INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 881918 G/A 1 30 15 45 14.1880369855167 7.90598150724164 6.28205547827509 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0726264932345926 ENSG00000188976:ENST00000483767:exon_881782_882440:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_881782_881925:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_881782_881925:NOC2L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 981931 A/G 1 3 7 10 1.41880369855167 3.68945803671276 -2.27065433816109 A:G A G 10 0.527065433816109 0.207504053786451 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_981777_982115:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_981777_982115:AGRN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 982722 A/G 1 10 8 18 4.72934566183891 4.21652347052887 0.512822191310037 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_982707_982834:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_982707_982834:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000466223:exon_982581_982834:AGRN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 986737 T/C 0 61 0 61 28.8490085372173 0 28.8490085372173 T T 10 0.527065433816109 1.18114737550356e-17 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_986633_986749:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_986633_986749:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000419249:exon_986633_986749:AGRN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 1147422 C/T 1 21 21 42 9.93162588986171 11.0683741101383 -1.13674822027658 T:C C T 10 0.527065433816109 0.758957157762768 ENSG00000186827:ENST00000379236:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000497869:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000379234:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000453580:exon_1147399_1147518:TNFRSF4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 1247494 T/C 1 111 124 235 52.4957368464119 65.3561137931975 -12.8603769467856 T:C T C 10 0.527065433816109 0.102273414493758 ENSG00000127054:ENST00000470030:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000497304:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000323275:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000411962:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000462432:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000478641:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000421495:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000419704:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532772:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000485710:exon_1247460_1247527:CPSF3L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 1249187 G/A 1 60 66 126 28.3760739710335 34.7863186318632 -6.41024466082974 A:G G A 10 0.527065433816109 0.284335495826535 ENSG00000127054:ENST00000470030:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000323275:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000411962:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000462432:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000478641:exon_1249112_1250550:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000421495:exon_1249112_1249485:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000419704:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532772:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000485710:exon_1249112_1249205:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531377:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527383:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531292:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000467408:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000434694:exon_1249125_1249301:CPSF3L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 1277183 C/T 0 8 0 8 3.78347652947113 0 3.78347652947113 C C 10 0.527065433816109 0.00845817134857238 ENSG00000107404:ENST00000378891:exon_1277047_1277185:DVL1;ENSG00000107404:ENST00000378888:exon_1277047_1277185:DVL1;ENSG00000107404:ENST00000345100:exon_1277047_1277185:DVL1;ENSG00000107404:ENST00000263743:exon_1277047_1277185:DVL1;ENSG00000107404:ENST00000472445:exon_1277150_1277536:DVL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 1342612 G/C 1 236 247 483 111.612557619398 130.185162152579 -18.5726045331807 T:C:G G C 10 0.527065433816109 0.0919306233950625 ENSG00000242485:ENST00000344843:exon_1342511_1342693:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000487659:exon_1342511_1342648:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000482352:exon_1342511_1342670:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000477686:exon_1342511_1342615:MRPL20 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 1421531 C/A 1 7 8 15 3.31054196328724 4.21652347052887 -0.905981507241636 A:C C A 10 0.527065433816109 0.797198000532565 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1421162_1421615:ATAD3B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 1425700 T/C 1 17 15 32 8.03988762512615 7.90598150724164 0.133906117884511 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1425634_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1424584_1426051:ATAD3B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 1479333 A/G 1 92 68 160 43.509980088918 35.8404494994954 7.66953058942256 A:T:G A G 10 0.527065433816109 0.235588903820840 ENSG00000160075:ENST00000291386:exon_1479249_1479367:SSU72;ENSG00000160075:ENST00000378726:exon_1479249_1479367:SSU72 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 1635565 C/T 1 13 15 28 6.14814936039058 7.90598150724164 -1.75783214685105 T:C C T 10 0.527065433816109 0.572286226612737 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000463652:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635478_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468800:exon_1635488_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000464748:exon_1635538_1635585:CDK11A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 1686040 G/T 1 18 43 61 8.51282219131004 22.6638136540927 -14.1509914627827 T:G G T 10 0.527065433816109 0.000285134381859245 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000469045:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000480499:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497747:exon_1685983_1686305:NADK;ENSG00000008130:ENST00000477235:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000489538:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497615:exon_1685983_1686335:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497186:exon_1685983_1686137:NADK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 2340200 T/C 1 14 9 23 6.62108392657447 4.74358890434498 1.87749502222949 T:C T C 10 0.527065433816109 0.532747084553437 ENSG00000157911:ENST00000288774:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000447513:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000507596:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000510434:exon_2339895_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000508384:exon_2339969_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000515760:exon_2340022_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000502666:exon_2340043_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000504111:exon_2340074_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000514502:exon_2340194_2340297:PEX10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 3659742 C/T 1 7 8 15 3.31054196328724 4.21652347052887 -0.905981507241636 T:C C T 10 0.527065433816109 0.797198000532565 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 3703698 A/G 1 27 37 64 12.7692332869651 19.501421051196 -6.73218776423098 A:G A G 10 0.527065433816109 0.103667121063268 ENSG00000130764:ENST00000378251:exon_3703413_3703874:LRRC47 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 6278414 A/G 1 7 16 23 3.31054196328724 8.43304694105774 -5.12250497777051 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0369714255077611 ENSG00000158286:ENST00000377948:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000377939:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000496676:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000483336:exon_6278349_6278429:RNF207 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 6279370 G/C 1 5 16 21 2.36467283091945 8.43304694105774 -6.06837411013829 C:G G C 10 0.527065433816109 0.0085261785713212 ENSG00000158286:ENST00000377948:exon_6279296_6281351:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000377939:exon_6279296_6281359:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000496676:exon_6279296_6280865:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000483336:exon_6279296_6279403:RNF207 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 6693097 A/G 1 33 25 58 15.6068406840684 13.1766358454027 2.43020483866568 A:G A G 10 0.527065433816109 0.599389178257391 ENSG00000041988:ENST00000054650:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000307896:exon_6692856_6693428:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000400912:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000484669:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000487819:exon_6692856_6693181:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000472925:exon_6692451_6693111:THAP3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 6705874 G/C 1 11 7 18 5.2022802280228 3.68945803671276 1.51282219131004 C:G G C 10 0.527065433816109 0.638183169005014 ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000294401:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000426784:exon_6705860_6706038:DNAJC11 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 8030994 G/A 1 153 153 306 72.3589886261353 80.6410113738647 -8.28202274772937 A:G G A 10 0.527065433816109 0.359809555866848 ENSG00000116288:ENST00000493373:exon_8030954_8031023:PARK7;ENSG00000116288:ENST00000338639:exon_8030954_8031023:PARK7;ENSG00000116288:ENST00000460192:exon_8030954_8031108:PARK7;ENSG00000116288:ENST00000493678:exon_8030954_8031023:PARK7;ENSG00000116288:ENST00000377493:exon_8030954_8031023:PARK7;ENSG00000116288:ENST00000465354:exon_8030954_8031581:PARK7;ENSG00000116288:ENST00000377491:exon_8030954_8031023:PARK7;ENSG00000116288:ENST00000377488:exon_8030954_8031023:PARK7;ENSG00000116288:ENST00000497113:exon_8030954_8031023:PARK7;ENSG00000116288:ENST00000469225:exon_8030954_8031023:PARK7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 9416151 G/A 1 2 10 12 0.945869132367782 5.27065433816109 -4.32478520579331 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0174711201999007 ENSG00000171621:ENST00000328089:exon_9415802_9416644:SPSB1;ENSG00000171621:ENST00000450402:exon_9415802_9416556:SPSB1;ENSG00000171621:ENST00000357898:exon_9415802_9416644:SPSB1;ENSG00000171621:ENST00000377399:exon_9415766_9416644:SPSB1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 9416346 C/T 1 8 5 13 3.78347652947113 2.63532716908055 1.14814936039058 T:C C T 10 0.527065433816109 0.588366380954527 ENSG00000171621:ENST00000328089:exon_9415802_9416644:SPSB1;ENSG00000171621:ENST00000450402:exon_9415802_9416556:SPSB1;ENSG00000171621:ENST00000357898:exon_9415802_9416644:SPSB1;ENSG00000171621:ENST00000377399:exon_9415766_9416644:SPSB1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 9784423 C/T 1 54 42 96 25.5384665739301 22.1367482202766 3.40171835365353 T:C C T 10 0.527065433816109 0.540043055533881 ENSG00000171608:ENST00000377346:exon_9784334_9784479:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000361110:exon_9784334_9784479:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000360563:exon_9784334_9784479:PIK3CD HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 9804693 C/T 1 18 19 37 8.51282219131004 10.0142432425061 -1.50142105119603 T:C C T 10 0.527065433816109 0.626124356535162 ENSG00000171603:ENST00000377298:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000361311:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000435891:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000377288:exon_9804453_9804701:CLSTN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 9811541 A/G 1 21 25 46 9.93162588986171 13.1766358454027 -3.24500995554102 A:G A G 10 0.527065433816109 0.37698278837888 ENSG00000171603:ENST00000377298:exon_9811531_9811739:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000361311:exon_9811531_9811739:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000435891:exon_9811531_9811639:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000377288:exon_9811531_9811739:CLSTN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 10713765 T/C 1 6 9 15 2.83760739710335 4.74358890434498 -1.90598150724164 T:C T C 10 0.527065433816109 0.439435430476406 ENSG00000130940:ENST00000377022:exon_10713434_10714275:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000344008:exon_10713434_10714275:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000496432:exon_10713041_10714275:CASZ1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 11132217 G/A 1 46 32 78 21.754990044459 16.8660938821155 4.8888961623435 A:G G A 10 0.527065433816109 0.307656339829944 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000469634:exon_11130957_11133083:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000478271:exon_11132144_11132452:EXOSC10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 11140823 G/A 1 37 26 63 17.498578948804 13.7037012792188 3.79487766958513 A:G G A 10 0.527065433816109 0.378034230860026 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11140821_11140969:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11140821_11140969:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11140821_11140969:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000472078:exon_11140556_11140914:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000485606:exon_11140758_11140969:EXOSC10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 11141187 C/G 1 29 21 50 13.7151024193328 11.0683741101383 2.64672830919455 T:C:G C G 10 0.527065433816109 0.4817003241602 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11141139_11141295:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11141139_11141295:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11141139_11141274:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000485606:exon_11141139_11141295:EXOSC10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 11728894 G/A 1 19 16 35 8.98575675749393 8.43304694105774 0.552709816436183 A:G G A 10 0.527065433816109 0.867565017882364 ENSG00000116663:ENST00000376749:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000376753:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000474239:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000449067:exon_11728753_11729001:FBXO6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 12082334 A/T 1 36 34 70 17.0256443826201 17.9202247497477 -0.894580367127631 A:T A T 10 0.527065433816109 0.904850795425394 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12082152_12082499:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12082152_12082499:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12082152_12082499:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12082279_12082499:MIIP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 12082461 C/T 1 25 23 48 11.8233641545973 12.1225049777705 -0.299140823173234 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12082152_12082499:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12082152_12082499:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12082152_12082499:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12082279_12082499:MIIP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 12164437 C/T 1 4 10 14 1.89173826473556 5.27065433816109 -3.37891607342553 T:C C T 10 0.527065433816109 0.10564189817501 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12164436_12164588:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12164436_12164588:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000417814:exon_12164436_12164588:TNFRSF8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 12186058 A/G 1 10 8 18 4.72934566183891 4.21652347052887 0.512822191310037 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12186008_12186109:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12186008_12186109:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000417814:exon_12186008_12186109:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000413146:exon_12185956_12186109:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000479933:exon_12185991_12186109:TNFRSF8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 12198297 T/C 1 14 22 36 6.62108392657447 11.5954395439544 -4.97435561737993 T:C T C 10 0.527065433816109 0.131916977901947 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12198286_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12198289_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000413146:exon_12198286_12198493:TNFRSF8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 15904318 C/T 1 15 7 22 7.09401849275836 3.68945803671276 3.4045604560456 T:C C T 10 0.527065433816109 0.199603075522895 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15904180_15904359:AGMAT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 15905501 G/A 1 11 3 14 5.2022802280228 1.58119630144833 3.62108392657447 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0624001951377552 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15905354_15905549:AGMAT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 15909744 C/T 1 9 7 16 4.25641109565502 3.68945803671276 0.566953058942256 T:C C T 10 0.527065433816109 0.808175848721287 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15909688_15909890:AGMAT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 15911349 G/A 1 2 7 9 0.945869132367782 3.68945803671276 -2.74358890434498 A:G G A 10 0.527065433816109 0.094465581682091 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15911191_15911605:AGMAT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 15986547 T/C 1 11 5 16 5.2022802280228 2.63532716908055 2.56695305894226 T:C T C 10 0.527065433816109 0.220807585221878 ENSG00000197312:ENST00000480945:exon_15986332_15995539:DDI2;ENSG00000197312:ENST00000320153:exon_15986332_15987552:DDI2;ENSG00000215695:ENST00000345034:exon_15986364_15988217:RSC1A1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 16042766 T/C 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 T:C T C 10 0.527065433816109 0.757490641773051 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16042732_16042838:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16042732_16042838:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16042732_16042838:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000462455:exon_16042732_16042838:PLEKHM2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 16044401 G/A 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 A:G G A 10 0.527065433816109 0.488810537661758 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16044388_16044487:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16044388_16044487:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16044388_16044487:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000462455:exon_16044388_16044487:PLEKHM2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 16056364 G/A 1 19 19 38 8.98575675749393 10.0142432425061 -1.02848648501215 A:G G A 10 0.527065433816109 0.748251620330117 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000477849:exon_16056340_16056424:PLEKHM2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 16258261 G/A 1 6 5 11 2.83760739710335 2.63532716908055 0.202280228022801 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 16525056 G/T 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 T:G G T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000142632:ENST00000478117:exon_16524349_16525239:ARHGEF19;ENSG00000142632:ENST00000270747:exon_16524599_16525239:ARHGEF19;ENSG00000142632:ENST00000421561:exon_16524599_16525139:ARHGEF19 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 17312743 C/T 1 31 22 53 14.6609715517006 11.5954395439544 3.06553200774622 T:C C T 10 0.527065433816109 0.413051085989322 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17312454_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17312476_17312853:ATP13A2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 17313343 G/A 1 17 22 39 8.03988762512615 11.5954395439544 -3.55555191882825 A:G G A 10 0.527065433816109 0.265865248020101 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17312958_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17313300_17313451:ATP13A2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 17313654 C/T 1 11 5 16 5.2022802280228 2.63532716908055 2.56695305894226 T:C C T 10 0.527065433816109 0.220807585221878 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17313541_17313764:ATP13A2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 17314702 C/T 1 17 12 29 8.03988762512615 6.32478520579331 1.71510241933284 T:C C T 10 0.527065433816109 0.580177374586883 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17314633_17314729:ATP13A2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 17314942 G/A 1 14 13 27 6.62108392657447 6.85185063960942 -0.230766713034944 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17314817_17314969:ATP13A2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 17319011 G/A 1 6 7 13 2.83760739710335 3.68945803671276 -0.851850639609417 A:G G A 10 0.527065433816109 0.783042148004503 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17318981_17319076:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17318981_17319076:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17318981_17319076:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000503552:exon_17318981_17319076:ATP13A2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 17739586 G/A 1 27 33 60 12.7692332869651 17.3931593159316 -4.62392602896654 A:G G A 10 0.527065433816109 0.246408472077430 ENSG00000179051:ENST00000375436:exon_17739569_17739674:RCC2;ENSG00000179051:ENST00000375433:exon_17739569_17739674:RCC2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 20977000 A/C 1 12 9 21 5.67521479420669 4.74358890434498 0.931625889861711 A:C A C 10 0.527065433816109 0.827834701908173 ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 20982631 G/A 1 110 68 178 52.022802280228 35.8404494994954 16.1823527807326 A:T:G G A 10 0.527065433816109 0.0161668124068999 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000486473:exon_20982594_20982680:DDOST HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 24077451 C/T 1 21 26 47 9.93162588986171 13.7037012792188 -3.77207538935713 T:C C T 10 0.527065433816109 0.307397368395779 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24077335_24078520:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24077335_24078520:TCEB3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 24134721 T/C 1 14 18 32 6.62108392657447 9.48717780868996 -2.86609388211549 T:C T C 10 0.527065433816109 0.376746667004893 ENSG00000117305:ENST00000374490:exon_24134625_24134813:HMGCL;ENSG00000117305:ENST00000436439:exon_24134625_24134813:HMGCL;ENSG00000117305:ENST00000374487:exon_24134625_24134813:HMGCL;ENSG00000117305:ENST00000235958:exon_24134625_24134813:HMGCL;ENSG00000117305:ENST00000496907:exon_24134625_24134813:HMGCL;ENSG00000117305:ENST00000374483:exon_24134625_24134813:HMGCL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 24200969 T/C 1 34 5 39 16.0797752502523 2.63532716908055 13.4444480811717 T:C T C 10 0.527065433816109 7.15347941403767e-06 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 24200983 C/T 1 34 8 42 16.0797752502523 4.21652347052887 11.8632517797234 T:C C T 10 0.527065433816109 0.000265583571137356 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 24201094 G/C 1 28 9 37 13.2421678531489 4.74358890434498 8.49857894880397 C:G G C 10 0.527065433816109 0.00492705864987621 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 24201109 C/T 1 25 6 31 11.8233641545973 3.16239260289665 8.66097155170062 T:C:G C T 10 0.527065433816109 0.00182208565594113 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 24201162 G/A 1 12 23 35 5.67521479420669 12.1225049777705 -6.44729018356382 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0406951810794896 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 24201262 A/G 1 25 9 34 11.8233641545973 4.74358890434498 7.07977525025229 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0159010908484800 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 24201357 A/G 1 17 8 25 8.03988762512615 4.21652347052887 3.82336415459727 A:G A G 10 0.527065433816109 0.160743808741323 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 24201448 C/T 1 15 13 28 7.09401849275836 6.85185063960942 0.242167853148946 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 24201643 G/A 1 20 15 35 9.45869132367782 7.90598150724164 1.55270981643618 A:G G A 10 0.527065433816109 0.616674394972612 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 24201919 T/C 1 18 10 28 8.51282219131004 5.27065433816109 3.24216785314895 T:C T C 10 0.527065433816109 0.258318455384860 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 24201920 T/C 1 18 10 28 8.51282219131004 5.27065433816109 3.24216785314895 T:C T C 10 0.527065433816109 0.258318455384860 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 25570081 T/C 1 129 137 266 61.0085590377219 72.2079644328069 -11.199405395085 T:C T C 10 0.527065433816109 0.176892528529597 ENSG00000117616:ENST00000498238:exon_25570041_25571792:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000243189:exon_25570041_25570124:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000473314:exon_25570041_25570715:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000417642:exon_25570041_25571792:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000475766:exon_25570041_25570124:C1orf63 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 26496455 C/T 1 140 123 263 66.2108392657447 64.8290483593814 1.38179090636332 A:T:C C T 10 0.527065433816109 0.901752135532527 ENSG00000142684:ENST00000374266:exon_26496362_26496674:ZNF593;ENSG00000142684:ENST00000270812:exon_26496433_26496674:ZNF593 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 26496651 T/C 1 191 179 370 90.3305021411232 94.3447126530835 -4.01421051196034 A:T:C T C 10 0.527065433816109 0.67744154090075 ENSG00000142684:ENST00000374266:exon_26496362_26496674:ZNF593;ENSG00000142684:ENST00000270812:exon_26496433_26496674:ZNF593 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 26582091 G/A 1 5 8 13 2.36467283091945 4.21652347052887 -1.85185063960942 A:G G A 10 0.527065433816109 0.407023665875808 ENSG00000130695:ENST00000476272:exon_26581662_26582356:CCDC21;ENSG00000130695:ENST00000252992:exon_26581662_26582356:CCDC21;ENSG00000130695:ENST00000451429:exon_26581662_26582356:CCDC21 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 26786627 G/A 1 21 15 36 9.93162588986171 7.90598150724164 2.02564438262007 A:G G A 10 0.527065433816109 0.510707568161342 ENSG00000117682:ENST00000434391:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000357049:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374192:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000525682:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000236342:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000526219:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000360009:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374194:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000430232:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000416052:exon_26786528_26786635:DHDDS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 27680292 A/G 1 37 36 73 17.498578948804 18.9743556173799 -1.47577666857596 A:G A G 10 0.527065433816109 0.727151314854547 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27680204_27680421:SYTL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 27736478 T/C 1 25 22 47 11.8233641545973 11.5954395439544 0.227924610642875 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000158195:ENST00000430629:exon_27736186_27736700:WASF2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 27942276 G/A 1 29 24 53 13.7151024193328 12.6495704115866 1.06553200774622 A:G G A 10 0.527065433816109 0.785204347579957 ENSG00000000938:ENST00000374005:exon_27942200_27942355:FGR;ENSG00000000938:ENST00000399173:exon_27942200_27942355:FGR;ENSG00000000938:ENST00000374004:exon_27942200_27942355:FGR;ENSG00000000938:ENST00000374003:exon_27942200_27942355:FGR;ENSG00000000938:ENST00000457296:exon_27942200_27942355:FGR HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 28562676 A/G 1 381 342 723 180.188069716062 180.256378365109 -0.0683086490468554 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000130770:ENST00000497986:exon_28562620_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000417632:exon_28562644_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000335514:exon_28562644_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000468425:exon_28562653_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562665_28562781:ATPIF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 28564252 A/G 1 23 9 32 10.8774950222295 4.74358890434498 6.13390611788451 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0333712788581583 ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562872_28564609:ATPIF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 28564279 A/G 1 40 12 52 18.9173826473556 6.32478520579331 12.5925974415623 A:G A G 10 0.527065433816109 0.000424833657914927 ENSG00000130770:ENST00000497986:exon_28564272_28564616:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562872_28564609:ATPIF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 28800380 C/A 1 6 11 17 2.83760739710335 5.7977197719772 -2.96011237487385 A:C C A 10 0.527065433816109 0.223637867238073 ENSG00000204138:ENST00000373839:exon_28800066_28800663:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000493669:exon_28800066_28800663:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373836:exon_28800066_28800663:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373835:exon_28800066_28800663:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373837:exon_28800066_28800663:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373838:exon_28800066_28800663:PHACTR4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 28861636 G/A 1 11 6 17 5.2022802280228 3.16239260289665 2.03988762512615 A:G G A 10 0.527065433816109 0.344390478204234 ENSG00000180198:ENST00000398962:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000398958:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373834:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000427469:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000434290:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373833:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000419074:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373832:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000439292:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373831:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000411533:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000430407:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000429051:exon_28861562_28861658:RCC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 29475648 T/G 1 84 87 171 39.7265035594468 45.8546927420015 -6.12818918255465 T:G T G 10 0.527065433816109 0.358823632819840 ENSG00000116350:ENST00000373795:exon_29474255_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000434636:exon_29475262_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000466448:exon_29475183_29475738:SRSF4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 29542637 A/G 1 14 4 18 6.62108392657447 2.10826173526444 4.51282219131004 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0352268999907301 ENSG00000116353:ENST00000373791:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000398820:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000373792:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000263702:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000473030:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000478505:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000490529:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000463052:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000489248:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000475861:exon_29542513_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000472630:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000474946:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000464915:exon_29542549_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000482610:exon_29542605_29542648:MECR HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 31426815 A/G 1 28 16 44 13.2421678531489 8.43304694105774 4.8091209120912 A:G A G 10 0.527065433816109 0.174324045572009 ENSG00000134644:ENST00000424085:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000257075:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373747:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373749:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000423018:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000525843:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000426105:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000498419:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000440538:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373741:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373742:exon_31426561_31426828:PUM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 31898687 C/T 1 22 4 26 10.4045604560456 2.10826173526444 8.29629872078116 T:C C T 10 0.527065433816109 0.00118717082425453 ENSG00000168528:ENST00000373710:exon_31898623_31898760:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000487207:exon_31898623_31898705:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000373709:exon_31898623_31898760:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000491976:exon_31898623_31898760:SERINC2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 32096265 A/G 1 94 108 202 44.4558492212858 56.9230668521398 -12.467217630854 A:G A G 10 0.527065433816109 0.090567924991685 ENSG00000162517:ENST00000373703:exon_32095463_32096443:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000461006:exon_32095941_32096333:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000478502:exon_32096050_32096443:PEF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 35900615 A/G 1 23 33 56 10.8774950222295 17.3931593159316 -6.51566429370211 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0835595230707025 ENSG00000142687:ENST00000325722:exon_35899091_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373258:exon_35899092_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373266:exon_35899706_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000426982:exon_35900566_35900682:KIAA0319L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 36068863 T/C 1 145 114 259 68.5755120966642 60.0854594550364 8.49005264162776 A:T:C T C 10 0.527065433816109 0.319422520128961 ENSG00000126067:ENST00000373237:exon_36067185_36068975:PSMB2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 36642420 T/C 1 110 99 209 52.022802280228 52.1794779477948 -0.156675667566788 A:T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000116871:ENST00000316156:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373150:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373151:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000474796:exon_36642298_36642435:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000309824:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000530975:exon_36642318_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000487131:exon_36642407_36642443:MAP7D1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 36807481 C/T 1 16 16 32 7.56695305894226 8.43304694105774 -0.866093882115489 T:C C T 10 0.527065433816109 0.859939208718838 ENSG00000196182:ENST00000373129:exon_36805225_36807574:STK40;ENSG00000196182:ENST00000359297:exon_36805225_36809049:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373130:exon_36805225_36807574:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373132:exon_36805225_36807574:STK40 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 36809505 G/A 1 18 13 31 8.51282219131004 6.85185063960942 1.66097155170062 A:G G A 10 0.527065433816109 0.593331687247524 ENSG00000196182:ENST00000373129:exon_36809461_36809580:STK40;ENSG00000196182:ENST00000359297:exon_36809461_36809580:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373130:exon_36809461_36809580:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373132:exon_36809461_36809580:STK40;ENSG00000196182:ENST00000425273:exon_36809461_36809580:STK40 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 38148765 A/G 1 6 7 13 2.83760739710335 3.68945803671276 -0.851850639609417 A:G A G 10 0.527065433816109 0.783042148004503 ENSG00000116922:ENST00000358011:exon_38147242_38148832:C1orf109;ENSG00000116922:ENST00000494120:exon_38147242_38148832:C1orf109;ENSG00000116922:ENST00000464178:exon_38148408_38148832:C1orf109 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 38327982 G/T 1 39 18 57 18.4444480811717 9.48717780868996 8.95727027248178 T:G G T 10 0.527065433816109 0.0232737431378029 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38327740_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38327757_38328102:INPP5B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 38338795 A/G 1 12 10 22 5.67521479420669 5.27065433816109 0.404560456045601 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000474758:exon_38338602_38339059:INPP5B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 38423853 G/C 1 140 130 270 66.2108392657447 68.5185063960942 -2.30766713034944 T:C:G G C 10 0.527065433816109 0.807486576864 ENSG00000183431:ENST00000373019:exon_38422647_38423935:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000448721:exon_38423631_38423935:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000487062:exon_38423735_38423935:SF3A3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 40557033 A/G 1 21 17 38 9.93162588986171 8.96011237487385 0.971513514987857 A:G A G 10 0.527065433816109 0.871244863274115 ENSG00000131238:ENST00000433473:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000372783:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000372776:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000529905:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000530704:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000439754:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000527311:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000372779:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000527107:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000526547:exon_40557001_40557071:PPT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 40773149 T/C 1 6 10 16 2.83760739710335 5.27065433816109 -2.43304694105774 T:C T C 10 0.527065433816109 0.316907244333737 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40773118_40773171:COL9A2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 40980731 G/T 1 22 10 32 10.4045604560456 5.27065433816109 5.13390611788451 T:G G T 10 0.527065433816109 0.0775021378258386 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000420209:exon_40980187_40980894:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000418186:exon_40980187_40980888:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000443729:exon_40980187_40980958:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000419161:exon_40980187_40980958:DEM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 41979156 A/G 1 14 10 24 6.62108392657447 5.27065433816109 1.35042958841338 A:G A G 10 0.527065433816109 0.68432289568664 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41978487_41979421:HIVEP3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 42880516 T/C 1 22 24 46 10.4045604560456 12.6495704115866 -2.24500995554101 T:C T C 10 0.527065433816109 0.556153822172808 ENSG00000177181:ENST00000431473:exon_42880155_42880850:RIMKLA;ENSG00000177181:ENST00000372570:exon_42880155_42880830:RIMKLA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 43131653 G/A 1 24 24 48 11.3504295884134 12.6495704115866 -1.29914082317323 A:G G A 10 0.527065433816109 0.773140822853663 ENSG00000171960:ENST00000304979:exon_43131651_43131738:PPIH;ENSG00000171960:ENST00000372550:exon_43131651_43131738:PPIH;ENSG00000171960:ENST00000440068:exon_43131651_43131738:PPIH;ENSG00000171960:ENST00000455203:exon_43131651_43131738:PPIH;ENSG00000171960:ENST00000461351:exon_43131651_43131738:PPIH HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 43630460 G/A 1 157 152 309 74.2507268908709 80.1139459400486 -5.8632190491777 A:G G A 10 0.527065433816109 0.530965007691935 ENSG00000117395:ENST00000236051:exon_43630314_43630476:EBNA1BP2;ENSG00000117395:ENST00000431635:exon_43630314_43630476:EBNA1BP2;ENSG00000117395:ENST00000463906:exon_43630314_43630476:EBNA1BP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 45111150 G/A 1 78 51 129 36.8888961623435 26.8803371246216 10.0085590377219 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0785253062047431 ENSG00000187147:ENST00000355387:exon_45111082_45111160:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000416840:exon_45111079_45111160:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000361799:exon_45111082_45111160:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000453887:exon_45111079_45111160:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000372247:exon_45111082_45111160:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000443020:exon_45111079_45111160:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000372248:exon_45111082_45111160:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000440132:exon_45111082_45111160:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000335497:exon_45111082_45111160:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000474064:exon_45111082_45111160:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000444372:exon_45111079_45111160:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000475378:exon_45111082_45111160:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000484745:exon_45111082_45111160:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000474394:exon_45111082_45111160:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000480686:exon_45111082_45111160:RNF220 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 45218895 A/T 1 9 6 15 4.25641109565502 3.16239260289665 1.09401849275836 A:T A T 10 0.527065433816109 0.615224246448703 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000455186:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45218804_45218926:KIF2C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 45224998 A/C 1 15 14 29 7.09401849275836 7.37891607342553 -0.284897580667162 A:C A C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45224878_45225020:KIF2C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 45226084 G/A 1 14 20 34 6.62108392657447 10.5413086763222 -3.92022474974771 A:G G A 10 0.527065433816109 0.228892942719341 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45225952_45226156:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45225952_45226156:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45225952_45226156:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45225952_45226156:KIF2C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 45267395 C/T 1 10 11 21 4.72934566183891 5.7977197719772 -1.06837411013829 T:C C T 10 0.527065433816109 0.667942291105539 ENSG00000173846:ENST00000372201:exon_45267294_45267423:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000465443:exon_45267294_45267423:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000476731:exon_45267306_45267423:PLK3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 45270024 G/C 1 8 17 25 3.78347652947113 8.96011237487385 -5.17663584540273 A:C:G G C 10 0.527065433816109 0.0449126618304287 ENSG00000173846:ENST00000372201:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000465443:exon_45270011_45270451:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000492398:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000461358:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000461769:exon_45270011_45270173:PLK3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 45444038 G/A 1 14 12 26 6.62108392657447 6.32478520579331 0.296298720781166 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000070785:ENST00000360403:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000372183:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000480675:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000477953:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000372182:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000487532:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000497010:exon_45443987_45444132:EIF2B3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 45469176 A/T 1 28 27 55 13.2421678531489 14.2307667130349 -0.988598859885997 A:T A T 10 0.527065433816109 0.789149255611955 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000372168:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486132:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45468220_45469248:HECTD3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 45479772 G/T 1 9 5 14 4.25641109565502 2.63532716908055 1.62108392657447 T:G G T 10 0.527065433816109 0.433551468090942 ENSG00000126088:ENST00000494399:exon_45479581_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000490385:exon_45479581_45479892:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460906:exon_45479247_45479792:UROD;ENSG00000126088:ENST00000496439:exon_45479266_45479810:UROD;ENSG00000126088:ENST00000472254:exon_45479722_45480248:UROD HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 46073489 G/A 1 12 8 20 5.67521479420669 4.21652347052887 1.45869132367782 A:G G A 10 0.527065433816109 0.65554767387655 ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000470768:exon_46072993_46073644:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46072993_46074009:NASP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 46094027 A/G 1 79 51 130 37.3618307285274 26.8803371246216 10.4814936039058 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0785667455555698 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46092978_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46093629_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46093900_46094080:GPBP1L1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 46095272 T/C 1 75 51 126 35.4700924637918 26.8803371246216 8.58975533917026 T:C T C 10 0.527065433816109 0.130069717554910 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46095248_46095387:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000468724:exon_46095260_46095350:GPBP1L1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 46496709 A/G 1 9 3 12 4.25641109565502 1.58119630144833 2.67521479420669 A:G A G 10 0.527065433816109 0.153067812973243 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000432341:exon_46496679_46496709:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46496679_46496962:MAST2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 46498375 A/G 1 11 3 14 5.2022802280228 1.58119630144833 3.62108392657447 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0624001951377552 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46498268_46498390:MAST2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 47746667 A/G 1 1 7 8 0.472934566183891 3.68945803671276 -3.21652347052887 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0307713746552577 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371874:exon_47746618_47746728:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000447475:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000418131:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000436811:exon_47746618_47746729:STIL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 51826921 T/C 1 15 20 35 7.09401849275836 10.5413086763222 -3.44729018356382 T:C T C 10 0.527065433816109 0.309807945350998 ENSG00000085832:ENST00000371730:exon_51826843_51827027:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000371733:exon_51826843_51827027:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000396122:exon_51826843_51827027:EPS15 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 51873951 G/A 1 15 9 24 7.09401849275836 4.74358890434498 2.35042958841338 A:G G A 10 0.527065433816109 0.415272769718452 ENSG00000085832:ENST00000371733:exon_51873807_51874004:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000396122:exon_51873807_51874004:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000493793:exon_51873807_51874004:EPS15 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 52264064 A/G 1 42 28 70 19.8632517797234 14.7578321468511 5.10541963287237 A:G A G 10 0.527065433816109 0.233307070753411 ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000497358:exon_52263921_52264083:NRD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 52266350 C/T 1 40 42 82 18.9173826473556 22.1367482202766 -3.21936557292094 T:C C T 10 0.527065433816109 0.507898275005 ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000497358:exon_52266228_52266355:NRD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 52826181 C/T 1 12 13 25 5.67521479420669 6.85185063960942 -1.17663584540273 T:C C T 10 0.527065433816109 0.691622871057986 ENSG00000154222:ENST00000441197:exon_52826096_52826221:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000371586:exon_52826096_52826221:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000491136:exon_52826096_52826804:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000284376:exon_52826096_52826221:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000460261:exon_52826096_52826221:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000371573:exon_52826096_52826221:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000450942:exon_52826096_52826221:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000438831:exon_52826096_52826221:CC2D1B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 52826789 C/T 1 9 7 16 4.25641109565502 3.68945803671276 0.566953058942256 T:C C T 10 0.527065433816109 0.808175848721287 ENSG00000154222:ENST00000441197:exon_52826646_52826804:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000371586:exon_52826646_52826804:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000491136:exon_52826096_52826804:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000284376:exon_52826646_52826804:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000371573:exon_52826646_52826804:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000450942:exon_52826646_52826804:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000438831:exon_52826646_52826804:CC2D1B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 52882406 A/G 1 67 70 137 31.6866159343207 36.8945803671276 -5.20796443280694 A:G A G 10 0.527065433816109 0.392798075570115 ENSG00000134748:ENST00000257181:exon_52882320_52883992:PRPF38A;ENSG00000134748:ENST00000474048:exon_52882320_52882694:PRPF38A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 53072454 T/C 1 8 5 13 3.78347652947113 2.63532716908055 1.14814936039058 T:C T C 10 0.527065433816109 0.588366380954527 ENSG00000116157:ENST00000361314:exon_53072356_53072617:GPX7;ENSG00000116157:ENST00000459779:exon_53072356_53073080:GPX7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 53153432 T/C 1 25 28 53 11.8233641545973 14.7578321468511 -2.93446799225378 T:C T C 10 0.527065433816109 0.491969934500807 ENSG00000162377:ENST00000371538:exon_53152508_53153840:C1orf163;ENSG00000162377:ENST00000486918:exon_53153234_53153840:C1orf163 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 55223536 C/T 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000162396:ENST00000371279:exon_55222571_55224863:PARS2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 55319902 A/G 1 24 26 50 11.3504295884134 13.7037012792188 -2.35327169080545 A:G A G 10 0.527065433816109 0.571717732519724 ENSG00000116133:ENST00000371269:exon_55319710_55319907:DHCR24 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 64114301 T/C 1 16 25 41 7.56695305894226 13.1766358454027 -5.60968278646047 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0864387566063377 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64114188_64114323:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64114188_64114323:PGM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 75172001 T/A 1 90 97 187 42.5641109565502 51.1253470801626 -8.56123612361239 A:T T A 10 0.527065433816109 0.213910967431204 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75171170_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75171170_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000492102:exon_75171172_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75171174_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75171656_75172141:CRYZ HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 75175886 T/C 1 21 25 46 9.93162588986171 13.1766358454027 -3.24500995554102 T:C T C 10 0.527065433816109 0.37698278837888 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75175793_75175931:CRYZ HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 75214441 A/G 1 28 21 49 13.2421678531489 11.0683741101383 2.17379374301066 A:G A G 10 0.527065433816109 0.56952054478671 ENSG00000162623:ENST00000370867:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000457880:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000479111:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000483990:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000485401:exon_75214325_75214506:TYW3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 76227022 A/G 1 120 133 253 56.7521479420669 70.0997026975425 -13.3475547554756 A:G A G 10 0.527065433816109 0.101498659486823 ENSG00000117054:ENST00000370841:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526129:exon_76226807_76227300:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526196:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000370834:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000525808:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000420607:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000529059:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000481374:exon_76226807_76227055:ACADM HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 76255228 G/A 1 2 9 11 0.945869132367782 4.74358890434498 -3.7977197719772 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0310731489114619 ENSG00000137955:ENST00000496055:exon_76253182_76256202:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000461653:exon_76254844_76256202:RABGGTB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 77558057 G/C 1 6 8 14 2.83760739710335 4.21652347052887 -1.37891607342553 C:G G C 10 0.527065433816109 0.59467204210446 ENSG00000142892:ENST00000370812:exon_77554675_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000445065:exon_77554675_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000370813:exon_77557389_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000487906:exon_77557887_77558175:PIGK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 78180425 T/G 1 6 2 8 2.83760739710335 1.05413086763222 1.78347652947113 T:G T G 10 0.527065433816109 0.29481715391141 ENSG00000077254:ENST00000370794:exon_78180299_78180468:USP33;ENSG00000077254:ENST00000481579:exon_78180299_78180468:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370793:exon_78180299_78180468:USP33;ENSG00000077254:ENST00000357428:exon_78180299_78180468:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370792:exon_78180299_78180468:USP33;ENSG00000077254:ENST00000472462:exon_78180299_78180602:USP33 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 78408536 C/G 1 9 2 11 4.25641109565502 1.05413086763222 3.2022802280228 C:G C G 10 0.527065433816109 0.0696872224921074 ENSG00000162614:ENST00000330010:exon_78408146_78409576:NEXN;ENSG00000162614:ENST00000294624:exon_78408146_78409576:NEXN;ENSG00000162614:ENST00000334785:exon_78408146_78408909:NEXN;ENSG00000162614:ENST00000480732:exon_78408146_78408884:NEXN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 78426088 A/G 1 65 56 121 30.7407468019529 29.5156642937021 1.22508250825081 A:G A G 10 0.527065433816109 0.855825374895588 ENSG00000162613:ENST00000294623:exon_78426029_78426180:FUBP1;ENSG00000162613:ENST00000370773:exon_78426029_78426180:FUBP1;ENSG00000162613:ENST00000436586:exon_78426029_78426180:FUBP1;ENSG00000162613:ENST00000394922:exon_78426029_78426180:FUBP1;ENSG00000162613:ENST00000370768:exon_78426029_78426180:FUBP1;ENSG00000162613:ENST00000370767:exon_78426029_78426180:FUBP1;ENSG00000162613:ENST00000470287:exon_78426029_78426470:FUBP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 84961108 G/A 1 24 25 49 11.3504295884134 13.1766358454027 -1.82620625698934 A:G G A 10 0.527065433816109 0.668496292583397 ENSG00000117133:ENST00000370654:exon_84961056_84961138:RPF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 85020769 G/A 1 13 6 19 6.14814936039058 3.16239260289665 2.98575675749393 A:G G A 10 0.527065433816109 0.250133651156978 ENSG00000117151:ENST00000477677:exon_85018804_85020882:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370630:exon_85018807_85020882:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370625:exon_85020536_85020882:CTBS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 85029077 C/T 1 11 20 31 5.2022802280228 10.5413086763222 -5.33902844829938 T:C C T 10 0.527065433816109 0.070818349776375 ENSG00000117151:ENST00000477677:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370630:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370625:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000465118:exon_85028940_85029101:CTBS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 85113203 T/C 1 4 8 12 1.89173826473556 4.21652347052887 -2.32478520579331 T:C T C 10 0.527065433816109 0.248670873824186 ENSG00000117155:ENST00000342203:exon_85109390_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000437941:exon_85109599_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000481102:exon_85113022_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000476905:exon_85113024_85113290:SSX2IP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 85724328 C/T 1 8 5 13 3.78347652947113 2.63532716908055 1.14814936039058 T:C C T 10 0.527065433816109 0.588366380954527 ENSG00000162642:ENST00000294661:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000471115:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000493514:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000344356:exon_85724207_85724405:C1orf52 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 85741921 G/C 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 C:G G C 10 0.527065433816109 1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 89582702 A/G 1 50 55 105 23.6467283091945 28.988598859886 -5.34187055069145 A:G A G 10 0.527065433816109 0.328600627815426 ENSG00000162645:ENST00000464839:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000370466:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000463660:exon_89582675_89582917:GBP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 93303186 A/G 1 80 458 538 37.8347652947113 241.395968687778 -203.561203393067 A:T:G A G 10 0.527065433816109 9.18571530821208e-75 ENSG00000122406:ENST00000432788:exon_93303013_93303190:RPL5;ENSG00000122406:ENST00000370321:exon_93303013_93303190:RPL5;ENSG00000122406:ENST00000490963:exon_93303013_93303190:RPL5;ENSG00000122406:ENST00000497519:exon_93302167_93303190:RPL5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 93306317 G/A 1 7 4 11 3.31054196328724 2.10826173526444 1.2022802280228 A:G G A 10 0.527065433816109 0.555399509917260 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 93620393 G/A 1 31 23 54 14.6609715517006 12.1225049777705 2.53846657393011 A:G G A 10 0.527065433816109 0.499691311634221 ENSG00000117500:ENST00000370282:exon_93615299_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000370290:exon_93617415_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000483033:exon_93619753_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000479918:exon_93619789_93620445:TMED5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 93646433 T/C 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 T:C T C 10 0.527065433816109 0.160556933333404 ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93646281_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93646326_93646439:CCDC18 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 93672688 C/T 1 5 9 14 2.36467283091945 4.74358890434498 -2.37891607342553 T:C C T 10 0.527065433816109 0.284872281969498 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000455267:exon_93672664_93672955:CCDC18 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 93720070 C/G 1 11 11 22 5.2022802280228 5.7977197719772 -0.595439543954399 C:G C G 10 0.527065433816109 0.833638974534111 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93720028_93720171:CCDC18 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 94342061 C/T 1 127 105 232 60.0626899053542 55.3418705506914 4.72081935466271 T:C C T 10 0.527065433816109 0.554426057606613 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 109338861 G/C 1 9 12 21 4.25641109565502 6.32478520579331 -2.06837411013829 C:G G C 10 0.527065433816109 0.390094196298263 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109338856_109338994:STXBP3;ENSG00000116266:ENST00000472099:exon_109338857_109339348:STXBP3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 109351501 A/G 1 19 19 38 8.98575675749393 10.0142432425061 -1.02848648501215 A:G A G 10 0.527065433816109 0.748251620330117 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109351405_109352148:STXBP3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 110170896 T/C 1 9 11 20 4.25641109565502 5.7977197719772 -1.54130867632218 T:C T C 10 0.527065433816109 0.510653805220797 ENSG00000116337:ENST00000526301:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000342115:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528667:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000256578:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393689:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000358729:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000369840:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528454:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393688:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000529299:exon_110170705_110171157:AMPD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 110466338 C/A 1 4 9 13 1.89173826473556 4.74358890434498 -2.85185063960942 A:C C A 10 0.527065433816109 0.163735013053684 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 110466466 T/C 1 7 7 14 3.31054196328724 3.68945803671276 -0.378916073425526 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 110466810 C/A 1 4 7 11 1.89173826473556 3.68945803671276 -1.7977197719772 A:C C A 10 0.527065433816109 0.36886039388561 ENSG00000184371:ENST00000344188:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000420111:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369801:exon_110466682_110466812:CSF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 110883569 A/T 1 4 5 9 1.89173826473556 2.63532716908055 -0.743588904344981 A:T A T 10 0.527065433816109 0.743612144716174 ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110881128_110884890:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110882058_110884890:RBM15 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 110888948 G/A 1 92 58 150 43.509980088918 30.5697951613343 12.9401849275836 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0405761807709789 ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110888930_110889299:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110888930_110889299:RBM15 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 111441829 C/T 1 528 479 1007 249.709450945094 252.464342797916 -2.7548918528218 A:T:C C T 10 0.527065433816109 0.874640272499019 ENSG00000143119:ENST00000429072:exon_111441746_111442558:CD53;ENSG00000143119:ENST00000271324:exon_111441746_111442550:CD53;ENSG00000143119:ENST00000476408:exon_111441746_111442136:CD53;ENSG00000143119:ENST00000497404:exon_111441746_111442473:CD53;ENSG00000143119:ENST00000464329:exon_111441746_111441938:CD53 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 111783982 C/A 1 188 5 193 88.9116984425715 2.63532716908055 86.276371273491 A:C C A 10 0.527065433816109 4.20733144344282e-45 ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000472825:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000529459:exon_111783949_111784065:CHI3L2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 111957245 G/A 1 11 6 17 5.2022802280228 3.16239260289665 2.03988762512615 A:G G A 10 0.527065433816109 0.344390478204234 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 111957311 G/C 1 4 9 13 1.89173826473556 4.74358890434498 -2.85185063960942 C:G G C 10 0.527065433816109 0.163735013053684 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 112298829 T/C 1 8 2 10 3.78347652947113 1.05413086763222 2.72934566183891 T:C T C 10 0.527065433816109 0.114525614534534 ENSG00000064703:ENST00000533164:exon_112298435_112298847:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112297927_112298847:DDX20 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 112308953 T/C 1 24 22 46 11.3504295884134 11.5954395439544 -0.245009955541015 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 112308972 G/A 1 27 20 47 12.7692332869651 10.5413086763222 2.22792461064287 A:G G A 10 0.527065433816109 0.560933930099591 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 112999227 G/A 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 A:G G A 10 0.527065433816109 0.488810537661758 ENSG00000143079:ENST00000271277:exon_112998553_113003786:CTTNBP2NL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 113456546 A/T 1 24 37 61 11.3504295884134 19.501421051196 -8.15099146278265 A:T A T 10 0.527065433816109 0.0401779528562345 ENSG00000155380:ENST00000369626:exon_113454469_113456787:SLC16A1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 114252993 G/A 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 A:G G A 10 0.527065433816109 0.160556933333404 ENSG00000116793:ENST00000474926:exon_114252876_114253097:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369597:exon_114252876_114253097:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369596:exon_114252876_114253097:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000393357:exon_114252876_114253097:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000431577:exon_114252876_114253097:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369598:exon_114252876_114253097:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369600:exon_114252876_114253097:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369604:exon_114252876_114253097:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000357783:exon_114252876_114253097:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000418893:exon_114252876_114253097:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000412670:exon_114252876_114253097:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000447664:exon_114252876_114253097:PHTF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 114438951 A/G 1 20 17 37 9.45869132367782 8.96011237487385 0.498578948803965 A:C:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000134262:ENST00000369567:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369569:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000256658:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369566:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479285:exon_114437678_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000462591:exon_114438880_114440561:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479801:exon_114438667_114439087:AP4B1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 114442702 C/T 1 10 10 20 4.72934566183891 5.27065433816109 -0.541308676322181 T:C C T 10 0.527065433816109 0.826649432830958 ENSG00000134262:ENST00000369567:exon_114442526_114443022:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369569:exon_114442526_114443022:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000256658:exon_114442526_114443022:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369566:exon_114442526_114443022:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479285:exon_114442526_114442867:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369564:exon_114442526_114443022:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000489499:exon_114442564_114443022:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000432415:exon_114442610_114443022:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000489092:exon_114442684_114443022:AP4B1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 114444444 T/G 1 5 6 11 2.36467283091945 3.16239260289665 -0.797719771977199 T:G T G 10 0.527065433816109 0.765666449819686 ENSG00000134262:ENST00000369569:exon_114444377_114444507:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000256658:exon_114444377_114444507:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000484201:exon_114444377_114444507:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369564:exon_114444377_114444507:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000489499:exon_114444377_114444507:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000489092:exon_114444377_114444507:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369571:exon_114444377_114444507:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000472122:exon_114444377_114444741:AP4B1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 117948206 T/C 1 36 60 96 17.0256443826201 31.6239260289665 -14.5982816463465 T:C T C 10 0.527065433816109 0.00296160058330300 ENSG00000198162:ENST00000356554:exon_117948171_117948267:MAN1A2;ENSG00000198162:ENST00000369450:exon_117948171_117948267:MAN1A2;ENSG00000198162:ENST00000413355:exon_117948171_117948267:MAN1A2;ENSG00000198162:ENST00000329466:exon_117948171_117948267:MAN1A2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 118166096 C/T 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 T:C C T 10 0.527065433816109 0.757490641773051 ENSG00000183508:ENST00000369448:exon_118165464_118170994:FAM46C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 120285546 G/A 1 43 26 69 20.3361863459073 13.7037012792188 6.63248506668848 A:G G A 10 0.527065433816109 0.117876036445747 ENSG00000092621:ENST00000369409:exon_120285430_120285667:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000369407:exon_120285430_120285667:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000482968:exon_120285430_120285667:PHGDH HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 144912153 A/G 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 A:G A G 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144912130_144912294:PDE4DIP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 144912233 C/T 0 8 0 8 3.78347652947113 0 3.78347652947113 C C 10 0.527065433816109 0.00845817134857238 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144912130_144912294:PDE4DIP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 144918984 C/T 1 4 5 9 1.89173826473556 2.63532716908055 -0.743588904344981 T:C C T 10 0.527065433816109 0.743612144716174 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000525886:exon_144918833_144919011:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000532801:exon_144918961_144918991:PDE4DIP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 144931087 T/C 0 15 0 15 7.09401849275836 0 7.09401849275836 T T 10 0.527065433816109 8.05366101825798e-05 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 144931330 C/T 0 13 0 13 6.14814936039058 0 6.14814936039058 C C 10 0.527065433816109 0.000301448697684757 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 144931581 C/G 0 9 0 9 4.25641109565502 0 4.25641109565502 C C 10 0.527065433816109 0.0043225365335067 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 145103928 G/A 0 0 53 53 0 27.9344679922538 -27.9344679922538 A G A 10 0.527065433816109 5.8137457074514e-18 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 63 63 0 33.2051223304149 -33.2051223304149 C T C 10 0.527065433816109 3.25436757315049e-21 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 33 33 0 17.3931593159316 -17.3931593159316 T G T 10 0.527065433816109 1.85538861671793e-11 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 37 37 0 19.501421051196 -19.501421051196 A C A 10 0.527065433816109 9.28194769069903e-13 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 80 0 80 37.8347652947113 0 37.8347652947113 G G 10 0.527065433816109 9.48303835690956e-23 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 51 51 0 26.8803371246216 -26.8803371246216 C T C 10 0.527065433816109 2.59928510107165e-17 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 83 83 0 43.746431006737 -43.746431006737 T C T 10 0.527065433816109 1.01973599160812e-27 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 145112501 C/T 0 107 0 107 50.6039985816763 0 50.6039985816763 C C 10 0.527065433816109 1.85033439441595e-30 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 145439633 T/C 1 43 49 92 20.3361863459073 25.8262062569893 -5.49001991108203 T:C T C 10 0.527065433816109 0.253142327246346 ENSG00000117289:ENST00000369317:exon_145439593_145439665:TXNIP;ENSG00000117289:ENST00000425134:exon_145439306_145439665:TXNIP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 145585518 A/C 1 9 8 17 4.25641109565502 4.21652347052887 0.0398876251261466 A:C A C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000131788:ENST00000393045:exon_145585356_145586546:PIAS3;ENSG00000131788:ENST00000369298:exon_145585356_145586546:PIAS3;ENSG00000131788:ENST00000475261:exon_145585356_145586546:PIAS3;ENSG00000131788:ENST00000472114:exon_145584799_145586546:PIAS3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 145586839 C/T 1 7 4 11 3.31054196328724 2.10826173526444 1.2022802280228 T:C C T 10 0.527065433816109 0.555399509917260 ENSG00000186364:ENST00000334513:exon_145586804_145586956:NUDT17;ENSG00000186364:ENST00000444015:exon_145586804_145586949:NUDT17;ENSG00000186364:ENST00000467151:exon_145586804_145586956:NUDT17;ENSG00000186364:ENST00000498192:exon_145586804_145586956:NUDT17;ENSG00000186364:ENST00000477878:exon_145586807_145586956:NUDT17 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 146751782 A/C 1 7 14 21 3.31054196328724 7.37891607342553 -4.06837411013829 A:C A C 10 0.527065433816109 0.0833995299023928 ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146751699_146751864:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146751699_146751864:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146751699_146751864:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146751699_146751864:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000361293:exon_146751699_146751864:CHD1L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 146767149 G/T 1 66 67 133 31.2136813681368 35.3133840656793 -4.0997026975425 T:G G T 10 0.527065433816109 0.488311701175649 ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146767112_146767441:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146767112_146767441:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146767112_146767443:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146767112_146767443:CHD1L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 147119273 G/A 1 7 15 22 3.31054196328724 7.90598150724164 -4.5954395439544 A:G G A 10 0.527065433816109 0.05593119353183 ENSG00000162836:ENST00000460583:exon_147119170_147119368:ACP6;ENSG00000162836:ENST00000369238:exon_147119172_147119368:ACP6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 150130983 G/T 1 5 5 10 2.36467283091945 2.63532716908055 -0.270654338161091 T:G G T 10 0.527065433816109 1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 150199123 G/T 1 51 51 102 24.1196628753784 26.8803371246216 -2.76067424924312 A:T:G G T 10 0.527065433816109 0.620565230400403 ENSG00000143401:ENST00000314136:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369116:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000421169:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369119:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000436748:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369115:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000533654:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000534220:exon_150198940_150199127:ANP32E HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 150305647 C/T 1 11 9 20 5.2022802280228 4.74358890434498 0.45869132367782 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000117360:ENST00000324862:exon_150305450_150305670:PRPF3;ENSG00000117360:ENST00000496202:exon_150305450_150305670:PRPF3;ENSG00000117360:ENST00000414970:exon_150305450_150305670:PRPF3;ENSG00000117360:ENST00000467329:exon_150305450_150305670:PRPF3;ENSG00000117360:ENST00000467514:exon_150305450_150305670:PRPF3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 150429944 A/G 1 5 7 12 2.36467283091945 3.68945803671276 -1.32478520579331 A:G A G 10 0.527065433816109 0.566621218006073 ENSG00000163125:ENST00000492220:exon_150429764_150430046:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000401000:exon_150429764_150430046:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000369068:exon_150429764_150430046:RPRD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 150445819 A/G 1 27 17 44 12.7692332869651 8.96011237487385 3.8091209120912 A:G A G 10 0.527065433816109 0.291442452370904 ENSG00000163125:ENST00000492220:exon_150443037_150446032:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000401000:exon_150443037_150449042:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000369068:exon_150443037_150446032:RPRD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 150550924 T/C 1 25 45 70 11.8233641545973 23.7179445217249 -11.8945803671276 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0055413277716297 ENSG00000143384:ENST00000369026:exon_150550720_150550967:MCL1;ENSG00000143384:ENST00000439749:exon_150550720_150550967:MCL1;ENSG00000143384:ENST00000464132:exon_150550720_150551253:MCL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 150727539 G/A 1 25 29 54 11.8233641545973 15.2848975806672 -3.46153342606989 A:G G A 10 0.527065433816109 0.413784672599997 ENSG00000163131:ENST00000368985:exon_150727477_150727626:CTSS;ENSG00000163131:ENST00000480760:exon_150727477_150727626:CTSS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 150789864 A/C 1 8 5 13 3.78347652947113 2.63532716908055 1.14814936039058 A:C A C 10 0.527065433816109 0.588366380954527 ENSG00000143437:ENST00000358595:exon_150789837_150789909:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000322733:exon_150789837_150789909:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000342710:exon_150789837_150789909:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000394700:exon_150789837_150789924:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000354396:exon_150789837_150789909:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000515192:exon_150789837_150789909:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000505755:exon_150789837_150789909:ARNT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 150939883 A/G 1 20 14 34 9.45869132367782 7.37891607342553 2.07977525025229 A:G A G 10 0.527065433816109 0.497604517851488 ENSG00000143418:ENST00000368954:exon_150939868_150939960:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000271688:exon_150939868_150939960:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000345896:exon_150939868_150939960:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000460664:exon_150939868_150940190:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000368949:exon_150939868_150939960:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000496562:exon_150939868_150940107:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000361419:exon_150939868_150939960:LASS2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 150940308 G/A 1 17 9 26 8.03988762512615 4.74358890434498 3.29629872078117 A:G G A 10 0.527065433816109 0.239819406952834 ENSG00000143418:ENST00000368954:exon_150940296_150940353:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000271688:exon_150940296_150940353:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000345896:exon_150940296_150940353:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000460664:exon_150940296_150940353:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000368949:exon_150940296_150940353:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000361419:exon_150940296_150940353:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000421609:exon_150940296_150940353:LASS2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 151026815 C/T 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 T:C C T 10 0.527065433816109 0.757490641773051 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 154580458 C/A 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 A:C C A 10 0.527065433816109 0.729753293915306 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 154987526 C/T 1 16 14 30 7.56695305894226 7.37891607342553 0.188036985516729 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000160685:ENST00000368426:exon_154987131_154988290:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000487542:exon_154987131_154987785:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000417934:exon_154987131_154988290:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000292176:exon_154986924_154988290:ZBTB7B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 154988957 A/G 1 19 29 48 8.98575675749393 15.2848975806672 -6.29914082317323 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0822475837388551 ENSG00000160685:ENST00000368426:exon_154988696_154990998:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000417934:exon_154988696_154990998:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000292176:exon_154988696_154989457:ZBTB7B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 155033308 G/A 1 10 2 12 4.72934566183891 1.05413086763222 3.67521479420669 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0418936923317288 ENSG00000143537:ENST00000527418:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000529473:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000526491:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000356955:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000449910:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000359280:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000355956:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368410:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000271836:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000461564:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368413:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000531455:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000472434:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000498481:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000461234:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000462116:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000468053:exon_155033239_155033308:ADAM15 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 156104292 G/A 1 114 71 185 53.9145405449636 37.4216458009437 16.4928947440198 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0151371841687099 ENSG00000160789:ENST00000368301:exon_156104194_156104319:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000347559:exon_156104194_156104319:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000361308:exon_156104194_156104319:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368300:exon_156104194_156104319:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000292302:exon_156104194_156104319:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392355:exon_156104194_156104319:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368299:exon_156104194_156104319:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000502357:exon_156104194_156104319:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000448611:exon_156104194_156104319:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000515459:exon_156104194_156104319:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368297:exon_156104194_156104319:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000504687:exon_156104194_156104319:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000473598:exon_156104194_156104319:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392353:exon_156104194_156104319:LMNA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 156437822 T/G 1 32 24 56 15.1339061178845 12.6495704115866 2.48433570629789 T:G T G 10 0.527065433816109 0.592859468162575 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156437785_156438091:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156437785_156438091:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000353795:exon_156437785_156438091:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000340875:exon_156437785_156438091:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156437785_156438091:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156437785_156438091:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000464356:exon_156437785_156438091:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000454816:exon_156437785_156438091:MEF2D HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 156446903 T/C 1 6 7 13 2.83760739710335 3.68945803671276 -0.851850639609417 T:C T C 10 0.527065433816109 0.783042148004503 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000353795:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000340875:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000454816:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000493077:exon_156446721_156446994:MEF2D HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 156450719 G/A 1 4 9 13 1.89173826473556 4.74358890434498 -2.85185063960942 A:G G A 10 0.527065433816109 0.163735013053684 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 156450740 G/A 1 12 4 16 5.67521479420669 2.10826173526444 3.56695305894226 A:G G A 10 0.527065433816109 0.083657893276571 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 156706559 A/C,G 0 0 17 17 0 8.96011237487385 -8.96011237487385 C:G A C 10 0.527065433816109 2.96222451976555e-06 ENSG00000143303:ENST00000368218:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000368216:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000476229:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000497515:exon_156706424_156706752:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000481920:exon_156706473_156706694:C1orf66 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 156760887 C/A 1 7 6 13 3.31054196328724 3.16239260289665 0.148149360390583 A:C C A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000143294:ENST00000368201:exon_156760859_156760954:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000454659:exon_156760859_156760954:PRCC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 157508882 C/T 1 15 12 27 7.09401849275836 6.32478520579331 0.769233286965056 T:C C T 10 0.527065433816109 0.848360844335184 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368189:exon_157508876_157509154:FCRL5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 157509025 C/T 1 6 2 8 2.83760739710335 1.05413086763222 1.78347652947113 T:C C T 10 0.527065433816109 0.29481715391141 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368189:exon_157508876_157509154:FCRL5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 158813819 A/G 1 32 10 42 15.1339061178845 5.27065433816109 9.86325177972342 A:G A G 10 0.527065433816109 0.00285270553355618 ENSG00000163563:ENST00000368141:exon_158813745_158813912:MNDA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 158986477 G/C 1 221 187 408 104.51853912664 98.5612361236124 5.95730300302752 C:G G C 10 0.527065433816109 0.585553112533153 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000447473:exon_158986323_158986482:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158986323_158986490:IFI16 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 158990247 A/G 1 185 149 334 87.4928947440198 78.5327496386003 8.96014510541957 A:G A G 10 0.527065433816109 0.35158654271162 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_158990131_158990319:IFI16 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 159002377 C/A 1 123 108 231 58.1709516406186 56.9230668521398 1.24788478847881 A:C C A 10 0.527065433816109 0.89526249228235 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 159002389 T/A 1 112 98 210 52.9686714125958 51.6524125139787 1.3162588986171 A:T T A 10 0.527065433816109 0.890158358600217 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 159024668 A/T 1 369 344 713 174.512854921856 181.310509232742 -6.79765431088575 A:T:G A T 10 0.527065433816109 0.625916309092605 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159024611_159024945:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159024611_159024918:IFI16 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 160303416 G/A 1 8 4 12 3.78347652947113 2.10826173526444 1.67521479420669 A:G G A 10 0.527065433816109 0.396148353996528 ENSG00000122218:ENST00000368069:exon_160303393_160303469:COPA;ENSG00000122218:ENST00000241704:exon_160303393_160303469:COPA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 160793442 A/G 1 8 8 16 3.78347652947113 4.21652347052887 -0.433046941057745 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000122224:ENST00000341032:exon_160793416_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368041:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368040:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000263285:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000392203:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368037:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368036:exon_160793419_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368035:exon_160793297_160793586:LY9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 160793560 A/G 1 19 25 44 8.98575675749393 13.1766358454027 -4.1908790879088 A:G A G 10 0.527065433816109 0.228563041881665 ENSG00000122224:ENST00000341032:exon_160793416_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368041:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368040:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000263285:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000392203:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368037:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368036:exon_160793419_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368035:exon_160793297_160793586:LY9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 160808796 G/A 1 5 7 12 2.36467283091945 3.68945803671276 -1.32478520579331 A:G G A 10 0.527065433816109 0.566621218006073 ENSG00000122223:ENST00000368034:exon_160808729_160808839:CD244;ENSG00000122223:ENST00000368033:exon_160808729_160808839:CD244;ENSG00000122223:ENST00000492063:exon_160808729_160808839:CD244;ENSG00000122223:ENST00000322302:exon_160808729_160808839:CD244;ENSG00000122223:ENST00000481677:exon_160808610_160808955:CD244;ENSG00000122223:ENST00000368032:exon_160808729_160808839:CD244 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 161013121 C/T 1 24 15 39 11.3504295884134 7.90598150724164 3.44444808117175 T:C C T 10 0.527065433816109 0.33619587613068 ENSG00000158773:ENST00000368020:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000368021:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000442467:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000435396:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000368019:exon_161013058_161013149:USF1;ENSG00000158773:ENST00000473969:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000531842:exon_161013058_161013132:USF1;ENSG00000158773:ENST00000496363:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000491629:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000534633:exon_161013043_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000529476:exon_161013058_161013150:USF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 161017445 A/C 1 140 135 275 66.2108392657447 71.1538335651747 -4.94299429942998 A:C:G A C 10 0.527065433816109 0.58685565463829 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161016738_161018145:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 161017556 C/T 1 186 139 325 87.9658293102037 73.2620953004392 14.7037340097646 T:C C T 10 0.527065433816109 0.107231400842036 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161016738_161018145:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 161019040 G/C 1 120 103 223 56.7521479420669 54.2877396830592 2.46440825900768 T:C:G G C 10 0.527065433816109 0.788582820303534 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161018779_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368017:exon_161018962_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000490279:exon_161018580_161019124:ARHGAP30 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 161088583 T/G 1 10 12 22 4.72934566183891 6.32478520579331 -1.5954395439544 T:G T G 10 0.527065433816109 0.528175996250381 ENSG00000158793:ENST00000368009:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000392190:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000453609:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000486962:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000492411:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000368008:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000478277:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000496861:exon_161088010_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000491497:exon_161088171_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000485594:exon_161088576_161088671:NIT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 161094190 A/G 1 18 17 35 8.51282219131004 8.96011237487385 -0.447290183563815 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000158793:ENST00000368008:exon_161093931_161095235:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000479728:exon_161093931_161094601:NIT1;ENSG00000158796:ENST00000368006:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000392188:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000458050:exon_161094130_161094252:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000368005:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000464113:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000473679:exon_161094130_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000490843:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000463227:exon_161093928_161094316:DEDD HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 161145005 C/T 1 23 19 42 10.8774950222295 10.0142432425061 0.86325177972342 T:C C T 10 0.527065433816109 0.87758689264439 ENSG00000158850:ENST00000319769:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000470882:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000407555:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000310413:exon_161144924_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000367998:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000367997:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000466504:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000465740:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000493164:exon_161144697_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000496313:exon_161144785_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000487004:exon_161144842_161145018:B4GALT3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 161172233 C/A 1 52 35 87 24.5925974415623 18.4472901835638 6.14530725799851 A:C C A 10 0.527065433816109 0.198705693742733 ENSG00000158864:ENST00000479948:exon_161171937_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000496133:exon_161171937_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000367993:exon_161171937_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000496553:exon_161171836_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000467295:exon_161172139_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000475570:exon_161172162_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000478866:exon_161172166_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000392179:exon_161172169_161172270:NDUFS2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 163313568 A/C 1 6 6 12 2.83760739710335 3.16239260289665 -0.324785205793308 A:C A C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000143228:ENST00000524800:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000367900:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000271452:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000497990:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527439:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527120:exon_163313523_163313613:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000531529:exon_163313523_163313605:NUF2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 165648710 G/A 1 17 17 34 8.03988762512615 8.96011237487385 -0.920224749747707 A:G G A 10 0.527065433816109 0.86398633692205 ENSG00000143149:ENST00000354775:exon_165648679_165648819:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000491436:exon_165648679_165648819:ALDH9A1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 165652273 A/G 1 4 11 15 1.89173826473556 5.7977197719772 -3.90598150724164 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0669719709120964 ENSG00000143149:ENST00000354775:exon_165652218_165652347:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000461664:exon_165652218_165652347:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000471457:exon_165652062_165652347:ALDH9A1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 166818566 A/G 1 9 4 13 4.25641109565502 2.10826173526444 2.14814936039058 A:G A G 10 0.527065433816109 0.276012087147778 ENSG00000143157:ENST00000367876:exon_166818175_166819660:POGK;ENSG00000143157:ENST00000367875:exon_166818175_166823710:POGK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 166826773 C/T 1 12 8 20 5.67521479420669 4.21652347052887 1.45869132367782 T:C C T 10 0.527065433816109 0.65554767387655 ENSG00000152382:ENST00000467021:exon_166825747_166826956:TADA1;ENSG00000152382:ENST00000367874:exon_166825747_166826956:TADA1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 169676486 A/G 1 26 14 40 12.2962987207812 7.37891607342553 4.91738264735564 A:G A G 10 0.527065433816109 0.153412291699272 ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169676483_169676590:SELL;ENSG00000188404:ENST00000463108:exon_169676483_169676590:SELL;ENSG00000188404:ENST00000479657:exon_169676483_169676590:SELL;ENSG00000188404:ENST00000466340:exon_169676483_169676590:SELL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 169823660 C/T 1 12 13 25 5.67521479420669 6.85185063960942 -1.17663584540273 T:C C T 10 0.527065433816109 0.691622871057986 ENSG00000000457:ENST00000367772:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367771:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367770:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000423670:exon_169823652_169824105:SCYL3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 169823718 T/C 1 13 23 36 6.14814936039058 12.1225049777705 -5.97435561737993 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0648456645038685 ENSG00000000457:ENST00000367772:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367771:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367770:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000423670:exon_169823652_169824105:SCYL3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 169951997 C/T 1 6 12 18 2.83760739710335 6.32478520579331 -3.48717780868996 T:C C T 10 0.527065433816109 0.154794984631189 ENSG00000075945:ENST00000361580:exon_169951843_169952008:KIFAP3;ENSG00000075945:ENST00000367765:exon_169951843_169952008:KIFAP3;ENSG00000075945:ENST00000367767:exon_169951843_169952008:KIFAP3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 172410814 C/T 1 43 22 65 20.3361863459073 11.5954395439544 8.74074680195291 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0342371839782547 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 174969271 C/T 1 68 59 127 32.1595505005046 31.0968605951504 1.06268990535415 T:C C T 10 0.527065433816109 0.85949369992783 ENSG00000116161:ENST00000426793:exon_174969225_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000367679:exon_174968869_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000483307:exon_174969081_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000473925:exon_174969091_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000450101:exon_174969204_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000392063:exon_174969204_174969331:CACYBP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 179310262 C/T 1 8 6 14 3.78347652947113 3.16239260289665 0.621083926574474 T:C C T 10 0.527065433816109 0.794786264772641 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179310163_179310445:SOAT1;ENSG00000057252:ENST00000426956:exon_179310163_179310445:SOAT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 180080290 T/A 1 9 8 17 4.25641109565502 4.21652347052887 0.0398876251261466 A:T T A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000135837:ENST00000367607:exon_180080132_180084015:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000419991:exon_180080132_180084014:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000429851:exon_180080132_180082515:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000490141:exon_180080132_180080327:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000417046:exon_180080132_180080330:CEP350 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 180080313 C/T 1 8 11 19 3.78347652947113 5.7977197719772 -2.01424324250607 T:C C T 10 0.527065433816109 0.369297985076747 ENSG00000135837:ENST00000367607:exon_180080132_180084015:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000419991:exon_180080132_180084014:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000429851:exon_180080132_180082515:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000490141:exon_180080132_180080327:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000417046:exon_180080132_180080330:CEP350 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 180165718 C/T 1 25 19 44 11.8233641545973 10.0142432425061 1.8091209120912 T:C C T 10 0.527065433816109 0.651788664604569 ENSG00000116260:ENST00000392029:exon_180165397_180165734:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367602:exon_180165397_180173165:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367600:exon_180165397_180165734:QSOX1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 180953853 A/G 1 9 8 17 4.25641109565502 4.21652347052887 0.0398876251261466 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000135823:ENST00000258301:exon_180953813_180953907:STX6;ENSG00000135823:ENST00000469135:exon_180953813_180953907:STX6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 182356399 A/G 1 8 7 15 3.78347652947113 3.68945803671276 0.0940184927583645 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000135821:ENST00000331872:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000417584:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000311223:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000435013:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000339526:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000491322:exon_182352029_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000484996:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000489818:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000475808:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000480604:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000462444:exon_182355910_182356427:GLUL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 182844020 C/T 1 25 19 44 11.8233641545973 10.0142432425061 1.8091209120912 T:C C T 10 0.527065433816109 0.651788664604569 ENSG00000135829:ENST00000367549:exon_182843989_182844089:DHX9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 182993133 C/T 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 T:C C T 10 0.527065433816109 0.757490641773051 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_182992597_182993269:LAMC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 183094547 T/C 1 10 1 11 4.72934566183891 0.527065433816109 4.2022802280228 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0129888667495459 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183094532_183094685:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000466964:exon_183094323_183094685:LAMC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 183105534 T/C 1 18 10 28 8.51282219131004 5.27065433816109 3.24216785314895 T:C T C 10 0.527065433816109 0.258318455384860 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183105521_183105720:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000495918:exon_183105521_183105720:LAMC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 183105705 G/A 1 14 15 29 6.62108392657447 7.90598150724164 -1.28489758066716 A:G G A 10 0.527065433816109 0.711321912285436 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183105521_183105720:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000495918:exon_183105521_183105720:LAMC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 184764681 G/A 1 14 12 26 6.62108392657447 6.32478520579331 0.296298720781166 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000135842:ENST00000367511:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000392012:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000487074:exon_184763252_184765231:FAM129A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 184764824 C/T 1 13 3 16 6.14814936039058 1.58119630144833 4.56695305894226 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0242272766688289 ENSG00000135842:ENST00000367511:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000392012:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000487074:exon_184763252_184765231:FAM129A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 184765072 A/G 1 14 3 17 6.62108392657447 1.58119630144833 5.03988762512615 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0148820665879415 ENSG00000135842:ENST00000367511:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000392012:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000487074:exon_184763252_184765231:FAM129A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 197070442 G/T 1 8 5 13 3.78347652947113 2.63532716908055 1.14814936039058 T:G G T 10 0.527065433816109 0.588366380954527 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000445725:exon_197069561_197070645:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 200522566 G/C 1 13 9 22 6.14814936039058 4.74358890434498 1.4045604560456 C:G G C 10 0.527065433816109 0.670793133404155 ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200520628_200522895:KIF14 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 201437477 A/T 1 12 13 25 5.67521479420669 6.85185063960942 -1.17663584540273 A:T A T 10 0.527065433816109 0.691622871057986 ENSG00000174307:ENST00000367311:exon_201437469_201438312:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000485436:exon_201437473_201437709:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000367309:exon_201437469_201438076:PHLDA3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 201969082 G/A 1 19 30 49 8.98575675749393 15.8119630144833 -6.82620625698934 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0621287701777836 ENSG00000176393:ENST00000481780:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492587:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000447312:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000478617:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492849:exon_201969030_201969143:RNPEP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 201973565 G/A 1 52 50 102 24.5925974415623 26.3532716908055 -1.76067424924312 A:G G A 10 0.527065433816109 0.766470231591517 ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000479531:exon_201973482_201973624:RNPEP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 202304868 T/C 1 10 17 27 4.72934566183891 8.96011237487385 -4.23076671303494 T:C T C 10 0.527065433816109 0.123454818791915 ENSG00000077152:ENST00000367274:exon_202304774_202304946:UBE2T;ENSG00000077152:ENST00000487227:exon_202304774_202304946:UBE2T;ENSG00000077152:ENST00000460852:exon_202304774_202304946:UBE2T HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 202715284 G/A 1 11 5 16 5.2022802280228 2.63532716908055 2.56695305894226 A:G G A 10 0.527065433816109 0.220807585221878 ENSG00000117139:ENST00000367265:exon_202715270_202715451:KDM5B;ENSG00000117139:ENST00000367264:exon_202715270_202715451:KDM5B;ENSG00000117139:ENST00000235790:exon_202715270_202715451:KDM5B;ENSG00000117139:ENST00000498276:exon_202715270_202715723:KDM5B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 204378775 T/C 1 7 6 13 3.31054196328724 3.16239260289665 0.148149360390583 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000158615:ENST00000367188:exon_204378620_204380919:PPP1R15B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 205052939 G/A 1 6 3 9 2.83760739710335 1.58119630144833 1.25641109565502 A:G G A 10 0.527065433816109 0.513555929047552 ENSG00000174529:ENST00000367167:exon_205052258_205053588:TMEM81 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 207087435 C/T 1 109 95 204 51.5498677140441 50.0712162125304 1.47865150151375 T:C C T 10 0.527065433816109 0.888522105136485 ENSG00000162894:ENST00000420007:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000367091:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000463473:exon_207087207_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000525793:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000529560:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000533312:exon_207086977_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000530505:exon_207087146_207087439:FAIM3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 207653364 A/G 1 24 38 62 11.3504295884134 20.0284864850121 -8.67805689659876 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0303865030033934 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207653323_207653398:CR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 207653395 C/A 1 33 25 58 15.6068406840684 13.1766358454027 2.43020483866568 A:C C A 10 0.527065433816109 0.599389178257391 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207653323_207653398:CR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 209950681 T/C 1 10 8 18 4.72934566183891 4.21652347052887 0.512822191310037 T:C:G T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 209950760 C/G 1 46 55 101 21.754990044459 28.988598859886 -7.23360881542701 C:G C G 10 0.527065433816109 0.163206407306981 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367023:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000474496:exon_209950697_209950766:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000477431:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000488702:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 212619339 T/C 1 96 98 194 45.4017183536535 51.6524125139787 -6.25069416032515 T:C T C 10 0.527065433816109 0.388546670303641 ENSG00000117691:ENST00000366988:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000479589:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000473900:exon_212619172_212619714:NENF HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 212911836 T/C 1 48 37 85 22.7008591768268 19.501421051196 3.19943812563073 T:C T C 10 0.527065433816109 0.515838138071085 ENSG00000117697:ENST00000366977:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366975:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000422588:exon_212910933_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366976:exon_212911825_212912028:NSL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 213068595 C/T 1 13 9 22 6.14814936039058 4.74358890434498 1.4045604560456 T:C C T 10 0.527065433816109 0.670793133404155 ENSG00000162769:ENST00000366971:exon_213068558_213072705:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000419102:exon_213068558_213068676:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000483790:exon_213068558_213068736:FLVCR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 215793834 G/A 1 9 9 18 4.25641109565502 4.74358890434498 -0.487177808689962 A:G G A 10 0.527065433816109 0.81881957561072 ENSG00000136636:ENST00000259154:exon_215793399_215795073:KCTD3;ENSG00000136636:ENST00000444044:exon_215793399_215795147:KCTD3;ENSG00000136636:ENST00000495537:exon_215793399_215795073:KCTD3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 218478411 G/C 1 43 42 85 20.3361863459073 22.1367482202766 -1.80056187436927 C:G G C 10 0.527065433816109 0.74491033142616 ENSG00000067533:ENST00000366932:exon_218478370_218478467:RRP15 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 220326637 G/A 1 6 11 17 2.83760739710335 5.7977197719772 -2.96011237487385 A:G G A 10 0.527065433816109 0.223637867238073 ENSG00000118873:ENST00000358951:exon_220326527_220326748:RAB3GAP2;ENSG00000118873:ENST00000491005:exon_220326527_220326748:RAB3GAP2;ENSG00000118873:ENST00000474966:exon_220326527_220327064:RAB3GAP2;ENSG00000118873:ENST00000491305:exon_220326527_220326748:RAB3GAP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 222802376 A/G 1 5 5 10 2.36467283091945 2.63532716908055 -0.270654338161091 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000470521:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222801816_222803731:MIA3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 222802803 T/G 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 T:G T G 10 0.527065433816109 0.160556933333404 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000470521:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222801816_222803731:MIA3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 222803204 A/G 1 6 11 17 2.83760739710335 5.7977197719772 -2.96011237487385 A:G A G 10 0.527065433816109 0.223637867238073 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000470521:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222801816_222803731:MIA3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 225611661 C/T 1 10 8 18 4.72934566183891 4.21652347052887 0.512822191310037 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000425080:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000421383:exon_225611623_225611791:LBR HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 226923264 G/A 1 11 17 28 5.2022802280228 8.96011237487385 -3.75783214685105 A:G G A 10 0.527065433816109 0.185940056269729 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 226923687 A/G 1 13 12 25 6.14814936039058 6.32478520579331 -0.176635845402726 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 226923938 A/C 1 5 8 13 2.36467283091945 4.21652347052887 -1.85185063960942 A:C A C 10 0.527065433816109 0.407023665875808 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 227077809 C/T 1 6 8 14 2.83760739710335 4.21652347052887 -1.37891607342553 T:C C T 10 0.527065433816109 0.59467204210446 ENSG00000143801:ENST00000366783:exon_227077736_227077834:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000422240:exon_227077736_227077834:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000460775:exon_227077736_227077834:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000366782:exon_227077736_227077834:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000391872:exon_227077736_227077834:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000496965:exon_227077736_227077834:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000472139:exon_227077736_227077834:PSEN2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 227170708 C/T 1 13 19 32 6.14814936039058 10.0142432425061 -3.86609388211549 T:C C T 10 0.527065433816109 0.215046593941621 ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227170595_227170735:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227170595_227170735:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227170595_227170735:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366776:exon_227170595_227170735:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000478406:exon_227170595_227171936:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227170595_227170735:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366775:exon_227170595_227170735:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000442168:exon_227170595_227170735:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227170595_227170735:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227170595_227170735:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000485462:exon_227170595_227170735:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000479852:exon_227170708_227170735:ADCK3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 228289080 G/A 1 25 29 54 11.8233641545973 15.2848975806672 -3.46153342606989 A:T:G G A 10 0.527065433816109 0.413784672599997 ENSG00000143793:ENST00000469781:exon_228289040_228290261:C1orf35;ENSG00000143793:ENST00000272139:exon_228289040_228289174:C1orf35;ENSG00000143793:ENST00000485896:exon_228289040_228289174:C1orf35;ENSG00000143793:ENST00000472617:exon_228289040_228289174:C1orf35 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 229730452 G/A 1 14 5 19 6.62108392657447 2.63532716908055 3.98575675749393 A:G G A 10 0.527065433816109 0.105309144964889 ENSG00000135801:ENST00000366676:exon_229728858_229730841:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000258281:exon_229728868_229730841:TAF5L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 229738170 T/G 1 12 16 28 5.67521479420669 8.43304694105774 -2.75783214685105 T:G T G 10 0.527065433816109 0.345892538884562 ENSG00000135801:ENST00000366676:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000258281:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000366675:exon_229734941_229738666:TAF5L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 229772693 T/G 1 4 13 17 1.89173826473556 6.85185063960942 -4.96011237487385 T:G T G 10 0.527065433816109 0.0257575567814497 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 229790048 A/G 1 10 7 17 4.72934566183891 3.68945803671276 1.03988762512615 A:G A G 10 0.527065433816109 0.637665492029096 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229789996_229790135:URB2;ENSG00000135763:ENST00000434387:exon_229789996_229790135:URB2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 231042732 T/A 1 21 13 34 9.93162588986171 6.85185063960942 3.07977525025229 A:T:C T A 10 0.527065433816109 0.308163033725043 ENSG00000143643:ENST00000366661:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000366662:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000414259:exon_231041990_231042765:TTC13 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 231377081 C/T 1 8 1 9 3.78347652947113 0.527065433816109 3.25641109565502 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0415432498690979 ENSG00000116906:ENST00000366646:exon_231376919_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000436239:exon_231376953_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000366647:exon_231376956_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000416000:exon_231376962_231377202:GNPAT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 231401902 G/A 1 13 10 23 6.14814936039058 5.27065433816109 0.877495022229492 A:G G A 10 0.527065433816109 0.835491706691073 ENSG00000116906:ENST00000366646:exon_231401760_231401911:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000366647:exon_231401760_231401911:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000416000:exon_231401760_231401911:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000492459:exon_231401880_231401911:GNPAT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 231408091 A/G 1 16 21 37 7.56695305894226 11.0683741101383 -3.50142105119603 A:G A G 10 0.527065433816109 0.254752916438468 ENSG00000116906:ENST00000366646:exon_231408058_231408137:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000366647:exon_231408058_231408137:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000416000:exon_231408058_231408137:GNPAT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 234745009 A/G 0 0 73 73 0 38.475776668576 -38.475776668576 T:G A G 10 0.527065433816109 1.82170133234401e-24 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234744241_234745271:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234744193_234745271:IRF2BP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 235505379 T/C 1 17 19 36 8.03988762512615 10.0142432425061 -1.97435561737993 T:C T C 10 0.527065433816109 0.617192754782756 ENSG00000152904:ENST00000488594:exon_235505326_235506408:GGPS1;ENSG00000152904:ENST00000471812:exon_235505326_235505911:GGPS1;ENSG00000152904:ENST00000358966:exon_235505326_235507840:GGPS1;ENSG00000152904:ENST00000451121:exon_235505326_235507840:GGPS1;ENSG00000152904:ENST00000282841:exon_235505326_235507847:GGPS1;ENSG00000152904:ENST00000391855:exon_235505326_235506453:GGPS1;ENSG00000152904:ENST00000476121:exon_235505326_235506380:GGPS1;ENSG00000152904:ENST00000497327:exon_235505326_235505874:GGPS1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 236700807 T/A 1 15 9 24 7.09401849275836 4.74358890434498 2.35042958841338 A:T T A 10 0.527065433816109 0.415272769718452 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 236700823 T/C 1 15 10 25 7.09401849275836 5.27065433816109 1.82336415459727 T:C T C 10 0.527065433816109 0.550103280555877 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 236700857 C/T 1 12 2 14 5.67521479420669 1.05413086763222 4.62108392657447 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0147159799087008 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 236702209 C/T 1 9 2 11 4.25641109565502 1.05413086763222 3.2022802280228 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0696872224921074 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 236702210 A/G 1 9 2 11 4.25641109565502 1.05413086763222 3.2022802280228 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0696872224921074 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 236702374 G/A 1 9 8 17 4.25641109565502 4.21652347052887 0.0398876251261466 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236702260_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 236706862 G/C 1 13 15 28 6.14814936039058 7.90598150724164 -1.75783214685105 C:G G C 10 0.527065433816109 0.572286226612737 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236706842_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236706327_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525789:exon_236706596_236706948:LGALS8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 236711323 T/C 1 33 42 75 15.6068406840684 22.1367482202766 -6.52990753620818 T:C T C 10 0.527065433816109 0.134441687621822 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236711312_236711581:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236711312_236711583:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236711312_236712563:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236711312_236714310:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236711312_236712302:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236711312_236712096:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236711312_236711580:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236711312_236711595:LGALS8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 236716959 C/T 1 9 20 29 4.25641109565502 10.5413086763222 -6.28489758066716 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0244650521509432 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236716881_236717039:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236716881_236717039:HEATR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 236717926 T/C 1 25 19 44 11.8233641545973 10.0142432425061 1.8091209120912 T:C T C 10 0.527065433816109 0.651788664604569 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236717898_236718052:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236717898_236718052:HEATR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 236718620 T/C 1 35 30 65 16.5527098164362 15.8119630144833 0.740746801952913 T:C T C 10 0.527065433816109 0.90151482793581 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236718596_236718764:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236718596_236718764:HEATR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 236719193 A/G 1 36 28 64 17.0256443826201 14.7578321468511 2.26781223576902 A:T:G A G 10 0.527065433816109 0.617630603233185 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 236721610 G/A 1 17 32 49 8.03988762512615 16.8660938821155 -8.82620625698934 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0143174282933401 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 236721660 T/C 1 7 15 22 3.31054196328724 7.90598150724164 -4.5954395439544 T:C T C 10 0.527065433816109 0.05593119353183 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 236758887 T/C 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 T:C T C 10 0.527065433816109 0.488810537661758 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236758840_236758973:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236758840_236758973:HEATR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 241667523 C/T 1 99 64 163 46.8205220522052 33.732187764231 13.0883342879742 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0414759336662758 ENSG00000091483:ENST00000366560:exon_241667342_241667545:FH HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 242030151 A/G 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 A:G A G 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242030132_242030357:EXO1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 242042545 A/G 1 8 4 12 3.78347652947113 2.10826173526444 1.67521479420669 A:G A G 10 0.527065433816109 0.396148353996528 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242042342_242042645:EXO1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 245851609 C/G 1 11 6 17 5.2022802280228 3.16239260289665 2.03988762512615 C:G C G 10 0.527065433816109 0.344390478204234 ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245848707_245852109:KIF26B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 246021941 T/C 1 9 10 19 4.25641109565502 5.27065433816109 -1.01424324250607 T:C T C 10 0.527065433816109 0.654162232160302 ENSG00000185420:ENST00000366516:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000366517:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000490107:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000483072:exon_246021798_246021949:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000470510:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000388985:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000493441:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000488153:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000492487:exon_246021800_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000391836:exon_246021864_246021972:SMYD3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 246707858 A/G 1 17 25 42 8.03988762512615 13.1766358454027 -5.13674822027658 A:G A G 10 0.527065433816109 0.123532870976711 ENSG00000162851:ENST00000366514:exon_246707823_246707983:TFB2M HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 249142169 C/T 1 26 26 52 12.2962987207812 13.7037012792188 -1.40740255843767 T:C C T 10 0.527065433816109 0.78155462222789 ENSG00000171161:ENST00000306562:exon_249141251_249143716:ZNF672;ENSG00000171161:ENST00000394454:exon_249141474_249142832:ZNF672 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 1 249150116 G/C 1 15 14 29 7.09401849275836 7.37891607342553 -0.284897580667162 C:G G C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000171163:ENST00000463519:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000306601:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000427146:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000366471:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000533927:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000476503:exon_249149924_249150142:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000366469:exon_249149924_249150138:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000477070:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000412341:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000451251:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000315492:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000470787:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000474351:exon_249149924_249150285:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000478107:exon_249149924_249150142:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000491971:exon_249149794_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000496411:exon_249149927_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000468455:exon_249149981_249150142:ZNF692 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 1046712 G/A 1 39 29 68 18.4444480811717 15.2848975806672 3.15955050050458 A:G G A 10 0.527065433816109 0.468180370582603 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1046617_1046808:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000491635:exon_1046617_1046808:GTPBP4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 3150973 C/T 1 47 31 78 22.2279246106429 16.3390284482994 5.8888961623435 T:C C T 10 0.527065433816109 0.21218442561445 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000468050:exon_3150893_3150985:PFKP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 3172121 C/T 1 54 60 114 25.5384665739301 31.6239260289665 -6.08545945503643 T:C C T 10 0.527065433816109 0.261592292585699 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3172011_3172133:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3171199_3172175:PFKP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 3180227 T/C 1 84 73 157 39.7265035594468 38.475776668576 1.25072689087088 T:C T C 10 0.527065433816109 0.873184923133833 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 3180298 C/T 1 47 49 96 22.2279246106429 25.8262062569893 -3.59828164634647 T:C C T 10 0.527065433816109 0.475818114926959 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 3180316 T/C 1 56 50 106 26.4843357062979 26.3532716908055 0.131064015492441 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 3189380 C/T 1 17 13 30 8.03988762512615 6.85185063960942 1.18803698551673 T:C C T 10 0.527065433816109 0.717319151421924 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451454:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3189342_3189442:PITRM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 3190265 A/G 1 7 3 10 3.31054196328724 1.58119630144833 1.72934566183891 A:G A G 10 0.527065433816109 0.350932787230552 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3189764_3191591:PITRM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 3200292 G/A 1 9 12 21 4.25641109565502 6.32478520579331 -2.06837411013829 A:G G A 10 0.527065433816109 0.390094196298263 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000430362:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3200232_3200345:PITRM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 3202065 T/C 1 10 12 22 4.72934566183891 6.32478520579331 -1.5954395439544 T:C T C 10 0.527065433816109 0.528175996250381 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3202040_3202128:PITRM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 3206027 A/G 1 4 15 19 1.89173826473556 7.90598150724164 -6.01424324250607 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0094497196601332 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3205917_3206073:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000488065:exon_3205324_3206077:PITRM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 3207705 G/C 1 5 9 14 2.36467283091945 4.74358890434498 -2.37891607342553 C:G G C 10 0.527065433816109 0.284872281969498 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3207605_3207719:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3207605_3207719:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3207605_3207719:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3207605_3207719:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3207605_3207719:PITRM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 5808086 G/A 1 266 221 487 125.800594604915 116.48146087336 9.3191337315549 A:T:G G A 10 0.527065433816109 0.414115154029376 ENSG00000057608:ENST00000380191:exon_5807186_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000435969:exon_5807186_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380131:exon_5807187_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380153:exon_5807187_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000479928:exon_5807192_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000447751:exon_5807812_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380181:exon_5807917_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380132:exon_5807917_5808115:GDI2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 5925971 C/A 1 8 7 15 3.78347652947113 3.68945803671276 0.0940184927583645 A:C C A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000134461:ENST00000380094:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000463862:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000380092:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000437663:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000191063:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000492368:exon_5925932_5926040:ANKRD16 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 6002368 T/G 1 5 7 12 2.36467283091945 3.68945803671276 -1.32478520579331 T:G T G 10 0.527065433816109 0.566621218006073 ENSG00000134470:ENST00000435171:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397251:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379977:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397253:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000425111:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397248:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000414280:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000534292:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000319465:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532948:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379972:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000528354:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000447291:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379974:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532039:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397250:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379971:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000530685:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397255:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000525219:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397246:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000429135:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000453922:exon_6002358_6002530:IL15RA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 8006798 A/G 1 15 12 27 7.09401849275836 6.32478520579331 0.769233286965056 A:G A G 10 0.527065433816109 0.848360844335184 ENSG00000165632:ENST00000344293:exon_8005883_8007705:TAF3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 11299735 A/T 1 10 1 11 4.72934566183891 0.527065433816109 4.2022802280228 A:T A T 10 0.527065433816109 0.0129888667495459 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11299701_11299835:CELF2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 11356160 C/T 1 9 6 15 4.25641109565502 3.16239260289665 1.09401849275836 T:C C T 10 0.527065433816109 0.615224246448703 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11356102_11356233:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11356102_11356221:CELF2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 11504752 T/C 1 13 4 17 6.14814936039058 2.10826173526444 4.03988762512615 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0545992094317132 ENSG00000148429:ENST00000277575:exon_11502509_11505848:USP6NL;ENSG00000148429:ENST00000379237:exon_11502511_11505848:USP6NL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 11805354 A/G 1 10 6 16 4.72934566183891 3.16239260289665 1.56695305894226 A:G A G 10 0.527065433816109 0.465150778014472 ENSG00000134463:ENST00000379215:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000496136:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000428613:exon_11805223_11806069:ECHDC3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 11805357 G/A 1 10 6 16 4.72934566183891 3.16239260289665 1.56695305894226 A:G G A 10 0.527065433816109 0.465150778014472 ENSG00000134463:ENST00000379215:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000496136:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000428613:exon_11805223_11806069:ECHDC3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 12071397 G/A 1 71 61 132 33.5783541990563 32.1509914627826 1.42736273627361 A:C:G G A 10 0.527065433816109 0.861707868613185 ENSG00000151461:ENST00000356352:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000357604:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000379172:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313999:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000397053:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313977:exon_12070744_12071523:UPF2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 12131081 T/G 1 5 7 12 2.36467283091945 3.68945803671276 -1.32478520579331 T:G T G 10 0.527065433816109 0.566621218006073 ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12130985_12131254:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000437298:exon_12130985_12131254:DHTKD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 12143105 C/G 1 7 6 13 3.31054196328724 3.16239260289665 0.148149360390583 C:G C G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12143041_12143180:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000448829:exon_12143041_12143180:DHTKD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 12292344 A/G 1 134 131 265 63.3732318686414 69.0455718299103 -5.6723399612689 A:G A G 10 0.527065433816109 0.498959003230254 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 13151224 G/A 1 22 30 52 10.4045604560456 15.8119630144833 -5.40740255843767 A:G G A 10 0.527065433816109 0.164378247730046 ENSG00000123240:ENST00000263036:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378764:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000396951:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000487935:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000482140:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378757:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000430081:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378752:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378748:exon_13151097_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378747:exon_13151112_13151288:OPTN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 13320338 C/T 1 10 5 15 4.72934566183891 2.63532716908055 2.09401849275836 T:C C T 10 0.527065433816109 0.312436282519101 ENSG00000107537:ENST00000396913:exon_13319796_13320354:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000263038:exon_13319800_13320354:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000378659:exon_13319800_13320354:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000437577:exon_13319800_13320354:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000396920:exon_13319843_13320354:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000534344:exon_13319843_13320354:PHYH HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 13658436 G/A 1 15 12 27 7.09401849275836 6.32478520579331 0.769233286965056 A:G G A 10 0.527065433816109 0.848360844335184 ENSG00000165630:ENST00000378572:exon_13658398_13658553:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000378544:exon_13658398_13658553:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000298451:exon_13658398_13658553:PRPF18 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 13708245 G/A 1 16 14 30 7.56695305894226 7.37891607342553 0.188036985516729 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000151474:ENST00000358621:exon_13708097_13708325:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000378502:exon_13708097_13708325:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000357447:exon_13708097_13708325:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000378503:exon_13708097_13708325:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000264546:exon_13708224_13708325:FRMD4A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 15145361 G/A 1 39 42 81 18.4444480811717 22.1367482202766 -3.69230013910483 A:G G A 10 0.527065433816109 0.437138637421536 ENSG00000152464:ENST00000378203:exon_15145304_15146250:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378201:exon_15145304_15145714:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378202:exon_15145304_15146254:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378197:exon_15145304_15146256:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000441850:exon_15145304_15145819:RPP38;ENSG00000152465:ENST00000466201:exon_15144583_15145682:NMT2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 15145855 C/G 1 64 52 116 30.267812235769 27.4074025584377 2.86040967733135 C:G C G 10 0.527065433816109 0.642331979564595 ENSG00000152464:ENST00000378203:exon_15145304_15146250:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378202:exon_15145304_15146254:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378197:exon_15145304_15146256:RPP38 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 16796919 C/A 1 14 10 24 6.62108392657447 5.27065433816109 1.35042958841338 A:C C A 10 0.527065433816109 0.68432289568664 ENSG00000148484:ENST00000345264:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377921:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000396726:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000464074:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377911:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377903:exon_16796870_16796988:RSU1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 22839628 T/C 1 13 6 19 6.14814936039058 3.16239260289665 2.98575675749393 T:C T C 10 0.527065433816109 0.250133651156978 ENSG00000150867:ENST00000323883:exon_22839588_22839701:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376573:exon_22839588_22839701:PIP4K2A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 23003226 A/G 1 10 20 30 4.72934566183891 10.5413086763222 -5.81196301448327 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0430163986130637 ENSG00000150867:ENST00000323883:exon_23003112_23003503:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376573:exon_23003112_23003484:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376565:exon_23003112_23003503:PIP4K2A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 24813454 G/A 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 A:G G A 10 0.527065433816109 0.160556933333404 ENSG00000120549:ENST00000376462:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376456:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376452:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000447159:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000458595:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000323059:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000450158:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000442879:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376454:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000430453:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000438429:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000307544:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000396445:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376451:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000396446:exon_24813252_24813693:KIAA1217 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 24908686 T/C 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000107863:ENST00000396432:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000320481:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000486374:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000376410:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000445703:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000446003:exon_24908402_24910298:ARHGAP21 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 25312689 A/G 1 3 12 15 1.41880369855167 6.32478520579331 -4.90598150724164 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0169647338688556 ENSG00000185875:ENST00000524413:exon_25312105_25315593:THNSL1;ENSG00000185875:ENST00000376356:exon_25312105_25315593:THNSL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 25313818 C/T 1 13 16 29 6.14814936039058 8.43304694105774 -2.28489758066716 T:C C T 10 0.527065433816109 0.458714620526297 ENSG00000185875:ENST00000524413:exon_25312105_25315593:THNSL1;ENSG00000185875:ENST00000376356:exon_25312105_25315593:THNSL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 27303605 A/T 1 1 9 10 0.472934566183891 4.74358890434498 -4.27065433816109 A:T A T 10 0.527065433816109 0.00845260157850117 ENSG00000107890:ENST00000445828:exon_27303423_27303608:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27303423_27303640:ANKRD26 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 27400861 G/A 1 101 114 215 47.766391184573 60.0854594550364 -12.3190682704634 A:G G A 10 0.527065433816109 0.101049371019807 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27399383_27401049:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27399383_27401049:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27399383_27401049:YME1L1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 27434483 G/A 1 21 16 37 9.93162588986171 8.43304694105774 1.49857894880397 A:G G A 10 0.527065433816109 0.742468766164557 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27434348_27436597:YME1L1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 27462061 G/A 1 10 19 29 4.72934566183891 10.0142432425061 -5.28489758066716 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0619173766904125 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27462050_27462188:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27462050_27462188:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27462047_27462188:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27462047_27462188:MASTL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 32635834 G/A 1 16 7 23 7.56695305894226 3.68945803671276 3.87749502222949 A:G G A 10 0.527065433816109 0.1427729718521 ENSG00000120616:ENST00000319778:exon_32635691_32636146:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000263062:exon_32635691_32636113:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000480402:exon_32635691_32636146:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000469059:exon_32635691_32636049:EPC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 34620220 C/T 1 12 17 29 5.67521479420669 8.96011237487385 -3.28489758066716 T:C C T 10 0.527065433816109 0.265505019787144 ENSG00000148498:ENST00000374789:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374788:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000346874:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374794:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000350537:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374790:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000466092:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374776:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374773:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000340077:exon_34620045_34620272:PARD3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 38407519 A/G 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000075407:ENST00000361085:exon_38406318_38411511:ZNF37A;ENSG00000075407:ENST00000351773:exon_38406318_38412276:ZNF37A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 44112214 C/T 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 T:C C T 10 0.527065433816109 0.160556933333404 ENSG00000198298:ENST00000361807:exon_44111739_44113351:ZNF485;ENSG00000198298:ENST00000374437:exon_44111739_44113351:ZNF485;ENSG00000198298:ENST00000374435:exon_44111739_44113351:ZNF485 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 44112763 C/G 1 5 7 12 2.36467283091945 3.68945803671276 -1.32478520579331 C:G C G 10 0.527065433816109 0.566621218006073 ENSG00000198298:ENST00000361807:exon_44111739_44113351:ZNF485;ENSG00000198298:ENST00000374437:exon_44111739_44113351:ZNF485;ENSG00000198298:ENST00000374435:exon_44111739_44113351:ZNF485 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 45473317 C/T 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000165507:ENST00000298295:exon_45471577_45473503:C10orf10;ENSG00000165507:ENST00000432283:exon_45473233_45473478:C10orf10;ENSG00000165507:ENST00000448778:exon_45473227_45473667:C10orf10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 51827763 A/G 1 4 8 12 1.89173826473556 4.21652347052887 -2.32478520579331 A:G A G 10 0.527065433816109 0.248670873824186 ENSG00000099290:ENST00000434114:exon_51827684_51827768:FAM21A;ENSG00000099290:ENST00000282633:exon_51827721_51827768:FAM21A;ENSG00000099290:ENST00000351071:exon_51827721_51827768:FAM21A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 61552774 C/T 1 6 3 9 2.83760739710335 1.58119630144833 1.25641109565502 T:C C T 10 0.527065433816109 0.513555929047552 ENSG00000108091:ENST00000263102:exon_61548521_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000491922:exon_61551510_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000395341:exon_61552735_61552869:CCDC6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 61665886 C/A 1 6 3 9 2.83760739710335 1.58119630144833 1.25641109565502 A:C C A 10 0.527065433816109 0.513555929047552 ENSG00000108091:ENST00000263102:exon_61665880_61666414:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000395341:exon_61665880_61666818:CCDC6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 64564934 C/G 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 C:G C G 10 0.527065433816109 0.488810537661758 ENSG00000181915:ENST00000373783:exon_64564516_64568238:ADO HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 70101417 G/C 1 103 103 206 48.7122603169408 54.2877396830592 -5.57547936611846 C:G G C 10 0.527065433816109 0.443558708815922 ENSG00000096746:ENST00000469172:exon_70101342_70101437:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000441000:exon_70101342_70101437:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000265866:exon_70101342_70101437:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000354695:exon_70101342_70101437:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000481819:exon_70101342_70101437:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000491200:exon_70101342_70101437:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000490442:exon_70100931_70101608:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000478698:exon_70100931_70101608:HNRNPH3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 70482238 G/A 1 11 3 14 5.2022802280228 1.58119630144833 3.62108392657447 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0624001951377552 ENSG00000060339:ENST00000265872:exon_70482212_70482334:CCAR1;ENSG00000060339:ENST00000494903:exon_70482212_70482334:CCAR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 70549579 G/A 1 19 25 44 8.98575675749393 13.1766358454027 -4.1908790879088 A:C:G G A 10 0.527065433816109 0.228563041881665 ENSG00000060339:ENST00000265872:exon_70549467_70549672:CCAR1;ENSG00000060339:ENST00000480627:exon_70549467_70549629:CCAR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 70738629 T/C 1 43 24 67 20.3361863459073 12.6495704115866 7.6866159343207 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0664484115803013 ENSG00000165732:ENST00000354185:exon_70738598_70738732:DDX21 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 71905695 A/G 1 15 7 22 7.09401849275836 3.68945803671276 3.4045604560456 A:G A G 10 0.527065433816109 0.199603075522895 ENSG00000156521:ENST00000287078:exon_71905177_71906342:TYSND1;ENSG00000156521:ENST00000335494:exon_71905177_71906412:TYSND1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 71906150 T/C 1 7 14 21 3.31054196328724 7.37891607342553 -4.06837411013829 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0833995299023928 ENSG00000156521:ENST00000287078:exon_71905177_71906342:TYSND1;ENSG00000156521:ENST00000335494:exon_71905177_71906412:TYSND1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 72179746 C/T 1 11 16 27 5.2022802280228 8.43304694105774 -3.23076671303494 T:C C T 10 0.527065433816109 0.249321234596434 ENSG00000148730:ENST00000373218:exon_72179670_72179855:EIF4EBP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 73521371 C/T 1 12 16 28 5.67521479420669 8.43304694105774 -2.75783214685105 T:C C T 10 0.527065433816109 0.345892538884562 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73521355_73521783:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73521355_73521783:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000481568:exon_73521355_73521701:C10orf54 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 74916135 G/A 1 21 18 39 9.93162588986171 9.48717780868996 0.444448081171748 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000484976:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000453402:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000413026:exon_74916033_74916211:ECD HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 75006804 A/G 1 14 11 25 6.62108392657447 5.7977197719772 0.823364154597274 A:G A G 10 0.527065433816109 0.84228244308015 ENSG00000213551:ENST00000372950:exon_75006768_75008620:DNAJC9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 75148116 A/G 1 46 42 88 21.754990044459 22.1367482202766 -0.381758175817595 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000138279:ENST00000372921:exon_75148070_75148172:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000372919:exon_75148070_75148172:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000492380:exon_75148070_75148172:ANXA7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 75558867 G/A 1 11 16 27 5.2022802280228 8.43304694105774 -3.23076671303494 A:G G A 10 0.527065433816109 0.249321234596434 ENSG00000214655:ENST00000412131:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000436194:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000414462:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000398706:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000433366:exon_75558760_75559669:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000492395:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000412198:exon_75558760_75559248:KIAA0913 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 75562161 C/A 1 29 17 46 13.7151024193328 8.96011237487385 4.75499004445899 A:C C A 10 0.527065433816109 0.184527054779399 ENSG00000166507:ENST00000309979:exon_75561669_75562334:NDST2;ENSG00000166507:ENST00000299641:exon_75561669_75562334:NDST2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 75574935 G/T 1 8 4 12 3.78347652947113 2.10826173526444 1.67521479420669 T:G G T 10 0.527065433816109 0.396148353996528 ENSG00000148660:ENST00000322635:exon_75574761_75575005:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000351293:exon_75574761_75575005:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000322680:exon_75574761_75575005:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000423381:exon_75574761_75575005:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000394762:exon_75574761_75575005:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000394763:exon_75574761_75575005:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000433289:exon_75574761_75575005:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000372765:exon_75574761_75575005:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000305762:exon_75574761_75575005:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000441192:exon_75574761_75575005:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000472912:exon_75574761_75575005:CAMK2G HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 75936611 C/T 1 9 3 12 4.25641109565502 1.58119630144833 2.67521479420669 T:C C T 10 0.527065433816109 0.153067812973243 ENSG00000156110:ENST00000372734:exon_75936444_75936644:ADK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 76285163 T/C 1 32 39 71 15.1339061178845 20.5555519188283 -5.42164580094374 T:C T C 10 0.527065433816109 0.234454342388555 ENSG00000156110:ENST00000286621:exon_76285014_76285184:ADK;ENSG00000156110:ENST00000372734:exon_76285014_76285184:ADK;ENSG00000156110:ENST00000467840:exon_76285122_76285184:ADK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 76990646 G/A 1 9 9 18 4.25641109565502 4.74358890434498 -0.487177808689962 A:G G A 10 0.527065433816109 0.81881957561072 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 81841692 G/T 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 T:G G T 10 0.527065433816109 0.757490641773051 ENSG00000133678:ENST00000472622:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372281:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000528687:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372277:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372275:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372274:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000411627:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372273:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000467529:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000463029:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000476173:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000483732:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000463209:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000450179:exon_81841597_81841700:C10orf57 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 81925866 T/C 1 112 96 208 52.9686714125958 50.5982816463465 2.37038976624932 T:C T C 10 0.527065433816109 0.781326973696719 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81925840_81925953:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81925840_81925953:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81925840_81925953:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81925840_81925953:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81925840_81925953:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81925840_81925953:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81925840_81925953:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81925840_81925953:ANXA11 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 88730312 T/C 1 41 23 64 19.3903172135395 12.1225049777705 7.26781223576902 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0793630628080017 ENSG00000148671:ENST00000372013:exon_88730233_88730672:C10orf116;ENSG00000148671:ENST00000372012:exon_88730233_88730487:C10orf116 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 88930249 A/T 1 7 7 14 3.31054196328724 3.68945803671276 -0.378916073425526 A:T A T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000122376:ENST00000298784:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000298786:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000358313:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000342900:exon_88930235_88930429:FAM35A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 90342837 C/G 1 8 7 15 3.78347652947113 3.68945803671276 0.0940184927583645 C:G C G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000184719:ENST00000371947:exon_90342830_90344287:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000437752:exon_90342830_90342947:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000331772:exon_90342830_90342970:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000466945:exon_90342830_90343089:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000481793:exon_90342830_90343087:RNLS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 90767482 A/G 1 27 25 52 12.7692332869651 13.1766358454027 -0.407402558437671 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000026103:ENST00000371875:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355740:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000352159:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000357339:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000494410:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000488877:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000492756:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355279:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000460510:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000477270:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000313771:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000466081:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000371857:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000487314:exon_90767457_90767594:FAS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 91162677 C/T 1 62 49 111 29.3219431034012 25.8262062569893 3.49573684641189 T:C C T 10 0.527065433816109 0.5686550665644 ENSG00000185745:ENST00000371804:exon_91162038_91163745:IFIT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 91497207 A/G 1 17 11 28 8.03988762512615 5.7977197719772 2.24216785314895 A:G A G 10 0.527065433816109 0.45216611994601 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 96098373 C/T 1 7 5 12 3.31054196328724 2.63532716908055 0.675214794206692 T:C C T 10 0.527065433816109 0.778351128206284 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96098365_96098493:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96098365_96098493:NOC3L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 97023630 T/C 1 196 151 347 92.6951749720426 79.5868805062325 13.1082944658102 T:C T C 10 0.527065433816109 0.162465650565532 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_97023621_97023820:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000477757:exon_97023621_97023820:PDLIM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 97990583 A/G 1 65 61 126 30.7407468019529 32.1509914627826 -1.41024466082974 A:G A G 10 0.527065433816109 0.858479196927619 ENSG00000095585:ENST00000413476:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393894:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000428924:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000427367:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000224337:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000371176:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393889:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000467799:exon_97990550_97990590:BLNK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 98380277 C/T 1 14 18 32 6.62108392657447 9.48717780868996 -2.86609388211549 T:C C T 10 0.527065433816109 0.376746667004893 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98380109_98380314:PIK3AP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 98386558 G/A 1 6 6 12 2.83760739710335 3.16239260289665 -0.324785205793308 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98386465_98386662:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98386465_98386662:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98386465_98386662:PIK3AP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 99125949 C/T 1 33 30 63 15.6068406840684 15.8119630144833 -0.20512233041487 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99125647_99125990:RRP12 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 99126249 G/A 1 31 27 58 14.6609715517006 14.2307667130349 0.430204838665675 A:T:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99126203_99126317:RRP12 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 99139475 G/A 1 10 7 17 4.72934566183891 3.68945803671276 1.03988762512615 A:G G A 10 0.527065433816109 0.637665492029096 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99139385_99139527:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99139385_99139527:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99139385_99139527:RRP12 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 99141205 A/G 1 7 2 9 3.31054196328724 1.05413086763222 2.25641109565502 A:G A G 10 0.527065433816109 0.185447766343339 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99141143_99141240:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99141143_99141240:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99141143_99141240:RRP12 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 99155984 G/A 1 7 4 11 3.31054196328724 2.10826173526444 1.2022802280228 A:G G A 10 0.527065433816109 0.555399509917260 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99155975_99156058:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99155975_99156058:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99155975_99156058:RRP12 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 99219885 G/A 1 21 23 44 9.93162588986171 12.1225049777705 -2.1908790879088 A:G G A 10 0.527065433816109 0.547870250177767 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000485400:exon_99219119_99220076:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99219830_99219989:MMS19 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 99220707 C/T 1 8 14 22 3.78347652947113 7.37891607342553 -3.5954395439544 T:C C T 10 0.527065433816109 0.138871874223119 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99220664_99221123:MMS19 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 99229394 G/A 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 A:G G A 10 0.527065433816109 0.488810537661758 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 100183515 G/C 1 11 7 18 5.2022802280228 3.68945803671276 1.51282219131004 C:G G C 10 0.527065433816109 0.638183169005014 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000478087:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000359632:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000470095:exon_100183510_100183644:HPS1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 100190920 G/A 1 20 10 30 9.45869132367782 5.27065433816109 4.18803698551673 A:G G A 10 0.527065433816109 0.145039750225682 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000478087:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000359632:exon_100190888_100191039:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000338546:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000414009:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000480020:exon_100190888_100191048:HPS1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 101639682 G/A 1 18 11 29 8.51282219131004 5.7977197719772 2.71510241933284 A:G G A 10 0.527065433816109 0.355748397679087 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 101639796 G/A 1 33 14 47 15.6068406840684 7.37891607342553 8.22792461064288 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0187679653910883 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 101645498 T/C 1 13 6 19 6.14814936039058 3.16239260289665 2.98575675749393 T:C T C 10 0.527065433816109 0.250133651156978 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101645444_101645623:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101645444_101645623:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101645444_101645623:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101645444_101645623:DNMBP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 101645534 G/A 1 8 2 10 3.78347652947113 1.05413086763222 2.72934566183891 A:G G A 10 0.527065433816109 0.114525614534534 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101645444_101645623:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101645444_101645623:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101645444_101645623:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101645444_101645623:DNMBP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 101715899 G/A 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101714971_101716962:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101714971_101716962:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101714971_101716962:DNMBP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 102006625 G/A 1 8 5 13 3.78347652947113 2.63532716908055 1.14814936039058 A:G G A 10 0.527065433816109 0.588366380954527 ENSG00000095485:ENST00000472872:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000468709:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000354105:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000338048:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000482452:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000370379:exon_102006552_102006668:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000466955:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000496796:exon_102006552_102006692:CWF19L1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 102016044 C/T 1 7 6 13 3.31054196328724 3.16239260289665 0.148149360390583 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000095485:ENST00000472872:exon_102016019_102016233:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000354105:exon_102016019_102016233:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000338048:exon_102016019_102016233:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000496796:exon_102016019_102016233:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000473842:exon_102016019_102016233:CWF19L1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 102046380 T/G 1 25 19 44 11.8233641545973 10.0142432425061 1.8091209120912 T:G T G 10 0.527065433816109 0.651788664604569 ENSG00000196072:ENST00000358848:exon_102046362_102046439:BLOC1S2;ENSG00000196072:ENST00000370372:exon_102046362_102046437:BLOC1S2;ENSG00000196072:ENST00000370376:exon_102046362_102046446:BLOC1S2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 102762256 C/T 1 3 10 13 1.41880369855167 5.27065433816109 -3.85185063960942 T:C C T 10 0.527065433816109 0.048374706262986 ENSG00000107816:ENST00000426584:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000489526:exon_102762254_102762934:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000429732:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000481129:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102759233_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000454422:exon_102762254_102762703:LZTS2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 103298099 G/T 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 T:G G T 10 0.527065433816109 0.488810537661758 ENSG00000166167:ENST00000370187:exon_103298050_103298128:BTRC;ENSG00000166167:ENST00000393441:exon_103298050_103298128:BTRC;ENSG00000166167:ENST00000408038:exon_103298050_103298128:BTRC;ENSG00000166167:ENST00000493877:exon_103298050_103298128:BTRC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 104160959 C/T 1 463 443 906 218.968704143142 233.489987180536 -14.5212830373948 T:C C T 10 0.527065433816109 0.334836275894078 ENSG00000077150:ENST00000454143:exon_104160937_104161088:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000428099:exon_104160937_104161088:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000369966:exon_104160937_104161088:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000336486:exon_104160937_104161088:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000189444:exon_104160937_104161088:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000473400:exon_104160704_104161026:NFKB2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 104161967 T/C 1 7 12 19 3.31054196328724 6.32478520579331 -3.01424324250607 T:C T C 10 0.527065433816109 0.176593061472052 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 104184081 G/A 1 111 87 198 52.4957368464119 45.8546927420015 6.6410441044104 A:G G A 10 0.527065433816109 0.355572746787907 ENSG00000107874:ENST00000369937:exon_104184021_104184151:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000486762:exon_104184021_104184151:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000477994:exon_104183788_104184151:CUEDC2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 104184953 C/G 1 21 28 49 9.93162588986171 14.7578321468511 -4.82620625698934 T:C:G C G 10 0.527065433816109 0.197863822869172 ENSG00000107874:ENST00000369937:exon_104184872_104184955:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000477994:exon_104184872_104184955:CUEDC2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 104572963 T/C 1 9 6 15 4.25641109565502 3.16239260289665 1.09401849275836 T:C T C 10 0.527065433816109 0.615224246448703 ENSG00000166272:ENST00000448841:exon_104572352_104575997:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000369889:exon_104572352_104576021:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000393281:exon_104572352_104576021:C10orf26 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 104849468 G/A 1 43 32 75 20.3361863459073 16.8660938821155 3.47009246379182 A:G G A 10 0.527065433816109 0.488070469167216 ENSG00000076685:ENST00000343289:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000423468:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369871:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000404739:exon_104847774_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369857:exon_104847942_104849665:NT5C2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 104934709 T/C 1 9 2 11 4.25641109565502 1.05413086763222 3.2022802280228 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0696872224921074 ENSG00000076685:ENST00000343289:exon_104934615_104934739:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369871:exon_104934615_104934739:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000404739:exon_104934615_104934739:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369857:exon_104934615_104934739:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000452156:exon_104934615_104934739:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000461461:exon_104934615_104934739:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369853:exon_104934615_104934739:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000470299:exon_104934615_104934739:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000467380:exon_104934615_104934739:NT5C2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 105194086 C/T 1 15 16 31 7.09401849275836 8.43304694105774 -1.33902844829938 T:C C T 10 0.527065433816109 0.720005693406807 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105194005_105194107:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000466959:exon_105194005_105194459:PDCD11 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 105205302 A/C 1 77 53 130 36.4159615961596 27.9344679922538 8.48149360390583 A:C A C 10 0.527065433816109 0.159657171533368 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105205135_105206049:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000478543:exon_105205135_105205481:PDCD11 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 105206874 T/C 1 16 14 30 7.56695305894226 7.37891607342553 0.188036985516729 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000138172:ENST00000369788:exon_105206543_105207325:CALHM2;ENSG00000138172:ENST00000260743:exon_105206546_105207325:CALHM2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 105657363 C/G 1 23 18 41 10.8774950222295 9.48717780868996 1.39031721353953 C:G C G 10 0.527065433816109 0.755087232770045 ENSG00000107960:ENST00000224950:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000369764:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000466828:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000472951:exon_105657306_105657477:OBFC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 112058426 T/C 1 21 14 35 9.93162588986171 7.37891607342553 2.55270981643618 T:C T C 10 0.527065433816109 0.403531860603846 ENSG00000119953:ENST00000369603:exon_112058406_112058548:SMNDC1;ENSG00000119953:ENST00000369592:exon_112058406_112058548:SMNDC1;ENSG00000119953:ENST00000460483:exon_112058406_112058548:SMNDC1;ENSG00000119953:ENST00000471297:exon_112058406_112058568:SMNDC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 114177616 G/A 1 15 5 20 7.09401849275836 2.63532716908055 4.45869132367782 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0705444615831227 ENSG00000197142:ENST00000354655:exon_114177604_114177699:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000393081:exon_114177604_114177699:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000356116:exon_114177604_114177699:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000433418:exon_114177604_114177699:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000369410:exon_114177604_114177699:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000354273:exon_114177604_114177699:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000495539:exon_114177604_114177699:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000467340:exon_114177604_114177696:ACSL5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 115609915 C/G 1 5 8 13 2.36467283091945 4.21652347052887 -1.85185063960942 C:G C G 10 0.527065433816109 0.407023665875808 ENSG00000198924:ENST00000369305:exon_115608739_115610403:DCLRE1A;ENSG00000198924:ENST00000361384:exon_115608739_115610403:DCLRE1A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 115610004 G/A 1 8 8 16 3.78347652947113 4.21652347052887 -0.433046941057745 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000198924:ENST00000369305:exon_115608739_115610403:DCLRE1A;ENSG00000198924:ENST00000361384:exon_115608739_115610403:DCLRE1A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 119043554 C/T 1 8 10 18 3.78347652947113 5.27065433816109 -1.48717780868996 T:C C T 10 0.527065433816109 0.49133381096339 ENSG00000165650:ENST00000334464:exon_119040000_119044982:PDZD8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 120446114 A/G 1 2 7 9 0.945869132367782 3.68945803671276 -2.74358890434498 A:G A G 10 0.527065433816109 0.094465581682091 ENSG00000151893:ENST00000369156:exon_120446110_120446153:C10orf46;ENSG00000151893:ENST00000369151:exon_120446110_120446153:C10orf46;ENSG00000151893:ENST00000493518:exon_120446110_120446153:C10orf46;ENSG00000151893:ENST00000490610:exon_120446110_120446293:C10orf46;ENSG00000151893:ENST00000489169:exon_120446110_120446153:C10orf46 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 121196335 G/A 1 11 10 21 5.2022802280228 5.27065433816109 -0.06837411013829 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000198873:ENST00000392870:exon_121196163_121196353:GRK5;ENSG00000198873:ENST00000369108:exon_121196163_121196353:GRK5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 121596498 C/T 1 32 27 59 15.1339061178845 14.2307667130349 0.903139404849567 T:C C T 10 0.527065433816109 0.89646404402546 ENSG00000197771:ENST00000360003:exon_121596408_121596541:C10orf119;ENSG00000197771:ENST00000369077:exon_121596408_121596541:C10orf119;ENSG00000197771:ENST00000466047:exon_121596408_121596541:C10orf119 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 121671651 T/C 1 3 6 9 1.41880369855167 3.16239260289665 -1.74358890434498 T:C T C 10 0.527065433816109 0.323067031523113 ENSG00000107651:ENST00000369075:exon_121671556_121671676:SEC23IP;ENSG00000107651:ENST00000446561:exon_121671556_121671676:SEC23IP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 121685559 G/A 1 13 15 28 6.14814936039058 7.90598150724164 -1.75783214685105 A:G G A 10 0.527065433816109 0.572286226612737 ENSG00000107651:ENST00000369075:exon_121685548_121685739:SEC23IP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 121693246 A/G 1 65 49 114 30.7407468019529 25.8262062569893 4.91454054496357 A:G A G 10 0.527065433816109 0.398769535716941 ENSG00000107651:ENST00000369075:exon_121693198_121693299:SEC23IP;ENSG00000107651:ENST00000475542:exon_121693198_121693282:SEC23IP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 122649482 A/G 1 4 9 13 1.89173826473556 4.74358890434498 -2.85185063960942 A:G A G 10 0.527065433816109 0.163735013053684 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122649407_122649521:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122649407_122649521:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122649407_122649521:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000478567:exon_122649407_122649521:WDR11 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 123503187 T/C 1 6 3 9 2.83760739710335 1.58119630144833 1.25641109565502 T:C T C 10 0.527065433816109 0.513555929047552 ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123499939_123503373:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123499939_123503373:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123502626_123503373:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000423243:exon_123502710_123503373:ATE1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 123670445 T/C 1 7 8 15 3.31054196328724 4.21652347052887 -0.905981507241636 T:C T C 10 0.527065433816109 0.797198000532565 ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123670421_123670666:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123670421_123670666:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123670421_123670666:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000423243:exon_123670421_123670666:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000470613:exon_123670421_123670458:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000455628:exon_123670421_123670666:ATE1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 124610027 G/A 1 2 9 11 0.945869132367782 4.74358890434498 -3.7977197719772 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0310731489114619 ENSG00000138161:ENST00000368904:exon_124609940_124610309:CUZD1;ENSG00000213185:ENST00000368898:exon_124609940_124610066:FAM24B;ENSG00000213185:ENST00000368896:exon_124609940_124610036:FAM24B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 126172863 A/G 1 14 7 21 6.62108392657447 3.68945803671276 2.93162588986171 A:G A G 10 0.527065433816109 0.274579453085168 ENSG00000107902:ENST00000392757:exon_126172708_126172895:LHPP;ENSG00000107902:ENST00000368842:exon_126172708_126172895:LHPP;ENSG00000107902:ENST00000368839:exon_126172708_126172895:LHPP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 127496038 T/A 1 8 21 29 3.78347652947113 11.0683741101383 -7.28489758066716 A:T T A 10 0.527065433816109 0.00833453551620774 ENSG00000188690:ENST00000368797:exon_127495982_127496056:UROS;ENSG00000188690:ENST00000368781:exon_127495982_127496056:UROS;ENSG00000188690:ENST00000368786:exon_127495982_127496056:UROS;ENSG00000188690:ENST00000465260:exon_127495982_127496056:UROS;ENSG00000188690:ENST00000420761:exon_127495982_127496056:UROS;ENSG00000188690:ENST00000368778:exon_127495982_127496056:UROS;ENSG00000188690:ENST00000368774:exon_127495719_127496056:UROS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 127530325 T/C 1 26 18 44 12.2962987207812 9.48717780868996 2.8091209120912 T:C T C 10 0.527065433816109 0.451633586147347 ENSG00000107949:ENST00000299130:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000107949:ENST00000429863:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000089876:ENST00000368721:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284690:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284688:exon_127530312_127530503:DHX32 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 133761285 G/A 1 37 31 68 17.498578948804 16.3390284482994 1.15955050050459 A:G G A 10 0.527065433816109 0.80904747771111 ENSG00000175470:ENST00000455566:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000482010:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000422256:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000398018:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000490777:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000470416:exon_133761034_133761295:PPP2R2D HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 133769482 G/C 1 39 52 91 18.4444480811717 27.4074025584377 -8.96295447726592 C:G G C 10 0.527065433816109 0.0737325773603501 ENSG00000175470:ENST00000455566:exon_133769188_133773331:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000482010:exon_133769188_133770059:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000422256:exon_133769188_133770037:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000398018:exon_133769188_133770051:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000490777:exon_133769188_133769746:PPP2R2D HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 134021485 C/T 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 T:C C T 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134020994_134021655:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368622:exon_134020996_134021655:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000298630:exon_134020996_134021655:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000462160:exon_134020996_134021655:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368625:exon_134020996_134021655:STK32C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 10 134145314 A/G 1 11 16 27 5.2022802280228 8.43304694105774 -3.23076671303494 A:G A G 10 0.527065433816109 0.249321234596434 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 290816 A/G 1 7 18 25 3.31054196328724 9.48717780868996 -6.17663584540272 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0155412658231286 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_290678_292095:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_290658_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_290678_291113:ATHL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 293188 T/C 1 24 42 66 11.3504295884134 22.1367482202766 -10.7863186318632 T:C T C 10 0.527065433816109 0.00923956574807588 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_292886_293502:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_293068_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000476372:exon_293163_293727:ATHL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 308168 G/A 1 38 41 79 17.9715135149879 21.6096827864605 -3.63816927147262 A:G G A 10 0.527065433816109 0.431810057712906 ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_308163_308438:IFITM2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 309127 A/G 1 353 307 660 166.945901862914 161.809088181545 5.13681368136804 A:G A G 10 0.527065433816109 0.696831767626915 ENSG00000185201:ENST00000533141:exon_309013_309230:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_309013_309395:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000443559:exon_309063_309252:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000327366:exon_309063_309272:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000527146:exon_309013_309392:IFITM2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 405861 C/T 1 9 16 25 4.25641109565502 8.43304694105774 -4.17663584540273 T:C C T 10 0.527065433816109 0.110142448138222 ENSG00000185187:ENST00000528845:exon_405716_406059:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000526395:exon_405716_406059:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000532587:exon_405716_406059:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000431843:exon_405716_406059:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000397632:exon_405716_406059:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000332725:exon_405716_406059:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000527295:exon_405716_406059:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000527987:exon_405728_406059:SIGIRR HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 406337 G/A 1 7 4 11 3.31054196328724 2.10826173526444 1.2022802280228 A:G G A 10 0.527065433816109 0.555399509917260 ENSG00000185187:ENST00000528845:exon_406142_406370:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000531205:exon_405872_406538:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000382520:exon_405903_406538:SIGIRR HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 500540 G/A 1 71 47 118 33.5783541990563 24.7720753893571 8.80627880969913 A:G G A 10 0.527065433816109 0.116916309545536 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_500484_500738:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529115:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000527485:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529368:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529306:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000524780:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000531149:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000531223:exon_500484_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000528713:exon_499897_500654:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000526013:exon_500486_500655:RNH1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 534197 C/T 1 5 6 11 2.36467283091945 3.16239260289665 -0.797719771977199 T:C C T 10 0.527065433816109 0.765666449819686 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 562421 G/A 1 19 14 33 8.98575675749393 7.37891607342553 1.6068406840684 A:G G A 10 0.527065433816109 0.605453933677343 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_562084_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000524468:exon_562079_562456:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_562385_562776:RASSF7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 563257 G/A 1 15 32 47 7.09401849275836 16.8660938821155 -9.77207538935713 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0050909625159334 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_563189_563993:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_563189_564012:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_563189_563980:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_563189_563478:RASSF7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 563649 C/T 1 21 31 52 9.93162588986171 16.3390284482994 -6.40740255843767 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0947534622494034 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_563189_563993:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_563189_564012:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_563189_563980:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_563558_564018:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_563558_564021:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_563558_563685:RASSF7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 608593 G/A 1 44 33 77 20.8091209120912 17.3931593159316 3.4159615961596 A:G G A 10 0.527065433816109 0.493870463969599 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_607066_609720:PHRF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 771034 A/G 1 13 15 28 6.14814936039058 7.90598150724164 -1.75783214685105 A:G A G 10 0.527065433816109 0.572286226612737 ENSG00000177225:ENST00000465313:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000319863:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000354286:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000479959:exon_768386_771467:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000524550:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000532320:exon_770550_771426:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000530209:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000534603:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000529966:exon_770993_771212:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000533960:exon_770844_771104:PDDC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 772490 G/A 1 12 2 14 5.67521479420669 1.05413086763222 4.62108392657447 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0147159799087008 ENSG00000177225:ENST00000528309:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000397472:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000319863:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000354286:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000479959:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000526650:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000526325:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000524550:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000532320:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000530209:exon_772427_772614:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000534603:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000529966:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000532839:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000442059:exon_772427_772521:PDDC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 793588 G/A 1 8 6 14 3.78347652947113 3.16239260289665 0.621083926574474 A:G G A 10 0.527065433816109 0.794786264772641 ENSG00000177542:ENST00000320230:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000531214:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000481290:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000531437:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000529351:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000533385:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000526152:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000528606:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000527734:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000527723:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000531514:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000528936:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000456706:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000532484:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000524891:exon_793478_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000529066:exon_793587_793619:SLC25A22 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 802379 T/C 1 25 17 42 11.8233641545973 8.96011237487385 2.86325177972342 T:C T C 10 0.527065433816109 0.440661082707359 ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000531286:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_802195_802396:LRDD HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 804212 C/A 1 10 6 16 4.72934566183891 3.16239260289665 1.56695305894226 A:C C A 10 0.527065433816109 0.465150778014472 ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_804094_804675:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_804094_805103:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_804094_804469:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_802682_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_802682_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534649:exon_804094_804463:LRDD HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 837582 G/A 1 36 79 115 17.0256443826201 41.6381692714726 -24.6125248888525 A:G G A 10 0.527065433816109 5.39261419960466e-06 ENSG00000177697:ENST00000397420:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000397421:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000436957:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000322008:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000529810:exon_837460_837613:CD151;ENSG00000177697:ENST00000528143:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000530726:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000532045:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000528011:exon_837460_837612:CD151;ENSG00000177697:ENST00000532075:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_837356_837605:POLR2L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 840477 A/G 1 357 298 655 168.837640127649 157.065499277201 11.7721408504486 A:G A G 10 0.527065433816109 0.36821897514361 ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_840262_840480:POLR2L;ENSG00000177700:ENST00000322028:exon_839721_840480:POLR2L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 1298430 C/A 1 34 27 61 16.0797752502523 14.2307667130349 1.84900853721735 A:C C A 10 0.527065433816109 0.701105241861212 ENSG00000078902:ENST00000317204:exon_1295601_1298483:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000527886:exon_1295602_1298483:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000525159:exon_1295603_1298483:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000263646:exon_1296883_1298483:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000382211:exon_1298302_1298483:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000530506:exon_1298047_1298483:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000527938:exon_1298243_1298483:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000530541:exon_1298385_1298483:TOLLIP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 1309956 C/T 1 11 9 20 5.2022802280228 4.74358890434498 0.45869132367782 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000078902:ENST00000317204:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000527886:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000525159:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000263646:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000382211:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000530506:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000530541:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000528719:exon_1309866_1310006:TOLLIP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 1977552 G/A 1 404 263 667 191.065564738292 138.618209093637 52.4473556446553 A:G G A 10 0.527065433816109 4.55568158286407e-05 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1977486_1977825:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1977486_1977678:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000484918:exon_1977486_1977576:MRPL23 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 2924591 G/A 1 13 5 18 6.14814936039058 2.63532716908055 3.51282219131004 A:G G A 10 0.527065433816109 0.104967213978269 ENSG00000110628:ENST00000347936:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000312221:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449793:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000380574:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000485423:exon_2924344_2924719:SLC22A18 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 2943671 G/C 1 5 10 15 2.36467283091945 5.27065433816109 -2.90598150724164 C:G G C 10 0.527065433816109 0.194890792920314 ENSG00000110628:ENST00000347936:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000312221:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449793:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000380574:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000463571:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000441077:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449603:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000495518:exon_2943666_2943786:SLC22A18 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 3028140 G/A 1 50 32 82 23.6467283091945 16.8660938821155 6.78063442707906 A:C:G G A 10 0.527065433816109 0.150587886760006 ENSG00000110619:ENST00000380525:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000531387:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397111:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397114:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000484484:exon_3028109_3028240:CARS;ENSG00000110619:ENST00000278224:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000466442:exon_3028109_3030127:CARS;ENSG00000110619:ENST00000470221:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000526890:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000529772:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000401769:exon_3028109_3028189:CARS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 3381369 G/C 1 27 20 47 12.7692332869651 10.5413086763222 2.22792461064287 C:G G C 10 0.527065433816109 0.560933930099591 ENSG00000005801:ENST00000354599:exon_3379157_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000399602:exon_3379996_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000429541:exon_3380175_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000005082:exon_3380224_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000526601:exon_3380347_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000343338:exon_3381174_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000438262:exon_3381227_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000528410:exon_3381269_3381795:ZNF195 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 3381843 A/G 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 A:G A G 10 0.527065433816109 0.757490641773051 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 3707220 C/T 1 19 21 40 8.98575675749393 11.0683741101383 -2.08261735264436 T:C C T 10 0.527065433816109 0.530180704004301 ENSG00000110713:ENST00000324932:exon_3707203_3707424:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000429801:exon_3707203_3707424:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000359171:exon_3707203_3707424:NUP98 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 3714489 C/T 1 9 7 16 4.25641109565502 3.68945803671276 0.566953058942256 T:C C T 10 0.527065433816109 0.808175848721287 ENSG00000110713:ENST00000324932:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000355260:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000429801:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000359171:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000524563:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000530345:exon_3714287_3714605:NUP98 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 4409599 G/A 1 11 6 17 5.2022802280228 3.16239260289665 2.03988762512615 A:G G A 10 0.527065433816109 0.344390478204234 ENSG00000132109:ENST00000254436:exon_4409530_4409760:TRIM21 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 5686266 G/A 1 33 15 48 15.6068406840684 7.90598150724164 7.70085917682677 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0296187135320921 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5684787_5686625:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5684788_5686625:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5684788_5686625:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5684794_5686625:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5684847_5686912:TRIM5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 5688940 C/T 1 6 7 13 2.83760739710335 3.68945803671276 -0.851850639609417 T:C C T 10 0.527065433816109 0.783042148004503 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5688919_5688941:TRIM5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 5700340 T/C 1 12 9 21 5.67521479420669 4.74358890434498 0.931625889861711 T:C T C 10 0.527065433816109 0.827834701908173 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000492086:exon_5700304_5700370:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000465634:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700304_5700399:TRIM5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 5701281 G/A 1 27 17 44 12.7692332869651 8.96011237487385 3.8091209120912 A:G G A 10 0.527065433816109 0.291442452370904 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000419850:exon_5701192_5701468:TRIM5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 5701409 G/C 1 23 11 34 10.8774950222295 5.7977197719772 5.07977525025229 C:G G C 10 0.527065433816109 0.0876908004722013 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000419850:exon_5701192_5701468:TRIM5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 5717762 T/C 1 96 78 174 45.4017183536535 41.1111038376565 4.29061451599703 T:C T C 10 0.527065433816109 0.543979002550854 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000460454:exon_5717397_5718243:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5717722_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5717732_5717885:TRIM22 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 5718517 G/A 1 134 86 220 63.3732318686414 45.3276273081854 18.045604560456 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0150500927272076 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5718478_5718573:TRIM22 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 5730294 C/T 1 98 95 193 46.3475874860213 50.0712162125304 -3.72362872650905 T:C C T 10 0.527065433816109 0.614177850982424 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5730283_5732093:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5730283_5732092:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5730283_5730393:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5730283_5730677:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5730283_5730367:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000493494:exon_5730283_5730547:TRIM22 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 6239344 G/A 1 13 7 20 6.14814936039058 3.68945803671276 2.45869132367782 A:G G A 10 0.527065433816109 0.371081802214505 ENSG00000051009:ENST00000449352:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000442917:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000265978:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000524416:exon_6237800_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000532797:exon_6239035_6239380:FAM160A2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 6340706 A/G 1 1 11 12 0.472934566183891 5.7977197719772 -5.32478520579331 A:G A G 10 0.527065433816109 0.00225918952558817 ENSG00000170955:ENST00000532354:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6340360_6340901:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6340374_6340794:PRKCDBP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 7656809 G/A 1 4 6 10 1.89173826473556 3.16239260289665 -1.27065433816109 A:G G A 10 0.527065433816109 0.532268681489131 ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7656783_7656824:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000533792:exon_7656783_7656824:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528883:exon_7656783_7656824:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530181:exon_7656783_7656824:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000534409:exon_7656783_7656824:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530582:exon_7656783_7656824:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000532381:exon_7656783_7656824:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530081:exon_7656783_7656824:PPFIBP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 7686584 A/T 1 71 54 125 33.5783541990563 28.4615334260699 5.11682077298637 A:T A T 10 0.527065433816109 0.371697777647082 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 8132302 G/A 0 8 0 8 3.78347652947113 0 3.78347652947113 G G 10 0.527065433816109 0.00845817134857238 ENSG00000166405:ENST00000396677:exon_8127597_8132684:RIC3;ENSG00000166405:ENST00000335425:exon_8127640_8132684:RIC3;ENSG00000166405:ENST00000343202:exon_8130489_8132684:RIC3;ENSG00000166405:ENST00000309737:exon_8130496_8132684:RIC3;ENSG00000166405:ENST00000526962:exon_8130983_8132684:RIC3;ENSG00000166405:ENST00000524799:exon_8132206_8132684:RIC3;ENSG00000166405:ENST00000530060:exon_8132017_8132684:RIC3;ENSG00000166405:ENST00000528463:exon_8132212_8132684:RIC3;ENSG00000166405:ENST00000425599:exon_8132245_8132684:RIC3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 9607032 A/G 1 11 11 22 5.2022802280228 5.7977197719772 -0.595439543954399 A:G A G 10 0.527065433816109 0.833638974534111 ENSG00000166483:ENST00000450114:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000299613:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000524612:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000530712:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000530175:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000532275:exon_9606989_9607074:WEE1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 11292700 G/C 1 10 10 20 4.72934566183891 5.27065433816109 -0.541308676322181 C:G G C 10 0.527065433816109 0.826649432830958 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11292423_11292837:GALNTL4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 11977573 T/C 1 65 71 136 30.7407468019529 37.4216458009437 -6.68089899899083 T:C T C 10 0.527065433816109 0.26483376304282 ENSG00000170242:ENST00000339865:exon_11977548_11980870:USP47;ENSG00000170242:ENST00000527733:exon_11977548_11977968:USP47;ENSG00000170242:ENST00000399455:exon_11977548_11980870:USP47;ENSG00000170242:ENST00000305481:exon_11977548_11980701:USP47;ENSG00000170242:ENST00000529813:exon_11977548_11978492:USP47 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 17111272 A/G 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000011405:ENST00000265970:exon_17108119_17111467:PIK3C2A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 17809639 C/T 1 36 25 61 17.0256443826201 13.1766358454027 3.84900853721735 T:C C T 10 0.527065433816109 0.370004501743918 ENSG00000129158:ENST00000531299:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000531926:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000528369:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000527494:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000528200:exon_17809596_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000524589:exon_17809599_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529440:exon_17809599_17809960:SERGEF HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 17809724 T/C 1 27 22 49 12.7692332869651 11.5954395439544 1.17379374301066 T:C T C 10 0.527065433816109 0.776222455481774 ENSG00000129158:ENST00000531299:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000531926:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000528369:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000527494:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000528200:exon_17809596_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000524589:exon_17809599_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529440:exon_17809599_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529151:exon_17809702_17809960:SERGEF HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 17981047 C/T 1 6 15 21 2.83760739710335 7.90598150724164 -5.06837411013829 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0295301958115794 ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529151:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000533241:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525168:exon_17981017_17981170:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529728:exon_17981000_17981183:SERGEF HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 18505552 G/A 1 21 24 45 9.93162588986171 12.6495704115866 -2.71794452172491 A:G G A 10 0.527065433816109 0.457121681892115 ENSG00000074319:ENST00000357193:exon_18505417_18505619:TSG101;ENSG00000074319:ENST00000251968:exon_18505417_18505619:TSG101 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 18633897 T/C 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000179119:ENST00000336349:exon_18633861_18634035:SPTY2D1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 18633971 G/A 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 A:G G A 10 0.527065433816109 0.488810537661758 ENSG00000179119:ENST00000336349:exon_18633861_18634035:SPTY2D1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 28057957 T/C 1 12 13 25 5.67521479420669 6.85185063960942 -1.17663584540273 T:C T C 10 0.527065433816109 0.691622871057986 ENSG00000121621:ENST00000263181:exon_28057764_28058211:KIF18A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 32956620 A/G 1 3 7 10 1.41880369855167 3.68945803671276 -2.27065433816109 A:G A G 10 0.527065433816109 0.207504053786451 ENSG00000060749:ENST00000399302:exon_32953289_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000078652:exon_32954638_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000428421:exon_32953289_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000527788:exon_32954638_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000524678:exon_32956130_32956981:QSER1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 33881016 T/C 1 12 21 33 5.67521479420669 11.0683741101383 -5.3931593159316 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0798944393600821 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33880125_33881121:LMO2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 33886294 A/G 1 6 9 15 2.83760739710335 4.74358890434498 -1.90598150724164 A:G A G 10 0.527065433816109 0.439435430476406 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33886148_33886363:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33886148_33886363:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33886148_33886475:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33886148_33886697:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33886148_33886363:LMO2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 34130342 A/G 1 9 8 17 4.25641109565502 4.21652347052887 0.0398876251261466 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000135372:ENST00000257829:exon_34130289_34130380:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000531723:exon_34130289_34130380:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000529523:exon_34130289_34130380:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000527971:exon_34130289_34130380:NAT10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 34154641 C/T 1 13 13 26 6.14814936039058 6.85185063960942 -0.703701279218835 T:C C T 10 0.527065433816109 0.84562040810587 ENSG00000135372:ENST00000452756:exon_34154573_34154689:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000257829:exon_34154573_34154689:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000531159:exon_34154573_34154689:NAT10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 34156722 A/G 1 12 13 25 5.67521479420669 6.85185063960942 -1.17663584540273 A:G A G 10 0.527065433816109 0.691622871057986 ENSG00000135372:ENST00000452756:exon_34156722_34156838:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000257829:exon_34156722_34156838:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000531159:exon_34156722_34156838:NAT10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 34482908 C/T 1 7 5 12 3.31054196328724 2.63532716908055 0.675214794206692 T:C C T 10 0.527065433816109 0.778351128206284 ENSG00000121691:ENST00000241052:exon_34482798_34482936:CAT;ENSG00000121691:ENST00000530343:exon_34482280_34482936:CAT;ENSG00000121691:ENST00000525707:exon_34482750_34482936:CAT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 34910397 C/T 1 15 18 33 7.09401849275836 9.48717780868996 -2.3931593159316 T:C C T 10 0.527065433816109 0.486378086106079 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34910299_34910416:APIP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 34916657 C/T 1 16 12 28 7.56695305894226 6.32478520579331 1.24216785314895 T:C C T 10 0.527065433816109 0.707378189652233 ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34916557_34916657:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34916557_34916657:APIP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 34937813 G/A 1 13 9 22 6.14814936039058 4.74358890434498 1.4045604560456 A:G G A 10 0.527065433816109 0.670793133404155 ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34937775_34938046:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34937775_34937939:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34937775_34937898:APIP;ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34937677_34938033:PDHX HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 34969112 A/G 1 8 6 14 3.78347652947113 3.16239260289665 0.621083926574474 A:G A G 10 0.527065433816109 0.794786264772641 ENSG00000110435:ENST00000533550:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000430469:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000533262:exon_34969053_34969153:PDHX HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 34979095 C/T 1 12 8 20 5.67521479420669 4.21652347052887 1.45869132367782 T:C C T 10 0.527065433816109 0.65554767387655 ENSG00000110435:ENST00000533550:exon_34978931_34979130:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34978931_34979130:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34978931_34979130:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000533262:exon_34978931_34979130:PDHX HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 34988343 T/C 1 7 11 18 3.31054196328724 5.7977197719772 -2.48717780868996 A:T:C T C 10 0.527065433816109 0.249990861970352 ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34988187_34988361:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34988187_34988361:PDHX HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 34991727 T/C 1 13 5 18 6.14814936039058 2.63532716908055 3.51282219131004 T:C T C 10 0.527065433816109 0.104967213978269 ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34991686_34991833:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34991686_34991833:PDHX HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 35641312 G/A 1 9 11 20 4.25641109565502 5.7977197719772 -1.54130867632218 A:G G A 10 0.527065433816109 0.510653805220797 ENSG00000179431:ENST00000317811:exon_35639735_35642419:FJX1;ENSG00000179431:ENST00000532914:exon_35641236_35641609:FJX1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 35827958 A/G 1 10 6 16 4.72934566183891 3.16239260289665 1.56695305894226 A:G A G 10 0.527065433816109 0.465150778014472 ENSG00000166326:ENST00000299413:exon_35827908_35829775:TRIM44;ENSG00000166326:ENST00000532066:exon_35827908_35828171:TRIM44 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 43940602 C/G 1 35 47 82 16.5527098164362 24.7720753893571 -8.21936557292094 C:G C G 10 0.527065433816109 0.0767399887777277 ENSG00000166199:ENST00000532962:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000302708:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000530803:exon_43940592_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532410:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532129:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000529434:exon_43940354_43940686:ALKBH3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 43940644 G/T 1 65 36 101 30.7407468019529 18.9743556173799 11.766391184573 T:G G T 10 0.527065433816109 0.0215583224108729 ENSG00000166199:ENST00000532962:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000302708:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000530803:exon_43940592_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532410:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532129:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000529434:exon_43940354_43940686:ALKBH3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 44639921 C/T 1 11 2 13 5.2022802280228 1.05413086763222 4.14814936039058 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0249340260292124 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 44640268 A/G 1 433 412 845 204.780667157625 217.150958732237 -12.3702915746121 A:G A G 10 0.527065433816109 0.408356504985621 ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000529277:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44640190_44640273:CD82 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 45827482 G/A 1 8 13 21 3.78347652947113 6.85185063960942 -3.06837411013829 A:G G A 10 0.527065433816109 0.196016840944122 ENSG00000181830:ENST00000442528:exon_45827361_45827887:SLC35C1;ENSG00000181830:ENST00000456334:exon_45827361_45827887:SLC35C1;ENSG00000181830:ENST00000526817:exon_45827361_45827607:SLC35C1;ENSG00000181830:ENST00000530670:exon_45827361_45827517:SLC35C1;ENSG00000181830:ENST00000314134:exon_45825957_45827887:SLC35C1;ENSG00000181830:ENST00000530471:exon_45827361_45827887:SLC35C1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 47267079 C/T 1 15 4 19 7.09401849275836 2.10826173526444 4.98575675749393 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0224980824685121 ENSG00000134575:ENST00000256997:exon_47267025_47267123:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000534752:exon_47267025_47267127:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000534448:exon_47267025_47267123:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000527256:exon_47267025_47267123:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000533929:exon_47267025_47267123:ACP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 57076820 T/G 1 17 24 41 8.03988762512615 12.6495704115866 -4.60968278646047 T:G T G 10 0.527065433816109 0.161379357013086 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57076366_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57076369_57078030:TNKS1BP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 57077464 T/C 1 12 18 30 5.67521479420669 9.48717780868996 -3.81196301448327 T:C T C 10 0.527065433816109 0.20072953525879 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57076366_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57076369_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000530920:exon_57077306_57078030:TNKS1BP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 57081197 G/C 1 3 7 10 1.41880369855167 3.68945803671276 -2.27065433816109 C:G G C 10 0.527065433816109 0.207504053786451 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 57157405 A/G 1 9 3 12 4.25641109565502 1.58119630144833 2.67521479420669 A:G A G 10 0.527065433816109 0.153067812973243 ENSG00000186652:ENST00000311862:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000533605:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000525955:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000530105:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000254979:ENST00000534081:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8;ENSG00000254979:ENST00000529411:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8;ENSG00000254979:ENST00000528835:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 59410479 A/T 1 25 35 60 11.8233641545973 18.4472901835638 -6.62392602896654 A:T A T 10 0.527065433816109 0.0935130170594951 ENSG00000166889:ENST00000300146:exon_59410353_59410508:PATL1;ENSG00000166889:ENST00000428532:exon_59410413_59410508:PATL1;ENSG00000166889:ENST00000435054:exon_59410353_59410508:PATL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 60609972 A/G 1 49 41 90 23.1737937430107 21.6096827864605 1.56411095655018 A:G A G 10 0.527065433816109 0.752811219852047 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 60610065 G/A 1 43 48 91 20.3361863459073 25.2991408231732 -4.96295447726592 A:G G A 10 0.527065433816109 0.344791106974243 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60610019_60610098:CCDC86 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 60617834 C/A 1 72 74 146 34.0512887652402 39.0028421023921 -4.95155333715191 A:C C A 10 0.527065433816109 0.455821897173934 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60617679_60618561:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60617679_60618553:CCDC86 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 60666341 G/A 1 122 95 217 57.6980170744347 50.0712162125304 7.62680086190434 A:T:C:G G A 10 0.527065433816109 0.308515438327824 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60666334_60666403:PRPF19 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 60701136 C/G 1 5 5 10 2.36467283091945 2.63532716908055 -0.270654338161091 C:G C G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60701014_60701216:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60701014_60701216:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60701014_60701216:TMEM132A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 60703777 G/A 1 8 9 17 3.78347652947113 4.74358890434498 -0.960112374873853 A:G G A 10 0.527065433816109 0.80902600536977 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 60704213 C/T 1 9 9 18 4.25641109565502 4.74358890434498 -0.487177808689962 T:C C T 10 0.527065433816109 0.81881957561072 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 60899767 A/G 1 7 2 9 3.31054196328724 1.05413086763222 2.25641109565502 A:G A G 10 0.527065433816109 0.185447766343339 ENSG00000167987:ENST00000301765:exon_60897730_60900011:VPS37C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 61089037 T/C 1 6 8 14 2.83760739710335 4.21652347052887 -1.37891607342553 T:C T C 10 0.527065433816109 0.59467204210446 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 61106892 G/C 1 34 12 46 16.0797752502523 6.32478520579331 9.75499004445899 C:G G C 10 0.527065433816109 0.00454512726326692 ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000532173:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529092:exon_61106726_61106998:DAK;ENSG00000149476:ENST00000448123:exon_61106830_61106907:DAK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 61112802 C/T 1 43 18 61 20.3361863459073 9.48717780868996 10.8490085372173 T:C C T 10 0.527065433816109 0.00661423646469778 ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000534084:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000525366:exon_61112786_61113037:DAK;ENSG00000149476:ENST00000524440:exon_61112791_61113037:DAK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 61165280 G/A 1 9 4 13 4.25641109565502 2.10826173526444 2.14814936039058 A:G G A 10 0.527065433816109 0.276012087147778 ENSG00000187049:ENST00000334888:exon_61165246_61165447:TMEM216;ENSG00000187049:ENST00000398979:exon_61165246_61165447:TMEM216 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 61165741 G/C 1 2 7 9 0.945869132367782 3.68945803671276 -2.74358890434498 C:G G C 10 0.527065433816109 0.094465581682091 ENSG00000187049:ENST00000334888:exon_61165733_61166323:TMEM216 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 61179285 G/A 1 15 9 24 7.09401849275836 4.74358890434498 2.35042958841338 A:G G A 10 0.527065433816109 0.415272769718452 ENSG00000149532:ENST00000340437:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000394888:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000439958:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000477890:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000448745:exon_61179241_61179409:CPSF7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 62287737 C/A 1 6 13 19 2.83760739710335 6.85185063960942 -4.01424324250607 A:C C A 10 0.527065433816109 0.0701843497785835 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 62346131 C/T 1 30 23 53 14.1880369855167 12.1225049777705 2.06553200774622 T:C C T 10 0.527065433816109 0.585538533570791 ENSG00000149016:ENST00000308436:exon_62346033_62346502:TUT1;ENSG00000149016:ENST00000476907:exon_62346033_62346502:TUT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 63970625 G/A 1 104 115 219 49.1851948831247 60.6125248888525 -11.4273300057279 A:G G A 10 0.527065433816109 0.136370434556306 ENSG00000168439:ENST00000358794:exon_63970597_63970700:STIP1;ENSG00000168439:ENST00000305218:exon_63970597_63970700:STIP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 63979162 C/T 1 134 110 244 63.3732318686414 57.977197719772 5.3960341488694 A:T:C C T 10 0.527065433816109 0.521580182707154 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63979117_63979219:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63979117_63979219:FERMT3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 63990505 C/G 1 13 11 24 6.14814936039058 5.7977197719772 0.350429588413383 C:G C G 10 0.527065433816109 1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 63993287 C/T 1 13 15 28 6.14814936039058 7.90598150724164 -1.75783214685105 T:C C T 10 0.527065433816109 0.572286226612737 ENSG00000149743:ENST00000317459:exon_63993258_63993341:TRPT1;ENSG00000149743:ENST00000394546:exon_63993258_63993341:TRPT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 63994161 G/C 1 93 95 188 43.9829146551019 50.0712162125304 -6.0883015574285 A:T:C:G G C 10 0.527065433816109 0.381596708300107 ENSG00000149761:ENST00000441250:exon_63994107_63994604:NUDT22;ENSG00000149761:ENST00000428347:exon_63994107_63994604:NUDT22;ENSG00000149761:ENST00000279206:exon_63994107_63994604:NUDT22 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 63994510 C/G 1 51 68 119 24.1196628753784 35.8404494994954 -11.720786624117 C:G C G 10 0.527065433816109 0.0345475455685532 ENSG00000149761:ENST00000441250:exon_63994107_63994604:NUDT22;ENSG00000149761:ENST00000428347:exon_63994107_63994604:NUDT22;ENSG00000149761:ENST00000279206:exon_63994107_63994604:NUDT22 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 64031241 C/T 1 7 5 12 3.31054196328724 2.63532716908055 0.675214794206692 T:C C T 10 0.527065433816109 0.778351128206284 ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64031163_64031267:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64031163_64031267:PLCB3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 64496357 G/T 1 5 5 10 2.36467283091945 2.63532716908055 -0.270654338161091 T:G G T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000068831:ENST00000464324:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000377494:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000421556:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000394432:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000377497:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000354024:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000488071:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000437237:exon_64496335_64496514:RASGRP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 64572602 G/A 1 8 16 24 3.78347652947113 8.43304694105774 -4.64957041158662 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0663902982699974 ENSG00000133895:ENST00000377321:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377326:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000312049:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000315422:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000448517:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000449150:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000337652:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394376:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394373:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000443283:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394374:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000417021:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377313:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000478548:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000487019:exon_64572598_64572670:MEN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 64789194 T/C 1 127 111 238 60.0626899053542 58.5042631535881 1.55842675176605 T:C T C 10 0.527065433816109 0.845923087745613 ENSG00000213465:ENST00000246747:exon_64789193_64789656:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529384:exon_64789193_64789360:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000533729:exon_64789193_64789632:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529254:exon_64788988_64789588:ARL2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 64806270 C/T 1 15 10 25 7.09401849275836 5.27065433816109 1.82336415459727 T:C C T 10 0.527065433816109 0.550103280555877 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64806044_64806301:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64806044_64806301:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64802992_64806301:SNX15 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 64807235 C/T 1 20 9 29 9.45869132367782 4.74358890434498 4.71510241933284 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0943626462970606 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64807158_64808042:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64807158_64808044:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64807158_64807264:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64807158_64808042:SNX15 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 64812857 G/A 1 27 4 31 12.7692332869651 2.10826173526444 10.6609715517006 A:G G A 10 0.527065433816109 8.62200701925958e-05 ENSG00000168060:ENST00000358658:exon_64812295_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000355369:exon_64812297_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000339885:exon_64812297_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000526799:exon_64812698_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000529274:exon_64812708_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000528977:exon_64812708_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000340252:exon_64812743_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000355721:exon_64812743_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000356632:exon_64812743_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000526516:exon_64812776_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000532802:exon_64812785_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000530995:exon_64812823_64812929:NAALADL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 64884052 G/A 1 22 22 44 10.4045604560456 11.5954395439544 -1.1908790879088 A:G G A 10 0.527065433816109 0.763915403997477 ENSG00000174276:ENST00000310597:exon_64883876_64885170:ZNHIT2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 64950376 G/C 1 53 43 96 25.0655320077462 22.6638136540927 2.40171835365353 A:C:G G C 10 0.527065433816109 0.682964945013968 ENSG00000014216:ENST00000528396:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000529133:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533820:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530571:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527739:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526966:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533129:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000524773:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530442:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000279247:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000259755:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000528739:exon_64950373_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527189:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527469:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000534373:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526954:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000531068:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527699:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533909:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527323:exon_64949933_64950439:CAPN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 64950970 C/T 1 51 52 103 24.1196628753784 27.4074025584377 -3.28773968305923 T:C C T 10 0.527065433816109 0.554287491642136 ENSG00000014216:ENST00000528396:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000529133:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533820:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530571:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527739:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526966:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533129:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000524773:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530442:exon_64950945_64951139:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000279247:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000259755:exon_64950946_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000528739:exon_64950945_64951053:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527189:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527469:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000534373:exon_64950945_64951014:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526954:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000531068:exon_64950945_64950974:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527699:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533909:exon_64950945_64951052:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527323:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526468:exon_64950807_64951063:CAPN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 65161129 C/T 1 4 5 9 1.89173826473556 2.63532716908055 -0.743588904344981 T:C C T 10 0.527065433816109 0.743612144716174 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65161044_65161145:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000528854:exon_65161044_65161226:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000533782:exon_65161044_65161145:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65161044_65161145:FRMD8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 65338034 A/G 1 9 4 13 4.25641109565502 2.10826173526444 2.14814936039058 A:G A G 10 0.527065433816109 0.276012087147778 ENSG00000173465:ENST00000531405:exon_65337931_65338226:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000527920:exon_65337956_65338226:SSSCA1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 65349063 G/A 1 28 34 62 13.2421678531489 17.9202247497477 -4.67805689659876 A:G G A 10 0.527065433816109 0.253585767248682 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533237:exon_65349010_65349487:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 65349756 T/G 1 8 18 26 3.78347652947113 9.48717780868996 -5.70370127921883 T:G T G 10 0.527065433816109 0.0299890666647011 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 65664346 T/C 1 5 10 15 2.36467283091945 5.27065433816109 -2.90598150724164 T:C T C 10 0.527065433816109 0.194890792920314 ENSG00000175592:ENST00000455710:exon_65664280_65664477:FOSL1;ENSG00000175592:ENST00000312562:exon_65664280_65664477:FOSL1;ENSG00000175592:ENST00000531493:exon_65664280_65664477:FOSL1;ENSG00000175592:ENST00000532401:exon_65664280_65664477:FOSL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 66105194 G/A 1 100 101 201 47.2934566183891 53.233608815427 -5.94015219703792 A:G G A 10 0.527065433816109 0.437228177201422 ENSG00000174744:ENST00000425825:exon_66104804_66105278:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000524699:exon_66104810_66105360:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000359957:exon_66104810_66105360:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000530238:exon_66104840_66105360:BRMS1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 66109033 T/C 1 46 50 96 21.754990044459 26.3532716908055 -4.59828164634647 T:C T C 10 0.527065433816109 0.359147044986908 ENSG00000174744:ENST00000425825:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000524699:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000359957:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000530238:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000394043:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000527375:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000530756:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000534617:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000525127:exon_66109004_66109094:BRMS1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 66610645 G/C 1 33 35 68 15.6068406840684 18.4472901835638 -2.84044949949541 C:G G C 10 0.527065433816109 0.544231598428833 ENSG00000173715:ENST00000360962:exon_66610640_66610799:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000346672:exon_66610640_66610799:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000527634:exon_66610640_66610761:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000528340:exon_66610640_66610793:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000532565:exon_66610640_66610761:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000525449:exon_66610640_66610795:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000532727:exon_66610640_66610763:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000531415:exon_66610640_66610744:C11orf80;ENSG00000173653:ENST00000533277:exon_66610306_66611332:RCE1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 66612999 C/T 1 42 17 59 19.8632517797234 8.96011237487385 10.9031394048496 T:C C T 10 0.527065433816109 0.00570785608481897 ENSG00000173653:ENST00000533277:exon_66612637_66613997:RCE1;ENSG00000173653:ENST00000309657:exon_66612971_66613033:RCE1;ENSG00000173653:ENST00000524849:exon_66612971_66613033:RCE1;ENSG00000173653:ENST00000525356:exon_66612971_66613033:RCE1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 66626234 T/C 1 17 7 24 8.03988762512615 3.68945803671276 4.35042958841338 T:C T C 10 0.527065433816109 0.100628513344123 ENSG00000173621:ENST00000393952:exon_66625206_66626347:LRFN4;ENSG00000173621:ENST00000309602:exon_66624973_66626564:LRFN4;ENSG00000173621:ENST00000525479:exon_66624996_66626528:LRFN4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 67200819 C/T 1 88 61 149 41.6182418241824 32.1509914627826 9.46725036139976 T:C C T 10 0.527065433816109 0.139477988384008 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67200810_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000526268:exon_67200597_67200918:RPS6KB2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 67202156 C/T 1 85 70 155 40.1994381256307 36.8945803671276 3.3048577585031 T:C C T 10 0.527065433816109 0.629706988323312 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67202053_67202872:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000531765:exon_67201848_67202425:RPS6KB2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 67351585 C/G 1 3 9 12 1.41880369855167 4.74358890434498 -3.32478520579331 C:G C G 10 0.527065433816109 0.0800200924234215 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 67352256 C/A 1 6 7 13 2.83760739710335 3.68945803671276 -0.851850639609417 A:C C A 10 0.527065433816109 0.783042148004503 ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67351605_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000489040:exon_67352156_67352535:GSTP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 67352689 A/G 1 1642 1315 2957 776.558557673949 693.091045468183 83.4675122057655 A:C:G A G 10 0.527065433816109 0.00209900531268892 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67351605_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67352509_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67352266_67352712:GSTP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 67353844 C/T 1 17 15 32 8.03988762512615 7.90598150724164 0.133906117884511 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 67353970 T/C 1 1587 1478 3065 750.547156533835 779.002711180209 -28.4555546463743 T:C T C 10 0.527065433816109 0.311059252407836 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67353860_67354131:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67353860_67354121:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67353860_67354125:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67353860_67354120:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67353860_67354075:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67353860_67354040:GSTP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 67397251 G/C 1 15 6 21 7.09401849275836 3.16239260289665 3.93162588986171 C:G G C 10 0.527065433816109 0.124258383180660 ENSG00000167799:ENST00000301490:exon_67397189_67397401:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000376693:exon_67397189_67397392:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000534054:exon_67396390_67397392:NUDT8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 67559770 C/A 1 9 3 12 4.25641109565502 1.58119630144833 2.67521479420669 A:C C A 10 0.527065433816109 0.153067812973243 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 68030015 C/T 1 48 40 88 22.7008591768268 21.0826173526444 1.61824182418241 T:C C T 10 0.527065433816109 0.749883052034738 ENSG00000171067:ENST00000304271:exon_68028803_68030386:C11orf24;ENSG00000171067:ENST00000530166:exon_68029931_68030386:C11orf24 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 68192690 G/A 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 A:G G A 10 0.527065433816109 0.160556933333404 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68192570_68192760:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68192570_68192760:LRP5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 68560787 C/T 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000110090:ENST00000376618:exon_68560783_68560870:CPT1A;ENSG00000110090:ENST00000265641:exon_68560783_68560870:CPT1A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 68682402 A/G 1 7 1 8 3.31054196328724 0.527065433816109 2.78347652947113 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0735220313078182 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68682291_68682491:IGHMBP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 68704028 C/T 1 5 6 11 2.36467283091945 3.16239260289665 -0.797719771977199 T:C C T 10 0.527065433816109 0.765666449819686 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68703705_68704559:IGHMBP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 68705674 C/A 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 A:C C A 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68705650_68705822:IGHMBP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 70253475 C/T 1 8 12 20 3.78347652947113 6.32478520579331 -2.54130867632218 T:C C T 10 0.527065433816109 0.271710696844368 ENSG00000085733:ENST00000346329:exon_70253404_70253490:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000301843:exon_70253404_70253490:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000482755:exon_70253404_70253490:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000527622:exon_70253404_70253490:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000376561:exon_70253404_70253490:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000415461:exon_70253459_70253490:CTTN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 70279766 C/T 1 15 9 24 7.09401849275836 4.74358890434498 2.35042958841338 T:C C T 10 0.527065433816109 0.415272769718452 ENSG00000085733:ENST00000346329:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000301843:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000376561:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000393747:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000529736:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000533931:exon_70279731_70279824:CTTN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 71146577 G/A 1 79 63 142 37.3618307285274 33.2051223304149 4.15670839811252 A:C:G G A 10 0.527065433816109 0.502318287648234 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 71155129 G/A 1 15 12 27 7.09401849275836 6.32478520579331 0.769233286965056 A:G G A 10 0.527065433816109 0.848360844335184 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71155003_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527316:exon_71155039_71155165:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525346:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000531364:exon_71155043_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000529990:exon_71155080_71155299:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527452:exon_71155087_71155261:DHCR7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 71155171 C/T 1 16 11 27 7.56695305894226 5.7977197719772 1.76923328696506 T:C C T 10 0.527065433816109 0.565832725058203 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71155003_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525346:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000531364:exon_71155043_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000529990:exon_71155080_71155299:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527452:exon_71155087_71155261:DHCR7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 71169547 G/C 1 12 6 18 5.67521479420669 3.16239260289665 2.51282219131004 C:G G C 10 0.527065433816109 0.345457652895314 ENSG00000172890:ENST00000534634:exon_71169474_71170102:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524709:exon_71169474_71169558:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529120:exon_71169474_71169602:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524949:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000533769:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527538:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525245:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71169474_71169590:NADSYN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 71191817 C/T 1 16 14 30 7.56695305894226 7.37891607342553 0.188036985516729 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71191801_71191925:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71191801_71191925:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527852:exon_71191801_71191925:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529840:exon_71191801_71191925:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530055:exon_71191801_71191925:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000526039:exon_71191801_71191925:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527227:exon_71191801_71192476:NADSYN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 71192439 C/A 1 12 18 30 5.67521479420669 9.48717780868996 -3.81196301448327 A:C C A 10 0.527065433816109 0.20072953525879 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71192402_71192450:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71192402_71192450:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527852:exon_71192402_71192450:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529840:exon_71192402_71192450:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530055:exon_71192402_71192450:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000526039:exon_71192402_71192450:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527227:exon_71191801_71192476:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000531236:exon_71191857_71193071:NADSYN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 71720030 G/A 1 57 55 112 26.9572702724818 28.988598859886 -2.03132858740421 A:G G A 10 0.527065433816109 0.706203951300402 ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71720013_71720231:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71720013_71720231:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71720013_71720231:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000351960:exon_71720013_71720231:NUMA1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 71941212 A/G 1 10 5 15 4.72934566183891 2.63532716908055 2.09401849275836 A:G A G 10 0.527065433816109 0.312436282519101 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71941165_71941315:INPPL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 71949064 C/G 1 7 13 20 3.31054196328724 6.85185063960942 -3.54130867632218 C:G C G 10 0.527065433816109 0.122410043320359 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 72408657 C/T 1 41 23 64 19.3903172135395 12.1225049777705 7.26781223576902 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0793630628080017 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72408643_72408694:ARAP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 72415329 G/A 1 15 10 25 7.09401849275836 5.27065433816109 1.82336415459727 A:G G A 10 0.527065433816109 0.550103280555877 ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000340247:exon_72415197_72415379:ARAP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 73106237 A/C 1 9 10 19 4.25641109565502 5.27065433816109 -1.01424324250607 A:C A C 10 0.527065433816109 0.654162232160302 ENSG00000054967:ENST00000064780:exon_73106132_73106330:RELT;ENSG00000054967:ENST00000393580:exon_73106132_73106330:RELT;ENSG00000054967:ENST00000438119:exon_73106132_73106330:RELT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 73106294 A/C 1 15 9 24 7.09401849275836 4.74358890434498 2.35042958841338 A:C A C 10 0.527065433816109 0.415272769718452 ENSG00000054967:ENST00000064780:exon_73106132_73106330:RELT;ENSG00000054967:ENST00000393580:exon_73106132_73106330:RELT;ENSG00000054967:ENST00000438119:exon_73106132_73106330:RELT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 73120653 A/G 1 8 5 13 3.78347652947113 2.63532716908055 1.14814936039058 A:G A G 10 0.527065433816109 0.588366380954527 ENSG00000054965:ENST00000064778:exon_73120532_73120706:FAM168A;ENSG00000054965:ENST00000356467:exon_73120532_73120706:FAM168A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 73611349 G/C 1 6 6 12 2.83760739710335 3.16239260289665 -0.324785205793308 C:G G C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000175575:ENST00000310571:exon_73611315_73611465:PAAF1;ENSG00000175575:ENST00000376384:exon_73611315_73611465:PAAF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 74329615 T/C 1 7 13 20 3.31054196328724 6.85185063960942 -3.54130867632218 A:T:C T C 10 0.527065433816109 0.122410043320359 ENSG00000077514:ENST00000528481:exon_74329582_74329639:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530511:exon_74329582_74329815:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000531615:exon_74329582_74329720:POLD3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 76257215 T/C 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 T:C T C 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000158636:ENST00000524490:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000334736:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000393457:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000524767:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000533248:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000525919:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000525038:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000529032:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000531793:exon_76256992_76257341:C11orf30 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 77790655 G/C 1 131 61 192 61.9544281700897 32.1509914627826 29.8034367073071 C:G G C 10 0.527065433816109 1.73041130358624e-05 ENSG00000151366:ENST00000528251:exon_77790625_77790890:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000530054:exon_77790625_77790911:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000281031:exon_77790625_77791265:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000527806:exon_77790625_77790887:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000534029:exon_77790625_77790865:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000525085:exon_77790625_77790865:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000528164:exon_77790625_77790907:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000324742:exon_77790625_77790931:NDUFC2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 77815059 A/G 1 17 10 27 8.03988762512615 5.27065433816109 2.76923328696506 A:G A G 10 0.527065433816109 0.337600540873158 ENSG00000159063:ENST00000530608:exon_77815026_77815098:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000299626:exon_77815026_77815098:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000531213:exon_77815026_77815098:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000526849:exon_77815026_77815098:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000376156:exon_77815026_77815098:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000526737:exon_77815026_77815098:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532306:exon_77815026_77815098:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000421284:exon_77815026_77815098:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532552:exon_77815026_77815098:ALG8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 77825320 T/C 1 6 17 23 2.83760739710335 8.96011237487385 -6.12250497777051 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0117768599702312 ENSG00000159063:ENST00000299626:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000376156:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000526737:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532306:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000421284:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532440:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000524925:exon_77825312_77825422:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000529139:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525755:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000530454:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525870:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532050:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000527099:exon_77825312_77825438:ALG8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 78189653 T/C 1 6 6 12 2.83760739710335 3.16239260289665 -0.324785205793308 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000137513:ENST00000281038:exon_78189631_78189729:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000528850:exon_78189631_78189729:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000525345:exon_78189631_78189729:NARS2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 85692181 A/C 1 9 3 12 4.25641109565502 1.58119630144833 2.67521479420669 A:C A C 10 0.527065433816109 0.153067812973243 ENSG00000073921:ENST00000341783:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000349405:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532317:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526033:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000447890:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000454118:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000530692:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393346:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000529760:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000528398:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532603:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000356360:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000529016:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526961:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393343:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000530542:exon_85692172_85692271:PICALM HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 85968623 C/T 1 5 7 12 2.36467283091945 3.68945803671276 -1.32478520579331 A:T:C C T 10 0.527065433816109 0.566621218006073 ENSG00000074266:ENST00000263360:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000528180:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000351625:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000327320:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000525244:exon_85968557_85968638:EED HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 89935586 G/T 1 12 13 25 5.67521479420669 6.85185063960942 -1.17663584540273 T:G G T 10 0.527065433816109 0.691622871057986 ENSG00000110172:ENST00000320585:exon_89934328_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529987:exon_89934612_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000533724:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000457199:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529726:exon_89935117_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000525317:exon_89935575_89935719:CHORDC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 93212161 A/G 1 15 21 36 7.09401849275836 11.0683741101383 -3.97435561737993 A:G A G 10 0.527065433816109 0.242276196341047 ENSG00000166002:ENST00000525141:exon_93211638_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000298966:exon_93211638_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000527149:exon_93212107_93212435:C11orf75 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 93212254 C/T 1 16 13 29 7.56695305894226 6.85185063960942 0.715102419332838 T:C C T 10 0.527065433816109 0.853844997602006 ENSG00000166002:ENST00000525141:exon_93211638_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000298966:exon_93211638_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000527149:exon_93212107_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000529714:exon_93212200_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000526869:exon_93212215_93212435:C11orf75 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 93464175 A/C 1 21 34 55 9.93162588986171 17.9202247497477 -7.988598859886 A:T:C A C 10 0.527065433816109 0.0418176023621212 ENSG00000166012:ENST00000323981:exon_93463114_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000530769:exon_93463843_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000529900:exon_93463833_93464382:TAF1D HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 93913036 A/G 1 9 2 11 4.25641109565502 1.05413086763222 3.2022802280228 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0696872224921074 ENSG00000110218:ENST00000227638:exon_93912768_93913423:PANX1;ENSG00000110218:ENST00000436171:exon_93912768_93913423:PANX1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 94231257 C/G 1 10 15 25 4.72934566183891 7.90598150724164 -3.17663584540273 C:G C G 10 0.527065433816109 0.232365445872985 ENSG00000168876:ENST00000302755:exon_94231237_94232737:ANKRD49 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 94862577 G/T 1 10 2 12 4.72934566183891 1.05413086763222 3.67521479420669 T:G G T 10 0.527065433816109 0.0418936923317288 ENSG00000149218:ENST00000278505:exon_94861541_94865815:ENDOD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 95512060 A/G 1 4 9 13 1.89173826473556 4.74358890434498 -2.85185063960942 A:G A G 10 0.527065433816109 0.163735013053684 ENSG00000077458:ENST00000358780:exon_95511986_95512121:FAM76B;ENSG00000077458:ENST00000398187:exon_95511986_95512121:FAM76B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 95564259 A/G 1 67 55 122 31.6866159343207 28.988598859886 2.6980170744347 A:G A G 10 0.527065433816109 0.651050153883059 ENSG00000166037:ENST00000325486:exon_95564190_95565854:CEP57;ENSG00000166037:ENST00000325542:exon_95564190_95565854:CEP57 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 95580926 G/A 1 8 1 9 3.78347652947113 0.527065433816109 3.25641109565502 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0415432498690979 ENSG00000087053:ENST00000346299:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000393223:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000409459:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000352297:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000444541:exon_95580878_95581063:MTMR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 95825797 A/G 1 1 9 10 0.472934566183891 4.74358890434498 -4.27065433816109 A:G A G 10 0.527065433816109 0.00845260157850117 ENSG00000184384:ENST00000524717:exon_95825056_95826681:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000331217:exon_95825056_95826684:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000440572:exon_95825056_95826681:MAML2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 102207851 G/A 1 60 57 117 28.3760739710335 30.0427297275182 -1.66665575648476 A:G G A 10 0.527065433816109 0.781680754617493 ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102207640_102208465:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102207640_102210134:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532609:exon_102207640_102208162:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000527336:exon_102207640_102208022:BIRC3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 108009660 C/A 1 33 29 62 15.6068406840684 15.2848975806672 0.321943103401241 A:C C A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000075239:ENST00000265838:exon_108009625_108009768:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000531813:exon_108009625_108009768:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000528370:exon_108009625_108009891:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000534773:exon_108009447_108009768:ACAT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 111724133 C/T 1 9 6 15 4.25641109565502 3.16239260289665 1.09401849275836 T:C C T 10 0.527065433816109 0.615224246448703 ENSG00000086848:ENST00000524457:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000532374:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000531154:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000398006:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527228:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524880:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000428306:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000433884:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000320165:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000530851:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527883:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527714:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524386:exon_111724103_111724208:FDXACB1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 111747297 A/G 1 5 10 15 2.36467283091945 5.27065433816109 -2.90598150724164 A:G A G 10 0.527065433816109 0.194890792920314 ENSG00000086848:ENST00000524880:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000428306:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527377:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000255561:ENST00000260257:exon_111747205_111747363:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000531487:exon_111747205_111747363:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000528274:exon_111747205_111747363:AP001781.3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 111754574 A/C 1 76 45 121 35.9430270299757 23.7179445217249 12.2250825082508 A:C A C 10 0.527065433816109 0.0286445662349248 ENSG00000137720:ENST00000528125:exon_111754495_111754624:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000260276:exon_111754495_111756699:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000530214:exon_111754495_111754798:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000529270:exon_111754495_111754793:C11orf1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 111896324 C/T 1 11 8 19 5.2022802280228 4.21652347052887 0.985756757493928 T:C C T 10 0.527065433816109 0.819106308579823 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000452417:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111896132_111896348:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111896164_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111896320_111896475:DLAT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 111908162 T/C 1 21 8 29 9.93162588986171 4.21652347052887 5.71510241933284 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0399617112691331 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111907997_111908184:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111907997_111908184:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111907997_111908184:DLAT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 111916647 G/A 1 2 7 9 0.945869132367782 3.68945803671276 -2.74358890434498 A:G G A 10 0.527065433816109 0.094465581682091 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000452417:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111916587_111916694:DLAT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 113679119 C/T 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000048028:ENST00000260188:exon_113679020_113679159:USP28;ENSG00000048028:ENST00000003302:exon_113679020_113679159:USP28 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 116728630 G/C 1 5 9 14 2.36467283091945 4.74358890434498 -2.37891607342553 C:G G C 10 0.527065433816109 0.284872281969498 ENSG00000160584:ENST00000488337:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000445177:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375300:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000292055:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375288:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000465421:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000415541:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000446921:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000480468:exon_116727630_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000434315:exon_116728473_116729415:SIK3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 117099025 A/G 1 16 10 26 7.56695305894226 5.27065433816109 2.29629872078116 A:G A G 10 0.527065433816109 0.434503000465296 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117098932_117099066:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000525027:exon_117098932_117099066:PCSK7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 117163765 C/A 1 12 14 26 5.67521479420669 7.37891607342553 -1.70370127921883 A:C C A 10 0.527065433816109 0.558800654726479 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 117163824 C/G 1 10 7 17 4.72934566183891 3.68945803671276 1.03988762512615 T:C:G C G 10 0.527065433816109 0.637665492029096 ENSG00000186318:ENST00000313005:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000392937:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000528053:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000510630:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000428381:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000513780:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000445823:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000292095:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000530824:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000530844:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000510915:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000504995:exon_117163787_117163904:BACE1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 117222592 G/A 1 6 5 11 2.83760739710335 2.63532716908055 0.202280228022801 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000110274:ENST00000525734:exon_117222506_117222658:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533153:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000525416:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000527324:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000527609:exon_117222506_117222675:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533570:exon_117222506_117222676:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000529538:exon_117222506_117222704:CEP164 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 117267884 A/G 1 8 8 16 3.78347652947113 4.21652347052887 -0.433046941057745 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533223:exon_117267807_117268029:CEP164 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 117866331 T/C 1 4 5 9 1.89173826473556 2.63532716908055 -0.743588904344981 T:C T C 10 0.527065433816109 0.743612144716174 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117866304_117866425:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117866304_117866425:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117866304_117866425:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117866304_117866425:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117866304_117866425:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117866304_117866425:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530178:exon_117866304_117866425:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000525467:exon_117865674_117866425:IL10RA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 118405068 A/G 1 6 2 8 2.83760739710335 1.05413086763222 1.78347652947113 A:G A G 10 0.527065433816109 0.29481715391141 ENSG00000149582:ENST00000411589:exon_118404981_118405070:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000442938:exon_118404984_118405070:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000359862:exon_118404981_118405070:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000526465:exon_118404981_118405070:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000354284:exon_118404981_118405070:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000526973:exon_118404981_118405070:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000354064:exon_118404981_118405070:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000533627:exon_118404981_118405070:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000533102:exon_118404984_118405070:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000524522:exon_118404984_118405070:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000313236:exon_118404981_118405070:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000524725:exon_118404981_118405070:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000526853:exon_118404984_118405070:TMEM25 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 118430519 C/T 1 4 6 10 1.89173826473556 3.16239260289665 -1.27065433816109 T:C C T 10 0.527065433816109 0.532268681489131 ENSG00000118096:ENST00000264021:exon_118430500_118430579:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000264020:exon_118430500_118430579:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000530872:exon_118430500_118430579:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000531939:exon_118430500_118431137:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000534156:exon_118430500_118430579:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000534114:exon_118430500_118430579:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000528378:exon_118430500_118430579:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000533918:exon_118430500_118430579:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000530185:exon_118430500_118430579:IFT46 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 118471423 T/C 1 37 16 53 17.498578948804 8.43304694105774 9.06553200774622 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0131018029603860 ENSG00000095139:ENST00000392859:exon_118471340_118471708:ARCN1;ENSG00000095139:ENST00000359415:exon_118471340_118473643:ARCN1;ENSG00000095139:ENST00000264028:exon_118471340_118473643:ARCN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 118925341 G/A 1 13 16 29 6.14814936039058 8.43304694105774 -2.28489758066716 A:G G A 10 0.527065433816109 0.458714620526297 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530473:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531694:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534233:exon_118925211_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000526656:exon_118925249_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534654:exon_118925280_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531968:exon_118925297_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529683:exon_118925333_118925387:HYOU1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 118940957 C/G 1 8 8 16 3.78347652947113 4.21652347052887 -0.433046941057745 C:G C G 10 0.527065433816109 1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 118947634 C/T 1 15 17 32 7.09401849275836 8.96011237487385 -1.86609388211549 T:C C T 10 0.527065433816109 0.596331739273101 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 118949331 C/T 1 13 13 26 6.14814936039058 6.85185063960942 -0.703701279218835 T:C C T 10 0.527065433816109 0.84562040810587 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 118952173 A/G 1 87 79 166 41.1453072579985 41.6381692714726 -0.492862013474102 A:G A G 10 0.527065433816109 0.938245551343626 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 118955679 C/T 1 14 11 25 6.62108392657447 5.7977197719772 0.823364154597274 T:C C T 10 0.527065433816109 0.84228244308015 ENSG00000149397:ENST00000278715:exon_118955587_118955776:HMBS;ENSG00000149397:ENST00000442944:exon_118955624_118955776:HMBS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 119005132 C/T 1 16 15 31 7.56695305894226 7.90598150724164 -0.339028448299381 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000172273:ENST00000437496:exon_119004794_119005764:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000350777:exon_119004794_119006752:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000527755:exon_119004794_119005764:HINFP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 119052826 C/A 1 9 11 20 4.25641109565502 5.7977197719772 -1.54130867632218 A:C C A 10 0.527065433816109 0.510653805220797 ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000469103:exon_119052803_119053054:NLRX1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 121475922 T/A 1 9 5 14 4.25641109565502 2.63532716908055 1.62108392657447 A:T T A 10 0.527065433816109 0.433551468090942 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000527934:exon_121475822_121475948:SORL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 124502020 A/T 1 26 29 55 12.2962987207812 15.2848975806672 -2.988598859886 A:T A T 10 0.527065433816109 0.422097833598551 ENSG00000154144:ENST00000473629:exon_124501989_124502330:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000530731:exon_124501989_124502348:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000284290:exon_124501989_124505287:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000441174:exon_124501989_124504698:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000375005:exon_124501989_124502331:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000529543:exon_124501989_124503320:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000438907:exon_124501989_124502134:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000491010:exon_124500284_124502339:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000531033:exon_124501989_124502301:TBRG1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 124967487 T/A 1 26 15 41 12.2962987207812 7.90598150724164 4.39031721353953 A:T T A 10 0.527065433816109 0.210674491710289 ENSG00000150433:ENST00000455225:exon_124966398_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531909:exon_124966441_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527257:exon_124966931_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000528724:exon_124966967_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531262:exon_124967038_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532156:exon_124967139_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532407:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000279968:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531851:exon_124967153_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000526175:exon_124967222_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527766:exon_124967235_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529609:exon_124967338_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529583:exon_124967382_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527271:exon_124967426_124967636:TMEM218 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 125452313 A/G 1 35 23 58 16.5527098164362 12.1225049777705 4.43020483866568 A:G A G 10 0.527065433816109 0.292860404052975 ENSG00000149547:ENST00000530985:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000531350:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000534430:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000525737:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527628:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527675:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000278903:exon_125452302_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000343678:exon_125452306_125452315:EI24 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 125479363 G/A 1 43 41 84 20.3361863459073 21.6096827864605 -1.27349644055316 A:G G A 10 0.527065433816109 0.827332072931509 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125479329_125479793:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000526726:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531001:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000524639:exon_125479314_125479484:STT3A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 126073387 G/A 1 18 14 32 8.51282219131004 7.37891607342553 1.13390611788451 A:G G A 10 0.527065433816109 0.726408228699705 ENSG00000165526:ENST00000298317:exon_126071993_126073552:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000533628:exon_126072309_126073552:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000526942:exon_126072677_126073552:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000530903:exon_126073217_126073552:RPUSD4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 126081403 T/C 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 T:C T C 10 0.527065433816109 0.160556933333404 ENSG00000165526:ENST00000298317:exon_126081345_126081587:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000533628:exon_126081345_126081541:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000526942:exon_126081345_126081524:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000532674:exon_126081345_126081587:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000532800:exon_126081345_126081525:RPUSD4;ENSG00000197798:ENST00000533050:exon_126081309_126081725:FAM118B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 126162607 G/A 1 9 6 15 4.25641109565502 3.16239260289665 1.09401849275836 A:G G A 10 0.527065433816109 0.615224246448703 ENSG00000150455:ENST00000392679:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000279992:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000438974:exon_126162372_126163012:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392678:exon_126162372_126163139:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392680:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000479770:exon_126162372_126162950:TIRAP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 126162843 C/T 1 6 2 8 2.83760739710335 1.05413086763222 1.78347652947113 T:C:G C T 10 0.527065433816109 0.29481715391141 ENSG00000150455:ENST00000392679:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000279992:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000438974:exon_126162372_126163012:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392678:exon_126162372_126163139:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392680:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000479770:exon_126162372_126162950:TIRAP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 126215441 C/T 1 95 91 186 44.9287837874696 47.9629544772659 -3.03417068979628 T:C:G C T 10 0.527065433816109 0.660290908552413 ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126215242_126215644:DCPS;ENSG00000110063:ENST00000530860:exon_126215242_126215644:DCPS;ENSG00000110063:ENST00000529149:exon_126215242_126215611:DCPS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 128333503 T/C 1 18 24 42 8.51282219131004 12.6495704115866 -4.13674822027658 T:C T C 10 0.527065433816109 0.218577350649714 ENSG00000134954:ENST00000345075:exon_128333404_128333518:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000392668:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000319397:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000526145:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000530924:exon_128333404_128333524:ETS1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 130784488 A/G 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 A:G A G 10 0.527065433816109 0.160556933333404 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130784161_130786404:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130784161_130786344:SNX19 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 11 134047243 T/C 1 11 7 18 5.2022802280228 3.68945803671276 1.51282219131004 T:C T C 10 0.527065433816109 0.638183169005014 ENSG00000151503:ENST00000534532:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000281189:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000534548:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000525964:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000530396:exon_134047114_134047970:NCAPD3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 547683 T/C 1 4 8 12 1.89173826473556 4.21652347052887 -2.32478520579331 T:C T C 10 0.527065433816109 0.248670873824186 ENSG00000120647:ENST00000412006:exon_547501_547720:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000422000:exon_547501_547720:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000239830:exon_547501_547720:CCDC77 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 863152 G/A 1 7 6 13 3.31054196328724 3.16239260289665 0.148149360390583 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_862089_863490:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_862225_863490:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000447667:exon_862225_863490:WNK1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 988894 G/A 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 A:G G A 10 0.527065433816109 0.160556933333404 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_988739_989197:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_988739_989197:WNK1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 990912 A/C 1 8 5 13 3.78347652947113 2.63532716908055 1.14814936039058 A:C A C 10 0.527065433816109 0.588366380954527 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_990858_990955:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_990858_990955:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_990858_990955:WNK1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 994014 C/T 1 20 13 33 9.45869132367782 6.85185063960942 2.6068406840684 T:C C T 10 0.527065433816109 0.388602120912087 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_993815_995250:WNK1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 998365 G/T 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 T:G G T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_998306_998389:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_998306_998389:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_998306_998389:WNK1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 2968169 A/G 1 35 32 67 16.5527098164362 16.8660938821155 -0.313384065679305 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2966852_2968829:FOXM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 2997397 G/A 1 59 36 95 27.9031394048496 18.9743556173799 8.92878378746964 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0801654249503547 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 6560573 G/T 1 383 315 698 181.13393884843 166.025611652074 15.1083271963559 T:G G T 10 0.527065433816109 0.255670328376731 ENSG00000139193:ENST00000266557:exon_6560434_6560884:CD27 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 6562285 C/T 1 16 18 34 7.56695305894226 9.48717780868996 -1.92022474974771 T:C C T 10 0.527065433816109 0.607114972313979 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562233_6562463:TAPBPL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 6562293 C/T 1 13 15 28 6.14814936039058 7.90598150724164 -1.75783214685105 T:C C T 10 0.527065433816109 0.572286226612737 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562233_6562463:TAPBPL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 6562753 A/G 1 10 14 24 4.72934566183891 7.37891607342553 -2.64957041158662 A:G A G 10 0.527065433816109 0.311132051737374 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 6562810 A/G 1 22 2 24 10.4045604560456 1.05413086763222 9.35042958841338 A:G A G 10 0.527065433816109 0.00010142357563302 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 6562823 C/T 1 31 8 39 14.6609715517006 4.21652347052887 10.4444480811717 T:C C T 10 0.527065433816109 0.000655129735574517 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 6562836 G/A 1 34 15 49 16.0797752502523 7.90598150724164 8.17379374301066 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0216094962032565 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 6572048 A/G 1 47 35 82 22.2279246106429 18.4472901835638 3.78063442707906 A:G A G 10 0.527065433816109 0.439675541417635 ENSG00000139190:ENST00000396943:exon_6571406_6573652:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000361716:exon_6571406_6574107:VAMP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 6575044 G/T 1 9 7 16 4.25641109565502 3.68945803671276 0.566953058942256 T:G G T 10 0.527065433816109 0.808175848721287 ENSG00000139190:ENST00000400911:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000396943:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000361716:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000355479:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000396308:exon_6575008_6575166:VAMP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 6619284 C/G 1 7 6 13 3.31054196328724 3.16239260289665 0.148149360390583 C:G C G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6619241_6619299:NCAPD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 6631169 C/A 1 27 32 59 12.7692332869651 16.8660938821155 -4.09686059515043 A:C C A 10 0.527065433816109 0.299307337404182 ENSG00000010292:ENST00000382457:exon_6630964_6631203:NCAPD2;ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6630964_6631203:NCAPD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 6637845 T/C 1 87 105 192 41.1453072579985 55.3418705506914 -14.1965632926929 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0429334960971612 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6637845_6638022:NCAPD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 6638116 C/T 1 57 42 99 26.9572702724818 22.1367482202766 4.82052205220521 T:C C T 10 0.527065433816109 0.365466360015355 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6638111_6638205:NCAPD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 6639088 A/G 1 68 84 152 32.1595505005046 44.2734964405532 -12.1139459400486 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0513495850286617 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6638941_6639124:NCAPD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 6647109 T/C 1 7894 8 7902 3733.34546545564 4.21652347052887 3729.12894198511 T:C T C 10 0.527065433816109 4.94065645841247e-324 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646750_6647162:GAPDH HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 6787622 C/T 1 13 11 24 6.14814936039058 5.7977197719772 0.350429588413383 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000126746:ENST00000319770:exon_6787293_6787626:ZNF384;ENSG00000126746:ENST00000361959:exon_6787293_6787626:ZNF384;ENSG00000126746:ENST00000396795:exon_6787293_6787626:ZNF384;ENSG00000126746:ENST00000436774:exon_6787293_6787626:ZNF384;ENSG00000126746:ENST00000396799:exon_6787293_6787626:ZNF384;ENSG00000126746:ENST00000417772:exon_6787293_6787626:ZNF384;ENSG00000126746:ENST00000396801:exon_6787293_6787626:ZNF384 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 6887020 T/C 1 12 4 16 5.67521479420669 2.10826173526444 3.56695305894226 T:C T C 10 0.527065433816109 0.083657893276571 ENSG00000089692:ENST00000203629:exon_6886957_6887087:LAG3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 6954875 C/T 1 5 9 14 2.36467283091945 4.74358890434498 -2.37891607342553 T:C C T 10 0.527065433816109 0.284872281969498 ENSG00000111664:ENST00000229264:exon_6954750_6954966:GNB3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 6959751 A/G 1 43 36 79 20.3361863459073 18.9743556173799 1.36183072852739 A:G A G 10 0.527065433816109 0.82200530156151 ENSG00000111665:ENST00000229265:exon_6959631_6959760:CDCA3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 6965194 A/G 1 30 36 66 14.1880369855167 18.9743556173799 -4.7863186318632 A:G A G 10 0.527065433816109 0.267664985074733 ENSG00000111667:ENST00000229268:exon_6965181_6965314:USP5;ENSG00000111667:ENST00000389231:exon_6965181_6965314:USP5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 7022085 T/A 1 6 8 14 2.83760739710335 4.21652347052887 -1.37891607342553 A:T T A 10 0.527065433816109 0.59467204210446 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7021894_7022191:LRRC23 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 7023123 A/G 1 18 23 41 8.51282219131004 12.1225049777705 -3.60968278646047 A:G A G 10 0.527065433816109 0.276679885087024 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000382257:exon_7023055_7023405:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7023055_7023358:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000428946:exon_7023055_7023393:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000323702:exon_7023055_7023392:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000436789:exon_7023055_7023132:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000429740:exon_7023055_7023235:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000472633:exon_7023055_7023392:LRRC23 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 7047143 C/A 1 9 10 19 4.25641109565502 5.27065433816109 -1.01424324250607 A:C C A 10 0.527065433816109 0.654162232160302 ENSG00000111676:ENST00000356654:exon_7047008_7047230:ATN1;ENSG00000111676:ENST00000396684:exon_7047008_7047230:ATN1;ENSG00000111676:ENST00000229279:exon_7047008_7047230:ATN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 7287956 C/T 1 3 9 12 1.41880369855167 4.74358890434498 -3.32478520579331 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0800200924234215 ENSG00000139182:ENST00000266546:exon_7287923_7288131:CLSTN3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 8074192 G/A 1 11 18 29 5.2022802280228 9.48717780868996 -4.28489758066716 A:G G A 10 0.527065433816109 0.136626685226646 ENSG00000059804:ENST00000075120:exon_8071826_8074227:SLC2A3;ENSG00000059804:ENST00000486749:exon_8071827_8074227:SLC2A3;ENSG00000059804:ENST00000469295:exon_8073667_8074227:SLC2A3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 9094548 A/G 1 14 7 21 6.62108392657447 3.68945803671276 2.93162588986171 A:G A G 10 0.527065433816109 0.274579453085168 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 12630346 G/A 1 12 30 42 5.67521479420669 15.8119630144833 -10.1367482202766 A:G G A 10 0.527065433816109 0.00181656388565840 ENSG00000111266:ENST00000228862:exon_12628831_12630949:DUSP16;ENSG00000111266:ENST00000298573:exon_12628831_12630949:DUSP16 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 12633204 G/A 1 8 10 18 3.78347652947113 5.27065433816109 -1.48717780868996 A:G G A 10 0.527065433816109 0.49133381096339 ENSG00000111266:ENST00000228862:exon_12633157_12633280:DUSP16;ENSG00000111266:ENST00000298573:exon_12633157_12633280:DUSP16 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 12870938 G/A 1 35 34 69 16.5527098164362 17.9202247497477 -1.36751493331152 A:G G A 10 0.527065433816109 0.809732708588606 ENSG00000111276:ENST00000228872:exon_12870397_12871248:CDKN1B;ENSG00000111276:ENST00000396340:exon_12870756_12871248:CDKN1B;ENSG00000111276:ENST00000442489:exon_12870795_12870987:CDKN1B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 12871099 T/G 1 17 16 33 8.03988762512615 8.43304694105774 -0.393159315931598 T:G T G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000111276:ENST00000228872:exon_12870397_12871248:CDKN1B;ENSG00000111276:ENST00000396340:exon_12870756_12871248:CDKN1B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 12967127 C/T 1 22 20 42 10.4045604560456 10.5413086763222 -0.13674822027658 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000213782:ENST00000352940:exon_12967065_12967158:DDX47;ENSG00000213782:ENST00000358007:exon_12967065_12967158:DDX47;ENSG00000213782:ENST00000426619:exon_12967065_12967158:DDX47 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 21623969 A/G 1 45 49 94 21.2820554782751 25.8262062569893 -4.54415077871425 A:G A G 10 0.527065433816109 0.354563900467793 ENSG00000121350:ENST00000240651:exon_21621440_21624176:PYROXD1;ENSG00000004700:ENST00000396093:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000444129:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000421138:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000314748:exon_21623903_21624032:RECQL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 22213786 C/T 1 38 39 77 17.9715135149879 20.5555519188283 -2.5840384038404 T:C C T 10 0.527065433816109 0.570061531695144 ENSG00000111726:ENST00000229329:exon_22213766_22213860:CMAS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 24970966 G/A 1 14 6 20 6.62108392657447 3.16239260289665 3.45869132367782 A:G G A 10 0.527065433816109 0.177782475899471 ENSG00000060982:ENST00000261192:exon_24964281_24970983:BCAT1;ENSG00000060982:ENST00000342945:exon_24964281_24970983:BCAT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 25242595 C/G 1 30 40 70 14.1880369855167 21.0826173526444 -6.89458036712763 C:G C G 10 0.527065433816109 0.119163285072937 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242548_25242611:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242548_25242611:LRMP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 26551810 A/G 1 18 17 35 8.51282219131004 8.96011237487385 -0.447290183563815 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26551809_26551974:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26551809_26551974:ITPR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 26733062 T/C 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 T:C T C 10 0.527065433816109 0.757490641773051 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26732960_26733088:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26732960_26733088:ITPR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 26806955 G/A 1 10 3 13 4.72934566183891 1.58119630144833 3.14814936039058 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0984259133401166 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26806909_26807059:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26806909_26807059:ITPR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 26809412 T/G 1 7 2 9 3.31054196328724 1.05413086763222 2.25641109565502 T:G T G 10 0.527065433816109 0.185447766343339 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26809230_26809481:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26809230_26809481:ITPR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 29486745 T/C 1 6 7 13 2.83760739710335 3.68945803671276 -0.851850639609417 T:C T C 10 0.527065433816109 0.783042148004503 ENSG00000064763:ENST00000182377:exon_29486565_29487005:FAR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 31255405 C/T 1 5 6 11 2.36467283091945 3.16239260289665 -0.797719771977199 T:C C T 10 0.527065433816109 0.765666449819686 ENSG00000013573:ENST00000407793:exon_31255361_31255461:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000228264:exon_31255361_31255461:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000350437:exon_31255361_31255461:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000404673:exon_31255361_31255461:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000251758:exon_31255361_31255461:DDX11 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 32134943 A/G 1 14 4 18 6.62108392657447 2.10826173526444 4.51282219131004 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0352268999907301 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 32135441 T/C 1 3 8 11 1.41880369855167 4.21652347052887 -2.7977197719772 T:C T C 10 0.527065433816109 0.130149709511191 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 32137447 C/T 1 20 28 48 9.45869132367782 14.7578321468511 -5.29914082317323 T:C C T 10 0.527065433816109 0.148177844747361 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 32137512 C/G 1 21 21 42 9.93162588986171 11.0683741101383 -1.13674822027658 C:G C G 10 0.527065433816109 0.758957157762768 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 32875406 A/G 1 4 8 12 1.89173826473556 4.21652347052887 -2.32478520579331 A:G A G 10 0.527065433816109 0.248670873824186 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32875361_32875567:DNM1L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 32896365 G/C 1 24 30 54 11.3504295884134 15.8119630144833 -4.46153342606989 C:G G C 10 0.527065433816109 0.275473216814721 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32896288_32898584:DNM1L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 32896366 A/T 1 24 30 54 11.3504295884134 15.8119630144833 -4.46153342606989 A:T A T 10 0.527065433816109 0.275473216814721 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32896288_32898584:DNM1L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 32908237 C/A 1 27 19 46 12.7692332869651 10.0142432425061 2.75499004445898 A:C C A 10 0.527065433816109 0.462107335664755 ENSG00000139131:ENST00000324868:exon_32908030_32908874:YARS2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 32908518 G/A 1 23 19 42 10.8774950222295 10.0142432425061 0.86325177972342 A:G G A 10 0.527065433816109 0.87758689264439 ENSG00000139131:ENST00000324868:exon_32908030_32908874:YARS2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 38714929 A/G 1 5 5 10 2.36467283091945 2.63532716908055 -0.270654338161091 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000175548:ENST00000308742:exon_38713963_38723527:ALG10B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 44180295 G/A 1 6 10 16 2.83760739710335 5.27065433816109 -2.43304694105774 A:G G A 10 0.527065433816109 0.316907244333737 ENSG00000198001:ENST00000448290:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000431837:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000440781:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000356669:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000446056:exon_44180202_44180360:IRAK4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 47629368 G/T 1 2 12 14 0.945869132367782 6.32478520579331 -5.37891607342553 T:G G T 10 0.527065433816109 0.00536153701805031 ENSG00000179715:ENST00000321382:exon_47628790_47630439:FAM113B;ENSG00000179715:ENST00000432328:exon_47628790_47630439:FAM113B;ENSG00000179715:ENST00000330951:exon_47629207_47629770:FAM113B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 48468505 T/C 1 7 7 14 3.31054196328724 3.68945803671276 -0.378916073425526 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000079387:ENST00000004980:exon_48468473_48468576:SENP1;ENSG00000079387:ENST00000448372:exon_48468473_48468576:SENP1;ENSG00000079387:ENST00000339976:exon_48468473_48468576:SENP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 48477422 A/G 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 A:G A G 10 0.527065433816109 0.757490641773051 ENSG00000079387:ENST00000004980:exon_48477374_48477545:SENP1;ENSG00000079387:ENST00000448372:exon_48477374_48477545:SENP1;ENSG00000079387:ENST00000339976:exon_48477374_48477545:SENP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 48526712 G/A 1 16 9 25 7.56695305894226 4.74358890434498 2.82336415459727 A:G G A 10 0.527065433816109 0.3181294657177 ENSG00000152556:ENST00000340802:exon_48526651_48526840:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000359794:exon_48526651_48526840:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000395233:exon_48526651_48526840:PFKM HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 49230035 T/G 1 49 30 79 23.1737937430107 15.8119630144833 7.36183072852738 T:G T G 10 0.527065433816109 0.114308602533111 ENSG00000174243:ENST00000398375:exon_49229904_49230049:DDX23;ENSG00000174243:ENST00000308025:exon_49229904_49230049:DDX23 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 50189602 A/G 1 4 5 9 1.89173826473556 2.63532716908055 -0.743588904344981 A:G A G 10 0.527065433816109 0.743612144716174 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 50189807 C/A 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 A:C C A 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 50190160 C/T 1 7 9 16 3.31054196328724 4.74358890434498 -1.43304694105774 T:C C T 10 0.527065433816109 0.618149317471371 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 50190653 C/T 1 6 6 12 2.83760739710335 3.16239260289665 -0.324785205793308 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 50190667 A/T 1 5 6 11 2.36467283091945 3.16239260289665 -0.797719771977199 A:T A T 10 0.527065433816109 0.765666449819686 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 50232169 A/T 1 7 5 12 3.31054196328724 2.63532716908055 0.675214794206692 A:T A T 10 0.527065433816109 0.778351128206284 ENSG00000186666:ENST00000333924:exon_50231560_50232798:BCDIN3D HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 51203371 C/T 1 20 18 38 9.45869132367782 9.48717780868996 -0.0284864850121433 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000123268:ENST00000262053:exon_51203239_51203372:ATF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 51749611 G/A 1 12 10 22 5.67521479420669 5.27065433816109 0.404560456045601 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000139629:ENST00000356317:exon_51749590_51749742:GALNT6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 51773557 G/A 1 13 3 16 6.14814936039058 1.58119630144833 4.56695305894226 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0242272766688289 ENSG00000139629:ENST00000356317:exon_51773075_51773668:GALNT6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 53587468 T/G 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 T:G T G 10 0.527065433816109 0.488810537661758 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 53647373 T/C 1 24 31 55 11.3504295884134 16.3390284482994 -4.988598859886 T:C T C 10 0.527065433816109 0.223903712877637 ENSG00000182544:ENST00000328704:exon_53646602_53647536:MFSD5;ENSG00000182544:ENST00000329548:exon_53646602_53648188:MFSD5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 53680636 G/C 1 2 7 9 0.945869132367782 3.68945803671276 -2.74358890434498 C:G G C 10 0.527065433816109 0.094465581682091 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53679708_53680696:ESPL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 53682986 C/T 1 7 10 17 3.31054196328724 5.27065433816109 -1.96011237487385 T:C C T 10 0.527065433816109 0.467399584608424 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682874_53683087:ESPL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 53777171 A/G 1 3 11 14 1.41880369855167 5.7977197719772 -4.37891607342553 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0288253172835926 ENSG00000185591:ENST00000327443:exon_53775894_53777406:SP1;ENSG00000185591:ENST00000426431:exon_53775894_53777406:SP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 53875761 G/C 1 3 6 9 1.41880369855167 3.16239260289665 -1.74358890434498 C:G G C 10 0.527065433816109 0.323067031523113 ENSG00000139625:ENST00000444144:exon_53875725_53875995:MAP3K12;ENSG00000139625:ENST00000267079:exon_53875725_53875995:MAP3K12 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 54575458 T/C 1 41 24 65 19.3903172135395 12.6495704115866 6.74074680195291 T:C T C 10 0.527065433816109 0.106371780886056 ENSG00000123415:ENST00000508340:exon_54573783_54576174:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505128:exon_54575241_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000337581:exon_54575252_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000508394:exon_54575253_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505662:exon_54575269_54576407:SMUG1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 54911426 C/T 1 33 22 55 15.6068406840684 11.5954395439544 4.011401140114 T:C C T 10 0.527065433816109 0.344610371723735 ENSG00000123338:ENST00000293373:exon_54911317_54911426:NCKAP1L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 54970454 T/C 1 7 2 9 3.31054196328724 1.05413086763222 2.25641109565502 T:C T C 10 0.527065433816109 0.185447766343339 ENSG00000123360:ENST00000243052:exon_54970355_54970485:PDE1B;ENSG00000123360:ENST00000394277:exon_54970355_54970485:PDE1B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 56151291 T/C 1 54 43 97 25.5384665739301 22.6638136540927 2.87465291983742 T:C T C 10 0.527065433816109 0.611553271050864 ENSG00000205323:ENST00000444631:exon_56151167_56151337:SARNP;ENSG00000205323:ENST00000336133:exon_56151058_56151337:SARNP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 56435929 C/G 1 5 7 12 2.36467283091945 3.68945803671276 -1.32478520579331 C:G C G 10 0.527065433816109 0.566621218006073 ENSG00000197728:ENST00000356464:exon_56435686_56435953:RPS26 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 56750036 C/T 1 5 5 10 2.36467283091945 2.63532716908055 -0.270654338161091 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000170581:ENST00000314128:exon_56749916_56750069:STAT2;ENSG00000170581:ENST00000418572:exon_56749916_56750069:STAT2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 56814653 G/A 1 11 20 31 5.2022802280228 10.5413086763222 -5.33902844829938 A:G G A 10 0.527065433816109 0.070818349776375 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56814597_56814665:TIMELESS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 56815922 C/T 1 14 11 25 6.62108392657447 5.7977197719772 0.823364154597274 T:C C T 10 0.527065433816109 0.84228244308015 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56815890_56815975:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56815890_56815975:TIMELESS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 56822378 T/A 1 7 2 9 3.31054196328724 1.05413086763222 2.25641109565502 A:T T A 10 0.527065433816109 0.185447766343339 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56822333_56822436:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56822333_56822436:TIMELESS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 56827694 C/G 1 5 7 12 2.36467283091945 3.68945803671276 -1.32478520579331 C:G C G 10 0.527065433816109 0.566621218006073 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56827557_56827710:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56827557_56827710:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56827557_56827710:TIMELESS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 56992377 A/C 1 59 41 100 27.9031394048496 21.6096827864605 6.29345661838909 A:C A C 10 0.527065433816109 0.229737017293866 ENSG00000076108:ENST00000379441:exon_56989380_56992567:BAZ2A;ENSG00000076108:ENST00000179765:exon_56989380_56992567:BAZ2A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 57627074 G/T 1 221 173 394 104.51853912664 91.1823200501869 13.336219076453 A:T:G G T 10 0.527065433816109 0.189593524422587 ENSG00000182199:ENST00000449049:exon_57626963_57627128:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000393827:exon_57626963_57627128:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000328923:exon_57626963_57627128:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000414700:exon_57626963_57627128:SHMT2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 57649840 C/T 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000179912:ENST00000347140:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000429355:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000393811:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000402412:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000358907:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000403821:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000418182:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000438036:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000413953:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000441731:exon_57649773_57649857:R3HDM2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 58010163 A/G 1 7 6 13 3.31054196328724 3.16239260289665 0.148149360390583 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000240771:ENST00000333972:exon_58010067_58010278:ARHGEF25;ENSG00000240771:ENST00000286494:exon_58010067_58010278:ARHGEF25;ENSG00000240771:ENST00000471370:exon_58010067_58010278:ARHGEF25 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 58112189 A/G 1 157 190 347 74.2507268908709 100.142432425061 -25.8917055341898 A:G A G 10 0.527065433816109 0.00603582916474507 ENSG00000135506:ENST00000257966:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000315970:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000413095:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000435406:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000439210:exon_58111929_58112204:OS9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 58335626 A/T 1 13 9 22 6.14814936039058 4.74358890434498 1.4045604560456 A:T A T 10 0.527065433816109 0.670793133404155 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58335360_58335671:XRCC6BP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 58350631 C/T 1 19 10 29 8.98575675749393 5.27065433816109 3.71510241933284 T:C C T 10 0.527065433816109 0.194852812464932 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58350470_58351051:XRCC6BP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 64196045 C/T 1 13 11 24 6.14814936039058 5.7977197719772 0.350429588413383 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000118600:ENST00000261234:exon_64195871_64196185:TMEM5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 66546100 A/G 1 44 46 90 20.8091209120912 24.245009955541 -3.43588904344981 A:G A G 10 0.527065433816109 0.52672854103775 ENSG00000155957:ENST00000426857:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000358230:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000286424:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000398033:exon_66546051_66546156:TMBIM4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 69646914 G/A 1 51 47 98 24.1196628753784 24.7720753893571 -0.652412513978685 A:G G A 10 0.527065433816109 0.919655744310662 ENSG00000111605:ENST00000435070:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000266679:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000351671:exon_69646831_69646934:CPSF6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 72013832 A/G 1 1 8 9 0.472934566183891 4.21652347052887 -3.74358890434498 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0161943073002794 ENSG00000133858:ENST00000378743:exon_72013706_72013904:ZFC3H1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 75900588 A/G 1 12 14 26 5.67521479420669 7.37891607342553 -1.70370127921883 A:G A G 10 0.527065433816109 0.558800654726479 ENSG00000111615:ENST00000229214:exon_75900562_75900696:KRR1;ENSG00000111615:ENST00000438169:exon_75900562_75900696:KRR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 76453966 G/A 1 365 361 726 172.62111665712 190.270621607615 -17.6495049504952 A:G G A 10 0.527065433816109 0.193404885537099 ENSG00000187109:ENST00000393263:exon_76453918_76454059:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000261182:exon_76453918_76454059:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000431879:exon_76453918_76454059:NAP1L1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 80190650 C/G 1 27 43 70 12.7692332869651 22.6638136540927 -9.89458036712763 C:G C G 10 0.527065433816109 0.0223218169274422 ENSG00000058272:ENST00000261207:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000341878:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000312727:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000360825:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000450142:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000437004:exon_80190562_80190730:PPP1R12A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 93196422 T/G 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 T:G T G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000102189:ENST00000322349:exon_93196180_93196510:EEA1;ENSG00000102189:ENST00000418984:exon_93196180_93196510:EEA1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 94965487 G/A 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 A:G G A 10 0.527065433816109 0.160556933333404 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94960896_94965513:TMCC3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 94976084 T/C 1 5 6 11 2.36467283091945 3.16239260289665 -0.797719771977199 T:C T C 10 0.527065433816109 0.765666449819686 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 95681597 G/A 1 25 26 51 11.8233641545973 13.7037012792188 -1.88033712462156 A:G G A 10 0.527065433816109 0.674500080792558 ENSG00000028203:ENST00000436874:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000261219:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397792:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000356859:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397796:exon_95681440_95681633:VEZT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 95876908 G/A 1 3 6 9 1.41880369855167 3.16239260289665 -1.74358890434498 A:G G A 10 0.527065433816109 0.323067031523113 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 98926721 C/T 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 T:C C T 10 0.527065433816109 0.488810537661758 ENSG00000120802:ENST00000266732:exon_98926601_98928321:TMPO HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 98927830 C/G 1 11 15 26 5.2022802280228 7.90598150724164 -2.70370127921884 C:G C G 10 0.527065433816109 0.329044999714734 ENSG00000120802:ENST00000266732:exon_98926601_98928321:TMPO HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 99007356 T/C 1 31 28 59 14.6609715517006 14.7578321468511 -0.0968605951504333 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000166130:ENST00000342502:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000420861:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000393042:exon_99007183_99008118:IKBIP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 99007623 C/T 1 63 57 120 29.7948776695851 30.0427297275182 -0.247852057933084 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000166130:ENST00000342502:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000420861:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000393042:exon_99007183_99008118:IKBIP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 102108345 T/C 1 3 14 17 1.41880369855167 7.37891607342553 -5.96011237487385 T:C T C 10 0.527065433816109 0.00569841126221938 ENSG00000111666:ENST00000229266:exon_102108282_102108423:CHPT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 102117589 C/T 1 7 22 29 3.31054196328724 11.5954395439544 -8.28489758066716 T:C C T 10 0.527065433816109 0.00241639772418503 ENSG00000111666:ENST00000229266:exon_102117500_102117625:CHPT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 102158763 T/C 1 8 3 11 3.78347652947113 1.58119630144833 2.2022802280228 T:C T C 10 0.527065433816109 0.234094659981005 ENSG00000111670:ENST00000299314:exon_102157980_102159082:GNPTAB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 102295218 T/C 1 7 13 20 3.31054196328724 6.85185063960942 -3.54130867632218 T:C T C 10 0.527065433816109 0.122410043320359 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 102455729 G/A 1 29 21 50 13.7151024193328 11.0683741101383 2.64672830919455 A:G G A 10 0.527065433816109 0.4817003241602 ENSG00000120860:ENST00000240079:exon_102455690_102455899:CCDC53 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 104376693 G/A 0 0 22 22 0 11.5954395439544 -11.5954395439544 A G A 10 0.527065433816109 7.00847064292001e-08 ENSG00000139372:ENST00000392872:exon_104376577_104376712:TDG;ENSG00000139372:ENST00000266775:exon_104376577_104376712:TDG HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 104709559 C/T 1 8 7 15 3.78347652947113 3.68945803671276 0.0940184927583645 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000198431:ENST00000525566:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000429002:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526266:exon_104709555_104709604:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000503506:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526691:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000531691:exon_104709555_104709679:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000388854:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526390:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000531689:exon_104709555_104709610:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000529546:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526580:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000354940:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000524698:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000527688:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000378070:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000527335:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000397736:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000427956:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526950:exon_104709555_104709674:TXNRD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 108127965 A/G 1 15 6 21 7.09401849275836 3.16239260289665 3.93162588986171 A:G A G 10 0.527065433816109 0.124258383180660 ENSG00000110851:ENST00000228437:exon_108126644_108128299:PRDM4;ENSG00000110851:ENST00000446655:exon_108126644_108128299:PRDM4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 109536136 G/T 1 9 9 18 4.25641109565502 4.74358890434498 -0.487177808689962 T:G G T 10 0.527065433816109 0.81881957561072 ENSG00000076248:ENST00000336865:exon_109536007_109536443:UNG;ENSG00000076248:ENST00000446767:exon_109536132_109536197:UNG HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 109894028 A/G 1 3 6 9 1.41880369855167 3.16239260289665 -1.74358890434498 A:G A G 10 0.527065433816109 0.323067031523113 ENSG00000110906:ENST00000228495:exon_109893923_109894118:KCTD10;ENSG00000110906:ENST00000440541:exon_109893923_109894049:KCTD10;ENSG00000110906:ENST00000424763:exon_109893923_109894171:KCTD10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 109994870 A/T 1 70 53 123 33.1054196328724 27.9344679922538 5.17095164061859 A:T A T 10 0.527065433816109 0.36753722609709 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_109991525_109994941:MMAB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 110019338 C/T 1 20 9 29 9.45869132367782 4.74358890434498 4.71510241933284 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0943626462970606 ENSG00000110921:ENST00000392727:exon_110019200_110019355:MVK;ENSG00000110921:ENST00000447878:exon_110019200_110019355:MVK;ENSG00000110921:ENST00000228510:exon_110019200_110019355:MVK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 113388544 T/C 1 7 13 20 3.31054196328724 6.85185063960942 -3.54130867632218 T:C T C 10 0.527065433816109 0.122410043320359 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113388498_113388780:OAS3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 113825679 C/T 1 8 3 11 3.78347652947113 1.58119630144833 2.2022802280228 T:C C T 10 0.527065433816109 0.234094659981005 ENSG00000151176:ENST00000280800:exon_113825549_113825711:PLBD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 113826442 C/G 1 12 17 29 5.67521479420669 8.96011237487385 -3.28489758066716 C:G C G 10 0.527065433816109 0.265505019787144 ENSG00000151176:ENST00000280800:exon_113826264_113827201:PLBD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 114400207 G/A 1 12 11 23 5.67521479420669 5.7977197719772 -0.122504977770507 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114400037_114400219:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114400037_114400219:RBM19 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 117465981 T/C 1 9 1 10 4.25641109565502 0.527065433816109 3.72934566183891 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0232976587027389 ENSG00000174989:ENST00000309909:exon_117465833_117468953:FBXW8;ENSG00000174989:ENST00000455858:exon_117465833_117468953:FBXW8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 117476896 C/A 1 38 32 70 17.9715135149879 16.8660938821155 1.10541963287237 A:C C A 10 0.527065433816109 0.811940360907092 ENSG00000088992:ENST00000470612:exon_117476728_117477015:TESC;ENSG00000088992:ENST00000335209:exon_117476729_117477015:TESC;ENSG00000088992:ENST00000392545:exon_117476729_117477015:TESC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 120589064 G/C 1 3 10 13 1.41880369855167 5.27065433816109 -3.85185063960942 C:G G C 10 0.527065433816109 0.048374706262986 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120588949_120589195:GCN1L1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 120589160 A/G 1 6 15 21 2.83760739710335 7.90598150724164 -5.06837411013829 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0295301958115794 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120588949_120589195:GCN1L1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 120591143 A/G 1 6 3 9 2.83760739710335 1.58119630144833 1.25641109565502 A:G A G 10 0.527065433816109 0.513555929047552 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120591017_120591211:GCN1L1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 120636549 C/A 1 59 17 76 27.9031394048496 8.96011237487385 18.9430270299757 A:C C A 10 0.527065433816109 8.99125105485768e-06 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 120661977 T/C 1 10 3 13 4.72934566183891 1.58119630144833 3.14814936039058 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0984259133401166 ENSG00000089159:ENST00000424649:exon_120661954_120662180:PXN;ENSG00000089159:ENST00000228307:exon_120661954_120662180:PXN;ENSG00000089159:ENST00000267257:exon_120661954_120662180:PXN;ENSG00000089159:ENST00000458477:exon_120661954_120662180:PXN;ENSG00000089159:ENST00000323871:exon_120661954_120662183:PXN;ENSG00000089159:ENST00000440827:exon_120661954_120662180:PXN;ENSG00000089159:ENST00000331257:exon_120661954_120662180:PXN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 120960057 C/T 1 18 21 39 8.51282219131004 11.0683741101383 -2.55555191882825 T:C C T 10 0.527065433816109 0.427246720594883 ENSG00000110871:ENST00000288532:exon_120960017_120960166:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000445328:exon_120960017_120960166:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000302223:exon_120960017_120960166:COQ5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 121174899 T/C 1 9 16 25 4.25641109565502 8.43304694105774 -4.17663584540273 T:C T C 10 0.527065433816109 0.110142448138222 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121174789_121174938:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121174789_121174938:ACADS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 121176083 G/A 1 36 27 63 17.0256443826201 14.2307667130349 2.79487766958513 A:G G A 10 0.527065433816109 0.529144788399096 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176083_121176253:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176083_121176253:ACADS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 121176679 C/T 1 42 34 76 19.8632517797234 17.9202247497477 1.94302702997571 T:C C T 10 0.527065433816109 0.73067271976469 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176623_121176718:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176623_121176718:ACADS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 121177272 G/C 1 60 49 109 28.3760739710335 25.8262062569893 2.54986771404411 C:G G C 10 0.527065433816109 0.633108496632721 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121177099_121177810:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121177099_121177810:ACADS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 121442199 T/A 1 10 13 23 4.72934566183891 6.85185063960942 -2.12250497777051 A:T T A 10 0.527065433816109 0.409255873477579 ENSG00000157895:ENST00000288757:exon_121440848_121442292:C12orf43;ENSG00000157895:ENST00000445832:exon_121440848_121442295:C12orf43 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 121458759 G/A 1 26 15 41 12.2962987207812 7.90598150724164 4.39031721353953 A:G G A 10 0.527065433816109 0.210674491710289 ENSG00000135114:ENST00000257570:exon_121458121_121458861:OASL;ENSG00000135114:ENST00000339275:exon_121458519_121458861:OASL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 121471337 G/A 1 16 18 34 7.56695305894226 9.48717780868996 -1.92022474974771 A:G G A 10 0.527065433816109 0.607114972313979 ENSG00000135114:ENST00000257570:exon_121471264_121471546:OASL;ENSG00000135114:ENST00000339275:exon_121471264_121471546:OASL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 121476658 G/A 1 6 7 13 2.83760739710335 3.68945803671276 -0.851850639609417 A:G G A 10 0.527065433816109 0.783042148004503 ENSG00000135114:ENST00000257570:exon_121476577_121477045:OASL;ENSG00000135114:ENST00000339275:exon_121476577_121476959:OASL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 121660787 T/C 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 T:C T C 10 0.527065433816109 0.160556933333404 ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121660750_121660846:P2RX4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 121678558 C/T 1 6 2 8 2.83760739710335 1.05413086763222 1.78347652947113 T:C C T 10 0.527065433816109 0.29481715391141 ENSG00000110931:ENST00000347034:exon_121675497_121678672:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000324774:exon_121675497_121678672:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392474:exon_121675497_121678672:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000337174:exon_121675497_121678672:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000402834:exon_121678341_121678672:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000404169:exon_121678341_121678672:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000412367:exon_121678341_121678672:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000360452:exon_121678341_121678672:CAMKK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 121712077 T/A 1 4 5 9 1.89173826473556 2.63532716908055 -0.743588904344981 A:T T A 10 0.527065433816109 0.743612144716174 ENSG00000110931:ENST00000347034:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000324774:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392474:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000337174:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000446440:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000402834:exon_121711859_121712329:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000404169:exon_121711859_121712329:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000412367:exon_121711859_121712329:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000360452:exon_121711859_121712329:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392473:exon_121711859_121712388:CAMKK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 121878659 C/T 1 25 18 43 11.8233641545973 9.48717780868996 2.33618634590731 T:C C T 10 0.527065433816109 0.542438582027985 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121878619_121878780:KDM2B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 121880520 G/A 1 34 29 63 16.0797752502523 15.2848975806672 0.794877669585132 A:G G A 10 0.527065433816109 0.899895745439529 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121879960_121880642:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121879960_121880639:KDM2B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 121881848 G/A 1 37 19 56 17.498578948804 10.0142432425061 7.48433570629789 A:G G A 10 0.527065433816109 0.060008606291716 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121881815_121882084:KDM2B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 122079441 T/C 1 93 126 219 43.9829146551019 66.4102446608297 -22.4273300057279 T:C T C 10 0.527065433816109 0.00282427464556474 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 122353796 A/G 1 43 48 91 20.3361863459073 25.2991408231732 -4.96295447726592 A:G A G 10 0.527065433816109 0.344791106974243 ENSG00000110801:ENST00000261817:exon_122353762_122353850:PSMD9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 122617989 A/G 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000175727:ENST00000319080:exon_122617895_122618534:MLXIP;ENSG00000175727:ENST00000377037:exon_122617982_122618077:MLXIP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 122618131 A/G 1 5 6 11 2.36467283091945 3.16239260289665 -0.797719771977199 A:G A G 10 0.527065433816109 0.765666449819686 ENSG00000175727:ENST00000319080:exon_122617895_122618534:MLXIP;ENSG00000175727:ENST00000377037:exon_122618129_122618689:MLXIP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 123351975 T/C 1 7 7 14 3.31054196328724 3.68945803671276 -0.378916073425526 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000139722:ENST00000267202:exon_123349882_123352154:VPS37B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 123466111 C/T 1 20 16 36 9.45869132367782 8.43304694105774 1.02564438262007 T:C C T 10 0.527065433816109 0.867743765953611 ENSG00000182196:ENST00000392433:exon_123465364_123466426:ARL6IP4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 123799974 A/G 1 10 7 17 4.72934566183891 3.68945803671276 1.03988762512615 A:G A G 10 0.527065433816109 0.637665492029096 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123799920_123799991:SBNO1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 123810873 G/A 1 17 11 28 8.03988762512615 5.7977197719772 2.24216785314895 A:G G A 10 0.527065433816109 0.45216611994601 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123810699_123810881:SBNO1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 124144395 A/G 1 12 9 21 5.67521479420669 4.74358890434498 0.931625889861711 A:G A G 10 0.527065433816109 0.827834701908173 ENSG00000111358:ENST00000228955:exon_124144342_124144477:GTF2H3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 124229429 T/C 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000185344:ENST00000330342:exon_124229429_124229519:ATP6V0A2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 124422135 C/T 1 19 26 45 8.98575675749393 13.7037012792188 -4.71794452172491 T:C C T 10 0.527065433816109 0.179853878045916 ENSG00000119242:ENST00000238156:exon_124420983_124422377:CCDC92 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 124427306 T/A 1 7 15 22 3.31054196328724 7.90598150724164 -4.5954395439544 A:T T A 10 0.527065433816109 0.05593119353183 ENSG00000119242:ENST00000238156:exon_124427291_124427332:CCDC92 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 124496864 T/G 0 19 0 19 8.98575675749393 0 8.98575675749393 T T 10 0.527065433816109 5.85564597738366e-06 ENSG00000179195:ENST00000337815:exon_124496093_124499951:ZNF664;ENSG00000179195:ENST00000392404:exon_124496093_124499965:ZNF664 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 124497113 A/G 0 27 0 27 12.7692332869651 0 12.7692332869651 A A 10 0.527065433816109 3.25854994353295e-08 ENSG00000179195:ENST00000337815:exon_124496093_124499951:ZNF664;ENSG00000179195:ENST00000392404:exon_124496093_124499965:ZNF664 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 124826462 C/T 1 18 15 33 8.51282219131004 7.90598150724164 0.606840684068402 T:C C T 10 0.527065433816109 0.863380846524397 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000453428:exon_124826369_124826601:NCOR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 124856618 A/G 1 18 24 42 8.51282219131004 12.6495704115866 -4.13674822027658 A:G A G 10 0.527065433816109 0.218577350649714 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124856568_124857156:NCOR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 124856660 T/A 1 13 15 28 6.14814936039058 7.90598150724164 -1.75783214685105 A:T T A 10 0.527065433816109 0.572286226612737 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124856568_124857156:NCOR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 124957627 C/T 1 7 2 9 3.31054196328724 1.05413086763222 2.25641109565502 T:C C T 10 0.527065433816109 0.185447766343339 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000420698:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000448008:exon_124957498_124957677:NCOR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 124979789 T/G 1 7 1 8 3.31054196328724 0.527065433816109 2.78347652947113 T:G T G 10 0.527065433816109 0.0735220313078182 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124979693_124979798:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000420698:exon_124979693_124979914:NCOR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 125398039 G/C 1 1611 1636 3247 761.897586122248 862.279049723154 -100.381463600906 A:T:C:G G C 10 0.527065433816109 0.000438191308132513 ENSG00000150991:ENST00000339647:exon_125396194_125398320:UBC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 129278864 A/G 1 49 52 101 23.1737937430107 27.4074025584377 -4.23360881542702 A:G A G 10 0.527065433816109 0.426024488028243 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129277739_129278901:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129278765_129278901:SLC15A4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 129293346 C/T 1 25 31 56 11.8233641545973 16.3390284482994 -4.51566429370211 T:C C T 10 0.527065433816109 0.231786854797879 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129293333_129293501:SLC15A4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 132284053 G/A 1 44 29 73 20.8091209120912 15.2848975806672 5.52422333142404 A:G G A 10 0.527065433816109 0.199872061103863 ENSG00000061936:ENST00000261674:exon_132283968_132284282:SFSWAP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 133212582 G/A 1 14 4 18 6.62108392657447 2.10826173526444 4.51282219131004 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0352268999907301 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133212478_133212610:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133212478_133212610:POLE;ENSG00000177084:ENST00000434528:exon_133212478_133212610:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133212478_133212610:POLE HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 133277873 G/A 1 25 25 50 11.8233641545973 13.1766358454027 -1.35327169080545 A:G G A 10 0.527065433816109 0.77744172481451 ENSG00000176894:ENST00000317479:exon_133277836_133277955:PGAM5;ENSG00000176894:ENST00000428960:exon_133277836_133277955:PGAM5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 133331537 G/A 1 15 15 30 7.09401849275836 7.90598150724164 -0.811963014483272 A:G G A 10 0.527065433816109 0.855562656731326 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133331261_133331719:ANKLE2;ENSG00000176915:ENST00000337516:exon_133331261_133331719:ANKLE2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 133683261 T/C 1 26 22 48 12.2962987207812 11.5954395439544 0.700859176826766 T:C T C 10 0.527065433816109 0.885763109275193 ENSG00000196387:ENST00000355557:exon_133682096_133684260:ZNF140 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 12 133768553 A/T 1 8 5 13 3.78347652947113 2.63532716908055 1.14814936039058 A:T A T 10 0.527065433816109 0.588366380954527 ENSG00000090612:ENST00000416488:exon_133768494_133768589:ZNF268;ENSG00000090612:ENST00000228289:exon_133768494_133768589:ZNF268 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 21735998 T/C 1 7 7 14 3.31054196328724 3.68945803671276 -0.378916073425526 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000165480:ENST00000298260:exon_21735929_21736014:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000314759:exon_21735929_21736014:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000400018:exon_21735929_21736014:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000465471:exon_21735929_21736014:SKA3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 23929842 T/C 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000455470:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000445163:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000399986:exon_23928658_23930146:SACS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 24436475 C/T 1 8 4 12 3.78347652947113 2.10826173526444 1.67521479420669 T:C C T 10 0.527065433816109 0.396148353996528 ENSG00000027001:ENST00000382172:exon_24436441_24436501:MIPEP;ENSG00000027001:ENST00000494139:exon_24436441_24436501:MIPEP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 25029218 C/T 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25029155_25029350:PARP4;ENSG00000102699:ENST00000484989:exon_25029155_25029272:PARP4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 25029295 C/T 1 8 11 19 3.78347652947113 5.7977197719772 -2.01424324250607 T:C C T 10 0.527065433816109 0.369297985076747 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25029155_25029350:PARP4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 26788114 A/G 1 40 38 78 18.9173826473556 20.0284864850121 -1.11110383765651 A:G A G 10 0.527065433816109 0.821356918884759 ENSG00000127870:ENST00000346166:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381588:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000399762:exon_26786906_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381570:exon_26786912_26789729:RNF6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 28239970 G/A 1 143 133 276 67.6296429642964 70.0997026975425 -2.47005973324609 A:C:G G A 10 0.527065433816109 0.809510842200681 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 36886469 T/C 1 4 7 11 1.89173826473556 3.68945803671276 -1.7977197719772 T:C T C 10 0.527065433816109 0.36886039388561 ENSG00000133104:ENST00000438666:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000355182:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000451493:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000423217:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000494062:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000491805:exon_36886456_36886721:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000460126:exon_36886456_36886548:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000475603:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000482146:exon_36886456_36886614:SPG20 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 37580139 G/A 1 15 19 34 7.09401849275836 10.0142432425061 -2.92022474974771 A:G G A 10 0.527065433816109 0.3909112203143 ENSG00000120699:ENST00000489088:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000389704:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000379809:exon_37580095_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000239893:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000474661:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000490537:exon_37580094_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000488779:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000464235:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000495092:exon_37580057_37580162:EXOSC8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 37583831 G/A 1 42 57 99 19.8632517797234 30.0427297275182 -10.1794779477948 A:G G A 10 0.527065433816109 0.044030958736931 ENSG00000102710:ENST00000490716:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000484078:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000360252:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000483214:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000475892:exon_37583630_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000350612:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000472948:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000356185:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000469488:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000473871:exon_37583634_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000464744:exon_37583754_37583946:FAM48A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 39586343 G/C 1 54 37 91 25.5384665739301 19.501421051196 6.03704552273408 C:G G C 10 0.527065433816109 0.209768224662615 ENSG00000120685:ENST00000484434:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000468017:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000492646:exon_39586220_39586612:C13orf23 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 39587166 A/G 1 52 70 122 24.5925974415623 36.8945803671276 -12.3019829255653 A:T:G A G 10 0.527065433816109 0.0292545117016993 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 39587677 A/G 1 29 38 67 13.7151024193328 20.0284864850121 -6.31338406567931 A:T:G A G 10 0.527065433816109 0.141858815973820 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 39587865 A/C 1 49 45 94 23.1737937430107 23.7179445217249 -0.544150778714251 A:C A C 10 0.527065433816109 0.918120559931059 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 39587889 T/C 1 50 52 102 23.6467283091945 27.4074025584377 -3.76067424924312 T:C T C 10 0.527065433816109 0.488190254514119 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 41834744 C/T 1 3 11 14 1.41880369855167 5.7977197719772 -4.37891607342553 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0288253172835926 ENSG00000120662:ENST00000430347:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379480:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379477:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000486236:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000452359:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000497679:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000239852:exon_41834629_41835051:MTRF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 42032572 T/C 1 6 3 9 2.83760739710335 1.58119630144833 1.25641109565502 T:C T C 10 0.527065433816109 0.513555929047552 ENSG00000102760:ENST00000379359:exon_42032421_42032606:C13orf15 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 43462352 T/C 1 63 57 120 29.7948776695851 30.0427297275182 -0.247852057933084 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43460524_43462638:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43462118_43462638:EPSTI1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 43597865 A/G 1 14 7 21 6.62108392657447 3.68945803671276 2.93162588986171 A:G A G 10 0.527065433816109 0.274579453085168 ENSG00000120675:ENST00000379221:exon_43597339_43597870:DNAJC15;ENSG00000120675:ENST00000474320:exon_43597339_43597870:DNAJC15 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 44543675 G/A 0 57 1 58 26.9572702724818 0.527065433816109 26.4302048386657 C:G G C 10 0.527065433816109 4.20680039502635e-15 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 45563464 G/C 1 10 8 18 4.72934566183891 4.21652347052887 0.512822191310037 C:G G C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000083635:ENST00000379161:exon_45563160_45563618:NUFIP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 46559482 T/C 1 24 36 60 11.3504295884134 18.9743556173799 -7.62392602896654 T:C T C 10 0.527065433816109 0.052709210740218 ENSG00000123200:ENST00000242848:exon_46559432_46559896:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000378921:exon_46559432_46559896:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000282007:exon_46559432_46559896:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000431251:exon_46559432_46559896:ZC3H13 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 46946157 C/T 1 12 34 46 5.67521479420669 17.9202247497477 -12.245009955541 T:C C T 10 0.527065433816109 0.000311762997134494 ENSG00000102445:ENST00000378797:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000429979:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378781:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378787:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000441284:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000389908:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378784:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000322896:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000417405:exon_46946076_46946213:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000439642:exon_46946076_46946732:C13orf18 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 48547467 A/T 1 7 8 15 3.31054196328724 4.21652347052887 -0.905981507241636 A:T A T 10 0.527065433816109 0.797198000532565 ENSG00000136143:ENST00000378654:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000378645:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000378642:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000331052:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000434484:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000433022:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000497202:exon_48547399_48547527:SUCLA2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 50050983 A/G 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50050612_50051175:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50050612_50051175:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50050612_50051175:SETDB2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 50102810 G/A 1 126 97 223 59.5897553391703 51.1253470801626 8.46440825900768 A:G G A 10 0.527065433816109 0.283248628753903 ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50102647_50103123:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50102647_50103111:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000426879:exon_50102647_50102844:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50102647_50103117:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000486276:exon_50102647_50103112:PHF11 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 50108252 T/C 1 4 8 12 1.89173826473556 4.21652347052887 -2.32478520579331 T:C T C 10 0.527065433816109 0.248670873824186 ENSG00000136144:ENST00000258646:exon_50106082_50108398:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000378302:exon_50106090_50108398:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000471984:exon_50108054_50108398:RCBTB1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 50204880 G/A 1 12 3 15 5.67521479420669 1.58119630144833 4.09401849275836 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0390849308207645 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 50205025 T/C 1 6 12 18 2.83760739710335 6.32478520579331 -3.48717780868996 T:C T C 10 0.527065433816109 0.154794984631189 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 50283819 T/C 1 2 11 13 0.945869132367782 5.7977197719772 -4.85185063960942 T:C T C 10 0.527065433816109 0.00972131543990577 ENSG00000102753:ENST00000261667:exon_50283708_50283836:KPNA3;ENSG00000102753:ENST00000457886:exon_50283708_50283836:KPNA3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 52602919 A/C 1 4 6 10 1.89173826473556 3.16239260289665 -1.27065433816109 A:C A C 10 0.527065433816109 0.532268681489131 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 52603194 G/T 1 9 4 13 4.25641109565502 2.10826173526444 2.14814936039058 T:G G T 10 0.527065433816109 0.276012087147778 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 52603775 C/T 1 8 6 14 3.78347652947113 3.16239260289665 0.621083926574474 T:C C T 10 0.527065433816109 0.794786264772641 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 73349359 G/C 1 12 17 29 5.67521479420669 8.96011237487385 -3.28489758066716 C:G G C 10 0.527065433816109 0.265505019787144 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73349349_73349513:DIS3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 73350079 T/C 1 12 9 21 5.67521479420669 4.74358890434498 0.931625889861711 T:C T C 10 0.527065433816109 0.827834701908173 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73350063_73350230:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73350063_73350230:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73350063_73350230:DIS3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 76397731 G/A 1 6 3 9 2.83760739710335 1.58119630144833 1.25641109565502 A:G G A 10 0.527065433816109 0.513555929047552 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76397701_76398009:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377499:exon_76397701_76398009:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76397701_76398009:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76397701_76398009:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76397701_76398009:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76397701_76398009:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76397701_76398009:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000447038:exon_76397701_76398009:LMO7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 76423248 T/C 1 8 2 10 3.78347652947113 1.05413086763222 2.72934566183891 T:C T C 10 0.527065433816109 0.114525614534534 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76423112_76423428:LMO7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 76427347 C/A 0 10 0 10 4.72934566183891 0 4.72934566183891 C C 10 0.527065433816109 0.00221418962581423 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76427228_76427524:LMO7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 76427403 G/A 1 12 3 15 5.67521479420669 1.58119630144833 4.09401849275836 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0390849308207645 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76427228_76427524:LMO7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 76427410 C/G 1 13 3 16 6.14814936039058 1.58119630144833 4.56695305894226 C:G C G 10 0.527065433816109 0.0242272766688289 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76427228_76427524:LMO7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 77632470 C/T 1 13 13 26 6.14814936039058 6.85185063960942 -0.703701279218835 T:C C T 10 0.527065433816109 0.84562040810587 ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77632353_77632541:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77632353_77632541:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000429715:exon_77632353_77632541:MYCBP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 77641789 T/C 1 8 14 22 3.78347652947113 7.37891607342553 -3.5954395439544 T:C T C 10 0.527065433816109 0.138871874223119 ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77641716_77641999:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77641716_77641999:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000429715:exon_77641716_77641999:MYCBP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 79940811 T/C 1 6 7 13 2.83760739710335 3.68945803671276 -0.851850639609417 T:C T C 10 0.527065433816109 0.783042148004503 ENSG00000139746:ENST00000484573:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000267229:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438737:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438724:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000327303:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000453752:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000461008:exon_79940768_79940845:RBM26 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 99105395 G/A 1 56 25 81 26.4843357062979 13.1766358454027 13.3076998608952 A:C:G G A 10 0.527065433816109 0.00356288633741672 ENSG00000102572:ENST00000397517:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376554:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376547:exon_99104413_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376541:exon_99104414_99105463:STK24 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 99947261 C/T 1 164 179 343 77.5612688541581 94.3447126530835 -16.7834437989254 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0742763722956427 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 103492092 G/A 1 17 11 28 8.03988762512615 5.7977197719772 2.24216785314895 A:G G A 10 0.527065433816109 0.45216611994601 ENSG00000134897:ENST00000257336:exon_103491922_103493881:BIVM;ENSG00000134897:ENST00000448849:exon_103491901_103492215:BIVM;ENSG00000134897:ENST00000419638:exon_103491922_103492168:BIVM;ENSG00000134897:ENST00000418659:exon_103491922_103492240:BIVM;ENSG00000134897:ENST00000490317:exon_103491922_103492513:BIVM HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 103504517 T/C 1 10 11 21 4.72934566183891 5.7977197719772 -1.06837411013829 T:C T C 10 0.527065433816109 0.667942291105539 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472151:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375958:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375955:exon_103504468_103504643:ERCC5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 111176393 A/G 1 6 10 16 2.83760739710335 5.27065433816109 -2.43304694105774 A:G A G 10 0.527065433816109 0.316907244333737 ENSG00000139832:ENST00000267328:exon_111175417_111176544:RAB20 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 111279844 G/A 1 13 9 22 6.14814936039058 4.74358890434498 1.4045604560456 A:G G A 10 0.527065433816109 0.670793133404155 ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111279786_111279899:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000424185:exon_111279786_111279894:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000397191:exon_111279786_111279894:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111279786_111279894:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000439607:exon_111279786_111279894:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111279786_111279894:CARKD HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 111290880 G/A 1 43 15 58 20.3361863459073 7.90598150724164 12.4302048386657 A:G G A 10 0.527065433816109 0.00094136278237805 ENSG00000213995:ENST00000458711:exon_111290725_111291452:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111290725_111290892:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111290725_111292340:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111290589_111292340:CARKD HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 111298392 A/G 1 30 22 52 14.1880369855167 11.5954395439544 2.59259744156233 A:G A G 10 0.527065433816109 0.490882199034543 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111298314_111298420:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000487253:exon_111298314_111298643:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000480437:exon_111298314_111298625:CARS2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 111340342 G/A 1 19 16 35 8.98575675749393 8.43304694105774 0.552709816436183 A:G G A 10 0.527065433816109 0.867565017882364 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111340294_111340365:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000465145:exon_111340294_111340365:CARS2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 111371958 G/A 1 21 28 49 9.93162588986171 14.7578321468511 -4.82620625698934 A:G G A 10 0.527065433816109 0.197863822869172 ENSG00000153487:ENST00000338450:exon_111371576_111372522:ING1;ENSG00000153487:ENST00000333219:exon_111371576_111373421:ING1;ENSG00000153487:ENST00000375775:exon_111371576_111372522:ING1;ENSG00000153487:ENST00000375777:exon_111371576_111373420:ING1;ENSG00000153487:ENST00000375774:exon_111371576_111373418:ING1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 115002305 G/A 1 25 19 44 11.8233641545973 10.0142432425061 1.8091209120912 A:G G A 10 0.527065433816109 0.651788664604569 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115002277_115002371:CDC16 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 115004914 C/T 1 8 9 17 3.78347652947113 4.74358890434498 -0.960112374873853 T:C C T 10 0.527065433816109 0.80902600536977 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115004785_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115004825_115004965:CDC16 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 115004935 T/C 1 16 15 31 7.56695305894226 7.90598150724164 -0.339028448299381 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115004785_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115004825_115004965:CDC16 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 115030714 T/C 1 85 133 218 40.1994381256307 70.0997026975425 -29.9002645719118 T:C T C 10 0.527065433816109 5.72963268285815e-05 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000461716:exon_115030368_115030715:CDC16 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 13 115047305 G/A 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 A:G G A 10 0.527065433816109 0.757490641773051 ENSG00000169062:ENST00000375299:exon_115047059_115047321:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000492270:exon_115047078_115047321:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000351487:exon_115047103_115047321:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000484246:exon_115047120_115047321:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000480362:exon_115047195_115047321:UPF3A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 20824181 T/C 1 21 23 44 9.93162588986171 12.1225049777705 -2.1908790879088 T:C T C 10 0.527065433816109 0.547870250177767 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000446919:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000532299:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000530598:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000534664:exon_20824069_20824190:PARP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 20825965 A/C 1 26 31 57 12.2962987207812 16.3390284482994 -4.04272972751822 A:C A C 10 0.527065433816109 0.291796715148721 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20825555_20826062:PARP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 20916249 T/C 1 8 1 9 3.78347652947113 0.527065433816109 3.25641109565502 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0415432498690979 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 20916958 T/C 1 30 27 57 14.1880369855167 14.2307667130349 -0.0427297275182159 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20916892_20916970:OSGEP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 20925154 T/G 1 313 315 628 148.028519215558 166.025611652074 -17.9970924365165 T:G T G 10 0.527065433816109 0.150505162230289 ENSG00000100823:ENST00000442613:exon_20925150_20925925:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000216714:exon_20925150_20925933:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000398030:exon_20925150_20925895:APEX1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 20940515 C/T 1 10 12 22 4.72934566183891 6.32478520579331 -1.5954395439544 T:C C T 10 0.527065433816109 0.528175996250381 ENSG00000198805:ENST00000361505:exon_20940467_20940636:PNP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 21929367 A/G 1 4 10 14 1.89173826473556 5.27065433816109 -3.37891607342553 A:G A G 10 0.527065433816109 0.10564189817501 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21929105_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21929105_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000417141:exon_21929357_21929462:RAB2B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 21960816 T/C 1 27 22 49 12.7692332869651 11.5954395439544 1.17379374301066 T:C T C 10 0.527065433816109 0.776222455481774 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 21960969 G/A 1 47 51 98 22.2279246106429 26.8803371246216 -4.65241251397869 A:G G A 10 0.527065433816109 0.363695789080450 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 21967916 A/G 1 44 37 81 20.8091209120912 19.501421051196 1.30769986089517 A:G A G 10 0.527065433816109 0.824261379059883 ENSG00000165819:ENST00000298717:exon_21967908_21967946:METTL3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 21968619 A/G 1 6 7 13 2.83760739710335 3.68945803671276 -0.851850639609417 A:G A G 10 0.527065433816109 0.783042148004503 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 23236524 C/T 1 32 46 78 15.1339061178845 24.245009955541 -9.1111038376565 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0413846129253301 ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000483939:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000473744:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000431881:exon_23236457_23236623:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23236491_23236618:OXA1L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 23242828 T/C 1 35 31 66 16.5527098164362 16.3390284482994 0.213681368136804 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000404278:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23242447_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23242462_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23242462_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23242499_23242925:SLC7A7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 23282110 A/G 1 10 7 17 4.72934566183891 3.68945803671276 1.03988762512615 A:G A G 10 0.527065433816109 0.637665492029096 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000404278:exon_23282109_23282416:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23282109_23282649:SLC7A7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 23282449 C/T 1 15 5 20 7.09401849275836 2.63532716908055 4.45869132367782 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0705444615831227 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000488800:exon_23282184_23282649:SLC7A7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 23341951 C/T 1 27 27 54 12.7692332869651 14.2307667130349 -1.46153342606989 T:C C T 10 0.527065433816109 0.785492693376586 ENSG00000197324:ENST00000359591:exon_23341947_23341991:LRP10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 23374435 G/A 1 19 16 35 8.98575675749393 8.43304694105774 0.552709816436183 A:G G A 10 0.527065433816109 0.867565017882364 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000307814:exon_23374303_23374455:RBM23 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 23374862 C/T 1 9 18 27 4.25641109565502 9.48717780868996 -5.23076671303494 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0532568708901856 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000307814:exon_23374815_23374868:RBM23 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 23467664 G/A 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 A:G G A 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000100802:ENST00000299088:exon_23467636_23468611:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000341470:exon_23467636_23468611:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000397382:exon_23467636_23468365:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000397380:exon_23467636_23468365:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000397379:exon_23467636_23468365:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000397377:exon_23467636_23467950:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000397376:exon_23467636_23467950:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000406429:exon_23467636_23468365:C14orf93 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 23745062 G/A 1 21 27 48 9.93162588986171 14.2307667130349 -4.29914082317323 A:G G A 10 0.527065433816109 0.247929025438883 ENSG00000215271:ENST00000357460:exon_23742844_23746396:HOMEZ HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 23793305 C/T 1 9 2 11 4.25641109565502 1.05413086763222 3.2022802280228 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0696872224921074 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 24032793 C/T 1 45 5 50 21.2820554782751 2.63532716908055 18.6467283091946 T:C C T 10 0.527065433816109 3.09304771019933e-08 ENSG00000213983:ENST00000308724:exon_24032793_24032847:AP1G2;ENSG00000213983:ENST00000397120:exon_24032793_24032847:AP1G2;ENSG00000213983:ENST00000460049:exon_24032793_24032847:AP1G2;ENSG00000213983:ENST00000465445:exon_24032793_24032847:AP1G2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 24422995 T/G 1 11 4 15 5.2022802280228 2.10826173526444 3.09401849275836 T:G T G 10 0.527065433816109 0.126517172009480 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24422964_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24422972_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24422988_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24422995_24423125:DHRS4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 24423007 G/A 1 13 4 17 6.14814936039058 2.10826173526444 4.03988762512615 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0545992094317132 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24422964_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24422972_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24422988_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24422995_24423125:DHRS4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 24423090 A/G 1 26 4 30 12.2962987207812 2.10826173526444 10.1880369855167 A:G A G 10 0.527065433816109 0.000146915303870298 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24422964_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24422972_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24422988_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24422995_24423125:DHRS4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 24424367 G/A 1 33 2 35 15.6068406840684 1.05413086763222 14.5527098164362 A:G G A 10 0.527065433816109 1.35033642223127e-07 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24424244_24424421:DHRS4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 24458162 G/C 1 7 19 26 3.31054196328724 10.0142432425061 -6.70370127921884 C:G G C 10 0.527065433816109 0.00990348032110563 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 24563681 C/T 1 3 6 9 1.41880369855167 3.16239260289665 -1.74358890434498 T:C C T 10 0.527065433816109 0.323067031523113 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 24587639 G/A 1 21 18 39 9.93162588986171 9.48717780868996 0.444448081171748 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 24587667 C/T 1 13 8 21 6.14814936039058 4.21652347052887 1.93162588986171 T:C C T 10 0.527065433816109 0.513458776648042 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 24615435 T/C 1 400 400 800 189.173826473556 210.826173526444 -21.6523470528873 T:C T C 10 0.527065433816109 0.127939413628615 ENSG00000100911:ENST00000216802:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000429021:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000396881:exon_24615417_24615449:PSME2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 24617238 C/T 1 22 27 49 10.4045604560456 14.2307667130349 -3.82620625698934 T:C C T 10 0.527065433816109 0.317085355555119 ENSG00000092098:ENST00000324103:exon_24617185_24617331:RNF31 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 24647814 T/C 1 54 43 97 25.5384665739301 22.6638136540927 2.87465291983742 T:C T C 10 0.527065433816109 0.611553271050864 ENSG00000100918:ENST00000311457:exon_24647812_24647878:REC8;ENSG00000100918:ENST00000447460:exon_24647812_24647878:REC8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 24647957 C/T 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 T:C C T 10 0.527065433816109 1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 24653523 G/C 1 38 35 73 17.9715135149879 18.4472901835638 -0.475776668575961 T:C:G G C 10 0.527065433816109 0.907418998595416 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653504_24653624:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653504_24653624:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653504_24653624:IPO4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 24653954 G/A 1 17 12 29 8.03988762512615 6.32478520579331 1.71510241933284 A:G G A 10 0.527065433816109 0.580177374586883 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653856_24653969:IPO4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 24654489 T/C 1 17 25 42 8.03988762512615 13.1766358454027 -5.13674822027658 T:C T C 10 0.527065433816109 0.123532870976711 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24654389_24654518:IPO4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 24679877 C/T 1 105 82 187 49.6581294493086 43.2193655729209 6.43876387638761 T:C C T 10 0.527065433816109 0.379582354490334 ENSG00000254692:ENST00000530611:exon_24679860_24679974:RP11-468E2.1;ENSG00000254505:ENST00000347519:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000530996:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533523:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533011:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000524955:exon_24679860_24680067:CHMP4A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 24680765 A/T 1 209 176 385 98.8433243324332 92.7635163516352 6.07980798079802 A:T A T 10 0.527065433816109 0.540692998886611 ENSG00000254692:ENST00000530611:exon_24680621_24680798:RP11-468E2.1;ENSG00000254505:ENST00000347519:exon_24680621_24680798:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000530996:exon_24680621_24680798:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533523:exon_24680617_24680798:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533011:exon_24680621_24680798:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000527154:exon_24680458_24680798:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000531158:exon_24680716_24680798:CHMP4A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 24736027 G/A 1 49 49 98 23.1737937430107 25.8262062569893 -2.65241251397869 A:G G A 10 0.527065433816109 0.6139615933236 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24735982_24736095:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24735982_24736095:RABGGTA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 24736961 T/C 1 30 31 61 14.1880369855167 16.3390284482994 -2.15099146278265 T:C T C 10 0.527065433816109 0.609613893645318 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24736866_24736982:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24736866_24736982:RABGGTA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 24760764 G/A 1 28 14 42 13.2421678531489 7.37891607342553 5.86325177972342 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0882399545178529 ENSG00000157379:ENST00000288111:exon_24760762_24760831:DHRS1;ENSG00000157379:ENST00000396813:exon_24760762_24760831:DHRS1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 24805463 G/T 1 12 6 18 5.67521479420669 3.16239260289665 2.51282219131004 T:G G T 10 0.527065433816109 0.345457652895314 ENSG00000129465:ENST00000216274:exon_24805227_24805601:RIPK3;ENSG00000129465:ENST00000382557:exon_24805228_24805601:RIPK3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 24901249 A/C 1 13 5 18 6.14814936039058 2.63532716908055 3.51282219131004 A:C A C 10 0.527065433816109 0.104967213978269 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24900669_24901816:KHNYN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 31103205 G/T 1 6 11 17 2.83760739710335 5.7977197719772 -2.96011237487385 T:G G T 10 0.527065433816109 0.223637867238073 ENSG00000092108:ENST00000311943:exon_31103153_31103243:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000463622:exon_31103153_31103243:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000458591:exon_31103153_31103243:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000484733:exon_31103153_31103243:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000396629:exon_31103153_31103243:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000421551:exon_31103153_31103243:SCFD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 31143151 G/A 1 6 5 11 2.83760739710335 2.63532716908055 0.202280228022801 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000092108:ENST00000311943:exon_31143130_31143203:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000463622:exon_31143130_31143203:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000458591:exon_31143130_31143203:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000484733:exon_31143130_31143203:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000396629:exon_31143130_31143203:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000421551:exon_31143130_31143203:SCFD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 31355096 C/G 1 45 29 74 21.2820554782751 15.2848975806672 5.99715789760793 C:G C G 10 0.527065433816109 0.200010629912027 ENSG00000100473:ENST00000216361:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000382493:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000460581:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000396618:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000468826:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000475087:exon_31355002_31355518:COCH HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 31359024 A/T 1 50 40 90 23.6467283091945 21.0826173526444 2.56411095655018 A:T A T 10 0.527065433816109 0.599587823961476 ENSG00000100473:ENST00000216361:exon_31358822_31359822:COCH;ENSG00000100473:ENST00000382493:exon_31358822_31359822:COCH;ENSG00000100473:ENST00000460581:exon_31358822_31359822:COCH;ENSG00000100473:ENST00000396618:exon_31358822_31359824:COCH;ENSG00000100473:ENST00000468826:exon_31358822_31359347:COCH HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 31578762 C/T 1 9 14 23 4.25641109565502 7.37891607342553 -3.12250497777051 T:C C T 10 0.527065433816109 0.214605087918318 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000399321:exon_31578603_31578806:HECTD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 31582526 T/C 1 8 14 22 3.78347652947113 7.37891607342553 -3.5954395439544 T:C T C 10 0.527065433816109 0.138871874223119 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31582483_31582690:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31582483_31582690:HECTD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 31598248 A/G 1 8 10 18 3.78347652947113 5.27065433816109 -1.48717780868996 A:T:G A G 10 0.527065433816109 0.49133381096339 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31597818_31598654:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31597818_31598654:HECTD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 31647241 G/A 1 8 3 11 3.78347652947113 1.58119630144833 2.2022802280228 A:G G A 10 0.527065433816109 0.234094659981005 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31647226_31647460:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31647226_31647460:HECTD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 35062312 C/T 1 14 13 27 6.62108392657447 6.85185063960942 -0.230766713034944 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000129515:ENST00000396526:exon_35062251_35062356:SNX6;ENSG00000129515:ENST00000396534:exon_35062251_35062356:SNX6;ENSG00000129515:ENST00000355110:exon_35062251_35062356:SNX6;ENSG00000129515:ENST00000362031:exon_35062251_35062356:SNX6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 35222732 C/T 1 32 17 49 15.1339061178845 8.96011237487385 6.17379374301066 A:T:C C T 10 0.527065433816109 0.0863472958571167 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35221938_35222910:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35221943_35222910:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35221943_35222910:BAZ1A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 35546373 T/C 1 5 12 17 2.36467283091945 6.32478520579331 -3.96011237487385 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0861119132037109 ENSG00000151327:ENST00000396472:exon_35546356_35546422:FAM177A1;ENSG00000151327:ENST00000382406:exon_35546356_35546422:FAM177A1;ENSG00000151327:ENST00000280987:exon_35546356_35546422:FAM177A1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 35591174 T/C 1 20 24 44 9.45869132367782 12.6495704115866 -3.1908790879088 T:C T C 10 0.527065433816109 0.367001266855463 ENSG00000092020:ENST00000261475:exon_35591108_35591519:PPP2R3C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 35873770 G/A 1 212 260 472 100.262128030985 137.037012792188 -36.7748847612035 A:G G A 10 0.527065433816109 0.000751870475518866 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35873624_35873952:NFKBIA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 39545199 A/G 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 A:G A G 10 0.527065433816109 0.488810537661758 ENSG00000100934:ENST00000307712:exon_39545139_39545297:SEC23A;ENSG00000100934:ENST00000457395:exon_39545139_39545297:SEC23A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 39644498 G/A 1 11 12 23 5.2022802280228 6.32478520579331 -1.12250497777051 A:G G A 10 0.527065433816109 0.680359986743593 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39644425_39644596:PNN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 39648629 C/T 1 134 130 264 63.3732318686414 68.5185063960942 -5.14527452745279 T:C C T 10 0.527065433816109 0.538072762091839 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39648528_39648666:PNN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 39818028 A/G 1 19 15 34 8.98575675749393 7.90598150724164 1.07977525025229 A:G A G 10 0.527065433816109 0.73476249675926 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 50583083 G/T 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 T:G G T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000100483:ENST00000395859:exon_50583005_50583297:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000491402:exon_50583005_50583318:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000395860:exon_50583005_50583275:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000484763:exon_50582798_50583276:C14orf138 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 50585248 C/T 1 17 20 37 8.03988762512615 10.5413086763222 -2.50142105119603 T:C C T 10 0.527065433816109 0.416458168600068 ENSG00000100485:ENST00000216373:exon_50583847_50585571:SOS2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 51202311 G/C 1 17 13 30 8.03988762512615 6.85185063960942 1.18803698551673 C:G G C 10 0.527065433816109 0.717319151421924 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51202234_51202335:NIN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 51204996 C/T 1 28 29 57 13.2421678531489 15.2848975806672 -2.04272972751821 T:C C T 10 0.527065433816109 0.598485538982968 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51204858_51205004:NIN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 51224374 T/G 1 9 1 10 4.25641109565502 0.527065433816109 3.72934566183891 T:G T G 10 0.527065433816109 0.0232976587027389 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 51224417 G/C 0 9 0 9 4.25641109565502 0 4.25641109565502 G G 10 0.527065433816109 0.0043225365335067 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 51716188 T/G 1 24 19 43 11.3504295884134 10.0142432425061 1.33618634590731 T:G T G 10 0.527065433816109 0.760832572532408 ENSG00000139921:ENST00000457354:exon_51716186_51716287:TMX1;ENSG00000139921:ENST00000267434:exon_51716186_51716287:TMX1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 51716467 G/A 1 37 32 69 17.498578948804 16.8660938821155 0.632485066688478 A:G G A 10 0.527065433816109 0.904578923673105 ENSG00000139921:ENST00000457354:exon_51716411_51716483:TMX1;ENSG00000139921:ENST00000267434:exon_51716411_51716483:TMX1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 53325090 C/T 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 T:C C T 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000073712:ENST00000341590:exon_53323986_53325268:FERMT2;ENSG00000073712:ENST00000395631:exon_53323986_53325268:FERMT2;ENSG00000073712:ENST00000343279:exon_53323993_53325268:FERMT2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 55510110 G/A 1 8 2 10 3.78347652947113 1.05413086763222 2.72934566183891 A:G G A 10 0.527065433816109 0.114525614534534 ENSG00000180008:ENST00000339298:exon_55509670_55516204:SOCS4;ENSG00000180008:ENST00000395472:exon_55509670_55516206:SOCS4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 55604935 C/A 1 30 43 73 14.1880369855167 22.6638136540927 -8.47577666857596 A:C C A 10 0.527065433816109 0.0599910405791106 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55604763_55605086:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55603699_55605086:LGALS3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 55605036 A/C 1 38 62 100 17.9715135149879 32.6780568965988 -14.7065433816109 A:C A C 10 0.527065433816109 0.00354824654680311 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55604763_55605086:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55603699_55605086:LGALS3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 55619311 A/G 1 24 35 59 11.3504295884134 18.4472901835638 -7.09686059515043 A:G A G 10 0.527065433816109 0.068589569384434 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55619308_55619365:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55619308_55619365:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55619308_55619365:DLGAP5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 55817708 T/C 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 55818517 T/A 1 7 6 13 3.31054196328724 3.16239260289665 0.148149360390583 A:T T A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 55818706 T/C 1 9 13 22 4.25641109565502 6.85185063960942 -2.5954395439544 T:C T C 10 0.527065433816109 0.292055393163298 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 60585131 A/G 1 9 5 14 4.25641109565502 2.63532716908055 1.62108392657447 A:G A G 10 0.527065433816109 0.433551468090942 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000483571:exon_60585095_60585410:C14orf135 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 60591829 T/C 1 7 8 15 3.31054196328724 4.21652347052887 -0.905981507241636 T:C T C 10 0.527065433816109 0.797198000532565 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000483571:exon_60590936_60591969:C14orf135 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 60591887 G/A 1 6 11 17 2.83760739710335 5.7977197719772 -2.96011237487385 A:G G A 10 0.527065433816109 0.223637867238073 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000483571:exon_60590936_60591969:C14orf135 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 60611648 C/T 1 58 14 72 27.4302048386657 7.37891607342553 20.0512887652402 T:C C T 10 0.527065433816109 1.2798369436121e-06 ENSG00000100612:ENST00000216500:exon_60610838_60611731:DHRS7;ENSG00000100612:ENST00000360557:exon_60611502_60611731:DHRS7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 64522674 G/C 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 C:G G C 10 0.527065433816109 0.488810537661758 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64522662_64522984:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64522662_64522984:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64522662_64522984:SYNE2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 64637147 C/A 1 9 5 14 4.25641109565502 2.63532716908055 1.62108392657447 A:C C A 10 0.527065433816109 0.433551468090942 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64636946_64637180:SYNE2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 64656855 T/C 1 3 6 9 1.41880369855167 3.16239260289665 -1.74358890434498 T:C T C 10 0.527065433816109 0.323067031523113 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64656789_64656955:SYNE2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 64686125 G/T 1 41 41 82 19.3903172135395 21.6096827864605 -2.21936557292094 T:G G T 10 0.527065433816109 0.658986952510235 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000458046:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000441438:exon_64685926_64686128:SYNE2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 64935411 C/T 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000179841:ENST00000394718:exon_64934850_64935705:AKAP5;ENSG00000179841:ENST00000430028:exon_64934850_64941221:AKAP5;ENSG00000179841:ENST00000320636:exon_64934503_64936423:AKAP5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 64988279 A/G 1 11 13 24 5.2022802280228 6.85185063960942 -1.64957041158662 A:G A G 10 0.527065433816109 0.544155066076199 ENSG00000126804:ENST00000358738:exon_64988205_64990120:ZBTB1;ENSG00000126804:ENST00000394712:exon_64988205_64991665:ZBTB1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 64988924 T/C 1 17 19 36 8.03988762512615 10.0142432425061 -1.97435561737993 T:C T C 10 0.527065433816109 0.617192754782756 ENSG00000126804:ENST00000358738:exon_64988205_64990120:ZBTB1;ENSG00000126804:ENST00000394712:exon_64988205_64991665:ZBTB1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 66136163 C/A 1 4 6 10 1.89173826473556 3.16239260289665 -1.27065433816109 A:C C A 10 0.527065433816109 0.532268681489131 ENSG00000033170:ENST00000360689:exon_66135961_66136198:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000342677:exon_66135961_66136198:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394586:exon_66135961_66136198:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394585:exon_66135961_66136198:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000358307:exon_66135961_66136198:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394581:exon_66135961_66136198:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000417683:exon_66136133_66136198:FUT8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 69259662 C/A 1 35 41 76 16.5527098164362 21.6096827864605 -5.05697297002429 A:T:C C A 10 0.527065433816109 0.252771241577906 ENSG00000185650:ENST00000439696:exon_69259599_69259785:ZFP36L1;ENSG00000185650:ENST00000336440:exon_69259599_69261453:ZFP36L1;ENSG00000185650:ENST00000435246:exon_69259599_69261453:ZFP36L1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 72055468 A/C 1 18 13 31 8.51282219131004 6.85185063960942 1.66097155170062 A:C A C 10 0.527065433816109 0.593331687247524 ENSG00000197555:ENST00000381232:exon_72054288_72056087:SIPA1L1;ENSG00000197555:ENST00000358550:exon_72054288_72056087:SIPA1L1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 72117156 T/C 1 2 12 14 0.945869132367782 6.32478520579331 -5.37891607342553 T:C T C 10 0.527065433816109 0.00536153701805031 ENSG00000197555:ENST00000381232:exon_72117052_72117226:SIPA1L1;ENSG00000197555:ENST00000358550:exon_72117052_72117226:SIPA1L1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 72191466 C/T 1 52 63 115 24.5925974415623 33.2051223304149 -8.61252488885254 T:C C T 10 0.527065433816109 0.112902124061108 ENSG00000197555:ENST00000381232:exon_72191387_72191552:SIPA1L1;ENSG00000197555:ENST00000358550:exon_72191387_72191552:SIPA1L1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 73440864 C/T 1 5 13 18 2.36467283091945 6.85185063960942 -4.48717780868996 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0558624418352255 ENSG00000165861:ENST00000394207:exon_73440788_73440901:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000318876:exon_73440788_73440901:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000446254:exon_73440788_73440901:ZFYVE1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 73491270 C/T 1 6 5 11 2.83760739710335 2.63532716908055 0.202280228022801 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000165861:ENST00000318876:exon_73490734_73491650:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000446254:exon_73490734_73491650:ZFYVE1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 74205878 C/T 1 5 6 11 2.36467283091945 3.16239260289665 -0.797719771977199 T:C C T 10 0.527065433816109 0.765666449819686 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000451078:exon_74205263_74206177:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74205263_74206958:C14orf43 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 74759006 C/T 1 12 15 27 5.67521479420669 7.90598150724164 -2.23076671303494 T:C C T 10 0.527065433816109 0.443412923825397 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481935:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000474270:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000496015:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000469672:exon_74758990_74759079:ABCD4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 74759301 G/T 1 8 9 17 3.78347652947113 4.74358890434498 -0.960112374873853 T:G G T 10 0.527065433816109 0.80902600536977 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481935:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000474270:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000496015:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000469672:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000460308:exon_74759254_74759345:ABCD4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 74759477 C/T 1 4 8 12 1.89173826473556 4.21652347052887 -2.32478520579331 T:C C T 10 0.527065433816109 0.248670873824186 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481935:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000474270:exon_74759451_74759529:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000496015:exon_74759451_74759951:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000469672:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000460308:exon_74759451_74759572:ABCD4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 75245368 C/T 1 9 5 14 4.25641109565502 2.63532716908055 1.62108392657447 T:C C T 10 0.527065433816109 0.433551468090942 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75245150_75245386:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75245150_75245386:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75245150_75245386:YLPM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 75248669 G/T 1 19 20 39 8.98575675749393 10.5413086763222 -1.55555191882825 T:G G T 10 0.527065433816109 0.634061562037635 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75248037_75249028:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75248626_75249028:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75248626_75249028:YLPM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 75279395 T/A 1 27 18 45 12.7692332869651 9.48717780868996 3.28205547827509 A:T T A 10 0.527065433816109 0.371783597602969 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75279331_75279485:YLPM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 75367807 C/T 1 23 23 46 10.8774950222295 12.1225049777705 -1.24500995554101 T:C C T 10 0.527065433816109 0.76863739181059 ENSG00000119689:ENST00000334220:exon_75367769_75367936:DLST;ENSG00000119689:ENST00000238671:exon_75367769_75367936:DLST;ENSG00000119689:ENST00000334212:exon_75367769_75367936:DLST HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 76368544 T/C 1 7 2 9 3.31054196328724 1.05413086763222 2.25641109565502 T:C T C 10 0.527065433816109 0.185447766343339 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76368485_76368567:TTLL5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 77492891 G/A 1 30 34 64 14.1880369855167 17.9202247497477 -3.73218776423098 A:G G A 10 0.527065433816109 0.381933329653174 ENSG00000119669:ENST00000238647:exon_77490888_77495034:C14orf4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 77794283 T/C 1 15 7 22 7.09401849275836 3.68945803671276 3.4045604560456 T:C T C 10 0.527065433816109 0.199603075522895 ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77794255_77794380:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77794255_77794380:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77794255_77794380:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393741:exon_77794123_77794380:GSTZ1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 91700846 G/A 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000119714:ENST00000531499:exon_91698876_91701523:GPR68;ENSG00000119714:ENST00000238699:exon_91698877_91701523:GPR68;ENSG00000119714:ENST00000529102:exon_91700381_91701523:GPR68 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 91739081 A/G 1 32 26 58 15.1339061178845 13.7037012792188 1.43020483866568 A:G A G 10 0.527065433816109 0.79289117620917 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000427583:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000334448:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000331194:exon_91738969_91739562:CCDC88C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 91773568 T/C 1 5 5 10 2.36467283091945 2.63532716908055 -0.270654338161091 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91773382_91773570:CCDC88C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 92549586 G/A 1 7 3 10 3.31054196328724 1.58119630144833 1.72934566183891 A:G G A 10 0.527065433816109 0.350932787230552 ENSG00000066427:ENST00000429774:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359819:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393289:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359366:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393287:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000502250:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000503767:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000340660:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000532032:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000447800:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000515746:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000506466:exon_92549470_92549602:ATXN3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 93118038 A/G 1 4 7 11 1.89173826473556 3.68945803671276 -1.7977197719772 A:G A G 10 0.527065433816109 0.36886039388561 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 93118198 C/T 1 6 2 8 2.83760739710335 1.05413086763222 1.78347652947113 T:C C T 10 0.527065433816109 0.29481715391141 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 93119407 C/T 1 41 36 77 19.3903172135395 18.9743556173799 0.415961596159605 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 93412743 G/A 1 10 12 22 4.72934566183891 6.32478520579331 -1.5954395439544 A:G G A 10 0.527065433816109 0.528175996250381 ENSG00000100605:ENST00000354313:exon_93412676_93412838:ITPK1;ENSG00000100605:ENST00000405174:exon_93412676_93412838:ITPK1;ENSG00000100605:ENST00000267615:exon_93412676_93412838:ITPK1;ENSG00000100605:ENST00000311458:exon_93412676_93412838:ITPK1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 94423294 T/C 1 7 14 21 3.31054196328724 7.37891607342553 -4.06837411013829 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0833995299023928 ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94423112_94423767:ASB2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 94521372 G/A 1 112 101 213 52.9686714125958 53.233608815427 -0.264937402831222 A:T:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000089737:ENST00000423579:exon_94521342_94521530:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94521342_94521530:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94521342_94521530:DDX24 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 94524216 T/C 1 172 120 292 81.3447453836292 63.2478520579331 18.0968933256962 T:C:G T C 10 0.527065433816109 0.0348824510452918 ENSG00000089737:ENST00000423579:exon_94524168_94524243:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94524168_94524243:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94524168_94524243:DDX24 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 94929541 G/A 1 1 8 9 0.472934566183891 4.21652347052887 -3.74358890434498 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0161943073002794 ENSG00000170054:ENST00000448305:exon_94929060_94929633:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000298845:exon_94929060_94929633:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000337425:exon_94929060_94929633:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000424550:exon_94929060_94929633:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000380365:exon_94929060_94929633:SERPINA9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 95562368 C/T 1 16 14 30 7.56695305894226 7.37891607342553 0.188036985516729 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000100697:ENST00000343455:exon_95562162_95563050:DICER1;ENSG00000100697:ENST00000526495:exon_95562162_95563050:DICER1;ENSG00000100697:ENST00000393063:exon_95562162_95563050:DICER1;ENSG00000100697:ENST00000527414:exon_95562162_95563050:DICER1;ENSG00000100697:ENST00000532939:exon_95561685_95563050:DICER1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 96010424 G/A 1 147 85 232 69.521381229032 44.8005618743693 24.7208193546627 A:G G A 10 0.527065433816109 0.00123131388645593 ENSG00000182512:ENST00000331334:exon_96010284_96011055:GLRX5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 97321630 G/C 1 46 44 90 21.754990044459 23.1908790879088 -1.43588904344981 C:G G C 10 0.527065433816109 0.832938773115847 ENSG00000100749:ENST00000216639:exon_97321561_97321693:VRK1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 100808845 G/A 1 162 119 281 76.6153997217903 62.720786624117 13.8946130976734 A:G G A 10 0.527065433816109 0.106595155982642 ENSG00000140105:ENST00000392882:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000355338:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000358655:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000344102:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000392880:exon_100808735_100808908:WARS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 102493761 A/G 1 11 9 20 5.2022802280228 4.74358890434498 0.45869132367782 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102493720_102493881:DYNC1H1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 102504838 C/T 1 12 20 32 5.67521479420669 10.5413086763222 -4.86609388211549 T:C C T 10 0.527065433816109 0.110018782960629 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102504797_102504943:DYNC1H1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 102514227 T/C 1 35 39 74 16.5527098164362 20.5555519188283 -4.00284210239207 T:C T C 10 0.527065433816109 0.354712036617424 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102514154_102514365:DYNC1H1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 102550803 G/A 1 354 378 732 167.418836429097 199.230733982489 -31.8118975533918 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0196549674362399 ENSG00000080824:ENST00000334701:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000216281:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000441629:exon_102550736_102550901:HSP90AA1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 102675350 G/C 1 5 11 16 2.36467283091945 5.7977197719772 -3.43304694105774 C:G G C 10 0.527065433816109 0.130692436904043 ENSG00000140153:ENST00000335263:exon_102674940_102676199:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000454394:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000342702:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000299135:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000401892:exon_102674940_102676199:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000424963:exon_102674936_102676863:WDR20 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 102807671 C/T 1 20 8 28 9.45869132367782 4.21652347052887 5.24216785314895 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0576018519819824 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102807660_102809044:ZNF839 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 102808273 C/A 1 12 23 35 5.67521479420669 12.1225049777705 -6.44729018356382 A:C C A 10 0.527065433816109 0.0406951810794896 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102807660_102809044:ZNF839 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 102901023 G/A 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000196663:ENST00000359520:exon_102900572_102901548:TECPR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 105222037 C/T 1 43 35 78 20.3361863459073 18.4472901835638 1.8888961623435 T:C C T 10 0.527065433816109 0.734086575643227 ENSG00000184990:ENST00000329967:exon_105221967_105222161:SIVA1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 105688082 C/T 1 6 6 12 2.83760739710335 3.16239260289665 -0.324785205793308 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000185024:ENST00000327359:exon_105687985_105688251:BRF1;ENSG00000185024:ENST00000379937:exon_105687985_105688251:BRF1;ENSG00000185024:ENST00000446501:exon_105687985_105688251:BRF1;ENSG00000185024:ENST00000392557:exon_105687985_105688251:BRF1;ENSG00000185024:ENST00000440513:exon_105687985_105688251:BRF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 105715515 C/T 1 8 5 13 3.78347652947113 2.63532716908055 1.14814936039058 T:C C T 10 0.527065433816109 0.588366380954527 ENSG00000184887:ENST00000327471:exon_105715494_105715584:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000392554:exon_105715494_105715584:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000463376:exon_105715241_105715584:BTBD6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 105716034 C/T 1 16 14 30 7.56695305894226 7.37891607342553 0.188036985516729 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000184887:ENST00000327471:exon_105715977_105717421:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000392554:exon_105715977_105717430:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000463376:exon_105715977_105716298:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000392553:exon_105715977_105716633:BTBD6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 105930406 G/A 1 27 21 48 12.7692332869651 11.0683741101383 1.70085917682677 A:G G A 10 0.527065433816109 0.666365310723135 ENSG00000182979:ENST00000435036:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000414153:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000331320:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000406191:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000405646:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000438610:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000434050:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000490198:exon_105930369_105930484:MTA1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 14 105931154 G/A 1 59 55 114 27.9031394048496 28.988598859886 -1.08545945503643 A:G G A 10 0.527065433816109 0.851686088597162 ENSG00000182979:ENST00000414153:exon_105931011_105931200:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000331320:exon_105931011_105931200:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000406191:exon_105931011_105931200:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000405646:exon_105931011_105931200:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000438610:exon_105931011_105931200:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000434050:exon_105931011_105931200:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000490198:exon_105930800_105931200:MTA1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 22925851 C/T 1 12 1 13 5.67521479420669 0.527065433816109 5.14814936039058 T:C C T 10 0.527065433816109 0.00398496992472695 ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22925777_22925899:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22925777_22925899:CYFIP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 22960868 G/C 1 17 30 47 8.03988762512615 15.8119630144833 -7.77207538935713 C:G G C 10 0.527065433816109 0.0277560628632119 ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22960793_22960889:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22960793_22960889:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000435939:exon_22960793_22960889:CYFIP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 22969232 G/A 1 26 10 36 12.2962987207812 5.27065433816109 7.02564438262007 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0195670679337307 ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22969163_22969362:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22969163_22969362:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000435939:exon_22969163_22969362:CYFIP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 22969282 C/T 1 23 7 30 10.8774950222295 3.68945803671276 7.18803698551673 T:C C T 10 0.527065433816109 0.00964803953228681 ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22969163_22969362:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22969163_22969362:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000435939:exon_22969163_22969362:CYFIP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 29561415 G/C 1 39 35 74 18.4444480811717 18.4472901835638 -0.00284210239206928 C:G G C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000185115:ENST00000332303:exon_29560353_29562033:NDNL2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 34652349 C/T 1 18 26 44 8.51282219131004 13.7037012792188 -5.1908790879088 T:C C T 10 0.527065433816109 0.131777644537270 ENSG00000176454:ENST00000314891:exon_34652312_34652410:LPCAT4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 40265799 A/G 1 7 7 14 3.31054196328724 3.68945803671276 -0.378916073425526 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40265793_40265950:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40265793_40265950:EIF2AK4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 40308859 G/T 1 18 6 24 8.51282219131004 3.16239260289665 5.35042958841338 T:G G T 10 0.527065433816109 0.038955690909113 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40308703_40308873:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40308703_40308873:EIF2AK4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 40327290 A/G 1 61 70 131 28.8490085372173 36.8945803671276 -8.04557182991028 A:G A G 10 0.527065433816109 0.162532960394850 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40327228_40327797:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40327228_40327797:EIF2AK4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 40327301 G/A 1 73 76 149 34.524223331424 40.0569729700243 -5.53274963860025 A:G G A 10 0.527065433816109 0.36813941074471 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40327228_40327797:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40327228_40327797:EIF2AK4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 40330518 T/G 1 209 208 417 98.8433243324332 109.629610233751 -10.7862859013175 T:G T G 10 0.527065433816109 0.303146848654192 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40330483_40330595:SRP14 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 40590134 G/A 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 A:G G A 10 0.527065433816109 0.160556933333404 ENSG00000137841:ENST00000456256:exon_40590078_40590160:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000260402:exon_40590078_40590160:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000389812:exon_40590078_40590160:PLCB2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 40855210 T/A 1 43 31 74 20.3361863459073 16.3390284482994 3.99715789760793 A:T T A 10 0.527065433816109 0.415300481237201 ENSG00000128891:ENST00000358005:exon_40854971_40855226:C15orf57;ENSG00000128891:ENST00000416810:exon_40854971_40855226:C15orf57;ENSG00000128891:ENST00000360470:exon_40854971_40855226:C15orf57 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 40861741 C/G 1 27 27 54 12.7692332869651 14.2307667130349 -1.46153342606989 C:G C G 10 0.527065433816109 0.785492693376586 ENSG00000166133:ENST00000315616:exon_40861499_40862142:RPUSD2;ENSG00000166133:ENST00000417769:exon_40861537_40861959:RPUSD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 40862064 C/T 1 16 21 37 7.56695305894226 11.0683741101383 -3.50142105119603 T:C C T 10 0.527065433816109 0.254752916438468 ENSG00000166133:ENST00000315616:exon_40861499_40862142:RPUSD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 41105926 T/G 1 16 6 22 7.56695305894226 3.16239260289665 4.4045604560456 T:C:G T G 10 0.527065433816109 0.085542216220796 ENSG00000166140:ENST00000355341:exon_41105911_41106009:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000299173:exon_41105911_41106009:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000336455:exon_41105911_41106009:ZFYVE19 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 41146880 T/C 1 8 4 12 3.78347652947113 2.10826173526444 1.67521479420669 T:C T C 10 0.527065433816109 0.396148353996528 ENSG00000166145:ENST00000344051:exon_41146837_41146887:SPINT1;ENSG00000166145:ENST00000431806:exon_41146837_41146887:SPINT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 41813279 C/T 1 7 24 31 3.31054196328724 12.6495704115866 -9.33902844829938 T:C C T 10 0.527065433816109 0.000904887201472003 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41812589_41813345:RPAP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 41819716 C/T 1 7 9 16 3.31054196328724 4.74358890434498 -1.43304694105774 T:C C T 10 0.527065433816109 0.618149317471371 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41819621_41819803:RPAP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 41822163 C/T 1 6 2 8 2.83760739710335 1.05413086763222 1.78347652947113 T:C C T 10 0.527065433816109 0.29481715391141 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41822062_41822177:RPAP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 41827757 T/A 1 6 7 13 2.83760739710335 3.68945803671276 -0.851850639609417 A:T T A 10 0.527065433816109 0.783042148004503 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41827710_41827830:RPAP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 42115747 G/C 1 7 5 12 3.31054196328724 2.63532716908055 0.675214794206692 C:G G C 10 0.527065433816109 0.778351128206284 ENSG00000137802:ENST00000457542:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000512970:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000389931:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000221214:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000260357:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000505373:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000456763:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000505061:exon_42115645_42116259:MAPKBP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 42459034 T/C 1 9 11 20 4.25641109565502 5.7977197719772 -1.54130867632218 T:C T C 10 0.527065433816109 0.510653805220797 ENSG00000166887:ENST00000318006:exon_42458970_42459111:VPS39;ENSG00000166887:ENST00000348544:exon_42458970_42459111:VPS39 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 42734320 C/T 1 7 2 9 3.31054196328724 1.05413086763222 2.25641109565502 T:C C T 10 0.527065433816109 0.185447766343339 ENSG00000103994:ENST00000263805:exon_42734271_42734612:ZFP106;ENSG00000103994:ENST00000434903:exon_42734271_42734612:ZFP106 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 42820589 G/A 1 52 47 99 24.5925974415623 24.7720753893571 -0.179477947794794 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000092531:ENST00000249647:exon_42820460_42820618:SNAP23 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 43527819 T/C 1 11 7 18 5.2022802280228 3.68945803671276 1.51282219131004 T:C T C 10 0.527065433816109 0.638183169005014 ENSG00000104055:ENST00000220420:exon_43527667_43528035:TGM5;ENSG00000104055:ENST00000349114:exon_43527667_43528035:TGM5;ENSG00000104055:ENST00000396996:exon_43527667_43528035:TGM5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 43621947 A/G 1 4 8 12 1.89173826473556 4.21652347052887 -2.32478520579331 A:G A G 10 0.527065433816109 0.248670873824186 ENSG00000168806:ENST00000305641:exon_43619976_43622891:LCMT2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 43661802 T/C 1 5 7 12 2.36467283091945 3.68945803671276 -1.32478520579331 T:C T C 10 0.527065433816109 0.566621218006073 ENSG00000140265:ENST00000396976:exon_43661794_43662246:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000396972:exon_43661794_43662258:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000267817:exon_43661794_43662258:ZSCAN29 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 43724646 T/G 1 12 16 28 5.67521479420669 8.43304694105774 -2.75783214685105 T:G T G 10 0.527065433816109 0.345892538884562 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43724392_43724875:TP53BP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 43733730 A/G 1 7 3 10 3.31054196328724 1.58119630144833 1.72934566183891 A:G A G 10 0.527065433816109 0.350932787230552 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43733724_43733781:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43733724_43733781:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43733724_43733781:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43733724_43733781:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43733724_43733781:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43733724_43733781:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000413546:exon_43733724_43733781:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000480860:exon_43733457_43733781:TP53BP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 43748304 A/G 1 11 13 24 5.2022802280228 6.85185063960942 -1.64957041158662 A:G A G 10 0.527065433816109 0.544155066076199 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43748090_43748529:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000413546:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000480860:exon_43748090_43748350:TP53BP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 44038899 C/T 1 55 118 173 26.011401140114 62.1937211903009 -36.1823200501869 T:C C T 10 0.527065433816109 4.15162224917156e-08 ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44038590_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000469684:exon_44038608_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000446523:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000455250:exon_44038810_44038904:PDIA3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 44053617 C/T 1 6 6 12 2.83760739710335 3.16239260289665 -0.324785205793308 T:C C T 10 0.527065433816109 1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 44061802 C/T 1 63 94 157 29.7948776695851 49.5441507787142 -19.7492731091291 T:C C T 10 0.527065433816109 0.00176049465571336 ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44061716_44061844:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44061716_44061844:PDIA3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 44069069 G/C 1 4 9 13 1.89173826473556 4.74358890434498 -2.85185063960942 C:G G C 10 0.527065433816109 0.163735013053684 ENSG00000128886:ENST00000319359:exon_44068968_44069741:ELL3;ENSG00000128886:ENST00000486851:exon_44068968_44069164:ELL3;ENSG00000128886:ENST00000433927:exon_44068968_44069162:ELL3;ENSG00000128886:ENST00000497700:exon_44068968_44069166:ELL3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 44093927 T/C 1 75 75 150 35.4700924637918 39.5299075362082 -4.05981507241636 T:C T C 10 0.527065433816109 0.51411961338581 ENSG00000140264:ENST00000448830:exon_44093909_44094787:SERF2;ENSG00000140264:ENST00000409617:exon_44093909_44094071:SERF2;ENSG00000242028:ENST00000406925:exon_44093909_44094280:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000442995:exon_44093909_44094489:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000458412:exon_44093716_44095241:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000497142:exon_44093909_44094126:C15orf63 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 44102010 A/C 1 27 32 59 12.7692332869651 16.8660938821155 -4.09686059515043 A:C A C 10 0.527065433816109 0.299307337404182 ENSG00000140259:ENST00000267812:exon_44101953_44102112:MFAP1;ENSG00000140259:ENST00000484386:exon_44101953_44102330:MFAP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 44864966 C/A 1 13 13 26 6.14814936039058 6.85185063960942 -0.703701279218835 A:C C A 10 0.527065433816109 0.84562040810587 ENSG00000104133:ENST00000261866:exon_44864881_44865018:SPG11 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 45047573 C/T 1 15 1 16 7.09401849275836 0.527065433816109 6.56695305894226 T:C C T 10 0.527065433816109 0.00066261836826734 ENSG00000185880:ENST00000329464:exon_45047098_45047574:TRIM69 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 45361180 A/T 1 3 6 9 1.41880369855167 3.16239260289665 -1.74358890434498 A:T A T 10 0.527065433816109 0.323067031523113 ENSG00000140263:ENST00000267814:exon_45361075_45361250:SORD HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 45694610 C/T 1 5 8 13 2.36467283091945 4.21652347052887 -1.85185063960942 T:C C T 10 0.527065433816109 0.407023665875808 ENSG00000171763:ENST00000305560:exon_45694529_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000531970:exon_45694573_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000396655:exon_45694587_45696889:SPATA5L1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 45694768 G/T 1 4 8 12 1.89173826473556 4.21652347052887 -2.32478520579331 T:G G T 10 0.527065433816109 0.248670873824186 ENSG00000171763:ENST00000305560:exon_45694529_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000531970:exon_45694573_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000396655:exon_45694587_45696889:SPATA5L1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 48626647 A/G 1 148 124 272 69.9943157952159 65.3561137931975 4.63820200201835 A:G A G 10 0.527065433816109 0.585209860527612 ENSG00000128951:ENST00000331200:exon_48626614_48626705:DUT;ENSG00000128951:ENST00000450740:exon_48626614_48626705:DUT;ENSG00000128951:ENST00000249783:exon_48626614_48626705:DUT;ENSG00000128951:ENST00000455976:exon_48626614_48626705:DUT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 49620200 C/T 1 19 18 37 8.98575675749393 9.48717780868996 -0.501421051196035 T:C C T 10 0.527065433816109 0.871040774660792 ENSG00000156958:ENST00000327171:exon_49620149_49622002:GALK2;ENSG00000156958:ENST00000396509:exon_49620149_49622002:GALK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 50769520 G/A 1 18 11 29 8.51282219131004 5.7977197719772 2.71510241933284 A:G G A 10 0.527065433816109 0.355748397679087 ENSG00000138592:ENST00000396444:exon_50769473_50769696:USP8;ENSG00000138592:ENST00000307179:exon_50769473_50769696:USP8;ENSG00000138592:ENST00000433963:exon_50769473_50769696:USP8;ENSG00000138592:ENST00000425032:exon_50769473_50769696:USP8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 50776525 T/C 1 12 9 21 5.67521479420669 4.74358890434498 0.931625889861711 T:C T C 10 0.527065433816109 0.827834701908173 ENSG00000138592:ENST00000396444:exon_50776472_50776558:USP8;ENSG00000138592:ENST00000307179:exon_50776472_50776558:USP8;ENSG00000138592:ENST00000433963:exon_50776472_50776558:USP8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 50867082 G/A 1 10 5 15 4.72934566183891 2.63532716908055 2.09401849275836 A:G G A 10 0.527065433816109 0.312436282519101 ENSG00000092439:ENST00000313478:exon_50867049_50867332:TRPM7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 50867142 C/T 1 12 2 14 5.67521479420669 1.05413086763222 4.62108392657447 T:C:G C T 10 0.527065433816109 0.0147159799087008 ENSG00000092439:ENST00000313478:exon_50867049_50867332:TRPM7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 51040384 T/C 1 8 5 13 3.78347652947113 2.63532716908055 1.14814936039058 T:C T C 10 0.527065433816109 0.588366380954527 ENSG00000138600:ENST00000261854:exon_51040310_51040399:AC012100.1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 52605861 A/G 1 31 30 61 14.6609715517006 15.8119630144833 -1.15099146278265 A:G A G 10 0.527065433816109 0.798526816530836 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52599480_52606045:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52599483_52606045:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52599485_52606045:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52599485_52606045:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52599485_52606045:MYO5A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 52611451 A/G 1 5 12 17 2.36467283091945 6.32478520579331 -3.96011237487385 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0861119132037109 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52611257_52611539:MYO5A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 52652174 T/C 1 6 2 8 2.83760739710335 1.05413086763222 1.78347652947113 T:C T C 10 0.527065433816109 0.29481715391141 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52652165_52652278:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52652165_52652278:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52652165_52652278:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52652165_52652278:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52652165_52652278:MYO5A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 52671864 G/C 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 C:G G C 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52671822_52671930:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52671822_52671930:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52671822_52671930:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52671822_52671930:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52671822_52671930:MYO5A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 55489065 G/A 1 53 60 113 25.0655320077462 31.6239260289665 -6.55839402122032 A:G G A 10 0.527065433816109 0.222003741584715 ENSG00000137876:ENST00000260443:exon_55489008_55489265:RSL24D1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 55489104 A/G 1 31 33 64 14.6609715517006 17.3931593159316 -2.73218776423098 A:G A G 10 0.527065433816109 0.532459202195631 ENSG00000137876:ENST00000260443:exon_55489008_55489265:RSL24D1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 55497691 G/A 1 33 22 55 15.6068406840684 11.5954395439544 4.011401140114 A:G G A 10 0.527065433816109 0.344610371723735 ENSG00000069974:ENST00000396307:exon_55495164_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000396304:exon_55495802_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000423492:exon_55495802_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000336787:exon_55495802_55497903:RAB27A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 55647492 C/T 1 28 25 53 13.2421678531489 13.1766358454027 0.0655320077462207 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000069943:ENST00000164305:exon_55647484_55647845:PIGB;ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 55653031 A/G 1 10 5 15 4.72934566183891 2.63532716908055 2.09401849275836 A:G A G 10 0.527065433816109 0.312436282519101 ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55651737_55653142:CCPG1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 55664220 G/A 1 8 6 14 3.78347652947113 3.16239260289665 0.621083926574474 A:G G A 10 0.527065433816109 0.794786264772641 ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55663991_55664242:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55663991_55664264:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55663991_55664242:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000425574:exon_55663991_55664242:CCPG1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 59963488 A/G 1 6 11 17 2.83760739710335 5.7977197719772 -2.96011237487385 A:G A G 10 0.527065433816109 0.223637867238073 ENSG00000140299:ENST00000267859:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000415213:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000409352:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000439052:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000448414:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000464390:exon_59963380_59963513:BNIP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 63855190 G/A 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 A:G G A 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000140455:ENST00000380324:exon_63855094_63855207:USP3;ENSG00000140455:ENST00000268049:exon_63855094_63855207:USP3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 64418397 G/A 1 25 13 38 11.8233641545973 6.85185063960942 4.97151351498786 A:G G A 10 0.527065433816109 0.142728539340958 ENSG00000028528:ENST00000353874:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000261889:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000380285:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000440389:exon_64418278_64418419:SNX1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 64448365 C/T 1 25 17 42 11.8233641545973 8.96011237487385 2.86325177972342 T:C C T 10 0.527065433816109 0.440661082707359 ENSG00000157734:ENST00000325881:exon_64446586_64449680:SNX22 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 64962630 A/C 1 7 1 8 3.31054196328724 0.527065433816109 2.78347652947113 A:C A C 10 0.527065433816109 0.0735220313078182 ENSG00000180357:ENST00000326648:exon_64962545_64962632:ZNF609 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 65108479 T/C 1 30 19 49 14.1880369855167 10.0142432425061 4.17379374301066 T:C T C 10 0.527065433816109 0.254423420594167 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65107831_65108556:PIF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 65108504 A/T 1 24 41 65 11.3504295884134 21.6096827864605 -10.2592531980471 A:T:C A T 10 0.527065433816109 0.0125735464524256 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65107831_65108556:PIF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 65153690 G/A 1 6 3 9 2.83760739710335 1.58119630144833 1.25641109565502 A:G G A 10 0.527065433816109 0.513555929047552 ENSG00000249240:ENST00000502574:exon_65153676_65153774:AC069368.3;ENSG00000249240:ENST00000437723:exon_65153676_65153774:AC069368.3;ENSG00000241839:ENST00000323544:exon_65153676_65153774:PLEKHO2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 65157482 C/T 1 22 23 45 10.4045604560456 12.1225049777705 -1.71794452172491 T:C C T 10 0.527065433816109 0.655670665211511 ENSG00000241839:ENST00000323544:exon_65157098_65160206:PLEKHO2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 65273399 T/C 1 3 6 9 1.41880369855167 3.16239260289665 -1.74358890434498 T:C T C 10 0.527065433816109 0.323067031523113 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 66621346 A/G 1 13 17 30 6.14814936039058 8.96011237487385 -2.81196301448327 A:G A G 10 0.527065433816109 0.361765470838631 ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66621308_66621462:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66621308_66621462:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66621308_66621462:DIS3L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 66629394 T/C 1 22 32 54 10.4045604560456 16.8660938821155 -6.46153342606989 T:C T C 10 0.527065433816109 0.101086788217580 ENSG00000075131:ENST00000261881:exon_66629052_66629519:TIPIN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 66641417 T/C 1 30 36 66 14.1880369855167 18.9743556173799 -4.7863186318632 T:C T C 10 0.527065433816109 0.267664985074733 ENSG00000075131:ENST00000261881:exon_66641398_66641461:TIPIN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 66793613 T/G 1 13 10 23 6.14814936039058 5.27065433816109 0.877495022229492 T:G T G 10 0.527065433816109 0.835491706691073 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 67457698 A/G 1 10 8 18 4.72934566183891 4.21652347052887 0.512822191310037 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000166949:ENST00000327367:exon_67457591_67457722:SMAD3;ENSG00000166949:ENST00000439724:exon_67457591_67457722:SMAD3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 67473790 C/T 1 7 5 12 3.31054196328724 2.63532716908055 0.675214794206692 T:C C T 10 0.527065433816109 0.778351128206284 ENSG00000166949:ENST00000327367:exon_67473579_67473791:SMAD3;ENSG00000166949:ENST00000439724:exon_67473579_67473791:SMAD3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 67528374 T/G 1 8 3 11 3.78347652947113 1.58119630144833 2.2022802280228 T:G T G 10 0.527065433816109 0.234094659981005 ENSG00000103591:ENST00000261880:exon_67528317_67528406:AAGAB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 70345626 C/T 1 20 12 32 9.45869132367782 6.32478520579331 3.13390611788451 T:C C T 10 0.527065433816109 0.292423890948533 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70345566_70345713:TLE3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 70346923 C/T 1 26 16 42 12.2962987207812 8.43304694105774 3.86325177972342 T:C C T 10 0.527065433816109 0.279774955150085 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70346777_70347024:TLE3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 73027478 T/C 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000140463:ENST00000268057:exon_73027454_73027523:BBS4;ENSG00000140463:ENST00000395205:exon_73027454_73027523:BBS4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 74328116 A/G 1 82 73 155 38.7806344270791 38.475776668576 0.304857758503097 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 74328141 G/T 1 74 84 158 34.9971578976079 44.2734964405532 -9.27633854294523 T:G G T 10 0.527065433816109 0.151551941198228 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 74703929 T/C 1 70 66 136 33.1054196328724 34.7863186318632 -1.68089899899083 T:C T C 10 0.527065433816109 0.797058978387052 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74703897_74704051:SEMA7A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 75093389 C/T 1 220 246 466 104.045604560456 129.658096718763 -25.6124921583068 A:T:C:G C T 10 0.527065433816109 0.017970061998221 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75093353_75093443:CSK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 75189930 A/G 1 60 94 154 28.3760739710335 49.5441507787142 -21.1680768076808 A:G A G 10 0.527065433816109 0.000669890712739733 ENSG00000178802:ENST00000352410:exon_75189853_75191798:MPI;ENSG00000178802:ENST00000323744:exon_75189853_75190569:MPI HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 75499995 T/G 1 53 50 103 25.0655320077462 26.3532716908055 -1.28773968305923 T:G T G 10 0.527065433816109 0.843772517255142 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 75631983 G/A 1 7 10 17 3.31054196328724 5.27065433816109 -1.96011237487385 A:G G A 10 0.527065433816109 0.467399584608424 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 75648617 G/A 1 2 7 9 0.945869132367782 3.68945803671276 -2.74358890434498 A:G G A 10 0.527065433816109 0.094465581682091 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 75650836 G/A 1 61 51 112 28.8490085372173 26.8803371246216 1.96867141259579 A:G G A 10 0.527065433816109 0.776656948247869 ENSG00000140400:ENST00000267978:exon_75650803_75650959:MAN2C1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 75650972 G/A 1 30 4 34 14.1880369855167 2.10826173526444 12.0797752502523 A:G G A 10 0.527065433816109 1.70899723133540e-05 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 75909803 A/G 1 4 14 18 1.89173826473556 7.37891607342553 -5.48717780868996 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0156821937771927 ENSG00000169371:ENST00000308588:exon_75909749_75909893:SNUPN;ENSG00000169371:ENST00000371091:exon_75909749_75909893:SNUPN;ENSG00000169371:ENST00000432476:exon_75909749_75909893:SNUPN;ENSG00000169371:ENST00000394932:exon_75909749_75909893:SNUPN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 75932129 G/T 1 121 114 235 57.2250825082508 60.0854594550364 -2.86037694678562 T:G G T 10 0.527065433816109 0.744042785533517 ENSG00000177971:ENST00000314852:exon_75931426_75932609:IMP3;ENSG00000177971:ENST00000403490:exon_75931690_75932552:IMP3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 76578762 G/A 1 63 45 108 29.7948776695851 23.7179445217249 6.07693314786022 A:C:G G A 10 0.527065433816109 0.249079218712247 ENSG00000140374:ENST00000267950:exon_76578712_76578822:ETFA;ENSG00000140374:ENST00000433983:exon_76578712_76578822:ETFA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 77344793 T/A 1 44 66 110 20.8091209120912 34.7863186318632 -13.977197719772 A:T T A 10 0.527065433816109 0.009617400374197 ENSG00000140391:ENST00000267970:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000346495:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000424443:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000423920:exon_77344727_77344810:TSPAN3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 78585106 C/T 1 37 37 74 17.498578948804 19.501421051196 -2.00284210239207 T:C C T 10 0.527065433816109 0.643736399913137 ENSG00000140395:ENST00000267973:exon_78584958_78585130:WDR61 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 78789488 C/T 1 3 7 10 1.41880369855167 3.68945803671276 -2.27065433816109 T:C C T 10 0.527065433816109 0.207504053786451 ENSG00000136381:ENST00000258886:exon_78789468_78789653:IREB2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 78841220 T/C 1 460 423 883 217.54990044459 222.948678504214 -5.39877805962428 T:C T C 10 0.527065433816109 0.736125395447556 ENSG00000041357:ENST00000417370:exon_78841132_78841560:PSMA4;ENSG00000041357:ENST00000413382:exon_78841132_78841560:PSMA4;ENSG00000041357:ENST00000044462:exon_78841132_78841604:PSMA4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 79237247 C/G 1 46 97 143 21.754990044459 51.1253470801626 -29.3703570357036 C:G C G 10 0.527065433816109 8.75091790455058e-07 ENSG00000103811:ENST00000220166:exon_79237233_79237433:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000394758:exon_79237233_79237260:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000444399:exon_79237233_79237256:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000525807:exon_79237233_79237404:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000533777:exon_79237233_79237388:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529861:exon_79237120_79237436:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534038:exon_79237233_79237388:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000530010:exon_79237233_79237340:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534268:exon_79236880_79237363:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528436:exon_79237233_79237384:CTSH HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 80191343 G/A 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 A:G G A 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000136371:ENST00000478497:exon_80191189_80191467:MTHFS;ENSG00000136371:ENST00000485386:exon_80191246_80191467:MTHFS;ENSG00000180953:ENST00000322484:exon_80191185_80191467:ST20;ENSG00000180953:ENST00000417278:exon_80191185_80191467:ST20 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 80260014 T/C 1 16 43 59 7.56695305894226 22.6638136540927 -15.0968605951504 T:C T C 10 0.527065433816109 0.000113680600529400 ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80259979_80260034:BCL2A1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 80263217 C/T 1 374 361 735 176.877527752775 190.270621607615 -13.3930938548401 T:C:G C T 10 0.527065433816109 0.336851390713057 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 80263345 A/C 1 201 201 402 95.0598478029621 105.940152197038 -10.8803043940758 A:C A C 10 0.527065433816109 0.294227899158787 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 80263406 C/T 1 217 215 432 102.626800861904 113.319068270463 -10.6922674085591 T:C C T 10 0.527065433816109 0.311796907948063 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 81584925 C/T 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 T:C C T 10 0.527065433816109 0.488810537661758 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81584897_81585378:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81584897_81585378:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81584897_81585240:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81584897_81585378:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81584897_81585378:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81584897_81585378:IL16 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 82512429 C/G 1 5 12 17 2.36467283091945 6.32478520579331 -3.96011237487385 C:G C G 10 0.527065433816109 0.0861119132037109 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82512419_82512570:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82512419_82512570:EFTUD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 83680287 A/G 1 5 14 19 2.36467283091945 7.37891607342553 -5.01424324250607 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0357427938666352 ENSG00000169609:ENST00000514272:exon_83680238_83680356:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000510873:exon_83680238_83680343:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000512638:exon_83680238_83680301:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000513601:exon_83680249_83680391:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000304177:exon_83680249_83680358:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000508990:exon_83680238_83680337:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000505341:exon_83678989_83680346:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000506912:exon_83680238_83680362:C15orf40 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 83686759 T/C 1 62 43 105 29.3219431034012 22.6638136540927 6.65812944930855 T:C T C 10 0.527065433816109 0.204758625170925 ENSG00000064726:ENST00000261721:exon_83685174_83686977:BTBD1;ENSG00000064726:ENST00000379403:exon_83685185_83686977:BTBD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 83735926 C/G 1 19 12 31 8.98575675749393 6.32478520579331 2.66097155170062 C:G C G 10 0.527065433816109 0.372709146379426 ENSG00000064726:ENST00000261721:exon_83735503_83736106:BTBD1;ENSG00000064726:ENST00000379403:exon_83735503_83736106:BTBD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 85186837 T/C 1 12 13 25 5.67521479420669 6.85185063960942 -1.17663584540273 T:C T C 10 0.527065433816109 0.691622871057986 ENSG00000177082:ENST00000434634:exon_85186014_85186954:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000398528:exon_85186014_85186954:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000323189:exon_85186719_85186954:WDR73 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 85188994 T/C 1 21 9 30 9.93162588986171 4.74358890434498 5.18803698551673 T:C T C 10 0.527065433816109 0.067446084470933 ENSG00000177082:ENST00000434634:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000398528:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000323189:exon_85188702_85189067:WDR73 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 86284523 C/T 1 23 29 52 10.8774950222295 15.2848975806672 -4.40740255843767 A:T:C C T 10 0.527065433816109 0.26649000121404 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86284277_86284726:AKAP13 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 86287867 G/A 1 25 12 37 11.8233641545973 6.32478520579331 5.49857894880397 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0725137172237727 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86287859_86289400:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86287859_86292586:AKAP13 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 89169614 A/G 1 7 7 14 3.31054196328724 3.68945803671276 -0.378916073425526 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89169377_89169980:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89169377_89169980:AEN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 89169858 A/G 1 16 10 26 7.56695305894226 5.27065433816109 2.29629872078116 A:G A G 10 0.527065433816109 0.434503000465296 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89169377_89169980:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89169377_89169980:AEN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 89172558 G/C 1 4 5 9 1.89173826473556 2.63532716908055 -0.743588904344981 C:G G C 10 0.527065433816109 0.743612144716174 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89172457_89172657:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89172457_89172657:AEN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 89182596 A/G 1 365 287 652 172.62111665712 151.267779505223 21.3533371518969 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0994525264689414 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89182574_89182825:ISG20;ENSG00000172183:ENST00000379224:exon_89182574_89182825:ISG20 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 90771750 T/G 1 8 8 16 3.78347652947113 4.21652347052887 -0.433046941057745 T:G T G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000185033:ENST00000332496:exon_90771136_90772892:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000437083:exon_90771136_90772890:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000411539:exon_90771136_90772892:SEMA4B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 90784663 C/T 1 8 3 11 3.78347652947113 1.58119630144833 2.2022802280228 T:C C T 10 0.527065433816109 0.234094659981005 ENSG00000183208:ENST00000448438:exon_90784132_90785312:C15orf58;ENSG00000183208:ENST00000329600:exon_90784132_90785312:C15orf58 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 91010776 T/C 1 7 14 21 3.31054196328724 7.37891607342553 -4.06837411013829 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0833995299023928 ENSG00000140575:ENST00000268182:exon_91010682_91010824:IQGAP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 91017718 C/T 1 7 5 12 3.31054196328724 2.63532716908055 0.675214794206692 T:C C T 10 0.527065433816109 0.778351128206284 ENSG00000140575:ENST00000268182:exon_91017717_91017925:IQGAP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 91083353 G/A 1 8 6 14 3.78347652947113 3.16239260289665 0.621083926574474 A:G G A 10 0.527065433816109 0.794786264772641 ENSG00000140577:ENST00000437186:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000268184:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000420329:exon_91083271_91083369:CRTC3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 91428290 C/T 1 8 7 15 3.78347652947113 3.68945803671276 0.0940184927583645 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000182511:ENST00000416779:exon_91428267_91428402:FES;ENSG00000182511:ENST00000328850:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000470152:exon_91428267_91428643:FES;ENSG00000182511:ENST00000414248:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000394306:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000394304:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000481665:exon_91428267_91428759:FES;ENSG00000182511:ENST00000394302:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000452243:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000464684:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000443697:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000444422:exon_91428276_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000394300:exon_91428276_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000450438:exon_91428276_91428488:FES HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 91478544 A/C 1 10 3 13 4.72934566183891 1.58119630144833 3.14814936039058 A:C A C 10 0.527065433816109 0.0984259133401166 ENSG00000140553:ENST00000394275:exon_91478174_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000495068:exon_91478515_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000497152:exon_91478515_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000418476:exon_91478515_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000268159:exon_91478516_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000454296:exon_91478532_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000439771:exon_91478532_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000486253:exon_91478540_91478605:UNC45A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 93527619 C/T 1 8 5 13 3.78347652947113 2.63532716908055 1.14814936039058 T:C C T 10 0.527065433816109 0.588366380954527 ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93527560_93527730:CHD2;ENSG00000173575:ENST00000309818:exon_93527560_93527730:CHD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 101464915 T/C 1 4 6 10 1.89173826473556 3.16239260289665 -1.27065433816109 T:C T C 10 0.527065433816109 0.532268681489131 ENSG00000154237:ENST00000532029:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000534045:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000527698:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101464777_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101464808_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101464808_101464934:LRRK1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 101595257 G/A 1 4 5 9 1.89173826473556 2.63532716908055 -0.743588904344981 A:G G A 10 0.527065433816109 0.743612144716174 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101595151_101595428:LRRK1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 101598200 G/A 1 4 5 9 1.89173826473556 2.63532716908055 -0.743588904344981 A:G G A 10 0.527065433816109 0.743612144716174 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525395:exon_101598195_101598346:LRRK1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 101606261 C/T 1 8 16 24 3.78347652947113 8.43304694105774 -4.64957041158662 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0663902982699974 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101605557_101606410:LRRK1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 101718097 C/G 1 12 11 23 5.67521479420669 5.7977197719772 -0.122504977770507 C:G C G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 101718239 C/G 1 12 13 25 5.67521479420669 6.85185063960942 -1.17663584540273 C:G C G 10 0.527065433816109 0.691622871057986 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 15 102224341 G/A 1 4 6 10 1.89173826473556 3.16239260289665 -1.27065433816109 A:G G A 10 0.527065433816109 0.532268681489131 ENSG00000185418:ENST00000335968:exon_102224278_102224440:TARSL2;ENSG00000185418:ENST00000333018:exon_102224278_102224440:TARSL2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 304514 C/T 1 14 7 21 6.62108392657447 3.68945803671276 2.93162588986171 T:C C T 10 0.527065433816109 0.274579453085168 ENSG00000167930:ENST00000399932:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301679:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000419173:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000426695:exon_304328_304564:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000438220:exon_304387_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000447499:exon_304380_304673:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000453430:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000449945:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000420046:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301678:exon_304387_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000420500:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000417499:exon_304328_304618:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442458:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000450082:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442854:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000496874:exon_304121_304680:ITFG3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 347184 A/G 1 20 22 42 9.45869132367782 11.5954395439544 -2.13674822027658 A:G A G 10 0.527065433816109 0.539221144360839 ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000461023:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000421566:exon_347056_347226:AXIN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 417757 T/C 1 185 160 345 87.4928947440198 84.3304694105775 3.16242533344237 T:C:G T C 10 0.527065433816109 0.746554506822486 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_416927_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_417394_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_417394_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_417396_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_417398_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_417409_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_417427_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_417613_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_417724_417782:MRPL28 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 424277 G/A 1 23 13 36 10.8774950222295 6.85185063960942 4.02564438262007 A:G G A 10 0.527065433816109 0.186752054600957 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000424078:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000448854:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000467452:exon_424221_424399:TMEM8A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 677629 T/C 1 5 5 10 2.36467283091945 2.63532716908055 -0.270654338161091 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000197562:ENST00000248139:exon_677342_679272:RAB40C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 705844 T/C 1 19 11 30 8.98575675749393 5.7977197719772 3.18803698551673 T:C T C 10 0.527065433816109 0.275830848602445 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_705773_705889:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000429287:exon_705773_706050:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000420061:exon_705773_705889:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000389495:exon_705773_705888:WDR90 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 706534 G/A 1 12 3 15 5.67521479420669 1.58119630144833 4.09401849275836 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0390849308207645 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_706302_706537:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000420061:exon_706302_706537:WDR90 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 706668 G/A 1 14 1 15 6.62108392657447 0.527065433816109 6.09401849275836 A:G G A 10 0.527065433816109 0.00120765688843076 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 711712 C/T 1 4 5 9 1.89173826473556 2.63532716908055 -0.743588904344981 T:C C T 10 0.527065433816109 0.743612144716174 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_711597_711787:WDR90 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 711905 A/G 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_711891_712059:WDR90 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 715847 A/G 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 A:G A G 10 0.527065433816109 0.757490641773051 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 715990 G/A 1 13 19 32 6.14814936039058 10.0142432425061 -3.86609388211549 A:G G A 10 0.527065433816109 0.215046593941621 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_715950_716124:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_715950_716124:WDR90 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 716428 G/A 1 6 3 9 2.83760739710335 1.58119630144833 1.25641109565502 A:G G A 10 0.527065433816109 0.513555929047552 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 717523 G/T 1 19 18 37 8.98575675749393 9.48717780868996 -0.501421051196035 T:G G T 10 0.527065433816109 0.871040774660792 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_717432_717829:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_717432_717829:WDR90 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 718514 C/G 1 22 32 54 10.4045604560456 16.8660938821155 -6.46153342606989 C:G C G 10 0.527065433816109 0.101086788217580 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_718488_718569:RHOT2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 720986 G/A 1 22 19 41 10.4045604560456 10.0142432425061 0.390317213539529 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_720892_721000:RHOT2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 722331 C/T 1 25 20 45 11.8233641545973 10.5413086763222 1.28205547827509 T:C C T 10 0.527065433816109 0.76625053826379 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722254_722384:RHOT2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 722548 A/G 1 49 46 95 23.1737937430107 24.245009955541 -1.07121621253036 A:G A G 10 0.527065433816109 0.83786184389904 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722489_722566:RHOT2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 723647 C/G 1 64 54 118 30.267812235769 28.4615334260699 1.80627880969913 A:C:G C G 10 0.527065433816109 0.782416838916367 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_723480_724174:RHOT2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 735921 T/C 1 18 10 28 8.51282219131004 5.27065433816109 3.24216785314895 T:C T C 10 0.527065433816109 0.258318455384860 ENSG00000127580:ENST00000293883:exon_735869_735990:WDR24;ENSG00000127580:ENST00000248142:exon_735869_735990:WDR24 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 772061 C/T 1 19 4 23 8.98575675749393 2.10826173526444 6.87749502222949 T:C C T 10 0.527065433816109 0.00536626114009287 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 772141 G/C 1 8 8 16 3.78347652947113 4.21652347052887 -0.433046941057745 A:C:G G C 10 0.527065433816109 1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 774520 C/T 1 14 15 29 6.62108392657447 7.90598150724164 -1.28489758066716 T:C C T 10 0.527065433816109 0.711321912285436 ENSG00000162004:ENST00000463539:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482878:exon_772582_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000478979:exon_772583_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000479742:exon_774322_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000481804:exon_774106_775880:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000466708:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482152:exon_774322_774635:CCDC78 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 774692 A/G 1 12 12 24 5.67521479420669 6.32478520579331 -0.649570411586616 A:G A G 10 0.527065433816109 0.83992621234606 ENSG00000162004:ENST00000463539:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000485091:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000293889:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482878:exon_772582_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000478979:exon_772583_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000345165:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000479742:exon_774322_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000481804:exon_774106_775880:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000466708:exon_774322_774806:CCDC78 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 778024 T/C 1 31 28 59 14.6609715517006 14.7578321468511 -0.0968605951504333 A:T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000103253:ENST00000341413:exon_777965_778029:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389701:exon_777965_778029:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389703:exon_777965_778029:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389702:exon_777965_778029:HAGHL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 778820 G/A 1 42 29 71 19.8632517797234 15.2848975806672 4.57835419905626 A:G G A 10 0.527065433816109 0.287297344422727 ENSG00000103253:ENST00000341413:exon_778794_779715:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389701:exon_778794_778868:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389703:exon_778794_778895:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389702:exon_778794_779168:HAGHL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 780339 A/G 1 58 38 96 27.4302048386657 20.0284864850121 7.40171835365353 A:G A G 10 0.527065433816109 0.152161312035775 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_779753_780655:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_779771_780655:NARFL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 781633 G/A 1 4 9 13 1.89173826473556 4.74358890434498 -2.85185063960942 A:G G A 10 0.527065433816109 0.163735013053684 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_781565_781702:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_781565_781702:NARFL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 784765 C/T 1 14 13 27 6.62108392657447 6.85185063960942 -0.230766713034944 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_784737_784871:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_784737_784871:NARFL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 1004554 C/T 1 7 8 15 3.31054196328724 4.21652347052887 -0.905981507241636 T:C C T 10 0.527065433816109 0.797198000532565 ENSG00000103227:ENST00000262301:exon_1004357_1004666:LMF1;ENSG00000103227:ENST00000399843:exon_1004357_1004666:LMF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 1400973 C/T 1 106 95 201 50.1310640154924 50.0712162125304 0.0598478029620821 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000007520:ENST00000007390:exon_1400808_1401001:C16orf42 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 1559838 T/C 1 40 34 74 18.9173826473556 17.9202247497477 0.997157897607931 T:C T C 10 0.527065433816109 0.907426516443574 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1559831_1560453:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1559831_1560458:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1559831_1560455:TELO2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 1812972 G/C 1 8 10 18 3.78347652947113 5.27065433816109 -1.48717780868996 C:G G C 10 0.527065433816109 0.49133381096339 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1812837_1813007:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1812837_1813007:MAPK8IP3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 1814391 T/C 1 13 14 27 6.14814936039058 7.37891607342553 -1.23076671303494 T:C T C 10 0.527065433816109 0.701898180501923 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 1814440 A/G 1 14 14 28 6.62108392657447 7.37891607342553 -0.757832146851053 A:G A G 10 0.527065433816109 0.850808986253895 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 1818503 G/C 1 28 19 47 13.2421678531489 10.0142432425061 3.22792461064287 A:C:G G C 10 0.527065433816109 0.382708500640441 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1818478_1818627:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1818478_1818627:MAPK8IP3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 1820992 T/A 1 186 161 347 87.9658293102037 84.8575348443936 3.10829446581016 A:T:C T A 10 0.527065433816109 0.747319187952374 ENSG00000103024:ENST00000219302:exon_1820882_1820994:NME3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 1822159 T/C 1 246 183 429 116.341903281237 96.452974388348 19.8889288928892 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0592211382107923 ENSG00000074071:ENST00000397375:exon_1821891_1822514:MRPS34;ENSG00000074071:ENST00000177742:exon_1821891_1822535:MRPS34;ENSG00000074071:ENST00000432952:exon_1821891_1822535:MRPS34 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 1827836 T/C 1 35 29 64 16.5527098164362 15.2848975806672 1.26781223576902 T:C T C 10 0.527065433816109 0.802944353518891 ENSG00000197774:ENST00000307394:exon_1826069_1830628:EME2;ENSG00000197774:ENST00000422472:exon_1826069_1830628:EME2;ENSG00000162032:ENST00000301717:exon_1827748_1827873:SPSB3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 1838037 C/G 1 78 73 151 36.8888961623435 38.475776668576 -1.58688050623247 C:G C G 10 0.527065433816109 0.807319072468197 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1837942_1838052:NUBP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 2014424 C/G 1 9 36 45 4.25641109565502 18.9743556173799 -14.7179445217249 C:G C G 10 0.527065433816109 8.46239832502389e-06 ENSG00000140988:ENST00000526908:exon_2014277_2014539:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 2014591 C/T 1 750 209 959 354.700924637918 110.156675667567 244.544248970351 T:C C T 10 0.527065433816109 3.72442826323798e-60 ENSG00000140988:ENST00000526522:exon_2014450_2014804:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527109:exon_2014450_2014631:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527871:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000530225:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531065:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533161:exon_2014450_2014814:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000343262:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000529806:exon_2014450_2014813:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531182:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527302:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 2025206 A/C 1 18 33 51 8.51282219131004 17.3931593159316 -8.88033712462156 A:C A C 10 0.527065433816109 0.0163522519590807 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025188_2025263:TBL3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 2025604 G/C 1 39 41 80 18.4444480811717 21.6096827864605 -3.16523470528873 C:G G C 10 0.527065433816109 0.50298857028686 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025530_2025711:TBL3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 2025678 C/A 1 34 27 61 16.0797752502523 14.2307667130349 1.84900853721735 A:C C A 10 0.527065433816109 0.701105241861212 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025530_2025711:TBL3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 2028402 A/C 1 60 74 134 28.3760739710335 39.0028421023921 -10.6267681313586 A:C A C 10 0.527065433816109 0.0694381018882887 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2028314_2028472:TBL3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 2036048 T/C 1 64 71 135 30.267812235769 37.4216458009437 -7.15383356517472 T:C T C 10 0.527065433816109 0.22817759724447 ENSG00000127554:ENST00000248114:exon_2035867_2037746:GFER;ENSG00000127554:ENST00000425414:exon_2035867_2037746:GFER HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 2048796 C/T 1 48 37 85 22.7008591768268 19.501421051196 3.19943812563073 T:C C T 10 0.527065433816109 0.515838138071085 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2048703_2048853:ZNF598 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 2048826 C/G 1 30 33 63 14.1880369855167 17.3931593159316 -3.20512233041487 C:G C G 10 0.527065433816109 0.450354844465412 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2048703_2048853:ZNF598 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 2049640 A/G 1 53 56 109 25.0655320077462 29.5156642937021 -4.45013228595588 A:G A G 10 0.527065433816109 0.443001993470681 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 2049728 C/T 1 40 60 100 18.9173826473556 31.6239260289665 -12.7065433816109 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0120876947313098 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 2049849 T/C 1 51 52 103 24.1196628753784 27.4074025584377 -3.28773968305923 T:C T C 10 0.527065433816109 0.554287491642136 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 2050141 G/A 0 90 0 90 42.5641109565502 0 42.5641109565502 G G 10 0.527065433816109 1.2024486559273e-25 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 2050192 G/T 1 49 34 83 23.1737937430107 17.9202247497477 5.25356899326295 T:G G T 10 0.527065433816109 0.272356077619220 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 2114407 C/T 1 2 7 9 0.945869132367782 3.68945803671276 -2.74358890434498 T:C C T 10 0.527065433816109 0.094465581682091 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2114273_2114428:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2114273_2114428:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2114273_2114428:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2114273_2114428:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2114273_2114428:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2114273_2114428:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000490108:exon_2114273_2114428:TSC2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 2140010 A/G 1 20 25 45 9.45869132367782 13.1766358454027 -3.71794452172491 A:G A G 10 0.527065433816109 0.297438980798901 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000306101:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000472577:exon_2139528_2140195:PKD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 2140454 T/C 1 12 12 24 5.67521479420669 6.32478520579331 -0.649570411586616 T:C T C 10 0.527065433816109 0.83992621234606 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000306101:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000472577:exon_2140286_2140591:PKD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 2140532 G/A 0 24 0 24 11.3504295884134 0 11.3504295884134 G G 10 0.527065433816109 2.26902357091146e-07 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000306101:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000472577:exon_2140286_2140591:PKD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 2140680 T/C 1 8 9 17 3.78347652947113 4.74358890434498 -0.960112374873853 T:C T C 10 0.527065433816109 0.80902600536977 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2140675_2140809:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2140675_2140809:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2140675_2140809:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000306101:exon_2140675_2140809:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2140675_2140809:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000472577:exon_2140675_2140840:PKD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 2222286 C/T 1 17 16 33 8.03988762512615 8.43304694105774 -0.393159315931598 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000131653:ENST00000326181:exon_2222192_2222375:TRAF7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 2255807 G/A 0 0 10 10 0 5.27065433816109 -5.27065433816109 A G A 10 0.527065433816109 0.000559771227864236 ENSG00000167965:ENST00000397124:exon_2255742_2255876:MLST8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 2812647 C/T 1 51 47 98 24.1196628753784 24.7720753893571 -0.652412513978685 T:C C T 10 0.527065433816109 0.919655744310662 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 2815237 A/C 1 184 160 344 87.0199601778359 84.3304694105775 2.68949076725849 A:C A C 10 0.527065433816109 0.787360811834104 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 2820882 G/T 1 537 535 1072 253.965862040749 281.980007091618 -28.0141450508689 A:T:G G T 10 0.527065433816109 0.0868250660904944 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2820859_2821411:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2820859_2821411:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382300:exon_2820859_2821411:SRRM2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 2821525 G/A 1 10 7 17 4.72934566183891 3.68945803671276 1.03988762512615 A:G G A 10 0.527065433816109 0.637665492029096 ENSG00000103363:ENST00000409906:exon_2821415_2822103:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000262306:exon_2821415_2821605:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000409477:exon_2821416_2822103:TCEB2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 2867450 G/C 0 0 71 71 0 37.4216458009437 -37.4216458009437 C G C 10 0.527065433816109 8.14469942449532e-24 ENSG00000007038:ENST00000455114:exon_2867431_2867457:PRSS21;ENSG00000007038:ENST00000450020:exon_2867431_2867457:PRSS21;ENSG00000007038:ENST00000005995:exon_2867431_2867457:PRSS21 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 2871121 T/C 0 0 101 101 0 53.233608815427 -53.233608815427 C T C 10 0.527065433816109 1.42858727607277e-33 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 2871555 G/A 0 0 188 188 0 99.0883015574285 -99.0883015574285 A G A 10 0.527065433816109 7.28783874345696e-62 ENSG00000007038:ENST00000455114:exon_2871367_2871720:PRSS21;ENSG00000007038:ENST00000450020:exon_2871367_2871720:PRSS21;ENSG00000007038:ENST00000005995:exon_2871367_2871720:PRSS21 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 2882197 G/T 1 47 61 108 22.2279246106429 32.1509914627826 -9.92306685213977 T:G G T 10 0.527065433816109 0.0666371300989978 ENSG00000162078:ENST00000382280:exon_2881797_2882285:ZG16B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 2983138 C/T 1 21 5 26 9.93162588986171 2.63532716908055 7.29629872078116 T:C C T 10 0.527065433816109 0.00497893995424531 ENSG00000059122:ENST00000416288:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000253928:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000399667:exon_2983131_2983583:FLYWCH1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 2983483 C/G 1 18 18 36 8.51282219131004 9.48717780868996 -0.974355617379924 C:G C G 10 0.527065433816109 0.742458916413507 ENSG00000059122:ENST00000416288:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000253928:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000399667:exon_2983131_2983583:FLYWCH1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 3452193 T/G 1 12 13 25 5.67521479420669 6.85185063960942 -1.17663584540273 T:G T G 10 0.527065433816109 0.691622871057986 ENSG00000103343:ENST00000344823:exon_3451190_3452406:ZNF174;ENSG00000103343:ENST00000268655:exon_3451420_3452406:ZNF174 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 3639139 A/G 1 6 2 8 2.83760739710335 1.05413086763222 1.78347652947113 A:G A G 10 0.527065433816109 0.29481715391141 ENSG00000188827:ENST00000294008:exon_3639003_3641311:SLX4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 3707747 G/A 1 7 6 13 3.31054196328724 3.16239260289665 0.148149360390583 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000213918:ENST00000407479:exon_3707721_3707817:DNASE1;ENSG00000213918:ENST00000414110:exon_3707721_3707817:DNASE1;ENSG00000213918:ENST00000246949:exon_3707721_3707817:DNASE1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 3721773 G/C 1 107 72 179 50.6039985816763 37.9487112347598 12.6552873469165 C:G G C 10 0.527065433816109 0.0613314528350765 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3721723_3721792:TRAP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 3724465 G/C 1 70 70 140 33.1054196328724 36.8945803671276 -3.78916073425526 T:C:G G C 10 0.527065433816109 0.553881758797245 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3724340_3724495:TRAP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 3778337 G/A 1 18 21 39 8.51282219131004 11.0683741101383 -2.55555191882825 A:T:G G A 10 0.527065433816109 0.427246720594883 ENSG00000005339:ENST00000262367:exon_3775055_3779875:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000382070:exon_3775055_3779875:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000323508:exon_3775055_3779875:CREBBP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 4445327 C/T 1 10 10 20 4.72934566183891 5.27065433816109 -0.541308676322181 T:C C T 10 0.527065433816109 0.826649432830958 ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4445290_4445340:CORO7;ENSG00000103426:ENST00000423908:exon_4445290_4445340:CORO7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 4476089 T/C 1 10 19 29 4.72934566183891 10.0142432425061 -5.28489758066716 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0619173766904125 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4475806_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4475858_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4475882_4476093:DNAJA3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 4484396 A/T 1 10 14 24 4.72934566183891 7.37891607342553 -2.64957041158662 A:T A T 10 0.527065433816109 0.311132051737374 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4484385_4484518:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4484385_4484518:DNAJA3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 4496973 T/A 1 10 14 24 4.72934566183891 7.37891607342553 -2.64957041158662 A:T T A 10 0.527065433816109 0.311132051737374 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4496887_4497015:DNAJA3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 4707346 G/A 1 8 2 10 3.78347652947113 1.05413086763222 2.72934566183891 A:G G A 10 0.527065433816109 0.114525614534534 ENSG00000102858:ENST00000262370:exon_4707247_4707364:MGRN1;ENSG00000102858:ENST00000415496:exon_4707247_4707364:MGRN1;ENSG00000102858:ENST00000399577:exon_4707247_4707364:MGRN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 4748825 C/T 1 9 10 19 4.25641109565502 5.27065433816109 -1.01424324250607 T:C C T 10 0.527065433816109 0.654162232160302 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4748801_4748942:ANKS3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 4752134 A/G 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 A:G A G 10 0.527065433816109 0.160556933333404 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4752103_4752243:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4752103_4752243:ANKS3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 4855279 A/G 1 30 47 77 14.1880369855167 24.7720753893571 -10.5840384038404 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0165321043028208 ENSG00000140632:ENST00000321919:exon_4853204_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000441951:exon_4855102_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000436648:exon_4855102_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000381983:exon_4855102_4855311:GLYR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 4925291 T/G 1 3 6 9 1.41880369855167 3.16239260289665 -1.74358890434498 T:G T G 10 0.527065433816109 0.323067031523113 ENSG00000118900:ENST00000262376:exon_4924212_4925435:UBN1;ENSG00000118900:ENST00000396658:exon_4924212_4925435:UBN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 4930100 C/T 1 10 10 20 4.72934566183891 5.27065433816109 -0.541308676322181 T:C C T 10 0.527065433816109 0.826649432830958 ENSG00000118900:ENST00000262376:exon_4930084_4932361:UBN1;ENSG00000118900:ENST00000396658:exon_4930084_4932361:UBN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 5075542 G/A 1 4 9 13 1.89173826473556 4.74358890434498 -2.85185063960942 A:G G A 10 0.527065433816109 0.163735013053684 ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5074845_5075686:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5074873_5075686:NAGPA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 5075633 G/A 1 14 7 21 6.62108392657447 3.68945803671276 2.93162588986171 A:G G A 10 0.527065433816109 0.274579453085168 ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5074845_5075686:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5074873_5075686:NAGPA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 5140541 G/C 1 10 4 14 4.72934566183891 2.10826173526444 2.62108392657447 C:G G C 10 0.527065433816109 0.18849020884602 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5140433_5140566:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5140433_5140566:FAM86A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 8953081 C/G 1 39 30 69 18.4444480811717 15.8119630144833 2.63248506668847 C:G C G 10 0.527065433816109 0.548715912356438 ENSG00000153048:ENST00000396593:exon_8953028_8953192:CARHSP1;ENSG00000153048:ENST00000311052:exon_8953028_8953192:CARHSP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 10862964 A/G 1 78 98 176 36.8888961623435 51.6524125139787 -14.7635163516352 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0284124619290606 ENSG00000103274:ENST00000283027:exon_10862904_10863208:NUBP1;ENSG00000103274:ENST00000433392:exon_10862904_10863208:NUBP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 11001743 G/A 1 16 13 29 7.56695305894226 6.85185063960942 0.715102419332838 A:G G A 10 0.527065433816109 0.853844997602006 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 11017058 G/A 1 6 6 12 2.83760739710335 3.16239260289665 -0.324785205793308 A:G G A 10 0.527065433816109 1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 11769948 C/T 1 11 12 23 5.2022802280228 6.32478520579331 -1.12250497777051 T:C C T 10 0.527065433816109 0.680359986743593 ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 11769963 C/T 1 13 12 25 6.14814936039058 6.32478520579331 -0.176635845402726 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 11773662 C/G 1 109 115 224 51.5498677140441 60.6125248888525 -9.06265717480843 T:C:G C G 10 0.527065433816109 0.229085596442880 ENSG00000153066:ENST00000283033:exon_11772943_11773693:TXNDC11;ENSG00000153066:ENST00000356957:exon_11772943_11773693:TXNDC11 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 11852354 A/C 1 7 17 24 3.31054196328724 8.96011237487385 -5.64957041158662 A:C A C 10 0.527065433816109 0.0241168448802507 ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11852287_11852395:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11852287_11852395:ZC3H7A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 11940390 T/C 1 326 335 661 154.176668575948 176.566920328397 -22.3902517524481 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0864781968788462 ENSG00000171490:ENST00000396503:exon_11940358_11940459:RSL1D1;ENSG00000171490:ENST00000355674:exon_11940358_11940459:RSL1D1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 11969724 G/C 1 26 41 67 12.2962987207812 21.6096827864605 -9.31338406567931 A:C:G G C 10 0.527065433816109 0.0270830234800730 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000420576:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_11969618_11969786:GSPT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 12223637 A/G 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 A:G A G 10 0.527065433816109 1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 16139714 T/C 1 9 1 10 4.25641109565502 0.527065433816109 3.72934566183891 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0232976587027389 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16139693_16139870:ABCC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 16228242 G/A 1 9 13 22 4.25641109565502 6.85185063960942 -2.5954395439544 A:G G A 10 0.527065433816109 0.292055393163298 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16228207_16228365:ABCC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 19085298 C/T 1 7 6 13 3.31054196328724 3.16239260289665 0.148149360390583 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000167186:ENST00000321998:exon_19085243_19085357:COQ7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 19548290 G/A 1 4 5 9 1.89173826473556 2.63532716908055 -0.743588904344981 A:G G A 10 0.527065433816109 0.743612144716174 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 19590444 T/C 1 6 3 9 2.83760739710335 1.58119630144833 1.25641109565502 T:C T C 10 0.527065433816109 0.513555929047552 ENSG00000103544:ENST00000438132:exon_19590374_19590450:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000251143:exon_19590374_19590450:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000417362:exon_19590374_19590450:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000448695:exon_19590307_19590450:C16orf62 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 19680546 T/C 1 9 10 19 4.25641109565502 5.27065433816109 -1.01424324250607 T:C T C 10 0.527065433816109 0.654162232160302 ENSG00000103544:ENST00000438132:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000251143:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000417362:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000448695:exon_19680482_19680621:C16orf62 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 19710824 G/A 1 36 24 60 17.0256443826201 12.6495704115866 4.37607397103346 A:G G A 10 0.527065433816109 0.301271865561524 ENSG00000103544:ENST00000438132:exon_19710824_19710970:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000251143:exon_19710824_19710970:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000417362:exon_19710824_19710970:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000448695:exon_19710824_19710970:C16orf62 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 20748331 C/A 1 10 15 25 4.72934566183891 7.90598150724164 -3.17663584540273 A:C C A 10 0.527065433816109 0.232365445872985 ENSG00000066654:ENST00000381337:exon_20748182_20748608:THUMPD1;ENSG00000066654:ENST00000396083:exon_20744991_20748608:THUMPD1;ENSG00000066654:ENST00000431224:exon_20746723_20748608:THUMPD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 21190853 A/C 1 13 20 33 6.14814936039058 10.5413086763222 -4.3931593159316 A:C A C 10 0.527065433816109 0.162357439542855 ENSG00000011638:ENST00000233047:exon_21190796_21191937:TMEM159;ENSG00000011638:ENST00000261388:exon_21190796_21191935:TMEM159;ENSG00000011638:ENST00000451578:exon_21190796_21191935:TMEM159 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 23409402 C/T 1 15 9 24 7.09401849275836 4.74358890434498 2.35042958841338 T:C C T 10 0.527065433816109 0.415272769718452 ENSG00000168434:ENST00000307149:exon_23409367_23409450:COG7;ENSG00000168434:ENST00000429391:exon_23409372_23409413:COG7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 23607510 G/A 1 61 47 108 28.8490085372173 24.7720753893571 4.07693314786022 A:G G A 10 0.527065433816109 0.442562822126038 ENSG00000004779:ENST00000007516:exon_23607444_23607677:NDUFAB1;ENSG00000004779:ENST00000484769:exon_23607444_23607624:NDUFAB1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 23701538 A/G 1 161 158 319 76.1424651556064 83.2763385429452 -7.13387338733878 A:G A G 10 0.527065433816109 0.432841544101101 ENSG00000166851:ENST00000300093:exon_23701181_23701688:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000330792:exon_23701452_23701541:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000425844:exon_23701181_23701688:PLK1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 24582299 C/G 1 75 82 157 35.4700924637918 43.2193655729209 -7.74927310912912 C:G C G 10 0.527065433816109 0.230794501258496 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 24583406 A/G 1 138 150 288 65.2649701333769 79.0598150724164 -13.7948449390394 A:G A G 10 0.527065433816109 0.111026819011372 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 24788645 T/A 1 9 4 13 4.25641109565502 2.10826173526444 2.14814936039058 A:T T A 10 0.527065433816109 0.276012087147778 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395801:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24788569_24788679:TNRC6A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 24801737 G/A 1 5 7 12 2.36467283091945 3.68945803671276 -1.32478520579331 A:G G A 10 0.527065433816109 0.566621218006073 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395801:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000352205:exon_24801651_24803138:TNRC6A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 24801979 C/T 1 11 9 20 5.2022802280228 4.74358890434498 0.45869132367782 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395801:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000352205:exon_24801651_24803138:TNRC6A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 24802325 C/T 1 4 5 9 1.89173826473556 2.63532716908055 -0.743588904344981 T:C C T 10 0.527065433816109 0.743612144716174 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395801:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000352205:exon_24801651_24803138:TNRC6A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 24835168 G/A 1 12 6 18 5.67521479420669 3.16239260289665 2.51282219131004 A:G G A 10 0.527065433816109 0.345457652895314 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24834753_24836196:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24834753_24837548:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24834753_24837545:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24834753_24837548:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000432286:exon_24834753_24836090:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000450465:exon_24834753_24836107:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000464539:exon_24834753_24836107:TNRC6A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 27238110 C/T 1 65 48 113 30.7407468019529 25.2991408231732 5.44160597877968 T:C C T 10 0.527065433816109 0.346231284733408 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27238041_27238157:NSMCE1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 27246617 T/C 1 35 46 81 16.5527098164362 24.245009955541 -7.69230013910483 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0952492107022258 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27246499_27246620:NSMCE1;ENSG00000169189:ENST00000358787:exon_27246499_27246620:NSMCE1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 27356203 A/G 1 12 9 21 5.67521479420669 4.74358890434498 0.931625889861711 A:G A G 10 0.527065433816109 0.827834701908173 ENSG00000077238:ENST00000380925:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000449195:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27356190_27356341:IL4R HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 28145165 T/A 1 14 17 31 6.62108392657447 8.96011237487385 -2.33902844829938 A:T T A 10 0.527065433816109 0.473001163337348 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28145162_28145254:XPO6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 29675928 C/T 1 124 132 256 58.6438862068025 69.5726372637264 -10.9287510569239 T:C C T 10 0.527065433816109 0.188608395597838 ENSG00000197471:ENST00000395389:exon_29675016_29676848:SPN;ENSG00000197471:ENST00000436527:exon_29675016_29676114:SPN;ENSG00000197471:ENST00000360121:exon_29675016_29681811:SPN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 29706444 C/T 1 82 100 182 38.7806344270791 52.7065433816109 -13.9259089545318 A:T:C C T 10 0.527065433816109 0.0447537256161879 ENSG00000103485:ENST00000449759:exon_29705985_29706465:QPRT;ENSG00000103485:ENST00000395384:exon_29705985_29706520:QPRT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 29842324 G/A 1 16 60 76 7.56695305894226 31.6239260289665 -24.0569729700243 A:G G A 10 0.527065433816109 2.30407104885565e-08 ENSG00000013364:ENST00000357402:exon_29842199_29842394:MVP;ENSG00000013364:ENST00000395353:exon_29842199_29842394:MVP;ENSG00000013364:ENST00000424666:exon_29842199_29842369:MVP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 29848101 G/A 1 15 43 58 7.09401849275836 22.6638136540927 -15.5697951613343 A:G G A 10 0.527065433816109 5.42163828065075e-05 ENSG00000013364:ENST00000357402:exon_29848043_29848279:MVP;ENSG00000013364:ENST00000395353:exon_29848043_29848279:MVP;ENSG00000013364:ENST00000424666:exon_29848043_29848279:MVP;ENSG00000013364:ENST00000452209:exon_29848043_29848279:MVP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 29994922 C/T 1 13 8 21 6.14814936039058 4.21652347052887 1.93162588986171 T:C C T 10 0.527065433816109 0.513458776648042 ENSG00000149930:ENST00000416441:exon_29994824_29994985:TAOK2;ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29994824_29994985:TAOK2;ENSG00000149930:ENST00000279394:exon_29994824_29994985:TAOK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 29998200 A/G 1 4 5 9 1.89173826473556 2.63532716908055 -0.743588904344981 A:G A G 10 0.527065433816109 0.743612144716174 ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29997586_29999719:TAOK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 30000901 G/A 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 A:G G A 10 0.527065433816109 0.757490641773051 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 30199584 G/A 1 40 25 65 18.9173826473556 13.1766358454027 5.74074680195291 A:G G A 10 0.527065433816109 0.172303780611432 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 30536918 C/G 1 47 32 79 22.2279246106429 16.8660938821155 5.36183072852739 C:G C G 10 0.527065433816109 0.260003968941194 ENSG00000169957:ENST00000380412:exon_30535325_30537372:ZNF768 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 31193942 C/A 1 264 236 500 124.854725472547 124.387442380602 0.467283091945475 A:C C A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000089280:ENST00000254108:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000433338:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000394533:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000380244:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000487045:exon_31193834_31194283:FUS;ENSG00000089280:ENST00000491029:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000354711:exon_31193834_31193985:FUS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 31477460 G/A 1 24 28 52 11.3504295884134 14.7578321468511 -3.40740255843767 A:G G A 10 0.527065433816109 0.405024145914244 ENSG00000140691:ENST00000408912:exon_31477400_31478426:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000268314:exon_31477400_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000457010:exon_31475715_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000412665:exon_31477400_31478485:ARMC5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 46943745 G/A 1 5 5 10 2.36467283091945 2.63532716908055 -0.270654338161091 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000166123:ENST00000340124:exon_46943596_46943839:GPT2;ENSG00000166123:ENST00000440783:exon_46943596_46943839:GPT2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 47294579 G/A 1 9 5 14 4.25641109565502 2.63532716908055 1.62108392657447 A:G G A 10 0.527065433816109 0.433551468090942 ENSG00000129636:ENST00000320640:exon_47294456_47294606:ITFG1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 50342658 C/T 1 7 3 10 3.31054196328724 1.58119630144833 1.72934566183891 T:C C T 10 0.527065433816109 0.350932787230552 ENSG00000121281:ENST00000394697:exon_50342578_50342703:ADCY7;ENSG00000121281:ENST00000254235:exon_50342578_50342703:ADCY7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 50827518 C/T 1 41 47 88 19.3903172135395 24.7720753893571 -5.38175817581759 T:C C T 10 0.527065433816109 0.285763778418714 ENSG00000083799:ENST00000427738:exon_50827457_50827575:CYLD;ENSG00000083799:ENST00000311559:exon_50827457_50827575:CYLD;ENSG00000083799:ENST00000398568:exon_50827457_50827575:CYLD HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 53262964 C/T 1 19 24 43 8.98575675749393 12.6495704115866 -3.66381365409269 T:C C T 10 0.527065433816109 0.287202275245489 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53262895_53263012:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53262895_53263012:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53262895_53263012:CHD9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 53358439 A/G 1 5 7 12 2.36467283091945 3.68945803671276 -1.32478520579331 A:G A G 10 0.527065433816109 0.566621218006073 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53357932_53361413:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53357932_53361413:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53357932_53361413:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000450543:exon_53357932_53358807:CHD9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 53504721 T/C 1 9 8 17 4.25641109565502 4.21652347052887 0.0398876251261466 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000103479:ENST00000262133:exon_53504658_53504834:RBL2;ENSG00000103479:ENST00000379935:exon_53504658_53504834:RBL2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 56508787 G/A 1 18 28 46 8.51282219131004 14.7578321468511 -6.24500995554101 A:T:G G A 10 0.527065433816109 0.0761030390817141 ENSG00000087263:ENST00000336111:exon_56508740_56508862:OGFOD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 56969148 G/A 1 167 210 377 78.9800725527098 110.683741101383 -31.7036685486731 A:G G A 10 0.527065433816109 0.00113769170481907 ENSG00000051108:ENST00000439977:exon_56969147_56969224:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000379792:exon_56969147_56969224:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000300302:exon_56969147_56969224:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000344114:exon_56969147_56969224:HERPUD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 57016092 G/A 1 14 18 32 6.62108392657447 9.48717780868996 -2.86609388211549 A:G G A 10 0.527065433816109 0.376746667004893 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57016077_57016149:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57016077_57016149:CETP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 57060213 C/T 1 9 8 17 4.25641109565502 4.21652347052887 0.0398876251261466 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57059280_57060930:NLRC5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 57060340 T/C 1 19 13 32 8.98575675749393 6.85185063960942 2.13390611788451 T:C T C 10 0.527065433816109 0.483562767697165 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57059280_57060930:NLRC5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 57060353 T/C 1 16 17 33 7.56695305894226 8.96011237487385 -1.3931593159316 T:C T C 10 0.527065433816109 0.728041976709469 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57059280_57060930:NLRC5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 57075406 T/C 1 5 5 10 2.36467283091945 2.63532716908055 -0.270654338161091 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57075397_57075486:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57075397_57075486:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57075397_57075486:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57075397_57075486:NLRC5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 57080528 C/A 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 A:C C A 10 0.527065433816109 0.488810537661758 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57080464_57080553:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57080464_57080553:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57080464_57080553:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57080464_57080553:NLRC5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 57392733 A/C 1 140 137 277 66.2108392657447 72.2079644328069 -5.99712516706219 A:C A C 10 0.527065433816109 0.471055535446215 ENSG00000102962:ENST00000219235:exon_57392684_57392801:CCL22 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 57555076 C/T 1 8 10 18 3.78347652947113 5.27065433816109 -1.48717780868996 T:C C T 10 0.527065433816109 0.49133381096339 ENSG00000135736:ENST00000258214:exon_57554980_57555088:CCDC102A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 57601792 C/T 1 6 9 15 2.83760739710335 4.74358890434498 -1.90598150724164 T:C C T 10 0.527065433816109 0.439435430476406 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000349457:exon_57601768_57602036:GPR114 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 57602000 C/T 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 T:C C T 10 0.527065433816109 0.488810537661758 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000349457:exon_57601768_57602036:GPR114 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 58030634 C/T 1 8 4 12 3.78347652947113 2.10826173526444 1.67521479420669 T:C C T 10 0.527065433816109 0.396148353996528 ENSG00000166188:ENST00000299237:exon_58028573_58032426:ZNF319 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 58035429 C/A 1 5 10 15 2.36467283091945 5.27065433816109 -2.90598150724164 A:C C A 10 0.527065433816109 0.194890792920314 ENSG00000103005:ENST00000219281:exon_58035305_58035485:C16orf57;ENSG00000103005:ENST00000423271:exon_58035305_58035485:C16orf57 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 58054099 C/G 1 23 28 51 10.8774950222295 14.7578321468511 -3.88033712462156 C:G C G 10 0.527065433816109 0.326511207268883 ENSG00000103005:ENST00000219281:exon_58054045_58055522:C16orf57 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 58550484 G/A 1 6 6 12 2.83760739710335 3.16239260289665 -0.324785205793308 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000103037:ENST00000310682:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000219315:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000427443:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000443717:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000418480:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000422445:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000467320:exon_58550036_58550576:SETD6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 58552921 G/A 1 8 9 17 3.78347652947113 4.74358890434498 -0.960112374873853 A:G G A 10 0.527065433816109 0.80902600536977 ENSG00000103037:ENST00000310682:exon_58552628_58553566:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000394266:exon_58552628_58554431:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000219315:exon_58552628_58553014:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000427443:exon_58552628_58553419:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000443717:exon_58552628_58553001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000422445:exon_58552628_58553407:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000463954:exon_58552628_58552980:SETD6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 58579274 C/T 1 30 26 56 14.1880369855167 13.7037012792188 0.484335706297893 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58579265_58579395:CNOT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 58743454 A/C 1 35 33 68 16.5527098164362 17.3931593159316 -0.840449499495413 A:C A C 10 0.527065433816109 0.90350426845052 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000494627:exon_58742953_58743471:GOT2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 58750604 G/A 1 35 26 61 16.5527098164362 13.7037012792188 2.84900853721735 A:G G A 10 0.527065433816109 0.522197745293983 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58750567_58750717:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58750567_58750717:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58750567_58750717:GOT2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 58757668 A/C 1 22 16 38 10.4045604560456 8.43304694105774 1.97151351498786 A:C A C 10 0.527065433816109 0.626639326207 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000496461:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000492378:exon_58757650_58757806:GOT2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 58757683 A/G 1 19 16 35 8.98575675749393 8.43304694105774 0.552709816436183 A:G A G 10 0.527065433816109 0.867565017882364 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000496461:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000492378:exon_58757650_58757806:GOT2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 66976576 C/T 1 14 26 40 6.62108392657447 13.7037012792188 -7.08261735264436 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0268280784248345 ENSG00000172831:ENST00000417689:exon_66976551_66976640:CES2;ENSG00000172831:ENST00000317091:exon_66976551_66976688:CES2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 67116169 C/T 1 10 11 21 4.72934566183891 5.7977197719772 -1.06837411013829 T:C C T 10 0.527065433816109 0.667942291105539 ENSG00000067955:ENST00000290858:exon_67116116_67116242:CBFB;ENSG00000067955:ENST00000412916:exon_67116116_67116211:CBFB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 67201734 G/A 0 10 0 10 4.72934566183891 0 4.72934566183891 G G 10 0.527065433816109 0.00221418962581423 ENSG00000102878:ENST00000421453:exon_67201727_67201850:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000264009:exon_67201623_67201850:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000522870:exon_67201727_67201850:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000522295:exon_67201727_67201850:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000434833:exon_67201727_67201850:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000521314:exon_67201623_67201850:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000521624:exon_67201727_67201850:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000523562:exon_67201727_67201850:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000521374:exon_67201623_67201850:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000519224:exon_67201727_67201820:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000517750:exon_67201727_67201850:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000519601:exon_67201727_67201850:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000520833:exon_67201727_67201850:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000520528:exon_67201727_67201850:HSF4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 67210855 G/C 1 10 6 16 4.72934566183891 3.16239260289665 1.56695305894226 C:G G C 10 0.527065433816109 0.465150778014472 ENSG00000196123:ENST00000440525:exon_67209507_67210878:KIAA0895L;ENSG00000196123:ENST00000290881:exon_67209509_67210878:KIAA0895L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 67261121 C/G 1 25 19 44 11.8233641545973 10.0142432425061 1.8091209120912 C:G C G 10 0.527065433816109 0.651788664604569 ENSG00000168701:ENST00000304800:exon_67261016_67261127:TMEM208 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 67264083 C/A 1 62 51 113 29.3219431034012 26.8803371246216 2.44160597877968 A:C C A 10 0.527065433816109 0.706504423809807 ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67263969_67264131:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67263969_67264131:FHOD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 67265360 C/A 1 22 25 47 10.4045604560456 13.1766358454027 -2.77207538935713 A:C C A 10 0.527065433816109 0.466326829120314 ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67265333_67265452:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67265333_67265452:FHOD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 67266065 T/C 1 17 21 38 8.03988762512615 11.0683741101383 -3.02848648501214 T:C T C 10 0.527065433816109 0.334938956276879 ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67265942_67266097:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67265942_67266097:FHOD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 67686382 G/A 1 21 18 39 9.93162588986171 9.48717780868996 0.444448081171748 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000159753:ENST00000334583:exon_67686375_67686441:RLTPR;ENSG00000159753:ENST00000398282:exon_67686375_67686441:RLTPR HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 67709199 C/T 1 5 10 15 2.36467283091945 5.27065433816109 -2.90598150724164 T:C C T 10 0.527065433816109 0.194890792920314 ENSG00000141098:ENST00000268797:exon_67708436_67709956:GFOD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 67719595 G/A 1 9 5 14 4.25641109565502 2.63532716908055 1.62108392657447 A:G G A 10 0.527065433816109 0.433551468090942 ENSG00000141098:ENST00000268797:exon_67719360_67719705:GFOD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 67911517 T/C 1 19 15 34 8.98575675749393 7.90598150724164 1.07977525025229 T:C T C 10 0.527065433816109 0.73476249675926 ENSG00000038358:ENST00000358933:exon_67911412_67911559:EDC4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 67964203 T/C 1 11 9 20 5.2022802280228 4.74358890434498 0.45869132367782 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000141086:ENST00000319955:exon_67964088_67964221:CTRL;ENSG00000141086:ENST00000432773:exon_67963848_67964221:CTRL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 67969930 A/G 1 313 291 604 148.028519215558 153.376041240488 -5.34752202492984 A:G A G 10 0.527065433816109 0.683696919364973 ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969866_67970006:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969866_67970215:PSMB10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 67979423 G/T 1 11 10 21 5.2022802280228 5.27065433816109 -0.06837411013829 T:G G T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000124067:ENST00000338335:exon_67979272_67979456:SLC12A4;ENSG00000124067:ENST00000422611:exon_67979272_67979456:SLC12A4;ENSG00000124067:ENST00000316341:exon_67979272_67979456:SLC12A4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 68055495 G/C 1 60 53 113 28.3760739710335 27.9344679922538 0.441605978779677 C:G G C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000182810:ENST00000332395:exon_68055174_68057959:DDX28 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 68088485 A/G 1 5 8 13 2.36467283091945 4.21652347052887 -1.85185063960942 A:G A G 10 0.527065433816109 0.407023665875808 ENSG00000167264:ENST00000358896:exon_68088477_68088520:DUS2L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 68344696 C/T 1 4 5 9 1.89173826473556 2.63532716908055 -0.743588904344981 T:C C T 10 0.527065433816109 0.743612144716174 ENSG00000103061:ENST00000263997:exon_68344638_68344848:SLC7A6OS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 68387373 C/T 1 10 2 12 4.72934566183891 1.05413086763222 3.67521479420669 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0418936923317288 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 68389772 C/T 1 24 30 54 11.3504295884134 15.8119630144833 -4.46153342606989 T:C C T 10 0.527065433816109 0.275473216814721 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68389626_68389786:PRMT7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 69177268 C/T 1 52 31 83 24.5925974415623 16.3390284482994 8.25356899326295 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0784128468995878 ENSG00000141076:ENST00000314423:exon_69177081_69177292:CIRH1A;ENSG00000141076:ENST00000352319:exon_69177081_69177292:CIRH1A;ENSG00000141076:ENST00000453167:exon_69177081_69177292:CIRH1A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 69354963 A/G 1 67 58 125 31.6866159343207 30.5697951613343 1.11682077298637 A:G A G 10 0.527065433816109 0.858288982586286 ENSG00000132612:ENST00000254950:exon_69354954_69355173:VPS4A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 69355155 G/A 1 61 62 123 28.8490085372173 32.6780568965988 -3.82904835938141 A:G G A 10 0.527065433816109 0.52763794804239 ENSG00000132612:ENST00000254950:exon_69354954_69355173:VPS4A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 69356612 C/G 1 26 17 43 12.2962987207812 8.96011237487385 3.33618634590731 C:G C G 10 0.527065433816109 0.360409680483293 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 69373414 T/C 1 17 18 35 8.03988762512615 9.48717780868996 -1.44729018356382 T:C T C 10 0.527065433816109 0.735507990949289 ENSG00000213380:ENST00000306875:exon_69373079_69373513:COG8;ENSG00000213380:ENST00000401849:exon_69373079_69373460:COG8;ENSG00000132603:ENST00000254940:exon_69373343_69373788:NIP7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 69967897 T/C 1 5 9 14 2.36467283091945 4.74358890434498 -2.37891607342553 T:C T C 10 0.527065433816109 0.284872281969498 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69967873_69968032:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69967873_69968032:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69967873_69968032:WWP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 69970329 A/G 1 8 8 16 3.78347652947113 4.21652347052887 -0.433046941057745 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69970215_69970355:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69970215_69970355:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69970215_69970355:WWP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 70287177 A/G 1 198 162 360 93.6410441044104 85.3846002782097 8.25644382620075 A:T:G A G 10 0.527065433816109 0.398596867741363 ENSG00000090861:ENST00000261772:exon_70287171_70287284:AARS;ENSG00000090861:ENST00000418685:exon_70287171_70287284:AARS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 70303580 G/A 1 35 26 61 16.5527098164362 13.7037012792188 2.84900853721735 A:G G A 10 0.527065433816109 0.522197745293983 ENSG00000090861:ENST00000261772:exon_70303521_70303666:AARS;ENSG00000090861:ENST00000418685:exon_70303521_70303666:AARS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 70395369 C/T 1 10 15 25 4.72934566183891 7.90598150724164 -3.17663584540273 T:C C T 10 0.527065433816109 0.232365445872985 ENSG00000168872:ENST00000302243:exon_70395321_70395413:DDX19A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 70395387 C/T 1 12 13 25 5.67521479420669 6.85185063960942 -1.17663584540273 T:C C T 10 0.527065433816109 0.691622871057986 ENSG00000168872:ENST00000302243:exon_70395321_70395413:DDX19A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 70506907 T/C 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 T:C T C 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000157353:ENST00000288078:exon_70506886_70507256:FUK;ENSG00000157353:ENST00000378912:exon_70506886_70507256:FUK;ENSG00000157353:ENST00000464499:exon_70506886_70507256:FUK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 70515355 C/T 1 19 14 33 8.98575675749393 7.37891607342553 1.6068406840684 T:C C T 10 0.527065433816109 0.605453933677343 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000526700:exon_70515262_70515390:COG4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 72135014 T/C 1 4 7 11 1.89173826473556 3.68945803671276 -1.7977197719772 T:C T C 10 0.527065433816109 0.36886039388561 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72134985_72135092:DHX38 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 72822296 G/A 1 14 4 18 6.62108392657447 2.10826173526444 4.51282219131004 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0352268999907301 ENSG00000140836:ENST00000268489:exon_72816784_72822747:ZFHX3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 72822645 G/A 1 10 4 14 4.72934566183891 2.10826173526444 2.62108392657447 A:G G A 10 0.527065433816109 0.18849020884602 ENSG00000140836:ENST00000268489:exon_72816784_72822747:ZFHX3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 75269003 G/A 1 27 28 55 12.7692332869651 14.7578321468511 -1.988598859886 A:G G A 10 0.527065433816109 0.592673370363313 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75268787_75269884:BCAR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 75269325 C/T 1 15 15 30 7.09401849275836 7.90598150724164 -0.811963014483272 T:C C T 10 0.527065433816109 0.855562656731326 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75268787_75269884:BCAR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 75269534 C/T 1 16 15 31 7.56695305894226 7.90598150724164 -0.339028448299381 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75268787_75269884:BCAR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 75276775 G/A 1 12 17 29 5.67521479420669 8.96011237487385 -3.28489758066716 A:G G A 10 0.527065433816109 0.265505019787144 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75276368_75276988:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75276368_75276988:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75276368_75276988:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75276368_75276988:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75276368_75276988:BCAR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 75646576 G/T 1 11 9 20 5.2022802280228 4.74358890434498 0.45869132367782 T:G G T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000065457:ENST00000307921:exon_75646141_75646759:ADAT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 75646685 G/T 1 6 5 11 2.83760739710335 2.63532716908055 0.202280228022801 T:G G T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000065457:ENST00000307921:exon_75646141_75646759:ADAT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 77228866 T/C 1 8 10 18 3.78347652947113 5.27065433816109 -1.48717780868996 A:T:C T C 10 0.527065433816109 0.49133381096339 ENSG00000103111:ENST00000248248:exon_77228232_77229051:MON1B;ENSG00000103111:ENST00000439557:exon_77228232_77229051:MON1B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 77775672 A/G 1 8 4 12 3.78347652947113 2.10826173526444 1.67521479420669 A:G A G 10 0.527065433816109 0.396148353996528 ENSG00000140876:ENST00000268533:exon_77775479_77776151:NUDT7;ENSG00000140876:ENST00000437314:exon_77775479_77776151:NUDT7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 81888152 A/G 1 16 19 35 7.56695305894226 10.0142432425061 -2.44729018356382 A:G A G 10 0.527065433816109 0.498936848739828 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81888049_81888192:PLCG2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 81902879 C/G 1 12 9 21 5.67521479420669 4.74358890434498 0.931625889861711 C:G C G 10 0.527065433816109 0.827834701908173 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81902819_81902903:PLCG2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 84088026 T/C 1 28 24 52 13.2421678531489 12.6495704115866 0.592597441562331 T:C T C 10 0.527065433816109 0.890506383551295 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 84115483 G/A 1 7 1 8 3.31054196328724 0.527065433816109 2.78347652947113 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0735220313078182 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84115352_84115513:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84115352_84115513:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84115352_84115513:MBTPS1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 84212779 G/A 1 50 37 87 23.6467283091945 19.501421051196 4.14530725799851 A:G G A 10 0.527065433816109 0.392020478024582 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 84212928 G/A 1 44 39 83 20.8091209120912 20.5555519188283 0.253568993262949 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 84213965 G/A 1 12 8 20 5.67521479420669 4.21652347052887 1.45869132367782 A:G G A 10 0.527065433816109 0.65554767387655 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 84778685 A/G 1 10 72 82 4.72934566183891 37.9487112347598 -33.2193655729209 A:G A G 10 0.527065433816109 1.86263347924973e-14 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 84778690 C/T 1 71 6 77 33.5783541990563 3.16239260289665 30.4159615961596 T:C C T 10 0.527065433816109 9.62644206771466e-14 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 84778697 G/C 1 69 2 71 32.6324850666885 1.05413086763222 31.5783541990563 C:G G C 10 0.527065433816109 4.98099560441491e-17 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 84808824 C/G 1 37 56 93 17.498578948804 29.5156642937021 -12.0170853448981 C:G C G 10 0.527065433816109 0.0164480119872991 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84808766_84808831:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84808766_84808831:USP10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 86565882 G/C 1 6 10 16 2.83760739710335 5.27065433816109 -2.43304694105774 C:G G C 10 0.527065433816109 0.316907244333737 ENSG00000103248:ENST00000381214:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000360900:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000322911:exon_86563783_86566087:MTHFSD HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 87788864 G/A 1 14 7 21 6.62108392657447 3.68945803671276 2.93162588986171 A:G G A 10 0.527065433816109 0.274579453085168 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87788800_87788898:KLHDC4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 88066717 C/T 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000497491:exon_88066715_88066825:BANP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 88643673 C/G 1 19 14 33 8.98575675749393 7.37891607342553 1.6068406840684 C:G C G 10 0.527065433816109 0.605453933677343 ENSG00000158545:ENST00000301011:exon_88643518_88644134:ZC3H18;ENSG00000158545:ENST00000452588:exon_88643518_88644134:ZC3H18;ENSG00000158545:ENST00000289509:exon_88643518_88644134:ZC3H18 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 88713501 A/G 1 4 6 10 1.89173826473556 3.16239260289665 -1.27065433816109 A:G A G 10 0.527065433816109 0.532268681489131 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 88779739 A/G 1 25 25 50 11.8233641545973 13.1766358454027 -1.35327169080545 A:G A G 10 0.527065433816109 0.77744172481451 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779720_88779855:CTU2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 88780090 G/A 1 18 19 37 8.51282219131004 10.0142432425061 -1.50142105119603 A:G G A 10 0.527065433816109 0.626124356535162 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780055_88780186:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780055_88780186:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780055_88780186:CTU2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 88780923 C/G 1 6 3 9 2.83760739710335 1.58119630144833 1.25641109565502 C:G C G 10 0.527065433816109 0.513555929047552 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 88781125 T/C 1 36 33 69 17.0256443826201 17.3931593159316 -0.367514933311522 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780995_88781145:CTU2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 88871908 A/G 1 43 41 84 20.3361863459073 21.6096827864605 -1.27349644055316 A:G A G 10 0.527065433816109 0.827332072931509 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88871848_88872045:CDT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 88873790 C/T 1 42 32 74 19.8632517797234 16.8660938821155 2.99715789760793 T:C C T 10 0.527065433816109 0.560807934352792 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88873689_88873890:CDT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 89199651 G/A 1 30 30 60 14.1880369855167 15.8119630144833 -1.62392602896654 A:G G A 10 0.527065433816109 0.699619388999212 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89199544_89199670:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89199544_89199670:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89199544_89199670:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000378345:exon_89199544_89199670:ACSF3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 89294595 C/T 1 8 1 9 3.78347652947113 0.527065433816109 3.25641109565502 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0415432498690979 ENSG00000170100:ENST00000433976:exon_89293102_89295363:ZNF778;ENSG00000170100:ENST00000306502:exon_89293102_89295363:ZNF778 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 89628073 G/A 1 3586 3457 7043 1695.94335433543 1822.06520470229 -126.121850366856 A:T:G G A 10 0.527065433816109 0.00263576598108994 ENSG00000167526:ENST00000311528:exon_89627986_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000491523:exon_89627986_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000484610:exon_89627635_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000467736:exon_89627986_89628118:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000393099:exon_89627986_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000399461:exon_89627986_89628159:RPL13 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 89662990 T/C 1 47 25 72 22.2279246106429 13.1766358454027 9.05128876524015 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0338449795272308 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 89663072 G/A 1 52 21 73 24.5925974415623 11.0683741101383 13.524223331424 A:G G A 10 0.527065433816109 0.00145407568590402 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 89712369 G/C 1 37 43 80 17.498578948804 22.6638136540927 -5.16523470528872 C:G G C 10 0.527065433816109 0.263940706569796 ENSG00000131165:ENST00000253475:exon_89710846_89712495:CHMP1A;ENSG00000131165:ENST00000397901:exon_89710846_89712495:CHMP1A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 89764549 G/A 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 A:G G A 10 0.527065433816109 0.488810537661758 ENSG00000158792:ENST00000289805:exon_89762751_89764713:SPATA2L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 89789898 T/C 1 13 14 27 6.14814936039058 7.37891607342553 -1.23076671303494 T:C T C 10 0.527065433816109 0.701898180501923 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89789668_89790117:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89789668_89790117:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89789668_89790117:ZNF276 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 89836323 C/T 1 9 11 20 4.25641109565502 5.7977197719772 -1.54130867632218 T:C C T 10 0.527065433816109 0.510653805220797 ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89836245_89836432:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89836245_89836432:FANCA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 89838086 C/A 1 7 6 13 3.31054196328724 3.16239260289665 0.148149360390583 A:C C A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89838086_89838222:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89838086_89838222:FANCA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 16 90102835 A/G 1 4 6 10 1.89173826473556 3.16239260289665 -1.27065433816109 A:G A G 10 0.527065433816109 0.532268681489131 ENSG00000141013:ENST00000268699:exon_90102789_90102994:GAS8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 465775 G/A 1 8 6 14 3.78347652947113 3.16239260289665 0.621083926574474 A:G G A 10 0.527065433816109 0.794786264772641 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_465743_465985:VPS53 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 617869 G/A 1 6 7 13 2.83760739710335 3.68945803671276 -0.851850639609417 A:G G A 10 0.527065433816109 0.783042148004503 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_617863_618096:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_617863_618096:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_617863_618096:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_617863_618096:VPS53 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 649067 A/G 1 43 37 80 20.3361863459073 19.501421051196 0.834765294711278 A:G A G 10 0.527065433816109 0.911022605258642 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 649232 C/T 1 49 77 126 23.1737937430107 40.5840384038404 -17.4102446608297 T:C C T 10 0.527065433816109 0.00229385567877065 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 650518 G/A 1 21 31 52 9.93162588986171 16.3390284482994 -6.40740255843767 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0947534622494034 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4;ENSG00000179409:ENST00000437269:exon_649871_650522:GEMIN4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 685640 G/T 1 32 31 63 15.1339061178845 16.3390284482994 -1.20512233041487 T:G G T 10 0.527065433816109 0.801458749519592 ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_685482_685691:GLOD4;ENSG00000171861:ENST00000304478:exon_685513_685932:RNMTL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 961900 G/A 1 11 4 15 5.2022802280228 2.10826173526444 3.09401849275836 A:G G A 10 0.527065433816109 0.126517172009480 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 1377943 A/G 1 24 34 58 11.3504295884134 17.9202247497477 -6.56979516133432 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0885077872928735 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1377904_1377984:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1377904_1377984:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1377904_1377984:MYO1C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 1494567 G/A 1 27 22 49 12.7692332869651 11.5954395439544 1.17379374301066 A:G G A 10 0.527065433816109 0.776222455481774 ENSG00000167703:ENST00000301335:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000382147:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000412517:exon_1494563_1494765:SLC43A2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 1494765 C/T 1 14 17 31 6.62108392657447 8.96011237487385 -2.33902844829938 T:C C T 10 0.527065433816109 0.473001163337348 ENSG00000167703:ENST00000301335:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000382147:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000412517:exon_1494563_1494765:SLC43A2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 1637074 A/G 1 10 20 30 4.72934566183891 10.5413086763222 -5.81196301448327 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0430163986130637 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 1637458 G/A 1 9 9 18 4.25641109565502 4.74358890434498 -0.487177808689962 A:G G A 10 0.527065433816109 0.81881957561072 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 1639350 C/T 1 17 8 25 8.03988762512615 4.21652347052887 3.82336415459727 T:C C T 10 0.527065433816109 0.160743808741323 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1638866_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1639333_1639512:WDR81 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 1640709 C/T 1 25 36 61 11.8233641545973 18.9743556173799 -7.15099146278265 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0729171362968903 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1640659_1641879:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1640659_1641782:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1640659_1641888:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1640659_1641878:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1640659_1641886:WDR81 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 1640793 C/T 1 17 21 38 8.03988762512615 11.0683741101383 -3.02848648501214 T:C C T 10 0.527065433816109 0.334938956276879 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1640659_1641879:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1640659_1641782:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1640659_1641888:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1640659_1641878:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1640659_1641886:WDR81 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 1703543 G/C 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 C:G G C 10 0.527065433816109 0.757490641773051 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1703151_1704318:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000491788:exon_1703151_1704099:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000495309:exon_1703510_1704011:SMYD4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 2203175 C/G 1 7 8 15 3.31054196328724 4.21652347052887 -0.905981507241636 C:G C G 10 0.527065433816109 0.797198000532565 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 2203453 A/G 1 4 6 10 1.89173826473556 3.16239260289665 -1.27065433816109 A:G A G 10 0.527065433816109 0.532268681489131 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 2595964 G/A 1 39 51 90 18.4444480811717 26.8803371246216 -8.43588904344982 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0906813274749767 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2595865_2595990:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2595865_2595990:KIAA0664 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 2606715 G/A 1 8 6 14 3.78347652947113 3.16239260289665 0.621083926574474 A:G G A 10 0.527065433816109 0.794786264772641 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2606612_2606783:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2606612_2606783:KIAA0664 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 4457571 C/T 1 19 13 32 8.98575675749393 6.85185063960942 2.13390611788451 T:C C T 10 0.527065433816109 0.483562767697165 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4457490_4457573:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4457490_4457573:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000426435:exon_4457490_4457573:MYBBP1A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 4458598 G/C 1 15 21 36 7.09401849275836 11.0683741101383 -3.97435561737993 C:G G C 10 0.527065433816109 0.242276196341047 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4458422_4458681:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4458422_4458679:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000426435:exon_4458422_4458681:MYBBP1A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 4594228 C/T 1 12 7 19 5.67521479420669 3.68945803671276 1.98575675749393 T:C C T 10 0.527065433816109 0.491846751029638 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4594183_4594288:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4594183_4594288:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4594183_4594288:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4594183_4594288:PELP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 4622638 C/T 1 21 17 38 9.93162588986171 8.96011237487385 0.971513514987857 T:C C T 10 0.527065433816109 0.871244863274115 ENSG00000141480:ENST00000381488:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000346341:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000269260:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000412477:exon_4622578_4622715:ARRB2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 4701019 C/T 1 129 171 300 61.0085590377219 90.1281891825546 -29.1196301448327 T:C C T 10 0.527065433816109 0.000783552431798643 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4700977_4701106:PSMB6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 4712617 C/T 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 T:C C T 10 0.527065433816109 0.160556933333404 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4712593_4712658:PLD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 4849284 G/A 1 2436 2655 5091 1152.06860322396 1399.35872678177 -247.290123557811 A:T:C:G G A 10 0.527065433816109 4.36195078184608e-12 ENSG00000108518:ENST00000225655:exon_4848947_4849292:PFN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 4873216 G/A 1 12 7 19 5.67521479420669 3.68945803671276 1.98575675749393 A:G G A 10 0.527065433816109 0.491846751029638 ENSG00000108509:ENST00000348066:exon_4873197_4873380:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000381311:exon_4873197_4873380:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000361571:exon_4873197_4873380:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000358183:exon_4873197_4873380:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000414043:exon_4873197_4873380:CAMTA2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 4875566 T/C 1 16 13 29 7.56695305894226 6.85185063960942 0.715102419332838 T:C T C 10 0.527065433816109 0.853844997602006 ENSG00000108509:ENST00000348066:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000381311:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000361571:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000358183:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000414043:exon_4875527_4875831:CAMTA2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 4883045 C/T 1 3 8 11 1.41880369855167 4.21652347052887 -2.7977197719772 T:C C T 10 0.527065433816109 0.130149709511191 ENSG00000108509:ENST00000348066:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000381311:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000361571:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000358183:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000414043:exon_4882979_4883916:CAMTA2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 4926882 A/G 1 57 44 101 26.9572702724818 23.1908790879088 3.76639118457299 A:G A G 10 0.527065433816109 0.486212098989559 ENSG00000129250:ENST00000320785:exon_4926763_4931696:KIF1C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 5085354 T/C 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 T:C T C 10 0.527065433816109 0.160556933333404 ENSG00000180626:ENST00000399604:exon_5082830_5087571:ZNF594;ENSG00000180626:ENST00000381752:exon_5083373_5086253:ZNF594;ENSG00000180626:ENST00000315777:exon_5085340_5085418:ZNF594;ENSG00000180626:ENST00000389222:exon_5085338_5085418:ZNF594 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 5126674 A/G 1 12 12 24 5.67521479420669 6.32478520579331 -0.649570411586616 A:G A G 10 0.527065433816109 0.83992621234606 ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 5418107 G/A 1 24 47 71 11.3504295884134 24.7720753893571 -13.4216458009437 A:G G A 10 0.527065433816109 0.00180206955392294 ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5417439_5418393:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5417439_5418393:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5417439_5418393:NLRP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 5418799 G/A 1 24 31 55 11.3504295884134 16.3390284482994 -4.988598859886 A:G G A 10 0.527065433816109 0.223903712877637 ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5418793_5418837:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5418793_5418837:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5418793_5418837:NLRP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 5424886 G/A 1 16 27 43 7.56695305894226 14.2307667130349 -6.66381365409269 A:G G A 10 0.527065433816109 0.047057137139925 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 5425077 T/C 1 16 23 39 7.56695305894226 12.1225049777705 -4.55555191882825 T:C T C 10 0.527065433816109 0.151991739048869 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 6661584 T/C 1 4 5 9 1.89173826473556 2.63532716908055 -0.743588904344981 T:C T C 10 0.527065433816109 0.743612144716174 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 6942108 C/T 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 T:C C T 10 0.527065433816109 0.757490641773051 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6941471_6942208:SLC16A13 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 7127718 T/C 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 T:C T C 10 0.527065433816109 0.488810537661758 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 7129840 T/C 1 13 3 16 6.14814936039058 1.58119630144833 4.56695305894226 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0242272766688289 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7129740_7129958:DVL2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 7132556 C/T 1 9 26 35 4.25641109565502 13.7037012792188 -9.44729018356382 T:C C T 10 0.527065433816109 0.00186277359400216 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7132454_7132593:DVL2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 7133162 G/A 1 13 10 23 6.14814936039058 5.27065433816109 0.877495022229492 A:G G A 10 0.527065433816109 0.835491706691073 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7133127_7133262:DVL2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 7133609 G/A 1 10 14 24 4.72934566183891 7.37891607342553 -2.64957041158662 A:G G A 10 0.527065433816109 0.311132051737374 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7133604_7133749:DVL2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 7154534 G/A 1 168 107 275 79.4530071188937 56.3960014183237 23.05700570057 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0054286386608752 ENSG00000175826:ENST00000380825:exon_7154514_7154995:CTDNEP1;ENSG00000175826:ENST00000318988:exon_7154514_7154920:CTDNEP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 7155861 G/A 1 38 20 58 17.9715135149879 10.5413086763222 7.43020483866567 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0647237213344463 ENSG00000170291:ENST00000354429:exon_7155745_7155915:C17orf81;ENSG00000170291:ENST00000396627:exon_7155745_7155915:C17orf81;ENSG00000170291:ENST00000396628:exon_7155551_7155915:C17orf81;ENSG00000170291:ENST00000356683:exon_7155745_7155915:C17orf81 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 7224921 C/G 1 9 10 19 4.25641109565502 5.27065433816109 -1.01424324250607 C:G C G 10 0.527065433816109 0.654162232160302 ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7224879_7225106:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7224879_7225106:NEURL4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 7252328 G/A 1 145 116 261 68.5755120966642 61.1395903226686 7.43592177399554 A:C:G G A 10 0.527065433816109 0.385538351962989 ENSG00000072818:ENST00000158762:exon_7252314_7252486:ACAP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 7366651 C/G 1 6 6 12 2.83760739710335 3.16239260289665 -0.324785205793308 C:G C G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000174282:ENST00000311403:exon_7362685_7367209:ZBTB4;ENSG00000174282:ENST00000380599:exon_7362688_7367209:ZBTB4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 7400815 T/C 1 19 12 31 8.98575675749393 6.32478520579331 2.66097155170062 A:T:C T C 10 0.527065433816109 0.372709146379426 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7400675_7400836:POLR2A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 7417160 G/A 1 175 179 354 82.7635490821809 94.3447126530835 -11.5811635709026 A:G G A 10 0.527065433816109 0.221239155894385 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7416340_7417933:POLR2A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 7460517 G/C 1 40 32 72 18.9173826473556 16.8660938821155 2.05128876524015 C:G G C 10 0.527065433816109 0.639248762605829 ENSG00000239697:ENST00000293825:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000322272:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462619:exon_7460416_7460549:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462811:exon_7460416_7460891:TNFSF12 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 7477938 G/C 1 209 170 379 98.8433243324332 89.6011237487385 9.24220058369468 A:C:G G C 10 0.527065433816109 0.354678683154695 ENSG00000161960:ENST00000293831:exon_7477864_7477996:EIF4A1;ENSG00000161960:ENST00000380512:exon_7477864_7477996:EIF4A1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 7484101 C/A 1 7 7 14 3.31054196328724 3.68945803671276 -0.378916073425526 A:C C A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000129226:ENST00000250092:exon_7484029_7484101:CD68;ENSG00000129226:ENST00000380498:exon_7484029_7484101:CD68 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 7484812 G/A 1 10 10 20 4.72934566183891 5.27065433816109 -0.541308676322181 A:G G A 10 0.527065433816109 0.826649432830958 ENSG00000129226:ENST00000250092:exon_7484696_7485431:CD68;ENSG00000129226:ENST00000380498:exon_7484696_7485428:CD68 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 7490379 G/C 1 2 7 9 0.945869132367782 3.68945803671276 -2.74358890434498 C:G G C 10 0.527065433816109 0.094465581682091 ENSG00000129255:ENST00000449455:exon_7490217_7490589:MPDU1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 7490810 G/A 1 133 113 246 62.9002973024575 59.5583940212203 3.34190328123717 A:G G A 10 0.527065433816109 0.701799525246188 ENSG00000129255:ENST00000250124:exon_7490744_7491523:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000449455:exon_7490744_7491504:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000359822:exon_7490744_7491027:MPDU1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 7529902 G/A 1 69 93 162 32.6324850666885 49.0170853448981 -16.3846002782097 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0115956881009862 ENSG00000141504:ENST00000380466:exon_7529552_7529932:SAT2;ENSG00000141504:ENST00000269298:exon_7529556_7529932:SAT2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 7750232 T/C 1 4 5 9 1.89173826473556 2.63532716908055 -0.743588904344981 T:C T C 10 0.527065433816109 0.743612144716174 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750137_7750334:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750137_7750334:KDM6B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 7760397 G/A 1 185 169 354 87.4928947440198 89.0740583149224 -1.5811635709026 A:G G A 10 0.527065433816109 0.873269194861685 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760333_7760516:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 7760704 A/G 1 49 55 104 23.1737937430107 28.988598859886 -5.81480511687534 A:T:G A G 10 0.527065433816109 0.280240923690075 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760701_7760809:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 8053085 T/G 1 7 4 11 3.31054196328724 2.10826173526444 1.2022802280228 T:G T G 10 0.527065433816109 0.555399509917260 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8053073_8053194:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8053073_8053194:PER1;ENSG00000179094:ENST00000413754:exon_8053073_8053194:PER1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 8064779 C/G 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 C:G C G 10 0.527065433816109 0.757490641773051 ENSG00000220205:ENST00000404970:exon_8063724_8064842:VAMP2;ENSG00000220205:ENST00000481878:exon_8064637_8064842:VAMP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 8076741 A/G 1 5 10 15 2.36467283091945 5.27065433816109 -2.90598150724164 A:G A G 10 0.527065433816109 0.194890792920314 ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 8076778 C/T 1 6 3 9 2.83760739710335 1.58119630144833 1.25641109565502 T:C C T 10 0.527065433816109 0.513555929047552 ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 8108339 G/A 1 121 78 199 57.2250825082508 41.1111038376565 16.1139786705943 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0230465167639702 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 8172506 T/G 1 27 27 54 12.7692332869651 14.2307667130349 -1.46153342606989 T:G T G 10 0.527065433816109 0.785492693376586 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8172272_8173809:PFAS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 8701423 A/G 1 4 7 11 1.89173826473556 3.68945803671276 -1.7977197719772 A:G A G 10 0.527065433816109 0.36886039388561 ENSG00000185156:ENST00000329805:exon_8700481_8702586:MFSD6L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 8736394 T/C 1 5 6 11 2.36467283091945 3.16239260289665 -0.797719771977199 T:C T C 10 0.527065433816109 0.765666449819686 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 9471711 T/G 1 12 11 23 5.67521479420669 5.7977197719772 -0.122504977770507 T:G T G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000170310:ENST00000306357:exon_9471688_9471787:STX8;ENSG00000170310:ENST00000415554:exon_9471688_9471787:STX8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 10614442 A/G 1 39 35 74 18.4444480811717 18.4472901835638 -0.00284210239206928 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000170222:ENST00000379774:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000468843:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000401658:exon_10614151_10614548:C17orf48 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 12898295 T/C 1 27 26 53 12.7692332869651 13.7037012792188 -0.934467992253779 T:C T C 10 0.527065433816109 0.890762645569914 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000424152:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000480891:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000487229:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000465825:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000491478:exon_12898081_12898379:ELAC2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 12899963 T/C 1 18 21 39 8.51282219131004 11.0683741101383 -2.55555191882825 T:C T C 10 0.527065433816109 0.427246720594883 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000424152:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000480891:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000487229:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000465825:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000491478:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000492559:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000457438:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000407336:exon_12899735_12900002:ELAC2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 12915009 G/A 1 9 11 20 4.25641109565502 5.7977197719772 -1.54130867632218 A:G G A 10 0.527065433816109 0.510653805220797 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000407336:exon_12914980_12915099:ELAC2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 15942832 C/T 1 23 24 47 10.8774950222295 12.6495704115866 -1.77207538935712 T:C:G C T 10 0.527065433816109 0.662226393311836 ENSG00000141027:ENST00000268712:exon_15942747_15942968:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395851:exon_15942747_15942968:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395849:exon_15942747_15942968:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000470782:exon_15942747_15942968:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000464381:exon_15942747_15942968:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395857:exon_15942747_15942968:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000455704:exon_15942747_15942968:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000458113:exon_15942747_15942968:NCOR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 16325968 A/G 1 45 28 73 21.2820554782751 14.7578321468511 6.52422333142404 A:G A G 10 0.527065433816109 0.129427944110057 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 16342718 G/A 1 558 428 986 263.897487930611 225.584005673295 38.3134822573165 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0153183005319700 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 16344600 T/C 1 28 20 48 13.2421678531489 10.5413086763222 2.70085917682677 T:C:G T C 10 0.527065433816109 0.472118631264818 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 17062241 C/G 1 15 9 24 7.09401849275836 4.74358890434498 2.35042958841338 C:G C G 10 0.527065433816109 0.415272769718452 ENSG00000133030:ENST00000444976:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395811:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395804:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000429184:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000341712:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000442194:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000423885:exon_17061811_17062316:MPRIP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 18775900 A/G 1 32 24 56 15.1339061178845 12.6495704115866 2.48433570629789 A:G A G 10 0.527065433816109 0.592859468162575 ENSG00000141127:ENST00000441887:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000395656:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000414602:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000492129:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000487101:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000432893:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000455992:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000412418:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000478622:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000419284:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000268835:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000422237:exon_18775896_18775962:PRPSAP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 19284522 G/A 1 9 5 14 4.25641109565502 2.63532716908055 1.62108392657447 A:G G A 10 0.527065433816109 0.433551468090942 ENSG00000166484:ENST00000308406:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000299612:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000490660:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000395604:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000412231:exon_19283921_19285124:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000395602:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000482850:exon_19283921_19284526:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000457323:exon_19281842_19285779:MAPK7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 19861458 C/T 1 9 12 21 4.25641109565502 6.32478520579331 -2.06837411013829 T:C C T 10 0.527065433816109 0.390094196298263 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19861327_19861884:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19861327_19861884:AKAP10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 20107773 T/C 1 9 4 13 4.25641109565502 2.10826173526444 2.14814936039058 T:C T C 10 0.527065433816109 0.276012087147778 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 20108239 A/T 1 5 8 13 2.36467283091945 4.21652347052887 -1.85185063960942 A:T A T 10 0.527065433816109 0.407023665875808 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 20109189 C/T 1 8 13 21 3.78347652947113 6.85185063960942 -3.06837411013829 T:C C T 10 0.527065433816109 0.196016840944122 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 20163529 A/G 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 A:G A G 10 0.527065433816109 0.488810537661758 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20163505_20163607:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20163505_20163607:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20163505_20163607:SPECC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 27 0 27 12.7692332869651 0 12.7692332869651 T T 10 0.527065433816109 3.25854994353295e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 21203907 T/C 0 26 0 26 12.2962987207812 0 12.2962987207812 T T 10 0.527065433816109 6.21844783605952e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 37 0 37 17.498578948804 0 17.498578948804 G G 10 0.527065433816109 9.03689818706367e-11 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 21203941 G/A 0 38 0 38 17.9715135149879 0 17.9715135149879 G G 10 0.527065433816109 4.59975349727465e-11 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 39 0 39 18.4444480811717 0 18.4444480811717 C C 10 0.527065433816109 2.34450063224823e-11 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 21203964 C/G 0 38 0 38 17.9715135149879 0 17.9715135149879 C C 10 0.527065433816109 4.59975349727465e-11 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 33 0 33 15.6068406840684 0 15.6068406840684 C C 10 0.527065433816109 6.81578510796941e-10 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 32 0 32 15.1339061178845 0 15.1339061178845 C C 10 0.527065433816109 1.29718645308374e-09 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 20 0 20 9.45869132367782 0 9.45869132367782 C C 10 0.527065433816109 3.05044406302006e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 32 0 32 15.1339061178845 0 15.1339061178845 C C 10 0.527065433816109 1.29718645308374e-09 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 33 0 33 15.6068406840684 0 15.6068406840684 G G 10 0.527065433816109 6.81578510796941e-10 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 78 0 78 36.8888961623435 0 36.8888961623435 G G 10 0.527065433816109 3.66583139574338e-22 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 25932609 C/T 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000141068:ENST00000268763:exon_25932460_25932839:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000319524:exon_25932460_25932839:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398982:exon_25932460_25932839:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398988:exon_25932460_25932839:KSR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 26874314 G/A 1 134 129 263 63.3732318686414 67.9914409622781 -4.61820909363667 A:G G A 10 0.527065433816109 0.578813960684257 ENSG00000109103:ENST00000335765:exon_26873725_26874427:UNC119;ENSG00000109103:ENST00000484980:exon_26873726_26874427:UNC119;ENSG00000109103:ENST00000301032:exon_26873726_26874867:UNC119;ENSG00000109103:ENST00000470125:exon_26873729_26874867:UNC119 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 27424316 G/A 1 3 6 9 1.41880369855167 3.16239260289665 -1.74358890434498 A:G G A 10 0.527065433816109 0.323067031523113 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000533652:exon_27423915_27424371:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527686:exon_27424164_27424368:MYO18A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 27613677 G/A 1 5 11 16 2.36467283091945 5.7977197719772 -3.43304694105774 A:G G A 10 0.527065433816109 0.130692436904043 ENSG00000108256:ENST00000225388:exon_27613010_27614734:NUFIP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 27904711 G/A 1 16 8 24 7.56695305894226 4.21652347052887 3.35042958841338 A:G G A 10 0.527065433816109 0.220267510738085 ENSG00000108262:ENST00000225394:exon_27904663_27904760:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000394868:exon_27904663_27904760:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000473217:exon_27904663_27904760:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000394869:exon_27904663_27904760:GIT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 28576076 T/C 1 34 41 75 16.0797752502523 21.6096827864605 -5.52990753620818 T:C T C 10 0.527065433816109 0.205577745721602 ENSG00000108578:ENST00000261714:exon_28575223_28576186:BLMH;ENSG00000108578:ENST00000394819:exon_28575223_28576186:BLMH HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 28612448 G/C 1 11 13 24 5.2022802280228 6.85185063960942 -1.64957041158662 C:G G C 10 0.527065433816109 0.544155066076199 ENSG00000108578:ENST00000261714:exon_28612406_28612498:BLMH;ENSG00000108578:ENST00000394819:exon_28612406_28612498:BLMH HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 29111125 T/G 1 40 19 59 18.9173826473556 10.0142432425061 8.90313940484956 T:G T G 10 0.527065433816109 0.0258388052501668 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29109726_29111461:CRLF3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 29113016 A/G 1 15 8 23 7.09401849275836 4.21652347052887 2.87749502222949 A:G A G 10 0.527065433816109 0.297180505397360 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29112937_29113049:CRLF3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 29226630 T/A 1 7 7 14 3.31054196328724 3.68945803671276 -0.378916073425526 A:T T A 10 0.527065433816109 1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 29298413 T/C 1 6 3 9 2.83760739710335 1.58119630144833 1.25641109565502 T:C T C 10 0.527065433816109 0.513555929047552 ENSG00000181481:ENST00000328381:exon_29298041_29298463:RNF135;ENSG00000181481:ENST00000324689:exon_29298041_29298463:RNF135;ENSG00000181481:ENST00000443677:exon_29298290_29298463:RNF135 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 29646032 G/A 1 30 17 47 14.1880369855167 8.96011237487385 5.22792461064287 A:G G A 10 0.527065433816109 0.144612971266651 ENSG00000126860:ENST00000462804:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000247270:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000461237:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394756:exon_29644676_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394755:exon_29644676_29646041:EVI2A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 29857346 G/C 1 6 7 13 2.83760739710335 3.68945803671276 -0.851850639609417 C:G G C 10 0.527065433816109 0.783042148004503 ENSG00000131242:ENST00000394744:exon_29857344_29857487:RAB11FIP4;ENSG00000131242:ENST00000325874:exon_29857344_29857487:RAB11FIP4;ENSG00000131242:ENST00000394742:exon_29857344_29857487:RAB11FIP4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 30533970 A/G 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 A:C:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000126858:ENST00000333942:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000394692:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000358365:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000354266:exon_30533929_30534048:RHOT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 33459419 G/A 1 25 48 73 11.8233641545973 25.2991408231732 -13.475776668576 A:G G A 10 0.527065433816109 0.00208915562925046 ENSG00000073536:ENST00000442241:exon_33458366_33459468:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000360831:exon_33458370_33459468:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000262335:exon_33459090_33459468:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000436188:exon_33459263_33459468:NLE1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 33460367 G/A 1 12 30 42 5.67521479420669 15.8119630144833 -10.1367482202766 A:G G A 10 0.527065433816109 0.00181656388565840 ENSG00000073536:ENST00000442241:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000360831:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000262335:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000436188:exon_33460358_33460517:NLE1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 33460431 C/T 1 14 20 34 6.62108392657447 10.5413086763222 -3.92022474974771 T:C C T 10 0.527065433816109 0.228892942719341 ENSG00000073536:ENST00000442241:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000360831:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000262335:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000436188:exon_33460358_33460517:NLE1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 33460516 A/G 1 12 46 58 5.67521479420669 24.245009955541 -18.5697951613343 A:G A G 10 0.527065433816109 9.4729818136688e-07 ENSG00000073536:ENST00000442241:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000360831:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000262335:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000436188:exon_33460358_33460517:NLE1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 33464864 C/T 1 2 10 12 0.945869132367782 5.27065433816109 -4.32478520579331 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0174711201999007 ENSG00000073536:ENST00000442241:exon_33464833_33464909:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000360831:exon_33464833_33464909:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000262335:exon_33464829_33464909:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000479807:exon_33464833_33464909:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000473567:exon_33464833_33464909:NLE1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 33679943 C/T 1 7 5 12 3.31054196328724 2.63532716908055 0.675214794206692 T:C C T 10 0.527065433816109 0.778351128206284 ENSG00000172716:ENST00000308377:exon_33677324_33680158:SLFN11;ENSG00000172716:ENST00000394566:exon_33677324_33680158:SLFN11;ENSG00000172716:ENST00000321335:exon_33677324_33680158:SLFN11;ENSG00000172716:ENST00000442678:exon_33677331_33680158:SLFN11 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 33749919 A/C 1 7 10 17 3.31054196328724 5.27065433816109 -1.96011237487385 A:C A C 10 0.527065433816109 0.467399584608424 ENSG00000172123:ENST00000394562:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000452764:exon_33749009_33750089:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000304905:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000447040:exon_33749664_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000445092:exon_33749840_33750087:SLFN12 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 33768383 T/A 1 13 7 20 6.14814936039058 3.68945803671276 2.45869132367782 A:T T A 10 0.527065433816109 0.371081802214505 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000360502:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33764562_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33766003_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000534689:exon_33766499_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33766517_33768385:SLFN13 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 33772550 C/T 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 T:C C T 10 0.527065433816109 0.757490641773051 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33771634_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33771634_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33772392_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33771634_33773029:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000524511:exon_33772381_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000531588:exon_33772467_33772712:SLFN13 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 33998802 G/C 1 9 2 11 4.25641109565502 1.05413086763222 3.2022802280228 C:G G C 10 0.527065433816109 0.0696872224921074 ENSG00000006125:ENST00000262325:exon_33998773_33998919:AP2B1;ENSG00000006125:ENST00000312678:exon_33998773_33998919:AP2B1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 35346641 T/C 1 30 16 46 14.1880369855167 8.43304694105774 5.75499004445898 T:C T C 10 0.527065433816109 0.10422483112699 ENSG00000108270:ENST00000225402:exon_35346546_35346710:AATF HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 35771468 C/T 1 2 8 10 0.945869132367782 4.21652347052887 -3.27065433816109 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0545836587495111 ENSG00000108264:ENST00000394395:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000490992:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000225396:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000417170:exon_35771356_35771477:TADA2A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 35937637 T/C 1 3 6 9 1.41880369855167 3.16239260289665 -1.74358890434498 T:C T C 10 0.527065433816109 0.323067031523113 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35937478_35937711:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35937478_35937711:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35937478_35937711:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000378189:exon_35937478_35937711:SYNRG HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 36909061 A/G 1 192 177 369 90.8034367073071 93.2905817854513 -2.48714507814422 A:G A G 10 0.527065433816109 0.794645448542326 ENSG00000108294:ENST00000225426:exon_36909003_36909082:PSMB3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 36926731 T/G 1 6 3 9 2.83760739710335 1.58119630144833 1.25641109565502 T:G T G 10 0.527065433816109 0.513555929047552 ENSG00000141720:ENST00000269554:exon_36926689_36926792:PIP4K2B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 36926767 G/A 1 9 3 12 4.25641109565502 1.58119630144833 2.67521479420669 A:G G A 10 0.527065433816109 0.153067812973243 ENSG00000141720:ENST00000269554:exon_36926689_36926792:PIP4K2B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 36963226 G/T 1 20 19 39 9.45869132367782 10.0142432425061 -0.555551918828254 T:G G T 10 0.527065433816109 0.87396986201025 ENSG00000108296:ENST00000225428:exon_36963018_36963229:CWC25 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 37070658 A/G 1 25 23 48 11.8233641545973 12.1225049777705 -0.299140823173234 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000429030:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000419929:exon_37070578_37070728:LASP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 38137364 G/A 1 122 124 246 57.6980170744347 65.3561137931975 -7.65809671876283 A:G G A 10 0.527065433816109 0.338601888421512 ENSG00000108344:ENST00000264639:exon_38137050_38137443:PSMD3;ENSG00000108344:ENST00000415039:exon_38137312_38137443:PSMD3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 38179492 A/G 1 15 22 37 7.09401849275836 11.5954395439544 -4.50142105119603 A:G A G 10 0.527065433816109 0.142521190648815 ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000492176:exon_38179384_38179760:MED24 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 38991003 T/C 1 21 33 54 9.93162588986171 17.3931593159316 -7.46153342606989 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0553926613362779 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 38991052 T/G 1 35 6 41 16.5527098164362 3.16239260289665 13.3903172135395 T:G T G 10 0.527065433816109 1.39773037460674e-05 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 38991053 T/A 1 35 5 40 16.5527098164362 2.63532716908055 13.9173826473556 A:T T A 10 0.527065433816109 4.21815033363347e-06 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 40255812 C/T 1 23 21 44 10.8774950222295 11.0683741101383 -0.190879087908797 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000108771:ENST00000251642:exon_40255626_40255816:DHX58 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 40257163 T/C 1 17 17 34 8.03988762512615 8.96011237487385 -0.920224749747707 T:C T C 10 0.527065433816109 0.86398633692205 ENSG00000108771:ENST00000251642:exon_40257036_40257185:DHX58;ENSG00000108771:ENST00000423748:exon_40257036_40257185:DHX58 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 40280291 G/A 1 35 37 72 16.5527098164362 19.501421051196 -2.94871123475985 A:G G A 10 0.527065433816109 0.555419759764363 ENSG00000108774:ENST00000346213:exon_40280279_40280401:RAB5C;ENSG00000108774:ENST00000393860:exon_40280279_40280401:RAB5C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 40342166 G/A 1 7 7 14 3.31054196328724 3.68945803671276 -0.378916073425526 A:G G A 10 0.527065433816109 1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 40344455 C/T 1 31 31 62 14.6609715517006 16.3390284482994 -1.67805689659876 T:C C T 10 0.527065433816109 0.703909850936478 ENSG00000167925:ENST00000454210:exon_40344259_40344727:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000393854:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000428494:exon_40344259_40344727:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000301671:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000414034:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000377472:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000436923:exon_40344259_40344760:GHDC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 40462531 C/T 1 36 29 65 17.0256443826201 15.2848975806672 1.74074680195291 T:C C T 10 0.527065433816109 0.710407346696226 ENSG00000126561:ENST00000345506:exon_40462525_40463961:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000452307:exon_40462525_40463956:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000468096:exon_40462525_40462541:STAT5A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 40818451 G/A 1 25 16 41 11.8233641545973 8.43304694105774 3.39031721353953 A:G G A 10 0.527065433816109 0.348557547568282 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818341_40818502:TUBG2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 41338439 C/A 0 14 0 14 6.62108392657447 0 6.62108392657447 C C 10 0.527065433816109 0.000155677962065792 ENSG00000188554:ENST00000389312:exon_41338267_41338461:NBR1;ENSG00000188554:ENST00000422280:exon_41338267_41338461:NBR1;ENSG00000188554:ENST00000341165:exon_41338267_41338461:NBR1;ENSG00000188554:ENST00000389311:exon_41338267_41338461:NBR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 42268274 C/T 1 31 37 68 14.6609715517006 19.501421051196 -4.84044949949541 T:C C T 10 0.527065433816109 0.274564874462762 ENSG00000168591:ENST00000357984:exon_42267869_42269098:TMUB2;ENSG00000168591:ENST00000319511:exon_42267869_42269098:TMUB2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 42398052 A/G 1 107 76 183 50.6039985816763 40.0569729700243 10.547025611652 A:T:G A G 10 0.527065433816109 0.12064369133838 ENSG00000013306:ENST00000225308:exon_42397990_42398099:SLC25A39;ENSG00000013306:ENST00000377095:exon_42397990_42398099:SLC25A39 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 42398757 C/A 1 14 7 21 6.62108392657447 3.68945803671276 2.93162588986171 A:C C A 10 0.527065433816109 0.274579453085168 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 42475983 G/C 1 15 9 24 7.09401849275836 4.74358890434498 2.35042958841338 C:G G C 10 0.527065433816109 0.415272769718452 ENSG00000186566:ENST00000335500:exon_42472652_42478821:GPATCH8;ENSG00000186566:ENST00000434000:exon_42474784_42478821:GPATCH8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 43111688 G/A 1 20 15 35 9.45869132367782 7.90598150724164 1.55270981643618 A:G G A 10 0.527065433816109 0.616674394972612 ENSG00000172992:ENST00000452796:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000342350:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000310604:exon_43111555_43111758:DCAKD HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 43316360 G/A 1 18 17 35 8.51282219131004 8.96011237487385 -0.447290183563815 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000184922:ENST00000328118:exon_43316322_43316432:FMNL1;ENSG00000184922:ENST00000331495:exon_43316322_43316432:FMNL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 43319770 C/T 1 33 34 67 15.6068406840684 17.9202247497477 -2.3133840656793 A:T:C C T 10 0.527065433816109 0.62516151162875 ENSG00000184922:ENST00000328118:exon_43319708_43319832:FMNL1;ENSG00000184922:ENST00000331495:exon_43319708_43319832:FMNL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 43342141 G/C 1 24 22 46 11.3504295884134 11.5954395439544 -0.245009955541015 C:G G C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000006062:ENST00000344686:exon_43340488_43342167:MAP3K14;ENSG00000006062:ENST00000376926:exon_43340495_43342167:MAP3K14 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 43545893 T/C 1 4 8 12 1.89173826473556 4.21652347052887 -2.32478520579331 T:C T C 10 0.527065433816109 0.248670873824186 ENSG00000225190:ENST00000430334:exon_43545575_43545959:PLEKHM1;ENSG00000225190:ENST00000446609:exon_43545575_43545959:PLEKHM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 43552537 G/A 1 2 8 10 0.945869132367782 4.21652347052887 -3.27065433816109 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0545836587495111 ENSG00000225190:ENST00000430334:exon_43552466_43553092:PLEKHM1;ENSG00000225190:ENST00000446609:exon_43552466_43553092:PLEKHM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 43552921 C/T 1 4 8 12 1.89173826473556 4.21652347052887 -2.32478520579331 T:C C T 10 0.527065433816109 0.248670873824186 ENSG00000225190:ENST00000430334:exon_43552466_43553092:PLEKHM1;ENSG00000225190:ENST00000446609:exon_43552466_43553092:PLEKHM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 44108906 A/G 1 25 22 47 11.8233641545973 11.5954395439544 0.227924610642875 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44107334_44109069:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44107334_44109069:KIAA1267 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 44109474 G/A 1 8 9 17 3.78347652947113 4.74358890434498 -0.960112374873853 A:G G A 10 0.527065433816109 0.80902600536977 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44109413_44109665:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44109413_44109665:KIAA1267 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 44110532 G/A 1 6 2 8 2.83760739710335 1.05413086763222 1.78347652947113 A:G G A 10 0.527065433816109 0.29481715391141 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44110446_44110558:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44110446_44110558:KIAA1267 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 44117119 A/G 1 4 5 9 1.89173826473556 2.63532716908055 -0.743588904344981 A:G A G 10 0.527065433816109 0.743612144716174 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44117068_44117250:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44117068_44117250:KIAA1267 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 44248769 T/C 0 0 10 10 0 5.27065433816109 -5.27065433816109 C:G T C 10 0.527065433816109 0.000559771227864236 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44248221_44249594:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44248221_44249598:KIAA1267 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 44248814 G/A 1 3 14 17 1.41880369855167 7.37891607342553 -5.96011237487385 A:G G A 10 0.527065433816109 0.00569841126221938 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44248221_44249594:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44248221_44249598:KIAA1267 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 44248837 T/C 1 7 9 16 3.31054196328724 4.74358890434498 -1.43304694105774 T:C T C 10 0.527065433816109 0.618149317471371 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44248221_44249594:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44248221_44249598:KIAA1267 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 44249096 A/C 1 8 2 10 3.78347652947113 1.05413086763222 2.72934566183891 A:C A C 10 0.527065433816109 0.114525614534534 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44248221_44249594:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44248221_44249598:KIAA1267 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 45008570 G/A 1 19 29 48 8.98575675749393 15.2848975806672 -6.29914082317323 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0822475837388551 ENSG00000108433:ENST00000225567:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000393456:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000415811:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000439730:exon_45008465_45008573:GOSR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 45885687 A/G 1 23 27 50 10.8774950222295 14.2307667130349 -3.35327169080545 A:T:G A G 10 0.527065433816109 0.395979594350165 ENSG00000006025:ENST00000007414:exon_45884733_45885765:OSBPL7;ENSG00000006025:ENST00000392507:exon_45884733_45885765:OSBPL7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 45994044 C/T 1 26 15 41 12.2962987207812 7.90598150724164 4.39031721353953 T:C C T 10 0.527065433816109 0.210674491710289 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2;ENSG00000167182:ENST00000322172:exon_45993522_45994136:SP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 45994094 T/C 1 35 24 59 16.5527098164362 12.6495704115866 3.90313940484957 T:C T C 10 0.527065433816109 0.361762649360650 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2;ENSG00000167182:ENST00000322172:exon_45993522_45994136:SP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 45994154 G/A 1 30 23 53 14.1880369855167 12.1225049777705 2.06553200774622 A:G G A 10 0.527065433816109 0.585538533570791 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 46002744 G/T 1 17 6 23 8.03988762512615 3.16239260289665 4.87749502222949 T:G G T 10 0.527065433816109 0.0580867060926943 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_46002714_46002907:SP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 46020698 C/T 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 T:C C T 10 0.527065433816109 0.488810537661758 ENSG00000108439:ENST00000225573:exon_46020672_46020796:PNPO;ENSG00000108439:ENST00000434554:exon_46020672_46020796:PNPO HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 46939658 C/G 1 56 38 94 26.4843357062979 20.0284864850121 6.45584922128575 C:G C G 10 0.527065433816109 0.214964370284165 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000416445:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000507306:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509784:exon_46939638_46939666:CALCOCO2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 47000251 C/T 1 45 27 72 21.2820554782751 14.2307667130349 7.05128876524015 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0997054485757431 ENSG00000159202:ENST00000360943:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000389608:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000405215:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506498:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000504684:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000513342:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506271:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000514948:exon_47000209_47000459:UBE2Z HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 47007963 C/T 1 103 110 213 48.7122603169408 57.977197719772 -9.26493740283122 T:C C T 10 0.527065433816109 0.216890859953806 ENSG00000159210:ENST00000502492:exon_47006678_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509995:exon_47007733_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000290330:exon_47007736_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000514089:exon_47007743_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000515572:exon_47007750_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000504000:exon_47007752_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509989:exon_47007788_47007974:SNF8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 47794909 G/A 1 39 19 58 18.4444480811717 10.0142432425061 8.43020483866567 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0344797331315694 ENSG00000121104:ENST00000240364:exon_47794875_47795076:FAM117A;ENSG00000121104:ENST00000513602:exon_47794875_47795076:FAM117A;ENSG00000121104:ENST00000503573:exon_47794875_47795076:FAM117A;ENSG00000121104:ENST00000511743:exon_47794875_47795076:FAM117A;ENSG00000121104:ENST00000509062:exon_47794875_47795076:FAM117A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 47795035 G/A 1 32 33 65 15.1339061178845 17.3931593159316 -2.25925319804709 A:G G A 10 0.527065433816109 0.62012346828026 ENSG00000121104:ENST00000240364:exon_47794875_47795076:FAM117A;ENSG00000121104:ENST00000513602:exon_47794875_47795076:FAM117A;ENSG00000121104:ENST00000503573:exon_47794875_47795076:FAM117A;ENSG00000121104:ENST00000511743:exon_47794875_47795076:FAM117A;ENSG00000121104:ENST00000509062:exon_47794875_47795076:FAM117A;ENSG00000121104:ENST00000503855:exon_47794919_47795076:FAM117A;ENSG00000121104:ENST00000514018:exon_47794949_47795076:FAM117A;ENSG00000121104:ENST00000505159:exon_47794968_47795076:FAM117A;ENSG00000121104:ENST00000506156:exon_47795019_47795076:FAM117A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 48172779 A/C 1 10 3 13 4.72934566183891 1.58119630144833 3.14814936039058 A:C A C 10 0.527065433816109 0.0984259133401166 ENSG00000005882:ENST00000503176:exon_48172639_48172917:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000442211:exon_48172727_48172917:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000508960:exon_48172739_48172917:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000505897:exon_48172751_48172917:PDK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 48539035 T/C 1 6 7 13 2.83760739710335 3.68945803671276 -0.851850639609417 T:C T C 10 0.527065433816109 0.783042148004503 ENSG00000167107:ENST00000510410:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000506582:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48539018_48539047:ACSF2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 48559559 A/G 1 7 7 14 3.31054196328724 3.68945803671276 -0.378916073425526 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000136444:ENST00000258955:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000515221:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000451010:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000504284:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000506211:exon_48559458_48559817:RSAD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 48628160 A/G 1 18 24 42 8.51282219131004 12.6495704115866 -4.13674822027658 A:G A G 10 0.527065433816109 0.218577350649714 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505559:exon_48627897_48628252:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512181:exon_48628069_48628163:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511347:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505656:exon_48628069_48628212:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504265:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515619:exon_48628069_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000508528:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000513618:exon_48627761_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504271:exon_48628095_48628278:SPATA20 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 48628470 T/A 1 13 12 25 6.14814936039058 6.32478520579331 -0.176635845402726 A:T T A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48628359_48628583:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628359_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504265:exon_48628359_48628745:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515619:exon_48628069_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504271:exon_48628359_48628551:SPATA20 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 48629458 A/G 1 25 22 47 11.8233641545973 11.5954395439544 0.227924610642875 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628359_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512071:exon_48629146_48629541:SPATA20 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 48631607 T/C 1 4 5 9 1.89173826473556 2.63532716908055 -0.743588904344981 T:C T C 10 0.527065433816109 0.743612144716174 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 48633043 G/A 1 85 65 150 40.1994381256307 34.2592531980471 5.94018492758364 A:G G A 10 0.527065433816109 0.368495361384039 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48632853_48633211:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48632853_48633213:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48632853_48633213:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48632853_48633211:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48632853_48633213:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48632853_48633213:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48632853_48633211:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512071:exon_48632853_48633137:SPATA20 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 48773484 G/A 1 13 5 18 6.14814936039058 2.63532716908055 3.51282219131004 A:G G A 10 0.527065433816109 0.104967213978269 ENSG00000154945:ENST00000285243:exon_48770553_48773504:ANKRD40 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 49350802 A/C 1 10 15 25 4.72934566183891 7.90598150724164 -3.17663584540273 A:C A C 10 0.527065433816109 0.232365445872985 ENSG00000011260:ENST00000225298:exon_49350723_49350811:UTP18;ENSG00000011260:ENST00000508506:exon_49350723_49350811:UTP18 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 55926640 G/T 1 121 92 213 57.2250825082508 48.490019911082 8.73506259716878 T:C:G G T 10 0.527065433816109 0.243678984994884 ENSG00000181610:ENST00000313608:exon_55926601_55926771:MRPS23 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 56572347 G/A 1 24 22 46 11.3504295884134 11.5954395439544 -0.245009955541015 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000108389:ENST00000323456:exon_56572293_56573691:MTMR4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 56585872 G/C 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 C:G G C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000108389:ENST00000323456:exon_56585829_56585925:MTMR4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 57290383 G/A 1 26 33 59 12.2962987207812 17.3931593159316 -5.09686059515043 A:G G A 10 0.527065433816109 0.194176796417611 ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57290090_57290962:C17orf71 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 58031412 A/G 1 5 6 11 2.36467283091945 3.16239260289665 -0.797719771977199 A:G A G 10 0.527065433816109 0.765666449819686 ENSG00000189050:ENST00000305783:exon_58031406_58031507:RNFT1;ENSG00000189050:ENST00000482446:exon_58031406_58031507:RNFT1;ENSG00000189050:ENST00000343124:exon_58031406_58031507:RNFT1;ENSG00000189050:ENST00000442346:exon_58031406_58031507:RNFT1;ENSG00000189050:ENST00000466544:exon_58031406_58031507:RNFT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 58525013 T/C 1 11 8 19 5.2022802280228 4.21652347052887 0.985756757493928 T:C T C 10 0.527065433816109 0.819106308579823 ENSG00000062725:ENST00000083182:exon_58520520_58525195:APPBP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 61901197 T/A 1 33 48 81 15.6068406840684 25.2991408231732 -9.69230013910483 A:T T A 10 0.527065433816109 0.0343076942316558 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61901177_61901312:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61901177_61901312:FTSJ3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 61903445 G/C 1 10 19 29 4.72934566183891 10.0142432425061 -5.28489758066716 C:G G C 10 0.527065433816109 0.0619173766904125 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61903416_61903495:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61903416_61903495:FTSJ3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 61908271 C/T 1 210 196 406 99.3162588986171 103.304825027957 -3.98856612934027 T:C:G C T 10 0.527065433816109 0.691304211039614 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908169_61908295:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908169_61908295:PSMC5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 61908556 C/T 1 319 282 601 150.866126612661 148.632452336143 2.23367427651846 A:T:C C T 10 0.527065433816109 0.870255208309802 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908396_61908586:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908396_61908586:PSMC5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 62007498 A/G 1 174 152 326 82.290614515997 80.1139459400486 2.17666857594844 A:G A G 10 0.527065433816109 0.824590633497565 ENSG00000007312:ENST00000392795:exon_62007434_62007745:CD79B;ENSG00000007312:ENST00000006750:exon_62007434_62007745:CD79B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 62492582 C/T 1 7 2 9 3.31054196328724 1.05413086763222 2.25641109565502 T:C C T 10 0.527065433816109 0.185447766343339 ENSG00000136480:ENST00000322670:exon_62492525_62493169:POLG2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 65717525 T/C 1 5 10 15 2.36467283091945 5.27065433816109 -2.90598150724164 T:C T C 10 0.527065433816109 0.194890792920314 ENSG00000130935:ENST00000253247:exon_65717494_65717642:NOL11 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 66246416 A/G 1 36 23 59 17.0256443826201 12.1225049777705 4.90313940484957 A:G A G 10 0.527065433816109 0.240579320070543 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392721:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66246329_66246611:AMZ2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 66253095 T/A 1 80 80 160 37.8347652947113 42.1652347052887 -4.33046941057745 A:T:C T A 10 0.527065433816109 0.526721156280593 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66252955_66253214:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66252955_66253214:AMZ2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 66267650 T/G 1 6 2 8 2.83760739710335 1.05413086763222 1.78347652947113 T:G T G 10 0.527065433816109 0.29481715391141 ENSG00000108932:ENST00000327268:exon_66266980_66267795:SLC16A6;ENSG00000108932:ENST00000344066:exon_66267095_66267795:SLC16A6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 67081830 T/C 1 8 1 9 3.78347652947113 0.527065433816109 3.25641109565502 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0415432498690979 ENSG00000154262:ENST00000284425:exon_67081766_67081857:ABCA6;ENSG00000154262:ENST00000446604:exon_67081766_67081857:ABCA6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 70118935 C/T 1 11 6 17 5.2022802280228 3.16239260289665 2.03988762512615 T:C C T 10 0.527065433816109 0.344390478204234 ENSG00000125398:ENST00000245479:exon_70118860_70119113:SOX9;ENSG00000125398:ENST00000455872:exon_70118860_70119113:SOX9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 71197323 G/C 1 14 14 28 6.62108392657447 7.37891607342553 -0.757832146851053 C:G G C 10 0.527065433816109 0.850808986253895 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 72860654 G/A 1 21 30 51 9.93162588986171 15.8119630144833 -5.88033712462156 A:G G A 10 0.527065433816109 0.122274858212795 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000420580:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72860602_72860686:FDXR HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 72862593 C/T 1 10 22 32 4.72934566183891 11.5954395439544 -6.86609388211549 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0200664862912242 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72862568_72862690:FDXR HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 73016621 C/T 1 47 76 123 22.2279246106429 40.0569729700243 -17.8290483593814 T:C C T 10 0.527065433816109 0.00148600103100728 ENSG00000167862:ENST00000301585:exon_73016583_73016752:ICT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 73317794 T/C 1 68 91 159 32.1595505005046 47.9629544772659 -15.8034039767613 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0136202079526448 ENSG00000177885:ENST00000316804:exon_73317740_73317908:GRB2;ENSG00000177885:ENST00000392562:exon_73317740_73317908:GRB2;ENSG00000177885:ENST00000392564:exon_73317740_73317908:GRB2;ENSG00000177885:ENST00000392563:exon_73317740_73317908:GRB2;ENSG00000177885:ENST00000316615:exon_73317740_73317908:GRB2;ENSG00000177885:ENST00000462266:exon_73317740_73317908:GRB2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 73625430 G/A 1 12 10 22 5.67521479420669 5.27065433816109 0.404560456045601 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73625014_73625555:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73625014_73625555:RECQL5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 73774841 G/A 1 7 6 13 3.31054196328724 3.16239260289665 0.148149360390583 A:G G A 10 0.527065433816109 1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 73774877 G/A 1 4 6 10 1.89173826473556 3.16239260289665 -1.27065433816109 A:G G A 10 0.527065433816109 0.532268681489131 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 73816026 A/G 1 6 8 14 2.83760739710335 4.21652347052887 -1.37891607342553 A:G A G 10 0.527065433816109 0.59467204210446 ENSG00000132478:ENST00000293218:exon_73816001_73816189:UNK;ENSG00000178932:ENST00000326348:exon_73815663_73816134:AC087289.1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 73839137 G/A 1 15 13 28 7.09401849275836 6.85185063960942 0.242167853148946 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73839095_73839154:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73839095_73839154:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73839095_73839154:UNC13D HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 73839326 C/T 1 18 7 25 8.51282219131004 3.68945803671276 4.82336415459728 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0699762447208913 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73839240_73839347:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73839240_73839347:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73839240_73839347:UNC13D HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 73888354 G/A 1 2 8 10 0.945869132367782 4.21652347052887 -3.27065433816109 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0545836587495111 ENSG00000141569:ENST00000269383:exon_73888348_73888581:TRIM65 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 73888534 G/A 1 6 2 8 2.83760739710335 1.05413086763222 1.78347652947113 A:G G A 10 0.527065433816109 0.29481715391141 ENSG00000141569:ENST00000269383:exon_73888348_73888581:TRIM65 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 74261677 T/C 1 227 194 421 107.356146523743 102.250694160325 5.1054523634181 T:C T C 10 0.527065433816109 0.625829944640463 ENSG00000185262:ENST00000327490:exon_74261283_74261706:FAM100B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 74307737 T/C 1 8 26 34 3.78347652947113 13.7037012792188 -9.92022474974771 T:C T C 10 0.527065433816109 0.000821472313146413 ENSG00000161542:ENST00000448426:exon_74306868_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000446526:exon_74307014_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000324684:exon_74307015_74307781:PRPSAP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 75190962 C/T 1 11 21 32 5.2022802280228 11.0683741101383 -5.86609388211549 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0500439124076423 ENSG00000129657:ENST00000443798:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000430767:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000413679:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000436233:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000392476:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000262775:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000431431:exon_75190759_75190993:SEC14L1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 76113954 G/A 1 95 70 165 44.9287837874696 36.8945803671276 8.03420342034201 A:G G A 10 0.527065433816109 0.213384941219273 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76113883_76114016:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76113883_76114016:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76113883_76114016:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392466:exon_76113883_76114016:TMC6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 76120065 A/G 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 A:G A G 10 0.527065433816109 0.160556933333404 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 76170830 C/T 1 102 113 215 48.2393257507569 59.5583940212203 -11.3190682704634 T:C C T 10 0.527065433816109 0.132863293042654 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76170160_76171031:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76170773_76171031:TK1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 76178748 T/C 1 22 21 43 10.4045604560456 11.0683741101383 -0.663813654092689 T:C T C 10 0.527065433816109 0.879376180264087 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76178670_76178763:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76178670_76178763:TK1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 76395430 C/T 1 10 11 21 4.72934566183891 5.7977197719772 -1.06837411013829 T:C C T 10 0.527065433816109 0.667942291105539 ENSG00000087157:ENST00000262764:exon_76395429_76395618:PGS1;ENSG00000087157:ENST00000329897:exon_76395429_76395618:PGS1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 76799795 G/A 1 42 24 66 19.8632517797234 12.6495704115866 7.2136813681368 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0843766864800057 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 76799860 T/C 1 23 20 43 10.8774950222295 10.5413086763222 0.336186345907311 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 76799898 A/G 1 28 25 53 13.2421678531489 13.1766358454027 0.0655320077462207 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 76988785 G/A 1 26 26 52 12.2962987207812 13.7037012792188 -1.40740255843767 A:G G A 10 0.527065433816109 0.78155462222789 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000339300:exon_76987799_76990002:CANT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 76989782 G/A 1 9 9 18 4.25641109565502 4.74358890434498 -0.487177808689962 A:G G A 10 0.527065433816109 0.81881957561072 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000339300:exon_76987799_76990002:CANT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 76993459 C/T 1 7 6 13 3.31054196328724 3.16239260289665 0.148149360390583 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76993074_76994045:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76993074_76993726:CANT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 76993546 A/G 1 9 7 16 4.25641109565502 3.68945803671276 0.566953058942256 A:G A G 10 0.527065433816109 0.808175848721287 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76993074_76994045:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76993074_76993726:CANT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 77078109 A/G 1 6 2 8 2.83760739710335 1.05413086763222 1.78347652947113 A:G A G 10 0.527065433816109 0.29481715391141 ENSG00000167280:ENST00000311595:exon_77077980_77078145:ENGASE;ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77077980_77078145:ENGASE HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 77768654 C/A 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 A:C C A 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000141570:ENST00000269385:exon_77765931_77769357:CBX8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 77808961 G/A 1 37 33 70 17.498578948804 17.3931593159316 0.105419632872369 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000141582:ENST00000269397:exon_77806955_77809194:CBX4;ENSG00000141582:ENST00000448310:exon_77808843_77809194:CBX4;ENSG00000141582:ENST00000495122:exon_77808942_77809319:CBX4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 78078709 T/C 1 7 4 11 3.31054196328724 2.10826173526444 1.2022802280228 T:C T C 10 0.527065433816109 0.555399509917260 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78078354_78078931:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78078354_78078931:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78078354_78078931:GAA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 78175483 T/C 1 14 3 17 6.62108392657447 1.58119630144833 5.03988762512615 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0148820665879415 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 78184393 C/T 1 9 12 21 4.25641109565502 6.32478520579331 -2.06837411013829 T:C C T 10 0.527065433816109 0.390094196298263 ENSG00000181523:ENST00000326317:exon_78183079_78184810:SGSH HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 78333840 T/C 1 6 2 8 2.83760739710335 1.05413086763222 1.78347652947113 T:C T C 10 0.527065433816109 0.29481715391141 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 78337058 G/C 1 13 1 14 6.14814936039058 0.527065433816109 5.62108392657447 C:G G C 10 0.527065433816109 0.00219646826073131 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78336902_78337114:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78336902_78337114:RNF213 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 78337584 A/G 1 9 2 11 4.25641109565502 1.05413086763222 3.2022802280228 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0696872224921074 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78337409_78337590:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78337409_78337590:RNF213 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 78346830 G/A 1 6 9 15 2.83760739710335 4.74358890434498 -1.90598150724164 A:G G A 10 0.527065433816109 0.439435430476406 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78346775_78346965:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78346775_78346965:RNF213 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 78363847 G/A 1 32 31 63 15.1339061178845 16.3390284482994 -1.20512233041487 A:G G A 10 0.527065433816109 0.801458749519592 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78363812_78363996:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78363812_78363996:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000427003:exon_78363812_78363996:RNF213 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 79165171 G/A 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 A:G G A 10 0.527065433816109 0.488810537661758 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 79169641 G/A 1 11 9 20 5.2022802280228 4.74358890434498 0.45869132367782 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79169635_79169751:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79169635_79169751:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79169635_79169751:AZI1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 79170578 C/T 1 7 15 22 3.31054196328724 7.90598150724164 -4.5954395439544 T:C C T 10 0.527065433816109 0.05593119353183 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79170501_79170626:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79170501_79170626:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79170501_79170626:AZI1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 79202956 T/C 1 20 22 42 9.45869132367782 11.5954395439544 -2.13674822027658 T:C T C 10 0.527065433816109 0.539221144360839 ENSG00000167302:ENST00000300714:exon_79202079_79203276:C17orf56;ENSG00000167302:ENST00000374769:exon_79202079_79203276:C17orf56 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 79220016 T/C 1 85 70 155 40.1994381256307 36.8945803671276 3.3048577585031 T:C T C 10 0.527065433816109 0.629706988323312 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 79220224 G/C 1 55 47 102 26.011401140114 24.7720753893571 1.23932575075688 C:G G C 10 0.527065433816109 0.843166822004751 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 79226362 G/A 1 38 36 74 17.9715135149879 18.9743556173799 -1.00284210239207 A:G G A 10 0.527065433816109 0.817153461956963 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79225995_79226483:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79225995_79226483:SLC38A10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 79244802 T/C 1 17 6 23 8.03988762512615 3.16239260289665 4.87749502222949 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0580867060926943 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79244718_79244824:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79244718_79244824:SLC38A10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 79478019 G/A 1 3771 4158 7929 1783.43624907945 2191.53807380738 -408.101824727928 A:T:C:G G A 10 0.527065433816109 5.05438817912515e-20 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79477953_79478134:ACTG1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 79478323 T/C 1 4025 3884 7909 1903.56162889016 2047.12214494177 -143.560516051607 A:T:C:G T C 10 0.527065433816109 0.00127761412267323 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79478214_79478652:ACTG1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 79478871 C/T 1 9 13 22 4.25641109565502 6.85185063960942 -2.5954395439544 T:C C T 10 0.527065433816109 0.292055393163298 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 79478916 G/T 1 11 5 16 5.2022802280228 2.63532716908055 2.56695305894226 T:G G T 10 0.527065433816109 0.220807585221878 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 79511135 A/G 1 25 23 48 11.8233641545973 12.1225049777705 -0.299140823173234 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000185504:ENST00000361039:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79511030_79511146:C17orf70 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 79514129 G/A 1 23 18 41 10.8774950222295 9.48717780868996 1.39031721353953 A:G G A 10 0.527065433816109 0.755087232770045 ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79513935_79515054:C17orf70 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 79526402 G/C 1 49 37 86 23.1737937430107 19.501421051196 3.67237269181462 C:G G C 10 0.527065433816109 0.451162042837941 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79523915_79526442:NPLOC4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 79580457 C/A 1 8 9 17 3.78347652947113 4.74358890434498 -0.960112374873853 A:C C A 10 0.527065433816109 0.80902600536977 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79580344_79580520:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79580344_79580520:NPLOC4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 79632363 C/T 1 164 117 281 77.5612688541581 61.6666557564848 15.8946130976734 T:C C T 10 0.527065433816109 0.06384907687359 ENSG00000204237:ENST00000374741:exon_79632067_79632614:C17orf90 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 79637367 C/G 1 27 17 44 12.7692332869651 8.96011237487385 3.8091209120912 C:G C G 10 0.527065433816109 0.291442452370904 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79637255_79637483:CCDC137 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 79639708 C/T 1 38 25 63 17.9715135149879 13.1766358454027 4.79487766958513 A:T:C C T 10 0.527065433816109 0.256699464369307 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79639525_79640937:CCDC137 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 79662067 A/G 1 18 14 32 8.51282219131004 7.37891607342553 1.13390611788451 A:G A G 10 0.527065433816109 0.726408228699705 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79661954_79662097:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79661954_79662097:HGS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 79663880 T/C 1 51 48 99 24.1196628753784 25.2991408231732 -1.17947794779479 T:C T C 10 0.527065433816109 0.840862151066191 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79663854_79664028:HGS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 79663931 T/C 1 31 24 55 14.6609715517006 12.6495704115866 2.011401140114 T:C T C 10 0.527065433816109 0.685779705718237 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79663854_79664028:HGS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 79668135 G/T 1 101 71 172 47.766391184573 37.4216458009437 10.3447453836292 T:G G T 10 0.527065433816109 0.126572721059291 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79668075_79668161:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79668075_79668161:HGS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 79671714 T/C 1 263 212 475 124.381790906363 111.737871969015 12.6439189373482 T:C:G T C 10 0.527065433816109 0.25090194266206 ENSG00000183093:ENST00000333676:exon_79671663_79671746:MRPL12;ENSG00000183093:ENST00000332396:exon_79671663_79671746:MRPL12 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 79974731 T/C 1 38 38 76 17.9715135149879 20.0284864850121 -2.05697297002429 T:C T C 10 0.527065433816109 0.647663006006319 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79974676_79974745:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79974676_79974745:ASPSCR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 79991603 C/T 1 10 3 13 4.72934566183891 1.58119630144833 3.14814936039058 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0984259133401166 ENSG00000169750:ENST00000306897:exon_79991575_79992077:RAC3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 80012449 G/A 1 56 38 94 26.4843357062979 20.0284864850121 6.45584922128575 A:G G A 10 0.527065433816109 0.214964370284165 ENSG00000169727:ENST00000306823:exon_80012374_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392358:exon_80012386_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000320548:exon_80012408_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000355130:exon_80012386_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392357:exon_80011744_80012686:GPS1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 80019207 G/C 1 46 37 83 21.754990044459 19.501421051196 2.25356899326295 T:C:G G C 10 0.527065433816109 0.660977384666012 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80019085_80019229:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80019085_80019229:DUS1L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 80045086 G/C 1 22 24 46 10.4045604560456 12.6495704115866 -2.24500995554101 C:G G C 10 0.527065433816109 0.556153822172808 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80044926_80045129:FASN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 80320561 G/A 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 A:G G A 10 0.527065433816109 0.757490641773051 ENSG00000182459:ENST00000333437:exon_80319756_80321652:TEX19 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 80350331 G/A 1 21 23 44 9.93162588986171 12.1225049777705 -2.1908790879088 A:G G A 10 0.527065433816109 0.547870250177767 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80350100_80350410:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80350100_80350410:C17orf101 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 80545030 G/A 1 47 50 97 22.2279246106429 26.3532716908055 -4.12534708016258 A:G G A 10 0.527065433816109 0.417283512164858 ENSG00000141568:ENST00000473637:exon_80544939_80545148:FOXK2;ENSG00000141568:ENST00000335255:exon_80544939_80545148:FOXK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 80863857 T/C 1 7 6 13 3.31054196328724 3.16239260289665 0.148149360390583 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000397466:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80863812_80863929:TBCD HGDP00239_parsed_pileup.txt . 17 81006387 G/A 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000175711:ENST00000320865:exon_81006347_81006446:B3GNTL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 658064 G/C 1 6 5 11 2.83760739710335 2.63532716908055 0.202280228022801 C:G G C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000176912:ENST00000323813:exon_657842_658340:C18orf56 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 672836 A/G 1 28 28 56 13.2421678531489 14.7578321468511 -1.51566429370211 A:G A G 10 0.527065433816109 0.690633534633794 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_672557_673076:ENOSF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 674320 A/G 1 50 39 89 23.6467283091945 20.5555519188283 3.09117639036629 A:T:G A G 10 0.527065433816109 0.526136549762657 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_674161_674406:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000251101:exon_673859_674406:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000319815:exon_673861_674406:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000340116:exon_674038_674406:ENOSF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 691266 A/G 1 5 10 15 2.36467283091945 5.27065433816109 -2.90598150724164 A:G A G 10 0.527065433816109 0.194890792920314 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000251101:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000319815:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000340116:exon_691204_691276:ENOSF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 693828 A/C 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 A:C A C 10 0.527065433816109 1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 2750477 A/G 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 A:G A G 10 0.527065433816109 0.160556933333404 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2750348_2750505:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2750348_2750505:SMCHD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 2891847 C/T 1 4 24 28 1.89173826473556 12.6495704115866 -10.7578321468511 T:C C T 10 0.527065433816109 3.41052584450134e-05 ENSG00000132205:ENST00000254528:exon_2890559_2892484:EMILIN2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 2909700 C/T 1 5 9 14 2.36467283091945 4.74358890434498 -2.37891607342553 T:C C T 10 0.527065433816109 0.284872281969498 ENSG00000132205:ENST00000254528:exon_2909689_2909817:EMILIN2;ENSG00000132205:ENST00000308080:exon_2909689_2909817:EMILIN2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 9944956 T/C 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 T:C T C 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000101558:ENST00000340541:exon_9944921_9945055:VAPA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 9944960 A/G 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 A:G A G 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000101558:ENST00000340541:exon_9944921_9945055:VAPA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 9954058 T/C 1 170 193 363 80.3988762512615 101.723628726509 -21.3247524752476 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0271611167782275 ENSG00000101558:ENST00000340541:exon_9954050_9954797:VAPA;ENSG00000101558:ENST00000400000:exon_9954050_9960018:VAPA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 12329536 C/G 1 117 123 240 55.3333442435152 64.8290483593814 -9.49570411586618 C:G C G 10 0.527065433816109 0.220199380798662 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 12348285 T/C 1 29 23 52 13.7151024193328 12.1225049777705 1.59259744156233 T:C T C 10 0.527065433816109 0.679527476175954 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12348272_12348382:AFG3L2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 12351342 C/T 1 34 27 61 16.0797752502523 14.2307667130349 1.84900853721735 T:C C T 10 0.527065433816109 0.701105241861212 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12351305_12351412:AFG3L2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 12971179 C/T 1 34 20 54 16.0797752502523 10.5413086763222 5.53846657393011 T:C C T 10 0.527065433816109 0.136278803558187 ENSG00000085415:ENST00000399892:exon_12971152_12971250:SEH1L;ENSG00000085415:ENST00000262124:exon_12971152_12971250:SEH1L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 13124609 T/C 1 7 11 18 3.31054196328724 5.7977197719772 -2.48717780868996 T:C T C 10 0.527065433816109 0.249990861970352 ENSG00000101639:ENST00000513183:exon_13124486_13125029:CEP192 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 19154143 G/A 1 6 7 13 2.83760739710335 3.68945803671276 -0.851850639609417 A:G G A 10 0.527065433816109 0.783042148004503 ENSG00000141446:ENST00000269214:exon_19153275_19155391:ESCO1;ENSG00000141446:ENST00000383276:exon_19153275_19155391:ESCO1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 21109250 T/C 1 27 21 48 12.7692332869651 11.0683741101383 1.70085917682677 T:C T C 10 0.527065433816109 0.666365310723135 ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21109143_21109262:C18orf8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 21109252 T/C 1 24 27 51 11.3504295884134 14.2307667130349 -2.88033712462156 T:C T C 10 0.527065433816109 0.483732371966034 ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21109143_21109262:C18orf8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 21109269 T/C 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 T:C T C 10 0.527065433816109 0.729753293915306 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 24035675 T/C 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 T:C T C 10 0.527065433816109 0.757490641773051 ENSG00000134504:ENST00000317932:exon_24034874_24035865:KCTD1;ENSG00000134504:ENST00000417602:exon_24034877_24035865:KCTD1;ENSG00000134504:ENST00000408011:exon_24034877_24035865:KCTD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 29122799 G/A 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 A:G G A 10 0.527065433816109 0.160556933333404 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29122483_29122815:DSG2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 29125854 A/G 1 13 3 16 6.14814936039058 1.58119630144833 4.56695305894226 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0242272766688289 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29125684_29128813:DSG2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 29432624 T/C 1 12 7 19 5.67521479420669 3.68945803671276 1.98575675749393 T:C T C 10 0.527065433816109 0.491846751029638 ENSG00000153339:ENST00000283351:exon_29432558_29432626:TRAPPC8;ENSG00000153339:ENST00000451747:exon_29432558_29432626:TRAPPC8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 32822382 G/T 1 7 9 16 3.31054196328724 4.74358890434498 -1.43304694105774 T:G G T 10 0.527065433816109 0.618149317471371 ENSG00000186812:ENST00000330501:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000261333:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000355632:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000421371:exon_32822355_32822848:ZNF397 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 32822782 A/G 1 4 6 10 1.89173826473556 3.16239260289665 -1.27065433816109 A:G A G 10 0.527065433816109 0.532268681489131 ENSG00000186812:ENST00000330501:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000261333:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000355632:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000421371:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000416663:exon_32822570_32822864:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000438172:exon_32822570_32822865:ZNF397 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 32917644 T/C 1 5 16 21 2.36467283091945 8.43304694105774 -6.06837411013829 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0085261785713212 ENSG00000172466:ENST00000261332:exon_32912176_32917734:ZNF24;ENSG00000172466:ENST00000399061:exon_32917189_32917734:ZNF24 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 33048554 C/T 1 41 43 84 19.3903172135395 22.6638136540927 -3.27349644055316 T:C C T 10 0.527065433816109 0.512725735222643 ENSG00000153391:ENST00000441607:exon_33048293_33048706:INO80C;ENSG00000153391:ENST00000334598:exon_33048297_33048706:INO80C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 33557466 A/G 1 17 19 36 8.03988762512615 10.0142432425061 -1.97435561737993 A:G A G 10 0.527065433816109 0.617192754782756 ENSG00000141428:ENST00000333234:exon_33557373_33557563:C18orf21;ENSG00000141428:ENST00000269194:exon_33557373_33557563:C18orf21 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 33694120 G/A 1 9 6 15 4.25641109565502 3.16239260289665 1.09401849275836 A:G G A 10 0.527065433816109 0.615224246448703 ENSG00000141424:ENST00000269187:exon_33694060_33694437:SLC39A6;ENSG00000141424:ENST00000440549:exon_33694060_33694437:SLC39A6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 33718326 A/C 1 10 4 14 4.72934566183891 2.10826173526444 2.62108392657447 A:C A C 10 0.527065433816109 0.18849020884602 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33718233_33718389:ELP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 33725931 G/A 1 14 11 25 6.62108392657447 5.7977197719772 0.823364154597274 A:G G A 10 0.527065433816109 0.84228244308015 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33725911_33726011:ELP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 33750046 C/T 1 28 57 85 13.2421678531489 30.0427297275182 -16.8005618743693 T:C C T 10 0.527065433816109 0.000293393544780011 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33750026_33750159:ELP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 33750060 A/G 1 27 57 84 12.7692332869651 30.0427297275182 -17.2734964405532 A:G A G 10 0.527065433816109 0.000173221491199281 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33750026_33750159:ELP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 34273279 C/G 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 C:G C G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000134775:ENST00000445677:exon_34273172_34273386:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000359247:exon_34273172_34273386:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000257209:exon_34273172_34273386:FHOD3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 34289203 G/A 1 17 7 24 8.03988762512615 3.68945803671276 4.35042958841338 A:G G A 10 0.527065433816109 0.100628513344123 ENSG00000134775:ENST00000445677:exon_34289058_34289354:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000359247:exon_34289058_34289354:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000257209:exon_34289058_34289354:FHOD3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 47318626 T/C 1 26 28 54 12.2962987207812 14.7578321468511 -2.46153342606989 T:C T C 10 0.527065433816109 0.586081751821012 ENSG00000167315:ENST00000285093:exon_47318522_47318697:ACAA2;ENSG00000167315:ENST00000398549:exon_47318522_47318697:ACAA2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 47809871 G/T 1 6 5 11 2.83760739710335 2.63532716908055 0.202280228022801 T:G G T 10 0.527065433816109 1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 47810251 C/G 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 C:G C G 10 0.527065433816109 0.160556933333404 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 47811374 G/A 1 66 67 133 31.2136813681368 35.3133840656793 -4.0997026975425 A:G G A 10 0.527065433816109 0.488311701175649 ENSG00000154832:ENST00000285106:exon_47811372_47811617:CXXC1;ENSG00000154832:ENST00000412036:exon_47811372_47811617:CXXC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 47812587 C/T 1 75 72 147 35.4700924637918 37.9487112347598 -2.47861877096803 T:C C T 10 0.527065433816109 0.680758472160116 ENSG00000154832:ENST00000285106:exon_47812392_47812627:CXXC1;ENSG00000154832:ENST00000412036:exon_47812392_47812627:CXXC1;ENSG00000154832:ENST00000445672:exon_47812392_47812627:CXXC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 47918639 A/C 1 18 11 29 8.51282219131004 5.7977197719772 2.71510241933284 A:C A C 10 0.527065433816109 0.355748397679087 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47918469_47920543:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47918469_47920534:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000417656:exon_47918469_47920534:SKA1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 52895531 T/C 1 40 40 80 18.9173826473556 21.0826173526444 -2.16523470528873 T:C T C 10 0.527065433816109 0.65528667482148 ENSG00000196628:ENST00000354452:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000457482:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000356073:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000398339:exon_52895452_52895592:TCF4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 56149099 T/C 1 2 11 13 0.945869132367782 5.7977197719772 -4.85185063960942 T:C T C 10 0.527065433816109 0.00972131543990577 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56148479_56149271:ALPK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 56196451 C/T 1 11 4 15 5.2022802280228 2.10826173526444 3.09401849275836 T:C C T 10 0.527065433816109 0.126517172009480 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56196323_56196470:ALPK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 56202120 G/A 1 5 21 26 2.36467283091945 11.0683741101383 -8.70370127921884 A:G G A 10 0.527065433816109 0.000618494439649605 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 56202394 C/T 1 3 6 9 1.41880369855167 3.16239260289665 -1.74358890434498 T:C C T 10 0.527065433816109 0.323067031523113 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 56202683 T/C 1 5 6 11 2.36467283091945 3.16239260289665 -0.797719771977199 T:C T C 10 0.527065433816109 0.765666449819686 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 56202768 C/A 1 13 4 17 6.14814936039058 2.10826173526444 4.03988762512615 A:C C A 10 0.527065433816109 0.0545992094317132 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 56202982 A/T 1 9 6 15 4.25641109565502 3.16239260289665 1.09401849275836 A:T A T 10 0.527065433816109 0.615224246448703 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 56203074 G/A 1 9 5 14 4.25641109565502 2.63532716908055 1.62108392657447 A:G G A 10 0.527065433816109 0.433551468090942 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 56203120 C/T 1 13 1 14 6.14814936039058 0.527065433816109 5.62108392657447 T:C C T 10 0.527065433816109 0.00219646826073131 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 56203411 G/C 1 27 6 33 12.7692332869651 3.16239260289665 9.6068406840684 C:G G C 10 0.527065433816109 0.000712829901482026 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 56203447 A/G 1 30 5 35 14.1880369855167 2.63532716908055 11.5527098164362 A:G A G 10 0.527065433816109 5.75948489823169e-05 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 56203891 G/T 1 22 2 24 10.4045604560456 1.05413086763222 9.35042958841338 T:G G T 10 0.527065433816109 0.00010142357563302 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 56203898 T/G 1 17 3 20 8.03988762512615 1.58119630144833 6.45869132367782 T:G T G 10 0.527065433816109 0.00330052115114613 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 56204250 A/C 1 19 9 28 8.98575675749393 4.74358890434498 4.24216785314895 A:C A C 10 0.527065433816109 0.130471808387002 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 56204644 T/G 1 8 19 27 3.78347652947113 10.0142432425061 -6.23076671303494 T:G T G 10 0.527065433816109 0.0197843323780507 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 56204671 A/T 1 12 9 21 5.67521479420669 4.74358890434498 0.931625889861711 A:T A T 10 0.527065433816109 0.827834701908173 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 56204932 T/G 1 21 3 24 9.93162588986171 1.58119630144833 8.35042958841338 T:G T G 10 0.527065433816109 0.000667239012032751 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 56204945 C/G 1 22 3 25 10.4045604560456 1.58119630144833 8.82336415459728 C:G C G 10 0.527065433816109 0.000385736392458478 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 56204977 C/T 1 24 1 25 11.3504295884134 0.527065433816109 10.8233641545973 T:C C T 10 0.527065433816109 2.82270645285809e-06 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 56204991 C/T 1 25 1 26 11.8233641545973 0.527065433816109 11.2962987207812 T:C C T 10 0.527065433816109 1.53272822160740e-06 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 56205262 A/C 1 27 9 36 12.7692332869651 4.74358890434498 8.02564438262008 A:C A C 10 0.527065433816109 0.00733401304362966 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 56205481 G/A 1 13 9 22 6.14814936039058 4.74358890434498 1.4045604560456 A:C:G G A 10 0.527065433816109 0.670793133404155 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 57022754 T/C 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 T:C T C 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000074695:ENST00000251047:exon_57022736_57022890:LMAN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 60985879 T/C 1 60 39 99 28.3760739710335 20.5555519188283 7.8205220522052 T:C T C 10 0.527065433816109 0.130953932309778 ENSG00000171791:ENST00000398117:exon_60985315_60987361:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000333681:exon_60985315_60986185:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000444484:exon_60985187_60986185:BCL2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 61022791 C/T 1 13 3 16 6.14814936039058 1.58119630144833 4.56695305894226 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0242272766688289 ENSG00000119537:ENST00000406396:exon_61022731_61022796:KDSR;ENSG00000119537:ENST00000326575:exon_61022731_61022796:KDSR HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 67531642 T/C 1 26 32 58 12.2962987207812 16.8660938821155 -4.56979516133432 T:C T C 10 0.527065433816109 0.239141449163809 ENSG00000150637:ENST00000280200:exon_67528097_67531675:CD226 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 67671382 G/A 1 18 26 44 8.51282219131004 13.7037012792188 -5.1908790879088 A:G G A 10 0.527065433816109 0.131777644537270 ENSG00000176225:ENST00000255674:exon_67671045_67671472:RTTN;ENSG00000176225:ENST00000454359:exon_67671045_67671472:RTTN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 72168608 G/A 1 27 21 48 12.7692332869651 11.0683741101383 1.70085917682677 A:G G A 10 0.527065433816109 0.666365310723135 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72168564_72168707:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72168564_72168707:CNDP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 72176083 T/C 1 44 37 81 20.8091209120912 19.501421051196 1.30769986089517 A:T:C T C 10 0.527065433816109 0.824261379059883 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72176075_72176163:CNDP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 72178161 T/C 1 38 19 57 17.9715135149879 10.0142432425061 7.95727027248178 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0456656304420482 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72178048_72178248:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72178048_72178248:CNDP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 72998268 T/C 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 72998886 T/C 1 9 3 12 4.25641109565502 1.58119630144833 2.67521479420669 T:C T C 10 0.527065433816109 0.153067812973243 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 72999359 T/C 1 12 6 18 5.67521479420669 3.16239260289665 2.51282219131004 T:C T C 10 0.527065433816109 0.345457652895314 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 77227476 A/G 1 20 14 34 9.45869132367782 7.37891607342553 2.07977525025229 A:G A G 10 0.527065433816109 0.497604517851488 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77227450_77227582:NFATC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 77246444 C/T 1 14 6 20 6.62108392657447 3.16239260289665 3.45869132367782 T:C C T 10 0.527065433816109 0.177782475899471 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77246248_77246937:NFATC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 77473127 C/T 1 13 20 33 6.14814936039058 10.5413086763222 -4.3931593159316 T:C C T 10 0.527065433816109 0.162357439542855 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77472972_77473138:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77472972_77473138:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77472972_77473138:CTDP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 77805856 A/C 1 42 46 88 19.8632517797234 24.245009955541 -4.38175817581759 A:C A C 10 0.527065433816109 0.393299284559069 ENSG00000101546:ENST00000306735:exon_77805774_77810651:RBFA;ENSG00000101546:ENST00000262197:exon_77805774_77806377:RBFA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 77894308 C/T 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 T:C C T 10 0.527065433816109 0.757490641773051 ENSG00000101544:ENST00000262198:exon_77893495_77898226:ADNP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 77895192 G/A 1 17 12 29 8.03988762512615 6.32478520579331 1.71510241933284 A:G G A 10 0.527065433816109 0.580177374586883 ENSG00000101544:ENST00000262198:exon_77893495_77898226:ADNP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 18 77896308 A/G 1 13 8 21 6.14814936039058 4.21652347052887 1.93162588986171 A:G A G 10 0.527065433816109 0.513458776648042 ENSG00000101544:ENST00000262198:exon_77893495_77898226:ADNP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 518957 C/A 1 39 21 60 18.4444480811717 11.0683741101383 7.37607397103346 A:C C A 10 0.527065433816109 0.0695276205724595 ENSG00000141933:ENST00000388800:exon_518889_519291:C19orf20;ENSG00000141933:ENST00000359315:exon_518889_519653:C19orf20 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 532066 C/T 1 27 32 59 12.7692332869651 16.8660938821155 -4.09686059515043 T:C C T 10 0.527065433816109 0.299307337404182 ENSG00000099804:ENST00000215574:exon_531733_532108:CDC34 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 580665 T/C 1 155 141 296 73.3048577585031 74.3162261680714 -1.01136840956828 T:C T C 10 0.527065433816109 0.907479275297628 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580646_580782:BSG HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 619021 G/C 1 10 9 19 4.72934566183891 4.74358890434498 -0.0142432425060717 C:G G C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_618997_619110:POLRMT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 621561 C/A 1 21 30 51 9.93162588986171 15.8119630144833 -5.88033712462156 A:C C A 10 0.527065433816109 0.122274858212795 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_621259_621846:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_621058_621846:POLRMT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 652238 A/G 1 45 50 95 21.2820554782751 26.3532716908055 -5.07121621253036 A:G A G 10 0.527065433816109 0.305889221316214 ENSG00000070423:ENST00000292363:exon_652233_652296:RNF126;ENSG00000070423:ENST00000340092:exon_652233_652296:RNF126 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 804327 C/T 1 101 77 178 47.766391184573 40.5840384038404 7.18235278073259 T:C C T 10 0.527065433816109 0.293895480582656 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804292_804438:PTBP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 804612 C/T 1 101 81 182 47.766391184573 42.6923001391048 5.07409104546816 T:C C T 10 0.527065433816109 0.458966075951441 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804532_804702:PTBP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 871222 G/A 1 68 58 126 32.1595505005046 30.5697951613343 1.58975533917026 A:G G A 10 0.527065433816109 0.789713676265927 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_871037_871253:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_871037_871253:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_871037_871253:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_871037_871253:MED16 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 872089 A/G 1 24 24 48 11.3504295884134 12.6495704115866 -1.29914082317323 A:G A G 10 0.527065433816109 0.773140822853663 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_871926_872118:MED16 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 885818 A/G 1 39 40 79 18.4444480811717 21.0826173526444 -2.63816927147262 A:G A G 10 0.527065433816109 0.574561429768666 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_885770_886201:MED16 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 929678 G/A 1 17 13 30 8.03988762512615 6.85185063960942 1.18803698551673 A:G G A 10 0.527065433816109 0.717319151421924 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_929262_929896:ARID3A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 966891 C/T 1 8 3 11 3.78347652947113 1.58119630144833 2.2022802280228 T:C C T 10 0.527065433816109 0.234094659981005 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 991129 G/A 1 49 79 128 23.1737937430107 41.6381692714726 -18.464375528462 A:G G A 10 0.527065433816109 0.00134717073507742 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_991081_991145:WDR18 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 1010691 A/G 1 142 113 255 67.1567083981125 59.5583940212203 7.59831437689219 A:G A G 10 0.527065433816109 0.34753826945062 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1009650_1010894:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1009650_1010894:C19orf6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 1014398 A/G 1 64 42 106 30.267812235769 22.1367482202766 8.13106401549244 A:T:G A G 10 0.527065433816109 0.120193147684566 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1014191_1014472:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1014191_1014472:C19orf6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 1036552 T/C 1 256 173 429 121.071248943076 91.1823200501869 29.8889288928892 T:C T C 10 0.527065433816109 0.00428109056147467 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 1085966 A/G 1 111 141 252 52.4957368464119 74.3162261680714 -21.8204893216595 A:G A G 10 0.527065433816109 0.00657853389218746 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1085659_1086627:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1085659_1086627:HMHA1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 1106477 G/C 1 11 8 19 5.2022802280228 4.21652347052887 0.985756757493928 C:G G C 10 0.527065433816109 0.819106308579823 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 1119019 C/T 1 8 7 15 3.78347652947113 3.68945803671276 0.0940184927583645 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1119010_1119163:SBNO2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 1127615 G/C 1 3 6 9 1.41880369855167 3.16239260289665 -1.74358890434498 C:G G C 10 0.527065433816109 0.323067031523113 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1127603_1127764:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1127603_1127764:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1127523_1127764:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1127603_1127764:SBNO2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 1250397 C/T 1 7 7 14 3.31054196328724 3.68945803671276 -0.378916073425526 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000167470:ENST00000300952:exon_1249889_1250528:MIDN;ENSG00000167470:ENST00000395622:exon_1249887_1250528:MIDN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 1271274 C/T 1 8 6 14 3.78347652947113 3.16239260289665 0.621083926574474 A:T:C C T 10 0.527065433816109 0.794786264772641 ENSG00000099622:ENST00000427032:exon_1271139_1271364:CIRBP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 1271529 C/T 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 T:C C T 10 0.527065433816109 0.160556933333404 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 1360575 G/A 1 13 11 24 6.14814936039058 5.7977197719772 0.350429588413383 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000160953:ENST00000415183:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000356765:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000344663:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000311401:exon_1360135_1361031:MUM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 1370675 C/G 1 19 10 29 8.98575675749393 5.27065433816109 3.71510241933284 C:G C G 10 0.527065433816109 0.194852812464932 ENSG00000160953:ENST00000415183:exon_1370641_1371077:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000344663:exon_1370641_1371077:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000311401:exon_1370641_1371077:MUM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 1388538 C/T 1 67 57 124 31.6866159343207 30.0427297275182 1.64388620680248 T:C C T 10 0.527065433816109 0.787928990495893 ENSG00000115286:ENST00000313408:exon_1388524_1388937:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000233627:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000450862:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000414651:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000382445:exon_1388524_1388592:NDUFS7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 1818839 G/A 1 17 16 33 8.03988762512615 8.43304694105774 -0.393159315931598 A:T:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1818705_1818842:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1818705_1818842:REXO1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 1986455 A/G 1 109 107 216 51.5498677140441 56.3960014183237 -4.84613370427956 A:C:G A G 10 0.527065433816109 0.539857062506343 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 1997363 A/G 1 18 23 41 8.51282219131004 12.1225049777705 -3.60968278646047 A:G A G 10 0.527065433816109 0.276679885087024 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1997343_1997462:BTBD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 2041032 T/C 1 13 11 24 6.14814936039058 5.7977197719772 0.350429588413383 T:C T C 10 0.527065433816109 1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 2073354 C/A 1 61 52 113 28.8490085372173 27.4074025584377 1.44160597877968 A:C C A 10 0.527065433816109 0.850671188204833 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2071037_2073423:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2073140_2073423:MOBKL2A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 2078409 A/G 1 70 76 146 33.1054196328724 40.0569729700243 -6.95155333715192 A:G A G 10 0.527065433816109 0.281232404100313 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 2078488 T/C 1 72 50 122 34.0512887652402 26.3532716908055 7.6980170744347 T:C T C 10 0.527065433816109 0.174259615681654 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 2098015 T/C 1 4 6 10 1.89173826473556 3.16239260289665 -1.27065433816109 T:C T C 10 0.527065433816109 0.532268681489131 ENSG00000099840:ENST00000498554:exon_2097928_2098126:IZUMO4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 2099250 G/A 1 17 7 24 8.03988762512615 3.68945803671276 4.35042958841338 A:C:G G A 10 0.527065433816109 0.100628513344123 ENSG00000099840:ENST00000497445:exon_2098435_2099583:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000478879:exon_2098435_2099592:IZUMO4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 2109157 T/C 1 22 28 50 10.4045604560456 14.7578321468511 -4.35327169080545 T:C T C 10 0.527065433816109 0.257309426807562 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2109085_2109206:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2109085_2109206:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2109085_2109206:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2109085_2109206:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2109085_2109206:AP3D1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 2110746 G/A 1 69 52 121 32.6324850666885 27.4074025584377 5.2250825082508 A:G G A 10 0.527065433816109 0.363342882062871 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2110706_2110895:AP3D1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 2116649 A/G 1 23 18 41 10.8774950222295 9.48717780868996 1.39031721353953 A:T:G A G 10 0.527065433816109 0.755087232770045 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2116604_2116745:AP3D1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 2118692 C/T 1 14 13 27 6.62108392657447 6.85185063960942 -0.230766713034944 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2118600_2118831:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2118600_2118831:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2118600_2118831:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2118600_2118831:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2118600_2118831:AP3D1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 2138654 T/G 1 4 7 11 1.89173826473556 3.68945803671276 -1.7977197719772 T:G T G 10 0.527065433816109 0.36886039388561 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2138618_2138713:AP3D1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 2226655 C/A 1 23 34 57 10.8774950222295 17.9202247497477 -7.04272972751821 A:C C A 10 0.527065433816109 0.0643382312883973 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 2226676 G/A 1 33 40 73 15.6068406840684 21.0826173526444 -5.47577666857596 A:G G A 10 0.527065433816109 0.24094539279432 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 2337468 G/A 1 7 5 12 3.31054196328724 2.63532716908055 0.675214794206692 A:G G A 10 0.527065433816109 0.778351128206284 ENSG00000005206:ENST00000382189:exon_2337442_2337624:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000432705:exon_2337442_2337624:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2337442_2337624:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000320335:exon_2337442_2337624:AC004410.1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 2339856 C/T 1 14 6 20 6.62108392657447 3.16239260289665 3.45869132367782 T:C C T 10 0.527065433816109 0.177782475899471 ENSG00000005206:ENST00000382189:exon_2339823_2339965:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000432705:exon_2339823_2339964:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2339823_2339965:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000320335:exon_2339823_2339965:AC004410.1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 2353150 C/A 1 27 25 52 12.7692332869651 13.1766358454027 -0.407402558437671 A:C C A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2352944_2353207:AC004410.1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 2917178 G/A 1 9 8 17 4.25641109565502 4.21652347052887 0.0398876251261466 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 2917287 C/A 1 10 10 20 4.72934566183891 5.27065433816109 -0.541308676322181 A:C C A 10 0.527065433816109 0.826649432830958 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 2917509 G/A 1 9 5 14 4.25641109565502 2.63532716908055 1.62108392657447 A:G G A 10 0.527065433816109 0.433551468090942 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 2917522 G/A 1 11 5 16 5.2022802280228 2.63532716908055 2.56695305894226 A:G G A 10 0.527065433816109 0.220807585221878 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 2917612 T/C 1 2 12 14 0.945869132367782 6.32478520579331 -5.37891607342553 T:C T C 10 0.527065433816109 0.00536153701805031 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 2917798 A/G 1 14 4 18 6.62108392657447 2.10826173526444 4.51282219131004 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0352268999907301 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 2933480 C/T 1 7 10 17 3.31054196328724 5.27065433816109 -1.96011237487385 T:C C T 10 0.527065433816109 0.467399584608424 ENSG00000175691:ENST00000314531:exon_2933217_2934813:ZNF77 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 2994903 T/C 1 8 11 19 3.78347652947113 5.7977197719772 -2.01424324250607 T:C T C 10 0.527065433816109 0.369297985076747 ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2994898_2995121:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2994898_2995182:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2994898_2995149:TLE6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 2994921 G/A 1 8 9 17 3.78347652947113 4.74358890434498 -0.960112374873853 A:G G A 10 0.527065433816109 0.80902600536977 ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2994898_2995121:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2994898_2995182:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2994898_2995149:TLE6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 3155902 G/A 1 18 18 36 8.51282219131004 9.48717780868996 -0.974355617379924 A:G G A 10 0.527065433816109 0.742458916413507 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3155821_3155950:GNA15 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 3162909 C/T 1 34 39 73 16.0797752502523 20.5555519188283 -4.47577666857596 A:T:C C T 10 0.527065433816109 0.348466130054019 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3162791_3163766:GNA15 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 3207422 T/C 1 33 43 76 15.6068406840684 22.6638136540927 -7.05697297002429 T:C T C 10 0.527065433816109 0.108957916281653 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207389_3207467:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207389_3207467:NCLN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 3207646 A/G 1 69 73 142 32.6324850666885 38.475776668576 -5.84329160188749 A:G A G 10 0.527065433816109 0.355417245893565 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207627_3209572:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207627_3209572:NCLN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 3526352 C/T 1 18 18 36 8.51282219131004 9.48717780868996 -0.974355617379924 T:C C T 10 0.527065433816109 0.742458916413507 ENSG00000105325:ENST00000441788:exon_3526257_3526384:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000395095:exon_3526257_3526384:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000221926:exon_3526257_3526384:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000313639:exon_3526257_3526384:FZR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 3534842 G/A 1 33 22 55 15.6068406840684 11.5954395439544 4.011401140114 A:G G A 10 0.527065433816109 0.344610371723735 ENSG00000105325:ENST00000441788:exon_3534793_3536755:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000395095:exon_3534793_3538325:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000221926:exon_3534793_3538325:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000313639:exon_3534793_3538325:FZR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 3575588 G/A 1 45 42 87 21.2820554782751 22.1367482202766 -0.854692742001486 A:C:G G A 10 0.527065433816109 0.914604704803019 ENSG00000064961:ENST00000416526:exon_3575538_3575658:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000333651:exon_3575538_3575658:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000417382:exon_3575538_3575640:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000453933:exon_3575538_3575612:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000435022:exon_3575538_3575658:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000402569:exon_3575538_3575658:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000262949:exon_3575500_3575658:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000488973:exon_3575538_3575658:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000486028:exon_3575538_3575962:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000483417:exon_3575540_3575658:HMG20B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 3624046 C/A 1 9 5 14 4.25641109565502 2.63532716908055 1.62108392657447 A:C C A 10 0.527065433816109 0.433551468090942 ENSG00000105298:ENST00000429344:exon_3623686_3624160:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000248420:exon_3623686_3624160:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000446452:exon_3623786_3624125:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000221899:exon_3623686_3624160:C19orf29 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 3653525 C/T 1 7 2 9 3.31054196328724 1.05413086763222 2.25641109565502 T:C C T 10 0.527065433816109 0.185447766343339 ENSG00000186111:ENST00000335312:exon_3653288_3653587:PIP5K1C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 3982967 G/A 1 840 836 1676 397.265035594468 440.626702670267 -43.3616670757987 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0353718994608242 ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3982805_3983016:EEF2;ENSG00000167658:ENST00000445244:exon_3982805_3983016:EEF2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 3983184 A/G 1 778 758 1536 367.943092491067 399.515598832611 -31.5725063415435 A:C:G A G 10 0.527065433816109 0.107485043598673 ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3983108_3983289:EEF2;ENSG00000167658:ENST00000445244:exon_3983108_3983289:EEF2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 4013322 T/C 1 13 23 36 6.14814936039058 12.1225049777705 -5.97435561737993 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0648456645038685 ENSG00000105229:ENST00000262971:exon_4012921_4013347:PIAS4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 4028783 C/T 1 14 19 33 6.62108392657447 10.0142432425061 -3.3931593159316 T:C C T 10 0.527065433816109 0.295708648069723 ENSG00000105229:ENST00000262971:exon_4028718_4028846:PIAS4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 4033462 T/C 1 10 10 20 4.72934566183891 5.27065433816109 -0.541308676322181 T:C T C 10 0.527065433816109 0.826649432830958 ENSG00000105229:ENST00000262971:exon_4033418_4033578:PIAS4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 4102449 G/A 1 63 61 124 29.7948776695851 32.1509914627826 -2.35611379319752 A:G G A 10 0.527065433816109 0.719260520458709 ENSG00000126934:ENST00000262948:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000394867:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000481271:exon_4102374_4103202:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000443189:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000465472:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000472395:exon_4102374_4102502:MAP2K2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 4323571 C/T 1 2 7 9 0.945869132367782 3.68945803671276 -2.74358890434498 T:C C T 10 0.527065433816109 0.094465581682091 ENSG00000105255:ENST00000221856:exon_4323530_4323833:FSD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 4670313 C/G 1 71 65 136 33.5783541990563 34.2592531980471 -0.680898998990834 C:G C G 10 0.527065433816109 0.931692418427554 ENSG00000074842:ENST00000262947:exon_4670173_4670415:C19orf10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 4847713 A/G 1 59 37 96 27.9031394048496 19.501421051196 8.40171835365353 A:G A G 10 0.527065433816109 0.10153721894822 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4847703_4847902:PLIN3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 4847874 A/G 1 68 45 113 32.1595505005046 23.7179445217249 8.44160597877968 A:G A G 10 0.527065433816109 0.131380377287428 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4847703_4847902:PLIN3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 4852106 A/G 1 63 28 91 29.7948776695851 14.7578321468511 15.0370455227341 A:G A G 10 0.527065433816109 0.00155181030188737 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4852028_4852313:PLIN3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 4852137 C/T 1 50 20 70 23.6467283091945 10.5413086763222 13.1054196328724 T:C C T 10 0.527065433816109 0.00171435053168193 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4852028_4852313:PLIN3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 4859937 T/C 1 31 37 68 14.6609715517006 19.501421051196 -4.84044949949541 T:C T C 10 0.527065433816109 0.274564874462762 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4859838_4860036:PLIN3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 5110794 A/G 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000127663:ENST00000159111:exon_5110633_5110829:KDM4B;ENSG00000127663:ENST00000381759:exon_5110633_5110829:KDM4B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 5206775 A/G 1 14 14 28 6.62108392657447 7.37891607342553 -0.757832146851053 A:G A G 10 0.527065433816109 0.850808986253895 ENSG00000105426:ENST00000355005:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000262963:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000348075:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000355322:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000356037:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000357368:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000353284:exon_5205519_5206853:PTPRS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 5696146 G/A 1 65 47 112 30.7407468019529 24.7720753893571 5.96867141259579 A:G G A 10 0.527065433816109 0.297898354515287 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5696065_5696181:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5696065_5696181:LONP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 5783905 G/A 1 8 3 11 3.78347652947113 1.58119630144833 2.2022802280228 A:G G A 10 0.527065433816109 0.234094659981005 ENSG00000212123:ENST00000390672:exon_5782971_5784610:PRR22;ENSG00000212123:ENST00000419421:exon_5782971_5784064:PRR22 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 5786815 G/A 1 22 10 32 10.4045604560456 5.27065433816109 5.13390611788451 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0775021378258386 ENSG00000141994:ENST00000320699:exon_5786760_5786856:DUS3L;ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5786760_5786856:DUS3L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 5789565 T/C 1 26 22 48 12.2962987207812 11.5954395439544 0.700859176826766 T:C T C 10 0.527065433816109 0.885763109275193 ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5789218_5789730:DUS3L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 6374813 T/C 1 1 7 8 0.472934566183891 3.68945803671276 -3.21652347052887 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0307713746552577 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 6468907 G/A 1 54 68 122 25.5384665739301 35.8404494994954 -10.3019829255653 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0695180434276436 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6468857_6468964:DENND1C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 6495736 A/G 1 11 16 27 5.2022802280228 8.43304694105774 -3.23076671303494 A:G A G 10 0.527065433816109 0.249321234596434 ENSG00000104833:ENST00000264071:exon_6494331_6496232:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000411712:exon_6495175_6495767:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000412858:exon_6495175_6495861:TUBB4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 6665020 T/C 1 14 5 19 6.62108392657447 2.63532716908055 3.98575675749393 T:C T C 10 0.527065433816109 0.105309144964889 ENSG00000125735:ENST00000245912:exon_6664568_6665361:TNFSF14;ENSG00000125735:ENST00000366236:exon_6664568_6665361:TNFSF14;ENSG00000125735:ENST00000326176:exon_6664568_6665361:TNFSF14 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 6763718 A/G 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 A:G A G 10 0.527065433816109 0.488810537661758 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6763691_6763827:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6763691_6763827:SH2D3A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 6772872 G/C 1 10 18 28 4.72934566183891 9.48717780868996 -4.75783214685105 C:G G C 10 0.527065433816109 0.0880177854726634 ENSG00000141968:ENST00000304076:exon_6772722_6773022:VAV1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 7125297 G/A 1 11 9 20 5.2022802280228 4.74358890434498 0.45869132367782 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7125294_7125538:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7125294_7125538:INSR HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 7163140 T/G 1 13 5 18 6.14814936039058 2.63532716908055 3.51282219131004 T:G T G 10 0.527065433816109 0.104967213978269 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7163043_7163210:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7163043_7163210:INSR HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 7163154 G/A 1 14 6 20 6.62108392657447 3.16239260289665 3.45869132367782 A:G G A 10 0.527065433816109 0.177782475899471 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7163043_7163210:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7163043_7163210:INSR HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 7166376 C/T 1 12 7 19 5.67521479420669 3.68945803671276 1.98575675749393 T:C C T 10 0.527065433816109 0.491846751029638 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7166165_7166415:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7166165_7166415:INSR HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 7622226 G/A 1 3 6 9 1.41880369855167 3.16239260289665 -1.74358890434498 A:G G A 10 0.527065433816109 0.323067031523113 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 7623700 G/A 1 4 10 14 1.89173826473556 5.27065433816109 -3.37891607342553 A:G G A 10 0.527065433816109 0.10564189817501 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 7685843 G/A 1 63 62 125 29.7948776695851 32.6780568965988 -2.88317922701363 A:G G A 10 0.527065433816109 0.654462163849064 ENSG00000076924:ENST00000358368:exon_7685732_7685922:XAB2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 7689289 C/T 1 30 24 54 14.1880369855167 12.6495704115866 1.53846657393011 T:C C T 10 0.527065433816109 0.685648357642606 ENSG00000076924:ENST00000358368:exon_7689187_7689331:XAB2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 7706656 C/T 1 67 43 110 31.6866159343207 22.6638136540927 9.02280228022801 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0864994948347461 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7706591_7706739:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7706591_7706739:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7706591_7706739:STXBP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 7712193 G/A 1 12 6 18 5.67521479420669 3.16239260289665 2.51282219131004 A:G G A 10 0.527065433816109 0.345457652895314 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 7712277 A/G 1 92 36 128 43.509980088918 18.9743556173799 24.535624471538 A:G A G 10 0.527065433816109 1.16814618312461e-05 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7712240_7712397:STXBP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 7712585 T/G 1 11 9 20 5.2022802280228 4.74358890434498 0.45869132367782 T:G T G 10 0.527065433816109 1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 7762427 G/A 1 496 412 908 234.57554482721 217.150958732237 17.424586094973 A:T:G G A 10 0.527065433816109 0.258478011153883 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7762413_7762475:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7762413_7762475:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7762413_7762475:FCER2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 7986638 C/G 1 25 20 45 11.8233641545973 10.5413086763222 1.28205547827509 C:G C G 10 0.527065433816109 0.76625053826379 ENSG00000104976:ENST00000221573:exon_7986590_7986658:SNAPC2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 8367359 G/C 1 84 76 160 39.7265035594468 40.0569729700243 -0.33046941057745 C:G G C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000167775:ENST00000323539:exon_8367011_8367489:CD320;ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8367011_8367489:CD320 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 8367709 C/T 1 49 44 93 23.1737937430107 23.1908790879088 -0.0170853448981418 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000167775:ENST00000323539:exon_8367661_8367722:CD320;ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8367661_8367864:CD320 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 8368758 G/A 1 29 16 45 13.7151024193328 8.43304694105774 5.28205547827509 A:G G A 10 0.527065433816109 0.135457057717144 ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8368739_8368972:CD320 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 8368794 C/A 1 23 21 44 10.8774950222295 11.0683741101383 -0.190879087908797 A:C C A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8368739_8368972:CD320 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 8373152 T/C 1 21 12 33 9.93162588986171 6.32478520579331 3.6068406840684 T:C T C 10 0.527065433816109 0.226444851651302 ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8373033_8373239:CD320 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 8387820 A/T 1 10 7 17 4.72934566183891 3.68945803671276 1.03988762512615 A:T A T 10 0.527065433816109 0.637665492029096 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 8468337 C/T 1 160 141 301 75.6695305894225 74.3162261680714 1.35330442135117 T:C C T 10 0.527065433816109 0.908133720309112 ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 8468485 C/T 1 148 124 272 69.9943157952159 65.3561137931975 4.63820200201835 T:C C T 10 0.527065433816109 0.585209860527612 ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 8503345 G/C 1 17 7 24 8.03988762512615 3.68945803671276 4.35042958841338 A:C:G G C 10 0.527065433816109 0.100628513344123 ENSG00000099785:ENST00000381035:exon_8503272_8503895:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000215555:exon_8503272_8503895:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000393944:exon_8503272_8503895:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000429675:exon_8503272_8503895:MARCH2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 10218524 C/G 1 93 84 177 43.9829146551019 44.2734964405532 -0.290581785451302 C:G C G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000130810:ENST00000253107:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000342696:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000393793:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000446223:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000430370:exon_10218480_10218530:PPAN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 10221151 C/G 1 26 27 53 12.2962987207812 14.2307667130349 -1.93446799225378 C:G C G 10 0.527065433816109 0.680255744497599 ENSG00000130810:ENST00000486482:exon_10221134_10221290:PPAN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 10224526 C/T 1 80 98 178 37.8347652947113 51.6524125139787 -13.8176472192674 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0424744115041692 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 10224548 G/A 1 95 79 174 44.9287837874696 41.6381692714726 3.29061451599703 A:G G A 10 0.527065433816109 0.649061351123295 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 10225777 A/G 1 435 397 832 205.726536289993 209.244977224995 -3.51844093500273 A:T:G A G 10 0.527065433816109 0.808087644537453 ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11;ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10225690_10225805:EIF3G HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 10226256 A/G 1 240 243 483 113.504295884134 128.076900417315 -14.5726045331807 A:G A G 10 0.527065433816109 0.186599182270033 ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10226155_10226261:EIF3G HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 10415781 T/C 1 8 1 9 3.78347652947113 0.527065433816109 3.25641109565502 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0415432498690979 ENSG00000220201:ENST00000403903:exon_10415479_10415884:ZGLP1;ENSG00000220201:ENST00000480726:exon_10415479_10415884:ZGLP1;ENSG00000220201:ENST00000403352:exon_10415751_10415884:ZGLP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 10426422 A/C 1 9 6 15 4.25641109565502 3.16239260289665 1.09401849275836 A:C A C 10 0.527065433816109 0.615224246448703 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000492239:exon_10426381_10426471:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000494368:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426062_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426007_10426435:FDX1L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 10426628 T/C 1 6 7 13 2.83760739710335 3.68945803671276 -0.851850639609417 T:C T C 10 0.527065433816109 0.783042148004503 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426528_10426685:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426528_10426691:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426528_10426672:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426528_10426682:FDX1L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 10431799 G/T 1 52 41 93 24.5925974415623 21.6096827864605 2.98291465510186 T:G G T 10 0.527065433816109 0.603847124647687 ENSG00000161847:ENST00000293677:exon_10431724_10431935:RAVER1;ENSG00000161847:ENST00000331131:exon_10431766_10431935:RAVER1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 10444603 C/G 1 489 497 986 231.265002863923 261.951520606606 -30.6865177426835 A:T:C:G C G 10 0.527065433816109 0.0517097181096973 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10444454_10444735:ICAM3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 10445165 C/A 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 A:C C A 10 0.527065433816109 1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 10449465 C/A 1 133 116 249 62.9002973024575 61.1395903226686 1.76070697978885 A:C C A 10 0.527065433816109 0.849131139091637 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10449358_10449624:ICAM3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 10450236 C/T 1 184 140 324 87.0199601778359 73.7891607342553 13.2307994435807 T:C C T 10 0.527065433816109 0.148096605309523 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10450215_10450345:ICAM3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 10450285 G/A 1 101 47 148 47.766391184573 24.7720753893571 22.9943157952159 A:T:C:G G A 10 0.527065433816109 0.000140255697188427 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10450215_10450345:ICAM3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 10475649 C/T 1 17 14 31 8.03988762512615 7.37891607342553 0.66097155170062 T:C C T 10 0.527065433816109 0.858827214622317 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10475527_10475724:TYK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 10506101 C/T 1 47 42 89 22.2279246106429 22.1367482202766 0.0911763903662965 T:C C T 10 0.527065433816109 1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 10556897 C/T 1 7 5 12 3.31054196328724 2.63532716908055 0.675214794206692 T:C C T 10 0.527065433816109 0.778351128206284 ENSG00000065989:ENST00000380702:exon_10556894_10557085:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000352831:exon_10556894_10557085:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000293683:exon_10556894_10557085:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000440014:exon_10556894_10557085:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000419866:exon_10556894_10557085:PDE4A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 10668383 T/C 1 6 8 14 2.83760739710335 4.21652347052887 -1.37891607342553 T:C T C 10 0.527065433816109 0.59467204210446 ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668228_10668571:KRI1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 10668452 A/G 1 25 50 75 11.8233641545973 26.3532716908055 -14.5299075362082 A:G A G 10 0.527065433816109 0.00106096221157218 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10668445_10668571:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668228_10668571:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10668445_10668571:KRI1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 10672493 C/T 1 15 11 26 7.09401849275836 5.7977197719772 1.29629872078116 T:C C T 10 0.527065433816109 0.696440239382925 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000432197:exon_10672467_10672521:KRI1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 10676423 G/A 1 8 8 16 3.78347652947113 4.21652347052887 -0.433046941057745 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10676393_10676466:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10676393_10676466:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10676393_10676696:KRI1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 10939792 T/C 1 55 57 112 26.011401140114 30.0427297275182 -4.03132858740421 T:C T C 10 0.527065433816109 0.450782997303554 ENSG00000079805:ENST00000389252:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000389253:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000359692:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000314646:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000355667:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000408974:exon_10939712_10939944:DNM2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 11224265 A/G 1 9 7 16 4.25641109565502 3.68945803671276 0.566953058942256 A:G A G 10 0.527065433816109 0.808175848721287 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11224211_11224438:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11224211_11224438:LDLR HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 11226800 C/T 1 6 2 8 2.83760739710335 1.05413086763222 1.78347652947113 T:C C T 10 0.527065433816109 0.29481715391141 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11226770_11226888:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11226770_11226888:LDLR HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 11277232 G/A 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 A:G G A 10 0.527065433816109 0.757490641773051 ENSG00000197256:ENST00000355150:exon_11274943_11277287:KANK2;ENSG00000197256:ENST00000432929:exon_11274943_11277287:KANK2;ENSG00000197256:ENST00000439675:exon_11276266_11277287:KANK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 11319491 G/A 1 9 4 13 4.25641109565502 2.10826173526444 2.14814936039058 A:G G A 10 0.527065433816109 0.276012087147778 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11319362_11319505:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11319362_11319505:DOCK6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 11465316 G/C 1 19 25 44 8.98575675749393 13.1766358454027 -4.1908790879088 C:G G C 10 0.527065433816109 0.228563041881665 ENSG00000183401:ENST00000458408:exon_11465256_11465372:CCDC159;ENSG00000183401:ENST00000427879:exon_11465256_11465374:CCDC159 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 11470370 C/G 1 1 7 8 0.472934566183891 3.68945803671276 -3.21652347052887 C:G C G 10 0.527065433816109 0.0307713746552577 ENSG00000105520:ENST00000427915:exon_11470283_11470396:AC024575.1;ENSG00000105520:ENST00000251473:exon_11470208_11470396:AC024575.1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 12059645 A/G 1 10 5 15 4.72934566183891 2.63532716908055 2.09401849275836 A:G A G 10 0.527065433816109 0.312436282519101 ENSG00000196757:ENST00000254321:exon_12059091_12061578:ZNF700;ENSG00000196757:ENST00000482090:exon_12059091_12061588:ZNF700 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 13008607 G/T 1 23 31 54 10.8774950222295 16.3390284482994 -5.46153342606989 T:G G T 10 0.527065433816109 0.172379776379050 ENSG00000105607:ENST00000457854:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000222214:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000421816:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000422947:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000426001:exon_13008517_13008677:GCDH HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 13054781 G/T 1 651 681 1332 307.880402585713 358.93156042877 -51.0511578430572 T:G G T 10 0.527065433816109 0.00512506462437947 ENSG00000179218:ENST00000316448:exon_13054527_13055304:CALR HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 13220676 G/A 1 6 7 13 2.83760739710335 3.68945803671276 -0.851850639609417 A:G G A 10 0.527065433816109 0.783042148004503 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 13936385 C/T 1 2 8 10 0.945869132367782 4.21652347052887 -3.27065433816109 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0545836587495111 ENSG00000132003:ENST00000254323:exon_13936364_13936527:ZSWIM4;ENSG00000132003:ENST00000440752:exon_13936364_13936527:ZSWIM4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 14030689 T/C 1 7 19 26 3.31054196328724 10.0142432425061 -6.70370127921884 T:C T C 10 0.527065433816109 0.00990348032110563 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000397486:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14030631_14030764:CC2D1A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 14065341 T/C 1 15 12 27 7.09401849275836 6.32478520579331 0.769233286965056 T:C T C 10 0.527065433816109 0.848360844335184 ENSG00000132017:ENST00000254337:exon_14065338_14065473:DCAF15 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 14071071 G/A 1 11 4 15 5.2022802280228 2.10826173526444 3.09401849275836 A:G G A 10 0.527065433816109 0.126517172009480 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 14153293 T/C 1 11 25 36 5.2022802280228 13.1766358454027 -7.97435561737993 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0112179311892065 ENSG00000104998:ENST00000263379:exon_14153265_14153424:IL27RA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 14590236 C/T 1 7 6 13 3.31054196328724 3.16239260289665 0.148149360390583 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14590224_14590336:GIPC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 14590279 G/C 1 12 6 18 5.67521479420669 3.16239260289665 2.51282219131004 C:G G C 10 0.527065433816109 0.345457652895314 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14590224_14590336:GIPC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 14629171 C/T 1 25 17 42 11.8233641545973 8.96011237487385 2.86325177972342 T:C C T 10 0.527065433816109 0.440661082707359 ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14628951_14629201:DNAJB1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 14847013 G/C 1 2 7 9 0.945869132367782 3.68945803671276 -2.74358890434498 C:G G C 10 0.527065433816109 0.094465581682091 ENSG00000127507:ENST00000353005:exon_14843205_14847056:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000353876:exon_14843205_14847056:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392967:exon_14843205_14847056:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000346057:exon_14843205_14847056:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392965:exon_14843205_14847056:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000315576:exon_14843205_14847056:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000360222:exon_14843205_14847056:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392964:exon_14843205_14847056:EMR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 15226970 G/A 1 37 26 63 17.498578948804 13.7037012792188 3.79487766958513 A:G G A 10 0.527065433816109 0.378034230860026 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 15350594 G/A 1 44 37 81 20.8091209120912 19.501421051196 1.30769986089517 A:G G A 10 0.527065433816109 0.824261379059883 ENSG00000141867:ENST00000263377:exon_15350470_15350632:BRD4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 16259603 C/T 1 12 24 36 5.67521479420669 12.6495704115866 -6.97435561737992 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0285846957968839 ENSG00000196684:ENST00000253680:exon_16259534_16259685:HSH2D;ENSG00000196684:ENST00000397372:exon_16259534_16259685:HSH2D HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 16339715 C/T 1 21 35 56 9.93162588986171 18.4472901835638 -8.51566429370211 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0313171976814825 ENSG00000072958:ENST00000291439:exon_16339581_16339739:AP1M1;ENSG00000072958:ENST00000444449:exon_16339581_16339739:AP1M1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 16611978 T/C 1 5 5 10 2.36467283091945 2.63532716908055 -0.270654338161091 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000105072:ENST00000221671:exon_16611603_16612362:C19orf44 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 16666101 G/C 1 7 10 17 3.31054196328724 5.27065433816109 -1.96011237487385 T:C:G G C 10 0.527065433816109 0.467399584608424 ENSG00000127526:ENST00000436494:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000409648:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000248069:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000421082:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000469055:exon_16665963_16666412:SLC35E1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 17170885 C/T 1 7 4 11 3.31054196328724 2.10826173526444 1.2022802280228 T:C C T 10 0.527065433816109 0.555399509917260 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17170807_17170899:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17170807_17170902:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000335009:exon_17170807_17170902:HAUS8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 17305440 T/C 1 26 25 51 12.2962987207812 13.1766358454027 -0.880337124621562 T:C T C 10 0.527065433816109 0.888692505225519 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 17306031 T/C 1 67 69 136 31.6866159343207 36.3675149333115 -4.68089899899083 T:C:G T C 10 0.527065433816109 0.440301876486986 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 17312992 C/T 1 49 29 78 23.1737937430107 15.2848975806672 7.88889616234349 T:C C T 10 0.527065433816109 0.088409846267475 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17312939_17313112:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17312939_17313112:MYO9B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 17316782 T/C 1 46 37 83 21.754990044459 19.501421051196 2.25356899326295 T:C T C 10 0.527065433816109 0.660977384666012 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17316769_17316961:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17316769_17316961:MYO9B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 17317955 A/G 1 34 19 53 16.0797752502523 10.0142432425061 6.06553200774622 A:G A G 10 0.527065433816109 0.100323714240355 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17317922_17318053:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17317922_17318053:MYO9B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 17337557 G/T 1 25 9 34 11.8233641545973 4.74358890434498 7.07977525025229 T:G G T 10 0.527065433816109 0.0159010908484800 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337502_17337678:OCEL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 17337928 C/T 1 19 8 27 8.98575675749393 4.21652347052887 4.76923328696506 A:T:C C T 10 0.527065433816109 0.082110621308263 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 17395055 C/G 1 8 2 10 3.78347652947113 1.05413086763222 2.72934566183891 C:G C G 10 0.527065433816109 0.114525614534534 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17394898_17395075:ANKLE1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 17412366 G/A 1 6 6 12 2.83760739710335 3.16239260289665 -0.324785205793308 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000127220:ENST00000247706:exon_17411665_17412433:ABHD8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 17412399 G/A 1 5 5 10 2.36467283091945 2.63532716908055 -0.270654338161091 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000127220:ENST00000247706:exon_17411665_17412433:ABHD8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 17424897 C/T 1 53 55 108 25.0655320077462 28.988598859886 -3.92306685213978 T:C C T 10 0.527065433816109 0.500156126352932 ENSG00000130311:ENST00000359866:exon_17424832_17424912:DDA1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 17448961 A/C 1 15 11 26 7.09401849275836 5.7977197719772 1.29629872078116 A:C A C 10 0.527065433816109 0.696440239382925 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17448817_17449064:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17448817_17449064:GTPBP3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 17450016 T/C 1 7 13 20 3.31054196328724 6.85185063960942 -3.54130867632218 T:C T C 10 0.527065433816109 0.122410043320359 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17449763_17450075:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17449932_17450075:GTPBP3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 17451981 G/A 0 52 0 52 24.5925974415623 0 24.5925974415623 G G 10 0.527065433816109 4.16783851507582e-15 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17451853_17452131:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17451853_17452131:GTPBP3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 17533126 A/G 1 7 15 22 3.31054196328724 7.90598150724164 -4.5954395439544 A:G A G 10 0.527065433816109 0.05593119353183 ENSG00000141971:ENST00000524382:exon_17533094_17533267:FAM125A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 17648350 T/C 1 10 10 20 4.72934566183891 5.27065433816109 -0.541308676322181 T:C T C 10 0.527065433816109 0.826649432830958 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17648185_17648352:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17648185_17648352:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17648185_17648352:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17648185_17648352:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000300971:exon_17648185_17648352:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000435646:exon_17648185_17648352:FAM129C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 17651370 A/G 1 17 6 23 8.03988762512615 3.16239260289665 4.87749502222949 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0580867060926943 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000300971:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000435646:exon_17651201_17651391:FAM129C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 17664090 C/T 1 32 36 68 15.1339061178845 18.9743556173799 -3.84044949949541 T:C C T 10 0.527065433816109 0.395689797058548 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 17692127 C/T 1 20 31 51 9.45869132367782 16.3390284482994 -6.88033712462156 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0673969500240361 ENSG00000130309:ENST00000252599:exon_17691986_17693965:GLT25D1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 17837981 A/G 1 50 30 80 23.6467283091945 15.8119630144833 7.83476529471127 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0926541151097181 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 17845156 G/A 1 44 52 96 20.8091209120912 27.4074025584377 -6.59828164634647 A:G G A 10 0.527065433816109 0.18503265364493 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17845082_17845322:MAP1S HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 17885880 C/T 1 6 5 11 2.83760739710335 2.63532716908055 0.202280228022801 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17885865_17885889:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17885865_17885889:FCHO1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 17892591 A/G 1 15 5 20 7.09401849275836 2.63532716908055 4.45869132367782 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0705444615831227 ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17892521_17892629:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17892521_17892629:FCHO1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 18186618 T/C 1 4 6 10 1.89173826473556 3.16239260289665 -1.27065433816109 T:C T C 10 0.527065433816109 0.532268681489131 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18186559_18186678:IL12RB1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 18191664 C/G 1 7 4 11 3.31054196328724 2.10826173526444 1.2022802280228 C:G C G 10 0.527065433816109 0.555399509917260 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18191642_18191811:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18191642_18191811:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18191642_18191811:IL12RB1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 18234441 C/T 1 2 8 10 0.945869132367782 4.21652347052887 -3.27065433816109 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0545836587495111 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18234390_18234465:MAST3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 18255359 G/A 1 11 5 16 5.2022802280228 2.63532716908055 2.56695305894226 A:G G A 10 0.527065433816109 0.220807585221878 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18255276_18255503:MAST3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 18257750 C/T 1 3 7 10 1.41880369855167 3.68945803671276 -2.27065433816109 T:C C T 10 0.527065433816109 0.207504053786451 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18257691_18257827:MAST3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 18285944 G/A 1 419 324 743 198.15958323105 170.769200556419 27.390382674631 A:T:G G A 10 0.527065433816109 0.0471911736759293 ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18285850_18286032:IFI30 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 18288069 A/G 1 759 682 1441 358.957335733573 359.458625862586 -0.501290129013114 A:T:G A G 10 0.527065433816109 0.978960486394622 ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18287950_18288102:IFI30 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 18304700 A/G 1 13 20 33 6.14814936039058 10.5413086763222 -4.3931593159316 A:G A G 10 0.527065433816109 0.162357439542855 ENSG00000254858:ENST00000534421:exon_18304674_18304970:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000417827:exon_18304674_18304828:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000445735:exon_18304674_18304844:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000533807:exon_18304042_18304844:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000532896:exon_18304042_18304844:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000247712:exon_18304674_18304844:AC068499.1;ENSG00000127226:ENST00000534474:exon_18304674_18304833:MPV17L2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 18305824 C/T 1 15 20 35 7.09401849275836 10.5413086763222 -3.44729018356382 A:T:C C T 10 0.527065433816109 0.309807945350998 ENSG00000254858:ENST00000417827:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000445735:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000533807:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000532896:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000247712:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000127226:ENST00000534474:exon_18305768_18305896:MPV17L2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 19136541 C/T 1 26 12 38 12.2962987207812 6.32478520579331 5.97151351498786 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0725244522356651 ENSG00000064607:ENST00000337018:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000330854:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000452918:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000392342:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000424153:exon_19135428_19137035:SUGP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 19230868 A/G 1 51 40 91 24.1196628753784 21.0826173526444 3.03704552273408 A:G A G 10 0.527065433816109 0.531126976362322 ENSG00000064545:ENST00000450333:exon_19230429_19230992:TMEM161A;ENSG00000064545:ENST00000162044:exon_19230429_19230992:TMEM161A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 19606634 G/A 1 32 16 48 15.1339061178845 8.43304694105774 6.70085917682677 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0600179568927337 ENSG00000167491:ENST00000360315:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000252577:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000429563:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000404158:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000358713:exon_19606563_19606694:GATAD2A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 19740729 C/G 1 125 157 282 59.1168207729864 82.7492731091291 -23.6324523361427 C:G C G 10 0.527065433816109 0.00502753049644179 ENSG00000089639:ENST00000203556:exon_19740288_19741145:GMIP;ENSG00000089639:ENST00000445806:exon_19740288_19741145:GMIP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 19789528 A/G 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 A:G A G 10 0.527065433816109 1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 20003109 A/G 1 4 10 14 1.89173826473556 5.27065433816109 -3.37891607342553 A:G A G 10 0.527065433816109 0.10564189817501 ENSG00000213988:ENST00000355650:exon_20002283_20004292:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000355095:exon_20003002_20003556:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000427401:exon_20003035_20003166:ZNF90 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 20044886 T/C 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000213988:ENST00000427325:exon_20043991_20045259:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000343769:exon_20043991_20045766:ZNF90 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 21132211 A/T 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 A:T A T 10 0.527065433816109 0.757490641773051 ENSG00000105750:ENST00000328178:exon_21131550_21133501:ZNF85;ENSG00000105750:ENST00000345030:exon_21131550_21133108:ZNF85 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 21132394 C/T 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000105750:ENST00000328178:exon_21131550_21133501:ZNF85;ENSG00000105750:ENST00000345030:exon_21131550_21133108:ZNF85 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 21132751 A/T 1 5 5 10 2.36467283091945 2.63532716908055 -0.270654338161091 A:T A T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000105750:ENST00000328178:exon_21131550_21133501:ZNF85;ENSG00000105750:ENST00000345030:exon_21131550_21133108:ZNF85 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 21133129 T/C 1 9 5 14 4.25641109565502 2.63532716908055 1.62108392657447 T:C T C 10 0.527065433816109 0.433551468090942 ENSG00000105750:ENST00000328178:exon_21131550_21133501:ZNF85 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 21300462 A/G 0 9 0 9 4.25641109565502 0 4.25641109565502 A A 10 0.527065433816109 0.0043225365335067 ENSG00000160352:ENST00000343332:exon_21299613_21301019:ZNF714;ENSG00000160352:ENST00000291770:exon_21299613_21307879:ZNF714 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 21990638 T/C 1 13 17 30 6.14814936039058 8.96011237487385 -2.81196301448327 T:C T C 10 0.527065433816109 0.361765470838631 ENSG00000198521:ENST00000397148:exon_21990085_21992609:ZNF43;ENSG00000198521:ENST00000354959:exon_21990128_21992609:ZNF43 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 23542697 G/C 1 10 10 20 4.72934566183891 5.27065433816109 -0.541308676322181 C:G G C 10 0.527065433816109 0.826649432830958 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 23543095 T/C 1 14 9 23 6.62108392657447 4.74358890434498 1.87749502222949 T:C T C 10 0.527065433816109 0.532747084553437 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 23545004 G/A 1 6 5 11 2.83760739710335 2.63532716908055 0.202280228022801 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 23545447 A/G 1 4 8 12 1.89173826473556 4.21652347052887 -2.32478520579331 A:G A G 10 0.527065433816109 0.248670873824186 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 24310032 A/T 1 14 9 23 6.62108392657447 4.74358890434498 1.87749502222949 A:T A T 10 0.527065433816109 0.532747084553437 ENSG00000213096:ENST00000357002:exon_24309056_24312643:ZNF254 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 30314666 C/T 1 37 33 70 17.498578948804 17.3931593159316 0.105419632872369 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000105173:ENST00000262643:exon_30314562_30315216:CCNE1;ENSG00000105173:ENST00000357943:exon_30314562_30315216:CCNE1;ENSG00000105173:ENST00000444983:exon_30314562_30315216:CCNE1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 33183291 G/A 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 A:G G A 10 0.527065433816109 0.488810537661758 ENSG00000213965:ENST00000397061:exon_33182867_33183580:NUDT19 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 33183316 A/G 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000213965:ENST00000397061:exon_33182867_33183580:NUDT19 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 33608733 C/A 1 9 1 10 4.25641109565502 0.527065433816109 3.72934566183891 A:C C A 10 0.527065433816109 0.0232976587027389 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33608731_33608947:GPATCH1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 33878198 A/G 1 26 29 55 12.2962987207812 15.2848975806672 -2.988598859886 A:G A G 10 0.527065433816109 0.422097833598551 ENSG00000124299:ENST00000397032:exon_33877865_33878387:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000436370:exon_33877865_33878387:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000244137:exon_33877865_33878387:PEPD HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 34872382 G/A 1 218 198 416 103.099735428088 104.35895589559 -1.25922046750136 A:G G A 10 0.527065433816109 0.921804345184901 ENSG00000105220:ENST00000415930:exon_34872371_34872424:GPI;ENSG00000105220:ENST00000356487:exon_34872371_34872424:GPI;ENSG00000105220:ENST00000414931:exon_34872371_34872424:GPI HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 34959979 A/G 1 169 120 289 79.9259416850776 63.2478520579331 16.6780896271445 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0518643543944043 ENSG00000126261:ENST00000246548:exon_34959945_34960795:UBA2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 35175775 C/T 1 22 15 37 10.4045604560456 7.90598150724164 2.49857894880397 T:C C T 10 0.527065433816109 0.510756997645196 ENSG00000089335:ENST00000457781:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000527499:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505242:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000525595:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000423823:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000221282:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000446502:exon_35175157_35177237:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505365:exon_35175098_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000509196:exon_35175157_35177296:ZNF302 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 35512766 C/T 1 61 45 106 28.8490085372173 23.7179445217249 5.13106401549244 T:C C T 10 0.527065433816109 0.332087596763077 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35512595_35512768:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35512595_35512768:GRAMD1A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 35660508 G/A 1 344 306 650 162.689490767258 161.282022747729 1.40746801952912 A:G G A 10 0.527065433816109 0.937391941543517 ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35660469_35660786:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35660469_35660536:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35660469_35660783:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392217:exon_35660469_35660784:FXYD5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 35741456 T/C 1 13 12 25 6.14814936039058 6.32478520579331 -0.176635845402726 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35741228_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35741218_35741562:LSR HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 35828619 T/C 1 13 19 32 6.14814936039058 10.0142432425061 -3.86609388211549 T:C T C 10 0.527065433816109 0.215046593941621 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 35828773 C/T 1 119 102 221 56.279213375883 53.7606742492431 2.5185391266399 T:C C T 10 0.527065433816109 0.787644698750707 ENSG00000012124:ENST00000085219:exon_35828658_35828924:CD22;ENSG00000012124:ENST00000419549:exon_35828658_35828924:CD22;ENSG00000012124:ENST00000270311:exon_35828658_35828924:CD22 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 35836530 G/A 1 245 217 462 115.868968715053 114.373199138096 1.49576957695763 A:G G A 10 0.527065433816109 0.925769990406845 ENSG00000012124:ENST00000085219:exon_35836505_35836623:CD22;ENSG00000012124:ENST00000341773:exon_35836505_35836623:CD22;ENSG00000012124:ENST00000419549:exon_35836505_35836623:CD22 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 36038390 A/G 1 38 54 92 17.9715135149879 28.4615334260699 -10.490019911082 A:C:G A G 10 0.527065433816109 0.0362002976039143 ENSG00000105677:ENST00000392204:exon_36038226_36038397:TMEM147;ENSG00000105677:ENST00000222284:exon_36038226_36038428:TMEM147 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 36206050 A/C 1 130 135 265 61.4814936039058 71.1538335651747 -9.6723399612689 A:C A C 10 0.527065433816109 0.242747323385877 ENSG00000011590:ENST00000262630:exon_36205425_36206409:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000481182:exon_36205425_36206409:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000392197:exon_36205529_36206409:ZBTB32 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 36207336 G/C 1 38 44 82 17.9715135149879 23.1908790879088 -5.21936557292094 A:C:G G C 10 0.527065433816109 0.269463031590272 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 36218478 C/T 1 5 5 10 2.36467283091945 2.63532716908055 -0.270654338161091 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36218339_36218523:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36218339_36218523:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36218339_36218523:AD000671.3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 36222857 C/T 1 1 16 17 0.472934566183891 8.43304694105774 -7.96011237487385 T:C C T 10 0.527065433816109 7.77776455483336e-05 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36222809_36223036:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36222809_36223036:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36222809_36223036:AD000671.3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 36223747 A/G 1 6 9 15 2.83760739710335 4.74358890434498 -1.90598150724164 A:G A G 10 0.527065433816109 0.439435430476406 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36223116_36224409:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36223116_36224409:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36223116_36224409:AD000671.3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 36224161 C/A 1 16 6 22 7.56695305894226 3.16239260289665 4.4045604560456 A:C C A 10 0.527065433816109 0.085542216220796 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36223116_36224409:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36223116_36224409:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36223116_36224409:AD000671.3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 36230767 A/G 1 98 85 183 46.3475874860213 44.8005618743693 1.54702561165205 A:G A G 10 0.527065433816109 0.824750533373724 ENSG00000126246:ENST00000246532:exon_36230611_36230989:TMEM149 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 36258721 C/T 1 5 8 13 2.36467283091945 4.21652347052887 -1.85185063960942 T:C C T 10 0.527065433816109 0.407023665875808 ENSG00000167595:ENST00000396911:exon_36258705_36258967:C19orf55;ENSG00000167595:ENST00000396908:exon_36258705_36258938:C19orf55 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 36258842 G/C 1 5 7 12 2.36467283091945 3.68945803671276 -1.32478520579331 C:G G C 10 0.527065433816109 0.566621218006073 ENSG00000167595:ENST00000396911:exon_36258705_36258967:C19orf55;ENSG00000167595:ENST00000396908:exon_36258705_36258938:C19orf55 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 36594369 C/T 1 15 7 22 7.09401849275836 3.68945803671276 3.4045604560456 T:C C T 10 0.527065433816109 0.199603075522895 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36594245_36594883:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36594245_36594883:WDR62 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 36595436 A/C 1 12 13 25 5.67521479420669 6.85185063960942 -1.17663584540273 A:C A C 10 0.527065433816109 0.691622871057986 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36595420_36595577:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36595420_36595577:WDR62 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 36727365 G/A 1 37 39 76 17.498578948804 20.5555519188283 -3.05697297002429 A:G G A 10 0.527065433816109 0.492917432827855 ENSG00000167635:ENST00000428827:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000456324:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000443387:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000301233:exon_36726561_36729673:ZNF146 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 37038092 T/C 1 5 5 10 2.36467283091945 2.63532716908055 -0.270654338161091 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000186020:ENST00000396897:exon_37034518_37039224:ZNF529;ENSG00000186020:ENST00000334116:exon_37034518_37039224:ZNF529 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 37309784 A/G 1 3 6 9 1.41880369855167 3.16239260289665 -1.74358890434498 A:G A G 10 0.527065433816109 0.323067031523113 ENSG00000197863:ENST00000356725:exon_37309224_37311016:ZNF790 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 37310886 G/A 1 7 3 10 3.31054196328724 1.58119630144833 1.72934566183891 A:G G A 10 0.527065433816109 0.350932787230552 ENSG00000197863:ENST00000356725:exon_37309224_37311016:ZNF790;ENSG00000197863:ENST00000528994:exon_37310709_37311016:ZNF790;ENSG00000197863:ENST00000525288:exon_37310839_37311016:ZNF790 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 37853366 G/C 1 18 11 29 8.51282219131004 5.7977197719772 2.71510241933284 C:G G C 10 0.527065433816109 0.355748397679087 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853011_37853489:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 37853375 T/C 1 17 11 28 8.03988762512615 5.7977197719772 2.24216785314895 T:C T C 10 0.527065433816109 0.45216611994601 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853011_37853489:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 37854235 G/T 1 33 33 66 15.6068406840684 17.3931593159316 -1.7863186318632 T:G G T 10 0.527065433816109 0.712114541327499 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 38652993 C/T 1 12 6 18 5.67521479420669 3.16239260289665 2.51282219131004 T:C C T 10 0.527065433816109 0.345457652895314 ENSG00000105738:ENST00000222345:exon_38652893_38653011:SIPA1L3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 38800165 C/T 1 41 43 84 19.3903172135395 22.6638136540927 -3.27349644055316 T:C C T 10 0.527065433816109 0.512725735222643 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 38800176 G/A 1 39 36 75 18.4444480811717 18.9743556173799 -0.529907536208178 A:G G A 10 0.527065433816109 0.908514468867745 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 38893856 G/C 1 12 13 25 5.67521479420669 6.85185063960942 -1.17663584540273 C:G G C 10 0.527065433816109 0.691622871057986 ENSG00000130244:ENST00000343358:exon_38893775_38893858:FAM98C;ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38893775_38893858:FAM98C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 39092142 C/T 1 75 55 130 35.4700924637918 28.988598859886 6.48149360390583 T:C C T 10 0.527065433816109 0.291849875475931 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39092081_39092165:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39092081_39092165:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39092081_39092165:MAP4K1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 39196745 C/T 1 38 22 60 17.9715135149879 11.5954395439544 6.37607397103346 T:C C T 10 0.527065433816109 0.120265455876735 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000445727:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000495553:exon_39196684_39196771:ACTN4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 39224413 A/G 1 7 5 12 3.31054196328724 2.63532716908055 0.675214794206692 A:G A G 10 0.527065433816109 0.778351128206284 ENSG00000182472:ENST00000328867:exon_39224343_39224421:CAPN12 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 39322087 T/G 1 166 185 351 78.5071379865259 97.5071052559802 -18.9999672694543 T:G T G 10 0.527065433816109 0.0477942157979494 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39321949_39322156:ECH1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 39868269 G/A 1 10 6 16 4.72934566183891 3.16239260289665 1.56695305894226 A:G G A 10 0.527065433816109 0.465150778014472 ENSG00000179134:ENST00000314471:exon_39868125_39868464:SAMD4B;ENSG00000179134:ENST00000429637:exon_39868125_39868464:SAMD4B;ENSG00000179134:ENST00000392067:exon_39868125_39868464:SAMD4B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 39913634 G/A 1 17 30 47 8.03988762512615 15.8119630144833 -7.77207538935713 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0277560628632119 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39913372_39914293:PLEKHG2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 39914748 G/A 1 44 29 73 20.8091209120912 15.2848975806672 5.52422333142404 A:G G A 10 0.527065433816109 0.199872061103863 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 39915637 G/A 1 40 39 79 18.9173826473556 20.5555519188283 -1.63816927147262 A:G G A 10 0.527065433816109 0.736307637474676 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 39915758 C/G 1 65 50 115 30.7407468019529 26.3532716908055 4.38747511114746 C:G C G 10 0.527065433816109 0.455290213085148 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 39924129 T/C 1 17 16 33 8.03988762512615 8.43304694105774 -0.393159315931598 T:C T C 10 0.527065433816109 1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 39926509 A/C 1 2189 1712 3901 1035.25376537654 902.336022693179 132.917742683359 A:T:C A C 10 0.527065433816109 1.98782153841350e-05 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 39926521 G/A 1 2101 1655 3756 993.635523552355 872.29329296566 121.342230586694 A:T:C:G G A 10 0.527065433816109 7.62886709084804e-05 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 39963828 T/A 1 4 8 12 1.89173826473556 4.21652347052887 -2.32478520579331 A:T T A 10 0.527065433816109 0.248670873824186 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 40199914 C/G 1 15 2 17 7.09401849275836 1.05413086763222 6.03988762512615 C:G C G 10 0.527065433816109 0.00291025365992467 ENSG00000006659:ENST00000392052:exon_40199837_40200087:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000360675:exon_40199837_40200087:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000392051:exon_40199837_40200087:LGALS14 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 40928944 A/G 1 14 16 30 6.62108392657447 8.43304694105774 -1.81196301448327 A:G A G 10 0.527065433816109 0.584756224731591 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 40929363 T/C 1 33 28 61 15.6068406840684 14.7578321468511 0.849008537217349 T:C T C 10 0.527065433816109 0.89821356604899 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 40964312 G/A 1 20 20 40 9.45869132367782 10.5413086763222 -1.08261735264436 A:G G A 10 0.527065433816109 0.753743095912526 ENSG00000090013:ENST00000263368:exon_40964288_40964452:BLVRB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 41128309 C/T 1 8 13 21 3.78347652947113 6.85185063960942 -3.06837411013829 T:C C T 10 0.527065433816109 0.196016840944122 ENSG00000090006:ENST00000204005:exon_41128306_41128572:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000308370:exon_41128306_41128572:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000396819:exon_41128306_41128572:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41128306_41128572:LTBP4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 41128415 G/A 1 4 5 9 1.89173826473556 2.63532716908055 -0.743588904344981 A:G G A 10 0.527065433816109 0.743612144716174 ENSG00000090006:ENST00000204005:exon_41128306_41128572:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000308370:exon_41128306_41128572:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000396819:exon_41128306_41128572:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41128306_41128572:LTBP4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 41129842 C/T 1 13 5 18 6.14814936039058 2.63532716908055 3.51282219131004 T:C C T 10 0.527065433816109 0.104967213978269 ENSG00000090006:ENST00000204005:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000308370:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000396819:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41129841_41129987:LTBP4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 41211056 T/C 1 12 4 16 5.67521479420669 2.10826173526444 3.56695305894226 T:C T C 10 0.527065433816109 0.083657893276571 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41211001_41211086:ADCK4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 41263403 A/G 1 152 126 278 71.8860540599514 66.4102446608297 5.47580939912169 A:G A G 10 0.527065433816109 0.548161748002245 ENSG00000077312:ENST00000243563:exon_41263237_41263409:SNRPA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 41271104 T/C 1 115 85 200 54.3874751111475 44.8005618743693 9.58691323677819 T:C T C 10 0.527065433816109 0.179106005261620 ENSG00000077312:ENST00000243563:exon_41270913_41271290:SNRPA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 41307170 G/A 1 49 44 93 23.1737937430107 23.1908790879088 -0.0170853448981418 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000171570:ENST00000303961:exon_41306244_41307320:EGLN2;ENSG00000171570:ENST00000406058:exon_41306181_41307320:EGLN2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 41313202 C/A 1 7 4 11 3.31054196328724 2.10826173526444 1.2022802280228 A:C C A 10 0.527065433816109 0.555399509917260 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 41869392 T/C 1 11 6 17 5.2022802280228 3.16239260289665 2.03988762512615 T:C T C 10 0.527065433816109 0.344390478204234 ENSG00000123810:ENST00000243578:exon_41869337_41869428:B9D2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 41889748 T/C 1 12 14 26 5.67521479420669 7.37891607342553 -1.70370127921883 T:C T C 10 0.527065433816109 0.558800654726479 ENSG00000142046:ENST00000392002:exon_41889620_41889985:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000356385:exon_41889466_41889985:TMEM91 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 41903220 G/A 1 25 40 65 11.8233641545973 21.0826173526444 -9.25925319804709 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0249000141384011 ENSG00000077348:ENST00000221233:exon_41903086_41903256:EXOSC5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 41928652 C/T 1 55 43 98 26.011401140114 22.6638136540927 3.34758748602131 T:C C T 10 0.527065433816109 0.544335384735049 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41928534_41928675:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41928534_41928675:BCKDHA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 41930396 A/G 1 141 94 235 66.6837738319286 49.5441507787142 17.1396230532144 A:C:G A G 10 0.527065433816109 0.0262789911433661 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41930343_41930909:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41930343_41930906:BCKDHA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 41939297 C/G 1 18 23 41 8.51282219131004 12.1225049777705 -3.60968278646047 C:G C G 10 0.527065433816109 0.276679885087024 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41939177_41939339:ATP5SL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 41944237 T/C 1 23 9 32 10.8774950222295 4.74358890434498 6.13390611788451 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0333712788581583 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000301183:exon_41944123_41944319:ATP5SL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 42463447 C/T 1 37 77 114 17.498578948804 40.5840384038404 -23.0854594550364 T:C C T 10 0.527065433816109 1.90437394419601e-05 ENSG00000105404:ENST00000222008:exon_42463389_42463528:RABAC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 42799049 C/T 1 38 35 73 17.9715135149879 18.4472901835638 -0.475776668575961 T:C C T 10 0.527065433816109 0.907418998595416 ENSG00000079432:ENST00000160740:exon_42798976_42799949:CIC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 43979589 G/T 1 15 12 27 7.09401849275836 6.32478520579331 0.769233286965056 T:G G T 10 0.527065433816109 0.848360844335184 ENSG00000176531:ENST00000292140:exon_43979255_43979696:PHLDB3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 44031324 C/T 1 22 19 41 10.4045604560456 10.0142432425061 0.390317213539529 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000105755:ENST00000292147:exon_44031249_44031396:ETHE1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 44237525 C/T 1 17 32 49 8.03988762512615 16.8660938821155 -8.82620625698934 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0143174282933401 ENSG00000105771:ENST00000270066:exon_44237476_44237604:C19orf61 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 44611957 T/C 1 8 7 15 3.78347652947113 3.68945803671276 0.0940184927583645 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 45854919 T/G 1 23 16 39 10.8774950222295 8.43304694105774 2.44444808117175 T:G T G 10 0.527065433816109 0.521907979788335 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45854853_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45854853_45854979:ERCC2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 45855524 G/A 1 41 21 62 19.3903172135395 11.0683741101383 8.32194310340124 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0411608678528056 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45855467_45855610:ERCC2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 46057081 A/G 1 2 7 9 0.945869132367782 3.68945803671276 -2.74358890434498 A:G A G 10 0.527065433816109 0.094465581682091 ENSG00000125741:ENST00000263275:exon_46052412_46057169:OPA3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 46181392 G/C 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 T:C:G G C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000010310:ENST00000263281:exon_46181346_46181484:GIPR HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 46275976 G/C 1 10 12 22 4.72934566183891 6.32478520579331 -1.5954395439544 C:G G C 10 0.527065433816109 0.528175996250381 ENSG00000104936:ENST00000458663:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000447742:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000291270:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000377750:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000342805:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000343373:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000348168:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000354227:exon_46275899_46276010:DMPK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 46327053 C/T 1 28 27 55 13.2421678531489 14.2307667130349 -0.988598859885997 T:C C T 10 0.527065433816109 0.789149255611955 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46327025_46327133:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46327025_46327133:SYMPK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 46518651 A/G 1 9 14 23 4.25641109565502 7.37891607342553 -3.12250497777051 A:G A G 10 0.527065433816109 0.214605087918318 ENSG00000104983:ENST00000263284:exon_46518603_46518685:CCDC61 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 46518682 G/A 1 10 13 23 4.72934566183891 6.85185063960942 -2.12250497777051 A:G G A 10 0.527065433816109 0.409255873477579 ENSG00000104983:ENST00000263284:exon_46518603_46518685:CCDC61 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 47137459 C/T 1 8 7 15 3.78347652947113 3.68945803671276 0.0940184927583645 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000167414:ENST00000300873:exon_47137333_47137461:GNG8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 47282162 G/A 1 77 65 142 36.4159615961596 34.2592531980471 2.15670839811251 A:G G A 10 0.527065433816109 0.737363755281835 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47281932_47282165:SLC1A5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 47569826 G/A 1 22 18 40 10.4045604560456 9.48717780868996 0.917382647355639 A:G G A 10 0.527065433816109 0.874517876555203 ENSG00000130749:ENST00000253048:exon_47567449_47571126:ZC3H4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 47585517 G/C 1 7 3 10 3.31054196328724 1.58119630144833 1.72934566183891 C:G G C 10 0.527065433816109 0.350932787230552 ENSG00000130749:ENST00000253048:exon_47585441_47585552:ZC3H4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 47978638 C/T 1 14 11 25 6.62108392657447 5.7977197719772 0.823364154597274 T:C C T 10 0.527065433816109 0.84228244308015 ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47978400_47978801:KPTN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 48259220 C/T 1 5 6 11 2.36467283091945 3.16239260289665 -0.797719771977199 T:C C T 10 0.527065433816109 0.765666449819686 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 48598823 A/G 0 11 0 11 5.2022802280228 0 5.2022802280228 A A 10 0.527065433816109 0.00113672191344106 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48598721_48598861:PLA2G4C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 48601512 G/A 1 20 1 21 9.45869132367782 0.527065433816109 8.93162588986171 A:G G A 10 0.527065433816109 3.22428843203162e-05 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48601396_48601516:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48601364_48601516:PLA2G4C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 48622427 A/G 1 26 37 63 12.2962987207812 19.501421051196 -7.20512233041487 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0773145651574367 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48622394_48622447:LIG1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 48654553 G/T 1 12 12 24 5.67521479420669 6.32478520579331 -0.649570411586616 T:G G T 10 0.527065433816109 0.83992621234606 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48654489_48654596:LIG1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 48668830 G/A 1 12 15 27 5.67521479420669 7.90598150724164 -2.23076671303494 A:G G A 10 0.527065433816109 0.443412923825397 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48668807_48668880:LIG1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 49300605 T/C 1 10 5 15 4.72934566183891 2.63532716908055 2.09401849275836 T:C T C 10 0.527065433816109 0.312436282519101 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 49339098 T/C 1 7 13 20 3.31054196328724 6.85185063960942 -3.54130867632218 T:C T C 10 0.527065433816109 0.122410043320359 ENSG00000087076:ENST00000263278:exon_49339062_49339100:HSD17B14 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 49376582 G/A 1 36 48 84 17.0256443826201 25.2991408231732 -8.27349644055316 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0801602270757512 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 49377086 T/C 1 129 120 249 61.0085590377219 63.2478520579331 -2.23929302021116 T:C T C 10 0.527065433816109 0.799749625620782 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 49377242 G/C 1 146 128 274 69.0484466628481 67.464375528462 1.58407113438612 C:G G C 10 0.527065433816109 0.856218328159033 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 49377319 A/G 1 132 115 247 62.4273627362736 60.6125248888525 1.81483784742107 A:G A G 10 0.527065433816109 0.848498624384229 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 49377436 G/C 1 105 133 238 49.6581294493086 70.0997026975425 -20.4415732482339 C:G G C 10 0.527065433816109 0.00927554151602881 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 49378994 A/G 1 105 105 210 49.6581294493086 55.3418705506914 -5.68374110138289 A:C:G A G 10 0.527065433816109 0.447593150151003 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 49379167 C/T 1 124 119 243 58.6438862068025 62.720786624117 -4.0769004173145 T:C C T 10 0.527065433816109 0.607843534869041 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 49379182 G/C 1 143 113 256 67.6296429642964 59.5583940212203 8.07124894307609 C:G G C 10 0.527065433816109 0.317354837910742 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 49459104 A/G 1 12 6 18 5.67521479420669 3.16239260289665 2.51282219131004 A:G A G 10 0.527065433816109 0.345457652895314 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 49485548 G/A 1 9 11 20 4.25641109565502 5.7977197719772 -1.54130867632218 A:G G A 10 0.527065433816109 0.510653805220797 ENSG00000104812:ENST00000323798:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000263276:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000484289:exon_49485512_49485632:GYS1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 49489229 C/T 1 7 4 11 3.31054196328724 2.10826173526444 1.2022802280228 T:C C T 10 0.527065433816109 0.555399509917260 ENSG00000104812:ENST00000323798:exon_49489107_49489292:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000263276:exon_49489107_49489292:GYS1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 49949589 A/T 1 7 3 10 3.31054196328724 1.58119630144833 1.72934566183891 A:T A T 10 0.527065433816109 0.350932787230552 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49949556_49949680:PIH1D1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 49950298 C/T 1 76 53 129 35.9430270299757 27.9344679922538 8.00855903772193 T:C C T 10 0.527065433816109 0.185747705747441 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49950281_49950356:PIH1D1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 49950356 C/G 1 77 58 135 36.4159615961596 30.5697951613343 5.84616643482528 C:G C G 10 0.527065433816109 0.343311812787903 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49950281_49950356:PIH1D1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 49954803 C/T 1 83 44 127 39.253568993263 23.1908790879088 16.0626899053542 T:C C T 10 0.527065433816109 0.00436822667605413 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 49954807 T/G 1 82 38 120 38.7806344270791 20.0284864850121 18.7521479420669 T:G T G 10 0.527065433816109 0.000658322776576844 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 49964968 C/T 1 5 6 11 2.36467283091945 3.16239260289665 -0.797719771977199 T:C C T 10 0.527065433816109 0.765666449819686 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49964876_49965057:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49964876_49965057:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000433981:exon_49964876_49965225:ALDH16A1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 49964977 C/G 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 C:G C G 10 0.527065433816109 0.488810537661758 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49964876_49965057:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49964876_49965057:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000433981:exon_49964876_49965225:ALDH16A1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 49965173 A/T 1 11 4 15 5.2022802280228 2.10826173526444 3.09401849275836 A:T A T 10 0.527065433816109 0.126517172009480 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49965141_49965293:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000433981:exon_49964876_49965225:ALDH16A1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 49967680 G/A 1 13 12 25 6.14814936039058 6.32478520579331 -0.176635845402726 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49967674_49967779:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49967674_49967779:ALDH16A1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 49983673 C/T 1 15 9 24 7.09401849275836 4.74358890434498 2.35042958841338 T:C C T 10 0.527065433816109 0.415272769718452 ENSG00000090554:ENST00000204637:exon_49983555_49983733:FLT3LG;ENSG00000090554:ENST00000436815:exon_49983555_49983733:FLT3LG HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 49994470 T/A 1 13 13 26 6.14814936039058 6.85185063960942 -0.703701279218835 A:T T A 10 0.527065433816109 0.84562040810587 ENSG00000142541:ENST00000488946:exon_49993107_49994804:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000472481:exon_49994036_49994485:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476268:exon_49993104_49994523:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000468655:exon_49994297_49994483:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476300:exon_49994297_49994804:RPL13A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 49994476 T/C 1 13 13 26 6.14814936039058 6.85185063960942 -0.703701279218835 T:C T C 10 0.527065433816109 0.84562040810587 ENSG00000142541:ENST00000488946:exon_49993107_49994804:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000472481:exon_49994036_49994485:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476268:exon_49993104_49994523:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000468655:exon_49994297_49994483:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476300:exon_49994297_49994804:RPL13A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 50017724 C/T 1 9 20 29 4.25641109565502 10.5413086763222 -6.28489758066716 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0244650521509432 ENSG00000104870:ENST00000221466:exon_50017468_50017743:FCGRT;ENSG00000104870:ENST00000426395:exon_50017468_50017743:FCGRT;ENSG00000104870:ENST00000415900:exon_50017697_50017743:FCGRT;ENSG00000104870:ENST00000452439:exon_50017468_50017743:FCGRT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 50059982 C/G 1 128 95 223 60.535624471538 50.0712162125304 10.4644082590077 T:C:G C G 10 0.527065433816109 0.179710787314134 ENSG00000142546:ENST00000339093:exon_50059806_50059993:NOSIP;ENSG00000142546:ENST00000391853:exon_50059806_50059993:NOSIP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 50162909 C/G 1 183 191 374 86.547025611652 100.669497858877 -14.1224722472248 C:G C G 10 0.527065433816109 0.147261946422001 ENSG00000126456:ENST00000377139:exon_50162829_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000377135:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000309877:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000442265:exon_50162830_50163090:IRF3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 50312801 C/T 1 14 14 28 6.62108392657447 7.37891607342553 -0.757832146851053 T:C C T 10 0.527065433816109 0.850808986253895 ENSG00000010361:ENST00000525130:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000528094:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000533418:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000529634:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000525370:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000313777:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000377092:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000445575:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000527973:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000529004:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000528043:exon_50312652_50312832:FUZ HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 50321858 G/A 1 21 26 47 9.93162588986171 13.7037012792188 -3.77207538935713 A:G G A 10 0.527065433816109 0.307397368395779 ENSG00000104973:ENST00000355584:exon_50321828_50321873:MED25;ENSG00000104973:ENST00000377077:exon_50321828_50321873:MED25;ENSG00000104973:ENST00000312881:exon_50321828_50321873:MED25;ENSG00000104973:ENST00000456294:exon_50321828_50321873:MED25;ENSG00000104973:ENST00000312865:exon_50321828_50321873:MED25 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 50358133 T/G 1 40 40 80 18.9173826473556 21.0826173526444 -2.16523470528873 T:C:G T G 10 0.527065433816109 0.65528667482148 ENSG00000104960:ENST00000221557:exon_50358088_50358145:PTOV1;ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50358088_50358145:PTOV1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 50361353 C/T 1 75 50 125 35.4700924637918 26.3532716908055 9.11682077298637 T:C C T 10 0.527065433816109 0.107356463977490 ENSG00000104960:ENST00000221557:exon_50361314_50361371:PTOV1;ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50361314_50361371:PTOV1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 50383636 T/C 1 21 30 51 9.93162588986171 15.8119630144833 -5.88033712462156 T:C T C 10 0.527065433816109 0.122274858212795 ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50383536_50383659:TBC1D17 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 50393269 A/G 1 142 182 324 67.1567083981125 95.9259089545318 -28.7692005564193 A:G A G 10 0.527065433816109 0.00148765717908250 ENSG00000104951:ENST00000341114:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000391826:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000319225:exon_50392917_50393857:IL4I1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 50412417 G/A 1 145 126 271 68.5755120966642 66.4102446608297 2.16526743583445 A:G G A 10 0.527065433816109 0.807978158378129 ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 50436115 C/T 1 268 54 322 126.746463737283 28.4615334260699 98.2849303112129 T:C C T 10 0.527065433816109 1.32234820068901e-30 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 50548599 C/G 1 8 2 10 3.78347652947113 1.05413086763222 2.72934566183891 C:G C G 10 0.527065433816109 0.114525614534534 ENSG00000142528:ENST00000270617:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000391821:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000445728:exon_50548544_50548750:ZNF473 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 50548692 G/A 1 3 8 11 1.41880369855167 4.21652347052887 -2.7977197719772 A:G G A 10 0.527065433816109 0.130149709511191 ENSG00000142528:ENST00000270617:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000391821:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000445728:exon_50548544_50548750:ZNF473 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 50926126 C/T 1 51 44 95 24.1196628753784 23.1908790879088 0.928783787469641 T:C C T 10 0.527065433816109 0.918250140900077 ENSG00000142539:ENST00000270632:exon_50926080_50926294:SPIB;ENSG00000142539:ENST00000417618:exon_50926080_50926294:SPIB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 51323232 T/C 1 87 147 234 41.1453072579985 77.478618770968 -36.3333115129695 T:C T C 10 0.527065433816109 2.07812431879712e-06 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323155_51323291:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323155_51323291:KLK1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 51323473 C/G 1 45 70 115 21.2820554782751 36.8945803671276 -15.6125248888525 T:C:G C G 10 0.527065433816109 0.00371880947273876 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 51323501 A/G 1 55 83 138 26.011401140114 43.746431006737 -17.735029866623 A:G A G 10 0.527065433816109 0.00275472246584459 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 51850290 G/A 1 76 60 136 35.9430270299757 31.6239260289665 4.31910100100917 A:G G A 10 0.527065433816109 0.492485644332244 ENSG00000105379:ENST00000309244:exon_51850154_51850312:ETFB;ENSG00000105379:ENST00000354232:exon_51850154_51850312:ETFB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 52376040 G/A 1 6 2 8 2.83760739710335 1.05413086763222 1.78347652947113 A:G G A 10 0.527065433816109 0.29481715391141 ENSG00000161551:ENST00000301399:exon_52374535_52376959:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000440236:exon_52374555_52376959:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000420592:exon_52375252_52376782:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000451628:exon_52375710_52376782:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000342582:exon_52375785_52376782:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000458390:exon_52375803_52376959:ZNF577 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 52376119 G/A 1 6 5 11 2.83760739710335 2.63532716908055 0.202280228022801 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000161551:ENST00000301399:exon_52374535_52376959:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000440236:exon_52374555_52376959:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000420592:exon_52375252_52376782:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000451628:exon_52375710_52376782:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000342582:exon_52375785_52376782:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000458390:exon_52375803_52376959:ZNF577 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 52376126 C/T 1 8 4 12 3.78347652947113 2.10826173526444 1.67521479420669 T:C C T 10 0.527065433816109 0.396148353996528 ENSG00000161551:ENST00000301399:exon_52374535_52376959:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000440236:exon_52374555_52376959:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000420592:exon_52375252_52376782:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000451628:exon_52375710_52376782:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000342582:exon_52375785_52376782:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000458390:exon_52375803_52376959:ZNF577 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 52448669 G/C 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 C:G G C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000176024:ENST00000391794:exon_52447372_52449005:ZNF613;ENSG00000176024:ENST00000293471:exon_52447372_52449005:ZNF613 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 52887437 A/C 1 1 7 8 0.472934566183891 3.68945803671276 -3.21652347052887 A:C A C 10 0.527065433816109 0.0307713746552577 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 52887904 T/C 1 2 12 14 0.945869132367782 6.32478520579331 -5.37891607342553 T:C T C 10 0.527065433816109 0.00536153701805031 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 53056953 G/A 1 3 7 10 1.41880369855167 3.68945803671276 -2.27065433816109 A:G G A 10 0.527065433816109 0.207504053786451 ENSG00000198482:ENST00000487863:exon_53056360_53059303:ZNF808;ENSG00000198482:ENST00000359798:exon_53056360_53059589:ZNF808 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 53577419 G/C 1 3 6 9 1.41880369855167 3.16239260289665 -1.74358890434498 C:G G C 10 0.527065433816109 0.323067031523113 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000355147:exon_53577393_53577521:ZNF160 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 53958798 G/T 1 4 6 10 1.89173826473556 3.16239260289665 -1.27065433816109 T:G G T 10 0.527065433816109 0.532268681489131 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 53959343 G/A 1 7 4 11 3.31054196328724 2.10826173526444 1.2022802280228 A:G G A 10 0.527065433816109 0.555399509917260 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 53959568 G/C 1 10 10 20 4.72934566183891 5.27065433816109 -0.541308676322181 C:G G C 10 0.527065433816109 0.826649432830958 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 54080144 A/G 1 8 2 10 3.78347652947113 1.05413086763222 2.72934566183891 A:G A G 10 0.527065433816109 0.114525614534534 ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000514022:exon_54079951_54080314:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000505949:exon_54079951_54080346:ZNF331 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 54677897 G/A 1 37 46 83 17.498578948804 24.245009955541 -6.74643100673705 A:G G A 10 0.527065433816109 0.153158014340311 ENSG00000125505:ENST00000437868:exon_54677109_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000245615:exon_54677109_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000494142:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000431666:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000338624:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000449249:exon_54677768_54678125:MBOAT7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 54711329 C/T 1 2078 2179 4257 982.758028530125 1148.4755802853 -165.717551755176 A:T:C:G C T 10 0.527065433816109 3.72523764963763e-07 ENSG00000170889:ENST00000302907:exon_54711266_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000436445:exon_54711266_54711390:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000391752:exon_54711266_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000402367:exon_54710421_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000445961:exon_54711266_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000391751:exon_54711266_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000495002:exon_54711266_54711512:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000391753:exon_54711266_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000441429:exon_54710144_54711498:RPS9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 55142739 A/C 1 9 4 13 4.25641109565502 2.10826173526444 2.14814936039058 A:C A C 10 0.527065433816109 0.276012087147778 ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55142713_55142757:LILRB1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 55143083 T/C 1 20 8 28 9.45869132367782 4.21652347052887 5.24216785314895 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0576018519819824 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55142951_55143238:LILRB1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 55143452 T/C 1 29 14 43 13.7151024193328 7.37891607342553 6.33618634590731 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0659147109987077 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 55143491 G/T 1 31 18 49 14.6609715517006 9.48717780868996 5.17379374301066 T:G G T 10 0.527065433816109 0.153685932505165 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 55145454 G/A 1 13 7 20 6.14814936039058 3.68945803671276 2.45869132367782 A:G G A 10 0.527065433816109 0.371081802214505 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55145425_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55145425_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55145425_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55145422_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55145425_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55145422_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55145422_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55145425_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55145422_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55145422_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55145422_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55145425_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000473412:exon_55145422_55145634:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000462628:exon_55145422_55145472:LILRB1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 55148331 C/T 1 106 36 142 50.1310640154924 18.9743556173799 31.1567083981125 T:C C T 10 0.527065433816109 1.18454920326344e-07 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55148183_55148470:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55148183_55148470:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55148183_55148641:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000462628:exon_55148183_55148979:LILRB1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 55175740 C/T 1 8 5 13 3.78347652947113 2.63532716908055 1.14814936039058 T:C C T 10 0.527065433816109 0.588366380954527 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175637_55175936:LILRB4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 55176262 A/G 1 9 3 12 4.25641109565502 1.58119630144833 2.67521479420669 A:G A G 10 0.527065433816109 0.153067812973243 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55176250_55176300:LILRB4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 55485899 G/A 0 17 0 17 8.03988762512615 0 8.03988762512615 G G 10 0.527065433816109 2.16560032017563e-05 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55485868_55485912:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55485868_55485912:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55485868_55485912:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55485868_55485912:NLRP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 55512137 C/A 1 138 1 139 65.2649701333769 0.527065433816109 64.7379046995608 A:C C A 10 0.527065433816109 2.89323769375585e-37 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 55556472 G/C 1 17 5 22 8.03988762512615 2.63532716908055 5.4045604560456 C:G G C 10 0.527065433816109 0.0304098197224306 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55555711_55556677:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55555711_55556677:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55555711_55556677:RDH13 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 55556574 G/C 1 11 8 19 5.2022802280228 4.21652347052887 0.985756757493928 C:G G C 10 0.527065433816109 0.819106308579823 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55555711_55556677:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55555711_55556677:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55555711_55556677:RDH13 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 55739605 C/T 1 7 5 12 3.31054196328724 2.63532716908055 0.675214794206692 T:C C T 10 0.527065433816109 0.778351128206284 ENSG00000180089:ENST00000327042:exon_55739559_55739805:TMEM86B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 55739813 G/A 1 6 8 14 2.83760739710335 4.21652347052887 -1.37891607342553 A:G G A 10 0.527065433816109 0.59467204210446 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 55995272 G/A 1 17 24 41 8.03988762512615 12.6495704115866 -4.60968278646047 A:G G A 10 0.527065433816109 0.161379357013086 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 55998317 C/A 1 47 37 84 22.2279246106429 19.501421051196 2.72650355944684 A:C C A 10 0.527065433816109 0.585882049104275 ENSG00000090971:ENST00000205194:exon_55997775_55998935:NAT14 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 56089353 C/T 1 36 45 81 17.0256443826201 23.7179445217249 -6.69230013910483 T:C C T 10 0.527065433816109 0.148461011656311 ENSG00000218891:ENST00000325421:exon_56088893_56091007:ZNF579 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 56104136 T/C 1 14 12 26 6.62108392657447 6.32478520579331 0.296298720781166 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000179943:ENST00000221665:exon_56102738_56105012:FIZ1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 56114045 C/T 1 29 30 59 13.7151024193328 15.8119630144833 -2.09686059515043 T:C C T 10 0.527065433816109 0.60413021738366 ENSG00000171443:ENST00000301073:exon_56113441_56114504:ZNF524 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 56156447 A/G 1 111 102 213 52.4957368464119 53.7606742492431 -1.26493740283123 A:G A G 10 0.527065433816109 0.890927417979033 ENSG00000171425:ENST00000270451:exon_56155919_56156988:ZNF581 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 56160399 T/C 1 27 30 57 12.7692332869651 15.8119630144833 -3.04272972751822 T:C T C 10 0.527065433816109 0.429416487144673 ENSG00000173581:ENST00000308964:exon_56160368_56160443:CCDC106 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 56162776 C/T 1 35 35 70 16.5527098164362 18.4472901835638 -1.89458036712763 T:C C T 10 0.527065433816109 0.719853221303067 ENSG00000173581:ENST00000308964:exon_56162649_56162861:CCDC106 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 56170657 G/A 1 69 62 131 32.6324850666885 32.6780568965988 -0.045571829910287 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000063244:ENST00000450554:exon_56170576_56170711:U2AF2;ENSG00000063244:ENST00000308924:exon_56170576_56170711:U2AF2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 57946924 G/C 1 10 4 14 4.72934566183891 2.10826173526444 2.62108392657447 C:G G C 10 0.527065433816109 0.18849020884602 ENSG00000186230:ENST00000380830:exon_57946693_57946961:ZNF749;ENSG00000186230:ENST00000334181:exon_57946697_57946961:ZNF749;ENSG00000186230:ENST00000415248:exon_57946711_57946961:ZNF749 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 58453342 T/C 1 10 11 21 4.72934566183891 5.7977197719772 -1.06837411013829 T:C T C 10 0.527065433816109 0.667942291105539 ENSG00000152454:ENST00000282308:exon_58452206_58454015:ZNF256 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 58774071 A/G 1 45 41 86 21.2820554782751 21.6096827864605 -0.327627308185377 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000441758:exon_58773743_58774120:ZNF544 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 58806083 T/C 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000083842:ENST00000196548:exon_58805464_58807254:ZNF8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 58928786 A/G 1 9 12 21 4.25641109565502 6.32478520579331 -2.06837411013829 A:G A G 10 0.527065433816109 0.390094196298263 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000354635:exon_58928309_58929110:ZNF584 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 58929200 A/C 0 10 0 10 4.72934566183891 0 4.72934566183891 A A 10 0.527065433816109 0.00221418962581423 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 58991900 G/A 1 11 14 25 5.2022802280228 7.37891607342553 -2.17663584540273 A:G G A 10 0.527065433816109 0.426973917354727 ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58991543_58992591:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58991543_58992591:ZNF446 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 59028585 G/A 1 17 9 26 8.03988762512615 4.74358890434498 3.29629872078117 A:G G A 10 0.527065433816109 0.239819406952834 ENSG00000119574:ENST00000354590:exon_59027762_59029040:ZBTB45 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 19 59074653 T/C 1 8 6 14 3.78347652947113 3.16239260289665 0.621083926574474 T:C T C 10 0.527065433816109 0.794786264772641 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 272203 C/T 1 12 11 23 5.67521479420669 5.7977197719772 -0.122504977770507 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000407983:exon_272037_272557:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000439645:exon_272192_272630:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405364:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405233:exon_272192_273155:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_272192_272305:ACP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 277003 A/G 1 108 95 203 51.0769331478602 50.0712162125304 1.00571693532986 A:G A G 10 0.527065433816109 0.94398639869257 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000442386:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000484464:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000463831:exon_276980_277085:ACP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 677295 C/T 1 20 25 45 9.45869132367782 13.1766358454027 -3.71794452172491 T:C C T 10 0.527065433816109 0.297438980798901 ENSG00000151353:ENST00000281017:exon_677289_677439:TMEM18;ENSG00000151353:ENST00000432667:exon_677289_677406:TMEM18 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 3392075 T/C 1 47 41 88 22.2279246106429 21.6096827864605 0.618241824182405 T:C T C 10 0.527065433816109 0.915380903662967 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 3392295 A/G 1 41 41 82 19.3903172135395 21.6096827864605 -2.21936557292094 A:G A G 10 0.527065433816109 0.658986952510235 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 8871342 C/A 1 14 15 29 6.62108392657447 7.90598150724164 -1.28489758066716 A:C C A 10 0.527065433816109 0.711321912285436 ENSG00000134313:ENST00000256707:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000427284:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000418530:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000473731:exon_8869059_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000488729:exon_8870331_8872112:KIDINS220 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 20818764 C/T 1 6 10 16 2.83760739710335 5.27065433816109 -2.43304694105774 T:C C T 10 0.527065433816109 0.316907244333737 ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20817582_20819005:HS1BP3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 20838222 C/T 1 6 9 15 2.83760739710335 4.74358890434498 -1.90598150724164 T:C C T 10 0.527065433816109 0.439435430476406 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000237821:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000458740:exon_20838196_20838275:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000402541:exon_20834476_20838412:HS1BP3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 21001137 C/T 1 2 8 10 0.945869132367782 4.21652347052887 -3.27065433816109 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0545836587495111 ENSG00000118961:ENST00000381090:exon_21001070_21001225:C2orf43;ENSG00000118961:ENST00000237822:exon_21001070_21001225:C2orf43;ENSG00000118961:ENST00000435420:exon_21001052_21001223:C2orf43;ENSG00000118961:ENST00000412261:exon_21001070_21001225:C2orf43;ENSG00000118961:ENST00000440866:exon_21001070_21001225:C2orf43;ENSG00000118961:ENST00000402479:exon_21001052_21001225:C2orf43;ENSG00000118961:ENST00000419825:exon_21001070_21001225:C2orf43 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 24300563 T/C 1 15 15 30 7.09401849275836 7.90598150724164 -0.811963014483272 T:C T C 10 0.527065433816109 0.855562656731326 ENSG00000115129:ENST00000335934:exon_24300303_24300631:TP53I3;ENSG00000115129:ENST00000238721:exon_24300305_24300631:TP53I3;ENSG00000115129:ENST00000313482:exon_24300306_24300631:TP53I3;ENSG00000115129:ENST00000407482:exon_24300504_24300631:TP53I3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 24439048 A/G 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 A:G A G 10 0.527065433816109 0.488810537661758 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24438918_24439101:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24438918_24439101:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24438918_24439101:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24438918_24439101:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24438918_24439101:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24438918_24439101:ITSN2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 25046090 T/C 1 42 49 91 19.8632517797234 25.8262062569893 -5.96295447726592 T:C T C 10 0.527065433816109 0.248029229906771 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000485887:exon_25046078_25046232:ADCY3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 25050977 T/C 1 27 24 51 12.7692332869651 12.6495704115866 0.11966287537844 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000455323:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000450524:exon_25050771_25051030:ADCY3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 25064193 G/A 1 4 7 11 1.89173826473556 3.68945803671276 -1.7977197719772 A:G G A 10 0.527065433816109 0.36886039388561 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000427849:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000430440:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000435135:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000479517:exon_25064128_25064255:ADCY3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 26455127 G/A 1 28 26 54 13.2421678531489 13.7037012792188 -0.461533426069888 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000084754:ENST00000380649:exon_26455028_26455147:HADHA;ENSG00000084754:ENST00000457468:exon_26455028_26455147:HADHA;ENSG00000084754:ENST00000461025:exon_26455070_26455147:HADHA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 26502875 T/C 1 66 63 129 31.2136813681368 33.2051223304149 -1.99144096227806 T:C T C 10 0.527065433816109 0.725415530053972 ENSG00000138029:ENST00000317799:exon_26502862_26502983:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000405867:exon_26502862_26502983:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000494615:exon_26502862_26502983:HADHB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 27590418 G/T 1 17 14 31 8.03988762512615 7.37891607342553 0.66097155170062 T:G G T 10 0.527065433816109 0.858827214622317 ENSG00000115211:ENST00000347454:exon_27590324_27590426:EIF2B4;ENSG00000115211:ENST00000405940:exon_27590324_27590426:EIF2B4;ENSG00000115211:ENST00000445933:exon_27590324_27590426:EIF2B4;ENSG00000115211:ENST00000451130:exon_27590324_27590426:EIF2B4;ENSG00000115211:ENST00000493344:exon_27590324_27590426:EIF2B4;ENSG00000115211:ENST00000475582:exon_27588425_27591600:EIF2B4;ENSG00000115211:ENST00000417567:exon_27590324_27590426:EIF2B4;ENSG00000115211:ENST00000414437:exon_27590222_27590426:EIF2B4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 32800422 C/G 1 20 10 30 9.45869132367782 5.27065433816109 4.18803698551673 C:G C G 10 0.527065433816109 0.145039750225682 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32800223_32800433:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32800223_32800433:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000471232:exon_32800223_32800433:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000470250:exon_32800358_32800433:BIRC6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 37230734 C/T 1 4 5 9 1.89173826473556 2.63532716908055 -0.743588904344981 T:C C T 10 0.527065433816109 0.743612144716174 ENSG00000008869:ENST00000233099:exon_37230685_37230829:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000354531:exon_37230685_37230829:HEATR5B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 38536626 T/G 1 4 6 10 1.89173826473556 3.16239260289665 -1.27065433816109 T:G T G 10 0.527065433816109 0.532268681489131 ENSG00000119787:ENST00000378954:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000406122:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000405384:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000402054:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000419554:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000452935:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000332337:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000449130:exon_38536520_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000443098:exon_38536573_38536648:ATL2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 39025555 G/A 1 20 14 34 9.45869132367782 7.37891607342553 2.07977525025229 A:G G A 10 0.527065433816109 0.497604517851488 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39024871_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000423682:exon_39025515_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000452978:exon_39024878_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39025110_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39025422_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000477981:exon_39025494_39025584:DHX57 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 39050141 A/C 1 20 19 39 9.45869132367782 10.0142432425061 -0.555551918828254 A:C A C 10 0.527065433816109 0.87396986201025 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000452978:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39050135_39050411:DHX57 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 42515388 A/G 1 6 5 11 2.83760739710335 2.63532716908055 0.202280228022801 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000440432:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000480320:exon_42515367_42517053:EML4;ENSG00000143924:ENST00000406175:exon_42515367_42515462:EML4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 42990010 C/A 1 19 13 32 8.98575675749393 6.85185063960942 2.13390611788451 A:C C A 10 0.527065433816109 0.483562767697165 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 42990101 G/C 1 26 9 35 12.2962987207812 4.74358890434498 7.55270981643618 C:G G C 10 0.527065433816109 0.0108399704615904 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 42990336 T/G 1 21 9 30 9.93162588986171 4.74358890434498 5.18803698551673 T:G T G 10 0.527065433816109 0.067446084470933 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 42990522 C/T 1 10 2 12 4.72934566183891 1.05413086763222 3.67521479420669 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0418936923317288 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 42991200 C/G 1 14 12 26 6.62108392657447 6.32478520579331 0.296298720781166 C:G C G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 43015704 T/A 1 6 3 9 2.83760739710335 1.58119630144833 1.25641109565502 A:T T A 10 0.527065433816109 0.513555929047552 ENSG00000162882:ENST00000294973:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402698:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000404451:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000431905:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000406924:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402268:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000414285:exon_43015669_43015747:HAAO HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 44004010 T/C 1 6 3 9 2.83760739710335 1.58119630144833 1.25641109565502 T:C T C 10 0.527065433816109 0.513555929047552 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000330811:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000496980:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000406852:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000479242:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000398823:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000462426:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000378587:exon_44003962_44004038:DYNC2LI1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 44028013 A/T 1 7 2 9 3.31054196328724 1.05413086763222 2.25641109565502 A:T A T 10 0.527065433816109 0.185447766343339 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44027980_44028056:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44027980_44028056:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000330811:exon_44027980_44028056:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000489222:exon_44027980_44028056:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000378587:exon_44027980_44028056:DYNC2LI1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 44036922 T/C 1 15 10 25 7.09401849275836 5.27065433816109 1.82336415459727 T:C T C 10 0.527065433816109 0.550103280555877 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 44123758 G/A 1 8 7 15 3.78347652947113 3.68945803671276 0.0940184927583645 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000138095:ENST00000472420:exon_44123376_44123847:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000483489:exon_44123583_44123847:LRPPRC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 45640334 T/C 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 T:C T C 10 0.527065433816109 0.488810537661758 ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45640253_45640432:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45640253_45640432:SRBD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 45640374 C/A 1 6 7 13 2.83760739710335 3.68945803671276 -0.851850639609417 A:C C A 10 0.527065433816109 0.783042148004503 ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45640253_45640432:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45640253_45640432:SRBD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 45645512 C/T 1 5 13 18 2.36467283091945 6.85185063960942 -4.48717780868996 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0558624418352255 ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45645504_45645680:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45645504_45645680:SRBD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 45879305 C/T 1 4 7 11 1.89173826473556 3.68945803671276 -1.7977197719772 T:C C T 10 0.527065433816109 0.36886039388561 ENSG00000171132:ENST00000421201:exon_45879043_45879587:PRKCE;ENSG00000171132:ENST00000306156:exon_45878913_45879587:PRKCE HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 47177618 G/A 1 6 7 13 2.83760739710335 3.68945803671276 -0.851850639609417 A:G G A 10 0.527065433816109 0.783042148004503 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47177502_47177665:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47177502_47177665:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47177502_47177665:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47177502_47177665:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000461601:exon_47177502_47177665:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47177502_47177665:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47177502_47177665:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47177560_47177665:TTC7A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 47251469 G/C 1 10 17 27 4.72934566183891 8.96011237487385 -4.23076671303494 C:G G C 10 0.527065433816109 0.123454818791915 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000461601:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000440051:exon_47251426_47251498:TTC7A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 47278901 G/A 1 8 1 9 3.78347652947113 0.527065433816109 3.25641109565502 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0415432498690979 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484337:exon_47278885_47279019:TTC7A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 47301029 A/G 1 57 35 92 26.9572702724818 18.4472901835638 8.50998008891797 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0768598541542852 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47300841_47301187:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47300841_47302463:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47300841_47301062:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47300841_47303276:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47300841_47302696:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47300841_47302463:TTC7A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 48010558 C/A 1 6 9 15 2.83760739710335 4.74358890434498 -1.90598150724164 A:C C A 10 0.527065433816109 0.439435430476406 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48010221_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000445503:exon_48010221_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000446255:exon_48010221_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000456246:exon_48010267_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000493177:exon_48010309_48010632:MSH6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 48018081 A/G 1 8 8 16 3.78347652947113 4.21652347052887 -0.433046941057745 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48018066_48018262:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000445503:exon_48018066_48018262:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000446255:exon_48018066_48018262:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000455383:exon_48018066_48018262:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000420813:exon_48018066_48018262:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000411819:exon_48018066_48018262:MSH6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 48023115 T/C 1 6 8 14 2.83760739710335 4.21652347052887 -1.37891607342553 T:C T C 10 0.527065433816109 0.59467204210446 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000446255:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000456246:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000455383:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000420813:exon_48023033_48023175:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000411819:exon_48023033_48023202:MSH6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 48030838 A/T 1 11 8 19 5.2022802280228 4.21652347052887 0.985756757493928 A:T A T 10 0.527065433816109 0.819106308579823 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 53955850 C/T 1 9 5 14 4.25641109565502 2.63532716908055 1.62108392657447 T:C C T 10 0.527065433816109 0.433551468090942 ENSG00000115239:ENST00000406053:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000420735:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000352846:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000263634:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406625:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000482829:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406687:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000394717:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000498475:exon_53955849_53955984:ASB3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 54035447 A/G 1 21 19 40 9.93162588986171 10.0142432425061 -0.0826173526443625 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000068912:ENST00000405123:exon_54035436_54035597:ERLEC1;ENSG00000068912:ENST00000185150:exon_54035436_54035597:ERLEC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 54035508 G/C 1 12 18 30 5.67521479420669 9.48717780868996 -3.81196301448327 C:G G C 10 0.527065433816109 0.20072953525879 ENSG00000068912:ENST00000405123:exon_54035436_54035597:ERLEC1;ENSG00000068912:ENST00000185150:exon_54035436_54035597:ERLEC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 54115904 A/G 1 14 7 21 6.62108392657447 3.68945803671276 2.93162588986171 A:G A G 10 0.527065433816109 0.274579453085168 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54115858_54115949:PSME4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 54120025 A/T 1 9 6 15 4.25641109565502 3.16239260289665 1.09401849275836 A:T A T 10 0.527065433816109 0.615224246448703 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54119945_54120097:PSME4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 54133744 T/C 1 8 8 16 3.78347652947113 4.21652347052887 -0.433046941057745 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54133735_54133830:PSME4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 54844790 C/T 1 7 1 8 3.31054196328724 0.527065433816109 2.78347652947113 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0735220313078182 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54844745_54844825:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000389980:exon_54844745_54844825:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54844745_54844825:SPTBN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 54858511 C/T 1 74 63 137 34.9971578976079 33.2051223304149 1.79203556719307 T:C C T 10 0.527065433816109 0.797694184231637 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54857992_54858748:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54857992_54858748:SPTBN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 54886347 G/A 1 47 70 117 22.2279246106429 36.8945803671276 -14.6666557564848 A:T:G G A 10 0.527065433816109 0.0071311184875737 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000496323:exon_54886291_54886403:SPTBN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 55470115 C/T 1 31 17 48 14.6609715517006 8.96011237487385 5.70085917682677 T:C C T 10 0.527065433816109 0.112255584682816 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000418823:exon_55470076_55470216:MTIF2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 55490819 G/T 1 13 10 23 6.14814936039058 5.27065433816109 0.877495022229492 T:G G T 10 0.527065433816109 0.835491706691073 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55490776_55491006:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000417741:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000446660:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000366137:exon_55490777_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000441307:exon_55490783_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000404297:exon_55490784_55491001:MTIF2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 55771161 A/G 1 42 34 76 19.8632517797234 17.9202247497477 1.94302702997571 A:G A G 10 0.527065433816109 0.73067271976469 ENSG00000163001:ENST00000339012:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000349456:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000407816:exon_55771161_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000490934:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000481791:exon_55771156_55771505:CCDC104 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 55806912 G/A 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000138041:ENST00000272313:exon_55806815_55806917:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000407823:exon_55806815_55806917:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000345102:exon_55806815_55806917:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000424063:exon_55806815_55806917:SMEK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 58316814 A/G 1 8 15 23 3.78347652947113 7.90598150724164 -4.12250497777051 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0967595787231926 ENSG00000028116:ENST00000435505:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000417641:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000412104:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000423109:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000394539:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000437272:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000340157:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000432057:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000440705:exon_58316766_58316858:VRK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 58388696 A/G 1 42 24 66 19.8632517797234 12.6495704115866 7.2136813681368 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0843766864800057 ENSG00000115392:ENST00000403295:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000233741:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000402135:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000403676:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000449070:exon_58388657_58388773:FANCL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 61415492 A/G 1 108 100 208 51.0769331478602 52.7065433816109 -1.62961023375068 A:G A G 10 0.527065433816109 0.835227180192243 ENSG00000173209:ENST00000403692:exon_61415044_61416060:AHSA2;ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398569:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000263989:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000411912:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000436269:exon_61414685_61415844:USP34 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 61417617 A/G 1 4 14 18 1.89173826473556 7.37891607342553 -5.48717780868996 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0156821937771927 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 64779509 G/A 1 40 30 70 18.9173826473556 15.8119630144833 3.10541963287237 A:G G A 10 0.527065433816109 0.475089836994007 ENSG00000119844:ENST00000238856:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000422803:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000238855:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000498706:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409933:exon_64778609_64780543:AFTPH HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 64806634 C/T 1 21 25 46 9.93162588986171 13.1766358454027 -3.24500995554102 A:T:C C T 10 0.527065433816109 0.37698278837888 ENSG00000119844:ENST00000238856:exon_64806620_64806680:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000422803:exon_64806620_64806680:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000238855:exon_64806620_64806680:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000498706:exon_64806620_64808407:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409933:exon_64806620_64806680:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409183:exon_64806620_64806680:AFTPH HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 65245365 G/A 1 21 18 39 9.93162588986171 9.48717780868996 0.444448081171748 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65245205_65245399:SLC1A4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 68364478 T/C 1 13 3 16 6.14814936039058 1.58119630144833 4.56695305894226 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0242272766688289 ENSG00000243667:ENST00000492039:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295122:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295121:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000457114:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000406245:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000409164:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68364431_68364565:PPP3R1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 68388823 A/G 1 22 29 51 10.4045604560456 15.2848975806672 -4.88033712462156 A:G A G 10 0.527065433816109 0.206677853430802 ENSG00000115946:ENST00000263657:exon_68388815_68388898:PNO1;ENSG00000115946:ENST00000430742:exon_68388815_68388898:PNO1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 68607978 A/C 1 61 43 104 28.8490085372173 22.6638136540927 6.18519488312466 A:C A C 10 0.527065433816109 0.239462488983794 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68607855_68608036:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68607855_68608036:PLEK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 69049729 G/A 1 17 11 28 8.03988762512615 5.7977197719772 2.24216785314895 A:G G A 10 0.527065433816109 0.45216611994601 ENSG00000163219:ENST00000409202:exon_69049472_69050004:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000295381:exon_69049472_69050004:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000467265:exon_69049472_69050004:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000409030:exon_69049472_69050004:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000409220:exon_69049472_69050004:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000482106:exon_69049472_69050004:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000497259:exon_69049472_69050004:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000479844:exon_69049472_69050004:ARHGAP25 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 70524577 G/A 1 63 74 137 29.7948776695851 39.0028421023921 -9.20796443280694 A:G G A 10 0.527065433816109 0.12367031323227 ENSG00000035141:ENST00000037869:exon_70523107_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000460307:exon_70523108_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000450256:exon_70524143_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000430566:exon_70524308_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000438759:exon_70524558_70524609:FAM136A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 71297695 T/C 1 97 25 122 45.8746529198374 13.1766358454027 32.6980170744347 T:C T C 10 0.527065433816109 9.42668423168965e-10 ENSG00000124357:ENST00000497690:exon_71297632_71297749:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000434004:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000455662:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000244204:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000531934:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443938:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000450272:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000465105:exon_71297632_71298149:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000480411:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000475709:exon_71295780_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000533981:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000472519:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000489309:exon_71296108_71298957:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000464638:exon_71297430_71297969:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000428360:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524736:exon_71297643_71297716:NAGK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 71351403 C/A 1 11 8 19 5.2022802280228 4.21652347052887 0.985756757493928 A:C C A 10 0.527065433816109 0.819106308579823 ENSG00000124370:ENST00000244217:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000466481:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000486135:exon_71351336_71351673:MCEE HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 71360144 A/C 1 22 36 58 10.4045604560456 18.9743556173799 -8.56979516133432 A:C A C 10 0.527065433816109 0.0255584187243546 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 71360195 C/T 1 41 31 72 19.3903172135395 16.3390284482994 3.05128876524015 T:C C T 10 0.527065433816109 0.481811897606333 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 71360282 G/A 1 53 55 108 25.0655320077462 28.988598859886 -3.92306685213978 A:G G A 10 0.527065433816109 0.500156126352932 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 71360625 G/T 1 48 55 103 22.7008591768268 28.988598859886 -6.28773968305923 T:G G T 10 0.527065433816109 0.236563660926413 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 71365676 G/A 1 20 20 40 9.45869132367782 10.5413086763222 -1.08261735264436 A:C:G G A 10 0.527065433816109 0.753743095912526 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71365620_71366343:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 71376999 G/A 1 30 45 75 14.1880369855167 23.7179445217249 -9.52990753620818 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0283345891732963 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71376996_71377230:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000493360:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 71417134 C/T 1 3 6 9 1.41880369855167 3.16239260289665 -1.74358890434498 T:C C T 10 0.527065433816109 0.323067031523113 ENSG00000124374:ENST00000244221:exon_71416975_71417151:PAIP2B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 71633275 T/C 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 T:C T C 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000494241:exon_71633258_71633392:ZNF638 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 71633389 C/T 1 7 5 12 3.31054196328724 2.63532716908055 0.675214794206692 T:C C T 10 0.527065433816109 0.778351128206284 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000494241:exon_71633258_71633392:ZNF638 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 73461483 C/A 1 62 118 180 29.3219431034012 62.1937211903009 -32.8717780868996 A:C C A 10 0.527065433816109 9.61616204186592e-07 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73461366_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000461290:exon_73461397_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000464397:exon_73461435_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000399032:exon_73461436_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73461436_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000480489:exon_73461437_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409924:exon_73461437_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73461448_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000473786:exon_73461464_73461512:CCT7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 73478461 A/T 1 189 202 391 89.3846330087554 106.467217630854 -17.0825846220986 A:T A T 10 0.527065433816109 0.0852202011607772 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73478354_73478560:CCT7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 73829372 C/T 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 T:C C T 10 0.527065433816109 0.757490641773051 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73829312_73829495:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73829312_73829495:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73829312_73829495:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000464408:exon_73829312_73829495:ALMS1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 74185876 A/T 1 119 116 235 56.279213375883 61.1395903226686 -4.86037694678562 A:T A T 10 0.527065433816109 0.556696573285272 ENSG00000114956:ENST00000264093:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000348222:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000418996:exon_74185837_74186073:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000356837:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000440532:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000347161:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000448982:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000462685:exon_74185837_74185915:DGUOK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 75882399 G/A 1 114 50 164 53.9145405449636 26.3532716908055 27.5612688541581 A:G G A 10 0.527065433816109 1.44916091000511e-05 ENSG00000115364:ENST00000393909:exon_75882190_75884986:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000409374:exon_75882190_75882428:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000453233:exon_75882190_75882428:MRPL19 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 75907351 T/C 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 T:C T C 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75907319_75907440:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75907319_75907440:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75907319_75907440:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75907319_75907440:C2orf3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 86371883 T/C 1 196 113 309 92.6951749720426 59.5583940212203 33.1367809508223 T:C T C 10 0.527065433816109 0.000161940533737795 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86371059_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86371059_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86371063_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86371063_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86371063_86372004:IMMT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 86385668 T/C 1 7 1 8 3.31054196328724 0.527065433816109 2.78347652947113 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0735220313078182 ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86385499_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000490238:exon_86385600_86385844:IMMT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 86400824 G/A 1 48 56 104 22.7008591768268 29.5156642937021 -6.81480511687534 A:G G A 10 0.527065433816109 0.20176377720387 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86400773_86400885:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000398211:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409258:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000486633:exon_86400631_86400884:IMMT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 86433240 C/T 1 73 76 149 34.524223331424 40.0569729700243 -5.53274963860025 T:C C T 10 0.527065433816109 0.36813941074471 ENSG00000132313:ENST00000254644:exon_86433229_86433418:MRPL35;ENSG00000132313:ENST00000337109:exon_86433229_86433418:MRPL35;ENSG00000132313:ENST00000409180:exon_86433229_86433418:MRPL35 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 86839364 T/C 1 5 6 11 2.36467283091945 3.16239260289665 -0.797719771977199 T:C T C 10 0.527065433816109 0.765666449819686 ENSG00000239305:ENST00000237455:exon_86839282_86839397:RNF103;ENSG00000239305:ENST00000472030:exon_86839282_86841822:RNF103;ENSG00000239305:ENST00000463333:exon_86839282_86839397:RNF103;ENSG00000239305:ENST00000477307:exon_86839282_86839397:RNF103 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 89160139 T/C 1 6 13 19 2.83760739710335 6.85185063960942 -4.01424324250607 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0701843497785835 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 89160374 A/G 1 4 31 35 1.89173826473556 16.3390284482994 -14.4472901835638 A:G A G 10 0.527065433816109 4.70223254893344e-07 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 89160742 C/T 1 8 11 19 3.78347652947113 5.7977197719772 -2.01424324250607 T:C C T 10 0.527065433816109 0.369297985076747 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 89160996 T/C 1 13 1 14 6.14814936039058 0.527065433816109 5.62108392657447 T:C T C 10 0.527065433816109 0.00219646826073131 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 89160997 A/T 0 13 0 13 6.14814936039058 0 6.14814936039058 A A 10 0.527065433816109 0.000301448697684757 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 89161030 T/G 1 8 3 11 3.78347652947113 1.58119630144833 2.2022802280228 T:G T G 10 0.527065433816109 0.234094659981005 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 89161033 T/C 1 10 5 15 4.72934566183891 2.63532716908055 2.09401849275836 T:C T C 10 0.527065433816109 0.312436282519101 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 89442246 G/A 1 5 4357 4362 2.36467283091945 2296.42409513679 -2294.05942230587 A:G G A 10 0.527065433816109 0 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 89442354 A/T 1 7 6556 6563 3.31054196328724 3455.44098409841 -3452.13044213512 A:T:C A T 10 0.527065433816109 0 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 96789787 T/C 1 10 7 17 4.72934566183891 3.68945803671276 1.03988762512615 T:C T C 10 0.527065433816109 0.637665492029096 ENSG00000188886:ENST00000342380:exon_96789589_96790010:ASTL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 96795714 G/A 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 A:G G A 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000188886:ENST00000342380:exon_96795563_96795717:ASTL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 96942928 C/T 1 104 86 190 49.1851948831247 45.3276273081854 3.85756757493928 T:C C T 10 0.527065433816109 0.611267532916884 ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96942819_96942979:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000497539:exon_96942819_96942979:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000429650:exon_96942819_96942979:SNRNP200 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 96944553 G/A 1 89 80 169 42.0911763903663 42.1652347052887 -0.0740583149224321 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000497539:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000429650:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000484372:exon_96944547_96944736:SNRNP200 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 96952833 A/G 1 46 37 83 21.754990044459 19.501421051196 2.25356899326295 A:G A G 10 0.527065433816109 0.660977384666012 ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96952744_96952898:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000480615:exon_96952744_96952898:SNRNP200 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 96993757 C/T 1 19 8 27 8.98575675749393 4.21652347052887 4.76923328696506 T:C C T 10 0.527065433816109 0.082110621308263 ENSG00000198885:ENST00000439118:exon_96992380_96994064:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000420728:exon_96992380_96994062:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000361124:exon_96991961_96994066:ITPRIPL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 96993884 A/G 1 12 13 25 5.67521479420669 6.85185063960942 -1.17663584540273 A:G A G 10 0.527065433816109 0.691622871057986 ENSG00000198885:ENST00000439118:exon_96992380_96994064:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000420728:exon_96992380_96994062:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000361124:exon_96991961_96994066:ITPRIPL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 97020049 T/C 1 8 7 15 3.78347652947113 3.68945803671276 0.0940184927583645 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000121152:ENST00000240423:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000427946:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000477409:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435975:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000455200:exon_97019921_97020126:NCAPH HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 97030247 T/C 1 20 10 30 9.45869132367782 5.27065433816109 4.18803698551673 A:T:C T C 10 0.527065433816109 0.145039750225682 ENSG00000121152:ENST00000240423:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000427946:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435975:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000455200:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435349:exon_97030218_97030329:NCAPH HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 98274527 G/C 1 39 25 64 18.4444480811717 13.1766358454027 5.26781223576902 C:G G C 10 0.527065433816109 0.211154719052605 ENSG00000115073:ENST00000289228:exon_98274406_98274580:ACTR1B;ENSG00000115073:ENST00000451664:exon_98274441_98274580:ACTR1B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 98355990 G/A 1 19 4 23 8.98575675749393 2.10826173526444 6.87749502222949 A:G G A 10 0.527065433816109 0.00536626114009287 ENSG00000115085:ENST00000264972:exon_98355838_98356323:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000389518:exon_98355838_98356323:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000463643:exon_98355838_98356325:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000442208:exon_98355838_98356323:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000487283:exon_98355838_98356322:ZAP70 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 98409046 G/A 1 22 23 45 10.4045604560456 12.1225049777705 -1.71794452172491 A:G G A 10 0.527065433816109 0.655670665211511 ENSG00000075568:ENST00000186436:exon_98408849_98409447:TMEM131;ENSG00000075568:ENST00000425805:exon_98408849_98409447:TMEM131 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 99778985 T/C 1 14 18 32 6.62108392657447 9.48717780868996 -2.86609388211549 T:C T C 10 0.527065433816109 0.376746667004893 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 99779131 T/C 1 20 24 44 9.45869132367782 12.6495704115866 -3.1908790879088 T:C T C 10 0.527065433816109 0.367001266855463 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 99804642 T/C 1 8 11 19 3.78347652947113 5.7977197719772 -2.01424324250607 T:C T C 10 0.527065433816109 0.369297985076747 ENSG00000241962:ENST00000424491:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000512183:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308656:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308644:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000509871:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000185414:ENST00000410042:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000338148:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000473743:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000449429:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409145:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409841:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000476721:exon_99804640_99804720:MRPL30 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 99812070 G/A 1 21 28 49 9.93162588986171 14.7578321468511 -4.82620625698934 A:G G A 10 0.527065433816109 0.197863822869172 ENSG00000241962:ENST00000424491:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000512183:exon_99812036_99814089:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308656:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308644:exon_99812036_99813896:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000509871:exon_99812036_99812286:C2orf15;ENSG00000185414:ENST00000338148:exon_99812036_99814089:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000465432:exon_99812036_99812485:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409841:exon_99812036_99812286:MRPL30 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 99978048 G/A 1 327 314 641 154.649603142132 165.498546218258 -10.8489430761259 A:T:G G A 10 0.527065433816109 0.406204334207796 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99977611_99978283:EIF5B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 100020111 A/G 1 6 6 12 2.83760739710335 3.16239260289665 -0.324785205793308 A:G A G 10 0.527065433816109 1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 100022772 T/C 1 12 5 17 5.67521479420669 2.63532716908055 3.03988762512615 T:C T C 10 0.527065433816109 0.153398734504230 ENSG00000135945:ENST00000485487:exon_100022372_100022815:REV1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 100055158 T/C 1 15 17 32 7.09401849275836 8.96011237487385 -1.86609388211549 T:C T C 10 0.527065433816109 0.596331739273101 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000450415:exon_100055063_100055189:REV1;ENSG00000135945:ENST00000486117:exon_100055063_100055279:REV1;ENSG00000135945:ENST00000482887:exon_100055063_100055239:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100055036_100055772:REV1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 101624471 T/C 1 13 10 23 6.14814936039058 5.27065433816109 0.877495022229492 T:C T C 10 0.527065433816109 0.835491706691073 ENSG00000204634:ENST00000463751:exon_101622395_101624492:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000376840:exon_101624079_101624735:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000409318:exon_101624079_101624735:TBC1D8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 101635538 C/T 1 54 12 66 25.5384665739301 6.32478520579331 19.2136813681368 T:C C T 10 0.527065433816109 1.39905611573307e-06 ENSG00000071082:ENST00000409028:exon_101635460_101636078:RPL31 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 101638888 A/G 1 3 10 13 1.41880369855167 5.27065433816109 -3.85185063960942 A:G A G 10 0.527065433816109 0.048374706262986 ENSG00000204634:ENST00000463751:exon_101638743_101638970:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000376840:exon_101638743_101638983:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000409318:exon_101638743_101638983:TBC1D8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 101644855 G/A 1 12 1 13 5.67521479420669 0.527065433816109 5.14814936039058 A:G G A 10 0.527065433816109 0.00398496992472695 ENSG00000204634:ENST00000376840:exon_101644765_101644894:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000409318:exon_101644765_101644894:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000473937:exon_101644765_101644894:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000485875:exon_101644807_101644894:TBC1D8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 105885961 T/C 1 8 10 18 3.78347652947113 5.27065433816109 -1.48717780868996 T:C T C 10 0.527065433816109 0.49133381096339 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105885729_105886162:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105885729_105886162:TGFBRAP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 109380345 C/T 1 3 7 10 1.41880369855167 3.68945803671276 -2.27065433816109 T:C C T 10 0.527065433816109 0.207504053786451 ENSG00000153201:ENST00000283195:exon_109379693_109384844:RANBP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 113496453 G/A 1 7 7 14 3.31054196328724 3.68945803671276 -0.378916073425526 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000169607:ENST00000302450:exon_113494184_113496625:CKAP2L;ENSG00000169607:ENST00000435431:exon_113495444_113496625:CKAP2L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 113537223 C/A 1 1 7 8 0.472934566183891 3.68945803671276 -3.21652347052887 A:C C A 10 0.527065433816109 0.0307713746552577 ENSG00000115008:ENST00000263339:exon_113537073_113537243:IL1A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 118575215 C/G 1 59 45 104 27.9031394048496 23.7179445217249 4.18519488312466 C:G C G 10 0.527065433816109 0.433234602954684 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118575020_118575304:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000474694:exon_118575020_118575304:DDX18 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 118583940 C/T 1 17 23 40 8.03988762512615 12.1225049777705 -4.08261735264436 T:C C T 10 0.527065433816109 0.208392139970142 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118583845_118583958:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000415038:exon_118583845_118583958:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000476149:exon_118583845_118587042:DDX18 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 120060082 T/C 1 16 13 29 7.56695305894226 6.85185063960942 0.715102419332838 T:C T C 10 0.527065433816109 0.853844997602006 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120059801_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120059804_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120060020_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120060020_120060124:C2orf76 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 120078778 T/C 1 22 10 32 10.4045604560456 5.27065433816109 5.13390611788451 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0775021378258386 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000414534:exon_120078745_120078780:C2orf76 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 127826533 A/G 1 8 23 31 3.78347652947113 12.1225049777705 -8.33902844829938 A:G A G 10 0.527065433816109 0.00337929647851644 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127826500_127826607:BIN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 128459214 C/G 1 11 9 20 5.2022802280228 4.74358890434498 0.45869132367782 C:G C G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000136709:ENST00000322313:exon_128458596_128464126:WDR33;ENSG00000173349:ENST00000310981:exon_128458597_128461385:SFT2D3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 128939799 C/T 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128939704_128939864:UGGT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 135711516 C/T 1 8 3 11 3.78347652947113 1.58119630144833 2.2022802280228 T:C C T 10 0.527065433816109 0.234094659981005 ENSG00000082258:ENST00000419781:exon_135710800_135714413:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000452839:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000295238:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000264157:exon_135710800_135716912:CCNT2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 135711657 G/A 1 7 5 12 3.31054196328724 2.63532716908055 0.675214794206692 A:G G A 10 0.527065433816109 0.778351128206284 ENSG00000082258:ENST00000419781:exon_135710800_135714413:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000452839:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000295238:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000264157:exon_135710800_135716912:CCNT2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 135893372 A/G 1 18 21 39 8.51282219131004 11.0683741101383 -2.55555191882825 A:G A G 10 0.527065433816109 0.427246720594883 ENSG00000115839:ENST00000264158:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000442034:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000487003:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 136393658 A/G 1 8 5 13 3.78347652947113 2.63532716908055 1.14814936039058 A:G A G 10 0.527065433816109 0.588366380954527 ENSG00000048991:ENST00000422577:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409478:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000264160:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000439263:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000329971:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000448751:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000410054:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409606:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000456040:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000486532:exon_136393658_136393753:R3HDM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 136409574 A/C 1 15 11 26 7.09401849275836 5.7977197719772 1.29629872078116 A:C A C 10 0.527065433816109 0.696440239382925 ENSG00000048991:ENST00000409478:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000264160:exon_136409303_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000439263:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000329971:exon_136409303_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000448751:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000410054:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409606:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000429703:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000487294:exon_136409300_136409591:R3HDM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 136511817 A/G 1 18 17 35 8.51282219131004 8.96011237487385 -0.447290183563815 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000144224:ENST00000272638:exon_136511729_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000416538:exon_136511109_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000470687:exon_136511729_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000490163:exon_136511722_136511847:UBXN4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 143798189 A/G 1 55 63 118 26.011401140114 33.2051223304149 -7.19372119030086 A:G A G 10 0.527065433816109 0.197254621063154 ENSG00000115919:ENST00000264170:exon_143797997_143798227:KYNU;ENSG00000115919:ENST00000409512:exon_143797997_143798227:KYNU HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 152138522 T/C 1 35 33 68 16.5527098164362 17.3931593159316 -0.840449499495413 T:C T C 10 0.527065433816109 0.90350426845052 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152138462_152138557:NMI HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 152139416 G/A 1 49 43 92 23.1737937430107 22.6638136540927 0.509980088917967 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000491771:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000414946:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000477072:exon_152139285_152139468:NMI HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 158290914 G/C 1 101 99 200 47.766391184573 52.1794779477948 -4.41308676322181 C:G G C 10 0.527065433816109 0.571166286644541 ENSG00000115165:ENST00000264192:exon_158290882_158290936:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000418920:exon_158290882_158290936:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000457793:exon_158290882_158290936:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000497432:exon_158290882_158290936:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000439355:exon_158290882_158290936:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000462109:exon_158290673_158290936:CYTIP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 160604812 C/T 1 13 14 27 6.14814936039058 7.37891607342553 -1.23076671303494 T:C C T 10 0.527065433816109 0.701898180501923 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 160605268 T/C 1 37 32 69 17.498578948804 16.8660938821155 0.632485066688478 T:C T C 10 0.527065433816109 0.904578923673105 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 160663678 T/C 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 T:C T C 10 0.527065433816109 0.160556933333404 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 160711045 G/C 1 5 8 13 2.36467283091945 4.21652347052887 -1.85185063960942 C:G G C 10 0.527065433816109 0.407023665875808 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 163128824 T/C 1 62 52 114 29.3219431034012 27.4074025584377 1.91454054496357 T:C T C 10 0.527065433816109 0.778605279272988 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163128736_163128897:IFIH1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 163144694 T/C 1 25 35 60 11.8233641545973 18.4472901835638 -6.62392602896654 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0935130170594951 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163144645_163144865:IFIH1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 171910313 C/T 1 10 9 19 4.72934566183891 4.74358890434498 -0.0142432425060717 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000198586:ENST00000431350:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000360843:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000442919:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000359766:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000521943:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000434911:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000409443:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000478683:exon_171910271_171911639:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000486857:exon_171910227_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000453628:exon_171910292_171910363:TLK1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 172411273 G/A 1 33 42 75 15.6068406840684 22.1367482202766 -6.52990753620818 A:G G A 10 0.527065433816109 0.134441687621822 ENSG00000071967:ENST00000409484:exon_172411034_172412117:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000321348:exon_172411034_172414643:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000375252:exon_172411034_172414156:CYBRD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 173356031 C/T 1 10 8 18 4.72934566183891 4.21652347052887 0.512822191310037 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000091409:ENST00000409532:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000264107:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000264106:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000343713:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000375221:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000409080:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000442250:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000458358:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000416789:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000475302:exon_173355949_173356059:ITGA6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 174131392 T/C 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000091436:ENST00000409176:exon_174130778_174131511:AC013461.1;ENSG00000091436:ENST00000375213:exon_174130778_174132738:AC013461.1;ENSG00000091436:ENST00000431503:exon_174130778_174131478:AC013461.1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 176043097 A/G 1 456 469 925 215.658162179854 247.193688459755 -31.5355262799009 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0380728565094955 ENSG00000154518:ENST00000284727:exon_176040986_176043130:ATP5G3;ENSG00000154518:ENST00000409194:exon_176042795_176043130:ATP5G3;ENSG00000154518:ENST00000392541:exon_176042873_176043130:ATP5G3;ENSG00000154518:ENST00000497075:exon_176042914_176043978:ATP5G3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 178977492 C/T 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000155636:ENST00000424000:exon_178977151_178977573:RBM45;ENSG00000155636:ENST00000286070:exon_178977182_178977573:RBM45;ENSG00000155636:ENST00000456670:exon_178977182_178977573:RBM45 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 179403593 G/A 1 7 4 11 3.31054196328724 2.10826173526444 1.2022802280228 A:G G A 10 0.527065433816109 0.555399509917260 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 179406191 C/T 1 3 7 10 1.41880369855167 3.68945803671276 -2.27065433816109 T:C C T 10 0.527065433816109 0.207504053786451 ENSG00000155657:ENST00000473181:exon_179406009_179406311:TTN;ENSG00000155657:ENST00000460472:exon_179406009_179406311:TTN;ENSG00000155657:ENST00000359218:exon_179406009_179406311:TTN;ENSG00000155657:ENST00000356127:exon_179406009_179406311:TTN;ENSG00000155657:ENST00000342175:exon_179406009_179406311:TTN;ENSG00000155657:ENST00000342992:exon_179406009_179406311:TTN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 180810180 C/T 1 56 60 116 26.4843357062979 31.6239260289665 -5.13959032266865 T:C C T 10 0.527065433816109 0.353465691764055 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 180810358 C/T 1 36 35 71 17.0256443826201 18.4472901835638 -1.42164580094374 T:C C T 10 0.527065433816109 0.812329725530216 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000404136:exon_180810348_180810442:CWC22 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 182780874 C/T 1 12 6 18 5.67521479420669 3.16239260289665 2.51282219131004 T:C C T 10 0.527065433816109 0.345457652895314 ENSG00000138434:ENST00000431877:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000320370:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000409001:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000261006:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000428267:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000454579:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000440623:exon_182779943_182781732:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000416081:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000491720:exon_182779943_182783402:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000409136:exon_182779943_182781154:SSFA2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 191064753 C/T 1 25 9 34 11.8233641545973 4.74358890434498 7.07977525025229 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0159010908484800 ENSG00000187699:ENST00000396974:exon_191064423_191065205:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409545:exon_191064423_191064789:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409870:exon_191064423_191064935:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000340623:exon_191064423_191068210:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000443551:exon_191064423_191064940:C2orf88 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 191161622 T/C 1 10 16 26 4.72934566183891 8.43304694105774 -3.70370127921884 T:C T C 10 0.527065433816109 0.170685024102423 ENSG00000198130:ENST00000392332:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000359678:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000392331:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000409934:exon_191161539_191161679:HIBCH HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 191184475 A/G 1 8 10 18 3.78347652947113 5.27065433816109 -1.48717780868996 A:G A G 10 0.527065433816109 0.49133381096339 ENSG00000198130:ENST00000392332:exon_191184442_191184616:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000359678:exon_191184442_191184771:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000392331:exon_191184442_191184771:HIBCH HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 191235610 A/G 1 9 18 27 4.25641109565502 9.48717780868996 -5.23076671303494 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0532568708901856 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191235570_191236390:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191235570_191236391:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000470892:exon_191235570_191235767:INPP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 191301368 A/G 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 A:G A G 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000151690:ENST00000392328:exon_191300703_191302287:MFSD6;ENSG00000151690:ENST00000281416:exon_191300638_191302287:MFSD6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 198257795 T/C 1 106 108 214 50.1310640154924 56.9230668521398 -6.79200283664733 T:C T C 10 0.527065433816109 0.373679371669087 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198257696_198257912:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000479532:exon_198257696_198258075:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000424674:exon_198257776_198257912:SF3B1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 198265526 A/G 1 46 69 115 21.754990044459 36.3675149333115 -14.6125248888525 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0066839518316009 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198265439_198265660:SF3B1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 198283305 T/C 1 16 20 36 7.56695305894226 10.5413086763222 -2.97435561737993 T:C T C 10 0.527065433816109 0.404326898078554 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198283233_198283312:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000470268:exon_198283233_198284839:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000482158:exon_198283233_198283686:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000409915:exon_198283233_198283312:SF3B1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 198362018 T/C 1 193 211 404 91.276371273491 111.210806535199 -19.9344352617081 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0518660742912829 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000486181:exon_198361864_198362231:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198361615_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198361892_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198362009_198362116:HSPD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 201253956 A/G 1 6 8 14 2.83760739710335 4.21652347052887 -1.37891607342553 A:G A G 10 0.527065433816109 0.59467204210446 ENSG00000196141:ENST00000439084:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409718:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000358677:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409988:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000439395:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000444012:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000451764:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000360760:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000423749:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000471601:exon_201253946_201255577:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000457757:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000428692:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000453663:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409140:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000459656:exon_201253946_201255591:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409397:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409755:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409151:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000421573:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000449647:exon_201253946_201254006:SPATS2L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 201354935 C/G 1 24 33 57 11.3504295884134 17.3931593159316 -6.04272972751821 C:G C G 10 0.527065433816109 0.113222797637748 ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201353675_201355339:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201353681_201355339:KCTD18 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 201355106 G/A 1 25 18 43 11.8233641545973 9.48717780868996 2.33618634590731 A:G G A 10 0.527065433816109 0.542438582027985 ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201353675_201355339:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201353681_201355339:KCTD18 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 201437214 A/G 1 18 8 26 8.51282219131004 4.21652347052887 4.29629872078117 A:G A G 10 0.527065433816109 0.115642458787279 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 201437334 T/C 1 13 17 30 6.14814936039058 8.96011237487385 -2.81196301448327 T:C T C 10 0.527065433816109 0.361765470838631 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 201736112 T/C 1 73 20 93 34.524223331424 10.5413086763222 23.9829146551019 T:C T C 10 0.527065433816109 3.54219214441978e-07 ENSG00000240344:ENST00000286175:exon_201735630_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000392283:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000465823:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000234288:exon_201735680_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000415562:exon_201735875_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409264:exon_201735936_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409361:exon_201735953_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409449:exon_201735990_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000463866:exon_201736097_201736244:PPIL3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 201736166 A/C 1 78 19 97 36.8888961623435 10.0142432425061 26.8746529198374 A:C A C 10 0.527065433816109 1.7985747034696e-08 ENSG00000240344:ENST00000422134:exon_201736166_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000286175:exon_201735630_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000392283:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000465823:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000234288:exon_201735680_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000415562:exon_201735875_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409264:exon_201735936_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409361:exon_201735953_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409449:exon_201735990_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000463866:exon_201736097_201736244:PPIL3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 201768238 C/T 1 25 21 46 11.8233641545973 11.0683741101383 0.754990044458983 T:C C T 10 0.527065433816109 0.883192822161537 ENSG00000196290:ENST00000416651:exon_201768217_201768655:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000419903:exon_201768217_201768655:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000358515:exon_201768217_201768646:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000403702:exon_201768217_201768646:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409020:exon_201768217_201768653:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000359683:exon_201768217_201768653:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409357:exon_201768217_201768619:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409588:exon_201768217_201768648:NIF3L1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 201785837 G/A 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000115942:ENST00000234296:exon_201785716_201785862:ORC2;ENSG00000115942:ENST00000464147:exon_201785716_201785862:ORC2;ENSG00000115942:ENST00000487853:exon_201785716_201786461:ORC2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 202006096 G/A 1 11 45 56 5.2022802280228 23.7179445217249 -18.5156642937021 A:G G A 10 0.527065433816109 5.7375755083183e-07 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 202025621 A/G 1 30 46 76 14.1880369855167 24.245009955541 -10.0569729700243 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0217142891134632 ENSG00000003402:ENST00000309955:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000443227:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000340870:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000343375:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000341582:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000423241:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000457277:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000479953:exon_202025155_202025760:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000474842:exon_202025155_202025665:CFLAR HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 202245244 A/G 1 7 6 13 3.31054196328724 3.16239260289665 0.148149360390583 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000115993:ENST00000332624:exon_202241930_202245941:TRAK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 208478055 A/G 1 17 15 32 8.03988762512615 7.90598150724164 0.133906117884511 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208473839_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208476828_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208477447_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208477451_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208477467_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208477567_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208477704_208478167:FAM119A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 208489101 C/A 1 14 7 21 6.62108392657447 3.68945803671276 2.93162588986171 A:C C A 10 0.527065433816109 0.274579453085168 ENSG00000144401:ENST00000432416:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000458426:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000425132:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000461419:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208488953_208489275:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208488953_208489124:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208488953_208489290:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000471128:exon_208488953_208489128:FAM119A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 209108317 C/T 1 13 13 26 6.14814936039058 6.85185063960942 -0.703701279218835 T:C C T 10 0.527065433816109 0.84562040810587 ENSG00000138413:ENST00000345146:exon_209108151_209108328:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000423977:exon_209108151_209108328:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000446179:exon_209108151_209108328:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000415913:exon_209108151_209108328:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000441842:exon_209108151_209108328:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000454793:exon_209108211_209108328:IDH1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 209113192 G/A 1 12 10 22 5.67521479420669 5.27065433816109 0.404560456045601 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000138413:ENST00000345146:exon_209113093_209113384:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000423977:exon_209113093_209113384:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000446179:exon_209113093_209113384:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000415913:exon_209113093_209113384:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000454793:exon_209113090_209113384:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000432663:exon_209113093_209113384:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000415282:exon_209113093_209113384:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000462386:exon_209112106_209113384:IDH1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 216904019 A/T 1 5 13 18 2.36467283091945 6.85185063960942 -4.48717780868996 A:T A T 10 0.527065433816109 0.0558624418352255 ENSG00000115425:ENST00000442122:exon_216903914_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000448681:exon_216903112_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000265322:exon_216903132_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000461330:exon_216903979_216904083:PECR HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 216923679 C/T 1 6 5 11 2.83760739710335 2.63532716908055 0.202280228022801 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000115425:ENST00000265322:exon_216923618_216923699:PECR;ENSG00000115425:ENST00000461330:exon_216923618_216923699:PECR;ENSG00000115425:ENST00000497889:exon_216923618_216923699:PECR HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 217012901 A/G 1 106 70 176 50.1310640154924 36.8945803671276 13.2364836483648 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0495403505608473 ENSG00000079246:ENST00000392133:exon_217012806_217012999:XRCC5;ENSG00000079246:ENST00000392132:exon_217012806_217012999:XRCC5;ENSG00000079246:ENST00000328063:exon_217012806_217012999:XRCC5;ENSG00000079246:ENST00000460284:exon_217012806_217012999:XRCC5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 217288388 G/C 1 12 15 27 5.67521479420669 7.90598150724164 -2.23076671303494 T:C:G G C 10 0.527065433816109 0.443412923825397 ENSG00000138375:ENST00000357276:exon_217288356_217288406:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000358207:exon_217288356_217288406:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000392128:exon_217288356_217288406:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000412913:exon_217288356_217288406:SMARCAL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 217315787 T/C 1 24 20 44 11.3504295884134 10.5413086763222 0.809120912091203 T:C T C 10 0.527065433816109 0.880472588106527 ENSG00000138375:ENST00000357276:exon_217315569_217315787:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000358207:exon_217315569_217315787:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000392128:exon_217315569_217315787:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000486983:exon_217315569_217316324:SMARCAL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 217363597 C/T 1 1514 968 2482 716.022933202411 510.199339933994 205.823593268417 A:T:C:G C T 10 0.527065433816109 1.03281773154338e-16 ENSG00000197756:ENST00000491306:exon_217362912_217363600:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000490649:exon_217363548_217363600:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000478153:exon_217363548_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000487233:exon_217363567_217363600:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000446558:exon_217363578_217363600:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000420712:exon_217363585_217363600:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000359681:exon_217363590_217364121:RPL37A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 217363638 G/A 1 17 2 19 8.03988762512615 1.05413086763222 6.98575675749393 A:G G A 10 0.527065433816109 0.000964118492781663 ENSG00000197756:ENST00000478153:exon_217363548_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000359681:exon_217363590_217364121:RPL37A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 219563910 G/A 1 4 9 13 1.89173826473556 4.74358890434498 -2.85185063960942 A:G G A 10 0.527065433816109 0.163735013053684 ENSG00000163482:ENST00000295709:exon_219563325_219564071:STK36;ENSG00000163482:ENST00000392106:exon_219563325_219564071:STK36;ENSG00000163482:ENST00000392105:exon_219563325_219564071:STK36;ENSG00000163482:ENST00000440309:exon_219563325_219564071:STK36;ENSG00000163482:ENST00000431040:exon_219563325_219564071:STK36;ENSG00000163482:ENST00000419433:exon_219563325_219564071:STK36 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 220087088 T/G 1 22 13 35 10.4045604560456 6.85185063960942 3.55270981643618 T:G T G 10 0.527065433816109 0.241322609328583 ENSG00000198925:ENST00000446716:exon_220086994_220087172:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409033:exon_220086994_220087172:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000396761:exon_220086994_220087172:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409618:exon_220086994_220087172:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000361242:exon_220086994_220087172:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409422:exon_220086994_220087172:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000429920:exon_220086994_220087172:ATG9A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 220100787 C/T 1 38 37 75 17.9715135149879 19.501421051196 -1.52990753620818 T:C C T 10 0.527065433816109 0.73026740330791 ENSG00000163516:ENST00000323348:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000466238:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000409849:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000477479:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000463792:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000419723:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000410034:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000460966:exon_220100732_220101373:ANKZF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 220250232 G/C 1 23 23 46 10.8774950222295 12.1225049777705 -1.24500995554101 C:G G C 10 0.527065433816109 0.76863739181059 ENSG00000123992:ENST00000273075:exon_220250146_220250253:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373972:exon_220250146_220250253:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000523282:exon_220250146_220250253:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373963:exon_220250146_220250253:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373966:exon_220250146_220250253:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000337010:exon_220250146_220250253:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000429013:exon_220250146_220250253:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000460963:exon_220249308_220250253:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000522421:exon_220249876_220250253:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000322176:exon_220250153_220250253:DNPEP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 220404648 C/T 1 22 40 62 10.4045604560456 21.0826173526444 -10.6780568965988 T:C C T 10 0.527065433816109 0.00731331589228059 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 220404726 G/A 1 19 39 58 8.98575675749393 20.5555519188283 -11.5697951613343 A:G G A 10 0.527065433816109 0.00239797754074362 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 220405230 G/A 1 17 16 33 8.03988762512615 8.43304694105774 -0.393159315931598 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 220406722 T/C 1 20 16 36 9.45869132367782 8.43304694105774 1.02564438262007 T:C T C 10 0.527065433816109 0.867743765953611 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220406338_220406911:CHPF;ENSG00000123989:ENST00000373891:exon_220406182_220406911:CHPF HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 223436607 C/T 1 160 105 265 75.6695305894225 55.3418705506914 20.3276600387311 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0137259661487310 ENSG00000116120:ENST00000281828:exon_223435255_223436741:FARSB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 225346646 T/C 1 63 70 133 29.7948776695851 36.8945803671276 -7.0997026975425 T:C T C 10 0.527065433816109 0.224987732020354 ENSG00000036257:ENST00000264414:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000344951:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409096:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409777:exon_225346609_225346795:CUL3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 225761024 C/T 1 8 2 10 3.78347652947113 1.05413086763222 2.72934566183891 T:C C T 10 0.527065433816109 0.114525614534534 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225761012_225761094:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225761012_225761094:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225761012_225761094:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000492369:exon_225761012_225761094:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000471810:exon_225761012_225761094:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000474102:exon_225761012_225761094:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000435582:exon_225761012_225761094:DOCK10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 231042276 A/G 1 58 62 120 27.4302048386657 32.6780568965988 -5.24785205793308 A:G A G 10 0.527065433816109 0.36109277537786 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000489597:exon_231042082_231042396:SP110 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 231072709 C/T 1 38 29 67 17.9715135149879 15.2848975806672 2.68661593432069 T:C C T 10 0.527065433816109 0.542393160293233 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000490880:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231072706_231072774:SP110 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 231077112 G/A 1 75 77 152 35.4700924637918 40.5840384038404 -5.11394594004857 A:G G A 10 0.527065433816109 0.417522692966466 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077064_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000455674:exon_231077111_231077145:SP110 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 231110582 C/T 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000079263:ENST00000350136:exon_231110578_231110655:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392044:exon_231110578_231110655:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392045:exon_231110578_231110655:SP140;ENSG00000079263:ENST00000417495:exon_231110578_231110655:SP140 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 231118041 A/C 1 5 16 21 2.36467283091945 8.43304694105774 -6.06837411013829 A:C A C 10 0.527065433816109 0.0085261785713212 ENSG00000079263:ENST00000392045:exon_231118031_231118132:SP140 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 231149097 T/C 1 6 9 15 2.83760739710335 4.74358890434498 -1.90598150724164 T:C T C 10 0.527065433816109 0.439435430476406 ENSG00000079263:ENST00000350136:exon_231149061_231149126:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392045:exon_231149061_231149126:SP140;ENSG00000079263:ENST00000417495:exon_231149061_231149126:SP140;ENSG00000079263:ENST00000343805:exon_231149061_231149126:SP140;ENSG00000079263:ENST00000420434:exon_231149061_231149126:SP140;ENSG00000079263:ENST00000476126:exon_231149061_231149126:SP140 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 231222655 G/T 1 7 5 12 3.31054196328724 2.63532716908055 0.675214794206692 T:G G T 10 0.527065433816109 0.778351128206284 ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000458341:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231222518_231222682:SP140L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 231222675 T/C 1 9 5 14 4.25641109565502 2.63532716908055 1.62108392657447 T:C T C 10 0.527065433816109 0.433551468090942 ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000458341:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231222518_231222682:SP140L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 231248261 C/T 1 6 5 11 2.83760739710335 2.63532716908055 0.202280228022801 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000079263:ENST00000486687:exon_231248225_231248290:SP140;ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000483728:exon_231248225_231248290:SP140L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 231333763 A/G 1 122 91 213 57.6980170744347 47.9629544772659 9.73506259716877 A:G A G 10 0.527065433816109 0.192509166160866 ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000413284:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000452345:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494508:exon_231333547_231333811:SP100 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 231406070 G/A 1 7 8 15 3.31054196328724 4.21652347052887 -0.905981507241636 A:G G A 10 0.527065433816109 0.797198000532565 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231406016_231406087:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231406016_231406087:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231406016_231406087:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231406016_231406087:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231406016_231406087:SP100 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 231407663 C/T 1 25 25 50 11.8233641545973 13.1766358454027 -1.35327169080545 T:C C T 10 0.527065433816109 0.77744172481451 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231407551_231407898:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231407551_231410317:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231407551_231408805:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231407551_231407837:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231407551_231408805:SP100 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 231774844 G/A 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 A:G G A 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000135898:ENST00000444078:exon_231774337_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392040:exon_231772043_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392039:exon_231774581_231775811:GPR55 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 232035429 G/A 1 60 96 156 28.3760739710335 50.5982816463465 -22.222207675313 A:G G A 10 0.527065433816109 0.000394065698615918 ENSG00000173692:ENST00000308696:exon_232035280_232035435:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000373635:exon_232035280_232035435:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000491229:exon_232035116_232035435:PSMD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 233925166 G/A 1 6 15 21 2.83760739710335 7.90598150724164 -5.06837411013829 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0295301958115794 ENSG00000168918:ENST00000422935:exon_233924677_233925322:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000451407:exon_233925062_233925322:INPP5D HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 234113057 G/A 1 70 55 125 33.1054196328724 28.988598859886 4.11682077298637 A:G G A 10 0.527065433816109 0.474931849080931 ENSG00000168918:ENST00000359570:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000450745:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000455936:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000415617:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000445964:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000435188:exon_234112772_234113363:INPP5D HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 234386134 A/G 1 6 13 19 2.83760739710335 6.85185063960942 -4.01424324250607 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0701843497785835 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234384166_234386149:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234384172_234386149:USP40;ENSG00000085982:ENST00000483519:exon_234384172_234386149:USP40 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 234394487 G/A 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 A:G G A 10 0.527065433816109 0.160556933333404 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000483519:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000450940:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000496298:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000454354:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000473191:exon_234394413_234394623:USP40 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 234394569 A/G 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 A:G A G 10 0.527065433816109 0.488810537661758 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000483519:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000450940:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000496298:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000454354:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000473191:exon_234394413_234394623:USP40 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 234750542 G/C 1 23 23 46 10.8774950222295 12.1225049777705 -1.24500995554101 C:G G C 10 0.527065433816109 0.76863739181059 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 234750831 T/C 1 12 6 18 5.67521479420669 3.16239260289665 2.51282219131004 T:C T C 10 0.527065433816109 0.345457652895314 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000453122:exon_234750762_234750851:HJURP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 238668802 A/G 1 30 42 72 14.1880369855167 22.1367482202766 -7.94871123475985 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0759516071546024 ENSG00000124831:ENST00000308482:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000391999:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000483443:exon_238668707_238668848:LRRFIP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 238671328 A/G 1 83 60 143 39.253568993263 31.6239260289665 7.62964296429641 A:G A G 10 0.527065433816109 0.209824685520631 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 238671609 A/G 1 134 98 232 63.3732318686414 51.6524125139787 11.7208193546627 A:G A G 10 0.527065433816109 0.130564386134213 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 238671889 G/A 1 180 114 294 85.1282219131004 60.0854594550364 25.0427624580639 A:G G A 10 0.527065433816109 0.00346314740101492 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 238671940 C/T 1 219 173 392 103.572669994272 91.1823200501869 12.3903499440853 T:C C T 10 0.527065433816109 0.224750177301340 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 238672703 C/G 1 144 155 299 68.1025775304803 81.6951422414969 -13.5925647110166 C:G C G 10 0.527065433816109 0.118127795496662 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 238672795 C/T 1 96 112 208 45.4017183536535 59.0313285874042 -13.6296102337507 A:T:C C T 10 0.527065433816109 0.0609000673122228 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 239006879 C/T 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 T:C C T 10 0.527065433816109 0.757490641773051 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_239006843_239008053:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_239006843_239008054:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000429612:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_239006811_239008054:SCLY HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 239162038 A/G 1 6 2 8 2.83760739710335 1.05413086763222 1.78347652947113 A:G A G 10 0.527065433816109 0.29481715391141 ENSG00000132326:ENST00000254657:exon_239161553_239162343:PER2;ENSG00000132326:ENST00000254658:exon_239161553_239162343:PER2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 239241527 T/C 1 6 2 8 2.83760739710335 1.05413086763222 1.78347652947113 T:C T C 10 0.527065433816109 0.29481715391141 ENSG00000204104:ENST00000373327:exon_239241465_239241536:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391993:exon_239241465_239241536:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391994:exon_239241465_239241536:TRAF3IP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 240961728 T/C 1 34 21 55 16.0797752502523 11.0683741101383 5.011401140114 T:C T C 10 0.527065433816109 0.180298853729486 ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000407129:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000497536:exon_240961589_240961757:NDUFA10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 241463595 T/C 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000144504:ENST00000373318:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000272972:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000361678:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000391987:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000403283:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000401804:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000373320:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000405523:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000405002:exon_241461355_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000480230:exon_241461356_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000484526:exon_241461356_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000459901:exon_241462675_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000496300:exon_241463240_241463798:ANKMY1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 241500896 C/T 1 4 9 13 1.89173826473556 4.74358890434498 -2.85185063960942 T:C C T 10 0.527065433816109 0.163735013053684 ENSG00000188542:ENST00000343217:exon_241500747_241500936:DUSP28;ENSG00000188542:ENST00000405954:exon_241500747_241503431:DUSP28;ENSG00000188542:ENST00000438823:exon_241500747_241500936:DUSP28 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 241537421 G/A 1 7 11 18 3.31054196328724 5.7977197719772 -2.48717780868996 A:G G A 10 0.527065433816109 0.249990861970352 ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000352879:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000357048:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000416591:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000354082:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000391983:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000493058:exon_241537305_241537504:CAPN10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 242036797 A/G 1 26 27 53 12.2962987207812 14.2307667130349 -1.93446799225378 A:G A G 10 0.527065433816109 0.680255744497599 ENSG00000122085:ENST00000241527:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000455202:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000493169:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000414146:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000391980:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000406593:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000439144:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000424798:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000460915:exon_242036341_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000407095:exon_242036602_242036842:MTERFD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 242046785 A/C 1 112 73 185 52.9686714125958 38.475776668576 14.4928947440198 A:C A C 10 0.527065433816109 0.0329193027704225 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000472072:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242046768_242046914:PASK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 242051777 G/A 1 54 11 65 25.5384665739301 5.7977197719772 19.7407468019529 A:G G A 10 0.527065433816109 5.53976121859983e-07 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000489256:exon_242051655_242052201:PASK;ENSG00000115687:ENST00000475666:exon_242051655_242051840:PASK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 242066314 T/C 1 27 21 48 12.7692332869651 11.0683741101383 1.70085917682677 T:C T C 10 0.527065433816109 0.666365310723135 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 242082262 T/C 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 T:C T C 10 0.527065433816109 0.757490641773051 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242082252_242082489:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242082252_242082489:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242082252_242082489:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242082252_242082489:PASK;ENSG00000115687:ENST00000437780:exon_242082252_242082489:PASK;ENSG00000115687:ENST00000452907:exon_242082252_242082489:PASK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 242435042 C/T 1 87 70 157 41.1453072579985 36.8945803671276 4.25072689087088 T:C C T 10 0.527065433816109 0.523081870393221 ENSG00000115694:ENST00000316586:exon_242432089_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000403346:exon_242434432_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000401869:exon_242434434_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000405883:exon_242434437_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000494699:exon_242434461_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000487962:exon_242434465_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000405585:exon_242434664_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000478403:exon_242434863_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000470438:exon_242434905_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000465009:exon_242434953_242435116:STK25 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 242573211 T/C 1 45 59 104 21.2820554782751 31.0968605951504 -9.81480511687534 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0617202270460722 ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 242610738 T/C 1 41 26 67 19.3903172135395 13.7037012792188 5.68661593432069 T:C T C 10 0.527065433816109 0.179284906782832 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610727_242610840:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610727_242612014:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610727_242612046:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610727_242610781:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610727_242610984:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242610727_242611332:ATG4B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 2 242618050 A/G 1 18 42 60 8.51282219131004 22.1367482202766 -13.6239260289665 A:G A G 10 0.527065433816109 0.000427524168155161 ENSG00000168393:ENST00000305784:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000400770:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000472618:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000445261:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000432348:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000420144:exon_242617867_242618064:DTYMK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 256727 T/A 1 9 2 11 4.25641109565502 1.05413086763222 3.2022802280228 A:T T A 10 0.527065433816109 0.0696872224921074 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_256609_256727:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_256609_256727:C20orf96 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 256763 G/C 1 8 1 9 3.78347652947113 0.527065433816109 3.25641109565502 C:G G C 10 0.527065433816109 0.0415432498690979 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 257733 A/G 1 9 10 19 4.25641109565502 5.27065433816109 -1.01424324250607 A:G A G 10 0.527065433816109 0.654162232160302 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_257457_257786:C20orf96 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 259818 G/A 1 7 4 11 3.31054196328724 2.10826173526444 1.2022802280228 A:G G A 10 0.527065433816109 0.555399509917260 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_259813_259971:C20orf96 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 278806 C/T 1 35 42 77 16.5527098164362 22.1367482202766 -5.5840384038404 T:C C T 10 0.527065433816109 0.210972200220687 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 279483 T/C 1 57 52 109 26.9572702724818 27.4074025584377 -0.450132285955885 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 368735 C/T 1 22 15 37 10.4045604560456 7.90598150724164 2.49857894880397 T:C C T 10 0.527065433816109 0.510756997645196 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_368655_368945:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000449710:exon_368655_368945:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000485293:exon_368655_368814:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_368655_368945:TRIB3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 368761 G/A 1 14 21 35 6.62108392657447 11.0683741101383 -4.44729018356382 A:G G A 10 0.527065433816109 0.174853592434960 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_368655_368945:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000449710:exon_368655_368945:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000485293:exon_368655_368814:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_368655_368945:TRIB3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 368905 A/G 1 30 25 55 14.1880369855167 13.1766358454027 1.011401140114 A:G A G 10 0.527065433816109 0.89274393257936 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_368655_368945:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000449710:exon_368655_368945:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_368655_368945:TRIB3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 371972 T/C 1 24 18 42 11.3504295884134 9.48717780868996 1.86325177972342 T:C T C 10 0.527065433816109 0.643885642884425 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000449710:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_371931_372223:TRIB3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 377226 C/T 1 67 44 111 31.6866159343207 23.1908790879088 8.4957368464119 T:C C T 10 0.527065433816109 0.127909614317142 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_376842_378203:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_376842_378197:TRIB3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 391025 T/C 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 T:C T C 10 0.527065433816109 0.757490641773051 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 825678 T/C 1 19 13 32 8.98575675749393 6.85185063960942 2.13390611788451 T:C T C 10 0.527065433816109 0.483562767697165 ENSG00000125898:ENST00000381941:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000304189:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000381939:exon_825354_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000246100:exon_825351_826922:FAM110A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 1099339 C/T 1 55 53 108 26.011401140114 27.9344679922538 -1.92306685213978 T:C C T 10 0.527065433816109 0.772672700574295 ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1099253_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000461847:exon_1099270_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1099295_1099545:PSMF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 1426393 C/T 1 45 37 82 21.2820554782751 19.501421051196 1.78063442707906 T:C:G C T 10 0.527065433816109 0.74064914872008 ENSG00000088833:ENST00000216879:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000353088:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381658:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000461211:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000476071:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000350991:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381653:exon_1426311_1426794:NSFL1C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 3204084 G/A 1 90 109 199 42.5641109565502 57.4501322859559 -14.8860213294057 A:G G A 10 0.527065433816109 0.039276993237673 ENSG00000125877:ENST00000483354:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000380113:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000455664:exon_3204012_3204504:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000490838:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000460550:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000399838:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000461029:exon_3204012_3204095:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000472295:exon_3204012_3204516:ITPA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 5166418 G/A 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 A:G G A 10 0.527065433816109 0.488810537661758 ENSG00000101290:ENST00000460006:exon_5166404_5166472:CDS2;ENSG00000101290:ENST00000379062:exon_5166404_5166472:CDS2;ENSG00000101290:ENST00000450570:exon_5166404_5166472:CDS2;ENSG00000101290:ENST00000468817:exon_5166404_5166472:CDS2;ENSG00000101290:ENST00000379070:exon_5166404_5166472:CDS2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 5843812 T/C 1 8 15 23 3.78347652947113 7.90598150724164 -4.12250497777051 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0967595787231926 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000378971:exon_5843670_5843920:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000445603:exon_5843670_5843854:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000442185:exon_5843670_5843950:C20orf196 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 5844121 C/T 1 23 26 49 10.8774950222295 13.7037012792188 -2.82620625698934 T:C C T 10 0.527065433816109 0.475190656882952 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 5844122 A/G 1 23 28 51 10.8774950222295 14.7578321468511 -3.88033712462156 A:G A G 10 0.527065433816109 0.326511207268883 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 6011934 C/T 1 32 21 53 15.1339061178845 11.0683741101383 4.06553200774622 T:C C T 10 0.527065433816109 0.274637085499918 ENSG00000088766:ENST00000378863:exon_6011931_6012016:CRLS1;ENSG00000088766:ENST00000378868:exon_6011931_6012016:CRLS1;ENSG00000088766:ENST00000489345:exon_6011931_6012016:CRLS1;ENSG00000088766:ENST00000464921:exon_6011931_6012016:CRLS1;ENSG00000088766:ENST00000478846:exon_6011809_6012016:CRLS1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 7963041 C/T 1 24 44 68 11.3504295884134 23.1908790879088 -11.8404494994954 T:C C T 10 0.527065433816109 0.00489298088952276 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7957995_7963268:TMX4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 7967980 G/C 1 6 2 8 2.83760739710335 1.05413086763222 1.78347652947113 C:G G C 10 0.527065433816109 0.29481715391141 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7967935_7968036:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000527925:exon_7967935_7968036:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000462384:exon_7967957_7968036:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000530935:exon_7967971_7968036:TMX4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 7980390 C/T 1 7 4 11 3.31054196328724 2.10826173526444 1.2022802280228 T:C C T 10 0.527065433816109 0.555399509917260 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7980379_7980507:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000527925:exon_7980379_7980469:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000462384:exon_7980379_7980507:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000530935:exon_7980379_7980507:TMX4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 13695680 C/T 1 31 33 64 14.6609715517006 17.3931593159316 -2.73218776423098 T:C C T 10 0.527065433816109 0.532459202195631 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13694969_13695814:ESF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 13747441 A/G 1 33 28 61 15.6068406840684 14.7578321468511 0.849008537217349 A:G A G 10 0.527065433816109 0.89821356604899 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13747424_13747571:ESF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 17596155 C/A 1 11 14 25 5.2022802280228 7.37891607342553 -2.17663584540273 A:C C A 10 0.527065433816109 0.426973917354727 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17596076_17596174:RRBP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 17597482 G/A 1 22 30 52 10.4045604560456 15.8119630144833 -5.40740255843767 A:G G A 10 0.527065433816109 0.164378247730046 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17597377_17597484:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17597377_17597484:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17597377_17597484:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17597377_17597484:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17597377_17597484:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17597377_17597484:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17597377_17597484:RRBP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 17608170 C/T 1 17 15 32 8.03988762512615 7.90598150724164 0.133906117884511 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000495501:exon_17608149_17608327:RRBP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 18142564 A/G 1 6 8 14 2.83760739710335 4.21652347052887 -1.37891607342553 A:G A G 10 0.527065433816109 0.59467204210446 ENSG00000149474:ENST00000278816:exon_18142464_18142883:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000377681:exon_18142467_18142883:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000435364:exon_18142464_18142883:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000489634:exon_18142464_18142883:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000434922:exon_18142467_18142883:CSRP2BP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 18513372 C/T 1 31 14 45 14.6609715517006 7.37891607342553 7.28205547827509 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0357732281117833 ENSG00000101310:ENST00000457769:exon_18513308_18513388:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377481:exon_18513308_18513388:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000336714:exon_18513308_18513388:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000262544:exon_18513308_18513388:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377475:exon_18513308_18513388:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377465:exon_18513308_18513388:SEC23B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 20032998 T/C 1 5 9 14 2.36467283091945 4.74358890434498 -2.37891607342553 T:C T C 10 0.527065433816109 0.284872281969498 ENSG00000101343:ENST00000377327:exon_20032936_20033366:CRNKL1;ENSG00000101343:ENST00000377340:exon_20032936_20033402:CRNKL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 30753270 T/C 1 24 29 53 11.3504295884134 15.2848975806672 -3.93446799225378 T:C T C 10 0.527065433816109 0.335683375125894 ENSG00000101337:ENST00000398022:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000375795:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000421148:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000217315:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000413032:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000495749:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000479591:exon_30753098_30753390:TM9SF4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 31291161 C/T 1 65 56 121 30.7407468019529 29.5156642937021 1.22508250825081 T:C C T 10 0.527065433816109 0.855825374895588 ENSG00000149600:ENST00000278980:exon_31290493_31291260:COMMD7;ENSG00000149600:ENST00000446419:exon_31290494_31291260:COMMD7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 31427635 C/T 1 51 49 100 24.1196628753784 25.8262062569893 -1.70654338161091 T:C C T 10 0.527065433816109 0.764340672640551 ENSG00000101367:ENST00000375571:exon_31427541_31427662:MAPRE1;ENSG00000101367:ENST00000414525:exon_31427541_31427662:MAPRE1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 31981849 T/C 1 10 4 14 4.72934566183891 2.10826173526444 2.62108392657447 T:C T C 10 0.527065433816109 0.18849020884602 ENSG00000101391:ENST00000481964:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000346416:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000357886:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000339269:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000473997:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000375351:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000452723:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000477105:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000461356:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 32212690 C/T 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000078699:ENST00000375279:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000342704:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000346541:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000397800:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000492345:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000359606:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000397803:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000491618:exon_32212570_32212823:CBFA2T2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 32295541 C/T 1 8 13 21 3.78347652947113 6.85185063960942 -3.06837411013829 T:C C T 10 0.527065433816109 0.196016840944122 ENSG00000101417:ENST00000409299:exon_32294512_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000344022:exon_32295075_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000217398:exon_32295295_32295775:PXMP4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 32379263 T/C 1 7 3 10 3.31054196328724 1.58119630144833 1.72934566183891 T:C T C 10 0.527065433816109 0.350932787230552 ENSG00000131061:ENST00000342427:exon_32378794_32380075:ZNF341;ENSG00000131061:ENST00000375200:exon_32378794_32380075:ZNF341;ENSG00000131061:ENST00000497876:exon_32378794_32380075:ZNF341;ENSG00000131061:ENST00000483118:exon_32378794_32380075:ZNF341;ENSG00000131061:ENST00000493497:exon_32378794_32380075:ZNF341 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 33703607 C/T 1 57 46 103 26.9572702724818 24.245009955541 2.71226031694077 T:C C T 10 0.527065433816109 0.622611961491133 ENSG00000088298:ENST00000374491:exon_33703160_33703736:EDEM2;ENSG00000088298:ENST00000374492:exon_33703167_33703736:EDEM2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 33872311 G/C 1 17 20 37 8.03988762512615 10.5413086763222 -2.50142105119603 C:G G C 10 0.527065433816109 0.416458168600068 ENSG00000242372:ENST00000440766:exon_33872184_33872326:EIF6;ENSG00000242372:ENST00000374436:exon_33872184_33872518:EIF6;ENSG00000242372:ENST00000462894:exon_33872184_33872505:EIF6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 34090519 G/A 1 10 9 19 4.72934566183891 4.74358890434498 -0.0142432425060717 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000126001:ENST00000397527:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000356095:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000342580:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000425525:exon_34090218_34090632:CEP250 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 34144746 A/G 1 232 231 463 109.720819354663 121.752115211521 -12.0312958568585 A:G A G 10 0.527065433816109 0.264390951339404 ENSG00000125991:ENST00000348547:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000357394:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000447986:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000355563:exon_34144744_34144830:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000279052:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000416206:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000413587:exon_34144744_34144837:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000465298:exon_34144744_34144867:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000442139:exon_34144648_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000451605:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488935:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488384:exon_34144381_34144880:ERGIC3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 34214173 G/A 1 185 156 341 87.4928947440198 82.222207675313 5.27068706870681 A:G G A 10 0.527065433816109 0.587799253817316 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34213953_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000415920:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000462352:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000498814:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000473373:exon_34213966_34214725:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34213980_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34213988_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34214008_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34214081_34214303:CPNE1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 34219480 G/A 1 127 105 232 60.0626899053542 55.3418705506914 4.72081935466271 A:G G A 10 0.527065433816109 0.554426057606613 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000412056:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000486021:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414664:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000416778:exon_34219416_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439806:exon_34219434_34219500:CPNE1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 34219496 T/C 1 102 93 195 48.2393257507569 49.0170853448981 -0.777759594141266 T:C T C 10 0.527065433816109 0.942873841068575 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000412056:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000486021:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414664:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000416778:exon_34219416_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439806:exon_34219434_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439669:exon_34219481_34219500:CPNE1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 34220755 C/T 1 35 46 81 16.5527098164362 24.245009955541 -7.69230013910483 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0952492107022258 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000412056:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414664:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000416778:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439806:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439669:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000420363:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000434795:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000440240:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000458038:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437100:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414711:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000435747:exon_34220717_34220845:CPNE1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 34243017 C/T 1 39 29 68 18.4444480811717 15.2848975806672 3.15955050050458 T:C C T 10 0.527065433816109 0.468180370582603 ENSG00000244462:ENST00000374114:exon_34236847_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000359646:exon_34238064_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000374104:exon_34238248_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000424458:exon_34242372_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000431148:exon_34242815_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000435161:exon_34242843_34243266:RBM12 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 36770588 C/T 1 4 7 11 1.89173826473556 3.68945803671276 -1.7977197719772 T:C C T 10 0.527065433816109 0.36886039388561 ENSG00000198959:ENST00000361475:exon_36770466_36770601:TGM2;ENSG00000198959:ENST00000485572:exon_36770466_36770601:TGM2;ENSG00000198959:ENST00000468262:exon_36770466_36770601:TGM2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 37396120 A/G 1 14 13 27 6.62108392657447 6.85185063960942 -0.230766713034944 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37396107_37396239:ACTR5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 37400490 G/A 1 23 2 25 10.8774950222295 1.05413086763222 9.82336415459728 A:G G A 10 0.527065433816109 5.60778522657518e-05 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37400202_37400834:ACTR5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 37400506 C/T 1 22 3 25 10.4045604560456 1.58119630144833 8.82336415459728 T:C C T 10 0.527065433816109 0.000385736392458478 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37400202_37400834:ACTR5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 37555116 G/C 1 3 9 12 1.41880369855167 4.74358890434498 -3.32478520579331 C:G G C 10 0.527065433816109 0.0800200924234215 ENSG00000101447:ENST00000217429:exon_37554955_37555568:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000449225:exon_37555069_37555568:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000424027:exon_37555086_37555451:FAM83D HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 37667182 C/T 1 7 7 14 3.31054196328724 3.68945803671276 -0.378916073425526 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000101452:ENST00000373325:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373323:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000252011:exon_37667142_37668366:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373321:exon_37667142_37668363:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000484417:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000449559:exon_37667142_37667289:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000493450:exon_37667142_37668366:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000482619:exon_37667142_37667279:DHX35 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 42088666 C/T 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 T:C C T 10 0.527065433816109 0.757490641773051 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 42089511 T/C 1 277 165 442 131.002874832938 86.965796579658 44.0370782532798 T:C T C 10 0.527065433816109 2.63289847980242e-05 ENSG00000124193:ENST00000244020:exon_42089343_42092245:SRSF6;ENSG00000124193:ENST00000483871:exon_42089343_42092245:SRSF6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 42343821 C/G 1 78 57 135 36.8888961623435 30.0427297275182 6.84616643482528 C:G C G 10 0.527065433816109 0.262625941405052 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42343774_42343923:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42343774_42343923:MYBL2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 43530234 A/C 1 128 86 214 60.535624471538 45.3276273081854 15.2079971633527 A:C A C 10 0.527065433816109 0.0398941069033153 ENSG00000166913:ENST00000353703:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000479421:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000372839:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000428262:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000445830:exon_43530172_43530397:YWHAB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 44052992 G/A 1 25 27 52 11.8233641545973 14.2307667130349 -2.40740255843767 A:G G A 10 0.527065433816109 0.579040222476404 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44052856_44053021:PIGT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 44054349 T/C 1 45 51 96 21.2820554782751 26.8803371246216 -5.59828164634647 T:C T C 10 0.527065433816109 0.262243755375797 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44054214_44054884:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44054214_44054882:PIGT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 44420682 T/C 1 11 4 15 5.2022802280228 2.10826173526444 3.09401849275836 T:C T C 10 0.527065433816109 0.126517172009480 ENSG00000101457:ENST00000372622:exon_44420576_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372614:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372605:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000439990:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000449078:exon_44420659_44420748:DNTTIP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 44505973 T/C 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 T:C T C 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000132801:ENST00000255152:exon_44505353_44507761:ZSWIM3;ENSG00000132801:ENST00000454862:exon_44505353_44507767:ZSWIM3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 44512484 C/T 1 14 9 23 6.62108392657447 4.74358890434498 1.87749502222949 T:C C T 10 0.527065433816109 0.532747084553437 ENSG00000168612:ENST00000372523:exon_44511172_44513905:ZSWIM1;ENSG00000168612:ENST00000372520:exon_44511172_44513037:ZSWIM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 44596545 G/A 1 6 5 11 2.83760739710335 2.63532716908055 0.202280228022801 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44596373_44596666:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44596373_44596666:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000476822:exon_44596373_44596666:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000494955:exon_44596373_44597497:ZNF335 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 44750850 C/G 1 4 15 19 1.89173826473556 7.90598150724164 -6.01424324250607 C:G C G 10 0.527065433816109 0.0094497196601332 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 44979458 G/A 1 51 66 117 24.1196628753784 34.7863186318632 -10.6666557564848 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0518574376564051 ENSG00000080189:ENST00000317734:exon_44979400_44979529:SLC35C2;ENSG00000080189:ENST00000243896:exon_44979400_44979529:SLC35C2;ENSG00000080189:ENST00000372227:exon_44979400_44979529:SLC35C2;ENSG00000080189:ENST00000493599:exon_44978167_44979529:SLC35C2;ENSG00000080189:ENST00000372229:exon_44979400_44979529:SLC35C2;ENSG00000080189:ENST00000372230:exon_44979400_44979529:SLC35C2;ENSG00000080189:ENST00000372225:exon_44979400_44979529:SLC35C2;ENSG00000080189:ENST00000372223:exon_44979400_44979529:SLC35C2;ENSG00000080189:ENST00000480329:exon_44978994_44979529:SLC35C2;ENSG00000080189:ENST00000487729:exon_44979410_44979529:SLC35C2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 45318042 G/A 1 21 12 33 9.93162588986171 6.32478520579331 3.6068406840684 A:G G A 10 0.527065433816109 0.226444851651302 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45317771_45318418:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45317766_45318079:TP53RK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 45318069 C/G 1 28 13 41 13.2421678531489 6.85185063960942 6.39031721353953 C:G C G 10 0.527065433816109 0.0593354271638038 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45317771_45318418:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45317766_45318079:TP53RK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 45867852 A/G 1 17 14 31 8.03988762512615 7.37891607342553 0.66097155170062 A:G A G 10 0.527065433816109 0.858827214622317 ENSG00000101040:ENST00000360911:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000311275:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000467200:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000262975:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000471951:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000352431:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000396281:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000461685:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000468376:exon_45866054_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000372023:exon_45867242_45867882:ZMYND8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 47244450 G/A 0 31 0 31 14.6609715517006 0 14.6609715517006 G G 10 0.527065433816109 2.46966826967894e-09 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47244399_47244501:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47244399_47244501:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47244399_47244501:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47244399_47244501:PREX1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 47249077 C/T 1 27 16 43 12.7692332869651 8.43304694105774 4.33618634590731 T:C C T 10 0.527065433816109 0.222039748031112 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47249034_47249177:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47248815_47249177:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47249034_47249177:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47248815_47249177:PREX1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 47258763 C/T 1 21 17 38 9.93162588986171 8.96011237487385 0.971513514987857 T:C C T 10 0.527065433816109 0.871244863274115 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000496915:exon_47258651_47258796:PREX1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 47261017 T/C 1 25 20 45 11.8233641545973 10.5413086763222 1.28205547827509 T:C T C 10 0.527065433816109 0.76625053826379 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47260947_47261035:PREX1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 47262549 C/T 1 16 10 26 7.56695305894226 5.27065433816109 2.29629872078116 T:C C T 10 0.527065433816109 0.434503000465296 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47262389_47262595:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47262389_47262595:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47262389_47262595:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47262389_47262595:PREX1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 47267480 A/G 1 10 6 16 4.72934566183891 3.16239260289665 1.56695305894226 A:G A G 10 0.527065433816109 0.465150778014472 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47267432_47267593:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47267432_47267593:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47267432_47267593:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47267432_47267593:PREX1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 47267940 G/A 1 10 15 25 4.72934566183891 7.90598150724164 -3.17663584540273 A:G G A 10 0.527065433816109 0.232365445872985 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47267934_47268121:PREX1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 47269233 C/G 1 9 4 13 4.25641109565502 2.10826173526444 2.14814936039058 C:G C G 10 0.527065433816109 0.276012087147778 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47269124_47269244:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47269124_47269244:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47269124_47269244:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47269124_47269244:PREX1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 47307618 G/A 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 A:G G A 10 0.527065433816109 0.757490641773051 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47307485_47307634:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47307485_47307634:PREX1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 47850182 C/T 1 41 31 72 19.3903172135395 16.3390284482994 3.05128876524015 T:C C T 10 0.527065433816109 0.481811897606333 ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47850105_47850246:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47850105_47852768:DDX27 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 47865509 G/A 1 21 28 49 9.93162588986171 14.7578321468511 -4.82620625698934 A:G G A 10 0.527065433816109 0.197863822869172 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 47872327 A/G 1 3 9 12 1.41880369855167 4.74358890434498 -3.32478520579331 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0800200924234215 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 47872377 C/G 1 9 16 25 4.25641109565502 8.43304694105774 -4.17663584540273 C:G C G 10 0.527065433816109 0.110142448138222 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47872345_47872484:ZNFX1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 48522330 G/A 1 27 18 45 12.7692332869651 9.48717780868996 3.28205547827509 A:G G A 10 0.527065433816109 0.371783597602969 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 48522585 G/A 1 28 12 40 13.2421678531489 6.32478520579331 6.91738264735564 A:G G A 10 0.527065433816109 0.038230233702595 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 48524827 A/G 1 8 4 12 3.78347652947113 2.10826173526444 1.67521479420669 A:G A G 10 0.527065433816109 0.396148353996528 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48524692_48525129:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48524692_48525129:SPATA2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 48808443 G/A 0 40 0 40 18.9173826473556 0 18.9173826473556 G G 10 0.527065433816109 1.19667933166930e-11 ENSG00000172216:ENST00000303004:exon_48807376_48809212:CEBPB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 50769183 G/A 1 12 17 29 5.67521479420669 8.96011237487385 -3.28489758066716 A:G G A 10 0.527065433816109 0.265505019787144 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 50769379 C/T 1 12 15 27 5.67521479420669 7.90598150724164 -2.23076671303494 T:C C T 10 0.527065433816109 0.443412923825397 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 50769549 A/G 1 12 13 25 5.67521479420669 6.85185063960942 -1.17663584540273 A:G A G 10 0.527065433816109 0.691622871057986 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 52561469 A/G 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 A:G A G 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000064787:ENST00000448484:exon_52561465_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371440:exon_52561465_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000448710:exon_52560079_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000434986:exon_52560079_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000395961:exon_52560080_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371435:exon_52560080_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000422805:exon_52561322_52561535:BCAS1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 52645167 C/A 1 1 7 8 0.472934566183891 3.68945803671276 -3.21652347052887 A:C C A 10 0.527065433816109 0.0307713746552577 ENSG00000064787:ENST00000448484:exon_52644931_52645239:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371440:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000448710:exon_52645080_52645289:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000434986:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000395961:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371435:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000411563:exon_52644411_52645511:BCAS1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 54961541 A/T 1 20 22 42 9.45869132367782 11.5954395439544 -2.13674822027658 A:T A T 10 0.527065433816109 0.539221144360839 ENSG00000087586:ENST00000395914:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395909:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000347343:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395915:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000312783:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000371356:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395913:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395911:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395907:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000441357:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000420474:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000422322:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000456249:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000451915:exon_54961393_54961589:AURKA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 56179586 G/A 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 A:G G A 10 0.527065433816109 0.757490641773051 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56178902_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56178902_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56178906_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56179111_56179825:ZBP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 56190634 C/T 1 6 2 8 2.83760739710335 1.05413086763222 1.78347652947113 T:C C T 10 0.527065433816109 0.29481715391141 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56190568_56193137:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000357677:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000343535:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000480037:exon_56190568_56191524:ZBP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 57288422 T/C 1 4 7 11 1.89173826473556 3.68945803671276 -1.7977197719772 T:C T C 10 0.527065433816109 0.36886039388561 ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57287535_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527081:exon_57287877_57289149:NPEPL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 57289017 C/T 1 27 27 54 12.7692332869651 14.2307667130349 -1.46153342606989 T:C C T 10 0.527065433816109 0.785492693376586 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57288973_57289149:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57288973_57289149:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57288973_57289149:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57288973_57289149:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57288968_57289149:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57287535_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57288476_57289149:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527081:exon_57287877_57289149:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525068:exon_57288787_57289149:NPEPL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 57571763 A/G 1 119 78 197 56.279213375883 41.1111038376565 15.1681095382265 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0322240289008691 ENSG00000101160:ENST00000217131:exon_57571694_57571856:CTSZ HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 57572839 G/T 1 7 3 10 3.31054196328724 1.58119630144833 1.72934566183891 T:G G T 10 0.527065433816109 0.350932787230552 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 60768497 C/T 1 18 20 38 8.51282219131004 10.5413086763222 -2.02848648501214 T:C C T 10 0.527065433816109 0.520721033667497 ENSG00000101181:ENST00000436421:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000466933:exon_60768472_60769109:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000471352:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000467101:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000370823:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000448254:exon_60768472_60768680:GTPBP5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 60881330 G/A 1 32 39 71 15.1339061178845 20.5555519188283 -5.42164580094374 A:G G A 10 0.527065433816109 0.234454342388555 ENSG00000130706:ENST00000423787:exon_60881253_60881376:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000370744:exon_60881253_60881376:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000253003:exon_60881253_60881376:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000462554:exon_60881253_60881376:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000465805:exon_60881253_60881376:ADRM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 60963494 C/T 1 31 8 39 14.6609715517006 4.21652347052887 10.4444480811717 T:C C T 10 0.527065433816109 0.000655129735574517 ENSG00000171858:ENST00000492356:exon_60963365_60963575:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370562:exon_60962667_60963576:RPS21 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 61303264 C/T 1 11 17 28 5.2022802280228 8.96011237487385 -3.75783214685105 T:C C T 10 0.527065433816109 0.185940056269729 ENSG00000101187:ENST00000370512:exon_61303102_61303647:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000217159:exon_61303102_61303647:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000497209:exon_61303102_61303645:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000370507:exon_61303102_61303645:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000342674:exon_61303220_61303363:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000466961:exon_61303102_61303506:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000451793:exon_61303102_61303645:SLCO4A1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 61439696 C/G 1 5 5 10 2.36467283091945 2.63532716908055 -0.270654338161091 C:G C G 10 0.527065433816109 1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 61488785 T/C 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000101190:ENST00000335351:exon_61488747_61488990:TCFL5;ENSG00000101190:ENST00000217162:exon_61488747_61488990:TCFL5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 61512376 G/A 1 4 6 10 1.89173826473556 3.16239260289665 -1.27065433816109 A:G G A 10 0.527065433816109 0.532268681489131 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61509090_61513766:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61509095_61513766:DIDO1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 61834024 C/G 1 39 35 74 18.4444480811717 18.4472901835638 -0.00284210239206928 C:G C G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000149658:ENST00000370339:exon_61833639_61835159:YTHDF1;ENSG00000149658:ENST00000370333:exon_61833639_61835159:YTHDF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 61834695 G/A 1 22 24 46 10.4045604560456 12.6495704115866 -2.24500995554101 A:G G A 10 0.527065433816109 0.556153822172808 ENSG00000149658:ENST00000370339:exon_61833639_61835159:YTHDF1;ENSG00000149658:ENST00000370333:exon_61833639_61835159:YTHDF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 62191558 G/A 1 31 30 61 14.6609715517006 15.8119630144833 -1.15099146278265 A:G G A 10 0.527065433816109 0.798526816530836 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191524_62191680:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191524_62191680:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191524_62191680:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191524_62191680:RP4-697K14.7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 62191937 G/A 1 28 17 45 13.2421678531489 8.96011237487385 4.28205547827509 A:G G A 10 0.527065433816109 0.233117105529577 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 62193019 C/T 1 25 27 52 11.8233641545973 14.2307667130349 -2.40740255843767 T:C C T 10 0.527065433816109 0.579040222476404 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 62193445 G/A 1 20 22 42 9.45869132367782 11.5954395439544 -2.13674822027658 A:G G A 10 0.527065433816109 0.539221144360839 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193425_62193556:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193425_62193556:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193425_62193556:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193425_62193556:RP4-697K14.7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 62194128 G/A 1 8 4 12 3.78347652947113 2.10826173526444 1.67521479420669 A:G G A 10 0.527065433816109 0.396148353996528 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 62195220 C/T 1 13 11 24 6.14814936039058 5.7977197719772 0.350429588413383 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 62196033 C/T 1 5 5 10 2.36467283091945 2.63532716908055 -0.270654338161091 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 62196182 G/C 1 20 5 25 9.45869132367782 2.63532716908055 6.82336415459727 C:G G C 10 0.527065433816109 0.00793196247949601 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 62221766 C/T 1 7 7 14 3.31054196328724 3.68945803671276 -0.378916073425526 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000101216:ENST00000266068:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370069:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370077:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000447518:exon_62221638_62221772:GMEB2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 62326110 A/C 1 11 9 20 5.2022802280228 4.74358890434498 0.45869132367782 A:C A C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62326094_62326331:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62326094_62326327:RTEL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 62331989 T/G 1 35 31 66 16.5527098164362 16.3390284482994 0.213681368136804 T:G T G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000101246:ENST00000359715:exon_62331954_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000440854:exon_62329996_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000485858:exon_62331954_62332129:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000217224:exon_62331954_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000324228:exon_62331954_62332054:ARFRP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 62372706 G/A 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000125520:ENST00000493772:exon_62372605_62372832:SLC2A4RG HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 62373510 C/T 1 41 29 70 19.3903172135395 15.2848975806672 4.10541963287237 T:C C T 10 0.527065433816109 0.340678955354277 ENSG00000125520:ENST00000266077:exon_62373483_62373583:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000474248:exon_62373483_62373519:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000485897:exon_62373483_62373583:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000493772:exon_62373483_62373583:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000491109:exon_62373222_62373583:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000473157:exon_62373483_62373583:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000482718:exon_62373483_62373888:SLC2A4RG HGDP00239_parsed_pileup.txt . 20 62373707 G/T 1 64 53 117 30.267812235769 27.9344679922538 2.33334424351524 T:G G T 10 0.527065433816109 0.71147098369783 ENSG00000125520:ENST00000266077:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000485897:exon_62373689_62373843:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000493772:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000491109:exon_62373689_62373887:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000473157:exon_62373689_62373717:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000482718:exon_62373483_62373888:SLC2A4RG HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 15918577 G/C 1 39 39 78 18.4444480811717 20.5555519188283 -2.11110383765651 C:G G C 10 0.527065433816109 0.651512573059077 ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15918526_15918664:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400564:exon_15918526_15918662:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000493640:exon_15918526_15918634:SAMSN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 16337111 G/A 1 4 5 9 1.89173826473556 2.63532716908055 -0.743588904344981 A:G G A 10 0.527065433816109 0.743612144716174 ENSG00000180530:ENST00000400199:exon_16333556_16340847:NRIP1;ENSG00000180530:ENST00000400202:exon_16333556_16340847:NRIP1;ENSG00000180530:ENST00000318948:exon_16333556_16340847:NRIP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 26978950 A/G 1 75 79 154 35.4700924637918 41.6381692714726 -6.16807680768079 A:G A G 10 0.527065433816109 0.333472586300943 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26978761_26978967:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26978761_26978967:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26978761_26978967:MRPL39 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 27056250 A/G 1 1 7 8 0.472934566183891 3.68945803671276 -3.21652347052887 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0307713746552577 ENSG00000154721:ENST00000480456:exon_27056195_27056260:JAM2;ENSG00000154721:ENST00000400533:exon_27056195_27056260:JAM2;ENSG00000154721:ENST00000400532:exon_27056195_27056260:JAM2;ENSG00000154721:ENST00000400537:exon_27056195_27056260:JAM2;ENSG00000154721:ENST00000400535:exon_27056195_27056260:JAM2;ENSG00000154721:ENST00000425221:exon_27056195_27056260:JAM2;ENSG00000154721:ENST00000312957:exon_27056195_27056260:JAM2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 30714776 T/C 1 6 8 14 2.83760739710335 4.21652347052887 -1.37891607342553 T:C T C 10 0.527065433816109 0.59467204210446 ENSG00000156273:ENST00000286800:exon_30714720_30718469:BACH1;ENSG00000156273:ENST00000399921:exon_30714720_30718469:BACH1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 33068962 T/C 1 5 8 13 2.36467283091945 4.21652347052887 -1.85185063960942 T:C T C 10 0.527065433816109 0.407023665875808 ENSG00000156304:ENST00000435228:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000419806:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000434667:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000286835:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000399804:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000467731:exon_33068882_33069049:SFRS15 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 34131515 C/T 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 T:C C T 10 0.527065433816109 0.488810537661758 ENSG00000159086:ENST00000331923:exon_34131391_34131580:GCFC1;ENSG00000159086:ENST00000443785:exon_34131391_34131580:GCFC1;ENSG00000159086:ENST00000290178:exon_34131391_34131580:GCFC1;ENSG00000159086:ENST00000472588:exon_34131391_34131580:GCFC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 34614250 T/C 1 28 12 40 13.2421678531489 6.32478520579331 6.91738264735564 T:C T C 10 0.527065433816109 0.038230233702595 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 34614255 T/G 1 28 6 34 13.2421678531489 3.16239260289665 10.0797752502523 T:G T G 10 0.527065433816109 0.000442359186564551 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 34640788 A/G 1 13 11 24 6.14814936039058 5.7977197719772 0.350429588413383 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000249624:ENST00000433395:exon_34640699_34640822:AP000295.9;ENSG00000243646:ENST00000290200:exon_34640699_34640822:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000422891:exon_34640699_34640822:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000493295:exon_34640233_34640822:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000498371:exon_34640587_34640822:IL10RB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 34715699 G/C 1 12 13 25 5.67521479420669 6.85185063960942 -1.17663584540273 C:G G C 10 0.527065433816109 0.691622871057986 ENSG00000142166:ENST00000270139:exon_34715574_34715728:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000442357:exon_34715574_34715728:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000416947:exon_34715574_34715728:IFNAR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 34787312 A/G 1 33 50 83 15.6068406840684 26.3532716908055 -10.7464310067371 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0206450261194161 ENSG00000159128:ENST00000290219:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000439213:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000381995:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000405436:exon_34787195_34787327:IFNGR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 34897113 C/T 1 45 40 85 21.2820554782751 21.0826173526444 0.199438125630731 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000159131:ENST00000381831:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000381815:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000381839:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000424203:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000460305:exon_34897076_34897135:GART;ENSG00000159131:ENST00000467575:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000361093:exon_34896316_34897307:GART HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 34926260 C/T 1 86 73 159 40.6723726918146 38.475776668576 2.19659602323866 T:C C T 10 0.527065433816109 0.751164792941786 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 34945721 T/C 1 2 30 32 0.945869132367782 15.8119630144833 -14.8660938821155 T:C T C 10 0.527065433816109 2.68643791357068e-08 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381692:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000458557:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000457208:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000467616:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000484294:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000473102:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000470533:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000478183:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000465834:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000477419:exon_34945331_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000491794:exon_34945520_34945761:SON HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 34962169 G/C 1 12 19 31 5.67521479420669 10.0142432425061 -4.33902844829938 C:G G C 10 0.527065433816109 0.149606556087491 ENSG00000205758:ENST00000381554:exon_34961647_34962227:CRYZL1;ENSG00000205758:ENST00000416217:exon_34961650_34962227:CRYZL1;ENSG00000205758:ENST00000290244:exon_34961692_34962227:CRYZL1;ENSG00000205758:ENST00000468349:exon_34961767_34962227:CRYZL1;ENSG00000205758:ENST00000381540:exon_34961773_34962227:CRYZL1;ENSG00000205758:ENST00000452420:exon_34961774_34962227:CRYZL1;ENSG00000205758:ENST00000480893:exon_34961866_34962227:CRYZL1;ENSG00000205758:ENST00000445393:exon_34961923_34962227:CRYZL1;ENSG00000205758:ENST00000437996:exon_34962075_34962227:CRYZL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 35757787 C/T 1 26 19 45 12.2962987207812 10.0142432425061 2.28205547827509 T:C C T 10 0.527065433816109 0.551919035282903 ENSG00000205670:ENST00000481710:exon_35757776_35757942:FAM165B;ENSG00000205670:ENST00000399292:exon_35757776_35757942:FAM165B;ENSG00000205670:ENST00000489469:exon_35757776_35757942:FAM165B;ENSG00000205670:ENST00000495363:exon_35757776_35757942:FAM165B;ENSG00000205670:ENST00000474455:exon_35757776_35758931:FAM165B;ENSG00000205670:ENST00000399295:exon_35757776_35757942:FAM165B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 35757915 A/G 1 33 31 64 15.6068406840684 16.3390284482994 -0.732187764230979 A:G A G 10 0.527065433816109 0.900684249681405 ENSG00000205670:ENST00000481710:exon_35757776_35757942:FAM165B;ENSG00000205670:ENST00000399292:exon_35757776_35757942:FAM165B;ENSG00000205670:ENST00000489469:exon_35757776_35757942:FAM165B;ENSG00000205670:ENST00000495363:exon_35757776_35757942:FAM165B;ENSG00000205670:ENST00000474455:exon_35757776_35758931:FAM165B;ENSG00000205670:ENST00000399295:exon_35757776_35757942:FAM165B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 37444973 C/T 1 81 46 127 38.3076998608952 24.245009955541 14.0626899053542 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0127653391129010 ENSG00000159228:ENST00000530908:exon_37444113_37445464:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000290349:exon_37444744_37445464:CBR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 38525356 T/C 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000182670:ENST00000418766:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000485402:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000438055:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000414818:exon_38525251_38525577:TTC3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 38563725 G/A 1 14 4 18 6.62108392657447 2.10826173526444 4.51282219131004 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0352268999907301 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38563635_38563725:TTC3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 38568009 G/C 1 31 13 44 14.6609715517006 6.85185063960942 7.8091209120912 C:G G C 10 0.527065433816109 0.0226084198222746 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 38568308 C/T 1 19 37 56 8.98575675749393 19.501421051196 -10.5156642937021 T:C C T 10 0.527065433816109 0.00688605675478215 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 40549466 T/C 1 36 84 120 17.0256443826201 44.2734964405532 -27.2478520579331 T:C T C 10 0.527065433816109 5.58970187101729e-07 ENSG00000183527:ENST00000331573:exon_40549361_40549497:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000440607:exon_40549361_40549497:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000481921:exon_40549361_40549497:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000411828:exon_40549361_40549497:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000380900:exon_40549361_40549497:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000431628:exon_40549361_40549497:PSMG1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 40552307 A/G 1 15 28 43 7.09401849275836 14.7578321468511 -7.66381365409269 A:G A G 10 0.527065433816109 0.021653969072132 ENSG00000183527:ENST00000331573:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000440607:exon_40552211_40552364:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000411828:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000380900:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000431628:exon_40552211_40552362:PSMG1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 40768841 T/C 1 15 18 33 7.09401849275836 9.48717780868996 -2.3931593159316 T:C T C 10 0.527065433816109 0.486378086106079 ENSG00000182093:ENST00000333781:exon_40768792_40769815:WRB;ENSG00000182093:ENST00000398753:exon_40768792_40769042:WRB;ENSG00000182093:ENST00000380708:exon_40768792_40769815:WRB;ENSG00000182093:ENST00000466787:exon_40768792_40769180:WRB;ENSG00000182093:ENST00000490860:exon_40768792_40769030:WRB;ENSG00000182093:ENST00000417111:exon_40768792_40769081:WRB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 42824661 A/G 1 433 435 868 204.780667157625 229.273463710007 -24.4927965523827 A:C:G A G 10 0.527065433816109 0.102704469114381 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000491110:exon_42824548_42824747:MX1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 44293744 C/G 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 C:G C G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000479429:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000463902:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000470658:exon_44293661_44293801:WDR4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 44323461 G/A 1 23 25 48 10.8774950222295 13.1766358454027 -2.29914082317323 A:G G A 10 0.527065433816109 0.564095668987021 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 44323590 T/G 1 58 41 99 27.4302048386657 21.6096827864605 5.82052205220521 A:T:G T G 10 0.527065433816109 0.268501727952317 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 44324365 G/A 1 62 34 96 29.3219431034012 17.9202247497477 11.4017183536535 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0240419777506890 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 44485350 G/A 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 A:G G A 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000160200:ENST00000352178:exon_44485313_44485382:CBS;ENSG00000160200:ENST00000359624:exon_44485313_44485382:CBS;ENSG00000160200:ENST00000398165:exon_44485313_44485382:CBS;ENSG00000160200:ENST00000398158:exon_44485313_44485382:CBS;ENSG00000160200:ENST00000461686:exon_44485313_44485382:CBS;ENSG00000160200:ENST00000398168:exon_44485313_44485382:CBS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 45217559 T/C 1 90 75 165 42.5641109565502 39.5299075362082 3.03420342034201 T:C T C 10 0.527065433816109 0.641045043502623 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000483896:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217512_45217576:RRP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 45648880 C/T 1 15 19 34 7.09401849275836 10.0142432425061 -2.92022474974771 T:C C T 10 0.527065433816109 0.3909112203143 ENSG00000160223:ENST00000407780:exon_45642874_45648927:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400377:exon_45646717_45648927:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400379:exon_45646717_45649972:ICOSLG HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 45656774 C/T 1 19 18 37 8.98575675749393 9.48717780868996 -0.501421051196035 T:C C T 10 0.527065433816109 0.871040774660792 ENSG00000160223:ENST00000407780:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000344330:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400379:exon_45656750_45657100:ICOSLG HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 46271452 C/T 1 32 21 53 15.1339061178845 11.0683741101383 4.06553200774622 T:C C T 10 0.527065433816109 0.274637085499918 ENSG00000183255:ENST00000397887:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000330938:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000445724:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000423073:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000397886:exon_46271322_46271542:PTTG1IP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 46311813 A/G 1 18 19 37 8.51282219131004 10.0142432425061 -1.50142105119603 A:G A G 10 0.527065433816109 0.626124356535162 ENSG00000160255:ENST00000475170:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46311724_46311911:ITGB2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 46950863 C/T 1 5 10 15 2.36467283091945 5.27065433816109 -2.90598150724164 T:C C T 10 0.527065433816109 0.194890792920314 ENSG00000173638:ENST00000417954:exon_46950684_46950885:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46950684_46950885:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46950684_46950885:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46950684_46950885:SLC19A1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 47581423 C/T 1 3 60 63 1.41880369855167 31.6239260289665 -30.2051223304149 T:C C T 10 0.527065433816109 3.59734418910665e-16 ENSG00000160284:ENST00000330205:exon_47581062_47581619:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000416550:exon_47581063_47581619:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000291672:exon_47581075_47581619:C21orf56 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 47581835 C/T 1 1 46 47 0.472934566183891 24.245009955541 -23.7720753893571 T:C C T 10 0.527065433816109 2.77347450319792e-14 ENSG00000160284:ENST00000330205:exon_47581830_47581981:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000416550:exon_47581830_47581981:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000291672:exon_47581830_47581981:C21orf56 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 47581949 C/T 0 0 49 49 0 25.8262062569893 -25.8262062569893 T C T 10 0.527065433816109 1.16212221459801e-16 ENSG00000160284:ENST00000330205:exon_47581830_47581981:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000416550:exon_47581830_47581981:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000291672:exon_47581830_47581981:C21orf56 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 47614469 A/C 1 11 21 32 5.2022802280228 11.0683741101383 -5.86609388211549 A:C A C 10 0.527065433816109 0.0500439124076423 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000419093:exon_47614405_47614494:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47614405_47614575:LSS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 47635627 C/G 1 5 22 27 2.36467283091945 11.5954395439544 -9.23076671303494 C:G C G 10 0.527065433816109 0.000357388236067735 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000464357:exon_47635599_47635707:LSS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 47676711 G/A 1 18 29 47 8.51282219131004 15.2848975806672 -6.77207538935712 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0569729161559202 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000467026:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000481113:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000494755:exon_47676390_47676900:MCM3AP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 47685939 A/G 1 14 7 21 6.62108392657447 3.68945803671276 2.93162588986171 A:G A G 10 0.527065433816109 0.274579453085168 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47685839_47686080:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47685839_47686080:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47685839_47686866:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47685839_47686080:MCM3AP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 47836653 C/T 1 8 8 16 3.78347652947113 4.21652347052887 -0.433046941057745 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 47852085 G/A 1 7 12 19 3.31054196328724 6.32478520579331 -3.01424324250607 A:G G A 10 0.527065433816109 0.176593061472052 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 47863757 A/C 1 10 10 20 4.72934566183891 5.27065433816109 -0.541308676322181 A:C A C 10 0.527065433816109 0.826649432830958 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47863723_47863861:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47863723_47863861:PCNT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 21 48063476 C/G 1 35 23 58 16.5527098164362 12.1225049777705 4.43020483866568 T:C:G C G 10 0.527065433816109 0.292860404052975 ENSG00000160310:ENST00000355680:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397638:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397637:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000334494:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397628:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000458387:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000291705:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397634:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000451211:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000440086:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000482508:exon_48063198_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000481861:exon_48063447_48063551:PRMT2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 17625915 G/A 1 16 14 30 7.56695305894226 7.37891607342553 0.188036985516729 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000069998:ENST00000155674:exon_17625914_17626007:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000336737:exon_17625914_17626007:CECR5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 17630486 C/A 1 14 11 25 6.62108392657447 5.7977197719772 0.823364154597274 A:C C A 10 0.527065433816109 0.84228244308015 ENSG00000069998:ENST00000155674:exon_17630432_17630635:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000336737:exon_17630432_17630635:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000480451:exon_17630432_17630635:CECR5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 17662793 A/G 1 4 9 13 1.89173826473556 4.74358890434498 -2.85185063960942 A:G A G 10 0.527065433816109 0.163735013053684 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000449907:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000330232:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17662710_17662912:CECR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 17669306 T/C 1 2 13 15 0.945869132367782 6.85185063960942 -5.90598150724164 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0029348150649902 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000449907:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000330232:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000469063:exon_17669229_17669617:CECR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 18609642 C/T 1 24 34 58 11.3504295884134 17.9202247497477 -6.56979516133432 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0885077872928735 ENSG00000215193:ENST00000474897:exon_18609121_18609801:PEX26;ENSG00000183785:ENST00000316027:exon_18609121_18609801:TUBA8;ENSG00000183785:ENST00000330423:exon_18609121_18609801:TUBA8;ENSG00000183785:ENST00000416740:exon_18609121_18609801:TUBA8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 19318912 C/T 1 54 53 107 25.5384665739301 27.9344679922538 -2.39600141832367 T:C C T 10 0.527065433816109 0.698784699513273 ENSG00000100084:ENST00000340170:exon_19318221_19319079:HIRA;ENSG00000100084:ENST00000263208:exon_19318221_19319079:HIRA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 19423250 G/A 1 166 99 265 78.5071379865259 52.1794779477948 26.3276600387311 A:G G A 10 0.527065433816109 0.00133569284003356 ENSG00000185608:ENST00000333130:exon_19423161_19423598:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000443660:exon_19423161_19423590:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000471259:exon_19423161_19423533:MRPL40 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 19808769 C/T 1 7 5 12 3.31054196328724 2.63532716908055 0.675214794206692 T:C C T 10 0.527065433816109 0.778351128206284 ENSG00000185838:ENST00000329517:exon_19808751_19808898:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000403325:exon_19808751_19808898:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000405009:exon_19808751_19808898:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000451413:exon_19808751_19808882:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000453108:exon_19808751_19808898:GNB1L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 19950235 C/T 1 65 49 114 30.7407468019529 25.8262062569893 4.91454054496357 T:C C T 10 0.527065433816109 0.398769535716941 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19949756_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000467943:exon_19950050_19950399:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19950070_19950338:COMT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 19950268 G/A 1 85 88 173 40.1994381256307 46.3817581758176 -6.18232005018686 A:G G A 10 0.527065433816109 0.361414273560684 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19949756_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000467943:exon_19950050_19950399:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19950070_19950338:COMT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 19951271 G/A 1 104 71 175 49.1851948831247 37.4216458009437 11.7635490821809 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0815477565619937 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000428707:exon_19951222_19951282:COMT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 21348914 C/T 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000099949:ENST00000479606:exon_21348847_21349016:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000215739:exon_21348847_21349016:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000389355:exon_21348847_21349016:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000495142:exon_21348616_21349016:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000491432:exon_21348766_21349016:LZTR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 21982892 C/T 1 84 92 176 39.7265035594468 48.490019911082 -8.76351635163519 T:C C T 10 0.527065433816109 0.199503106898264 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21982381_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21982403_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21982411_21983076:YDJC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 21984205 A/G 1 80 65 145 37.8347652947113 34.2592531980471 3.57551209666418 A:G A G 10 0.527065433816109 0.561685499016568 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21984140_21984301:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21983597_21984320:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21984140_21984353:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21984140_21984353:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21984140_21984332:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21984140_21984327:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21984140_21984303:YDJC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 23165340 C/G 1 6 5 11 2.83760739710335 2.63532716908055 0.202280228022801 C:G C G 10 0.527065433816109 1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 23237592 G/A 1 309 248 557 146.136780950822 130.712227586395 15.4245533644273 A:G G A 10 0.527065433816109 0.202985218257283 ENSG00000254709:ENST00000532223:exon_23237555_23238005:D87023.8;ENSG00000254709:ENST00000526893:exon_23237555_23238005:D87023.8;ENSG00000254709:ENST00000531372:exon_23237555_23238005:D87023.8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 23237826 T/C 1 293 55 348 138.56982789188 28.988598859886 109.581229031994 T:C T C 10 0.527065433816109 3.46952258180376e-35 ENSG00000254709:ENST00000532223:exon_23237555_23238005:D87023.8;ENSG00000254709:ENST00000526893:exon_23237555_23238005:D87023.8;ENSG00000254709:ENST00000531372:exon_23237555_23238005:D87023.8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 23237850 A/G 1 252 13 265 119.179510678341 6.85185063960942 112.327660038731 A:G A G 10 0.527065433816109 2.51385363672033e-53 ENSG00000254709:ENST00000532223:exon_23237555_23238005:D87023.8;ENSG00000254709:ENST00000526893:exon_23237555_23238005:D87023.8;ENSG00000254709:ENST00000531372:exon_23237555_23238005:D87023.8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 23237860 A/G 1 235 48 283 111.139623053214 25.2991408231732 85.8404822300411 A:G A G 10 0.527065433816109 1.38832018889011e-26 ENSG00000254709:ENST00000532223:exon_23237555_23238005:D87023.8;ENSG00000254709:ENST00000526893:exon_23237555_23238005:D87023.8;ENSG00000254709:ENST00000531372:exon_23237555_23238005:D87023.8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 24109550 T/C 1 4 8 12 1.89173826473556 4.21652347052887 -2.32478520579331 T:C T C 10 0.527065433816109 0.248670873824186 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 24167513 G/A 1 115 59 174 54.3874751111475 31.0968605951504 23.290614515997 A:G G A 10 0.527065433816109 0.000446420306244150 ENSG00000099956:ENST00000344921:exon_24167412_24167602:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000263121:exon_24167412_24167602:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000407422:exon_24167412_24167602:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000407082:exon_24167412_24167602:SMARCB1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 24179132 G/A 1 19 16 35 8.98575675749393 8.43304694105774 0.552709816436183 A:G G A 10 0.527065433816109 0.867565017882364 ENSG00000099958:ENST00000404056:exon_24176690_24179404:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000290730:exon_24176690_24179341:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000464034:exon_24178921_24179149:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000488272:exon_24178921_24179149:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000318109:exon_24178921_24179149:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000476077:exon_24178921_24179341:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000464110:exon_24178954_24179341:DERL3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 24224655 G/A 1 8 4 12 3.78347652947113 2.10826173526444 1.67521479420669 A:G G A 10 0.527065433816109 0.396148353996528 ENSG00000133460:ENST00000345044:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398356:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398359:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000407566:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000467660:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405286:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000255830:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000489322:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405340:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000461809:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000316185:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398363:exon_24224646_24224733:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000472526:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000473357:exon_24222596_24224833:SLC2A11;ENSG00000251357:ENST00000447957:exon_24224646_24224833:AP000350.10;ENSG00000251357:ENST00000502845:exon_24224646_24224833:AP000350.10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 24224659 C/A 1 7 4 11 3.31054196328724 2.10826173526444 1.2022802280228 A:C C A 10 0.527065433816109 0.555399509917260 ENSG00000133460:ENST00000345044:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398356:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398359:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000407566:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000467660:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405286:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000255830:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000489322:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405340:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000461809:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000316185:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398363:exon_24224646_24224733:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000472526:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000473357:exon_24222596_24224833:SLC2A11;ENSG00000251357:ENST00000447957:exon_24224646_24224833:AP000350.10;ENSG00000251357:ENST00000502845:exon_24224646_24224833:AP000350.10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 24573683 C/T 1 48 45 93 22.7008591768268 23.7179445217249 -1.01708534489814 T:C C T 10 0.527065433816109 0.836327347725233 ENSG00000099991:ENST00000263119:exon_24573472_24573785:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000405822:exon_24573472_24573785:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000398319:exon_24573472_24573785:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000403176:exon_24573472_24573785:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000337989:exon_24573472_24573785:CABIN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 25753231 G/A 1 6 5 11 2.83760739710335 2.63532716908055 0.202280228022801 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000100068:ENST00000467672:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402859:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000444995:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402785:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000474163:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000484509:exon_25753222_25753773:LRP5L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 26829914 T/C 1 5 5 10 2.36467283091945 2.63532716908055 -0.270654338161091 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000128203:ENST00000215906:exon_26829358_26830467:ASPHD2;ENSG00000128203:ENST00000382701:exon_26829358_26830467:ASPHD2;ENSG00000128203:ENST00000456021:exon_26829581_26830467:ASPHD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 26830316 G/A 1 4 6 10 1.89173826473556 3.16239260289665 -1.27065433816109 A:G G A 10 0.527065433816109 0.532268681489131 ENSG00000128203:ENST00000215906:exon_26829358_26830467:ASPHD2;ENSG00000128203:ENST00000382701:exon_26829358_26830467:ASPHD2;ENSG00000128203:ENST00000456021:exon_26829581_26830467:ASPHD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 29621128 C/G 1 8 9 17 3.78347652947113 4.74358890434498 -0.960112374873853 C:G C G 10 0.527065433816109 0.80902600536977 ENSG00000186998:ENST00000334018:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429226:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404755:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404820:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000426629:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429415:exon_29621128_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000448676:exon_29621128_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000435194:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000457925:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000484039:exon_29621122_29621205:EMID1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 29630337 G/A 1 28 17 45 13.2421678531489 8.96011237487385 4.28205547827509 A:G G A 10 0.527065433816109 0.233117105529577 ENSG00000186998:ENST00000334018:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404755:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404820:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000426629:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429415:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000448676:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000435194:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000457925:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000433143:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000487477:exon_29630294_29630338:EMID1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 29913272 C/T 1 8 5 13 3.78347652947113 2.63532716908055 1.14814936039058 T:C C T 10 0.527065433816109 0.588366380954527 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29913252_29913355:THOC5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 30184950 A/G 1 134 128 262 63.3732318686414 67.464375528462 -4.09114365982057 A:T:G A G 10 0.527065433816109 0.621099579754008 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30184597_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30184600_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30184605_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30184631_30185173:ASCC2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 30689998 G/A 1 14 12 26 6.62108392657447 6.32478520579331 0.296298720781166 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000248751:ENST00000330168:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000434987:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000434291:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000418047:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000447976:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000470854:exon_30689974_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000467596:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000462073:exon_30689640_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000466666:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000437122:exon_30689910_30690099:TBC1D10A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 30824508 C/T 1 95 78 173 44.9287837874696 41.1111038376565 3.81767994981313 T:C C T 10 0.527065433816109 0.594355420915797 ENSG00000249590:ENST00000454552:exon_30824449_30824977:RP4-539M6.19;ENSG00000249590:ENST00000439838:exon_30824449_30824974:RP4-539M6.19;ENSG00000249590:ENST00000439023:exon_30824449_30824977:RP4-539M6.19;ENSG00000242114:ENST00000266263:exon_30824449_30825045:MTFP1;ENSG00000242114:ENST00000355143:exon_30824449_30825040:MTFP1;ENSG00000242114:ENST00000412752:exon_30824449_30824630:MTFP1;ENSG00000242114:ENST00000407550:exon_30824449_30824938:MTFP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 31333631 T/C 1 10 17 27 4.72934566183891 8.96011237487385 -4.23076671303494 T:C T C 10 0.527065433816109 0.123454818791915 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31333570_31333698:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31333570_31333698:MORC2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 31663842 C/G 1 7 1 8 3.31054196328724 0.527065433816109 2.78347652947113 C:G C G 10 0.527065433816109 0.0735220313078182 ENSG00000182541:ENST00000444929:exon_31663762_31663893:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000436394:exon_31663762_31663893:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000406516:exon_31663762_31663893:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000331728:exon_31663762_31663893:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000333611:exon_31663762_31663893:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000340552:exon_31663762_31663893:LIMK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 31741067 G/A 1 16 19 35 7.56695305894226 10.0142432425061 -2.44729018356382 A:G G A 10 0.527065433816109 0.498936848739828 ENSG00000100105:ENST00000266269:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000405309:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000351933:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000440325:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000215919:exon_31740318_31741762:PATZ1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 31859859 A/G 1 14 5 19 6.62108392657447 2.63532716908055 3.98575675749393 A:G A G 10 0.527065433816109 0.105309144964889 ENSG00000184708:ENST00000397525:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000330125:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000382180:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397523:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000420671:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000423097:exon_31859686_31859953:EIF4ENIF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 32011225 T/C 1 11 18 29 5.2022802280228 9.48717780868996 -4.28489758066716 T:C T C 10 0.527065433816109 0.136626685226646 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000474741:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000476577:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000464333:exon_32010357_32012863:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000357852:exon_32010372_32011265:SFI1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 32795641 C/T 1 36 44 80 17.0256443826201 23.1908790879088 -6.16523470528872 T:C C T 10 0.527065433816109 0.179851500962020 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000498434:exon_32795590_32795972:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000476619:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000485373:exon_32795590_32795746:C22orf28 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 35660875 G/T 1 10 7 17 4.72934566183891 3.68945803671276 1.03988762512615 T:G G T 10 0.527065433816109 0.637665492029096 ENSG00000100281:ENST00000420166:exon_35660641_35661563:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000418170:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000455359:exon_35660641_35661560:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397385:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397384:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000216106:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000444518:exon_35660641_35661596:HMGXB4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 35742925 T/G 1 19 22 41 8.98575675749393 11.5954395439544 -2.60968278646047 T:G T G 10 0.527065433816109 0.437604105511424 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35742923_35742962:TOM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 35743124 G/C 1 31 16 47 14.6609715517006 8.43304694105774 6.22792461064287 C:G G C 10 0.527065433816109 0.079445017853643 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35743048_35743966:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35743048_35743952:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35743048_35743974:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35743048_35743976:TOM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 35799447 G/A 1 70 54 124 33.1054196328724 28.4615334260699 4.64388620680248 A:G G A 10 0.527065433816109 0.419454763510407 ENSG00000100297:ENST00000216122:exon_35799407_35799535:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000447561:exon_35799407_35799535:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000444582:exon_35799407_35799535:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000455261:exon_35799407_35799535:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000416905:exon_35799407_35799535:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000426383:exon_35799407_35799535:MCM5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 35806815 T/C 1 32 42 74 15.1339061178845 22.1367482202766 -7.00284210239207 T:C T C 10 0.527065433816109 0.104771832169543 ENSG00000100297:ENST00000216122:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000447561:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000444582:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000382011:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000455261:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000444778:exon_35806737_35806865:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000426383:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000464908:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000493076:exon_35806402_35806903:MCM5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 35815880 G/A 1 127 108 235 60.0626899053542 56.9230668521398 3.13962305321438 A:G G A 10 0.527065433816109 0.695532886930667 ENSG00000100297:ENST00000216122:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000447561:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000382011:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000455261:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000426383:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000493076:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000402457:exon_35815877_35816005:MCM5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 35819180 G/A 1 4 5 9 1.89173826473556 2.63532716908055 -0.743588904344981 A:G G A 10 0.527065433816109 0.743612144716174 ENSG00000100297:ENST00000493076:exon_35817311_35820494:MCM5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 36537500 A/T 1 24 41 65 11.3504295884134 21.6096827864605 -10.2592531980471 A:T A T 10 0.527065433816109 0.0125735464524256 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 36545137 A/T 1 13 4 17 6.14814936039058 2.10826173526444 4.03988762512615 A:T A T 10 0.527065433816109 0.0545992094317132 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36545094_36545419:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36545094_36545190:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36545094_36545190:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36545094_36545190:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36545094_36545419:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36545094_36545190:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36545094_36545190:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487355:exon_36545094_36545190:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000426939:exon_36545094_36545190:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000534251:exon_36545094_36545233:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000531195:exon_36545094_36545190:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487783:exon_36545094_36545190:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000525184:exon_36545094_36545190:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000485453:exon_36545094_36545419:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000530895:exon_36545094_36545419:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000472303:exon_36545123_36545190:APOL3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 36657740 G/A 1 21 37 58 9.93162588986171 19.501421051196 -9.56979516133432 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0124464291398484 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000439680:exon_36657642_36657745:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000427990:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36657642_36657768:APOL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 36684354 T/C 1 152 121 273 71.8860540599514 63.7749174917492 8.11113656820223 T:C T C 10 0.527065433816109 0.332749974409105 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 36684358 C/A 1 148 109 257 69.9943157952159 57.4501322859559 12.54418350926 A:T:C C A 10 0.527065433816109 0.118785095902333 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 37271882 T/C 1 4 8 12 1.89173826473556 4.21652347052887 -2.32478520579331 T:C T C 10 0.527065433816109 0.248670873824186 ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37271695_37272136:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000336951:exon_37271695_37272114:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37271695_37272136:NCF4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 37333794 A/G 1 2 11 13 0.945869132367782 5.7977197719772 -4.85185063960942 A:G A G 10 0.527065433816109 0.00972131543990577 ENSG00000100368:ENST00000403662:exon_37333419_37336491:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000262825:exon_37333419_37336481:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000406230:exon_37333419_37334653:CSF2RB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 37531436 G/A 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000100385:ENST00000447922:exon_37531368_37531448:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000216223:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000406505:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000445799:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000431111:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000483573:exon_37531368_37531482:IL2RB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 37578579 C/T 1 1 7 8 0.472934566183891 3.68945803671276 -3.21652347052887 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0307713746552577 ENSG00000133466:ENST00000397110:exon_37578192_37578775:C1QTNF6;ENSG00000133466:ENST00000337843:exon_37576207_37578775:C1QTNF6;ENSG00000133466:ENST00000470655:exon_37578192_37578622:C1QTNF6;ENSG00000133466:ENST00000493023:exon_37576211_37578775:C1QTNF6;ENSG00000133466:ENST00000434784:exon_37578214_37578775:C1QTNF6;ENSG00000133466:ENST00000255836:exon_37578228_37578622:C1QTNF6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 39096004 T/G 1 9 20 29 4.25641109565502 10.5413086763222 -6.28489758066716 T:G T G 10 0.527065433816109 0.0244650521509432 ENSG00000100221:ENST00000216039:exon_39095808_39096672:JOSD1;ENSG00000100221:ENST00000427389:exon_39095808_39096128:JOSD1;ENSG00000100221:ENST00000412832:exon_39095808_39096128:JOSD1;ENSG00000100221:ENST00000417712:exon_39095806_39096128:JOSD1;ENSG00000100221:ENST00000456626:exon_39095808_39096623:JOSD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 39477123 T/C 1 99 66 165 46.8205220522052 34.7863186318632 12.034203420342 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0616678957728881 ENSG00000239713:ENST00000407997:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000480000:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000461827:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000486357:exon_39476938_39477199:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000494150:exon_39475667_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000481958:exon_39476640_39477232:APOBEC3G HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 39496336 G/T 1 13 4 17 6.14814936039058 2.10826173526444 4.03988762512615 T:G G T 10 0.527065433816109 0.0545992094317132 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 39496412 G/C 1 14 8 22 6.62108392657447 4.21652347052887 2.4045604560456 C:G G C 10 0.527065433816109 0.394231574114095 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 39497404 G/C 1 9 5 14 4.25641109565502 2.63532716908055 1.62108392657447 C:G G C 10 0.527065433816109 0.433551468090942 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 39498038 G/C 1 23 12 35 10.8774950222295 6.32478520579331 4.55270981643618 C:G G C 10 0.527065433816109 0.130959499644876 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497923_39498053:APOBEC3H HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 40760298 C/T 1 55 42 97 26.011401140114 22.1367482202766 3.87465291983742 T:C C T 10 0.527065433816109 0.476983919069071 ENSG00000239900:ENST00000216194:exon_40760280_40760369:ADSL;ENSG00000239900:ENST00000454266:exon_40760280_40760369:ADSL;ENSG00000239900:ENST00000342312:exon_40760280_40760369:ADSL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 40814500 T/C 1 14 16 30 6.62108392657447 8.43304694105774 -1.81196301448327 T:C T C 10 0.527065433816109 0.584756224731591 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000469304:exon_40814378_40814524:MKL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 40814594 C/T 1 12 26 38 5.67521479420669 13.7037012792188 -8.02848648501214 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0137045035559203 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 40814636 C/T 1 29 9 38 13.7151024193328 4.74358890434498 8.97151351498786 T:C C T 10 0.527065433816109 0.00328826491218887 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 41610024 G/A 1 10 4 14 4.72934566183891 2.10826173526444 2.62108392657447 A:G G A 10 0.527065433816109 0.18849020884602 ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000481902:exon_41609855_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000489136:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000413732:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000450939:exon_41609897_41610030:L3MBTL2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 41645757 C/G 1 32 24 56 15.1339061178845 12.6495704115866 2.48433570629789 C:G C G 10 0.527065433816109 0.592859468162575 ENSG00000100401:ENST00000405486:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000356244:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000405383:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000455915:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000407260:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000493783:exon_41645733_41645821:RANGAP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 41911525 C/T 1 46 39 85 21.754990044459 20.5555519188283 1.19943812563073 T:C C T 10 0.527065433816109 0.828597326477411 ENSG00000100412:ENST00000216254:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000396512:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000478010:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000481310:exon_41911517_41911539:ACO2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 42059768 G/T 1 422 368 790 199.578386929602 193.960079644328 5.61830728527386 A:T:G G T 10 0.527065433816109 0.695252165658611 ENSG00000196419:ENST00000360079:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402580:exon_42059626_42060044:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000428575:exon_42059626_42060042:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000359308:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405878:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402409:exon_42059645_42060010:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405506:exon_42059626_42060038:XRCC6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 42276742 G/C 1 76 98 174 35.9430270299757 51.6524125139787 -15.709385484003 C:G G C 10 0.527065433816109 0.018470427082879 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42276720_42276996:SREBF2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 42280866 G/A 1 64 57 121 30.267812235769 30.0427297275182 0.225082508250807 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42280846_42281015:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42280846_42281015:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42280846_42281015:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42280846_42281015:SREBF2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 42280889 G/A 1 56 47 103 26.4843357062979 24.7720753893571 1.71226031694077 A:G G A 10 0.527065433816109 0.767803499486712 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42280846_42281015:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42280846_42281015:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42280846_42281015:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42280846_42281015:SREBF2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 42341308 A/G 1 36 61 97 17.0256443826201 32.1509914627826 -15.1253470801626 A:G A G 10 0.527065433816109 0.00220681968401682 ENSG00000100162:ENST00000215980:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000404067:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402338:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000407253:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000442367:exon_42341229_42341393:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402420:exon_42341229_42341393:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000396437:exon_42340925_42341308:CENPM HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 42343091 G/A 1 19 19 38 8.98575675749393 10.0142432425061 -1.02848648501215 A:T:G G A 10 0.527065433816109 0.748251620330117 ENSG00000100162:ENST00000215980:exon_42343024_42343168:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000407253:exon_42343024_42343140:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000442367:exon_42343024_42343148:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000396437:exon_42343024_42343155:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000460824:exon_42343024_42343137:CENPM HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 42463814 C/T 1 6 16 22 2.83760739710335 8.43304694105774 -5.5954395439544 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0187626819162822 ENSG00000198951:ENST00000396398:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000403363:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000402937:exon_42463769_42463940:NAGA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 42486723 G/A 1 120 156 276 56.7521479420669 82.222207675313 -25.4700597332461 A:G G A 10 0.527065433816109 0.00251629242373228 ENSG00000184983:ENST00000498737:exon_42486610_42486959:NDUFA6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 42606257 C/T 1 24 21 45 11.3504295884134 11.0683741101383 0.282055478275094 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000100207:ENST00000359486:exon_42605657_42611448:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000335626:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000396348:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000418801:exon_42605657_42611445:TCF20 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 43088971 C/T 1 57 77 134 26.9572702724818 40.5840384038404 -13.6267681313586 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0194432459334174 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 43089055 G/C 1 56 66 122 26.4843357062979 34.7863186318632 -8.3019829255653 C:G G C 10 0.527065433816109 0.146795369556973 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 43089849 T/C 1 15 26 41 7.09401849275836 13.7037012792188 -6.60968278646047 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0423283957981262 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 43558926 A/G 1 191 127 318 90.3305021411232 66.9373100946459 23.3931920464773 A:G A G 10 0.527065433816109 0.00967772038016426 ENSG00000100300:ENST00000337554:exon_43558809_43559248:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000396265:exon_43558809_43559247:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000361449:exon_43558809_43559247:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000329563:exon_43558809_43559216:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000445018:exon_43558809_43558997:TSPO HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 44368122 A/G 1 16 11 27 7.56695305894226 5.7977197719772 1.76923328696506 A:G A G 10 0.527065433816109 0.565832725058203 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000493161:exon_44368116_44368222:SAMM50 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 44372632 C/T 1 29 33 62 13.7151024193328 17.3931593159316 -3.67805689659876 T:C C T 10 0.527065433816109 0.374840602349109 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44372630_44372701:SAMM50 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 44386281 C/T 1 100 88 188 47.2934566183891 46.3817581758176 0.911698442571499 T:C C T 10 0.527065433816109 0.941808364986846 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000494795:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000465768:exon_44386208_44386286:SAMM50 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 44594584 C/G 1 155 54 209 73.3048577585031 28.4615334260699 44.8433243324332 A:C:G C G 10 0.527065433816109 2.46098959603252e-10 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000472551:exon_44594501_44594602:PARVG HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 44602229 A/C 1 141 255 396 66.6837738319286 134.401685623108 -67.7179117911792 A:C A C 10 0.527065433816109 9.85941334988254e-12 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44602197_44602535:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44602197_44602515:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44602197_44602308:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44602197_44603038:PARVG HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 45132704 T/C 1 13 22 35 6.14814936039058 11.5954395439544 -5.44729018356382 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0890899538545959 ENSG00000186654:ENST00000432186:exon_45132652_45132789:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000492475:exon_45132652_45132754:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000006251:exon_45132652_45133560:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000404016:exon_45132652_45133545:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000403581:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396141:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000336985:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000431834:exon_45132652_45133321:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000418332:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396139:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000432916:exon_45132652_45133542:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000477331:exon_45132652_45133095:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000455389:exon_45132652_45133512:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000495017:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000475850:exon_45132652_45133561:PRR5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 45132785 T/C 1 4 13 17 1.89173826473556 6.85185063960942 -4.96011237487385 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0257575567814497 ENSG00000186654:ENST00000432186:exon_45132652_45132789:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000006251:exon_45132652_45133560:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000404016:exon_45132652_45133545:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000403581:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396141:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000336985:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000431834:exon_45132652_45133321:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000418332:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396139:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000432916:exon_45132652_45133542:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000477331:exon_45132652_45133095:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000455389:exon_45132652_45133512:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000495017:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000475850:exon_45132652_45133561:PRR5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 45723807 G/C 1 27 4 31 12.7692332869651 2.10826173526444 10.6609715517006 C:G G C 10 0.527065433816109 8.62200701925958e-05 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000442334:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405673:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000477714:exon_45723723_45724122:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000427777:exon_45723723_45723841:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45723723_45723944:FAM118A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 45723842 G/A 1 20 6 26 9.45869132367782 3.16239260289665 6.29629872078116 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0169546141691883 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000442334:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405673:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000477714:exon_45723723_45724122:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45723723_45723944:FAM118A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 45728370 G/A 1 27 5 32 12.7692332869651 2.63532716908055 10.1339061178845 A:G G A 10 0.527065433816109 0.000265890589525014 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000459849:exon_45728306_45728572:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000476754:exon_45728306_45728536:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000487732:exon_45728306_45728591:FAM118A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 46751394 C/T 1 16 9 25 7.56695305894226 4.74358890434498 2.82336415459727 T:C C T 10 0.527065433816109 0.3181294657177 ENSG00000100416:ENST00000441818:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000290846:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000456595:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381021:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000453630:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000457572:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381019:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000491612:exon_46751341_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000485559:exon_46749414_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000470831:exon_46750607_46751969:TRMU HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 47083010 T/C 1 10 7 17 4.72934566183891 3.68945803671276 1.03988762512615 T:C T C 10 0.527065433816109 0.637665492029096 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47080308_47083103:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47082880_47083103:CERK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 47083012 T/A 1 10 7 17 4.72934566183891 3.68945803671276 1.03988762512615 A:T T A 10 0.527065433816109 0.637665492029096 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47080308_47083103:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47082880_47083103:CERK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 50632869 C/T 1 37 26 63 17.498578948804 13.7037012792188 3.79487766958513 T:C C T 10 0.527065433816109 0.378034230860026 ENSG00000170638:ENST00000380909:exon_50632769_50632935:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000303434:exon_50632769_50632935:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000463233:exon_50632769_50632935:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395827:exon_50632769_50632935:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395829:exon_50632769_50632935:TRABD HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 50660137 G/A 1 5 8 13 2.36467283091945 4.21652347052887 -1.85185063960942 A:G G A 10 0.527065433816109 0.407023665875808 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50659704_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658621_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 50664612 A/G 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50664479_50664618:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50664479_50664618:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50664479_50664618:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50664479_50664618:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50664479_50664618:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000473946:exon_50664479_50664620:TUBGCP6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 50696678 G/A 1 11 9 20 5.2022802280228 4.74358890434498 0.45869132367782 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000482969:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000492218:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395778:exon_50696672_50696730:MAPK12 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 50716167 G/A 1 41 22 63 19.3903172135395 11.5954395439544 7.79487766958513 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0578610515733572 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479818:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50716020_50716167:PLXNB2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 50719251 A/G 1 32 34 66 15.1339061178845 17.9202247497477 -2.7863186318632 A:G A G 10 0.527065433816109 0.538421154485760 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50719173_50719402:PLXNB2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 50722134 T/C 1 11 8 19 5.2022802280228 4.21652347052887 0.985756757493928 T:C T C 10 0.527065433816109 0.819106308579823 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000496720:exon_50722031_50722179:PLXNB2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 50723048 G/A 1 9 7 16 4.25641109565502 3.68945803671276 0.566953058942256 A:G G A 10 0.527065433816109 0.808175848721287 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50723002_50723094:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50723002_50723094:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50723002_50723094:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50723002_50723094:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000496720:exon_50723002_50723094:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000434732:exon_50723002_50723094:PLXNB2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 50752150 C/T 1 75 49 124 35.4700924637918 25.8262062569893 9.64388620680248 A:T:C C T 10 0.527065433816109 0.0877381848340752 ENSG00000205593:ENST00000413817:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000380836:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000495607:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000411673:exon_50752064_50752153:FAM116B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 50869692 G/C 1 12 16 28 5.67521479420669 8.43304694105774 -2.75783214685105 C:G G C 10 0.527065433816109 0.345892538884562 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50869602_50869811:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50869602_50869811:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50869602_50869811:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50869602_50869811:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50869602_50869811:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50869602_50869811:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50869594_50869811:PPP6R2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 50876662 T/G 1 10 21 31 4.72934566183891 11.0683741101383 -6.33902844829938 T:G T G 10 0.527065433816109 0.0295396769833096 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50876603_50876727:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50876603_50876727:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50876603_50876727:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50876603_50876727:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50876603_50876727:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50876603_50876727:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50876603_50876727:PPP6R2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 50877166 G/C 1 29 19 48 13.7151024193328 10.0142432425061 3.70085917682677 C:G G C 10 0.527065433816109 0.313629264756482 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50877028_50877191:PPP6R2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 50895020 C/T 1 19 18 37 8.98575675749393 9.48717780868996 -0.501421051196035 T:C C T 10 0.527065433816109 0.871040774660792 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000476293:exon_50895018_50895102:SBF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 50941985 T/C 1 44 32 76 20.8091209120912 16.8660938821155 3.94302702997571 T:C T C 10 0.527065433816109 0.421577549281502 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50941380_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50941426_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50941690_50942128:LMF2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 50944163 G/A 1 11 11 22 5.2022802280228 5.7977197719772 -0.595439543954399 A:G G A 10 0.527065433816109 0.833638974534111 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 50945256 A/G 1 6 13 19 2.83760739710335 6.85185063960942 -4.01424324250607 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0701843497785835 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50945211_50945464:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50945211_50945464:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50945211_50945549:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50945224_50945464:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50945211_50945464:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000507607:exon_50945211_50945679:LMF2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 50962078 G/T 1 134 120 254 63.3732318686414 63.2478520579331 0.125379810708303 T:C:G G T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 50962259 G/A 1 172 165 337 81.3447453836292 86.965796579658 -5.62105119602874 A:G G A 10 0.527065433816109 0.54880963117662 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 50964236 G/A 1 181 162 343 85.6011564792843 85.3846002782097 0.21655620107461 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000025708:ENST00000395680:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395681:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000252029:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000487577:exon_50964184_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395678:exon_50964185_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000476284:exon_50964186_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000425169:exon_50964214_50964347:TYMP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 50988062 G/T 1 19 24 43 8.98575675749393 12.6495704115866 -3.66381365409269 T:G G T 10 0.527065433816109 0.287202275245489 ENSG00000130487:ENST00000395676:exon_50986462_50989451:KLHDC7B;ENSG00000130487:ENST00000252783:exon_50986462_50988541:KLHDC7B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 51009953 C/T 1 35 30 65 16.5527098164362 15.8119630144833 0.740746801952913 T:C C T 10 0.527065433816109 0.90151482793581 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000440709:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000497224:exon_51009587_51009968:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51009804_51009968:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51009804_51009962:CTA-384D8.32 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 51018579 A/G 1 4 7 11 1.89173826473556 3.68945803671276 -1.7977197719772 A:G A G 10 0.527065433816109 0.36886039388561 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 22 51064068 G/A 1 13 17 30 6.14814936039058 8.96011237487385 -2.81196301448327 A:G G A 10 0.527065433816109 0.361765470838631 ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51064007_51064109:ARSA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 9406836 T/C 1 10 2 12 4.72934566183891 1.05413086763222 3.67521479420669 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0418936923317288 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000417036:exon_9406700_9406874:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000419437:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9406705_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9406700_9407004:THUMPD3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 9422210 T/C 1 7 10 17 3.31054196328724 5.27065433816109 -1.96011237487385 T:C T C 10 0.527065433816109 0.467399584608424 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000441127:exon_9422187_9422316:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000461636:exon_9422187_9422572:THUMPD3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 9425911 G/A 1 25 16 41 11.8233641545973 8.43304694105774 3.39031721353953 A:G G A 10 0.527065433816109 0.348557547568282 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000484006:exon_9425896_9426060:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9425896_9426019:THUMPD3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 9425944 G/C 1 24 28 52 11.3504295884134 14.7578321468511 -3.40740255843767 C:G G C 10 0.527065433816109 0.405024145914244 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000484006:exon_9425896_9426060:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9425896_9426019:THUMPD3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 9426224 G/A 1 52 47 99 24.5925974415623 24.7720753893571 -0.179477947794794 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9426208_9427386:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9426208_9428475:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9426208_9426554:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9426208_9426554:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9426208_9426344:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9426208_9426554:THUMPD3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 10005741 C/T 1 47 25 72 22.2279246106429 13.1766358454027 9.05128876524015 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0338449795272308 ENSG00000125037:ENST00000245046:exon_10004221_10005881:TMEM111 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 10067794 A/G 1 8 9 17 3.78347652947113 4.74358890434498 -0.960112374873853 A:G A G 10 0.527065433816109 0.80902600536977 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 10067797 T/C 1 7 9 16 3.31054196328724 4.74358890434498 -1.43304694105774 T:C T C 10 0.527065433816109 0.618149317471371 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 10138069 T/G 1 4 8 12 1.89173826473556 4.21652347052887 -2.32478520579331 T:C:G T G 10 0.527065433816109 0.248670873824186 ENSG00000144554:ENST00000287647:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000470028:exon_10138010_10138156:FANCD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 10302172 G/A 1 16 11 27 7.56695305894226 5.7977197719772 1.76923328696506 A:G G A 10 0.527065433816109 0.565832725058203 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 10311939 C/T 1 15 19 34 7.09401849275836 10.0142432425061 -2.92022474974771 T:C C T 10 0.527065433816109 0.3909112203143 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10311815_10312699:TATDN2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 10312507 A/G 1 17 24 41 8.03988762512615 12.6495704115866 -4.60968278646047 A:G A G 10 0.527065433816109 0.161379357013086 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10311815_10312699:TATDN2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 11596302 T/C 1 23 31 54 10.8774950222295 16.3390284482994 -5.46153342606989 T:C T C 10 0.527065433816109 0.172379776379050 ENSG00000197548:ENST00000442589:exon_11596285_11599132:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354449:exon_11596285_11599139:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000446450:exon_11596285_11596462:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354956:exon_11596285_11596557:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000466605:exon_11596285_11596349:ATG7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 11643465 T/C 1 8 8 16 3.78347652947113 4.21652347052887 -0.433046941057745 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000144560:ENST00000273038:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000413604:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000426568:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000430365:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000404339:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000445411:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000418000:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000458499:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000417206:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000417466:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000424709:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000419541:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000437722:exon_11643307_11643496:VGLL4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 11684957 C/T 1 11 5 16 5.2022802280228 2.63532716908055 2.56695305894226 T:C C T 10 0.527065433816109 0.220807585221878 ENSG00000144560:ENST00000430365:exon_11684911_11685398:VGLL4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 12881757 C/T 1 25 15 40 11.8233641545973 7.90598150724164 3.91738264735564 T:C C T 10 0.527065433816109 0.267702288795201 ENSG00000144713:ENST00000396957:exon_12881641_12881840:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000435983:exon_12881641_12881852:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000396953:exon_12881641_12883028:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000457131:exon_12881641_12881840:RPL32 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 13360786 T/C 1 62 66 128 29.3219431034012 34.7863186318632 -5.46437552846196 T:C T C 10 0.527065433816109 0.376127173064011 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13360730_13360825:NUP210 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 14712473 G/A 1 23 23 46 10.8774950222295 12.1225049777705 -1.24500995554101 A:G G A 10 0.527065433816109 0.76863739181059 ENSG00000154781:ENST00000383794:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000303688:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000285042:exon_14712403_14712701:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000476763:exon_14712403_14712534:C3orf19 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 15311325 A/G 1 6 2 8 2.83760739710335 1.05413086763222 1.78347652947113 A:G A G 10 0.527065433816109 0.29481715391141 ENSG00000131370:ENST00000448619:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000383791:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000426925:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000253688:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000408919:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000366391:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000450625:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000417936:exon_15311220_15311384:SH3BP5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 16305674 C/G 1 21 10 31 9.93162588986171 5.27065433816109 4.66097155170062 C:G C G 10 0.527065433816109 0.106634642714296 ENSG00000154813:ENST00000488423:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000285082:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000462982:exon_16305662_16305736:DPH3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 16358584 T/C 1 229 163 392 108.302015656111 85.9116657120258 22.3903499440852 T:C:G T C 10 0.527065433816109 0.0259212173921897 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16357352_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16357363_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16358037_16358739:RFTN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 16364919 A/C 1 138 98 236 65.2649701333769 51.6524125139787 13.6125576193983 A:C:G A C 10 0.527065433816109 0.0785422262215316 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16364883_16364964:RFTN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 16364954 C/T 1 97 63 160 45.8746529198374 33.2051223304149 12.6695305894226 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0477283063614854 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16364883_16364964:RFTN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 17051450 C/A 1 8 1 9 3.78347652947113 0.527065433816109 3.25641109565502 A:C C A 10 0.527065433816109 0.0415432498690979 ENSG00000154822:ENST00000460467:exon_17051166_17051578:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 17053499 A/G 1 7 9 16 3.31054196328724 4.74358890434498 -1.43304694105774 A:G A G 10 0.527065433816109 0.618149317471371 ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000419842:exon_17051986_17053652:PLCL2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 17053613 C/T 1 4 7 11 1.89173826473556 3.68945803671276 -1.7977197719772 T:C C T 10 0.527065433816109 0.36886039388561 ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000419842:exon_17051986_17053652:PLCL2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 19992432 G/T 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 T:G G T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000144566:ENST00000273047:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000443878:exon_19992298_19992436:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000412966:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000446547:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000422242:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000476544:exon_19992298_19992717:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000455772:exon_19992298_19992553:RAB5A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 20216519 T/A 1 11 8 19 5.2022802280228 4.21652347052887 0.985756757493928 A:T T A 10 0.527065433816109 0.819106308579823 ENSG00000129810:ENST00000419233:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000263753:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000515745:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000509679:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000523325:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000522131:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000533388:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000534034:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000383774:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000425061:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000443724:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000472533:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000421451:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000482867:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412997:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000437051:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412868:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000417364:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000456624:exon_20216214_20216547:SGOL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 33038747 C/G 1 18 12 30 8.51282219131004 6.32478520579331 2.18803698551673 C:G C G 10 0.527065433816109 0.468463502774368 ENSG00000170266:ENST00000399402:exon_33038112_33038836:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000307363:exon_33038112_33038836:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000307377:exon_33038221_33038836:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000445488:exon_33038226_33038836:GLB1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 37366459 C/A 1 16 62 78 7.56695305894226 32.6780568965988 -25.1111038376565 A:C C A 10 0.527065433816109 8.3719989239945e-09 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 37368755 T/A 1 37 31 68 17.498578948804 16.3390284482994 1.15955050050459 A:T T A 10 0.527065433816109 0.80904747771111 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 39185077 G/A 1 25 37 62 11.8233641545973 19.501421051196 -7.67805689659876 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0563931970143451 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 39186728 C/T 1 5 12 17 2.36467283091945 6.32478520579331 -3.96011237487385 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0861119132037109 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39186488_39186747:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39186488_39186747:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39186488_39186747:CSRNP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 39449137 T/C 1 91 31 122 43.0370455227341 16.3390284482994 26.6980170744347 T:C T C 10 0.527065433816109 1.04685698549437e-06 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000477325:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000475346:exon_39449112_39449686:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000487876:exon_39449112_39449567:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39449094_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000444512:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39449111_39449277:RPSA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 39450065 C/T 1 9 6 15 4.25641109565502 3.16239260289665 1.09401849275836 T:C C T 10 0.527065433816109 0.615224246448703 ENSG00000168028:ENST00000490490:exon_39449695_39450215:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000478027:exon_39450028_39450215:RPSA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 39453160 G/A 1 296 310 606 139.988631590432 163.390284482994 -23.4016528925621 A:T:G G A 10 0.527065433816109 0.0612135396179313 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000478027:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000495394:exon_39451750_39453268:RPSA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 40558150 G/C 1 3 14 17 1.41880369855167 7.37891607342553 -5.96011237487385 C:G G C 10 0.527065433816109 0.00569841126221938 ENSG00000177842:ENST00000314529:exon_40557351_40560227:ZNF620;ENSG00000177842:ENST00000418905:exon_40557351_40559200:ZNF620 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 40573744 A/G 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000172888:ENST00000403205:exon_40573521_40575017:ZNF621;ENSG00000172888:ENST00000339296:exon_40573521_40579187:ZNF621;ENSG00000172888:ENST00000431278:exon_40573521_40575562:ZNF621;ENSG00000172888:ENST00000462161:exon_40573521_40573748:ZNF621;ENSG00000172888:ENST00000492098:exon_40573521_40574352:ZNF621 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 42166943 C/T 1 6 9 15 2.83760739710335 4.74358890434498 -1.90598150724164 T:C C T 10 0.527065433816109 0.439435430476406 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42166912_42167106:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000484786:exon_42166912_42167106:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42166912_42167106:TRAK1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 42236415 A/G 1 14 4 18 6.62108392657447 2.10826173526444 4.51282219131004 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0352268999907301 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000484786:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000449246:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000427771:exon_42236296_42236433:TRAK1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 44884647 C/A 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 A:C C A 10 0.527065433816109 0.160556933333404 ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000422209:exon_44884615_44884726:KIF15 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 45052775 G/C 1 54 54 108 25.5384665739301 28.4615334260699 -2.92306685213978 C:G G C 10 0.527065433816109 0.630145671512985 ENSG00000075914:ENST00000461361:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000265564:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000468667:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000491476:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000486727:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000459856:exon_45052725_45052885:EXOSC7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 47385389 G/A 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 A:G G A 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000114648:ENST00000232766:exon_47385045_47388306:KLHL18;ENSG00000114648:ENST00000442272:exon_47385045_47386067:KLHL18 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 47452118 G/A 1 11 13 24 5.2022802280228 6.85185063960942 -1.64957041158662 A:G G A 10 0.527065433816109 0.544155066076199 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 47452786 G/A 1 22 22 44 10.4045604560456 11.5954395439544 -1.1908790879088 A:G G A 10 0.527065433816109 0.763915403997477 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 47956424 C/T 1 65 57 122 30.7407468019529 30.0427297275182 0.698017074434699 T:C C T 10 0.527065433816109 0.927932056754924 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47956307_47956429:MAP4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 47958037 G/T 1 65 49 114 30.7407468019529 25.8262062569893 4.91454054496357 T:G G T 10 0.527065433816109 0.398769535716941 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47957441_47958664:MAP4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 48474249 A/G 1 24 25 49 11.3504295884134 13.1766358454027 -1.82620625698934 A:G A G 10 0.527065433816109 0.668496292583397 ENSG00000164051:ENST00000447018:exon_48473574_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395694:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000412398:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395696:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000296441:exon_48473587_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000442740:exon_48473605_48474576:CCDC51 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 48488192 G/C 1 7 1 8 3.31054196328724 0.527065433816109 2.78347652947113 C:G G C 10 0.527065433816109 0.0735220313078182 ENSG00000164053:ENST00000421175:exon_48488114_48488203:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000454733:exon_48488114_48488203:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000320211:exon_48488137_48488496:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000346691:exon_48488137_48488496:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000424906:exon_48488141_48488203:ATRIP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 48508585 C/T 1 186 130 316 87.9658293102037 68.5185063960942 19.4473229141095 T:C C T 10 0.527065433816109 0.032126799803236 ENSG00000213689:ENST00000395677:exon_48506886_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000296443:exon_48508029_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000433541:exon_48508139_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000444177:exon_48508067_48509042:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000456089:exon_48508464_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000492235:exon_48508177_48508832:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000422277:exon_48507673_48509041:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000436480:exon_48507673_48509041:TREX1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 48725707 C/T 1 53 59 112 25.0655320077462 31.0968605951504 -6.03132858740421 T:C C T 10 0.527065433816109 0.257783491656663 ENSG00000068745:ENST00000328631:exon_48725436_48726206:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000395507:exon_48725437_48726206:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000395509:exon_48725437_48726206:IP6K2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 48727112 G/A 1 15 17 32 7.09401849275836 8.96011237487385 -1.86609388211549 A:G G A 10 0.527065433816109 0.596331739273101 ENSG00000068745:ENST00000328631:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000395507:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000395509:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000479914:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000491686:exon_48727043_48727146:IP6K2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 49064110 A/G 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 A:G A G 10 0.527065433816109 1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 49067904 T/C 1 103 105 208 48.7122603169408 55.3418705506914 -6.62961023375068 T:C T C 10 0.527065433816109 0.367280470213556 ENSG00000198218:ENST00000395443:exon_49067140_49068077:QRICH1;ENSG00000198218:ENST00000498392:exon_49067364_49068077:QRICH1;ENSG00000198218:ENST00000357496:exon_49067365_49068077:QRICH1;ENSG00000198218:ENST00000424300:exon_49067645_49068077:QRICH1;ENSG00000198218:ENST00000489642:exon_49067808_49068077:QRICH1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 49135961 C/G 1 8 9 17 3.78347652947113 4.74358890434498 -0.960112374873853 C:G C G 10 0.527065433816109 0.80902600536977 ENSG00000172053:ENST00000494984:exon_49135786_49136125:QARS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 49141116 G/A 1 41 47 88 19.3903172135395 24.7720753893571 -5.38175817581759 A:G G A 10 0.527065433816109 0.285763778418714 ENSG00000172053:ENST00000306125:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000430182:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000414533:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000464962:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000494838:exon_49141064_49141301:QARS;ENSG00000172053:ENST00000452739:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000482261:exon_49140778_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000470619:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000479495:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000418549:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000417025:exon_49141064_49141139:QARS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 49313978 C/T 1 8 3 11 3.78347652947113 1.58119630144833 2.2022802280228 T:C C T 10 0.527065433816109 0.234094659981005 ENSG00000188315:ENST00000343010:exon_49313860_49315342:C3orf62;ENSG00000188315:ENST00000436325:exon_49313860_49314274:C3orf62 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 49343175 G/A 1 5 9 14 2.36467283091945 4.74358890434498 -2.37891607342553 A:G G A 10 0.527065433816109 0.284872281969498 ENSG00000114316:ENST00000351842:exon_49343148_49343321:USP4;ENSG00000114316:ENST00000265560:exon_49343148_49343321:USP4;ENSG00000114316:ENST00000485450:exon_49343148_49343321:USP4;ENSG00000114316:ENST00000431357:exon_49343148_49343321:USP4;ENSG00000114316:ENST00000486549:exon_49343148_49343321:USP4;ENSG00000114316:ENST00000488520:exon_49343148_49343321:USP4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 49362369 C/T 1 2 8 10 0.945869132367782 4.21652347052887 -3.27065433816109 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0545836587495111 ENSG00000114316:ENST00000351842:exon_49362327_49362472:USP4;ENSG00000114316:ENST00000265560:exon_49362327_49362472:USP4;ENSG00000114316:ENST00000416417:exon_49362327_49362472:USP4;ENSG00000114316:ENST00000415188:exon_49362327_49362472:USP4;ENSG00000114316:ENST00000464168:exon_49362327_49362472:USP4;ENSG00000114316:ENST00000491791:exon_49362327_49362472:USP4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 49570200 C/T 1 4 5 9 1.89173826473556 2.63532716908055 -0.743588904344981 T:C C T 10 0.527065433816109 0.743612144716174 ENSG00000173402:ENST00000308775:exon_49568230_49573044:DAG1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 49714225 T/C 1 30 44 74 14.1880369855167 23.1908790879088 -9.00284210239207 T:C T C 10 0.527065433816109 0.04706077768159 ENSG00000164062:ENST00000296456:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000449966:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000446089:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000442186:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000438011:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000463995:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000447436:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000457042:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000447541:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000482301:exon_49714210_49714250:APEH HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 49721532 G/A 1 18 24 42 8.51282219131004 12.6495704115866 -4.13674822027658 A:G G A 10 0.527065433816109 0.218577350649714 ENSG00000173531:ENST00000448220:exon_49721380_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000449682:exon_49721380_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000383728:exon_49721381_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000479115:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000492329:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000428801:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000488350:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000493836:exon_49721482_49721622:MST1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 49721798 C/A 1 16 25 41 7.56695305894226 13.1766358454027 -5.60968278646047 A:C C A 10 0.527065433816109 0.0864387566063377 ENSG00000173531:ENST00000448220:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000449682:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000383728:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000479115:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000492329:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000428801:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000488350:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000493836:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000484144:exon_49721758_49721886:MST1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 49738945 C/T 1 5 6 11 2.36467283091945 3.16239260289665 -0.797719771977199 T:C C T 10 0.527065433816109 0.765666449819686 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000389066:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000432042:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000494005:exon_49738924_49739041:RNF123 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 49751585 C/T 1 14 5 19 6.62108392657447 2.63532716908055 3.98575675749393 T:C C T 10 0.527065433816109 0.105309144964889 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000389066:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000469978:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000433785:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000444689:exon_49751523_49751607:RNF123 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 49758764 A/G 1 26 29 55 12.2962987207812 15.2848975806672 -2.988598859886 A:G A G 10 0.527065433816109 0.422097833598551 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000433785:exon_49758618_49758959:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000498376:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000173540:ENST00000480687:exon_49754277_49759316:GMPPB;ENSG00000173540:ENST00000308375:exon_49757357_49759580:GMPPB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 49847623 A/G 1 14 10 24 6.62108392657447 5.27065433816109 1.35042958841338 A:G A G 10 0.527065433816109 0.68432289568664 ENSG00000182179:ENST00000473992:exon_49847411_49847783:UBA7;ENSG00000182179:ENST00000489826:exon_49847412_49847861:UBA7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 50103917 G/A 1 57 64 121 26.9572702724818 33.732187764231 -6.77491749174919 A:G G A 10 0.527065433816109 0.236802979669633 ENSG00000004534:ENST00000442092:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000266022:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000443081:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000419610:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000422955:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000454079:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000434592:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000421682:exon_50103825_50103935:RBM6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 50357869 A/C 1 4 7 11 1.89173826473556 3.68945803671276 -1.7977197719772 A:C A C 10 0.527065433816109 0.36886039388561 ENSG00000068001:ENST00000447092:exon_50357000_50360213:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000357750:exon_50357000_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000395139:exon_50357000_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000442581:exon_50357000_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000481597:exon_50357000_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000458018:exon_50357558_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000424190:exon_50357568_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000426286:exon_50357677_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000428028:exon_50357691_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000415028:exon_50357778_50357966:HYAL2;ENSG00000114383:ENST00000462137:exon_50357458_50357966:TUSC2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 51426454 C/T 1 224 218 442 105.937342825192 114.900264571912 -8.9629217467202 T:C C T 10 0.527065433816109 0.418087992825207 ENSG00000145050:ENST00000528157:exon_51426336_51426828:AC092037.1;ENSG00000145050:ENST00000518640:exon_51426336_51426828:AC092037.1;ENSG00000145050:ENST00000438713:exon_51426336_51426828:AC092037.1;ENSG00000145050:ENST00000446668:exon_51426336_51426693:AC092037.1;ENSG00000145050:ENST00000470900:exon_51426336_51426775:AC092037.1;ENSG00000145050:ENST00000482262:exon_51426336_51426580:AC092037.1;ENSG00000249398:ENST00000273628:exon_51426336_51426520:MANF HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 52237970 C/T 1 29 37 66 13.7151024193328 19.501421051196 -5.78631863186319 T:C C T 10 0.527065433816109 0.175183058286885 ENSG00000023330:ENST00000469224:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000394965:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000441729:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000442476:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000310271:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000484952:exon_52237879_52238028:ALAS1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 52256697 C/T 1 27 33 60 12.7692332869651 17.3931593159316 -4.62392602896654 T:C C T 10 0.527065433816109 0.246408472077430 ENSG00000239732:ENST00000360658:exon_52255096_52258328:TLR9;ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52255097_52258328:RP11-330H6.5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 52263967 G/A 1 38 43 81 17.9715135149879 22.6638136540927 -4.69230013910483 A:G G A 10 0.527065433816109 0.3176015651382 ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52263936_52264086:RP11-330H6.5;ENSG00000247596:ENST00000305533:exon_52263936_52264086:TWF2;ENSG00000247596:ENST00000499914:exon_52263936_52264086:TWF2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 52563199 A/T 1 56 34 90 26.4843357062979 17.9202247497477 8.56411095655019 A:T A T 10 0.527065433816109 0.0733322474207377 ENSG00000168268:ENST00000307092:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000307076:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000422318:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000459839:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000492555:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000489316:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000471522:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000487779:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000490681:exon_52563166_52563350:NT5DC2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 52720080 A/C 1 13 13 26 6.14814936039058 6.85185063960942 -0.703701279218835 A:C A C 10 0.527065433816109 0.84562040810587 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468146:exon_52720021_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52720032_52720218:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468885:exon_52720046_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000462550:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000492349:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52720065_52720121:GNL3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 52727257 G/A 1 207 201 408 97.8974552000654 105.940152197038 -8.0426969969725 A:G G A 10 0.527065433816109 0.428079225699476 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000497356:exon_52727186_52727560:GNL3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 52727736 A/G 1 375 313 688 177.350462318959 164.971480784442 12.378981534517 A:G A G 10 0.527065433816109 0.359527587343533 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000497356:exon_52727648_52727795:GNL3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 52874439 G/A 1 6 5 11 2.83760739710335 2.63532716908055 0.202280228022801 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000213533:ENST00000355083:exon_52870772_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000477591:exon_52874234_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000464769:exon_52874310_52874626:TMEM110 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 52874446 C/T 1 5 6 11 2.36467283091945 3.16239260289665 -0.797719771977199 T:C C T 10 0.527065433816109 0.765666449819686 ENSG00000213533:ENST00000355083:exon_52870772_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000477591:exon_52874234_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000464769:exon_52874310_52874626:TMEM110 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 53259850 C/T 1 238 260 498 112.558426751766 137.037012792188 -24.4785860404223 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0311304163975573 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53258723_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53259767_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53259655_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53259668_53262165:TKT;ENSG00000163931:ENST00000461139:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53259675_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53259718_53259947:TKT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 53264485 A/G 1 258 244 502 122.017118075444 128.603965851131 -6.58684777568673 A:G A G 10 0.527065433816109 0.561472089851785 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000461139:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53264473_53264637:TKT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 53267342 G/A 0 0 9 9 0 4.74358890434498 -4.74358890434498 A G A 10 0.527065433816109 0.00118361242313293 ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000494523:exon_53267172_53269035:TKT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 53269046 T/C 1 136 113 249 64.3191010010092 59.5583940212203 4.76070697978885 T:C T C 10 0.527065433816109 0.56817379249831 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53268999_53269080:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53268999_53269209:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53268999_53269132:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000472528:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000466765:exon_53268999_53269176:TKT;ENSG00000163931:ENST00000487660:exon_53268868_53269190:TKT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 53269163 G/A 1 94 75 169 44.4558492212858 39.5299075362082 4.92594168507758 A:G G A 10 0.527065433816109 0.488264984484259 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53268999_53269209:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000472528:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000466765:exon_53268999_53269176:TKT;ENSG00000163931:ENST00000487660:exon_53268868_53269190:TKT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 53321631 A/C 1 27 21 48 12.7692332869651 11.0683741101383 1.70085917682677 A:C A C 10 0.527065433816109 0.666365310723135 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 56628031 G/A 1 8 5 13 3.78347652947113 2.63532716908055 1.14814936039058 A:G G A 10 0.527065433816109 0.588366380954527 ENSG00000180376:ENST00000436465:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000422222:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000394672:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000326595:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000471681:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000341455:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000484623:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000468108:exon_56627972_56628056:CCDC66 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 56667358 G/A 1 19 17 36 8.98575675749393 8.96011237487385 0.0256443826200741 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000163946:ENST00000459993:exon_56667072_56668000:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000431842:exon_56667072_56667871:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000493960:exon_56667072_56667994:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000355628:exon_56667072_56667871:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000447900:exon_56667072_56667994:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000296313:exon_56667072_56667871:C3orf63 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 56667682 G/C 1 16 9 25 7.56695305894226 4.74358890434498 2.82336415459727 C:G G C 10 0.527065433816109 0.3181294657177 ENSG00000163946:ENST00000459993:exon_56667072_56668000:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000431842:exon_56667072_56667871:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000493960:exon_56667072_56667994:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000355628:exon_56667072_56667871:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000447900:exon_56667072_56667994:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000296313:exon_56667072_56667871:C3orf63 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 56763328 T/C 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 T:C T C 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56761449_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56762260_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56763015_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56763049_56763650:ARHGEF3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 56771251 A/C 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 A:C A C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56771213_56771383:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56771213_56771383:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56771213_56771383:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56771213_56771383:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56771213_56771383:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56771213_56771383:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000495373:exon_56771213_56771383:ARHGEF3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 58382846 C/T 1 4 6 10 1.89173826473556 3.16239260289665 -1.27065433816109 T:C C T 10 0.527065433816109 0.532268681489131 ENSG00000168297:ENST00000356151:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000468776:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000302779:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000383716:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000463280:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000383715:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000484288:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479241:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000477308:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479134:exon_58382766_58382927:PXK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 58410554 C/T 1 15 14 29 7.09401849275836 7.37891607342553 -0.284897580667162 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000168297:ENST00000356151:exon_58410479_58410878:PXK;ENSG00000168297:ENST00000468776:exon_58410479_58410785:PXK;ENSG00000168297:ENST00000302779:exon_58410479_58410878:PXK;ENSG00000168297:ENST00000383716:exon_58410479_58410878:PXK;ENSG00000168297:ENST00000463280:exon_58410479_58411748:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479241:exon_58410479_58411746:PXK;ENSG00000168297:ENST00000477308:exon_58410479_58410785:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479134:exon_58410479_58411601:PXK;ENSG00000168297:ENST00000493474:exon_58410479_58410902:PXK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 58416535 C/T 1 39 29 68 18.4444480811717 15.2848975806672 3.15955050050458 T:C C T 10 0.527065433816109 0.468180370582603 ENSG00000168291:ENST00000302746:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000383714:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000469364:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000479945:exon_58416384_58417520:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000474765:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000461692:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000480626:exon_58416384_58416669:PDHB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 66419942 A/G 1 10 9 19 4.72934566183891 4.74358890434498 -0.0142432425060717 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66419902_66419966:SLC25A26 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 66419956 C/T 1 10 15 25 4.72934566183891 7.90598150724164 -3.17663584540273 T:C C T 10 0.527065433816109 0.232365445872985 ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66419902_66419966:SLC25A26 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 66434643 T/C 1 7 3 10 3.31054196328724 1.58119630144833 1.72934566183891 T:C T C 10 0.527065433816109 0.350932787230552 ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66434415_66434696:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66434556_66434696:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66434415_66434696:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66434415_66434696:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66434415_66434696:LRIG1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 69096614 G/A 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 A:G G A 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000144747:ENST00000398559:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000356248:exon_69096500_69097284:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000488010:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000438636:exon_69096509_69097713:TMF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 73114003 T/C 1 13 14 27 6.14814936039058 7.37891607342553 -1.23076671303494 T:C T C 10 0.527065433816109 0.701898180501923 ENSG00000163605:ENST00000356692:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000482242:exon_73114003_73114133:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000488810:exon_73114003_73114117:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000394284:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000460360:exon_73114003_73114441:PPP4R2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 81698130 T/C 1 7 9 16 3.31054196328724 4.74358890434498 -1.43304694105774 T:C T C 10 0.527065433816109 0.618149317471371 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000498468:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000486920:exon_81698118_81698142:GBE1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 88199313 G/T 1 13 15 28 6.14814936039058 7.90598150724164 -1.75783214685105 T:G G T 10 0.527065433816109 0.572286226612737 ENSG00000179021:ENST00000318887:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000383697:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000486971:exon_88199137_88199335:C3orf38 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 97664173 C/T 1 30 24 54 14.1880369855167 12.6495704115866 1.53846657393011 T:C C T 10 0.527065433816109 0.685648357642606 ENSG00000170854:ENST00000442492:exon_97660661_97664186:MINA;ENSG00000170854:ENST00000333396:exon_97663086_97664186:MINA;ENSG00000170854:ENST00000394198:exon_97663195_97664186:MINA;ENSG00000170854:ENST00000506682:exon_97663250_97664186:MINA;ENSG00000170854:ENST00000360258:exon_97663404_97664186:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503517:exon_97664021_97664186:MINA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 97664725 C/T 1 17 6 23 8.03988762512615 3.16239260289665 4.87749502222949 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0580867060926943 ENSG00000170854:ENST00000442492:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000333396:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000394198:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000506682:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000360258:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503517:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503097:exon_97664182_97664731:MINA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 98307696 T/G 1 15 11 26 7.09401849275836 5.7977197719772 1.29629872078116 T:G T G 10 0.527065433816109 0.696440239382925 ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98307557_98307698:CPOX HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 99886662 G/A 1 15 20 35 7.09401849275836 10.5413086763222 -3.44729018356382 A:G G A 10 0.527065433816109 0.309807945350998 ENSG00000184220:ENST00000421999:exon_99886582_99886684:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000491299:exon_99886582_99886684:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000489081:exon_99886582_99886684:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000478909:exon_99886582_99886684:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000497345:exon_99886582_99886684:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000479555:exon_99886582_99886684:C3orf26 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 100467018 T/C 1 107 97 204 50.6039985816763 51.1253470801626 -0.521348498486248 T:C T C 10 0.527065433816109 0.944234648640449 ENSG00000114354:ENST00000418917:exon_100466993_100467786:TFG;ENSG00000114354:ENST00000490574:exon_100466993_100467771:TFG;ENSG00000114354:ENST00000240851:exon_100466993_100467810:TFG;ENSG00000114354:ENST00000406587:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000443578:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000476228:exon_100466993_100467808:TFG;ENSG00000114354:ENST00000481203:exon_100466993_100467807:TFG HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 105389153 A/G 1 30 20 50 14.1880369855167 10.5413086763222 3.64672830919455 A:G A G 10 0.527065433816109 0.324181898841577 ENSG00000114423:ENST00000394030:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000476370:exon_105389077_105392837:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000407712:exon_105389077_105389196:CBLB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 105422844 C/T 1 10 12 22 4.72934566183891 6.32478520579331 -1.5954395439544 T:C C T 10 0.527065433816109 0.528175996250381 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105422832_105423017:CBLB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 105438957 T/G 1 5 5 10 2.36467283091945 2.63532716908055 -0.270654338161091 T:G T G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105438891_105439094:CBLB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 105439026 G/A 1 12 3 15 5.67521479420669 1.58119630144833 4.09401849275836 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0390849308207645 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105438891_105439094:CBLB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 108373022 G/A 1 7 3 10 3.31054196328724 1.58119630144833 1.72934566183891 A:G G A 10 0.527065433816109 0.350932787230552 ENSG00000198919:ENST00000361582:exon_108372992_108373157:DZIP3;ENSG00000198919:ENST00000495008:exon_108372992_108373157:DZIP3;ENSG00000198919:ENST00000463306:exon_108372992_108373157:DZIP3;ENSG00000198919:ENST00000437062:exon_108372992_108373157:DZIP3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 112059768 C/G 1 5 7 12 2.36467283091945 3.68945803671276 -1.32478520579331 C:G C G 10 0.527065433816109 0.566621218006073 ENSG00000091972:ENST00000498096:exon_112059749_112059830:CD200;ENSG00000091972:ENST00000451093:exon_112059749_112059830:CD200;ENSG00000091972:ENST00000315711:exon_112059749_112059830:CD200;ENSG00000091972:ENST00000473539:exon_112059749_112059830:CD200;ENSG00000091972:ENST00000393901:exon_112059749_112059830:CD200 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 112066430 C/T 1 19 8 27 8.98575675749393 4.21652347052887 4.76923328696506 T:C C T 10 0.527065433816109 0.082110621308263 ENSG00000091972:ENST00000498096:exon_112066410_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000451093:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000315711:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000473539:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000393901:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000383681:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000478595:exon_112066410_112066677:CD200 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 113169205 C/T 1 8 2 10 3.78347652947113 1.05413086763222 2.72934566183891 T:C C T 10 0.527065433816109 0.114525614534534 ENSG00000163611:ENST00000295872:exon_113169183_113169363:SPICE1;ENSG00000163611:ENST00000496105:exon_113167682_113169363:SPICE1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 119134391 C/T 1 15 15 30 7.09401849275836 7.90598150724164 -0.811963014483272 T:C C T 10 0.527065433816109 0.855562656731326 ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119132703_119139561:ARHGAP31 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 119211294 A/G 1 9 3 12 4.25641109565502 1.58119630144833 2.67521479420669 A:G A G 10 0.527065433816109 0.153067812973243 ENSG00000163389:ENST00000295588:exon_119211129_119213555:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000486607:exon_119211129_119211324:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000473648:exon_119211129_119211993:POGLUT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 119219573 A/G 1 46 48 94 21.754990044459 25.2991408231732 -3.54415077871425 A:G A G 10 0.527065433816109 0.47160416616395 ENSG00000113845:ENST00000494664:exon_119219542_119219707:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000264244:exon_119219542_119219707:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000463927:exon_119219542_119219707:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000469324:exon_119219221_119219707:C3orf1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 119236104 G/A 1 88 59 147 41.6182418241824 31.0968605951504 10.521381229032 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0834232261672264 ENSG00000113845:ENST00000494664:exon_119236052_119236162:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000493694:exon_119236052_119236162:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000264244:exon_119236052_119236162:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000486418:exon_119236052_119236162:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000492164:exon_119236052_119236162:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000466984:exon_119236052_119236162:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000463927:exon_119236052_119236162:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000498399:exon_119236052_119236162:C3orf1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 119236179 G/A 1 33 26 59 15.6068406840684 13.7037012792188 1.90313940484957 A:G G A 10 0.527065433816109 0.696191290061621 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 119242443 C/T 1 14 13 27 6.62108392657447 6.85185063960942 -0.230766713034944 T:C C T 10 0.527065433816109 1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 119301139 C/T 1 12 6 18 5.67521479420669 3.16239260289665 2.51282219131004 T:C C T 10 0.527065433816109 0.345457652895314 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000481816:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119300912_119301314:ADPRH HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 119720980 T/A 1 2 9 11 0.945869132367782 4.74358890434498 -3.7977197719772 A:T T A 10 0.527065433816109 0.0310731489114619 ENSG00000082701:ENST00000264235:exon_119720893_119721086:GSK3B;ENSG00000082701:ENST00000316626:exon_119720893_119721086:GSK3B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 120424912 C/T 1 6 3 9 2.83760739710335 1.58119630144833 1.25641109565502 T:C C T 10 0.527065433816109 0.513555929047552 ENSG00000144840:ENST00000273375:exon_120424847_120424961:RABL3;ENSG00000144840:ENST00000473654:exon_120424847_120424961:RABL3;ENSG00000144840:ENST00000485161:exon_120424847_120424961:RABL3;ENSG00000144840:ENST00000481015:exon_120424847_120424961:RABL3;ENSG00000144840:ENST00000465022:exon_120424847_120424961:RABL3;ENSG00000144840:ENST00000491398:exon_120424847_120424961:RABL3;ENSG00000144840:ENST00000483733:exon_120424847_120424961:RABL3;ENSG00000144840:ENST00000468192:exon_120424847_120424961:RABL3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 120500093 C/T 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000153767:ENST00000283875:exon_120499890_120501916:GTF2E1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 121351338 C/T 1 144 158 302 68.1025775304803 83.2763385429452 -15.1737610124649 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0838850450220245 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121351253_121351410:HCLS1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 121353254 T/C 1 173 173 346 81.8176799498131 91.1823200501869 -9.36464010037372 T:C T C 10 0.527065433816109 0.332535985304835 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121353054_121353265:HCLS1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 121413637 G/A 1 15 22 37 7.09401849275836 11.5954395439544 -4.50142105119603 A:G G A 10 0.527065433816109 0.142521190648815 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 121415610 G/A 1 10 11 21 4.72934566183891 5.7977197719772 -1.06837411013829 A:G G A 10 0.527065433816109 0.667942291105539 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 121500699 C/T 1 23 24 47 10.8774950222295 12.6495704115866 -1.77207538935712 T:C C T 10 0.527065433816109 0.662226393311836 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121500590_121500721:IQCB1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 121712238 C/T 1 5 6 11 2.36467283091945 3.16239260289665 -0.797719771977199 T:C C T 10 0.527065433816109 0.765666449819686 ENSG00000145103:ENST00000273691:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000344209:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000393631:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000462014:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000460554:exon_121711996_121712798:ILDR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 121712805 G/C 1 6 2 8 2.83760739710335 1.05413086763222 1.78347652947113 C:G G C 10 0.527065433816109 0.29481715391141 ENSG00000145103:ENST00000273691:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000344209:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000383663:exon_121712627_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000393631:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000462014:exon_121711997_121712817:ILDR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 121825197 G/A 1 23 12 35 10.8774950222295 6.32478520579331 4.55270981643618 A:G G A 10 0.527065433816109 0.130959499644876 ENSG00000114013:ENST00000469710:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000493101:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000330540:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000383662:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000264468:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000393627:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000478741:exon_121825045_121825347:CD86 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 122259640 T/C 1 53 36 89 25.0655320077462 18.9743556173799 6.0911763903663 T:C T C 10 0.527065433816109 0.204253976789268 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000492382:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000489652:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122259319_122259699:PARP9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 122274757 G/C 1 22 22 44 10.4045604560456 11.5954395439544 -1.1908790879088 C:G G C 10 0.527065433816109 0.763915403997477 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000466126:exon_122274711_122274968:PARP9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 122345870 C/T 1 10 2 12 4.72934566183891 1.05413086763222 3.67521479420669 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0418936923317288 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122345674_122345880:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122345674_122345880:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122345674_122345880:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000473627:exon_122345674_122345880:PARP15 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 122354037 A/G 1 41 58 99 19.3903172135395 30.5697951613343 -11.1794779477948 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0266535185981960 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122353867_122354041:PARP15 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 122354716 C/T 1 41 44 85 19.3903172135395 23.1908790879088 -3.80056187436927 T:C C T 10 0.527065433816109 0.447558055434526 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122354658_122354886:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 123634046 G/A 1 14 7 21 6.62108392657447 3.68945803671276 2.93162588986171 A:G G A 10 0.527065433816109 0.274579453085168 ENSG00000175455:ENST00000310351:exon_123632300_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000485727:exon_123632564_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409657:exon_123632572_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000489746:exon_123632574_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000433542:exon_123633166_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409697:exon_123633469_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000488653:exon_123633469_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000483247:exon_123633509_123634136:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000419247:exon_123634046_123634136:CCDC14 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 123665902 T/G 1 5 6 11 2.36467283091945 3.16239260289665 -0.797719771977199 T:G T G 10 0.527065433816109 0.765666449819686 ENSG00000175455:ENST00000310351:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000485727:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409657:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000495381:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000489746:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000433542:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409697:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000488653:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000426152:exon_123665651_123665904:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000435910:exon_123665860_123666166:CCDC14 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 124802677 A/G 1 37 27 64 17.498578948804 14.2307667130349 3.26781223576902 A:G A G 10 0.527065433816109 0.453764604861396 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 124802881 A/G 1 24 12 36 11.3504295884134 6.32478520579331 5.02564438262008 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0979476499773242 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124802734_124802893:SLC12A8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 124802888 C/T 1 23 12 35 10.8774950222295 6.32478520579331 4.55270981643618 T:C:G C T 10 0.527065433816109 0.130959499644876 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124802734_124802893:SLC12A8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 124951821 C/T 1 13 10 23 6.14814936039058 5.27065433816109 0.877495022229492 T:C C T 10 0.527065433816109 0.835491706691073 ENSG00000163848:ENST00000360647:exon_124944405_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000484491:exon_124950920_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000492394:exon_124950923_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000485866:exon_124951172_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000497929:exon_124951185_124952783:ZNF148 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 125726048 G/C 1 21 21 42 9.93162588986171 11.0683741101383 -1.13674822027658 C:G G C 10 0.527065433816109 0.758957157762768 ENSG00000114544:ENST00000360370:exon_125725198_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000346785:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000383598:exon_125725201_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000512557:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000506102:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000458524:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315891:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000508835:exon_125725699_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315921:exon_125725916_125726068:SLC41A3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 126180705 G/A 1 13 13 26 6.14814936039058 6.85185063960942 -0.703701279218835 A:G G A 10 0.527065433816109 0.84562040810587 ENSG00000070476:ENST00000389709:exon_126180378_126181063:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000515545:exon_126180113_126181063:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000435595:exon_126180113_126181063:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000336332:exon_126179926_126181063:ZXDC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 127295902 C/T 1 20 13 33 9.45869132367782 6.85185063960942 2.6068406840684 T:C C T 10 0.527065433816109 0.388602120912087 ENSG00000163870:ENST00000296210:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000450633:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000355552:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000393400:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000483868:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000489960:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000490290:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000469111:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000490643:exon_127295833_127295919:TPRA1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 127318280 T/C 1 15 12 27 7.09401849275836 6.32478520579331 0.769233286965056 T:C T C 10 0.527065433816109 0.848360844335184 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127318161_127318390:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127318161_127318390:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000480910:exon_127318161_127318390:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000472731:exon_127317945_127318390:MCM2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 127323830 C/T 1 38 33 71 17.9715135149879 17.3931593159316 0.578354199056257 T:C C T 10 0.527065433816109 0.906030773736334 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468659:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127323739_127323999:MCM2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 127394820 C/T 1 13 5 18 6.14814936039058 2.63532716908055 3.51282219131004 T:C C T 10 0.527065433816109 0.104967213978269 ENSG00000114626:ENST00000483857:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000361019:exon_127394813_127394903:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000393363:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000232744:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000475265:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000493365:exon_127394813_127395278:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000453791:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000475042:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000479280:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000467179:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000468137:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000464431:exon_127394329_127395274:ABTB1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 128350922 G/A 1 60 46 106 28.3760739710335 24.245009955541 4.13106401549244 A:C:G G A 10 0.527065433816109 0.437930155692649 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128350791_128351000:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128350791_128351000:RPN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 128614185 A/C 1 16 9 25 7.56695305894226 4.74358890434498 2.82336415459727 A:C A C 10 0.527065433816109 0.3181294657177 ENSG00000177646:ENST00000514643:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000512801:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505192:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000514336:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000453462:exon_128614153_128614191:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128614153_128614259:ACAD9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 128618283 T/C 1 8 8 16 3.78347652947113 4.21652347052887 -0.433046941057745 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128618130_128618304:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128618130_128618304:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505192:exon_128618130_128618304:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128618130_128618304:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128618130_128618304:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511526:exon_128618130_128618304:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000508971:exon_128618208_128618304:ACAD9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 128890350 G/A 1 218 216 434 103.099735428088 113.84613370428 -10.7463982761913 A:G G A 10 0.527065433816109 0.312850382881674 ENSG00000169714:ENST00000502976:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000422453:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000451728:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000446936:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000307433:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000393290:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000500450:exon_128890289_128890351:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000504813:exon_128890289_128890351:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000441626:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000502372:exon_128889922_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000512338:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000507573:exon_128890095_128890614:CNBP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 128976396 T/C 1 34 37 71 16.0797752502523 19.501421051196 -3.42164580094374 T:C:G T C 10 0.527065433816109 0.476071784484456 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128976313_128976470:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128976313_128976470:COPG HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 128984583 C/T 1 42 44 86 19.8632517797234 23.1908790879088 -3.32762730818538 T:C C T 10 0.527065433816109 0.517472310019568 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128984392_128984635:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128984392_128984635:COPG;ENSG00000181789:ENST00000513410:exon_128984392_128984635:COPG HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 129023630 G/A 1 89 54 143 42.0911763903663 28.4615334260699 13.6296429642964 A:G G A 10 0.527065433816109 0.023652818019234 ENSG00000183624:ENST00000383463:exon_129023432_129024136:C3orf37;ENSG00000183624:ENST00000417226:exon_129023432_129024136:C3orf37;ENSG00000183624:ENST00000502878:exon_129023432_129024146:C3orf37;ENSG00000183624:ENST00000389735:exon_129023432_129024105:C3orf37 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 129152089 G/A 1 46 23 69 21.754990044459 12.1225049777705 9.63248506668848 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0217575745964095 ENSG00000129071:ENST00000429544:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000249910:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000393278:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000503197:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000509828:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000507208:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000511009:exon_129151941_129152396:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000515266:exon_129151941_129152090:MBD4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 129155670 C/T 1 55 60 115 26.011401140114 31.6239260289665 -5.61252488885254 T:C:G C T 10 0.527065433816109 0.305428140726678 ENSG00000129071:ENST00000429544:exon_129155304_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000249910:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000503197:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000507208:exon_129155286_129156151:MBD4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 130718472 G/A 1 45 52 97 21.2820554782751 27.4074025584377 -6.12534708016258 A:G G A 10 0.527065433816109 0.223436473020301 ENSG00000017260:ENST00000504381:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000505330:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000507488:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000510168:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000508532:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000513801:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000504948:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000328560:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000533801:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000428331:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000393221:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000422190:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000359644:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000347421:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000504612:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000514654:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000507194:exon_130718362_130718503:ATP2C1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 133524717 G/C 1 18 20 38 8.51282219131004 10.5413086763222 -2.02848648501214 C:G G C 10 0.527065433816109 0.520721033667497 ENSG00000144867:ENST00000466490:exon_133524520_133524846:SRPRB;ENSG00000144867:ENST00000484684:exon_133524459_133524846:SRPRB;ENSG00000144867:ENST00000273406:exon_133524665_133524846:SRPRB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 134967263 C/A 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 A:C C A 10 0.527065433816109 0.488810537661758 ENSG00000154928:ENST00000398015:exon_134967158_134967351:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000360935:exon_134967158_134967351:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000425716:exon_134967158_134967351:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000493838:exon_134967158_134967351:EPHB1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 140695307 C/A 1 26 19 45 12.2962987207812 10.0142432425061 2.28205547827509 A:C C A 10 0.527065433816109 0.551919035282903 ENSG00000114120:ENST00000446041:exon_140695105_140698775:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000324194:exon_140695102_140695492:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000502594:exon_140695102_140695325:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000453248:exon_140695102_140695323:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000511757:exon_140695102_140695489:SLC25A36 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 141464146 G/A 1 184 166 350 87.0199601778359 87.4928620134741 -0.472901835638154 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000114125:ENST00000273480:exon_141464001_141466402:RNF7;ENSG00000114125:ENST00000480908:exon_141464001_141464542:RNF7;ENSG00000114125:ENST00000393000:exon_141464001_141464544:RNF7;ENSG00000114125:ENST00000477012:exon_141464001_141464511:RNF7;ENSG00000114125:ENST00000477393:exon_141464001_141464359:RNF7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 142178144 C/T 1 11 13 24 5.2022802280228 6.85185063960942 -1.64957041158662 T:C C T 10 0.527065433816109 0.544155066076199 ENSG00000175054:ENST00000350721:exon_142178069_142178225:ATR;ENSG00000175054:ENST00000513291:exon_142178069_142178225:ATR;ENSG00000175054:ENST00000383101:exon_142178069_142178225:ATR HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 145788467 T/C 1 14 8 22 6.62108392657447 4.21652347052887 2.4045604560456 T:C T C 10 0.527065433816109 0.394231574114095 ENSG00000152952:ENST00000282903:exon_145787227_145788659:PLOD2;ENSG00000152952:ENST00000461497:exon_145787227_145788659:PLOD2;ENSG00000152952:ENST00000360060:exon_145787231_145788659:PLOD2;ENSG00000152952:ENST00000494950:exon_145787968_145788659:PLOD2;ENSG00000152952:ENST00000495700:exon_145788028_145788659:PLOD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 150128154 T/C 1 7 7 14 3.31054196328724 3.68945803671276 -0.378916073425526 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000196428:ENST00000361875:exon_150126122_150129095:TSC22D2;ENSG00000196428:ENST00000361136:exon_150126122_150129095:TSC22D2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 150128484 C/A 1 3 9 12 1.41880369855167 4.74358890434498 -3.32478520579331 A:C C A 10 0.527065433816109 0.0800200924234215 ENSG00000196428:ENST00000361875:exon_150126122_150129095:TSC22D2;ENSG00000196428:ENST00000361136:exon_150126122_150129095:TSC22D2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 150262318 C/T 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 T:C C T 10 0.527065433816109 0.757490641773051 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 150285520 T/C 1 27 30 57 12.7692332869651 15.8119630144833 -3.04272972751822 T:C T C 10 0.527065433816109 0.429416487144673 ENSG00000144895:ENST00000487799:exon_150285480_150285553:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000460851:exon_150285480_150285553:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000494558:exon_150285480_150285553:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000406576:exon_150285480_150285553:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000482093:exon_150285480_150285553:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000273435:exon_150285480_150285553:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000462221:exon_150285480_150285553:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000472926:exon_150285186_150285553:EIF2A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 156266774 C/T 1 78 88 166 36.8888961623435 46.3817581758176 -9.4928620134741 T:C C T 10 0.527065433816109 0.140674179718643 ENSG00000114850:ENST00000265044:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467789:exon_156266655_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000476217:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000498205:exon_156266694_156266888:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000478842:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000464138:exon_156266594_156266786:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000463503:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000496050:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467733:exon_156266694_156266792:SSR3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 160804167 C/T 1 4 7 11 1.89173826473556 3.68945803671276 -1.7977197719772 T:C C T 10 0.527065433816109 0.36886039388561 ENSG00000169255:ENST00000392779:exon_160801671_160804576:B3GALNT1;ENSG00000169255:ENST00000320474:exon_160801671_160804576:B3GALNT1;ENSG00000169255:ENST00000392780:exon_160801671_160804576:B3GALNT1;ENSG00000169255:ENST00000392781:exon_160801685_160804576:B3GALNT1;ENSG00000169255:ENST00000473285:exon_160802771_160804576:B3GALNT1;ENSG00000169255:ENST00000488170:exon_160803547_160804576:B3GALNT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 160956548 A/G 1 8 4 12 3.78347652947113 2.10826173526444 1.67521479420669 A:G A G 10 0.527065433816109 0.396148353996528 ENSG00000169251:ENST00000351193:exon_160956518_160956614:NMD3;ENSG00000169251:ENST00000472947:exon_160956518_160956614:NMD3;ENSG00000169251:ENST00000460469:exon_160956518_160956614:NMD3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 171338237 T/G 1 8 2 10 3.78347652947113 1.05413086763222 2.72934566183891 T:G T G 10 0.527065433816109 0.114525614534534 ENSG00000075651:ENST00000356327:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000351298:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000342215:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000446289:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000340989:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000465816:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000467432:exon_171338176_171338310:PLD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 171395468 A/G 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 A:G A G 10 0.527065433816109 0.757490641773051 ENSG00000075651:ENST00000356327:exon_171395356_171395484:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000351298:exon_171395356_171395484:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000342215:exon_171395356_171395484:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000340989:exon_171395356_171395484:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000471075:exon_171395356_171395643:PLD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 171404478 C/A 1 6 3 9 2.83760739710335 1.58119630144833 1.25641109565502 A:C C A 10 0.527065433816109 0.513555929047552 ENSG00000075651:ENST00000351298:exon_171404475_171404588:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000340989:exon_171404475_171404588:PLD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 172224303 A/G 1 36 25 61 17.0256443826201 13.1766358454027 3.84900853721735 A:G A G 10 0.527065433816109 0.370004501743918 ENSG00000121858:ENST00000241261:exon_172223298_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000420541:exon_172223452_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000382750:exon_172224300_172224709:TNFSF10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 174951756 T/C 1 8 5 13 3.78347652947113 2.63532716908055 1.14814936039058 T:C T C 10 0.527065433816109 0.588366380954527 ENSG00000177694:ENST00000454872:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000485853:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000473253:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000316366:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000489299:exon_174951721_174951994:NAALADL2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 182853670 T/C 1 34 24 58 16.0797752502523 12.6495704115866 3.43020483866568 T:C T C 10 0.527065433816109 0.430505549440576 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182853505_182853675:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182853505_182853675:LAMP3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 182871962 C/T 1 43 32 75 20.3361863459073 16.8660938821155 3.47009246379182 T:C C T 10 0.527065433816109 0.488070469167216 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000476015:exon_182871689_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000470251:exon_182871728_182872179:LAMP3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 183212026 C/T 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 T:C C T 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000172578:ENST00000341319:exon_183211867_183212069:KLHL6;ENSG00000172578:ENST00000468734:exon_183211867_183212069:KLHL6;ENSG00000172578:ENST00000489245:exon_183208798_183212069:KLHL6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 183226072 G/A 1 9 1 10 4.25641109565502 0.527065433816109 3.72934566183891 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0232976587027389 ENSG00000172578:ENST00000341319:exon_183225847_183226296:KLHL6;ENSG00000172578:ENST00000468734:exon_183225847_183226296:KLHL6;ENSG00000172578:ENST00000489245:exon_183225847_183226296:KLHL6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 183226114 G/T 1 1 8 9 0.472934566183891 4.21652347052887 -3.74358890434498 T:G G T 10 0.527065433816109 0.0161943073002794 ENSG00000172578:ENST00000341319:exon_183225847_183226296:KLHL6;ENSG00000172578:ENST00000468734:exon_183225847_183226296:KLHL6;ENSG00000172578:ENST00000489245:exon_183225847_183226296:KLHL6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 183861243 A/G 1 40 56 96 18.9173826473556 29.5156642937021 -10.5982816463465 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0319178280268446 ENSG00000145191:ENST00000491144:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000273783:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000444495:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000481054:exon_183860840_183862012:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000465218:exon_183860840_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000484154:exon_183861230_183861497:EIF2B5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 183976103 C/T 1 20 26 46 9.45869132367782 13.7037012792188 -4.24500995554102 T:C C T 10 0.527065433816109 0.23834712232267 ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183976076_183977373:ECE2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 183976108 T/C 1 25 20 45 11.8233641545973 10.5413086763222 1.28205547827509 T:C T C 10 0.527065433816109 0.76625053826379 ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183976076_183977373:ECE2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 183976241 A/G 1 17 14 31 8.03988762512615 7.37891607342553 0.66097155170062 A:G A G 10 0.527065433816109 0.858827214622317 ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183976076_183977373:ECE2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 184020542 G/T 1 22 26 48 10.4045604560456 13.7037012792188 -3.29914082317323 T:G G T 10 0.527065433816109 0.386637260888145 ENSG00000175166:ENST00000310118:exon_184020467_184020611:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000445558:exon_184020467_184020563:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000435761:exon_184020467_184020611:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000439383:exon_184020467_184020611:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000485937:exon_184020467_184020560:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000491149:exon_184020467_184020611:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000460628:exon_184020528_184020611:PSMD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 184026703 C/T 1 95 85 180 44.9287837874696 44.8005618743693 0.128221913100376 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000175166:ENST00000310118:exon_184026496_184026842:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000435761:exon_184026496_184026788:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000439383:exon_184026496_184026836:PSMD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 184039666 A/G 1 65 57 122 30.7407468019529 30.0427297275182 0.698017074434699 A:G A G 10 0.527065433816109 0.927932056754924 ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000450424:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000421110:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000413967:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000426123:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000444861:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000457456:exon_184039070_184039815:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184039070_184039891:EIF4G1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 184766301 T/C 1 13 12 25 6.14814936039058 6.32478520579331 -0.176635845402726 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000156931:ENST00000287546:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000436792:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000446204:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000437079:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000492449:exon_184766267_184766347:VPS8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 191100561 C/A 1 28 44 72 13.2421678531489 23.1908790879088 -9.94871123475985 A:C C A 10 0.527065433816109 0.0242654929962075 ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191100535_191100614:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191100535_191100614:CCDC50 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 195594805 A/G 1 24 20 44 11.3504295884134 10.5413086763222 0.809120912091203 A:G A G 10 0.527065433816109 0.880472588106527 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 195595054 C/T 1 24 19 43 11.3504295884134 10.0142432425061 1.33618634590731 T:C C T 10 0.527065433816109 0.760832572532408 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000495247:exon_195594955_195595168:TNK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 195595405 G/A 1 14 15 29 6.62108392657447 7.90598150724164 -1.28489758066716 A:G G A 10 0.527065433816109 0.711321912285436 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000495247:exon_195595404_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000464041:exon_195595088_195597076:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000439230:exon_195595094_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000481865:exon_195595096_195597076:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000424563:exon_195595227_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000478623:exon_195595377_195595580:TNK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 196199204 G/T 1 8 20 28 3.78347652947113 10.5413086763222 -6.75783214685105 T:G G T 10 0.527065433816109 0.0129074452767581 ENSG00000163961:ENST00000318037:exon_196195654_196199643:RNF168;ENSG00000163961:ENST00000437070:exon_196198631_196199643:RNF168 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 196388099 G/C 1 68 83 151 32.1595505005046 43.746431006737 -11.5868805062325 T:C:G G C 10 0.527065433816109 0.0611055297932963 ENSG00000174004:ENST00000328557:exon_196386623_196388875:LRRC33 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 196544948 T/C 1 10 7 17 4.72934566183891 3.68945803671276 1.03988762512615 T:C T C 10 0.527065433816109 0.637665492029096 ENSG00000180370:ENST00000327134:exon_196544928_196545027:PAK2;ENSG00000180370:ENST00000426668:exon_196544928_196545027:PAK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 196674916 A/C 1 5 5 10 2.36467283091945 2.63532716908055 -0.270654338161091 A:C A C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000119227:ENST00000412723:exon_196673214_196675556:PIGZ;ENSG00000119227:ENST00000413127:exon_196673608_196675444:PIGZ HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 196735763 T/C 1 15 15 30 7.09401849275836 7.90598150724164 -0.811963014483272 T:C T C 10 0.527065433816109 0.855562656731326 ENSG00000163975:ENST00000296350:exon_196735680_196735836:MFI2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 196742290 T/C 1 9 3 12 4.25641109565502 1.58119630144833 2.67521479420669 T:C T C 10 0.527065433816109 0.153067812973243 ENSG00000163975:ENST00000296350:exon_196742236_196742387:MFI2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 196743130 T/C 1 9 11 20 4.25641109565502 5.7977197719772 -1.54130867632218 T:C T C 10 0.527065433816109 0.510653805220797 ENSG00000163975:ENST00000296350:exon_196743060_196743240:MFI2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 196746629 T/C 1 24 10 34 11.3504295884134 5.27065433816109 6.07977525025229 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0396744208926045 ENSG00000163975:ENST00000296351:exon_196745824_196746672:MFI2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 196865242 C/T 1 4 5 9 1.89173826473556 2.63532716908055 -0.743588904344981 T:C C T 10 0.527065433816109 0.743612144716174 ENSG00000075711:ENST00000346964:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000357674:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000381807:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000314062:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000359922:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000419354:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000452595:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000422288:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000448528:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000443183:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000392382:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000450955:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000419227:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000392381:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000471733:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000447466:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000477312:exon_196865093_196865262:DLG1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 3 197495334 G/A 1 10 10 20 4.72934566183891 5.27065433816109 -0.541308676322181 A:G G A 10 0.527065433816109 0.826649432830958 ENSG00000122068:ENST00000428738:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000494309:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000415708:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000241502:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000392374:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000412924:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000418169:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000426031:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000424384:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000428395:exon_197495306_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000463136:exon_197495310_197495458:FYTTD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 155713 A/G 1 3 8 11 1.41880369855167 4.21652347052887 -2.7977197719772 A:G A G 10 0.527065433816109 0.130149709511191 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 515489 G/A 1 6 11 17 2.83760739710335 5.7977197719772 -2.96011237487385 A:G G A 10 0.527065433816109 0.223637867238073 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504187:exon_515449_515750:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503111:exon_515449_516631:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000506402:exon_515449_515641:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000509768:exon_515449_516632:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000506898:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000507493:exon_515449_515730:PIGG HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 517376 T/C 1 10 8 18 4.72934566183891 4.21652347052887 0.512822191310037 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508562:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511247:exon_517309_517702:PIGG HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 517461 T/C 1 4 10 14 1.89173826473556 5.27065433816109 -3.37891607342553 T:C T C 10 0.527065433816109 0.10564189817501 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508562:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511247:exon_517309_517702:PIGG HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 517622 C/T 1 6 9 15 2.83760739710335 4.74358890434498 -1.90598150724164 T:C C T 10 0.527065433816109 0.439435430476406 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508562:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511247:exon_517309_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508669:exon_517621_517702:PIGG HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 520853 G/A 1 8 12 20 3.78347652947113 6.32478520579331 -2.54130867632218 A:C:G G A 10 0.527065433816109 0.271710696844368 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508669:exon_520828_521329:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503261:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000510235:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_520739_521019:PIGG HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 527677 T/C 1 5 8 13 2.36467283091945 4.21652347052887 -1.85185063960942 T:C T C 10 0.527065433816109 0.407023665875808 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503261:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513239:exon_524629_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513192:exon_525903_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504879:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508144:exon_527421_527770:PIGG HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 533001 T/C 1 14 18 32 6.62108392657447 9.48717780868996 -2.86609388211549 T:C T C 10 0.527065433816109 0.376746667004893 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_532942_533314:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_532942_533154:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513239:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513192:exon_532942_533314:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508144:exon_532942_533985:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000515237:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000505800:exon_532942_533312:PIGG HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 673772 C/T 1 19 17 36 8.98575675749393 8.96011237487385 0.0256443826200741 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000215375:ENST00000506838:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000505477:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000503300:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000511290:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000400159:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000513662:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000507804:exon_673703_673807:MYL5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 941518 C/T 1 8 5 13 3.78347652947113 2.63532716908055 1.14814936039058 T:C C T 10 0.527065433816109 0.588366380954527 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000507319:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514453:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505734:exon_941497_942377:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504744:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000452360:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515876:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513682:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504505:exon_941497_941942:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514546:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504850:exon_941497_942298:TMEM175 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 951947 T/C 1 41 39 80 19.3903172135395 20.5555519188283 -1.16523470528873 T:C T C 10 0.527065433816109 0.823391496960525 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515740:exon_951612_952363:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000508204:exon_951612_952297:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505148:exon_951612_952427:TMEM175 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 1018705 C/A 1 8 3 11 3.78347652947113 1.58119630144833 2.2022802280228 A:C:G C A 10 0.527065433816109 0.234094659981005 ENSG00000127418:ENST00000398484:exon_1018693_1020679:FGFRL1;ENSG00000127418:ENST00000510644:exon_1018693_1019775:FGFRL1;ENSG00000127418:ENST00000504138:exon_1018693_1019135:FGFRL1;ENSG00000127418:ENST00000264748:exon_1018693_1020686:FGFRL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 1165130 G/T 1 8 5 13 3.78347652947113 2.63532716908055 1.14814936039058 T:G G T 10 0.527065433816109 0.588366380954527 ENSG00000159674:ENST00000290902:exon_1165051_1165274:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000431380:exon_1165051_1165274:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000507466:exon_1165051_1165413:SPON2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 1330759 T/C 1 40 28 68 18.9173826473556 14.7578321468511 4.15955050050458 A:T:C T C 10 0.527065433816109 0.333135925888521 ENSG00000090316:ENST00000303400:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505177:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503653:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000264750:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000382947:exon_1330649_1330778:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000452175:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000514708:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000509531:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000510794:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505839:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000512289:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000506530:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503162:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000515766:exon_1330649_1332405:MAEA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 1843424 T/C 1 9 10 19 4.25641109565502 5.27065433816109 -1.01424324250607 T:C T C 10 0.527065433816109 0.654162232160302 ENSG00000168924:ENST00000302787:exon_1843074_1843524:LETM1;ENSG00000168924:ENST00000505551:exon_1843074_1843524:LETM1;ENSG00000168924:ENST00000466175:exon_1843074_1843524:LETM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 2492191 T/C 1 18 25 43 8.51282219131004 13.1766358454027 -4.66381365409269 T:C T C 10 0.527065433816109 0.170670447865436 ENSG00000063978:ENST00000503659:exon_2492064_2492229:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000504224:exon_2492064_2492229:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000314289:exon_2492064_2492229:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000502316:exon_2492064_2492229:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000507247:exon_2492064_2492229:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000509258:exon_2492064_2492229:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000504782:exon_2492064_2492525:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000513284:exon_2492064_2492229:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000507784:exon_2492064_2492229:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000513578:exon_2492064_2492229:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000511859:exon_2492064_2492229:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000511892:exon_2492064_2492229:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000513643:exon_2492064_2492229:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000509206:exon_2492064_2492229:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000506706:exon_2492064_2492229:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000511600:exon_2492064_2492229:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000513450:exon_2492064_2492229:RNF4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 2702115 A/G 1 34 29 63 16.0797752502523 15.2848975806672 0.794877669585132 A:G A G 10 0.527065433816109 0.899895745439529 ENSG00000125386:ENST00000324666:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000382839:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000512465:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000502458:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000513898:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000505311:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000513350:exon_2701407_2702228:FAM193A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 2744087 G/A 1 88 73 161 41.6182418241824 38.475776668576 3.14246515560644 A:G G A 10 0.527065433816109 0.636561782844465 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 2826400 T/C 1 4 5 9 1.89173826473556 2.63532716908055 -0.743588904344981 T:C T C 10 0.527065433816109 0.743612144716174 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512131:exon_2826340_2826644:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510074:exon_2826340_2826641:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511237:exon_2826340_2826509:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513095:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503393:exon_2826340_2826429:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000509677:exon_2826340_2826828:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000506932:exon_2826340_2826509:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2826392_2826486:SH3BP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 2831383 T/G 1 16 7 23 7.56695305894226 3.68945803671276 3.87749502222949 T:G T G 10 0.527065433816109 0.1427729718521 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2831220_2831461:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000505941:exon_2831220_2831532:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510204:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515802:exon_2831220_2831874:SH3BP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 2906707 G/T 1 45 47 92 21.2820554782751 24.7720753893571 -3.49001991108203 T:G G T 10 0.527065433816109 0.467345758811689 ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503169:exon_2906491_2907448:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000514940:exon_2906491_2906835:ADD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 2916762 C/G 1 31 51 82 14.6609715517006 26.8803371246216 -12.2193655729209 C:G C G 10 0.527065433816109 0.00771411878997303 ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000514940:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513762:exon_2916611_2916767:ADD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 2933271 G/A 1 6 11 17 2.83760739710335 5.7977197719772 -2.96011237487385 A:G G A 10 0.527065433816109 0.223637867238073 ENSG00000109736:ENST00000508276:exon_2933102_2933663:MFSD10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 2934308 G/A 1 5 5 10 2.36467283091945 2.63532716908055 -0.270654338161091 A:G G A 10 0.527065433816109 1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 2943361 T/C 1 23 14 37 10.8774950222295 7.37891607342553 3.49857894880397 T:C T C 10 0.527065433816109 0.323291196351422 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000507120:exon_2943309_2943443:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2943309_2943456:NOP14 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 2951804 A/G 1 29 21 50 13.7151024193328 11.0683741101383 2.64672830919455 A:G A G 10 0.527065433816109 0.4817003241602 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2951661_2951940:NOP14 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 3213832 G/A 1 11 9 20 5.2022802280228 4.74358890434498 0.45869132367782 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3213656_3213869:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3213656_3213869:HTT;ENSG00000197386:ENST00000509751:exon_3213639_3213869:HTT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 3215835 T/C 1 18 18 36 8.51282219131004 9.48717780868996 -0.974355617379924 T:C T C 10 0.527065433816109 0.742458916413507 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3215685_3215862:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3215685_3215862:HTT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 3227419 A/G 1 16 17 33 7.56695305894226 8.96011237487385 -1.3931593159316 A:G A G 10 0.527065433816109 0.728041976709469 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3227388_3227470:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3227388_3227470:HTT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 3234980 G/A 1 19 8 27 8.98575675749393 4.21652347052887 4.76923328696506 A:G G A 10 0.527065433816109 0.082110621308263 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3234890_3235080:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3234890_3235080:HTT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 3514695 A/G 1 70 71 141 33.1054196328724 37.4216458009437 -4.31622616807137 A:G A G 10 0.527065433816109 0.500153963102216 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 3949637 G/A 1 6 2 8 2.83760739710335 1.05413086763222 1.78347652947113 A:G G A 10 0.527065433816109 0.29481715391141 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 5830414 T/C 1 15 22 37 7.09401849275836 11.5954395439544 -4.50142105119603 A:T:C T C 10 0.527065433816109 0.142521190648815 ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5830246_5830772:EVC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 6303354 G/A 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 A:G G A 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 8228948 T/C 1 8 8 16 3.78347652947113 4.21652347052887 -0.433046941057745 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000514274:exon_8228707_8229196:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000508438:exon_8228688_8229000:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000509553:exon_8228707_8229272:SH3TC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 8394094 G/A 1 8 17 25 3.78347652947113 8.96011237487385 -5.17663584540273 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0449126618304287 ENSG00000087008:ENST00000413009:exon_8394060_8394180:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000356406:exon_8394060_8394180:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000503233:exon_8394060_8394180:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000510365:exon_8394060_8394180:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000508302:exon_8394060_8394180:ACOX3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 10099340 T/C 1 77 99 176 36.4159615961596 52.1794779477948 -15.7635163516352 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0191104546890285 ENSG00000071127:ENST00000499869:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000439733:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000382452:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000400001:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000508079:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000264785:exon_10099334_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000505851:exon_10099336_10099515:WDR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 13606576 A/T 1 45 46 91 21.2820554782751 24.245009955541 -2.96295447726592 A:T A T 10 0.527065433816109 0.599888950930786 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 15835844 A/C 1 7 4 11 3.31054196328724 2.10826173526444 1.2022802280228 A:C A C 10 0.527065433816109 0.555399509917260 ENSG00000004468:ENST00000502843:exon_15835840_15835925:CD38;ENSG00000004468:ENST00000226279:exon_15835840_15835925:CD38;ENSG00000004468:ENST00000510674:exon_15835840_15835925:CD38 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 22390167 C/T 1 2 15 17 0.945869132367782 7.90598150724164 -6.96011237487385 T:C C T 10 0.527065433816109 0.000863295106090712 ENSG00000152990:ENST00000334304:exon_22389007_22390570:GPR125;ENSG00000152990:ENST00000499527:exon_22389023_22390570:GPR125;ENSG00000152990:ENST00000282943:exon_22389331_22390570:GPR125 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 25253995 C/T 1 17 7 24 8.03988762512615 3.68945803671276 4.35042958841338 T:C C T 10 0.527065433816109 0.100628513344123 ENSG00000038210:ENST00000512921:exon_25253943_25254097:PI4K2B;ENSG00000038210:ENST00000264864:exon_25253943_25254097:PI4K2B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 36069805 G/A 1 3 11 14 1.41880369855167 5.7977197719772 -4.37891607342553 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0288253172835926 ENSG00000047365:ENST00000303965:exon_36067620_36069900:ARAP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 38016395 T/G 1 4 14 18 1.89173826473556 7.37891607342553 -5.48717780868996 T:G T G 10 0.527065433816109 0.0156821937771927 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000446803:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38016130_38016594:TBC1D1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 38023279 G/C 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 C:G G C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000446803:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000510573:exon_38023207_38023339:TBC1D1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 38023294 G/A 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000446803:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000510573:exon_38023207_38023339:TBC1D1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 38774785 A/G 1 150 103 253 70.9401849275836 54.2877396830592 16.6524452445244 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0376938557992851 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 38775040 A/G 1 85 65 150 40.1994381256307 34.2592531980471 5.94018492758364 A:G A G 10 0.527065433816109 0.368495361384039 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 38776107 T/G 1 48 19 67 22.7008591768268 10.0142432425061 12.6866159343207 T:G T G 10 0.527065433816109 0.00202847188844749 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 38776180 C/A 1 36 12 48 17.0256443826201 6.32478520579331 10.7008591768268 A:C C A 10 0.527065433816109 0.00211028562954157 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 38776235 A/G 1 37 16 53 17.498578948804 8.43304694105774 9.06553200774622 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0131018029603860 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 38776320 C/T 1 18 11 29 8.51282219131004 5.7977197719772 2.71510241933284 T:C C T 10 0.527065433816109 0.355748397679087 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 38776491 T/G 1 76 61 137 35.9430270299757 32.1509914627826 3.79203556719306 T:G T G 10 0.527065433816109 0.549689203580203 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 38776725 C/A 1 59 71 130 27.9031394048496 37.4216458009437 -9.51850639609418 A:C C A 10 0.527065433816109 0.0959403050277736 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 38777059 C/T 1 50 56 106 23.6467283091945 29.5156642937021 -5.86893598450756 T:C C T 10 0.527065433816109 0.284689751537932 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000502321:exon_38776887_38777176:TLR10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 38777173 A/T 1 25 21 46 11.8233641545973 11.0683741101383 0.754990044458983 A:T A T 10 0.527065433816109 0.883192822161537 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000502321:exon_38776887_38777176:TLR10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 38777236 T/G 1 23 40 63 10.8774950222295 21.0826173526444 -10.2051223304149 T:G T G 10 0.527065433816109 0.0113018288305936 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 38798294 T/G 1 51 39 90 24.1196628753784 20.5555519188283 3.56411095655018 T:G T G 10 0.527065433816109 0.462214399044109 ENSG00000174125:ENST00000308979:exon_38797880_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000502213:exon_38797904_38800519:TLR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 38798425 G/A 1 42 32 74 19.8632517797234 16.8660938821155 2.99715789760793 A:G G A 10 0.527065433816109 0.560807934352792 ENSG00000174125:ENST00000308979:exon_38797880_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000502213:exon_38797904_38800519:TLR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 38995374 T/C 1 13 5 18 6.14814936039058 2.63532716908055 3.51282219131004 T:C T C 10 0.527065433816109 0.104967213978269 ENSG00000121895:ENST00000381938:exon_38995358_38995618:TMEM156;ENSG00000121895:ENST00000344606:exon_38995355_38995618:TMEM156 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 39303925 A/G 1 25 20 45 11.8233641545973 10.5413086763222 1.28205547827509 A:G A G 10 0.527065433816109 0.76625053826379 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39303898_39303996:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39303898_39303996:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000505077:exon_39303898_39303996:RFC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 39458051 A/G 1 64 7 71 30.267812235769 3.68945803671276 26.5783541990563 A:G A G 10 0.527065433816109 2.55759455335471e-11 ENSG00000163682:ENST00000295955:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503277:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000449470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000508595:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000514842:exon_39458026_39459301:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503040:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000504470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000511075:exon_39457431_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000437992:exon_39457948_39458158:RPL9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 40123790 T/G 1 7 3 10 3.31054196328724 1.58119630144833 1.72934566183891 T:G T G 10 0.527065433816109 0.350932787230552 ENSG00000078177:ENST00000261435:exon_40121552_40123929:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000381804:exon_40121552_40123929:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000511480:exon_40121552_40123929:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000513269:exon_40121552_40123929:N4BP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 40440215 T/C 1 9 8 17 4.25641109565502 4.21652347052887 0.0398876251261466 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000163694:ENST00000319592:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381793:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381795:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000510871:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000295971:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000514014:exon_40439788_40440814:RBM47 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 42051452 A/G 1 6 5 11 2.83760739710335 2.63532716908055 0.202280228022801 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000014824:ENST00000264451:exon_42051394_42051496:SLC30A9;ENSG00000014824:ENST00000513699:exon_42051394_42051496:SLC30A9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 42457545 G/A 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000124406:ENST00000381668:exon_42457542_42457616:ATP8A1;ENSG00000124406:ENST00000514372:exon_42457542_42457616:ATP8A1;ENSG00000124406:ENST00000381662:exon_42457542_42457616:ATP8A1;ENSG00000124406:ENST00000264449:exon_42457542_42457616:ATP8A1;ENSG00000124406:ENST00000506602:exon_42457542_42457616:ATP8A1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 54218834 G/A 1 6 3 9 2.83760739710335 1.58119630144833 1.25641109565502 A:G G A 10 0.527065433816109 0.513555929047552 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54218765_54218933:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54218765_54218933:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000503450:exon_54218765_54218933:SCFD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 56756531 T/C 1 6 5 11 2.83760739710335 2.63532716908055 0.202280228022801 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000090989:ENST00000381295:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000346134:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000349598:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000511971:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000509302:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000504321:exon_56756389_56756552:EXOC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 57204777 A/C 1 10 27 37 4.72934566183891 14.2307667130349 -9.50142105119603 A:C A C 10 0.527065433816109 0.00252684713083029 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57204771_57204957:AASDH HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 57211352 T/C 0 10 0 10 4.72934566183891 0 4.72934566183891 T T 10 0.527065433816109 0.00221418962581423 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57211293_57211456:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57211293_57211456:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57211293_57211456:AASDH HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 57215677 G/A 1 7 8 15 3.31054196328724 4.21652347052887 -0.905981507241636 A:G G A 10 0.527065433816109 0.797198000532565 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000502617:exon_57215094_57216224:AASDH HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 57273840 C/G 1 13 6 19 6.14814936039058 3.16239260289665 2.98575675749393 C:G C G 10 0.527065433816109 0.250133651156978 ENSG00000128059:ENST00000264220:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000507648:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000510643:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000507724:exon_57273816_57273882:PPAT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 57333822 G/T 1 10 12 22 4.72934566183891 6.32478520579331 -1.5954395439544 T:G G T 10 0.527065433816109 0.528175996250381 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57333081_57333910:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57333783_57333910:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000504757:exon_57333784_57333910:SRP72 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 68442968 A/G 1 23 27 50 10.8774950222295 14.2307667130349 -3.35327169080545 A:G A G 10 0.527065433816109 0.395979594350165 ENSG00000035720:ENST00000265404:exon_68442921_68442977:STAP1;ENSG00000035720:ENST00000396225:exon_68442921_68442977:STAP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 68447040 C/T 1 22 28 50 10.4045604560456 14.7578321468511 -4.35327169080545 T:C C T 10 0.527065433816109 0.257309426807562 ENSG00000035720:ENST00000265404:exon_68447023_68447189:STAP1;ENSG00000035720:ENST00000396225:exon_68447023_68447189:STAP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 73930552 G/C 1 6 2 8 2.83760739710335 1.05413086763222 1.78347652947113 C:G G C 10 0.527065433816109 0.29481715391141 ENSG00000163626:ENST00000295890:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000449739:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000520291:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000533586:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000507544:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000510031:exon_73930495_73930616:COX18 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 73942678 C/T 1 48 39 87 22.7008591768268 20.5555519188283 2.14530725799851 T:C C T 10 0.527065433816109 0.668855902550236 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73942657_73942821:ANKRD17 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 73943124 C/G 1 17 24 41 8.03988762512615 12.6495704115866 -4.60968278646047 C:G C G 10 0.527065433816109 0.161379357013086 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73943072_73943250:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73943072_73943250:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73943072_73943250:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73943072_73943250:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73943072_73943250:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000510127:exon_73943086_73943250:ANKRD17 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 73956805 T/G 1 40 33 73 18.9173826473556 17.3931593159316 1.52422333142404 T:G T G 10 0.527065433816109 0.814852260786346 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73956384_73958017:ANKRD17 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 73957567 C/A 1 29 23 52 13.7151024193328 12.1225049777705 1.59259744156233 A:C C A 10 0.527065433816109 0.679527476175954 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73956384_73958017:ANKRD17 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 75937971 C/T 1 2 7 9 0.945869132367782 3.68945803671276 -2.74358890434498 T:C C T 10 0.527065433816109 0.094465581682091 ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 76726333 T/A 1 19 18 37 8.98575675749393 9.48717780868996 -0.501421051196035 A:T T A 10 0.527065433816109 0.871040774660792 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76726293_76726456:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76726293_76726456:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76726293_76726456:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76726293_76726456:USO1;ENSG00000138768:ENST00000508454:exon_76726162_76726456:USO1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 76878716 G/C 1 25 26 51 11.8233641545973 13.7037012792188 -1.88033712462156 C:G G C 10 0.527065433816109 0.674500080792558 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76878671_76878861:SDAD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 77055474 A/G 1 15 14 29 7.09401849275836 7.37891607342553 -0.284897580667162 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77055329_77055515:NUP54 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 77057501 A/G 1 12 9 21 5.67521479420669 4.74358890434498 0.931625889861711 A:G A G 10 0.527065433816109 0.827834701908173 ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514307:exon_77057341_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000506098:exon_77057474_77057565:NUP54 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 77065580 T/C 1 11 1 12 5.2022802280228 0.527065433816109 4.67521479420669 T:C T C 10 0.527065433816109 0.00720790163310933 ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000502850:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514307:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000506098:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000508583:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514901:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000510569:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000510884:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000513352:exon_77065543_77065626:NUP54 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 77871016 T/G 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 T:G T G 10 0.527065433816109 0.757490641773051 ENSG00000138758:ENST00000264893:exon_77870856_77871083:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000502584:exon_77870904_77871083:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000510641:exon_77870919_77871083:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000505788:exon_77870962_77871083:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000512575:exon_77870989_77871083:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000510515:exon_77870990_77871083:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000504637:exon_77871015_77871083:SEPT11 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 79786856 G/A 1 13 9 22 6.14814936039058 4.74358890434498 1.4045604560456 A:G G A 10 0.527065433816109 0.670793133404155 ENSG00000138756:ENST00000389010:exon_79786711_79786874:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000502871:exon_79786711_79786874:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000335016:exon_79786711_79786874:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000264889:exon_79786711_79786874:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000505725:exon_79786711_79786927:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000502613:exon_79786711_79786874:BMP2K HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 79800080 G/A 1 27 17 44 12.7692332869651 8.96011237487385 3.8091209120912 A:G G A 10 0.527065433816109 0.291442452370904 ENSG00000138756:ENST00000389010:exon_79799888_79800589:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000502871:exon_79799888_79801123:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000264889:exon_79799888_79800083:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000507670:exon_79799888_79800586:BMP2K HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 83748747 T/A 1 107 103 210 50.6039985816763 54.2877396830592 -3.6837411013829 A:T:G T A 10 0.527065433816109 0.628940576250089 ENSG00000138674:ENST00000395310:exon_83748522_83748785:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000348405:exon_83748522_83748785:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000513858:exon_83748522_83748785:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000503937:exon_83748522_83748785:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000509142:exon_83748522_83748785:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000443462:exon_83748522_83748785:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000432794:exon_83748522_83748785:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000311785:exon_83748522_83748785:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000448323:exon_83748522_83748785:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000326950:exon_83748582_83748785:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505472:exon_83748522_83748785:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000500777:exon_83748522_83748785:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000355196:exon_83748522_83748785:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508502:exon_83748522_83748785:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000515062:exon_83748522_83748765:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000264405:exon_83748522_83748785:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505984:exon_83748522_83748785:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000511338:exon_83748522_83748785:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000514362:exon_83748653_83748785:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000515749:exon_83748701_83748785:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000509691:exon_83748709_83748785:SEC31A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 83795806 T/C 1 7 3 10 3.31054196328724 1.58119630144833 1.72934566183891 T:C T C 10 0.527065433816109 0.350932787230552 ENSG00000138674:ENST00000395310:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000348405:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000513858:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000509142:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000443462:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000432794:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000311785:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000448323:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000326950:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505472:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000500777:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000355196:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508502:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505984:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508479:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000436790:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000503058:exon_83795764_83795904:SEC31A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 84374480 C/T 1 8 5 13 3.78347652947113 2.63532716908055 1.14814936039058 T:C C T 10 0.527065433816109 0.588366380954527 ENSG00000163312:ENST00000508591:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000295488:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000510985:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000422434:exon_84374384_84375098:HELQ HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 84383810 C/T 1 7 1 8 3.31054196328724 0.527065433816109 2.78347652947113 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0735220313078182 ENSG00000163322:ENST00000321945:exon_84382092_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000475656:exon_84382098_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000506553:exon_84383162_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000504777:exon_84383228_84384055:FAM175A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 89397091 A/G 1 5 6 11 2.36467283091945 3.16239260289665 -0.797719771977199 A:G A G 10 0.527065433816109 0.765666449819686 ENSG00000138646:ENST00000264350:exon_89396992_89397181:HERC5;ENSG00000138646:ENST00000508159:exon_89396992_89397181:HERC5;ENSG00000138646:ENST00000510223:exon_89396992_89397181:HERC5;ENSG00000138646:ENST00000502913:exon_89396992_89397181:HERC5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 90034686 A/G 1 11 9 20 5.2022802280228 4.74358890434498 0.45869132367782 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000180346:ENST00000317005:exon_90033968_90036050:TIGD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 90035549 A/G 1 20 14 34 9.45869132367782 7.37891607342553 2.07977525025229 A:C:G A G 10 0.527065433816109 0.497604517851488 ENSG00000180346:ENST00000317005:exon_90033968_90036050:TIGD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 95186055 A/G 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 A:G A G 10 0.527065433816109 0.160556933333404 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000509418:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000506089:exon_95185679_95186057:SMARCAD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 103189036 G/A 1 18 18 36 8.51282219131004 9.48717780868996 -0.974355617379924 A:G G A 10 0.527065433816109 0.742458916413507 ENSG00000138821:ENST00000424970:exon_103189029_103189236:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000356736:exon_103189029_103189236:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000394833:exon_103189029_103189236:SLC39A8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 103225513 T/C 1 5 14 19 2.36467283091945 7.37891607342553 -5.01424324250607 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0357427938666352 ENSG00000138821:ENST00000424970:exon_103225474_103225638:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000356736:exon_103225474_103225638:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000394833:exon_103225474_103225638:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000512337:exon_103225474_103225645:SLC39A8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 103228734 C/T 1 6 3 9 2.83760739710335 1.58119630144833 1.25641109565502 T:C C T 10 0.527065433816109 0.513555929047552 ENSG00000138821:ENST00000424970:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000356736:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000394833:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000510255:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000512657:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000502903:exon_103228714_103228762:SLC39A8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 103488146 C/A 1 13 15 28 6.14814936039058 7.90598150724164 -1.75783214685105 A:C C A 10 0.527065433816109 0.572286226612737 ENSG00000109320:ENST00000226574:exon_103488144_103488292:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000394820:exon_103488144_103488292:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000507079:exon_103488144_103488292:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000505458:exon_103488144_103488292:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000509165:exon_103488144_103488292:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000513803:exon_103488144_103488292:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000502367:exon_103488144_103488241:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000510638:exon_103488144_103488292:NFKB1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 103555992 A/G 1 10 19 29 4.72934566183891 10.0142432425061 -5.28489758066716 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0619173766904125 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103555945_103556202:MANBA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 103557077 G/A 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000508141:exon_103557063_103557164:MANBA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 103789810 C/A 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 A:C C A 10 0.527065433816109 0.160556933333404 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 108641317 G/A 1 6 6 12 2.83760739710335 3.16239260289665 -0.324785205793308 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108641276_108641608:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108641276_108641378:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000514489:exon_108641276_108641382:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000504987:exon_108641160_108641369:PAPSS1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 110603784 T/C 1 31 27 58 14.6609715517006 14.2307667130349 0.430204838665675 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110603738_110603898:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000472310:exon_110603738_110604350:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110603738_110603898:CCDC109B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 113199075 A/G 1 155 89 244 73.3048577585031 46.9088236096337 26.3960341488694 A:G A G 10 0.527065433816109 0.000821134408685897 ENSG00000145365:ENST00000361717:exon_113196783_113199590:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000438746:exon_113197177_113199342:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000500655:exon_113198915_113199590:TIFA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 122617745 G/A 1 44 21 65 20.8091209120912 11.0683741101383 9.74074680195291 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0177764855312575 ENSG00000164111:ENST00000296511:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000512232:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000501272:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000506395:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000515017:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000511552:exon_122617736_122618130:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000513428:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000513523:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000513728:exon_122617736_122617779:ANXA5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 123814308 C/T 1 8 5 13 3.78347652947113 2.63532716908055 1.14814936039058 T:C C T 10 0.527065433816109 0.588366380954527 ENSG00000138685:ENST00000264498:exon_123813366_123819391:FGF2;ENSG00000138685:ENST00000394350:exon_123813366_123819376:FGF2;ENSG00000170917:ENST00000512116:exon_123813730_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000304430:exon_123813799_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000339154:exon_123813799_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000503370:exon_123813801_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000510735:exon_123813805_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000394344:exon_123813806_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000502270:exon_123813896_123814380:NUDT6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 128811117 G/C 1 3 7 10 1.41880369855167 3.68945803671276 -2.27065433816109 C:G G C 10 0.527065433816109 0.207504053786451 ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128811021_128811391:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128811021_128811391:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507249:exon_128811021_128811391:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128811021_128811391:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000510605:exon_128811021_128811391:PLK4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 130030644 C/T 1 9 1 10 4.25641109565502 0.527065433816109 3.72934566183891 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0232976587027389 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130030628_130031121:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130030628_130030691:C4orf33 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 130032843 A/G 1 13 15 28 6.14814936039058 7.90598150724164 -1.75783214685105 A:G A G 10 0.527065433816109 0.572286226612737 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130032841_130034487:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130032841_130033842:C4orf33 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 139964442 T/C 1 3 14 17 1.41880369855167 7.37891607342553 -5.96011237487385 T:C T C 10 0.527065433816109 0.00569841126221938 ENSG00000151014:ENST00000280614:exon_139964228_139964497:CCRN4L;ENSG00000151014:ENST00000504378:exon_139964228_139965045:CCRN4L;ENSG00000151014:ENST00000515616:exon_139964226_139964497:CCRN4L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 144135718 G/A 1 20 22 42 9.45869132367782 11.5954395439544 -2.13674822027658 A:G G A 10 0.527065433816109 0.539221144360839 ENSG00000170185:ENST00000510377:exon_144134734_144136730:USP38;ENSG00000170185:ENST00000307017:exon_144134734_144136096:USP38;ENSG00000170185:ENST00000511739:exon_144134734_144136096:USP38 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 144442611 T/C 1 5 14 19 2.36467283091945 7.37891607342553 -5.01424324250607 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0357427938666352 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 144442735 C/T 1 12 10 22 5.67521479420669 5.27065433816109 0.404560456045601 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 156273768 T/C 1 8 6 14 3.78347652947113 3.16239260289665 0.621083926574474 T:C T C 10 0.527065433816109 0.794786264772641 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156273748_156273880:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156273748_156273880:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000503466:exon_156273748_156273838:MAP9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 156294333 T/C 0 0 11 11 0 5.7977197719772 -5.7977197719772 C T C 10 0.527065433816109 0.000264735162812196 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156294288_156294608:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156294288_156294608:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156294288_156294608:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000433024:exon_156294288_156294608:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000393836:exon_156294288_156294608:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000379248:exon_156294288_156294608:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000393834:exon_156294288_156294608:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000481250:exon_156294148_156294608:MAP9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 156721098 G/A 1 1 7 8 0.472934566183891 3.68945803671276 -3.21652347052887 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0307713746552577 ENSG00000061918:ENST00000505154:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000502959:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000505764:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000507146:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000264424:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000503520:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000513437:exon_156721029_156721226:GUCY1B3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 159601676 C/T 1 6 12 18 2.83760739710335 6.32478520579331 -3.48717780868996 T:C C T 10 0.527065433816109 0.154794984631189 ENSG00000171503:ENST00000511912:exon_159601619_159601759:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000355672:exon_159601619_159601759:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000436096:exon_159601619_159601759:ETFDH HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 164435265 A/C 1 26 24 50 12.2962987207812 12.6495704115866 -0.353271690805451 A:T:C:G A C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164435226_164435310:C4orf43 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 164440581 T/C 1 59 58 117 27.9031394048496 30.5697951613343 -2.66665575648476 A:T:C T C 10 0.527065433816109 0.644137861695789 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164440486_164440872:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164440486_164441691:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164440486_164440871:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164440486_164440615:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000503148:exon_164440486_164440710:C4orf43 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 169282355 T/C 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000181381:ENST00000510590:exon_169282300_169282362:DDX60L;ENSG00000181381:ENST00000511577:exon_169282300_169282362:DDX60L;ENSG00000181381:ENST00000260184:exon_169282300_169282362:DDX60L;ENSG00000181381:ENST00000513103:exon_169282300_169282590:DDX60L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 170663235 C/T 1 11 15 26 5.2022802280228 7.90598150724164 -2.70370127921884 T:C C T 10 0.527065433816109 0.329044999714734 ENSG00000056050:ENST00000393381:exon_170663108_170663258:C4orf27 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 184426387 C/T 1 10 5 15 4.72934566183891 2.63532716908055 2.09401849275836 T:C C T 10 0.527065433816109 0.312436282519101 ENSG00000168556:ENST00000302327:exon_184426147_184426520:ING2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 184629699 G/A 1 17 20 37 8.03988762512615 10.5413086763222 -2.50142105119603 A:G G A 10 0.527065433816109 0.416458168600068 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184629560_184629727:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000357207:exon_184629689_184629727:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184629560_184629727:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000505676:exon_184629689_184629727:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000512476:exon_184629560_184629727:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000511955:exon_184629560_184629727:C4orf41 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 186111639 T/C 1 20 20 40 9.45869132367782 10.5413086763222 -1.08261735264436 T:C T C 10 0.527065433816109 0.753743095912526 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 186112111 G/A 1 13 7 20 6.14814936039058 3.68945803671276 2.45869132367782 A:G G A 10 0.527065433816109 0.371081802214505 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000503223:exon_186111922_186112366:KIAA1430 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 190862155 T/G 1 40 34 74 18.9173826473556 17.9202247497477 0.997157897607931 T:G T G 10 0.527065433816109 0.907426516443574 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 4 190862182 C/T 1 34 27 61 16.0797752502523 14.2307667130349 1.84900853721735 T:C C T 10 0.527065433816109 0.701105241861212 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000514482:exon_190862179_190862226:FRG1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 231111 T/C 1 59 58 117 27.9031394048496 30.5697951613343 -2.66665575648476 A:T:C T C 10 0.527065433816109 0.644137861695789 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_231031_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512962:exon_231058_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_231058_231115:SDHA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 311478 T/C 1 112 121 233 52.9686714125958 63.7749174917492 -10.8062460791534 A:T:C T C 10 0.527065433816109 0.168257673424518 ENSG00000249915:ENST00000264933:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000513582:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000507528:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505717:exon_311408_311609:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505526:exon_311408_312526:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000507473:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000511482:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000512466:exon_308312_311517:PDCD6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 422955 C/G 1 3 7 10 1.41880369855167 3.68945803671276 -2.27065433816109 C:G C G 10 0.527065433816109 0.207504053786451 ENSG00000063438:ENST00000505113:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000510910:exon_422492_422973:AHRR HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 453567 G/A 1 33 25 58 15.6068406840684 13.1766358454027 2.43020483866568 A:G G A 10 0.527065433816109 0.599389178257391 ENSG00000180104:ENST00000512944:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000340158:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000315013:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000503889:exon_453512_454166:EXOC3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 475104 A/G 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 A:G A G 10 0.527065433816109 0.488810537661758 ENSG00000066230:ENST00000264938:exon_474998_475247:SLC9A3;ENSG00000066230:ENST00000514375:exon_474998_475247:SLC9A3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 479905 A/C 1 32 12 44 15.1339061178845 6.32478520579331 8.8091209120912 A:C A C 10 0.527065433816109 0.00953354926603896 ENSG00000066230:ENST00000507407:exon_479752_480080:SLC9A3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 1467004 A/G 1 31 22 53 14.6609715517006 11.5954395439544 3.06553200774622 A:G A G 10 0.527065433816109 0.413051085989322 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 6600064 G/T 1 161 181 342 76.1424651556064 95.3988435207157 -19.2563783651093 T:G G T 10 0.527065433816109 0.0395255922086048 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6599352_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6599353_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6599354_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6599513_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6599682_6600345:NSUN2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 6754890 G/C 1 13 12 25 6.14814936039058 6.32478520579331 -0.176635845402726 C:G G C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000112941:ENST00000230859:exon_6754864_6757161:PAPD7;ENSG00000112941:ENST00000514697:exon_6754864_6755599:PAPD7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 7866967 G/C 1 3 6 9 1.41880369855167 3.16239260289665 -1.74358890434498 A:C:G G C 10 0.527065433816109 0.323067031523113 ENSG00000124279:ENST00000264669:exon_7866759_7868309:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000511261:exon_7866759_7867502:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000507036:exon_7866759_7868283:FASTKD3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 10250430 G/A 1 7 9 16 3.31054196328724 4.74358890434498 -1.43304694105774 A:G G A 10 0.527065433816109 0.618149317471371 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10250033_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10250328_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000511700:exon_10250355_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000513114:exon_10250406_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10250416_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000508451:exon_10250421_10250557:CCT5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 10250443 T/C 1 10 12 22 4.72934566183891 6.32478520579331 -1.5954395439544 T:C T C 10 0.527065433816109 0.528175996250381 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10250033_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10250328_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000511700:exon_10250355_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000513114:exon_10250406_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10250416_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000508451:exon_10250421_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000423695:exon_10250431_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000510326:exon_10250431_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000512975:exon_10250431_10250557:CCT5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 10254817 A/G 1 78 73 151 36.8888961623435 38.475776668576 -1.58688050623247 A:G A G 10 0.527065433816109 0.807319072468197 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503026:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000513114:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10254786_10254835:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000508451:exon_10254786_10255142:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515676:exon_10254786_10254950:CCT5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 10256161 T/C 1 62 47 109 29.3219431034012 24.7720753893571 4.54986771404412 T:C T C 10 0.527065433816109 0.389985436075840 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503026:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000511700:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503454:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515676:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000506600:exon_10256067_10256265:CCT5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 10262740 C/A 1 3 11 14 1.41880369855167 5.7977197719772 -4.37891607342553 A:C C A 10 0.527065433816109 0.0288253172835926 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 32403346 C/T 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000056097:ENST00000265069:exon_32403211_32403502:ZFR;ENSG00000056097:ENST00000382126:exon_32403211_32403502:ZFR HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 33461355 G/A 1 147 98 245 69.521381229032 51.6524125139787 17.8689687150533 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0249477467962135 ENSG00000113407:ENST00000502553:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000265112:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000414361:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000508361:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000455217:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000507716:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509731:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509410:exon_33461263_33461400:TARS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 36985303 A/G 1 15 18 33 7.09401849275836 9.48717780868996 -2.3931593159316 A:G A G 10 0.527065433816109 0.486378086106079 ENSG00000164190:ENST00000282516:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000448238:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000504430:exon_36984778_36986403:NIPBL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 37036492 C/T 1 4 11 15 1.89173826473556 5.7977197719772 -3.90598150724164 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0669719709120964 ENSG00000164190:ENST00000282516:exon_37036481_37036589:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000448238:exon_37036481_37036589:NIPBL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 42801268 C/T 0 0 10 10 0 5.27065433816109 -5.27065433816109 T C T 10 0.527065433816109 0.000559771227864236 ENSG00000198865:ENST00000361970:exon_42799761_42802462:CCDC152;ENSG00000250722:ENST00000514985:exon_42799982_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000512980:exon_42799985_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000511224:exon_42800214_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000506577:exon_42800233_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000507920:exon_42800921_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000509276:exon_42801030_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000514218:exon_42801036_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000513303:exon_42801207_42801433:SEPP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 43656024 T/C 1 7 16 23 3.31054196328724 8.43304694105774 -5.12250497777051 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0369714255077611 ENSG00000112992:ENST00000264663:exon_43655942_43656175:NNT;ENSG00000112992:ENST00000344920:exon_43655942_43656175:NNT;ENSG00000112992:ENST00000512996:exon_43655942_43656175:NNT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 52096889 C/A 1 27 26 53 12.7692332869651 13.7037012792188 -0.934467992253779 A:C C A 10 0.527065433816109 0.890762645569914 ENSG00000152684:ENST00000274311:exon_52095719_52096954:PELO;ENSG00000152684:ENST00000381463:exon_52095956_52096954:PELO HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 52856504 G/C 1 12 12 24 5.67521479420669 6.32478520579331 -0.649570411586616 C:G G C 10 0.527065433816109 0.83992621234606 ENSG00000164258:ENST00000507026:exon_52856463_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000502423:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000296684:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506974:exon_52856477_52856590:NDUFS4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 56526783 G/A 1 56 32 88 26.4843357062979 16.8660938821155 9.61824182418241 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0425590516006241 ENSG00000062194:ENST00000424459:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000454432:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000514387:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000506184:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000511209:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000264779:exon_56526673_56526796:GPBP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 61694379 T/C 1 16 12 28 7.56695305894226 6.32478520579331 1.24216785314895 T:C T C 10 0.527065433816109 0.707378189652233 ENSG00000086189:ENST00000199320:exon_61694338_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000506390:exon_61694338_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000514911:exon_61694256_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000509182:exon_61694338_61694387:DIMT1L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 64097145 C/G 1 36 35 71 17.0256443826201 18.4472901835638 -1.42164580094374 C:G C G 10 0.527065433816109 0.812329725530216 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000506168:exon_64097129_64097159:CWC27 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 64273018 G/A 1 28 8 36 13.2421678531489 4.21652347052887 9.02564438262008 A:G G A 10 0.527065433816109 0.002413370612521 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64272962_64273065:CWC27 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 68417643 C/T 1 6 5 11 2.83760739710335 2.63532716908055 0.202280228022801 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68417580_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68417574_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000512367:exon_68417521_68417722:SLC30A5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 68419054 A/T 1 14 23 37 6.62108392657447 12.1225049777705 -5.50142105119603 A:T A T 10 0.527065433816109 0.0983578462032 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68419026_68419339:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68419026_68419366:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68419026_68419247:SLC30A5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 68463014 G/T 1 22 31 53 10.4045604560456 16.3390284482994 -5.93446799225378 T:G G T 10 0.527065433816109 0.129497208248913 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68462837_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68462913_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68462962_68463110:CCNB1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 68531253 C/T 1 9 4 13 4.25641109565502 2.10826173526444 2.14814936039058 T:C C T 10 0.527065433816109 0.276012087147778 ENSG00000134058:ENST00000506563:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512687:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000256443:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515391:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512985:exon_68531221_68531322:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515180:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000506789:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000510106:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000514676:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000504147:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000508726:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000502604:exon_68530944_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000513629:exon_68530970_68531280:CDK7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 70806310 A/C 1 8 7 15 3.78347652947113 3.68945803671276 0.0940184927583645 A:C A C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 70806457 G/A 1 11 7 18 5.2022802280228 3.68945803671276 1.51282219131004 A:G G A 10 0.527065433816109 0.638183169005014 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 70806649 T/A 1 10 2 12 4.72934566183891 1.05413086763222 3.67521479420669 A:T T A 10 0.527065433816109 0.0418936923317288 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 70806711 C/G 1 11 6 17 5.2022802280228 3.16239260289665 2.03988762512615 C:G C G 10 0.527065433816109 0.344390478204234 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 70898367 G/A 1 23 15 38 10.8774950222295 7.90598150724164 2.97151351498786 A:G G A 10 0.527065433816109 0.417054731193523 ENSG00000131844:ENST00000512218:exon_70898333_70898460:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000323375:exon_70898333_70898460:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000423066:exon_70898333_70898460:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000340941:exon_70898333_70898460:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000509358:exon_70898333_70898460:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000507169:exon_70898333_70898892:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000505787:exon_70898333_70898460:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000510895:exon_70898336_70898460:MCCC2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 72798724 T/G 1 4 7 11 1.89173826473556 3.68945803671276 -1.7977197719772 T:G T G 10 0.527065433816109 0.36886039388561 ENSG00000145741:ENST00000514360:exon_72798313_72798942:BTF3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 73207372 T/A 1 6 9 15 2.83760739710335 4.74358890434498 -1.90598150724164 A:T T A 10 0.527065433816109 0.439435430476406 ENSG00000214944:ENST00000296794:exon_73207100_73207522:RP11-428C6.1;ENSG00000214944:ENST00000437974:exon_73207100_73207400:RP11-428C6.1;ENSG00000214944:ENST00000426542:exon_73207100_73207400:RP11-428C6.1;ENSG00000214944:ENST00000287898:exon_73207100_73207400:RP11-428C6.1;ENSG00000214944:ENST00000296799:exon_73207100_73207400:RP11-428C6.1;ENSG00000214944:ENST00000512883:exon_73207100_73207400:RP11-428C6.1;ENSG00000214944:ENST00000503341:exon_73207100_73207527:RP11-428C6.1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 73985215 A/G 1 3 7 10 1.41880369855167 3.68945803671276 -2.27065433816109 A:G A G 10 0.527065433816109 0.207504053786451 ENSG00000049860:ENST00000511181:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000261416:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000513079:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000515528:exon_73985153_73985674:HEXB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 74656175 G/A 1 59 44 103 27.9031394048496 23.1908790879088 4.71226031694077 A:G G A 10 0.527065433816109 0.375448227453339 ENSG00000113161:ENST00000511206:exon_74656113_74656583:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000287936:exon_74656113_74657929:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000343975:exon_74656113_74657248:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000429286:exon_74656113_74657924:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000509085:exon_74656113_74656307:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000511986:exon_74656113_74656306:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000512053:exon_74656113_74656354:HMGCR HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 75003678 T/C 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 T:C T C 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000514838:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000446329:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000510798:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000282199:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000503835:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000504862:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000515285:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000512125:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000508467:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000507421:exon_75003309_75003700:POC5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 76343999 T/C 1 11 20 31 5.2022802280228 10.5413086763222 -5.33902844829938 T:C T C 10 0.527065433816109 0.070818349776375 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76343986_76344097:AGGF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 76734084 C/T 1 7 17 24 3.31054196328724 8.96011237487385 -5.64957041158662 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0241168448802507 ENSG00000164253:ENST00000296679:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000502528:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000414719:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000515253:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507029:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511630:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507654:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000509701:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511791:exon_76734083_76734186:WDR41 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 77334907 T/G 1 3 8 11 1.41880369855167 4.21652347052887 -2.7977197719772 T:G T G 10 0.527065433816109 0.130149709511191 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77334867_77335098:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77334867_77335098:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000522901:exon_77334867_77334974:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000523204:exon_77334867_77335098:AP3B1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 86659205 G/A 1 4 6 10 1.89173826473556 3.16239260289665 -1.27065433816109 A:G G A 10 0.527065433816109 0.532268681489131 ENSG00000145715:ENST00000274376:exon_86659165_86659321:RASA1;ENSG00000145715:ENST00000515800:exon_86659165_86659321:RASA1;ENSG00000145715:ENST00000534133:exon_86659165_86659321:RASA1;ENSG00000145715:ENST00000456692:exon_86659165_86659321:RASA1;ENSG00000145715:ENST00000389275:exon_86659165_86659321:RASA1;ENSG00000145715:ENST00000506290:exon_86659165_86659321:RASA1;ENSG00000145715:ENST00000512763:exon_86659165_86659321:RASA1;ENSG00000145715:ENST00000509953:exon_86659165_86659321:RASA1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 86695274 A/G 1 34 20 54 16.0797752502523 10.5413086763222 5.53846657393011 A:G A G 10 0.527065433816109 0.136278803558187 ENSG00000134480:ENST00000505587:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000510921:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000508855:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000256897:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000504878:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000511207:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000504115:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000448765:exon_86695211_86695322:CCNH HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 89703641 C/G 1 29 16 45 13.7151024193328 8.43304694105774 5.28205547827509 C:G C G 10 0.527065433816109 0.135457057717144 ENSG00000153140:ENST00000283122:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522083:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522864:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000518458:exon_89703516_89703647:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522565:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522842:exon_89703516_89703651:CETN3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 94826655 C/A 1 16 8 24 7.56695305894226 4.21652347052887 3.35042958841338 A:C C A 10 0.527065433816109 0.220267510738085 ENSG00000198677:ENST00000358746:exon_94826612_94826740:TTC37;ENSG00000198677:ENST00000502768:exon_94826612_94826740:TTC37 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 95152313 A/G 1 87 74 161 41.1453072579985 39.0028421023921 2.14246515560644 A:G A G 10 0.527065433816109 0.752773726343312 ENSG00000173221:ENST00000508780:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507605:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000237858:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000379979:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507412:exon_95152211_95155206:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000505427:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000512469:exon_95152114_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000448201:exon_95152217_95152329:GLRX HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 96112083 T/G 1 24 17 41 11.3504295884134 8.96011237487385 2.39031721353953 T:G T G 10 0.527065433816109 0.532450659052457 ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96110188_96112255:ERAP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 96117555 C/T 1 14 8 22 6.62108392657447 4.21652347052887 2.4045604560456 T:C C T 10 0.527065433816109 0.394231574114095 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96117397_96117558:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96117397_96117558:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96117398_96117558:ERAP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 96121524 C/T 1 12 6 18 5.67521479420669 3.16239260289665 2.51282219131004 T:C C T 10 0.527065433816109 0.345457652895314 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96121343_96121675:ERAP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 96139464 C/T 1 7 5 12 3.31054196328724 2.63532716908055 0.675214794206692 T:C C T 10 0.527065433816109 0.778351128206284 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000503921:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000508227:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507154:exon_96139243_96139642:ERAP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 96215680 C/T 1 25 4 29 11.8233641545973 2.10826173526444 9.71510241933284 T:C C T 10 0.527065433816109 0.000249384270314561 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96215268_96215964:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96215268_96215964:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96215268_96215964:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96215268_96215964:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96215268_96215964:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96215268_96215964:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510309:exon_96215268_96215964:ERAP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 96231000 G/T 1 7 2 9 3.31054196328724 1.05413086763222 2.25641109565502 T:G G T 10 0.527065433816109 0.185447766343339 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000508077:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96230950_96231063:ERAP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 96232142 T/A 0 17 0 17 8.03988762512615 0 8.03988762512615 T T 10 0.527065433816109 2.16560032017563e-05 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96232107_96232208:ERAP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 96237326 G/A 1 11 1 12 5.2022802280228 0.527065433816109 4.67521479420669 A:G G A 10 0.527065433816109 0.00720790163310933 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96237210_96237385:ERAP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 96245343 C/T 1 15 4 19 7.09401849275836 2.10826173526444 4.98575675749393 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0224980824685121 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 96245439 C/T 1 33 1 34 15.6068406840684 0.527065433816109 15.0797752502523 T:C C T 10 0.527065433816109 1.74660135073577e-08 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 96249115 C/T 1 46 5 51 21.754990044459 2.63532716908055 19.1196628753784 A:T:C:G C T 10 0.527065433816109 1.75280731056307e-08 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000512869:exon_96249042_96249161:ERAP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 96498783 G/A 1 8 15 23 3.78347652947113 7.90598150724164 -4.12250497777051 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0967595787231926 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96496571_96498929:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000511293:exon_96498640_96498929:RIOK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 96503523 C/T 1 33 18 51 15.6068406840684 9.48717780868996 6.11966287537844 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0933128938173034 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96503171_96503695:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96502450_96503695:RIOK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 96513471 G/C 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 C:G G C 10 0.527065433816109 0.160556933333404 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96513436_96513552:RIOK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 99897866 G/A 1 10 7 17 4.72934566183891 3.68945803671276 1.03988762512615 A:G G A 10 0.527065433816109 0.637665492029096 ENSG00000174132:ENST00000312637:exon_99897758_99897892:FAM174A;ENSG00000174132:ENST00000505792:exon_99897756_99897892:FAM174A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 102345546 A/C 1 5 7 12 2.36467283091945 3.68945803671276 -1.32478520579331 A:C A C 10 0.527065433816109 0.566621218006073 ENSG00000145730:ENST00000438793:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000529394:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000346918:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000345721:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000348126:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000304400:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000274392:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000379787:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000455264:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000379799:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000510006:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000515456:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000504691:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000504456:exon_102345455_102345570:PAM HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 102520400 A/C 1 6 14 20 2.83760739710335 7.37891607342553 -4.54130867632218 A:C A C 10 0.527065433816109 0.0458603743663600 ENSG00000145725:ENST00000321521:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000358359:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000451606:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000513500:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000414217:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000509597:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000507966:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000511724:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000511022:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000510672:exon_102519944_102520445:PPIP5K2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 110819753 G/C 1 7 23 30 3.31054196328724 12.1225049777705 -8.81196301448327 C:G G C 10 0.527065433816109 0.00148427034042095 ENSG00000152495:ENST00000512453:exon_110819724_110820283:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000282356:exon_110819724_110830584:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000515231:exon_110819724_110820464:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000509645:exon_110819724_110821293:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000510858:exon_110819724_110820296:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000512890:exon_110819724_110820230:CAMK4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 111497125 G/T 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 T:G G T 10 0.527065433816109 0.160556933333404 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 115177207 T/C 1 6 8 14 2.83760739710335 4.21652347052887 -1.37891607342553 T:C T C 10 0.527065433816109 0.59467204210446 ENSG00000145782:ENST00000509910:exon_115177087_115177555:ATG12;ENSG00000145782:ENST00000274459:exon_115177087_115177507:ATG12;ENSG00000145782:ENST00000500945:exon_115177087_115177262:ATG12;ENSG00000145782:ENST00000513322:exon_115176515_115177520:ATG12;ENSG00000145782:ENST00000379594:exon_115177087_115177534:ATG12;ENSG00000145782:ENST00000505993:exon_115177087_115177262:ATG12;ENSG00000145782:ENST00000513167:exon_115177087_115177241:ATG12;ENSG00000145782:ENST00000514775:exon_115177087_115177256:ATG12;ENSG00000177879:ENST00000316788:exon_115177178_115177803:AP3S1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 118829584 G/A 1 8 10 18 3.78347652947113 5.27065433816109 -1.48717780868996 A:G G A 10 0.527065433816109 0.49133381096339 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118829513_118829641:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118829513_118829641:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118829513_118829641:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118829513_118829641:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118829513_118829641:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118829513_118829641:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118829513_118829641:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504051:exon_118829490_118829642:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118829513_118829641:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118829513_118829641:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118829487_118829641:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000520216:exon_118829513_118829641:HSD17B4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 122165317 C/T 1 72 94 166 34.0512887652402 49.5441507787142 -15.4928620134741 T:C:G C T 10 0.527065433816109 0.0194327317117393 ENSG00000205302:ENST00000379516:exon_122165293_122165803:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000514949:exon_122165293_122165450:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000510372:exon_122165293_122165366:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000506847:exon_122165293_122165468:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000507321:exon_122165293_122165450:SNX2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 122682348 A/G 1 12 7 19 5.67521479420669 3.68945803671276 1.98575675749393 A:G A G 10 0.527065433816109 0.491846751029638 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122680697_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122681952_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122682094_122682447:CEP120 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 126887569 G/A 1 18 9 27 8.51282219131004 4.74358890434498 3.76923328696506 A:G G A 10 0.527065433816109 0.178112334024906 ENSG00000164244:ENST00000296666:exon_126887399_126890781:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000442138:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000330542:exon_126887399_126887569:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000420037:exon_126887399_126887570:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000337087:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000513427:exon_126887399_126888148:PRRC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 131822055 T/C 1 23 24 47 10.8774950222295 12.6495704115866 -1.77207538935712 T:C T C 10 0.527065433816109 0.662226393311836 ENSG00000125347:ENST00000245414:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000405885:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000459982:exon_131821815_131822378:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000458069:exon_131822033_131822065:IRF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 132099999 A/G 1 13 8 21 6.14814936039058 4.21652347052887 1.93162588986171 A:G A G 10 0.527065433816109 0.513458776648042 ENSG00000164402:ENST00000378719:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378721:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000296873:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000412572:exon_132099951_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000448933:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378706:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378699:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378701:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000458488:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000371478:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000453480:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000414594:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000371493:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000481794:exon_132099653_132100111:SEPT8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 137088805 C/T 1 442 443 885 209.03707825328 233.489987180536 -24.4529089272565 T:C C T 10 0.527065433816109 0.106070042131949 ENSG00000177733:ENST00000314940:exon_137087075_137090039:HNRNPA0 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 137621741 G/A 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 A:G G A 10 0.527065433816109 0.757490641773051 ENSG00000158402:ENST00000323760:exon_137621711_137621822:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000357274:exon_137621711_137621822:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000348983:exon_137621711_137621822:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000356505:exon_137621711_137621822:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000415130:exon_137621711_137621822:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000513970:exon_137621711_137621822:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000514555:exon_137621711_137621822:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000514017:exon_137621711_137621822:CDC25C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 137902339 T/C 1 79 92 171 37.3618307285274 48.490019911082 -11.1281891825546 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0922469737231391 ENSG00000113013:ENST00000297185:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000501917:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000507097:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000523929:exon_137902315_137902400:HSPA9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 138266546 G/A 1 46 54 100 21.754990044459 28.4615334260699 -6.7065433816109 A:G G A 10 0.527065433816109 0.193395584380225 ENSG00000044115:ENST00000521724:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000302763:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000518825:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000355078:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000521387:exon_138266519_138266763:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000520520:exon_138266519_138266624:CTNNA1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 138773090 A/G 1 7 2 9 3.31054196328724 1.05413086763222 2.25641109565502 A:G A G 10 0.527065433816109 0.185447766343339 ENSG00000170464:ENST00000302060:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000507405:exon_138773061_138773249:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000506870:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515581:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515277:exon_138773061_138773247:DNAJC18 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 138857919 T/C 1 10 11 21 4.72934566183891 5.7977197719772 -1.06837411013829 T:C T C 10 0.527065433816109 0.667942291105539 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138857855_138858789:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000509573:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511886:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502825:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138857855_138858093:TMEM173 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 138861146 C/G 1 5 6 11 2.36467283091945 3.16239260289665 -0.797719771977199 C:G C G 10 0.527065433816109 0.765666449819686 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138860375_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138861063_138861214:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514119:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000515507:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511850:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502362:exon_138860831_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514348:exon_138861004_138861289:TMEM173 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 139422232 G/A 1 7 6 13 3.31054196328724 3.16239260289665 0.148149360390583 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000158458:ENST00000289422:exon_139421955_139422732:NRG2;ENSG00000158458:ENST00000361474:exon_139421955_139422879:NRG2;ENSG00000158458:ENST00000394770:exon_139421955_139422879:NRG2;ENSG00000158458:ENST00000289409:exon_139421955_139422654:NRG2;ENSG00000158458:ENST00000358522:exon_139421955_139422654:NRG2;ENSG00000158458:ENST00000378238:exon_139421955_139422654:NRG2;ENSG00000158458:ENST00000446269:exon_139421955_139422879:NRG2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 140041960 T/G 1 42 28 70 19.8632517797234 14.7578321468511 5.10541963287237 T:G T G 10 0.527065433816109 0.233307070753411 ENSG00000113141:ENST00000417647:exon_140041887_140042063:IK;ENSG00000113141:ENST00000261812:exon_140041887_140042063:IK;ENSG00000113141:ENST00000515592:exon_140041764_140042064:IK;ENSG00000113141:ENST00000518969:exon_140041887_140042012:IK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 140048209 T/C 1 8 12 20 3.78347652947113 6.32478520579331 -2.54130867632218 T:C T C 10 0.527065433816109 0.271710696844368 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000403979:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140048197_140048376:WDR55 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 140048707 A/G 1 15 21 36 7.09401849275836 11.0683741101383 -3.97435561737993 A:G A G 10 0.527065433816109 0.242276196341047 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048664_140048833:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000403979:exon_140048664_140048833:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140048476_140048833:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140048664_140048833:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140048664_140048833:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511364:exon_140048664_140048833:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000520764:exon_140048664_140048833:WDR55 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 140052271 A/G 1 9 5 14 4.25641109565502 2.63532716908055 1.62108392657447 A:G A G 10 0.527065433816109 0.433551468090942 ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140051963_140053709:WDR55;ENSG00000255017:ENST00000533480:exon_140052030_140052491:AC116353.1;ENSG00000254679:ENST00000523844:exon_140052030_140052491:DND1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 142421415 T/G 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 T:G T G 10 0.527065433816109 0.488810537661758 ENSG00000145819:ENST00000274498:exon_142421381_142421455:ARHGAP26;ENSG00000145819:ENST00000418668:exon_142421381_142421455:ARHGAP26;ENSG00000145819:ENST00000449681:exon_142421381_142421455:ARHGAP26;ENSG00000145819:ENST00000378004:exon_142421381_142421455:ARHGAP26;ENSG00000145819:ENST00000529700:exon_142421381_142421455:ARHGAP26;ENSG00000145819:ENST00000469131:exon_142421381_142421455:ARHGAP26;ENSG00000145819:ENST00000469396:exon_142421381_142421455:ARHGAP26;ENSG00000145819:ENST00000443674:exon_142421381_142421455:ARHGAP26 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 145887453 G/A 1 21 15 36 9.93162588986171 7.90598150724164 2.02564438262007 A:G G A 10 0.527065433816109 0.510707568161342 ENSG00000113649:ENST00000296702:exon_145887436_145887519:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000394421:exon_145887436_145887519:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000506524:exon_145887436_145887519:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000503741:exon_145887436_145887519:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000511077:exon_145886934_145887519:TCERG1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 149776232 C/T 1 69 63 132 32.6324850666885 33.2051223304149 -0.572637263726392 T:C C T 10 0.527065433816109 0.930749968193966 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149775845_149776405:TCOF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 149825159 G/C 1 6 6 12 2.83760739710335 3.16239260289665 -0.324785205793308 C:G G C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000164587:ENST00000519855:exon_149824987_149825248:RPS14 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 149826526 C/T 1 3917 3575 7492 1852.4846957423 1884.25892589259 -31.774230150289 T:C:G C T 10 0.527065433816109 0.466058825297066 ENSG00000164587:ENST00000401695:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000407193:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000521466:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000518139:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000312037:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 149827098 G/A 1 14 7 21 6.62108392657447 3.68945803671276 2.93162588986171 A:G G A 10 0.527065433816109 0.274579453085168 ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 149907602 A/G 1 7 1 8 3.31054196328724 0.527065433816109 2.78347652947113 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0735220313078182 ENSG00000070614:ENST00000523767:exon_149907366_149907860:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000261797:exon_149907366_149907860:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000424060:exon_149907366_149907860:NDST1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 150489390 A/G 1 201 245 446 95.0598478029621 129.131031284947 -34.0711834819846 A:T:G A G 10 0.527065433816109 0.00125201799512199 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150489314_150489407:ANXA6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 150565008 C/T 1 15 14 29 7.09401849275836 7.37891607342553 -0.284897580667162 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150565008_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000522964:exon_150564983_150565102:CCDC69 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 150567015 G/A 1 22 13 35 10.4045604560456 6.85185063960942 3.55270981643618 A:G G A 10 0.527065433816109 0.241322609328583 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150566947_150567020:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150566947_150567020:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150566947_150567020:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150566947_150567020:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000522964:exon_150566947_150567020:CCDC69 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 150578574 A/G 1 15 11 26 7.09401849275836 5.7977197719772 1.29629872078116 A:G A G 10 0.527065433816109 0.696440239382925 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000524344:exon_150578403_150578645:CCDC69 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 153783753 C/T 1 2 8 10 0.945869132367782 4.21652347052887 -3.27065433816109 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0545836587495111 ENSG00000164574:ENST00000297107:exon_153783664_153783771:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000520647:exon_153783664_153783771:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000377661:exon_153783664_153783771:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000519544:exon_153783664_153783771:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000519235:exon_153783664_153783771:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000517958:exon_153783337_153783776:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000427235:exon_153783337_153783771:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000377657:exon_153783595_153783776:GALNT10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 154275786 G/A 1 10 9 19 4.72934566183891 4.74358890434498 -0.0142432425060717 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154275652_154275903:GEMIN5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 154291409 C/T 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154291287_154291458:GEMIN5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 154346259 A/G 1 105 83 188 49.6581294493086 43.746431006737 5.91169844257151 A:G A G 10 0.527065433816109 0.421854376205584 ENSG00000082515:ENST00000523037:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000265229:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000439747:exon_154346246_154346526:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000522038:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000342738:exon_154346246_154346528:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000519059:exon_154346246_154346453:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000520040:exon_154346246_154346505:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000518364:exon_154346246_154346531:MRPL22 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 154346296 G/A 1 110 70 180 52.022802280228 36.8945803671276 15.1282219131004 A:G G A 10 0.527065433816109 0.025063264702023 ENSG00000082515:ENST00000523037:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000265229:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000439747:exon_154346246_154346526:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000522038:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000342738:exon_154346246_154346528:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000519059:exon_154346246_154346453:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000520040:exon_154346246_154346505:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000518364:exon_154346246_154346531:MRPL22 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 159659273 C/T 1 1 7 8 0.472934566183891 3.68945803671276 -3.21652347052887 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0307713746552577 ENSG00000170231:ENST00000393980:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000310650:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000393982:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000523955:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000402432:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000521362:exon_159659042_159659280:FABP6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 169111233 C/T 1 19 11 30 8.98575675749393 5.7977197719772 3.18803698551673 T:C C T 10 0.527065433816109 0.275830848602445 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169111200_169111354:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169111200_169111354:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169111200_169111354:DOCK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 169129422 A/G 1 15 14 29 7.09401849275836 7.37891607342553 -0.284897580667162 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523684:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519223:exon_169129307_169129627:DOCK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 169435713 A/C 1 34 15 49 16.0797752502523 7.90598150724164 8.17379374301066 A:C A C 10 0.527065433816109 0.0216094962032565 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169435692_169435750:DOCK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 169454941 C/G 1 26 22 48 12.2962987207812 11.5954395439544 0.700859176826766 C:G C G 10 0.527065433816109 0.885763109275193 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000433448:exon_169454867_169454952:DOCK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 169461547 C/T 1 42 29 71 19.8632517797234 15.2848975806672 4.57835419905626 T:C C T 10 0.527065433816109 0.287297344422727 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169461403_169461559:DOCK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 171481606 A/G 1 61 48 109 28.8490085372173 25.2991408231732 3.54986771404412 A:G A G 10 0.527065433816109 0.503857358836202 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171481573_171481698:STK10;ENSG00000072786:ENST00000520476:exon_171481573_171481698:STK10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 174937193 C/T 1 7 17 24 3.31054196328724 8.96011237487385 -5.64957041158662 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0241168448802507 ENSG00000164466:ENST00000507017:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502393:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000507823:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000513725:exon_174937112_174937315:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000506963:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502865:exon_174937112_174937210:SFXN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 174953743 G/A 1 17 11 28 8.03988762512615 5.7977197719772 2.24216785314895 A:G G A 10 0.527065433816109 0.45216611994601 ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174953641_174956745:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000421887:exon_174953641_174953886:SFXN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 176370402 A/G 1 7 19 26 3.31054196328724 10.0142432425061 -6.70370127921884 A:G A G 10 0.527065433816109 0.00990348032110563 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176370328_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176370336_176370489:UIMC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 176378574 G/T 1 3 8 11 1.41880369855167 4.21652347052887 -2.7977197719772 T:G G T 10 0.527065433816109 0.130149709511191 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176378475_176378578:UIMC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 176382994 T/C 1 10 8 18 4.72934566183891 4.21652347052887 0.512822191310037 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176382960_176383036:UIMC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 176402401 G/A 1 18 11 29 8.51282219131004 5.7977197719772 2.71510241933284 A:G G A 10 0.527065433816109 0.355748397679087 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000509236:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000417486:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000515488:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000507513:exon_176402397_176402481:UIMC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 176721272 G/C 1 12 23 35 5.67521479420669 12.1225049777705 -6.44729018356382 C:G G C 10 0.527065433816109 0.0406951810794896 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176720833_176727216:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176720833_176722763:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176720833_176727211:NSD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 176734855 G/C 1 23 17 40 10.8774950222295 8.96011237487385 1.91738264735564 C:G G C 10 0.527065433816109 0.63551854294801 ENSG00000213347:ENST00000503473:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000509339:exon_176734782_176735063:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000423571:exon_176733818_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000439742:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000503782:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000303165:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000513063:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000513169:exon_176734814_176734965:MXD3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 176830627 G/A 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 A:G G A 10 0.527065433816109 0.160556933333404 ENSG00000131187:ENST00000502854:exon_176830482_176831091:F12;ENSG00000131187:ENST00000504406:exon_176830255_176830751:F12;ENSG00000131187:ENST00000510358:exon_176830482_176831473:F12 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 176916516 C/T 1 21 18 39 9.93162588986171 9.48717780868996 0.444448081171748 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000196923:ENST00000493815:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000359895:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000356618:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355841:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000460994:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000486828:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393551:exon_176916394_176916628:PDLIM7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 176931706 G/C 1 13 23 36 6.14814936039058 12.1225049777705 -5.97435561737993 C:G G C 10 0.527065433816109 0.0648456645038685 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 176936590 T/C 1 29 41 70 13.7151024193328 21.6096827864605 -7.89458036712763 A:T:C T C 10 0.527065433816109 0.0719059334191569 ENSG00000146094:ENST00000377112:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000357198:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000501403:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000510898:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000509310:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000502380:exon_176935785_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000512660:exon_176936167_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000510389:exon_176936503_176936658:DOK3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 176936819 C/G 1 10 5 15 4.72934566183891 2.63532716908055 2.09401849275836 C:G C G 10 0.527065433816109 0.312436282519101 ENSG00000146094:ENST00000357198:exon_176936803_176936858:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000510380:exon_176936803_176936847:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000506493:exon_176936759_176936830:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000502885:exon_176936759_176936827:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000510898:exon_176936759_176936853:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000512660:exon_176936759_176936827:DOK3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 177031348 T/C 1 4 10 14 1.89173826473556 5.27065433816109 -3.37891607342553 T:C T C 10 0.527065433816109 0.10564189817501 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000502420:exon_177031280_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000510761:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505468:exon_177031067_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000507061:exon_177031313_177031542:B4GALT7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 177035964 T/C 1 22 22 44 10.4045604560456 11.5954395439544 -1.1908790879088 T:C T C 10 0.527065433816109 0.763915403997477 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505145:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000515353:exon_177034366_177036015:B4GALT7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 177483184 A/G 1 12 2 14 5.67521479420669 1.05413086763222 4.62108392657447 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0147159799087008 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 179036433 G/A 1 43 52 95 20.3361863459073 27.4074025584377 -7.07121621253036 A:G G A 10 0.527065433816109 0.151436018921100 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179036377_179037027:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179036377_179036520:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179036377_179037019:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179036377_179037012:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179036377_179037013:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000503583:exon_179036377_179036473:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000508797:exon_179036377_179036971:RUFY1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 179193598 C/T 1 5 6 11 2.36467283091945 3.16239260289665 -0.797719771977199 T:C C T 10 0.527065433816109 0.765666449819686 ENSG00000161021:ENST00000292599:exon_179192327_179193742:MAML1;ENSG00000161021:ENST00000376951:exon_179192327_179193742:MAML1;ENSG00000161021:ENST00000503050:exon_179192327_179193742:MAML1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 179201847 G/A 1 13 11 24 6.14814936039058 5.7977197719772 0.350429588413383 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000161021:ENST00000292599:exon_179200896_179204287:MAML1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 5 180661980 T/C 1 27 34 61 12.7692332869651 17.9202247497477 -5.15099146278265 T:C T C 10 0.527065433816109 0.201035425408997 ENSG00000146063:ENST00000351937:exon_180661932_180661995:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000315073:exon_180661174_180662809:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000508930:exon_180661174_180662806:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000503114:exon_180661932_180661995:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515223:exon_180657744_180662803:TRIM41 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 235 120 355 111.139623053214 63.2478520579331 47.8917709952813 A:C:G G A 10 0.527065433816109 2.91521276164935e-07 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 599209 T/C 1 6 7 13 2.83760739710335 3.68945803671276 -0.851850639609417 T:C T C 10 0.527065433816109 0.783042148004503 ENSG00000112685:ENST00000230449:exon_599080_599225:EXOC2;ENSG00000112685:ENST00000448181:exon_599080_599225:EXOC2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 2784571 G/A 1 25 16 41 11.8233641545973 8.43304694105774 3.39031721353953 A:G G A 10 0.527065433816109 0.348557547568282 ENSG00000124535:ENST00000380773:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380771:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380769:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380764:exon_2784558_2784637:WRNIP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 4031998 A/G 1 55 62 117 26.011401140114 32.6780568965988 -6.66665575648476 A:G A G 10 0.527065433816109 0.229400626354837 ENSG00000112739:ENST00000480058:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000337659:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000489943:exon_4031793_4032335:PRPF4B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 4133855 C/T 1 9 17 26 4.25641109565502 8.96011237487385 -4.70370127921883 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0771187960080057 ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000478266:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4133783_4134016:PECI;ENSG00000198721:ENST00000495548:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000489086:exon_4133783_4133935:PECI HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 12124587 C/G 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 C:G C G 10 0.527065433816109 0.160556933333404 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 12124855 G/A 1 4 6 10 1.89173826473556 3.16239260289665 -1.27065433816109 A:G G A 10 0.527065433816109 0.532268681489131 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 13599303 C/T 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000124523:ENST00000379262:exon_13599264_13599387:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000379250:exon_13599264_13599387:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000397350:exon_13599264_13599387:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000359782:exon_13599264_13599387:SIRT5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 13711279 A/G 1 5 6 11 2.36467283091945 3.16239260289665 -0.797719771977199 A:G A G 10 0.527065433816109 0.765666449819686 ENSG00000010017:ENST00000011619:exon_13711167_13711796:RANBP9;ENSG00000010017:ENST00000283152:exon_13711167_13711953:RANBP9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 13791083 C/T 1 9 12 21 4.25641109565502 6.32478520579331 -2.06837411013829 T:C C T 10 0.527065433816109 0.390094196298263 ENSG00000050393:ENST00000379170:exon_13791020_13791096:CCDC90A;ENSG00000050393:ENST00000488770:exon_13791020_13791096:CCDC90A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 16306751 G/A 1 9 7 16 4.25641109565502 3.68945803671276 0.566953058942256 A:G G A 10 0.527065433816109 0.808175848721287 ENSG00000124788:ENST00000244769:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000436367:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000450222:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000379065:exon_16306534_16307090:ATXN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 18237661 C/T 1 48 37 85 22.7008591768268 19.501421051196 3.19943812563073 T:C C T 10 0.527065433816109 0.515838138071085 ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000507591:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515770:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000512145:exon_18237281_18237747:DEK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 18264210 G/A 1 29 33 62 13.7151024193328 17.3931593159316 -3.67805689659876 A:G G A 10 0.527065433816109 0.374840602349109 ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515742:exon_18264074_18264439:DEK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 24403377 C/T 1 2 8 10 0.945869132367782 4.21652347052887 -3.27065433816109 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0545836587495111 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24403153_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24403153_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24403182_24403464:MRS2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 25600602 A/G 1 6 7 13 2.83760739710335 3.68945803671276 -0.851850639609417 A:G A G 10 0.527065433816109 0.783042148004503 ENSG00000079691:ENST00000399313:exon_25600542_25600948:LRRC16A;ENSG00000079691:ENST00000329474:exon_25600542_25600974:LRRC16A;ENSG00000079691:ENST00000439347:exon_25600542_25600974:LRRC16A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 25605091 G/A 1 1 7 8 0.472934566183891 3.68945803671276 -3.21652347052887 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0307713746552577 ENSG00000079691:ENST00000329474:exon_25605040_25605121:LRRC16A;ENSG00000079691:ENST00000439347:exon_25605040_25605121:LRRC16A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 26056604 G/A 1 147 275 422 69.521381229032 144.94299429943 -75.421613070398 A:G G A 10 0.527065433816109 2.10737452755046e-13 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 26184102 G/A 1 2 8 10 0.945869132367782 4.21652347052887 -3.27065433816109 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0545836587495111 ENSG00000197697:ENST00000356530:exon_26183958_26184454:HIST1H2BE HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 26545632 G/A 1 112 112 224 52.9686714125958 59.0313285874042 -6.06265717480842 A:C:G G A 10 0.527065433816109 0.422775232461489 ENSG00000182952:ENST00000328219:exon_26545355_26547160:HMGN4;ENSG00000182952:ENST00000377575:exon_26545355_26546482:HMGN4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 26598188 A/G 1 44 47 91 20.8091209120912 24.7720753893571 -3.96295447726592 A:G A G 10 0.527065433816109 0.462606457340422 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26598142_26598338:ABT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 28270047 C/G 1 4 6 10 1.89173826473556 3.16239260289665 -1.27065433816109 C:G C G 10 0.527065433816109 0.532268681489131 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28268501_28270326:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28268501_28270325:PGBD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 29523676 C/G 1 44 51 95 20.8091209120912 26.8803371246216 -6.07121621253036 C:G C G 10 0.527065433816109 0.219045431694842 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 29691303 G/A 1 343 453 796 162.216556201075 238.760641518697 -76.5440853176228 A:G G A 10 0.527065433816109 6.26674139239798e-08 ENSG00000204642:ENST00000376861:exon_29691083_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000414333:exon_29691056_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000334668:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000462777:exon_29691169_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29691185_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000482257:exon_29691211_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29691219_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000434407:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000433607:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000486194:exon_29691281_29691704:HLA-F HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 29691713 A/C 1 20 30 50 9.45869132367782 15.8119630144833 -6.35327169080545 A:C A C 10 0.527065433816109 0.0884692684668621 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 29691744 C/G 1 18 25 43 8.51282219131004 13.1766358454027 -4.66381365409269 C:G C G 10 0.527065433816109 0.170670447865436 ENSG00000204642:ENST00000485513:exon_29691717_29692225:HLA-F HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 29693969 C/T 1 26 19 45 12.2962987207812 10.0142432425061 2.28205547827509 T:C C T 10 0.527065433816109 0.551919035282903 ENSG00000204642:ENST00000484704:exon_29693788_29694303:HLA-F HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 29694680 A/C 1 18 8 26 8.51282219131004 4.21652347052887 4.29629872078117 A:C A C 10 0.527065433816109 0.115642458787279 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 29694681 A/T 1 16 8 24 7.56695305894226 4.21652347052887 3.35042958841338 A:T A T 10 0.527065433816109 0.220267510738085 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 29910663 G/A 1 1534 949 2483 725.481624526089 500.185096691488 225.296527834601 A:G G A 10 0.527065433816109 8.41374228945739e-20 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 29910801 C/A 0 0 194 194 0 102.250694160325 -102.250694160325 A C A 10 0.527065433816109 8.15464571938273e-64 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 29910839 C/T 1 8 18 26 3.78347652947113 9.48717780868996 -5.70370127921883 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0299890666647011 ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 29911003 G/A 1 14 5 19 6.62108392657447 2.63532716908055 3.98575675749393 A:G G A 10 0.527065433816109 0.105309144964889 ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 29911356 G/A 1 6 37 43 2.83760739710335 19.501421051196 -16.6638136540927 A:G G A 10 0.527065433816109 2.39041790212382e-07 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 30154199 T/C 1 32 24 56 15.1339061178845 12.6495704115866 2.48433570629789 T:C T C 10 0.527065433816109 0.592859468162575 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000480999:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30152234_30154335:TRIM26 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 30166266 C/T 1 34 18 52 16.0797752502523 9.48717780868996 6.59259744156233 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0717776580076237 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000416596:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000420345:exon_30166206_30166301:TRIM26 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 30166886 C/T 1 26 22 48 12.2962987207812 11.5954395439544 0.700859176826766 T:C C T 10 0.527065433816109 0.885763109275193 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30166443_30167041:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000426696:exon_30166668_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000416596:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000420345:exon_30166668_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000418026:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000434785:exon_30166515_30166924:TRIM26 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 30231224 G/A 1 4 8 12 1.89173826473556 4.21652347052887 -2.32478520579331 A:G G A 10 0.527065433816109 0.248670873824186 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 30313340 G/C 1 93 77 170 43.9829146551019 40.5840384038404 3.39887625126146 C:G G C 10 0.527065433816109 0.645092048586188 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30313268_30313350:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30313268_30313350:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30313244_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000466327:exon_30313268_30313706:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30313075_30314334:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30313075_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30313268_30313350:RPP21 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 30627867 T/C 1 21 18 39 9.93162588986171 9.48717780868996 0.444448081171748 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000204560:ENST00000376442:exon_30627809_30628019:DHX16;ENSG00000204560:ENST00000376437:exon_30627809_30628019:DHX16;ENSG00000204560:ENST00000480966:exon_30627809_30628354:DHX16 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 30647005 C/G 1 80 77 157 37.8347652947113 40.5840384038404 -2.74927310912912 T:C:G C G 10 0.527065433816109 0.689749961409792 ENSG00000146112:ENST00000274853:exon_30646956_30647166:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000399199:exon_30646956_30647166:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000488324:exon_30646956_30647166:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000467662:exon_30646956_30647166:KIAA1949 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 30671989 G/C 1 35 34 69 16.5527098164362 17.9202247497477 -1.36751493331152 C:G G C 10 0.527065433816109 0.809732708588606 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 30680916 C/T 1 1 9 10 0.472934566183891 4.74358890434498 -4.27065433816109 T:C C T 10 0.527065433816109 0.00845260157850117 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000422104:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30680733_30681131:MDC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 30865204 A/C 1 7 5 12 3.31054196328724 2.63532716908055 0.675214794206692 A:C A C 10 0.527065433816109 0.778351128206284 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000361741:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000482873:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30865138_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000417521:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30865156_30865374:DDR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 30867106 C/T 1 12 7 19 5.67521479420669 3.68945803671276 1.98575675749393 T:C C T 10 0.527065433816109 0.491846751029638 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30866933_30867931:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30866933_30867617:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30866933_30867930:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30866933_30867209:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30866933_30867195:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30866665_30867181:DDR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 30877760 A/C 1 12 12 24 5.67521479420669 6.32478520579331 -0.649570411586616 A:C A C 10 0.527065433816109 0.83992621234606 ENSG00000213780:ENST00000259895:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000376316:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000453897:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000487746:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30877709_30877840:VARS2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 30887972 C/T 1 7 8 15 3.31054196328724 4.21652347052887 -0.905981507241636 T:C C T 10 0.527065433816109 0.797198000532565 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30887866_30887993:VARS2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 30888161 T/C 1 8 20 28 3.78347652947113 10.5413086763222 -6.75783214685105 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0129074452767581 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30888110_30888213:VARS2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 30889389 T/C 1 10 14 24 4.72934566183891 7.37891607342553 -2.64957041158662 T:C T C 10 0.527065433816109 0.311132051737374 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30889366_30889468:VARS2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 30893127 G/A 1 17 12 29 8.03988762512615 6.32478520579331 1.71510241933284 A:G G A 10 0.527065433816109 0.580177374586883 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893051_30893162:VARS2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 30893941 G/A 1 48 28 76 22.7008591768268 14.7578321468511 7.94302702997572 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0842083224149694 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893886_30894236:VARS2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31110391 G/C 1 42 32 74 19.8632517797234 16.8660938821155 2.99715789760793 C:G G C 10 0.527065433816109 0.560807934352792 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31110221_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31110238_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31110297_31110493:CCHCR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31111180 T/C 1 48 17 65 22.7008591768268 8.96011237487385 13.7407468019529 T:C T C 10 0.527065433816109 0.000680343901565437 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509859:exon_31110915_31111190:CCHCR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31112737 C/A 1 43 10 53 20.3361863459073 5.27065433816109 15.0655320077462 A:C C A 10 0.527065433816109 2.34085171954014e-05 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112464_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31112662_31112892:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112297_31112850:CCHCR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31113030 A/G 1 29 5 34 13.7151024193328 2.63532716908055 11.0797752502523 A:G A G 10 0.527065433816109 9.62619197498148e-05 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31113052 G/A 1 31 3 34 14.6609715517006 1.58119630144833 13.0797752502523 A:G G A 10 0.527065433816109 2.38649562385381e-06 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31116210 G/A 1 16 2 18 7.56695305894226 1.05413086763222 6.51282219131004 A:G G A 10 0.527065433816109 0.00167845298305209 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31116246 G/A 1 11 1 12 5.2022802280228 0.527065433816109 4.67521479420669 A:G G A 10 0.527065433816109 0.00720790163310933 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31118565 C/G 1 23 4 27 10.8774950222295 2.10826173526444 8.76923328696506 C:G C G 10 0.527065433816109 0.000709244799742726 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31118522_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31118525_31118637:CCHCR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31122315 G/C 0 15 0 15 7.09401849275836 0 7.09401849275836 G G 10 0.527065433816109 8.05366101825798e-05 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31122482 G/A 0 12 0 12 5.67521479420669 0 5.67521479420669 G G 10 0.527065433816109 0.00058479648438031 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31122333_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31122349_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31122371_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31122388_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31122460_31122576:CCHCR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31122500 G/A 0 13 1 14 6.14814936039058 0.527065433816109 5.62108392657447 T:G G T 10 0.527065433816109 0.00219646826073131 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31122333_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31122349_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31122371_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31122388_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31122460_31122576:CCHCR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31124849 C/T 1 17 6 23 8.03988762512615 3.16239260289665 4.87749502222949 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0580867060926943 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000480060:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000505392:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31124508_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000428174:exon_31124508_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507226:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000475684:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000488920:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507892:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000506831:exon_31124800_31125568:CCHCR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31129616 A/G 1 10 5 15 4.72934566183891 2.63532716908055 2.09401849275836 A:G A G 10 0.527065433816109 0.312436282519101 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31129642 A/C 1 18 9 27 8.51282219131004 4.74358890434498 3.76923328696506 A:C A C 10 0.527065433816109 0.178112334024906 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31130502 T/C 1 27 44 71 12.7692332869651 23.1908790879088 -10.4216458009437 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0168617436855836 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31130254_31130784:TCF19 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31237124 T/C 1 2612 1377 3989 1235.30508687232 725.769102364782 509.535984507541 T:C:G T C 10 0.527065433816109 8.07382143204705e-60 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31237162 C/G 1 2693 1016 3709 1273.61278673322 535.498480757167 738.114305976052 A:T:C:G C G 10 0.527065433816109 8.80912930972524e-136 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31237333 T/A 0 22 0 22 10.4045604560456 0 10.4045604560456 T T 10 0.527065433816109 8.30445599701487e-07 ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237270_31237862:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31239417 C/T 1 1876 658 2534 887.225246160979 346.809055451 540.41619070998 A:T:C:G C T 10 0.527065433816109 1.70208468514459e-107 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31239506 C/G 1 945 490 1435 446.923165043777 258.262062569893 188.661102473884 T:C:G C G 10 0.527065433816109 7.03727017627192e-24 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31239821 G/T 1 1077 76 1153 509.350527780051 40.0569729700243 469.293554810026 A:T:C:G G T 10 0.527065433816109 1.60974625567427e-204 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239776_31239882:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239776_31239850:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239776_31239846:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31239776_31239867:HLA-C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31322402 C/T 1 31 9 40 14.6609715517006 4.74358890434498 9.91738264735564 T:C C T 10 0.527065433816109 0.00218590064477592 ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31322459 T/C 1 34 3 37 16.0797752502523 1.58119630144833 14.498578948804 T:C T C 10 0.527065433816109 4.21764557673969e-07 ENSG00000234745:ENST00000497377:exon_31322410_31322853:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31323353 G/A 1 838 256 1094 396.319166462101 134.928751056924 261.390415405177 A:T:G G A 10 0.527065433816109 1.09027265733613e-59 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31323094_31323579:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000426590:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000498007:exon_31323168_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000434333:exon_31323284_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000474381:exon_31323299_31324219:HLA-B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31378864 A/G 1 9 2 11 4.25641109565502 1.05413086763222 3.2022802280228 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0696872224921074 ENSG00000204520:ENST00000484008:exon_31378849_31379136:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000364810:exon_31378849_31379136:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000458313:exon_31378849_31379136:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000449934:exon_31378849_31379136:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000376219:exon_31378849_31379136:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000468458:exon_31378640_31379136:AL645933.1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31431780 T/G 1 48 34 82 22.7008591768268 17.9202247497477 4.78063442707906 T:G T G 10 0.527065433816109 0.32024234582018 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31431813 A/G 1 41 44 85 19.3903172135395 23.1908790879088 -3.80056187436927 A:G A G 10 0.527065433816109 0.447558055434526 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31474820 C/T 1 9 3 12 4.25641109565502 1.58119630144833 2.67521479420669 T:C C T 10 0.527065433816109 0.153067812973243 ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31474799_31475077:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31474799_31475077:MICB;ENSG00000204516:ENST00000494577:exon_31474799_31475077:MICB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31477681 A/G 1 7 6 13 3.31054196328724 3.16239260289665 0.148149360390583 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31477559_31478901:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31477559_31478901:MICB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31540556 T/C 1 55 55 110 26.011401140114 28.988598859886 -2.97719771977199 T:C T C 10 0.527065433816109 0.56864466011278 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540511_31540618:LTA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31540784 C/A 1 110 102 212 52.022802280228 53.7606742492431 -1.73787196901512 A:C C A 10 0.527065433816109 0.836667206330713 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540705_31540810:LTA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31548451 A/G 1 404 280 684 191.065564738292 147.578321468511 43.4872432697814 A:C:G A G 10 0.527065433816109 0.000857140639866093 ENSG00000227507:ENST00000483972:exon_31548302_31548940:LTB;ENSG00000227507:ENST00000429299:exon_31548332_31548940:LTB;ENSG00000227507:ENST00000446745:exon_31548332_31548940:LTB;ENSG00000227507:ENST00000482429:exon_31548401_31548940:LTB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31549556 T/G 1 5 10 15 2.36467283091945 5.27065433816109 -2.90598150724164 T:G T G 10 0.527065433816109 0.194890792920314 ENSG00000227507:ENST00000482429:exon_31549336_31550183:LTB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31556922 C/T 1 13 48 61 6.14814936039058 25.2991408231732 -19.1509914627826 T:C C T 10 0.527065433816109 9.24963131997004e-07 ENSG00000204475:ENST00000495600:exon_31556672_31557008:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000491161:exon_31556672_31557008:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000340027:exon_31556672_31556953:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376073:exon_31556672_31557008:NCR3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31592064 C/T 1 35 9 44 16.5527098164362 4.74358890434498 11.8091209120912 T:C C T 10 0.527065433816109 0.000382425222200891 ENSG00000204469:ENST00000414096:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000469577:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31592038_31592137:BAT2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31595882 C/A 1 34 31 65 16.0797752502523 16.3390284482994 -0.259253198047087 A:C C A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31595542_31596016:BAT2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31601344 T/C 1 104 97 201 49.1851948831247 51.1253470801626 -1.94015219703792 T:C T C 10 0.527065433816109 0.832240776541447 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31601156_31601424:BAT2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31605199 G/C 1 27 32 59 12.7692332869651 16.8660938821155 -4.09686059515043 C:G G C 10 0.527065433816109 0.299307337404182 ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31610686 A/G 1 57 51 108 26.9572702724818 26.8803371246216 0.076933147860224 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000470875:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000465348:exon_31610461_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000438149:exon_31610609_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000436214:exon_31610647_31610892:BAT3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31627523 C/T 1 33 32 65 15.6068406840684 16.8660938821155 -1.25925319804709 T:C C T 10 0.527065433816109 0.804301015458133 ENSG00000204439:ENST00000375911:exon_31626075_31628549:C6orf47 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31630318 C/G 1 33 22 55 15.6068406840684 11.5954395439544 4.011401140114 C:G C G 10 0.527065433816109 0.344610371723735 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31657413 T/C 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 T:C T C 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000204427:ENST00000395952:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000475742:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000492084:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000375842:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000495769:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000440843:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000471644:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000477016:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000498420:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204422:ENST00000461287:exon_31657358_31657481:XXbac-BPG32J3.20 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31729359 A/G 1 13 18 31 6.14814936039058 9.48717780868996 -3.33902844829938 A:G A G 10 0.527065433816109 0.28095429484387 ENSG00000204410:ENST00000375755:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000534153:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375750:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528100:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375742:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395817:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000383401:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375703:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375740:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528640:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375696:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000423982:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000463144:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395853:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000431848:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000484309:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000429846:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000491552:exon_31729249_31729392:MSH5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31762843 G/C 1 7 4 11 3.31054196328724 2.10826173526444 1.2022802280228 C:G G C 10 0.527065433816109 0.555399509917260 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000440048:exon_31762608_31763276:VARS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31762844 G/T 1 7 4 11 3.31054196328724 2.10826173526444 1.2022802280228 T:G G T 10 0.527065433816109 0.555399509917260 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000440048:exon_31762608_31763276:VARS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31778272 G/A 1 4 6 10 1.89173826473556 3.16239260289665 -1.27065433816109 A:G G A 10 0.527065433816109 0.532268681489131 ENSG00000204390:ENST00000375654:exon_31777396_31779762:HSPA1L;ENSG00000204390:ENST00000417199:exon_31777396_31779762:HSPA1L;ENSG00000204390:ENST00000375653:exon_31777824_31779230:HSPA1L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31860337 T/C 1 7 7 14 3.31054196328724 3.68945803671276 -0.378916073425526 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000204371:ENST00000480912:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000395728:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375528:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375530:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375537:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000442298:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000463484:exon_31860195_31860339:EHMT2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31929808 C/T 1 20 18 38 9.45869132367782 9.48717780868996 -0.0284864850121433 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31929686_31929831:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31929686_31929831:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000477400:exon_31929686_31929831:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31929686_31929831:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000461073:exon_31929686_31929831:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31929686_31929831:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000466290:exon_31929686_31929831:SKIV2L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31938072 T/C 1 22 14 36 10.4045604560456 7.37891607342553 3.02564438262007 T:C T C 10 0.527065433816109 0.323110328061989 ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31938107 A/G 1 21 13 34 9.93162588986171 6.85185063960942 3.07977525025229 A:G A G 10 0.527065433816109 0.308163033725043 ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31938412 G/T 1 29 21 50 13.7151024193328 11.0683741101383 2.64672830919455 T:G G T 10 0.527065433816109 0.4817003241602 ENSG00000204348:ENST00000491327:exon_31938120_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000485557:exon_31938383_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000477826:exon_31938383_31940029:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000337523:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375349:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000495340:exon_31938370_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000478221:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375356:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000480240:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000474587:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000492946:exon_31938219_31939458:DOM3Z HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 31938451 T/C 1 19 19 38 8.98575675749393 10.0142432425061 -1.02848648501215 T:C T C 10 0.527065433816109 0.748251620330117 ENSG00000204348:ENST00000491327:exon_31938120_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000485557:exon_31938383_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000477826:exon_31938383_31940029:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000337523:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375349:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000495340:exon_31938370_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000478221:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375356:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000480240:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000474587:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000492946:exon_31938219_31939458:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000487914:exon_31938420_31938529:DOM3Z HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 32097290 C/T 1 7 5 12 3.31054196328724 2.63532716908055 0.675214794206692 T:C C T 10 0.527065433816109 0.778351128206284 ENSG00000204315:ENST00000375156:exon_32096484_32097631:FKBPL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 32147696 G/A 1 44 3 47 20.8091209120912 1.58119630144833 19.2279246106429 A:G G A 10 0.527065433816109 1.22433096968443e-09 ENSG00000204308:ENST00000375094:exon_32147654_32147708:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000427134:exon_32147654_32147708:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375087:exon_32147654_32147708:RNF5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 32148031 A/G 1 112 44 156 52.9686714125958 23.1908790879088 29.777792324687 A:G A G 10 0.527065433816109 1.68594285377026e-06 ENSG00000204308:ENST00000375094:exon_32148006_32148570:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375085:exon_32148006_32148541:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375087:exon_32148006_32148541:RNF5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 32151934 A/G 1 4 8 12 1.89173826473556 4.21652347052887 -2.32478520579331 A:G A G 10 0.527065433816109 0.248670873824186 ENSG00000204305:ENST00000484849:exon_32151658_32152023:AGER HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 32157639 C/T 1 9 5 14 4.25641109565502 2.63532716908055 1.62108392657447 T:C C T 10 0.527065433816109 0.433551468090942 ENSG00000204304:ENST00000375050:exon_32157472_32157963:PBX2;ENSG00000204304:ENST00000478678:exon_32157472_32157719:PBX2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 32159956 T/C 1 130 158 288 61.4814936039058 83.2763385429452 -21.7948449390394 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0110673445216858 ENSG00000213654:ENST00000487761:exon_32159925_32160049:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000472768:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375040:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375043:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000402726:exon_32159925_32160027:GPSM3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 32163274 G/A 1 5 7 12 2.36467283091945 3.68945803671276 -1.32478520579331 A:G G A 10 0.527065433816109 0.566621218006073 ENSG00000213654:ENST00000375043:exon_32163203_32163300:GPSM3;ENSG00000204301:ENST00000491215:exon_32162620_32164198:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000474612:exon_32162620_32163927:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000375023:exon_32162620_32163927:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000415698:exon_32162625_32163927:NOTCH4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 32163664 C/T 1 7 8 15 3.31054196328724 4.21652347052887 -0.905981507241636 T:C C T 10 0.527065433816109 0.797198000532565 ENSG00000204301:ENST00000491215:exon_32162620_32164198:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000474612:exon_32162620_32163927:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000375023:exon_32162620_32163927:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000415698:exon_32162625_32163927:NOTCH4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 32163799 T/C 1 8 4 12 3.78347652947113 2.10826173526444 1.67521479420669 T:C T C 10 0.527065433816109 0.396148353996528 ENSG00000204301:ENST00000491215:exon_32162620_32164198:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000474612:exon_32162620_32163927:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000375023:exon_32162620_32163927:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000415698:exon_32162625_32163927:NOTCH4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 32407709 C/A 1 1072 1215 2287 506.985854949131 640.384502086573 -133.398647137441 A:C:G C A 10 0.527065433816109 2.46236516863887e-08 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32407619_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32407647_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000462200:exon_32407649_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32407655_32407809:HLA-DRA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 32410941 T/C 1 7 2 9 3.31054196328724 1.05413086763222 2.25641109565502 T:C T C 10 0.527065433816109 0.185447766343339 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 32411035 A/C 1 1688 1592 3280 798.313547718408 839.088170635246 -40.7746229168376 A:T:C:G A C 10 0.527065433816109 0.156660121203819 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32410962_32411243:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32410962_32411122:HLA-DRA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 32411523 T/C 1 16 9 25 7.56695305894226 4.74358890434498 2.82336415459727 T:C T C 10 0.527065433816109 0.3181294657177 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 32411573 C/T 1 2790 2687 5477 1319.48743965306 1416.22482066388 -96.737381010829 A:T:C:G C T 10 0.527065433816109 0.00900545253134848 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32411533_32411698:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32411533_32411698:HLA-DRA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 32782112 C/T 1 49 37 86 23.1737937430107 19.501421051196 3.67237269181462 T:C C T 10 0.527065433816109 0.451162042837941 ENSG00000241106:ENST00000488325:exon_32782097_32782378:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32782097_32782378:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32781500_32782378:HLA-DOB;ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32782097_32782378:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32782097_32782378:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 32783086 A/G 1 53 40 93 25.0655320077462 21.0826173526444 3.98291465510186 A:G A G 10 0.527065433816109 0.467471942046936 ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32782821_32783090:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32782821_32783090:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000447394:exon_32782821_32783090:HLA-DOB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 32796685 A/G 1 43 28 71 20.3361863459073 14.7578321468511 5.57835419905626 A:G A G 10 0.527065433816109 0.193072205335064 ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32793192_32796811:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32796683_32796811:TAP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 32796751 T/C 1 49 51 100 23.1737937430107 26.8803371246216 -3.70654338161091 T:C T C 10 0.527065433816109 0.484111336653512 ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32793192_32796811:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32796683_32796811:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32796721_32796811:TAP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 32797297 T/C 1 23 46 69 10.8774950222295 24.245009955541 -13.3675149333115 T:C T C 10 0.527065433816109 0.00154442052393020 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32797177_32797313:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 32811629 G/T 1 147 153 300 69.521381229032 80.6410113738647 -11.1196301448327 T:G G T 10 0.527065433816109 0.203690325077383 ENSG00000204264:ENST00000395339:exon_32811627_32811797:PSMB8;ENSG00000204264:ENST00000374882:exon_32811627_32811824:PSMB8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 32821447 C/T 1 49 37 86 23.1737937430107 19.501421051196 3.67237269181462 T:C C T 10 0.527065433816109 0.451162042837941 ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32820816_32821755:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000425148:exon_32820816_32821755:TAP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 32903296 T/G 1 14 27 41 6.62108392657447 14.2307667130349 -7.60968278646047 T:G T G 10 0.527065433816109 0.0188659468844117 ENSG00000242574:ENST00000477537:exon_32903119_32904678:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 32917544 C/T 1 398 377 775 188.227957341189 198.703668548673 -10.4757112074845 T:C C T 10 0.527065433816109 0.471870112240727 ENSG00000204257:ENST00000395305:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000395303:exon_32917388_32917564:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000477541:exon_32917388_32918580:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000374843:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000532100:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000341486:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000464392:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000456800:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000422832:exon_32917434_32917666:HLA-DMA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 33232521 C/T 1 5 7 12 2.36467283091945 3.68945803671276 -1.32478520579331 T:C C T 10 0.527065433816109 0.566621218006073 ENSG00000223501:ENST00000493379:exon_33232151_33232677:VPS52 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 33235755 G/A 1 6 9 15 2.83760739710335 4.74358890434498 -1.90598150724164 A:G G A 10 0.527065433816109 0.439435430476406 ENSG00000223501:ENST00000482399:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000445902:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000478934:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000418054:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000495755:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000463486:exon_33235647_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000464425:exon_33235648_33235774:VPS52 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 33239905 A/G 1 4 7 11 1.89173826473556 3.68945803671276 -1.7977197719772 A:G A G 10 0.527065433816109 0.36886039388561 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 33240506 A/G 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 A:T:G A G 10 0.527065433816109 1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 33254665 A/G 1 61 62 123 28.8490085372173 32.6780568965988 -3.82904835938141 A:G A G 10 0.527065433816109 0.52763794804239 ENSG00000227057:ENST00000374617:exon_33254572_33254671:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000489905:exon_33254572_33254671:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000444176:exon_33254572_33254671:WDR46 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 33256397 G/A 1 46 59 105 21.754990044459 31.0968605951504 -9.34187055069145 A:G G A 10 0.527065433816109 0.078185998292825 ENSG00000227057:ENST00000374617:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000444176:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000477718:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000468157:exon_33256341_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000481025:exon_33256391_33256471:WDR46 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 33258443 G/A 1 10 10 20 4.72934566183891 5.27065433816109 -0.541308676322181 A:G G A 10 0.527065433816109 0.826649432830958 ENSG00000204220:ENST00000395134:exon_33258103_33258652:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000491382:exon_33257951_33258645:PFDN6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 33272712 C/A 1 7 3 10 3.31054196328724 1.58119630144833 1.72934566183891 A:C C A 10 0.527065433816109 0.350932787230552 ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 33272855 G/C 1 126 93 219 59.5897553391703 49.0170853448981 10.5726699942721 C:G G C 10 0.527065433816109 0.155836682150061 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437116:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000449540:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437741:exon_33272734_33273164:TAPBP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 33283766 T/C 1 14 15 29 6.62108392657447 7.90598150724164 -1.28489758066716 T:C T C 10 0.527065433816109 0.711321912285436 ENSG00000236104:ENST00000418724:exon_33282183_33284762:ZBTB22;ENSG00000236104:ENST00000431845:exon_33282195_33284762:ZBTB22 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 33371778 C/A 1 44 35 79 20.8091209120912 18.4472901835638 2.36183072852739 A:T:C C A 10 0.527065433816109 0.652703027428251 ENSG00000237649:ENST00000428849:exon_33371506_33371906:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000453530:exon_33371506_33371906:KIFC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 33636907 C/T 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 T:C C T 10 0.527065433816109 0.160556933333404 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33636751_33636933:ITPR3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 33638180 C/T 1 7 4 11 3.31054196328724 2.10826173526444 1.2022802280228 T:C C T 10 0.527065433816109 0.555399509917260 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33638102_33638353:ITPR3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 33740382 G/A 1 21 31 52 9.93162588986171 16.3390284482994 -6.40740255843767 A:T:G G A 10 0.527065433816109 0.0947534622494034 ENSG00000161904:ENST00000506578:exon_33738979_33740552:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000293760:exon_33738979_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000511171:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000374196:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000450389:exon_33739474_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000421671:exon_33739209_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000508327:exon_33740102_33740555:LEMD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 33740592 C/T 1 4 9 13 1.89173826473556 4.74358890434498 -2.85185063960942 T:C C T 10 0.527065433816109 0.163735013053684 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 34855748 G/C 1 18 26 44 8.51282219131004 13.7037012792188 -5.1908790879088 C:G G C 10 0.527065433816109 0.131777644537270 ENSG00000064995:ENST00000361288:exon_34855564_34855866:TAF11;ENSG00000064995:ENST00000420584:exon_34855564_34855819:TAF11 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 35260503 C/T 1 13 8 21 6.14814936039058 4.21652347052887 1.93162588986171 T:C C T 10 0.527065433816109 0.513458776648042 ENSG00000065029:ENST00000229405:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000373953:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000417184:exon_35260331_35260504:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000339411:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000440666:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000479226:exon_35260100_35260564:ZNF76 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 35260530 C/T 1 15 9 24 7.09401849275836 4.74358890434498 2.35042958841338 T:C C T 10 0.527065433816109 0.415272769718452 ENSG00000065029:ENST00000229405:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000373953:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000339411:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000440666:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000479226:exon_35260100_35260564:ZNF76 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 35285720 A/C 1 60 52 112 28.3760739710335 27.4074025584377 0.968671412595786 A:C A C 10 0.527065433816109 0.924668886262452 ENSG00000023892:ENST00000316637:exon_35285668_35285776:DEF6;ENSG00000023892:ENST00000468102:exon_35285385_35285776:DEF6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 35391787 C/T 1 9 12 21 4.25641109565502 6.32478520579331 -2.06837411013829 T:C C T 10 0.527065433816109 0.390094196298263 ENSG00000112033:ENST00000360694:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000418635:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000444397:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000311565:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000337400:exon_35391723_35391925:PPARD HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 35430686 G/A 1 9 8 17 4.25641109565502 4.21652347052887 0.0398876251261466 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000112039:ENST00000229769:exon_35430566_35430691:FANCE HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 35436571 C/T 1 20 19 39 9.45869132367782 10.0142432425061 -0.555551918828254 T:C C T 10 0.527065433816109 0.87396986201025 ENSG00000198755:ENST00000464112:exon_35436197_35436650:RPL10A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 35803192 C/A 1 10 13 23 4.72934566183891 6.85185063960942 -2.12250497777051 A:C C A 10 0.527065433816109 0.409255873477579 ENSG00000096063:ENST00000373825:exon_35800743_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000361690:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000423325:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000346162:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000373822:exon_35800811_35803265:SRPK1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 36824399 C/T 1 26 21 47 12.2962987207812 11.0683741101383 1.22792461064287 T:C C T 10 0.527065433816109 0.7713716147316 ENSG00000137168:ENST00000373699:exon_36824362_36824430:PPIL1;ENSG00000137168:ENST00000483552:exon_36824362_36824430:PPIL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 36882353 A/G 1 4 6 10 1.89173826473556 3.16239260289665 -1.27065433816109 A:G A G 10 0.527065433816109 0.532268681489131 ENSG00000198663:ENST00000359359:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000480824:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000355190:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000373685:exon_36882330_36882469:C6orf89 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 36936771 A/G 1 30 32 62 14.1880369855167 16.8660938821155 -2.67805689659876 A:G A G 10 0.527065433816109 0.526340091128519 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 36976637 G/C 1 15 10 25 7.09401849275836 5.27065433816109 1.82336415459727 C:G G C 10 0.527065433816109 0.550103280555877 ENSG00000146192:ENST00000489356:exon_36976610_36977807:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000497659:exon_36976610_36976857:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000459781:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000487975:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36976610_36976841:FGD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 36979583 C/T 1 9 6 15 4.25641109565502 3.16239260289665 1.09401849275836 T:C C T 10 0.527065433816109 0.615224246448703 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36979482_36979630:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000459781:exon_36979482_36979809:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36979482_36979630:FGD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 36988364 C/T 1 4 5 9 1.89173826473556 2.63532716908055 -0.743588904344981 A:T:C C T 10 0.527065433816109 0.743612144716174 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000470273:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000394459:exon_36988314_36988396:FGD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 36995222 G/A 1 16 11 27 7.56695305894226 5.7977197719772 1.76923328696506 A:G G A 10 0.527065433816109 0.565832725058203 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000487920:exon_36995205_36996845:FGD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 37443950 G/A 1 9 11 20 4.25641109565502 5.7977197719772 -1.54130867632218 A:G G A 10 0.527065433816109 0.510653805220797 ENSG00000137200:ENST00000373420:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000373427:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000373451:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000475364:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000457419:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000452299:exon_37443902_37443970:FTSJD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 38650628 T/G 1 45 54 99 21.2820554782751 28.4615334260699 -7.17947794779479 T:G T G 10 0.527065433816109 0.159270130318044 ENSG00000124767:ENST00000470973:exon_38650584_38650991:GLO1;ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38650584_38650651:GLO1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 38670837 G/A 1 28 22 50 13.2421678531489 11.5954395439544 1.64672830919455 A:G G A 10 0.527065433816109 0.67310833391504 ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38670747_38670917:GLO1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 41029342 T/C 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 T:C T C 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000124701:ENST00000426505:exon_41029234_41029434:APOBEC2;ENSG00000124701:ENST00000244669:exon_41029067_41029631:APOBEC2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 41303592 T/C 1 3 6 9 1.41880369855167 3.16239260289665 -1.74358890434498 T:C T C 10 0.527065433816109 0.323067031523113 ENSG00000096264:ENST00000373083:exon_41303393_41303666:NCR2;ENSG00000096264:ENST00000373089:exon_41303527_41303666:NCR2;ENSG00000096264:ENST00000373086:exon_41303589_41303666:NCR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 41309552 T/C 1 5 6 11 2.36467283091945 3.16239260289665 -0.797719771977199 T:C T C 10 0.527065433816109 0.765666449819686 ENSG00000096264:ENST00000373083:exon_41309532_41309667:NCR2;ENSG00000096264:ENST00000373089:exon_41309532_41309667:NCR2;ENSG00000096264:ENST00000373086:exon_41309532_41309667:NCR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 41652604 T/C 1 199 186 385 94.1139786705943 98.0341706897963 -3.92019201920198 T:C T C 10 0.527065433816109 0.720938610689367 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 41658889 C/T 1 58 60 118 27.4302048386657 31.6239260289665 -4.19372119030087 T:C C T 10 0.527065433816109 0.461549733420665 ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41658739_41659214:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000394283:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419396:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000416140:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419574:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000424495:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000445214:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419788:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000425401:exon_41658854_41658973:TFEB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 42906384 G/T 1 165 156 321 78.034203420342 82.222207675313 -4.18800425497101 T:G G T 10 0.527065433816109 0.654982684700909 ENSG00000137161:ENST00000372836:exon_42906306_42907025:CNPY3;ENSG00000137161:ENST00000394142:exon_42906306_42907007:CNPY3;ENSG00000137161:ENST00000336842:exon_42906306_42906445:CNPY3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 42932200 G/T 1 65 28 93 30.7407468019529 14.7578321468511 15.9829146551019 T:G G T 10 0.527065433816109 0.000838376864692784 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42931608_42932209:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42932073_42932209:PEX6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 42932202 C/T 1 65 29 94 30.7407468019529 15.2848975806672 15.4558492212858 T:C C T 10 0.527065433816109 0.00131177099178918 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42931608_42932209:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42932073_42932209:PEX6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 42933526 C/T 1 32 18 50 15.1339061178845 9.48717780868996 5.64672830919455 T:C C T 10 0.527065433816109 0.120285318288442 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42933419_42933527:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42933419_42933527:PEX6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 43173885 G/A 1 7 3 10 3.31054196328724 1.58119630144833 1.72934566183891 A:G G A 10 0.527065433816109 0.350932787230552 ENSG00000112659:ENST00000252050:exon_43173745_43173973:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000515773:exon_43173745_43173973:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000354495:exon_43173745_43173973:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000372647:exon_43173745_43173973:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000504485:exon_43173745_43173973:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000502719:exon_43173821_43173973:CUL9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 43184132 A/C 1 4 12 16 1.89173826473556 6.32478520579331 -4.43304694105774 A:C A C 10 0.527065433816109 0.0418122702791581 ENSG00000112659:ENST00000252050:exon_43183896_43184241:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000515773:exon_43183896_43184241:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000354495:exon_43183896_43184241:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000372647:exon_43183896_43184241:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000508656:exon_43183896_43184241:CUL9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 43188940 C/T 1 7 11 18 3.31054196328724 5.7977197719772 -2.48717780868996 T:C C T 10 0.527065433816109 0.249990861970352 ENSG00000112659:ENST00000252050:exon_43188896_43189059:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000515773:exon_43188896_43189059:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000354495:exon_43188896_43189059:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000372647:exon_43188896_43189059:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000506830:exon_43188896_43189059:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000512423:exon_43188485_43189016:CUL9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 43193877 G/A 1 194 101 295 91.7493058396748 53.233608815427 38.5156970242478 A:G G A 10 0.527065433816109 6.44256830579994e-06 ENSG00000112667:ENST00000230431:exon_43193771_43193881:C6orf108;ENSG00000112667:ENST00000509253:exon_43193771_43193881:C6orf108;ENSG00000112667:ENST00000393987:exon_43193373_43193881:C6orf108;ENSG00000112667:ENST00000505042:exon_43193787_43193881:C6orf108 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 43273604 A/G 1 7 10 17 3.31054196328724 5.27065433816109 -1.96011237487385 A:G A G 10 0.527065433816109 0.467399584608424 ENSG00000146215:ENST00000372569:exon_43273210_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000451294:exon_43273251_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000477866:exon_43273455_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000274990:exon_43273563_43273862:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000449267:exon_43273563_43273862:CRIP3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 43412865 T/C 1 8 3 11 3.78347652947113 1.58119630144833 2.2022802280228 T:C T C 10 0.527065433816109 0.234094659981005 ENSG00000124574:ENST00000372530:exon_43412863_43413052:ABCC10;ENSG00000124574:ENST00000244533:exon_43412863_43413052:ABCC10;ENSG00000124574:ENST00000463024:exon_43412863_43413052:ABCC10;ENSG00000124574:ENST00000372512:exon_43412838_43413052:ABCC10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 43492578 G/A 1 40 22 62 18.9173826473556 11.5954395439544 7.32194310340124 A:C:G G A 10 0.527065433816109 0.0744104831562438 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455854:exon_43492569_43494363:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000488195:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000486936:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455285:exon_43492569_43492706:XPO5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 43496662 A/C 1 25 22 47 11.8233641545973 11.5954395439544 0.227924610642875 A:C A C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000436943:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372250:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000398835:exon_43496566_43496663:XPO5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 43968814 A/G 1 11 9 20 5.2022802280228 4.74358890434498 0.45869132367782 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000181577:ENST00000442114:exon_43968317_43968880:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000336600:exon_43968754_43968880:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000439969:exon_43968711_43968880:C6orf223 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 44117607 C/T 1 11 5 16 5.2022802280228 2.63532716908055 2.56695305894226 T:C C T 10 0.527065433816109 0.220807585221878 ENSG00000137216:ENST00000259746:exon_44117596_44117702:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000323267:exon_44117596_44117702:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000371915:exon_44117596_44117702:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000371893:exon_44117596_44117702:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000533121:exon_44117596_44117702:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000482966:exon_44117596_44117702:TMEM63B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 44117664 C/T 1 7 3 10 3.31054196328724 1.58119630144833 1.72934566183891 T:C C T 10 0.527065433816109 0.350932787230552 ENSG00000137216:ENST00000259746:exon_44117596_44117702:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000323267:exon_44117596_44117702:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000371915:exon_44117596_44117702:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000371893:exon_44117596_44117702:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000533121:exon_44117596_44117702:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000482966:exon_44117596_44117702:TMEM63B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 44119676 A/G 1 8 3 11 3.78347652947113 1.58119630144833 2.2022802280228 A:G A G 10 0.527065433816109 0.234094659981005 ENSG00000137216:ENST00000259746:exon_44119583_44119745:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000323267:exon_44119583_44119745:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000371915:exon_44119583_44119745:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000371893:exon_44119583_44119745:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000533121:exon_44119583_44119745:TMEM63B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 44223010 G/T 1 74 93 167 34.9971578976079 49.0170853448981 -14.0199274472902 T:G G T 10 0.527065433816109 0.030194983489243 ENSG00000157593:ENST00000495706:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393810:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393812:exon_44221843_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000341553:exon_44222931_44223381:SLC35B2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 44269193 C/T 1 7 6 13 3.31054196328724 3.16239260289665 0.148149360390583 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000124608:ENST00000244571:exon_44269118_44269201:AARS2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 49403282 T/C 1 13 8 21 6.14814936039058 4.21652347052887 1.93162588986171 T:C T C 10 0.527065433816109 0.513458776648042 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49403169_49403336:MUT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 49412433 C/T 1 8 12 20 3.78347652947113 6.32478520579331 -2.54130867632218 T:C C T 10 0.527065433816109 0.271710696844368 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49412352_49412467:MUT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 49425446 T/C 1 16 15 31 7.56695305894226 7.90598150724164 -0.339028448299381 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49425404_49425771:MUT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 49439805 G/A 1 11 1 12 5.2022802280228 0.527065433816109 4.67521479420669 A:G G A 10 0.527065433816109 0.00720790163310933 ENSG00000031691:ENST00000335783:exon_49439776_49439896:CENPQ;ENSG00000031691:ENST00000371200:exon_49439776_49439896:CENPQ HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 52130963 T/C 1 5 5 10 2.36467283091945 2.63532716908055 -0.270654338161091 T:C T C 10 0.527065433816109 1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 57244780 G/A 0 10 0 10 4.72934566183891 0 4.72934566183891 G G 10 0.527065433816109 0.00221418962581423 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57244745_57244794:PRIM2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 18 18 0 9.48717780868996 -9.48717780868996 A G A 10 0.527065433816109 1.40093836819460e-06 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 57512529 C/A 0 10 0 10 4.72934566183891 0 4.72934566183891 C C 10 0.527065433816109 0.00221418962581423 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 57512565 T/C 0 0 9 9 0 4.74358890434498 -4.74358890434498 C T C 10 0.527065433816109 0.00118361242313293 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 70407465 A/T 1 27 25 52 12.7692332869651 13.1766358454027 -0.407402558437671 A:T A T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000168216:ENST00000370577:exon_70407455_70407533:LMBRD1;ENSG00000168216:ENST00000370570:exon_70407455_70407533:LMBRD1;ENSG00000168216:ENST00000472827:exon_70407455_70407533:LMBRD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 71546702 C/T 1 3 9 12 1.41880369855167 4.74358890434498 -3.32478520579331 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0800200924234215 ENSG00000112305:ENST00000370452:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000316999:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370442:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000420229:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000439432:exon_71546644_71546731:SMAP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 73332040 C/G 1 3 6 9 1.41880369855167 3.16239260289665 -1.74358890434498 C:G C G 10 0.527065433816109 0.323067031523113 ENSG00000185760:ENST00000342056:exon_73331520_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000370398:exon_73331809_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000370392:exon_73331834_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000403813:exon_73331918_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000355635:exon_73331918_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000402622:exon_73331918_73332315:KCNQ5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 74533192 T/G 1 9 6 15 4.25641109565502 3.16239260289665 1.09401849275836 T:G T G 10 0.527065433816109 0.615224246448703 ENSG00000156535:ENST00000422508:exon_74533182_74538040:CD109;ENSG00000156535:ENST00000287097:exon_74533182_74534789:CD109 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 79656562 A/T 1 11 6 17 5.2022802280228 3.16239260289665 2.03988762512615 A:T A T 10 0.527065433816109 0.344390478204234 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 79656570 G/A 1 13 6 19 6.14814936039058 3.16239260289665 2.98575675749393 A:G G A 10 0.527065433816109 0.250133651156978 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 79657391 G/A 1 6 3 9 2.83760739710335 1.58119630144833 1.25641109565502 A:G G A 10 0.527065433816109 0.513555929047552 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79657340_79657492:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79657340_79657492:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79657340_79657492:PHIP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 79675701 A/G 1 13 7 20 6.14814936039058 3.68945803671276 2.45869132367782 A:G A G 10 0.527065433816109 0.371081802214505 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79675662_79675773:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79675662_79675773:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79675662_79675773:PHIP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 79679577 A/G 1 8 12 20 3.78347652947113 6.32478520579331 -2.54130867632218 A:G A G 10 0.527065433816109 0.271710696844368 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79679552_79679634:PHIP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 80741243 A/T 1 13 10 23 6.14814936039058 5.27065433816109 0.877495022229492 A:T A T 10 0.527065433816109 0.835491706691073 ENSG00000112742:ENST00000509894:exon_80741184_80741276:TTK;ENSG00000112742:ENST00000230510:exon_80741184_80741276:TTK;ENSG00000112742:ENST00000369798:exon_80741184_80741276:TTK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 80749972 A/C 1 10 8 18 4.72934566183891 4.21652347052887 0.512822191310037 A:C A C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000112742:ENST00000509894:exon_80749913_80749997:TTK;ENSG00000112742:ENST00000230510:exon_80749913_80749997:TTK;ENSG00000112742:ENST00000369798:exon_80749913_80749997:TTK;ENSG00000112742:ENST00000504590:exon_80749913_80749988:TTK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 83880167 C/T 1 10 14 24 4.72934566183891 7.37891607342553 -2.64957041158662 T:C C T 10 0.527065433816109 0.311132051737374 ENSG00000083097:ENST00000484282:exon_83880008_83881069:DOPEY1;ENSG00000013375:ENST00000504780:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000513973:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000512866:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000369731:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000283977:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000416472:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000506587:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000509219:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000503356:exon_83880092_83880197:PGM3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 83881740 T/C 1 5 6 11 2.36467283091945 3.16239260289665 -0.797719771977199 T:C T C 10 0.527065433816109 0.765666449819686 ENSG00000013375:ENST00000513973:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000512866:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000369731:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000283977:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000416472:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000506587:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000509219:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000503356:exon_83881639_83881778:PGM3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 90368380 G/A 1 18 8 26 8.51282219131004 4.21652347052887 4.29629872078117 A:G G A 10 0.527065433816109 0.115642458787279 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90368329_90368636:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90368329_90368636:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90368329_90368636:MDN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 96999725 C/T 1 8 4 12 3.78347652947113 2.10826173526444 1.67521479420669 T:C C T 10 0.527065433816109 0.396148353996528 ENSG00000014123:ENST00000369278:exon_96999714_96999799:KIAA0776 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 97339078 A/G 1 50 51 101 23.6467283091945 26.8803371246216 -3.23360881542702 A:G A G 10 0.527065433816109 0.550582435566643 ENSG00000123545:ENST00000316149:exon_97337189_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000478382:exon_97338888_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000489477:exon_97339027_97339267:NDUFAF4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 97677118 G/A 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000146263:ENST00000275053:exon_97676770_97677279:MMS22L;ENSG00000146263:ENST00000369251:exon_97676770_97677279:MMS22L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 99817507 T/C 1 14 14 28 6.62108392657447 7.37891607342553 -0.757832146851053 T:C T C 10 0.527065433816109 0.850808986253895 ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99817276_99817696:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99817276_99817696:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369240:exon_99817280_99817696:COQ3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 105776792 G/A 1 5 11 16 2.36467283091945 5.7977197719772 -3.43304694105774 A:G G A 10 0.527065433816109 0.130692436904043 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105776704_105776901:PREP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 106999822 G/A 1 20 9 29 9.45869132367782 4.74358890434498 4.71510241933284 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0943626462970606 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000457437:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000285105:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000487681:exon_106999727_107000189:AIM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 107076783 A/T 1 4 15 19 1.89173826473556 7.90598150724164 -6.01424324250607 A:T A T 10 0.527065433816109 0.0094497196601332 ENSG00000130347:ENST00000369063:exon_107076623_107077362:RTN4IP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 107100396 A/G 1 22 18 40 10.4045604560456 9.48717780868996 0.917382647355639 A:G A G 10 0.527065433816109 0.874517876555203 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107100342_107100457:QRSL1;ENSG00000130348:ENST00000369044:exon_107100342_107101698:QRSL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 109762332 C/T 1 7 13 20 3.31054196328724 6.85185063960942 -3.54130867632218 T:C C T 10 0.527065433816109 0.122410043320359 ENSG00000185250:ENST00000440797:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000185250:ENST00000521072:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000185250:ENST00000368958:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109761966_109762374:SMPD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 109762588 G/T 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 T:G G T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109762560_109762656:SMPD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 109767931 C/T 1 51 14 65 24.1196628753784 7.37891607342553 16.7407468019529 T:C C T 10 0.527065433816109 2.79932824062242e-05 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 109775366 C/T 1 17 16 33 8.03988762512615 8.43304694105774 -0.393159315931598 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109775142_109775442:MICAL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 110146303 G/A 1 21 27 48 9.93162588986171 14.2307667130349 -4.29914082317323 A:G G A 10 0.527065433816109 0.247929025438883 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110146291_110146631:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110146291_110146634:FIG4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 111901453 G/T 1 6 5 11 2.83760739710335 2.63532716908055 0.202280228022801 T:G G T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000056972:ENST00000368761:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392555:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392556:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000359831:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000340026:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000532708:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000528599:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 116574455 G/A 1 13 13 26 6.14814936039058 6.85185063960942 -0.703701279218835 A:G G A 10 0.527065433816109 0.84562040810587 ENSG00000187189:ENST00000420283:exon_116571151_116575261:TSPYL4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 116575116 G/T 1 5 7 12 2.36467283091945 3.68945803671276 -1.32478520579331 T:G G T 10 0.527065433816109 0.566621218006073 ENSG00000187189:ENST00000420283:exon_116571151_116575261:TSPYL4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 116600774 C/G 1 28 14 42 13.2421678531489 7.37891607342553 5.86325177972342 C:G C G 10 0.527065433816109 0.0882399545178529 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 116600810 G/A 1 23 15 38 10.8774950222295 7.90598150724164 2.97151351498786 A:G G A 10 0.527065433816109 0.417054731193523 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 116973182 T/C 1 9 7 16 4.25641109565502 3.68945803671276 0.566953058942256 T:C T C 10 0.527065433816109 0.808175848721287 ENSG00000153975:ENST00000368576:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000368573:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000471919:exon_116973167_116973355:ZUFSP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 126249914 T/G 1 13 8 21 6.14814936039058 4.21652347052887 1.93162588986171 T:G T G 10 0.527065433816109 0.513458776648042 ENSG00000111912:ENST00000368357:exon_126249782_126252257:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000392477:exon_126249782_126252266:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000368353:exon_126249782_126252266:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000438495:exon_126249782_126252257:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000444128:exon_126249782_126252257:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000229634:exon_126249782_126252266:NCOA7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 126661502 G/T 1 38 47 85 17.9715135149879 24.7720753893571 -6.80056187436927 T:G G T 10 0.527065433816109 0.157862033350045 ENSG00000203760:ENST00000368326:exon_126661320_126661545:CENPW;ENSG00000203760:ENST00000368325:exon_126661320_126661590:CENPW;ENSG00000203760:ENST00000368328:exon_126661320_126661545:CENPW HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 133072650 A/G 1 10 14 24 4.72934566183891 7.37891607342553 -2.64957041158662 A:G A G 10 0.527065433816109 0.311132051737374 ENSG00000112303:ENST00000418593:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000326499:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000335846:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000422400:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000392389:exon_133072284_133072653:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525270:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525674:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000533835:exon_133072284_133072657:VNN2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 133135886 A/G 1 1047 486 1533 495.162490794534 256.153800834629 239.008689959905 A:G A G 10 0.527065433816109 3.30955055120181e-35 ENSG00000112306:ENST00000230050:exon_133135871_133135921:RPS12;ENSG00000112306:ENST00000484616:exon_133135871_133135921:RPS12 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 133138010 T/C 1 10 15 25 4.72934566183891 7.90598150724164 -3.17663584540273 T:C T C 10 0.527065433816109 0.232365445872985 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 113 0 113 53.4416059787797 0 53.4416059787797 T T 10 0.527065433816109 3.86412792911772e-32 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 135 0 135 63.8461664348253 0 63.8461664348253 A A 10 0.527065433816109 3.53956913172764e-38 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 135 0 135 63.8461664348253 0 63.8461664348253 A A 10 0.527065433816109 3.53956913172764e-38 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 136599202 C/G 0 67 0 67 31.6866159343207 0 31.6866159343207 C C 10 0.527065433816109 2.44018157678266e-19 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000533621:exon_136599003_136599241:BCLAF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 136599284 A/C 1 45 56 101 21.2820554782751 29.5156642937021 -8.23360881542701 A:C A C 10 0.527065433816109 0.110876915454524 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 89 1 90 42.0911763903663 0.527065433816109 41.5641109565502 T:G G T 10 0.527065433816109 8.49647062228078e-24 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 99 0 99 46.8205220522052 0 46.8205220522052 T T 10 0.527065433816109 3.30660272417108e-28 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 137519238 A/G 1 302 220 522 142.826238987535 115.954395439544 26.8718435479911 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0200882178178836 ENSG00000027697:ENST00000367739:exon_137518621_137519776:IFNGR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 139266402 G/A 1 11 10 21 5.2022802280228 5.27065433816109 -0.06837411013829 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000135597:ENST00000450536:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367672:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367668:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000409553:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367663:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000529597:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000445570:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000483468:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000409812:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000258062:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000415951:exon_139266356_139266509:REPS1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 139266776 A/G 1 20 14 34 9.45869132367782 7.37891607342553 2.07977525025229 A:G A G 10 0.527065433816109 0.497604517851488 ENSG00000135597:ENST00000450536:exon_139266638_139266834:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367672:exon_139266638_139266834:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367668:exon_139266638_139266834:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000409553:exon_139266638_139266834:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367663:exon_139266638_139266834:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000529597:exon_139266638_139266834:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000445570:exon_139266638_139266834:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000483468:exon_139266638_139266834:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000409812:exon_139266638_139266834:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000258062:exon_139266638_139266834:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000415951:exon_139266638_139266834:REPS1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 143382110 T/C 1 10 7 17 4.72934566183891 3.68945803671276 1.03988762512615 T:C T C 10 0.527065433816109 0.637665492029096 ENSG00000146416:ENST00000367601:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000419072:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000447498:exon_143381990_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000357847:exon_143382013_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000344492:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367598:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367596:exon_143382038_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000275235:exon_143382038_143382203:AIG1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 151686905 C/T 1 40 29 69 18.9173826473556 15.2848975806672 3.63248506668848 T:C C T 10 0.527065433816109 0.400927089395476 ENSG00000181472:ENST00000325144:exon_151685252_151688027:ZBTB2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 151726300 G/C 1 37 38 75 17.498578948804 20.0284864850121 -2.52990753620818 C:G G C 10 0.527065433816109 0.56547784657 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000336451:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151725990_151726402:RMND1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 151766397 G/A 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 A:G G A 10 0.527065433816109 0.729753293915306 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 152453291 G/A 1 10 6 16 4.72934566183891 3.16239260289665 1.56695305894226 A:G G A 10 0.527065433816109 0.465150778014472 ENSG00000131018:ENST00000478916:exon_152453257_152453349:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152453257_152453349:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152453257_152453349:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152453257_152453349:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152453257_152453349:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152453257_152453349:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152453257_152453349:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152453257_152453349:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152453257_152453349:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152453257_152453349:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152453257_152453349:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152453257_152453349:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152453257_152453349:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152453257_152453349:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000460912:exon_152453257_152453349:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152453257_152453349:SYNE1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 153296541 G/C 1 21 21 42 9.93162588986171 11.0683741101383 -1.13674822027658 C:G G C 10 0.527065433816109 0.758957157762768 ENSG00000112029:ENST00000229758:exon_153296042_153296756:FBXO5;ENSG00000112029:ENST00000367241:exon_153296042_153296756:FBXO5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 155575607 G/A 1 4 9 13 1.89173826473556 4.74358890434498 -2.85185063960942 A:G G A 10 0.527065433816109 0.163735013053684 ENSG00000146426:ENST00000461783:exon_155575553_155575707:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000318981:exon_155575553_155575707:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000456144:exon_155575553_155575707:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000367174:exon_155575553_155575707:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000360366:exon_155575553_155575707:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000529824:exon_155575553_155575707:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000528928:exon_155575553_155575707:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000528391:exon_155575553_155575707:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000456877:exon_155575553_155575707:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000275246:exon_155575553_155575707:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000462408:exon_155575553_155575707:TIAM2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 155577823 C/T 1 25 4 29 11.8233641545973 2.10826173526444 9.71510241933284 T:C C T 10 0.527065433816109 0.000249384270314561 ENSG00000146426:ENST00000461783:exon_155577618_155578854:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000318981:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000456144:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000367174:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000360366:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000529824:exon_155577618_155578324:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000528928:exon_155577618_155579221:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000528391:exon_155577594_155578324:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000456877:exon_155577618_155578334:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000275246:exon_155577618_155578354:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000462408:exon_155577618_155579216:TIAM2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 157528921 C/A 1 48 35 83 22.7008591768268 18.4472901835638 4.25356899326295 A:C C A 10 0.527065433816109 0.380108961415561 ENSG00000049618:ENST00000350026:exon_157527301_157530284:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000346085:exon_157527301_157529495:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000367148:exon_157527301_157530401:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000275248:exon_157527301_157530401:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000414678:exon_157527301_157530401:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000445852:exon_157527301_157529204:ARID1B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 159058767 C/A 1 6 10 16 2.83760739710335 5.27065433816109 -2.43304694105774 A:C C A 10 0.527065433816109 0.316907244333737 ENSG00000146425:ENST00000367088:exon_159057506_159058926:DYNLT1;ENSG00000146425:ENST00000367085:exon_159058252_159058926:DYNLT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 160505207 A/G 1 21 15 36 9.93162588986171 7.90598150724164 2.02564438262007 A:G A G 10 0.527065433816109 0.510707568161342 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160504982_160505216:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160504982_160505216:IGF2R HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 166736362 C/T 1 116 116 232 54.8604096773314 61.1395903226686 -6.27918064533729 T:C C T 10 0.527065433816109 0.43033419367251 ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166736345_166736374:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166736345_166738083:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000479490:exon_166736345_166738176:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166736345_166736374:SFT2D1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 170862300 G/C 1 134 126 260 63.3732318686414 66.4102446608297 -3.03701279218834 C:G G C 10 0.527065433816109 0.709892120194276 ENSG00000008018:ENST00000262193:exon_170862218_170862429:PSMB1;ENSG00000008018:ENST00000392093:exon_170862218_170862417:PSMB1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 170878793 T/C 1 6 7 13 2.83760739710335 3.68945803671276 -0.851850639609417 T:C T C 10 0.527065433816109 0.783042148004503 ENSG00000112592:ENST00000392091:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000392092:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000230354:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000446829:exon_170878700_170878828:TBP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 6 170892100 T/C 1 9 3 12 4.25641109565502 1.58119630144833 2.67521479420669 T:C T C 10 0.527065433816109 0.153067812973243 ENSG00000071994:ENST00000443345:exon_170890836_170892276:PDCD2;ENSG00000071994:ENST00000453163:exon_170890836_170892276:PDCD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 810219 T/C 1 11 4 15 5.2022802280228 2.10826173526444 3.09401849275836 T:C T C 10 0.527065433816109 0.126517172009480 ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000491496:exon_810108_812612:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_810108_810255:HEATR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 930689 C/T 1 48 63 111 22.7008591768268 33.2051223304149 -10.5042631535881 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0567939486798674 ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_930565_930703:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000412734:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000426056:exon_930565_930691:GET4;ENSG00000239857:ENST00000483469:exon_930565_930703:GET4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 940181 C/T 1 12 5 17 5.67521479420669 2.63532716908055 3.03988762512615 T:C C T 10 0.527065433816109 0.153398734504230 ENSG00000105963:ENST00000449296:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000265846:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000446141:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000478000:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000495809:exon_940170_941036:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000453175:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000437486:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000454383:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000453823:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000240230:ENST00000457254:exon_940170_940253:COX19 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 943868 G/A 1 8 3 11 3.78347652947113 1.58119630144833 2.2022802280228 A:G G A 10 0.527065433816109 0.234094659981005 ENSG00000105963:ENST00000449296:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000265846:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000446141:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000478000:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000453175:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000437486:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000454383:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000453823:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000481406:exon_943594_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000463358:exon_943789_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000477906:exon_943824_943909:ADAP1;ENSG00000240230:ENST00000457254:exon_943763_943909:COX19 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 1097394 T/C 1 3 8 11 1.41880369855167 4.21652347052887 -2.7977197719772 A:T:C T C 10 0.527065433816109 0.130149709511191 ENSG00000164849:ENST00000444847:exon_1097128_1098097:GPR146;ENSG00000164849:ENST00000397095:exon_1097128_1098894:GPR146;ENSG00000164849:ENST00000297468:exon_1097141_1098897:GPR146 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 1131411 C/T 1 9 14 23 4.25641109565502 7.37891607342553 -3.12250497777051 T:C C T 10 0.527065433816109 0.214605087918318 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000413368:exon_1131043_1131585:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER;ENSG00000164850:ENST00000354575:exon_1131365_1132285:GPER HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 1132153 G/A 1 27 11 38 12.7692332869651 5.7977197719772 6.97151351498786 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0332811013560006 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER;ENSG00000164850:ENST00000354575:exon_1131365_1132285:GPER HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 1132456 C/T 1 18 19 37 8.51282219131004 10.0142432425061 -1.50142105119603 T:C C T 10 0.527065433816109 0.626124356535162 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 1132505 G/A 1 18 26 44 8.51282219131004 13.7037012792188 -5.1908790879088 A:G G A 10 0.527065433816109 0.131777644537270 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 1195215 A/C 1 8 3 11 3.78347652947113 1.58119630144833 2.2022802280228 A:C A C 10 0.527065433816109 0.234094659981005 ENSG00000178381:ENST00000401903:exon_1195089_1195220:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000316495:exon_1195089_1195220:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000397083:exon_1195089_1195220:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000471448:exon_1195089_1195313:ZFAND2A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 1976457 C/T 1 23 30 53 10.8774950222295 15.8119630144833 -4.93446799225378 T:C C T 10 0.527065433816109 0.215358759931950 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000450235:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000437877:exon_1976323_1976533:MAD1L1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 2252886 C/T 1 14 6 20 6.62108392657447 3.16239260289665 3.45869132367782 T:C C T 10 0.527065433816109 0.177782475899471 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_2252847_2252908:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_2252847_2252908:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_2252847_2252908:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_2252847_2252908:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_2252847_2252908:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_2252847_2252908:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000486340:exon_2252847_2252908:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000469871:exon_2252847_2252908:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000445959:exon_2252847_2252908:MAD1L1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 2290522 C/T 1 73 57 130 34.524223331424 30.0427297275182 4.48149360390583 T:C C T 10 0.527065433816109 0.482410479859007 ENSG00000106268:ENST00000356714:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397049:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000447457:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397047:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397046:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397048:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000449983:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000343985:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000339737:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000431585:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000487426:exon_2290464_2290781:NUDT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 2394991 C/T 1 78 115 193 36.8888961623435 60.6125248888525 -23.723628726509 T:C C T 10 0.527065433816109 0.000675610812195049 ENSG00000106263:ENST00000431643:exon_2394869_2395055:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000360876:exon_2394501_2395055:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000413917:exon_2394869_2395055:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000397011:exon_2394517_2395055:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000314800:exon_2394557_2395055:EIF3B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 2577781 T/C 1 97 110 207 45.8746529198374 57.977197719772 -12.1025447999346 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0950687601693676 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 2578181 C/T 1 67 54 121 31.6866159343207 28.4615334260699 3.22508250825081 T:C C T 10 0.527065433816109 0.585626782960069 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 2578237 T/C 1 63 49 112 29.7948776695851 25.8262062569893 3.96867141259579 T:C T C 10 0.527065433816109 0.50790907013602 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 2578246 C/T 1 49 50 99 23.1737937430107 26.3532716908055 -3.1794779477948 T:C C T 10 0.527065433816109 0.546831567881593 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 2578371 G/A 1 37 42 79 17.498578948804 22.1367482202766 -4.63816927147261 A:G G A 10 0.527065433816109 0.311986191988147 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 2582907 C/T 1 25 8 33 11.8233641545973 4.21652347052887 7.6068406840684 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0084185450764372 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2582838_2582957:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2581754_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2581352_2583886:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000421712:exon_2582838_2582957:C7orf27 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 2752152 G/A 1 6 3 9 2.83760739710335 1.58119630144833 1.25641109565502 A:G G A 10 0.527065433816109 0.513555929047552 ENSG00000174945:ENST00000312371:exon_2751964_2756163:AMZ1;ENSG00000174945:ENST00000454653:exon_2751964_2755061:AMZ1;ENSG00000174945:ENST00000407112:exon_2751964_2752734:AMZ1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 4780514 G/T 1 8 12 20 3.78347652947113 6.32478520579331 -2.54130867632218 T:G G T 10 0.527065433816109 0.271710696844368 ENSG00000164916:ENST00000446823:exon_4780469_4780654:FOXK1;ENSG00000164916:ENST00000328914:exon_4780469_4780654:FOXK1;ENSG00000164916:ENST00000460979:exon_4780490_4780654:FOXK1;ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4780469_4780619:KIAA0415 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 4823971 C/T 1 12 16 28 5.67521479420669 8.43304694105774 -2.75783214685105 T:C C T 10 0.527065433816109 0.345892538884562 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000491375:exon_4823834_4824002:KIAA0415 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 4825307 T/A 1 38 17 55 17.9715135149879 8.96011237487385 9.011401140114 A:T T A 10 0.527065433816109 0.015097960602741 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4825153_4825315:KIAA0415 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 4825314 C/T 1 38 17 55 17.9715135149879 8.96011237487385 9.011401140114 T:C C T 10 0.527065433816109 0.015097960602741 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4825153_4825315:KIAA0415 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 5399044 C/G 1 11 16 27 5.2022802280228 8.43304694105774 -3.23076671303494 C:G C G 10 0.527065433816109 0.249321234596434 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000440081:exon_5399029_5399200:TNRC18 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 6189717 G/A 1 8 3 11 3.78347652947113 1.58119630144833 2.2022802280228 A:G G A 10 0.527065433816109 0.234094659981005 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6189214_6189933:USP42 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 6189750 C/T 1 14 4 18 6.62108392657447 2.10826173526444 4.51282219131004 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0352268999907301 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6189214_6189933:USP42 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 6189780 T/C 1 12 3 15 5.67521479420669 1.58119630144833 4.09401849275836 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0390849308207645 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6189214_6189933:USP42 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 6193464 T/G 1 9 9 18 4.25641109565502 4.74358890434498 -0.487177808689962 T:G T G 10 0.527065433816109 0.81881957561072 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193387_6193513:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 6194274 T/C 1 13 16 29 6.14814936039058 8.43304694105774 -2.28489758066716 T:C T C 10 0.527065433816109 0.458714620526297 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193813_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 7646651 G/T 1 48 47 95 22.7008591768268 24.7720753893571 -2.07121621253036 T:G G T 10 0.527065433816109 0.682322924823575 ENSG00000164654:ENST00000340080:exon_7646627_7647127:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000405785:exon_7646627_7646854:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000493227:exon_7646627_7648556:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000479694:exon_7646627_7648560:MIOS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 7646687 A/G 1 37 47 84 17.498578948804 24.7720753893571 -7.27349644055316 A:G A G 10 0.527065433816109 0.126006346323261 ENSG00000164654:ENST00000340080:exon_7646627_7647127:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000405785:exon_7646627_7646854:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000493227:exon_7646627_7648556:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000479694:exon_7646627_7648560:MIOS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 12728489 A/G 1 9 12 21 4.25641109565502 6.32478520579331 -2.06837411013829 A:G A G 10 0.527065433816109 0.390094196298263 ENSG00000122644:ENST00000396662:exon_12727791_12728804:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000356797:exon_12727791_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396664:exon_12727794_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396663:exon_12727791_12730559:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000404894:exon_12727794_12728539:ARL4A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 20201395 G/C 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 C:G G C 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20201371_20201493:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20201371_20201493:MACC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 21956405 G/A 1 4 6 10 1.89173826473556 3.16239260289665 -1.27065433816109 A:G G A 10 0.527065433816109 0.532268681489131 ENSG00000164649:ENST00000356195:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000406877:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000373934:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000405437:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000465490:exon_21956372_21956515:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000396561:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000447180:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000435031:exon_21956372_21956512:CDCA7L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 23545399 A/G 1 103 108 211 48.7122603169408 56.9230668521398 -8.210806535199 A:G A G 10 0.527065433816109 0.270279168073367 ENSG00000164548:ENST00000297071:exon_23545365_23545432:TRA2A;ENSG00000164548:ENST00000497730:exon_23545365_23545429:TRA2A;ENSG00000164548:ENST00000475970:exon_23545365_23545504:TRA2A;ENSG00000164548:ENST00000482395:exon_23545365_23545432:TRA2A;ENSG00000164548:ENST00000486934:exon_23545087_23545432:TRA2A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 24742436 T/C 1 107 144 251 50.6039985816763 75.8974224695197 -25.2934238878434 T:C T C 10 0.527065433816109 0.00153317839282651 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000479636:exon_24742379_24745656:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000430096:exon_24742046_24742452:DFNA5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 24758795 T/C 1 35 36 71 16.5527098164362 18.9743556173799 -2.42164580094374 T:C T C 10 0.527065433816109 0.634832853060882 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000414428:exon_24758694_24758837:DFNA5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 32598630 T/A 1 2 8 10 0.945869132367782 4.21652347052887 -3.27065433816109 A:T T A 10 0.527065433816109 0.0545836587495111 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000404479:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32598541_32599076:AVL9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 32908945 T/C 1 8 12 20 3.78347652947113 6.32478520579331 -2.54130867632218 T:C T C 10 0.527065433816109 0.271710696844368 ENSG00000170852:ENST00000304056:exon_32907784_32910492:KBTBD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 37298800 C/T 1 7 10 17 3.31054196328724 5.27065433816109 -1.96011237487385 T:C C T 10 0.527065433816109 0.467399584608424 ENSG00000155849:ENST00000361912:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000310758:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442573:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442504:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000474832:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000448602:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455119:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455879:exon_37298786_37298955:ELMO1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 38796570 G/A 1 6 5 11 2.83760739710335 2.63532716908055 0.202280228022801 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000006715:ENST00000310301:exon_38796438_38796582:VPS41;ENSG00000006715:ENST00000395969:exon_38796438_38796582:VPS41 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 43622806 T/C 1 86 81 167 40.6723726918146 42.6923001391048 -2.01992744729021 T:C T C 10 0.527065433816109 0.757259251560425 ENSG00000164543:ENST00000319357:exon_43622664_43623048:STK17A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 43846603 A/G 1 189 151 340 89.3846330087554 79.5868805062325 9.79775250252293 A:C:G A G 10 0.527065433816109 0.30223246300515 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43846576_43846938:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43846576_43846939:BLVRA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 44099664 T/C 1 124 114 238 58.6438862068025 60.0854594550364 -1.44157324823395 T:C T C 10 0.527065433816109 0.896736066041263 ENSG00000136279:ENST00000441840:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000448521:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000456905:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000440166:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000490734:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000498733:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452943:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000429716:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000468694:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000494774:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000411855:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000497184:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000432854:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000449997:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452661:exon_44099647_44099752:DBNL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 44112873 G/T 1 19 16 35 8.98575675749393 8.43304694105774 0.552709816436183 T:G G T 10 0.527065433816109 0.867565017882364 ENSG00000122678:ENST00000335195:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000242248:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000435068:exon_44111849_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000395831:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000458246:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000430942:exon_44111861_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000467607:exon_44112817_44112976:POLM HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 44120420 G/A 1 6 3 9 2.83760739710335 1.58119630144833 1.25641109565502 A:G G A 10 0.527065433816109 0.513555929047552 ENSG00000122678:ENST00000335195:exon_44120332_44120515:POLM;ENSG00000122678:ENST00000242248:exon_44120332_44120515:POLM;ENSG00000122678:ENST00000435068:exon_44120332_44120515:POLM;ENSG00000122678:ENST00000395831:exon_44120332_44120515:POLM;ENSG00000122678:ENST00000458246:exon_44120332_44120515:POLM;ENSG00000122678:ENST00000430942:exon_44120332_44120515:POLM;ENSG00000122678:ENST00000434229:exon_44120332_44120515:POLM;ENSG00000122678:ENST00000492605:exon_44120332_44120515:POLM;ENSG00000122678:ENST00000492312:exon_44120332_44120515:POLM;ENSG00000122678:ENST00000492321:exon_44120332_44120515:POLM;ENSG00000122678:ENST00000497300:exon_44120332_44120515:POLM;ENSG00000122678:ENST00000445616:exon_44120332_44120515:POLM;ENSG00000122678:ENST00000414235:exon_44120332_44120515:POLM;ENSG00000122678:ENST00000452049:exon_44120332_44120515:POLM;ENSG00000122678:ENST00000483644:exon_44120332_44120515:POLM HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 44800176 G/T 1 37 38 75 17.498578948804 20.0284864850121 -2.52990753620818 T:G G T 10 0.527065433816109 0.56547784657 ENSG00000122515:ENST00000413916:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000439149:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000309315:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000441627:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000433667:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000265346:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000414051:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000478045:exon_44799333_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000463056:exon_44799550_44800192:ZMIZ2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 45009723 G/A 1 133 107 240 62.9002973024575 56.3960014183237 6.50429588413382 A:C:G G A 10 0.527065433816109 0.437969460074132 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009639_45009753:MYO1G HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 45113170 G/A 1 65 56 121 30.7407468019529 29.5156642937021 1.22508250825081 A:G G A 10 0.527065433816109 0.855825374895588 ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000481194:exon_45109425_45114007:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000477605:exon_45113059_45113170:CCM2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 45139892 G/A 1 55 51 106 26.011401140114 26.8803371246216 -0.868935984507559 A:G G A 10 0.527065433816109 0.922586956181863 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45139741_45140025:TBRG4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 45148667 G/A 1 82 75 157 38.7806344270791 39.5299075362082 -0.74927310912912 A:G G A 10 0.527065433816109 0.936370055200072 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478532:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000461363:exon_45148426_45148682:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000471142:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000475893:exon_45148453_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000482285:exon_45148483_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495078:exon_45148527_45148886:TBRG4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 45148773 C/A 1 44 35 79 20.8091209120912 18.4472901835638 2.36183072852739 A:C C A 10 0.527065433816109 0.652703027428251 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478532:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000471142:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000475893:exon_45148453_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000482285:exon_45148483_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495078:exon_45148527_45148886:TBRG4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 50514313 T/C 1 7 7 14 3.31054196328724 3.68945803671276 -0.378916073425526 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000132436:ENST00000395556:exon_50511831_50514995:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000356889:exon_50511831_50514995:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000451252:exon_50511834_50515055:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000451735:exon_50511834_50515078:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000433017:exon_50512175_50514995:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000419119:exon_50512840_50514995:FIGNL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 56022813 C/T 1 143 113 256 67.6296429642964 59.5583940212203 8.07124894307609 T:C C T 10 0.527065433816109 0.317354837910742 ENSG00000249773:ENST00000426595:exon_56022602_56022932:RP11-15K19.2;ENSG00000239789:ENST00000285298:exon_56022602_56024192:MRPS17;ENSG00000239789:ENST00000443449:exon_56022602_56022865:MRPS17 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 63981563 A/G 1 5 6 11 2.36467283091945 3.16239260289665 -0.797719771977199 A:G A G 10 0.527065433816109 0.765666449819686 ENSG00000173041:ENST00000309683:exon_63980262_63982878:ZNF680 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 64169019 G/A 1 6 3 9 2.83760739710335 1.58119630144833 1.25641109565502 A:G G A 10 0.527065433816109 0.513555929047552 ENSG00000196247:ENST00000344930:exon_64166702_64171404:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000423627:exon_64166702_64171399:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000395391:exon_64166702_64171401:ZNF107 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 64291976 G/A 1 4 10 14 1.89173826473556 5.27065433816109 -3.37891607342553 A:G G A 10 0.527065433816109 0.10564189817501 ENSG00000197008:ENST00000307355:exon_64291829_64292580:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000494380:exon_64291829_64292181:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440155:exon_64291829_64292620:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440598:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000437743:exon_64291829_64294042:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000359735:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000430838:exon_64291829_64294054:ZNF138 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 64291987 G/A 1 10 5 15 4.72934566183891 2.63532716908055 2.09401849275836 A:G G A 10 0.527065433816109 0.312436282519101 ENSG00000197008:ENST00000307355:exon_64291829_64292580:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000494380:exon_64291829_64292181:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440155:exon_64291829_64292620:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440598:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000437743:exon_64291829_64294042:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000359735:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000430838:exon_64291829_64294054:ZNF138 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 64389067 G/A 1 4 5 9 1.89173826473556 2.63532716908055 -0.743588904344981 A:G G A 10 0.527065433816109 0.743612144716174 ENSG00000198039:ENST00000527278:exon_64388032_64389502:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000476120:exon_64388032_64389635:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000319636:exon_64388032_64389416:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000395375:exon_64388032_64391344:ZNF273 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 64389089 A/C 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 A:C A C 10 0.527065433816109 0.757490641773051 ENSG00000198039:ENST00000527278:exon_64388032_64389502:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000476120:exon_64388032_64389635:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000319636:exon_64388032_64389416:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000395375:exon_64388032_64391344:ZNF273 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 64451558 G/A 1 3 7 10 1.41880369855167 3.68945803671276 -2.27065433816109 A:G G A 10 0.527065433816109 0.207504053786451 ENSG00000213462:ENST00000394323:exon_64451187_64453792:ERV3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 64451656 G/A 1 1 7 8 0.472934566183891 3.68945803671276 -3.21652347052887 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0307713746552577 ENSG00000213462:ENST00000394323:exon_64451187_64453792:ERV3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 64863392 C/T 1 8 12 20 3.78347652947113 6.32478520579331 -2.54130867632218 T:C C T 10 0.527065433816109 0.271710696844368 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 64864607 G/A 1 10 16 26 4.72934566183891 8.43304694105774 -3.70370127921884 A:G G A 10 0.527065433816109 0.170685024102423 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 64864800 A/G 1 15 16 31 7.09401849275836 8.43304694105774 -1.33902844829938 A:G A G 10 0.527065433816109 0.720005693406807 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 65557564 C/T 1 50 43 93 23.6467283091945 22.6638136540927 0.982914655101858 T:C C T 10 0.527065433816109 0.917367197961824 ENSG00000126522:ENST00000304874:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000126522:ENST00000380839:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000126522:ENST00000395332:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000126522:ENST00000395331:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000126522:ENST00000493708:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000126522:ENST00000464970:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000249319:ENST00000450043:exon_65557544_65557650:AC068533.7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 65842128 G/A 1 3 8 11 1.41880369855167 4.21652347052887 -2.7977197719772 A:G G A 10 0.527065433816109 0.130149709511191 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 65842545 T/C 1 15 5 20 7.09401849275836 2.63532716908055 4.45869132367782 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0705444615831227 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 66459256 T/C 1 22 29 51 10.4045604560456 15.2848975806672 -4.88033712462156 T:C T C 10 0.527065433816109 0.206677853430802 ENSG00000126524:ENST00000246868:exon_66459199_66459328:SBDS;ENSG00000126524:ENST00000414306:exon_66459207_66459328:SBDS;ENSG00000126524:ENST00000454667:exon_66459207_66459328:SBDS;ENSG00000126524:ENST00000490953:exon_66459207_66459328:SBDS;ENSG00000126524:ENST00000463579:exon_66459207_66459353:SBDS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 70255022 G/C 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 C:G G C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000158321:ENST00000406775:exon_70254734_70257489:AUTS2;ENSG00000158321:ENST00000342771:exon_70254734_70258054:AUTS2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 72891754 C/T 1 31 32 63 14.6609715517006 16.8660938821155 -2.20512233041487 T:C C T 10 0.527065433816109 0.614942919159298 ENSG00000009954:ENST00000339594:exon_72891198_72892899:BAZ1B;ENSG00000009954:ENST00000404251:exon_72891198_72892899:BAZ1B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 73097654 C/T 1 47 44 91 22.2279246106429 23.1908790879088 -0.962954477265921 T:C C T 10 0.527065433816109 0.916465694159106 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30;ENSG00000071462:ENST00000464615:exon_73097355_73097713:WBSCR22 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 73151644 A/G 1 5 6 11 2.36467283091945 3.16239260289665 -0.797719771977199 A:G A G 10 0.527065433816109 0.765666449819686 ENSG00000106077:ENST00000497897:exon_73151551_73152065:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437775:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000357419:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000222800:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437891:exon_73151551_73151690:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000462381:exon_73151551_73151832:ABHD11 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 75959188 G/A 1 50 40 90 23.6467283091945 21.0826173526444 2.56411095655018 A:T:G G A 10 0.527065433816109 0.599587823961476 ENSG00000170027:ENST00000307630:exon_75956116_75959550:YWHAG;ENSG00000170027:ENST00000453207:exon_75958894_75959235:YWHAG HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 76062913 C/G 1 9 2 11 4.25641109565502 1.05413086763222 3.2022802280228 C:G C G 10 0.527065433816109 0.0696872224921074 ENSG00000188372:ENST00000336517:exon_76062787_76062964:ZP3;ENSG00000188372:ENST00000394857:exon_76062787_76062964:ZP3;ENSG00000188372:ENST00000416245:exon_76062787_76062964:ZP3;ENSG00000188372:ENST00000394860:exon_76062787_76062964:ZP3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 76111835 G/A 1 10 25 35 4.72934566183891 13.1766358454027 -8.44729018356382 A:G G A 10 0.527065433816109 0.00593611099119817 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000423646:exon_76111825_76111976:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000429179:exon_76111825_76111880:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000472426:exon_76111825_76111932:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 76112060 C/T 1 22 28 50 10.4045604560456 14.7578321468511 -4.35327169080545 T:C C T 10 0.527065433816109 0.257309426807562 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 77423574 G/A 1 44 36 80 20.8091209120912 18.9743556173799 1.83476529471128 A:G G A 10 0.527065433816109 0.737410813910484 ENSG00000135211:ENST00000257663:exon_77423045_77423740:TMEM60 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 89983808 T/G 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 T:G T G 10 0.527065433816109 0.757490641773051 ENSG00000105793:ENST00000426366:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000450619:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000453512:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000493392:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000417207:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_89983772_89983863:GTPBP10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 90014408 G/A 1 30 18 48 14.1880369855167 9.48717780868996 4.70085917682677 A:G G A 10 0.527065433816109 0.194550586676982 ENSG00000105793:ENST00000257659:exon_90014206_90015204:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_90014206_90020769:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_90014206_90020327:GTPBP10;ENSG00000157224:ENST00000422604:exon_90014206_90014552:CLDN12;ENSG00000157224:ENST00000416322:exon_90014206_90014552:CLDN12 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 92166253 G/C 1 13 21 34 6.14814936039058 11.0683741101383 -4.92022474974771 C:G G C 10 0.527065433816109 0.121002863813012 ENSG00000127993:ENST00000265732:exon_92166165_92166848:C7orf64;ENSG00000127993:ENST00000481551:exon_92163716_92167319:C7orf64 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 92734451 A/G 1 8 2 10 3.78347652947113 1.05413086763222 2.72934566183891 A:G A G 10 0.527065433816109 0.114525614534534 ENSG00000205413:ENST00000379958:exon_92728829_92735418:SAMD9;ENSG00000205413:ENST00000446617:exon_92731562_92735418:SAMD9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 92760502 G/A 1 98 93 191 46.3475874860213 49.0170853448981 -2.66949785887683 A:G G A 10 0.527065433816109 0.71747876546628 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 92760891 C/T 1 112 80 192 52.9686714125958 42.1652347052887 10.8034367073071 T:C C T 10 0.527065433816109 0.129018304569457 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000394472:exon_92760530_92761298:SAMD9L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 92762681 A/G 1 23 23 46 10.8774950222295 12.1225049777705 -1.24500995554101 A:C:G A G 10 0.527065433816109 0.76863739181059 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 92764776 T/C 1 10 7 17 4.72934566183891 3.68945803671276 1.03988762512615 T:C T C 10 0.527065433816109 0.637665492029096 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 92764982 C/T 1 16 7 23 7.56695305894226 3.68945803671276 3.87749502222949 T:C C T 10 0.527065433816109 0.1427729718521 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000394472:exon_92764833_92765284:SAMD9L HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 92985252 T/C 1 9 4 13 4.25641109565502 2.10826173526444 2.14814936039058 T:C T C 10 0.527065433816109 0.276012087147778 ENSG00000004766:ENST00000305866:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000441602:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000471188:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000474412:exon_92985203_92985390:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000443443:exon_92985203_92985498:CCDC132 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 95034775 G/C 1 11 17 28 5.2022802280228 8.96011237487385 -3.75783214685105 C:G G C 10 0.527065433816109 0.185940056269729 ENSG00000105854:ENST00000455123:exon_95034179_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000355659:exon_95034185_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000433091:exon_95034192_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000222572:exon_95034209_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000483292:exon_95034590_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000446142:exon_95034651_95034800:PON2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 96339061 C/T 1 163 122 285 77.0883342879742 64.3019829255653 12.7863513624089 T:C C T 10 0.527065433816109 0.138057623850865 ENSG00000127922:ENST00000466986:exon_96339000_96339124:SHFM1;ENSG00000127922:ENST00000417009:exon_96339000_96339173:SHFM1;ENSG00000127922:ENST00000444799:exon_96339000_96339170:SHFM1;ENSG00000127922:ENST00000449279:exon_96339000_96339192:SHFM1;ENSG00000127922:ENST00000488005:exon_96339000_96339163:SHFM1;ENSG00000127922:ENST00000413065:exon_96339000_96339163:SHFM1;ENSG00000127922:ENST00000248566:exon_96339000_96339203:SHFM1;ENSG00000127922:ENST00000476463:exon_96339000_96339185:SHFM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 97922851 C/T 1 9 6 15 4.25641109565502 3.16239260289665 1.09401849275836 T:C C T 10 0.527065433816109 0.615224246448703 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97920963_97922908:BAIAP2L1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 97933601 C/T 1 3 7 10 1.41880369855167 3.68945803671276 -2.27065433816109 T:C C T 10 0.527065433816109 0.207504053786451 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97933508_97933688:BAIAP2L1;ENSG00000006453:ENST00000480580:exon_97933508_97933677:BAIAP2L1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 97939818 G/A 1 6 7 13 2.83760739710335 3.68945803671276 -0.851850639609417 A:G G A 10 0.527065433816109 0.783042148004503 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97939757_97939904:BAIAP2L1;ENSG00000006453:ENST00000462558:exon_97939757_97939904:BAIAP2L1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 98645517 G/A 1 8 2 10 3.78347652947113 1.05413086763222 2.72934566183891 A:G G A 10 0.527065433816109 0.114525614534534 ENSG00000198742:ENST00000468960:exon_98645278_98645710:SMURF1;ENSG00000198742:ENST00000482799:exon_98645278_98645863:SMURF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 98984354 G/C 1 209 212 421 98.8433243324332 111.737871969015 -12.8945476365819 C:G G C 10 0.527065433816109 0.222356263528283 ENSG00000241685:ENST00000441989:exon_98984308_98984412:ARPC1A;ENSG00000241685:ENST00000432884:exon_98984308_98984412:ARPC1A;ENSG00000241685:ENST00000508211:exon_98984308_98984412:ARPC1A;ENSG00000130429:ENST00000443222:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000414376:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000252725:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000484600:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000455009:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000484375:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000418347:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000417330:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000431816:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000427217:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000458033:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000451682:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000451694:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000474880:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000445924:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000432343:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000493403:exon_98984308_98984412:ARPC1B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 99017737 G/A 1 18 20 38 8.51282219131004 10.5413086763222 -2.02848648501214 A:G G A 10 0.527065433816109 0.520721033667497 ENSG00000106246:ENST00000292478:exon_99014362_99017772:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000422429:exon_99016757_99017772:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000438524:exon_99016757_99017772:PTCD1;ENSG00000248919:ENST00000413834:exon_99017372_99017772:RP5-900K19.1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 99032517 G/A 1 4 7 11 1.89173826473556 3.68945803671276 -1.7977197719772 A:G G A 10 0.527065433816109 0.36886039388561 ENSG00000106246:ENST00000292478:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000422429:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000438524:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000485746:exon_99032413_99032642:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000430982:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000430029:exon_99032433_99032891:PTCD1;ENSG00000248919:ENST00000413834:exon_99032413_99032891:RP5-900K19.1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 99047978 T/C 1 17 16 33 8.03988762512615 8.43304694105774 -0.393159315931598 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000160917:ENST00000436336:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441811:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000292476:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000430038:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441580:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000412686:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000484112:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000452047:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000471455:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000440514:exon_99047948_99047994:CPSF4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 99050039 G/A 1 25 32 57 11.8233641545973 16.8660938821155 -5.04272972751822 A:G G A 10 0.527065433816109 0.187267991225713 ENSG00000106246:ENST00000482251:exon_99049991_99050232:PTCD1;ENSG00000160917:ENST00000436336:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441811:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000451876:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000292476:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441580:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000452047:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000471455:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000440514:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000465132:exon_99049991_99050887:CPSF4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 99055940 T/C 1 319 137 456 150.866126612661 72.2079644328069 78.6581621798543 T:C T C 10 0.527065433816109 7.31863626605034e-14 ENSG00000241468:ENST00000414062:exon_99055821_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000449683:exon_99055813_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000491560:exon_99055818_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000359832:exon_99055818_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000292475:exon_99055818_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000488775:exon_99055820_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000394186:exon_99055932_99055978:ATP5J2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 99081730 A/G 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000198556:ENST00000331410:exon_99081653_99081766:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000481472:exon_99081653_99081769:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000448667:exon_99081653_99081766:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000447047:exon_99081653_99081787:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000481108:exon_99081278_99081766:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000494186:exon_99081653_99081766:ZNF789 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 99091599 C/T 1 55 58 113 26.011401140114 30.5697951613343 -4.55839402122032 T:C C T 10 0.527065433816109 0.398074931123292 ENSG00000160908:ENST00000337673:exon_99090863_99092254:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000394177:exon_99090863_99092254:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000426306:exon_99090865_99092254:ZNF394 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 99669802 A/G 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000166526:ENST00000303915:exon_99669105_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000424697:exon_99667597_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000299667:exon_99667611_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000487620:exon_99667800_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000412947:exon_99669553_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000428683:exon_99669553_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000449785:exon_99669553_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000441298:exon_99669703_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000415068:exon_99669794_99669835:ZNF3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 100275862 G/A 1 305 312 617 144.245042686087 164.444415350626 -20.1993726645393 A:G G A 10 0.527065433816109 0.106832865124013 ENSG00000172354:ENST00000303210:exon_100275721_100275922:GNB2;ENSG00000172354:ENST00000451587:exon_100275721_100275922:GNB2;ENSG00000172354:ENST00000436220:exon_100275721_100275922:GNB2;ENSG00000172354:ENST00000424361:exon_100275721_100275922:GNB2;ENSG00000172354:ENST00000419828:exon_100275721_100275922:GNB2;ENSG00000172354:ENST00000427895:exon_100275721_100275922:GNB2;ENSG00000172354:ENST00000393926:exon_100275721_100275922:GNB2;ENSG00000172354:ENST00000431068:exon_100275721_100275920:GNB2;ENSG00000172354:ENST00000393924:exon_100275721_100275922:GNB2;ENSG00000172354:ENST00000469287:exon_100275721_100275922:GNB2;ENSG00000172354:ENST00000470354:exon_100275721_100275922:GNB2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 100280397 G/A 1 8 11 19 3.78347652947113 5.7977197719772 -2.01424324250607 A:G G A 10 0.527065433816109 0.369297985076747 ENSG00000146830:ENST00000275732:exon_100280213_100280400:GIGYF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 100731505 C/G 1 11 12 23 5.2022802280228 6.32478520579331 -1.12250497777051 C:G C G 10 0.527065433816109 0.680359986743593 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 100731829 T/C 1 22 21 43 10.4045604560456 11.0683741101383 -0.663813654092689 T:C T C 10 0.527065433816109 0.879376180264087 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 101916647 A/G 1 7 2 9 3.31054196328724 1.05413086763222 2.25641109565502 A:G A G 10 0.527065433816109 0.185447766343339 ENSG00000160967:ENST00000292538:exon_101916637_101916764:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000419439:exon_101916637_101916764:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000437600:exon_101916637_101916764:CUX1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 101917521 G/A 1 5 6 11 2.36467283091945 3.16239260289665 -0.797719771977199 A:G G A 10 0.527065433816109 0.765666449819686 ENSG00000160967:ENST00000292538:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000419439:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000437600:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000487284:exon_101917445_101917581:CUX1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 102098010 G/A 1 21 14 35 9.93162588986171 7.37891607342553 2.55270981643618 A:G G A 10 0.527065433816109 0.403531860603846 ENSG00000160993:ENST00000292566:exon_102096685_102098428:ALKBH4;ENSG00000160993:ENST00000490528:exon_102097281_102098428:ALKBH4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 102108532 G/A 1 8 16 24 3.78347652947113 8.43304694105774 -4.64957041158662 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0663902982699974 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102108509_102108634:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000463739:exon_102108509_102108634:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102108166_102109509:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000485808:exon_102108509_102108634:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000485417:exon_102108509_102108634:LRWD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 102112980 G/A 1 24 20 44 11.3504295884134 10.5413086763222 0.809120912091203 A:G G A 10 0.527065433816109 0.880472588106527 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102110189_102113613:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000488689:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000468175:exon_102112901_102113056:LRWD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 102760511 A/C 1 7 2 9 3.31054196328724 1.05413086763222 2.25641109565502 A:C A C 10 0.527065433816109 0.185447766343339 ENSG00000161048:ENST00000455523:exon_102760024_102760670:NAPEPLD;ENSG00000161048:ENST00000341533:exon_102760024_102760670:NAPEPLD;ENSG00000161048:ENST00000417955:exon_102760024_102760670:NAPEPLD;ENSG00000161048:ENST00000422589:exon_102760024_102760670:NAPEPLD;ENSG00000161048:ENST00000465647:exon_102760024_102760670:NAPEPLD;ENSG00000161048:ENST00000427257:exon_102760024_102760670:NAPEPLD HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 103838221 T/C 1 5 9 14 2.36467283091945 4.74358890434498 -2.37891607342553 T:C T C 10 0.527065433816109 0.284872281969498 ENSG00000164815:ENST00000297431:exon_103838173_103838247:ORC5;ENSG00000164815:ENST00000422497:exon_103838173_103838247:ORC5;ENSG00000164815:ENST00000447452:exon_103838173_103838247:ORC5;ENSG00000164815:ENST00000485726:exon_103838173_103838247:ORC5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 107559722 A/T 1 93 88 181 43.9829146551019 46.3817581758176 -2.39884352071574 A:T A T 10 0.527065433816109 0.765999750365635 ENSG00000091140:ENST00000205402:exon_107559639_107560360:DLD;ENSG00000091140:ENST00000415325:exon_107559639_107560038:DLD;ENSG00000091140:ENST00000417551:exon_107559639_107559828:DLD;ENSG00000091140:ENST00000440410:exon_107559639_107560158:DLD;ENSG00000091140:ENST00000437604:exon_107559639_107560100:DLD HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 108119731 G/A 1 3 9 12 1.41880369855167 4.74358890434498 -3.32478520579331 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0800200924234215 ENSG00000135241:ENST00000426128:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000257694:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000388728:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000422087:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000453144:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000436062:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000453085:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000481225:exon_108119628_108119756:PNPLA8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 112096073 T/C 1 6 8 14 2.83760739710335 4.21652347052887 -1.37891607342553 T:C T C 10 0.527065433816109 0.59467204210446 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112096057_112096141:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000443101:exon_112096057_112096128:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112096057_112096141:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000429071:exon_112096057_112096141:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000476927:exon_112096057_112096141:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000440625:exon_112096057_112096141:IFRD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 115897392 G/C 1 40 32 72 18.9173826473556 16.8660938821155 2.05128876524015 C:G G C 10 0.527065433816109 0.639248762605829 ENSG00000135269:ENST00000358204:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000492891:exon_115897348_115897722:TES;ENSG00000135269:ENST00000257721:exon_115897348_115898835:TES;ENSG00000135269:ENST00000393481:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000496912:exon_115897348_115897630:TES HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 117825681 A/G 1 6 9 15 2.83760739710335 4.74358890434498 -1.90598150724164 A:G A G 10 0.527065433816109 0.439435430476406 ENSG00000128534:ENST00000422760:exon_117824210_117825748:NAA38 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 120610901 C/T 1 7 11 18 3.31054196328724 5.7977197719772 -2.48717780868996 T:C C T 10 0.527065433816109 0.249990861970352 ENSG00000071243:ENST00000315870:exon_120610742_120610934:ING3;ENSG00000071243:ENST00000427726:exon_120610742_120610934:ING3;ENSG00000071243:ENST00000431467:exon_120610742_120610934:ING3;ENSG00000071243:ENST00000497502:exon_120610742_120610934:ING3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 127222521 G/A 1 14 10 24 6.62108392657447 5.27065433816109 1.35042958841338 A:G G A 10 0.527065433816109 0.68432289568664 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127220672_127223363:GCC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 127721507 T/C 1 83 105 188 39.253568993263 55.3418705506914 -16.0883015574285 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0194276869567922 ENSG00000197157:ENST00000438400:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000354725:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000486037:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000470463:exon_127721412_127721553:SND1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 127965924 T/G 1 8 6 14 3.78347652947113 3.16239260289665 0.621083926574474 T:G T G 10 0.527065433816109 0.794786264772641 ENSG00000106344:ENST00000223073:exon_127965871_127965944:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000415472:exon_127965871_127965944:RBM28 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 128388648 G/A 1 8 5 13 3.78347652947113 2.63532716908055 1.14814936039058 A:G G A 10 0.527065433816109 0.588366380954527 ENSG00000128595:ENST00000249364:exon_128388627_128388858:CALU;ENSG00000128595:ENST00000449187:exon_128388627_128388858:CALU;ENSG00000128595:ENST00000479257:exon_128388627_128388858:CALU;ENSG00000128595:ENST00000342367:exon_128388627_128388858:CALU HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 128409225 A/G 1 12 13 25 5.67521479420669 6.85185063960942 -1.17663584540273 A:G A G 10 0.527065433816109 0.691622871057986 ENSG00000128595:ENST00000249364:exon_128409117_128411528:CALU;ENSG00000128595:ENST00000449187:exon_128409117_128410630:CALU;ENSG00000128595:ENST00000479257:exon_128409117_128409990:CALU;ENSG00000128595:ENST00000342367:exon_128409117_128410630:CALU;ENSG00000128595:ENST00000493278:exon_128409117_128409250:CALU HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 128607384 G/A 1 33 32 65 15.6068406840684 16.8660938821155 -1.25925319804709 A:G G A 10 0.527065433816109 0.804301015458133 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128607334_128607446:TNPO3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 128641226 G/C 1 3 7 10 1.41880369855167 3.68945803671276 -2.27065433816109 C:G G C 10 0.527065433816109 0.207504053786451 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128641113_128641288:TNPO3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 133580447 G/A 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133580352_133580488:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000469115:exon_133580352_133580489:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000482089:exon_133580352_133580489:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000460346:exon_133580352_133580488:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000472020:exon_133580352_133580488:EXOC4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 134849213 G/A 1 20 5 25 9.45869132367782 2.63532716908055 6.82336415459727 A:G G A 10 0.527065433816109 0.00793196247949601 ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140;ENSG00000146859:ENST00000456488:exon_134849194_134849481:TMEM140 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 134849577 A/C 1 27 19 46 12.7692332869651 10.0142432425061 2.75499004445898 A:C A C 10 0.527065433816109 0.462107335664755 ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 134871775 C/T 1 17 37 54 8.03988762512615 19.501421051196 -11.4615334260699 T:C C T 10 0.527065433816109 0.00239255310486761 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134871724_134871861:WDR91 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 134879830 G/A 1 19 19 38 8.98575675749393 10.0142432425061 -1.02848648501215 A:G G A 10 0.527065433816109 0.748251620330117 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134879814_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000479698:exon_134879686_134879836:WDR91 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 134882901 G/T 1 23 16 39 10.8774950222295 8.43304694105774 2.44444808117175 T:G G T 10 0.527065433816109 0.521907979788335 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134882745_134882903:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134882745_134882903:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134882745_134882903:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134881796_134882903:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134882745_134882903:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000485942:exon_134882745_134882903:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000431482:exon_134882697_134882903:WDR91 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 134889141 G/A 1 14 13 27 6.62108392657447 6.85185063960942 -0.230766713034944 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000485942:exon_134889020_134889217:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000431482:exon_134889020_134889185:WDR91 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 135329690 T/C 1 32 36 68 15.1339061178845 18.9743556173799 -3.84044949949541 T:C T C 10 0.527065433816109 0.395689797058548 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000477620:exon_135329643_135329726:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000461255:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000490439:exon_135329647_135329766:NUP205 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 137600690 C/T 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000182158:ENST00000330387:exon_137600583_137600758:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000456390:exon_137600583_137600758:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000452463:exon_137600583_137600758:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000458726:exon_137600583_137600758:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000417785:exon_137600583_137600758:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000420629:exon_137600583_137600758:CREB3L2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 138761034 G/C 1 16 12 28 7.56695305894226 6.32478520579331 1.24216785314895 C:G G C 10 0.527065433816109 0.707378189652233 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000471652:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000460845:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 138764233 C/T 1 4 7 11 1.89173826473556 3.68945803671276 -1.7977197719772 T:C C T 10 0.527065433816109 0.36886039388561 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138763850_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000471652:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 139026152 T/G 1 26 13 39 12.2962987207812 6.85185063960942 5.44444808117175 T:G T G 10 0.527065433816109 0.107658656255069 ENSG00000164898:ENST00000297534:exon_139025878_139026268:C7orf55 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 139102490 A/G 1 9 4 13 4.25641109565502 2.10826173526444 2.14814936039058 A:G A G 10 0.527065433816109 0.276012087147778 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 139102498 A/T 1 8 5 13 3.78347652947113 2.63532716908055 1.14814936039058 A:T A T 10 0.527065433816109 0.588366380954527 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 141364712 G/A 1 6 2 8 2.83760739710335 1.05413086763222 1.78347652947113 A:G G A 10 0.527065433816109 0.29481715391141 ENSG00000127359:ENST00000297761:exon_141364704_141364854:KIAA1147;ENSG00000127359:ENST00000482493:exon_141364704_141364854:KIAA1147 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 1 382 1 383 180.661004282246 0.527065433816109 180.13393884843 T:C T C 10 0.527065433816109 1.16835829697450e-104 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 143086010 C/T 1 155 125 280 73.3048577585031 65.8831792270136 7.42167853148948 A:T:C C T 10 0.527065433816109 0.402167017133354 ENSG00000159840:ENST00000322764:exon_143085860_143086038:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000404957:exon_143085860_143086038:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000449423:exon_143085860_143086038:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000354434:exon_143085860_143086038:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000392910:exon_143085860_143086038:ZYX HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 148506363 T/G 1 6 6 12 2.83760739710335 3.16239260289665 -0.324785205793308 T:G T G 10 0.527065433816109 1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 149152906 G/A 1 20 7 27 9.45869132367782 3.68945803671276 5.76923328696506 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0326468428128768 ENSG00000196453:ENST00000247930:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000314683:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000440594:exon_149152268_149153128:ZNF777 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 150068605 G/A 1 94 48 142 44.4558492212858 25.2991408231732 19.1567083981125 A:G G A 10 0.527065433816109 0.00133775784633245 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 150068620 C/T 1 86 38 124 40.6723726918146 20.0284864850121 20.6438862068025 T:C C T 10 0.527065433816109 0.000202591107407938 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 150093701 A/C 1 15 12 27 7.09401849275836 6.32478520579331 0.769233286965056 A:C A C 10 0.527065433816109 0.848360844335184 ENSG00000196456:ENST00000478789:exon_150093601_150094003:ZNF775;ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775;ENSG00000196456:ENST00000490973:exon_150093601_150094067:ZNF775 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 150217309 C/T 1 16 20 36 7.56695305894226 10.5413086763222 -2.97435561737993 A:T:C C T 10 0.527065433816109 0.404326898078554 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 150324825 C/T 1 11 13 24 5.2022802280228 6.85185063960942 -1.64957041158662 T:C C T 10 0.527065433816109 0.544155066076199 ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000493969:exon_150324764_150325376:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000438845:exon_150324807_150325810:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000435189:exon_150324807_150325376:GIMAP6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 150325175 C/T 1 6 10 16 2.83760739710335 5.27065433816109 -2.43304694105774 T:C C T 10 0.527065433816109 0.316907244333737 ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000493969:exon_150324764_150325376:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000438845:exon_150324807_150325810:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000435189:exon_150324807_150325376:GIMAP6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 150389677 G/C 1 22 41 63 10.4045604560456 21.6096827864605 -11.2051223304149 C:G G C 10 0.527065433816109 0.00525477745367586 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 150733025 T/A 1 4 7 11 1.89173826473556 3.68945803671276 -1.7977197719772 A:T T A 10 0.527065433816109 0.36886039388561 ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482309:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000470645:exon_150732668_150733257:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000466514:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477719:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477092:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000491920:exon_150732969_150733054:ABCB8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 150763655 T/A 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 A:T T A 10 0.527065433816109 0.488810537661758 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150763604_150763848:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150763604_150763848:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150763604_150763848:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150763604_150763848:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150763604_150763848:SLC4A2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 150765065 T/C 1 4 8 12 1.89173826473556 4.21652347052887 -2.32478520579331 T:C T C 10 0.527065433816109 0.248670873824186 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150764961_150765141:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150764961_150765141:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150764961_150765141:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150764961_150765141:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150764961_150765141:SLC4A2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 150912750 G/T 1 25 33 58 11.8233641545973 17.3931593159316 -5.56979516133432 T:G G T 10 0.527065433816109 0.149901890727843 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150912690_150912818:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150912690_150912818:ABCF2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 150912786 T/C 1 26 33 59 12.2962987207812 17.3931593159316 -5.09686059515043 T:C T C 10 0.527065433816109 0.194176796417611 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150912690_150912818:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150912690_150912818:ABCF2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 150916228 G/A 1 26 35 61 12.2962987207812 18.4472901835638 -6.15099146278265 A:G G A 10 0.527065433816109 0.124631209336657 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000473874:exon_150916150_150916245:ABCF2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 150931268 C/G 1 45 43 88 21.2820554782751 22.6638136540927 -1.38175817581759 C:G C G 10 0.527065433816109 0.831108905127244 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150931172_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150929585_150931360:CHPF2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 150934975 C/G 1 109 92 201 51.5498677140441 48.490019911082 3.05984780296208 A:C:G C G 10 0.527065433816109 0.672461338350058 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150934460_150935905:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150934460_150935359:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150934460_150935908:CHPF2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 150935430 G/C 1 82 103 185 38.7806344270791 54.2877396830592 -15.5071052559802 C:G G C 10 0.527065433816109 0.0269118585258464 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150934460_150935905:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150934460_150935908:CHPF2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 151818777 T/C 1 9 6 15 4.25641109565502 3.16239260289665 1.09401849275836 T:C T C 10 0.527065433816109 0.615224246448703 ENSG00000178234:ENST00000430044:exon_151818631_151819425:GALNT11;ENSG00000178234:ENST00000443352:exon_151818631_151819425:GALNT11;ENSG00000178234:ENST00000434507:exon_151818631_151819245:GALNT11;ENSG00000178234:ENST00000320311:exon_151818631_151819245:GALNT11;ENSG00000178234:ENST00000452146:exon_151818631_151820172:GALNT11 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 157000176 T/C 1 15 13 28 7.09401849275836 6.85185063960942 0.242167853148946 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000009335:ENST00000348165:exon_157000092_157000249:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000435332:exon_157000092_157000249:UBE3C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 158526880 G/A 1 24 30 54 11.3504295884134 15.8119630144833 -4.46153342606989 A:G G A 10 0.527065433816109 0.275473216814721 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158523686_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158523689_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158523689_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158526140_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158526302_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158526304_158526943:ESYT2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 158528233 A/G 1 20 19 39 9.45869132367782 10.0142432425061 -0.555551918828254 A:G A G 10 0.527065433816109 0.87396986201025 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158528194_158528299:ESYT2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 158534381 G/C 1 19 21 40 8.98575675749393 11.0683741101383 -2.08261735264436 C:G G C 10 0.527065433816109 0.530180704004301 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 158536267 T/C 1 22 5 27 10.4045604560456 2.63532716908055 7.76923328696506 T:C T C 10 0.527065433816109 0.00310196395737277 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 158536334 G/A 1 12 7 19 5.67521479420669 3.68945803671276 1.98575675749393 A:G G A 10 0.527065433816109 0.491846751029638 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 7 158536345 A/G 1 13 7 20 6.14814936039058 3.68945803671276 2.45869132367782 A:G A G 10 0.527065433816109 0.371081802214505 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 623593 G/A 1 64 56 120 30.267812235769 29.5156642937021 0.752147942066916 A:T:G G A 10 0.527065433816109 0.927299181210367 ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000522893:exon_623289_623657:ERICH1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 6302183 G/C 1 14 20 34 6.62108392657447 10.5413086763222 -3.92022474974771 C:G G C 10 0.527065433816109 0.228892942719341 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 6302671 C/T 1 15 19 34 7.09401849275836 10.0142432425061 -2.92022474974771 T:C C T 10 0.527065433816109 0.3909112203143 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 6302971 C/T 1 21 13 34 9.93162588986171 6.85185063960942 3.07977525025229 T:C C T 10 0.527065433816109 0.308163033725043 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 6478986 C/T 1 10 7 17 4.72934566183891 3.68945803671276 1.03988762512615 T:C C T 10 0.527065433816109 0.637665492029096 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521129:exon_6478975_6479142:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 6479042 C/T 1 7 7 14 3.31054196328724 3.68945803671276 -0.378916073425526 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521129:exon_6478975_6479142:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 6479178 C/A 1 15 4 19 7.09401849275836 2.10826173526444 4.98575675749393 A:C C A 10 0.527065433816109 0.0224980824685121 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 6500544 C/T 1 14 10 24 6.62108392657447 5.27065433816109 1.35042958841338 T:C C T 10 0.527065433816109 0.68432289568664 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6500515_6501144:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6500515_6506026:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6500515_6500891:MCPH1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 11406593 T/C 1 38 51 89 17.9715135149879 26.8803371246216 -8.90882360963371 A:T:C T C 10 0.527065433816109 0.0705818980116638 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000533828:exon_11406533_11406612:BLK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 11418773 C/T 1 16 14 30 7.56695305894226 7.37891607342553 0.188036985516729 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000136573:ENST00000526097:exon_11417842_11418961:BLK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 11667179 C/T 1 101 104 205 47.766391184573 54.8148051168753 -7.04841393230235 T:C C T 10 0.527065433816109 0.328355440996469 ENSG00000079459:ENST00000530337:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529464:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000531733:exon_11667176_11667485:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000531249:exon_11667176_11667448:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000532266:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11666765_11667359:FDFT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 11689119 G/C 1 275 219 494 130.05700570057 115.427330005728 14.6296756948421 A:C:G G C 10 0.527065433816109 0.191528011338974 ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11689027_11689176:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529521:exon_11689027_11689303:FDFT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 11706581 T/G 1 6 5 11 2.83760739710335 2.63532716908055 0.202280228022801 T:G T G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532409:exon_11706555_11707087:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533110:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534636:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533572:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530296:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525076:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526195:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527243:exon_11706570_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534149:exon_11706571_11706673:CTSB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 11710888 G/C 1 10 5 15 4.72934566183891 2.63532716908055 2.09401849275836 C:G G C 10 0.527065433816109 0.312436282519101 ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11710838_11711023:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000415599:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531551:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534636:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533572:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530296:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525076:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526195:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527243:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534149:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526645:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525315:exon_11710838_11710971:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530573:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532370:exon_11710838_11711328:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000505496:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000524500:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531502:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527215:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532656:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534382:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000528965:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000524654:exon_11710867_11710988:CTSB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 17796373 C/T 1 2 8 10 0.945869132367782 4.21652347052887 -3.27065433816109 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0545836587495111 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518537:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523055:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518985:exon_17796348_17796525:PCM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 17796382 A/G 1 8 2 10 3.78347652947113 1.05413086763222 2.72934566183891 A:G A G 10 0.527065433816109 0.114525614534534 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518537:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523055:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518985:exon_17796348_17796525:PCM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 17796383 C/T 1 8 2 10 3.78347652947113 1.05413086763222 2.72934566183891 T:C C T 10 0.527065433816109 0.114525614534534 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518537:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523055:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518985:exon_17796348_17796525:PCM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 17814915 A/G 1 12 5 17 5.67521479420669 2.63532716908055 3.03988762512615 A:G A G 10 0.527065433816109 0.153398734504230 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17814773_17814930:PCM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 17819572 C/T 1 9 12 21 4.25641109565502 6.32478520579331 -2.06837411013829 T:C C T 10 0.527065433816109 0.390094196298263 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517836:exon_17819543_17819722:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518762:exon_17819543_17819683:PCM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 17927327 T/C 1 60 63 123 28.3760739710335 33.2051223304149 -4.82904835938141 T:C T C 10 0.527065433816109 0.416669978840093 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17927301_17927387:ASAH1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 17928811 C/T 1 40 29 69 18.9173826473556 15.2848975806672 3.63248506668848 T:C C T 10 0.527065433816109 0.400927089395476 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17928809_17928899:ASAH1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 21766900 G/A 1 11 32 43 5.2022802280228 16.8660938821155 -11.6638136540927 A:G G A 10 0.527065433816109 0.000363198530668701 ENSG00000147443:ENST00000276420:exon_21766384_21767442:DOK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 21767275 C/G 1 13 26 39 6.14814936039058 13.7037012792188 -7.55555191882825 C:G C G 10 0.527065433816109 0.0162634534086256 ENSG00000147443:ENST00000276420:exon_21766384_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000524001:exon_21766975_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000517422:exon_21767126_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000518197:exon_21767146_21767442:DOK2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 21862551 A/G 1 20 19 39 9.45869132367782 10.0142432425061 -0.555551918828254 A:G A G 10 0.527065433816109 0.87396986201025 ENSG00000130227:ENST00000434536:exon_21862506_21864095:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000252512:exon_21862506_21864096:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000433566:exon_21862506_21864095:XPO7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 21964944 C/A 1 27 19 46 12.7692332869651 10.0142432425061 2.75499004445898 A:C C A 10 0.527065433816109 0.462107335664755 ENSG00000173566:ENST00000522405:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000309188:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000521807:exon_21964385_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000420897:exon_21964454_21965857:NUDT18 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 22428708 A/G 1 8 8 16 3.78347652947113 4.21652347052887 -0.433046941057745 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000120896:ENST00000240123:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000434297:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000517535:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000428103:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000523965:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000521554:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000443610:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000523348:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000517962:exon_22428457_22428734:SORBS3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 22481449 A/G 1 42 36 78 19.8632517797234 18.9743556173799 0.888896162343496 A:G A G 10 0.527065433816109 0.90985743704415 ENSG00000147439:ENST00000276416:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000520489:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519513:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000399977:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519335:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519863:exon_22481428_22481562:BIN3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 22864622 T/C 1 11 4 15 5.2022802280228 2.10826173526444 3.09401849275836 T:C T C 10 0.527065433816109 0.126517172009480 ENSG00000008853:ENST00000519685:exon_22864241_22865259:RHOBTB2;ENSG00000008853:ENST00000522948:exon_22864241_22865259:RHOBTB2;ENSG00000008853:ENST00000251822:exon_22864241_22865259:RHOBTB2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 22880162 G/C 1 38 26 64 17.9715135149879 13.7037012792188 4.26781223576902 C:G G C 10 0.527065433816109 0.317551366318366 ENSG00000120889:ENST00000523752:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22879824_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22879987_22880497:TNFRSF10B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 23290451 C/T 1 7 12 19 3.31054196328724 6.32478520579331 -3.01424324250607 T:C C T 10 0.527065433816109 0.176593061472052 ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23286665_23290667:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000522255:exon_23290159_23290667:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23290439_23290667:ENTPD4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 23292985 A/G 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000197217:ENST00000518471:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000356206:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000521321:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000523958:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000522913:exon_23292905_23292990:ENTPD4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 23429037 A/C 1 8 7 15 3.78347652947113 3.68945803671276 0.0940184927583645 A:C A C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000147454:ENST00000519973:exon_23428848_23432976:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000290075:exon_23428848_23429716:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518881:exon_23428848_23429734:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523930:exon_23428988_23429371:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523883:exon_23428848_23429716:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000522164:exon_23428848_23429103:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000521637:exon_23428848_23429103:SLC25A37 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 25364331 G/A 1 27 36 63 12.7692332869651 18.9743556173799 -6.20512233041487 A:G G A 10 0.527065433816109 0.130364472213093 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 27255080 A/G 1 30 13 43 14.1880369855167 6.85185063960942 7.33618634590731 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0314614184743589 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 27255128 T/C 1 26 14 40 12.2962987207812 7.37891607342553 4.91738264735564 T:C T C 10 0.527065433816109 0.153412291699272 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 27255146 G/A 1 26 14 40 12.2962987207812 7.37891607342553 4.91738264735564 A:G G A 10 0.527065433816109 0.153412291699272 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 27255263 A/G 1 29 23 52 13.7151024193328 12.1225049777705 1.59259744156233 A:G A G 10 0.527065433816109 0.679527476175954 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 27277537 G/A 1 8 16 24 3.78347652947113 8.43304694105774 -4.64957041158662 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0663902982699974 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27277412_27277590:PTK2B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 27293865 C/T 1 41 44 85 19.3903172135395 23.1908790879088 -3.80056187436927 T:C C T 10 0.527065433816109 0.447558055434526 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27293768_27293865:PTK2B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 27301725 C/G 1 62 65 127 29.3219431034012 34.2592531980471 -4.93731009464585 C:G C G 10 0.527065433816109 0.423951943136938 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27301723_27301788:PTK2B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 27308585 A/C 1 91 72 163 43.0370455227341 37.9487112347598 5.08833428797423 A:T:C A C 10 0.527065433816109 0.433948349568761 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27308560_27308595:PTK2B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 27401964 A/C 1 24 10 34 11.3504295884134 5.27065433816109 6.07977525025229 A:C A C 10 0.527065433816109 0.0396744208926045 ENSG00000120915:ENST00000521400:exon_27401961_27403081:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000517536:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000521780:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000380476:exon_27401961_27402430:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000458037:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000415449:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000518379:exon_27401961_27402409:EPHX2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 28196783 C/G 1 67 58 125 31.6866159343207 30.5697951613343 1.11682077298637 C:G C G 10 0.527065433816109 0.858288982586286 ENSG00000168081:ENST00000518479:exon_28196557_28196893:PNOC;ENSG00000168081:ENST00000301908:exon_28196557_28197008:PNOC;ENSG00000168081:ENST00000519592:exon_28196557_28197725:PNOC;ENSG00000168081:ENST00000522209:exon_28196557_28197008:PNOC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 28206275 G/C 1 25 24 49 11.8233641545973 12.6495704115866 -0.826206256989343 C:G G C 10 0.527065433816109 0.886526711460922 ENSG00000186918:ENST00000344423:exon_28203102_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000520535:exon_28205795_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523202:exon_28206046_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523095:exon_28206076_28206347:ZNF395;ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28205804_28206347:FBXO16 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 31024638 C/T 1 5 10 15 2.36467283091945 5.27065433816109 -2.90598150724164 T:C C T 10 0.527065433816109 0.194890792920314 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_31024538_31024746:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_31024538_31024746:WRN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 31024654 T/C 1 10 6 16 4.72934566183891 3.16239260289665 1.56695305894226 T:C T C 10 0.527065433816109 0.465150778014472 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_31024538_31024746:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_31024538_31024746:WRN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 31030535 C/T 1 24 20 44 11.3504295884134 10.5413086763222 0.809120912091203 T:C C T 10 0.527065433816109 0.880472588106527 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_31030511_31031285:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_31030511_31031279:WRN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 33246538 A/G 1 3 11 14 1.41880369855167 5.7977197719772 -4.37891607342553 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0288253172835926 ENSG00000172728:ENST00000327671:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000380081:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518672:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000517942:exon_33246481_33246768:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000524021:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000520767:exon_33246414_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000335589:exon_33246433_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518076:exon_33246481_33247316:FUT10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 33246591 G/C 1 6 11 17 2.83760739710335 5.7977197719772 -2.96011237487385 C:G G C 10 0.527065433816109 0.223637867238073 ENSG00000172728:ENST00000327671:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000380081:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518672:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000517942:exon_33246481_33246768:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000524021:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000520767:exon_33246414_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000335589:exon_33246433_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518076:exon_33246481_33247316:FUT10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 33246685 G/A 1 2 9 11 0.945869132367782 4.74358890434498 -3.7977197719772 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0310731489114619 ENSG00000172728:ENST00000327671:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000380081:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518672:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000517942:exon_33246481_33246768:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000524021:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000520767:exon_33246414_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000335589:exon_33246433_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518076:exon_33246481_33247316:FUT10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 33356074 A/G 1 7 8 15 3.31054196328724 4.21652347052887 -0.905981507241636 A:G A G 10 0.527065433816109 0.797198000532565 ENSG00000198042:ENST00000360128:exon_33355950_33358687:MAK16;ENSG00000198042:ENST00000518389:exon_33355950_33356164:MAK16 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 33369944 T/C 1 11 8 19 5.2022802280228 4.21652347052887 0.985756757493928 T:C T C 10 0.527065433816109 0.819106308579823 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 33369994 A/G 1 9 14 23 4.25641109565502 7.37891607342553 -3.12250497777051 A:G A G 10 0.527065433816109 0.214605087918318 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 37635649 A/G 1 26 26 52 12.2962987207812 13.7037012792188 -1.40740255843767 A:G A G 10 0.527065433816109 0.78155462222789 ENSG00000147471:ENST00000328195:exon_37635491_37637283:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000437582:exon_37635491_37637285:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000521494:exon_37635491_37635880:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000517377:exon_37635491_37635918:PROSC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 38095662 C/T 1 4 7 11 1.89173826473556 3.68945803671276 -1.7977197719772 T:C C T 10 0.527065433816109 0.36886039388561 ENSG00000085788:ENST00000397166:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000519857:exon_38095607_38096576:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000526237:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000532222:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000520272:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000319246:exon_38095607_38095727:DDHD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 38677932 A/G 1 14 13 27 6.62108392657447 6.85185063960942 -0.230766713034944 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520340:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518415:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522904:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520973:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38677348_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521866:exon_38677439_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38677850_38678153:TACC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 38684853 T/C 1 8 4 12 3.78347652947113 2.10826173526444 1.67521479420669 T:C T C 10 0.527065433816109 0.396148353996528 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521642:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521050:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000330691:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000348567:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000523239:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000276520:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38684686_38685585:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520611:exon_38684686_38684893:TACC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 38695996 T/C 1 11 8 19 5.2022802280228 4.21652347052887 0.985756757493928 T:C T C 10 0.527065433816109 0.819106308579823 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520340:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518415:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522752:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000330691:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000348567:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000523239:exon_38695988_38696025:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000276520:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520973:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38695988_38696028:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521866:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520611:exon_38695988_38696064:TACC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 38848850 C/T 1 28 31 59 13.2421678531489 16.3390284482994 -3.09686059515043 T:C C T 10 0.527065433816109 0.436562505762116 ENSG00000169490:ENST00000456845:exon_38846327_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000456397:exon_38846327_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000412303:exon_38846327_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000397070:exon_38848324_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000316221:exon_38848324_38849064:TM2D2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 42024817 G/C 1 5 7 12 2.36467283091945 3.68945803671276 -1.32478520579331 C:G G C 10 0.527065433816109 0.566621218006073 ENSG00000070718:ENST00000518421:exon_42024682_42024889:AP3M2;ENSG00000070718:ENST00000174653:exon_42024682_42024889:AP3M2;ENSG00000070718:ENST00000396926:exon_42024682_42024889:AP3M2;ENSG00000070718:ENST00000521280:exon_42024682_42024889:AP3M2;ENSG00000070718:ENST00000522320:exon_42024434_42024889:AP3M2;ENSG00000070718:ENST00000522606:exon_42024807_42024889:AP3M2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 52746153 C/T 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 T:C C T 10 0.527065433816109 0.488810537661758 ENSG00000168300:ENST00000360540:exon_52746078_52746249:PCMTD1;ENSG00000168300:ENST00000519559:exon_52746078_52746249:PCMTD1;ENSG00000168300:ENST00000522514:exon_52746078_52746249:PCMTD1;ENSG00000168300:ENST00000519554:exon_52746078_52746249:PCMTD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 53537316 A/G 1 12 17 29 5.67521479420669 8.96011237487385 -3.28489758066716 A:G A G 10 0.527065433816109 0.265505019787144 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000519912:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53537277_53537347:RB1CC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 53555069 A/G 1 15 9 24 7.09401849275836 4.74358890434498 2.35042958841338 A:G A G 10 0.527065433816109 0.415272769718452 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53554911_53555151:RB1CC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 53569680 C/T 1 20 21 41 9.45869132367782 11.0683741101383 -1.60968278646047 T:C C T 10 0.527065433816109 0.641613115452976 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53568568_53570468:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53568568_53570468:RB1CC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 57892748 A/C 1 4 6 10 1.89173826473556 3.16239260289665 -1.27065433816109 A:C A C 10 0.527065433816109 0.532268681489131 ENSG00000104331:ENST00000262644:exon_57892594_57892756:IMPAD1;ENSG00000104331:ENST00000517461:exon_57892718_57892756:IMPAD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 63938764 G/A 1 9 15 24 4.25641109565502 7.90598150724164 -3.64957041158662 A:G G A 10 0.527065433816109 0.154983538383879 ENSG00000137563:ENST00000518466:exon_63938717_63938792:GGH;ENSG00000137563:ENST00000260118:exon_63938717_63938855:GGH;ENSG00000137563:ENST00000520609:exon_63938717_63938855:GGH;ENSG00000137563:ENST00000518113:exon_63938717_63938855:GGH;ENSG00000137563:ENST00000517622:exon_63938717_63938855:GGH HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 65493429 T/G 1 42 39 81 19.8632517797234 20.5555519188283 -0.692300139104834 T:G T G 10 0.527065433816109 0.911659310653634 ENSG00000180828:ENST00000321870:exon_65492814_65496181:BHLHE22 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 67341378 G/A 1 40 30 70 18.9173826473556 15.8119630144833 3.10541963287237 A:G G A 10 0.527065433816109 0.475089836994007 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 67342077 G/A 1 51 42 93 24.1196628753784 22.1367482202766 1.98291465510186 A:G G A 10 0.527065433816109 0.755590355146228 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 72965973 G/A 1 11 5 16 5.2022802280228 2.63532716908055 2.56695305894226 A:G G A 10 0.527065433816109 0.220807585221878 ENSG00000235531:ENST00000457356:exon_72964774_72968547:RP11-383H13.1;ENSG00000104321:ENST00000520788:exon_72965624_72966102:TRPA1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 72966002 G/A 1 11 5 16 5.2022802280228 2.63532716908055 2.56695305894226 A:G G A 10 0.527065433816109 0.220807585221878 ENSG00000235531:ENST00000457356:exon_72964774_72968547:RP11-383H13.1;ENSG00000104321:ENST00000523582:exon_72965988_72966102:TRPA1;ENSG00000104321:ENST00000262209:exon_72965988_72966102:TRPA1;ENSG00000104321:ENST00000520788:exon_72965624_72966102:TRPA1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 74893419 C/G 1 73 72 145 34.524223331424 37.9487112347598 -3.42448790333581 C:G C G 10 0.527065433816109 0.617939904190225 ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000517439:exon_74893390_74893601:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000519551:exon_74893390_74893716:TMEM70 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 74893821 A/G 1 110 87 197 52.022802280228 45.8546927420015 6.16810953822652 A:G A G 10 0.527065433816109 0.392526000738867 ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 74893850 C/G 1 56 54 110 26.4843357062979 28.4615334260699 -1.97719771977199 C:G C G 10 0.527065433816109 0.703951338802564 ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 79710440 G/T 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 T:G G T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000104432:ENST00000263851:exon_79710307_79710443:IL7;ENSG00000104432:ENST00000379114:exon_79710307_79710443:IL7;ENSG00000104432:ENST00000518982:exon_79710307_79710443:IL7;ENSG00000104432:ENST00000520269:exon_79710307_79710443:IL7;ENSG00000104432:ENST00000520215:exon_79710363_79710443:IL7;ENSG00000104432:ENST00000520317:exon_79710363_79710443:IL7;ENSG00000104432:ENST00000379113:exon_79710307_79710443:IL7;ENSG00000104432:ENST00000521323:exon_79710069_79710443:IL7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 86053624 A/G 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 A:G A G 10 0.527065433816109 0.757490641773051 ENSG00000133739:ENST00000399341:exon_86053617_86053752:LRRCC1;ENSG00000133739:ENST00000426019:exon_86053617_86053752:LRRCC1;ENSG00000133739:ENST00000360375:exon_86053617_86053752:LRRCC1;ENSG00000133739:ENST00000414626:exon_86053617_86053752:LRRCC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 90958422 T/C 1 15 7 22 7.09401849275836 3.68945803671276 3.4045604560456 T:C T C 10 0.527065433816109 0.199603075522895 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000520325:exon_90958368_90958853:NBN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 90967711 A/G 1 27 28 55 12.7692332869651 14.7578321468511 -1.988598859886 A:G A G 10 0.527065433816109 0.592673370363313 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90967511_90967783:NBN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 90990479 C/G 1 14 12 26 6.62108392657447 6.32478520579331 0.296298720781166 C:G C G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000452387:exon_90990448_90990542:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517772:exon_90990448_90990551:NBN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 94746049 T/G 1 6 10 16 2.83760739710335 5.27065433816109 -2.43304694105774 T:G T G 10 0.527065433816109 0.316907244333737 ENSG00000183808:ENST00000399300:exon_94741584_94748666:RBM12B;ENSG00000183808:ENST00000517700:exon_94742492_94746416:RBM12B;ENSG00000183808:ENST00000329529:exon_94745633_94746416:RBM12B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 95888307 C/T 1 17 15 32 8.03988762512615 7.90598150724164 0.133906117884511 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000521155:exon_95888302_95888370:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523998:exon_95888179_95888513:INTS8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 98656966 G/T 1 21 20 41 9.93162588986171 10.5413086763222 -0.609682786460471 T:C:G G T 10 0.527065433816109 0.876744141681202 ENSG00000147649:ENST00000336273:exon_98656407_98657115:MTDH;ENSG00000147649:ENST00000519934:exon_98656774_98657115:MTDH HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 98703317 A/G 1 60 53 113 28.3760739710335 27.9344679922538 0.441605978779677 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000147649:ENST00000336273:exon_98703180_98703416:MTDH;ENSG00000147649:ENST00000519934:exon_98703180_98703416:MTDH;ENSG00000147649:ENST00000522313:exon_98703180_98703392:MTDH;ENSG00000147649:ENST00000519293:exon_98703247_98703416:MTDH HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 100899793 G/A 1 617 524 1141 291.800627335461 276.182287319641 15.6183400158196 A:G G A 10 0.527065433816109 0.358191616626251 ENSG00000164919:ENST00000522934:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520517:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520468:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000297564:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520271:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000517682:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000524245:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000522940:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000518171:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000523016:exon_100899289_100899846:COX6C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 101252680 T/C 1 21 10 31 9.93162588986171 5.27065433816109 4.66097155170062 T:C T C 10 0.527065433816109 0.106634642714296 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101252631_101252999:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101252631_101252999:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000519424:exon_101252631_101252743:SPAG1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 101253184 G/A 1 23 20 43 10.8774950222295 10.5413086763222 0.336186345907311 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101253119_101254130:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101253119_101254130:SPAG1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 103292683 G/C 1 20 13 33 9.45869132367782 6.85185063960942 2.6068406840684 C:G G C 10 0.527065433816109 0.388602120912087 ENSG00000104517:ENST00000520539:exon_103292622_103292695:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000220959:exon_103292622_103292695:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000521922:exon_103292622_103292695:UBR5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 103662353 C/T 1 24 26 50 11.3504295884134 13.7037012792188 -2.35327169080545 T:C C T 10 0.527065433816109 0.571717732519724 ENSG00000155090:ENST00000285407:exon_103661007_103662619:KLF10;ENSG00000155090:ENST00000395884:exon_103661014_103662619:KLF10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 103663390 C/T 1 14 18 32 6.62108392657447 9.48717780868996 -2.86609388211549 T:C C T 10 0.527065433816109 0.376746667004893 ENSG00000155090:ENST00000285407:exon_103663377_103664289:KLF10;ENSG00000155090:ENST00000395884:exon_103663377_103664289:KLF10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 103663912 T/G 1 24 13 37 11.3504295884134 6.85185063960942 4.49857894880397 T:G T G 10 0.527065433816109 0.187077937277232 ENSG00000155090:ENST00000285407:exon_103663377_103664289:KLF10;ENSG00000155090:ENST00000395884:exon_103663377_103664289:KLF10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 103851052 T/C 1 10 23 33 4.72934566183891 12.1225049777705 -7.3931593159316 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0134942678339934 ENSG00000155096:ENST00000337198:exon_103850972_103851144:AZIN1;ENSG00000155096:ENST00000347770:exon_103850972_103851144:AZIN1;ENSG00000155096:ENST00000521536:exon_103850972_103851144:AZIN1;ENSG00000155096:ENST00000522311:exon_103850972_103851144:AZIN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 104337096 A/G 1 1 8 9 0.472934566183891 4.21652347052887 -3.74358890434498 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0161943073002794 ENSG00000164930:ENST00000522566:exon_104336709_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000522484:exon_104336709_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000523739:exon_104336709_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000358755:exon_104336709_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000521195:exon_104336709_104337726:FZD6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 104412771 T/C 1 19 19 38 8.98575675749393 10.0142432425061 -1.02848648501215 T:C T C 10 0.527065433816109 0.748251620330117 ENSG00000164933:ENST00000297578:exon_104410863_104412774:SLC25A32;ENSG00000164933:ENST00000521645:exon_104410863_104412774:SLC25A32;ENSG00000164933:ENST00000523256:exon_104412169_104412774:SLC25A32;ENSG00000164933:ENST00000523866:exon_104412286_104412774:SLC25A32 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 110301998 T/C 1 17 7 24 8.03988762512615 3.68945803671276 4.35042958841338 T:C T C 10 0.527065433816109 0.100628513344123 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000521439:exon_110301980_110302162:NUDCD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 110302047 T/G 1 10 4 14 4.72934566183891 2.10826173526444 2.62108392657447 T:G T G 10 0.527065433816109 0.18849020884602 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000521439:exon_110301980_110302162:NUDCD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 120575184 G/A 0 9 0 9 4.25641109565502 0 4.25641109565502 G G 10 0.527065433816109 0.0043225365335067 ENSG00000136960:ENST00000259486:exon_120575097_120575253:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000427067:exon_120575097_120575253:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000523861:exon_120575097_120575253:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000522167:exon_120575097_120575253:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000522826:exon_120575097_120575253:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000075322:exon_120575097_120575253:ENPP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 120818483 G/A 1 6 2 8 2.83760739710335 1.05413086763222 1.78347652947113 A:G G A 10 0.527065433816109 0.29481715391141 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 123964431 G/A 1 15 10 25 7.09401849275836 5.27065433816109 1.82336415459727 A:G G A 10 0.527065433816109 0.550103280555877 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 123964953 C/T 1 14 12 26 6.62108392657447 6.32478520579331 0.296298720781166 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 124027628 T/C 1 53 63 116 25.0655320077462 33.2051223304149 -8.13959032266865 T:C T C 10 0.527065433816109 0.137321222511037 ENSG00000136986:ENST00000259512:exon_124025458_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000524119:exon_124026389_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000405944:exon_124026389_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000419562:exon_124027405_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000427265:exon_124027445_124027825:DERL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 124142489 T/C 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 T:C T C 10 0.527065433816109 0.160556933333404 ENSG00000156787:ENST00000287380:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000309336:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000327098:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000522420:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000521676:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000524307:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518805:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518866:exon_124142438_124142573:WDR67 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 125463250 T/C 1 6 2 8 2.83760739710335 1.05413086763222 1.78347652947113 T:C T C 10 0.527065433816109 0.29481715391141 ENSG00000183665:ENST00000328599:exon_125463048_125465262:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000521443:exon_125463061_125463498:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000522518:exon_125463158_125463498:TRMT12 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 125498547 C/T 1 23 26 49 10.8774950222295 13.7037012792188 -2.82620625698934 T:C C T 10 0.527065433816109 0.475190656882952 ENSG00000170881:ENST00000303545:exon_125498072_125500155:RNF139 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 125562029 C/T 1 158 157 315 74.7236614570548 82.7492731091291 -8.02561165207435 T:C C T 10 0.527065433816109 0.367272841578501 ENSG00000147684:ENST00000276689:exon_125562002_125562220:NDUFB9;ENSG00000147684:ENST00000517367:exon_125562002_125562219:NDUFB9;ENSG00000147684:ENST00000518657:exon_125562002_125562219:NDUFB9;ENSG00000147684:ENST00000524241:exon_125562002_125562219:NDUFB9;ENSG00000147684:ENST00000517830:exon_125562015_125562074:NDUFB9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 126033096 T/C 1 77 68 145 36.4159615961596 35.8404494994954 0.575512096664191 T:C:G T C 10 0.527065433816109 0.933941412927855 ENSG00000104549:ENST00000523430:exon_126033026_126033113:SQLE;ENSG00000104549:ENST00000265896:exon_126033026_126033113:SQLE;ENSG00000104549:ENST00000518931:exon_126033026_126033179:SQLE HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 126034052 C/T 1 91 97 188 43.0370455227341 51.1253470801626 -8.0883015574285 T:C:G C T 10 0.527065433816109 0.243264454609731 ENSG00000104549:ENST00000523430:exon_126033995_126034523:SQLE;ENSG00000104549:ENST00000265896:exon_126033995_126034525:SQLE HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 135521970 G/A 1 60 42 102 28.3760739710335 22.1367482202766 6.23932575075688 A:G G A 10 0.527065433816109 0.234612844952587 ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135521952_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000518408:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000521673:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000522723:exon_135521944_135521992:ZFAT HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 141263015 G/A 1 11 10 21 5.2022802280228 5.27065433816109 -0.06837411013829 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000520857:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000521667:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000520532:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000518839:exon_141262876_141263028:TRAPPC9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 141310644 G/A 1 8 3 11 3.78347652947113 1.58119630144833 2.2022802280228 A:G G A 10 0.527065433816109 0.234094659981005 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000520857:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000521167:exon_141310568_141310713:TRAPPC9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 141559358 G/A 1 6 3 9 2.83760739710335 1.58119630144833 1.25641109565502 A:G G A 10 0.527065433816109 0.513555929047552 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141559213_141559397:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141559213_141559397:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141559213_141559397:EIF2C2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 141566311 C/T 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 T:C C T 10 0.527065433816109 0.488810537661758 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141566266_141566385:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141566266_141566385:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141566266_141566385:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000521325:exon_141566266_141566337:EIF2C2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 142200467 G/A 1 25 17 42 11.8233641545973 8.96011237487385 2.86325177972342 A:G G A 10 0.527065433816109 0.440661082707359 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520571:exon_142200383_142200723:DENND3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144103120 G/A 1 571 508 1079 270.045637291002 267.749240378583 2.29639691241834 A:G G A 10 0.527065433816109 0.902954384568047 ENSG00000160932:ENST00000517503:exon_144102983_144103827:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000292494:exon_144102983_144103829:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000429120:exon_144102983_144103827:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000521699:exon_144102983_144103828:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000520466:exon_144102983_144103826:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000521003:exon_144102983_144103319:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000522528:exon_144102983_144103341:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000522971:exon_144102983_144103599:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000519611:exon_144102966_144103217:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000521182:exon_144102983_144103826:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000519546:exon_144102966_144103672:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000522024:exon_144102983_144103309:LY6E HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144358381 G/A 1 27 30 57 12.7692332869651 15.8119630144833 -3.04272972751822 A:G G A 10 0.527065433816109 0.429416487144673 ENSG00000181638:ENST00000522452:exon_144358067_144358573:ZFP41;ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000517530:exon_144358173_144358581:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144618499 C/T 1 9 7 16 4.25641109565502 3.68945803671276 0.566953058942256 T:C C T 10 0.527065433816109 0.808175848721287 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144618427_144618623:ZC3H3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144620342 T/C 1 4 18 22 1.89173826473556 9.48717780868996 -7.5954395439544 T:C T C 10 0.527065433816109 0.00111932411687965 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144620855 C/A 1 13 26 39 6.14814936039058 13.7037012792188 -7.55555191882825 A:C C A 10 0.527065433816109 0.0162634534086256 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144621084 T/G 1 12 8 20 5.67521479420669 4.21652347052887 1.45869132367782 T:G T G 10 0.527065433816109 0.65554767387655 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144623574 T/C 1 7 8 15 3.31054196328724 4.21652347052887 -0.905981507241636 T:C T C 10 0.527065433816109 0.797198000532565 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144623546_144623623:ZC3H3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144657801 G/A 1 23 11 34 10.8774950222295 5.7977197719772 5.07977525025229 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0876908004722013 ENSG00000147813:ENST00000460623:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144657770_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144657793_144657872:NAPRT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144658711 G/A 1 25 12 37 11.8233641545973 6.32478520579331 5.49857894880397 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0725137172237727 ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144658248_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000480946:exon_144658610_144658742:NAPRT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144660046 G/A 1 15 16 31 7.09401849275836 8.43304694105774 -1.33902844829938 A:G G A 10 0.527065433816109 0.720005693406807 ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144659827_144660085:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144660031_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000480946:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000491904:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000462059:exon_144659986_144660491:NAPRT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144662353 G/A 1 777 583 1360 367.470157924883 307.279147914792 60.1910100100917 A:T:G G A 10 0.527065433816109 0.00111259399917796 ENSG00000104529:ENST00000529576:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530109:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000527741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526838:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528610:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000533833:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000395119:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529272:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000317198:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000419152:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529007:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531621:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524624:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524397:exon_144662180_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000534380:exon_144662204_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528382:exon_144662249_144662376:EEF1D HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144688313 G/A 1 15 12 27 7.09401849275836 6.32478520579331 0.769233286965056 A:G G A 10 0.527065433816109 0.848360844335184 ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144688232_144688324:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144688232_144688324:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144688232_144688324:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000447926:exon_144688232_144688324:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000433751:exon_144688232_144688324:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000495276:exon_144688232_144688324:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000462036:exon_144688286_144688324:PYCRL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144688736 C/G 1 6 3 9 2.83760739710335 1.58119630144833 1.25641109565502 C:G C G 10 0.527065433816109 0.513555929047552 ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144688637_144688849:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144688637_144688849:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144688637_144688849:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000447926:exon_144688637_144688849:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000433751:exon_144688637_144688789:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000495276:exon_144688637_144688849:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000462036:exon_144688637_144688849:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000482616:exon_144688638_144689302:PYCRL HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144697041 A/G 1 31 10 41 14.6609715517006 5.27065433816109 9.39031721353953 A:G A G 10 0.527065433816109 0.00427068425239350 ENSG00000104522:ENST00000529064:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000531473:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000425753:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000360125:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000529048:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000532308:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000533817:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000530474:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000525274:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000433984:exon_144696810_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000527549:exon_144696817_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000526290:exon_144696991_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000527006:exon_144697033_144697085:TSTA3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144732450 G/A 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 A:G G A 10 0.527065433816109 0.757490641773051 ENSG00000183309:ENST00000526926:exon_144732068_144734546:ZNF623;ENSG00000183309:ENST00000458270:exon_144732068_144734546:ZNF623;ENSG00000183309:ENST00000532796:exon_144731830_144736872:ZNF623;ENSG00000183309:ENST00000328466:exon_144731954_144733759:ZNF623 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144776713 A/C 0 0 15 15 0 7.90598150724164 -7.90598150724164 C A C 10 0.527065433816109 1.32438989383164e-05 ENSG00000181135:ENST00000454097:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000418203:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000533031:exon_144775841_144777526:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000358656:exon_144775841_144777555:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532486:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527561:exon_144775841_144776869:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532158:exon_144775841_144777527:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532205:exon_144775841_144777550:ZNF707 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144990528 A/G 1 54 32 86 25.5384665739301 16.8660938821155 8.67237269181462 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0664189092495716 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144991176 T/C 1 49 33 82 23.1737937430107 17.3931593159316 5.78063442707906 T:C T C 10 0.527065433816109 0.224172686743162 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144992103 T/C 1 33 30 63 15.6068406840684 15.8119630144833 -0.20512233041487 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144992361 T/C 1 9 17 26 4.25641109565502 8.96011237487385 -4.70370127921883 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0771187960080057 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144992862 A/G 1 17 21 38 8.03988762512615 11.0683741101383 -3.02848648501214 A:G A G 10 0.527065433816109 0.334938956276879 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144993324 C/T 1 28 11 39 13.2421678531489 5.7977197719772 7.44444808117175 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0234962649388322 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144993377 A/G 1 33 16 49 15.6068406840684 8.43304694105774 7.17379374301066 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0449572772605800 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144995494 C/T 1 16 12 28 7.56695305894226 6.32478520579331 1.24216785314895 T:C C T 10 0.527065433816109 0.707378189652233 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144995736 G/A 1 15 5 20 7.09401849275836 2.63532716908055 4.45869132367782 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0705444615831227 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144996029 A/G 1 4 13 17 1.89173826473556 6.85185063960942 -4.96011237487385 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0257575567814497 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144996408 T/G 1 10 6 16 4.72934566183891 3.16239260289665 1.56695305894226 T:G T G 10 0.527065433816109 0.465150778014472 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527303:exon_144996100_144996563:PLEC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144997656 C/T 1 11 12 23 5.2022802280228 6.32478520579331 -1.12250497777051 T:C:G C T 10 0.527065433816109 0.680359986743593 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144997927 G/A 1 18 7 25 8.51282219131004 3.68945803671276 4.82336415459728 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0699762447208913 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144998169 C/T 1 8 6 14 3.78347652947113 3.16239260289665 0.621083926574474 T:C C T 10 0.527065433816109 0.794786264772641 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144998190 A/G 1 6 7 13 2.83760739710335 3.68945803671276 -0.851850639609417 A:G A G 10 0.527065433816109 0.783042148004503 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144999417 C/T 1 5 6 11 2.36467283091945 3.16239260289665 -0.797719771977199 T:C C T 10 0.527065433816109 0.765666449819686 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144999621 C/T 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 T:C C T 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144999642 A/C 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 A:C A C 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 144999684 A/G 1 5 5 10 2.36467283091945 2.63532716908055 -0.270654338161091 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 145001031 T/C 1 6 6 12 2.83760739710335 3.16239260289665 -0.324785205793308 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527303:exon_145000952_145001050:PLEC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 145001588 C/T 1 12 7 19 5.67521479420669 3.68945803671276 1.98575675749393 T:C C T 10 0.527065433816109 0.491846751029638 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145001578_145001934:PLEC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 145001784 A/G 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 A:G A G 10 0.527065433816109 0.757490641773051 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145001578_145001934:PLEC HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 145057868 A/G 1 41 47 88 19.3903172135395 24.7720753893571 -5.38175817581759 A:G A G 10 0.527065433816109 0.285763778418714 ENSG00000178685:ENST00000526007:exon_145057335_145058526:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145057480_145057979:PARP10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 145058037 A/G 1 19 9 28 8.98575675749393 4.74358890434498 4.24216785314895 A:G A G 10 0.527065433816109 0.130471808387002 ENSG00000178685:ENST00000526007:exon_145057335_145058526:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528963:exon_145058010_145058272:PARP10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 145058986 A/G 1 33 33 66 15.6068406840684 17.3931593159316 -1.7863186318632 A:G A G 10 0.527065433816109 0.712114541327499 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313059:exon_145058896_145059496:PARP10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 145060112 G/A 1 47 32 79 22.2279246106429 16.8660938821155 5.36183072852739 A:G G A 10 0.527065433816109 0.260003968941194 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000533665:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000526985:exon_145059660_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525879:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528625:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525486:exon_145059886_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531537:exon_145059892_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529842:exon_145059893_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528914:exon_145059918_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528136:exon_145059939_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529311:exon_145060005_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528580:exon_145060017_145060401:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000530478:exon_145060059_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000532311:exon_145060076_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531707:exon_145060082_145060143:PARP10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 145154743 C/T 1 61 53 114 28.8490085372173 27.9344679922538 0.914540544963568 T:C C T 10 0.527065433816109 0.925341671014219 ENSG00000179526:ENST00000398712:exon_145154606_145154747:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000359551:exon_145154606_145154747:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000530216:exon_145154606_145154747:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000534242:exon_145154606_145154747:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000525275:exon_145154606_145154747:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000533948:exon_145154606_145154747:SHARPIN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 145161591 G/A 1 1 8 9 0.472934566183891 4.21652347052887 -3.74358890434498 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0161943073002794 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 145584040 C/A 1 25 26 51 11.8233641545973 13.7037012792188 -1.88033712462156 A:C C A 10 0.527065433816109 0.674500080792558 ENSG00000185803:ENST00000530047:exon_145583283_145584153:GPR172A;ENSG00000185803:ENST00000527078:exon_145583283_145584153:GPR172A;ENSG00000185803:ENST00000526338:exon_145583775_145584155:GPR172A;ENSG00000185803:ENST00000402965:exon_145583283_145584153:GPR172A;ENSG00000185803:ENST00000532887:exon_145583283_145584153:GPR172A;ENSG00000185803:ENST00000329994:exon_145583283_145584153:GPR172A;ENSG00000185803:ENST00000526779:exon_145583832_145584153:GPR172A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 145621556 A/G 1 5 5 10 2.36467283091945 2.63532716908055 -0.270654338161091 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000071894:ENST00000527827:exon_145621230_145621715:CPSF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 145623963 G/A 1 13 21 34 6.14814936039058 11.0683741101383 -4.92022474974771 A:G G A 10 0.527065433816109 0.121002863813012 ENSG00000071894:ENST00000349769:exon_145623915_145624028:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000527916:exon_145623913_145624028:CPSF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 145661675 G/A 1 8 3 11 3.78347652947113 1.58119630144833 2.2022802280228 A:G G A 10 0.527065433816109 0.234094659981005 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145661041_145661801:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145661041_145661801:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145661041_145661801:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145661041_145661801:NFKBIL2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 145979695 C/G 1 6 5 11 2.83760739710335 2.63532716908055 0.202280228022801 C:G C G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000198169:ENST00000524394:exon_145979590_145979706:ZNF251;ENSG00000198169:ENST00000292562:exon_145979577_145979706:ZNF251;ENSG00000198169:ENST00000533117:exon_145979577_145979706:ZNF251;ENSG00000198169:ENST00000525191:exon_145979577_145979706:ZNF251;ENSG00000198169:ENST00000530353:exon_145979577_145981802:ZNF251 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 146067054 G/A 1 16 14 30 7.56695305894226 7.37891607342553 0.188036985516729 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000147789:ENST00000532777:exon_146066740_146067216:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000530776:exon_146066740_146067121:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000532393:exon_146066740_146067167:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000170619:ENST00000530332:exon_146066427_146067128:COMMD5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 146068322 C/T 1 33 23 56 15.6068406840684 12.1225049777705 3.48433570629789 T:C C T 10 0.527065433816109 0.422274306937917 ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 8 146076708 C/T 1 35 35 70 16.5527098164362 18.4472901835638 -1.89458036712763 T:C C T 10 0.527065433816109 0.719853221303067 ENSG00000170619:ENST00000402718:exon_146075559_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000450361:exon_146075573_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000305103:exon_146075604_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000529143:exon_146076210_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000533270:exon_146076211_146076780:COMMD5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 312134 G/A 1 8 15 23 3.78347652947113 7.90598150724164 -4.12250497777051 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0967595787231926 ENSG00000107099:ENST00000524396:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000427010:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000454469:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382341:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000478380:exon_311954_312941:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000474772:exon_311958_312166:DOCK8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 2073292 A/G 1 3 10 13 1.41880369855167 5.27065433816109 -3.85185063960942 A:G A G 10 0.527065433816109 0.048374706262986 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2073212_2073342:SMARCA2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 2191309 C/G 1 30 50 80 14.1880369855167 26.3532716908055 -12.1652347052887 C:G C G 10 0.527065433816109 0.00702739158041539 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000302401:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382186:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000417599:exon_2191266_2191428:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382185:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382183:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000324954:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382182:exon_2191266_2191408:SMARCA2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 2811505 G/A 1 35 28 63 16.5527098164362 14.7578321468511 1.79487766958513 A:G G A 10 0.527065433816109 0.705840386551058 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2811361_2811583:KIAA0020 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 2828765 C/G 1 36 31 67 17.0256443826201 16.3390284482994 0.686615934320695 T:C:G C G 10 0.527065433816109 0.90307469955615 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2828675_2828778:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000469168:exon_2828475_2828778:KIAA0020 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 4860300 A/G 1 43 50 93 20.3361863459073 26.3532716908055 -6.01708534489814 A:G A G 10 0.527065433816109 0.214649527331521 ENSG00000120158:ENST00000381750:exon_4860125_4861064:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000381730:exon_4860125_4860472:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000448872:exon_4860125_4861064:RCL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 5969249 A/G 1 16 14 30 7.56695305894226 7.37891607342553 0.188036985516729 A:T:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 5969307 C/T 1 11 11 22 5.2022802280228 5.7977197719772 -0.595439543954399 T:C C T 10 0.527065433816109 0.833638974534111 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 6007551 T/C 1 6 4 10 2.83760739710335 2.10826173526444 0.72934566183891 T:C T C 10 0.527065433816109 0.757490641773051 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_6007195_6008003:KIAA2026 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 6012734 A/C 1 7 19 26 3.31054196328724 10.0142432425061 -6.70370127921884 A:C A C 10 0.527065433816109 0.00990348032110563 ENSG00000137040:ENST00000259569:exon_6011020_6015618:RANBP6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 6012968 A/G 1 9 12 21 4.25641109565502 6.32478520579331 -2.06837411013829 A:G A G 10 0.527065433816109 0.390094196298263 ENSG00000137040:ENST00000259569:exon_6011020_6015618:RANBP6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 7103816 C/T 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000420847:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000495890:exon_7103685_7104017:KDM4C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 7799606 C/A 1 114 63 177 53.9145405449636 33.2051223304149 20.7094182145487 A:C C A 10 0.527065433816109 0.00195463586545441 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 7799653 G/T 1 144 87 231 68.1025775304803 45.8546927420015 22.2478847884788 T:G G T 10 0.527065433816109 0.0036600912775872 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 15486870 A/G 1 116 126 242 54.8604096773314 66.4102446608297 -11.5498349834984 A:G A G 10 0.527065433816109 0.139173561682216 ENSG00000164985:ENST00000380733:exon_15486825_15486929:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000380738:exon_15486825_15486929:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000380715:exon_15486825_15486929:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000380716:exon_15486825_15486929:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000397519:exon_15486825_15486929:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000487363:exon_15486825_15486929:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000463712:exon_15486825_15486929:PSIP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 15571630 T/A 1 3 6 9 1.41880369855167 3.16239260289665 -1.74358890434498 A:T T A 10 0.527065433816109 0.323067031523113 ENSG00000164989:ENST00000297641:exon_15571622_15571757:C9orf93;ENSG00000164989:ENST00000380689:exon_15571622_15571757:C9orf93;ENSG00000164989:ENST00000380701:exon_15571622_15571757:C9orf93 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 20923696 C/G 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 C:G C G 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20923659_20923767:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20923659_20923767:KIAA1797 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 20988426 A/G 1 44 32 76 20.8091209120912 16.8660938821155 3.94302702997571 A:G A G 10 0.527065433816109 0.421577549281502 ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20988331_20988428:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20988331_20988428:KIAA1797 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 21029330 T/C 1 2 6 8 0.945869132367782 3.16239260289665 -2.21652347052887 T:C T C 10 0.527065433816109 0.160556933333404 ENSG00000188921:ENST00000495827:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000513293:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000521505:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000531631:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000380233:exon_21029294_21029397:PTPLAD2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 32542204 A/G 1 28 44 72 13.2421678531489 23.1908790879088 -9.94871123475985 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0242654929962075 ENSG00000197579:ENST00000360538:exon_32540542_32544324:TOPORS;ENSG00000197579:ENST00000379858:exon_32540824_32544324:TOPORS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 32552462 C/G 1 40 41 81 18.9173826473556 21.6096827864605 -2.69230013910483 C:G C G 10 0.527065433816109 0.578979020860475 ENSG00000197579:ENST00000360538:exon_32552432_32552551:TOPORS;ENSG00000197579:ENST00000379858:exon_32552432_32552551:TOPORS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 33026572 T/C 1 123 95 218 58.1709516406186 50.0712162125304 8.09973542808823 T:C T C 10 0.527065433816109 0.278545057631541 ENSG00000086061:ENST00000330899:exon_33026473_33026614:DNAJA1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 34107505 C/T 1 10 6 16 4.72934566183891 3.16239260289665 1.56695305894226 T:C C T 10 0.527065433816109 0.465150778014472 ENSG00000198876:ENST00000361264:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396989:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396990:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000450964:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000463286:exon_34107359_34107563:DCAF12 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 35091880 C/T 1 7 8 15 3.31054196328724 4.21652347052887 -0.905981507241636 T:C C T 10 0.527065433816109 0.797198000532565 ENSG00000165282:ENST00000474436:exon_35088687_35093577:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000378617:exon_35091237_35092764:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000465745:exon_35091237_35094356:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000341666:exon_35091237_35092764:PIGO HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 35606884 G/A 1 2 8 10 0.945869132367782 4.21652347052887 -3.27065433816109 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0545836587495111 ENSG00000107140:ENST00000336395:exon_35606834_35606980:TESK1;ENSG00000107140:ENST00000498522:exon_35606834_35606980:TESK1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 35609464 C/T 1 42 26 68 19.8632517797234 13.7037012792188 6.15955050050458 T:C C T 10 0.527065433816109 0.145907707526913 ENSG00000107140:ENST00000336395:exon_35608859_35610029:TESK1;ENSG00000107140:ENST00000498522:exon_35608859_35610038:TESK1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 37436755 G/A 1 223 125 348 105.464408259008 65.8831792270136 39.5812290319941 A:T:G G A 10 0.527065433816109 2.07460697542627e-05 ENSG00000137106:ENST00000318158:exon_37436658_37436987:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000460882:exon_37436658_37436845:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000497693:exon_37436658_37436986:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000480596:exon_37436658_37436984:GRHPR HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 37948724 T/C 1 7 5 12 3.31054196328724 2.63532716908055 0.675214794206692 T:C T C 10 0.527065433816109 0.778351128206284 ENSG00000107338:ENST00000377707:exon_37948632_37948751:SHB HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 38395928 C/T 1 26 11 37 12.2962987207812 5.7977197719772 6.49857894880397 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0331648594435006 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 38396002 C/T 1 29 12 41 13.7151024193328 6.32478520579331 7.39031721353953 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0273623937338728 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 38396065 G/T 1 30 33 63 14.1880369855167 17.3931593159316 -3.20512233041487 T:G G T 10 0.527065433816109 0.450354844465412 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 71841018 A/G 1 11 7 18 5.2022802280228 3.68945803671276 1.51282219131004 A:G A G 10 0.527065433816109 0.638183169005014 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71840938_71841091:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71840938_71841091:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71840938_71841091:TJP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 71851877 G/A 1 27 28 55 12.7692332869651 14.7578321468511 -1.988598859886 A:G G A 10 0.527065433816109 0.592673370363313 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71851865_71852052:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71851865_71852052:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71851865_71852052:TJP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 77563087 C/T 1 15 13 28 7.09401849275836 6.85185063960942 0.242167853148946 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000135045:ENST00000376854:exon_77561497_77563122:C9orf40 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 77752510 C/T 1 15 12 27 7.09401849275836 6.32478520579331 0.769233286965056 T:C C T 10 0.527065433816109 0.848360844335184 ENSG00000134996:ENST00000346234:exon_77752454_77752532:OSTF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 77761642 T/C 1 35 31 66 16.5527098164362 16.3390284482994 0.213681368136804 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000134996:ENST00000346234:exon_77761599_77762181:OSTF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 79986057 A/G 1 8 7 15 3.78347652947113 3.68945803671276 0.0940184927583645 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000197969:ENST00000360280:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376646:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376636:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000355766:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376634:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000423463:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000357409:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000477107:exon_79985942_79986065:VPS13A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 80851350 G/C 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 C:G G C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000148019:ENST00000415085:exon_80850991_80851519:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000277082:exon_80850991_80851519:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000415759:exon_80850991_80851519:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376597:exon_80850991_80851519:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000476652:exon_80851010_80851574:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376598:exon_80851011_80851519:CEP78 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 82006446 G/A 0 8 0 8 3.78347652947113 0 3.78347652947113 G G 10 0.527065433816109 0.00845817134857238 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 86278817 C/A 1 39 33 72 18.4444480811717 17.3931593159316 1.05128876524015 A:T:C C A 10 0.527065433816109 0.814735511308203 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000527373:exon_86278790_86278958:UBQLN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 88248239 T/C 1 3 6 9 1.41880369855167 3.16239260289665 -1.74358890434498 T:C T C 10 0.527065433816109 0.323067031523113 ENSG00000135049:ENST00000357081:exon_88247577_88248289:AGTPBP1;ENSG00000135049:ENST00000376083:exon_88247577_88248289:AGTPBP1;ENSG00000135049:ENST00000376109:exon_88247577_88248289:AGTPBP1;ENSG00000135049:ENST00000337006:exon_88247577_88248289:AGTPBP1;ENSG00000135049:ENST00000395847:exon_88247577_88248289:AGTPBP1;ENSG00000135049:ENST00000432218:exon_88247577_88248289:AGTPBP1;ENSG00000135049:ENST00000376082:exon_88247577_88248289:AGTPBP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 90265015 C/T 1 12 10 22 5.67521479420669 5.27065433816109 0.404560456045601 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469067:exon_90264836_90265426:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000475804:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000495281:exon_90264836_90265394:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000494010:exon_90264905_90265033:DAPK1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 90322023 G/A 1 33 50 83 15.6068406840684 26.3532716908055 -10.7464310067371 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0206450261194161 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90321047_90323546:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90321047_90323545:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90321047_90323543:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90321047_90322296:DAPK1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 92003679 C/T 1 14 12 26 6.62108392657447 6.32478520579331 0.296298720781166 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000187764:ENST00000420987:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000339861:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000429836:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_92003551_92003707:SEMA4D HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 95019048 G/A 1 32 33 65 15.1339061178845 17.3931593159316 -2.25925319804709 A:G G A 10 0.527065433816109 0.62012346828026 ENSG00000196305:ENST00000375643:exon_95018962_95019082:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375660:exon_95018962_95019082:IARS;ENSG00000196305:ENST00000443024:exon_95018962_95019082:IARS;ENSG00000196305:ENST00000447699:exon_95018962_95019082:IARS;ENSG00000196305:ENST00000451588:exon_95018962_95019082:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375629:exon_95018962_95019082:IARS;ENSG00000196305:ENST00000472894:exon_95018639_95019082:IARS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 95033302 G/A 1 15 17 32 7.09401849275836 8.96011237487385 -1.86609388211549 A:G G A 10 0.527065433816109 0.596331739273101 ENSG00000196305:ENST00000375643:exon_95033267_95033358:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375660:exon_95033267_95033358:IARS;ENSG00000196305:ENST00000443024:exon_95033267_95033358:IARS;ENSG00000196305:ENST00000447699:exon_95033267_95033358:IARS;ENSG00000196305:ENST00000451588:exon_95033267_95033358:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375629:exon_95033267_95033358:IARS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 95068046 C/T 1 43 22 65 20.3361863459073 11.5954395439544 8.74074680195291 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0342371839782547 ENSG00000198000:ENST00000360868:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000375594:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000442668:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000358855:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000477862:exon_95068035_95068112:NOL8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 95875381 G/C 1 15 8 23 7.09401849275836 4.21652347052887 2.87749502222949 C:G G C 10 0.527065433816109 0.297180505397360 ENSG00000165233:ENST00000375464:exon_95875274_95875564:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000466409:exon_95875274_95875564:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000468781:exon_95875274_95875489:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000490488:exon_95875274_95875554:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000488630:exon_95875274_95875565:C9orf89 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 96209943 T/C 1 14 12 26 6.62108392657447 6.32478520579331 0.296298720781166 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000188938:ENST00000479094:exon_96208776_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000423591:exon_96208776_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000375412:exon_96208776_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000375409:exon_96208783_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000523407:exon_96208807_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000520403:exon_96208815_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000520470:exon_96209187_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000483149:exon_96209187_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000483056:exon_96209206_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000476484:exon_96209206_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000428152:exon_96209550_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000428378:exon_96209917_96209979:FAM120AOS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 100286431 C/A 1 11 1 12 5.2022802280228 0.527065433816109 4.67521479420669 A:C C A 10 0.527065433816109 0.00720790163310933 ENSG00000136842:ENST00000259365:exon_100286423_100286590:TMOD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 100672338 C/T 1 12 10 22 5.67521479420669 5.27065433816109 0.404560456045601 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000136932:ENST00000375119:exon_100672242_100672898:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000375118:exon_100672242_100674753:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000478126:exon_100672271_100672898:C9orf156 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 100819070 T/G 1 22 13 35 10.4045604560456 6.85185063960942 3.55270981643618 T:G T G 10 0.527065433816109 0.241322609328583 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100819050_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100819052_100819222:NANS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 100819192 C/T 1 49 36 85 23.1737937430107 18.9743556173799 4.19943812563073 T:C C T 10 0.527065433816109 0.386115809567723 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100819050_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100819052_100819222:NANS HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 104324545 G/A 1 17 21 38 8.03988762512615 11.0683741101383 -3.02848648501214 A:G G A 10 0.527065433816109 0.334938956276879 ENSG00000155827:ENST00000389120:exon_104324528_104325622:RNF20 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 106894382 A/G 1 21 15 36 9.93162588986171 7.90598150724164 2.02564438262007 A:G A G 10 0.527065433816109 0.510707568161342 ENSG00000136824:ENST00000286398:exon_106894290_106894406:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374793:exon_106894290_106894406:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000303219:exon_106894290_106894406:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374787:exon_106894290_106894406:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000493955:exon_106894290_106894406:SMC2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 107515214 G/A 1 13 15 28 6.14814936039058 7.90598150724164 -1.75783214685105 A:G G A 10 0.527065433816109 0.572286226612737 ENSG00000136783:ENST00000374767:exon_107515187_107515345:NIPSNAP3A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 108147763 T/G 1 11 15 26 5.2022802280228 7.90598150724164 -2.70370127921884 T:G T G 10 0.527065433816109 0.329044999714734 ENSG00000070214:ENST00000374723:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000470972:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000374720:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000374724:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000361080:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000343170:exon_108147703_108147783:SLC44A1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 111653574 C/G 1 5 5 10 2.36467283091945 2.63532716908055 -0.270654338161091 C:G C G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111653483_111653684:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111653483_111653684:IKBKAP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 111665215 A/C 1 6 3 9 2.83760739710335 1.58119630144833 1.25641109565502 A:C A C 10 0.527065433816109 0.513555929047552 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111665119_111665222:IKBKAP HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 112898802 C/T 1 13 10 23 6.14814936039058 5.27065433816109 0.877495022229492 T:C C T 10 0.527065433816109 0.835491706691073 ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000480388:exon_112898407_112900706:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 112900199 T/C 1 26 9 35 12.2962987207812 4.74358890434498 7.55270981643618 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0108399704615904 ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000480388:exon_112898407_112900706:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 112900785 A/G 1 11 24 35 5.2022802280228 12.6495704115866 -7.44729018356382 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0165430117948476 ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000482335:exon_112900451_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 114173287 G/A 1 16 12 28 7.56695305894226 6.32478520579331 1.24216785314895 A:G G A 10 0.527065433816109 0.707378189652233 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114173260_114173422:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114173260_114173422:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114173260_114173422:KIAA0368 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 114687061 C/T 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000148154:ENST00000374279:exon_114687057_114687158:UGCG;ENSG00000148154:ENST00000490110:exon_114687057_114687158:UGCG;ENSG00000148154:ENST00000495085:exon_114687057_114687158:UGCG HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 114804173 G/A 1 8 7 15 3.78347652947113 3.68945803671276 0.0940184927583645 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000106868:ENST00000355396:exon_114804147_114804240:SUSD1;ENSG00000106868:ENST00000374270:exon_114804147_114804240:SUSD1;ENSG00000106868:ENST00000374263:exon_114804147_114804240:SUSD1;ENSG00000106868:ENST00000374264:exon_114804147_114804240:SUSD1;ENSG00000106868:ENST00000475283:exon_114804147_114804240:SUSD1;ENSG00000106868:ENST00000441934:exon_114804149_114804231:SUSD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 114982463 T/C 1 86 69 155 40.6723726918146 36.3675149333115 4.3048577585031 T:C T C 10 0.527065433816109 0.520275431844435 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 114982549 C/T 1 108 107 215 51.0769331478602 56.3960014183237 -5.31906827046345 T:C C T 10 0.527065433816109 0.494798099659002 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 115931703 G/A 1 22 30 52 10.4045604560456 15.8119630144833 -5.40740255843767 A:G G A 10 0.527065433816109 0.164378247730046 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 116172427 G/A 0 8 0 8 3.78347652947113 0 3.78347652947113 G G 10 0.527065433816109 0.00845817134857238 ENSG00000148229:ENST00000475080:exon_116172335_116172630:POLE3;ENSG00000157653:ENST00000490544:exon_116172334_116172437:C9orf43 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 117103973 A/G 1 51 54 105 24.1196628753784 28.4615334260699 -4.34187055069145 A:G A G 10 0.527065433816109 0.434597874183886 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117103813_117104005:AKNA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 117122202 C/T 1 15 13 28 7.09401849275836 6.85185063960942 0.242167853148946 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117122176_117122342:AKNA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 117124731 G/A 1 11 11 22 5.2022802280228 5.7977197719772 -0.595439543954399 A:G G A 10 0.527065433816109 0.833638974534111 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117124686_117124813:AKNA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 123163053 G/A 1 14 16 30 6.62108392657447 8.43304694105774 -1.81196301448327 A:G G A 10 0.527065433816109 0.584756224731591 ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000474262:exon_123163020_123163297:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000484546:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480467:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000433194:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000425647:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 123182202 C/T 1 2 10 12 0.945869132367782 5.27065433816109 -4.32478520579331 T:C C T 10 0.527065433816109 0.0174711201999007 ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000425647:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 123205912 C/G 1 10 6 16 4.72934566183891 3.16239260289665 1.56695305894226 C:G C G 10 0.527065433816109 0.465150778014472 ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000479584:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 123205981 C/T 1 9 8 17 4.25641109565502 4.21652347052887 0.0398876251261466 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000479584:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 123632045 A/G 1 31 38 69 14.6609715517006 20.0284864850121 -5.36751493331153 A:G A G 10 0.527065433816109 0.227896327630254 ENSG00000119403:ENST00000312189:exon_123631865_123632223:PHF19 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 123671520 G/A 1 167 178 345 78.9800725527098 93.8176472192674 -14.8375746665576 A:T:G G A 10 0.527065433816109 0.117834822442004 ENSG00000056558:ENST00000373887:exon_123671508_123671656:TRAF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 123929770 C/T 1 16 21 37 7.56695305894226 11.0683741101383 -3.50142105119603 A:T:C C T 10 0.527065433816109 0.254752916438468 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373845:exon_123929767_123929955:CEP110 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 124094726 G/A 1 12 16 28 5.67521479420669 8.43304694105774 -2.75783214685105 A:T:G G A 10 0.527065433816109 0.345892538884562 ENSG00000148180:ENST00000373823:exon_124094712_124095121:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394353:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000436847:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000449733:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000412819:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373808:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394352:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000341272:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373818:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373806:exon_124094712_124094940:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373805:exon_124094712_124095016:GSN;ENSG00000148180:ENST00000477553:exon_124094712_124094867:GSN HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 126520068 T/C 1 5 4 9 2.36467283091945 2.10826173526444 0.256411095655019 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000119522:ENST00000373624:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000473039:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394219:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373620:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373618:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394215:exon_126519982_126520101:DENND1A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 127643456 T/C 1 9 3 12 4.25641109565502 1.58119630144833 2.67521479420669 T:C T C 10 0.527065433816109 0.153067812973243 ENSG00000136935:ENST00000373555:exon_127643450_127643536:GOLGA1;ENSG00000136935:ENST00000475407:exon_127643450_127643536:GOLGA1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 127996046 A/G 1 33 12 45 15.6068406840684 6.32478520579331 9.28205547827509 A:G A G 10 0.527065433816109 0.00660572711099512 ENSG00000136933:ENST00000259460:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394125:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394124:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000373538:exon_127995967_127996334:RABEPK HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 128246786 G/A 1 43 37 80 20.3361863459073 19.501421051196 0.834765294711278 A:G G A 10 0.527065433816109 0.911022605258642 ENSG00000119487:ENST00000350766:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373503:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373498:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000529322:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000265960:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000394063:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373505:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373497:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000497932:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000496063:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000420643:exon_128246722_128246862:MAPKAP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 130213588 C/G 1 151 200 351 71.4131194937675 105.413086763222 -33.9999672694543 C:G C G 10 0.527065433816109 0.000328777685346575 ENSG00000197958:ENST00000361436:exon_130213560_130213684:RPL12;ENSG00000197958:ENST00000497825:exon_130213329_130213684:RPL12;ENSG00000197958:ENST00000497322:exon_130211889_130213684:RPL12 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 130504070 G/A 1 8 22 30 3.78347652947113 11.5954395439544 -7.81196301448327 A:G G A 10 0.527065433816109 0.00533059449256624 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000420366:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373274:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130504067_130504238:SH2D3C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 130536717 G/A 1 18 12 30 8.51282219131004 6.32478520579331 2.18803698551673 A:G G A 10 0.527065433816109 0.468463502774368 ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130536534_130536746:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130536269_130536746:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000468969:exon_130536631_130536746:SH2D3C HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 130581004 G/A 1 5 12 17 2.36467283091945 6.32478520579331 -3.96011237487385 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0861119132037109 ENSG00000106991:ENST00000373203:exon_130580995_130581111:ENG;ENSG00000106991:ENST00000344849:exon_130580995_130581111:ENG;ENSG00000106991:ENST00000480266:exon_130580995_130581069:ENG HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 130677015 G/A 1 13 20 33 6.14814936039058 10.5413086763222 -4.3931593159316 A:G G A 10 0.527065433816109 0.162357439542855 ENSG00000136840:ENST00000335791:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000343609:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000495983:exon_130676935_130677041:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000467674:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000361444:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000483438:exon_130676935_130677145:ST6GALNAC4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 130698029 G/C 1 82 77 159 38.7806344270791 40.5840384038404 -1.80340397676134 C:G G C 10 0.527065433816109 0.811833802611522 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 130698043 A/G 1 83 70 153 39.253568993263 36.8945803671276 2.35898862613532 A:G A G 10 0.527065433816109 0.746256032602754 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 130707081 A/G 1 12 6 18 5.67521479420669 3.16239260289665 2.51282219131004 A:G A G 10 0.527065433816109 0.345457652895314 ENSG00000167106:ENST00000373095:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000465821:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000373084:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000300434:exon_130707056_130707177:FAM102A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 130884753 C/T 1 28 32 60 13.2421678531489 16.8660938821155 -3.62392602896654 T:C C T 10 0.527065433816109 0.367600811132483 ENSG00000148334:ENST00000338961:exon_130884641_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000277462:exon_130884641_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000423319:exon_130884641_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000492057:exon_130884641_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000496594:exon_130884641_130885413:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000476811:exon_130884641_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000476655:exon_130884641_130884925:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000493205:exon_130884641_130885413:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000487063:exon_130884725_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000474124:exon_130884727_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000449878:exon_130884745_130884758:PTGES2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 131371212 T/C 1 33 42 75 15.6068406840684 22.1367482202766 -6.52990753620818 T:C T C 10 0.527065433816109 0.134441687621822 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131371153_131371256:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131371153_131371256:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131371153_131371256:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131371153_131371256:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131371153_131371256:SPTAN1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 131454120 C/T 1 4 6 10 1.89173826473556 3.16239260289665 -1.27065433816109 T:C C T 10 0.527065433816109 0.532268681489131 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 131475809 G/A 1 7 6 13 3.31054196328724 3.16239260289665 0.148149360390583 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000160447:ENST00000291906:exon_131475778_131475921:PKN3;ENSG00000160447:ENST00000483521:exon_131475778_131475921:PKN3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 131570177 A/C 1 4 8 12 1.89173826473556 4.21652347052887 -2.32478520579331 A:C A C 10 0.527065433816109 0.248670873824186 ENSG00000107021:ENST00000372648:exon_131570093_131572711:TBC1D13;ENSG00000107021:ENST00000223865:exon_131570093_131572703:TBC1D13 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 131584631 C/T 1 112 104 216 52.9686714125958 54.8148051168753 -1.84613370427955 A:T:C C T 10 0.527065433816109 0.83810489738803 ENSG00000167136:ENST00000372642:exon_131584607_131584956:ENDOG;ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131581930_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131584346_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131584370_131585112:C9orf114 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 131586374 G/A 1 13 8 21 6.14814936039058 4.21652347052887 1.93162588986171 A:G G A 10 0.527065433816109 0.513458776648042 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131586371_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000480366:exon_131586351_131586453:C9orf114 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 131670919 T/C 1 10 5 15 4.72934566183891 2.63532716908055 2.09401849275836 T:C T C 10 0.527065433816109 0.312436282519101 ENSG00000136802:ENST00000372600:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000372599:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000259324:exon_131669436_131671600:LRRC8A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 131767668 A/C 1 66 77 143 31.2136813681368 40.5840384038404 -9.37035703570359 A:C A C 10 0.527065433816109 0.131488983410650 ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131767582_131767809:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131767582_131767809:NUP188 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 131771505 C/T 1 21 12 33 9.93162588986171 6.32478520579331 3.6068406840684 T:C C T 10 0.527065433816109 0.226444851651302 ENSG00000148341:ENST00000372564:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000479237:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000372559:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000372554:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000461811:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000417224:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000416629:exon_131771385_131771625:SH3GLB2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 132569553 C/T 1 6 5 11 2.83760739710335 2.63532716908055 0.202280228022801 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000136816:ENST00000259339:exon_132569467_132569642:TOR1B;ENSG00000136816:ENST00000437263:exon_132569467_132569642:TOR1B;ENSG00000136816:ENST00000488169:exon_132569467_132569642:TOR1B HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 132580901 C/G 1 37 38 75 17.498578948804 20.0284864850121 -2.52990753620818 C:G C G 10 0.527065433816109 0.56547784657 ENSG00000136827:ENST00000437532:exon_132580799_132580926:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000427355:exon_132580799_132580926:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000351698:exon_132580799_132580926:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000474192:exon_132580632_132580926:TOR1A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 132623293 C/T 1 6 3 9 2.83760739710335 1.58119630144833 1.25641109565502 T:C C T 10 0.527065433816109 0.513555929047552 ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132623216_132623312:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132623216_132623312:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132623216_132623312:USP20 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 132636920 C/T 1 7 4 11 3.31054196328724 2.10826173526444 1.2022802280228 T:C C T 10 0.527065433816109 0.555399509917260 ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132636855_132637035:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132636855_132637035:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132636855_132637035:USP20 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 132662786 C/T 1 115 106 221 54.3874751111475 55.8689359845076 -1.4814608733601 T:C C T 10 0.527065433816109 0.840242150762376 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000443566:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000478129:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000462766:exon_132662705_132662812:FNBP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 133346226 C/T 0 0 10 10 0 5.27065433816109 -5.27065433816109 T C T 10 0.527065433816109 0.000559771227864236 ENSG00000130707:ENST00000334909:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000352480:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000372394:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000344866:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000372393:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000422569:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000443588:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000467695:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000493984:exon_133346221_133346291:ASS1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 133761001 A/G 1 11 23 34 5.2022802280228 12.1225049777705 -6.92022474974771 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0241700083560088 ENSG00000097007:ENST00000372348:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000438426:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000318560:exon_133759356_133763062:ABL1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 134136515 A/G 1 18 29 47 8.51282219131004 15.2848975806672 -6.77207538935712 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0569729161559202 ENSG00000126882:ENST00000247295:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000372269:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000372271:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000464831:exon_134136176_134136737:FAM78A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 134136677 A/G 1 13 15 28 6.14814936039058 7.90598150724164 -1.75783214685105 A:G A G 10 0.527065433816109 0.572286226612737 ENSG00000126882:ENST00000247295:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000372269:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000372271:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000464831:exon_134136176_134136737:FAM78A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 134497321 C/T 1 13 13 26 6.14814936039058 6.85185063960942 -0.703701279218835 T:C C T 10 0.527065433816109 0.84562040810587 ENSG00000107263:ENST00000266110:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372195:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000429421:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372189:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372190:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000411834:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000337036:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000357686:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000437236:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372191:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000431470:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000398415:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000419442:exon_134497183_134497385:RAPGEF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 135139901 T/C 1 53 66 119 25.0655320077462 34.7863186318632 -9.72078662411698 T:C T C 10 0.527065433816109 0.081071802423196 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000477049:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135136827_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135136827_135140372:SETX HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 135172412 A/G 1 4 6 10 1.89173826473556 3.16239260289665 -1.27065433816109 A:G A G 10 0.527065433816109 0.532268681489131 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135172274_135172441:SETX HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 135173685 T/C 1 10 16 26 4.72934566183891 8.43304694105774 -3.70370127921884 T:C T C 10 0.527065433816109 0.170685024102423 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135173467_135173699:SETX HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 135202829 T/C 1 10 9 19 4.72934566183891 4.74358890434498 -0.0142432425060717 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 135203231 C/T 1 12 9 21 5.67521479420669 4.74358890434498 0.931625889861711 T:C C T 10 0.527065433816109 0.827834701908173 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 135203409 A/C 1 10 11 21 4.72934566183891 5.7977197719772 -1.06837411013829 A:C A C 10 0.527065433816109 0.667942291105539 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 135203838 G/A 1 11 9 20 5.2022802280228 4.74358890434498 0.45869132367782 A:G G A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 135273607 C/G 1 15 13 28 7.09401849275836 6.85185063960942 0.242167853148946 C:G C G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135273528_135273713:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135273528_135273713:TTF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 135277341 C/A 1 37 30 67 17.498578948804 15.8119630144833 1.6866159343207 A:C C A 10 0.527065433816109 0.714815901421351 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135276842_135278215:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135276842_135278215:TTF1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 135526484 T/A 1 4 4 8 1.89173826473556 2.10826173526444 -0.216523470528872 A:T T A 10 0.527065433816109 1 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135526462_135526503:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135526462_135526503:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135526462_135526503:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135526462_135526503:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000310532:exon_135526462_135526503:DDX31 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 135554566 G/A 1 16 13 29 7.56695305894226 6.85185063960942 0.715102419332838 A:G G A 10 0.527065433816109 0.853844997602006 ENSG00000125484:ENST00000372146:exon_135553364_135555190:GTF3C4;ENSG00000125484:ENST00000483873:exon_135554265_135554697:GTF3C4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 135772717 G/A 1 9 5 14 4.25641109565502 2.63532716908055 1.62108392657447 A:G G A 10 0.527065433816109 0.433551468090942 ENSG00000165699:ENST00000298552:exon_135772571_135772732:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000440111:exon_135772571_135772732:TSC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 135933253 C/T 1 44 35 79 20.8091209120912 18.4472901835638 2.36183072852739 T:C C T 10 0.527065433816109 0.652703027428251 ENSG00000148308:ENST00000372097:exon_135933201_135933888:GTF3C5;ENSG00000148308:ENST00000372095:exon_135933201_135933888:GTF3C5;ENSG00000148308:ENST00000372108:exon_135933201_135933888:GTF3C5;ENSG00000148308:ENST00000342018:exon_135933201_135933888:GTF3C5;ENSG00000148308:ENST00000372099:exon_135933201_135933888:GTF3C5;ENSG00000148308:ENST00000460815:exon_135933201_135933268:GTF3C5;ENSG00000148308:ENST00000489842:exon_135933201_135933517:GTF3C5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 136324239 C/A 1 5 3 8 2.36467283091945 1.58119630144833 0.783476529471128 A:C:G C A 10 0.527065433816109 0.729753293915306 ENSG00000160323:ENST00000485925:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000371929:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000371916:exon_136324096_136324507:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000338351:exon_136324096_136324507:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000355699:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000356589:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000371910:exon_136324096_136324508:ADAMTS13 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 138378856 A/G 1 8 5 13 3.78347652947113 2.63532716908055 1.14814936039058 A:G A G 10 0.527065433816109 0.588366380954527 ENSG00000196422:ENST00000356818:exon_138376295_138380739:KIAA0649 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 139256468 C/G 1 26 18 44 12.2962987207812 9.48717780868996 2.8091209120912 C:G C G 10 0.527065433816109 0.451633586147347 ENSG00000213221:ENST00000371739:exon_139253932_139256632:DNLZ;ENSG00000213221:ENST00000371738:exon_139256352_139256632:DNLZ;ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139256355_139256632:CARD9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 139256541 C/T 1 13 11 24 6.14814936039058 5.7977197719772 0.350429588413383 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000213221:ENST00000371739:exon_139253932_139256632:DNLZ;ENSG00000213221:ENST00000371738:exon_139256352_139256632:DNLZ;ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139256355_139256632:CARD9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 139270975 C/T 1 10 5 15 4.72934566183891 2.63532716908055 2.09401849275836 T:C C T 10 0.527065433816109 0.312436282519101 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 139273288 C/T 1 19 28 47 8.98575675749393 14.7578321468511 -5.77207538935713 T:C:G C T 10 0.527065433816109 0.107843025766735 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 139273402 C/T 1 30 31 61 14.1880369855167 16.3390284482994 -2.15099146278265 T:C C T 10 0.527065433816109 0.609613893645318 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 139298580 C/T 1 19 11 30 8.98575675749393 5.7977197719772 3.18803698551673 T:C C T 10 0.527065433816109 0.275830848602445 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 139299637 C/T 1 22 13 35 10.4045604560456 6.85185063960942 3.55270981643618 T:C C T 10 0.527065433816109 0.241322609328583 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139299543_139299800:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139299570_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139299570_139299654:SDCCAG3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 139306467 C/T 1 45 41 86 21.2820554782751 21.6096827864605 -0.327627308185377 T:C C T 10 0.527065433816109 1 ENSG00000165688:ENST00000371720:exon_139306449_139306651:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000446975:exon_139306449_139306651:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000399219:exon_139306449_139306651:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000371717:exon_139306449_139306651:PMPCA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 139311471 C/T 1 50 54 104 23.6467283091945 28.4615334260699 -4.81480511687534 A:T:C C T 10 0.527065433816109 0.377127809478614 ENSG00000165688:ENST00000399219:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000371717:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000462616:exon_139310519_139311666:PMPCA HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 139368953 G/A 1 12 2 14 5.67521479420669 1.05413086763222 4.62108392657447 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0147159799087008 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 139369062 C/T 1 8 3 11 3.78347652947113 1.58119630144833 2.2022802280228 T:C C T 10 0.527065433816109 0.234094659981005 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 139371342 G/A 1 1 9 10 0.472934566183891 4.74358890434498 -4.27065433816109 A:G G A 10 0.527065433816109 0.00845260157850117 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 139371405 G/C 1 5 5 10 2.36467283091945 2.63532716908055 -0.270654338161091 C:G G C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 139371786 A/C 1 9 7 16 4.25641109565502 3.68945803671276 0.566953058942256 A:C A C 10 0.527065433816109 0.808175848721287 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 139391636 G/A 1 19 13 32 8.98575675749393 6.85185063960942 2.13390611788451 A:G G A 10 0.527065433816109 0.483562767697165 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 139732462 C/T 1 86 84 170 40.6723726918146 44.2734964405532 -3.60112374873854 T:C C T 10 0.527065433816109 0.591549238040908 ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139732314_139732467:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139732314_139732467:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139732314_139732467:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000435930:exon_139732314_139732467:C9orf86 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 139743882 C/T 1 46 35 81 21.754990044459 18.4472901835638 3.30769986089517 T:C C T 10 0.527065433816109 0.505092792514799 ENSG00000054148:ENST00000371661:exon_139743563_139744042:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000492540:exon_139743543_139744042:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000247665:exon_139743546_139744042:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000462205:exon_139743877_139744042:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000497413:exon_139743878_139744042:PHPT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 139835897 G/A 1 73 64 137 34.524223331424 33.732187764231 0.792035567193061 A:G G A 10 0.527065433816109 0.931910965311526 ENSG00000159069:ENST00000325285:exon_139835703_139835915:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000459905:exon_139835703_139835915:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000483559:exon_139835703_139835915:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000487794:exon_139835703_139835915:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000433269:exon_139835863_139835915:FBXW5 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 140077639 G/A 1 15 10 25 7.09401849275836 5.27065433816109 1.82336415459727 A:G G A 10 0.527065433816109 0.550103280555877 ENSG00000176248:ENST00000323927:exon_140077577_140077694:ANAPC2;ENSG00000176248:ENST00000459740:exon_140077577_140077694:ANAPC2;ENSG00000176248:ENST00000455910:exon_140077577_140077694:ANAPC2;ENSG00000176248:ENST00000471131:exon_140077577_140078066:ANAPC2;ENSG00000176248:ENST00000495611:exon_140077577_140077694:ANAPC2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 140079522 G/A 1 30 12 42 14.1880369855167 6.32478520579331 7.86325177972342 A:G G A 10 0.527065433816109 0.0194119416102601 ENSG00000176248:ENST00000323927:exon_140079365_140079539:ANAPC2;ENSG00000176248:ENST00000455910:exon_140079365_140079539:ANAPC2;ENSG00000176248:ENST00000495611:exon_140079365_140079539:ANAPC2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 140100224 A/G 1 10 3 13 4.72934566183891 1.58119630144833 3.14814936039058 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0984259133401166 ENSG00000188566:ENST00000458322:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000427047:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000371521:exon_140100147_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000344894:exon_140100147_140100364:NDOR1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . 9 140611436 T/C 1 16 15 31 7.56695305894226 7.90598150724164 -0.339028448299381 T:C T C 10 0.527065433816109 1 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000492232:exon_140611078_140611502:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460486:exon_140611078_140611631:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140611078_140611634:EHMT1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 200860 T/C 1 7 2 9 3.31054196328724 1.05413086763222 2.25641109565502 T:C T C 10 0.527065433816109 0.185447766343339 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000484611:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000430923:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000445062:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000429181:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000443019:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000415337:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000447472:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000448477:exon_200401_200981:PLCXD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 215823 C/T 1 10 13 23 4.72934566183891 6.85185063960942 -2.12250497777051 T:C C T 10 0.527065433816109 0.409255873477579 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_215764_220020:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_215764_216059:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_215764_220023:PLCXD1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 221705 G/A 1 139 130 269 65.7379046995608 68.5185063960942 -2.78060169653334 A:C:G G A 10 0.527065433816109 0.760264713829768 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_221196_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_221191_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_221417_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_221427_221864:GTPBP6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 229542 G/A 1 26 17 43 12.2962987207812 8.96011237487385 3.33618634590731 A:G G A 10 0.527065433816109 0.360409680483293 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_228086_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_229433_229591:GTPBP6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 295069 A/G 1 29 19 48 13.7151024193328 10.0142432425061 3.70085917682677 A:G A G 10 0.527065433816109 0.313629264756482 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 295132 T/C 1 35 19 54 16.5527098164362 10.0142432425061 6.53846657393011 T:C T C 10 0.527065433816109 0.0778040912931328 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 295231 A/G 1 25 12 37 11.8233641545973 6.32478520579331 5.49857894880397 A:G A G 10 0.527065433816109 0.0725137172237727 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 299362 A/G 1 28 18 46 13.2421678531489 9.48717780868996 3.75499004445899 A:G A G 10 0.527065433816109 0.302721621413937 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000468169:exon_299348_299631:PPP2R3B HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 299591 A/G 1 13 12 25 6.14814936039058 6.32478520579331 -0.176635845402726 A:G A G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000468169:exon_299348_299631:PPP2R3B HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 322161 A/G 1 3 5 8 1.41880369855167 2.63532716908055 -1.21652347052887 A:G A G 10 0.527065433816109 0.488810537661758 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000445792:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000496630:exon_322140_322251:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000381625:exon_322140_322325:PPP2R3B HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 1508324 G/A 1 1324 1126 2450 626.165365627472 593.475678476939 32.6896871505328 A:T:G G A 10 0.527065433816109 0.188493673742394 ENSG00000169100:ENST00000381401:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000475167:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000484026:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000447786:exon_1508256_1508620:SLC25A6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 1508583 T/C 1 747 662 1409 353.282120939367 348.917317186264 4.36480375310236 A:T:C T C 10 0.527065433816109 0.831000856257312 ENSG00000169100:ENST00000381401:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000475167:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000484026:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000447786:exon_1508256_1508620:SLC25A6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 1531648 C/T 1 77 71 148 36.4159615961596 37.4216458009437 -1.00568420478414 T:C C T 10 0.527065433816109 0.86967919538397 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1531625_1531747:ASMTL HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 1537881 C/T 1 28 23 51 13.2421678531489 12.1225049777705 1.11966287537844 T:C C T 10 0.527065433816109 0.780826477505031 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 1719897 C/G 1 25 53 78 11.8233641545973 27.9344679922538 -16.1111038376565 C:G C G 10 0.527065433816109 0.000256481612443525 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1719552_1721407:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1719552_1721395:AKAP17A HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 2139186 C/T 1 24 18 42 11.3504295884134 9.48717780868996 1.86325177972342 T:C C T 10 0.527065433816109 0.643885642884425 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2137557_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2138809_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2138809_2139270:DHRSX HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 2161129 C/G 1 15 13 28 7.09401849275836 6.85185063960942 0.242167853148946 C:G C G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000412516:exon_2161103_2161271:DHRSX HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 2632482 C/T 1 67 72 139 31.6866159343207 37.9487112347598 -6.26209530043915 T:C C T 10 0.527065433816109 0.308375569117069 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381184:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000398818:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000449611:exon_2632463_2632495:CD99 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 3592725 G/A 1 4 5 9 1.89173826473556 2.63532716908055 -0.743588904344981 A:G G A 10 0.527065433816109 0.743612144716174 ENSG00000183943:ENST00000262848:exon_3592639_3592807:PRKX HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 12906030 G/A 1 3 46 49 1.41880369855167 24.245009955541 -22.8262062569893 A:G G A 10 0.527065433816109 4.19730269175426e-12 ENSG00000196664:ENST00000380659:exon_12903631_12908499:TLR7 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 15838366 C/T 1 13 6 19 6.14814936039058 3.16239260289665 2.98575675749393 T:C C T 10 0.527065433816109 0.250133651156978 ENSG00000169249:ENST00000307771:exon_15838330_15838439:ZRSR2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 16859628 G/A 1 1 13 14 0.472934566183891 6.85185063960942 -6.37891607342553 A:G G A 10 0.527065433816109 0.000592602378086097 ENSG00000086712:ENST00000380122:exon_16859551_16862642:TXLNG;ENSG00000086712:ENST00000398155:exon_16859551_16860296:TXLNG;ENSG00000086712:ENST00000485153:exon_16859551_16862642:TXLNG HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 23722835 A/G 1 112 2 114 52.9686714125958 1.05413086763222 51.9145405449636 A:G A G 10 0.527065433816109 1.25988926299574e-28 ENSG00000123130:ENST00000379303:exon_23722811_23722961:ACOT9;ENSG00000123130:ENST00000336430:exon_23722811_23722961:ACOT9;ENSG00000123130:ENST00000379297:exon_23722811_23722961:ACOT9;ENSG00000123130:ENST00000379295:exon_23722811_23722961:ACOT9;ENSG00000123130:ENST00000494361:exon_23722811_23722961:ACOT9 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 24075862 A/G 1 57 7 64 26.9572702724818 3.68945803671276 23.267812235769 A:G A G 10 0.527065433816109 6.60944670356206e-10 ENSG00000130741:ENST00000253039:exon_24075750_24075871:EIF2S3;ENSG00000130741:ENST00000423068:exon_24075750_24075871:EIF2S3 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 24844699 C/A 1 14 1 15 6.62108392657447 0.527065433816109 6.09401849275836 A:C C A 10 0.527065433816109 0.00120765688843076 ENSG00000101868:ENST00000379068:exon_24844544_24844718:POLA1;ENSG00000101868:ENST00000379059:exon_24844544_24844718:POLA1;ENSG00000101868:ENST00000494204:exon_24844544_24844718:POLA1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 44401295 T/G 1 10 9 19 4.72934566183891 4.74358890434498 -0.0142432425060717 T:G T G 10 0.527065433816109 1 ENSG00000069509:ENST00000378045:exon_44401191_44401347:FUNDC1;ENSG00000069509:ENST00000483115:exon_44401191_44401550:FUNDC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 47444985 T/C 1 4 161 165 1.89173826473556 84.8575348443936 -82.965796579658 T:C T C 10 0.527065433816109 1.03257505844617e-46 ENSG00000102265:ENST00000218388:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377018:exon_47444335_47445482:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000456754:exon_47444604_47445422:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377017:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377013:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000445623:exon_47444741_47445066:TIMP1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 54841737 G/A 0 114 0 114 53.9145405449636 0 53.9145405449636 G G 10 0.527065433816109 2.03011246825633e-32 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54841681_54842123:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375062:exon_54841681_54842127:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54841681_54842127:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54841681_54842127:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000441374:exon_54841681_54842127:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000454156:exon_54841681_54842127:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54841681_54842440:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54841681_54842127:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54841681_54842123:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375060:exon_54841681_54842123:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54841681_54842127:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54841681_54842127:MAGED2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 55172580 G/C 0 0 40 40 0 21.0826173526444 -21.0826173526444 C G C 10 0.527065433816109 9.81843542603215e-14 ENSG00000182518:ENST00000472571:exon_55171789_55172744:FAM104B;ENSG00000182518:ENST00000477847:exon_55171820_55172744:FAM104B;ENSG00000182518:ENST00000489298:exon_55172371_55172744:FAM104B HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 55479299 G/A 1 1 44 45 0.472934566183891 23.1908790879088 -22.7179445217249 A:G G A 10 0.527065433816109 1.18822358322789e-13 ENSG00000187601:ENST00000342972:exon_55478538_55479998:MAGEH1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 70777405 C/G 0 0 15 15 0 7.90598150724164 -7.90598150724164 G C G 10 0.527065433816109 1.32438989383164e-05 ENSG00000147162:ENST00000373719:exon_70777343_70777522:OGT;ENSG00000147162:ENST00000488174:exon_70777343_70777522:OGT;ENSG00000147162:ENST00000373701:exon_70777343_70777522:OGT;ENSG00000147162:ENST00000415630:exon_70777343_70777522:OGT HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 71791912 C/T 0 9 0 9 4.25641109565502 0 4.25641109565502 C C 10 0.527065433816109 0.0043225365335067 ENSG00000147099:ENST00000373573:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373583:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373589:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000429103:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373568:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000436675:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000415409:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000440442:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000412342:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373571:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000439122:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373560:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373559:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373561:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000478743:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000421523:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373556:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373554:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000340176:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000444609:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000486704:exon_71791796_71791959:HDAC8 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 76937963 G/C 1 4 87 91 1.89173826473556 45.8546927420015 -43.9629544772659 C:G G C 10 0.527065433816109 1.50094949892115e-23 ENSG00000085224:ENST00000373344:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000395603:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000480283:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000395605:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000343347:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000400862:exon_76937807_76938943:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000400861:exon_76937807_76938943:ATRX HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 100608191 G/A 1 233 2 235 110.193753920847 1.05413086763222 109.139623053214 A:G G A 10 0.527065433816109 1.16171222365030e-61 ENSG00000010671:ENST00000372880:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000372869:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000372855:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000372859:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000372860:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000395179:exon_100608182_100608203:BTK;ENSG00000010671:ENST00000308731:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000443591:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000470069:exon_100608031_100608339:BTK HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 102842041 T/C 1 312 3 315 147.555584649374 1.58119630144833 145.974388347926 T:C T C 10 0.527065433816109 9.98258027841045e-82 ENSG00000133142:ENST00000372629:exon_102841577_102842446:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000414064:exon_102841578_102842653:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000468024:exon_102841577_102842446:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000472484:exon_102841577_102842657:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000415568:exon_102841582_102842430:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000472745:exon_102841577_102842622:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000494801:exon_102841582_102842454:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000452632:exon_102841878_102842251:TCEAL4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 118763406 C/T 1 4 284 288 1.89173826473556 149.686583203775 -147.794844939039 A:T:C C T 10 0.527065433816109 9.65425524724652e-86 ENSG00000125354:ENST00000360156:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000394616:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000520510:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000525360:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000394617:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000354228:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000460411:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000489216:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000354416:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000371492:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000394612:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000394610:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000343984:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000467310:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000481072:exon_118762779_118763471:SEPT6 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 118892888 G/C 0 0 12 12 0 6.32478520579331 -6.32478520579331 C G C 10 0.527065433816109 0.000125202409378208 ENSG00000187808:ENST00000343905:exon_118892576_118894127:ANKRD58 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 118893137 T/C 0 0 10 10 0 5.27065433816109 -5.27065433816109 C T C 10 0.527065433816109 0.000559771227864236 ENSG00000187808:ENST00000343905:exon_118892576_118894127:ANKRD58 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 118893413 T/C 0 0 13 13 0 6.85185063960942 -6.85185063960942 C T C 10 0.527065433816109 5.92125471644606e-05 ENSG00000187808:ENST00000343905:exon_118892576_118894127:ANKRD58 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 119590533 T/A 0 24 0 24 11.3504295884134 0 11.3504295884134 T T 10 0.527065433816109 2.26902357091146e-07 ENSG00000005893:ENST00000434600:exon_119590506_119590624:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000200639:exon_119590506_119590624:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000371335:exon_119590506_119590624:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000371345:exon_119590506_119590624:LAMP2 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 119760629 A/T 1 2 41 43 0.945869132367782 21.6096827864605 -20.6638136540927 A:T A T 10 0.527065433816109 1.32532533742127e-11 ENSG00000171155:ENST00000304661:exon_119759648_119761026:C1GALT1C1;ENSG00000171155:ENST00000371313:exon_119759786_119761026:C1GALT1C1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 129201153 G/A 0 0 23 23 0 12.1225049777705 -12.1225049777705 A G A 10 0.527065433816109 3.31454802312191e-08 ENSG00000102034:ENST00000335997:exon_129198849_129201500:ELF4;ENSG00000102034:ENST00000455513:exon_129198849_129201500:ELF4;ENSG00000102034:ENST00000308167:exon_129198903_129201500:ELF4;ENSG00000102034:ENST00000527455:exon_129198903_129201500:ELF4 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 129283520 A/G 0 36 0 36 17.0256443826201 0 17.0256443826201 A A 10 0.527065433816109 1.7778273869037e-10 ENSG00000156709:ENST00000416073:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000527892:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000319908:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000287295:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000529877:exon_129283444_129283543:AIFM1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 129306052 C/G 0 44 0 44 20.8091209120912 0 20.8091209120912 C C 10 0.527065433816109 8.2391943900537e-13 ENSG00000134594:ENST00000257017:exon_129305623_129306294:RAB33A HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 134185997 T/A 0 0 26 26 0 13.7037012792188 -13.7037012792188 A T A 10 0.527065433816109 3.50612574170348e-09 ENSG00000203950:ENST00000518153:exon_134185947_134186120:FAM127B;ENSG00000203950:ENST00000370775:exon_134184962_134186205:FAM127B;ENSG00000203950:ENST00000520964:exon_134185947_134186226:FAM127B;ENSG00000203950:ENST00000522309:exon_134185947_134186171:FAM127B HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 148582549 G/A 0 23 0 23 10.8774950222295 0 10.8774950222295 G G 10 0.527065433816109 4.33905424300581e-07 ENSG00000010404:ENST00000340855:exon_148582480_148582568:IDS;ENSG00000010404:ENST00000466323:exon_148582480_148582568:IDS;ENSG00000010404:ENST00000370441:exon_148582480_148582568:IDS;ENSG00000010404:ENST00000490775:exon_148582480_148582568:IDS;ENSG00000010404:ENST00000464251:exon_148582480_148582568:IDS;ENSG00000010404:ENST00000370443:exon_148582480_148582568:IDS HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 153195393 G/A 1 182 2 184 86.0740910454682 1.05413086763222 85.0199601778359 A:G G A 10 0.527065433816109 1.31991246245489e-47 ENSG00000102030:ENST00000464845:exon_153194695_153195676:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000482485:exon_153195280_153195676:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000370015:exon_153195367_153195760:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000393712:exon_153195374_153195756:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000370009:exon_153195377_153195676:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000466877:exon_153195379_153195676:NAA10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 153196345 G/A 0 9 0 9 4.25641109565502 0 4.25641109565502 G G 10 0.527065433816109 0.0043225365335067 ENSG00000102030:ENST00000482485:exon_153196216_153196893:NAA10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 153219665 C/T 0 18 0 18 8.51282219131004 0 8.51282219131004 C C 10 0.527065433816109 1.12537829388804e-05 ENSG00000172534:ENST00000310441:exon_153219517_153220993:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000369984:exon_153219517_153220993:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000354233:exon_153219517_153220993:HCFC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 153220360 A/G 1 15 3 18 7.09401849275836 1.58119630144833 5.51282219131004 A:G A G 10 0.527065433816109 0.00906925704428758 ENSG00000172534:ENST00000310441:exon_153219517_153220993:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000369984:exon_153219517_153220993:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000354233:exon_153219517_153220993:HCFC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 153220978 T/C 1 17 1 18 8.03988762512615 0.527065433816109 7.51282219131004 T:C T C 10 0.527065433816109 0.000198493747670646 ENSG00000172534:ENST00000310441:exon_153219517_153220993:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000369984:exon_153219517_153220993:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000354233:exon_153219517_153220993:HCFC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 153221657 T/C 0 19 0 19 8.98575675749393 0 8.98575675749393 T T 10 0.527065433816109 5.85564597738366e-06 ENSG00000172534:ENST00000310441:exon_153221642_153221862:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000369984:exon_153221642_153221862:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000354233:exon_153221642_153221862:HCFC1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 153247722 C/T 0 10 0 10 4.72934566183891 0 4.72934566183891 C C 10 0.527065433816109 0.00221418962581423 ENSG00000177854:ENST00000369982:exon_153247301_153248646:TMEM187 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 153247745 A/G 0 9 0 9 4.25641109565502 0 4.25641109565502 A A 10 0.527065433816109 0.0043225365335067 ENSG00000177854:ENST00000369982:exon_153247301_153248646:TMEM187 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 153247954 C/T 0 13 0 13 6.14814936039058 0 6.14814936039058 C C 10 0.527065433816109 0.000301448697684757 ENSG00000177854:ENST00000369982:exon_153247301_153248646:TMEM187 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 153248248 G/A 0 23 0 23 10.8774950222295 0 10.8774950222295 G G 10 0.527065433816109 4.33905424300581e-07 ENSG00000177854:ENST00000369982:exon_153247301_153248646:TMEM187 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 153278829 G/A 0 0 40 40 0 21.0826173526444 -21.0826173526444 A G A 10 0.527065433816109 9.81843542603215e-14 ENSG00000184216:ENST00000369980:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369974:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369973:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000444254:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000443220:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000467236:exon_153278787_153278884:IRAK1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 153284192 A/G 0 0 21 21 0 11.0683741101383 -11.0683741101383 G A G 10 0.527065433816109 1.48191127146221e-07 ENSG00000184216:ENST00000369980:exon_153284050_153284238:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369974:exon_153284050_153284238:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000393682:exon_153284050_153284238:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369973:exon_153284050_153284238:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000393687:exon_153284050_153284238:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000429936:exon_153284050_153284238:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000463031:exon_153284050_153284396:IRAK1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 153284483 G/A 0 0 29 29 0 15.2848975806672 -15.2848975806672 A G A 10 0.527065433816109 3.70877646993852e-10 ENSG00000184216:ENST00000369980:exon_153284426_153284529:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369974:exon_153284426_153284529:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000393682:exon_153284426_153284529:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000444230:exon_153284426_153284529:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369973:exon_153284426_153284529:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000393687:exon_153284426_153284529:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000429936:exon_153284426_153284529:IRAK1 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 153628119 T/C 0 0 49 49 0 25.8262062569893 -25.8262062569893 C T C 10 0.527065433816109 1.16212221459801e-16 ENSG00000147403:ENST00000482732:exon_153627679_153629254:RPL10 HGDP00239_parsed_pileup.txt . X 154507173 T/G 1 25 2 27 11.8233641545973 1.05413086763222 10.7692332869651 T:G T G 10 0.527065433816109 1.70082927926692e-05 ENSG00000155962:ENST00000369449:exon_154505500_154507353:CLIC2;ENSG00000155962:ENST00000422096:exon_154505526_154507353:CLIC2;ENSG00000155962:ENST00000360485:exon_154505526_154507353:CLIC2