INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 935280 G/T 1 6 5 11 2.82984090094666 2.64179924921111 0.188041651735547 T:G G T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000188290:ENST00000428771:exon_935072_935552:HES4;ENSG00000188290:ENST00000304952:exon_935246_935491:HES4;ENSG00000188290:ENST00000481869:exon_934906_935476:HES4;ENSG00000188290:ENST00000484667:exon_935246_935361:HES4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 1190523 C/T 1 186 202 388 87.7250679293465 106.728689668129 -19.0036217387825 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0597741061579763 ENSG00000160087:ENST00000450390:exon_1189289_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000347370:exon_1189294_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000349431:exon_1189850_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000339385:exon_1190304_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000348298:exon_1190304_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000400929:exon_1190365_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000464036:exon_1190428_1190867:UBE2J2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 1247494 T/C 1 163 127 290 76.8773444757177 67.1017009299623 9.77564354575534 T:C T C 10 0.528359849842223 0.263929205584296 ENSG00000127054:ENST00000470030:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000497304:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000323275:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000411962:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000462432:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000478641:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000421495:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000419704:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532772:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000485710:exon_1247460_1247527:CPSF3L HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 1249187 G/A 1 56 56 112 26.4118484088355 29.5881515911645 -3.17630318232897 A:G G A 10 0.528359849842223 0.570934731348282 ENSG00000127054:ENST00000470030:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000323275:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000411962:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000462432:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000478641:exon_1249112_1250550:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000421495:exon_1249112_1249485:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000419704:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532772:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000485710:exon_1249112_1249205:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531377:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527383:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531292:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000467408:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000434694:exon_1249125_1249301:CPSF3L HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 1342612 G/C 1 289 339 628 136.304003395598 179.113989096514 -42.809985700916 A:C:G G C 10 0.528359849842223 0.000670576698672736 ENSG00000242485:ENST00000344843:exon_1342511_1342693:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000487659:exon_1342511_1342648:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000482352:exon_1342511_1342670:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000477686:exon_1342511_1342615:MRPL20 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 1390875 C/T 0 17 0 17 8.01788255268221 0 8.01788255268221 C C 10 0.528359849842223 2.23171438281669e-05 ENSG00000215915:ENST00000378785:exon_1390840_1390899:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000435474:exon_1390840_1390899:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000475091:exon_1390840_1390899:ATAD3C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 1421531 C/A 1 12 6 18 5.65968180189332 3.17015909905334 2.48952270283999 A:C C A 10 0.528359849842223 0.345434571692356 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1421162_1421615:ATAD3B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 1425700 T/C 1 30 24 54 14.1492045047333 12.6806363962134 1.46856810851996 T:C T C 10 0.528359849842223 0.785488285002248 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1425634_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1424584_1426051:ATAD3B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 1430985 C/T 1 41 34 75 19.3372461564689 17.9642348946356 1.37301126183328 T:C C T 10 0.528359849842223 0.817376729159615 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1430865_1433228:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1430865_1431581:ATAD3B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 1551927 T/C 1 8 3 11 3.77312120126222 1.58507954952667 2.18804165173555 T:C T C 10 0.528359849842223 0.234829965499602 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000477990:exon_1551888_1554590:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514363:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000502470:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507082:exon_1551888_1553278:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000463492:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000510793:exon_1551654_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1551690_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1551691_1551994:MIB2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 1562536 G/A 1 6 6 12 2.82984090094666 3.17015909905334 -0.340318198106676 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378708:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000506488:exon_1562217_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514234:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505370:exon_1562454_1562587:MIB2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 1635565 C/T 1 16 7 23 7.54624240252443 3.69851894889556 3.84772345362887 T:C C T 10 0.528359849842223 0.143024131146224 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000463652:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635478_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468800:exon_1635488_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000464748:exon_1635538_1635585:CDK11A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 1684472 C/T 1 31 22 53 14.6208446548911 11.6239166965289 2.99692795836218 T:C C T 10 0.528359849842223 0.491889632652061 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1683910_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000498806:exon_1684414_1684499:NADK HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 2494330 G/A 1 166 152 318 78.292264926191 80.3106971760179 -2.01843224982689 A:G G A 10 0.528359849842223 0.822504997316854 ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000475523:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2492933_2495188:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000466750:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000427661:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463835:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000482602:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000480305:exon_2494304_2494335:TNFRSF14 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 3548136 T/C 1 7 11 18 3.30148105110444 5.81195834826445 -2.51047729716001 T:C T C 10 0.528359849842223 0.248719564040320 ENSG00000116213:ENST00000270708:exon_3548030_3548221:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378322:exon_3547331_3548221:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378317:exon_3547331_3548221:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378320:exon_3548030_3548221:WDR8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 3703698 A/G 1 12 10 22 5.65968180189332 5.28359849842223 0.376083303471095 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000130764:ENST00000378251:exon_3703413_3703874:LRRC47 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 6278414 A/G 1 3 6 9 1.41492045047333 3.17015909905334 -1.75523864858001 A:G A G 10 0.528359849842223 0.322385551531720 ENSG00000158286:ENST00000377948:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000377939:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000496676:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000483336:exon_6278349_6278429:RNF207 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 8418644 C/A 1 6 2 8 2.82984090094666 1.05671969968445 1.77312120126222 A:C C A 10 0.528359849842223 0.29537924054388 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8418256_8418976:RERE HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 8418650 T/C 1 6 2 8 2.82984090094666 1.05671969968445 1.77312120126222 T:C T C 10 0.528359849842223 0.29537924054388 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8418256_8418976:RERE HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 8921419 T/C 1 3774 3208 6982 1779.96992669545 1694.97839829385 84.9915284015995 T:C:G T C 10 0.528359849842223 0.0415780550057452 ENSG00000074800:ENST00000234590:exon_8921061_8921488:ENO1;ENSG00000074800:ENST00000464920:exon_8921064_8921488:ENO1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 10460485 T/C 1 18 21 39 8.48952270283999 11.0955568466867 -2.6060341438467 T:C T C 10 0.528359849842223 0.426218464944339 ENSG00000142657:ENST00000491493:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000377062:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000477958:exon_10460433_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000465632:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10460450_10460629:PGD HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 10473196 C/T 1 33 46 79 15.5641249552066 24.3045530927423 -8.74042813753561 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0551430667182121 ENSG00000142657:ENST00000490057:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000483936:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000493288:exon_10472891_10473308:PGD HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 11132217 G/A 1 37 22 59 17.4506855558378 11.6239166965289 5.82676885930885 A:G G A 10 0.528359849842223 0.151310485559417 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000469634:exon_11130957_11133083:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000478271:exon_11132144_11132452:EXOSC10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 11141187 C/G 1 25 18 43 11.7910037539444 9.51047729716001 2.28052645678441 C:G C G 10 0.528359849842223 0.54283693699514 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11141139_11141295:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11141139_11141295:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11141139_11141274:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000485606:exon_11141139_11141295:EXOSC10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 11728952 C/T 1 9 14 23 4.24476135141999 7.39703789779112 -3.15227654637113 T:C C T 10 0.528359849842223 0.213695268661202 ENSG00000116663:ENST00000376749:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000376753:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000474239:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000449067:exon_11728753_11729001:FBXO6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 12009955 C/T 1 3 6 9 1.41492045047333 3.17015909905334 -1.75523864858001 T:C C T 10 0.528359849842223 0.322385551531720 ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000449038:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12009830_12009963:PLOD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 12012748 G/A 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 A:G G A 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12012680_12012792:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000449038:exon_12012680_12012748:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12012680_12012792:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12012680_12012792:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12012680_12012792:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12012680_12012792:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12012680_12012792:PLOD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 12024235 C/T 1 5 6 11 2.35820075078889 3.17015909905334 -0.811958348264453 T:C C T 10 0.528359849842223 0.765428811190486 ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12024232_12024357:PLOD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 12082926 A/G 1 15 17 32 7.07460225236666 8.98211744731779 -1.90751519495113 A:G A G 10 0.528359849842223 0.596108751890824 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12082921_12082974:MIIP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 12252955 T/G 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 T:G T G 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000028137:ENST00000376259:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000492361:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000400863:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000489921:exon_12252920_12253065:TNFRSF1B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 12252976 C/T 1 3 6 9 1.41492045047333 3.17015909905334 -1.75523864858001 T:C C T 10 0.528359849842223 0.322385551531720 ENSG00000028137:ENST00000376259:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000492361:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000400863:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000489921:exon_12252920_12253065:TNFRSF1B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 12266945 C/T 1 14 23 37 6.60296210220888 12.1522765463711 -5.54931444416225 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0717918579058638 ENSG00000028137:ENST00000376259:exon_12266797_12269285:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000492361:exon_12266797_12269285:TNFRSF1B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 16056364 G/A 1 11 9 20 5.18804165173555 4.75523864858001 0.432803003155541 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000477849:exon_16056340_16056424:PLEKHM2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 16271260 G/A 1 14 9 23 6.60296210220888 4.75523864858001 1.84772345362887 A:G G A 10 0.528359849842223 0.533037275926842 ENSG00000116809:ENST00000375743:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375733:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444654:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375729:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000448462:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000492834:exon_16271192_16271334:ZBTB17 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 16577908 G/C 1 21 15 36 9.90444315331332 7.92539774763334 1.97904540567997 C:G G C 10 0.528359849842223 0.617184618708526 ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16573334_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000456164:exon_16577577_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000444116:exon_16577577_16578280:FBXO42 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 17314702 C/T 1 13 10 23 6.1313219520511 5.28359849842223 0.847723453628872 T:C C T 10 0.528359849842223 0.835609051250035 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17314633_17314729:ATP13A2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 17739586 G/A 1 5 6 11 2.35820075078889 3.17015909905334 -0.811958348264453 A:G G A 10 0.528359849842223 0.765428811190486 ENSG00000179051:ENST00000375436:exon_17739569_17739674:RCC2;ENSG00000179051:ENST00000375433:exon_17739569_17739674:RCC2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 19950064 G/A 1 163 195 358 76.8773444757177 103.030170719233 -26.1528262435158 A:G G A 10 0.528359849842223 0.00587623226907056 ENSG00000173436:ENST00000486890:exon_19949968_19950284:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000322753:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000467029:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000481464:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000498642:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000485362:exon_19949968_19950077:C1orf151 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 20977000 A/C 1 11 6 17 5.18804165173555 3.17015909905334 2.01788255268221 A:C A C 10 0.528359849842223 0.467320757987905 ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 20982631 G/A 1 61 43 104 28.7700491596244 22.7194735432156 6.05057561640881 A:G G A 10 0.528359849842223 0.240366635108688 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000486473:exon_20982594_20982680:DDOST HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 24077451 C/T 1 18 12 30 8.48952270283999 6.34031819810668 2.14920450473331 T:C C T 10 0.528359849842223 0.46922644197021 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24077335_24078520:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24077335_24078520:TCEB3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 25291010 A/T 1 5 10 15 2.35820075078889 5.28359849842223 -2.92539774763334 A:T A T 10 0.528359849842223 0.194650532535346 ENSG00000020633:ENST00000399916:exon_25291005_25291501:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000428150:exon_25291005_25291501:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000338888:exon_25291005_25291159:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000479341:exon_25291005_25291070:RUNX3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 26496651 T/C 1 239 255 494 112.721995887709 134.731761709767 -22.0097658220581 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0474985568745276 ENSG00000142684:ENST00000374266:exon_26496362_26496674:ZNF593;ENSG00000142684:ENST00000270812:exon_26496433_26496674:ZNF593 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 26515956 C/A 1 2 6 8 0.943280300315554 3.17015909905334 -2.22687879873778 A:C C A 10 0.528359849842223 0.159873274171007 ENSG00000142675:ENST00000361530:exon_26515770_26516377:CNKSR1;ENSG00000142675:ENST00000374253:exon_26515770_26516375:CNKSR1;ENSG00000142675:ENST00000482227:exon_26515770_26516373:CNKSR1;ENSG00000142675:ENST00000531191:exon_26515770_26516337:CNKSR1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 26609259 C/T 1 12 21 33 5.65968180189332 11.0955568466867 -5.43587504479336 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0797115509543596 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000486658:exon_26609140_26609280:UBXN11 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 26610891 A/C 1 15 15 30 7.07460225236666 7.92539774763334 -0.850795495266688 A:C:G A C 10 0.528359849842223 0.855436110683853 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26610853_26612032:UBXN11 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 26646726 A/G 1 1456 1315 2771 686.708058629723 694.793202542523 -8.08514391279982 A:G A G 10 0.528359849842223 0.760824275627644 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 26646730 A/G 1 1438 1300 2738 678.218535926883 686.86780479489 -8.6492688680064 A:C:G A G 10 0.528359849842223 0.744895680547794 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 27942276 G/A 1 23 19 42 10.8477234536289 10.0388371470022 0.808886306626636 A:G G A 10 0.528359849842223 0.877691071070743 ENSG00000000938:ENST00000374005:exon_27942200_27942355:FGR;ENSG00000000938:ENST00000399173:exon_27942200_27942355:FGR;ENSG00000000938:ENST00000374004:exon_27942200_27942355:FGR;ENSG00000000938:ENST00000374003:exon_27942200_27942355:FGR;ENSG00000000938:ENST00000457296:exon_27942200_27942355:FGR HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 29475648 T/G 1 37 49 86 17.4506855558378 25.8896326422689 -8.43894708643117 T:G T G 10 0.528359849842223 0.0833919122567508 ENSG00000116350:ENST00000373795:exon_29474255_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000434636:exon_29475262_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000466448:exon_29475183_29475738:SRSF4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 29529699 T/C 1 16 7 23 7.54624240252443 3.69851894889556 3.84772345362887 T:C T C 10 0.528359849842223 0.143024131146224 ENSG00000116353:ENST00000373791:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000398820:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000373792:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000475773:exon_29529643_29529713:MECR;ENSG00000116353:ENST00000263702:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000478505:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000463412:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000453185:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000489248:exon_29529654_29529745:MECR HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 29542637 A/G 1 7 6 13 3.30148105110444 3.17015909905334 0.131321952051101 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000116353:ENST00000373791:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000398820:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000373792:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000263702:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000473030:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000478505:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000490529:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000463052:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000489248:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000475861:exon_29542513_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000472630:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000474946:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000464915:exon_29542549_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000482610:exon_29542605_29542648:MECR HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 31206637 C/T 1 293 389 682 138.190563996229 205.531981588625 -67.3414175923961 A:T:C C T 10 0.528359849842223 2.55829975921773e-07 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31205316_31206764:LAPTM5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 31208042 C/T 1 228 257 485 107.533954235973 135.788481409451 -28.2545271734781 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0108177603333776 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31208020_31208112:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000424259:exon_31208020_31208112:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000464569:exon_31208020_31208112:LAPTM5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 31215364 T/C 1 42 40 82 19.8088863066266 21.1343939936889 -1.32550768706228 T:C T C 10 0.528359849842223 0.825178527206924 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000424259:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000464569:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000476492:exon_31214536_31215396:LAPTM5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 31732892 G/A 1 106 95 201 49.9938559167244 50.1941857350112 -0.200329818286818 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000060688:ENST00000263694:exon_31732417_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000486941:exon_31732520_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000489853:exon_31732521_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000373720:exon_31732557_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000491106:exon_31732633_31732968:SNRNP40 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 31842320 T/C 1 12 9 21 5.65968180189332 4.75523864858001 0.904443153313317 T:C T C 10 0.528359849842223 0.827907977261945 ENSG00000121769:ENST00000373713:exon_31842232_31842404:FABP3;ENSG00000121769:ENST00000497275:exon_31842232_31842437:FABP3;ENSG00000121769:ENST00000498148:exon_31842232_31842404:FABP3;ENSG00000121769:ENST00000482018:exon_31842232_31842404:FABP3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 32096265 A/G 1 98 86 184 46.2207347154622 45.4389470864312 0.78178762903098 A:G A G 10 0.528359849842223 0.941202941741825 ENSG00000162517:ENST00000373703:exon_32095463_32096443:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000461006:exon_32095941_32096333:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000478502:exon_32096050_32096443:PEF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 32384596 T/C 1 20 27 47 9.43280300315554 14.26571594574 -4.83291294258448 T:C T C 10 0.528359849842223 0.188425078694617 ENSG00000184007:ENST00000344035:exon_32384571_32385259:PTP4A2;ENSG00000184007:ENST00000457805:exon_32384571_32385259:PTP4A2;ENSG00000184007:ENST00000356536:exon_32384571_32385259:PTP4A2;ENSG00000184007:ENST00000470404:exon_32384571_32384724:PTP4A2;ENSG00000184007:ENST00000532001:exon_32384571_32384960:PTP4A2;ENSG00000184007:ENST00000528253:exon_32384571_32385065:PTP4A2;ENSG00000184007:ENST00000484483:exon_32384571_32384773:PTP4A2;ENSG00000184007:ENST00000468531:exon_32384571_32385259:PTP4A2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 32667609 C/T 1 142 139 281 66.9729013224043 73.442019128069 -6.46911780566465 T:C C T 10 0.528359849842223 0.473428050044156 ENSG00000160050:ENST00000373602:exon_32667514_32667700:CCDC28B;ENSG00000160050:ENST00000469003:exon_32667514_32667700:CCDC28B;ENSG00000160050:ENST00000421922:exon_32667514_32667700:CCDC28B;ENSG00000160050:ENST00000461819:exon_32667514_32667700:CCDC28B;ENSG00000160050:ENST00000483009:exon_32667297_32667700:CCDC28B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 33790496 G/A 1 7 12 19 3.30148105110444 6.34031819810668 -3.03883714700224 A:G G A 10 0.528359849842223 0.175485662480834 ENSG00000134686:ENST00000431992:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000419414:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000307890:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000361167:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000257118:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000373422:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000373418:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000485928:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000467894:exon_33790290_33790620:PHC2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 36787888 G/A 1 24 32 56 11.3193636037866 16.9075151949511 -5.58815159116449 A:G G A 10 0.528359849842223 0.142572014512912 ENSG00000142694:ENST00000270824:exon_36787632_36788326:FAM176B;ENSG00000142694:ENST00000490466:exon_36787882_36788326:FAM176B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 36820927 G/A 1 10 1 11 4.71640150157777 0.528359849842223 4.18804165173555 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0131144496962102 ENSG00000196182:ENST00000373129:exon_36820807_36821034:STK40;ENSG00000196182:ENST00000359297:exon_36820807_36821034:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373130:exon_36820807_36821034:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373132:exon_36820807_36821034:STK40;ENSG00000196182:ENST00000425273:exon_36820807_36821034:STK40;ENSG00000196182:ENST00000460417:exon_36820806_36821034:STK40;ENSG00000196182:ENST00000473733:exon_36820854_36821034:STK40;ENSG00000196182:ENST00000482458:exon_36820890_36821034:STK40 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 36921847 G/C 1 128 128 256 60.3699392201955 67.6300607798045 -7.26012155960908 C:G G C 10 0.528359849842223 0.381019566653248 ENSG00000116898:ENST00000373116:exon_36921788_36921979:MRPS15;ENSG00000116898:ENST00000488606:exon_36921788_36921979:MRPS15;ENSG00000116898:ENST00000477040:exon_36921788_36922167:MRPS15;ENSG00000116898:ENST00000462067:exon_36921788_36921979:MRPS15 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 38327982 G/T 1 33 15 48 15.5641249552066 7.92539774763334 7.6387272075733 T:G G T 10 0.528359849842223 0.0298641816311955 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38327740_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38327757_38328102:INPP5B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 38338795 A/G 1 5 5 10 2.35820075078889 2.64179924921111 -0.283598498422229 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000474758:exon_38338602_38339059:INPP5B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 38449910 T/C 1 10 11 21 4.71640150157777 5.81195834826445 -1.09555684668668 T:C T C 10 0.528359849842223 0.667251391828987 ENSG00000183431:ENST00000373019:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000448721:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000489537:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000461869:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000470585:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000462258:exon_38449790_38449932:SF3A3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 38463504 C/T 1 14 9 23 6.60296210220888 4.75523864858001 1.84772345362887 T:C C T 10 0.528359849842223 0.533037275926842 ENSG00000183386:ENST00000373016:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000485803:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000475084:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000477194:exon_38463356_38463542:FHL3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 40030823 C/T 1 111 123 234 52.3520566675133 64.9882615305934 -12.6362048630802 T:C C T 10 0.528359849842223 0.101819097789326 ENSG00000090621:ENST00000441204:exon_40030778_40031050:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000372862:exon_40030778_40031050:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000372858:exon_40030778_40031050:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000372857:exon_40030778_40031050:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000372856:exon_40030778_40031050:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000421687:exon_40030778_40031050:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000525045:exon_40030778_40030905:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000527718:exon_40030778_40031050:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000483770:exon_40030778_40030855:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000525669:exon_40030778_40031050:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000470443:exon_40030778_40031050:PABPC4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 40882753 A/G 1 82 88 170 38.6744923129377 46.4956667861156 -7.8211744731779 A:G A G 10 0.528359849842223 0.249266816301158 ENSG00000084070:ENST00000372718:exon_40882452_40882768:SMAP2;ENSG00000084070:ENST00000372708:exon_40882452_40882768:SMAP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 40980731 G/T 1 14 16 30 6.60296210220888 8.45375759747557 -1.85079549526669 T:G G T 10 0.528359849842223 0.584418289971274 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000420209:exon_40980187_40980894:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000418186:exon_40980187_40980888:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000443729:exon_40980187_40980958:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000419161:exon_40980187_40980958:DEM1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 41204569 C/T 1 5 5 10 2.35820075078889 2.64179924921111 -0.283598498422229 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000066136:ENST00000397229:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372657:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000413180:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372658:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000467203:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000424419:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000427410:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372655:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000447388:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000425457:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000453631:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000456393:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372654:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000534399:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372653:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372669:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372652:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372651:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000531464:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000440226:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000525290:exon_41204506_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000530965:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000416859:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000308733:exon_41204510_41204620:NFYC HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 41454328 A/G 1 4 11 15 1.88656060063111 5.81195834826445 -3.92539774763334 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0667977720808296 ENSG00000171793:ENST00000372621:exon_41454266_41454382:CTPS;ENSG00000171793:ENST00000479480:exon_41454266_41454382:CTPS;ENSG00000171793:ENST00000372616:exon_41454266_41454382:CTPS;ENSG00000171793:ENST00000480420:exon_41454169_41454382:CTPS;ENSG00000171793:ENST00000484267:exon_41454220_41454382:CTPS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 43824865 C/T 1 27 32 59 12.73428405426 16.9075151949511 -4.17323114069115 T:C C T 10 0.528359849842223 0.298361275642707 ENSG00000117399:ENST00000310955:exon_43824838_43825067:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000437896:exon_43824838_43825067:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000372462:exon_43824684_43825067:CDC20 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 43826794 G/A 1 58 68 126 27.3551287091511 35.9284697892712 -8.57334108012009 A:G G A 10 0.528359849842223 0.130030738918577 ENSG00000117399:ENST00000310955:exon_43826791_43826916:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000437896:exon_43826791_43826916:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000372462:exon_43826791_43826916:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000482046:exon_43826729_43826916:CDC20 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 44437719 C/T 1 10 16 26 4.71640150157777 8.45375759747557 -3.7373560958978 T:C C T 10 0.528359849842223 0.170014402542493 ENSG00000132768:ENST00000255108:exon_44437059_44437742:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000524776:exon_44437059_44437742:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000495421:exon_44437059_44437742:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000412950:exon_44437059_44437742:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000459879:exon_44437332_44437742:DPH2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 45218895 A/T 1 5 4 9 2.35820075078889 2.11343939936889 0.244761351419994 A:T A T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000455186:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45218804_45218926:KIF2C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 45224998 A/C 1 17 13 30 8.01788255268221 6.8686780479489 1.14920450473331 A:C A C 10 0.528359849842223 0.71778823657468 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45224878_45225020:KIF2C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 45226084 G/A 1 16 11 27 7.54624240252443 5.81195834826445 1.73428405425998 A:G G A 10 0.528359849842223 0.566334390424242 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45225952_45226156:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45225952_45226156:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45225952_45226156:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45225952_45226156:KIF2C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 45270024 G/C 1 12 6 18 5.65968180189332 3.17015909905334 2.48952270283999 C:G G C 10 0.528359849842223 0.345434571692356 ENSG00000173846:ENST00000372201:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000465443:exon_45270011_45270451:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000492398:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000461358:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000461769:exon_45270011_45270173:PLK3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 45444038 G/A 1 5 8 13 2.35820075078889 4.22687879873778 -1.8686780479489 A:G G A 10 0.528359849842223 0.406657390173804 ENSG00000070785:ENST00000360403:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000372183:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000480675:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000477953:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000372182:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000487532:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000497010:exon_45443987_45444132:EIF2B3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 45469176 A/T 1 20 18 38 9.43280300315554 9.51047729716001 -0.0776742940044723 A:T A T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000372168:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486132:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45468220_45469248:HECTD3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 46073489 G/A 1 2 9 11 0.943280300315554 4.75523864858001 -3.81195834826445 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0308448779834246 ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000470768:exon_46072993_46073644:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46072993_46074009:NASP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 46500613 T/C 1 14 17 31 6.60296210220888 8.98211744731779 -2.37915534510891 T:C T C 10 0.528359849842223 0.472662474431109 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46500210_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46500501_46501738:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46500499_46501794:MAST2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 46501359 A/G 1 28 41 69 13.2059242044178 21.6627538435311 -8.45682963911339 A:G A G 10 0.528359849842223 0.052914111238518 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46500210_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46500501_46501738:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000498364:exon_46501171_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46500499_46501794:MAST2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 46806550 C/T 1 17 4 21 8.01788255268221 2.11343939936889 5.90444315331332 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0141365439778428 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46805849_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46806397_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46806461_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46806474_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46806492_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000472157:exon_46806501_46806591:NSUN4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 46810670 T/C 1 21 11 32 9.90444315331332 5.81195834826445 4.09248480504887 T:C T C 10 0.528359849842223 0.160100789084104 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46810454_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000475281:exon_46810473_46811046:NSUN4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 46827485 C/T 1 57 34 91 26.8834885589933 17.9642348946356 8.91925366435771 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0737208608003351 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46827242_46827863:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46827242_46827862:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46827242_46830824:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46827242_46827862:NSUN4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 47717189 A/G 1 5 6 11 2.35820075078889 3.17015909905334 -0.811958348264453 A:G A G 10 0.528359849842223 0.765428811190486 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371874:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47715814_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47716294_47717594:STIL HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 51121198 T/C 1 9 7 16 4.24476135141999 3.69851894889556 0.546242402524432 T:C T C 10 0.528359849842223 0.808617085826636 ENSG00000185104:ENST00000396153:exon_51121114_51121200:FAF1;ENSG00000185104:ENST00000494400:exon_51121114_51121200:FAF1;ENSG00000185104:ENST00000371778:exon_51121114_51121200:FAF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 52264064 A/G 1 22 24 46 10.3760833034711 12.6806363962134 -2.30455309274226 A:G A G 10 0.528359849842223 0.555681736219941 ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000497358:exon_52263921_52264083:NRD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 52266242 G/A 1 25 21 46 11.7910037539444 11.0955568466867 0.695446907257745 A:G G A 10 0.528359849842223 0.88335940097612 ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000497358:exon_52266228_52266355:NRD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 52498370 C/T 1 29 16 45 13.6775643545755 8.45375759747557 5.22380675709997 T:C C T 10 0.528359849842223 0.135922546251885 ENSG00000198841:ENST00000371614:exon_52497775_52499488:KTI12 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 52882406 A/G 1 91 81 172 42.9192536643577 42.7971478372201 0.122105827137652 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000134748:ENST00000257181:exon_52882320_52883992:PRPF38A;ENSG00000134748:ENST00000474048:exon_52882320_52882694:PRPF38A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 52991638 C/T 1 7 7 14 3.30148105110444 3.69851894889556 -0.397037897791122 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000134744:ENST00000257177:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371544:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000433200:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000528642:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000395916:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000473856:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000355809:exon_52991235_52992045:ZCCHC11 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 53153432 T/C 1 23 14 37 10.8477234536289 7.39703789779112 3.45068555583775 T:C T C 10 0.528359849842223 0.323333341671099 ENSG00000162377:ENST00000371538:exon_53152508_53153840:C1orf163;ENSG00000162377:ENST00000486918:exon_53153234_53153840:C1orf163 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 54433584 A/G 1 66 58 124 31.1282499104133 30.6448712908489 0.483378619564352 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000116212:ENST00000371370:exon_54433338_54433841:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000319223:exon_54433338_54433841:LRRC42 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 54683925 G/A 1 100 91 191 47.1640150157777 48.0807463356423 -0.916731319864581 A:G G A 10 0.528359849842223 0.942251300861497 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 55319902 A/G 1 9 6 15 4.24476135141999 3.17015909905334 1.07460225236666 A:G A G 10 0.528359849842223 0.61599879202346 ENSG00000116133:ENST00000371269:exon_55319710_55319907:DHCR24 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 58999651 T/G 1 10 4 14 4.71640150157777 2.11343939936889 2.60296210220888 T:G T G 10 0.528359849842223 0.189361454505222 ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_58999625_58999732:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_58999625_58999732:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_58999625_58999732:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000469854:exon_58999621_58999732:OMA1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 59002221 T/C 1 6 9 15 2.82984090094666 4.75523864858001 -1.92539774763334 T:C T C 10 0.528359849842223 0.439217229441099 ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000469854:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000456980:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000467063:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000419242:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000426139:exon_59002185_59002413:OMA1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 67861520 C/A 1 5 6 11 2.35820075078889 3.17015909905334 -0.811958348264453 A:C C A 10 0.528359849842223 0.765428811190486 ENSG00000081985:ENST00000262345:exon_67861230_67862583:IL12RB2;ENSG00000081985:ENST00000371000:exon_67861230_67862583:IL12RB2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 71536574 G/C 1 10 13 23 4.71640150157777 6.8686780479489 -2.15227654637113 C:G G C 10 0.528359849842223 0.408345653063064 ENSG00000132485:ENST00000370920:exon_71536510_71536679:ZRANB2;ENSG00000132485:ENST00000254821:exon_71536510_71536679:ZRANB2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 75175886 T/C 1 31 16 47 14.6208446548911 8.45375759747557 6.16708705741552 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0798778302363329 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75175793_75175931:CRYZ HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 75190452 C/T 1 15 12 27 7.07460225236666 6.34031819810668 0.73428405425998 T:C C T 10 0.528359849842223 0.848556223067985 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75190395_75190518:CRYZ HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 75214441 A/G 1 18 17 35 8.48952270283999 8.98211744731779 -0.492594744477804 A:G A G 10 0.528359849842223 0.867578930748504 ENSG00000162623:ENST00000370867:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000457880:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000479111:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000483990:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000485401:exon_75214325_75214506:TYW3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 78178976 T/A 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 A:T T A 10 0.528359849842223 0.743278251879842 ENSG00000077254:ENST00000477949:exon_78178885_78179193:USP33 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 85029077 C/T 1 8 5 13 3.77312120126222 2.64179924921111 1.1313219520511 T:C C T 10 0.528359849842223 0.589076720209571 ENSG00000117151:ENST00000477677:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370630:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370625:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000465118:exon_85028940_85029101:CTBS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 85724328 C/T 1 4 8 12 1.88656060063111 4.22687879873778 -2.34031819810668 T:C C T 10 0.528359849842223 0.248211150341394 ENSG00000162642:ENST00000294661:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000471115:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000493514:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000344356:exon_85724207_85724405:C1orf52 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 86818572 T/C 1 10 9 19 4.71640150157777 4.75523864858001 -0.0388371470022362 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86818542_86818667:ODF2L HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 86820267 C/T 1 8 11 19 3.77312120126222 5.81195834826445 -2.03883714700224 T:C C T 10 0.528359849842223 0.368087451982495 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000476054:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000473792:exon_86820213_86820375:ODF2L HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 87190079 T/C 1 20 17 37 9.43280300315554 8.98211744731779 0.450685555837751 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000097033:ENST00000212369:exon_87189996_87190088:SH3GLB1;ENSG00000097033:ENST00000482504:exon_87189996_87190088:SH3GLB1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 89579941 T/C 1 58 53 111 27.3551287091511 28.0030720416378 -0.647943332486751 T:C T C 10 0.528359849842223 0.924458205836236 ENSG00000162645:ENST00000464839:exon_89579699_89579979:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000370466:exon_89579699_89579979:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000463660:exon_89579699_89579979:GBP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 89582690 G/C 1 37 43 80 17.4506855558378 22.7194735432156 -5.26878798737783 C:G G C 10 0.528359849842223 0.263206629052633 ENSG00000162645:ENST00000464839:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000370466:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000463660:exon_89582675_89582917:GBP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 93620393 G/A 1 22 9 31 10.3760833034711 4.75523864858001 5.62084465489109 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0480611380761907 ENSG00000117500:ENST00000370282:exon_93615299_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000370290:exon_93617415_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000483033:exon_93619753_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000479918:exon_93619789_93620445:TMED5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 109338861 G/C 1 7 1 8 3.30148105110444 0.528359849842223 2.77312120126222 C:G G C 10 0.528359849842223 0.073836867977041 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109338856_109338994:STXBP3;ENSG00000116266:ENST00000472099:exon_109338857_109339348:STXBP3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 109479978 G/T 1 10 14 24 4.71640150157777 7.39703789779112 -2.68063639621335 T:G G T 10 0.528359849842223 0.310254011572794 ENSG00000121940:ENST00000356970:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000423586:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369969:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000415331:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369968:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369971:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369970:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000348264:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000302500:exon_109479699_109480040:CLCC1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 110466338 C/A 1 4 6 10 1.88656060063111 3.17015909905334 -1.28359849842223 A:C C A 10 0.528359849842223 0.531770325189017 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 111441829 C/T 1 475 406 881 224.029071324944 214.514099035943 9.51497228900161 T:C C T 10 0.528359849842223 0.543600379561836 ENSG00000143119:ENST00000429072:exon_111441746_111442558:CD53;ENSG00000143119:ENST00000271324:exon_111441746_111442550:CD53;ENSG00000143119:ENST00000476408:exon_111441746_111442136:CD53;ENSG00000143119:ENST00000497404:exon_111441746_111442473:CD53;ENSG00000143119:ENST00000464329:exon_111441746_111441938:CD53 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 111730901 C/T 1 16 11 27 7.54624240252443 5.81195834826445 1.73428405425998 T:C C T 10 0.528359849842223 0.566334390424242 ENSG00000162777:ENST00000468692:exon_111730753_111730992:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000357640:exon_111730753_111730992:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000369752:exon_111730753_111730992:DENND2D HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 111783982 C/T 1 239 108 347 112.721995887709 57.0628637829601 55.6591321047486 T:C C T 10 0.528359849842223 1.74319753295213e-09 ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000472825:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000529459:exon_111783949_111784065:CHI3L2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 111957097 C/G 1 8 3 11 3.77312120126222 1.58507954952667 2.18804165173555 C:G C G 10 0.528359849842223 0.234829965499602 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 111991768 G/A 1 4 7 11 1.88656060063111 3.69851894889556 -1.81195834826445 A:G G A 10 0.528359849842223 0.368338354344120 ENSG00000116455:ENST00000235090:exon_111991677_111991998:WDR77;ENSG00000116455:ENST00000411751:exon_111991677_111991878:WDR77;ENSG00000116455:ENST00000421211:exon_111991677_111991878:WDR77;ENSG00000116459:ENST00000369722:exon_111991558_111992203:ATP5F1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 114354654 T/C 1 9 12 21 4.24476135141999 6.34031819810668 -2.09555684668668 T:C T C 10 0.528359849842223 0.389033912530957 ENSG00000081019:ENST00000261441:exon_114354332_114355098:RSBN1;ENSG00000081019:ENST00000434941:exon_114354332_114354662:RSBN1;ENSG00000081019:ENST00000476412:exon_114354332_114354915:RSBN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 114438951 A/G 1 7 13 20 3.30148105110444 6.8686780479489 -3.56719699684446 A:G A G 10 0.528359849842223 0.121497809215565 ENSG00000134262:ENST00000369567:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369569:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000256658:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369566:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479285:exon_114437678_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000462591:exon_114438880_114440561:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479801:exon_114438667_114439087:AP4B1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 114443899 G/A 1 2 7 9 0.943280300315554 3.69851894889556 -2.75523864858001 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0939591166432567 ENSG00000134262:ENST00000369569:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000256658:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000484201:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369564:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000489092:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369571:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000472122:exon_114443858_114444005:AP4B1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 115280605 A/C 1 21 14 35 9.90444315331332 7.39703789779112 2.5074052555222 A:C A C 10 0.528359849842223 0.498860075577052 ENSG00000009307:ENST00000339438:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000438362:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000358528:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000369533:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000261443:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000530886:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000369530:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000534699:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000529046:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000525132:exon_115280584_115280693:CSDE1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 117617705 A/G 1 9 11 20 4.24476135141999 5.81195834826445 -1.56719699684446 A:G A G 10 0.528359849842223 0.509651795713 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000470935:exon_117617492_117618066:TTF2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 117618067 C/T 1 8 12 20 3.77312120126222 6.34031819810668 -2.56719699684446 T:C C T 10 0.528359849842223 0.270560515458782 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000469638:exon_117617917_117618481:TTF2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 145103928 G/A 0 0 20 20 0 10.5671969968445 -10.5671969968445 A G A 10 0.528359849842223 2.96630210023732e-07 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 27 27 0 14.26571594574 -14.26571594574 C T C 10 0.528359849842223 1.53989377018403e-09 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 23 23 0 12.1522765463711 -12.1522765463711 T G T 10 0.528359849842223 3.11205802669420e-08 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 20 20 0 10.5671969968445 -10.5671969968445 A C A 10 0.528359849842223 2.96630210023732e-07 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 65 0 65 30.6566097602555 0 30.6566097602555 G G 10 0.528359849842223 1.02318529798508e-18 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 46 46 0 24.3045530927423 -24.3045530927423 C T C 10 0.528359849842223 9.68490516151184e-16 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 50 50 0 26.4179924921111 -26.4179924921111 T C T 10 0.528359849842223 4.7922387677576e-17 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 150445282 T/A 1 11 8 19 5.18804165173555 4.22687879873778 0.961162852997764 A:T T A 10 0.528359849842223 0.819131241753216 ENSG00000163125:ENST00000492220:exon_150443037_150446032:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000401000:exon_150443037_150449042:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000369068:exon_150443037_150446032:RPRD2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 151315287 G/C 1 42 19 61 19.8088863066266 10.0388371470022 9.7700491596244 C:G G C 10 0.528359849842223 0.0142730269670542 ENSG00000143390:ENST00000290524:exon_151313116_151315654:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000368870:exon_151314305_151315654:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000452671:exon_151314436_151315654:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000392746:exon_151314723_151315654:RFX5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 151735576 T/C 1 26 30 56 12.2626439041022 15.8507954952667 -3.58815159116448 T:C T C 10 0.528359849842223 0.351523203003093 ENSG00000143436:ENST00000368830:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000467306:exon_151735426_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000368829:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000478926:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000486707:exon_151735431_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000481777:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000461182:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000462783:exon_151735093_151735622:MRPL9;ENSG00000143450:ENST00000418982:exon_151735445_151735643:OAZ3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 155030557 A/C 1 4 6 10 1.88656060063111 3.17015909905334 -1.28359849842223 A:C A C 10 0.528359849842223 0.531770325189017 ENSG00000143537:ENST00000527418:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000529473:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000526491:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000356955:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000449910:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000359280:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000360674:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368412:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000355956:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368410:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000271836:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000461564:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368413:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000531455:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000447332:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000472434:exon_155030327_155030631:ADAM15 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 155181989 G/A 1 42 41 83 19.8088863066266 21.6627538435311 -1.85386753690451 A:G G A 10 0.528359849842223 0.741841246615678 ENSG00000173171:ENST00000368376:exon_155181918_155182010:MTX1;ENSG00000173171:ENST00000424959:exon_155181918_155182010:MTX1;ENSG00000173171:ENST00000481771:exon_155180339_155182010:MTX1;ENSG00000173171:ENST00000495589:exon_155181918_155182010:MTX1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 157508882 C/T 1 19 15 34 8.96116285299776 7.92539774763334 1.03576510536442 T:C C T 10 0.528359849842223 0.735352506151453 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368189:exon_157508876_157509154:FCRL5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 158813819 A/G 1 27 26 53 12.73428405426 13.7373560958978 -1.00307204163782 A:T:G A G 10 0.528359849842223 0.785232731385051 ENSG00000163563:ENST00000368141:exon_158813745_158813912:MNDA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 158986477 G/C 1 114 96 210 53.7669771179866 50.7225455848534 3.04443153313318 C:G G C 10 0.528359849842223 0.679127667514823 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000447473:exon_158986323_158986482:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158986323_158986490:IFI16 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 158990247 A/G 1 60 62 122 28.2984090094666 32.7583106902178 -4.4599016807512 A:C:G A G 10 0.528359849842223 0.468318974145359 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_158990131_158990319:IFI16 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 159002377 C/A 1 54 65 119 25.46856810852 34.3433902397445 -8.87482213122453 A:C C A 10 0.528359849842223 0.118261558820815 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 159002389 T/A 1 48 65 113 22.6387272075733 34.3433902397445 -11.7046630321712 A:T T A 10 0.528359849842223 0.0300536786411888 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 159024668 A/T 1 324 288 612 152.81140865112 152.16763675456 0.643771896559542 A:T A T 10 0.528359849842223 0.96772421761876 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159024611_159024945:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159024611_159024918:IFI16 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 160062340 G/A 1 7 8 15 3.30148105110444 4.22687879873778 -0.925397747633344 A:G G A 10 0.528359849842223 0.797109179414283 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062072_160062485:IGSF8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 160062472 C/T 1 10 6 16 4.71640150157777 3.17015909905334 1.54624240252443 T:C C T 10 0.528359849842223 0.46618456350988 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000358475:exon_160062376_160062485:IGSF8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 160062727 A/G 1 8 11 19 3.77312120126222 5.81195834826445 -2.03883714700224 A:G A G 10 0.528359849842223 0.368087451982495 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062714_160063121:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062714_160063121:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000358475:exon_160062714_160063121:IGSF8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 160616703 G/T 1 42 35 77 19.8088863066266 18.4925947444778 1.31629156214883 T:G G T 10 0.528359849842223 0.819810374678797 ENSG00000117090:ENST00000302035:exon_160616660_160617085:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000235739:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000497223:exon_160616660_160616869:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000392208:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000355199:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000494463:exon_160616660_160616811:SLAMF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 160720074 C/T 0 9 0 9 4.24476135141999 0 4.24476135141999 C C 10 0.528359849842223 0.00436376312451053 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 161013121 C/T 1 10 7 17 4.71640150157777 3.69851894889556 1.01788255268221 T:C C T 10 0.528359849842223 0.80899735416499 ENSG00000158773:ENST00000368020:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000368021:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000442467:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000435396:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000368019:exon_161013058_161013149:USF1;ENSG00000158773:ENST00000473969:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000531842:exon_161013058_161013132:USF1;ENSG00000158773:ENST00000496363:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000491629:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000534633:exon_161013043_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000529476:exon_161013058_161013150:USF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 161017556 C/T 1 140 139 279 66.0296210220888 73.442019128069 -7.4123981059802 T:C C T 10 0.528359849842223 0.401238291096950 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161016738_161018145:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 161019040 G/C 1 61 77 138 28.7700491596244 40.6837084378512 -11.9136592782268 C:G G C 10 0.528359849842223 0.0495055497201563 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161018779_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368017:exon_161018962_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000490279:exon_161018580_161019124:ARHGAP30 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 161182208 C/G 1 44 51 95 20.7521666069422 26.9463523419534 -6.19418573501118 A:C:G C G 10 0.528359849842223 0.218130424967422 ENSG00000158864:ENST00000367993:exon_161182141_161182270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000392179:exon_161182141_161182270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000483804:exon_161182141_161182270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000480762:exon_161182141_161182270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000465923:exon_161182141_161182270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000493849:exon_161182141_161182270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000468828:exon_161182141_161182270:NDUFS2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 161928327 A/G 1 40 41 81 18.8656060063111 21.6627538435311 -2.79714783722006 A:C:G A G 10 0.528359849842223 0.578467891715219 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161928236_161933860:ATF6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 165634336 C/T 1 10 7 17 4.71640150157777 3.69851894889556 1.01788255268221 T:C C T 10 0.528359849842223 0.80899735416499 ENSG00000143149:ENST00000354775:exon_165634255_165634367:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000463610:exon_165634255_165634443:ALDH9A1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 167673917 A/G 1 11 24 35 5.18804165173555 12.6806363962134 -7.4925947444778 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0164940004662695 ENSG00000198771:ENST00000367854:exon_167673901_167675486:RCSD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 169762807 T/G 1 12 21 33 5.65968180189332 11.0955568466867 -5.43587504479336 T:G T G 10 0.528359849842223 0.0797115509543596 ENSG00000171806:ENST00000310392:exon_169761670_169763038:C1orf156;ENSG00000171806:ENST00000303469:exon_169761670_169763038:C1orf156;ENSG00000171806:ENST00000454472:exon_169762283_169763038:C1orf156 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 169823718 T/C 1 10 6 16 4.71640150157777 3.17015909905334 1.54624240252443 T:C T C 10 0.528359849842223 0.46618456350988 ENSG00000000457:ENST00000367772:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367771:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367770:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000423670:exon_169823652_169824105:SCYL3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 169951997 C/T 1 5 7 12 2.35820075078889 3.69851894889556 -1.34031819810668 T:C C T 10 0.528359849842223 0.56626847898003 ENSG00000075945:ENST00000361580:exon_169951843_169952008:KIFAP3;ENSG00000075945:ENST00000367765:exon_169951843_169952008:KIFAP3;ENSG00000075945:ENST00000367767:exon_169951843_169952008:KIFAP3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 171486912 G/A 1 27 26 53 12.73428405426 13.7373560958978 -1.00307204163782 A:G G A 10 0.528359849842223 0.785232731385051 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000476522:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171486730_171486953:BAT2L2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 171753269 G/A 1 11 13 24 5.18804165173555 6.8686780479489 -1.68063639621335 A:G G A 10 0.528359849842223 0.543437824899314 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367736:exon_171752976_171753592:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000341850:exon_171752985_171753590:METTL13 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 171755182 G/A 1 17 14 31 8.01788255268221 7.39703789779112 0.620844654891088 A:G G A 10 0.528359849842223 0.859090255440116 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171755027_171755220:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171755027_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171755019_171755218:METTL13 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 171763549 C/T 1 21 25 46 9.90444315331332 13.2089962460556 -3.30455309274226 T:C C T 10 0.528359849842223 0.376401865918578 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367736:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000341850:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000466643:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000476386:exon_171763534_171763667:METTL13 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 172410967 G/A 1 51 49 100 24.0536476580466 25.8896326422689 -1.8359849842223 A:G G A 10 0.528359849842223 0.764067045630708 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 172411496 A/G 1 15 16 31 7.07460225236666 8.45375759747557 -1.37915534510891 A:G A G 10 0.528359849842223 0.719805878945864 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000478184:exon_172411471_172411970:PIGC HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 173457017 C/T 1 156 135 291 73.5758634246132 71.3285797287001 2.24728369591313 T:C C T 10 0.528359849842223 0.814463260802439 ENSG00000117592:ENST00000340385:exon_173456874_173457946:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000431633:exon_173456874_173457150:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000470017:exon_173456874_173457154:PRDX6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 174969271 C/T 1 47 31 78 22.1670870574155 16.3791553451089 5.78793171230661 T:C C T 10 0.528359849842223 0.212536525194973 ENSG00000116161:ENST00000426793:exon_174969225_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000367679:exon_174968869_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000483307:exon_174969081_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000473925:exon_174969091_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000450101:exon_174969204_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000392063:exon_174969204_174969331:CACYBP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 179051300 T/C 1 30 18 48 14.1492045047333 9.51047729716001 4.6387272075733 T:C T C 10 0.528359849842223 0.195285832758551 ENSG00000186283:ENST00000367627:exon_179050512_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000367625:exon_179051205_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000483887:exon_179051213_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000352445:exon_179051221_179051522:TOR3A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 180159654 C/T 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 T:C C T 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000116260:ENST00000392029:exon_180159568_180159715:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367602:exon_180159568_180159715:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367600:exon_180159568_180159715:QSOX1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 180159657 C/T 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 T:C C T 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000116260:ENST00000392029:exon_180159568_180159715:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367602:exon_180159568_180159715:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367600:exon_180159568_180159715:QSOX1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 180953853 A/G 1 9 10 19 4.24476135141999 5.28359849842223 -1.03883714700224 A:G A G 10 0.528359849842223 0.653351132943168 ENSG00000135823:ENST00000258301:exon_180953813_180953907:STX6;ENSG00000135823:ENST00000469135:exon_180953813_180953907:STX6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 181018236 A/G 1 8 4 12 3.77312120126222 2.11343939936889 1.65968180189332 A:G A G 10 0.528359849842223 0.396971345501871 ENSG00000153029:ENST00000486453:exon_181018188_181018833:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000434571:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367578:exon_181018188_181018448:MR1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 181024404 G/A 1 24 13 37 11.3193636037866 6.8686780479489 4.45068555583775 A:G G A 10 0.528359849842223 0.187099834807326 ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181024361_181024659:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181024361_181024420:MR1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 182356399 A/G 1 6 10 16 2.82984090094666 5.28359849842223 -2.45375759747557 A:G A G 10 0.528359849842223 0.316737715732456 ENSG00000135821:ENST00000331872:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000417584:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000311223:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000435013:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000339526:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000491322:exon_182352029_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000484996:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000489818:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000475808:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000480604:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000462444:exon_182355910_182356427:GLUL HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 183542387 T/C 1 10 4 14 4.71640150157777 2.11343939936889 2.60296210220888 T:C T C 10 0.528359849842223 0.189361454505222 ENSG00000116701:ENST00000367536:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000392014:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000413720:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000367535:exon_183542320_183542427:NCF2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 184023529 A/C 1 9 12 21 4.24476135141999 6.34031819810668 -2.09555684668668 A:C A C 10 0.528359849842223 0.389033912530957 ENSG00000198860:ENST00000361641:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000485209:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000533373:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000367518:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000423085:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000462677:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000457455:exon_184023495_184023569:TSEN15 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 201112981 A/G 1 29 26 55 13.6775643545755 13.7373560958978 -0.0597917413222628 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000116857:ENST00000367334:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367332:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367330:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367329:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367333:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000472411:exon_201112948_201114796:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000263947:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000421960:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000485839:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000495205:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000497582:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000455367:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000435310:exon_201112948_201113079:TMEM9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 201437477 A/T 1 8 16 24 3.77312120126222 8.45375759747557 -4.68063639621335 A:T A T 10 0.528359849842223 0.065866015885624 ENSG00000174307:ENST00000367311:exon_201437469_201438312:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000485436:exon_201437473_201437709:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000367309:exon_201437469_201438076:PHLDA3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 201458071 T/A 1 7 2 9 3.30148105110444 1.05671969968445 2.24476135141999 A:T T A 10 0.528359849842223 0.186011003558895 ENSG00000159176:ENST00000367306:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000533402:exon_201454411_201461627:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000527662:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000532313:exon_201454411_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000340006:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000531916:exon_201458001_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000532460:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000533432:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000530120:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000526723:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000524951:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000458271:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000527573:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000529975:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000533188:exon_201457755_201458112:CSRP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 201934578 G/A 1 49 33 82 23.1103673577311 17.4358750447934 5.67449231293772 A:G G A 10 0.528359849842223 0.224798945724888 ENSG00000134375:ENST00000367287:exon_201934561_201934671:TIMM17A;ENSG00000134375:ENST00000478378:exon_201934561_201934671:TIMM17A;ENSG00000134375:ENST00000482943:exon_201934561_201934671:TIMM17A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 201969082 G/A 1 20 10 30 9.43280300315554 5.28359849842223 4.14920450473331 A:G G A 10 0.528359849842223 0.145699655332193 ENSG00000176393:ENST00000481780:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492587:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000447312:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000478617:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492849:exon_201969030_201969143:RNPEP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 201973565 G/A 1 16 25 41 7.54624240252443 13.2089962460556 -5.66275384353114 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0857961534297176 ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000479531:exon_201973482_201973624:RNPEP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 202935911 T/C 1 7 2 9 3.30148105110444 1.05671969968445 2.24476135141999 T:C T C 10 0.528359849842223 0.186011003558895 ENSG00000159348:ENST00000367249:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000482572:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000473599:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000478009:exon_202935877_202936026:CYB5R1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 203818973 C/A 1 11 11 22 5.18804165173555 5.81195834826445 -0.623916696528905 A:C C A 10 0.528359849842223 0.833301388629641 ENSG00000058673:ENST00000367214:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000367212:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000332127:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000495527:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000367210:exon_203818839_203819154:ZC3H11A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 206647787 T/C 1 13 6 19 6.1313219520511 3.17015909905334 2.96116285299776 T:C T C 10 0.528359849842223 0.250170755672362 ENSG00000143466:ENST00000367120:exon_206647674_206647814:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000463979:exon_206647674_206647814:IKBKE HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 206648378 G/A 1 10 4 14 4.71640150157777 2.11343939936889 2.60296210220888 A:G G A 10 0.528359849842223 0.189361454505222 ENSG00000143466:ENST00000463979:exon_206648208_206648471:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000476449:exon_206648298_206648478:IKBKE HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 206778781 C/T 1 25 36 61 11.7910037539444 19.02095459432 -7.2299508403756 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0724092354395236 ENSG00000143486:ENST00000367114:exon_206778753_206778860:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000271764:exon_206778753_206778860:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000367111:exon_206778753_206778860:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000437518:exon_206778753_206778860:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000461334:exon_206778753_206778860:LGTN HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 207646322 G/A 1 10 10 20 4.71640150157777 5.28359849842223 -0.567196996844459 A:G G A 10 0.528359849842223 0.826247654639236 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207646218_207646524:CR2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 207646462 G/A 1 8 8 16 3.77312120126222 4.22687879873778 -0.453757597475567 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207646218_207646524:CR2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 209933331 A/G 1 22 12 34 10.3760833034711 6.34031819810668 4.03576510536442 A:G A G 10 0.528359849842223 0.174159678840555 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000479796:exon_209933327_209933462:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 209933540 A/G 1 35 12 47 16.5074052555222 6.34031819810668 10.1670870574155 A:G A G 10 0.528359849842223 0.00314175821065979 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 209936914 C/T 1 18 15 33 8.48952270283999 7.92539774763334 0.564124955206642 T:C C T 10 0.528359849842223 0.863674650795997 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 209950760 C/G 1 61 42 103 28.7700491596244 22.1911136933734 6.57893546625104 T:C:G C G 10 0.528359849842223 0.200906645891072 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367023:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000474496:exon_209950697_209950766:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000477431:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000488702:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 211836789 T/C 1 15 21 36 7.07460225236666 11.0955568466867 -4.02095459432003 T:C T C 10 0.528359849842223 0.186252542792442 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211836114_211836994:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000462283:exon_211836745_211836970:NEK2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 211840498 T/C 1 3 7 10 1.41492045047333 3.69851894889556 -2.28359849842223 T:C T C 10 0.528359849842223 0.206915350075299 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211840448_211840573:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000462283:exon_211840448_211840573:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000489633:exon_211840448_211840573:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211839772_211840573:NEK2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 212619339 T/C 1 156 147 303 73.5758634246132 77.6688979268068 -4.09303450219356 T:C T C 10 0.528359849842223 0.645666932454258 ENSG00000117691:ENST00000366988:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000479589:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000473900:exon_212619172_212619714:NENF HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 214813487 A/G 1 8 9 17 3.77312120126222 4.75523864858001 -0.98211744731779 A:G A G 10 0.528359849842223 0.637819172258138 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 214813782 A/G 1 6 5 11 2.82984090094666 2.64179924921111 0.188041651735547 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 214813941 C/G 1 7 7 14 3.30148105110444 3.69851894889556 -0.397037897791122 C:G C G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 214818846 A/G 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 A:G A G 10 0.528359849842223 0.743278251879842 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 214818945 A/C 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 A:C A C 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 214819328 G/A 1 7 11 18 3.30148105110444 5.81195834826445 -2.51047729716001 A:G G A 10 0.528359849842223 0.248719564040320 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 214819587 A/G 1 7 6 13 3.30148105110444 3.17015909905334 0.131321952051101 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 214819980 C/T 1 10 10 20 4.71640150157777 5.28359849842223 -0.567196996844459 T:C C T 10 0.528359849842223 0.826247654639236 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 214820299 A/G 1 9 9 18 4.24476135141999 4.75523864858001 -0.510477297160014 A:G A G 10 0.528359849842223 0.818347367308864 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 214820494 G/A 1 8 15 23 3.77312120126222 7.92539774763334 -4.15227654637113 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0960783456263223 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 214820524 T/C 1 12 14 26 5.65968180189332 7.39703789779112 -1.7373560958978 T:C T C 10 0.528359849842223 0.558215955592095 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 220154768 C/T 1 15 12 27 7.07460225236666 6.34031819810668 0.73428405425998 T:C C T 10 0.528359849842223 0.848556223067985 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220154720_220154799:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220154720_220154799:EPRS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 220321023 A/G 1 185 154 339 87.2534277791888 81.3674168757023 5.88601090348642 A:G A G 10 0.528359849842223 0.54967984184375 ENSG00000067704:ENST00000366922:exon_220320835_220321380:IARS2;ENSG00000067704:ENST00000302637:exon_220320835_220321380:IARS2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 226352498 T/G 1 8 5 13 3.77312120126222 2.64179924921111 1.1313219520511 T:G T G 10 0.528359849842223 0.589076720209571 ENSG00000182827:ENST00000366812:exon_226352490_226352630:ACBD3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 226573364 A/G 1 35 27 62 16.5074052555222 14.26571594574 2.24168930978218 A:G A G 10 0.528359849842223 0.612163216750618 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226573205_226573381:PARP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 227920103 G/A 1 61 38 99 28.7700491596244 20.0776742940045 8.69237486561993 A:G G A 10 0.528359849842223 0.087114747776911 ENSG00000143740:ENST00000480897:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000480265:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 230415244 T/C 1 16 25 41 7.54624240252443 13.2089962460556 -5.66275384353114 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0857961534297176 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230415049_230417870:GALNT2;ENSG00000143641:ENST00000485438:exon_230415049_230417866:GALNT2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 230829139 A/G 1 18 14 32 8.48952270283999 7.39703789779112 1.09248480504886 A:G A G 10 0.528359849842223 0.726939458112817 ENSG00000135775:ENST00000366669:exon_230829038_230829728:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366668:exon_230829038_230829728:COG2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 231042732 T/A 1 10 11 21 4.71640150157777 5.81195834826445 -1.09555684668668 A:T T A 10 0.528359849842223 0.667251391828987 ENSG00000143643:ENST00000366661:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000366662:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000414259:exon_231041990_231042765:TTC13 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 233086456 T/C 1 10 10 20 4.71640150157777 5.28359849842223 -0.567196996844459 T:C T C 10 0.528359849842223 0.826247654639236 ENSG00000135778:ENST00000494689:exon_233086351_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000490807:exon_233086360_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366628:exon_233086370_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000496662:exon_233086379_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366627:exon_233086386_233086490:C1orf57 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 234529519 C/T 1 19 3 22 8.96116285299776 1.58507954952667 7.3760833034711 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0019672226230009 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 234529540 G/A 1 18 2 20 8.48952270283999 1.05671969968445 7.43280300315554 A:G G A 10 0.528359849842223 0.000567093235272158 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 234529552 C/T 1 19 3 22 8.96116285299776 1.58507954952667 7.3760833034711 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0019672226230009 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 234529570 G/A 1 19 5 24 8.96116285299776 2.64179924921111 6.31936360378665 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0125837899335972 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 234744480 G/A 1 45 29 74 21.2238067571 15.3224356454245 5.9013711116755 A:G G A 10 0.528359849842223 0.200094540815309 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234744241_234745271:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234744193_234745271:IRF2BP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 234745009 A/G 1 7 11 18 3.30148105110444 5.81195834826445 -2.51047729716001 A:G A G 10 0.528359849842223 0.248719564040320 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234744241_234745271:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234744193_234745271:IRF2BP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 241755348 C/T 1 12 15 27 5.65968180189332 7.92539774763334 -2.26571594574002 T:C C T 10 0.528359849842223 0.442795735902603 ENSG00000117009:ENST00000366559:exon_241755255_241758944:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366558:exon_241755255_241755590:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366557:exon_241755255_241758944:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366555:exon_241755255_241755451:KMO;ENSG00000054277:ENST00000462265:exon_241755312_241755422:OPN3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 242042301 G/A 1 10 9 19 4.71640150157777 4.75523864858001 -0.0388371470022362 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 242042545 A/G 1 5 4 9 2.35820075078889 2.11343939936889 0.244761351419994 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242042342_242042645:EXO1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 246714520 G/A 1 8 5 13 3.77312120126222 2.64179924921111 1.1313219520511 A:G G A 10 0.528359849842223 0.589076720209571 ENSG00000162851:ENST00000366514:exon_246714515_246714604:TFB2M HGDP00247_parsed_pileup.txt . 1 247464573 C/T 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 T:C C T 10 0.528359849842223 0.743278251879842 ENSG00000162714:ENST00000462139:exon_247460714_247464578:ZNF496;ENSG00000162714:ENST00000461277:exon_247460714_247464578:ZNF496;ENSG00000162714:ENST00000294753:exon_247460714_247464578:ZNF496;ENSG00000162714:ENST00000366498:exon_247463623_247464578:ZNF496 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 1043205 T/G 1 5 4 9 2.35820075078889 2.11343939936889 0.244761351419994 T:G T G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1043148_1043248:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000491635:exon_1042046_1043248:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000360059:exon_1043148_1043248:GTPBP4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 1065710 C/T 1 29 19 48 13.6775643545755 10.0388371470022 3.6387272075733 T:C C T 10 0.528359849842223 0.314441680339925 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1063015_1065876:GTPBP4;ENSG00000148377:ENST00000277517:exon_1064847_1065774:IDI2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 3150898 C/T 1 20 14 34 9.43280300315554 7.39703789779112 2.03576510536442 T:C C T 10 0.528359849842223 0.498590448787879 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000468050:exon_3150893_3150985:PFKP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 3155353 C/T 1 29 13 42 13.6775643545755 6.8686780479489 6.80888630662664 T:C C T 10 0.528359849842223 0.04354442594464 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155311_3155380:PFKP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 3155620 A/G 1 16 13 29 7.54624240252443 6.8686780479489 0.677564354575535 A:G A G 10 0.528359849842223 0.854075321976803 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 3155698 C/T 1 36 27 63 16.97904540568 14.26571594574 2.71332945993995 T:C C T 10 0.528359849842223 0.529666079537744 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3155650_3155710:PFKP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 3172121 C/T 1 40 26 66 18.8656060063111 13.7373560958978 5.12824991041329 T:C C T 10 0.528359849842223 0.219394118065339 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3172011_3172133:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3171199_3172175:PFKP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 3178723 C/T 1 92 169 261 43.3908938145155 89.2928146233357 -45.9019208088202 T:C C T 10 0.528359849842223 1.24458332762655e-08 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3178642_3178997:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3178642_3178985:PFKP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 3180298 C/T 1 57 54 111 26.8834885589933 28.53143189148 -1.64794333248675 T:C C T 10 0.528359849842223 0.776049052540568 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 3180316 T/C 1 49 42 91 23.1103673577311 22.1911136933734 0.919253664357711 T:C T C 10 0.528359849842223 0.916475174549222 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 3189380 C/T 1 9 8 17 4.24476135141999 4.22687879873778 0.0178825526822095 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451454:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3189342_3189442:PITRM1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 3191823 C/T 1 13 8 21 6.1313219520511 4.22687879873778 1.90444315331332 T:C C T 10 0.528359849842223 0.513633535609652 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3191813_3191945:PITRM1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 5920121 T/C 1 7 9 16 3.30148105110444 4.75523864858001 -1.45375759747557 T:C T C 10 0.528359849842223 0.61804043960613 ENSG00000134461:ENST00000380094:exon_5920060_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000463862:exon_5920025_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000380092:exon_5920050_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000437663:exon_5920053_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000191063:exon_5920085_5920250:ANKRD16 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 5925971 C/A 1 6 11 17 2.82984090094666 5.81195834826445 -2.98211744731779 A:C C A 10 0.528359849842223 0.223532760143352 ENSG00000134461:ENST00000380094:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000463862:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000380092:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000437663:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000191063:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000492368:exon_5925932_5926040:ANKRD16 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 5995052 C/T 1 7 9 16 3.30148105110444 4.75523864858001 -1.45375759747557 T:C C T 10 0.528359849842223 0.61804043960613 ENSG00000134470:ENST00000397251:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379977:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397253:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000425111:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397248:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000414280:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000534292:exon_5994349_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000319465:exon_5994349_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532948:exon_5994356_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379972:exon_5994356_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000528354:exon_5994756_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000447291:exon_5994784_5995289:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379974:exon_5994861_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532039:exon_5995008_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397250:exon_5995014_5995169:IL15RA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 8006798 A/G 1 8 4 12 3.77312120126222 2.11343939936889 1.65968180189332 A:G A G 10 0.528359849842223 0.396971345501871 ENSG00000165632:ENST00000344293:exon_8005883_8007705:TAF3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 11356160 C/T 1 7 1 8 3.30148105110444 0.528359849842223 2.77312120126222 T:C C T 10 0.528359849842223 0.073836867977041 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11356102_11356233:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11356102_11356221:CELF2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 12131218 C/T 1 1 9 10 0.471640150157777 4.75523864858001 -4.28359849842223 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0083414999051374 ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12130985_12131254:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000437298:exon_12130985_12131254:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000415935:exon_12131174_12131254:DHTKD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 12209752 T/C 1 57 73 130 26.8834885589933 38.5702690384823 -11.686780479489 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0432540563697022 ENSG00000065665:ENST00000475268:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000495368:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000165609:ENST00000491614:exon_12207324_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378937:exon_12209575_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378952:exon_12209671_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000476462:exon_12209737_12209810:NUDT5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 12228298 C/T 1 31 29 60 14.6208446548911 15.3224356454245 -0.701590990533377 T:C C T 10 0.528359849842223 0.89750146228948 ENSG00000165609:ENST00000491614:exon_12228228_12228331:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378929:exon_12228228_12228331:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378937:exon_12228228_12228331:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378952:exon_12228228_12228331:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378940:exon_12228228_12228331:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378927:exon_12228228_12228331:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000444732:exon_12228228_12228331:NUDT5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 12292344 A/G 1 108 98 206 50.9371362170399 51.7792652845378 -0.842129067497929 A:G A G 10 0.528359849842223 0.944395533286877 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 12292348 G/T 1 95 102 197 44.8058142649888 53.8927046839067 -9.08689041891792 T:G G T 10 0.528359849842223 0.199569173016516 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 12867598 C/G 1 2 7 9 0.943280300315554 3.69851894889556 -2.75523864858001 C:G C G 10 0.528359849842223 0.0939591166432567 ENSG00000183049:ENST00000378847:exon_12867572_12867689:CAMK1D;ENSG00000183049:ENST00000378845:exon_12867572_12868142:CAMK1D HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 13151224 G/A 1 21 9 30 9.90444315331332 4.75523864858001 5.14920450473331 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0678805540980871 ENSG00000123240:ENST00000263036:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378764:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000396951:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000487935:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000482140:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378757:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000430081:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378752:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378748:exon_13151097_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378747:exon_13151112_13151288:OPTN HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 13152400 T/A 1 17 16 33 8.01788255268221 8.45375759747557 -0.435875044793358 A:T T A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000123240:ENST00000263036:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378764:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000396951:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378757:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000430081:exon_13152180_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378752:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378748:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378747:exon_13152274_13152476:OPTN HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 13330402 T/C 1 6 11 17 2.82984090094666 5.81195834826445 -2.98211744731779 T:C T C 10 0.528359849842223 0.223532760143352 ENSG00000107537:ENST00000396913:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000263038:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000378659:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000437577:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000396920:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000534344:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000453759:exon_13330360_13330541:PHYH HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 13653653 A/G 1 8 10 18 3.77312120126222 5.28359849842223 -1.51047729716001 A:G A G 10 0.528359849842223 0.490179587566891 ENSG00000165630:ENST00000378572:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000417658:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000378544:exon_13653615_13653683:PRPF18 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 15145855 C/G 1 76 59 135 35.8446514119911 31.1732311406912 4.6714202712999 C:G C G 10 0.528359849842223 0.438789433600186 ENSG00000152464:ENST00000378203:exon_15145304_15146250:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378202:exon_15145304_15146254:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378197:exon_15145304_15146256:RPP38 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 23003226 A/G 1 6 3 9 2.82984090094666 1.58507954952667 1.24476135141999 A:G A G 10 0.528359849842223 0.514115714513849 ENSG00000150867:ENST00000323883:exon_23003112_23003503:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376573:exon_23003112_23003484:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376565:exon_23003112_23003503:PIP4K2A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 25313818 C/T 1 12 8 20 5.65968180189332 4.22687879873778 1.43280300315554 T:C C T 10 0.528359849842223 0.655637718042508 ENSG00000185875:ENST00000524413:exon_25312105_25315593:THNSL1;ENSG00000185875:ENST00000376356:exon_25312105_25315593:THNSL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 30728101 T/C 1 128 137 265 60.3699392201955 72.3852994283845 -12.0153602081891 A:T:C T C 10 0.528359849842223 0.140293278696562 ENSG00000107968:ENST00000375328:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000263056:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000415139:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375322:exon_30727845_30728371:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000413724:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375321:exon_30727751_30728203:MAP3K8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 32311791 C/T 1 8 13 21 3.77312120126222 6.8686780479489 -3.09555684668668 T:C C T 10 0.528359849842223 0.194999185861965 ENSG00000170759:ENST00000302418:exon_32311776_32311964:KIF5B;ENSG00000170759:ENST00000403329:exon_32311776_32311964:KIF5B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 34620220 C/T 1 18 10 28 8.48952270283999 5.28359849842223 3.20592420441776 T:C C T 10 0.528359849842223 0.258981777720527 ENSG00000148498:ENST00000374789:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374788:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000346874:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374794:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000350537:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374790:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000466092:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374776:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374773:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000340077:exon_34620045_34620272:PARD3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 43088774 T/C 1 5 4 9 2.35820075078889 2.11343939936889 0.244761351419994 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000196693:ENST00000416780:exon_43084555_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000359467:exon_43084563_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000395836:exon_43087991_43090135:ZNF33B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 43883342 T/A 1 68 72 140 32.0715302107288 38.0419091886401 -5.97037897791122 A:T T A 10 0.528359849842223 0.351803546660256 ENSG00000169813:ENST00000357065:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000356053:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000443950:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000337970:exon_43881470_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000477108:exon_43883037_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000498176:exon_43883091_43883384:HNRNPF HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 51585463 A/G 1 12 9 21 5.65968180189332 4.75523864858001 0.904443153313317 A:G A G 10 0.528359849842223 0.827907977261945 ENSG00000138293:ENST00000438493:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000452682:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000414907:exon_51584616_51585466:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000430396:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374087:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000344348:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374082:exon_51584616_51585463:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000443446:exon_51584616_51585599:NCOA4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 52103707 A/G 1 6 8 14 2.82984090094666 4.22687879873778 -1.39703789779112 A:G A G 10 0.528359849842223 0.594448035256428 ENSG00000198964:ENST00000361543:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000361781:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000492601:exon_52103252_52104094:SGMS1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 61552692 G/T 1 6 3 9 2.82984090094666 1.58507954952667 1.24476135141999 T:G G T 10 0.528359849842223 0.514115714513849 ENSG00000108091:ENST00000263102:exon_61548521_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000491922:exon_61551510_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000395341:exon_61552607_61552732:CCDC6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 61552774 C/T 1 5 4 9 2.35820075078889 2.11343939936889 0.244761351419994 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000108091:ENST00000263102:exon_61548521_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000491922:exon_61551510_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000395341:exon_61552735_61552869:CCDC6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 64927823 C/G 1 26 28 54 12.2626439041022 14.7940757955822 -2.53143189148004 C:G C G 10 0.528359849842223 0.499038897383572 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64926981_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000467356:exon_64926981_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64926990_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64926990_64927894:JMJD1C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 70502288 G/A 1 6 8 14 2.82984090094666 4.22687879873778 -1.39703789779112 A:G G A 10 0.528359849842223 0.594448035256428 ENSG00000060339:ENST00000265872:exon_70502133_70502326:CCAR1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 70696713 C/T 1 8 7 15 3.77312120126222 3.69851894889556 0.0746022523666556 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000107625:ENST00000373585:exon_70696692_70696851:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000466265:exon_70696692_70696851:DDX50 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 70700944 A/G 1 47 44 91 22.1670870574155 23.2478333930578 -1.08074633564229 A:G A G 10 0.528359849842223 0.834363106287534 ENSG00000107625:ENST00000373585:exon_70700816_70700950:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000466265:exon_70700816_70700950:DDX50 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 70702980 T/C 1 52 55 107 24.5252878082044 29.0597917413223 -4.53450393311785 A:T:C T C 10 0.528359849842223 0.385340810215681 ENSG00000107625:ENST00000373585:exon_70702969_70703013:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000466265:exon_70702969_70703013:DDX50 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 70856852 G/A 1 90 140 230 42.4476135141999 73.9703789779112 -31.5227654637113 A:G G A 10 0.528359849842223 3.81497736811246e-05 ENSG00000122862:ENST00000242465:exon_70856840_70856987:SRGN HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 72179746 C/T 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 T:C C T 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000148730:ENST00000373218:exon_72179670_72179855:EIF4EBP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 72358577 G/A 1 8 3 11 3.77312120126222 1.58507954952667 2.18804165173555 A:G G A 10 0.528359849842223 0.234829965499602 ENSG00000180644:ENST00000373209:exon_72357104_72358937:PRF1;ENSG00000180644:ENST00000441259:exon_72357105_72358937:PRF1;ENSG00000180644:ENST00000318971:exon_72357105_72358937:PRF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 72643671 C/T 1 79 65 144 37.2595718624644 34.3433902397445 2.91618162271989 T:C C T 10 0.528359849842223 0.676627979192919 ENSG00000166228:ENST00000299299:exon_72643267_72643805:PCBD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 73520632 A/C 1 5 4 9 2.35820075078889 2.11343939936889 0.244761351419994 A:C A C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73520625_73520681:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73520625_73520681:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000481568:exon_73520288_73520681:C10orf54 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 75936611 C/T 1 7 5 12 3.30148105110444 2.64179924921111 0.659681801893325 T:C C T 10 0.528359849842223 0.778733618574385 ENSG00000156110:ENST00000372734:exon_75936444_75936644:ADK HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 81926702 G/A 1 38 38 76 17.9223257059955 20.0776742940045 -2.15534858800894 A:G G A 10 0.528359849842223 0.646984535290531 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000481805:exon_81926155_81926740:ANXA11 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 86273249 T/C 1 6 6 12 2.82984090094666 3.17015909905334 -0.340318198106676 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86273205_86278276:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86273205_86278273:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000494144:exon_86273205_86274161:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000493409:exon_86273205_86273417:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000498300:exon_86273205_86273458:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000466105:exon_86273205_86273452:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000480006:exon_86273205_86273626:FAM190B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 88203068 T/C 1 6 9 15 2.82984090094666 4.75523864858001 -1.92539774763334 T:C T C 10 0.528359849842223 0.439217229441099 ENSG00000062650:ENST00000342368:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000484070:exon_88203032_88203789:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000298767:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000372076:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000420749:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000263070:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000372075:exon_88203032_88203120:WAPAL HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 88730312 T/C 1 14 11 25 6.60296210220888 5.81195834826445 0.791003753944426 T:C T C 10 0.528359849842223 0.84244030516468 ENSG00000148671:ENST00000372013:exon_88730233_88730672:C10orf116;ENSG00000148671:ENST00000372012:exon_88730233_88730487:C10orf116 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 88930249 A/T 1 7 4 11 3.30148105110444 2.11343939936889 1.18804165173555 A:T A T 10 0.528359849842223 0.556038959282085 ENSG00000122376:ENST00000298784:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000298786:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000358313:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000342900:exon_88930235_88930429:FAM35A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 90771829 T/C 1 22 25 47 10.3760833034711 13.2089962460556 -2.83291294258448 T:C T C 10 0.528359849842223 0.465854513198614 ENSG00000026103:ENST00000371875:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355740:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000352159:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000484444:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000357339:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000479522:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000488877:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000492756:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355279:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000313771:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000494799:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000487314:exon_90771756_90771838:FAS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 91162677 C/T 1 31 21 52 14.6208446548911 11.0955568466867 3.52528780820441 T:C C T 10 0.528359849842223 0.335486180710102 ENSG00000185745:ENST00000371804:exon_91162038_91163745:IFIT1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 91178000 C/T 1 21 13 34 9.90444315331332 6.8686780479489 3.03576510536442 T:C C T 10 0.528359849842223 0.309257438537999 ENSG00000152778:ENST00000371795:exon_91176962_91180758:IFIT5;ENSG00000152778:ENST00000416601:exon_91177575_91178576:IFIT5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 91497631 T/A 1 8 9 17 3.77312120126222 4.75523864858001 -0.98211744731779 A:T T A 10 0.528359849842223 0.637819172258138 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 91498127 T/C 1 5 13 18 2.35820075078889 6.8686780479489 -4.51047729716001 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0558148062050748 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 91498254 A/G 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 91498318 A/G 1 8 13 21 3.77312120126222 6.8686780479489 -3.09555684668668 A:G A G 10 0.528359849842223 0.194999185861965 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 95454681 G/C 1 21 14 35 9.90444315331332 7.39703789779112 2.5074052555222 C:G G C 10 0.528359849842223 0.498860075577052 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95454618_95454694:FRA10AC1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 95458141 A/G 1 15 10 25 7.07460225236666 5.28359849842223 1.79100375394443 A:G A G 10 0.528359849842223 0.550502230599065 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95458058_95458153:FRA10AC1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 95459817 C/T 1 16 9 25 7.54624240252443 4.75523864858001 2.79100375394443 T:C C T 10 0.528359849842223 0.318599865175394 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95459787_95459863:FRA10AC1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 96313960 A/C 1 5 4 9 2.35820075078889 2.11343939936889 0.244761351419994 A:C A C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000119969:ENST00000419900:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000348459:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000437940:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000371332:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394045:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394044:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394036:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000239026:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000462057:exon_96313881_96314005:HELLS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 97447373 A/T 1 5 10 15 2.35820075078889 5.28359849842223 -2.92539774763334 A:T A T 10 0.528359849842223 0.194650532535346 ENSG00000119977:ENST00000265993:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000343162:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000371217:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000480852:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000443432:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000371209:exon_97447349_97447476:TCTN3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 97599537 G/C 1 22 28 50 10.3760833034711 14.7940757955822 -4.41799249211115 C:G G C 10 0.528359849842223 0.256994483457112 ENSG00000138185:ENST00000453258:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371206:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000481316:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371205:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371203:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000483213:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371207:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000490659:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000494070:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000461927:exon_97599057_97599565:ENTPD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 97990583 A/G 1 17 24 41 8.01788255268221 12.6806363962134 -4.66275384353114 A:G A G 10 0.528359849842223 0.160542135631296 ENSG00000095585:ENST00000413476:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393894:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000428924:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000427367:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000224337:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000371176:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393889:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000467799:exon_97990550_97990590:BLNK HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 99116903 C/T 1 36 61 97 16.97904540568 32.2299508403756 -15.2509054346956 T:C C T 10 0.528359849842223 0.00216034826539026 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99116115_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99116458_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99116458_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99116459_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99116459_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000465394:exon_99116863_99116953:RRP12 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 99126249 G/A 1 14 31 45 6.60296210220888 16.3791553451089 -9.77619324290004 A:G G A 10 0.528359849842223 0.00415230978238046 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99126203_99126317:RRP12 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 99129230 T/C 1 16 5 21 7.54624240252443 2.64179924921111 4.90444315331332 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0466596726290735 ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99129182_99129339:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99129182_99129339:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99129182_99129339:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99129182_99129339:RRP12 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 99139140 G/A 1 12 4 16 5.65968180189332 2.11343939936889 3.54624240252443 A:G G A 10 0.528359849842223 0.084329322912919 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99139050_99139171:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99139050_99139171:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99139050_99139171:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000490815:exon_99139050_99139171:RRP12 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 99205731 A/G 1 5 7 12 2.35820075078889 3.69851894889556 -1.34031819810668 A:G A G 10 0.528359849842223 0.56626847898003 ENSG00000171311:ENST00000464440:exon_99205712_99205751:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370902:exon_99205712_99205774:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370886:exon_99205712_99205743:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370885:exon_99205712_99205750:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370884:exon_99205712_99205774:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000485122:exon_99205712_99205742:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000476234:exon_99205712_99205763:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000489158:exon_99205712_99205763:EXOSC1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 99219464 A/G 1 39 43 82 18.3939658561533 22.7194735432156 -4.32550768706228 A:G A G 10 0.528359849842223 0.376603009087161 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99219416_99219498:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99219416_99219498:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99219416_99219498:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000444411:exon_99219416_99219498:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99219416_99219498:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99219416_99219498:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000485400:exon_99219119_99220076:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99219416_99219498:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99219416_99219498:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99219416_99219498:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99219416_99219498:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99219416_99219498:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99219416_99219498:MMS19 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 101639796 G/A 1 11 10 21 5.18804165173555 5.28359849842223 -0.0955568466866819 A:T:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 101639877 A/C 1 9 7 16 4.24476135141999 3.69851894889556 0.546242402524432 A:C A C 10 0.528359849842223 0.808617085826636 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 102116311 A/C 1 3 8 11 1.41492045047333 4.22687879873778 -2.81195834826445 A:C A C 10 0.528359849842223 0.129693174868926 ENSG00000099194:ENST00000423840:exon_102116289_102116367:SCD;ENSG00000099194:ENST00000370355:exon_102116289_102116521:SCD HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 102766574 A/G 1 9 12 21 4.24476135141999 6.34031819810668 -2.09555684668668 A:G A G 10 0.528359849842223 0.389033912530957 ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102766242_102767593:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102766242_102766586:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102766242_102767593:LZTS2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 103368654 T/C 1 30 21 51 14.1492045047333 11.0955568466867 3.05364765804663 T:C T C 10 0.528359849842223 0.404317121307017 ENSG00000166171:ENST00000370151:exon_103368592_103368694:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370147:exon_103368624_103368694:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370148:exon_103368624_103368659:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000475443:exon_103368624_103368801:DPCD HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 103558701 G/A 1 26 23 49 12.2626439041022 12.1522765463711 0.110367357731075 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000198408:ENST00000439817:exon_103558599_103559212:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000361464:exon_103558599_103559212:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000357797:exon_103558599_103559212:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000482611:exon_103558599_103559089:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000370094:exon_103558599_103559212:MGEA5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 103577726 G/A 1 5 4 9 2.35820075078889 2.11343939936889 0.244761351419994 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000198408:ENST00000439817:exon_103577581_103578222:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000361464:exon_103577581_103578175:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000357797:exon_103577581_103578175:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000370094:exon_103577581_103578175:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000419011:exon_103577581_103578180:MGEA5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 103900729 G/A 1 14 4 18 6.60296210220888 2.11343939936889 4.48952270283999 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0356558289545135 ENSG00000148840:ENST00000278070:exon_103898857_103901761:PPRC1;ENSG00000148840:ENST00000413464:exon_103898857_103901761:PPRC1;ENSG00000148840:ENST00000412852:exon_103898857_103901761:PPRC1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 103920475 T/C 1 54 51 105 25.46856810852 26.9463523419534 -1.47778423343341 T:C T C 10 0.528359849842223 0.770538148685944 ENSG00000166197:ENST00000405356:exon_103920209_103920850:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000429062:exon_103920209_103920850:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000370007:exon_103920209_103920850:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000488254:exon_103920209_103920850:NOLC1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 103922063 G/C 1 46 46 92 21.6954469072577 24.3045530927423 -2.60910618548451 C:G G C 10 0.528359849842223 0.602870418349612 ENSG00000166197:ENST00000405356:exon_103921868_103923627:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000429062:exon_103921868_103923627:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000370007:exon_103921868_103923623:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000488254:exon_103921868_103922356:NOLC1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 104184953 C/G 1 15 16 31 7.07460225236666 8.45375759747557 -1.37915534510891 C:G C G 10 0.528359849842223 0.719805878945864 ENSG00000107874:ENST00000369937:exon_104184872_104184955:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000477994:exon_104184872_104184955:CUEDC2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 106022789 C/A 1 210 155 365 99.0444315331332 81.8957767255446 17.1486548075886 A:C C A 10 0.528359849842223 0.0747156281500182 ENSG00000148834:ENST00000493946:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000369713:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000445155:exon_106022737_106022835:GSTO1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 112266771 C/T 1 18 5 23 8.48952270283999 2.64179924921111 5.84772345362887 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0196785659484936 ENSG00000138166:ENST00000369583:exon_112266693_112266912:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000476681:exon_112266693_112266864:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000468749:exon_112266693_112266912:DUSP5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 115489152 C/G 1 6 3 9 2.82984090094666 1.58507954952667 1.24476135141999 C:G C G 10 0.528359849842223 0.514115714513849 ENSG00000165806:ENST00000369331:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369321:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000345633:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369318:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000442393:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000393012:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369315:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000298700:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000452490:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000487232:exon_115489070_115489262:CASP7 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 115489167 G/A 1 6 3 9 2.82984090094666 1.58507954952667 1.24476135141999 A:G G A 10 0.528359849842223 0.514115714513849 ENSG00000165806:ENST00000369331:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369321:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000345633:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369318:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000442393:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000393012:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369315:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000298700:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000452490:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000487232:exon_115489070_115489262:CASP7 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 127524761 C/T 1 77 46 123 36.3162915621488 24.3045530927423 12.0117384694066 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0303820458103827 ENSG00000107949:ENST00000278100:exon_127524673_127525122:BCCIP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 129903592 G/A 1 20 23 43 9.43280300315554 12.1522765463711 -2.71947354321559 A:G G A 10 0.528359849842223 0.446808686838299 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 129904917 G/A 1 13 5 18 6.1313219520511 2.64179924921111 3.48952270283999 A:G G A 10 0.528359849842223 0.154751153489626 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 129905238 T/A 1 7 11 18 3.30148105110444 5.81195834826445 -2.51047729716001 A:T T A 10 0.528359849842223 0.248719564040320 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 129906903 C/T 1 10 7 17 4.71640150157777 3.69851894889556 1.01788255268221 T:C C T 10 0.528359849842223 0.80899735416499 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 131959150 C/T 1 29 41 70 13.6775643545755 21.6627538435311 -7.98518948895561 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0717712707341532 ENSG00000108010:ENST00000331244:exon_131959060_131959261:GLRX3;ENSG00000108010:ENST00000368644:exon_131959060_131959261:GLRX3;ENSG00000108010:ENST00000481034:exon_131959060_131959261:GLRX3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 133761285 G/A 1 43 31 74 20.2805264567844 16.3791553451089 3.9013711116755 A:G G A 10 0.528359849842223 0.415409440642038 ENSG00000175470:ENST00000455566:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000482010:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000422256:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000398018:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000490777:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000470416:exon_133761034_133761295:PPP2R2D HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 134021506 G/A 1 11 6 17 5.18804165173555 3.17015909905334 2.01788255268221 A:G G A 10 0.528359849842223 0.467320757987905 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134020994_134021655:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368622:exon_134020996_134021655:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000298630:exon_134020996_134021655:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000462160:exon_134020996_134021655:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368625:exon_134020996_134021655:STK32C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 134145314 A/G 1 20 15 35 9.43280300315554 7.92539774763334 1.5074052555222 A:G A G 10 0.528359849842223 0.735466789742701 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 134161633 A/G 1 8 1 9 3.77312120126222 0.528359849842223 3.24476135141999 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0417871149536542 ENSG00000148814:ENST00000368615:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000392638:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000432555:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000344079:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368614:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000462656:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368613:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000356571:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368612:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000450442:exon_134161488_134161853:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368610:exon_134161488_134161860:LRRC27 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 10 135233678 G/A 1 29 30 59 13.6775643545755 15.8507954952667 -2.17323114069115 A:G G A 10 0.528359849842223 0.603435926650153 ENSG00000254536:ENST00000468317:exon_135233530_135233999:RP11-108K14.8;ENSG00000148824:ENST00000317502:exon_135233530_135234174:MTG1;ENSG00000148824:ENST00000432508:exon_135233530_135233986:MTG1;ENSG00000148824:ENST00000460848:exon_135233530_135234811:MTG1;ENSG00000148824:ENST00000473735:exon_135233530_135234022:MTG1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 27362359 T/G 1 15 9 24 7.07460225236666 4.75523864858001 2.31936360378665 T:G T G 10 0.528359849842223 0.415665286985416 ENSG00000109881:ENST00000529615:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000343895:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000328697:exon_27362243_27362384:CCDC34 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 33881016 T/C 1 48 49 97 22.6387272075733 25.8896326422689 -3.25090543469563 T:C T C 10 0.528359849842223 0.542371698052753 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33880125_33881121:LMO2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 33886294 A/G 1 3 11 14 1.41492045047333 5.81195834826445 -4.39703789779112 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0286834249686330 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33886148_33886363:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33886148_33886363:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33886148_33886475:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33886148_33886697:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33886148_33886363:LMO2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 34165053 G/A 1 48 41 89 22.6387272075733 21.6627538435311 0.975973364042154 A:G G A 10 0.528359849842223 0.915530331291206 ENSG00000135372:ENST00000452756:exon_34164992_34165075:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000257829:exon_34164992_34165075:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000531159:exon_34164992_34165075:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000532555:exon_34164992_34165075:NAT10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 34910397 C/T 1 8 11 19 3.77312120126222 5.81195834826445 -2.03883714700224 T:C C T 10 0.528359849842223 0.368087451982495 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34910299_34910416:APIP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 34916657 C/T 1 7 5 12 3.30148105110444 2.64179924921111 0.659681801893325 T:C C T 10 0.528359849842223 0.778733618574385 ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34916557_34916657:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34916557_34916657:APIP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 34937813 G/A 1 11 8 19 5.18804165173555 4.22687879873778 0.961162852997764 A:G G A 10 0.528359849842223 0.819131241753216 ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34937775_34938046:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34937775_34937939:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34937775_34937898:APIP;ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34937677_34938033:PDHX HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 35201842 C/T 1 137 134 271 64.6147005716155 70.8002198788579 -6.18551930724242 T:C C T 10 0.528359849842223 0.465657054280821 ENSG00000026508:ENST00000263398:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000360158:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437706:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000449691:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000423360:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433354:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437835:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000415148:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528086:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000428726:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433892:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000434472:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000352818:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000442151:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000525211:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526669:exon_35201821_35201876:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526000:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000279452:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000527889:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531118:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528455:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531873:exon_35201826_35201954:CD44 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 35641312 G/A 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 A:G G A 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000179431:ENST00000317811:exon_35639735_35642419:FJX1;ENSG00000179431:ENST00000532914:exon_35641236_35641609:FJX1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 44636833 G/A 1 44 47 91 20.7521666069422 24.8329129425845 -4.08074633564229 A:C:G G A 10 0.528359849842223 0.402678859765598 ENSG00000085117:ENST00000526958:exon_44636822_44636845:CD82;ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530601:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44636822_44636923:CD82 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 45935384 A/G 1 26 25 51 12.2626439041022 13.2089962460556 -0.94635234195337 A:G A G 10 0.528359849842223 0.888642400409326 ENSG00000121680:ENST00000241041:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000378750:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000532681:exon_45935370_45935489:PEX16 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 46958351 C/G 1 9 14 23 4.24476135141999 7.39703789779112 -3.15227654637113 C:G C G 10 0.528359849842223 0.213695268661202 ENSG00000149179:ENST00000533124:exon_46958240_46958402:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000528488:exon_46958248_46958402:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000525279:exon_46958281_46958402:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000522712:exon_46958296_46958402:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000278460:exon_46958298_46958402:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000531648:exon_46958299_46958402:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000527234:exon_46958299_46958402:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000378618:exon_46958305_46958402:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000532840:exon_46958311_46958402:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000395460:exon_46958319_46958402:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000532633:exon_46958329_46958402:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000378615:exon_46958329_46958402:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000526424:exon_46958330_46958402:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000525895:exon_46958330_46958402:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000527667:exon_46958331_46958402:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000527784:exon_46958331_46958402:C11orf49 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 47434986 G/A 1 3 8 11 1.41492045047333 4.22687879873778 -2.81195834826445 A:G G A 10 0.528359849842223 0.129693174868926 ENSG00000165915:ENST00000533076:exon_47434951_47435058:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000441589:exon_47434951_47435058:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000362021:exon_47434951_47435058:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000354884:exon_47434951_47435058:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000526614:exon_47434951_47435058:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000524928:exon_47434951_47435058:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000529740:exon_47434951_47435058:SLC39A13 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 47605895 G/A 1 203 180 383 95.7429504820287 95.1047729716001 0.638177510428619 A:G G A 10 0.528359849842223 0.959223304835213 ENSG00000213619:ENST00000533507:exon_47605866_47606113:NDUFS3;ENSG00000213619:ENST00000263774:exon_47605866_47606114:NDUFS3;ENSG00000213619:ENST00000526871:exon_47605866_47606017:NDUFS3;ENSG00000213619:ENST00000525378:exon_47605866_47606079:NDUFS3;ENSG00000213619:ENST00000525212:exon_47605866_47606113:NDUFS3;ENSG00000213619:ENST00000527178:exon_47605866_47605907:NDUFS3;ENSG00000110536:ENST00000527079:exon_47605866_47606113:PTPMT1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 57076820 T/G 1 10 6 16 4.71640150157777 3.17015909905334 1.54624240252443 T:G T G 10 0.528359849842223 0.46618456350988 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57076366_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57076369_57078030:TNKS1BP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 60230531 C/T 1 59 63 122 27.8267688593088 33.28667054006 -5.4599016807512 T:C C T 10 0.528359849842223 0.364563469321364 ENSG00000156738:ENST00000345732:exon_60230475_60230594:MS4A1;ENSG00000156738:ENST00000527101:exon_60230475_60230594:MS4A1;ENSG00000156738:ENST00000532073:exon_60230475_60230594:MS4A1;ENSG00000156738:ENST00000534668:exon_60230475_60230594:MS4A1;ENSG00000156738:ENST00000534503:exon_60230475_60230594:MS4A1;ENSG00000156738:ENST00000533306:exon_60230475_60230594:MS4A1;ENSG00000156738:ENST00000389939:exon_60230475_60230594:MS4A1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 60610065 G/A 1 22 35 57 10.3760833034711 18.4925947444778 -8.11651144100671 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0338548107885393 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60610019_60610098:CCDC86 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 60617834 C/A 1 49 59 108 23.1103673577311 31.1732311406912 -8.06286378296008 A:C C A 10 0.528359849842223 0.123947753052655 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60617679_60618561:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60617679_60618553:CCDC86 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 61633174 C/T 1 32 26 58 15.0924848050489 13.7373560958978 1.35512870915107 T:C C T 10 0.528359849842223 0.793004130702636 ENSG00000134824:ENST00000257261:exon_61633110_61634826:FADS2;ENSG00000134824:ENST00000522056:exon_61633110_61633429:FADS2;ENSG00000134824:ENST00000278840:exon_61633110_61634826:FADS2;ENSG00000134824:ENST00000523235:exon_61633110_61634819:FADS2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 62334908 G/C 1 908 384 1292 428.249256343262 202.890182339414 225.359074003848 A:T:C:G G C 10 0.528359849842223 2.80553896051287e-37 ENSG00000254772:ENST00000329251:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000525340:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000378019:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000524420:exon_62334871_62335000:EEF1G HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 62378660 G/A 1 9 10 19 4.24476135141999 5.28359849842223 -1.03883714700224 A:G G A 10 0.528359849842223 0.653351132943168 ENSG00000149499:ENST00000394773:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000394776:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000278845:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494176:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000529309:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494448:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466886:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466671:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000419857:exon_62378584_62378816:EML3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 62378801 T/C 1 3 9 12 1.41492045047333 4.75523864858001 -3.34031819810668 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0796925302844448 ENSG00000149499:ENST00000394773:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000394776:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000278845:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494176:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000529309:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494448:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466886:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466671:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000419857:exon_62378584_62378816:EML3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 62430659 T/A 1 5 4 9 2.35820075078889 2.11343939936889 0.244761351419994 A:T T A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000162194:ENST00000525675:exon_62430587_62430805:C11orf48 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 62434173 G/A 1 9 8 17 4.24476135141999 4.22687879873778 0.0178825526822095 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000214756:ENST00000398922:exon_62433826_62434869:METTL12;ENSG00000214756:ENST00000532971:exon_62433868_62435580:METTL12;ENSG00000214756:ENST00000529868:exon_62433119_62435968:METTL12 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 62439569 G/A 1 162 142 304 76.4057043255599 75.0270986775957 1.37860564796422 A:T:C:G G A 10 0.528359849842223 0.908567933353988 ENSG00000204922:ENST00000531323:exon_62439425_62441049:C11orf83;ENSG00000204922:ENST00000377953:exon_62439425_62439848:C11orf83 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 62563805 G/A 1 30 26 56 14.1492045047333 13.7373560958978 0.411848408835516 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000162231:ENST00000294172:exon_62563759_62563817:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531709:exon_62563759_62563817:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000532297:exon_62563759_62563817:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000533048:exon_62563759_62563817:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000530875:exon_62563759_62563817:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000533440:exon_62563759_62563817:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531872:exon_62563759_62563814:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531579:exon_62563777_62563817:NXF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 63767186 A/G 1 7 6 13 3.30148105110444 3.17015909905334 0.131321952051101 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000133315:ENST00000255681:exon_63767114_63767235:MACROD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 63967459 C/T 1 33 51 84 15.5641249552066 26.9463523419534 -11.3822273867467 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0157453688141144 ENSG00000168439:ENST00000358794:exon_63967412_63967508:STIP1;ENSG00000168439:ENST00000305218:exon_63967412_63967508:STIP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 63987031 G/C 1 86 73 159 40.5610529135688 38.5702690384823 1.99078387508656 C:G G C 10 0.528359849842223 0.811743302074792 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63986996_63987130:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63986996_63987130:FERMT3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 63987989 G/A 1 121 105 226 57.068458169091 55.4777842334334 1.59067393565761 A:G G A 10 0.528359849842223 0.841894734818186 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63987908_63988141:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63987908_63988141:FERMT3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 63988045 G/A 0 315 1 316 148.5666472997 0.528359849842223 148.038287449858 C:G G C 10 0.528359849842223 9.50063424396289e-86 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63987908_63988141:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63987908_63988141:FERMT3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 63990541 C/T 1 179 113 292 84.4235868782421 59.7046630321712 24.7189238460709 T:C C T 10 0.528359849842223 0.00401358339936108 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63990520_63990661:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63990520_63990661:FERMT3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 64004661 C/T 1 44 52 96 20.7521666069422 27.4747121917956 -6.7225455848534 T:C C T 10 0.528359849842223 0.184218206512204 ENSG00000173511:ENST00000426086:exon_64004659_64004694:VEGFB;ENSG00000173511:ENST00000309422:exon_64004659_64004694:VEGFB HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 64032784 G/A 1 1 13 14 0.471640150157777 6.8686780479489 -6.39703789779112 A:G G A 10 0.528359849842223 0.000581750846549151 ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64032782_64032974:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64032782_64032974:PLCB3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 64039136 G/A 1 34 24 58 16.0357651053644 12.6806363962134 3.35512870915107 A:G G A 10 0.528359849842223 0.430750877119943 ENSG00000002330:ENST00000394532:exon_64039085_64039275:BAD;ENSG00000002330:ENST00000309032:exon_64039085_64039275:BAD;ENSG00000002330:ENST00000394531:exon_64039085_64039275:BAD;ENSG00000002330:ENST00000493798:exon_64039085_64039340:BAD;ENSG00000002330:ENST00000492141:exon_64039085_64039275:BAD HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 64109595 C/T 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64109466_64109611:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64109466_64109611:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64109466_64109611:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64109466_64109611:CCDC88B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 64111076 C/G 0 9 0 9 4.24476135141999 0 4.24476135141999 C C 10 0.528359849842223 0.00436376312451053 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64110979_64111087:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64110979_64111087:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64110979_64111087:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64110979_64111087:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494566:exon_64110979_64111087:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000492980:exon_64111011_64111087:CCDC88B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 64789194 T/C 1 154 118 272 72.6325831242977 62.3464622813823 10.2861208429154 T:C T C 10 0.528359849842223 0.224614947281657 ENSG00000213465:ENST00000246747:exon_64789193_64789656:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529384:exon_64789193_64789360:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000533729:exon_64789193_64789632:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529254:exon_64788988_64789588:ARL2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 64802388 A/C 1 6 5 11 2.82984090094666 2.64179924921111 0.188041651735547 A:C A C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64802319_64802434:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64802319_64802434:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000529673:exon_64802319_64802434:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000534637:exon_64802319_64802434:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000524831:exon_64802319_64802434:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64802319_64802434:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64802319_64802434:SNX15 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 64806270 C/T 1 8 10 18 3.77312120126222 5.28359849842223 -1.51047729716001 T:C C T 10 0.528359849842223 0.490179587566891 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64806044_64806301:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64806044_64806301:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64802992_64806301:SNX15 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 64807235 C/T 1 18 10 28 8.48952270283999 5.28359849842223 3.20592420441776 T:C C T 10 0.528359849842223 0.258981777720527 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64807158_64808042:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64807158_64808044:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64807158_64807264:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64807158_64808042:SNX15 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 64854812 G/A 1 23 32 55 10.8477234536289 16.9075151949511 -6.05979174132226 A:G G A 10 0.528359849842223 0.106650007355774 ENSG00000162300:ENST00000294258:exon_64854788_64854905:ZFPL1;ENSG00000162300:ENST00000530744:exon_64854788_64854882:ZFPL1;ENSG00000162300:ENST00000528123:exon_64854788_64854888:ZFPL1;ENSG00000187066:ENST00000528029:exon_64852451_64856579:AP003068.6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 64882441 G/A 1 10 13 23 4.71640150157777 6.8686780479489 -2.15227654637113 A:G G A 10 0.528359849842223 0.408345653063064 ENSG00000149809:ENST00000526809:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533766:exon_64882185_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000534371:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000525385:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000345348:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531321:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529292:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526085:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000524690:exon_64882385_64882507:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531029:exon_64882385_64882476:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529233:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000532328:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000527968:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000528802:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526048:exon_64882385_64883070:TM7SF2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 64883547 G/A 1 66 66 132 31.1282499104133 34.8717500895867 -3.74350017917343 A:G G A 10 0.528359849842223 0.542180836751189 ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64883365_64883828:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64883365_64883856:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000345348:exon_64883365_64883707:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529292:exon_64883365_64883745:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64883365_64883702:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526048:exon_64883365_64883681:TM7SF2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 64884663 C/T 1 12 22 34 5.65968180189332 11.6239166965289 -5.96423489463558 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0572156935854705 ENSG00000174276:ENST00000310597:exon_64883876_64885170:ZNHIT2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 65168281 C/T 1 5 7 12 2.35820075078889 3.69851894889556 -1.34031819810668 T:C C T 10 0.528359849842223 0.56626847898003 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65168195_65168338:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65168195_65168338:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000416776:exon_65168195_65168338:FRMD8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 65271832 C/T 1 80 51 131 37.7312120126222 26.9463523419534 10.7848596706688 T:C C T 10 0.528359849842223 0.065873098719661 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 65351074 G/A 1 14 26 40 6.60296210220888 13.7373560958978 -7.13439399368892 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0264831037646116 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533465:exon_65351063_65351236:EHBP1L1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 65359778 G/T 1 175 1 176 82.537026277611 0.528359849842223 82.0086664277688 T:G G T 10 0.528359849842223 5.4966225518736e-47 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65359674_65360121:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000529099:exon_65359674_65359933:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000529596:exon_65359674_65359949:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533364:exon_65359674_65359842:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000527214:exon_65359674_65359933:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000529056:exon_65359674_65359951:EHBP1L1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 65412467 G/A 1 11 17 28 5.18804165173555 8.98211744731779 -3.79407579558224 A:G G A 10 0.528359849842223 0.185381237118026 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65412426_65412600:SIPA1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 65546346 G/A 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 A:G G A 10 0.528359849842223 1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 65623519 G/A 1 1476 1627 3103 696.140861632879 859.641475693297 -163.500614060418 A:C:G G A 10 0.528359849842223 4.44582884615689e-09 ENSG00000172757:ENST00000525451:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530945:exon_65622303_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000308162:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000527344:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531407:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000524553:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534769:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531413:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000532134:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530413:exon_65623406_65623944:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534784:exon_65623428_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000526975:exon_65623445_65623713:CFL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 65623739 A/G 1 2 10 12 0.943280300315554 5.28359849842223 -4.34031819810667 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0173281289522322 ENSG00000172757:ENST00000530413:exon_65623406_65623944:CFL1;ENSG00000172803:ENST00000530101:exon_65623600_65624367:SNX32 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 65628334 G/A 1 8 7 15 3.77312120126222 3.69851894889556 0.0746022523666556 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000172732:ENST00000529857:exon_65628146_65628359:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65627872_65628359:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65627876_65628359:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65628016_65628573:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65628331_65628359:MUS81 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 65629932 T/C 1 8 3 11 3.77312120126222 1.58507954952667 2.18804165173555 T:C T C 10 0.528359849842223 0.234829965499602 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000533555:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530111:exon_65629915_65630000:MUS81 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 65629934 G/C 1 8 4 12 3.77312120126222 2.11343939936889 1.65968180189332 C:G G C 10 0.528359849842223 0.396971345501871 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000533555:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530111:exon_65629915_65630000:MUS81 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 65631167 C/T 1 8 11 19 3.77312120126222 5.81195834826445 -2.03883714700224 T:C C T 10 0.528359849842223 0.368087451982495 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631104_65631372:MUS81 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 65631973 G/A 1 12 14 26 5.65968180189332 7.39703789779112 -1.7373560958978 A:G G A 10 0.528359849842223 0.558215955592095 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65631968_65632084:MUS81 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 65632262 G/T 1 20 25 45 9.43280300315554 13.2089962460556 -3.77619324290003 T:G G T 10 0.528359849842223 0.296773186900531 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65632191_65632794:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65632191_65632616:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65632215_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65632191_65632286:MUS81 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 65829174 A/G 1 173 158 331 81.5937459772954 83.4808562750712 -1.88711029777581 A:G A G 10 0.528359849842223 0.86885461737244 ENSG00000087365:ENST00000528302:exon_65829157_65829246:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000322535:exon_65829157_65829246:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000355456:exon_65829157_65829246:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000530981:exon_65829157_65829246:SF3B2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 66031660 C/T 1 18 11 29 8.48952270283999 5.81195834826445 2.67756435457553 T:C C T 10 0.528359849842223 0.356497062925024 ENSG00000174996:ENST00000417856:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000414181:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394067:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000316924:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000421552:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000452607:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000454322:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394066:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394065:exon_66031517_66031690:KLC2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 66033430 C/T 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 T:C C T 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000174996:ENST00000417856:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000414181:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394067:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000316924:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000421552:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000452607:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000454322:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394066:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394065:exon_66033325_66033483:KLC2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 66056457 G/A 1 23 17 40 10.8477234536289 8.98211744731779 1.86560600631108 A:G G A 10 0.528359849842223 0.635707427315866 ENSG00000174851:ENST00000471387:exon_66056426_66056599:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000359461:exon_66056426_66056616:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000376901:exon_66056426_66056641:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000376904:exon_66056426_66056620:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000484814:exon_66056426_66056599:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000431556:exon_66056426_66056478:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000528575:exon_66056426_66056508:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000376899:exon_66056426_66056614:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000474986:exon_66056426_66056608:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000534374:exon_66056426_66056606:YIF1A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 66612471 C/T 1 3 8 11 1.41492045047333 4.22687879873778 -2.81195834826445 T:C C T 10 0.528359849842223 0.129693174868926 ENSG00000173653:ENST00000533277:exon_66612340_66612507:RCE1;ENSG00000173653:ENST00000309657:exon_66612340_66612507:RCE1;ENSG00000173653:ENST00000524506:exon_66612340_66612507:RCE1;ENSG00000173653:ENST00000524849:exon_66612340_66612507:RCE1;ENSG00000173653:ENST00000532775:exon_66612340_66612479:RCE1;ENSG00000173653:ENST00000525356:exon_66612340_66612507:RCE1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 67235051 G/A 1 20 3 23 9.43280300315554 1.58507954952667 7.84772345362887 A:G G A 10 0.528359849842223 0.00115096307780593 ENSG00000172663:ENST00000393877:exon_67234972_67235061:TMEM134;ENSG00000172663:ENST00000308022:exon_67234972_67235061:TMEM134;ENSG00000172663:ENST00000452789:exon_67234972_67235061:TMEM134 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 68201295 C/T 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 T:C C T 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68201070_68201306:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68201070_68201306:LRP5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 68703959 A/G 1 7 2 9 3.30148105110444 1.05671969968445 2.24476135141999 A:G A G 10 0.528359849842223 0.186011003558895 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68703705_68704559:IGHMBP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 68704264 C/T 1 8 5 13 3.77312120126222 2.64179924921111 1.1313219520511 T:C C T 10 0.528359849842223 0.589076720209571 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68703705_68704559:IGHMBP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 71146577 G/A 1 38 47 85 17.9223257059955 24.8329129425845 -6.91058723658895 A:G G A 10 0.528359849842223 0.157508101538046 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 71169547 G/C 1 10 8 18 4.71640150157777 4.22687879873778 0.489522702839987 C:G G C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000172890:ENST00000534634:exon_71169474_71170102:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524709:exon_71169474_71169558:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529120:exon_71169474_71169602:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524949:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000533769:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527538:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525245:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71169474_71169590:NADSYN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 73689104 G/A 1 102 56 158 48.1072953160933 29.5881515911645 18.5191437249288 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0031407261142425 ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73688931_73689141:UCP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 74546905 G/A 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 A:G G A 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000166439:ENST00000299563:exon_74546591_74553458:RNF169 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 75277757 C/G 1 7 10 17 3.30148105110444 5.28359849842223 -1.98211744731779 C:G C G 10 0.528359849842223 0.345289018090792 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000529643:exon_75277361_75277894:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525492:exon_75277653_75277963:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528990:exon_75277361_75277889:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000533449:exon_75277361_75277846:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 75277992 C/T 1 11 11 22 5.18804165173555 5.81195834826445 -0.623916696528905 T:C C T 10 0.528359849842223 0.833301388629641 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75277764_75278016:SERPINH1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 75279846 C/T 1 8 7 15 3.77312120126222 3.69851894889556 0.0746022523666556 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75278827_75279874:SERPINH1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 75282882 G/A 1 10 17 27 4.71640150157777 8.98211744731779 -4.26571594574002 A:G G A 10 0.528359849842223 0.122911026635503 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75282826_75283827:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75282826_75283825:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75282826_75283827:SERPINH1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 75852448 C/T 1 25 28 53 11.7910037539444 14.7940757955822 -3.00307204163782 T:C C T 10 0.528359849842223 0.413294279745137 ENSG00000198382:ENST00000356136:exon_75851755_75854239:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000528420:exon_75851755_75852838:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000533454:exon_75851755_75852544:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000531818:exon_75851755_75853695:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000532130:exon_75851755_75852827:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000525183:exon_75851755_75852704:UVRAG HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 77378388 T/C 1 9 7 16 4.24476135141999 3.69851894889556 0.546242402524432 T:C T C 10 0.528359849842223 0.808617085826636 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77371041_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77377275_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77377275_77378536:RSF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 77378505 A/G 1 13 19 32 6.1313219520511 10.0388371470022 -3.90751519495113 A:G A G 10 0.528359849842223 0.214738050722661 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77371041_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77377275_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77377275_77378536:RSF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 77412851 A/G 1 11 15 26 5.18804165173555 7.92539774763334 -2.7373560958978 A:G A G 10 0.528359849842223 0.328310143364427 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77411766_77414578:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000526324:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000528095:exon_77412164_77413540:RSF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 77583266 G/A 1 9 6 15 4.24476135141999 3.17015909905334 1.07460225236666 A:G G A 10 0.528359849842223 0.61599879202346 ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77583221_77583407:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77583221_77583397:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77583221_77583400:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77583221_77583398:C11orf67 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 77583376 G/A 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77583221_77583407:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77583221_77583397:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77583221_77583400:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77583221_77583398:C11orf67 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 77825320 T/C 1 5 5 10 2.35820075078889 2.64179924921111 -0.283598498422229 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000159063:ENST00000299626:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000376156:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000526737:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532306:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000421284:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532440:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000524925:exon_77825312_77825422:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000529139:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525755:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000530454:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525870:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532050:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000527099:exon_77825312_77825438:ALG8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 82535963 C/T 1 66 54 120 31.1282499104133 28.53143189148 2.59681801893325 T:C C T 10 0.528359849842223 0.648735724552253 ENSG00000137509:ENST00000313010:exon_82534544_82536164:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532767:exon_82535409_82542480:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000393399:exon_82535410_82536164:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532709:exon_82535415_82536164:PRCP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 82644904 G/A 1 7 3 10 3.30148105110444 1.58507954952667 1.71640150157777 A:G G A 10 0.528359849842223 0.35163323596596 ENSG00000165490:ENST00000528759:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000533655:exon_82642774_82645701:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000329143:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000430323:exon_82642774_82645697:C11orf82 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 82973004 C/T 1 27 31 58 12.73428405426 16.3791553451089 -3.64487129084893 T:C C T 10 0.528359849842223 0.359206872941214 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82970139_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000455220:exon_82972359_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525504:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82972504_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527495:exon_82972772_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82972799_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82972837_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82972838_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82972933_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82972971_82973008:CCDC90B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 93517886 G/C 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 C:G G C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000042429:ENST00000251871:exon_93517393_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000530819:exon_93517448_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533359:exon_93517528_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533133:exon_93517577_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000427225:exon_93517884_93517929:MED17 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 104825649 C/T 1 38 26 64 17.9223257059955 13.7373560958978 4.18496961009773 T:C C T 10 0.528359849842223 0.318220169222102 ENSG00000196954:ENST00000444739:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000393150:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000421898:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000533730:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000529183:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000524843:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000531333:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000417440:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000531546:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000416586:exon_104825474_104825728:CASP4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 104900488 G/A 1 9 5 14 4.24476135141999 2.64179924921111 1.60296210220888 A:G G A 10 0.528359849842223 0.434484743557366 ENSG00000137752:ENST00000532439:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000526568:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000527979:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000533400:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000436863:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000415981:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000393136:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000446369:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000525825:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000534497:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000529871:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000528974:exon_104900392_104900626:CASP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 111908162 T/C 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 T:C T C 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111907997_111908184:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111907997_111908184:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111907997_111908184:DLAT HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 116633825 C/T 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 T:C C T 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 117163765 C/A 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 A:C C A 10 0.528359849842223 0.743278251879842 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 117282800 G/T 1 19 9 28 8.96116285299776 4.75523864858001 4.20592420441776 T:G G T 10 0.528359849842223 0.130990173643306 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117282788_117283984:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117282788_117283984:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117282788_117283059:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117282788_117283982:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000528706:exon_117282788_117283055:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533433:exon_117282788_117283546:CEP164 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 117691386 G/A 1 19 30 49 8.96116285299776 15.8507954952667 -6.88963264226892 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0618883454318042 ENSG00000137731:ENST00000532119:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000528014:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000292079:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000260287:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000534383:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000533281:exon_117691275_117691411:FXYD2;ENSG00000254844:ENST00000531850:exon_117691176_117691436:RP11-728F11.3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 118828942 A/G 1 24 20 44 11.3193636037866 10.5671969968445 0.75216660694219 A:G A G 10 0.528359849842223 0.880608683416714 ENSG00000110375:ENST00000534788:exon_118828807_118829264:UPK2;ENSG00000110375:ENST00000264031:exon_118828807_118829269:UPK2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 118886117 C/T 1 18 24 42 8.48952270283999 12.6806363962134 -4.19111369337337 T:C C T 10 0.528359849842223 0.217733138356581 ENSG00000186166:ENST00000334418:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000526463:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000532132:exon_118885998_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000527356:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000533787:exon_118886017_118886138:CCDC84 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 118886656 G/A 1 6 8 14 2.82984090094666 4.22687879873778 -1.39703789779112 A:G G A 10 0.528359849842223 0.594448035256428 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 118890022 C/T 1 33 48 81 15.5641249552066 25.3612727924267 -9.79714783722006 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0340289033090454 ENSG00000196655:ENST00000533632:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000527680:exon_118889853_118890213:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000447216:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000531290:exon_118889476_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000359005:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000525079:exon_118889853_118890134:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000533012:exon_118889853_118890027:TRAPPC4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 118895686 C/T 1 21 19 40 9.90444315331332 10.0388371470022 -0.134393993688917 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118895567_118896164:TRAPPC4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 118922200 G/A 1 15 11 26 7.07460225236666 5.81195834826445 1.2626439041022 A:G G A 10 0.528359849842223 0.696773212715701 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118922150_118922337:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118922150_118922337:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118922150_118922337:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118922150_118922337:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118922150_118922337:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118922150_118922337:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530473:exon_118922150_118922337:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529114:exon_118922150_118922337:HYOU1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 118925341 G/A 1 8 9 17 3.77312120126222 4.75523864858001 -0.98211744731779 A:G G A 10 0.528359849842223 0.637819172258138 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530473:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531694:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534233:exon_118925211_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000526656:exon_118925249_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534654:exon_118925280_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531968:exon_118925297_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529683:exon_118925333_118925387:HYOU1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 118940957 C/G 1 8 3 11 3.77312120126222 1.58507954952667 2.18804165173555 C:G C G 10 0.528359849842223 0.234829965499602 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 118949331 C/T 1 10 13 23 4.71640150157777 6.8686780479489 -2.15227654637113 T:C C T 10 0.528359849842223 0.408345653063064 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 118952173 A/G 1 65 59 124 30.6566097602555 31.1732311406912 -0.516621380435645 A:G A G 10 0.528359849842223 0.92861417200515 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 118955679 C/T 1 10 6 16 4.71640150157777 3.17015909905334 1.54624240252443 T:C C T 10 0.528359849842223 0.46618456350988 ENSG00000149397:ENST00000278715:exon_118955587_118955776:HMBS;ENSG00000149397:ENST00000442944:exon_118955624_118955776:HMBS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 119206375 G/A 1 8 3 11 3.77312120126222 1.58507954952667 2.18804165173555 A:G G A 10 0.528359849842223 0.234829965499602 ENSG00000173456:ENST00000311413:exon_119205237_119208021:RNF26 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 122928622 A/G 1 1922 2069 3991 906.492368603248 1093.17652932356 -186.684160720312 A:T:C:G A G 10 0.528359849842223 3.58895706782334e-09 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928204_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122928205_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122928206_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122928409_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122928487_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122928587_122928627:HSPA8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 122929407 T/G 1 956 882 1838 450.887983550835 466.013387560841 -15.1254040100058 T:C:G T G 10 0.528359849842223 0.483441924651543 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928960_122929969:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122929340_122929805:HSPA8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 124967487 T/A 1 17 18 35 8.01788255268221 9.51047729716001 -1.4925947444778 A:T:C T A 10 0.528359849842223 0.616789910783587 ENSG00000150433:ENST00000455225:exon_124966398_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531909:exon_124966441_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527257:exon_124966931_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000528724:exon_124966967_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531262:exon_124967038_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532156:exon_124967139_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532407:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000279968:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531851:exon_124967153_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000526175:exon_124967222_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527766:exon_124967235_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529609:exon_124967338_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529583:exon_124967382_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527271:exon_124967426_124967636:TMEM218 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 126163612 T/G 0 10 0 10 4.71640150157777 0 4.71640150157777 T T 10 0.528359849842223 0.00224013880625445 ENSG00000150455:ENST00000392679:exon_126163563_126164828:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000279992:exon_126163582_126163687:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392680:exon_126163563_126164579:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000479770:exon_126163563_126164534:TIRAP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 126174164 C/T 1 37 29 66 17.4506855558378 15.3224356454245 2.12824991041328 T:C C T 10 0.528359849842223 0.623895837614678 ENSG00000255062:ENST00000524964:exon_126174103_126174213:RP11-712L6.5;ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126173647_126174176:DCPS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 126201403 T/C 1 18 24 42 8.48952270283999 12.6806363962134 -4.19111369337337 T:C T C 10 0.528359849842223 0.217733138356581 ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126201300_126201445:DCPS;ENSG00000110063:ENST00000530860:exon_126201299_126201445:DCPS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 128333503 T/C 1 2 9 11 0.943280300315554 4.75523864858001 -3.81195834826445 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0308448779834246 ENSG00000134954:ENST00000345075:exon_128333404_128333518:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000392668:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000319397:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000526145:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000530924:exon_128333404_128333524:ETS1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 11 130011433 A/G 1 3 6 9 1.41492045047333 3.17015909905334 -1.75523864858001 A:G A G 10 0.528359849842223 0.322385551531720 ENSG00000084234:ENST00000533616:exon_130011393_130011467:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000528499:exon_130011393_130011467:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000263574:exon_130011393_130011467:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000345598:exon_130011393_130011467:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000338167:exon_130011393_130011467:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000278756:exon_130011393_130011467:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000533860:exon_130011393_130011467:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000530493:exon_130010390_130011467:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000525604:exon_130011307_130011969:APLP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 988894 G/A 1 7 4 11 3.30148105110444 2.11343939936889 1.18804165173555 A:G G A 10 0.528359849842223 0.556038959282085 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_988739_989197:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_988739_989197:WNK1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 1702219 T/C 1 7 3 10 3.30148105110444 1.58507954952667 1.71640150157777 T:C T C 10 0.528359849842223 0.35163323596596 ENSG00000171823:ENST00000339235:exon_1702039_1703331:FBXL14 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 4461485 G/A 1 8 10 18 3.77312120126222 5.28359849842223 -1.51047729716001 A:G G A 10 0.528359849842223 0.490179587566891 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4461426_4469188:C12orf5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 6554628 G/A 1 109 110 219 51.4087763671977 58.1195834826445 -6.71080711544683 A:T:G G A 10 0.528359849842223 0.379279835088893 ENSG00000139193:ENST00000266557:exon_6554590_6554721:CD27 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 6560573 G/T 1 322 309 631 151.868128350804 163.263193601247 -11.3950652504427 T:G G T 10 0.528359849842223 0.380392401440105 ENSG00000139193:ENST00000266557:exon_6560434_6560884:CD27 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 6562285 C/T 1 9 10 19 4.24476135141999 5.28359849842223 -1.03883714700224 T:C C T 10 0.528359849842223 0.653351132943168 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562233_6562463:TAPBPL HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 6562293 C/T 1 9 10 19 4.24476135141999 5.28359849842223 -1.03883714700224 T:C C T 10 0.528359849842223 0.653351132943168 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562233_6562463:TAPBPL HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 6562753 A/G 1 15 8 23 7.07460225236666 4.22687879873778 2.84772345362887 A:G A G 10 0.528359849842223 0.297507531604697 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 6562810 A/G 0 18 0 18 8.48952270283999 0 8.48952270283999 A A 10 0.528359849842223 1.16311150270635e-05 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 6562823 C/T 1 21 4 25 9.90444315331332 2.11343939936889 7.79100375394443 T:C C T 10 0.528359849842223 0.00198749493531708 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 6562836 G/A 1 19 10 29 8.96116285299776 5.28359849842223 3.67756435457554 A:G G A 10 0.528359849842223 0.195530753568808 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 6572048 A/G 1 25 19 44 11.7910037539444 10.0388371470022 1.75216660694219 A:G A G 10 0.528359849842223 0.652159077427638 ENSG00000139190:ENST00000396943:exon_6571406_6573652:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000361716:exon_6571406_6574107:VAMP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 6631169 C/A 1 10 15 25 4.71640150157777 7.92539774763334 -3.20899624605557 A:C C A 10 0.528359849842223 0.231576293849315 ENSG00000010292:ENST00000382457:exon_6630964_6631203:NCAPD2;ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6630964_6631203:NCAPD2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 6637845 T/C 1 41 62 103 19.3372461564689 32.7583106902178 -13.421064533749 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0099593520052228 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6637845_6638022:NCAPD2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 6638116 C/T 1 23 27 50 10.8477234536289 14.26571594574 -3.41799249211115 T:C C T 10 0.528359849842223 0.395680379406461 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6638111_6638205:NCAPD2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 6639088 A/G 1 62 66 128 29.2416893097822 34.8717500895867 -5.63006077980453 A:G A G 10 0.528359849842223 0.331079791504107 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6638941_6639124:NCAPD2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 6839913 C/T 1 32 37 69 15.0924848050489 19.5493144441622 -4.45682963911338 T:C C T 10 0.528359849842223 0.334776088296559 ENSG00000111652:ENST00000229251:exon_6839835_6839986:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000455113:exon_6839835_6839986:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000442593:exon_6839835_6839986:COPS7A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 6858126 G/A 1 113 97 210 53.2953369678288 51.2509054346956 2.04443153313319 A:G G A 10 0.528359849842223 0.78273506618463 ENSG00000089693:ENST00000435120:exon_6857936_6858148:MLF2;ENSG00000089693:ENST00000203630:exon_6857936_6858148:MLF2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 6965194 A/G 1 8 11 19 3.77312120126222 5.81195834826445 -2.03883714700224 A:G A G 10 0.528359849842223 0.368087451982495 ENSG00000111667:ENST00000229268:exon_6965181_6965314:USP5;ENSG00000111667:ENST00000389231:exon_6965181_6965314:USP5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 7022085 T/A 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 A:T T A 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7021894_7022191:LRRC23 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 7023123 A/G 1 9 25 34 4.24476135141999 13.2089962460556 -8.96423489463558 A:G A G 10 0.528359849842223 0.00290046972367630 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000382257:exon_7023055_7023405:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7023055_7023358:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000428946:exon_7023055_7023393:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000323702:exon_7023055_7023392:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000436789:exon_7023055_7023132:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000429740:exon_7023055_7023235:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000472633:exon_7023055_7023392:LRRC23 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 7592035 G/T 0 32 0 32 15.0924848050489 0 15.0924848050489 G G 10 0.528359849842223 2.68490048337506e-09 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 9094548 A/G 1 13 2 15 6.1313219520511 1.05671969968445 5.07460225236666 A:G A G 10 0.528359849842223 0.00874696199680708 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 9822387 C/G 1 23 18 41 10.8477234536289 9.51047729716001 1.33724615646886 C:G C G 10 0.528359849842223 0.7552554662341 ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9822313_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9822324_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9822325_9822391:CLEC2D HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 9833524 C/G 1 18 15 33 8.48952270283999 7.92539774763334 0.564124955206642 C:G C G 10 0.528359849842223 0.863674650795997 ENSG00000069493:ENST00000479410:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000487752:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000444971:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000430909:exon_9833521_9833629:CLEC2D HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 9906067 T/C 1 27 24 51 12.73428405426 12.6806363962134 0.0536476580466285 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000110848:ENST00000228434:exon_9905082_9906185:CD69 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 9906179 G/A 1 13 12 25 6.1313219520511 6.34031819810668 -0.208996246055574 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000110848:ENST00000228434:exon_9905082_9906185:CD69 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 10999708 T/C 1 7 5 12 3.30148105110444 2.64179924921111 0.659681801893325 T:C T C 10 0.528359849842223 0.778733618574385 ENSG00000111215:ENST00000228811:exon_10999644_10999966:PRR4;ENSG00000111215:ENST00000431566:exon_10999640_10999909:PRR4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 10999780 C/T 1 6 2 8 2.82984090094666 1.05671969968445 1.77312120126222 T:C C T 10 0.528359849842223 0.29537924054388 ENSG00000111215:ENST00000228811:exon_10999644_10999966:PRR4;ENSG00000111215:ENST00000431566:exon_10999640_10999909:PRR4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 12871099 T/G 1 6 9 15 2.82984090094666 4.75523864858001 -1.92539774763334 T:G T G 10 0.528359849842223 0.439217229441099 ENSG00000111276:ENST00000228872:exon_12870397_12871248:CDKN1B;ENSG00000111276:ENST00000396340:exon_12870756_12871248:CDKN1B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 14927825 C/G 1 59 52 111 27.8267688593088 27.4747121917956 0.352056667513253 C:G C G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000111332:ENST00000389078:exon_14927349_14927957:H2AFJ HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 14976178 T/A 1 6 3 9 2.82984090094666 1.58507954952667 1.24476135141999 A:T T A 10 0.528359849842223 0.514115714513849 ENSG00000182993:ENST00000330828:exon_14975846_14977349:C12orf60 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 14976553 G/C 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 C:G G C 10 0.528359849842223 0.743278251879842 ENSG00000182993:ENST00000330828:exon_14975846_14977349:C12orf60 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 16516994 G/A 1 189 92 281 89.1399883798199 48.6091061854845 40.5308821943354 A:G G A 10 0.528359849842223 1.11324393221819e-06 ENSG00000008394:ENST00000010404:exon_16516729_16517343:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396210:exon_16516729_16517342:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396209:exon_16516729_16517343:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396207:exon_16516729_16517343:MGST1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 21623122 T/G 1 10 10 20 4.71640150157777 5.28359849842223 -0.567196996844459 T:G T G 10 0.528359849842223 0.826247654639236 ENSG00000121350:ENST00000240651:exon_21621440_21624176:PYROXD1;ENSG00000004700:ENST00000396093:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000444129:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000421138:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000314748:exon_21622697_21623280:RECQL HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 22213786 C/T 1 28 15 43 13.2059242044178 7.92539774763334 5.28052645678441 T:C C T 10 0.528359849842223 0.126572866615993 ENSG00000111726:ENST00000229329:exon_22213766_22213860:CMAS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 25242595 C/G 1 18 7 25 8.48952270283999 3.69851894889556 4.79100375394443 C:G C G 10 0.528359849842223 0.0702196494635416 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242548_25242611:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242548_25242611:LRMP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 25243115 G/C 1 48 15 63 22.6387272075733 7.92539774763334 14.71332945994 C:G G C 10 0.528359849842223 0.000198742660505153 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242991_25243131:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242991_25243131:LRMP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 31253995 C/T 1 7 2 9 3.30148105110444 1.05671969968445 2.24476135141999 T:C C T 10 0.528359849842223 0.186011003558895 ENSG00000013573:ENST00000407793:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000228264:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000350437:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000404673:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000251758:exon_31253961_31254064:DDX11 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 42554505 A/G 1 26 27 53 12.2626439041022 14.26571594574 -2.00307204163782 A:G A G 10 0.528359849842223 0.585643289467418 ENSG00000015153:ENST00000327791:exon_42550906_42554628:YAF2;ENSG00000015153:ENST00000380790:exon_42550906_42554628:YAF2;ENSG00000015153:ENST00000442791:exon_42552837_42554628:YAF2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 46321514 A/T 1 9 5 14 4.24476135141999 2.64179924921111 1.60296210220888 A:T A T 10 0.528359849842223 0.434484743557366 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 48539482 T/G 1 90 72 162 42.4476135141999 38.0419091886401 4.40570432555988 T:G T G 10 0.528359849842223 0.529186198703564 ENSG00000152556:ENST00000340802:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000359794:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000395233:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000312352:exon_48539347_48539488:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000443538:exon_48539347_48539887:PFKM HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 49048738 G/T 1 15 8 23 7.07460225236666 4.22687879873778 2.84772345362887 T:G G T 10 0.528359849842223 0.297507531604697 ENSG00000139620:ENST00000420613:exon_49048724_49048843:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000324947:exon_49048724_49048843:C12orf41 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 49230035 T/G 1 24 24 48 11.3193636037866 12.6806363962134 -1.3612727924267 T:G T G 10 0.528359849842223 0.772944113464232 ENSG00000174243:ENST00000398375:exon_49229904_49230049:DDX23;ENSG00000174243:ENST00000308025:exon_49229904_49230049:DDX23 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 50848132 T/A 1 4 6 10 1.88656060063111 3.17015909905334 -1.28359849842223 A:T T A 10 0.528359849842223 0.531770325189017 ENSG00000161813:ENST00000429001:exon_50848097_50848200:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000398464:exon_50848097_50848200:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000398473:exon_50848097_50848200:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000293618:exon_50848097_50848200:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000522085:exon_50848097_50848200:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000518444:exon_50848097_50848200:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000441650:exon_50848097_50848200:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000518561:exon_50848097_50848200:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000520064:exon_50848097_50848200:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000347328:exon_50848097_50848200:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000521120:exon_50848097_50848745:LARP4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 51681903 T/C 1 16 17 33 7.54624240252443 8.98211744731779 -1.43587504479336 T:C T C 10 0.528359849842223 0.727923620154862 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51681892_51681972:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51681892_51681972:BIN2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 51685831 T/C 1 23 33 56 10.8477234536289 17.4358750447934 -6.58815159116448 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0827974276403631 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51685375_51686128:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51685375_51686128:BIN2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 53647373 T/C 1 12 9 21 5.65968180189332 4.75523864858001 0.904443153313317 T:C T C 10 0.528359849842223 0.827907977261945 ENSG00000182544:ENST00000328704:exon_53646602_53647536:MFSD5;ENSG00000182544:ENST00000329548:exon_53646602_53648188:MFSD5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 53682326 G/A 1 2 6 8 0.943280300315554 3.17015909905334 -2.22687879873778 A:G G A 10 0.528359849842223 0.159873274171007 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682322_53682483:ESPL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 53682457 G/A 1 2 6 8 0.943280300315554 3.17015909905334 -2.22687879873778 A:G G A 10 0.528359849842223 0.159873274171007 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682322_53682483:ESPL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 53682986 C/T 1 3 6 9 1.41492045047333 3.17015909905334 -1.75523864858001 T:C C T 10 0.528359849842223 0.322385551531720 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682874_53683087:ESPL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 54110197 A/G 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 A:G A G 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54110044_54110199:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54110044_54110199:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54110044_54110199:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54110044_54110199:CALCOCO1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 54575458 T/C 1 68 47 115 32.0715302107288 24.8329129425845 7.23861726814436 T:C T C 10 0.528359849842223 0.191354381233352 ENSG00000123415:ENST00000508340:exon_54573783_54576174:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505128:exon_54575241_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000337581:exon_54575252_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000508394:exon_54575253_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505662:exon_54575269_54576407:SMUG1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 55355033 C/T 1 25 16 41 11.7910037539444 8.45375759747557 3.33724615646886 T:C C T 10 0.528359849842223 0.348882224113598 ENSG00000135426:ENST00000524622:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524923:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000532804:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55354989_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000531122:exon_55354952_55355051:KIAA0748 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 56814653 G/A 1 6 5 11 2.82984090094666 2.64179924921111 0.188041651735547 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56814597_56814665:TIMELESS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 56815922 C/T 1 12 8 20 5.65968180189332 4.22687879873778 1.43280300315554 T:C C T 10 0.528359849842223 0.655637718042508 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56815890_56815975:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56815890_56815975:TIMELESS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 57106660 A/T 1 2517 1953 4470 1187.11825794712 1031.88678674186 155.231471205263 A:T:C:G A T 10 0.528359849842223 3.38537674586548e-06 ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57106570_57106692:NACA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 57108203 A/G 1 1116 1070 2186 526.350407576079 565.345039331179 -38.9946317550994 A:C:G A G 10 0.528359849842223 0.0990127113276983 ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57108146_57108223:NACA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 57133140 T/G 1 14 8 22 6.60296210220888 4.22687879873778 2.37608330347109 T:G T G 10 0.528359849842223 0.394490393359378 ENSG00000198056:ENST00000338193:exon_57133078_57133147:PRIM1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 57870155 A/C 1 30 18 48 14.1492045047333 9.51047729716001 4.6387272075733 A:C A C 10 0.528359849842223 0.195285832758551 ENSG00000123329:ENST00000393791:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000340423:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000430041:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000423291:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000424809:exon_57870147_57870237:ARHGAP9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 58112189 A/G 1 152 177 329 71.6893028239821 93.5196934220735 -21.8303905980913 A:T:G A G 10 0.528359849842223 0.0174655719058740 ENSG00000135506:ENST00000257966:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000315970:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000413095:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000435406:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000439210:exon_58111929_58112204:OS9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 58141030 G/A 1 22 15 37 10.3760833034711 7.92539774763334 2.45068555583775 A:G G A 10 0.528359849842223 0.510804939493191 ENSG00000135452:ENST00000257910:exon_58140999_58142004:TSPAN31 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 58162739 A/G 1 35 53 88 16.5074052555222 28.0030720416378 -11.4956667861156 A:G A G 10 0.528359849842223 0.018311168617814 ENSG00000037897:ENST00000324871:exon_58162254_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000257848:exon_58162365_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000408972:exon_58162368_58162934:METTL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 64202890 C/G 1 2 7 9 0.943280300315554 3.69851894889556 -2.75523864858001 C:G C G 10 0.528359849842223 0.0939591166432567 ENSG00000118600:ENST00000261234:exon_64202455_64203300:TMEM5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 66546100 A/G 1 11 18 29 5.18804165173555 9.51047729716001 -4.32243564542447 A:G A G 10 0.528359849842223 0.136176040576689 ENSG00000155957:ENST00000426857:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000358230:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000286424:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000398033:exon_66546051_66546156:TMBIM4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 67706466 G/A 1 100 84 184 47.1640150157777 44.3822273867467 2.78178762903098 A:G G A 10 0.528359849842223 0.712266160957116 ENSG00000111530:ENST00000299218:exon_67706386_67708388:CAND1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 68707287 G/A 1 4 6 10 1.88656060063111 3.17015909905334 -1.28359849842223 A:G G A 10 0.528359849842223 0.531770325189017 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68707223_68707332:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68707223_68707332:MDM1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 69646914 G/A 1 18 32 50 8.48952270283999 16.9075151949511 -8.41799249211115 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0225101917787941 ENSG00000111605:ENST00000435070:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000266679:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000351671:exon_69646831_69646934:CPSF6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 72164395 C/T 1 6 3 9 2.82984090094666 1.58507954952667 1.24476135141999 T:C C T 10 0.528359849842223 0.514115714513849 ENSG00000080371:ENST00000261263:exon_72164372_72164479:RAB21 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 72307616 A/G 1 3 6 9 1.41492045047333 3.17015909905334 -1.75523864858001 A:G A G 10 0.528359849842223 0.322385551531720 ENSG00000121749:ENST00000319106:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000393309:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000485960:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000462788:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000407399:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000483828:exon_72307606_72307713:TBC1D15 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 72312268 G/A 1 7 7 14 3.30148105110444 3.69851894889556 -0.397037897791122 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000121749:ENST00000319106:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000393309:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000485960:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000462788:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000407399:exon_72312231_72312328:TBC1D15 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 75884254 C/T 1 9 6 15 4.24476135141999 3.17015909905334 1.07460225236666 T:C C T 10 0.528359849842223 0.61599879202346 ENSG00000139278:ENST00000266659:exon_75884186_75884298:GLIPR1;ENSG00000139278:ENST00000456650:exon_75884186_75884298:GLIPR1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 75900588 A/G 1 6 14 20 2.82984090094666 7.39703789779112 -4.56719699684446 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0453201930852521 ENSG00000111615:ENST00000229214:exon_75900562_75900696:KRR1;ENSG00000111615:ENST00000438169:exon_75900562_75900696:KRR1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 93202801 C/T 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000102189:ENST00000322349:exon_93202793_93202932:EEA1;ENSG00000102189:ENST00000418984:exon_93202793_93202932:EEA1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 95681597 G/A 1 15 11 26 7.07460225236666 5.81195834826445 1.2626439041022 A:G G A 10 0.528359849842223 0.696773212715701 ENSG00000028203:ENST00000436874:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000261219:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397792:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000356859:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397796:exon_95681440_95681633:VEZT HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 102494849 T/C 1 9 8 17 4.24476135141999 4.22687879873778 0.0178825526822095 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000075188:ENST00000251074:exon_102494810_102494882:NUP37 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 104341398 T/A 1 3 6 9 1.41492045047333 3.17015909905334 -1.75523864858001 A:T T A 10 0.528359849842223 0.322385551531720 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 106903321 T/C 1 6 8 14 2.82984090094666 4.22687879873778 -1.39703789779112 T:C T C 10 0.528359849842223 0.594448035256428 ENSG00000013503:ENST00000228347:exon_106903198_106903974:POLR3B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 108102757 A/G 1 53 60 113 24.9969279583622 31.7015909905334 -6.70466303217119 A:G A G 10 0.528359849842223 0.221083905484342 ENSG00000136045:ENST00000412830:exon_108102703_108102793:PWP1;ENSG00000136045:ENST00000258531:exon_108102703_108102793:PWP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 108954862 G/C 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 C:G G C 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108954777_108954944:SART3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 109994870 A/T 1 73 81 154 34.4297309615177 42.7971478372201 -8.36741687570233 A:T A T 10 0.528359849842223 0.19648598332981 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_109991525_109994941:MMAB HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 110011229 G/T 1 10 4 14 4.71640150157777 2.11343939936889 2.60296210220888 T:G G T 10 0.528359849842223 0.189361454505222 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 110011230 C/T 1 10 5 15 4.71640150157777 2.64179924921111 2.07460225236666 T:C C T 10 0.528359849842223 0.313475377913303 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 112471090 G/T 1 7 5 12 3.30148105110444 2.64179924921111 0.659681801893325 T:G G T 10 0.528359849842223 0.778733618574385 ENSG00000111300:ENST00000261745:exon_112471037_112471183:NAA25 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 113424893 C/G 1 13 12 25 6.1313219520511 6.34031819810668 -0.208996246055574 C:G C G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000111335:ENST00000342315:exon_113424843_113425113:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000392583:exon_113424843_113425113:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000449768:exon_113424843_113426607:OAS2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 113533150 C/T 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 T:C C T 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000135144:ENST00000257600:exon_113533130_113533219:DTX1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 113596736 G/A 1 126 111 237 59.4266589198799 58.6479433324867 0.778715587393158 A:G G A 10 0.528359849842223 0.948170116111093 ENSG00000123064:ENST00000314045:exon_113594986_113596917:DDX54;ENSG00000123064:ENST00000306014:exon_113594986_113596914:DDX54 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 113623241 C/G 1 11 22 33 5.18804165173555 11.6239166965289 -6.43587504479336 C:G C G 10 0.528359849842223 0.0348400795769079 ENSG00000123064:ENST00000314045:exon_113623083_113623284:DDX54;ENSG00000123064:ENST00000306014:exon_113623083_113623284:DDX54 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 113826442 C/G 1 21 14 35 9.90444315331332 7.39703789779112 2.5074052555222 C:G C G 10 0.528359849842223 0.498860075577052 ENSG00000151176:ENST00000280800:exon_113826264_113827201:PLBD2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 114374887 T/C 1 9 18 27 4.24476135141999 9.51047729716001 -5.26571594574002 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0528943613053108 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114374812_114374941:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114374812_114374941:RBM19 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 114377835 A/G 1 9 2 11 4.24476135141999 1.05671969968445 3.18804165173555 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0701050773055379 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114377765_114377965:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114377765_114377965:RBM19 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 114383651 C/T 1 2 7 9 0.943280300315554 3.69851894889556 -2.75523864858001 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0939591166432567 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114383633_114383729:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114383633_114383729:RBM19 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 114386639 A/G 1 12 3 15 5.65968180189332 1.58507954952667 4.07460225236666 A:G A G 10 0.528359849842223 0.039472132090448 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114386638_114386841:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114386638_114386841:RBM19 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 114395651 T/C 1 4 9 13 1.88656060063111 4.75523864858001 -2.8686780479489 T:C T C 10 0.528359849842223 0.163373721097630 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114395587_114395855:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114395587_114395855:RBM19 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 120960057 C/T 1 20 15 35 9.43280300315554 7.92539774763334 1.5074052555222 T:C C T 10 0.528359849842223 0.735466789742701 ENSG00000110871:ENST00000288532:exon_120960017_120960166:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000445328:exon_120960017_120960166:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000302223:exon_120960017_120960166:COQ5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 121017171 A/G 1 117 99 216 55.1818975684599 52.3076251343801 2.87427243407984 A:G A G 10 0.528359849842223 0.733430182106342 ENSG00000167272:ENST00000357500:exon_121016849_121017215:POP5;ENSG00000167272:ENST00000341039:exon_121016849_121017215:POP5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 121174938 C/T 1 6 7 13 2.82984090094666 3.69851894889556 -0.868678047948899 T:C C T 10 0.528359849842223 0.782884637593256 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121174789_121174938:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121174789_121174938:ACADS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 121176083 G/A 1 20 15 35 9.43280300315554 7.92539774763334 1.5074052555222 A:G G A 10 0.528359849842223 0.735466789742701 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176083_121176253:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176083_121176253:ACADS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 121177272 G/C 1 26 22 48 12.2626439041022 11.6239166965289 0.638727207573298 C:G G C 10 0.528359849842223 0.885958855013826 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121177099_121177810:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121177099_121177810:ACADS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 121471337 G/A 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 A:G G A 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000135114:ENST00000257570:exon_121471264_121471546:OASL;ENSG00000135114:ENST00000339275:exon_121471264_121471546:OASL HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 121666646 A/G 1 6 7 13 2.82984090094666 3.69851894889556 -0.868678047948899 A:G A G 10 0.528359849842223 0.782884637593256 ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121666528_121666669:P2RX4;ENSG00000135124:ENST00000359949:exon_121666528_121666669:P2RX4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 122079189 C/T 1 67 62 129 31.5998900605711 32.7583106902178 -1.15842062964676 T:C C T 10 0.528359849842223 0.860296902337881 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 122231573 C/T 1 10 15 25 4.71640150157777 7.92539774763334 -3.20899624605557 T:C C T 10 0.528359849842223 0.231576293849315 ENSG00000139725:ENST00000267205:exon_122231402_122231594:RHOF HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 122326812 T/C 1 9 13 22 4.24476135141999 6.8686780479489 -2.62391669652891 T:C T C 10 0.528359849842223 0.291037847710403 ENSG00000110801:ENST00000261817:exon_122326646_122326900:PSMD9;ENSG00000110801:ENST00000340175:exon_122326646_122326900:PSMD9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 122812503 G/C 1 5 7 12 2.35820075078889 3.69851894889556 -1.34031819810668 C:G G C 10 0.528359849842223 0.56626847898003 ENSG00000130779:ENST00000361654:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000358808:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000302528:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000392458:exon_122812494_122812709:CLIP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 124104049 A/G 1 22 29 51 10.3760833034711 15.3224356454245 -4.94635234195337 A:G A G 10 0.528359849842223 0.206436286782056 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124103979_124104271:DDX55 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 124104686 G/A 1 53 60 113 24.9969279583622 31.7015909905334 -6.70466303217119 A:G G A 10 0.528359849842223 0.221083905484342 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124104511_124105480:DDX55 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 124821413 G/A 1 22 22 44 10.3760833034711 11.6239166965289 -1.24783339305781 A:G G A 10 0.528359849842223 0.763577975108391 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447675:exon_124821299_124821676:NCOR2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 124821416 C/T 1 19 23 42 8.96116285299776 12.1522765463711 -3.19111369337336 T:C C T 10 0.528359849842223 0.355811216933603 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447675:exon_124821299_124821676:NCOR2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 125396425 G/A 1 1745 1956 3701 823.012062025321 1033.47186629139 -210.459804266067 A:T:C:G G A 10 0.528359849842223 4.46941921902542e-12 ENSG00000150991:ENST00000339647:exon_125396194_125398320:UBC HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 125398039 G/C 1 1205 1446 2651 568.326380940121 764.008342871854 -195.681961931733 A:T:C:G G C 10 0.528359849842223 2.96624107460486e-14 ENSG00000150991:ENST00000339647:exon_125396194_125398320:UBC HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 125626685 C/T 1 10 12 22 4.71640150157777 6.34031819810668 -1.62391669652891 T:C C T 10 0.528359849842223 0.527319699445417 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125626638_125627871:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125626638_125627861:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125626638_125627861:AACS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 132561987 C/T 1 13 13 26 6.1313219520511 6.8686780479489 -0.737356095897796 T:C C T 10 0.528359849842223 0.845396168977588 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132561946_132565005:EP400 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 132626425 G/A 1 5 14 19 2.35820075078889 7.39703789779112 -5.03883714700224 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0223377147745195 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626395_132626501:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626395_132626501:DDX51 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 132626668 T/C 1 9 4 13 4.24476135141999 2.11343939936889 2.1313219520511 T:C T C 10 0.528359849842223 0.276905486309559 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626664_132626735:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626664_132626735:DDX51 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 133208979 T/C 1 14 17 31 6.60296210220888 8.98211744731779 -2.37915534510891 T:C T C 10 0.528359849842223 0.472662474431109 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000434528:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133208901_133209094:POLE HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 133272470 G/T 1 12 12 24 5.65968180189332 6.34031819810668 -0.680636396213352 T:G G T 10 0.528359849842223 0.839647550159473 ENSG00000176894:ENST00000317479:exon_133272470_133272632:PGAM5;ENSG00000176894:ENST00000428960:exon_133272470_133272632:PGAM5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 133294333 C/T 1 9 11 20 4.24476135141999 5.81195834826445 -1.56719699684446 T:C C T 10 0.528359849842223 0.509651795713 ENSG00000176894:ENST00000454808:exon_133294296_133294384:PGAM5;ENSG00000176894:ENST00000317555:exon_133294296_133294384:PGAM5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 133303973 C/G 1 38 33 71 17.9223257059955 17.4358750447934 0.486450661202174 C:G C G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133302255_133304029:ANKLE2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 133306589 C/T 1 49 50 99 23.1103673577311 26.4179924921111 -3.30762513438007 T:C C T 10 0.528359849842223 0.546288518636751 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133306265_133306856:ANKLE2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 133306710 C/T 1 20 22 42 9.43280300315554 11.6239166965289 -2.19111369337336 T:C C T 10 0.528359849842223 0.538499760343504 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133306265_133306856:ANKLE2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 133331364 G/A 1 4 11 15 1.88656060063111 5.81195834826445 -3.92539774763334 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0667977720808296 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133331261_133331719:ANKLE2;ENSG00000176915:ENST00000337516:exon_133331261_133331719:ANKLE2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 133331537 G/A 1 9 6 15 4.24476135141999 3.17015909905334 1.07460225236666 A:G G A 10 0.528359849842223 0.61599879202346 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133331261_133331719:ANKLE2;ENSG00000176915:ENST00000337516:exon_133331261_133331719:ANKLE2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 133393323 C/T 1 6 3 9 2.82984090094666 1.58507954952667 1.24476135141999 T:C C T 10 0.528359849842223 0.514115714513849 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133393246_133393398:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133393126_133393398:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133393126_133393398:GOLGA3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 133683261 T/C 1 18 16 34 8.48952270283999 8.45375759747557 0.035765105364419 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000196387:ENST00000355557:exon_133682096_133684260:ZNF140 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 12 133778796 C/T 1 11 9 20 5.18804165173555 4.75523864858001 0.432803003155541 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000090612:ENST00000416488:exon_133778730_133778955:ZNF268;ENSG00000090612:ENST00000228289:exon_133778730_133781730:ZNF268 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 21751033 C/G 1 8 12 20 3.77312120126222 6.34031819810668 -2.56719699684446 C:G C G 10 0.528359849842223 0.270560515458782 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 22178258 C/T 1 5 4 9 2.35820075078889 2.11343939936889 0.244761351419994 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000165487:ENST00000382374:exon_22178078_22178353:EFHA1;ENSG00000165487:ENST00000469058:exon_22178078_22178304:EFHA1;ENSG00000165487:ENST00000468222:exon_22178078_22178320:EFHA1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 28197436 C/T 1 212 174 386 99.9877118334487 91.9346138725468 8.05309796090194 T:C C T 10 0.528359849842223 0.415241992267816 ENSG00000186184:ENST00000302979:exon_28197012_28197589:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000399696:exon_28197012_28197583:POLR1D HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 28239940 G/C 1 99 105 204 46.6923748656199 55.4777842334334 -8.78540936781349 C:G G C 10 0.528359849842223 0.233300187541374 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 28239970 G/A 1 128 132 260 60.3699392201955 69.7435001791734 -9.37356095897796 A:G G A 10 0.528359849842223 0.263523341689461 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 33091940 T/C 1 41 43 84 19.3372461564689 22.7194735432156 -3.38222738674673 T:C T C 10 0.528359849842223 0.512338500784047 ENSG00000244754:ENST00000503814:exon_33091031_33092140:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000267068:exon_33091031_33092140:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000511143:exon_33091625_33092140:N4BP2L2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 37580139 G/A 1 14 13 27 6.60296210220888 6.8686780479489 -0.26571594574002 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000120699:ENST00000489088:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000389704:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000379809:exon_37580095_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000239893:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000474661:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000490537:exon_37580094_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000488779:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000464235:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000495092:exon_37580057_37580162:EXOSC8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 37583831 G/A 1 35 35 70 16.5074052555222 18.4925947444778 -1.9851894889556 A:G G A 10 0.528359849842223 0.634654791834064 ENSG00000102710:ENST00000490716:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000484078:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000360252:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000483214:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000475892:exon_37583630_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000350612:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000472948:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000356185:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000469488:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000473871:exon_37583634_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000464744:exon_37583754_37583946:FAM48A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 39622075 T/C 1 6 6 12 2.82984090094666 3.17015909905334 -0.340318198106676 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000188811:ENST00000470258:exon_39621811_39624246:NHLRC3;ENSG00000188811:ENST00000379600:exon_39621811_39624246:NHLRC3;ENSG00000188811:ENST00000379599:exon_39621811_39624246:NHLRC3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 43462422 A/T 1 73 36 109 34.4297309615177 19.02095459432 15.4087763671977 A:T A T 10 0.528359849842223 0.00379680316094075 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43460524_43462638:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43462118_43462638:EPSTI1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 43469157 G/A 1 17 28 45 8.01788255268221 14.7940757955822 -6.77619324290003 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0515887267696382 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000398762:exon_43469145_43469244:EPSTI1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 43469211 G/A 1 15 9 24 7.07460225236666 4.75523864858001 2.31936360378665 A:T:G G A 10 0.528359849842223 0.415665286985416 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000398762:exon_43469145_43469244:EPSTI1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 43597865 A/G 1 9 5 14 4.24476135141999 2.64179924921111 1.60296210220888 A:G A G 10 0.528359849842223 0.434484743557366 ENSG00000120675:ENST00000379221:exon_43597339_43597870:DNAJC15;ENSG00000120675:ENST00000474320:exon_43597339_43597870:DNAJC15 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 45589184 A/C 1 10 12 22 4.71640150157777 6.34031819810668 -1.62391669652891 A:C A C 10 0.528359849842223 0.527319699445417 ENSG00000133114:ENST00000379151:exon_45589087_45589218:KIAA1704;ENSG00000133114:ENST00000497558:exon_45589087_45589218:KIAA1704;ENSG00000133114:ENST00000361121:exon_45589087_45589218:KIAA1704;ENSG00000133114:ENST00000357537:exon_45589087_45589218:KIAA1704 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 46541673 T/A 1 12 12 24 5.65968180189332 6.34031819810668 -0.680636396213352 A:T T A 10 0.528359849842223 0.839647550159473 ENSG00000123200:ENST00000242848:exon_46541639_46542163:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000378921:exon_46541639_46542163:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000282007:exon_46541639_46542163:ZC3H13 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 46562935 A/G 1 19 19 38 8.96116285299776 10.0388371470022 -1.07767429400447 A:G A G 10 0.528359849842223 0.747680748664144 ENSG00000123200:ENST00000242848:exon_46562922_46563232:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000378921:exon_46562922_46563232:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000282007:exon_46562922_46563232:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000431251:exon_46562922_46563232:ZC3H13 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 46946157 C/T 1 8 10 18 3.77312120126222 5.28359849842223 -1.51047729716001 T:C C T 10 0.528359849842223 0.490179587566891 ENSG00000102445:ENST00000378797:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000429979:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378781:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378787:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000441284:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000389908:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378784:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000322896:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000417405:exon_46946076_46946213:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000439642:exon_46946076_46946732:C13orf18 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 47308109 A/G 1 3 11 14 1.41492045047333 5.81195834826445 -4.39703789779112 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0286834249686330 ENSG00000136141:ENST00000311191:exon_47308056_47308133:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000258643:exon_47308056_47308133:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389798:exon_47308056_47308133:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389797:exon_47308056_47308133:LRCH1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 48547467 A/T 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 A:T A T 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000136143:ENST00000378654:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000378645:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000378642:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000331052:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000434484:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000433022:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000497202:exon_48547399_48547527:SUCLA2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 50057097 G/A 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 A:G G A 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50056873_50057098:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50056873_50057098:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50056873_50057098:SETDB2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 50057633 A/G 1 6 2 8 2.82984090094666 1.05671969968445 1.77312120126222 A:G A G 10 0.528359849842223 0.29537924054388 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50057600_50057699:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50057600_50057699:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50057600_50057699:SETDB2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 50080847 A/G 1 15 11 26 7.07460225236666 5.81195834826445 1.2626439041022 A:G A G 10 0.528359849842223 0.696773212715701 ENSG00000136147:ENST00000482487:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000496623:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000467763:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000485919:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000442195:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50080771_50080892:PHF11 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 50102810 G/A 1 199 172 371 93.8563898813976 90.8778941728623 2.97849570853529 A:G G A 10 0.528359849842223 0.794903645113516 ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50102647_50103123:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50102647_50103111:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000426879:exon_50102647_50102844:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50102647_50103117:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000486276:exon_50102647_50103112:PHF11 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 50205025 T/C 1 12 6 18 5.65968180189332 3.17015909905334 2.48952270283999 T:C T C 10 0.528359849842223 0.345434571692356 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 76427253 T/G 1 8 7 15 3.77312120126222 3.69851894889556 0.0746022523666556 T:G T G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76427228_76427524:LMO7 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 96638636 A/C 1 5 7 12 2.35820075078889 3.69851894889556 -1.34031819810668 A:C A C 10 0.528359849842223 0.56626847898003 ENSG00000102595:ENST00000376747:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000376722:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000465196:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000376714:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000461329:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000467305:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000397618:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000376712:exon_96638587_96638686:UGGT2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 99105395 G/A 1 25 35 60 11.7910037539444 18.4925947444778 -6.70159099053338 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0928914677608068 ENSG00000102572:ENST00000397517:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376554:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376547:exon_99104413_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376541:exon_99104414_99105463:STK24 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 99948178 C/A 1 15 24 39 7.07460225236666 12.6806363962134 -5.6060341438467 A:C C A 10 0.528359849842223 0.0787377450084265 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 100543589 A/G 1 4 12 16 1.88656060063111 6.34031819810668 -4.45375759747557 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0417035604139189 ENSG00000125246:ENST00000376360:exon_100543572_100544824:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000376355:exon_100543572_100543691:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000323941:exon_100543572_100543691:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000376354:exon_100543572_100543867:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000339105:exon_100543572_100543691:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000419700:exon_100543572_100543691:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000425186:exon_100543572_100543867:CLYBL HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 111176519 G/T 1 6 3 9 2.82984090094666 1.58507954952667 1.24476135141999 T:G G T 10 0.528359849842223 0.514115714513849 ENSG00000139832:ENST00000267328:exon_111175417_111176544:RAB20 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 111290880 G/A 1 17 12 29 8.01788255268221 6.34031819810668 1.67756435457553 A:G G A 10 0.528359849842223 0.580776281232183 ENSG00000213995:ENST00000458711:exon_111290725_111291452:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111290725_111290892:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111290725_111292340:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111290589_111292340:CARKD HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 111298392 A/G 1 31 32 63 14.6208446548911 16.9075151949511 -2.28667054006005 A:G A G 10 0.528359849842223 0.61446924526043 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111298314_111298420:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000487253:exon_111298314_111298643:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000480437:exon_111298314_111298625:CARS2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 111319754 T/C 1 12 16 28 5.65968180189332 8.45375759747557 -2.79407579558224 T:C T C 10 0.528359849842223 0.345302340839643 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111319687_111319820:CARS2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 111340342 G/A 1 12 10 22 5.65968180189332 5.28359849842223 0.376083303471095 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111340294_111340365:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000465145:exon_111340294_111340365:CARS2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 111532288 G/A 1 19 8 27 8.96116285299776 4.22687879873778 4.73428405425998 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0824690479347734 ENSG00000088448:ENST00000267339:exon_111530887_111532459:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000485844:exon_111532115_111532459:ANKRD10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 111563052 C/T 1 6 6 12 2.82984090094666 3.17015909905334 -0.340318198106676 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000088448:ENST00000267339:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000310847:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000465753:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000489973:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000494859:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000375758:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000460846:exon_111562965_111563117:ANKRD10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 114748709 G/A 1 3 7 10 1.41492045047333 3.69851894889556 -2.28359849842223 A:G G A 10 0.528359849842223 0.206915350075299 ENSG00000185989:ENST00000334062:exon_114747194_114748833:RASA3;ENSG00000185989:ENST00000389544:exon_114747201_114748833:RASA3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 115002305 G/A 1 9 5 14 4.24476135141999 2.64179924921111 1.60296210220888 A:G G A 10 0.528359849842223 0.434484743557366 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115002277_115002371:CDC16 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 115004914 C/T 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 T:C C T 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115004785_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115004825_115004965:CDC16 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 13 115004935 T/C 1 4 12 16 1.88656060063111 6.34031819810668 -4.45375759747557 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0417035604139189 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115004785_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115004825_115004965:CDC16 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 20779835 T/C 1 123 139 262 58.0117384694066 73.442019128069 -15.4302806586624 T:C:G T C 10 0.528359849842223 0.0632005869073832 ENSG00000100814:ENST00000398160:exon_20779529_20779911:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000437553:exon_20779530_20779911:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000358932:exon_20779530_20779911:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000353689:exon_20779530_20779911:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398169:exon_20779571_20779911:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398163:exon_20779588_20779911:CCNB1IP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 20823052 G/A 1 24 12 36 11.3193636037866 6.34031819810668 4.97904540567997 A:G G A 10 0.528359849842223 0.131869325610955 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000446919:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527384:exon_20822801_20823106:PARP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 20825965 A/C 1 31 39 70 14.6208446548911 20.6060341438467 -5.98518948895561 A:C A C 10 0.528359849842223 0.187493181625775 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20825555_20826062:PARP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 20837033 T/C 1 6 4 10 2.82984090094666 2.11343939936889 0.71640150157777 T:C T C 10 0.528359849842223 0.757839432335683 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20836957_20837061:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20836957_20837061:TEP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 23020638 T/C 1 62 70 132 29.2416893097822 36.9851894889556 -7.74350017917343 T:C T C 10 0.528359849842223 0.191179952177373 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 23021039 G/A 1 79 78 157 37.2595718624644 41.2120682876934 -3.95249642522901 A:G G A 10 0.528359849842223 0.575919168001286 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 23240328 T/A 1 518 438 956 244.309597781729 231.421614230894 12.8879835508349 A:T T A 10 0.528359849842223 0.418050786324347 ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23240227_23240389:OXA1L HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 23374435 G/A 1 8 8 16 3.77312120126222 4.22687879873778 -0.453757597475567 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000307814:exon_23374303_23374455:RBM23 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 23374862 C/T 1 9 1 10 4.24476135141999 0.528359849842223 3.71640150157777 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0234763819888152 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000307814:exon_23374815_23374868:RBM23 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 23549285 G/A 1 15 10 25 7.07460225236666 5.28359849842223 1.79100375394443 A:G G A 10 0.528359849842223 0.550502230599065 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 23549319 A/G 1 11 3 14 5.18804165173555 1.58507954952667 3.60296210220888 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0628940949466435 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 23549383 G/T 1 21 9 30 9.90444315331332 4.75523864858001 5.14920450473331 T:G G T 10 0.528359849842223 0.0678805540980871 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 23549785 T/C 1 14 21 35 6.60296210220888 11.0955568466867 -4.4925947444778 T:C T C 10 0.528359849842223 0.174746470874083 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 24424367 G/A 0 10 0 10 4.71640150157777 0 4.71640150157777 G G 10 0.528359849842223 0.00224013880625445 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24424244_24424421:DHRS4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 24567422 C/T 1 63 41 104 29.71332945994 21.6627538435311 8.05057561640881 T:C C T 10 0.528359849842223 0.117100624033699 ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24567412_24567596:PCK2;ENSG00000100889:ENST00000396973:exon_24567412_24567596:PCK2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 24587639 G/A 1 11 6 17 5.18804165173555 3.17015909905334 2.01788255268221 A:G G A 10 0.528359849842223 0.467320757987905 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 24587667 C/T 1 5 5 10 2.35820075078889 2.64179924921111 -0.283598498422229 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 24615435 T/C 1 396 434 830 186.76949946248 229.308174831525 -42.5386753690451 T:C:G T C 10 0.528359849842223 0.0034711387859299 ENSG00000100911:ENST00000216802:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000429021:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000396881:exon_24615417_24615449:PSME2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 24617238 C/T 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 T:C C T 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000092098:ENST00000324103:exon_24617185_24617331:RNF31 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 24629744 G/A 1 50 58 108 23.5820075078889 30.6448712908489 -7.06286378296008 A:G G A 10 0.528359849842223 0.178416484289046 ENSG00000092098:ENST00000382682:exon_24629729_24629870:RNF31;ENSG00000092098:ENST00000491351:exon_24629729_24629869:RNF31;ENSG00000092098:ENST00000324103:exon_24629729_24629866:RNF31;ENSG00000092098:ENST00000382687:exon_24629729_24629870:RNF31;ENSG00000092098:ENST00000483895:exon_24629729_24629814:RNF31 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 24647814 T/C 1 59 16 75 27.8267688593088 8.45375759747557 19.3730112618333 T:C T C 10 0.528359849842223 4.40345257316795e-06 ENSG00000100918:ENST00000311457:exon_24647812_24647878:REC8;ENSG00000100918:ENST00000447460:exon_24647812_24647878:REC8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 24653965 C/T 1 12 2 14 5.65968180189332 1.05671969968445 4.60296210220888 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0148919960155353 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653856_24653969:IPO4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 24654489 T/C 1 9 8 17 4.24476135141999 4.22687879873778 0.0178825526822095 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24654389_24654518:IPO4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 24679877 C/T 1 111 111 222 52.3520566675133 58.6479433324867 -6.29588666497349 T:C C T 10 0.528359849842223 0.420045695865666 ENSG00000254692:ENST00000530611:exon_24679860_24679974:RP11-468E2.1;ENSG00000254505:ENST00000347519:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000530996:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533523:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533011:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000524955:exon_24679860_24680067:CHMP4A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 24702789 C/T 1 31 28 59 14.6208446548911 14.7940757955822 -0.173231140691154 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000100938:ENST00000355299:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000421944:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000420554:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000399440:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000348719:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000456667:exon_24702685_24702804:GMPR2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 24718515 G/A 0 0 8 8 0 4.22687879873778 -4.22687879873778 A G A 10 0.528359849842223 0.00244842131534247 ENSG00000092295:ENST00000206765:exon_24718322_24718747:TGM1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 24736027 G/A 1 42 46 88 19.8088863066266 24.3045530927423 -4.49566678611562 A:G G A 10 0.528359849842223 0.339187882000785 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24735982_24736095:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24735982_24736095:RABGGTA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 24736961 T/C 1 25 31 56 11.7910037539444 16.3791553451089 -4.58815159116449 T:C T C 10 0.528359849842223 0.230665067759772 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24736866_24736982:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24736866_24736982:RABGGTA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 24761805 A/C 1 6 6 12 2.82984090094666 3.17015909905334 -0.340318198106676 A:C A C 10 0.528359849842223 1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 24785784 C/T 1 9 8 17 4.24476135141999 4.22687879873778 0.0178825526822095 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000213903:ENST00000345363:exon_24784843_24786152:LTB4R;ENSG00000213903:ENST00000396789:exon_24784843_24787061:LTB4R;ENSG00000213903:ENST00000396782:exon_24784843_24787242:LTB4R HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 24845841 T/C 1 17 6 23 8.01788255268221 3.17015909905334 4.84772345362887 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0582276127373582 ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24845500_24848810:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24845500_24846084:NFATC4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 24901433 C/T 1 5 5 10 2.35820075078889 2.64179924921111 -0.283598498422229 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24900669_24901816:KHNYN HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 31355096 C/G 1 4 16 20 1.88656060063111 8.45375759747557 -6.56719699684446 C:G C G 10 0.528359849842223 0.00330603823866459 ENSG00000100473:ENST00000216361:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000382493:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000460581:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000396618:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000468826:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000475087:exon_31355002_31355518:COCH HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 31359024 A/T 1 8 45 53 3.77312120126222 23.7761932429 -20.0030720416378 A:T A T 10 0.528359849842223 1.68084653104122e-08 ENSG00000100473:ENST00000216361:exon_31358822_31359822:COCH;ENSG00000100473:ENST00000382493:exon_31358822_31359822:COCH;ENSG00000100473:ENST00000460581:exon_31358822_31359822:COCH;ENSG00000100473:ENST00000396618:exon_31358822_31359824:COCH;ENSG00000100473:ENST00000468826:exon_31358822_31359347:COCH HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 31578762 C/T 1 5 4 9 2.35820075078889 2.11343939936889 0.244761351419994 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000399321:exon_31578603_31578806:HECTD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 35546373 T/C 1 2 10 12 0.943280300315554 5.28359849842223 -4.34031819810667 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0173281289522322 ENSG00000151327:ENST00000396472:exon_35546356_35546422:FAM177A1;ENSG00000151327:ENST00000382406:exon_35546356_35546422:FAM177A1;ENSG00000151327:ENST00000280987:exon_35546356_35546422:FAM177A1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 35591174 T/C 1 12 10 22 5.65968180189332 5.28359849842223 0.376083303471095 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000092020:ENST00000261475:exon_35591108_35591519:PPP2R3C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 35761675 C/G 1 27 32 59 12.73428405426 16.9075151949511 -4.17323114069115 C:G C G 10 0.528359849842223 0.298361275642707 ENSG00000100902:ENST00000261479:exon_35761563_35761758:PSMA6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 35872926 G/A 1 122 118 240 57.5400983192488 62.3464622813823 -4.80636396213351 A:G G A 10 0.528359849842223 0.560826358464984 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35872896_35873004:NFKBIA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 39818028 A/G 1 19 15 34 8.96116285299776 7.92539774763334 1.03576510536442 A:G A G 10 0.528359849842223 0.735352506151453 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 39818145 G/A 1 26 28 54 12.2626439041022 14.7940757955822 -2.53143189148004 A:G G A 10 0.528359849842223 0.499038897383572 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 50065717 G/C 1 12 8 20 5.65968180189332 4.22687879873778 1.43280300315554 C:G G C 10 0.528359849842223 0.655637718042508 ENSG00000165501:ENST00000361579:exon_50065415_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000318317:exon_50065479_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50065672_50065921:PPIL5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 50092471 T/C 1 5 9 14 2.35820075078889 4.75523864858001 -2.39703789779112 T:C T C 10 0.528359849842223 0.284555554939117 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50091892_50092766:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50091892_50092766:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50091907_50092766:C14orf104 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 50100386 T/C 1 23 17 40 10.8477234536289 8.98211744731779 1.86560600631108 T:C T C 10 0.528359849842223 0.635707427315866 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50100005_50101948:C14orf104 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 51225132 G/T 1 6 2 8 2.82984090094666 1.05671969968445 1.77312120126222 T:G G T 10 0.528359849842223 0.29537924054388 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 53529669 A/T 1 5 10 15 2.35820075078889 5.28359849842223 -2.92539774763334 A:T A T 10 0.528359849842223 0.194650532535346 ENSG00000100523:ENST00000357758:exon_53529661_53529923:DDHD1;ENSG00000100523:ENST00000395606:exon_53529661_53529923:DDHD1;ENSG00000100523:ENST00000323669:exon_53529661_53529923:DDHD1;ENSG00000100523:ENST00000395610:exon_53529661_53529923:DDHD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 55529860 A/G 1 46 30 76 21.6954469072577 15.8507954952667 5.84465141199106 A:G A G 10 0.528359849842223 0.206336840724426 ENSG00000168175:ENST00000395468:exon_55529336_55530043:MAPK1IP1L HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 55611839 A/T 1 203 157 360 95.7429504820287 82.952496425229 12.7904540567997 A:T:G A T 10 0.528359849842223 0.186965149921616 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55611834_55612147:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55611834_55612126:LGALS3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 55643908 A/G 1 11 8 19 5.18804165173555 4.22687879873778 0.961162852997764 A:G A G 10 0.528359849842223 0.819131241753216 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55643780_55644054:DLGAP5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 55655692 C/T 1 7 4 11 3.30148105110444 2.11343939936889 1.18804165173555 T:C C T 10 0.528359849842223 0.556038959282085 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55655660_55655898:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55655660_55655898:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55655660_55655898:DLGAP5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 55818403 T/C 1 4 6 10 1.88656060063111 3.17015909905334 -1.28359849842223 T:C T C 10 0.528359849842223 0.531770325189017 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 56096731 A/G 1 10 10 20 4.71640150157777 5.28359849842223 -0.567196996844459 A:G A G 10 0.528359849842223 0.826247654639236 ENSG00000126777:ENST00000438792:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395314:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000459737:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395308:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395311:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000413890:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000416613:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000356229:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000334975:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395309:exon_56096675_56096815:KTN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 56146357 G/A 1 9 20 29 4.24476135141999 10.5671969968445 -6.32243564542447 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0242787054733523 ENSG00000126777:ENST00000438792:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395314:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000459737:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395308:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395311:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000413890:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000416613:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000356229:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000334975:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395309:exon_56146283_56146403:KTN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 57741550 A/G 1 6 3 9 2.82984090094666 1.58507954952667 1.24476135141999 A:G A G 10 0.528359849842223 0.514115714513849 ENSG00000053770:ENST00000431972:exon_57740962_57741607:MUDENG;ENSG00000053770:ENST00000446279:exon_57740962_57741742:MUDENG;ENSG00000053770:ENST00000261558:exon_57740962_57741607:MUDENG HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 58831142 A/G 1 14 16 30 6.60296210220888 8.45375759747557 -1.85079549526669 A:G A G 10 0.528359849842223 0.584418289971274 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58830888_58832018:ARID4A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 58838668 A/G 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58838604_58840451:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58838604_58839012:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58838604_58838944:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000466065:exon_58838604_58838678:ARID4A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 58838701 C/T 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 T:C C T 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58838604_58840451:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58838604_58839012:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58838604_58838944:ARID4A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 64676098 A/G 1 6 5 11 2.82984090094666 2.64179924921111 0.188041651735547 A:G A G 10 0.528359849842223 1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 64686125 G/T 1 17 7 24 8.01788255268221 3.69851894889556 4.31936360378665 T:G G T 10 0.528359849842223 0.100883806268711 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000458046:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000441438:exon_64685926_64686128:SYNE2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 64988830 C/A 1 6 7 13 2.82984090094666 3.69851894889556 -0.868678047948899 A:C C A 10 0.528359849842223 0.782884637593256 ENSG00000126804:ENST00000358738:exon_64988205_64990120:ZBTB1;ENSG00000126804:ENST00000394712:exon_64988205_64991665:ZBTB1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 64989813 G/C 1 29 23 52 13.6775643545755 12.1522765463711 1.52528780820441 C:G G C 10 0.528359849842223 0.781488412847641 ENSG00000126804:ENST00000358738:exon_64988205_64990120:ZBTB1;ENSG00000126804:ENST00000394712:exon_64988205_64991665:ZBTB1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 65550994 C/A 1 11 2 13 5.18804165173555 1.05671969968445 4.1313219520511 A:C C A 10 0.528359849842223 0.0251781600722013 ENSG00000125952:ENST00000246163:exon_65550462_65551017:MAX HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 69521345 G/A 1 15 18 33 7.07460225236666 9.51047729716001 -2.43587504479336 A:G G A 10 0.528359849842223 0.486172453869617 ENSG00000139990:ENST00000341516:exon_69517638_69522328:DCAF5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 73958812 T/C 1 17 17 34 8.01788255268221 8.98211744731779 -0.964234894635581 T:C T C 10 0.528359849842223 0.863945522489226 ENSG00000255242:ENST00000531973:exon_73957669_73960096:C14orf169 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 75248652 C/G 1 7 5 12 3.30148105110444 2.64179924921111 0.659681801893325 C:G C G 10 0.528359849842223 0.778733618574385 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75248037_75249028:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75248626_75249028:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75248626_75249028:YLPM1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 75248669 G/T 1 6 6 12 2.82984090094666 3.17015909905334 -0.340318198106676 T:G G T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75248037_75249028:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75248626_75249028:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75248626_75249028:YLPM1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 75359670 G/A 1 6 3 9 2.82984090094666 1.58507954952667 1.24476135141999 A:G G A 10 0.528359849842223 0.514115714513849 ENSG00000119689:ENST00000334220:exon_75359537_75359689:DLST;ENSG00000119689:ENST00000238671:exon_75359537_75359689:DLST;ENSG00000119689:ENST00000334212:exon_75359537_75359689:DLST HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 76330181 G/A 1 2 6 8 0.943280300315554 3.17015909905334 -2.22687879873778 A:G G A 10 0.528359849842223 0.159873274171007 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000286653:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76330010_76330205:TTLL5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 76368544 T/C 1 5 7 12 2.35820075078889 3.69851894889556 -1.34031819810668 T:C T C 10 0.528359849842223 0.56626847898003 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76368485_76368567:TTLL5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 77926011 C/T 1 51 34 85 24.0536476580466 17.9642348946356 6.08941276341105 T:C C T 10 0.528359849842223 0.193914657952587 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77925959_77926149:AHSA1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 77928525 A/G 1 57 69 126 26.8834885589933 36.4568296391134 -9.57334108012009 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0905288991349111 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77928503_77928585:AHSA1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 77935520 G/A 1 232 191 423 109.420514836604 100.916731319865 8.50378351673969 A:G G A 10 0.528359849842223 0.435896623138844 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77935420_77935807:AHSA1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 78174473 A/C 1 64 75 139 30.1849696100977 39.6269887381667 -9.44201912806899 A:C A C 10 0.528359849842223 0.125921126180657 ENSG00000119705:ENST00000238688:exon_78174425_78174551:C14orf156 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 88477882 A/C 1 9 13 22 4.24476135141999 6.8686780479489 -2.62391669652891 A:C:G A C 10 0.528359849842223 0.291037847710403 ENSG00000140030:ENST00000267549:exon_88476733_88478422:GPR65 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 91671124 G/A 1 9 9 18 4.24476135141999 4.75523864858001 -0.510477297160014 A:G G A 10 0.528359849842223 0.818347367308864 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91671050_91671211:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522816:exon_91671050_91671169:C14orf159 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 91739108 C/G 1 15 15 30 7.07460225236666 7.92539774763334 -0.850795495266688 C:G C G 10 0.528359849842223 0.855436110683853 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000427583:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000334448:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000331194:exon_91738969_91739562:CCDC88C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 92436176 C/T 1 21 32 53 9.90444315331332 16.9075151949511 -7.00307204163782 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0726714289382662 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92435462_92436237:TRIP11 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 92441066 C/T 1 5 7 12 2.35820075078889 3.69851894889556 -1.34031819810668 T:C C T 10 0.528359849842223 0.56626847898003 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92440971_92441087:TRIP11 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 93118669 G/A 1 12 15 27 5.65968180189332 7.92539774763334 -2.26571594574002 A:G G A 10 0.528359849842223 0.442795735902603 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 93263982 C/G 1 10 3 13 4.71640150157777 1.58507954952667 3.1313219520511 C:G C G 10 0.528359849842223 0.0990276262490944 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93263753_93264326:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93263753_93264326:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93263783_93264012:GOLGA5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 93275841 A/G 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93275645_93275864:GOLGA5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 93299538 T/C 1 8 4 12 3.77312120126222 2.11343939936889 1.65968180189332 T:C T C 10 0.528359849842223 0.396971345501871 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93299467_93299692:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93299467_93299692:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93299467_93299692:GOLGA5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 93685626 T/C 1 17 8 25 8.01788255268221 4.22687879873778 3.79100375394443 T:C T C 10 0.528359849842223 0.161132514170427 ENSG00000012963:ENST00000013070:exon_93685558_93685707:UBR7;ENSG00000012963:ENST00000416753:exon_93685558_93685707:UBR7 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 94401102 C/T 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 T:C C T 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94400499_94401138:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94400513_94401138:ASB2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 99876505 A/G 1 6 2 8 2.82984090094666 1.05671969968445 1.77312120126222 A:G A G 10 0.528359849842223 0.29537924054388 ENSG00000183576:ENST00000329331:exon_99876141_99876552:SETD3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 105180706 A/C,G 0 0 15 15 0 7.92539774763334 -7.92539774763334 C:G A C 10 0.528359849842223 1.27104677907891e-05 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 105222037 C/T 1 39 43 82 18.3939658561533 22.7194735432156 -4.32550768706228 T:C C T 10 0.528359849842223 0.376603009087161 ENSG00000184990:ENST00000329967:exon_105221967_105222161:SIVA1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 105238711 G/A 1 15 22 37 7.07460225236666 11.6239166965289 -4.54931444416225 A:G G A 10 0.528359849842223 0.141495484069128 ENSG00000142208:ENST00000349310:exon_105238702_105238789:AKT1;ENSG00000142208:ENST00000407796:exon_105238702_105238789:AKT1;ENSG00000142208:ENST00000402615:exon_105238702_105238789:AKT1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 105716854 G/A 1 15 12 27 7.07460225236666 6.34031819810668 0.73428405425998 A:G G A 10 0.528359849842223 0.848556223067985 ENSG00000184887:ENST00000327471:exon_105715977_105717421:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000392554:exon_105715977_105717430:BTBD6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 105954705 C/T 1 478 510 988 225.443991775417 269.463523419534 -44.0195316441163 T:C:G C T 10 0.528359849842223 0.0055393340715243 ENSG00000213145:ENST00000496700:exon_105952654_105954725:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000409393:exon_105954668_105954725:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000392531:exon_105954668_105954725:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000330233:exon_105954668_105954725:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000460900:exon_105953534_105954853:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000461556:exon_105954668_105954725:CRIP1;ENSG00000185347:ENST00000477724:exon_105954668_105954725:C14orf80 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 106174261 C/G 1 78 98 176 36.7879317123066 51.7792652845378 -14.9913335722312 C:G C G 10 0.528359849842223 0.0282744826604604 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 106452817 A/G 1 17 2 19 8.01788255268221 1.05671969968445 6.96116285299776 A:G A G 10 0.528359849842223 0.00098805752484957 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 106494269 T/C 1 10 64 74 4.71640150157777 33.8150303899023 -29.0986288883245 T:C T C 10 0.528359849842223 2.14383060001279e-12 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 106791131 A/G 1 195 13 208 91.9698292807665 6.8686780479489 85.1011512328176 A:T:G A G 10 0.528359849842223 1.37493273434703e-38 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 107170005 T/C 1 14 19 33 6.60296210220888 10.0388371470022 -3.43587504479336 T:C T C 10 0.528359849842223 0.295465692465376 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 107170077 C/T 1 21 2 23 9.90444315331332 1.05671969968445 8.84772345362887 T:C C T 10 0.528359849842223 0.000182810342075884 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 14 107170219 C/G 1 17 8 25 8.01788255268221 4.22687879873778 3.79100375394443 C:G C G 10 0.528359849842223 0.161132514170427 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 22960868 G/C 1 9 8 17 4.24476135141999 4.22687879873778 0.0178825526822095 C:G G C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22960793_22960889:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22960793_22960889:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000435939:exon_22960793_22960889:CYFIP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 34159986 T/C 1 8 9 17 3.77312120126222 4.75523864858001 -0.98211744731779 T:C T C 10 0.528359849842223 0.637819172258138 ENSG00000169857:ENST00000306730:exon_34159696_34160056:AVEN HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 40477831 G/A 1 8 10 18 3.77312120126222 5.28359849842223 -1.51047729716001 A:G G A 10 0.528359849842223 0.490179587566891 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40477752_40477843:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40477752_40477843:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40477752_40477843:BUB1B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 40581543 T/C 1 11 10 21 5.18804165173555 5.28359849842223 -0.0955568466866819 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000137841:ENST00000456256:exon_40581473_40581559:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000260402:exon_40581473_40581559:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000389812:exon_40581473_40581559:PLCB2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 41634587 A/G 1 12 1 13 5.65968180189332 0.528359849842223 5.1313219520511 A:G A G 10 0.528359849842223 0.00404147265660156 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 41634588 C/A 1 12 1 13 5.65968180189332 0.528359849842223 5.1313219520511 A:C C A 10 0.528359849842223 0.00404147265660156 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 41813279 C/T 1 4 8 12 1.88656060063111 4.22687879873778 -2.34031819810668 T:C C T 10 0.528359849842223 0.248211150341394 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41812589_41813345:RPAP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 42139642 C/T 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000168970:ENST00000490848:exon_42139535_42139721:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000382448:exon_42139535_42139721:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000491746:exon_42139535_42139721:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000487292:exon_42139535_42139721:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000458483:exon_42139535_42139721:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000243708:ENST00000452633:exon_42139535_42139721:PLA2G4B;ENSG00000243708:ENST00000483748:exon_42139535_42139721:PLA2G4B;ENSG00000243708:ENST00000484140:exon_42139535_42139721:PLA2G4B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 42211486 A/G 1 11 11 22 5.18804165173555 5.81195834826445 -0.623916696528905 A:G A G 10 0.528359849842223 0.833301388629641 ENSG00000103966:ENST00000220325:exon_42211408_42211820:EHD4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 42820589 G/A 1 12 7 19 5.65968180189332 3.69851894889556 1.96116285299776 A:G G A 10 0.528359849842223 0.491898728253755 ENSG00000092531:ENST00000249647:exon_42820460_42820618:SNAP23 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 43017426 T/G 1 6 3 9 2.82984090094666 1.58507954952667 1.24476135141999 T:G T G 10 0.528359849842223 0.514115714513849 ENSG00000140326:ENST00000267892:exon_43017342_43017449:CDAN1;ENSG00000140326:ENST00000356231:exon_43017342_43017449:CDAN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 43748304 A/G 1 3 6 9 1.41492045047333 3.17015909905334 -1.75523864858001 A:G A G 10 0.528359849842223 0.322385551531720 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43748090_43748529:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000413546:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000480860:exon_43748090_43748350:TP53BP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 44038899 C/T 1 31 56 87 14.6208446548911 29.5881515911645 -14.9673069362734 T:C C T 10 0.528359849842223 0.00168630158435221 ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44038590_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000469684:exon_44038608_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000446523:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000455250:exon_44038810_44038904:PDIA3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 44061802 C/T 1 66 91 157 31.1282499104133 48.0807463356423 -16.952496425229 T:C C T 10 0.528359849842223 0.00814025923722352 ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44061716_44061844:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44061716_44061844:PDIA3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 44093927 T/C 1 82 99 181 38.6744923129377 52.3076251343801 -13.6331328214424 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0444522426048997 ENSG00000140264:ENST00000448830:exon_44093909_44094787:SERF2;ENSG00000140264:ENST00000409617:exon_44093909_44094071:SERF2;ENSG00000242028:ENST00000406925:exon_44093909_44094280:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000442995:exon_44093909_44094489:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000458412:exon_44093716_44095241:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000497142:exon_44093909_44094126:C15orf63 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 44102010 A/C 1 29 32 61 13.6775643545755 16.9075151949511 -3.2299508403756 A:C A C 10 0.528359849842223 0.442790348291658 ENSG00000140259:ENST00000267812:exon_44101953_44102112:MFAP1;ENSG00000140259:ENST00000484386:exon_44101953_44102330:MFAP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 44120474 A/G 1 4 6 10 1.88656060063111 3.17015909905334 -1.28359849842223 A:G A G 10 0.528359849842223 0.531770325189017 ENSG00000092470:ENST00000263795:exon_44120163_44120564:WDR76;ENSG00000092470:ENST00000381246:exon_44120163_44120564:WDR76;ENSG00000092470:ENST00000452115:exon_44120273_44120564:WDR76 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 45047134 G/A 1 5 9 14 2.35820075078889 4.75523864858001 -2.39703789779112 A:G G A 10 0.528359849842223 0.284555554939117 ENSG00000185880:ENST00000329464:exon_45047098_45047574:TRIM69 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 45654327 A/G 1 26 33 59 12.2626439041022 17.4358750447934 -5.17323114069115 A:G A G 10 0.528359849842223 0.193291146437756 ENSG00000171766:ENST00000396659:exon_45653322_45654419:GATM;ENSG00000171766:ENST00000305575:exon_45653322_45654419:GATM;ENSG00000171766:ENST00000432007:exon_45653324_45654419:GATM HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 49917341 G/A 1 6 3 9 2.82984090094666 1.58507954952667 1.24476135141999 A:G G A 10 0.528359849842223 0.514115714513849 ENSG00000104047:ENST00000403028:exon_49917310_49917628:DTWD1;ENSG00000104047:ENST00000329873:exon_49917310_49917628:DTWD1;ENSG00000104047:ENST00000251250:exon_49917310_49917628:DTWD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 50773787 A/G 1 20 19 39 9.43280300315554 10.0388371470022 -0.606034143846694 A:G A G 10 0.528359849842223 0.87369517076565 ENSG00000138592:ENST00000396444:exon_50773678_50774262:USP8;ENSG00000138592:ENST00000307179:exon_50773678_50774262:USP8;ENSG00000138592:ENST00000433963:exon_50773678_50774262:USP8;ENSG00000138592:ENST00000425032:exon_50773678_50774262:USP8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 50789423 G/A 1 11 7 18 5.18804165173555 3.69851894889556 1.48952270283999 A:G G A 10 0.528359849842223 0.63817833418455 ENSG00000138592:ENST00000396444:exon_50789286_50789428:USP8;ENSG00000138592:ENST00000307179:exon_50789286_50789428:USP8;ENSG00000138592:ENST00000433963:exon_50789286_50789428:USP8;ENSG00000138592:ENST00000425032:exon_50789286_50789428:USP8;ENSG00000138592:ENST00000419830:exon_50789286_50789428:USP8;ENSG00000138592:ENST00000396440:exon_50789286_50789428:USP8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 52611451 A/G 1 5 7 12 2.35820075078889 3.69851894889556 -1.34031819810668 A:G A G 10 0.528359849842223 0.56626847898003 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52611257_52611539:MYO5A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 63414083 A/C 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 A:C A C 10 0.528359849842223 0.743278251879842 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63413999_63414427:LACTB;ENSG00000103642:ENST00000413507:exon_63414032_63414427:LACTB HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 63433766 G/A 1 49 58 107 23.1103673577311 30.6448712908489 -7.53450393311786 A:G G A 10 0.528359849842223 0.147608805477114 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 63548787 G/A 1 7 2 9 3.30148105110444 1.05671969968445 2.24476135141999 A:G G A 10 0.528359849842223 0.186011003558895 ENSG00000166128:ENST00000321437:exon_63548704_63548793:RAB8B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 64418397 G/A 1 12 8 20 5.65968180189332 4.22687879873778 1.43280300315554 A:G G A 10 0.528359849842223 0.655637718042508 ENSG00000028528:ENST00000353874:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000261889:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000380285:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000440389:exon_64418278_64418419:SNX1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 64419374 G/T 1 9 12 21 4.24476135141999 6.34031819810668 -2.09555684668668 T:G G T 10 0.528359849842223 0.389033912530957 ENSG00000028528:ENST00000353874:exon_64419373_64419451:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000261889:exon_64419373_64419451:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000380285:exon_64419373_64419451:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000440389:exon_64419373_64419451:SNX1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 64448365 C/T 1 18 14 32 8.48952270283999 7.39703789779112 1.09248480504886 T:C C T 10 0.528359849842223 0.726939458112817 ENSG00000157734:ENST00000325881:exon_64446586_64449680:SNX22 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 64706332 A/G 1 13 18 31 6.1313219520511 9.51047729716001 -3.37915534510891 A:G A G 10 0.528359849842223 0.280569742102825 ENSG00000103671:ENST00000261884:exon_64706284_64706410:TRIP4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 64737225 G/A 1 17 9 26 8.01788255268221 4.75523864858001 3.2626439041022 A:G G A 10 0.528359849842223 0.24033639007444 ENSG00000103671:ENST00000261884:exon_64737205_64737307:TRIP4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 64962630 A/C 1 3 8 11 1.41492045047333 4.22687879873778 -2.81195834826445 A:C A C 10 0.528359849842223 0.129693174868926 ENSG00000180357:ENST00000326648:exon_64962545_64962632:ZNF609 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 65108504 A/T 1 18 17 35 8.48952270283999 8.98211744731779 -0.492594744477804 A:T A T 10 0.528359849842223 0.867578930748504 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65107831_65108556:PIF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 65739303 C/A 1 23 23 46 10.8477234536289 12.1522765463711 -1.30455309274226 A:C C A 10 0.528359849842223 0.76837168366382 ENSG00000074603:ENST00000341861:exon_65734801_65739344:DPP8;ENSG00000074603:ENST00000358939:exon_65738955_65739344:DPP8;ENSG00000074603:ENST00000300141:exon_65738957_65739344:DPP8;ENSG00000074603:ENST00000321147:exon_65738959_65739344:DPP8;ENSG00000074603:ENST00000321118:exon_65738975_65739344:DPP8;ENSG00000074603:ENST00000339244:exon_65738975_65739344:DPP8;ENSG00000074603:ENST00000395652:exon_65738975_65739344:DPP8;ENSG00000074603:ENST00000445674:exon_65738975_65739344:DPP8;ENSG00000074603:ENST00000449834:exon_65738975_65739344:DPP8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 65871698 G/T 1 67 57 124 31.5998900605711 30.1165114410067 1.48337861956436 T:G G T 10 0.528359849842223 0.857331349770374 ENSG00000138614:ENST00000395644:exon_65871095_65871997:C15orf44;ENSG00000138614:ENST00000420799:exon_65871120_65871997:C15orf44;ENSG00000138614:ENST00000442903:exon_65871120_65871997:C15orf44;ENSG00000138614:ENST00000313182:exon_65871120_65871997:C15orf44;ENSG00000138614:ENST00000431261:exon_65871403_65871997:C15orf44 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 66625161 A/G 1 20 20 40 9.43280300315554 10.5671969968445 -1.13439399368892 A:G A G 10 0.528359849842223 0.753253297480391 ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66625074_66625248:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66625074_66625248:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66625074_66625248:DIS3L HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 70345626 C/T 1 7 6 13 3.30148105110444 3.17015909905334 0.131321952051101 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70345566_70345713:TLE3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 70346923 C/T 1 9 9 18 4.24476135141999 4.75523864858001 -0.510477297160014 T:C C T 10 0.528359849842223 0.818347367308864 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70346777_70347024:TLE3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 70351788 T/C 1 6 4 10 2.82984090094666 2.11343939936889 0.71640150157777 T:C T C 10 0.528359849842223 0.757839432335683 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70351749_70351799:TLE3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 73044863 G/A 1 15 17 32 7.07460225236666 8.98211744731779 -1.90751519495113 A:G G A 10 0.528359849842223 0.596108751890824 ENSG00000159322:ENST00000450412:exon_73043636_73045236:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000311669:exon_73043710_73045233:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000456471:exon_73043710_73045233:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000443764:exon_73044682_73045233:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000331065:exon_73044764_73044958:ADPGK HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 74328141 G/T 1 72 51 123 33.9580908113599 26.9463523419534 7.01173846940657 T:G G T 10 0.528359849842223 0.240248029647143 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 74328206 G/C 1 56 79 135 26.4118484088355 41.7404281375356 -15.3285797287001 C:G G C 10 0.528359849842223 0.0094933902474285 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 74703022 G/A 1 61 59 120 28.7700491596244 31.1732311406912 -2.40318198106675 A:G G A 10 0.528359849842223 0.714747167427414 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74701630_74703326:SEMA7A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 74703929 T/C 1 15 15 30 7.07460225236666 7.92539774763334 -0.850795495266688 T:C T C 10 0.528359849842223 0.855436110683853 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74703897_74704051:SEMA7A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 74706943 G/A 1 20 34 54 9.43280300315554 17.9642348946356 -8.53143189148004 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0207727975275324 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74706888_74707086:SEMA7A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 74709975 G/A 1 5 8 13 2.35820075078889 4.22687879873778 -1.8686780479489 A:G G A 10 0.528359849842223 0.406657390173804 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74709932_74710016:SEMA7A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 74948096 G/A 1 6 11 17 2.82984090094666 5.81195834826445 -2.98211744731779 A:G G A 10 0.528359849842223 0.223532760143352 ENSG00000179151:ENST00000315127:exon_74948074_74948409:EDC3;ENSG00000179151:ENST00000426797:exon_74948074_74948409:EDC3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 75091247 C/T 1 117 97 214 55.1818975684599 51.2509054346956 3.93099213376429 T:C C T 10 0.528359849842223 0.631868554915264 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75091167_75091279:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75091167_75091279:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75091167_75091279:CSK HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 75093389 C/T 1 167 176 343 78.7639050763488 92.9913335722312 -14.2274284958825 T:C C T 10 0.528359849842223 0.129987513992066 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75093353_75093443:CSK HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 75094881 C/T 1 278 242 520 131.115961743862 127.863083661818 3.25287808204406 T:C:G C T 10 0.528359849842223 0.792222178022486 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75094672_75095539:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75094672_75095537:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75094672_75095537:CSK HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 75130093 T/C 0 14 0 14 6.60296210220888 0 6.60296210220888 T T 10 0.528359849842223 0.000159084334186246 ENSG00000140474:ENST00000440863:exon_75130092_75130139:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000418051:exon_75130092_75130139:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000268074:exon_75130092_75130139:ULK3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 75189930 A/G 1 39 48 87 18.3939658561533 25.3612727924267 -6.9673069362734 A:G A G 10 0.528359849842223 0.16233515496114 ENSG00000178802:ENST00000352410:exon_75189853_75191798:MPI;ENSG00000178802:ENST00000323744:exon_75189853_75190569:MPI HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 75499399 C/A 1 9 6 15 4.24476135141999 3.17015909905334 1.07460225236666 A:C C A 10 0.528359849842223 0.61599879202346 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 75650836 G/A 1 38 22 60 17.9223257059955 11.6239166965289 6.29840900946662 A:G G A 10 0.528359849842223 0.120539066099910 ENSG00000140400:ENST00000267978:exon_75650803_75650959:MAN2C1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 75650972 G/A 1 13 1 14 6.1313219520511 0.528359849842223 5.60296210220888 A:G G A 10 0.528359849842223 0.00223305209677928 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 75909803 A/G 1 8 9 17 3.77312120126222 4.75523864858001 -0.98211744731779 A:G A G 10 0.528359849842223 0.637819172258138 ENSG00000169371:ENST00000308588:exon_75909749_75909893:SNUPN;ENSG00000169371:ENST00000371091:exon_75909749_75909893:SNUPN;ENSG00000169371:ENST00000432476:exon_75909749_75909893:SNUPN;ENSG00000169371:ENST00000394932:exon_75909749_75909893:SNUPN HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 75932129 G/T 1 61 77 138 28.7700491596244 40.6837084378512 -11.9136592782268 T:G G T 10 0.528359849842223 0.0495055497201563 ENSG00000177971:ENST00000314852:exon_75931426_75932609:IMP3;ENSG00000177971:ENST00000403490:exon_75931690_75932552:IMP3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 77025687 C/T 1 3 6 9 1.41492045047333 3.17015909905334 -1.75523864858001 T:C C T 10 0.528359849842223 0.322385551531720 ENSG00000140386:ENST00000324767:exon_77025570_77025725:SCAPER;ENSG00000140386:ENST00000303521:exon_77025570_77025725:SCAPER HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 77344793 T/A 1 36 60 96 16.97904540568 31.7015909905334 -14.7225455848534 A:T T A 10 0.528359849842223 0.00289932986023868 ENSG00000140391:ENST00000267970:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000346495:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000424443:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000423920:exon_77344727_77344810:TSPAN3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 78841220 T/C 1 733 713 1446 345.712230065651 376.720572937505 -31.0083428718544 T:C:G T C 10 0.528359849842223 0.102532714271686 ENSG00000041357:ENST00000417370:exon_78841132_78841560:PSMA4;ENSG00000041357:ENST00000413382:exon_78841132_78841560:PSMA4;ENSG00000041357:ENST00000044462:exon_78841132_78841604:PSMA4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 80137560 T/C 1 63 44 107 29.71332945994 23.2478333930578 6.46549606688214 T:C T C 10 0.528359849842223 0.245145610626699 ENSG00000136371:ENST00000258874:exon_80137318_80137784:MTHFS;ENSG00000136371:ENST00000479961:exon_80137537_80137784:MTHFS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 81592802 A/G 1 54 71 125 25.46856810852 37.5135493387978 -12.0449812302779 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0317398554884065 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81591721_81592816:IL16 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 82443824 C/T 1 23 26 49 10.8477234536289 13.7373560958978 -2.88963264226892 T:C C T 10 0.528359849842223 0.474851569576429 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 82443939 G/A 1 25 19 44 11.7910037539444 10.0388371470022 1.75216660694219 A:G G A 10 0.528359849842223 0.652159077427638 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 82456227 T/C 1 6 5 11 2.82984090094666 2.64179924921111 0.188041651735547 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82456194_82456325:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82456194_82456325:EFTUD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 83481880 A/G 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 A:G A G 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000156232:ENST00000286760:exon_83481855_83482028:WHAMM;ENSG00000156232:ENST00000234505:exon_83481855_83482028:WHAMM HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 83686759 T/C 1 21 28 49 9.90444315331332 14.7940757955822 -4.88963264226892 T:C T C 10 0.528359849842223 0.197493207154773 ENSG00000064726:ENST00000261721:exon_83685174_83686977:BTBD1;ENSG00000064726:ENST00000379403:exon_83685185_83686977:BTBD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 85341859 G/A 1 10 6 16 4.71640150157777 3.17015909905334 1.54624240252443 A:G G A 10 0.528359849842223 0.46618456350988 ENSG00000166716:ENST00000299927:exon_85341819_85342106:ZNF592 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 89169653 G/A 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 A:G G A 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89169377_89169980:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89169377_89169980:AEN HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 89169858 A/G 1 2 7 9 0.943280300315554 3.69851894889556 -2.75523864858001 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0939591166432567 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89169377_89169980:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89169377_89169980:AEN HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 90168873 T/C 1 6 2 8 2.82984090094666 1.05671969968445 1.77312120126222 T:C T C 10 0.528359849842223 0.29537924054388 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90166854_90169017:C15orf42 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 90617539 C/T 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 T:C C T 10 0.528359849842223 0.730064285841028 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 91083353 G/A 1 10 6 16 4.71640150157777 3.17015909905334 1.54624240252443 A:G G A 10 0.528359849842223 0.46618456350988 ENSG00000140577:ENST00000437186:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000268184:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000420329:exon_91083271_91083369:CRTC3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 91430436 T/C 1 5 4 9 2.35820075078889 2.11343939936889 0.244761351419994 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000182511:ENST00000328850:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000414248:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000394306:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000394304:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000394302:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000464684:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000444422:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000394300:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000450438:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000497945:exon_91430417_91430605:FES HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 91543761 C/T 1 15 8 23 7.07460225236666 4.22687879873778 2.84772345362887 T:C C T 10 0.528359849842223 0.297507531604697 ENSG00000184056:ENST00000333371:exon_91543720_91543821:VPS33B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 93536197 C/T 1 11 5 16 5.18804165173555 2.64179924921111 2.54624240252443 T:C C T 10 0.528359849842223 0.221849866555357 ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93536089_93536228:CHD2;ENSG00000173575:ENST00000309818:exon_93536089_93536228:CHD2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 93567864 A/C 1 5 10 15 2.35820075078889 5.28359849842223 -2.92539774763334 A:C A C 10 0.528359849842223 0.194650532535346 ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93567602_93571237:CHD2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 100269635 G/C 1 12 4 16 5.65968180189332 2.11343939936889 3.54624240252443 C:G G C 10 0.528359849842223 0.084329322912919 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 100269680 G/C 1 4 10 14 1.88656060063111 5.28359849842223 -3.39703789779112 C:G G C 10 0.528359849842223 0.105381577517645 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 101717680 G/T 1 2 7 9 0.943280300315554 3.69851894889556 -2.75523864858001 T:G G T 10 0.528359849842223 0.0939591166432567 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 102192502 G/A 0 14 0 14 6.60296210220888 0 6.60296210220888 G G 10 0.528359849842223 0.000159084334186246 ENSG00000184277:ENST00000428002:exon_102192474_102192594:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000347970:exon_102192474_102192594:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000333202:exon_102192474_102192570:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000453041:exon_102192474_102192594:TM2D3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 15 102192540 T/G 0 12 0 12 5.65968180189332 0 5.65968180189332 T T 10 0.528359849842223 0.000594474716960591 ENSG00000184277:ENST00000428002:exon_102192474_102192594:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000347970:exon_102192474_102192594:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000333202:exon_102192474_102192570:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000453041:exon_102192474_102192594:TM2D3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 239952 A/T 1 15 39 54 7.07460225236666 20.6060341438467 -13.53143189148 A:T A T 10 0.528359849842223 0.000303029267622877 ENSG00000007392:ENST00000337351:exon_238968_240134:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000397783:exon_239930_240134:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000442701:exon_239946_240134:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000419516:exon_239895_240134:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000397780:exon_239895_240134:LUC7L HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 347184 A/G 1 6 6 12 2.82984090094666 3.17015909905334 -0.340318198106676 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000461023:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000421566:exon_347056_347226:AXIN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 396264 A/G 1 7 4 11 3.30148105110444 2.11343939936889 1.18804165173555 A:G A G 10 0.528359849842223 0.556038959282085 ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_396148_397106:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000461023:exon_396148_396322:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_396148_397106:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000421566:exon_396148_396444:AXIN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 419092 A/G 1 157 118 275 74.047503574771 62.3464622813823 11.7010412933887 A:G A G 10 0.528359849842223 0.164949186564934 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 424277 G/A 1 21 14 35 9.90444315331332 7.39703789779112 2.5074052555222 A:G G A 10 0.528359849842223 0.498860075577052 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000424078:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000448854:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000467452:exon_424221_424399:TMEM8A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 426432 T/C 1 13 13 26 6.1313219520511 6.8686780479489 -0.737356095897796 T:C T C 10 0.528359849842223 0.845396168977588 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000475348:exon_426136_426475:TMEM8A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 427479 T/C 1 8 7 15 3.77312120126222 3.69851894889556 0.0746022523666556 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 427516 T/C 1 6 6 12 2.82984090094666 3.17015909905334 -0.340318198106676 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 449659 G/A 1 90 95 185 42.4476135141999 50.1941857350112 -7.74657222081125 A:G G A 10 0.528359849842223 0.269573746880950 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000444498:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000420816:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000426167:exon_449627_449739:NME4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 450309 C/T 1 234 241 475 110.36379513692 127.334723811976 -16.9709286750559 T:C C T 10 0.528359849842223 0.129283669069807 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_450219_450746:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_450219_450734:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_450219_450633:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_450219_450759:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_450219_450506:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_450109_450648:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_450219_450416:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_450219_450749:NME4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 630902 C/G 1 2 6 8 0.943280300315554 3.17015909905334 -2.22687879873778 C:G C G 10 0.528359849842223 0.159873274171007 ENSG00000007541:ENST00000409527:exon_630858_630972:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_630858_630972:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_630858_630972:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000420990:exon_630858_630972:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000443147:exon_630858_630972:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_630183_630972:PIGQ HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 677629 T/C 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 T:C T C 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000197562:ENST00000248139:exon_677342_679272:RAB40C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 705360 T/C 1 8 4 12 3.77312120126222 2.11343939936889 1.65968180189332 T:C T C 10 0.528359849842223 0.396971345501871 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_705307_705468:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000429287:exon_705307_705468:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000420061:exon_705307_705468:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000389495:exon_705307_705468:WDR90 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 717523 G/T 1 17 10 27 8.01788255268221 5.28359849842223 2.73428405425998 T:G G T 10 0.528359849842223 0.338211687976306 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_717432_717829:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_717432_717829:WDR90 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 718514 C/G 1 7 6 13 3.30148105110444 3.17015909905334 0.131321952051101 C:G C G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_718488_718569:RHOT2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 720986 G/A 1 5 13 18 2.35820075078889 6.8686780479489 -4.51047729716001 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0558148062050748 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_720892_721000:RHOT2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 722331 C/T 1 17 12 29 8.01788255268221 6.34031819810668 1.67756435457553 T:C C T 10 0.528359849842223 0.580776281232183 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722254_722384:RHOT2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 722548 A/G 1 19 6 25 8.96116285299776 3.17015909905334 5.79100375394443 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0259496009174721 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722489_722566:RHOT2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 723647 C/G 1 35 26 61 16.5074052555222 13.7373560958978 2.7700491596244 C:G C G 10 0.528359849842223 0.522603835271785 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_723480_724174:RHOT2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 735921 T/C 1 14 13 27 6.60296210220888 6.8686780479489 -0.26571594574002 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000127580:ENST00000293883:exon_735869_735990:WDR24;ENSG00000127580:ENST00000248142:exon_735869_735990:WDR24 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 772061 C/T 1 9 7 16 4.24476135141999 3.69851894889556 0.546242402524432 T:C C T 10 0.528359849842223 0.808617085826636 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 772141 G/C 1 7 2 9 3.30148105110444 1.05671969968445 2.24476135141999 C:G G C 10 0.528359849842223 0.186011003558895 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 774520 C/T 1 9 1 10 4.24476135141999 0.528359849842223 3.71640150157777 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0234763819888152 ENSG00000162004:ENST00000463539:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482878:exon_772582_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000478979:exon_772583_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000479742:exon_774322_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000481804:exon_774106_775880:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000466708:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482152:exon_774322_774635:CCDC78 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 778024 T/C 1 13 14 27 6.1313219520511 7.39703789779112 -1.26571594574002 T:C T C 10 0.528359849842223 0.701520600568723 ENSG00000103253:ENST00000341413:exon_777965_778029:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389701:exon_777965_778029:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389703:exon_777965_778029:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389702:exon_777965_778029:HAGHL HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 778820 G/A 1 20 18 38 9.43280300315554 9.51047729716001 -0.0776742940044723 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000103253:ENST00000341413:exon_778794_779715:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389701:exon_778794_778868:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389703:exon_778794_778895:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389702:exon_778794_779168:HAGHL HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 781633 G/A 1 6 2 8 2.82984090094666 1.05671969968445 1.77312120126222 A:G G A 10 0.528359849842223 0.29537924054388 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_781565_781702:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_781565_781702:NARFL HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 847743 C/T 1 28 26 54 13.2059242044178 13.7373560958978 -0.53143189148004 T:C C T 10 0.528359849842223 0.892510218259089 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000498439:exon_847694_847751:CHTF18 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 1374818 A/G 1 153 130 283 72.1609429741399 68.686780479489 3.4741624946509 A:C:G A G 10 0.528359849842223 0.72098696720017 ENSG00000103275:ENST00000325437:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000355803:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397514:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397515:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000406620:exon_1374731_1375351:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000403747:exon_1374731_1375215:UBE2I HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 1552761 C/T 1 7 11 18 3.30148105110444 5.81195834826445 -2.51047729716001 T:C C T 10 0.528359849842223 0.248719564040320 ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1552314_1553003:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1552646_1552762:TELO2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 1555589 A/G 1 27 19 46 12.73428405426 10.0388371470022 2.69544690725774 A:G A G 10 0.528359849842223 0.462739811254651 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1555411_1555602:TELO2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 1838703 G/A 1 98 107 205 46.2207347154622 56.5345039331179 -10.3137692176557 A:G G A 10 0.528359849842223 0.161741140912778 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1838570_1839192:NUBP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 2049640 A/G 1 20 10 30 9.43280300315554 5.28359849842223 4.14920450473331 A:G A G 10 0.528359849842223 0.145699655332193 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 2138269 T/C 1 44 37 81 20.7521666069422 19.5493144441622 1.20285216277994 T:C T C 10 0.528359849842223 0.824481567075184 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000497886:exon_2138228_2138326:TSC2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 2140010 A/G 1 6 10 16 2.82984090094666 5.28359849842223 -2.45375759747557 A:G A G 10 0.528359849842223 0.316737715732456 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000306101:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000472577:exon_2139528_2140195:PKD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 2140454 T/C 1 6 2 8 2.82984090094666 1.05671969968445 1.77312120126222 T:C T C 10 0.528359849842223 0.29537924054388 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000306101:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000472577:exon_2140286_2140591:PKD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 2946433 C/T 1 45 38 83 21.2238067571 20.0776742940045 1.1461324630955 T:C C T 10 0.528359849842223 0.826724680357065 ENSG00000162076:ENST00000396958:exon_2946353_2946772:FLYWCH2;ENSG00000162076:ENST00000431751:exon_2946353_2946772:FLYWCH2;ENSG00000162076:ENST00000293981:exon_2946353_2946772:FLYWCH2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 2983483 C/G 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 C:G C G 10 0.528359849842223 0.743278251879842 ENSG00000059122:ENST00000416288:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000253928:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000399667:exon_2983131_2983583:FLYWCH1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 3170188 C/T 1 7 11 18 3.30148105110444 5.81195834826445 -2.51047729716001 T:C C T 10 0.528359849842223 0.248719564040320 ENSG00000122386:ENST00000382192:exon_3169257_3170518:ZNF205;ENSG00000122386:ENST00000219091:exon_3169257_3170484:ZNF205 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 3191356 G/A 1 6 2 8 2.82984090094666 1.05671969968445 1.77312120126222 A:G G A 10 0.528359849842223 0.29537924054388 ENSG00000085644:ENST00000396878:exon_3190690_3192804:ZNF213;ENSG00000085644:ENST00000332670:exon_3190690_3192804:ZNF213;ENSG00000085644:ENST00000416391:exon_3190690_3192804:ZNF213 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 3533577 C/G 1 4 8 12 1.88656060063111 4.22687879873778 -2.34031819810668 C:G C G 10 0.528359849842223 0.248211150341394 ENSG00000122390:ENST00000424546:exon_3533363_3533598:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000407558:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000414063:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000360862:exon_3533363_3533598:NAT15 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 3712006 G/A 1 80 70 150 37.7312120126222 36.9851894889556 0.746022523666561 A:G G A 10 0.528359849842223 0.93492536724248 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3711988_3712133:TRAP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 4408478 C/T 1 30 34 64 14.1492045047333 17.9642348946356 -3.81503038990227 T:C C T 10 0.528359849842223 0.381352613722471 ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4408368_4408484:CORO7 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 4445327 C/T 1 4 6 10 1.88656060063111 3.17015909905334 -1.28359849842223 T:C C T 10 0.528359849842223 0.531770325189017 ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4445290_4445340:CORO7;ENSG00000103426:ENST00000423908:exon_4445290_4445340:CORO7 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 4484396 A/T 1 7 2 9 3.30148105110444 1.05671969968445 2.24476135141999 A:T A T 10 0.528359849842223 0.186011003558895 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4484385_4484518:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4484385_4484518:DNAJA3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 4496973 T/A 1 6 6 12 2.82984090094666 3.17015909905334 -0.340318198106676 A:T T A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4496887_4497015:DNAJA3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 4511752 T/C 1 174 60 234 82.0653861274532 31.7015909905334 50.3637951369198 T:C T C 10 0.528359849842223 1.83760378340330e-11 ENSG00000153406:ENST00000283429:exon_4511695_4511960:NMRAL1;ENSG00000153406:ENST00000404295:exon_4511696_4511960:NMRAL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 4524155 C/G 1 24 11 35 11.3193636037866 5.81195834826445 5.5074052555222 C:G C G 10 0.528359849842223 0.0646314996296706 ENSG00000153406:ENST00000283429:exon_4524094_4524167:NMRAL1;ENSG00000153406:ENST00000404295:exon_4524094_4524167:NMRAL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 4556911 G/A 1 22 33 55 10.3760833034711 17.4358750447934 -7.05979174132226 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0594966527757083 ENSG00000103415:ENST00000406590:exon_4556896_4557013:HMOX2;ENSG00000103415:ENST00000458134:exon_4556896_4557013:HMOX2;ENSG00000103415:ENST00000219700:exon_4556896_4557013:HMOX2;ENSG00000103415:ENST00000398595:exon_4556896_4557013:HMOX2;ENSG00000103415:ENST00000414777:exon_4556896_4557013:HMOX2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 4748825 C/T 1 9 7 16 4.24476135141999 3.69851894889556 0.546242402524432 T:C C T 10 0.528359849842223 0.808617085826636 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4748801_4748942:ANKS3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 5139186 G/C 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 C:G G C 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5139108_5139257:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5139108_5139257:FAM86A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 8729124 G/A 1 6 4 10 2.82984090094666 2.11343939936889 0.71640150157777 A:G G A 10 0.528359849842223 0.757839432335683 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8729025_8729169:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8729025_8729169:C16orf68 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 8953081 C/G 1 14 18 32 6.60296210220888 9.51047729716001 -2.90751519495114 T:C:G C G 10 0.528359849842223 0.376444568242269 ENSG00000153048:ENST00000396593:exon_8953028_8953192:CARHSP1;ENSG00000153048:ENST00000311052:exon_8953028_8953192:CARHSP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 10862964 A/G 1 112 136 248 52.823696817671 71.8569395785423 -19.0332427608713 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0156885075465333 ENSG00000103274:ENST00000283027:exon_10862904_10863208:NUBP1;ENSG00000103274:ENST00000433392:exon_10862904_10863208:NUBP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 11001914 G/A 0 8 0 8 3.77312120126222 0 3.77312120126222 G G 10 0.528359849842223 0.00852191332774871 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 11035888 C/A 1 10 14 24 4.71640150157777 7.39703789779112 -2.68063639621335 A:C C A 10 0.528359849842223 0.310254011572794 ENSG00000182108:ENST00000331808:exon_11035426_11036317:DEXI;ENSG00000182108:ENST00000469379:exon_11035426_11035988:DEXI HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 11773662 C/G 1 63 55 118 29.71332945994 29.0597917413223 0.653537718617692 C:G C G 10 0.528359849842223 0.926759434181168 ENSG00000153066:ENST00000283033:exon_11772943_11773693:TXNDC11;ENSG00000153066:ENST00000356957:exon_11772943_11773693:TXNDC11 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 12162969 A/G 1 7 2 9 3.30148105110444 1.05671969968445 2.24476135141999 A:G A G 10 0.528359849842223 0.186011003558895 ENSG00000048471:ENST00000306030:exon_12162914_12162989:SNX29;ENSG00000048471:ENST00000323433:exon_12162914_12162989:SNX29 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 12758966 T/C 1 6 4 10 2.82984090094666 2.11343939936889 0.71640150157777 T:C T C 10 0.528359849842223 0.757839432335683 ENSG00000103381:ENST00000433677:exon_12753657_12758972:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000261660:exon_12753657_12758972:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000381774:exon_12756937_12758972:CPPED1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 14540868 C/T 1 13 11 24 6.1313219520511 5.81195834826445 0.319363603786649 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000140694:ENST00000420015:exon_14540745_14540938:PARN;ENSG00000140694:ENST00000437198:exon_14540745_14540938:PARN;ENSG00000140694:ENST00000341484:exon_14540745_14540938:PARN HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 15122812 C/G 1 14 17 31 6.60296210220888 8.98211744731779 -2.37915534510891 C:G C G 10 0.528359849842223 0.472662474431109 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15122735_15122823:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15122735_15122823:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000447912:exon_15122735_15122823:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15122735_15122823:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15122735_15123657:PDXDC1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 15129970 A/G 1 6 17 23 2.82984090094666 8.98211744731779 -6.15227654637113 A:T:G A G 10 0.528359849842223 0.0115920294245276 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000447912:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15129873_15131543:PDXDC1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 15131962 A/G 1 90 50 140 42.4476135141999 26.4179924921111 16.0296210220888 A:C:G A G 10 0.528359849842223 0.0066870020174512 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15131710_15132067:NTAN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 15131974 G/T 1 81 51 132 38.2028521627799 26.9463523419534 11.2564998208266 A:T:G G T 10 0.528359849842223 0.0549108964033518 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15131710_15132067:NTAN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 15133889 T/G 1 15 18 33 7.07460225236666 9.51047729716001 -2.43587504479336 T:G T G 10 0.528359849842223 0.486172453869617 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15133826_15133923:NTAN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 15793639 C/T 1 26 25 51 12.2626439041022 13.2089962460556 -0.94635234195337 T:C C T 10 0.528359849842223 0.888642400409326 ENSG00000072864:ENST00000396353:exon_15793586_15793679:NDE1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 15818141 A/C 1 11 17 28 5.18804165173555 8.98211744731779 -3.79407579558224 A:C A C 10 0.528359849842223 0.185381237118026 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1;ENSG00000133392:ENST00000300036:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000338282:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396320:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396324:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000452625:exon_15818018_15818266:MYH11 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 15818310 G/A 1 12 23 35 5.65968180189332 12.1522765463711 -6.4925947444778 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0406207835300952 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 15818653 G/A 1 35 23 58 16.5074052555222 12.1522765463711 4.35512870915107 A:G G A 10 0.528359849842223 0.293106230007202 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1;ENSG00000133392:ENST00000300036:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000338282:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396320:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396324:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000452625:exon_15818504_15818656:MYH11 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 19726275 C/T 1 46 31 77 21.6954469072577 16.3791553451089 5.31629156214883 T:C C T 10 0.528359849842223 0.254023859104797 ENSG00000103550:ENST00000219837:exon_19725440_19726362:C16orf88;ENSG00000103550:ENST00000420899:exon_19725440_19726359:C16orf88 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 21190853 A/C 1 6 6 12 2.82984090094666 3.17015909905334 -0.340318198106676 A:C A C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000011638:ENST00000233047:exon_21190796_21191937:TMEM159;ENSG00000011638:ENST00000261388:exon_21190796_21191935:TMEM159;ENSG00000011638:ENST00000451578:exon_21190796_21191935:TMEM159 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 24583406 A/G 1 126 107 233 59.4266589198799 56.5345039331179 2.89215498676205 A:G A G 10 0.528359849842223 0.74296184670868 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 27238110 C/T 1 57 53 110 26.8834885589933 28.0030720416378 -1.11958348264453 T:C C T 10 0.528359849842223 0.848970946034384 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27238041_27238157:NSMCE1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 27246617 T/C 1 40 41 81 18.8656060063111 21.6627538435311 -2.79714783722006 T:C T C 10 0.528359849842223 0.578467891715219 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27246499_27246620:NSMCE1;ENSG00000169189:ENST00000358787:exon_27246499_27246620:NSMCE1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 27356203 A/G 1 7 1 8 3.30148105110444 0.528359849842223 2.77312120126222 A:G A G 10 0.528359849842223 0.073836867977041 ENSG00000077238:ENST00000380925:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000449195:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27356190_27356341:IL4R HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 28506428 C/T 1 7 6 13 3.30148105110444 3.17015909905334 0.131321952051101 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28506420_28507410:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28506420_28507410:AC138894.1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 28507644 C/G 1 8 10 18 3.77312120126222 5.28359849842223 -1.51047729716001 C:G C G 10 0.528359849842223 0.490179587566891 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 28508048 A/G 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 28508069 C/T 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 28508447 A/G 1 11 13 24 5.18804165173555 6.8686780479489 -1.68063639621335 A:G A G 10 0.528359849842223 0.543437824899314 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 28602991 A/G 1 10 4 14 4.71640150157777 2.11343939936889 2.60296210220888 A:G A G 10 0.528359849842223 0.189361454505222 ENSG00000176476:ENST00000317058:exon_28602911_28603111:CCDC101 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 28603012 A/G 1 25 16 41 11.7910037539444 8.45375759747557 3.33724615646886 A:G A G 10 0.528359849842223 0.348882224113598 ENSG00000176476:ENST00000317058:exon_28602911_28603111:CCDC101 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 28847246 T/C 1 6 2 8 2.82984090094666 1.05671969968445 1.77312120126222 T:C T C 10 0.528359849842223 0.29537924054388 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 28883241 A/G 1 14 10 24 6.60296210220888 5.28359849842223 1.31936360378665 A:G A G 10 0.528359849842223 0.684580806653448 ENSG00000178188:ENST00000359285:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000395532:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000322610:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000337120:exon_28883101_28883304:SH2B1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 28944396 C/G 1 36 31 67 16.97904540568 16.3791553451089 0.59989006057106 C:G C G 10 0.528359849842223 0.903254118401401 ENSG00000177455:ENST00000324662:exon_28944232_28944435:CD19 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 28944700 G/T 1 25 20 45 11.7910037539444 10.5671969968445 1.22380675709997 T:G G T 10 0.528359849842223 0.766543030528917 ENSG00000177455:ENST00000324662:exon_28944555_28944830:CD19 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 29675928 C/T 1 109 92 201 51.4087763671977 48.6091061854845 2.79967018171318 T:C C T 10 0.528359849842223 0.724139287870005 ENSG00000197471:ENST00000395389:exon_29675016_29676848:SPN;ENSG00000197471:ENST00000436527:exon_29675016_29676114:SPN;ENSG00000197471:ENST00000360121:exon_29675016_29681811:SPN HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 29994922 C/T 1 7 6 13 3.30148105110444 3.17015909905334 0.131321952051101 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000149930:ENST00000416441:exon_29994824_29994985:TAOK2;ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29994824_29994985:TAOK2;ENSG00000149930:ENST00000279394:exon_29994824_29994985:TAOK2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 29998200 A/G 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 A:G A G 10 0.528359849842223 0.743278251879842 ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29997586_29999719:TAOK2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 30199584 G/A 1 17 13 30 8.01788255268221 6.8686780479489 1.14920450473331 A:C:G G A 10 0.528359849842223 0.71778823657468 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 30364712 G/A 1 89 65 154 41.9759733640422 34.3433902397445 7.63258312429766 A:G G A 10 0.528359849842223 0.226779902700979 ENSG00000169217:ENST00000305596:exon_30364689_30365121:CD2BP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 30408961 C/T 1 6 2 8 2.82984090094666 1.05671969968445 1.77312120126222 T:C C T 10 0.528359849842223 0.29537924054388 ENSG00000180035:ENST00000495929:exon_30408651_30410681:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000528032:exon_30408651_30409012:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000524644:exon_30408651_30409001:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000320159:exon_30408651_30411429:ZNF48 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 30666210 C/T 1 29 29 58 13.6775643545755 15.3224356454245 -1.64487129084893 T:C C T 10 0.528359849842223 0.694599697286077 ENSG00000156858:ENST00000287463:exon_30665950_30666535:PRR14;ENSG00000156858:ENST00000300835:exon_30665950_30666535:PRR14 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 31193942 C/A 1 169 140 309 79.7071853766643 73.9703789779112 5.73680639875312 A:C C A 10 0.528359849842223 0.531092347088549 ENSG00000089280:ENST00000254108:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000433338:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000394533:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000380244:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000487045:exon_31193834_31194283:FUS;ENSG00000089280:ENST00000491029:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000354711:exon_31193834_31193985:FUS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 53262964 C/T 1 15 6 21 7.07460225236666 3.17015909905334 3.90444315331332 T:C C T 10 0.528359849842223 0.124380190819060 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53262895_53263012:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53262895_53263012:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53262895_53263012:CHD9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 56396486 C/T 1 34 35 69 16.0357651053644 18.4925947444778 -2.45682963911338 T:C C T 10 0.528359849842223 0.629902241716515 ENSG00000159461:ENST00000290649:exon_56395364_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000492830:exon_56395472_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000314566:exon_56396337_56396528:AMFR HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 56396520 G/T 1 40 38 78 18.8656060063111 20.0776742940045 -1.21206828769339 T:G G T 10 0.528359849842223 0.821046331241224 ENSG00000159461:ENST00000290649:exon_56395364_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000492830:exon_56395472_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000314566:exon_56396337_56396528:AMFR HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 56855487 C/T 1 11 3 14 5.18804165173555 1.58507954952667 3.60296210220888 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0628940949466435 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56855416_56855505:NUP93 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 57016092 G/A 1 3 6 9 1.41492045047333 3.17015909905334 -1.75523864858001 A:G G A 10 0.528359849842223 0.322385551531720 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57016077_57016149:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57016077_57016149:CETP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 57206205 C/T 1 1 10 11 0.471640150157777 5.28359849842223 -4.81195834826445 T:C C T 10 0.528359849842223 0.00431811926858725 ENSG00000172775:ENST00000309137:exon_57206163_57206284:FAM192A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 57499902 T/C 1 9 10 19 4.24476135141999 5.28359849842223 -1.03883714700224 T:C T C 10 0.528359849842223 0.653351132943168 ENSG00000102978:ENST00000219252:exon_57499865_57499933:POLR2C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 67132676 C/T 1 6 4 10 2.82984090094666 2.11343939936889 0.71640150157777 T:C C T 10 0.528359849842223 0.757839432335683 ENSG00000067955:ENST00000290858:exon_67132613_67134961:CBFB;ENSG00000067955:ENST00000412916:exon_67132613_67134956:CBFB HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 67265360 C/A 1 11 17 28 5.18804165173555 8.98211744731779 -3.79407579558224 A:C C A 10 0.528359849842223 0.185381237118026 ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67265333_67265452:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67265333_67265452:FHOD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 67578257 C/T 1 10 8 18 4.71640150157777 4.22687879873778 0.489522702839987 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000039523:ENST00000379312:exon_67578202_67578334:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000042381:exon_67578202_67578334:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000422602:exon_67578202_67578334:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000428437:exon_67578202_67578334:FAM65A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 67694044 C/T 1 14 9 23 6.60296210220888 4.75523864858001 1.84772345362887 T:C C T 10 0.528359849842223 0.533037275926842 ENSG00000102977:ENST00000219251:exon_67694025_67694713:ACD;ENSG00000102977:ENST00000393919:exon_67694025_67694646:ACD;ENSG00000102977:ENST00000429497:exon_67694025_67694718:ACD HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 67696346 C/T 1 8 15 23 3.77312120126222 7.92539774763334 -4.15227654637113 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0960783456263223 ENSG00000102981:ENST00000458121:exon_67695799_67696680:PARD6A;ENSG00000102981:ENST00000219255:exon_67695796_67696677:PARD6A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 67911517 T/C 1 5 5 10 2.35820075078889 2.64179924921111 -0.283598498422229 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000038358:ENST00000358933:exon_67911412_67911559:EDC4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 67917958 G/A 1 107 114 221 50.4654960668821 60.2330228820134 -9.76752681513127 A:G G A 10 0.528359849842223 0.200582694201167 ENSG00000038358:ENST00000358933:exon_67917859_67918406:EDC4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 67964203 T/C 1 13 6 19 6.1313219520511 3.17015909905334 2.96116285299776 T:C T C 10 0.528359849842223 0.250170755672362 ENSG00000141086:ENST00000319955:exon_67964088_67964221:CTRL;ENSG00000141086:ENST00000432773:exon_67963848_67964221:CTRL HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 67969531 A/G 1 173 106 279 81.5937459772954 56.0061440832756 25.5876018940198 A:G A G 10 0.528359849842223 0.00218978989701517 ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969485_67969600:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969452_67969600:PSMB10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 67969930 A/G 1 272 201 473 128.286120842915 106.200329818287 22.0857910246285 A:C:G A G 10 0.528359849842223 0.0427545874740566 ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969866_67970006:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969866_67970215:PSMB10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 69354963 A/G 1 21 22 43 9.90444315331332 11.6239166965289 -1.71947354321559 A:G A G 10 0.528359849842223 0.648275396895171 ENSG00000132612:ENST00000254950:exon_69354954_69355173:VPS4A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 69356612 C/G 1 15 6 21 7.07460225236666 3.17015909905334 3.90444315331332 C:G C G 10 0.528359849842223 0.124380190819060 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 69364030 G/A 1 14 6 20 6.60296210220888 3.17015909905334 3.43280300315554 A:G G A 10 0.528359849842223 0.177870101535749 ENSG00000213380:ENST00000288022:exon_69363900_69364498:COG8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 69373414 T/C 1 2 7 9 0.943280300315554 3.69851894889556 -2.75523864858001 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0939591166432567 ENSG00000213380:ENST00000306875:exon_69373079_69373513:COG8;ENSG00000213380:ENST00000401849:exon_69373079_69373460:COG8;ENSG00000132603:ENST00000254940:exon_69373343_69373788:NIP7 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 69745145 G/A 1 28 30 58 13.2059242044178 15.8507954952667 -2.64487129084893 A:G G A 10 0.528359849842223 0.512734741502988 ENSG00000181019:ENST00000320623:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379047:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379046:exon_69743307_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000439109:exon_69744745_69745184:NQO1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 69782855 C/T 1 86 72 158 40.5610529135688 38.0419091886401 2.51914372492877 T:C C T 10 0.528359849842223 0.750040939160071 ENSG00000141101:ENST00000268802:exon_69782821_69783021:NOB1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 69783465 G/A 1 114 105 219 53.7669771179866 55.4777842334334 -1.71080711544683 A:G G A 10 0.528359849842223 0.839253759942588 ENSG00000141101:ENST00000268802:exon_69783462_69783533:NOB1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 69973825 G/A 1 12 16 28 5.65968180189332 8.45375759747557 -2.79407579558224 A:G G A 10 0.528359849842223 0.345302340839643 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69973744_69975644:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69973744_69975643:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69973744_69975643:WWP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 70303580 G/A 1 16 19 35 7.54624240252443 10.0388371470022 -2.4925947444778 A:G G A 10 0.528359849842223 0.403896486545389 ENSG00000090861:ENST00000261772:exon_70303521_70303666:AARS;ENSG00000090861:ENST00000418685:exon_70303521_70303666:AARS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 70395387 C/T 1 8 4 12 3.77312120126222 2.11343939936889 1.65968180189332 T:C C T 10 0.528359849842223 0.396971345501871 ENSG00000168872:ENST00000302243:exon_70395321_70395413:DDX19A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 70422231 C/T 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 T:C C T 10 0.528359849842223 0.730064285841028 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 70515355 C/T 1 9 12 21 4.24476135141999 6.34031819810668 -2.09555684668668 T:C C T 10 0.528359849842223 0.389033912530957 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000526700:exon_70515262_70515390:COG4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 70569215 A/T 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 A:T A T 10 0.528359849842223 0.743278251879842 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70569211_70569323:SF3B3;ENSG00000189091:ENST00000310750:exon_70569211_70569245:SF3B3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 70602221 C/T 1 39 39 78 18.3939658561533 20.6060341438467 -2.21206828769339 T:C C T 10 0.528359849842223 0.650934695836213 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70602186_70602398:SF3B3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 70726795 C/A 1 8 6 14 3.77312120126222 3.17015909905334 0.602962102208878 A:C C A 10 0.528359849842223 0.795199355745845 ENSG00000103043:ENST00000261776:exon_70726724_70726874:VAC14 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 72142248 C/T 1 16 19 35 7.54624240252443 10.0388371470022 -2.4925947444778 T:C C T 10 0.528359849842223 0.403896486545389 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72142126_72142281:DHX38;ENSG00000140829:ENST00000427670:exon_72142126_72142281:DHX38 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 75269534 C/T 1 10 11 21 4.71640150157777 5.81195834826445 -1.09555684668668 T:C C T 10 0.528359849842223 0.667251391828987 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75268787_75269884:BCAR1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 81010073 C/T 1 127 150 277 59.8982990700377 79.2539774763334 -19.3556784062958 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0220579946338146 ENSG00000103121:ENST00000219400:exon_81009699_81010076:C16orf61;ENSG00000103121:ENST00000486645:exon_81009699_81010076:C16orf61 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 81056441 T/G 1 4 8 12 1.88656060063111 4.22687879873778 -2.34031819810668 T:G T G 10 0.528359849842223 0.248211150341394 ENSG00000166451:ENST00000299572:exon_81056360_81056490:CENPN HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 81077451 C/G 1 15 3 18 7.07460225236666 1.58507954952667 5.48952270283999 C:G C G 10 0.528359849842223 0.00922208590374973 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 81077873 A/G 1 13 23 36 6.1313219520511 12.1522765463711 -6.02095459432003 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0465288361202032 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 81819768 T/C 1 13 9 22 6.1313219520511 4.75523864858001 1.37608330347109 A:T:C T C 10 0.528359849842223 0.670970373739377 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81819548_81819787:PLCG2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 81929488 C/T 1 14 10 24 6.60296210220888 5.28359849842223 1.31936360378665 T:C C T 10 0.528359849842223 0.684580806653448 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81929412_81929532:PLCG2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 82182286 C/G 1 7 8 15 3.30148105110444 4.22687879873778 -0.925397747633344 C:G C G 10 0.528359849842223 0.797109179414283 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82181767_82182468:MPHOSPH6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 82182354 G/A 1 5 9 14 2.35820075078889 4.75523864858001 -2.39703789779112 A:G G A 10 0.528359849842223 0.284555554939117 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82181767_82182468:MPHOSPH6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 84691044 C/T 1 13 12 25 6.1313219520511 6.34031819810668 -0.208996246055574 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84690477_84691550:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84690477_84691519:KLHL36 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 84778762 C/T 1 22 13 35 10.3760833034711 6.8686780479489 3.5074052555222 T:C C T 10 0.528359849842223 0.309707532755505 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 84779248 T/G 1 12 6 18 5.65968180189332 3.17015909905334 2.48952270283999 T:G T G 10 0.528359849842223 0.345434571692356 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 85009970 A/G 1 7 6 13 3.30148105110444 3.17015909905334 0.131321952051101 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000153786:ENST00000313732:exon_85007787_85010125:ZDHHC7;ENSG00000153786:ENST00000344861:exon_85008069_85010125:ZDHHC7 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 85711860 C/T 1 117 87 204 55.1818975684599 45.9673069362734 9.21459063218652 T:C C T 10 0.528359849842223 0.207133105535883 ENSG00000131153:ENST00000253462:exon_85709804_85711943:GINS2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 87788864 G/A 1 12 6 18 5.65968180189332 3.17015909905334 2.48952270283999 A:G G A 10 0.528359849842223 0.345434571692356 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87788800_87788898:KLHDC4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 88713236 A/G 1 191 254 445 90.0832686801354 134.203401859925 -44.1201331797892 A:T:C:G A G 10 0.528359849842223 3.42069667322196e-05 ENSG00000051523:ENST00000261623:exon_88713163_88713246:CYBA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 88724347 G/T 1 27 20 47 12.73428405426 10.5671969968445 2.16708705741552 T:G G T 10 0.528359849842223 0.56154755072977 ENSG00000167508:ENST00000301012:exon_88724323_88724437:MVD;ENSG00000167508:ENST00000378400:exon_88724323_88724437:MVD HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 88781125 T/C 1 43 28 71 20.2805264567844 14.7940757955822 5.48645066120217 T:C T C 10 0.528359849842223 0.234343169981200 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780995_88781145:CTU2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 88781614 G/C 1 33 25 58 15.5641249552066 13.2089962460556 2.35512870915107 T:C:G G C 10 0.528359849842223 0.599589399066381 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000103335:ENST00000301015:exon_88781588_88782262:FAM38A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 88870967 T/C 1 23 11 34 10.8477234536289 5.81195834826445 5.03576510536442 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0883772041442789 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88870953_88871075:CDT1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 88872229 A/G 1 26 33 59 12.2626439041022 17.4358750447934 -5.17323114069115 A:G A G 10 0.528359849842223 0.193291146437756 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88872132_88872277:CDT1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 88872511 T/C 1 29 33 62 13.6775643545755 17.4358750447934 -3.75831069021782 T:C T C 10 0.528359849842223 0.374119141381512 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88872429_88872529:CDT1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 88874632 C/G 1 79 67 146 37.2595718624644 35.4001099394289 1.85946192303545 C:G C G 10 0.528359849842223 0.803783987982484 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88874523_88875665:CDT1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 89167395 C/T 1 15 2 17 7.07460225236666 1.05671969968445 6.01788255268221 T:C C T 10 0.528359849842223 0.00296655703561078 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 89167404 T/C 1 15 2 17 7.07460225236666 1.05671969968445 6.01788255268221 T:C T C 10 0.528359849842223 0.00296655703561078 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 89167431 G/C 0 12 0 12 5.65968180189332 0 5.65968180189332 G G 10 0.528359849842223 0.000594474716960591 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 89167443 T/C 1 12 1 13 5.65968180189332 0.528359849842223 5.1313219520511 T:C T C 10 0.528359849842223 0.00404147265660156 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 89167458 C/A 1 9 3 12 4.24476135141999 1.58507954952667 2.65968180189332 A:C C A 10 0.528359849842223 0.153759275498468 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 89180883 G/A 1 10 6 16 4.71640150157777 3.17015909905334 1.54624240252443 A:G G A 10 0.528359849842223 0.46618456350988 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000378345:exon_89180747_89180895:ACSF3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 89294184 G/A 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 A:G G A 10 0.528359849842223 0.743278251879842 ENSG00000170100:ENST00000433976:exon_89293102_89295363:ZNF778;ENSG00000170100:ENST00000306502:exon_89293102_89295363:ZNF778 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 89713057 G/A 1 13 17 30 6.1313219520511 8.98211744731779 -2.85079549526669 A:G G A 10 0.528359849842223 0.36131987801409 ENSG00000131165:ENST00000253475:exon_89712935_89713122:CHMP1A;ENSG00000131165:ENST00000397901:exon_89712935_89713122:CHMP1A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 16 89799804 A/C 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 A:C A C 10 0.528359849842223 0.743278251879842 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89799710_89799820:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89799710_89799820:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89799710_89799820:ZNF276 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 465775 G/A 1 4 6 10 1.88656060063111 3.17015909905334 -1.28359849842223 A:G G A 10 0.528359849842223 0.531770325189017 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_465743_465985:VPS53 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 648186 G/A 1 138 118 256 65.0863407217732 62.3464622813823 2.73987844039092 A:G G A 10 0.528359849842223 0.754500679253593 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 648498 C/T 1 69 53 122 32.5431703608866 28.0030720416378 4.54009831924879 T:C C T 10 0.528359849842223 0.416304527147321 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 649232 C/T 1 43 36 79 20.2805264567844 19.02095459432 1.25957186246439 T:C C T 10 0.528359849842223 0.82217770035759 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 649547 G/C 1 18 17 35 8.48952270283999 8.98211744731779 -0.492594744477804 C:G G C 10 0.528359849842223 0.867578930748504 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 649935 G/C 1 4 8 12 1.88656060063111 4.22687879873778 -2.34031819810668 C:G G C 10 0.528359849842223 0.248211150341394 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4;ENSG00000179409:ENST00000437269:exon_649871_650522:GEMIN4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 685640 G/T 1 15 17 32 7.07460225236666 8.98211744731779 -1.90751519495113 T:G G T 10 0.528359849842223 0.596108751890824 ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_685482_685691:GLOD4;ENSG00000171861:ENST00000304478:exon_685513_685932:RNMTL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 1373518 T/C 1 9 14 23 4.24476135141999 7.39703789779112 -3.15227654637113 A:T:C T C 10 0.528359849842223 0.213695268661202 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1373469_1373628:MYO1C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 1373612 C/T 1 12 11 23 5.65968180189332 5.81195834826445 -0.152276546371128 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1373469_1373628:MYO1C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 1538669 C/T 1 5 6 11 2.35820075078889 3.17015909905334 -0.811958348264453 T:C C T 10 0.528359849842223 0.765428811190486 ENSG00000074660:ENST00000263071:exon_1537152_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000348987:exon_1537152_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000434376:exon_1537153_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000452948:exon_1537153_1538911:SCARF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 1565211 T/C 1 17 9 26 8.01788255268221 4.75523864858001 3.2626439041022 T:C T C 10 0.528359849842223 0.24033639007444 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1565200_1565447:PRPF8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 1637302 A/G 1 5 6 11 2.35820075078889 3.17015909905334 -0.811958348264453 A:G A G 10 0.528359849842223 0.765428811190486 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 1637458 G/A 1 6 7 13 2.82984090094666 3.69851894889556 -0.868678047948899 A:G G A 10 0.528359849842223 0.782884637593256 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 1640793 C/T 1 17 6 23 8.01788255268221 3.17015909905334 4.84772345362887 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0582276127373582 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1640659_1641879:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1640659_1641782:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1640659_1641888:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1640659_1641878:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1640659_1641886:WDR81 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 1680002 T/C 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 T:C T C 10 0.528359849842223 0.743278251879842 ENSG00000132386:ENST00000254722:exon_1679826_1680036:SERPINF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 1782957 C/T 1 25 24 49 11.7910037539444 12.6806363962134 -0.889632642268925 T:C C T 10 0.528359849842223 0.886442948084777 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1782854_1782993:RPA1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 1795180 T/C 1 8 14 22 3.77312120126222 7.39703789779112 -3.62391669652891 T:C T C 10 0.528359849842223 0.138020116768675 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1795127_1795234:RPA1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 1964751 C/T 1 6 6 12 2.82984090094666 3.17015909905334 -0.340318198106676 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_1963133_1964916:SMG6;ENSG00000070366:ENST00000354901:exon_1963133_1964916:SMG6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 2203025 T/G 1 9 6 15 4.24476135141999 3.17015909905334 1.07460225236666 T:G T G 10 0.528359849842223 0.61599879202346 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 2203167 T/G 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 T:G T G 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 2238152 T/C 1 16 8 24 7.54624240252443 4.22687879873778 3.31936360378665 T:C T C 10 0.528359849842223 0.220638511719371 ENSG00000167721:ENST00000301364:exon_2237766_2238190:TSR1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 3567049 A/G 1 6 11 17 2.82984090094666 5.81195834826445 -2.98211744731779 A:G A G 10 0.528359849842223 0.223532760143352 ENSG00000213977:ENST00000225525:exon_3566196_3567179:TAX1BP3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 3582954 C/T 1 18 9 27 8.48952270283999 4.75523864858001 3.73428405425998 T:C C T 10 0.528359849842223 0.178643998794982 ENSG00000083454:ENST00000381833:exon_3582884_3583078:P2RX5;ENSG00000083454:ENST00000435558:exon_3582884_3583078:P2RX5;ENSG00000083454:ENST00000225328:exon_3582884_3583078:P2RX5;ENSG00000083454:ENST00000345901:exon_3582884_3583078:P2RX5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 3828702 T/C 1 15 19 34 7.07460225236666 10.0388371470022 -2.96423489463558 T:C T C 10 0.528359849842223 0.390750775814974 ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3827169_3828732:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3827169_3828735:ATP2A3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 3844787 C/G 1 3 6 9 1.41492045047333 3.17015909905334 -1.75523864858001 C:G C G 10 0.528359849842223 0.322385551531720 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3844730_3844948:ATP2A3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 4575283 A/G 1 186 188 374 87.7250679293465 99.3316517703379 -11.6065838409914 A:G A G 10 0.528359849842223 0.233881586853275 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4574986_4576230:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4574986_4576440:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4574986_4576440:PELP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 4577950 C/A 1 24 19 43 11.3193636037866 10.0388371470022 1.28052645678441 A:C C A 10 0.528359849842223 0.761064302771798 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4577855_4577964:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4577805_4577964:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4577805_4577964:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4577805_4577964:PELP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 4586245 G/C 1 8 3 11 3.77312120126222 1.58507954952667 2.18804165173555 C:G G C 10 0.528359849842223 0.234829965499602 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4586098_4586247:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4586098_4586247:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4586098_4586247:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4586098_4586247:PELP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 4622638 C/T 1 14 17 31 6.60296210220888 8.98211744731779 -2.37915534510891 T:C C T 10 0.528359849842223 0.472662474431109 ENSG00000141480:ENST00000381488:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000346341:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000269260:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000412477:exon_4622578_4622715:ARRB2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 4699552 G/A 1 27 19 46 12.73428405426 10.0388371470022 2.69544690725774 A:G G A 10 0.528359849842223 0.462739811254651 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4699439_4699591:PSMB6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 4701019 C/T 1 123 121 244 58.0117384694066 63.931541830909 -5.9198033615024 T:C:G C T 10 0.528359849842223 0.480685307490686 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4700977_4701106:PSMB6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 4797305 G/A 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 A:G G A 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000141503:ENST00000355280:exon_4797283_4797388:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000347992:exon_4797283_4797388:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000453408:exon_4797283_4797388:MINK1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 4926882 A/G 1 36 25 61 16.97904540568 13.2089962460556 3.7700491596244 A:G A G 10 0.528359849842223 0.370462897529812 ENSG00000129250:ENST00000320785:exon_4926763_4931696:KIF1C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 5126674 A/G 1 11 7 18 5.18804165173555 3.69851894889556 1.48952270283999 A:G A G 10 0.528359849842223 0.63817833418455 ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 5126689 G/A 1 12 6 18 5.65968180189332 3.17015909905334 2.48952270283999 A:G G A 10 0.528359849842223 0.345434571692356 ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 5326089 C/T 1 73 78 151 34.4297309615177 41.2120682876934 -6.78233732617566 T:C C T 10 0.528359849842223 0.289533554378256 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 5326145 C/G 1 69 89 158 32.5431703608866 47.0240266359578 -14.4808562750712 C:G C G 10 0.528359849842223 0.0253604179113665 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 6353679 A/C 1 6 2 8 2.82984090094666 1.05671969968445 1.77312120126222 A:C A C 10 0.528359849842223 0.29537924054388 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 6919093 T/C 1 107 100 207 50.4654960668821 52.8359849842223 -2.37048891734015 T:C T C 10 0.528359849842223 0.780753744970422 ENSG00000161939:ENST00000439424:exon_6919093_6919194:C17orf49;ENSG00000161939:ENST00000293804:exon_6919093_6919194:C17orf49 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 7132556 C/T 1 12 5 17 5.65968180189332 2.64179924921111 3.01788255268221 T:C C T 10 0.528359849842223 0.154369157381661 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7132454_7132593:DVL2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 7154582 T/C 1 47 38 85 22.1670870574155 20.0776742940045 2.08941276341105 T:C T C 10 0.528359849842223 0.665544339900252 ENSG00000175826:ENST00000380825:exon_7154514_7154995:CTDNEP1;ENSG00000175826:ENST00000318988:exon_7154514_7154920:CTDNEP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 7293715 C/T 1 24 24 48 11.3193636037866 12.6806363962134 -1.3612727924267 T:C C T 10 0.528359849842223 0.772944113464232 ENSG00000187838:ENST00000324822:exon_7293055_7293760:PLSCR3;ENSG00000187838:ENST00000380658:exon_7293055_7293760:PLSCR3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 7297452 A/G 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 A:G A G 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000187838:ENST00000324822:exon_7297423_7297590:PLSCR3;ENSG00000187838:ENST00000380658:exon_7297423_7297590:PLSCR3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 7460517 G/C 1 7 6 13 3.30148105110444 3.17015909905334 0.131321952051101 C:G G C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000239697:ENST00000293825:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000322272:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462619:exon_7460416_7460549:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462811:exon_7460416_7460891:TNFSF12 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 7460685 G/A 1 9 11 20 4.24476135141999 5.81195834826445 -1.56719699684446 A:G G A 10 0.528359849842223 0.509651795713 ENSG00000239697:ENST00000293825:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000322272:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462811:exon_7460416_7460891:TNFSF12 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 7462969 A/G 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000239697:ENST00000518220:exon_7462941_7463019:TNFSF12;ENSG00000248871:ENST00000293826:exon_7462941_7463019:TNFSF12-TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000438470:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000436057:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000349228:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000338784:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000396545:exon_7462941_7463019:TNFSF13 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 7478498 G/A 1 249 208 457 117.438397389286 109.898848767182 7.53954862210411 A:G G A 10 0.528359849842223 0.482669050163188 ENSG00000161960:ENST00000293831:exon_7478437_7478576:EIF4A1;ENSG00000161960:ENST00000380512:exon_7478437_7478720:EIF4A1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 7484782 G/A 1 4 10 14 1.88656060063111 5.28359849842223 -3.39703789779112 A:G G A 10 0.528359849842223 0.105381577517645 ENSG00000129226:ENST00000250092:exon_7484696_7485431:CD68;ENSG00000129226:ENST00000380498:exon_7484696_7485428:CD68 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 7490379 G/C 1 2 6 8 0.943280300315554 3.17015909905334 -2.22687879873778 C:G G C 10 0.528359849842223 0.159873274171007 ENSG00000129255:ENST00000449455:exon_7490217_7490589:MPDU1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 7530147 G/C 1 5 6 11 2.35820075078889 3.17015909905334 -0.811958348264453 C:G G C 10 0.528359849842223 0.765428811190486 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 7530271 C/T 1 43 25 68 20.2805264567844 13.2089962460556 7.07153021072884 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0900417468085478 ENSG00000141504:ENST00000380466:exon_7530261_7530362:SAT2;ENSG00000141504:ENST00000269298:exon_7530261_7530362:SAT2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 8076741 A/G 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 A:G A G 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 8076802 T/A 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 A:T T A 10 0.528359849842223 0.743278251879842 ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 8108339 G/A 1 161 96 257 75.9340641754021 50.7225455848534 25.2115185905487 A:G G A 10 0.528359849842223 0.00173780211708271 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 8731943 T/C 1 14 9 23 6.60296210220888 4.75523864858001 1.84772345362887 T:C T C 10 0.528359849842223 0.533037275926842 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 9395231 G/A 1 58 41 99 27.3551287091511 21.6627538435311 5.69237486561993 A:G G A 10 0.528359849842223 0.269081804690452 ENSG00000170310:ENST00000306357:exon_9395146_9395238:STX8;ENSG00000170310:ENST00000415554:exon_9395146_9395238:STX8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 10614442 A/G 1 79 50 129 37.2595718624644 26.4179924921111 10.8415793703532 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0637126303355043 ENSG00000170222:ENST00000379774:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000468843:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000401658:exon_10614151_10614548:C17orf48 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 16342833 T/C 1 7 1 8 3.30148105110444 0.528359849842223 2.77312120126222 T:C T C 10 0.528359849842223 0.073836867977041 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 16344599 A/G 1 23 21 44 10.8477234536289 11.0955568466867 -0.24783339305781 A:G A G 10 0.528359849842223 1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 16344600 T/C 1 21 23 44 9.90444315331332 12.1522765463711 -2.24783339305781 T:C T C 10 0.528359849842223 0.547275169731435 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 16852206 A/C 1 56 117 173 26.4118484088355 61.8181024315401 -35.4062540227046 A:T:C:G A C 10 0.528359849842223 6.74874198655469e-08 ENSG00000240505:ENST00000437538:exon_16852052_16852297:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16852052_16852297:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16852052_16852297:TNFRSF13B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 17062241 C/G 1 5 4 9 2.35820075078889 2.11343939936889 0.244761351419994 C:G C G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000133030:ENST00000444976:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395811:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395804:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000429184:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000341712:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000442194:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000423885:exon_17061811_17062316:MPRIP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 17080575 C/T 1 15 12 27 7.07460225236666 6.34031819810668 0.73428405425998 T:C C T 10 0.528359849842223 0.848556223067985 ENSG00000133030:ENST00000444976:exon_17080564_17080726:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395811:exon_17080564_17080726:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395804:exon_17080564_17080726:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000429184:exon_17080564_17080726:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000341712:exon_17080564_17080726:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000313485:exon_17080564_17080726:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000414263:exon_17080564_17080726:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000462033:exon_17080566_17080726:MPRIP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 17168164 G/A 1 33 22 55 15.5641249552066 11.6239166965289 3.94020825867774 A:G G A 10 0.528359849842223 0.344651010612741 ENSG00000141030:ENST00000268717:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000486810:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000417352:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000439936:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000492672:exon_17168116_17168295:COPS3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 17380391 G/A 1 3 6 9 1.41492045047333 3.17015909905334 -1.75523864858001 A:G G A 10 0.528359849842223 0.322385551531720 ENSG00000141026:ENST00000268711:exon_17380300_17380579:MED9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 17409560 C/T 1 14 15 29 6.60296210220888 7.92539774763334 -1.32243564542447 T:C C T 10 0.528359849842223 0.711035870554003 ENSG00000133027:ENST00000255389:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395783:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395782:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000490392:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000484838:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000435340:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000448294:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000343219:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395781:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000477595:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000482906:exon_17409541_17409615:PEMT HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 17707105 T/C 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 T:C T C 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17707070_17707163:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17707070_17707355:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17707070_17707433:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17707070_17707355:RAI1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 17750907 G/A 1 7 1 8 3.30148105110444 0.528359849842223 2.77312120126222 A:G G A 10 0.528359849842223 0.073836867977041 ENSG00000175662:ENST00000379504:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000318094:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000478943:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000395739:exon_17750663_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000486413:exon_17750866_17751097:TOM1L2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 17997209 G/A 1 9 5 14 4.24476135141999 2.64179924921111 1.60296210220888 A:G G A 10 0.528359849842223 0.434484743557366 ENSG00000108591:ENST00000395726:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000225729:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000473213:exon_17997127_17997594:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000467099:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000496428:exon_17997127_17997282:DRG2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 18232096 G/A 1 18 13 31 8.48952270283999 6.8686780479489 1.62084465489109 A:G G A 10 0.528359849842223 0.594022867419225 ENSG00000176974:ENST00000316694:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395684:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000352886:exon_18231195_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000354098:exon_18231842_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395685:exon_18231871_18232233:SHMT1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 18775900 A/G 1 12 14 26 5.65968180189332 7.39703789779112 -1.7373560958978 A:G A G 10 0.528359849842223 0.558215955592095 ENSG00000141127:ENST00000441887:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000395656:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000414602:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000492129:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000487101:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000432893:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000455992:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000412418:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000478622:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000419284:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000268835:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000422237:exon_18775896_18775962:PRPSAP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 18874720 C/G 1 6 3 9 2.82984090094666 1.58507954952667 1.24476135141999 C:G C G 10 0.528359849842223 0.514115714513849 ENSG00000188522:ENST00000388995:exon_18872102_18875061:FAM83G;ENSG00000188522:ENST00000345041:exon_18874381_18875061:FAM83G HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 19578873 A/T 1 18 10 28 8.48952270283999 5.28359849842223 3.20592420441776 A:T A T 10 0.528359849842223 0.258981777720527 ENSG00000072210:ENST00000176643:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000395575:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000339618:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000472059:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000476965:exon_19578871_19579060:ALDH3A2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 20108239 A/T 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 A:T A T 10 0.528359849842223 0.743278251879842 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 20109189 C/T 1 7 5 12 3.30148105110444 2.64179924921111 0.659681801893325 T:C C T 10 0.528359849842223 0.778733618574385 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 9 0 9 4.24476135141999 0 4.24476135141999 T T 10 0.528359849842223 0.00436376312451053 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 12 0 12 5.65968180189332 0 5.65968180189332 G G 10 0.528359849842223 0.000594474716960591 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 11 0 11 5.18804165173555 0 5.18804165173555 C C 10 0.528359849842223 0.00115270771725888 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 0 11 0 11 5.18804165173555 0 5.18804165173555 C C 10 0.528359849842223 0.00115270771725888 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 28 0 28 13.2059242044178 0 13.2059242044178 C C 10 0.528359849842223 1.81858892580192e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 18 0 18 8.48952270283999 0 8.48952270283999 C C 10 0.528359849842223 1.16311150270635e-05 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 12 0 12 5.65968180189332 0 5.65968180189332 C C 10 0.528359849842223 0.000594474716960591 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 12 0 12 5.65968180189332 0 5.65968180189332 G G 10 0.528359849842223 0.000594474716960591 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 46 0 46 21.6954469072577 0 21.6954469072577 G G 10 0.528359849842223 2.30669063776462e-13 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 25970633 G/A 1 16 27 43 7.54624240252443 14.26571594574 -6.71947354321559 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0466584374450767 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25970551_25970646:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25970551_25970646:LGALS9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 25974061 G/T 1 157 130 287 74.047503574771 68.686780479489 5.36072309528201 T:G G T 10 0.528359849842223 0.554512745657155 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25974056_25974144:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000302228:exon_25974056_25974144:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000310394:exon_25974056_25974144:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25974056_25974144:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000313648:exon_25974056_25974144:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000467111:exon_25974056_25974144:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000481514:exon_25974056_25974144:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000486774:exon_25974056_25974458:LGALS9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 27009749 C/T 1 7 3 10 3.30148105110444 1.58507954952667 1.71640150157777 T:C C T 10 0.528359849842223 0.35163323596596 ENSG00000109111:ENST00000314616:exon_27009745_27009874:SUPT6H;ENSG00000109111:ENST00000347486:exon_27009745_27009874:SUPT6H HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 27207571 C/T 1 40 30 70 18.8656060063111 15.8507954952667 3.0148105110444 T:C C T 10 0.528359849842223 0.549764126858522 ENSG00000132589:ENST00000394906:exon_27206353_27207617:FLOT2;ENSG00000132589:ENST00000394908:exon_27206353_27207617:FLOT2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 27889578 T/C 1 7 3 10 3.30148105110444 1.58507954952667 1.71640150157777 T:C T C 10 0.528359849842223 0.35163323596596 ENSG00000168792:ENST00000307201:exon_27887691_27890104:ABHD15 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 28511978 G/A 1 80 57 137 37.7312120126222 30.1165114410067 7.61470057161546 A:G G A 10 0.528359849842223 0.200145132712378 ENSG00000126653:ENST00000247026:exon_28511633_28513493:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000475652:exon_28511633_28512211:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000394826:exon_28511633_28513491:CCDC55 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 29226630 T/A 1 7 7 14 3.30148105110444 3.69851894889556 -0.397037897791122 A:T T A 10 0.528359849842223 1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 29646032 G/A 1 29 39 68 13.6775643545755 20.6060341438467 -6.92846978927116 A:G G A 10 0.528359849842223 0.113707396511427 ENSG00000126860:ENST00000462804:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000247270:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000461237:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394756:exon_29644676_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394755:exon_29644676_29646041:EVI2A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 29857460 G/A 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 A:G G A 10 0.528359849842223 0.743278251879842 ENSG00000131242:ENST00000394744:exon_29857344_29857487:RAB11FIP4;ENSG00000131242:ENST00000325874:exon_29857344_29857487:RAB11FIP4;ENSG00000131242:ENST00000394742:exon_29857344_29857487:RAB11FIP4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 30222002 T/C 1 8 5 13 3.77312120126222 2.64179924921111 1.1313219520511 T:C T C 10 0.528359849842223 0.589076720209571 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30221989_30222030:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000490218:exon_30221989_30222030:UTP6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 33289046 G/C 1 14 11 25 6.60296210220888 5.81195834826445 0.791003753944426 C:G G C 10 0.528359849842223 0.84244030516468 ENSG00000198783:ENST00000361952:exon_33288549_33290205:ZNF830 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 33428307 G/A 1 1 7 8 0.471640150157777 3.69851894889556 -3.22687879873778 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0304648716291925 ENSG00000185379:ENST00000345365:exon_33428220_33428384:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000474236:exon_33428220_33428384:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000360276:exon_33428220_33428384:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000335858:exon_33428220_33428384:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000394589:exon_33428220_33428384:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000489139:exon_33428220_33428384:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000345766:exon_33428220_33428384:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000460118:exon_33428220_33428384:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000494406:exon_33428220_33428384:RAD51L3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 33768383 T/A 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 A:T T A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000360502:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33764562_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33766003_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000534689:exon_33766499_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33766517_33768385:SLFN13 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 34252537 A/C 1 7 4 11 3.30148105110444 2.11343939936889 1.18804165173555 A:C A C 10 0.528359849842223 0.556038959282085 ENSG00000187456:ENST00000293273:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000419453:exon_34252519_34252554:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000394529:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000431884:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000436836:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000430160:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000425909:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000394528:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000394527:exon_34252519_34252641:RDM1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 34945658 A/G 1 54 56 110 25.46856810852 29.5881515911645 -4.11958348264453 A:G A G 10 0.528359849842223 0.446066647908785 ENSG00000005955:ENST00000304718:exon_34945638_34946278:GGNBP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 36894839 G/A 1 19 21 40 8.96116285299776 11.0955568466867 -2.13439399368892 A:G G A 10 0.528359849842223 0.52932968160044 ENSG00000056661:ENST00000360797:exon_36894794_36894848:PCGF2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 37054772 C/T 1 6 6 12 2.82984090094666 3.17015909905334 -0.340318198106676 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37054665_37054772:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37054665_37054772:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000429030:exon_37054665_37054772:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000443937:exon_37054665_37055078:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37054665_37054772:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000419929:exon_37054665_37054772:LASP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 38179492 A/G 1 7 12 19 3.30148105110444 6.34031819810668 -3.03883714700224 A:G A G 10 0.528359849842223 0.175485662480834 ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000492176:exon_38179384_38179760:MED24 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 39983808 G/C 1 28 4 32 13.2059242044178 2.11343939936889 11.0924848050489 C:G G C 10 0.528359849842223 5.15236480100817e-05 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 39983820 G/A 1 30 5 35 14.1492045047333 2.64179924921111 11.5074052555222 A:G G A 10 0.528359849842223 5.92391489534627e-05 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 39983849 G/C 1 61 10 71 28.7700491596244 5.28359849842223 23.4864506612022 C:G G C 10 0.528359849842223 5.94418726491227e-09 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 39987130 T/C 1 26 5 31 12.2626439041022 2.64179924921111 9.62084465489109 T:C T C 10 0.528359849842223 0.000446747297889338 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000521789:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000486304:exon_39987053_39987132:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000460893:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000481693:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000475053:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000495317:exon_39987053_39987142:NT5C3L HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 40734729 A/G 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 A:G A G 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000141699:ENST00000309428:exon_40734692_40734824:FAM134C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 40818451 G/A 1 28 6 34 13.2059242044178 3.17015909905334 10.0357651053644 A:G G A 10 0.528359849842223 0.000452403973640338 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818341_40818502:TUBG2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 40818699 A/G 1 43 17 60 20.2805264567844 8.98211744731779 11.2984090094666 A:G A G 10 0.528359849842223 0.00407863682217096 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818621_40819021:TUBG2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 40822678 C/T 1 8 12 20 3.77312120126222 6.34031819810668 -2.56719699684446 T:C C T 10 0.528359849842223 0.270560515458782 ENSG00000068137:ENST00000293349:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000412503:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000456950:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000445882:exon_40822591_40822723:PLEKHH3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 40849573 G/A 1 7 5 12 3.30148105110444 2.64179924921111 0.659681801893325 A:G G A 10 0.528359849842223 0.778733618574385 ENSG00000108797:ENST00000264638:exon_40849572_40849817:CNTNAP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 40931054 T/C 1 105 109 214 49.5222157665666 57.5912236328023 -8.06900786623572 T:C T C 10 0.528359849842223 0.274027765352801 ENSG00000131475:ENST00000253794:exon_40930975_40931616:VPS25 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 41223094 T/C 1 7 3 10 3.30148105110444 1.58507954952667 1.71640150157777 T:C T C 10 0.528359849842223 0.35163323596596 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000491747:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000478531:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000484087:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493919:exon_41222945_41223255:BRCA1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 41291953 C/G 1 13 3 16 6.1313219520511 1.58507954952667 4.54624240252443 C:G C G 10 0.528359849842223 0.0245197351496243 ENSG00000198496:ENST00000460115:exon_41291833_41292300:NBR2;ENSG00000198496:ENST00000356906:exon_41291833_41292350:NBR2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 42152103 G/A 1 12 7 19 5.65968180189332 3.69851894889556 1.96116285299776 A:G G A 10 0.528359849842223 0.491898728253755 ENSG00000141349:ENST00000269097:exon_42152048_42152138:G6PC3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 42398052 A/G 1 92 77 169 43.3908938145155 40.6837084378512 2.70718537666432 A:G A G 10 0.528359849842223 0.700527231282324 ENSG00000013306:ENST00000225308:exon_42397990_42398099:SLC25A39;ENSG00000013306:ENST00000377095:exon_42397990_42398099:SLC25A39 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 42398802 G/A 1 68 74 142 32.0715302107288 39.0986288883245 -7.02709867759566 A:G G A 10 0.528359849842223 0.240576155017061 ENSG00000013306:ENST00000225308:exon_42398802_42398926:SLC25A39;ENSG00000013306:ENST00000377095:exon_42398802_42398926:SLC25A39 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 42756260 T/C 1 15 7 22 7.07460225236666 3.69851894889556 3.3760833034711 T:C T C 10 0.528359849842223 0.199830145980257 ENSG00000180329:ENST00000315286:exon_42754805_42756411:CCDC43;ENSG00000180329:ENST00000457422:exon_42754805_42756411:CCDC43 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 43183028 G/A 1 120 108 228 56.5968180189332 57.0628637829601 -0.466045764026831 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43182987_43186377:NMT1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 43214804 C/T 1 6 6 12 2.82984090094666 3.17015909905334 -0.340318198106676 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000181513:ENST00000431281:exon_43214735_43214821:ACBD4;ENSG00000181513:ENST00000321854:exon_43214735_43214821:ACBD4;ENSG00000181513:ENST00000428033:exon_43214735_43214821:ACBD4;ENSG00000181513:ENST00000398322:exon_43214735_43214821:ACBD4;ENSG00000181513:ENST00000376955:exon_43214735_43214821:ACBD4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 43316360 G/A 1 6 11 17 2.82984090094666 5.81195834826445 -2.98211744731779 A:G G A 10 0.528359849842223 0.223532760143352 ENSG00000184922:ENST00000328118:exon_43316322_43316432:FMNL1;ENSG00000184922:ENST00000331495:exon_43316322_43316432:FMNL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 43319770 C/T 1 23 14 37 10.8477234536289 7.39703789779112 3.45068555583775 T:C C T 10 0.528359849842223 0.323333341671099 ENSG00000184922:ENST00000328118:exon_43319708_43319832:FMNL1;ENSG00000184922:ENST00000331495:exon_43319708_43319832:FMNL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 43342141 G/C 1 7 4 11 3.30148105110444 2.11343939936889 1.18804165173555 C:G G C 10 0.528359849842223 0.556038959282085 ENSG00000006062:ENST00000344686:exon_43340488_43342167:MAP3K14;ENSG00000006062:ENST00000376926:exon_43340495_43342167:MAP3K14 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 45008570 G/A 1 30 20 50 14.1492045047333 10.5671969968445 3.58200750788885 A:T:G G A 10 0.528359849842223 0.325134118381987 ENSG00000108433:ENST00000225567:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000393456:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000415811:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000439730:exon_45008465_45008573:GOSR2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 45822579 G/A 1 7 7 14 3.30148105110444 3.69851894889556 -0.397037897791122 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000073861:ENST00000177694:exon_45822114_45823485:TBX21 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 45885687 A/G 1 10 15 25 4.71640150157777 7.92539774763334 -3.20899624605557 A:G A G 10 0.528359849842223 0.231576293849315 ENSG00000006025:ENST00000007414:exon_45884733_45885765:OSBPL7;ENSG00000006025:ENST00000392507:exon_45884733_45885765:OSBPL7 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 45885756 C/T 1 11 7 18 5.18804165173555 3.69851894889556 1.48952270283999 T:C C T 10 0.528359849842223 0.63817833418455 ENSG00000006025:ENST00000007414:exon_45884733_45885765:OSBPL7;ENSG00000006025:ENST00000392507:exon_45884733_45885765:OSBPL7 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 45904420 C/T 1 7 8 15 3.30148105110444 4.22687879873778 -0.925397747633344 T:C C T 10 0.528359849842223 0.797109179414283 ENSG00000159111:ENST00000351111:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000290208:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000414011:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000421763:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000466016:exon_45904261_45904570:MRPL10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 45994044 C/T 1 9 1 10 4.24476135141999 0.528359849842223 3.71640150157777 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0234763819888152 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2;ENSG00000167182:ENST00000322172:exon_45993522_45994136:SP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 45994094 T/C 1 12 5 17 5.65968180189332 2.64179924921111 3.01788255268221 T:C T C 10 0.528359849842223 0.154369157381661 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2;ENSG00000167182:ENST00000322172:exon_45993522_45994136:SP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 45994154 G/A 1 5 5 10 2.35820075078889 2.64179924921111 -0.283598498422229 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 46002744 G/T 1 8 10 18 3.77312120126222 5.28359849842223 -1.51047729716001 T:G G T 10 0.528359849842223 0.490179587566891 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_46002714_46002907:SP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 46103760 A/G 1 5 7 12 2.35820075078889 3.69851894889556 -1.34031819810668 A:G A G 10 0.528359849842223 0.56626847898003 ENSG00000005243:ENST00000006101:exon_46103535_46103841:COPZ2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 46198876 G/C 1 33 46 79 15.5641249552066 24.3045530927423 -8.74042813753561 C:G G C 10 0.528359849842223 0.0551430667182121 ENSG00000002919:ENST00000393405:exon_46198597_46200105:SNX11;ENSG00000002919:ENST00000359238:exon_46198597_46200105:SNX11;ENSG00000002919:ENST00000439357:exon_46198597_46200105:SNX11;ENSG00000002919:ENST00000452859:exon_46198597_46200105:SNX11 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 46262171 C/T 1 14 10 24 6.60296210220888 5.28359849842223 1.31936360378665 T:C C T 10 0.528359849842223 0.684580806653448 ENSG00000141293:ENST00000336915:exon_46262085_46262209:SKAP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 46474107 G/A 1 5 4 9 2.35820075078889 2.11343939936889 0.244761351419994 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000141293:ENST00000336915:exon_46474042_46474147:SKAP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 46929908 T/C 1 12 26 38 5.65968180189332 13.7373560958978 -8.07767429400447 T:C T C 10 0.528359849842223 0.00920717769963116 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000513119:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000416445:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000514962:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000514006:exon_46929868_46930220:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000511816:exon_46929868_46930007:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509112:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000506971:exon_46929702_46929990:CALCOCO2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 46939658 C/G 1 56 54 110 26.4118484088355 28.53143189148 -2.11958348264453 C:G C G 10 0.528359849842223 0.703285297851651 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000416445:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000507306:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509784:exon_46939638_46939666:CALCOCO2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 47007963 C/T 1 126 102 228 59.4266589198799 53.8927046839067 5.53395423597316 T:C C T 10 0.528359849842223 0.466606385756406 ENSG00000159210:ENST00000502492:exon_47006678_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509995:exon_47007733_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000290330:exon_47007736_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000514089:exon_47007743_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000515572:exon_47007750_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000504000:exon_47007752_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509989:exon_47007788_47007974:SNF8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 48226811 C/T 1 24 28 52 11.3193636037866 14.7940757955822 -3.47471219179559 T:C C T 10 0.528359849842223 0.404863709236347 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 48539035 T/C 1 5 8 13 2.35820075078889 4.22687879873778 -1.8686780479489 T:C T C 10 0.528359849842223 0.406657390173804 ENSG00000167107:ENST00000510410:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000506582:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48539018_48539047:ACSF2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 48549791 C/G 1 6 5 11 2.82984090094666 2.64179924921111 0.188041651735547 C:G C G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000167107:ENST00000510410:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000508245:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000510262:exon_48549789_48549807:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000512119:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000512537:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000503295:exon_48549492_48549940:ACSF2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 48560883 A/G 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 A:G A G 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000136444:ENST00000509398:exon_48560701_48560896:RSAD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 48628092 A/G 1 7 2 9 3.30148105110444 1.05671969968445 2.24476135141999 A:G A G 10 0.528359849842223 0.186011003558895 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505559:exon_48627897_48628252:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512181:exon_48628069_48628163:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511347:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505656:exon_48628069_48628212:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504265:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515619:exon_48628069_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000508528:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000513618:exon_48627761_48628278:SPATA20 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 48628470 T/A 1 6 3 9 2.82984090094666 1.58507954952667 1.24476135141999 A:T T A 10 0.528359849842223 0.514115714513849 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48628359_48628583:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628359_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504265:exon_48628359_48628745:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515619:exon_48628069_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504271:exon_48628359_48628551:SPATA20 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 49338275 G/A 0 26 0 26 12.2626439041022 0 12.2626439041022 G G 10 0.528359849842223 6.58074432959507e-08 ENSG00000011260:ENST00000225298:exon_49337889_49338287:UTP18 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 55027850 T/C 1 8 10 18 3.77312120126222 5.28359849842223 -1.51047729716001 T:C T C 10 0.528359849842223 0.490179587566891 ENSG00000121058:ENST00000240316:exon_55027250_55028357:COIL HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 55079471 T/C 1 15 12 27 7.07460225236666 6.34031819810668 0.73428405425998 T:C T C 10 0.528359849842223 0.848556223067985 ENSG00000121064:ENST00000262288:exon_55079379_55079542:SCPEP1;ENSG00000121064:ENST00000393142:exon_55079379_55079542:SCPEP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 58031412 A/G 1 7 2 9 3.30148105110444 1.05671969968445 2.24476135141999 A:G A G 10 0.528359849842223 0.186011003558895 ENSG00000189050:ENST00000305783:exon_58031406_58031507:RNFT1;ENSG00000189050:ENST00000482446:exon_58031406_58031507:RNFT1;ENSG00000189050:ENST00000343124:exon_58031406_58031507:RNFT1;ENSG00000189050:ENST00000442346:exon_58031406_58031507:RNFT1;ENSG00000189050:ENST00000466544:exon_58031406_58031507:RNFT1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 61901197 T/A 1 24 47 71 11.3193636037866 24.8329129425845 -13.5135493387978 A:T T A 10 0.528359849842223 0.00178948642604387 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61901177_61901312:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61901177_61901312:FTSJ3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 61903445 G/C 1 9 11 20 4.24476135141999 5.81195834826445 -1.56719699684446 C:G G C 10 0.528359849842223 0.509651795713 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61903416_61903495:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61903416_61903495:FTSJ3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 61908271 C/T 1 235 200 435 110.835435287078 105.671969968445 5.16346531863302 T:C C T 10 0.528359849842223 0.631315860758838 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908169_61908295:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908169_61908295:PSMC5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 61908556 C/T 1 336 315 651 158.471090453013 166.4333527003 -7.96226224728713 T:C C T 10 0.528359849842223 0.555998373461705 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908396_61908586:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908396_61908586:PSMC5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 62007498 A/G 1 103 102 205 48.578935466251 53.8927046839067 -5.3137692176557 A:G A G 10 0.528359849842223 0.484406383655574 ENSG00000007312:ENST00000392795:exon_62007434_62007745:CD79B;ENSG00000007312:ENST00000006750:exon_62007434_62007745:CD79B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 65362552 T/A 1 8 10 18 3.77312120126222 5.28359849842223 -1.51047729716001 A:T T A 10 0.528359849842223 0.490179587566891 ENSG00000197170:ENST00000356126:exon_65362528_65362743:PSMD12;ENSG00000197170:ENST00000357146:exon_65362528_65362721:PSMD12 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 65739627 A/G 1 29 26 55 13.6775643545755 13.7373560958978 -0.0597917413222628 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000130935:ENST00000253247:exon_65739595_65739702:NOL11 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 65988049 T/C 1 9 3 12 4.24476135141999 1.58507954952667 2.65968180189332 T:C T C 10 0.528359849842223 0.153759275498468 ENSG00000186665:ENST00000449250:exon_65987218_65988219:C17orf58;ENSG00000186665:ENST00000334461:exon_65987218_65988219:C17orf58 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 66039350 A/G 1 86 83 169 40.5610529135688 43.8538675369045 -3.29281462333567 A:G A G 10 0.528359849842223 0.64413444201204 ENSG00000182481:ENST00000330459:exon_66039216_66039479:KPNA2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 66246416 A/G 1 26 26 52 12.2626439041022 13.7373560958978 -1.47471219179559 A:G A G 10 0.528359849842223 0.680184256512312 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392721:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66246329_66246611:AMZ2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 66253095 T/A 1 76 65 141 35.8446514119911 34.3433902397445 1.50126117224656 A:T:C T A 10 0.528359849842223 0.866108414683239 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66252955_66253214:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66252955_66253214:AMZ2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 67513003 C/A 1 7 2 9 3.30148105110444 1.05671969968445 2.24476135141999 A:C C A 10 0.528359849842223 0.186011003558895 ENSG00000108984:ENST00000359094:exon_67512996_67513044:MAP2K6;ENSG00000108984:ENST00000435374:exon_67512996_67513044:MAP2K6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 71197748 G/A 1 12 12 24 5.65968180189332 6.34031819810668 -0.680636396213352 A:G G A 10 0.528359849842223 0.839647550159473 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 71232881 G/C 1 3 7 10 1.41492045047333 3.69851894889556 -2.28359849842223 C:G G C 10 0.528359849842223 0.206915350075299 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 72860654 G/A 1 17 16 33 8.01788255268221 8.45375759747557 -0.435875044793358 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000420580:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72860602_72860686:FDXR HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 73038746 T/C 1 49 61 110 23.1103673577311 32.2299508403756 -9.11958348264453 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0859726600909469 ENSG00000167863:ENST00000301587:exon_73038624_73038754:ATP5H;ENSG00000167863:ENST00000344546:exon_73038624_73038754:ATP5H HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 73124974 T/G 1 4 6 10 1.88656060063111 3.17015909905334 -1.28359849842223 T:G T G 10 0.528359849842223 0.531770325189017 ENSG00000125449:ENST00000245543:exon_73124772_73126360:ARMC7 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 73824121 T/C 1 34 51 85 16.0357651053644 26.9463523419534 -10.910587236589 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0219970635513683 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73823310_73824167:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73824079_73824167:UNC13D HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 73827205 T/C 1 24 31 55 11.3193636037866 16.3791553451089 -5.05979174132226 T:C T C 10 0.528359849842223 0.179198214518466 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73827179_73827250:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73827179_73827250:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73827203_73827250:UNC13D HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 73836162 C/G 1 9 10 19 4.24476135141999 5.28359849842223 -1.03883714700224 C:G C G 10 0.528359849842223 0.653351132943168 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73836099_73836191:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73836099_73836191:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73836099_73836191:UNC13D HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 73886888 A/G 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 A:G A G 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000141569:ENST00000269383:exon_73885041_73887428:TRIM65 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 73900688 T/C 1 19 17 36 8.96116285299776 8.98211744731779 -0.0209545943200258 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000204316:ENST00000309352:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000409963:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000477736:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000493104:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000493383:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000461602:exon_73900307_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000464758:exon_73900303_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000410030:exon_73900621_73900800:MRPL38 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 74307737 T/C 1 21 13 34 9.90444315331332 6.8686780479489 3.03576510536442 T:C T C 10 0.528359849842223 0.309257438537999 ENSG00000161542:ENST00000448426:exon_74306868_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000446526:exon_74307014_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000324684:exon_74307015_74307781:PRPSAP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 75483528 C/T 1 54 47 101 25.46856810852 24.8329129425845 0.635655165935482 T:C C T 10 0.528359849842223 0.92091598365984 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75483506_75483634:SEPT9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 75494746 A/G 1 13 24 37 6.1313219520511 12.6806363962134 -6.54931444416225 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0329429774445540 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 75494780 A/T 1 61 49 110 28.7700491596244 25.8896326422689 2.88041651735547 A:T A T 10 0.528359849842223 0.633336273438112 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 76113954 G/A 1 46 47 93 21.6954469072577 24.8329129425845 -3.13746603532674 A:G G A 10 0.528359849842223 0.534395948235668 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76113883_76114016:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76113883_76114016:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76113883_76114016:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392466:exon_76113883_76114016:TMC6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 76120211 G/A 1 8 10 18 3.77312120126222 5.28359849842223 -1.51047729716001 A:G G A 10 0.528359849842223 0.490179587566891 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76120070_76120260:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76120070_76120260:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000306591:exon_76120070_76120260:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76120070_76120260:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000441202:exon_76120070_76120260:TMC6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 76131070 G/A 1 4 7 11 1.88656060063111 3.69851894889556 -1.81195834826445 A:G G A 10 0.528359849842223 0.368338354344120 ENSG00000167895:ENST00000318430:exon_76130951_76131090:TMC8;ENSG00000167895:ENST00000439484:exon_76130951_76131090:TMC8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 76167047 C/T 1 183 215 398 86.3101474788732 113.597367716078 -27.2872202372047 T:C C T 10 0.528359849842223 0.00664972491920939 ENSG00000108639:ENST00000225777:exon_76166898_76167135:SYNGR2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 76988785 G/A 1 10 7 17 4.71640150157777 3.69851894889556 1.01788255268221 A:G G A 10 0.528359849842223 0.80899735416499 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000339300:exon_76987799_76990002:CANT1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 77768654 C/A 1 7 4 11 3.30148105110444 2.11343939936889 1.18804165173555 A:C C A 10 0.528359849842223 0.556038959282085 ENSG00000141570:ENST00000269385:exon_77765931_77769357:CBX8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 78092063 G/A 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78091992_78092156:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78091992_78092156:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78091992_78092156:GAA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 78093133 G/A 1 11 20 31 5.18804165173555 10.5671969968445 -5.37915534510891 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0705612512202543 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78093071_78093678:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78093071_78093678:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78093071_78093678:GAA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 78354661 C/T 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 T:C C T 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78354631_78354787:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78354631_78354787:RNF213 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 79225000 A/G 0 11 0 11 5.18804165173555 0 5.18804165173555 A A 10 0.528359849842223 0.00115270771725888 ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79224673_79225412:SLC38A10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 79478019 G/A 1 3951 3930 7881 1863.45023327338 2076.45420987994 -213.003976606559 A:T:C:G G A 10 0.528359849842223 1.61719165910740e-06 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79477953_79478134:ACTG1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 79511135 A/G 1 14 10 24 6.60296210220888 5.28359849842223 1.31936360378665 A:G A G 10 0.528359849842223 0.684580806653448 ENSG00000185504:ENST00000361039:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79511030_79511146:C17orf70 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 79662067 A/G 1 15 4 19 7.07460225236666 2.11343939936889 4.96116285299776 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0357275109314323 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79661954_79662097:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79661954_79662097:HGS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 79663880 T/C 1 24 15 39 11.3193636037866 7.92539774763334 3.3939658561533 T:C T C 10 0.528359849842223 0.336379893246964 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79663854_79664028:HGS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 79663931 T/C 1 19 14 33 8.96116285299776 7.39703789779112 1.56412495520664 T:C T C 10 0.528359849842223 0.606232866801656 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79663854_79664028:HGS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 79668135 G/T 1 65 50 115 30.6566097602555 26.4179924921111 4.23861726814436 T:G G T 10 0.528359849842223 0.455717416045626 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79668075_79668161:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79668075_79668161:HGS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 79668552 C/T 1 57 64 121 26.8834885589933 33.8150303899023 -6.93154183090898 T:C C T 10 0.528359849842223 0.236412572954049 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79668538_79669143:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79668538_79669149:HGS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 79671714 T/C 1 302 249 551 142.435325347649 131.561602610714 10.8737227369352 T:C T C 10 0.528359849842223 0.370265038365491 ENSG00000183093:ENST00000333676:exon_79671663_79671746:MRPL12;ENSG00000183093:ENST00000332396:exon_79671663_79671746:MRPL12 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 79803101 A/G 1 414 410 824 195.25902216532 216.627538435311 -21.3685162699917 A:C:G A G 10 0.528359849842223 0.142752698923214 ENSG00000185624:ENST00000331483:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000450722:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000436463:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000415593:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000473021:exon_79803020_79803332:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000476482:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000439918:exon_79803043_79803106:P4HB HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 79803433 G/A 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 A:G G A 10 0.528359849842223 0.743278251879842 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 79805134 G/A 1 123 131 254 58.0117384694066 69.2151403293312 -11.2034018599246 A:G G A 10 0.528359849842223 0.166924620224582 ENSG00000185624:ENST00000331483:exon_79805119_79805223:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000450722:exon_79805119_79805223:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000436463:exon_79805119_79805223:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000415593:exon_79805119_79805203:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000439918:exon_79805119_79805206:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000478034:exon_79805119_79805223:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000472244:exon_79805119_79805223:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000484286:exon_79805119_79805724:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000477607:exon_79805119_79805223:P4HB HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 79974731 T/C 1 31 24 55 14.6208446548911 12.6806363962134 1.94020825867774 T:C T C 10 0.528359849842223 0.685815231300223 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79974676_79974745:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79974676_79974745:ASPSCR1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 79991603 C/T 1 13 8 21 6.1313219520511 4.22687879873778 1.90444315331332 T:C C T 10 0.528359849842223 0.513633535609652 ENSG00000169750:ENST00000306897:exon_79991575_79992077:RAC3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 79993919 C/T 1 83 75 158 39.1461324630955 39.6269887381667 -0.480856275071226 T:C C T 10 0.528359849842223 0.936714315326804 ENSG00000169738:ENST00000306869:exon_79993757_79993939:DCXR HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 80006957 A/C 1 5 8 13 2.35820075078889 4.22687879873778 -1.8686780479489 A:C A C 10 0.528359849842223 0.406657390173804 ENSG00000169733:ENST00000310496:exon_80006907_80006992:RFNG HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 80012449 G/A 1 38 42 80 17.9223257059955 22.1911136933734 -4.26878798737783 A:G G A 10 0.528359849842223 0.370950553344917 ENSG00000169727:ENST00000306823:exon_80012374_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392358:exon_80012386_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000320548:exon_80012408_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000355130:exon_80012386_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392357:exon_80011744_80012686:GPS1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 80019207 G/C 1 32 21 53 15.0924848050489 11.0955568466867 3.99692795836218 C:G G C 10 0.528359849842223 0.335582922569488 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80019085_80019229:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80019085_80019229:DUS1L HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 80042792 C/T 1 6 4 10 2.82984090094666 2.11343939936889 0.71640150157777 T:C C T 10 0.528359849842223 0.757839432335683 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80042675_80042829:FASN HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 80059532 T/G 1 48 31 79 22.6387272075733 16.3791553451089 6.25957186246438 T:G T G 10 0.528359849842223 0.176600740452147 ENSG00000176155:ENST00000445854:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000389641:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392347:exon_80059346_80059742:CCDC57 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 80352234 G/A 1 6 13 19 2.82984090094666 6.8686780479489 -4.03883714700224 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0694562925428504 ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80352207_80352419:C17orf101 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 17 81043039 A/G 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000176845:ENST00000320095:exon_81042814_81043199:METRNL HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 658064 G/C 1 9 5 14 4.24476135141999 2.64179924921111 1.60296210220888 C:G G C 10 0.528359849842223 0.434484743557366 ENSG00000176912:ENST00000323813:exon_657842_658340:C18orf56 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 673016 C/T 1 118 126 244 55.6535377186177 66.5733410801201 -10.9198033615024 T:C C T 10 0.528359849842223 0.178017970969389 ENSG00000176890:ENST00000323274:exon_672860_673578:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323250:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323224:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_672557_673076:ENOSF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 9221883 C/G 1 14 4 18 6.60296210220888 2.11343939936889 4.48952270283999 C:G C G 10 0.528359849842223 0.0356558289545135 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9221850_9221997:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9221850_9221997:ANKRD12 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 9254785 C/T 1 58 45 103 27.3551287091511 23.7761932429 3.57893546625104 T:C:G C T 10 0.528359849842223 0.491513460750516 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000359158:exon_9254209_9255428:ANKRD12 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 9255784 C/A 1 75 92 167 35.3730112618333 48.6091061854845 -13.2360949236512 A:C C A 10 0.528359849842223 0.0437504166926157 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000400020:exon_9255630_9255795:ANKRD12 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 9255982 A/G 1 111 97 208 52.3520566675133 51.2509054346956 1.10115123281763 A:G A G 10 0.528359849842223 0.889765369977665 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 11886563 C/G 1 7 8 15 3.30148105110444 4.22687879873778 -0.925397747633344 C:G C G 10 0.528359849842223 0.797109179414283 ENSG00000154889:ENST00000496196:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000309976:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000344987:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000399978:exon_11886498_11886620:MPPE1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 20577669 G/A 1 10 15 25 4.71640150157777 7.92539774763334 -3.20899624605557 A:G G A 10 0.528359849842223 0.231576293849315 ENSG00000101773:ENST00000327155:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000327174:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000360790:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000399725:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000399722:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000399721:exon_20577583_20577697:RBBP8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 47803354 C/T 1 9 8 17 4.24476135141999 4.22687879873778 0.0178825526822095 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000141644:ENST00000353909:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269471:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000424334:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000436910:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000349085:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000347968:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269468:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000457839:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000382948:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000339998:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398495:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398493:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398488:exon_47803202_47803368:MBD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 47810351 A/G 1 45 58 103 21.2238067571 30.6448712908489 -9.42106453374896 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0751785038146504 ENSG00000154832:ENST00000285106:exon_47810264_47810471:CXXC1;ENSG00000154832:ENST00000412036:exon_47810264_47810471:CXXC1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 52895531 T/C 1 28 20 48 13.2059242044178 10.5671969968445 2.6387272075733 T:C T C 10 0.528359849842223 0.472872700098135 ENSG00000196628:ENST00000354452:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000457482:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000356073:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000398339:exon_52895452_52895592:TCF4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 56149048 A/G 1 5 6 11 2.35820075078889 3.17015909905334 -0.811958348264453 A:G A G 10 0.528359849842223 0.765428811190486 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56148479_56149271:ALPK2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 56202768 C/A 1 7 8 15 3.30148105110444 4.22687879873778 -0.925397747633344 A:C C A 10 0.528359849842223 0.797109179414283 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 56202982 A/T 1 7 1 8 3.30148105110444 0.528359849842223 2.77312120126222 A:T A T 10 0.528359849842223 0.073836867977041 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 56203411 G/C 1 20 1 21 9.43280300315554 0.528359849842223 8.90444315331332 C:G G C 10 0.528359849842223 3.34226097310804e-05 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 56203447 A/G 1 15 1 16 7.07460225236666 0.528359849842223 6.54624240252443 A:G A G 10 0.528359849842223 0.00067717223257758 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 56203891 G/T 1 9 7 16 4.24476135141999 3.69851894889556 0.546242402524432 T:G G T 10 0.528359849842223 0.808617085826636 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 56203898 T/G 1 5 6 11 2.35820075078889 3.17015909905334 -0.811958348264453 T:G T G 10 0.528359849842223 0.765428811190486 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 56204250 A/C 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 A:C A C 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 56204671 A/T 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 A:T A T 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 56204747 G/A 1 7 4 11 3.30148105110444 2.11343939936889 1.18804165173555 A:G G A 10 0.528359849842223 0.556038959282085 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 56204932 T/G 0 8 0 8 3.77312120126222 0 3.77312120126222 T T 10 0.528359849842223 0.00852191332774871 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 56204945 C/G 0 10 0 10 4.71640150157777 0 4.71640150157777 C C 10 0.528359849842223 0.00224013880625445 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 56204977 C/T 1 14 1 15 6.60296210220888 0.528359849842223 6.07460225236666 T:C C T 10 0.528359849842223 0.00123091211215962 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 56204991 C/T 1 13 2 15 6.1313219520511 1.05671969968445 5.07460225236666 T:C C T 10 0.528359849842223 0.00874696199680708 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 56205262 A/C 1 10 8 18 4.71640150157777 4.22687879873778 0.489522702839987 A:C A C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 56205481 G/A 1 9 3 12 4.24476135141999 1.58507954952667 2.65968180189332 A:G G A 10 0.528359849842223 0.153759275498468 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 60985773 C/T 1 16 32 48 7.54624240252443 16.9075151949511 -9.3612727924267 T:C C T 10 0.528359849842223 0.00863351709289093 ENSG00000171791:ENST00000398117:exon_60985315_60987361:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000333681:exon_60985315_60986185:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000444484:exon_60985187_60986185:BCL2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 60985879 T/C 1 35 31 66 16.5074052555222 16.3791553451089 0.128249910413285 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000171791:ENST00000398117:exon_60985315_60987361:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000333681:exon_60985315_60986185:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000444484:exon_60985187_60986185:BCL2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 61654329 C/T 1 23 16 39 10.8477234536289 8.45375759747557 2.3939658561533 T:C:G C T 10 0.528359849842223 0.522076593040372 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 67531642 T/C 1 12 16 28 5.65968180189332 8.45375759747557 -2.79407579558224 T:C T C 10 0.528359849842223 0.345302340839643 ENSG00000150637:ENST00000280200:exon_67528097_67531675:CD226 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 67687860 T/C 1 12 6 18 5.65968180189332 3.17015909905334 2.48952270283999 T:C T C 10 0.528359849842223 0.345434571692356 ENSG00000176225:ENST00000255674:exon_67687851_67688053:RTTN;ENSG00000176225:ENST00000454359:exon_67687851_67688053:RTTN HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 72168608 G/A 1 15 12 27 7.07460225236666 6.34031819810668 0.73428405425998 A:G G A 10 0.528359849842223 0.848556223067985 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72168564_72168707:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72168564_72168707:CNDP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 72176083 T/C 1 20 12 32 9.43280300315554 6.34031819810668 3.09248480504887 T:C T C 10 0.528359849842223 0.293376611277297 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72176075_72176163:CNDP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 18 72178161 T/C 1 16 1 17 7.54624240252443 0.528359849842223 7.01788255268221 T:C T C 10 0.528359849842223 0.000371920925506487 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72178048_72178248:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72178048_72178248:CNDP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 518957 C/A 1 24 11 35 11.3193636037866 5.81195834826445 5.5074052555222 A:C C A 10 0.528359849842223 0.0646314996296706 ENSG00000141933:ENST00000388800:exon_518889_519291:C19orf20;ENSG00000141933:ENST00000359315:exon_518889_519653:C19orf20 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 579627 C/T 1 88 175 263 41.5043332138844 92.462973722389 -50.9586405085046 T:C C T 10 0.528359849842223 2.80005726456237e-10 ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000396012:exon_579500_579656:BSG HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 580388 C/G 1 145 229 374 68.3878217728777 120.994405613869 -52.6065838409914 C:G C G 10 0.528359849842223 5.94494704635024e-08 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580379_580461:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580379_580461:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580379_580461:BSG HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 619021 G/C 1 10 7 17 4.71640150157777 3.69851894889556 1.01788255268221 C:G G C 10 0.528359849842223 0.80899735416499 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_618997_619110:POLRMT HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 652238 A/G 1 39 31 70 18.3939658561533 16.3791553451089 2.01481051104439 A:G A G 10 0.528359849842223 0.719767526218434 ENSG00000070423:ENST00000292363:exon_652233_652296:RNF126;ENSG00000070423:ENST00000340092:exon_652233_652296:RNF126 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 805088 G/A 1 25 31 56 11.7910037539444 16.3791553451089 -4.58815159116449 A:G G A 10 0.528359849842223 0.230665067759772 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_805013_805187:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_805013_805187:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_805013_805187:PTBP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 1010396 G/C 1 57 53 110 26.8834885589933 28.0030720416378 -1.11958348264453 C:G G C 10 0.528359849842223 0.848970946034384 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1009650_1010894:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1009650_1010894:C19orf6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 1010406 G/A 1 53 48 101 24.9969279583622 25.3612727924267 -0.364344834064521 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1009650_1010894:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1009650_1010894:C19orf6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 1011338 C/T 1 13 4 17 6.1313219520511 2.11343939936889 4.01788255268221 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0551460585509432 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 1012120 G/A 1 17 22 39 8.01788255268221 11.6239166965289 -3.6060341438467 A:G G A 10 0.528359849842223 0.264789174277522 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1012065_1012187:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1012065_1012187:C19orf6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 1085966 A/G 1 103 116 219 48.578935466251 61.2897425816979 -12.7108071154468 A:C:G A G 10 0.528359849842223 0.0906472480831747 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1085659_1086627:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1085659_1086627:HMHA1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 1244112 C/T 1 436 380 816 205.635105468791 200.776742940045 4.85836252874606 T:C C T 10 0.528359849842223 0.752366695123816 ENSG00000099624:ENST00000395633:exon_1244096_1244184:ATP5D;ENSG00000099624:ENST00000215375:exon_1244096_1244184:ATP5D HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 1272040 T/C 1 248 267 515 116.966757239129 141.072079907874 -24.1053226687448 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0341439404966457 ENSG00000099622:ENST00000320936:exon_1271980_1272050:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000413636:exon_1271980_1272442:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000427032:exon_1271980_1272050:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000444172:exon_1271980_1272442:CIRBP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 1388538 C/T 1 29 31 60 13.6775643545755 16.3791553451089 -2.70159099053338 T:C C T 10 0.528359849842223 0.519314438679369 ENSG00000115286:ENST00000313408:exon_1388524_1388937:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000233627:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000450862:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000414651:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000382445:exon_1388524_1388592:NDUFS7 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 1397443 G/A 1 68 43 111 32.0715302107288 22.7194735432156 9.35205666751325 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0867008692663187 ENSG00000130005:ENST00000252288:exon_1397089_1397498:GAMT;ENSG00000130005:ENST00000455182:exon_1397092_1397498:GAMT HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 1619333 G/A 1 20 12 32 9.43280300315554 6.34031819810668 3.09248480504887 A:G G A 10 0.528359849842223 0.293376611277297 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 1619339 T/C 1 19 15 34 8.96116285299776 7.92539774763334 1.03576510536442 T:C T C 10 0.528359849842223 0.735352506151453 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 1622116 G/A 1 21 19 40 9.90444315331332 10.0388371470022 -0.134393993688917 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1622053_1622222:TCF3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 1827565 A/G 1 2 6 8 0.943280300315554 3.17015909905334 -2.22687879873778 A:G A G 10 0.528359849842223 0.159873274171007 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1826877_1828630:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1826877_1828630:REXO1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 1854557 A/G 1 10 10 20 4.71640150157777 5.28359849842223 -0.567196996844459 A:G A G 10 0.528359849842223 0.826247654639236 ENSG00000129911:ENST00000250916:exon_1852398_1854759:KLF16 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 1912817 C/T 1 12 13 25 5.65968180189332 6.8686780479489 -1.20899624605557 T:C C T 10 0.528359849842223 0.691147811736871 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 1912934 T/C 1 22 14 36 10.3760833034711 7.39703789779112 2.97904540567997 T:C T C 10 0.528359849842223 0.404305772705418 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 1986520 G/A 1 46 35 81 21.6954469072577 18.4925947444778 3.20285216277994 A:G G A 10 0.528359849842223 0.505627445243209 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 1997363 A/G 1 5 6 11 2.35820075078889 3.17015909905334 -0.811958348264453 A:G A G 10 0.528359849842223 0.765428811190486 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1997343_1997462:BTBD2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 2109157 T/C 1 13 18 31 6.1313219520511 9.51047729716001 -3.37915534510891 T:C T C 10 0.528359849842223 0.280569742102825 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2109085_2109206:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2109085_2109206:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2109085_2109206:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2109085_2109206:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2109085_2109206:AP3D1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 2110746 G/A 1 42 20 62 19.8088863066266 10.5671969968445 9.24168930978218 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0215105507703653 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2110706_2110895:AP3D1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 2116649 A/G 1 6 6 12 2.82984090094666 3.17015909905334 -0.340318198106676 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2116604_2116745:AP3D1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 2118692 C/T 1 8 5 13 3.77312120126222 2.64179924921111 1.1313219520511 T:C C T 10 0.528359849842223 0.589076720209571 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2118600_2118831:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2118600_2118831:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2118600_2118831:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2118600_2118831:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2118600_2118831:AP3D1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 2252990 C/G 1 11 4 15 5.18804165173555 2.11343939936889 3.07460225236666 C:G C G 10 0.528359849842223 0.127304492801181 ENSG00000167476:ENST00000300961:exon_2252911_2253002:JSRP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 2427266 G/A 1 194 179 373 91.4981891306088 94.5764131217579 -3.07822399114916 A:G G A 10 0.528359849842223 0.755916647081364 ENSG00000099800:ENST00000215570:exon_2427254_2427322:TIMM13 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 2433890 A/G 1 14 13 27 6.60296210220888 6.8686780479489 -0.26571594574002 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000176619:ENST00000532465:exon_2433824_2433897:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000325327:exon_2433824_2434103:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000490554:exon_2433824_2434103:LMNB2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 2917287 C/A 1 2 7 9 0.943280300315554 3.69851894889556 -2.75523864858001 A:C C A 10 0.528359849842223 0.0939591166432567 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 2917612 T/C 1 4 7 11 1.88656060063111 3.69851894889556 -1.81195834826445 T:C T C 10 0.528359849842223 0.368338354344120 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 3162909 C/T 1 13 9 22 6.1313219520511 4.75523864858001 1.37608330347109 T:C C T 10 0.528359849842223 0.670970373739377 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3162791_3163766:GNA15 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 3544634 T/C 1 60 69 129 28.2984090094666 36.4568296391134 -8.15842062964676 T:C T C 10 0.528359849842223 0.158690954457508 ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3544198_3544730:C19orf28 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 3544725 G/A 1 29 41 70 13.6775643545755 21.6627538435311 -7.98518948895561 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0717712707341532 ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3544198_3544730:C19orf28 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 3982967 G/A 1 230 259 489 108.477234536289 136.845201109136 -28.367966572847 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0111303894166703 ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3982805_3983016:EEF2;ENSG00000167658:ENST00000445244:exon_3982805_3983016:EEF2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 3983184 A/G 1 198 191 389 93.3847497312399 100.916731319865 -7.53198158862473 A:C:G A G 10 0.528359849842223 0.446709237491832 ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3983108_3983289:EEF2;ENSG00000167658:ENST00000445244:exon_3983108_3983289:EEF2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 4013322 T/C 1 8 6 14 3.77312120126222 3.17015909905334 0.602962102208878 T:C T C 10 0.528359849842223 0.795199355745845 ENSG00000105229:ENST00000262971:exon_4012921_4013347:PIAS4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 4028783 C/T 1 4 9 13 1.88656060063111 4.75523864858001 -2.8686780479489 T:C C T 10 0.528359849842223 0.163373721097630 ENSG00000105229:ENST00000262971:exon_4028718_4028846:PIAS4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 4102449 G/A 1 46 51 97 21.6954469072577 26.9463523419534 -5.25090543469563 A:G G A 10 0.528359849842223 0.309676170803525 ENSG00000126934:ENST00000262948:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000394867:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000481271:exon_4102374_4103202:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000443189:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000465472:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000472395:exon_4102374_4102502:MAP2K2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 4325433 G/A 1 4 6 10 1.88656060063111 3.17015909905334 -1.28359849842223 A:G G A 10 0.528359849842223 0.531770325189017 ENSG00000178078:ENST00000424810:exon_4325393_4325542:STAP2;ENSG00000178078:ENST00000314714:exon_4325393_4325542:STAP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 4352959 A/G 1 6 9 15 2.82984090094666 4.75523864858001 -1.92539774763334 A:G A G 10 0.528359849842223 0.439217229441099 ENSG00000008382:ENST00000359935:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262966:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262967:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000429880:exon_4352894_4353026:MPND HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 4847874 A/G 1 31 15 46 14.6208446548911 7.92539774763334 6.69544690725774 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0546275199177374 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4847703_4847902:PLIN3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 5692020 C/A 1 37 83 120 17.4506855558378 43.8538675369045 -26.4031819810668 A:T:C C A 10 0.528359849842223 1.40696720962669e-06 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5691845_5692219:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5691846_5692219:LONP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 5786815 G/A 1 17 8 25 8.01788255268221 4.22687879873778 3.79100375394443 A:G G A 10 0.528359849842223 0.161132514170427 ENSG00000141994:ENST00000320699:exon_5786760_5786856:DUS3L;ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5786760_5786856:DUS3L HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 5917616 G/A 1 33 47 80 15.5641249552066 24.8329129425845 -9.26878798737784 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0434579355063021 ENSG00000031823:ENST00000034275:exon_5916154_5917664:RANBP3;ENSG00000031823:ENST00000340578:exon_5916154_5917664:RANBP3;ENSG00000031823:ENST00000439268:exon_5916154_5917664:RANBP3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 6374813 T/C 1 5 7 12 2.35820075078889 3.69851894889556 -1.34031819810668 T:C T C 10 0.528359849842223 0.56626847898003 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 6477256 G/T 1 9 4 13 4.24476135141999 2.11343939936889 2.1313219520511 T:G G T 10 0.528359849842223 0.276905486309559 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6477229_6477294:DENND1C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 6495736 A/G 1 5 5 10 2.35820075078889 2.64179924921111 -0.283598498422229 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000104833:ENST00000264071:exon_6494331_6496232:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000411712:exon_6495175_6495767:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000412858:exon_6495175_6495861:TUBB4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 6755007 T/C 1 8 11 19 3.77312120126222 5.81195834826445 -2.03883714700224 T:C T C 10 0.528359849842223 0.368087451982495 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6754842_6755326:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6754842_6755326:SH2D3A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 6755155 T/C 1 9 3 12 4.24476135141999 1.58507954952667 2.65968180189332 T:C T C 10 0.528359849842223 0.153759275498468 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6754842_6755326:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6754842_6755326:SH2D3A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 6772872 G/C 1 6 3 9 2.82984090094666 1.58507954952667 1.24476135141999 C:G G C 10 0.528359849842223 0.514115714513849 ENSG00000141968:ENST00000304076:exon_6772722_6773022:VAV1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 7163140 T/G 1 10 6 16 4.71640150157777 3.17015909905334 1.54624240252443 T:G T G 10 0.528359849842223 0.46618456350988 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7163043_7163210:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7163043_7163210:INSR HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 7163154 G/A 1 12 5 17 5.65968180189332 2.64179924921111 3.01788255268221 A:G G A 10 0.528359849842223 0.154369157381661 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7163043_7163210:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7163043_7163210:INSR HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 7166388 G/A 1 11 6 17 5.18804165173555 3.17015909905334 2.01788255268221 A:G G A 10 0.528359849842223 0.467320757987905 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7166165_7166415:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7166165_7166415:INSR HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 7975876 G/A 1 7 2 9 3.30148105110444 1.05671969968445 2.24476135141999 A:G G A 10 0.528359849842223 0.186011003558895 ENSG00000076984:ENST00000397981:exon_7975865_7976044:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000397983:exon_7975865_7976044:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000468058:exon_7975865_7976044:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000397979:exon_7975865_7976044:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000425613:exon_7975865_7976044:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000494348:exon_7975865_7975990:MAP2K7 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 8326866 C/T 1 54 31 85 25.46856810852 16.3791553451089 9.08941276341105 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0507636809056535 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 8326904 G/A 1 52 61 113 24.5252878082044 32.2299508403756 -7.70466303217119 A:T:G G A 10 0.528359849842223 0.157844774710107 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 8326944 G/A 1 44 41 85 20.7521666069422 21.6627538435311 -0.910587236588952 A:G G A 10 0.528359849842223 0.913579238088291 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 8468243 G/A 1 9 12 21 4.24476135141999 6.34031819810668 -2.09555684668668 A:G G A 10 0.528359849842223 0.389033912530957 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 8468337 C/T 1 77 120 197 36.3162915621488 63.4031819810668 -27.0868904189179 T:C C T 10 0.528359849842223 0.000142319234571884 ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 8468485 C/T 1 85 74 159 40.089412763411 39.0986288883245 0.990783875086549 T:C C T 10 0.528359849842223 0.93672209197714 ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 8486884 G/A 1 7 8 15 3.30148105110444 4.22687879873778 -0.925397747633344 A:G G A 10 0.528359849842223 0.797109179414283 ENSG00000099785:ENST00000381035:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000215555:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000393944:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000429675:exon_8486607_8486900:MARCH2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 9721401 A/T 1 15 14 29 7.07460225236666 7.39703789779112 -0.322435645424465 A:T A T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000171469:ENST00000354661:exon_9718003_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000302851:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000424629:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000326044:exon_9720432_9722012:ZNF561 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 9922223 G/A 1 9 7 16 4.24476135141999 3.69851894889556 0.546242402524432 A:G G A 10 0.528359849842223 0.808617085826636 ENSG00000127452:ENST00000247977:exon_9920947_9922393:FBXL12 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 10395683 A/G 1 43 37 80 20.2805264567844 19.5493144441622 0.731212012622166 A:G A G 10 0.528359849842223 0.911122834094348 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000423829:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000444336:exon_10395605_10395685:ICAM1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 10415781 T/C 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000220201:ENST00000403903:exon_10415479_10415884:ZGLP1;ENSG00000220201:ENST00000480726:exon_10415479_10415884:ZGLP1;ENSG00000220201:ENST00000403352:exon_10415751_10415884:ZGLP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 10426628 T/C 1 7 5 12 3.30148105110444 2.64179924921111 0.659681801893325 T:C T C 10 0.528359849842223 0.778733618574385 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426528_10426685:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426528_10426691:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426528_10426672:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426528_10426682:FDX1L HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 10441117 G/A 0 0 8 8 0 4.22687879873778 -4.22687879873778 A G A 10 0.528359849842223 0.00244842131534247 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 10461586 T/C 1 430 390 820 202.805264567844 206.060341438467 -3.25507687062284 T:C T C 10 0.528359849842223 0.833806097015652 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10461205_10461644:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525976:exon_10461209_10461644:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000530220:exon_10461209_10461644:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10461209_10461644:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10461209_10461644:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000530560:exon_10461424_10461644:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529422:exon_10461464_10461969:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524470:exon_10461529_10461644:TYK2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 10600442 G/C 1 12 12 24 5.65968180189332 6.34031819810668 -0.680636396213352 C:G G C 10 0.528359849842223 0.839647550159473 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10600324_10600529:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10600324_10600529:KEAP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 10668383 T/C 1 2 6 8 0.943280300315554 3.17015909905334 -2.22687879873778 T:C T C 10 0.528359849842223 0.159873274171007 ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668228_10668571:KRI1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 10668673 A/G 1 17 15 32 8.01788255268221 7.92539774763334 0.0924848050488656 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10668648_10668736:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668648_10668736:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10668648_10668736:KRI1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 10670184 C/G 1 19 19 38 8.96116285299776 10.0388371470022 -1.07767429400447 C:G C G 10 0.528359849842223 0.747680748664144 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10670035_10670205:KRI1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 10672493 C/T 1 8 11 19 3.77312120126222 5.81195834826445 -2.03883714700224 T:C C T 10 0.528359849842223 0.368087451982495 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000432197:exon_10672467_10672521:KRI1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 10676423 G/A 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 A:G G A 10 0.528359849842223 0.743278251879842 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10676393_10676466:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10676393_10676466:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10676393_10676696:KRI1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 10742170 A/G 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000129353:ENST00000335757:exon_10742151_10742211:SLC44A2;ENSG00000129353:ENST00000380614:exon_10742151_10742211:SLC44A2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 10794630 G/T 1 68 64 132 32.0715302107288 33.8150303899023 -1.74350017917343 T:G G T 10 0.528359849842223 0.793955703299038 ENSG00000129351:ENST00000336059:exon_10794593_10794652:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000449870:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000318511:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000420083:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000407004:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000250241:exon_10794593_10794646:ILF3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 10939792 T/C 1 18 29 47 8.48952270283999 15.3224356454245 -6.83291294258448 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0566706410772743 ENSG00000079805:ENST00000389252:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000389253:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000359692:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000314646:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000355667:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000408974:exon_10939712_10939944:DNM2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 11105608 T/C 1 10 16 26 4.71640150157777 8.45375759747557 -3.7373560958978 T:C T C 10 0.528359849842223 0.170014402542493 ENSG00000127616:ENST00000358026:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000421844:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000429416:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000344626:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000444061:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000450717:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000413806:exon_11105504_11105677:SMARCA4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 11227554 C/T 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 T:C C T 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11227535_11227674:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11227535_11227674:LDLR HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 11227602 C/T 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 T:C C T 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11227535_11227674:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11227535_11227674:LDLR HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 11233941 A/G 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11233850_11234020:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11233850_11234020:LDLR HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 11465316 G/C 1 21 13 34 9.90444315331332 6.8686780479489 3.03576510536442 C:G G C 10 0.528359849842223 0.309257438537999 ENSG00000183401:ENST00000458408:exon_11465256_11465372:CCDC159;ENSG00000183401:ENST00000427879:exon_11465256_11465374:CCDC159 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 11488725 G/A 1 7 6 13 3.30148105110444 3.17015909905334 0.131321952051101 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000187266:ENST00000222139:exon_11488475_11489271:EPOR HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 11558275 G/A 1 93 103 196 43.8625339646733 54.421064533749 -10.5585305690757 A:G G A 10 0.528359849842223 0.133529063666143 ENSG00000130175:ENST00000412601:exon_11558254_11558433:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000252455:exon_11558254_11558412:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000436195:exon_11558254_11558433:PRKCSH HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 12774208 G/C 1 9 5 14 4.24476135141999 2.64179924921111 1.60296210220888 C:G G C 10 0.528359849842223 0.434484743557366 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12774131_12774276:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12774131_12774276:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12774131_12774276:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000462144:exon_12774131_12774232:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000486847:exon_12774122_12774276:MAN2B1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 12780179 G/A 1 178 114 292 83.9519467280843 60.2330228820134 23.7189238460709 A:G G A 10 0.528359849842223 0.00579652623025291 ENSG00000105583:ENST00000222190:exon_12780168_12780465:C19orf56 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 13010520 A/G 1 28 61 89 13.2059242044178 32.2299508403756 -19.0240266359578 A:G A G 10 0.528359849842223 6.76880287045599e-05 ENSG00000105607:ENST00000457854:exon_13010514_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000222214:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000421816:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000422947:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000426001:exon_13010282_13010782:GCDH HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 13220734 G/A 1 35 12 47 16.5074052555222 6.34031819810668 10.1670870574155 A:G G A 10 0.528359849842223 0.00314175821065979 ENSG00000104907:ENST00000437766:exon_13220729_13220815:TRMT1;ENSG00000104907:ENST00000357720:exon_13220729_13220815:TRMT1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 13264398 C/T 1 62 42 104 29.2416893097822 22.1911136933734 7.05057561640881 A:T:C C T 10 0.528359849842223 0.170558421427587 ENSG00000160888:ENST00000292433:exon_13263758_13265716:IER2;ENSG00000160888:ENST00000393152:exon_13263893_13265716:IER2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 13264549 C/T 1 70 54 124 33.0148105110444 28.53143189148 4.48337861956436 T:C C T 10 0.528359849842223 0.47193838131877 ENSG00000160888:ENST00000292433:exon_13263758_13265716:IER2;ENSG00000160888:ENST00000393152:exon_13263893_13265716:IER2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 13885309 C/T 1 81 58 139 38.2028521627799 30.6448712908489 7.55798087193101 T:C C T 10 0.528359849842223 0.203723343612369 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885257_13885388:C19orf53 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 13885484 A/G 1 364 336 700 171.677014657431 177.528909546987 -5.85189488955606 A:G A G 10 0.528359849842223 0.677136841373978 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885466_13885521:C19orf53 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 14581063 A/G 1 111 88 199 52.3520566675133 46.4956667861156 5.85638988139763 A:T:G A G 10 0.528359849842223 0.434988320786149 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14580975_14581117:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14580975_14581117:PKN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 15226970 G/A 1 24 23 47 11.3193636037866 12.1522765463711 -0.83291294258448 A:G G A 10 0.528359849842223 0.884138966354763 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 15227030 G/A 1 27 29 56 12.73428405426 15.3224356454245 -2.58815159116449 A:G G A 10 0.528359849842223 0.505978184331374 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 15229993 A/G 1 12 18 30 5.65968180189332 9.51047729716001 -3.85079549526669 A:G A G 10 0.528359849842223 0.200292236553294 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15229977_15230113:ILVBL HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 15233581 C/A 1 12 17 29 5.65968180189332 8.98211744731779 -3.32243564542447 A:C C A 10 0.528359849842223 0.264981051050274 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15233504_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000531635:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000527093:exon_15233504_15233615:ILVBL HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 15350594 G/A 1 7 9 16 3.30148105110444 4.75523864858001 -1.45375759747557 A:G G A 10 0.528359849842223 0.61804043960613 ENSG00000141867:ENST00000263377:exon_15350470_15350632:BRD4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 15562624 G/A 1 65 74 139 30.6566097602555 39.0986288883245 -8.44201912806899 A:G G A 10 0.528359849842223 0.173846364821460 ENSG00000105122:ENST00000343625:exon_15562438_15562749:RASAL3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 16243002 A/C 1 7 5 12 3.30148105110444 2.64179924921111 0.659681801893325 A:C A C 10 0.528359849842223 0.778733618574385 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 16259623 C/T 1 5 11 16 2.35820075078889 5.81195834826445 -3.45375759747557 T:C C T 10 0.528359849842223 0.130530190247833 ENSG00000196684:ENST00000253680:exon_16259534_16259685:HSH2D;ENSG00000196684:ENST00000397372:exon_16259534_16259685:HSH2D HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 16339715 C/T 1 11 13 24 5.18804165173555 6.8686780479489 -1.68063639621335 T:C C T 10 0.528359849842223 0.543437824899314 ENSG00000072958:ENST00000291439:exon_16339581_16339739:AP1M1;ENSG00000072958:ENST00000444449:exon_16339581_16339739:AP1M1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 17337555 C/A 1 15 3 18 7.07460225236666 1.58507954952667 5.48952270283999 A:C C A 10 0.528359849842223 0.00922208590374973 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337502_17337678:OCEL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 17337871 A/G 1 9 5 14 4.24476135141999 2.64179924921111 1.60296210220888 A:G A G 10 0.528359849842223 0.434484743557366 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 17337882 C/G 1 7 4 11 3.30148105110444 2.11343939936889 1.18804165173555 C:G C G 10 0.528359849842223 0.556038959282085 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 17339112 G/A 1 10 12 22 4.71640150157777 6.34031819810668 -1.62391669652891 A:G G A 10 0.528359849842223 0.527319699445417 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17339065_17339118:OCEL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 17412218 C/T 1 8 3 11 3.77312120126222 1.58507954952667 2.18804165173555 T:C C T 10 0.528359849842223 0.234829965499602 ENSG00000127220:ENST00000247706:exon_17411665_17412433:ABHD8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 18285944 G/A 1 236 175 411 111.307075437235 92.462973722389 18.8441017148464 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0674465553001916 ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18285850_18286032:IFI30 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 18288069 A/G 1 802 827 1629 378.255400426537 436.953595819518 -58.6981953929812 A:G A G 10 0.528359849842223 0.00368210923940409 ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18287950_18288102:IFI30 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 18304700 A/G 1 13 21 34 6.1313219520511 11.0955568466867 -4.96423489463558 A:G A G 10 0.528359849842223 0.120845091405459 ENSG00000254858:ENST00000534421:exon_18304674_18304970:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000417827:exon_18304674_18304828:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000445735:exon_18304674_18304844:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000533807:exon_18304042_18304844:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000532896:exon_18304042_18304844:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000247712:exon_18304674_18304844:AC068499.1;ENSG00000127226:ENST00000534474:exon_18304674_18304833:MPV17L2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 18305824 C/T 1 14 19 33 6.60296210220888 10.0388371470022 -3.43587504479336 T:C C T 10 0.528359849842223 0.295465692465376 ENSG00000254858:ENST00000417827:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000445735:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000533807:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000532896:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000247712:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000127226:ENST00000534474:exon_18305768_18305896:MPV17L2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 18497024 G/C 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 C:G G C 10 0.528359849842223 0.743278251879842 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18496968_18497276:GDF15 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 18679379 C/G 1 48 44 92 22.6387272075733 23.2478333930578 -0.609106185484514 C:G C G 10 0.528359849842223 0.917141487562022 ENSG00000105700:ENST00000222307:exon_18679212_18680176:C19orf50 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 18684563 C/T 0 79 4 83 37.2595718624644 2.11343939936889 35.1461324630955 A:C C A 10 0.528359849842223 2.05571019790986e-17 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 18685964 G/T 1 3451 3221 6672 1627.63015819449 1701.8470763418 -74.2169181473116 A:T:C:G G T 10 0.528359849842223 0.0695504625470733 ENSG00000221983:ENST00000430157:exon_18685867_18688269:UBA52;ENSG00000221983:ENST00000442744:exon_18685867_18688269:UBA52 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 19115172 C/T 1 25 13 38 11.7910037539444 6.8686780479489 4.92232570599553 T:C C T 10 0.528359849842223 0.142798882823016 ENSG00000064607:ENST00000337018:exon_19114977_19115455:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000456085:exon_19114977_19115455:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000452918:exon_19114977_19115455:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000392342:exon_19114977_19115455:SUGP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 19243175 C/T 1 11 6 17 5.18804165173555 3.17015909905334 2.01788255268221 T:C C T 10 0.528359849842223 0.467320757987905 ENSG00000064545:ENST00000162044:exon_19243161_19243317:TMEM161A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 19257383 G/A 1 67 53 120 31.5998900605711 28.0030720416378 3.59681801893325 A:G G A 10 0.528359849842223 0.523583069634957 ENSG00000213999:ENST00000162023:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000409224:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000424583:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000410050:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000414036:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000444486:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000421262:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000409447:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000064489:ENST00000502742:exon_19257364_19257457:AC002126.6;ENSG00000064489:ENST00000354191:exon_19257364_19257457:AC002126.6;ENSG00000064489:ENST00000514819:exon_19257364_19257457:AC002126.6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 19414176 C/A 1 15 8 23 7.07460225236666 4.22687879873778 2.84772345362887 A:C C A 10 0.528359849842223 0.297507531604697 ENSG00000105705:ENST00000247001:exon_19414157_19414257:SUGP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 19606634 G/A 1 3 12 15 1.41492045047333 6.34031819810668 -4.92539774763334 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0168777015247188 ENSG00000167491:ENST00000360315:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000252577:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000429563:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000404158:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000358713:exon_19606563_19606694:GATAD2A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 19740729 C/G 1 137 165 302 64.6147005716155 87.1793752239668 -22.5646746523513 A:C:G C G 10 0.528359849842223 0.00948826310963012 ENSG00000089639:ENST00000203556:exon_19740288_19741145:GMIP;ENSG00000089639:ENST00000445806:exon_19740288_19741145:GMIP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 19745479 C/T 1 35 22 57 16.5074052555222 11.6239166965289 4.88348855899329 T:C C T 10 0.528359849842223 0.232473863878925 ENSG00000089639:ENST00000203556:exon_19745316_19745512:GMIP;ENSG00000089639:ENST00000445806:exon_19745316_19745512:GMIP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 19790159 A/C 1 12 18 30 5.65968180189332 9.51047729716001 -3.85079549526669 A:C A C 10 0.528359849842223 0.200292236553294 ENSG00000181896:ENST00000318110:exon_19789990_19791412:ZNF101;ENSG00000181896:ENST00000415440:exon_19789990_19791412:ZNF101 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 20828522 A/G 1 5 5 10 2.35820075078889 2.64179924921111 -0.283598498422229 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000188171:ENST00000392298:exon_20828490_20828585:ZNF626;ENSG00000188171:ENST00000453075:exon_20828490_20828585:ZNF626;ENSG00000188171:ENST00000291750:exon_20828490_20828585:ZNF626 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 23542697 G/C 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 C:G G C 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 30498452 A/G 1 9 14 23 4.24476135141999 7.39703789779112 -3.15227654637113 A:G A G 10 0.528359849842223 0.213695268661202 ENSG00000105176:ENST00000360605:exon_30498377_30498545:C19orf2;ENSG00000105176:ENST00000392271:exon_30498377_30498545:C19orf2;ENSG00000105176:ENST00000312051:exon_30498377_30498545:C19orf2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 33096816 C/T 1 6 8 14 2.82984090094666 4.22687879873778 -1.39703789779112 T:C C T 10 0.528359849842223 0.594448035256428 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33096741_33096860:ANKRD27 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 33370070 A/G 1 7 7 14 3.30148105110444 3.69851894889556 -0.397037897791122 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33369908_33370284:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33369908_33370284:CCDC123 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 33370084 T/A 1 10 8 18 4.71640150157777 4.22687879873778 0.489522702839987 A:T T A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33369908_33370284:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33369908_33370284:CCDC123 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 33370161 A/C 1 6 4 10 2.82984090094666 2.11343939936889 0.71640150157777 A:C A C 10 0.528359849842223 0.757839432335683 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33369908_33370284:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33369908_33370284:CCDC123 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 33605300 A/G 1 13 1 14 6.1313219520511 0.528359849842223 5.60296210220888 A:G A G 10 0.528359849842223 0.00223305209677928 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33605159_33605325:GPATCH1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 33605312 T/C 1 13 3 16 6.1313219520511 1.58507954952667 4.54624240252443 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0245197351496243 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33605159_33605325:GPATCH1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 33608733 C/A 1 15 3 18 7.07460225236666 1.58507954952667 5.48952270283999 A:C C A 10 0.528359849842223 0.00922208590374973 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33608731_33608947:GPATCH1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 34706531 A/G 1 17 28 45 8.01788255268221 14.7940757955822 -6.77619324290003 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0515887267696382 ENSG00000105216:ENST00000324222:exon_34706501_34706566:LSM14A;ENSG00000105216:ENST00000356258:exon_34706501_34706566:LSM14A;ENSG00000105216:ENST00000433627:exon_34706501_34706566:LSM14A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 34718317 A/G 1 51 61 112 24.0536476580466 32.2299508403756 -8.17630318232897 A:G A G 10 0.528359849842223 0.130269534725123 ENSG00000105216:ENST00000324222:exon_34718270_34720420:LSM14A;ENSG00000105216:ENST00000356258:exon_34718270_34720420:LSM14A;ENSG00000105216:ENST00000433627:exon_34718270_34720420:LSM14A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 34895674 G/T 1 10 3 13 4.71640150157777 1.58507954952667 3.1313219520511 T:G G T 10 0.528359849842223 0.0990276262490944 ENSG00000126249:ENST00000246535:exon_34895554_34895720:PDCD2L HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 35175775 C/T 1 6 6 12 2.82984090094666 3.17015909905334 -0.340318198106676 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000089335:ENST00000457781:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000527499:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505242:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000525595:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000423823:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000221282:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000446502:exon_35175157_35177237:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505365:exon_35175098_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000509196:exon_35175157_35177296:ZNF302 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 35506729 G/A 1 26 7 33 12.2626439041022 3.69851894889556 8.56412495520664 A:C:G G A 10 0.528359849842223 0.00269789903320963 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35506728_35506871:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35506728_35506871:GRAMD1A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 35770064 C/T 1 24 20 44 11.3193636037866 10.5671969968445 0.75216660694219 T:C C T 10 0.528359849842223 0.880608683416714 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 35828619 T/C 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 T:C T C 10 0.528359849842223 0.743278251879842 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 35828773 C/T 1 39 24 63 18.3939658561533 12.6806363962134 5.71332945993995 T:C C T 10 0.528359849842223 0.165774715157198 ENSG00000012124:ENST00000085219:exon_35828658_35828924:CD22;ENSG00000012124:ENST00000419549:exon_35828658_35828924:CD22;ENSG00000012124:ENST00000270311:exon_35828658_35828924:CD22 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 36038390 A/G 1 31 55 86 14.6208446548911 29.0597917413223 -14.4389470864312 A:G A G 10 0.528359849842223 0.00230355118612323 ENSG00000105677:ENST00000392204:exon_36038226_36038397:TMEM147;ENSG00000105677:ENST00000222284:exon_36038226_36038428:TMEM147 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 36431118 C/T 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000126243:ENST00000246529:exon_36430312_36431742:LRFN3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 36594659 A/T 1 21 21 42 9.90444315331332 11.0955568466867 -1.19111369337336 A:T A T 10 0.528359849842223 0.758545099845217 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36594245_36594883:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36594245_36594883:WDR62 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 36595436 A/C 1 11 8 19 5.18804165173555 4.22687879873778 0.961162852997764 A:C A C 10 0.528359849842223 0.819131241753216 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36595420_36595577:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36595420_36595577:WDR62 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 36605647 T/C 1 6 8 14 2.82984090094666 4.22687879873778 -1.39703789779112 T:C T C 10 0.528359849842223 0.594448035256428 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 37038338 A/G 1 3 6 9 1.41492045047333 3.17015909905334 -1.75523864858001 A:G A G 10 0.528359849842223 0.322385551531720 ENSG00000186020:ENST00000396897:exon_37034518_37039224:ZNF529;ENSG00000186020:ENST00000334116:exon_37034518_37039224:ZNF529 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 37038416 T/C 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000186020:ENST00000396897:exon_37034518_37039224:ZNF529;ENSG00000186020:ENST00000334116:exon_37034518_37039224:ZNF529 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 38610504 G/A 1 6 5 11 2.82984090094666 2.64179924921111 0.188041651735547 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000105738:ENST00000222345:exon_38609946_38610522:SIPA1L3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 38798086 T/C 1 83 82 165 39.1461324630955 43.3255076870623 -4.17937522396679 T:C T C 10 0.528359849842223 0.533316650646189 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38798068_38798161:YIF1B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 38800165 C/T 1 30 25 55 14.1492045047333 13.2089962460556 0.940208258677739 T:C C T 10 0.528359849842223 0.892757410613882 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 39086580 A/G 1 56 46 102 26.4118484088355 24.3045530927423 2.10729531609326 A:G A G 10 0.528359849842223 0.692797829848317 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39086579_39086641:MAP4K1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 39086604 T/C 1 57 42 99 26.8834885589933 22.1911136933734 4.69237486561993 T:C T C 10 0.528359849842223 0.366056444315008 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39086579_39086641:MAP4K1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 39096361 G/T 1 48 37 85 22.6387272075733 19.5493144441622 3.08941276341105 T:G G T 10 0.528359849842223 0.516607574190314 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39096208_39096370:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39096208_39096370:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39096208_39096370:MAP4K1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 39098766 G/A 1 19 17 36 8.96116285299776 8.98211744731779 -0.0209545943200258 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39098752_39098810:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39098752_39098810:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39098752_39098810:MAP4K1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 39191323 C/T 1 6 9 15 2.82984090094666 4.75523864858001 -1.92539774763334 T:C C T 10 0.528359849842223 0.439217229441099 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39191240_39191354:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000445727:exon_39191240_39191354:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000424234:exon_39191240_39191344:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39191240_39191354:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000495553:exon_39191240_39191354:ACTN4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 39307103 C/T 1 129 137 266 60.8415793703532 72.3852994283845 -11.5437200580313 T:C C T 10 0.528359849842223 0.158298920677960 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39307093_39307163:ECH1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 39398122 C/T 1 67 44 111 31.5998900605711 23.2478333930578 8.35205666751325 T:C C T 10 0.528359849842223 0.128018622248572 ENSG00000104825:ENST00000313582:exon_39398039_39398299:NFKBIB;ENSG00000104825:ENST00000392079:exon_39398039_39399531:NFKBIB HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 39416887 C/T 1 6 6 12 2.82984090094666 3.17015909905334 -0.340318198106676 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000104835:ENST00000448145:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000221431:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000430193:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000455102:exon_39416845_39416940:FBXO17 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 39423295 C/T 1 123 122 245 58.0117384694066 64.4599016807512 -6.44816321134462 T:C:G C T 10 0.528359849842223 0.442619212509915 ENSG00000128626:ENST00000308018:exon_39422973_39423657:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000402029:exon_39422973_39423657:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000407800:exon_39422973_39423657:MRPS12 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 39913634 G/A 1 6 11 17 2.82984090094666 5.81195834826445 -2.98211744731779 A:G G A 10 0.528359849842223 0.223532760143352 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39913372_39914293:PLEKHG2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 39914748 G/A 1 13 17 30 6.1313219520511 8.98211744731779 -2.85079549526669 A:G G A 10 0.528359849842223 0.36131987801409 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 39915637 G/A 1 19 16 35 8.96116285299776 8.45375759747557 0.507405255522198 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 39915758 C/G 1 25 40 65 11.7910037539444 21.1343939936889 -9.34339023974449 C:G C G 10 0.528359849842223 0.0247135411127029 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 39924129 T/C 1 9 23 32 4.24476135141999 12.1522765463711 -7.90751519495114 T:C T C 10 0.528359849842223 0.00696992725153594 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 39926509 A/C 1 1938 1575 3513 914.038611005772 832.166763501501 81.8718475042708 A:T:C A C 10 0.528359849842223 0.00587000209626878 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 39926521 G/A 1 1871 1520 3391 882.438720945201 803.106971760179 79.331749185022 A:C:G G A 10 0.528359849842223 0.00656681133571514 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 39976232 A/T 1 48 43 91 22.6387272075733 22.7194735432156 -0.0807463356422886 A:T A T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000105197:ENST00000314349:exon_39976184_39976242:TIMM50 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 40030654 G/C 1 8 2 10 3.77312120126222 1.05671969968445 2.71640150157777 C:G G C 10 0.528359849842223 0.11503004681301 ENSG00000176396:ENST00000390658:exon_40028890_40030870:EID2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 40197924 T/C 1 8 12 20 3.77312120126222 6.34031819810668 -2.56719699684446 T:C T C 10 0.528359849842223 0.270560515458782 ENSG00000006659:ENST00000392052:exon_40197818_40198028:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000360675:exon_40197818_40198028:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000392051:exon_40197818_40198028:LGALS14 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 40199914 C/G 1 34 26 60 16.0357651053644 13.7373560958978 2.29840900946662 C:G C G 10 0.528359849842223 0.605987609797116 ENSG00000006659:ENST00000392052:exon_40199837_40200087:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000360675:exon_40199837_40200087:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000392051:exon_40199837_40200087:LGALS14 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 40316835 C/T 1 7 9 16 3.30148105110444 4.75523864858001 -1.45375759747557 T:C C T 10 0.528359849842223 0.61804043960613 ENSG00000105204:ENST00000323039:exon_40316820_40316926:DYRK1B;ENSG00000105204:ENST00000430012:exon_40316820_40316926:DYRK1B;ENSG00000105204:ENST00000348817:exon_40316820_40316926:DYRK1B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 41082868 T/C 1 12 10 22 5.65968180189332 5.28359849842223 0.376083303471095 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000160410:ENST00000291842:exon_41082757_41082891:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000428635:exon_41082790_41082891:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000418276:exon_41082790_41082891:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000446701:exon_41082790_41082891:SHKBP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 41135475 G/A 1 22 16 38 10.3760833034711 8.45375759747557 1.92232570599553 A:G G A 10 0.528359849842223 0.626731773939179 ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41135301_41135725:LTBP4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 41211056 T/C 1 3 6 9 1.41492045047333 3.17015909905334 -1.75523864858001 T:C T C 10 0.528359849842223 0.322385551531720 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41211001_41211086:ADCK4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 41938222 C/T 1 10 16 26 4.71640150157777 8.45375759747557 -3.7373560958978 T:C C T 10 0.528359849842223 0.170014402542493 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41937224_41938313:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41937236_41938313:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41937236_41938313:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000301183:exon_41937236_41938313:ATP5SL HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 42392310 C/T 1 11 10 21 5.18804165173555 5.28359849842223 -0.0955568466866819 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000076928:ENST00000391981:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000347545:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000354532:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000316079:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000337665:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000378152:exon_42392263_42392349:ARHGEF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 42463447 C/T 1 70 114 184 33.0148105110444 60.2330228820134 -27.218212370969 T:C C T 10 0.528359849842223 6.12961945798552e-05 ENSG00000105404:ENST00000222008:exon_42463389_42463528:RABAC1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 44031324 C/T 1 27 16 43 12.73428405426 8.45375759747557 4.28052645678441 T:C C T 10 0.528359849842223 0.222472196071539 ENSG00000105755:ENST00000292147:exon_44031249_44031396:ETHE1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 44055726 T/C 1 5 8 13 2.35820075078889 4.22687879873778 -1.8686780479489 T:C T C 10 0.528359849842223 0.406657390173804 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44055723_44055839:XRCC1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 44057227 T/C 1 21 28 49 9.90444315331332 14.7940757955822 -4.88963264226892 T:C T C 10 0.528359849842223 0.197493207154773 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44057134_44057243:XRCC1;ENSG00000073050:ENST00000458471:exon_44057134_44057243:XRCC1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 44153100 A/G 1 9 6 15 4.24476135141999 3.17015909905334 1.07460225236666 A:G A G 10 0.528359849842223 0.61599879202346 ENSG00000011422:ENST00000340093:exon_44152732_44153295:PLAUR;ENSG00000011422:ENST00000221264:exon_44152732_44153295:PLAUR HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 44611066 T/C 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 T:C T C 10 0.528359849842223 0.743278251879842 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 44611420 A/G 1 9 12 21 4.24476135141999 6.34031819810668 -2.09555684668668 A:G A G 10 0.528359849842223 0.389033912530957 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 44611957 T/C 1 10 10 20 4.71640150157777 5.28359849842223 -0.567196996844459 T:C T C 10 0.528359849842223 0.826247654639236 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 44612005 A/G 1 11 12 23 5.18804165173555 6.34031819810668 -1.15227654637113 A:G A G 10 0.528359849842223 0.679780772383216 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 44612014 A/T 1 13 8 21 6.1313219520511 4.22687879873778 1.90444315331332 A:T A T 10 0.528359849842223 0.513633535609652 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 44612231 A/G 1 14 12 26 6.60296210220888 6.34031819810668 0.262643904102203 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 45395714 T/C 1 53 50 103 24.9969279583622 26.4179924921111 -1.42106453374896 T:C T C 10 0.528359849842223 0.84365526234365 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45395650_45395717:TOMM40 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 45396144 C/T 1 31 28 59 14.6208446548911 14.7940757955822 -0.173231140691154 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45396094_45396186:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45396094_45396186:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45396094_45396186:TOMM40 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 45667207 C/T 1 108 121 229 50.9371362170399 63.931541830909 -12.9944056138691 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0977684371424075 ENSG00000007255:ENST00000006275:exon_45667174_45667267:TRAPPC6A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 45854919 T/G 1 16 13 29 7.54624240252443 6.8686780479489 0.677564354575535 T:G T G 10 0.528359849842223 0.854075321976803 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45854853_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45854853_45854979:ERCC2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 45855524 G/A 1 23 28 51 10.8477234536289 14.7940757955822 -3.94635234195337 A:G G A 10 0.528359849842223 0.326269179876975 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45855467_45855610:ERCC2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 45867259 C/T 1 23 12 35 10.8477234536289 6.34031819810668 4.5074052555222 T:C C T 10 0.528359849842223 0.131859650779055 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45867244_45867377:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45867244_45867377:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45867244_45867377:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45867244_45867377:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45867244_45867377:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45867244_45867377:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391940:exon_45867244_45867377:ERCC2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 45912002 A/C 1 14 11 25 6.60296210220888 5.81195834826445 0.791003753944426 A:C A C 10 0.528359849842223 0.84244030516468 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 45912343 A/G 1 28 16 44 13.2059242044178 8.45375759747557 4.75216660694219 A:G A G 10 0.528359849842223 0.174782422681267 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 45912406 G/A 1 20 21 41 9.43280300315554 11.0955568466867 -1.66275384353114 A:G G A 10 0.528359849842223 0.64097476320802 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 45923653 A/G 1 38 32 70 17.9223257059955 16.9075151949511 1.0148105110444 A:G A G 10 0.528359849842223 0.904821084858741 ENSG00000012061:ENST00000300853:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000340192:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000428893:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000013807:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000391935:exon_45923582_45923685:ERCC1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 46124517 C/T 1 16 8 24 7.54624240252443 4.22687879873778 3.31936360378665 T:C C T 10 0.528359849842223 0.220638511719371 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46124465_46124590:EML2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 46129999 C/A 1 5 10 15 2.35820075078889 5.28359849842223 -2.92539774763334 A:C C A 10 0.528359849842223 0.194650532535346 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46129963_46130097:EML2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 46206262 G/A 1 37 31 68 17.4506855558378 16.3791553451089 1.07153021072884 A:G G A 10 0.528359849842223 0.809422454797467 ENSG00000011478:ENST00000012049:exon_46206162_46206586:QPCTL HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 46268902 C/T 1 6 5 11 2.82984090094666 2.64179924921111 0.188041651735547 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 46269076 G/A 1 9 1 10 4.24476135141999 0.528359849842223 3.71640150157777 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0234763819888152 ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 46327053 C/T 1 20 17 37 9.43280300315554 8.98211744731779 0.450685555837751 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46327025_46327133:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46327025_46327133:SYMPK HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 46330809 G/A 1 30 35 65 14.1492045047333 18.4925947444778 -4.34339023974449 A:G G A 10 0.528359849842223 0.320573854747951 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46330768_46330881:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46330768_46330881:SYMPK HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 46387941 G/A 1 18 18 36 8.48952270283999 9.51047729716001 -1.02095459432003 A:G G A 10 0.528359849842223 0.74180339875181 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 46394187 C/T 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 T:C C T 10 0.528359849842223 0.743278251879842 ENSG00000176182:ENST00000322217:exon_46393285_46394581:MYPOP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 46518651 A/G 1 11 16 27 5.18804165173555 8.45375759747557 -3.26571594574002 A:G A G 10 0.528359849842223 0.248661671527112 ENSG00000104983:ENST00000263284:exon_46518603_46518685:CCDC61 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 46518682 G/A 1 13 17 30 6.1313219520511 8.98211744731779 -2.85079549526669 A:G G A 10 0.528359849842223 0.36131987801409 ENSG00000104983:ENST00000263284:exon_46518603_46518685:CCDC61 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 46857015 C/T 1 15 15 30 7.07460225236666 7.92539774763334 -0.850795495266688 T:C C T 10 0.528359849842223 0.855436110683853 ENSG00000011485:ENST00000012443:exon_46857005_46857246:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000451918:exon_46857005_46857164:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000478046:exon_46857005_46857246:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000391919:exon_46857005_46857246:PPP5C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 47223949 G/A 1 23 17 40 10.8477234536289 8.98211744731779 1.86560600631108 A:G G A 10 0.528359849842223 0.635707427315866 ENSG00000090372:ENST00000391910:exon_47223793_47224028:STRN4;ENSG00000090372:ENST00000263280:exon_47223793_47224028:STRN4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 47278859 C/G 1 102 105 207 48.1072953160933 55.4777842334334 -7.37048891734015 C:G C G 10 0.528359849842223 0.329805496075668 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47278140_47279004:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47278140_47279004:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47278142_47279004:SLC1A5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 47761646 G/C 1 8 11 19 3.77312120126222 5.81195834826445 -2.03883714700224 C:G G C 10 0.528359849842223 0.368087451982495 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47761587_47761660:CCDC9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 47768128 G/C 1 10 8 18 4.71640150157777 4.22687879873778 0.489522702839987 C:G G C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47768030_47768203:CCDC9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 47770015 A/C 1 19 8 27 8.96116285299776 4.22687879873778 4.73428405425998 A:C A C 10 0.528359849842223 0.0824690479347734 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47769868_47770049:CCDC9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 47774772 T/C 1 36 11 47 16.97904540568 5.81195834826445 11.1670870574155 A:T:C T C 10 0.528359849842223 0.00110612123076847 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47774531_47775208:CCDC9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 48248834 T/C 1 312 259 571 147.151726849226 136.845201109136 10.3065257400907 A:T:C:G T C 10 0.528359849842223 0.401945187472269 ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48248808_48249040:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48248808_48249040:GLTSCR2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 48254334 C/T 1 397 359 756 187.241139612637 189.681186093358 -2.44004648072055 T:C:G C T 10 0.528359849842223 0.884160402055554 ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48254165_48254364:GLTSCR2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 48551546 A/T 1 4 6 10 1.88656060063111 3.17015909905334 -1.28359849842223 A:T A T 10 0.528359849842223 0.531770325189017 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48551104_48551645:PLA2G4C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 48621036 C/G 1 22 12 34 10.3760833034711 6.34031819810668 4.03576510536442 C:G C G 10 0.528359849842223 0.174159678840555 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48620895_48621038:LIG1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 48622427 A/G 1 24 12 36 11.3193636037866 6.34031819810668 4.97904540567997 A:G A G 10 0.528359849842223 0.131869325610955 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48622394_48622447:LIG1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 49132634 G/A 1 10 11 21 4.71640150157777 5.81195834826445 -1.09555684668668 A:G G A 10 0.528359849842223 0.667251391828987 ENSG00000063176:ENST00000406269:exon_49131938_49133661:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000245222:exon_49131938_49133661:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000340932:exon_49132118_49133030:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000443164:exon_49131938_49132983:SPHK2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 49376582 G/A 1 21 35 56 9.90444315331332 18.4925947444778 -8.58815159116448 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0229433262683954 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 49377086 T/C 1 84 107 191 39.6177726132533 56.5345039331179 -16.9167313198646 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0165595178009797 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 49377242 G/C 1 131 113 244 61.7848596706688 59.7046630321712 2.0801966384976 C:G G C 10 0.528359849842223 0.797962798879557 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 49377319 A/G 1 116 117 233 54.7102574183021 61.8181024315401 -7.10784501323795 A:G A G 10 0.528359849842223 0.358875312668473 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 49377436 G/C 1 109 124 233 51.4087763671977 65.5166213804357 -14.107845013238 T:C:G G C 10 0.528359849842223 0.0662994188673484 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 49378994 A/G 1 127 118 245 59.8982990700377 62.3464622813823 -2.44816321134462 A:C:G A G 10 0.528359849842223 0.798042920672713 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 49379167 C/T 1 162 168 330 76.4057043255599 88.7644547734935 -12.3587504479336 T:C C T 10 0.528359849842223 0.185699783824249 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 49379182 G/C 1 147 125 272 69.3311020731932 66.0449812302779 3.28612084291535 C:G G C 10 0.528359849842223 0.715754698655927 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 49469087 T/C 1 1408 1410 2818 664.06933142215 744.987388277534 -80.9180568553843 T:C:G T C 10 0.528359849842223 0.00237781656205715 ENSG00000087086:ENST00000331825:exon_49469027_49469173:FTL HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 49485548 G/A 1 5 4 9 2.35820075078889 2.11343939936889 0.244761351419994 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000104812:ENST00000323798:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000263276:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000484289:exon_49485512_49485632:GYS1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 49950298 C/T 1 73 73 146 34.4297309615177 38.5702690384823 -4.14053807696455 T:C C T 10 0.528359849842223 0.508020886036131 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49950281_49950356:PIH1D1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 49950356 C/G 1 63 87 150 29.71332945994 45.9673069362734 -16.2539774763334 C:G C G 10 0.528359849842223 0.00872030307864607 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49950281_49950356:PIH1D1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 49954803 C/T 1 80 45 125 37.7312120126222 23.7761932429 13.9550187697221 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0152315952656565 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 49954807 T/G 1 72 40 112 33.9580908113599 21.1343939936889 12.823696817671 T:G T G 10 0.528359849842223 0.0176265037437191 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 49967680 G/A 1 10 9 19 4.71640150157777 4.75523864858001 -0.0388371470022362 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49967674_49967779:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49967674_49967779:ALDH16A1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 49983673 C/T 1 7 7 14 3.30148105110444 3.69851894889556 -0.397037897791122 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000090554:ENST00000204637:exon_49983555_49983733:FLT3LG;ENSG00000090554:ENST00000436815:exon_49983555_49983733:FLT3LG HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 49994470 T/A 1 5 5 10 2.35820075078889 2.64179924921111 -0.283598498422229 A:T T A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000142541:ENST00000488946:exon_49993107_49994804:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000472481:exon_49994036_49994485:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476268:exon_49993104_49994523:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000468655:exon_49994297_49994483:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476300:exon_49994297_49994804:RPL13A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 49994476 T/C 1 5 6 11 2.35820075078889 3.17015909905334 -0.811958348264453 T:C T C 10 0.528359849842223 0.765428811190486 ENSG00000142541:ENST00000488946:exon_49993107_49994804:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000472481:exon_49994036_49994485:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476268:exon_49993104_49994523:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000468655:exon_49994297_49994483:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476300:exon_49994297_49994804:RPL13A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 50017724 C/T 1 2 9 11 0.943280300315554 4.75523864858001 -3.81195834826445 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0308448779834246 ENSG00000104870:ENST00000221466:exon_50017468_50017743:FCGRT;ENSG00000104870:ENST00000426395:exon_50017468_50017743:FCGRT;ENSG00000104870:ENST00000415900:exon_50017697_50017743:FCGRT;ENSG00000104870:ENST00000452439:exon_50017468_50017743:FCGRT HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 50059982 C/G 1 137 111 248 64.6147005716155 58.6479433324867 5.96675723912871 C:G C G 10 0.528359849842223 0.484245554707148 ENSG00000142546:ENST00000339093:exon_50059806_50059993:NOSIP;ENSG00000142546:ENST00000391853:exon_50059806_50059993:NOSIP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 50162909 C/G 1 181 149 330 85.3668671785576 78.7256176264912 6.64124955206643 A:C:G C G 10 0.528359849842223 0.473955308111837 ENSG00000126456:ENST00000377139:exon_50162829_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000377135:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000309877:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000442265:exon_50162830_50163090:IRF3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 50162953 C/T 1 145 126 271 68.3878217728777 66.5733410801201 1.81448069275758 T:C C T 10 0.528359849842223 0.855256628812272 ENSG00000126456:ENST00000377139:exon_50162829_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000377135:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000309877:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000442265:exon_50162830_50163090:IRF3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 50367445 C/T 1 13 15 28 6.1313219520511 7.92539774763334 -1.79407579558224 T:C C T 10 0.528359849842223 0.57182784530717 ENSG00000039650:ENST00000322344:exon_50367436_50367493:PNKP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 50965272 T/C 1 1 8 9 0.471640150157777 4.22687879873778 -3.75523864858001 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0160065907912342 ENSG00000086967:ENST00000357701:exon_50965157_50965293:MYBPC2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 50967640 G/A 1 2 7 9 0.943280300315554 3.69851894889556 -2.75523864858001 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0939591166432567 ENSG00000086967:ENST00000357701:exon_50967603_50967789:MYBPC2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 50983930 C/T 1 30 21 51 14.1492045047333 11.0955568466867 3.05364765804663 T:C C T 10 0.528359849842223 0.404317121307017 ENSG00000161671:ENST00000430752:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376920:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000334976:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376918:exon_50983838_50984019:C19orf63 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 51323232 T/C 1 77 124 201 36.3162915621488 65.5166213804357 -29.2003298182868 T:C T C 10 0.528359849842223 3.83137106238679e-05 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323155_51323291:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323155_51323291:KLK1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 51323473 C/G 1 57 64 121 26.8834885589933 33.8150303899023 -6.93154183090898 C:G C G 10 0.528359849842223 0.236412572954049 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 51323501 A/G 1 49 62 111 23.1103673577311 32.7583106902178 -9.64794333248675 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0710288100888578 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 51379893 C/T 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000167751:ENST00000325321:exon_51379728_51380014:KLK2;ENSG00000167751:ENST00000358049:exon_51379728_51380014:KLK2;ENSG00000167751:ENST00000423722:exon_51379728_51380014:KLK2;ENSG00000167751:ENST00000391810:exon_51379728_51380014:KLK2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 51850290 G/A 1 78 81 159 36.7879317123066 42.7971478372201 -6.00921612491345 A:G G A 10 0.528359849842223 0.341860198290287 ENSG00000105379:ENST00000309244:exon_51850154_51850312:ETFB;ENSG00000105379:ENST00000354232:exon_51850154_51850312:ETFB HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 52448669 G/C 1 2 6 8 0.943280300315554 3.17015909905334 -2.22687879873778 C:G G C 10 0.528359849842223 0.159873274171007 ENSG00000176024:ENST00000391794:exon_52447372_52449005:ZNF613;ENSG00000176024:ENST00000293471:exon_52447372_52449005:ZNF613 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 53117531 C/T 1 7 15 22 3.30148105110444 7.92539774763334 -4.62391669652891 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0553869729753656 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53117014_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53117014_53118056:ZNF83 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 54080067 T/C 0 10 0 10 4.71640150157777 0 4.71640150157777 T T 10 0.528359849842223 0.00224013880625445 ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000514374:exon_54079951_54080113:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000509047:exon_54079951_54080074:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511567:exon_54079951_54080129:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000514022:exon_54079951_54080314:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513265:exon_54079951_54080107:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000505949:exon_54079951_54080346:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000502616:exon_54079951_54080071:ZNF331 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 54697079 C/T 1 59 43 102 27.8267688593088 22.7194735432156 5.10729531609326 T:C:G C T 10 0.528359849842223 0.322938724828851 ENSG00000170892:ENST00000302937:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000496583:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396383:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396388:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000429671:exon_54697030_54697173:TSEN34 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 54710154 G/C 1 1151 1189 2340 542.857812831601 628.219861462403 -85.3620486308017 A:T:C:G G C 10 0.528359849842223 0.000429494836857054 ENSG00000170889:ENST00000302907:exon_54710144_54710330:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000484121:exon_54710144_54710715:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000455593:exon_54710144_54710330:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000436445:exon_54710144_54710330:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000391752:exon_54710144_54710330:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000402367:exon_54710144_54710330:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000445961:exon_54710144_54710330:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000495002:exon_54710144_54710592:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000391753:exon_54710144_54710330:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000441429:exon_54710144_54711498:RPS9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 54969169 C/T 1 27 30 57 12.73428405426 15.8507954952667 -3.11651144100671 T:C C T 10 0.528359849842223 0.428389705751813 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54969113_54969181:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54969113_54969181:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54969113_54969181:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54969113_54969181:LENG8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 54973280 C/G 1 16 12 28 7.54624240252443 6.34031819810668 1.20592420441776 C:G C G 10 0.528359849842223 0.707781354301213 ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 55086775 C/T 1 2 8 10 0.943280300315554 4.22687879873778 -3.28359849842223 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0542343953774601 ENSG00000239998:ENST00000439534:exon_55086723_55087019:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000251377:exon_55086723_55087019:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000391738:exon_55086723_55087019:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000251376:exon_55086723_55087019:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000391737:exon_55086723_55087019:LILRA2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 55176262 A/G 1 15 14 29 7.07460225236666 7.39703789779112 -0.322435645424465 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55176250_55176300:LILRB4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 55178162 A/G 1 50 26 76 23.5820075078889 13.7373560958978 9.84465141199106 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0284457964191018 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000484241:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000470943:exon_55178145_55178841:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000461262:exon_55178148_55178489:LILRB4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 55179364 A/G 1 40 78 118 18.8656060063111 41.2120682876934 -22.3464622813823 A:G A G 10 0.528359849842223 4.16999433833879e-05 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55179324_55181810:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55179324_55179844:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55179324_55179855:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55179324_55179848:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55179324_55179848:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55179324_55179848:LILRB4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 55485899 G/A 1 1 14 15 0.471640150157777 7.39703789779112 -6.92539774763334 A:G G A 10 0.528359849842223 0.000296110740071189 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55485868_55485912:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55485868_55485912:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55485868_55485912:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55485868_55485912:NLRP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 55493728 C/T 1 20 7 27 9.43280300315554 3.69851894889556 5.73428405425998 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0328385215076746 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 55493847 C/T 1 20 3 23 9.43280300315554 1.58507954952667 7.84772345362887 T:C C T 10 0.528359849842223 0.00115096307780593 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 55512232 C/A 1 16 111 127 7.54624240252443 58.6479433324867 -51.1017009299623 A:C C A 10 0.528359849842223 2.51504882323984e-21 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 55512316 T/G 1 22 75 97 10.3760833034711 39.6269887381667 -29.2509054346956 T:G T G 10 0.528359849842223 2.17823318164803e-09 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 55559715 G/A 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 A:G G A 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55559697_55559909:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55559697_55559909:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55559697_55559909:RDH13 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 55560106 G/A 1 6 4 10 2.82984090094666 2.11343939936889 0.71640150157777 A:G G A 10 0.528359849842223 0.757839432335683 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55560027_55560131:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55560027_55560131:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55560027_55560131:RDH13 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 55751238 A/C 1 54 60 114 25.46856810852 31.7015909905334 -6.23302288201342 A:C A C 10 0.528359849842223 0.260716832377691 ENSG00000105063:ENST00000443936:exon_55751194_55751279:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000327021:exon_55751194_55751279:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000412770:exon_55751194_55751279:PPP6R1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 55753536 C/A 1 17 18 35 8.01788255268221 9.51047729716001 -1.4925947444778 A:C C A 10 0.528359849842223 0.616789910783587 ENSG00000105063:ENST00000443936:exon_55753534_55753647:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000327021:exon_55753534_55753647:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000412770:exon_55753534_55753647:PPP6R1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 55756992 A/G 1 17 11 28 8.01788255268221 5.81195834826445 2.20592420441776 A:G A G 10 0.528359849842223 0.452810588997136 ENSG00000105063:ENST00000443936:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000327021:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000412770:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000444538:exon_55756860_55757046:PPP6R1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 55899602 C/T 1 5 6 11 2.35820075078889 3.17015909905334 -0.811958348264453 T:C C T 10 0.528359849842223 0.765428811190486 ENSG00000108107:ENST00000426763:exon_55899298_55903449:RPL28 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 55994240 C/T 1 9 6 15 4.24476135141999 3.17015909905334 1.07460225236666 T:C C T 10 0.528359849842223 0.61599879202346 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 56090076 G/T 1 14 17 31 6.60296210220888 8.98211744731779 -2.37915534510891 T:G G T 10 0.528359849842223 0.472662474431109 ENSG00000218891:ENST00000325421:exon_56088893_56091007:ZNF579 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 56114045 C/T 1 29 18 47 13.6775643545755 9.51047729716001 4.16708705741552 T:C C T 10 0.528359849842223 0.244626330111475 ENSG00000171443:ENST00000301073:exon_56113441_56114504:ZNF524 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 57931303 C/A 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 A:C C A 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000186272:ENST00000307658:exon_57931003_57933307:ZNF17;ENSG00000186272:ENST00000449441:exon_57931003_57933307:ZNF17 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 58018618 A/G 1 1 9 10 0.471640150157777 4.75523864858001 -4.28359849842223 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0083414999051374 ENSG00000152439:ENST00000282292:exon_58017726_58019508:ZNF773;ENSG00000152439:ENST00000430084:exon_58017726_58019508:ZNF773 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 58132106 A/C 1 3 9 12 1.41492045047333 4.75523864858001 -3.34031819810668 A:C A C 10 0.528359849842223 0.0796925302844448 ENSG00000213762:ENST00000396161:exon_58131528_58134372:ZNF134 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 58152795 C/T 1 6 3 9 2.82984090094666 1.58507954952667 1.24476135141999 T:C C T 10 0.528359849842223 0.514115714513849 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 58152817 G/C 1 8 4 12 3.77312120126222 2.11343939936889 1.65968180189332 C:G G C 10 0.528359849842223 0.396971345501871 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 58153000 T/C 1 12 3 15 5.65968180189332 1.58507954952667 4.07460225236666 T:C T C 10 0.528359849842223 0.039472132090448 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 58153009 C/T 1 13 6 19 6.1313219520511 3.17015909905334 2.96116285299776 T:C C T 10 0.528359849842223 0.250170755672362 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 58153577 T/C 1 7 8 15 3.30148105110444 4.22687879873778 -0.925397747633344 T:C T C 10 0.528359849842223 0.797109179414283 ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 58231807 A/G 1 3 12 15 1.41492045047333 6.34031819810668 -4.92539774763334 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0168777015247188 ENSG00000083814:ENST00000317398:exon_58231120_58233065:ZNF671;ENSG00000083814:ENST00000335820:exon_58231782_58231850:ZNF671 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 58773815 C/T 1 16 18 34 7.54624240252443 9.51047729716001 -1.96423489463558 T:C C T 10 0.528359849842223 0.607001800802704 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000441758:exon_58773743_58774120:ZNF544 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 58774071 A/G 1 32 19 51 15.0924848050489 10.0388371470022 5.05364765804663 A:G A G 10 0.528359849842223 0.163531305813739 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000441758:exon_58773743_58774120:ZNF544 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 58928786 A/G 1 11 8 19 5.18804165173555 4.22687879873778 0.961162852997764 A:G A G 10 0.528359849842223 0.819131241753216 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000354635:exon_58928309_58929110:ZNF584 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 58929052 G/A 1 16 13 29 7.54624240252443 6.8686780479489 0.677564354575535 A:G G A 10 0.528359849842223 0.854075321976803 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000354635:exon_58928309_58929110:ZNF584 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 58929136 G/A 1 14 5 19 6.60296210220888 2.64179924921111 3.96116285299776 A:G G A 10 0.528359849842223 0.105313476648990 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 19 58929194 A/G 1 16 15 31 7.54624240252443 7.92539774763334 -0.379155345108911 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 272203 C/T 1 4 6 10 1.88656060063111 3.17015909905334 -1.28359849842223 T:C C T 10 0.528359849842223 0.531770325189017 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000407983:exon_272037_272557:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000439645:exon_272192_272630:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405364:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405233:exon_272192_273155:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_272192_272305:ACP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 277003 A/G 1 100 137 237 47.1640150157777 72.3852994283845 -25.2212844126068 A:G A G 10 0.528359849842223 0.00111096586882151 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000442386:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000484464:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000463831:exon_276980_277085:ACP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 3392075 T/C 1 16 13 29 7.54624240252443 6.8686780479489 0.677564354575535 T:C T C 10 0.528359849842223 0.854075321976803 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 3392295 A/G 1 18 13 31 8.48952270283999 6.8686780479489 1.62084465489109 A:G A G 10 0.528359849842223 0.594022867419225 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 3483205 C/T 1 89 64 153 41.9759733640422 33.8150303899023 8.16094297413989 T:C C T 10 0.528359849842223 0.19566710709737 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3482990_3483342:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469400:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000493792:exon_3482990_3483336:TTC15 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 3597974 T/C 1 13 7 20 6.1313219520511 3.69851894889556 2.43280300315554 T:C T C 10 0.528359849842223 0.371201911365638 ENSG00000171865:ENST00000436842:exon_3597963_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000315212:exon_3597963_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000464986:exon_3597714_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000454734:exon_3597964_3598062:RNASEH1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 3628383 C/A 1 14 12 26 6.60296210220888 6.34031819810668 0.262643904102203 A:C C A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000171863:ENST00000481006:exon_3623407_3628508:RPS7 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 10930903 T/C 1 52 49 101 24.5252878082044 25.8896326422689 -1.36434483406452 T:C T C 10 0.528359849842223 0.842165136600927 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10930845_10930959:PDIA6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 10933249 C/T 1 51 35 86 24.0536476580466 18.4925947444778 5.56105291356883 T:C C T 10 0.528359849842223 0.236866464173864 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10933222_10933328:PDIA6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 10942687 C/T 1 6 5 11 2.82984090094666 2.64179924921111 0.188041651735547 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000489662:exon_10942625_10942766:PDIA6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 24432839 A/G 1 5 5 10 2.35820075078889 2.64179924921111 -0.283598498422229 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000479575:exon_24432687_24433198:ITSN2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 25046090 T/C 1 17 19 36 8.01788255268221 10.0388371470022 -2.02095459432003 T:C T C 10 0.528359849842223 0.509691879371529 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000485887:exon_25046078_25046232:ADCY3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 25050977 T/C 1 3 10 13 1.41492045047333 5.28359849842223 -3.8686780479489 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0481535635556358 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000455323:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000450524:exon_25050771_25051030:ADCY3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 27423279 A/G 1 12 17 29 5.65968180189332 8.98211744731779 -3.32243564542447 A:G A G 10 0.528359849842223 0.264981051050274 ENSG00000138074:ENST00000461757:exon_27422455_27423447:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000310574:exon_27422455_27423447:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000488743:exon_27422973_27423447:SLC5A6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 27466368 C/T 1 91 80 171 42.9192536643577 42.2687879873778 0.650465676979877 T:C C T 10 0.528359849842223 0.939076536188521 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27466284_27466660:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27466284_27466653:CAD;ENSG00000084774:ENST00000428460:exon_27466284_27466458:CAD HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 32983526 C/T 1 8 1 9 3.77312120126222 0.528359849842223 3.24476135141999 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0417871149536542 ENSG00000018699:ENST00000317907:exon_32983359_32983586:TTC27;ENSG00000018699:ENST00000433416:exon_32983359_32983586:TTC27 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 42990336 T/G 1 4 9 13 1.88656060063111 4.75523864858001 -2.8686780479489 T:G T G 10 0.528359849842223 0.163373721097630 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 44004010 T/C 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 T:C T C 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000330811:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000496980:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000406852:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000479242:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000398823:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000462426:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000378587:exon_44003962_44004038:DYNC2LI1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 44036922 T/C 1 20 16 36 9.43280300315554 8.45375759747557 0.979045405679974 T:C T C 10 0.528359849842223 0.86774215603001 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 46986416 A/G 1 5 8 13 2.35820075078889 4.22687879873778 -1.8686780479489 A:G A G 10 0.528359849842223 0.406657390173804 ENSG00000171150:ENST00000306503:exon_46985658_46990268:SOCS5;ENSG00000171150:ENST00000394861:exon_46985658_46989452:SOCS5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 47220622 G/A 1 9 6 15 4.24476135141999 3.17015909905334 1.07460225236666 A:G G A 10 0.528359849842223 0.61599879202346 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000461601:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000474321:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47220589_47220667:TTC7A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 54120025 A/T 1 5 4 9 2.35820075078889 2.11343939936889 0.244761351419994 A:T A T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54119945_54120097:PSME4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 54858664 C/T 1 7 7 14 3.30148105110444 3.69851894889556 -0.397037897791122 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54857992_54858748:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54857992_54858748:SPTBN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 55470115 C/T 1 13 8 21 6.1313219520511 4.22687879873778 1.90444315331332 T:C C T 10 0.528359849842223 0.513633535609652 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000418823:exon_55470076_55470216:MTIF2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 55490819 G/T 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 T:G G T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55490776_55491006:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000417741:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000446660:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000366137:exon_55490777_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000441307:exon_55490783_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000404297:exon_55490784_55491001:MTIF2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 58316814 A/G 1 7 17 24 3.30148105110444 8.98211744731779 -5.68063639621335 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0238323866689461 ENSG00000028116:ENST00000435505:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000417641:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000412104:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000423109:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000394539:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000437272:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000340157:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000432057:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000440705:exon_58316766_58316858:VRK2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 61413819 G/A 1 93 140 233 43.8625339646733 73.9703789779112 -30.1078450132379 A:G G A 10 0.528359849842223 9.9688581312845e-05 ENSG00000173209:ENST00000357022:exon_61413752_61414686:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000489653:exon_61413752_61414048:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000394457:exon_61413752_61414686:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000493628:exon_61413752_61413921:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000430934:exon_61413752_61414052:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000389584:exon_61413752_61414052:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000471542:exon_61413752_61414047:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000484217:exon_61413752_61413942:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000410073:exon_61413752_61413945:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000491217:exon_61413581_61413910:AHSA2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 61415492 A/G 1 75 63 138 35.3730112618333 33.28667054006 2.08634072177323 A:G A G 10 0.528359849842223 0.733922800696101 ENSG00000173209:ENST00000403692:exon_61415044_61416060:AHSA2;ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398569:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000263989:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000411912:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000436269:exon_61414685_61415844:USP34 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 61417617 A/G 1 7 16 23 3.30148105110444 8.45375759747557 -5.15227654637113 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0365722846410322 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 64124722 C/A 1 6 5 11 2.82984090094666 2.64179924921111 0.188041651735547 A:C C A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000143952:ENST00000354504:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000272322:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000409558:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000416400:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000394400:exon_64124630_64124724:VPS54 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 64779509 G/A 1 10 14 24 4.71640150157777 7.39703789779112 -2.68063639621335 A:G G A 10 0.528359849842223 0.310254011572794 ENSG00000119844:ENST00000238856:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000422803:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000238855:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000498706:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409933:exon_64778609_64780543:AFTPH HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 65245365 G/A 1 11 7 18 5.18804165173555 3.69851894889556 1.48952270283999 A:G G A 10 0.528359849842223 0.63817833418455 ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65245205_65245399:SLC1A4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 65298839 A/G 1 4 8 12 1.88656060063111 4.22687879873778 -2.34031819810668 A:G A G 10 0.528359849842223 0.248211150341394 ENSG00000011523:ENST00000475851:exon_65298588_65298978:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000260569:exon_65298588_65299703:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000497039:exon_65297863_65299703:CEP68 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 68607947 G/T 1 32 23 55 15.0924848050489 12.1522765463711 2.94020825867774 T:G G T 10 0.528359849842223 0.499965306393987 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68607855_68608036:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68607855_68608036:PLEK HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 68622914 G/A 1 78 75 153 36.7879317123066 39.6269887381667 -2.83905702586011 A:G G A 10 0.528359849842223 0.685772034575059 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 70122305 G/A 1 8 14 22 3.77312120126222 7.39703789779112 -3.62391669652891 A:G G A 10 0.528359849842223 0.138020116768675 ENSG00000124380:ENST00000244227:exon_70122226_70122346:SNRNP27;ENSG00000124380:ENST00000409116:exon_70122226_70122346:SNRNP27;ENSG00000124380:ENST00000450162:exon_70122226_70122346:SNRNP27 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 70524577 G/A 1 57 61 118 26.8834885589933 32.2299508403756 -5.34646228138231 A:G G A 10 0.528359849842223 0.356692062855805 ENSG00000035141:ENST00000037869:exon_70523107_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000460307:exon_70523108_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000450256:exon_70524143_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000430566:exon_70524308_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000438759:exon_70524558_70524609:FAM136A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 71304738 G/A 1 125 135 260 58.9550187697221 71.3285797287001 -12.373560958978 A:G G A 10 0.528359849842223 0.135896971199493 ENSG00000124357:ENST00000455662:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000244204:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000418807:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443872:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443938:exon_71304700_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000450272:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000475709:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000472519:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000489309:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524736:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524537:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000490998:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000468601:exon_71304688_71304766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000498022:exon_71304661_71304766:NAGK HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 71351487 G/A 1 15 16 31 7.07460225236666 8.45375759747557 -1.37915534510891 A:G G A 10 0.528359849842223 0.719805878945864 ENSG00000124370:ENST00000244217:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000466481:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000486135:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000494660:exon_71351477_71351673:MCEE HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 71351536 T/G 1 13 13 26 6.1313219520511 6.8686780479489 -0.737356095897796 T:G T G 10 0.528359849842223 0.845396168977588 ENSG00000124370:ENST00000413592:exon_71351498_71351581:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000244217:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000466481:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000486135:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000494660:exon_71351477_71351673:MCEE HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 71360144 A/C 1 14 15 29 6.60296210220888 7.92539774763334 -1.32243564542447 A:C A C 10 0.528359849842223 0.711035870554003 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 71360625 G/T 1 37 19 56 17.4506855558378 10.0388371470022 7.41184840883552 T:G G T 10 0.528359849842223 0.0600344231329072 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 71365676 G/A 1 24 19 43 11.3193636037866 10.0388371470022 1.28052645678441 A:G G A 10 0.528359849842223 0.761064302771798 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71365620_71366343:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 71376999 G/A 1 70 38 108 33.0148105110444 20.0776742940045 12.9371362170399 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0155806068094512 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71376996_71377230:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000493360:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 73461483 C/A 1 16 126 142 7.54624240252443 66.5733410801201 -59.0270986775957 A:C C A 10 0.528359849842223 2.74488148327128e-25 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73461366_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000461290:exon_73461397_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000464397:exon_73461435_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000399032:exon_73461436_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73461436_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000480489:exon_73461437_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409924:exon_73461437_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73461448_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000473786:exon_73461464_73461512:CCT7 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 73478461 A/T 1 137 149 286 64.6147005716155 78.7256176264912 -14.1109170548758 A:T A T 10 0.528359849842223 0.097426889260168 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73478354_73478560:CCT7 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 73957124 A/G 1 31 68 99 14.6208446548911 35.9284697892712 -21.3076251343801 A:G A G 10 0.528359849842223 1.85479835536776e-05 ENSG00000144034:ENST00000272424:exon_73956957_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000495950:exon_73957012_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000485758:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000409716:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000318190:exon_73957017_73957156:TPRKB HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 74687781 G/A 1 126 130 256 59.4266589198799 68.686780479489 -9.26012155960908 A:G G A 10 0.528359849842223 0.259963985261855 ENSG00000115274:ENST00000452361:exon_74687348_74688011:INO80B;ENSG00000115274:ENST00000441673:exon_74687348_74687973:INO80B;ENSG00000239779:ENST00000233615:exon_74687348_74688018:WBP1;ENSG00000239779:ENST00000393972:exon_74687348_74688018:WBP1;ENSG00000239779:ENST00000484744:exon_74687348_74688010:WBP1;ENSG00000239779:ENST00000409737:exon_74687348_74687983:WBP1;ENSG00000239779:ENST00000494741:exon_74687348_74687823:WBP1;ENSG00000239779:ENST00000480116:exon_74687714_74688010:WBP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 74701613 C/G 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 C:G C G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000135637:ENST00000393965:exon_74700917_74701929:CCDC142;ENSG00000135637:ENST00000290418:exon_74701229_74701929:CCDC142 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 75882376 A/G 1 67 87 154 31.5998900605711 45.9673069362734 -14.3674168757023 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0235523827900867 ENSG00000115364:ENST00000393909:exon_75882190_75884986:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000409374:exon_75882190_75882428:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000453233:exon_75882190_75882428:MRPL19 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 75882399 G/A 1 78 56 134 36.7879317123066 29.5881515911645 7.19978012114212 A:T:G G A 10 0.528359849842223 0.226306619869503 ENSG00000115364:ENST00000393909:exon_75882190_75884986:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000409374:exon_75882190_75882428:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000453233:exon_75882190_75882428:MRPL19 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 85622059 T/C 1 30 62 92 14.1492045047333 32.7583106902178 -18.6091061854845 T:C T C 10 0.528359849842223 0.000140725927755907 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85621871_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000453973:exon_85621876_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85621890_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85621951_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85622016_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000471064:exon_85622018_85622081:CAPG HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 85769711 C/G 1 35 38 73 16.5074052555222 20.0776742940045 -3.57026903848227 C:G C G 10 0.528359849842223 0.414166544925267 ENSG00000168906:ENST00000306434:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000424323:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000481412:exon_85769278_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000409017:exon_85769688_85769870:MAT2A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 85806266 C/T 1 309 221 530 145.736806398753 116.767526815131 28.9692795836218 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0116296910071821 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85806132_85806290:VAMP8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 85808737 A/G 1 479 448 927 225.915631925575 236.705212729316 -10.7895808037407 A:G A G 10 0.528359849842223 0.489717037871636 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 85808871 C/T 1 305 239 544 143.850245798122 126.278004112291 17.5722416858307 T:C C T 10 0.528359849842223 0.133025317519370 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 85824251 T/C 1 431 378 809 203.276904718002 199.72002324036 3.55688147764164 A:T:C:G T C 10 0.528359849842223 0.80541537525347 ENSG00000168894:ENST00000441634:exon_85824227_85824704:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000306368:exon_85824227_85824301:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000443647:exon_85824227_85824301:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000456023:exon_85824076_85824301:RNF181 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 85852667 G/A 1 14 11 25 6.60296210220888 5.81195834826445 0.791003753944426 A:G G A 10 0.528359849842223 0.84244030516468 ENSG00000168883:ENST00000459775:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000448971:exon_85852662_85852712:USP39;ENSG00000168883:ENST00000442708:exon_85852662_85852740:USP39;ENSG00000168883:ENST00000450066:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409268:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409025:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000452873:exon_85852662_85852719:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409470:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000487400:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000323701:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000458268:exon_85852662_85852813:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409766:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000493829:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000467885:exon_85852662_85852814:USP39 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 89160152 A/G 1 10 4 14 4.71640150157777 2.11343939936889 2.60296210220888 A:G A G 10 0.528359849842223 0.189361454505222 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 89160394 T/G 1 7 3 10 3.30148105110444 1.58507954952667 1.71640150157777 T:C:G T G 10 0.528359849842223 0.35163323596596 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 89185056 C/G 1 8 4 12 3.77312120126222 2.11343939936889 1.65968180189332 C:G C G 10 0.528359849842223 0.396971345501871 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 89197190 C/T 0 0 64 64 0 33.8150303899023 -33.8150303899023 T C T 10 0.528359849842223 1.29148454564305e-21 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 89246951 C/G 0 50 0 50 23.5820075078889 0 23.5820075078889 C C 10 0.528359849842223 1.67438866384521e-14 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 96521726 G/A 1 9 8 17 4.24476135141999 4.22687879873778 0.0178825526822095 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000174501:ENST00000456556:exon_96521014_96521928:AC073995.2;ENSG00000174501:ENST00000420871:exon_96521014_96521928:AC073995.2;ENSG00000174501:ENST00000419039:exon_96521014_96521928:AC073995.2;ENSG00000174501:ENST00000488721:exon_96521014_96521928:AC073995.2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 96944553 G/A 1 38 35 73 17.9223257059955 18.4925947444778 -0.570269038482273 A:G G A 10 0.528359849842223 0.907189370129825 ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000497539:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000429650:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000484372:exon_96944547_96944736:SNRNP200 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 97757420 T/C 1 9 3 12 4.24476135141999 1.58507954952667 2.65968180189332 T:C T C 10 0.528359849842223 0.153759275498468 ENSG00000144199:ENST00000414820:exon_97757199_97757449:FAHD2B;ENSG00000144199:ENST00000272610:exon_97757199_97757449:FAHD2B;ENSG00000144199:ENST00000483657:exon_97757199_97757449:FAHD2B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 99778735 A/G 1 6 3 9 2.82984090094666 1.58507954952667 1.24476135141999 A:G A G 10 0.528359849842223 0.514115714513849 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000449211:exon_99778420_99778826:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000415142:exon_99778420_99778738:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 99778985 T/C 1 13 11 24 6.1313219520511 5.81195834826445 0.319363603786649 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 99812070 G/A 1 14 12 26 6.60296210220888 6.34031819810668 0.262643904102203 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000241962:ENST00000424491:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000512183:exon_99812036_99814089:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308656:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308644:exon_99812036_99813896:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000509871:exon_99812036_99812286:C2orf15;ENSG00000185414:ENST00000338148:exon_99812036_99814089:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000465432:exon_99812036_99812485:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409841:exon_99812036_99812286:MRPL30 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 99978048 G/A 1 228 200 428 107.533954235973 105.671969968445 1.86198426752858 A:T:G G A 10 0.528359849842223 0.88455446159781 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99977611_99978283:EIF5B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 99995517 C/T 1 95 94 189 44.8058142649888 49.665825885169 -4.86001162018014 A:T:C C T 10 0.528359849842223 0.512175836337671 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995482_99995589:EIF5B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 101898412 G/C 1 8 8 16 3.77312120126222 4.22687879873778 -0.453757597475567 C:G G C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000163162:ENST00000424632:exon_101898321_101898519:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000295317:exon_101898321_101898519:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000490553:exon_101897955_101898519:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000463726:exon_101898321_101898519:RNF149 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 105665808 C/T 1 16 14 30 7.54624240252443 7.39703789779112 0.149204504733311 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000135972:ENST00000258455:exon_105665629_105665808:MRPS9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 105705507 C/T 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 T:C C T 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000135972:ENST00000258455:exon_105705442_105705527:MRPS9;ENSG00000135972:ENST00000413583:exon_105705476_105705527:MRPS9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 105713697 A/G 1 52 32 84 24.5252878082044 16.9075151949511 7.61777261325327 A:T:G A G 10 0.528359849842223 0.101794536228482 ENSG00000135972:ENST00000258455:exon_105713613_105713782:MRPS9;ENSG00000135972:ENST00000413583:exon_105713613_105713746:MRPS9;ENSG00000135972:ENST00000472220:exon_105713613_105713782:MRPS9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 113940006 G/A 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 A:G G A 10 0.528359849842223 0.743278251879842 ENSG00000125637:ENST00000465917:exon_113939923_113940621:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 113940681 T/C 1 10 9 19 4.71640150157777 4.75523864858001 -0.0388371470022362 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 113940839 G/C 1 10 8 18 4.71640150157777 4.22687879873778 0.489522702839987 C:G G C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 113943470 A/G 1 4 11 15 1.88656060063111 5.81195834826445 -3.92539774763334 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0667977720808296 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113943454_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113942942_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113943239_113943832:PSD4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 118575215 C/G 1 43 40 83 20.2805264567844 21.1343939936889 -0.853867536904502 C:G C G 10 0.528359849842223 0.912571745633825 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118575020_118575304:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000474694:exon_118575020_118575304:DDX18 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 120060082 T/C 1 15 21 36 7.07460225236666 11.0955568466867 -4.02095459432003 T:C T C 10 0.528359849842223 0.186252542792442 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120059801_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120059804_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120060020_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120060020_120060124:C2orf76 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 120078778 T/C 1 6 7 13 2.82984090094666 3.69851894889556 -0.868678047948899 T:C T C 10 0.528359849842223 0.782884637593256 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000414534:exon_120078745_120078780:C2orf76 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 127453664 A/C 1 270 290 560 127.3428405426 153.224356454245 -25.8815159116449 A:C A C 10 0.528359849842223 0.0307986400381753 ENSG00000136732:ENST00000259254:exon_127453522_127454246:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000409836:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000356887:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000464053:exon_127453522_127454243:GYPC HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 128464116 G/A 1 43 30 73 20.2805264567844 15.8507954952667 4.42973096151773 A:G G A 10 0.528359849842223 0.348503937206037 ENSG00000136709:ENST00000322313:exon_128458596_128464126:WDR33 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 128608184 C/T 1 15 6 21 7.07460225236666 3.17015909905334 3.90444315331332 T:C C T 10 0.528359849842223 0.124380190819060 ENSG00000144231:ENST00000272645:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409698:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000411634:exon_128608164_128608259:POLR2D HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 135893372 A/G 1 20 9 29 9.43280300315554 4.75523864858001 4.67756435457553 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0948461921883953 ENSG00000115839:ENST00000264158:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000442034:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000487003:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 135911422 T/C 1 22 17 39 10.3760833034711 8.98211744731779 1.3939658561533 T:C T C 10 0.528359849842223 0.749081235623355 ENSG00000115839:ENST00000264158:exon_135911219_135911446:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000442034:exon_135911219_135911446:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000487003:exon_135911219_135911446:RAB3GAP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 136511817 A/G 1 13 19 32 6.1313219520511 10.0388371470022 -3.90751519495113 A:G A G 10 0.528359849842223 0.214738050722661 ENSG00000144224:ENST00000272638:exon_136511729_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000416538:exon_136511109_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000470687:exon_136511729_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000490163:exon_136511722_136511847:UBXN4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 143798189 A/G 1 50 39 89 23.5820075078889 20.6060341438467 2.97597336404216 A:G A G 10 0.528359849842223 0.595789269567458 ENSG00000115919:ENST00000264170:exon_143797997_143798227:KYNU;ENSG00000115919:ENST00000409512:exon_143797997_143798227:KYNU HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 152132130 A/G 1 73 71 144 34.4297309615177 37.5135493387978 -3.0838183772801 A:G A G 10 0.528359849842223 0.617403287729779 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152131998_152132184:NMI HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 152138522 T/C 1 17 22 39 8.01788255268221 11.6239166965289 -3.6060341438467 T:C T C 10 0.528359849842223 0.264789174277522 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152138462_152138557:NMI HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 152320118 G/A 1 6 2 8 2.82984090094666 1.05671969968445 1.77312120126222 A:G G A 10 0.528359849842223 0.29537924054388 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 152322095 A/T 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 A:T A T 10 0.528359849842223 0.743278251879842 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152321214_152322634:RIF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 152331418 C/G 1 9 8 17 4.24476135141999 4.22687879873778 0.0178825526822095 C:G C G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152331371_152332136:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152331371_152332419:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152331371_152333863:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152331371_152331733:RIF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 160604936 G/A 1 7 4 11 3.30148105110444 2.11343939936889 1.18804165173555 A:G G A 10 0.528359849842223 0.556038959282085 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 163124051 C/T 1 120 120 240 56.5968180189332 63.4031819810668 -6.8063639621335 T:C:G C T 10 0.528359849842223 0.400791185494763 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163123989_163124079:IFIH1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 163128824 T/C 1 41 42 83 19.3372461564689 22.1911136933734 -2.85386753690451 T:C T C 10 0.528359849842223 0.582917894974707 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163128736_163128897:IFIH1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 170402752 T/C 1 9 15 24 4.24476135141999 7.92539774763334 -3.68063639621335 T:C T C 10 0.528359849842223 0.154213959723728 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170402728_170403214:FASTKD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 170403030 T/C 1 4 12 16 1.88656060063111 6.34031819810668 -4.45375759747557 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0417035604139189 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170402728_170403214:FASTKD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 170411693 T/C 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 T:C T C 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170411634_170411765:FASTKD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 179974609 T/C 1 5 6 11 2.35820075078889 3.17015909905334 -0.811958348264453 T:C T C 10 0.528359849842223 0.765428811190486 ENSG00000187231:ENST00000436925:exon_179966419_179974755:SESTD1;ENSG00000187231:ENST00000428443:exon_179966483_179974755:SESTD1;ENSG00000187231:ENST00000446758:exon_179974049_179974755:SESTD1;ENSG00000187231:ENST00000335289:exon_179974079_179974755:SESTD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 180810264 A/T 1 68 49 117 32.0715302107288 25.8896326422689 6.18189756845991 A:T A T 10 0.528359849842223 0.267324138531465 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 180810358 C/T 1 46 28 74 21.6954469072577 14.7940757955822 6.9013711116755 T:C C T 10 0.528359849842223 0.129664724582530 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000404136:exon_180810348_180810442:CWC22 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 184025875 G/T 1 6 10 16 2.82984090094666 5.28359849842223 -2.45375759747557 T:G G T 10 0.528359849842223 0.316737715732456 ENSG00000163002:ENST00000409798:exon_184025782_184026166:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000295119:exon_184025782_184026408:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000374930:exon_184025782_184025972:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000479162:exon_184024216_184026408:NUP35 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 184025876 A/T 1 6 10 16 2.82984090094666 5.28359849842223 -2.45375759747557 A:T A T 10 0.528359849842223 0.316737715732456 ENSG00000163002:ENST00000409798:exon_184025782_184026166:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000295119:exon_184025782_184026408:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000374930:exon_184025782_184025972:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000479162:exon_184024216_184026408:NUP35 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 190742010 C/T 1 27 29 56 12.73428405426 15.3224356454245 -2.58815159116449 T:C C T 10 0.528359849842223 0.505978184331374 ENSG00000064933:ENST00000374827:exon_190741998_190742354:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000434338:exon_190741998_190742354:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000441310:exon_190741998_190742355:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000342075:exon_190741998_190742353:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000409823:exon_190741998_190742162:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000418224:exon_190741998_190742162:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000450931:exon_190741998_190742353:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000447232:exon_190741998_190742355:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000432292:exon_190741998_190742355:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000409593:exon_190741998_190742162:PMS1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 190742024 A/G 1 31 27 58 14.6208446548911 14.26571594574 0.355128709151069 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000064933:ENST00000374827:exon_190741998_190742354:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000434338:exon_190741998_190742354:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000441310:exon_190741998_190742355:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000342075:exon_190741998_190742353:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000409823:exon_190741998_190742162:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000418224:exon_190741998_190742162:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000450931:exon_190741998_190742353:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000447232:exon_190741998_190742355:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000432292:exon_190741998_190742355:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000409593:exon_190741998_190742162:PMS1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 191064753 C/T 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 T:C C T 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000187699:ENST00000396974:exon_191064423_191065205:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409545:exon_191064423_191064789:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409870:exon_191064423_191064935:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000340623:exon_191064423_191068210:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000443551:exon_191064423_191064940:C2orf88 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 198001319 A/G 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000065413:ENST00000282272:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000328737:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000450567:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000337207:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000409153:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000409919:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000447713:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000443014:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000463879:exon_197998695_198001386:ANKRD44 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 201337667 A/C 1 7 9 16 3.30148105110444 4.75523864858001 -1.45375759747557 A:C A C 10 0.528359849842223 0.61804043960613 ENSG00000196141:ENST00000409718:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000358677:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409988:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409385:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000360760:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409140:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409755:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409151:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000468832:exon_201337555_201337770:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000462190:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000460095:exon_201337555_201337715:SPATS2L HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 201354935 C/G 1 15 12 27 7.07460225236666 6.34031819810668 0.73428405425998 C:G C G 10 0.528359849842223 0.848556223067985 ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201353675_201355339:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201353681_201355339:KCTD18 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 201355106 G/A 1 6 6 12 2.82984090094666 3.17015909905334 -0.340318198106676 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201353675_201355339:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201353681_201355339:KCTD18 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 201768238 C/T 1 27 30 57 12.73428405426 15.8507954952667 -3.11651144100671 T:C C T 10 0.528359849842223 0.428389705751813 ENSG00000196290:ENST00000416651:exon_201768217_201768655:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000419903:exon_201768217_201768655:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000358515:exon_201768217_201768646:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000403702:exon_201768217_201768646:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409020:exon_201768217_201768653:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000359683:exon_201768217_201768653:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409357:exon_201768217_201768619:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409588:exon_201768217_201768648:NIF3L1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 202006096 G/A 1 9 57 66 4.24476135141999 30.1165114410067 -25.8717500895867 A:G G A 10 0.528359849842223 6.0825124133964e-11 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 202025621 A/G 1 39 32 71 18.3939658561533 16.9075151949511 1.48645066120217 A:G A G 10 0.528359849842223 0.812298206397479 ENSG00000003402:ENST00000309955:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000443227:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000340870:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000343375:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000341582:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000423241:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000457277:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000479953:exon_202025155_202025760:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000474842:exon_202025155_202025665:CFLAR HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 203139844 T/C 1 23 16 39 10.8477234536289 8.45375759747557 2.3939658561533 T:C T C 10 0.528359849842223 0.522076593040372 ENSG00000055044:ENST00000264279:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000426814:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000488403:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000492740:exon_203139836_203140406:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000472050:exon_203139836_203139912:NOP58 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 203155936 A/C 1 47 52 99 22.1670870574155 27.4747121917956 -5.30762513438007 A:C A C 10 0.528359849842223 0.314387069971116 ENSG00000055044:ENST00000264279:exon_203155848_203155993:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000433543:exon_203155848_203155993:NOP58 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 207008763 C/A 1 13 9 22 6.1313219520511 4.75523864858001 1.37608330347109 A:C C A 10 0.528359849842223 0.670970373739377 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207008742_207008856:NDUFS1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 208478055 A/G 1 11 9 20 5.18804165173555 4.75523864858001 0.432803003155541 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208473839_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208476828_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208477447_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208477451_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208477467_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208477567_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208477704_208478167:FAM119A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 216904019 A/T 1 14 5 19 6.60296210220888 2.64179924921111 3.96116285299776 A:T A T 10 0.528359849842223 0.105313476648990 ENSG00000115425:ENST00000442122:exon_216903914_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000448681:exon_216903112_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000265322:exon_216903132_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000461330:exon_216903979_216904083:PECR HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 216923679 C/T 1 5 4 9 2.35820075078889 2.11343939936889 0.244761351419994 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000115425:ENST00000265322:exon_216923618_216923699:PECR;ENSG00000115425:ENST00000461330:exon_216923618_216923699:PECR;ENSG00000115425:ENST00000497889:exon_216923618_216923699:PECR HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 217288388 G/C 1 10 11 21 4.71640150157777 5.81195834826445 -1.09555684668668 C:G G C 10 0.528359849842223 0.667251391828987 ENSG00000138375:ENST00000357276:exon_217288356_217288406:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000358207:exon_217288356_217288406:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000392128:exon_217288356_217288406:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000412913:exon_217288356_217288406:SMARCAL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 217363597 C/T 1 1502 1059 2561 708.403505536981 559.533080982914 148.870424554067 A:T:C:G C T 10 0.528359849842223 3.54533115739701e-09 ENSG00000197756:ENST00000491306:exon_217362912_217363600:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000490649:exon_217363548_217363600:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000478153:exon_217363548_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000487233:exon_217363567_217363600:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000446558:exon_217363578_217363600:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000420712:exon_217363585_217363600:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000359681:exon_217363590_217364121:RPL37A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 217363638 G/A 1 6 3 9 2.82984090094666 1.58507954952667 1.24476135141999 A:G G A 10 0.528359849842223 0.514115714513849 ENSG00000197756:ENST00000478153:exon_217363548_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000359681:exon_217363590_217364121:RPL37A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 219103580 A/G 1 2 6 8 0.943280300315554 3.17015909905334 -2.22687879873778 A:G A G 10 0.528359849842223 0.159873274171007 ENSG00000163466:ENST00000465395:exon_219103387_219103918:ARPC2;ENSG00000163466:ENST00000472753:exon_219103387_219103740:ARPC2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 219136133 G/C 1 30 10 40 14.1492045047333 5.28359849842223 8.86560600631108 C:G G C 10 0.528359849842223 0.00635904999089084 ENSG00000127838:ENST00000248451:exon_219136104_219136272:PNKD;ENSG00000127838:ENST00000273077:exon_219136104_219136272:PNKD;ENSG00000127838:ENST00000469689:exon_219135243_219136272:PNKD;ENSG00000127838:ENST00000472650:exon_219136103_219136272:PNKD HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 219140288 G/C 1 3 9 12 1.41492045047333 4.75523864858001 -3.34031819810668 C:G G C 10 0.528359849842223 0.0796925302844448 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219138915_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000465082:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000445635:exon_219139729_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219140155_219140344:TMBIM1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 219507166 G/A 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 A:G G A 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000115568:ENST00000449707:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000336124:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000396788:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000411696:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000450765:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000433921:exon_219506751_219509787:ZNF142 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 219941063 G/A 1 21 17 38 9.90444315331332 8.98211744731779 0.922325705995528 A:G G A 10 0.528359849842223 0.871280354317309 ENSG00000187736:ENST00000409720:exon_219940039_219941167:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000356853:exon_219940043_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000418099:exon_219940051_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000494211:exon_219941014_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000426304:exon_219941025_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000491159:exon_219941040_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000415353:exon_219941042_219941167:NHEJ1;ENSG00000213901:ENST00000498327:exon_219940051_219941177:SLC23A3;ENSG00000213901:ENST00000318673:exon_219940695_219941177:SLC23A3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 220022214 T/G 1 11 2 13 5.18804165173555 1.05671969968445 4.1313219520511 T:G T G 10 0.528359849842223 0.0251781600722013 ENSG00000187736:ENST00000409720:exon_220022194_220022406:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000356853:exon_220022194_220022406:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000418099:exon_220022194_220022406:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000426304:exon_220022194_220022343:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000415353:exon_220022194_220022406:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000457600:exon_220022194_220022406:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000450447:exon_220022194_220022279:NHEJ1;ENSG00000213901:ENST00000498327:exon_220022194_220022406:SLC23A3;ENSG00000213901:ENST00000318673:exon_220022194_220022406:SLC23A3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 220046975 C/A 1 14 19 33 6.60296210220888 10.0388371470022 -3.43587504479336 A:C C A 10 0.528359849842223 0.295465692465376 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220046735_220047030:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220046735_220047030:FAM134A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 220047393 C/T 1 24 19 43 11.3193636037866 10.0388371470022 1.28052645678441 T:C C T 10 0.528359849842223 0.761064302771798 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220047136_220048522:FAM134A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 220100787 C/T 1 30 27 57 14.1492045047333 14.26571594574 -0.116511441006708 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000163516:ENST00000323348:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000466238:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000409849:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000477479:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000463792:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000419723:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000410034:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000460966:exon_220100732_220101373:ANKZF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 220406722 T/C 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 T:C T C 10 0.528359849842223 0.743278251879842 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220406338_220406911:CHPF;ENSG00000123989:ENST00000373891:exon_220406182_220406911:CHPF HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 220473355 G/A 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 A:G G A 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000144589:ENST00000456909:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000426736:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000475396:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000473899:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000254493:ENST00000295641:exon_220473305_220473510:STK11IP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 220476443 C/T 1 2 6 8 0.943280300315554 3.17015909905334 -2.22687879873778 T:C C T 10 0.528359849842223 0.159873274171007 ENSG00000144589:ENST00000456909:exon_220476326_220476556:AC009955.1;ENSG00000254493:ENST00000295641:exon_220476326_220476556:STK11IP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 228221725 A/G 1 61 58 119 28.7700491596244 30.6448712908489 -1.87482213122453 A:G A G 10 0.528359849842223 0.783138668732204 ENSG00000168958:ENST00000304593:exon_228221702_228222550:MFF;ENSG00000168958:ENST00000476924:exon_228221702_228221970:MFF;ENSG00000168958:ENST00000353339:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000354503:exon_228221702_228221931:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409565:exon_228221702_228222515:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409616:exon_228221702_228221867:MFF;ENSG00000168958:ENST00000460756:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000337110:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000524634:exon_228221702_228221847:MFF;ENSG00000168958:ENST00000349901:exon_228221702_228222528:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392059:exon_228221702_228222543:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392058:exon_228221702_228222524:MFF;ENSG00000168958:ENST00000456345:exon_228221702_228222097:MFF;ENSG00000168958:ENST00000490857:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000476262:exon_228221702_228222547:MFF;ENSG00000168958:ENST00000477362:exon_228221702_228221897:MFF HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 228401695 C/T 1 6 16 22 2.82984090094666 8.45375759747557 -5.62391669652891 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0184915387057276 ENSG00000173744:ENST00000409979:exon_228401617_228401709:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000310078:exon_228401617_228401709:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409315:exon_228401617_228401709:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000373671:exon_228401617_228401709:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409171:exon_228401617_228401709:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000458212:exon_228401671_228401709:AGFG1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 231042276 A/G 1 139 102 241 65.557980871931 53.8927046839067 11.6652761880243 A:T:G A G 10 0.528359849842223 0.138041119221237 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000489597:exon_231042082_231042396:SP110 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 231072709 C/T 1 51 37 88 24.0536476580466 19.5493144441622 4.50433321388438 T:C:G C T 10 0.528359849842223 0.393131493139616 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000490880:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231072706_231072774:SP110 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 231077112 G/A 1 54 53 107 25.46856810852 28.0030720416378 -2.53450393311786 A:G G A 10 0.528359849842223 0.629719954362201 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077064_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000455674:exon_231077111_231077145:SP110 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 231222655 G/T 1 9 9 18 4.24476135141999 4.75523864858001 -0.510477297160014 T:G G T 10 0.528359849842223 0.818347367308864 ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000458341:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231222518_231222682:SP140L HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 231222675 T/C 1 10 9 19 4.71640150157777 4.75523864858001 -0.0388371470022362 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000458341:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231222518_231222682:SP140L HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 231331799 T/C 1 11 12 23 5.18804165173555 6.34031819810668 -1.15227654637113 T:C T C 10 0.528359849842223 0.679780772383216 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 231331896 G/A 1 89 55 144 41.9759733640422 29.0597917413223 12.9161816227199 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0365585844857157 ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000413284:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000452345:exon_231331835_231331930:SP100 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 231333763 A/G 1 122 90 212 57.5400983192488 47.5523864858001 9.98771183344873 A:T:C:G A G 10 0.528359849842223 0.191079415125060 ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000413284:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000452345:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494508:exon_231333547_231333811:SP100 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 231738168 G/A 1 12 10 22 5.65968180189332 5.28359849842223 0.376083303471095 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 231738263 C/T 1 77 20 97 36.3162915621488 10.5671969968445 25.7490945653044 T:C C T 10 0.528359849842223 6.81637146299316e-08 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 231738269 G/A 1 73 11 84 34.4297309615177 5.81195834826445 28.6177726132533 A:G G A 10 0.528359849842223 4.10862106528669e-11 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 232263127 G/A 1 4 6 10 1.88656060063111 3.17015909905334 -1.28359849842223 A:G G A 10 0.528359849842223 0.531770325189017 ENSG00000156966:ENST00000287590:exon_232262442_232265875:B3GNT7 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 234115337 G/A 1 7 5 12 3.30148105110444 2.64179924921111 0.659681801893325 A:G G A 10 0.528359849842223 0.778733618574385 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 238668802 A/G 1 15 9 24 7.07460225236666 4.75523864858001 2.31936360378665 A:G A G 10 0.528359849842223 0.415665286985416 ENSG00000124831:ENST00000308482:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000391999:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000483443:exon_238668707_238668848:LRRFIP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 238671328 A/G 1 40 25 65 18.8656060063111 13.2089962460556 5.65660976025551 A:G A G 10 0.528359849842223 0.172941395782116 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 238672703 C/G 1 54 62 116 25.46856810852 32.7583106902178 -7.28974258169787 C:G C G 10 0.528359849842223 0.193005081365263 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 239353190 C/T 1 10 5 15 4.71640150157777 2.64179924921111 2.07460225236666 T:C C T 10 0.528359849842223 0.313475377913303 ENSG00000065802:ENST00000264607:exon_239352983_239353368:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000409297:exon_239352983_239353368:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000438264:exon_239352983_239353368:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000468122:exon_239352983_239353368:ASB1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 240961728 T/C 1 14 12 26 6.60296210220888 6.34031819810668 0.262643904102203 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000407129:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000497536:exon_240961589_240961757:NDUFA10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 241516094 G/C 1 21 24 45 9.90444315331332 12.6806363962134 -2.77619324290003 C:G G C 10 0.528359849842223 0.456513677019051 ENSG00000142327:ENST00000451363:exon_241515952_241516144:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000270357:exon_241515952_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000486058:exon_241515952_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000481757:exon_241513530_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000493398:exon_241515952_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000464550:exon_241515952_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000471657:exon_241515952_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000437406:exon_241515985_241516182:RNPEPL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 241536126 A/G 1 7 7 14 3.30148105110444 3.69851894889556 -0.397037897791122 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241536098_241536359:CAPN10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 241537421 G/A 1 8 6 14 3.77312120126222 3.17015909905334 0.602962102208878 A:G G A 10 0.528359849842223 0.795199355745845 ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000352879:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000357048:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000416591:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000354082:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000391983:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000493058:exon_241537305_241537504:CAPN10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 242573211 T/C 1 34 34 68 16.0357651053644 17.9642348946356 -1.92846978927116 T:C T C 10 0.528359849842223 0.715874133223021 ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 242610773 T/A 1 36 31 67 16.97904540568 16.3791553451089 0.59989006057106 A:T T A 10 0.528359849842223 0.903254118401401 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610727_242610840:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610727_242612014:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610727_242612046:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610727_242610781:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610727_242610984:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242610727_242611332:ATG4B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 242618050 A/G 1 36 44 80 16.97904540568 23.2478333930578 -6.26878798737784 A:G A G 10 0.528359849842223 0.17917072932591 ENSG00000168393:ENST00000305784:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000400770:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000472618:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000445261:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000432348:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000420144:exon_242617867_242618064:DTYMK HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 242690770 T/C 1 5 7 12 2.35820075078889 3.69851894889556 -1.34031819810668 T:C T C 10 0.528359849842223 0.56626847898003 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000454048:exon_242690661_242690794:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000432449:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000496252:exon_242690661_242690804:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242690661_242690803:D2HGDH HGDP00247_parsed_pileup.txt . 2 242793273 A/G 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 A:G A G 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000188389:ENST00000334409:exon_242792033_242793449:PDCD1;ENSG00000188389:ENST00000418831:exon_242792849_242793449:PDCD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 256727 T/A 1 3 8 11 1.41492045047333 4.22687879873778 -2.81195834826445 A:T T A 10 0.528359849842223 0.129693174868926 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_256609_256727:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_256609_256727:C20orf96 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 257733 A/G 1 5 10 15 2.35820075078889 5.28359849842223 -2.92539774763334 A:G A G 10 0.528359849842223 0.194650532535346 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_257457_257786:C20orf96 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 259969 G/C 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 C:G G C 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_259813_259971:C20orf96 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 368905 A/G 1 25 7 32 11.7910037539444 3.69851894889556 8.09248480504887 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0041688167312201 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_368655_368945:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000449710:exon_368655_368945:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_368655_368945:TRIB3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 371972 T/C 1 14 13 27 6.60296210220888 6.8686780479489 -0.26571594574002 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000449710:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_371931_372223:TRIB3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 377226 C/T 1 33 23 56 15.5641249552066 12.1522765463711 3.41184840883551 T:C C T 10 0.528359849842223 0.422386275000903 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_376842_378203:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_376842_378197:TRIB3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 1099523 T/G 1 33 34 67 15.5641249552066 17.9642348946356 -2.40010993942894 T:G T G 10 0.528359849842223 0.624898889221033 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000438768:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1099253_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000461847:exon_1099270_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1099295_1099545:PSMF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 1115919 A/G 1 38 34 72 17.9223257059955 17.9642348946356 -0.0419091886400516 A:C:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000479715:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000484891:exon_1115483_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000435720:exon_1115821_1115949:PSMF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 2097688 T/C 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 T:C T C 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000125834:ENST00000381482:exon_2097312_2098061:STK35;ENSG00000125834:ENST00000246032:exon_2097312_2098061:STK35;ENSG00000125834:ENST00000493263:exon_2097312_2098061:STK35 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 2635212 A/G 1 44 57 101 20.7521666069422 30.1165114410067 -9.36434483406452 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0723978399291598 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000494697:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000469588:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000445139:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000460258:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000496775:exon_2634880_2635221:NOP56 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 2638492 G/A 1 47 41 88 22.1670870574155 21.6627538435311 0.504333213884379 A:G G A 10 0.528359849842223 1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 2638579 T/C 1 775 701 1476 365.521116372277 370.380254739398 -4.85913836712109 T:C T C 10 0.528359849842223 0.814502173508316 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000462630:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467857:exon_2638575_2639039:NOP56 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 2945759 C/T 1 6 3 9 2.82984090094666 1.58507954952667 1.24476135141999 T:C C T 10 0.528359849842223 0.514115714513849 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000455631:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000431048:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000418580:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000430705:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_2945507_2945848:PTPRA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 3090848 T/G 1 6 4 10 2.82984090094666 2.11343939936889 0.71640150157777 T:G T G 10 0.528359849842223 0.757839432335683 ENSG00000185019:ENST00000217173:exon_3088219_3090960:UBOX5;ENSG00000185019:ENST00000348031:exon_3088219_3090960:UBOX5;ENSG00000185019:ENST00000440298:exon_3088219_3090960:UBOX5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 3193978 G/A 1 15 21 36 7.07460225236666 11.0955568466867 -4.02095459432003 A:G G A 10 0.528359849842223 0.186252542792442 ENSG00000125877:ENST00000460676:exon_3193965_3194072:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000380113:exon_3193965_3194029:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000455664:exon_3193965_3194029:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000490838:exon_3193902_3194029:ITPA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 3204084 G/A 1 66 77 143 31.1282499104133 40.6837084378512 -9.55545852743788 A:G G A 10 0.528359849842223 0.112165977619886 ENSG00000125877:ENST00000483354:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000380113:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000455664:exon_3204012_3204504:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000490838:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000460550:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000399838:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000461029:exon_3204012_3204095:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000472295:exon_3204012_3204516:ITPA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 5843812 T/C 1 13 5 18 6.1313219520511 2.64179924921111 3.48952270283999 T:C T C 10 0.528359849842223 0.154751153489626 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000378971:exon_5843670_5843920:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000445603:exon_5843670_5843854:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000442185:exon_5843670_5843950:C20orf196 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 5844121 C/T 1 12 5 17 5.65968180189332 2.64179924921111 3.01788255268221 T:C C T 10 0.528359849842223 0.154369157381661 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 5844122 A/G 1 12 5 17 5.65968180189332 2.64179924921111 3.01788255268221 A:G A G 10 0.528359849842223 0.154369157381661 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 5923203 T/C 1 15 19 34 7.07460225236666 10.0388371470022 -2.96423489463558 T:C T C 10 0.528359849842223 0.390750775814974 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 5923204 T/C 1 15 18 33 7.07460225236666 9.51047729716001 -2.43587504479336 T:C T C 10 0.528359849842223 0.486172453869617 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 17596155 C/A 1 16 24 40 7.54624240252443 12.6806363962134 -5.13439399368892 A:C C A 10 0.528359849842223 0.114492078649188 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17596076_17596174:RRBP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 17600357 G/A 1 22 16 38 10.3760833034711 8.45375759747557 1.92232570599553 A:G G A 10 0.528359849842223 0.626731773939179 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17599241_17600462:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17600278_17600373:RRBP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 17932210 C/T 1 58 48 106 27.3551287091511 25.3612727924267 1.99385591672436 T:C C T 10 0.528359849842223 0.770562441620804 ENSG00000089006:ENST00000377768:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000490175:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000377759:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000483485:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000377739:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000476648:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000431277:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000419004:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000494401:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000474883:exon_17932170_17932239:SNX5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 17943492 A/T 1 5 4 9 2.35820075078889 2.11343939936889 0.244761351419994 A:T A T 10 0.528359849842223 1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 17968923 T/C 1 8 7 15 3.77312120126222 3.69851894889556 0.0746022523666556 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000125871:ENST00000377710:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000377709:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000412478:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000467391:exon_17968809_17968941:C20orf72 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 18143355 C/T 1 6 4 10 2.82984090094666 2.11343939936889 0.71640150157777 T:C C T 10 0.528359849842223 0.757839432335683 ENSG00000149474:ENST00000278816:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000377681:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000435364:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000489634:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000434922:exon_18143021_18143589:CSRP2BP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 23618427 C/T 1 31 37 68 14.6208446548911 19.5493144441622 -4.92846978927116 T:C C T 10 0.528359849842223 0.274247230394415 ENSG00000101439:ENST00000398411:exon_23618257_23618582:CST3;ENSG00000101439:ENST00000376925:exon_23618257_23618663:CST3;ENSG00000101439:ENST00000398409:exon_23618257_23618569:CST3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 30157026 A/G 1 226 72 298 106.590673935658 38.0419091886401 68.5487647470176 A:G A G 10 0.528359849842223 3.51305648058294e-16 ENSG00000101294:ENST00000335574:exon_30156923_30157370:HM13;ENSG00000101294:ENST00000340852:exon_30156923_30157370:HM13;ENSG00000101294:ENST00000398174:exon_30156923_30157370:HM13;ENSG00000101294:ENST00000376127:exon_30156923_30157345:HM13;ENSG00000101294:ENST00000492709:exon_30156923_30157370:HM13;ENSG00000101294:ENST00000469097:exon_30156923_30157221:HM13;ENSG00000101294:ENST00000460389:exon_30156923_30157111:HM13;ENSG00000101294:ENST00000468559:exon_30156923_30157370:HM13;ENSG00000101294:ENST00000493364:exon_30156923_30157055:HM13;ENSG00000101294:ENST00000487281:exon_30156923_30157370:HM13 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 30381758 G/C 1 16 15 31 7.54624240252443 7.92539774763334 -0.379155345108911 C:G G C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000088325:ENST00000300403:exon_30381651_30381827:TPX2;ENSG00000088325:ENST00000340513:exon_30381651_30381827:TPX2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 30382315 A/G 1 28 20 48 13.2059242044178 10.5671969968445 2.6387272075733 A:G A G 10 0.528359849842223 0.472872700098135 ENSG00000088325:ENST00000300403:exon_30382205_30382351:TPX2;ENSG00000088325:ENST00000340513:exon_30382205_30382351:TPX2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 31427635 C/T 1 34 30 64 16.0357651053644 15.8507954952667 0.184969610097731 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000101367:ENST00000375571:exon_31427541_31427662:MAPRE1;ENSG00000101367:ENST00000414525:exon_31427541_31427662:MAPRE1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 33872311 G/C 1 13 6 19 6.1313219520511 3.17015909905334 2.96116285299776 C:G G C 10 0.528359849842223 0.250170755672362 ENSG00000242372:ENST00000440766:exon_33872184_33872326:EIF6;ENSG00000242372:ENST00000374436:exon_33872184_33872518:EIF6;ENSG00000242372:ENST00000462894:exon_33872184_33872505:EIF6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 34144746 A/G 1 214 238 452 100.930992133764 125.749644262449 -24.8186521286848 A:C:G A G 10 0.528359849842223 0.0208927851876047 ENSG00000125991:ENST00000348547:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000357394:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000447986:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000355563:exon_34144744_34144830:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000279052:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000416206:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000413587:exon_34144744_34144837:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000465298:exon_34144744_34144867:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000442139:exon_34144648_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000451605:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488935:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488384:exon_34144381_34144880:ERGIC3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 34214173 G/A 1 58 151 209 27.3551287091511 79.7823373261757 -52.4272086170246 A:G G A 10 0.528359849842223 3.03850691625762e-13 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34213953_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000415920:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000462352:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000498814:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000473373:exon_34213966_34214725:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34213980_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34213988_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34214008_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34214081_34214303:CPNE1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 34218673 G/C 1 74 26 100 34.9013711116755 13.7373560958978 21.1640150157777 C:G G C 10 0.528359849842223 1.98744617742132e-05 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34218361_34218956:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34218663_34218717:CPNE1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 34219480 G/A 1 18 97 115 8.48952270283999 51.2509054346956 -42.7613827318556 A:G G A 10 0.528359849842223 1.52546044590082e-16 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000412056:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000486021:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414664:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000416778:exon_34219416_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439806:exon_34219434_34219500:CPNE1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 34220755 C/T 1 3 28 31 1.41492045047333 14.7940757955822 -13.3791553451089 T:C C T 10 0.528359849842223 6.02553733148239e-07 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000412056:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414664:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000416778:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439806:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439669:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000420363:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000434795:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000440240:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000458038:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437100:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414711:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000435747:exon_34220717_34220845:CPNE1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 34502107 G/A 1 6 11 17 2.82984090094666 5.81195834826445 -2.98211744731779 A:G G A 10 0.528359849842223 0.223532760143352 ENSG00000025293:ENST00000374012:exon_34501955_34502119:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000439301:exon_34501955_34502119:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000373994:exon_34501955_34502119:PHF20 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 35865054 C/T 1 167 161 328 78.7639050763488 85.0659358245979 -6.30203074824914 A:T:C C T 10 0.528359849842223 0.507047210683997 ENSG00000118705:ENST00000237530:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373622:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000338768:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373628:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000397161:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000437329:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000470352:exon_35864983_35865112:RPN2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 36640187 C/T 1 10 7 17 4.71640150157777 3.69851894889556 1.01788255268221 T:C C T 10 0.528359849842223 0.80899735416499 ENSG00000101407:ENST00000373448:exon_36639917_36642259:TTI1;ENSG00000101407:ENST00000373447:exon_36639917_36642259:TTI1;ENSG00000101407:ENST00000449821:exon_36639917_36642305:TTI1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 37396181 T/C 1 11 2 13 5.18804165173555 1.05671969968445 4.1313219520511 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0251781600722013 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37396107_37396239:ACTR5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 37400490 G/A 1 16 5 21 7.54624240252443 2.64179924921111 4.90444315331332 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0466596726290735 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37400202_37400834:ACTR5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 37400506 C/T 1 12 3 15 5.65968180189332 1.58507954952667 4.07460225236666 T:C C T 10 0.528359849842223 0.039472132090448 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37400202_37400834:ACTR5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 42089511 T/C 1 233 210 443 109.892154986762 110.955568466867 -1.06341348010477 A:T:C T C 10 0.528359849842223 0.924245875629802 ENSG00000124193:ENST00000244020:exon_42089343_42092245:SRSF6;ENSG00000124193:ENST00000483871:exon_42089343_42092245:SRSF6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 42825929 C/T 1 83 67 150 39.1461324630955 35.4001099394289 3.74602252366656 T:C C T 10 0.528359849842223 0.567551241228762 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 42826350 A/C 1 50 36 86 23.5820075078889 19.02095459432 4.56105291356883 A:C A C 10 0.528359849842223 0.333409875594616 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 42826379 C/T 1 41 29 70 19.3372461564689 15.3224356454245 4.01481051104439 T:C C T 10 0.528359849842223 0.402196412336259 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 43252915 T/C 1 26 37 63 12.2626439041022 19.5493144441622 -7.28667054006005 T:C T C 10 0.528359849842223 0.076875904906072 ENSG00000196839:ENST00000372874:exon_43252843_43252970:ADA;ENSG00000196839:ENST00000464097:exon_43252843_43252970:ADA;ENSG00000196839:ENST00000492931:exon_43252843_43252970:ADA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 43530234 A/C 1 60 49 109 28.2984090094666 25.8896326422689 2.4087763671977 A:C A C 10 0.528359849842223 0.701423406931717 ENSG00000166913:ENST00000353703:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000479421:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000372839:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000428262:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000445830:exon_43530172_43530397:YWHAB HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 43566787 A/G 1 5 6 11 2.35820075078889 3.17015909905334 -0.811958348264453 A:G A G 10 0.528359849842223 0.765428811190486 ENSG00000101104:ENST00000255136:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000421240:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372821:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217073:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000476056:exon_43566686_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372824:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372819:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217075:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000479873:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372826:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000474208:exon_43566743_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000489068:exon_43566686_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372822:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000482486:exon_43566484_43566832:PABPC1L HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 43588968 G/C 1 10 7 17 4.71640150157777 3.69851894889556 1.01788255268221 C:G G C 10 0.528359849842223 0.80899735416499 ENSG00000025772:ENST00000372813:exon_43588848_43589127:TOMM34;ENSG00000025772:ENST00000372810:exon_43588848_43589036:TOMM34 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 43629135 G/A 1 11 2 13 5.18804165173555 1.05671969968445 4.1313219520511 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0251781600722013 ENSG00000101109:ENST00000372806:exon_43629033_43629161:STK4;ENSG00000101109:ENST00000396731:exon_43629033_43629161:STK4;ENSG00000101109:ENST00000372801:exon_43629033_43629161:STK4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 44052992 G/A 1 11 7 18 5.18804165173555 3.69851894889556 1.48952270283999 A:G G A 10 0.528359849842223 0.63817833418455 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44052856_44053021:PIGT HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 44520579 C/G 1 9 3 12 4.24476135141999 1.58507954952667 2.65968180189332 C:G C G 10 0.528359849842223 0.153759275498468 ENSG00000064601:ENST00000372471:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000372484:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000354880:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000191018:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000419493:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000372459:exon_44520555_44520666:CTSA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 44691350 T/G 1 11 10 21 5.18804165173555 5.28359849842223 -0.0955568466866819 T:G T G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000124160:ENST00000290231:exon_44689624_44691528:NCOA5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 45318042 G/A 1 3 12 15 1.41492045047333 6.34031819810668 -4.92539774763334 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0168777015247188 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45317771_45318418:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45317766_45318079:TP53RK HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 45318069 C/G 1 10 11 21 4.71640150157777 5.81195834826445 -1.09555684668668 C:G C G 10 0.528359849842223 0.667251391828987 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45317771_45318418:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45317766_45318079:TP53RK HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 47253043 G/A 1 13 12 25 6.1313219520511 6.34031819810668 -0.208996246055574 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47253001_47253221:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47253001_47253221:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47253001_47253221:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47253001_47253221:PREX1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 48522392 G/A 1 23 26 49 10.8477234536289 13.7373560958978 -2.88963264226892 A:G G A 10 0.528359849842223 0.474851569576429 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 48522585 G/A 1 8 12 20 3.77312120126222 6.34031819810668 -2.56719699684446 A:G G A 10 0.528359849842223 0.270560515458782 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 49196284 C/T 1 10 11 21 4.71640150157777 5.81195834826445 -1.09555684668668 T:C C T 10 0.528359849842223 0.667251391828987 ENSG00000196396:ENST00000371621:exon_49196240_49196463:PTPN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 49508683 G/A 1 14 12 26 6.60296210220888 6.34031819810668 0.262643904102203 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000101126:ENST00000371602:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000349014:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396029:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396032:exon_49506883_49511049:ADNP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 49509175 C/T 1 21 18 39 9.90444315331332 9.51047729716001 0.393965856153304 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000101126:ENST00000371602:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000349014:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396029:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396032:exon_49506883_49511049:ADNP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 54945211 T/G 1 44 34 78 20.7521666069422 17.9642348946356 2.78793171230661 T:G T G 10 0.528359849842223 0.571515955334642 ENSG00000087586:ENST00000395914:exon_54944445_54945396:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395909:exon_54944445_54945396:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000347343:exon_54944446_54945396:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395915:exon_54944446_54945396:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000312783:exon_54944446_54945396:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000371356:exon_54944446_54945396:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395913:exon_54944446_54945396:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395911:exon_54944446_54945396:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395907:exon_54944721_54945715:AURKA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 54945309 T/C 1 38 42 80 17.9223257059955 22.1911136933734 -4.26878798737783 T:C T C 10 0.528359849842223 0.370950553344917 ENSG00000087586:ENST00000395914:exon_54944445_54945396:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395909:exon_54944445_54945396:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000347343:exon_54944446_54945396:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395915:exon_54944446_54945396:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000312783:exon_54944446_54945396:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000371356:exon_54944446_54945396:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395913:exon_54944446_54945396:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395911:exon_54944446_54945396:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395907:exon_54944721_54945715:AURKA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 56185209 G/A 1 8 3 11 3.77312120126222 1.58507954952667 2.18804165173555 A:G G A 10 0.528359849842223 0.234829965499602 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000357677:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000343535:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000453793:exon_56185205_56185321:ZBP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 57269495 G/A 1 7 4 11 3.30148105110444 2.11343939936889 1.18804165173555 A:G G A 10 0.528359849842223 0.556038959282085 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57269478_57269648:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371137:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000445528:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000533788:exon_57269477_57269648:NPEPL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 57290347 C/G 1 20 25 45 9.43280300315554 13.2089962460556 -3.77619324290003 C:G C G 10 0.528359849842223 0.296773186900531 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57290224_57290466:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57290224_57290689:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57290224_57290606:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57290224_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57290224_57290466:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57287535_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57290224_57291367:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527081:exon_57290224_57290900:NPEPL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 57571763 A/G 1 81 89 170 38.2028521627799 47.0240266359578 -8.8211744731779 A:G A G 10 0.528359849842223 0.191561233532917 ENSG00000101160:ENST00000217131:exon_57571694_57571856:CTSZ HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 60713311 G/A 1 139 149 288 65.557980871931 78.7256176264912 -13.1676367545602 A:G G A 10 0.528359849842223 0.125028276396166 ENSG00000101182:ENST00000370873:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000442551:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000395567:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000484488:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000370861:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000486193:exon_60713227_60713346:PSMA7 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 60713332 A/G 1 145 135 280 68.3878217728777 71.3285797287001 -2.94075795582242 A:G A G 10 0.528359849842223 0.764782542793675 ENSG00000101182:ENST00000370873:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000442551:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000395567:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000484488:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000370861:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000486193:exon_60713227_60713346:PSMA7 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 60770942 C/T 1 5 8 13 2.35820075078889 4.22687879873778 -1.8686780479489 T:C C T 10 0.528359849842223 0.406657390173804 ENSG00000101181:ENST00000436421:exon_60770858_60771005:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000471352:exon_60770858_60771005:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000467101:exon_60770858_60771005:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000370823:exon_60770858_60771005:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000448254:exon_60770858_60771005:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000472005:exon_60770858_60771005:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000466099:exon_60770858_60771005:GTPBP5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 60883273 A/C 1 8 8 16 3.77312120126222 4.22687879873778 -0.453757597475567 A:C A C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000130702:ENST00000492698:exon_60883011_60883502:LAMA5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 60963494 C/T 1 11 5 16 5.18804165173555 2.64179924921111 2.54624240252443 T:C C T 10 0.528359849842223 0.221849866555357 ENSG00000171858:ENST00000492356:exon_60963365_60963575:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370562:exon_60962667_60963576:RPS21 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 61444523 C/T 1 83 57 140 39.1461324630955 30.1165114410067 9.02962102208879 T:C C T 10 0.528359849842223 0.128516616000930 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61443582_61444558:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61443582_61444558:OGFR HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 61538601 C/T 1 8 9 17 3.77312120126222 4.75523864858001 -0.98211744731779 T:C C T 10 0.528359849842223 0.637819172258138 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395340:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395335:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370371:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370368:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000354665:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370366:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000266071:exon_61538499_61538711:DIDO1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 61542863 G/A 1 5 4 9 2.35820075078889 2.11343939936889 0.244761351419994 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395340:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395335:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370371:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370368:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000354665:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370366:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000266071:exon_61542126_61542966:DIDO1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 61834695 G/A 1 7 9 16 3.30148105110444 4.75523864858001 -1.45375759747557 A:G G A 10 0.528359849842223 0.61804043960613 ENSG00000149658:ENST00000370339:exon_61833639_61835159:YTHDF1;ENSG00000149658:ENST00000370333:exon_61833639_61835159:YTHDF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 62119717 C/T 1 5 7 12 2.35820075078889 3.69851894889556 -1.34031819810668 T:C C T 10 0.528359849842223 0.56626847898003 ENSG00000101210:ENST00000298049:exon_62119366_62119778:EEF1A2;ENSG00000101210:ENST00000217182:exon_62119366_62119778:EEF1A2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 62127326 G/A 1 7 2 9 3.30148105110444 1.05671969968445 2.24476135141999 A:G G A 10 0.528359849842223 0.186011003558895 ENSG00000101210:ENST00000298049:exon_62127209_62127388:EEF1A2;ENSG00000101210:ENST00000217182:exon_62127209_62127388:EEF1A2;ENSG00000101210:ENST00000449908:exon_62127209_62130101:EEF1A2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 20 62331816 C/T 1 18 23 41 8.48952270283999 12.1522765463711 -3.66275384353114 T:C C T 10 0.528359849842223 0.275737811319982 ENSG00000101246:ENST00000359715:exon_62329996_62331882:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000440854:exon_62329996_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000485858:exon_62330809_62331882:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000217224:exon_62330809_62331882:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000324228:exon_62330809_62331882:ARFRP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 21 34614255 T/G 1 14 11 25 6.60296210220888 5.81195834826445 0.791003753944426 T:G T G 10 0.528359849842223 0.84244030516468 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 21 35281393 A/G 1 205 217 422 96.6862307823443 114.654087415762 -17.9678566334181 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0877915235727468 ENSG00000249209:ENST00000429238:exon_35281386_35281515:AP000304.12;ENSG00000241837:ENST00000491703:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000290299:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000418933:exon_35281386_35281399:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000495005:exon_35281118_35281515:ATP5O HGDP00247_parsed_pileup.txt . 21 37420650 G/A 1 7 5 12 3.30148105110444 2.64179924921111 0.659681801893325 A:G G A 10 0.528359849842223 0.778733618574385 ENSG00000185917:ENST00000399215:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399212:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000332131:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399205:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399208:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399201:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399207:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000414900:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000424303:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000429161:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000485865:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000446166:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000442559:exon_37420620_37420694:SETD4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 21 37444973 C/T 1 40 73 113 18.8656060063111 38.5702690384823 -19.7046630321712 T:C C T 10 0.528359849842223 0.000216101508281170 ENSG00000159228:ENST00000530908:exon_37444113_37445464:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000290349:exon_37444744_37445464:CBR1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 21 38437951 T/G 1 49 43 92 23.1103673577311 22.7194735432156 0.39089381451549 T:G T G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000185808:ENST00000464265:exon_38435146_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000360525:exon_38436448_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399102:exon_38437674_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399098:exon_38437674_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399103:exon_38437674_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000329667:exon_38437674_38438012:PIGP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 21 40549466 T/C 1 50 60 110 23.5820075078889 31.7015909905334 -8.11958348264452 T:C T C 10 0.528359849842223 0.127094951404087 ENSG00000183527:ENST00000331573:exon_40549361_40549497:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000440607:exon_40549361_40549497:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000481921:exon_40549361_40549497:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000411828:exon_40549361_40549497:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000380900:exon_40549361_40549497:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000431628:exon_40549361_40549497:PSMG1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 21 40552307 A/G 1 16 17 33 7.54624240252443 8.98211744731779 -1.43587504479336 A:G A G 10 0.528359849842223 0.727923620154862 ENSG00000183527:ENST00000331573:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000440607:exon_40552211_40552364:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000411828:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000380900:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000431628:exon_40552211_40552362:PSMG1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 21 42812891 C/T 1 97 86 183 45.7490945653044 45.4389470864312 0.310147478873205 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42812814_42812952:MX1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 21 42817930 G/A 1 243 253 496 114.60855648834 133.675042010082 -19.0664855217426 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0875874589474207 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000486275:exon_42817927_42818068:MX1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 21 42824661 A/G 1 234 189 423 110.36379513692 99.8600116201801 10.5037835167397 A:G A G 10 0.528359849842223 0.330060228531454 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000491110:exon_42824548_42824747:MX1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 21 42824733 G/A 1 317 372 689 149.509927600015 196.549864141307 -47.0399365412916 A:C:G G A 10 0.528359849842223 0.000379809044285964 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000491110:exon_42824548_42824747:MX1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 21 45217559 T/C 1 84 71 155 39.6177726132533 37.5135493387978 2.10422327445544 T:C T C 10 0.528359849842223 0.74827908050103 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000483896:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217512_45217576:RRP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 21 45732116 C/T 1 32 14 46 15.0924848050489 7.39703789779112 7.69544690725774 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0261957468958814 ENSG00000141959:ENST00000349048:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000397961:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000496824:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000466134:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000491298:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000403390:exon_45731988_45732177:PFKL HGDP00247_parsed_pileup.txt . 21 45750248 G/A 1 4 6 10 1.88656060063111 3.17015909905334 -1.28359849842223 A:G G A 10 0.528359849842223 0.531770325189017 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 21 47581423 C/T 1 27 93 120 12.73428405426 49.1374660353267 -36.4031819810668 T:C C T 10 0.528359849842223 1.98732450912435e-11 ENSG00000160284:ENST00000330205:exon_47581062_47581619:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000416550:exon_47581063_47581619:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000291672:exon_47581075_47581619:C21orf56 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 21 47581835 C/T 1 18 54 72 8.48952270283999 28.53143189148 -20.0419091886401 T:C C T 10 0.528359849842223 2.3370772848356e-06 ENSG00000160284:ENST00000330205:exon_47581830_47581981:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000416550:exon_47581830_47581981:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000291672:exon_47581830_47581981:C21orf56 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 21 47581949 C/T 1 10 20 30 4.71640150157777 10.5671969968445 -5.85079549526669 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0427862000607947 ENSG00000160284:ENST00000330205:exon_47581830_47581981:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000416550:exon_47581830_47581981:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000291672:exon_47581830_47581981:C21orf56 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 21 47614469 A/C 1 1 12 13 0.471640150157777 6.34031819810668 -5.8686780479489 A:C A C 10 0.528359849842223 0.00113937636486808 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000419093:exon_47614405_47614494:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47614405_47614575:LSS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 21 47635627 C/G 1 2 7 9 0.943280300315554 3.69851894889556 -2.75523864858001 C:G C G 10 0.528359849842223 0.0939591166432567 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000464357:exon_47635599_47635707:LSS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 21 47676711 G/A 1 23 9 32 10.8477234536289 4.75523864858001 6.09248480504886 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0336908770936798 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000467026:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000481113:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000494755:exon_47676390_47676900:MCM3AP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 21 47852085 G/A 1 4 7 11 1.88656060063111 3.69851894889556 -1.81195834826445 A:G G A 10 0.528359849842223 0.368338354344120 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT HGDP00247_parsed_pileup.txt . 21 48063476 C/G 1 17 17 34 8.01788255268221 8.98211744731779 -0.964234894635581 C:G C G 10 0.528359849842223 0.863945522489226 ENSG00000160310:ENST00000355680:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397638:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397637:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000334494:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397628:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000458387:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000291705:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397634:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000451211:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000440086:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000482508:exon_48063198_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000481861:exon_48063447_48063551:PRMT2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 18609642 C/T 1 9 7 16 4.24476135141999 3.69851894889556 0.546242402524432 T:C C T 10 0.528359849842223 0.808617085826636 ENSG00000215193:ENST00000474897:exon_18609121_18609801:PEX26;ENSG00000183785:ENST00000316027:exon_18609121_18609801:TUBA8;ENSG00000183785:ENST00000330423:exon_18609121_18609801:TUBA8;ENSG00000183785:ENST00000416740:exon_18609121_18609801:TUBA8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 19165478 A/G 1 29 34 63 13.6775643545755 17.9642348946356 -4.28667054006005 A:G A G 10 0.528359849842223 0.313291679421674 ENSG00000100075:ENST00000215882:exon_19165455_19165554:SLC25A1;ENSG00000100075:ENST00000451283:exon_19165455_19165554:SLC25A1;ENSG00000100075:ENST00000470922:exon_19165240_19165554:SLC25A1;ENSG00000100075:ENST00000461267:exon_19165455_19165554:SLC25A1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 19423250 G/A 1 248 196 444 116.966757239129 103.558530569076 13.408226670053 A:T:G G A 10 0.528359849842223 0.216474113951731 ENSG00000185608:ENST00000333130:exon_19423161_19423598:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000443660:exon_19423161_19423590:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000471259:exon_19423161_19423533:MRPL40 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 19789541 A/C 1 41 16 57 19.3372461564689 8.45375759747557 10.8834885589933 A:C A C 10 0.528359849842223 0.004884128932481 ENSG00000185838:ENST00000329517:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000403325:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000460402:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000451413:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000481086:exon_19789522_19789739:GNB1L HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 19950235 C/T 1 49 37 86 23.1103673577311 19.5493144441622 3.56105291356883 T:C C T 10 0.528359849842223 0.452053695914226 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19949756_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000467943:exon_19950050_19950399:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19950070_19950338:COMT HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 19951207 C/G 1 23 21 44 10.8477234536289 11.0955568466867 -0.24783339305781 C:G C G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 19951271 G/A 1 98 103 201 46.2207347154622 54.421064533749 -8.20032981828681 A:G G A 10 0.528359849842223 0.258643693450062 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000428707:exon_19951222_19951282:COMT HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 21984205 A/G 1 33 30 63 15.5641249552066 15.8507954952667 -0.286670540060046 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21984140_21984301:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21983597_21984320:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21984140_21984353:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21984140_21984353:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21984140_21984332:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21984140_21984327:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21984140_21984303:YDJC HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 22049783 C/T 1 12 10 22 5.65968180189332 5.28359849842223 0.376083303471095 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000100023:ENST00000412327:exon_22049687_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000335025:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000398831:exon_22049683_22050712:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000456792:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000417788:exon_22049683_22052201:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000406385:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000446951:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000462188:exon_22049226_22049785:PPIL2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 22453513 C/T 0 103 0 103 48.578935466251 0 48.578935466251 C C 10 0.528359849842223 3.05745345257698e-29 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 22550450 C/G 1 19 4 23 8.96116285299776 2.11343939936889 6.84772345362887 C:G C G 10 0.528359849842223 0.00538254792161541 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 22550510 T/G 1 31 17 48 14.6208446548911 8.98211744731779 5.6387272075733 T:G T G 10 0.528359849842223 0.112833197636628 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 23154683 C/T 1 44 193 237 20.7521666069422 101.973451019549 -81.2212844126068 T:C C T 10 0.528359849842223 1.62712504885569e-27 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 23223570 G/A 0 19 3 22 8.96116285299776 1.58507954952667 7.3760833034711 T:G G T 10 0.528359849842223 0.0019672226230009 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 26860269 G/C 1 6 15 21 2.82984090094666 7.92539774763334 -5.09555684668668 C:G G C 10 0.528359849842223 0.0291421032618403 ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000312736:exon_26860210_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000422379:exon_26860205_26860792:HPS4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 26937327 C/G 1 16 14 30 7.54624240252443 7.39703789779112 0.149204504733311 C:G C G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000128294:ENST00000338754:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000528868:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000403880:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000398110:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000422943:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000455980:exon_26936755_26937601:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000446035:exon_26936755_26937600:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000442495:exon_26937172_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000454778:exon_26937237_26937684:TPST2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 29727866 C/T 1 20 14 34 9.43280300315554 7.39703789779112 2.03576510536442 T:C C T 10 0.528359849842223 0.498590448787879 ENSG00000100280:ENST00000482818:exon_29727776_29728310:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000472057:exon_29727776_29727905:AP1B1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 29886413 A/G 1 33 11 44 15.5641249552066 5.81195834826445 9.75216660694219 A:G A G 10 0.528359849842223 0.00366290487797116 ENSG00000100285:ENST00000310624:exon_29884838_29887379:NEFH;ENSG00000100285:ENST00000328842:exon_29886042_29886692:NEFH HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 30184950 A/G 1 125 146 271 58.9550187697221 77.1405380769645 -18.1855193072424 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0284398212175375 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30184597_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30184600_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30184605_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30184631_30185173:ASCC2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 30200713 G/A 1 8 13 21 3.77312120126222 6.8686780479489 -3.09555684668668 A:G G A 10 0.528359849842223 0.194999185861965 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30200627_30200819:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30200627_30200813:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30200627_30200819:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30200627_30200819:ASCC2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 30200761 C/G 1 14 19 33 6.60296210220888 10.0388371470022 -3.43587504479336 C:G C G 10 0.528359849842223 0.295465692465376 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30200627_30200819:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30200627_30200813:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30200627_30200819:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30200627_30200819:ASCC2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 30221120 C/T 1 11 6 17 5.18804165173555 3.17015909905334 2.01788255268221 A:T:C C T 10 0.528359849842223 0.467320757987905 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000431535:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000495967:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000412689:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000465667:exon_30221075_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000463203:exon_30221076_30221347:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000495681:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000462454:exon_30221092_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000453160:exon_30221097_30221246:ASCC2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 30689998 G/A 1 11 7 18 5.18804165173555 3.69851894889556 1.48952270283999 A:G G A 10 0.528359849842223 0.63817833418455 ENSG00000248751:ENST00000330168:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000434987:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000434291:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000418047:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000447976:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000470854:exon_30689974_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000467596:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000462073:exon_30689640_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000466666:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000437122:exon_30689910_30690099:TBC1D10A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 30987861 G/C 1 6 4 10 2.82984090094666 2.11343939936889 0.71640150157777 C:G G C 10 0.528359849842223 0.757839432335683 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30987797_30987927:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30987797_30987867:PES1;ENSG00000100029:ENST00000433575:exon_30987797_30987865:PES1;ENSG00000100029:ENST00000466614:exon_30987797_30987877:PES1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 31333631 T/C 1 8 6 14 3.77312120126222 3.17015909905334 0.602962102208878 T:C T C 10 0.528359849842223 0.795199355745845 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31333570_31333698:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31333570_31333698:MORC2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 31737436 G/A 1 9 7 16 4.24476135141999 3.69851894889556 0.546242402524432 A:G G A 10 0.528359849842223 0.808617085826636 ENSG00000100105:ENST00000215919:exon_31736663_31737669:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000465287:exon_31736663_31737669:PATZ1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 31741067 G/A 1 5 4 9 2.35820075078889 2.11343939936889 0.244761351419994 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000100105:ENST00000266269:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000405309:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000351933:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000440325:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000215919:exon_31740318_31741762:PATZ1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 32007153 G/A 1 8 2 10 3.77312120126222 1.05671969968445 2.71640150157777 A:G G A 10 0.528359849842223 0.11503004681301 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000524296:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000417682:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000466991:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000491973:exon_32007129_32007289:SFI1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 32011225 T/C 1 17 20 37 8.01788255268221 10.5671969968445 -2.54931444416225 T:C T C 10 0.528359849842223 0.415286332140313 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000474741:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000476577:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000464333:exon_32010357_32012863:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000357852:exon_32010372_32011265:SFI1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 32352791 G/A 1 129 179 308 60.8415793703532 94.5764131217579 -33.7348337514047 A:G G A 10 0.528359849842223 0.000125759234877362 ENSG00000128245:ENST00000248975:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000397492:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000471374:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000427094:exon_32352126_32353589:YWHAH HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 32795641 C/T 1 25 22 47 11.7910037539444 11.6239166965289 0.167087057415522 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000498434:exon_32795590_32795972:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000476619:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000485373:exon_32795590_32795746:C22orf28 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 35660875 G/T 1 9 13 22 4.24476135141999 6.8686780479489 -2.62391669652891 T:G G T 10 0.528359849842223 0.291037847710403 ENSG00000100281:ENST00000420166:exon_35660641_35661563:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000418170:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000455359:exon_35660641_35661560:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397385:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397384:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000216106:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000444518:exon_35660641_35661596:HMGXB4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 36661330 G/A 1 9 15 24 4.24476135141999 7.92539774763334 -3.68063639621335 A:G G A 10 0.528359849842223 0.154213959723728 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000427990:exon_36661197_36661361:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 36661536 C/A 1 19 29 48 8.96116285299776 15.3224356454245 -6.3612727924267 A:C C A 10 0.528359849842223 0.0819284197174238 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 36661566 G/A 1 18 26 44 8.48952270283999 13.7373560958978 -5.24783339305781 A:G G A 10 0.528359849842223 0.131166419988705 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 36661646 G/A 1 13 27 40 6.1313219520511 14.26571594574 -8.13439399368892 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0109930947889461 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 36661842 G/A 1 22 21 43 10.3760833034711 11.0955568466867 -0.719473543215587 A:G G A 10 0.528359849842223 0.879182848917074 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 36691607 A/C 1 59 68 127 27.8267688593088 35.9284697892712 -8.10170092996232 A:C A C 10 0.528359849842223 0.155716535512676 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36691551_36691763:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36691551_36691763:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36691551_36691763:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000459960:exon_36691558_36691763:MYH9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 37271802 C/T 1 15 7 22 7.07460225236666 3.69851894889556 3.3760833034711 T:C C T 10 0.528359849842223 0.199830145980257 ENSG00000100365:ENST00000447071:exon_37271695_37271874:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000248899:exon_37271695_37271825:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37271695_37272136:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000336951:exon_37271695_37272114:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000439078:exon_37271695_37271874:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37271695_37272136:NCF4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 37273742 G/A 1 53 29 82 24.9969279583622 15.3224356454245 9.67449231293772 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0353825641811927 ENSG00000100365:ENST00000248899:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37273670_37273806:NCF4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 38039128 A/G 1 22 8 30 10.3760833034711 4.22687879873778 6.14920450473331 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0276754547647250 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38039105_38039181:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38039105_38039181:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000336738:exon_38039105_38039181:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38039105_38039181:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38039105_38039181:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38039105_38039181:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000495174:exon_38039105_38039181:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38039105_38039181:SH3BP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 38039708 T/C 1 38 32 70 17.9223257059955 16.9075151949511 1.0148105110444 T:C T C 10 0.528359849842223 0.904821084858741 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000336738:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000495174:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000471650:exon_38039462_38039795:SH3BP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 38046718 A/G 1 16 23 39 7.54624240252443 12.1522765463711 -4.6060341438467 A:G A G 10 0.528359849842223 0.151055456428611 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000466097:exon_38046549_38046785:SH3BP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 38164106 C/T 1 11 5 16 5.18804165173555 2.64179924921111 2.54624240252443 T:C C T 10 0.528359849842223 0.221849866555357 ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38164081_38164183:NOL12;ENSG00000100106:ENST00000406386:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000344404:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000403663:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000421615:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000448466:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000443065:exon_38164081_38164183:TRIOBP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 38212762 A/G 1 14 14 28 6.60296210220888 7.39703789779112 -0.794075795582243 A:G A G 10 0.528359849842223 0.850635285686568 ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38212574_38212904:GCAT HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 38251629 C/G 1 54 36 90 25.46856810852 19.02095459432 6.44761351419993 C:G C G 10 0.528359849842223 0.204960152763072 ENSG00000100129:ENST00000412331:exon_38251572_38251651:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000262832:exon_38251572_38251651:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000439997:exon_38251572_38251651:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000381683:exon_38251572_38251651:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000425539:exon_38251572_38251651:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000414316:exon_38251572_38251651:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000436452:exon_38251572_38251651:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000477256:exon_38251572_38251651:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000451427:exon_38251572_38251651:EIF3L HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 38323700 C/T 1 5 5 10 2.35820075078889 2.64179924921111 -0.283598498422229 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000100139:ENST00000215957:exon_38323418_38323833:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000414653:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000454685:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000402631:exon_38323418_38323833:MICALL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 39440149 C/T 1 14 13 27 6.60296210220888 6.8686780479489 -0.26571594574002 A:T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000128394:ENST00000381565:exon_39440088_39440428:APOBEC3F HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 39445554 G/A 1 6 7 13 2.82984090094666 3.69851894889556 -0.868678047948899 A:G G A 10 0.528359849842223 0.782884637593256 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39445430_39445586:APOBEC3F;ENSG00000128394:ENST00000476513:exon_39445430_39445586:APOBEC3F HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 39448615 A/G 1 16 22 38 7.54624240252443 11.6239166965289 -4.07767429400447 A:G A G 10 0.528359849842223 0.196930142064475 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 39448711 C/A 1 25 18 43 11.7910037539444 9.51047729716001 2.28052645678441 A:C C A 10 0.528359849842223 0.54283693699514 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 39448750 T/C 1 22 18 40 10.3760833034711 9.51047729716001 0.865606006311081 T:C T C 10 0.528359849842223 0.874588571314228 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 40814500 T/C 1 9 8 17 4.24476135141999 4.22687879873778 0.0178825526822095 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000469304:exon_40814378_40814524:MKL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 40814594 C/T 1 14 10 24 6.60296210220888 5.28359849842223 1.31936360378665 T:C C T 10 0.528359849842223 0.684580806653448 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 42280889 G/A 1 17 13 30 8.01788255268221 6.8686780479489 1.14920450473331 A:C:G G A 10 0.528359849842223 0.71778823657468 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42280846_42281015:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42280846_42281015:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42280846_42281015:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42280846_42281015:SREBF2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 42912029 G/T 1 38 25 63 17.9223257059955 13.2089962460556 4.71332945993996 T:G G T 10 0.528359849842223 0.257281872150388 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000416699:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000483303:exon_42912017_42912302:RRP7A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 42981890 G/A 1 9 12 21 4.24476135141999 6.34031819810668 -2.09555684668668 A:G G A 10 0.528359849842223 0.389033912530957 ENSG00000100227:ENST00000445215:exon_42979727_42981974:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000348657:exon_42979727_42981974:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000252115:exon_42979727_42981974:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000415122:exon_42979729_42981974:POLDIP3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 42998902 G/T 1 14 10 24 6.60296210220888 5.28359849842223 1.31936360378665 T:G G T 10 0.528359849842223 0.684580806653448 ENSG00000100227:ENST00000445215:exon_42998776_42999166:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000348657:exon_42998776_42999166:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000252115:exon_42998776_42999166:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000415122:exon_42998776_42999166:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000451060:exon_42998776_42999166:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000339677:exon_42998776_42999166:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000491021:exon_42998776_42999018:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000452567:exon_42998776_42999166:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000414913:exon_42998776_42999166:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000454057:exon_42998776_42999166:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000463133:exon_42998774_42999166:POLDIP3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 43010817 G/A 1 8 10 18 3.77312120126222 5.28359849842223 -1.51047729716001 A:G G A 10 0.528359849842223 0.490179587566891 ENSG00000100227:ENST00000445215:exon_43010805_43010875:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000348657:exon_43010805_43010937:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000252115:exon_43010805_43010968:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000415122:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000451060:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000339677:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000452567:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000414913:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000454057:exon_43010805_43010866:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000463133:exon_43010805_43010883:POLDIP3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 43195147 A/G 1 10 10 20 4.71640150157777 5.28359849842223 -0.567196996844459 A:G A G 10 0.528359849842223 0.826247654639236 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000429508:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000452960:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000456251:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000440262:exon_43195045_43195166:ARFGAP3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 43203137 C/T 1 5 10 15 2.35820075078889 5.28359849842223 -2.92539774763334 T:C C T 10 0.528359849842223 0.194650532535346 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000429508:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000452960:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000456251:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453516:exon_43203080_43203169:ARFGAP3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 43278220 C/T 1 7 7 14 3.30148105110444 3.69851894889556 -0.397037897791122 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000100266:ENST00000505238:exon_43278190_43278256:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000496919:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000473715:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000263246:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000337959:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000407585:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000403744:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000402229:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000436831:exon_43278190_43278310:PACSIN2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 43289473 G/A 1 4 10 14 1.88656060063111 5.28359849842223 -3.39703789779112 A:G G A 10 0.528359849842223 0.105381577517645 ENSG00000100266:ENST00000496919:exon_43289463_43289560:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000473715:exon_43289463_43289560:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000263246:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000337959:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000407585:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000403744:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000402229:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000436831:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000453643:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000418133:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000422336:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000445706:exon_43289463_43289619:PACSIN2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 43558926 A/G 1 84 20 104 39.6177726132533 10.5671969968445 29.0505756164088 A:G A G 10 0.528359849842223 4.70390446927035e-09 ENSG00000100300:ENST00000337554:exon_43558809_43559248:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000396265:exon_43558809_43559247:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000361449:exon_43558809_43559247:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000329563:exon_43558809_43559216:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000445018:exon_43558809_43558997:TSPO HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 44368122 A/G 1 13 14 27 6.1313219520511 7.39703789779112 -1.26571594574002 A:G A G 10 0.528359849842223 0.701520600568723 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000493161:exon_44368116_44368222:SAMM50 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 44372632 C/T 1 40 23 63 18.8656060063111 12.1522765463711 6.71332945993995 T:C C T 10 0.528359849842223 0.101049288083040 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44372630_44372701:SAMM50 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 44386281 C/T 1 93 87 180 43.8625339646733 45.9673069362734 -2.10477297160013 T:C C T 10 0.528359849842223 0.76566490773566 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000494795:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000465768:exon_44386208_44386286:SAMM50 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 45723854 C/G 0 9 0 9 4.24476135141999 0 4.24476135141999 C C 10 0.528359849842223 0.00436376312451053 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000442334:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405673:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000477714:exon_45723723_45724122:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45723723_45723944:FAM118A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 46685380 C/T 1 2 6 8 0.943280300315554 3.17015909905334 -2.22687879873778 T:C C T 10 0.528359849842223 0.159873274171007 ENSG00000075234:ENST00000381031:exon_46685299_46685458:TTC38;ENSG00000075234:ENST00000445282:exon_46685299_46685458:TTC38;ENSG00000075234:ENST00000451998:exon_46685299_46685458:TTC38 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 46704243 C/T 1 11 6 17 5.18804165173555 3.17015909905334 2.01788255268221 T:C C T 10 0.528359849842223 0.467320757987905 ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46704216_46704840:GTSE1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 46704676 A/G 1 7 9 16 3.30148105110444 4.75523864858001 -1.45375759747557 A:G A G 10 0.528359849842223 0.61804043960613 ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46704216_46704840:GTSE1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 46709881 G/A 1 2 11 13 0.943280300315554 5.81195834826445 -4.8686780479489 A:G G A 10 0.528359849842223 0.00963483143493747 ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46709787_46709910:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46709787_46709910:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46709787_46709910:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46709787_46709910:GTSE1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 46712077 C/T 1 3 9 12 1.41492045047333 4.75523864858001 -3.34031819810668 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0796925302844448 ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46711929_46712309:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46711929_46712309:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46711929_46712309:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46711929_46712309:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000479645:exon_46711934_46712309:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000466510:exon_46711934_46712309:GTSE1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 46719100 C/G 1 8 5 13 3.77312120126222 2.64179924921111 1.1313219520511 C:G C G 10 0.528359849842223 0.589076720209571 ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46719087_46719159:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46719087_46719159:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46719087_46719159:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46719087_46719159:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000479645:exon_46719087_46719159:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000466510:exon_46719087_46719159:GTSE1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 46722531 C/T 1 4 10 14 1.88656060063111 5.28359849842223 -3.39703789779112 T:C C T 10 0.528359849842223 0.105381577517645 ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000479645:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000466510:exon_46722333_46723213:GTSE1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 50297888 T/C 1 10 16 26 4.71640150157777 8.45375759747557 -3.7373560958978 T:C T C 10 0.528359849842223 0.170014402542493 ENSG00000182858:ENST00000330817:exon_50297827_50297902:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000332276:exon_50297827_50297902:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000486602:exon_50297827_50297902:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000492791:exon_50297827_50297902:ALG12 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 50301476 T/C 1 3 10 13 1.41492045047333 5.28359849842223 -3.8686780479489 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0481535635556358 ENSG00000182858:ENST00000330817:exon_50301369_50301592:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000332276:exon_50301369_50301592:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000486602:exon_50301369_50301566:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000492791:exon_50301369_50301592:ALG12 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 50313438 T/C 1 10 6 16 4.71640150157777 3.17015909905334 1.54624240252443 T:C T C 10 0.528359849842223 0.46618456350988 ENSG00000184164:ENST00000450207:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000457871:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000482956:exon_50313378_50313488:CRELD2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 50319079 T/G 1 67 25 92 31.5998900605711 13.2089962460556 18.3908938145155 T:C:G T G 10 0.528359849842223 9.85591437794968e-05 ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50319065_50320153:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000487969:exon_50316858_50319205:CRELD2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 50319170 A/G 1 111 41 152 52.3520566675133 21.6627538435311 30.6893028239821 A:G A G 10 0.528359849842223 5.07752639038503e-07 ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50319065_50320153:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000487969:exon_50316858_50319205:CRELD2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 50356302 C/T 1 8 4 12 3.77312120126222 2.11343939936889 1.65968180189332 T:C C T 10 0.528359849842223 0.396971345501871 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 50356555 T/C 1 11 1 12 5.18804165173555 0.528359849842223 4.65968180189332 T:C T C 10 0.528359849842223 0.00729327072053999 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 50356693 T/C 1 85 73 158 40.089412763411 38.5702690384823 1.51914372492877 T:C T C 10 0.528359849842223 0.873443349126893 ENSG00000198355:ENST00000360612:exon_50356588_50357728:PIM3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 50637597 G/C 1 187 189 376 88.1967080795043 99.8600116201801 -11.6633035406758 C:G G C 10 0.528359849842223 0.235029187035954 ENSG00000170638:ENST00000380909:exon_50636774_50637993:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000303434:exon_50636774_50638027:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000463233:exon_50636774_50638024:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395827:exon_50636774_50637904:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395829:exon_50637545_50637998:TRABD HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 50716167 G/A 1 19 25 44 8.96116285299776 13.2089962460556 -4.24783339305781 A:G G A 10 0.528359849842223 0.227845767854781 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479818:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50716020_50716167:PLXNB2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 50719251 A/G 1 16 17 33 7.54624240252443 8.98211744731779 -1.43587504479336 A:G A G 10 0.528359849842223 0.727923620154862 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50719173_50719402:PLXNB2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 50720622 C/T 1 5 8 13 2.35820075078889 4.22687879873778 -1.8686780479489 T:C C T 10 0.528359849842223 0.406657390173804 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50720613_50720742:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50720613_50720742:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50720613_50720991:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50720613_50720742:PLXNB2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 50752150 C/T 1 48 41 89 22.6387272075733 21.6627538435311 0.975973364042154 T:C C T 10 0.528359849842223 0.915530331291206 ENSG00000205593:ENST00000413817:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000380836:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000495607:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000411673:exon_50752064_50752153:FAM116B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 50845187 C/T 1 3 6 9 1.41492045047333 3.17015909905334 -1.75523864858001 T:C C T 10 0.528359849842223 0.322385551531720 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50845118_50845304:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50845118_50845304:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50845118_50845304:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50845118_50845304:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50845118_50845304:PPP6R2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 50877144 C/T 1 17 19 36 8.01788255268221 10.0388371470022 -2.02095459432003 T:C C T 10 0.528359849842223 0.509691879371529 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50877028_50877191:PPP6R2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 50941985 T/C 1 30 30 60 14.1492045047333 15.8507954952667 -1.70159099053338 T:C T C 10 0.528359849842223 0.699113837436635 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50941380_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50941426_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50941690_50942128:LMF2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 50944128 G/A 1 7 6 13 3.30148105110444 3.17015909905334 0.131321952051101 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 50944163 G/A 1 5 5 10 2.35820075078889 2.64179924921111 -0.283598498422229 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 50962208 T/G 1 144 109 253 67.9161816227199 57.5912236328023 10.3249579899176 T:G T G 10 0.528359849842223 0.207918306759159 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 50962782 C/G 1 53 51 104 24.9969279583622 26.9463523419534 -1.94942438359119 C:G C G 10 0.528359849842223 0.768429494806365 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000439934:exon_50962431_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000423348:exon_50962431_50962853:SCO2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 50964236 G/A 1 241 182 423 113.665276188024 96.1614926712846 17.5037835167397 A:G G A 10 0.528359849842223 0.088540023185734 ENSG00000025708:ENST00000395680:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395681:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000252029:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000487577:exon_50964184_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395678:exon_50964185_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000476284:exon_50964186_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000425169:exon_50964214_50964347:TYMP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 50988062 G/T 1 3 11 14 1.41492045047333 5.81195834826445 -4.39703789779112 T:G G T 10 0.528359849842223 0.0286834249686330 ENSG00000130487:ENST00000395676:exon_50986462_50989451:KLHDC7B;ENSG00000130487:ENST00000252783:exon_50986462_50988541:KLHDC7B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 51009953 C/T 1 6 16 22 2.82984090094666 8.45375759747557 -5.62391669652891 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0184915387057276 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000440709:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000497224:exon_51009587_51009968:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51009804_51009968:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51009804_51009962:CTA-384D8.32 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 51011376 G/C 1 7 2 9 3.30148105110444 1.05671969968445 2.24476135141999 C:G G C 10 0.528359849842223 0.186011003558895 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000475238:exon_51011304_51011529:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000423069:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51011304_51011489:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51011304_51011489:CTA-384D8.32 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 22 51064039 G/C 1 21 29 50 9.90444315331332 15.3224356454245 -5.41799249211115 C:G G C 10 0.528359849842223 0.156018758098866 ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51064007_51064109:ARSA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 3189279 A/G 1 10 12 22 4.71640150157777 6.34031819810668 -1.62391669652891 A:G A G 10 0.528359849842223 0.527319699445417 ENSG00000072756:ENST00000251607:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000473275:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000280591:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000434583:exon_3189134_3189387:TRNT1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 3194088 C/T 1 7 5 12 3.30148105110444 2.64179924921111 0.659681801893325 T:C C T 10 0.528359849842223 0.778733618574385 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 9792876 G/C 1 20 13 33 9.43280300315554 6.8686780479489 2.56412495520664 C:G G C 10 0.528359849842223 0.389614952678449 ENSG00000114026:ENST00000302003:exon_9792629_9792876:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000344629:exon_9792629_9792876:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000302036:exon_9792629_9792876:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000457221:exon_9792629_9792876:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000349503:exon_9792629_9792876:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000359753:exon_9792629_9792876:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339542:exon_9792629_9792876:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339511:exon_9792629_9792876:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000449570:exon_9792629_9792876:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000302008:exon_9792629_9792876:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000383826:exon_9792629_9792876:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000429146:exon_9792629_9792876:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000432857:exon_9792648_9792876:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000426518:exon_9792763_9792876:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000352937:exon_9792776_9792876:OGG1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 9798773 C/G 1 15 9 24 7.07460225236666 4.75523864858001 2.31936360378665 C:G C G 10 0.528359849842223 0.415665286985416 ENSG00000114026:ENST00000302003:exon_9798728_9799091:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000344629:exon_9798745_9799197:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339542:exon_9798745_9799087:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339511:exon_9798451_9799061:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000425665:exon_9798451_9798888:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000383825:exon_9798451_9798875:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000416333:exon_9798728_9798875:OGG1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 9867625 C/T 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 T:C C T 10 0.528359849842223 0.743278251879842 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9867484_9867632:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000482269:exon_9867090_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000492440:exon_9867250_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000466245:exon_9867545_9867632:TTLL3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 9870857 G/A 1 12 17 29 5.65968180189332 8.98211744731779 -3.32243564542447 A:G G A 10 0.528359849842223 0.264981051050274 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9870644_9871079:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000431204:exon_9870644_9870936:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9870363_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000466245:exon_9870644_9871019:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9870847_9871079:TTLL3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 9871030 T/G 1 22 20 42 10.3760833034711 10.5671969968445 -0.191113693373364 T:G T G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9870644_9871079:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9870363_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9870847_9871079:TTLL3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 9874914 C/T 1 5 9 14 2.35820075078889 4.75523864858001 -2.39703789779112 T:C C T 10 0.528359849842223 0.284555554939117 ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9874788_9874929:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9874788_9874929:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9874788_9874929:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9874788_9874929:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9874788_9874957:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9874788_9874929:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9874788_9874929:TTLL3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 9934605 T/C 1 34 32 66 16.0357651053644 16.9075151949511 -0.871750089586715 T:C T C 10 0.528359849842223 0.90202914613877 ENSG00000171135:ENST00000307768:exon_9934599_9936033:JAGN1;ENSG00000171135:ENST00000489724:exon_9934493_9934655:JAGN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 9990800 G/C 1 15 9 24 7.07460225236666 4.75523864858001 2.31936360378665 C:G G C 10 0.528359849842223 0.415665286985416 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 9991101 C/G 1 7 7 14 3.30148105110444 3.69851894889556 -0.397037897791122 C:G C G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 9991163 A/G 1 8 8 16 3.77312120126222 4.22687879873778 -0.453757597475567 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 10302045 C/T 1 7 6 13 3.30148105110444 3.17015909905334 0.131321952051101 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 10302056 A/G 1 7 6 13 3.30148105110444 3.17015909905334 0.131321952051101 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 10302172 G/A 1 8 7 15 3.77312120126222 3.69851894889556 0.0746022523666556 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 14187449 G/T 1 28 34 62 13.2059242044178 17.9642348946356 -4.75831069021782 T:G G T 10 0.528359849842223 0.252856596992441 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14186647_14187659:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14186650_14187659:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14187229_14187659:XPC HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 14193889 C/T 1 6 10 16 2.82984090094666 5.28359849842223 -2.45375759747557 T:C C T 10 0.528359849842223 0.316737715732456 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14193835_14193916:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14193835_14193916:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14193835_14193916:XPC HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 14712473 G/A 1 17 21 38 8.01788255268221 11.0955568466867 -3.07767429400447 A:G G A 10 0.528359849842223 0.333788022356865 ENSG00000154781:ENST00000383794:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000303688:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000285042:exon_14712403_14712701:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000476763:exon_14712403_14712534:C3orf19 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 15610070 C/T 1 12 23 35 5.65968180189332 12.1522765463711 -6.4925947444778 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0406207835300952 ENSG00000131373:ENST00000321169:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000435217:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000451445:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000383779:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000456194:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000457447:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000416898:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000422591:exon_15609939_15610093:HACL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 16305674 C/G 1 16 4 20 7.54624240252443 2.11343939936889 5.43280300315554 C:G C G 10 0.528359849842223 0.0225946964797547 ENSG00000154813:ENST00000488423:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000285082:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000462982:exon_16305662_16305736:DPH3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 16358584 T/C 1 90 93 183 42.4476135141999 49.1374660353267 -6.6898525211268 T:C T C 10 0.528359849842223 0.336240665309538 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16357352_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16357363_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16358037_16358739:RFTN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 16364919 A/C 1 61 79 140 28.7700491596244 41.7404281375356 -12.9703789779112 A:C A C 10 0.528359849842223 0.0339480606947351 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16364883_16364964:RFTN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 17053614 C/G 1 4 6 10 1.88656060063111 3.17015909905334 -1.28359849842223 C:G C G 10 0.528359849842223 0.531770325189017 ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000419842:exon_17051986_17053652:PLCL2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 17131421 C/T 1 19 22 41 8.96116285299776 11.6239166965289 -2.66275384353114 T:C C T 10 0.528359849842223 0.436717906973358 ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17131225_17132086:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17131225_17132094:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17131225_17132085:PLCL2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 20216519 T/A 1 7 6 13 3.30148105110444 3.17015909905334 0.131321952051101 A:T T A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000129810:ENST00000419233:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000263753:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000515745:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000509679:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000523325:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000522131:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000533388:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000534034:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000383774:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000425061:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000443724:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000472533:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000421451:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000482867:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412997:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000437051:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412868:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000417364:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000456624:exon_20216214_20216547:SGOL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 33038747 C/G 1 6 13 19 2.82984090094666 6.8686780479489 -4.03883714700224 C:G C G 10 0.528359849842223 0.0694562925428504 ENSG00000170266:ENST00000399402:exon_33038112_33038836:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000307363:exon_33038112_33038836:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000307377:exon_33038221_33038836:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000445488:exon_33038226_33038836:GLB1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 33174156 T/G 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 T:G T G 10 0.528359849842223 0.743278251879842 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33174047_33174192:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33174047_33174192:CRTAP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 33174168 G/A 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 A:G G A 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33174047_33174192:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33174047_33174192:CRTAP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 33905566 C/T 1 10 22 32 4.71640150157777 11.6239166965289 -6.90751519495113 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0199568850231959 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000465122:exon_33905498_33905609:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000489869:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33905388_33905621:PDCD6IP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 33907945 A/G 1 49 38 87 23.1103673577311 20.0776742940045 3.0326930637266 A:G A G 10 0.528359849842223 0.521925438491148 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33907843_33907960:PDCD6IP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 37365159 G/A 1 13 5 18 6.1313219520511 2.64179924921111 3.48952270283999 A:G G A 10 0.528359849842223 0.154751153489626 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000429018:exon_37365079_37366450:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 37366459 C/A 1 13 25 38 6.1313219520511 13.2089962460556 -7.07767429400447 A:C C A 10 0.528359849842223 0.0230770469965845 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 37368755 T/A 1 16 16 32 7.54624240252443 8.45375759747557 -0.907515194951134 A:T T A 10 0.528359849842223 0.859856844278653 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 39180263 G/A 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 A:G G A 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000168026:ENST00000301819:exon_39180202_39180394:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000431162:exon_39180202_39180391:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000430597:exon_39180202_39180350:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000440121:exon_39180202_39180370:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000472866:exon_39180202_39180390:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000493856:exon_39180202_39180393:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000460460:exon_39180047_39180394:TTC21A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 39185077 G/A 1 10 10 20 4.71640150157777 5.28359849842223 -0.567196996844459 A:G G A 10 0.528359849842223 0.826247654639236 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 39449137 T/C 1 57 13 70 26.8834885589933 6.8686780479489 20.0148105110444 A:T:C T C 10 0.528359849842223 8.68177807749378e-07 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000477325:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000475346:exon_39449112_39449686:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000487876:exon_39449112_39449567:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39449094_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000444512:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39449111_39449277:RPSA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 39450065 C/T 1 5 5 10 2.35820075078889 2.64179924921111 -0.283598498422229 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000168028:ENST00000490490:exon_39449695_39450215:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000478027:exon_39450028_39450215:RPSA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 39453160 G/A 1 239 221 460 112.721995887709 116.767526815131 -4.04553092742256 A:G G A 10 0.528359849842223 0.708963356922162 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000478027:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000495394:exon_39451750_39453268:RPSA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 40498845 C/T 1 6 10 16 2.82984090094666 5.28359849842223 -2.45375759747557 T:C C T 10 0.528359849842223 0.316737715732456 ENSG00000188846:ENST00000338970:exon_40498783_40498854:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000465325:exon_40498794_40498854:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000396203:exon_40498831_40498965:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000416518:exon_40498845_40498965:RPL14 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 42265166 T/C 1 10 10 20 4.71640150157777 5.28359849842223 -0.567196996844459 T:C T C 10 0.528359849842223 0.826247654639236 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42264434_42267381:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42264434_42267260:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42264434_42267381:TRAK1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 42679497 C/T 1 5 13 18 2.35820075078889 6.8686780479489 -4.51047729716001 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0558148062050748 ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000468735:exon_42678360_42679718:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000465584:exon_42678360_42679711:NKTR HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 42679777 T/G 1 11 17 28 5.18804165173555 8.98211744731779 -3.79407579558224 T:G T G 10 0.528359849842223 0.185381237118026 ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 45052775 G/C 1 39 43 82 18.3939658561533 22.7194735432156 -4.32550768706228 C:G G C 10 0.528359849842223 0.376603009087161 ENSG00000075914:ENST00000461361:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000265564:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000468667:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000491476:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000486727:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000459856:exon_45052725_45052885:EXOSC7 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 45637439 T/C 1 6 4 10 2.82984090094666 2.11343939936889 0.71640150157777 T:C T C 10 0.528359849842223 0.757839432335683 ENSG00000144791:ENST00000440097:exon_45635816_45637779:LIMD1;ENSG00000144791:ENST00000273317:exon_45636351_45637779:LIMD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 46963735 C/T 1 132 137 269 62.2564998208266 72.3852994283845 -10.128799607558 T:C C T 10 0.528359849842223 0.222306125310942 ENSG00000160799:ENST00000425441:exon_46963726_46963802:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000292314:exon_46963726_46963802:CCDC12 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 47712202 T/C 1 5 5 10 2.35820075078889 2.64179924921111 -0.283598498422229 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000173473:ENST00000254480:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000425518:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000483847:exon_47711840_47712207:SMARCC1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 48474249 A/G 1 28 18 46 13.2059242044178 9.51047729716001 3.69544690725774 A:G A G 10 0.528359849842223 0.303393051481767 ENSG00000164051:ENST00000447018:exon_48473574_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395694:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000412398:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395696:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000296441:exon_48473587_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000442740:exon_48473605_48474576:CCDC51 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 48508585 C/T 1 145 134 279 68.3878217728777 70.8002198788579 -2.4123981059802 T:C C T 10 0.528359849842223 0.81049555422746 ENSG00000213689:ENST00000395677:exon_48506886_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000296443:exon_48508029_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000433541:exon_48508139_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000444177:exon_48508067_48509042:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000456089:exon_48508464_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000492235:exon_48508177_48508832:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000422277:exon_48507673_48509041:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000436480:exon_48507673_48509041:TREX1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 48725707 C/T 1 53 43 96 24.9969279583622 22.7194735432156 2.2774544151466 T:C C T 10 0.528359849842223 0.683213288420069 ENSG00000068745:ENST00000328631:exon_48725436_48726206:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000395507:exon_48725437_48726206:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000395509:exon_48725437_48726206:IP6K2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 49053219 A/G 1 228 225 453 107.533954235973 118.8809662145 -11.347011978527 A:C:G A G 10 0.528359849842223 0.300552294188441 ENSG00000178252:ENST00000395474:exon_49052258_49053386:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000354294:exon_49053187_49053261:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000315574:exon_49052258_49053386:WDR6;ENSG00000178149:ENST00000498794:exon_49052924_49054946:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000467457:exon_49052958_49053773:DALRD3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 49054692 T/C 1 19 12 31 8.96116285299776 6.34031819810668 2.62084465489109 T:C T C 10 0.528359849842223 0.373591761776205 ENSG00000178149:ENST00000441576:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000460505:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000341949:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000498498:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000498794:exon_49052924_49054946:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000440857:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000313778:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000395462:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000467457:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000484831:exon_49054661_49054946:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000420952:exon_49054661_49054789:DALRD3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 49055265 G/A 1 13 8 21 6.1313219520511 4.22687879873778 1.90444315331332 A:G G A 10 0.528359849842223 0.513633535609652 ENSG00000178149:ENST00000441576:exon_49055046_49055302:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000460505:exon_49055046_49055302:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000341949:exon_49055046_49055302:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000498794:exon_49055046_49056009:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000440857:exon_49055046_49055302:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000313778:exon_49055046_49055302:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000395462:exon_49055046_49055302:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000467457:exon_49055046_49055454:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000484831:exon_49055046_49055302:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000420952:exon_49055046_49055302:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000496568:exon_49055046_49055302:DALRD3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 49067904 T/C 1 71 59 130 33.4864506612022 31.1732311406912 2.31321952051102 T:C T C 10 0.528359849842223 0.725629856469675 ENSG00000198218:ENST00000395443:exon_49067140_49068077:QRICH1;ENSG00000198218:ENST00000498392:exon_49067364_49068077:QRICH1;ENSG00000198218:ENST00000357496:exon_49067365_49068077:QRICH1;ENSG00000198218:ENST00000424300:exon_49067645_49068077:QRICH1;ENSG00000198218:ENST00000489642:exon_49067808_49068077:QRICH1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 49141116 G/A 1 18 14 32 8.48952270283999 7.39703789779112 1.09248480504886 A:G G A 10 0.528359849842223 0.726939458112817 ENSG00000172053:ENST00000306125:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000430182:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000414533:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000464962:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000494838:exon_49141064_49141301:QARS;ENSG00000172053:ENST00000452739:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000482261:exon_49140778_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000470619:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000479495:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000418549:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000417025:exon_49141064_49141139:QARS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 49343175 G/A 1 6 4 10 2.82984090094666 2.11343939936889 0.71640150157777 A:G G A 10 0.528359849842223 0.757839432335683 ENSG00000114316:ENST00000351842:exon_49343148_49343321:USP4;ENSG00000114316:ENST00000265560:exon_49343148_49343321:USP4;ENSG00000114316:ENST00000485450:exon_49343148_49343321:USP4;ENSG00000114316:ENST00000431357:exon_49343148_49343321:USP4;ENSG00000114316:ENST00000486549:exon_49343148_49343321:USP4;ENSG00000114316:ENST00000488520:exon_49343148_49343321:USP4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 49714225 T/C 1 28 21 49 13.2059242044178 11.0955568466867 2.11036735773108 T:C T C 10 0.528359849842223 0.570236750708112 ENSG00000164062:ENST00000296456:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000449966:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000446089:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000442186:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000438011:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000463995:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000447436:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000457042:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000447541:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000482301:exon_49714210_49714250:APEH HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 49721532 G/A 1 11 14 25 5.18804165173555 7.39703789779112 -2.20899624605557 A:G G A 10 0.528359849842223 0.426211756189236 ENSG00000173531:ENST00000448220:exon_49721380_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000449682:exon_49721380_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000383728:exon_49721381_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000479115:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000492329:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000428801:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000488350:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000493836:exon_49721482_49721622:MST1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 49721798 C/A 1 26 14 40 12.2626439041022 7.39703789779112 4.86560600631108 A:C C A 10 0.528359849842223 0.153607090386718 ENSG00000173531:ENST00000448220:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000449682:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000383728:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000479115:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000492329:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000428801:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000488350:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000493836:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000484144:exon_49721758_49721886:MST1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 49866584 T/G 1 6 8 14 2.82984090094666 4.22687879873778 -1.39703789779112 T:G T G 10 0.528359849842223 0.594448035256428 ENSG00000183763:ENST00000331456:exon_49866034_49866658:TRAIP;ENSG00000183763:ENST00000491060:exon_49866054_49866941:TRAIP;ENSG00000183763:ENST00000473195:exon_49866521_49866658:TRAIP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 49949071 A/G 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 A:G A G 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000164077:ENST00000296473:exon_49948959_49949444:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000419032:exon_49948959_49949444:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000417270:exon_49948959_49949444:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000484985:exon_49948965_49949444:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000483022:exon_49949054_49949444:MON1A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 50103917 G/A 1 47 61 108 22.1670870574155 32.2299508403756 -10.0628637829601 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0542783623526028 ENSG00000004534:ENST00000442092:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000266022:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000443081:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000419610:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000422955:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000454079:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000434592:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000421682:exon_50103825_50103935:RBM6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 50114515 C/T 1 33 7 40 15.5641249552066 3.69851894889556 11.8656060063111 T:C C T 10 0.528359849842223 0.000177314794639548 ENSG00000004534:ENST00000442092:exon_50114441_50114682:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000266022:exon_50114441_50114683:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000443081:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000419610:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000422955:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000454079:exon_50114441_50114680:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000421682:exon_50114441_50114682:RBM6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 50153356 T/C 1 42 35 77 19.8088863066266 18.4925947444778 1.31629156214883 T:C T C 10 0.528359849842223 0.819810374678797 ENSG00000003756:ENST00000347869:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464087:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000475128:exon_50153339_50153376:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000475590:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000492430:exon_50153339_50153613:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000479275:exon_50153339_50153664:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464988:exon_50153339_50153413:RBM5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 52720080 A/C 1 12 5 17 5.65968180189332 2.64179924921111 3.01788255268221 A:C A C 10 0.528359849842223 0.154369157381661 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468146:exon_52720021_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52720032_52720218:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468885:exon_52720046_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000462550:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000492349:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52720065_52720121:GNL3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 52721305 G/A 1 80 84 164 37.7312120126222 44.3822273867467 -6.65101537412456 A:G G A 10 0.528359849842223 0.309899350321579 ENSG00000163938:ENST00000479230:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468146:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000462550:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000492349:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000474423:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000460073:exon_52721262_52721399:GNL3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 52727257 G/A 1 161 147 308 75.9340641754021 77.6688979268068 -1.73483375140468 A:G G A 10 0.528359849842223 0.864137735359927 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000497356:exon_52727186_52727560:GNL3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 52874446 C/T 1 7 6 13 3.30148105110444 3.17015909905334 0.131321952051101 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000213533:ENST00000355083:exon_52870772_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000477591:exon_52874234_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000464769:exon_52874310_52874626:TMEM110 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 53125922 T/C 1 58 58 116 27.3551287091511 30.6448712908489 -3.28974258169787 T:C T C 10 0.528359849842223 0.57726703246641 ENSG00000163933:ENST00000296292:exon_53122499_53126086:RFT1;ENSG00000163933:ENST00000394738:exon_53125681_53126086:RFT1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 53220215 G/A 1 46 66 112 21.6954469072577 34.8717500895867 -13.176303182329 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0137163427613276 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53220183_53220356:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53220183_53220356:PRKCD HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 53222761 C/T 1 39 27 66 18.3939658561533 14.26571594574 4.12824991041328 T:C C T 10 0.528359849842223 0.326236966099226 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53222736_53222874:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53222736_53222874:PRKCD HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 53321631 A/C 1 17 10 27 8.01788255268221 5.28359849842223 2.73428405425998 A:C A C 10 0.528359849842223 0.338211687976306 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 56658871 T/C 1 5 4 9 2.35820075078889 2.11343939936889 0.244761351419994 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000163946:ENST00000459993:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000431842:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000493960:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000355628:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000447900:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000296313:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000487036:exon_56658863_56659034:C3orf63 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 58183636 G/A 1 8 8 16 3.77312120126222 4.22687879873778 -0.453757597475567 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000163687:ENST00000486455:exon_58183548_58183705:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000483681:exon_58183548_58183705:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000318316:exon_58183548_58183705:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000450710:exon_58183548_58183705:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000394549:exon_58183548_58183705:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000477209:exon_58183548_58183705:DNASE1L3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 58410554 C/T 1 6 8 14 2.82984090094666 4.22687879873778 -1.39703789779112 T:C C T 10 0.528359849842223 0.594448035256428 ENSG00000168297:ENST00000356151:exon_58410479_58410878:PXK;ENSG00000168297:ENST00000468776:exon_58410479_58410785:PXK;ENSG00000168297:ENST00000302779:exon_58410479_58410878:PXK;ENSG00000168297:ENST00000383716:exon_58410479_58410878:PXK;ENSG00000168297:ENST00000463280:exon_58410479_58411748:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479241:exon_58410479_58411746:PXK;ENSG00000168297:ENST00000477308:exon_58410479_58410785:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479134:exon_58410479_58411601:PXK;ENSG00000168297:ENST00000493474:exon_58410479_58410902:PXK HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 58416535 C/T 1 27 23 50 12.73428405426 12.1522765463711 0.582007507888852 T:C C T 10 0.528359849842223 0.888420697881728 ENSG00000168291:ENST00000302746:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000383714:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000469364:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000479945:exon_58416384_58417520:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000474765:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000461692:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000480626:exon_58416384_58416669:PDHB HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 66430811 T/G 1 6 5 11 2.82984090094666 2.64179924921111 0.188041651735547 T:G T G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66430541_66431377:SLC25A26;ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66429221_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66429221_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66429222_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66429222_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66430649_66430913:LRIG1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 66430877 G/C 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 C:G G C 10 0.528359849842223 0.743278251879842 ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66430541_66431377:SLC25A26;ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66429221_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66429221_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66429222_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66429222_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66430649_66430913:LRIG1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 81698130 T/C 1 5 4 9 2.35820075078889 2.11343939936889 0.244761351419994 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000498468:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000486920:exon_81698118_81698142:GBE1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 97664725 C/T 1 9 3 12 4.24476135141999 1.58507954952667 2.65968180189332 T:C C T 10 0.528359849842223 0.153759275498468 ENSG00000170854:ENST00000442492:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000333396:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000394198:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000506682:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000360258:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503517:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503097:exon_97664182_97664731:MINA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 98250986 C/T 1 38 31 69 17.9223257059955 16.3791553451089 1.54317036088662 T:C C T 10 0.528359849842223 0.719651589681371 ENSG00000154165:ENST00000284311:exon_98250855_98251994:GPR15 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 105389153 A/G 1 12 12 24 5.65968180189332 6.34031819810668 -0.680636396213352 A:G A G 10 0.528359849842223 0.839647550159473 ENSG00000114423:ENST00000394030:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000476370:exon_105389077_105392837:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000407712:exon_105389077_105389196:CBLB HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 105438957 T/G 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 T:G T G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105438891_105439094:CBLB HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 119133554 G/A 1 3 7 10 1.41492045047333 3.69851894889556 -2.28359849842223 A:G G A 10 0.528359849842223 0.206915350075299 ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119132703_119139561:ARHGAP31 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 119331875 G/A 1 4 6 10 1.88656060063111 3.17015909905334 -1.28359849842223 A:G G A 10 0.528359849842223 0.531770325189017 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000475963:exon_119331864_119331965:PLA1A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 123634046 G/A 1 5 8 13 2.35820075078889 4.22687879873778 -1.8686780479489 A:G G A 10 0.528359849842223 0.406657390173804 ENSG00000175455:ENST00000310351:exon_123632300_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000485727:exon_123632564_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409657:exon_123632572_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000489746:exon_123632574_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000433542:exon_123633166_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409697:exon_123633469_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000488653:exon_123633469_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000483247:exon_123633509_123634136:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000419247:exon_123634046_123634136:CCDC14 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 124456742 G/C 1 57 50 107 26.8834885589933 26.4179924921111 0.465496066882146 C:G G C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124456415_124457290:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000498715:exon_124456415_124457218:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124456639_124457086:UMPS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 124462808 C/T 1 56 58 114 26.4118484088355 30.6448712908489 -4.23302288201342 T:C C T 10 0.528359849842223 0.453582126791225 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124462762_124464040:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000474588:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124462762_124463138:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000495751:exon_124462762_124462917:UMPS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 127323830 C/T 1 13 12 25 6.1313219520511 6.34031819810668 -0.208996246055574 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468659:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127323739_127323999:MCM2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 127379270 C/T 1 7 12 19 3.30148105110444 6.34031819810668 -3.03883714700224 T:C C T 10 0.528359849842223 0.175485662480834 ENSG00000114631:ENST00000342480:exon_127379221_127380002:PODXL2;ENSG00000114631:ENST00000302192:exon_127379221_127379876:PODXL2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 128344786 G/A 1 72 74 146 33.9580908113599 39.0986288883245 -5.14053807696455 A:G G A 10 0.528359849842223 0.407952774779033 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128344717_128344855:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128344717_128344855:RPN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 128356852 C/T 1 58 57 115 27.3551287091511 30.1165114410067 -2.76138273185564 T:C C T 10 0.528359849842223 0.640946949614247 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000495462:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000479113:exon_128356663_128356948:RPN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 132277866 G/A 1 8 16 24 3.77312120126222 8.45375759747557 -4.68063639621335 A:G G A 10 0.528359849842223 0.065866015885624 ENSG00000240303:ENST00000496418:exon_132276982_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000355458:exon_132276982_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000264990:exon_132276988_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000485198:exon_132277316_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000469042:exon_132277668_132277929:ACAD11;ENSG00000113971:ENST00000471702:exon_132276986_132277929:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393156:exon_132276986_132277929:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393144:exon_132276986_132277929:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000326682:exon_132276986_132277929:NPHP3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 133524717 G/C 1 12 11 23 5.65968180189332 5.81195834826445 -0.152276546371128 C:G G C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000144867:ENST00000466490:exon_133524520_133524846:SRPRB;ENSG00000144867:ENST00000484684:exon_133524459_133524846:SRPRB;ENSG00000144867:ENST00000273406:exon_133524665_133524846:SRPRB HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 137880743 G/A 1 5 8 13 2.35820075078889 4.22687879873778 -1.8686780479489 A:G G A 10 0.528359849842223 0.406657390173804 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 142178144 C/T 1 11 9 20 5.18804165173555 4.75523864858001 0.432803003155541 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000175054:ENST00000350721:exon_142178069_142178225:ATR;ENSG00000175054:ENST00000513291:exon_142178069_142178225:ATR;ENSG00000175054:ENST00000383101:exon_142178069_142178225:ATR HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 149468530 T/G 1 8 7 15 3.77312120126222 3.69851894889556 0.0746022523666556 T:G T G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000483708:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000469896:exon_149468290_149468638:COMMD2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 149700519 T/C 1 77 1 78 36.3162915621488 0.528359849842223 35.7879317123066 T:C T C 10 0.528359849842223 2.11348411159428e-20 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 150262318 C/T 1 5 4 9 2.35820075078889 2.11343939936889 0.244761351419994 T:C C T 10 0.528359849842223 1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 150280445 C/G 1 9 8 17 4.24476135141999 4.22687879873778 0.0178825526822095 C:G C G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000144895:ENST00000487799:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000460851:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000474505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000406576:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000482093:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000469331:exon_150280329_150280695:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000273435:exon_150280344_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000490505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000462221:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000477551:exon_150280329_150280447:EIF2A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 154018887 G/C 1 12 17 29 5.65968180189332 8.98211744731779 -3.32243564542447 C:G G C 10 0.528359849842223 0.264981051050274 ENSG00000174953:ENST00000496811:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000308361:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000329463:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000481941:exon_154018776_154018916:DHX36 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 158320703 C/A 1 7 6 13 3.30148105110444 3.17015909905334 0.131321952051101 A:C C A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000178053:ENST00000355893:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000491767:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000312827:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000484955:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000359117:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000498592:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000471745:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000497004:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392821:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392820:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000469452:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000482628:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000478894:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392822:exon_158320596_158320728:MLF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 158408032 G/A 1 5 8 13 2.35820075078889 4.22687879873778 -1.8686780479489 A:G G A 10 0.528359849842223 0.406657390173804 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158407952_158408112:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158407952_158408112:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158407952_158408112:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158407952_158408112:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000477721:exon_158407952_158408375:GFM1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 160156951 C/T 1 6 2 8 2.82984090094666 1.05671969968445 1.77312120126222 T:C C T 10 0.528359849842223 0.29537924054388 ENSG00000248710:ENST00000483754:exon_160156020_160156974:RP11-432B6.3;ENSG00000213186:ENST00000309784:exon_160153291_160156974:TRIM59;ENSG00000213186:ENST00000479460:exon_160156439_160156974:TRIM59;ENSG00000213186:ENST00000471396:exon_160156507_160156974:TRIM59;ENSG00000213186:ENST00000496222:exon_160156519_160156974:TRIM59;ENSG00000213186:ENST00000471155:exon_160156629_160156974:TRIM59;ENSG00000213186:ENST00000494486:exon_160156637_160156974:TRIM59;ENSG00000213186:ENST00000468542:exon_160156789_160156974:TRIM59 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 171087469 G/A 1 19 12 31 8.96116285299776 6.34031819810668 2.62084465489109 A:G G A 10 0.528359849842223 0.373591761776205 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000465393:exon_171087409_171087474:TNIK HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 172224303 A/G 1 14 10 24 6.60296210220888 5.28359849842223 1.31936360378665 A:C:G A G 10 0.528359849842223 0.684580806653448 ENSG00000121858:ENST00000241261:exon_172223298_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000420541:exon_172223452_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000382750:exon_172224300_172224709:TNFSF10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 178952020 C/T 1 26 19 45 12.2626439041022 10.0388371470022 2.22380675709997 T:C C T 10 0.528359849842223 0.552426756151953 ENSG00000121879:ENST00000263967:exon_178951882_178957881:PIK3CA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 179051472 A/G 1 27 26 53 12.73428405426 13.7373560958978 -1.00307204163782 A:T:G A G 10 0.528359849842223 0.785232731385051 ENSG00000121864:ENST00000496856:exon_179051057_179052402:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000326361:exon_179051057_179053323:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000466264:exon_179051057_179051617:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000484866:exon_179051057_179052400:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000466663:exon_179051057_179051518:ZNF639 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 179051810 A/G 1 35 42 77 16.5074052555222 22.1911136933734 -5.68370843785117 A:G A G 10 0.528359849842223 0.210066702748101 ENSG00000121864:ENST00000496856:exon_179051057_179052402:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000326361:exon_179051057_179053323:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000484866:exon_179051057_179052400:ZNF639 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 180334623 C/T 1 6 4 10 2.82984090094666 2.11343939936889 0.71640150157777 T:C C T 10 0.528359849842223 0.757839432335683 ENSG00000145075:ENST00000476379:exon_180334614_180334754:CCDC39;ENSG00000145075:ENST00000273654:exon_180334614_180334754:CCDC39;ENSG00000145075:ENST00000442201:exon_180334614_180334754:CCDC39 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 183861243 A/G 1 32 32 64 15.0924848050489 16.9075151949511 -1.81503038990227 A:G A G 10 0.528359849842223 0.707741933231175 ENSG00000145191:ENST00000491144:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000273783:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000444495:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000481054:exon_183860840_183862012:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000465218:exon_183860840_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000484154:exon_183861230_183861497:EIF2B5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 183911465 C/T 1 51 53 104 24.0536476580466 28.0030720416378 -3.94942438359119 T:C C T 10 0.528359849842223 0.491948235345297 ENSG00000161204:ENST00000429586:exon_183911328_183911795:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000292808:exon_183911328_183911793:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000473311:exon_183911328_183911800:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000468892:exon_183911328_183911790:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000466742:exon_183911328_183911794:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000480562:exon_183911328_183911794:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000480539:exon_183911328_183911557:ABCF3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 183975365 C/T 1 4 9 13 1.88656060063111 4.75523864858001 -2.8686780479489 T:C C T 10 0.528359849842223 0.163373721097630 ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183975261_183975544:ECE2;ENSG00000145194:ENST00000351385:exon_183975261_183975544:ECE2;ENSG00000145194:ENST00000402825:exon_183975261_183975544:ECE2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 184020542 G/T 1 5 12 17 2.35820075078889 6.34031819810668 -3.98211744731779 T:G G T 10 0.528359849842223 0.0860154858945592 ENSG00000175166:ENST00000310118:exon_184020467_184020611:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000445558:exon_184020467_184020563:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000435761:exon_184020467_184020611:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000439383:exon_184020467_184020611:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000485937:exon_184020467_184020560:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000491149:exon_184020467_184020611:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000460628:exon_184020528_184020611:PSMD2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 184026703 C/T 1 89 83 172 41.9759733640422 43.8538675369045 -1.87789417286235 A:T:C C T 10 0.528359849842223 0.818877890686317 ENSG00000175166:ENST00000310118:exon_184026496_184026842:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000435761:exon_184026496_184026788:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000439383:exon_184026496_184026836:PSMD2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 184039666 A/G 1 14 12 26 6.60296210220888 6.34031819810668 0.262643904102203 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000450424:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000421110:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000413967:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000426123:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000444861:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000457456:exon_184039070_184039815:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184039070_184039891:EIF4G1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 184766301 T/C 1 4 10 14 1.88656060063111 5.28359849842223 -3.39703789779112 T:C T C 10 0.528359849842223 0.105381577517645 ENSG00000156931:ENST00000287546:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000436792:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000446204:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000437079:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000492449:exon_184766267_184766347:VPS8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 185135448 G/A 0 1144 22 1166 539.556331780497 11.6239166965289 527.932415083968 T:C:G G T 10 0.528359849842223 1.70327501297492e-278 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 186301703 A/G 1 59 59 118 27.8267688593088 31.1732311406912 -3.34646228138231 A:G A G 10 0.528359849842223 0.580392434371863 ENSG00000090520:ENST00000439351:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000265028:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000495390:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000418776:exon_186301654_186301765:DNAJB11 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 186509517 G/A 1 91 65 156 42.9192536643577 34.3433902397445 8.57586342461322 A:G G A 10 0.528359849842223 0.173639515451858 ENSG00000163918:ENST00000433496:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000479307:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000392481:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000296273:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000417876:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000494047:exon_186509112_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000460408:exon_186509479_186509639:RFC4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 187088612 C/T 1 13 11 24 6.1313219520511 5.81195834826445 0.319363603786649 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 187088656 C/T 1 5 5 10 2.35820075078889 2.64179924921111 -0.283598498422229 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 187088923 G/A 1 16 10 26 7.54624240252443 5.28359849842223 2.2626439041022 A:G G A 10 0.528359849842223 0.435024050007921 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 187088926 G/A 1 17 10 27 8.01788255268221 5.28359849842223 2.73428405425998 A:G G A 10 0.528359849842223 0.338211687976306 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 191075902 C/T 1 32 20 52 15.0924848050489 10.5671969968445 4.52528780820441 T:C C T 10 0.528359849842223 0.215061509100599 ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191075787_191075913:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191075787_191075913:CCDC50 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 193374964 T/C 1 3 8 11 1.41492045047333 4.22687879873778 -2.81195834826445 T:C T C 10 0.528359849842223 0.129693174868926 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000482865:exon_193374869_193375021:OPA1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 194373832 T/C 1 9 5 14 4.24476135141999 2.64179924921111 1.60296210220888 T:C T C 10 0.528359849842223 0.434484743557366 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194373458_194373871:LSG1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 194373833 G/A 1 9 5 14 4.24476135141999 2.64179924921111 1.60296210220888 A:G G A 10 0.528359849842223 0.434484743557366 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194373458_194373871:LSG1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 194408704 A/G 1 11 10 21 5.18804165173555 5.28359849842223 -0.0955568466866819 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000185112:ENST00000329759:exon_194406622_194409762:FAM43A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 195800811 C/T 1 6 12 18 2.82984090094666 6.34031819810668 -3.51047729716001 T:C C T 10 0.528359849842223 0.10474530419304 ENSG00000072274:ENST00000360110:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000420415:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000392396:exon_195800801_195800996:TFRC HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 196199204 G/T 1 21 12 33 9.90444315331332 6.34031819810668 3.56412495520664 T:G G T 10 0.528359849842223 0.227419373413979 ENSG00000163961:ENST00000318037:exon_196195654_196199643:RNF168;ENSG00000163961:ENST00000437070:exon_196198631_196199643:RNF168 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 196281208 T/C 1 21 32 53 9.90444315331332 16.9075151949511 -7.00307204163782 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0726714289382662 ENSG00000185798:ENST00000332629:exon_196281056_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000429115:exon_196281059_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000433160:exon_196281065_196281678:WDR53 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 196460680 C/T 1 6 10 16 2.82984090094666 5.28359849842223 -2.45375759747557 T:C C T 10 0.528359849842223 0.316737715732456 ENSG00000163964:ENST00000392391:exon_196460630_196462878:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000314118:exon_196460630_196462855:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000296333:exon_196460630_196460773:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000453218:exon_196460630_196460911:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000415832:exon_196460630_196461160:PIGX HGDP00247_parsed_pileup.txt . 3 196771554 T/C 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 T:C T C 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000075711:ENST00000346964:exon_196769431_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000357674:exon_196769431_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000381807:exon_196769431_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000314062:exon_196769431_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000359922:exon_196769431_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000469371:exon_196769904_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000419354:exon_196770502_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000452595:exon_196771131_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000422288:exon_196771202_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000448528:exon_196771422_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000443183:exon_196771431_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000392382:exon_196771494_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000450955:exon_196771494_196771600:DLG1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 517461 T/C 1 6 3 9 2.82984090094666 1.58507954952667 1.24476135141999 T:C T C 10 0.528359849842223 0.514115714513849 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508562:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511247:exon_517309_517702:PIGG HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 520853 G/A 1 4 6 10 1.88656060063111 3.17015909905334 -1.28359849842223 A:G G A 10 0.528359849842223 0.531770325189017 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508669:exon_520828_521329:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503261:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000510235:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_520739_521019:PIGG HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 527677 T/C 1 5 6 11 2.35820075078889 3.17015909905334 -0.811958348264453 T:C T C 10 0.528359849842223 0.765428811190486 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503261:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513239:exon_524629_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513192:exon_525903_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504879:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508144:exon_527421_527770:PIGG HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 533001 T/C 1 9 15 24 4.24476135141999 7.92539774763334 -3.68063639621335 T:C T C 10 0.528359849842223 0.154213959723728 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_532942_533314:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_532942_533154:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513239:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513192:exon_532942_533314:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508144:exon_532942_533985:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000515237:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000505800:exon_532942_533312:PIGG HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 759872 T/C 1 13 8 21 6.1313219520511 4.22687879873778 1.90444315331332 T:C T C 10 0.528359849842223 0.513633535609652 ENSG00000185619:ENST00000362003:exon_759820_764428:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000505655:exon_759820_764428:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000521023:exon_759820_764428:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000470161:exon_759820_760396:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000430644:exon_759823_760387:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000440452:exon_759820_760193:PCGF3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 1843324 C/T 1 13 11 24 6.1313219520511 5.81195834826445 0.319363603786649 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000168924:ENST00000302787:exon_1843074_1843524:LETM1;ENSG00000168924:ENST00000505551:exon_1843074_1843524:LETM1;ENSG00000168924:ENST00000466175:exon_1843074_1843524:LETM1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 2744087 G/A 1 74 74 148 34.9013711116755 39.0986288883245 -4.197257776649 A:G G A 10 0.528359849842223 0.510693222713777 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 2933271 G/A 1 9 4 13 4.24476135141999 2.11343939936889 2.1313219520511 A:G G A 10 0.528359849842223 0.276905486309559 ENSG00000109736:ENST00000508276:exon_2933102_2933663:MFSD10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 2943361 T/C 1 13 17 30 6.1313219520511 8.98211744731779 -2.85079549526669 T:C T C 10 0.528359849842223 0.36131987801409 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000507120:exon_2943309_2943443:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2943309_2943456:NOP14 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 2951804 A/G 1 25 27 52 11.7910037539444 14.26571594574 -2.47471219179559 A:G A G 10 0.528359849842223 0.578917863368676 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2951661_2951940:NOP14 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 3514695 A/G 1 68 70 138 32.0715302107288 36.9851894889556 -4.91365927822677 A:G A G 10 0.528359849842223 0.44300261297059 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 4861974 C/T 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 T:C C T 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000163132:ENST00000382723:exon_4861393_4862095:MSX1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 5830414 T/C 1 7 15 22 3.30148105110444 7.92539774763334 -4.62391669652891 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0553869729753656 ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5830246_5830772:EVC HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 13606576 A/T 1 14 19 33 6.60296210220888 10.0388371470022 -3.43587504479336 A:T A T 10 0.528359849842223 0.295465692465376 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 17586703 T/C 1 44 45 89 20.7521666069422 23.7761932429 -3.02402663595784 T:C T C 10 0.528359849842223 0.526231807923112 ENSG00000002549:ENST00000226299:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000509583:exon_17586595_17587079:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000508014:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000513105:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000504614:exon_17586595_17586759:LAP3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 17829990 G/C 1 5 8 13 2.35820075078889 4.22687879873778 -1.8686780479489 C:G G C 10 0.528359849842223 0.406657390173804 ENSG00000109805:ENST00000251496:exon_17829901_17830011:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000514176:exon_17829901_17830011:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000510063:exon_17829901_17830011:NCAPG HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 37836302 T/C 1 11 5 16 5.18804165173555 2.64179924921111 2.54624240252443 T:C T C 10 0.528359849842223 0.221849866555357 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000515668:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000505986:exon_37836240_37836346:PGM2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 37857342 G/C 1 23 24 47 10.8477234536289 12.6806363962134 -1.83291294258448 C:G G C 10 0.528359849842223 0.661896191224521 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37857229_37857362:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000512556:exon_37857229_37857362:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000510084:exon_37857229_37857362:PGM2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 37903756 T/C 1 6 4 10 2.82984090094666 2.11343939936889 0.71640150157777 T:C T C 10 0.528359849842223 0.757839432335683 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 37904082 T/C 1 6 2 8 2.82984090094666 1.05671969968445 1.77312120126222 T:C T C 10 0.528359849842223 0.29537924054388 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 38774785 A/G 1 80 88 168 37.7312120126222 46.4956667861156 -8.76445477349345 A:G A G 10 0.528359849842223 0.189051406982984 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 38774889 T/C 1 39 65 104 18.3939658561533 34.3433902397445 -15.9494243835912 T:C T C 10 0.528359849842223 0.00217765669342562 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 38775040 A/G 1 42 66 108 19.8088863066266 34.8717500895867 -15.0628637829601 A:G A G 10 0.528359849842223 0.00378894242380428 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 38776107 T/G 1 10 8 18 4.71640150157777 4.22687879873778 0.489522702839987 T:G T G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 38776180 C/A 1 7 12 19 3.30148105110444 6.34031819810668 -3.03883714700224 A:C C A 10 0.528359849842223 0.175485662480834 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 38776491 T/G 1 23 69 92 10.8477234536289 36.4568296391134 -25.6091061854845 T:G T G 10 0.528359849842223 8.37257808401852e-08 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 39302029 T/C 1 7 6 13 3.30148105110444 3.17015909905334 0.131321952051101 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000505077:exon_39301936_39302034:RFC1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 53751932 C/T 1 13 12 25 6.1313219520511 6.34031819810668 -0.208996246055574 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_53751914_53752033:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_53751914_53752033:SCFD2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 54011576 T/C 1 7 12 19 3.30148105110444 6.34031819810668 -3.03883714700224 T:C T C 10 0.528359849842223 0.175485662480834 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54011500_54011749:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54011500_54011749:SCFD2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 57215677 G/A 1 8 1 9 3.77312120126222 0.528359849842223 3.24476135141999 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0417871149536542 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000502617:exon_57215094_57216224:AASDH HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 57843295 C/A 0 11 0 11 5.18804165173555 0 5.18804165173555 C C 10 0.528359849842223 0.00115270771725888 ENSG00000084092:ENST00000264230:exon_57842608_57844989:C4orf14 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 68374597 C/T 1 6 3 9 2.82984090094666 1.58507954952667 1.24476135141999 T:C C T 10 0.528359849842223 0.514115714513849 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000507196:exon_68374532_68374637:CENPC1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 68442968 A/G 1 18 13 31 8.48952270283999 6.8686780479489 1.62084465489109 A:T:G A G 10 0.528359849842223 0.594022867419225 ENSG00000035720:ENST00000265404:exon_68442921_68442977:STAP1;ENSG00000035720:ENST00000396225:exon_68442921_68442977:STAP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 68447040 C/T 1 17 14 31 8.01788255268221 7.39703789779112 0.620844654891088 T:C C T 10 0.528359849842223 0.859090255440116 ENSG00000035720:ENST00000265404:exon_68447023_68447189:STAP1;ENSG00000035720:ENST00000396225:exon_68447023_68447189:STAP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 73942678 C/T 1 28 27 55 13.2059242044178 14.26571594574 -1.05979174132226 T:C C T 10 0.528359849842223 0.78863638822351 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73942657_73942821:ANKRD17 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 73956736 G/A 1 8 6 14 3.77312120126222 3.17015909905334 0.602962102208878 A:G G A 10 0.528359849842223 0.795199355745845 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73956384_73958017:ANKRD17 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 75937971 C/T 1 7 2 9 3.30148105110444 1.05671969968445 2.24476135141999 T:C C T 10 0.528359849842223 0.186011003558895 ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 75938179 G/A 1 10 4 14 4.71640150157777 2.11343939936889 2.60296210220888 A:G G A 10 0.528359849842223 0.189361454505222 ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 76720885 T/C 1 5 6 11 2.35820075078889 3.17015909905334 -0.811958348264453 T:C T C 10 0.528359849842223 0.765428811190486 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76720775_76720885:USO1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 76722353 G/A 1 12 17 29 5.65968180189332 8.98211744731779 -3.32243564542447 A:G G A 10 0.528359849842223 0.264981051050274 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76722232_76722353:USO1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 76878716 G/C 1 16 31 47 7.54624240252443 16.3791553451089 -8.83291294258448 C:G G C 10 0.528359849842223 0.0123059709391539 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76878671_76878861:SDAD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 77053834 T/C 1 8 6 14 3.77312120126222 3.17015909905334 0.602962102208878 T:C T C 10 0.528359849842223 0.795199355745845 ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000502850:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514313:exon_77053473_77053872:NUP54 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 84374480 C/T 1 10 13 23 4.71640150157777 6.8686780479489 -2.15227654637113 T:C C T 10 0.528359849842223 0.408345653063064 ENSG00000163312:ENST00000508591:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000295488:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000510985:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000422434:exon_84374384_84375098:HELQ HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 84380955 G/T 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 T:G G T 10 0.528359849842223 0.730064285841028 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 103555992 A/G 1 6 13 19 2.82984090094666 6.8686780479489 -4.03883714700224 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0694562925428504 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103555945_103556202:MANBA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 103557077 G/A 1 5 4 9 2.35820075078889 2.11343939936889 0.244761351419994 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000508141:exon_103557063_103557164:MANBA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 106395181 G/A 1 12 10 22 5.65968180189332 5.28359849842223 0.376083303471095 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000138777:ENST00000341695:exon_106395051_106395238:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000380004:exon_106395051_106395227:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000348706:exon_106395051_106395221:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000351450:exon_106395051_106395224:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000354147:exon_106395051_106395207:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000432483:exon_106395051_106395207:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000357415:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000510015:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000509426:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000508518:exon_106395051_106395197:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000514209:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000457404:exon_106395051_106395219:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000502833:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000504028:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000513649:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000499847:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000502610:exon_106395051_106395189:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000505713:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000310267:exon_106395051_106395216:PPA2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 108931039 T/C 1 51 33 84 24.0536476580466 17.4358750447934 6.61777261325327 T:C T C 10 0.528359849842223 0.156499144940509 ENSG00000138796:ENST00000403312:exon_108930915_108931043:HADH;ENSG00000138796:ENST00000351726:exon_108930915_108931043:HADH;ENSG00000138796:ENST00000309522:exon_108930915_108931043:HADH;ENSG00000138796:ENST00000505878:exon_108930915_108931043:HADH;ENSG00000138796:ENST00000454409:exon_108930915_108931043:HADH HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 130030783 C/T 1 10 9 19 4.71640150157777 4.75523864858001 -0.0388371470022362 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130030628_130031121:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130030628_130030827:C4orf33 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 140036029 G/A 1 851 1 852 401.365767784268 0.528359849842223 400.837407934426 A:G G A 10 0.528359849842223 8.6256681230827e-234 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 156273768 T/C 1 2 6 8 0.943280300315554 3.17015909905334 -2.22687879873778 T:C T C 10 0.528359849842223 0.159873274171007 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156273748_156273880:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156273748_156273880:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000503466:exon_156273748_156273838:MAP9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 156274377 T/C 1 5 7 12 2.35820075078889 3.69851894889556 -1.34031819810668 T:C T C 10 0.528359849842223 0.56626847898003 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156274331_156274492:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156274331_156274492:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156274331_156274492:MAP9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 159601676 C/T 1 2 8 10 0.943280300315554 4.22687879873778 -3.28359849842223 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0542343953774601 ENSG00000171503:ENST00000511912:exon_159601619_159601759:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000355672:exon_159601619_159601759:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000436096:exon_159601619_159601759:ETFDH HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 159631991 G/T 1 21 18 39 9.90444315331332 9.51047729716001 0.393965856153304 T:G G T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000171497:ENST00000307720:exon_159631914_159632000:PPID;ENSG00000171497:ENST00000512699:exon_159631914_159632000:PPID HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 164435265 A/C 1 22 38 60 10.3760833034711 20.0776742940045 -9.70159099053338 A:T:C:G A C 10 0.528359849842223 0.0136801034598211 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164435226_164435310:C4orf43 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 164440581 T/C 1 45 48 93 21.2238067571 25.3612727924267 -4.13746603532674 T:C T C 10 0.528359849842223 0.407330314163326 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164440486_164440872:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164440486_164441691:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164440486_164440871:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164440486_164440615:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000503148:exon_164440486_164440710:C4orf43 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 165118796 G/A 0 0 8 8 0 4.22687879873778 -4.22687879873778 A G A 10 0.528359849842223 0.00244842131534247 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 170669945 C/T 1 12 2 14 5.65968180189332 1.05671969968445 4.60296210220888 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0148919960155353 ENSG00000056050:ENST00000393381:exon_170669895_170669993:C4orf27 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 174253178 T/C 1 331 401 732 156.112889702224 211.872299786731 -55.7594100845072 T:C T C 10 0.528359849842223 3.86792039155783e-05 ENSG00000164104:ENST00000296503:exon_174252846_174253389:HMGB2;ENSG00000164104:ENST00000446922:exon_174252852_174253389:HMGB2;ENSG00000164104:ENST00000438704:exon_174252852_174253389:HMGB2;ENSG00000164104:ENST00000511316:exon_174252856_174254365:HMGB2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 185310218 C/T 1 31 25 56 14.6208446548911 13.2089962460556 1.41184840883552 T:C C T 10 0.528359849842223 0.789323184946513 ENSG00000168310:ENST00000393593:exon_185308867_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000505067:exon_185310176_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000502750:exon_185310194_185310220:IRF2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 186320880 A/G 1 70 47 117 33.0148105110444 24.8329129425845 8.18189756845992 A:G A G 10 0.528359849842223 0.138830658045241 ENSG00000186352:ENST00000335174:exon_186320724_186320927:ANKRD37;ENSG00000186352:ENST00000511393:exon_186320724_186321782:ANKRD37;ENSG00000186352:ENST00000506424:exon_186320724_186320897:ANKRD37;ENSG00000109775:ENST00000514247:exon_186320694_186321632:UFSP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 186320890 G/A 1 48 67 115 22.6387272075733 35.4001099394289 -12.7613827318556 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0192906528684013 ENSG00000186352:ENST00000335174:exon_186320724_186320927:ANKRD37;ENSG00000186352:ENST00000511393:exon_186320724_186321782:ANKRD37;ENSG00000186352:ENST00000506424:exon_186320724_186320897:ANKRD37;ENSG00000109775:ENST00000514247:exon_186320694_186321632:UFSP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 186320906 C/G 1 76 53 129 35.8446514119911 28.0030720416378 7.84157937035324 C:G C G 10 0.528359849842223 0.185882656639274 ENSG00000186352:ENST00000335174:exon_186320724_186320927:ANKRD37;ENSG00000186352:ENST00000511393:exon_186320724_186321782:ANKRD37;ENSG00000109775:ENST00000514247:exon_186320694_186321632:UFSP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 4 190862155 T/G 1 37 32 69 17.4506855558378 16.9075151949511 0.543170360886617 T:G T G 10 0.528359849842223 0.904782970997671 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 433056 G/T 1 3 6 9 1.41492045047333 3.17015909905334 -1.75523864858001 T:G G T 10 0.528359849842223 0.322385551531720 ENSG00000063438:ENST00000505113:exon_432921_433062:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_432921_433062:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_432921_433062:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_432921_433062:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_432921_433062:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000507048:exon_432140_433062:AHRR HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 442586 G/C 1 6 5 11 2.82984090094666 2.64179924921111 0.188041651735547 C:G G C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 442675 C/T 1 9 14 23 4.24476135141999 7.39703789779112 -3.15227654637113 T:C C T 10 0.528359849842223 0.213695268661202 ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 442790 G/A 1 19 9 28 8.96116285299776 4.75523864858001 4.20592420441776 A:G G A 10 0.528359849842223 0.130990173643306 ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 453567 G/A 1 17 14 31 8.01788255268221 7.39703789779112 0.620844654891088 A:G G A 10 0.528359849842223 0.859090255440116 ENSG00000180104:ENST00000512944:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000340158:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000315013:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000503889:exon_453512_454166:EXOC3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 453583 C/T 1 13 18 31 6.1313219520511 9.51047729716001 -3.37915534510891 T:C C T 10 0.528359849842223 0.280569742102825 ENSG00000180104:ENST00000512944:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000340158:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000315013:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000503889:exon_453512_454166:EXOC3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 870619 A/G 1 6 14 20 2.82984090094666 7.39703789779112 -4.56719699684446 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0453201930852521 ENSG00000028310:ENST00000483234:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000495794:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000490814:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000495265:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000388890:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000323510:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000323547:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000489816:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000433367:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000415990:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000435709:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000483173:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000467963:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000519112:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000518250:exon_870588_870668:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000523139:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000518251:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000475706:exon_870403_870690:BRD9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 1466919 G/A 1 8 8 16 3.77312120126222 4.22687879873778 -0.453757597475567 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 1467004 A/G 1 3 6 9 1.41492045047333 3.17015909905334 -1.75523864858001 A:G A G 10 0.528359849842223 0.322385551531720 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 1494909 C/T 1 15 5 20 7.07460225236666 2.64179924921111 4.43280300315554 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0705808549653656 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000514484:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000507282:exon_1494815_1495043:LPCAT1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 1799013 G/C 1 149 135 284 70.2743823735088 71.3285797287001 -1.05419735519131 C:G G C 10 0.528359849842223 0.905521369845557 ENSG00000171421:ENST00000505818:exon_1798500_1799061:MRPL36;ENSG00000171421:ENST00000382647:exon_1798501_1799061:MRPL36;ENSG00000171421:ENST00000505059:exon_1798501_1799061:MRPL36;ENSG00000171421:ENST00000508987:exon_1798501_1799061:MRPL36;ENSG00000171421:ENST00000510999:exon_1798943_1799061:MRPL36 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 5489383 G/A 1 13 19 32 6.1313219520511 10.0388371470022 -3.90751519495113 A:G G A 10 0.528359849842223 0.214738050722661 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5489262_5490347:KIAA0947 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 10250443 T/C 1 7 3 10 3.30148105110444 1.58507954952667 1.71640150157777 T:C T C 10 0.528359849842223 0.35163323596596 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10250033_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10250328_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000511700:exon_10250355_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000513114:exon_10250406_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10250416_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000508451:exon_10250421_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000423695:exon_10250431_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000510326:exon_10250431_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000512975:exon_10250431_10250557:CCT5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 10254817 A/G 1 49 37 86 23.1103673577311 19.5493144441622 3.56105291356883 A:G A G 10 0.528359849842223 0.452053695914226 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503026:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000513114:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10254786_10254835:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000508451:exon_10254786_10255142:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515676:exon_10254786_10254950:CCT5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 10256161 T/C 1 27 30 57 12.73428405426 15.8507954952667 -3.11651144100671 T:C:G T C 10 0.528359849842223 0.428389705751813 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503026:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000511700:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503454:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515676:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000506600:exon_10256067_10256265:CCT5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 10258512 G/A 1 127 152 279 59.8982990700377 80.3106971760179 -20.4123981059802 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0163137009163185 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10258498_10258647:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503026:exon_10258498_10258647:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10258498_10258647:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10258498_10258647:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000423695:exon_10258498_10258647:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000512975:exon_10258498_10258647:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503454:exon_10258498_10258647:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515676:exon_10258498_10258647:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000506600:exon_10258498_10258647:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000514674:exon_10258498_10258647:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000509846:exon_10258498_10258647:CCT5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 33989518 C/T 1 6 4 10 2.82984090094666 2.11343939936889 0.71640150157777 T:C C T 10 0.528359849842223 0.757839432335683 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_33986283_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_33987279_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_33989216_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_33988789_33989607:AMACR;ENSG00000082196:ENST00000382079:exon_33987279_33989607:C1QTNF3;ENSG00000082196:ENST00000441713:exon_33987279_33989607:C1QTNF3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 34908877 T/C 1 20 20 40 9.43280300315554 10.5671969968445 -1.13439399368892 T:C T C 10 0.528359849842223 0.753253297480391 ENSG00000113456:ENST00000382038:exon_34905369_34909053:RAD1;ENSG00000113456:ENST00000341754:exon_34908277_34909053:RAD1;ENSG00000113456:ENST00000325577:exon_34908659_34909053:RAD1;ENSG00000113456:ENST00000513914:exon_34908760_34909053:RAD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 34915948 A/G 1 7 5 12 3.30148105110444 2.64179924921111 0.659681801893325 A:G A G 10 0.528359849842223 0.778733618574385 ENSG00000113456:ENST00000382038:exon_34915521_34916871:RAD1;ENSG00000113460:ENST00000336767:exon_34915481_34916002:BRIX1;ENSG00000113460:ENST00000510960:exon_34915782_34916002:BRIX1;ENSG00000113460:ENST00000515798:exon_34915815_34916002:BRIX1;ENSG00000113460:ENST00000510834:exon_34915821_34916002:BRIX1;ENSG00000113460:ENST00000506023:exon_34915857_34916002:BRIX1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 34945122 A/G 1 30 60 90 14.1492045047333 31.7015909905334 -17.5523864858001 A:G A G 10 0.528359849842223 0.000281918089711735 ENSG00000168724:ENST00000342382:exon_34944972_34945130:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000382021:exon_34944972_34945130:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000303525:exon_34944972_34945130:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000514237:exon_34944972_34945130:DNAJC21 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 34954079 C/G 1 31 37 68 14.6208446548911 19.5493144441622 -4.92846978927116 C:G C G 10 0.528359849842223 0.274247230394415 ENSG00000168724:ENST00000342382:exon_34954031_34954106:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000382021:exon_34954031_34954106:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000303525:exon_34954031_34954106:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000506762:exon_34954031_34954296:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000509626:exon_34953631_34954106:DNAJC21 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 43039793 T/C 1 19 14 33 8.96116285299776 7.39703789779112 1.56412495520664 T:C T C 10 0.528359849842223 0.606232866801656 ENSG00000177721:ENST00000314890:exon_43039335_43041453:C5orf39 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 43175103 C/T 1 9 10 19 4.24476135141999 5.28359849842223 -1.03883714700224 T:C C T 10 0.528359849842223 0.653351132943168 ENSG00000172262:ENST00000510026:exon_43174549_43175836:ZNF131;ENSG00000172262:ENST00000509156:exon_43174549_43175390:ZNF131;ENSG00000172262:ENST00000306938:exon_43174549_43175821:ZNF131;ENSG00000172262:ENST00000399534:exon_43174549_43175821:ZNF131;ENSG00000172262:ENST00000505606:exon_43174549_43176342:ZNF131;ENSG00000172262:ENST00000509634:exon_43174549_43176349:ZNF131 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 44809162 G/C 1 18 10 28 8.48952270283999 5.28359849842223 3.20592420441776 C:G G C 10 0.528359849842223 0.258981777720527 ENSG00000112996:ENST00000507110:exon_44809027_44809665:MRPS30 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 64064943 G/A 1 5 4 9 2.35820075078889 2.11343939936889 0.244761351419994 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64064757_64065015:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64064773_64065015:CWC27 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 64267595 T/C 1 15 11 26 7.07460225236666 5.81195834826445 1.2626439041022 T:C T C 10 0.528359849842223 0.696773212715701 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64267530_64267639:CWC27 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 68417643 C/T 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68417580_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68417574_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000512367:exon_68417521_68417722:SLC30A5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 68419054 A/T 1 6 9 15 2.82984090094666 4.75523864858001 -1.92539774763334 A:T A T 10 0.528359849842223 0.439217229441099 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68419026_68419339:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68419026_68419366:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68419026_68419247:SLC30A5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 68695940 T/G 1 10 15 25 4.71640150157777 7.92539774763334 -3.20899624605557 T:G T G 10 0.528359849842223 0.231576293849315 ENSG00000152942:ENST00000361732:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000509734:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354868:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000521422:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354312:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000345306:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000305138:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000282891:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000358030:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000380774:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000513214:exon_68695876_68695996:RAD17 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 70806457 G/A 1 9 4 13 4.24476135141999 2.11343939936889 2.1313219520511 A:G G A 10 0.528359849842223 0.276905486309559 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 70806649 T/A 1 11 9 20 5.18804165173555 4.75523864858001 0.432803003155541 A:T T A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 70806711 C/G 1 9 8 17 4.24476135141999 4.22687879873778 0.0178825526822095 C:G C G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 70806958 G/A 1 3 9 12 1.41492045047333 4.75523864858001 -3.34031819810668 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0796925302844448 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 71519664 C/T 1 15 13 28 7.07460225236666 6.8686780479489 0.205924204417758 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000113048:ENST00000261413:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000431255:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000457646:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515226:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000503239:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000513900:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000508863:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522562:exon_71519630_71519677:MRPS27 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 71524163 A/T 1 6 3 9 2.82984090094666 1.58507954952667 1.24476135141999 A:T A T 10 0.528359849842223 0.514115714513849 ENSG00000113048:ENST00000261413:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000457646:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515226:exon_71522877_71525380:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000503239:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000513900:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000508863:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522562:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522042:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515404:exon_71523590_71524195:MRPS27 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 73981270 T/C 1 7 4 11 3.30148105110444 2.11343939936889 1.18804165173555 T:C T C 10 0.528359849842223 0.556038959282085 ENSG00000049860:ENST00000261416:exon_73980969_73981384:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000513079:exon_73981021_73981384:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000515528:exon_73981031_73981384:HEXB HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 73985215 A/G 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 A:G A G 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000049860:ENST00000511181:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000261416:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000513079:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000515528:exon_73985153_73985674:HEXB HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 74063154 C/G 1 103 126 229 48.578935466251 66.5733410801201 -17.994405613869 C:G C G 10 0.528359849842223 0.0203241760619012 ENSG00000164347:ENST00000296805:exon_74062763_74063196:GFM2;ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74062817_74063188:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000514918:exon_74063073_74063188:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000513356:exon_74063088_74063188:NSA2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 74069863 A/G 1 222 221 443 104.704113335027 116.767526815131 -12.0634134801048 A:G A G 10 0.528359849842223 0.253758749718712 ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74069693_74069885:NSA2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 74656175 G/A 1 25 27 52 11.7910037539444 14.26571594574 -2.47471219179559 A:G G A 10 0.528359849842223 0.578917863368676 ENSG00000113161:ENST00000511206:exon_74656113_74656583:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000287936:exon_74656113_74657929:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000343975:exon_74656113_74657248:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000429286:exon_74656113_74657924:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000509085:exon_74656113_74656307:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000511986:exon_74656113_74656306:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000512053:exon_74656113_74656354:HMGCR HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 74998598 G/A 1 3 6 9 1.41492045047333 3.17015909905334 -1.75523864858001 A:G G A 10 0.528359849842223 0.322385551531720 ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000514838:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000446329:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000510798:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000282199:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000503835:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000504862:exon_74998430_74998657:POC5;ENSG00000152359:ENST00000515285:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000502826:exon_74998440_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000506164:exon_74998495_74998635:POC5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 76359024 C/A 1 12 11 23 5.65968180189332 5.81195834826445 -0.152276546371128 A:C C A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76358877_76361059:AGGF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 80149981 A/G 1 2 10 12 0.943280300315554 5.28359849842223 -4.34031819810667 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0173281289522322 ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_80149949_80150135:MSH3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 80168937 G/A 1 7 9 16 3.30148105110444 4.75523864858001 -1.45375759747557 A:G G A 10 0.528359849842223 0.61804043960613 ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_80168935_80169106:MSH3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 80600619 C/G 1 33 34 67 15.5641249552066 17.9642348946356 -2.40010993942894 C:G C G 10 0.528359849842223 0.624898889221033 ENSG00000131732:ENST00000254037:exon_80597422_80600960:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000407610:exon_80600560_80600960:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000380199:exon_80600560_80600960:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000438268:exon_80600560_80600960:ZCCHC9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 81549240 C/A 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 A:C C A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000152348:ENST00000282185:exon_81549133_81549248:ATG10;ENSG00000152348:ENST00000458350:exon_81549133_81549248:ATG10;ENSG00000152348:ENST00000504770:exon_81549133_81549250:ATG10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 81572184 G/C 1 9 5 14 4.24476135141999 2.64179924921111 1.60296210220888 C:G G C 10 0.528359849842223 0.434484743557366 ENSG00000152348:ENST00000514253:exon_81571964_81572241:ATG10;ENSG00000186468:ENST00000507980:exon_81571697_81572337:RPS23 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 81613822 A/G 1 7 2 9 3.30148105110444 1.05671969968445 2.24476135141999 A:G A G 10 0.528359849842223 0.186011003558895 ENSG00000205464:ENST00000380167:exon_81613817_81614225:ATP6AP1L;ENSG00000205464:ENST00000439350:exon_81613817_81614147:ATP6AP1L;ENSG00000205464:ENST00000514672:exon_81613817_81614199:ATP6AP1L HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 86695274 A/G 1 17 24 41 8.01788255268221 12.6806363962134 -4.66275384353114 A:G A G 10 0.528359849842223 0.160542135631296 ENSG00000134480:ENST00000505587:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000510921:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000508855:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000256897:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000504878:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000511207:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000504115:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000448765:exon_86695211_86695322:CCNH HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 94050447 C/T 1 9 3 12 4.24476135141999 1.58507954952667 2.65968180189332 T:C C T 10 0.528359849842223 0.153759275498468 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 94050487 T/A 1 7 2 9 3.30148105110444 1.05671969968445 2.24476135141999 A:T T A 10 0.528359849842223 0.186011003558895 ENSG00000175471:ENST00000514040:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000515393:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312202:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000429576:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000505078:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312216:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000395933:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000508509:exon_94050482_94050591:MCTP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 110456704 A/T 1 3 15 18 1.41492045047333 7.92539774763334 -6.51047729716001 A:T A T 10 0.528359849842223 0.00324527402048683 ENSG00000134987:ENST00000506538:exon_110456694_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000323652:exon_110456694_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000513710:exon_110456697_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505840:exon_110456694_110456839:WDR36 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 110819753 G/C 1 8 5 13 3.77312120126222 2.64179924921111 1.1313219520511 C:G G C 10 0.528359849842223 0.589076720209571 ENSG00000152495:ENST00000512453:exon_110819724_110820283:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000282356:exon_110819724_110830584:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000515231:exon_110819724_110820464:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000509645:exon_110819724_110821293:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000510858:exon_110819724_110820296:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000512890:exon_110819724_110820230:CAMK4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 112257908 T/C 0 16 0 16 7.54624240252443 0 7.54624240252443 T T 10 0.528359849842223 4.28820721621858e-05 ENSG00000129625:ENST00000379638:exon_112257770_112258236:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000513339:exon_112257770_112257924:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000511865:exon_112257770_112257927:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000504247:exon_112257770_112257986:REEP5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 115428334 G/T 1 5 6 11 2.35820075078889 3.17015909905334 -0.811958348264453 T:G G T 10 0.528359849842223 0.765428811190486 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115428242_115428392:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000506589:exon_115428242_115428397:COMMD10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 115428381 T/G 1 4 6 10 1.88656060063111 3.17015909905334 -1.28359849842223 T:G T G 10 0.528359849842223 0.531770325189017 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115428242_115428392:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000506589:exon_115428242_115428397:COMMD10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 115469773 C/T 1 8 5 13 3.77312120126222 2.64179924921111 1.1313219520511 T:C C T 10 0.528359849842223 0.589076720209571 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115469765_115469875:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115469765_115469875:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115469765_115469875:COMMD10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 118691784 T/C 1 24 17 41 11.3193636037866 8.98211744731779 2.33724615646886 T:C T C 10 0.528359849842223 0.532736028634317 ENSG00000145779:ENST00000504771:exon_118690009_118691816:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000503646:exon_118691718_118691816:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000415806:exon_118691730_118691816:TNFAIP8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 118728953 G/C 1 81 76 157 38.2028521627799 40.1553485880089 -1.952496425229 C:G G C 10 0.528359849842223 0.810569439398326 ENSG00000145779:ENST00000274456:exon_118728511_118729089:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000513374:exon_118728511_118729438:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000504771:exon_118728511_118730293:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000503646:exon_118728511_118730293:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000504642:exon_118728511_118729141:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000415806:exon_118728511_118730294:TNFAIP8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 126140522 T/C 1 8 8 16 3.77312120126222 4.22687879873778 -0.453757597475567 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000113368:ENST00000460265:exon_126140468_126140624:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000261366:exon_126140468_126140624:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000504788:exon_126140468_126140624:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000472034:exon_126140468_126140624:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000492190:exon_126140468_126140606:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000395354:exon_126140468_126140624:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000463908:exon_126140468_126140624:LMNB1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 126171974 C/T 1 47 51 98 22.1670870574155 26.9463523419534 -4.77926528453785 A:T:C C T 10 0.528359849842223 0.362965920218076 ENSG00000113368:ENST00000460265:exon_126171915_126172706:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000261366:exon_126171915_126172712:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000504788:exon_126171915_126172263:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000484340:exon_126171915_126172366:LMNB1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 126887569 G/A 1 10 8 18 4.71640150157777 4.22687879873778 0.489522702839987 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000164244:ENST00000296666:exon_126887399_126890781:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000442138:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000330542:exon_126887399_126887569:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000420037:exon_126887399_126887570:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000337087:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000513427:exon_126887399_126888148:PRRC1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 131607080 A/G 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 A:G A G 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000131435:ENST00000253754:exon_131606996_131607159:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000474421:exon_131606608_131607566:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000379018:exon_131606996_131607159:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000484620:exon_131606996_131607159:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000462597:exon_131606996_131607601:PDLIM4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 131607494 C/T 1 7 4 11 3.30148105110444 2.11343939936889 1.18804165173555 T:C C T 10 0.528359849842223 0.556038959282085 ENSG00000131435:ENST00000253754:exon_131607484_131607601:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000474421:exon_131606608_131607566:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000484620:exon_131607484_131607526:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000462597:exon_131606996_131607601:PDLIM4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 131822055 T/C 1 18 14 32 8.48952270283999 7.39703789779112 1.09248480504886 T:C T C 10 0.528359849842223 0.726939458112817 ENSG00000125347:ENST00000245414:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000405885:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000459982:exon_131821815_131822378:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000458069:exon_131822033_131822065:IRF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 132437531 C/T 1 91 103 194 42.9192536643577 54.421064533749 -11.5018108693912 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0987365138249384 ENSG00000170606:ENST00000304858:exon_132437451_132437570:HSPA4;ENSG00000170606:ENST00000514825:exon_132437288_132437570:HSPA4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 133956668 G/A 1 7 6 13 3.30148105110444 3.17015909905334 0.131321952051101 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000152700:ENST00000402673:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000507419:exon_133956623_133956691:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000394992:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000282606:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000439578:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000503318:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000505758:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000502286:exon_133956623_133956742:SAR1B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 137088805 C/T 1 222 243 465 104.704113335027 128.39144351166 -23.6873301766337 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0289954116409672 ENSG00000177733:ENST00000314940:exon_137087075_137090039:HNRNPA0 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 137500665 G/A 1 9 4 13 4.24476135141999 2.11343939936889 2.1313219520511 A:G G A 10 0.528359849842223 0.276905486309559 ENSG00000112983:ENST00000254900:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000230901:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000454473:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000418329:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000441656:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000402931:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000411594:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000239899:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000455658:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000512140:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000506167:exon_137500403_137500855:BRD8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 137665323 G/A 1 2 9 11 0.943280300315554 4.75523864858001 -3.81195834826445 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0308448779834246 ENSG00000158402:ENST00000323760:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000356505:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000513970:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000514555:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000503022:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000510119:exon_137665242_137665336:CDC25C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 137892170 G/A 1 298 273 571 140.548764747018 144.242239006927 -3.69347425990929 A:T:G G A 10 0.528359849842223 0.769297107386604 ENSG00000113013:ENST00000297185:exon_137892141_137892281:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000524109:exon_137892141_137892281:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000512328:exon_137892141_137892262:HSPA9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 138456815 T/C 1 11 12 23 5.18804165173555 6.34031819810668 -1.15227654637113 T:C T C 10 0.528359849842223 0.679780772383216 ENSG00000120725:ENST00000394817:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000265195:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509534:exon_138456724_138456859:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000508639:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000513453:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000507002:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505830:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505353:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000504666:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509400:exon_138456724_138456862:SIL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 138857925 C/G 1 5 10 15 2.35820075078889 5.28359849842223 -2.92539774763334 C:G C G 10 0.528359849842223 0.194650532535346 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138857855_138858789:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000509573:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511886:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502825:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138857855_138858093:TMEM173 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 138861078 C/T 1 5 4 9 2.35820075078889 2.11343939936889 0.244761351419994 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138860375_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138861063_138861214:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514119:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000515507:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511850:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502362:exon_138860831_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514348:exon_138861004_138861289:TMEM173 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 139574050 G/A 1 62 51 113 29.2416893097822 26.9463523419534 2.29533696782881 A:G G A 10 0.528359849842223 0.706694366570279 ENSG00000120306:ENST00000261811:exon_139574031_139574237:C5orf32;ENSG00000120306:ENST00000509589:exon_139574031_139574237:C5orf32;ENSG00000120306:ENST00000504227:exon_139574031_139574237:C5orf32 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 139938303 G/A 1 7 15 22 3.30148105110444 7.92539774763334 -4.62391669652891 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0553869729753656 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139937853_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000509914:exon_139937854_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139937854_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000358580:exon_139937854_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000467078:exon_139937857_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000356738:exon_139937857_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000354402:exon_139937857_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000357560:exon_139937857_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139937979_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000412920:exon_139938170_139938406:APBB3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 140048544 C/T 1 8 5 13 3.77312120126222 2.64179924921111 1.1313219520511 T:C C T 10 0.528359849842223 0.589076720209571 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000403979:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140048476_140048833:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511364:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000520764:exon_140048506_140048575:WDR55 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 140057566 A/G 1 53 56 109 24.9969279583622 29.5881515911645 -4.5912236328023 A:G A G 10 0.528359849842223 0.389296238258345 ENSG00000170445:ENST00000504156:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000457527:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000431330:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000504366:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000307633:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000448240:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000438307:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000415192:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000512655:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000506579:exon_140057240_140058712:HARS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 140953316 G/A 1 6 6 12 2.82984090094666 3.17015909905334 -0.340318198106676 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000131504:ENST00000389054:exon_140953059_140953775:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000398557:exon_140953059_140953775:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000520569:exon_140953059_140953775:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000398566:exon_140953059_140953775:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000398562:exon_140953059_140953510:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000253811:exon_140953059_140953775:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000518047:exon_140953059_140953775:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000521457:exon_140953059_140953775:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000389057:exon_140953059_140953775:DIAPH1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 141019110 C/A 1 9 6 15 4.24476135141999 3.17015909905334 1.07460225236666 A:C C A 10 0.528359849842223 0.61599879202346 ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000517794:exon_141019031_141019196:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520465:exon_141018875_141019410:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 141019569 G/C 1 9 10 19 4.24476135141999 5.28359849842223 -1.03883714700224 C:G G C 10 0.528359849842223 0.653351132943168 ENSG00000164620:ENST00000520674:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 141019830 C/G 1 17 13 30 8.01788255268221 6.8686780479489 1.14920450473331 C:G C G 10 0.528359849842223 0.71778823657468 ENSG00000164620:ENST00000520674:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 141307833 T/C 1 5 11 16 2.35820075078889 5.81195834826445 -3.45375759747557 T:C T C 10 0.528359849842223 0.130530190247833 ENSG00000081791:ENST00000432126:exon_141307716_141307863:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000194118:exon_141307716_141307863:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000508751:exon_141307716_141307863:KIAA0141 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 141309265 C/T 1 9 4 13 4.24476135141999 2.11343939936889 2.1313219520511 T:C C T 10 0.528359849842223 0.276905486309559 ENSG00000081791:ENST00000432126:exon_141309147_141309305:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000194118:exon_141309147_141309305:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000508751:exon_141309147_141309305:KIAA0141 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 145890028 A/G 1 36 38 74 16.97904540568 20.0776742940045 -3.0986288883245 A:G A G 10 0.528359849842223 0.486723827615755 ENSG00000113649:ENST00000296702:exon_145890004_145891524:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000394421:exon_145890004_145890586:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000506524:exon_145890004_145891071:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000511077:exon_145890004_145891068:TCERG1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 149754991 C/T 1 3 9 12 1.41492045047333 4.75523864858001 -3.34031819810668 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0796925302844448 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149754946_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149754180_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149754902_149755117:TCOF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 149755421 A/G 1 8 8 16 3.77312120126222 4.22687879873778 -0.453757597475567 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149755284_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149755284_149755472:TCOF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 149755744 G/C 1 18 12 30 8.48952270283999 6.34031819810668 2.14920450473331 C:G G C 10 0.528359849842223 0.46922644197021 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149755284_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149755645_149755893:TCOF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 149759096 T/C 1 20 14 34 9.43280300315554 7.39703789779112 2.03576510536442 T:C T C 10 0.528359849842223 0.498590448787879 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149759095_149760422:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000506063:exon_149759095_149759207:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000506767:exon_149759095_149759295:TCOF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 149792113 G/A 1 7 3 10 3.30148105110444 1.58507954952667 1.71640150157777 A:G G A 10 0.528359849842223 0.35163323596596 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 149792135 G/A 1 7 2 9 3.30148105110444 1.05671969968445 2.24476135141999 A:G G A 10 0.528359849842223 0.186011003558895 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 149792337 C/T 1 11 14 25 5.18804165173555 7.39703789779112 -2.20899624605557 T:C C T 10 0.528359849842223 0.426211756189236 ENSG00000019582:ENST00000353334:exon_149792188_149792492:CD74;ENSG00000019582:ENST00000517791:exon_149792188_149792475:CD74 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 149826526 C/T 1 3850 3501 7351 1815.81457810744 1849.78783429762 -33.973256190181 A:T:C:G C T 10 0.528359849842223 0.433798926890833 ENSG00000164587:ENST00000401695:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000407193:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000521466:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000518139:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000312037:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 149827098 G/A 1 9 5 14 4.24476135141999 2.64179924921111 1.60296210220888 A:G G A 10 0.528359849842223 0.434484743557366 ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 150413289 C/T 1 100 83 183 47.1640150157777 43.8538675369045 3.3101474788732 T:C C T 10 0.528359849842223 0.657144303663094 ENSG00000145901:ENST00000520931:exon_150413169_150413360:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000389378:exon_150413169_150413360:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000315050:exon_150413169_150413360:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523338:exon_150413169_150413360:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522574:exon_150413169_150413360:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522226:exon_150413169_150413360:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521591:exon_150413169_150413360:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000518977:exon_150413169_150413360:TNIP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 150425467 G/A 1 49 46 95 23.1103673577311 24.3045530927423 -1.19418573501118 A:G G A 10 0.528359849842223 0.837555249217297 ENSG00000145901:ENST00000520931:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000389378:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000315050:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523338:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000417127:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522226:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000519339:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521591:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000518977:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000524280:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523200:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521782:exon_150425422_150425922:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522100:exon_150425427_150425511:TNIP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 150436422 C/T 1 44 43 87 20.7521666069422 22.7194735432156 -1.9673069362734 T:C C T 10 0.528359849842223 0.747547731955499 ENSG00000145901:ENST00000520931:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000389378:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000315050:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523338:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000417127:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522226:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000519339:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521591:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000518977:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000524280:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523200:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522100:exon_150436327_150436518:TNIP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 150489390 A/G 1 196 159 355 92.4414694309243 84.0092161249135 8.43225330601085 A:G A G 10 0.528359849842223 0.395064015268206 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150489314_150489407:ANXA6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 150518988 G/A 1 61 63 124 28.7700491596244 33.28667054006 -4.51662138043564 A:G G A 10 0.528359849842223 0.419913526460902 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517486:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000519644:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517677:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521749:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517757:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000520378:exon_150518239_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523164:exon_150518914_150519008:ANXA6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 150639409 A/G 1 10 8 18 4.71640150157777 4.22687879873778 0.489522702839987 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000196743:ENST00000523466:exon_150639316_150639477:GM2A;ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150639316_150639477:GM2A;ENSG00000196743:ENST00000523004:exon_150639360_150639477:GM2A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 150647012 A/G 1 20 17 37 9.43280300315554 8.98211744731779 0.450685555837751 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150646857_150650001:GM2A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 153372525 G/A 1 20 14 34 9.43280300315554 7.39703789779112 2.03576510536442 A:G G A 10 0.528359849842223 0.498590448787879 ENSG00000055147:ENST00000351797:exon_153369688_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000522858:exon_153371263_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000442256:exon_153371271_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000435178:exon_153371271_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520667:exon_153372059_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000433795:exon_153372066_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518914:exon_153372248_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518946:exon_153372274_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520313:exon_153372515_153372670:FAM114A2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 156747669 A/G 1 7 14 21 3.30148105110444 7.39703789779112 -4.09555684668668 A:G A G 10 0.528359849842223 0.082681392551285 ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156747663_156747810:CYFIP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 156753257 C/T 1 11 9 20 5.18804165173555 4.75523864858001 0.432803003155541 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520960:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000518555:exon_156752608_156753275:CYFIP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 162896650 C/T 1 2 7 9 0.943280300315554 3.69851894889556 -2.75523864858001 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0939591166432567 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000520345:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000522094:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162896647_162896712:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000517936:exon_162896647_162896916:HMMR HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 162902516 T/C 1 13 8 21 6.1313219520511 4.22687879873778 1.90444315331332 T:C T C 10 0.528359849842223 0.513633535609652 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162902464_162902678:HMMR HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 162909716 C/T 1 16 9 25 7.54624240252443 4.75523864858001 2.79100375394443 T:C C T 10 0.528359849842223 0.318599865175394 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162909648_162909794:HMMR HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 162940999 A/G 1 13 18 31 6.1313219520511 9.51047729716001 -3.37915534510891 A:G A G 10 0.528359849842223 0.280569742102825 ENSG00000038274:ENST00000280969:exon_162940848_162941000:MAT2B;ENSG00000038274:ENST00000415433:exon_162940848_162941000:MAT2B;ENSG00000038274:ENST00000321757:exon_162940848_162941000:MAT2B;ENSG00000038274:ENST00000421814:exon_162940848_162941000:MAT2B;ENSG00000038274:ENST00000518095:exon_162940848_162941000:MAT2B;ENSG00000038274:ENST00000523606:exon_162940848_162941000:MAT2B;ENSG00000038274:ENST00000520449:exon_162940848_162941000:MAT2B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 167943827 G/A 1 29 33 62 13.6775643545755 17.4358750447934 -3.75831069021782 A:G G A 10 0.528359849842223 0.374119141381512 ENSG00000113643:ENST00000231572:exon_167943783_167943955:RARS;ENSG00000113643:ENST00000520013:exon_167943783_167943955:RARS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 169267784 G/A 1 7 6 13 3.30148105110444 3.17015909905334 0.131321952051101 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520836:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520181:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519628:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169267761_169267856:DOCK2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 169435713 A/C 1 10 11 21 4.71640150157777 5.81195834826445 -1.09555684668668 A:C A C 10 0.528359849842223 0.667251391828987 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169435692_169435750:DOCK2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 169454941 C/G 1 10 9 19 4.71640150157777 4.75523864858001 -0.0388371470022362 C:G C G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000433448:exon_169454867_169454952:DOCK2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 169461547 C/T 1 10 8 18 4.71640150157777 4.22687879873778 0.489522702839987 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169461403_169461559:DOCK2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 171481606 A/G 1 21 20 41 9.90444315331332 10.5671969968445 -0.66275384353114 A:G A G 10 0.528359849842223 0.876511049600661 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171481573_171481698:STK10;ENSG00000072786:ENST00000520476:exon_171481573_171481698:STK10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 171534795 G/A 1 11 12 23 5.18804165173555 6.34031819810668 -1.15227654637113 A:G G A 10 0.528359849842223 0.679780772383216 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171534784_171534856:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171534784_171535292:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171534784_171534856:STK10;ENSG00000072786:ENST00000521322:exon_171534784_171535030:STK10;ENSG00000072786:ENST00000518267:exon_171534784_171534856:STK10;ENSG00000072786:ENST00000519441:exon_171534784_171535065:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517381:exon_171534784_171534856:STK10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 171615058 C/T 1 10 3 13 4.71640150157777 1.58507954952667 3.1313219520511 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0990276262490944 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171614891_171615390:STK10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 172386952 C/A 1 3 8 11 1.41492045047333 4.22687879873778 -2.81195834826445 A:C C A 10 0.528359849842223 0.129693174868926 ENSG00000037241:ENST00000519974:exon_172386868_172387044:RPL26L1;ENSG00000037241:ENST00000521476:exon_172386868_172387044:RPL26L1;ENSG00000037241:ENST00000265100:exon_172386868_172387044:RPL26L1;ENSG00000037241:ENST00000519239:exon_172386868_172387044:RPL26L1;ENSG00000037241:ENST00000519522:exon_172386868_172386992:RPL26L1;ENSG00000037241:ENST00000519156:exon_172386768_172387044:RPL26L1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 172395581 C/T 1 4 12 16 1.88656060063111 6.34031819810668 -4.45375759747557 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0417035604139189 ENSG00000037241:ENST00000519974:exon_172395462_172395602:RPL26L1;ENSG00000037241:ENST00000521476:exon_172395462_172395602:RPL26L1;ENSG00000037241:ENST00000265100:exon_172395462_172395602:RPL26L1;ENSG00000037241:ENST00000519239:exon_172395462_172395602:RPL26L1;ENSG00000037241:ENST00000519156:exon_172395462_172395602:RPL26L1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 175811233 C/T 1 138 171 309 65.0863407217732 90.3495343230201 -25.2631936012469 T:C C T 10 0.528359849842223 0.00433079900217759 ENSG00000048162:ENST00000510123:exon_175810949_175811284:NOP16;ENSG00000048162:ENST00000389158:exon_175810949_175811375:NOP16;ENSG00000048162:ENST00000507413:exon_175810961_175811287:NOP16;ENSG00000048162:ENST00000451293:exon_175811099_175811287:NOP16;ENSG00000048162:ENST00000341213:exon_175811099_175811365:NOP16;ENSG00000048162:ENST00000502663:exon_175811209_175811284:NOP16 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 175815782 G/C 1 242 69 311 114.136916338182 36.4568296391134 77.6800866990687 C:G G C 10 0.528359849842223 1.25848840169749e-19 ENSG00000048162:ENST00000389158:exon_175815434_175815976:NOP16;ENSG00000146066:ENST00000274787:exon_175815748_175815974:HIGD2A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 175815787 A/C 1 250 72 322 117.910037539444 38.0419091886401 79.8681283508042 A:C A C 10 0.528359849842223 4.1308005376183e-20 ENSG00000048162:ENST00000389158:exon_175815434_175815976:NOP16;ENSG00000146066:ENST00000274787:exon_175815748_175815974:HIGD2A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 175815874 T/C 1 205 51 256 96.6862307823443 26.9463523419534 69.7398784403909 T:C T C 10 0.528359849842223 1.32188015933108e-19 ENSG00000048162:ENST00000389158:exon_175815434_175815976:NOP16;ENSG00000146066:ENST00000274787:exon_175815748_175815974:HIGD2A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 176721119 G/A 1 6 9 15 2.82984090094666 4.75523864858001 -1.92539774763334 A:G G A 10 0.528359849842223 0.439217229441099 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176720833_176727216:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176720833_176722763:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176720833_176727211:NSD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 176721151 T/C 1 3 11 14 1.41492045047333 5.81195834826445 -4.39703789779112 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0286834249686330 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176720833_176727216:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176720833_176722763:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176720833_176727211:NSD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 176721272 G/C 1 9 7 16 4.24476135141999 3.69851894889556 0.546242402524432 C:G G C 10 0.528359849842223 0.808617085826636 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176720833_176727216:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176720833_176722763:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176720833_176727211:NSD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 176734647 C/T 1 26 33 59 12.2626439041022 17.4358750447934 -5.17323114069115 T:C C T 10 0.528359849842223 0.193291146437756 ENSG00000213347:ENST00000423571:exon_176733818_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000439742:exon_176734206_176734704:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000503782:exon_176734209_176734704:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000303165:exon_176734215_176734704:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000513063:exon_176734436_176734704:MXD3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 176734855 G/C 1 11 7 18 5.18804165173555 3.69851894889556 1.48952270283999 C:G G C 10 0.528359849842223 0.63817833418455 ENSG00000213347:ENST00000503473:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000509339:exon_176734782_176735063:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000423571:exon_176733818_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000439742:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000503782:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000303165:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000513063:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000513169:exon_176734814_176734965:MXD3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 177548196 G/A 1 12 7 19 5.65968180189332 3.69851894889556 1.96116285299776 A:G G A 10 0.528359849842223 0.491898728253755 ENSG00000145911:ENST00000274605:exon_177548099_177548353:N4BP3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 177565255 C/T 1 13 8 21 6.1313219520511 4.22687879873778 1.90444315331332 T:C C T 10 0.528359849842223 0.513633535609652 ENSG00000145916:ENST00000313386:exon_177565109_177565259:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000515098:exon_177565109_177565259:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000507575:exon_177565109_177565259:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000502814:exon_177565109_177565259:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000512663:exon_177565109_177565397:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000507457:exon_177565109_177565259:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000508647:exon_177565109_177565259:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000512811:exon_177565109_177565259:RMND5B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 177569969 C/G 1 7 7 14 3.30148105110444 3.69851894889556 -0.397037897791122 C:G C G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000145916:ENST00000313386:exon_177569853_177569993:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000515098:exon_177569853_177569993:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000507575:exon_177569584_177569993:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000512663:exon_177569853_177569977:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000507457:exon_177569853_177569993:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000512811:exon_177569853_177569993:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000515360:exon_177569853_177569993:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000513162:exon_177568673_177569993:RMND5B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 177574561 T/C 1 30 20 50 14.1492045047333 10.5671969968445 3.58200750788885 T:C T C 10 0.528359849842223 0.325134118381987 ENSG00000145916:ENST00000313386:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000515098:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000507575:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000515360:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000513162:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000507937:exon_177572971_177574636:RMND5B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 179036457 G/C 1 36 41 77 16.97904540568 21.6627538435311 -4.68370843785117 C:G G C 10 0.528359849842223 0.305365126576087 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179036377_179037027:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179036377_179036520:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179036377_179037019:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179036377_179037012:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179036377_179037013:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000503583:exon_179036377_179036473:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000508797:exon_179036377_179036971:RUFY1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 5 179290845 T/G 1 13 19 32 6.1313219520511 10.0388371470022 -3.90751519495113 T:G T G 10 0.528359849842223 0.214738050722661 ENSG00000197226:ENST00000518085:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179289738_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520794:exon_179289743_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000524222:exon_179290404_179291128:TBC1D9B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 108 78 186 50.9371362170399 41.2120682876934 9.72506792934653 A:G G A 10 0.528359849842223 0.163084812944354 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 4031998 A/G 1 49 52 101 23.1103673577311 27.4747121917956 -4.36434483406452 A:G A G 10 0.528359849842223 0.425525448722117 ENSG00000112739:ENST00000480058:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000337659:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000489943:exon_4031793_4032335:PRPF4B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 4116262 G/A 1 49 42 91 23.1103673577311 22.1911136933734 0.919253664357711 A:G G A 10 0.528359849842223 0.916475174549222 ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4115923_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4115927_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4115934_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4115936_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000478266:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4115941_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4115942_4116263:PECI HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 7310259 A/G 1 7 6 13 3.30148105110444 3.17015909905334 0.131321952051101 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000124783:ENST00000474597:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000244763:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000397511:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000489567:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000479365:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000462112:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000488834:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000483409:exon_7310150_7310262:SSR1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 10702625 T/C 1 16 26 42 7.54624240252443 13.7373560958978 -6.19111369337336 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0635982184506476 ENSG00000111845:ENST00000379568:exon_10702602_10702722:PAK1IP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 11213832 T/C 1 3 7 10 1.41492045047333 3.69851894889556 -2.28359849842223 T:C T C 10 0.528359849842223 0.206915350075299 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000379433:exon_11213514_11213960:NEDD9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 16145325 A/G 1 6 3 9 2.82984090094666 1.58507954952667 1.24476135141999 A:G A G 10 0.528359849842223 0.514115714513849 ENSG00000007944:ENST00000356840:exon_16145128_16145548:MYLIP;ENSG00000007944:ENST00000349606:exon_16145128_16145548:MYLIP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 16306751 G/A 1 4 7 11 1.88656060063111 3.69851894889556 -1.81195834826445 A:G G A 10 0.528359849842223 0.368338354344120 ENSG00000124788:ENST00000244769:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000436367:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000450222:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000379065:exon_16306534_16307090:ATXN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 21201493 G/A 1 8 13 21 3.77312120126222 6.8686780479489 -3.09555684668668 A:G G A 10 0.528359849842223 0.194999185861965 ENSG00000145996:ENST00000274695:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000397216:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378624:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378610:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000476517:exon_21201341_21201505:CDKAL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 24418348 G/A 1 6 4 10 2.82984090094666 2.11343939936889 0.71640150157777 A:G G A 10 0.528359849842223 0.757839432335683 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24418312_24418395:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24418312_24418464:MRS2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 24423918 G/A 1 16 16 32 7.54624240252443 8.45375759747557 -0.907515194951134 A:G G A 10 0.528359849842223 0.859856844278653 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24423812_24425809:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24423812_24425809:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24423812_24425810:MRS2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 24653376 G/A 1 10 3 13 4.71640150157777 1.58507954952667 3.1313219520511 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0990276262490944 ENSG00000111802:ENST00000378198:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000478507:exon_24653211_24653381:TDP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 25967038 C/T 1 10 10 20 4.71640150157777 5.28359849842223 -0.567196996844459 T:C C T 10 0.528359849842223 0.826247654639236 ENSG00000112343:ENST00000349458:exon_25966563_25967161:TRIM38;ENSG00000112343:ENST00000357085:exon_25966744_25967161:TRIM38 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 26045929 T/C 1 6 5 11 2.82984090094666 2.64179924921111 0.188041651735547 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000196532:ENST00000360577:exon_26045612_26047022:HIST1H3C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 26056549 A/G 1 228 250 478 107.533954235973 132.089962460556 -24.5560082245826 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0248073650748568 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 26104448 A/G 1 49 25 74 23.1103673577311 13.2089962460556 9.9013711116755 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0262941794426711 ENSG00000197061:ENST00000377803:exon_26104104_26104518:HIST1H4C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 26124430 C/T 1 9 16 25 4.24476135141999 8.45375759747557 -4.20899624605557 T:C C T 10 0.528359849842223 0.109520651937700 ENSG00000180573:ENST00000377791:exon_26124373_26124969:HIST1H2AC;ENSG00000180573:ENST00000314088:exon_26124418_26124977:HIST1H2AC HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 26156843 G/A 1 6 3 9 2.82984090094666 1.58507954952667 1.24476135141999 A:G G A 10 0.528359849842223 0.514115714513849 ENSG00000168298:ENST00000304218:exon_26156559_26157343:HIST1H1E HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 26184041 A/G 1 19 26 45 8.96116285299776 13.7373560958978 -4.77619324290003 A:G A G 10 0.528359849842223 0.179238168707575 ENSG00000197697:ENST00000356530:exon_26183958_26184454:HIST1H2BE HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 26184102 G/A 1 36 33 69 16.97904540568 17.4358750447934 -0.456829639113383 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000197697:ENST00000356530:exon_26183958_26184454:HIST1H2BE HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 26197493 C/A 1 6 8 14 2.82984090094666 4.22687879873778 -1.39703789779112 A:C C A 10 0.528359849842223 0.594448035256428 ENSG00000197409:ENST00000377831:exon_26197012_26197497:HIST1H3D HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 26199222 G/A 1 7 1 8 3.30148105110444 0.528359849842223 2.77312120126222 A:G G A 10 0.528359849842223 0.073836867977041 ENSG00000197409:ENST00000377831:exon_26199087_26199464:HIST1H3D;ENSG00000196866:ENST00000341023:exon_26199079_26199471:HIST1H2AD HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 26216656 T/C 1 6 2 8 2.82984090094666 1.05671969968445 1.77312120126222 T:C T C 10 0.528359849842223 0.29537924054388 ENSG00000187990:ENST00000339812:exon_26216491_26216871:HIST1H2BG HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 26285503 C/T 1 2 8 10 0.943280300315554 4.22687879873778 -3.28359849842223 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0542343953774601 ENSG00000158406:ENST00000289352:exon_26285262_26285762:HIST1H4H;ENSG00000158406:ENST00000377727:exon_26285341_26285737:HIST1H4H HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 26393021 G/A 1 15 8 23 7.07460225236666 4.22687879873778 2.84772345362887 A:G G A 10 0.528359849842223 0.297507531604697 ENSG00000124508:ENST00000356709:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000352867:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000482536:exon_26392603_26393235:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000432533:exon_26392450_26393236:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000416795:exon_26392603_26394220:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000495632:exon_26391031_26394197:BTN2A2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 28891423 G/A 1 14 10 24 6.60296210220888 5.28359849842223 1.31936360378665 A:G G A 10 0.528359849842223 0.684580806653448 ENSG00000204713:ENST00000377199:exon_28890990_28891766:TRIM27;ENSG00000204713:ENST00000377194:exon_28890990_28891765:TRIM27;ENSG00000204713:ENST00000481474:exon_28890990_28891690:TRIM27;ENSG00000204713:ENST00000444898:exon_28890990_28891768:TRIM27 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 29523952 A/G 1 21 34 55 9.90444315331332 17.9642348946356 -8.05979174132226 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0310374590272786 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 29691303 G/A 1 210 263 473 99.0444315331332 138.958640508505 -39.9142089753715 A:G G A 10 0.528359849842223 0.000266658803680692 ENSG00000204642:ENST00000376861:exon_29691083_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000414333:exon_29691056_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000334668:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000462777:exon_29691169_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29691185_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000482257:exon_29691211_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29691219_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000434407:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000433607:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000486194:exon_29691281_29691704:HLA-F HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 29691713 A/C 1 8 4 12 3.77312120126222 2.11343939936889 1.65968180189332 A:C A C 10 0.528359849842223 0.396971345501871 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 29691744 C/G 1 5 6 11 2.35820075078889 3.17015909905334 -0.811958348264453 C:G C G 10 0.528359849842223 0.765428811190486 ENSG00000204642:ENST00000485513:exon_29691717_29692225:HLA-F HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 29693726 G/T 1 11 14 25 5.18804165173555 7.39703789779112 -2.20899624605557 T:G G T 10 0.528359849842223 0.426211756189236 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 29693969 C/T 1 26 17 43 12.2626439041022 8.98211744731779 3.28052645678441 T:C C T 10 0.528359849842223 0.360873411396874 ENSG00000204642:ENST00000484704:exon_29693788_29694303:HLA-F HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 29694680 A/C 1 16 4 20 7.54624240252443 2.11343939936889 5.43280300315554 A:C A C 10 0.528359849842223 0.0225946964797547 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 29694681 A/T 1 16 4 20 7.54624240252443 2.11343939936889 5.43280300315554 A:T A T 10 0.528359849842223 0.0225946964797547 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 29910324 G/C 1 23 139 162 10.8477234536289 73.442019128069 -62.5942956744401 C:G G C 10 0.528359849842223 1.19700638199324e-24 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910181_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910022_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910278_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910287_29910403:HLA-A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 29910402 G/A 1 680 22 702 320.715302107288 11.6239166965289 309.091385410759 A:G G A 10 0.528359849842223 1.22133675775131e-154 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910181_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910022_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910278_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910287_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29910325_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910326_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910329_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910331_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910331_29910403:HLA-A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 29910801 C/A 1 2 599 601 0.943280300315554 316.487550055492 -315.544269755176 A:C:G C A 10 0.528359849842223 1.57035625601762e-191 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 29912297 A/G 1 744 110 854 350.900271717386 58.1195834826445 292.780688234742 A:G A G 10 0.528359849842223 2.16001091519488e-101 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 29912386 G/C 1 2388 224 2612 1126.27667857677 118.352606364658 1007.92407221211 C:G G C 10 0.528359849842223 0 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 30166266 C/T 1 9 13 22 4.24476135141999 6.8686780479489 -2.62391669652891 T:C C T 10 0.528359849842223 0.291037847710403 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000416596:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000420345:exon_30166206_30166301:TRIM26 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 30166475 C/T 1 14 12 26 6.60296210220888 6.34031819810668 0.262643904102203 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30166443_30167041:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000416596:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000418026:exon_30166443_30166930:TRIM26 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 30166632 C/T 1 11 11 22 5.18804165173555 5.81195834826445 -0.623916696528905 T:C C T 10 0.528359849842223 0.833301388629641 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30166443_30167041:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000416596:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000418026:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000434785:exon_30166515_30166924:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000487829:exon_30166541_30166767:TRIM26 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 30313340 G/C 1 91 89 180 42.9192536643577 47.0240266359578 -4.10477297160013 C:G G C 10 0.528359849842223 0.551067429371948 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30313268_30313350:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30313268_30313350:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30313244_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000466327:exon_30313268_30313706:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30313075_30314334:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30313075_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30313268_30313350:RPP21 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 30314566 T/G 1 46 33 79 21.6954469072577 17.4358750447934 4.25957186246439 T:C:G T G 10 0.528359849842223 0.36823490131207 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 30314567 C/A 1 47 33 80 22.1670870574155 17.4358750447934 4.73121201262217 A:C C A 10 0.528359849842223 0.314520034808296 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 30458064 G/A 1 272 265 537 128.286120842915 140.015360208189 -11.7292393652737 A:G G A 10 0.528359849842223 0.320277115571409 ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30458017_30458292:HLA-E HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 30521137 G/A 1 13 20 33 6.1313219520511 10.5671969968445 -4.43587504479336 A:G G A 10 0.528359849842223 0.162127367912405 ENSG00000204590:ENST00000376621:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000429126:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000426875:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000376602:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430946:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430441:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000433809:exon_30521137_30521334:GNL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 30569951 G/A 1 15 8 23 7.07460225236666 4.22687879873778 2.84772345362887 A:G G A 10 0.528359849842223 0.297507531604697 ENSG00000204569:ENST00000376511:exon_30569713_30570468:PPP1R10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 30627867 T/C 1 14 11 25 6.60296210220888 5.81195834826445 0.791003753944426 T:C T C 10 0.528359849842223 0.84244030516468 ENSG00000204560:ENST00000376442:exon_30627809_30628019:DHX16;ENSG00000204560:ENST00000376437:exon_30627809_30628019:DHX16;ENSG00000204560:ENST00000480966:exon_30627809_30628354:DHX16 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 30652651 T/G 1 16 16 32 7.54624240252443 8.45375759747557 -0.907515194951134 T:G T G 10 0.528359849842223 0.859856844278653 ENSG00000146112:ENST00000274853:exon_30652185_30655672:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000399199:exon_30652185_30653823:KIAA1949 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 30671312 A/C 1 24 24 48 11.3193636037866 12.6806363962134 -1.3612727924267 A:C A C 10 0.528359849842223 0.772944113464232 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671195_30671314:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671195_30671314:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671195_30671314:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000422104:exon_30671195_30671314:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000489540:exon_30671195_30671858:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671195_30671314:MDC1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 30671588 A/T 1 23 20 43 10.8477234536289 10.5671969968445 0.280526456784413 A:T A T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000422104:exon_30671398_30671598:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000489540:exon_30671195_30671858:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 30671726 G/C 1 17 17 34 8.01788255268221 8.98211744731779 -0.964234894635581 C:G G C 10 0.528359849842223 0.863945522489226 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000489540:exon_30671195_30671858:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 30673064 C/T 1 4 6 10 1.88656060063111 3.17015909905334 -1.28359849842223 T:C C T 10 0.528359849842223 0.531770325189017 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 30673113 G/T 1 6 5 11 2.82984090094666 2.64179924921111 0.188041651735547 T:G G T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 30673351 C/G 0 9 0 9 4.24476135141999 0 4.24476135141999 C C 10 0.528359849842223 0.00436376312451053 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000417033:exon_30673225_30673875:MDC1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 30673359 T/G 0 11 0 11 5.18804165173555 0 5.18804165173555 T T 10 0.528359849842223 0.00115270771725888 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000417033:exon_30673225_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000492462:exon_30673359_30673875:MDC1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 30695920 C/T 1 482 359 841 227.330552376049 189.681186093358 37.6493662826905 A:T:C:G C T 10 0.528359849842223 0.00956316893329654 ENSG00000137312:ENST00000376389:exon_30695486_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000487376:exon_30695486_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000376385:exon_30695486_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000456573:exon_30695513_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000432446:exon_30695513_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000422641:exon_30695513_30695922:FLOT1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 30698541 A/G 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 A:G A G 10 0.528359849842223 0.743278251879842 ENSG00000137312:ENST00000487376:exon_30698459_30698877:FLOT1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 30708944 T/A 1 7 1 8 3.30148105110444 0.528359849842223 2.77312120126222 A:T T A 10 0.528359849842223 0.073836867977041 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 30890264 G/A 1 7 11 18 3.30148105110444 5.81195834826445 -2.51047729716001 A:G G A 10 0.528359849842223 0.248719564040320 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30890227_30890331:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30890227_30890331:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30890159_30890331:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30890227_30890331:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30890227_30890331:VARS2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 31110391 G/C 1 39 46 85 18.3939658561533 24.3045530927423 -5.91058723658895 C:G G C 10 0.528359849842223 0.231934124221918 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31110221_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31110238_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31110297_31110493:CCHCR1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 31111124 C/A 1 17 24 41 8.01788255268221 12.6806363962134 -4.66275384353114 A:C C A 10 0.528359849842223 0.160542135631296 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509859:exon_31110915_31111190:CCHCR1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 31111174 C/A 1 28 10 38 13.2059242044178 5.28359849842223 7.92232570599553 A:C C A 10 0.528359849842223 0.0137024802902281 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509859:exon_31110915_31111190:CCHCR1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 31112484 C/T 1 6 17 23 2.82984090094666 8.98211744731779 -6.15227654637113 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0115920294245276 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112464_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31112406_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112297_31112850:CCHCR1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 31112823 T/C 1 15 9 24 7.07460225236666 4.75523864858001 2.31936360378665 T:C T C 10 0.528359849842223 0.415665286985416 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112464_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31112662_31112892:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112297_31112850:CCHCR1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 31113052 G/A 1 7 18 25 3.30148105110444 9.51047729716001 -6.20899624605557 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0153436520614843 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 31116210 G/A 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 A:G G A 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 31118898 A/T 1 7 6 13 3.30148105110444 3.17015909905334 0.131321952051101 A:T A T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118732_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31118644_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000505392:exon_31118662_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31118752_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31118847_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31118869_31118899:CCHCR1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 31129707 C/T 1 12 15 27 5.65968180189332 7.92539774763334 -2.26571594574002 T:C C T 10 0.528359849842223 0.442795735902603 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 31239417 C/T 1 13 12 25 6.1313219520511 6.34031819810668 -0.208996246055574 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 31239430 C/T 1 13 14 27 6.1313219520511 7.39703789779112 -1.26571594574002 T:C C T 10 0.528359849842223 0.701520600568723 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 31239501 G/T 1 16 12 28 7.54624240252443 6.34031819810668 1.20592420441776 T:G G T 10 0.528359849842223 0.707781354301213 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 31239518 C/T 1 14 13 27 6.60296210220888 6.8686780479489 -0.26571594574002 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 31323353 G/A 1 342 235 577 161.30093135396 124.164564712922 37.1363666410374 A:G G A 10 0.528359849842223 0.00201184012132452 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31323094_31323579:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000426590:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000498007:exon_31323168_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000434333:exon_31323284_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000474381:exon_31323299_31324219:HLA-B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 31431820 C/T 1 19 13 32 8.96116285299776 6.8686780479489 2.09248480504887 T:C C T 10 0.528359849842223 0.484439446584996 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 31498737 G/A 1 12 15 27 5.65968180189332 7.92539774763334 -2.26571594574002 A:G G A 10 0.528359849842223 0.442795735902603 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 31540556 T/C 1 39 59 98 18.3939658561533 31.1732311406912 -12.7792652845378 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0111497365169548 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540511_31540618:LTA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 31540757 A/C 1 52 62 114 24.5252878082044 32.7583106902178 -8.23302288201342 A:C A C 10 0.528359849842223 0.133470063095263 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540705_31540810:LTA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 31595882 C/A 1 5 6 11 2.35820075078889 3.17015909905334 -0.811958348264453 A:C C A 10 0.528359849842223 0.765428811190486 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31595542_31596016:BAT2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 31601344 T/C 1 35 30 65 16.5074052555222 15.8507954952667 0.65660976025551 T:C T C 10 0.528359849842223 0.901668832899586 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31601156_31601424:BAT2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 31601735 G/A 1 26 17 43 12.2626439041022 8.98211744731779 3.28052645678441 A:G G A 10 0.528359849842223 0.360873411396874 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31601636_31601766:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31601636_31601766:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31601636_31601766:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31601636_31601766:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31601636_31601766:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000460302:exon_31601731_31602142:BAT2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 31604010 C/G 1 79 73 152 37.2595718624644 38.5702690384823 -1.31069717601789 C:G C G 10 0.528359849842223 0.871037163629092 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603986_31604027:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603986_31604196:BAT2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 31627523 C/T 1 18 23 41 8.48952270283999 12.1522765463711 -3.66275384353114 T:C C T 10 0.528359849842223 0.275737811319982 ENSG00000204439:ENST00000375911:exon_31626075_31628549:C6orf47 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 31629995 G/A 1 20 15 35 9.43280300315554 7.92539774763334 1.5074052555222 A:G G A 10 0.528359849842223 0.735466789742701 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 31807489 C/T 1 27 15 42 12.73428405426 7.92539774763334 4.80888630662664 T:C C T 10 0.528359849842223 0.164273437353973 ENSG00000204387:ENST00000375640:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375641:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375639:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375638:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375635:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375642:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395789:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375633:exon_31807320_31807541:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395788:exon_31807320_31807541:C6orf48 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 31856212 C/T 1 6 12 18 2.82984090094666 6.34031819810668 -3.51047729716001 T:C C T 10 0.528359849842223 0.10474530419304 ENSG00000204371:ENST00000480912:exon_31856140_31856283:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000395728:exon_31856140_31856283:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375528:exon_31856140_31856283:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375530:exon_31856140_31856283:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375537:exon_31856140_31856283:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000442298:exon_31856140_31856283:EHMT2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 32088656 G/A 1 23 19 42 10.8477234536289 10.0388371470022 0.808886306626636 A:G G A 10 0.528359849842223 0.877691071070743 ENSG00000213676:ENST00000375203:exon_32088548_32088679:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000375201:exon_32088548_32088679:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000433846:exon_32088548_32088679:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000495579:exon_32088219_32088679:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000485314:exon_32088286_32088679:ATF6B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 32159674 G/A 1 85 86 171 40.089412763411 45.4389470864312 -5.34953432302012 A:G G A 10 0.528359849842223 0.443882068760468 ENSG00000213654:ENST00000487761:exon_32159486_32159685:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375040:exon_32159486_32159685:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375043:exon_32159486_32159685:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000402726:exon_32159486_32159685:GPSM3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 32159956 T/C 1 70 77 147 33.0148105110444 40.6837084378512 -7.66889792680677 T:C T C 10 0.528359849842223 0.215769197721091 ENSG00000213654:ENST00000487761:exon_32159925_32160049:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000472768:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375040:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375043:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000402726:exon_32159925_32160027:GPSM3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 32407709 C/A 1 168 214 382 79.2355452265065 113.069007866236 -33.8334626397292 A:C C A 10 0.528359849842223 0.000580425410136604 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32407619_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32407647_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000462200:exon_32407649_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32407655_32407809:HLA-DRA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 32410210 T/C 1 6 5 11 2.82984090094666 2.64179924921111 0.188041651735547 T:C T C 10 0.528359849842223 1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 32410215 T/C 1 6 5 11 2.82984090094666 2.64179924921111 0.188041651735547 T:C T C 10 0.528359849842223 1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 32411035 A/C 1 1754 2388 4142 827.256823376741 1261.72332142323 -434.466498046487 A:T:C:G A C 10 0.528359849842223 1.34007052376657e-41 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32410962_32411243:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32410962_32411122:HLA-DRA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 32411646 T/G 1 1740 2646 4386 820.653861274532 1398.04016268252 -577.38630140799 T:C:G T G 10 0.528359849842223 2.123158972951e-68 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32411533_32411698:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32411533_32411698:HLA-DRA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 32605234 G/A 0 475 0 475 224.029071324944 0 224.029071324944 G G 10 0.528359849842223 2.66766060190744e-132 ENSG00000196735:ENST00000422863:exon_32605198_32605308:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 32605295 C/T 0 988 0 988 465.980468355884 0 465.980468355884 C C 10 0.528359849842223 1.90358038057445e-274 ENSG00000196735:ENST00000422863:exon_32605198_32605308:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 32784662 T/C 1 36 31 67 16.97904540568 16.3791553451089 0.59989006057106 T:C T C 10 0.528359849842223 0.903254118401401 ENSG00000241106:ENST00000488325:exon_32784638_32784753:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32784638_32784825:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32784638_32784765:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000447394:exon_32784638_32784687:HLA-DOB;ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32784638_32784729:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32784638_32784729:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 32796793 G/A 1 27 14 41 12.73428405426 7.39703789779112 5.33724615646886 A:G G A 10 0.528359849842223 0.117179074572567 ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32793192_32796811:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32796683_32796811:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32796721_32796811:TAP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 32811629 G/T 1 139 126 265 65.557980871931 66.5733410801201 -1.01536020818908 T:C:G G T 10 0.528359849842223 0.90224493369935 ENSG00000204264:ENST00000395339:exon_32811627_32811797:PSMB8;ENSG00000204264:ENST00000374882:exon_32811627_32811824:PSMB8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 32821447 C/T 1 14 12 26 6.60296210220888 6.34031819810668 0.262643904102203 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32820816_32821755:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000425148:exon_32820816_32821755:TAP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 32826233 A/G 1 283 294 577 133.474162494651 155.337795853614 -21.8636333589627 A:C:G A G 10 0.528359849842223 0.072899456894156 ENSG00000240065:ENST00000395330:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000464863:exon_32826141_32826677:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000374859:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000453265:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000395333:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000467593:exon_32826141_32826499:PSMB9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 32904981 G/A 1 158 164 322 74.5191437249288 86.6510153741246 -12.1318716491958 A:G G A 10 0.528359849842223 0.180621841066034 ENSG00000242574:ENST00000438510:exon_32904949_32905216:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000414017:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000440643:exon_32904949_32905233:HLA-DMB HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 32905172 C/T 1 63 75 138 29.71332945994 39.6269887381667 -9.91365927822677 T:C C T 10 0.528359849842223 0.104922494540915 ENSG00000242574:ENST00000438510:exon_32904949_32905216:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000414017:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000440643:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000248993:ENST00000429234:exon_32905141_32905233:XXbac-BPG181M17.5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 32942302 G/A 1 2 6 8 0.943280300315554 3.17015909905334 -2.22687879873778 A:G G A 10 0.528359849842223 0.159873274171007 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000456339:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32942239_32942542:BRD2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 32944746 G/A 1 2 8 10 0.943280300315554 4.22687879873778 -3.28359849842223 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0542343953774601 ENSG00000204256:ENST00000464592:exon_32944339_32945347:BRD2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 32946133 T/C 1 122 112 234 57.5400983192488 59.176303182329 -1.63620486308017 T:C T C 10 0.528359849842223 0.844472088988728 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000463639:exon_32945903_32946578:BRD2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 32974551 G/T 1 31 28 59 14.6208446548911 14.7940757955822 -0.173231140691154 T:G G T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32971955_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32971959_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32973372_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000490305:exon_32974384_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32974523_32974618:HLA-DOA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 33036505 G/C 1 1044 433 1477 492.392316764719 228.779814981683 263.612501783037 A:C:G G C 10 0.528359849842223 2.42606636823268e-44 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33035437_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036475_33036581:HLA-DPA1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 33036971 C/T 1 734 36 770 346.183870215808 19.02095459432 327.162915621488 T:C C T 10 0.528359849842223 9.87706374721567e-154 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 33036999 T/C 1 945 74 1019 445.699941899099 39.0986288883245 406.601313010775 T:C T C 10 0.528359849842223 1.41840729088363e-172 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 33037419 G/A 1 1521 214 1735 717.364668389979 113.069007866236 604.295660523743 A:C:G G A 10 0.528359849842223 6.51526219617718e-212 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 33037424 T/C 1 1488 227 1715 701.800543434772 119.937685914185 581.862857520588 A:T:C:G T C 10 0.528359849842223 3.28329585337947e-197 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 33037522 T/C 1 768 132 900 362.219635321173 69.7435001791734 292.476135141999 A:T:C:G T C 10 0.528359849842223 7.91150830445797e-95 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 33037557 C/T 0 570 0 570 268.834885589933 0 268.834885589933 C C 10 0.528359849842223 1.21294551318394e-158 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 33037560 G/A 0 575 0 575 271.193086340722 0 271.193086340722 G G 10 0.528359849842223 9.3259267347048e-160 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 33037579 A/T 0 517 2 519 243.837957631571 1.05671969968445 242.781237931886 A:C A C 10 0.528359849842223 1.78263861109657e-139 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 33053609 G/A 1 1234 933 2167 582.003945294697 492.959739902794 89.0442053919029 A:C:G G A 10 0.528359849842223 0.000127351178244772 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33053556_33053683:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33053556_33053683:HLA-DPB1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 33163451 G/A 1 12 15 27 5.65968180189332 7.92539774763334 -2.26571594574002 A:G G A 10 0.528359849842223 0.442795735902603 ENSG00000204231:ENST00000374685:exon_33163347_33163479:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000374680:exon_33163347_33163479:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000483281:exon_33163347_33163479:RXRB HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 33219675 A/G 1 7 5 12 3.30148105110444 2.64179924921111 0.659681801893325 A:G A G 10 0.528359849842223 0.778733618574385 ENSG00000223501:ENST00000482399:exon_33219637_33219748:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000445902:exon_33219637_33219748:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000478934:exon_33219637_33219748:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000418054:exon_33219637_33219748:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000495981:exon_33219637_33219748:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000493674:exon_33219637_33219748:VPS52 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 33239905 A/G 1 5 8 13 2.35820075078889 4.22687879873778 -1.8686780479489 A:G A G 10 0.528359849842223 0.406657390173804 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 33256397 G/A 1 48 29 77 22.6387272075733 15.3224356454245 7.31629156214883 A:G G A 10 0.528359849842223 0.109762523924 ENSG00000227057:ENST00000374617:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000444176:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000477718:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000468157:exon_33256341_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000481025:exon_33256391_33256471:WDR46 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 33260215 C/T 1 11 13 24 5.18804165173555 6.8686780479489 -1.68063639621335 T:C C T 10 0.528359849842223 0.543437824899314 ENSG00000237441:ENST00000491168:exon_33260207_33260321:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000483151:exon_33260207_33260321:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000437840:exon_33260207_33260321:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000466866:exon_33260207_33260321:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000497454:exon_33260207_33260321:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000421215:exon_33260207_33260321:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000471319:exon_33260207_33260321:RGL2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 33281842 G/T 0 8 0 8 3.77312120126222 0 3.77312120126222 G G 10 0.528359849842223 0.00852191332774871 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33281782_33282164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33281782_33282028:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33281782_33282031:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000423872:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000458089:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000467025:exon_33281782_33281992:TAPBP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 33286825 G/A 1 147 154 301 69.3311020731932 81.3674168757023 -12.0363148025091 A:G G A 10 0.528359849842223 0.166349867511043 ENSG00000204209:ENST00000266000:exon_33286774_33286996:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000374542:exon_33286774_33286996:DAXX HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 33288271 A/G 1 60 54 114 28.2984090094666 28.53143189148 -0.233022882013415 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000204209:ENST00000266000:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000374542:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000468536:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000477162:exon_33288157_33288368:DAXX HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 36713263 A/G 1 11 5 16 5.18804165173555 2.64179924921111 2.54624240252443 A:G A G 10 0.528359849842223 0.221849866555357 ENSG00000124772:ENST00000459703:exon_36713165_36713292:CPNE5;ENSG00000124772:ENST00000244751:exon_36713165_36713292:CPNE5;ENSG00000124772:ENST00000493411:exon_36713164_36713292:CPNE5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 36824399 C/T 1 27 14 41 12.73428405426 7.39703789779112 5.33724615646886 T:C C T 10 0.528359849842223 0.117179074572567 ENSG00000137168:ENST00000373699:exon_36824362_36824430:PPIL1;ENSG00000137168:ENST00000483552:exon_36824362_36824430:PPIL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 36882353 A/G 1 2 7 9 0.943280300315554 3.69851894889556 -2.75523864858001 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0939591166432567 ENSG00000198663:ENST00000359359:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000480824:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000355190:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000373685:exon_36882330_36882469:C6orf89 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 36938432 G/A 1 13 7 20 6.1313219520511 3.69851894889556 2.43280300315554 A:G G A 10 0.528359849842223 0.371201911365638 ENSG00000137409:ENST00000373616:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000490662:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373627:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373565:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373550:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000337855:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000471737:exon_36938423_36938692:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000418541:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000460219:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000492754:exon_36938182_36938470:MTCH1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 36988364 C/T 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 T:C C T 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000470273:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000394459:exon_36988314_36988396:FGD2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 36995222 G/A 1 7 4 11 3.30148105110444 2.11343939936889 1.18804165173555 A:G G A 10 0.528359849842223 0.556038959282085 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000487920:exon_36995205_36996845:FGD2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 38650588 T/A 1 15 9 24 7.07460225236666 4.75523864858001 2.31936360378665 A:T T A 10 0.528359849842223 0.415665286985416 ENSG00000124767:ENST00000470973:exon_38650584_38650991:GLO1;ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38650584_38650651:GLO1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 38670837 G/A 1 10 12 22 4.71640150157777 6.34031819810668 -1.62391669652891 A:G G A 10 0.528359849842223 0.527319699445417 ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38670747_38670917:GLO1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 41652604 T/C 1 103 92 195 48.578935466251 48.6091061854845 -0.0301707192334746 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 41895150 G/A 1 13 10 23 6.1313219520511 5.28359849842223 0.847723453628872 A:G G A 10 0.528359849842223 0.835609051250035 ENSG00000112578:ENST00000230340:exon_41895112_41895274:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000494032:exon_41895112_41895382:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000489290:exon_41895112_41895274:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000475702:exon_41895112_41895274:BYSL HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 41900406 C/T 1 61 60 121 28.7700491596244 31.7015909905334 -2.93154183090898 A:T:C C T 10 0.528359849842223 0.649096978934308 ENSG00000112578:ENST00000230340:exon_41900099_41900784:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000372996:exon_41900099_41900734:BYSL HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 42932200 G/T 1 11 30 41 5.18804165173555 15.8507954952667 -10.6627538435311 T:G G T 10 0.528359849842223 0.000879455802313955 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42931608_42932209:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42932073_42932209:PEX6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 42932202 C/T 1 11 31 42 5.18804165173555 16.3791553451089 -11.1911136933734 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0005585337272882 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42931608_42932209:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42932073_42932209:PEX6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 42992828 C/G 1 22 21 43 10.3760833034711 11.0955568466867 -0.719473543215587 C:G C G 10 0.528359849842223 0.879182848917074 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42992723_42992870:RRP36 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 43646268 T/C 1 37 5 42 17.4506855558378 2.64179924921111 14.8088863066266 T:C T C 10 0.528359849842223 1.53286055547626e-06 ENSG00000096080:ENST00000372133:exon_43646255_43646362:MRPS18A;ENSG00000096080:ENST00000372118:exon_43646255_43646362:MRPS18A;ENSG00000096080:ENST00000372116:exon_43646255_43646362:MRPS18A;ENSG00000096080:ENST00000427312:exon_43646255_43646362:MRPS18A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 44081718 G/A 1 349 266 615 164.602412405064 140.543720058031 24.0586923470329 A:G G A 10 0.528359849842223 0.052598162911985 ENSG00000180992:ENST00000372014:exon_44081194_44081946:MRPL14 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 44371714 C/T 1 16 20 36 7.54624240252443 10.5671969968445 -3.02095459432003 T:C C T 10 0.528359849842223 0.322201312928829 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44371546_44371764:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44371546_44371764:CDC5L HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 44413463 T/A 1 24 30 54 11.3193636037866 15.8507954952667 -4.53143189148004 A:T T A 10 0.528359849842223 0.223101265038033 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44413392_44413604:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44413392_44413604:CDC5L HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 53363559 T/C 1 11 7 18 5.18804165173555 3.69851894889556 1.48952270283999 T:C T C 10 0.528359849842223 0.63817833418455 ENSG00000001084:ENST00000229416:exon_53362139_53363765:GCLC;ENSG00000001084:ENST00000509541:exon_53362139_53363765:GCLC;ENSG00000001084:ENST00000515580:exon_53362940_53363765:GCLC HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 8 8 0 4.22687879873778 -4.22687879873778 A G A 10 0.528359849842223 0.00244842131534247 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 64290076 A/G 1 13 18 31 6.1313219520511 9.51047729716001 -3.37915534510891 A:G A G 10 0.528359849842223 0.280569742102825 ENSG00000112245:ENST00000370651:exon_64289962_64293492:PTP4A1;ENSG00000112245:ENST00000370650:exon_64289962_64292331:PTP4A1;ENSG00000112245:ENST00000370644:exon_64289962_64290079:PTP4A1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 70407465 A/T 1 36 28 64 16.97904540568 14.7940757955822 2.18496961009773 A:T A T 10 0.528359849842223 0.618128757416409 ENSG00000168216:ENST00000370577:exon_70407455_70407533:LMBRD1;ENSG00000168216:ENST00000370570:exon_70407455_70407533:LMBRD1;ENSG00000168216:ENST00000472827:exon_70407455_70407533:LMBRD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 74135016 C/T 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 T:C C T 10 0.528359849842223 0.743278251879842 ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74133432_74135301:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74134940_74135250:C6orf150 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 80741243 A/T 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 A:T A T 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000112742:ENST00000509894:exon_80741184_80741276:TTK;ENSG00000112742:ENST00000230510:exon_80741184_80741276:TTK;ENSG00000112742:ENST00000369798:exon_80741184_80741276:TTK HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 80749972 A/C 1 7 4 11 3.30148105110444 2.11343939936889 1.18804165173555 A:C A C 10 0.528359849842223 0.556038959282085 ENSG00000112742:ENST00000509894:exon_80749913_80749997:TTK;ENSG00000112742:ENST00000230510:exon_80749913_80749997:TTK;ENSG00000112742:ENST00000369798:exon_80749913_80749997:TTK;ENSG00000112742:ENST00000504590:exon_80749913_80749988:TTK HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 83667045 C/T 1 9 2 11 4.24476135141999 1.05671969968445 3.18804165173555 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0701050773055379 ENSG00000118420:ENST00000369747:exon_83667031_83667169:UBE2CBP;ENSG00000118420:ENST00000237186:exon_83667031_83667169:UBE2CBP;ENSG00000118420:ENST00000392921:exon_83667031_83667169:UBE2CBP;ENSG00000118420:ENST00000509102:exon_83667031_83667169:UBE2CBP;ENSG00000118420:ENST00000430071:exon_83667031_83667169:UBE2CBP HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 83880167 C/T 1 13 7 20 6.1313219520511 3.69851894889556 2.43280300315554 T:C C T 10 0.528359849842223 0.371201911365638 ENSG00000083097:ENST00000484282:exon_83880008_83881069:DOPEY1;ENSG00000013375:ENST00000504780:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000513973:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000512866:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000369731:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000283977:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000416472:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000506587:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000509219:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000503356:exon_83880092_83880197:PGM3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 83881740 T/C 1 6 6 12 2.82984090094666 3.17015909905334 -0.340318198106676 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000013375:ENST00000513973:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000512866:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000369731:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000283977:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000416472:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000506587:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000509219:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000503356:exon_83881639_83881778:PGM3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 87969737 C/T 1 10 13 23 4.71640150157777 6.8686780479489 -2.15227654637113 T:C C T 10 0.528359849842223 0.408345653063064 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 87970301 C/G 1 45 52 97 21.2238067571 27.4747121917956 -6.25090543469562 C:G C G 10 0.528359849842223 0.222650838929638 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000496806:exon_87969793_87970363:ZNF292 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 88224164 T/C 1 6 7 13 2.82984090094666 3.69851894889556 -0.868678047948899 T:C T C 10 0.528359849842223 0.782884637593256 ENSG00000146282:ENST00000369536:exon_88224096_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000392851:exon_88224096_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000369523:exon_88224098_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000493269:exon_88224125_88224217:RARS2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 90347511 T/C 1 24 23 47 11.3193636037866 12.1522765463711 -0.83291294258448 T:C T C 10 0.528359849842223 0.884138966354763 ENSG00000083099:ENST00000520897:exon_90347461_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000412237:exon_90347461_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000523793:exon_90347461_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000520441:exon_90347444_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000523377:exon_90347461_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000517396:exon_90347444_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000524153:exon_90347461_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000520318:exon_90347444_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000521961:exon_90347444_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000523075:exon_90347461_90347601:LYRM2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 90368380 G/A 1 10 8 18 4.71640150157777 4.22687879873778 0.489522702839987 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90368329_90368636:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90368329_90368636:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90368329_90368636:MDN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 90371202 G/A 1 6 9 15 2.82984090094666 4.75523864858001 -1.92539774763334 A:G G A 10 0.528359849842223 0.439217229441099 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90371150_90371297:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90371150_90371297:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90371150_90371297:MDN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 97339088 C/T 1 71 75 146 33.4864506612022 39.6269887381667 -6.14053807696455 T:C C T 10 0.528359849842223 0.320638570933574 ENSG00000123545:ENST00000316149:exon_97337189_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000478382:exon_97338888_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000489477:exon_97339027_97339267:NDUFAF4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 100957344 T/C 1 23 37 60 10.8477234536289 19.5493144441622 -8.70159099053338 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0276117200956860 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100956070_100957409:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000518006:exon_100957094_100957409:ASCC3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 100966006 C/T 1 10 7 17 4.71640150157777 3.69851894889556 1.01788255268221 T:C C T 10 0.528359849842223 0.80899735416499 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100965867_100966018:ASCC3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 109762265 C/T 1 12 12 24 5.65968180189332 6.34031819810668 -0.680636396213352 T:C C T 10 0.528359849842223 0.839647550159473 ENSG00000185250:ENST00000440797:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000185250:ENST00000521072:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000185250:ENST00000368958:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109761966_109762374:SMPD2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 109802661 T/C 1 44 22 66 20.7521666069422 11.6239166965289 9.12824991041328 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0262886277721206 ENSG00000112365:ENST00000230122:exon_109802278_109803257:ZBTB24 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 110146303 G/A 1 30 16 46 14.1492045047333 8.45375759747557 5.69544690725774 A:G G A 10 0.528359849842223 0.104680743883885 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110146291_110146631:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110146291_110146634:FIG4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 118320595 C/A 0 561 0 561 264.590124238513 0 264.590124238513 C C 10 0.528359849842223 3.92876921611234e-156 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 118886961 G/T 1 5 4 9 2.35820075078889 2.11343939936889 0.244761351419994 T:G G T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000111860:ENST00000368491:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000368488:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000434604:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000392500:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000360290:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000419517:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000392498:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000483035:exon_118886198_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000472713:exon_118886722_118887479:C6orf204 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 129905249 A/G 1 2 10 12 0.943280300315554 5.28359849842223 -4.34031819810667 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0173281289522322 ENSG00000146376:ENST00000368149:exon_129905133_129905257:ARHGAP18;ENSG00000146376:ENST00000275189:exon_129905133_129905257:ARHGAP18;ENSG00000146376:ENST00000483367:exon_129905133_129905257:ARHGAP18;ENSG00000146376:ENST00000463225:exon_129905133_129905257:ARHGAP18 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 134308187 T/G 1 24 23 47 11.3193636037866 12.1522765463711 -0.83291294258448 T:G T G 10 0.528359849842223 0.884138966354763 ENSG00000028839:ENST00000237264:exon_134308099_134308637:TBPL1;ENSG00000028839:ENST00000477527:exon_134308099_134308637:TBPL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 62 0 62 29.2416893097822 0 29.2416893097822 T T 10 0.528359849842223 7.04111433919584e-18 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 75 0 75 35.3730112618333 0 35.3730112618333 A A 10 0.528359849842223 2.84211904594023e-21 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 76 0 76 35.8446514119911 0 35.8446514119911 A A 10 0.528359849842223 1.44943383653073e-21 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 30 0 30 14.1492045047333 0 14.1492045047333 G G 10 0.528359849842223 5.03565382858182e-09 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 32 0 32 15.0924848050489 0 15.0924848050489 T T 10 0.528359849842223 2.68490048337506e-09 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 137519588 A/C 1 123 136 259 58.0117384694066 71.8569395785423 -13.8452011091357 A:C A C 10 0.528359849842223 0.0927443731533146 ENSG00000027697:ENST00000367739:exon_137518621_137519776:IFNGR1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 139229872 C/T 1 12 17 29 5.65968180189332 8.98211744731779 -3.32243564542447 T:C C T 10 0.528359849842223 0.264981051050274 ENSG00000135597:ENST00000450536:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367672:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367668:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000409553:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367663:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000529597:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000445570:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000478483:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000483468:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000409812:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000258062:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000484164:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000415951:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000526022:exon_139229805_139229874:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000526244:exon_139229805_139230049:REPS1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 143382110 T/C 1 12 14 26 5.65968180189332 7.39703789779112 -1.7373560958978 T:C T C 10 0.528359849842223 0.558215955592095 ENSG00000146416:ENST00000367601:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000419072:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000447498:exon_143381990_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000357847:exon_143382013_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000344492:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367598:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367596:exon_143382038_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000275235:exon_143382038_143382203:AIG1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 149953981 C/T 1 8 7 15 3.77312120126222 3.69851894889556 0.0746022523666556 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000186625:ENST00000335647:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000335643:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000367411:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000444282:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000420200:exon_149953895_149954052:KATNA1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 150004779 A/G 1 11 8 19 5.18804165173555 4.22687879873778 0.961162852997764 A:G A G 10 0.528359849842223 0.819131241753216 ENSG00000131023:ENST00000253339:exon_150004215_150005728:LATS1;ENSG00000131023:ENST00000441107:exon_150004215_150005728:LATS1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 150114745 G/A 1 32 19 51 15.0924848050489 10.0388371470022 5.05364765804663 A:G G A 10 0.528359849842223 0.163531305813739 ENSG00000120265:ENST00000367384:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000484601:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000367378:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000464889:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000367380:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000486585:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000495487:exon_150114685_150114768:PCMT1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 151266624 C/T 1 7 8 15 3.30148105110444 4.22687879873778 -0.925397747633344 T:C C T 10 0.528359849842223 0.797109179414283 ENSG00000120254:ENST00000367321:exon_151266603_151266677:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000367310:exon_151266603_151266677:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000392243:exon_151266603_151266677:MTHFD1L HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 151726300 G/C 1 50 44 94 23.5820075078889 23.2478333930578 0.334174114831043 C:G G C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000336451:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151725990_151726402:RMND1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 151766552 G/A 1 4 6 10 1.88656060063111 3.17015909905334 -1.28359849842223 A:G G A 10 0.528359849842223 0.531770325189017 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000491268:exon_151766443_151766960:RMND1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 151766822 C/A 1 7 5 12 3.30148105110444 2.64179924921111 0.659681801893325 A:C C A 10 0.528359849842223 0.778733618574385 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000491268:exon_151766443_151766960:RMND1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 151789868 G/A 1 15 5 20 7.07460225236666 2.64179924921111 4.43280300315554 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0705808549653656 ENSG00000146476:ENST00000367294:exon_151789478_151791236:C6orf211 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 151789912 C/T 1 12 15 27 5.65968180189332 7.92539774763334 -2.26571594574002 T:C C T 10 0.528359849842223 0.442795735902603 ENSG00000146476:ENST00000367294:exon_151789478_151791236:C6orf211 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 159065758 C/G 1 11 15 26 5.18804165173555 7.92539774763334 -2.7373560958978 C:G C G 10 0.528359849842223 0.328310143364427 ENSG00000146425:ENST00000367089:exon_159065714_159065771:DYNLT1;ENSG00000146425:ENST00000367085:exon_159065714_159065770:DYNLT1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 159184462 A/G 1 10 7 17 4.71640150157777 3.69851894889556 1.01788255268221 A:G A G 10 0.528359849842223 0.80899735416499 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159184336_159184541:SYTL3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 159185563 T/A 1 20 25 45 9.43280300315554 13.2089962460556 -3.77619324290003 A:T T A 10 0.528359849842223 0.296773186900531 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159185527_159185754:SYTL3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 159398803 C/T 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 T:C C T 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000130363:ENST00000367069:exon_159397312_159398880:RSPH3;ENSG00000130363:ENST00000449822:exon_159397866_159398880:RSPH3;ENSG00000130363:ENST00000252655:exon_159398268_159398880:RSPH3;ENSG00000130363:ENST00000297262:exon_159398268_159398880:RSPH3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 159420574 T/C 1 7 2 9 3.30148105110444 1.05671969968445 2.24476135141999 T:C T C 10 0.528359849842223 0.186011003558895 ENSG00000130363:ENST00000367069:exon_159420467_159421219:RSPH3;ENSG00000130363:ENST00000449822:exon_159420467_159420813:RSPH3;ENSG00000130363:ENST00000252655:exon_159420467_159421198:RSPH3;ENSG00000130363:ENST00000297262:exon_159420467_159421198:RSPH3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 160113872 A/G 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 A:G A G 10 0.528359849842223 0.743278251879842 ENSG00000112096:ENST00000367055:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000444946:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000367054:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000337404:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000452684:exon_160112027_160113895:SOD2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 160196343 A/G 1 56 63 119 26.4118484088355 33.28667054006 -6.87482213122453 A:G A G 10 0.528359849842223 0.232577124503553 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160196202_160196345:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160196318_160197304:ACAT2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 160198359 C/T 1 22 30 52 10.3760833034711 15.8507954952667 -5.47471219179559 T:C C T 10 0.528359849842223 0.164207960217374 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 160198395 G/A 1 50 45 95 23.5820075078889 23.7761932429 -0.194185735011178 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 170058374 C/T 1 5 8 13 2.35820075078889 4.22687879873778 -1.8686780479489 T:C C T 10 0.528359849842223 0.406657390173804 ENSG00000184465:ENST00000423258:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000401031:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000333572:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000443144:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000420344:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000448612:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000441385:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000467418:exon_170058372_170058454:WDR27 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 170176146 G/A 1 13 12 25 6.1313219520511 6.34031819810668 -0.208996246055574 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366772:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392094:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000418781:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000492738:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170175974_170176161:C6orf70 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 170176647 C/T 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 T:C C T 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170176551_170176769:C6orf70 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 6 170176648 A/G 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 A:G A G 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170176551_170176769:C6orf70 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 931960 G/A 1 35 32 67 16.5074052555222 16.9075151949511 -0.400109939428937 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_931915_932055:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_931915_932055:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_931915_932055:GET4;ENSG00000239857:ENST00000483469:exon_931915_932111:GET4;ENSG00000239857:ENST00000464468:exon_931937_932055:GET4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 1938001 G/A 1 58 46 104 27.3551287091511 24.3045530927423 3.05057561640881 A:G G A 10 0.528359849842223 0.55757465709132 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_1937836_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_1937836_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_1937836_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_1937848_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_1937836_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_1937836_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000450235:exon_1937836_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000437877:exon_1937836_1938026:MAD1L1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 1976432 C/T 1 23 14 37 10.8477234536289 7.39703789779112 3.45068555583775 T:C C T 10 0.528359849842223 0.323333341671099 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000450235:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000437877:exon_1976323_1976533:MAD1L1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 1976457 C/T 1 21 24 45 9.90444315331332 12.6806363962134 -2.77619324290003 T:C C T 10 0.528359849842223 0.456513677019051 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000450235:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000437877:exon_1976323_1976533:MAD1L1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 2257612 G/A 1 22 9 31 10.3760833034711 4.75523864858001 5.62084465489109 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0480611380761907 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000469871:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000445959:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000429625:exon_2257597_2257678:MAD1L1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 5254227 C/G 1 10 9 19 4.71640150157777 4.75523864858001 -0.0388371470022362 C:G C G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000157954:ENST00000288828:exon_5254166_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000401525:exon_5254166_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000404704:exon_5254166_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000466014:exon_5254166_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000485854:exon_5254166_5254333:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000382384:exon_5254166_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000496867:exon_5254166_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000475309:exon_5253817_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000484262:exon_5253900_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000315176:exon_5254120_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000465102:exon_5254192_5254335:WIPI2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 5347749 G/A 1 12 15 27 5.65968180189332 7.92539774763334 -2.26571594574002 A:G G A 10 0.528359849842223 0.442795735902603 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5346426_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5346431_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5346431_5347943:TNRC18 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 5353344 G/A 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5352134_5353490:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5352134_5353494:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000328270:exon_5352742_5353494:TNRC18 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 5399044 C/G 1 19 10 29 8.96116285299776 5.28359849842223 3.67756435457554 C:G C G 10 0.528359849842223 0.195530753568808 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000440081:exon_5399029_5399200:TNRC18 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 5410425 G/C 1 7 2 9 3.30148105110444 1.05671969968445 2.24476135141999 C:G G C 10 0.528359849842223 0.186011003558895 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5410020_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5410006_5410995:TNRC18 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 5568288 C/A 1 4048 3850 7898 1909.19932783868 2034.18542189256 -124.986094053877 A:T:C:G C A 10 0.528359849842223 0.00500761753244846 ENSG00000075624:ENST00000331789:exon_5567912_5568350:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000425660:exon_5567912_5568350:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000462494:exon_5567912_5569031:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000445914:exon_5568267_5568350:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000493945:exon_5567635_5568350:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000484841:exon_5567912_5568350:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000473257:exon_5567912_5568350:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000477812:exon_5568101_5568350:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000432588:exon_5568223_5568350:ACTB HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 5568366 A/G 1 22 22 44 10.3760833034711 11.6239166965289 -1.24783339305781 A:G A G 10 0.528359849842223 0.763577975108391 ENSG00000075624:ENST00000462494:exon_5567912_5569031:ACTB HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 5569327 G/A 1 15 21 36 7.07460225236666 11.0955568466867 -4.02095459432003 A:G G A 10 0.528359849842223 0.186252542792442 ENSG00000075624:ENST00000484841:exon_5569166_5569364:ACTB HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 5632828 C/T 1 190 97 287 89.6116285299776 51.2509054346956 38.360723095282 T:C C T 10 0.528359849842223 4.82711443873521e-06 ENSG00000075618:ENST00000382361:exon_5632454_5633399:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000340250:exon_5632454_5633399:FSCN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 6026942 G/T 1 7 7 14 3.30148105110444 3.69851894889556 -0.397037897791122 T:G G T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 6066461 T/C 1 20 21 41 9.43280300315554 11.0955568466867 -1.66275384353114 T:C T C 10 0.528359849842223 0.64097476320802 ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6066359_6066592:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000490523:exon_6066359_6066592:EIF2AK1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 6189780 T/C 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 T:C T C 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6189214_6189933:USP42 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 6441688 T/C 1 4 6 10 1.88656060063111 3.17015909905334 -1.28359849842223 T:C T C 10 0.528359849842223 0.531770325189017 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 6449496 T/C 1 7 11 18 3.30148105110444 5.81195834826445 -2.51047729716001 T:C T C 10 0.528359849842223 0.248719564040320 ENSG00000164535:ENST00000462934:exon_6448757_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000297056:exon_6448760_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000482149:exon_6448761_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000428902:exon_6448763_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000421761:exon_6448763_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000425398:exon_6449148_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000436575:exon_6449231_6449666:DAGLB HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 7645667 C/T 1 34 37 71 16.0357651053644 19.5493144441622 -3.51354933879783 T:C C T 10 0.528359849842223 0.408375229353734 ENSG00000164654:ENST00000340080:exon_7645573_7645702:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000405785:exon_7645573_7645702:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000493227:exon_7645573_7645702:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000479694:exon_7644749_7645702:MIOS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 7646687 A/G 1 43 51 94 20.2805264567844 26.9463523419534 -6.66582588516896 A:G A G 10 0.528359849842223 0.179923464450077 ENSG00000164654:ENST00000340080:exon_7646627_7647127:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000405785:exon_7646627_7646854:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000493227:exon_7646627_7648556:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000479694:exon_7646627_7648560:MIOS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 21940823 A/G 1 56 52 108 26.4118484088355 27.4747121917956 -1.06286378296008 A:G A G 10 0.528359849842223 0.847724157983386 ENSG00000105877:ENST00000409508:exon_21940625_21941186:DNAH11;ENSG00000105877:ENST00000328843:exon_21940625_21941457:DNAH11;ENSG00000105877:ENST00000424253:exon_21940625_21941457:DNAH11;ENSG00000164649:ENST00000356195:exon_21940518_21941970:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000488845:exon_21940519_21941970:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000406877:exon_21940519_21941970:CDCA7L HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 23235483 A/G 1 6 5 11 2.82984090094666 2.64179924921111 0.188041651735547 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000136243:ENST00000258742:exon_23235458_23235534:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000485250:exon_23235458_23235534:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000438012:exon_23235458_23235534:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000487595:exon_23235458_23235534:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000413919:exon_23235458_23235534:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000437140:exon_23235458_23235534:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000486136:exon_23235458_23235534:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000477844:exon_23234022_23235534:NUPL2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 23239133 C/T 1 20 19 39 9.43280300315554 10.0388371470022 -0.606034143846694 T:C C T 10 0.528359849842223 0.87369517076565 ENSG00000136243:ENST00000258742:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000485250:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000438012:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000413919:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000437140:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000477844:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000489145:exon_23239043_23239161:NUPL2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 23340618 C/T 1 46 56 102 21.6954469072577 29.5881515911645 -7.89270468390674 T:C C T 10 0.528359849842223 0.136535473489853 ENSG00000156928:ENST00000466681:exon_23340458_23340636:C7orf30;ENSG00000156928:ENST00000287543:exon_23340458_23340636:C7orf30;ENSG00000156928:ENST00000481564:exon_23340458_23340814:C7orf30 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 24742436 T/C 1 63 64 127 29.71332945994 33.8150303899023 -4.10170092996232 T:C T C 10 0.528359849842223 0.478180468744299 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000479636:exon_24742379_24745656:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000430096:exon_24742046_24742452:DFNA5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 24758795 T/C 1 13 10 23 6.1313219520511 5.28359849842223 0.847723453628872 T:C T C 10 0.528359849842223 0.835609051250035 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000414428:exon_24758694_24758837:DFNA5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 24854765 G/A 1 8 1 9 3.77312120126222 0.528359849842223 3.24476135141999 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0417871149536542 ENSG00000070882:ENST00000313367:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000353930:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000352860:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409863:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000396431:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409452:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409759:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409555:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000396429:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409069:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000486214:exon_24854732_24854822:OSBPL3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 30544360 G/A 1 35 28 63 16.5074052555222 14.7940757955822 1.71332945993995 A:G G A 10 0.528359849842223 0.706198584796422 ENSG00000006625:ENST00000275428:exon_30544185_30544460:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000440082:exon_30544185_30544445:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000005374:exon_30544185_30544418:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409144:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000447901:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409390:exon_30544185_30544415:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409436:exon_30544185_30544432:GGCT HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 30634661 C/G 1 8 8 16 3.77312120126222 4.22687879873778 -0.453757597475567 C:G C G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30634297_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000454308:exon_30634457_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000478124:exon_30634500_30634759:GARS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 40027484 A/G 1 6 3 9 2.82984090094666 1.58507954952667 1.24476135141999 A:G A G 10 0.528359849842223 0.514115714513849 ENSG00000065883:ENST00000181839:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000326351:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000340829:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000484589:exon_40027435_40027857:CDK13 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 40127767 G/A 1 8 2 10 3.77312120126222 1.05671969968445 2.71640150157777 A:G G A 10 0.528359849842223 0.11503004681301 ENSG00000065883:ENST00000181839:exon_40127725_40127930:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000340829:exon_40127725_40127930:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000478563:exon_40127725_40127930:CDK13 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 44099664 T/C 1 106 105 211 49.9938559167244 55.4777842334334 -5.48392831670905 T:C T C 10 0.528359849842223 0.449277644806450 ENSG00000136279:ENST00000441840:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000448521:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000456905:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000440166:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000490734:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000498733:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452943:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000429716:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000468694:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000494774:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000411855:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000497184:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000432854:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000449997:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452661:exon_44099647_44099752:DBNL HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 44104788 A/C 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 A:C A C 10 0.528359849842223 0.743278251879842 ENSG00000136279:ENST00000432854:exon_44100376_44109055:DBNL;ENSG00000164708:ENST00000297283:exon_44104715_44105186:PGAM2;ENSG00000164708:ENST00000425387:exon_44104715_44104789:PGAM2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 44112873 G/T 1 5 9 14 2.35820075078889 4.75523864858001 -2.39703789779112 T:G G T 10 0.528359849842223 0.284555554939117 ENSG00000122678:ENST00000335195:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000242248:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000435068:exon_44111849_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000395831:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000458246:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000430942:exon_44111861_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000467607:exon_44112817_44112976:POLM HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 44611235 T/C 1 19 29 48 8.96116285299776 15.3224356454245 -6.3612727924267 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0819284197174238 ENSG00000136271:ENST00000258772:exon_44611091_44611335:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000446987:exon_44611091_44611335:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000421223:exon_44611091_44611335:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000485367:exon_44611091_44611335:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000467318:exon_44611091_44611335:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000433257:exon_44611091_44611335:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000431640:exon_44611091_44611335:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000415758:exon_44611091_44611335:DDX56 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 44839429 C/T 1 18 17 35 8.48952270283999 8.98211744731779 -0.492594744477804 T:C C T 10 0.528359849842223 0.867578930748504 ENSG00000196262:ENST00000468812:exon_44839301_44839473:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000451562:exon_44839301_44839610:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000355968:exon_44839301_44839473:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000489459:exon_44839301_44839473:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000415933:exon_44839301_44839473:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000494484:exon_44838991_44839473:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000480603:exon_44839301_44839473:PPIA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 45005795 G/A 1 83 89 172 39.1461324630955 47.0240266359578 -7.87789417286235 A:G G A 10 0.528359849842223 0.251955835464445 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45005672_45006437:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45005672_45005879:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45005672_45006437:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45005672_45005879:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45005672_45005879:MYO1G HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 45009325 G/A 1 94 83 177 44.334174114831 43.8538675369045 0.480306577926541 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009304_45009474:MYO1G HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 45009723 G/A 1 75 72 147 35.3730112618333 38.0419091886401 -2.66889792680678 A:G G A 10 0.528359849842223 0.68008628938346 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009639_45009753:MYO1G HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 45015107 G/A 1 18 28 46 8.48952270283999 14.7940757955822 -6.30455309274226 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0757102052445327 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45015083_45015248:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45015083_45015248:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45015083_45015248:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45015083_45015248:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45015075_45015248:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000435656:exon_45015083_45015248:MYO1G HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 45016621 C/T 1 11 21 32 5.18804165173555 11.0955568466867 -5.90751519495113 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0498614778431398 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45016462_45016670:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45016462_45016670:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45016462_45016670:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45016462_45016670:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000435656:exon_45016462_45016670:MYO1G HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 45104131 G/A 1 12 16 28 5.65968180189332 8.45375759747557 -2.79407579558224 A:G G A 10 0.528359849842223 0.345302340839643 ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000478582:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000482714:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000492883:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000472223:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000476594:exon_45104062_45104221:CCM2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 45113170 G/A 1 69 64 133 32.5431703608866 33.8150303899023 -1.27186002901566 A:G G A 10 0.528359849842223 0.862264580911453 ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000481194:exon_45109425_45114007:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000477605:exon_45113059_45113170:CCM2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 45139892 G/A 1 50 45 95 23.5820075078889 23.7761932429 -0.194185735011178 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45139741_45140025:TBRG4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 45139919 A/C 1 53 68 121 24.9969279583622 35.9284697892712 -10.931541830909 A:C A C 10 0.528359849842223 0.0554231377346199 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45139741_45140025:TBRG4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 45148667 G/A 1 58 58 116 27.3551287091511 30.6448712908489 -3.28974258169787 A:G G A 10 0.528359849842223 0.57726703246641 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478532:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000461363:exon_45148426_45148682:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000471142:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000475893:exon_45148453_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000482285:exon_45148483_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495078:exon_45148527_45148886:TBRG4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 45148773 C/A 1 16 19 35 7.54624240252443 10.0388371470022 -2.4925947444778 A:C C A 10 0.528359849842223 0.403896486545389 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478532:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000471142:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000475893:exon_45148453_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000482285:exon_45148483_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495078:exon_45148527_45148886:TBRG4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 48004962 C/T 1 6 3 9 2.82984090094666 1.58507954952667 1.24476135141999 T:C C T 10 0.528359849842223 0.514115714513849 ENSG00000136273:ENST00000436444:exon_48003783_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000258774:exon_48002885_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000458191:exon_48004897_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000432325:exon_48004763_48005035:HUS1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 55540707 G/A 1 10 14 24 4.71640150157777 7.39703789779112 -2.68063639621335 A:G G A 10 0.528359849842223 0.310254011572794 ENSG00000154978:ENST00000285279:exon_55538306_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000428648:exon_55538307_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000433959:exon_55538307_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000428097:exon_55539630_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000418904:exon_55539896_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000454227:exon_55540402_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000453256:exon_55540447_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000427700:exon_55540470_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000455023:exon_55540578_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000414113:exon_55540610_55540738:VOPP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 56126360 T/C 1 156 127 283 73.5758634246132 67.1017009299623 6.4741624946509 T:C T C 10 0.528359849842223 0.475002945349695 ENSG00000146731:ENST00000275603:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000335503:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000482776:exon_56126313_56126703:CCT6A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 64291976 G/A 1 9 9 18 4.24476135141999 4.75523864858001 -0.510477297160014 A:G G A 10 0.528359849842223 0.818347367308864 ENSG00000197008:ENST00000307355:exon_64291829_64292580:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000494380:exon_64291829_64292181:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440155:exon_64291829_64292620:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440598:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000437743:exon_64291829_64294042:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000359735:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000430838:exon_64291829_64294054:ZNF138 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 64388472 C/A 1 5 5 10 2.35820075078889 2.64179924921111 -0.283598498422229 A:C C A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000198039:ENST00000527278:exon_64388032_64389502:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000476120:exon_64388032_64389635:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000319636:exon_64388032_64389416:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000395375:exon_64388032_64391344:ZNF273 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 65842534 T/C 1 7 7 14 3.30148105110444 3.69851894889556 -0.397037897791122 T:C T C 10 0.528359849842223 1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 66785137 C/A 1 8 8 16 3.77312120126222 4.22687879873778 -0.453757597475567 A:C C A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66785090_66786513:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66785090_66785250:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66785090_66785384:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66785090_66785395:STAG3L4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 72891754 C/T 1 12 13 25 5.65968180189332 6.8686780479489 -1.20899624605557 T:C C T 10 0.528359849842223 0.691147811736871 ENSG00000009954:ENST00000339594:exon_72891198_72892899:BAZ1B;ENSG00000009954:ENST00000404251:exon_72891198_72892899:BAZ1B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 73097238 G/A 1 30 31 61 14.1492045047333 16.3791553451089 -2.2299508403756 A:G G A 10 0.528359849842223 0.60903113034402 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 73097948 G/C 1 22 15 37 10.3760833034711 7.92539774763334 2.45068555583775 C:G G C 10 0.528359849842223 0.510804939493191 ENSG00000071462:ENST00000265758:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000420399:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000457629:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000423166:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421304:exon_73097899_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000432522:exon_73097901_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421744:exon_73097903_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000478670:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000496153:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000441822:exon_73097931_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000428163:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000436944:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000463307:exon_73097939_73098003:WBSCR22 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 73151644 A/G 1 8 6 14 3.77312120126222 3.17015909905334 0.602962102208878 A:G A G 10 0.528359849842223 0.795199355745845 ENSG00000106077:ENST00000497897:exon_73151551_73152065:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437775:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000357419:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000222800:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437891:exon_73151551_73151690:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000462381:exon_73151551_73151832:ABHD11 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 73249299 G/C 0 8 0 8 3.77312120126222 0 3.77312120126222 G G 10 0.528359849842223 0.00852191332774871 ENSG00000165171:ENST00000297873:exon_73248920_73249332:WBSCR27;ENSG00000165171:ENST00000434654:exon_73248926_73249332:WBSCR27;ENSG00000165171:ENST00000458679:exon_73249245_73249410:WBSCR27 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 75583325 A/G 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 A:G A G 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000127948:ENST00000453773:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000439963:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000448410:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000421059:exon_75583307_75583427:POR;ENSG00000127948:ENST00000471238:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000412521:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000414186:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000432753:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000449920:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000418341:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000412064:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75583307_75583498:POR HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 75609677 A/G 1 8 9 17 3.77312120126222 4.75523864858001 -0.98211744731779 A:G A G 10 0.528359849842223 0.637819172258138 ENSG00000127948:ENST00000453773:exon_75609657_75609711:POR;ENSG00000127948:ENST00000439963:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000448410:exon_75609657_75610056:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000412521:exon_75609657_75609729:POR;ENSG00000127948:ENST00000414186:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000432753:exon_75609657_75609789:POR;ENSG00000127948:ENST00000412064:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75609657_75610040:POR;ENSG00000127948:ENST00000426184:exon_75609657_75609757:POR;ENSG00000127948:ENST00000475509:exon_75609657_75609678:POR HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 75615006 C/T 1 13 14 27 6.1313219520511 7.39703789779112 -1.26571594574002 T:C C T 10 0.528359849842223 0.701520600568723 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75614897_75615031:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000496888:exon_75614897_75615063:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75614888_75615167:POR HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 75630274 T/C 1 23 9 32 10.8477234536289 4.75523864858001 6.09248480504886 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0336908770936798 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000438695:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75630208_75630320:STYXL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 75659815 T/C 1 22 10 32 10.3760833034711 5.28359849842223 5.09248480504887 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0780586521627687 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000441791:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000474328:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000460184:exon_75659739_75659842:STYXL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 75959188 G/A 1 11 8 19 5.18804165173555 4.22687879873778 0.961162852997764 A:G G A 10 0.528359849842223 0.819131241753216 ENSG00000170027:ENST00000307630:exon_75956116_75959550:YWHAG;ENSG00000170027:ENST00000453207:exon_75958894_75959235:YWHAG HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 76111835 G/A 1 9 4 13 4.24476135141999 2.11343939936889 2.1313219520511 A:G G A 10 0.528359849842223 0.276905486309559 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000423646:exon_76111825_76111976:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000429179:exon_76111825_76111880:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000472426:exon_76111825_76111932:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 76112060 C/T 1 12 8 20 5.65968180189332 4.22687879873778 1.43280300315554 T:C C T 10 0.528359849842223 0.655637718042508 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 77256713 A/G 1 15 17 32 7.07460225236666 8.98211744731779 -1.90751519495113 A:G A G 10 0.528359849842223 0.596108751890824 ENSG00000127947:ENST00000248594:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000415482:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000435495:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000407343:exon_77256473_77256992:PTPN12 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 77423574 G/A 1 26 14 40 12.2626439041022 7.39703789779112 4.86560600631108 A:G G A 10 0.528359849842223 0.153607090386718 ENSG00000135211:ENST00000257663:exon_77423045_77423740:TMEM60 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 89982132 T/C 1 3 7 10 1.41492045047333 3.69851894889556 -2.28359849842223 T:C T C 10 0.528359849842223 0.206915350075299 ENSG00000105793:ENST00000426366:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000421719:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000450619:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000453512:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000493392:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000257659:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000417207:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000477972:exon_89982130_89982546:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000439832:exon_89982130_89982323:GTPBP10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 91503228 C/T 1 8 5 13 3.77312120126222 2.64179924921111 1.1313219520511 T:C C T 10 0.528359849842223 0.589076720209571 ENSG00000127989:ENST00000419292:exon_91500243_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000351870:exon_91502205_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000406735:exon_91502636_91504078:MTERF HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 91842554 T/C 1 4 8 12 1.88656060063111 4.22687879873778 -2.34031819810668 T:C T C 10 0.528359849842223 0.248211150341394 ENSG00000001631:ENST00000312763:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394507:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000340022:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000486261:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000475770:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394505:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000412043:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394503:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000415227:exon_91842509_91842715:KRIT1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 92028039 C/A 1 4 9 13 1.88656060063111 4.75523864858001 -2.8686780479489 A:C C A 10 0.528359849842223 0.163373721097630 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 93551428 C/T 1 2 6 8 0.943280300315554 3.17015909905334 -2.22687879873778 T:C C T 10 0.528359849842223 0.159873274171007 ENSG00000127920:ENST00000248564:exon_93551011_93551545:GNG11 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 97922851 C/T 1 12 23 35 5.65968180189332 12.1522765463711 -6.4925947444778 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0406207835300952 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97920963_97922908:BAIAP2L1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 99693078 G/A 1 173 156 329 81.5937459772954 82.4241365753868 -0.830390598091356 A:G G A 10 0.528359849842223 0.955979004231249 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000491245:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000493352:exon_99693010_99693287:MCM7 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 99703891 C/T 1 6 7 13 2.82984090094666 3.69851894889556 -0.868678047948899 T:C C T 10 0.528359849842223 0.782884637593256 ENSG00000221838:ENST00000433787:exon_99703864_99703914:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000438383:exon_99703864_99703914:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000445208:exon_99703864_99703914:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000429084:exon_99703864_99703914:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000359593:exon_99703864_99703914:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000446007:exon_99703864_99703914:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000421755:exon_99703864_99703914:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99703864_99703914:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000455152:exon_99703864_99703914:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000422582:exon_99703864_99703914:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000450807:exon_99703864_99703914:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000445295:exon_99703864_99703914:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000489387:exon_99703600_99703914:AP4M1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 99704796 A/T 1 58 23 81 27.3551287091511 12.1522765463711 15.2028521627799 A:T A T 10 0.528359849842223 0.00074792863425427 ENSG00000221838:ENST00000433787:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000429084:exon_99704281_99704800:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000359593:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000455152:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 99704827 A/G 1 60 33 93 28.2984090094666 17.4358750447934 10.8625339646733 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0286754096589162 ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 99747130 G/A 1 124 103 227 58.4833786195644 54.421064533749 4.06231408581539 A:G G A 10 0.528359849842223 0.595633395273527 ENSG00000188186:ENST00000341942:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000460732:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000474831:exon_99747122_99747188:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000494136:exon_99747122_99747510:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000441173:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000468582:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000488241:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000473459:exon_99746980_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000466498:exon_99746982_99747202:C7orf59 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 99752566 G/A 1 17 15 32 8.01788255268221 7.92539774763334 0.0924848050488656 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000146826:ENST00000394035:exon_99752043_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000457641:exon_99752043_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000419037:exon_99752043_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000316937:exon_99752043_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000448720:exon_99752047_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000456769:exon_99752047_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000470260:exon_99752098_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000419841:exon_99752447_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000275726:exon_99752489_99752758:C7orf43 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 99757612 G/A 1 6 4 10 2.82984090094666 2.11343939936889 0.71640150157777 A:G G A 10 0.528359849842223 0.757839432335683 ENSG00000197093:ENST00000426974:exon_99756866_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000413800:exon_99756867_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000495882:exon_99756867_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000360039:exon_99756868_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000423751:exon_99757269_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000411994:exon_99757439_99758582:GAL3ST4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 99817585 G/T 1 28 15 43 13.2059242044178 7.92539774763334 5.28052645678441 T:G G T 10 0.528359849842223 0.126572866615993 ENSG00000066923:ENST00000451963:exon_99816240_99817651:STAG3;ENSG00000213413:ENST00000317271:exon_99817336_99817651:PVRIG HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 100033389 C/T 1 67 47 114 31.5998900605711 24.8329129425845 6.76697711798658 T:C C T 10 0.528359849842223 0.222976576151934 ENSG00000160813:ENST00000470295:exon_100033254_100033759:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000487452:exon_100033254_100033390:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000292330:exon_100033254_100033390:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000491407:exon_100033254_100033687:C7orf47 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 100458795 T/C 1 4 7 11 1.88656060063111 3.69851894889556 -1.81195834826445 T:C T C 10 0.528359849842223 0.368338354344120 ENSG00000146828:ENST00000448342:exon_100458634_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000418037:exon_100458760_100458802:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000428758:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000275729:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000415287:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000354161:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000416675:exon_100458760_100458852:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000475687:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000474019:exon_100457772_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000467972:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000487651:exon_100456358_100459206:SLC12A9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 100468284 A/G 1 27 28 55 12.73428405426 14.7940757955822 -2.05979174132226 A:G A G 10 0.528359849842223 0.591748559616533 ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100468196_100469343:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000417475:exon_100468196_100468297:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100467992_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000463125:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000429658:exon_100468196_100468365:TRIP6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 100482026 T/C 1 51 41 92 24.0536476580466 21.6627538435311 2.39089381451549 T:C T C 10 0.528359849842223 0.676517030913684 ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000474896:exon_100481989_100482173:SRRT HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 100486035 C/A 1 32 45 77 15.0924848050489 23.7761932429 -8.68370843785117 A:C C A 10 0.528359849842223 0.0522564056073356 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 100486088 C/T 1 34 34 68 16.0357651053644 17.9642348946356 -1.92846978927116 T:C C T 10 0.528359849842223 0.715874133223021 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 100486656 T/G 1 11 5 16 5.18804165173555 2.64179924921111 2.54624240252443 T:G T G 10 0.528359849842223 0.221849866555357 ENSG00000176125:ENST00000388761:exon_100486346_100487339:UFSP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 100861452 T/C 1 8 9 17 3.77312120126222 4.75523864858001 -0.98211744731779 T:C T C 10 0.528359849842223 0.637819172258138 ENSG00000106400:ENST00000305105:exon_100860949_100861498:ZNHIT1;ENSG00000106400:ENST00000461205:exon_100861447_100861498:ZNHIT1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 102087202 T/C 1 10 10 20 4.71640150157777 5.28359849842223 -0.567196996844459 T:C T C 10 0.528359849842223 0.826247654639236 ENSG00000160991:ENST00000495936:exon_102086960_102087422:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000488996:exon_102086960_102087495:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000356387:exon_102086960_102097268:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000478730:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000468241:exon_102086960_102087371:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000403646:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000473939:exon_102086960_102089179:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000458233:exon_102086960_102087661:ORAI2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 102112980 G/A 1 11 16 27 5.18804165173555 8.45375759747557 -3.26571594574002 A:G G A 10 0.528359849842223 0.248661671527112 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102110189_102113613:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000488689:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000468175:exon_102112901_102113056:LRWD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 102114087 C/T 1 113 29 142 53.2953369678288 15.3224356454245 37.9729013224043 T:C C T 10 0.528359849842223 5.59915145519817e-11 ENSG00000005075:ENST00000292614:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000306744:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000393794:exon_102113910_102114131:POLR2J HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 104717517 C/T 1 9 11 20 4.24476135141999 5.81195834826445 -1.56719699684446 T:C C T 10 0.528359849842223 0.509651795713 ENSG00000005483:ENST00000311117:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334884:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000393656:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000351043:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334877:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000257745:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334914:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000478990:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000476671:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000482560:exon_104717410_104717640:MLL5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 106826381 C/T 1 5 7 12 2.35820075078889 3.69851894889556 -1.34031819810668 T:C C T 10 0.528359849842223 0.56626847898003 ENSG00000105856:ENST00000468410:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000222574:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000485846:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000463202:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000417005:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000498408:exon_106826246_106826387:HBP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 107218033 T/C 1 8 21 29 3.77312120126222 11.0955568466867 -7.32243564542447 T:C T C 10 0.528359849842223 0.00824320311169802 ENSG00000105865:ENST00000422290:exon_107217758_107218460:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000265720:exon_107217758_107218906:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000431839:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000406564:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000402620:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000443233:exon_107217758_107218295:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000436411:exon_107217758_107218750:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000485825:exon_107217758_107218101:DUS4L HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 107559722 A/T 1 55 49 104 25.9402082586777 25.8896326422689 0.050575616408814 A:T A T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000091140:ENST00000205402:exon_107559639_107560360:DLD;ENSG00000091140:ENST00000415325:exon_107559639_107560038:DLD;ENSG00000091140:ENST00000417551:exon_107559639_107559828:DLD;ENSG00000091140:ENST00000440410:exon_107559639_107560158:DLD;ENSG00000091140:ENST00000437604:exon_107559639_107560100:DLD HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 116557939 C/T 1 29 24 53 13.6775643545755 12.6806363962134 0.996927958362182 T:C C T 10 0.528359849842223 0.890744927126588 ENSG00000198898:ENST00000361183:exon_116557781_116559315:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000458284:exon_116557781_116559312:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426419:exon_116557781_116559312:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426421:exon_116557781_116558242:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000393463:exon_116557781_116559312:CAPZA2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 117825681 A/G 1 7 3 10 3.30148105110444 1.58507954952667 1.71640150157777 A:G A G 10 0.528359849842223 0.35163323596596 ENSG00000128534:ENST00000422760:exon_117824210_117825748:NAA38 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 123185691 C/T 1 20 10 30 9.43280300315554 5.28359849842223 4.14920450473331 T:C C T 10 0.528359849842223 0.145699655332193 ENSG00000128609:ENST00000471770:exon_123185665_123185730:NDUFA5;ENSG00000128609:ENST00000355749:exon_123185665_123185730:NDUFA5;ENSG00000128609:ENST00000378795:exon_123185665_123185730:NDUFA5;ENSG00000128609:ENST00000459880:exon_123185665_123185879:NDUFA5;ENSG00000128609:ENST00000466896:exon_123185665_123185730:NDUFA5;ENSG00000128609:ENST00000467117:exon_123185665_123185730:NDUFA5;ENSG00000128609:ENST00000470123:exon_123185665_123185730:NDUFA5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 127222157 G/A 1 8 2 10 3.77312120126222 1.05671969968445 2.71640150157777 A:G G A 10 0.528359849842223 0.11503004681301 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127220672_127223363:GCC1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 127721507 T/C 1 41 49 90 19.3372461564689 25.8896326422689 -6.55238648580007 T:C T C 10 0.528359849842223 0.171364743322616 ENSG00000197157:ENST00000438400:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000354725:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000486037:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000470463:exon_127721412_127721553:SND1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 128034629 C/T 1 24 29 53 11.3193636037866 15.3224356454245 -4.00307204163782 T:C C T 10 0.528359849842223 0.275050422671343 ENSG00000106348:ENST00000469328:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000484496:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000419067:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000338791:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000496200:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000354269:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000348127:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000378717:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000416064:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000343214:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000470772:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000480861:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000460045:exon_128034510_128035052:IMPDH1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 138732457 G/A 1 13 10 23 6.1313219520511 5.28359849842223 0.847723453628872 A:G G A 10 0.528359849842223 0.835609051250035 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 138732497 G/A 1 8 8 16 3.77312120126222 4.22687879873778 -0.453757597475567 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 138761034 G/C 1 18 8 26 8.48952270283999 4.22687879873778 4.2626439041022 C:G G C 10 0.528359849842223 0.116025215951166 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000471652:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000460845:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 139726121 G/A 1 8 8 16 3.77312120126222 4.22687879873778 -0.453757597475567 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139725997_139726148:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139725997_139726148:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139725997_139726148:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139725997_139726148:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000491598:exon_139725997_139726148:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000484111:exon_139725997_139726148:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000496624:exon_139725996_139726148:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489383:exon_139726004_139726148:PARP12 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 140158851 C/G 1 10 10 20 4.71640150157777 5.28359849842223 -0.567196996844459 C:G C G 10 0.528359849842223 0.826247654639236 ENSG00000133606:ENST00000255977:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475010:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000474576:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000496169:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000443720:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000471104:exon_140158807_140159033:MKRN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 140159721 T/C 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 T:C T C 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000133606:ENST00000255977:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475010:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000474576:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000496169:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000443720:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000471104:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000467513:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000494939:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000498535:exon_140159572_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000473444:exon_140159598_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475180:exon_140159641_140159736:MKRN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 1 281 1 282 132.530882194335 0.528359849842223 132.002522344493 T:C T C 10 0.528359849842223 2.06475452382882e-76 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 148700849 C/T 1 117 197 314 55.1818975684599 104.086890418918 -48.904992850458 T:C C T 10 0.528359849842223 3.34965573245433e-08 ENSG00000155660:ENST00000286091:exon_148700154_148701301:PDIA4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 148701047 C/T 1 297 199 496 140.07712459686 105.143610118602 34.9335144782574 T:C C T 10 0.528359849842223 0.00188526692431297 ENSG00000155660:ENST00000286091:exon_148700154_148701301:PDIA4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 150068371 T/C 1 26 12 38 12.2626439041022 6.34031819810668 5.92232570599553 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0725596301625199 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000522266:exon_150068317_150068481:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 150068605 G/A 1 25 14 39 11.7910037539444 7.39703789779112 4.39396585615331 A:G G A 10 0.528359849842223 0.19917561097288 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 150068620 C/T 1 18 15 33 8.48952270283999 7.92539774763334 0.564124955206642 T:C C T 10 0.528359849842223 0.863674650795997 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 150068933 T/C 1 29 17 46 13.6775643545755 8.98211744731779 4.69544690725774 T:C T C 10 0.528359849842223 0.185122606556153 ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 150217309 C/T 1 17 8 25 8.01788255268221 4.22687879873778 3.79100375394443 T:C C T 10 0.528359849842223 0.161132514170427 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 150389594 G/T 1 15 23 38 7.07460225236666 12.1522765463711 -5.07767429400447 T:G G T 10 0.528359849842223 0.106173710802573 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 150389677 G/C 1 14 15 29 6.60296210220888 7.92539774763334 -1.32243564542447 C:G G C 10 0.528359849842223 0.711035870554003 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 150439500 C/T 1 17 5 22 8.01788255268221 2.64179924921111 5.37608330347109 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0304693485322208 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000493304:exon_150439271_150439605:GIMAP5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 150440043 C/T 1 21 15 36 9.90444315331332 7.92539774763334 1.97904540567997 T:C C T 10 0.528359849842223 0.617184618708526 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 150733025 T/A 1 10 3 13 4.71640150157777 1.58507954952667 3.1313219520511 A:T T A 10 0.528359849842223 0.0990276262490944 ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482309:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000470645:exon_150732668_150733257:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000466514:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477719:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477092:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000491920:exon_150732969_150733054:ABCB8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 150773287 T/C 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 T:C T C 10 0.528359849842223 0.488145622466204 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 150916228 G/A 1 21 18 39 9.90444315331332 9.51047729716001 0.393965856153304 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000473874:exon_150916150_150916245:ABCF2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 150931268 C/G 1 26 21 47 12.2626439041022 11.0955568466867 1.16708705741552 C:G C G 10 0.528359849842223 0.771722344050785 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150931172_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150929585_150931360:CHPF2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 150934975 C/G 1 65 73 138 30.6566097602555 38.5702690384823 -7.91365927822676 C:G C G 10 0.528359849842223 0.200776458749675 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150934460_150935905:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150934460_150935359:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150934460_150935908:CHPF2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 151859683 G/A 1 6 4 10 2.82984090094666 2.11343939936889 0.71640150157777 A:G G A 10 0.528359849842223 0.757839432335683 ENSG00000055609:ENST00000360104:exon_151859202_151860911:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000262189:exon_151859202_151860911:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000355193:exon_151859202_151860911:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000424877:exon_151859202_151860419:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000473186:exon_151859202_151860911:MLL3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 7 158672619 A/G 1 6 7 13 2.82984090094666 3.69851894889556 -0.868678047948899 A:G A G 10 0.528359849842223 0.782884637593256 ENSG00000126870:ENST00000407559:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000308978:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000444851:exon_158672471_158672680:WDR60 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 1514009 C/A 1 21 4 25 9.90444315331332 2.11343939936889 7.79100375394443 A:C C A 10 0.528359849842223 0.00198749493531708 ENSG00000198010:ENST00000421627:exon_1513849_1514060:DLGAP2;ENSG00000198010:ENST00000356067:exon_1513849_1514060:DLGAP2;ENSG00000198010:ENST00000357934:exon_1513849_1514060:DLGAP2;ENSG00000198010:ENST00000520901:exon_1513849_1514060:DLGAP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 6302154 G/T 1 5 11 16 2.35820075078889 5.81195834826445 -3.45375759747557 T:G G T 10 0.528359849842223 0.130530190247833 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 6302671 C/T 1 14 14 28 6.60296210220888 7.39703789779112 -0.794075795582243 T:C C T 10 0.528359849842223 0.850635285686568 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 6478986 C/T 1 8 6 14 3.77312120126222 3.17015909905334 0.602962102208878 T:C C T 10 0.528359849842223 0.795199355745845 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521129:exon_6478975_6479142:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 6479042 C/T 1 9 4 13 4.24476135141999 2.11343939936889 2.1313219520511 T:C C T 10 0.528359849842223 0.276905486309559 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521129:exon_6478975_6479142:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 6479178 C/A 1 7 10 17 3.30148105110444 5.28359849842223 -1.98211744731779 A:C C A 10 0.528359849842223 0.345289018090792 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 6566351 C/G 1 18 7 25 8.48952270283999 3.69851894889556 4.79100375394443 C:G C G 10 0.528359849842223 0.0702196494635416 ENSG00000155189:ENST00000285518:exon_6565878_6566408:AGPAT5;ENSG00000155189:ENST00000523234:exon_6566187_6566408:AGPAT5;ENSG00000155189:ENST00000518327:exon_6566214_6566408:AGPAT5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 8176554 C/T 1 8 9 17 3.77312120126222 4.75523864858001 -0.98211744731779 T:C C T 10 0.528359849842223 0.637819172258138 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 8654898 C/T 1 6 3 9 2.82984090094666 1.58507954952667 1.24476135141999 T:C C T 10 0.528359849842223 0.514115714513849 ENSG00000147324:ENST00000276282:exon_8654875_8655001:MFHAS1;ENSG00000147324:ENST00000521881:exon_8654875_8655001:MFHAS1;ENSG00000147324:ENST00000520715:exon_8654875_8655001:MFHAS1;ENSG00000147324:ENST00000520091:exon_8654875_8655001:MFHAS1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 10623138 T/A 1 69 50 119 32.5431703608866 26.4179924921111 6.12517786877547 A:T T A 10 0.528359849842223 0.271708574328388 ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10622473_10623426:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10622669_10623426:PINX1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 10692242 G/A 1 7 10 17 3.30148105110444 5.28359849842223 -1.98211744731779 A:G G A 10 0.528359849842223 0.345289018090792 ENSG00000254093:ENST00000354846:exon_10692176_10692285:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10692176_10692285:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10692176_10692285:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000524114:exon_10692176_10692285:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000523559:exon_10692176_10692285:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000520018:exon_10692176_10692285:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000524026:exon_10691862_10692285:PINX1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 17142065 C/T 1 5 7 12 2.35820075078889 3.69851894889556 -1.34031819810668 T:C C T 10 0.528359849842223 0.56626847898003 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521976:exon_17141982_17142125:VPS37A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 17819572 C/T 1 4 7 11 1.88656060063111 3.69851894889556 -1.81195834826445 T:C C T 10 0.528359849842223 0.368338354344120 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517836:exon_17819543_17819722:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518762:exon_17819543_17819683:PCM1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 17927327 T/C 1 25 45 70 11.7910037539444 23.7761932429 -11.9851894889556 T:C T C 10 0.528359849842223 0.00550826985765723 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17927301_17927387:ASAH1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 17928811 C/T 1 12 12 24 5.65968180189332 6.34031819810668 -0.680636396213352 T:C C T 10 0.528359849842223 0.839647550159473 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17928809_17928899:ASAH1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 22471824 G/A 1 9 7 16 4.24476135141999 3.69851894889556 0.546242402524432 A:G G A 10 0.528359849842223 0.808617085826636 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000522599:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521020:exon_22471398_22471827:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 22473224 T/C 1 25 26 51 11.7910037539444 13.7373560958978 -1.94635234195337 T:C T C 10 0.528359849842223 0.674358667550351 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520738:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 22880162 G/C 1 12 12 24 5.65968180189332 6.34031819810668 -0.680636396213352 C:G G C 10 0.528359849842223 0.839647550159473 ENSG00000120889:ENST00000523752:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22879824_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22879987_22880497:TNFRSF10B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 23291835 T/C 1 7 5 12 3.30148105110444 2.64179924921111 0.659681801893325 T:C T C 10 0.528359849842223 0.778733618574385 ENSG00000197217:ENST00000518471:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000356206:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000521321:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000522255:exon_23291830_23292251:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000523958:exon_23291606_23291991:ENTPD4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 26240646 A/G 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 A:G A G 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000104765:ENST00000380629:exon_26240414_26240746:BNIP3L;ENSG00000104765:ENST00000520077:exon_26240570_26240746:BNIP3L HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 27255080 A/G 1 8 5 13 3.77312120126222 2.64179924921111 1.1313219520511 A:G A G 10 0.528359849842223 0.589076720209571 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 27255128 T/C 1 5 4 9 2.35820075078889 2.11343939936889 0.244761351419994 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 27255263 A/G 1 9 17 26 4.24476135141999 8.98211744731779 -4.7373560958978 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0766357420476439 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 27277537 G/A 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 A:G G A 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27277412_27277590:PTK2B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 27293865 C/T 1 25 18 43 11.7910037539444 9.51047729716001 2.28052645678441 T:C C T 10 0.528359849842223 0.54283693699514 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27293768_27293865:PTK2B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 27301725 C/G 1 55 43 98 25.9402082586777 22.7194735432156 3.22073471546215 C:G C G 10 0.528359849842223 0.544781201012207 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27301723_27301788:PTK2B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 27308585 A/C 1 81 66 147 38.2028521627799 34.8717500895867 3.33110207319323 A:T:C A C 10 0.528359849842223 0.620457288212083 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27308560_27308595:PTK2B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 27667969 C/G 1 11 7 18 5.18804165173555 3.69851894889556 1.48952270283999 C:G C G 10 0.528359849842223 0.63817833418455 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27667137_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27667718_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000524266:exon_27667811_27668018:PBK HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 28384712 A/G 1 18 12 30 8.48952270283999 6.34031819810668 2.14920450473331 A:G A G 10 0.528359849842223 0.46922644197021 ENSG00000104290:ENST00000240093:exon_28384664_28385681:FZD3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 29197672 A/G 1 30 18 48 14.1492045047333 9.51047729716001 4.6387272075733 A:G A G 10 0.528359849842223 0.195285832758551 ENSG00000120875:ENST00000240100:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000404690:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000240101:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000462477:exon_29197615_29197760:DUSP4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 31024638 C/T 1 6 4 10 2.82984090094666 2.11343939936889 0.71640150157777 T:C C T 10 0.528359849842223 0.757839432335683 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_31024538_31024746:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_31024538_31024746:WRN HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 33356074 A/G 1 6 6 12 2.82984090094666 3.17015909905334 -0.340318198106676 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000198042:ENST00000360128:exon_33355950_33358687:MAK16;ENSG00000198042:ENST00000518389:exon_33355950_33356164:MAK16 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 33357818 A/G 1 13 12 25 6.1313219520511 6.34031819810668 -0.208996246055574 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000198042:ENST00000360128:exon_33355950_33358687:MAK16 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 33369994 A/G 1 5 11 16 2.35820075078889 5.81195834826445 -3.45375759747557 A:G A G 10 0.528359849842223 0.130530190247833 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 37728019 T/G 1 6 2 8 2.82984090094666 1.05671969968445 1.77312120126222 T:G T G 10 0.528359849842223 0.29537924054388 ENSG00000156675:ENST00000287263:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000330843:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522727:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000523182:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522774:exon_37727938_37730796:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000524118:exon_37727905_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000343853:exon_37727905_37728046:RAB11FIP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 37985897 A/G 1 10 11 21 4.71640150157777 5.81195834826445 -1.09555684668668 A:G A G 10 0.528359849842223 0.667251391828987 ENSG00000129691:ENST00000343823:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000250635:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517496:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000428278:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000521652:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000524247:exon_37985858_37985976:ASH2L HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 38458696 T/C 0 20 0 20 9.43280300315554 0 9.43280300315554 T T 10 0.528359849842223 3.17135425565646e-06 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 38848850 C/T 1 31 22 53 14.6208446548911 11.6239166965289 2.99692795836218 T:C C T 10 0.528359849842223 0.491889632652061 ENSG00000169490:ENST00000456845:exon_38846327_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000456397:exon_38846327_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000412303:exon_38846327_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000397070:exon_38848324_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000316221:exon_38848324_38849064:TM2D2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 53537316 A/G 1 6 8 14 2.82984090094666 4.22687879873778 -1.39703789779112 A:G A G 10 0.528359849842223 0.594448035256428 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000519912:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53537277_53537347:RB1CC1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 53555069 A/G 1 10 6 16 4.71640150157777 3.17015909905334 1.54624240252443 A:G A G 10 0.528359849842223 0.46618456350988 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53554911_53555151:RB1CC1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 74888616 G/C 1 7 10 17 3.30148105110444 5.28359849842223 -1.98211744731779 C:G G C 10 0.528359849842223 0.345289018090792 ENSG00000175606:ENST00000523794:exon_74888540_74888726:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74888430_74888726:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000517439:exon_74888442_74888726:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74888444_74888726:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000517614:exon_74888454_74888726:TMEM70 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 74893821 A/G 1 134 90 224 63.1997801211421 47.5523864858001 15.6473936353421 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0379835424762941 ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 74893850 C/G 1 49 52 101 23.1103673577311 27.4747121917956 -4.36434483406452 C:G C G 10 0.528359849842223 0.425525448722117 ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 87497176 G/A 1 27 21 48 12.73428405426 11.0955568466867 1.6387272075733 A:G G A 10 0.528359849842223 0.666903728216877 ENSG00000176623:ENST00000519789:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519639:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523911:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000520719:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000518390:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000524172:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87496920_87497190:FAM82B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 87519315 T/G 1 14 6 20 6.60296210220888 3.17015909905334 3.43280300315554 T:G T G 10 0.528359849842223 0.177870101535749 ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523911:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519966:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000430676:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000524172:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523370:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000521045:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000518772:exon_87519224_87519341:FAM82B HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 87570665 A/C 1 7 3 10 3.30148105110444 1.58507954952667 1.71640150157777 A:C A C 10 0.528359849842223 0.35163323596596 ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87570516_87573726:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87570516_87573726:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517490:exon_87570516_87573639:CPNE3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 90958422 T/C 1 8 7 15 3.77312120126222 3.69851894889556 0.0746022523666556 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000520325:exon_90958368_90958853:NBN HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 90967711 A/G 1 7 16 23 3.30148105110444 8.45375759747557 -5.15227654637113 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0365722846410322 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90967511_90967783:NBN HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 90990479 C/G 1 5 7 12 2.35820075078889 3.69851894889556 -1.34031819810668 C:G C G 10 0.528359849842223 0.56626847898003 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000452387:exon_90990448_90990542:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517772:exon_90990448_90990551:NBN HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 91064126 G/A 1 21 25 46 9.90444315331332 13.2089962460556 -3.30455309274226 A:G G A 10 0.528359849842223 0.376401865918578 ENSG00000104325:ENST00000519328:exon_91064066_91064148:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000220764:exon_91064066_91064236:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000517597:exon_91064066_91064200:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000522161:exon_91064066_91064227:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000524332:exon_91064066_91064178:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000520148:exon_91064066_91064320:DECR1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 95500924 A/G 1 50 47 97 23.5820075078889 24.8329129425845 -1.25090543469562 A:G A G 10 0.528359849842223 0.839115418846002 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95499921_95501088:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95500600_95501088:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95500600_95501088:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000521080:exon_95500748_95501088:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000522263:exon_95500748_95501088:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000522196:exon_95500749_95501088:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000517624:exon_95500843_95501088:KIAA1429 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 95888307 C/T 1 22 19 41 10.3760833034711 10.0388371470022 0.33724615646886 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000521155:exon_95888302_95888370:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523998:exon_95888179_95888513:INTS8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 99057159 C/T 1 18 8 26 8.48952270283999 4.22687879873778 4.2626439041022 T:C C T 10 0.528359849842223 0.116025215951166 ENSG00000156482:ENST00000518850:exon_99057055_99057316:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000520998:exon_99056661_99057316:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521112:exon_99057096_99057627:RPL30 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 101153024 G/A 1 5 6 11 2.35820075078889 3.17015909905334 -0.811958348264453 A:G G A 10 0.528359849842223 0.765428811190486 ENSG00000156509:ENST00000428847:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000428185:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000388828:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000517806:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000520987:exon_101152911_101154396:FBXO43 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 101253184 G/A 1 15 14 29 7.07460225236666 7.39703789779112 -0.322435645424465 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101253119_101254130:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101253119_101254130:SPAG1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 104432545 A/G 1 16 13 29 7.54624240252443 6.8686780479489 0.677564354575535 A:G A G 10 0.528359849842223 0.854075321976803 ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521716:exon_104432492_104432876:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521971:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000388778:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000519682:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000518554:exon_104432492_104432691:DCAF13 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 110283256 T/C 1 11 6 17 5.18804165173555 3.17015909905334 2.01788255268221 T:C T C 10 0.528359849842223 0.467320757987905 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110283234_110283359:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110283234_110283359:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110283234_110283359:NUDCD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 110283353 T/G 1 9 2 11 4.24476135141999 1.05671969968445 3.18804165173555 T:G T G 10 0.528359849842223 0.0701050773055379 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110283234_110283359:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110283234_110283359:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110283234_110283359:NUDCD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 110301998 T/C 1 7 7 14 3.30148105110444 3.69851894889556 -0.397037897791122 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000521439:exon_110301980_110302162:NUDCD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 117864217 A/G 1 14 5 19 6.60296210220888 2.64179924921111 3.96116285299776 A:G A G 10 0.528359849842223 0.105313476648990 ENSG00000164754:ENST00000297338:exon_117864187_117864335:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000523986:exon_117862857_117864491:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000518055:exon_117864187_117864490:RAD21 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 123964953 C/T 1 6 3 9 2.82984090094666 1.58507954952667 1.24476135141999 T:C C T 10 0.528359849842223 0.514115714513849 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 124031541 T/C 1 16 11 27 7.54624240252443 5.81195834826445 1.73428405425998 T:C T C 10 0.528359849842223 0.566334390424242 ENSG00000136986:ENST00000259512:exon_124031435_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000524119:exon_124026389_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000419562:exon_124031435_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000519018:exon_124031435_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000523036:exon_124031435_124031545:DERL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 124448804 T/A 1 7 3 10 3.30148105110444 1.58507954952667 1.71640150157777 A:T T A 10 0.528359849842223 0.35163323596596 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124448693_124448841:WDYHV1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 124449466 C/T 1 8 5 13 3.77312120126222 2.64179924921111 1.1313219520511 T:C C T 10 0.528359849842223 0.589076720209571 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000518125:exon_124449450_124449574:WDYHV1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 125463435 C/G 1 6 5 11 2.82984090094666 2.64179924921111 0.188041651735547 C:G C G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000183665:ENST00000328599:exon_125463048_125465262:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000521443:exon_125463061_125463498:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000522518:exon_125463158_125463498:TRMT12 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 125499363 G/A 1 22 19 41 10.3760833034711 10.0388371470022 0.33724615646886 A:G G A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000170881:ENST00000303545:exon_125498072_125500155:RNF139 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 125528135 G/A 1 10 15 25 4.71640150157777 7.92539774763334 -3.20899624605557 A:G G A 10 0.528359849842223 0.231576293849315 ENSG00000147687:ENST00000276692:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523214:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519548:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000522810:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000517678:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519776:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000521546:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000521973:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000520321:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000522310:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519232:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000520938:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523888:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523152:exon_125528128_125528271:TATDN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 133844508 C/T 1 5 6 11 2.35820075078889 3.17015909905334 -0.811958348264453 T:C C T 10 0.528359849842223 0.765428811190486 ENSG00000129292:ENST00000395386:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000220847:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000395390:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000460236:exon_133844480_133844644:PHF20L1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 135524797 G/T 1 20 21 41 9.43280300315554 11.0955568466867 -1.66275384353114 T:G G T 10 0.528359849842223 0.64097476320802 ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000518408:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135524718_135524844:ZFAT HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 135602581 A/G 1 7 4 11 3.30148105110444 2.11343939936889 1.18804165173555 A:G A G 10 0.528359849842223 0.556038959282085 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000517307:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135602511_135602598:ZFAT HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 140744387 G/A 0 10 0 10 4.71640150157777 0 4.71640150157777 G G 10 0.528359849842223 0.00224013880625445 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_140744222_140744445:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000520857:exon_140744222_140744445:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_140744222_140744445:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_140744222_140744445:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_140744222_140744445:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000521667:exon_140744222_140744445:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000522504:exon_140744222_140744445:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000521700:exon_140744222_140744445:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000519482:exon_140744222_140744445:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000524162:exon_140744336_140744445:TRAPPC9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 142200467 G/A 1 5 15 20 2.35820075078889 7.92539774763334 -5.56719699684446 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0137514081211492 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520571:exon_142200383_142200723:DENND3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 142204326 C/G 1 7 14 21 3.30148105110444 7.39703789779112 -4.09555684668668 C:G C G 10 0.528359849842223 0.082681392551285 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 142221794 C/A 1 5 4 9 2.35820075078889 2.11343939936889 0.244761351419994 A:C C A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000022567:ENST00000519067:exon_142217265_142222655:SLC45A4;ENSG00000022567:ENST00000517878:exon_142220628_142221796:SLC45A4;ENSG00000022567:ENST00000024061:exon_142220700_142221796:SLC45A4;ENSG00000022567:ENST00000433583:exon_142220870_142221796:SLC45A4;ENSG00000022567:ENST00000425766:exon_142220870_142221796:SLC45A4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 144358302 C/T 1 12 5 17 5.65968180189332 2.64179924921111 3.01788255268221 T:C C T 10 0.528359849842223 0.154369157381661 ENSG00000181638:ENST00000522452:exon_144358067_144358573:ZFP41;ENSG00000250571:ENST00000522479:exon_144358067_144358351:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000517530:exon_144358173_144358581:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000522033:exon_144358067_144358340:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 144358381 G/A 1 14 20 34 6.60296210220888 10.5671969968445 -3.96423489463558 A:G G A 10 0.528359849842223 0.228718418270199 ENSG00000181638:ENST00000522452:exon_144358067_144358573:ZFP41;ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000517530:exon_144358173_144358581:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 144392368 G/A 1 26 16 42 12.2626439041022 8.45375759747557 3.80888630662664 A:C:G G A 10 0.528359849842223 0.280162214523433 ENSG00000184428:ENST00000519977:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000517857:exon_144392238_144392673:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144391892_144392387:TOP1MT HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 144403485 G/C 1 7 3 10 3.30148105110444 1.58507954952667 1.71640150157777 C:G G C 10 0.528359849842223 0.35163323596596 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144403371_144403556:TOP1MT HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 144406705 C/T 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 T:C C T 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522041:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519591:exon_144406655_144406799:TOP1MT HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 144620183 T/C 1 10 17 27 4.71640150157777 8.98211744731779 -4.26571594574002 T:C T C 10 0.528359849842223 0.122911026635503 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 144643169 C/T 1 5 7 12 2.35820075078889 3.69851894889556 -1.34031819810668 T:C C T 10 0.528359849842223 0.56626847898003 ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144641947_144643593:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526469:exon_144642798_144643593:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526051:exon_144643031_144643593:GSDMD HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 144644405 G/A 1 45 22 67 21.2238067571 11.6239166965289 9.59989006057106 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0199143574433389 ENSG00000104518:ENST00000526406:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533063:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000262580:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531184:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144644129_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000528475:exon_144643912_144644691:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526469:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000534602:exon_144644379_144644532:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531173:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000525208:exon_144644379_144644520:GSDMD HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 144658630 G/A 1 16 1 17 7.54624240252443 0.528359849842223 7.01788255268221 A:G G A 10 0.528359849842223 0.000371920925506487 ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144658248_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000480946:exon_144658610_144658742:NAPRT1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 144658711 G/A 0 0 11 11 0 5.81195834826445 -5.81195834826445 A G A 10 0.528359849842223 0.000256873000444934 ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144658248_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000480946:exon_144658610_144658742:NAPRT1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 144662353 G/A 1 1048 1074 2122 494.27887736535 567.458478730547 -73.1796013651971 A:C:G G A 10 0.528359849842223 0.00149722994253955 ENSG00000104529:ENST00000529576:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530109:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000527741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526838:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528610:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000533833:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000395119:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529272:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000317198:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000419152:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529007:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531621:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524624:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524397:exon_144662180_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000534380:exon_144662204_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528382:exon_144662249_144662376:EEF1D HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 144671244 C/A 1 5 4 9 2.35820075078889 2.11343939936889 0.244761351419994 A:C C A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530616:exon_144671161_144671392:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000525223:exon_144670998_144671486:EEF1D HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 144671922 G/A 1 7 8 15 3.30148105110444 4.22687879873778 -0.925397747633344 A:G G A 10 0.528359849842223 0.797109179414283 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526710:exon_144671351_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531281:exon_144671481_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532596:exon_144671681_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524883:exon_144671710_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531670:exon_144671715_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528519:exon_144671780_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529832:exon_144671814_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530306:exon_144671865_144672251:EEF1D HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 144681777 G/T 1 5 9 14 2.35820075078889 4.75523864858001 -2.39703789779112 T:G G T 10 0.528359849842223 0.284555554939117 ENSG00000179886:ENST00000504548:exon_144680005_144682485:TIGD5;ENSG00000179886:ENST00000321385:exon_144680075_144682075:TIGD5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 144687092 T/C 1 24 17 41 11.3193636037866 8.98211744731779 2.33724615646886 T:C T C 10 0.528359849842223 0.532736028634317 ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144686083_144688052:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144686083_144688052:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144687077_144687127:PYCRL HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 144776713 A/C 1 10 3 13 4.71640150157777 1.58507954952667 3.1313219520511 A:C A C 10 0.528359849842223 0.0990276262490944 ENSG00000181135:ENST00000454097:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000418203:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000533031:exon_144775841_144777526:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000358656:exon_144775841_144777555:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532486:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527561:exon_144775841_144776869:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532158:exon_144775841_144777527:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532205:exon_144775841_144777550:ZNF707 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 144990335 G/A 1 19 11 30 8.96116285299776 5.81195834826445 3.14920450473331 A:G G A 10 0.528359849842223 0.276639688593771 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 144990528 A/G 1 10 6 16 4.71640150157777 3.17015909905334 1.54624240252443 A:G A G 10 0.528359849842223 0.46618456350988 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 144991176 T/C 1 14 16 30 6.60296210220888 8.45375759747557 -1.85079549526669 T:C T C 10 0.528359849842223 0.584418289971274 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 144992103 T/C 1 7 8 15 3.30148105110444 4.22687879873778 -0.925397747633344 T:C T C 10 0.528359849842223 0.797109179414283 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 144992361 T/C 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 T:C T C 10 0.528359849842223 0.743278251879842 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 144993324 C/T 1 5 6 11 2.35820075078889 3.17015909905334 -0.811958348264453 T:C C T 10 0.528359849842223 0.765428811190486 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 144993377 A/G 1 8 6 14 3.77312120126222 3.17015909905334 0.602962102208878 A:G A G 10 0.528359849842223 0.795199355745845 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 144996408 T/G 1 5 5 10 2.35820075078889 2.64179924921111 -0.283598498422229 T:G T G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527303:exon_144996100_144996563:PLEC HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 144998514 C/T 1 5 5 10 2.35820075078889 2.64179924921111 -0.283598498422229 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 145058037 A/G 1 5 6 11 2.35820075078889 3.17015909905334 -0.811958348264453 A:G A G 10 0.528359849842223 0.765428811190486 ENSG00000178685:ENST00000526007:exon_145057335_145058526:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528963:exon_145058010_145058272:PARP10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 145058986 A/G 1 21 22 43 9.90444315331332 11.6239166965289 -1.71947354321559 A:G A G 10 0.528359849842223 0.648275396895171 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313059:exon_145058896_145059496:PARP10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 145060112 G/A 1 6 15 21 2.82984090094666 7.92539774763334 -5.09555684668668 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0291421032618403 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000533665:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000526985:exon_145059660_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525879:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528625:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525486:exon_145059886_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531537:exon_145059892_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529842:exon_145059893_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528914:exon_145059918_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528136:exon_145059939_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529311:exon_145060005_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528580:exon_145060017_145060401:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000530478:exon_145060059_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000532311:exon_145060076_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531707:exon_145060082_145060143:PARP10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 145623963 G/A 1 10 5 15 4.71640150157777 2.64179924921111 2.07460225236666 A:G G A 10 0.528359849842223 0.313475377913303 ENSG00000071894:ENST00000349769:exon_145623915_145624028:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000527916:exon_145623913_145624028:CPSF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 145737816 C/T 1 13 13 26 6.1313219520511 6.8686780479489 -0.737356095897796 T:C C T 10 0.528359849842223 0.845396168977588 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145737775_145737944:RECQL4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 145741765 G/A 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 A:G G A 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 145979138 C/T 1 1 7 8 0.471640150157777 3.69851894889556 -3.22687879873778 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0304648716291925 ENSG00000198169:ENST00000292562:exon_145979068_145979181:ZNF251;ENSG00000198169:ENST00000533117:exon_145979079_145979181:ZNF251;ENSG00000198169:ENST00000525191:exon_145978841_145979181:ZNF251;ENSG00000198169:ENST00000530353:exon_145979066_145979181:ZNF251 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 146156247 C/A 1 11 14 25 5.18804165173555 7.39703789779112 -2.20899624605557 A:C C A 10 0.528359849842223 0.426211756189236 ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146155744_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146155771_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000435605:exon_146156124_146157979:ZNF16 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 8 146157339 T/C 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146155744_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146155771_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000435605:exon_146156124_146157979:ZNF16 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 2811505 G/A 1 51 36 87 24.0536476580466 19.02095459432 5.0326930637266 A:G G A 10 0.528359849842223 0.285426453021968 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2811361_2811583:KIAA0020 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 2828765 C/G 1 24 30 54 11.3193636037866 15.8507954952667 -4.53143189148004 C:G C G 10 0.528359849842223 0.223101265038033 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2828675_2828778:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000469168:exon_2828475_2828778:KIAA0020 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 4860300 A/G 1 35 36 71 16.5074052555222 19.02095459432 -2.51354933879783 A:G A G 10 0.528359849842223 0.554950105376365 ENSG00000120158:ENST00000381750:exon_4860125_4861064:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000381730:exon_4860125_4860472:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000448872:exon_4860125_4861064:RCL1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 5969249 A/G 1 4 7 11 1.88656060063111 3.69851894889556 -1.81195834826445 A:G A G 10 0.528359849842223 0.368338354344120 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 6012734 A/C 1 8 6 14 3.77312120126222 3.17015909905334 0.602962102208878 A:C A C 10 0.528359849842223 0.795199355745845 ENSG00000137040:ENST00000259569:exon_6011020_6015618:RANBP6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 7174673 G/A 1 9 11 20 4.24476135141999 5.81195834826445 -1.56719699684446 A:G G A 10 0.528359849842223 0.509651795713 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7174553_7175647:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7174553_7175648:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7174553_7175647:KDM4C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 19116543 G/A 1 73 48 121 34.4297309615177 25.3612727924267 9.06845816909102 A:G G A 10 0.528359849842223 0.101884523776372 ENSG00000147872:ENST00000464326:exon_19116357_19116647:PLIN2;ENSG00000147872:ENST00000411567:exon_19115760_19116647:PLIN2;ENSG00000147872:ENST00000276914:exon_19115768_19116647:PLIN2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 19119674 A/G 1 37 31 68 17.4506855558378 16.3791553451089 1.07153021072884 A:G A G 10 0.528359849842223 0.809422454797467 ENSG00000147872:ENST00000276914:exon_19119648_19119829:PLIN2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 19376258 G/C 1 2 8 10 0.943280300315554 4.22687879873778 -3.28359849842223 C:G G C 10 0.528359849842223 0.0542343953774601 ENSG00000137154:ENST00000380394:exon_19375713_19376386:RPS6;ENSG00000137154:ENST00000498815:exon_19376253_19376386:RPS6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 20988426 A/G 1 17 15 32 8.01788255268221 7.92539774763334 0.0924848050488656 A:G A G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20988331_20988428:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20988331_20988428:KIAA1797 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 27062721 C/T 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000096872:ENST00000433700:exon_27062616_27062923:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000443698:exon_27062616_27062923:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000380062:exon_27062616_27062928:IFT74 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 32542204 A/G 1 22 21 43 10.3760833034711 11.0955568466867 -0.719473543215587 A:G A G 10 0.528359849842223 0.879182848917074 ENSG00000197579:ENST00000360538:exon_32540542_32544324:TOPORS;ENSG00000197579:ENST00000379858:exon_32540824_32544324:TOPORS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 33026572 T/C 1 74 76 150 34.9013711116755 40.1553485880089 -5.25397747633344 T:C T C 10 0.528359849842223 0.413860853029243 ENSG00000086061:ENST00000330899:exon_33026473_33026614:DNAJA1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 34339042 C/A 1 9 21 30 4.24476135141999 11.0955568466867 -6.85079549526669 A:C C A 10 0.528359849842223 0.0161750033237305 ENSG00000164978:ENST00000379158:exon_34339022_34339164:NUDT2;ENSG00000164978:ENST00000346365:exon_34339022_34339164:NUDT2;ENSG00000164978:ENST00000379155:exon_34339022_34339164:NUDT2;ENSG00000164978:ENST00000379154:exon_34339035_34339164:NUDT2;ENSG00000164978:ENST00000337747:exon_34339022_34339164:NUDT2;ENSG00000164978:ENST00000407581:exon_34339022_34339164:NUDT2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 34649442 A/G 1 12 16 28 5.65968180189332 8.45375759747557 -2.79407579558224 A:G A G 10 0.528359849842223 0.345302340839643 ENSG00000213930:ENST00000378842:exon_34649407_34649561:GALT;ENSG00000213930:ENST00000450095:exon_34649407_34649561:GALT;ENSG00000213930:ENST00000489643:exon_34648995_34650279:GALT;ENSG00000213930:ENST00000488412:exon_34649174_34649561:GALT HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 36191149 T/C 1 126 122 248 59.4266589198799 64.4599016807512 -5.0332427608713 T:C T C 10 0.528359849842223 0.525496244992388 ENSG00000122705:ENST00000433436:exon_36190892_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000345519:exon_36190920_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000464497:exon_36190928_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000470744:exon_36190929_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000242285:exon_36190934_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000396603:exon_36190960_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000466396:exon_36190960_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000462562:exon_36190990_36191270:CLTA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 37492679 G/T 1 19 13 32 8.96116285299776 6.8686780479489 2.09248480504887 T:G G T 10 0.528359849842223 0.484439446584996 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000421959:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37492654_37492712:POLR1E HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 37493588 C/T 1 11 10 21 5.18804165173555 5.28359849842223 -0.0955568466866819 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37493556_37493700:POLR1E HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 37500895 T/C 1 25 17 42 11.7910037539444 8.98211744731779 2.80888630662664 T:C T C 10 0.528359849842223 0.441041179109703 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37500837_37500918:POLR1E HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 37503087 G/A 1 74 58 132 34.9013711116755 30.6448712908489 4.25649982082657 A:G G A 10 0.528359849842223 0.486144712583087 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37503040_37503694:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37503040_37503693:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37503040_37503694:POLR1E HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 37780831 A/G 1 96 75 171 45.2774544151466 39.6269887381667 5.65046567697987 A:G A G 10 0.528359849842223 0.400307441988303 ENSG00000107371:ENST00000465229:exon_37780272_37780877:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000327304:exon_37779949_37780877:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000490516:exon_37780585_37780877:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000396521:exon_37780604_37780877:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000489414:exon_37780688_37780877:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000482614:exon_37780803_37780877:EXOSC3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 71679937 A/G 1 30 35 65 14.1492045047333 18.4925947444778 -4.34339023974449 A:G A G 10 0.528359849842223 0.320573854747951 ENSG00000165060:ENST00000377270:exon_71679854_71679951:FXN;ENSG00000165060:ENST00000533967:exon_71679854_71679951:FXN;ENSG00000165060:ENST00000396366:exon_71679854_71679959:FXN;ENSG00000165060:ENST00000396364:exon_71679854_71679959:FXN;ENSG00000165060:ENST00000498653:exon_71679854_71679951:FXN;ENSG00000165060:ENST00000484259:exon_71679854_71679951:FXN HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 71862975 C/T 1 9 2 11 4.24476135141999 1.05671969968445 3.18804165173555 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0701050773055379 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 71862987 G/A 1 7 2 9 3.30148105110444 1.05671969968445 2.24476135141999 A:G G A 10 0.528359849842223 0.186011003558895 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 77684690 A/C 1 6 8 14 2.82984090094666 4.22687879873778 -1.39703789779112 A:C A C 10 0.528359849842223 0.594448035256428 ENSG00000106733:ENST00000376811:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000361092:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000494066:exon_77683912_77684958:C9orf95 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 77761642 T/C 1 17 27 44 8.01788255268221 14.26571594574 -6.24783339305781 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0695941459131042 ENSG00000134996:ENST00000346234:exon_77761599_77762181:OSTF1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 80919756 T/G 1 8 5 13 3.77312120126222 2.64179924921111 1.1313219520511 T:G T G 10 0.528359849842223 0.589076720209571 ENSG00000135069:ENST00000421149:exon_80919651_80919856:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000376588:exon_80919651_80919856:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000347159:exon_80919651_80919856:PSAT1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 86278817 C/A 1 19 15 34 8.96116285299776 7.92539774763334 1.03576510536442 A:C C A 10 0.528359849842223 0.735352506151453 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000527373:exon_86278790_86278958:UBQLN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 86284178 C/A 1 7 7 14 3.30148105110444 3.69851894889556 -0.397037897791122 A:C C A 10 0.528359849842223 1 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86284100_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86281265_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86284100_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86284100_86284206:UBQLN1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 90265015 C/T 1 5 3 8 2.35820075078889 1.58507954952667 0.773121201262216 T:C C T 10 0.528359849842223 0.730064285841028 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469067:exon_90264836_90265426:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000475804:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000495281:exon_90264836_90265394:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000494010:exon_90264905_90265033:DAPK1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 90322023 G/A 1 14 24 38 6.60296210220888 12.6806363962134 -6.07767429400447 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0520447626489152 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90321047_90323546:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90321047_90323545:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90321047_90323543:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90321047_90322296:DAPK1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 93641151 T/C 1 11 10 21 5.18804165173555 5.28359849842223 -0.0955568466866819 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 95018903 A/G 1 2 6 8 0.943280300315554 3.17015909905334 -2.22687879873778 A:G A G 10 0.528359849842223 0.159873274171007 ENSG00000196305:ENST00000472894:exon_95018639_95019082:IARS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 95068046 C/T 1 30 24 54 14.1492045047333 12.6806363962134 1.46856810851996 T:C C T 10 0.528359849842223 0.785488285002248 ENSG00000198000:ENST00000360868:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000375594:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000442668:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000358855:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000477862:exon_95068035_95068112:NOL8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 95838070 G/C 1 9 2 11 4.24476135141999 1.05671969968445 3.18804165173555 C:G G C 10 0.528359849842223 0.0701050773055379 ENSG00000157303:ENST00000375472:exon_95838066_95838254:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000375469:exon_95838066_95838254:SUSD3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 95840256 A/G 1 14 8 22 6.60296210220888 4.22687879873778 2.37608330347109 A:G A G 10 0.528359849842223 0.394490393359378 ENSG00000157303:ENST00000375472:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000465709:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000375469:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000471462:exon_95840125_95840275:SUSD3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 95875381 G/C 1 12 2 14 5.65968180189332 1.05671969968445 4.60296210220888 C:G G C 10 0.528359849842223 0.0148919960155353 ENSG00000165233:ENST00000375464:exon_95875274_95875564:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000466409:exon_95875274_95875564:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000468781:exon_95875274_95875489:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000490488:exon_95875274_95875554:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000488630:exon_95875274_95875565:C9orf89 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 99250463 C/T 1 8 13 21 3.77312120126222 6.8686780479489 -3.09555684668668 T:C C T 10 0.528359849842223 0.194999185861965 ENSG00000130956:ENST00000375251:exon_99250371_99250556:HABP4;ENSG00000130956:ENST00000375249:exon_99250371_99250556:HABP4;ENSG00000130956:ENST00000466976:exon_99250371_99250556:HABP4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 100447310 A/C 1 19 34 53 8.96116285299776 17.9642348946356 -9.00307204163782 A:C A C 10 0.528359849842223 0.0184740954817492 ENSG00000136936:ENST00000375128:exon_100447205_100447322:XPA;ENSG00000136936:ENST00000462523:exon_100447205_100447322:XPA;ENSG00000136936:ENST00000496104:exon_100447243_100447322:XPA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 100459578 T/C 1 7 6 13 3.30148105110444 3.17015909905334 0.131321952051101 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000136936:ENST00000375128:exon_100459403_100459639:XPA HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 100823084 T/C 1 38 30 68 17.9223257059955 15.8507954952667 2.07153021072884 T:C T C 10 0.528359849842223 0.629475212685535 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 103064530 G/A 1 4 8 12 1.88656060063111 4.22687879873778 -2.34031819810668 A:G G A 10 0.528359849842223 0.248211150341394 ENSG00000136891:ENST00000374902:exon_103064366_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000477648:exon_103064368_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000444730:exon_103064372_103064586:TEX10 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 107515214 G/A 1 20 11 31 9.43280300315554 5.81195834826445 3.62084465489109 A:G G A 10 0.528359849842223 0.211786636832756 ENSG00000136783:ENST00000374767:exon_107515187_107515345:NIPSNAP3A HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 114174415 T/C 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114174294_114174428:KIAA0368 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 115931692 A/G 1 21 21 42 9.90444315331332 11.0955568466867 -1.19111369337336 A:G A G 10 0.528359849842223 0.758545099845217 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 115931703 G/A 1 19 21 40 8.96116285299776 11.0955568466867 -2.13439399368892 A:G G A 10 0.528359849842223 0.52932968160044 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 116136198 C/T 1 25 29 54 11.7910037539444 15.3224356454245 -3.53143189148004 T:C C T 10 0.528359849842223 0.343685161395390 ENSG00000119431:ENST00000238379:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000374180:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000485934:exon_116136168_116136809:HDHD3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 116191667 G/C 1 4 5 9 1.88656060063111 2.64179924921111 -0.755238648580006 C:G G C 10 0.528359849842223 0.743278251879842 ENSG00000157653:ENST00000374165:exon_116191452_116191964:C9orf43;ENSG00000157653:ENST00000288462:exon_116191452_116191964:C9orf43;ENSG00000157653:ENST00000451722:exon_116191452_116191875:C9orf43 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 123170733 C/G 1 6 5 11 2.82984090094666 2.64179924921111 0.188041651735547 C:G C G 10 0.528359849842223 1 ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000425647:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123168424_123170746:CDK5RAP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 127101924 C/T 1 39 22 61 18.3939658561533 11.6239166965289 6.7700491596244 T:C C T 10 0.528359849842223 0.095257459422184 ENSG00000119408:ENST00000373603:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000373600:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000373601:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000320246:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000454453:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000394199:exon_127101850_127101944:NEK6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 127177161 A/G 1 46 45 91 21.6954469072577 23.7761932429 -2.08074633564229 A:G A G 10 0.528359849842223 0.675757673371013 ENSG00000136930:ENST00000259457:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000498485:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000441097:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000466951:exon_127177121_127177214:PSMB7 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 128246786 G/A 1 22 25 47 10.3760833034711 13.2089962460556 -2.83291294258448 A:G G A 10 0.528359849842223 0.465854513198614 ENSG00000119487:ENST00000350766:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373503:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373498:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000529322:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000265960:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000394063:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373505:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373497:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000497932:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000496063:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000420643:exon_128246722_128246862:MAPKAP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 130164993 C/T 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 T:C C T 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000136856:ENST00000373371:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000451404:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000476835:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000419917:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373354:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373360:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373355:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000419132:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000439597:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000423934:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373350:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000430147:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000484617:exon_130164643_130165032:SLC2A8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 130206669 C/T 1 10 5 15 4.71640150157777 2.64179924921111 2.07460225236666 T:C C T 10 0.528359849842223 0.313475377913303 ENSG00000196152:ENST00000342483:exon_130206308_130207651:ZNF79 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 130504070 G/A 1 10 10 20 4.71640150157777 5.28359849842223 -0.567196996844459 A:G G A 10 0.528359849842223 0.826247654639236 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000420366:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373274:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130504067_130504238:SH2D3C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 130523904 T/C 1 5 6 11 2.35820075078889 3.17015909905334 -0.811958348264453 T:C T C 10 0.528359849842223 0.765428811190486 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130523890_130523931:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000440630:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000464239:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000488685:exon_130523890_130523929:SH2D3C HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 130550819 C/T 1 4 4 8 1.88656060063111 2.11343939936889 -0.226878798737784 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000136807:ENST00000498339:exon_130550701_130550971:CDK9 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 130566668 G/A 1 13 10 23 6.1313219520511 5.28359849842223 0.847723453628872 A:G G A 10 0.528359849842223 0.835609051250035 ENSG00000136877:ENST00000479147:exon_130566564_130566672:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000479375:exon_130566564_130566692:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373247:exon_130566564_130566692:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373245:exon_130566564_130566692:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000393706:exon_130566564_130566692:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373244:exon_130566564_130566692:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000488307:exon_130566564_130566692:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373228:exon_130566564_130566692:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000460181:exon_130566564_130566692:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000475765:exon_130566564_130566692:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000496586:exon_130566564_130566692:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373225:exon_130566564_130566692:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000431857:exon_130566564_130566692:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000469468:exon_130566564_130566681:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000423577:exon_130566564_130566692:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000469310:exon_130566565_130566692:FPGS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 130575515 C/T 1 56 59 115 26.4118484088355 31.1732311406912 -4.76138273185564 T:C C T 10 0.528359849842223 0.401052255421054 ENSG00000136877:ENST00000373247:exon_130575474_130576343:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373245:exon_130575474_130576556:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000393706:exon_130575474_130576556:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373244:exon_130575474_130576556:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373228:exon_130575474_130575703:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000460181:exon_130575474_130576337:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373225:exon_130575474_130576338:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000488506:exon_130575474_130575563:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000467826:exon_130575474_130575602:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000475270:exon_130575474_130575853:FPGS HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 130581049 T/C 1 2 8 10 0.943280300315554 4.22687879873778 -3.28359849842223 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0542343953774601 ENSG00000106991:ENST00000373203:exon_130580995_130581111:ENG;ENSG00000106991:ENST00000344849:exon_130580995_130581111:ENG;ENSG00000106991:ENST00000480266:exon_130580995_130581069:ENG HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 130698029 G/C 1 80 57 137 37.7312120126222 30.1165114410067 7.61470057161546 C:G G C 10 0.528359849842223 0.200145132712378 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 130698043 A/G 1 78 55 133 36.7879317123066 29.0597917413223 7.72813997098435 A:G A G 10 0.528359849842223 0.193001671812208 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 130938661 C/T 1 16 15 31 7.54624240252443 7.92539774763334 -0.379155345108911 T:C C T 10 0.528359849842223 1 ENSG00000148337:ENST00000372954:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000393608:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325721:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000357558:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372948:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000277465:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372938:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000465583:exon_130938630_130938707:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000415526:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000471839:exon_130938630_130938754:CIZ1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 130941121 T/C 1 23 35 58 10.8477234536289 18.4925947444778 -7.64487129084893 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0486097012029335 ENSG00000148337:ENST00000372954:exon_130940988_130941183:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000393608:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325721:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000357558:exon_130940988_130941183:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372948:exon_130940988_130941183:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000277465:exon_130940988_130941183:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372938:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000415526:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000475471:exon_130940648_130941288:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000476239:exon_130940988_130941183:CIZ1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 131285955 A/G 1 5 6 11 2.35820075078889 3.17015909905334 -0.811958348264453 A:G A G 10 0.528359849842223 0.765428811190486 ENSG00000119392:ENST00000309971:exon_131285871_131286125:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000372770:exon_131285871_131286125:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000494417:exon_131285927_131286125:GLE1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 131585069 A/G 1 17 8 25 8.01788255268221 4.22687879873778 3.79100375394443 A:G A G 10 0.528359849842223 0.161132514170427 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131581930_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131584346_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131584370_131585112:C9orf114 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 131586374 G/A 1 12 5 17 5.65968180189332 2.64179924921111 3.01788255268221 A:G G A 10 0.528359849842223 0.154369157381661 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131586371_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000480366:exon_131586351_131586453:C9orf114 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 131588888 G/C 1 4 10 14 1.88656060063111 5.28359849842223 -3.39703789779112 C:G G C 10 0.528359849842223 0.105381577517645 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131588883_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000466556:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467396:exon_131588819_131588908:C9orf114 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 139621120 A/G 1 8 5 13 3.77312120126222 2.64179924921111 1.1313219520511 A:G A G 10 0.528359849842223 0.589076720209571 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 139744524 C/T 1 195 151 346 91.9698292807665 79.7823373261757 12.1874919545909 T:C C T 10 0.528359849842223 0.196444005559336 ENSG00000054148:ENST00000371661:exon_139744465_139744589:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000492540:exon_139744465_139745012:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000247665:exon_139744465_139744589:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000462205:exon_139744465_139744589:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000497413:exon_139744465_139744589:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000463215:exon_139744231_139744589:PHPT1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 139820421 G/A 1 33 27 60 15.5641249552066 14.26571594574 1.29840900946662 A:G G A 10 0.528359849842223 0.79654116728588 ENSG00000127191:ENST00000247668:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000359662:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000432785:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000371645:exon_139820135_139821059:TRAF2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 139836694 C/T 1 23 23 46 10.8477234536289 12.1522765463711 -1.30455309274226 T:C C T 10 0.528359849842223 0.76837168366382 ENSG00000159069:ENST00000325285:exon_139836498_139836918:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000459905:exon_139836552_139836918:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000483559:exon_139836498_139837147:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000487794:exon_139836207_139836918:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000433269:exon_139836498_139836918:FBXW5 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 140006202 G/A 1 193 219 412 91.026548980451 115.710807115447 -24.6842581349959 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0155652470549401 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000470766:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006142_140006206:DPP7 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 140006491 C/T 1 9 3 12 4.24476135141999 1.58507954952667 2.65968180189332 T:C C T 10 0.528359849842223 0.153759275498468 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 140008934 A/G 1 11 8 19 5.18804165173555 4.22687879873778 0.961162852997764 A:G A G 10 0.528359849842223 0.819131241753216 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140008915_140009165:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140008915_140008944:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000472306:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000485456:exon_140008915_140009170:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000478597:exon_140008915_140009178:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000497375:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473703:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000491807:exon_140008695_140009028:DPP7 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 140115554 G/A 1 9 11 20 4.24476135141999 5.81195834826445 -1.56719699684446 A:G G A 10 0.528359849842223 0.509651795713 ENSG00000212864:ENST00000392827:exon_140114707_140115760:RNF208;ENSG00000212864:ENST00000391553:exon_140114707_140115775:RNF208 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 140262426 C/T 1 3 7 10 1.41492045047333 3.69851894889556 -2.28359849842223 T:C C T 10 0.528359849842223 0.206915350075299 ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000490886:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000479452:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487613:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000460390:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000475006:exon_140262017_140262441:EXD3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . 9 140267490 G/A 1 10 5 15 4.71640150157777 2.64179924921111 2.07460225236666 A:G G A 10 0.528359849842223 0.313475377913303 ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000490886:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000479452:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487613:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000460390:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000475006:exon_140267357_140267524:EXD3 HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 200860 T/C 1 5 4 9 2.35820075078889 2.11343939936889 0.244761351419994 T:C T C 10 0.528359849842223 1 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000484611:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000430923:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000445062:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000429181:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000443019:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000415337:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000447472:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000448477:exon_200401_200981:PLCXD1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 221705 G/A 1 124 123 247 58.4833786195644 64.9882615305934 -6.50488291102906 A:G G A 10 0.528359849842223 0.408284714841891 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_221196_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_221191_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_221417_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_221427_221864:GTPBP6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 229542 G/A 1 5 8 13 2.35820075078889 4.22687879873778 -1.8686780479489 A:G G A 10 0.528359849842223 0.406657390173804 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_228086_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_229433_229591:GTPBP6 HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 295069 A/G 0 24 0 24 11.3193636037866 0 11.3193636037866 A A 10 0.528359849842223 2.38712468791883e-07 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 295097 C/T 1 24 1 25 11.3193636037866 0.528359849842223 10.7910037539444 T:C C T 10 0.528359849842223 5.56709099732714e-06 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 295132 T/C 1 21 2 23 9.90444315331332 1.05671969968445 8.84772345362887 T:C T C 10 0.528359849842223 0.000182810342075884 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 295231 A/G 1 22 4 26 10.3760833034711 2.11343939936889 8.2626439041022 A:G A G 10 0.528359849842223 0.00119621644823030 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 299360 G/A 1 19 1 20 8.96116285299776 0.528359849842223 8.43280300315554 A:G G A 10 0.528359849842223 6.11398356751478e-05 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000468169:exon_299348_299631:PPP2R3B HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 1546792 G/A 1 37 44 81 17.4506855558378 23.2478333930578 -5.79714783722006 A:G G A 10 0.528359849842223 0.221047025365419 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 1719897 C/G 1 12 19 31 5.65968180189332 10.0388371470022 -4.37915534510891 C:G C G 10 0.528359849842223 0.149261297974045 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1719552_1721407:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1719552_1721395:AKAP17A HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 1720322 G/A 1 44 49 93 20.7521666069422 25.8896326422689 -5.13746603532674 A:G G A 10 0.528359849842223 0.300177219640624 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1719552_1721407:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1719552_1721395:AKAP17A HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 2139186 C/T 1 24 19 43 11.3193636037866 10.0388371470022 1.28052645678441 T:C C T 10 0.528359849842223 0.761064302771798 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2137557_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2138809_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2138809_2139270:DHRSX HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 2161129 C/G 1 6 8 14 2.82984090094666 4.22687879873778 -1.39703789779112 C:G C G 10 0.528359849842223 0.594448035256428 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000412516:exon_2161103_2161271:DHRSX HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 2632482 C/T 1 63 17 80 29.71332945994 8.98211744731779 20.7312120126222 T:C C T 10 0.528359849842223 2.63465327334389e-06 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381184:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000398818:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000449611:exon_2632463_2632495:CD99 HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 13681115 C/T 1 7 1 8 3.30148105110444 0.528359849842223 2.77312120126222 T:C C T 10 0.528359849842223 0.073836867977041 ENSG00000176896:ENST00000314720:exon_13680620_13682247:TCEANC;ENSG00000176896:ENST00000490617:exon_13680620_13682947:TCEANC;ENSG00000176896:ENST00000380600:exon_13680620_13683528:TCEANC;ENSG00000176896:ENST00000467590:exon_13680863_13681679:TCEANC HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 16859628 G/A 1 10 3 13 4.71640150157777 1.58507954952667 3.1313219520511 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0990276262490944 ENSG00000086712:ENST00000380122:exon_16859551_16862642:TXLNG;ENSG00000086712:ENST00000398155:exon_16859551_16860296:TXLNG;ENSG00000086712:ENST00000485153:exon_16859551_16862642:TXLNG HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 46434164 T/C 1 5 13 18 2.35820075078889 6.8686780479489 -4.51047729716001 T:C T C 10 0.528359849842223 0.0558148062050748 ENSG00000147119:ENST00000276055:exon_46433219_46434858:CHST7 HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 46472826 G/A 1 12 2 14 5.65968180189332 1.05671969968445 4.60296210220888 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0148919960155353 ENSG00000065923:ENST00000328306:exon_46472724_46472829:SLC9A7;ENSG00000065923:ENST00000464933:exon_46472724_46472829:SLC9A7;ENSG00000065923:ENST00000491894:exon_46472724_46472829:SLC9A7 HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 47062534 G/A 1 38 72 110 17.9223257059955 38.0419091886401 -20.1195834826445 A:C:G G A 10 0.528359849842223 0.000121223162210177 ENSG00000130985:ENST00000377351:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000335972:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000424033:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000377271:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000490869:exon_47062533_47062613:UBA1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 48382174 G/T 1 134 48 182 63.1997801211421 25.3612727924267 37.8385073287154 T:G G T 10 0.528359849842223 1.07465447492069e-08 ENSG00000147155:ENST00000495186:exon_48382087_48382460:EBP;ENSG00000147155:ENST00000498425:exon_48382142_48382460:EBP;ENSG00000147155:ENST00000446158:exon_48382087_48382460:EBP;ENSG00000147155:ENST00000414061:exon_48382087_48382460:EBP HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 48418126 A/G 1 16 5 21 7.54624240252443 2.64179924921111 4.90444315331332 A:G A G 10 0.528359849842223 0.0466596726290735 ENSG00000068354:ENST00000376771:exon_48418002_48420997:TBC1D25;ENSG00000068354:ENST00000481090:exon_48418002_48418274:TBC1D25;ENSG00000068354:ENST00000427713:exon_48418002_48419449:TBC1D25 HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 48418659 G/A 1 19 6 25 8.96116285299776 3.17015909905334 5.79100375394443 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0259496009174721 ENSG00000068354:ENST00000376771:exon_48418002_48420997:TBC1D25;ENSG00000068354:ENST00000427713:exon_48418002_48419449:TBC1D25 HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 48751471 A/G 1 110 21 131 51.8804165173555 11.0955568466867 40.7848596706688 A:G A G 10 0.528359849842223 9.81289410172027e-14 ENSG00000126768:ENST00000376582:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000466995:exon_48751183_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000396779:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000495490:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000472645:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000465150:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000490755:exon_48751380_48751508:TIMM17B HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 48838048 T/G 1 12 45 57 5.65968180189332 23.7761932429 -18.1165114410067 T:G T G 10 0.528359849842223 1.53971371296920e-06 ENSG00000068400:ENST00000376425:exon_48838008_48838103:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376444:exon_48838008_48838103:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376441:exon_48838008_48838103:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000473581:exon_48838008_48838103:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376423:exon_48838008_48838103:GRIPAP1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 54836361 A/G 1 75 12 87 35.3730112618333 6.34031819810668 29.0326930637266 A:G A G 10 0.528359849842223 7.95017827773961e-11 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375062:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54836305_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000441374:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000454156:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54836314_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375060:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000485483:exon_54836155_54836565:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54836314_54836646:MAGED2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 54836505 A/G 1 28 5 33 13.2059242044178 2.64179924921111 10.5641249552066 A:G A G 10 0.528359849842223 0.000163936138225979 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375062:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54836305_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000441374:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000454156:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54836314_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375060:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000485483:exon_54836155_54836565:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54836314_54836646:MAGED2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 54837340 C/T 1 41 13 54 19.3372461564689 6.8686780479489 12.46856810852 T:C C T 10 0.528359849842223 0.000579513843332069 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000463787:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54837254_54837563:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54837254_54837562:MAGED2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 54838077 C/T 1 29 10 39 13.6775643545755 5.28359849842223 8.3939658561533 T:C C T 10 0.528359849842223 0.00937160407686927 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375062:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000441374:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000454156:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000463787:exon_54838007_54838077:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375060:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000487482:exon_54837965_54838086:MAGED2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 57475132 T/C 0 8 0 8 3.77312120126222 0 3.77312120126222 T T 10 0.528359849842223 0.00852191332774871 ENSG00000165591:ENST00000374900:exon_57474957_57475151:FAAH2;ENSG00000165591:ENST00000491179:exon_57475115_57475151:FAAH2;ENSG00000165591:ENST00000465623:exon_57474957_57475151:FAAH2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 70324157 C/T 1 1 7 8 0.471640150157777 3.69851894889556 -3.22687879873778 T:C C T 10 0.528359849842223 0.0304648716291925 ENSG00000204165:ENST00000374251:exon_70324148_70324254:CXorf65;ENSG00000204165:ENST00000485951:exon_70324088_70324254:CXorf65;ENSG00000204165:ENST00000466160:exon_70324148_70324298:CXorf65;ENSG00000204165:ENST00000438526:exon_70324088_70324254:CXorf65 HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 71493691 C/T 1 1781 3193 4974 839.991107431001 1687.05300054622 -847.061893115217 T:C:G C T 10 0.528359849842223 9.8936263994288e-129 ENSG00000198034:ENST00000316084:exon_71493651_71493822:RPS4X;ENSG00000198034:ENST00000486733:exon_71493651_71495000:RPS4X HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 71549512 G/C 1 6 18 24 2.82984090094666 9.51047729716001 -6.68063639621335 C:G G C 10 0.528359849842223 0.00718681996701237 ENSG00000147099:ENST00000373573:exon_71549366_71549926:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373583:exon_71549366_71549559:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373589:exon_71549366_71549926:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000429103:exon_71549367_71549926:HDAC8 HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 73072134 T/C 1 68 239 307 32.0715302107288 126.278004112291 -94.2064739015624 T:C T C 10 0.528359849842223 4.14460125914428e-28 HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 102842041 T/C 1 72 332 404 33.9580908113599 175.415470147618 -141.457379336258 T:C T C 10 0.528359849842223 8.42674630779434e-48 ENSG00000133142:ENST00000372629:exon_102841577_102842446:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000414064:exon_102841578_102842653:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000468024:exon_102841577_102842446:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000472484:exon_102841577_102842657:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000415568:exon_102841582_102842430:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000472745:exon_102841577_102842622:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000494801:exon_102841582_102842454:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000452632:exon_102841878_102842251:TCEAL4 HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 118587003 C/T 1 2 15 17 0.943280300315554 7.92539774763334 -6.98211744731779 T:C C T 10 0.528359849842223 0.000854490635954355 ENSG00000077713:ENST00000217909:exon_118586828_118588441:SLC25A43;ENSG00000077713:ENST00000488158:exon_118586918_118588435:SLC25A43;ENSG00000077713:ENST00000326714:exon_118586828_118588435:SLC25A43;ENSG00000077713:ENST00000336249:exon_118586828_118588435:SLC25A43;ENSG00000077713:ENST00000493093:exon_118586828_118587145:SLC25A43 HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 118893054 C/A 1 3 5 8 1.41492045047333 2.64179924921111 -1.22687879873778 A:C C A 10 0.528359849842223 0.488145622466204 ENSG00000187808:ENST00000343905:exon_118892576_118894127:ANKRD58 HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 118893413 T/C 0 0 9 9 0 4.75523864858001 -4.75523864858001 C T C 10 0.528359849842223 0.00115477379681763 ENSG00000187808:ENST00000343905:exon_118892576_118894127:ANKRD58 HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 119590533 T/A 1 6 2 8 2.82984090094666 1.05671969968445 1.77312120126222 A:T T A 10 0.528359849842223 0.29537924054388 ENSG00000005893:ENST00000434600:exon_119590506_119590624:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000200639:exon_119590506_119590624:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000371335:exon_119590506_119590624:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000371345:exon_119590506_119590624:LAMP2 HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 119760629 A/T 1 21 1 22 9.90444315331332 0.528359849842223 9.37608330347109 A:T A T 10 0.528359849842223 1.82548374591351e-05 ENSG00000171155:ENST00000304661:exon_119759648_119761026:C1GALT1C1;ENSG00000171155:ENST00000371313:exon_119759786_119761026:C1GALT1C1 HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 134713855 G/A 1 10 2 12 4.71640150157777 1.05671969968445 3.65968180189333 A:G G A 10 0.528359849842223 0.0422203445745613 ENSG00000165359:ENST00000370752:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000481908:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000356856:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000493637:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000494957:exon_134713810_134714087:DDX26B HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 153051907 G/A 1 8 3 11 3.77312120126222 1.58507954952667 2.18804165173555 A:G G A 10 0.528359849842223 0.234829965499602 HGDP00247_parsed_pileup.txt . X 153762634 G/A 1 12 4 16 5.65968180189332 2.11343939936889 3.54624240252443 A:G G A 10 0.528359849842223 0.084329322912919 ENSG00000160211:ENST00000393562:exon_153762553_153762711:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000291567:exon_153762553_153762711:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000442162:exon_153762553_153762711:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000434882:exon_153762553_153762711:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000393564:exon_153762553_153762711:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000369620:exon_153762553_153762711:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000439227:exon_153762553_153762714:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000440967:exon_153762553_153762714:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000433845:exon_153762553_153762711:G6PD