 C/T 1 8 3 11 3.41384415983832 1.71980844006063 1.69403571977769 T:C C T 10 0.57326948002021 0.372574328023575 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 465775 G/A 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 A:G G A 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_465743_465985:VPS53 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 648186 G/A 1 70 57 127 29.8711363985853 32.676360361152 -2.80522396256668 A:G G A 10 0.57326948002021 0.654013119583177 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 648498 C/T 1 19 31 50 8.10787987961601 17.7713538806265 -9.6634740010105 T:C C T 10 0.57326948002021 0.00644151006848062 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 649547 G/C 1 10 12 22 4.2673051997979 6.87923376024252 -2.61192856044462 C:G G C 10 0.57326948002021 0.285971290233503 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 1370542 C/A 1 46 36 82 19.6296039190703 20.6377012807276 -1.00809736165722 A:C C A 10 0.57326948002021 0.824232016556443 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1370536_1370635:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1370536_1370635:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1370536_1370635:MYO1C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 1373518 T/C 1 8 10 18 3.41384415983832 5.7326948002021 -2.31885064036378 T:C T C 10 0.57326948002021 0.34156534419122 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1373469_1373628:MYO1C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 1377943 A/G 1 9 16 25 3.84057467981811 9.17231168032336 -5.33173700050525 A:G A G 10 0.57326948002021 0.041544107781009 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1377904_1377984:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1377904_1377984:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1377904_1377984:MYO1C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 1639458 A/G 1 7 6 13 2.98711363985853 3.43961688012126 -0.452503240262731 A:G A G 10 0.57326948002021 0.787569123349065 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1638866_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1639333_1639512:WDR81 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 1690752 G/A 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 A:G G A 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1690716_1690898:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000491788:exon_1690716_1690898:SMYD4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 1703564 C/T 1 8 5 13 3.41384415983832 2.86634740010105 0.547496759737269 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1703151_1704318:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000491788:exon_1703151_1704099:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000495309:exon_1703510_1704011:SMYD4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 1782957 C/T 1 32 26 58 13.6553766393533 14.9050064805255 -1.24962984117218 T:C C T 10 0.57326948002021 0.79112078189613 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1782854_1782993:RPA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 1940232 A/G 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 A:G A G 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000108963:ENST00000263083:exon_1940129_1940250:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000442776:exon_1940129_1940250:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000417873:exon_1940129_1940250:DPH1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 1943888 T/C 1 7 4 11 2.98711363985853 2.29307792008084 0.694035719777689 T:C T C 10 0.57326948002021 0.767959695054619 ENSG00000108963:ENST00000263083:exon_1943799_1943899:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000442776:exon_1943799_1943899:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000417873:exon_1943799_1943899:DPH1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 2203167 T/G 1 12 7 19 5.12076623975748 4.01288636014147 1.10787987961601 T:G T G 10 0.57326948002021 0.651195141393552 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 2203175 C/G 1 7 10 17 2.98711363985853 5.7326948002021 -2.74558116034357 C:G C G 10 0.57326948002021 0.221546928311467 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 2595704 C/A 1 35 40 75 14.9355681992926 22.9307792008084 -7.99521100151575 A:C C A 10 0.57326948002021 0.0792134207993339 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2595655_2595776:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2595655_2595776:KIAA0664 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 2600186 G/A 1 4 16 20 1.70692207991916 9.17231168032336 -7.4653896004042 A:G G A 10 0.57326948002021 0.000991837416233635 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2600013_2600236:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2600013_2600236:KIAA0664 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 2606715 G/A 1 5 6 11 2.13365259989895 3.43961688012126 -1.30596428022231 A:G G A 10 0.57326948002021 0.545300564874909 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2606612_2606783:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2606612_2606783:KIAA0664 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 3840928 A/G 1 2 6 8 0.85346103995958 3.43961688012126 -2.58615584016168 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0801462458318362 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3840710_3840930:ATP2A3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 4391153 A/G 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 A:G A G 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000182557:ENST00000355530:exon_4391101_4391498:SPNS3;ENSG00000182557:ENST00000333476:exon_4391101_4391498:SPNS3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 4391201 A/G 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 A:G A G 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000182557:ENST00000355530:exon_4391101_4391498:SPNS3;ENSG00000182557:ENST00000333476:exon_4391101_4391498:SPNS3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 4575283 A/G 1 106 140 246 45.2334351178577 80.2577272028294 -35.0242920849717 A:G A G 10 0.57326948002021 7.78273454546546e-06 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4574986_4576230:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4574986_4576440:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4574986_4576440:PELP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 4577950 C/A 1 20 14 34 8.5346103995958 8.02577272028294 0.508837679312858 A:C C A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4577855_4577964:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4577805_4577964:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4577805_4577964:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4577805_4577964:PELP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 4622638 C/T 1 20 24 44 8.5346103995958 13.758467520485 -5.22385712088924 T:C C T 10 0.57326948002021 0.127659922158617 ENSG00000141480:ENST00000381488:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000346341:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000269260:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000412477:exon_4622578_4622715:ARRB2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 4701402 C/T 1 297 286 583 126.738964433998 163.95507128578 -37.2161068517825 T:C:G C T 10 0.57326948002021 0.00193537220997566 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4701304_4701448:PSMB6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 4797305 G/A 1 4 19 23 1.70692207991916 10.892120120384 -9.18519804046483 A:G G A 10 0.57326948002021 0.000154922913372557 ENSG00000141503:ENST00000355280:exon_4797283_4797388:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000347992:exon_4797283_4797388:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000453408:exon_4797283_4797388:MINK1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 4856580 T/C 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 T:C T C 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000108515:ENST00000520221:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522798:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522301:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000521811:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000519602:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000441285:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000381335:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000323997:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000422083:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000519834:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522249:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000517627:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000521659:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000518175:exon_4856567_4856636:ENO3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 4875566 T/C 1 7 2 9 2.98711363985853 1.14653896004042 1.84057467981811 T:C T C 10 0.57326948002021 0.31706387914541 ENSG00000108509:ENST00000348066:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000381311:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000361571:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000358183:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000414043:exon_4875527_4875831:CAMTA2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 5126674 A/G 1 28 20 48 11.9484545594341 11.4653896004042 0.483064959029917 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 5126689 G/A 1 25 17 42 10.6682629994947 9.74558116034357 0.922681839151178 A:G G A 10 0.57326948002021 0.876402432680401 ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 5264916 C/T 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5264503_5264970:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5264503_5264970:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5264503_5264970:RABEP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 5280440 T/C 1 9 15 24 3.84057467981811 8.59904220030315 -4.75846752048504 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0623248403031247 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5280411_5280600:RABEP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 5284698 A/G 1 6 5 11 2.56038311987874 2.86634740010105 -0.305964280222311 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 5284719 T/C 1 4 6 10 1.70692207991916 3.43961688012126 -1.7326948002021 T:C T C 10 0.57326948002021 0.342315301618549 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 5284770 G/A 1 8 9 17 3.41384415983832 5.15942532018189 -1.74558116034357 A:G G A 10 0.57326948002021 0.464916768474155 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 5289580 A/G 1 79 79 158 33.7117110784034 45.2882889215966 -11.5765778431932 A:G A G 10 0.57326948002021 0.064639431873855 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5289346_5289589:NUP88 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 5290033 T/C 1 58 53 111 24.7503701588278 30.3832824410711 -5.63291228224331 T:C T C 10 0.57326948002021 0.292048277711522 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5290028_5290146:NUP88 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 5294976 T/A 1 14 8 22 5.97422727971706 4.58615584016168 1.38807143955538 A:T:G T A 10 0.57326948002021 0.668312643486638 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5294881_5294982:NUP88 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 5308377 C/T 1 16 15 31 6.82768831967664 8.59904220030315 -1.77135388062651 T:C C T 10 0.57326948002021 0.587256026041615 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5308377_5308563:NUP88 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 5326089 C/T 1 108 98 206 46.0868961578173 56.1804090419806 -10.0935128841633 T:C C T 10 0.57326948002021 0.159348985448084 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 5326145 C/G 1 103 76 179 43.9532435579184 43.568480481536 0.384763076382399 C:G C G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 5392161 C/T 1 7 3 10 2.98711363985853 1.71980844006063 1.2673051997979 T:C C T 10 0.57326948002021 0.532053210294076 ENSG00000167842:ENST00000381165:exon_5392143_5394134:MIS12 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 5462129 G/T 1 9 3 12 3.84057467981811 1.71980844006063 2.12076623975748 T:G G T 10 0.57326948002021 0.256104231229550 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5461659_5463363:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5461659_5463363:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5461659_5463363:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5461659_5463363:NLRP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 6663895 C/G 1 4 6 10 1.70692207991916 3.43961688012126 -1.7326948002021 C:G C G 10 0.57326948002021 0.342315301618549 ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000438512:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6663725_6663920:XAF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 6943266 G/A 1 7 17 24 2.98711363985853 9.74558116034357 -6.75846752048504 A:G G A 10 0.57326948002021 0.00658353132192458 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6943082_6943438:SLC16A13 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 7293715 C/T 1 13 16 29 5.54749675973727 9.17231168032336 -3.62481492058609 T:C C T 10 0.57326948002021 0.191464076020977 ENSG00000187838:ENST00000324822:exon_7293055_7293760:PLSCR3;ENSG00000187838:ENST00000380658:exon_7293055_7293760:PLSCR3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 7399866 G/A 1 10 11 21 4.2673051997979 6.30596428022231 -2.03865908042441 A:G G A 10 0.57326948002021 0.385389697267756 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7399759_7399932:POLR2A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 7402600 T/C 1 7 5 12 2.98711363985853 2.86634740010105 0.120766239757479 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7402600_7402810:POLR2A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 7411770 C/T 1 23 18 41 9.81480195953517 10.3188506403638 -0.504048680828612 T:C C T 10 0.57326948002021 0.875869234765251 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7411570_7411794:POLR2A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 7468277 C/T 1 14 6 20 5.97422727971706 3.43961688012126 2.5346103995958 T:C C T 10 0.57326948002021 0.36622341140112 ENSG00000161956:ENST00000321337:exon_7468276_7468387:SENP3;ENSG00000161956:ENST00000429205:exon_7468276_7468387:SENP3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 7495842 A/C 1 12 7 19 5.12076623975748 4.01288636014147 1.10787987961601 A:C A C 10 0.57326948002021 0.651195141393552 ENSG00000129245:ENST00000250113:exon_7495822_7495917:FXR2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 7496839 G/A 1 6 6 12 2.56038311987874 3.43961688012126 -0.879233760242521 A:G G A 10 0.57326948002021 0.771962928640395 ENSG00000129245:ENST00000250113:exon_7496721_7496943:FXR2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 7592560 C/T 1 6 8 14 2.56038311987874 4.58615584016168 -2.02577272028294 T:C C T 10 0.57326948002021 0.291858897104158 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7592542_7592640:WRAP53 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 8132763 T/C 1 5 8 13 2.13365259989895 4.58615584016168 -2.45250324026273 T:C T C 10 0.57326948002021 0.261241293669647 ENSG00000178971:ENST00000315684:exon_8132620_8132764:C17orf68;ENSG00000178971:ENST00000449476:exon_8132620_8132764:C17orf68 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 8416901 C/T 1 9 4 13 3.84057467981811 2.29307792008084 1.54749675973727 T:C C T 10 0.57326948002021 0.576729970937834 ENSG00000133026:ENST00000269243:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000360416:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000379980:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000396239:exon_8416856_8416987:MYH10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 8700982 C/T 1 6 7 13 2.56038311987874 4.01288636014147 -1.45250324026273 T:C C T 10 0.57326948002021 0.418185809776403 ENSG00000185156:ENST00000329805:exon_8700481_8702586:MFSD6L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 8736394 T/C 1 8 3 11 3.41384415983832 1.71980844006063 1.69403571977769 T:C T C 10 0.57326948002021 0.372574328023575 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 8738575 A/G 1 5 8 13 2.13365259989895 4.58615584016168 -2.45250324026273 A:G A G 10 0.57326948002021 0.261241293669647 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 9471711 T/G 1 26 19 45 11.0949935194745 10.892120120384 0.202873399090548 T:G T G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000170310:ENST00000306357:exon_9471688_9471787:STX8;ENSG00000170310:ENST00000415554:exon_9471688_9471787:STX8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 10614442 A/G 1 25 26 51 10.6682629994947 14.9050064805255 -4.23674348103071 A:G A G 10 0.57326948002021 0.258085312917606 ENSG00000170222:ENST00000379774:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000468843:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000401658:exon_10614151_10614548:C17orf48 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 12899902 C/T 1 19 7 26 8.10787987961601 4.01288636014147 4.09499351947454 T:C C T 10 0.57326948002021 0.115859596879634 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000424152:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000480891:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000487229:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000465825:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000491478:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000492559:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000457438:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000407336:exon_12899735_12900002:ELAC2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 12899963 T/C 1 8 6 14 3.41384415983832 3.43961688012126 -0.0257727202829408 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000424152:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000480891:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000487229:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000465825:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000491478:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000492559:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000457438:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000407336:exon_12899735_12900002:ELAC2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 12915009 G/A 1 7 9 16 2.98711363985853 5.15942532018189 -2.17231168032336 A:G G A 10 0.57326948002021 0.316607002067173 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000407336:exon_12914980_12915099:ELAC2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 16321032 G/C 1 5 4 9 2.13365259989895 2.29307792008084 -0.15942532018189 C:G G C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16320876_16321182:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16320876_16321182:TRPV2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 16456614 T/G 1 16 11 27 6.82768831967664 6.30596428022231 0.521724039454329 T:G T G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000141040:ENST00000268727:exon_16453631_16456740:ZNF287;ENSG00000141040:ENST00000395825:exon_16454701_16456740:ZNF287;ENSG00000141040:ENST00000395824:exon_16454701_16456740:ZNF287;ENSG00000141040:ENST00000498796:exon_16456424_16456740:ZNF287 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 16852206 A/C 1 68 92 160 29.0176753586257 52.7407921618593 -23.7231168032336 A:T:C A C 10 0.57326948002021 0.000214289583634174 ENSG00000240505:ENST00000437538:exon_16852052_16852297:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16852052_16852297:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16852052_16852297:TNFRSF13B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 16855878 C/T 1 30 30 60 12.8019155993937 17.1980844006063 -4.3961688012126 T:C C T 10 0.57326948002021 0.296390622748550 ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16855760_16855897:TNFRSF13B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 17168164 G/A 1 17 11 28 7.25441883965643 6.30596428022231 0.948454559434118 A:G G A 10 0.57326948002021 0.849071983987724 ENSG00000141030:ENST00000268717:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000486810:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000417352:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000439936:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000492672:exon_17168116_17168295:COPS3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 17184480 C/T 1 7 17 24 2.98711363985853 9.74558116034357 -6.75846752048504 T:C C T 10 0.57326948002021 0.00658353132192458 ENSG00000141030:ENST00000268717:exon_17184446_17184607:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000417352:exon_17184446_17184553:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000492672:exon_17184446_17184560:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000477299:exon_17184446_17184560:COPS3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 17394611 G/A 1 6 6 12 2.56038311987874 3.43961688012126 -0.879233760242521 A:G G A 10 0.57326948002021 0.771962928640395 ENSG00000141026:ENST00000268711:exon_17394593_17396535:MED9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 17425631 C/T 1 3 5 8 1.28019155993937 2.86634740010105 -1.58615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.29890034016204 ENSG00000133027:ENST00000255389:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395783:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395782:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000435340:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000448294:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000343219:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395781:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000421096:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000461404:exon_17425594_17425709:PEMT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 17700573 T/C 1 7 3 10 2.98711363985853 1.71980844006063 1.2673051997979 T:C T C 10 0.57326948002021 0.532053210294076 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17696263_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000261641:exon_17696263_17701056:RAI1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 17700792 C/T 1 5 4 9 2.13365259989895 2.29307792008084 -0.15942532018189 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17696263_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000261641:exon_17696263_17701056:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17700698_17701668:RAI1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 17717574 G/A 0 27 0 27 11.5217240394543 0 11.5217240394543 G G 10 0.57326948002021 3.68305939694579e-07 ENSG00000072310:ENST00000338854:exon_17717559_17717724:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000355815:exon_17717559_17717724:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000261646:exon_17717559_17717724:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395751:exon_17717559_17717724:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395757:exon_17717559_17717724:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395756:exon_17717559_17717724:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000418712:exon_17717559_17717724:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000423161:exon_17717559_17717724:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000435530:exon_17717559_17717724:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000486311:exon_17717559_17717690:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000478616:exon_17717559_17717669:SREBF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 17750907 G/A 1 7 3 10 2.98711363985853 1.71980844006063 1.2673051997979 A:G G A 10 0.57326948002021 0.532053210294076 ENSG00000175662:ENST00000379504:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000318094:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000478943:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000395739:exon_17750663_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000486413:exon_17750866_17751097:TOM1L2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 18181037 C/A 1 9 6 15 3.84057467981811 3.43961688012126 0.400957799696849 A:C C A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000177302:ENST00000321105:exon_18180989_18181671:TOP3A;ENSG00000177302:ENST00000469739:exon_18180989_18181671:TOP3A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 18250889 C/T 1 7 15 22 2.98711363985853 8.59904220030315 -5.61192856044462 T:C C T 10 0.57326948002021 0.017849705176637 ENSG00000176974:ENST00000316694:exon_18250810_18250970:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000352886:exon_18250810_18250970:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000354098:exon_18250810_18250970:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395685:exon_18250810_18250970:SHMT1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 18775900 A/G 1 15 17 32 6.40095779969685 9.74558116034357 -3.34462336064672 A:G A G 10 0.57326948002021 0.283704858668405 ENSG00000141127:ENST00000441887:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000395656:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000414602:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000492129:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000487101:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000432893:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000455992:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000412418:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000478622:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000419284:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000268835:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000422237:exon_18775896_18775962:PRPSAP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 19812541 T/C 1 2 6 8 0.85346103995958 3.43961688012126 -2.58615584016168 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0801462458318362 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19812494_19812589:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19812494_19812589:AKAP10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 20108555 T/C 1 10 8 18 4.2673051997979 4.58615584016168 -0.318850640363781 A:T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 20109189 C/T 1 9 6 15 3.84057467981811 3.43961688012126 0.400957799696849 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 22 0 22 9.38807143955538 0 9.38807143955538 T T 10 0.57326948002021 8.09620308970156e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 21203907 T/C 0 20 0 20 8.5346103995958 0 8.5346103995958 T T 10 0.57326948002021 2.95605062910185e-05 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 21 0 21 8.96134091957559 0 8.96134091957559 G G 10 0.57326948002021 1.54083226890994e-05 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 21203941 G/A 0 22 0 22 9.38807143955538 0 9.38807143955538 G G 10 0.57326948002021 8.09620308970156e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 21 0 21 8.96134091957559 0 8.96134091957559 C C 10 0.57326948002021 1.54083226890994e-05 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 21203964 C/G 0 18 0 18 7.68114935963622 0 7.68114935963622 C C 10 0.57326948002021 5.02598222325515e-05 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 0 23 0 23 9.81480195953517 0 9.81480195953517 C C 10 0.57326948002021 4.29047864123503e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 22 0 22 9.38807143955538 0 9.38807143955538 C C 10 0.57326948002021 8.09620308970156e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 19 0 19 8.10787987961601 0 8.10787987961601 C C 10 0.57326948002021 2.81261925897944e-05 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 9 0 9 3.84057467981811 0 3.84057467981811 C C 10 0.57326948002021 0.0128294351955714 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 10 0 10 4.2673051997979 0 4.2673051997979 C C 10 0.57326948002021 0.0067236069534815 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 10 0 10 4.2673051997979 0 4.2673051997979 G G 10 0.57326948002021 0.0067236069534815 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 32 0 32 13.6553766393533 0 13.6553766393533 G G 10 0.57326948002021 3.74660184609862e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 26676135 C/T 1 56 50 106 23.8969091188682 28.6634740010105 -4.76656488214227 T:C C T 10 0.57326948002021 0.377202985854228 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 27422053 C/T 1 7 5 12 2.98711363985853 2.86634740010105 0.120766239757479 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530557:exon_27421954_27422077:MYO18A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 27424316 G/A 1 6 4 10 2.56038311987874 2.29307792008084 0.267305199797899 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000533652:exon_27423915_27424371:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527686:exon_27424164_27424368:MYO18A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 27889578 T/C 1 4 6 10 1.70692207991916 3.43961688012126 -1.7326948002021 T:C T C 10 0.57326948002021 0.342315301618549 ENSG00000168792:ENST00000307201:exon_27887691_27890104:ABHD15 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 27904711 G/A 1 3 7 10 1.28019155993937 4.01288636014147 -2.7326948002021 A:G G A 10 0.57326948002021 0.109775478323748 ENSG00000108262:ENST00000225394:exon_27904663_27904760:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000394868:exon_27904663_27904760:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000473217:exon_27904663_27904760:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000394869:exon_27904663_27904760:GIT1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 29161990 C/T 1 7 2 9 2.98711363985853 1.14653896004042 1.84057467981811 T:C C T 10 0.57326948002021 0.31706387914541 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29161166_29163066:ATAD5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 29162615 A/G 1 9 14 23 3.84057467981811 8.02577272028294 -4.18519804046483 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0922104210502733 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29161166_29163066:ATAD5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 29226630 T/A 1 9 11 20 3.84057467981811 6.30596428022231 -2.4653896004042 A:T T A 10 0.57326948002021 0.269322135581906 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 29646032 G/A 1 11 10 21 4.69403571977769 5.7326948002021 -1.03865908042441 A:G G A 10 0.57326948002021 0.66464815614549 ENSG00000126860:ENST00000462804:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000247270:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000461237:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394756:exon_29644676_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394755:exon_29644676_29646041:EVI2A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 30190348 A/G 1 165 155 320 70.4105357966653 88.8567694031326 -18.4462336064672 A:C:G A G 10 0.57326948002021 0.0417418696139939 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30187923_30190535:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000477128:exon_30190193_30190535:UTP6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 30222002 T/C 1 6 6 12 2.56038311987874 3.43961688012126 -0.879233760242521 T:C T C 10 0.57326948002021 0.771962928640395 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30221989_30222030:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000490218:exon_30221989_30222030:UTP6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 30696296 G/A 1 5 7 12 2.13365259989895 4.01288636014147 -1.87923376024252 A:G G A 10 0.57326948002021 0.382460042999359 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 33592591 C/T 1 7 1 8 2.98711363985853 0.57326948002021 2.41384415983832 T:C C T 10 0.57326948002021 0.149609550462636 ENSG00000166750:ENST00000299977:exon_33592091_33594739:SLFN5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 34416537 G/A 1 337 235 572 143.808185233189 134.718327804749 9.08985742843987 A:G G A 10 0.57326948002021 0.447137058997536 ENSG00000006075:ENST00000225245:exon_34416529_34416643:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000470334:exon_34416529_34417515:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000394470:exon_34416529_34416634:CCL3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 34854280 G/A 1 6 10 16 2.56038311987874 5.7326948002021 -3.17231168032336 A:G G A 10 0.57326948002021 0.131350999414970 ENSG00000141140:ENST00000431794:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000268852:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000378326:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000415126:exon_34854110_34854403:MYO19 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 34942595 G/A 1 30 41 71 12.8019155993937 23.5040486808286 -10.7021330814349 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0115557934581854 ENSG00000005955:ENST00000304718:exon_34942480_34942628:GGNBP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 36909061 A/G 1 115 116 231 49.0740097976758 66.4992596823444 -17.4252498846685 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0235348036382073 ENSG00000108294:ENST00000225426:exon_36909003_36909082:PSMB3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 36963226 G/T 1 14 14 28 5.97422727971706 8.02577272028294 -2.05154544056588 T:G G T 10 0.57326948002021 0.450176838712125 ENSG00000108296:ENST00000225428:exon_36963018_36963229:CWC25 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 36966697 G/A 1 1 8 9 0.42673051997979 4.58615584016168 -4.15942532018189 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0061424649460709 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 37070658 A/G 1 4 10 14 1.70692207991916 5.7326948002021 -4.02577272028294 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0543340383697456 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000429030:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000419929:exon_37070578_37070728:LASP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 38146154 T/C 1 62 64 126 26.457292238747 36.6892467212934 -10.2319544825465 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0715721864901928 ENSG00000108344:ENST00000264639:exon_38145992_38146182:PSMD3;ENSG00000108344:ENST00000415039:exon_38145992_38146182:PSMD3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 38175866 G/A 1 36 38 74 15.3622987192724 21.784240240768 -6.42194152149554 A:G G A 10 0.57326948002021 0.157998861967742 ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38175350_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38175350_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000476821:exon_38175350_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38175351_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38175355_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38175361_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000491466:exon_38175398_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000422942:exon_38175756_38175898:MED24 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 38186106 C/T 1 6 8 14 2.56038311987874 4.58615584016168 -2.02577272028294 T:C C T 10 0.57326948002021 0.291858897104158 ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38186001_38186112:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38186001_38186112:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38186001_38186112:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38186001_38186112:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38186001_38186112:MED24 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 38188967 C/T 1 2 7 9 0.85346103995958 4.01288636014147 -3.15942532018189 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0433151286077531 ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38188902_38189015:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38188902_38189015:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38188902_38189015:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38188902_38189015:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38188902_38189015:MED24 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 38991003 T/C 1 19 15 34 8.10787987961601 8.59904220030315 -0.491162320687142 T:C T C 10 0.57326948002021 0.864181187644753 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 39925925 A/G 1 16 22 38 6.82768831967664 12.6119285604446 -5.78424024076798 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0705026941920413 ENSG00000173801:ENST00000393930:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000310706:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000393931:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000449889:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000437187:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000420370:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000424457:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000437369:exon_39925878_39925929:JUP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 40054884 C/T 1 6 6 12 2.56038311987874 3.43961688012126 -0.879233760242521 T:C C T 10 0.57326948002021 0.771962928640395 ENSG00000131473:ENST00000352035:exon_40054884_40055038:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000401700:exon_40054884_40055038:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000353196:exon_40054884_40055038:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000393896:exon_40054884_40055038:ACLY HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 40125864 G/A 1 22 14 36 9.38807143955538 8.02577272028294 1.36229871927244 A:G G A 10 0.57326948002021 0.737252293683266 ENSG00000173786:ENST00000393892:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000310262:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000472031:exon_40125493_40126246:CNP;ENSG00000173786:ENST00000393888:exon_40125493_40127194:CNP;ENSG00000173786:ENST00000486438:exon_40125493_40125980:CNP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 40257055 T/C 1 9 2 11 3.84057467981811 1.14653896004042 2.69403571977769 T:C T C 10 0.57326948002021 0.131175688856066 ENSG00000108771:ENST00000251642:exon_40257036_40257185:DHX58;ENSG00000108771:ENST00000423748:exon_40257036_40257185:DHX58 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 40280291 G/A 1 37 20 57 15.7890292392522 11.4653896004042 4.32363963884803 A:G G A 10 0.57326948002021 0.284774649468464 ENSG00000108774:ENST00000346213:exon_40280279_40280401:RAB5C;ENSG00000108774:ENST00000393860:exon_40280279_40280401:RAB5C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 40282473 C/T 1 19 13 32 8.10787987961601 7.45250324026273 0.655376639353278 T:C C T 10 0.57326948002021 0.860030624222388 ENSG00000108774:ENST00000346213:exon_40282355_40282608:RAB5C;ENSG00000108774:ENST00000393860:exon_40282355_40282608:RAB5C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 40344455 C/T 1 12 8 20 5.12076623975748 4.58615584016168 0.534610399595799 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000167925:ENST00000454210:exon_40344259_40344727:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000393854:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000428494:exon_40344259_40344727:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000301671:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000414034:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000377472:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000436923:exon_40344259_40344760:GHDC HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 40714804 C/A 1 7 6 13 2.98711363985853 3.43961688012126 -0.452503240262731 A:C C A 10 0.57326948002021 0.787569123349065 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40714092_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40714374_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000426807:exon_40714641_40714850:COASY HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 40716520 A/G 1 27 30 57 11.5217240394543 17.1980844006063 -5.67636036115197 A:G A G 10 0.57326948002021 0.141347407326323 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000449624:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40716464_40716595:COASY HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 40818451 G/A 1 22 19 41 9.38807143955538 10.892120120384 -1.50404868082861 A:G G A 10 0.57326948002021 0.639273685314282 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818341_40818502:TUBG2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 40818699 A/G 1 32 29 61 13.6553766393533 16.6248149205861 -2.96943828123281 A:G A G 10 0.57326948002021 0.440976917710705 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818621_40819021:TUBG2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 40822678 C/T 1 8 7 15 3.41384415983832 4.01288636014147 -0.599042200303151 T:C C T 10 0.57326948002021 0.7979049378473 ENSG00000068137:ENST00000293349:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000412503:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000456950:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000445882:exon_40822591_40822723:PLEKHH3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 40970264 C/T 1 26 27 53 11.0949935194745 15.4782759605457 -4.38328244107113 A:T:C C T 10 0.57326948002021 0.266479378093127 ENSG00000126581:ENST00000361523:exon_40970239_40970433:BECN1;ENSG00000126581:ENST00000438274:exon_40970239_40970433:BECN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 42398052 A/G 1 86 73 159 36.6988247182619 41.8486720414753 -5.1498473232134 A:G A G 10 0.57326948002021 0.423296527759082 ENSG00000013306:ENST00000225308:exon_42397990_42398099:SLC25A39;ENSG00000013306:ENST00000377095:exon_42397990_42398099:SLC25A39 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 42398757 C/A 1 7 2 9 2.98711363985853 1.14653896004042 1.84057467981811 A:C C A 10 0.57326948002021 0.31706387914541 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 42475557 C/T 1 9 4 13 3.84057467981811 2.29307792008084 1.54749675973727 T:C C T 10 0.57326948002021 0.576729970937834 ENSG00000186566:ENST00000335500:exon_42472652_42478821:GPATCH8;ENSG00000186566:ENST00000434000:exon_42474784_42478821:GPATCH8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 43003484 T/C 1 7 13 20 2.98711363985853 7.45250324026273 -4.4653896004042 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0677059243274011 ENSG00000186185:ENST00000438933:exon_43003360_43003554:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000339151:exon_43003448_43003554:KIF18B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 43112145 G/A 1 11 9 20 4.69403571977769 5.15942532018189 -0.465389600404201 A:G G A 10 0.57326948002021 0.825497110151158 ENSG00000172992:ENST00000452796:exon_43112142_43112367:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000342350:exon_43112142_43112367:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000310604:exon_43112142_43112367:DCAKD HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 43175906 C/T 1 36 36 72 15.3622987192724 20.6377012807276 -5.27540256145512 T:C C T 10 0.57326948002021 0.233685278056039 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43175750_43175920:NMT1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 43183028 G/A 1 76 75 151 32.431519518464 42.9952110015158 -10.5636914830517 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0844953746275728 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43182987_43186377:NMT1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 45008570 G/A 1 15 16 31 6.40095779969685 9.17231168032336 -2.77135388062651 A:G G A 10 0.57326948002021 0.365073379223067 ENSG00000108433:ENST00000225567:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000393456:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000415811:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000439730:exon_45008465_45008573:GOSR2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 45822579 G/A 1 3 7 10 1.28019155993937 4.01288636014147 -2.7326948002021 A:G G A 10 0.57326948002021 0.109775478323748 ENSG00000073861:ENST00000177694:exon_45822114_45823485:TBX21 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 45885687 A/G 1 14 10 24 5.97422727971706 5.7326948002021 0.241532479514959 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000006025:ENST00000007414:exon_45884733_45885765:OSBPL7;ENSG00000006025:ENST00000392507:exon_45884733_45885765:OSBPL7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 45885756 C/T 1 10 7 17 4.2673051997979 4.01288636014147 0.254418839656429 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000006025:ENST00000007414:exon_45884733_45885765:OSBPL7;ENSG00000006025:ENST00000392507:exon_45884733_45885765:OSBPL7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 45915395 T/C 1 7 10 17 2.98711363985853 5.7326948002021 -2.74558116034357 T:C T C 10 0.57326948002021 0.221546928311467 ENSG00000141295:ENST00000407215:exon_45915049_45915816:SCRN2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 46000406 T/C 1 10 3 13 4.2673051997979 1.71980844006063 2.54749675973727 T:C T C 10 0.57326948002021 0.173621486623774 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_46000328_46000640:SP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 46926615 G/A 1 31 27 58 13.2286461193735 15.4782759605457 -2.24962984117218 A:G G A 10 0.57326948002021 0.596223580306913 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509415:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000513119:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000505071:exon_46926614_46926631:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000502761:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000514962:exon_46926614_46926739:CALCOCO2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 46998572 G/A 1 9 10 19 3.84057467981811 5.7326948002021 -1.89212012038399 A:G G A 10 0.57326948002021 0.487623161721597 ENSG00000159202:ENST00000360943:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000389608:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000508468:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000405215:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506498:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000504684:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000513342:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506271:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000514948:exon_46998564_46998634:UBE2Z HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 47018293 C/T 1 31 29 60 13.2286461193735 16.6248149205861 -3.3961688012126 T:C C T 10 0.57326948002021 0.433829723969839 ENSG00000159210:ENST00000502492:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509995:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000290330:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000507302:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000514929:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000510558:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000512243:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000515174:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000510195:exon_47018286_47018424:SNF8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 47293906 G/A 1 24 17 41 10.241532479515 9.74558116034357 0.495951319171388 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000108798:ENST00000225941:exon_47293893_47294060:ABI3;ENSG00000108798:ENST00000419580:exon_47293893_47294042:ABI3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 48433306 C/T 1 7 3 10 2.98711363985853 1.71980844006063 1.2673051997979 T:C C T 10 0.57326948002021 0.532053210294076 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48433142_48433358:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48433142_48433358:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48433142_48433358:XYLT2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 48447918 T/C 1 30 35 65 12.8019155993937 20.0644318007074 -7.26251620131366 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0788716355936343 ENSG00000108826:ENST00000507088:exon_48447816_48447947:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000508200:exon_48447816_48447934:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000225969:exon_48447816_48447947:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000393275:exon_48447816_48447947:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000503633:exon_48447816_48447947:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000442592:exon_48447816_48447947:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000511860:exon_48447816_48447947:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000514928:exon_48447596_48447947:MRPL27 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 48450536 T/G 1 10 16 26 4.2673051997979 9.17231168032336 -4.90500648052546 T:G T G 10 0.57326948002021 0.0724098343795343 ENSG00000108826:ENST00000225969:exon_48450492_48450575:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000393275:exon_48450492_48450575:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000503633:exon_48450492_48450557:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000442592:exon_48450492_48450562:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000514928:exon_48450492_48450536:MRPL27 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 48456251 C/T 1 1 7 8 0.42673051997979 4.01288636014147 -3.58615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0245816827973848 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510007:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510246:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000513077:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000514211:exon_48456244_48456585:EME1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 48470190 T/C 1 7 7 14 2.98711363985853 4.01288636014147 -1.02577272028294 T:C T C 10 0.57326948002021 0.5990458397462 ENSG00000108829:ENST00000225972:exon_48470100_48470258:LRRC59 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 48539035 T/C 1 3 5 8 1.28019155993937 2.86634740010105 -1.58615584016168 T:C T C 10 0.57326948002021 0.29890034016204 ENSG00000167107:ENST00000510410:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000506582:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48539018_48539047:ACSF2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 48560883 A/G 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 A:G A G 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000136444:ENST00000509398:exon_48560701_48560896:RSAD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 56424630 T/G 1 7 9 16 2.98711363985853 5.15942532018189 -2.17231168032336 T:G T G 10 0.57326948002021 0.316607002067173 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 61895287 C/T 1 59 61 120 25.1771006788076 34.9694382812328 -9.79233760242521 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0792992285600437 ENSG00000198231:ENST00000359353:exon_61895054_61896676:DDX42;ENSG00000198231:ENST00000389924:exon_61895054_61896676:DDX42;ENSG00000198231:ENST00000457800:exon_61895054_61896676:DDX42 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 61901197 T/A 1 44 36 80 18.7761428791108 20.6377012807276 -1.8615584016168 A:T T A 10 0.57326948002021 0.734802669248793 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61901177_61901312:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61901177_61901312:FTSJ3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 61908271 C/T 1 112 96 208 47.7938182377365 55.0338700819402 -7.24005184420369 T:C C T 10 0.57326948002021 0.326633566668532 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908169_61908295:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908169_61908295:PSMC5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 61908316 G/A 1 4 7 11 1.70692207991916 4.01288636014147 -2.30596428022231 A:G G A 10 0.57326948002021 0.223014268684580 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 65362552 T/A 1 10 18 28 4.2673051997979 10.3188506403638 -6.05154544056588 A:T:C T A 10 0.57326948002021 0.0335868906291596 ENSG00000197170:ENST00000356126:exon_65362528_65362743:PSMD12;ENSG00000197170:ENST00000357146:exon_65362528_65362721:PSMD12 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 66246416 A/G 1 36 22 58 15.3622987192724 12.6119285604446 2.75037015882782 A:G A G 10 0.57326948002021 0.508636405380874 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392721:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66246329_66246611:AMZ2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 66253095 T/A 1 164 156 320 69.9838052766856 89.4300388831528 -19.4462336064672 A:T:G T A 10 0.57326948002021 0.0315993017845608 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66252955_66253214:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66252955_66253214:AMZ2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 70120551 A/C 1 14 6 20 5.97422727971706 3.43961688012126 2.5346103995958 A:C A C 10 0.57326948002021 0.36622341140112 ENSG00000125398:ENST00000245479:exon_70119684_70122561:SOX9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 73016621 C/T 1 34 36 70 14.5088376793129 20.6377012807276 -6.1288636014147 T:C C T 10 0.57326948002021 0.147933943571596 ENSG00000167862:ENST00000301585:exon_73016583_73016752:ICT1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 73127217 G/C 1 5 11 16 2.13365259989895 6.30596428022231 -4.17231168032336 C:G G C 10 0.57326948002021 0.0430098754235704 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 73205976 T/C 1 11 6 17 4.69403571977769 3.43961688012126 1.25441883965643 T:C T C 10 0.57326948002021 0.629145660806696 ENSG00000125450:ENST00000245544:exon_73205918_73206080:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000449421:exon_73205918_73206080:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000447371:exon_73205918_73206080:NUP85 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 73221446 A/G 1 11 10 21 4.69403571977769 5.7326948002021 -1.03865908042441 A:G A G 10 0.57326948002021 0.66464815614549 ENSG00000125450:ENST00000245544:exon_73221437_73221559:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000449421:exon_73221437_73221559:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000447371:exon_73221437_73221559:NUP85 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 73230856 C/T 1 27 23 50 11.5217240394543 13.1851980404648 -1.6634740010105 T:C C T 10 0.57326948002021 0.66928969982904 ENSG00000125450:ENST00000245544:exon_73230732_73230883:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000447371:exon_73230732_73231009:NUP85 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 73257986 C/T 1 23 32 55 9.81480195953517 18.3446233606467 -8.52982140111155 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0282145221812717 ENSG00000125445:ENST00000245539:exon_73257749_73258064:MRPS7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 73513281 C/G 1 5 4 9 2.13365259989895 2.29307792008084 -0.15942532018189 C:G C G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73513242_73513325:TSEN54;ENSG00000182173:ENST00000434205:exon_73513242_73513325:TSEN54 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 73839137 G/A 1 4 6 10 1.70692207991916 3.43961688012126 -1.7326948002021 A:G G A 10 0.57326948002021 0.342315301618549 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73839095_73839154:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73839095_73839154:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73839095_73839154:UNC13D HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 73888534 G/A 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 A:G G A 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000141569:ENST00000269383:exon_73888348_73888581:TRIM65 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 74261677 T/C 1 83 60 143 35.4186331583226 34.3961688012126 1.02246435710996 T:C T C 10 0.57326948002021 0.932667995149414 ENSG00000185262:ENST00000327490:exon_74261283_74261706:FAM100B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 74467664 C/G 1 12 14 26 5.12076623975748 8.02577272028294 -2.90500648052546 C:G C G 10 0.57326948002021 0.3215675945048 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74466976_74468134:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74466976_74468134:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74466979_74468921:RHBDF2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 74733099 G/A 1 73 65 138 31.1513279585247 37.2625162013137 -6.11118824278898 A:G G A 10 0.57326948002021 0.302550847375805 ENSG00000161547:ENST00000392485:exon_74732881_74733412:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000359995:exon_74732969_74733413:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000358156:exon_74732881_74733242:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000452355:exon_74733066_74733242:SRSF2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 75085434 G/A 1 8 5 13 3.41384415983832 2.86634740010105 0.547496759737269 A:G G A 10 0.57326948002021 1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 75495397 T/C 1 165 90 255 70.4105357966653 51.5942532018189 18.8162825948464 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0189954424235099 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 76121031 C/T 1 9 6 15 3.84057467981811 3.43961688012126 0.400957799696849 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000306591:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000441202:exon_76120970_76121066:TMC6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 76170830 C/T 1 60 70 130 25.6038311987874 40.1288636014147 -14.5250324026273 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0127349964564036 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76170160_76171031:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76170773_76171031:TK1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 76694918 G/A 1 14 8 22 5.97422727971706 4.58615584016168 1.38807143955538 A:G G A 10 0.57326948002021 0.668312643486638 ENSG00000108669:ENST00000446868:exon_76694902_76695050:CYTH1;ENSG00000108669:ENST00000361101:exon_76694902_76695050:CYTH1;ENSG00000108669:ENST00000392453:exon_76694902_76695050:CYTH1;ENSG00000108669:ENST00000262763:exon_76694902_76695050:CYTH1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 76798437 G/A 1 29 13 42 12.3751850794139 7.45250324026273 4.92268183915118 A:C:G G A 10 0.57326948002021 0.159679318307718 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76798406_76798617:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76798406_76798617:USP36 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 76799860 T/C 1 15 14 29 6.40095779969685 8.02577272028294 -1.62481492058609 T:C T C 10 0.57326948002021 0.57654103737025 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 76799898 A/G 1 14 22 36 5.97422727971706 12.6119285604446 -6.63770128072756 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0285356803829016 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 76803659 T/C 1 16 7 23 6.82768831967664 4.01288636014147 2.81480195953517 T:C T C 10 0.57326948002021 0.293949418892179 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76803041_76803718:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76803041_76803718:USP36 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 76988785 G/A 1 9 7 16 3.84057467981811 4.01288636014147 -0.172311680323361 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000339300:exon_76987799_76990002:CANT1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 77078109 A/G 1 5 6 11 2.13365259989895 3.43961688012126 -1.30596428022231 A:G A G 10 0.57326948002021 0.545300564874909 ENSG00000167280:ENST00000311595:exon_77077980_77078145:ENGASE;ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77077980_77078145:ENGASE HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 77808961 G/A 1 6 4 10 2.56038311987874 2.29307792008084 0.267305199797899 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000141582:ENST00000269397:exon_77806955_77809194:CBX4;ENSG00000141582:ENST00000448310:exon_77808843_77809194:CBX4;ENSG00000141582:ENST00000495122:exon_77808942_77809319:CBX4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 78113832 G/A 1 19 10 29 8.10787987961601 5.7326948002021 2.37518507941391 A:G G A 10 0.57326948002021 0.454314630634957 ENSG00000141543:ENST00000269349:exon_78113807_78113939:EIF4A3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 78350110 G/A 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 A:G G A 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78350101_78350343:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78350101_78350343:RNF213 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 78389478 G/A 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 A:G G A 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000173818:ENST00000520537:exon_78389450_78390053:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000522577:exon_78389450_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000518137:exon_78389450_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000520367:exon_78389450_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000523999:exon_78389450_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000519117:exon_78389450_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000323854:exon_78389450_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000397538:exon_78389450_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000521330:exon_78389115_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000522751:exon_78389115_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000520136:exon_78389450_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000520284:exon_78389450_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000523228:exon_78389450_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000523828:exon_78389450_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000522200:exon_78389253_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000520118:exon_78389450_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000521565:exon_78389450_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000521847:exon_78389269_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000521830:exon_78389269_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000518644:exon_78389450_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000523165:exon_78389453_78389621:CTD-2526A2.1;ENSG00000173818:ENST00000517295:exon_78389469_78389621:CTD-2526A2.1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 79163758 G/A 1 20 24 44 8.5346103995958 13.758467520485 -5.22385712088924 A:G G A 10 0.57326948002021 0.127659922158617 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79163715_79163775:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79163715_79163775:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79163715_79163775:AZI1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 79165171 G/A 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 A:G G A 10 0.57326948002021 0.509627549256674 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 79166384 C/T 1 8 6 14 3.41384415983832 3.43961688012126 -0.0257727202829408 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79166276_79166393:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79166276_79166393:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79166276_79166393:AZI1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 79169641 G/A 1 9 9 18 3.84057467981811 5.15942532018189 -1.31885064036378 A:G G A 10 0.57326948002021 0.635341898612975 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79169635_79169751:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79169635_79169751:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79169635_79169751:AZI1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 79170578 C/T 1 9 5 14 3.84057467981811 2.86634740010105 0.974227279717059 T:C C T 10 0.57326948002021 0.788481610276296 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79170501_79170626:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79170501_79170626:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79170501_79170626:AZI1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 79202956 T/C 1 6 12 18 2.56038311987874 6.87923376024252 -4.31885064036378 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0544603635560848 ENSG00000167302:ENST00000300714:exon_79202079_79203276:C17orf56;ENSG00000167302:ENST00000374769:exon_79202079_79203276:C17orf56 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 79219635 C/T 1 32 27 59 13.6553766393533 15.4782759605457 -1.82289932119239 T:C C T 10 0.57326948002021 0.693403888411906 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 79511135 A/G 1 12 17 29 5.12076623975748 9.74558116034357 -4.62481492058609 A:G A G 10 0.57326948002021 0.092444560372685 ENSG00000185504:ENST00000361039:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79511030_79511146:C17orf70 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 79514129 G/A 1 6 7 13 2.56038311987874 4.01288636014147 -1.45250324026273 A:G G A 10 0.57326948002021 0.418185809776403 ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79513935_79515054:C17orf70 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 79564304 G/T 1 5 4 9 2.13365259989895 2.29307792008084 -0.15942532018189 T:G G T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79564271_79564342:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79564271_79564342:NPLOC4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 79634774 A/T 1 8 7 15 3.41384415983832 4.01288636014147 -0.599042200303151 A:T A T 10 0.57326948002021 0.7979049378473 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79634759_79634892:CCDC137 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 79634813 T/C 1 6 10 16 2.56038311987874 5.7326948002021 -3.17231168032336 T:C T C 10 0.57326948002021 0.131350999414970 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79634759_79634892:CCDC137 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 79637367 C/G 1 15 28 43 6.40095779969685 16.0515454405659 -9.65058764086903 C:G C G 10 0.57326948002021 0.00327373639501321 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79637255_79637483:CCDC137 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 79638805 C/T 1 30 17 47 12.8019155993937 9.74558116034357 3.05633443905013 T:C C T 10 0.57326948002021 0.381533111996689 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79638774_79638856:CCDC137 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 79663931 T/C 1 15 13 28 6.40095779969685 7.45250324026273 -1.05154544056588 T:C T C 10 0.57326948002021 0.705949684866759 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79663854_79664028:HGS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 79817127 G/A 1 65 58 123 27.7374837986863 33.2496298411722 -5.51214604248583 A:G G A 10 0.57326948002021 0.317537526472066 ENSG00000185624:ENST00000331483:exon_79817057_79817263:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000450722:exon_79817092_79817263:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000436463:exon_79817068_79817263:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000467086:exon_79817057_79817263:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000471535:exon_79817057_79817263:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000466567:exon_79816690_79817263:P4HB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 79954544 T/A 1 17 12 29 7.25441883965643 6.87923376024252 0.375185079413908 A:T T A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79954296_79954722:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79954296_79954722:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000344865:exon_79954296_79954722:ASPSCR1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 79974731 T/C 1 19 34 53 8.10787987961601 19.4911623206871 -11.3832824410711 T:C T C 10 0.57326948002021 0.00200895766661580 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79974676_79974745:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79974676_79974745:ASPSCR1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 80006957 A/C 1 6 7 13 2.56038311987874 4.01288636014147 -1.45250324026273 A:C A C 10 0.57326948002021 0.418185809776403 ENSG00000169733:ENST00000310496:exon_80006907_80006992:RFNG HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 80008392 G/T 1 7 7 14 2.98711363985853 4.01288636014147 -1.02577272028294 T:G G T 10 0.57326948002021 0.5990458397462 ENSG00000169733:ENST00000310496:exon_80008278_80008431:RFNG;ENSG00000169733:ENST00000429557:exon_80007879_80008431:RFNG HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 80014861 T/G 1 8 1 9 3.41384415983832 0.57326948002021 2.84057467981811 T:G T G 10 0.57326948002021 0.0881139701997098 ENSG00000169727:ENST00000392357:exon_80014505_80015346:GPS1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 80039481 G/A 1 28 25 53 11.9484545594341 14.3317370005053 -2.38328244107113 A:G G A 10 0.57326948002021 0.579006058463278 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80039477_80039719:FASN HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 80043739 A/G 1 12 7 19 5.12076623975748 4.01288636014147 1.10787987961601 A:G A G 10 0.57326948002021 0.651195141393552 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80043358_80043747:FASN HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 80045086 G/C 1 9 6 15 3.84057467981811 3.43961688012126 0.400957799696849 C:G G C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80044926_80045129:FASN HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 80059596 T/C 1 102 82 184 43.5265130379386 47.0080973616572 -3.48158432371865 T:C T C 10 0.57326948002021 0.602819925061214 ENSG00000176155:ENST00000445854:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000389641:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392347:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392345:exon_80059566_80059742:CCDC57 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 80085633 A/G 1 3 5 8 1.28019155993937 2.86634740010105 -1.58615584016168 A:G A G 10 0.57326948002021 0.29890034016204 ENSG00000176155:ENST00000445854:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000389641:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392347:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392345:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392346:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000419322:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000324808:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000412801:exon_80085368_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000483145:exon_80085581_80085784:CCDC57 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 80085703 G/T 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 T:G G T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000176155:ENST00000445854:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000389641:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392347:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392345:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392346:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000419322:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000324808:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000412801:exon_80085368_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000483145:exon_80085581_80085784:CCDC57 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 80350331 G/A 1 17 16 33 7.25441883965643 9.17231168032336 -1.91789284066693 A:G G A 10 0.57326948002021 0.598175714760715 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80350100_80350410:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80350100_80350410:C17orf101 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 80585094 C/T 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000141580:ENST00000392325:exon_80585080_80585167:WDR45L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 80887244 T/C 1 24 32 56 10.241532479515 18.3446233606467 -8.10309088113176 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0308815626438086 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80887238_80887376:TBCD HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 80899281 G/A 1 26 27 53 11.0949935194745 15.4782759605457 -4.38328244107113 A:G G A 10 0.57326948002021 0.266479378093127 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80899275_80899338:TBCD HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 80992932 A/C 1 3 9 12 1.28019155993937 5.15942532018189 -3.87923376024252 A:C A C 10 0.57326948002021 0.0369288562011821 ENSG00000175711:ENST00000320865:exon_80992911_80992975:B3GNTL1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 17 81006629 C/T 1 2 6 8 0.85346103995958 3.43961688012126 -2.58615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0801462458318362 ENSG00000175711:ENST00000320865:exon_81006545_81006661:B3GNTL1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 166819 T/C 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 A:T:C T C 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000101557:ENST00000400266:exon_166787_166819:USP14;ENSG00000101557:ENST00000261601:exon_166787_166819:USP14;ENSG00000101557:ENST00000383589:exon_166787_166819:USP14 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 9936132 T/C 1 9 13 22 3.84057467981811 7.45250324026273 -3.61192856044462 T:C T C 10 0.57326948002021 0.134283230160958 ENSG00000101558:ENST00000340541:exon_9936107_9936210:VAPA;ENSG00000101558:ENST00000400000:exon_9936107_9936210:VAPA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 9944956 T/C 1 8 4 12 3.41384415983832 2.29307792008084 1.12076623975748 T:C T C 10 0.57326948002021 0.573925568669172 ENSG00000101558:ENST00000340541:exon_9944921_9945055:VAPA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 9944960 A/G 1 8 3 11 3.41384415983832 1.71980844006063 1.69403571977769 A:G A G 10 0.57326948002021 0.372574328023575 ENSG00000101558:ENST00000340541:exon_9944921_9945055:VAPA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 12329536 C/G 1 99 85 184 42.2463214779992 48.7279058017179 -6.48158432371865 C:G C G 10 0.57326948002021 0.333795427248722 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 12348285 T/C 1 7 18 25 2.98711363985853 10.3188506403638 -7.33173700050525 T:C T C 10 0.57326948002021 0.00393512078551115 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12348272_12348382:AFG3L2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 12351342 C/T 1 17 23 40 7.25441883965643 13.1851980404648 -5.9307792008084 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0773853347122453 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12351305_12351412:AFG3L2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 12718593 A/G 1 29 35 64 12.3751850794139 20.0644318007074 -7.68924672129345 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0579851083701808 ENSG00000128789:ENST00000317615:exon_12718516_12718634:PSMG2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 12984144 C/A 1 12 14 26 5.12076623975748 8.02577272028294 -2.90500648052546 A:C C A 10 0.57326948002021 0.3215675945048 ENSG00000085415:ENST00000399892:exon_12984039_12984189:SEH1L;ENSG00000085415:ENST00000262124:exon_12984039_12984189:SEH1L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 13116432 G/T 1 6 6 12 2.56038311987874 3.43961688012126 -0.879233760242521 T:G G T 10 0.57326948002021 0.771962928640395 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13116022_13116735:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000508539:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513183:exon_13116403_13116502:CEP192 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 20577669 G/A 1 10 21 31 4.2673051997979 12.0386590804244 -7.77135388062651 A:G G A 10 0.57326948002021 0.00590376686360403 ENSG00000101773:ENST00000327155:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000327174:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000360790:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000399725:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000399722:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000399721:exon_20577583_20577697:RBBP8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 21109250 T/C 1 11 13 24 4.69403571977769 7.45250324026273 -2.75846752048504 T:C T C 10 0.57326948002021 0.303503076139145 ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21109143_21109262:C18orf8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 32822382 G/T 1 7 3 10 2.98711363985853 1.71980844006063 1.2673051997979 T:G G T 10 0.57326948002021 0.532053210294076 ENSG00000186812:ENST00000330501:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000261333:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000355632:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000421371:exon_32822355_32822848:ZNF397 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 33607031 T/C 1 8 3 11 3.41384415983832 1.71980844006063 1.69403571977769 T:C T C 10 0.57326948002021 0.372574328023575 ENSG00000141425:ENST00000399022:exon_33606863_33607038:RPRD1A;ENSG00000141425:ENST00000357384:exon_33606863_33607038:RPRD1A;ENSG00000141425:ENST00000337059:exon_33606863_33607038:RPRD1A;ENSG00000141425:ENST00000319040:exon_33606863_33607038:RPRD1A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 47017820 A/G 1 3 5 8 1.28019155993937 2.86634740010105 -1.58615584016168 A:G A G 10 0.57326948002021 0.29890034016204 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 47803354 C/T 1 9 9 18 3.84057467981811 5.15942532018189 -1.31885064036378 T:C C T 10 0.57326948002021 0.635341898612975 ENSG00000141644:ENST00000353909:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269471:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000424334:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000436910:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000349085:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000347968:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269468:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000457839:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000382948:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000339998:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398495:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398493:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398488:exon_47803202_47803368:MBD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 47812587 C/T 1 45 47 92 19.2028733990905 26.9436655609499 -7.74079216185932 T:C C T 10 0.57326948002021 0.113853751156743 ENSG00000154832:ENST00000285106:exon_47812392_47812627:CXXC1;ENSG00000154832:ENST00000412036:exon_47812392_47812627:CXXC1;ENSG00000154832:ENST00000445672:exon_47812392_47812627:CXXC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 56203891 G/T 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 T:G G T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 56204932 T/G 1 8 1 9 3.41384415983832 0.57326948002021 2.84057467981811 T:G T G 10 0.57326948002021 0.0881139701997098 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 56204945 C/G 1 8 1 9 3.41384415983832 0.57326948002021 2.84057467981811 C:G C G 10 0.57326948002021 0.0881139701997098 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 56204977 C/T 1 8 2 10 3.41384415983832 1.14653896004042 2.2673051997979 T:C C T 10 0.57326948002021 0.205360643158888 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 56204991 C/T 1 9 2 11 3.84057467981811 1.14653896004042 2.69403571977769 T:C C T 10 0.57326948002021 0.131175688856066 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 56205472 G/T 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 T:G G T 10 0.57326948002021 0.479875249837149 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 56205481 G/A 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 A:G G A 10 0.57326948002021 0.479875249837149 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 61022791 C/T 1 7 7 14 2.98711363985853 4.01288636014147 -1.02577272028294 T:C C T 10 0.57326948002021 0.5990458397462 ENSG00000119537:ENST00000406396:exon_61022731_61022796:KDSR;ENSG00000119537:ENST00000326575:exon_61022731_61022796:KDSR HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 61582751 T/G 1 16 10 26 6.82768831967664 5.7326948002021 1.09499351947454 T:G T G 10 0.57326948002021 0.697516950667805 ENSG00000242550:ENST00000397996:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000418725:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61582736_61582912:SERPINB10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 61585260 T/C 1 8 4 12 3.41384415983832 2.29307792008084 1.12076623975748 T:C T C 10 0.57326948002021 0.573925568669172 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61585199_61585336:SERPINB10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 61587053 G/A 1 8 6 14 3.41384415983832 3.43961688012126 -0.0257727202829408 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61587022_61587139:SERPINB10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 61602495 C/T 1 38 49 87 16.215759759232 28.0902045209903 -11.8744447617583 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0122998079204743 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61602072_61603345:SERPINB10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 61650865 G/A 1 8 10 18 3.41384415983832 5.7326948002021 -2.31885064036378 A:G G A 10 0.57326948002021 0.34156534419122 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000397988:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000441827:exon_61650813_61650881:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61650813_61650955:SERPINB8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 61654297 A/G 1 25 22 47 10.6682629994947 12.6119285604446 -1.94366556094987 A:G A G 10 0.57326948002021 0.55980056664508 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 67531642 T/C 1 6 10 16 2.56038311987874 5.7326948002021 -3.17231168032336 T:C T C 10 0.57326948002021 0.131350999414970 ENSG00000150637:ENST00000280200:exon_67528097_67531675:CD226 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 67687860 T/C 1 1 9 10 0.42673051997979 5.15942532018189 -4.7326948002021 T:C T C 10 0.57326948002021 0.00289017099563971 ENSG00000176225:ENST00000255674:exon_67687851_67688053:RTTN;ENSG00000176225:ENST00000454359:exon_67687851_67688053:RTTN HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 72776121 G/A 0 0 9 9 0 5.15942532018189 -5.15942532018189 A G A 10 0.57326948002021 0.0004692273784325 ENSG00000215421:ENST00000299687:exon_72775106_72777628:ZNF407 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 74728823 C/T 1 3 6 9 1.28019155993937 3.43961688012126 -2.15942532018189 T:C C T 10 0.57326948002021 0.183674374674640 ENSG00000197971:ENST00000382582:exon_74728788_74729051:MBP;ENSG00000197971:ENST00000355994:exon_74728788_74729224:MBP;ENSG00000197971:ENST00000397875:exon_74728788_74729011:MBP;ENSG00000197971:ENST00000397866:exon_74728788_74729018:MBP;ENSG00000197971:ENST00000397865:exon_74728788_74729042:MBP;ENSG00000197971:ENST00000527041:exon_74728788_74729021:MBP;ENSG00000197971:ENST00000359645:exon_74728788_74728998:MBP;ENSG00000197971:ENST00000397869:exon_74728788_74729011:MBP;ENSG00000197971:ENST00000354542:exon_74728788_74729217:MBP;ENSG00000197971:ENST00000526111:exon_74728788_74728869:MBP;ENSG00000197971:ENST00000529144:exon_74728788_74728869:MBP;ENSG00000197971:ENST00000397868:exon_74728788_74729011:MBP;ENSG00000197971:ENST00000473302:exon_74728788_74729011:MBP;ENSG00000197971:ENST00000483025:exon_74728788_74729011:MBP;ENSG00000197971:ENST00000493623:exon_74728788_74729011:MBP;ENSG00000197971:ENST00000484548:exon_74728788_74728998:MBP;ENSG00000197971:ENST00000467108:exon_74728788_74729014:MBP;ENSG00000197971:ENST00000459948:exon_74728788_74729017:MBP;ENSG00000197971:ENST00000482445:exon_74728788_74729011:MBP;ENSG00000197971:ENST00000498683:exon_74728788_74729224:MBP;ENSG00000197971:ENST00000397863:exon_74724735_74729224:MBP;ENSG00000197971:ENST00000397860:exon_74724735_74729224:MBP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 77171061 T/G 1 11 6 17 4.69403571977769 3.43961688012126 1.25441883965643 A:T:G T G 10 0.57326948002021 0.629145660806696 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77170400_77171501:NFATC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 77208922 C/T 1 9 14 23 3.84057467981811 8.02577272028294 -4.18519804046483 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0922104210502733 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77208782_77208984:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77208782_77208984:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77208782_77208984:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77208782_77208984:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77208782_77208984:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77208782_77208984:NFATC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 77475455 G/A 1 14 21 35 5.97422727971706 12.0386590804244 -6.06443180070735 A:C:G G A 10 0.57326948002021 0.041258720266933 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77474491_77475528:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77474491_77475528:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77474491_77475528:CTDP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 77478011 C/T 1 12 6 18 5.12076623975748 3.43961688012126 1.68114935963622 T:C C T 10 0.57326948002021 0.482786461758876 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77477810_77478016:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77477810_77478016:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77477810_77478016:CTDP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 77663940 G/A 1 30 30 60 12.8019155993937 17.1980844006063 -4.3961688012126 A:G G A 10 0.57326948002021 0.296390622748550 ENSG00000122490:ENST00000397778:exon_77662420_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000409073:exon_77662421_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000466449:exon_77663578_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000351365:exon_77662488_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000357575:exon_77662488_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000474967:exon_77662515_77664183:PQLC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 18 77896242 C/T 1 8 4 12 3.41384415983832 2.29307792008084 1.12076623975748 T:C C T 10 0.57326948002021 0.573925568669172 ENSG00000101544:ENST00000262198:exon_77893495_77898226:ADNP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 518957 C/A 1 3 10 13 1.28019155993937 5.7326948002021 -4.45250324026273 A:C C A 10 0.57326948002021 0.0209775680683305 ENSG00000141933:ENST00000388800:exon_518889_519291:C19orf20;ENSG00000141933:ENST00000359315:exon_518889_519653:C19orf20 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 518991 C/G 1 4 7 11 1.70692207991916 4.01288636014147 -2.30596428022231 C:G C G 10 0.57326948002021 0.223014268684580 ENSG00000141933:ENST00000388800:exon_518889_519291:C19orf20;ENSG00000141933:ENST00000359315:exon_518889_519653:C19orf20 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 579627 C/T 1 156 196 352 66.5699611168472 112.360818083961 -45.7908569671139 T:C C T 10 0.57326948002021 1.08820319121910e-06 ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000396012:exon_579500_579656:BSG HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 580388 C/G 1 210 240 450 89.6134091957559 137.58467520485 -47.9712660090945 A:C:G C G 10 0.57326948002021 5.63299804308144e-06 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580379_580461:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580379_580461:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580379_580461:BSG HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 619021 G/C 1 15 7 22 6.40095779969685 4.01288636014147 2.38807143955538 C:G G C 10 0.57326948002021 0.390273785353222 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_618997_619110:POLRMT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 804396 C/T 1 13 18 31 5.54749675973727 10.3188506403638 -4.77135388062651 T:C C T 10 0.57326948002021 0.101679461535614 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804292_804438:PTBP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 804642 C/T 1 19 36 55 8.10787987961601 20.6377012807276 -12.5298214011116 A:T:C C T 10 0.57326948002021 0.000897472124313561 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804532_804702:PTBP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 808586 C/G 1 46 42 88 19.6296039190703 24.0773181608488 -4.44771424177848 T:C:G C G 10 0.57326948002021 0.388705659154623 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000350092:exon_808546_808762:PTBP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 808742 G/T 1 44 39 83 18.7761428791108 22.3575097207882 -3.58136684167744 T:G G T 10 0.57326948002021 0.438912502473887 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000350092:exon_808546_808762:PTBP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 868115 C/T 1 24 36 60 10.241532479515 20.6377012807276 -10.3961688012126 T:C C T 10 0.57326948002021 0.00856105221082661 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_867964_868251:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_867964_868499:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_867964_868499:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_867964_868499:MED16 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 871222 G/A 1 19 25 44 8.10787987961601 14.3317370005053 -6.22385712088924 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0671672204757469 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_871037_871253:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_871037_871253:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_871037_871253:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_871037_871253:MED16 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 871996 A/G 1 14 9 23 5.97422727971706 5.15942532018189 0.814801959535169 A:G A G 10 0.57326948002021 0.834555320864254 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_871926_872118:MED16 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 929678 G/A 1 9 11 20 3.84057467981811 6.30596428022231 -2.4653896004042 A:G G A 10 0.57326948002021 0.269322135581906 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_929262_929896:ARID3A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 966693 C/T 1 29 30 59 12.3751850794139 17.1980844006063 -4.82289932119239 T:C C T 10 0.57326948002021 0.236199377046639 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_966572_966868:ARID3A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 1014398 A/G 1 26 16 42 11.0949935194745 9.17231168032336 1.92268183915118 A:G A G 10 0.57326948002021 0.64063792575317 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1014191_1014472:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1014191_1014472:C19orf6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 1036456 C/G 1 57 26 83 24.323639638848 14.9050064805255 9.41863315832257 C:G C G 10 0.57326948002021 0.0451196143818988 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 1036468 A/G 1 56 27 83 23.8969091188682 15.4782759605457 8.41863315832257 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0752007702981166 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 1037941 G/T 1 71 24 95 30.2978669185651 13.758467520485 16.53939939808 T:G G T 10 0.57326948002021 0.000554925440000133 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1037624_1039060:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1037624_1039060:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1037624_1039060:CNN2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 1068734 T/C 1 4 8 12 1.70692207991916 4.58615584016168 -2.87923376024252 T:C T C 10 0.57326948002021 0.141786607964141 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 1068738 G/A 1 6 7 13 2.56038311987874 4.01288636014147 -1.45250324026273 A:G G A 10 0.57326948002021 0.418185809776403 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 1074000 A/T 1 15 16 31 6.40095779969685 9.17231168032336 -2.77135388062651 A:T A T 10 0.57326948002021 0.365073379223067 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1073947_1074013:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1073947_1074013:HMHA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 1077985 A/G 1 17 18 35 7.25441883965643 10.3188506403638 -3.06443180070735 A:G A G 10 0.57326948002021 0.309302325896262 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1077856_1078044:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1077856_1078044:HMHA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 1079959 G/A 1 29 33 62 12.3751850794139 18.9178928406669 -6.54270776125302 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0964981487017688 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1079927_1080117:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1079927_1080117:HMHA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 1080311 G/C 1 25 42 67 10.6682629994947 24.0773181608488 -13.4090551613541 C:G G C 10 0.57326948002021 0.00118106898182375 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1080254_1080378:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1080254_1080378:HMHA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 1081617 A/G 1 17 32 49 7.25441883965643 18.3446233606467 -11.0902045209903 A:G A G 10 0.57326948002021 0.00207822074135520 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1081549_1081737:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1081549_1081737:HMHA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 1085966 A/G 1 67 53 120 28.5909448386459 30.3832824410711 -1.79233760242521 A:G A G 10 0.57326948002021 0.78208684672149 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1085659_1086627:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1085659_1086627:HMHA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 1256998 C/T 1 7 7 14 2.98711363985853 4.01288636014147 -1.02577272028294 T:C C T 10 0.57326948002021 0.5990458397462 ENSG00000167470:ENST00000300952:exon_1256994_1259139:MIDN;ENSG00000167470:ENST00000395622:exon_1256994_1259078:MIDN HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 1271274 C/T 1 4 7 11 1.70692207991916 4.01288636014147 -2.30596428022231 T:C C T 10 0.57326948002021 0.223014268684580 ENSG00000099622:ENST00000427032:exon_1271139_1271364:CIRBP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 1272040 T/C 1 393 364 757 167.705094352057 208.670090727356 -40.964996375299 A:T:C T C 10 0.57326948002021 0.00289642345476307 ENSG00000099622:ENST00000320936:exon_1271980_1272050:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000413636:exon_1271980_1272442:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000427032:exon_1271980_1272050:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000444172:exon_1271980_1272442:CIRBP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 1360575 G/A 1 5 7 12 2.13365259989895 4.01288636014147 -1.87923376024252 A:G G A 10 0.57326948002021 0.382460042999359 ENSG00000160953:ENST00000415183:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000356765:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000344663:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000311401:exon_1360135_1361031:MUM1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 1388538 C/T 1 37 37 74 15.7890292392522 21.2109707607478 -5.42194152149554 T:C C T 10 0.57326948002021 0.239696846590566 ENSG00000115286:ENST00000313408:exon_1388524_1388937:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000233627:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000450862:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000414651:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000382445:exon_1388524_1388592:NDUFS7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 1615767 T/C 1 64 56 120 27.3107532787066 32.1030908811318 -4.79233760242521 T:C T C 10 0.57326948002021 0.406482479177349 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1615284_1615820:TCF3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 1619339 T/C 1 47 35 82 20.0563344390501 20.0644318007074 -0.00809736165722796 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 1622116 G/A 1 29 11 40 12.3751850794139 6.30596428022231 6.0692207991916 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0558219317533492 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1622053_1622222:TCF3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 1827565 A/G 1 6 7 13 2.56038311987874 4.01288636014147 -1.45250324026273 A:G A G 10 0.57326948002021 0.418185809776403 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1826877_1828630:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1826877_1828630:REXO1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 1912817 C/T 1 5 7 12 2.13365259989895 4.01288636014147 -1.87923376024252 T:C C T 10 0.57326948002021 0.382460042999359 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 1912934 T/C 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 T:C T C 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 1918134 G/A 1 9 6 15 3.84057467981811 3.43961688012126 0.400957799696849 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000227500:ENST00000452128:exon_1918126_1918282:SCAMP4;ENSG00000227500:ENST00000316097:exon_1918126_1918282:SCAMP4;ENSG00000227500:ENST00000460767:exon_1918126_1918282:SCAMP4;ENSG00000227500:ENST00000489554:exon_1918126_1918282:SCAMP4;ENSG00000227500:ENST00000414057:exon_1918126_1918282:SCAMP4;ENSG00000227500:ENST00000409472:exon_1918126_1918282:SCAMP4;ENSG00000227500:ENST00000411971:exon_1918126_1918282:SCAMP4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 1986520 G/A 1 38 34 72 16.215759759232 19.4911623206871 -3.27540256145512 A:G G A 10 0.57326948002021 0.475261639617826 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 2110746 G/A 1 30 31 61 12.8019155993937 17.7713538806265 -4.96943828123282 A:G G A 10 0.57326948002021 0.198781998865651 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2110706_2110895:AP3D1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 2116649 A/G 1 20 10 30 8.5346103995958 5.7326948002021 2.8019155993937 A:G A G 10 0.57326948002021 0.358284681355315 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2116604_2116745:AP3D1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 2138654 T/G 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 T:G T G 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2138618_2138713:AP3D1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 2213895 G/A 1 8 4 12 3.41384415983832 2.29307792008084 1.12076623975748 A:G G A 10 0.57326948002021 0.573925568669172 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2213848_2213985:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2213848_2213985:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000440640:exon_2213848_2213985:DOT1L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 2217845 C/G 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 C:G C G 10 0.57326948002021 0.741310101183539 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2217771_2217917:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2217771_2217917:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000440640:exon_2217771_2217917:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000482433:exon_2217771_2217917:DOT1L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 2226676 G/A 1 17 11 28 7.25441883965643 6.30596428022231 0.948454559434118 A:G G A 10 0.57326948002021 0.849071983987724 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 2226772 G/C 1 17 20 37 7.25441883965643 11.4653896004042 -4.21097076074777 C:G G C 10 0.57326948002021 0.184431768655712 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 2254458 C/T 1 13 21 34 5.54749675973727 12.0386590804244 -6.49116232068714 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0358422121396472 ENSG00000167476:ENST00000300961:exon_2254444_2254481:JSRP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 2433890 A/G 1 24 14 38 10.241532479515 8.02577272028294 2.21575975923202 A:G A G 10 0.57326948002021 0.515031987333069 ENSG00000176619:ENST00000532465:exon_2433824_2433897:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000325327:exon_2433824_2434103:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000490554:exon_2433824_2434103:LMNB2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 2732986 T/C 1 34 27 61 14.5088376793129 15.4782759605457 -0.969438281232813 T:C T C 10 0.57326948002021 0.797359788295434 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 2762585 A/C 1 3 9 12 1.28019155993937 5.15942532018189 -3.87923376024252 A:C A C 10 0.57326948002021 0.0369288562011821 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2762504_2762642:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2762504_2762642:SGTA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 2853566 A/G 1 3 6 9 1.28019155993937 3.43961688012126 -2.15942532018189 A:G A G 10 0.57326948002021 0.183674374674640 ENSG00000186300:ENST00000334241:exon_2852378_2857682:ZNF555 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 2917186 T/C 1 5 6 11 2.13365259989895 3.43961688012126 -1.30596428022231 T:C T C 10 0.57326948002021 0.545300564874909 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 2917612 T/C 1 7 6 13 2.98711363985853 3.43961688012126 -0.452503240262731 T:C T C 10 0.57326948002021 0.787569123349065 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 2994903 T/C 1 2 7 9 0.85346103995958 4.01288636014147 -3.15942532018189 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0433151286077531 ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2994898_2995121:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2994898_2995182:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2994898_2995149:TLE6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 2994921 G/A 1 3 8 11 1.28019155993937 4.58615584016168 -3.30596428022231 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0642027293927821 ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2994898_2995121:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2994898_2995182:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2994898_2995149:TLE6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 3155902 G/A 1 18 6 24 7.68114935963622 3.43961688012126 4.24153247951496 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0986672035644979 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3155821_3155950:GNA15 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 3186085 G/T 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 T:G G T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3185875_3186212:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3185875_3186212:NCLN HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 3530837 C/T 1 3 8 11 1.28019155993937 4.58615584016168 -3.30596428022231 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0642027293927821 ENSG00000105325:ENST00000441788:exon_3530790_3530855:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000395095:exon_3530790_3530855:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000221926:exon_3530790_3530855:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000313639:exon_3530790_3530855:FZR1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 3534842 G/A 1 26 19 45 11.0949935194745 10.892120120384 0.202873399090548 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000105325:ENST00000441788:exon_3534793_3536755:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000395095:exon_3534793_3538325:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000221926:exon_3534793_3538325:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000313639:exon_3534793_3538325:FZR1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 3544971 C/T 1 7 5 12 2.98711363985853 2.86634740010105 0.120766239757479 T:C C T 10 0.57326948002021 1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 3547295 G/A 1 8 8 16 3.41384415983832 4.58615584016168 -1.17231168032336 A:G G A 10 0.57326948002021 0.617511810756066 ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3547270_3547362:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3547270_3547362:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3547270_3547362:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3547270_3547362:C19orf28 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 3611972 G/A 1 11 8 19 4.69403571977769 4.58615584016168 0.107879879616009 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000105298:ENST00000429344:exon_3610626_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000248420:exon_3611902_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000446452:exon_3611902_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000221899:exon_3611925_3612411:C19orf29;ENSG00000226800:ENST00000447295:exon_3611729_3612412:C19orf29OS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 3653525 C/T 1 3 5 8 1.28019155993937 2.86634740010105 -1.58615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.29890034016204 ENSG00000186111:ENST00000335312:exon_3653288_3653587:PIP5K1C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 3982895 G/A 1 264 272 536 112.656857274665 155.929298565497 -43.2724412908326 A:G G A 10 0.57326948002021 0.000199919281437626 ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3982805_3983016:EEF2;ENSG00000167658:ENST00000445244:exon_3982805_3983016:EEF2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 4102449 G/A 1 30 43 73 12.8019155993937 24.650587640869 -11.8486720414753 A:G G A 10 0.57326948002021 0.00619751184652111 ENSG00000126934:ENST00000262948:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000394867:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000481271:exon_4102374_4103202:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000443189:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000465472:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000472395:exon_4102374_4102502:MAP2K2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 4180836 C/T 1 9 10 19 3.84057467981811 5.7326948002021 -1.89212012038399 T:C C T 10 0.57326948002021 0.487623161721597 ENSG00000077463:ENST00000337491:exon_4180779_4180906:SIRT6;ENSG00000077463:ENST00000305232:exon_4180779_4180906:SIRT6;ENSG00000077463:ENST00000269860:exon_4180779_4180906:SIRT6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 4233095 T/C 0 14 0 14 5.97422727971706 0 5.97422727971706 T T 10 0.57326948002021 0.000545539563981559 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 4233096 G/A 0 15 0 15 6.40095779969685 0 6.40095779969685 G G 10 0.57326948002021 0.000297275113311910 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 4233107 C/T 1 17 1 18 7.25441883965643 0.57326948002021 6.68114935963622 T:C C T 10 0.57326948002021 0.00114577621103584 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 4234856 T/A 1 12 13 25 5.12076623975748 7.45250324026273 -2.33173700050525 A:T T A 10 0.57326948002021 0.419590889375568 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 4236996 G/A 1 184 164 348 78.5184156762814 94.0161947233144 -15.4977790470331 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0932984699711419 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 4237067 A/G 1 168 195 363 71.6907273566047 111.787548603941 -40.0968212473363 A:G A G 10 0.57326948002021 2.59279959681541e-05 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 4251069 T/C 1 14 15 29 5.97422727971706 8.59904220030315 -2.62481492058609 T:C T C 10 0.57326948002021 0.351504521856456 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4251024_4251168:CCDC94 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 4254375 C/T 1 22 8 30 9.38807143955538 4.58615584016168 4.8019155993937 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0958994067080494 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4254352_4254486:CCDC94 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 4357555 A/G 1 14 11 25 5.97422727971706 6.30596428022231 -0.331737000505251 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000008382:ENST00000359935:exon_4357512_4357582:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262966:exon_4357512_4357582:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262967:exon_4357512_4357582:MPND;ENSG00000008382:ENST00000429880:exon_4357512_4357582:MPND HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 4847713 A/G 1 23 21 44 9.81480195953517 12.0386590804244 -2.22385712088924 A:G A G 10 0.57326948002021 0.543383983765855 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4847703_4847902:PLIN3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 4847874 A/G 1 40 21 61 17.0692207991916 12.0386590804244 5.03056171876719 A:G A G 10 0.57326948002021 0.243769964745829 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4847703_4847902:PLIN3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 4852106 A/G 1 20 20 40 8.5346103995958 11.4653896004042 -2.9307792008084 A:G A G 10 0.57326948002021 0.424468842140107 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4852028_4852313:PLIN3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 5206748 G/A 1 41 33 74 17.4959513191714 18.9178928406669 -1.42194152149554 A:G G A 10 0.57326948002021 0.81436371598221 ENSG00000105426:ENST00000355005:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000262963:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000348075:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000355322:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000356037:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000357368:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000353284:exon_5205519_5206853:PTPRS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 5206775 A/G 1 58 46 104 24.7503701588278 26.3703960809297 -1.62002592210185 A:G A G 10 0.57326948002021 0.766746589065424 ENSG00000105426:ENST00000355005:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000262963:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000348075:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000355322:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000356037:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000357368:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000353284:exon_5205519_5206853:PTPRS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 5208319 G/A 1 49 30 79 20.9097954790097 17.1980844006063 3.71171107840341 A:G G A 10 0.57326948002021 0.427512036370039 ENSG00000105426:ENST00000355005:exon_5208248_5208402:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000262963:exon_5208248_5208402:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000348075:exon_5208248_5208402:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000355322:exon_5208248_5208402:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000356037:exon_5208248_5208402:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000357368:exon_5208248_5208402:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000353284:exon_5208248_5208402:PTPRS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 6374813 T/C 1 5 6 11 2.13365259989895 3.43961688012126 -1.30596428022231 T:C T C 10 0.57326948002021 0.545300564874909 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 6458240 G/C 1 3 5 8 1.28019155993937 2.86634740010105 -1.58615584016168 C:G G C 10 0.57326948002021 0.29890034016204 ENSG00000125648:ENST00000264088:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000422102:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000441950:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000301454:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000414491:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000334510:exon_6458209_6458335:SLC25A23 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 6471291 C/T 1 20 6 26 8.5346103995958 3.43961688012126 5.09499351947454 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0477900700572469 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6471276_6471316:DENND1C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 6477256 G/T 1 12 5 17 5.12076623975748 2.86634740010105 2.25441883965643 T:G G T 10 0.57326948002021 0.331859417462969 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6477229_6477294:DENND1C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 6535080 T/C 1 21 17 38 8.96134091957559 9.74558116034357 -0.784240240767982 T:C T C 10 0.57326948002021 0.870136342761597 ENSG00000125657:ENST00000245817:exon_6534611_6535939:TNFSF9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 6731304 G/A 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 A:G G A 10 0.57326948002021 0.741310101183539 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 6772872 G/C 1 7 6 13 2.98711363985853 3.43961688012126 -0.452503240262731 C:G G C 10 0.57326948002021 0.787569123349065 ENSG00000141968:ENST00000304076:exon_6772722_6773022:VAV1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 6850762 G/C 1 17 24 41 7.25441883965643 13.758467520485 -6.50404868082861 C:G G C 10 0.57326948002021 0.0567404432356352 ENSG00000141968:ENST00000304076:exon_6850681_6850768:VAV1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 7083761 A/G 1 4 9 13 1.70692207991916 5.15942532018189 -3.45250324026273 A:G A G 10 0.57326948002021 0.088426240843314 ENSG00000130544:ENST00000439035:exon_7082889_7087979:ZNF557;ENSG00000130544:ENST00000414706:exon_7082889_7087979:ZNF557;ENSG00000130544:ENST00000252840:exon_7082889_7087979:ZNF557 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 7132295 C/T 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7132169_7132328:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7132169_7132328:INSR HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 7533850 A/G 1 2 8 10 0.85346103995958 4.58615584016168 -3.7326948002021 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0229850767056374 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7533711_7534017:ARHGEF18 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 7711221 T/C 1 45 44 89 19.2028733990905 25.2238571208892 -6.02098372179869 T:C T C 10 0.57326948002021 0.200215428753526 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7711135_7711230:STXBP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 7712277 A/G 1 68 63 131 29.0176753586257 36.1159772412732 -7.09830188264752 A:G A G 10 0.57326948002021 0.217032460656824 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7712240_7712397:STXBP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 7712425 G/C 1 6 11 17 2.56038311987874 6.30596428022231 -3.74558116034357 C:G G C 10 0.57326948002021 0.0853131245996917 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 7712585 T/G 1 9 11 20 3.84057467981811 6.30596428022231 -2.4653896004042 T:G T G 10 0.57326948002021 0.269322135581906 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 7761812 A/G 1 50 57 107 21.3365259989895 32.676360361152 -11.3398343621625 A:T:G A G 10 0.57326948002021 0.031179643166613 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 7975586 C/T 1 8 8 16 3.41384415983832 4.58615584016168 -1.17231168032336 T:C C T 10 0.57326948002021 0.617511810756066 ENSG00000076984:ENST00000397981:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000397983:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000468058:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000397979:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000425613:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000494348:exon_7975145_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000465324:exon_7975581_7975620:MAP2K7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 8326904 G/A 1 48 32 80 20.4830649590299 18.3446233606467 2.1384415983832 A:G G A 10 0.57326948002021 0.652972257333257 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 8367359 G/C 1 74 69 143 31.5780584785045 39.5555941213945 -7.97753564289004 C:G G C 10 0.57326948002021 0.177456847563574 ENSG00000167775:ENST00000323539:exon_8367011_8367489:CD320;ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8367011_8367489:CD320 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 8367709 C/T 1 31 31 62 13.2286461193735 17.7713538806265 -4.54270776125303 T:C C T 10 0.57326948002021 0.250318308869366 ENSG00000167775:ENST00000323539:exon_8367661_8367722:CD320;ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8367661_8367864:CD320 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 8368758 G/A 1 18 14 32 7.68114935963622 8.02577272028294 -0.344623360646722 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8368739_8368972:CD320 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 8368794 C/A 1 20 17 37 8.5346103995958 9.74558116034357 -1.21097076074777 A:C C A 10 0.57326948002021 0.740714372974236 ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8368739_8368972:CD320 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 8386998 T/C 1 4 6 10 1.70692207991916 3.43961688012126 -1.7326948002021 T:C T C 10 0.57326948002021 0.342315301618549 ENSG00000233927:ENST00000445365:exon_8386540_8387376:RPS28 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 9524185 A/G 1 16 31 47 6.82768831967664 17.7713538806265 -10.9436655609499 A:G A G 10 0.57326948002021 0.00168185871811376 ENSG00000174652:ENST00000361151:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000361451:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000437513:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000393865:exon_9524180_9524218:ZNF266 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 10224526 C/T 1 48 51 99 20.4830649590299 29.2367434810307 -8.7536785220008 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0839644473523713 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 10265593 G/T 1 8 12 20 3.41384415983832 6.87923376024252 -3.4653896004042 T:G G T 10 0.57326948002021 0.173354231238589 ENSG00000130816:ENST00000340748:exon_10265581_10265732:DNMT1;ENSG00000130816:ENST00000359526:exon_10265581_10265732:DNMT1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 10334663 T/G 1 9 5 14 3.84057467981811 2.86634740010105 0.974227279717059 T:G T G 10 0.57326948002021 0.788481610276296 ENSG00000175898:ENST00000317726:exon_10332109_10335623:S1PR2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 10370490 T/A 1 212 195 407 90.4668702357155 111.787548603941 -21.3206783682255 A:T T A 10 0.57326948002021 0.0352353483902414 ENSG00000105364:ENST00000253099:exon_10370293_10370719:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000307422:exon_10370293_10370719:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000393733:exon_10369285_10370736:MRPL4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 10395973 G/A 1 30 35 65 12.8019155993937 20.0644318007074 -7.26251620131366 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0788716355936343 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10395791_10397291:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10395791_10397291:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000423829:exon_10395791_10397291:ICAM1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 10444603 C/G 1 336 414 750 143.381454713209 237.333564728367 -93.9521100151575 C:G C G 10 0.57326948002021 6.66419538553443e-12 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10444454_10444735:ICAM3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 10475652 C/A 1 5 5 10 2.13365259989895 2.86634740010105 -0.732694800202101 A:C C A 10 0.57326948002021 0.752834960365011 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10475527_10475724:TYK2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 10577843 C/A 1 15 15 30 6.40095779969685 8.59904220030315 -2.1980844006063 A:C C A 10 0.57326948002021 0.462600157558141 ENSG00000065989:ENST00000380702:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000352831:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000293683:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000440014:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000419866:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000344979:exon_10577563_10580305:PDE4A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 10600442 G/C 1 14 21 35 5.97422727971706 12.0386590804244 -6.06443180070735 C:G G C 10 0.57326948002021 0.041258720266933 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10600324_10600529:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10600324_10600529:KEAP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 10668383 T/C 1 12 6 18 5.12076623975748 3.43961688012126 1.68114935963622 T:C:G T C 10 0.57326948002021 0.482786461758876 ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668228_10668571:KRI1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 10668673 A/G 1 27 25 52 11.5217240394543 14.3317370005053 -2.81001296105092 A:G A G 10 0.57326948002021 0.4839274740643 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10668648_10668736:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668648_10668736:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10668648_10668736:KRI1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 10670184 C/G 1 24 12 36 10.241532479515 6.87923376024252 3.36229871927244 C:G C G 10 0.57326948002021 0.312918993783316 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10670035_10670205:KRI1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 10672493 C/T 1 9 13 22 3.84057467981811 7.45250324026273 -3.61192856044462 T:C C T 10 0.57326948002021 0.134283230160958 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000432197:exon_10672467_10672521:KRI1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 10794630 G/T 1 96 107 203 40.9661299180598 61.3398343621625 -20.3737044441026 T:G G T 10 0.57326948002021 0.00444343987872510 ENSG00000129351:ENST00000336059:exon_10794593_10794652:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000449870:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000318511:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000420083:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000407004:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000250241:exon_10794593_10794646:ILF3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 11105608 T/C 1 21 30 51 8.96134091957559 17.1980844006063 -8.23674348103071 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0230918629983645 ENSG00000127616:ENST00000358026:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000421844:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000429416:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000344626:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000444061:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000450717:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000413806:exon_11105504_11105677:SMARCA4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 11465316 G/C 1 6 14 20 2.56038311987874 8.02577272028294 -5.4653896004042 C:G G C 10 0.57326948002021 0.0213031697059382 ENSG00000183401:ENST00000458408:exon_11465256_11465372:CCDC159;ENSG00000183401:ENST00000427879:exon_11465256_11465374:CCDC159 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 12989560 G/A 1 21 26 47 8.96134091957559 14.9050064805255 -5.94366556094987 A:G G A 10 0.57326948002021 0.103744927528537 ENSG00000105612:ENST00000222219:exon_12989484_12989648:DNASE2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 13008607 G/T 1 20 16 36 8.5346103995958 9.17231168032336 -0.637701280727562 T:G G T 10 0.57326948002021 0.867097715567763 ENSG00000105607:ENST00000457854:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000222214:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000421816:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000422947:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000426001:exon_13008517_13008677:GCDH HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 13054781 G/T 1 508 459 967 216.779104149733 263.130691329276 -46.3515871795431 A:T:G G T 10 0.57326948002021 0.00276821189952372 ENSG00000179218:ENST00000316448:exon_13054527_13055304:CALR HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 13220676 G/A 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 A:G G A 10 0.57326948002021 0.730571677019219 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 13249244 A/G 1 27 27 54 11.5217240394543 15.4782759605457 -3.95655192109134 A:G A G 10 0.57326948002021 0.275375955279130 ENSG00000160877:ENST00000292431:exon_13248961_13251955:NACC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 13883026 G/T 1 18 14 32 7.68114935963622 8.02577272028294 -0.344623360646722 T:G G T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000037757:ENST00000040663:exon_13882935_13885096:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000319545:exon_13882935_13883361:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000445479:exon_13882935_13883361:MRI1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 13883099 A/G 1 14 15 29 5.97422727971706 8.59904220030315 -2.62481492058609 A:G A G 10 0.57326948002021 0.351504521856456 ENSG00000037757:ENST00000040663:exon_13882935_13885096:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000319545:exon_13882935_13883361:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000445479:exon_13882935_13883361:MRI1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 13885309 C/T 1 92 95 187 39.2592078381407 54.46060060192 -15.2013927637793 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0264934273357491 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885257_13885388:C19orf53 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 13885484 A/G 1 401 390 791 171.118938511896 223.575097207882 -52.4561586959861 A:G A G 10 0.57326948002021 0.000182218820977972 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885466_13885521:C19orf53 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 14030689 T/C 1 3 5 8 1.28019155993937 2.86634740010105 -1.58615584016168 T:C T C 10 0.57326948002021 0.29890034016204 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000397486:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14030631_14030764:CC2D1A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 14580328 A/G 1 123 178 301 52.4878539575142 102.041967443597 -49.5541134860832 A:G A G 10 0.57326948002021 1.18335646552128e-08 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14580153_14580329:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14580153_14580329:PKN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 14581063 A/G 1 101 99 200 43.0997825179588 56.7536785220008 -13.653896004042 A:C:G A G 10 0.57326948002021 0.0536418067968912 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14580975_14581117:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14580975_14581117:PKN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 14582539 C/T 1 95 68 163 40.53939939808 38.9823246413743 1.55707475670576 T:C C T 10 0.57326948002021 0.874229404728785 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14582393_14582671:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14582393_14582678:PKN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 14629150 G/A 1 8 12 20 3.41384415983832 6.87923376024252 -3.4653896004042 A:G G A 10 0.57326948002021 0.173354231238589 ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14628951_14629201:DNAJB1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 14682804 G/C 1 78 77 155 33.2849805584236 44.1417499615562 -10.8567694031326 C:G G C 10 0.57326948002021 0.0878974038349826 ENSG00000099795:ENST00000215565:exon_14682701_14682886:NDUFB7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 15226970 G/A 1 23 23 46 9.81480195953517 13.1851980404648 -3.37039608092966 A:G G A 10 0.57326948002021 0.371389870801451 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 15227030 G/A 1 26 23 49 11.0949935194745 13.1851980404648 -2.09020452099029 A:G G A 10 0.57326948002021 0.565790189929858 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 15229993 A/G 1 18 15 33 7.68114935963622 8.59904220030315 -0.917892840666932 A:G A G 10 0.57326948002021 0.860635492003374 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15229977_15230113:ILVBL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 15233581 C/A 1 10 5 15 4.2673051997979 2.86634740010105 1.40095779969685 A:C C A 10 0.57326948002021 0.604487754064262 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15233504_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000531635:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000527093:exon_15233504_15233615:ILVBL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 15234344 G/A 1 3 5 8 1.28019155993937 2.86634740010105 -1.58615584016168 A:G G A 10 0.57326948002021 0.29890034016204 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15234186_15234845:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15234186_15234387:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15234186_15234387:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000269733:exon_15234186_15234387:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000531635:exon_15234186_15234387:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000527093:exon_15234186_15234387:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533747:exon_15234186_15234387:ILVBL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 16238279 C/T 1 17 23 40 7.25441883965643 13.1851980404648 -5.9307792008084 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0773853347122453 ENSG00000167461:ENST00000300935:exon_16238247_16238336:RAB8A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 16314299 C/T 1 1 7 8 0.42673051997979 4.01288636014147 -3.58615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0245816827973848 ENSG00000072958:ENST00000291439:exon_16314270_16314426:AP1M1;ENSG00000072958:ENST00000444449:exon_16314270_16314426:AP1M1;ENSG00000072958:ENST00000429941:exon_16314270_16314426:AP1M1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 17163661 C/T 1 26 18 44 11.0949935194745 10.3188506403638 0.776142879110758 T:C C T 10 0.57326948002021 0.87956576134095 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17163635_17163776:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17163635_17163776:HAUS8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 17170885 C/T 1 8 8 16 3.41384415983832 4.58615584016168 -1.17231168032336 T:C C T 10 0.57326948002021 0.617511810756066 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17170807_17170899:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17170807_17170902:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000335009:exon_17170807_17170902:HAUS8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 17303774 T/G 1 16 8 24 6.82768831967664 4.58615584016168 2.24153247951496 T:G T G 10 0.57326948002021 0.413539465644685 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17303555_17303871:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17303555_17303871:MYO9B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 17305440 T/C 1 15 13 28 6.40095779969685 7.45250324026273 -1.05154544056588 T:C T C 10 0.57326948002021 0.705949684866759 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 17306031 T/C 1 28 26 54 11.9484545594341 14.9050064805255 -2.95655192109134 T:C T C 10 0.57326948002021 0.413469896020095 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 17312992 C/T 1 24 13 37 10.241532479515 7.45250324026273 2.78902923925223 T:C C T 10 0.57326948002021 0.408111022976147 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17312939_17313112:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17312939_17313112:MYO9B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 17316782 T/C 1 20 15 35 8.5346103995958 8.59904220030315 -0.0644318007073519 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17316769_17316961:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17316769_17316961:MYO9B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 17317955 A/G 1 32 30 62 13.6553766393533 17.1980844006063 -3.54270776125302 A:G A G 10 0.57326948002021 0.371433858345876 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17317922_17318053:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17317922_17318053:MYO9B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 17321487 A/G 1 7 8 15 2.98711363985853 4.58615584016168 -1.59904220030315 A:G A G 10 0.57326948002021 0.441591135560738 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 17321669 A/G 1 3 6 9 1.28019155993937 3.43961688012126 -2.15942532018189 A:G A G 10 0.57326948002021 0.183674374674640 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 17337871 A/G 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 A:G A G 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 17337882 C/G 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 C:G C G 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 17339112 G/A 1 22 13 35 9.38807143955538 7.45250324026273 1.93556819929265 A:G G A 10 0.57326948002021 0.609163402904419 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17339065_17339118:OCEL1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 17351535 G/A 1 7 11 18 2.98711363985853 6.30596428022231 -3.31885064036378 A:G G A 10 0.57326948002021 0.151800613284305 ENSG00000160113:ENST00000291442:exon_17351480_17351574:NR2F6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 17631821 G/A 1 115 116 231 49.0740097976758 66.4992596823444 -17.4252498846685 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0235348036382073 ENSG00000130313:ENST00000252603:exon_17631753_17632095:PGLS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 17664418 G/A 1 9 6 15 3.84057467981811 3.43961688012126 0.400957799696849 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17664122_17664647:FAM129C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 17837090 C/T 1 10 11 21 4.2673051997979 6.30596428022231 -2.03865908042441 T:C C T 10 0.57326948002021 0.385389697267756 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 17837425 C/G 1 11 4 15 4.69403571977769 2.29307792008084 2.40095779969685 C:G C G 10 0.57326948002021 0.29761519006674 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 17837512 G/A 1 6 8 14 2.56038311987874 4.58615584016168 -2.02577272028294 A:G G A 10 0.57326948002021 0.291858897104158 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 17885270 A/G 1 7 2 9 2.98711363985853 1.14653896004042 1.84057467981811 A:G A G 10 0.57326948002021 0.31706387914541 ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17885203_17885287:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17885203_17885287:FCHO1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 17885880 C/T 1 7 8 15 2.98711363985853 4.58615584016168 -1.59904220030315 T:C C T 10 0.57326948002021 0.441591135560738 ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17885865_17885889:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17885865_17885889:FCHO1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 17886940 G/A 1 6 8 14 2.56038311987874 4.58615584016168 -2.02577272028294 A:G G A 10 0.57326948002021 0.291858897104158 ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17886792_17886970:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17886792_17886970:FCHO1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 18679379 C/G 1 23 35 58 9.81480195953517 20.0644318007074 -10.2496298411722 C:G C G 10 0.57326948002021 0.0076421315854855 ENSG00000105700:ENST00000222307:exon_18679212_18680176:C19orf50 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 18684563 C/T 1 81 4 85 34.565172118363 2.29307792008084 32.2720941982821 A:T:C C A 10 0.57326948002021 3.36109097790326e-15 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 18685964 G/T 1 3138 2700 5838 1339.08037169658 1547.82759605457 -208.747224357986 A:T:C:G G T 10 0.57326948002021 3.67154738735256e-08 ENSG00000221983:ENST00000430157:exon_18685867_18688269:UBA52;ENSG00000221983:ENST00000442744:exon_18685867_18688269:UBA52 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 19023853 T/C 1 81 96 177 34.565172118363 55.0338700819402 -20.4686979635772 A:T:C T C 10 0.57326948002021 0.00228464514986344 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000351079:exon_19023793_19023855:COPE HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 19243175 C/T 1 8 7 15 3.41384415983832 4.01288636014147 -0.599042200303151 T:C C T 10 0.57326948002021 0.7979049378473 ENSG00000064545:ENST00000162044:exon_19243161_19243317:TMEM161A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 19257383 G/A 1 41 40 81 17.4959513191714 22.9307792008084 -5.43482788163701 A:C:G G A 10 0.57326948002021 0.261169150708260 ENSG00000213999:ENST00000162023:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000409224:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000424583:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000410050:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000414036:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000444486:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000421262:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000409447:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000064489:ENST00000502742:exon_19257364_19257457:AC002126.6;ENSG00000064489:ENST00000354191:exon_19257364_19257457:AC002126.6;ENSG00000064489:ENST00000514819:exon_19257364_19257457:AC002126.6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 19674395 C/T 0 68 0 68 29.0176753586257 0 29.0176753586257 C C 10 0.57326948002021 4.04461089420311e-17 ENSG00000105717:ENST00000251203:exon_19674318_19674424:PBX4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 19675696 C/T 1 13 11 24 5.54749675973727 6.30596428022231 -0.758467520485041 T:C C T 10 0.57326948002021 0.83740962540527 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 21688495 C/T 1 7 8 15 2.98711363985853 4.58615584016168 -1.59904220030315 T:C C T 10 0.57326948002021 0.441591135560738 ENSG00000197013:ENST00000358491:exon_21688437_21688576:ZNF429 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 21719401 T/C 1 3 9 12 1.28019155993937 5.15942532018189 -3.87923376024252 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0369288562011821 ENSG00000197013:ENST00000358491:exon_21719082_21721079:ZNF429 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 30314666 C/T 1 35 15 50 14.9355681992926 8.59904220030315 6.3365259989895 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0855000911721832 ENSG00000105173:ENST00000262643:exon_30314562_30315216:CCNE1;ENSG00000105173:ENST00000357943:exon_30314562_30315216:CCNE1;ENSG00000105173:ENST00000444983:exon_30314562_30315216:CCNE1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 33098632 G/C 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 C:G G C 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33098541_33098738:ANKRD27 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 33106621 C/T 1 2 7 9 0.85346103995958 4.01288636014147 -3.15942532018189 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0433151286077531 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33106564_33106686:ANKRD27 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 33878198 A/G 1 23 25 48 9.81480195953517 14.3317370005053 -4.51693504097008 A:G A G 10 0.57326948002021 0.192316088333029 ENSG00000124299:ENST00000397032:exon_33877865_33878387:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000436370:exon_33877865_33878387:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000244137:exon_33877865_33878387:PEPD HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 33878837 G/A 1 6 10 16 2.56038311987874 5.7326948002021 -3.17231168032336 A:G G A 10 0.57326948002021 0.131350999414970 ENSG00000124299:ENST00000397032:exon_33878796_33878987:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000436370:exon_33878796_33878987:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000244137:exon_33878796_33878987:PEPD HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 35175775 C/T 1 19 10 29 8.10787987961601 5.7326948002021 2.37518507941391 T:C C T 10 0.57326948002021 0.454314630634957 ENSG00000089335:ENST00000457781:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000527499:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505242:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000525595:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000423823:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000221282:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000446502:exon_35175157_35177237:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505365:exon_35175098_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000509196:exon_35175157_35177296:ZNF302 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 35660508 G/A 1 237 190 427 101.13513323521 108.92120120384 -7.78606796862969 A:G G A 10 0.57326948002021 0.463139650484477 ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35660469_35660786:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35660469_35660536:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35660469_35660783:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392217:exon_35660469_35660784:FXYD5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 35836530 G/A 1 147 107 254 62.7293864370291 61.3398343621625 1.38955207486664 A:G G A 10 0.57326948002021 0.899107538328777 ENSG00000012124:ENST00000085219:exon_35836505_35836623:CD22;ENSG00000012124:ENST00000341773:exon_35836505_35836623:CD22;ENSG00000012124:ENST00000419549:exon_35836505_35836623:CD22 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 35837428 G/A 1 9 7 16 3.84057467981811 4.01288636014147 -0.172311680323361 A:G G A 10 0.57326948002021 1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 36142187 C/T 1 279 294 573 119.057815074361 168.541227125942 -49.4834120515804 T:C C T 10 0.57326948002021 3.37270010797698e-05 ENSG00000126267:ENST00000246554:exon_36142135_36142251:COX6B1;ENSG00000126267:ENST00000392201:exon_36142135_36142251:COX6B1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 36224705 A/G 1 8 11 19 3.41384415983832 6.30596428022231 -2.89212012038399 A:T:G A G 10 0.57326948002021 0.245610170938846 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36224664_36224773:AD000671.3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 36230174 T/C 1 71 47 118 30.2978669185651 26.9436655609499 3.35420135761521 T:C T C 10 0.57326948002021 0.577048866825868 ENSG00000126246:ENST00000246532:exon_36230153_36230527:TMEM149;ENSG00000126246:ENST00000344990:exon_36230153_36230527:TMEM149 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 36259494 C/A 1 2 7 9 0.85346103995958 4.01288636014147 -3.15942532018189 A:C C A 10 0.57326948002021 0.0433151286077531 ENSG00000167595:ENST00000396911:exon_36259306_36260077:C19orf55 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 36275074 G/A 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 A:G G A 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000004777:ENST00000314737:exon_36275074_36275219:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000007510:exon_36275074_36275219:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000378944:exon_36275074_36275219:ARHGAP33 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 36278187 G/A 1 6 10 16 2.56038311987874 5.7326948002021 -3.17231168032336 A:G G A 10 0.57326948002021 0.131350999414970 ENSG00000004777:ENST00000314737:exon_36278070_36279724:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000007510:exon_36278070_36279724:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000378944:exon_36278070_36278461:ARHGAP33 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 36594063 C/T 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 T:C C T 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36594058_36594109:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36594058_36594109:WDR62 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 36727365 G/A 1 12 12 24 5.12076623975748 6.87923376024252 -1.75846752048504 A:G G A 10 0.57326948002021 0.537756757259522 ENSG00000167635:ENST00000428827:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000456324:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000443387:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000301233:exon_36726561_36729673:ZNF146 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 37005298 A/G 1 9 11 20 3.84057467981811 6.30596428022231 -2.4653896004042 A:G A G 10 0.57326948002021 0.269322135581906 ENSG00000254004:ENST00000523638:exon_37001597_37006601:ZNF260 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 37854235 G/T 1 26 25 51 11.0949935194745 14.3317370005053 -3.23674348103071 T:G G T 10 0.57326948002021 0.396657800675249 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 38055612 A/T 1 7 4 11 2.98711363985853 2.29307792008084 0.694035719777689 A:T A T 10 0.57326948002021 0.767959695054619 ENSG00000180479:ENST00000328550:exon_38054726_38057193:ZNF571;ENSG00000180479:ENST00000451802:exon_38055156_38057193:ZNF571 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 39219780 T/C 1 149 164 313 63.5828474769887 94.0161947233144 -30.4333472463257 T:C T C 10 0.57326948002021 0.000588663976655932 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000424234:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000440400:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000497637:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000477174:exon_39219636_39219794:ACTN4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 39322087 T/G 1 91 73 164 38.8324773181609 41.8486720414753 -3.01619472331445 T:G T G 10 0.57326948002021 0.636604375238652 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39321949_39322156:ECH1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 39884273 G/C 1 17 18 35 7.25441883965643 10.3188506403638 -3.06443180070735 C:G G C 10 0.57326948002021 0.309302325896262 ENSG00000063322:ENST00000315588:exon_39884193_39884277:MED29;ENSG00000063322:ENST00000435462:exon_39884193_39884277:MED29 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 39908574 C/T 1 8 3 11 3.41384415983832 1.71980844006063 1.69403571977769 T:C C T 10 0.57326948002021 0.372574328023575 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000378550:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000409797:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000478523:exon_39908485_39908745:PLEKHG2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 40030704 C/T 1 7 7 14 2.98711363985853 4.01288636014147 -1.02577272028294 T:C C T 10 0.57326948002021 0.5990458397462 ENSG00000176396:ENST00000390658:exon_40028890_40030870:EID2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 40928944 A/G 1 11 22 33 4.69403571977769 12.6119285604446 -7.91789284066693 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0074073512139065 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 40929363 T/C 1 24 23 47 10.241532479515 13.1851980404648 -2.94366556094987 T:C T C 10 0.57326948002021 0.461261755452396 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 40964312 G/A 1 36 29 65 15.3622987192724 16.6248149205861 -1.26251620131365 A:G G A 10 0.57326948002021 0.80236763074031 ENSG00000090013:ENST00000263368:exon_40964288_40964452:BLVRB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 41082868 T/C 1 11 16 27 4.69403571977769 9.17231168032336 -4.47827596054567 T:C T C 10 0.57326948002021 0.117847361849525 ENSG00000160410:ENST00000291842:exon_41082757_41082891:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000428635:exon_41082790_41082891:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000418276:exon_41082790_41082891:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000446701:exon_41082790_41082891:SHKBP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 41128309 C/T 1 5 4 9 2.13365259989895 2.29307792008084 -0.15942532018189 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000090006:ENST00000204005:exon_41128306_41128572:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000308370:exon_41128306_41128572:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000396819:exon_41128306_41128572:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41128306_41128572:LTBP4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 41313202 C/A 1 3 6 9 1.28019155993937 3.43961688012126 -2.15942532018189 A:C C A 10 0.57326948002021 0.183674374674640 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 44031324 C/T 1 26 20 46 11.0949935194745 11.4653896004042 -0.370396080929662 T:C:G C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000105755:ENST00000292147:exon_44031249_44031396:ETHE1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 44055726 T/C 1 5 8 13 2.13365259989895 4.58615584016168 -2.45250324026273 T:C T C 10 0.57326948002021 0.261241293669647 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44055723_44055839:XRCC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 44057227 T/C 1 22 14 36 9.38807143955538 8.02577272028294 1.36229871927244 T:C T C 10 0.57326948002021 0.737252293683266 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44057134_44057243:XRCC1;ENSG00000073050:ENST00000458471:exon_44057134_44057243:XRCC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 44079120 G/A 1 6 6 12 2.56038311987874 3.43961688012126 -0.879233760242521 A:G G A 10 0.57326948002021 0.771962928640395 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44079062_44079154:XRCC1;ENSG00000073050:ENST00000458471:exon_44079062_44079154:XRCC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 44153100 A/G 1 5 5 10 2.13365259989895 2.86634740010105 -0.732694800202101 A:G A G 10 0.57326948002021 0.752834960365011 ENSG00000011422:ENST00000340093:exon_44152732_44153295:PLAUR;ENSG00000011422:ENST00000221264:exon_44152732_44153295:PLAUR HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 44470147 G/A 1 5 7 12 2.13365259989895 4.01288636014147 -1.87923376024252 A:G G A 10 0.57326948002021 0.382460042999359 ENSG00000159882:ENST00000251269:exon_44469956_44471861:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000322979:exon_44469956_44471752:ZNF230 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 44501518 G/A 1 5 5 10 2.13365259989895 2.86634740010105 -0.732694800202101 A:G G A 10 0.57326948002021 0.752834960365011 ENSG00000204920:ENST00000270014:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000407951:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000425747:exon_44500245_44502477:ZNF155 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 44610798 A/T 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 A:T A T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 44611066 T/C 1 7 7 14 2.98711363985853 4.01288636014147 -1.02577272028294 T:C T C 10 0.57326948002021 0.5990458397462 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 44611957 T/C 1 8 16 24 3.41384415983832 9.17231168032336 -5.75846752048504 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0221343051201857 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 44660967 A/G 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 A:G A G 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000159905:ENST00000426739:exon_44660405_44664462:ZNF234;ENSG00000159905:ENST00000244316:exon_44660405_44664462:ZNF234 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 44739303 T/C 1 4 8 12 1.70692207991916 4.58615584016168 -2.87923376024252 T:C T C 10 0.57326948002021 0.141786607964141 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 44739399 T/C 1 6 4 10 2.56038311987874 2.29307792008084 0.267305199797899 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 45860626 G/C 1 11 8 19 4.69403571977769 4.58615584016168 0.107879879616009 C:G G C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45860528_45860629:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45860528_45860629:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45860528_45860629:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45860528_45860629:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45860528_45860629:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45860528_45860629:ERCC2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 46057081 A/G 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000125741:ENST00000263275:exon_46052412_46057169:OPA3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 46133251 C/T 1 21 12 33 8.96134091957559 6.87923376024252 2.08210715933307 T:C C T 10 0.57326948002021 0.488134134702606 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46133209_46133304:EML2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 46133256 G/A 1 22 11 33 9.38807143955538 6.30596428022231 3.08210715933307 A:G G A 10 0.57326948002021 0.297231884099840 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46133209_46133304:EML2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 46141845 T/C 1 7 6 13 2.98711363985853 3.43961688012126 -0.452503240262731 T:C T C 10 0.57326948002021 0.787569123349065 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46141763_46141892:EML2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 46206262 G/A 1 28 17 45 11.9484545594341 9.74558116034357 2.20287339909055 A:G G A 10 0.57326948002021 0.549435382361426 ENSG00000011478:ENST00000012049:exon_46206162_46206586:QPCTL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 46268902 C/T 1 6 5 11 2.56038311987874 2.86634740010105 -0.305964280222311 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 46275976 G/C 1 17 14 31 7.25441883965643 8.02577272028294 -0.771353880626512 C:G G C 10 0.57326948002021 0.856498190226456 ENSG00000104936:ENST00000458663:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000447742:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000291270:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000377750:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000342805:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000343373:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000348168:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000354227:exon_46275899_46276010:DMPK HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 46332369 C/T 1 14 17 31 5.97422727971706 9.74558116034357 -3.77135388062651 T:C C T 10 0.57326948002021 0.204011615668564 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46332228_46332463:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46332228_46332463:SYMPK HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 46341824 C/T 1 23 21 44 9.81480195953517 12.0386590804244 -2.22385712088924 T:C C T 10 0.57326948002021 0.543383983765855 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46341719_46341873:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46341719_46341873:SYMPK HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 46352122 A/G 1 9 10 19 3.84057467981811 5.7326948002021 -1.89212012038399 A:G A G 10 0.57326948002021 0.487623161721597 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46352008_46352134:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46352008_46352134:SYMPK HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 47223949 G/A 1 18 14 32 7.68114935963622 8.02577272028294 -0.344623360646722 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000090372:ENST00000391910:exon_47223793_47224028:STRN4;ENSG00000090372:ENST00000263280:exon_47223793_47224028:STRN4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 47770032 C/T 1 25 23 48 10.6682629994947 13.1851980404648 -2.51693504097008 T:C C T 10 0.57326948002021 0.469311949283943 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47769868_47770049:CCDC9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 47773647 C/T 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 T:C C T 10 0.57326948002021 1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 47978671 G/A 1 4 6 10 1.70692207991916 3.43961688012126 -1.7326948002021 A:G G A 10 0.57326948002021 0.342315301618549 ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47978400_47978801:KPTN HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 48255804 A/G 1 146 166 312 62.3026559170493 95.1627336833549 -32.8600777663055 A:C:G A G 10 0.57326948002021 0.000192093040140875 ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48255769_48255864:GLTSCR2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 48715153 T/C 1 6 7 13 2.56038311987874 4.01288636014147 -1.45250324026273 T:C T C 10 0.57326948002021 0.418185809776403 ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48711361_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48711513_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000377461:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518979:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520753:exon_48713744_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000357778:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48714047_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48714409_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520015:exon_48714634_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48714823_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48715084_48715232:CARD8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 48722180 C/T 1 7 5 12 2.98711363985853 2.86634740010105 0.120766239757479 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000105483:ENST00000518450:exon_48722128_48722210:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000517510:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48722128_48722269:CARD8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 48836673 G/T 1 3 5 8 1.28019155993937 2.86634740010105 -1.58615584016168 T:G G T 10 0.57326948002021 0.29890034016204 ENSG00000161558:ENST00000435956:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000377431:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000436660:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000293261:exon_48835613_48836690:TMEM143 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 49377086 T/C 1 106 90 196 45.2334351178577 51.5942532018189 -6.36081808396116 T:C T C 10 0.57326948002021 0.386284501041525 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 49377242 G/C 1 131 95 226 55.9016981173525 54.46060060192 1.44109751543252 C:G G C 10 0.57326948002021 0.893067232012878 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 49377424 G/A 1 57 57 114 24.323639638848 32.676360361152 -8.35272072230394 A:G G A 10 0.57326948002021 0.129519240244538 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 49377873 G/A 1 165 139 304 70.4105357966653 79.6844577228092 -9.27392192614386 A:C:G G A 10 0.57326948002021 0.296732674621099 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 49377918 G/T 1 169 134 303 72.1174578765845 76.8181103227082 -4.70065244612366 T:C:G G T 10 0.57326948002021 0.601394280647244 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 49407660 G/A 1 30 32 62 12.8019155993937 18.3446233606467 -5.54270776125302 A:G G A 10 0.57326948002021 0.159826287792324 ENSG00000104805:ENST00000405315:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000407032:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000452087:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000443560:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000411700:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000451312:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000263273:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000424608:exon_49407604_49407711:NUCB1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 49459554 C/T 1 131 96 227 55.9016981173525 55.0338700819402 0.867828035412316 A:T:C C T 10 0.57326948002021 0.946542938436935 ENSG00000087088:ENST00000502487:exon_49459455_49459590:BAX;ENSG00000087088:ENST00000345358:exon_49459455_49459590:BAX;ENSG00000087088:ENST00000391871:exon_49459455_49459590:BAX;ENSG00000087088:ENST00000513545:exon_49459455_49459590:BAX;ENSG00000087088:ENST00000515540:exon_49459455_49459573:BAX;ENSG00000087088:ENST00000356483:exon_49459455_49459590:BAX;ENSG00000087088:ENST00000415969:exon_49459455_49459590:BAX;ENSG00000087088:ENST00000354470:exon_49459455_49459590:BAX;ENSG00000087088:ENST00000506183:exon_49459455_49459590:BAX;ENSG00000087088:ENST00000293288:exon_49459455_49459590:BAX;ENSG00000087088:ENST00000503726:exon_49459455_49459590:BAX;ENSG00000087088:ENST00000513217:exon_49459110_49459590:BAX;ENSG00000087088:ENST00000507757:exon_49459501_49459590:BAX HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 49469087 T/C 1 1604 1686 3290 684.475754047583 966.532343314074 -282.056589266491 T:C T C 10 0.57326948002021 5.27593271283923e-23 ENSG00000087086:ENST00000331825:exon_49469027_49469173:FTL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 49481243 T/C 1 10 7 17 4.2673051997979 4.01288636014147 0.254418839656429 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000104812:ENST00000323798:exon_49481181_49481259:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000263276:exon_49481181_49481259:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000472004:exon_49481181_49481243:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000496048:exon_49481181_49481259:GYS1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 49513273 C/T 1 85 105 190 36.2720941982821 60.1932954021221 -23.9212012038399 T:C C T 10 0.57326948002021 0.000538632690235099 ENSG00000183207:ENST00000221413:exon_49513230_49513323:RUVBL2;ENSG00000183207:ENST00000413176:exon_49513230_49513428:RUVBL2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 49838891 C/A 1 10 4 14 4.2673051997979 2.29307792008084 1.97422727971706 A:C C A 10 0.57326948002021 0.419102837465114 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 49839015 T/C 1 278 237 515 118.631084554382 135.86486676479 -17.2337822104082 T:C T C 10 0.57326948002021 0.129888152234303 ENSG00000104894:ENST00000323906:exon_49838971_49839043:CD37;ENSG00000104894:ENST00000391859:exon_49838971_49839043:CD37;ENSG00000104894:ENST00000426897:exon_49838971_49839043:CD37 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 49841203 G/A 1 179 154 333 76.3847630763824 88.2834999231123 -11.8987368467299 A:G G A 10 0.57326948002021 0.202541267462916 ENSG00000104894:ENST00000323906:exon_49841182_49841286:CD37;ENSG00000104894:ENST00000426897:exon_49841182_49841286:CD37 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 49950690 G/A 1 83 65 148 35.4186331583226 37.2625162013137 -1.84388304299109 A:G G A 10 0.57326948002021 0.803248794461329 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49950595_49950724:PIH1D1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 50059982 C/G 1 75 69 144 32.0047889984842 39.5555941213945 -7.55080512291025 C:G C G 10 0.57326948002021 0.207281901765369 ENSG00000142546:ENST00000339093:exon_50059806_50059993:NOSIP;ENSG00000142546:ENST00000391853:exon_50059806_50059993:NOSIP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 50140092 G/A 1 6 4 10 2.56038311987874 2.29307792008084 0.267305199797899 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000126458:ENST00000246792:exon_50140081_50140183:RRAS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 50162909 C/G 1 138 143 281 58.888811757211 81.97753564289 -23.088723885679 C:G C G 10 0.57326948002021 0.00654609778408542 ENSG00000126456:ENST00000377139:exon_50162829_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000377135:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000309877:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000442265:exon_50162830_50163090:IRF3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 50302713 C/T 1 16 9 25 6.82768831967664 5.15942532018189 1.66826299949475 T:C C T 10 0.57326948002021 0.550023905237784 ENSG00000196961:ENST00000354293:exon_50302584_50302752:AP2A1;ENSG00000196961:ENST00000359032:exon_50302584_50302752:AP2A1;ENSG00000196961:ENST00000456192:exon_50302584_50302752:AP2A1;ENSG00000196961:ENST00000413690:exon_50302584_50302752:AP2A1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 50321858 G/A 1 9 4 13 3.84057467981811 2.29307792008084 1.54749675973727 A:G G A 10 0.57326948002021 0.576729970937834 ENSG00000104973:ENST00000355584:exon_50321828_50321873:MED25;ENSG00000104973:ENST00000377077:exon_50321828_50321873:MED25;ENSG00000104973:ENST00000312881:exon_50321828_50321873:MED25;ENSG00000104973:ENST00000456294:exon_50321828_50321873:MED25;ENSG00000104973:ENST00000312865:exon_50321828_50321873:MED25 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 50360989 A/G 1 45 34 79 19.2028733990905 19.4911623206871 -0.288288921596592 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000104960:ENST00000221557:exon_50360950_50361039:PTOV1;ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50360950_50361039:PTOV1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 50361353 C/T 1 66 74 140 28.1642143186661 42.4219415214955 -14.2577272028294 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0165782931599556 ENSG00000104960:ENST00000221557:exon_50361314_50361371:PTOV1;ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50361314_50361371:PTOV1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 50364929 G/C 1 13 13 26 5.54749675973727 7.45250324026273 -1.90500648052546 C:G G C 10 0.57326948002021 0.552801604096124 ENSG00000039650:ENST00000322344:exon_50364865_50364952:PNKP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 50393269 A/G 1 451 152 603 192.455464510885 87.1369609630719 105.318503547813 A:G A G 10 0.57326948002021 5.25351521193368e-19 ENSG00000104951:ENST00000341114:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000391826:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000319225:exon_50392917_50393857:IL4I1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 50436371 G/A 1 1208 257 1465 515.490468135586 147.330256365194 368.160211770392 A:G G A 10 0.57326948002021 1.92725961612660e-93 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 50905151 G/A 1 1 9 10 0.42673051997979 5.15942532018189 -4.7326948002021 A:G G A 10 0.57326948002021 0.00289017099563971 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50905035_50905181:POLD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 50983930 C/T 1 34 31 65 14.5088376793129 17.7713538806265 -3.26251620131366 T:C C T 10 0.57326948002021 0.452505874248582 ENSG00000161671:ENST00000430752:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376920:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000334976:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376918:exon_50983838_50984019:C19orf63 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 51323232 T/C 1 102 80 182 43.5265130379386 45.8615584016168 -2.33504536367823 T:C T C 10 0.57326948002021 0.764488234674931 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323155_51323291:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323155_51323291:KLK1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 51323473 C/G 1 48 58 106 20.4830649590299 33.2496298411722 -12.7665648821423 C:G C G 10 0.57326948002021 0.0138800619560315 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 51323501 A/G 1 53 54 107 22.6167175589289 30.9565519210913 -8.33983436216247 A:G A G 10 0.57326948002021 0.117599548128923 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 52471872 A/G 1 6 18 24 2.56038311987874 10.3188506403638 -7.75846752048504 A:G A G 10 0.57326948002021 0.00162500705093829 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52471831_52471926:ZNF615 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 52519608 C/T 1 5 4 9 2.13365259989895 2.29307792008084 -0.15942532018189 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000142556:ENST00000270649:exon_52516577_52520612:ZNF614 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 53085659 C/T 1 8 9 17 3.41384415983832 5.15942532018189 -1.74558116034357 T:C C T 10 0.57326948002021 0.464916768474155 ENSG00000167562:ENST00000301093:exon_53085455_53088049:ZNF701;ENSG00000167562:ENST00000391786:exon_53085455_53085751:ZNF701;ENSG00000167562:ENST00000391785:exon_53085455_53088049:ZNF701 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 54697079 C/T 1 23 25 48 9.81480195953517 14.3317370005053 -4.51693504097008 T:C C T 10 0.57326948002021 0.192316088333029 ENSG00000170892:ENST00000302937:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000496583:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396383:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396388:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000429671:exon_54697030_54697173:TSEN34 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 54711258 T/G 1 49 96 145 20.9097954790097 55.0338700819402 -34.1240746029305 T:G T G 10 0.57326948002021 1.65332240699207e-08 ENSG00000170889:ENST00000402367:exon_54710421_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000441429:exon_54710144_54711498:RPS9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 54965860 G/A 1 19 15 34 8.10787987961601 8.59904220030315 -0.491162320687142 A:G G A 10 0.57326948002021 0.864181187644753 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54965609_54965861:LENG8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 54966579 C/G 1 12 19 31 5.12076623975748 10.892120120384 -5.77135388062651 C:G C G 10 0.57326948002021 0.0448672635242156 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54966543_54966622:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54966543_54966746:LENG8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 55143083 T/C 1 9 17 26 3.84057467981811 9.74558116034357 -5.90500648052546 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0273604369369939 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55142951_55143238:LILRB1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 55148331 C/T 1 48 17 65 20.4830649590299 9.74558116034357 10.7374837986863 T:C C T 10 0.57326948002021 0.00799345258242662 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55148183_55148470:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55148183_55148470:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55148183_55148641:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000462628:exon_55148183_55148979:LILRB1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 55494881 C/G 0 0 23 23 0 13.1851980404648 -13.1851980404648 G C G 10 0.57326948002021 3.11555350021115e-09 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 55512137 C/A 0 0 88 88 0 50.4477142417785 -50.4477142417785 A C A 10 0.57326948002021 2.84135850447239e-33 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 55512232 C/A 0 0 65 65 0 37.2625162013137 -37.2625162013137 A C A 10 0.57326948002021 9.11991562423762e-25 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 55512316 T/G 1 1 94 95 0.42673051997979 53.8873311218997 -53.46060060192 T:G T G 10 0.57326948002021 9.41716927778381e-34 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 55614923 T/C 1 5 14 19 2.13365259989895 8.02577272028294 -5.89212012038399 T:C T C 10 0.57326948002021 0.00903562790233332 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55614777_55614936:PPP1R12C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 55738746 G/A 1 5 6 11 2.13365259989895 3.43961688012126 -1.30596428022231 A:G G A 10 0.57326948002021 0.545300564874909 ENSG00000180089:ENST00000327042:exon_55738116_55738931:TMEM86B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 55739605 C/T 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000180089:ENST00000327042:exon_55739559_55739805:TMEM86B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 55756980 A/G 1 7 13 20 2.98711363985853 7.45250324026273 -4.4653896004042 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0677059243274011 ENSG00000105063:ENST00000443936:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000327021:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000412770:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000444538:exon_55756860_55757046:PPP6R1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 55995272 G/A 1 16 15 31 6.82768831967664 8.59904220030315 -1.77135388062651 A:G G A 10 0.57326948002021 0.587256026041615 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 56160735 G/A 1 9 5 14 3.84057467981811 2.86634740010105 0.974227279717059 A:G G A 10 0.57326948002021 0.788481610276296 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 56392920 C/T 1 11 1 12 4.69403571977769 0.57326948002021 4.12076623975748 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0174805184170179 ENSG00000160505:ENST00000301295:exon_56392836_56393218:NLRP4;ENSG00000160505:ENST00000346986:exon_56392836_56393218:NLRP4;ENSG00000160505:ENST00000419009:exon_56392836_56393218:NLRP4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 58018618 A/G 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000152439:ENST00000282292:exon_58017726_58019508:ZNF773;ENSG00000152439:ENST00000430084:exon_58017726_58019508:ZNF773 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 58152795 C/T 1 4 10 14 1.70692207991916 5.7326948002021 -4.02577272028294 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0543340383697456 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 58152817 G/C 1 6 10 16 2.56038311987874 5.7326948002021 -3.17231168032336 C:G G C 10 0.57326948002021 0.131350999414970 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 58153000 T/C 1 12 7 19 5.12076623975748 4.01288636014147 1.10787987961601 T:C T C 10 0.57326948002021 0.651195141393552 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 58153009 C/T 1 12 7 19 5.12076623975748 4.01288636014147 1.10787987961601 T:C C T 10 0.57326948002021 0.651195141393552 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 58153577 T/C 1 4 6 10 1.70692207991916 3.43961688012126 -1.7326948002021 T:C T C 10 0.57326948002021 0.342315301618549 ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 58596449 C/T 1 9 8 17 3.84057467981811 4.58615584016168 -0.745581160343571 T:C C T 10 0.57326948002021 0.807894812450834 ENSG00000176293:ENST00000515535:exon_58595587_58597677:ZNF135;ENSG00000121413:ENST00000240727:exon_58595210_58596746:ZSCAN18;ENSG00000121413:ENST00000433686:exon_58595212_58596746:ZSCAN18;ENSG00000121413:ENST00000402070:exon_58595212_58596746:ZSCAN18;ENSG00000121413:ENST00000421612:exon_58595212_58596743:ZSCAN18 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 58718247 T/C 1 8 2 10 3.41384415983832 1.14653896004042 2.2673051997979 T:C T C 10 0.57326948002021 0.205360643158888 ENSG00000171606:ENST00000326804:exon_58718087_58718568:ZNF274;ENSG00000171606:ENST00000424679:exon_58718087_58718361:ZNF274;ENSG00000171606:ENST00000345813:exon_58718087_58718361:ZNF274 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 59010593 A/G 1 8 5 13 3.41384415983832 2.86634740010105 0.547496759737269 A:G A G 10 0.57326948002021 1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 59061357 C/T 1 228 229 457 97.2945585553921 131.278710924628 -33.984152369236 T:C C T 10 0.57326948002021 0.00150757866223140 ENSG00000130726:ENST00000341753:exon_59061316_59061402:TRIM28;ENSG00000130726:ENST00000253024:exon_59061316_59061402:TRIM28 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 59073613 A/G 1 13 17 30 5.54749675973727 9.74558116034357 -4.1980844006063 A:G A G 10 0.57326948002021 0.140525503500616 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 59074429 C/T 1 14 6 20 5.97422727971706 3.43961688012126 2.5346103995958 T:C C T 10 0.57326948002021 0.36622341140112 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 19 59074653 T/C 1 6 5 11 2.56038311987874 2.86634740010105 -0.305964280222311 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 272203 C/T 1 10 8 18 4.2673051997979 4.58615584016168 -0.318850640363781 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000407983:exon_272037_272557:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000439645:exon_272192_272630:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405364:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405233:exon_272192_273155:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_272192_272305:ACP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 277003 A/G 1 83 80 163 35.4186331583226 45.8615584016168 -10.4429252432942 A:G A G 10 0.57326948002021 0.112989078332976 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000442386:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000484464:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000463831:exon_276980_277085:ACP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 3469463 G/C 1 24 22 46 10.241532479515 12.6119285604446 -2.37039608092966 C:G G C 10 0.57326948002021 0.551532028814459 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469147:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000433382:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000479897:exon_3469368_3469578:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000473348:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000461577:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000489032:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000437733:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3469444_3469479:TTC15 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 3483181 C/T 1 53 80 133 22.6167175589289 45.8615584016168 -23.2448408426879 T:C C T 10 0.57326948002021 6.81332256522014e-05 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3482990_3483342:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469400:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000493792:exon_3482990_3483336:TTC15 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 3597974 T/C 1 12 8 20 5.12076623975748 4.58615584016168 0.534610399595799 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000171865:ENST00000436842:exon_3597963_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000315212:exon_3597963_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000464986:exon_3597714_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000454734:exon_3597964_3598062:RNASEH1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 10262920 T/G 1 16 15 31 6.82768831967664 8.59904220030315 -1.77135388062651 T:G T G 10 0.57326948002021 0.587256026041615 ENSG00000171848:ENST00000304567:exon_10262455_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000360566:exon_10262455_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000459969:exon_10262839_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000461327:exon_10262866_10263184:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000498343:exon_10262866_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000463887:exon_10262866_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000491447:exon_10262879_10263024:RRM2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 10717806 C/T 1 31 17 48 13.2286461193735 9.74558116034357 3.48306495902992 T:C C T 10 0.57326948002021 0.381556433168928 ENSG00000115761:ENST00000345985:exon_10717762_10717864:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000381685:exon_10717762_10717864:NOL10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 10930903 T/C 1 52 32 84 22.1899870389491 18.3446233606467 3.84536367830236 T:C:G T C 10 0.57326948002021 0.440710776406218 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10930845_10930959:PDIA6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 10933249 C/T 1 31 34 65 13.2286461193735 19.4911623206871 -6.26251620131365 T:C C T 10 0.57326948002021 0.132311825913794 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10933222_10933328:PDIA6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 20838318 G/A 1 6 8 14 2.56038311987874 4.58615584016168 -2.02577272028294 A:G G A 10 0.57326948002021 0.291858897104158 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000237821:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000402541:exon_20834476_20838412:HS1BP3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 25046090 T/C 1 14 24 38 5.97422727971706 13.758467520485 -7.78424024076798 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0132271482547016 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000485887:exon_25046078_25046232:ADCY3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 25050977 T/C 1 3 6 9 1.28019155993937 3.43961688012126 -2.15942532018189 T:C T C 10 0.57326948002021 0.183674374674640 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000455323:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000450524:exon_25050771_25051030:ADCY3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 25384169 G/A 1 11 1 12 4.69403571977769 0.57326948002021 4.12076623975748 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0174805184170179 ENSG00000115138:ENST00000380794:exon_25383722_25384621:POMC;ENSG00000115138:ENST00000405623:exon_25383784_25384621:POMC;ENSG00000115138:ENST00000264708:exon_25383854_25384621:POMC;ENSG00000115138:ENST00000395826:exon_25383922_25384621:POMC;ENSG00000115138:ENST00000449220:exon_25384015_25384621:POMC HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 27438519 A/G 1 83 76 159 35.4186331583226 43.568480481536 -8.1498473232134 A:G A G 10 0.57326948002021 0.199989791904941 ENSG00000138085:ENST00000380171:exon_27438500_27438621:C2orf28;ENSG00000138085:ENST00000405489:exon_27438500_27438621:C2orf28;ENSG00000138085:ENST00000419744:exon_27438500_27438534:C2orf28 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 27672200 C/T 1 5 6 11 2.13365259989895 3.43961688012126 -1.30596428022231 T:C C T 10 0.57326948002021 0.545300564874909 ENSG00000138002:ENST00000260570:exon_27672161_27672247:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000509128:exon_27672161_27672247:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000507184:exon_27672161_27672247:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000425023:exon_27672161_27672247:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000450564:exon_27672161_27672247:IFT172 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 27887034 C/A 1 7 4 11 2.98711363985853 2.29307792008084 0.694035719777689 A:C C A 10 0.57326948002021 0.767959695054619 ENSG00000163798:ENST00000326019:exon_27886338_27887444:SLC4A1AP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 29001691 A/G 1 8 4 12 3.41384415983832 2.29307792008084 1.12076623975748 A:G A G 10 0.57326948002021 0.573925568669172 ENSG00000213639:ENST00000455580:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000420282:exon_29001675_29001865:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000441461:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000427786:exon_29001675_29001797:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000358506:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000395367:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000296122:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000395366:exon_29001675_29001905:PPP1CB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 29092679 T/C 1 9 11 20 3.84057467981811 6.30596428022231 -2.4653896004042 T:C T C 10 0.57326948002021 0.269322135581906 ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29092445_29093167:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29092445_29093161:TRMT61B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 29092850 G/T 1 4 8 12 1.70692207991916 4.58615584016168 -2.87923376024252 T:G G T 10 0.57326948002021 0.141786607964141 ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29092445_29093167:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29092445_29093161:TRMT61B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 29129418 A/G 1 7 4 11 2.98711363985853 2.29307792008084 0.694035719777689 A:G A G 10 0.57326948002021 0.767959695054619 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29129326_29129447:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000440983:exon_29129326_29129447:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000296126:exon_29129326_29129447:WDR43 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 29152456 A/G 1 13 17 30 5.54749675973727 9.74558116034357 -4.1980844006063 A:G A G 10 0.57326948002021 0.140525503500616 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29152445_29152576:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000466067:exon_29152445_29152576:WDR43 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 29404441 G/A 1 12 7 19 5.12076623975748 4.01288636014147 1.10787987961601 A:G G A 10 0.57326948002021 0.651195141393552 ENSG00000115295:ENST00000401617:exon_29404438_29404563:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000404424:exon_29404438_29404789:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000402240:exon_29404438_29404789:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000320081:exon_29404438_29406679:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000530644:exon_29404438_29406679:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000379543:exon_29404438_29406678:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000450018:exon_29404438_29404563:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000481628:exon_29404438_29404624:CLIP4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 30381505 T/C 1 20 15 35 8.5346103995958 8.59904220030315 -0.0644318007073519 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000119801:ENST00000379520:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000379519:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470653:exon_30381296_30381739:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000261353:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000493029:exon_30381374_30381856:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402003:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000408026:exon_30381485_30382422:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402708:exon_30381485_30382417:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470120:exon_30381485_30381832:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000492439:exon_30381485_30381613:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000495673:exon_30381485_30382004:YPEL5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 32800422 C/G 1 8 6 14 3.41384415983832 3.43961688012126 -0.0257727202829408 C:G C G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32800223_32800433:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32800223_32800433:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000471232:exon_32800223_32800433:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000470250:exon_32800358_32800433:BIRC6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 33759395 C/T 1 8 8 16 3.41384415983832 4.58615584016168 -1.17231168032336 T:C C T 10 0.57326948002021 0.617511810756066 ENSG00000152689:ENST00000402538:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000337416:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000403687:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000407811:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000490150:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000419772:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000468856:exon_33756792_33759467:RASGRP3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 33764176 A/G 1 17 11 28 7.25441883965643 6.30596428022231 0.948454559434118 A:G A G 10 0.57326948002021 0.849071983987724 ENSG00000152689:ENST00000402538:exon_33764161_33764277:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000337416:exon_33764161_33764277:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000403687:exon_33764161_33764277:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000407811:exon_33764164_33764277:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000490150:exon_33764161_33764416:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000419772:exon_33764161_33764390:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000468856:exon_33764161_33765248:RASGRP3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 37438993 G/A 1 58 54 112 24.7503701588278 30.9565519210913 -6.20618176226353 A:G G A 10 0.57326948002021 0.252089591543327 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37438986_37439182:CEBPZ;ENSG00000115816:ENST00000489306:exon_37438986_37439251:CEBPZ HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 37458711 G/A 1 11 6 17 4.69403571977769 3.43961688012126 1.25441883965643 A:G G A 10 0.57326948002021 0.629145660806696 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37458555_37458856:CEBPZ HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 37494591 A/G 1 7 6 13 2.98711363985853 3.43961688012126 -0.452503240262731 A:G A G 10 0.57326948002021 0.787569123349065 ENSG00000115825:ENST00000379066:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000234179:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000469275:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000452104:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000443977:exon_37494573_37494679:PRKD3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 39082344 T/C 1 7 3 10 2.98711363985853 1.71980844006063 1.2673051997979 T:C T C 10 0.57326948002021 0.532053210294076 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39082199_39082394:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39081196_39082394:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39082199_39082417:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000474104:exon_39080187_39082394:DHX57 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 42556935 A/G 1 4 6 10 1.70692207991916 3.43961688012126 -1.7326948002021 A:G A G 10 0.57326948002021 0.342315301618549 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42556874_42559688:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42556874_42559688:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42556874_42557884:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42556874_42558014:EML4;ENSG00000143924:ENST00000440432:exon_42556874_42557423:EML4;ENSG00000143924:ENST00000406175:exon_42556874_42559688:EML4;ENSG00000143924:ENST00000453191:exon_42556874_42557423:EML4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 43452618 C/T 1 4 6 10 1.70692207991916 3.43961688012126 -1.7326948002021 T:C C T 10 0.57326948002021 0.342315301618549 ENSG00000152518:ENST00000282388:exon_43449541_43452891:ZFP36L2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 44036913 T/C 1 17 12 29 7.25441883965643 6.87923376024252 0.375185079413908 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 44123758 G/A 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 A:G G A 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000138095:ENST00000472420:exon_44123376_44123847:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000483489:exon_44123583_44123847:LRPPRC HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 44201376 T/C 1 7 5 12 2.98711363985853 2.86634740010105 0.120766239757479 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000138095:ENST00000260665:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409946:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409659:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000447246:exon_44201289_44201434:LRPPRC HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 54858511 C/T 1 5 12 17 2.13365259989895 6.87923376024252 -4.74558116034357 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0259019095214919 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54857992_54858748:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54857992_54858748:SPTBN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 54886347 G/A 1 10 18 28 4.2673051997979 10.3188506403638 -6.05154544056588 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0335868906291596 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000496323:exon_54886291_54886403:SPTBN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 55883317 G/T 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 T:G G T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415489:exon_55883266_55883355:PNPT1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 58276070 T/C 1 18 14 32 7.68114935963622 8.02577272028294 -0.344623360646722 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000028116:ENST00000435505:exon_58275962_58276102:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000417641:exon_58275962_58276102:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000412104:exon_58275962_58276102:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000423109:exon_58275962_58276102:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000394539:exon_58275962_58276102:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000437272:exon_58275962_58276102:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000340157:exon_58275962_58276102:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000432057:exon_58275962_58276102:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000440705:exon_58276016_58276102:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000428021:exon_58275962_58276102:VRK2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 64327544 G/T 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 T:G G T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000197329:ENST00000358912:exon_64327532_64327633:PELI1;ENSG00000197329:ENST00000466177:exon_64327532_64327633:PELI1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 65245365 G/A 1 9 7 16 3.84057467981811 4.01288636014147 -0.172311680323361 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65245205_65245399:SLC1A4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 65296798 G/A 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 A:G G A 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65296533_65296935:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000260569:exon_65296533_65296935:CEP68 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 65301548 G/A 1 5 10 15 2.13365259989895 5.7326948002021 -3.59904220030315 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0702450866322387 ENSG00000011523:ENST00000497039:exon_65301416_65301618:CEP68 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 67631831 G/A 1 9 12 21 3.84057467981811 6.87923376024252 -3.03865908042441 A:G G A 10 0.57326948002021 0.192086447359513 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 68361859 C/T 1 8 7 15 3.41384415983832 4.01288636014147 -0.599042200303151 T:C C T 10 0.57326948002021 0.7979049378473 ENSG00000243667:ENST00000492039:exon_68361834_68361931:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295122:exon_68361834_68361931:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295121:exon_68361834_68361931:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000457114:exon_68361834_68361931:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000406245:exon_68361216_68361931:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000409164:exon_68361222_68361931:WDR92;ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68361834_68361931:PPP3R1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 68364535 T/C 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 T:C T C 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000243667:ENST00000492039:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295122:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295121:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000457114:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000406245:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000409164:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68364431_68364565:PPP3R1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 68607947 G/T 1 22 20 42 9.38807143955538 11.4653896004042 -2.07731816084882 T:G G T 10 0.57326948002021 0.535628514064652 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68607855_68608036:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68607855_68608036:PLEK HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 68613710 G/A 1 12 9 21 5.12076623975748 5.15942532018189 -0.0386590804244111 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68613634_68613818:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68613634_68613818:PLEK HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 68622952 G/C 1 78 77 155 33.2849805584236 44.1417499615562 -10.8567694031326 C:G G C 10 0.57326948002021 0.0878974038349826 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 71305456 C/T 1 78 41 119 33.2849805584236 23.5040486808286 9.780931877595 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0780570716933023 ENSG00000124357:ENST00000455662:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000244204:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000418807:exon_71305448_71306935:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443872:exon_71305448_71305715:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443938:exon_71305448_71305771:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000450272:exon_71305448_71305743:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000475709:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000472519:exon_71305448_71305750:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000489309:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524537:exon_71305448_71305763:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000490998:exon_71305448_71305769:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000468601:exon_71305448_71305484:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000498022:exon_71305448_71305765:NAGK HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 71351403 C/A 1 2 7 9 0.85346103995958 4.01288636014147 -3.15942532018189 A:C C A 10 0.57326948002021 0.0433151286077531 ENSG00000124370:ENST00000244217:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000466481:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000486135:exon_71351336_71351673:MCEE HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 71360282 G/A 1 16 11 27 6.82768831967664 6.30596428022231 0.521724039454329 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 71366957 C/A 1 24 15 39 10.241532479515 8.59904220030315 1.64249027921181 A:C C A 10 0.57326948002021 0.630966343038844 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71366925_71366992:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71366925_71366992:MPHOSPH10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 71654175 G/A 1 24 32 56 10.241532479515 18.3446233606467 -8.10309088113176 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0308815626438086 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71653980_71654544:ZNF638 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 73477527 C/T 1 150 123 273 64.0095779969685 70.5121460424858 -6.50256804551735 T:C C T 10 0.57326948002021 0.427097787778686 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73477434_73477566:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73477434_73477566:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73477434_73477566:CCT7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 73957124 A/G 1 11 21 32 4.69403571977769 12.0386590804244 -7.34462336064672 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0114063207896947 ENSG00000144034:ENST00000272424:exon_73956957_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000495950:exon_73957012_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000485758:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000409716:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000318190:exon_73957017_73957156:TPRKB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 74185876 A/T 1 173 160 333 73.8243799565037 91.7231168032336 -17.8987368467299 A:T A T 10 0.57326948002021 0.0523602219668738 ENSG00000114956:ENST00000264093:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000348222:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000418996:exon_74185837_74186073:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000356837:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000440532:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000347161:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000448982:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000462685:exon_74185837_74185915:DGUOK HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 74690039 G/A 1 24 16 40 10.241532479515 9.17231168032336 1.0692207991916 A:G G A 10 0.57326948002021 0.873249991689135 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74688184_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74688185_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000409065:exon_74688196_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74688197_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74689123_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74689902_74690139:MOGS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 74690378 C/T 1 19 21 40 8.10787987961601 12.0386590804244 -3.9307792008084 T:C C T 10 0.57326948002021 0.262881037202777 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74690317_74690773:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000489655:exon_74690317_74690764:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000414701:exon_74690317_74690513:MOGS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 74699778 C/A 1 93 70 163 39.6859383581205 40.1288636014147 -0.442925243294241 A:C C A 10 0.57326948002021 0.93710201055799 ENSG00000204822:ENST00000258105:exon_74699696_74700449:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000409710:exon_74699696_74699814:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000468875:exon_74699696_74699791:MRPL53;ENSG00000135637:ENST00000454193:exon_74699696_74699923:CCDC142 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 74784207 A/C 1 79 91 170 33.7117110784034 52.1675226818391 -18.4558116034357 A:C A C 10 0.57326948002021 0.00510983024227866 ENSG00000115325:ENST00000409429:exon_74783435_74784663:DOK1;ENSG00000115325:ENST00000233668:exon_74783435_74784681:DOK1;ENSG00000115325:ENST00000340004:exon_74783435_74784678:DOK1;ENSG00000115325:ENST00000489958:exon_74783435_74784312:DOK1;ENSG00000115325:ENST00000480318:exon_74783435_74784241:DOK1;ENSG00000115325:ENST00000464613:exon_74783435_74784640:DOK1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 75113657 C/T 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75113617_75113800:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75113617_75113800:HK2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 75915035 C/T 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 T:C:G C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75914953_75915103:C2orf3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 89160049 T/C 1 20 1 21 8.5346103995958 0.57326948002021 7.96134091957559 T:C T C 10 0.57326948002021 0.000202266259275464 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 89160080 G/A 1 45 2 47 19.2028733990905 1.14653896004042 18.0563344390501 A:G G A 10 0.57326948002021 5.1389833199825e-09 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 89160102 T/C 1 11 15 26 4.69403571977769 8.59904220030315 -3.90500648052546 T:C T C 10 0.57326948002021 0.163967486410313 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 89160112 G/A 0 9 0 9 3.84057467981811 0 3.84057467981811 G G 10 0.57326948002021 0.0128294351955714 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 89160129 C/G 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 C:G C G 10 0.57326948002021 1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 89160133 A/T 0 8 0 8 3.41384415983832 0 3.41384415983832 A A 10 0.57326948002021 0.0127642064234436 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 97019936 G/A 1 5 5 10 2.13365259989895 2.86634740010105 -0.732694800202101 A:G G A 10 0.57326948002021 0.752834960365011 ENSG00000121152:ENST00000240423:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000427946:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000477409:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435975:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000455200:exon_97019921_97020126:NCAPH HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 99804642 T/C 1 14 18 32 5.97422727971706 10.3188506403638 -4.34462336064672 T:C T C 10 0.57326948002021 0.152042284460693 ENSG00000241962:ENST00000424491:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000512183:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308656:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308644:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000509871:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000185414:ENST00000410042:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000338148:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000473743:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000449429:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409145:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409841:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000476721:exon_99804640_99804720:MRPL30 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 99995517 C/T 1 118 107 225 50.3542013576152 61.3398343621625 -10.9856330045473 T:C C T 10 0.57326948002021 0.138846023639959 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995482_99995589:EIF5B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 100022772 T/C 1 11 7 18 4.69403571977769 4.01288636014147 0.681149359636219 T:C T C 10 0.57326948002021 0.81555142020924 ENSG00000135945:ENST00000485487:exon_100022372_100022815:REV1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 100055158 T/C 1 19 24 43 8.10787987961601 13.758467520485 -5.65058764086903 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0905137487212382 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000450415:exon_100055063_100055189:REV1;ENSG00000135945:ENST00000486117:exon_100055063_100055279:REV1;ENSG00000135945:ENST00000482887:exon_100055063_100055239:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100055036_100055772:REV1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 100058870 C/T 1 7 1 8 2.98711363985853 0.57326948002021 2.41384415983832 T:C C T 10 0.57326948002021 0.149609550462636 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100058779_100058931:REV1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 105665808 C/T 1 12 15 27 5.12076623975748 8.59904220030315 -3.47827596054567 T:C C T 10 0.57326948002021 0.179899627685799 ENSG00000135972:ENST00000258455:exon_105665629_105665808:MRPS9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 105705507 C/T 1 7 8 15 2.98711363985853 4.58615584016168 -1.59904220030315 T:C C T 10 0.57326948002021 0.441591135560738 ENSG00000135972:ENST00000258455:exon_105705442_105705527:MRPS9;ENSG00000135972:ENST00000413583:exon_105705476_105705527:MRPS9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 105713697 A/G 1 80 42 122 34.1384415983832 24.0773181608488 10.0611234375344 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0675656919639618 ENSG00000135972:ENST00000258455:exon_105713613_105713782:MRPS9;ENSG00000135972:ENST00000413583:exon_105713613_105713746:MRPS9;ENSG00000135972:ENST00000472220:exon_105713613_105713782:MRPS9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 113346512 A/C 1 31 30 61 13.2286461193735 17.1980844006063 -3.96943828123281 A:C A C 10 0.57326948002021 0.304103315633498 ENSG00000125611:ENST00000324913:exon_113346443_113346617:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000454841:exon_113346443_113346617:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000409719:exon_113343777_113346852:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000469030:exon_113346443_113346617:CHCHD5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 113537223 C/A 1 7 8 15 2.98711363985853 4.58615584016168 -1.59904220030315 A:C C A 10 0.57326948002021 0.441591135560738 ENSG00000115008:ENST00000263339:exon_113537073_113537243:IL1A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 113940681 T/C 1 8 10 18 3.41384415983832 5.7326948002021 -2.31885064036378 T:C T C 10 0.57326948002021 0.34156534419122 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 113940839 G/C 1 4 9 13 1.70692207991916 5.15942532018189 -3.45250324026273 C:G G C 10 0.57326948002021 0.088426240843314 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 113943470 A/G 1 8 3 11 3.41384415983832 1.71980844006063 1.69403571977769 A:G A G 10 0.57326948002021 0.372574328023575 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113943454_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113942942_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113943239_113943832:PSD4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 120060082 T/C 1 22 17 39 9.38807143955538 9.74558116034357 -0.357509720788192 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120059801_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120059804_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120060020_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120060020_120060124:C2orf76 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 120438938 C/T 1 7 3 10 2.98711363985853 1.71980844006063 1.2673051997979 T:C C T 10 0.57326948002021 0.532053210294076 ENSG00000144120:ENST00000401466:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000424086:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000272521:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000415646:exon_120438430_120439035:TMEM177 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 128249554 T/C 1 20 26 46 8.5346103995958 14.9050064805255 -6.37039608092966 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0726796180164733 ENSG00000163166:ENST00000295321:exon_128249547_128249664:IWS1;ENSG00000163166:ENST00000433551:exon_128249547_128249664:IWS1;ENSG00000163166:ENST00000455721:exon_128249547_128249664:IWS1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 128394955 A/G 1 4 11 15 1.70692207991916 6.30596428022231 -4.59904220030315 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0192066748704768 ENSG00000169994:ENST00000428314:exon_128394891_128395303:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000272666:exon_128394891_128395303:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000389524:exon_128394891_128395303:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000409816:exon_128394891_128395303:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000496841:exon_128394891_128395304:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000409090:exon_128394891_128395301:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000491278:exon_128394369_128395300:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000494959:exon_128394891_128395271:MYO7B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 135893372 A/G 1 22 5 27 9.38807143955538 2.86634740010105 6.52172403945433 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0109338295808396 ENSG00000115839:ENST00000264158:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000442034:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000487003:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 135911422 T/C 1 21 24 45 8.96134091957559 13.758467520485 -4.79712660090945 T:C T C 10 0.57326948002021 0.174850938628959 ENSG00000115839:ENST00000264158:exon_135911219_135911446:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000442034:exon_135911219_135911446:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000487003:exon_135911219_135911446:RAB3GAP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 150432976 C/T 1 47 55 102 20.0563344390501 31.5298214011116 -11.4734869620614 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0271614600953835 ENSG00000168288:ENST00000303319:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000428879:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000422782:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000436114:exon_150432951_150432992:MMADHC HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 152322095 A/T 1 19 12 31 8.10787987961601 6.87923376024252 1.22864611937349 A:T A T 10 0.57326948002021 0.719158288803253 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152321214_152322634:RIF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 152331418 C/G 1 11 5 16 4.69403571977769 2.86634740010105 1.82768831967664 C:G C G 10 0.57326948002021 0.452437779938541 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152331371_152332136:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152331371_152332419:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152331371_152333863:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152331371_152331733:RIF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 160112881 G/T 1 1 7 8 0.42673051997979 4.01288636014147 -3.58615584016168 T:G G T 10 0.57326948002021 0.0245816827973848 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160112707_160112886:WDSUB1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 160604812 C/T 1 3 5 8 1.28019155993937 2.86634740010105 -1.58615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.29890034016204 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 160673526 A/G 1 8 9 17 3.41384415983832 5.15942532018189 -1.74558116034357 A:G A G 10 0.57326948002021 0.464916768474155 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160673317_160673543:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160673317_160673543:RP11-357L2.1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 160676427 C/A 1 12 9 21 5.12076623975748 5.15942532018189 -0.0386590804244111 A:C C A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160676237_160676431:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160676237_160676431:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160676237_160676431:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160676237_160676431:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160676237_160676431:RP11-357L2.1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 170402752 T/C 1 15 17 32 6.40095779969685 9.74558116034357 -3.34462336064672 T:C T C 10 0.57326948002021 0.283704858668405 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170402728_170403214:FASTKD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 170493863 A/G 1 135 137 272 57.6086201972716 78.5379187627688 -20.9292985654971 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0118377575320193 ENSG00000138398:ENST00000260970:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000530133:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000409714:exon_170492923_170494221:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000448752:exon_170492923_170494131:PPIG HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 170938389 C/T 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 T:C C T 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000144357:ENST00000272793:exon_170938236_170940641:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000442603:exon_170938236_170940637:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000418381:exon_170938236_170940637:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000421104:exon_170938236_170940637:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000430321:exon_170938236_170940641:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000392632:exon_170938236_170940630:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000392631:exon_170938236_170940637:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000439681:exon_170938236_170938769:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000444475:exon_170938236_170940641:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000474426:exon_170938236_170940641:UBR3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 171822576 C/T 1 37 36 73 15.7890292392522 20.6377012807276 -4.84867204147533 T:C C T 10 0.57326948002021 0.286963460182943 ENSG00000115806:ENST00000234160:exon_171822300_171823639:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000424423:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000442798:exon_171822300_171823133:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000452526:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000486498:exon_171822300_171823111:GORASP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 171850329 T/G 1 39 44 83 16.6424902792118 25.2238571208892 -8.58136684167744 T:G T G 10 0.57326948002021 0.0597305257595777 ENSG00000198586:ENST00000431350:exon_171847333_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000360843:exon_171847333_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000442919:exon_171847333_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000359766:exon_171850202_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000356075:exon_171850007_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000521943:exon_171850017_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000434911:exon_171850237_171850466:TLK1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 172216969 T/C 1 2 8 10 0.85346103995958 4.58615584016168 -3.7326948002021 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0229850767056374 ENSG00000123600:ENST00000447486:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000375258:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392601:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392604:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000460188:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000428182:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392599:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000462821:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000442778:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000453846:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000442541:exon_172216932_172217023:METTL8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 172374120 G/A 1 1 245 246 0.42673051997979 140.451022604951 -140.024292084972 A:G G A 10 0.57326948002021 3.45353450034393e-89 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 172411273 G/A 1 11 33 44 4.69403571977769 18.9178928406669 -14.2238571208892 A:G G A 10 0.57326948002021 2.06051385301609e-05 ENSG00000071967:ENST00000409484:exon_172411034_172412117:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000321348:exon_172411034_172414643:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000375252:exon_172411034_172414156:CYBRD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 173451074 T/C 1 15 4 19 6.40095779969685 2.29307792008084 4.10787987961601 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0647708307520217 ENSG00000152256:ENST00000282077:exon_173451006_173451116:PDK1;ENSG00000152256:ENST00000392571:exon_173451006_173451116:PDK1;ENSG00000152256:ENST00000410055:exon_173451006_173451116:PDK1;ENSG00000152256:ENST00000466437:exon_173451006_173451116:PDK1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 174946760 T/C 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 T:C T C 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000138430:ENST00000284719:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000344357:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000409546:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000449400:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000392560:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000462000:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000429575:exon_174946738_174946792:OLA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 176043097 A/G 1 534 486 1020 227.874097669208 278.608967289822 -50.7348696206143 A:C:G A G 10 0.57326948002021 0.00138303818498152 ENSG00000154518:ENST00000284727:exon_176040986_176043130:ATP5G3;ENSG00000154518:ENST00000409194:exon_176042795_176043130:ATP5G3;ENSG00000154518:ENST00000392541:exon_176042873_176043130:ATP5G3;ENSG00000154518:ENST00000497075:exon_176042914_176043978:ATP5G3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 183622547 T/G 1 15 7 22 6.40095779969685 4.01288636014147 2.38807143955538 T:G T G 10 0.57326948002021 0.390273785353222 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183622419_183622552:DNAJC10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 183627504 A/G 1 16 19 35 6.82768831967664 10.892120120384 -4.06443180070735 A:G A G 10 0.57326948002021 0.174793597467876 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183627409_183627528:DNAJC10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 187368733 G/A 1 5 6 11 2.13365259989895 3.43961688012126 -1.30596428022231 A:G G A 10 0.57326948002021 0.545300564874909 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 190531615 T/C 1 8 5 13 3.41384415983832 2.86634740010105 0.547496759737269 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000138381:ENST00000260952:exon_190530767_190532322:ASNSD1;ENSG00000138381:ENST00000420250:exon_190530767_190532322:ASNSD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 191161622 T/C 1 4 8 12 1.70692207991916 4.58615584016168 -2.87923376024252 T:C T C 10 0.57326948002021 0.141786607964141 ENSG00000198130:ENST00000392332:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000359678:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000392331:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000409934:exon_191161539_191161679:HIBCH HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 191224981 G/T 1 7 3 10 2.98711363985853 1.71980844006063 1.2673051997979 T:G G T 10 0.57326948002021 0.532053210294076 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000413239:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000431594:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000444194:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000417336:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000422454:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458647:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000423767:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000409027:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458193:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000487628:exon_191224744_191225032:INPP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 191859935 C/T 1 43 51 94 18.349412359131 29.2367434810307 -10.8873311218997 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0280757100031946 ENSG00000115415:ENST00000361099:exon_191859787_191859945:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000409465:exon_191859787_191859945:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000392322:exon_191859787_191859945:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000452281:exon_191859787_191859945:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000392323:exon_191859787_191859945:STAT1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 198257795 T/C 1 42 41 83 17.9226818391512 23.5040486808286 -5.58136684167743 T:C T C 10 0.57326948002021 0.223625347264493 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198257696_198257912:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000479532:exon_198257696_198258075:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000424674:exon_198257776_198257912:SF3B1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 198265526 A/G 1 20 21 41 8.5346103995958 12.0386590804244 -3.50404868082861 A:G A G 10 0.57326948002021 0.273648441106036 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198265439_198265660:SF3B1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 198283305 T/C 1 7 6 13 2.98711363985853 3.43961688012126 -0.452503240262731 T:C T C 10 0.57326948002021 0.787569123349065 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198283233_198283312:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000470268:exon_198283233_198284839:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000482158:exon_198283233_198283686:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000409915:exon_198283233_198283312:SF3B1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 198362018 T/C 1 93 93 186 39.6859383581205 53.3140616418795 -13.6281232837591 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0454237285521627 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000486181:exon_198361864_198362231:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198361615_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198361892_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198362009_198362116:HSPD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 201437334 T/C 1 3 5 8 1.28019155993937 2.86634740010105 -1.58615584016168 T:C T C 10 0.57326948002021 0.29890034016204 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 201437524 A/C 1 8 6 14 3.41384415983832 3.43961688012126 -0.0257727202829408 A:C A C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 207631461 G/A 1 7 2 9 2.98711363985853 1.14653896004042 1.84057467981811 A:G G A 10 0.57326948002021 0.31706387914541 ENSG00000118246:ENST00000236980:exon_207631368_207632194:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000418289:exon_207631368_207631789:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000402774:exon_207631368_207632194:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000403094:exon_207631368_207632194:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000487777:exon_207631368_207632194:FASTKD2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 208477852 G/A 1 18 6 24 7.68114935963622 3.43961688012126 4.24153247951496 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0986672035644979 ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208473839_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208476828_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208477447_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208477451_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208477467_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208477567_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208477704_208478167:FAM119A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 208477956 C/T 1 27 13 40 11.5217240394543 7.45250324026273 4.0692207991916 T:C C T 10 0.57326948002021 0.205303651473091 ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208473839_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208476828_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208477447_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208477451_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208477467_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208477567_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208477704_208478167:FAM119A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 208489101 C/A 1 6 8 14 2.56038311987874 4.58615584016168 -2.02577272028294 A:C C A 10 0.57326948002021 0.291858897104158 ENSG00000144401:ENST00000432416:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000458426:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000425132:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000461419:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208488953_208489275:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208488953_208489124:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208488953_208489290:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000471128:exon_208488953_208489128:FAM119A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 214182100 A/T 1 12 9 21 5.12076623975748 5.15942532018189 -0.0386590804244111 A:T A T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000144451:ENST00000432529:exon_214181943_214182702:SPAG16 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 216190020 C/G 1 29 33 62 12.3751850794139 18.9178928406669 -6.54270776125302 C:G C G 10 0.57326948002021 0.0964981487017688 ENSG00000138363:ENST00000236959:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000444305:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000488712:exon_216189903_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000443953:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000435675:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000427397:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000413174:exon_216189964_216190052:ATIC HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 220096678 A/C 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 A:C A C 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000163516:ENST00000323348:exon_220096650_220096762:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000466238:exon_220096650_220096762:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000453432:exon_220096650_220096762:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000477479:exon_220096650_220096762:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000463792:exon_220096650_220096762:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000486203:exon_220096650_220096762:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000416565:exon_220096650_220096735:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000410034:exon_220096650_220096762:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000447157:exon_220096650_220096762:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000436226:exon_220096650_220096762:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000491181:exon_220096650_220096762:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000465550:exon_220095347_220096762:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000489580:exon_220096566_220096762:ANKZF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 220250237 G/A 1 10 5 15 4.2673051997979 2.86634740010105 1.40095779969685 A:G G A 10 0.57326948002021 0.604487754064262 ENSG00000123992:ENST00000273075:exon_220250146_220250253:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373972:exon_220250146_220250253:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000523282:exon_220250146_220250253:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373963:exon_220250146_220250253:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373966:exon_220250146_220250253:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000337010:exon_220250146_220250253:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000429013:exon_220250146_220250253:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000460963:exon_220249308_220250253:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000522421:exon_220249876_220250253:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000322176:exon_220250153_220250253:DNPEP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 223489175 T/C 1 43 61 104 18.349412359131 34.9694382812328 -16.6200259221018 T:C T C 10 0.57326948002021 0.00139149365714761 ENSG00000116120:ENST00000281828:exon_223488991_223489198:FARSB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 225346646 T/C 1 38 47 85 16.215759759232 26.9436655609499 -10.7279058017179 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0210661627112477 ENSG00000036257:ENST00000264414:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000344951:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409096:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409777:exon_225346609_225346795:CUL3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 228197238 G/A 1 34 35 69 14.5088376793129 20.0644318007074 -5.5555941213945 A:G G A 10 0.57326948002021 0.182417777238012 ENSG00000168958:ENST00000304593:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000476924:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000353339:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000354503:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000530359:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000531278:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409565:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000452930:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409616:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000460756:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000337110:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000470090:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000534203:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000524634:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000349901:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392059:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392058:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000436791:exon_228197135_228197304:MFF HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 228416712 A/G 1 8 8 16 3.41384415983832 4.58615584016168 -1.17231168032336 A:G A G 10 0.57326948002021 0.617511810756066 ENSG00000173744:ENST00000409979:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000310078:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409315:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000373671:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409171:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000458212:exon_228416675_228416833:AGFG1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 231050715 A/G 1 69 83 152 29.4444058786055 47.5813668416774 -18.1369609630719 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0039540164443561 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231050710_231050859:SP110 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 231072709 C/T 1 37 36 73 15.7890292392522 20.6377012807276 -4.84867204147533 T:C:G C T 10 0.57326948002021 0.286963460182943 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000490880:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231072706_231072774:SP110 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 231248261 C/T 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 T:C C T 10 0.57326948002021 0.741310101183539 ENSG00000079263:ENST00000486687:exon_231248225_231248290:SP140;ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000483728:exon_231248225_231248290:SP140L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 231258150 C/T 1 7 6 13 2.98711363985853 3.43961688012126 -0.452503240262731 T:C C T 10 0.57326948002021 0.787569123349065 ENSG00000079263:ENST00000486687:exon_231258129_231258176:SP140;ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000483728:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000496870:exon_231258129_231258176:SP140L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 231333763 A/G 1 97 102 199 41.3928604380396 58.4734869620614 -17.0806265240218 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0148639853559202 ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000413284:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000452345:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494508:exon_231333547_231333811:SP100 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 231338211 T/G 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 T:G T G 10 0.57326948002021 0.741310101183539 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 231406070 G/A 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 A:G G A 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231406016_231406087:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231406016_231406087:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231406016_231406087:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231406016_231406087:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231406016_231406087:SP100 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 231407663 C/T 1 9 5 14 3.84057467981811 2.86634740010105 0.974227279717059 T:C C T 10 0.57326948002021 0.788481610276296 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231407551_231407898:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231407551_231410317:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231407551_231408805:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231407551_231407837:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231407551_231408805:SP100 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 232196564 C/T 1 13 3 16 5.54749675973727 1.71980844006063 3.82768831967664 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0744376636268041 ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000428662:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000486787:exon_232196505_232196609:ARMC9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 232196597 G/A 1 13 7 20 5.54749675973727 4.01288636014147 1.5346103995958 A:G G A 10 0.57326948002021 0.652301753764728 ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000428662:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000486787:exon_232196505_232196609:ARMC9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 232576569 G/A 1 37 39 76 15.7890292392522 22.3575097207882 -6.56848048153597 A:G G A 10 0.57326948002021 0.132879770416778 ENSG00000187514:ENST00000481928:exon_232576058_232576693:PTMA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 234115337 G/A 1 6 12 18 2.56038311987874 6.87923376024252 -4.31885064036378 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0544603635560848 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 238990388 G/A 1 3 8 11 1.28019155993937 4.58615584016168 -3.30596428022231 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0642027293927821 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238990350_238990477:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000413463:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000423324:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000443532:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000482031:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000431487:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238987206_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238990376_238990477:SCLY HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 238999883 T/C 1 6 6 12 2.56038311987874 3.43961688012126 -0.879233760242521 T:C T C 10 0.57326948002021 0.771962928640395 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238999859_238999895:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238999859_239003163:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238999859_238999928:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238999859_239000724:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238999859_239000114:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000440143:exon_238999859_239000164:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000433750:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000463433:exon_238999859_238999895:SCLY HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 240946766 T/C 1 33 30 63 14.0821071593331 17.1980844006063 -3.11597724127323 T:C T C 10 0.57326948002021 0.446509661056126 ENSG00000130414:ENST00000419408:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000476216:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000422018:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000444548:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000448880:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240946733_240946787:NDUFA10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 242573211 T/C 1 27 28 55 11.5217240394543 16.0515454405659 -4.52982140111155 T:C T C 10 0.57326948002021 0.222688631217463 ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 2 242690675 G/A 1 6 8 14 2.56038311987874 4.58615584016168 -2.02577272028294 A:G G A 10 0.57326948002021 0.291858897104158 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000454048:exon_242690661_242690794:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000432449:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000496252:exon_242690661_242690804:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242690661_242690803:D2HGDH HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 256727 T/A 1 6 7 13 2.56038311987874 4.01288636014147 -1.45250324026273 A:T T A 10 0.57326948002021 0.418185809776403 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_256609_256727:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_256609_256727:C20orf96 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 257733 A/G 1 9 8 17 3.84057467981811 4.58615584016168 -0.745581160343571 A:G A G 10 0.57326948002021 0.807894812450834 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_257457_257786:C20orf96 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 259969 G/C 1 8 4 12 3.41384415983832 2.29307792008084 1.12076623975748 C:G G C 10 0.57326948002021 0.573925568669172 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_259813_259971:C20orf96 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 278806 C/T 1 12 16 28 5.12076623975748 9.17231168032336 -4.05154544056588 T:C C T 10 0.57326948002021 0.129977558853454 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 279483 T/C 1 14 6 20 5.97422727971706 3.43961688012126 2.5346103995958 T:C T C 10 0.57326948002021 0.36622341140112 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 368905 A/G 1 10 16 26 4.2673051997979 9.17231168032336 -4.90500648052546 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0724098343795343 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_368655_368945:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000449710:exon_368655_368945:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_368655_368945:TRIB3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 391025 T/C 1 3 5 8 1.28019155993937 2.86634740010105 -1.58615584016168 T:C T C 10 0.57326948002021 0.29890034016204 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 391170 C/T 1 56 73 129 23.8969091188682 41.8486720414753 -17.9517629226071 T:C C T 10 0.57326948002021 0.00174020443299590 ENSG00000125826:ENST00000475269:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400245:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400247:exon_391056_391408:RBCK1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 825678 T/C 1 10 12 22 4.2673051997979 6.87923376024252 -2.61192856044462 T:C T C 10 0.57326948002021 0.285971290233503 ENSG00000125898:ENST00000381941:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000304189:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000381939:exon_825354_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000246100:exon_825351_826922:FAM110A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 1099523 T/G 1 31 25 56 13.2286461193735 14.3317370005053 -1.10309088113176 T:C:G T G 10 0.57326948002021 0.788079451579218 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000438768:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1099253_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000461847:exon_1099270_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1099295_1099545:PSMF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 2637071 T/C 1 118 151 269 50.3542013576152 86.5636914830517 -36.2094901254365 T:C T C 10 0.57326948002021 1.07904222515051e-05 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480992:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000484998:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000415272:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480447:exon_2636805_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000490753:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000471023:exon_2637056_2637195:NOP56 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 2996497 C/T 1 3 6 9 1.28019155993937 3.43961688012126 -2.15942532018189 T:C C T 10 0.57326948002021 0.183674374674640 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_2996495_2996531:PTPRA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 3193842 C/A 1 21 21 42 8.96134091957559 12.0386590804244 -3.07731816084882 A:C C A 10 0.57326948002021 0.352547289305668 ENSG00000125877:ENST00000483354:exon_3193815_3193872:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000460676:exon_3193815_3193872:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000380113:exon_3193815_3193872:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000455664:exon_3193815_3193872:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000460550:exon_3193815_3193872:ITPA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 3193978 G/A 1 25 21 46 10.6682629994947 12.0386590804244 -1.37039608092966 A:G G A 10 0.57326948002021 0.766010444052857 ENSG00000125877:ENST00000460676:exon_3193965_3194072:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000380113:exon_3193965_3194029:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000455664:exon_3193965_3194029:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000490838:exon_3193902_3194029:ITPA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 3204084 G/A 1 69 66 135 29.4444058786055 37.8357856813339 -8.39137980272835 A:G G A 10 0.57326948002021 0.163665682807889 ENSG00000125877:ENST00000483354:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000380113:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000455664:exon_3204012_3204504:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000490838:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000460550:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000399838:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000461029:exon_3204012_3204095:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000472295:exon_3204012_3204516:ITPA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 4854682 A/G 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 A:G A G 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000089057:ENST00000379333:exon_4854582_4854738:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000338244:exon_4854582_4854738:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000379324:exon_4854582_4854738:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000424750:exon_4854582_4854738:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000437886:exon_4854582_4854738:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000423430:exon_4854582_4854738:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000468355:exon_4854582_4854738:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000496331:exon_4854523_4854738:SLC23A2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 5556512 G/A 1 8 7 15 3.41384415983832 4.01288636014147 -0.599042200303151 A:G G A 10 0.57326948002021 0.7979049378473 ENSG00000125772:ENST00000378992:exon_5556462_5556624:GPCPD1;ENSG00000125772:ENST00000379019:exon_5556462_5556624:GPCPD1;ENSG00000125772:ENST00000481038:exon_5556462_5556624:GPCPD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 5844122 A/G 1 8 2 10 3.41384415983832 1.14653896004042 2.2673051997979 A:G A G 10 0.57326948002021 0.205360643158888 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 10386013 C/A 1 9 7 16 3.84057467981811 4.01288636014147 -0.172311680323361 A:C C A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10385428_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10385832_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10385832_10386335:MKKS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 10386059 G/A 1 12 12 24 5.12076623975748 6.87923376024252 -1.75846752048504 A:G G A 10 0.57326948002021 0.537756757259522 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10385428_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10385832_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10385832_10386335:MKKS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 13747441 A/G 1 34 34 68 14.5088376793129 19.4911623206871 -4.98232464137428 A:G A G 10 0.57326948002021 0.223092261966280 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13747424_13747571:ESF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 17585218 T/G 1 44 50 94 18.7761428791108 28.6634740010105 -9.88733112189975 T:G T G 10 0.57326948002021 0.0470617487705253 ENSG00000125868:ENST00000246069:exon_17585200_17585276:DSTN;ENSG00000125868:ENST00000474024:exon_17585200_17585276:DSTN;ENSG00000125868:ENST00000449141:exon_17585200_17585276:DSTN;ENSG00000125868:ENST00000403962:exon_17585200_17585276:DSTN HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 17596155 C/A 1 16 8 24 6.82768831967664 4.58615584016168 2.24153247951496 A:C C A 10 0.57326948002021 0.413539465644685 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17596076_17596174:RRBP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 17600357 G/A 1 15 21 36 6.40095779969685 12.0386590804244 -5.63770128072756 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0643544654261354 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17599241_17600462:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17600278_17600373:RRBP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 17602571 A/G 1 11 9 20 4.69403571977769 5.15942532018189 -0.465389600404201 A:G A G 10 0.57326948002021 0.825497110151158 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17602500_17602592:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17602500_17602592:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17602500_17602592:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17602500_17602592:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17602500_17602592:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17602500_17602592:RRBP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 25260931 A/G 1 5 8 13 2.13365259989895 4.58615584016168 -2.45250324026273 A:G A G 10 0.57326948002021 0.261241293669647 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25260902_25261048:PYGB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 25262769 G/A 1 3 9 12 1.28019155993937 5.15942532018189 -3.87923376024252 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0369288562011821 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25262669_25262783:PYGB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 25264814 T/C 1 7 5 12 2.98711363985853 2.86634740010105 0.120766239757479 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25264740_25264887:PYGB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 25276297 G/A 1 17 6 23 7.25441883965643 3.43961688012126 3.81480195953517 A:G G A 10 0.57326948002021 0.139756598539207 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25276240_25276306:PYGB;ENSG00000100994:ENST00000428458:exon_25276240_25276306:PYGB;ENSG00000100994:ENST00000471359:exon_25276240_25276306:PYGB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 25276304 C/T 1 18 7 25 7.68114935963622 4.01288636014147 3.66826299949475 T:C C T 10 0.57326948002021 0.159848312280910 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25276240_25276306:PYGB;ENSG00000100994:ENST00000428458:exon_25276240_25276306:PYGB;ENSG00000100994:ENST00000471359:exon_25276240_25276306:PYGB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 25282944 A/G 1 16 16 32 6.82768831967664 9.17231168032336 -2.34462336064672 A:G A G 10 0.57326948002021 0.475465289868101 ENSG00000100997:ENST00000376542:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000376517:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000339157:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000526543:exon_25282855_25282982:ABHD12 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 25288632 G/A 1 9 8 17 3.84057467981811 4.58615584016168 -0.745581160343571 A:G G A 10 0.57326948002021 0.807894812450834 ENSG00000100997:ENST00000376542:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000376517:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000339157:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000526543:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000491682:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000481556:exon_25288602_25288681:ABHD12 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 30753270 T/C 1 15 11 26 6.40095779969685 6.30596428022231 0.0949935194745386 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000101337:ENST00000398022:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000375795:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000421148:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000217315:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000413032:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000495749:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000479591:exon_30753098_30753390:TM9SF4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 31427635 C/T 1 20 20 40 8.5346103995958 11.4653896004042 -2.9307792008084 T:C C T 10 0.57326948002021 0.424468842140107 ENSG00000101367:ENST00000375571:exon_31427541_31427662:MAPRE1;ENSG00000101367:ENST00000414525:exon_31427541_31427662:MAPRE1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 32212690 C/T 1 10 6 16 4.2673051997979 3.43961688012126 0.827688319676639 T:C C T 10 0.57326948002021 0.802879700667955 ENSG00000078699:ENST00000375279:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000342704:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000346541:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000397800:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000492345:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000359606:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000397803:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000491618:exon_32212570_32212823:CBFA2T2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 32295541 C/T 1 10 10 20 4.2673051997979 5.7326948002021 -1.4653896004042 T:C C T 10 0.57326948002021 0.508038948022547 ENSG00000101417:ENST00000409299:exon_32294512_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000344022:exon_32295075_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000217398:exon_32295295_32295775:PXMP4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 32379263 T/C 1 4 7 11 1.70692207991916 4.01288636014147 -2.30596428022231 T:C T C 10 0.57326948002021 0.223014268684580 ENSG00000131061:ENST00000342427:exon_32378794_32380075:ZNF341;ENSG00000131061:ENST00000375200:exon_32378794_32380075:ZNF341;ENSG00000131061:ENST00000497876:exon_32378794_32380075:ZNF341;ENSG00000131061:ENST00000483118:exon_32378794_32380075:ZNF341;ENSG00000131061:ENST00000493497:exon_32378794_32380075:ZNF341 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 33147737 C/G 1 14 4 18 5.97422727971706 2.29307792008084 3.68114935963622 C:G C G 10 0.57326948002021 0.09647104666029 ENSG00000101460:ENST00000374837:exon_33147540_33148149:MAP1LC3A;ENSG00000101460:ENST00000397711:exon_33147540_33148086:MAP1LC3A;ENSG00000101460:ENST00000360668:exon_33147540_33148149:MAP1LC3A;ENSG00000101460:ENST00000476428:exon_33147540_33148149:MAP1LC3A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 33703607 C/T 1 30 19 49 12.8019155993937 10.892120120384 1.90979547900971 T:C C T 10 0.57326948002021 0.665568283639579 ENSG00000088298:ENST00000374491:exon_33703160_33703736:EDEM2;ENSG00000088298:ENST00000374492:exon_33703167_33703736:EDEM2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 33971914 C/T 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000101019:ENST00000349714:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000359226:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374394:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374384:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374385:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374377:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000453855:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000407996:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397556:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000443429:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000438533:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397554:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000491125:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397553:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000495752:exon_33971841_33971936:UQCC HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 34090519 G/A 1 3 8 11 1.28019155993937 4.58615584016168 -3.30596428022231 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0642027293927821 ENSG00000126001:ENST00000397527:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000356095:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000342580:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000425525:exon_34090218_34090632:CEP250 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 37396120 A/G 1 13 12 25 5.54749675973727 6.87923376024252 -1.33173700050525 A:G A G 10 0.57326948002021 0.686966178648469 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37396107_37396239:ACTR5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 42343821 C/G 1 59 51 110 25.1771006788076 29.2367434810307 -4.05964280222311 C:G C G 10 0.57326948002021 0.441991335458441 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42343774_42343923:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42343774_42343923:MYBL2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 43588968 G/C 1 16 8 24 6.82768831967664 4.58615584016168 2.24153247951496 C:G G C 10 0.57326948002021 0.413539465644685 ENSG00000025772:ENST00000372813:exon_43588848_43589127:TOMM34;ENSG00000025772:ENST00000372810:exon_43588848_43589036:TOMM34 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 44054349 T/C 1 5 13 18 2.13365259989895 7.45250324026273 -5.31885064036378 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0153851573106349 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44054214_44054884:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44054214_44054882:PIGT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 44520579 C/G 1 14 8 22 5.97422727971706 4.58615584016168 1.38807143955538 C:G C G 10 0.57326948002021 0.668312643486638 ENSG00000064601:ENST00000372471:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000372484:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000354880:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000191018:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000419493:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000372459:exon_44520555_44520666:CTSA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 44691350 T/G 1 10 8 18 4.2673051997979 4.58615584016168 -0.318850640363781 T:G T G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000124160:ENST00000290231:exon_44689624_44691528:NCOA5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 47253043 G/A 1 10 4 14 4.2673051997979 2.29307792008084 1.97422727971706 A:G G A 10 0.57326948002021 0.419102837465114 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47253001_47253221:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47253001_47253221:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47253001_47253221:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47253001_47253221:PREX1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 47850182 C/T 1 11 21 32 4.69403571977769 12.0386590804244 -7.34462336064672 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0114063207896947 ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47850105_47850246:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47850105_47852768:DDX27 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 47865509 G/A 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 A:G G A 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 47872377 C/G 1 8 5 13 3.41384415983832 2.86634740010105 0.547496759737269 C:G C G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47872345_47872484:ZNFX1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 48522330 G/A 1 9 7 16 3.84057467981811 4.01288636014147 -0.172311680323361 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 48522585 G/A 1 8 4 12 3.41384415983832 2.29307792008084 1.12076623975748 A:G G A 10 0.57326948002021 0.573925568669172 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 48746189 C/T 1 6 10 16 2.56038311987874 5.7326948002021 -3.17231168032336 T:C C T 10 0.57326948002021 0.131350999414970 ENSG00000240849:ENST00000522930:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371650:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371656:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371652:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000453505:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371658:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000124208:ENST00000341698:exon_48746083_48746227:TMEM189-UBE2V1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 52561469 A/G 0 20 0 20 8.5346103995958 0 8.5346103995958 A A 10 0.57326948002021 2.95605062910185e-05 ENSG00000064787:ENST00000448484:exon_52561465_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371440:exon_52561465_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000448710:exon_52560079_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000434986:exon_52560079_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000395961:exon_52560080_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371435:exon_52560080_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000422805:exon_52561322_52561535:BCAS1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 55052115 C/T 1 16 23 39 6.82768831967664 13.1851980404648 -6.35750972078819 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0509134292572144 ENSG00000022277:ENST00000023939:exon_55052041_55052180:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000395881:exon_55052041_55052180:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000357348:exon_55052041_55052180:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000449062:exon_55052041_55052180:C20orf43 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 57244493 G/A 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 A:G G A 10 0.57326948002021 0.741310101183539 ENSG00000254995:ENST00000371138:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000254995:ENST00000435446:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000124222:ENST00000355957:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000312283:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000359617:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000371141:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000371132:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000358029:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000464640:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000361830:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000361770:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000468590:exon_57244358_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000438253:exon_57244347_57244509:STX16 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 57290347 C/G 1 41 42 83 17.4959513191714 24.0773181608488 -6.58136684167743 T:C:G C G 10 0.57326948002021 0.150243771567127 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57290224_57290466:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57290224_57290689:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57290224_57290606:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57290224_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57290224_57290466:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57287535_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57290224_57291367:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527081:exon_57290224_57290900:NPEPL1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 57478807 C/T 1 218 197 415 93.0272533555942 112.934087563981 -19.9068342083872 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0528268815820326 ENSG00000087460:ENST00000313949:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371075:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000419558:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000472183:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000462499:exon_57478727_57478829:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000482112:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000490374:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467227:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371100:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371102:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464624:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000450130:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000349036:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488546:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000481039:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468895:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467321:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000477931:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000485673:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000470512:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464788:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000469431:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000478585:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000474497:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480975:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480232:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371095:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371085:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000354359:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000265620:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000306090:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371082:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488652:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476935:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468942:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000492907:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487862:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000496934:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476196:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000494081:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487981:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000493958:exon_57478796_57478846:GNAS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 60881330 G/A 1 33 20 53 14.0821071593331 11.4653896004042 2.61671755892887 A:G G A 10 0.57326948002021 0.491098265202947 ENSG00000130706:ENST00000423787:exon_60881253_60881376:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000370744:exon_60881253_60881376:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000253003:exon_60881253_60881376:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000462554:exon_60881253_60881376:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000465805:exon_60881253_60881376:ADRM1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 60883273 A/C 1 11 3 14 4.69403571977769 1.71980844006063 2.97422727971706 A:C A C 10 0.57326948002021 0.174656120913287 ENSG00000130702:ENST00000492698:exon_60883011_60883502:LAMA5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 61443870 C/G 1 46 33 79 19.6296039190703 18.9178928406669 0.711711078403408 C:G C G 10 0.57326948002021 0.909835787675783 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370468:exon_61443582_61444281:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61443582_61444558:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61443582_61444558:OGFR HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 61488785 T/C 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 T:C T C 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000101190:ENST00000335351:exon_61488747_61488990:TCFL5;ENSG00000101190:ENST00000217162:exon_61488747_61488990:TCFL5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 61595636 C/T 1 12 7 19 5.12076623975748 4.01288636014147 1.10787987961601 T:C C T 10 0.57326948002021 0.651195141393552 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000459704:exon_61595580_61595667:SLC17A9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 61834695 G/A 1 9 12 21 3.84057467981811 6.87923376024252 -3.03865908042441 A:G G A 10 0.57326948002021 0.192086447359513 ENSG00000149658:ENST00000370339:exon_61833639_61835159:YTHDF1;ENSG00000149658:ENST00000370333:exon_61833639_61835159:YTHDF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 61869826 C/T 1 42 99 141 17.9226818391512 56.7536785220008 -38.8309966828496 T:C C T 10 0.57326948002021 5.61403775662237e-11 ENSG00000101197:ENST00000342412:exon_61869748_61869829:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000217169:exon_61869748_61869829:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000370327:exon_61869748_61869829:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000395306:exon_61869554_61869829:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000426135:exon_61869560_61869829:BIRC7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 61870634 A/G 1 20 18 38 8.5346103995958 10.3188506403638 -1.78424024076798 A:G A G 10 0.57326948002021 0.623674035833263 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 61870727 G/C 1 79 23 102 33.7117110784034 13.1851980404648 20.5265130379386 C:G G C 10 0.57326948002021 3.17442967199017e-05 ENSG00000101197:ENST00000217169:exon_61870710_61870962:BIRC7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 62126185 A/G 1 2 8 10 0.85346103995958 4.58615584016168 -3.7326948002021 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0229850767056374 ENSG00000101210:ENST00000298049:exon_62126158_62126454:EEF1A2;ENSG00000101210:ENST00000217182:exon_62126158_62126454:EEF1A2;ENSG00000101210:ENST00000449908:exon_62126158_62126454:EEF1A2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 62321655 G/A 1 1 7 8 0.42673051997979 4.01288636014147 -3.58615584016168 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0245816827973848 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000425905:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62321647_62321794:RTEL1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 62326110 A/C 1 7 8 15 2.98711363985853 4.58615584016168 -1.59904220030315 A:C A C 10 0.57326948002021 0.441591135560738 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62326094_62326331:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62326094_62326327:RTEL1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 62328742 C/T 1 8 3 11 3.41384415983832 1.71980844006063 1.69403571977769 T:C C T 10 0.57326948002021 0.372574328023575 ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62328681_62328875:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62328681_62328875:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62328681_62328875:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62328681_62328875:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62328681_62328875:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62328681_62328875:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000369993:exon_62328681_62328875:RTEL1;ENSG00000243509:ENST00000369996:exon_62328681_62328875:TNFRSF6B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 62328829 C/G 1 9 1 10 3.84057467981811 0.57326948002021 3.2673051997979 C:G C G 10 0.57326948002021 0.051520419622225 ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62328681_62328875:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62328681_62328875:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62328681_62328875:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62328681_62328875:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62328681_62328875:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62328681_62328875:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000369993:exon_62328681_62328875:RTEL1;ENSG00000243509:ENST00000369996:exon_62328681_62328875:TNFRSF6B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 62331989 T/G 1 28 30 58 11.9484545594341 17.1980844006063 -5.24962984117218 T:G T G 10 0.57326948002021 0.184580198386962 ENSG00000101246:ENST00000359715:exon_62331954_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000440854:exon_62329996_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000485858:exon_62331954_62332129:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000217224:exon_62331954_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000324228:exon_62331954_62332054:ARFRP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 62373707 G/T 1 19 26 45 8.10787987961601 14.9050064805255 -6.79712660090945 T:G G T 10 0.57326948002021 0.0493461954845848 ENSG00000125520:ENST00000266077:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000485897:exon_62373689_62373843:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000493772:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000491109:exon_62373689_62373887:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000473157:exon_62373689_62373717:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000482718:exon_62373483_62373888:SLC2A4RG HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 62607160 C/T 1 23 48 71 9.81480195953517 27.5169350409701 -17.7021330814349 T:C C T 10 0.57326948002021 3.18365029338233e-05 ENSG00000130590:ENST00000369886:exon_62607045_62607185:SAMD10;ENSG00000130590:ENST00000498830:exon_62607045_62607185:SAMD10;ENSG00000130590:ENST00000478694:exon_62607045_62607185:SAMD10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 62641575 G/A 1 33 61 94 14.0821071593331 34.9694382812328 -20.8873311218997 A:G G A 10 0.57326948002021 2.26181540943245e-05 ENSG00000101161:ENST00000266079:exon_62641553_62641671:PRPF6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 62663416 C/T 1 5 5 10 2.13365259989895 2.86634740010105 -0.732694800202101 T:C C T 10 0.57326948002021 0.752834960365011 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 20 62707935 G/A 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000171700:ENST00000395042:exon_62707878_62707999:RGS19;ENSG00000171700:ENST00000332298:exon_62707878_62707999:RGS19;ENSG00000171700:ENST00000493165:exon_62707878_62707999:RGS19;ENSG00000171700:ENST00000479996:exon_62707917_62707999:RGS19 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 15399864 T/C 1 2 11 13 0.85346103995958 6.30596428022231 -5.45250324026273 T:C T C 10 0.57326948002021 0.00319980416353301 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 15918577 G/C 1 18 27 45 7.68114935963622 15.4782759605457 -7.79712660090945 C:G G C 10 0.57326948002021 0.0230841672052596 ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15918526_15918664:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400564:exon_15918526_15918662:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000493640:exon_15918526_15918634:SAMSN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 19169218 G/C 1 8 3 11 3.41384415983832 1.71980844006063 1.69403571977769 C:G G C 10 0.57326948002021 0.372574328023575 ENSG00000154642:ENST00000284881:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400559:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400558:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000405964:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000493464:exon_19169040_19169435:C21orf91 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 30408670 A/T 1 67 70 137 28.5909448386459 40.1288636014147 -11.5379187627688 A:T A T 10 0.57326948002021 0.0473425203095226 ENSG00000156256:ENST00000399975:exon_30408592_30408695:USP16;ENSG00000156256:ENST00000399976:exon_30408592_30408695:USP16;ENSG00000156256:ENST00000334352:exon_30408592_30408695:USP16;ENSG00000156256:ENST00000474835:exon_30408592_30408695:USP16 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 34640788 A/G 1 4 8 12 1.70692207991916 4.58615584016168 -2.87923376024252 A:G A G 10 0.57326948002021 0.141786607964141 ENSG00000249624:ENST00000433395:exon_34640699_34640822:AP000295.9;ENSG00000243646:ENST00000290200:exon_34640699_34640822:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000422891:exon_34640699_34640822:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000493295:exon_34640233_34640822:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000498371:exon_34640587_34640822:IL10RB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 34655545 C/T 1 29 16 45 12.3751850794139 9.17231168032336 3.20287339909055 T:C C T 10 0.57326948002021 0.368665607875106 ENSG00000249624:ENST00000451624:exon_34655399_34656082:AP000295.9;ENSG00000243646:ENST00000290200:exon_34655399_34655546:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000422891:exon_34655399_34655546:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000493295:exon_34655399_34655546:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000498371:exon_34655399_34655546:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000451065:exon_34655399_34655546:IL10RB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 34787312 A/G 1 21 15 36 8.96134091957559 8.59904220030315 0.362298719272438 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000159128:ENST00000290219:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000439213:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000381995:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000405436:exon_34787195_34787327:IFNGR2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 35281393 A/G 1 187 211 398 79.7986072362207 120.959860284264 -41.1612530480436 A:T:G A G 10 0.57326948002021 3.82349678462676e-05 ENSG00000249209:ENST00000429238:exon_35281386_35281515:AP000304.12;ENSG00000241837:ENST00000491703:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000290299:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000418933:exon_35281386_35281399:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000495005:exon_35281118_35281515:ATP5O HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 36080290 C/T 1 7 3 10 2.98711363985853 1.71980844006063 1.2673051997979 T:C C T 10 0.57326948002021 0.532053210294076 ENSG00000159212:ENST00000360731:exon_36080242_36080367:CLIC6;ENSG00000159212:ENST00000349499:exon_36080242_36080367:CLIC6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 38525356 T/C 1 5 5 10 2.13365259989895 2.86634740010105 -0.732694800202101 T:C T C 10 0.57326948002021 0.752834960365011 ENSG00000182670:ENST00000418766:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000485402:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000438055:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000414818:exon_38525251_38525577:TTC3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 38563725 G/A 1 11 13 24 4.69403571977769 7.45250324026273 -2.75846752048504 A:G G A 10 0.57326948002021 0.303503076139145 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38563635_38563725:TTC3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 38568009 G/C 1 18 15 33 7.68114935963622 8.59904220030315 -0.917892840666932 C:G G C 10 0.57326948002021 0.860635492003374 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 38568308 C/T 1 6 18 24 2.56038311987874 10.3188506403638 -7.75846752048504 T:C C T 10 0.57326948002021 0.00162500705093829 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 42821113 T/C 1 190 124 314 81.0787987961601 71.0854155225061 9.99338327365403 A:T:C T C 10 0.57326948002021 0.278367438988933 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000486275:exon_42821064_42821712:MX1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 42824661 A/G 1 129 166 295 55.0482370773929 95.1627336833549 -40.114496605962 A:G A G 10 0.57326948002021 2.95291517794489e-06 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000491110:exon_42824548_42824747:MX1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 44485350 G/A 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 A:G G A 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000160200:ENST00000352178:exon_44485313_44485382:CBS;ENSG00000160200:ENST00000359624:exon_44485313_44485382:CBS;ENSG00000160200:ENST00000398165:exon_44485313_44485382:CBS;ENSG00000160200:ENST00000398158:exon_44485313_44485382:CBS;ENSG00000160200:ENST00000461686:exon_44485313_44485382:CBS;ENSG00000160200:ENST00000398168:exon_44485313_44485382:CBS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 45173472 G/A 1 67 45 112 28.5909448386459 25.7971266009095 2.79381823773647 A:G G A 10 0.57326948002021 0.633566445367674 ENSG00000160209:ENST00000468090:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000291565:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000463355:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000498040:exon_45173464_45173535:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000481512:exon_45173464_45173475:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000490666:exon_45173464_45173535:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467640:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467908:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000343528:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398078:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000468392:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000461123:exon_45173464_45173600:PDXK HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 45217929 T/C 1 19 35 54 8.10787987961601 20.0644318007074 -11.9565519210913 T:C:G T C 10 0.57326948002021 0.00134605460930936 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217788_45217981:RRP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 45219524 T/C 1 18 21 39 7.68114935963622 12.0386590804244 -4.35750972078819 T:C T C 10 0.57326948002021 0.194863329204646 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45219451_45219530:RRP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 45220483 A/G 1 14 20 34 5.97422727971706 11.4653896004042 -5.49116232068714 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0813413199549323 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45220398_45220495:RRP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 45389031 C/G 1 11 2 13 4.69403571977769 1.14653896004042 3.54749675973727 C:G C G 10 0.57326948002021 0.052191540754762 ENSG00000160216:ENST00000291572:exon_45388999_45389160:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000438598:exon_45388999_45389160:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000398061:exon_45388999_45389160:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000327505:exon_45388999_45389160:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000445582:exon_45388999_45389034:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000398063:exon_45388999_45389160:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000398058:exon_45388999_45389160:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000457068:exon_45388999_45389160:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000422850:exon_45388999_45389160:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000479117:exon_45388999_45389160:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000481319:exon_45388999_45389148:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000467358:exon_45388999_45389160:AGPAT3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 45503121 G/A 1 8 1 9 3.41384415983832 0.57326948002021 2.84057467981811 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0881139701997098 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45502669_45503183:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45502669_45503183:TRAPPC10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 45523416 C/T 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 T:C C T 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45523174_45526433:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45523174_45524614:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000459741:exon_45523174_45526433:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000468864:exon_45523174_45524932:TRAPPC10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 45528919 G/A 1 5 5 10 2.13365259989895 2.86634740010105 -0.732694800202101 A:G G A 10 0.57326948002021 0.752834960365011 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45528865_45528977:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000456705:exon_45528865_45528977:PWP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 45538647 T/C 1 12 2 14 5.12076623975748 1.14653896004042 3.97422727971706 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0326866049956063 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45538644_45538714:PWP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 45540919 A/G 1 18 11 29 7.68114935963622 6.30596428022231 1.37518507941391 A:G A G 10 0.57326948002021 0.708728911475518 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45540833_45540983:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45540833_45542238:PWP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 45547886 G/A 1 18 9 27 7.68114935963622 5.15942532018189 2.52172403945433 A:G G A 10 0.57326948002021 0.437000269366422 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45547813_45548031:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000494310:exon_45547813_45548031:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000476948:exon_45547680_45548031:PWP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 45547913 C/A 1 15 18 33 6.40095779969685 10.3188506403638 -3.91789284066693 A:C C A 10 0.57326948002021 0.217368410121292 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45547813_45548031:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000494310:exon_45547813_45548031:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000476948:exon_45547680_45548031:PWP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 45553596 T/C 1 52 25 77 22.1899870389491 14.3317370005053 7.85825003844383 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0834310336082152 ENSG00000160221:ENST00000291577:exon_45553487_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000495007:exon_45553498_45554036:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000427803:exon_45553500_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000493883:exon_45553521_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000480786:exon_45553556_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000348499:exon_45553562_45553720:C21orf33 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 45564766 C/G 1 133 143 276 56.7551591573121 81.97753564289 -25.222376485578 C:G C G 10 0.57326948002021 0.00231810793068168 ENSG00000160221:ENST00000291577:exon_45564703_45565605:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000495007:exon_45564702_45564894:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000348499:exon_45564703_45565605:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000449622:exon_45564702_45565605:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000419699:exon_45564703_45564798:C21orf33 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 45648905 G/A 1 26 9 35 11.0949935194745 5.15942532018189 5.93556819929265 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0585394980218781 ENSG00000160223:ENST00000407780:exon_45642874_45648927:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400377:exon_45646717_45648927:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400379:exon_45646717_45649972:ICOSLG HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 45655258 G/A 0 21 0 21 8.96134091957559 0 8.96134091957559 G G 10 0.57326948002021 1.54083226890994e-05 ENSG00000160223:ENST00000407780:exon_45655155_45655445:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000344330:exon_45655155_45655445:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400377:exon_45655155_45655445:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400379:exon_45655155_45655445:ICOSLG HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 45656774 C/T 1 8 8 16 3.41384415983832 4.58615584016168 -1.17231168032336 T:C C T 10 0.57326948002021 0.617511810756066 ENSG00000160223:ENST00000407780:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000344330:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400379:exon_45656750_45657100:ICOSLG HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 45750048 C/T 0 82 0 82 34.9919026383428 0 34.9919026383428 C C 10 0.57326948002021 3.04794307321852e-20 ENSG00000160226:ENST00000339818:exon_45748827_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000380160:exon_45749773_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000325223:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000397956:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000496321:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000462742:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000470196:exon_45749774_45750209:C21orf2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 45751822 G/A 1 11 14 25 4.69403571977769 8.02577272028294 -3.33173700050525 A:G G A 10 0.57326948002021 0.224888309077082 ENSG00000160226:ENST00000339818:exon_45751726_45751897:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000380160:exon_45751726_45751897:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000325223:exon_45751726_45751897:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000397956:exon_45751726_45751897:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000496321:exon_45751726_45751897:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000462742:exon_45750346_45751897:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000470196:exon_45751731_45751851:C21orf2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 46313442 G/T 1 22 25 47 9.38807143955538 14.3317370005053 -4.94366556094987 T:G G T 10 0.57326948002021 0.183814629473468 ENSG00000160255:ENST00000475170:exon_46313319_46313942:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46312832_46314975:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46313319_46313459:ITGB2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 46320313 C/T 1 21 3 24 8.96134091957559 1.71980844006063 7.24153247951496 T:C C T 10 0.57326948002021 0.00294997956356510 ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000320216:exon_46320235_46320390:ITGB2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 46330674 C/A 1 11 3 14 4.69403571977769 1.71980844006063 2.97422727971706 A:C C A 10 0.57326948002021 0.174656120913287 ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46330640_46330741:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523663:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000522931:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000517563:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000522688:exon_46330515_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000520389:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000524251:exon_46330515_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000517819:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397846:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000521995:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000518033:exon_46330236_46330700:ITGB2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 47614469 A/C 1 8 9 17 3.41384415983832 5.15942532018189 -1.74558116034357 A:C A C 10 0.57326948002021 0.464916768474155 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000419093:exon_47614405_47614494:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47614405_47614575:LSS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 47676711 G/A 1 16 20 36 6.82768831967664 11.4653896004042 -4.63770128072756 A:G G A 10 0.57326948002021 0.130768035009174 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000467026:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000481113:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000494755:exon_47676390_47676900:MCM3AP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 47676840 A/G 1 23 14 37 9.81480195953517 8.02577272028294 1.78902923925223 A:G A G 10 0.57326948002021 0.620118304579096 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000467026:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000481113:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000494755:exon_47676390_47676900:MCM3AP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 47695220 A/G 1 5 6 11 2.13365259989895 3.43961688012126 -1.30596428022231 A:G A G 10 0.57326948002021 0.545300564874909 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47695100_47695239:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47695100_47695239:MCM3AP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 47703734 G/A 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47703529_47703752:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47703529_47703752:MCM3AP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 47777063 G/A 1 5 5 10 2.13365259989895 2.86634740010105 -0.732694800202101 A:G G A 10 0.57326948002021 0.752834960365011 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47776889_47777106:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000337772:exon_47776889_47777106:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47776889_47777106:PCNT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 47786524 A/G 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 A:G A G 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47786499_47787054:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47786499_47787054:PCNT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 47808679 C/T 1 11 4 15 4.69403571977769 2.29307792008084 2.40095779969685 T:C C T 10 0.57326948002021 0.29761519006674 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47808657_47808799:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47808657_47808799:PCNT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 47821588 A/G 1 10 6 16 4.2673051997979 3.43961688012126 0.827688319676639 A:G A G 10 0.57326948002021 0.802879700667955 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47821465_47821635:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47821465_47821635:PCNT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 47836654 G/A 1 6 4 10 2.56038311987874 2.29307792008084 0.267305199797899 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 47850484 G/C 1 10 8 18 4.2673051997979 4.58615584016168 -0.318850640363781 C:G G C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47850421_47850571:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47850421_47850571:PCNT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 47851753 A/G 1 16 4 20 6.82768831967664 2.29307792008084 4.5346103995958 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0431631487200801 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47851443_47851892:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000482575:exon_47851443_47851949:PCNT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 47851796 G/A 1 27 7 34 11.5217240394543 4.01288636014147 7.50883767931286 A:G G A 10 0.57326948002021 0.00891877352171383 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47851443_47851892:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000482575:exon_47851443_47851949:PCNT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 47852049 G/A 1 11 13 24 4.69403571977769 7.45250324026273 -2.75846752048504 A:G G A 10 0.57326948002021 0.303503076139145 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 21 47855876 A/G 1 14 17 31 5.97422727971706 9.74558116034357 -3.77135388062651 A:G A G 10 0.57326948002021 0.204011615668564 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47855817_47856061:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47855817_47856061:PCNT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 17589297 G/A 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 A:G G A 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 17589794 C/A 1 7 5 12 2.98711363985853 2.86634740010105 0.120766239757479 A:C C A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 17630486 C/A 1 5 8 13 2.13365259989895 4.58615584016168 -2.45250324026273 A:C C A 10 0.57326948002021 0.261241293669647 ENSG00000069998:ENST00000155674:exon_17630432_17630635:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000336737:exon_17630432_17630635:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000480451:exon_17630432_17630635:CECR5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 19122665 C/T 1 8 7 15 3.41384415983832 4.01288636014147 -0.599042200303151 T:C C T 10 0.57326948002021 0.7979049378473 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19122573_19122688:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19122573_19122688:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19122573_19122688:DGCR14 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 19423250 G/A 1 105 96 201 44.8067045978779 55.0338700819402 -10.2271654840622 A:G G A 10 0.57326948002021 0.153907302501560 ENSG00000185608:ENST00000333130:exon_19423161_19423598:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000443660:exon_19423161_19423590:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000471259:exon_19423161_19423533:MRPL40 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 19789541 A/C 1 41 23 64 17.4959513191714 13.1851980404648 4.31075327870656 A:C A C 10 0.57326948002021 0.312867463994978 ENSG00000185838:ENST00000329517:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000403325:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000460402:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000451413:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000481086:exon_19789522_19789739:GNB1L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 19950263 G/T 1 47 50 97 20.0563344390501 28.6634740010105 -8.60713956196038 T:G G T 10 0.57326948002021 0.0814248289389669 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19949756_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000467943:exon_19950050_19950399:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19950070_19950338:COMT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 19950268 G/A 1 47 53 100 20.0563344390501 30.3832824410711 -10.326948002021 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0427985081096575 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19949756_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000467943:exon_19950050_19950399:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19950070_19950338:COMT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 20074006 A/G 1 7 5 12 2.98711363985853 2.86634740010105 0.120766239757479 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000128191:ENST00000351989:exon_20073210_20074206:DGCR8;ENSG00000128191:ENST00000383024:exon_20073210_20074206:DGCR8;ENSG00000128191:ENST00000495826:exon_20073343_20074844:DGCR8;ENSG00000128191:ENST00000407755:exon_20073345_20074206:DGCR8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 20103189 T/C 1 1 7 8 0.42673051997979 4.01288636014147 -3.58615584016168 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0245816827973848 ENSG00000099899:ENST00000468917:exon_20102860_20103303:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000494641:exon_20103100_20103303:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000464535:exon_20103133_20103303:TRMT2A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 20131116 G/A 1 10 3 13 4.2673051997979 1.71980844006063 2.54749675973727 A:G G A 10 0.57326948002021 0.173621486623774 ENSG00000099904:ENST00000334554:exon_20130279_20131279:ZDHHC8;ENSG00000099904:ENST00000320602:exon_20130279_20131279:ZDHHC8;ENSG00000099904:ENST00000405930:exon_20130279_20131279:ZDHHC8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 21982892 C/T 1 35 28 63 14.9355681992926 16.0515454405659 -1.11597724127323 T:C C T 10 0.57326948002021 0.799773477714156 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21982381_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21982403_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21982411_21983076:YDJC HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 21984205 A/G 1 22 11 33 9.38807143955538 6.30596428022231 3.08210715933307 A:G A G 10 0.57326948002021 0.297231884099840 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21984140_21984301:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21983597_21984320:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21984140_21984353:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21984140_21984353:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21984140_21984332:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21984140_21984327:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21984140_21984303:YDJC HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 24108412 G/A 1 199 165 364 84.9193734759782 94.5894642033347 -9.67009072735645 A:G G A 10 0.57326948002021 0.31426284723768 ENSG00000250479:ENST00000476831:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000520222:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000401675:exon_24108315_24108483:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000484558:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000523865:exon_24108315_24108651:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000517886:exon_24108315_24108462:CHCHD10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 24167513 G/A 1 96 110 206 40.9661299180598 63.0596428022231 -22.0935128841633 A:G G A 10 0.57326948002021 0.00237367215884097 ENSG00000099956:ENST00000344921:exon_24167412_24167602:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000263121:exon_24167412_24167602:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000407422:exon_24167412_24167602:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000407082:exon_24167412_24167602:SMARCB1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 24179132 G/A 1 14 11 25 5.97422727971706 6.30596428022231 -0.331737000505251 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000099958:ENST00000404056:exon_24176690_24179404:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000290730:exon_24176690_24179341:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000464034:exon_24178921_24179149:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000488272:exon_24178921_24179149:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000318109:exon_24178921_24179149:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000476077:exon_24178921_24179341:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000464110:exon_24178954_24179341:DERL3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 24313743 T/G 1 195 312 507 83.212451396059 178.860077766306 -95.6476263702465 A:T:G T G 10 0.57326948002021 1.92419473539217e-17 ENSG00000099974:ENST00000215770:exon_24313475_24314721:DDTL;ENSG00000099977:ENST00000398344:exon_24313554_24313812:DDT;ENSG00000099977:ENST00000350608:exon_24313554_24313812:DDT;ENSG00000099977:ENST00000428792:exon_24313559_24313812:DDT;ENSG00000099977:ENST00000404092:exon_24313567_24313812:DDT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 24964128 T/C 1 357 385 742 152.342795632785 220.708749807781 -68.3659541749959 A:T:C:G T C 10 0.57326948002021 5.07028051621609e-07 ENSG00000100028:ENST00000215829:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000457691:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000402849:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000404603:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000458544:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000448916:exon_24963952_24964144:SNRPD3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 25016283 C/T 1 4 6 10 1.70692207991916 3.43961688012126 -1.7326948002021 T:C C T 10 0.57326948002021 0.342315301618549 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 25753231 G/A 1 3 8 11 1.28019155993937 4.58615584016168 -3.30596428022231 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0642027293927821 ENSG00000100068:ENST00000467672:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402859:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000444995:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402785:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000474163:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000484509:exon_25753222_25753773:LRP5L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 26860269 G/C 1 8 6 14 3.41384415983832 3.43961688012126 -0.0257727202829408 C:G G C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000312736:exon_26860210_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000422379:exon_26860205_26860792:HPS4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 29196494 C/T 1 14 19 33 5.97422727971706 10.892120120384 -4.91789284066693 T:C C T 10 0.57326948002021 0.111857154160159 ENSG00000100219:ENST00000216037:exon_29196286_29196585:XBP1;ENSG00000100219:ENST00000403532:exon_29196286_29196546:XBP1;ENSG00000100219:ENST00000344347:exon_29196286_29196544:XBP1;ENSG00000100219:ENST00000415306:exon_29196286_29196535:XBP1;ENSG00000100219:ENST00000482720:exon_29196286_29196557:XBP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 30163526 A/G 1 261 241 502 111.376665714725 138.157944684871 -26.7812789701454 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0167352575499794 ENSG00000184076:ENST00000330029:exon_30163358_30163537:UQCR10;ENSG00000184076:ENST00000401406:exon_30163363_30163596:UQCR10;ENSG00000184076:ENST00000332801:exon_30163440_30163537:UQCR10;ENSG00000184076:ENST00000406782:exon_30163388_30163558:UQCR10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 30184950 A/G 1 65 84 149 27.7374837986863 48.1546363216976 -20.4171525230113 A:G A G 10 0.57326948002021 0.000873377451109933 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30184597_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30184600_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30184605_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30184631_30185173:ASCC2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 30689998 G/A 1 7 10 17 2.98711363985853 5.7326948002021 -2.74558116034357 A:G G A 10 0.57326948002021 0.221546928311467 ENSG00000248751:ENST00000330168:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000434987:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000434291:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000418047:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000447976:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000470854:exon_30689974_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000467596:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000462073:exon_30689640_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000466666:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000437122:exon_30689910_30690099:TBC1D10A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 31838085 G/A 1 17 17 34 7.25441883965643 9.74558116034357 -2.49116232068714 A:G G A 10 0.57326948002021 0.392022589767345 ENSG00000184708:ENST00000344710:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000495101:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397525:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000330125:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000382180:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397523:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000420671:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000445424:exon_31837789_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000475437:exon_31838021_31838104:EIF4ENIF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 31998612 G/A 1 7 12 19 2.98711363985853 6.87923376024252 -3.89212012038399 A:G G A 10 0.57326948002021 0.102154620750249 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000524296:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000417682:exon_31998593_31998771:SFI1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 32002294 T/C 1 6 9 15 2.56038311987874 5.15942532018189 -2.59904220030315 T:C T C 10 0.57326948002021 0.198144643439766 ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32000855_32002416:SFI1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 32352791 G/A 1 79 79 158 33.7117110784034 45.2882889215966 -11.5765778431932 A:G G A 10 0.57326948002021 0.064639431873855 ENSG00000128245:ENST00000248975:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000397492:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000471374:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000427094:exon_32352126_32353589:YWHAH HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 35742925 T/G 1 26 16 42 11.0949935194745 9.17231168032336 1.92268183915118 T:G T G 10 0.57326948002021 0.64063792575317 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35742923_35742962:TOM1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 35743124 G/C 1 28 21 49 11.9484545594341 12.0386590804244 -0.0902045209902926 C:G G C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35743048_35743966:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35743048_35743952:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35743048_35743974:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35743048_35743976:TOM1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 35802661 C/G 1 39 35 74 16.6424902792118 20.0644318007074 -3.42194152149555 C:G C G 10 0.57326948002021 0.480964188669524 ENSG00000100297:ENST00000216122:exon_35802546_35802718:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000447561:exon_35802546_35802718:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000444582:exon_35802546_35802718:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000382011:exon_35802546_35802718:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000455261:exon_35802546_35802718:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000416905:exon_35802546_35802718:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000444778:exon_35802546_35802718:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000426383:exon_35802546_35802718:MCM5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 35815880 G/A 1 175 159 334 74.6778409964632 91.1498473232134 -16.4720063267501 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0765502382327762 ENSG00000100297:ENST00000216122:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000447561:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000382011:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000455261:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000426383:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000493076:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000402457:exon_35815877_35816005:MCM5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 36684331 C/T 1 102 114 216 43.5265130379386 65.3527207223039 -21.8262076843654 T:C C T 10 0.57326948002021 0.00303576340717229 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 36684354 T/C 1 97 92 189 41.3928604380396 52.7407921618593 -11.3479317238197 T:C T C 10 0.57326948002021 0.105529732205559 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 36684358 C/A 1 103 77 180 43.9532435579184 44.1417499615562 -0.18850640363781 A:C C A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 36912448 A/G 1 9 2 11 3.84057467981811 1.14653896004042 2.69403571977769 A:G A G 10 0.57326948002021 0.131175688856066 ENSG00000100353:ENST00000462794:exon_36912110_36912654:EIF3D HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 36912630 A/G 1 154 150 304 65.7165000768877 85.9904220030315 -20.2739219261439 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0202960005466456 ENSG00000100353:ENST00000397177:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000216190:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000405442:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000426531:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000458572:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000462794:exon_36912110_36912654:EIF3D HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 36921659 G/C 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 C:G G C 10 0.57326948002021 0.509627549256674 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 36922052 T/C 1 45 51 96 19.2028733990905 29.2367434810307 -10.0338700819402 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0395162950414921 ENSG00000100353:ENST00000397177:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000216190:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000405442:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000455547:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000457241:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000432675:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000402116:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000496875:exon_36921711_36922178:EIF3D HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 36922067 G/A 1 34 41 75 14.5088376793129 23.5040486808286 -8.99521100151575 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0464502138777865 ENSG00000100353:ENST00000397177:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000216190:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000405442:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000455547:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000457241:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000432675:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000402116:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000496875:exon_36921711_36922178:EIF3D HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 37273805 C/T 1 92 103 195 39.2592078381407 59.0467564420816 -19.787548603941 T:C:G C T 10 0.57326948002021 0.00467326494054972 ENSG00000100365:ENST00000248899:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37273670_37273806:NCF4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 37333794 A/G 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 A:G A G 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000100368:ENST00000403662:exon_37333419_37336491:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000262825:exon_37333419_37336481:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000406230:exon_37333419_37334653:CSF2RB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 37414468 T/G 1 4 11 15 1.70692207991916 6.30596428022231 -4.59904220030315 T:G T G 10 0.57326948002021 0.0192066748704768 ENSG00000128311:ENST00000403892:exon_37414179_37415508:TST;ENSG00000128311:ENST00000249042:exon_37414179_37414794:TST;ENSG00000128311:ENST00000413912:exon_37414179_37414794:TST;ENSG00000128311:ENST00000438203:exon_37414402_37414794:TST HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 37524619 G/T 1 12 16 28 5.12076623975748 9.17231168032336 -4.05154544056588 T:G G T 10 0.57326948002021 0.129977558853454 ENSG00000100385:ENST00000216223:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000406505:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000445799:exon_37524065_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000431111:exon_37524133_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000483573:exon_37524562_37524888:IL2RB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 37622815 A/G 1 183 218 401 78.0916851563016 124.972746644406 -46.8810614881042 A:G A G 10 0.57326948002021 3.08760120837412e-06 ENSG00000128340:ENST00000249071:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000417990:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000406508:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000481215:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000405484:exon_37622713_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000458421:exon_37622713_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000441619:exon_37622793_37622843:RAC2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 38035851 A/G 1 4 10 14 1.70692207991916 5.7326948002021 -4.02577272028294 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0543340383697456 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38035057_38035853:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38035482_38035853:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000336738:exon_38035684_38035853:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38035684_38035853:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38035700_38035853:SH3BP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 38039128 A/G 1 10 24 34 4.2673051997979 13.758467520485 -9.49116232068714 A:G A G 10 0.57326948002021 0.00142296286023328 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38039105_38039181:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38039105_38039181:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000336738:exon_38039105_38039181:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38039105_38039181:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38039105_38039181:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38039105_38039181:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000495174:exon_38039105_38039181:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38039105_38039181:SH3BP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 38039708 T/C 1 28 33 61 11.9484545594341 18.9178928406669 -6.96943828123281 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0915741976335109 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000336738:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000495174:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000471650:exon_38039462_38039795:SH3BP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 38046718 A/G 1 21 19 40 8.96134091957559 10.892120120384 -1.9307792008084 A:G A G 10 0.57326948002021 0.632079311578613 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000466097:exon_38046549_38046785:SH3BP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 38051999 C/T 1 60 67 127 25.6038311987874 38.4090551613541 -12.8052239625667 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0246622115072679 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38051933_38052049:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38051933_38052048:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38051933_38052049:SH3BP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 38084910 T/C 1 12 13 25 5.12076623975748 7.45250324026273 -2.33173700050525 T:C T C 10 0.57326948002021 0.419590889375568 ENSG00000100101:ENST00000493862:exon_38084857_38084999:NOL12;ENSG00000100101:ENST00000359114:exon_38084857_38084999:NOL12;ENSG00000100101:ENST00000438329:exon_38084857_38084999:NOL12;ENSG00000100101:ENST00000468597:exon_38084857_38084999:NOL12;ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38084857_38084999:NOL12;ENSG00000100101:ENST00000484650:exon_38084857_38084999:NOL12 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 38204089 C/T 1 8 10 18 3.41384415983832 5.7326948002021 -2.31885064036378 T:C C T 10 0.57326948002021 0.34156534419122 ENSG00000100116:ENST00000323205:exon_38203912_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38203919_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000445195:exon_38203923_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000415371:exon_38203930_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000478203:exon_38203941_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000426858:exon_38203945_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000451984:exon_38204021_38204170:GCAT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 38212624 C/T 1 42 33 75 17.9226818391512 18.9178928406669 -0.995211001515752 T:C C T 10 0.57326948002021 0.816493383680874 ENSG00000100116:ENST00000323205:exon_38212574_38212732:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38212574_38212904:GCAT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 39440149 C/T 1 11 5 16 4.69403571977769 2.86634740010105 1.82768831967664 T:C C T 10 0.57326948002021 0.452437779938541 ENSG00000128394:ENST00000381565:exon_39440088_39440428:APOBEC3F HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 39448711 C/A 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 A:C C A 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 39448750 T/C 1 6 6 12 2.56038311987874 3.43961688012126 -0.879233760242521 T:C T C 10 0.57326948002021 0.771962928640395 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 39477123 T/C 1 27 22 49 11.5217240394543 12.6119285604446 -1.09020452099029 T:C T C 10 0.57326948002021 0.774067141426912 ENSG00000239713:ENST00000407997:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000480000:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000461827:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000486357:exon_39476938_39477199:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000494150:exon_39475667_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000481958:exon_39476640_39477232:APOBEC3G HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 39477566 A/G 1 31 25 56 13.2286461193735 14.3317370005053 -1.10309088113176 A:G A G 10 0.57326948002021 0.788079451579218 ENSG00000239713:ENST00000407997:exon_39477476_39477590:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000480000:exon_39477476_39477692:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000461827:exon_39477476_39477590:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000494150:exon_39477476_39478684:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000481958:exon_39477476_39479219:APOBEC3G HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 39496412 G/C 1 6 7 13 2.56038311987874 4.01288636014147 -1.45250324026273 C:G G C 10 0.57326948002021 0.418185809776403 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 39497404 G/C 1 11 1 12 4.69403571977769 0.57326948002021 4.12076623975748 C:G G C 10 0.57326948002021 0.0174805184170179 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 39498038 G/C 1 13 3 16 5.54749675973727 1.71980844006063 3.82768831967664 C:G G C 10 0.57326948002021 0.0744376636268041 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497923_39498053:APOBEC3H HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 39917515 A/C 1 197 183 380 84.0659124360186 104.908314843698 -20.8424024076798 A:C A C 10 0.57326948002021 0.0333792170948699 ENSG00000128272:ENST00000404241:exon_39917359_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000337304:exon_39916569_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000396680:exon_39917359_39917676:ATF4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 40814500 T/C 1 4 8 12 1.70692207991916 4.58615584016168 -2.87923376024252 T:C T C 10 0.57326948002021 0.141786607964141 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000469304:exon_40814378_40814524:MKL1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 40814533 C/T 1 5 9 14 2.13365259989895 5.15942532018189 -3.02577272028294 T:C C T 10 0.57326948002021 0.112496331869413 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 40814636 C/T 1 2 10 12 0.85346103995958 5.7326948002021 -4.87923376024252 T:C C T 10 0.57326948002021 0.00622716432297784 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 40815089 G/C 1 6 7 13 2.56038311987874 4.01288636014147 -1.45250324026273 C:G G C 10 0.57326948002021 0.418185809776403 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 41626240 G/A 1 18 21 39 7.68114935963622 12.0386590804244 -4.35750972078819 A:G G A 10 0.57326948002021 0.194863329204646 ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41626143_41627275:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41626143_41626658:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41626143_41627274:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41626143_41627275:L3MBTL2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 41648966 A/G 1 28 17 45 11.9484545594341 9.74558116034357 2.20287339909055 A:G A G 10 0.57326948002021 0.549435382361426 ENSG00000100401:ENST00000405486:exon_41648876_41648995:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000356244:exon_41648876_41648995:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000405383:exon_41648876_41648995:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000455915:exon_41648876_41648995:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000407260:exon_41648876_41648995:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000493783:exon_41648876_41649036:RANGAP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 41726053 G/A 1 6 6 12 2.56038311987874 3.43961688012126 -0.879233760242521 A:G G A 10 0.57326948002021 0.771962928640395 ENSG00000100403:ENST00000352645:exon_41726027_41726107:ZC3H7B;ENSG00000100403:ENST00000351589:exon_41726027_41726107:ZC3H7B;ENSG00000100403:ENST00000486331:exon_41726027_41726107:ZC3H7B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 41833116 C/T 1 7 3 10 2.98711363985853 1.71980844006063 1.2673051997979 T:C C T 10 0.57326948002021 0.532053210294076 ENSG00000183864:ENST00000327492:exon_41829496_41833411:TOB2;ENSG00000183864:ENST00000434408:exon_41833046_41833411:TOB2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 41911525 C/T 1 23 24 47 9.81480195953517 13.758467520485 -3.94366556094987 T:C C T 10 0.57326948002021 0.301859119359584 ENSG00000100412:ENST00000216254:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000396512:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000478010:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000481310:exon_41911517_41911539:ACO2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 41980567 C/T 1 17 15 32 7.25441883965643 8.59904220030315 -1.34462336064672 A:T:C C T 10 0.57326948002021 0.721478695176765 ENSG00000100417:ENST00000216259:exon_41980531_41980607:PMM1;ENSG00000100417:ENST00000482178:exon_41980531_41981406:PMM1;ENSG00000100417:ENST00000472620:exon_41980531_41980607:PMM1;ENSG00000100417:ENST00000485648:exon_41980531_41980607:PMM1;ENSG00000100417:ENST00000466645:exon_41980531_41980607:PMM1;ENSG00000100417:ENST00000478337:exon_41980010_41980607:PMM1;ENSG00000100417:ENST00000414636:exon_41980531_41980607:PMM1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 42059833 G/A 1 414 399 813 176.666435271633 228.734522528064 -52.0680872564308 A:C:G G A 10 0.57326948002021 0.000255958973240188 ENSG00000196419:ENST00000360079:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402580:exon_42059626_42060044:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000428575:exon_42059626_42060042:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000359308:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405878:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402409:exon_42059645_42060010:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405506:exon_42059626_42060038:XRCC6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 42076330 G/A 1 54 60 114 23.0434480789087 34.3961688012126 -11.3527207223039 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0368770719185709 ENSG00000100138:ENST00000355257:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000215956:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000401959:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000463675:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000402458:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000488571:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000469028:exon_42076250_42076368:NHP2L1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 42177816 C/A 1 20 17 37 8.5346103995958 9.74558116034357 -1.21097076074777 A:C C A 10 0.57326948002021 0.740714372974236 ENSG00000167077:ENST00000401548:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000400107:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000300398:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000419798:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000462450:exon_42177689_42177828:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000498456:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000487535:exon_42177355_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000476893:exon_42177403_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000484966:exon_42177450_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000403492:exon_42177739_42177849:MEI1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 42191540 C/T 1 19 10 29 8.10787987961601 5.7326948002021 2.37518507941391 T:C C T 10 0.57326948002021 0.454314630634957 ENSG00000167077:ENST00000401548:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000400107:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000487535:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000476893:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000484966:exon_42191415_42191546:MEI1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 42276825 G/A 1 19 11 30 8.10787987961601 6.30596428022231 1.8019155993937 A:G G A 10 0.57326948002021 0.582251642589673 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42276720_42276996:SREBF2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 42341308 A/G 1 40 30 70 17.0692207991916 17.1980844006063 -0.128863601414704 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000100162:ENST00000215980:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000404067:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402338:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000407253:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000442367:exon_42341229_42341393:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402420:exon_42341229_42341393:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000396437:exon_42340925_42341308:CENPM HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 42343091 G/A 1 22 17 39 9.38807143955538 9.74558116034357 -0.357509720788192 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000100162:ENST00000215980:exon_42343024_42343168:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000407253:exon_42343024_42343140:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000442367:exon_42343024_42343148:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000396437:exon_42343024_42343155:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000460824:exon_42343024_42343137:CENPM HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 42463814 C/T 1 7 7 14 2.98711363985853 4.01288636014147 -1.02577272028294 T:C C T 10 0.57326948002021 0.5990458397462 ENSG00000198951:ENST00000396398:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000403363:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000402937:exon_42463769_42463940:NAGA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 42486723 G/A 1 287 118 405 122.4716592342 67.6457986423848 54.8258605918149 A:G G A 10 0.57326948002021 2.07658447036147e-08 ENSG00000184983:ENST00000498737:exon_42486610_42486959:NDUFA6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 42486765 C/T 1 31 16 47 13.2286461193735 9.17231168032336 4.05633443905013 T:C C T 10 0.57326948002021 0.242510686092321 ENSG00000184983:ENST00000498737:exon_42486610_42486959:NDUFA6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 42910142 C/T 1 113 49 162 48.2205487577163 28.0902045209903 20.130344236726 T:C:G C T 10 0.57326948002021 0.00141751302842922 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42910112_42910310:RRP7A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 42968536 G/A 1 6 6 12 2.56038311987874 3.43961688012126 -0.879233760242521 A:G G A 10 0.57326948002021 0.771962928640395 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 43088971 C/T 1 16 21 37 6.82768831967664 12.0386590804244 -5.21097076074777 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0965853684749376 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 43089055 G/C 1 17 29 46 7.25441883965643 16.6248149205861 -9.37039608092966 T:C:G G C 10 0.57326948002021 0.00675516863654033 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 43089289 G/A 1 23 22 45 9.81480195953517 12.6119285604446 -2.79712660090945 A:G G A 10 0.57326948002021 0.451877469232294 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 43089849 T/C 1 9 11 20 3.84057467981811 6.30596428022231 -2.4653896004042 T:C T C 10 0.57326948002021 0.269322135581906 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 43195147 A/G 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 A:G A G 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000429508:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000452960:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000456251:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000440262:exon_43195045_43195166:ARFGAP3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 43203137 C/T 1 6 4 10 2.56038311987874 2.29307792008084 0.267305199797899 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000429508:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000452960:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000456251:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453516:exon_43203080_43203169:ARFGAP3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 43308063 G/A 1 7 5 12 2.98711363985853 2.86634740010105 0.120766239757479 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000100266:ENST00000263246:exon_43308027_43308163:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000337959:exon_43308027_43308163:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000407585:exon_43308027_43308163:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000403744:exon_43308027_43308163:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000402229:exon_43308027_43308163:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000436831:exon_43308027_43308094:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000453643:exon_43308027_43308163:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000418133:exon_43308027_43308163:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000422336:exon_43308027_43308163:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000445706:exon_43308027_43308163:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000453079:exon_43308027_43308163:PACSIN2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 43455531 C/T 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 T:C C T 10 0.57326948002021 0.741310101183539 ENSG00000100271:ENST00000495814:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000343040:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000439248:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000266254:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000331018:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000443978:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000440761:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000438461:exon_43455390_43455533:TTLL1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 43570546 G/A 1 14 15 29 5.97422727971706 8.59904220030315 -2.62481492058609 A:G G A 10 0.57326948002021 0.351504521856456 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43570505_43570621:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43570505_43570621:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43570505_43570621:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000484118:exon_43570505_43570621:TTLL12 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 43575935 C/T 1 8 9 17 3.41384415983832 5.15942532018189 -1.74558116034357 T:C C T 10 0.57326948002021 0.464916768474155 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43575847_43576006:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43575847_43576006:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43575847_43576006:TTLL12 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 43576904 G/A 1 6 7 13 2.56038311987874 4.01288636014147 -1.45250324026273 A:G G A 10 0.57326948002021 0.418185809776403 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43576748_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43576748_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000357017:exon_43576762_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43576748_43576946:TTLL12 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 44586522 C/T 1 12 20 32 5.12076623975748 11.4653896004042 -6.34462336064672 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0307023658694406 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44586431_44586546:PARVG HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 44594584 C/G 1 23 24 47 9.81480195953517 13.758467520485 -3.94366556094987 C:G C G 10 0.57326948002021 0.301859119359584 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000472551:exon_44594501_44594602:PARVG HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 45128232 T/C 1 4 6 10 1.70692207991916 3.43961688012126 -1.7326948002021 T:C T C 10 0.57326948002021 0.342315301618549 ENSG00000186654:ENST00000432186:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000492475:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000006251:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000404016:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000403581:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396141:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000336985:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000457960:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000431834:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000418332:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396139:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000432916:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000477331:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000455389:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000495017:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000241484:ENST00000517296:exon_45128131_45128271:ARHGAP8;ENSG00000248405:ENST00000352766:exon_45128131_45128271:PRR5-ARHGAP8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 45132687 G/A 1 11 6 17 4.69403571977769 3.43961688012126 1.25441883965643 A:G G A 10 0.57326948002021 0.629145660806696 ENSG00000186654:ENST00000432186:exon_45132652_45132789:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000492475:exon_45132652_45132754:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000006251:exon_45132652_45133560:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000404016:exon_45132652_45133545:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000403581:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396141:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000336985:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000431834:exon_45132652_45133321:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000418332:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396139:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000432916:exon_45132652_45133542:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000477331:exon_45132652_45133095:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000455389:exon_45132652_45133512:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000495017:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000475850:exon_45132652_45133561:PRR5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 45577231 T/C 1 3 7 10 1.28019155993937 4.01288636014147 -2.7326948002021 A:T:C T C 10 0.57326948002021 0.109775478323748 ENSG00000093000:ENST00000347635:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000432759:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000425733:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000355253:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000407019:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000493456:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000396096:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000440908:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000422489:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000469163:exon_45577167_45577248:NUP50 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 46704577 T/G 1 13 16 29 5.54749675973727 9.17231168032336 -3.62481492058609 T:G T G 10 0.57326948002021 0.191464076020977 ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46704216_46704840:GTSE1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 46704771 C/T 1 13 8 21 5.54749675973727 4.58615584016168 0.961340919575589 T:C C T 10 0.57326948002021 0.826246679179264 ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46704216_46704840:GTSE1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 50356555 T/C 1 6 9 15 2.56038311987874 5.15942532018189 -2.59904220030315 T:C T C 10 0.57326948002021 0.198144643439766 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 50356693 T/C 1 74 92 166 31.5780584785045 52.7407921618593 -21.1627336833549 T:C T C 10 0.57326948002021 0.00122590489784635 ENSG00000198355:ENST00000360612:exon_50356588_50357728:PIM3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 50635848 C/G 1 9 5 14 3.84057467981811 2.86634740010105 0.974227279717059 C:G C G 10 0.57326948002021 0.788481610276296 ENSG00000170638:ENST00000472677:exon_50635322_50636615:TRABD HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 50648577 C/T 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.730571677019219 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 50658698 T/A 1 10 10 20 4.2673051997979 5.7326948002021 -1.4653896004042 A:T T A 10 0.57326948002021 0.508038948022547 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658621_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50658680_50658845:TUBGCP6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 50716167 G/A 1 24 23 47 10.241532479515 13.1851980404648 -2.94366556094987 A:G G A 10 0.57326948002021 0.461261755452396 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479818:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50716020_50716167:PLXNB2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 50719251 A/G 1 19 20 39 8.10787987961601 11.4653896004042 -3.35750972078819 A:G A G 10 0.57326948002021 0.331619302492795 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50719173_50719402:PLXNB2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 50722134 T/C 1 3 6 9 1.28019155993937 3.43961688012126 -2.15942532018189 T:C T C 10 0.57326948002021 0.183674374674640 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000496720:exon_50722031_50722179:PLXNB2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 50751529 G/C 1 20 38 58 8.5346103995958 21.784240240768 -13.2496298411722 C:G G C 10 0.57326948002021 0.000499588728444672 ENSG00000205593:ENST00000413817:exon_50751428_50751537:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000380836:exon_50751428_50751537:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000495607:exon_50751428_50751537:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000411673:exon_50751428_50751537:FAM116B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 50877144 C/T 1 8 13 21 3.41384415983832 7.45250324026273 -4.03865908042441 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0812407434582742 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50877028_50877191:PPP6R2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 50928026 G/A 1 2 10 12 0.85346103995958 5.7326948002021 -4.87923376024252 A:G G A 10 0.57326948002021 0.00622716432297784 ENSG00000100253:ENST00000216075:exon_50927961_50928073:MIOX;ENSG00000100253:ENST00000395732:exon_50927961_50928059:MIOX;ENSG00000100253:ENST00000451761:exon_50927961_50928073:MIOX HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 50942121 C/T 1 28 14 42 11.9484545594341 8.02577272028294 3.92268183915118 T:C C T 10 0.57326948002021 0.274966634431200 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50941380_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50941426_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50941690_50942128:LMF2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 50943004 C/A 1 12 2 14 5.12076623975748 1.14653896004042 3.97422727971706 A:C C A 10 0.57326948002021 0.0326866049956063 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50942988_50943081:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50942769_50943156:LMF2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 50943010 G/A 1 11 2 13 4.69403571977769 1.14653896004042 3.54749675973727 A:G G A 10 0.57326948002021 0.052191540754762 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50942988_50943081:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50942769_50943156:LMF2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 50943232 G/A 1 19 11 30 8.10787987961601 6.30596428022231 1.8019155993937 A:G G A 10 0.57326948002021 0.582251642589673 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50943231_50943413:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50943231_50943413:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50943231_50943413:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50943231_50943413:LMF2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 50944163 G/A 1 5 6 11 2.13365259989895 3.43961688012126 -1.30596428022231 A:G G A 10 0.57326948002021 0.545300564874909 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 50961169 A/G 1 6 6 12 2.56038311987874 3.43961688012126 -0.879233760242521 A:G A G 10 0.57326948002021 0.771962928640395 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 50962208 T/G 1 165 125 290 70.4105357966653 71.6586850025263 -1.24814920586091 T:G T G 10 0.57326948002021 0.905538215603506 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 50962782 C/G 1 56 56 112 23.8969091188682 32.1030908811318 -8.20618176226353 C:G C G 10 0.57326948002021 0.126546526770548 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000439934:exon_50962431_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000423348:exon_50962431_50962853:SCO2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 50964153 T/C 1 7 3 10 2.98711363985853 1.71980844006063 1.2673051997979 T:C T C 10 0.57326948002021 0.532053210294076 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 50964862 G/A 1 56 61 117 23.8969091188682 34.9694382812328 -11.0725291623646 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0400221955335025 ENSG00000130489:ENST00000423348:exon_50964675_50964868:SCO2;ENSG00000025708:ENST00000395680:exon_50964675_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395681:exon_50964675_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000252029:exon_50964675_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000487577:exon_50964675_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395678:exon_50964675_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000476284:exon_50964430_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000425169:exon_50964675_50964905:TYMP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 51011376 G/C 1 12 15 27 5.12076623975748 8.59904220030315 -3.47827596054567 C:G G C 10 0.57326948002021 0.179899627685799 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000475238:exon_51011304_51011529:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000423069:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51011304_51011489:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51011304_51011489:CTA-384D8.32 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 51063610 C/T 1 5 14 19 2.13365259989895 8.02577272028294 -5.89212012038399 T:C C T 10 0.57326948002021 0.00903562790233332 ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51063446_51063892:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51063446_51063892:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51063450_51063892:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51063456_51063892:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51063457_51063892:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51063461_51063892:ARSA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 51064416 T/C 1 5 10 15 2.13365259989895 5.7326948002021 -3.59904220030315 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0702450866322387 ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51064364_51064491:ARSA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 22 51065600 G/A 1 9 3 12 3.84057467981811 1.71980844006063 2.12076623975748 A:G G A 10 0.57326948002021 0.256104231229550 ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51065594_51065834:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51065594_51065834:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51065594_51065834:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51065594_51065834:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51065594_51065834:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51065594_51065834:ARSA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 3197918 A/G 1 3 5 8 1.28019155993937 2.86634740010105 -1.58615584016168 A:G A G 10 0.57326948002021 0.29890034016204 ENSG00000113851:ENST00000491834:exon_3195108_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000231948:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000432408:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000424814:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000488263:exon_3195108_3198468:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000482844:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000480249:exon_3197774_3197965:CRBN HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 9406704 G/A 1 8 8 16 3.41384415983832 4.58615584016168 -1.17231168032336 A:G G A 10 0.57326948002021 0.617511810756066 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000417036:exon_9406700_9406874:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000419437:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9406700_9407004:THUMPD3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 9406836 T/C 1 7 4 11 2.98711363985853 2.29307792008084 0.694035719777689 T:C T C 10 0.57326948002021 0.767959695054619 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000417036:exon_9406700_9406874:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000419437:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9406705_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9406700_9407004:THUMPD3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 9422210 T/C 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 T:C T C 10 0.57326948002021 0.741310101183539 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000441127:exon_9422187_9422316:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000461636:exon_9422187_9422572:THUMPD3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 9425911 G/A 1 25 9 34 10.6682629994947 5.15942532018189 5.50883767931286 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0582350825728249 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000484006:exon_9425896_9426060:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9425896_9426019:THUMPD3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 9517369 C/T 1 20 19 39 8.5346103995958 10.892120120384 -2.35750972078819 T:C C T 10 0.57326948002021 0.517909441520215 ENSG00000168137:ENST00000402198:exon_9517167_9519838:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000402466:exon_9517167_9519838:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000406341:exon_9517167_9519838:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000407969:exon_9517167_9519838:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000302463:exon_9517167_9518162:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000493918:exon_9517167_9518143:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000413704:exon_9517167_9517838:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000466242:exon_9517167_9518143:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000459941:exon_9517167_9517389:SETD5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 9798773 C/G 1 5 4 9 2.13365259989895 2.29307792008084 -0.15942532018189 C:G C G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000114026:ENST00000302003:exon_9798728_9799091:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000344629:exon_9798745_9799197:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339542:exon_9798745_9799087:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339511:exon_9798451_9799061:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000425665:exon_9798451_9798888:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000383825:exon_9798451_9798875:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000416333:exon_9798728_9798875:OGG1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 9822122 C/A 1 33 32 65 14.0821071593331 18.3446233606467 -4.26251620131365 A:C C A 10 0.57326948002021 0.316290795764773 ENSG00000171148:ENST00000301964:exon_9821544_9822233:TADA3;ENSG00000171148:ENST00000492103:exon_9821651_9822233:TADA3;ENSG00000171148:ENST00000440161:exon_9821940_9822233:TADA3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 9867625 C/T 1 8 10 18 3.41384415983832 5.7326948002021 -2.31885064036378 T:C C T 10 0.57326948002021 0.34156534419122 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9867484_9867632:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000482269:exon_9867090_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000492440:exon_9867250_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000466245:exon_9867545_9867632:TTLL3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 9870857 G/A 1 25 23 48 10.6682629994947 13.1851980404648 -2.51693504097008 A:G G A 10 0.57326948002021 0.469311949283943 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9870644_9871079:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000431204:exon_9870644_9870936:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9870363_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000466245:exon_9870644_9871019:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9870847_9871079:TTLL3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 9871030 T/G 1 26 21 47 11.0949935194745 12.0386590804244 -0.943665560949873 T:G T G 10 0.57326948002021 0.770658102370439 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9870644_9871079:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9870363_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9870847_9871079:TTLL3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 9932427 G/C 1 19 27 46 8.10787987961601 15.4782759605457 -7.37039608092966 C:G G C 10 0.57326948002021 0.0359218782239474 ENSG00000171135:ENST00000307768:exon_9932238_9932495:JAGN1;ENSG00000171135:ENST00000489724:exon_9932317_9932495:JAGN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 9934605 T/C 1 31 29 60 13.2286461193735 16.6248149205861 -3.3961688012126 T:C T C 10 0.57326948002021 0.433829723969839 ENSG00000171135:ENST00000307768:exon_9934599_9936033:JAGN1;ENSG00000171135:ENST00000489724:exon_9934493_9934655:JAGN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 9990800 G/C 1 3 7 10 1.28019155993937 4.01288636014147 -2.7326948002021 C:G G C 10 0.57326948002021 0.109775478323748 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 9990892 G/C 1 8 10 18 3.41384415983832 5.7326948002021 -2.31885064036378 C:G G C 10 0.57326948002021 0.34156534419122 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 9991101 C/G 1 4 7 11 1.70692207991916 4.01288636014147 -2.30596428022231 C:G C G 10 0.57326948002021 0.223014268684580 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 9991163 A/G 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 A:G A G 10 0.57326948002021 0.741310101183539 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 10311939 C/T 1 5 6 11 2.13365259989895 3.43961688012126 -1.30596428022231 T:C C T 10 0.57326948002021 0.545300564874909 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10311815_10312699:TATDN2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 10312507 A/G 1 6 4 10 2.56038311987874 2.29307792008084 0.267305199797899 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10311815_10312699:TATDN2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 11880760 T/C 1 7 7 14 2.98711363985853 4.01288636014147 -1.02577272028294 T:C T C 10 0.57326948002021 0.5990458397462 ENSG00000144559:ENST00000273037:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000455809:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000457498:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000444133:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000411947:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000417723:exon_11880696_11880788:C3orf31 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 11887991 C/G 1 6 5 11 2.56038311987874 2.86634740010105 -0.305964280222311 C:G C G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000144559:ENST00000273037:exon_11887976_11888393:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000455809:exon_11887976_11888246:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000457498:exon_11887976_11888355:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000444133:exon_11887976_11888253:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000411947:exon_11887976_11888366:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000417723:exon_11887976_11888359:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000494388:exon_11887976_11888338:C3orf31 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 13368892 G/A 0 26 0 26 11.0949935194745 0 11.0949935194745 G G 10 0.57326948002021 6.72288922311111e-07 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13368717_13368937:NUP210 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 14174427 A/T 1 5 7 12 2.13365259989895 4.01288636014147 -1.87923376024252 A:T A T 10 0.57326948002021 0.382460042999359 ENSG00000170876:ENST00000306077:exon_14174366_14174435:TMEM43 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 14175262 T/C 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 T:C T C 10 0.57326948002021 0.741310101183539 ENSG00000170876:ENST00000306077:exon_14175239_14175309:TMEM43 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 14199908 C/T 1 6 14 20 2.56038311987874 8.02577272028294 -5.4653896004042 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0213031697059382 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14199511_14200392:XPC HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 15610070 C/T 1 18 17 35 7.68114935963622 9.74558116034357 -2.06443180070735 T:C C T 10 0.57326948002021 0.498226006157124 ENSG00000131373:ENST00000321169:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000435217:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000451445:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000383779:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000456194:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000457447:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000416898:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000422591:exon_15609939_15610093:HACL1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 16419309 C/T 1 68 37 105 29.0176753586257 21.2109707607478 7.80670459787795 T:C C T 10 0.57326948002021 0.138861382345469 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16419225_16419609:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16419225_16419609:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000451036:exon_16419226_16419609:RFTN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 20216519 T/A 1 8 5 13 3.41384415983832 2.86634740010105 0.547496759737269 A:T T A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000129810:ENST00000419233:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000263753:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000515745:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000509679:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000523325:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000522131:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000533388:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000534034:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000383774:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000425061:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000443724:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000472533:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000421451:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000482867:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412997:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000437051:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412868:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000417364:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000456624:exon_20216214_20216547:SGOL1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 23848835 A/C 1 17 12 29 7.25441883965643 6.87923376024252 0.375185079413908 A:C A C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000170142:ENST00000306627:exon_23848728_23848912:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000484048:exon_23848728_23849379:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000346855:exon_23848728_23848912:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000495141:exon_23848728_23848912:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000481622:exon_23848728_23848912:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000442670:exon_23848580_23848912:UBE2E1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 25781080 T/C 1 5 8 13 2.13365259989895 4.58615584016168 -2.45250324026273 T:C T C 10 0.57326948002021 0.261241293669647 ENSG00000151092:ENST00000428257:exon_25781068_25781290:NGLY1;ENSG00000151092:ENST00000280700:exon_25781068_25781290:NGLY1;ENSG00000151092:ENST00000493324:exon_25781068_25781290:NGLY1;ENSG00000151092:ENST00000396649:exon_25781068_25781290:NGLY1;ENSG00000151092:ENST00000308710:exon_25781068_25781290:NGLY1;ENSG00000151092:ENST00000417874:exon_25781068_25781290:NGLY1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 33174168 G/A 1 7 1 8 2.98711363985853 0.57326948002021 2.41384415983832 A:G G A 10 0.57326948002021 0.149609550462636 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33174047_33174192:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33174047_33174192:CRTAP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 33879770 G/A 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 A:G G A 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33879696_33879819:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33879696_33879819:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000412887:exon_33879696_33879819:PDCD6IP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 33907915 A/G 1 40 31 71 17.0692207991916 17.7713538806265 -0.702133081434916 A:G A G 10 0.57326948002021 0.904742933583764 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33907843_33907960:PDCD6IP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 37363353 G/T 1 15 7 22 6.40095779969685 4.01288636014147 2.38807143955538 T:G G T 10 0.57326948002021 0.390273785353222 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37363222_37363377:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37363222_37363377:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000429018:exon_37363222_37363377:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37363222_37363377:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37363222_37363377:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37363222_37363377:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37363222_37363377:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000497537:exon_37363080_37363377:GOLGA4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 37368758 T/C 1 33 47 80 14.0821071593331 26.9436655609499 -12.8615584016168 T:C T C 10 0.57326948002021 0.00447895290425039 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 38047680 G/A 1 12 6 18 5.12076623975748 3.43961688012126 1.68114935963622 A:G G A 10 0.57326948002021 0.482786461758876 ENSG00000136059:ENST00000283713:exon_38047672_38047743:VILL;ENSG00000136059:ENST00000383759:exon_38047672_38047743:VILL;ENSG00000136059:ENST00000356246:exon_38047672_38047743:VILL;ENSG00000136059:ENST00000465644:exon_38047672_38047743:VILL;ENSG00000136059:ENST00000486616:exon_38047672_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000488209:exon_38047672_38047695:VILL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 38047954 G/C 1 6 15 21 2.56038311987874 8.59904220030315 -6.03865908042441 C:G G C 10 0.57326948002021 0.0131179684069756 ENSG00000136059:ENST00000283713:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000383759:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000356246:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000465644:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000486616:exon_38047672_38048191:VILL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 42251263 C/T 1 7 8 15 2.98711363985853 4.58615584016168 -1.59904220030315 T:C C T 10 0.57326948002021 0.441591135560738 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42251259_42254115:TRAK1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 42251329 C/T 1 5 5 10 2.13365259989895 2.86634740010105 -0.732694800202101 T:C C T 10 0.57326948002021 0.752834960365011 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42251259_42254115:TRAK1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 42610374 A/G 1 7 4 11 2.98711363985853 2.29307792008084 0.694035719777689 A:G A G 10 0.57326948002021 0.767959695054619 ENSG00000093183:ENST00000423701:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000273156:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000417572:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000449617:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000264454:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456515:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000493107:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000383750:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000450981:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000445388:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000454141:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000416880:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000420163:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456222:exon_42610357_42610565:SEC22C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 42679497 C/T 1 38 42 80 16.215759759232 24.0773181608488 -7.8615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0894856680774661 ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000468735:exon_42678360_42679718:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000465584:exon_42678360_42679711:NKTR HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 42679777 T/G 1 37 47 84 15.7890292392522 26.9436655609499 -11.1546363216976 T:G T G 10 0.57326948002021 0.0151578987704970 ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 44884647 C/A 1 6 6 12 2.56038311987874 3.43961688012126 -0.879233760242521 A:C C A 10 0.57326948002021 0.771962928640395 ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000422209:exon_44884615_44884726:KIF15 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 48309828 C/G 1 6 8 14 2.56038311987874 4.58615584016168 -2.02577272028294 C:G C G 10 0.57326948002021 0.291858897104158 ENSG00000164048:ENST00000354698:exon_48309405_48312477:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000448461:exon_48309405_48312459:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000457782:exon_48309408_48312480:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000296437:exon_48309408_48310234:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000431517:exon_48309408_48310276:ZNF589 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 49323561 C/T 1 12 12 24 5.12076623975748 6.87923376024252 -1.75846752048504 T:C C T 10 0.57326948002021 0.537756757259522 ENSG00000114316:ENST00000351842:exon_49323531_49323758:USP4;ENSG00000114316:ENST00000265560:exon_49323531_49323758:USP4;ENSG00000114316:ENST00000485450:exon_49323531_49323758:USP4;ENSG00000114316:ENST00000431357:exon_49323531_49323758:USP4;ENSG00000114316:ENST00000475873:exon_49323531_49323758:USP4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 49758764 A/G 1 18 24 42 7.68114935963622 13.758467520485 -6.07731816084882 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0622662604263501 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000433785:exon_49758618_49758959:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000498376:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000173540:ENST00000480687:exon_49754277_49759316:GMPPB;ENSG00000173540:ENST00000308375:exon_49757357_49759580:GMPPB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 50005863 G/A 1 17 15 32 7.25441883965643 8.59904220030315 -1.34462336064672 A:G G A 10 0.57326948002021 0.721478695176765 ENSG00000004534:ENST00000266022:exon_50004903_50006181:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000443081:exon_50004631_50006181:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000454079:exon_50004631_50006181:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000425608:exon_50004903_50006181:RBM6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 51970296 T/G 1 24 31 55 10.241532479515 17.7713538806265 -7.52982140111155 T:G T G 10 0.57326948002021 0.041745520321588 ENSG00000114767:ENST00000232888:exon_51970273_51970365:RRP9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 52179966 T/C 1 4 6 10 1.70692207991916 3.43961688012126 -1.7326948002021 T:C T C 10 0.57326948002021 0.342315301618549 ENSG00000164087:ENST00000296484:exon_52179862_52179977:POC1A;ENSG00000164087:ENST00000394970:exon_52179862_52179977:POC1A;ENSG00000164087:ENST00000474012:exon_52179862_52179977:POC1A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 52237970 C/T 1 40 32 72 17.0692207991916 18.3446233606467 -1.27540256145512 T:C C T 10 0.57326948002021 0.811975531913966 ENSG00000023330:ENST00000469224:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000394965:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000441729:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000442476:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000310271:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000484952:exon_52237879_52238028:ALAS1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 52521920 C/T 1 7 5 12 2.98711363985853 2.86634740010105 0.120766239757479 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000010322:ENST00000479054:exon_52521212_52522621:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000345716:exon_52521212_52522621:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000414197:exon_52521212_52522621:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000489895:exon_52521212_52522621:NISCH HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 53259850 C/T 1 325 372 697 138.687418993432 213.256246567518 -74.5688275740864 T:C C T 10 0.57326948002021 1.60602854475524e-08 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53258723_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53259767_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53259655_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53259668_53262165:TKT;ENSG00000163931:ENST00000461139:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53259675_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53259718_53259947:TKT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 53264485 A/G 1 135 150 285 57.6086201972716 85.9904220030315 -28.3818018057599 A:G A G 10 0.57326948002021 0.000775865400909285 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000461139:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53264473_53264637:TKT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 53267155 G/A 1 3 5 8 1.28019155993937 2.86634740010105 -1.58615584016168 A:G G A 10 0.57326948002021 0.29890034016204 ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000466765:exon_53266776_53267290:TKT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 53267296 G/A 1 7 5 12 2.98711363985853 2.86634740010105 0.120766239757479 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000494523:exon_53267172_53269035:TKT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 53267342 G/A 1 9 5 14 3.84057467981811 2.86634740010105 0.974227279717059 A:G G A 10 0.57326948002021 0.788481610276296 ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000494523:exon_53267172_53269035:TKT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 53269046 T/C 1 94 112 206 40.1126688781003 64.2061817622635 -24.0935128841633 A:T:C T C 10 0.57326948002021 0.00088748180321283 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53268999_53269080:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53268999_53269209:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53268999_53269132:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000472528:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000466765:exon_53268999_53269176:TKT;ENSG00000163931:ENST00000487660:exon_53268868_53269190:TKT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 53269163 G/A 1 43 50 93 18.349412359131 28.6634740010105 -10.3140616418795 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0356388323951757 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53268999_53269209:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000472528:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000466765:exon_53268999_53269176:TKT;ENSG00000163931:ENST00000487660:exon_53268868_53269190:TKT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 53925849 C/T 1 23 25 48 9.81480195953517 14.3317370005053 -4.51693504097008 T:C C T 10 0.57326948002021 0.192316088333029 ENSG00000113811:ENST00000495461:exon_53925797_53926015:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000488746:exon_53925797_53925892:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000487571:exon_53925797_53925882:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000485414:exon_53925797_53925912:RP11-884K10.5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 58112488 C/T 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 T:C C T 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58112329_58112489:FLNB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 58154327 C/T 1 57 48 105 24.323639638848 27.5169350409701 -3.19329540212205 T:C C T 10 0.57326948002021 0.554524885397704 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58154167_58155520:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000484981:exon_58154167_58154385:FLNB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 58410554 C/T 1 8 5 13 3.41384415983832 2.86634740010105 0.547496759737269 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000168297:ENST00000356151:exon_58410479_58410878:PXK;ENSG00000168297:ENST00000468776:exon_58410479_58410785:PXK;ENSG00000168297:ENST00000302779:exon_58410479_58410878:PXK;ENSG00000168297:ENST00000383716:exon_58410479_58410878:PXK;ENSG00000168297:ENST00000463280:exon_58410479_58411748:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479241:exon_58410479_58411746:PXK;ENSG00000168297:ENST00000477308:exon_58410479_58410785:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479134:exon_58410479_58411601:PXK;ENSG00000168297:ENST00000493474:exon_58410479_58410902:PXK HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 58414382 C/T 1 3 6 9 1.28019155993937 3.43961688012126 -2.15942532018189 T:C C T 10 0.57326948002021 0.183674374674640 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 58416535 C/T 1 23 19 42 9.81480195953517 10.892120120384 -1.07731816084882 T:C C T 10 0.57326948002021 0.756852995556134 ENSG00000168291:ENST00000302746:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000383714:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000469364:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000479945:exon_58416384_58417520:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000474765:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000461692:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000480626:exon_58416384_58416669:PDHB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 59908126 A/G 1 12 3 15 5.12076623975748 1.71980844006063 3.40095779969685 A:G A G 10 0.57326948002021 0.114787974061423 ENSG00000189283:ENST00000492590:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000476844:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000466788:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000468189:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000341848:exon_59908072_59908140:FHIT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 63981635 C/T 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 T:C C T 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000163635:ENST00000474112:exon_63981181_63982312:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000398590:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000295900:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000487717:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000484332:exon_63981181_63982159:ATXN7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 63982082 G/A 1 8 6 14 3.41384415983832 3.43961688012126 -0.0257727202829408 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000163635:ENST00000474112:exon_63981181_63982312:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000398590:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000295900:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000487717:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000484332:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000522345:exon_63981986_63982159:ATXN7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 66419942 A/G 1 11 9 20 4.69403571977769 5.15942532018189 -0.465389600404201 A:G A G 10 0.57326948002021 0.825497110151158 ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66419902_66419966:SLC25A26 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 66419956 C/T 1 11 8 19 4.69403571977769 4.58615584016168 0.107879879616009 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66419902_66419966:SLC25A26 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 73111809 A/G 1 7 2 9 2.98711363985853 1.14653896004042 1.84057467981811 A:C:G A G 10 0.57326948002021 0.31706387914541 ENSG00000255423:ENST00000533473:exon_73110810_73112488:AC103559.1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 73111998 C/T 1 7 5 12 2.98711363985853 2.86634740010105 0.120766239757479 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000255423:ENST00000533473:exon_73110810_73112488:AC103559.1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 75471230 C/T 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 T:C C T 10 0.57326948002021 1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 75471295 C/T 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 T:C C T 10 0.57326948002021 0.741310101183539 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 75471341 G/A 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 A:G G A 10 0.57326948002021 1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 75472209 C/T 1 6 8 14 2.56038311987874 4.58615584016168 -2.02577272028294 T:C C T 10 0.57326948002021 0.291858897104158 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 87276699 C/T 1 7 9 16 2.98711363985853 5.15942532018189 -2.17231168032336 T:C C T 10 0.57326948002021 0.316607002067173 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87276421_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87276435_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000494980:exon_87276452_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87276459_87276706:CHMP2B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 87294929 A/G 1 8 5 13 3.41384415983832 2.86634740010105 0.547496759737269 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87294864_87295058:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87294864_87295058:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000494980:exon_87294864_87294968:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87294864_87295058:CHMP2B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 87299075 A/C 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 A:C A C 10 0.57326948002021 0.741310101183539 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000494980:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87299025_87299127:CHMP2B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 98304467 T/C 1 9 8 17 3.84057467981811 4.58615584016168 -0.745581160343571 T:C T C 10 0.57326948002021 0.807894812450834 ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98304285_98304503:CPOX;ENSG00000080819:ENST00000510489:exon_98304285_98304706:CPOX HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 100467018 T/C 1 18 27 45 7.68114935963622 15.4782759605457 -7.79712660090945 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0230841672052596 ENSG00000114354:ENST00000418917:exon_100466993_100467786:TFG;ENSG00000114354:ENST00000490574:exon_100466993_100467771:TFG;ENSG00000114354:ENST00000240851:exon_100466993_100467810:TFG;ENSG00000114354:ENST00000406587:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000443578:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000476228:exon_100466993_100467808:TFG;ENSG00000114354:ENST00000481203:exon_100466993_100467807:TFG HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 112727184 A/T 1 10 13 23 4.2673051997979 7.45250324026273 -3.18519804046483 A:T A T 10 0.57326948002021 0.207996353000423 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000412848:exon_112727106_112727195:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112727018_112727647:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000461381:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000482229:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472762:exon_112727018_112727277:C3orf17 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 119150836 C/T 1 23 17 40 9.81480195953517 9.74558116034357 0.0692207991915978 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000176142:ENST00000438581:exon_119148347_119151061:TMEM39A;ENSG00000176142:ENST00000319172:exon_119148347_119151061:TMEM39A;ENSG00000176142:ENST00000473684:exon_119148347_119151061:TMEM39A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 119305169 G/A 1 7 4 11 2.98711363985853 2.29307792008084 0.694035719777689 A:G G A 10 0.57326948002021 0.767959695054619 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000481816:exon_119305132_119305210:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000471850:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000485496:exon_119305132_119305386:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119305132_119305492:ADPRH HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 119331874 C/T 0 0 25 25 0 14.3317370005053 -14.3317370005053 T C T 10 0.57326948002021 5.67338979565023e-10 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000475963:exon_119331864_119331965:PLA1A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 119331892 C/G 0 0 27 27 0 15.4782759605457 -15.4782759605457 A:G C G 10 0.57326948002021 1.03311824917168e-10 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000475963:exon_119331864_119331965:PLA1A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 122247579 C/T 1 19 14 33 8.10787987961601 8.02577272028294 0.0821071593330682 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122246806_122247590:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000492382:exon_122246806_122247590:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122246808_122247590:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000489652:exon_122246808_122247590:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122246852_122247590:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122246865_122247590:PARP9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 122259606 T/C 1 15 17 32 6.40095779969685 9.74558116034357 -3.34462336064672 T:C T C 10 0.57326948002021 0.283704858668405 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000492382:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000489652:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122259319_122259699:PARP9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 122274757 G/C 1 14 13 27 5.97422727971706 7.45250324026273 -1.47827596054567 C:G G C 10 0.57326948002021 0.566216117859316 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000466126:exon_122274711_122274968:PARP9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 122354037 A/G 1 39 36 75 16.6424902792118 20.6377012807276 -3.99521100151576 A:G A G 10 0.57326948002021 0.353082349228503 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122353867_122354041:PARP15 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 122354792 G/A 1 46 40 86 19.6296039190703 22.9307792008084 -3.30117528173806 A:G G A 10 0.57326948002021 0.51345987516012 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122354658_122354886:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 122864436 G/A 1 7 7 14 2.98711363985853 4.01288636014147 -1.02577272028294 A:G G A 10 0.57326948002021 0.5990458397462 ENSG00000065485:ENST00000489923:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000472319:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000467157:exon_122863354_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000485208:exon_122864369_122864439:PDIA5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 122880191 T/C 1 8 9 17 3.41384415983832 5.15942532018189 -1.74558116034357 T:C T C 10 0.57326948002021 0.464916768474155 ENSG00000065485:ENST00000489923:exon_122880168_122880302:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122880168_122880302:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122880168_122880302:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000467157:exon_122880168_122880950:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000469649:exon_122880168_122880302:PDIA5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 123634046 G/A 1 4 6 10 1.70692207991916 3.43961688012126 -1.7326948002021 A:G G A 10 0.57326948002021 0.342315301618549 ENSG00000175455:ENST00000310351:exon_123632300_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000485727:exon_123632564_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409657:exon_123632572_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000489746:exon_123632574_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000433542:exon_123633166_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409697:exon_123633469_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000488653:exon_123633469_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000483247:exon_123633509_123634136:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000419247:exon_123634046_123634136:CCDC14 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 124456742 G/C 1 20 16 36 8.5346103995958 9.17231168032336 -0.637701280727562 C:G G C 10 0.57326948002021 0.867097715567763 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124456415_124457290:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000498715:exon_124456415_124457218:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124456639_124457086:UMPS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 124462808 C/T 1 45 54 99 19.2028733990905 30.9565519210913 -11.7536785220008 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0192093348625453 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124462762_124464040:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000474588:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124462762_124463138:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000495751:exon_124462762_124462917:UMPS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 124951821 C/T 1 12 9 21 5.12076623975748 5.15942532018189 -0.0386590804244111 T:C:G C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000163848:ENST00000360647:exon_124944405_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000484491:exon_124950920_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000492394:exon_124950923_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000485866:exon_124951172_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000497929:exon_124951185_124952783:ZNF148 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 125726048 G/C 1 9 13 22 3.84057467981811 7.45250324026273 -3.61192856044462 C:G G C 10 0.57326948002021 0.134283230160958 ENSG00000114544:ENST00000360370:exon_125725198_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000346785:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000383598:exon_125725201_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000512557:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000506102:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000458524:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315891:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000508835:exon_125725699_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315921:exon_125725916_125726068:SLC41A3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 125734340 A/T 1 5 4 9 2.13365259989895 2.29307792008084 -0.15942532018189 A:T A T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000114544:ENST00000360370:exon_125734337_125734416:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000346785:exon_125734337_125734416:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000383598:exon_125734337_125734416:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000512557:exon_125734337_125734416:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000506102:exon_125734337_125734416:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000458524:exon_125734337_125734416:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315891:exon_125734337_125734416:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000508835:exon_125734337_125734416:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315921:exon_125734337_125734416:SLC41A3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 126451937 G/T 1 8 8 16 3.41384415983832 4.58615584016168 -1.17231168032336 T:G G T 10 0.57326948002021 0.617511810756066 ENSG00000159685:ENST00000290913:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000503119:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000508789:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000514908:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000513253:exon_126451921_126452065:CHCHD6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 127292333 G/A 1 46 35 81 19.6296039190703 20.0644318007074 -0.434827881637016 A:G G A 10 0.57326948002021 0.911188101945285 ENSG00000163870:ENST00000296210:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000450633:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000355552:exon_127291930_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000393400:exon_127291936_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000483868:exon_127291974_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000489960:exon_127291989_127292631:TPRA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 127323818 C/T 1 19 10 29 8.10787987961601 5.7326948002021 2.37518507941391 T:C C T 10 0.57326948002021 0.454314630634957 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468659:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127323739_127323999:MCM2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 127323830 C/T 1 13 19 32 5.54749675973727 10.892120120384 -5.34462336064672 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0726299501727317 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468659:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127323739_127323999:MCM2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 128344786 G/A 1 49 54 103 20.9097954790097 30.9565519210913 -10.0467564420816 A:T:G G A 10 0.57326948002021 0.0467909735321631 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128344717_128344855:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128344717_128344855:RPN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 128356852 C/T 1 21 21 42 8.96134091957559 12.0386590804244 -3.07731816084882 T:C C T 10 0.57326948002021 0.352547289305668 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000495462:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000479113:exon_128356663_128356948:RPN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 128614185 A/C 1 7 1 8 2.98711363985853 0.57326948002021 2.41384415983832 A:C A C 10 0.57326948002021 0.149609550462636 ENSG00000177646:ENST00000514643:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000512801:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505192:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000514336:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000453462:exon_128614153_128614191:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128614153_128614259:ACAD9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 128627933 C/T 1 8 4 12 3.41384415983832 2.29307792008084 1.12076623975748 T:C C T 10 0.57326948002021 0.573925568669172 ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511526:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000508971:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511325:exon_128627816_128627942:ACAD9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 130743812 G/A 1 3 8 11 1.28019155993937 4.58615584016168 -3.30596428022231 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0642027293927821 ENSG00000034533:ENST00000514044:exon_130742849_130744175:ASTE1;ENSG00000034533:ENST00000264992:exon_130742849_130744175:ASTE1;ENSG00000034533:ENST00000507978:exon_130742849_130744175:ASTE1;ENSG00000034533:ENST00000446270:exon_130743068_130744175:ASTE1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 133191385 C/A 1 2 10 12 0.85346103995958 5.7326948002021 -4.87923376024252 A:C C A 10 0.57326948002021 0.00622716432297784 ENSG00000170819:ENST00000302334:exon_133191189_133191409:BFSP2;ENSG00000170819:ENST00000510039:exon_133191189_133191409:BFSP2;ENSG00000170819:ENST00000503047:exon_133191186_133191409:BFSP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 133342192 C/T 1 5 11 16 2.13365259989895 6.30596428022231 -4.17231168032336 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0430098754235704 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133342155_133342301:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000513818:exon_133342155_133342301:TOPBP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 137880743 G/A 1 8 5 13 3.41384415983832 2.86634740010105 0.547496759737269 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 148704081 G/A 0 9 0 9 3.84057467981811 0 3.84057467981811 G G 10 0.57326948002021 0.0128294351955714 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 149468530 T/G 1 5 11 16 2.13365259989895 6.30596428022231 -4.17231168032336 T:G T G 10 0.57326948002021 0.0430098754235704 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000483708:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000469896:exon_149468290_149468638:COMMD2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 158320597 T/C 1 7 5 12 2.98711363985853 2.86634740010105 0.120766239757479 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000178053:ENST00000355893:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000491767:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000312827:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000484955:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000359117:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000498592:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000471745:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000497004:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392821:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392820:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000469452:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000482628:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000478894:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392822:exon_158320596_158320728:MLF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 158366900 G/A 1 9 3 12 3.84057467981811 1.71980844006063 2.12076623975748 A:G G A 10 0.57326948002021 0.256104231229550 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478576:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000312756:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478251:exon_158366830_158368809:GFM1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 158409262 C/T 1 21 27 48 8.96134091957559 15.4782759605457 -6.51693504097008 T:C C T 10 0.57326948002021 0.059311388605649 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158409125_158410364:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158409125_158410358:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000472383:exon_158409125_158409688:GFM1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 160122169 G/A 1 15 9 24 6.40095779969685 5.15942532018189 1.24153247951496 A:G G A 10 0.57326948002021 0.683372620411482 ENSG00000113810:ENST00000357388:exon_160122116_160122292:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000360111:exon_160122116_160122292:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000472991:exon_160122116_160122292:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000472282:exon_160122166_160122292:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000467468:exon_160122116_160122292:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000468653:exon_160122116_160122292:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000469762:exon_160122116_160122292:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000489573:exon_160122116_160122292:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000462787:exon_160122116_160122292:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000485867:exon_160122116_160122292:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000344722:exon_160122116_160122292:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000392788:exon_160122116_160122292:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000470240:exon_160122116_160122292:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000497984:exon_160122116_160122292:SMC4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 172224303 A/G 1 2 7 9 0.85346103995958 4.01288636014147 -3.15942532018189 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0433151286077531 ENSG00000121858:ENST00000241261:exon_172223298_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000420541:exon_172223452_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000382750:exon_172224300_172224709:TNFSF10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 182853554 G/A 1 6 9 15 2.56038311987874 5.15942532018189 -2.59904220030315 A:G G A 10 0.57326948002021 0.198144643439766 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182853505_182853675:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182853505_182853675:LAMP3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 183904049 A/G 1 7 3 10 2.98711363985853 1.71980844006063 1.2673051997979 A:G A G 10 0.57326948002021 0.532053210294076 ENSG00000161204:ENST00000429586:exon_183903811_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000421340:exon_183903883_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000485921:exon_183903892_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000463685:exon_183903948_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000478288:exon_183903949_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000292808:exon_183903962_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000473311:exon_183903964_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000481116:exon_183903979_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000498136:exon_183903984_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000466416:exon_183903987_183904068:ABCF3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 184019681 G/A 1 12 12 24 5.12076623975748 6.87923376024252 -1.75846752048504 A:G G A 10 0.57326948002021 0.537756757259522 ENSG00000175166:ENST00000310118:exon_184019635_184019859:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000459910:exon_184019559_184019723:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000487475:exon_184019325_184019849:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000433010:exon_184019635_184019852:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000445558:exon_184019582_184019859:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000435761:exon_184019646_184019859:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000439383:exon_184019635_184019859:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000463602:exon_184019559_184019859:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000485937:exon_184019510_184019859:PSMD2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 184049143 C/T 1 83 92 175 35.4186331583226 52.7407921618593 -17.3221590035368 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0092304361449753 ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382362:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000422614:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000460829:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000475721:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000464548:exon_184049054_184049394:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000478291:exon_184049102_184049152:EIF4G1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 186301703 A/G 1 64 73 137 27.3107532787066 41.8486720414753 -14.5379187627688 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0152759933760245 ENSG00000090520:ENST00000439351:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000265028:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000495390:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000418776:exon_186301654_186301765:DNAJB11 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 186507757 G/A 1 119 121 240 50.780931877595 69.3656070824454 -18.5846752048504 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0157883937287260 ENSG00000163918:ENST00000433496:exon_186507669_186507853:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000479307:exon_186507681_186508195:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000392481:exon_186507684_186507853:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000296273:exon_186507689_186507853:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000417876:exon_186507692_186507849:RFC4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 187088745 G/C 1 3 11 14 1.28019155993937 6.30596428022231 -5.02577272028294 C:G G C 10 0.57326948002021 0.0118102507890714 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 187088812 C/T 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 T:C C T 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 187088903 C/A 1 10 7 17 4.2673051997979 4.01288636014147 0.254418839656429 A:C C A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 187088926 G/A 1 11 9 20 4.69403571977769 5.15942532018189 -0.465389600404201 A:G G A 10 0.57326948002021 0.825497110151158 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 187089031 C/A 1 15 12 27 6.40095779969685 6.87923376024252 -0.478275960545671 A:C C A 10 0.57326948002021 0.84842088295701 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 191075902 C/T 1 8 14 22 3.41384415983832 8.02577272028294 -4.61192856044462 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0534624074876792 ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191075787_191075913:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191075787_191075913:CCDC50 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 194408704 A/G 1 20 28 48 8.5346103995958 16.0515454405659 -7.51693504097008 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0398905774936818 ENSG00000185112:ENST00000329759:exon_194406622_194409762:FAM43A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 195453064 T/G 1 16 6 22 6.82768831967664 3.43961688012126 3.38807143955538 T:G T G 10 0.57326948002021 0.195585685750270 ENSG00000176945:ENST00000447234:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000320736:exon_195452544_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000436408:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000445522:exon_195451098_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000381954:exon_195452544_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000498018:exon_195453052_195453443:MUC20 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 3 197401952 T/C 1 4 6 10 1.70692207991916 3.43961688012126 -1.7326948002021 T:C T C 10 0.57326948002021 0.342315301618549 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197398264_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197400833_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197400833_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197400891_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197401889_197402067:KIAA0226 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 86798 C/T 1 11 8 19 4.69403571977769 4.58615584016168 0.107879879616009 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000197701:ENST00000339368:exon_85622_88099:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000507368:exon_85622_87412:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000512065:exon_85622_87410:ZNF595 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 87113 T/C 1 19 27 46 8.10787987961601 15.4782759605457 -7.37039608092966 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0359218782239474 ENSG00000197701:ENST00000339368:exon_85622_88099:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000507368:exon_85622_87412:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000512065:exon_85622_87410:ZNF595 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 337709 T/C 1 10 2 12 4.2673051997979 1.14653896004042 3.12076623975748 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0830011205774995 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 759883 G/A 1 12 8 20 5.12076623975748 4.58615584016168 0.534610399595799 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000185619:ENST00000362003:exon_759820_764428:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000505655:exon_759820_764428:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000521023:exon_759820_764428:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000470161:exon_759820_760396:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000430644:exon_759823_760387:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000440452:exon_759820_760193:PCGF3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 995919 G/C 1 9 1 10 3.84057467981811 0.57326948002021 3.2673051997979 C:G G C 10 0.57326948002021 0.051520419622225 ENSG00000127415:ENST00000247933:exon_995770_995949:IDUA;ENSG00000127415:ENST00000453894:exon_995467_996273:IDUA;ENSG00000127415:ENST00000514698:exon_995467_996273:IDUA;ENSG00000127415:ENST00000514224:exon_995770_995949:IDUA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 996165 G/A 0 11 0 11 4.69403571977769 0 4.69403571977769 G G 10 0.57326948002021 0.00354570384655509 ENSG00000127415:ENST00000247933:exon_996057_996273:IDUA;ENSG00000127415:ENST00000453894:exon_995467_996273:IDUA;ENSG00000127415:ENST00000514698:exon_995467_996273:IDUA;ENSG00000127415:ENST00000514224:exon_996057_996273:IDUA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 996248 G/C 1 7 2 9 2.98711363985853 1.14653896004042 1.84057467981811 C:G G C 10 0.57326948002021 0.31706387914541 ENSG00000127415:ENST00000247933:exon_996057_996273:IDUA;ENSG00000127415:ENST00000453894:exon_995467_996273:IDUA;ENSG00000127415:ENST00000514698:exon_995467_996273:IDUA;ENSG00000127415:ENST00000514224:exon_996057_996273:IDUA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 996888 C/T 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 T:C C T 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000127415:ENST00000247933:exon_996824_996945:IDUA;ENSG00000127415:ENST00000453894:exon_996824_996945:IDUA;ENSG00000127415:ENST00000514698:exon_996824_996945:IDUA;ENSG00000127415:ENST00000514224:exon_996824_996945:IDUA;ENSG00000127415:ENST00000502829:exon_996824_997177:IDUA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 1316263 A/G 1 14 5 19 5.97422727971706 2.86634740010105 3.10787987961601 A:G A G 10 0.57326948002021 0.170278135204151 ENSG00000090316:ENST00000303400:exon_1316169_1316291:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505177:exon_1316169_1316291:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000512308:exon_1316169_1316291:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503653:exon_1316169_1316291:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000452175:exon_1316169_1316291:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000509254:exon_1316169_1316291:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000502558:exon_1316169_1316291:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000510794:exon_1316169_1316291:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505839:exon_1316169_1316291:MAEA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 2744087 G/A 1 41 65 106 17.4959513191714 37.2625162013137 -19.7665648821423 A:G G A 10 0.57326948002021 0.000161967964334113 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 2822467 G/T 1 8 3 11 3.41384415983832 1.71980844006063 1.69403571977769 T:G G T 10 0.57326948002021 0.372574328023575 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000389838:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512131:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510074:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511237:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513095:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503393:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000509677:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000506932:exon_2822396_2822480:SH3BP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 2831383 T/G 1 7 12 19 2.98711363985853 6.87923376024252 -3.89212012038399 T:G T G 10 0.57326948002021 0.102154620750249 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2831220_2831461:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000505941:exon_2831220_2831532:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510204:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515802:exon_2831220_2831874:SH3BP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 2933271 G/A 1 14 26 40 5.97422727971706 14.9050064805255 -8.9307792008084 A:G G A 10 0.57326948002021 0.00591972612799279 ENSG00000109736:ENST00000508276:exon_2933102_2933663:MFSD10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 3189547 C/A 1 6 7 13 2.56038311987874 4.01288636014147 -1.45250324026273 A:C C A 10 0.57326948002021 0.418185809776403 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3189378_3189613:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3189378_3190820:HTT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 3215835 T/C 1 9 2 11 3.84057467981811 1.14653896004042 2.69403571977769 T:C T C 10 0.57326948002021 0.131175688856066 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3215685_3215862:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3215685_3215862:HTT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 3231661 G/A 1 12 10 22 5.12076623975748 5.7326948002021 -0.611928560444621 A:G G A 10 0.57326948002021 0.831433502359143 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000513806:exon_3231614_3231769:HTT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 3514695 A/G 1 54 60 114 23.0434480789087 34.3961688012126 -11.3527207223039 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0368770719185709 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 3519762 A/G 1 27 28 55 11.5217240394543 16.0515454405659 -4.52982140111155 A:C:G A G 10 0.57326948002021 0.222688631217463 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000515119:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000509198:exon_3519388_3519919:LRPAP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 4864876 C/T 1 7 9 16 2.98711363985853 5.15942532018189 -2.17231168032336 T:C C T 10 0.57326948002021 0.316607002067173 ENSG00000163132:ENST00000382723:exon_4864428_4865663:MSX1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 8228948 T/C 1 5 5 10 2.13365259989895 2.86634740010105 -0.732694800202101 T:C T C 10 0.57326948002021 0.752834960365011 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000514274:exon_8228707_8229196:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000508438:exon_8228688_8229000:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000509553:exon_8228707_8229272:SH3TC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 8229713 A/G 1 5 6 11 2.13365259989895 3.43961688012126 -1.30596428022231 A:G A G 10 0.57326948002021 0.545300564874909 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 8229774 C/T 1 4 7 11 1.70692207991916 4.01288636014147 -2.30596428022231 T:C C T 10 0.57326948002021 0.223014268684580 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 8230070 T/C 1 1 8 9 0.42673051997979 4.58615584016168 -4.15942532018189 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0061424649460709 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 8230235 T/C 1 3 8 11 1.28019155993937 4.58615584016168 -3.30596428022231 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0642027293927821 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 8242552 G/A 1 32 55 87 13.6553766393533 31.5298214011116 -17.8744447617583 A:G G A 10 0.57326948002021 0.000128266632645017 ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8242425_8242830:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8242425_8242818:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502350:exon_8242425_8242818:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502559:exon_8242425_8242818:SH3TC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 8375342 G/A 1 14 14 28 5.97422727971706 8.02577272028294 -2.05154544056588 A:G G A 10 0.57326948002021 0.450176838712125 ENSG00000087008:ENST00000512411:exon_8375288_8375542:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000515797:exon_8375288_8375355:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000356406:exon_8375288_8375355:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000503233:exon_8375288_8375355:ACOX3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 8418148 T/G 1 11 5 16 4.69403571977769 2.86634740010105 1.82768831967664 T:G T G 10 0.57326948002021 0.452437779938541 ENSG00000087008:ENST00000413009:exon_8418105_8418262:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000356406:exon_8418105_8418262:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000503233:exon_8418105_8418262:ACOX3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 10099340 T/C 1 49 62 111 20.9097954790097 35.542707761253 -14.6329122822433 T:C T C 10 0.57326948002021 0.00534986628411946 ENSG00000071127:ENST00000499869:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000439733:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000382452:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000400001:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000508079:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000264785:exon_10099334_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000505851:exon_10099336_10099515:WDR1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 13601337 G/A 1 7 6 13 2.98711363985853 3.43961688012126 -0.452503240262731 A:G G A 10 0.57326948002021 0.787569123349065 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 25419283 T/C 1 20 15 35 8.5346103995958 8.59904220030315 -0.0644318007073519 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000053900:ENST00000315368:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000510092:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000504256:exon_25417088_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000515848:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000506973:exon_25419238_25420119:ANAPC4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 37851856 A/C 1 10 13 23 4.2673051997979 7.45250324026273 -3.18519804046483 A:C A C 10 0.57326948002021 0.207996353000423 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37851805_37851994:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000512556:exon_37851805_37851994:PGM2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 38774785 A/G 1 54 83 137 23.0434480789087 47.5813668416774 -24.5379187627688 A:C:G A G 10 0.57326948002021 2.88160629554274e-05 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 38774889 T/C 1 38 45 83 16.215759759232 25.7971266009095 -9.58136684167743 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0352751701416464 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 38775040 A/G 1 32 36 68 13.6553766393533 20.6377012807276 -6.98232464137428 A:G A G 10 0.57326948002021 0.110276830414867 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 38775794 A/G 1 10 9 19 4.2673051997979 5.15942532018189 -0.892120120383991 A:G A G 10 0.57326948002021 0.817360355716801 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 38776107 T/G 1 8 7 15 3.41384415983832 4.01288636014147 -0.599042200303151 T:G T G 10 0.57326948002021 0.7979049378473 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 38776180 C/A 1 5 9 14 2.13365259989895 5.15942532018189 -3.02577272028294 A:C C A 10 0.57326948002021 0.112496331869413 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 38776491 T/G 1 25 80 105 10.6682629994947 45.8615584016168 -35.1932954021221 T:G T G 10 0.57326948002021 3.44547871764608e-12 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 39116911 T/C 1 11 10 21 4.69403571977769 5.7326948002021 -1.03865908042441 T:C T C 10 0.57326948002021 0.66464815614549 ENSG00000109790:ENST00000261425:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000508137:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000504108:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000381930:exon_39116779_39117952:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000261426:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000359687:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000515612:exon_39116779_39116950:KLHL5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 39302029 T/C 1 12 6 18 5.12076623975748 3.43961688012126 1.68114935963622 T:C T C 10 0.57326948002021 0.482786461758876 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000505077:exon_39301936_39302034:RFC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 39303925 A/G 1 6 11 17 2.56038311987874 6.30596428022231 -3.74558116034357 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0853131245996917 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39303898_39303996:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39303898_39303996:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000505077:exon_39303898_39303996:RFC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 39458051 A/G 1 69 3 72 29.4444058786055 1.71980844006063 27.7245974385449 A:G A G 10 0.57326948002021 1.31529361937902e-13 ENSG00000163682:ENST00000295955:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503277:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000449470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000508595:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000514842:exon_39458026_39459301:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503040:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000504470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000511075:exon_39457431_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000437992:exon_39457948_39458158:RPL9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 53751932 C/T 1 7 4 11 2.98711363985853 2.29307792008084 0.694035719777689 T:C C T 10 0.57326948002021 0.767959695054619 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_53751914_53752033:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_53751914_53752033:SCFD2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 54011526 A/G 1 5 7 12 2.13365259989895 4.01288636014147 -1.87923376024252 A:G A G 10 0.57326948002021 0.382460042999359 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54011500_54011749:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54011500_54011749:SCFD2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 57204587 A/G 1 14 14 28 5.97422727971706 8.02577272028294 -2.05154544056588 A:G A G 10 0.57326948002021 0.450176838712125 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57204459_57204957:AASDH HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 73943124 C/G 1 8 17 25 3.41384415983832 9.74558116034357 -6.33173700050525 C:G C G 10 0.57326948002021 0.0139782981157786 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73943072_73943250:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73943072_73943250:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73943072_73943250:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73943072_73943250:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73943072_73943250:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000510127:exon_73943086_73943250:ANKRD17 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 73956736 G/A 1 19 6 25 8.10787987961601 3.43961688012126 4.66826299949475 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0689572231619998 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73956384_73958017:ANKRD17 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 73956805 T/G 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 A:T:G T G 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73956384_73958017:ANKRD17 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 73957567 C/A 1 5 5 10 2.13365259989895 2.86634740010105 -0.732694800202101 A:C C A 10 0.57326948002021 0.752834960365011 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73956384_73958017:ANKRD17 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 76720885 T/C 1 4 7 11 1.70692207991916 4.01288636014147 -2.30596428022231 T:C T C 10 0.57326948002021 0.223014268684580 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76720775_76720885:USO1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 76836137 A/G 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 A:G A G 10 0.57326948002021 0.741310101183539 ENSG00000138744:ENST00000286733:exon_76836021_76836138:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000513045:exon_76836021_76836138:NAAA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 89421086 A/G 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000138646:ENST00000264350:exon_89421077_89421143:HERC5;ENSG00000138646:ENST00000508159:exon_89421077_89421143:HERC5;ENSG00000138646:ENST00000510223:exon_89421077_89421143:HERC5;ENSG00000138646:ENST00000502913:exon_89421077_89421143:HERC5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 103225513 T/C 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 T:C T C 10 0.57326948002021 0.741310101183539 ENSG00000138821:ENST00000424970:exon_103225474_103225638:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000356736:exon_103225474_103225638:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000394833:exon_103225474_103225638:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000512337:exon_103225474_103225645:SLC39A8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 103790293 C/T 1 26 34 60 11.0949935194745 19.4911623206871 -8.3961688012126 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0359781901005688 ENSG00000145354:ENST00000273986:exon_103790135_103790344:CISD2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 104004064 T/C 1 2 6 8 0.85346103995958 3.43961688012126 -2.58615584016168 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0801462458318362 ENSG00000164038:ENST00000508136:exon_104004028_104004086:NHEDC2;ENSG00000164039:ENST00000296424:exon_104004028_104004086:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000492366:exon_104004028_104004086:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000464039:exon_104004028_104004086:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000475058:exon_104004028_104004086:BDH2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 108641317 G/A 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 A:G G A 10 0.57326948002021 0.741310101183539 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108641276_108641608:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108641276_108641378:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000514489:exon_108641276_108641382:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000504987:exon_108641160_108641369:PAPSS1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 108641339 C/T 1 2 6 8 0.85346103995958 3.43961688012126 -2.58615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0801462458318362 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108641276_108641608:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108641276_108641378:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000514489:exon_108641276_108641382:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000504987:exon_108641160_108641369:PAPSS1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 108911051 T/C 1 8 11 19 3.41384415983832 6.30596428022231 -2.89212012038399 T:C T C 10 0.57326948002021 0.245610170938846 ENSG00000138796:ENST00000403312:exon_108910870_108911220:HADH;ENSG00000138796:ENST00000351726:exon_108910912_108911220:HADH;ENSG00000138796:ENST00000309522:exon_108910940_108911220:HADH;ENSG00000138796:ENST00000511742:exon_108911011_108911220:HADH HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 108931039 T/C 1 36 30 66 15.3622987192724 17.1980844006063 -1.83578568133386 T:C:G T C 10 0.57326948002021 0.709274961721453 ENSG00000138796:ENST00000403312:exon_108930915_108931043:HADH;ENSG00000138796:ENST00000351726:exon_108930915_108931043:HADH;ENSG00000138796:ENST00000309522:exon_108930915_108931043:HADH;ENSG00000138796:ENST00000505878:exon_108930915_108931043:HADH;ENSG00000138796:ENST00000454409:exon_108930915_108931043:HADH HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 110605744 A/T 1 212 285 497 90.4668702357155 163.38180180576 -72.9149315700444 A:T A T 10 0.57326948002021 6.52411640376568e-11 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000494604:exon_110605596_110606523:CCDC109B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 113350415 C/T 1 7 2 9 2.98711363985853 1.14653896004042 1.84057467981811 T:C C T 10 0.57326948002021 0.31706387914541 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 113362316 A/G 1 3 5 8 1.28019155993937 2.86634740010105 -1.58615584016168 A:G A G 10 0.57326948002021 0.29890034016204 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 128814964 G/T 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 T:G G T 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000515069:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507249:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000508113:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507577:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000510192:exon_128814889_128815036:PLK4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 130032843 A/G 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 A:G A G 10 0.57326948002021 0.741310101183539 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130032841_130034487:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130032841_130033842:C4orf33 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 140036029 G/A 1 352 2 354 150.209143032886 1.14653896004042 149.062604072846 A:G G A 10 0.57326948002021 1.54172193015908e-81 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 144442735 C/T 1 4 6 10 1.70692207991916 3.43961688012126 -1.7326948002021 T:C C T 10 0.57326948002021 0.342315301618549 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 154318414 A/C 1 7 2 9 2.98711363985853 1.14653896004042 1.84057467981811 A:C A C 10 0.57326948002021 0.31706387914541 ENSG00000121211:ENST00000240488:exon_154318371_154318485:MND1;ENSG00000121211:ENST00000509752:exon_154318371_154318485:MND1;ENSG00000121211:ENST00000504860:exon_154318371_154318485:MND1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 154318420 G/T 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 T:G G T 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000121211:ENST00000240488:exon_154318371_154318485:MND1;ENSG00000121211:ENST00000509752:exon_154318371_154318485:MND1;ENSG00000121211:ENST00000504860:exon_154318371_154318485:MND1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 154318460 T/G 1 14 13 27 5.97422727971706 7.45250324026273 -1.47827596054567 T:G T G 10 0.57326948002021 0.566216117859316 ENSG00000121211:ENST00000240488:exon_154318371_154318485:MND1;ENSG00000121211:ENST00000509752:exon_154318371_154318485:MND1;ENSG00000121211:ENST00000504860:exon_154318371_154318485:MND1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 155459194 A/T 1 38 25 63 16.215759759232 14.3317370005053 1.88402275872677 A:T A T 10 0.57326948002021 0.703006777086663 ENSG00000171566:ENST00000499023:exon_155459121_155459260:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000393905:exon_155459121_155459260:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000506627:exon_155459121_155459234:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000503251:exon_155459121_155459260:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000302078:exon_155459121_155459260:PLRG1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 155461113 T/C 1 25 23 48 10.6682629994947 13.1851980404648 -2.51693504097008 T:C T C 10 0.57326948002021 0.469311949283943 ENSG00000171566:ENST00000499023:exon_155461103_155461205:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000393905:exon_155461103_155461205:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000506627:exon_155461103_155461205:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000302078:exon_155461103_155461205:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000507125:exon_155461103_155461424:PLRG1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 159631991 G/T 1 15 15 30 6.40095779969685 8.59904220030315 -2.1980844006063 T:G G T 10 0.57326948002021 0.462600157558141 ENSG00000171497:ENST00000307720:exon_159631914_159632000:PPID;ENSG00000171497:ENST00000512699:exon_159631914_159632000:PPID HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 159636487 G/A 1 6 5 11 2.56038311987874 2.86634740010105 -0.305964280222311 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000171497:ENST00000307720:exon_159636449_159636555:PPID;ENSG00000171497:ENST00000512699:exon_159636449_159636555:PPID HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 159636830 C/T 1 13 8 21 5.54749675973727 4.58615584016168 0.961340919575589 T:C C T 10 0.57326948002021 0.826246679179264 ENSG00000171497:ENST00000307720:exon_159636714_159636836:PPID HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 164435265 A/C 1 21 28 49 8.96134091957559 16.0515454405659 -7.09020452099029 A:C:G A C 10 0.57326948002021 0.043710099547433 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164435226_164435310:C4orf43 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 164440581 T/C 1 43 43 86 18.349412359131 24.650587640869 -6.30117528173807 T:C T C 10 0.57326948002021 0.190777866365666 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164440486_164440872:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164440486_164441691:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164440486_164440871:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164440486_164440615:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000503148:exon_164440486_164440710:C4orf43 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 183815688 A/G 1 13 15 28 5.54749675973727 8.59904220030315 -3.05154544056588 A:G A G 10 0.57326948002021 0.256818512999306 ENSG00000129187:ENST00000500813:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000357067:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000312820:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000452807:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000438320:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507543:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507631:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510370:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000503182:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510307:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000512766:exon_183815646_183815758:DCTD HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 184615117 A/C 1 7 4 11 2.98711363985853 2.29307792008084 0.694035719777689 A:C A C 10 0.57326948002021 0.767959695054619 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184615070_184615191:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000357207:exon_184615070_184615191:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184615070_184615191:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000505676:exon_184615070_184615191:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000512476:exon_184615070_184615191:C4orf41 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 185655171 C/T 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185655170_185655287:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185655170_185655284:MLF1IP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 186299260 A/G 1 23 21 44 9.81480195953517 12.0386590804244 -2.22385712088924 A:G A G 10 0.57326948002021 0.543383983765855 ENSG00000109771:ENST00000362004:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000328559:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000510776:exon_186298063_186300172:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000505916:exon_186299235_186299361:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000511404:exon_186299235_186299361:LRP2BP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 190862155 T/G 1 37 41 78 15.7890292392522 23.5040486808286 -7.71501944157638 T:G T G 10 0.57326948002021 0.085952919447352 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 4 190862182 C/T 1 29 30 59 12.3751850794139 17.1980844006063 -4.82289932119239 T:C C T 10 0.57326948002021 0.236199377046639 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000514482:exon_190862179_190862226:FRG1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 205656 C/T 1 12 23 35 5.12076623975748 13.1851980404648 -8.06443180070735 T:C C T 10 0.57326948002021 0.00930230936489672 ENSG00000164366:ENST00000296824:exon_204872_206073:CCDC127 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 231111 T/C 1 34 27 61 14.5088376793129 15.4782759605457 -0.969438281232813 T:C T C 10 0.57326948002021 0.797359788295434 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_231031_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512962:exon_231058_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_231058_231115:SDHA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 311478 T/C 1 90 95 185 38.4057467981811 54.46060060192 -16.0548538037389 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0209586912788450 ENSG00000249915:ENST00000264933:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000513582:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000507528:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505717:exon_311408_311609:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505526:exon_311408_312526:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000507473:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000511482:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000512466:exon_308312_311517:PDCD6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 434981 G/C 1 10 19 29 4.2673051997979 10.892120120384 -6.62481492058609 C:G G C 10 0.57326948002021 0.0146077537589922 ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_433968_435008:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_433968_435225:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000507048:exon_433968_435224:AHRR HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 442586 G/C 1 13 3 16 5.54749675973727 1.71980844006063 3.82768831967664 C:G G C 10 0.57326948002021 0.0744376636268041 ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 442790 G/A 1 18 8 26 7.68114935963622 4.58615584016168 3.09499351947454 A:G G A 10 0.57326948002021 0.240782463359774 ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 453567 G/A 1 24 10 34 10.241532479515 5.7326948002021 4.50883767931286 A:G G A 10 0.57326948002021 0.164401220901512 ENSG00000180104:ENST00000512944:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000340158:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000315013:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000503889:exon_453512_454166:EXOC3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 475104 A/G 1 12 20 32 5.12076623975748 11.4653896004042 -6.34462336064672 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0307023658694406 ENSG00000066230:ENST00000264938:exon_474998_475247:SLC9A3;ENSG00000066230:ENST00000514375:exon_474998_475247:SLC9A3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 479905 A/C 1 20 43 63 8.5346103995958 24.650587640869 -16.1159772412732 A:C A C 10 0.57326948002021 5.63771081249031e-05 ENSG00000066230:ENST00000507407:exon_479752_480080:SLC9A3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 1467004 A/G 1 16 23 39 6.82768831967664 13.1851980404648 -6.35750972078819 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0509134292572144 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 5489383 G/A 1 18 11 29 7.68114935963622 6.30596428022231 1.37518507941391 A:G G A 10 0.57326948002021 0.708728911475518 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5489262_5490347:KIAA0947 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 6600150 G/A 1 105 91 196 44.8067045978779 52.1675226818391 -7.36081808396117 A:G G A 10 0.57326948002021 0.312075195320893 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6599352_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6599353_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6599354_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6599513_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6599682_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000514127:exon_6600143_6600345:NSUN2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 6604787 C/T 1 38 23 61 16.215759759232 13.1851980404648 3.03056171876719 T:C C T 10 0.57326948002021 0.517829808157771 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6604718_6604995:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000514127:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000502932:exon_6604718_6604821:NSUN2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 6633779 C/G 1 5 6 11 2.13365259989895 3.43961688012126 -1.30596428022231 C:G C G 10 0.57326948002021 0.545300564874909 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6633456_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000513117:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6633569_6633982:SRD5A1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 17353999 T/A 0 227 0 227 96.8678280354123 0 96.8678280354123 T T 10 0.57326948002021 1.88586478298959e-55 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 17354033 C/T 0 27 0 27 11.5217240394543 0 11.5217240394543 C C 10 0.57326948002021 3.68305939694579e-07 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 34908877 T/C 1 25 17 42 10.6682629994947 9.74558116034357 0.922681839151178 T:C T C 10 0.57326948002021 0.876402432680401 ENSG00000113456:ENST00000382038:exon_34905369_34909053:RAD1;ENSG00000113456:ENST00000341754:exon_34908277_34909053:RAD1;ENSG00000113456:ENST00000325577:exon_34908659_34909053:RAD1;ENSG00000113456:ENST00000513914:exon_34908760_34909053:RAD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 34945122 A/G 1 56 78 134 23.8969091188682 44.7150194415764 -20.8181103227082 A:G A G 10 0.57326948002021 0.000320617256364650 ENSG00000168724:ENST00000342382:exon_34944972_34945130:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000382021:exon_34944972_34945130:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000303525:exon_34944972_34945130:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000514237:exon_34944972_34945130:DNAJC21 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 34954079 C/G 1 26 48 74 11.0949935194745 27.5169350409701 -16.4219415214955 C:G C G 10 0.57326948002021 0.000140835144792359 ENSG00000168724:ENST00000342382:exon_34954031_34954106:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000382021:exon_34954031_34954106:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000303525:exon_34954031_34954106:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000506762:exon_34954031_34954296:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000509626:exon_34953631_34954106:DNAJC21 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 36985303 A/G 1 3 6 9 1.28019155993937 3.43961688012126 -2.15942532018189 A:G A G 10 0.57326948002021 0.183674374674640 ENSG00000164190:ENST00000282516:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000448238:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000504430:exon_36984778_36986403:NIPBL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 43039793 T/C 1 4 9 13 1.70692207991916 5.15942532018189 -3.45250324026273 T:C T C 10 0.57326948002021 0.088426240843314 ENSG00000177721:ENST00000314890:exon_43039335_43041453:C5orf39 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 43294192 C/T 1 11 11 22 4.69403571977769 6.30596428022231 -1.61192856044462 T:C C T 10 0.57326948002021 0.522736284345544 ENSG00000112972:ENST00000325110:exon_43294158_43294264:HMGCS1;ENSG00000112972:ENST00000433297:exon_43294158_43294264:HMGCS1;ENSG00000112972:ENST00000508319:exon_43293836_43294264:HMGCS1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 44809162 G/C 1 9 10 19 3.84057467981811 5.7326948002021 -1.89212012038399 C:G G C 10 0.57326948002021 0.487623161721597 ENSG00000112996:ENST00000507110:exon_44809027_44809665:MRPS30 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 52856504 G/C 1 12 14 26 5.12076623975748 8.02577272028294 -2.90500648052546 C:G G C 10 0.57326948002021 0.3215675945048 ENSG00000164258:ENST00000507026:exon_52856463_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000502423:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000296684:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506974:exon_52856477_52856590:NDUFS4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 52942197 A/G 1 39 48 87 16.6424902792118 27.5169350409701 -10.8744447617583 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0223772593007689 ENSG00000164258:ENST00000507026:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000502423:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000296684:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506974:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506765:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000509443:exon_52942025_52942235:NDUFS4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 61694379 T/C 1 6 7 13 2.56038311987874 4.01288636014147 -1.45250324026273 T:C T C 10 0.57326948002021 0.418185809776403 ENSG00000086189:ENST00000199320:exon_61694338_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000506390:exon_61694338_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000514911:exon_61694256_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000509182:exon_61694338_61694387:DIMT1L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 64064943 G/A 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 A:G G A 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64064757_64065015:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64064773_64065015:CWC27 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 64097145 C/G 1 22 17 39 9.38807143955538 9.74558116034357 -0.357509720788192 C:G C G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000506168:exon_64097129_64097159:CWC27 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 64267595 T/C 1 15 12 27 6.40095779969685 6.87923376024252 -0.478275960545671 T:C T C 10 0.57326948002021 0.84842088295701 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64267530_64267639:CWC27 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 64273018 G/A 1 25 26 51 10.6682629994947 14.9050064805255 -4.23674348103071 A:G G A 10 0.57326948002021 0.258085312917606 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64272962_64273065:CWC27 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 64881936 A/G 1 20 16 36 8.5346103995958 9.17231168032336 -0.637701280727562 A:G A G 10 0.57326948002021 0.867097715567763 ENSG00000113593:ENST00000261308:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000510930:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000511908:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000513773:exon_64881826_64882008:PPWD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 65108215 A/G 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000123213:ENST00000380985:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000340159:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000502464:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506799:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000511299:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000509935:exon_65108082_65108218:NLN HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 68695940 T/G 1 9 12 21 3.84057467981811 6.87923376024252 -3.03865908042441 T:G T G 10 0.57326948002021 0.192086447359513 ENSG00000152942:ENST00000361732:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000509734:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354868:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000521422:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354312:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000345306:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000305138:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000282891:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000358030:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000380774:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000513214:exon_68695876_68695996:RAD17 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 70800475 C/T 1 5 5 10 2.13365259989895 2.86634740010105 -0.732694800202101 T:C C T 10 0.57326948002021 0.752834960365011 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70800448_70800578:BDP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 70806457 G/A 1 15 11 26 6.40095779969685 6.30596428022231 0.0949935194745386 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 70806649 T/A 1 14 7 21 5.97422727971706 4.01288636014147 1.96134091957559 A:T T A 10 0.57326948002021 0.509441892718872 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 71519664 C/T 1 7 6 13 2.98711363985853 3.43961688012126 -0.452503240262731 T:C C T 10 0.57326948002021 0.787569123349065 ENSG00000113048:ENST00000261413:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000431255:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000457646:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515226:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000503239:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000513900:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000508863:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522562:exon_71519630_71519677:MRPS27 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 71524163 A/T 1 11 5 16 4.69403571977769 2.86634740010105 1.82768831967664 A:T A T 10 0.57326948002021 0.452437779938541 ENSG00000113048:ENST00000261413:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000457646:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515226:exon_71522877_71525380:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000503239:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000513900:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000508863:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522562:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522042:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515404:exon_71523590_71524195:MRPS27 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 72182857 A/G 1 5 7 12 2.13365259989895 4.01288636014147 -1.87923376024252 A:G A G 10 0.57326948002021 0.382460042999359 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 74017499 C/T 1 25 19 44 10.6682629994947 10.892120120384 -0.223857120889242 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000164347:ENST00000296805:exon_74017029_74017608:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000345239:exon_74017031_74017608:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000509430:exon_74017083_74017608:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000515125:exon_74017098_74017608:GFM2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 75469885 C/T 0 0 16 16 0 9.17231168032336 -9.17231168032336 T C T 10 0.57326948002021 1.20909180845388e-06 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 76734084 C/T 1 11 12 23 4.69403571977769 6.87923376024252 -2.18519804046483 T:C C T 10 0.57326948002021 0.402290518448411 ENSG00000164253:ENST00000296679:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000502528:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000414719:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000515253:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507029:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511630:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507654:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000509701:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511791:exon_76734083_76734186:WDR41 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 81571896 A/G 1 2108 2731 4839 899.547936117397 1565.59894993519 -666.051013817796 A:G A G 10 0.57326948002021 2.58880439216657e-82 ENSG00000186468:ENST00000296674:exon_81569177_81572074:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000510019:exon_81571240_81571953:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000507980:exon_81571697_81572337:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000512346:exon_81571879_81571953:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000504293:exon_81571879_81572074:RPS23 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 81608521 G/T 1 5 5 10 2.13365259989895 2.86634740010105 -0.732694800202101 T:G G T 10 0.57326948002021 0.752834960365011 ENSG00000205464:ENST00000380167:exon_81608430_81608670:ATP6AP1L;ENSG00000205464:ENST00000439350:exon_81608430_81608670:ATP6AP1L;ENSG00000205464:ENST00000508366:exon_81608430_81608670:ATP6AP1L;ENSG00000205464:ENST00000514672:exon_81608430_81608670:ATP6AP1L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 95152313 A/G 1 36 66 102 15.3622987192724 37.8357856813339 -22.4734869620614 A:G A G 10 0.57326948002021 8.28531757353616e-06 ENSG00000173221:ENST00000508780:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507605:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000237858:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000379979:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507412:exon_95152211_95155206:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000505427:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000512469:exon_95152114_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000448201:exon_95152217_95152329:GLRX HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 95234350 A/G 1 7 1 8 2.98711363985853 0.57326948002021 2.41384415983832 A:G A G 10 0.57326948002021 0.149609550462636 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 95234377 C/T 1 7 3 10 2.98711363985853 1.71980844006063 1.2673051997979 T:C C T 10 0.57326948002021 0.532053210294076 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 95234392 A/C 1 6 4 10 2.56038311987874 2.29307792008084 0.267305199797899 A:C A C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 95236415 G/A 1 6 4 10 2.56038311987874 2.29307792008084 0.267305199797899 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000504288:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000513343:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000505584:exon_95235932_95236484:ELL2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 96086334 G/C 1 31 28 59 13.2286461193735 16.0515454405659 -2.82289932119239 C:G G C 10 0.57326948002021 0.510992003432404 ENSG00000153113:ENST00000338252:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508830:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395812:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000359176:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000325674:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395813:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510756:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512355:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508608:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000341926:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000361634:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511049:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000309190:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510156:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000509903:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511782:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000504465:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000513666:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000348386:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510500:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000437034:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508579:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000515663:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000283095:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000484552:exon_96086291_96086386:CAST HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 96112083 T/G 1 11 9 20 4.69403571977769 5.15942532018189 -0.465389600404201 T:G T G 10 0.57326948002021 0.825497110151158 ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96110188_96112255:ERAP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 96118852 G/C 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 C:G G C 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96118755_96118939:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96118755_96118939:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96118755_96118939:ERAP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 96121524 C/T 1 3 7 10 1.28019155993937 4.01288636014147 -2.7326948002021 T:C C T 10 0.57326948002021 0.109775478323748 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96121343_96121675:ERAP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 96231000 G/T 1 4 6 10 1.70692207991916 3.43961688012126 -1.7326948002021 T:G G T 10 0.57326948002021 0.342315301618549 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000508077:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96230950_96231063:ERAP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 96245343 C/T 1 11 3 14 4.69403571977769 1.71980844006063 2.97422727971706 T:C C T 10 0.57326948002021 0.174656120913287 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 96245439 C/T 1 18 8 26 7.68114935963622 4.58615584016168 3.09499351947454 T:C C T 10 0.57326948002021 0.240782463359774 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 96249115 C/T 1 29 1 30 12.3751850794139 0.57326948002021 11.8019155993937 T:C C T 10 0.57326948002021 2.11656509600770e-06 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000512869:exon_96249042_96249161:ERAP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 99897866 G/A 1 5 4 9 2.13365259989895 2.29307792008084 -0.15942532018189 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000174132:ENST00000312637:exon_99897758_99897892:FAM174A;ENSG00000174132:ENST00000505792:exon_99897756_99897892:FAM174A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 102343252 C/T 1 1 7 8 0.42673051997979 4.01288636014147 -3.58615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0245816827973848 ENSG00000145730:ENST00000438793:exon_102343161_102343361:PAM;ENSG00000145730:ENST00000529394:exon_102343161_102343361:PAM;ENSG00000145730:ENST00000346918:exon_102343161_102343361:PAM;ENSG00000145730:ENST00000345721:exon_102343161_102343361:PAM;ENSG00000145730:ENST00000348126:exon_102343161_102343361:PAM;ENSG00000145730:ENST00000304400:exon_102343161_102343361:PAM;ENSG00000145730:ENST00000274392:exon_102343161_102343361:PAM;ENSG00000145730:ENST00000379787:exon_102343161_102343361:PAM;ENSG00000145730:ENST00000455264:exon_102343161_102343361:PAM;ENSG00000145730:ENST00000379799:exon_102343161_102343361:PAM;ENSG00000145730:ENST00000510006:exon_102343157_102343361:PAM;ENSG00000145730:ENST00000515456:exon_102343246_102343361:PAM HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 108714141 A/C 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 A:C A C 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 112929013 T/A 1 4 10 14 1.70692207991916 5.7326948002021 -4.02577272028294 A:T T A 10 0.57326948002021 0.0543340383697456 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000512600:exon_112927693_112930982:YTHDC2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 122682348 A/G 1 5 4 9 2.13365259989895 2.29307792008084 -0.15942532018189 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122680697_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122681952_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122682094_122682447:CEP120 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 131822055 T/C 1 14 10 24 5.97422727971706 5.7326948002021 0.241532479514959 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000125347:ENST00000245414:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000405885:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000459982:exon_131821815_131822378:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000458069:exon_131822033_131822065:IRF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 132094507 C/T 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 T:C C T 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000164402:ENST00000296873:exon_132091697_132094516:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000412572:exon_132091697_132094516:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000448933:exon_132091697_132094516:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378706:exon_132092025_132094699:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378699:exon_132093835_132094516:SEPT8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 134223593 A/G 1 9 8 17 3.84057467981811 4.58615584016168 -0.745581160343571 A:G A G 10 0.57326948002021 0.807894812450834 ENSG00000113621:ENST00000441965:exon_134223465_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000358387:exon_134223385_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000506916:exon_134223391_134223752:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000507024:exon_134223385_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000508810:exon_134223385_134223870:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000508779:exon_134223385_134223872:TXNDC15 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 137665323 G/A 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 A:G G A 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000158402:ENST00000323760:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000356505:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000513970:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000514555:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000503022:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000510119:exon_137665242_137665336:CDC25C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 137892170 G/A 1 258 243 501 110.096474154786 139.304483644911 -29.2080094901252 A:G G A 10 0.57326948002021 0.00877827243068915 ENSG00000113013:ENST00000297185:exon_137892141_137892281:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000524109:exon_137892141_137892281:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000512328:exon_137892141_137892262:HSPA9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 137902339 T/C 1 39 78 117 16.6424902792118 44.7150194415764 -28.0725291623646 T:C T C 10 0.57326948002021 2.68014387579098e-07 ENSG00000113013:ENST00000297185:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000501917:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000507097:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000523929:exon_137902315_137902400:HSPA9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 138266546 G/A 1 16 24 40 6.82768831967664 13.758467520485 -6.9307792008084 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0364109679551896 ENSG00000044115:ENST00000521724:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000302763:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000518825:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000355078:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000521387:exon_138266519_138266763:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000520520:exon_138266519_138266624:CTNNA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 138266552 C/G 1 23 16 39 9.81480195953517 9.17231168032336 0.642490279211808 C:G C G 10 0.57326948002021 0.87286737334041 ENSG00000044115:ENST00000521724:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000302763:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000518825:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000355078:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000521387:exon_138266519_138266763:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000520520:exon_138266519_138266624:CTNNA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 138456815 T/C 1 13 7 20 5.54749675973727 4.01288636014147 1.5346103995958 T:C T C 10 0.57326948002021 0.652301753764728 ENSG00000120725:ENST00000394817:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000265195:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509534:exon_138456724_138456859:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000508639:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000513453:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000507002:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505830:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505353:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000504666:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509400:exon_138456724_138456862:SIL1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 139936760 G/T 1 38 49 87 16.215759759232 28.0902045209903 -11.8744447617583 T:G G T 10 0.57326948002021 0.0122998079204743 ENSG00000213523:ENST00000336283:exon_139936732_139936857:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000523259:exon_139936732_139937031:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000520427:exon_139936732_139936917:SRA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 139938303 G/A 1 9 12 21 3.84057467981811 6.87923376024252 -3.03865908042441 A:G G A 10 0.57326948002021 0.192086447359513 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139937853_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000509914:exon_139937854_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139937854_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000358580:exon_139937854_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000467078:exon_139937857_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000356738:exon_139937857_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000354402:exon_139937857_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000357560:exon_139937857_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139937979_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000412920:exon_139938170_139938406:APBB3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 139940233 G/A 1 6 5 11 2.56038311987874 2.86634740010105 -0.305964280222311 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000509914:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000467078:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000356738:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000354402:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000357560:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000412920:exon_139940224_139940339:APBB3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 139941318 A/G 1 5 5 10 2.13365259989895 2.86634740010105 -0.732694800202101 A:G A G 10 0.57326948002021 0.752834960365011 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000504872:exon_139941172_139941434:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511463:exon_139941228_139941580:APBB3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 140048209 T/C 1 15 5 20 6.40095779969685 2.86634740010105 3.5346103995958 T:C T C 10 0.57326948002021 0.119776766604918 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000403979:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140048197_140048376:WDR55 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 140048544 C/T 1 16 5 21 6.82768831967664 2.86634740010105 3.96134091957559 T:C C T 10 0.57326948002021 0.120419688346373 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000403979:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140048476_140048833:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511364:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000520764:exon_140048506_140048575:WDR55 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 141019110 C/A 1 13 27 40 5.54749675973727 15.4782759605457 -9.9307792008084 A:C C A 10 0.57326948002021 0.00202803523466225 ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000517794:exon_141019031_141019196:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520465:exon_141018875_141019410:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 141019569 G/C 1 18 10 28 7.68114935963622 5.7326948002021 1.94845455943412 C:G G C 10 0.57326948002021 0.567675413951762 ENSG00000164620:ENST00000520674:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 141019830 C/G 1 18 16 34 7.68114935963622 9.17231168032336 -1.49116232068714 C:G C G 10 0.57326948002021 0.60774078808005 ENSG00000164620:ENST00000520674:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 141309824 G/A 1 12 5 17 5.12076623975748 2.86634740010105 2.25441883965643 A:G G A 10 0.57326948002021 0.331859417462969 ENSG00000081791:ENST00000432126:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000194118:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000508751:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000502729:exon_141309812_141309839:KIAA0141 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 149792113 G/A 1 28 24 52 11.9484545594341 13.758467520485 -1.81001296105092 A:G G A 10 0.57326948002021 0.674619570674296 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 149792135 G/A 1 22 16 38 9.38807143955538 9.17231168032336 0.215759759232018 A:G G A 10 0.57326948002021 1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 149792337 C/T 1 18 12 30 7.68114935963622 6.87923376024252 0.801915599393698 T:C C T 10 0.57326948002021 0.854651896908109 ENSG00000019582:ENST00000353334:exon_149792188_149792492:CD74;ENSG00000019582:ENST00000517791:exon_149792188_149792475:CD74 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 149826526 C/T 1 4050 3739 7789 1728.25860591815 2143.45458579557 -415.195979877416 A:T:C:G C T 10 0.57326948002021 2.79739669013171e-21 ENSG00000164587:ENST00000401695:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000407193:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000521466:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000518139:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000312037:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 149827098 G/A 1 15 7 22 6.40095779969685 4.01288636014147 2.38807143955538 A:G G A 10 0.57326948002021 0.390273785353222 ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 150489390 A/G 1 231 229 460 98.5747501153315 131.278710924628 -32.7039608092966 A:T:G A G 10 0.57326948002021 0.00217147868574496 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150489314_150489407:ANXA6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 150518988 G/A 1 56 43 99 23.8969091188682 24.650587640869 -0.753678522000797 A:G G A 10 0.57326948002021 0.919185319107473 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517486:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000519644:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517677:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521749:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517757:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000520378:exon_150518239_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523164:exon_150518914_150519008:ANXA6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 150565008 C/T 1 8 8 16 3.41384415983832 4.58615584016168 -1.17231168032336 T:C C T 10 0.57326948002021 0.617511810756066 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150565008_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000522964:exon_150564983_150565102:CCDC69 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 150578574 A/G 1 2 7 9 0.85346103995958 4.01288636014147 -3.15942532018189 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0433151286077531 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000524344:exon_150578403_150578645:CCDC69 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 150646888 T/C 1 43 28 71 18.349412359131 16.0515454405659 2.29786691856508 T:C T C 10 0.57326948002021 0.632295362855692 ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150646857_150650001:GM2A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 156747669 A/G 1 13 16 29 5.54749675973727 9.17231168032336 -3.62481492058609 A:G A G 10 0.57326948002021 0.191464076020977 ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156747663_156747810:CYFIP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 156753257 C/T 1 5 7 12 2.13365259989895 4.01288636014147 -1.87923376024252 T:C C T 10 0.57326948002021 0.382460042999359 ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520960:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000518555:exon_156752608_156753275:CYFIP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 156754995 T/C 1 6 4 10 2.56038311987874 2.29307792008084 0.267305199797899 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156754981_156755057:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156754981_156755057:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156754981_156755057:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156754981_156755057:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156754981_156755057:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156754981_156755057:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156754981_156755057:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156754981_156755057:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156754981_156755057:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156754981_156755057:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156754981_156755057:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520960:exon_156754981_156755018:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000518555:exon_156754981_156755057:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520424:exon_156754933_156755057:CYFIP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 156757766 C/T 1 8 9 17 3.41384415983832 5.15942532018189 -1.74558116034357 T:C C T 10 0.57326948002021 0.464916768474155 ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156757750_156757858:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156757750_156757858:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156757750_156757858:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156757750_156757858:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156757750_156757858:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156757750_156757858:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156757750_156757858:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156757750_156757858:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156757750_156757858:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156757750_156757858:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156757750_156757858:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520424:exon_156757750_156757858:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000398252:exon_156757750_156757858:CYFIP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 162868910 T/G 1 16 29 45 6.82768831967664 16.6248149205861 -9.79712660090945 T:G T G 10 0.57326948002021 0.00385925768919955 ENSG00000113328:ENST00000512163:exon_162868892_162868970:CCNG1;ENSG00000113328:ENST00000393929:exon_162868892_162868970:CCNG1;ENSG00000113328:ENST00000340828:exon_162868892_162868970:CCNG1;ENSG00000113328:ENST00000511683:exon_162868892_162868970:CCNG1;ENSG00000113328:ENST00000514590:exon_162868892_162868970:CCNG1;ENSG00000113328:ENST00000510664:exon_162868892_162868970:CCNG1;ENSG00000113328:ENST00000504553:exon_162868892_162868970:CCNG1;ENSG00000113328:ENST00000514367:exon_162868662_162868970:CCNG1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 162902516 T/C 1 9 13 22 3.84057467981811 7.45250324026273 -3.61192856044462 T:C T C 10 0.57326948002021 0.134283230160958 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162902464_162902678:HMMR HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 162909687 G/A 1 13 11 24 5.54749675973727 6.30596428022231 -0.758467520485041 A:G G A 10 0.57326948002021 0.83740962540527 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162909648_162909794:HMMR HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 162909716 C/T 1 17 12 29 7.25441883965643 6.87923376024252 0.375185079413908 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162909648_162909794:HMMR HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 169267784 G/A 1 12 8 20 5.12076623975748 4.58615584016168 0.534610399595799 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520836:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520181:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519628:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169267761_169267856:DOCK2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 169454941 C/G 1 13 8 21 5.54749675973727 4.58615584016168 0.961340919575589 C:G C G 10 0.57326948002021 0.826246679179264 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000433448:exon_169454867_169454952:DOCK2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 169461547 C/T 1 20 16 36 8.5346103995958 9.17231168032336 -0.637701280727562 T:C C T 10 0.57326948002021 0.867097715567763 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169461403_169461559:DOCK2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 169504743 T/C 1 34 29 63 14.5088376793129 16.6248149205861 -2.11597724127323 T:C T C 10 0.57326948002021 0.61190043618647 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520450:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519868:exon_169504714_169504841:DOCK2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 171481667 G/A 1 26 24 50 11.0949935194745 13.758467520485 -2.6634740010105 A:G G A 10 0.57326948002021 0.476380378672828 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171481573_171481698:STK10;ENSG00000072786:ENST00000520476:exon_171481573_171481698:STK10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 171523436 G/A 1 25 21 46 10.6682629994947 12.0386590804244 -1.37039608092966 A:G G A 10 0.57326948002021 0.766010444052857 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171523430_171523564:STK10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 175815782 G/C 1 138 46 184 58.888811757211 26.3703960809297 32.5184156762814 C:G G C 10 0.57326948002021 6.95357936332759e-07 ENSG00000048162:ENST00000389158:exon_175815434_175815976:NOP16;ENSG00000146066:ENST00000274787:exon_175815748_175815974:HIGD2A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 175815787 A/C 1 144 52 196 61.4491948770898 29.8100129610509 31.6391819160388 A:C:G A C 10 0.57326948002021 3.22713645969577e-06 ENSG00000048162:ENST00000389158:exon_175815434_175815976:NOP16;ENSG00000146066:ENST00000274787:exon_175815748_175815974:HIGD2A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 175815874 T/C 1 260 128 388 110.949935194745 73.3784934425869 37.5714417521585 T:C T C 10 0.57326948002021 0.000113129136967218 ENSG00000048162:ENST00000389158:exon_175815434_175815976:NOP16;ENSG00000146066:ENST00000274787:exon_175815748_175815974:HIGD2A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 176378574 G/T 1 5 6 11 2.13365259989895 3.43961688012126 -1.30596428022231 T:G G T 10 0.57326948002021 0.545300564874909 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176378475_176378578:UIMC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 176382995 G/A 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 A:G G A 10 0.57326948002021 0.741310101183539 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176382960_176383036:UIMC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 176396684 G/A 1 10 13 23 4.2673051997979 7.45250324026273 -3.18519804046483 A:G G A 10 0.57326948002021 0.207996353000423 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176396602_176396707:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176396602_176396707:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176396602_176396707:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176396602_176396707:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176396602_176396707:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176396598_176396707:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176396602_176396707:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176396602_176396707:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000509236:exon_176396602_176396707:UIMC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 176402401 G/A 1 16 13 29 6.82768831967664 7.45250324026273 -0.624814920586092 A:G G A 10 0.57326948002021 0.852402921615568 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000509236:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000417486:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000515488:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000507513:exon_176402397_176402481:UIMC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 176939375 G/A 1 90 80 170 38.4057467981811 45.8615584016168 -7.45581160343571 A:G G A 10 0.57326948002021 0.277649003186648 ENSG00000183258:ENST00000512334:exon_176939323_176939546:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000330503:exon_176939323_176939394:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507955:exon_176939323_176939394:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000505081:exon_176939323_176939394:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000503078:exon_176939323_176939394:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507900:exon_176939323_176939394:DDX41 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 176940384 G/A 1 43 48 91 18.349412359131 27.5169350409701 -9.16752268183912 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0564987347316466 ENSG00000183258:ENST00000330503:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507955:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000505081:exon_176940354_176940848:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000503078:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507900:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000504807:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000512027:exon_176940003_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000511040:exon_176940354_176940485:DDX41 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 177035964 T/C 1 13 7 20 5.54749675973727 4.01288636014147 1.5346103995958 T:C T C 10 0.57326948002021 0.652301753764728 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505145:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000515353:exon_177034366_177036015:B4GALT7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 177574561 T/C 1 15 14 29 6.40095779969685 8.02577272028294 -1.62481492058609 T:C T C 10 0.57326948002021 0.57654103737025 ENSG00000145916:ENST00000313386:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000515098:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000507575:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000515360:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000513162:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000507937:exon_177572971_177574636:RMND5B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 179036457 G/C 1 20 20 40 8.5346103995958 11.4653896004042 -2.9307792008084 C:G G C 10 0.57326948002021 0.424468842140107 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179036377_179037027:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179036377_179036520:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179036377_179037019:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179036377_179037012:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179036377_179037013:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000503583:exon_179036377_179036473:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000508797:exon_179036377_179036971:RUFY1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 180219304 C/T 1 6 14 20 2.56038311987874 8.02577272028294 -5.4653896004042 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0213031697059382 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 180486785 G/C 1 9 11 20 3.84057467981811 6.30596428022231 -2.4653896004042 C:G G C 10 0.57326948002021 0.269322135581906 ENSG00000165810:ENST00000327705:exon_180486237_180488523:BTNL9;ENSG00000165810:ENST00000376842:exon_180486237_180488518:BTNL9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 180486841 C/T 1 6 7 13 2.56038311987874 4.01288636014147 -1.45250324026273 T:C C T 10 0.57326948002021 0.418185809776403 ENSG00000165810:ENST00000327705:exon_180486237_180488523:BTNL9;ENSG00000165810:ENST00000376842:exon_180486237_180488518:BTNL9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 180651231 G/A 1 3 8 11 1.28019155993937 4.58615584016168 -3.30596428022231 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0642027293927821 ENSG00000146063:ENST00000351937:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000315073:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000508930:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000438174:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000451234:exon_180651000_180651293:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000503114:exon_180651058_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515223:exon_180651166_180651812:TRIM41 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 5 180665065 G/C 1 15 8 23 6.40095779969685 4.58615584016168 1.81480195953517 C:G G C 10 0.57326948002021 0.530254060134089 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 75 25 100 32.0047889984842 14.3317370005053 17.673051997979 A:G G A 10 0.57326948002021 0.000351379922167405 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 2784571 G/A 1 22 12 34 9.38807143955538 6.87923376024252 2.50883767931286 A:G G A 10 0.57326948002021 0.488583104805745 ENSG00000124535:ENST00000380773:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380771:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380769:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380764:exon_2784558_2784637:WRNIP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 2955802 T/C 1 4 6 10 1.70692207991916 3.43961688012126 -1.7326948002021 T:C T C 10 0.57326948002021 0.342315301618549 ENSG00000124570:ENST00000380524:exon_2955758_2955904:SERPINB6;ENSG00000124570:ENST00000380520:exon_2955758_2955904:SERPINB6;ENSG00000124570:ENST00000335686:exon_2955758_2955904:SERPINB6;ENSG00000124570:ENST00000380529:exon_2955758_2955904:SERPINB6;ENSG00000124570:ENST00000380539:exon_2955758_2955904:SERPINB6;ENSG00000124570:ENST00000380546:exon_2955758_2955904:SERPINB6;ENSG00000124570:ENST00000380500:exon_2955792_2955904:SERPINB6;ENSG00000124570:ENST00000316782:exon_2955758_2955904:SERPINB6;ENSG00000124570:ENST00000440670:exon_2955791_2955904:SERPINB6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 3010337 A/G 1 12 11 23 5.12076623975748 6.30596428022231 -1.18519804046483 A:G A G 10 0.57326948002021 0.67579941697981 ENSG00000124588:ENST00000426637:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380472:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000397717:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000338130:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380441:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380455:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380454:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380430:exon_3010259_3010423:NQO2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 3010390 C/T 1 14 15 29 5.97422727971706 8.59904220030315 -2.62481492058609 T:C C T 10 0.57326948002021 0.351504521856456 ENSG00000124588:ENST00000426637:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380472:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000397717:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000338130:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380441:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380455:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380454:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380430:exon_3010259_3010423:NQO2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 3015790 A/G 1 9 2 11 3.84057467981811 1.14653896004042 2.69403571977769 A:G A G 10 0.57326948002021 0.131175688856066 ENSG00000124588:ENST00000380472:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000397717:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000338130:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380455:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380430:exon_3015764_3015877:NQO2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 3015865 C/T 1 9 5 14 3.84057467981811 2.86634740010105 0.974227279717059 T:C C T 10 0.57326948002021 0.788481610276296 ENSG00000124588:ENST00000380472:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000397717:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000338130:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380455:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380430:exon_3015764_3015877:NQO2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 3152800 C/T 1 12 5 17 5.12076623975748 2.86634740010105 2.25441883965643 T:C C T 10 0.57326948002021 0.331859417462969 ENSG00000137274:ENST00000434640:exon_3152722_3152809:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000424847:exon_3152722_3152903:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000430655:exon_3152722_3153429:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000380375:exon_3152722_3153428:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000380368:exon_3152722_3153428:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000433912:exon_3152722_3152879:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000380379:exon_3152722_3153812:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000490918:exon_3152722_3153296:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000423798:exon_3152772_3153262:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000464040:exon_3152722_3153280:BPHL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 4031998 A/G 1 96 81 177 40.9661299180598 46.434827881637 -5.46869796357718 A:T:G A G 10 0.57326948002021 0.404516615896496 ENSG00000112739:ENST00000480058:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000337659:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000489943:exon_4031793_4032335:PRPF4B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 5431340 A/G 1 9 2 11 3.84057467981811 1.14653896004042 2.69403571977769 A:G A G 10 0.57326948002021 0.131175688856066 ENSG00000145982:ENST00000274680:exon_5431274_5431405:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000397563:exon_5431274_5431405:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000324331:exon_5431274_5431405:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000445533:exon_5431274_5431405:FARS2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 7231843 G/A 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 A:G G A 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000334984:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7230073_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000397521:exon_7231813_7232140:RREB1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 7248990 G/A 1 9 3 12 3.84057467981811 1.71980844006063 2.12076623975748 A:G G A 10 0.57326948002021 0.256104231229550 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7248744_7249507:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7248744_7252213:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7248744_7251263:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000334984:exon_7248744_7250245:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7248744_7252209:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7248744_7249045:RREB1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 7609117 T/C 1 8 8 16 3.41384415983832 4.58615584016168 -1.17231168032336 T:C T C 10 0.57326948002021 0.617511810756066 ENSG00000168566:ENST00000342415:exon_7609058_7612091:SNRNP48;ENSG00000168566:ENST00000496946:exon_7609058_7609439:SNRNP48 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 13801615 T/C 1 18 13 31 7.68114935963622 7.45250324026273 0.228646119373488 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000050393:ENST00000379170:exon_13801520_13801621:CCDC90A;ENSG00000050393:ENST00000488770:exon_13801520_13801621:CCDC90A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 14131804 G/A 1 22 14 36 9.38807143955538 8.02577272028294 1.36229871927244 A:G G A 10 0.57326948002021 0.737252293683266 ENSG00000112149:ENST00000379153:exon_14131751_14131979:CD83 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 16145325 A/G 1 11 3 14 4.69403571977769 1.71980844006063 2.97422727971706 A:G A G 10 0.57326948002021 0.174656120913287 ENSG00000007944:ENST00000356840:exon_16145128_16145548:MYLIP;ENSG00000007944:ENST00000349606:exon_16145128_16145548:MYLIP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 16290761 T/A 0 11 0 11 4.69403571977769 0 4.69403571977769 T T 10 0.57326948002021 0.00354570384655509 ENSG00000137198:ENST00000259727:exon_16290693_16290852:GMPR HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 16306751 G/A 1 7 1 8 2.98711363985853 0.57326948002021 2.41384415983832 A:G G A 10 0.57326948002021 0.149609550462636 ENSG00000124788:ENST00000244769:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000436367:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000450222:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000379065:exon_16306534_16307090:ATXN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 24418348 G/A 1 7 2 9 2.98711363985853 1.14653896004042 1.84057467981811 A:G G A 10 0.57326948002021 0.31706387914541 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24418312_24418395:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24418312_24418464:MRS2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 24653376 G/A 1 12 8 20 5.12076623975748 4.58615584016168 0.534610399595799 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000111802:ENST00000378198:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000478507:exon_24653211_24653381:TDP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 26056583 G/A 1 51 34 85 21.7632565189693 19.4911623206871 2.27209419828214 A:G G A 10 0.57326948002021 0.661852192018594 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 26056604 G/A 1 50 39 89 21.3365259989895 22.3575097207882 -1.0209837217987 A:G G A 10 0.57326948002021 0.831068903861989 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 26124823 C/G 1 8 3 11 3.41384415983832 1.71980844006063 1.69403571977769 C:G C G 10 0.57326948002021 0.372574328023575 ENSG00000180573:ENST00000377791:exon_26124373_26124969:HIST1H2AC;ENSG00000180573:ENST00000314088:exon_26124418_26124977:HIST1H2AC HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 26205178 C/A 1 9 6 15 3.84057467981811 3.43961688012126 0.400957799696849 A:C C A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000198518:ENST00000360441:exon_26204858_26206266:HIST1H4E HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 26285560 A/G 1 2 7 9 0.85346103995958 4.01288636014147 -3.15942532018189 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0433151286077531 ENSG00000158406:ENST00000289352:exon_26285262_26285762:HIST1H4H;ENSG00000158406:ENST00000377727:exon_26285341_26285737:HIST1H4H HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 26285683 T/C 1 7 9 16 2.98711363985853 5.15942532018189 -2.17231168032336 T:C T C 10 0.57326948002021 0.316607002067173 ENSG00000158406:ENST00000289352:exon_26285262_26285762:HIST1H4H;ENSG00000158406:ENST00000377727:exon_26285341_26285737:HIST1H4H HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 26370605 T/C 1 11 11 22 4.69403571977769 6.30596428022231 -1.61192856044462 T:C T C 10 0.57326948002021 0.522736284345544 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 26370660 G/A 1 4 9 13 1.70692207991916 5.15942532018189 -3.45250324026273 A:G G A 10 0.57326948002021 0.088426240843314 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 26393021 G/A 1 8 8 16 3.41384415983832 4.58615584016168 -1.17231168032336 A:G G A 10 0.57326948002021 0.617511810756066 ENSG00000124508:ENST00000356709:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000352867:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000482536:exon_26392603_26393235:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000432533:exon_26392450_26393236:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000416795:exon_26392603_26394220:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000495632:exon_26391031_26394197:BTN2A2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 26545418 C/T 1 23 21 44 9.81480195953517 12.0386590804244 -2.22385712088924 T:C C T 10 0.57326948002021 0.543383983765855 ENSG00000182952:ENST00000328219:exon_26545355_26547160:HMGN4;ENSG00000182952:ENST00000377575:exon_26545355_26546482:HMGN4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 26597333 A/G 1 9 21 30 3.84057467981811 12.0386590804244 -8.1980844006063 A:G A G 10 0.57326948002021 0.00288141759087768 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26597180_26597451:ABT1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 26598798 G/A 1 29 17 46 12.3751850794139 9.74558116034357 2.62960391907034 A:G G A 10 0.57326948002021 0.46010162287194 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26598493_26600278:ABT1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 27834677 C/T 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000184357:ENST00000331442:exon_27834570_27835359:HIST1H1B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 28244846 A/T 1 4 9 13 1.70692207991916 5.15942532018189 -3.45250324026273 A:T A T 10 0.57326948002021 0.088426240843314 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 28891423 G/A 1 5 10 15 2.13365259989895 5.7326948002021 -3.59904220030315 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0702450866322387 ENSG00000204713:ENST00000377199:exon_28890990_28891766:TRIM27;ENSG00000204713:ENST00000377194:exon_28890990_28891765:TRIM27;ENSG00000204713:ENST00000481474:exon_28890990_28891690:TRIM27;ENSG00000204713:ENST00000444898:exon_28890990_28891768:TRIM27 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 29691390 C/G 1 13 10 23 5.54749675973727 5.7326948002021 -0.185198040464831 C:G C G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000204642:ENST00000462777:exon_29691169_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29691219_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000486194:exon_29691281_29691704:HLA-F HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 29691391 T/C 1 13 10 23 5.54749675973727 5.7326948002021 -0.185198040464831 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000204642:ENST00000462777:exon_29691169_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29691219_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000486194:exon_29691281_29691704:HLA-F HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 29693011 C/T 1 409 280 689 174.532782671734 160.515454405659 14.0173282660753 T:C C T 10 0.57326948002021 0.298403268391172 ENSG00000204642:ENST00000376861:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000334668:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000489502:exon_29692897_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000485513:exon_29692808_29693076:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000429294:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000484704:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000465459:exon_29692831_29693083:HLA-F HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 30030057 G/A 1 75 72 147 32.0047889984842 41.2754025614551 -9.27061356297088 A:G G A 10 0.57326948002021 0.13334162548814 ENSG00000066379:ENST00000471008:exon_30026676_30030110:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000332435:exon_30030001_30030110:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376782:exon_30030001_30030110:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000359374:exon_30030001_30030110:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376785:exon_30030001_30030110:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000463141:exon_30030001_30030110:ZNRD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 30032495 A/G 1 63 53 116 26.8840227587268 30.3832824410711 -3.49925968234437 A:G A G 10 0.57326948002021 0.512730038028601 ENSG00000066379:ENST00000471008:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000332435:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376782:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000359374:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376785:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000463141:exon_30032450_30032686:ZNRD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 30036471 C/A 1 12 13 25 5.12076623975748 7.45250324026273 -2.33173700050525 A:C C A 10 0.57326948002021 0.419590889375568 ENSG00000204619:ENST00000376773:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376772:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376769:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376765:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376763:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376758:exon_30035983_30036475:PPP1R11 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 30154199 T/C 1 18 16 34 7.68114935963622 9.17231168032336 -1.49116232068714 T:C T C 10 0.57326948002021 0.60774078808005 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000480999:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30152234_30154335:TRIM26 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 30309508 T/C 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 T:C T C 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000204599:ENST00000396551:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376656:exon_30309489_30311505:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396548:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376659:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396547:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30309489_30309673:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30309489_30309673:XXbac-BPG283O16.8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 30313268 G/A 1 36 30 66 15.3622987192724 17.1980844006063 -1.83578568133386 A:G G A 10 0.57326948002021 0.709274961721453 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30313268_30313350:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30313268_30313350:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30313244_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000466327:exon_30313268_30313706:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30313075_30314334:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30313075_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30313268_30313350:RPP21 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 30314566 T/G 1 63 50 113 26.8840227587268 28.6634740010105 -1.77945124228374 T:G T G 10 0.57326948002021 0.775640223735242 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 30314567 C/A 1 62 50 112 26.457292238747 28.6634740010105 -2.20618176226353 A:T:C C A 10 0.57326948002021 0.702816411009542 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 30570224 G/T 1 18 18 36 7.68114935963622 10.3188506403638 -2.63770128072756 T:G G T 10 0.57326948002021 0.402265706696478 ENSG00000204569:ENST00000376511:exon_30569713_30570468:PPP1R10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 30638722 T/C 1 7 8 15 2.98711363985853 4.58615584016168 -1.59904220030315 T:C T C 10 0.57326948002021 0.441591135560738 ENSG00000204560:ENST00000376442:exon_30638567_30638729:DHX16;ENSG00000204560:ENST00000415603:exon_30638567_30638729:DHX16 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 30893991 A/C 1 49 48 97 20.9097954790097 27.5169350409701 -6.60713956196037 A:C A C 10 0.57326948002021 0.18296717840926 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893886_30894236:VARS2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31110786 T/A 1 48 43 91 20.4830649590299 24.650587640869 -4.16752268183912 A:T:C T A 10 0.57326948002021 0.397452662340119 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31110740_31110869:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31110740_31110869:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31110740_31110911:CCHCR1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31111180 T/C 1 30 25 55 12.8019155993937 14.3317370005053 -1.52982140111155 T:C T C 10 0.57326948002021 0.684699926921338 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509859:exon_31110915_31111190:CCHCR1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31113052 G/A 1 21 20 41 8.96134091957559 11.4653896004042 -2.50404868082861 A:G G A 10 0.57326948002021 0.434514181456687 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31239417 C/T 1 336 5 341 143.381454713209 2.86634740010105 140.515107313108 T:C C T 10 0.57326948002021 5.52835849087101e-73 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31239430 C/T 1 342 10 352 145.941837833088 5.7326948002021 140.209143032886 A:T:C C T 10 0.57326948002021 4.17636800132886e-68 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31239601 C/T 0 148 0 148 63.1561169570089 0 63.1561169570089 C C 10 0.57326948002021 2.7130265852031e-36 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31239821 G/T 0 26 0 26 11.0949935194745 0 11.0949935194745 G G 10 0.57326948002021 6.72288922311111e-07 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239776_31239882:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239776_31239850:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239776_31239846:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31239776_31239867:HLA-C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31322367 T/G 1 56 25 81 23.8969091188682 14.3317370005053 9.56517211836299 T:G T G 10 0.57326948002021 0.0328566754602237 ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31322402 C/T 1 46 16 62 19.6296039190703 9.17231168032336 10.457292238747 T:C C T 10 0.57326948002021 0.00687172662672357 ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31322459 T/C 1 81 8 89 34.565172118363 4.58615584016168 29.9790162782013 T:C T C 10 0.57326948002021 3.29637881382098e-12 ENSG00000234745:ENST00000497377:exon_31322410_31322853:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31322855 C/T 1 68 34 102 29.0176753586257 19.4911623206871 9.52651303793857 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0576873181499394 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31322911 C/T 1 1620 486 2106 691.30344236726 278.608967289822 412.694475077438 T:C:G C T 10 0.57326948002021 5.14793584084419e-79 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31322899_31323000:HLA-B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31431874 G/T 1 10 16 26 4.2673051997979 9.17231168032336 -4.90500648052546 T:G G T 10 0.57326948002021 0.0724098343795343 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31498737 G/A 1 35 20 55 14.9355681992926 11.4653896004042 3.47017859888845 A:G G A 10 0.57326948002021 0.413748575100199 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31540556 T/C 1 26 33 59 11.0949935194745 18.9178928406669 -7.82289932119239 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0477016283411544 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540511_31540618:LTA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31540588 G/A 1 26 20 46 11.0949935194745 11.4653896004042 -0.370396080929662 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540511_31540618:LTA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31602967 G/A 1 46 24 70 19.6296039190703 13.758467520485 5.8711363985853 A:G G A 10 0.57326948002021 0.183687921466862 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000484787:exon_31602909_31603093:BAT2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31605199 G/C 1 28 26 54 11.9484545594341 14.9050064805255 -2.95655192109134 C:G G C 10 0.57326948002021 0.413469896020095 ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31610686 A/G 1 17 13 30 7.25441883965643 7.45250324026273 -0.198084400606302 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000470875:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000465348:exon_31610461_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000438149:exon_31610609_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000436214:exon_31610647_31610892:BAT3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31627449 C/G 1 16 18 34 6.82768831967664 10.3188506403638 -3.49116232068714 C:G C G 10 0.57326948002021 0.230426739072596 ENSG00000204439:ENST00000375911:exon_31626075_31628549:C6orf47 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31630241 C/T 1 29 51 80 12.3751850794139 29.2367434810307 -16.8615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.000165403174092839 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31630318 C/G 1 44 27 71 18.7761428791108 15.4782759605457 3.29786691856509 C:G C G 10 0.57326948002021 0.472715120143152 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31635710 T/C 1 86 101 187 36.6988247182619 57.9002174820412 -21.2013927637793 T:C T C 10 0.57326948002021 0.00187108025450671 ENSG00000204435:ENST00000375885:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375882:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000468255:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000465481:exon_31635645_31636018:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000481269:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000496869:exon_31635627_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375865:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375866:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31635645_31635747:LY6G5B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31729359 A/G 1 12 8 20 5.12076623975748 4.58615584016168 0.534610399595799 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000204410:ENST00000375755:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000534153:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375750:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528100:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375742:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395817:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000383401:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375703:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375740:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528640:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375696:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000423982:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000463144:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395853:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000431848:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000484309:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000429846:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000491552:exon_31729249_31729392:MSH5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31731881 C/T 1 29 34 63 12.3751850794139 19.4911623206871 -7.11597724127323 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0751084251841295 ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000476085:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000228727:ENST00000433778:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000415669:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000425424:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000494299:exon_31731397_31731936:C6orf26 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31748820 G/A 1 37 37 74 15.7890292392522 21.2109707607478 -5.42194152149554 A:G G A 10 0.57326948002021 0.239696846590566 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000433799:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000428445:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000482996:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000479051:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000459667:exon_31748796_31749527:VARS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31778272 G/A 1 3 6 9 1.28019155993937 3.43961688012126 -2.15942532018189 A:G G A 10 0.57326948002021 0.183674374674640 ENSG00000204390:ENST00000375654:exon_31777396_31779762:HSPA1L;ENSG00000204390:ENST00000417199:exon_31777396_31779762:HSPA1L;ENSG00000204390:ENST00000375653:exon_31777824_31779230:HSPA1L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31807489 C/T 1 118 119 237 50.3542013576152 68.219068122405 -17.8648667647898 T:C:G C T 10 0.57326948002021 0.0213806191467799 ENSG00000204387:ENST00000375640:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375641:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375639:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375638:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375635:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375642:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395789:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375633:exon_31807320_31807541:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395788:exon_31807320_31807541:C6orf48 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31856212 C/T 1 3 6 9 1.28019155993937 3.43961688012126 -2.15942532018189 T:C C T 10 0.57326948002021 0.183674374674640 ENSG00000204371:ENST00000480912:exon_31856140_31856283:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000395728:exon_31856140_31856283:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375528:exon_31856140_31856283:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375530:exon_31856140_31856283:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375537:exon_31856140_31856283:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000442298:exon_31856140_31856283:EHMT2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31860337 T/C 1 4 6 10 1.70692207991916 3.43961688012126 -1.7326948002021 T:C T C 10 0.57326948002021 0.342315301618549 ENSG00000204371:ENST00000480912:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000395728:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375528:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375530:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375537:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000442298:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000463484:exon_31860195_31860339:EHMT2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31936456 T/C 1 5 16 21 2.13365259989895 9.17231168032336 -7.03865908042441 T:C T C 10 0.57326948002021 0.00303938446135697 ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31936400_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000483553:exon_31936400_31936573:SKIV2L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31936679 C/T 1 27 18 45 11.5217240394543 10.3188506403638 1.20287339909055 T:C C T 10 0.57326948002021 0.764871316499117 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31936400_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000484835:exon_31936463_31936763:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000483553:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000471818:exon_31936678_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000485349:exon_31936648_31937185:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000491994:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000470453:exon_31936648_31936866:SKIV2L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31938412 G/T 1 16 7 23 6.82768831967664 4.01288636014147 2.81480195953517 T:G G T 10 0.57326948002021 0.293949418892179 ENSG00000204348:ENST00000491327:exon_31938120_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000485557:exon_31938383_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000477826:exon_31938383_31940029:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000337523:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375349:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000495340:exon_31938370_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000478221:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375356:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000480240:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000474587:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000492946:exon_31938219_31939458:DOM3Z HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 31938451 T/C 1 15 9 24 6.40095779969685 5.15942532018189 1.24153247951496 T:C T C 10 0.57326948002021 0.683372620411482 ENSG00000204348:ENST00000491327:exon_31938120_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000485557:exon_31938383_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000477826:exon_31938383_31940029:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000337523:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375349:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000495340:exon_31938370_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000478221:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375356:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000480240:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000474587:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000492946:exon_31938219_31939458:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000487914:exon_31938420_31938529:DOM3Z HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 32097290 C/T 1 9 3 12 3.84057467981811 1.71980844006063 2.12076623975748 T:C C T 10 0.57326948002021 0.256104231229550 ENSG00000204315:ENST00000375156:exon_32096484_32097631:FKBPL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 32147696 G/A 1 25 1 26 10.6682629994947 0.57326948002021 10.0949935194745 A:G G A 10 0.57326948002021 1.22931929144201e-05 ENSG00000204308:ENST00000375094:exon_32147654_32147708:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000427134:exon_32147654_32147708:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375087:exon_32147654_32147708:RNF5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 32148031 A/G 1 48 33 81 20.4830649590299 18.9178928406669 1.56517211836299 A:G A G 10 0.57326948002021 0.822412045526413 ENSG00000204308:ENST00000375094:exon_32148006_32148570:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375085:exon_32148006_32148541:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375087:exon_32148006_32148541:RNF5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 32151934 A/G 1 6 8 14 2.56038311987874 4.58615584016168 -2.02577272028294 A:G A G 10 0.57326948002021 0.291858897104158 ENSG00000204305:ENST00000484849:exon_32151658_32152023:AGER HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 32154998 C/T 1 7 4 11 2.98711363985853 2.29307792008084 0.694035719777689 T:C C T 10 0.57326948002021 0.767959695054619 ENSG00000204304:ENST00000478678:exon_32154750_32155172:PBX2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 32157639 C/T 1 5 5 10 2.13365259989895 2.86634740010105 -0.732694800202101 T:C C T 10 0.57326948002021 0.752834960365011 ENSG00000204304:ENST00000375050:exon_32157472_32157963:PBX2;ENSG00000204304:ENST00000478678:exon_32157472_32157719:PBX2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 32159956 T/C 1 48 45 93 20.4830649590299 25.7971266009095 -5.31406164187953 T:C T C 10 0.57326948002021 0.294637881907601 ENSG00000213654:ENST00000487761:exon_32159925_32160049:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000472768:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375040:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375043:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000402726:exon_32159925_32160027:GPSM3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 32163274 G/A 1 20 17 37 8.5346103995958 9.74558116034357 -1.21097076074777 A:G G A 10 0.57326948002021 0.740714372974236 ENSG00000213654:ENST00000375043:exon_32163203_32163300:GPSM3;ENSG00000204301:ENST00000491215:exon_32162620_32164198:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000474612:exon_32162620_32163927:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000375023:exon_32162620_32163927:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000415698:exon_32162625_32163927:NOTCH4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 32163799 T/C 1 5 6 11 2.13365259989895 3.43961688012126 -1.30596428022231 T:C T C 10 0.57326948002021 0.545300564874909 ENSG00000204301:ENST00000491215:exon_32162620_32164198:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000474612:exon_32162620_32163927:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000375023:exon_32162620_32163927:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000415698:exon_32162625_32163927:NOTCH4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 32407709 C/A 1 507 430 937 216.352373629754 246.50587640869 -30.1535027789368 A:C C A 10 0.57326948002021 0.0475399934043052 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32407619_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32407647_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000462200:exon_32407649_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32407655_32407809:HLA-DRA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 32410941 T/C 1 11 6 17 4.69403571977769 3.43961688012126 1.25441883965643 T:C T C 10 0.57326948002021 0.629145660806696 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 32411035 A/C 1 2170 1976 4146 926.005228356144 1132.78049251994 -206.775264163791 A:T:C:G A C 10 0.57326948002021 1.06110364264232e-10 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32410962_32411243:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32410962_32411122:HLA-DRA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 32411523 T/C 1 12 12 24 5.12076623975748 6.87923376024252 -1.75846752048504 T:C T C 10 0.57326948002021 0.537756757259522 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 32411573 C/T 1 1807 1497 3304 771.10204960348 858.184411590254 -87.082361986774 T:C C T 10 0.57326948002021 0.00234071426118871 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32411533_32411698:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32411533_32411698:HLA-DRA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 32605234 G/A 0 86 0 86 36.6988247182619 0 36.6988247182619 G G 10 0.57326948002021 2.36288678863149e-21 ENSG00000196735:ENST00000422863:exon_32605198_32605308:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 32605284 G/A 0 0 85 85 0 48.7279058017179 -48.7279058017179 A G A 10 0.57326948002021 3.65649445279422e-32 ENSG00000196735:ENST00000422863:exon_32605198_32605308:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 32605309 A/G 0 0 89 89 0 51.0209837217987 -51.0209837217987 G A G 10 0.57326948002021 1.21249439206249e-33 ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 32629155 C/A 0 0 36 36 0 20.6377012807276 -20.6377012807276 A C A 10 0.57326948002021 4.847673676696e-14 ENSG00000179344:ENST00000487676:exon_32629124_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000374943:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000434651:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399084:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000484729:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 32782112 C/T 1 23 20 43 9.81480195953517 11.4653896004042 -1.65058764086903 T:C C T 10 0.57326948002021 0.645419722067063 ENSG00000241106:ENST00000488325:exon_32782097_32782378:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32782097_32782378:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32781500_32782378:HLA-DOB;ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32782097_32782378:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32782097_32782378:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 32783086 A/G 1 24 17 41 10.241532479515 9.74558116034357 0.495951319171388 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32782821_32783090:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32782821_32783090:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000447394:exon_32782821_32783090:HLA-DOB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 32796653 C/A 1 18 27 45 7.68114935963622 15.4782759605457 -7.79712660090945 A:C C A 10 0.57326948002021 0.0230841672052596 ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32793192_32796811:TAP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 32796685 A/G 1 19 27 46 8.10787987961601 15.4782759605457 -7.37039608092966 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0359218782239474 ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32793192_32796811:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32796683_32796811:TAP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 32797297 T/C 1 11 24 35 4.69403571977769 13.758467520485 -9.06443180070735 T:C T C 10 0.57326948002021 0.00305688552965755 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32797177_32797313:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 32800224 C/A 1 28 10 38 11.9484545594341 5.7326948002021 6.21575975923202 A:C C A 10 0.57326948002021 0.0484095802895971 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800072_32800238:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800110_32800238:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 32811629 G/T 1 98 112 210 41.8195909580194 64.2061817622635 -22.3865908042441 T:G G T 10 0.57326948002021 0.00208484129562195 ENSG00000204264:ENST00000395339:exon_32811627_32811797:PSMB8;ENSG00000204264:ENST00000374882:exon_32811627_32811824:PSMB8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 32814975 T/C 1 82 87 169 34.9919026383428 49.8744447617583 -14.8825421234155 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0238772593248900 ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000487296:exon_32814845_32815452:TAP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 32818774 T/C 1 54 42 96 23.0434480789087 24.0773181608488 -1.03387008194017 T:C T C 10 0.57326948002021 0.83716660834926 ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32818721_32818926:TAP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 32821447 C/T 1 14 7 21 5.97422727971706 4.01288636014147 1.96134091957559 T:C C T 10 0.57326948002021 0.509441892718872 ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32820816_32821755:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000425148:exon_32820816_32821755:TAP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 32917544 C/T 1 267 327 594 113.937048834604 187.459119966609 -73.5220711320048 T:C C T 10 0.57326948002021 1.50992301168864e-09 ENSG00000204257:ENST00000395305:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000395303:exon_32917388_32917564:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000477541:exon_32917388_32918580:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000374843:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000532100:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000341486:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000464392:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000456800:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000422832:exon_32917434_32917666:HLA-DMA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 32974551 G/T 1 20 22 42 8.5346103995958 12.6119285604446 -4.07731816084882 T:G G T 10 0.57326948002021 0.214803853287604 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32971955_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32971959_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32973372_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000490305:exon_32974384_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32974523_32974618:HLA-DOA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 33036505 G/C 1 659 402 1061 281.215412666682 230.454330968124 50.7610816985571 C:G G C 10 0.57326948002021 0.00170818713340641 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33035437_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036475_33036581:HLA-DPA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 33036971 C/T 1 840 30 870 358.453636783024 17.1980844006063 341.255552382417 T:C C T 10 0.57326948002021 4.2413342339736e-159 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 33036999 T/C 1 894 67 961 381.497084861932 38.4090551613541 343.088029700578 A:T:C T C 10 0.57326948002021 3.92475527698517e-137 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 33037419 G/A 1 1463 111 1574 624.306750730433 63.6329122822433 560.673838448189 A:G G A 10 0.57326948002021 2.96278029278147e-222 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 33037424 T/C 1 1408 111 1519 600.836572131544 63.6329122822433 537.203659849301 A:T:C:G T C 10 0.57326948002021 1.02094909647424e-210 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 33037522 T/C 1 598 58 656 255.184850947914 33.2496298411722 221.935221106742 A:T:C T C 10 0.57326948002021 1.27180586787996e-82 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 33037557 C/T 0 529 0 529 225.740445069309 0 225.740445069309 C C 10 0.57326948002021 1.60604570423800e-128 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 33037560 G/A 0 532 1 533 227.020636629248 0.57326948002021 226.447367149228 T:G G T 10 0.57326948002021 8.383569659857e-127 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 33037579 A/T 0 599 2 601 255.611581467894 1.14653896004042 254.465042507854 A:C A C 10 0.57326948002021 6.70979634111526e-141 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 33048640 A/G 1 959 81 1040 409.234568660619 46.434827881637 362.799740778982 A:T:G A G 10 0.57326948002021 4.74946400706739e-140 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000469120:exon_33048449_33049009:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000488575:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000471184:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33048220_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33048466_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 33052950 T/C 1 673 170 843 287.189639946399 97.4558116034357 189.733828342963 T:C T C 10 0.57326948002021 3.4869313538483e-43 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 33052958 C/T 1 700 197 897 298.711363985853 112.934087563981 185.777276421872 T:C C T 10 0.57326948002021 1.17217451952108e-38 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 33052986 T/C 1 500 185 685 213.365259989895 106.054853803739 107.310406186156 T:C T C 10 0.57326948002021 2.06927345023568e-17 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 33169392 G/C 1 26 19 45 11.0949935194745 10.892120120384 0.202873399090548 C:G G C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000112473:ENST00000374675:exon_33169019_33169433:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000374677:exon_33168650_33169433:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000496894:exon_33168702_33169433:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000467504:exon_33169023_33169433:SLC39A7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 33172442 C/T 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000204228:ENST00000374662:exon_33172419_33172497:HSD17B8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 33173842 G/A 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 A:G G A 10 0.57326948002021 0.730571677019219 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 33218589 C/T 1 32 34 66 13.6553766393533 19.4911623206871 -5.83578568133386 T:C C T 10 0.57326948002021 0.170783754580607 ENSG00000223501:ENST00000482399:exon_33218049_33218764:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000445902:exon_33218049_33218764:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000478934:exon_33218049_33218764:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000418054:exon_33218050_33218764:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000495981:exon_33218383_33218764:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000493674:exon_33218588_33218764:VPS52 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 33235755 G/A 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 A:G G A 10 0.57326948002021 0.741310101183539 ENSG00000223501:ENST00000482399:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000445902:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000478934:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000418054:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000495755:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000463486:exon_33235647_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000464425:exon_33235648_33235774:VPS52 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 33258443 G/A 1 8 5 13 3.41384415983832 2.86634740010105 0.547496759737269 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000204220:ENST00000395134:exon_33258103_33258652:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000491382:exon_33257951_33258645:PFDN6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 33272855 G/C 1 20 16 36 8.5346103995958 9.17231168032336 -0.637701280727562 C:G G C 10 0.57326948002021 0.867097715567763 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437116:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000449540:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437741:exon_33272734_33273164:TAPBP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 33283766 T/C 1 7 4 11 2.98711363985853 2.29307792008084 0.694035719777689 T:C T C 10 0.57326948002021 0.767959695054619 ENSG00000236104:ENST00000418724:exon_33282183_33284762:ZBTB22;ENSG00000236104:ENST00000431845:exon_33282195_33284762:ZBTB22 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 33288271 A/G 1 48 60 108 20.4830649590299 34.3961688012126 -13.9131038421827 A:G A G 10 0.57326948002021 0.00835627390107917 ENSG00000204209:ENST00000266000:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000374542:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000468536:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000477162:exon_33288157_33288368:DAXX HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 33371806 G/A 1 20 23 43 8.5346103995958 13.1851980404648 -4.65058764086903 A:G G A 10 0.57326948002021 0.166552542966824 ENSG00000237649:ENST00000428849:exon_33371506_33371906:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000453530:exon_33371506_33371906:KIFC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 33740382 G/A 1 13 7 20 5.54749675973727 4.01288636014147 1.5346103995958 A:G G A 10 0.57326948002021 0.652301753764728 ENSG00000161904:ENST00000506578:exon_33738979_33740552:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000293760:exon_33738979_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000511171:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000374196:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000450389:exon_33739474_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000421671:exon_33739209_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000508327:exon_33740102_33740555:LEMD2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 33740592 C/T 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.730571677019219 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 34741175 G/A 1 7 2 9 2.98711363985853 1.14653896004042 1.84057467981811 A:G G A 10 0.57326948002021 0.31706387914541 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 35391787 C/T 1 6 5 11 2.56038311987874 2.86634740010105 -0.305964280222311 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000112033:ENST00000360694:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000418635:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000444397:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000311565:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000337400:exon_35391723_35391925:PPARD HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 36437849 G/T 1 3 6 9 1.28019155993937 3.43961688012126 -2.15942532018189 T:G G T 10 0.57326948002021 0.183674374674640 ENSG00000112078:ENST00000373731:exon_36437829_36438034:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000483557:exon_36437829_36438034:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000498267:exon_36437829_36438034:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000481911:exon_36437829_36438034:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000449081:exon_36437829_36438034:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000265344:exon_36437829_36438034:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000460983:exon_36437829_36438034:KCTD20 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 36651971 C/A 1 35 33 68 14.9355681992926 18.9178928406669 -3.98232464137428 A:C C A 10 0.57326948002021 0.329859443398294 ENSG00000124762:ENST00000459970:exon_36651874_36652288:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000478800:exon_36651874_36652275:CDKN1A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 36653597 C/T 1 26 18 44 11.0949935194745 10.3188506403638 0.776142879110758 T:C C T 10 0.57326948002021 0.87956576134095 ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36653528_36655108:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36653528_36655116:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36653528_36655108:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36653528_36653701:CDKN1A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 36988364 C/T 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000470273:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000394459:exon_36988314_36988396:FGD2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 37349033 G/A 1 15 8 23 6.40095779969685 4.58615584016168 1.81480195953517 A:G G A 10 0.57326948002021 0.530254060134089 ENSG00000112130:ENST00000373479:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000394443:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000229866:exon_37348926_37349130:RNF8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 38650588 T/A 1 26 18 44 11.0949935194745 10.3188506403638 0.776142879110758 A:T T A 10 0.57326948002021 0.87956576134095 ENSG00000124767:ENST00000470973:exon_38650584_38650991:GLO1;ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38650584_38650651:GLO1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 41903782 A/C 1 7 5 12 2.98711363985853 2.86634740010105 0.120766239757479 A:C A C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000112576:ENST00000372991:exon_41902671_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511642:exon_41902672_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372987:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000414200:exon_41902723_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000510503:exon_41903173_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511686:exon_41903634_41903845:CCND3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 42658949 T/A 1 10 12 22 4.2673051997979 6.87923376024252 -2.61192856044462 A:T T A 10 0.57326948002021 0.285971290233503 ENSG00000024048:ENST00000372899:exon_42658770_42661242:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372901:exon_42658770_42661242:UBR2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 43273604 A/G 1 5 4 9 2.13365259989895 2.29307792008084 -0.15942532018189 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000146215:ENST00000372569:exon_43273210_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000451294:exon_43273251_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000477866:exon_43273455_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000274990:exon_43273563_43273862:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000449267:exon_43273563_43273862:CRIP3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 43496662 A/C 1 12 12 24 5.12076623975748 6.87923376024252 -1.75846752048504 A:C A C 10 0.57326948002021 0.537756757259522 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000436943:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372250:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000398835:exon_43496566_43496663:XPO5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 43970666 C/T 1 8 6 14 3.41384415983832 3.43961688012126 -0.0257727202829408 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000181577:ENST00000442114:exon_43970418_43972887:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000336600:exon_43970418_43972877:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000439969:exon_43970418_43972845:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000448947:exon_43970418_43971142:C6orf223 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 44081510 C/T 1 128 74 202 54.6215065574131 42.4219415214955 12.1995650359176 T:C C T 10 0.57326948002021 0.08783728266357 ENSG00000180992:ENST00000372014:exon_44081194_44081946:MRPL14 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 44222907 T/C 1 19 16 35 8.10787987961601 9.17231168032336 -1.06443180070735 T:C T C 10 0.57326948002021 0.73499662446166 ENSG00000157593:ENST00000495706:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393810:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393812:exon_44221843_44223381:SLC35B2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 49403282 T/C 1 9 13 22 3.84057467981811 7.45250324026273 -3.61192856044462 T:C T C 10 0.57326948002021 0.134283230160958 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49403169_49403336:MUT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 49412433 C/T 1 3 5 8 1.28019155993937 2.86634740010105 -1.58615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.29890034016204 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49412352_49412467:MUT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 19 19 0 10.892120120384 -10.892120120384 A G A 10 0.57326948002021 9.39551074667438e-08 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 57512529 C/A 0 10 0 10 4.2673051997979 0 4.2673051997979 C C 10 0.57326948002021 0.0067236069534815 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 74229792 A/G 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 A:G A G 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000156508:ENST00000316292:exon_74229606_74230741:EEF1A1;ENSG00000156508:ENST00000456206:exon_74229606_74230741:EEF1A1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 83880167 C/T 1 13 16 29 5.54749675973727 9.17231168032336 -3.62481492058609 T:C C T 10 0.57326948002021 0.191464076020977 ENSG00000083097:ENST00000484282:exon_83880008_83881069:DOPEY1;ENSG00000013375:ENST00000504780:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000513973:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000512866:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000369731:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000283977:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000416472:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000506587:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000509219:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000503356:exon_83880092_83880197:PGM3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 87969236 C/T 1 6 5 11 2.56038311987874 2.86634740010105 -0.305964280222311 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 87969371 G/A 1 37 34 71 15.7890292392522 19.4911623206871 -3.70213308143491 A:G G A 10 0.57326948002021 0.401917377107357 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 87969737 C/T 1 24 17 41 10.241532479515 9.74558116034357 0.495951319171388 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 87970301 C/G 1 145 131 276 61.8759253970695 75.0983018826475 -13.222376485578 C:G C G 10 0.57326948002021 0.113638978456652 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000496806:exon_87969793_87970363:ZNF292 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 89790730 G/A 1 19 17 36 8.10787987961601 9.74558116034357 -1.63770128072756 A:G G A 10 0.57326948002021 0.615519905971095 ENSG00000146278:ENST00000336032:exon_89790497_89791153:PNRC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 89793894 G/C 1 51 41 92 21.7632565189693 23.5040486808286 -1.74079216185932 C:G G C 10 0.57326948002021 0.75222871684444 ENSG00000146278:ENST00000369472:exon_89793472_89794064:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000336032:exon_89793472_89794879:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000354922:exon_89793472_89793916:PNRC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 99825348 T/C 1 9 2 11 3.84057467981811 1.14653896004042 2.69403571977769 T:C T C 10 0.57326948002021 0.131175688856066 ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000479163:exon_99825262_99825361:COQ3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 105776866 A/C 1 7 8 15 2.98711363985853 4.58615584016168 -1.59904220030315 A:C A C 10 0.57326948002021 0.441591135560738 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105776704_105776901:PREP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 105821449 A/G 1 5 7 12 2.13365259989895 4.01288636014147 -1.87923376024252 A:G A G 10 0.57326948002021 0.382460042999359 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105821244_105821453:PREP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 106992464 A/G 1 9 2 11 3.84057467981811 1.14653896004042 2.69403571977769 A:G A G 10 0.57326948002021 0.131175688856066 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106992446_106992572:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000457437:exon_106992446_106992572:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000285105:exon_106992446_106992572:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000487681:exon_106992459_106992572:AIM1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 107113715 G/A 1 10 9 19 4.2673051997979 5.15942532018189 -0.892120120383991 A:G G A 10 0.57326948002021 0.817360355716801 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107113657_107116292:QRSL1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 108222653 G/A 1 7 4 11 2.98711363985853 2.29307792008084 0.694035719777689 A:G G A 10 0.57326948002021 0.767959695054619 ENSG00000025796:ENST00000369002:exon_108222574_108222721:SEC63;ENSG00000025796:ENST00000437345:exon_108222574_108222721:SEC63;ENSG00000025796:ENST00000423697:exon_108222574_108222721:SEC63;ENSG00000025796:ENST00000466419:exon_108222574_108222721:SEC63 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 110146303 G/A 1 28 30 58 11.9484545594341 17.1980844006063 -5.24962984117218 A:G G A 10 0.57326948002021 0.184580198386962 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110146291_110146631:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110146291_110146634:FIG4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 118320595 C/A 0 24 0 24 10.241532479515 0 10.241532479515 C C 10 0.57326948002021 2.29355090872990e-06 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 131190838 G/A 1 23 1 24 9.81480195953517 0.57326948002021 9.24153247951496 A:G G A 10 0.57326948002021 3.71717917635673e-05 ENSG00000079819:ENST00000337057:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000257986:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000368128:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000527411:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000524581:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000529208:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000527423:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000456097:exon_131190799_131191266:EPB41L2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 131277390 G/A 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 A:G G A 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000079819:ENST00000528282:exon_131277134_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000530481:exon_131277134_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000445890:exon_131277134_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000337057:exon_131277134_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000357633:exon_131277134_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000425439:exon_131277134_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000257986:exon_131277134_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000392427:exon_131277134_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000368128:exon_131277134_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000527411:exon_131277134_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000525271:exon_131277134_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000525193:exon_131277134_131277625:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000527659:exon_131277134_131277625:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000529208:exon_131277134_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000529709:exon_131277134_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000532499:exon_131277138_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000526983:exon_131277165_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000531356:exon_131277244_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000530707:exon_131277272_131277639:EPB41L2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 133077063 T/C 1 5 4 9 2.13365259989895 2.29307792008084 -0.15942532018189 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000112303:ENST00000418593:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000326499:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000335846:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000422400:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000392389:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525270:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525674:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525289:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000532053:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000533835:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000531279:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000526157:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000526192:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000524919:exon_133077021_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000530536:exon_133077053_133077174:VNN2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 133135886 A/G 1 1005 502 1507 428.864172579689 287.781278970145 141.082893609543 A:G A G 10 0.57326948002021 1.18849239721885e-13 ENSG00000112306:ENST00000230050:exon_133135871_133135921:RPS12;ENSG00000112306:ENST00000484616:exon_133135871_133135921:RPS12 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 133138010 T/C 1 13 14 27 5.54749675973727 8.02577272028294 -2.47827596054567 T:C T C 10 0.57326948002021 0.338662384198784 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 135287533 A/G 1 15 18 33 6.40095779969685 10.3188506403638 -3.91789284066693 A:T:G A G 10 0.57326948002021 0.217368410121292 ENSG00000112339:ENST00000367837:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000445176:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000367824:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000527005:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000527578:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000415177:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000367826:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000533274:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000526100:exon_135287467_135287611:HBS1L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 116 0 116 49.5007403176556 0 49.5007403176556 T T 10 0.57326948002021 1.07746415709797e-28 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 141 0 141 60.1690033171504 0 60.1690033171504 A A 10 0.57326948002021 9.91689166284487e-35 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 142 0 142 60.5957338371302 0 60.5957338371302 A A 10 0.57326948002021 5.52607590751367e-35 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 20 0 20 8.5346103995958 0 8.5346103995958 G G 10 0.57326948002021 2.95605062910185e-05 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 19 0 19 8.10787987961601 0 8.10787987961601 T T 10 0.57326948002021 2.81261925897944e-05 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 137519588 A/C 1 20 25 45 8.5346103995958 14.3317370005053 -5.79712660090945 A:C A C 10 0.57326948002021 0.0968040181239068 ENSG00000027697:ENST00000367739:exon_137518621_137519776:IFNGR1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 139229872 C/T 1 28 34 62 11.9484545594341 19.4911623206871 -7.54270776125302 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0550022646551498 ENSG00000135597:ENST00000450536:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367672:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367668:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000409553:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367663:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000529597:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000445570:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000478483:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000483468:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000409812:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000258062:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000484164:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000415951:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000526022:exon_139229805_139229874:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000526244:exon_139229805_139230049:REPS1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 149953981 C/T 1 5 6 11 2.13365259989895 3.43961688012126 -1.30596428022231 T:C C T 10 0.57326948002021 0.545300564874909 ENSG00000186625:ENST00000335647:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000335643:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000367411:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000444282:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000420200:exon_149953895_149954052:KATNA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 150004779 A/G 1 7 4 11 2.98711363985853 2.29307792008084 0.694035719777689 A:G A G 10 0.57326948002021 0.767959695054619 ENSG00000131023:ENST00000253339:exon_150004215_150005728:LATS1;ENSG00000131023:ENST00000441107:exon_150004215_150005728:LATS1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 150114745 G/A 1 16 20 36 6.82768831967664 11.4653896004042 -4.63770128072756 A:G G A 10 0.57326948002021 0.130768035009174 ENSG00000120265:ENST00000367384:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000484601:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000367378:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000464889:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000367380:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000486585:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000495487:exon_150114685_150114768:PCMT1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 151674326 A/C 1 9 1 10 3.84057467981811 0.57326948002021 3.2673051997979 A:C A C 10 0.57326948002021 0.051520419622225 ENSG00000131016:ENST00000402676:exon_151669846_151674887:AKAP12;ENSG00000131016:ENST00000253332:exon_151669846_151674887:AKAP12;ENSG00000131016:ENST00000354675:exon_151669846_151674887:AKAP12;ENSG00000131016:ENST00000359755:exon_151669846_151674887:AKAP12 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 151686905 C/T 1 1 12 13 0.42673051997979 6.87923376024252 -6.45250324026273 T:C C T 10 0.57326948002021 0.000287295249188175 ENSG00000181472:ENST00000325144:exon_151685252_151688027:ZBTB2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 151766552 G/A 1 9 4 13 3.84057467981811 2.29307792008084 1.54749675973727 A:G G A 10 0.57326948002021 0.576729970937834 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000491268:exon_151766443_151766960:RMND1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 151789868 G/A 1 9 9 18 3.84057467981811 5.15942532018189 -1.31885064036378 A:G G A 10 0.57326948002021 0.635341898612975 ENSG00000146476:ENST00000367294:exon_151789478_151791236:C6orf211 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 151789912 C/T 1 9 7 16 3.84057467981811 4.01288636014147 -0.172311680323361 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000146476:ENST00000367294:exon_151789478_151791236:C6orf211 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 153296541 G/C 1 5 11 16 2.13365259989895 6.30596428022231 -4.17231168032336 C:G G C 10 0.57326948002021 0.0430098754235704 ENSG00000112029:ENST00000229758:exon_153296042_153296756:FBXO5;ENSG00000112029:ENST00000367241:exon_153296042_153296756:FBXO5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 153296633 G/A 1 2 6 8 0.85346103995958 3.43961688012126 -2.58615584016168 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0801462458318362 ENSG00000112029:ENST00000229758:exon_153296042_153296756:FBXO5;ENSG00000112029:ENST00000367241:exon_153296042_153296756:FBXO5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 155153131 G/A 1 14 8 22 5.97422727971706 4.58615584016168 1.38807143955538 A:G G A 10 0.57326948002021 0.668312643486638 ENSG00000213079:ENST00000367178:exon_155153073_155155192:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000367186:exon_155153073_155155192:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000417268:exon_155153073_155155190:RBM16 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 155153307 G/A 1 10 10 20 4.2673051997979 5.7326948002021 -1.4653896004042 A:G G A 10 0.57326948002021 0.508038948022547 ENSG00000213079:ENST00000367178:exon_155153073_155155192:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000367186:exon_155153073_155155192:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000417268:exon_155153073_155155190:RBM16 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 155578175 C/G 1 18 24 42 7.68114935963622 13.758467520485 -6.07731816084882 C:G C G 10 0.57326948002021 0.0622662604263501 ENSG00000146426:ENST00000461783:exon_155577618_155578854:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000318981:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000456144:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000367174:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000360366:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000529824:exon_155577618_155578324:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000528928:exon_155577618_155579221:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000528391:exon_155577594_155578324:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000456877:exon_155577618_155578334:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000275246:exon_155577618_155578354:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000462408:exon_155577618_155579216:TIAM2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 160113872 A/G 1 13 4 17 5.54749675973727 2.29307792008084 3.25441883965643 A:G A G 10 0.57326948002021 0.142310709307259 ENSG00000112096:ENST00000367055:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000444946:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000367054:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000337404:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000452684:exon_160112027_160113895:SOD2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 160198359 C/T 1 35 38 73 14.9355681992926 21.784240240768 -6.84867204147533 T:C C T 10 0.57326948002021 0.123569711815539 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 160199687 T/C 1 25 25 50 10.6682629994947 14.3317370005053 -3.6634740010105 T:C T C 10 0.57326948002021 0.318503165103250 ENSG00000120438:ENST00000321394:exon_160199530_160200293:TCP1;ENSG00000120438:ENST00000392168:exon_160199531_160200293:TCP1;ENSG00000120438:ENST00000420894:exon_160199531_160200293:TCP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 166736362 C/T 1 66 112 178 28.1642143186661 64.2061817622635 -36.0419674435974 T:C:G C T 10 0.57326948002021 7.60229865818791e-08 ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166736345_166736374:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166736345_166738083:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000479490:exon_166736345_166738176:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166736345_166736374:SFT2D1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 168299019 G/A 1 5 4 9 2.13365259989895 2.29307792008084 -0.15942532018189 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000130396:ENST00000344191:exon_168298885_168299147:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000351017:exon_168298885_168299147:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392108:exon_168298885_168299147:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392112:exon_168298885_168299147:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366806:exon_168298885_168299147:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000341575:exon_168298885_168299147:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366809:exon_168298885_168299147:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000400822:exon_168298885_168299147:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000447894:exon_168298885_168299147:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366805:exon_168298885_168299147:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000423229:exon_168298885_168299147:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000503021:exon_168298885_168299143:MLLT4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 170862300 G/C 1 57 46 103 24.323639638848 26.3703960809297 -2.04675644208163 C:G G C 10 0.57326948002021 0.691343591560002 ENSG00000008018:ENST00000262193:exon_170862218_170862429:PSMB1;ENSG00000008018:ENST00000392093:exon_170862218_170862417:PSMB1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 6 170881317 C/T 1 8 4 12 3.41384415983832 2.29307792008084 1.12076623975748 T:C C T 10 0.57326948002021 0.573925568669172 ENSG00000112592:ENST00000392091:exon_170881274_170881944:TBP;ENSG00000112592:ENST00000392092:exon_170881274_170881944:TBP;ENSG00000112592:ENST00000230354:exon_170881274_170881941:TBP;ENSG00000112592:ENST00000446829:exon_170881274_170881941:TBP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 538191 C/T 1 10 4 14 4.2673051997979 2.29307792008084 1.97422727971706 A:T:C C T 10 0.57326948002021 0.419102837465114 ENSG00000197461:ENST00000402802:exon_536895_538211:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000344323:exon_536895_538211:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000354513:exon_537946_538211:PDGFA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 552046 A/G 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 A:G A G 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000197461:ENST00000402802:exon_551988_552092:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000344323:exon_551988_552092:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000354513:exon_551988_552092:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000482462:exon_551988_553104:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000400761:exon_551988_552092:PDGFA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 810219 T/C 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 T:C T C 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000491496:exon_810108_812612:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_810108_810255:HEATR2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 1542697 G/A 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 A:G G A 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1542537_1542827:INTS1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 1542814 T/C 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 T:C T C 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1542537_1542827:INTS1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 1938001 G/A 1 24 18 42 10.241532479515 10.3188506403638 -0.0773181608488223 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_1937836_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_1937836_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_1937836_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_1937848_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_1937836_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_1937836_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000450235:exon_1937836_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000437877:exon_1937836_1938026:MAD1L1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 1976432 C/T 1 13 14 27 5.54749675973727 8.02577272028294 -2.47827596054567 T:C C T 10 0.57326948002021 0.338662384198784 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000450235:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000437877:exon_1976323_1976533:MAD1L1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 2297006 A/G 1 154 146 300 65.7165000768877 83.6973440829507 -17.980844006063 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0408904575332381 ENSG00000106266:ENST00000222990:exon_2297000_2297149:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000480807:exon_2297000_2297253:SNX8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 2303986 T/C 1 28 26 54 11.9484545594341 14.9050064805255 -2.95655192109134 T:C T C 10 0.57326948002021 0.413469896020095 ENSG00000106266:ENST00000222990:exon_2303933_2304093:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000479689:exon_2303933_2304093:SNX8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 2394991 C/T 1 24 28 52 10.241532479515 16.0515454405659 -5.81001296105092 T:C C T 10 0.57326948002021 0.122604771341081 ENSG00000106263:ENST00000431643:exon_2394869_2395055:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000360876:exon_2394501_2395055:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000413917:exon_2394869_2395055:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000397011:exon_2394517_2395055:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000314800:exon_2394557_2395055:EIF3B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 2578246 C/T 1 24 19 43 10.241532479515 10.892120120384 -0.650587640869032 T:C:G C T 10 0.57326948002021 0.878129893383601 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 2954962 G/A 1 17 18 35 7.25441883965643 10.3188506403638 -3.06443180070735 A:G G A 10 0.57326948002021 0.309302325896262 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2954871_2955006:CARD11 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 2957005 T/C 1 5 5 10 2.13365259989895 2.86634740010105 -0.732694800202101 T:C T C 10 0.57326948002021 0.752834960365011 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2956924_2957019:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000480332:exon_2956924_2957019:CARD11 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 4825307 T/A 1 15 6 21 6.40095779969685 3.43961688012126 2.96134091957559 A:T T A 10 0.57326948002021 0.269857208962559 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4825153_4825315:KIAA0415 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 4825314 C/T 1 14 6 20 5.97422727971706 3.43961688012126 2.5346103995958 T:C C T 10 0.57326948002021 0.36622341140112 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4825153_4825315:KIAA0415 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 5347749 G/A 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 A:T:G G A 10 0.57326948002021 0.741310101183539 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5346426_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5346431_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5346431_5347943:TNRC18 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 5352949 G/C 1 4 11 15 1.70692207991916 6.30596428022231 -4.59904220030315 C:G G C 10 0.57326948002021 0.0192066748704768 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5352134_5353490:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5352134_5353494:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000328270:exon_5352742_5353494:TNRC18 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 5353344 G/A 1 4 13 17 1.70692207991916 7.45250324026273 -5.74558116034357 A:G G A 10 0.57326948002021 0.00605416471738995 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5352134_5353490:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5352134_5353494:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000328270:exon_5352742_5353494:TNRC18 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 5410425 G/C 1 3 5 8 1.28019155993937 2.86634740010105 -1.58615584016168 C:G G C 10 0.57326948002021 0.29890034016204 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5410020_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5410006_5410995:TNRC18 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 5568366 A/G 1 24 27 51 10.241532479515 15.4782759605457 -5.23674348103071 A:G A G 10 0.57326948002021 0.157097187237842 ENSG00000075624:ENST00000462494:exon_5567912_5569031:ACTB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 5568749 G/A 1 23 27 50 9.81480195953517 15.4782759605457 -5.6634740010105 A:G G A 10 0.57326948002021 0.116403086360696 ENSG00000075624:ENST00000462494:exon_5567912_5569031:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000480301:exon_5568698_5569294:ACTB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 5569327 G/A 1 22 22 44 9.38807143955538 12.6119285604446 -3.22385712088924 A:G G A 10 0.57326948002021 0.361684849446788 ENSG00000075624:ENST00000484841:exon_5569166_5569364:ACTB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 6026988 G/A 1 5 11 16 2.13365259989895 6.30596428022231 -4.17231168032336 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0430098754235704 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 6048973 C/A 1 17 16 33 7.25441883965643 9.17231168032336 -1.91789284066693 A:C C A 10 0.57326948002021 0.598175714760715 ENSG00000106305:ENST00000223029:exon_6048876_6049129:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000400479:exon_6048886_6049009:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000415999:exon_6048921_6049129:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000395236:exon_6048947_6049129:AIMP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 6063283 C/T 1 51 54 105 21.7632565189693 30.9565519210913 -9.19329540212206 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0757852928735487 ENSG00000106305:ENST00000223029:exon_6062934_6063465:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000400479:exon_6062934_6063326:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000395236:exon_6062934_6063378:AIMP2;ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6061881_6064432:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000422786:exon_6062807_6063377:EIF2AK1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 6066461 T/C 1 30 22 52 12.8019155993937 12.6119285604446 0.189987038949077 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6066359_6066592:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000490523:exon_6066359_6066592:EIF2AK1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 6621277 G/A 1 11 8 19 4.69403571977769 4.58615584016168 0.107879879616009 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000136247:ENST00000405731:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396707:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396713:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000335965:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000493944:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396709:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000474097:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000483589:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396706:exon_6621238_6621311:ZDHHC4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 8125964 C/T 1 13 8 21 5.54749675973727 4.58615584016168 0.961340919575589 T:C C T 10 0.57326948002021 0.826246679179264 ENSG00000106415:ENST00000456919:exon_8125823_8126968:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000223145:exon_8125823_8128710:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000489405:exon_8125823_8126569:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000482540:exon_8125823_8128707:GLCCI1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 12728489 A/G 1 9 1 10 3.84057467981811 0.57326948002021 3.2673051997979 A:G A G 10 0.57326948002021 0.051520419622225 ENSG00000122644:ENST00000396662:exon_12727791_12728804:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000356797:exon_12727791_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396664:exon_12727794_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396663:exon_12727791_12730559:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000404894:exon_12727794_12728539:ARL4A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 19744417 T/C 1 20 23 43 8.5346103995958 13.1851980404648 -4.65058764086903 T:C T C 10 0.57326948002021 0.166552542966824 ENSG00000105849:ENST00000222567:exon_19744402_19744543:TWISTNB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 21940823 A/G 1 37 46 83 15.7890292392522 26.3703960809297 -10.5813668416774 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0199207815519881 ENSG00000105877:ENST00000409508:exon_21940625_21941186:DNAH11;ENSG00000105877:ENST00000328843:exon_21940625_21941457:DNAH11;ENSG00000105877:ENST00000424253:exon_21940625_21941457:DNAH11;ENSG00000164649:ENST00000356195:exon_21940518_21941970:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000488845:exon_21940519_21941970:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000406877:exon_21940519_21941970:CDCA7L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 23239133 C/T 1 10 9 19 4.2673051997979 5.15942532018189 -0.892120120383991 T:C C T 10 0.57326948002021 0.817360355716801 ENSG00000136243:ENST00000258742:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000485250:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000438012:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000413919:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000437140:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000477844:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000489145:exon_23239043_23239161:NUPL2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 23340618 C/T 1 64 69 133 27.3107532787066 39.5555941213945 -12.2448408426879 A:T:C C T 10 0.57326948002021 0.0352228241763153 ENSG00000156928:ENST00000466681:exon_23340458_23340636:C7orf30;ENSG00000156928:ENST00000287543:exon_23340458_23340636:C7orf30;ENSG00000156928:ENST00000481564:exon_23340458_23340814:C7orf30 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 24756951 C/T 1 7 9 16 2.98711363985853 5.15942532018189 -2.17231168032336 T:C C T 10 0.57326948002021 0.316607002067173 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000446822:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24756088_24756993:DFNA5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 27827103 T/A 1 12 26 38 5.12076623975748 14.9050064805255 -9.78424024076798 A:T T A 10 0.57326948002021 0.00160646036184174 ENSG00000106052:ENST00000265393:exon_27827037_27827222:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000433216:exon_27827037_27827222:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000409980:exon_27827037_27827222:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000396319:exon_27827037_27827222:TAX1BP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 32909182 G/A 1 5 8 13 2.13365259989895 4.58615584016168 -2.45250324026273 A:G G A 10 0.57326948002021 0.261241293669647 ENSG00000170852:ENST00000304056:exon_32907784_32910492:KBTBD2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 33075573 A/G 1 11 4 15 4.69403571977769 2.29307792008084 2.40095779969685 A:G A G 10 0.57326948002021 0.29761519006674 ENSG00000122643:ENST00000456458:exon_33075546_33075600:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000381626:exon_33075546_33075600:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000396152:exon_33075546_33075600:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000405342:exon_33075546_33075581:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000409467:exon_33075546_33075600:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000409787:exon_33075546_33075595:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000464840:exon_33075546_33075600:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000449201:exon_33075546_33075600:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000497542:exon_33075546_33075600:NT5C3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 37298800 C/T 1 7 1 8 2.98711363985853 0.57326948002021 2.41384415983832 T:C C T 10 0.57326948002021 0.149609550462636 ENSG00000155849:ENST00000361912:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000310758:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442573:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442504:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000474832:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000448602:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455119:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455879:exon_37298786_37298955:ELMO1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 40027484 A/G 1 8 5 13 3.41384415983832 2.86634740010105 0.547496759737269 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000065883:ENST00000181839:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000326351:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000340829:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000484589:exon_40027435_40027857:CDK13 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 40127767 G/A 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 A:G G A 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000065883:ENST00000181839:exon_40127725_40127930:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000340829:exon_40127725_40127930:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000478563:exon_40127725_40127930:CDK13 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 43622806 T/C 1 18 5 23 7.68114935963622 2.86634740010105 4.81480195953517 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0559273279208919 ENSG00000164543:ENST00000319357:exon_43622664_43623048:STK17A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 43830888 T/C 1 14 20 34 5.97422727971706 11.4653896004042 -5.49116232068714 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0813413199549323 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000424330:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000453612:exon_43830848_43831446:BLVRA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 43843423 G/A 1 49 31 80 20.9097954790097 17.7713538806265 3.1384415983832 A:G G A 10 0.57326948002021 0.499850913844481 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43843275_43843446:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43843275_43843446:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000486984:exon_43843275_43843434:BLVRA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 43846603 A/G 1 66 81 147 28.1642143186661 46.434827881637 -18.2706135629709 A:T:G A G 10 0.57326948002021 0.00261395108666270 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43846576_43846938:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43846576_43846939:BLVRA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 44096439 T/G 1 32 35 67 13.6553766393533 20.0644318007074 -6.40905516135408 T:G T G 10 0.57326948002021 0.137748221752818 ENSG00000136279:ENST00000441840:exon_44096339_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000448521:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000458579:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000440166:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000464762:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000439815:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000490734:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000498733:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452943:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000485932:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000429716:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000468694:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000441904:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000494774:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000411855:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000423561:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000497184:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000432854:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000449997:exon_44096392_44096502:DBNL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 44099664 T/C 1 53 48 101 22.6167175589289 27.5169350409701 -4.90021748204121 T:C T C 10 0.57326948002021 0.365360909396278 ENSG00000136279:ENST00000441840:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000448521:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000456905:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000440166:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000490734:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000498733:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452943:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000429716:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000468694:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000494774:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000411855:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000497184:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000432854:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000449997:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452661:exon_44099647_44099752:DBNL HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 44112873 G/T 1 12 9 21 5.12076623975748 5.15942532018189 -0.0386590804244111 T:G G T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000122678:ENST00000335195:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000242248:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000435068:exon_44111849_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000395831:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000458246:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000430942:exon_44111861_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000467607:exon_44112817_44112976:POLM HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 44800176 G/T 1 18 7 25 7.68114935963622 4.01288636014147 3.66826299949475 T:G G T 10 0.57326948002021 0.159848312280910 ENSG00000122515:ENST00000413916:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000439149:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000309315:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000441627:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000433667:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000265346:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000414051:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000478045:exon_44799333_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000463056:exon_44799550_44800192:ZMIZ2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 44805240 G/C 1 5 7 12 2.13365259989895 4.01288636014147 -1.87923376024252 C:G G C 10 0.57326948002021 0.382460042999359 ENSG00000122515:ENST00000480964:exon_44804934_44805324:ZMIZ2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 44836314 A/G 1 19 21 40 8.10787987961601 12.0386590804244 -3.9307792008084 A:G A G 10 0.57326948002021 0.262881037202777 ENSG00000196262:ENST00000468812:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000481437:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000451562:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000355968:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000489459:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000479021:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000415933:exon_44836281_44836392:PPIA HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 44840864 G/A 1 29 23 52 12.3751850794139 13.1851980404648 -0.810012961050923 A:G G A 10 0.57326948002021 0.888732617924052 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 45139892 G/A 1 73 62 135 31.1513279585247 35.542707761253 -4.39137980272836 A:G G A 10 0.57326948002021 0.486531678871042 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45139741_45140025:TBRG4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 48004962 C/T 1 8 5 13 3.41384415983832 2.86634740010105 0.547496759737269 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000136273:ENST00000436444:exon_48003783_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000258774:exon_48002885_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000458191:exon_48004897_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000432325:exon_48004763_48005035:HUS1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 55540707 G/A 1 6 9 15 2.56038311987874 5.15942532018189 -2.59904220030315 A:G G A 10 0.57326948002021 0.198144643439766 ENSG00000154978:ENST00000285279:exon_55538306_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000428648:exon_55538307_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000433959:exon_55538307_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000428097:exon_55539630_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000418904:exon_55539896_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000454227:exon_55540402_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000453256:exon_55540447_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000427700:exon_55540470_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000455023:exon_55540578_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000414113:exon_55540610_55540738:VOPP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 56126360 T/C 1 106 100 206 45.2334351178577 57.326948002021 -12.0935128841633 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0912114923454943 ENSG00000146731:ENST00000275603:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000335503:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000482776:exon_56126313_56126703:CCT6A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 64291976 G/A 1 13 15 28 5.54749675973727 8.59904220030315 -3.05154544056588 A:G G A 10 0.57326948002021 0.256818512999306 ENSG00000197008:ENST00000307355:exon_64291829_64292580:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000494380:exon_64291829_64292181:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440155:exon_64291829_64292620:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440598:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000437743:exon_64291829_64294042:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000359735:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000430838:exon_64291829_64294054:ZNF138 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 65425894 A/G 1 144 128 272 61.4491948770898 73.3784934425869 -11.9292985654971 A:G A G 10 0.57326948002021 0.158464998721466 ENSG00000169919:ENST00000304895:exon_65425671_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000466883:exon_65425675_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000345660:exon_65425675_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000447929:exon_65425685_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000430730:exon_65425685_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000421103:exon_65425688_65426050:GUSB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 65439879 G/C 1 11 5 16 4.69403571977769 2.86634740010105 1.82768831967664 C:G G C 10 0.57326948002021 0.452437779938541 ENSG00000169919:ENST00000466883:exon_65439282_65441147:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000489482:exon_65439513_65439993:GUSB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 65447182 C/T 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000169919:ENST00000304895:exon_65446961_65447301:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000345660:exon_65446961_65447200:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000447929:exon_65446961_65447183:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000430730:exon_65446961_65447202:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000421103:exon_65446961_65447198:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000446111:exon_65446961_65447200:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000452642:exon_65446983_65447193:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000429291:exon_65446983_65447228:GUSB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 65557564 C/T 1 29 38 67 12.3751850794139 21.784240240768 -9.40905516135407 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0255277208388732 ENSG00000126522:ENST00000304874:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000126522:ENST00000380839:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000126522:ENST00000395332:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000126522:ENST00000395331:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000126522:ENST00000493708:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000126522:ENST00000464970:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000249319:ENST00000450043:exon_65557544_65557650:AC068533.7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 65842545 T/C 1 8 7 15 3.41384415983832 4.01288636014147 -0.599042200303151 T:C T C 10 0.57326948002021 0.7979049378473 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 66785137 C/A 1 29 11 40 12.3751850794139 6.30596428022231 6.0692207991916 A:C C A 10 0.57326948002021 0.0558219317533492 ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66785090_66786513:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66785090_66785250:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66785090_66785384:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66785090_66785395:STAG3L4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 72717933 C/T 1 27 15 42 11.5217240394543 8.59904220030315 2.92268183915118 T:C C T 10 0.57326948002021 0.43614407135636 ENSG00000130305:ENST00000428206:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000471461:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000438747:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000252594:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000446455:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000310326:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000478977:exon_72717928_72718033:NSUN5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 72891754 C/T 1 15 17 32 6.40095779969685 9.74558116034357 -3.34462336064672 T:C C T 10 0.57326948002021 0.283704858668405 ENSG00000009954:ENST00000339594:exon_72891198_72892899:BAZ1B;ENSG00000009954:ENST00000404251:exon_72891198_72892899:BAZ1B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 73097720 G/C 1 3 7 10 1.28019155993937 4.01288636014147 -2.7326948002021 C:G G C 10 0.57326948002021 0.109775478323748 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 73803548 C/A 1 10 4 14 4.2673051997979 2.29307792008084 1.97422727971706 A:C C A 10 0.57326948002021 0.419102837465114 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73803433_73803589:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73803433_73803589:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73803433_73803589:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000493166:exon_73803433_73803589:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000491075:exon_73803433_73803762:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000474962:exon_73803000_73803589:CLIP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 73814749 G/C 1 4 7 11 1.70692207991916 4.01288636014147 -2.30596428022231 C:G G C 10 0.57326948002021 0.223014268684580 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73814700_73814885:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73814700_73814885:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73814700_73814885:CLIP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 75051324 G/C 1 7 1 8 2.98711363985853 0.57326948002021 2.41384415983832 C:G G C 10 0.57326948002021 0.149609550462636 ENSG00000135213:ENST00000257665:exon_75050792_75052486:POM121C;ENSG00000135213:ENST00000453279:exon_75050792_75052486:POM121C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 75513062 A/G 1 4 17 21 1.70692207991916 9.74558116034357 -8.03865908042441 A:G A G 10 0.57326948002021 0.000535778995469036 ENSG00000005486:ENST00000006777:exon_75513016_75513166:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000318622:exon_75513016_75513166:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000454791:exon_75513016_75513166:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000413229:exon_75513016_75513166:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000428119:exon_75513016_75513166:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000467406:exon_75512808_75513166:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000470957:exon_75512839_75513166:RHBDD2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 75615006 C/T 1 16 13 29 6.82768831967664 7.45250324026273 -0.624814920586092 T:C C T 10 0.57326948002021 0.852402921615568 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75614897_75615031:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000496888:exon_75614897_75615063:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75614888_75615167:POR HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 75615287 G/A 1 21 20 41 8.96134091957559 11.4653896004042 -2.50404868082861 A:G G A 10 0.57326948002021 0.434514181456687 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75615241_75615386:POR HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 75630274 T/C 1 18 18 36 7.68114935963622 10.3188506403638 -2.63770128072756 T:C T C 10 0.57326948002021 0.402265706696478 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000438695:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75630208_75630320:STYXL1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 75659815 T/C 1 12 8 20 5.12076623975748 4.58615584016168 0.534610399595799 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000441791:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000474328:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000460184:exon_75659739_75659842:STYXL1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 75959188 G/A 1 7 13 20 2.98711363985853 7.45250324026273 -4.4653896004042 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0677059243274011 ENSG00000170027:ENST00000307630:exon_75956116_75959550:YWHAG;ENSG00000170027:ENST00000453207:exon_75958894_75959235:YWHAG HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 76111835 G/A 1 12 14 26 5.12076623975748 8.02577272028294 -2.90500648052546 A:G G A 10 0.57326948002021 0.3215675945048 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000423646:exon_76111825_76111976:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000429179:exon_76111825_76111880:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000472426:exon_76111825_76111932:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 76112060 C/T 1 17 13 30 7.25441883965643 7.45250324026273 -0.198084400606302 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 93551428 C/T 1 1 7 8 0.42673051997979 4.01288636014147 -3.58615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0245816827973848 ENSG00000127920:ENST00000248564:exon_93551011_93551545:GNG11 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 95034775 G/C 1 5 9 14 2.13365259989895 5.15942532018189 -3.02577272028294 C:G G C 10 0.57326948002021 0.112496331869413 ENSG00000105854:ENST00000455123:exon_95034179_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000355659:exon_95034185_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000433091:exon_95034192_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000222572:exon_95034209_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000483292:exon_95034590_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000446142:exon_95034651_95034800:PON2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 97488569 A/T 1 41 29 70 17.4959513191714 16.6248149205861 0.8711363985853 A:T A T 10 0.57326948002021 0.904045821990418 ENSG00000070669:ENST00000394309:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000454046:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000437628:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000394308:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000175506:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000422745:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000455086:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000444334:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000442734:exon_97488554_97488710:ASNS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 97933601 C/T 1 12 11 23 5.12076623975748 6.30596428022231 -1.18519804046483 T:C C T 10 0.57326948002021 0.67579941697981 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97933508_97933688:BAIAP2L1;ENSG00000006453:ENST00000480580:exon_97933508_97933677:BAIAP2L1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 98984354 G/C 1 90 121 211 38.4057467981811 69.3656070824454 -30.9598602842643 C:G G C 10 0.57326948002021 1.97269683229029e-05 ENSG00000241685:ENST00000441989:exon_98984308_98984412:ARPC1A;ENSG00000241685:ENST00000432884:exon_98984308_98984412:ARPC1A;ENSG00000241685:ENST00000508211:exon_98984308_98984412:ARPC1A;ENSG00000130429:ENST00000443222:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000414376:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000252725:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000484600:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000455009:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000484375:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000418347:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000417330:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000431816:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000427217:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000458033:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000451682:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000451694:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000474880:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000445924:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000432343:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000493403:exon_98984308_98984412:ARPC1B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 99017737 G/A 1 9 15 24 3.84057467981811 8.59904220030315 -4.75846752048504 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0623248403031247 ENSG00000106246:ENST00000292478:exon_99014362_99017772:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000422429:exon_99016757_99017772:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000438524:exon_99016757_99017772:PTCD1;ENSG00000248919:ENST00000413834:exon_99017372_99017772:RP5-900K19.1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 99047978 T/C 1 6 5 11 2.56038311987874 2.86634740010105 -0.305964280222311 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000160917:ENST00000436336:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441811:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000292476:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000430038:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441580:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000412686:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000484112:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000452047:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000471455:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000440514:exon_99047948_99047994:CPSF4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 99050039 G/A 1 13 7 20 5.54749675973727 4.01288636014147 1.5346103995958 A:G G A 10 0.57326948002021 0.652301753764728 ENSG00000106246:ENST00000482251:exon_99049991_99050232:PTCD1;ENSG00000160917:ENST00000436336:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441811:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000451876:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000292476:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441580:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000452047:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000471455:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000440514:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000465132:exon_99049991_99050887:CPSF4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 99055940 T/C 1 422 170 592 180.080279431471 97.4558116034357 82.6244678280356 T:C:G T C 10 0.57326948002021 2.84186869941212e-12 ENSG00000241468:ENST00000414062:exon_99055821_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000449683:exon_99055813_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000491560:exon_99055818_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000359832:exon_99055818_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000292475:exon_99055818_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000488775:exon_99055820_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000394186:exon_99055932_99055978:ATP5J2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 99690690 G/C 1 443 434 877 189.041620351047 248.798954328771 -59.7573339777242 T:C:G G C 10 0.57326948002021 5.48328442874667e-05 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99690351_99690756:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000343023:exon_99690403_99690739:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99690404_99690756:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99690404_99690756:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99690404_99690756:MCM7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 99690747 T/C 1 383 332 715 163.43778915226 190.32546736671 -26.8876782144502 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0450326277452023 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99690351_99690756:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99690404_99690756:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99690404_99690756:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99690404_99690756:MCM7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 99693552 G/A 1 141 95 236 60.1690033171504 54.46060060192 5.70840271523043 A:T:G G A 10 0.57326948002021 0.469693232695697 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99693397_99693790:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99693397_99693790:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99693397_99693790:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99693397_99693790:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000491245:exon_99693397_99693611:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000354230:exon_99693445_99693599:MCM7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 99704796 A/T 1 28 13 41 11.9484545594341 7.45250324026273 4.49595131917139 A:T A T 10 0.57326948002021 0.205983357250767 ENSG00000221838:ENST00000433787:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000429084:exon_99704281_99704800:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000359593:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000455152:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 99704827 A/G 1 38 20 58 16.215759759232 11.4653896004042 4.75037015882782 A:G A G 10 0.57326948002021 0.233247336231180 ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 99707712 A/G 1 6 4 10 2.56038311987874 2.29307792008084 0.267305199797899 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000106290:ENST00000487115:exon_99707700_99707897:TAF6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 99747130 G/A 1 109 98 207 46.5136266777971 56.1804090419806 -9.66678236418348 A:T:G G A 10 0.57326948002021 0.182115441678300 ENSG00000188186:ENST00000341942:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000460732:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000474831:exon_99747122_99747188:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000494136:exon_99747122_99747510:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000441173:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000468582:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000488241:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000473459:exon_99746980_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000466498:exon_99746982_99747202:C7orf59 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 99751017 A/G 1 8 5 13 3.41384415983832 2.86634740010105 0.547496759737269 A:G A G 10 0.57326948002021 1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 100137085 G/C 1 10 6 16 4.2673051997979 3.43961688012126 0.827688319676639 C:G G C 10 0.57326948002021 0.802879700667955 ENSG00000106351:ENST00000430857:exon_100136834_100137190:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000477022:exon_100136835_100137190:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000300176:exon_100136848_100137190:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000262935:exon_100136882_100137190:AGFG2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 100281768 T/C 1 3 6 9 1.28019155993937 3.43961688012126 -2.15942532018189 T:C T C 10 0.57326948002021 0.183674374674640 ENSG00000146830:ENST00000275732:exon_100281643_100281780:GIGYF1;ENSG00000146830:ENST00000472105:exon_100281643_100281960:GIGYF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 100304864 C/A 1 55 63 118 23.4701785988884 36.1159772412732 -12.6457986423848 A:C C A 10 0.57326948002021 0.0199544792359019 ENSG00000172336:ENST00000303151:exon_100304444_100305118:POP7;ENSG00000172336:ENST00000457480:exon_100304444_100304865:POP7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 100466441 G/A 1 20 25 45 8.5346103995958 14.3317370005053 -5.79712660090945 A:T:G G A 10 0.57326948002021 0.0968040181239068 ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000417475:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000437505:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000463125:exon_100465918_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000429658:exon_100466433_100466488:TRIP6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 100470851 G/A 1 95 108 203 40.53939939808 61.9131038421827 -21.3737044441026 A:G G A 10 0.57326948002021 0.00280992871301201 ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100470794_100471076:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100470794_100471076:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100470794_100471075:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100470794_100471076:TRIP6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 100482339 C/T 1 3 5 8 1.28019155993937 2.86634740010105 -1.58615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.29890034016204 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 100482526 C/G 1 7 6 13 2.98711363985853 3.43961688012126 -0.452503240262731 C:G C G 10 0.57326948002021 0.787569123349065 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 100486088 C/T 1 57 38 95 24.323639638848 21.784240240768 2.53939939808005 T:C C T 10 0.57326948002021 0.678443814032265 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 100486110 C/T 1 152 164 316 64.8630390369281 94.0161947233144 -29.1531556863864 A:T:C:G C T 10 0.57326948002021 0.00115441779505863 ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000448764:exon_100486095_100486277:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000342198:exon_100486095_100486120:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000445337:exon_100486095_100486281:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000477529:exon_100486095_100486285:SRRT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 100731829 T/C 1 8 11 19 3.41384415983832 6.30596428022231 -2.89212012038399 T:C T C 10 0.57326948002021 0.245610170938846 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 100732321 C/T 1 8 17 25 3.41384415983832 9.74558116034357 -6.33173700050525 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0139782981157786 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 101837149 G/A 1 1 7 8 0.42673051997979 4.01288636014147 -3.58615584016168 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0245816827973848 ENSG00000160967:ENST00000292538:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000419439:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000360264:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000425244:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000393824:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000338990:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000437600:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000292535:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000412016:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000415720:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000436903:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000431850:exon_101837122_101837170:CUX1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 102087202 T/C 1 4 10 14 1.70692207991916 5.7326948002021 -4.02577272028294 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0543340383697456 ENSG00000160991:ENST00000495936:exon_102086960_102087422:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000488996:exon_102086960_102087495:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000356387:exon_102086960_102097268:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000478730:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000468241:exon_102086960_102087371:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000403646:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000473939:exon_102086960_102089179:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000458233:exon_102086960_102087661:ORAI2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 102112980 G/A 1 15 8 23 6.40095779969685 4.58615584016168 1.81480195953517 A:G G A 10 0.57326948002021 0.530254060134089 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102110189_102113613:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000488689:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000468175:exon_102112901_102113056:LRWD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 102114087 C/T 1 101 25 126 43.0997825179588 14.3317370005053 28.7680455174535 T:C C T 10 0.57326948002021 1.01790951970555e-07 ENSG00000005075:ENST00000292614:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000306744:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000393794:exon_102113910_102114131:POLR2J HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 104717517 C/T 1 43 37 80 18.349412359131 21.2109707607478 -2.8615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.572287933503473 ENSG00000005483:ENST00000311117:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334884:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000393656:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000351043:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334877:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000257745:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334914:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000478990:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000476671:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000482560:exon_104717410_104717640:MLL5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 104752798 G/A 1 10 15 25 4.2673051997979 8.59904220030315 -4.33173700050525 A:G G A 10 0.57326948002021 0.104461185238695 ENSG00000005483:ENST00000311117:exon_104752272_104754532:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334884:exon_104752272_104754808:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000351043:exon_104752272_104754808:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334877:exon_104752272_104754808:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000257745:exon_104752272_104754531:MLL5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 106826381 C/T 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000105856:ENST00000468410:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000222574:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000485846:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000463202:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000417005:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000498408:exon_106826246_106826387:HBP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 107218033 T/C 1 15 17 32 6.40095779969685 9.74558116034357 -3.34462336064672 T:C T C 10 0.57326948002021 0.283704858668405 ENSG00000105865:ENST00000422290:exon_107217758_107218460:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000265720:exon_107217758_107218906:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000431839:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000406564:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000402620:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000443233:exon_107217758_107218295:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000436411:exon_107217758_107218750:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000485825:exon_107217758_107218101:DUS4L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 108212353 G/A 1 6 5 11 2.56038311987874 2.86634740010105 -0.305964280222311 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000128590:ENST00000249356:exon_108212161_108212387:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000491582:exon_108212161_108212507:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000465725:exon_108212159_108212387:DNAJB9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 111981007 G/A 1 13 12 25 5.54749675973727 6.87923376024252 -1.33173700050525 A:G G A 10 0.57326948002021 0.686966178648469 ENSG00000198839:ENST00000361822:exon_111980927_111981101:ZNF277;ENSG00000198839:ENST00000361946:exon_111980927_111981101:ZNF277 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 112102355 T/G 1 7 10 17 2.98711363985853 5.7326948002021 -2.74558116034357 T:G T G 10 0.57326948002021 0.221546928311467 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112102325_112102433:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112102325_112102433:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000421296:exon_112102325_112102433:IFRD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 112112279 G/A 1 14 24 38 5.97422727971706 13.758467520485 -7.78424024076798 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0132271482547016 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000421296:exon_112112274_112112299:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000489994:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000470441:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000462155:exon_112112274_112112402:IFRD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 128034629 C/T 1 32 25 57 13.6553766393533 14.3317370005053 -0.676360361151973 T:C C T 10 0.57326948002021 0.893859224756966 ENSG00000106348:ENST00000469328:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000484496:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000419067:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000338791:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000496200:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000354269:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000348127:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000378717:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000416064:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000343214:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000470772:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000480861:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000460045:exon_128034510_128035052:IMPDH1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 128038555 C/G 1 8 2 10 3.41384415983832 1.14653896004042 2.2673051997979 C:G C G 10 0.57326948002021 0.205360643158888 ENSG00000106348:ENST00000469328:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000484496:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000419067:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000338791:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000496200:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000354269:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000348127:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000378717:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000416064:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000343214:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000470772:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000480861:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000497868:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000468842:exon_128038544_128038667:IMPDH1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 128503072 G/T 1 146 171 317 62.3026559170493 98.0290810834559 -35.7264251664066 T:G G T 10 0.57326948002021 6.59689089213554e-05 ENSG00000128524:ENST00000249289:exon_128502880_128503116:ATP6V1F;ENSG00000128524:ENST00000492758:exon_128502958_128503116:ATP6V1F HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 129664312 T/C 1 6 12 18 2.56038311987874 6.87923376024252 -4.31885064036378 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0544603635560848 ENSG00000091732:ENST00000358303:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000360708:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000467642:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000311873:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000435129:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000477578:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000471022:exon_129664103_129664346:ZC3HC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 129813738 T/C 1 5 6 11 2.13365259989895 3.43961688012126 -1.30596428022231 T:C T C 10 0.57326948002021 0.545300564874909 ENSG00000146842:ENST00000397622:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000336804:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000462753:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000473456:exon_129813665_129813779:TMEM209 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 131347009 T/C 0 246 0 246 104.975707915028 0 104.975707915028 T T 10 0.57326948002021 3.92656900465652e-60 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 134849213 G/A 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 A:G G A 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140;ENSG00000146859:ENST00000456488:exon_134849194_134849481:TMEM140 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 135329690 T/C 1 21 23 44 8.96134091957559 13.1851980404648 -4.22385712088924 T:C T C 10 0.57326948002021 0.223481862197547 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000477620:exon_135329643_135329726:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000461255:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000490439:exon_135329647_135329766:NUP205 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 138732497 G/A 1 10 2 12 4.2673051997979 1.14653896004042 3.12076623975748 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0830011205774995 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 138761034 G/C 1 3 8 11 1.28019155993937 4.58615584016168 -3.30596428022231 C:G G C 10 0.57326948002021 0.0642027293927821 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000471652:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000460845:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 139026152 T/G 1 33 15 48 14.0821071593331 8.59904220030315 5.48306495902992 T:G T G 10 0.57326948002021 0.14369057577983 ENSG00000164898:ENST00000297534:exon_139025878_139026268:C7orf55 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 139102490 A/G 1 5 4 9 2.13365259989895 2.29307792008084 -0.15942532018189 A:G A G 10 0.57326948002021 1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 140159721 T/C 1 15 8 23 6.40095779969685 4.58615584016168 1.81480195953517 T:C T C 10 0.57326948002021 0.530254060134089 ENSG00000133606:ENST00000255977:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475010:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000474576:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000496169:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000443720:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000471104:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000467513:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000494939:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000498535:exon_140159572_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000473444:exon_140159598_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475180:exon_140159641_140159736:MKRN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 140404746 C/T 1 112 104 216 47.7938182377365 59.6200259221018 -11.8262076843654 T:C C T 10 0.57326948002021 0.113505212167009 ENSG00000090266:ENST00000482954:exon_140404660_140404763:NDUFB2;ENSG00000090266:ENST00000476279:exon_140404660_140404769:NDUFB2;ENSG00000090266:ENST00000247866:exon_140404660_140404763:NDUFB2;ENSG00000090266:ENST00000465506:exon_140404660_140405462:NDUFB2;ENSG00000090266:ENST00000464564:exon_140404660_140404763:NDUFB2;ENSG00000090266:ENST00000476181:exon_140404660_140404763:NDUFB2;ENSG00000090266:ENST00000204307:exon_140404660_140404763:NDUFB2;ENSG00000090266:ENST00000464566:exon_140404660_140404763:NDUFB2;ENSG00000090266:ENST00000460088:exon_140404660_140404763:NDUFB2;ENSG00000090266:ENST00000472695:exon_140404660_140404763:NDUFB2;ENSG00000090266:ENST00000476470:exon_140404660_140404763:NDUFB2;ENSG00000090266:ENST00000471136:exon_140404660_140404763:NDUFB2;ENSG00000090266:ENST00000475276:exon_140404660_140404763:NDUFB2;ENSG00000090266:ENST00000479181:exon_140404660_140404763:NDUFB2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 141364712 G/A 1 6 4 10 2.56038311987874 2.29307792008084 0.267305199797899 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000127359:ENST00000297761:exon_141364704_141364854:KIAA1147;ENSG00000127359:ENST00000482493:exon_141364704_141364854:KIAA1147 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 142494785 C/A 0 36 0 36 15.3622987192724 0 15.3622987192724 C C 10 0.57326948002021 2.89615622905026e-09 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 0 311 0 311 132.713191713715 0 132.713191713715 T T 10 0.57326948002021 7.59822669663231e-76 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 150034184 T/C 1 7 7 14 2.98711363985853 4.01288636014147 -1.02577272028294 T:C T C 10 0.57326948002021 0.5990458397462 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 150034378 A/G 1 5 5 10 2.13365259989895 2.86634740010105 -0.732694800202101 A:G A G 10 0.57326948002021 0.752834960365011 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 150037660 A/G 1 7 3 10 2.98711363985853 1.71980844006063 1.2673051997979 A:G A G 10 0.57326948002021 0.532053210294076 ENSG00000106538:ENST00000478771:exon_150037189_150038749:RARRES2;ENSG00000106538:ENST00000223271:exon_150037525_150037718:RARRES2;ENSG00000106538:ENST00000467793:exon_150037525_150037718:RARRES2;ENSG00000106538:ENST00000466675:exon_150037525_150038732:RARRES2;ENSG00000106538:ENST00000482669:exon_150037525_150037718:RARRES2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 150066900 A/G 1 12 12 24 5.12076623975748 6.87923376024252 -1.75846752048504 A:G A G 10 0.57326948002021 0.537756757259522 ENSG00000214022:ENST00000487455:exon_150066760_150067133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150066831_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000473391:exon_150066760_150067691:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150066831_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000495535:exon_150066760_150067223:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150066765_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000469309:exon_150066760_150067500:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000522266:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150066733_150066957:REPIN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 150068605 G/A 1 8 7 15 3.41384415983832 4.01288636014147 -0.599042200303151 A:G G A 10 0.57326948002021 0.7979049378473 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 150068620 C/T 1 9 9 18 3.84057467981811 5.15942532018189 -1.31885064036378 T:C C T 10 0.57326948002021 0.635341898612975 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 150093701 A/C 1 6 9 15 2.56038311987874 5.15942532018189 -2.59904220030315 A:C A C 10 0.57326948002021 0.198144643439766 ENSG00000196456:ENST00000478789:exon_150093601_150094003:ZNF775;ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775;ENSG00000196456:ENST00000490973:exon_150093601_150094067:ZNF775 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 150094851 A/G 1 5 8 13 2.13365259989895 4.58615584016168 -2.45250324026273 A:G A G 10 0.57326948002021 0.261241293669647 ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 150217248 A/G 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 A:G A G 10 0.57326948002021 0.741310101183539 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 150217309 C/T 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 150324825 C/T 1 7 2 9 2.98711363985853 1.14653896004042 1.84057467981811 T:C C T 10 0.57326948002021 0.31706387914541 ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000493969:exon_150324764_150325376:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000438845:exon_150324807_150325810:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000435189:exon_150324807_150325376:GIMAP6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 150389677 G/C 1 11 8 19 4.69403571977769 4.58615584016168 0.107879879616009 C:G G C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 150417319 G/A 1 8 1 9 3.41384415983832 0.57326948002021 2.84057467981811 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0881139701997098 ENSG00000213203:ENST00000307194:exon_150417136_150421372:GIMAP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 150439500 C/T 1 22 53 75 9.38807143955538 30.3832824410711 -20.9952110015158 T:C C T 10 0.57326948002021 1.63905897478556e-06 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000493304:exon_150439271_150439605:GIMAP5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 150440043 C/T 1 48 111 159 20.4830649590299 63.6329122822433 -43.1498473232134 T:C C T 10 0.57326948002021 5.54561279955135e-12 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 150768786 G/A 1 6 10 16 2.56038311987874 5.7326948002021 -3.17231168032336 A:G G A 10 0.57326948002021 0.131350999414970 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000493040:exon_150768564_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000460010:exon_150768752_150769223:SLC4A2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 150773807 A/T 1 90 64 154 38.4057467981811 36.6892467212934 1.71650007688766 A:T:C:G A T 10 0.57326948002021 0.807336681143397 ENSG00000164896:ENST00000483105:exon_150773679_150773888:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000489884:exon_150773711_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000465272:exon_150773713_150774114:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000467237:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000353841:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297532:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482571:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297530:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000460980:exon_150773716_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000469237:exon_150773725_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482806:exon_150773733_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000483953:exon_150773742_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000466855:exon_150773803_150773919:FASTK HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 150779334 C/T 1 40 30 70 17.0692207991916 17.1980844006063 -0.128863601414704 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000164897:ENST00000297533:exon_150779262_150779680:TMUB1;ENSG00000164897:ENST00000392818:exon_150779262_150779680:TMUB1;ENSG00000164897:ENST00000462940:exon_150779262_150779995:TMUB1;ENSG00000164897:ENST00000482202:exon_150779262_150779680:TMUB1;ENSG00000164897:ENST00000476627:exon_150779262_150779680:TMUB1;ENSG00000164897:ENST00000488752:exon_150779262_150779680:TMUB1;ENSG00000164897:ENST00000492838:exon_150779262_150779680:TMUB1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 151064064 C/T 1 8 4 12 3.41384415983832 2.29307792008084 1.12076623975748 T:C C T 10 0.57326948002021 0.573925568669172 ENSG00000013374:ENST00000413040:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000355851:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000480907:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000497987:exon_151064025_151064211:NUB1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 151074296 A/G 1 19 13 32 8.10787987961601 7.45250324026273 0.655376639353278 A:G A G 10 0.57326948002021 0.860030624222388 ENSG00000013374:ENST00000413040:exon_151074133_151075535:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000355851:exon_151074133_151075535:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000460712:exon_151074133_151074367:NUB1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 154738409 T/C 1 21 29 50 8.96134091957559 16.6248149205861 -7.6634740010105 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0319096954719616 ENSG00000214106:ENST00000411526:exon_154738350_154738546:AC093726.6;ENSG00000214106:ENST00000449486:exon_154738303_154738501:AC093726.6;ENSG00000157212:ENST00000404141:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000457196:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000464717:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000397192:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000323199:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000357094:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000473219:exon_154738389_154738523:PAXIP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 156746890 C/T 1 2 7 9 0.85346103995958 4.01288636014147 -3.15942532018189 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0433151286077531 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156746797_156746992:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000460332:exon_156746806_156746992:NOM1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 158526880 G/A 1 12 21 33 5.12076623975748 12.0386590804244 -6.91789284066693 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0207968975760368 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158523686_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158523689_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158523689_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158526140_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158526302_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158526304_158526943:ESYT2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 158528233 A/G 1 8 10 18 3.41384415983832 5.7326948002021 -2.31885064036378 A:G A G 10 0.57326948002021 0.34156534419122 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158528194_158528299:ESYT2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 158534372 G/A 1 6 12 18 2.56038311987874 6.87923376024252 -4.31885064036378 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0544603635560848 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 158534381 G/C 1 6 11 17 2.56038311987874 6.30596428022231 -3.74558116034357 C:G G C 10 0.57326948002021 0.0853131245996917 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 158536267 T/C 1 7 9 16 2.98711363985853 5.15942532018189 -2.17231168032336 T:C T C 10 0.57326948002021 0.316607002067173 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 158536334 G/A 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 A:G G A 10 0.57326948002021 0.741310101183539 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 7 158536345 A/G 1 6 4 10 2.56038311987874 2.29307792008084 0.267305199797899 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 6302154 G/T 1 5 8 13 2.13365259989895 4.58615584016168 -2.45250324026273 T:G G T 10 0.57326948002021 0.261241293669647 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 6302671 C/T 1 14 10 24 5.97422727971706 5.7326948002021 0.241532479514959 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 6302971 C/T 1 11 14 25 4.69403571977769 8.02577272028294 -3.33173700050525 A:T:C C T 10 0.57326948002021 0.224888309077082 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 6390027 A/G 1 2 6 8 0.85346103995958 3.43961688012126 -2.58615584016168 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0801462458318362 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 6479182 G/A 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 6500544 C/T 1 7 5 12 2.98711363985853 2.86634740010105 0.120766239757479 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6500515_6501144:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6500515_6506026:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6500515_6500891:MCPH1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 8176221 C/T 1 19 11 30 8.10787987961601 6.30596428022231 1.8019155993937 T:C C T 10 0.57326948002021 0.582251642589673 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 9567700 C/A 1 5 8 13 2.13365259989895 4.58615584016168 -2.45250324026273 A:C C A 10 0.57326948002021 0.261241293669647 ENSG00000173273:ENST00000520408:exon_9567652_9567919:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000310430:exon_9567652_9567730:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000518281:exon_9567652_9567730:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000434877:exon_9567652_9567919:TNKS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 10623240 T/C 1 15 34 49 6.40095779969685 19.4911623206871 -13.0902045209903 T:C T C 10 0.57326948002021 0.000224888366522654 ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10622473_10623426:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10622669_10623426:PINX1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 10623254 C/A 1 26 14 40 11.0949935194745 8.02577272028294 3.0692207991916 A:C C A 10 0.57326948002021 0.343251951727088 ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10622473_10623426:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10622669_10623426:PINX1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 11666337 A/G 1 48 59 107 20.4830649590299 33.8228993211924 -13.3398343621625 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0107928928111989 ENSG00000079459:ENST00000530337:exon_11666303_11666400:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11666303_11666400:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11666303_11666400:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11666303_11666400:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11666303_11666400:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11666303_11666400:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11666303_11666400:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11665926_11666400:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000531733:exon_11665999_11666400:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000531249:exon_11666019_11666400:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000532266:exon_11666300_11666400:FDFT1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 17819572 C/T 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 T:C C T 10 0.57326948002021 0.741310101183539 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517836:exon_17819543_17819722:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518762:exon_17819543_17819683:PCM1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 17927327 T/C 1 25 18 43 10.6682629994947 10.3188506403638 0.349412359130968 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17927301_17927387:ASAH1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 17928811 C/T 1 29 27 56 12.3751850794139 15.4782759605457 -3.10309088113176 T:C C T 10 0.57326948002021 0.419758420102696 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17928809_17928899:ASAH1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 21862551 A/G 1 7 15 22 2.98711363985853 8.59904220030315 -5.61192856044462 A:G A G 10 0.57326948002021 0.017849705176637 ENSG00000130227:ENST00000434536:exon_21862506_21864095:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000252512:exon_21862506_21864096:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000433566:exon_21862506_21864095:XPO7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 21965113 T/C 1 8 3 11 3.41384415983832 1.71980844006063 1.69403571977769 T:C T C 10 0.57326948002021 0.372574328023575 ENSG00000173566:ENST00000522405:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000309188:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000521807:exon_21964385_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000420897:exon_21964454_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000522379:exon_21965024_21965406:NUDT18 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 22471938 G/T 1 7 8 15 2.98711363985853 4.58615584016168 -1.59904220030315 T:G G T 10 0.57326948002021 0.441591135560738 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22471903_22472016:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22471903_22472016:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22471903_22472016:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000522599:exon_22471903_22472016:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521020:exon_22471903_22472086:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520738:exon_22471901_22472016:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 22548790 G/T 1 7 1 8 2.98711363985853 0.57326948002021 2.41384415983832 T:G G T 10 0.57326948002021 0.149609550462636 ENSG00000179388:ENST00000317216:exon_22545172_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000522910:exon_22547556_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000519492:exon_22547937_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000524088:exon_22547985_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000518773:exon_22548678_22548995:EGR3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 22880162 G/C 1 15 16 31 6.40095779969685 9.17231168032336 -2.77135388062651 C:G G C 10 0.57326948002021 0.365073379223067 ENSG00000120889:ENST00000523752:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22879824_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22879987_22880497:TNFRSF10B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 22886020 A/G 1 7 1 8 2.98711363985853 0.57326948002021 2.41384415983832 A:G A G 10 0.57326948002021 0.149609550462636 ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22885844_22886115:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000518531:exon_22885778_22886115:TNFRSF10B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 23104195 G/T 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 T:G G T 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000147457:ENST00000397677:exon_23103769_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000313219:exon_23103604_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000519414:exon_23104150_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000517325:exon_23104155_23104337:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000442460:exon_23104157_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000519984:exon_23104172_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000519529:exon_23104172_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000519503:exon_23104179_23104507:CHMP7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 23291835 T/C 1 10 10 20 4.2673051997979 5.7326948002021 -1.4653896004042 T:C T C 10 0.57326948002021 0.508038948022547 ENSG00000197217:ENST00000518471:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000356206:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000521321:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000522255:exon_23291830_23292251:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000523958:exon_23291606_23291991:ENTPD4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 23429329 T/C 1 19 16 35 8.10787987961601 9.17231168032336 -1.06443180070735 T:C T C 10 0.57326948002021 0.73499662446166 ENSG00000147454:ENST00000519973:exon_23428848_23432976:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000290075:exon_23428848_23429716:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518881:exon_23428848_23429734:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523930:exon_23428988_23429371:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523883:exon_23428848_23429716:SLC25A37 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 25361033 A/G 1 6 10 16 2.56038311987874 5.7326948002021 -3.17231168032336 A:T:G A G 10 0.57326948002021 0.131350999414970 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25360889_25361060:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25360889_25361060:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25360889_25361060:CDCA2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 25364101 G/C 1 8 19 27 3.41384415983832 10.892120120384 -7.47827596054567 C:G G C 10 0.57326948002021 0.00541689868545728 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 25364319 T/A 1 23 28 51 9.81480195953517 16.0515454405659 -6.23674348103071 A:T T A 10 0.57326948002021 0.089195278882361 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 25364894 T/G 1 25 21 46 10.6682629994947 12.0386590804244 -1.37039608092966 T:G T G 10 0.57326948002021 0.766010444052857 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 25365278 G/A 1 32 24 56 13.6553766393533 13.758467520485 -0.103090881131763 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000435898:exon_25365252_25365327:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 26240646 A/G 1 8 6 14 3.41384415983832 3.43961688012126 -0.0257727202829408 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000104765:ENST00000380629:exon_26240414_26240746:BNIP3L;ENSG00000104765:ENST00000520077:exon_26240570_26240746:BNIP3L HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 26510792 T/C 1 6 3 9 2.56038311987874 1.71980844006063 0.84057467981811 T:C T C 10 0.57326948002021 0.741310101183539 ENSG00000092964:ENST00000521913:exon_26510748_26510913:DPYSL2;ENSG00000092964:ENST00000311151:exon_26510748_26510913:DPYSL2;ENSG00000092964:ENST00000522745:exon_26510748_26510913:DPYSL2;ENSG00000092964:ENST00000523027:exon_26510748_26510913:DPYSL2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 27293865 C/T 1 26 26 52 11.0949935194745 14.9050064805255 -3.81001296105092 T:C C T 10 0.57326948002021 0.326772290650383 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27293768_27293865:PTK2B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 27311703 T/C 1 29 34 63 12.3751850794139 19.4911623206871 -7.11597724127323 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0751084251841295 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000482543:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27311548_27312128:PTK2B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 27315876 A/G 1 100 74 174 42.673051997979 42.4219415214955 0.251110476483454 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 27315900 A/G 1 97 76 173 41.3928604380396 43.568480481536 -2.17562004349634 A:G A G 10 0.57326948002021 0.758783100726174 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 28196783 C/G 1 47 48 95 20.0563344390501 27.5169350409701 -7.46060060191996 C:G C G 10 0.57326948002021 0.146058337427346 ENSG00000168081:ENST00000518479:exon_28196557_28196893:PNOC;ENSG00000168081:ENST00000301908:exon_28196557_28197008:PNOC;ENSG00000168081:ENST00000519592:exon_28196557_28197725:PNOC;ENSG00000168081:ENST00000522209:exon_28196557_28197008:PNOC HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 28625640 G/C 1 13 12 25 5.54749675973727 6.87923376024252 -1.33173700050525 C:G G C 10 0.57326948002021 0.686966178648469 ENSG00000104299:ENST00000523303:exon_28625178_28625839:INTS9;ENSG00000104299:ENST00000521022:exon_28625178_28625839:INTS9;ENSG00000104299:ENST00000416984:exon_28625178_28625839:INTS9;ENSG00000104299:ENST00000397363:exon_28625178_28625839:INTS9;ENSG00000104299:ENST00000521777:exon_28625275_28625839:INTS9;ENSG00000104299:ENST00000517383:exon_28625429_28625893:INTS9;ENSG00000104299:ENST00000522363:exon_28625464_28625839:INTS9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 29197672 A/G 1 52 58 110 22.1899870389491 33.2496298411722 -11.0596428022231 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0342256025157272 ENSG00000120875:ENST00000240100:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000404690:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000240101:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000462477:exon_29197615_29197760:DUSP4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 31024654 T/C 1 10 4 14 4.2673051997979 2.29307792008084 1.97422727971706 T:C T C 10 0.57326948002021 0.419102837465114 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_31024538_31024746:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_31024538_31024746:WRN HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 37635649 A/G 1 9 10 19 3.84057467981811 5.7326948002021 -1.89212012038399 A:G A G 10 0.57326948002021 0.487623161721597 ENSG00000147471:ENST00000328195:exon_37635491_37637283:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000437582:exon_37635491_37637285:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000521494:exon_37635491_37635880:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000517377:exon_37635491_37635918:PROSC HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 38458696 T/C 0 15 0 15 6.40095779969685 0 6.40095779969685 T T 10 0.57326948002021 0.000297275113311910 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 38848850 C/T 1 20 14 34 8.5346103995958 8.02577272028294 0.508837679312858 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000169490:ENST00000456845:exon_38846327_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000456397:exon_38846327_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000412303:exon_38846327_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000397070:exon_38848324_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000316221:exon_38848324_38849064:TM2D2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 59739438 A/C 1 4 7 11 1.70692207991916 4.01288636014147 -2.30596428022231 A:C A C 10 0.57326948002021 0.223014268684580 ENSG00000198846:ENST00000361421:exon_59739381_59739461:TOX HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 65493429 T/G 1 2 6 8 0.85346103995958 3.43961688012126 -2.58615584016168 T:G T G 10 0.57326948002021 0.0801462458318362 ENSG00000180828:ENST00000321870:exon_65492814_65496181:BHLHE22 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 67592152 T/C 1 15 6 21 6.40095779969685 3.43961688012126 2.96134091957559 T:C T C 10 0.57326948002021 0.269857208962559 ENSG00000104205:ENST00000520044:exon_67591956_67592259:SGK3;ENSG00000104205:ENST00000519289:exon_67591956_67592259:SGK3;ENSG00000213865:ENST00000521113:exon_67591956_67592259:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000519561:exon_67591956_67593393:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000390159:exon_67591956_67593235:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000396609:exon_67591956_67592259:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000518860:exon_67591774_67592259:C8orf44 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 68112655 T/G 1 8 8 16 3.41384415983832 4.58615584016168 -1.17231168032336 T:G T G 10 0.57326948002021 0.617511810756066 ENSG00000066777:ENST00000520381:exon_68112631_68112748:ARFGEF1;ENSG00000066777:ENST00000522878:exon_68112631_68112748:ARFGEF1;ENSG00000066777:ENST00000262215:exon_68112631_68112748:ARFGEF1;ENSG00000066777:ENST00000517743:exon_68112631_68112748:ARFGEF1;ENSG00000066777:ENST00000518290:exon_68109909_68112748:ARFGEF1;ENSG00000066777:ENST00000517955:exon_68112631_68112748:ARFGEF1;ENSG00000066777:ENST00000518789:exon_68112631_68112748:ARFGEF1;ENSG00000066777:ENST00000518230:exon_68112164_68112748:ARFGEF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 81905397 A/G 1 5 9 14 2.13365259989895 5.15942532018189 -3.02577272028294 A:G A G 10 0.57326948002021 0.112496331869413 ENSG00000076641:ENST00000220597:exon_81905338_81905542:PAG1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 87519315 T/G 1 18 4 22 7.68114935963622 2.29307792008084 5.38807143955538 T:G T G 10 0.57326948002021 0.0286961630094187 ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523911:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519966:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000430676:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000524172:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523370:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000521045:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000518772:exon_87519224_87519341:FAM82B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 87556997 G/T 1 9 2 11 3.84057467981811 1.14653896004042 2.69403571977769 T:G G T 10 0.57326948002021 0.131175688856066 ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87556968_87557066:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87556968_87557066:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000523072:exon_87556968_87557036:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517391:exon_87556968_87557066:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517862:exon_87556968_87557561:CPNE3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 90958422 T/C 1 7 8 15 2.98711363985853 4.58615584016168 -1.59904220030315 T:C T C 10 0.57326948002021 0.441591135560738 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000520325:exon_90958368_90958853:NBN HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 90990479 C/G 1 6 6 12 2.56038311987874 3.43961688012126 -0.879233760242521 C:G C G 10 0.57326948002021 0.771962928640395 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000452387:exon_90990448_90990542:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517772:exon_90990448_90990551:NBN HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 95161102 G/A 1 1 7 8 0.42673051997979 4.01288636014147 -3.58615584016168 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0245816827973848 ENSG00000079112:ENST00000027335:exon_95160972_95161102:CDH17;ENSG00000079112:ENST00000441892:exon_95160972_95161102:CDH17;ENSG00000079112:ENST00000450165:exon_95160972_95161102:CDH17;ENSG00000079112:ENST00000520952:exon_95160972_95161102:CDH17 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 95500924 A/G 1 68 56 124 29.0176753586257 32.1030908811318 -3.08541552250605 A:G A G 10 0.57326948002021 0.586864555750445 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95499921_95501088:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95500600_95501088:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95500600_95501088:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000521080:exon_95500748_95501088:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000522263:exon_95500748_95501088:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000522196:exon_95500749_95501088:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000517624:exon_95500843_95501088:KIAA1429 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 95877787 T/C 1 2 7 9 0.85346103995958 4.01288636014147 -3.15942532018189 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0433151286077531 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520315:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000517918:exon_95877734_95877918:INTS8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 95888307 C/T 1 13 15 28 5.54749675973727 8.59904220030315 -3.05154544056588 T:C C T 10 0.57326948002021 0.256818512999306 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000521155:exon_95888302_95888370:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523998:exon_95888179_95888513:INTS8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 99057150 C/A 1 18 16 34 7.68114935963622 9.17231168032336 -1.49116232068714 A:C C A 10 0.57326948002021 0.60774078808005 ENSG00000156482:ENST00000518850:exon_99057055_99057316:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000520998:exon_99056661_99057316:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521112:exon_99057096_99057627:RPL30 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 99057526 G/A 1 13 6 19 5.54749675973727 3.43961688012126 2.10787987961601 A:G G A 10 0.57326948002021 0.363933046022059 ENSG00000156482:ENST00000517489:exon_99057171_99057627:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521112:exon_99057096_99057627:RPL30 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 99168383 T/C 1 3 7 10 1.28019155993937 4.01288636014147 -2.7326948002021 T:C T C 10 0.57326948002021 0.109775478323748 ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99168278_99168640:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99168278_99168640:POP1;ENSG00000104356:ENST00000517435:exon_99168186_99168640:POP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 103662353 C/T 1 6 8 14 2.56038311987874 4.58615584016168 -2.02577272028294 T:C C T 10 0.57326948002021 0.291858897104158 ENSG00000155090:ENST00000285407:exon_103661007_103662619:KLF10;ENSG00000155090:ENST00000395884:exon_103661014_103662619:KLF10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 104432545 A/G 1 18 12 30 7.68114935963622 6.87923376024252 0.801915599393698 A:T:G A G 10 0.57326948002021 0.854651896908109 ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521716:exon_104432492_104432876:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521971:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000388778:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000519682:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000518554:exon_104432492_104432691:DCAF13 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 110283256 T/C 0 8 0 8 3.41384415983832 0 3.41384415983832 T T 10 0.57326948002021 0.0127642064234436 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110283234_110283359:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110283234_110283359:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110283234_110283359:NUDCD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 110283353 T/G 1 6 4 10 2.56038311987874 2.29307792008084 0.267305199797899 T:G T G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110283234_110283359:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110283234_110283359:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110283234_110283359:NUDCD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 120744349 T/C 1 6 8 14 2.56038311987874 4.58615584016168 -2.02577272028294 T:C T C 10 0.57326948002021 0.291858897104158 ENSG00000064313:ENST00000378164:exon_120743015_120744426:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000529653:exon_120744055_120744426:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000526969:exon_120744302_120744426:TAF2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 124449466 C/T 1 4 6 10 1.70692207991916 3.43961688012126 -1.7326948002021 T:C C T 10 0.57326948002021 0.342315301618549 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000518125:exon_124449450_124449574:WDYHV1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 125463435 C/G 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 C:G C G 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000183665:ENST00000328599:exon_125463048_125465262:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000521443:exon_125463061_125463498:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000522518:exon_125463158_125463498:TRMT12 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 125463937 G/C 1 11 8 19 4.69403571977769 4.58615584016168 0.107879879616009 C:G G C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000183665:ENST00000328599:exon_125463048_125465262:TRMT12 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 125499363 G/A 1 13 12 25 5.54749675973727 6.87923376024252 -1.33173700050525 A:G G A 10 0.57326948002021 0.686966178648469 ENSG00000170881:ENST00000303545:exon_125498072_125500155:RNF139 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 125528135 G/A 1 22 12 34 9.38807143955538 6.87923376024252 2.50883767931286 A:G G A 10 0.57326948002021 0.488583104805745 ENSG00000147687:ENST00000276692:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523214:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519548:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000522810:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000517678:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519776:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000521546:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000521973:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000520321:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000522310:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519232:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000520938:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523888:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523152:exon_125528128_125528271:TATDN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 131124388 A/C 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 A:C A C 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000153317:ENST00000524124:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000357668:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000521075:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000518721:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000343135:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000519483:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000520189:exon_131124340_131124660:ASAP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 133844508 C/T 1 9 9 18 3.84057467981811 5.15942532018189 -1.31885064036378 T:C C T 10 0.57326948002021 0.635341898612975 ENSG00000129292:ENST00000395386:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000220847:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000395390:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000460236:exon_133844480_133844644:PHF20L1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 141461266 A/G 1 2 6 8 0.85346103995958 3.43961688012126 -2.58615584016168 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0801462458318362 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141460889_141461482:TRAPPC9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 142200467 G/A 1 21 19 40 8.96134091957559 10.892120120384 -1.9307792008084 A:G G A 10 0.57326948002021 0.632079311578613 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520571:exon_142200383_142200723:DENND3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 142204326 C/G 1 57 39 96 24.323639638848 22.3575097207882 1.96612991805983 C:G C G 10 0.57326948002021 0.757145167607382 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 144403408 C/T 1 7 9 16 2.98711363985853 5.15942532018189 -2.17231168032336 T:C C T 10 0.57326948002021 0.316607002067173 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144403371_144403556:TOP1MT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 144403449 G/A 1 7 5 12 2.98711363985853 2.86634740010105 0.120766239757479 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144403371_144403556:TOP1MT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 144413416 G/A 1 5 5 10 2.13365259989895 2.86634740010105 -0.732694800202101 A:G G A 10 0.57326948002021 0.752834960365011 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522041:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519591:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523417:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518007:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518760:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000520950:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522043:exon_144413394_144413509:TOP1MT HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 144642854 G/A 1 17 13 30 7.25441883965643 7.45250324026273 -0.198084400606302 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000104518:ENST00000526406:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533348:exon_144642773_144642856:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533063:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000262580:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531184:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000534018:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144641947_144643593:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000528475:exon_144642210_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526469:exon_144642798_144643593:GSDMD HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 144657600 G/A 1 36 10 46 15.3622987192724 5.7326948002021 9.62960391907034 A:G G A 10 0.57326948002021 0.00418761360283029 ENSG00000147813:ENST00000460623:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144657593_144657695:NAPRT1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 144658711 G/A 1 2 16 18 0.85346103995958 9.17231168032336 -8.31885064036378 A:G G A 10 0.57326948002021 0.000111054890730405 ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144658248_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000480946:exon_144658610_144658742:NAPRT1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 144662353 G/A 1 692 668 1360 295.297519826015 382.9440126535 -87.6464928274856 A:G G A 10 0.57326948002021 1.79331244132785e-06 ENSG00000104529:ENST00000529576:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530109:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000527741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526838:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528610:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000533833:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000395119:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529272:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000317198:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000419152:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529007:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531621:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524624:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524397:exon_144662180_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000534380:exon_144662204_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528382:exon_144662249_144662376:EEF1D HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 144671922 G/A 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526710:exon_144671351_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531281:exon_144671481_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532596:exon_144671681_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524883:exon_144671710_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531670:exon_144671715_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528519:exon_144671780_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529832:exon_144671814_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530306:exon_144671865_144672251:EEF1D HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 144671956 G/A 1 7 6 13 2.98711363985853 3.43961688012126 -0.452503240262731 A:G G A 10 0.57326948002021 0.787569123349065 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526710:exon_144671351_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531281:exon_144671481_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532596:exon_144671681_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524883:exon_144671710_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531670:exon_144671715_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528519:exon_144671780_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529832:exon_144671814_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530306:exon_144671865_144672251:EEF1D HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 144681714 G/A 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 A:G G A 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000179886:ENST00000504548:exon_144680005_144682485:TIGD5;ENSG00000179886:ENST00000321385:exon_144680075_144682075:TIGD5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 144681777 G/T 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 T:G G T 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000179886:ENST00000504548:exon_144680005_144682485:TIGD5;ENSG00000179886:ENST00000321385:exon_144680075_144682075:TIGD5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 144697041 A/G 1 18 16 34 7.68114935963622 9.17231168032336 -1.49116232068714 A:G A G 10 0.57326948002021 0.60774078808005 ENSG00000104522:ENST00000529064:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000531473:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000425753:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000360125:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000529048:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000532308:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000533817:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000530474:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000525274:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000433984:exon_144696810_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000527549:exon_144696817_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000526290:exon_144696991_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000527006:exon_144697033_144697085:TSTA3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 144893084 G/A 1 8 3 11 3.41384415983832 1.71980844006063 1.69403571977769 A:G G A 10 0.57326948002021 0.372574328023575 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144893076_144893242:SCRIB HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 145057868 A/G 1 19 23 42 8.10787987961601 13.1851980404648 -5.07731816084882 A:G A G 10 0.57326948002021 0.120661493153583 ENSG00000178685:ENST00000526007:exon_145057335_145058526:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145057480_145057979:PARP10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 145110038 C/T 1 4 7 11 1.70692207991916 4.01288636014147 -2.30596428022231 T:C C T 10 0.57326948002021 0.223014268684580 ENSG00000178814:ENST00000534424:exon_145109932_145110092:OPLAH;ENSG00000178814:ENST00000426825:exon_145109932_145110092:OPLAH;ENSG00000178814:ENST00000360660:exon_145109932_145110092:OPLAH HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 145154257 C/G 1 30 34 64 12.8019155993937 19.4911623206871 -6.68924672129344 C:G C G 10 0.57326948002021 0.100630378229177 ENSG00000179526:ENST00000398712:exon_145154180_145154333:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000359551:exon_145154180_145154333:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000361077:exon_145154180_145154333:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000530216:exon_145154153_145154333:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000534242:exon_145154194_145154333:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000525275:exon_145154204_145154521:SHARPIN HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 145621587 G/A 1 10 10 20 4.2673051997979 5.7326948002021 -1.4653896004042 A:G G A 10 0.57326948002021 0.508038948022547 ENSG00000071894:ENST00000349769:exon_145621563_145621715:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000527827:exon_145621230_145621715:CPSF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 145623963 G/A 1 6 7 13 2.56038311987874 4.01288636014147 -1.45250324026273 A:G G A 10 0.57326948002021 0.418185809776403 ENSG00000071894:ENST00000349769:exon_145623915_145624028:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000527916:exon_145623913_145624028:CPSF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 146068322 C/T 1 27 34 61 11.5217240394543 19.4911623206871 -7.96943828123281 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0512695172355052 ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 8 146076708 C/T 1 15 19 34 6.40095779969685 10.892120120384 -4.49116232068714 T:C C T 10 0.57326948002021 0.122729190657319 ENSG00000170619:ENST00000402718:exon_146075559_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000450361:exon_146075573_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000305103:exon_146075604_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000529143:exon_146076210_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000533270:exon_146076211_146076780:COMMD5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 2029199 G/A 1 3 6 9 1.28019155993937 3.43961688012126 -2.15942532018189 A:G G A 10 0.57326948002021 0.183674374674640 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000450198:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000457226:exon_2028987_2029221:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000439732:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2029006_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2029019_2029247:SMARCA2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 2060768 T/C 1 5 4 9 2.13365259989895 2.29307792008084 -0.15942532018189 T:C T C 10 0.57326948002021 1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 2828742 C/A 1 13 16 29 5.54749675973727 9.17231168032336 -3.62481492058609 A:C C A 10 0.57326948002021 0.191464076020977 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2828675_2828778:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000469168:exon_2828475_2828778:KIAA0020 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 2828765 C/G 1 15 19 34 6.40095779969685 10.892120120384 -4.49116232068714 C:G C G 10 0.57326948002021 0.122729190657319 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2828675_2828778:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000469168:exon_2828475_2828778:KIAA0020 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 2838470 C/T 1 22 21 43 9.38807143955538 12.0386590804244 -2.65058764086903 T:C C T 10 0.57326948002021 0.44292382105004 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2838426_2838517:KIAA0020 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 4685008 C/T 1 9 1 10 3.84057467981811 0.57326948002021 3.2673051997979 T:C C T 10 0.57326948002021 0.051520419622225 ENSG00000106993:ENST00000381858:exon_4684877_4685158:CDC37L1;ENSG00000106993:ENST00000381854:exon_4684877_4685158:CDC37L1;ENSG00000106993:ENST00000381845:exon_4684877_4685158:CDC37L1;ENSG00000106993:ENST00000479095:exon_4684877_4685475:CDC37L1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 5969249 A/G 1 14 11 25 5.97422727971706 6.30596428022231 -0.331737000505251 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 5969307 C/T 1 6 9 15 2.56038311987874 5.15942532018189 -2.59904220030315 T:C C T 10 0.57326948002021 0.198144643439766 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 6007551 T/C 1 5 6 11 2.13365259989895 3.43961688012126 -1.30596428022231 T:C T C 10 0.57326948002021 0.545300564874909 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_6007195_6008003:KIAA2026 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 7798518 G/C 1 167 171 338 71.2639968366249 98.0290810834559 -26.765084246831 T:C:G G C 10 0.57326948002021 0.00352927542393792 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7796490_7798637:C9orf123;ENSG00000137038:ENST00000484082:exon_7798199_7798637:C9orf123;ENSG00000137038:ENST00000469050:exon_7798344_7798637:C9orf123 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 7799749 C/T 1 79 83 162 33.7117110784034 47.5813668416774 -13.869655763274 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0317247162882255 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 15591372 T/A 1 9 8 17 3.84057467981811 4.58615584016168 -0.745581160343571 A:T T A 10 0.57326948002021 0.807894812450834 ENSG00000164989:ENST00000297641:exon_15591364_15591554:C9orf93;ENSG00000164989:ENST00000380689:exon_15591364_15591554:C9orf93;ENSG00000164989:ENST00000380701:exon_15591364_15591554:C9orf93 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 19376255 A/C 1 7 4 11 2.98711363985853 2.29307792008084 0.694035719777689 A:C A C 10 0.57326948002021 0.767959695054619 ENSG00000137154:ENST00000380394:exon_19375713_19376386:RPS6;ENSG00000137154:ENST00000498815:exon_19376253_19376386:RPS6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 19376258 G/C 1 7 7 14 2.98711363985853 4.01288636014147 -1.02577272028294 C:G G C 10 0.57326948002021 0.5990458397462 ENSG00000137154:ENST00000380394:exon_19375713_19376386:RPS6;ENSG00000137154:ENST00000498815:exon_19376253_19376386:RPS6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 20988426 A/G 1 13 9 22 5.54749675973727 5.15942532018189 0.388071439555379 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20988331_20988428:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20988331_20988428:KIAA1797 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 21029330 T/C 1 1 7 8 0.42673051997979 4.01288636014147 -3.58615584016168 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0245816827973848 ENSG00000188921:ENST00000495827:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000513293:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000521505:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000531631:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000380233:exon_21029294_21029397:PTPLAD2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 32542204 A/G 1 17 21 38 7.25441883965643 12.0386590804244 -4.78424024076798 A:G A G 10 0.57326948002021 0.139655979025922 ENSG00000197579:ENST00000360538:exon_32540542_32544324:TOPORS;ENSG00000197579:ENST00000379858:exon_32540824_32544324:TOPORS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 32552373 A/C 0 75 0 75 32.0047889984842 0 32.0047889984842 A A 10 0.57326948002021 9.83884262150581e-19 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 35608899 G/C 1 6 8 14 2.56038311987874 4.58615584016168 -2.02577272028294 C:G G C 10 0.57326948002021 0.291858897104158 ENSG00000107140:ENST00000336395:exon_35608859_35610029:TESK1;ENSG00000107140:ENST00000498522:exon_35608859_35610038:TESK1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 35650859 G/A 1 19 11 30 8.10787987961601 6.30596428022231 1.8019155993937 A:G G A 10 0.57326948002021 0.582251642589673 ENSG00000137078:ENST00000259608:exon_35650751_35650937:SIT1;ENSG00000137078:ENST00000474403:exon_35650751_35650907:SIT1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 35662251 T/C 1 10 3 13 4.2673051997979 1.71980844006063 2.54749675973727 T:C T C 10 0.57326948002021 0.173621486623774 ENSG00000137135:ENST00000490638:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000490970:exon_35662176_35662264:C9orf100 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 35674053 G/A 1 1 49 50 0.42673051997979 28.0902045209903 -27.6634740010105 A:G G A 10 0.57326948002021 2.19421063701107e-17 ENSG00000137135:ENST00000490638:exon_35673808_35675863:C9orf100;ENSG00000107159:ENST00000378357:exon_35673853_35674359:CA9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 36657303 C/T 1 8 7 15 3.41384415983832 4.01288636014147 -0.599042200303151 T:C C T 10 0.57326948002021 0.7979049378473 ENSG00000165304:ENST00000298048:exon_36657238_36657360:MELK HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 37886429 G/A 1 18 7 25 7.68114935963622 4.01288636014147 3.66826299949475 A:G G A 10 0.57326948002021 0.159848312280910 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 37888101 C/T 1 5 9 14 2.13365259989895 5.15942532018189 -3.02577272028294 T:C C T 10 0.57326948002021 0.112496331869413 ENSG00000122696:ENST00000377716:exon_37887601_37888589:MCART1;ENSG00000122696:ENST00000242275:exon_37887648_37888589:MCART1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 38395928 C/T 1 14 8 22 5.97422727971706 4.58615584016168 1.38807143955538 T:C C T 10 0.57326948002021 0.668312643486638 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 38396002 C/T 1 8 7 15 3.41384415983832 4.01288636014147 -0.599042200303151 T:C C T 10 0.57326948002021 0.7979049378473 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 38396065 G/T 1 13 7 20 5.54749675973727 4.01288636014147 1.5346103995958 T:G G T 10 0.57326948002021 0.652301753764728 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 71679937 A/G 1 15 12 27 6.40095779969685 6.87923376024252 -0.478275960545671 A:G A G 10 0.57326948002021 0.84842088295701 ENSG00000165060:ENST00000377270:exon_71679854_71679951:FXN;ENSG00000165060:ENST00000533967:exon_71679854_71679951:FXN;ENSG00000165060:ENST00000396366:exon_71679854_71679959:FXN;ENSG00000165060:ENST00000396364:exon_71679854_71679959:FXN;ENSG00000165060:ENST00000498653:exon_71679854_71679951:FXN;ENSG00000165060:ENST00000484259:exon_71679854_71679951:FXN HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 71862975 C/T 1 11 5 16 4.69403571977769 2.86634740010105 1.82768831967664 T:C C T 10 0.57326948002021 0.452437779938541 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 71862987 G/A 1 10 5 15 4.2673051997979 2.86634740010105 1.40095779969685 A:G G A 10 0.57326948002021 0.604487754064262 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 74526615 G/T 1 2 7 9 0.85346103995958 4.01288636014147 -3.15942532018189 T:G G T 10 0.57326948002021 0.0433151286077531 ENSG00000155621:ENST00000479413:exon_74526426_74526752:C9orf85;ENSG00000155621:ENST00000334731:exon_74526461_74526752:C9orf85;ENSG00000155621:ENST00000377031:exon_74526461_74526752:C9orf85;ENSG00000155621:ENST00000473252:exon_74526557_74526752:C9orf85;ENSG00000155621:ENST00000486911:exon_74526577_74526752:C9orf85;ENSG00000155621:ENST00000356065:exon_74526584_74526752:C9orf85 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 79999509 A/G 1 2 7 9 0.85346103995958 4.01288636014147 -3.15942532018189 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0433151286077531 ENSG00000197969:ENST00000355766:exon_79999501_79999599:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000357409:exon_79999501_80000107:VPS13A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 82006446 G/A 0 20 0 20 8.5346103995958 0 8.5346103995958 G G 10 0.57326948002021 2.95605062910185e-05 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 86258685 A/C 1 14 17 31 5.97422727971706 9.74558116034357 -3.77135388062651 A:C A C 10 0.57326948002021 0.204011615668564 ENSG00000148057:ENST00000533522:exon_86258344_86259045:C9orf103;ENSG00000148057:ENST00000277124:exon_86258344_86259045:C9orf103;ENSG00000148057:ENST00000405990:exon_86258344_86259038:C9orf103;ENSG00000148057:ENST00000376419:exon_86258344_86258819:C9orf103;ENSG00000148057:ENST00000454393:exon_86258344_86259038:C9orf103 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 86278913 C/T 1 24 13 37 10.241532479515 7.45250324026273 2.78902923925223 T:C C T 10 0.57326948002021 0.408111022976147 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000527373:exon_86278790_86278958:UBQLN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 86284178 C/A 1 6 7 13 2.56038311987874 4.01288636014147 -1.45250324026273 A:C C A 10 0.57326948002021 0.418185809776403 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86284100_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86281265_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86284100_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86284100_86284206:UBQLN1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 90321583 C/T 1 8 3 11 3.41384415983832 1.71980844006063 1.69403571977769 T:C C T 10 0.57326948002021 0.372574328023575 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90321047_90323546:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90321047_90323545:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90321047_90323543:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90321047_90322296:DAPK1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 92003679 C/T 1 4 6 10 1.70692207991916 3.43961688012126 -1.7326948002021 T:C C T 10 0.57326948002021 0.342315301618549 ENSG00000187764:ENST00000420987:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000339861:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000429836:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_92003551_92003707:SEMA4D HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 93637015 C/T 1 5 4 9 2.13365259989895 2.29307792008084 -0.15942532018189 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93636954_93637131:SYK HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 93640009 G/A 1 7 3 10 2.98711363985853 1.71980844006063 1.2673051997979 A:G G A 10 0.57326948002021 0.532053210294076 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93639853_93640062:SYK HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 95073501 C/A 1 15 12 27 6.40095779969685 6.87923376024252 -0.478275960545671 A:C C A 10 0.57326948002021 0.84842088295701 ENSG00000198000:ENST00000360868:exon_95073428_95073541:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000442668:exon_95073428_95073541:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000358855:exon_95073428_95073541:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000434228:exon_95073428_95073541:NOL8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 95838070 G/C 1 12 7 19 5.12076623975748 4.01288636014147 1.10787987961601 C:G G C 10 0.57326948002021 0.651195141393552 ENSG00000157303:ENST00000375472:exon_95838066_95838254:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000375469:exon_95838066_95838254:SUSD3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 95840256 A/G 1 13 12 25 5.54749675973727 6.87923376024252 -1.33173700050525 A:G A G 10 0.57326948002021 0.686966178648469 ENSG00000157303:ENST00000375472:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000465709:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000375469:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000471462:exon_95840125_95840275:SUSD3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 99250463 C/T 1 9 13 22 3.84057467981811 7.45250324026273 -3.61192856044462 T:C C T 10 0.57326948002021 0.134283230160958 ENSG00000130956:ENST00000375251:exon_99250371_99250556:HABP4;ENSG00000130956:ENST00000375249:exon_99250371_99250556:HABP4;ENSG00000130956:ENST00000466976:exon_99250371_99250556:HABP4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 100672338 C/T 1 7 5 12 2.98711363985853 2.86634740010105 0.120766239757479 T:C C T 10 0.57326948002021 1 ENSG00000136932:ENST00000375119:exon_100672242_100672898:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000375118:exon_100672242_100674753:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000478126:exon_100672271_100672898:C9orf156 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 100819070 T/G 1 22 20 42 9.38807143955538 11.4653896004042 -2.07731816084882 T:G T G 10 0.57326948002021 0.535628514064652 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100819050_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100819052_100819222:NANS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 100819192 C/T 1 33 36 69 14.0821071593331 20.6377012807276 -6.55559412139449 T:C C T 10 0.57326948002021 0.114921778261598 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100819050_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100819052_100819222:NANS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 100823084 T/C 1 42 46 88 17.9226818391512 26.3703960809297 -8.44771424177848 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0840648792059358 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 103064530 G/A 1 16 24 40 6.82768831967664 13.758467520485 -6.9307792008084 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0364109679551896 ENSG00000136891:ENST00000374902:exon_103064366_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000477648:exon_103064368_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000444730:exon_103064372_103064586:TEX10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 104309445 T/C 1 6 4 10 2.56038311987874 2.29307792008084 0.267305199797899 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000155827:ENST00000389120:exon_104309419_104309496:RNF20 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 111659277 G/T 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 T:G G T 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111659233_111659318:IKBKAP HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 113006420 A/G 1 510 460 970 217.632565189693 263.703960809297 -46.0713956196037 A:G A G 10 0.57326948002021 0.00311948697219099 ENSG00000136810:ENST00000374517:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000374515:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000487892:exon_113006299_113006499:TXN HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 114174415 T/C 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114174294_114174428:KIAA0368 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 114359624 C/A 0 0 15 15 0 8.59904220030315 -8.59904220030315 A C A 10 0.57326948002021 2.83338489244018e-06 ENSG00000106853:ENST00000309195:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374324:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000407693:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000333580:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000238248:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000422125:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374313:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374308:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000485319:exon_114359597_114359693:PTGR1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 114411891 C/T 1 4 8 12 1.70692207991916 4.58615584016168 -2.87923376024252 T:C C T 10 0.57326948002021 0.141786607964141 ENSG00000059769:ENST00000313525:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000463589:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000447096:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000436202:exon_114411733_114412203:DNAJC25 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 114982463 T/C 1 33 14 47 14.0821071593331 8.02577272028294 6.05633443905013 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0781451502944202 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 114982549 C/T 1 32 16 48 13.6553766393533 9.17231168032336 4.48306495902992 T:C C T 10 0.57326948002021 0.242789075118719 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 115167994 A/T 1 10 1 11 4.2673051997979 0.57326948002021 3.69403571977769 A:T A T 10 0.57326948002021 0.0300213135924451 ENSG00000119471:ENST00000398805:exon_115167904_115168002:HSDL2;ENSG00000119471:ENST00000262542:exon_115167904_115168002:HSDL2;ENSG00000119471:ENST00000398803:exon_115167904_115168002:HSDL2;ENSG00000119471:ENST00000488101:exon_115167904_115168002:HSDL2;ENSG00000119471:ENST00000467434:exon_115167904_115168002:HSDL2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 115931593 G/A 1 16 19 35 6.82768831967664 10.892120120384 -4.06443180070735 A:G G A 10 0.57326948002021 0.174793597467876 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 115931692 A/G 1 16 12 28 6.82768831967664 6.87923376024252 -0.0515454405658815 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 115932012 G/T 1 9 16 25 3.84057467981811 9.17231168032336 -5.33173700050525 T:G G T 10 0.57326948002021 0.041544107781009 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 116060124 T/C 1 2 11 13 0.85346103995958 6.30596428022231 -5.45250324026273 T:C T C 10 0.57326948002021 0.00319980416353301 ENSG00000165188:ENST00000441031:exon_116059480_116060501:RNF183;ENSG00000165188:ENST00000416588:exon_116059723_116060501:RNF183;ENSG00000165188:ENST00000478815:exon_116059734_116062045:RNF183;ENSG00000165188:ENST00000297894:exon_116059734_116060501:RNF183 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 116060221 C/T 1 6 7 13 2.56038311987874 4.01288636014147 -1.45250324026273 T:C C T 10 0.57326948002021 0.418185809776403 ENSG00000165188:ENST00000441031:exon_116059480_116060501:RNF183;ENSG00000165188:ENST00000416588:exon_116059723_116060501:RNF183;ENSG00000165188:ENST00000478815:exon_116059734_116062045:RNF183;ENSG00000165188:ENST00000297894:exon_116059734_116060501:RNF183 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 116060487 T/C 1 4 5 9 1.70692207991916 2.86634740010105 -1.15942532018189 T:C T C 10 0.57326948002021 0.509627549256674 ENSG00000165188:ENST00000441031:exon_116059480_116060501:RNF183;ENSG00000165188:ENST00000416588:exon_116059723_116060501:RNF183;ENSG00000165188:ENST00000478815:exon_116059734_116062045:RNF183;ENSG00000165188:ENST00000297894:exon_116059734_116060501:RNF183 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 116136198 C/T 1 1 26 27 0.42673051997979 14.9050064805255 -14.4782759605457 T:C C T 10 0.57326948002021 3.85061571152747e-09 ENSG00000119431:ENST00000238379:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000374180:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000485934:exon_116136168_116136809:HDHD3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 123632045 A/G 1 49 45 94 20.9097954790097 25.7971266009095 -4.88733112189974 A:G A G 10 0.57326948002021 0.348086315168951 ENSG00000119403:ENST00000312189:exon_123631865_123632223:PHF19 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 123860689 C/T 1 2 7 9 0.85346103995958 4.01288636014147 -3.15942532018189 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0433151286077531 ENSG00000119397:ENST00000373865:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000414114:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123860664_123860850:CEP110 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 123917020 T/A 1 3 6 9 1.28019155993937 3.43961688012126 -2.15942532018189 A:T T A 10 0.57326948002021 0.183674374674640 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123916999_123917230:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394372:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373847:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000431571:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373845:exon_123916999_123917230:CEP110 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 124914613 C/T 1 19 43 62 8.10787987961601 24.650587640869 -16.542707761253 T:C C T 10 0.57326948002021 2.76620886265415e-05 ENSG00000119421:ENST00000373768:exon_124914524_124914687:NDUFA8 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 128246786 G/A 1 16 28 44 6.82768831967664 16.0515454405659 -9.22385712088924 A:G G A 10 0.57326948002021 0.00578735338801608 ENSG00000119487:ENST00000350766:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373503:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373498:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000529322:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000265960:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000394063:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373505:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373497:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000497932:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000496063:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000420643:exon_128246722_128246862:MAPKAP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 129595895 T/C 1 5 3 8 2.13365259989895 1.71980844006063 0.41384415983832 T:C T C 10 0.57326948002021 1 ENSG00000169155:ENST00000449886:exon_129594766_129600489:ZBTB43;ENSG00000169155:ENST00000373464:exon_129594766_129600489:ZBTB43;ENSG00000169155:ENST00000373457:exon_129593688_129599382:ZBTB43 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 130504070 G/A 1 12 12 24 5.12076623975748 6.87923376024252 -1.75846752048504 A:G G A 10 0.57326948002021 0.537756757259522 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000420366:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373274:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130504067_130504238:SH2D3C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 130506906 C/T 1 11 12 23 4.69403571977769 6.87923376024252 -2.18519804046483 T:C C T 10 0.57326948002021 0.402290518448411 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130506843_130507378:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130506843_130507292:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000420366:exon_130506843_130507378:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130506843_130507378:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373274:exon_130506843_130507378:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130506843_130507378:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130506843_130507378:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130506843_130507378:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000468969:exon_130506843_130507098:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000484160:exon_130506843_130506999:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000471939:exon_130506843_130507378:SH2D3C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 130536717 G/A 1 5 6 11 2.13365259989895 3.43961688012126 -1.30596428022231 A:G G A 10 0.57326948002021 0.545300564874909 ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130536534_130536746:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130536269_130536746:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000468969:exon_130536631_130536746:SH2D3C HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 130630233 G/T 1 52 53 105 22.1899870389491 30.3832824410711 -8.19329540212205 T:G G T 10 0.57326948002021 0.114602141241874 ENSG00000106992:ENST00000373176:exon_130628759_130630355:AK1;ENSG00000106992:ENST00000476274:exon_130630118_130630355:AK1;ENSG00000106992:ENST00000413016:exon_130630169_130630355:AK1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 130941259 G/T 1 14 17 31 5.97422727971706 9.74558116034357 -3.77135388062651 T:G G T 10 0.57326948002021 0.204011615668564 ENSG00000148337:ENST00000393608:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325721:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372941:exon_130941245_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372938:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000415526:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325669:exon_130941241_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000475471:exon_130940648_130941288:CIZ1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 131027963 A/G 1 11 10 21 4.69403571977769 5.7326948002021 -1.03865908042441 A:G A G 10 0.57326948002021 0.66464815614549 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000450617:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000490257:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000468488:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000458730:exon_131027864_131027970:GOLGA2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 131585069 A/G 1 15 17 32 6.40095779969685 9.74558116034357 -3.34462336064672 A:G A G 10 0.57326948002021 0.283704858668405 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131581930_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131584346_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131584370_131585112:C9orf114 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 131586374 G/A 1 12 11 23 5.12076623975748 6.30596428022231 -1.18519804046483 A:G G A 10 0.57326948002021 0.67579941697981 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131586371_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000480366:exon_131586351_131586453:C9orf114 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 131588888 G/C 1 23 15 38 9.81480195953517 8.59904220030315 1.21575975923202 C:G G C 10 0.57326948002021 0.74503664152294 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131588883_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000466556:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467396:exon_131588819_131588908:C9orf114 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 132400480 G/A 1 8 11 19 3.41384415983832 6.30596428022231 -2.89212012038399 A:G G A 10 0.57326948002021 0.245610170938846 ENSG00000148331:ENST00000277458:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000277459:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000450050:exon_132399173_132400736:ASB6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 132569553 C/T 1 7 3 10 2.98711363985853 1.71980844006063 1.2673051997979 T:C C T 10 0.57326948002021 0.532053210294076 ENSG00000136816:ENST00000259339:exon_132569467_132569642:TOR1B;ENSG00000136816:ENST00000437263:exon_132569467_132569642:TOR1B;ENSG00000136816:ENST00000488169:exon_132569467_132569642:TOR1B HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 132580901 C/G 1 14 14 28 5.97422727971706 8.02577272028294 -2.05154544056588 C:G C G 10 0.57326948002021 0.450176838712125 ENSG00000136827:ENST00000437532:exon_132580799_132580926:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000427355:exon_132580799_132580926:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000351698:exon_132580799_132580926:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000474192:exon_132580632_132580926:TOR1A HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 132637712 G/A 1 6 5 11 2.56038311987874 2.86634740010105 -0.305964280222311 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000474895:exon_132637589_132637758:USP20 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 132662786 C/T 1 72 45 117 30.7245974385449 25.7971266009095 4.92747083763543 T:C C T 10 0.57326948002021 0.400480713353827 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000443566:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000478129:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000462766:exon_132662705_132662812:FNBP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 132678195 G/A 1 9 5 14 3.84057467981811 2.86634740010105 0.974227279717059 A:G G A 10 0.57326948002021 0.788481610276296 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 132720770 A/G 1 34 47 81 14.5088376793129 26.9436655609499 -12.434827881637 A:G A G 10 0.57326948002021 0.00668401138739683 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132720770_132720832:FNBP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 134350458 C/T 1 7 7 14 2.98711363985853 4.01288636014147 -1.02577272028294 T:C C T 10 0.57326948002021 0.5990458397462 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 135139901 T/C 1 23 27 50 9.81480195953517 15.4782759605457 -5.6634740010105 T:C T C 10 0.57326948002021 0.116403086360696 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000477049:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135136827_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135136827_135140372:SETX HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 135202230 A/C 1 12 5 17 5.12076623975748 2.86634740010105 2.25441883965643 A:C A C 10 0.57326948002021 0.331859417462969 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 135206460 A/G 1 5 4 9 2.13365259989895 2.29307792008084 -0.15942532018189 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135206439_135206526:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135206439_135206526:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135206439_135206526:SETX;ENSG00000107290:ENST00000419901:exon_135206439_135206526:SETX HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 135277130 C/A 1 25 34 59 10.6682629994947 19.4911623206871 -8.82289932119239 A:C C A 10 0.57326948002021 0.0246539989249547 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135276842_135278215:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135276842_135278215:TTF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 135771712 T/C 1 10 12 22 4.2673051997979 6.87923376024252 -2.61192856044462 T:C T C 10 0.57326948002021 0.285971290233503 ENSG00000165699:ENST00000298552:exon_135766735_135772141:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000440111:exon_135766736_135772141:TSC1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 135974100 G/A 1 34 26 60 14.5088376793129 14.9050064805255 -0.396168801212603 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135973608_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135974025_135974149:RALGDS HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 136199466 G/A 1 18 10 28 7.68114935963622 5.7326948002021 1.94845455943412 A:G G A 10 0.57326948002021 0.567675413951762 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136199384_136199596:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136199384_136199775:SURF6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 136199503 G/A 1 26 13 39 11.0949935194745 7.45250324026273 3.64249027921181 A:G G A 10 0.57326948002021 0.260782729778200 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136199384_136199596:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136199384_136199775:SURF6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 136227260 A/G 1 58 52 110 24.7503701588278 29.8100129610509 -5.05964280222311 A:G A G 10 0.57326948002021 0.336463379410183 ENSG00000148291:ENST00000371964:exon_136227141_136227310:SURF2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 136337168 G/A 1 14 7 21 5.97422727971706 4.01288636014147 1.96134091957559 A:G G A 10 0.57326948002021 0.509441892718872 ENSG00000160326:ENST00000371897:exon_136336217_136337298:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000485978:exon_136336217_136337298:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000371899:exon_136336217_136337298:SLC2A6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 136340200 T/G 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 T:G T G 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000160326:ENST00000371897:exon_136340083_136340235:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000485978:exon_136340083_136340235:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000371899:exon_136340083_136340235:SLC2A6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 137005023 C/T 1 4 4 8 1.70692207991916 2.29307792008084 -0.58615584016168 T:C C T 10 0.57326948002021 0.730571677019219 ENSG00000196363:ENST00000358625:exon_137004942_137005080:WDR5;ENSG00000196363:ENST00000425041:exon_137004914_137005080:WDR5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 139273402 C/T 1 12 15 27 5.12076623975748 8.59904220030315 -3.47827596054567 T:C C T 10 0.57326948002021 0.179899627685799 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 139276430 G/A 1 6 4 10 2.56038311987874 2.29307792008084 0.267305199797899 A:G G A 10 0.57326948002021 1 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139276276_139276525:SNAPC4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 140002989 T/C 1 49 29 78 20.9097954790097 16.6248149205861 4.28498055842362 T:C:G T C 10 0.57326948002021 0.360765030410817 ENSG00000177239:ENST00000371589:exon_140002840_140003635:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000474902:exon_140002840_140003633:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000392853:exon_140001983_140003635:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000480100:exon_140002840_140003633:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000475449:exon_140002983_140003529:MAN1B1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 140006137 C/T 1 4 38 42 1.70692207991916 21.784240240768 -20.0773181608488 T:C C T 10 0.57326948002021 1.86302527783161e-10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 140006425 C/G 1 174 168 342 74.2511104764834 96.3092726433953 -22.0581621669118 A:C:G C G 10 0.57326948002021 0.0186100412948503 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006393_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000488415:exon_140006360_140006481:DPP7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 140008750 G/C 1 21 14 35 8.96134091957559 8.02577272028294 0.935568199292648 C:G G C 10 0.57326948002021 0.864764591021419 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000472306:exon_140008695_140008830:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000485456:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000478597:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000497375:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473703:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000491807:exon_140008695_140009028:DPP7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 140008934 A/G 1 15 20 35 6.40095779969685 11.4653896004042 -5.06443180070735 A:G A G 10 0.57326948002021 0.0894470662968279 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140008915_140009165:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140008915_140008944:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000472306:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000485456:exon_140008915_140009170:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000478597:exon_140008915_140009178:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000497375:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473703:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000491807:exon_140008695_140009028:DPP7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 140100224 A/G 1 7 5 12 2.98711363985853 2.86634740010105 0.120766239757479 A:G A G 10 0.57326948002021 1 ENSG00000188566:ENST00000458322:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000427047:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000371521:exon_140100147_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000344894:exon_140100147_140100364:NDOR1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 140201433 G/A 1 7 11 18 2.98711363985853 6.30596428022231 -3.31885064036378 A:G G A 10 0.57326948002021 0.151800613284305 ENSG00000187609:ENST00000491734:exon_140201348_140201715:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140201348_140201715:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140201357_140201715:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487745:exon_140201369_140201715:EXD3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 140327663 C/T 1 12 2 14 5.12076623975748 1.14653896004042 3.97422727971706 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0326866049956063 ENSG00000188747:ENST00000341349:exon_140327657_140327715:NOXA1;ENSG00000188747:ENST00000392815:exon_140327657_140327715:NOXA1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . 9 140446806 C/T 1 196 167 363 83.6391819160388 95.7360031633751 -12.0968212473362 T:C C T 10 0.57326948002021 0.203140306765938 ENSG00000182154:ENST00000371443:exon_140446526_140447007:MRPL41 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 200860 T/C 1 6 13 19 2.56038311987874 7.45250324026273 -4.89212012038399 T:C T C 10 0.57326948002021 0.0342651369713289 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000484611:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000430923:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000445062:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000429181:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000443019:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000415337:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000447472:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000448477:exon_200401_200981:PLCXD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 207362 C/T 1 11 13 24 4.69403571977769 7.45250324026273 -2.75846752048504 T:C C T 10 0.57326948002021 0.303503076139145 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000484611:exon_207315_207459:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000430923:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000415337:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000447472:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000448477:exon_207315_207424:PLCXD1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 295132 T/C 1 25 22 47 10.6682629994947 12.6119285604446 -1.94366556094987 T:C T C 10 0.57326948002021 0.55980056664508 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 295231 A/G 1 32 32 64 13.6553766393533 18.3446233606467 -4.68924672129344 A:G A G 10 0.57326948002021 0.256277368402754 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 1471138 G/T 1 11 27 38 4.69403571977769 15.4782759605457 -10.784240240768 T:G G T 10 0.57326948002021 0.000472058353450178 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 1497644 G/C 1 18 17 35 7.68114935963622 9.74558116034357 -2.06443180070735 C:G G C 10 0.57326948002021 0.498226006157124 ENSG00000185291:ENST00000331035:exon_1497552_1497657:IL3RA;ENSG00000185291:ENST00000381469:exon_1497552_1497657:IL3RA HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 1500009 T/C 1 6 8 14 2.56038311987874 4.58615584016168 -2.02577272028294 T:C T C 10 0.57326948002021 0.291858897104158 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 1508324 G/A 1 618 508 1126 263.71946134751 291.220895850267 -27.5014345027565 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0976322497898966 ENSG00000169100:ENST00000381401:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000475167:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000484026:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000447786:exon_1508256_1508620:SLC25A6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 1508583 T/C 1 289 243 532 123.325120274159 139.304483644911 -15.9793633707518 T:C T C 10 0.57326948002021 0.161084773549142 ENSG00000169100:ENST00000381401:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000475167:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000484026:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000447786:exon_1508256_1508620:SLC25A6 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 1531648 C/T 1 77 66 143 32.8582500384438 37.8357856813339 -4.97753564289003 T:C C T 10 0.57326948002021 0.399421701470051 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1531625_1531747:ASMTL HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 1554649 T/C 1 12 6 18 5.12076623975748 3.43961688012126 1.68114935963622 T:C T C 10 0.57326948002021 0.482786461758876 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1554587_1554651:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1554587_1554651:ASMTL HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 2139186 C/T 1 10 10 20 4.2673051997979 5.7326948002021 -1.4653896004042 T:C C T 10 0.57326948002021 0.508038948022547 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2137557_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2138809_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2138809_2139270:DHRSX HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 2161129 C/G 1 7 3 10 2.98711363985853 1.71980844006063 1.2673051997979 C:G C G 10 0.57326948002021 0.532053210294076 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000412516:exon_2161103_2161271:DHRSX HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 2406733 G/C 1 15 18 33 6.40095779969685 10.3188506403638 -3.91789284066693 C:G G C 10 0.57326948002021 0.217368410121292 ENSG00000214717:ENST00000381222:exon_2404477_2408810:ZBED1;ENSG00000214717:ENST00000381218:exon_2406227_2408813:ZBED1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 2644302 C/T 1 78 32 110 33.2849805584236 18.3446233606467 14.9403571977769 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0037480083509955 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381184:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000398818:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000449611:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000482293:exon_2644301_2644404:CD99;ENSG00000002586:ENST00000482405:exon_2644301_2644414:CD99 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 12809661 G/A 1 1 11 12 0.42673051997979 6.30596428022231 -5.87923376024252 A:G G A 10 0.57326948002021 0.000624264011460467 ENSG00000101911:ENST00000380663:exon_12809474_12809738:PRPS2;ENSG00000101911:ENST00000380668:exon_12809489_12809738:PRPS2;ENSG00000101911:ENST00000398491:exon_12809525_12809738:PRPS2;ENSG00000101911:ENST00000489404:exon_12809607_12809738:PRPS2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 13397003 C/T 0 24 0 24 10.241532479515 0 10.241532479515 C C 10 0.57326948002021 2.29355090872990e-06 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 16870817 A/G 0 0 8 8 0 4.58615584016168 -4.58615584016168 G A G 10 0.57326948002021 0.0010995871081701 ENSG00000102054:ENST00000486166:exon_16870675_16871965:RBBP7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 23723711 C/G 1 4 11 15 1.70692207991916 6.30596428022231 -4.59904220030315 C:G C G 10 0.57326948002021 0.0192066748704768 ENSG00000123130:ENST00000379303:exon_23723626_23723711:ACOT9;ENSG00000123130:ENST00000336430:exon_23723626_23723711:ACOT9;ENSG00000123130:ENST00000379297:exon_23723626_23723711:ACOT9;ENSG00000123130:ENST00000379295:exon_23723626_23723711:ACOT9;ENSG00000123130:ENST00000494361:exon_23723626_23723711:ACOT9;ENSG00000123130:ENST00000473710:exon_23723626_23723711:ACOT9 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 24075862 A/G 1 19 2 21 8.10787987961601 1.14653896004042 6.96134091957559 A:G A G 10 0.57326948002021 0.00151604582659672 ENSG00000130741:ENST00000253039:exon_24075750_24075871:EIF2S3;ENSG00000130741:ENST00000423068:exon_24075750_24075871:EIF2S3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 46472826 G/A 1 2 11 13 0.85346103995958 6.30596428022231 -5.45250324026273 A:G G A 10 0.57326948002021 0.00319980416353301 ENSG00000065923:ENST00000328306:exon_46472724_46472829:SLC9A7;ENSG00000065923:ENST00000464933:exon_46472724_46472829:SLC9A7;ENSG00000065923:ENST00000491894:exon_46472724_46472829:SLC9A7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 47444985 T/C 1 78 31 109 33.2849805584236 17.7713538806265 15.5136266777971 T:C T C 10 0.57326948002021 0.00257355899410590 ENSG00000102265:ENST00000218388:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377018:exon_47444335_47445482:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000456754:exon_47444604_47445422:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377017:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377013:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000445623:exon_47444741_47445066:TIMP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 47662972 T/G 0 0 12 12 0 6.87923376024252 -6.87923376024252 G T G 10 0.57326948002021 3.64623335124065e-05 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 48382174 G/T 1 8 62 70 3.41384415983832 35.542707761253 -32.1288636014147 T:G G T 10 0.57326948002021 2.07125534911149e-15 ENSG00000147155:ENST00000495186:exon_48382087_48382460:EBP;ENSG00000147155:ENST00000498425:exon_48382142_48382460:EBP;ENSG00000147155:ENST00000446158:exon_48382087_48382460:EBP;ENSG00000147155:ENST00000414061:exon_48382087_48382460:EBP HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 48418659 G/A 1 1 7 8 0.42673051997979 4.01288636014147 -3.58615584016168 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0245816827973848 ENSG00000068354:ENST00000376771:exon_48418002_48420997:TBC1D25;ENSG00000068354:ENST00000427713:exon_48418002_48419449:TBC1D25 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 48419024 T/C 1 20 2 22 8.5346103995958 1.14653896004042 7.38807143955538 T:C T C 10 0.57326948002021 0.000906543379172857 ENSG00000068354:ENST00000376771:exon_48418002_48420997:TBC1D25;ENSG00000068354:ENST00000427713:exon_48418002_48419449:TBC1D25 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 48751471 A/G 1 15 61 76 6.40095779969685 34.9694382812328 -28.568480481536 A:G A G 10 0.57326948002021 4.05972270486094e-11 ENSG00000126768:ENST00000376582:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000466995:exon_48751183_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000396779:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000495490:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000472645:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000465150:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000490755:exon_48751380_48751508:TIMM17B HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 48847497 T/C 1 21 3 24 8.96134091957559 1.71980844006063 7.24153247951496 T:C T C 10 0.57326948002021 0.00294997956356510 ENSG00000068400:ENST00000376425:exon_48847338_48847522:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376444:exon_48847338_48847522:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376441:exon_48847338_48847522:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000473581:exon_48847338_48847798:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376423:exon_48847338_48847514:GRIPAP1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 48888074 T/C 1 14 1 15 5.97422727971706 0.57326948002021 5.40095779969685 T:C T C 10 0.57326948002021 0.00348432740693871 ENSG00000068323:ENST00000315869:exon_48886242_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000493583:exon_48886242_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000478476:exon_48886242_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000336239:exon_48887729_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000495940:exon_48888024_48888110:TFE3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 49032208 G/A 1 2 20 22 0.85346103995958 11.4653896004042 -10.6119285604446 A:G G A 10 0.57326948002021 3.26679320219044e-06 ENSG00000012211:ENST00000376317:exon_49031151_49032614:PRICKLE3;ENSG00000012211:ENST00000453382:exon_49031970_49032614:PRICKLE3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 49103224 G/A 1 1 8 9 0.42673051997979 4.58615584016168 -4.15942532018189 A:G G A 10 0.57326948002021 0.0061424649460709 ENSG00000101997:ENST00000376227:exon_49103192_49103386:CCDC22 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 51645065 G/C 1 2 9 11 0.85346103995958 5.15942532018189 -4.30596428022231 C:G G C 10 0.57326948002021 0.0120270282768556 ENSG00000179222:ENST00000494718:exon_51644649_51645450:MAGED1;ENSG00000179222:ENST00000473931:exon_51644649_51645450:MAGED1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 54836361 A/G 1 31 5 36 13.2286461193735 2.86634740010105 10.3622987192724 A:G A G 10 0.57326948002021 0.000299519748606992 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375062:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54836305_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000441374:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000454156:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54836314_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375060:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000485483:exon_54836155_54836565:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54836314_54836646:MAGED2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 54836505 A/G 1 17 6 23 7.25441883965643 3.43961688012126 3.81480195953517 A:G A G 10 0.57326948002021 0.139756598539207 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375062:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54836305_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000441374:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000454156:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54836314_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375060:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000485483:exon_54836155_54836565:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54836314_54836646:MAGED2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 54837340 C/T 1 20 4 24 8.5346103995958 2.29307792008084 6.24153247951496 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0117615195144483 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000463787:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54837254_54837563:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54837254_54837562:MAGED2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 54838077 C/T 1 12 5 17 5.12076623975748 2.86634740010105 2.25441883965643 T:C C T 10 0.57326948002021 0.331859417462969 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375062:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000441374:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000454156:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000463787:exon_54838007_54838077:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375060:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000487482:exon_54837965_54838086:MAGED2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 55479299 G/A 1 35 5 40 14.9355681992926 2.86634740010105 12.0692207991916 A:G G A 10 0.57326948002021 7.3455477436743e-05 ENSG00000187601:ENST00000342972:exon_55478538_55479998:MAGEH1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 70282764 G/A 1 2 10 12 0.85346103995958 5.7326948002021 -4.87923376024252 A:G G A 10 0.57326948002021 0.00622716432297784 ENSG00000147164:ENST00000374281:exon_70282704_70282799:SNX12;ENSG00000147164:ENST00000483560:exon_70282704_70282781:SNX12;ENSG00000147164:ENST00000374274:exon_70282704_70282799:SNX12;ENSG00000147164:ENST00000490561:exon_70282694_70282799:SNX12;ENSG00000147164:ENST00000465030:exon_70282704_70282799:SNX12;ENSG00000147164:ENST00000276105:exon_70282704_70282799:SNX12 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 70324157 C/T 1 11 6 17 4.69403571977769 3.43961688012126 1.25441883965643 T:C C T 10 0.57326948002021 0.629145660806696 ENSG00000204165:ENST00000374251:exon_70324148_70324254:CXorf65;ENSG00000204165:ENST00000485951:exon_70324088_70324254:CXorf65;ENSG00000204165:ENST00000466160:exon_70324148_70324298:CXorf65;ENSG00000204165:ENST00000438526:exon_70324088_70324254:CXorf65 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 118587003 C/T 1 17 1 18 7.25441883965643 0.57326948002021 6.68114935963622 T:C C T 10 0.57326948002021 0.00114577621103584 ENSG00000077713:ENST00000217909:exon_118586828_118588441:SLC25A43;ENSG00000077713:ENST00000488158:exon_118586918_118588435:SLC25A43;ENSG00000077713:ENST00000326714:exon_118586828_118588435:SLC25A43;ENSG00000077713:ENST00000336249:exon_118586828_118588435:SLC25A43;ENSG00000077713:ENST00000493093:exon_118586828_118587145:SLC25A43 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 118604436 T/C 1 303 50 353 129.299347553876 28.6634740010105 100.635873552866 T:C:G T C 10 0.57326948002021 1.05528511311846e-30 ENSG00000005022:ENST00000317881:exon_118604336_118604476:SLC25A5;ENSG00000005022:ENST00000460013:exon_118604336_118604476:SLC25A5;ENSG00000005022:ENST00000463551:exon_118604225_118604476:SLC25A5 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 118893413 T/C 0 8 0 8 3.41384415983832 0 3.41384415983832 T T 10 0.57326948002021 0.0127642064234436 ENSG00000187808:ENST00000343905:exon_118892576_118894127:ANKRD58 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 119760629 A/T 1 6 2 8 2.56038311987874 1.14653896004042 1.41384415983832 A:T A T 10 0.57326948002021 0.479875249837149 ENSG00000171155:ENST00000304661:exon_119759648_119761026:C1GALT1C1;ENSG00000171155:ENST00000371313:exon_119759786_119761026:C1GALT1C1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 129201179 C/T 1 7 1 8 2.98711363985853 0.57326948002021 2.41384415983832 T:C C T 10 0.57326948002021 0.149609550462636 ENSG00000102034:ENST00000335997:exon_129198849_129201500:ELF4;ENSG00000102034:ENST00000455513:exon_129198849_129201500:ELF4;ENSG00000102034:ENST00000308167:exon_129198903_129201500:ELF4;ENSG00000102034:ENST00000527455:exon_129198903_129201500:ELF4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 129283520 A/G 1 2 14 16 0.85346103995958 8.02577272028294 -7.17231168032336 A:G A G 10 0.57326948002021 0.000425110027138719 ENSG00000156709:ENST00000416073:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000527892:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000319908:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000287295:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000529877:exon_129283444_129283543:AIFM1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 134713861 C/T 1 15 2 17 6.40095779969685 1.14653896004042 5.25441883965643 T:C C T 10 0.57326948002021 0.0119321519252070 ENSG00000165359:ENST00000370752:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000481908:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000356856:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000493637:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000494957:exon_134713810_134714087:DDX26B HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 135310785 T/C 1 31 3 34 13.2286461193735 1.71980844006063 11.5088376793129 T:C T C 10 0.57326948002021 3.08497627635447e-05 ENSG00000129680:ENST00000370661:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000316077:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370663:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000399283:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000218318:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370660:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000495432:exon_135310782_135311154:MAP7D3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 135313034 T/G 1 8 1 9 3.41384415983832 0.57326948002021 2.84057467981811 T:G T G 10 0.57326948002021 0.0881139701997098 ENSG00000129680:ENST00000370661:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000316077:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370663:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000399283:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000218318:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370660:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000477124:exon_135312998_135313314:MAP7D3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 135593629 C/T 1 15 75 90 6.40095779969685 42.9952110015158 -36.5942532018189 T:C C T 10 0.57326948002021 4.26643716587275e-15 ENSG00000102241:ENST00000218364:exon_135592967_135594505:HTATSF1;ENSG00000102241:ENST00000415377:exon_135592967_135593831:HTATSF1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 152713260 G/A 1 4 28 32 1.70692207991916 16.0515454405659 -14.3446233606467 A:G G A 10 0.57326948002021 2.08687679530624e-07 ENSG00000183479:ENST00000393862:exon_152713206_152713321:TREX2;ENSG00000183479:ENST00000330912:exon_152713206_152713367:TREX2;ENSG00000183479:ENST00000338525:exon_152713206_152713367:TREX2;ENSG00000183479:ENST00000334497:exon_152713206_152713367:TREX2;ENSG00000183479:ENST00000370232:exon_152713206_152713367:TREX2;ENSG00000183479:ENST00000402951:exon_152713206_152713321:TREX2;ENSG00000183479:ENST00000414588:exon_152713206_152713321:TREX2;ENSG00000213397:ENST00000370211:exon_152713124_152713367:HAUS7;ENSG00000213397:ENST00000370212:exon_152713124_152713367:HAUS7;ENSG00000213397:ENST00000460898:exon_152713128_152713367:HAUS7;ENSG00000213397:ENST00000435662:exon_152713128_152713367:HAUS7;ENSG00000213397:ENST00000484394:exon_152713128_152713367:HAUS7;ENSG00000213397:ENST00000477380:exon_152713128_152713367:HAUS7;ENSG00000213397:ENST00000437046:exon_152713207_152713367:HAUS7 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 153176383 G/A 1 10 14 24 4.2673051997979 8.02577272028294 -3.75846752048504 A:G G A 10 0.57326948002021 0.148587179400831 ENSG00000089820:ENST00000393721:exon_153176376_153176453:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000370028:exon_153176376_153176453:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000350060:exon_153176376_153176453:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000494397:exon_153176376_153176453:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000370016:exon_153176376_153176453:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000470209:exon_153176376_153176453:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000494302:exon_153176376_153176453:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000404127:exon_153176376_153176453:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000454164:exon_153176376_153176555:ARHGAP4 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 153195393 G/A 1 16 100 116 6.82768831967664 57.326948002021 -50.4992596823444 A:G G A 10 0.57326948002021 4.92444724962343e-22 ENSG00000102030:ENST00000464845:exon_153194695_153195676:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000482485:exon_153195280_153195676:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000370015:exon_153195367_153195760:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000393712:exon_153195374_153195756:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000370009:exon_153195377_153195676:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000466877:exon_153195379_153195676:NAA10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 153196345 G/A 1 1 13 14 0.42673051997979 7.45250324026273 -7.02577272028294 A:G G A 10 0.57326948002021 0.000131517489451657 ENSG00000102030:ENST00000482485:exon_153196216_153196893:NAA10 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 153248248 G/A 0 0 8 8 0 4.58615584016168 -4.58615584016168 A G A 10 0.57326948002021 0.0010995871081701 ENSG00000177854:ENST00000369982:exon_153247301_153248646:TMEM187 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 153278829 G/A 1 16 1 17 6.82768831967664 0.57326948002021 6.25441883965643 A:G G A 10 0.57326948002021 0.00205462138888271 ENSG00000184216:ENST00000369980:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369974:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369973:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000444254:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000443220:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000467236:exon_153278787_153278884:IRAK1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 153284483 G/A 0 8 0 8 3.41384415983832 0 3.41384415983832 G G 10 0.57326948002021 0.0127642064234436 ENSG00000184216:ENST00000369980:exon_153284426_153284529:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369974:exon_153284426_153284529:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000393682:exon_153284426_153284529:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000444230:exon_153284426_153284529:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369973:exon_153284426_153284529:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000393687:exon_153284426_153284529:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000429936:exon_153284426_153284529:IRAK1 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 153296445 G/A 1 41 5 46 17.4959513191714 2.86634740010105 14.6296039190703 A:G G A 10 0.57326948002021 3.77943823983893e-06 ENSG00000169057:ENST00000303391:exon_153287024_153296901:MECP2;ENSG00000169057:ENST00000453960:exon_153295685_153296901:MECP2 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 153579448 A/G 1 3 7 10 1.28019155993937 4.01288636014147 -2.7326948002021 A:G A G 10 0.57326948002021 0.109775478323748 ENSG00000196924:ENST00000490936:exon_153578399_153580064:FLNA HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 153588202 C/T 1 1 22 23 0.42673051997979 12.6119285604446 -12.1851980404648 T:C C T 10 0.57326948002021 9.93804981962055e-08 ENSG00000196924:ENST00000420627:exon_153588100_153588273:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000360319:exon_153588100_153588273:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369854:exon_153588100_153588273:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369863:exon_153588100_153588273:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369852:exon_153588100_153588273:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369856:exon_153588100_153588273:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000422373:exon_153588100_153588273:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000428077:exon_153588100_153588273:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369850:exon_153588100_153588273:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000344736:exon_153588100_153588273:FLNA HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 153706264 C/G 1 12 93 105 5.12076623975748 53.3140616418795 -48.1932954021221 C:G C G 10 0.57326948002021 1.12485254126242e-22 ENSG00000196976:ENST00000407062:exon_153706028_153706750:LAGE3;ENSG00000196976:ENST00000357360:exon_153706108_153706397:LAGE3 HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 153760654 G/A 1 5 30 35 2.13365259989895 17.1980844006063 -15.0644318007074 A:G G A 10 0.57326948002021 2.77021546701914e-07 ENSG00000160211:ENST00000393562:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000291567:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000442162:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000434882:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000393564:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000369620:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000490651:exon_153760601_153760677:G6PD HGDP00237_parsed_pileup.txt . X 154507173 T/G 1 7 2 9 2.98711363985853 1.14653896004042 1.84057467981811 T:G T G 10 0.57326948002021 0.31706387914541 ENSG00000155962:ENST00000369449:exon_154505500_154507353:CLIC2;ENSG00000155962:ENST00000422096:exon_154505526_154507353:CLIC2;ENSG00000155962:ENST00000360485:exon_154505526_154507353:CLIC2