INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 881627 G/A 1 50 36 86 23.4029200613051 19.1498975558603 4.25302250544486 A:G G A 10 0.531941598773897 0.388280123207261 ENSG00000188976:ENST00000483767:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_881553_881666:NOC2L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 900505 G/C 1 13 12 25 6.08475921593934 6.38329918528676 -0.298539969347426 C:G G C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000187961:ENST00000338591:exon_900343_901095:KLHL17;ENSG00000187961:ENST00000473277:exon_900343_901095:KLHL17 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 984302 T/C 1 9 8 17 4.21252561103493 4.25553279019118 -0.0430071791562492 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_984247_984439:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_984247_984439:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000492947:exon_983909_984439:AGRN HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 990380 C/T 1 32 21 53 14.9778688392353 11.1707735742518 3.80709526498346 T:C C T 10 0.531941598773897 0.336205581962333 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_990204_991496:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_990204_991492:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000461111:exon_990204_991492:AGRN HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 1139202 T/C 1 29 16 45 13.573693635557 8.51106558038235 5.06262805517463 T:C T C 10 0.531941598773897 0.137823616055446 ENSG00000186891:ENST00000328596:exon_1138888_1139340:TNFRSF18;ENSG00000186891:ENST00000379268:exon_1138891_1139348:TNFRSF18 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 1164049 G/A 1 91 93 184 42.5933145115754 49.4705686859724 -6.87725417439705 A:G G A 10 0.531941598773897 0.336954659047746 ENSG00000078808:ENST00000360001:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000465727:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000263741:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000459994:exon_1163848_1164326:SDF4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 1190523 C/T 1 120 125 245 56.1670081471324 66.4926998467371 -10.3256916996048 T:C C T 10 0.531941598773897 0.200409237046623 ENSG00000160087:ENST00000450390:exon_1189289_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000347370:exon_1189294_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000349431:exon_1189850_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000339385:exon_1190304_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000348298:exon_1190304_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000400929:exon_1190365_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000464036:exon_1190428_1190867:UBE2J2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 1231656 G/A 1 7 8 15 3.27640880858272 4.25553279019118 -0.979123981608455 A:G G A 10 0.531941598773897 0.617504794360634 ENSG00000131584:ENST00000354700:exon_1231591_1231660:ACAP3;ENSG00000131584:ENST00000353662:exon_1231591_1231660:ACAP3;ENSG00000131584:ENST00000492936:exon_1231591_1231660:ACAP3;ENSG00000131584:ENST00000467278:exon_1231591_1231660:ACAP3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 1246438 G/A 1 41 28 69 19.1903944502702 14.8943647656691 4.29602968460111 A:G G A 10 0.531941598773897 0.335274045371465 ENSG00000169972:ENST00000379031:exon_1246289_1246451:PUSL1;ENSG00000169972:ENST00000467712:exon_1246289_1246449:PUSL1;ENSG00000169972:ENST00000493657:exon_1245416_1246451:PUSL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 1250957 G/A 1 22 24 46 10.2972848269743 12.7665983705735 -2.46931354359926 A:G G A 10 0.531941598773897 0.555014626360537 ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1250900_1250998:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000323275:exon_1250900_1250998:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000411962:exon_1250900_1250998:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000462432:exon_1250900_1250998:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000421495:exon_1250900_1250998:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1250900_1250998:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000419704:exon_1250900_1250998:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1250900_1250998:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1250900_1250998:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531377:exon_1250900_1250998:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527383:exon_1250900_1250988:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000467408:exon_1250784_1250981:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000533916:exon_1250900_1251077:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000488042:exon_1250900_1250998:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000526797:exon_1250900_1250998:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000526332:exon_1250900_1250998:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000430786:exon_1250900_1250998:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527719:exon_1250900_1250998:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000530031:exon_1250900_1250998:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000526113:exon_1250900_1250998:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000526904:exon_1250526_1250998:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000525603:exon_1250940_1250998:CPSF3L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 1551927 T/C 1 4 6 10 1.87223360490441 3.19164959264338 -1.31941598773897 T:C T C 10 0.531941598773897 0.530535902085358 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000477990:exon_1551888_1554590:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514363:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000502470:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507082:exon_1551888_1553278:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000463492:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000510793:exon_1551654_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1551690_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1551691_1551994:MIB2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 1562536 G/A 1 11 6 17 5.14864241348713 3.19164959264338 1.95699282084375 A:G G A 10 0.531941598773897 0.467371914131112 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378708:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000506488:exon_1562217_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514234:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505370:exon_1562454_1562587:MIB2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 1635565 C/T 1 15 10 25 7.02087601839154 5.31941598773897 1.70146003065257 T:C C T 10 0.531941598773897 0.551956894105179 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000463652:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635478_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468800:exon_1635488_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000464748:exon_1635538_1635585:CDK11A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 1635749 C/A 1 25 22 47 11.7014600306526 11.7027151730257 -0.00125514237315905 A:C C A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635478_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468397:exon_1635662_1635994:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635662_1636041:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000495016:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468800:exon_1635662_1636094:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000464748:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000489300:exon_1635682_1635783:CDK11A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 1684472 C/T 1 29 20 49 13.573693635557 10.6388319754779 2.93486166007905 T:C C T 10 0.531941598773897 0.474675065311661 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1683910_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000498806:exon_1684414_1684499:NADK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 1686040 G/T 1 24 18 42 11.2334016294265 9.57494877793015 1.65845285149632 T:G G T 10 0.531941598773897 0.645434913074799 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000469045:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000480499:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497747:exon_1685983_1686305:NADK;ENSG00000008130:ENST00000477235:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000489538:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497615:exon_1685983_1686335:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497186:exon_1685983_1686137:NADK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 2340200 T/C 1 18 12 30 8.42505122206985 6.38329918528676 2.04175203678309 T:C T C 10 0.531941598773897 0.471800907485699 ENSG00000157911:ENST00000288774:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000447513:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000507596:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000510434:exon_2339895_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000508384:exon_2339969_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000515760:exon_2340022_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000502666:exon_2340043_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000504111:exon_2340074_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000514502:exon_2340194_2340297:PEX10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 2452569 T/C 1 10 11 21 4.68058401226103 5.85135758651287 -1.17077357425184 T:C T C 10 0.531941598773897 0.665565590544789 ENSG00000157881:ENST00000378466:exon_2452540_2452754:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000425477:exon_2452540_2452754:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000486396:exon_2452540_2452754:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000502770:exon_2452540_2453380:PANK4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 3548832 G/C 1 18 9 27 8.42505122206985 4.78747438896507 3.63757683310478 C:G G C 10 0.531941598773897 0.180522865991152 ENSG00000116213:ENST00000270708:exon_3548777_3548902:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378322:exon_3548777_3548902:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378317:exon_3548777_3548902:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378320:exon_3548777_3548902:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000471223:exon_3548450_3553662:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000424367:exon_3548777_3548902:WDR8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 3745924 G/A 1 5 9 14 2.34029200613052 4.78747438896507 -2.44718238283456 A:G G A 10 0.531941598773897 0.283917011510726 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3745830_3745937:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3745830_3745937:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000461667:exon_3745830_3745937:KIAA0562 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 3753136 A/T 1 6 2 8 2.80835040735662 1.06388319754779 1.74446720980882 A:T A T 10 0.531941598773897 0.297069782823554 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3753059_3753256:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3753059_3753256:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494653:exon_3753059_3753256:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000443466:exon_3753059_3753256:KIAA0562 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 3755675 T/C 1 6 2 8 2.80835040735662 1.06388319754779 1.74446720980882 T:C T C 10 0.531941598773897 0.297069782823554 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3755528_3755683:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3755528_3755683:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494653:exon_3755528_3755683:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000428079:exon_3755647_3755683:KIAA0562 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 3761479 C/T 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 T:C C T 10 0.531941598773897 0.730998912113487 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494653:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000428079:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494951:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378223:exon_3761471_3761547:KIAA0562 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 3800242 A/G 1 8 1 9 3.74446720980882 0.531941598773897 3.21252561103493 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0425222470212816 ENSG00000169598:ENST00000378209:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000491998:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000430539:exon_3800071_3801984:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000468793:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000477548:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000339350:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000378206:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000475969:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000448632:exon_3800071_3800305:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000461150:exon_3800071_3800364:DFFB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 6142308 T/C 1 1 9 10 0.468058401226103 4.78747438896507 -4.31941598773897 T:C T C 10 0.531941598773897 0.00805407978646269 ENSG00000069424:ENST00000378111:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378097:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378092:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000428161:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000389632:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000458166:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378087:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000341524:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000352527:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000435937:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000164247:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378083:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000472700:exon_6142255_6142334:KCNAB2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 6158562 A/G 1 52 37 89 24.3390368637574 19.6818391546342 4.65719770912316 A:G A G 10 0.531941598773897 0.340583220246855 ENSG00000069424:ENST00000378097:exon_6158545_6161253:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378092:exon_6158545_6158634:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000341524:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000352527:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000164247:exon_6158545_6161239:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378083:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000481789:exon_6158545_6158870:KCNAB2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 6278414 A/G 1 12 1 13 5.61670081471324 0.531941598773897 5.08475921593934 A:G A G 10 0.531941598773897 0.00421262497881301 ENSG00000158286:ENST00000377948:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000377939:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000496676:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000483336:exon_6278349_6278429:RNF207 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 6279370 G/C 1 7 7 14 3.27640880858272 3.72359119141728 -0.447182382834558 C:G G C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000158286:ENST00000377948:exon_6279296_6281351:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000377939:exon_6279296_6281359:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000496676:exon_6279296_6280865:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000483336:exon_6279296_6279403:RNF207 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 6659505 G/A 1 4 7 11 1.87223360490441 3.72359119141728 -1.85135758651287 A:G G A 10 0.531941598773897 0.36707898879345 ENSG00000162413:ENST00000377658:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000377663:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000467612:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000496707:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000463043:exon_6659107_6659512:KLHL21 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 6693097 A/G 1 13 27 40 6.08475921593934 14.3624231668952 -8.27766395095588 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0105795294223291 ENSG00000041988:ENST00000054650:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000307896:exon_6692856_6693428:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000400912:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000484669:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000487819:exon_6692856_6693181:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000472925:exon_6692451_6693111:THAP3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 6694574 G/A 1 43 47 90 20.1265112527224 25.0012551423732 -4.87474388965073 A:G G A 10 0.531941598773897 0.341949367964384 ENSG00000041988:ENST00000377627:exon_6694080_6695646:THAP3;ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000451196:exon_6694228_6694844:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000465508:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6694228_6695760:DNAJC11 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 6695694 A/G 1 13 11 24 6.08475921593934 5.85135758651287 0.233401629426472 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000465508:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000294401:exon_6695173_6695760:DNAJC11 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 6704635 A/G 1 12 9 21 5.61670081471324 4.78747438896507 0.829226425748162 A:G A G 10 0.531941598773897 0.828237202108702 ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6704618_6704734:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000465508:exon_6704618_6704734:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6704618_6704734:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000294401:exon_6704618_6704734:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000472414:exon_6704618_6704734:DNAJC11 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 6705944 C/T 1 10 12 22 4.68058401226103 6.38329918528676 -1.70271517302573 T:C C T 10 0.531941598773897 0.525263941191058 ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000451196:exon_6705931_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000349363:exon_6705931_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000294401:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000426784:exon_6705860_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000473993:exon_6705936_6706038:DNAJC11 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 7889941 C/T 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 T:C C T 10 0.531941598773897 0.486426237614014 ENSG00000049246:ENST00000377532:exon_7889894_7890221:PER3;ENSG00000049246:ENST00000361923:exon_7889897_7890221:PER3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 10460485 T/C 1 37 63 100 17.3181608453658 33.5123207227555 -16.1941598773897 T:C T C 10 0.531941598773897 0.00127098184520267 ENSG00000142657:ENST00000491493:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000377062:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000477958:exon_10460433_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000465632:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10460450_10460629:PGD HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 10473196 C/T 1 58 66 124 27.147387271114 35.1081455190772 -7.96075824796323 A:T:C C T 10 0.531941598773897 0.176842292690453 ENSG00000142657:ENST00000490057:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000483936:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000493288:exon_10472891_10473308:PGD HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 10596341 C/T 1 4 10 14 1.87223360490441 5.31941598773897 -3.44718238283456 T:C C T 10 0.531941598773897 0.104830012761555 ENSG00000142655:ENST00000472851:exon_10596270_10596629:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000356607:exon_10596270_10596354:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000491661:exon_10596270_10596354:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000492696:exon_10596270_10596346:PEX14 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 10713765 T/C 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000130940:ENST00000377022:exon_10713434_10714275:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000344008:exon_10713434_10714275:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000496432:exon_10713041_10714275:CASZ1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 11854476 T/G 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 T:G T G 10 0.531941598773897 0.486426237614014 ENSG00000177000:ENST00000376592:exon_11854415_11854595:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376583:exon_11854415_11854595:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376590:exon_11854415_11854595:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376585:exon_11854415_11854595:MTHFR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 12009955 C/T 1 5 7 12 2.34029200613052 3.72359119141728 -1.38329918528676 T:C C T 10 0.531941598773897 0.56545794539378 ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000449038:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12009830_12009963:PLOD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 12082334 A/T 1 33 20 53 15.4459272404614 10.6388319754779 4.80709526498346 A:T A T 10 0.531941598773897 0.215800805717494 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12082152_12082499:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12082152_12082499:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12082152_12082499:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12082279_12082499:MIIP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 12082926 A/G 1 23 20 43 10.7653432282004 10.6388319754779 0.126511252722429 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12082921_12082974:MIIP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 12090001 T/C 1 1 12 13 0.468058401226103 6.38329918528676 -5.91524078406066 T:C T C 10 0.531941598773897 0.00108934549731077 ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12089280_12090181:MIIP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 14105298 G/A 1 15 14 29 7.02087601839154 7.44718238283456 -0.426306364443014 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 14107360 T/A 1 6 5 11 2.80835040735662 2.65970799386948 0.148642413487133 A:T T A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 14109114 A/G 1 23 21 44 10.7653432282004 11.1707735742518 -0.405430346051469 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000470057:exon_14107414_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 15904318 C/T 1 13 4 17 6.08475921593934 2.12776639509559 3.95699282084375 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0859338076537107 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15904180_15904359:AGMAT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 15986547 T/C 1 8 1 9 3.74446720980882 0.531941598773897 3.21252561103493 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0425222470212816 ENSG00000197312:ENST00000480945:exon_15986332_15995539:DDI2;ENSG00000197312:ENST00000320153:exon_15986332_15987552:DDI2;ENSG00000215695:ENST00000345034:exon_15986364_15988217:RSC1A1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 16044401 G/A 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 A:G G A 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16044388_16044487:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16044388_16044487:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16044388_16044487:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000462455:exon_16044388_16044487:PLEKHM2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 16056364 G/A 1 24 12 36 11.2334016294265 6.38329918528676 4.85010244413971 A:G G A 10 0.531941598773897 0.132224358079480 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000477849:exon_16056340_16056424:PLEKHM2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 17739586 G/A 1 20 26 46 9.36116802452206 13.8304815681213 -4.46931354359926 A:G G A 10 0.531941598773897 0.236894498951614 ENSG00000179051:ENST00000375436:exon_17739569_17739674:RCC2;ENSG00000179051:ENST00000375433:exon_17739569_17739674:RCC2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 19411129 A/G 1 42 46 88 19.6584528514963 24.4693135435993 -4.81086069210294 A:G A G 10 0.531941598773897 0.336706667044383 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19410998_19411192:UBR4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 19413261 T/A 1 20 37 57 9.36116802452206 19.6818391546342 -10.3206711301121 A:T T A 10 0.531941598773897 0.00749071118925828 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19413173_19413315:UBR4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 19415304 C/T 1 51 52 103 23.8709784625313 27.6609631362426 -3.78998467371139 T:C C T 10 0.531941598773897 0.489940569960636 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19415253_19415471:UBR4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 19433449 A/G 1 21 12 33 9.82922642574816 6.38329918528676 3.4459272404614 A:G A G 10 0.531941598773897 0.295354237162159 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000494503:exon_19433331_19433460:UBR4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 19684006 G/C 1 154 126 280 72.0809937888199 67.024641445511 5.05635234330883 T:C:G G C 10 0.531941598773897 0.549992079684187 ENSG00000077549:ENST00000264203:exon_19683916_19684057:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000375144:exon_19683916_19684057:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000401084:exon_19683916_19684057:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000375145:exon_19683916_19684057:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000401082:exon_19683916_19684057:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000375142:exon_19683916_19684057:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000433834:exon_19683916_19684057:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000264202:exon_19683916_19684057:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000413711:exon_19683916_19684057:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000459967:exon_19683916_19684057:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000457768:exon_19683939_19684057:CAPZB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 19775375 G/A 1 6 2 8 2.80835040735662 1.06388319754779 1.74446720980882 A:G G A 10 0.531941598773897 0.297069782823554 ENSG00000077549:ENST00000264203:exon_19775328_19775824:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000401082:exon_19775328_19775408:CAPZB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 19950062 T/C 1 111 155 266 51.9544825360974 82.450947809954 -30.4964652738566 T:C T C 10 0.531941598773897 0.00021488174403625 ENSG00000173436:ENST00000486890:exon_19949968_19950284:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000322753:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000467029:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000481464:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000498642:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000485362:exon_19949968_19950077:C1orf151 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 20977221 A/T 1 15 8 23 7.02087601839154 4.25553279019118 2.76534322820037 A:T A T 10 0.531941598773897 0.298803195708385 ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 20978832 T/C 1 341 364 705 159.607914818101 193.626741953699 -34.0188271355974 A:T:C T C 10 0.531941598773897 0.0114011882595743 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20978270_20979021:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20978685_20979021:DDOST HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 24083494 C/T 1 20 26 46 9.36116802452206 13.8304815681213 -4.46931354359926 T:C C T 10 0.531941598773897 0.236894498951614 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24083443_24083615:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24083443_24083615:TCEB3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 25291010 A/T 1 14 10 24 6.55281761716544 5.31941598773897 1.23340162942647 A:T A T 10 0.531941598773897 0.685547420411967 ENSG00000020633:ENST00000399916:exon_25291005_25291501:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000428150:exon_25291005_25291501:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000338888:exon_25291005_25291159:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000479341:exon_25291005_25291070:RUNX3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 25572984 T/G 1 21 16 37 9.82922642574816 8.51106558038235 1.31816084536581 T:G T G 10 0.531941598773897 0.742914221594095 ENSG00000117616:ENST00000498238:exon_25572935_25573520:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000243189:exon_25572935_25573520:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000473314:exon_25572935_25573520:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000417642:exon_25572935_25573022:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000475766:exon_25572935_25573026:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000431849:exon_25572935_25573520:C1orf63 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 26153196 C/A 1 13 11 24 6.08475921593934 5.85135758651287 0.233401629426472 A:C C A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000117640:ENST00000424294:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000336146:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000374303:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000432144:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000533762:exon_26153106_26153198:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000529116:exon_26153106_26153211:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000474295:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000488327:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000472643:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000526894:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000478284:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000524618:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000374307:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000525713:exon_26153106_26153198:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000374301:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000464008:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000526158:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000530599:exon_26153106_26153297:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000374300:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000466284:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000497956:exon_26152123_26153317:FAM54B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 26496651 T/C 1 165 217 382 77.229636202307 115.431326933936 -38.2016907316287 T:C T C 10 0.531941598773897 9.42637251838748e-05 ENSG00000142684:ENST00000374266:exon_26496362_26496674:ZNF593;ENSG00000142684:ENST00000270812:exon_26496433_26496674:ZNF593 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 26609259 C/T 1 12 16 28 5.61670081471324 8.51106558038235 -2.89436476566912 T:C C T 10 0.531941598773897 0.344142676441251 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000486658:exon_26609140_26609280:UBXN11 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 26610891 A/C 1 20 11 31 9.36116802452206 5.85135758651287 3.50981043800919 A:C A C 10 0.531941598773897 0.280029533205116 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26610853_26612032:UBXN11 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 26646726 A/G 1 1241 1123 2364 580.860475921594 597.370415423086 -16.5099395014926 A:T:G A G 10 0.531941598773897 0.496522062603624 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 26646730 A/G 1 1237 1117 2354 578.988242316689 594.178765830443 -15.1905235137536 A:G A G 10 0.531941598773897 0.535562475144966 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 26786627 G/A 1 9 9 18 4.21252561103493 4.78747438896507 -0.574948777930146 A:G G A 10 0.531941598773897 0.81714898933323 ENSG00000117682:ENST00000434391:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000357049:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374192:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000525682:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000236342:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000526219:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000360009:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374194:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000430232:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000416052:exon_26786528_26786635:DHDDS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 26883511 A/C 1 19 17 36 8.89310962329596 9.04300717915625 -0.149897555860294 A:C A C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000488985:exon_26883489_26883527:RPS6KA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 26887592 T/C 1 40 30 70 18.7223360490441 15.9582479632169 2.76408808582721 T:C T C 10 0.531941598773897 0.550381743281753 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000403732:exon_26887536_26887625:RPS6KA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 27210722 G/A 1 25 6 31 11.7014600306526 3.19164959264338 8.50981043800919 A:G G A 10 0.531941598773897 0.00194623542091154 ENSG00000142751:ENST00000374135:exon_27210651_27210781:GPN2;ENSG00000142751:ENST00000374133:exon_27210651_27210781:GPN2;ENSG00000142751:ENST00000374131:exon_27210651_27210781:GPN2;ENSG00000142751:ENST00000477418:exon_27210651_27210781:GPN2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 27676925 G/A 1 17 22 39 7.95699282084375 11.7027151730257 -3.74572235218198 A:G G A 10 0.531941598773897 0.262456063529319 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27676880_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27676463_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27675889_27678549:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27675889_27677827:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000496001:exon_27676880_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000485269:exon_27676463_27676976:SYTL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 27679954 G/A 1 51 55 106 23.8709784625313 29.2567879325643 -5.38580947003308 A:G G A 10 0.531941598773897 0.33051240733879 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27677963_27679979:SYTL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 27680292 A/G 1 37 22 59 17.3181608453658 11.7027151730257 5.61544567234008 A:G A G 10 0.531941598773897 0.152843385636766 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27680204_27680421:SYTL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 27736478 T/C 1 11 15 26 5.14864241348713 7.97912398160846 -2.83048156812132 T:C T C 10 0.531941598773897 0.326715412920753 ENSG00000158195:ENST00000430629:exon_27736186_27736700:WASF2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 27942276 G/A 1 31 26 57 14.5098104380092 13.8304815681213 0.67932886988787 A:G G A 10 0.531941598773897 0.895016616370849 ENSG00000000938:ENST00000374005:exon_27942200_27942355:FGR;ENSG00000000938:ENST00000399173:exon_27942200_27942355:FGR;ENSG00000000938:ENST00000374004:exon_27942200_27942355:FGR;ENSG00000000938:ENST00000374003:exon_27942200_27942355:FGR;ENSG00000000938:ENST00000457296:exon_27942200_27942355:FGR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 31215364 T/C 1 88 69 157 41.1891393078971 36.7039703153989 4.48516899249817 T:C T C 10 0.531941598773897 0.522456263078037 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000424259:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000464569:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000476492:exon_31214536_31215396:LAPTM5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 31426815 A/G 1 16 10 26 7.48893441961765 5.31941598773897 2.16951843187868 A:G A G 10 0.531941598773897 0.436884592808153 ENSG00000134644:ENST00000424085:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000257075:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373747:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373749:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000423018:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000525843:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000426105:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000498419:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000440538:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373741:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373742:exon_31426561_31426828:PUM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 31732892 G/A 1 58 68 126 27.147387271114 36.172028716625 -9.02464144551103 A:G G A 10 0.531941598773897 0.108961976049108 ENSG00000060688:ENST00000263694:exon_31732417_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000486941:exon_31732520_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000489853:exon_31732521_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000373720:exon_31732557_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000491106:exon_31732633_31732968:SNRNP40 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 32096265 A/G 1 76 73 149 35.5724384931838 38.8317367104945 -3.25929821731066 A:G A G 10 0.531941598773897 0.622688410968257 ENSG00000162517:ENST00000373703:exon_32095463_32096443:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000461006:exon_32095941_32096333:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000478502:exon_32096050_32096443:PEF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 33960062 A/G 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 A:G A G 10 0.531941598773897 0.730998912113487 ENSG00000121903:ENST00000373411:exon_33959818_33961991:ZSCAN20;ENSG00000121903:ENST00000326544:exon_33959818_33961253:ZSCAN20;ENSG00000121903:ENST00000361328:exon_33959818_33961995:ZSCAN20;ENSG00000121903:ENST00000401072:exon_33959818_33961991:ZSCAN20 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 36602943 C/T 1 1 7 8 0.468058401226103 3.72359119141728 -3.25553279019118 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0296580964656471 ENSG00000054116:ENST00000462715:exon_36602182_36603579:TRAPPC3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 36642420 T/C 1 50 55 105 23.4029200613051 29.2567879325643 -5.85386787125919 T:C T C 10 0.531941598773897 0.282150782802369 ENSG00000116871:ENST00000316156:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373150:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373151:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000474796:exon_36642298_36642435:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000309824:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000530975:exon_36642318_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000487131:exon_36642407_36642443:MAP7D1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 36752152 C/T 1 54 55 109 25.2751536662096 29.2567879325643 -3.98163426635477 T:C C T 10 0.531941598773897 0.444758443999302 ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 36787888 G/A 1 32 22 54 14.9778688392353 11.7027151730257 3.27515366620956 A:G G A 10 0.531941598773897 0.414583913427625 ENSG00000142694:ENST00000270824:exon_36787632_36788326:FAM176B;ENSG00000142694:ENST00000490466:exon_36787882_36788326:FAM176B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 36807481 C/T 1 24 16 40 11.2334016294265 8.51106558038235 2.72233604904412 T:C C T 10 0.531941598773897 0.430738074110928 ENSG00000196182:ENST00000373129:exon_36805225_36807574:STK40;ENSG00000196182:ENST00000359297:exon_36805225_36809049:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373130:exon_36805225_36807574:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373132:exon_36805225_36807574:STK40 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 38148765 A/G 1 7 7 14 3.27640880858272 3.72359119141728 -0.447182382834558 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000116922:ENST00000358011:exon_38147242_38148832:C1orf109;ENSG00000116922:ENST00000494120:exon_38147242_38148832:C1orf109;ENSG00000116922:ENST00000464178:exon_38148408_38148832:C1orf109 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 38329999 C/G 1 8 17 25 3.74446720980882 9.04300717915625 -5.29853996934743 C:G C G 10 0.531941598773897 0.0436233643084444 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38329984_38330095:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38329984_38330095:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38329984_38330095:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38329984_38330095:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38329984_38330095:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000487328:exon_38329984_38330521:INPP5B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 38423853 G/C 1 121 96 217 56.6350665483585 51.0663934822941 5.56867306606434 C:G G C 10 0.531941598773897 0.455250760955227 ENSG00000183431:ENST00000373019:exon_38422647_38423935:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000448721:exon_38423631_38423935:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000487062:exon_38423735_38423935:SF3A3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 39494426 C/T 1 843 703 1546 394.573232233605 373.95494393805 20.6182882955552 T:C C T 10 0.531941598773897 0.296176175897039 ENSG00000168653:ENST00000372969:exon_39494395_39494612:NDUFS5;ENSG00000168653:ENST00000372967:exon_39494395_39494612:NDUFS5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 39908506 G/A 1 4 10 14 1.87223360490441 5.31941598773897 -3.44718238283456 A:G G A 10 0.531941598773897 0.104830012761555 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39908386_39908583:MACF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 39914363 G/C 1 9 8 17 4.21252561103493 4.25553279019118 -0.0430071791562492 C:G G C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39914266_39914435:MACF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 40525813 A/T 0 147 0 147 68.8045849802371 0 68.8045849802371 A A 10 0.531941598773897 6.12703899746662e-41 ENSG00000131236:ENST00000372797:exon_40525739_40525842:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000372802:exon_40525742_40525842:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000449311:exon_40525739_40525842:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000421589:exon_40525739_40525842:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000414281:exon_40525739_40525842:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000420216:exon_40525739_40525842:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000372792:exon_40525739_40525842:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000372798:exon_40525742_40525842:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000340450:exon_40525742_40525842:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000372805:exon_40525739_40525842:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000435719:exon_40525742_40525842:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000430361:exon_40525742_40525830:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000427843:exon_40525739_40525842:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000417287:exon_40525739_40525842:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000424977:exon_40525739_40525842:CAP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 40557033 A/G 1 15 10 25 7.02087601839154 5.31941598773897 1.70146003065257 A:G A G 10 0.531941598773897 0.551956894105179 ENSG00000131238:ENST00000433473:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000372783:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000372776:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000529905:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000530704:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000439754:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000527311:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000372779:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000527107:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000526547:exon_40557001_40557071:PPT1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 40705427 C/G 1 17 16 33 7.95699282084375 8.51106558038235 -0.554072759538601 C:G C G 10 0.531941598773897 0.863259581534653 ENSG00000117000:ENST00000372771:exon_40701464_40706593:RLF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 40768276 C/T 1 5 7 12 2.34029200613052 3.72359119141728 -1.38329918528676 T:C C T 10 0.531941598773897 0.56545794539378 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 40771432 C/T 1 24 17 41 11.2334016294265 9.04300717915625 2.19039445027022 T:C C T 10 0.531941598773897 0.534116506061887 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40771387_40771440:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40771387_40771440:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40771387_40771440:COL9A2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 40773149 T/C 0 13 0 13 6.08475921593934 0 6.08475921593934 T T 10 0.531941598773897 0.000324792060879682 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40773118_40773171:COL9A2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 40773150 G/A 0 13 0 13 6.08475921593934 0 6.08475921593934 G G 10 0.531941598773897 0.000324792060879682 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40773118_40773171:COL9A2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 40980731 G/T 1 11 18 29 5.14864241348713 9.57494877793015 -4.42630636444301 T:G G T 10 0.531941598773897 0.135324510743046 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000420209:exon_40980187_40980894:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000418186:exon_40980187_40980888:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000443729:exon_40980187_40980958:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000419161:exon_40980187_40980958:DEM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 41979156 A/G 1 9 12 21 4.21252561103493 6.38329918528676 -2.17077357425184 A:G A G 10 0.531941598773897 0.386440894347250 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41978487_41979421:HIVEP3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 42880516 T/C 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 T:C T C 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000177181:ENST00000431473:exon_42880155_42880850:RIMKLA;ENSG00000177181:ENST00000372570:exon_42880155_42880830:RIMKLA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 43131653 G/A 1 15 17 32 7.02087601839154 9.04300717915625 -2.02213116076471 A:G G A 10 0.531941598773897 0.484705211465766 ENSG00000171960:ENST00000304979:exon_43131651_43131738:PPIH;ENSG00000171960:ENST00000372550:exon_43131651_43131738:PPIH;ENSG00000171960:ENST00000440068:exon_43131651_43131738:PPIH;ENSG00000171960:ENST00000455203:exon_43131651_43131738:PPIH;ENSG00000171960:ENST00000461351:exon_43131651_43131738:PPIH HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 43395635 C/T 1 8 5 13 3.74446720980882 2.65970799386948 1.08475921593934 T:C C T 10 0.531941598773897 0.591209044900214 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43395544_43395706:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43395544_43395706:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43395544_43395646:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000439722:exon_43395544_43395706:SLC2A1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 43396414 G/A 1 4 7 11 1.87223360490441 3.72359119141728 -1.85135758651287 A:G G A 10 0.531941598773897 0.36707898879345 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43396297_43396537:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43396297_43396537:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000475162:exon_43396297_43396537:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000439722:exon_43396297_43396611:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372500:exon_43395990_43396537:SLC2A1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 43408966 G/A 1 12 4 16 5.61670081471324 2.12776639509559 3.48893441961765 A:G G A 10 0.531941598773897 0.130296081303923 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000415851:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372500:exon_43408897_43408992:SLC2A1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 45269333 A/G 1 8 7 15 3.74446720980882 3.72359119141728 0.0208760183915446 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000173846:ENST00000372201:exon_45269272_45269363:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000465443:exon_45269272_45269363:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000492398:exon_45269272_45269363:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000461358:exon_45269272_45269696:PLK3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 45469155 C/T 1 16 22 38 7.48893441961765 11.7027151730257 -4.21378075340809 T:C C T 10 0.531941598773897 0.194523768358096 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000372168:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486132:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45468220_45469248:HECTD3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 45469586 G/A 1 16 18 34 7.48893441961765 9.57494877793015 -2.0860143583125 A:G G A 10 0.531941598773897 0.496174811226608 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000372168:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486132:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486296:exon_45469527_45469608:HECTD3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 45479709 A/G 1 49 39 88 22.934861660079 20.745722352182 2.18913930789707 A:G A G 10 0.531941598773897 0.670239501655143 ENSG00000126088:ENST00000246337:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000491300:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000434478:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000494399:exon_45479581_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000372135:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460334:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000462688:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000490385:exon_45479581_45479892:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460906:exon_45479247_45479792:UROD;ENSG00000126088:ENST00000469548:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000486699:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000478467:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000496439:exon_45479266_45479810:UROD HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 45797505 C/G 1 15 14 29 7.02087601839154 7.44718238283456 -0.426306364443014 C:G C G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000132781:ENST00000372104:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000448481:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000456914:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000354383:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000475516:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000355498:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372098:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000481571:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372110:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372115:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000528332:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000525481:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000532813:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372100:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000450313:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000426432:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000431970:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000467459:exon_45797333_45797544:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000482094:exon_45797333_45797755:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000533178:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000412971:exon_45797406_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000462388:exon_45797419_45797758:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000466231:exon_45797442_45797521:MUTYH HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 45810923 G/A 1 4 7 11 1.87223360490441 3.72359119141728 -1.85135758651287 A:G G A 10 0.531941598773897 0.36707898879345 ENSG00000070759:ENST00000372084:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000372086:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000341771:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000372083:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000486676:exon_45809556_45811230:TESK2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 46496709 A/G 1 3 9 12 1.40417520367831 4.78747438896507 -3.38329918528676 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0789092376202323 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000432341:exon_46496679_46496709:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46496679_46496962:MAST2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 46500744 G/C 1 18 16 34 8.42505122206985 8.51106558038235 -0.0860143583124984 C:G G C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46500210_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46500501_46501738:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46500499_46501794:MAST2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 46743900 C/T 1 35 23 58 16.3820440429136 12.2346567717996 4.14738727111397 T:C C T 10 0.531941598773897 0.294768350791727 ENSG00000085999:ENST00000442598:exon_46743744_46744145:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000371975:exon_46743744_46744144:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000488942:exon_46743744_46744111:RAD54L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 46746164 C/T 1 44 34 78 20.5945696539485 18.0860143583125 2.50855529563603 T:C C T 10 0.531941598773897 0.650227181396563 ENSG00000132128:ENST00000496156:exon_46746068_46746232:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000343304:exon_46746068_46746232:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000472710:exon_46746068_46746232:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000254454:exon_46746068_46746232:LRRC41 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 46806550 C/T 1 10 4 14 4.68058401226103 2.12776639509559 2.55281761716544 T:C C T 10 0.531941598773897 0.191981298637752 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46805849_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46806397_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46806461_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46806474_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46806492_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000472157:exon_46806501_46806591:NSUN4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 46810670 T/C 1 19 12 31 8.89310962329596 6.38329918528676 2.50981043800919 T:C T C 10 0.531941598773897 0.472209331224685 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46810454_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000475281:exon_46810473_46811046:NSUN4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 46827485 C/T 1 54 23 77 25.2751536662096 12.2346567717996 13.0404968944099 T:C C T 10 0.531941598773897 0.00285734153719704 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46827242_46827863:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46827242_46827862:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46827242_46830824:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46827242_46827862:NSUN4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 52264064 A/G 1 23 25 48 10.7653432282004 13.2985399693474 -2.53319674114706 A:G A G 10 0.531941598773897 0.473511669789107 ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000497358:exon_52263921_52264083:NRD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 52266242 G/A 1 20 23 43 9.36116802452206 12.2346567717996 -2.87348874727757 A:G G A 10 0.531941598773897 0.445428322775795 ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000497358:exon_52266228_52266355:NRD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 52290984 T/G 1 10 12 22 4.68058401226103 6.38329918528676 -1.70271517302573 T:G T G 10 0.531941598773897 0.525263941191058 ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000473805:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000475715:exon_52290969_52291054:NRD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 52498370 C/T 1 17 18 35 7.95699282084375 9.57494877793015 -1.6179559570864 T:C C T 10 0.531941598773897 0.614499880300632 ENSG00000198841:ENST00000371614:exon_52497775_52499488:KTI12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 52498861 A/T 1 23 21 44 10.7653432282004 11.1707735742518 -0.405430346051469 A:T A T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000198841:ENST00000371614:exon_52497775_52499488:KTI12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 52851608 G/A 1 5 7 12 2.34029200613052 3.72359119141728 -1.38329918528676 A:G G A 10 0.531941598773897 0.56545794539378 ENSG00000085840:ENST00000371568:exon_52851524_52851621:ORC1;ENSG00000085840:ENST00000371566:exon_52851524_52851621:ORC1;ENSG00000085840:ENST00000476332:exon_52851524_52851621:ORC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 52882406 A/G 1 74 73 147 34.6363216907316 38.8317367104945 -4.19541501976286 A:G A G 10 0.531941598773897 0.509074006450487 ENSG00000134748:ENST00000257181:exon_52882320_52883992:PRPF38A;ENSG00000134748:ENST00000474048:exon_52882320_52882694:PRPF38A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 52991638 C/T 1 9 6 15 4.21252561103493 3.19164959264338 1.02087601839154 T:C C T 10 0.531941598773897 0.79696986700649 ENSG00000134744:ENST00000257177:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371544:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000433200:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000528642:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000395916:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000473856:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000355809:exon_52991235_52992045:ZCCHC11 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 53072454 T/C 1 10 1 11 4.68058401226103 0.531941598773897 4.14864241348713 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0134938009805301 ENSG00000116157:ENST00000361314:exon_53072356_53072617:GPX7;ENSG00000116157:ENST00000459779:exon_53072356_53073080:GPX7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 53676448 G/A 1 32 24 56 14.9778688392353 12.7665983705735 2.21127046866177 A:G G A 10 0.531941598773897 0.593947977589294 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53675687_53676991:CPT2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 53712727 C/T 1 13 8 21 6.08475921593934 4.25553279019118 1.82922642574816 T:C C T 10 0.531941598773897 0.514430539711333 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53711217_53712728:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000529670:exon_53712628_53712728:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53712225_53712728:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53712240_53712728:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53712240_53712728:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53712630_53712728:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53712690_53712728:LRP8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 53716416 G/A 1 10 3 13 4.68058401226103 1.59582479632169 3.08475921593934 A:G G A 10 0.531941598773897 0.100839397920929 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000529670:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53716362_53716534:LRP8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 53732315 G/T 1 5 8 13 2.34029200613052 4.25553279019118 -1.91524078406066 T:G G T 10 0.531941598773897 0.405859977542485 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000459674:exon_53732145_53734270:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000475501:exon_53732145_53732319:LRP8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 62579907 C/T 1 3 7 10 1.40417520367831 3.72359119141728 -2.31941598773897 T:C C T 10 0.531941598773897 0.205442831458325 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62579725_62580597:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62579725_62579922:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62579725_62580582:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000465798:exon_62579762_62579918:INADL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 64095111 A/G 1 22 15 37 10.2972848269743 7.97912398160846 2.31816084536581 A:G A G 10 0.531941598773897 0.511489396344633 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64095096_64095258:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64095096_64095258:PGM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 64114301 T/C 1 17 30 47 7.95699282084375 15.9582479632169 -8.00125514237316 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0272555560538619 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64114188_64114323:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64114188_64114323:PGM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 65310489 T/C 1 15 12 27 7.02087601839154 6.38329918528676 0.63757683310478 T:C T C 10 0.531941598773897 0.8492386336171 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65310437_65310572:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65310437_65310572:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65310437_65310572:JAK1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 70897857 C/T 1 7 10 17 3.27640880858272 5.31941598773897 -2.04300717915625 T:C C T 10 0.531941598773897 0.341802442613557 ENSG00000116761:ENST00000370938:exon_70897766_70897918:CTH;ENSG00000116761:ENST00000411986:exon_70897766_70897918:CTH;ENSG00000116761:ENST00000346806:exon_70897766_70897918:CTH HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 110170896 T/C 1 17 12 29 7.95699282084375 6.38329918528676 1.57369363555699 T:C T C 10 0.531941598773897 0.582816143128388 ENSG00000116337:ENST00000526301:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000342115:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528667:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000256578:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393689:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000358729:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000369840:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528454:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393688:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000529299:exon_110170705_110171157:AMPD2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 110173775 G/T 1 25 24 49 11.7014600306526 12.7665983705735 -1.06513833992095 T:G G T 10 0.531941598773897 0.776433754395787 ENSG00000116337:ENST00000342115:exon_110173565_110174673:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000256578:exon_110173565_110174673:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393689:exon_110173565_110174320:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000358729:exon_110173565_110174163:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000369840:exon_110173565_110174320:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528454:exon_110173565_110173839:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393688:exon_110173565_110174671:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000476688:exon_110173565_110174190:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528958:exon_110173565_110174122:AMPD2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 110279701 C/T 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 T:C C T 10 0.531941598773897 0.486426237614014 ENSG00000134202:ENST00000256594:exon_110276554_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000361066:exon_110279124_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000486823:exon_110279552_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000476321:exon_110279597_110280189:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000488824:exon_110279598_110279791:GSTM3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 110466338 C/A 1 16 17 33 7.48893441961765 9.04300717915625 -1.5540727595386 A:C C A 10 0.531941598773897 0.605214107466076 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 110466466 T/C 1 24 12 36 11.2334016294265 6.38329918528676 4.85010244413971 T:C T C 10 0.531941598773897 0.132224358079480 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 110466810 C/A 1 12 11 23 5.61670081471324 5.85135758651287 -0.234656771799632 A:C C A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000184371:ENST00000344188:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000420111:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369801:exon_110466682_110466812:CSF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 110888948 G/A 1 33 24 57 15.4459272404614 12.7665983705735 2.67932886988787 A:G G A 10 0.531941598773897 0.509082009950511 ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110888930_110889299:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110888930_110889299:RBM15 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 111778325 C/T 1 13 7 20 6.08475921593934 3.72359119141728 2.36116802452206 T:C C T 10 0.531941598773897 0.371872863862178 ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000528451:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000486561:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000474304:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000477185:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000467038:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497587:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111778261_111778385:CHI3L2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 111783982 C/A 1 11 4 15 5.14864241348713 2.12776639509559 3.02087601839155 A:C C A 10 0.531941598773897 0.129673765714287 ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000472825:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000529459:exon_111783949_111784065:CHI3L2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 111957097 C/G 1 7 4 11 3.27640880858272 2.12776639509559 1.14864241348713 C:G C G 10 0.531941598773897 0.55795959209382 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 111957311 G/C 1 6 3 9 2.80835040735662 1.59582479632169 1.21252561103493 C:G G C 10 0.531941598773897 0.515798041804277 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 111957693 A/G 1 7 3 10 3.27640880858272 1.59582479632169 1.68058401226103 A:G A G 10 0.531941598773897 0.3537387028518 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 120285546 G/A 1 26 17 43 12.1695184318787 9.04300717915625 3.12651125272243 A:G G A 10 0.531941598773897 0.362880097286973 ENSG00000092621:ENST00000369409:exon_120285430_120285667:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000369407:exon_120285430_120285667:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000482968:exon_120285430_120285667:PHGDH HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 144916748 C/G 1 14 2 16 6.55281761716544 1.06388319754779 5.48893441961765 C:G C G 10 0.531941598773897 0.00536230535166799 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144916705_144916749:PDE4DIP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 144917546 A/G 1 10 1 11 4.68058401226103 0.531941598773897 4.14864241348713 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0134938009805301 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144917499_144917636:PDE4DIP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 144922523 C/T 0 9 0 9 4.21252561103493 0 4.21252561103493 C C 10 0.531941598773897 0.00448836920646731 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144922519_144922638:PDE4DIP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 144930940 T/C 0 8 0 8 3.74446720980882 0 3.74446720980882 T T 10 0.531941598773897 0.00871435563033556 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 145103928 G/A 1 30 21 51 14.0417520367831 11.1707735742518 2.87097846253125 A:G G A 10 0.531941598773897 0.483732777794563 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 51 51 0 27.1290215374687 -27.1290215374687 C T C 10 0.531941598773897 1.53215353310363e-17 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 32 32 0 17.0221311607647 -17.0221311607647 T G T 10 0.531941598773897 2.81579760352438e-11 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 33 33 0 17.5540727595386 -17.5540727595386 A C A 10 0.531941598773897 1.31795772448191e-11 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 59 0 59 27.6154456723401 0 27.6154456723401 G G 10 0.531941598773897 6.93862026047721e-17 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 46 46 0 24.4693135435993 -24.4693135435993 C T C 10 0.531941598773897 6.82027777337675e-16 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 65 65 0 34.5762039203033 -34.5762039203033 T C T 10 0.531941598773897 3.71110220214264e-22 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 147092112 G/A 1 7 3 10 3.27640880858272 1.59582479632169 1.68058401226103 A:G G A 10 0.531941598773897 0.3537387028518 ENSG00000116128:ENST00000234739:exon_147090622_147092863:BCL9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 150199123 G/T 1 61 29 90 28.5515624747923 15.426306364443 13.1252561103493 T:G G T 10 0.531941598773897 0.0058373827799197 ENSG00000143401:ENST00000314136:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369116:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000421169:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369119:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000436748:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369115:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000533654:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000534220:exon_150198940_150199127:ANP32E HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 150280550 G/A 1 273 300 573 127.779943534726 159.582479632169 -31.802536097443 A:G G A 10 0.531941598773897 0.00831453191071314 ENSG00000187145:ENST00000309092:exon_150280482_150281414:MRPS21;ENSG00000187145:ENST00000369084:exon_150280482_150281414:MRPS21 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 150445819 A/G 1 25 16 41 11.7014600306526 8.51106558038235 3.19039445027022 A:G A G 10 0.531941598773897 0.350474441250631 ENSG00000163125:ENST00000492220:exon_150443037_150446032:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000401000:exon_150443037_150449042:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000369068:exon_150443037_150446032:RPRD2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 150727539 G/A 1 25 16 41 11.7014600306526 8.51106558038235 3.19039445027022 A:G G A 10 0.531941598773897 0.350474441250631 ENSG00000163131:ENST00000368985:exon_150727477_150727626:CTSS;ENSG00000163131:ENST00000480760:exon_150727477_150727626:CTSS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 151006539 C/A 1 8 5 13 3.74446720980882 2.65970799386948 1.08475921593934 A:C C A 10 0.531941598773897 0.591209044900214 ENSG00000143363:ENST00000271620:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000271619:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000302413:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368937:exon_151006282_151007683:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000431193:exon_151006282_151006589:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368936:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368935:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368934:exon_151006282_151008187:PRUNE HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 151239051 T/C 1 265 266 531 124.035476324917 141.496465273857 -17.4609889489393 T:C:G T C 10 0.531941598773897 0.139201940971974 ENSG00000159352:ENST00000368884:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000368881:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000426273:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000418119:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000476855:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000445776:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000427779:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000470396:exon_151238996_151239201:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000453615:exon_151239020_151239063:PSMD4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 151288172 G/A 1 11 15 26 5.14864241348713 7.97912398160846 -2.83048156812132 A:G G A 10 0.531941598773897 0.326715412920753 ENSG00000143393:ENST00000368874:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368875:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000271657:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368873:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000392756:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000414081:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368872:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000438243:exon_151288116_151288985:PI4KB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 151372138 G/A 1 89 100 189 41.6571977091232 53.1941598773897 -11.5369621682665 A:G G A 10 0.531941598773897 0.094131182756673 ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151372010_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495288:exon_151372036_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495805:exon_151372055_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372063_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151372066_151372203:PSMB4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 151374025 T/C 1 291 204 495 136.204994756796 108.516086149875 27.688908606921 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0131931444188231 ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151374018_151374106:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372457_151374382:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151374018_151374410:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000474100:exon_151373715_151374106:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000466425:exon_151374018_151374106:PSMB4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 151867560 G/A 1 11 4 15 5.14864241348713 2.12776639509559 3.02087601839155 A:G G A 10 0.531941598773897 0.129673765714287 ENSG00000159445:ENST00000368814:exon_151867484_151867670:THEM4;ENSG00000159445:ENST00000471464:exon_151867484_151867670:THEM4;ENSG00000159445:ENST00000344296:exon_151867484_151867670:THEM4;ENSG00000159445:ENST00000489410:exon_151867306_151867670:THEM4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 151881885 A/C 1 9 2 11 4.21252561103493 1.06388319754779 3.14864241348713 A:C A C 10 0.531941598773897 0.0713639747063953 ENSG00000159445:ENST00000368814:exon_151881836_151882284:THEM4;ENSG00000159445:ENST00000471464:exon_151881836_151881978:THEM4;ENSG00000159445:ENST00000344296:exon_151881836_151882113:THEM4;ENSG00000159445:ENST00000489410:exon_151881836_151882113:THEM4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 153909069 G/C 1 8 5 13 3.74446720980882 2.65970799386948 1.08475921593934 C:G G C 10 0.531941598773897 0.591209044900214 ENSG00000198837:ENST00000361217:exon_153909018_153909224:DENND4B;ENSG00000198837:ENST00000368646:exon_153909018_153909224:DENND4B;ENSG00000198837:ENST00000477746:exon_153909018_153909118:DENND4B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 153920564 A/G 1 79 86 165 36.9766136968621 45.7469774945551 -8.77036379769301 A:G A G 10 0.531941598773897 0.184866031858107 ENSG00000160741:ENST00000303569:exon_153920145_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368630:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153920154_153920805:CRTC2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 153926078 T/C 1 10 14 24 4.68058401226103 7.44718238283456 -2.76659837057353 T:C T C 10 0.531941598773897 0.30822661421643 ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000476883:exon_153926014_153926082:CRTC2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 154744807 C/G 1 14 3 17 6.55281761716544 1.59582479632169 4.95699282084375 C:G C G 10 0.531941598773897 0.0256055687201512 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 154919080 C/T 1 26 27 53 12.1695184318787 14.3624231668952 -2.19290473501654 T:C C T 10 0.531941598773897 0.583443066371679 ENSG00000163346:ENST00000368465:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000368463:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000351146:exon_154918455_154919279:PBXIP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 154987706 G/A 1 15 16 31 7.02087601839154 8.51106558038235 -1.49018956199081 A:G G A 10 0.531941598773897 0.595424051385011 ENSG00000160685:ENST00000368426:exon_154987131_154988290:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000487542:exon_154987131_154987785:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000417934:exon_154987131_154988290:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000292176:exon_154986924_154988290:ZBTB7B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 155300382 G/A 1 23 12 35 10.7653432282004 6.38329918528676 4.3820440429136 A:G G A 10 0.531941598773897 0.174979343497450 ENSG00000160753:ENST00000368354:exon_155300194_155300903:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000368352:exon_155300194_155300905:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000392405:exon_155300194_155300903:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000292253:exon_155300194_155300903:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000368347:exon_155300194_155300905:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000462780:exon_155300194_155300520:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000368349:exon_155300194_155300903:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000490373:exon_155300194_155300521:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000471876:exon_155300194_155300905:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000292254:exon_155300194_155300905:RUSC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 156104292 G/A 1 131 97 228 61.3156505606195 51.598335081068 9.71731547955148 A:G G A 10 0.531941598773897 0.20760587326632 ENSG00000160789:ENST00000368301:exon_156104194_156104319:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000347559:exon_156104194_156104319:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000361308:exon_156104194_156104319:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368300:exon_156104194_156104319:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000292302:exon_156104194_156104319:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392355:exon_156104194_156104319:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368299:exon_156104194_156104319:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000502357:exon_156104194_156104319:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000448611:exon_156104194_156104319:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000515459:exon_156104194_156104319:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368297:exon_156104194_156104319:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000504687:exon_156104194_156104319:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000473598:exon_156104194_156104319:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392353:exon_156104194_156104319:LMNA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 156105028 T/C 1 64 85 149 29.9557376784706 45.2150358957812 -15.2592982173107 A:T:C T C 10 0.531941598773897 0.0136128941471209 ENSG00000160789:ENST00000368301:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000347559:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000361308:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368300:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000292302:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392355:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368299:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000448611:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368297:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000473598:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392353:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000515824:exon_156104978_156105199:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368298:exon_156104904_156105103:LMNA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 156106185 T/C 1 150 192 342 70.2087601839154 102.132786964588 -31.9240267806728 T:C T C 10 0.531941598773897 0.000621503715170335 ENSG00000160789:ENST00000368301:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000347559:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000361308:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368300:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000292302:exon_156106005_156106188:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368299:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000448611:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368297:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000473598:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392353:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368298:exon_156106005_156107058:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000498722:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000508500:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000459904:exon_156106084_156106819:LMNA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 156146218 C/T 1 20 25 45 9.36116802452206 13.2985399693474 -3.93737194482537 T:C C T 10 0.531941598773897 0.295691926789102 ENSG00000196189:ENST00000355014:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368285:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368284:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368283:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368286:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368282:exon_156146196_156147543:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000484155:exon_156146196_156146447:SEMA4A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 156202173 A/G 1 35 28 63 16.3820440429136 14.8943647656691 1.48767927724449 A:G A G 10 0.531941598773897 0.800915918937566 ENSG00000160783:ENST00000490491:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368279:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000466489:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368277:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368276:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000320139:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000497069:exon_156202111_156202216:PMF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 156697301 A/G 1 24 23 47 11.2334016294265 12.2346567717996 -1.00125514237316 A:G A G 10 0.531941598773897 0.77245107664601 ENSG00000143319:ENST00000313146:exon_156696698_156698227:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000368219:exon_156696698_156697561:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000470713:exon_156697003_156697561:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000469074:exon_156697034_156697600:ISG20L2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 156703888 C/T 1 9 6 15 4.21252561103493 3.19164959264338 1.02087601839154 T:C C T 10 0.531941598773897 0.79696986700649 ENSG00000143303:ENST00000368216:exon_156703801_156704285:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000519086:exon_156703801_156704262:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000462397:exon_156703801_156703933:C1orf66 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 156713631 C/T 1 142 104 246 66.4642929741066 55.3219262724853 11.1423667016213 T:C C T 10 0.531941598773897 0.160183692105610 ENSG00000143321:ENST00000357325:exon_156713444_156713670:HDGF;ENSG00000143321:ENST00000368209:exon_156713444_156713670:HDGF;ENSG00000143321:ENST00000465180:exon_156713444_156713670:HDGF;ENSG00000143321:ENST00000482651:exon_156713444_156713670:HDGF;ENSG00000143321:ENST00000477306:exon_156713099_156713670:HDGF;ENSG00000143321:ENST00000368206:exon_156713444_156713670:HDGF;ENSG00000143321:ENST00000469145:exon_156713501_156713670:HDGF;ENSG00000143321:ENST00000471377:exon_156713595_156713670:HDGF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 158813819 A/G 1 19 35 54 8.89310962329596 18.6179559570864 -9.72484633379044 A:G A G 10 0.531941598773897 0.00919367652896923 ENSG00000163563:ENST00000368141:exon_158813745_158813912:MNDA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 158986477 G/C 1 157 122 279 73.4851689924982 64.8968750504154 8.58829394208274 C:G G C 10 0.531941598773897 0.308444473842859 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000447473:exon_158986323_158986482:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158986323_158986490:IFI16 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 158988270 T/C 1 114 141 255 53.3586577397757 75.0037654271195 -21.6451076873437 T:C T C 10 0.531941598773897 0.00692448100518747 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158988019_158988441:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158988019_158988441:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158988019_158988441:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158988019_158988441:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_158988019_158988441:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158988019_158988441:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158988019_158988441:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158988019_158988441:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158988019_158988441:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_158988019_158988441:IFI16 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 159002377 C/A 1 104 78 182 48.6780737275147 41.491444704364 7.18662902315074 A:C C A 10 0.531941598773897 0.298971916351502 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 159002389 T/A 1 95 70 165 44.4655481164798 37.2359119141728 7.22963620230699 A:T T A 10 0.531941598773897 0.275216541036268 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 159021506 C/T 1 108 110 218 50.5503073324191 58.5135758651287 -7.96326853270955 A:T:C C T 10 0.531941598773897 0.308666260232659 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159021469_159021888:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159021469_159021888:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159021469_159023514:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159021469_159023514:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159021469_159021888:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159021469_159021888:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159021469_159021888:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159021469_159021888:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159021469_159021888:IFI16 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 160303416 G/A 1 6 15 21 2.80835040735662 7.97912398160846 -5.17077357425184 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0281796668922795 ENSG00000122218:ENST00000368069:exon_160303393_160303469:COPA;ENSG00000122218:ENST00000241704:exon_160303393_160303469:COPA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 160327865 C/T 1 9 9 18 4.21252561103493 4.78747438896507 -0.574948777930146 T:C C T 10 0.531941598773897 0.81714898933323 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 160616703 G/T 1 65 43 108 30.4237960796967 22.8734887472776 7.55030733241912 T:G G T 10 0.531941598773897 0.149332876144529 ENSG00000117090:ENST00000302035:exon_160616660_160617085:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000235739:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000497223:exon_160616660_160616869:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000392208:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000355199:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000494463:exon_160616660_160616811:SLAMF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 161143674 C/T 1 16 12 28 7.48893441961765 6.38329918528676 1.10563523433088 T:C C T 10 0.531941598773897 0.709170099536473 ENSG00000158850:ENST00000319769:exon_161143649_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000470882:exon_161143395_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000407555:exon_161143649_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000310413:exon_161143649_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000367998:exon_161143649_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000367997:exon_161143649_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000466504:exon_161143649_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000465740:exon_161143649_161143839:B4GALT3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 161183516 C/T 1 98 69 167 45.8697233201581 36.7039703153989 9.1657530047592 T:C C T 10 0.531941598773897 0.163196703170179 ENSG00000158864:ENST00000367993:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000392179:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000483804:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000465923:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000493849:exon_161183439_161184086:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000468828:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000492153:exon_161183439_161183522:NDUFS2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 161721707 C/T 1 8 7 15 3.74446720980882 3.72359119141728 0.0208760183915446 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000081721:ENST00000367943:exon_161721656_161721774:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000464004:exon_161721656_161721774:DUSP12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 161928327 A/G 1 35 20 55 16.3820440429136 10.6388319754779 5.74321206743567 A:G A G 10 0.531941598773897 0.137493687895451 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161928236_161933860:ATF6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 165667781 T/G 1 7 3 10 3.27640880858272 1.59582479632169 1.68058401226103 T:G T G 10 0.531941598773897 0.3537387028518 ENSG00000143149:ENST00000354775:exon_165667615_165668100:ALDH9A1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 165697341 G/A 1 51 41 92 23.8709784625313 21.8096055497298 2.06137291280147 A:G G A 10 0.531941598773897 0.677714010717102 ENSG00000143183:ENST00000367881:exon_165696032_165697358:TMCO1;ENSG00000143183:ENST00000464650:exon_165696775_165697358:TMCO1;ENSG00000143183:ENST00000392129:exon_165696779_165697358:TMCO1;ENSG00000143183:ENST00000476143:exon_165696828_165697358:TMCO1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 166818566 A/G 1 13 3 16 6.08475921593934 1.59582479632169 4.48893441961765 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0254032968003037 ENSG00000143157:ENST00000367876:exon_166818175_166819660:POGK;ENSG00000143157:ENST00000367875:exon_166818175_166823710:POGK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 173907812 C/T 1 4 8 12 1.87223360490441 4.25553279019118 -2.38329918528676 T:C C T 10 0.531941598773897 0.247137734070613 ENSG00000135870:ENST00000367696:exon_173900352_173908009:RC3H1;ENSG00000135870:ENST00000258349:exon_173900352_173908009:RC3H1;ENSG00000135870:ENST00000367694:exon_173907549_173908012:RC3H1;ENSG00000135870:ENST00000479099:exon_173907714_173908009:RC3H1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 174188285 G/A 1 13 7 20 6.08475921593934 3.72359119141728 2.36116802452206 A:G G A 10 0.531941598773897 0.371872863862178 ENSG00000152061:ENST00000357444:exon_174188263_174188322:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000367689:exon_174188263_174188322:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000251507:exon_174188263_174188433:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000457696:exon_174188263_174188433:RABGAP1L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 179051300 T/C 1 54 39 93 25.2751536662096 20.745722352182 4.52943131402758 T:C T C 10 0.531941598773897 0.35227675565502 ENSG00000186283:ENST00000367627:exon_179050512_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000367625:exon_179051205_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000483887:exon_179051213_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000352445:exon_179051221_179051522:TOR3A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 179310439 C/T 1 5 5 10 2.34029200613052 2.65970799386948 -0.31941598773897 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179310163_179310445:SOAT1;ENSG00000057252:ENST00000426956:exon_179310163_179310445:SOAT1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 180124288 G/C 1 9 6 15 4.21252561103493 3.19164959264338 1.02087601839154 C:G G C 10 0.531941598773897 0.79696986700649 ENSG00000116260:ENST00000392029:exon_180123968_180124307:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367602:exon_180123969_180124307:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367600:exon_180124032_180124307:QSOX1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 181024404 G/A 1 24 16 40 11.2334016294265 8.51106558038235 2.72233604904412 A:G G A 10 0.531941598773897 0.430738074110928 ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181024361_181024659:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181024361_181024420:MR1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 181058313 G/A 1 12 22 34 5.61670081471324 11.7027151730257 -6.0860143583125 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0397380410649896 ENSG00000162783:ENST00000367577:exon_181057638_181059977:IER5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 182356399 A/G 1 25 29 54 11.7014600306526 15.426306364443 -3.72484633379044 A:G A G 10 0.531941598773897 0.341026372089542 ENSG00000135821:ENST00000331872:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000417584:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000311223:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000435013:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000339526:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000491322:exon_182352029_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000484996:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000489818:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000475808:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000480604:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000462444:exon_182355910_182356427:GLUL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 183094547 T/C 1 2 6 8 0.936116802452206 3.19164959264338 -2.25553279019118 T:C T C 10 0.531941598773897 0.158093130392085 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183094532_183094685:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000466964:exon_183094323_183094685:LAMC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 183105534 T/C 1 15 9 24 7.02087601839154 4.78747438896507 2.23340162942647 T:C T C 10 0.531941598773897 0.417145388014034 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183105521_183105720:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000495918:exon_183105521_183105720:LAMC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 183105705 G/A 1 18 14 32 8.42505122206985 7.44718238283456 0.977868839235295 A:G G A 10 0.531941598773897 0.859785955880876 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183105521_183105720:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000495918:exon_183105521_183105720:LAMC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 183515428 G/A 1 11 14 25 5.14864241348713 7.44718238283456 -2.29853996934743 A:G G A 10 0.531941598773897 0.424506026287143 ENSG00000116698:ENST00000367537:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000458370:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000367539:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000392015:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000413782:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000508461:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000347615:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000507469:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000515829:exon_183515101_183515472:SMG7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 183542387 T/C 1 10 17 27 4.68058401226103 9.04300717915625 -4.36242316689522 T:C T C 10 0.531941598773897 0.121756299423964 ENSG00000116701:ENST00000367536:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000392014:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000413720:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000367535:exon_183542320_183542427:NCF2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 184023529 A/C 1 15 5 20 7.02087601839154 2.65970799386948 4.36116802452206 A:C A C 10 0.531941598773897 0.0708766260039903 ENSG00000198860:ENST00000361641:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000485209:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000533373:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000367518:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000423085:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000462677:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000457455:exon_184023495_184023569:TSEN15 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 184764681 G/A 1 14 9 23 6.55281761716544 4.78747438896507 1.76534322820037 A:G G A 10 0.531941598773897 0.534173096135566 ENSG00000135842:ENST00000367511:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000392012:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000487074:exon_184763252_184765231:FAM129A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 184764824 C/T 1 15 12 27 7.02087601839154 6.38329918528676 0.63757683310478 T:C C T 10 0.531941598773897 0.8492386336171 ENSG00000135842:ENST00000367511:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000392012:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000487074:exon_184763252_184765231:FAM129A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 184765072 A/G 1 5 9 14 2.34029200613052 4.78747438896507 -2.44718238283456 A:G A G 10 0.531941598773897 0.283917011510726 ENSG00000135842:ENST00000367511:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000392012:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000487074:exon_184763252_184765231:FAM129A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 184801065 T/C 1 3 6 9 1.40417520367831 3.19164959264338 -1.78747438896507 T:C T C 10 0.531941598773897 0.320650472569791 ENSG00000135842:ENST00000367511:exon_184800981_184801096:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000392012:exon_184800981_184801096:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000487074:exon_184800981_184801096:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000461167:exon_184800981_184801096:FAM129A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 197070442 G/T 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 T:G G T 10 0.531941598773897 0.730998912113487 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000445725:exon_197069561_197070645:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 197070697 T/C 1 11 7 18 5.14864241348713 3.72359119141728 1.42505122206985 T:C T C 10 0.531941598773897 0.638380509834863 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 197070707 G/A 1 12 7 19 5.61670081471324 3.72359119141728 1.89310962329596 A:G G A 10 0.531941598773897 0.492334878036868 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 197070776 C/T 1 5 6 11 2.34029200613052 3.19164959264338 -0.851357586512867 T:C C T 10 0.531941598773897 0.764860318695721 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 200522775 A/T 1 10 11 21 4.68058401226103 5.85135758651287 -1.17077357425184 A:T A T 10 0.531941598773897 0.665565590544789 ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200520628_200522895:KIF14 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 200558363 T/C 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 T:C T C 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200558345_200558497:KIF14 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 200635550 T/C 1 11 6 17 5.14864241348713 3.19164959264338 1.95699282084375 T:C T C 10 0.531941598773897 0.467371914131112 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000436897:exon_200635387_200635879:DDX59 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 200635560 T/C 1 13 9 22 6.08475921593934 4.78747438896507 1.29728482697427 T:C T C 10 0.531941598773897 0.6717023671041 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000436897:exon_200635387_200635879:DDX59 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 201112981 A/G 1 22 18 40 10.2972848269743 9.57494877793015 0.72233604904412 A:G A G 10 0.531941598773897 0.874959579214964 ENSG00000116857:ENST00000367334:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367332:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367330:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367329:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367333:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000472411:exon_201112948_201114796:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000263947:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000421960:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000485839:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000495205:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000497582:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000455367:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000435310:exon_201112948_201113079:TMEM9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 201934578 G/A 1 44 37 81 20.5945696539485 19.6818391546342 0.912730499314343 A:G G A 10 0.531941598773897 0.911468598925405 ENSG00000134375:ENST00000367287:exon_201934561_201934671:TIMM17A;ENSG00000134375:ENST00000478378:exon_201934561_201934671:TIMM17A;ENSG00000134375:ENST00000482943:exon_201934561_201934671:TIMM17A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 201969082 G/A 1 41 22 63 19.1903944502702 11.7027151730257 7.48767927724449 A:G G A 10 0.531941598773897 0.076309390571571 ENSG00000176393:ENST00000481780:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492587:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000447312:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000478617:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492849:exon_201969030_201969143:RNPEP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 202705455 G/C 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 C:G G C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000117139:ENST00000367265:exon_202705341_202705520:KDM5B;ENSG00000117139:ENST00000367264:exon_202705341_202705520:KDM5B;ENSG00000117139:ENST00000235790:exon_202705341_202705520:KDM5B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 202931743 A/G 1 8 12 20 3.74446720980882 6.38329918528676 -2.63883197547794 A:G A G 10 0.531941598773897 0.267702187700883 ENSG00000159348:ENST00000367249:exon_202930997_202931827:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000497655:exon_202931004_202932293:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000482572:exon_202931675_202931827:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000483915:exon_202931678_202931827:CYB5R1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 202935911 T/C 1 8 11 19 3.74446720980882 5.85135758651287 -2.10689037670404 T:C T C 10 0.531941598773897 0.365044702459487 ENSG00000159348:ENST00000367249:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000482572:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000473599:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000478009:exon_202935877_202936026:CYB5R1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 202936329 C/T 1 9 12 21 4.21252561103493 6.38329918528676 -2.17077357425184 T:C C T 10 0.531941598773897 0.386440894347250 ENSG00000159348:ENST00000367249:exon_202936319_202936408:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000482572:exon_202936319_202936371:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000473599:exon_202936319_202936403:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000478009:exon_202936319_202936353:CYB5R1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 206647787 T/C 1 9 8 17 4.21252561103493 4.25553279019118 -0.0430071791562492 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000143466:ENST00000367120:exon_206647674_206647814:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000463979:exon_206647674_206647814:IKBKE HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 206757857 C/A 1 15 19 34 7.02087601839154 10.106890376704 -3.0860143583125 A:C C A 10 0.531941598773897 0.306815928235480 ENSG00000136653:ENST00000355294:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000367117:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000338603:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000367118:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000435226:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000304534:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000491368:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000481486:exon_206757807_206758627:RASSF5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 206905043 C/T 1 25 33 58 11.7014600306526 17.5540727595386 -5.85261272888603 T:C C T 10 0.531941598773897 0.147425938129722 ENSG00000162889:ENST00000294981:exon_206904985_206905070:MAPKAPK2;ENSG00000162889:ENST00000367103:exon_206904985_206905070:MAPKAPK2;ENSG00000162889:ENST00000479009:exon_206904633_206905070:MAPKAPK2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 207087435 C/T 1 80 85 165 37.4446720980882 45.2150358957812 -7.77036379769301 T:C C T 10 0.531941598773897 0.242112053642998 ENSG00000162894:ENST00000420007:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000367091:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000463473:exon_207087207_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000525793:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000529560:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000533312:exon_207086977_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000530505:exon_207087146_207087439:FAIM3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 207646322 G/A 1 21 14 35 9.82922642574816 7.44718238283456 2.3820440429136 A:G G A 10 0.531941598773897 0.499178152043228 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207646218_207646524:CR2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 207646462 G/A 1 10 9 19 4.68058401226103 4.78747438896507 -0.106890376704043 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207646218_207646524:CR2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 207653395 C/A 1 5 7 12 2.34029200613052 3.72359119141728 -1.38329918528676 A:C C A 10 0.531941598773897 0.56545794539378 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207653323_207653398:CR2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 211846876 A/G 1 14 5 19 6.55281761716544 2.65970799386948 3.89310962329596 A:G A G 10 0.531941598773897 0.105556053498551 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211846825_211847065:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211846825_211847065:NEK2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 214787130 G/A 1 11 5 16 5.14864241348713 2.65970799386948 2.48893441961765 A:G G A 10 0.531941598773897 0.316542725286372 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214787057_214787259:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000464322:exon_214787057_214787259:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000495259:exon_214787057_214787236:CENPF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 214811244 C/G 0 0 8 8 0 4.25553279019118 -4.25553279019118 G C G 10 0.531941598773897 0.00230356440294974 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214811209_214811344:CENPF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 214813487 A/G 1 14 12 26 6.55281761716544 6.38329918528676 0.169518431878677 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 214813782 A/G 1 8 11 19 3.74446720980882 5.85135758651287 -2.10689037670404 A:G A G 10 0.531941598773897 0.365044702459487 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 214813941 C/G 1 10 12 22 4.68058401226103 6.38329918528676 -1.70271517302573 C:G C G 10 0.531941598773897 0.525263941191058 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 214814125 G/A 1 10 11 21 4.68058401226103 5.85135758651287 -1.17077357425184 A:G G A 10 0.531941598773897 0.665565590544789 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 214814571 C/T 1 7 8 15 3.27640880858272 4.25553279019118 -0.979123981608455 T:C C T 10 0.531941598773897 0.617504794360634 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 214814582 G/A 1 9 6 15 4.21252561103493 3.19164959264338 1.02087601839154 A:G G A 10 0.531941598773897 0.79696986700649 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 214814733 T/G 1 14 11 25 6.55281761716544 5.85135758651287 0.701460030652575 T:G T G 10 0.531941598773897 0.843014210420399 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 214814778 G/A 1 11 6 17 5.14864241348713 3.19164959264338 1.95699282084375 A:G G A 10 0.531941598773897 0.467371914131112 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 214814925 C/T 1 6 6 12 2.80835040735662 3.19164959264338 -0.383299185286765 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 214814995 C/T 1 9 6 15 4.21252561103493 3.19164959264338 1.02087601839154 T:C C T 10 0.531941598773897 0.79696986700649 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 214815916 T/C 1 7 1 8 3.27640880858272 0.531941598773897 2.74446720980882 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0747852262017061 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 214816224 G/A 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 214818215 G/A 1 19 13 32 8.89310962329596 6.91524078406066 1.97786883923529 A:G G A 10 0.531941598773897 0.595907192228062 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 214818223 T/A 1 19 13 32 8.89310962329596 6.91524078406066 1.97786883923529 A:T T A 10 0.531941598773897 0.595907192228062 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 214818548 C/T 1 13 14 27 6.08475921593934 7.44718238283456 -1.36242316689522 T:C C T 10 0.531941598773897 0.700745604151725 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 214818846 A/G 1 13 13 26 6.08475921593934 6.91524078406066 -0.830481568121323 A:G A G 10 0.531941598773897 0.844915066483025 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 214818945 A/C 1 20 17 37 9.36116802452206 9.04300717915625 0.31816084536581 A:C A C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 214819044 C/T 1 20 18 38 9.36116802452206 9.57494877793015 -0.213780753408086 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 214819328 G/A 1 25 26 51 11.7014600306526 13.8304815681213 -2.12902153746875 A:G G A 10 0.531941598773897 0.576796488483639 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 214819587 A/G 1 19 24 43 8.89310962329596 12.7665983705735 -3.87348874727757 A:G A G 10 0.531941598773897 0.284893009772104 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 214819980 C/T 1 22 23 45 10.2972848269743 12.2346567717996 -1.93737194482537 T:C C T 10 0.531941598773897 0.654562986523687 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 214820099 A/G 1 20 25 45 9.36116802452206 13.2985399693474 -3.93737194482537 A:G A G 10 0.531941598773897 0.295691926789102 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 214820299 A/G 1 21 15 36 9.82922642574816 7.97912398160846 1.85010244413971 A:G A G 10 0.531941598773897 0.617609790822367 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 214820494 G/A 1 29 26 55 13.573693635557 13.8304815681213 -0.256787932564336 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 214820524 T/C 1 42 36 78 19.6584528514963 19.1498975558603 0.508555295636032 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 214830617 A/G 1 29 42 71 13.573693635557 22.3415471485037 -8.76785351294669 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0427949777870684 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214830276_214830752:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000469862:exon_214830276_214830753:CENPF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 214837110 C/G 1 59 45 104 27.6154456723401 23.9373719448254 3.67807372751471 C:G C G 10 0.531941598773897 0.492766663481267 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214836934_214837931:CENPF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 220154768 C/T 1 14 8 22 6.55281761716544 4.25553279019118 2.29728482697427 T:C C T 10 0.531941598773897 0.395573885710113 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220154720_220154799:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220154720_220154799:EPRS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 220197625 G/T 1 18 27 45 8.42505122206985 14.3624231668952 -5.93737194482537 T:G G T 10 0.531941598773897 0.099319351048208 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220197606_220197798:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220197606_220197798:EPRS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 221912361 T/C 1 13 19 32 6.08475921593934 10.106890376704 -4.02213116076471 T:C T C 10 0.531941598773897 0.161051411561187 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000418487:exon_221912276_221912783:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 221912808 T/C 1 12 9 21 5.61670081471324 4.78747438896507 0.829226425748162 T:C T C 10 0.531941598773897 0.828237202108702 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 225607144 C/T 1 4 7 11 1.87223360490441 3.72359119141728 -1.85135758651287 T:C C T 10 0.531941598773897 0.36707898879345 ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000425080:exon_225606965_225607154:LBR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 225609884 A/G 1 6 7 13 2.80835040735662 3.72359119141728 -0.915240784060662 A:G A G 10 0.531941598773897 0.782547085779911 ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225609779_225609979:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225609779_225609979:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225609813_225609979:LBR;ENSG00000143815:ENST00000425080:exon_225609779_225609979:LBR;ENSG00000143815:ENST00000488632:exon_225609779_225610129:LBR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 226034909 G/A 1 7 6 13 3.27640880858272 3.19164959264338 0.0847592159393384 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226034735_226034914:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000496025:exon_226034735_226035166:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000482753:exon_226034840_226034914:TMEM63A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 226352498 T/G 1 6 8 14 2.80835040735662 4.25553279019118 -1.44718238283456 T:G T G 10 0.531941598773897 0.594012234271892 ENSG00000182827:ENST00000366812:exon_226352490_226352630:ACBD3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 226570748 G/T 1 66 95 161 30.8918544809228 50.5344518835202 -19.6425974025974 T:G G T 10 0.531941598773897 0.00202435480499961 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226570737_226570884:PARP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 226573364 A/G 1 88 70 158 41.1891393078971 37.2359119141728 3.95322739372428 A:G A G 10 0.531941598773897 0.576988280758879 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226573205_226573381:PARP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 226923938 A/C 1 10 14 24 4.68058401226103 7.44718238283456 -2.76659837057353 A:C A C 10 0.531941598773897 0.30822661421643 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 226924642 C/T 1 8 6 14 3.74446720980882 3.19164959264338 0.552817617165442 T:C C T 10 0.531941598773897 0.796438673256377 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 227069677 T/C 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 T:C T C 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000143801:ENST00000366783:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000340188:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000495488:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000422240:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000366782:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000391872:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000496965:exon_227069589_227069749:PSEN2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 227069737 C/T 1 6 3 9 2.80835040735662 1.59582479632169 1.21252561103493 T:C C T 10 0.531941598773897 0.515798041804277 ENSG00000143801:ENST00000366783:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000340188:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000495488:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000422240:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000366782:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000391872:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000496965:exon_227069589_227069749:PSEN2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 228335125 C/T 1 216 201 417 101.100614664838 106.920261353553 -5.81964668871505 T:C C T 10 0.531941598773897 0.589445079379957 ENSG00000143774:ENST00000366730:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000462807:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000485838:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366726:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000312726:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000492871:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366728:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366727:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000453943:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366723:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366729:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000391865:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366722:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000498092:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000435153:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366721:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000460224:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000472939:exon_228335107_228335146:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000412265:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366719:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366720:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366718:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366715:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470040:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366716:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000485168:exon_228335107_228335188:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000478725:exon_228335107_228335260:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000420445:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000495999:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000486668:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000464858:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470155:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000481341:exon_228335111_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000498115:exon_228335107_228335400:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470740:exon_228335107_228335239:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000465025:exon_228335125_228335245:GUK1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 229738170 T/G 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 T:G T G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000135801:ENST00000366676:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000258281:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000366675:exon_229734941_229738666:TAF5L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 229772693 T/G 1 2 8 10 0.936116802452206 4.25553279019118 -3.31941598773897 T:G T G 10 0.531941598773897 0.0533475902799566 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 230384970 G/A 1 6 9 15 2.80835040735662 4.78747438896507 -1.97912398160846 A:G G A 10 0.531941598773897 0.316481765113816 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230384930_230385017:GALNT2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 231359982 T/C 1 35 36 71 16.3820440429136 19.1498975558603 -2.76785351294669 T:C T C 10 0.531941598773897 0.552873283922674 ENSG00000143633:ENST00000366649:exon_231359509_231360160:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000318906:exon_231359509_231361269:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000366651:exon_231359509_231360160:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000366648:exon_231359512_231360160:C1orf131 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 231401902 G/A 1 17 14 31 7.95699282084375 7.44718238283456 0.509810438009192 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000116906:ENST00000366646:exon_231401760_231401911:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000366647:exon_231401760_231401911:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000416000:exon_231401760_231401911:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000492459:exon_231401880_231401911:GNPAT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 231411033 G/A 1 16 12 28 7.48893441961765 6.38329918528676 1.10563523433088 A:G G A 10 0.531941598773897 0.709170099536473 ENSG00000116906:ENST00000366646:exon_231410967_231411066:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000366647:exon_231410967_231411066:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000469332:exon_231410642_231411066:GNPAT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 233086456 T/C 1 1 13 14 0.468058401226103 6.91524078406066 -6.44718238283456 T:C T C 10 0.531941598773897 0.000554847544540772 ENSG00000135778:ENST00000494689:exon_233086351_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000490807:exon_233086360_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366628:exon_233086370_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000496662:exon_233086379_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366627:exon_233086386_233086490:C1orf57 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 233091463 T/A 1 14 1 15 6.55281761716544 0.531941598773897 6.02087601839154 A:T T A 10 0.531941598773897 0.00130159750118145 ENSG00000135778:ENST00000490807:exon_233091303_233091465:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366628:exon_233091303_233091465:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366627:exon_233091303_233091465:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000479125:exon_233091303_233091465:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000487953:exon_233091404_233091465:C1orf57 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 234529552 C/T 1 23 33 56 10.7653432282004 17.5540727595386 -6.78872953133823 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0812817737479774 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 234529570 G/A 1 29 36 65 13.573693635557 19.1498975558603 -5.57620392030331 A:G G A 10 0.531941598773897 0.173332646428997 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 235383188 A/G 1 23 19 42 10.7653432282004 10.106890376704 0.658452851496325 A:G A G 10 0.531941598773897 0.87815859560474 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235383108_235383283:ARID4B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 235392546 T/C 1 23 15 38 10.7653432282004 7.97912398160846 2.78621924659191 T:C T C 10 0.531941598773897 0.41811352179146 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000418304:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000466653:exon_235391626_235392700:ARID4B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 242042301 G/A 1 5 5 10 2.34029200613052 2.65970799386948 -0.31941598773897 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 1 245861571 C/T 1 7 7 14 3.27640880858272 3.72359119141728 -0.447182382834558 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245861408_245861610:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245861408_245861610:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245861408_245861610:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245861408_245861610:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245861408_245861610:KIF26B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 3150973 C/T 1 30 35 65 14.0417520367831 18.6179559570864 -4.57620392030331 T:C C T 10 0.531941598773897 0.265569380398464 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000468050:exon_3150893_3150985:PFKP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 3172121 C/T 1 57 72 129 26.6793288698879 38.2997951117206 -11.6204662418327 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0425131230794108 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3172011_3172133:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3171199_3172175:PFKP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 3172145 C/T 1 62 84 146 29.0196208760184 44.6830942970074 -15.663473420989 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0100478568258583 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3171199_3172175:PFKP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 3178814 T/A 1 203 115 318 95.0158554488989 61.1732838589982 33.8425715899007 A:T T A 10 0.531941598773897 0.000158030317036252 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3178642_3178997:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3178642_3178985:PFKP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 3180227 T/C 1 99 50 149 46.3377817213842 26.5970799386949 19.7407017826893 A:T:C T C 10 0.531941598773897 0.00129467514440730 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 3180298 C/T 1 44 39 83 20.5945696539485 20.745722352182 -0.151152698233449 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 3191823 C/T 1 17 16 33 7.95699282084375 8.51106558038235 -0.554072759538601 T:C C T 10 0.531941598773897 0.863259581534653 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3191813_3191945:PITRM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 3200292 G/A 1 17 16 33 7.95699282084375 8.51106558038235 -0.554072759538601 A:T:G G A 10 0.531941598773897 0.863259581534653 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000430362:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3200232_3200345:PITRM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 3202065 T/C 1 21 24 45 9.82922642574816 12.7665983705735 -2.93737194482537 T:C T C 10 0.531941598773897 0.455542336849185 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3202040_3202128:PITRM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 3206027 A/G 1 7 10 17 3.27640880858272 5.31941598773897 -2.04300717915625 A:G A G 10 0.531941598773897 0.341802442613557 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3205917_3206073:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000488065:exon_3205324_3206077:PITRM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 5788608 G/C 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 C:G G C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5788142_5791990:C10orf18 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 5800880 A/C 1 3 7 10 1.40417520367831 3.72359119141728 -2.31941598773897 A:C A C 10 0.531941598773897 0.205442831458325 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5800850_5800955:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000442808:exon_5800850_5800955:C10orf18 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 5805010 G/T 1 8 11 19 3.74446720980882 5.85135758651287 -2.10689037670404 T:G G T 10 0.531941598773897 0.365044702459487 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5804992_5805703:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000442808:exon_5804992_5806943:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000459693:exon_5804495_5805703:C10orf18 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 5855225 G/A 1 33 32 65 15.4459272404614 17.0221311607647 -1.57620392030331 A:G G A 10 0.531941598773897 0.710865182093587 ENSG00000057608:ENST00000380191:exon_5855177_5855512:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000435969:exon_5855177_5855512:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380153:exon_5855177_5855512:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380181:exon_5855177_5855374:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380132:exon_5855177_5855374:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000456041:exon_5855177_5855350:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000418688:exon_5855177_5855392:GDI2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 6002368 T/G 1 2 7 9 0.936116802452206 3.72359119141728 -2.78747438896507 T:G T G 10 0.531941598773897 0.0926560584503697 ENSG00000134470:ENST00000435171:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397251:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379977:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397253:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000425111:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397248:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000414280:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000534292:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000319465:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532948:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379972:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000528354:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000447291:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379974:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532039:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397250:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379971:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000530685:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397255:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000525219:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397246:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000429135:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000453922:exon_6002358_6002530:IL15RA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 6008172 C/T 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 T:C C T 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000134470:ENST00000379977:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397253:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000425111:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397248:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000414280:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000534292:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000319465:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532948:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379972:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000528354:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532039:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000530685:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397255:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397246:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000429135:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000453922:exon_6008108_6008302:IL15RA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 11504752 T/C 1 7 9 16 3.27640880858272 4.78747438896507 -1.51106558038235 T:C T C 10 0.531941598773897 0.465195872310583 ENSG00000148429:ENST00000277575:exon_11502509_11505848:USP6NL;ENSG00000148429:ENST00000379237:exon_11502511_11505848:USP6NL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 11805354 A/G 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 A:G A G 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000134463:ENST00000379215:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000496136:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000428613:exon_11805223_11806069:ECHDC3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 11805357 G/A 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 A:G G A 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000134463:ENST00000379215:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000496136:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000428613:exon_11805223_11806069:ECHDC3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 12143105 C/G 1 5 6 11 2.34029200613052 3.19164959264338 -0.851357586512867 C:G C G 10 0.531941598773897 0.764860318695721 ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12143041_12143180:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000448829:exon_12143041_12143180:DHTKD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 12292344 A/G 1 114 91 205 53.3586577397757 48.4066854884246 4.95197225135111 A:G A G 10 0.531941598773897 0.528899634961413 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 12292348 G/T 1 84 111 195 39.3169057029926 59.0455174639026 -19.7286117609099 T:G G T 10 0.531941598773897 0.00504988078957008 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 13151224 G/A 1 26 23 49 12.1695184318787 12.2346567717996 -0.0651383399209546 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000123240:ENST00000263036:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378764:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000396951:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000487935:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000482140:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378757:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000430081:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378752:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378748:exon_13151097_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378747:exon_13151112_13151288:OPTN HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 13364914 C/G 1 12 26 38 5.61670081471324 13.8304815681213 -8.21378075340809 C:G C G 10 0.531941598773897 0.00878739336656718 ENSG00000086475:ENST00000327347:exon_13364835_13365047:SEPHS1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 16547058 A/G 1 6 9 15 2.80835040735662 4.78747438896507 -1.97912398160846 A:G A G 10 0.531941598773897 0.316481765113816 ENSG00000165983:ENST00000343656:exon_16547019_16547159:PTER;ENSG00000165983:ENST00000378000:exon_16547019_16547159:PTER;ENSG00000165983:ENST00000298942:exon_16547019_16547159:PTER HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 16796919 C/A 1 8 17 25 3.74446720980882 9.04300717915625 -5.29853996934743 A:C C A 10 0.531941598773897 0.0436233643084444 ENSG00000148484:ENST00000345264:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377921:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000396726:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000464074:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377911:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377903:exon_16796870_16796988:RSU1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 23003226 A/G 1 17 19 36 7.95699282084375 10.106890376704 -2.14989755586029 A:G A G 10 0.531941598773897 0.507116645066343 ENSG00000150867:ENST00000323883:exon_23003112_23003503:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376573:exon_23003112_23003484:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376565:exon_23003112_23003503:PIP4K2A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 27303605 A/T 1 4 10 14 1.87223360490441 5.31941598773897 -3.44718238283456 A:T A T 10 0.531941598773897 0.104830012761555 ENSG00000107890:ENST00000445828:exon_27303423_27303608:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27303423_27303640:ANKRD26 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 27317840 C/T 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 T:C C T 10 0.531941598773897 0.486426237614014 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27317781_27317874:ANKRD26 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 27434483 G/A 1 14 9 23 6.55281761716544 4.78747438896507 1.76534322820037 A:G G A 10 0.531941598773897 0.534173096135566 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27434348_27436597:YME1L1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 27437835 C/T 1 19 14 33 8.89310962329596 7.44718238283456 1.4459272404614 T:C C T 10 0.531941598773897 0.727901086312476 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000493741:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27437835_27437969:YME1L1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 27459670 C/T 1 11 10 21 5.14864241348713 5.31941598773897 -0.170773574251837 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27458873_27460012:MASTL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 27459746 C/G 1 19 16 35 8.89310962329596 8.51106558038235 0.382044042913604 C:G C G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27458873_27460012:MASTL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 27475444 T/C 1 14 13 27 6.55281761716544 6.91524078406066 -0.36242316689522 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 27475494 T/C 1 10 12 22 4.68058401226103 6.38329918528676 -1.70271517302573 T:C T C 10 0.531941598773897 0.525263941191058 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 35772402 G/A 1 9 15 24 4.21252561103493 7.97912398160846 -3.76659837057353 A:G G A 10 0.531941598773897 0.152424127615418 ENSG00000108100:ENST00000374706:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000490012:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000493157:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000374704:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000265375:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000492478:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000470025:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000456784:exon_35772158_35772406:CCNY HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 43292647 A/G 1 26 24 50 12.1695184318787 12.7665983705735 -0.597079938694852 A:G A G 10 0.531941598773897 0.888101194878607 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43291922_43292679:BMS1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 43678796 C/T 1 6 6 12 2.80835040735662 3.19164959264338 -0.383299185286765 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000169826:ENST00000374466:exon_43678698_43680756:CSGALNACT2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 43883342 T/A 1 96 84 180 44.9336065177059 44.6830942970074 0.250512220698532 A:T T A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000169813:ENST00000357065:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000356053:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000443950:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000337970:exon_43881470_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000477108:exon_43883037_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000498176:exon_43883091_43883384:HNRNPF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 45473317 C/T 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 T:C C T 10 0.531941598773897 0.730998912113487 ENSG00000165507:ENST00000298295:exon_45471577_45473503:C10orf10;ENSG00000165507:ENST00000432283:exon_45473233_45473478:C10orf10;ENSG00000165507:ENST00000448778:exon_45473227_45473667:C10orf10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 50678369 T/C 1 7 5 12 3.27640880858272 2.65970799386948 0.616700814713236 T:C T C 10 0.531941598773897 0.779881793407808 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50678228_50678935:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000374129:exon_50678228_50678935:ERCC6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 64564892 G/T 1 8 4 12 3.74446720980882 2.12776639509559 1.61670081471324 T:G G T 10 0.531941598773897 0.3994437340124 ENSG00000181915:ENST00000373783:exon_64564516_64568238:ADO HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 64564934 C/G 1 9 4 13 4.21252561103493 2.12776639509559 2.08475921593934 C:G C G 10 0.531941598773897 0.279590414707516 ENSG00000181915:ENST00000373783:exon_64564516_64568238:ADO HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 64952834 C/T 1 4 10 14 1.87223360490441 5.31941598773897 -3.44718238283456 T:C C T 10 0.531941598773897 0.104830012761555 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64952698_64952911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64952698_64952857:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64952698_64952911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000327520:exon_64952698_64952911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000497922:exon_64952698_64953097:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000490669:exon_64952699_64952911:JMJD1C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 70748784 G/A 1 8 8 16 3.74446720980882 4.25553279019118 -0.511065580382352 A:G G A 10 0.531941598773897 0.80799969147761 ENSG00000198954:ENST00000361983:exon_70748487_70749014:KIAA1279 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 70892791 C/T 1 18 7 25 8.42505122206985 3.72359119141728 4.70146003065257 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0711355828389848 ENSG00000122958:ENST00000373382:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000477667:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000263559:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000395098:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000489656:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000490696:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000467852:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000489794:exon_70892654_70892803:VPS26A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 71103597 C/G 1 9 7 16 4.21252561103493 3.72359119141728 0.488934419617648 C:G C G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000156515:ENST00000450646:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000464803:exon_71103583_71103599:HK1;ENSG00000156515:ENST00000480047:exon_71103583_71103599:HK1;ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000483077:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000476368:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000483054:exon_71103583_71103646:HK1;ENSG00000156515:ENST00000421088:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000436817:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000493591:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000494253:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000450557:exon_71103583_71103745:HK1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 71874048 G/A 1 30 18 48 14.0417520367831 9.57494877793015 4.46680325885294 A:G G A 10 0.531941598773897 0.247022898490075 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71873901_71874085:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71872030_71874085:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71872030_71874085:AIFM2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 71876382 C/T 1 30 33 63 14.0417520367831 17.5540727595386 -3.51232072275551 T:C C T 10 0.531941598773897 0.380235250864166 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71876378_71876539:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71876378_71876530:AIFM2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 71905695 A/G 1 9 12 21 4.21252561103493 6.38329918528676 -2.17077357425184 A:G A G 10 0.531941598773897 0.386440894347250 ENSG00000156521:ENST00000287078:exon_71905177_71906342:TYSND1;ENSG00000156521:ENST00000335494:exon_71905177_71906412:TYSND1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 72179746 C/T 1 13 8 21 6.08475921593934 4.25553279019118 1.82922642574816 T:C C T 10 0.531941598773897 0.514430539711333 ENSG00000148730:ENST00000373218:exon_72179670_72179855:EIF4EBP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 72643671 C/T 1 35 41 76 16.3820440429136 21.8096055497298 -5.42756150681617 T:C:G C T 10 0.531941598773897 0.250247451360931 ENSG00000166228:ENST00000299299:exon_72643267_72643805:PCBD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 88930249 A/T 1 5 5 10 2.34029200613052 2.65970799386948 -0.31941598773897 A:T A T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000122376:ENST00000298784:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000298786:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000358313:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000342900:exon_88930235_88930429:FAM35A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 88939898 C/T 1 13 12 25 6.08475921593934 6.38329918528676 -0.298539969347426 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000122376:ENST00000298784:exon_88939832_88940060:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000298786:exon_88939832_88940060:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000358313:exon_88939832_88940060:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000342900:exon_88939832_88940060:FAM35A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 91007339 C/T 1 2 7 9 0.936116802452206 3.72359119141728 -2.78747438896507 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0926560584503697 ENSG00000107798:ENST00000336233:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000371829:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000456827:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000425287:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000428800:exon_91007295_91007588:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000282673:exon_91007295_91007406:LIPA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 95276742 G/C 1 14 10 24 6.55281761716544 5.31941598773897 1.23340162942647 C:G G C 10 0.531941598773897 0.685547420411967 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000445435:exon_95276692_95277005:CEP55 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 95279506 A/T 1 7 12 19 3.27640880858272 6.38329918528676 -3.10689037670404 A:T A T 10 0.531941598773897 0.172695126179914 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000496302:exon_95279439_95280034:CEP55 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 96121609 G/A 1 10 8 18 4.68058401226103 4.25553279019118 0.425051222069854 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96121422_96121629:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96121422_96121629:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000463649:exon_96121422_96121629:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000461562:exon_96121422_96121629:NOC3L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 96997670 A/G 1 1284 1443 2727 600.986987174316 767.591727030733 -166.604739856417 A:G A G 10 0.531941598773897 1.79412358138148e-10 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_96997329_96997868:PDLIM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 96997820 A/G 1 855 787 1642 400.189933048318 418.638038235057 -18.4481051867389 A:C:G A G 10 0.531941598773897 0.373345597873801 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_96997329_96997868:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000492511:exon_96997697_96997868:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000477757:exon_96997767_96997868:PDLIM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 97386497 G/T 1 10 8 18 4.68058401226103 4.25553279019118 0.425051222069854 T:G G T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000059573:ENST00000371224:exon_97386460_97386533:ALDH18A1;ENSG00000059573:ENST00000371221:exon_97386460_97386533:ALDH18A1;ENSG00000059573:ENST00000489386:exon_97386460_97386533:ALDH18A1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 97388162 G/A 1 13 10 23 6.08475921593934 5.31941598773897 0.765343228200368 A:G G A 10 0.531941598773897 0.836065752858423 ENSG00000059573:ENST00000371224:exon_97388125_97388249:ALDH18A1;ENSG00000059573:ENST00000371221:exon_97388125_97388249:ALDH18A1;ENSG00000059573:ENST00000489386:exon_97388125_97388249:ALDH18A1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 97599537 G/C 1 34 38 72 15.9139856416875 20.2137807534081 -4.29979511172059 C:G G C 10 0.531941598773897 0.345274583339006 ENSG00000138185:ENST00000453258:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371206:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000481316:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371205:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371203:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000483213:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371207:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000490659:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000494070:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000461927:exon_97599057_97599565:ENTPD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 97605057 C/G 1 5 12 17 2.34029200613052 6.38329918528676 -4.04300717915625 C:G C G 10 0.531941598773897 0.0547442983897815 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 97607164 C/T 1 10 4 14 4.68058401226103 2.12776639509559 2.55281761716544 T:C C T 10 0.531941598773897 0.191981298637752 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 97990583 A/G 1 26 25 51 12.1695184318787 13.2985399693474 -1.12902153746875 A:G A G 10 0.531941598773897 0.780284712296535 ENSG00000095585:ENST00000413476:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393894:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000428924:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000427367:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000224337:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000371176:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393889:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000467799:exon_97990550_97990590:BLNK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 98287792 G/T 1 20 12 32 9.36116802452206 6.38329918528676 2.9778688392353 T:G G T 10 0.531941598773897 0.376146745723152 ENSG00000077147:ENST00000371142:exon_98287788_98287934:TM9SF3;ENSG00000077147:ENST00000485093:exon_98287788_98287930:TM9SF3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 98369536 A/G 1 18 18 36 8.42505122206985 9.57494877793015 -1.14989755586029 A:G A G 10 0.531941598773897 0.740298639827591 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000467625:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000489982:exon_98369469_98369624:PIK3AP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 98380277 C/T 1 20 20 40 9.36116802452206 10.6388319754779 -1.27766395095588 T:C C T 10 0.531941598773897 0.752231127320461 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98380109_98380314:PIK3AP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 98411293 G/A 1 14 19 33 6.55281761716544 10.106890376704 -3.5540727595386 A:G G A 10 0.531941598773897 0.226687187410749 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98411266_98411408:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98411266_98411408:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000468783:exon_98411266_98411408:PIK3AP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 99125949 C/T 1 37 22 59 17.3181608453658 11.7027151730257 5.61544567234008 T:C C T 10 0.531941598773897 0.152843385636766 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99125647_99125990:RRP12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 99129230 T/C 1 11 12 23 5.14864241348713 6.38329918528676 -1.23465677179963 T:C T C 10 0.531941598773897 0.678419761183294 ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99129182_99129339:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99129182_99129339:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99129182_99129339:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99129182_99129339:RRP12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 99139140 G/A 1 6 7 13 2.80835040735662 3.72359119141728 -0.915240784060662 A:G G A 10 0.531941598773897 0.782547085779911 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99139050_99139171:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99139050_99139171:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99139050_99139171:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000490815:exon_99139050_99139171:RRP12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 99205731 A/G 1 21 14 35 9.82922642574816 7.44718238283456 2.3820440429136 A:G A G 10 0.531941598773897 0.499178152043228 ENSG00000171311:ENST00000464440:exon_99205712_99205751:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370902:exon_99205712_99205774:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370886:exon_99205712_99205743:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370885:exon_99205712_99205750:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370884:exon_99205712_99205774:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000485122:exon_99205712_99205742:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000476234:exon_99205712_99205763:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000489158:exon_99205712_99205763:EXOSC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 99969568 A/G 1 5 5 10 2.34029200613052 2.65970799386948 -0.31941598773897 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000166024:ENST00000298999:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000314594:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000370584:exon_99967858_99969656:C10orf28 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 100179851 T/C 1 10 16 26 4.68058401226103 8.51106558038235 -3.83048156812132 T:C T C 10 0.531941598773897 0.168543383211345 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000462743:exon_100179802_100180126:HPS1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 100183570 G/C 1 12 16 28 5.61670081471324 8.51106558038235 -2.89436476566912 C:G G C 10 0.531941598773897 0.344142676441251 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000478087:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000359632:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000470095:exon_100183510_100183644:HPS1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 100195130 G/A 1 6 11 17 2.80835040735662 5.85135758651287 -3.04300717915625 A:G G A 10 0.531941598773897 0.152165296741825 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100195029_100195171:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100195029_100195171:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100195029_100195171:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100195089_100195171:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100195029_100195171:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000338546:exon_100195029_100195171:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000474873:exon_100194843_100195171:HPS1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 101502968 A/G 1 20 13 33 9.36116802452206 6.91524078406066 2.4459272404614 A:G A G 10 0.531941598773897 0.486111407071718 ENSG00000119929:ENST00000493385:exon_101502910_101503080:CUTC;ENSG00000119929:ENST00000370476:exon_101502910_101503119:CUTC;ENSG00000119929:ENST00000471520:exon_101502910_101503119:CUTC;ENSG00000119929:ENST00000370472:exon_101502910_101503119:CUTC HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 101639796 G/A 1 29 27 56 13.573693635557 14.3624231668952 -0.788729531338232 A:G G A 10 0.531941598773897 0.893754772775175 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 101639877 A/C 1 20 24 44 9.36116802452206 12.7665983705735 -3.40543034605147 A:C A C 10 0.531941598773897 0.365014976234833 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 101645498 T/C 1 8 5 13 3.74446720980882 2.65970799386948 1.08475921593934 T:C T C 10 0.531941598773897 0.591209044900214 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101645444_101645623:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101645444_101645623:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101645444_101645623:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101645444_101645623:DNMBP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 104161221 C/T 1 389 351 740 182.074718076954 186.711501169638 -4.63678309268377 T:C C T 10 0.531941598773897 0.740348584955939 ENSG00000077150:ENST00000454143:exon_104161206_104161275:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000428099:exon_104161206_104161275:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000369966:exon_104161206_104161275:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000336486:exon_104161206_104161275:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000189444:exon_104161206_104161275:NFKB2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 104849468 G/A 1 31 41 72 14.5098104380092 21.8096055497298 -7.29979511172058 A:G G A 10 0.531941598773897 0.097952760000676 ENSG00000076685:ENST00000343289:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000423468:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369871:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000404739:exon_104847774_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369857:exon_104847942_104849665:NT5C2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 105177645 G/T 1 6 20 26 2.80835040735662 10.6388319754779 -7.83048156812132 T:G G T 10 0.531941598773897 0.00256134568967004 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105177549_105177689:PDCD11 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 105194086 C/T 1 28 19 47 13.1056352343309 10.106890376704 2.99874485762684 T:C C T 10 0.531941598773897 0.465284564150502 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105194005_105194107:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000466959:exon_105194005_105194459:PDCD11 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 105205302 A/C 1 39 35 74 18.254277647818 18.6179559570864 -0.363678309268376 A:C A C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105205135_105206049:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000478543:exon_105205135_105205481:PDCD11 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 105206874 T/C 1 31 22 53 14.5098104380092 11.7027151730257 2.80709526498346 T:C T C 10 0.531941598773897 0.492475523279906 ENSG00000138172:ENST00000369788:exon_105206543_105207325:CALHM2;ENSG00000138172:ENST00000260743:exon_105206546_105207325:CALHM2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 105758670 A/G 1 11 3 14 5.14864241348713 1.59582479632169 3.55281761716544 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0643826376341994 ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105758657_105758729:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105758657_105758729:SLK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 105763026 C/T 1 13 7 20 6.08475921593934 3.72359119141728 2.36116802452206 T:C C T 10 0.531941598773897 0.371872863862178 ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105761930_105763285:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105761930_105763285:SLK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 105882765 A/G 1 8 4 12 3.74446720980882 2.12776639509559 1.61670081471324 A:G A G 10 0.531941598773897 0.3994437340124 ENSG00000156384:ENST00000369729:exon_105882723_105882844:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000463224:exon_105882723_105883121:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000369727:exon_105882723_105882844:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000336358:exon_105882524_105882844:C10orf78 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 106027059 G/A 1 62 59 121 29.0196208760184 31.3845543276599 -2.36493345164154 A:G G A 10 0.531941598773897 0.715784299743381 ENSG00000148834:ENST00000369713:exon_106027010_106027215:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000369710:exon_106027010_106027211:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000445155:exon_106027010_106027123:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000432659:exon_106027010_106027162:GSTO1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 124610027 G/A 1 9 7 16 4.21252561103493 3.72359119141728 0.488934419617648 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000138161:ENST00000368904:exon_124609940_124610309:CUZD1;ENSG00000213185:ENST00000368898:exon_124609940_124610066:FAM24B;ENSG00000213185:ENST00000368896:exon_124609940_124610036:FAM24B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 124742858 G/A 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000179988:ENST00000465232:exon_124742788_124743030:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000368887:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000405485:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000406217:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483455:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000497219:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000493461:exon_124742788_124745763:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483755:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000496079:exon_124742806_124742986:PSTK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 126172716 G/A 1 9 4 13 4.21252561103493 2.12776639509559 2.08475921593934 A:G G A 10 0.531941598773897 0.279590414707516 ENSG00000107902:ENST00000392757:exon_126172708_126172895:LHPP;ENSG00000107902:ENST00000368842:exon_126172708_126172895:LHPP;ENSG00000107902:ENST00000368839:exon_126172708_126172895:LHPP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 126186935 G/A 0 8 0 8 3.74446720980882 0 3.74446720980882 G G 10 0.531941598773897 0.00871435563033556 ENSG00000107902:ENST00000392757:exon_126186897_126187083:LHPP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 129917560 T/C 1 5 6 11 2.34029200613052 3.19164959264338 -0.851357586512867 T:C T C 10 0.531941598773897 0.764860318695721 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129917517_129917583:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129917517_129917583:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368652:exon_129917517_129917583:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000478293:exon_129917517_129917583:MKI67 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 131959150 C/T 1 34 42 76 15.9139856416875 22.3415471485037 -6.42756150681617 T:C C T 10 0.531941598773897 0.167413043412952 ENSG00000108010:ENST00000331244:exon_131959060_131959261:GLRX3;ENSG00000108010:ENST00000368644:exon_131959060_131959261:GLRX3;ENSG00000108010:ENST00000481034:exon_131959060_131959261:GLRX3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 134021506 G/A 1 9 4 13 4.21252561103493 2.12776639509559 2.08475921593934 A:G G A 10 0.531941598773897 0.279590414707516 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134020994_134021655:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368622:exon_134020996_134021655:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000298630:exon_134020996_134021655:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000462160:exon_134020996_134021655:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368625:exon_134020996_134021655:STK32C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 10 135103460 C/T 1 42 29 71 19.6584528514963 15.426306364443 4.23214648705331 T:C C T 10 0.531941598773897 0.342618650531414 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135103328_135103473:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000417178:exon_135103328_135103473:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135103328_135103473:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368562:exon_135103328_135104538:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135103328_135103473:TUBGCP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 18102014 G/A 1 11 10 21 5.14864241348713 5.31941598773897 -0.170773574251837 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000166788:ENST00000532403:exon_18101958_18102038:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000524803:exon_18101839_18102038:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000300013:exon_18101891_18102038:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000534721:exon_18101892_18102038:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000530436:exon_18101892_18102038:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531751:exon_18101892_18102038:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531581:exon_18101892_18102038:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000530237:exon_18101895_18102038:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000532452:exon_18101896_18102038:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000529318:exon_18101920_18102038:SAAL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 18108512 T/C 1 8 9 17 3.74446720980882 4.78747438896507 -1.04300717915625 T:C T C 10 0.531941598773897 0.635405848599126 ENSG00000166788:ENST00000524803:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000300013:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531751:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531581:exon_18108409_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000529318:exon_18108404_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531216:exon_18108413_18108601:SAAL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 18305359 A/T 1 9 8 17 4.21252561103493 4.25553279019118 -0.0430071791562492 A:T A T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000110756:ENST00000438420:exon_18305342_18305448:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000349215:exon_18305342_18305448:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000396253:exon_18305342_18305448:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000352460:exon_18305342_18305448:HPS5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 20404658 C/T 1 43 28 71 20.1265112527224 14.8943647656691 5.23214648705331 T:C C T 10 0.531941598773897 0.235201093926638 ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20404526_20404880:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20404526_20404914:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20404526_20405328:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20404526_20405162:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20404526_20405324:HTATIP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 31804978 G/C 1 17 14 31 7.95699282084375 7.44718238283456 0.509810438009192 C:G G C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000109911:ENST00000350638:exon_31804941_31805546:ELP4;ENSG00000109911:ENST00000265650:exon_31804941_31805327:ELP4;ENSG00000109911:ENST00000379163:exon_31804941_31805319:ELP4;ENSG00000109911:ENST00000395934:exon_31804941_31805323:ELP4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 32124978 T/C 1 9 9 18 4.21252561103493 4.78747438896507 -0.574948777930146 T:C T C 10 0.531941598773897 0.81714898933323 ENSG00000049449:ENST00000532942:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000054950:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000533898:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000532474:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000527337:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000531345:exon_32123541_32125026:RCN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 32956620 A/G 1 6 3 9 2.80835040735662 1.59582479632169 1.21252561103493 A:G A G 10 0.531941598773897 0.515798041804277 ENSG00000060749:ENST00000399302:exon_32953289_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000078652:exon_32954638_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000428421:exon_32953289_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000527788:exon_32954638_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000524678:exon_32956130_32956981:QSER1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 34154645 C/T 1 3 6 9 1.40417520367831 3.19164959264338 -1.78747438896507 T:C C T 10 0.531941598773897 0.320650472569791 ENSG00000135372:ENST00000452756:exon_34154573_34154689:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000257829:exon_34154573_34154689:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000531159:exon_34154573_34154689:NAT10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 35827958 A/G 1 17 7 24 7.95699282084375 3.72359119141728 4.23340162942647 A:C:G A G 10 0.531941598773897 0.101874345613790 ENSG00000166326:ENST00000299413:exon_35827908_35829775:TRIM44;ENSG00000166326:ENST00000532066:exon_35827908_35828171:TRIM44 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 43702530 A/G 1 20 36 56 9.36116802452206 19.1498975558603 -9.78872953133823 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0104692889524099 ENSG00000149084:ENST00000531185:exon_43702259_43702537:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000278353:exon_43702259_43702537:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000395700:exon_43702331_43702537:HSD17B12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 43876698 C/T 1 20 16 36 9.36116802452206 8.51106558038235 0.850102444139708 T:C C T 10 0.531941598773897 0.86790453569009 ENSG00000149084:ENST00000278353:exon_43876694_43878160:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533090:exon_43876694_43877448:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533802:exon_43876694_43876855:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000525736:exon_43876694_43878167:HSD17B12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 44636839 C/T 1 102 97 199 47.7419569250625 51.598335081068 -3.8563781560055 A:T:C C T 10 0.531941598773897 0.619180212554431 ENSG00000085117:ENST00000526958:exon_44636822_44636845:CD82;ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530601:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44636822_44636923:CD82 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 44640268 A/G 1 176 137 313 82.3782786157941 72.8759990320239 9.50227958377023 A:T:G A G 10 0.531941598773897 0.307958472835562 ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000529277:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44640190_44640273:CD82 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 46403649 G/A 1 7 4 11 3.27640880858272 2.12776639509559 1.14864241348713 A:G G A 10 0.531941598773897 0.55795959209382 ENSG00000110492:ENST00000405308:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000441869:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000490240:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000405994:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000359803:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000533952:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000395569:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000395566:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000481047:exon_46403261_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000405098:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000430827:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000489525:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000407067:exon_46403303_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000395565:exon_46403607_46403683:MDK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 48145375 A/C 1 8 5 13 3.74446720980882 2.65970799386948 1.08475921593934 A:C A C 10 0.531941598773897 0.591209044900214 ENSG00000149177:ENST00000278456:exon_48145165_48145422:PTPRJ;ENSG00000149177:ENST00000418331:exon_48145165_48145422:PTPRJ;ENSG00000149177:ENST00000440289:exon_48145165_48145422:PTPRJ HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 57076820 T/G 1 12 20 32 5.61670081471324 10.6388319754779 -5.0221311607647 T:G T G 10 0.531941598773897 0.0791275401125831 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57076366_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57076369_57078030:TNKS1BP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 57102096 A/G 1 65 75 140 30.4237960796967 39.8956199080423 -9.47182382834558 A:G A G 10 0.531941598773897 0.127108614962948 ENSG00000149136:ENST00000278412:exon_57101937_57102122:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000293880:exon_57101937_57102122:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000526696:exon_57101937_57102122:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000529002:exon_57101937_57102122:SSRP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 57509413 C/T 1 279 299 578 130.588293942083 159.050538033395 -28.4622440913125 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0195152659604405 ENSG00000211450:ENST00000534355:exon_57509281_57509426:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000533321:exon_57509281_57510529:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000388857:exon_57509281_57509426:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000528798:exon_57509281_57509426:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000534386:exon_57509171_57509426:C11orf31 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 58978684 G/A 1 20 7 27 9.36116802452206 3.72359119141728 5.63757683310478 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0335303352742837 ENSG00000197629:ENST00000361050:exon_58975983_58980424:MPEG1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 60666341 G/A 1 110 85 195 51.4864241348713 45.2150358957812 6.27138823909008 A:G G A 10 0.531941598773897 0.389546351969595 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60666334_60666403:PRPF19 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 60689445 T/C 1 45 31 76 21.0626280551746 16.4901895619908 4.57243849318383 T:C T C 10 0.531941598773897 0.303430229202797 ENSG00000110108:ENST00000227525:exon_60689246_60690913:TMEM109;ENSG00000110108:ENST00000446886:exon_60689246_60689485:TMEM109 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 60703403 G/A 1 8 8 16 3.74446720980882 4.25553279019118 -0.511065580382352 A:G G A 10 0.531941598773897 0.80799969147761 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 61165280 G/A 1 5 5 10 2.34029200613052 2.65970799386948 -0.31941598773897 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000187049:ENST00000334888:exon_61165246_61165447:TMEM216;ENSG00000187049:ENST00000398979:exon_61165246_61165447:TMEM216 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 61179285 G/A 1 9 3 12 4.21252561103493 1.59582479632169 2.61670081471324 A:G G A 10 0.531941598773897 0.155839710778340 ENSG00000149532:ENST00000340437:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000394888:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000439958:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000477890:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000448745:exon_61179241_61179409:CPSF7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 61895741 A/G 1 6 5 11 2.80835040735662 2.65970799386948 0.148642413487133 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61895623_61895773:INCENP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 61897359 C/T 1 10 6 16 4.68058401226103 3.19164959264338 1.48893441961765 T:C C T 10 0.531941598773897 0.61793977257828 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61897254_61897500:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61897254_61898062:INCENP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 61908440 T/C 1 12 11 23 5.61670081471324 5.85135758651287 -0.234656771799632 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61908385_61908516:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61908385_61908516:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528375:exon_61908385_61908516:INCENP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 62284468 A/C 1 76 83 159 35.5724384931838 44.1511526982335 -8.57871420504963 A:C A C 10 0.531941598773897 0.177434906351654 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 62285441 A/G 1 33 37 70 15.4459272404614 19.6818391546342 -4.23591191417279 A:G A G 10 0.531941598773897 0.338845641763656 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 62285665 C/T 1 32 29 61 14.9778688392353 15.426306364443 -0.448437525207718 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 62287828 T/C 1 16 19 35 7.48893441961765 10.106890376704 -2.6179559570864 T:C T C 10 0.531941598773897 0.400816899235724 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 62290719 A/G 1 9 8 17 4.21252561103493 4.25553279019118 -0.0430071791562492 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 63585804 C/A 1 21 27 48 9.82922642574816 14.3624231668952 -4.53319674114706 A:C C A 10 0.531941598773897 0.196297306113487 ENSG00000168005:ENST00000294244:exon_63585688_63585837:C11orf84 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 63988045 G/A 1 164 168 332 76.7615778010809 89.3661885940147 -12.6046107929338 A:G G A 10 0.531941598773897 0.169456473240368 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63987908_63988141:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63987908_63988141:FERMT3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 64111928 T/C 1 33 33 66 15.4459272404614 17.5540727595386 -2.1081455190772 A:T:C T C 10 0.531941598773897 0.62346038978909 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494566:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000492980:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64111646_64112629:CCDC88B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 64572602 G/A 1 10 10 20 4.68058401226103 5.31941598773897 -0.63883197547794 A:G G A 10 0.531941598773897 0.825252984872384 ENSG00000133895:ENST00000377321:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377326:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000312049:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000315422:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000448517:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000449150:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000337652:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394376:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394373:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000443283:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394374:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000417021:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377313:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000478548:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000487019:exon_64572598_64572670:MEN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 64662849 A/G 1 9 5 14 4.21252561103493 2.65970799386948 1.55281761716544 A:G A G 10 0.531941598773897 0.437286823633092 ENSG00000110046:ENST00000418259:exon_64662762_64662914:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377264:exon_64662762_64662914:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000421419:exon_64662762_64662914:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377262:exon_64662762_64662914:ATG2A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 64665358 T/G 1 7 11 18 3.27640880858272 5.85135758651287 -2.57494877793015 T:G T G 10 0.531941598773897 0.245484874120372 ENSG00000110046:ENST00000418259:exon_64665311_64665446:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377264:exon_64665311_64665446:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000421419:exon_64665311_64665446:ATG2A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 64665394 T/C 1 10 9 19 4.68058401226103 4.78747438896507 -0.106890376704043 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000110046:ENST00000418259:exon_64665311_64665446:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377264:exon_64665311_64665446:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000421419:exon_64665311_64665446:ATG2A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 64789194 T/C 1 104 85 189 48.6780737275147 45.2150358957812 3.46303783173346 T:C T C 10 0.531941598773897 0.661999581090136 ENSG00000213465:ENST00000246747:exon_64789193_64789656:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529384:exon_64789193_64789360:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000533729:exon_64789193_64789632:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529254:exon_64788988_64789588:ARL2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 64812155 G/A 1 25 30 55 11.7014600306526 15.9582479632169 -4.25678793256434 A:G G A 10 0.531941598773897 0.280482227625744 ENSG00000168061:ENST00000531072:exon_64811697_64812271:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000398846:exon_64811697_64812299:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000528109:exon_64811697_64812300:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000530213:exon_64811697_64812300:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000301885:exon_64811697_64812199:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000529996:exon_64811697_64812300:SAC3D1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 64813685 G/C 1 10 17 27 4.68058401226103 9.04300717915625 -4.36242316689522 C:G G C 10 0.531941598773897 0.121756299423964 ENSG00000168060:ENST00000533753:exon_64813661_64813736:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000532450:exon_64813661_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000358658:exon_64813661_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000355369:exon_64813661_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000339885:exon_64813661_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000526799:exon_64813661_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000529274:exon_64813661_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000528977:exon_64813661_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000340252:exon_64813661_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000355721:exon_64813661_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000356632:exon_64813661_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000526516:exon_64813661_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000530995:exon_64813661_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000533842:exon_64813661_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000534568:exon_64813661_64813843:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000533340:exon_64813661_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000531746:exon_64812946_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000528884:exon_64813661_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000531174:exon_64813471_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000529685:exon_64813661_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000453486:exon_64813608_64813834:NAALADL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 64898226 C/T 1 22 20 42 10.2972848269743 10.6388319754779 -0.341547148503674 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000162298:ENST00000294256:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000377190:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000307289:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000449943:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000526060:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000434219:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000526121:exon_64898200_64898273:SYVN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 65348725 G/A 1 15 18 33 7.02087601839154 9.57494877793015 -2.5540727595386 A:G G A 10 0.531941598773897 0.388509024006411 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65348682_65348844:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533237:exon_65348682_65348844:EHBP1L1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 65349756 T/G 1 22 14 36 10.2972848269743 7.44718238283456 2.85010244413971 T:G T G 10 0.531941598773897 0.404843859004633 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 65351074 G/A 1 40 26 66 18.7223360490441 13.8304815681213 4.8918544809228 A:G G A 10 0.531941598773897 0.267053995349572 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533465:exon_65351063_65351236:EHBP1L1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 65380916 G/A 1 19 11 30 8.89310962329596 5.85135758651287 3.04175203678309 A:G G A 10 0.531941598773897 0.279377137902125 ENSG00000173327:ENST00000309100:exon_65380489_65381713:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000524856:exon_65380489_65382853:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000527304:exon_65376103_65381707:MAP3K11 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 65387378 T/A 1 2 6 8 0.936116802452206 3.19164959264338 -2.25553279019118 A:T T A 10 0.531941598773897 0.158093130392085 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65387225_65387403:PCNXL3;ENSG00000197136:ENST00000531045:exon_65387329_65387403:PCNXL3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 65408937 C/T 1 19 17 36 8.89310962329596 9.04300717915625 -0.149897555860294 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65408302_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65408302_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65408272_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65408272_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65408300_65409071:SIPA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 65412467 G/A 1 35 36 71 16.3820440429136 19.1498975558603 -2.76785351294669 A:G G A 10 0.531941598773897 0.552873283922674 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65412426_65412600:SIPA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 65417434 G/A 1 78 76 154 36.508555295636 40.4275615068162 -3.91900621118014 A:G G A 10 0.531941598773897 0.572070534968644 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000531339:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000529725:exon_65417421_65417522:SIPA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 65546857 A/C 1 12 4 16 5.61670081471324 2.12776639509559 3.48893441961765 A:C A C 10 0.531941598773897 0.130296081303923 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 65547333 G/A 1 5 7 12 2.34029200613052 3.72359119141728 -1.38329918528676 A:G G A 10 0.531941598773897 0.56545794539378 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 66109033 T/C 1 49 42 91 22.934861660079 22.3415471485037 0.593314511575372 T:C T C 10 0.531941598773897 0.916767401119043 ENSG00000174744:ENST00000425825:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000524699:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000359957:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000530238:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000394043:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000527375:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000530756:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000534617:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000525127:exon_66109004_66109094:BRMS1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 66206169 C/T 1 12 20 32 5.61670081471324 10.6388319754779 -5.0221311607647 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0791275401125831 ENSG00000174547:ENST00000310999:exon_66206103_66206319:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000534488:exon_66206103_66206297:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000329819:exon_66206103_66206305:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000394025:exon_66206103_66206295:MRPL11 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 66254085 G/T 1 11 4 15 5.14864241348713 2.12776639509559 3.02087601839155 T:G G T 10 0.531941598773897 0.129673765714287 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000531354:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532019:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000526515:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000533725:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66254011_66254148:DPP3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 66272237 G/A 1 53 40 93 24.8070952649835 21.2776639509559 3.52943131402758 A:G G A 10 0.531941598773897 0.469558011138013 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66272083_66272245:DPP3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 66288733 G/C 1 7 7 14 3.27640880858272 3.72359119141728 -0.447182382834558 C:G G C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000174483:ENST00000532283:exon_66288250_66288773:BBS1;ENSG00000174165:ENST00000534073:exon_66288108_66288937:ZDHHC24;ENSG00000174165:ENST00000526986:exon_66288553_66288937:ZDHHC24 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 66313203 T/C 1 24 33 57 11.2334016294265 17.5540727595386 -6.32067113011213 T:C T C 10 0.531941598773897 0.110798240444307 ENSG00000174165:ENST00000534073:exon_66313194_66313507:ZDHHC24;ENSG00000174165:ENST00000526986:exon_66313194_66313706:ZDHHC24;ENSG00000174165:ENST00000310442:exon_66313194_66313709:ZDHHC24;ENSG00000174165:ENST00000525925:exon_66313194_66313477:ZDHHC24 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 66373305 G/A 1 68 54 122 31.827971283375 28.7248463337904 3.10312494958456 A:G G A 10 0.531941598773897 0.587506674319292 ENSG00000173992:ENST00000533244:exon_66373173_66373490:CCS;ENSG00000173992:ENST00000530384:exon_66373173_66373383:CCS;ENSG00000173992:ENST00000530961:exon_66373173_66373469:CCS;ENSG00000173992:ENST00000310190:exon_66373173_66373390:CCS;ENSG00000173992:ENST00000525435:exon_66373173_66373488:CCS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 66392880 C/T 1 26 25 51 12.1695184318787 13.2985399693474 -1.12902153746875 T:C C T 10 0.531941598773897 0.780284712296535 ENSG00000239306:ENST00000310137:exon_66391685_66393149:RBM14 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 66610645 G/C 1 23 14 37 10.7653432282004 7.44718238283456 3.31816084536581 C:G G C 10 0.531941598773897 0.324080190094996 ENSG00000173715:ENST00000360962:exon_66610640_66610799:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000346672:exon_66610640_66610799:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000527634:exon_66610640_66610761:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000528340:exon_66610640_66610793:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000532565:exon_66610640_66610761:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000525449:exon_66610640_66610795:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000532727:exon_66610640_66610763:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000531415:exon_66610640_66610744:C11orf80;ENSG00000173653:ENST00000533277:exon_66610306_66611332:RCE1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 66626234 T/C 1 14 13 27 6.55281761716544 6.91524078406066 -0.36242316689522 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000173621:ENST00000393952:exon_66625206_66626347:LRFN4;ENSG00000173621:ENST00000309602:exon_66624973_66626564:LRFN4;ENSG00000173621:ENST00000525479:exon_66624996_66626528:LRFN4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 67059499 G/T 1 11 15 26 5.14864241348713 7.97912398160846 -2.83048156812132 T:G G T 10 0.531941598773897 0.326715412920753 ENSG00000172932:ENST00000447274:exon_67059462_67059651:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000511455:exon_67059462_67059651:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000308440:exon_67059462_67059651:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000514166:exon_67059462_67059651:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000514779:exon_67059462_67059508:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000506531:exon_67059462_67059651:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000504729:exon_67059462_67059645:ANKRD13D HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 67173422 G/A 1 33 20 53 15.4459272404614 10.6388319754779 4.80709526498346 A:G G A 10 0.531941598773897 0.215800805717494 ENSG00000175463:ENST00000526387:exon_67173378_67173488:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000529635:exon_67173374_67173488:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000312390:exon_67173374_67173488:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000530967:exon_67173374_67173488:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000533745:exon_67173374_67173488:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000529132:exon_67173066_67173559:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000526474:exon_67173066_67176604:TBC1D10C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 67809268 C/T 1 19 20 39 8.89310962329596 10.6388319754779 -1.74572235218198 T:C C T 10 0.531941598773897 0.631703049540363 ENSG00000110719:ENST00000265686:exon_67809220_67809298:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000534673:exon_67809220_67809298:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000524598:exon_67809220_67809298:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000529657:exon_67809220_67809298:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000533947:exon_67809220_67809298:TCIRG1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 69462910 G/A 0 8 0 8 3.74446720980882 0 3.74446720980882 G G 10 0.531941598773897 0.00871435563033556 ENSG00000110092:ENST00000227507:exon_69462762_69462910:CCND1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 70049523 A/G 1 20 25 45 9.36116802452206 13.2985399693474 -3.93737194482537 A:G A G 10 0.531941598773897 0.295691926789102 ENSG00000168040:ENST00000301838:exon_70049269_70049851:FADD HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 71155129 G/A 1 31 20 51 14.5098104380092 10.6388319754779 3.87097846253125 A:G G A 10 0.531941598773897 0.326466932485374 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71155003_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527316:exon_71155039_71155165:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525346:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000531364:exon_71155043_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000529990:exon_71155080_71155299:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527452:exon_71155087_71155261:DHCR7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 71191817 C/T 1 22 10 32 10.2972848269743 5.31941598773897 4.9778688392353 T:C C T 10 0.531941598773897 0.109441981068251 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71191801_71191925:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71191801_71191925:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527852:exon_71191801_71191925:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529840:exon_71191801_71191925:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530055:exon_71191801_71191925:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000526039:exon_71191801_71191925:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527227:exon_71191801_71192476:NADSYN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 71192439 C/A 1 11 19 30 5.14864241348713 10.106890376704 -4.95824796321691 A:C C A 10 0.531941598773897 0.0980482543336807 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71192402_71192450:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71192402_71192450:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527852:exon_71192402_71192450:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529840:exon_71192402_71192450:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530055:exon_71192402_71192450:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000526039:exon_71192402_71192450:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527227:exon_71191801_71192476:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000531236:exon_71191857_71193071:NADSYN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 71196660 C/T 1 31 24 55 14.5098104380092 12.7665983705735 1.74321206743566 T:C C T 10 0.531941598773897 0.686489604173763 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71196588_71196694:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71196588_71196694:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529840:exon_71196588_71196694:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530055:exon_71196588_71196694:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000526039:exon_71196588_71196694:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000531236:exon_71195358_71196694:NADSYN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 71941212 A/G 1 10 21 31 4.68058401226103 11.1707735742518 -6.49018956199081 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0291041794033817 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71941165_71941315:INPPL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 71949064 C/G 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 C:G C G 10 0.531941598773897 0.486426237614014 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 72415329 G/A 1 8 9 17 3.74446720980882 4.78747438896507 -1.04300717915625 A:G G A 10 0.531941598773897 0.635405848599126 ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000340247:exon_72415197_72415379:ARAP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 73689104 G/A 1 100 83 183 46.8058401226103 44.1511526982335 2.65468742437685 A:G G A 10 0.531941598773897 0.71164220507525 ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73688931_73689141:UCP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 77790655 G/C 1 149 72 221 69.7407017826893 38.2997951117206 31.4409066709688 C:G G C 10 0.531941598773897 1.96808024379062e-05 ENSG00000151366:ENST00000528251:exon_77790625_77790890:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000530054:exon_77790625_77790911:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000281031:exon_77790625_77791265:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000527806:exon_77790625_77790887:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000534029:exon_77790625_77790865:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000525085:exon_77790625_77790865:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000528164:exon_77790625_77790907:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000324742:exon_77790625_77790931:NDUFC2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 77825320 T/C 1 7 5 12 3.27640880858272 2.65970799386948 0.616700814713236 T:C T C 10 0.531941598773897 0.779881793407808 ENSG00000159063:ENST00000299626:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000376156:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000526737:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532306:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000421284:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532440:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000524925:exon_77825312_77825422:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000529139:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525755:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000530454:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525870:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532050:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000527099:exon_77825312_77825438:ALG8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 82550387 A/G 1 13 5 18 6.08475921593934 2.65970799386948 3.42505122206985 A:G A G 10 0.531941598773897 0.154890143333981 ENSG00000137509:ENST00000313010:exon_82550303_82550467:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000393399:exon_82550303_82550467:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532709:exon_82550303_82551885:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000525772:exon_82550303_82550467:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000524642:exon_82550303_82550467:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000526918:exon_82550303_82550467:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000531283:exon_82550303_82550467:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532476:exon_82550324_82550467:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000531801:exon_82550373_82550467:PRCP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 82644764 C/G 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 C:G C G 10 0.531941598773897 0.730998912113487 ENSG00000165490:ENST00000528759:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000533655:exon_82642774_82645701:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000329143:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000430323:exon_82642774_82645697:C11orf82 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 82644904 G/A 1 7 5 12 3.27640880858272 2.65970799386948 0.616700814713236 A:G G A 10 0.531941598773897 0.779881793407808 ENSG00000165490:ENST00000528759:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000533655:exon_82642774_82645701:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000329143:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000430323:exon_82642774_82645697:C11orf82 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 82996986 A/C 1 15 11 26 7.02087601839154 5.85135758651287 1.16951843187868 A:C A C 10 0.531941598773897 0.697958031111334 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82996916_82997450:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82996596_82997394:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82996916_82997397:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82996170_82997041:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82996916_82997253:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82996916_82997398:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82996916_82997022:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82996916_82997021:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000534753:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527025:exon_82996916_82997033:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000528149:exon_82996596_82997128:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526265:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525916:exon_82996596_82997011:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000530253:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526631:exon_82996916_82997021:CCDC90B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 85342817 C/T 1 16 7 23 7.48893441961765 3.72359119141728 3.76534322820037 T:C C T 10 0.531941598773897 0.144040128246368 ENSG00000171204:ENST00000358867:exon_85342731_85342852:TMEM126B;ENSG00000171204:ENST00000531718:exon_85342731_85342852:TMEM126B;ENSG00000171204:ENST00000531477:exon_85342731_85342852:TMEM126B;ENSG00000171204:ENST00000304524:exon_85342731_85342852:TMEM126B;ENSG00000171204:ENST00000418327:exon_85342731_85342852:TMEM126B;ENSG00000171204:ENST00000528361:exon_85342731_85342852:TMEM126B;ENSG00000171204:ENST00000530783:exon_85342731_85342852:TMEM126B;ENSG00000171204:ENST00000534341:exon_85342731_85342852:TMEM126B;ENSG00000171204:ENST00000529197:exon_85342731_85342852:TMEM126B;ENSG00000171204:ENST00000393375:exon_85342731_85342852:TMEM126B;ENSG00000171204:ENST00000530901:exon_85342731_85342835:TMEM126B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 85374993 C/T 1 4 9 13 1.87223360490441 4.78747438896507 -2.91524078406066 T:C C T 10 0.531941598773897 0.162564563323673 ENSG00000137504:ENST00000490820:exon_85374568_85376146:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000528561:exon_85374568_85375148:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000260058:exon_85374859_85375697:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000527529:exon_85374859_85375148:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000525639:exon_85374859_85376146:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000398294:exon_85374859_85375269:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000527447:exon_85372110_85376146:CREBZF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 85692181 A/C 1 5 8 13 2.34029200613052 4.25553279019118 -1.91524078406066 A:C A C 10 0.531941598773897 0.405859977542485 ENSG00000073921:ENST00000341783:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000349405:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532317:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526033:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000447890:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000454118:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000530692:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393346:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000529760:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000528398:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532603:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000356360:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000529016:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526961:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393343:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000530542:exon_85692172_85692271:PICALM HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 87908563 G/A 1 4 7 11 1.87223360490441 3.72359119141728 -1.85135758651287 A:G G A 10 0.531941598773897 0.36707898879345 ENSG00000123892:ENST00000243662:exon_87908351_87908635:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000531138:exon_87908351_87908601:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000526372:exon_87908406_87908602:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000441495:exon_87908351_87908635:RAB38 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 93464175 A/C 1 5 6 11 2.34029200613052 3.19164959264338 -0.851357586512867 A:C A C 10 0.531941598773897 0.764860318695721 ENSG00000166012:ENST00000323981:exon_93463114_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000530769:exon_93463843_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000529900:exon_93463833_93464382:TAF1D HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 95564259 A/G 1 31 29 60 14.5098104380092 15.426306364443 -0.91649592643382 A:G A G 10 0.531941598773897 0.89721965492442 ENSG00000166037:ENST00000325486:exon_95564190_95565854:CEP57;ENSG00000166037:ENST00000325542:exon_95564190_95565854:CEP57 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 95580926 G/A 1 7 9 16 3.27640880858272 4.78747438896507 -1.51106558038235 A:G G A 10 0.531941598773897 0.465195872310583 ENSG00000087053:ENST00000346299:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000393223:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000409459:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000352297:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000444541:exon_95580878_95581063:MTMR2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 102272277 G/T 1 12 22 34 5.61670081471324 11.7027151730257 -6.0860143583125 T:G G T 10 0.531941598773897 0.0397380410649896 ENSG00000152558:ENST00000361236:exon_102272270_102272423:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000398136:exon_102272270_102272423:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000532161:exon_102272270_102272423:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000528969:exon_102272270_102272423:TMEM123 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 102272839 C/A 1 22 20 42 10.2972848269743 10.6388319754779 -0.341547148503674 A:C C A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000152558:ENST00000361236:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000398136:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000532161:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000528969:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000529492:exon_102272475_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000525577:exon_102272656_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000531103:exon_102272765_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000526676:exon_102272830_102272937:TMEM123 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 104825649 C/T 1 65 43 108 30.4237960796967 22.8734887472776 7.55030733241912 T:C C T 10 0.531941598773897 0.149332876144529 ENSG00000196954:ENST00000444739:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000393150:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000421898:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000533730:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000529183:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000524843:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000531333:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000417440:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000531546:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000416586:exon_104825474_104825728:CASP4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 104900488 G/A 1 19 4 23 8.89310962329596 2.12776639509559 6.76534322820037 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0054631890471876 ENSG00000137752:ENST00000532439:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000526568:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000527979:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000533400:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000436863:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000415981:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000393136:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000446369:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000525825:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000534497:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000529871:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000528974:exon_104900392_104900626:CASP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 107197640 T/C 1 9 17 26 4.21252561103493 9.04300717915625 -4.83048156812132 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0755619747818205 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107197071_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107197074_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107197086_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107197523_107197779:CWF19L2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 108040484 G/T 1 7 5 12 3.27640880858272 2.65970799386948 0.616700814713236 T:G G T 10 0.531941598773897 0.779881793407808 ENSG00000149308:ENST00000278612:exon_108040471_108040579:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000416540:exon_108040471_108040579:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000530859:exon_108040471_108040579:NPAT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 111724133 C/T 1 3 10 13 1.40417520367831 5.31941598773897 -3.91524078406066 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0476401233689254 ENSG00000086848:ENST00000524457:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000532374:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000531154:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000398006:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527228:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524880:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000428306:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000433884:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000320165:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000530851:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527883:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527714:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524386:exon_111724103_111724208:FDXACB1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 111896324 C/T 1 7 6 13 3.27640880858272 3.19164959264338 0.0847592159393384 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000452417:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111896132_111896348:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111896164_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111896320_111896475:DLAT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 111908162 T/C 1 23 12 35 10.7653432282004 6.38329918528676 4.3820440429136 T:C T C 10 0.531941598773897 0.174979343497450 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111907997_111908184:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111907997_111908184:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111907997_111908184:DLAT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 111916647 G/A 1 7 3 10 3.27640880858272 1.59582479632169 1.68058401226103 A:G G A 10 0.531941598773897 0.3537387028518 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000452417:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111916587_111916694:DLAT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 113194168 A/C 1 6 3 9 2.80835040735662 1.59582479632169 1.21252561103493 A:C A C 10 0.531941598773897 0.515798041804277 ENSG00000149292:ENST00000529221:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000429951:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000442859:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000531164:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000529850:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000436332:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000314756:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000278593:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000504025:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000520742:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000525965:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000464224:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000494714:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000393020:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000455306:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000489064:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000527781:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000483239:exon_113194010_113194173:TTC12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 113679119 C/T 1 7 2 9 3.27640880858272 1.06388319754779 2.21252561103493 T:C C T 10 0.531941598773897 0.187705653333192 ENSG00000048028:ENST00000260188:exon_113679020_113679159:USP28;ENSG00000048028:ENST00000003302:exon_113679020_113679159:USP28 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 116655600 G/A 1 22 35 57 10.2972848269743 18.6179559570864 -8.32067113011213 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0330155314131294 ENSG00000109917:ENST00000429220:exon_116655571_116655637:ZNF259;ENSG00000109917:ENST00000444935:exon_116655571_116655637:ZNF259;ENSG00000109917:ENST00000227322:exon_116655571_116655637:ZNF259;ENSG00000109917:ENST00000449430:exon_116655575_116655637:ZNF259 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 117077034 A/G 1 27 22 49 12.6375768331048 11.7027151730257 0.934861660079047 A:G A G 10 0.531941598773897 0.886406036104659 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117075053_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117075790_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000529458:exon_117076663_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000527037:exon_117076864_117077072:PCSK7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 117266312 C/G 1 6 6 12 2.80835040735662 3.19164959264338 -0.383299185286765 C:G C G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000529538:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533223:exon_117266263_117266438:CEP164 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 117869670 A/G 1 9 7 16 4.21252561103493 3.72359119141728 0.488934419617648 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117869430_117872194:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117869430_117870513:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117869430_117870592:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117869430_117870503:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117869430_117870613:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117869430_117872196:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000525467:exon_117869430_117870174:IL10RA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 118471423 T/C 1 18 19 37 8.42505122206985 10.106890376704 -1.68183915463419 T:C T C 10 0.531941598773897 0.623318092187015 ENSG00000095139:ENST00000392859:exon_118471340_118471708:ARCN1;ENSG00000095139:ENST00000359415:exon_118471340_118473643:ARCN1;ENSG00000095139:ENST00000264028:exon_118471340_118473643:ARCN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 118828942 A/G 1 6 5 11 2.80835040735662 2.65970799386948 0.148642413487133 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000110375:ENST00000534788:exon_118828807_118829264:UPK2;ENSG00000110375:ENST00000264031:exon_118828807_118829269:UPK2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 118925935 G/A 1 19 13 32 8.89310962329596 6.91524078406066 1.97786883923529 A:G G A 10 0.531941598773897 0.595907192228062 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000526571:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000528069:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530473:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531694:exon_118925897_118926130:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534233:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000526656:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534654:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531968:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529683:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532421:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000533381:exon_118925735_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530467:exon_118925867_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000527038:exon_118925896_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529174:exon_118925914_118926051:HYOU1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 118952173 A/G 1 57 52 109 26.6793288698879 27.6609631362426 -0.981634266354778 A:G A G 10 0.531941598773897 0.848536449179695 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 118967758 T/C 1 26 38 64 12.1695184318787 20.2137807534081 -8.04426232152941 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0456817279582368 ENSG00000172269:ENST00000409993:exon_118967213_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000354202:exon_118967217_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000392834:exon_118967220_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000461999:exon_118967221_118969197:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000481084:exon_118967221_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000414373:exon_118967259_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000442480:exon_118967668_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000432443:exon_118967708_118968007:DPAGT1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 119005132 C/T 1 15 14 29 7.02087601839154 7.44718238283456 -0.426306364443014 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000172273:ENST00000437496:exon_119004794_119005764:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000350777:exon_119004794_119006752:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000527755:exon_119004794_119005764:HINFP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 119052826 C/A 1 6 12 18 2.80835040735662 6.38329918528676 -3.57494877793015 A:C C A 10 0.531941598773897 0.102335500706016 ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000469103:exon_119052803_119053054:NLRX1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 11 119205830 A/G 1 17 14 31 7.95699282084375 7.44718238283456 0.509810438009192 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000173456:ENST00000311413:exon_119205237_119208021:RNF26 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 863152 G/A 1 8 3 11 3.74446720980882 1.59582479632169 2.14864241348713 A:G G A 10 0.531941598773897 0.23704105185636 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_862089_863490:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_862225_863490:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000447667:exon_862225_863490:WNK1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 968489 T/C 1 4 7 11 1.87223360490441 3.72359119141728 -1.85135758651287 T:C T C 10 0.531941598773897 0.36707898879345 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_968411_968630:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_968411_968630:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_968411_968630:WNK1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 990912 A/C 1 5 10 15 2.34029200613052 5.31941598773897 -2.97912398160845 A:C A C 10 0.531941598773897 0.194220689888646 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_990858_990955:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_990858_990955:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_990858_990955:WNK1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 993930 C/T 1 7 11 18 3.27640880858272 5.85135758651287 -2.57494877793015 T:C C T 10 0.531941598773897 0.245484874120372 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_993815_995250:WNK1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 994014 C/T 1 15 17 32 7.02087601839154 9.04300717915625 -2.02213116076471 T:C C T 10 0.531941598773897 0.484705211465766 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_993815_995250:WNK1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 1702561 G/A 1 7 5 12 3.27640880858272 2.65970799386948 0.616700814713236 A:G G A 10 0.531941598773897 0.779881793407808 ENSG00000171823:ENST00000339235:exon_1702039_1703331:FBXL14 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 1890199 G/A 1 6 3 9 2.80835040735662 1.59582479632169 1.21252561103493 A:G G A 10 0.531941598773897 0.515798041804277 ENSG00000006831:ENST00000357103:exon_1890055_1890242:ADIPOR2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 1893077 C/A 1 11 14 25 5.14864241348713 7.44718238283456 -2.29853996934743 A:C C A 10 0.531941598773897 0.424506026287143 ENSG00000006831:ENST00000357103:exon_1893046_1893239:ADIPOR2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 1893170 C/T 1 10 4 14 4.68058401226103 2.12776639509559 2.55281761716544 T:C C T 10 0.531941598773897 0.191981298637752 ENSG00000006831:ENST00000357103:exon_1893046_1893239:ADIPOR2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 2061614 G/A 1 10 13 23 4.68058401226103 6.91524078406066 -2.23465677179963 A:G G A 10 0.531941598773897 0.406199961903517 ENSG00000151065:ENST00000280665:exon_2061582_2062454:DCP1B;ENSG00000151065:ENST00000397173:exon_2061582_2062454:DCP1B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 2061982 G/A 1 10 13 23 4.68058401226103 6.91524078406066 -2.23465677179963 A:G G A 10 0.531941598773897 0.406199961903517 ENSG00000151065:ENST00000280665:exon_2061582_2062454:DCP1B;ENSG00000151065:ENST00000397173:exon_2061582_2062454:DCP1B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 2062075 C/T 1 20 13 33 9.36116802452206 6.91524078406066 2.4459272404614 T:C C T 10 0.531941598773897 0.486111407071718 ENSG00000151065:ENST00000280665:exon_2061582_2062454:DCP1B;ENSG00000151065:ENST00000397173:exon_2061582_2062454:DCP1B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 2062135 G/A 1 12 13 25 5.61670081471324 6.91524078406066 -1.29853996934743 A:G G A 10 0.531941598773897 0.690089572307467 ENSG00000151065:ENST00000280665:exon_2061582_2062454:DCP1B;ENSG00000151065:ENST00000397173:exon_2061582_2062454:DCP1B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 2064602 T/C 1 10 2 12 4.68058401226103 1.06388319754779 3.61670081471324 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0432053960157470 ENSG00000151065:ENST00000280665:exon_2064598_2064726:DCP1B;ENSG00000151065:ENST00000397173:exon_2064598_2064726:DCP1B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 2064616 A/G 0 8 0 8 3.74446720980882 0 3.74446720980882 A A 10 0.531941598773897 0.00871435563033556 ENSG00000151065:ENST00000280665:exon_2064598_2064726:DCP1B;ENSG00000151065:ENST00000397173:exon_2064598_2064726:DCP1B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 2064634 A/G 1 7 2 9 3.27640880858272 1.06388319754779 2.21252561103493 A:G A G 10 0.531941598773897 0.187705653333192 ENSG00000151065:ENST00000280665:exon_2064598_2064726:DCP1B;ENSG00000151065:ENST00000397173:exon_2064598_2064726:DCP1B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 2968169 A/G 1 42 26 68 19.6584528514963 13.8304815681213 5.827971283375 A:G A G 10 0.531941598773897 0.181345335696753 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2966852_2968829:FOXM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 2973615 T/C 1 5 5 10 2.34029200613052 2.65970799386948 -0.31941598773897 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2973486_2973661:FOXM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 4461485 G/A 1 29 18 47 13.573693635557 9.57494877793015 3.99874485762684 A:G G A 10 0.531941598773897 0.306216707157034 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4461426_4469188:C12orf5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 4662210 T/C 1 5 6 11 2.34029200613052 3.19164959264338 -0.851357586512867 T:C T C 10 0.531941598773897 0.764860318695721 ENSG00000111247:ENST00000321524:exon_4662149_4662313:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000352618:exon_4662149_4662313:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000228843:exon_4662149_4662313:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000442992:exon_4662149_4662313:RAD51AP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 4716513 C/T 1 9 22 31 4.21252561103493 11.7027151730257 -7.49018956199081 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0105126308748068 ENSG00000010219:ENST00000010132:exon_4716493_4716553:DYRK4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 5021984 T/A 1 3 6 9 1.40417520367831 3.19164959264338 -1.78747438896507 A:T T A 10 0.531941598773897 0.320650472569791 ENSG00000111262:ENST00000382545:exon_5020006_5027422:KCNA1;ENSG00000111262:ENST00000228858:exon_5020507_5022080:KCNA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 5022041 G/A 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 A:G G A 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000111262:ENST00000382545:exon_5020006_5027422:KCNA1;ENSG00000111262:ENST00000228858:exon_5020507_5022080:KCNA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 6450945 T/C 1 9 10 19 4.21252561103493 5.31941598773897 -1.10689037670404 T:C T C 10 0.531941598773897 0.651315646573759 ENSG00000067182:ENST00000162749:exon_6450942_6451261:TNFRSF1A;ENSG00000067182:ENST00000440083:exon_6450942_6451261:TNFRSF1A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 6554628 G/A 1 130 184 314 60.8475921593934 97.8772541743971 -37.0296620150037 A:G G A 10 0.531941598773897 3.38844240358645e-05 ENSG00000139193:ENST00000266557:exon_6554590_6554721:CD27 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 6562285 C/T 1 18 18 36 8.42505122206985 9.57494877793015 -1.14989755586029 T:C C T 10 0.531941598773897 0.740298639827591 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562233_6562463:TAPBPL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 6562293 C/T 1 15 14 29 7.02087601839154 7.44718238283456 -0.426306364443014 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562233_6562463:TAPBPL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 6562823 C/T 1 12 6 18 5.61670081471324 3.19164959264338 2.42505122206985 T:C C T 10 0.531941598773897 0.345678312274734 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 6562836 G/A 1 15 8 23 7.02087601839154 4.25553279019118 2.76534322820037 A:G G A 10 0.531941598773897 0.298803195708385 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 6567907 C/T 1 39 17 56 18.254277647818 9.04300717915625 9.21127046866177 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0154239063584905 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6567811_6568113:TAPBPL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 6575044 G/T 1 9 6 15 4.21252561103493 3.19164959264338 1.02087601839154 T:G G T 10 0.531941598773897 0.79696986700649 ENSG00000139190:ENST00000400911:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000396943:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000361716:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000355479:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000396308:exon_6575008_6575166:VAMP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 6637845 T/C 1 75 81 156 35.1043800919577 43.0872695006857 -7.98288940872794 T:C T C 10 0.531941598773897 0.228699230129984 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6637845_6638022:NCAPD2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 6639088 A/G 1 54 72 126 25.2751536662096 38.2997951117206 -13.024641445511 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0252385619536265 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6638941_6639124:NCAPD2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 6646320 T/C 1 4376 3295 7671 2048.22356376543 1752.74756795999 295.475995805436 A:T:C:G T C 10 0.531941598773897 1.33406543380459e-11 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000450282:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000448046:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000492719:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646267_6646382:GAPDH HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 6647109 T/C 1 4120 3741 7861 1928.40061305154 1989.99352101315 -61.5929079616044 A:T:C:G T C 10 0.531941598773897 0.164503184877595 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646750_6647162:GAPDH HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 6657538 T/G 1 6 4 10 2.80835040735662 2.12776639509559 0.68058401226103 T:G T G 10 0.531941598773897 0.758887050232993 ENSG00000010295:ENST00000488007:exon_6657231_6657711:IFFO1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 6729460 T/C 1 10 5 15 4.68058401226103 2.65970799386948 2.02087601839155 T:C T C 10 0.531941598773897 0.438857439709851 ENSG00000184574:ENST00000329858:exon_6728001_6730630:LPAR5;ENSG00000184574:ENST00000431922:exon_6728001_6730630:LPAR5;ENSG00000184574:ENST00000435659:exon_6729326_6730414:LPAR5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 7053258 C/T 1 69 60 129 32.2960296846011 31.9164959264338 0.379533758167288 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000111678:ENST00000229281:exon_7053203_7053336:C12orf57 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 7090193 A/G 1 13 4 17 6.08475921593934 2.12776639509559 3.95699282084375 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0859338076537107 ENSG00000111684:ENST00000261407:exon_7090166_7090344:LPCAT3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 7592035 G/T 0 36 0 36 16.8501024441397 0 16.8501024441397 G G 10 0.531941598773897 1.91883309173158e-10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 8074192 G/A 1 15 7 22 7.02087601839154 3.72359119141728 3.29728482697427 A:G G A 10 0.531941598773897 0.200805512516808 ENSG00000059804:ENST00000075120:exon_8071826_8074227:SLC2A3;ENSG00000059804:ENST00000486749:exon_8071827_8074227:SLC2A3;ENSG00000059804:ENST00000469295:exon_8073667_8074227:SLC2A3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 9094548 A/G 1 17 5 22 7.95699282084375 2.65970799386948 5.29728482697427 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0307593344565131 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 14577892 A/T 1 14 3 17 6.55281761716544 1.59582479632169 4.95699282084375 A:T A T 10 0.531941598773897 0.0256055687201512 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14576843_14578407:ATF7IP;ENSG00000171681:ENST00000396279:exon_14576850_14578391:ATF7IP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 14613700 A/G 1 14 14 28 6.55281761716544 7.44718238283456 -0.894364765669117 A:G A G 10 0.531941598773897 0.850300347768159 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14613429_14614067:ATF7IP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 14924028 A/G 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000197837:ENST00000358064:exon_14923613_14924065:HIST4H4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 14927825 C/G 1 39 39 78 18.254277647818 20.745722352182 -2.49144470436396 C:G C G 10 0.531941598773897 0.573054746273191 ENSG00000111332:ENST00000389078:exon_14927349_14927957:H2AFJ HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 14976178 T/A 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 A:T T A 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000182993:ENST00000330828:exon_14975846_14977349:C12orf60 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 15095558 C/G 1 1086 1203 2289 508.311423731548 639.925743324998 -131.61431959345 A:T:C:G C G 10 0.531941598773897 3.94913159125015e-08 ENSG00000111348:ENST00000228945:exon_15094950_15095655:ARHGDIB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 22814036 A/G 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 A:G A G 10 0.531941598773897 0.486426237614014 ENSG00000139163:ENST00000381409:exon_22813997_22814139:ETNK1;ENSG00000139163:ENST00000266517:exon_22813997_22814139:ETNK1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 25243115 G/C 1 51 25 76 23.8709784625313 13.2985399693474 10.5724384931838 C:G G C 10 0.531941598773897 0.0156625478498549 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242991_25243131:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242991_25243131:LRMP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 27064232 C/T 1 38 45 83 17.7862192465919 23.9373719448254 -6.15115269823345 T:C C T 10 0.531941598773897 0.187745743720147 ENSG00000064102:ENST00000261191:exon_27064111_27064250:C12orf11;ENSG00000064102:ENST00000335745:exon_27064111_27064250:C12orf11 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 28605426 G/A 1 10 25 35 4.68058401226103 13.2985399693474 -8.61795595708639 A:G G A 10 0.531941598773897 0.00374138140088079 ENSG00000123106:ENST00000381259:exon_28605411_28605587:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000381256:exon_28605411_28605587:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000306172:exon_28605411_28605587:CCDC91 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 30881809 T/C 1 6 4 10 2.80835040735662 2.12776639509559 0.68058401226103 T:C T C 10 0.531941598773897 0.758887050232993 ENSG00000110888:ENST00000298892:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000251071:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000433722:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000308433:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000438006:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000454014:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000417045:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000395805:exon_30881582_30882259:CAPRIN2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 32135186 T/A 1 12 2 14 5.61670081471324 1.06388319754779 4.55281761716544 A:T T A 10 0.531941598773897 0.0154240748469178 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 32137565 G/A 1 16 12 28 7.48893441961765 6.38329918528676 1.10563523433088 A:G G A 10 0.531941598773897 0.709170099536473 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 32137852 C/G 1 30 25 55 14.0417520367831 13.2985399693474 0.743212067435664 A:C:G C G 10 0.531941598773897 0.893001250241586 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 32481093 G/C 1 6 6 12 2.80835040735662 3.19164959264338 -0.383299185286765 C:G G C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000151746:ENST00000457150:exon_32480395_32481489:BICD1;ENSG00000151746:ENST00000281474:exon_32480395_32481489:BICD1;ENSG00000151746:ENST00000395758:exon_32480395_32481489:BICD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 32854366 A/C 1 7 10 17 3.27640880858272 5.31941598773897 -2.04300717915625 A:C A C 10 0.531941598773897 0.341802442613557 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32854349_32854496:DNM1L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 32860302 G/A 1 8 4 12 3.74446720980882 2.12776639509559 1.61670081471324 A:G G A 10 0.531941598773897 0.3994437340124 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32860301_32860347:DNM1L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 32875406 A/G 1 3 8 11 1.40417520367831 4.25553279019118 -2.85135758651287 A:G A G 10 0.531941598773897 0.128574530340517 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32875361_32875567:DNM1L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 32896365 G/C 1 10 17 27 4.68058401226103 9.04300717915625 -4.36242316689522 C:G G C 10 0.531941598773897 0.121756299423964 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32896288_32898584:DNM1L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 32896366 A/T 1 9 17 26 4.21252561103493 9.04300717915625 -4.83048156812132 A:T A T 10 0.531941598773897 0.0755619747818205 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32896288_32898584:DNM1L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 32908237 C/A 1 25 9 34 11.7014600306526 4.78747438896507 6.9139856416875 A:C C A 10 0.531941598773897 0.0240333468401101 ENSG00000139131:ENST00000324868:exon_32908030_32908874:YARS2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 32908346 G/C 1 16 16 32 7.48893441961765 8.51106558038235 -1.0221311607647 C:G G C 10 0.531941598773897 0.726993262697186 ENSG00000139131:ENST00000324868:exon_32908030_32908874:YARS2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 32908518 G/A 1 24 18 42 11.2334016294265 9.57494877793015 1.65845285149632 A:G G A 10 0.531941598773897 0.645434913074799 ENSG00000139131:ENST00000324868:exon_32908030_32908874:YARS2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 46321231 G/C 1 13 14 27 6.08475921593934 7.44718238283456 -1.36242316689522 C:G G C 10 0.531941598773897 0.700745604151725 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 48359984 C/T 1 6 14 20 2.80835040735662 7.44718238283456 -4.63883197547794 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0439672704170584 ENSG00000134291:ENST00000256686:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000434888:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000429772:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000424902:exon_48359872_48360012:TMEM106C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 49048738 G/T 1 21 16 37 9.82922642574816 8.51106558038235 1.31816084536581 T:G G T 10 0.531941598773897 0.742914221594095 ENSG00000139620:ENST00000420613:exon_49048724_49048843:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000324947:exon_49048724_49048843:C12orf41 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 49230035 T/G 1 33 33 66 15.4459272404614 17.5540727595386 -2.1081455190772 T:G T G 10 0.531941598773897 0.62346038978909 ENSG00000174243:ENST00000398375:exon_49229904_49230049:DDX23;ENSG00000174243:ENST00000308025:exon_49229904_49230049:DDX23 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 49333799 G/A 1 67 50 117 31.3599128821489 26.5970799386949 4.76283294345405 A:G G A 10 0.531941598773897 0.405071372798748 ENSG00000134287:ENST00000256682:exon_49333780_49333890:ARF3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 49390677 T/C 1 8 8 16 3.74446720980882 4.25553279019118 -0.511065580382352 T:C T C 10 0.531941598773897 0.80799969147761 ENSG00000181418:ENST00000421952:exon_49388932_49392449:DDN;ENSG00000181418:ENST00000313194:exon_49388933_49392449:DDN HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 50537815 A/G 1 14 13 27 6.55281761716544 6.91524078406066 -0.36242316689522 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000139624:ENST00000317551:exon_50537735_50537840:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000422340:exon_50537735_50537840:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000380189:exon_50537735_50537840:LASS5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 51442944 G/A 1 19 13 32 8.89310962329596 6.91524078406066 1.97786883923529 A:G G A 10 0.531941598773897 0.595907192228062 ENSG00000050426:ENST00000262055:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000418425:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000448283:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000380135:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000380123:exon_51442817_51442968:LETMD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 51453209 C/A 1 38 33 71 17.7862192465919 17.5540727595386 0.23214648705331 A:T:C C A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000050426:ENST00000262055:exon_51453144_51454207:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000418425:exon_51453144_51454207:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000448283:exon_51453144_51454201:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000380135:exon_51453144_51454201:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000380123:exon_51453144_51454201:LETMD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 53587468 T/G 1 7 8 15 3.27640880858272 4.25553279019118 -0.979123981608455 T:G T G 10 0.531941598773897 0.617504794360634 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 53647373 T/C 1 23 23 46 10.7653432282004 12.2346567717996 -1.46931354359926 T:C T C 10 0.531941598773897 0.768000736764247 ENSG00000182544:ENST00000328704:exon_53646602_53647536:MFSD5;ENSG00000182544:ENST00000329548:exon_53646602_53648188:MFSD5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 53647450 C/T 1 19 20 39 8.89310962329596 10.6388319754779 -1.74572235218198 T:C C T 10 0.531941598773897 0.631703049540363 ENSG00000182544:ENST00000328704:exon_53646602_53647536:MFSD5;ENSG00000182544:ENST00000329548:exon_53646602_53648188:MFSD5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 53682986 C/T 1 9 8 17 4.21252561103493 4.25553279019118 -0.0430071791562492 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682874_53683087:ESPL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 54109659 C/T 1 20 8 28 9.36116802452206 4.25553279019118 5.10563523433088 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0590556142832362 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54109577_54109831:CALCOCO1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 54651471 A/G 1 20 24 44 9.36116802452206 12.7665983705735 -3.40543034605147 A:G A G 10 0.531941598773897 0.365014976234833 ENSG00000094916:ENST00000439541:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000454593:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000209875:exon_54651298_54651476:CBX5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 54911426 C/T 1 26 34 60 12.1695184318787 18.0860143583125 -5.91649592643382 T:C C T 10 0.531941598773897 0.154214698393233 ENSG00000123338:ENST00000293373:exon_54911317_54911426:NCKAP1L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 55355033 C/T 1 31 26 57 14.5098104380092 13.8304815681213 0.67932886988787 T:C:G C T 10 0.531941598773897 0.895016616370849 ENSG00000135426:ENST00000524622:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524923:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000532804:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55354989_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000531122:exon_55354952_55355051:KIAA0748 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 55368245 G/A 1 5 5 10 2.34029200613052 2.65970799386948 -0.31941598773897 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000525978:exon_55368184_55368342:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524668:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000533607:exon_55368204_55368391:KIAA0748 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 56151291 T/C 1 50 60 110 23.4029200613051 31.9164959264338 -8.51357586512867 A:T:C T C 10 0.531941598773897 0.105373261586277 ENSG00000205323:ENST00000444631:exon_56151167_56151337:SARNP;ENSG00000205323:ENST00000336133:exon_56151058_56151337:SARNP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 56435929 C/G 1 7 6 13 3.27640880858272 3.19164959264338 0.0847592159393384 C:G C G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000197728:ENST00000356464:exon_56435686_56435953:RPS26 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 56559454 G/A 1 31 27 58 14.5098104380092 14.3624231668952 0.147387271113974 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000139613:ENST00000394023:exon_56559102_56559483:SMARCC2;ENSG00000139613:ENST00000347471:exon_56559102_56559483:SMARCC2;ENSG00000139613:ENST00000267064:exon_56559102_56559483:SMARCC2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 57108203 A/G 1 2176 2092 4268 1018.495081068 1112.82182463499 -94.3267435669924 A:C:G A G 10 0.531941598773897 0.00392741679367169 ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57108146_57108223:NACA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 57133140 T/G 1 15 11 26 7.02087601839154 5.85135758651287 1.16951843187868 T:G T G 10 0.531941598773897 0.697958031111334 ENSG00000198056:ENST00000338193:exon_57133078_57133147:PRIM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 58112189 A/G 1 145 205 350 67.8684681777849 109.048027748649 -41.179559570864 A:G A G 10 0.531941598773897 1.05632499353531e-05 ENSG00000135506:ENST00000257966:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000315970:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000413095:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000435406:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000439210:exon_58111929_58112204:OS9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 58162739 A/G 1 30 26 56 14.0417520367831 13.8304815681213 0.211270468661766 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000037897:ENST00000324871:exon_58162254_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000257848:exon_58162365_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000408972:exon_58162368_58162934:METTL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 58176614 T/C 1 21 23 44 9.82922642574816 12.2346567717996 -2.40543034605147 T:C T C 10 0.531941598773897 0.54624699205029 ENSG00000123297:ENST00000454289:exon_58176372_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000323833:exon_58176559_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000417094:exon_58176564_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000434359:exon_58176586_58176660:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000457189:exon_58176601_58176690:TSFM HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 62696599 C/T 1 4 6 10 1.87223360490441 3.19164959264338 -1.31941598773897 T:C C T 10 0.531941598773897 0.530535902085358 ENSG00000135655:ENST00000353364:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000280377:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000393654:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000312635:exon_62696571_62696701:USP15 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 62979216 G/A 1 9 5 14 4.21252561103493 2.65970799386948 1.55281761716544 A:G G A 10 0.531941598773897 0.437286823633092 ENSG00000061987:ENST00000393632:exon_62979074_62979281:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393630:exon_62979074_62979281:MON2;ENSG00000061987:ENST00000280379:exon_62979074_62979281:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393629:exon_62979074_62979281:MON2;ENSG00000061987:ENST00000261188:exon_62979074_62979281:MON2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 64875787 T/A 1 13 11 24 6.08475921593934 5.85135758651287 0.233401629426472 A:T T A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000183735:ENST00000331710:exon_64875622_64875801:TBK1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 67699536 G/A 1 41 42 83 19.1903944502702 22.3415471485037 -3.15115269823345 A:G G A 10 0.531941598773897 0.510587281495968 ENSG00000111530:ENST00000299218:exon_67698884_67700377:CAND1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 67706466 G/A 1 95 70 165 44.4655481164798 37.2359119141728 7.22963620230699 A:G G A 10 0.531941598773897 0.275216541036268 ENSG00000111530:ENST00000299218:exon_67706386_67708388:CAND1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 68707287 G/A 1 6 5 11 2.80835040735662 2.65970799386948 0.148642413487133 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68707223_68707332:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68707223_68707332:MDM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 68708761 C/T 1 4 8 12 1.87223360490441 4.25553279019118 -2.38329918528676 T:C C T 10 0.531941598773897 0.247137734070613 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68708728_68709045:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68708728_68709045:MDM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 69140339 G/C 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 C:G G C 10 0.531941598773897 0.730998912113487 ENSG00000175782:ENST00000398004:exon_69139936_69140559:SLC35E3;ENSG00000175782:ENST00000319429:exon_69140278_69140559:SLC35E3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 69646914 G/A 1 33 46 79 15.4459272404614 24.4693135435993 -9.02338630313787 A:G G A 10 0.531941598773897 0.042999846828131 ENSG00000111605:ENST00000435070:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000266679:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000351671:exon_69646831_69646934:CPSF6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 72008421 T/C 1 5 6 11 2.34029200613052 3.19164959264338 -0.851357586512867 T:C T C 10 0.531941598773897 0.764860318695721 ENSG00000133858:ENST00000378743:exon_72008315_72008480:ZFC3H1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 72164395 C/T 1 9 9 18 4.21252561103493 4.78747438896507 -0.574948777930146 T:C C T 10 0.531941598773897 0.81714898933323 ENSG00000080371:ENST00000261263:exon_72164372_72164479:RAB21 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 72307616 A/G 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000121749:ENST00000319106:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000393309:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000485960:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000462788:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000407399:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000483828:exon_72307606_72307713:TBC1D15 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 76449900 T/C 1 281 293 574 131.524410744535 155.858888440752 -24.3344776962169 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0446161324741887 ENSG00000187109:ENST00000393263:exon_76449813_76449941:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000261182:exon_76449813_76449941:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000431879:exon_76449813_76449941:NAP1L1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 76740149 G/A 1 6 5 11 2.80835040735662 2.65970799386948 0.148642413487133 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000179941:ENST00000393262:exon_76738254_76741567:BBS10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 93172892 A/C 1 7 19 26 3.27640880858272 10.106890376704 -6.83048156812132 A:C A C 10 0.531941598773897 0.00946161763159611 ENSG00000102189:ENST00000322349:exon_93172891_93173076:EEA1;ENSG00000102189:ENST00000418984:exon_93172891_93173076:EEA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 95681597 G/A 1 18 26 44 8.42505122206985 13.8304815681213 -5.40543034605147 A:G G A 10 0.531941598773897 0.130064908483984 ENSG00000028203:ENST00000436874:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000261219:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397792:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000356859:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397796:exon_95681440_95681633:VEZT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 95694394 G/A 1 101 110 211 47.2738985238364 58.5135758651287 -11.2396773412923 A:C:G G A 10 0.531941598773897 0.129137506674508 ENSG00000028203:ENST00000436874:exon_95693941_95696566:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000261219:exon_95693941_95694944:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000356859:exon_95692870_95694944:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397796:exon_95693941_95694944:VEZT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 102108345 T/C 1 3 11 14 1.40417520367831 5.85135758651287 -4.44718238283456 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0283658467048123 ENSG00000111666:ENST00000229266:exon_102108282_102108423:CHPT1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 102117589 C/T 1 2 13 15 0.936116802452206 6.91524078406066 -5.97912398160846 T:C C T 10 0.531941598773897 0.00283910693970397 ENSG00000111666:ENST00000229266:exon_102117500_102117625:CHPT1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 102295218 T/C 1 4 8 12 1.87223360490441 4.25553279019118 -2.38329918528676 T:C T C 10 0.531941598773897 0.247137734070613 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 102295219 C/T 1 4 8 12 1.87223360490441 4.25553279019118 -2.38329918528676 T:C C T 10 0.531941598773897 0.247137734070613 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 105570981 A/G 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 A:G A G 10 0.531941598773897 1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 106641297 G/A 1 9 10 19 4.21252561103493 5.31941598773897 -1.10689037670404 A:G G A 10 0.531941598773897 0.651315646573759 ENSG00000136026:ENST00000258512:exon_106641147_106641353:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000378026:exon_106641147_106641713:CKAP4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 107372277 C/T 1 6 6 12 2.80835040735662 3.19164959264338 -0.383299185286765 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000120832:ENST00000240050:exon_107371069_107372549:MTERFD3;ENSG00000120832:ENST00000392830:exon_107371069_107372549:MTERFD3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 108127965 A/G 1 5 11 16 2.34029200613052 5.85135758651287 -3.51106558038235 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0854588261300405 ENSG00000110851:ENST00000228437:exon_108126644_108128299:PRDM4;ENSG00000110851:ENST00000446655:exon_108126644_108128299:PRDM4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 108686008 C/G 1 1 7 8 0.468058401226103 3.72359119141728 -3.25553279019118 C:G C G 10 0.531941598773897 0.0296580964656471 ENSG00000174600:ENST00000312143:exon_108681821_108686736:CMKLR1;ENSG00000174600:ENST00000412676:exon_108681821_108686736:CMKLR1;ENSG00000174600:ENST00000436420:exon_108681821_108686736:CMKLR1;ENSG00000174600:ENST00000397688:exon_108681821_108686736:CMKLR1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 108941679 G/A 1 4 8 12 1.87223360490441 4.25553279019118 -2.38329918528676 A:G G A 10 0.531941598773897 0.247137734070613 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108941663_108941767:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108941663_108941767:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108941663_108941767:SART3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 108954862 G/C 1 9 7 16 4.21252561103493 3.72359119141728 0.488934419617648 C:G G C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108954777_108954944:SART3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 109894028 A/G 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 A:G A G 10 0.531941598773897 0.486426237614014 ENSG00000110906:ENST00000228495:exon_109893923_109894118:KCTD10;ENSG00000110906:ENST00000440541:exon_109893923_109894049:KCTD10;ENSG00000110906:ENST00000424763:exon_109893923_109894171:KCTD10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 112186274 C/T 1 10 4 14 4.68058401226103 2.12776639509559 2.55281761716544 T:C C T 10 0.531941598773897 0.191981298637752 ENSG00000111271:ENST00000413681:exon_112186121_112186279:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000392636:exon_112186121_112186279:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000455480:exon_112186121_112186279:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000313698:exon_112186121_112186279:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000508303:exon_112186121_112186279:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000504803:exon_112186121_112186279:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000507688:exon_112186121_112186279:ACAD10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 112580071 C/T 1 9 12 21 4.21252561103493 6.38329918528676 -2.17077357425184 T:C C T 10 0.531941598773897 0.386440894347250 ENSG00000135148:ENST00000257604:exon_112579893_112580099:TRAFD1;ENSG00000135148:ENST00000412615:exon_112579893_112580099:TRAFD1;ENSG00000135148:ENST00000432758:exon_112579893_112580099:TRAFD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 113403684 C/T 1 7 1 8 3.27640880858272 0.531941598773897 2.74446720980882 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0747852262017061 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113403549_113403834:OAS3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 113534588 G/A 1 5 7 12 2.34029200613052 3.72359119141728 -1.38329918528676 A:G G A 10 0.531941598773897 0.56545794539378 ENSG00000135144:ENST00000257600:exon_113534520_113535833:DTX1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 114261053 G/A 1 10 9 19 4.68058401226103 4.78747438896507 -0.106890376704043 A:C:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114259863_114261126:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114261014_114261126:RBM19 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 114377885 G/C 1 6 7 13 2.80835040735662 3.72359119141728 -0.915240784060662 C:G G C 10 0.531941598773897 0.782547085779911 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114377765_114377965:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114377765_114377965:RBM19 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 116403920 G/A 1 3 6 9 1.40417520367831 3.19164959264338 -1.78747438896507 A:G G A 10 0.531941598773897 0.320650472569791 ENSG00000123066:ENST00000281928:exon_116403887_116404048:MED13L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 117476896 C/A 1 3 10 13 1.40417520367831 5.31941598773897 -3.91524078406066 A:C C A 10 0.531941598773897 0.0476401233689254 ENSG00000088992:ENST00000470612:exon_117476728_117477015:TESC;ENSG00000088992:ENST00000335209:exon_117476729_117477015:TESC;ENSG00000088992:ENST00000392545:exon_117476729_117477015:TESC HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 118682751 C/T 1 2 8 10 0.936116802452206 4.25553279019118 -3.31941598773897 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0533475902799566 ENSG00000135090:ENST00000392533:exon_118682699_118682770:TAOK3;ENSG00000135090:ENST00000359811:exon_118682699_118682770:TAOK3;ENSG00000135090:ENST00000419821:exon_118682699_118682770:TAOK3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 121017171 A/G 1 85 93 178 39.7849641042188 49.4705686859724 -9.68560458175367 A:G A G 10 0.531941598773897 0.153798909900963 ENSG00000167272:ENST00000357500:exon_121016849_121017215:POP5;ENSG00000167272:ENST00000341039:exon_121016849_121017215:POP5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 121176083 G/A 1 22 13 35 10.2972848269743 6.91524078406066 3.3820440429136 A:G G A 10 0.531941598773897 0.310025950721381 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176083_121176253:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176083_121176253:ACADS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 121176679 C/T 1 19 15 34 8.89310962329596 7.97912398160846 0.913985641687501 T:C C T 10 0.531941598773897 0.863994683994008 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176623_121176718:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176623_121176718:ACADS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 121177272 G/C 1 27 19 46 12.6375768331048 10.106890376704 2.53068645640074 C:G G C 10 0.531941598773897 0.465208596029087 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121177099_121177810:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121177099_121177810:ACADS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 121660787 T/C 1 1 7 8 0.468058401226103 3.72359119141728 -3.25553279019118 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0296580964656471 ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121660750_121660846:P2RX4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 121666646 A/G 1 11 9 20 5.14864241348713 4.78747438896507 0.36116802452206 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121666528_121666669:P2RX4;ENSG00000135124:ENST00000359949:exon_121666528_121666669:P2RX4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 121691096 G/A 1 7 2 9 3.27640880858272 1.06388319754779 2.21252561103493 A:G G A 10 0.531941598773897 0.187705653333192 ENSG00000110931:ENST00000347034:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000324774:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392474:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000337174:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000446440:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000402834:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000404169:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000412367:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000360452:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392473:exon_121691076_121691275:CAMKK2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 121880445 C/A 1 32 34 66 14.9778688392353 18.0860143583125 -3.1081455190772 A:C C A 10 0.531941598773897 0.461332449996061 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121879960_121880642:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121879960_121880639:KDM2B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 122079189 C/T 1 49 74 123 22.934861660079 39.3636783092684 -16.4288166491893 T:C C T 10 0.531941598773897 0.00366918970079878 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 122079441 T/C 1 59 66 125 27.6154456723401 35.1081455190772 -7.49269984673713 T:C:G T C 10 0.531941598773897 0.180292657941104 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 122231573 C/T 1 15 12 27 7.02087601839154 6.38329918528676 0.63757683310478 T:C C T 10 0.531941598773897 0.8492386336171 ENSG00000139725:ENST00000267205:exon_122231402_122231594:RHOF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 122817580 A/G 1 6 2 8 2.80835040735662 1.06388319754779 1.74446720980882 A:G A G 10 0.531941598773897 0.297069782823554 ENSG00000130779:ENST00000361654:exon_122817534_122817690:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000358808:exon_122817534_122817690:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000302528:exon_122817534_122817690:CLIP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 123102921 T/G 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 T:G T G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000184445:ENST00000333479:exon_123102890_123102944:KNTC1;ENSG00000184445:ENST00000450485:exon_123102890_123102944:KNTC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 123105143 C/T 1 30 18 48 14.0417520367831 9.57494877793015 4.46680325885294 T:C C T 10 0.531941598773897 0.247022898490075 ENSG00000184445:ENST00000333479:exon_123105026_123105155:KNTC1;ENSG00000184445:ENST00000450485:exon_123105026_123105155:KNTC1;ENSG00000196917:ENST00000356987:exon_123104824_123105249:GPR81 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 123466111 C/T 1 16 10 26 7.48893441961765 5.31941598773897 2.16951843187868 T:C C T 10 0.531941598773897 0.436884592808153 ENSG00000182196:ENST00000392433:exon_123465364_123466426:ARL6IP4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 123799974 A/G 1 8 1 9 3.74446720980882 0.531941598773897 3.21252561103493 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0425222470212816 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123799920_123799991:SBNO1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 123806219 C/T 1 16 16 32 7.48893441961765 8.51106558038235 -1.0221311607647 T:C C T 10 0.531941598773897 0.726993262697186 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123806082_123806279:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123806082_123806279:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123806082_123806279:SBNO1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 123810873 G/A 1 15 11 26 7.02087601839154 5.85135758651287 1.16951843187868 A:G G A 10 0.531941598773897 0.697958031111334 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123810699_123810881:SBNO1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 124427306 T/A 1 5 8 13 2.34029200613052 4.25553279019118 -1.91524078406066 A:T T A 10 0.531941598773897 0.405859977542485 ENSG00000119242:ENST00000238156:exon_124427291_124427332:CCDC92 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 124821413 G/A 1 39 33 72 18.254277647818 17.5540727595386 0.700204888279416 A:G G A 10 0.531941598773897 0.906385614037813 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447675:exon_124821299_124821676:NCOR2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 124821416 C/T 1 41 44 85 19.1903944502702 23.4054303460515 -4.21503589578125 T:C C T 10 0.531941598773897 0.385448616122259 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447675:exon_124821299_124821676:NCOR2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 124856618 A/G 1 20 11 31 9.36116802452206 5.85135758651287 3.50981043800919 A:G A G 10 0.531941598773897 0.280029533205116 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124856568_124857156:NCOR2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 125284748 A/G 1 28 24 52 13.1056352343309 12.7665983705735 0.339036863757354 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125284670_125284788:SCARB1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 125561151 A/G 1 6 3 9 2.80835040735662 1.59582479632169 1.21252561103493 A:G A G 10 0.531941598773897 0.515798041804277 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125561037_125561157:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125561037_125561157:AACS;ENSG00000081760:ENST00000418937:exon_125561037_125561157:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125561037_125561157:AACS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 132401566 C/T 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 T:C C T 10 0.531941598773897 0.486426237614014 ENSG00000177169:ENST00000321867:exon_132401498_132401607:ULK1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 132405879 G/A 1 10 6 16 4.68058401226103 3.19164959264338 1.48893441961765 A:G G A 10 0.531941598773897 0.61793977257828 ENSG00000177169:ENST00000321867:exon_132405851_132407696:ULK1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 132416813 G/A 1 16 13 29 7.48893441961765 6.91524078406066 0.573693635556986 A:G G A 10 0.531941598773897 0.85485877023254 ENSG00000177192:ENST00000443358:exon_132416720_132416857:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000440818:exon_132416720_132416857:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000376649:exon_132416720_132416857:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000322060:exon_132416720_132416857:PUS1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 132527986 G/A 1 5 6 11 2.34029200613052 3.19164959264338 -0.851357586512867 A:G G A 10 0.531941598773897 0.764860318695721 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132527849_132528007:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132527849_132528007:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132527849_132528007:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132527849_132528007:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132527849_132528007:EP400 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 132624252 G/A 1 18 13 31 8.42505122206985 6.91524078406066 1.50981043800919 A:G G A 10 0.531941598773897 0.719547030730488 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132624180_132624314:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132624180_132624314:DDX51 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 132626425 G/A 1 6 12 18 2.80835040735662 6.38329918528676 -3.57494877793015 A:G G A 10 0.531941598773897 0.102335500706016 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626395_132626501:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626395_132626501:DDX51 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 132635581 C/T 1 26 28 54 12.1695184318787 14.8943647656691 -2.72484633379044 T:C C T 10 0.531941598773897 0.496698864509127 ENSG00000184967:ENST00000330579:exon_132635526_132635586:NOC4L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 133212582 G/A 1 7 4 11 3.27640880858272 2.12776639509559 1.14864241348713 A:G G A 10 0.531941598773897 0.55795959209382 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133212478_133212610:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133212478_133212610:POLE;ENSG00000177084:ENST00000434528:exon_133212478_133212610:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133212478_133212610:POLE HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 133220526 T/C 1 5 6 11 2.34029200613052 3.19164959264338 -0.851357586512867 T:C T C 10 0.531941598773897 0.764860318695721 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133220423_133220563:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133220423_133220563:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133220423_133220563:POLE HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 133277873 G/A 1 15 19 34 7.02087601839154 10.106890376704 -3.0860143583125 A:G G A 10 0.531941598773897 0.306815928235480 ENSG00000176894:ENST00000317479:exon_133277836_133277955:PGAM5;ENSG00000176894:ENST00000428960:exon_133277836_133277955:PGAM5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 133331537 G/A 1 15 17 32 7.02087601839154 9.04300717915625 -2.02213116076471 A:G G A 10 0.531941598773897 0.484705211465766 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133331261_133331719:ANKLE2;ENSG00000176915:ENST00000337516:exon_133331261_133331719:ANKLE2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 133423662 C/T 1 3 8 11 1.40417520367831 4.25553279019118 -2.85135758651287 T:C C T 10 0.531941598773897 0.128574530340517 ENSG00000072609:ENST00000443047:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000315585:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000450056:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000266880:exon_133423629_133423716:CHFR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 133682678 A/T 1 16 10 26 7.48893441961765 5.31941598773897 2.16951843187868 A:T A T 10 0.531941598773897 0.436884592808153 ENSG00000196387:ENST00000355557:exon_133682096_133684260:ZNF140;ENSG00000196387:ENST00000433577:exon_133682407_133682816:ZNF140 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 12 133683261 T/C 1 15 22 37 7.02087601839154 11.7027151730257 -4.68183915463419 T:C T C 10 0.531941598773897 0.139160753543391 ENSG00000196387:ENST00000355557:exon_133682096_133684260:ZNF140 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 21535837 T/G 0 244 1 245 114.206249899169 0.531941598773897 113.674308300395 T:C T C 10 0.531941598773897 1.62451321864896e-65 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 21735998 T/C 1 8 5 13 3.74446720980882 2.65970799386948 1.08475921593934 T:C T C 10 0.531941598773897 0.591209044900214 ENSG00000165480:ENST00000298260:exon_21735929_21736014:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000314759:exon_21735929_21736014:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000400018:exon_21735929_21736014:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000465471:exon_21735929_21736014:SKA3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 21742311 C/T 1 44 1 45 20.5945696539485 0.531941598773897 20.0626280551746 T:C C T 10 0.531941598773897 2.06614735070439e-11 ENSG00000165480:ENST00000298260:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000314759:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000400018:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000465471:exon_21742127_21742538:SKA3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 22178130 T/G 1 5 10 15 2.34029200613052 5.31941598773897 -2.97912398160845 T:G T G 10 0.531941598773897 0.194220689888646 ENSG00000165487:ENST00000382374:exon_22178078_22178353:EFHA1;ENSG00000165487:ENST00000469058:exon_22178078_22178304:EFHA1;ENSG00000165487:ENST00000468222:exon_22178078_22178320:EFHA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 23908034 A/G 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 A:G A G 10 0.531941598773897 0.486426237614014 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 23911748 C/T 1 7 5 12 3.27640880858272 2.65970799386948 0.616700814713236 T:C C T 10 0.531941598773897 0.779881793407808 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 23912428 C/T 1 7 7 14 3.27640880858272 3.72359119141728 -0.447182382834558 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 23929095 T/C 1 11 6 17 5.14864241348713 3.19164959264338 1.95699282084375 T:C T C 10 0.531941598773897 0.467371914131112 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000455470:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000423156:exon_23928658_23929622:SACS;ENSG00000151835:ENST00000445163:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000399986:exon_23928658_23930146:SACS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 23930055 A/T 1 5 13 18 2.34029200613052 6.91524078406066 -4.57494877793015 A:T A T 10 0.531941598773897 0.0345039109651272 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000455470:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000445163:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000399986:exon_23928658_23930146:SACS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 25000617 C/G 1 12 69 81 5.61670081471324 36.7039703153989 -31.0872695006857 C:G C G 10 0.531941598773897 8.58124380351514e-13 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25000604_25000736:PARP4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 25009297 G/T 1 11 43 54 5.14864241348713 22.8734887472776 -17.7248463337904 T:G G T 10 0.531941598773897 1.50479019684283e-06 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 25009441 C/G 0 0 32 32 0 17.0221311607647 -17.0221311607647 G C G 10 0.531941598773897 2.81579760352438e-11 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 25009485 C/G 1 2 23 25 0.936116802452206 12.2346567717996 -11.2985399693474 C:G C G 10 0.531941598773897 2.52535088702631e-06 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 25052261 C/T 1 7 2 9 3.27640880858272 1.06388319754779 2.21252561103493 T:C C T 10 0.531941598773897 0.187705653333192 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25052231_25052414:PARP4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 25075859 C/T 1 8 2 10 3.74446720980882 1.06388319754779 2.68058401226103 T:C C T 10 0.531941598773897 0.116548632110931 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25075771_25075972:PARP4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 25479541 A/C 1 16 6 22 7.48893441961765 3.19164959264338 4.29728482697427 A:C A C 10 0.531941598773897 0.086304076451531 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25479484_25481098:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25479484_25481098:CENPJ HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 28197436 C/T 1 95 94 189 44.4655481164798 50.0025102847463 -5.53696216826654 T:C C T 10 0.531941598773897 0.423699302550902 ENSG00000186184:ENST00000302979:exon_28197012_28197589:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000399696:exon_28197012_28197583:POLR1D HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 28222516 G/A 1 54 55 109 25.2751536662096 29.2567879325643 -3.98163426635477 A:C:G G A 10 0.531941598773897 0.444758443999302 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28222516_28222590:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28222516_28222586:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000489647:exon_28222516_28222590:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000472179:exon_28222147_28222590:POLR1D HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 28239940 G/C 1 111 130 241 51.9544825360974 69.1524078406066 -17.1979253045092 C:G G C 10 0.531941598773897 0.0281170480076447 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 28239970 G/A 1 144 181 325 67.4004097765588 96.2814293780754 -28.8810196015165 A:T:G G A 10 0.531941598773897 0.00149851515384643 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 31233063 G/A 1 15 19 34 7.02087601839154 10.106890376704 -3.0860143583125 A:G G A 10 0.531941598773897 0.306815928235480 ENSG00000132952:ENST00000255304:exon_31231611_31233686:USPL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 37580139 G/A 1 20 11 31 9.36116802452206 5.85135758651287 3.50981043800919 A:G G A 10 0.531941598773897 0.280029533205116 ENSG00000120699:ENST00000489088:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000389704:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000379809:exon_37580095_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000239893:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000474661:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000490537:exon_37580094_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000488779:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000464235:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000495092:exon_37580057_37580162:EXOSC8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 37583831 G/A 1 32 39 71 14.9778688392353 20.745722352182 -5.76785351294669 A:T:G G A 10 0.531941598773897 0.191051452631923 ENSG00000102710:ENST00000490716:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000484078:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000360252:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000483214:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000475892:exon_37583630_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000350612:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000472948:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000356185:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000469488:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000473871:exon_37583634_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000464744:exon_37583754_37583946:FAM48A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 39598616 G/A 1 5 5 10 2.34029200613052 2.65970799386948 -0.31941598773897 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39598610_39598693:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39598610_39598693:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39598610_39598693:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000496138:exon_39598614_39598693:C13orf23 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 41373254 G/A 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000102743:ENST00000478827:exon_41373193_41373451:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000379523:exon_41373193_41373451:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000426521:exon_41373193_41373451:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000338625:exon_41373193_41373451:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000417731:exon_41373193_41373451:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000470509:exon_41373193_41373308:SLC25A15 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 41379272 C/T 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 T:C C T 10 0.531941598773897 0.730998912113487 ENSG00000102743:ENST00000478827:exon_41379254_41379391:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000443985:exon_41379254_41379391:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000426521:exon_41379254_41379391:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000338625:exon_41379254_41379391:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000470509:exon_41379254_41379391:SLC25A15 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 41382711 A/T 1 6 2 8 2.80835040735662 1.06388319754779 1.74446720980882 A:T A T 10 0.531941598773897 0.297069782823554 ENSG00000102743:ENST00000443985:exon_41382574_41382732:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000379523:exon_41382574_41382732:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000426521:exon_41382574_41382732:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000338625:exon_41382574_41382732:SLC25A15 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 41635778 C/T 1 19 1 20 8.89310962329596 0.531941598773897 8.36116802452206 T:C C T 10 0.531941598773897 6.72430779561224e-05 ENSG00000120688:ENST00000379487:exon_41635410_41635811:WBP4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 43148565 T/C 1 10 6 16 4.68058401226103 3.19164959264338 1.48893441961765 T:C T C 10 0.531941598773897 0.61793977257828 ENSG00000120659:ENST00000239849:exon_43148289_43148658:TNFSF11;ENSG00000120659:ENST00000398795:exon_43148291_43148658:TNFSF11 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 43462352 T/C 1 39 37 76 18.254277647818 19.6818391546342 -1.42756150681617 T:C T C 10 0.531941598773897 0.818374677735664 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43460524_43462638:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43462118_43462638:EPSTI1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 45563464 G/C 1 5 5 10 2.34029200613052 2.65970799386948 -0.31941598773897 C:G G C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000083635:ENST00000379161:exon_45563160_45563618:NUFIP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 45841502 G/A 1 30 40 70 14.0417520367831 21.2776639509559 -7.23591191417279 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0935232472887757 ENSG00000188342:ENST00000340473:exon_45841368_45841511:GTF2F2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 46705068 C/A 1 315 278 593 147.438396386222 147.879764459143 -0.441368072920909 A:T:C C A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000136167:ENST00000323076:exon_46704949_46705073:LCP1;ENSG00000136167:ENST00000435666:exon_46704949_46705073:LCP1;ENSG00000136167:ENST00000398576:exon_46704949_46705073:LCP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 46946157 C/T 1 20 13 33 9.36116802452206 6.91524078406066 2.4459272404614 T:C C T 10 0.531941598773897 0.486111407071718 ENSG00000102445:ENST00000378797:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000429979:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378781:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378787:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000441284:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000389908:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378784:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000322896:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000417405:exon_46946076_46946213:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000439642:exon_46946076_46946732:C13orf18 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 47127813 C/T 1 8 1 9 3.74446720980882 0.531941598773897 3.21252561103493 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0425222470212816 ENSG00000136141:ENST00000311191:exon_47127303_47127838:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000258643:exon_47127303_47127838:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000443945:exon_47127305_47127838:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389798:exon_47127335_47127838:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389797:exon_47127395_47127838:LRCH1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 47345587 G/A 1 96 50 146 44.9336065177059 26.5970799386949 18.336526579011 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0027093852024802 ENSG00000139684:ENST00000378720:exon_47345391_47345631:ESD;ENSG00000139684:ENST00000378697:exon_47345470_47345631:ESD HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 47354101 C/T 1 87 124 211 40.721080906671 65.9607582479632 -25.2396773412923 T:C:G C T 10 0.531941598773897 0.000539906461011938 ENSG00000139684:ENST00000378720:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000378697:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000412582:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000471867:exon_47354070_47354166:ESD;ENSG00000139684:ENST00000495654:exon_47354089_47354168:ESD HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 50080847 A/G 1 13 10 23 6.08475921593934 5.31941598773897 0.765343228200368 A:G A G 10 0.531941598773897 0.836065752858423 ENSG00000136147:ENST00000482487:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000496623:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000467763:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000485919:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000442195:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50080771_50080892:PHF11 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 50102810 G/A 1 117 96 213 54.7628329434541 51.0663934822941 3.69643946115993 A:G G A 10 0.531941598773897 0.631248720369598 ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50102647_50103123:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50102647_50103111:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000426879:exon_50102647_50102844:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50102647_50103117:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000486276:exon_50102647_50103112:PHF11 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 50108252 T/C 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 T:C T C 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000136144:ENST00000258646:exon_50106082_50108398:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000378302:exon_50106090_50108398:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000471984:exon_50108054_50108398:RCBTB1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 50205025 T/C 1 10 8 18 4.68058401226103 4.25553279019118 0.425051222069854 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 52598799 G/A 1 6 6 12 2.80835040735662 3.19164959264338 -0.383299185286765 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52598142_52599073:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52598142_52599073:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000519151:exon_52598142_52599073:ALG11 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 52603775 C/T 1 8 2 10 3.74446720980882 1.06388319754779 2.68058401226103 T:C C T 10 0.531941598773897 0.116548632110931 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 53035665 T/A 1 16 11 27 7.48893441961765 5.85135758651287 1.63757683310478 A:T T A 10 0.531941598773897 0.568089830889223 ENSG00000136108:ENST00000398044:exon_53035193_53036061:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000258607:exon_53035193_53036061:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000378034:exon_53035193_53036061:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000378037:exon_53035193_53036061:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000490903:exon_53035193_53036061:CKAP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 73349359 G/C 1 11 12 23 5.14864241348713 6.38329918528676 -1.23465677179963 C:G G C 10 0.531941598773897 0.678419761183294 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73349349_73349513:DIS3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 73350079 T/C 1 12 15 27 5.61670081471324 7.97912398160846 -2.36242316689522 T:C T C 10 0.531941598773897 0.441519696755844 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73350063_73350230:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73350063_73350230:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73350063_73350230:DIS3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 77632470 C/T 1 13 9 22 6.08475921593934 4.78747438896507 1.29728482697427 T:C C T 10 0.531941598773897 0.6717023671041 ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77632353_77632541:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77632353_77632541:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000429715:exon_77632353_77632541:MYCBP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 79940811 T/C 1 3 6 9 1.40417520367831 3.19164959264338 -1.78747438896507 T:C T C 10 0.531941598773897 0.320650472569791 ENSG00000139746:ENST00000484573:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000267229:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438737:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438724:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000327303:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000453752:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000461008:exon_79940768_79940845:RBM26 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 99907341 G/A 1 4 6 10 1.87223360490441 3.19164959264338 -1.31941598773897 A:G G A 10 0.531941598773897 0.530535902085358 ENSG00000125245:ENST00000397470:exon_99906968_99908160:GPR18;ENSG00000125245:ENST00000397473:exon_99906968_99908160:GPR18;ENSG00000125245:ENST00000340807:exon_99906986_99908160:GPR18 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 99948178 C/A 1 67 87 154 31.3599128821489 46.278919093329 -14.9190062111801 A:C C A 10 0.531941598773897 0.0189202096990966 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 103418728 A/G 1 14 9 23 6.55281761716544 4.78747438896507 1.76534322820037 A:G A G 10 0.531941598773897 0.534173096135566 ENSG00000151287:ENST00000376027:exon_103418340_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376019:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376022:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376021:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376032:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376029:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376031:exon_103418467_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000455589:exon_103418467_103418930:C13orf27 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 103528002 G/C 1 78 63 141 36.508555295636 33.5123207227555 2.99623457288052 C:G G C 10 0.531941598773897 0.673223884189716 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103527657_103528345:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375954:exon_103527657_103528333:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472247:exon_103527657_103528242:ERCC5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 111176393 A/G 1 12 3 15 5.61670081471324 1.59582479632169 4.02087601839154 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0406404092414402 ENSG00000139832:ENST00000267328:exon_111175417_111176544:RAB20 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 111279844 G/A 1 8 4 12 3.74446720980882 2.12776639509559 1.61670081471324 A:G G A 10 0.531941598773897 0.3994437340124 ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111279786_111279899:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000424185:exon_111279786_111279894:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000397191:exon_111279786_111279894:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111279786_111279894:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000439607:exon_111279786_111279894:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111279786_111279894:CARKD HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 111290880 G/A 1 24 17 41 11.2334016294265 9.04300717915625 2.19039445027022 A:G G A 10 0.531941598773897 0.534116506061887 ENSG00000213995:ENST00000458711:exon_111290725_111291452:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111290725_111290892:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111290725_111292340:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111290589_111292340:CARKD HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 111532288 G/A 1 22 28 50 10.2972848269743 14.8943647656691 -4.59707993869485 A:G G A 10 0.531941598773897 0.204424034235794 ENSG00000088448:ENST00000267339:exon_111530887_111532459:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000485844:exon_111532115_111532459:ANKRD10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 111563052 C/T 1 8 4 12 3.74446720980882 2.12776639509559 1.61670081471324 A:T:C C T 10 0.531941598773897 0.3994437340124 ENSG00000088448:ENST00000267339:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000310847:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000465753:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000489973:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000494859:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000375758:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000460846:exon_111562965_111563117:ANKRD10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 111870037 T/C 1 3 9 12 1.40417520367831 4.78747438896507 -3.38329918528676 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0789092376202323 ENSG00000102606:ENST00000317133:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375741:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375739:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000449979:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000370623:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000491775:exon_111870026_111870147:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000469877:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000466143:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000218789:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375737:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375736:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000467053:exon_111870026_111870212:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426073:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426768:exon_111870026_111870232:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375723:exon_111870026_111870227:ARHGEF7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 113153217 C/A 1 7 2 9 3.27640880858272 1.06388319754779 2.21252561103493 A:C C A 10 0.531941598773897 0.187705653333192 ENSG00000126216:ENST00000375669:exon_113153123_113153250:TUBGCP3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 114150107 C/T 1 10 13 23 4.68058401226103 6.91524078406066 -2.23465677179963 T:C C T 10 0.531941598773897 0.406199961903517 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114149817_114150340:TMCO3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 114157846 G/A 1 11 2 13 5.14864241348713 1.06388319754779 4.08475921593934 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0259151954441924 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114157811_114157903:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114157811_114157903:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114157811_114157903:TMCO3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 115064423 G/A 1 17 8 25 7.95699282084375 4.25553279019118 3.70146003065257 A:G G A 10 0.531941598773897 0.162573073903609 ENSG00000169062:ENST00000375299:exon_115064315_115064475:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000351487:exon_115064315_115064475:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000474056:exon_115064315_115064475:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000493727:exon_115064315_115064475:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000475218:exon_115064315_115064475:UPF3A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 115090019 G/A 1 14 12 26 6.55281761716544 6.38329918528676 0.169518431878677 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000198824:ENST00000361283:exon_115089263_115092796:ZNF828 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 115090193 G/A 1 26 19 45 12.1695184318787 10.106890376704 2.06262805517463 A:G G A 10 0.531941598773897 0.554457273112304 ENSG00000198824:ENST00000361283:exon_115089263_115092796:ZNF828 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 13 115091399 T/C 1 28 33 61 13.1056352343309 17.5540727595386 -4.44843752520772 T:C T C 10 0.531941598773897 0.304687634405600 ENSG00000198824:ENST00000361283:exon_115089263_115092796:ZNF828 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 20757728 G/A 1 7 1 8 3.27640880858272 0.531941598773897 2.74446720980882 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0747852262017061 ENSG00000136319:ENST00000383029:exon_20757290_20757905:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000258821:exon_20757304_20757905:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000423949:exon_20757688_20757905:TTC5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 20757804 C/A 1 7 11 18 3.27640880858272 5.85135758651287 -2.57494877793015 A:C C A 10 0.531941598773897 0.245484874120372 ENSG00000136319:ENST00000383029:exon_20757290_20757905:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000258821:exon_20757304_20757905:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000423949:exon_20757688_20757905:TTC5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 20824181 T/C 1 28 19 47 13.1056352343309 10.106890376704 2.99874485762684 T:C T C 10 0.531941598773897 0.465284564150502 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000446919:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000532299:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000530598:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000534664:exon_20824069_20824190:PARP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 20837033 T/C 1 2 8 10 0.936116802452206 4.25553279019118 -3.31941598773897 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0533475902799566 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20836957_20837061:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20836957_20837061:TEP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 20916249 T/C 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 T:C T C 10 0.531941598773897 1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 21960816 T/C 1 10 22 32 4.68058401226103 11.7027151730257 -7.0221311607647 T:C T C 10 0.531941598773897 0.019789557283282 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 21960969 G/A 1 34 21 55 15.9139856416875 11.1707735742518 4.74321206743566 A:G G A 10 0.531941598773897 0.224894981525358 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 21967438 G/A 1 27 37 64 12.6375768331048 19.6818391546342 -7.04426232152941 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0806562811098329 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 21967916 A/G 1 50 49 99 23.4029200613051 26.065138339921 -2.6622182786158 A:G A G 10 0.531941598773897 0.615479134625771 ENSG00000165819:ENST00000298717:exon_21967908_21967946:METTL3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 22961854 A/G 1 1 7 8 0.468058401226103 3.72359119141728 -3.25553279019118 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0296580964656471 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 23020638 T/C 1 76 97 173 35.5724384931838 51.598335081068 -16.0258965878842 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0179323878374839 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 23020919 C/T 1 125 65 190 58.5073001532629 34.5762039203033 23.9310962329596 T:C C T 10 0.531941598773897 0.00046757391043927 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 23020921 G/C 1 149 82 231 69.7407017826893 43.6192110994596 26.1214906832298 C:G G C 10 0.531941598773897 0.00058278506779933 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 23020970 G/T 1 179 97 276 83.7824538194724 51.598335081068 32.1841187384044 T:G G T 10 0.531941598773897 0.000106267312475321 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 23021039 G/A 1 90 56 146 42.1252561103493 29.7887295313382 12.336526579011 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0462513675344109 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 23236524 C/T 1 22 24 46 10.2972848269743 12.7665983705735 -2.46931354359926 T:C C T 10 0.531941598773897 0.555014626360537 ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000483939:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000473744:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000431881:exon_23236457_23236623:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23236491_23236618:OXA1L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 23240328 T/A 1 435 452 887 203.605404533355 240.437602645801 -36.8321981124467 A:T T A 10 0.531941598773897 0.0140077278768924 ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23240227_23240389:OXA1L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 23282110 A/G 1 15 22 37 7.02087601839154 11.7027151730257 -4.68183915463419 A:G A G 10 0.531941598773897 0.139160753543391 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000404278:exon_23282109_23282416:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23282109_23282649:SLC7A7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 23282449 C/T 1 21 27 48 9.82922642574816 14.3624231668952 -4.53319674114706 T:C C T 10 0.531941598773897 0.196297306113487 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000488800:exon_23282184_23282649:SLC7A7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 23299135 G/T 1 65 56 121 30.4237960796967 29.7887295313382 0.635066548358459 T:G G T 10 0.531941598773897 0.927654028301315 ENSG00000172590:ENST00000355151:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000311892:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000448164:exon_23299092_23299157:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397496:exon_23299092_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000432849:exon_23299103_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000382894:exon_23299113_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397505:exon_23299119_23299149:MRPL52 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 23549319 A/G 1 27 35 62 12.6375768331048 18.6179559570864 -5.98037912398161 A:G A G 10 0.531941598773897 0.161008186190840 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 23549785 T/C 1 53 46 99 24.8070952649835 24.4693135435993 0.337781721384196 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 24026493 A/G 1 7 6 13 3.27640880858272 3.19164959264338 0.0847592159393384 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000157306:ENST00000288014:exon_24025198_24026513:THTPA;ENSG00000157306:ENST00000404535:exon_24025952_24026513:THTPA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 24587639 G/A 1 18 10 28 8.42505122206985 5.31941598773897 3.10563523433088 A:G G A 10 0.531941598773897 0.261281244740623 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 24587667 C/T 1 8 9 17 3.74446720980882 4.78747438896507 -1.04300717915625 T:C C T 10 0.531941598773897 0.635405848599126 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 24610455 C/T 1 44 58 102 20.5945696539485 30.852612728886 -10.2580430749375 T:C C T 10 0.531941598773897 0.046956271297026 ENSG00000100908:ENST00000216799:exon_24610316_24610525:FAM158A;ENSG00000100908:ENST00000419198:exon_24610316_24610768:FAM158A;ENSG00000100908:ENST00000396903:exon_24610316_24610667:FAM158A;ENSG00000100908:ENST00000439499:exon_24610316_24610525:FAM158A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 24652821 C/T 1 46 24 70 21.5306864564007 12.7665983705735 8.76408808582721 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0412616597435164 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24652796_24652873:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24652796_24652873:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24652796_24652873:IPO4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 24679877 C/T 1 67 58 125 31.3599128821489 30.852612728886 0.507300153262875 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000254692:ENST00000530611:exon_24679860_24679974:RP11-468E2.1;ENSG00000254505:ENST00000347519:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000530996:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533523:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533011:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000524955:exon_24679860_24680067:CHMP4A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 24761805 A/C 1 10 2 12 4.68058401226103 1.06388319754779 3.61670081471324 A:C A C 10 0.531941598773897 0.0432053960157470 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 24806902 G/A 1 10 8 18 4.68058401226103 4.25553279019118 0.425051222069854 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000129465:ENST00000216274:exon_24806901_24806968:RIPK3;ENSG00000129465:ENST00000382557:exon_24806901_24806968:RIPK3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 24807221 G/A 1 5 8 13 2.34029200613052 4.25553279019118 -1.91524078406066 A:G G A 10 0.531941598773897 0.405859977542485 ENSG00000129465:ENST00000216274:exon_24807079_24807246:RIPK3;ENSG00000129465:ENST00000382557:exon_24807079_24807246:RIPK3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 24839165 C/T 1 11 7 18 5.14864241348713 3.72359119141728 1.42505122206985 T:C C T 10 0.531941598773897 0.638380509834863 ENSG00000100968:ENST00000440487:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000422617:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000424781:exon_24838705_24839800:NFATC4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 24845543 T/C 1 31 47 78 14.5098104380092 25.0012551423732 -10.491444704364 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0226382376935320 ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24845500_24848810:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24845500_24846084:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000422617:exon_24845500_24845760:NFATC4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 24845841 T/C 1 15 13 28 7.02087601839154 6.91524078406066 0.105635234330883 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24845500_24848810:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24845500_24846084:NFATC4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 24901249 A/C 1 5 5 10 2.34029200613052 2.65970799386948 -0.31941598773897 A:C A C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24900669_24901816:KHNYN HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 31355096 C/G 1 8 9 17 3.74446720980882 4.78747438896507 -1.04300717915625 C:G C G 10 0.531941598773897 0.635405848599126 ENSG00000100473:ENST00000216361:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000382493:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000460581:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000396618:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000468826:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000475087:exon_31355002_31355518:COCH HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 31578762 C/T 1 16 13 29 7.48893441961765 6.91524078406066 0.573693635556986 T:C C T 10 0.531941598773897 0.85485877023254 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000399321:exon_31578603_31578806:HECTD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 31582526 T/C 1 12 9 21 5.61670081471324 4.78747438896507 0.829226425748162 T:C T C 10 0.531941598773897 0.828237202108702 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31582483_31582690:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31582483_31582690:HECTD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 35242828 G/A 1 8 9 17 3.74446720980882 4.78747438896507 -1.04300717915625 A:G G A 10 0.531941598773897 0.635405848599126 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35242778_35242932:BAZ1A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 35263983 T/C 1 30 40 70 14.0417520367831 21.2776639509559 -7.23591191417279 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0935232472887757 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35263955_35264093:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35263955_35264093:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35263955_35264093:BAZ1A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 35591174 T/C 1 17 31 48 7.95699282084375 16.4901895619908 -8.53319674114706 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0140947154399136 ENSG00000092020:ENST00000261475:exon_35591108_35591519:PPP2R3C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 35761640 T/G 1 17 13 30 7.95699282084375 6.91524078406066 1.04175203678309 T:G T G 10 0.531941598773897 0.719368372691395 ENSG00000100902:ENST00000261479:exon_35761563_35761758:PSMA6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 35783656 A/G 1 123 223 346 57.5711833508107 118.622976526579 -61.0517931757684 A:C:G A G 10 0.531941598773897 4.67745945246225e-11 ENSG00000100902:ENST00000261479:exon_35783567_35783661:PSMA6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 35871217 G/A 1 351 350 701 164.288498830362 186.179559570864 -21.8910607405018 A:T:C:G G A 10 0.531941598773897 0.103591957839797 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35870717_35871266:NFKBIA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 35871960 G/A 1 21 14 35 9.82922642574816 7.44718238283456 2.3820440429136 A:G G A 10 0.531941598773897 0.499178152043228 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 35872926 G/A 1 172 157 329 80.5060450108897 83.5148310075018 -3.00878599661212 A:T:C:G G A 10 0.531941598773897 0.740669878264921 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35872896_35873004:NFKBIA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 35873770 G/A 1 147 170 317 68.8045849802371 90.4300717915625 -21.6254868113254 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0154922072740878 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35873624_35873952:NFKBIA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 39517925 T/C 1 7 5 12 3.27640880858272 2.65970799386948 0.616700814713236 T:C T C 10 0.531941598773897 0.779881793407808 ENSG00000100934:ENST00000307712:exon_39517856_39517933:SEC23A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 39644498 G/A 1 13 8 21 6.08475921593934 4.25553279019118 1.82922642574816 A:G G A 10 0.531941598773897 0.514430539711333 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39644425_39644596:PNN HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 39736680 T/C 1 9 1 10 4.21252561103493 0.531941598773897 3.68058401226103 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0240156507488693 ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39736328_39736726:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39736328_39736726:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39736350_39736726:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39736618_39736726:CTAGE5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 39818145 G/A 1 22 18 40 10.2972848269743 9.57494877793015 0.72233604904412 A:G G A 10 0.531941598773897 0.874959579214964 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 39871017 T/C 1 6 6 12 2.80835040735662 3.19164959264338 -0.383299185286765 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000165355:ENST00000298097:exon_39870380_39871065:FBXO33 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 50065717 G/C 1 8 8 16 3.74446720980882 4.25553279019118 -0.511065580382352 C:G G C 10 0.531941598773897 0.80799969147761 ENSG00000165501:ENST00000361579:exon_50065415_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000318317:exon_50065479_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50065672_50065921:PPIL5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 50092471 T/C 1 13 10 23 6.08475921593934 5.31941598773897 0.765343228200368 T:C T C 10 0.531941598773897 0.836065752858423 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50091892_50092766:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50091892_50092766:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50091907_50092766:C14orf104 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 50100386 T/C 1 19 26 45 8.89310962329596 13.8304815681213 -4.93737194482537 T:C T C 10 0.531941598773897 0.17821739734461 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50100005_50101948:C14orf104 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 50318287 G/C 1 6 6 12 2.80835040735662 3.19164959264338 -0.383299185286765 C:G G C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000165525:ENST00000298310:exon_50318281_50318383:SDCCAG1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 50583083 G/T 1 6 3 9 2.80835040735662 1.59582479632169 1.21252561103493 T:G G T 10 0.531941598773897 0.515798041804277 ENSG00000100483:ENST00000395859:exon_50583005_50583297:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000491402:exon_50583005_50583318:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000395860:exon_50583005_50583275:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000484763:exon_50582798_50583276:C14orf138 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 50585248 C/T 1 17 14 31 7.95699282084375 7.44718238283456 0.509810438009192 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000100485:ENST00000216373:exon_50583847_50585571:SOS2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 50585484 T/C 1 10 3 13 4.68058401226103 1.59582479632169 3.08475921593934 T:C T C 10 0.531941598773897 0.100839397920929 ENSG00000100485:ENST00000216373:exon_50583847_50585571:SOS2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 51192659 G/A 1 16 12 28 7.48893441961765 6.38329918528676 1.10563523433088 A:G G A 10 0.531941598773897 0.709170099536473 ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51192551_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51192558_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51192558_51192784:NIN HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 51219398 A/G 1 23 26 49 10.7653432282004 13.8304815681213 -3.06513833992095 A:G A G 10 0.531941598773897 0.393859130468338 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51219236_51219451:NIN HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 51223789 C/T 1 9 3 12 4.21252561103493 1.59582479632169 2.61670081471324 T:C C T 10 0.531941598773897 0.155839710778340 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 51224374 T/G 1 11 8 19 5.14864241348713 4.25553279019118 0.893109623295957 T:G T G 10 0.531941598773897 0.819320657489995 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 51226730 G/A 1 25 26 51 11.7014600306526 13.8304815681213 -2.12902153746875 A:G G A 10 0.531941598773897 0.576796488483639 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51226575_51227077:NIN HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 51237701 A/G 1 4 8 12 1.87223360490441 4.25553279019118 -2.38329918528676 A:G A G 10 0.531941598773897 0.247137734070613 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453401:exon_51237570_51237710:NIN HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 55604935 C/A 1 15 20 35 7.02087601839154 10.6388319754779 -3.6179559570864 A:C C A 10 0.531941598773897 0.238889316028833 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55604763_55605086:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55603699_55605086:LGALS3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 55605036 A/C 1 22 29 51 10.2972848269743 15.426306364443 -5.12902153746875 A:C A C 10 0.531941598773897 0.162042317042382 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55604763_55605086:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55603699_55605086:LGALS3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 55619311 A/G 1 34 28 62 15.9139856416875 14.8943647656691 1.01962087601838 A:G A G 10 0.531941598773897 0.898869150047641 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55619308_55619365:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55619308_55619365:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55619308_55619365:DLGAP5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 55818517 T/A 1 4 6 10 1.87223360490441 3.19164959264338 -1.31941598773897 A:T T A 10 0.531941598773897 0.530535902085358 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 55818706 T/C 1 12 9 21 5.61670081471324 4.78747438896507 0.829226425748162 T:C T C 10 0.531941598773897 0.828237202108702 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 59939727 T/C 1 9 7 16 4.21252561103493 3.72359119141728 0.488934419617648 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000126790:ENST00000247194:exon_59939335_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000463432:exon_59939579_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000532049:exon_59939583_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000478430:exon_59939585_59939808:C14orf149 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 60585131 A/G 1 6 7 13 2.80835040735662 3.72359119141728 -0.915240784060662 A:G A G 10 0.531941598773897 0.782547085779911 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000483571:exon_60585095_60585410:C14orf135 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 60591829 T/C 1 6 9 15 2.80835040735662 4.78747438896507 -1.97912398160846 T:C T C 10 0.531941598773897 0.316481765113816 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000483571:exon_60590936_60591969:C14orf135 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 60611648 C/T 1 32 10 42 14.9778688392353 5.31941598773897 9.65845285149632 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0029380173438397 ENSG00000100612:ENST00000216500:exon_60610838_60611731:DHRS7;ENSG00000100612:ENST00000360557:exon_60611502_60611731:DHRS7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 64908845 G/A 1 66 64 130 30.8918544809228 34.0442623215294 -3.15240784060661 A:G G A 10 0.531941598773897 0.598715778324908 ENSG00000100714:ENST00000216605:exon_64908772_64908883:MTHFD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 64988830 C/A 1 10 21 31 4.68058401226103 11.1707735742518 -6.49018956199081 A:C C A 10 0.531941598773897 0.0291041794033817 ENSG00000126804:ENST00000358738:exon_64988205_64990120:ZBTB1;ENSG00000126804:ENST00000394712:exon_64988205_64991665:ZBTB1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 66136163 C/A 1 6 13 19 2.80835040735662 6.91524078406066 -4.10689037670404 A:C C A 10 0.531941598773897 0.0676157669394294 ENSG00000033170:ENST00000360689:exon_66135961_66136198:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000342677:exon_66135961_66136198:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394586:exon_66135961_66136198:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394585:exon_66135961_66136198:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000358307:exon_66135961_66136198:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394581:exon_66135961_66136198:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000417683:exon_66136133_66136198:FUT8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 68301824 G/A 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000182185:ENST00000487861:exon_68301797_68301913:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000479335:exon_68301797_68301913:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000403044:exon_68301797_68301913:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000471583:exon_68301797_68301913:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000487270:exon_68301797_68301913:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000344360:exon_68301797_68301913:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000488612:exon_68301797_68301913:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000485181:exon_68301797_68301913:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000390683:exon_68301797_68301913:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000402498:exon_68301797_68301913:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000342389:exon_68301797_68301913:RAD51L1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 69521345 G/A 1 17 20 37 7.95699282084375 10.6388319754779 -2.68183915463419 A:G G A 10 0.531941598773897 0.412639018051013 ENSG00000139990:ENST00000341516:exon_69517638_69522328:DCAF5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 71109153 C/G 1 10 7 17 4.68058401226103 3.72359119141728 0.956992820843751 A:C:G C G 10 0.531941598773897 0.809031865435945 ENSG00000133985:ENST00000256367:exon_71108504_71109252:TTC9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 72945012 T/C 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000182732:ENST00000402788:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000404301:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000343854:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000434263:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000453330:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000407322:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000406236:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000355512:exon_72944976_72945037:RGS6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 73404680 A/C 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 A:C A C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000119599:ENST00000358377:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000353777:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509320:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509153:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000514191:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000505361:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000340355:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000510612:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000508412:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000514486:exon_73404679_73404778:DCAF4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 73440864 C/T 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 T:C C T 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000165861:ENST00000394207:exon_73440788_73440901:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000318876:exon_73440788_73440901:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000446254:exon_73440788_73440901:ZFYVE1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 73958812 T/C 1 41 20 61 19.1903944502702 10.6388319754779 8.55156247479228 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0293232228186377 ENSG00000255242:ENST00000531973:exon_73957669_73960096:C14orf169 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 74759006 C/T 1 9 3 12 4.21252561103493 1.59582479632169 2.61670081471324 T:C C T 10 0.531941598773897 0.155839710778340 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481935:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000474270:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000496015:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000469672:exon_74758990_74759079:ABCD4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 74759301 G/T 1 6 2 8 2.80835040735662 1.06388319754779 1.74446720980882 T:G G T 10 0.531941598773897 0.297069782823554 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481935:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000474270:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000496015:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000469672:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000460308:exon_74759254_74759345:ABCD4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 74759477 C/T 1 7 5 12 3.27640880858272 2.65970799386948 0.616700814713236 T:C C T 10 0.531941598773897 0.779881793407808 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481935:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000474270:exon_74759451_74759529:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000496015:exon_74759451_74759951:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000469672:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000460308:exon_74759451_74759572:ABCD4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 75245368 C/T 1 7 7 14 3.27640880858272 3.72359119141728 -0.447182382834558 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75245150_75245386:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75245150_75245386:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75245150_75245386:YLPM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 75248669 G/T 1 8 9 17 3.74446720980882 4.78747438896507 -1.04300717915625 T:C:G G T 10 0.531941598773897 0.635405848599126 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75248037_75249028:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75248626_75249028:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75248626_75249028:YLPM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 75359670 G/A 1 24 9 33 11.2334016294265 4.78747438896507 6.4459272404614 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0347042310783979 ENSG00000119689:ENST00000334220:exon_75359537_75359689:DLST;ENSG00000119689:ENST00000238671:exon_75359537_75359689:DLST;ENSG00000119689:ENST00000334212:exon_75359537_75359689:DLST HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 76330181 G/A 1 4 6 10 1.87223360490441 3.19164959264338 -1.31941598773897 A:G G A 10 0.531941598773897 0.530535902085358 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000286653:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76330010_76330205:TTLL5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 77793207 G/A 1 2 6 8 0.936116802452206 3.19164959264338 -2.25553279019118 A:G G A 10 0.531941598773897 0.158093130392085 ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000349555:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77793181_77793248:GSTZ1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 77926011 C/T 1 53 58 111 24.8070952649835 30.852612728886 -6.04551746390257 T:C C T 10 0.531941598773897 0.255257697475648 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77925959_77926149:AHSA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 77928525 A/G 1 74 59 133 34.6363216907316 31.3845543276599 3.2517673630717 A:G A G 10 0.531941598773897 0.602720538075605 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77928503_77928585:AHSA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 77935520 G/A 1 141 123 264 65.9962345728805 65.4288166491893 0.567417923691195 A:G G A 10 0.531941598773897 0.950919861681955 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77935420_77935807:AHSA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 88477882 A/C 1 11 15 26 5.14864241348713 7.97912398160846 -2.83048156812132 A:C A C 10 0.531941598773897 0.326715412920753 ENSG00000140030:ENST00000267549:exon_88476733_88478422:GPR65 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 90744672 G/A 1 3 7 10 1.40417520367831 3.72359119141728 -2.31941598773897 A:G G A 10 0.531941598773897 0.205442831458325 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90744398_90744805:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90744402_90744805:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90744402_90744805:C14orf102 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 90745422 T/C 1 7 7 14 3.27640880858272 3.72359119141728 -0.447182382834558 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90745406_90745477:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90745406_90745477:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90745406_90745477:C14orf102 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 91671124 G/A 1 4 13 17 1.87223360490441 6.91524078406066 -5.04300717915625 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0154780184710084 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91671050_91671211:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522816:exon_91671050_91671169:C14orf159 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 92436176 C/T 1 18 16 34 8.42505122206985 8.51106558038235 -0.0860143583124984 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92435462_92436237:TRIP11 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 92460227 C/T 1 5 11 16 2.34029200613052 5.85135758651287 -3.51106558038235 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0854588261300405 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92460153_92460256:TRIP11 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 92588002 T/G 1 307 209 516 143.693929176414 111.175794143744 32.5181350326691 T:C:G T G 10 0.531941598773897 0.00412206401191523 ENSG00000183648:ENST00000329559:exon_92587986_92588153:NDUFB1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 93180727 A/G 1 22 11 33 10.2972848269743 5.85135758651287 4.4459272404614 A:G A G 10 0.531941598773897 0.16197606612851 ENSG00000100600:ENST00000334864:exon_93180721_93180796:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93180721_93180796:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93180721_93180796:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93180721_93180796:LGMN HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 94417421 G/A 1 7 6 13 3.27640880858272 3.19164959264338 0.0847592159393384 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94417345_94417590:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94417345_94417590:ASB2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 94417586 G/A 1 7 4 11 3.27640880858272 2.12776639509559 1.14864241348713 A:G G A 10 0.531941598773897 0.55795959209382 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94417345_94417590:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94417345_94417590:ASB2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 94524216 T/C 1 94 84 178 43.9974897152537 44.6830942970074 -0.685604581753672 T:C T C 10 0.531941598773897 0.94021101775575 ENSG00000089737:ENST00000423579:exon_94524168_94524243:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94524168_94524243:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94524168_94524243:DDX24 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 97018927 C/T 1 15 7 22 7.02087601839154 3.72359119141728 3.29728482697427 T:C C T 10 0.531941598773897 0.200805512516808 ENSG00000090060:ENST00000216277:exon_97018817_97018959:PAPOLA;ENSG00000090060:ENST00000392990:exon_97018817_97018959:PAPOLA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 97299853 A/G 1 22 29 51 10.2972848269743 15.426306364443 -5.12902153746875 A:G A G 10 0.531941598773897 0.162042317042382 ENSG00000100749:ENST00000216639:exon_97299804_97299968:VRK1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 97321689 C/T 1 42 22 64 19.6584528514963 11.7027151730257 7.95573767847059 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0594176922917793 ENSG00000100749:ENST00000216639:exon_97321561_97321693:VRK1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 100808845 G/A 1 135 74 209 63.1878841655239 39.3636783092684 23.8242058562555 A:G G A 10 0.531941598773897 0.00107466864940074 ENSG00000140105:ENST00000392882:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000355338:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000358655:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000344102:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000392880:exon_100808735_100808908:WARS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 100996312 T/C 1 6 6 12 2.80835040735662 3.19164959264338 -0.383299185286765 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000176473:ENST00000402312:exon_100996157_100996625:WDR25;ENSG00000176473:ENST00000335290:exon_100996157_100996640:WDR25 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 102493761 A/G 1 13 9 22 6.08475921593934 4.78747438896507 1.29728482697427 A:G A G 10 0.531941598773897 0.6717023671041 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102493720_102493881:DYNC1H1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 102504838 C/T 1 21 18 39 9.82922642574816 9.57494877793015 0.254277647818016 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102504797_102504943:DYNC1H1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 102514227 T/C 1 24 46 70 11.2334016294265 24.4693135435993 -13.2359119141728 T:C T C 10 0.531941598773897 0.00170561534245029 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102514154_102514365:DYNC1H1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 102550803 G/A 1 322 326 648 150.714805194805 173.41296120029 -22.6981560054853 A:C:G G A 10 0.531941598773897 0.0764987317057297 ENSG00000080824:ENST00000334701:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000216281:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000441629:exon_102550736_102550901:HSP90AA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 102675350 G/C 1 5 7 12 2.34029200613052 3.72359119141728 -1.38329918528676 C:G G C 10 0.531941598773897 0.56545794539378 ENSG00000140153:ENST00000335263:exon_102674940_102676199:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000454394:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000342702:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000299135:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000401892:exon_102674940_102676199:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000424963:exon_102674936_102676863:WDR20 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 102792489 G/A 1 2 7 9 0.936116802452206 3.72359119141728 -2.78747438896507 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0926560584503697 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102792322_102793224:ZNF839 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 102792631 G/A 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 A:G G A 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102792322_102793224:ZNF839 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 102808157 G/A 1 11 8 19 5.14864241348713 4.25553279019118 0.893109623295957 A:G G A 10 0.531941598773897 0.819320657489995 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102807660_102809044:ZNF839 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 103342049 T/C 1 13 19 32 6.08475921593934 10.106890376704 -4.02213116076471 T:C T C 10 0.531941598773897 0.161051411561187 ENSG00000131323:ENST00000392745:exon_103341961_103342065:TRAF3;ENSG00000131323:ENST00000347662:exon_103341961_103342065:TRAF3;ENSG00000131323:ENST00000351691:exon_103341961_103342065:TRAF3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 103593950 C/G 1 7 4 11 3.27640880858272 2.12776639509559 1.14864241348713 C:G C G 10 0.531941598773897 0.55795959209382 ENSG00000185215:ENST00000333007:exon_103593342_103593966:TNFAIP2;ENSG00000185215:ENST00000451723:exon_103593342_103593966:TNFAIP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 104165753 G/A 1 23 15 38 10.7653432282004 7.97912398160846 2.78621924659191 A:G G A 10 0.531941598773897 0.41811352179146 ENSG00000126215:ENST00000445556:exon_104165701_104165913:XRCC3;ENSG00000126215:ENST00000352127:exon_104165701_104165913:XRCC3;ENSG00000126215:ENST00000440302:exon_104165701_104165913:XRCC3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 104199356 C/T 1 13 9 22 6.08475921593934 4.78747438896507 1.29728482697427 T:C C T 10 0.531941598773897 0.6717023671041 ENSG00000100711:ENST00000311141:exon_104199320_104199995:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000216602:exon_104199320_104200004:ZFYVE21 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 104381502 T/C 1 116 65 181 54.2947745422279 34.5762039203033 19.7185706219246 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0035761268414989 ENSG00000156411:ENST00000414262:exon_104381403_104381526:C14orf2;ENSG00000156411:ENST00000286953:exon_104381403_104381526:C14orf2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 105478102 G/A 1 43 44 87 20.1265112527224 23.4054303460515 -3.27891909332904 A:G G A 10 0.531941598773897 0.519788680519337 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105478072_105478240:CDCA4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 105716034 C/T 1 9 8 17 4.21252561103493 4.25553279019118 -0.0430071791562492 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000184887:ENST00000327471:exon_105715977_105717421:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000392554:exon_105715977_105717430:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000463376:exon_105715977_105716298:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000392553:exon_105715977_105716633:BTBD6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 105930406 G/A 1 21 23 44 9.82922642574816 12.2346567717996 -2.40543034605147 A:G G A 10 0.531941598773897 0.54624699205029 ENSG00000182979:ENST00000435036:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000414153:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000331320:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000406191:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000405646:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000438610:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000434050:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000490198:exon_105930369_105930484:MTA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 106174261 C/G 1 20 5 25 9.36116802452206 2.65970799386948 6.70146003065257 C:G C G 10 0.531941598773897 0.00814766489019703 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 106307418 G/A 1 277 731 1008 129.652177139631 388.849308703719 -259.197131564088 A:T:C:G G A 10 0.531941598773897 1.79977269999761e-61 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 106321913 G/A 1 5595 1528 7123 2618.78675486005 812.806762926515 1805.97999193353 A:T:C:G G A 10 0.531941598773897 4.94065645841247e-324 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 106330070 G/A 1 22 5 27 10.2972848269743 2.65970799386948 7.63757683310478 A:C:G G A 10 0.531941598773897 0.00323063075974002 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 106791131 A/G 0 55 1 56 25.7432120674357 0.531941598773897 25.2112704686618 A:T A T 10 0.531941598773897 3.70853642285134e-14 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 14 107179106 C/T 0 21 0 21 9.82922642574816 0 9.82922642574816 C C 10 0.531941598773897 1.86962988852280e-06 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 22925851 C/T 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 T:C C T 10 0.531941598773897 0.730998912113487 ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22925777_22925899:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22925777_22925899:CYFIP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 22960868 G/C 1 13 16 29 6.08475921593934 8.51106558038235 -2.42630636444301 C:G G C 10 0.531941598773897 0.457380459449149 ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22960793_22960889:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22960793_22960889:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000435939:exon_22960793_22960889:CYFIP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 22969232 G/A 1 8 11 19 3.74446720980882 5.85135758651287 -2.10689037670404 A:G G A 10 0.531941598773897 0.365044702459487 ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22969163_22969362:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22969163_22969362:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000435939:exon_22969163_22969362:CYFIP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 25616729 C/T 1 9 11 20 4.21252561103493 5.85135758651287 -1.63883197547794 T:C C T 10 0.531941598773897 0.507167926311403 ENSG00000114062:ENST00000232165:exon_25615713_25616959:UBE3A;ENSG00000114062:ENST00000397954:exon_25615713_25616959:UBE3A;ENSG00000114062:ENST00000438097:exon_25615713_25616959:UBE3A;ENSG00000114062:ENST00000428984:exon_25615713_25616959:UBE3A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 34651977 C/T 1 10 9 19 4.68058401226103 4.78747438896507 -0.106890376704043 T:C C T 10 0.531941598773897 1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 40313141 C/T 1 13 6 19 6.08475921593934 3.19164959264338 2.89310962329596 T:C C T 10 0.531941598773897 0.250590825863854 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40313100_40313228:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40313100_40313228:EIF2AK4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 40328665 G/A 1 491 508 999 229.816675002017 270.22633217714 -40.4096571751231 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0111696716611194 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40327891_40328701:SRP14 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 40330518 T/G 1 125 128 253 58.5073001532629 68.0885246430588 -9.58122448979594 T:G T G 10 0.531941598773897 0.231849703379443 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40330483_40330595:SRP14 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 40589002 A/G 1 3 8 11 1.40417520367831 4.25553279019118 -2.85135758651287 A:G A G 10 0.531941598773897 0.128574530340517 ENSG00000137841:ENST00000456256:exon_40588959_40589109:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000260402:exon_40588947_40589109:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000389812:exon_40588947_40589109:PLCB2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 40590134 G/A 1 7 3 10 3.27640880858272 1.59582479632169 1.68058401226103 A:G G A 10 0.531941598773897 0.3537387028518 ENSG00000137841:ENST00000456256:exon_40590078_40590160:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000260402:exon_40590078_40590160:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000389812:exon_40590078_40590160:PLCB2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 40751555 C/A 1 8 5 13 3.74446720980882 2.65970799386948 1.08475921593934 A:C C A 10 0.531941598773897 0.591209044900214 ENSG00000140320:ENST00000416165:exon_40750650_40752095:BAHD1;ENSG00000140320:ENST00000339351:exon_40750650_40752095:BAHD1;ENSG00000140320:ENST00000442618:exon_40750650_40752095:BAHD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 40855210 T/A 1 54 28 82 25.2751536662096 14.8943647656691 10.3807889005404 A:T T A 10 0.531941598773897 0.0263091930629606 ENSG00000128891:ENST00000358005:exon_40854971_40855226:C15orf57;ENSG00000128891:ENST00000416810:exon_40854971_40855226:C15orf57;ENSG00000128891:ENST00000360470:exon_40854971_40855226:C15orf57 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 40862064 C/T 1 8 14 22 3.74446720980882 7.44718238283456 -3.70271517302573 T:C C T 10 0.531941598773897 0.135957589259186 ENSG00000166133:ENST00000315616:exon_40861499_40862142:RPUSD2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 41102372 A/G 1 14 20 34 6.55281761716544 10.6388319754779 -4.0860143583125 A:G A G 10 0.531941598773897 0.172340908154958 ENSG00000166140:ENST00000355341:exon_41102269_41102414:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000299173:exon_41102269_41102414:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000336455:exon_41102269_41102414:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000457207:exon_41102226_41102414:ZFYVE19 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 41105926 T/G 1 18 16 34 8.42505122206985 8.51106558038235 -0.0860143583124984 T:G T G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000166140:ENST00000355341:exon_41105911_41106009:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000299173:exon_41105911_41106009:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000336455:exon_41105911_41106009:ZFYVE19 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 41146880 T/C 1 12 17 29 5.61670081471324 9.04300717915625 -3.42630636444301 T:C T C 10 0.531941598773897 0.264016631003003 ENSG00000166145:ENST00000344051:exon_41146837_41146887:SPINT1;ENSG00000166145:ENST00000431806:exon_41146837_41146887:SPINT1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 41148199 C/T 1 7 3 10 3.27640880858272 1.59582479632169 1.68058401226103 T:C C T 10 0.531941598773897 0.3537387028518 ENSG00000166145:ENST00000344051:exon_41148090_41148260:SPINT1;ENSG00000166145:ENST00000431806:exon_41148090_41148260:SPINT1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 41149161 G/C 1 19 16 35 8.89310962329596 8.51106558038235 0.382044042913604 C:G G C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000166145:ENST00000344051:exon_41148968_41150405:SPINT1;ENSG00000166145:ENST00000431806:exon_41148968_41149852:SPINT1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 41191646 C/T 1 7 10 17 3.27640880858272 5.31941598773897 -2.04300717915625 T:C C T 10 0.531941598773897 0.341802442613557 ENSG00000104142:ENST00000220509:exon_41191342_41193212:VPS18 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 41272405 C/T 1 8 7 15 3.74446720980882 3.72359119141728 0.0208760183915446 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000128908:ENST00000361937:exon_41271078_41272638:INO80 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 41634587 A/G 1 24 7 31 11.2334016294265 3.72359119141728 7.50981043800919 A:G A G 10 0.531941598773897 0.00667671814366645 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 41634588 C/A 1 24 7 31 11.2334016294265 3.72359119141728 7.50981043800919 A:C C A 10 0.531941598773897 0.00667671814366645 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 41672384 A/G 1 78 55 133 36.508555295636 29.2567879325643 7.2517673630717 A:G A G 10 0.531941598773897 0.224164473058797 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41672291_41673245:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41672291_41673245:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450592:exon_41672291_41673245:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41672291_41673245:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41672291_41673245:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41672291_41673245:NUSAP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 41689166 C/A 1 35 38 73 16.3820440429136 20.2137807534081 -3.83173671049448 A:C C A 10 0.531941598773897 0.412103494971766 ENSG00000137806:ENST00000260361:exon_41688685_41689338:NDUFAF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 41689232 C/T 1 37 35 72 17.3181608453658 18.6179559570864 -1.29979511172058 T:C C T 10 0.531941598773897 0.813634141680367 ENSG00000137806:ENST00000260361:exon_41688685_41689338:NDUFAF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 41813279 C/T 1 7 10 17 3.27640880858272 5.31941598773897 -2.04300717915625 T:C C T 10 0.531941598773897 0.341802442613557 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41812589_41813345:RPAP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 41819716 C/T 1 6 7 13 2.80835040735662 3.72359119141728 -0.915240784060662 T:C C T 10 0.531941598773897 0.782547085779911 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41819621_41819803:RPAP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 41829230 A/G 1 5 5 10 2.34029200613052 2.65970799386948 -0.31941598773897 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41829143_41829399:RPAP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 42138456 G/A 1 3 6 9 1.40417520367831 3.19164959264338 -1.78747438896507 A:G G A 10 0.531941598773897 0.320650472569791 ENSG00000168970:ENST00000490848:exon_42138401_42138580:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000382448:exon_42138401_42138580:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000491746:exon_42138141_42138580:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000342159:exon_42138401_42138580:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000487292:exon_42138401_42138580:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000458483:exon_42138401_42138580:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000446407:exon_42138401_42138580:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000243708:ENST00000452633:exon_42138401_42138580:PLA2G4B;ENSG00000243708:ENST00000483748:exon_42138401_42138580:PLA2G4B;ENSG00000243708:ENST00000484140:exon_42138141_42138580:PLA2G4B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 42211486 A/G 1 26 39 65 12.1695184318787 20.745722352182 -8.57620392030331 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0348801295573271 ENSG00000103966:ENST00000220325:exon_42211408_42211820:EHD4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 42459034 T/C 1 6 6 12 2.80835040735662 3.19164959264338 -0.383299185286765 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000166887:ENST00000318006:exon_42458970_42459111:VPS39;ENSG00000166887:ENST00000348544:exon_42458970_42459111:VPS39 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 42820589 G/A 1 32 39 71 14.9778688392353 20.745722352182 -5.76785351294669 A:G G A 10 0.531941598773897 0.191051452631923 ENSG00000092531:ENST00000249647:exon_42820460_42820618:SNAP23 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 43018559 C/T 1 7 3 10 3.27640880858272 1.59582479632169 1.68058401226103 T:C C T 10 0.531941598773897 0.3537387028518 ENSG00000140326:ENST00000267892:exon_43018508_43018615:CDAN1;ENSG00000140326:ENST00000356231:exon_43018508_43018615:CDAN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 43653322 G/A 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000140265:ENST00000396976:exon_43650370_43654139:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000396972:exon_43650370_43654139:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000267817:exon_43650370_43654139:ZSCAN29 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 43653649 G/A 1 6 7 13 2.80835040735662 3.72359119141728 -0.915240784060662 A:G G A 10 0.531941598773897 0.782547085779911 ENSG00000140265:ENST00000396976:exon_43650370_43654139:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000396972:exon_43650370_43654139:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000267817:exon_43650370_43654139:ZSCAN29 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 43707808 A/T 1 22 13 35 10.2972848269743 6.91524078406066 3.3820440429136 A:T A T 10 0.531941598773897 0.310025950721381 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000476454:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000434561:exon_43707792_43708007:TP53BP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 43724646 T/G 1 11 9 20 5.14864241348713 4.78747438896507 0.36116802452206 T:G T G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43724392_43724875:TP53BP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 43748304 A/G 1 7 17 24 3.27640880858272 9.04300717915625 -5.76659837057353 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0231579699164620 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43748090_43748529:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000413546:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000480860:exon_43748090_43748350:TP53BP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 44038899 C/T 1 75 140 215 35.1043800919577 74.4718238283456 -39.3674437363879 T:C C T 10 0.531941598773897 7.4006994118358e-08 ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44038590_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000469684:exon_44038608_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000446523:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000455250:exon_44038810_44038904:PDIA3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 44061802 C/T 1 26 80 106 12.1695184318787 42.5553279019118 -30.3858094700331 T:C C T 10 0.531941598773897 2.17604089952146e-09 ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44061716_44061844:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44061716_44061844:PDIA3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 44120559 T/G 1 13 9 22 6.08475921593934 4.78747438896507 1.29728482697427 T:G T G 10 0.531941598773897 0.6717023671041 ENSG00000092470:ENST00000263795:exon_44120163_44120564:WDR76;ENSG00000092470:ENST00000381246:exon_44120163_44120564:WDR76;ENSG00000092470:ENST00000452115:exon_44120273_44120564:WDR76 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 44943757 A/G 1 8 5 13 3.74446720980882 2.65970799386948 1.08475921593934 A:G A G 10 0.531941598773897 0.591209044900214 ENSG00000104133:ENST00000261866:exon_44943689_44944137:SPG11;ENSG00000104133:ENST00000427534:exon_44943689_44944137:SPG11 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 45361180 A/T 1 19 1 20 8.89310962329596 0.531941598773897 8.36116802452206 A:T A T 10 0.531941598773897 6.72430779561224e-05 ENSG00000140263:ENST00000267814:exon_45361075_45361250:SORD HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 45661678 T/A 1 34 59 93 15.9139856416875 31.3845543276599 -15.4705686859724 A:T:G T A 10 0.531941598773897 0.00167855306930335 ENSG00000171766:ENST00000396659:exon_45661524_45661719:GATM;ENSG00000171766:ENST00000305575:exon_45661524_45661719:GATM;ENSG00000171766:ENST00000432007:exon_45661524_45661719:GATM HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 45695695 G/A 1 12 1 13 5.61670081471324 0.531941598773897 5.08475921593934 A:G G A 10 0.531941598773897 0.00421262497881301 ENSG00000171763:ENST00000305560:exon_45694529_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000531970:exon_45694573_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000396655:exon_45694587_45696889:SPATA5L1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 49048705 G/C 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 C:G G C 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000103995:ENST00000399334:exon_49048100_49048750:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000380950:exon_49048100_49048750:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000325747:exon_49048100_49048750:CEP152 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 49429410 A/G 1 13 21 34 6.08475921593934 11.1707735742518 -5.0860143583125 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0873779889613261 ENSG00000166200:ENST00000388901:exon_49429347_49429424:COPS2;ENSG00000166200:ENST00000299259:exon_49429347_49429424:COPS2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 49620200 C/T 1 24 16 40 11.2334016294265 8.51106558038235 2.72233604904412 T:C C T 10 0.531941598773897 0.430738074110928 ENSG00000156958:ENST00000327171:exon_49620149_49622002:GALK2;ENSG00000156958:ENST00000396509:exon_49620149_49622002:GALK2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 49917341 G/A 1 6 8 14 2.80835040735662 4.25553279019118 -1.44718238283456 A:G G A 10 0.531941598773897 0.594012234271892 ENSG00000104047:ENST00000403028:exon_49917310_49917628:DTWD1;ENSG00000104047:ENST00000329873:exon_49917310_49917628:DTWD1;ENSG00000104047:ENST00000251250:exon_49917310_49917628:DTWD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 52239558 G/A 1 22 27 49 10.2972848269743 14.3624231668952 -4.06513833992095 A:G G A 10 0.531941598773897 0.255242169376896 ENSG00000166477:ENST00000299601:exon_52239489_52239586:LEO1;ENSG00000166477:ENST00000315141:exon_52239489_52239586:LEO1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 52611451 A/G 1 7 8 15 3.27640880858272 4.25553279019118 -0.979123981608455 A:G A G 10 0.531941598773897 0.617504794360634 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52611257_52611539:MYO5A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 55611433 A/G 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 A:G A G 10 0.531941598773897 0.730998912113487 ENSG00000069943:ENST00000164305:exon_55611133_55611611:PIGB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 64418397 G/A 1 13 11 24 6.08475921593934 5.85135758651287 0.233401629426472 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000028528:ENST00000353874:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000261889:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000380285:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000440389:exon_64418278_64418419:SNX1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 64737225 G/A 1 15 11 26 7.02087601839154 5.85135758651287 1.16951843187868 A:G G A 10 0.531941598773897 0.697958031111334 ENSG00000103671:ENST00000261884:exon_64737205_64737307:TRIP4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 66618342 A/G 1 7 9 16 3.27640880858272 4.78747438896507 -1.51106558038235 A:G A G 10 0.531941598773897 0.465195872310583 ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66618169_66618702:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66618169_66618702:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66618169_66618702:DIS3L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 66629403 C/A 1 38 26 64 17.7862192465919 13.8304815681213 3.95573767847059 A:C C A 10 0.531941598773897 0.38081528037831 ENSG00000075131:ENST00000261881:exon_66629052_66629519:TIPIN HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 66793480 C/T 1 12 13 25 5.61670081471324 6.91524078406066 -1.29853996934743 T:C C T 10 0.531941598773897 0.690089572307467 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 67528374 T/G 1 5 7 12 2.34029200613052 3.72359119141728 -1.38329918528676 T:G T G 10 0.531941598773897 0.56545794539378 ENSG00000103591:ENST00000261880:exon_67528317_67528406:AAGAB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 68492028 G/A 1 6 5 11 2.80835040735662 2.65970799386948 0.148642413487133 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000129007:ENST00000354678:exon_68491879_68492300:CALML4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 73027478 T/C 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 T:C T C 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000140463:ENST00000268057:exon_73027454_73027523:BBS4;ENSG00000140463:ENST00000395205:exon_73027454_73027523:BBS4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 73044863 G/A 1 24 21 45 11.2334016294265 11.1707735742518 0.062628055174633 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000159322:ENST00000450412:exon_73043636_73045236:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000311669:exon_73043710_73045233:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000456471:exon_73043710_73045233:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000443764:exon_73044682_73045233:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000331065:exon_73044764_73044958:ADPGK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 74703929 T/C 1 39 48 87 18.254277647818 25.5331967411471 -7.27891909332904 T:C T C 10 0.531941598773897 0.132505492703019 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74703897_74704051:SEMA7A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 75130093 T/C 1 17 1 18 7.95699282084375 0.531941598773897 7.42505122206985 T:C T C 10 0.531941598773897 0.000220760484442127 ENSG00000140474:ENST00000440863:exon_75130092_75130139:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000418051:exon_75130092_75130139:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000268074:exon_75130092_75130139:ULK3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 75932129 G/T 1 61 58 119 28.5515624747923 30.852612728886 -2.30105025409375 T:G G T 10 0.531941598773897 0.713593676653291 ENSG00000177971:ENST00000314852:exon_75931426_75932609:IMP3;ENSG00000177971:ENST00000403490:exon_75931690_75932552:IMP3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 76496232 G/A 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 A:G G A 10 0.531941598773897 0.486426237614014 ENSG00000169758:ENST00000388942:exon_76496082_76497304:C15orf27;ENSG00000169758:ENST00000484722:exon_76496082_76497303:C15orf27;ENSG00000169758:ENST00000305457:exon_76496082_76497301:C15orf27 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 77344793 T/A 1 34 44 78 15.9139856416875 23.4054303460515 -7.49144470436397 A:T T A 10 0.531941598773897 0.111595462844605 ENSG00000140391:ENST00000267970:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000346495:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000424443:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000423920:exon_77344727_77344810:TSPAN3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 78585106 C/T 1 24 32 56 11.2334016294265 17.0221311607647 -5.78872953133823 T:C C T 10 0.531941598773897 0.140650111702907 ENSG00000140395:ENST00000267973:exon_78584958_78585130:WDR61 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 78841220 T/C 1 430 498 928 201.265112527224 264.906916189401 -63.6418036621764 T:C T C 10 0.531941598773897 3.3145515382581e-05 ENSG00000041357:ENST00000417370:exon_78841132_78841560:PSMA4;ENSG00000041357:ENST00000413382:exon_78841132_78841560:PSMA4;ENSG00000041357:ENST00000044462:exon_78841132_78841604:PSMA4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 80137689 G/A 1 36 25 61 16.8501024441397 13.2985399693474 3.55156247479228 A:G G A 10 0.531941598773897 0.372753180047245 ENSG00000136371:ENST00000258874:exon_80137318_80137784:MTHFS;ENSG00000136371:ENST00000479961:exon_80137537_80137784:MTHFS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 80260014 T/C 1 19 70 89 8.89310962329596 37.2359119141728 -28.3428022908768 T:C T C 10 0.531941598773897 1.39990471570528e-09 ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80259979_80260034:BCL2A1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 80263217 C/T 1 328 353 681 153.523155602162 187.775384367186 -34.2522287650239 T:C:G C T 10 0.531941598773897 0.00899268476510216 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 80263345 A/C 1 195 198 393 91.2713882390901 105.324436557232 -14.0530483181415 A:C A C 10 0.531941598773897 0.157292967177302 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 80263406 C/T 1 141 136 277 65.9962345728805 72.34405743325 -6.34782286036948 T:C C T 10 0.531941598773897 0.470108776512927 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 82444437 A/G 1 29 32 61 13.573693635557 17.0221311607647 -3.44843752520772 A:G A G 10 0.531941598773897 0.441689838032626 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 82512429 C/G 1 10 10 20 4.68058401226103 5.31941598773897 -0.63883197547794 C:G C G 10 0.531941598773897 0.825252984872384 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82512419_82512570:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82512419_82512570:EFTUD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 85189464 T/G 1 13 6 19 6.08475921593934 3.19164959264338 2.89310962329596 T:G T G 10 0.531941598773897 0.250590825863854 ENSG00000177082:ENST00000434634:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000398528:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000323189:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000419751:exon_85189293_85189579:WDR73 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 85341859 G/A 1 8 13 21 3.74446720980882 6.91524078406066 -3.17077357425184 A:G G A 10 0.531941598773897 0.192501336721756 ENSG00000166716:ENST00000299927:exon_85341819_85342106:ZNF592 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 86278309 G/A 1 10 6 16 4.68058401226103 3.19164959264338 1.48893441961765 A:G G A 10 0.531941598773897 0.61793977257828 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86278223_86278381:AKAP13 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 86284342 C/T 1 16 15 31 7.48893441961765 7.97912398160846 -0.490189561990808 T:C C T 10 0.531941598773897 0.859578776903335 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86284277_86284726:AKAP13 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 89182596 A/G 1 224 191 415 104.845081874647 101.600845365814 3.24423650883273 A:G A G 10 0.531941598773897 0.768023927599346 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89182574_89182825:ISG20;ENSG00000172183:ENST00000379224:exon_89182574_89182825:ISG20 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 89804043 C/T 1 1 7 8 0.468058401226103 3.72359119141728 -3.25553279019118 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0296580964656471 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89803944_89804074:FANCI HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 89836228 G/C 1 26 16 42 12.1695184318787 8.51106558038235 3.65845285149632 C:G G C 10 0.531941598773897 0.281941557223940 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89836173_89836294:FANCI HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 89858602 T/C 1 48 50 98 22.4668032588529 26.5970799386949 -4.13027667984191 T:C T C 10 0.531941598773897 0.419331107158607 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89858513_89858620:FANCI HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 89860786 A/C 1 6 3 9 2.80835040735662 1.59582479632169 1.21252561103493 A:C A C 10 0.531941598773897 0.515798041804277 ENSG00000140521:ENST00000526671:exon_89860607_89861059:POLG HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 90623052 T/C 1 8 6 14 3.74446720980882 3.19164959264338 0.552817617165442 T:C T C 10 0.531941598773897 0.796438673256377 ENSG00000140548:ENST00000268154:exon_90622892_90625432:ZNF710 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 90771750 T/G 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 T:G T G 10 0.531941598773897 0.730998912113487 ENSG00000185033:ENST00000332496:exon_90771136_90772892:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000437083:exon_90771136_90772890:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000411539:exon_90771136_90772892:SEMA4B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 90814664 C/T 1 59 40 99 27.6154456723401 21.2776639509559 6.3377817213842 T:C C T 10 0.531941598773897 0.226967023875961 ENSG00000182768:ENST00000331497:exon_90814420_90816463:NGRN;ENSG00000182768:ENST00000379095:exon_90814420_90815440:NGRN HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 91010776 T/C 1 13 6 19 6.08475921593934 3.19164959264338 2.89310962329596 T:C T C 10 0.531941598773897 0.250590825863854 ENSG00000140575:ENST00000268182:exon_91010682_91010824:IQGAP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 91304144 A/G 1 6 4 10 2.80835040735662 2.12776639509559 0.68058401226103 A:G A G 10 0.531941598773897 0.758887050232993 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91303824_91304485:BLM HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 91513674 T/C 1 15 13 28 7.02087601839154 6.91524078406066 0.105635234330883 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000198901:ENST00000417173:exon_91513634_91513744:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000394249:exon_91513634_91513744:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361188:exon_91513634_91513744:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000442656:exon_91513634_91513744:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361919:exon_91513634_91513744:PRC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 91525048 C/G 1 17 14 31 7.95699282084375 7.44718238283456 0.509810438009192 C:G C G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000198901:ENST00000417173:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000394249:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361188:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000442656:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361919:exon_91524978_91525211:PRC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 100246936 T/C 1 9 2 11 4.21252561103493 1.06388319754779 3.14864241348713 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0713639747063953 ENSG00000068305:ENST00000354410:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000346108:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000449277:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000338042:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000453228:exon_100246934_100247060:MEF2A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 101464915 T/C 1 6 3 9 2.80835040735662 1.59582479632169 1.21252561103493 T:C T C 10 0.531941598773897 0.515798041804277 ENSG00000154237:ENST00000532029:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000534045:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000527698:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101464777_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101464808_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101464808_101464934:LRRK1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 101591923 A/G 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 A:G A G 10 0.531941598773897 0.486426237614014 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101591916_101592165:LRRK1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 101606889 G/A 1 8 11 19 3.74446720980882 5.85135758651287 -2.10689037670404 A:G G A 10 0.531941598773897 0.365044702459487 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101606845_101606946:LRRK1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 101606890 C/A 1 8 11 19 3.74446720980882 5.85135758651287 -2.10689037670404 A:C C A 10 0.531941598773897 0.365044702459487 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101606845_101606946:LRRK1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 101718097 C/G 1 8 5 13 3.74446720980882 2.65970799386948 1.08475921593934 C:G C G 10 0.531941598773897 0.591209044900214 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 101718239 C/G 1 4 8 12 1.87223360490441 4.25553279019118 -2.38329918528676 C:G C G 10 0.531941598773897 0.247137734070613 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 15 102192540 T/G 1 18 10 28 8.42505122206985 5.31941598773897 3.10563523433088 T:G T G 10 0.531941598773897 0.261281244740623 ENSG00000184277:ENST00000428002:exon_102192474_102192594:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000347970:exon_102192474_102192594:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000333202:exon_102192474_102192570:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000453041:exon_102192474_102192594:TM2D3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 419092 A/G 1 120 81 201 56.1670081471324 43.0872695006857 13.0797386464467 A:G A G 10 0.531941598773897 0.066313658604301 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 419154 G/A 1 83 36 119 38.8488473017665 19.1498975558603 19.6989497459063 A:G G A 10 0.531941598773897 0.000304888015484335 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 420140 G/A 1 81 72 153 37.9127304993143 38.2997951117206 -0.387064612406242 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419931_420225:MRPL28 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 420179 G/A 1 89 75 164 41.6571977091232 39.8956199080423 1.76157780108089 A:G G A 10 0.531941598773897 0.814658949448464 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419931_420225:MRPL28 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 426432 T/C 1 26 16 42 12.1695184318787 8.51106558038235 3.65845285149632 T:C T C 10 0.531941598773897 0.281941557223940 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000475348:exon_426136_426475:TMEM8A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 427479 T/C 1 15 15 30 7.02087601839154 7.97912398160846 -0.958247963216911 T:C T C 10 0.531941598773897 0.85523751660529 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 427516 T/C 1 14 11 25 6.55281761716544 5.85135758651287 0.701460030652575 T:C T C 10 0.531941598773897 0.843014210420399 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 427784 G/A 1 18 10 28 8.42505122206985 5.31941598773897 3.10563523433088 A:G G A 10 0.531941598773897 0.261281244740623 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427671_427848:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427671_427805:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427671_427807:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427671_427848:TMEM8A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 427820 C/T 1 17 9 26 7.95699282084375 4.78747438896507 3.16951843187868 T:C C T 10 0.531941598773897 0.242193782306086 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427671_427848:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427671_427848:TMEM8A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 602595 G/C 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 C:G G C 10 0.531941598773897 0.730998912113487 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 603471 A/G 1 23 22 45 10.7653432282004 11.7027151730257 -0.937371944825365 A:G A G 10 0.531941598773897 0.881478231546286 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_603339_604636:SOLH;ENSG00000103326:ENST00000397687:exon_603339_604634:SOLH HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 778820 G/A 1 24 32 56 11.2334016294265 17.0221311607647 -5.78872953133823 A:G G A 10 0.531941598773897 0.140650111702907 ENSG00000103253:ENST00000341413:exon_778794_779715:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389701:exon_778794_778868:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389703:exon_778794_778895:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389702:exon_778794_779168:HAGHL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 784765 C/T 1 6 13 19 2.80835040735662 6.91524078406066 -4.10689037670404 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0676157669394294 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_784737_784871:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_784737_784871:NARFL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 1470318 C/T 1 31 34 65 14.5098104380092 18.0860143583125 -3.57620392030331 T:C C T 10 0.531941598773897 0.386770251711389 ENSG00000174109:ENST00000442039:exon_1469754_1470613:C16orf91 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 12758966 T/C 1 8 6 14 3.74446720980882 3.19164959264338 0.552817617165442 T:C T C 10 0.531941598773897 0.796438673256377 ENSG00000103381:ENST00000433677:exon_12753657_12758972:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000261660:exon_12753657_12758972:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000381774:exon_12756937_12758972:CPPED1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 12897578 G/T 1 2 6 8 0.936116802452206 3.19164959264338 -2.25553279019118 T:G G T 10 0.531941598773897 0.158093130392085 ENSG00000103381:ENST00000433677:exon_12897564_12897744:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000261660:exon_12897564_12897744:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000381774:exon_12897564_12897728:CPPED1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 14742400 T/G 1 21 21 42 9.82922642574816 11.1707735742518 -1.34154714850368 T:G T G 10 0.531941598773897 0.75774903675093 ENSG00000103429:ENST00000261658:exon_14742245_14742449:BFAR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 15122812 C/G 1 41 19 60 19.1903944502702 10.106890376704 9.08350407356618 C:G C G 10 0.531941598773897 0.0197445027122434 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15122735_15122823:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15122735_15122823:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000447912:exon_15122735_15122823:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15122735_15122823:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15122735_15123657:PDXDC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 15129940 C/T 1 23 21 44 10.7653432282004 11.1707735742518 -0.405430346051469 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000447912:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15129873_15131543:PDXDC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 15961351 T/C 0 13 0 13 6.08475921593934 0 6.08475921593934 T T 10 0.531941598773897 0.000324792060879682 ENSG00000133393:ENST00000255759:exon_15959576_15961373:C16orf63;ENSG00000133393:ENST00000413903:exon_15959576_15961373:C16orf63 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 15961356 C/T 1 17 2 19 7.95699282084375 1.06388319754779 6.89310962329596 T:C C T 10 0.531941598773897 0.00183503293898607 ENSG00000133393:ENST00000255759:exon_15959576_15961373:C16orf63;ENSG00000133393:ENST00000413903:exon_15959576_15961373:C16orf63 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 15961369 G/A 1 19 2 21 8.89310962329596 1.06388319754779 7.82922642574816 A:G G A 10 0.531941598773897 0.000586717576878659 ENSG00000133393:ENST00000255759:exon_15959576_15961373:C16orf63;ENSG00000133393:ENST00000413903:exon_15959576_15961373:C16orf63 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 19548461 C/T 1 7 4 11 3.27640880858272 2.12776639509559 1.14864241348713 T:C C T 10 0.531941598773897 0.55795959209382 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 19680546 T/C 1 4 9 13 1.87223360490441 4.78747438896507 -2.91524078406066 T:C T C 10 0.531941598773897 0.162564563323673 ENSG00000103544:ENST00000438132:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000251143:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000417362:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000448695:exon_19680482_19680621:C16orf62 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 19718313 G/A 1 36 24 60 16.8501024441397 12.7665983705735 4.08350407356618 A:G G A 10 0.531941598773897 0.303746057589208 ENSG00000103550:ENST00000219837:exon_19717676_19718543:C16orf88;ENSG00000103550:ENST00000420899:exon_19717723_19718543:C16orf88 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 23489711 C/G 1 14 14 28 6.55281761716544 7.44718238283456 -0.894364765669117 C:G C G 10 0.531941598773897 0.850300347768159 ENSG00000103365:ENST00000309859:exon_23489689_23489822:GGA2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 23535680 A/C 1 9 8 17 4.21252561103493 4.25553279019118 -0.0430071791562492 A:C A C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23533335_23535775:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23534832_23535775:EARS2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 23536684 T/C 1 5 9 14 2.34029200613052 4.78747438896507 -2.44718238283456 T:C T C 10 0.531941598773897 0.283917011510726 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23536565_23536700:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23536565_23536700:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23536448_23536700:EARS2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 23563501 C/T 1 6 3 9 2.80835040735662 1.59582479632169 1.21252561103493 T:C C T 10 0.531941598773897 0.515798041804277 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23563470_23563625:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23563470_23563625:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23563470_23563625:EARS2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 23634293 C/T 1 2 6 8 0.936116802452206 3.19164959264338 -2.25553279019118 T:C:G C T 10 0.531941598773897 0.158093130392085 ENSG00000083093:ENST00000261584:exon_23634290_23634451:PALB2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 23641461 C/G 1 5 6 11 2.34029200613052 3.19164959264338 -0.851357586512867 C:G C G 10 0.531941598773897 0.764860318695721 ENSG00000083093:ENST00000261584:exon_23640961_23641790:PALB2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 23672560 A/T 1 8 4 12 3.74446720980882 2.12776639509559 1.61670081471324 A:T A T 10 0.531941598773897 0.3994437340124 ENSG00000166847:ENST00000300087:exon_23672491_23672602:DCTN5;ENSG00000166847:ENST00000446651:exon_23672491_23672563:DCTN5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 23677006 A/G 1 27 32 59 12.6375768331048 17.0221311607647 -4.38455432765992 A:G A G 10 0.531941598773897 0.296738329064993 ENSG00000166847:ENST00000300087:exon_23676947_23677049:DCTN5;ENSG00000166847:ENST00000446651:exon_23676996_23677049:DCTN5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 23690219 G/T 1 22 22 44 10.2972848269743 11.7027151730257 -1.40543034605147 T:G G T 10 0.531941598773897 0.762998786164387 ENSG00000166851:ENST00000300093:exon_23690143_23690661:PLK1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 23701538 A/G 1 117 100 217 54.7628329434541 53.1941598773897 1.56867306606435 A:G A G 10 0.531941598773897 0.838671646834372 ENSG00000166851:ENST00000300093:exon_23701181_23701688:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000330792:exon_23701452_23701541:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000425844:exon_23701181_23701688:PLK1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 23847575 C/A 1 22 14 36 10.2972848269743 7.44718238283456 2.85010244413971 A:C C A 10 0.531941598773897 0.404843859004633 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_23847322_23847669:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_23847345_23847669:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000498058:exon_23847403_23847669:PRKCB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 24582299 C/G 1 61 50 111 28.5515624747923 26.5970799386949 1.95448253609743 C:G C G 10 0.531941598773897 0.775564489220899 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 24582877 G/A 1 64 41 105 29.9557376784706 21.8096055497298 8.14613212874081 A:G G A 10 0.531941598773897 0.118152330102364 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 24583406 A/G 1 97 122 219 45.401664918932 64.8968750504154 -19.4952101314834 A:G A G 10 0.531941598773897 0.00991993757228846 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 27238110 C/T 1 68 51 119 31.827971283375 27.1290215374687 4.69894974590625 T:C C T 10 0.531941598773897 0.409336181061941 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27238041_27238157:NSMCE1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 27472772 C/T 1 15 19 34 7.02087601839154 10.106890376704 -3.0860143583125 T:C C T 10 0.531941598773897 0.306815928235480 ENSG00000077235:ENST00000170629:exon_27471935_27472883:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000356183:exon_27471935_27472883:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000388971:exon_27471935_27472883:GTF3C1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 27474910 A/G 1 17 19 36 7.95699282084375 10.106890376704 -2.14989755586029 A:G A G 10 0.531941598773897 0.507116645066343 ENSG00000077235:ENST00000170629:exon_27474862_27474913:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000356183:exon_27474862_27474913:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000388971:exon_27474862_27474913:GTF3C1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 28506428 C/T 1 6 4 10 2.80835040735662 2.12776639509559 0.68058401226103 T:C C T 10 0.531941598773897 0.758887050232993 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28506420_28507410:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28506420_28507410:AC138894.1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 28508447 A/G 1 7 2 9 3.27640880858272 1.06388319754779 2.21252561103493 A:G A G 10 0.531941598773897 0.187705653333192 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 28847246 T/C 1 6 10 16 2.80835040735662 5.31941598773897 -2.51106558038235 T:C T C 10 0.531941598773897 0.221856598747246 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 28944700 G/T 1 38 30 68 17.7862192465919 15.9582479632169 1.827971283375 T:G G T 10 0.531941598773897 0.716066882090836 ENSG00000177455:ENST00000324662:exon_28944555_28944830:CD19 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 28993369 C/T 1 7 12 19 3.27640880858272 6.38329918528676 -3.10689037670404 T:C C T 10 0.531941598773897 0.172695126179914 ENSG00000169682:ENST00000311008:exon_28993222_28993377:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000452515:exon_28993222_28993377:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000323081:exon_28993222_28993377:SPNS1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 29998280 C/T 1 5 7 12 2.34029200613052 3.72359119141728 -1.38329918528676 T:C C T 10 0.531941598773897 0.56545794539378 ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29997586_29999719:TAOK2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 30393147 C/A 1 70 61 131 32.7640880858272 32.4484375252077 0.315650560619495 A:C C A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000180096:ENST00000321367:exon_30393081_30393204:SEPT1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 30408961 C/T 1 5 9 14 2.34029200613052 4.78747438896507 -2.44718238283456 T:C C T 10 0.531941598773897 0.283917011510726 ENSG00000180035:ENST00000495929:exon_30408651_30410681:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000528032:exon_30408651_30409012:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000524644:exon_30408651_30409001:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000320159:exon_30408651_30411429:ZNF48 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 30536083 G/A 1 51 51 102 23.8709784625313 27.1290215374687 -3.2580430749375 A:G G A 10 0.531941598773897 0.552204212342541 ENSG00000169957:ENST00000380412:exon_30535325_30537372:ZNF768 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 30666367 C/T 1 38 30 68 17.7862192465919 15.9582479632169 1.827971283375 T:C C T 10 0.531941598773897 0.716066882090836 ENSG00000156858:ENST00000287463:exon_30665950_30666535:PRR14;ENSG00000156858:ENST00000300835:exon_30665950_30666535:PRR14 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 31075175 G/A 1 8 5 13 3.74446720980882 2.65970799386948 1.08475921593934 A:G G A 10 0.531941598773897 0.591209044900214 ENSG00000167394:ENST00000394983:exon_31075134_31075802:ZNF668;ENSG00000167394:ENST00000300849:exon_31075134_31075802:ZNF668 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 31091209 T/C 1 13 9 22 6.08475921593934 4.78747438896507 1.29728482697427 T:C T C 10 0.531941598773897 0.6717023671041 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 31092075 G/A 1 6 10 16 2.80835040735662 5.31941598773897 -2.51106558038235 A:G G A 10 0.531941598773897 0.221856598747246 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 31121793 G/A 1 21 30 51 9.82922642574816 15.9582479632169 -6.12902153746875 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0929927326937413 ENSG00000103507:ENST00000394951:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000219794:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000394950:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000287507:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000394952:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000441132:exon_31121722_31121801:BCKDK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 31193942 C/A 1 325 326 651 152.118980398483 173.41296120029 -21.293980801807 A:T:C C A 10 0.531941598773897 0.0990170726964286 ENSG00000089280:ENST00000254108:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000433338:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000394533:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000380244:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000487045:exon_31193834_31194283:FUS;ENSG00000089280:ENST00000491029:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000354711:exon_31193834_31193985:FUS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 31374535 C/G 1 6 6 12 2.80835040735662 3.19164959264338 -0.383299185286765 C:G C G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000140678:ENST00000268296:exon_31374486_31374695:ITGAX;ENSG00000140678:ENST00000394880:exon_31374486_31374695:ITGAX HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 31476194 G/A 1 8 10 18 3.74446720980882 5.31941598773897 -1.57494877793015 A:G G A 10 0.531941598773897 0.487247762768628 ENSG00000140691:ENST00000408912:exon_31475715_31476208:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000268314:exon_31475715_31476208:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000457010:exon_31475715_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000412665:exon_31475715_31476208:ARMC5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 50827518 C/T 1 32 36 68 14.9778688392353 19.1498975558603 -4.172028716625 T:C C T 10 0.531941598773897 0.332349919853412 ENSG00000083799:ENST00000427738:exon_50827457_50827575:CYLD;ENSG00000083799:ENST00000311559:exon_50827457_50827575:CYLD;ENSG00000083799:ENST00000398568:exon_50827457_50827575:CYLD HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 53358439 A/G 1 6 3 9 2.80835040735662 1.59582479632169 1.21252561103493 A:G A G 10 0.531941598773897 0.515798041804277 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53357932_53361413:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53357932_53361413:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53357932_53361413:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000450543:exon_53357932_53358807:CHD9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 53504536 A/T 1 6 6 12 2.80835040735662 3.19164959264338 -0.383299185286765 A:T A T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000103479:ENST00000262133:exon_53504295_53504575:RBL2;ENSG00000103479:ENST00000379935:exon_53504295_53504575:RBL2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 53504721 T/C 1 9 3 12 4.21252561103493 1.59582479632169 2.61670081471324 T:C T C 10 0.531941598773897 0.155839710778340 ENSG00000103479:ENST00000262133:exon_53504658_53504834:RBL2;ENSG00000103479:ENST00000379935:exon_53504658_53504834:RBL2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 57016092 G/A 1 3 10 13 1.40417520367831 5.31941598773897 -3.91524078406066 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0476401233689254 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57016077_57016149:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57016077_57016149:CETP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 57060724 G/A 1 5 6 11 2.34029200613052 3.19164959264338 -0.851357586512867 A:G G A 10 0.531941598773897 0.764860318695721 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57059280_57060930:NLRC5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 57085465 C/T 1 6 7 13 2.80835040735662 3.72359119141728 -0.915240784060662 T:C C T 10 0.531941598773897 0.782547085779911 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57085450_57085533:NLRC5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 57180158 C/A 1 7 9 16 3.27640880858272 4.78747438896507 -1.51106558038235 A:C C A 10 0.531941598773897 0.465195872310583 ENSG00000140848:ENST00000290776:exon_57179997_57180233:CPNE2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 57392733 A/C 1 83 158 241 38.8488473017665 84.0467726062757 -45.1979253045092 A:C A C 10 0.531941598773897 6.21062371632675e-09 ENSG00000102962:ENST00000219235:exon_57392684_57392801:CCL22 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 57499902 T/C 1 19 35 54 8.89310962329596 18.6179559570864 -9.72484633379044 T:C T C 10 0.531941598773897 0.00919367652896923 ENSG00000102978:ENST00000219252:exon_57499865_57499933:POLR2C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 57601792 C/T 1 30 26 56 14.0417520367831 13.8304815681213 0.211270468661766 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000349457:exon_57601768_57602036:GPR114 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 57609000 C/G 1 41 37 78 19.1903944502702 19.6818391546342 -0.491444704363968 C:G C G 10 0.531941598773897 0.910280886761094 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000349457:exon_57608727_57609004:GPR114 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 67237090 G/A 1 7 4 11 3.27640880858272 2.12776639509559 1.14864241348713 A:G G A 10 0.531941598773897 0.55795959209382 ENSG00000102890:ENST00000360833:exon_67237022_67237126:ELMO3;ENSG00000102890:ENST00000393997:exon_67237022_67237126:ELMO3;ENSG00000102890:ENST00000477898:exon_67237022_67237126:ELMO3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 67686382 G/A 1 18 8 26 8.42505122206985 4.25553279019118 4.16951843187868 A:G G A 10 0.531941598773897 0.117413281095481 ENSG00000159753:ENST00000334583:exon_67686375_67686441:RLTPR;ENSG00000159753:ENST00000398282:exon_67686375_67686441:RLTPR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 67709199 C/T 1 9 7 16 4.21252561103493 3.72359119141728 0.488934419617648 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000141098:ENST00000268797:exon_67708436_67709956:GFOD2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 67911517 T/C 1 17 12 29 7.95699282084375 6.38329918528676 1.57369363555699 T:C T C 10 0.531941598773897 0.582816143128388 ENSG00000038358:ENST00000358933:exon_67911412_67911559:EDC4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 67964203 T/C 1 2 8 10 0.936116802452206 4.25553279019118 -3.31941598773897 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0533475902799566 ENSG00000141086:ENST00000319955:exon_67964088_67964221:CTRL;ENSG00000141086:ENST00000432773:exon_67963848_67964221:CTRL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 67969930 A/G 1 193 214 407 90.3352714366379 113.835502137614 -23.5002307009761 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0222079010539910 ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969866_67970006:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969866_67970215:PSMB10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 68024032 C/A 1 4 7 11 1.87223360490441 3.72359119141728 -1.85135758651287 A:C C A 10 0.531941598773897 0.36707898879345 ENSG00000167261:ENST00000322384:exon_68023950_68024034:DPEP2;ENSG00000167261:ENST00000268795:exon_68023950_68024034:DPEP2;ENSG00000167261:ENST00000393847:exon_68023950_68024034:DPEP2;ENSG00000167261:ENST00000412757:exon_68023950_68024034:DPEP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 68055495 G/C 1 30 26 56 14.0417520367831 13.8304815681213 0.211270468661766 C:G G C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000182810:ENST00000332395:exon_68055174_68057959:DDX28 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 68088485 A/G 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 A:G A G 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000167264:ENST00000358896:exon_68088477_68088520:DUS2L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 68225431 A/G 1 18 24 42 8.42505122206985 12.7665983705735 -4.34154714850368 A:G A G 10 0.531941598773897 0.216069212478974 ENSG00000072736:ENST00000379165:exon_68224671_68226113:NFATC3;ENSG00000072736:ENST00000349223:exon_68224671_68225678:NFATC3;ENSG00000072736:ENST00000346183:exon_68224671_68225678:NFATC3;ENSG00000072736:ENST00000329524:exon_68224671_68225678:NFATC3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 68387373 C/T 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 T:C C T 10 0.531941598773897 1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 68387457 C/T 1 20 29 49 9.36116802452206 15.426306364443 -6.06513833992095 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0872195165297759 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68387395_68387469:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68387395_68387469:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68387395_68387469:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68387395_68387469:PRMT7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 68389772 C/T 1 30 21 51 14.0417520367831 11.1707735742518 2.87097846253125 T:C C T 10 0.531941598773897 0.483732777794563 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68389626_68389786:PRMT7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 69177189 T/C 1 12 19 31 5.61670081471324 10.106890376704 -4.49018956199081 T:C T C 10 0.531941598773897 0.148746581952776 ENSG00000141076:ENST00000314423:exon_69177081_69177292:CIRH1A;ENSG00000141076:ENST00000352319:exon_69177081_69177292:CIRH1A;ENSG00000141076:ENST00000453167:exon_69177081_69177292:CIRH1A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 70164334 A/G 1 11 1 12 5.14864241348713 0.531941598773897 4.61670081471324 A:G A G 10 0.531941598773897 0.00755148197348677 ENSG00000090857:ENST00000288050:exon_70164326_70164447:PDPR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 70506907 T/C 0 8 0 8 3.74446720980882 0 3.74446720980882 T T 10 0.531941598773897 0.00871435563033556 ENSG00000157353:ENST00000288078:exon_70506886_70507256:FUK;ENSG00000157353:ENST00000378912:exon_70506886_70507256:FUK;ENSG00000157353:ENST00000464499:exon_70506886_70507256:FUK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 70726795 C/A 1 8 14 22 3.74446720980882 7.44718238283456 -3.70271517302573 A:C C A 10 0.531941598773897 0.135957589259186 ENSG00000103043:ENST00000261776:exon_70726724_70726874:VAC14 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 71318001 G/T 1 9 11 20 4.21252561103493 5.85135758651287 -1.63883197547794 T:G G T 10 0.531941598773897 0.507167926311403 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 71318577 T/C 1 3 6 9 1.40417520367831 3.19164959264338 -1.78747438896507 T:C T C 10 0.531941598773897 0.320650472569791 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 71950450 C/T 1 11 15 26 5.14864241348713 7.97912398160846 -2.83048156812132 T:C:G C T 10 0.531941598773897 0.326715412920753 ENSG00000182149:ENST00000378799:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000378798:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000439924:exon_71950365_71950511:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000424485:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000329908:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000456820:exon_71950365_71950545:KIAA0174 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 72042682 A/C 1 1 10 11 0.468058401226103 5.31941598773897 -4.85135758651287 A:C A C 10 0.531941598773897 0.00415411504617602 ENSG00000102967:ENST00000219240:exon_72042643_72042684:DHODH;ENSG00000102967:ENST00000378782:exon_72042643_72042684:DHODH HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 74425569 C/T 0 34 0 34 15.9139856416875 0 15.9139856416875 C C 10 0.531941598773897 7.22476007281823e-10 ENSG00000196436:ENST00000504746:exon_74425289_74425741:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000429990:exon_74425289_74425978:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000355290:exon_74425289_74426013:NPIPL2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 74664743 T/C 1 8 4 12 3.74446720980882 2.12776639509559 1.61670081471324 T:C T C 10 0.531941598773897 0.3994437340124 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74664679_74664855:RFWD3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 74664810 A/T 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 A:T A T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74664679_74664855:RFWD3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 74670458 C/T 1 5 5 10 2.34029200613052 2.65970799386948 -0.31941598773897 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74670244_74670475:RFWD3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 75269003 G/A 1 29 39 68 13.573693635557 20.745722352182 -7.17202871662499 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0891607682178193 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75268787_75269884:BCAR1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 75269325 C/T 1 19 13 32 8.89310962329596 6.91524078406066 1.97786883923529 T:C C T 10 0.531941598773897 0.595907192228062 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75268787_75269884:BCAR1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 75269534 C/T 1 13 13 26 6.08475921593934 6.91524078406066 -0.830481568121323 T:C C T 10 0.531941598773897 0.844915066483025 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75268787_75269884:BCAR1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 75276775 G/A 1 15 15 30 7.02087601839154 7.97912398160846 -0.958247963216911 A:G G A 10 0.531941598773897 0.85523751660529 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75276368_75276988:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75276368_75276988:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75276368_75276988:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75276368_75276988:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75276368_75276988:BCAR1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 81888152 A/G 1 25 25 50 11.7014600306526 13.2985399693474 -1.59707993869485 A:G A G 10 0.531941598773897 0.672871060346848 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81888049_81888192:PLCG2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 84212571 C/A 1 37 32 69 17.3181608453658 17.0221311607647 0.296029684601105 A:C C A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 84213114 C/T 1 26 16 42 12.1695184318787 8.51106558038235 3.65845285149632 T:C C T 10 0.531941598773897 0.281941557223940 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 84213434 A/T 1 19 16 35 8.89310962329596 8.51106558038235 0.382044042913604 A:T A T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 84215390 T/C 1 4 6 10 1.87223360490441 3.19164959264338 -1.31941598773897 T:C T C 10 0.531941598773897 0.530535902085358 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84215352_84215664:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84215352_84215469:TAF1C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 84695280 A/G 1 14 13 27 6.55281761716544 6.91524078406066 -0.36242316689522 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84695184_84701292:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84695184_84695915:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000426441:exon_84695184_84695915:KLHL36 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 84695490 C/T 1 25 32 57 11.7014600306526 17.0221311607647 -5.32067113011213 T:C C T 10 0.531941598773897 0.184360825057978 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84695184_84701292:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84695184_84695915:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000426441:exon_84695184_84695915:KLHL36 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 84778762 C/T 1 35 41 76 16.3820440429136 21.8096055497298 -5.42756150681617 T:C C T 10 0.531941598773897 0.250247451360931 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 84779248 T/G 1 27 13 40 12.6375768331048 6.91524078406066 5.72233604904412 T:G T G 10 0.531941598773897 0.081240342223947 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 84796603 A/G 1 24 29 53 11.2334016294265 15.426306364443 -4.19290473501654 A:G A G 10 0.531941598773897 0.27217962466019 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84796595_84796694:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84796595_84796694:USP10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 84808824 C/A,G 0 0 43 43 0 22.8734887472776 -22.8734887472776 A:G C A 10 0.531941598773897 6.65122942142048e-15 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84808766_84808831:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84808766_84808831:USP10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 85009970 A/G 1 14 20 34 6.55281761716544 10.6388319754779 -4.0860143583125 A:G A G 10 0.531941598773897 0.172340908154958 ENSG00000153786:ENST00000313732:exon_85007787_85010125:ZDHHC7;ENSG00000153786:ENST00000344861:exon_85008069_85010125:ZDHHC7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 85706047 A/C 1 12 19 31 5.61670081471324 10.106890376704 -4.49018956199081 A:C A C 10 0.531941598773897 0.148746581952776 ENSG00000131149:ENST00000405402:exon_85706011_85706960:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000416667:exon_85706011_85709812:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000253458:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000393243:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412862:exon_85706011_85709812:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412692:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000469381:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000438180:exon_85706011_85706499:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000496345:exon_85706011_85706102:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000471070:exon_85706011_85706254:KIAA0182 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 85711769 G/A 1 76 86 162 35.5724384931838 45.7469774945551 -10.1745390013713 A:G G A 10 0.531941598773897 0.115538116173286 ENSG00000131153:ENST00000253462:exon_85709804_85711943:GINS2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 85711860 C/T 1 68 55 123 31.827971283375 29.2567879325643 2.57118335081067 T:C C T 10 0.531941598773897 0.652728785224815 ENSG00000131153:ENST00000253462:exon_85709804_85711943:GINS2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 85954729 C/T 1 80 75 155 37.4446720980882 39.8956199080423 -2.45094780995404 T:C C T 10 0.531941598773897 0.74761171447872 ENSG00000140968:ENST00000268638:exon_85954712_85956197:IRF8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 86566039 C/T 1 8 5 13 3.74446720980882 2.65970799386948 1.08475921593934 T:C C T 10 0.531941598773897 0.591209044900214 ENSG00000103248:ENST00000381214:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000360900:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000322911:exon_86563783_86566087:MTHFSD HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 86566042 G/A 1 8 5 13 3.74446720980882 2.65970799386948 1.08475921593934 A:G G A 10 0.531941598773897 0.591209044900214 ENSG00000103248:ENST00000381214:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000360900:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000322911:exon_86563783_86566087:MTHFSD HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 87788864 G/A 1 9 11 20 4.21252561103493 5.85135758651287 -1.63883197547794 A:G G A 10 0.531941598773897 0.507167926311403 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87788800_87788898:KLHDC4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 87868141 G/C 1 15 20 35 7.02087601839154 10.6388319754779 -3.6179559570864 C:G G C 10 0.531941598773897 0.238889316028833 ENSG00000103257:ENST00000261622:exon_87868020_87868197:SLC7A5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 88779739 A/G 1 14 16 30 6.55281761716544 8.51106558038235 -1.95824796321691 A:G A G 10 0.531941598773897 0.583880929092300 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779720_88779855:CTU2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 88781040 A/G 1 27 34 61 12.6375768331048 18.0860143583125 -5.44843752520772 A:G A G 10 0.531941598773897 0.199115101820117 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780995_88781145:CTU2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 88781614 G/C 1 30 14 44 14.0417520367831 7.44718238283456 6.59456965394853 C:G G C 10 0.531941598773897 0.0499457453649488 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000103335:ENST00000301015:exon_88781588_88782262:FAM38A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 88876060 T/C 1 190 189 379 88.9310962329596 100.536962168267 -11.605865935307 T:C T C 10 0.531941598773897 0.236782796119345 ENSG00000198931:ENST00000378364:exon_88875877_88876248:APRT;ENSG00000198931:ENST00000426324:exon_88875877_88876114:APRT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 89349941 G/C 1 73 73 146 34.1682632895055 38.8317367104945 -4.66347342098896 C:G G C 10 0.531941598773897 0.45615123185254 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 89620328 G/A 1 12 11 23 5.61670081471324 5.85135758651287 -0.234656771799632 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000197912:ENST00000268704:exon_89620202_89620368:SPG7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 89623405 C/T 1 41 40 81 19.1903944502702 21.2776639509559 -2.08726950068566 T:C C T 10 0.531941598773897 0.65748718519213 ENSG00000197912:ENST00000268704:exon_89623295_89624174:SPG7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 89627460 T/G 1 1687 1298 2985 789.614522868436 690.460195208518 99.1543276599174 T:G T G 10 0.531941598773897 0.000280619712947612 ENSG00000167526:ENST00000311528:exon_89627348_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000491523:exon_89627348_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000484610:exon_89627348_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000487034:exon_89627348_89627931:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000467736:exon_89627348_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000393099:exon_89627119_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000399461:exon_89627312_89627776:RPL13 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 89760652 C/T 1 10 4 14 4.68058401226103 2.12776639509559 2.55281761716544 T:C C T 10 0.531941598773897 0.191981298637752 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 89764237 C/T 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000158792:ENST00000289805:exon_89762751_89764713:SPATA2L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 89777761 C/T 1 5 6 11 2.34029200613052 3.19164959264338 -0.851357586512867 T:C C T 10 0.531941598773897 0.764860318695721 ENSG00000075399:ENST00000389386:exon_89777735_89777820:C16orf7;ENSG00000075399:ENST00000261625:exon_89777735_89777820:C16orf7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 16 89805261 A/G 1 9 15 24 4.21252561103493 7.97912398160846 -3.76659837057353 A:G A G 10 0.531941598773897 0.152424127615418 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89804384_89807311:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89804384_89807333:ZNF276 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 293138 G/A 1 11 25 36 5.14864241348713 13.2985399693474 -8.14989755586029 A:C:G G A 10 0.531941598773897 0.00718853779031348 ENSG00000183688:ENST00000329099:exon_289769_293285:FAM101B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 293274 A/G 1 7 17 24 3.27640880858272 9.04300717915625 -5.76659837057353 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0231579699164620 ENSG00000183688:ENST00000329099:exon_289769_293285:FAM101B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 465775 G/A 1 13 8 21 6.08475921593934 4.25553279019118 1.82922642574816 A:G G A 10 0.531941598773897 0.514430539711333 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_465743_465985:VPS53 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 648186 G/A 1 79 56 135 36.9766136968621 29.7887295313382 7.1878841655239 A:C:G G A 10 0.531941598773897 0.227892123165342 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 648498 C/T 1 46 43 89 21.5306864564007 22.8734887472776 -1.34280229087684 T:C C T 10 0.531941598773897 0.831975380266546 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 649232 C/T 1 50 34 84 23.4029200613051 18.0860143583125 5.31690570299265 T:C C T 10 0.531941598773897 0.274626752137434 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 649547 G/C 1 22 12 34 10.2972848269743 6.38329918528676 3.9139856416875 A:C:G G C 10 0.531941598773897 0.228791510325275 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 649935 G/C 1 19 15 34 8.89310962329596 7.97912398160846 0.913985641687501 C:G G C 10 0.531941598773897 0.863994683994008 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4;ENSG00000179409:ENST00000437269:exon_649871_650522:GEMIN4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 685640 G/T 1 18 15 33 8.42505122206985 7.97912398160846 0.445927240461399 T:G G T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_685482_685691:GLOD4;ENSG00000171861:ENST00000304478:exon_685513_685932:RNMTL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 961900 G/A 1 4 8 12 1.87223360490441 4.25553279019118 -2.38329918528676 A:G G A 10 0.531941598773897 0.247137734070613 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 1373518 T/C 1 33 28 61 15.4459272404614 14.8943647656691 0.551562474792281 T:C T C 10 0.531941598773897 0.898808984703237 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1373469_1373628:MYO1C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 1377943 A/G 1 29 31 60 13.573693635557 16.4901895619908 -2.91649592643382 A:G A G 10 0.531941598773897 0.518134783387997 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1377904_1377984:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1377904_1377984:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1377904_1377984:MYO1C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 1494567 G/A 1 8 8 16 3.74446720980882 4.25553279019118 -0.511065580382352 A:G G A 10 0.531941598773897 0.80799969147761 ENSG00000167703:ENST00000301335:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000382147:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000412517:exon_1494563_1494765:SLC43A2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 1636934 A/G 1 9 1 10 4.21252561103493 0.531941598773897 3.68058401226103 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0240156507488693 ENSG00000167716:ENST00000468539:exon_1636821_1636939:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000418841:exon_1636821_1636973:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 1640709 C/T 1 8 9 17 3.74446720980882 4.78747438896507 -1.04300717915625 T:C C T 10 0.531941598773897 0.635405848599126 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1640659_1641879:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1640659_1641782:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1640659_1641888:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1640659_1641878:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1640659_1641886:WDR81 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 1680002 T/C 1 6 6 12 2.80835040735662 3.19164959264338 -0.383299185286765 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000132386:ENST00000254722:exon_1679826_1680036:SERPINF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 1703543 G/C 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 C:G G C 10 0.531941598773897 0.486426237614014 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1703151_1704318:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000491788:exon_1703151_1704099:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000495309:exon_1703510_1704011:SMYD4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 1795180 T/C 1 34 17 51 15.9139856416875 9.04300717915625 6.87097846253125 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0672422457218219 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1795127_1795234:RPA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 2236404 T/C 1 35 38 73 16.3820440429136 20.2137807534081 -3.83173671049448 T:C T C 10 0.531941598773897 0.412103494971766 ENSG00000167721:ENST00000301364:exon_2236255_2236418:TSR1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 2238675 A/G 1 12 18 30 5.61670081471324 9.57494877793015 -3.95824796321691 A:G A G 10 0.531941598773897 0.199554631640645 ENSG00000167721:ENST00000301364:exon_2238554_2238688:TSR1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 3564068 G/A 1 9 2 11 4.21252561103493 1.06388319754779 3.14864241348713 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0713639747063953 ENSG00000040531:ENST00000046640:exon_3563530_3564832:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000381870:exon_3563911_3564836:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000441220:exon_3563911_3564451:CTNS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 3564073 A/G 1 8 2 10 3.74446720980882 1.06388319754779 2.68058401226103 A:G A G 10 0.531941598773897 0.116548632110931 ENSG00000040531:ENST00000046640:exon_3563530_3564832:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000381870:exon_3563911_3564836:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000441220:exon_3563911_3564451:CTNS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 3564084 T/C 0 10 0 10 4.68058401226103 0 4.68058401226103 T T 10 0.531941598773897 0.00231867125731154 ENSG00000040531:ENST00000046640:exon_3563530_3564832:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000381870:exon_3563911_3564836:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000441220:exon_3563911_3564451:CTNS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 3567049 A/G 1 11 16 27 5.14864241348713 8.51106558038235 -3.36242316689522 A:G A G 10 0.531941598773897 0.247282153550661 ENSG00000213977:ENST00000225525:exon_3566196_3567179:TAX1BP3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 3568012 A/G 1 6 3 9 2.80835040735662 1.59582479632169 1.21252561103493 A:G A G 10 0.531941598773897 0.515798041804277 ENSG00000213977:ENST00000225525:exon_3567973_3568092:TAX1BP3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 3577146 C/T 1 52 72 124 24.3390368637574 38.2997951117206 -13.9607582479632 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0147840807107957 ENSG00000083454:ENST00000225328:exon_3576521_3577171:P2RX5;ENSG00000083454:ENST00000345901:exon_3576524_3577171:P2RX5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 12899963 T/C 1 20 17 37 9.36116802452206 9.04300717915625 0.31816084536581 A:T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000424152:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000480891:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000487229:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000465825:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000491478:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000492559:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000457438:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000407336:exon_12899735_12900002:ELAC2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 12915009 G/A 1 9 4 13 4.21252561103493 2.12776639509559 2.08475921593934 A:G G A 10 0.531941598773897 0.279590414707516 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000407336:exon_12914980_12915099:ELAC2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 16342833 T/C 1 10 12 22 4.68058401226103 6.38329918528676 -1.70271517302573 T:C T C 10 0.531941598773897 0.525263941191058 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 16344600 T/C 1 10 18 28 4.68058401226103 9.57494877793015 -4.89436476566912 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0867299445035572 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 16842912 A/G 1 136 165 301 63.65594256675 87.770363797693 -24.114421230943 A:G A G 10 0.531941598773897 0.00553714600023616 ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 17168164 G/A 1 25 16 41 11.7014600306526 8.51106558038235 3.19039445027022 A:G G A 10 0.531941598773897 0.350474441250631 ENSG00000141030:ENST00000268717:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000486810:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000417352:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000439936:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000492672:exon_17168116_17168295:COPS3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 17409560 C/T 1 20 14 34 9.36116802452206 7.44718238283456 1.9139856416875 T:C C T 10 0.531941598773897 0.607120734276307 ENSG00000133027:ENST00000255389:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395783:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395782:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000490392:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000484838:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000435340:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000448294:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000343219:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395781:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000477595:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000482906:exon_17409541_17409615:PEMT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 18088094 C/T 1 21 29 50 9.82922642574816 15.426306364443 -5.59707993869485 T:C C T 10 0.531941598773897 0.120493126715852 ENSG00000091542:ENST00000261650:exon_18086867_18088327:ALKBH5;ENSG00000091542:ENST00000399138:exon_18087289_18088327:ALKBH5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 18148485 G/A 1 114 125 239 53.3586577397757 66.4926998467371 -13.1340421069614 A:G G A 10 0.531941598773897 0.09209327070357 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18148150_18148586:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18148155_18148586:FLII HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 19578873 A/T 1 24 21 45 11.2334016294265 11.1707735742518 0.062628055174633 A:T A T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000072210:ENST00000176643:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000395575:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000339618:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000472059:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000476965:exon_19578871_19579060:ALDH3A2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 19812541 T/C 0 9 0 9 4.21252561103493 0 4.21252561103493 T T 10 0.531941598773897 0.00448836920646731 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19812494_19812589:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19812494_19812589:AKAP10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 19861458 C/T 1 4 12 16 1.87223360490441 6.38329918528676 -4.51106558038235 T:C C T 10 0.531941598773897 0.041514491390967 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19861327_19861884:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19861327_19861884:AKAP10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 22 0 22 10.2972848269743 0 10.2972848269743 T T 10 0.531941598773897 9.86918602009123e-07 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 28 0 28 13.1056352343309 0 13.1056352343309 G G 10 0.531941598773897 4.03513154805099e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 24 0 24 11.2334016294265 0 11.2334016294265 C C 10 0.531941598773897 2.75695917913493e-07 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 0 9 0 9 4.21252561103493 0 4.21252561103493 C C 10 0.531941598773897 0.00448836920646731 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 44 0 44 20.5945696539485 0 20.5945696539485 C C 10 0.531941598773897 1.02577784813703e-12 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 32 0 32 14.9778688392353 0 14.9778688392353 C C 10 0.531941598773897 2.74125988062033e-09 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 19 0 19 8.89310962329596 0 8.89310962329596 C C 10 0.531941598773897 6.73020200282232e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 28 1 29 13.1056352343309 0.531941598773897 12.573693635557 A:C C A 10 0.531941598773897 4.50888513500822e-07 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 29 0 29 13.573693635557 0 13.573693635557 G G 10 0.531941598773897 2.05465024610916e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 78 0 78 36.508555295636 0 36.508555295636 G G 10 0.531941598773897 4.90579783563282e-22 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 25974258 T/C 1 6 4 10 2.80835040735662 2.12776639509559 0.68058401226103 T:C T C 10 0.531941598773897 0.758887050232993 ENSG00000168961:ENST00000486774:exon_25974056_25974458:LGALS9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 26946680 G/A 1 35 30 65 16.3820440429136 15.9582479632169 0.423796079696695 A:C:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000007202:ENST00000389003:exon_26946672_26946793:KIAA0100;ENSG00000007202:ENST00000005905:exon_26946672_26946793:KIAA0100;ENSG00000007202:ENST00000528896:exon_26946672_26946793:KIAA0100 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 27438469 G/A 1 7 10 17 3.27640880858272 5.31941598773897 -2.04300717915625 A:T:G G A 10 0.531941598773897 0.341802442613557 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27438442_27438601:MYO18A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 27889578 T/C 1 11 6 17 5.14864241348713 3.19164959264338 1.95699282084375 T:C T C 10 0.531941598773897 0.467371914131112 ENSG00000168792:ENST00000307201:exon_27887691_27890104:ABHD15 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 29226630 T/A 1 6 7 13 2.80835040735662 3.72359119141728 -0.915240784060662 A:T T A 10 0.531941598773897 0.782547085779911 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 29226645 T/C 1 7 4 11 3.27640880858272 2.12776639509559 1.14864241348713 T:C T C 10 0.531941598773897 0.55795959209382 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 29326068 G/A 1 14 22 36 6.55281761716544 11.7027151730257 -5.14989755586029 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0957634101996178 ENSG00000181481:ENST00000328381:exon_29325680_29326929:RNF135;ENSG00000181481:ENST00000324689:exon_29325680_29326927:RNF135 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 29632233 C/T 1 114 98 212 53.3586577397757 52.1302766798419 1.22838105993383 T:C:G C T 10 0.531941598773897 0.890659640732887 ENSG00000185862:ENST00000330927:exon_29630790_29632648:EVI2B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 30222002 T/C 1 10 9 19 4.68058401226103 4.78747438896507 -0.106890376704043 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30221989_30222030:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000490218:exon_30221989_30222030:UTP6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 30696292 C/T 1 4 7 11 1.87223360490441 3.72359119141728 -1.85135758651287 T:C C T 10 0.531941598773897 0.36707898879345 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 33269648 C/G 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 C:G C G 10 0.531941598773897 0.730998912113487 ENSG00000132141:ENST00000436961:exon_33269503_33269662:CCT6B;ENSG00000132141:ENST00000314144:exon_33269503_33269662:CCT6B;ENSG00000132141:ENST00000421975:exon_33269503_33269662:CCT6B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 33768383 T/A 1 12 2 14 5.61670081471324 1.06388319754779 4.55281761716544 A:T T A 10 0.531941598773897 0.0154240748469178 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000360502:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33764562_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33766003_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000534689:exon_33766499_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33766517_33768385:SLFN13 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 33998802 G/C 1 6 10 16 2.80835040735662 5.31941598773897 -2.51106558038235 C:G G C 10 0.531941598773897 0.221856598747246 ENSG00000006125:ENST00000262325:exon_33998773_33998919:AP2B1;ENSG00000006125:ENST00000312678:exon_33998773_33998919:AP2B1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 34854280 G/A 1 12 5 17 5.61670081471324 2.65970799386948 2.95699282084375 A:G G A 10 0.531941598773897 0.223519240246810 ENSG00000141140:ENST00000431794:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000268852:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000378326:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000415126:exon_34854110_34854403:MYO19 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 34942595 G/A 1 30 26 56 14.0417520367831 13.8304815681213 0.211270468661766 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000005955:ENST00000304718:exon_34942480_34942628:GGNBP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 35771468 C/T 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000108264:ENST00000394395:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000490992:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000225396:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000417170:exon_35771356_35771477:TADA2A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 35913737 A/T 1 6 7 13 2.80835040735662 3.72359119141728 -0.915240784060662 A:T A T 10 0.531941598773897 0.782547085779911 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35913217_35914161:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35913217_35914161:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35913217_35914161:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35913217_35914161:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35913217_35914161:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35913217_35914161:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000421408:exon_35913217_35914161:SYNRG HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 36894839 G/A 1 25 29 54 11.7014600306526 15.426306364443 -3.72484633379044 A:G G A 10 0.531941598773897 0.341026372089542 ENSG00000056661:ENST00000360797:exon_36894794_36894848:PCGF2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 37074932 C/T 1 31 42 73 14.5098104380092 22.3415471485037 -7.83173671049448 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0780523270464493 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37074858_37078023:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37074858_37078023:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37074858_37075031:LASP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 37334243 G/A 1 11 6 17 5.14864241348713 3.19164959264338 1.95699282084375 A:G G A 10 0.531941598773897 0.467371914131112 ENSG00000067191:ENST00000394303:exon_37334237_37334332:CACNB1;ENSG00000067191:ENST00000344140:exon_37334237_37334332:CACNB1;ENSG00000067191:ENST00000394310:exon_37334237_37334332:CACNB1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 37814080 G/A 1 6 2 8 2.80835040735662 1.06388319754779 1.74446720980882 A:G G A 10 0.531941598773897 0.297069782823554 ENSG00000131748:ENST00000336308:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000394250:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000488876:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000484773:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000443521:exon_37814028_37814105:STARD3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 37884037 C/G 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 C:G C G 10 0.531941598773897 0.730998912113487 ENSG00000141736:ENST00000406381:exon_37883942_37884915:ERBB2;ENSG00000141736:ENST00000269571:exon_37883942_37884915:ERBB2;ENSG00000141736:ENST00000445658:exon_37883942_37884915:ERBB2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 38179492 A/G 1 22 17 39 10.2972848269743 9.04300717915625 1.25427764781802 A:G A G 10 0.531941598773897 0.749696452089819 ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000492176:exon_38179384_38179760:MED24 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 38990780 C/G 1 17 21 38 7.95699282084375 11.1707735742518 -3.21378075340809 C:G C G 10 0.531941598773897 0.3312378750863 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 38991003 T/C 1 28 15 43 13.1056352343309 7.97912398160846 5.12651125272243 T:C T C 10 0.531941598773897 0.128081941319138 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 38991032 T/A 1 22 15 37 10.2972848269743 7.97912398160846 2.31816084536581 A:T T A 10 0.531941598773897 0.511489396344633 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 39912145 T/A 1 3 16 19 1.40417520367831 8.51106558038235 -7.10689037670404 A:T T A 10 0.531941598773897 0.00101603384325911 ENSG00000173801:ENST00000393930:exon_39911982_39912147:JUP;ENSG00000173801:ENST00000310706:exon_39911982_39912147:JUP;ENSG00000173801:ENST00000393931:exon_39910856_39912147:JUP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 39925925 A/G 1 2 9 11 0.936116802452206 4.78747438896507 -3.85135758651287 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0302737640849297 ENSG00000173801:ENST00000393930:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000310706:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000393931:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000449889:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000437187:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000420370:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000424457:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000437369:exon_39925878_39925929:JUP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 39983808 G/C 1 31 1 32 14.5098104380092 0.531941598773897 13.9778688392353 C:G G C 10 0.531941598773897 6.83391844013055e-08 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 39983820 G/A 1 31 2 33 14.5098104380092 1.06388319754779 13.4459272404614 A:G G A 10 0.531941598773897 5.09331741983647e-07 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 39983849 G/C 1 60 9 69 28.0835040735662 4.78747438896507 23.2960296846011 C:G G C 10 0.531941598773897 3.49048422261291e-09 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 39987130 T/C 1 19 13 32 8.89310962329596 6.91524078406066 1.97786883923529 T:C T C 10 0.531941598773897 0.595907192228062 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000521789:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000486304:exon_39987053_39987132:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000460893:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000481693:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000475053:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000495317:exon_39987053_39987142:NT5C3L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 40048613 A/G 1 31 40 71 14.5098104380092 21.2776639509559 -6.76785351294669 A:G A G 10 0.531941598773897 0.122031804379401 ENSG00000131473:ENST00000352035:exon_40048532_40048700:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000401700:exon_40048532_40048700:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000353196:exon_40048532_40048700:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000393896:exon_40048532_40048700:ACLY HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 40175842 G/A 1 18 15 33 8.42505122206985 7.97912398160846 0.445927240461399 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000168256:ENST00000307641:exon_40175672_40177659:NKIRAS2;ENSG00000168256:ENST00000393884:exon_40175672_40177654:NKIRAS2;ENSG00000168256:ENST00000485789:exon_40175672_40176283:NKIRAS2;ENSG00000168256:ENST00000479407:exon_40175672_40176283:NKIRAS2;ENSG00000168256:ENST00000393885:exon_40175672_40177076:NKIRAS2;ENSG00000168256:ENST00000393880:exon_40175672_40176792:NKIRAS2;ENSG00000168256:ENST00000393881:exon_40175672_40176792:NKIRAS2;ENSG00000168256:ENST00000491638:exon_40175672_40176238:NKIRAS2;ENSG00000168256:ENST00000462043:exon_40175672_40176117:NKIRAS2;ENSG00000168256:ENST00000316082:exon_40175672_40175958:NKIRAS2;ENSG00000168256:ENST00000393879:exon_40175672_40177659:NKIRAS2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 40475056 G/A 1 53 32 85 24.8070952649835 17.0221311607647 7.78496410421875 A:G G A 10 0.531941598773897 0.102859346314259 ENSG00000168610:ENST00000264657:exon_40475022_40475161:STAT3;ENSG00000168610:ENST00000389272:exon_40475022_40475161:STAT3;ENSG00000168610:ENST00000404395:exon_40475022_40475161:STAT3;ENSG00000168610:ENST00000471989:exon_40475053_40475643:STAT3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 40714804 C/A 1 25 16 41 11.7014600306526 8.51106558038235 3.19039445027022 A:C C A 10 0.531941598773897 0.350474441250631 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40714092_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40714374_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000426807:exon_40714641_40714850:COASY HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 40716520 A/G 1 50 56 106 23.4029200613051 29.7887295313382 -6.38580947003308 A:G A G 10 0.531941598773897 0.242780277846905 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000449624:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40716464_40716595:COASY HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 40722029 A/G 1 29 29 58 13.573693635557 15.426306364443 -1.85261272888603 A:G A G 10 0.531941598773897 0.693538205676099 ENSG00000108788:ENST00000435881:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000346833:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000246912:exon_40722000_40722201:MLX HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 40725379 A/T 1 13 13 26 6.08475921593934 6.91524078406066 -0.830481568121323 A:T A T 10 0.531941598773897 0.844915066483025 ENSG00000131470:ENST00000253789:exon_40725329_40725382:PSMC3IP;ENSG00000131470:ENST00000393795:exon_40725329_40725382:PSMC3IP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 40818451 G/A 1 11 11 22 5.14864241348713 5.85135758651287 -0.702715173025734 A:G G A 10 0.531941598773897 0.832492408246346 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818341_40818502:TUBG2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 40818699 A/G 1 15 13 28 7.02087601839154 6.91524078406066 0.105635234330883 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818621_40819021:TUBG2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 40822678 C/T 1 18 18 36 8.42505122206985 9.57494877793015 -1.14989755586029 T:C C T 10 0.531941598773897 0.740298639827591 ENSG00000068137:ENST00000293349:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000412503:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000456950:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000445882:exon_40822591_40822723:PLEKHH3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 40926695 A/T 1 47 67 114 21.9987448576268 35.6400871178511 -13.6413422602243 A:T A T 10 0.531941598773897 0.0111762021261149 ENSG00000131475:ENST00000253794:exon_40926664_40926717:VPS25 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 41223094 T/C 1 7 5 12 3.27640880858272 2.65970799386948 0.616700814713236 T:C T C 10 0.531941598773897 0.779881793407808 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000491747:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000478531:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000484087:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493919:exon_41222945_41223255:BRCA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 41244000 T/C 1 4 6 10 1.87223360490441 3.19164959264338 -1.31941598773897 T:C T C 10 0.531941598773897 0.530535902085358 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 41245466 G/A 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 A:G G A 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 41291953 C/G 1 13 1 14 6.08475921593934 0.531941598773897 5.55281761716544 C:G C G 10 0.531941598773897 0.00234405000079555 ENSG00000198496:ENST00000460115:exon_41291833_41292300:NBR2;ENSG00000198496:ENST00000356906:exon_41291833_41292350:NBR2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 42152103 G/A 1 7 9 16 3.27640880858272 4.78747438896507 -1.51106558038235 A:G G A 10 0.531941598773897 0.465195872310583 ENSG00000141349:ENST00000269097:exon_42152048_42152138:G6PC3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 42225547 A/C 1 7 4 11 3.27640880858272 2.12776639509559 1.14864241348713 A:C A C 10 0.531941598773897 0.55795959209382 ENSG00000125319:ENST00000319977:exon_42225226_42226395:C17orf53;ENSG00000125319:ENST00000245382:exon_42225226_42226395:C17orf53 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 42254011 C/G 1 8 10 18 3.74446720980882 5.31941598773897 -1.57494877793015 C:G C G 10 0.531941598773897 0.487247762768628 ENSG00000168597:ENST00000303061:exon_42253354_42255184:C17orf65 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 42254281 A/G 1 8 7 15 3.74446720980882 3.72359119141728 0.0208760183915446 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000161664:ENST00000293414:exon_42254106_42254598:ASB16;ENSG00000168597:ENST00000303061:exon_42253354_42255184:C17orf65 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 42287519 C/T 1 76 85 161 35.5724384931838 45.2150358957812 -9.64259740259742 T:C C T 10 0.531941598773897 0.133827986438723 ENSG00000108312:ENST00000343638:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000302904:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000527034:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000533177:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000436088:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000393606:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000526094:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529383:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529373:exon_42287492_42287602:UBTF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 42475983 G/C 1 23 15 38 10.7653432282004 7.97912398160846 2.78621924659191 C:G G C 10 0.531941598773897 0.41811352179146 ENSG00000186566:ENST00000335500:exon_42472652_42478821:GPATCH8;ENSG00000186566:ENST00000434000:exon_42474784_42478821:GPATCH8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 43003484 T/C 1 12 15 27 5.61670081471324 7.97912398160846 -2.36242316689522 T:C T C 10 0.531941598773897 0.441519696755844 ENSG00000186185:ENST00000438933:exon_43003360_43003554:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000339151:exon_43003448_43003554:KIF18B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 43111688 G/A 1 6 16 22 2.80835040735662 8.51106558038235 -5.70271517302573 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0178261855578147 ENSG00000172992:ENST00000452796:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000342350:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000310604:exon_43111555_43111758:DCAKD HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 43311620 A/G 1 9 2 11 4.21252561103493 1.06388319754779 3.14864241348713 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0713639747063953 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 44109474 G/A 1 4 8 12 1.87223360490441 4.25553279019118 -2.38329918528676 A:G G A 10 0.531941598773897 0.247137734070613 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44109413_44109665:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44109413_44109665:KIAA1267 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 44248499 G/C 1 11 4 15 5.14864241348713 2.12776639509559 3.02087601839155 C:G G C 10 0.531941598773897 0.129673765714287 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44248221_44249594:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44248221_44249598:KIAA1267 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 45008570 G/A 1 24 39 63 11.2334016294265 20.745722352182 -9.51232072275551 A:C:G G A 10 0.531941598773897 0.0222907815308646 ENSG00000108433:ENST00000225567:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000393456:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000415811:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000439730:exon_45008465_45008573:GOSR2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 45811210 A/G 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 A:G A G 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000073861:ENST00000177694:exon_45810610_45811311:TBX21 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 45822579 G/A 1 8 4 12 3.74446720980882 2.12776639509559 1.61670081471324 A:G G A 10 0.531941598773897 0.3994437340124 ENSG00000073861:ENST00000177694:exon_45822114_45823485:TBX21 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 45885756 C/T 1 20 12 32 9.36116802452206 6.38329918528676 2.9778688392353 T:C C T 10 0.531941598773897 0.376146745723152 ENSG00000006025:ENST00000007414:exon_45884733_45885765:OSBPL7;ENSG00000006025:ENST00000392507:exon_45884733_45885765:OSBPL7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 45890707 C/T 1 5 7 12 2.34029200613052 3.72359119141728 -1.38329918528676 T:C C T 10 0.531941598773897 0.56545794539378 ENSG00000006025:ENST00000007414:exon_45890632_45890769:OSBPL7;ENSG00000006025:ENST00000392507:exon_45890632_45890769:OSBPL7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 45904420 C/T 1 21 17 38 9.82922642574816 9.04300717915625 0.786219246591912 T:C C T 10 0.531941598773897 0.871549817766073 ENSG00000159111:ENST00000351111:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000290208:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000414011:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000421763:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000466016:exon_45904261_45904570:MRPL10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 45994044 C/T 1 14 15 29 6.55281761716544 7.97912398160846 -1.42630636444301 T:C:G C T 10 0.531941598773897 0.710526726608856 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2;ENSG00000167182:ENST00000322172:exon_45993522_45994136:SP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 45994094 T/C 1 26 21 47 12.1695184318787 11.1707735742518 0.998744857626839 T:C T C 10 0.531941598773897 0.88400076579589 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2;ENSG00000167182:ENST00000322172:exon_45993522_45994136:SP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 45994154 G/A 1 20 25 45 9.36116802452206 13.2985399693474 -3.93737194482537 A:G G A 10 0.531941598773897 0.295691926789102 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 46002744 G/T 1 23 12 35 10.7653432282004 6.38329918528676 4.3820440429136 T:G G T 10 0.531941598773897 0.174979343497450 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_46002714_46002907:SP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 46103760 A/G 1 6 8 14 2.80835040735662 4.25553279019118 -1.44718238283456 A:G A G 10 0.531941598773897 0.594012234271892 ENSG00000005243:ENST00000006101:exon_46103535_46103841:COPZ2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 46939658 C/G 1 59 30 89 27.6154456723401 15.9582479632169 11.6571977091232 C:G C G 10 0.531941598773897 0.0143161456663495 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000416445:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000507306:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509784:exon_46939638_46939666:CALCOCO2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 47000251 C/T 1 26 16 42 12.1695184318787 8.51106558038235 3.65845285149632 T:C C T 10 0.531941598773897 0.281941557223940 ENSG00000159202:ENST00000360943:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000389608:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000405215:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506498:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000504684:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000513342:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506271:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000514948:exon_47000209_47000459:UBE2Z HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 47007963 C/T 1 119 119 238 55.6989497459063 63.3010502540937 -7.60210050818749 T:C C T 10 0.531941598773897 0.330492216309355 ENSG00000159210:ENST00000502492:exon_47006678_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509995:exon_47007733_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000290330:exon_47007736_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000514089:exon_47007743_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000515572:exon_47007750_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000504000:exon_47007752_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509989:exon_47007788_47007974:SNF8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 47300081 C/G 1 92 82 174 43.0613729128015 43.6192110994596 -0.557838186658081 C:G C G 10 0.531941598773897 0.939592260973946 ENSG00000108798:ENST00000225941:exon_47299914_47300587:ABI3;ENSG00000108798:ENST00000419580:exon_47299914_47300398:ABI3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 48226811 C/T 1 54 59 113 25.2751536662096 31.3845543276599 -6.10940066145036 T:C C T 10 0.531941598773897 0.259049745323033 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 48431032 G/A 0 0 9 9 0 4.78747438896507 -4.78747438896507 A G A 10 0.531941598773897 0.00107820267156602 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000509778:exon_48430991_48431035:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48430991_48431483:XYLT2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 48433958 T/C 1 3 6 9 1.40417520367831 3.19164959264338 -1.78747438896507 T:C T C 10 0.531941598773897 0.320650472569791 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000511654:exon_48433872_48434134:XYLT2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 48437456 C/G 1 14 14 28 6.55281761716544 7.44718238283456 -0.894364765669117 C:G C G 10 0.531941598773897 0.850300347768159 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48437330_48438512:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48437330_48438512:XYLT2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 48455985 A/T 1 11 4 15 5.14864241348713 2.12776639509559 3.02087601839155 A:T A T 10 0.531941598773897 0.129673765714287 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48455956_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48455956_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511519:exon_48455961_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510007:exon_48455961_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48455956_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000513077:exon_48455956_48456042:EME1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 48456193 T/C 1 6 2 8 2.80835040735662 1.06388319754779 1.74446720980882 T:C T C 10 0.531941598773897 0.297069782823554 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510007:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510246:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000513077:exon_48456135_48456256:EME1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 48539035 T/C 1 12 12 24 5.61670081471324 6.38329918528676 -0.766598370573529 T:C T C 10 0.531941598773897 0.83900902365855 ENSG00000167107:ENST00000510410:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000506582:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48539018_48539047:ACSF2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 48940422 T/C 1 14 24 38 6.55281761716544 12.7665983705735 -6.21378075340809 T:C T C 10 0.531941598773897 0.05071887569657 ENSG00000141232:ENST00000499247:exon_48939584_48941524:TOB1;ENSG00000141232:ENST00000268957:exon_48940341_48941524:TOB1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 49337993 A/G 1 45 50 95 21.0626280551746 26.5970799386949 -5.53445188352022 A:G A G 10 0.531941598773897 0.259990922568102 ENSG00000011260:ENST00000225298:exon_49337889_49338287:UTP18 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 49350802 A/C 1 1 10 11 0.468058401226103 5.31941598773897 -4.85135758651287 A:C A C 10 0.531941598773897 0.00415411504617602 ENSG00000011260:ENST00000225298:exon_49350723_49350811:UTP18;ENSG00000011260:ENST00000508506:exon_49350723_49350811:UTP18 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 54978794 G/A 1 4 6 10 1.87223360490441 3.19164959264338 -1.31941598773897 A:G G A 10 0.531941598773897 0.530535902085358 ENSG00000121060:ENST00000316881:exon_54978780_54978939:TRIM25 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 55028170 C/T 1 11 11 22 5.14864241348713 5.85135758651287 -0.702715173025734 T:C C T 10 0.531941598773897 0.832492408246346 ENSG00000121058:ENST00000240316:exon_55027250_55028357:COIL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 55183203 T/C 1 9 10 19 4.21252561103493 5.31941598773897 -1.10689037670404 T:C T C 10 0.531941598773897 0.651315646573759 ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000314126:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55182818_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55182802_55184539:AKAP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 55183716 T/C 1 6 17 23 2.80835040735662 9.04300717915625 -6.23465677179963 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0111435757833397 ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000314126:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55182818_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55182802_55184539:AKAP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 56769979 C/T 1 8 5 13 3.74446720980882 2.65970799386948 1.08475921593934 T:C C T 10 0.531941598773897 0.591209044900214 ENSG00000108384:ENST00000461271:exon_56769934_56770046:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000337432:exon_56769934_56770149:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000487921:exon_56769937_56769993:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000476741:exon_56769963_56770149:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000475762:exon_56769963_56771011:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000486827:exon_56769967_56771172:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000487525:exon_56769967_56770149:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000482007:exon_56769976_56770149:RAD51C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 57289730 G/T 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 T:G G T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57289702_57289847:C17orf71 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 58740492 T/C 1 6 6 12 2.80835040735662 3.19164959264338 -0.383299185286765 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000170836:ENST00000305921:exon_58740356_58742036:PPM1D HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 60741917 G/A 1 14 4 18 6.55281761716544 2.12776639509559 4.42505122206985 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0558351933659058 ENSG00000011028:ENST00000303375:exon_60741909_60742310:MRC2;ENSG00000011028:ENST00000446119:exon_60741909_60742310:MRC2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 61805747 G/A 1 7 7 14 3.27640880858272 3.72359119141728 -0.447182382834558 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000125695:ENST00000336174:exon_61805694_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000375840:exon_61805694_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000447001:exon_61805694_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000392950:exon_61805718_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000375841:exon_61805694_61805773:STRADA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 61901197 T/A 1 43 38 81 20.1265112527224 20.2137807534081 -0.087269500685661 A:T T A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61901177_61901312:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61901177_61901312:FTSJ3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 61903445 G/C 1 7 6 13 3.27640880858272 3.19164959264338 0.0847592159393384 C:G G C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61903416_61903495:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61903416_61903495:FTSJ3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 61908271 C/T 1 157 140 297 73.4851689924982 74.4718238283456 -0.986654835847403 T:C C T 10 0.531941598773897 0.907592477119982 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908169_61908295:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908169_61908295:PSMC5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 61908556 C/T 1 187 186 373 87.5269210292813 98.9411373719448 -11.4142163426636 T:C C T 10 0.531941598773897 0.253661161759616 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908396_61908586:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908396_61908586:PSMC5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 62007498 A/G 1 108 76 184 50.5503073324191 40.4275615068162 10.1227458256029 A:G A G 10 0.531941598773897 0.139987468049218 ENSG00000007312:ENST00000392795:exon_62007434_62007745:CD79B;ENSG00000007312:ENST00000006750:exon_62007434_62007745:CD79B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 62487017 G/C 1 8 1 9 3.74446720980882 0.531941598773897 3.21252561103493 C:G G C 10 0.531941598773897 0.0425222470212816 ENSG00000136480:ENST00000322670:exon_62486913_62487086:POLG2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 62496670 A/C 1 610 504 1114 285.515624747923 268.098565782044 17.4170589658787 A:T:C A C 10 0.531941598773897 0.307374621849161 ENSG00000108654:ENST00000225792:exon_62496667_62496891:DDX5;ENSG00000108654:ENST00000450599:exon_62496667_62496891:DDX5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 65362552 T/A 1 15 17 32 7.02087601839154 9.04300717915625 -2.02213116076471 A:T T A 10 0.531941598773897 0.484705211465766 ENSG00000197170:ENST00000356126:exon_65362528_65362743:PSMD12;ENSG00000197170:ENST00000357146:exon_65362528_65362721:PSMD12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 65739627 A/G 1 33 22 55 15.4459272404614 11.7027151730257 3.74321206743566 A:G A G 10 0.531941598773897 0.345696087861172 ENSG00000130935:ENST00000253247:exon_65739595_65739702:NOL11 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 66246416 A/G 1 34 40 74 15.9139856416875 21.2776639509559 -5.36367830926838 A:G A G 10 0.531941598773897 0.244064854772082 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392721:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66246329_66246611:AMZ2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 72443192 G/T 1 9 9 18 4.21252561103493 4.78747438896507 -0.574948777930146 T:G G T 10 0.531941598773897 0.81714898933323 ENSG00000170412:ENST00000392627:exon_72442988_72443568:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000481232:exon_72442988_72443568:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000342648:exon_72442988_72443566:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000417745:exon_72442988_72443566:GPRC5C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 72862593 C/T 1 19 13 32 8.89310962329596 6.91524078406066 1.97786883923529 T:C C T 10 0.531941598773897 0.595907192228062 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72862568_72862690:FDXR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 73016621 C/T 1 23 36 59 10.7653432282004 19.1498975558603 -8.38455432765992 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0360596062964370 ENSG00000167862:ENST00000301585:exon_73016583_73016752:ICT1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 73269676 C/T 1 29 37 66 13.573693635557 19.6818391546342 -6.1081455190772 T:C C T 10 0.531941598773897 0.140008143968281 ENSG00000125454:ENST00000375261:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000402418:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000416858:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000442286:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000320362:exon_73269062_73269720:SLC25A19 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 73513677 A/C 1 8 2 10 3.74446720980882 1.06388319754779 2.68058401226103 A:C:G A C 10 0.531941598773897 0.116548632110931 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73513638_73513736:TSEN54;ENSG00000182173:ENST00000434205:exon_73513638_73513736:TSEN54 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 73518203 G/C 1 12 24 36 5.61670081471324 12.7665983705735 -7.14989755586029 C:G G C 10 0.531941598773897 0.0190674669627654 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73517786_73518414:TSEN54 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 73519413 C/T 1 9 5 14 4.21252561103493 2.65970799386948 1.55281761716544 T:C C T 10 0.531941598773897 0.437286823633092 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73519356_73519416:TSEN54 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 73520359 C/G 1 17 12 29 7.95699282084375 6.38329918528676 1.57369363555699 C:G C G 10 0.531941598773897 0.582816143128388 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73520343_73520820:TSEN54 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 73627539 T/C 1 8 8 16 3.74446720980882 4.25553279019118 -0.511065580382352 T:C T C 10 0.531941598773897 0.80799969147761 ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73627530_73627748:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73627530_73627748:RECQL5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 73774877 G/A 1 6 7 13 2.80835040735662 3.72359119141728 -0.915240784060662 A:G G A 10 0.531941598773897 0.782547085779911 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 73823982 G/A 0 53 0 53 24.8070952649835 0 24.8070952649835 G G 10 0.531941598773897 3.16211805984419e-15 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73823310_73824167:UNC13D HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 73824121 T/C 1 61 37 98 28.5515624747923 19.6818391546342 8.86972332015809 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0848728287572669 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73823310_73824167:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73824079_73824167:UNC13D HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 73826120 C/T 1 36 29 65 16.8501024441397 15.426306364443 1.42379607969669 T:C C T 10 0.531941598773897 0.803988820950798 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73826109_73826232:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73826109_73826232:UNC13D HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 73827205 T/C 1 42 33 75 19.6584528514963 17.5540727595386 2.10438009195772 T:C T C 10 0.531941598773897 0.6453716075426 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73827179_73827250:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73827179_73827250:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73827203_73827250:UNC13D HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 73836162 C/G 1 21 20 41 9.82922642574816 10.6388319754779 -0.809605549729778 C:G C G 10 0.531941598773897 0.876041715677551 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73836099_73836191:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73836099_73836191:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73836099_73836191:UNC13D HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 73900688 T/C 1 34 32 66 15.9139856416875 17.0221311607647 -1.1081455190772 T:C T C 10 0.531941598773897 0.806122944740526 ENSG00000204316:ENST00000309352:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000409963:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000477736:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000493104:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000493383:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000461602:exon_73900307_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000464758:exon_73900303_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000410030:exon_73900621_73900800:MRPL38 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 73949540 G/C 1 4 9 13 1.87223360490441 4.78747438896507 -2.91524078406066 C:G G C 10 0.531941598773897 0.162564563323673 ENSG00000161533:ENST00000293217:exon_73949532_73949701:ACOX1;ENSG00000161533:ENST00000301608:exon_73949532_73949701:ACOX1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 74077483 G/A 1 41 48 89 19.1903944502702 25.5331967411471 -6.34280229087684 A:G G A 10 0.531941598773897 0.202388485854558 ENSG00000186919:ENST00000334586:exon_74077359_74077483:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000425015:exon_74077359_74077483:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000441571:exon_74077359_74077483:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000421794:exon_74077359_74077483:ZACN;ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 74307737 T/C 1 19 12 31 8.89310962329596 6.38329918528676 2.50981043800919 T:C T C 10 0.531941598773897 0.472209331224685 ENSG00000161542:ENST00000448426:exon_74306868_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000446526:exon_74307014_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000324684:exon_74307015_74307781:PRPSAP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 74387284 C/T 1 21 19 40 9.82922642574816 10.106890376704 -0.277663950955882 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000175931:ENST00000319380:exon_74385614_74387694:UBE2O HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 74477620 C/T 1 8 8 16 3.74446720980882 4.25553279019118 -0.511065580382352 T:C C T 10 0.531941598773897 0.80799969147761 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74477457_74477627:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74477457_74477627:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74477457_74477791:RHBDF2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 75085434 G/A 1 4 9 13 1.87223360490441 4.78747438896507 -2.91524078406066 A:G G A 10 0.531941598773897 0.162564563323673 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 75190962 C/T 1 21 10 31 9.82922642574816 5.31941598773897 4.50981043800919 T:C C T 10 0.531941598773897 0.109331858257390 ENSG00000129657:ENST00000443798:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000430767:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000413679:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000436233:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000392476:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000262775:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000431431:exon_75190759_75190993:SEC14L1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 76115353 T/C 1 18 10 28 8.42505122206985 5.31941598773897 3.10563523433088 T:C T C 10 0.531941598773897 0.261281244740623 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 76799795 G/A 1 27 22 49 12.6375768331048 11.7027151730257 0.934861660079047 A:G G A 10 0.531941598773897 0.886406036104659 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 76799860 T/C 1 17 20 37 7.95699282084375 10.6388319754779 -2.68183915463419 T:C T C 10 0.531941598773897 0.412639018051013 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 76799898 A/G 1 25 23 48 11.7014600306526 12.2346567717996 -0.533196741147057 A:G A G 10 0.531941598773897 0.886083412740157 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 76814782 G/A 1 6 8 14 2.80835040735662 4.25553279019118 -1.44718238283456 A:G G A 10 0.531941598773897 0.594012234271892 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76814749_76814860:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76814749_76814860:USP36 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 76993546 A/G 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 A:G A G 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76993074_76994045:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76993074_76993726:CANT1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 77768654 C/A 1 10 5 15 4.68058401226103 2.65970799386948 2.02087601839155 A:C C A 10 0.531941598773897 0.438857439709851 ENSG00000141570:ENST00000269385:exon_77765931_77769357:CBX8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 78078656 G/A 1 6 2 8 2.80835040735662 1.06388319754779 1.74446720980882 A:G G A 10 0.531941598773897 0.297069782823554 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78078354_78078931:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78078354_78078931:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78078354_78078931:GAA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 78087109 A/G 1 2 7 9 0.936116802452206 3.72359119141728 -2.78747438896507 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0926560584503697 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78087017_78087165:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78087017_78087165:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78087017_78087165:GAA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 78343347 T/C 1 3 8 11 1.40417520367831 4.25553279019118 -2.85135758651287 T:C T C 10 0.531941598773897 0.128574530340517 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78343302_78343471:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78343302_78343471:RNF213 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 78896529 C/T 1 6 4 10 2.80835040735662 2.12776639509559 0.68058401226103 T:C C T 10 0.531941598773897 0.758887050232993 ENSG00000141564:ENST00000306801:exon_78896524_78896627:RPTOR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 78938134 C/T 1 3 7 10 1.40417520367831 3.72359119141728 -2.31941598773897 T:C C T 10 0.531941598773897 0.205442831458325 ENSG00000141564:ENST00000306801:exon_78938062_78940173:RPTOR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 79164836 C/T 1 7 15 22 3.27640880858272 7.97912398160846 -4.70271517302573 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0540608837229035 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79164707_79164884:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79164707_79164884:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79164707_79164884:AZI1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 79166384 C/T 1 8 3 11 3.74446720980882 1.59582479632169 2.14864241348713 T:C C T 10 0.531941598773897 0.23704105185636 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79166276_79166393:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79166276_79166393:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79166276_79166393:AZI1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 79169641 G/A 1 7 4 11 3.27640880858272 2.12776639509559 1.14864241348713 A:G G A 10 0.531941598773897 0.55795959209382 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79169635_79169751:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79169635_79169751:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79169635_79169751:AZI1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 79169670 C/T 1 4 8 12 1.87223360490441 4.25553279019118 -2.38329918528676 T:C C T 10 0.531941598773897 0.247137734070613 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79169635_79169751:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79169635_79169751:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79169635_79169751:AZI1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 79170832 C/T 1 10 15 25 4.68058401226103 7.97912398160846 -3.29853996934743 T:C C T 10 0.531941598773897 0.229796903542653 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79170730_79170855:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79170730_79170855:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79170730_79170855:AZI1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 79182797 T/C 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79182728_79182822:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79182728_79182822:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79182728_79182822:AZI1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 79202800 T/C 1 12 25 37 5.61670081471324 13.2985399693474 -7.68183915463419 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0130057302225325 ENSG00000167302:ENST00000300714:exon_79202079_79203276:C17orf56;ENSG00000167302:ENST00000374769:exon_79202079_79203276:C17orf56 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 79203114 G/C 1 13 14 27 6.08475921593934 7.44718238283456 -1.36242316689522 C:G G C 10 0.531941598773897 0.700745604151725 ENSG00000167302:ENST00000300714:exon_79202079_79203276:C17orf56;ENSG00000167302:ENST00000374769:exon_79202079_79203276:C17orf56 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 79220224 G/C 1 36 41 77 16.8501024441397 21.8096055497298 -4.95950310559007 C:G G C 10 0.531941598773897 0.304043990534521 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 79479115 C/T 1 3804 4125 7929 1780.4941582641 2194.25909494233 -413.764936678229 A:T:C:G C T 10 0.531941598773897 1.51013906907041e-20 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79478929_79479168:ACTG1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 79511135 A/G 1 18 17 35 8.42505122206985 9.04300717915625 -0.617955957086396 A:G A G 10 0.531941598773897 0.866729421930043 ENSG00000185504:ENST00000361039:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79511030_79511146:C17orf70 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 79514028 C/G 1 13 8 21 6.08475921593934 4.25553279019118 1.82922642574816 C:G C G 10 0.531941598773897 0.514430539711333 ENSG00000185504:ENST00000361039:exon_79513935_79514112:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79513935_79515054:C17orf70 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 79514129 G/A 1 13 16 29 6.08475921593934 8.51106558038235 -2.42630636444301 A:G G A 10 0.531941598773897 0.457380459449149 ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79513935_79515054:C17orf70 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 79526402 G/C 1 19 11 30 8.89310962329596 5.85135758651287 3.04175203678309 C:G G C 10 0.531941598773897 0.279377137902125 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79523915_79526442:NPLOC4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 79589242 G/A 1 6 6 12 2.80835040735662 3.19164959264338 -0.383299185286765 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79589192_79589304:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79589192_79589304:NPLOC4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 79596811 C/T 1 4 7 11 1.87223360490441 3.72359119141728 -1.85135758651287 T:C C T 10 0.531941598773897 0.36707898879345 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79596751_79596831:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79596751_79596831:NPLOC4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 79618059 C/T 1 18 19 37 8.42505122206985 10.106890376704 -1.68183915463419 T:C C T 10 0.531941598773897 0.623318092187015 ENSG00000185527:ENST00000331056:exon_79617489_79618180:PDE6G;ENSG00000185527:ENST00000374743:exon_79617489_79618180:PDE6G HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 79867448 G/A 1 16 12 28 7.48893441961765 6.38329918528676 1.10563523433088 A:G G A 10 0.531941598773897 0.709170099536473 ENSG00000185813:ENST00000331285:exon_79867390_79867478:PCYT2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 79991708 C/G 1 9 10 19 4.21252561103493 5.31941598773897 -1.10689037670404 C:G C G 10 0.531941598773897 0.651315646573759 ENSG00000169750:ENST00000306897:exon_79991575_79992077:RAC3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 80045086 G/C 1 24 25 49 11.2334016294265 13.2985399693474 -2.06513833992095 C:G G C 10 0.531941598773897 0.569952387388795 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80044926_80045129:FASN HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 80059596 T/C 1 141 89 230 65.9962345728805 47.3428022908768 18.6534322820037 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0144033548568333 ENSG00000176155:ENST00000445854:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000389641:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392347:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392345:exon_80059566_80059742:CCDC57 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 80585094 C/T 1 5 5 10 2.34029200613052 2.65970799386948 -0.31941598773897 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000141580:ENST00000392325:exon_80585080_80585167:WDR45L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 80904844 C/T 0 9 0 9 4.21252561103493 0 4.21252561103493 C C 10 0.531941598773897 0.00448836920646731 ENSG00000175711:ENST00000320865:exon_80904755_80904859:B3GNTL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 17 81043039 A/G 1 8 2 10 3.74446720980882 1.06388319754779 2.68058401226103 A:G A G 10 0.531941598773897 0.116548632110931 ENSG00000176845:ENST00000320095:exon_81042814_81043199:METRNL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 3457539 A/G 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 A:G A G 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000177426:ENST00000401449:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000345133:exon_3457363_3458409:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000405385:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000407501:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000340165:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000343820:exon_3457363_3458388:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000457420:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000330513:exon_3457363_3458409:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000400167:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000472042:exon_3457363_3458409:TGIF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 9221883 C/G 1 26 22 48 12.1695184318787 11.7027151730257 0.466803258852943 C:G C G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9221850_9221997:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9221850_9221997:ANKRD12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 9254785 C/T 1 53 61 114 24.8070952649835 32.4484375252077 -7.64134226022426 T:C C T 10 0.531941598773897 0.159788820484139 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000359158:exon_9254209_9255428:ANKRD12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 9255784 C/A 1 100 82 182 46.8058401226103 43.6192110994596 3.18662902315074 A:C C A 10 0.531941598773897 0.656376773662596 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000400020:exon_9255630_9255795:ANKRD12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 9255982 A/G 1 107 112 219 50.082248931193 59.5774590626765 -9.49521013148345 A:T:G A G 10 0.531941598773897 0.199133256955657 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 9258531 C/T 1 24 16 40 11.2334016294265 8.51106558038235 2.72233604904412 T:C C T 10 0.531941598773897 0.430738074110928 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 9258537 T/C 1 24 17 41 11.2334016294265 9.04300717915625 2.19039445027022 T:C T C 10 0.531941598773897 0.534116506061887 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 9396331 G/A 1 4 7 11 1.87223360490441 3.72359119141728 -1.85135758651287 A:G G A 10 0.531941598773897 0.36707898879345 ENSG00000128791:ENST00000262120:exon_9396278_9396544:TWSG1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 9562042 C/T 1 4 7 11 1.87223360490441 3.72359119141728 -1.85135758651287 T:C C T 10 0.531941598773897 0.36707898879345 ENSG00000154845:ENST00000400556:exon_9561978_9562073:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000400555:exon_9561978_9562073:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000285124:exon_9561978_9562073:PPP4R1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 11886563 C/G 1 11 6 17 5.14864241348713 3.19164959264338 1.95699282084375 C:G C G 10 0.531941598773897 0.467371914131112 ENSG00000154889:ENST00000496196:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000309976:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000344987:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000399978:exon_11886498_11886620:MPPE1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 12329536 C/G 1 87 125 212 40.721080906671 66.4926998467371 -25.7716189400662 C:G C G 10 0.531941598773897 0.00042799892060743 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 12348285 T/C 1 25 28 53 11.7014600306526 14.8943647656691 -3.19290473501654 T:C T C 10 0.531941598773897 0.410531087599854 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12348272_12348382:AFG3L2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 12351342 C/T 1 35 19 54 16.3820440429136 10.106890376704 6.27515366620956 T:C C T 10 0.531941598773897 0.101538706894884 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12351305_12351412:AFG3L2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 12951898 C/T 1 12 13 25 5.61670081471324 6.91524078406066 -1.29853996934743 T:C C T 10 0.531941598773897 0.690089572307467 ENSG00000085415:ENST00000399892:exon_12951854_12951904:SEH1L;ENSG00000085415:ENST00000262124:exon_12951854_12951904:SEH1L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 12984144 C/A 1 23 23 46 10.7653432282004 12.2346567717996 -1.46931354359926 A:C C A 10 0.531941598773897 0.768000736764247 ENSG00000085415:ENST00000399892:exon_12984039_12984189:SEH1L;ENSG00000085415:ENST00000262124:exon_12984039_12984189:SEH1L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 13116432 G/T 1 5 7 12 2.34029200613052 3.72359119141728 -1.38329918528676 T:G G T 10 0.531941598773897 0.56545794539378 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13116022_13116735:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000508539:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513183:exon_13116403_13116502:CEP192 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 13124609 T/C 1 6 10 16 2.80835040735662 5.31941598773897 -2.51106558038235 T:C T C 10 0.531941598773897 0.221856598747246 ENSG00000101639:ENST00000513183:exon_13124486_13125029:CEP192 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 13645302 G/C 1 10 14 24 4.68058401226103 7.44718238283456 -2.76659837057353 C:G G C 10 0.531941598773897 0.30822661421643 ENSG00000168675:ENST00000361205:exon_13645126_13652753:C18orf1;ENSG00000168675:ENST00000399848:exon_13645126_13652753:C18orf1;ENSG00000168675:ENST00000359446:exon_13645126_13652753:C18orf1;ENSG00000168675:ENST00000399847:exon_13645126_13652753:C18orf1;ENSG00000168675:ENST00000361303:exon_13645126_13652753:C18orf1;ENSG00000168675:ENST00000435606:exon_13645126_13652753:C18orf1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 21119777 G/A 1 8 3 11 3.74446720980882 1.59582479632169 2.14864241348713 A:G G A 10 0.531941598773897 0.23704105185636 ENSG00000141458:ENST00000269228:exon_21119775_21119965:NPC1;ENSG00000141458:ENST00000412552:exon_21119775_21119965:NPC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 21739725 T/C 0 8 0 8 3.74446720980882 0 3.74446720980882 T T 10 0.531941598773897 0.00871435563033556 ENSG00000154040:ENST00000399496:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000399478:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000463087:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000486759:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000327201:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000399499:exon_21739436_21740033:CABYR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 29126670 T/C 1 14 17 31 6.55281761716544 9.04300717915625 -2.49018956199081 T:C T C 10 0.531941598773897 0.375691878346279 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29125684_29128813:DSG2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 29432624 T/C 1 11 5 16 5.14864241348713 2.65970799386948 2.48893441961765 T:C T C 10 0.531941598773897 0.316542725286372 ENSG00000153339:ENST00000283351:exon_29432558_29432626:TRAPPC8;ENSG00000153339:ENST00000451747:exon_29432558_29432626:TRAPPC8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 29625685 G/A 1 4 6 10 1.87223360490441 3.19164959264338 -1.31941598773897 A:G G A 10 0.531941598773897 0.530535902085358 ENSG00000101695:ENST00000217740:exon_29625605_29625695:RNF125 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 32712048 A/G 1 9 16 25 4.21252561103493 8.51106558038235 -4.29853996934743 A:G A G 10 0.531941598773897 0.108104723692125 ENSG00000166974:ENST00000413393:exon_32711996_32712154:MAPRE2;ENSG00000166974:ENST00000436190:exon_32711996_32712154:MAPRE2;ENSG00000166974:ENST00000300249:exon_32711996_32712154:MAPRE2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 32822382 G/T 1 8 9 17 3.74446720980882 4.78747438896507 -1.04300717915625 T:G G T 10 0.531941598773897 0.635405848599126 ENSG00000186812:ENST00000330501:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000261333:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000355632:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000421371:exon_32822355_32822848:ZNF397 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 32917644 T/C 1 10 7 17 4.68058401226103 3.72359119141728 0.956992820843751 T:C T C 10 0.531941598773897 0.809031865435945 ENSG00000172466:ENST00000261332:exon_32912176_32917734:ZNF24;ENSG00000172466:ENST00000399061:exon_32917189_32917734:ZNF24 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 33694120 G/A 1 4 6 10 1.87223360490441 3.19164959264338 -1.31941598773897 A:G G A 10 0.531941598773897 0.530535902085358 ENSG00000141424:ENST00000269187:exon_33694060_33694437:SLC39A6;ENSG00000141424:ENST00000440549:exon_33694060_33694437:SLC39A6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 33709977 G/C 1 5 10 15 2.34029200613052 5.31941598773897 -2.97912398160845 C:G G C 10 0.531941598773897 0.194220689888646 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33709864_33710034:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33709884_33710034:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33709884_33710034:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33709884_33710034:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33709884_33710034:ELP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 33718326 A/C 1 8 6 14 3.74446720980882 3.19164959264338 0.552817617165442 A:C A C 10 0.531941598773897 0.796438673256377 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33718233_33718389:ELP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 33725931 G/A 1 9 11 20 4.21252561103493 5.85135758651287 -1.63883197547794 A:G G A 10 0.531941598773897 0.507167926311403 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33725911_33726011:ELP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 33726295 A/G 1 16 17 33 7.48893441961765 9.04300717915625 -1.5540727595386 A:G A G 10 0.531941598773897 0.605214107466076 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33726213_33726344:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33726213_33726344:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33726213_33726344:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33726213_33726344:ELP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 33750046 C/T 1 29 25 54 13.573693635557 13.2985399693474 0.275153666209562 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33750026_33750159:ELP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 44407993 G/A 1 3 9 12 1.40417520367831 4.78747438896507 -3.38329918528676 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0789092376202323 ENSG00000078043:ENST00000398654:exon_44407922_44408093:PIAS2;ENSG00000078043:ENST00000262161:exon_44407922_44408093:PIAS2;ENSG00000078043:ENST00000398651:exon_44407922_44408093:PIAS2;ENSG00000078043:ENST00000324794:exon_44407922_44408093:PIAS2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 47009963 T/C 1 70 44 114 32.7640880858272 23.4054303460515 9.35865773977574 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0908328817268061 ENSG00000177576:ENST00000318240:exon_47009954_47010141:C18orf32 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 47803354 C/T 1 11 17 28 5.14864241348713 9.04300717915625 -3.89436476566912 T:C C T 10 0.531941598773897 0.184263926200264 ENSG00000141644:ENST00000353909:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269471:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000424334:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000436910:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000349085:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000347968:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269468:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000457839:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000382948:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000339998:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398495:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398493:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398488:exon_47803202_47803368:MBD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 47809871 G/T 1 12 11 23 5.61670081471324 5.85135758651287 -0.234656771799632 T:C:G G T 10 0.531941598773897 1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 47811374 G/A 1 65 87 152 30.4237960796967 46.278919093329 -15.8551230136323 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0115365906618684 ENSG00000154832:ENST00000285106:exon_47811372_47811617:CXXC1;ENSG00000154832:ENST00000412036:exon_47811372_47811617:CXXC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 47908556 G/A 1 6 5 11 2.80835040735662 2.65970799386948 0.148642413487133 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47908499_47908596:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47908499_47908596:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000417656:exon_47908499_47908596:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000488454:exon_47908499_47908596:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000494518:exon_47908499_47908596:SKA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 47918639 A/C 1 10 13 23 4.68058401226103 6.91524078406066 -2.23465677179963 A:C A C 10 0.531941598773897 0.406199961903517 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47918469_47920543:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47918469_47920534:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000417656:exon_47918469_47920534:SKA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 48458662 G/A 1 11 13 24 5.14864241348713 6.91524078406066 -1.76659837057353 A:G G A 10 0.531941598773897 0.541790058951456 ENSG00000082212:ENST00000321341:exon_48458628_48458730:ME2;ENSG00000082212:ENST00000382927:exon_48458628_48458730:ME2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 51820805 G/A 1 15 12 27 7.02087601839154 6.38329918528676 0.63757683310478 A:G G A 10 0.531941598773897 0.8492386336171 ENSG00000101751:ENST00000406285:exon_51820019_51824602:POLI;ENSG00000101751:ENST00000217800:exon_51820019_51821101:POLI HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 55268866 C/T 1 42 45 87 19.6584528514963 23.9373719448254 -4.27891909332904 A:T:C:G C T 10 0.531941598773897 0.390634331011699 ENSG00000134440:ENST00000256854:exon_55267896_55269015:NARS;ENSG00000134440:ENST00000423481:exon_55267896_55269015:NARS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 55270059 G/A 1 31 19 50 14.5098104380092 10.106890376704 4.40292006130515 A:T:G G A 10 0.531941598773897 0.256958209194573 ENSG00000134440:ENST00000256854:exon_55270044_55270175:NARS;ENSG00000134440:ENST00000423481:exon_55270044_55270175:NARS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 56149048 A/G 1 8 1 9 3.74446720980882 0.531941598773897 3.21252561103493 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0425222470212816 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56148479_56149271:ALPK2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 57000469 T/A 1 31 24 55 14.5098104380092 12.7665983705735 1.74321206743566 A:T T A 10 0.531941598773897 0.686489604173763 ENSG00000074695:ENST00000251047:exon_57000323_57000476:LMAN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 60241732 C/T 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 T:C C T 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000141664:ENST00000269499:exon_60241290_60242783:ZCCHC2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 61582867 A/G 1 3 23 26 1.40417520367831 12.2346567717996 -10.8304815681213 A:G A G 10 0.531941598773897 1.32064209409776e-05 ENSG00000242550:ENST00000397996:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000418725:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61582736_61582912:SERPINB10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 61587067 C/T 1 3 7 10 1.40417520367831 3.72359119141728 -2.31941598773897 T:C C T 10 0.531941598773897 0.205442831458325 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61587022_61587139:SERPINB10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 61600384 C/T 1 5 20 25 2.34029200613052 10.6388319754779 -8.29853996934743 T:C C T 10 0.531941598773897 0.000974133603943897 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61600282_61600437:SERPINB10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 61602495 C/T 1 6 28 34 2.80835040735662 14.8943647656691 -12.0860143583125 T:C C T 10 0.531941598773897 3.71240555547828e-05 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61602072_61603345:SERPINB10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 67687860 T/C 1 14 10 24 6.55281761716544 5.31941598773897 1.23340162942647 T:C T C 10 0.531941598773897 0.685547420411967 ENSG00000176225:ENST00000255674:exon_67687851_67688053:RTTN;ENSG00000176225:ENST00000454359:exon_67687851_67688053:RTTN HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 71928150 C/T 1 89 55 144 41.6571977091232 29.2567879325643 12.4004097765588 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0447039106704322 ENSG00000166347:ENST00000340533:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000494131:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000397914:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000299438:exon_71928150_71928179:CYB5A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 71959075 G/A 1 26 16 42 12.1695184318787 8.51106558038235 3.65845285149632 A:G G A 10 0.531941598773897 0.281941557223940 ENSG00000166347:ENST00000340533:exon_71958982_71959251:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000494131:exon_71958982_71959170:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000397914:exon_71958982_71959179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000299438:exon_71958982_71959179:CYB5A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 72776121 G/A 1 6 10 16 2.80835040735662 5.31941598773897 -2.51106558038235 A:G G A 10 0.531941598773897 0.221856598747246 ENSG00000215421:ENST00000299687:exon_72775106_72777628:ZNF407 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 74091069 C/T 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 T:C C T 10 0.531941598773897 0.730998912113487 ENSG00000101493:ENST00000524431:exon_74090810_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000443185:exon_74090965_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000217537:exon_74090968_74092259:ZNF516 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 74091235 G/C 1 6 2 8 2.80835040735662 1.06388319754779 1.74446720980882 C:G G C 10 0.531941598773897 0.297069782823554 ENSG00000101493:ENST00000524431:exon_74090810_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000443185:exon_74090965_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000217537:exon_74090968_74092259:ZNF516 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 74091242 G/A 1 7 2 9 3.27640880858272 1.06388319754779 2.21252561103493 A:G G A 10 0.531941598773897 0.187705653333192 ENSG00000101493:ENST00000524431:exon_74090810_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000443185:exon_74090965_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000217537:exon_74090968_74092259:ZNF516 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 74091961 C/T 1 6 2 8 2.80835040735662 1.06388319754779 1.74446720980882 T:C C T 10 0.531941598773897 0.297069782823554 ENSG00000101493:ENST00000524431:exon_74090810_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000443185:exon_74090965_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000217537:exon_74090968_74092259:ZNF516 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 77170477 C/A 1 10 11 21 4.68058401226103 5.85135758651287 -1.17077357425184 A:C C A 10 0.531941598773897 0.665565590544789 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77170400_77171501:NFATC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 77211764 T/C 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77211676_77211816:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77211676_77211816:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77211676_77211816:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77211676_77211816:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77211676_77211816:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77211676_77211816:NFATC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 77227476 A/G 1 20 15 35 9.36116802452206 7.97912398160846 1.3820440429136 A:G A G 10 0.531941598773897 0.735667946819423 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77227450_77227582:NFATC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 77246444 C/T 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77246248_77246937:NFATC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 77805856 A/C 1 30 26 56 14.0417520367831 13.8304815681213 0.211270468661766 A:C A C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000101546:ENST00000306735:exon_77805774_77810651:RBFA;ENSG00000101546:ENST00000262197:exon_77805774_77806377:RBFA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 18 77805949 A/C 1 72 63 135 33.7002048882794 33.5123207227555 0.187884165523904 A:C A C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000101546:ENST00000306735:exon_77805774_77810651:RBFA;ENSG00000101546:ENST00000262197:exon_77805774_77806377:RBFA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 619021 G/C 1 7 7 14 3.27640880858272 3.72359119141728 -0.447182382834558 C:G G C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_618997_619110:POLRMT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 622336 T/G 1 4 7 11 1.87223360490441 3.72359119141728 -1.85135758651287 T:G T G 10 0.531941598773897 0.36707898879345 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_622149_622373:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_622149_622373:POLRMT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 804327 C/T 1 98 83 181 45.8697233201581 44.1511526982335 1.71857062192464 T:C C T 10 0.531941598773897 0.823452916341918 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804292_804438:PTBP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 804396 C/T 1 105 77 182 49.1461321287408 40.9595031055901 8.18662902315074 T:C C T 10 0.531941598773897 0.235137541185329 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804292_804438:PTBP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 804612 C/T 1 66 65 131 30.8918544809228 34.5762039203033 -3.68434943938051 T:C C T 10 0.531941598773897 0.540649880943587 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804532_804702:PTBP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 804642 C/T 1 89 84 173 41.6571977091232 44.6830942970074 -3.02589658788418 T:C C T 10 0.531941598773897 0.648468624334156 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804532_804702:PTBP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 808586 C/G 1 82 88 170 38.3807889005404 46.8108606921029 -8.43007179156249 C:G C G 10 0.531941598773897 0.218722939582915 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000350092:exon_808546_808762:PTBP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 808742 G/T 1 82 85 167 38.3807889005404 45.2150358957812 -6.8342469952408 T:G G T 10 0.531941598773897 0.313555160899801 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000350092:exon_808546_808762:PTBP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 810573 C/A 1 91 99 190 42.5933145115754 52.6622182786158 -10.0689037670404 A:T:C C A 10 0.531941598773897 0.146525534015082 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_810543_810620:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_810543_810620:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_810543_810620:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000350092:exon_810543_810620:PTBP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 868115 C/T 1 31 38 69 14.5098104380092 20.2137807534081 -5.70397031539889 T:C C T 10 0.531941598773897 0.185136875094727 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_867964_868251:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_867964_868499:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_867964_868499:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_867964_868499:MED16 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 880066 G/A 1 5 17 22 2.34029200613052 9.04300717915625 -6.70271517302574 A:G G A 10 0.531941598773897 0.00477317999885122 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_879937_880148:MED16 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 885818 A/G 1 24 34 58 11.2334016294265 18.0860143583125 -6.85261272888603 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0865245789214582 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_885770_886201:MED16 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 966693 C/T 1 23 18 41 10.7653432282004 9.57494877793015 1.19039445027022 T:C C T 10 0.531941598773897 0.756062965822922 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_966572_966868:ARID3A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 966891 C/T 1 7 4 11 3.27640880858272 2.12776639509559 1.14864241348713 T:C C T 10 0.531941598773897 0.55795959209382 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 990281 G/A 1 47 34 81 21.9987448576268 18.0860143583125 3.91273049931434 A:G G A 10 0.531941598773897 0.436091871492207 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_990223_990364:WDR18 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 991129 G/A 1 77 91 168 36.0404968944099 48.4066854884246 -12.3661885940147 A:G G A 10 0.531941598773897 0.063270644096245 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_991081_991145:WDR18 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 991968 T/C 1 88 106 194 41.1891393078971 56.3858094700331 -15.196670162136 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0308187006946301 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_991955_992121:WDR18 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 1010406 G/A 1 91 77 168 42.5933145115754 40.9595031055901 1.6338114059853 A:G G A 10 0.531941598773897 0.817015916013578 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1009650_1010894:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1009650_1010894:C19orf6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 1011338 C/T 1 11 20 31 5.14864241348713 10.6388319754779 -5.49018956199081 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0701524103535984 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 1012120 G/A 1 50 73 123 23.4029200613051 38.8317367104945 -15.4288166491893 A:G G A 10 0.531941598773897 0.00649110546945508 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1012065_1012187:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1012065_1012187:C19orf6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 1014377 A/G 1 35 32 67 16.3820440429136 17.0221311607647 -0.640087117851099 A:G A G 10 0.531941598773897 0.902994620885551 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1014191_1014472:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1014191_1014472:C19orf6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 1036444 G/A 1 120 127 247 56.1670081471324 67.5565830442849 -11.3895748971526 A:T:G G A 10 0.531941598773897 0.160603078128909 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 1056065 A/G 1 5 5 10 2.34029200613052 2.65970799386948 -0.31941598773897 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1056065_1056242:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1056065_1056242:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1056065_1056242:ABCA7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 1065305 G/A 1 36 19 55 16.8501024441397 10.106890376704 6.74321206743566 A:G G A 10 0.531941598773897 0.078761795105573 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1065269_1065568:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1065269_1065568:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1065269_1065424:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000531478:exon_1065290_1065571:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000524383:exon_1065269_1065327:ABCA7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 1068734 T/C 1 22 7 29 10.2972848269743 3.72359119141728 6.57369363555699 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0152056818399152 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 1068738 G/A 1 25 10 35 11.7014600306526 5.31941598773897 6.3820440429136 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0406586612806235 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 1077985 A/G 1 27 40 67 12.6375768331048 21.2776639509559 -8.6400871178511 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0374246942007641 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1077856_1078044:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1077856_1078044:HMHA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 1081834 G/A 1 80 51 131 37.4446720980882 27.1290215374687 10.3156505606195 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0797029938011626 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1081823_1081960:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1081823_1081960:HMHA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 1085966 A/G 1 85 90 175 39.7849641042188 47.8747438896507 -8.08977978543198 A:G A G 10 0.531941598773897 0.226245662028987 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1085659_1086627:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1085659_1086627:HMHA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 1095336 C/T 1 48 40 88 22.4668032588529 21.2776639509559 1.18913930789706 T:C C T 10 0.531941598773897 0.831422429486675 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 1095352 C/G 1 13 15 28 6.08475921593934 7.97912398160846 -1.89436476566912 C:G C G 10 0.531941598773897 0.57093826541044 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 1095355 C/T 1 11 6 17 5.14864241348713 3.19164959264338 1.95699282084375 T:C C T 10 0.531941598773897 0.467371914131112 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 1223104 G/A 1 33 44 77 15.4459272404614 23.4054303460515 -7.95950310559007 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0860721227520426 ENSG00000118046:ENST00000326873:exon_1222984_1223171:STK11;ENSG00000118046:ENST00000405031:exon_1222984_1223171:STK11 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 1256998 C/T 1 20 15 35 9.36116802452206 7.97912398160846 1.3820440429136 T:C C T 10 0.531941598773897 0.735667946819423 ENSG00000167470:ENST00000300952:exon_1256994_1259139:MIDN;ENSG00000167470:ENST00000395622:exon_1256994_1259078:MIDN HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 1397443 G/A 1 53 26 79 24.8070952649835 13.8304815681213 10.9766136968621 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0131835978221590 ENSG00000130005:ENST00000252288:exon_1397089_1397498:GAMT;ENSG00000130005:ENST00000455182:exon_1397092_1397498:GAMT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 1611856 G/A 1 2 6 8 0.936116802452206 3.19164959264338 -2.25553279019118 A:G G A 10 0.531941598773897 0.158093130392085 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 1621914 A/G 1 57 52 109 26.6793288698879 27.6609631362426 -0.981634266354778 A:G A G 10 0.531941598773897 0.848536449179695 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1621837_1621969:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1621837_1621969:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1621837_1621969:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1621837_1621969:TCF3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 1827565 A/G 1 9 17 26 4.21252561103493 9.04300717915625 -4.83048156812132 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0755619747818205 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1826877_1828630:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1826877_1828630:REXO1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 1912817 C/T 1 12 14 26 5.61670081471324 7.44718238283456 -1.83048156812132 T:C C T 10 0.531941598773897 0.556956605195833 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 1912934 T/C 1 7 8 15 3.27640880858272 4.25553279019118 -0.979123981608455 T:C T C 10 0.531941598773897 0.617504794360634 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 2041032 T/C 1 6 8 14 2.80835040735662 4.25553279019118 -1.44718238283456 T:C T C 10 0.531941598773897 0.594012234271892 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 2046433 G/A 1 115 93 208 53.8267161410018 49.4705686859724 4.35614745502942 A:G G A 10 0.531941598773897 0.578535949461046 ENSG00000099875:ENST00000309340:exon_2046366_2046467:MKNK2;ENSG00000099875:ENST00000250896:exon_2046366_2046467:MKNK2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 2078176 C/T 1 64 42 106 29.9557376784706 22.3415471485037 7.61419052996692 T:C C T 10 0.531941598773897 0.145142247657601 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 2078409 A/G 1 49 39 88 22.934861660079 20.745722352182 2.18913930789707 A:T:G A G 10 0.531941598773897 0.670239501655143 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 2078488 T/C 1 52 38 90 24.3390368637574 20.2137807534081 4.12525611034927 T:C T C 10 0.531941598773897 0.399904814027301 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 2098015 T/C 0 0 8 8 0 4.25553279019118 -4.25553279019118 C T C 10 0.531941598773897 0.00230356440294974 ENSG00000099840:ENST00000498554:exon_2097928_2098126:IZUMO4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 2138654 T/G 1 12 5 17 5.61670081471324 2.65970799386948 2.95699282084375 T:G T G 10 0.531941598773897 0.223519240246810 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2138618_2138713:AP3D1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 2353150 C/A 1 18 18 36 8.42505122206985 9.57494877793015 -1.14989755586029 A:C C A 10 0.531941598773897 0.740298639827591 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2352944_2353207:AC004410.1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 2732986 T/C 1 42 57 99 19.6584528514963 30.3206711301121 -10.6622182786158 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0343633642155921 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 2762585 A/C 1 27 27 54 12.6375768331048 14.3624231668952 -1.72484633379044 A:C A C 10 0.531941598773897 0.683528061818154 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2762504_2762642:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2762504_2762642:SGTA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 2767192 G/T 1 17 17 34 7.95699282084375 9.04300717915625 -1.0860143583125 T:G G T 10 0.531941598773897 0.733832096008433 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2767134_2767218:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2767134_2767218:SGTA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 2917287 C/A 1 5 8 13 2.34029200613052 4.25553279019118 -1.91524078406066 A:C C A 10 0.531941598773897 0.405859977542485 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 2917612 T/C 1 5 8 13 2.34029200613052 4.25553279019118 -1.91524078406066 T:C T C 10 0.531941598773897 0.405859977542485 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 3155902 G/A 1 24 21 45 11.2334016294265 11.1707735742518 0.062628055174633 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3155821_3155950:GNA15 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 3534842 G/A 1 18 21 39 8.42505122206985 11.1707735742518 -2.74572235218198 A:G G A 10 0.531941598773897 0.423999280553551 ENSG00000105325:ENST00000441788:exon_3534793_3536755:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000395095:exon_3534793_3538325:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000221926:exon_3534793_3538325:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000313639:exon_3534793_3538325:FZR1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 3752515 G/A 1 20 29 49 9.36116802452206 15.426306364443 -6.06513833992095 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0872195165297759 ENSG00000011132:ENST00000439726:exon_3752506_3752718:APBA3;ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3752506_3752718:APBA3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 3753769 C/T 1 17 12 29 7.95699282084375 6.38329918528676 1.57369363555699 T:C C T 10 0.531941598773897 0.582816143128388 ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3753763_3753924:APBA3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 3982967 G/A 1 743 670 1413 347.767392110995 356.400871178511 -8.63347906751648 A:T:C:G G A 10 0.531941598773897 0.650490354768334 ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3982805_3983016:EEF2;ENSG00000167658:ENST00000445244:exon_3982805_3983016:EEF2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 3983184 A/G 1 652 618 1270 305.174077599419 328.739908042268 -23.5658304428492 A:G A G 10 0.531941598773897 0.186418774962058 ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3983108_3983289:EEF2;ENSG00000167658:ENST00000445244:exon_3983108_3983289:EEF2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 4013322 T/C 1 18 11 29 8.42505122206985 5.85135758651287 2.57369363555699 T:C T C 10 0.531941598773897 0.35905385704836 ENSG00000105229:ENST00000262971:exon_4012921_4013347:PIAS4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 4033462 T/C 1 4 6 10 1.87223360490441 3.19164959264338 -1.31941598773897 T:C T C 10 0.531941598773897 0.530535902085358 ENSG00000105229:ENST00000262971:exon_4033418_4033578:PIAS4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 4101062 G/T 1 32 42 74 14.9778688392353 22.3415471485037 -7.36367830926838 T:G G T 10 0.531941598773897 0.102444470890465 ENSG00000126934:ENST00000262948:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000394867:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000481271:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000443189:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000465472:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000472395:exon_4100962_4101141:MAP2K2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 4102449 G/A 1 69 61 130 32.2960296846011 32.4484375252077 -0.152407840606607 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000126934:ENST00000262948:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000394867:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000481271:exon_4102374_4103202:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000443189:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000465472:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000472395:exon_4102374_4102502:MAP2K2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 4117528 G/A 1 38 52 90 17.7862192465919 27.6609631362426 -9.87474388965073 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0442431731727502 ENSG00000126934:ENST00000262948:exon_4117417_4117627:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000394867:exon_4117417_4117627:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000443189:exon_4117417_4117627:MAP2K2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 4234792 A/C 1 219 194 413 102.504789868517 103.196670162136 -0.691880293619462 A:C A C 10 0.531941598773897 0.960696592360936 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4234664_4234821:EBI3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 4236996 G/A 1 322 316 638 150.714805194805 168.093545212551 -17.3787400177463 A:G G A 10 0.531941598773897 0.177360795488209 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 4237067 A/G 1 196 207 403 91.7394466403162 110.111910946197 -18.3724643058805 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0722331696186711 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 4251069 T/C 1 9 13 22 4.21252561103493 6.91524078406066 -2.70271517302573 T:C T C 10 0.531941598773897 0.288586288224940 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4251024_4251168:CCDC94 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 4254375 C/T 1 24 31 55 11.2334016294265 16.4901895619908 -5.25678793256434 T:C C T 10 0.531941598773897 0.176938470262111 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4254352_4254486:CCDC94 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 4325433 G/A 1 3 6 9 1.40417520367831 3.19164959264338 -1.78747438896507 A:G G A 10 0.531941598773897 0.320650472569791 ENSG00000178078:ENST00000424810:exon_4325393_4325542:STAP2;ENSG00000178078:ENST00000314714:exon_4325393_4325542:STAP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 4352959 A/G 1 6 14 20 2.80835040735662 7.44718238283456 -4.63883197547794 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0439672704170584 ENSG00000008382:ENST00000359935:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262966:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262967:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000429880:exon_4352894_4353026:MPND HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 4362691 G/C 1 11 12 23 5.14864241348713 6.38329918528676 -1.23465677179963 C:G G C 10 0.531941598773897 0.678419761183294 ENSG00000141985:ENST00000417295:exon_4362609_4362733:SH3GL1;ENSG00000141985:ENST00000269886:exon_4362609_4362733:SH3GL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 4454000 G/A 1 28 18 46 13.1056352343309 9.57494877793015 3.53068645640074 A:G G A 10 0.531941598773897 0.30602653954237 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4453927_4454090:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4453927_4454090:UBXN6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 4457650 C/T 1 11 20 31 5.14864241348713 10.6388319754779 -5.49018956199081 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0701524103535984 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4457612_4457694:UBXN6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 4670236 C/G 1 42 51 93 19.6584528514963 27.1290215374687 -7.47056868597242 C:G C G 10 0.531941598773897 0.145345360654246 ENSG00000074842:ENST00000262947:exon_4670173_4670415:C19orf10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 4818378 T/C 1 23 24 47 10.7653432282004 12.7665983705735 -2.00125514237316 T:C T C 10 0.531941598773897 0.562904715352254 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 4859937 T/C 1 39 44 83 18.254277647818 23.4054303460515 -5.15115269823345 T:C T C 10 0.531941598773897 0.272534165640402 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4859838_4860036:PLIN3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 4929413 T/C 1 7 3 10 3.27640880858272 1.59582479632169 1.68058401226103 T:C T C 10 0.531941598773897 0.3537387028518 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4929234_4929488:UHRF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 4929473 A/G 1 26 15 41 12.1695184318787 7.97912398160846 4.19039445027022 A:G A G 10 0.531941598773897 0.212432770706269 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4929234_4929488:UHRF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 5206775 A/G 1 20 6 26 9.36116802452206 3.19164959264338 6.16951843187868 A:G A G 10 0.531941598773897 0.01742763533912 ENSG00000105426:ENST00000355005:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000262963:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000348075:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000355322:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000356037:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000357368:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000353284:exon_5205519_5206853:PTPRS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 5210782 G/A 1 17 7 24 7.95699282084375 3.72359119141728 4.23340162942647 A:G G A 10 0.531941598773897 0.101874345613790 ENSG00000105426:ENST00000355005:exon_5210690_5210816:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000262963:exon_5210690_5210816:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000348075:exon_5210690_5210816:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000355322:exon_5210690_5210816:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000356037:exon_5210690_5210816:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000357368:exon_5210690_5210816:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000353284:exon_5210690_5210816:PTPRS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 5783634 T/C 1 6 2 8 2.80835040735662 1.06388319754779 1.74446720980882 T:C T C 10 0.531941598773897 0.297069782823554 ENSG00000212123:ENST00000390672:exon_5782971_5784610:PRR22;ENSG00000212123:ENST00000419421:exon_5782971_5784064:PRR22 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 5786815 G/A 1 14 13 27 6.55281761716544 6.91524078406066 -0.36242316689522 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000141994:ENST00000320699:exon_5786760_5786856:DUS3L;ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5786760_5786856:DUS3L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 5789609 C/A 0 16 0 16 7.48893441961765 0 7.48893441961765 C C 10 0.531941598773897 4.64046531196642e-05 ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5789218_5789730:DUS3L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 5908969 G/A 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 A:G G A 10 0.531941598773897 0.730998912113487 ENSG00000187650:ENST00000339485:exon_5908835_5910864:VMAC HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 6380469 C/T 1 111 103 214 51.9544825360974 54.7899846737114 -2.83550213761396 T:C:G C T 10 0.531941598773897 0.732110936040067 ENSG00000125651:ENST00000394456:exon_6379580_6380496:GTF2F1;ENSG00000125651:ENST00000429701:exon_6379580_6380496:GTF2F1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 6454651 T/C 1 12 9 21 5.61670081471324 4.78747438896507 0.829226425748162 T:C T C 10 0.531941598773897 0.828237202108702 ENSG00000125648:ENST00000264088:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000422102:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000441950:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000301454:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000414491:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000334510:exon_6454570_6454728:SLC25A23 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 6495736 A/G 1 9 7 16 4.21252561103493 3.72359119141728 0.488934419617648 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000104833:ENST00000264071:exon_6494331_6496232:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000411712:exon_6495175_6495767:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000412858:exon_6495175_6495861:TUBB4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 6731057 T/C 1 48 23 71 22.4668032588529 12.2346567717996 10.2321464870533 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0169448980081131 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6730998_6731122:GPR108;ENSG00000125734:ENST00000430424:exon_6730998_6731122:GPR108 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 6737509 G/A 1 7 1 8 3.27640880858272 0.531941598773897 2.74446720980882 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0747852262017061 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6737468_6737633:GPR108 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 6760974 T/C 1 12 11 23 5.61670081471324 5.85135758651287 -0.234656771799632 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6760649_6760998:SH2D3A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 6772872 G/C 1 20 17 37 9.36116802452206 9.04300717915625 0.31816084536581 C:G G C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000141968:ENST00000304076:exon_6772722_6773022:VAV1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 7125297 G/A 1 8 4 12 3.74446720980882 2.12776639509559 1.61670081471324 A:G G A 10 0.531941598773897 0.3994437340124 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7125294_7125538:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7125294_7125538:INSR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 7141775 G/A 1 6 2 8 2.80835040735662 1.06388319754779 1.74446720980882 A:G G A 10 0.531941598773897 0.297069782823554 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7141688_7141827:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7141688_7141827:INSR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 7166388 G/A 1 12 8 20 5.61670081471324 4.25553279019118 1.36116802452206 A:G G A 10 0.531941598773897 0.65611601649275 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7166165_7166415:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7166165_7166415:INSR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 7606291 C/T 1 11 8 19 5.14864241348713 4.25553279019118 0.893109623295957 T:C C T 10 0.531941598773897 0.819320657489995 ENSG00000032444:ENST00000221249:exon_7606240_7606320:PNPLA6;ENSG00000032444:ENST00000414982:exon_7606240_7606320:PNPLA6;ENSG00000032444:ENST00000450331:exon_7606240_7606320:PNPLA6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 7623700 G/A 1 4 7 11 1.87223360490441 3.72359119141728 -1.85135758651287 A:G G A 10 0.531941598773897 0.36707898879345 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 7712193 G/A 1 6 4 10 2.80835040735662 2.12776639509559 0.68058401226103 A:G G A 10 0.531941598773897 0.758887050232993 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 7712277 A/G 1 56 56 112 26.2112704686618 29.7887295313382 -3.57745906267647 A:G A G 10 0.531941598773897 0.508821698913552 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7712240_7712397:STXBP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 7712585 T/G 1 10 5 15 4.68058401226103 2.65970799386948 2.02087601839155 T:G T G 10 0.531941598773897 0.438857439709851 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 7763703 A/G 1 377 475 852 176.458017262241 252.672259417601 -76.2142421553603 A:T:C:G A G 10 0.531941598773897 2.02468056885523e-07 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7763627_7763740:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7763627_7763740:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7763627_7763740:FCER2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 7913974 T/C 1 6 4 10 2.80835040735662 2.12776639509559 0.68058401226103 T:C T C 10 0.531941598773897 0.758887050232993 ENSG00000142459:ENST00000270530:exon_7913807_7914031:EVI5L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 7916620 A/G 1 6 9 15 2.80835040735662 4.78747438896507 -1.97912398160846 A:G A G 10 0.531941598773897 0.316481765113816 ENSG00000142459:ENST00000270530:exon_7916567_7916656:EVI5L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 7986638 C/G 1 21 11 32 9.82922642574816 5.85135758651287 3.9778688392353 C:G C G 10 0.531941598773897 0.214399105369973 ENSG00000104976:ENST00000221573:exon_7986590_7986658:SNAPC2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 8326866 C/T 1 36 32 68 16.8501024441397 17.0221311607647 -0.172028716624997 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 8326904 G/A 1 38 47 85 17.7862192465919 25.0012551423732 -7.21503589578125 A:G G A 10 0.531941598773897 0.128301111871003 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 8326944 G/A 1 45 28 73 21.0626280551746 14.8943647656691 6.16826328950552 A:G G A 10 0.531941598773897 0.160197042971399 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 8326999 C/T 1 31 13 44 14.5098104380092 6.91524078406066 7.59456965394853 T:C:G C T 10 0.531941598773897 0.0232773864118166 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 8486884 G/A 1 8 5 13 3.74446720980882 2.65970799386948 1.08475921593934 A:G G A 10 0.531941598773897 0.591209044900214 ENSG00000099785:ENST00000381035:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000215555:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000393944:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000429675:exon_8486607_8486900:MARCH2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 8503345 G/C 1 13 13 26 6.08475921593934 6.91524078406066 -0.830481568121323 C:G G C 10 0.531941598773897 0.844915066483025 ENSG00000099785:ENST00000381035:exon_8503272_8503895:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000215555:exon_8503272_8503895:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000393944:exon_8503272_8503895:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000429675:exon_8503272_8503895:MARCH2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 8615609 G/A 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 A:G G A 10 0.531941598773897 1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 9524185 A/G 1 20 54 74 9.36116802452206 28.7248463337904 -19.3636783092684 A:G A G 10 0.531941598773897 6.33055989630704e-06 ENSG00000174652:ENST00000361151:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000361451:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000437513:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000393865:exon_9524180_9524218:ZNF266 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 10224548 G/A 1 43 55 98 20.1265112527224 29.2567879325643 -9.13027667984191 A:C:G G A 10 0.531941598773897 0.0686946447499267 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 10265044 G/A 1 15 16 31 7.02087601839154 8.51106558038235 -1.49018956199081 A:G G A 10 0.531941598773897 0.595424051385011 ENSG00000130816:ENST00000340748:exon_10264969_10265155:DNMT1;ENSG00000130816:ENST00000359526:exon_10264969_10265155:DNMT1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 10265593 G/T 1 22 19 41 10.2972848269743 10.106890376704 0.190394450270222 T:G G T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000130816:ENST00000340748:exon_10265581_10265732:DNMT1;ENSG00000130816:ENST00000359526:exon_10265581_10265732:DNMT1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 10267077 T/C 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 T:C T C 10 0.531941598773897 0.486426237614014 ENSG00000130816:ENST00000340748:exon_10267067_10267185:DNMT1;ENSG00000130816:ENST00000359526:exon_10267067_10267185:DNMT1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 10334663 T/G 1 14 5 19 6.55281761716544 2.65970799386948 3.89310962329596 T:G T G 10 0.531941598773897 0.105556053498551 ENSG00000175898:ENST00000317726:exon_10332109_10335623:S1PR2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 10404612 G/A 1 6 8 14 2.80835040735662 4.25553279019118 -1.44718238283456 A:G G A 10 0.531941598773897 0.594012234271892 ENSG00000105376:ENST00000221980:exon_10404374_10404619:ICAM5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 10426597 T/C 1 9 11 20 4.21252561103493 5.85135758651287 -1.63883197547794 T:C T C 10 0.531941598773897 0.507167926311403 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426528_10426685:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426528_10426691:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426528_10426672:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426528_10426682:FDX1L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 10426628 T/C 1 10 10 20 4.68058401226103 5.31941598773897 -0.63883197547794 T:C T C 10 0.531941598773897 0.825252984872384 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426528_10426685:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426528_10426691:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426528_10426672:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426528_10426682:FDX1L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 10439501 C/T 1 25 24 49 11.7014600306526 12.7665983705735 -1.06513833992095 T:C C T 10 0.531941598773897 0.776433754395787 ENSG00000161847:ENST00000293677:exon_10439318_10439787:RAVER1;ENSG00000161847:ENST00000331131:exon_10439318_10439787:RAVER1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 10439540 A/G 1 26 26 52 12.1695184318787 13.8304815681213 -1.66096313624265 A:G A G 10 0.531941598773897 0.678283697408892 ENSG00000161847:ENST00000293677:exon_10439318_10439787:RAVER1;ENSG00000161847:ENST00000331131:exon_10439318_10439787:RAVER1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 10439711 A/G 1 17 9 26 7.95699282084375 4.78747438896507 3.16951843187868 A:G A G 10 0.531941598773897 0.242193782306086 ENSG00000161847:ENST00000293677:exon_10439318_10439787:RAVER1;ENSG00000161847:ENST00000331131:exon_10439318_10439787:RAVER1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 10444826 G/A 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 A:G G A 10 0.531941598773897 0.730998912113487 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 10446568 T/C 1 121 75 196 56.6350665483585 39.8956199080423 16.7394466403162 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0180147845272105 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10446347_10446652:ICAM3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 10449358 T/C 1 151 130 281 70.6768185851415 69.1524078406066 1.52441074453493 T:C T C 10 0.531941598773897 0.904863707906477 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10449358_10449624:ICAM3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 10464687 A/G 1 28 31 59 13.1056352343309 16.4901895619908 -3.38455432765992 A:G A G 10 0.531941598773897 0.434164978808318 ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10464204_10464754:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10464587_10464910:TYK2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 10475652 C/A 1 10 16 26 4.68058401226103 8.51106558038235 -3.83048156812132 A:C C A 10 0.531941598773897 0.168543383211345 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10475527_10475724:TYK2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 10577843 C/A 1 28 37 65 13.1056352343309 19.6818391546342 -6.57620392030331 A:C C A 10 0.531941598773897 0.107325709446655 ENSG00000065989:ENST00000380702:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000352831:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000293683:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000440014:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000419866:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000344979:exon_10577563_10580305:PDE4A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 10600442 G/C 1 18 16 34 8.42505122206985 8.51106558038235 -0.0860143583124984 T:C:G G C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10600324_10600529:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10600324_10600529:KEAP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 10664632 A/G 1 42 42 84 19.6584528514963 22.3415471485037 -2.68309429700735 A:G A G 10 0.531941598773897 0.58561166100526 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10663761_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10664252_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10664267_10664957:KRI1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 10668452 A/G 1 40 35 75 18.7223360490441 18.6179559570864 0.104380091957726 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10668445_10668571:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668228_10668571:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10668445_10668571:KRI1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 10668673 A/G 1 31 39 70 14.5098104380092 20.745722352182 -6.23591191417279 A:G A G 10 0.531941598773897 0.150890672743733 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10668648_10668736:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668648_10668736:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10668648_10668736:KRI1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 10939792 T/C 1 41 42 83 19.1903944502702 22.3415471485037 -3.15115269823345 T:C T C 10 0.531941598773897 0.510587281495968 ENSG00000079805:ENST00000389252:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000389253:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000359692:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000314646:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000355667:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000408974:exon_10939712_10939944:DNM2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 11224265 A/G 1 8 2 10 3.74446720980882 1.06388319754779 2.68058401226103 A:G A G 10 0.531941598773897 0.116548632110931 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11224211_11224438:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11224211_11224438:LDLR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 11227554 C/T 1 6 8 14 2.80835040735662 4.25553279019118 -1.44718238283456 T:C C T 10 0.531941598773897 0.594012234271892 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11227535_11227674:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11227535_11227674:LDLR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 11465316 G/C 1 11 7 18 5.14864241348713 3.72359119141728 1.42505122206985 C:G G C 10 0.531941598773897 0.638380509834863 ENSG00000183401:ENST00000458408:exon_11465256_11465372:CCDC159;ENSG00000183401:ENST00000427879:exon_11465256_11465374:CCDC159 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 11624708 C/T 1 15 21 36 7.02087601839154 11.1707735742518 -4.14989755586029 T:C C T 10 0.531941598773897 0.183504814477384 ENSG00000130159:ENST00000270517:exon_11624619_11625036:ECSIT;ENSG00000130159:ENST00000252440:exon_11624619_11625036:ECSIT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 12059645 A/G 1 6 5 11 2.80835040735662 2.65970799386948 0.148642413487133 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000196757:ENST00000254321:exon_12059091_12061578:ZNF700;ENSG00000196757:ENST00000482090:exon_12059091_12061588:ZNF700 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 13879816 G/T 1 16 13 29 7.48893441961765 6.91524078406066 0.573693635556986 T:G G T 10 0.531941598773897 0.85485877023254 ENSG00000037757:ENST00000040663:exon_13879638_13879862:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000319545:exon_13879638_13879862:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000445479:exon_13879638_13879862:MRI1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 13883099 A/G 1 6 8 14 2.80835040735662 4.25553279019118 -1.44718238283456 A:G A G 10 0.531941598773897 0.594012234271892 ENSG00000037757:ENST00000040663:exon_13882935_13885096:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000319545:exon_13882935_13883361:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000445479:exon_13882935_13883361:MRI1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 14030684 G/A 1 6 7 13 2.80835040735662 3.72359119141728 -0.915240784060662 A:G G A 10 0.531941598773897 0.782547085779911 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000397486:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14030631_14030764:CC2D1A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 14065341 T/C 1 15 19 34 7.02087601839154 10.106890376704 -3.0860143583125 T:C T C 10 0.531941598773897 0.306815928235480 ENSG00000132017:ENST00000254337:exon_14065338_14065473:DCAF15 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 14512489 G/A 1 41 24 65 19.1903944502702 12.7665983705735 6.42379607969669 A:G G A 10 0.531941598773897 0.135303850749008 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000434474:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000393059:exon_14512465_14512572:CD97 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 14581063 A/G 1 92 72 164 43.0613729128015 38.2997951117206 4.76157780108089 A:G A G 10 0.531941598773897 0.481782396063177 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14580975_14581117:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14580975_14581117:PKN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 14582468 G/A 1 137 113 250 64.1240009679761 60.1094006614504 4.01460030652574 A:G G A 10 0.531941598773897 0.65739901630108 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14582393_14582671:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14582393_14582678:PKN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 14590236 C/T 1 12 10 22 5.61670081471324 5.31941598773897 0.297284826974265 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14590224_14590336:GIPC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 14682804 G/C 1 53 51 104 24.8070952649835 27.1290215374687 -2.32192627248529 C:G G C 10 0.531941598773897 0.694610887312233 ENSG00000099795:ENST00000215565:exon_14682701_14682886:NDUFB7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 14705574 T/C 1 10 13 23 4.68058401226103 6.91524078406066 -2.23465677179963 T:C T C 10 0.531941598773897 0.406199961903517 ENSG00000187912:ENST00000397439:exon_14705571_14705612:CLEC17A;ENSG00000187912:ENST00000417570:exon_14705571_14705612:CLEC17A;ENSG00000187912:ENST00000339847:exon_14705571_14705612:CLEC17A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 15226970 G/A 1 29 20 49 13.573693635557 10.6388319754779 2.93486166007905 A:G G A 10 0.531941598773897 0.474675065311661 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 15227030 G/A 1 33 20 53 15.4459272404614 10.6388319754779 4.80709526498346 A:G G A 10 0.531941598773897 0.215800805717494 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 17303774 T/G 1 21 20 41 9.82922642574816 10.6388319754779 -0.809605549729778 T:G T G 10 0.531941598773897 0.876041715677551 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17303555_17303871:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17303555_17303871:MYO9B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 17305440 T/C 1 24 39 63 11.2334016294265 20.745722352182 -9.51232072275551 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0222907815308646 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 17305632 C/T 1 43 44 87 20.1265112527224 23.4054303460515 -3.27891909332904 T:C C T 10 0.531941598773897 0.519788680519337 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 17306031 T/C 1 53 62 115 24.8070952649835 32.9803791239816 -8.17328385899815 T:C:G T C 10 0.531941598773897 0.135236106833223 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 17312992 C/T 1 45 38 83 21.0626280551746 20.2137807534081 0.848847301766547 T:C C T 10 0.531941598773897 0.912574928203473 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17312939_17313112:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17312939_17313112:MYO9B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 17316782 T/C 1 38 48 86 17.7862192465919 25.5331967411471 -7.74697749455515 T:C T C 10 0.531941598773897 0.105008744127817 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17316769_17316961:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17316769_17316961:MYO9B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 17317955 A/G 1 24 27 51 11.2334016294265 14.3624231668952 -3.12902153746875 A:G A G 10 0.531941598773897 0.402288489772621 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17317922_17318053:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17317922_17318053:MYO9B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 17337871 A/G 1 8 9 17 3.74446720980882 4.78747438896507 -1.04300717915625 A:G A G 10 0.531941598773897 0.635405848599126 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 17337882 C/G 1 7 10 17 3.27640880858272 5.31941598773897 -2.04300717915625 C:G C G 10 0.531941598773897 0.341802442613557 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 17339112 G/A 1 20 20 40 9.36116802452206 10.6388319754779 -1.27766395095588 A:G G A 10 0.531941598773897 0.752231127320461 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17339065_17339118:OCEL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 17650608 G/C 1 8 3 11 3.74446720980882 1.59582479632169 2.14864241348713 C:G G C 10 0.531941598773897 0.23704105185636 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 17651370 A/G 1 25 16 41 11.7014600306526 8.51106558038235 3.19039445027022 A:G A G 10 0.531941598773897 0.350474441250631 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000300971:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000435646:exon_17651201_17651391:FAM129C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 17654181 C/T 1 17 6 23 7.95699282084375 3.19164959264338 4.76534322820037 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0588173158418721 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000300971:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000435646:exon_17654126_17654242:FAM129C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 17660300 G/A 1 29 21 50 13.573693635557 11.1707735742518 2.40292006130515 A:T:G G A 10 0.531941598773897 0.571507118281637 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17660253_17660494:FAM129C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 17837090 C/T 1 35 22 57 16.3820440429136 11.7027151730257 4.67932886988787 T:C C T 10 0.531941598773897 0.233858379061741 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 17892591 A/G 1 23 11 34 10.7653432282004 5.85135758651287 4.9139856416875 A:G A G 10 0.531941598773897 0.120850315407806 ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17892521_17892629:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17892521_17892629:FCHO1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 18170384 G/A 1 14 8 22 6.55281761716544 4.25553279019118 2.29728482697427 A:G G A 10 0.531941598773897 0.395573885710113 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 18876309 A/G 1 1 9 10 0.468058401226103 4.78747438896507 -4.31941598773897 A:G A G 10 0.531941598773897 0.00805407978646269 ENSG00000105662:ENST00000262813:exon_18876214_18876338:CRTC1;ENSG00000105662:ENST00000338797:exon_18876214_18876338:CRTC1;ENSG00000105662:ENST00000321949:exon_18876214_18876338:CRTC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 19039030 C/T 0 189 0 189 88.4630378317335 0 88.4630378317335 C C 10 0.531941598773897 1.7225638228782e-52 ENSG00000105671:ENST00000247003:exon_19038937_19039436:DDX49;ENSG00000105671:ENST00000438170:exon_19038937_19039438:DDX49 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 19120837 T/C 1 19 18 37 8.89310962329596 9.57494877793015 -0.68183915463419 T:C T C 10 0.531941598773897 0.870005915919781 ENSG00000064607:ENST00000337018:exon_19120664_19121151:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000330854:exon_19120664_19121151:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000456085:exon_19120664_19121151:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000452918:exon_19120664_19121151:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000392342:exon_19120664_19121151:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000424153:exon_19120664_19121151:SUGP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 19136541 C/T 1 19 18 37 8.89310962329596 9.57494877793015 -0.68183915463419 T:C C T 10 0.531941598773897 0.870005915919781 ENSG00000064607:ENST00000337018:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000330854:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000452918:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000392342:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000424153:exon_19135428_19137035:SUGP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 19230868 A/G 1 18 26 44 8.42505122206985 13.8304815681213 -5.40543034605147 A:G A G 10 0.531941598773897 0.130064908483984 ENSG00000064545:ENST00000450333:exon_19230429_19230992:TMEM161A;ENSG00000064545:ENST00000162044:exon_19230429_19230992:TMEM161A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 19737686 C/T 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 T:C C T 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000064547:ENST00000407877:exon_19737352_19738093:LPAR2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 19744909 C/A 1 33 32 65 15.4459272404614 17.0221311607647 -1.57620392030331 A:C C A 10 0.531941598773897 0.710865182093587 ENSG00000089639:ENST00000203556:exon_19744612_19744999:GMIP;ENSG00000089639:ENST00000445806:exon_19744612_19744999:GMIP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 19823270 T/A 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 A:T T A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000105708:ENST00000344099:exon_19821282_19823898:ZNF14 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 21131728 A/G 1 2 10 12 0.936116802452206 5.31941598773897 -4.38329918528676 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0169762852174207 ENSG00000105750:ENST00000328178:exon_21131550_21133501:ZNF85;ENSG00000105750:ENST00000345030:exon_21131550_21133108:ZNF85 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 23837195 T/C 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 T:C T C 10 0.531941598773897 0.730998912113487 ENSG00000197372:ENST00000359788:exon_23835708_23837508:ZNF675;ENSG00000197372:ENST00000356096:exon_23837165_23837508:ZNF675 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 23927345 T/C 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 T:C T C 10 0.531941598773897 0.486426237614014 ENSG00000196172:ENST00000402377:exon_23921997_23928125:ZNF681;ENSG00000196172:ENST00000360204:exon_23921999_23928125:ZNF681 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 24310413 G/C 1 6 4 10 2.80835040735662 2.12776639509559 0.68058401226103 C:G G C 10 0.531941598773897 0.758887050232993 ENSG00000213096:ENST00000357002:exon_24309056_24312643:ZNF254 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 30193721 G/A 1 8 12 20 3.74446720980882 6.38329918528676 -2.63883197547794 A:G G A 10 0.531941598773897 0.267702187700883 ENSG00000131943:ENST00000323670:exon_30190483_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392276:exon_30192070_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392275:exon_30193248_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392278:exon_30193310_30193884:C19orf12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 33096786 G/A 1 5 9 14 2.34029200613052 4.78747438896507 -2.44718238283456 A:G G A 10 0.531941598773897 0.283917011510726 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33096741_33096860:ANKRD27 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 33096816 C/T 1 7 9 16 3.27640880858272 4.78747438896507 -1.51106558038235 T:C C T 10 0.531941598773897 0.465195872310583 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33096741_33096860:ANKRD27 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 33106621 C/T 1 5 8 13 2.34029200613052 4.25553279019118 -1.91524078406066 T:C C T 10 0.531941598773897 0.405859977542485 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33106564_33106686:ANKRD27 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 33467576 G/A 1 10 15 25 4.68058401226103 7.97912398160846 -3.29853996934743 A:G G A 10 0.531941598773897 0.229796903542653 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 33602757 C/T 1 4 6 10 1.87223360490441 3.19164959264338 -1.31941598773897 T:C C T 10 0.531941598773897 0.530535902085358 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33602630_33602808:GPATCH1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 33608733 C/A 1 7 1 8 3.27640880858272 0.531941598773897 2.74446720980882 A:C C A 10 0.531941598773897 0.0747852262017061 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33608731_33608947:GPATCH1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 33617508 G/A 1 8 9 17 3.74446720980882 4.78747438896507 -1.04300717915625 A:G G A 10 0.531941598773897 0.635405848599126 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33617494_33617639:GPATCH1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 33617583 C/T 1 15 7 22 7.02087601839154 3.72359119141728 3.29728482697427 T:C C T 10 0.531941598773897 0.200805512516808 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33617494_33617639:GPATCH1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 34872382 G/A 1 214 193 407 100.164497862386 102.664728563362 -2.50023070097608 A:G G A 10 0.531941598773897 0.804109076330287 ENSG00000105220:ENST00000415930:exon_34872371_34872424:GPI;ENSG00000105220:ENST00000356487:exon_34872371_34872424:GPI;ENSG00000105220:ENST00000414931:exon_34872371_34872424:GPI HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 34959979 A/G 1 74 64 138 34.6363216907316 34.0442623215294 0.592059369202211 A:T:G A G 10 0.531941598773897 0.932253052388064 ENSG00000126261:ENST00000246548:exon_34959945_34960795:UBA2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 35648365 T/G 1 63 45 108 29.4876792772445 23.9373719448254 5.55030733241912 T:G T G 10 0.531941598773897 0.290777953680979 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35648324_35648404:FXYD5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 35660546 T/C 1 199 205 404 93.1436218439945 109.048027748649 -15.9044059046544 T:C T C 10 0.531941598773897 0.122139970582200 ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35660469_35660786:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35660469_35660783:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392217:exon_35660469_35660784:FXYD5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 35757427 G/A 1 31 29 60 14.5098104380092 15.426306364443 -0.91649592643382 A:G G A 10 0.531941598773897 0.89721965492442 ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35757262_35757435:LSR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 36142187 C/T 1 229 217 446 107.185373880778 115.431326933936 -8.24595305315806 A:T:C C T 10 0.531941598773897 0.447890338053483 ENSG00000126267:ENST00000246554:exon_36142135_36142251:COX6B1;ENSG00000126267:ENST00000392201:exon_36142135_36142251:COX6B1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 36380810 G/A 1 14 9 23 6.55281761716544 4.78747438896507 1.76534322820037 A:G G A 10 0.531941598773897 0.534173096135566 ENSG00000167604:ENST00000352614:exon_36380792_36380956:NFKBID;ENSG00000167604:ENST00000396901:exon_36380792_36380956:NFKBID;ENSG00000167604:ENST00000340950:exon_36380792_36380956:NFKBID HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 36594659 A/T 1 19 11 30 8.89310962329596 5.85135758651287 3.04175203678309 A:T:G A T 10 0.531941598773897 0.279377137902125 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36594245_36594883:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36594245_36594883:WDR62 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 36595436 A/C 1 14 6 20 6.55281761716544 3.19164959264338 3.36116802452206 A:C A C 10 0.531941598773897 0.178417023545079 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36595420_36595577:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36595420_36595577:WDR62 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 36605647 T/C 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 T:C T C 10 0.531941598773897 0.486426237614014 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 36640769 T/C 1 265 308 573 124.035476324917 163.83801242236 -39.802536097443 T:C T C 10 0.531941598773897 0.00092986703227351 ENSG00000126247:ENST00000457326:exon_36640715_36641254:CAPNS1;ENSG00000126247:ENST00000246533:exon_36640715_36641254:CAPNS1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 37854235 G/T 1 26 23 49 12.1695184318787 12.2346567717996 -0.0651383399209546 T:G G T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 37854580 C/T 1 26 23 49 12.1695184318787 12.2346567717996 -0.0651383399209546 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 38652993 C/T 1 9 7 16 4.21252561103493 3.72359119141728 0.488934419617648 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000105738:ENST00000222345:exon_38652893_38653011:SIPA1L3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 39196736 G/A 1 56 66 122 26.2112704686618 35.1081455190772 -8.89687505041544 A:G G A 10 0.531941598773897 0.122710027073826 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000445727:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000495553:exon_39196684_39196771:ACTN4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 39219780 T/C 1 200 240 440 93.6116802452206 127.665983705735 -34.0543034605147 T:C T C 10 0.531941598773897 0.00134450239251381 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000424234:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000440400:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000497637:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000477174:exon_39219636_39219794:ACTN4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 39322087 T/G 1 124 155 279 58.0392417520368 82.450947809954 -24.4117060579173 T:G T G 10 0.531941598773897 0.00390796894363709 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39321949_39322156:ECH1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 39329055 G/A 1 524 440 964 245.262602242478 234.054303460515 11.2082987819633 A:G G A 10 0.531941598773897 0.477801255204303 ENSG00000104824:ENST00000221419:exon_39329037_39329238:HNRNPL;ENSG00000104824:ENST00000388750:exon_39329037_39329238:HNRNPL;ENSG00000104824:ENST00000388749:exon_39329037_39329238:HNRNPL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 39360597 C/T 1 14 13 27 6.55281761716544 6.91524078406066 -0.36242316689522 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000187994:ENST00000340740:exon_39360583_39360900:RINL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 39409074 C/G 1 15 15 30 7.02087601839154 7.97912398160846 -0.958247963216911 C:G C G 10 0.531941598773897 0.85523751660529 ENSG00000104835:ENST00000448145:exon_39409062_39409170:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000221431:exon_39409062_39409170:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000430193:exon_39409062_39409170:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000455102:exon_39409062_39409170:FBXO17 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 39898922 C/T 1 89 101 190 41.6571977091232 53.7261014761636 -12.0689037670404 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0813593144159748 ENSG00000128016:ENST00000248673:exon_39898383_39900013:ZFP36 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 39907036 C/T 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 T:C C T 10 0.531941598773897 0.486426237614014 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000378550:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000409797:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000451354:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39906988_39907054:PLEKHG2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 39914748 G/A 1 24 33 57 11.2334016294265 17.5540727595386 -6.32067113011213 A:G G A 10 0.531941598773897 0.110798240444307 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 39915637 G/A 1 17 23 40 7.95699282084375 12.2346567717996 -4.27766395095588 A:G G A 10 0.531941598773897 0.205382479947629 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 39915758 C/G 1 45 50 95 21.0626280551746 26.5970799386949 -5.53445188352022 C:G C G 10 0.531941598773897 0.259990922568102 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 39923952 G/A 1 3033 2873 5906 1419.62113091877 1528.26821327741 -108.647082358636 A:T:C:G G A 10 0.531941598773897 0.00466111920212563 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39923852_39924058:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39923852_39924058:RPS16 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 39924129 T/C 1 14 10 24 6.55281761716544 5.31941598773897 1.23340162942647 T:C T C 10 0.531941598773897 0.685547420411967 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 40023308 A/G 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000176401:ENST00000326282:exon_40021630_40023494:EID2B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 40030704 C/T 1 9 9 18 4.21252561103493 4.78747438896507 -0.574948777930146 T:C C T 10 0.531941598773897 0.81714898933323 ENSG00000176396:ENST00000390658:exon_40028890_40030870:EID2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 40719076 T/C 1 14 14 28 6.55281761716544 7.44718238283456 -0.894364765669117 T:C T C 10 0.531941598773897 0.850300347768159 ENSG00000130758:ENST00000253055:exon_40718983_40719095:MAP3K10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 40719410 C/T 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 T:C C T 10 0.531941598773897 0.730998912113487 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 40739513 A/G 1 56 62 118 26.2112704686618 32.9803791239816 -6.76910865531985 A:G A G 10 0.531941598773897 0.230667174188178 ENSG00000105221:ENST00000392038:exon_40736224_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000486368:exon_40738241_40739590:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000483166:exon_40738242_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000476266:exon_40738244_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000358335:exon_40738870_40739596:AKT2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 40929363 T/C 1 31 21 52 14.5098104380092 11.1707735742518 3.33903686375736 T:C T C 10 0.531941598773897 0.405279454149109 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 41082868 T/C 1 27 29 56 12.6375768331048 15.426306364443 -2.78872953133823 T:C T C 10 0.531941598773897 0.504031572967325 ENSG00000160410:ENST00000291842:exon_41082757_41082891:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000428635:exon_41082790_41082891:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000418276:exon_41082790_41082891:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000446701:exon_41082790_41082891:SHKBP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 41173372 G/A 1 7 15 22 3.27640880858272 7.97912398160846 -4.70271517302573 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0540608837229035 ENSG00000105245:ENST00000252891:exon_41171810_41174043:NUMBL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 41211056 T/C 1 5 9 14 2.34029200613052 4.78747438896507 -2.44718238283456 T:C T C 10 0.531941598773897 0.283917011510726 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41211001_41211086:ADCK4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 41220529 C/T 1 5 6 11 2.34029200613052 3.19164959264338 -0.851357586512867 T:C C T 10 0.531941598773897 0.764860318695721 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41220436_41220540:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41220436_41220540:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41220436_41220540:ADCK4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 41903220 G/A 1 23 31 54 10.7653432282004 16.4901895619908 -5.72484633379044 A:G G A 10 0.531941598773897 0.133896147464981 ENSG00000077348:ENST00000221233:exon_41903086_41903256:EXOSC5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 41928652 C/T 1 55 51 106 25.7432120674357 27.1290215374687 -1.38580947003308 T:C C T 10 0.531941598773897 0.8457976330168 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41928534_41928675:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41928534_41928675:BCKDHA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 41930396 A/G 1 77 83 160 36.0404968944099 44.1511526982335 -8.11065580382353 A:G A G 10 0.531941598773897 0.205626866281087 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41930343_41930909:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41930343_41930906:BCKDHA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 41939297 C/G 1 11 12 23 5.14864241348713 6.38329918528676 -1.23465677179963 C:G C G 10 0.531941598773897 0.678419761183294 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41939177_41939339:ATP5SL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 41944237 T/C 1 13 9 22 6.08475921593934 4.78747438896507 1.29728482697427 T:C T C 10 0.531941598773897 0.6717023671041 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000301183:exon_41944123_41944319:ATP5SL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 43979589 G/T 1 3 12 15 1.40417520367831 6.38329918528676 -4.97912398160846 T:G G T 10 0.531941598773897 0.0166918725543361 ENSG00000176531:ENST00000292140:exon_43979255_43979696:PHLDB3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 44055726 T/C 1 5 10 15 2.34029200613052 5.31941598773897 -2.97912398160845 T:C T C 10 0.531941598773897 0.194220689888646 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44055723_44055839:XRCC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 44057227 T/C 1 31 31 62 14.5098104380092 16.4901895619908 -1.98037912398161 T:C T C 10 0.531941598773897 0.613823951176013 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44057134_44057243:XRCC1;ENSG00000073050:ENST00000458471:exon_44057134_44057243:XRCC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 44118461 G/A 1 23 25 48 10.7653432282004 13.2985399693474 -2.53319674114706 A:G G A 10 0.531941598773897 0.473511669789107 ENSG00000226763:ENST00000526798:exon_44116179_44118649:SRRM5;ENSG00000226763:ENST00000417606:exon_44116253_44118649:SRRM5;ENSG00000131116:ENST00000300811:exon_44118381_44118586:ZNF428;ENSG00000131116:ENST00000391964:exon_44118381_44118586:ZNF428 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 44237525 C/T 1 25 15 40 11.7014600306526 7.97912398160846 3.72233604904412 T:C C T 10 0.531941598773897 0.269296966874486 ENSG00000105771:ENST00000270066:exon_44237476_44237604:C19orf61 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 44417575 A/G 1 15 12 27 7.02087601839154 6.38329918528676 0.63757683310478 A:G A G 10 0.531941598773897 0.8492386336171 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 44418077 C/T 1 6 3 9 2.80835040735662 1.59582479632169 1.21252561103493 T:C C T 10 0.531941598773897 0.515798041804277 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44417970_44418263:ZNF45 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 44418343 C/T 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 44418544 A/G 1 6 2 8 2.80835040735662 1.06388319754779 1.74446720980882 A:G A G 10 0.531941598773897 0.297069782823554 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 44418680 G/C 1 6 3 9 2.80835040735662 1.59582479632169 1.21252561103493 C:G G C 10 0.531941598773897 0.515798041804277 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 44418693 T/C 1 6 3 9 2.80835040735662 1.59582479632169 1.21252561103493 T:C T C 10 0.531941598773897 0.515798041804277 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 45395714 T/C 1 53 39 92 24.8070952649835 20.745722352182 4.06137291280148 T:C T C 10 0.531941598773897 0.40560629398398 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45395650_45395717:TOMM40 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 45396144 C/T 1 42 52 94 19.6584528514963 27.6609631362426 -8.00251028474632 T:C C T 10 0.531941598773897 0.099437406511503 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45396094_45396186:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45396094_45396186:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45396094_45396186:TOMM40 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 45911899 G/A 1 20 23 43 9.36116802452206 12.2346567717996 -2.87348874727757 A:G G A 10 0.531941598773897 0.445428322775795 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 45912002 A/C 1 23 22 45 10.7653432282004 11.7027151730257 -0.937371944825365 A:C A C 10 0.531941598773897 0.881478231546286 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 45912343 A/G 1 40 27 67 18.7223360490441 14.3624231668952 4.3599128821489 A:G A G 10 0.531941598773897 0.327809173828925 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 45912406 G/A 1 38 27 65 17.7862192465919 14.3624231668952 3.42379607969669 A:G G A 10 0.531941598773897 0.456234040146837 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 45912736 C/A 1 19 16 35 8.89310962329596 8.51106558038235 0.382044042913604 A:C C A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 45923653 A/G 1 38 30 68 17.7862192465919 15.9582479632169 1.827971283375 A:G A G 10 0.531941598773897 0.716066882090836 ENSG00000012061:ENST00000300853:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000340192:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000428893:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000013807:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000391935:exon_45923582_45923685:ERCC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 46133251 C/T 1 34 11 45 15.9139856416875 5.85135758651287 10.0626280551746 T:C C T 10 0.531941598773897 0.00256897447415445 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46133209_46133304:EML2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 46133256 G/A 1 32 10 42 14.9778688392353 5.31941598773897 9.65845285149632 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0029380173438397 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46133209_46133304:EML2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 46141845 T/C 1 22 9 31 10.2972848269743 4.78747438896507 5.50981043800919 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0493436682659477 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46141763_46141892:EML2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 46206262 G/A 1 33 34 67 15.4459272404614 18.0860143583125 -2.6400871178511 A:G G A 10 0.531941598773897 0.54211367762167 ENSG00000011478:ENST00000012049:exon_46206162_46206586:QPCTL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 47223949 G/A 1 36 35 71 16.8501024441397 18.6179559570864 -1.76785351294669 A:G G A 10 0.531941598773897 0.72184688316341 ENSG00000090372:ENST00000391910:exon_47223793_47224028:STRN4;ENSG00000090372:ENST00000263280:exon_47223793_47224028:STRN4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 47770015 A/C 1 20 11 31 9.36116802452206 5.85135758651287 3.50981043800919 A:C A C 10 0.531941598773897 0.280029533205116 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47769868_47770049:CCDC9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 47770032 C/T 1 25 13 38 11.7014600306526 6.91524078406066 4.78621924659191 T:C C T 10 0.531941598773897 0.143525135016181 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47769868_47770049:CCDC9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 47774772 T/C 1 38 10 48 17.7862192465919 5.31941598773897 12.4668032588529 T:C T C 10 0.531941598773897 0.000241705510907577 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47774531_47775208:CCDC9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 48571072 T/G 0 10 0 10 4.68058401226103 0 4.68058401226103 T T 10 0.531941598773897 0.00231867125731154 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48571048_48571143:PLA2G4C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 48598823 A/G 1 1 7 8 0.468058401226103 3.72359119141728 -3.25553279019118 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0296580964656471 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48598721_48598861:PLA2G4C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 48602948 T/C 1 2 13 15 0.936116802452206 6.91524078406066 -5.97912398160846 T:C T C 10 0.531941598773897 0.00283910693970397 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48602928_48603117:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48602928_48603117:PLA2G4C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 48608598 C/G 1 2 6 8 0.936116802452206 3.19164959264338 -2.25553279019118 C:G C G 10 0.531941598773897 0.158093130392085 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48608590_48608701:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48608590_48608701:PLA2G4C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 48621036 C/G 1 36 26 62 16.8501024441397 13.8304815681213 3.01962087601838 C:G C G 10 0.531941598773897 0.524916776742433 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48620895_48621038:LIG1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 48622427 A/G 1 35 26 61 16.3820440429136 13.8304815681213 2.55156247479228 A:G A G 10 0.531941598773897 0.524616192500396 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48622394_48622447:LIG1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 48722180 C/T 1 7 7 14 3.27640880858272 3.72359119141728 -0.447182382834558 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000105483:ENST00000518450:exon_48722128_48722210:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000517510:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48722128_48722269:CARD8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 49131505 G/A 1 19 20 39 8.89310962329596 10.6388319754779 -1.74572235218198 A:G G A 10 0.531941598773897 0.631703049540363 ENSG00000063176:ENST00000406269:exon_49131419_49131534:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000245222:exon_49131419_49131534:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000340932:exon_49131419_49131534:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000426514:exon_49131419_49131534:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000443164:exon_49131419_49131534:SPHK2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 49376584 G/A 1 29 38 67 13.573693635557 20.2137807534081 -6.6400871178511 A:G G A 10 0.531941598773897 0.112172010575825 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 49469087 T/C 1 1194 1262 2456 558.861731063967 671.310297652658 -112.448566588691 T:C T C 10 0.531941598773897 5.84246859387413e-06 ENSG00000087086:ENST00000331825:exon_49469027_49469173:FTL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 49485548 G/A 1 10 4 14 4.68058401226103 2.12776639509559 2.55281761716544 A:G G A 10 0.531941598773897 0.191981298637752 ENSG00000104812:ENST00000323798:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000263276:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000484289:exon_49485512_49485632:GYS1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 50059982 C/G 1 113 96 209 52.8905993385496 51.0663934822941 1.82420585625552 C:G C G 10 0.531941598773897 0.835404695336138 ENSG00000142546:ENST00000339093:exon_50059806_50059993:NOSIP;ENSG00000142546:ENST00000391853:exon_50059806_50059993:NOSIP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 50162909 C/G 1 93 113 206 43.5294313140276 60.1094006614504 -16.5799693474228 A:C:G C G 10 0.531941598773897 0.0212490380386086 ENSG00000126456:ENST00000377139:exon_50162829_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000377135:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000309877:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000442265:exon_50162830_50163090:IRF3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 50358133 T/G 1 45 31 76 21.0626280551746 16.4901895619908 4.57243849318383 T:G T G 10 0.531941598773897 0.303430229202797 ENSG00000104960:ENST00000221557:exon_50358088_50358145:PTOV1;ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50358088_50358145:PTOV1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 50383636 T/C 1 14 7 21 6.55281761716544 3.72359119141728 2.82922642574816 T:C T C 10 0.531941598773897 0.275620410755652 ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50383536_50383659:TBC1D17 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 50412417 G/A 1 77 66 143 36.0404968944099 35.1081455190772 0.932351375332722 A:G G A 10 0.531941598773897 0.933266684595481 ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 50412728 C/T 1 111 138 249 51.9544825360974 73.4079406307978 -21.4534580947004 A:T:C C T 10 0.531941598773897 0.00752985831064624 ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 50435747 T/C 1 99 59 158 46.3377817213842 31.3845543276599 14.9532273937243 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0204917428017511 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 50484234 G/A 1 16 13 29 7.48893441961765 6.91524078406066 0.573693635556986 A:G G A 10 0.531941598773897 0.85485877023254 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50484212_50484270:VRK3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 50863023 A/G 1 3 9 12 1.40417520367831 4.78747438896507 -3.38329918528676 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0789092376202323 ENSG00000131400:ENST00000253719:exon_50862997_50863119:NAPSA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 50865535 A/G 1 4 6 10 1.87223360490441 3.19164959264338 -1.31941598773897 A:G A G 10 0.531941598773897 0.530535902085358 ENSG00000131400:ENST00000253719:exon_50865429_50865570:NAPSA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 50926126 C/T 1 56 52 108 26.2112704686618 27.6609631362426 -1.44969266758088 T:C C T 10 0.531941598773897 0.847193944578614 ENSG00000142539:ENST00000270632:exon_50926080_50926294:SPIB;ENSG00000142539:ENST00000417618:exon_50926080_50926294:SPIB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 50967640 G/A 1 8 7 15 3.74446720980882 3.72359119141728 0.0208760183915446 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000086967:ENST00000357701:exon_50967603_50967789:MYBPC2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 51301395 C/T 1 151 156 307 70.6768185851415 82.9828894087279 -12.3060708235864 A:T:C C T 10 0.531941598773897 0.169878293739451 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 51301456 G/A 1 159 185 344 74.4212857949504 98.4091957731709 -23.9879099782206 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0110026398641462 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 51323473 C/G 1 51 83 134 23.8709784625313 44.1511526982335 -20.2801742357022 C:G C G 10 0.531941598773897 0.000498332457554969 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 51323501 A/G 1 57 92 149 26.6793288698879 48.9386270871985 -22.2592982173107 A:G A G 10 0.531941598773897 0.000282287444654027 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 51850290 G/A 1 58 69 127 27.147387271114 36.7039703153989 -9.55658304428492 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0917398465844323 ENSG00000105379:ENST00000309244:exon_51850154_51850312:ETFB;ENSG00000105379:ENST00000354232:exon_51850154_51850312:ETFB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 51919949 G/A 1 6 4 10 2.80835040735662 2.12776639509559 0.68058401226103 A:G G A 10 0.531941598773897 0.758887050232993 ENSG00000142512:ENST00000353836:exon_51919920_51920204:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000357375:exon_51919920_51920204:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000432469:exon_51919920_51919984:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000442846:exon_51919920_51920030:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000441969:exon_51919920_51920030:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000525998:exon_51919920_51920204:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000436984:exon_51919920_51920060:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000439889:exon_51919920_51920030:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000339313:exon_51919920_51920204:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000529627:exon_51919920_51920030:SIGLEC10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 52471872 A/G 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52471831_52471926:ZNF615 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 52519608 C/T 1 3 6 9 1.40417520367831 3.19164959264338 -1.78747438896507 T:C C T 10 0.531941598773897 0.320650472569791 ENSG00000142556:ENST00000270649:exon_52516577_52520612:ZNF614 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 52887904 T/C 0 0 13 13 0 6.91524078406066 -6.91524078406066 C T C 10 0.531941598773897 5.17488356924175e-05 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 53117531 C/T 1 12 8 20 5.61670081471324 4.25553279019118 1.36116802452206 T:C C T 10 0.531941598773897 0.65611601649275 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53117014_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53117014_53118056:ZNF83 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 53117809 C/A 1 7 2 9 3.27640880858272 1.06388319754779 2.21252561103493 A:C C A 10 0.531941598773897 0.187705653333192 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53117014_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53117014_53118056:ZNF83 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 53453777 C/T 1 6 3 9 2.80835040735662 1.59582479632169 1.21252561103493 T:C C T 10 0.531941598773897 0.515798041804277 ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 54611734 A/G 1 3 8 11 1.40417520367831 4.25553279019118 -2.85135758651287 A:G A G 10 0.531941598773897 0.128574530340517 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 54627915 C/T 1 32 33 65 14.9778688392353 17.5540727595386 -2.57620392030331 T:C C T 10 0.531941598773897 0.536590507435753 ENSG00000105618:ENST00000321030:exon_54627878_54628035:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000445811:exon_54627878_54628033:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000263436:exon_54627878_54628035:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000419967:exon_54627878_54628035:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000445124:exon_54627878_54628009:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000447810:exon_54627878_54627962:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000391755:exon_54627878_54628035:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000466404:exon_54627878_54628035:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000498612:exon_54627878_54628035:PRPF31 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 54634830 C/T 1 103 76 179 48.2100153262886 40.4275615068162 7.78245381947243 T:C C T 10 0.531941598773897 0.261484636552267 ENSG00000105618:ENST00000321030:exon_54634738_54635140:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000263436:exon_54634769_54634867:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000419967:exon_54634738_54635140:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000391755:exon_54634738_54635140:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000466404:exon_54634738_54635140:PRPF31 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 54677897 G/A 1 39 44 83 18.254277647818 23.4054303460515 -5.15115269823345 A:G G A 10 0.531941598773897 0.272534165640402 ENSG00000125505:ENST00000437868:exon_54677109_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000245615:exon_54677109_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000494142:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000431666:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000338624:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000449249:exon_54677768_54678125:MBOAT7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 54711329 C/T 1 1624 1817 3441 760.126843591191 966.537884972171 -206.41104138098 T:C:G C T 10 0.531941598773897 2.07921946905856e-12 ENSG00000170889:ENST00000302907:exon_54711266_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000436445:exon_54711266_54711390:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000391752:exon_54711266_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000402367:exon_54710421_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000445961:exon_54711266_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000391751:exon_54711266_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000495002:exon_54711266_54711512:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000391753:exon_54711266_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000441429:exon_54710144_54711498:RPS9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 54962467 G/A 1 12 12 24 5.61670081471324 6.38329918528676 -0.766598370573529 A:G G A 10 0.531941598773897 0.83900902365855 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376514:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000443957:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54962467_54962559:LENG8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 54966579 C/G 1 19 22 41 8.89310962329596 11.7027151730257 -2.80960554972978 C:G C G 10 0.531941598773897 0.434921363991057 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54966543_54966622:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54966543_54966746:LENG8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 54968038 A/G 1 53 50 103 24.8070952649835 26.5970799386949 -1.78998467371139 A:G A G 10 0.531941598773897 0.767380937371672 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54967815_54968100:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54967815_54968100:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54967815_54968100:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54967815_54968100:LENG8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 54973280 C/G 1 17 12 29 7.95699282084375 6.38329918528676 1.57369363555699 C:G C G 10 0.531941598773897 0.582816143128388 ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 55087313 T/G 1 9 8 17 4.21252561103493 4.25553279019118 -0.0430071791562492 T:G T G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000239998:ENST00000251377:exon_55087274_55087576:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000391738:exon_55087274_55087576:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000251376:exon_55087274_55087576:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000391737:exon_55087274_55087576:LILRA2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 55098700 G/A 1 9 8 17 4.21252561103493 4.25553279019118 -0.0430071791562492 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000239998:ENST00000251377:exon_55098668_55099027:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000391738:exon_55098668_55099025:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000251376:exon_55098668_55099027:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000391737:exon_55098668_55098862:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000472992:exon_55098668_55099014:LILRA2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 55142739 A/C 1 6 4 10 2.80835040735662 2.12776639509559 0.68058401226103 A:C A C 10 0.531941598773897 0.758887050232993 ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55142713_55142757:LILRB1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 55143083 T/C 1 26 17 43 12.1695184318787 9.04300717915625 3.12651125272243 T:C T C 10 0.531941598773897 0.362880097286973 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55142951_55143238:LILRB1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 55143452 T/C 1 31 21 52 14.5098104380092 11.1707735742518 3.33903686375736 T:C T C 10 0.531941598773897 0.405279454149109 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 55143491 G/T 1 44 24 68 20.5945696539485 12.7665983705735 7.827971283375 T:G G T 10 0.531941598773897 0.0677766951411183 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 55145093 G/C 1 20 24 44 9.36116802452206 12.7665983705735 -3.40543034605147 C:G G C 10 0.531941598773897 0.365014976234833 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000473412:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000462628:exon_55145089_55145139:LILRB1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 55145454 G/A 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 A:G G A 10 0.531941598773897 0.730998912113487 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55145425_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55145425_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55145425_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55145422_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55145425_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55145422_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55145422_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55145425_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55145422_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55145422_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55145422_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55145425_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000473412:exon_55145422_55145634:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000462628:exon_55145422_55145472:LILRB1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 55147015 C/T 1 23 28 51 10.7653432282004 14.8943647656691 -4.12902153746875 T:C C T 10 0.531941598773897 0.263764824535981 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55147008_55147060:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55147008_55147060:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55147008_55147060:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55147008_55147060:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55147008_55147060:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55147008_55147060:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55147008_55147060:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55147008_55147060:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55147008_55147060:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55147008_55147060:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55147008_55147060:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55147008_55147060:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000462628:exon_55147008_55148103:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000487425:exon_55147008_55147067:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480375:exon_55147008_55147556:LILRB1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 55175297 C/T 1 34 69 103 15.9139856416875 36.7039703153989 -20.7899846737114 T:C C T 10 0.531941598773897 4.29675790151174e-05 ENSG00000186818:ENST00000420271:exon_55175212_55175413:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55175292_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175212_55175496:LILRB4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 55175740 C/T 1 92 41 133 43.0613729128015 21.8096055497298 21.2517673630717 T:C C T 10 0.531941598773897 0.000235416967067121 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175637_55175936:LILRB4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 55175795 G/A 1 39 74 113 18.254277647818 39.3636783092684 -21.1094006614504 A:G G A 10 0.531941598773897 9.35450961385865e-05 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175637_55175936:LILRB4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 55179364 A/G 1 57 137 194 26.6793288698879 72.8759990320239 -46.196670162136 A:G A G 10 0.531941598773897 2.54890409861253e-11 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55179324_55181810:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55179324_55179844:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55179324_55179855:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55179324_55179848:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55179324_55179848:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55179324_55179848:LILRB4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 55512316 T/G 0 0 32 32 0 17.0221311607647 -17.0221311607647 G T G 10 0.531941598773897 2.81579760352438e-11 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 55624113 G/A 1 8 7 15 3.74446720980882 3.72359119141728 0.0208760183915446 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55624033_55624163:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55624033_55624163:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55624033_55624163:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55624033_55624163:PPP1R12C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 55756980 A/G 1 34 23 57 15.9139856416875 12.2346567717996 3.67932886988787 A:G A G 10 0.531941598773897 0.354945859263872 ENSG00000105063:ENST00000443936:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000327021:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000412770:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000444538:exon_55756860_55757046:PPP6R1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 55994240 C/T 1 10 6 16 4.68058401226103 3.19164959264338 1.48893441961765 T:C C T 10 0.531941598773897 0.61793977257828 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 55995272 G/A 1 15 7 22 7.02087601839154 3.72359119141728 3.29728482697427 A:G G A 10 0.531941598773897 0.200805512516808 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 55998262 C/T 1 9 13 22 4.21252561103493 6.91524078406066 -2.70271517302573 T:C C T 10 0.531941598773897 0.288586288224940 ENSG00000090971:ENST00000205194:exon_55997775_55998935:NAT14 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 56089353 C/T 1 18 21 39 8.42505122206985 11.1707735742518 -2.74572235218198 T:C C T 10 0.531941598773897 0.423999280553551 ENSG00000218891:ENST00000325421:exon_56088893_56091007:ZNF579 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 56090076 G/T 1 9 15 24 4.21252561103493 7.97912398160846 -3.76659837057353 T:G G T 10 0.531941598773897 0.152424127615418 ENSG00000218891:ENST00000325421:exon_56088893_56091007:ZNF579 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 56104136 T/C 1 11 7 18 5.14864241348713 3.72359119141728 1.42505122206985 T:C T C 10 0.531941598773897 0.638380509834863 ENSG00000179943:ENST00000221665:exon_56102738_56105012:FIZ1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 56153868 G/A 1 38 42 80 17.7862192465919 22.3415471485037 -4.55532790191176 A:G G A 10 0.531941598773897 0.315474427310367 ENSG00000213015:ENST00000325333:exon_56153863_56154835:ZNF580 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 56162776 C/T 1 31 30 61 14.5098104380092 15.9582479632169 -1.44843752520772 T:C C T 10 0.531941598773897 0.797746511794017 ENSG00000173581:ENST00000308964:exon_56162649_56162861:CCDC106 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 56180968 C/T 1 114 106 220 53.3586577397757 56.3858094700331 -3.02715173025734 T:C C T 10 0.531941598773897 0.685845661550909 ENSG00000063244:ENST00000450554:exon_56180810_56181058:U2AF2;ENSG00000063244:ENST00000308924:exon_56180810_56181058:U2AF2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 58004563 G/A 1 7 5 12 3.27640880858272 2.65970799386948 0.616700814713236 A:G G A 10 0.531941598773897 0.779881793407808 ENSG00000105136:ENST00000427558:exon_58004224_58005153:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000354197:exon_58004224_58005151:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000424930:exon_58004224_58006048:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000426954:exon_58004224_58006048:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000284020:exon_58004278_58004600:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000442920:exon_58004224_58005588:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000523439:exon_58004224_58005621:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000517598:exon_58004224_58005255:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000347466:exon_58004224_58006032:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000415379:exon_58004224_58006048:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000221735:exon_58004224_58006048:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000522346:exon_58004224_58006033:ZNF419 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 58152361 T/A 1 5 8 13 2.34029200613052 4.25553279019118 -1.91524078406066 A:T T A 10 0.531941598773897 0.405859977542485 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 58152795 C/T 1 6 7 13 2.80835040735662 3.72359119141728 -0.915240784060662 T:C C T 10 0.531941598773897 0.782547085779911 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 58152817 G/C 1 5 8 13 2.34029200613052 4.25553279019118 -1.91524078406066 C:G G C 10 0.531941598773897 0.405859977542485 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 58153000 T/C 1 5 9 14 2.34029200613052 4.78747438896507 -2.44718238283456 T:C T C 10 0.531941598773897 0.283917011510726 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 58153009 C/T 1 4 8 12 1.87223360490441 4.25553279019118 -2.38329918528676 T:C C T 10 0.531941598773897 0.247137734070613 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 58153577 T/C 1 7 10 17 3.27640880858272 5.31941598773897 -2.04300717915625 T:C T C 10 0.531941598773897 0.341802442613557 ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 58231807 A/G 1 10 12 22 4.68058401226103 6.38329918528676 -1.70271517302573 A:G A G 10 0.531941598773897 0.525263941191058 ENSG00000083814:ENST00000317398:exon_58231120_58233065:ZNF671;ENSG00000083814:ENST00000335820:exon_58231782_58231850:ZNF671 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 58774071 A/G 1 28 32 60 13.1056352343309 17.0221311607647 -3.91649592643382 A:G A G 10 0.531941598773897 0.365356515104242 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000441758:exon_58773743_58774120:ZNF544 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 58806083 T/C 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 T:C T C 10 0.531941598773897 0.486426237614014 ENSG00000083842:ENST00000196548:exon_58805464_58807254:ZNF8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 19 59028288 G/A 1 7 2 9 3.27640880858272 1.06388319754779 2.21252561103493 A:G G A 10 0.531941598773897 0.187705653333192 ENSG00000119574:ENST00000354590:exon_59027762_59029040:ZBTB45 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 677295 C/T 1 13 20 33 6.08475921593934 10.6388319754779 -4.5540727595386 T:C C T 10 0.531941598773897 0.119409279825191 ENSG00000151353:ENST00000281017:exon_677289_677439:TMEM18;ENSG00000151353:ENST00000432667:exon_677289_677406:TMEM18 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 1652354 G/A 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000130508:ENST00000252804:exon_1651944_1653447:PXDN HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 3261173 A/G 1 16 8 24 7.48893441961765 4.25553279019118 3.23340162942647 A:G A G 10 0.531941598773897 0.222052970761321 ENSG00000032389:ENST00000382125:exon_3261070_3261226:TSSC1;ENSG00000032389:ENST00000478754:exon_3261070_3261226:TSSC1;ENSG00000032389:ENST00000398659:exon_3261070_3261226:TSSC1;ENSG00000032389:ENST00000482570:exon_3261070_3261330:TSSC1;ENSG00000032389:ENST00000443925:exon_3261070_3261226:TSSC1;ENSG00000032389:ENST00000406835:exon_3261070_3261226:TSSC1;ENSG00000032389:ENST00000462515:exon_3261070_3261226:TSSC1;ENSG00000032389:ENST00000444776:exon_3261122_3261226:TSSC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 10262920 T/G 1 82 78 160 38.3807889005404 41.491444704364 -3.11065580382352 T:G T G 10 0.531941598773897 0.635247020787237 ENSG00000171848:ENST00000304567:exon_10262455_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000360566:exon_10262455_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000459969:exon_10262839_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000461327:exon_10262866_10263184:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000498343:exon_10262866_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000463887:exon_10262866_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000491447:exon_10262879_10263024:RRM2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 15747393 C/T 1 18 10 28 8.42505122206985 5.31941598773897 3.10563523433088 T:C C T 10 0.531941598773897 0.261281244740623 ENSG00000079785:ENST00000381341:exon_15747299_15747437:DDX1;ENSG00000079785:ENST00000233084:exon_15747299_15747437:DDX1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 24431184 C/T 1 6 4 10 2.80835040735662 2.12776639509559 0.68058401226103 T:C C T 10 0.531941598773897 0.758887050232993 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000427234:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000449392:exon_24431106_24431185:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000479575:exon_24431106_24431188:ITSN2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 24432839 A/G 1 11 10 21 5.14864241348713 5.31941598773897 -0.170773574251837 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000479575:exon_24432687_24433198:ITSN2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 24952491 A/G 1 4 6 10 1.87223360490441 3.19164959264338 -1.31941598773897 A:G A G 10 0.531941598773897 0.530535902085358 ENSG00000084676:ENST00000406961:exon_24952370_24952684:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000405141:exon_24952370_24952684:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000407230:exon_24952370_24952684:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000348332:exon_24952370_24952684:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000288599:exon_24952370_24952684:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000395856:exon_24952370_24952684:NCOA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 24974945 T/G 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 T:G T G 10 0.531941598773897 0.730998912113487 ENSG00000084676:ENST00000406961:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000405141:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000407230:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000348332:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000288599:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000395856:exon_24974851_24975025:NCOA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 25046090 T/C 1 28 31 59 13.1056352343309 16.4901895619908 -3.38455432765992 T:C T C 10 0.531941598773897 0.434164978808318 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000485887:exon_25046078_25046232:ADCY3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 25050977 T/C 1 20 16 36 9.36116802452206 8.51106558038235 0.850102444139708 T:C T C 10 0.531941598773897 0.86790453569009 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000455323:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000450524:exon_25050771_25051030:ADCY3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 25384169 G/A 1 80 44 124 37.4446720980882 23.4054303460515 14.0392417520368 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0116884409138672 ENSG00000115138:ENST00000380794:exon_25383722_25384621:POMC;ENSG00000115138:ENST00000405623:exon_25383784_25384621:POMC;ENSG00000115138:ENST00000264708:exon_25383854_25384621:POMC;ENSG00000115138:ENST00000395826:exon_25383922_25384621:POMC;ENSG00000115138:ENST00000449220:exon_25384015_25384621:POMC HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 26455127 G/A 1 49 19 68 22.934861660079 10.106890376704 12.827971283375 A:G G A 10 0.531941598773897 0.00214577984356273 ENSG00000084754:ENST00000380649:exon_26455028_26455147:HADHA;ENSG00000084754:ENST00000457468:exon_26455028_26455147:HADHA;ENSG00000084754:ENST00000461025:exon_26455070_26455147:HADHA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 26502875 T/C 1 53 47 100 24.8070952649835 25.0012551423732 -0.194159877389701 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000138029:ENST00000317799:exon_26502862_26502983:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000405867:exon_26502862_26502983:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000494615:exon_26502862_26502983:HADHB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 27260469 G/A 1 40 30 70 18.7223360490441 15.9582479632169 2.76408808582721 A:G G A 10 0.531941598773897 0.550381743281753 ENSG00000119777:ENST00000321326:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000238788:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000404032:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000435172:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000475258:exon_27260429_27260532:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000425720:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000460904:exon_27260429_27260683:TMEM214 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 27290525 A/G 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000084693:ENST00000441931:exon_27290362_27290703:AGBL5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 27293150 G/T 1 9 7 16 4.21252561103493 3.72359119141728 0.488934419617648 T:G G T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000084693:ENST00000487078:exon_27292960_27293490:AGBL5;ENSG00000084693:ENST00000360131:exon_27292960_27293488:AGBL5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 29001691 A/G 1 15 6 21 7.02087601839154 3.19164959264338 3.82922642574816 A:G A G 10 0.531941598773897 0.124993329418103 ENSG00000213639:ENST00000455580:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000420282:exon_29001675_29001865:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000441461:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000427786:exon_29001675_29001797:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000358506:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000395367:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000296122:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000395366:exon_29001675_29001905:PPP1CB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 29092679 T/C 1 7 15 22 3.27640880858272 7.97912398160846 -4.70271517302573 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0540608837229035 ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29092445_29093167:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29092445_29093161:TRMT61B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 29092850 G/T 1 11 12 23 5.14864241348713 6.38329918528676 -1.23465677179963 T:G G T 10 0.531941598773897 0.678419761183294 ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29092445_29093167:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29092445_29093161:TRMT61B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 29129418 A/G 1 14 10 24 6.55281761716544 5.31941598773897 1.23340162942647 A:G A G 10 0.531941598773897 0.685547420411967 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29129326_29129447:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000440983:exon_29129326_29129447:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000296126:exon_29129326_29129447:WDR43 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 29152456 A/G 1 18 29 47 8.42505122206985 15.426306364443 -7.00125514237316 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0562377860023005 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29152445_29152576:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000466067:exon_29152445_29152576:WDR43 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 33774761 T/C 1 14 10 24 6.55281761716544 5.31941598773897 1.23340162942647 T:C T C 10 0.531941598773897 0.685547420411967 ENSG00000152689:ENST00000402538:exon_33774671_33774818:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000337416:exon_33774671_33774818:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000403687:exon_33774671_33774818:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000407811:exon_33774671_33774818:RASGRP3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 42990010 C/A 1 5 6 11 2.34029200613052 3.19164959264338 -0.851357586512867 A:C C A 10 0.531941598773897 0.764860318695721 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 42990101 G/C 1 8 4 12 3.74446720980882 2.12776639509559 1.61670081471324 C:G G C 10 0.531941598773897 0.3994437340124 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 43452183 A/G 1 7 13 20 3.27640880858272 6.91524078406066 -3.63883197547794 A:G A G 10 0.531941598773897 0.119222790648670 ENSG00000152518:ENST00000282388:exon_43449541_43452891:ZFP36L2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 43452618 C/T 1 10 15 25 4.68058401226103 7.97912398160846 -3.29853996934743 T:C C T 10 0.531941598773897 0.229796903542653 ENSG00000152518:ENST00000282388:exon_43449541_43452891:ZFP36L2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 43625278 C/A 1 6 7 13 2.80835040735662 3.72359119141728 -0.915240784060662 A:C C A 10 0.531941598773897 0.782547085779911 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000407351:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000408045:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402796:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000485353:exon_43625110_43625278:THADA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 43801712 A/G 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 A:G A G 10 0.531941598773897 0.486426237614014 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000408045:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402796:exon_43801475_43801952:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402360:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000409142:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000404790:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000403856:exon_43801475_43802166:THADA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 47177617 C/T 1 6 7 13 2.80835040735662 3.72359119141728 -0.915240784060662 T:C C T 10 0.531941598773897 0.782547085779911 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47177502_47177665:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47177502_47177665:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47177502_47177665:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47177502_47177665:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000461601:exon_47177502_47177665:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47177502_47177665:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47177502_47177665:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47177560_47177665:TTC7A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 47220622 G/A 1 11 13 24 5.14864241348713 6.91524078406066 -1.76659837057353 A:G G A 10 0.531941598773897 0.541790058951456 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000461601:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000474321:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47220589_47220667:TTC7A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 47643476 C/T 1 11 9 20 5.14864241348713 4.78747438896507 0.36116802452206 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000095002:ENST00000233146:exon_47643435_47643568:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000394794:exon_47643435_47643568:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000406134:exon_47643435_47643568:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000419559:exon_47643435_47643568:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000432737:exon_47643435_47643568:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000453755:exon_47643435_47643568:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000448533:exon_47643435_47643568:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000394792:exon_47643435_47643509:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000422810:exon_47643435_47643568:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000413880:exon_47643435_47643568:MSH2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 48010554 C/T 1 12 7 19 5.61670081471324 3.72359119141728 1.89310962329596 T:C C T 10 0.531941598773897 0.492334878036868 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48010221_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000445503:exon_48010221_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000446255:exon_48010221_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000456246:exon_48010267_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000493177:exon_48010309_48010632:MSH6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 48030838 A/T 1 2 6 8 0.936116802452206 3.19164959264338 -2.25553279019118 A:T A T 10 0.531941598773897 0.158093130392085 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 48701883 C/G 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 C:G C G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000162869:ENST00000431614:exon_48701822_48701958:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000416913:exon_48701822_48701958:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000281394:exon_48701822_48701958:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000442041:exon_48701822_48701958:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000449090:exon_48701822_48701958:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000294952:exon_48701822_48701958:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000407194:exon_48701822_48701958:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000405538:exon_48701822_48701958:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000455978:exon_48701822_48701958:KLRAQ1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 48722897 G/T 1 9 10 19 4.21252561103493 5.31941598773897 -1.10689037670404 T:G G T 10 0.531941598773897 0.651315646573759 ENSG00000162869:ENST00000431614:exon_48722818_48722910:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000416913:exon_48722818_48722910:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000281394:exon_48722818_48722910:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000449090:exon_48722818_48722910:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000443895:exon_48722818_48722910:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000294952:exon_48722818_48722910:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000405538:exon_48722818_48723044:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000455978:exon_48722818_48722910:KLRAQ1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 54785900 C/T 1 8 7 15 3.74446720980882 3.72359119141728 0.0208760183915446 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54785531_54786024:SPTBN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 54872368 G/T 1 54 52 106 25.2751536662096 27.6609631362426 -2.38580947003308 T:G G T 10 0.531941598773897 0.697276503860638 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54872366_54872590:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54872366_54872590:SPTBN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 55277226 C/T 1 55 57 112 25.7432120674357 30.3206711301121 -4.57745906267647 T:C:G C T 10 0.531941598773897 0.395558319806006 ENSG00000115310:ENST00000337526:exon_55276881_55277680:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000317610:exon_55276881_55277680:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000357732:exon_55276881_55277680:RTN4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 55470115 C/T 1 20 10 30 9.36116802452206 5.31941598773897 4.04175203678309 T:C C T 10 0.531941598773897 0.147942672034983 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000418823:exon_55470076_55470216:MTIF2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 55490788 T/C 1 11 10 21 5.14864241348713 5.31941598773897 -0.170773574251837 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55490776_55491006:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000417741:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000446660:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000366137:exon_55490777_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000441307:exon_55490783_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000404297:exon_55490784_55491001:MTIF2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 55490819 G/T 1 9 14 23 4.21252561103493 7.44718238283456 -3.23465677179963 T:G G T 10 0.531941598773897 0.211539426770348 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55490776_55491006:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000417741:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000446660:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000366137:exon_55490777_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000441307:exon_55490783_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000404297:exon_55490784_55491001:MTIF2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 55806912 G/A 1 2 6 8 0.936116802452206 3.19164959264338 -2.25553279019118 A:G G A 10 0.531941598773897 0.158093130392085 ENSG00000138041:ENST00000272313:exon_55806815_55806917:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000407823:exon_55806815_55806917:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000345102:exon_55806815_55806917:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000424063:exon_55806815_55806917:SMEK2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 55844445 T/C 1 14 17 31 6.55281761716544 9.04300717915625 -2.49018956199081 T:C T C 10 0.531941598773897 0.375691878346279 ENSG00000138041:ENST00000272313:exon_55844280_55844749:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000407823:exon_55844280_55844758:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000345102:exon_55844280_55844723:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000424063:exon_55844280_55844796:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000477749:exon_55844280_55845113:SMEK2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 61417617 A/G 1 6 11 17 2.80835040735662 5.85135758651287 -3.04300717915625 A:G A G 10 0.531941598773897 0.152165296741825 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 64124722 C/A 1 10 4 14 4.68058401226103 2.12776639509559 2.55281761716544 A:C C A 10 0.531941598773897 0.191981298637752 ENSG00000143952:ENST00000354504:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000272322:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000409558:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000416400:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000394400:exon_64124630_64124724:VPS54 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 64327544 G/T 1 8 6 14 3.74446720980882 3.19164959264338 0.552817617165442 T:G G T 10 0.531941598773897 0.796438673256377 ENSG00000197329:ENST00000358912:exon_64327532_64327633:PELI1;ENSG00000197329:ENST00000466177:exon_64327532_64327633:PELI1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 65216798 C/A 1 14 25 39 6.55281761716544 13.2985399693474 -6.74572235218198 A:C C A 10 0.531941598773897 0.0363108016584154 ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65216535_65217304:SLC1A4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 65245365 G/A 1 11 21 32 5.14864241348713 11.1707735742518 -6.0221311607647 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0346310148879634 ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65245205_65245399:SLC1A4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 65248271 G/A 1 27 46 73 12.6375768331048 24.4693135435993 -11.8317367104945 A:G G A 10 0.531941598773897 0.00664743063039625 ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65248046_65250997:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65248046_65248528:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65248046_65250999:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65248046_65250997:SLC1A4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 65298839 A/G 1 9 2 11 4.21252561103493 1.06388319754779 3.14864241348713 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0713639747063953 ENSG00000011523:ENST00000475851:exon_65298588_65298978:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000260569:exon_65298588_65299703:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000497039:exon_65297863_65299703:CEP68 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 65299298 C/A 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 A:C C A 10 0.531941598773897 0.486426237614014 ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000260569:exon_65298588_65299703:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000497039:exon_65297863_65299703:CEP68 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 65299766 T/C 1 9 4 13 4.21252561103493 2.12776639509559 2.08475921593934 T:C T C 10 0.531941598773897 0.279590414707516 ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 65495887 G/A 1 119 102 221 55.6989497459063 54.2580430749375 1.44090667096876 A:G G A 10 0.531941598773897 0.892809204730393 ENSG00000138071:ENST00000260641:exon_65495698_65498387:ACTR2;ENSG00000138071:ENST00000377982:exon_65495698_65497280:ACTR2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 68385097 A/G 1 35 24 59 16.3820440429136 12.7665983705735 3.61544567234008 A:G A G 10 0.531941598773897 0.363962391719593 ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68384928_68385254:PPP3R1;ENSG00000115946:ENST00000263657:exon_68384976_68385273:PNO1;ENSG00000115946:ENST00000430742:exon_68385049_68385273:PNO1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 68388823 A/G 1 15 21 36 7.02087601839154 11.1707735742518 -4.14989755586029 A:G A G 10 0.531941598773897 0.183504814477384 ENSG00000115946:ENST00000263657:exon_68388815_68388898:PNO1;ENSG00000115946:ENST00000430742:exon_68388815_68388898:PNO1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 68613710 G/A 1 28 35 63 13.1056352343309 18.6179559570864 -5.51232072275551 A:G G A 10 0.531941598773897 0.167453949092511 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68613634_68613818:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68613634_68613818:PLEK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 68622914 G/A 1 200 186 386 93.6116802452206 98.9411373719448 -5.32945712672425 A:G G A 10 0.531941598773897 0.610124686398584 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 68622952 G/C 1 246 223 469 115.142366701621 118.622976526579 -3.48060982495771 C:G G C 10 0.531941598773897 0.746308668976909 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 69659126 A/T 1 3 9 12 1.40417520367831 4.78747438896507 -3.38329918528676 A:T A T 10 0.531941598773897 0.0789092376202323 ENSG00000169599:ENST00000410022:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000471185:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000303698:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000394305:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000404290:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000450796:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000484177:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000419370:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000438184:exon_69659034_69659137:NFU1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 70033584 C/T 1 13 12 25 6.08475921593934 6.38329918528676 -0.298539969347426 A:T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000196975:ENST00000477632:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000394295:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000460439:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000460942:exon_70033517_70033630:ANXA4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 70524577 G/A 1 82 48 130 38.3807889005404 25.5331967411471 12.8475921593934 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0276636978735422 ENSG00000035141:ENST00000037869:exon_70523107_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000460307:exon_70523108_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000450256:exon_70524143_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000430566:exon_70524308_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000438759:exon_70524558_70524609:FAM136A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 71351487 G/A 1 15 6 21 7.02087601839154 3.19164959264338 3.82922642574816 A:G G A 10 0.531941598773897 0.124993329418103 ENSG00000124370:ENST00000244217:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000466481:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000486135:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000494660:exon_71351477_71351673:MCEE HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 71360144 A/C 1 27 26 53 12.6375768331048 13.8304815681213 -1.19290473501654 A:C A C 10 0.531941598773897 0.784009164648988 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 71360625 G/T 1 40 39 79 18.7223360490441 20.745722352182 -2.02338630313786 T:G G T 10 0.531941598773897 0.653926320394566 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 71365676 G/A 1 20 26 46 9.36116802452206 13.8304815681213 -4.46931354359926 A:G G A 10 0.531941598773897 0.236894498951614 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71365620_71366343:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 71376999 G/A 1 69 45 114 32.2960296846011 23.9373719448254 8.35865773977574 A:G G A 10 0.531941598773897 0.132990640146774 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71376996_71377230:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000493360:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 73477527 C/T 1 174 145 319 81.4421618133419 77.1315318222151 4.31062999112686 T:C C T 10 0.531941598773897 0.653717991163176 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73477434_73477566:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73477434_73477566:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73477434_73477566:CCT7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 73828538 G/A 1 5 5 10 2.34029200613052 2.65970799386948 -0.31941598773897 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73828322_73828563:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73828322_73828563:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73828322_73828563:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000464408:exon_73828322_73828563:ALMS1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 73829372 C/T 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73829312_73829495:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73829312_73829495:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73829312_73829495:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000464408:exon_73829312_73829495:ALMS1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 73957124 A/G 1 28 42 70 13.1056352343309 22.3415471485037 -9.23591191417279 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0307402812464088 ENSG00000144034:ENST00000272424:exon_73956957_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000495950:exon_73957012_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000485758:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000409716:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000318190:exon_73957017_73957156:TPRKB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 74166053 G/A 1 31 8 39 14.5098104380092 4.25553279019118 10.254277647818 A:G G A 10 0.531941598773897 0.00105567977002708 ENSG00000114956:ENST00000264093:exon_74166037_74166149:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000348222:exon_74166037_74166149:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000489796:exon_74166037_74166149:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000493055:exon_74166037_74166149:DGUOK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 74690039 G/A 1 24 29 53 11.2334016294265 15.426306364443 -4.19290473501654 A:G G A 10 0.531941598773897 0.27217962466019 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74688184_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74688185_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000409065:exon_74688196_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74688197_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74689123_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74689902_74690139:MOGS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 74690378 C/T 1 34 32 66 15.9139856416875 17.0221311607647 -1.1081455190772 T:C C T 10 0.531941598773897 0.806122944740526 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74690317_74690773:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000489655:exon_74690317_74690764:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000414701:exon_74690317_74690513:MOGS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 74699778 C/A 1 191 120 311 89.3991546341857 63.8329918528676 25.566162781318 A:C C A 10 0.531941598773897 0.00371948087828638 ENSG00000204822:ENST00000258105:exon_74699696_74700449:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000409710:exon_74699696_74699814:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000468875:exon_74699696_74699791:MRPL53;ENSG00000135637:ENST00000454193:exon_74699696_74699923:CCDC142 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 74710491 C/T 1 11 5 16 5.14864241348713 2.65970799386948 2.48893441961765 T:C C T 10 0.531941598773897 0.316542725286372 ENSG00000135637:ENST00000474681:exon_74710195_74710535:CCDC142;ENSG00000115282:ENST00000489152:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000424122:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000449459:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000464241:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000410003:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000435361:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000441635:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000433490:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000442235:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000463704:exon_74710449_74710832:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000491252:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000233623:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000459957:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000463189:exon_74710449_74710690:TTC31 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 74718268 G/A 1 19 22 41 8.89310962329596 11.7027151730257 -2.80960554972978 A:G G A 10 0.531941598773897 0.434921363991057 ENSG00000115282:ENST00000489152:exon_74717371_74718311:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000424122:exon_74718255_74718311:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000449459:exon_74717783_74718311:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000464241:exon_74718255_74718311:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000410003:exon_74718255_74718311:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000441635:exon_74718255_74718311:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000442235:exon_74718255_74718311:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000491252:exon_74717371_74718311:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000233623:exon_74718255_74718311:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000459957:exon_74718255_74718311:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000463189:exon_74718255_74718311:TTC31 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 74761539 T/A 1 17 16 33 7.95699282084375 8.51106558038235 -0.554072759538601 A:T T A 10 0.531941598773897 0.863259581534653 ENSG00000115318:ENST00000470907:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000264094:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000393937:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409549:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409986:exon_74761443_74761558:LOXL3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 75113657 C/T 1 4 7 11 1.87223360490441 3.72359119141728 -1.85135758651287 T:C C T 10 0.531941598773897 0.36707898879345 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75113617_75113800:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75113617_75113800:HK2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 85553784 C/T 1 20 12 32 9.36116802452206 6.38329918528676 2.9778688392353 T:C C T 10 0.531941598773897 0.376146745723152 ENSG00000152291:ENST00000377386:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000282120:exon_85553631_85553927:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000398263:exon_85553631_85553927:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409232:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409015:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000444342:exon_85553631_85554808:TGOLN2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 85554080 G/A 1 28 11 39 13.1056352343309 5.85135758651287 7.25427764781802 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0237757096391134 ENSG00000152291:ENST00000377386:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409232:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409015:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000444342:exon_85553631_85554808:TGOLN2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 85622059 T/C 1 39 52 91 18.254277647818 27.6609631362426 -9.40668548842463 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0581048518566009 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85621871_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000453973:exon_85621876_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85621890_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85621951_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85622016_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000471064:exon_85622018_85622081:CAPG HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 85625222 T/G 1 15 39 54 7.02087601839154 20.745722352182 -13.7248463337904 T:G T G 10 0.531941598773897 0.000186395511000441 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000453973:exon_85625143_85625254:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000471064:exon_85625143_85625475:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000483659:exon_85625143_85625275:CAPG HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 85769711 C/G 1 105 65 170 49.1461321287408 34.5762039203033 14.5699282084375 C:G C G 10 0.531941598773897 0.0258327597533280 ENSG00000168906:ENST00000306434:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000424323:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000481412:exon_85769278_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000409017:exon_85769688_85769870:MAT2A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 85808737 A/G 1 389 376 765 182.074718076954 200.010041138985 -17.9353230620312 A:C:G A G 10 0.531941598773897 0.204763613010093 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 85808871 C/T 1 283 277 560 132.460527546987 147.347822860369 -14.8872953133823 T:C C T 10 0.531941598773897 0.219433090963857 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 85818886 C/T 1 6 8 14 2.80835040735662 4.25553279019118 -1.44718238283456 T:C C T 10 0.531941598773897 0.594012234271892 ENSG00000168899:ENST00000306384:exon_85818848_85818985:VAMP5;ENSG00000168899:ENST00000462451:exon_85818720_85818987:VAMP5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 86344237 A/G 1 6 8 14 2.80835040735662 4.25553279019118 -1.44718238283456 A:G A G 10 0.531941598773897 0.594012234271892 ENSG00000132300:ENST00000254630:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000409326:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000465560:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000409783:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000418628:exon_86344178_86344243:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000409277:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000483925:exon_86344178_86344282:PTCD3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 86371883 T/C 1 103 89 192 48.2100153262886 47.3428022908768 0.867213035411773 T:C T C 10 0.531941598773897 0.942390937407035 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86371059_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86371059_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86371063_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86371063_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86371063_86372004:IMMT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 86385812 T/C 1 18 15 33 8.42505122206985 7.97912398160846 0.445927240461399 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86385499_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000490238:exon_86385600_86385844:IMMT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 86389114 G/A 1 34 37 71 15.9139856416875 19.6818391546342 -3.76785351294669 A:G G A 10 0.531941598773897 0.40589450386652 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86389099_86389202:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86389099_86389202:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86389099_86389202:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86389099_86389202:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86389099_86389202:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86389099_86389202:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86389099_86389202:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86389099_86389202:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86389099_86389202:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000490238:exon_86389075_86389202:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409258:exon_86389099_86389202:IMMT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 86433240 C/T 1 36 55 91 16.8501024441397 29.2567879325643 -12.4066854884246 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0113150667882371 ENSG00000132313:ENST00000254644:exon_86433229_86433418:MRPL35;ENSG00000132313:ENST00000337109:exon_86433229_86433418:MRPL35;ENSG00000132313:ENST00000409180:exon_86433229_86433418:MRPL35 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 88874891 C/A 1 13 4 17 6.08475921593934 2.12776639509559 3.95699282084375 A:C C A 10 0.531941598773897 0.0859338076537107 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000415570:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000470706:exon_88874879_88874926:EIF2AK3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 89442350 T/C 1 135 111 246 63.1878841655239 59.0455174639026 4.14236670162133 T:C T C 10 0.531941598773897 0.609801450413084 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 96685021 A/G 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 A:G A G 10 0.531941598773897 0.730998912113487 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 96689176 G/A 1 20 2 22 9.36116802452206 1.06388319754779 8.29728482697427 A:G G A 10 0.531941598773897 0.000329711801518638 ENSG00000186281:ENST00000486463:exon_96689057_96689188:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000359548:exon_96689057_96689188:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000434632:exon_96689057_96689188:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000453542:exon_96689057_96689188:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000398024:exon_96689057_96689188:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000335448:exon_96689045_96689188:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000484440:exon_96688706_96689188:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000471757:exon_96689057_96689188:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000482704:exon_96688854_96689748:GPAT2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 96859034 A/G 1 21 18 39 9.82922642574816 9.57494877793015 0.254277647818016 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000084090:ENST00000337288:exon_96858980_96859090:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000393595:exon_96858980_96859090:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000443962:exon_96858980_96859090:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000495687:exon_96858869_96859090:STARD7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 96861159 C/G 1 10 12 22 4.68058401226103 6.38329918528676 -1.70271517302573 T:C:G C G 10 0.531941598773897 0.525263941191058 ENSG00000084090:ENST00000337288:exon_96861079_96861287:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000393595:exon_96861079_96861287:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000462501:exon_96861079_96861252:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000443962:exon_96861079_96861287:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000488084:exon_96860941_96861287:STARD7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 96919642 C/T 1 13 13 26 6.08475921593934 6.91524078406066 -0.830481568121323 T:C C T 10 0.531941598773897 0.844915066483025 ENSG00000135956:ENST00000258439:exon_96916312_96919853:TMEM127;ENSG00000135956:ENST00000432959:exon_96917398_96919853:TMEM127;ENSG00000135956:ENST00000435268:exon_96919538_96919853:TMEM127 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 96944553 G/A 1 71 65 136 33.2321464870533 34.5762039203033 -1.34405743324999 A:G G A 10 0.531941598773897 0.863666205754 ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000497539:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000429650:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000484372:exon_96944547_96944736:SNRNP200 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 96952833 A/G 1 36 36 72 16.8501024441397 19.1498975558603 -2.29979511172058 A:G A G 10 0.531941598773897 0.637238043074143 ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96952744_96952898:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000480615:exon_96952744_96952898:SNRNP200 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 96993757 C/T 1 10 10 20 4.68058401226103 5.31941598773897 -0.63883197547794 T:C C T 10 0.531941598773897 0.825252984872384 ENSG00000198885:ENST00000439118:exon_96992380_96994064:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000420728:exon_96992380_96994062:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000361124:exon_96991961_96994066:ITPRIPL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 96993884 A/G 1 15 6 21 7.02087601839154 3.19164959264338 3.82922642574816 A:G A G 10 0.531941598773897 0.124993329418103 ENSG00000198885:ENST00000439118:exon_96992380_96994064:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000420728:exon_96992380_96994062:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000361124:exon_96991961_96994066:ITPRIPL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 97020049 T/C 1 12 6 18 5.61670081471324 3.19164959264338 2.42505122206985 T:C T C 10 0.531941598773897 0.345678312274734 ENSG00000121152:ENST00000240423:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000427946:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000477409:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435975:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000455200:exon_97019921_97020126:NCAPH HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 97030247 T/C 1 11 19 30 5.14864241348713 10.106890376704 -4.95824796321691 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0980482543336807 ENSG00000121152:ENST00000240423:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000427946:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435975:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000455200:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435349:exon_97030218_97030329:NCAPH HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 97523675 C/A 1 4 6 10 1.87223360490441 3.19164959264338 -1.31941598773897 A:C C A 10 0.531941598773897 0.530535902085358 ENSG00000213337:ENST00000443120:exon_97523625_97523751:ANKRD39;ENSG00000213337:ENST00000393537:exon_97523625_97523832:ANKRD39 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 98274527 G/C 1 27 29 56 12.6375768331048 15.426306364443 -2.78872953133823 C:G G C 10 0.531941598773897 0.504031572967325 ENSG00000115073:ENST00000289228:exon_98274406_98274580:ACTR1B;ENSG00000115073:ENST00000451664:exon_98274441_98274580:ACTR1B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 98354511 G/A 1 15 5 20 7.02087601839154 2.65970799386948 4.36116802452206 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0708766260039903 ENSG00000115085:ENST00000264972:exon_98354458_98354570:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000389518:exon_98354458_98354570:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000463643:exon_98354458_98354570:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000442208:exon_98354458_98354570:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000487283:exon_98354458_98354570:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000451498:exon_98354458_98354570:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000489250:exon_98354458_98355040:ZAP70 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 98355990 G/A 1 9 3 12 4.21252561103493 1.59582479632169 2.61670081471324 A:G G A 10 0.531941598773897 0.155839710778340 ENSG00000115085:ENST00000264972:exon_98355838_98356323:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000389518:exon_98355838_98356323:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000463643:exon_98355838_98356325:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000442208:exon_98355838_98356323:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000487283:exon_98355838_98356322:ZAP70 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 98375485 C/T 1 18 21 39 8.42505122206985 11.1707735742518 -2.74572235218198 T:C C T 10 0.531941598773897 0.423999280553551 ENSG00000075568:ENST00000485245:exon_98375356_98381780:TMEM131;ENSG00000075568:ENST00000186436:exon_98375356_98375516:TMEM131;ENSG00000075568:ENST00000425805:exon_98375356_98375516:TMEM131;ENSG00000075568:ENST00000469447:exon_98375359_98375516:TMEM131 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 98409046 G/A 1 11 16 27 5.14864241348713 8.51106558038235 -3.36242316689522 A:G G A 10 0.531941598773897 0.247282153550661 ENSG00000075568:ENST00000186436:exon_98408849_98409447:TMEM131;ENSG00000075568:ENST00000425805:exon_98408849_98409447:TMEM131 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 99193496 C/T 1 8 1 9 3.74446720980882 0.531941598773897 3.21252561103493 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0425222470212816 ENSG00000040933:ENST00000409016:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409851:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409463:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000074304:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409540:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000523221:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000498026:exon_99193452_99193606:INPP4A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 99226173 T/A 1 3 7 10 1.40417520367831 3.72359119141728 -2.31941598773897 A:T T A 10 0.531941598773897 0.205442831458325 ENSG00000115446:ENST00000409975:exon_99225042_99226502:UNC50;ENSG00000115446:ENST00000409347:exon_99226106_99226502:UNC50 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 99978048 G/A 1 328 307 635 153.523155602162 163.306070823586 -9.78291522142462 A:G G A 10 0.531941598773897 0.450004815969971 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99977611_99978283:EIF5B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 99995804 T/C 1 67 60 127 31.3599128821489 31.9164959264338 -0.55658304428492 T:C T C 10 0.531941598773897 0.929381229123553 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995781_99995891:EIF5B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 100019496 A/G 1 16 19 35 7.48893441961765 10.106890376704 -2.6179559570864 A:G A G 10 0.531941598773897 0.400816899235724 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465086:exon_100019352_100019893:REV1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 100022772 T/C 1 5 5 10 2.34029200613052 2.65970799386948 -0.31941598773897 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000135945:ENST00000485487:exon_100022372_100022815:REV1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 100055506 A/G 1 14 8 22 6.55281761716544 4.25553279019118 2.29728482697427 A:G A G 10 0.531941598773897 0.395573885710113 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100055036_100055772:REV1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 101010082 G/C 1 8 8 16 3.74446720980882 4.25553279019118 -0.511065580382352 C:G G C 10 0.531941598773897 0.80799969147761 ENSG00000115526:ENST00000264249:exon_101008327_101010244:CHST10;ENSG00000115526:ENST00000409701:exon_101009707_101010244:CHST10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 101627925 C/T 1 2 6 8 0.936116802452206 3.19164959264338 -2.25553279019118 T:C C T 10 0.531941598773897 0.158093130392085 ENSG00000204634:ENST00000376840:exon_101627913_101628002:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000409318:exon_101627913_101628002:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000494011:exon_101627502_101628002:TBC1D8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 101635538 C/T 1 69 7 76 32.2960296846011 3.72359119141728 28.5724384931838 T:C C T 10 0.531941598773897 1.81680914734158e-12 ENSG00000071082:ENST00000409028:exon_101635460_101636078:RPL31 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 101638828 C/T 1 7 3 10 3.27640880858272 1.59582479632169 1.68058401226103 T:C C T 10 0.531941598773897 0.3537387028518 ENSG00000204634:ENST00000463751:exon_101638743_101638970:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000376840:exon_101638743_101638983:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000409318:exon_101638743_101638983:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000494011:exon_101638743_101638835:TBC1D8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 101644855 G/A 1 4 6 10 1.87223360490441 3.19164959264338 -1.31941598773897 A:G G A 10 0.531941598773897 0.530535902085358 ENSG00000204634:ENST00000376840:exon_101644765_101644894:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000409318:exon_101644765_101644894:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000473937:exon_101644765_101644894:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000485875:exon_101644807_101644894:TBC1D8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 101898412 G/C 1 12 6 18 5.61670081471324 3.19164959264338 2.42505122206985 C:G G C 10 0.531941598773897 0.345678312274734 ENSG00000163162:ENST00000424632:exon_101898321_101898519:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000295317:exon_101898321_101898519:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000490553:exon_101897955_101898519:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000463726:exon_101898321_101898519:RNF149 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 101925026 T/C 1 3 6 9 1.40417520367831 3.19164959264338 -1.78747438896507 T:C T C 10 0.531941598773897 0.320650472569791 ENSG00000163162:ENST00000424632:exon_101924591_101925163:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000295317:exon_101924591_101925158:RNF149 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 105885961 T/C 1 10 14 24 4.68058401226103 7.44718238283456 -2.76659837057353 T:C T C 10 0.531941598773897 0.30822661421643 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105885729_105886162:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105885729_105886162:TGFBRAP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 109099572 C/G 1 16 6 22 7.48893441961765 3.19164959264338 4.29728482697427 C:G C G 10 0.531941598773897 0.086304076451531 ENSG00000135968:ENST00000409325:exon_109099518_109099622:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000309863:exon_109099518_109099622:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000482325:exon_109099518_109099622:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393318:exon_109099518_109099622:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000447558:exon_109099518_109099612:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393321:exon_109099518_109099622:GCC2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 114220055 T/C 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 T:C T C 10 0.531941598773897 0.730998912113487 ENSG00000136682:ENST00000259199:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000448780:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000426479:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000358604:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000456188:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000492566:exon_114219985_114220411:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000472995:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000486174:exon_114219985_114220071:CBWD2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 118575215 C/G 1 68 56 124 31.827971283375 29.7887295313382 2.03924175203677 C:G C G 10 0.531941598773897 0.720089391086077 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118575020_118575304:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000474694:exon_118575020_118575304:DDX18 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 118583100 G/A 1 15 26 41 7.02087601839154 13.8304815681213 -6.80960554972978 A:G G A 10 0.531941598773897 0.040987785762863 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118583023_118583175:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000415038:exon_118583023_118583175:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000476149:exon_118583023_118583175:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000461443:exon_118583023_118583559:DDX18 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 120129841 A/G 1 717 652 1369 335.597873679116 346.825922400581 -11.228048721465 A:G A G 10 0.531941598773897 0.551351008355827 ENSG00000155368:ENST00000355857:exon_120129821_120130126:DBI;ENSG00000155368:ENST00000409094:exon_120129821_120130057:DBI;ENSG00000155368:ENST00000311521:exon_120129821_120130122:DBI;ENSG00000155368:ENST00000460901:exon_120129821_120130030:DBI;ENSG00000155368:ENST00000393103:exon_120129821_120129983:DBI;ENSG00000155368:ENST00000475783:exon_120129821_120130076:DBI HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 120438515 G/C 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 C:G G C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000144120:ENST00000401466:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000424086:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000272521:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000445518:exon_120438408_120438771:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000409951:exon_120438408_120438699:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000415646:exon_120438430_120439035:TMEM177 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 120438523 A/G 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 A:G A G 10 0.531941598773897 0.486426237614014 ENSG00000144120:ENST00000401466:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000424086:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000272521:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000445518:exon_120438408_120438771:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000409951:exon_120438408_120438699:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000415646:exon_120438430_120439035:TMEM177 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 120439230 C/G 1 7 16 23 3.27640880858272 8.51106558038235 -5.23465677179963 C:G C G 10 0.531941598773897 0.0356123513558871 ENSG00000144120:ENST00000401466:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000424086:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000272521:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000415646:exon_120439135_120439242:TMEM177 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 128393800 T/C 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 T:C T C 10 0.531941598773897 0.730998912113487 ENSG00000169994:ENST00000428314:exon_128393783_128393899:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000272666:exon_128393783_128393899:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000389524:exon_128393783_128393899:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000409816:exon_128393783_128393899:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000496841:exon_128393783_128393899:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000409090:exon_128393783_128393899:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000491278:exon_128393783_128393899:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000494959:exon_128393783_128393899:MYO7B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 128394955 A/G 1 18 5 23 8.42505122206985 2.65970799386948 5.76534322820037 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0199342778807926 ENSG00000169994:ENST00000428314:exon_128394891_128395303:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000272666:exon_128394891_128395303:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000389524:exon_128394891_128395303:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000409816:exon_128394891_128395303:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000496841:exon_128394891_128395304:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000409090:exon_128394891_128395301:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000491278:exon_128394369_128395300:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000494959:exon_128394891_128395271:MYO7B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 128477084 G/C 1 16 23 39 7.48893441961765 12.2346567717996 -4.74572235218198 C:G G C 10 0.531941598773897 0.149013423149373 ENSG00000136709:ENST00000322313:exon_128476839_128477927:WDR33 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 128522383 T/C 1 48 37 85 22.4668032588529 19.6818391546342 2.78496410421875 T:C T C 10 0.531941598773897 0.58761067493376 ENSG00000136709:ENST00000409658:exon_128520107_128522553:WDR33 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 128610648 T/C 1 19 23 42 8.89310962329596 12.2346567717996 -3.34154714850368 T:C T C 10 0.531941598773897 0.354119637621621 ENSG00000144231:ENST00000272645:exon_128610499_128610679:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409955:exon_128610499_128610679:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409698:exon_128610499_128610679:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000411634:exon_128610499_128610679:POLR2D HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 128939817 G/A 1 4 6 10 1.87223360490441 3.19164959264338 -1.31941598773897 A:G G A 10 0.531941598773897 0.530535902085358 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128939704_128939864:UGGT1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 130910937 G/C 1 37 29 66 17.3181608453658 15.426306364443 1.8918544809228 C:G G C 10 0.531941598773897 0.711822505039494 ENSG00000136699:ENST00000454468:exon_130910892_130911023:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000412570:exon_130910892_130911023:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000433118:exon_130910892_130911023:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000351288:exon_130910892_130911023:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000339679:exon_130910892_130911023:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000491319:exon_130910892_130911023:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000491128:exon_130910892_130911023:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000482171:exon_130910892_130911023:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439886:exon_130910892_130911023:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000409031:exon_130910892_130911023:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000453750:exon_130910892_130911023:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000443958:exon_130910892_130911023:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000431183:exon_130910892_130911023:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000426662:exon_130910892_130911023:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000452225:exon_130910892_130911023:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000449159:exon_130910929_130911023:SMPD4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 132277686 C/T 1 14 9 23 6.55281761716544 4.78747438896507 1.76534322820037 T:C C T 10 0.531941598773897 0.534173096135566 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 132290399 G/A 1 3 7 10 1.40417520367831 3.72359119141728 -2.31941598773897 A:G G A 10 0.531941598773897 0.205442831458325 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 135214259 G/A 1 6 2 8 2.80835040735662 1.06388319754779 1.74446720980882 A:G G A 10 0.531941598773897 0.297069782823554 ENSG00000152128:ENST00000281924:exon_135213330_135214347:TMEM163;ENSG00000152128:ENST00000467316:exon_135213331_135214347:TMEM163;ENSG00000152128:ENST00000476823:exon_135213335_135214347:TMEM163 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 136873084 G/A 1 31 12 43 14.5098104380092 6.38329918528676 8.12651125272243 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0140522837846077 ENSG00000121966:ENST00000409817:exon_136871919_136873813:CXCR4;ENSG00000121966:ENST00000241393:exon_136871921_136873482:CXCR4;ENSG00000121966:ENST00000466288:exon_136872207_136873482:CXCR4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 150438756 G/C 1 19 42 61 8.89310962329596 22.3415471485037 -13.4484375252077 C:G G C 10 0.531941598773897 0.000716948488324597 ENSG00000168288:ENST00000303319:exon_150438641_150438785:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000428879:exon_150438641_150438785:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000422782:exon_150438641_150438785:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000436114:exon_150438641_150438785:MMADHC HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 152132130 A/G 1 76 92 168 35.5724384931838 48.9386270871985 -13.3661885940147 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0441546306924713 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152131998_152132184:NMI HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 152138522 T/C 1 34 29 63 15.9139856416875 15.426306364443 0.487679277244489 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152138462_152138557:NMI HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 152320118 G/A 1 8 9 17 3.74446720980882 4.78747438896507 -1.04300717915625 A:G G A 10 0.531941598773897 0.635405848599126 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 152322095 A/T 1 16 18 34 7.48893441961765 9.57494877793015 -2.0860143583125 A:T A T 10 0.531941598773897 0.496174811226608 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152321214_152322634:RIF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 152331418 C/G 1 6 11 17 2.80835040735662 5.85135758651287 -3.04300717915625 C:G C G 10 0.531941598773897 0.152165296741825 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152331371_152332136:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152331371_152332419:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152331371_152333863:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152331371_152331733:RIF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 160676427 C/A 1 17 10 27 7.95699282084375 5.31941598773897 2.63757683310478 A:C C A 10 0.531941598773897 0.340358411285523 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160676237_160676431:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160676237_160676431:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160676237_160676431:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160676237_160676431:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160676237_160676431:RP11-357L2.1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 160738677 G/A 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000054219:ENST00000484559:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160738635_160738826:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160738635_160738826:RP11-357L2.1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 163124051 C/T 1 58 66 124 27.147387271114 35.1081455190772 -7.96075824796323 T:C C T 10 0.531941598773897 0.176842292690453 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163123989_163124079:IFIH1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 163208893 T/G 1 13 12 25 6.08475921593934 6.38329918528676 -0.298539969347426 T:G T G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000115271:ENST00000473240:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000446271:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000429691:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000437150:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000481161:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000453113:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000487445:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000479199:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000233612:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000421131:exon_163208848_163208917:GCA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 172188368 C/T 1 7 2 9 3.27640880858272 1.06388319754779 2.21252561103493 T:C C T 10 0.531941598773897 0.187705653333192 ENSG00000123600:ENST00000447486:exon_172188314_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000375258:exon_172188314_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000483284:exon_172188314_172189305:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392601:exon_172188314_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000438609:exon_172188275_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392604:exon_172188314_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000460188:exon_172188314_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000428182:exon_172188314_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000460539:exon_172188318_172188377:METTL8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 172216969 T/C 1 5 5 10 2.34029200613052 2.65970799386948 -0.31941598773897 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000123600:ENST00000447486:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000375258:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392601:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392604:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000460188:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000428182:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392599:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000462821:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000442778:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000453846:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000442541:exon_172216932_172217023:METTL8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 172374120 G/A 1 2 370 372 0.936116802452206 196.818391546342 -195.88227474389 A:G G A 10 0.531941598773897 2.01229374585023e-118 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 172411273 G/A 1 40 48 88 18.7223360490441 25.5331967411471 -6.81086069210294 A:G G A 10 0.531941598773897 0.164869173066155 ENSG00000071967:ENST00000409484:exon_172411034_172412117:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000321348:exon_172411034_172414643:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000375252:exon_172411034_172414156:CYBRD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 179325735 C/G 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 C:G C G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000204311:ENST00000409117:exon_179325709_179326117:DFNB59;ENSG00000204311:ENST00000437056:exon_179325709_179326014:DFNB59;ENSG00000204311:ENST00000375129:exon_179325709_179326001:DFNB59;ENSG00000204311:ENST00000442710:exon_179325709_179325931:DFNB59 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 180810180 C/T 1 52 68 120 24.3390368637574 36.172028716625 -11.8329918528676 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0350466940370002 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 180810264 A/T 1 47 55 102 21.9987448576268 29.2567879325643 -7.2580430749375 A:T A T 10 0.531941598773897 0.164935504310398 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 183593697 C/T 1 9 4 13 4.21252561103493 2.12776639509559 2.08475921593934 T:C C T 10 0.531941598773897 0.279590414707516 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000494462:exon_183593303_183593834:DNAJC10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 183622547 T/G 1 11 9 20 5.14864241348713 4.78747438896507 0.36116802452206 T:G T G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183622419_183622552:DNAJC10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 183627504 A/G 1 17 11 28 7.95699282084375 5.85135758651287 2.10563523433088 A:G A G 10 0.531941598773897 0.455035720336675 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183627409_183627528:DNAJC10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 183817957 T/A 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 A:T T A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000061676:ENST00000361354:exon_183817841_183818059:NCKAP1;ENSG00000061676:ENST00000360982:exon_183817841_183818059:NCKAP1;ENSG00000061676:ENST00000456371:exon_183817841_183818059:NCKAP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 185802363 A/G 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 A:G A G 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000170396:ENST00000302277:exon_185800510_185804219:ZNF804A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 190531615 T/C 1 9 10 19 4.21252561103493 5.31941598773897 -1.10689037670404 T:C T C 10 0.531941598773897 0.651315646573759 ENSG00000138381:ENST00000260952:exon_190530767_190532322:ASNSD1;ENSG00000138381:ENST00000420250:exon_190530767_190532322:ASNSD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 191301368 A/G 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000151690:ENST00000392328:exon_191300703_191302287:MFSD6;ENSG00000151690:ENST00000281416:exon_191300638_191302287:MFSD6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 197004439 A/G 1 14 5 19 6.55281761716544 2.65970799386948 3.89310962329596 A:G A G 10 0.531941598773897 0.105556053498551 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197004344_197004523:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197004344_197004523:STK17B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 197021372 T/A 1 20 32 52 9.36116802452206 17.0221311607647 -7.66096313624264 A:T T A 10 0.531941598773897 0.0370128920893029 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000420683:exon_197021296_197021375:STK17B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 198257795 T/C 1 66 58 124 30.8918544809228 30.852612728886 0.0392417520367694 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198257696_198257912:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000479532:exon_198257696_198258075:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000424674:exon_198257776_198257912:SF3B1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 198265526 A/G 1 40 38 78 18.7223360490441 20.2137807534081 -1.49144470436397 A:G A G 10 0.531941598773897 0.735302773451444 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198265439_198265660:SF3B1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 198283305 T/C 1 29 29 58 13.573693635557 15.426306364443 -1.85261272888603 T:C T C 10 0.531941598773897 0.693538205676099 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198283233_198283312:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000470268:exon_198283233_198284839:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000482158:exon_198283233_198283686:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000409915:exon_198283233_198283312:SF3B1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 198334842 C/T 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000115520:ENST00000263960:exon_198334794_198334895:COQ10B;ENSG00000115520:ENST00000409398:exon_198334794_198334895:COQ10B;ENSG00000115520:ENST00000409010:exon_198334794_198334895:COQ10B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 198362018 T/C 1 139 138 277 65.0601177704283 73.4079406307978 -8.34782286036946 A:T:C T C 10 0.531941598773897 0.335457332865557 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000486181:exon_198361864_198362231:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198361615_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198361892_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198362009_198362116:HSPD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 201371768 G/T 1 6 5 11 2.80835040735662 2.65970799386948 0.148642413487133 A:T:G G T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000468413:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000478816:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000458583:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000447556:exon_201371580_201371814:KCTD18 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 201436555 A/G 1 15 13 28 7.02087601839154 6.91524078406066 0.105635234330883 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 201437048 A/G 1 6 5 11 2.80835040735662 2.65970799386948 0.148642413487133 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 201437334 T/C 1 9 14 23 4.21252561103493 7.44718238283456 -3.23465677179963 T:C T C 10 0.531941598773897 0.211539426770348 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 202025621 A/G 1 14 14 28 6.55281761716544 7.44718238283456 -0.894364765669117 A:G A G 10 0.531941598773897 0.850300347768159 ENSG00000003402:ENST00000309955:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000443227:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000340870:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000343375:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000341582:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000423241:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000457277:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000479953:exon_202025155_202025760:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000474842:exon_202025155_202025665:CFLAR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 202050677 A/G 1 4 6 10 1.87223360490441 3.19164959264338 -1.31941598773897 A:G A G 10 0.531941598773897 0.530535902085358 ENSG00000003400:ENST00000286186:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000360132:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000460140:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000272879:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000438843:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000374650:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000346817:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000313728:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000448480:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000484926:exon_202050494_202051103:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000492363:exon_202050501_202050847:CASP10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 202149696 G/A 1 6 5 11 2.80835040735662 2.65970799386948 0.148642413487133 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000064012:ENST00000392263:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000392264:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000303385:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000392266:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000264274:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000392259:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000432109:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000264275:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000358485:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000339403:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000323492:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000444430:exon_202149539_202150040:CASP8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 203139844 T/C 1 50 50 100 23.4029200613051 26.5970799386949 -3.1941598773897 T:C T C 10 0.531941598773897 0.548516022938569 ENSG00000055044:ENST00000264279:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000426814:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000488403:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000492740:exon_203139836_203140406:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000472050:exon_203139836_203139912:NOP58 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 203155936 A/C 1 54 65 119 25.2751536662096 34.5762039203033 -9.30105025409375 A:C A C 10 0.531941598773897 0.098046810247302 ENSG00000055044:ENST00000264279:exon_203155848_203155993:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000433543:exon_203155848_203155993:NOP58 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 203421199 G/A 1 11 13 24 5.14864241348713 6.91524078406066 -1.76659837057353 A:G G A 10 0.531941598773897 0.541790058951456 ENSG00000204217:ENST00000374580:exon_203419975_203421254:BMPR2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 203748363 C/G 1 6 6 12 2.80835040735662 3.19164959264338 -0.383299185286765 C:G C G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000138442:ENST00000455330:exon_203748332_203748464:WDR12;ENSG00000138442:ENST00000261015:exon_203748332_203748464:WDR12;ENSG00000138442:ENST00000464820:exon_203748196_203748464:WDR12;ENSG00000138442:ENST00000463824:exon_203748312_203748464:WDR12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 207006676 T/C 1 20 31 51 9.36116802452206 16.4901895619908 -7.12902153746875 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0497079980743547 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207006665_207006793:NDUFS1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 207012483 A/G 1 17 10 27 7.95699282084375 5.31941598773897 2.63757683310478 A:G A G 10 0.531941598773897 0.340358411285523 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000456284:exon_207012477_207012558:NDUFS1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 208478055 A/G 1 8 13 21 3.74446720980882 6.91524078406066 -3.17077357425184 A:G A G 10 0.531941598773897 0.192501336721756 ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208473839_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208476828_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208477447_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208477451_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208477467_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208477567_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208477704_208478167:FAM119A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 208489101 C/A 1 9 2 11 4.21252561103493 1.06388319754779 3.14864241348713 A:C C A 10 0.531941598773897 0.0713639747063953 ENSG00000144401:ENST00000432416:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000458426:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000425132:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000461419:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208488953_208489275:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208488953_208489124:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208488953_208489290:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000471128:exon_208488953_208489128:FAM119A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 216904019 A/T 1 6 8 14 2.80835040735662 4.25553279019118 -1.44718238283456 A:T A T 10 0.531941598773897 0.594012234271892 ENSG00000115425:ENST00000442122:exon_216903914_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000448681:exon_216903112_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000265322:exon_216903132_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000461330:exon_216903979_216904083:PECR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 216908679 C/T 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 T:C C T 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000115425:ENST00000442122:exon_216908627_216908738:PECR;ENSG00000115425:ENST00000448681:exon_216908627_216908738:PECR;ENSG00000115425:ENST00000265322:exon_216908627_216908738:PECR;ENSG00000115425:ENST00000461330:exon_216908627_216908738:PECR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 216923679 C/T 1 10 3 13 4.68058401226103 1.59582479632169 3.08475921593934 T:C C T 10 0.531941598773897 0.100839397920929 ENSG00000115425:ENST00000265322:exon_216923618_216923699:PECR;ENSG00000115425:ENST00000461330:exon_216923618_216923699:PECR;ENSG00000115425:ENST00000497889:exon_216923618_216923699:PECR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 217279850 T/C 1 19 16 35 8.89310962329596 8.51106558038235 0.382044042913604 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000138375:ENST00000430374:exon_217279370_217279864:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000357276:exon_217279370_217280238:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000358207:exon_217279370_217280238:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000427645:exon_217279731_217280238:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000392128:exon_217279836_217280238:SMARCAL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 217364013 C/T 1 1740 1469 3209 814.421618133419 781.422208598855 32.9994095345645 A:T:C:G C T 10 0.531941598773897 0.250228481096836 ENSG00000197756:ENST00000491306:exon_217363993_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000490649:exon_217363993_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000478153:exon_217363548_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000487233:exon_217363993_217366183:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000446558:exon_217363993_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000420712:exon_217363993_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000359681:exon_217363590_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000456586:exon_217363993_217364121:RPL37A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 219103580 A/G 1 7 1 8 3.27640880858272 0.531941598773897 2.74446720980882 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0747852262017061 ENSG00000163466:ENST00000465395:exon_219103387_219103918:ARPC2;ENSG00000163466:ENST00000472753:exon_219103387_219103740:ARPC2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 219129216 G/A 1 51 57 108 23.8709784625313 30.3206711301121 -6.44969266758088 A:T:G G A 10 0.531941598773897 0.247128298959367 ENSG00000127837:ENST00000248450:exon_219128850_219129331:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000444053:exon_219128852_219129331:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000475678:exon_219128853_219129331:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000420660:exon_219128885_219129331:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000494720:exon_219128904_219129331:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000489767:exon_219128906_219129331:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000422731:exon_219129083_219129331:AAMP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 219140288 G/C 1 12 6 18 5.61670081471324 3.19164959264338 2.42505122206985 C:G G C 10 0.531941598773897 0.345678312274734 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219138915_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000465082:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000445635:exon_219139729_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219140155_219140344:TMBIM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 219146868 T/C 1 10 6 16 4.68058401226103 3.19164959264338 1.48893441961765 T:C T C 10 0.531941598773897 0.61793977257828 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000439306:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000429501:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000425694:exon_219146663_219146931:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000495113:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000418569:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000440422:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444183:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453776:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444000:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453281:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000451181:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000434015:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000413976:exon_219146727_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000420341:exon_219146841_219146904:TMBIM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 219146882 G/C 1 11 6 17 5.14864241348713 3.19164959264338 1.95699282084375 C:G G C 10 0.531941598773897 0.467371914131112 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000439306:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000429501:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000425694:exon_219146663_219146931:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000495113:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000418569:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000440422:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444183:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453776:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444000:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453281:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000451181:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000434015:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000413976:exon_219146727_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000420341:exon_219146841_219146904:TMBIM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 219267781 C/T 1 41 27 68 19.1903944502702 14.3624231668952 4.827971283375 T:C C T 10 0.531941598773897 0.274513798683011 ENSG00000144579:ENST00000491064:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000443891:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000473420:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000498160:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000273062:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000497677:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000452977:exon_219267734_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000428361:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000488627:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000482272:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000464255:exon_219267758_219267850:CTDSP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 219503113 C/T 1 20 21 41 9.36116802452206 11.1707735742518 -1.80960554972978 T:C C T 10 0.531941598773897 0.63968648210344 ENSG00000115568:ENST00000449707:exon_219502639_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000336124:exon_219502639_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000396788:exon_219502639_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000411696:exon_219502644_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000450765:exon_219502868_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000433921:exon_219502868_219503531:ZNF142 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 219508263 G/T 1 11 11 22 5.14864241348713 5.85135758651287 -0.702715173025734 T:G G T 10 0.531941598773897 0.832492408246346 ENSG00000115568:ENST00000449707:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000336124:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000396788:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000411696:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000450765:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000433921:exon_219506751_219509787:ZNF142 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 219527712 C/T 1 33 28 61 15.4459272404614 14.8943647656691 0.551562474792281 T:C C T 10 0.531941598773897 0.898808984703237 ENSG00000074582:ENST00000359273:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392109:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392110:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392111:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000412366:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000439945:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000431802:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000477422:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000460579:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000465706:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000426649:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000436603:exon_219527606_219527723:BCS1L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 219527866 T/C 1 33 19 52 15.4459272404614 10.106890376704 5.33903686375735 T:C T C 10 0.531941598773897 0.164505541586603 ENSG00000074582:ENST00000359273:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392109:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392110:exon_219527857_219528165:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392111:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000412366:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000439945:exon_219527857_219528127:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000431802:exon_219527857_219528165:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000477422:exon_219527857_219528136:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000460579:exon_219527857_219528137:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000465706:exon_219527857_219528164:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000426649:exon_219527857_219528165:BCS1L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 219528995 T/C 1 51 48 99 23.8709784625313 25.5331967411471 -1.66221827861581 T:C T C 10 0.531941598773897 0.763165706437702 ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219528587_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219528615_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000474339:exon_219528890_219529258:RNF25 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 219529247 A/C 1 64 43 107 29.9557376784706 22.8734887472776 7.08224893119302 A:C A C 10 0.531941598773897 0.176248971259712 ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219528587_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219528615_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000474339:exon_219528890_219529258:RNF25 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 219529881 G/A 1 19 13 32 8.89310962329596 6.91524078406066 1.97786883923529 A:G G A 10 0.531941598773897 0.595907192228062 ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219529878_219529970:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219529878_219529970:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000463188:exon_219529878_219529970:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000423170:exon_219529877_219529970:RNF25 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 219533378 T/C 1 8 12 20 3.74446720980882 6.38329918528676 -2.63883197547794 T:C T C 10 0.531941598773897 0.267702187700883 ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219533328_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219532802_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000463188:exon_219533328_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000423170:exon_219533328_219533402:RNF25 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 220087441 T/C 1 17 12 29 7.95699282084375 6.38329918528676 1.57369363555699 T:C T C 10 0.531941598773897 0.582816143128388 ENSG00000198925:ENST00000446716:exon_220087367_220087460:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409033:exon_220087367_220087615:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000396761:exon_220087367_220087615:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409618:exon_220087367_220087615:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000361242:exon_220087367_220087615:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409422:exon_220087367_220087615:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000429920:exon_220087367_220087615:ATG9A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 220090147 T/C 1 10 5 15 4.68058401226103 2.65970799386948 2.02087601839155 T:C T C 10 0.531941598773897 0.438857439709851 ENSG00000198925:ENST00000409033:exon_220090133_220090294:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000396761:exon_220090133_220090294:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409618:exon_220090133_220090294:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000361242:exon_220090133_220090294:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409422:exon_220090133_220090294:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000431715:exon_220090133_220090294:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000436856:exon_220090133_220090294:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000457841:exon_220090133_220090294:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000428226:exon_220090133_220090294:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000412355:exon_220090133_220090294:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000432520:exon_220090133_220090294:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000439812:exon_220090133_220090294:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000456708:exon_220090133_220090294:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000466217:exon_220090054_220090294:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000486766:exon_220090137_220090294:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000455079:exon_220090137_220090294:ATG9A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 224743373 C/T 1 3 8 11 1.40417520367831 4.25553279019118 -2.85135758651287 T:C:G C T 10 0.531941598773897 0.128574530340517 ENSG00000085449:ENST00000462702:exon_224743246_224743405:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000233055:exon_224740064_224743447:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000352510:exon_224740065_224743447:WDFY1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 228217260 C/A 1 11 18 29 5.14864241348713 9.57494877793015 -4.42630636444301 A:C C A 10 0.531941598773897 0.135324510743046 ENSG00000168958:ENST00000304593:exon_228217230_228217289:MFF;ENSG00000168958:ENST00000353339:exon_228217230_228217289:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409616:exon_228217230_228217289:MFF;ENSG00000168958:ENST00000349901:exon_228217230_228217289:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392059:exon_228217230_228217289:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392058:exon_228217230_228217289:MFF;ENSG00000168958:ENST00000490857:exon_228217230_228217289:MFF;ENSG00000168958:ENST00000476262:exon_228216397_228217289:MFF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 228398422 A/G 1 23 17 40 10.7653432282004 9.04300717915625 1.72233604904412 A:G A G 10 0.531941598773897 0.636706170154125 ENSG00000173744:ENST00000409979:exon_228398265_228398474:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000310078:exon_228398265_228398474:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409315:exon_228398265_228398474:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000373671:exon_228398265_228398474:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409171:exon_228398265_228398474:AGFG1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 228416712 A/G 1 16 14 30 7.48893441961765 7.44718238283456 0.0417520367830893 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000173744:ENST00000409979:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000310078:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409315:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000373671:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409171:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000458212:exon_228416675_228416833:AGFG1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 230638876 G/A 1 28 30 58 13.1056352343309 15.9582479632169 -2.85261272888603 A:G G A 10 0.531941598773897 0.511174979037986 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230638813_230638977:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389045:exon_230638813_230638977:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230638813_230638977:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000418123:exon_230638813_230638977:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000459841:exon_230638277_230638977:TRIP12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 231110582 C/T 1 15 6 21 7.02087601839154 3.19164959264338 3.82922642574816 T:C C T 10 0.531941598773897 0.124993329418103 ENSG00000079263:ENST00000350136:exon_231110578_231110655:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392044:exon_231110578_231110655:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392045:exon_231110578_231110655:SP140;ENSG00000079263:ENST00000417495:exon_231110578_231110655:SP140 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 231258150 C/T 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 T:C C T 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000079263:ENST00000486687:exon_231258129_231258176:SP140;ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000483728:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000496870:exon_231258129_231258176:SP140L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 231331799 T/C 1 13 15 28 6.08475921593934 7.97912398160846 -1.89436476566912 T:C T C 10 0.531941598773897 0.57093826541044 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 231331896 G/A 1 79 70 149 36.9766136968621 37.2359119141728 -0.259298217310651 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000413284:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000452345:exon_231331835_231331930:SP100 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 231333763 A/G 1 111 114 225 51.9544825360974 60.6413422602243 -8.68685972412683 A:G A G 10 0.531941598773897 0.256416946808279 ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000413284:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000452345:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494508:exon_231333547_231333811:SP100 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 231407663 C/T 1 7 6 13 3.27640880858272 3.19164959264338 0.0847592159393384 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231407551_231407898:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231407551_231410317:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231407551_231408805:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231407551_231407837:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231407551_231408805:SP100 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 231774844 G/A 1 4 10 14 1.87223360490441 5.31941598773897 -3.44718238283456 A:G G A 10 0.531941598773897 0.104830012761555 ENSG00000135898:ENST00000444078:exon_231774337_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392040:exon_231772043_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392039:exon_231774581_231775811:GPR55 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 232196564 C/T 1 7 3 10 3.27640880858272 1.59582479632169 1.68058401226103 T:C C T 10 0.531941598773897 0.3537387028518 ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000428662:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000486787:exon_232196505_232196609:ARMC9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 232196597 G/A 1 7 4 11 3.27640880858272 2.12776639509559 1.14864241348713 A:G G A 10 0.531941598773897 0.55795959209382 ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000428662:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000486787:exon_232196505_232196609:ARMC9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 232263127 G/A 1 6 7 13 2.80835040735662 3.72359119141728 -0.915240784060662 A:G G A 10 0.531941598773897 0.782547085779911 ENSG00000156966:ENST00000287590:exon_232262442_232265875:B3GNT7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 232320581 T/G 1 5 9 14 2.34029200613052 4.78747438896507 -2.44718238283456 T:G T G 10 0.531941598773897 0.283917011510726 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 233925166 G/A 1 16 10 26 7.48893441961765 5.31941598773897 2.16951843187868 A:G G A 10 0.531941598773897 0.436884592808153 ENSG00000168918:ENST00000422935:exon_233924677_233925322:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000451407:exon_233925062_233925322:INPP5D HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 234371351 G/A 1 5 7 12 2.34029200613052 3.72359119141728 -1.38329918528676 A:G G A 10 0.531941598773897 0.56545794539378 ENSG00000077044:ENST00000264057:exon_234371289_234371381:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000409813:exon_234371289_234371381:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000430834:exon_234371289_234371381:DGKD HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 234386134 A/G 1 5 5 10 2.34029200613052 2.65970799386948 -0.31941598773897 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234384166_234386149:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234384172_234386149:USP40;ENSG00000085982:ENST00000483519:exon_234384172_234386149:USP40 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 234750542 G/C 1 26 30 56 12.1695184318787 15.9582479632169 -3.78872953133823 C:G G C 10 0.531941598773897 0.349290464119377 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 2 234750831 T/C 1 14 9 23 6.55281761716544 4.78747438896507 1.76534322820037 T:C T C 10 0.531941598773897 0.534173096135566 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000453122:exon_234750762_234750851:HJURP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 1115919 A/G 1 45 30 75 21.0626280551746 15.9582479632169 5.10438009195772 A:C:G A G 10 0.531941598773897 0.249227439931628 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000479715:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000484891:exon_1115483_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000435720:exon_1115821_1115949:PSMF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 1145043 G/A 1 59 47 106 27.6154456723401 25.0012551423732 2.61419052996692 A:T:G G A 10 0.531941598773897 0.627841194331123 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1144962_1145120:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000438768:exon_1144962_1145120:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1144962_1145120:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1144962_1145120:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1144962_1145120:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000461847:exon_1144962_1145120:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1144962_1145120:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000484891:exon_1144962_1145120:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000435720:exon_1144962_1145120:PSMF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 1426393 C/T 1 32 20 52 14.9778688392353 10.6388319754779 4.33903686375736 T:C C T 10 0.531941598773897 0.266699612471639 ENSG00000088833:ENST00000216879:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000353088:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381658:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000461211:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000476071:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000350991:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381653:exon_1426311_1426794:NSFL1C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 3193842 C/A 1 23 12 35 10.7653432282004 6.38329918528676 4.3820440429136 A:C C A 10 0.531941598773897 0.174979343497450 ENSG00000125877:ENST00000483354:exon_3193815_3193872:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000460676:exon_3193815_3193872:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000380113:exon_3193815_3193872:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000455664:exon_3193815_3193872:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000460550:exon_3193815_3193872:ITPA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 3765955 G/A 1 33 25 58 15.4459272404614 13.2985399693474 2.14738727111397 A:G G A 10 0.531941598773897 0.600887246336378 ENSG00000125817:ENST00000379751:exon_3764500_3767337:CENPB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 5843710 C/T 1 5 5 10 2.34029200613052 2.65970799386948 -0.31941598773897 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000378971:exon_5843670_5843920:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000445603:exon_5843670_5843854:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000442185:exon_5843670_5843950:C20orf196 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 5843812 T/C 1 7 5 12 3.27640880858272 2.65970799386948 0.616700814713236 T:C T C 10 0.531941598773897 0.779881793407808 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000378971:exon_5843670_5843920:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000445603:exon_5843670_5843854:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000442185:exon_5843670_5843950:C20orf196 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 5844121 C/T 1 5 6 11 2.34029200613052 3.19164959264338 -0.851357586512867 T:C C T 10 0.531941598773897 0.764860318695721 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 5844122 A/G 1 5 6 11 2.34029200613052 3.19164959264338 -0.851357586512867 A:G A G 10 0.531941598773897 0.764860318695721 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 5919274 G/A 1 13 21 34 6.08475921593934 11.1707735742518 -5.0860143583125 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0873779889613261 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5917881_5919372:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5918479_5919372:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5918479_5919372:TRMT6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 7963041 C/T 1 11 19 30 5.14864241348713 10.106890376704 -4.95824796321691 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0980482543336807 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7957995_7963268:TMX4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 10386013 C/A 1 7 12 19 3.27640880858272 6.38329918528676 -3.10689037670404 A:C C A 10 0.531941598773897 0.172695126179914 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10385428_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10385832_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10385832_10386335:MKKS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 10386059 G/A 1 9 20 29 4.21252561103493 10.6388319754779 -6.42630636444301 A:C:G G A 10 0.531941598773897 0.0239038471153897 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10385428_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10385832_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10385832_10386335:MKKS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 17640898 A/T 0 76 0 76 35.5724384931838 0 35.5724384931838 A A 10 0.531941598773897 1.79474484907834e-21 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17640625_17641173:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17639241_17641173:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17639241_17641152:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17639250_17641152:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17640625_17641173:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000398782:exon_17640251_17641173:RRBP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 17950545 A/T 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 A:T A T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000125871:ENST00000377710:exon_17950444_17951013:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000377709:exon_17950444_17950773:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000377704:exon_17950444_17951013:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000412478:exon_17950503_17950773:C20orf72 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 30753270 T/C 1 19 15 34 8.89310962329596 7.97912398160846 0.913985641687501 T:C T C 10 0.531941598773897 0.863994683994008 ENSG00000101337:ENST00000398022:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000375795:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000421148:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000217315:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000413032:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000495749:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000479591:exon_30753098_30753390:TM9SF4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 30915461 T/C 1 8 9 17 3.74446720980882 4.78747438896507 -1.04300717915625 T:C T C 10 0.531941598773897 0.635405848599126 ENSG00000101350:ENST00000375712:exon_30915359_30915464:KIF3B;ENSG00000101350:ENST00000418717:exon_30915359_30915464:KIF3B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 31291161 C/T 1 39 48 87 18.254277647818 25.5331967411471 -7.27891909332904 T:C C T 10 0.531941598773897 0.132505492703019 ENSG00000149600:ENST00000278980:exon_31290493_31291260:COMMD7;ENSG00000149600:ENST00000446419:exon_31290494_31291260:COMMD7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 31427635 C/T 1 41 31 72 19.1903944502702 16.4901895619908 2.70020488827942 T:C C T 10 0.531941598773897 0.556360202010162 ENSG00000101367:ENST00000375571:exon_31427541_31427662:MAPRE1;ENSG00000101367:ENST00000414525:exon_31427541_31427662:MAPRE1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 31981849 T/C 1 7 3 10 3.27640880858272 1.59582479632169 1.68058401226103 T:C T C 10 0.531941598773897 0.3537387028518 ENSG00000101391:ENST00000481964:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000346416:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000357886:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000339269:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000473997:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000375351:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000452723:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000477105:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000461356:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 32212690 C/T 1 4 7 11 1.87223360490441 3.72359119141728 -1.85135758651287 T:C C T 10 0.531941598773897 0.36707898879345 ENSG00000078699:ENST00000375279:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000342704:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000346541:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000397800:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000492345:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000359606:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000397803:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000491618:exon_32212570_32212823:CBFA2T2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 32295541 C/T 1 6 5 11 2.80835040735662 2.65970799386948 0.148642413487133 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000101417:ENST00000409299:exon_32294512_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000344022:exon_32295075_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000217398:exon_32295295_32295775:PXMP4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 33147737 C/G 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 C:G C G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000101460:ENST00000374837:exon_33147540_33148149:MAP1LC3A;ENSG00000101460:ENST00000397711:exon_33147540_33148086:MAP1LC3A;ENSG00000101460:ENST00000360668:exon_33147540_33148149:MAP1LC3A;ENSG00000101460:ENST00000476428:exon_33147540_33148149:MAP1LC3A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 33337751 T/C 1 6 4 10 2.80835040735662 2.12776639509559 0.68058401226103 T:C T C 10 0.531941598773897 0.758887050232993 ENSG00000198646:ENST00000397675:exon_33337206_33338322:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000374796:exon_33337206_33338322:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000359003:exon_33337206_33338322:NCOA6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 33657126 G/A 1 6 3 9 2.80835040735662 1.59582479632169 1.21252561103493 A:G G A 10 0.531941598773897 0.515798041804277 ENSG00000100991:ENST00000252015:exon_33657099_33657215:TRPC4AP;ENSG00000100991:ENST00000451813:exon_33657099_33657215:TRPC4AP;ENSG00000100991:ENST00000432634:exon_33657099_33657215:TRPC4AP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 33867924 G/A 1 1 7 8 0.468058401226103 3.72359119141728 -3.25553279019118 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0296580964656471 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 33872311 G/C 1 21 16 37 9.82922642574816 8.51106558038235 1.31816084536581 C:G G C 10 0.531941598773897 0.742914221594095 ENSG00000242372:ENST00000440766:exon_33872184_33872326:EIF6;ENSG00000242372:ENST00000374436:exon_33872184_33872518:EIF6;ENSG00000242372:ENST00000462894:exon_33872184_33872505:EIF6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 34144746 A/G 1 176 171 347 82.3782786157941 90.9620133903364 -8.58373477454226 A:G A G 10 0.531941598773897 0.360913356849743 ENSG00000125991:ENST00000348547:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000357394:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000447986:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000355563:exon_34144744_34144830:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000279052:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000416206:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000413587:exon_34144744_34144837:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000465298:exon_34144744_34144867:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000442139:exon_34144648_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000451605:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488935:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488384:exon_34144381_34144880:ERGIC3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 34214173 G/A 1 162 171 333 75.8254609986287 90.9620133903364 -15.1365523917077 A:G G A 10 0.531941598773897 0.099603282097697 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34213953_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000415920:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000462352:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000498814:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000473373:exon_34213966_34214725:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34213980_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34213988_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34214008_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34214081_34214303:CPNE1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 34219480 G/A 1 133 123 256 62.2517673630717 65.4288166491893 -3.17704928611763 A:G G A 10 0.531941598773897 0.707353702255735 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000412056:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000486021:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414664:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000416778:exon_34219416_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439806:exon_34219434_34219500:CPNE1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 34219496 T/C 1 131 105 236 61.3156505606195 55.8538678712592 5.4617826893603 T:C T C 10 0.531941598773897 0.514321655718744 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000412056:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000486021:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414664:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000416778:exon_34219416_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439806:exon_34219434_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439669:exon_34219481_34219500:CPNE1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 34220755 C/T 1 38 46 84 17.7862192465919 24.4693135435993 -6.68309429700735 T:C C T 10 0.531941598773897 0.155728038401616 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000412056:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414664:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000416778:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439806:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439669:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000420363:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000434795:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000440240:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000458038:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437100:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414711:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000435747:exon_34220717_34220845:CPNE1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 34243017 C/T 1 30 15 45 14.0417520367831 7.97912398160846 6.06262805517463 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0743078107997643 ENSG00000244462:ENST00000374114:exon_34236847_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000359646:exon_34238064_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000374104:exon_34238248_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000424458:exon_34242372_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000431148:exon_34242815_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000435161:exon_34242843_34243266:RBM12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 37396120 A/G 1 6 2 8 2.80835040735662 1.06388319754779 1.74446720980882 A:G A G 10 0.531941598773897 0.297069782823554 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37396107_37396239:ACTR5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 37400490 G/A 1 10 4 14 4.68058401226103 2.12776639509559 2.55281761716544 A:G G A 10 0.531941598773897 0.191981298637752 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37400202_37400834:ACTR5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 37400506 C/T 1 9 3 12 4.21252561103493 1.59582479632169 2.61670081471324 T:C C T 10 0.531941598773897 0.155839710778340 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37400202_37400834:ACTR5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 37555116 G/C 1 5 5 10 2.34029200613052 2.65970799386948 -0.31941598773897 C:G G C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000101447:ENST00000217429:exon_37554955_37555568:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000449225:exon_37555069_37555568:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000424027:exon_37555086_37555451:FAM83D HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 37570725 C/T 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 T:C C T 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000101447:ENST00000217429:exon_37570602_37570769:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000449225:exon_37570602_37570769:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000424027:exon_37570602_37570769:FAM83D HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 37667182 C/T 1 10 2 12 4.68058401226103 1.06388319754779 3.61670081471324 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0432053960157470 ENSG00000101452:ENST00000373325:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373323:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000252011:exon_37667142_37668366:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373321:exon_37667142_37668363:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000484417:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000449559:exon_37667142_37667289:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000493450:exon_37667142_37668366:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000482619:exon_37667142_37667279:DHX35 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 39797465 T/C 1 7 3 10 3.27640880858272 1.59582479632169 1.68058401226103 T:C T C 10 0.531941598773897 0.3537387028518 ENSG00000124181:ENST00000244007:exon_39797407_39797510:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000373271:exon_39797407_39797510:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000373272:exon_39797407_39797510:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000477870:exon_39797407_39797510:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000483175:exon_39797396_39797510:PLCG1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 39801128 C/T 1 7 16 23 3.27640880858272 8.51106558038235 -5.23465677179963 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0356123513558871 ENSG00000124181:ENST00000244007:exon_39801061_39801285:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000373271:exon_39801061_39801285:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000373272:exon_39801061_39801285:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000461641:exon_39801051_39801285:PLCG1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 42328639 T/C 1 55 38 93 25.7432120674357 20.2137807534081 5.52943131402758 T:C T C 10 0.531941598773897 0.255357030253362 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42328397_42328684:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42328397_42328684:MYBL2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 43629135 G/A 1 17 14 31 7.95699282084375 7.44718238283456 0.509810438009192 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000101109:ENST00000372806:exon_43629033_43629161:STK4;ENSG00000101109:ENST00000396731:exon_43629033_43629161:STK4;ENSG00000101109:ENST00000372801:exon_43629033_43629161:STK4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 44054349 T/C 1 22 22 44 10.2972848269743 11.7027151730257 -1.40543034605147 T:C T C 10 0.531941598773897 0.762998786164387 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44054214_44054884:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44054214_44054882:PIGT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 44596207 C/G 1 5 7 12 2.34029200613052 3.72359119141728 -1.38329918528676 C:G C G 10 0.531941598773897 0.56545794539378 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000476822:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000494955:exon_44595506_44596273:ZNF335 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 44691350 T/G 1 17 20 37 7.95699282084375 10.6388319754779 -2.68183915463419 T:C:G T G 10 0.531941598773897 0.412639018051013 ENSG00000124160:ENST00000290231:exon_44689624_44691528:NCOA5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 44746982 T/C 1 40 41 81 18.7223360490441 21.8096055497298 -3.08726950068566 T:C T C 10 0.531941598773897 0.505914912013191 ENSG00000101017:ENST00000372285:exon_44746911_44747033:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372276:exon_44746955_44747033:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372278:exon_44746976_44747033:CD40 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 45867852 A/G 1 15 20 35 7.02087601839154 10.6388319754779 -3.6179559570864 A:G A G 10 0.531941598773897 0.238889316028833 ENSG00000101040:ENST00000360911:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000311275:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000467200:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000262975:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000471951:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000352431:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000396281:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000461685:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000468376:exon_45866054_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000372023:exon_45867242_45867882:ZMYND8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 46268493 A/G 1 12 12 24 5.61670081471324 6.38329918528676 -0.766598370573529 A:G A G 10 0.531941598773897 0.83900902365855 ENSG00000124151:ENST00000372004:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000341724:exon_46268366_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000340189:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371998:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371997:exon_46268366_46268566:NCOA3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 47244450 G/A 1 15 18 33 7.02087601839154 9.57494877793015 -2.5540727595386 A:G G A 10 0.531941598773897 0.388509024006411 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47244399_47244501:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47244399_47244501:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47244399_47244501:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47244399_47244501:PREX1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 47246077 C/G 1 16 12 28 7.48893441961765 6.38329918528676 1.10563523433088 C:G C G 10 0.531941598773897 0.709170099536473 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47245987_47246159:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47245987_47246159:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47245987_47246159:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47245987_47246159:PREX1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 47246127 G/A 1 23 21 44 10.7653432282004 11.1707735742518 -0.405430346051469 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47245987_47246159:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47245987_47246159:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47245987_47246159:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47245987_47246159:PREX1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 47249116 G/A 1 39 39 78 18.254277647818 20.745722352182 -2.49144470436396 A:G G A 10 0.531941598773897 0.573054746273191 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47249034_47249177:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47248815_47249177:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47249034_47249177:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47248815_47249177:PREX1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 47249170 G/A 1 45 43 88 21.0626280551746 22.8734887472776 -1.81086069210294 A:G G A 10 0.531941598773897 0.74896666641171 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47249034_47249177:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47248815_47249177:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47249034_47249177:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47248815_47249177:PREX1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 47258763 C/T 1 20 16 36 9.36116802452206 8.51106558038235 0.850102444139708 T:C C T 10 0.531941598773897 0.86790453569009 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000496915:exon_47258651_47258796:PREX1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 47267480 A/G 1 21 6 27 9.82922642574816 3.19164959264338 6.63757683310478 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0114044771771917 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47267432_47267593:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47267432_47267593:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47267432_47267593:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47267432_47267593:PREX1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 47267940 G/A 1 30 10 40 14.0417520367831 5.31941598773897 8.72233604904412 A:G G A 10 0.531941598773897 0.00646126169311068 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47267934_47268121:PREX1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 47269233 C/G 1 9 6 15 4.21252561103493 3.19164959264338 1.02087601839154 C:G C G 10 0.531941598773897 0.79696986700649 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47269124_47269244:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47269124_47269244:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47269124_47269244:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47269124_47269244:PREX1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 47273726 C/T 1 5 5 10 2.34029200613052 2.65970799386948 -0.31941598773897 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47273578_47273726:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47273578_47273726:PREX1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 47351095 G/A 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 A:G G A 10 0.531941598773897 0.730998912113487 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47351083_47351187:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47351083_47351187:PREX1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 47630449 C/T 1 5 6 11 2.34029200613052 3.19164959264338 -0.851357586512867 T:C C T 10 0.531941598773897 0.764860318695721 ENSG00000124198:ENST00000371917:exon_47630368_47630497:ARFGEF2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 47712930 G/T 1 94 85 179 43.9974897152537 45.2150358957812 -1.21754618052757 T:G G T 10 0.531941598773897 0.881064192863339 ENSG00000124207:ENST00000449004:exon_47712886_47713484:CSE1L;ENSG00000124207:ENST00000417408:exon_47712886_47713484:CSE1L;ENSG00000124207:ENST00000262982:exon_47712886_47713489:CSE1L;ENSG00000124207:ENST00000476393:exon_47712345_47713069:CSE1L;ENSG00000124207:ENST00000469700:exon_47712713_47713489:CSE1L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 47850182 C/T 1 27 15 42 12.6375768331048 7.97912398160846 4.65845285149633 T:C C T 10 0.531941598773897 0.165790542880097 ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47850105_47850246:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47850105_47852768:DDX27 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 47865372 G/A 1 17 7 24 7.95699282084375 3.72359119141728 4.23340162942647 A:G G A 10 0.531941598773897 0.101874345613790 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 47865509 G/A 1 15 8 23 7.02087601839154 4.25553279019118 2.76534322820037 A:G G A 10 0.531941598773897 0.298803195708385 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 47872377 C/G 1 10 11 21 4.68058401226103 5.85135758651287 -1.17077357425184 C:G C G 10 0.531941598773897 0.665565590544789 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47872345_47872484:ZNFX1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 47874063 T/C 1 14 8 22 6.55281761716544 4.25553279019118 2.29728482697427 T:C T C 10 0.531941598773897 0.395573885710113 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000455070:exon_47873954_47874201:ZNFX1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 47886684 G/A 1 9 4 13 4.21252561103493 2.12776639509559 2.08475921593934 A:G G A 10 0.531941598773897 0.279590414707516 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000455070:exon_47886479_47887760:ZNFX1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 48522734 A/C 1 11 5 16 5.14864241348713 2.65970799386948 2.48893441961765 A:C A C 10 0.531941598773897 0.316542725286372 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 48523269 G/A 1 7 6 13 3.27640880858272 3.19164959264338 0.0847592159393384 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 48568704 T/C 1 24 29 53 11.2334016294265 15.426306364443 -4.19290473501654 T:C T C 10 0.531941598773897 0.27217962466019 ENSG00000124226:ENST00000449816:exon_48568680_48568733:RNF114;ENSG00000124226:ENST00000434441:exon_48568613_48568748:RNF114;ENSG00000124226:ENST00000244061:exon_48568613_48570429:RNF114 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 49196284 C/T 1 24 25 49 11.2334016294265 13.2985399693474 -2.06513833992095 T:C C T 10 0.531941598773897 0.569952387388795 ENSG00000196396:ENST00000371621:exon_49196240_49196463:PTPN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 50803573 G/A 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 A:G G A 10 0.531941598773897 0.730998912113487 ENSG00000020256:ENST00000371518:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000361387:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50803371_50803604:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371516:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000461898:exon_50803371_50803610:ZFP64 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 52192408 C/T 1 8 10 18 3.74446720980882 5.31941598773897 -1.57494877793015 T:C C T 10 0.531941598773897 0.487247762768628 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000437222:exon_52192266_52192566:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 52193214 A/G 1 11 7 18 5.14864241348713 3.72359119141728 1.42505122206985 A:G A G 10 0.531941598773897 0.638380509834863 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 52193368 C/T 1 7 7 14 3.27640880858272 3.72359119141728 -0.447182382834558 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 52198340 T/A 1 7 6 13 3.27640880858272 3.19164959264338 0.0847592159393384 A:T T A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52198000_52199707:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52198000_52199636:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52198000_52199707:ZNF217 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 52561469 A/G 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 A:G A G 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000064787:ENST00000448484:exon_52561465_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371440:exon_52561465_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000448710:exon_52560079_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000434986:exon_52560079_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000395961:exon_52560080_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371435:exon_52560080_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000422805:exon_52561322_52561535:BCAS1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 52645114 T/C 1 6 2 8 2.80835040735662 1.06388319754779 1.74446720980882 T:C T C 10 0.531941598773897 0.297069782823554 ENSG00000064787:ENST00000448484:exon_52644931_52645239:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371440:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000448710:exon_52645080_52645289:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000434986:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000395961:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371435:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000411563:exon_52644411_52645511:BCAS1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 52645166 A/G 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000064787:ENST00000448484:exon_52644931_52645239:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371440:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000448710:exon_52645080_52645289:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000434986:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000395961:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371435:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000411563:exon_52644411_52645511:BCAS1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 54961541 A/T 1 25 11 36 11.7014600306526 5.85135758651287 5.85010244413971 A:T A T 10 0.531941598773897 0.0649984363270525 ENSG00000087586:ENST00000395914:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395909:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000347343:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395915:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000312783:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000371356:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395913:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395911:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395907:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000441357:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000420474:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000422322:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000456249:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000451915:exon_54961393_54961589:AURKA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 55088404 A/G 1 41 48 89 19.1903944502702 25.5331967411471 -6.34280229087684 A:G A G 10 0.531941598773897 0.202388485854558 ENSG00000022277:ENST00000023939:exon_55088371_55088484:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000395881:exon_55088371_55088484:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000357348:exon_55088371_55088484:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000435342:exon_55088371_55088484:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000449062:exon_55088371_55088484:C20orf43 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 56179586 G/A 1 7 1 8 3.27640880858272 0.531941598773897 2.74446720980882 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0747852262017061 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56178902_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56178902_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56178906_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56179111_56179825:ZBP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 56188219 C/T 1 4 8 12 1.87223360490441 4.25553279019118 -2.38329918528676 T:C C T 10 0.531941598773897 0.247137734070613 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56188219_56188386:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56188219_56188386:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56188219_56188386:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56188219_56188386:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000357677:exon_56188219_56188386:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000343535:exon_56188219_56188386:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000480037:exon_56187947_56188386:ZBP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 56189985 C/G 1 11 5 16 5.14864241348713 2.65970799386948 2.48893441961765 C:G C G 10 0.531941598773897 0.316542725286372 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56189943_56190116:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56189943_56190116:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56189943_56190116:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56189943_56190116:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000357677:exon_56189943_56190116:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000343535:exon_56189943_56190116:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000480037:exon_56189943_56190116:ZBP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 56227514 T/C 1 7 3 10 3.27640880858272 1.59582479632169 1.68058401226103 T:C T C 10 0.531941598773897 0.3537387028518 ENSG00000124225:ENST00000341744:exon_56223448_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000347215:exon_56223448_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395816:exon_56223448_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395821:exon_56223454_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000265626:exon_56223454_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395814:exon_56227093_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000414037:exon_56227264_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395819:exon_56227463_56227654:PMEPA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 57268867 C/A 1 7 4 11 3.27640880858272 2.12776639509559 1.14864241348713 A:C C A 10 0.531941598773897 0.55795959209382 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57268793_57268978:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371137:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000445528:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57268225_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57268235_57268978:NPEPL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 57290347 C/G 1 18 24 42 8.42505122206985 12.7665983705735 -4.34154714850368 C:G C G 10 0.531941598773897 0.216069212478974 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57290224_57290466:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57290224_57290689:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57290224_57290606:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57290224_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57290224_57290466:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57287535_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57290224_57291367:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527081:exon_57290224_57290900:NPEPL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 57572614 T/C 1 9 3 12 4.21252561103493 1.59582479632169 2.61670081471324 T:C T C 10 0.531941598773897 0.155839710778340 ENSG00000101160:ENST00000488395:exon_57572447_57572808:CTSZ HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 61443636 G/A 1 43 47 90 20.1265112527224 25.0012551423732 -4.87474388965073 A:G G A 10 0.531941598773897 0.341949367964384 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370468:exon_61443582_61444281:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61443582_61444558:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61443582_61444558:OGFR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 61443716 G/A 1 25 25 50 11.7014600306526 13.2985399693474 -1.59707993869485 A:G G A 10 0.531941598773897 0.672871060346848 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370468:exon_61443582_61444281:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61443582_61444558:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61443582_61444558:OGFR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 61444523 C/T 1 51 44 95 23.8709784625313 23.4054303460515 0.465548116479784 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61443582_61444558:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61443582_61444558:OGFR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 61488785 T/C 1 4 9 13 1.87223360490441 4.78747438896507 -2.91524078406066 T:C T C 10 0.531941598773897 0.162564563323673 ENSG00000101190:ENST00000335351:exon_61488747_61488990:TCFL5;ENSG00000101190:ENST00000217162:exon_61488747_61488990:TCFL5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 61588159 A/G 1 14 15 29 6.55281761716544 7.97912398160846 -1.42630636444301 A:G A G 10 0.531941598773897 0.710526726608856 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000411611:exon_61588117_61588314:SLC17A9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 61595636 C/T 1 12 17 29 5.61670081471324 9.04300717915625 -3.42630636444301 T:C C T 10 0.531941598773897 0.264016631003003 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000459704:exon_61595580_61595667:SLC17A9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 61833675 G/A 1 34 22 56 15.9139856416875 11.7027151730257 4.21127046866177 A:G G A 10 0.531941598773897 0.285603024139518 ENSG00000149658:ENST00000370339:exon_61833639_61835159:YTHDF1;ENSG00000149658:ENST00000370333:exon_61833639_61835159:YTHDF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 62126185 A/G 0 0 9 9 0 4.78747438896507 -4.78747438896507 G A G 10 0.531941598773897 0.00107820267156602 ENSG00000101210:ENST00000298049:exon_62126158_62126454:EEF1A2;ENSG00000101210:ENST00000217182:exon_62126158_62126454:EEF1A2;ENSG00000101210:ENST00000449908:exon_62126158_62126454:EEF1A2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 62195087 A/G 1 10 6 16 4.68058401226103 3.19164959264338 1.48893441961765 A:G A G 10 0.531941598773897 0.61793977257828 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 62196253 C/A 1 6 5 11 2.80835040735662 2.65970799386948 0.148642413487133 A:C C A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 62221610 T/C 1 13 5 18 6.08475921593934 2.65970799386948 3.42505122206985 T:C T C 10 0.531941598773897 0.154890143333981 ENSG00000101216:ENST00000266068:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370069:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370077:exon_62218955_62222082:GMEB2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 62222060 C/T 1 5 5 10 2.34029200613052 2.65970799386948 -0.31941598773897 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000101216:ENST00000266068:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370069:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370077:exon_62218955_62222082:GMEB2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 62227081 A/G 1 4 6 10 1.87223360490441 3.19164959264338 -1.31941598773897 A:G A G 10 0.531941598773897 0.530535902085358 ENSG00000101216:ENST00000266068:exon_62226963_62227120:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370069:exon_62226963_62227120:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370077:exon_62226963_62227120:GMEB2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 62339942 G/A 1 30 22 52 14.0417520367831 11.7027151730257 2.33903686375736 A:G G A 10 0.531941598773897 0.579274779305336 ENSG00000197114:ENST00000448100:exon_62339905_62340516:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000355969:exon_62339905_62340516:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000477340:exon_62339905_62340516:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000490623:exon_62339905_62340516:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000357119:exon_62339905_62340516:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000431125:exon_62339905_62340223:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000369967:exon_62339905_62340516:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000328969:exon_62339905_62340516:ZGPAT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 62340115 C/G 1 21 38 59 9.82922642574816 20.2137807534081 -10.3845543276599 C:G C G 10 0.531941598773897 0.0085579881939647 ENSG00000197114:ENST00000448100:exon_62339905_62340516:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000355969:exon_62339905_62340516:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000477340:exon_62339905_62340516:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000490623:exon_62339905_62340516:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000357119:exon_62339905_62340516:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000431125:exon_62339905_62340223:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000369967:exon_62339905_62340516:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000328969:exon_62339905_62340516:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000486025:exon_62339959_62340516:ZGPAT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 62369997 C/T 1 84 88 172 39.3169057029926 46.8108606921029 -7.49395498911029 T:C C T 10 0.531941598773897 0.253003922918458 ENSG00000197114:ENST00000490623:exon_62369951_62370456:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000486025:exon_62369951_62370456:ZGPAT;ENSG00000203896:ENST00000490824:exon_62369951_62370456:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000309546:exon_62369951_62370456:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000487026:exon_62369951_62370027:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000480139:exon_62369951_62370158:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000476183:exon_62369951_62370147:LIME1;ENSG00000125520:ENST00000476221:exon_62369951_62370284:SLC2A4RG HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 62372706 G/A 1 3 6 9 1.40417520367831 3.19164959264338 -1.78747438896507 A:G G A 10 0.531941598773897 0.320650472569791 ENSG00000125520:ENST00000493772:exon_62372605_62372832:SLC2A4RG HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 62372813 G/A 1 18 24 42 8.42505122206985 12.7665983705735 -4.34154714850368 A:G G A 10 0.531941598773897 0.216069212478974 ENSG00000125520:ENST00000266077:exon_62372723_62372832:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000474248:exon_62372723_62372832:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000485897:exon_62372723_62372832:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000493772:exon_62372605_62372832:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000491109:exon_62372757_62372832:SLC2A4RG HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 62373707 G/T 1 25 27 52 11.7014600306526 14.3624231668952 -2.66096313624264 T:G G T 10 0.531941598773897 0.489171346191312 ENSG00000125520:ENST00000266077:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000485897:exon_62373689_62373843:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000493772:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000491109:exon_62373689_62373887:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000473157:exon_62373689_62373717:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000482718:exon_62373483_62373888:SLC2A4RG HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 62595169 A/G 1 6 3 9 2.80835040735662 1.59582479632169 1.21252561103493 A:G A G 10 0.531941598773897 0.515798041804277 ENSG00000196700:ENST00000369888:exon_62595142_62595266:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000217130:exon_62595142_62595266:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000450537:exon_62595142_62595266:ZNF512B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 20 62607160 C/T 1 16 60 76 7.48893441961765 31.9164959264338 -24.4275615068162 T:C C T 10 0.531941598773897 1.20160611725167e-08 ENSG00000130590:ENST00000369886:exon_62607045_62607185:SAMD10;ENSG00000130590:ENST00000498830:exon_62607045_62607185:SAMD10;ENSG00000130590:ENST00000478694:exon_62607045_62607185:SAMD10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 19169218 G/C 1 12 14 26 5.61670081471324 7.44718238283456 -1.83048156812132 C:G G C 10 0.531941598773897 0.556956605195833 ENSG00000154642:ENST00000284881:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400559:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400558:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000405964:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000493464:exon_19169040_19169435:C21orf91 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 30714776 T/C 1 4 6 10 1.87223360490441 3.19164959264338 -1.31941598773897 T:C T C 10 0.531941598773897 0.530535902085358 ENSG00000156273:ENST00000286800:exon_30714720_30718469:BACH1;ENSG00000156273:ENST00000399921:exon_30714720_30718469:BACH1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 34614250 T/C 1 15 13 28 7.02087601839154 6.91524078406066 0.105635234330883 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 34614255 T/G 1 15 16 31 7.02087601839154 8.51106558038235 -1.49018956199081 T:G T G 10 0.531941598773897 0.595424051385011 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 34640788 A/G 1 13 16 29 6.08475921593934 8.51106558038235 -2.42630636444301 A:G A G 10 0.531941598773897 0.457380459449149 ENSG00000249624:ENST00000433395:exon_34640699_34640822:AP000295.9;ENSG00000243646:ENST00000290200:exon_34640699_34640822:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000422891:exon_34640699_34640822:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000493295:exon_34640233_34640822:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000498371:exon_34640587_34640822:IL10RB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 34715699 G/C 1 7 7 14 3.27640880858272 3.72359119141728 -0.447182382834558 C:G G C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000142166:ENST00000270139:exon_34715574_34715728:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000442357:exon_34715574_34715728:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000416947:exon_34715574_34715728:IFNAR1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 34787312 A/G 1 32 39 71 14.9778688392353 20.745722352182 -5.76785351294669 A:G A G 10 0.531941598773897 0.191051452631923 ENSG00000159128:ENST00000290219:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000439213:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000381995:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000405436:exon_34787195_34787327:IFNGR2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 34924243 T/C 1 26 34 60 12.1695184318787 18.0860143583125 -5.91649592643382 T:C T C 10 0.531941598773897 0.154214698393233 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 34925689 G/A 1 27 41 68 12.6375768331048 21.8096055497298 -9.172028716625 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0285405720949013 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 35281393 A/G 1 194 162 356 90.803329837864 86.1745390013713 4.62879083649267 A:G A G 10 0.531941598773897 0.633035732057358 ENSG00000249209:ENST00000429238:exon_35281386_35281515:AP000304.12;ENSG00000241837:ENST00000491703:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000290299:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000418933:exon_35281386_35281399:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000495005:exon_35281118_35281515:ATP5O HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 35281421 T/C 1 164 141 305 76.7615778010809 75.0037654271195 1.75781237396141 A:T:C T C 10 0.531941598773897 0.863436562536682 ENSG00000249209:ENST00000429238:exon_35281386_35281515:AP000304.12;ENSG00000241837:ENST00000491703:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000290299:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000495005:exon_35281118_35281515:ATP5O HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 37442632 G/C 1 21 16 37 9.82922642574816 8.51106558038235 1.31816084536581 C:G G C 10 0.531941598773897 0.742914221594095 ENSG00000159228:ENST00000466328:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000530908:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000290349:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000439427:exon_37442313_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000399191:exon_37442333_37442702:CBR1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 37444973 C/T 1 53 39 92 24.8070952649835 20.745722352182 4.06137291280148 T:C C T 10 0.531941598773897 0.40560629398398 ENSG00000159228:ENST00000530908:exon_37444113_37445464:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000290349:exon_37444744_37445464:CBR1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 38563686 G/C 1 10 12 22 4.68058401226103 6.38329918528676 -1.70271517302573 C:G G C 10 0.531941598773897 0.525263941191058 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38563635_38563725:TTC3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 40549466 T/C 1 29 53 82 13.573693635557 28.1929047350165 -14.6192110994596 T:C T C 10 0.531941598773897 0.00126628317642686 ENSG00000183527:ENST00000331573:exon_40549361_40549497:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000440607:exon_40549361_40549497:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000481921:exon_40549361_40549497:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000411828:exon_40549361_40549497:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000380900:exon_40549361_40549497:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000431628:exon_40549361_40549497:PSMG1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 40552307 A/G 1 35 33 68 16.3820440429136 17.5540727595386 -1.172028716625 A:C:G A G 10 0.531941598773897 0.808681480526202 ENSG00000183527:ENST00000331573:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000440607:exon_40552211_40552364:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000411828:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000380900:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000431628:exon_40552211_40552362:PSMG1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 40720494 C/T 1 51 57 108 23.8709784625313 30.3206711301121 -6.44969266758088 T:C C T 10 0.531941598773897 0.247128298959367 ENSG00000205581:ENST00000380749:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000431390:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000492280:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000288344:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000486741:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000436324:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000380748:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000419378:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000489072:exon_40720471_40720788:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000482192:exon_40720471_40720549:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000380747:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000485550:exon_40720471_40720523:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000443046:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000464078:exon_40720348_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000491183:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000479586:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000471260:exon_40720471_40720546:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000482733:exon_40719921_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000463631:exon_40720348_40720503:HMGN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 42821113 T/C 1 201 178 379 94.0797386464467 94.6856045817537 -0.605865935306966 T:C T C 10 0.531941598773897 0.95898698390421 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000486275:exon_42821064_42821712:MX1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 43805637 C/T 1 1 20 21 0.468058401226103 10.6388319754779 -10.1707735742518 T:C C T 10 0.531941598773897 4.71464217210947e-06 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398397:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000422004:exon_43805518_43805643:TMPRSS3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 45217559 T/C 1 84 66 150 39.3169057029926 35.1081455190772 4.20876018391544 T:C T C 10 0.531941598773897 0.513470959143854 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000483896:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217512_45217576:RRP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 45217929 T/C 1 29 29 58 13.573693635557 15.426306364443 -1.85261272888603 T:C T C 10 0.531941598773897 0.693538205676099 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217788_45217981:RRP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 45219524 T/C 1 22 32 54 10.2972848269743 17.0221311607647 -6.72484633379044 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0761330749175242 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45219451_45219530:RRP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 45220483 A/G 1 32 37 69 14.9778688392353 19.6818391546342 -4.70397031539889 A:G A G 10 0.531941598773897 0.278576973777761 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45220398_45220495:RRP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 45503121 G/A 1 8 11 19 3.74446720980882 5.85135758651287 -2.10689037670404 A:G G A 10 0.531941598773897 0.365044702459487 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45502669_45503183:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45502669_45503183:TRAPPC10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 45506819 T/C 1 6 4 10 2.80835040735662 2.12776639509559 0.68058401226103 T:C T C 10 0.531941598773897 0.758887050232993 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45506683_45506841:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45506683_45506841:TRAPPC10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 45538647 T/C 1 11 9 20 5.14864241348713 4.78747438896507 0.36116802452206 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45538644_45538714:PWP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 45540919 A/G 1 23 11 34 10.7653432282004 5.85135758651287 4.9139856416875 A:C:G A G 10 0.531941598773897 0.120850315407806 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45540833_45540983:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45540833_45542238:PWP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 45544594 T/C 1 33 26 59 15.4459272404614 13.8304815681213 1.61544567234007 T:C T C 10 0.531941598773897 0.697549042901138 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45544461_45544608:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45544461_45546000:PWP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 45553596 T/C 1 31 26 57 14.5098104380092 13.8304815681213 0.67932886988787 T:C T C 10 0.531941598773897 0.895016616370849 ENSG00000160221:ENST00000291577:exon_45553487_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000495007:exon_45553498_45554036:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000427803:exon_45553500_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000493883:exon_45553521_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000480786:exon_45553556_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000348499:exon_45553562_45553720:C21orf33 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 45732116 C/T 1 57 66 123 26.6793288698879 35.1081455190772 -8.42881664918934 T:C C T 10 0.531941598773897 0.148002959397643 ENSG00000141959:ENST00000349048:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000397961:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000496824:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000466134:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000491298:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000403390:exon_45731988_45732177:PFKL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 45750248 G/A 1 5 5 10 2.34029200613052 2.65970799386948 -0.31941598773897 A:G G A 10 0.531941598773897 1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 45751822 G/A 1 28 24 52 13.1056352343309 12.7665983705735 0.339036863757354 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000160226:ENST00000339818:exon_45751726_45751897:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000380160:exon_45751726_45751897:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000325223:exon_45751726_45751897:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000397956:exon_45751726_45751897:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000496321:exon_45751726_45751897:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000462742:exon_45750346_45751897:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000470196:exon_45751731_45751851:C21orf2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 46330674 C/A 1 17 25 42 7.95699282084375 13.2985399693474 -5.34154714850367 A:C C A 10 0.531941598773897 0.121427303513723 ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46330640_46330741:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523663:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000522931:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000517563:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000522688:exon_46330515_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000520389:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000524251:exon_46330515_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000517819:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397846:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000521995:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000518033:exon_46330236_46330700:ITGB2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 46387078 G/T 1 9 4 13 4.21252561103493 2.12776639509559 2.08475921593934 T:G G T 10 0.531941598773897 0.279590414707516 ENSG00000160256:ENST00000291634:exon_46386949_46387096:C21orf70;ENSG00000160256:ENST00000397826:exon_46386949_46387096:C21orf70;ENSG00000160256:ENST00000458015:exon_46386949_46387096:C21orf70;ENSG00000160256:ENST00000479127:exon_46386949_46387096:C21orf70 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 46396659 G/C 1 24 23 47 11.2334016294265 12.2346567717996 -1.00125514237316 C:G G C 10 0.531941598773897 0.77245107664601 ENSG00000160256:ENST00000291634:exon_46396595_46396904:C21orf70;ENSG00000160256:ENST00000397826:exon_46396595_46396904:C21orf70;ENSG00000160256:ENST00000479127:exon_46396595_46396888:C21orf70;ENSG00000160256:ENST00000485207:exon_46396595_46396888:C21orf70 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 46951556 A/G 1 10 7 17 4.68058401226103 3.72359119141728 0.956992820843751 A:G A G 10 0.531941598773897 0.809031865435945 ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000477688:exon_46951332_46952062:SLC19A1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 47642609 G/A 0 16 0 16 7.48893441961765 0 7.48893441961765 G G 10 0.531941598773897 4.64046531196642e-05 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47642544_47642652:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47642577_47642652:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47642544_47642652:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47642577_47642652:LSS;ENSG00000160285:ENST00000464357:exon_47642544_47642652:LSS;ENSG00000160285:ENST00000450351:exon_47642544_47642652:LSS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 47777063 G/A 1 4 8 12 1.87223360490441 4.25553279019118 -2.38329918528676 A:G G A 10 0.531941598773897 0.247137734070613 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47776889_47777106:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000337772:exon_47776889_47777106:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47776889_47777106:PCNT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 47786817 C/G 1 1 7 8 0.468058401226103 3.72359119141728 -3.25553279019118 C:G C G 10 0.531941598773897 0.0296580964656471 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47786499_47787054:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47786499_47787054:PCNT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 47787002 T/C 0 0 8 8 0 4.25553279019118 -4.25553279019118 C T C 10 0.531941598773897 0.00230356440294974 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47786499_47787054:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47786499_47787054:PCNT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 47811272 C/T 1 6 4 10 2.80835040735662 2.12776639509559 0.68058401226103 T:C C T 10 0.531941598773897 0.758887050232993 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47811079_47811291:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47811079_47811291:PCNT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 47836653 C/T 0 0 9 9 0 4.78747438896507 -4.78747438896507 T C T 10 0.531941598773897 0.00107820267156602 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 47836654 G/A 0 9 0 9 4.21252561103493 0 4.21252561103493 G G 10 0.531941598773897 0.00448836920646731 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 47851796 G/A 1 15 13 28 7.02087601839154 6.91524078406066 0.105635234330883 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47851443_47851892:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000482575:exon_47851443_47851949:PCNT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 47852032 A/G 1 8 17 25 3.74446720980882 9.04300717915625 -5.29853996934743 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0436233643084444 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 47855876 A/G 1 12 9 21 5.61670081471324 4.78747438896507 0.829226425748162 A:G A G 10 0.531941598773897 0.828237202108702 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47855817_47856061:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47855817_47856061:PCNT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 21 47987547 C/T 1 3 6 9 1.40417520367831 3.19164959264338 -1.78747438896507 T:C C T 10 0.531941598773897 0.320650472569791 ENSG00000160305:ENST00000400274:exon_47987283_47989621:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000318711:exon_47987283_47988600:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000358985:exon_47987283_47988600:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000417564:exon_47987283_47989765:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000478105:exon_47987283_47989621:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000479654:exon_47987283_47989621:DIP2A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 17630486 C/A 1 19 16 35 8.89310962329596 8.51106558038235 0.382044042913604 A:C C A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000069998:ENST00000155674:exon_17630432_17630635:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000336737:exon_17630432_17630635:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000480451:exon_17630432_17630635:CECR5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 17690409 G/A 1 3 9 12 1.40417520367831 4.78747438896507 -3.38329918528676 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0789092376202323 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17690246_17690575:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17690246_17690779:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17690246_17690614:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000441548:exon_17690246_17690613:CECR1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 17690430 C/G 1 8 1 9 3.74446720980882 0.531941598773897 3.21252561103493 C:G C G 10 0.531941598773897 0.0425222470212816 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17690246_17690575:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17690246_17690779:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17690246_17690614:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000441548:exon_17690246_17690613:CECR1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 19124938 G/A 1 5 15 20 2.34029200613052 7.97912398160846 -5.63883197547794 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0131403353624642 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19124836_19124945:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19124836_19124945:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19124836_19124945:DGCR14 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 19423250 G/A 1 115 94 209 53.8267161410018 50.0025102847463 3.82420585625552 A:G G A 10 0.531941598773897 0.62778326361817 ENSG00000185608:ENST00000333130:exon_19423161_19423598:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000443660:exon_19423161_19423590:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000471259:exon_19423161_19423533:MRPL40 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 19808874 G/A 1 9 11 20 4.21252561103493 5.85135758651287 -1.63883197547794 A:G G A 10 0.531941598773897 0.507167926311403 ENSG00000185838:ENST00000329517:exon_19808751_19808898:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000403325:exon_19808751_19808898:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000405009:exon_19808751_19808898:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000451413:exon_19808751_19808882:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000453108:exon_19808751_19808898:GNB1L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 19882984 T/G 1 10 7 17 4.68058401226103 3.72359119141728 0.956992820843751 T:G T G 10 0.531941598773897 0.809031865435945 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000494454:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000474308:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000475995:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19882930_19883104:TXNRD2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 19907099 C/A 1 12 10 22 5.61670081471324 5.31941598773897 0.297284826974265 A:C C A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496729:exon_19907066_19907122:TXNRD2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 19950235 C/T 1 57 48 105 26.6793288698879 25.5331967411471 1.14613212874081 T:C C T 10 0.531941598773897 0.845487458875626 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19949756_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000467943:exon_19950050_19950399:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19950070_19950338:COMT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 19951271 G/A 1 87 81 168 40.721080906671 43.0872695006857 -2.36618859401469 A:G G A 10 0.531941598773897 0.757274373169054 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000428707:exon_19951222_19951282:COMT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 21073059 A/G 1 11 8 19 5.14864241348713 4.25553279019118 0.893109623295957 A:G A G 10 0.531941598773897 0.819320657489995 ENSG00000241973:ENST00000255882:exon_21072981_21073110:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000492581:exon_21072981_21073110:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000477245:exon_21072981_21073110:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000466772:exon_21072981_21073110:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000399213:exon_21072981_21073110:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000414196:exon_21072981_21073110:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000437178:exon_21072981_21073110:PI4KA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 21213380 C/T 1 24 26 50 11.2334016294265 13.8304815681213 -2.59707993869485 T:C C T 10 0.531941598773897 0.48144383909983 ENSG00000099940:ENST00000215730:exon_21213271_21213635:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000490458:exon_21213369_21213635:SNAP29 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 21213416 A/G 1 36 37 73 16.8501024441397 19.6818391546342 -2.83173671049448 A:G A G 10 0.531941598773897 0.558110638862312 ENSG00000241973:ENST00000449120:exon_21213411_21213705:PI4KA;ENSG00000099940:ENST00000215730:exon_21213271_21213635:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000490458:exon_21213369_21213635:SNAP29 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 21354970 C/G 1 46 28 74 21.5306864564007 14.8943647656691 6.63632169073162 C:G C G 10 0.531941598773897 0.130822556626383 ENSG00000184436:ENST00000498406:exon_21354936_21355076:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000215742:exon_21354936_21355076:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000471073:exon_21354936_21356084:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000438917:exon_21354936_21355019:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000399133:exon_21354936_21355076:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000476667:exon_21354936_21355700:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000466670:exon_21354936_21355700:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000488975:exon_21354936_21355018:THAP7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 22049783 C/T 1 13 12 25 6.08475921593934 6.38329918528676 -0.298539969347426 A:T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000100023:ENST00000412327:exon_22049687_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000335025:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000398831:exon_22049683_22050712:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000456792:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000417788:exon_22049683_22052201:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000406385:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000446951:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000462188:exon_22049226_22049785:PPIL2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 22330082 T/C 1 7 4 11 3.27640880858272 2.12776639509559 1.14864241348713 T:C T C 10 0.531941598773897 0.55795959209382 ENSG00000100038:ENST00000398789:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000357179:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457179:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000398793:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000444502:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000403680:exon_22330012_22330087:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000449517:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000450071:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000413067:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000424393:exon_22330012_22330116:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000437929:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000430142:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000489581:exon_22330012_22330168:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000456075:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000449704:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000442653:exon_22330012_22330341:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000437103:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000434517:exon_22330018_22330179:TOP3B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 23101523 G/A 0 66 0 66 30.8918544809228 0 30.8918544809228 G G 10 0.531941598773897 1.30171268355693e-18 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 23135466 T/A 1 47 1 48 21.9987448576268 0.531941598773897 21.4668032588529 A:T T A 10 0.531941598773897 3.22729463157845e-12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 23627369 A/G 1 9 7 16 4.21252561103493 3.72359119141728 0.488934419617648 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000290956:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000292697:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000334149:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000436011:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000487968:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000466076:exon_23627220_23627388:BCR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 24109550 T/C 1 7 6 13 3.27640880858272 3.19164959264338 0.0847592159393384 T:C T C 10 0.531941598773897 1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 24224655 G/A 1 11 5 16 5.14864241348713 2.65970799386948 2.48893441961765 A:G G A 10 0.531941598773897 0.316542725286372 ENSG00000133460:ENST00000345044:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398356:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398359:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000407566:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000467660:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405286:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000255830:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000489322:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405340:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000461809:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000316185:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398363:exon_24224646_24224733:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000472526:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000473357:exon_24222596_24224833:SLC2A11;ENSG00000251357:ENST00000447957:exon_24224646_24224833:AP000350.10;ENSG00000251357:ENST00000502845:exon_24224646_24224833:AP000350.10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 24224659 C/A 1 9 6 15 4.21252561103493 3.19164959264338 1.02087601839154 A:C C A 10 0.531941598773897 0.79696986700649 ENSG00000133460:ENST00000345044:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398356:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398359:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000407566:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000467660:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405286:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000255830:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000489322:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405340:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000461809:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000316185:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398363:exon_24224646_24224733:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000472526:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000473357:exon_24222596_24224833:SLC2A11;ENSG00000251357:ENST00000447957:exon_24224646_24224833:AP000350.10;ENSG00000251357:ENST00000502845:exon_24224646_24224833:AP000350.10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 24237221 C/G 1 15 24 39 7.02087601839154 12.7665983705735 -5.74572235218198 C:G C G 10 0.531941598773897 0.0772012295077207 ENSG00000240972:ENST00000465752:exon_24236959_24237414:MIF;ENSG00000218537:ENST00000406213:exon_24236613_24237719:AP000350.4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 24837301 T/C 1 20 23 43 9.36116802452206 12.2346567717996 -2.87348874727757 T:C T C 10 0.531941598773897 0.445428322775795 ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24836551_24838324:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000513294:exon_24836551_24838328:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000417596:exon_24836551_24837457:SPECC1L;ENSG00000128271:ENST00000444262:exon_24836551_24837313:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000337539:exon_24836551_24838328:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000491194:exon_24836551_24838289:ADORA2A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 24964128 T/C 1 356 289 645 166.628790836493 153.731122045656 12.8976687908364 A:T:C:G T C 10 0.531941598773897 0.323966095844854 ENSG00000100028:ENST00000215829:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000457691:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000402849:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000404603:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000458544:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000448916:exon_24963952_24964144:SNRPD3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 26830285 A/G 1 8 6 14 3.74446720980882 3.19164959264338 0.552817617165442 A:G A G 10 0.531941598773897 0.796438673256377 ENSG00000128203:ENST00000215906:exon_26829358_26830467:ASPHD2;ENSG00000128203:ENST00000382701:exon_26829358_26830467:ASPHD2;ENSG00000128203:ENST00000456021:exon_26829581_26830467:ASPHD2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 26860269 G/C 1 24 24 48 11.2334016294265 12.7665983705735 -1.53319674114706 T:C:G G C 10 0.531941598773897 0.667283691419537 ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000312736:exon_26860210_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000422379:exon_26860205_26860792:HPS4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 26937327 C/G 1 24 15 39 11.2334016294265 7.97912398160846 3.25427764781802 C:G C G 10 0.531941598773897 0.337551815433964 ENSG00000128294:ENST00000338754:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000528868:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000403880:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000398110:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000422943:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000455980:exon_26936755_26937601:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000446035:exon_26936755_26937600:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000442495:exon_26937172_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000454778:exon_26937237_26937684:TPST2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 29621128 C/G 1 3 7 10 1.40417520367831 3.72359119141728 -2.31941598773897 C:G C G 10 0.531941598773897 0.205442831458325 ENSG00000186998:ENST00000334018:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429226:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404755:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404820:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000426629:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429415:exon_29621128_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000448676:exon_29621128_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000435194:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000457925:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000484039:exon_29621122_29621205:EMID1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 29630337 G/A 1 11 5 16 5.14864241348713 2.65970799386948 2.48893441961765 A:G G A 10 0.531941598773897 0.316542725286372 ENSG00000186998:ENST00000334018:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404755:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404820:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000426629:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429415:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000448676:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000435194:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000457925:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000433143:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000487477:exon_29630294_29630338:EMID1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 29688538 T/C 1 125 112 237 58.5073001532629 59.5774590626765 -1.07015890941359 T:C T C 10 0.531941598773897 0.896597075983654 ENSG00000182944:ENST00000397938:exon_29688477_29688595:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000332050:exon_29688477_29688595:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000406548:exon_29688477_29688595:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000331029:exon_29688489_29688595:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000405024:exon_29688477_29688595:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000414183:exon_29688477_29688595:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000451900:exon_29688477_29688595:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000332035:exon_29688477_29688595:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000354516:exon_29688477_29688595:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000479135:exon_29688477_29688595:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000469669:exon_29688477_29688595:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000483629:exon_29688477_29688595:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000360091:exon_29688477_29688595:EWSR1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 29886413 A/G 1 9 1 10 4.21252561103493 0.531941598773897 3.68058401226103 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0240156507488693 ENSG00000100285:ENST00000310624:exon_29884838_29887379:NEFH;ENSG00000100285:ENST00000328842:exon_29886042_29886692:NEFH HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 29908072 C/T 1 14 16 30 6.55281761716544 8.51106558038235 -1.95824796321691 T:C C T 10 0.531941598773897 0.583880929092300 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29908010_29908125:THOC5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 29957570 G/A 1 34 53 87 15.9139856416875 28.1929047350165 -12.278919093329 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0096374544508826 ENSG00000184117:ENST00000216121:exon_29957495_29957635:NIPSNAP1;ENSG00000184117:ENST00000437094:exon_29957495_29957635:NIPSNAP1;ENSG00000184117:ENST00000415100:exon_29957495_29957635:NIPSNAP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 30163526 A/G 1 369 313 682 172.713550052432 166.49772041623 6.21582963620224 A:G A G 10 0.531941598773897 0.645324349552559 ENSG00000184076:ENST00000330029:exon_30163358_30163537:UQCR10;ENSG00000184076:ENST00000401406:exon_30163363_30163596:UQCR10;ENSG00000184076:ENST00000332801:exon_30163440_30163537:UQCR10;ENSG00000184076:ENST00000406782:exon_30163388_30163558:UQCR10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 30184950 A/G 1 96 102 198 44.9336065177059 54.2580430749375 -9.32443655723161 A:G A G 10 0.531941598773897 0.199898368193572 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30184597_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30184600_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30184605_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30184631_30185173:ASCC2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 30700607 T/G 1 6 15 21 2.80835040735662 7.97912398160846 -5.17077357425184 T:G T G 10 0.531941598773897 0.0281796668922795 ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30700520_30700640:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000393906:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000490449:exon_30700520_30700619:TBC1D10A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 30733111 C/A 1 22 21 43 10.2972848269743 11.1707735742518 -0.873488747277571 A:C C A 10 0.531941598773897 0.878828782939674 ENSG00000099995:ENST00000439242:exon_30733015_30733169:SF3A1;ENSG00000099995:ENST00000446990:exon_30733015_30733169:SF3A1;ENSG00000099995:ENST00000215793:exon_30733015_30733169:SF3A1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 31333631 T/C 1 9 16 25 4.21252561103493 8.51106558038235 -4.29853996934743 T:C T C 10 0.531941598773897 0.108104723692125 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31333570_31333698:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31333570_31333698:MORC2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 31342376 G/C 1 5 5 10 2.34029200613052 2.65970799386948 -0.31941598773897 C:G G C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31342328_31342436:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31342328_31342436:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000476152:exon_31342328_31342436:MORC2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 31679110 G/C 1 6 4 10 2.80835040735662 2.12776639509559 0.68058401226103 C:G G C 10 0.531941598773897 0.758887050232993 ENSG00000100100:ENST00000215912:exon_31677579_31679274:PIK3IP1;ENSG00000100100:ENST00000480654:exon_31677580_31679274:PIK3IP1;ENSG00000100100:ENST00000416925:exon_31677599_31679274:PIK3IP1;ENSG00000100100:ENST00000441972:exon_31677599_31679274:PIK3IP1;ENSG00000100100:ENST00000493034:exon_31677665_31679274:PIK3IP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 31741067 G/A 1 17 8 25 7.95699282084375 4.25553279019118 3.70146003065257 A:G G A 10 0.531941598773897 0.162573073903609 ENSG00000100105:ENST00000266269:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000405309:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000351933:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000440325:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000215919:exon_31740318_31741762:PATZ1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 31838085 G/A 1 17 26 43 7.95699282084375 13.8304815681213 -5.87348874727757 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0918411535891552 ENSG00000184708:ENST00000344710:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000495101:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397525:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000330125:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000382180:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397523:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000420671:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000445424:exon_31837789_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000475437:exon_31838021_31838104:EIF4ENIF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 32795641 C/T 1 37 34 71 17.3181608453658 18.0860143583125 -0.76785351294669 T:C C T 10 0.531941598773897 0.905552825768685 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000498434:exon_32795590_32795972:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000476619:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000485373:exon_32795590_32795746:C22orf28 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 32871383 T/G 1 19 8 27 8.89310962329596 4.25553279019118 4.63757683310478 T:G T G 10 0.531941598773897 0.0837468527196273 ENSG00000100225:ENST00000452138:exon_32871224_32871385:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32871224_32871385:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32871244_32871385:FBXO7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 32875190 G/A 1 54 56 110 25.2751536662096 29.7887295313382 -4.51357586512867 A:G G A 10 0.531941598773897 0.39179175808257 ENSG00000100225:ENST00000266087:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000437452:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000425028:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000492535:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000452138:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000444207:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000465418:exon_32874968_32875218:FBXO7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 32887150 C/T 1 59 55 114 27.6154456723401 29.2567879325643 -1.64134226022426 T:C C T 10 0.531941598773897 0.778837508234565 ENSG00000100225:ENST00000266087:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000420700:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000437452:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000425028:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000492535:exon_32883732_32889268:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32887073_32887168:FBXO7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 35742925 T/G 1 17 15 32 7.95699282084375 7.97912398160846 -0.0221311607647046 T:G T G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35742923_35742962:TOM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 35743124 G/C 1 24 17 41 11.2334016294265 9.04300717915625 2.19039445027022 A:C:G G C 10 0.531941598773897 0.534116506061887 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35743048_35743966:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35743048_35743952:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35743048_35743974:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35743048_35743976:TOM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 36623920 G/A 1 29 37 66 13.573693635557 19.6818391546342 -6.1081455190772 A:G G A 10 0.531941598773897 0.140008143968281 ENSG00000128335:ENST00000358502:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000249066:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000451256:exon_36623388_36624326:APOL2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 36907098 T/C 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000100353:ENST00000478547:exon_36906903_36907215:EIF3D HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 37334121 C/T 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 T:C C T 10 0.531941598773897 0.486426237614014 ENSG00000100368:ENST00000403662:exon_37333419_37336491:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000262825:exon_37333419_37336481:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000406230:exon_37333419_37334653:CSF2RB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 37524619 G/T 1 21 27 48 9.82922642574816 14.3624231668952 -4.53319674114706 T:G G T 10 0.531941598773897 0.196297306113487 ENSG00000100385:ENST00000216223:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000406505:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000445799:exon_37524065_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000431111:exon_37524133_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000483573:exon_37524562_37524888:IL2RB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 38164106 C/T 1 9 7 16 4.21252561103493 3.72359119141728 0.488934419617648 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38164081_38164183:NOL12;ENSG00000100106:ENST00000406386:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000344404:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000403663:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000421615:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000448466:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000443065:exon_38164081_38164183:TRIOBP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 38212762 A/G 1 17 16 33 7.95699282084375 8.51106558038235 -0.554072759538601 A:G A G 10 0.531941598773897 0.863259581534653 ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38212574_38212904:GCAT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 38273749 T/C 1 458 498 956 214.370747761555 264.906916189401 -50.5361684278455 A:T:C T C 10 0.531941598773897 0.00118051822898117 ENSG00000100129:ENST00000412331:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000262832:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000381683:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000433002:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000425539:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000477256:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000406934:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000482600:exon_38273681_38274178:EIF3L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 38323507 G/T 1 7 7 14 3.27640880858272 3.72359119141728 -0.447182382834558 T:G G T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000100139:ENST00000215957:exon_38323418_38323833:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000414653:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000454685:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000402631:exon_38323418_38323833:MICALL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 39069181 T/C 1 13 13 26 6.08475921593934 6.91524078406066 -0.830481568121323 T:C T C 10 0.531941598773897 0.844915066483025 ENSG00000100211:ENST00000396811:exon_39069164_39069851:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000216029:exon_39069164_39069859:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000489847:exon_39069164_39069418:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000454616:exon_39069164_39069849:CBY1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 39134715 T/C 1 43 43 86 20.1265112527224 22.8734887472776 -2.74697749455515 T:C T C 10 0.531941598773897 0.589701432945497 ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000455125:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000470642:exon_39134592_39134759:SUN2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 39440149 C/T 1 8 14 22 3.74446720980882 7.44718238283456 -3.70271517302573 T:C C T 10 0.531941598773897 0.135957589259186 ENSG00000128394:ENST00000381565:exon_39440088_39440428:APOBEC3F HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 39445554 G/A 1 6 5 11 2.80835040735662 2.65970799386948 0.148642413487133 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39445430_39445586:APOBEC3F;ENSG00000128394:ENST00000476513:exon_39445430_39445586:APOBEC3F HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 39448711 C/A 1 9 7 16 4.21252561103493 3.72359119141728 0.488934419617648 A:C C A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 39448750 T/C 1 9 9 18 4.21252561103493 4.78747438896507 -0.574948777930146 T:C T C 10 0.531941598773897 0.81714898933323 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 39477123 T/C 1 59 37 96 27.6154456723401 19.6818391546342 7.93360651770589 T:C T C 10 0.531941598773897 0.124606203500270 ENSG00000239713:ENST00000407997:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000480000:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000461827:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000486357:exon_39476938_39477199:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000494150:exon_39475667_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000481958:exon_39476640_39477232:APOBEC3G HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 39496336 G/T 1 20 15 35 9.36116802452206 7.97912398160846 1.3820440429136 T:G G T 10 0.531941598773897 0.735667946819423 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 39496412 G/C 1 51 24 75 23.8709784625313 12.7665983705735 11.1043800919577 C:G G C 10 0.531941598773897 0.0106920851608369 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 39497404 G/C 1 9 9 18 4.21252561103493 4.78747438896507 -0.574948777930146 C:G G C 10 0.531941598773897 0.81714898933323 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 39497452 A/G 0 10 0 10 4.68058401226103 0 4.68058401226103 A A 10 0.531941598773897 0.00231867125731154 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 39497454 G/C 1 11 2 13 5.14864241348713 1.06388319754779 4.08475921593934 C:G G C 10 0.531941598773897 0.0259151954441924 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 39498038 G/C 1 26 28 54 12.1695184318787 14.8943647656691 -2.72484633379044 A:C:G G C 10 0.531941598773897 0.496698864509127 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497923_39498053:APOBEC3H HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 39709009 G/A 1 4 7 11 1.87223360490441 3.72359119141728 -1.85135758651287 A:G G A 10 0.531941598773897 0.36707898879345 ENSG00000100316:ENST00000473638:exon_39708889_39709315:RPL3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 41610024 G/A 1 9 9 18 4.21252561103493 4.78747438896507 -0.574948777930146 A:G G A 10 0.531941598773897 0.81714898933323 ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000481902:exon_41609855_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000489136:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000413732:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000450939:exon_41609897_41610030:L3MBTL2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 41613188 C/T 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 T:C C T 10 0.531941598773897 0.486426237614014 ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000481902:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000413732:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41613127_41615540:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000449635:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000450939:exon_41613127_41613206:L3MBTL2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 41752747 G/A 1 8 14 22 3.74446720980882 7.44718238283456 -3.70271517302573 A:G G A 10 0.531941598773897 0.135957589259186 ENSG00000100403:ENST00000352645:exon_41752649_41752812:ZC3H7B;ENSG00000100403:ENST00000351589:exon_41752649_41752812:ZC3H7B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 41833116 C/T 1 9 2 11 4.21252561103493 1.06388319754779 3.14864241348713 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0713639747063953 ENSG00000183864:ENST00000327492:exon_41829496_41833411:TOB2;ENSG00000183864:ENST00000434408:exon_41833046_41833411:TOB2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 41903813 A/C 1 17 23 40 7.95699282084375 12.2346567717996 -4.27766395095588 A:C A C 10 0.531941598773897 0.205382479947629 ENSG00000100412:ENST00000216254:exon_41903795_41904053:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000396512:exon_41903795_41904053:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000471094:exon_41903795_41904053:ACO2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 42059768 G/T 1 387 296 683 181.138601274502 157.454713237074 23.6838880374283 A:T:G G T 10 0.531941598773897 0.0715351971400328 ENSG00000196419:ENST00000360079:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402580:exon_42059626_42060044:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000428575:exon_42059626_42060042:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000359308:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405878:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402409:exon_42059645_42060010:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405506:exon_42059626_42060038:XRCC6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 42073134 C/T 1 11 85 96 5.14864241348713 45.2150358957812 -40.0663934822941 T:C C T 10 0.531941598773897 1.12874460852661e-17 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 42076381 C/A 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 A:C C A 10 0.531941598773897 1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 42269966 C/T 1 77 61 138 36.0404968944099 32.4484375252077 3.59205936920221 A:T:C:G C T 10 0.531941598773897 0.55169266772872 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42269802_42270023:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42269802_42270023:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42269802_42270023:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42269802_42270023:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000462539:exon_42269693_42270023:SREBF2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 43032742 C/T 1 30 25 55 14.0417520367831 13.2985399693474 0.743212067435664 T:C C T 10 0.531941598773897 0.893001250241586 ENSG00000100243:ENST00000352397:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000396309:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000361740:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000396303:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000407623:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000414587:exon_43032721_43032825:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000407332:exon_43032721_43032896:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000402438:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000438270:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000466276:exon_43032721_43032852:CYB5R3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 43088971 C/T 1 7 19 26 3.27640880858272 10.106890376704 -6.83048156812132 T:C C T 10 0.531941598773897 0.00946161763159611 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 43089055 G/C 1 9 14 23 4.21252561103493 7.44718238283456 -3.23465677179963 C:G G C 10 0.531941598773897 0.211539426770348 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 43455531 C/T 1 6 7 13 2.80835040735662 3.72359119141728 -0.915240784060662 T:C C T 10 0.531941598773897 0.782547085779911 ENSG00000100271:ENST00000495814:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000343040:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000439248:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000266254:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000331018:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000443978:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000440761:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000438461:exon_43455390_43455533:TTLL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 43459846 G/A 1 5 5 10 2.34029200613052 2.65970799386948 -0.31941598773897 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000100271:ENST00000495814:exon_43459819_43459927:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000343040:exon_43459819_43459927:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000439248:exon_43459819_43459927:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000266254:exon_43459819_43459927:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000331018:exon_43459819_43459927:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000443978:exon_43459819_43459927:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000440761:exon_43459819_43459927:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000438461:exon_43459819_43459927:TTLL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 43529314 G/C 1 29 20 49 13.573693635557 10.6388319754779 2.93486166007905 T:C:G G C 10 0.531941598773897 0.474675065311661 ENSG00000100294:ENST00000327555:exon_43528886_43529492:MCAT;ENSG00000100294:ENST00000290429:exon_43528889_43529492:MCAT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 43576904 G/A 1 10 8 18 4.68058401226103 4.25553279019118 0.425051222069854 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43576748_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43576748_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000357017:exon_43576762_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43576748_43576946:TTLL12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 44368204 A/G 1 13 14 27 6.08475921593934 7.44718238283456 -1.36242316689522 A:G A G 10 0.531941598773897 0.700745604151725 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000493161:exon_44368116_44368222:SAMM50 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 44379822 T/C 1 42 27 69 19.6584528514963 14.3624231668952 5.29602968460111 T:C T C 10 0.531941598773897 0.228093809286911 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44379813_44379880:SAMM50 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 44379838 A/G 1 50 31 81 23.4029200613051 16.4901895619908 6.91273049931434 A:G A G 10 0.531941598773897 0.147416354836171 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44379813_44379880:SAMM50 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 44386281 C/T 1 95 100 195 44.4655481164798 53.1941598773897 -8.72861176090992 T:C C T 10 0.531941598773897 0.222718390480904 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000494795:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000465768:exon_44386208_44386286:SAMM50 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 44559755 C/T 1 148 135 283 69.2726433814632 71.8121158344761 -2.53947245301286 T:C C T 10 0.531941598773897 0.76619168894958 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44559738_44559810:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44559738_44559810:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44559738_44559810:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44559738_44559810:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44559738_44559810:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44559738_44559810:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000484345:exon_44559738_44559810:PARVB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 44586522 C/T 1 20 25 45 9.36116802452206 13.2985399693474 -3.93737194482537 T:C C T 10 0.531941598773897 0.295691926789102 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44586431_44586546:PARVG HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 44594584 C/G 1 57 52 109 26.6793288698879 27.6609631362426 -0.981634266354778 C:G C G 10 0.531941598773897 0.848536449179695 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000472551:exon_44594501_44594602:PARVG HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 44602229 A/C 1 143 131 274 66.9323513753327 69.6843494393805 -2.75199806404778 A:T:C A C 10 0.531941598773897 0.762276586619035 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44602197_44602535:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44602197_44602515:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44602197_44602308:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44602197_44603038:PARVG HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 47085924 G/A 1 4 7 11 1.87223360490441 3.72359119141728 -1.85135758651287 A:G G A 10 0.531941598773897 0.36707898879345 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47085889_47086097:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47085889_47086097:CERK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 47116905 G/A 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47116799_47116912:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47116799_47116912:CERK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50187853 C/T 1 8 2 10 3.74446720980882 1.06388319754779 2.68058401226103 T:C C T 10 0.531941598773897 0.116548632110931 ENSG00000100425:ENST00000404034:exon_50187682_50187942:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000216267:exon_50187682_50187942:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000404760:exon_50187682_50187942:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000438393:exon_50187682_50187942:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000342989:exon_50187682_50187942:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000457780:exon_50187682_50187942:BRD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50217387 G/A 1 9 4 13 4.21252561103493 2.12776639509559 2.08475921593934 A:G G A 10 0.531941598773897 0.279590414707516 ENSG00000100425:ENST00000404034:exon_50216599_50217979:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000216267:exon_50216599_50218452:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000404760:exon_50216599_50217979:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000342989:exon_50216599_50218452:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000457780:exon_50216599_50218452:BRD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50318061 G/C 1 35 46 81 16.3820440429136 24.4693135435993 -8.08726950068566 C:G G C 10 0.531941598773897 0.0754301223728273 ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50318008_50318103:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000457871:exon_50318008_50318103:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50318008_50318103:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50318008_50318103:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50318008_50318103:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000444954:exon_50318008_50318103:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000487969:exon_50316858_50319205:CRELD2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50356555 T/C 1 8 7 15 3.74446720980882 3.72359119141728 0.0208760183915446 T:C T C 10 0.531941598773897 1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50356693 T/C 1 118 99 217 55.2308913446802 52.6622182786158 2.56867306606435 T:C T C 10 0.531941598773897 0.73435862128744 ENSG00000198355:ENST00000360612:exon_50356588_50357728:PIM3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50635848 C/G 1 1 7 8 0.468058401226103 3.72359119141728 -3.25553279019118 C:G C G 10 0.531941598773897 0.0296580964656471 ENSG00000170638:ENST00000472677:exon_50635322_50636615:TRABD HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50637597 G/C 1 127 137 264 59.4434169557151 72.8759990320239 -13.4325820763088 C:G G C 10 0.531941598773897 0.108664644775310 ENSG00000170638:ENST00000380909:exon_50636774_50637993:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000303434:exon_50636774_50638027:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000463233:exon_50636774_50638024:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395827:exon_50636774_50637904:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395829:exon_50637545_50637998:TRABD HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50658698 T/A 1 8 18 26 3.74446720980882 9.57494877793015 -5.83048156812132 A:T T A 10 0.531941598773897 0.0290707701029405 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658621_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50658680_50658845:TUBGCP6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50682865 G/A 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 A:G G A 10 0.531941598773897 0.730998912113487 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50682148_50682993:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50682148_50683421:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50682148_50683400:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50682148_50683400:TUBGCP6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50684296 T/C 1 21 16 37 9.82922642574816 8.51106558038235 1.31816084536581 T:C T C 10 0.531941598773897 0.742914221594095 ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000477814:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000497952:exon_50684220_50684521:HDAC10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50687178 C/T 1 31 27 58 14.5098104380092 14.3624231668952 0.147387271113974 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000100429:ENST00000216271:exon_50687091_50687180:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000415993:exon_50687091_50687180:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000440393:exon_50687091_50687180:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000498366:exon_50687091_50687180:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000483222:exon_50687091_50687180:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000477814:exon_50687091_50687180:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000349505:exon_50687091_50687180:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000395791:exon_50687091_50687180:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000471375:exon_50687091_50687180:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000476310:exon_50687091_50687180:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000470378:exon_50687091_50687632:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000496909:exon_50687124_50687180:HDAC10;ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50687091_50687180:MAPK12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50687328 C/A 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 A:C C A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000100429:ENST00000477814:exon_50687260_50687637:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000471375:exon_50687260_50687469:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000476310:exon_50687260_50687504:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000470378:exon_50687091_50687632:HDAC10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50688348 A/G 1 22 30 52 10.2972848269743 15.9582479632169 -5.66096313624264 A:G A G 10 0.531941598773897 0.127173698980300 ENSG00000100429:ENST00000216271:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000415993:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000440393:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000429374:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000498366:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000483222:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000448072:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000349505:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000395791:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000496909:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000488270:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000489424:exon_50688288_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000470965:exon_50688297_50688393:HDAC10;ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50688289_50688393:MAPK12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50693889 G/A 1 39 32 71 18.254277647818 17.0221311607647 1.23214648705331 A:G G A 10 0.531941598773897 0.812671214883134 ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50693882_50693960:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50693882_50693960:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50693882_50693960:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50693882_50693960:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50693882_50693960:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50693882_50693960:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50693882_50693960:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000496942:exon_50693882_50693960:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000482969:exon_50693882_50693960:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000497738:exon_50693882_50693960:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50693882_50693960:MAPK12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50694297 A/G 1 26 13 39 12.1695184318787 6.91524078406066 5.25427764781802 A:G A G 10 0.531941598773897 0.108537631293608 ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000496942:exon_50694044_50694628:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000482969:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000497738:exon_50694239_50694582:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50694239_50694310:MAPK12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50695370 G/A 1 22 9 31 10.2972848269743 4.78747438896507 5.50981043800919 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0493436682659477 ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50695364_50695393:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50695364_50695393:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50695217_50695393:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50695217_50695393:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000496942:exon_50695028_50695536:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50695364_50695393:MAPK12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50704661 T/C 1 9 15 24 4.21252561103493 7.97912398160846 -3.76659837057353 T:C T C 10 0.531941598773897 0.152424127615418 ENSG00000185386:ENST00000330651:exon_50704655_50704734:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000395764:exon_50704655_50704734:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000417877:exon_50704655_50704734:MAPK11 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50716167 G/A 1 38 36 74 17.7862192465919 19.1498975558603 -1.36367830926838 A:G G A 10 0.531941598773897 0.816030344850575 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479818:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50716020_50716167:PLXNB2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50719251 A/G 1 25 33 58 11.7014600306526 17.5540727595386 -5.85261272888603 A:C:G A G 10 0.531941598773897 0.147425938129722 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50719173_50719402:PLXNB2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50720622 C/T 1 14 18 32 6.55281761716544 9.57494877793015 -3.0221311607647 T:C C T 10 0.531941598773897 0.294000108613194 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50720613_50720742:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50720613_50720742:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50720613_50720991:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50720613_50720742:PLXNB2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50721492 C/T 1 7 10 17 3.27640880858272 5.31941598773897 -2.04300717915625 T:C C T 10 0.531941598773897 0.341802442613557 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50721479_50721615:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50721479_50721615:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50721479_50721615:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50721479_50721615:PLXNB2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50722134 T/C 1 11 5 16 5.14864241348713 2.65970799386948 2.48893441961765 T:C T C 10 0.531941598773897 0.316542725286372 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000496720:exon_50722031_50722179:PLXNB2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50752150 C/T 1 51 42 93 23.8709784625313 22.3415471485037 1.52943131402758 T:C C T 10 0.531941598773897 0.835512552646175 ENSG00000205593:ENST00000413817:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000380836:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000495607:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000411673:exon_50752064_50752153:FAM116B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50876662 T/G 1 12 9 21 5.61670081471324 4.78747438896507 0.829226425748162 T:G T G 10 0.531941598773897 0.828237202108702 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50876603_50876727:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50876603_50876727:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50876603_50876727:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50876603_50876727:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50876603_50876727:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50876603_50876727:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50876603_50876727:PPP6R2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50882427 C/T 1 41 46 87 19.1903944502702 24.4693135435993 -5.27891909332904 T:C C T 10 0.531941598773897 0.283060625578302 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50882295_50882546:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50882295_50882546:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50882295_50882546:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50882295_50882546:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50882295_50882546:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50882295_50882546:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50882295_50882546:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000470046:exon_50881516_50882546:PPP6R2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50895020 C/T 1 10 15 25 4.68058401226103 7.97912398160846 -3.29853996934743 T:C C T 10 0.531941598773897 0.229796903542653 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000476293:exon_50895018_50895102:SBF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50898026 G/A 1 20 11 31 9.36116802452206 5.85135758651287 3.50981043800919 A:G G A 10 0.531941598773897 0.280029533205116 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50897899_50898095:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50897899_50898095:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50897899_50898095:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50897899_50898095:SBF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50901009 C/T 1 8 8 16 3.74446720980882 4.25553279019118 -0.511065580382352 T:C C T 10 0.531941598773897 0.80799969147761 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000356279:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50900988_50901146:SBF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50942121 C/T 1 39 34 73 18.254277647818 18.0860143583125 0.168263289505518 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50941380_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50941426_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50941690_50942128:LMF2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50943004 C/A 1 26 8 34 12.1695184318787 4.25553279019118 7.9139856416875 A:C C A 10 0.531941598773897 0.00889759731160049 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50942988_50943081:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50942769_50943156:LMF2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50943010 G/A 1 23 9 32 10.7653432282004 4.78747438896507 5.9778688392353 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0496101120203737 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50942988_50943081:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50942769_50943156:LMF2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50943232 G/A 1 35 13 48 16.3820440429136 6.91524078406066 9.46680325885294 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0059030843142625 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50943231_50943413:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50943231_50943413:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50943231_50943413:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50943231_50943413:LMF2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50944128 G/A 1 7 12 19 3.27640880858272 6.38329918528676 -3.10689037670404 A:G G A 10 0.531941598773897 0.172695126179914 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50944163 G/A 1 8 14 22 3.74446720980882 7.44718238283456 -3.70271517302573 A:G G A 10 0.531941598773897 0.135957589259186 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50945256 A/G 1 8 8 16 3.74446720980882 4.25553279019118 -0.511065580382352 A:C:G A G 10 0.531941598773897 0.80799969147761 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50945211_50945464:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50945211_50945464:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50945211_50945549:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50945224_50945464:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50945211_50945464:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000507607:exon_50945211_50945679:LMF2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50962208 T/G 1 99 114 213 46.3377817213842 60.6413422602243 -14.3035605388401 T:G T G 10 0.531941598773897 0.0543853587010816 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50962259 G/A 1 133 102 235 62.2517673630717 54.2580430749375 7.9937242881342 A:G G A 10 0.531941598773897 0.326849475270211 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50962782 C/G 1 69 46 115 32.2960296846011 24.4693135435993 7.82671614100185 C:G C G 10 0.531941598773897 0.160980223728289 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000439934:exon_50962431_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000423348:exon_50962431_50962853:SCO2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50969647 C/G 1 66 75 141 30.8918544809228 39.8956199080423 -9.00376542711948 C:G C G 10 0.531941598773897 0.129771667148981 ENSG00000177989:ENST00000468249:exon_50969620_50970251:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000401779:exon_50969620_50969724:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000403326:exon_50969620_50969724:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000456888:exon_50969620_50969724:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000438960:exon_50969620_50969770:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000424610:exon_50969620_50969724:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000329363:exon_50969620_50969724:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000405135:exon_50969620_50969770:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000428989:exon_50969620_50969724:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000463472:exon_50969620_50969852:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000469660:exon_50969620_50969724:ODF3B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50987287 A/G 1 4 9 13 1.87223360490441 4.78747438896507 -2.91524078406066 A:G A G 10 0.531941598773897 0.162564563323673 ENSG00000130487:ENST00000395676:exon_50986462_50989451:KLHDC7B;ENSG00000130487:ENST00000252783:exon_50986462_50988541:KLHDC7B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 50988062 G/T 1 4 7 11 1.87223360490441 3.72359119141728 -1.85135758651287 T:G G T 10 0.531941598773897 0.36707898879345 ENSG00000130487:ENST00000395676:exon_50986462_50989451:KLHDC7B;ENSG00000130487:ENST00000252783:exon_50986462_50988541:KLHDC7B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 51009953 C/T 1 14 22 36 6.55281761716544 11.7027151730257 -5.14989755586029 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0957634101996178 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000440709:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000497224:exon_51009587_51009968:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51009804_51009968:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51009804_51009962:CTA-384D8.32 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 51018579 A/G 1 6 9 15 2.80835040735662 4.78747438896507 -1.97912398160846 A:G A G 10 0.531941598773897 0.316481765113816 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 22 51064039 G/C 1 30 16 46 14.0417520367831 8.51106558038235 5.53068645640074 C:G G C 10 0.531941598773897 0.106496692628217 ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51064007_51064109:ARSA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 4842231 C/T 1 9 3 12 4.21252561103493 1.59582479632169 2.61670081471324 T:C C T 10 0.531941598773897 0.155839710778340 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000467545:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000493491:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000463980:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000490572:exon_4842109_4842284:ITPR1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 9412826 G/A 1 17 19 36 7.95699282084375 10.106890376704 -2.14989755586029 A:G G A 10 0.531941598773897 0.507116645066343 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9412744_9413220:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9412744_9413220:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9412744_9413220:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9412744_9413220:THUMPD3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 9798773 C/G 1 6 9 15 2.80835040735662 4.78747438896507 -1.97912398160846 C:G C G 10 0.531941598773897 0.316481765113816 ENSG00000114026:ENST00000302003:exon_9798728_9799091:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000344629:exon_9798745_9799197:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339542:exon_9798745_9799087:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339511:exon_9798451_9799061:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000425665:exon_9798451_9798888:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000383825:exon_9798451_9798875:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000416333:exon_9798728_9798875:OGG1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 9867625 C/T 1 22 7 29 10.2972848269743 3.72359119141728 6.57369363555699 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0152056818399152 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9867484_9867632:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000482269:exon_9867090_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000492440:exon_9867250_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000466245:exon_9867545_9867632:TTLL3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 9870857 G/A 1 24 19 43 11.2334016294265 10.106890376704 1.12651125272243 A:G G A 10 0.531941598773897 0.762055335482114 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9870644_9871079:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000431204:exon_9870644_9870936:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9870363_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000466245:exon_9870644_9871019:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9870847_9871079:TTLL3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 9871030 T/G 1 21 16 37 9.82922642574816 8.51106558038235 1.31816084536581 T:G T G 10 0.531941598773897 0.742914221594095 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9870644_9871079:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9870363_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9870847_9871079:TTLL3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 9934605 T/C 1 81 50 131 37.9127304993143 26.5970799386949 11.3156505606195 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0537893083595208 ENSG00000171135:ENST00000307768:exon_9934599_9936033:JAGN1;ENSG00000171135:ENST00000489724:exon_9934493_9934655:JAGN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 9990800 G/C 1 13 16 29 6.08475921593934 8.51106558038235 -2.42630636444301 C:G G C 10 0.531941598773897 0.457380459449149 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 9991101 C/G 1 22 24 46 10.2972848269743 12.7665983705735 -2.46931354359926 C:G C G 10 0.531941598773897 0.555014626360537 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 9991163 A/G 1 18 13 31 8.42505122206985 6.91524078406066 1.50981043800919 A:G A G 10 0.531941598773897 0.719547030730488 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 10067794 A/G 1 5 7 12 2.34029200613052 3.72359119141728 -1.38329918528676 A:G A G 10 0.531941598773897 0.56545794539378 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 10067797 T/C 1 5 7 12 2.34029200613052 3.72359119141728 -1.38329918528676 T:C T C 10 0.531941598773897 0.56545794539378 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 10115033 G/T 1 8 5 13 3.74446720980882 2.65970799386948 1.08475921593934 T:G G T 10 0.531941598773897 0.591209044900214 ENSG00000144554:ENST00000287647:exon_10114937_10115046:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10114937_10115046:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10114937_10115046:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10114937_10115046:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10114937_10115046:FANCD2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 10138069 T/G 1 7 10 17 3.27640880858272 5.31941598773897 -2.04300717915625 T:G T G 10 0.531941598773897 0.341802442613557 ENSG00000144554:ENST00000287647:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000470028:exon_10138010_10138156:FANCD2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 10142949 C/T 1 35 25 60 16.3820440429136 13.2985399693474 3.08350407356618 T:C C T 10 0.531941598773897 0.440872004600328 ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10142872_10143610:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000470028:exon_10142872_10142966:FANCD2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 10311939 C/T 1 11 12 23 5.14864241348713 6.38329918528676 -1.23465677179963 T:C C T 10 0.531941598773897 0.678419761183294 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10311815_10312699:TATDN2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 10312507 A/G 1 8 11 19 3.74446720980882 5.85135758651287 -2.10689037670404 A:G A G 10 0.531941598773897 0.365044702459487 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10311815_10312699:TATDN2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 11606490 G/A 1 8 10 18 3.74446720980882 5.31941598773897 -1.57494877793015 A:G G A 10 0.531941598773897 0.487247762768628 ENSG00000144560:ENST00000273038:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000413604:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000451674:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000424529:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000426568:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000430365:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000404339:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000445411:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000418000:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000458499:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000417206:exon_11606240_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000417466:exon_11606322_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000424709:exon_11606326_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000419541:exon_11606366_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000437722:exon_11606389_11606493:VGLL4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 11887991 C/G 1 13 9 22 6.08475921593934 4.78747438896507 1.29728482697427 C:G C G 10 0.531941598773897 0.6717023671041 ENSG00000144559:ENST00000273037:exon_11887976_11888393:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000455809:exon_11887976_11888246:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000457498:exon_11887976_11888355:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000444133:exon_11887976_11888253:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000411947:exon_11887976_11888366:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000417723:exon_11887976_11888359:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000494388:exon_11887976_11888338:C3orf31 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 12881757 C/T 1 26 22 48 12.1695184318787 11.7027151730257 0.466803258852943 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000144713:ENST00000396957:exon_12881641_12881840:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000435983:exon_12881641_12881852:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000396953:exon_12881641_12883028:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000457131:exon_12881641_12881840:RPL32 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 13361287 C/T 1 35 28 63 16.3820440429136 14.8943647656691 1.48767927724449 T:C C T 10 0.531941598773897 0.800915918937566 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13361263_13361479:NUP210 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 13361391 A/G 1 19 28 47 8.89310962329596 14.8943647656691 -6.00125514237316 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0815452421786333 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13361263_13361479:NUP210 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 13364876 G/T 1 25 15 40 11.7014600306526 7.97912398160846 3.72233604904412 T:G G T 10 0.531941598773897 0.269296966874486 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13364809_13364932:NUP210 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 13367406 C/T 1 17 18 35 7.95699282084375 9.57494877793015 -1.6179559570864 T:C C T 10 0.531941598773897 0.614499880300632 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13367295_13367431:NUP210 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 13368892 G/A 1 25 21 46 11.7014600306526 11.1707735742518 0.530686456400737 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13368717_13368937:NUP210 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 13379400 C/T 1 14 14 28 6.55281761716544 7.44718238283456 -0.894364765669117 T:C C T 10 0.531941598773897 0.850300347768159 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13379337_13379417:NUP210 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 13383315 G/C 1 20 12 32 9.36116802452206 6.38329918528676 2.9778688392353 C:G G C 10 0.531941598773897 0.376146745723152 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13383248_13383383:NUP210 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 13383540 A/G 1 15 13 28 7.02087601839154 6.91524078406066 0.105635234330883 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13383496_13383623:NUP210 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 13395579 C/A 1 3 6 9 1.40417520367831 3.19164959264338 -1.78747438896507 A:T:C C A 10 0.531941598773897 0.320650472569791 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13395415_13395607:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000479519:exon_13395415_13396194:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13395415_13395607:NUP210 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 13399786 G/A 1 9 10 19 4.21252561103493 5.31941598773897 -1.10689037670404 A:G G A 10 0.531941598773897 0.651315646573759 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13399722_13399895:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13399722_13399895:NUP210 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 13407556 T/C 1 5 10 15 2.34029200613052 5.31941598773897 -2.97912398160845 T:C T C 10 0.531941598773897 0.194220689888646 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13407446_13407591:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13407446_13407591:NUP210 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 14174427 A/T 1 6 7 13 2.80835040735662 3.72359119141728 -0.915240784060662 A:T A T 10 0.531941598773897 0.782547085779911 ENSG00000170876:ENST00000306077:exon_14174366_14174435:TMEM43 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 14175262 T/C 1 6 5 11 2.80835040735662 2.65970799386948 0.148642413487133 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000170876:ENST00000306077:exon_14175239_14175309:TMEM43 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 14187449 G/T 1 46 47 93 21.5306864564007 25.0012551423732 -3.47056868597242 T:G G T 10 0.531941598773897 0.533216264384609 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14186647_14187659:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14186650_14187659:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14187229_14187659:XPC HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 14199887 G/A 1 12 14 26 5.61670081471324 7.44718238283456 -1.83048156812132 A:G G A 10 0.531941598773897 0.556956605195833 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14199511_14200392:XPC HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 14712473 G/A 1 16 19 35 7.48893441961765 10.106890376704 -2.6179559570864 A:G G A 10 0.531941598773897 0.400816899235724 ENSG00000154781:ENST00000383794:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000303688:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000285042:exon_14712403_14712701:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000476763:exon_14712403_14712534:C3orf19 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 15719049 T/C 1 7 7 14 3.27640880858272 3.72359119141728 -0.447182382834558 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000206560:ENST00000399451:exon_15718987_15719069:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383777:exon_15718987_15719069:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383776:exon_15718987_15719069:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000412318:exon_15718987_15719069:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000497037:exon_15718987_15719069:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000479043:exon_15718987_15719113:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000451422:exon_15719043_15719069:ANKRD28 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 17053499 A/G 1 9 8 17 4.21252561103493 4.25553279019118 -0.0430071791562492 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000419842:exon_17051986_17053652:PLCL2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 20215872 G/A 1 6 4 10 2.80835040735662 2.12776639509559 0.68058401226103 A:G G A 10 0.531941598773897 0.758887050232993 ENSG00000129810:ENST00000263753:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000509679:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000522131:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000533388:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000421451:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000482867:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412997:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412868:exon_20215741_20216547:SGOL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 23848835 A/C 1 24 25 49 11.2334016294265 13.2985399693474 -2.06513833992095 A:C A C 10 0.531941598773897 0.569952387388795 ENSG00000170142:ENST00000306627:exon_23848728_23848912:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000484048:exon_23848728_23849379:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000346855:exon_23848728_23848912:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000495141:exon_23848728_23848912:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000481622:exon_23848728_23848912:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000442670:exon_23848580_23848912:UBE2E1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 23934772 G/A 1 7 13 20 3.27640880858272 6.91524078406066 -3.63883197547794 A:G G A 10 0.531941598773897 0.119222790648670 ENSG00000197885:ENST00000388759:exon_23933151_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000443659:exon_23933552_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000421515:exon_23933555_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000425478:exon_23933572_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000418853:exon_23933574_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000437230:exon_23933588_23934824:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000412028:exon_23933798_23934824:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000415901:exon_23933801_23934824:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000416026:exon_23934556_23934828:NKIRAS1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 33155782 G/A 1 3 7 10 1.40417520367831 3.72359119141728 -2.31941598773897 A:G G A 10 0.531941598773897 0.205442831458325 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33155471_33156040:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000423366:exon_33155531_33156040:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33155546_33156040:CRTAP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 33434831 G/A 1 15 9 24 7.02087601839154 4.78747438896507 2.23340162942647 A:G G A 10 0.531941598773897 0.417145388014034 ENSG00000153560:ENST00000283629:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000492136:exon_33429830_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000447368:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000466441:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000283628:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000486388:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000464787:exon_33434804_33434946:UBP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 33458266 T/C 1 5 5 10 2.34029200613052 2.65970799386948 -0.31941598773897 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000153560:ENST00000283629:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000447368:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000283628:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000481761:exon_33458250_33458312:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000418410:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000456378:exon_33458250_33458326:UBP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 39139776 G/A 1 6 8 14 2.80835040735662 4.25553279019118 -1.44718238283456 A:G G A 10 0.531941598773897 0.594012234271892 ENSG00000114745:ENST00000441302:exon_39138150_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000319283:exon_39138150_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000453680:exon_39138156_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000452389:exon_39138156_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000422110:exon_39138159_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000431601:exon_39138950_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000479927:exon_39139519_39139980:GORASP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 39185077 G/A 1 23 12 35 10.7653432282004 6.38329918528676 4.3820440429136 A:G G A 10 0.531941598773897 0.174979343497450 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 39186728 C/T 1 6 9 15 2.80835040735662 4.78747438896507 -1.97912398160846 T:C C T 10 0.531941598773897 0.316481765113816 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39186488_39186747:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39186488_39186747:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39186488_39186747:CSRNP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 39188182 C/T 1 3 6 9 1.40417520367831 3.19164959264338 -1.78747438896507 T:C C T 10 0.531941598773897 0.320650472569791 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39187969_39188213:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39187969_39188213:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39187969_39188218:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39188154_39188213:CSRNP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 39449137 T/C 1 27 15 42 12.6375768331048 7.97912398160846 4.65845285149633 T:C:G T C 10 0.531941598773897 0.165790542880097 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000477325:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000475346:exon_39449112_39449686:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000487876:exon_39449112_39449567:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39449094_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000444512:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39449111_39449277:RPSA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 39450065 C/T 1 10 9 19 4.68058401226103 4.78747438896507 -0.106890376704043 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000168028:ENST00000490490:exon_39449695_39450215:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000478027:exon_39450028_39450215:RPSA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 39453160 G/A 1 158 156 314 73.9532273937243 82.9828894087279 -9.02966201500365 A:G G A 10 0.531941598773897 0.309353641268000 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000478027:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000495394:exon_39451750_39453268:RPSA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 40498845 C/T 1 14 15 29 6.55281761716544 7.97912398160846 -1.42630636444301 T:C C T 10 0.531941598773897 0.710526726608856 ENSG00000188846:ENST00000338970:exon_40498783_40498854:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000465325:exon_40498794_40498854:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000396203:exon_40498831_40498965:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000416518:exon_40498845_40498965:RPL14 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 40558150 G/C 1 2 7 9 0.936116802452206 3.72359119141728 -2.78747438896507 C:G G C 10 0.531941598773897 0.0926560584503697 ENSG00000177842:ENST00000314529:exon_40557351_40560227:ZNF620;ENSG00000177842:ENST00000418905:exon_40557351_40559200:ZNF620 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 41996136 T/C 1 7 1 8 3.27640880858272 0.531941598773897 2.74446720980882 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0747852262017061 ENSG00000168038:ENST00000301831:exon_41996114_41996299:ULK4;ENSG00000168038:ENST00000420927:exon_41996114_41996299:ULK4;ENSG00000168038:ENST00000497684:exon_41996114_41996290:ULK4;ENSG00000168038:ENST00000453224:exon_41996114_41996299:ULK4;ENSG00000168038:ENST00000431379:exon_41996114_41996299:ULK4;ENSG00000168038:ENST00000414606:exon_41996114_41996299:ULK4;ENSG00000168038:ENST00000460978:exon_41996114_41996299:ULK4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 42251329 C/T 1 10 14 24 4.68058401226103 7.44718238283456 -2.76659837057353 T:C C T 10 0.531941598773897 0.30822661421643 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42251259_42254115:TRAK1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 42265166 T/C 1 20 19 39 9.36116802452206 10.106890376704 -0.745722352181984 T:C T C 10 0.531941598773897 0.873105151585132 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42264434_42267381:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42264434_42267260:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42264434_42267381:TRAK1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 42610374 A/G 1 12 13 25 5.61670081471324 6.91524078406066 -1.29853996934743 A:G A G 10 0.531941598773897 0.690089572307467 ENSG00000093183:ENST00000423701:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000273156:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000417572:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000449617:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000264454:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456515:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000493107:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000383750:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000450981:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000445388:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000454141:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000416880:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000420163:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456222:exon_42610357_42610565:SEC22C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 42679497 C/T 1 29 28 57 13.573693635557 14.8943647656691 -1.32067113011213 T:C C T 10 0.531941598773897 0.791099629473173 ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000468735:exon_42678360_42679718:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000465584:exon_42678360_42679711:NKTR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 42679777 T/G 1 37 29 66 17.3181608453658 15.426306364443 1.8918544809228 T:G T G 10 0.531941598773897 0.711822505039494 ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 44612050 C/T 1 2 6 8 0.936116802452206 3.19164959264338 -2.25553279019118 T:C C T 10 0.531941598773897 0.158093130392085 ENSG00000196345:ENST00000426540:exon_44611414_44612986:ZNF167;ENSG00000196345:ENST00000273320:exon_44611414_44613650:ZNF167;ENSG00000196345:ENST00000447279:exon_44611417_44612157:ZNF167 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 44884647 C/A 1 8 6 14 3.74446720980882 3.19164959264338 0.552817617165442 A:C C A 10 0.531941598773897 0.796438673256377 ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000422209:exon_44884615_44884726:KIF15 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 45052775 G/C 1 56 47 103 26.2112704686618 25.0012551423732 1.21001532628861 C:G G C 10 0.531941598773897 0.84388943632255 ENSG00000075914:ENST00000461361:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000265564:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000468667:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000491476:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000486727:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000459856:exon_45052725_45052885:EXOSC7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 45637439 T/C 1 9 8 17 4.21252561103493 4.25553279019118 -0.0430071791562492 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000144791:ENST00000440097:exon_45635816_45637779:LIMD1;ENSG00000144791:ENST00000273317:exon_45636351_45637779:LIMD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 46008087 G/A 1 6 2 8 2.80835040735662 1.06388319754779 1.74446720980882 A:G G A 10 0.531941598773897 0.297069782823554 ENSG00000163820:ENST00000296137:exon_46007769_46010195:FYCO1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 47043238 C/T 1 11 9 20 5.14864241348713 4.78747438896507 0.36116802452206 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000475689:exon_47043179_47043316:NBEAL2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 47045739 C/G 1 42 49 91 19.6584528514963 26.065138339921 -6.40668548842463 C:G C G 10 0.531941598773897 0.207294745674812 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000441027:exon_47045662_47045883:NBEAL2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 47049193 A/G 1 5 8 13 2.34029200613052 4.25553279019118 -1.91524078406066 A:G A G 10 0.531941598773897 0.405859977542485 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 47125385 G/A 1 26 30 56 12.1695184318787 15.9582479632169 -3.78872953133823 A:G G A 10 0.531941598773897 0.349290464119377 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000492397:exon_47125210_47125436:SETD2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 47162886 C/T 1 16 12 28 7.48893441961765 6.38329918528676 1.10563523433088 T:C C T 10 0.531941598773897 0.709170099536473 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47161672_47165277:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47161672_47165740:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47161672_47164616:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47161672_47166038:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47161672_47165025:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000412450:exon_47161973_47166038:SETD2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 47452583 C/T 1 11 13 24 5.14864241348713 6.91524078406066 -1.76659837057353 T:C C T 10 0.531941598773897 0.541790058951456 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 47452786 G/A 1 9 16 25 4.21252561103493 8.51106558038235 -4.29853996934743 A:G G A 10 0.531941598773897 0.108104723692125 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 47956424 C/T 1 54 55 109 25.2751536662096 29.2567879325643 -3.98163426635477 T:C C T 10 0.531941598773897 0.444758443999302 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47956307_47956429:MAP4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 47958037 G/T 1 60 37 97 28.0835040735662 19.6818391546342 8.40166491893199 T:G G T 10 0.531941598773897 0.103128503087647 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47957441_47958664:MAP4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 48309828 C/G 1 8 21 29 3.74446720980882 11.1707735742518 -7.42630636444301 C:G C G 10 0.531941598773897 0.00805332788523684 ENSG00000164048:ENST00000354698:exon_48309405_48312477:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000448461:exon_48309405_48312459:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000457782:exon_48309408_48312480:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000296437:exon_48309408_48310234:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000431517:exon_48309408_48310276:ZNF589 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 48727112 G/A 1 18 14 32 8.42505122206985 7.44718238283456 0.977868839235295 A:G G A 10 0.531941598773897 0.859785955880876 ENSG00000068745:ENST00000328631:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000395507:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000395509:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000479914:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000491686:exon_48727043_48727146:IP6K2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 49053219 A/G 1 191 153 344 89.3991546341857 81.3870646124062 8.01209002177941 A:C:G A G 10 0.531941598773897 0.417747251695573 ENSG00000178252:ENST00000395474:exon_49052258_49053386:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000354294:exon_49053187_49053261:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000315574:exon_49052258_49053386:WDR6;ENSG00000178149:ENST00000498794:exon_49052924_49054946:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000467457:exon_49052958_49053773:DALRD3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 49054692 T/C 1 17 11 28 7.95699282084375 5.85135758651287 2.10563523433088 T:C T C 10 0.531941598773897 0.455035720336675 ENSG00000178149:ENST00000441576:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000460505:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000341949:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000498498:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000498794:exon_49052924_49054946:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000440857:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000313778:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000395462:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000467457:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000484831:exon_49054661_49054946:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000420952:exon_49054661_49054789:DALRD3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 49135961 C/G 1 9 7 16 4.21252561103493 3.72359119141728 0.488934419617648 C:G C G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000172053:ENST00000494984:exon_49135786_49136125:QARS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 49153557 G/A 1 13 9 22 6.08475921593934 4.78747438896507 1.29728482697427 A:G G A 10 0.531941598773897 0.6717023671041 ENSG00000172046:ENST00000398896:exon_49153480_49153595:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398898:exon_49153480_49153595:USP19;ENSG00000172046:ENST00000417901:exon_49153480_49153595:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398909:exon_49153480_49153595:USP19;ENSG00000172046:ENST00000423450:exon_49153480_49153595:USP19;ENSG00000172046:ENST00000425298:exon_49153505_49153595:USP19;ENSG00000172046:ENST00000453664:exon_49153480_49153595:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398892:exon_49153480_49153595:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398888:exon_49153480_49153595:USP19;ENSG00000172046:ENST00000434032:exon_49153480_49153595:USP19;ENSG00000172046:ENST00000306026:exon_49153480_49153595:USP19;ENSG00000172046:ENST00000464931:exon_49153481_49153595:USP19 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 49463700 C/T 1 5 6 11 2.34029200613052 3.19164959264338 -0.851357586512867 T:C C T 10 0.531941598773897 0.764860318695721 ENSG00000145029:ENST00000273598:exon_49463685_49463861:NICN1;ENSG00000145029:ENST00000421969:exon_49463685_49463861:NICN1;ENSG00000145029:ENST00000430622:exon_49463685_49463861:NICN1;ENSG00000145029:ENST00000423832:exon_49463685_49463861:NICN1;ENSG00000145029:ENST00000497742:exon_49463685_49463855:NICN1;ENSG00000145029:ENST00000436744:exon_49463685_49463861:NICN1;ENSG00000145029:ENST00000422593:exon_49463685_49463861:NICN1;ENSG00000145029:ENST00000494057:exon_49463685_49463861:NICN1;ENSG00000145029:ENST00000461015:exon_49463685_49463840:NICN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 49760477 G/A 1 22 12 34 10.2972848269743 6.38329918528676 3.9139856416875 A:G G A 10 0.531941598773897 0.228791510325275 ENSG00000173540:ENST00000480687:exon_49760405_49760547:GMPPB;ENSG00000173540:ENST00000308375:exon_49760405_49760547:GMPPB;ENSG00000173540:ENST00000308388:exon_49760405_49760547:GMPPB;ENSG00000173540:ENST00000481959:exon_49760165_49760547:GMPPB;ENSG00000173540:ENST00000495627:exon_49760425_49760735:GMPPB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 50609624 T/G 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 T:G T G 10 0.531941598773897 0.730998912113487 ENSG00000114735:ENST00000434410:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000232854:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000448997:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000455834:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000424388:exon_50609546_50609639:HEMK1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 51970296 T/G 1 57 38 95 26.6793288698879 20.2137807534081 6.46554811647978 T:G T G 10 0.531941598773897 0.217126905744452 ENSG00000114767:ENST00000232888:exon_51970273_51970365:RRP9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 52237970 C/T 1 47 39 86 21.9987448576268 20.745722352182 1.25302250544486 T:C C T 10 0.531941598773897 0.829362570864952 ENSG00000023330:ENST00000469224:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000394965:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000441729:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000442476:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000310271:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000484952:exon_52237879_52238028:ALAS1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 52256697 C/T 1 23 24 47 10.7653432282004 12.7665983705735 -2.00125514237316 T:C C T 10 0.531941598773897 0.562904715352254 ENSG00000239732:ENST00000360658:exon_52255096_52258328:TLR9;ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52255097_52258328:RP11-330H6.5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 52263967 G/A 1 44 51 95 20.5945696539485 27.1290215374687 -6.53445188352022 A:G G A 10 0.531941598773897 0.182969691046264 ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52263936_52264086:RP11-330H6.5;ENSG00000247596:ENST00000305533:exon_52263936_52264086:TWF2;ENSG00000247596:ENST00000499914:exon_52263936_52264086:TWF2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 52643685 T/C 1 6 6 12 2.80835040735662 3.19164959264338 -0.383299185286765 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000163939:ENST00000356770:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000394830:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296302:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000337303:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000412587:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409057:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000410007:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296303:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409114:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409767:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000423351:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000446103:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000480064:exon_52643102_52643971:PBRM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 52720080 A/C 1 10 18 28 4.68058401226103 9.57494877793015 -4.89436476566912 A:C A C 10 0.531941598773897 0.0867299445035572 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468146:exon_52720021_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52720032_52720218:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468885:exon_52720046_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000462550:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000492349:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52720065_52720121:GNL3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 52721305 G/A 1 93 105 198 43.5294313140276 55.8538678712592 -12.3244365572316 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0872716990707846 ENSG00000163938:ENST00000479230:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468146:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000462550:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000492349:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000474423:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000460073:exon_52721262_52721399:GNL3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 52727257 G/A 1 149 129 278 69.7407017826893 68.6204662418327 1.12023554085663 A:G G A 10 0.531941598773897 0.904470613708395 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000497356:exon_52727186_52727560:GNL3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 53213657 T/C 1 22 19 41 10.2972848269743 10.106890376704 0.190394450270222 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000163932:ENST00000478843:exon_53213593_53213710:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53213593_53213792:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53213593_53213792:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000487897:exon_53213593_53213792:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000464818:exon_53213593_53213792:PRKCD HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 53220215 G/A 1 80 71 151 37.4446720980882 37.7678535129467 -0.323181414858446 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53220183_53220356:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53220183_53220356:PRKCD HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 53222761 C/T 1 49 46 95 22.934861660079 24.4693135435993 -1.53445188352022 T:C C T 10 0.531941598773897 0.758873886083059 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53222736_53222874:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53222736_53222874:PRKCD HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 53259850 C/T 1 225 204 429 105.313140275873 108.516086149875 -3.20294587400183 T:C:G C T 10 0.531941598773897 0.771717690728374 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53258723_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53259767_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53259655_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53259668_53262165:TKT;ENSG00000163931:ENST00000461139:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53259675_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53259718_53259947:TKT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 53264485 A/G 1 252 235 487 117.950717108978 125.006275711866 -7.05555860288784 A:G A G 10 0.531941598773897 0.52531026513703 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000461139:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53264473_53264637:TKT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 53269046 T/C 1 128 120 248 59.9114753569412 63.8329918528676 -3.92151649592646 T:C:G T C 10 0.531941598773897 0.65611493607312 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53268999_53269080:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53268999_53269209:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53268999_53269132:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000472528:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000466765:exon_53268999_53269176:TKT;ENSG00000163931:ENST00000487660:exon_53268868_53269190:TKT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 53269163 G/A 1 87 67 154 40.721080906671 35.6400871178511 5.08099378881986 A:G G A 10 0.531941598773897 0.4206719493922 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53268999_53269209:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000472528:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000466765:exon_53268999_53269176:TKT;ENSG00000163931:ENST00000487660:exon_53268868_53269190:TKT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 53857803 A/C 1 9 2 11 4.21252561103493 1.06388319754779 3.14864241348713 A:C A C 10 0.531941598773897 0.0713639747063953 ENSG00000016391:ENST00000315251:exon_53857333_53858094:CHDH;ENSG00000016391:ENST00000481668:exon_53857571_53858094:CHDH;ENSG00000016391:ENST00000467802:exon_53857658_53858094:CHDH HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 53899276 C/T 1 23 12 35 10.7653432282004 6.38329918528676 4.3820440429136 T:C C T 10 0.531941598773897 0.174979343497450 ENSG00000056736:ENST00000288167:exon_53898773_53899827:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000475124:exon_53898773_53899615:IL17RB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 53905308 T/C 1 37 31 68 17.3181608453658 16.4901895619908 0.827971283375003 T:C T C 10 0.531941598773897 0.903516111850388 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000486794:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000495993:exon_53905185_53905523:ACTR8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 53906513 G/A 1 7 13 20 3.27640880858272 6.91524078406066 -3.63883197547794 A:G G A 10 0.531941598773897 0.119222790648670 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000486794:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000495993:exon_53906411_53906551:ACTR8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 53925849 C/T 1 25 24 49 11.7014600306526 12.7665983705735 -1.06513833992095 T:C C T 10 0.531941598773897 0.776433754395787 ENSG00000113811:ENST00000495461:exon_53925797_53926015:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000488746:exon_53925797_53925892:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000487571:exon_53925797_53925882:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000485414:exon_53925797_53925912:RP11-884K10.5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 56628031 G/A 1 9 5 14 4.21252561103493 2.65970799386948 1.55281761716544 A:G G A 10 0.531941598773897 0.437286823633092 ENSG00000180376:ENST00000436465:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000422222:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000394672:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000326595:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000471681:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000341455:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000484623:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000468108:exon_56627972_56628056:CCDC66 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 56667682 G/C 1 5 10 15 2.34029200613052 5.31941598773897 -2.97912398160845 C:G G C 10 0.531941598773897 0.194220689888646 ENSG00000163946:ENST00000459993:exon_56667072_56668000:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000431842:exon_56667072_56667871:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000493960:exon_56667072_56667994:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000355628:exon_56667072_56667871:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000447900:exon_56667072_56667994:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000296313:exon_56667072_56667871:C3orf63 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 56763316 G/A 1 10 4 14 4.68058401226103 2.12776639509559 2.55281761716544 A:G G A 10 0.531941598773897 0.191981298637752 ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56761449_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56762260_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56763015_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56763049_56763650:ARHGEF3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 56763328 T/C 1 10 4 14 4.68058401226103 2.12776639509559 2.55281761716544 T:C T C 10 0.531941598773897 0.191981298637752 ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56761449_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56762260_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56763015_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56763049_56763650:ARHGEF3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 58097556 T/G 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 T:G T G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58097518_58097608:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58097518_58097608:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58097518_58097608:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58097518_58097608:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58097518_58097608:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58097518_58097608:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58097518_58097608:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58097518_58097608:FLNB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 58109162 G/A 1 10 7 17 4.68058401226103 3.72359119141728 0.956992820843751 A:G G A 10 0.531941598773897 0.809031865435945 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58108820_58109417:FLNB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 58112488 C/T 1 10 4 14 4.68058401226103 2.12776639509559 2.55281761716544 T:C C T 10 0.531941598773897 0.191981298637752 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58112329_58112489:FLNB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 58118555 G/A 1 7 2 9 3.27640880858272 1.06388319754779 2.21252561103493 A:G G A 10 0.531941598773897 0.187705653333192 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58117805_58118658:FLNB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 58118558 G/A 1 2 7 9 0.936116802452206 3.72359119141728 -2.78747438896507 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0926560584503697 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58117805_58118658:FLNB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 58154327 C/T 1 30 11 41 14.0417520367831 5.85135758651287 8.19039445027022 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0116484915925301 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58154167_58155520:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000484981:exon_58154167_58154385:FLNB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 66419942 A/G 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 A:G A G 10 0.531941598773897 0.486426237614014 ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66419902_66419966:SLC25A26 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 66431943 C/T 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 T:C C T 10 0.531941598773897 0.730998912113487 ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66431903_66432055:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66431903_66432055:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66431903_66432055:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66431903_66432055:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66431903_66432055:LRIG1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 69096614 G/A 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000144747:ENST00000398559:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000356248:exon_69096500_69097284:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000488010:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000438636:exon_69096509_69097713:TMF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 69151152 C/A 1 25 17 42 11.7014600306526 9.04300717915625 2.65845285149632 A:C C A 10 0.531941598773897 0.442766555360741 ENSG00000144746:ENST00000273258:exon_69150990_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000435015:exon_69151060_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000412089:exon_69151110_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000484921:exon_69150990_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000470936:exon_69150990_69151381:ARL6IP5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 72799703 C/T 1 15 22 37 7.02087601839154 11.7027151730257 -4.68183915463419 T:C C T 10 0.531941598773897 0.139160753543391 ENSG00000144736:ENST00000468371:exon_72798428_72799987:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000325599:exon_72798430_72799987:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000444040:exon_72798430_72799987:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000463369:exon_72799110_72799987:SHQ1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 87276699 C/T 1 19 20 39 8.89310962329596 10.6388319754779 -1.74572235218198 T:C C T 10 0.531941598773897 0.631703049540363 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87276421_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87276435_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000494980:exon_87276452_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87276459_87276706:CHMP2B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 87299075 A/C 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 A:C A C 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000494980:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87299025_87299127:CHMP2B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 88199179 T/C 1 10 8 18 4.68058401226103 4.25553279019118 0.425051222069854 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000179021:ENST00000318887:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000383697:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000486971:exon_88199137_88199335:C3orf38 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 88199298 T/C 1 9 7 16 4.21252561103493 3.72359119141728 0.488934419617648 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000179021:ENST00000318887:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000383697:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000486971:exon_88199137_88199335:C3orf38 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 97664725 C/T 1 4 6 10 1.87223360490441 3.19164959264338 -1.31941598773897 T:C C T 10 0.531941598773897 0.530535902085358 ENSG00000170854:ENST00000442492:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000333396:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000394198:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000506682:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000360258:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503517:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503097:exon_97664182_97664731:MINA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 98250862 C/A 1 71 37 108 33.2321464870533 19.6818391546342 13.5503073324191 A:T:C C A 10 0.531941598773897 0.0091323516716502 ENSG00000154165:ENST00000284311:exon_98250855_98251994:GPR15 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 98304467 T/C 1 15 12 27 7.02087601839154 6.38329918528676 0.63757683310478 T:C T C 10 0.531941598773897 0.8492386336171 ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98304285_98304503:CPOX;ENSG00000080819:ENST00000510489:exon_98304285_98304706:CPOX HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 101283792 C/G 1 40 31 71 18.7223360490441 16.4901895619908 2.23214648705331 C:G C G 10 0.531941598773897 0.635449714720201 ENSG00000174173:ENST00000309922:exon_101283614_101285290:RG9MTD1;ENSG00000174173:ENST00000495642:exon_101283614_101284561:RG9MTD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 105266331 A/G 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 A:G A G 10 0.531941598773897 0.486426237614014 ENSG00000170017:ENST00000389926:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000389927:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000306107:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000472644:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000486979:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000465413:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000491388:exon_105266234_105266371:ALCAM HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 107881382 T/C 1 15 12 27 7.02087601839154 6.38329918528676 0.63757683310478 T:C T C 10 0.531941598773897 0.8492386336171 ENSG00000114446:ENST00000264538:exon_107879659_107881502:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000457963:exon_107881118_107881502:IFT57 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 112724713 C/T 1 34 22 56 15.9139856416875 11.7027151730257 4.21127046866177 T:C C T 10 0.531941598773897 0.285603024139518 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112721287_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000412848:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112723764_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112723764_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112723801_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112723811_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112724023_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112724090_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112724090_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112724169_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112724328_112724851:C3orf17 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 119150836 C/T 1 19 13 32 8.89310962329596 6.91524078406066 1.97786883923529 T:C C T 10 0.531941598773897 0.595907192228062 ENSG00000176142:ENST00000438581:exon_119148347_119151061:TMEM39A;ENSG00000176142:ENST00000319172:exon_119148347_119151061:TMEM39A;ENSG00000176142:ENST00000473684:exon_119148347_119151061:TMEM39A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 119222456 G/C 1 7 13 20 3.27640880858272 6.91524078406066 -3.63883197547794 C:G G C 10 0.531941598773897 0.119222790648670 ENSG00000113845:ENST00000494664:exon_119222379_119222467:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000264244:exon_119222379_119222467:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000492164:exon_119222379_119222467:C3orf1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 119263680 C/T 1 41 44 85 19.1903944502702 23.4054303460515 -4.21503589578125 T:C C T 10 0.531941598773897 0.385448616122259 ENSG00000121594:ENST00000264246:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000383669:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000383668:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000478182:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000463729:exon_119263190_119263714:CD80 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 119305169 G/A 1 6 9 15 2.80835040735662 4.78747438896507 -1.97912398160846 A:G G A 10 0.531941598773897 0.316481765113816 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000481816:exon_119305132_119305210:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000471850:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000485496:exon_119305132_119305386:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119305132_119305492:ADPRH HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 121351338 C/T 1 161 141 302 75.3574025974026 75.0037654271195 0.353637170283108 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121351253_121351410:HCLS1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 121353254 T/C 1 156 162 318 73.0171105912721 86.1745390013713 -13.1574284100992 T:C T C 10 0.531941598773897 0.144177782366051 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121353054_121353265:HCLS1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 121363680 C/T 1 126 101 227 58.975358554489 53.7261014761636 5.24925707832538 T:C:G C T 10 0.531941598773897 0.506373779333343 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121363665_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121363665_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121363665_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121363665_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000464274:exon_121363665_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000487290:exon_121363665_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000481314:exon_121363077_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000497391:exon_121363665_121363775:HCLS1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 121413637 G/A 1 30 30 60 14.0417520367831 15.9582479632169 -1.91649592643382 A:G G A 10 0.531941598773897 0.69831696377399 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 121415610 G/A 1 12 11 23 5.61670081471324 5.85135758651287 -0.234656771799632 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 121500699 C/T 1 37 24 61 17.3181608453658 12.7665983705735 4.55156247479228 T:C C T 10 0.531941598773897 0.251382336622539 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121500590_121500721:IQCB1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 121507231 A/T 1 26 34 60 12.1695184318787 18.0860143583125 -5.91649592643382 A:T A T 10 0.531941598773897 0.154214698393233 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121507131_121507279:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121507131_121507279:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121507131_121507279:IQCB1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 122274757 G/C 1 17 25 42 7.95699282084375 13.2985399693474 -5.34154714850367 C:G G C 10 0.531941598773897 0.121427303513723 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000466126:exon_122274711_122274968:PARP9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 122418750 G/A 1 6 8 14 2.80835040735662 4.25553279019118 -1.44718238283456 A:G G A 10 0.531941598773897 0.594012234271892 ENSG00000173193:ENST00000474629:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000398162:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000310290:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000460683:exon_122418237_122420482:PARP14 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 122419083 C/A 1 11 3 14 5.14864241348713 1.59582479632169 3.55281761716544 A:C C A 10 0.531941598773897 0.0643826376341994 ENSG00000173193:ENST00000474629:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000398162:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000310290:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000460683:exon_122418237_122420482:PARP14 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 122446642 C/T 1 11 15 26 5.14864241348713 7.97912398160846 -2.83048156812132 T:C C T 10 0.531941598773897 0.326715412920753 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 122459477 A/G 1 21 17 38 9.82922642574816 9.04300717915625 0.786219246591912 A:G A G 10 0.531941598773897 0.871549817766073 ENSG00000169087:ENST00000383659:exon_122458846_122459722:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000471534:exon_122458850_122459722:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000306103:exon_122458850_122459722:HSPBAP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 123634046 G/A 1 14 19 33 6.55281761716544 10.106890376704 -3.5540727595386 A:G G A 10 0.531941598773897 0.226687187410749 ENSG00000175455:ENST00000310351:exon_123632300_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000485727:exon_123632564_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409657:exon_123632572_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000489746:exon_123632574_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000433542:exon_123633166_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409697:exon_123633469_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000488653:exon_123633469_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000483247:exon_123633509_123634136:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000419247:exon_123634046_123634136:CCDC14 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 124456742 G/C 1 39 26 65 18.254277647818 13.8304815681213 4.42379607969669 C:G G C 10 0.531941598773897 0.320223327464117 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124456415_124457290:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000498715:exon_124456415_124457218:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124456639_124457086:UMPS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 124462808 C/T 1 38 32 70 17.7862192465919 17.0221311607647 0.764088085827208 T:C C T 10 0.531941598773897 0.904972290269033 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124462762_124464040:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000474588:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124462762_124463138:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000495751:exon_124462762_124462917:UMPS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 124731689 T/A 1 7 2 9 3.27640880858272 1.06388319754779 2.21252561103493 A:T T A 10 0.531941598773897 0.187705653333192 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124731467_124732834:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124731384_124732834:HEG1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 124738107 C/T 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 T:C C T 10 0.531941598773897 0.486426237614014 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124738106_124738441:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124738106_124738441:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000477536:exon_124738106_124738340:HEG1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 124802677 A/G 1 129 98 227 60.3795337581673 52.1302766798419 8.24925707832538 A:T:G A G 10 0.531941598773897 0.287555797149071 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 124802881 A/G 1 102 56 158 47.7419569250625 29.7887295313382 17.9532273937243 A:C:G A G 10 0.531941598773897 0.00407660095971074 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124802734_124802893:SLC12A8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 124802888 C/T 1 105 68 173 49.1461321287408 36.172028716625 12.9741034121158 T:C C T 10 0.531941598773897 0.056514741379667 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124802734_124802893:SLC12A8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 124826408 T/C 1 48 46 94 22.4668032588529 24.4693135435993 -2.00251028474632 T:C T C 10 0.531941598773897 0.680926041183793 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124826325_124826615:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124826325_124826475:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124826321_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000461616:exon_124826325_124826421:SLC12A8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 124951821 C/T 1 12 9 21 5.61670081471324 4.78747438896507 0.829226425748162 T:C C T 10 0.531941598773897 0.828237202108702 ENSG00000163848:ENST00000360647:exon_124944405_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000484491:exon_124950920_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000492394:exon_124950923_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000485866:exon_124951172_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000497929:exon_124951185_124952783:ZNF148 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 125726048 G/C 1 18 16 34 8.42505122206985 8.51106558038235 -0.0860143583124984 C:G G C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000114544:ENST00000360370:exon_125725198_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000346785:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000383598:exon_125725201_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000512557:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000506102:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000458524:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315891:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000508835:exon_125725699_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315921:exon_125725916_125726068:SLC41A3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 127394820 C/T 1 6 2 8 2.80835040735662 1.06388319754779 1.74446720980882 T:C C T 10 0.531941598773897 0.297069782823554 ENSG00000114626:ENST00000483857:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000361019:exon_127394813_127394903:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000393363:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000232744:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000475265:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000493365:exon_127394813_127395278:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000453791:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000475042:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000479280:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000467179:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000468137:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000464431:exon_127394329_127395274:ABTB1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 128356852 C/T 1 85 80 165 39.7849641042188 42.5553279019118 -2.77036379769301 A:T:C C T 10 0.531941598773897 0.696763441859533 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000495462:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000479113:exon_128356663_128356948:RPN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 133524717 G/C 1 12 12 24 5.61670081471324 6.38329918528676 -0.766598370573529 C:G G C 10 0.531941598773897 0.83900902365855 ENSG00000144867:ENST00000466490:exon_133524520_133524846:SRPRB;ENSG00000144867:ENST00000484684:exon_133524459_133524846:SRPRB;ENSG00000144867:ENST00000273406:exon_133524665_133524846:SRPRB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 134225969 T/C 1 7 14 21 3.27640880858272 7.44718238283456 -4.17077357425184 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0809103045789491 ENSG00000182923:ENST00000332047:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000354446:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000511574:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000413794:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000438820:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000337090:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000383229:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000504013:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000512894:exon_134225951_134226095:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000513612:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000427599:exon_134225951_134226128:CEP63 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 148704081 G/A 0 12 0 12 5.61670081471324 0 5.61670081471324 G G 10 0.531941598773897 0.000623856131489939 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 148727133 G/A 1 7 5 12 3.27640880858272 2.65970799386948 0.616700814713236 A:G G A 10 0.531941598773897 0.779881793407808 ENSG00000163754:ENST00000345003:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000296048:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000353986:exon_148727063_148727187:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000484197:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000461191:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000497528:exon_148727063_148727176:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000479119:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000469873:exon_148726668_148727189:GYG1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 148759325 T/C 1 11 5 16 5.14864241348713 2.65970799386948 2.48893441961765 T:C T C 10 0.531941598773897 0.316542725286372 ENSG00000071794:ENST00000465259:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000310053:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392912:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000494055:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000467858:exon_148759277_148759467:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000471807:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000497427:exon_148759277_148759831:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000483382:exon_148759288_148759455:HLTF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 148881673 C/T 1 3 7 10 1.40417520367831 3.72359119141728 -2.31941598773897 T:C C T 10 0.531941598773897 0.205442831458325 ENSG00000163755:ENST00000296051:exon_148881629_148881736:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000460120:exon_148881629_148881736:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000460822:exon_148881629_148881736:HPS3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 149459413 C/T 1 25 8 33 11.7014600306526 4.25553279019118 7.4459272404614 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0133282209953246 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149456257_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149459177_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149459213_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000483708:exon_149459362_149459505:COMMD2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 149468530 T/G 1 11 5 16 5.14864241348713 2.65970799386948 2.48893441961765 T:G T G 10 0.531941598773897 0.316542725286372 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000483708:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000469896:exon_149468290_149468638:COMMD2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 149678534 C/T 1 15 10 25 7.02087601839154 5.31941598773897 1.70146003065257 T:C C T 10 0.531941598773897 0.551956894105179 ENSG00000082996:ENST00000392894:exon_149678527_149679926:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000344229:exon_149678527_149679909:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000491086:exon_149678527_149678803:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467977:exon_149678527_149678552:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000474348:exon_149678527_149678620:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467996:exon_149678527_149678537:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000361785:exon_149678527_149679913:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000482083:exon_149678527_149678672:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000468289:exon_149678527_149679161:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000493238:exon_149678527_149679161:RNF13 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 149700519 T/C 0 63 0 63 29.4876792772445 0 29.4876792772445 T T 10 0.531941598773897 9.759242245072e-18 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 150280445 C/G 1 7 10 17 3.27640880858272 5.31941598773897 -2.04300717915625 C:G C G 10 0.531941598773897 0.341802442613557 ENSG00000144895:ENST00000487799:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000460851:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000474505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000406576:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000482093:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000469331:exon_150280329_150280695:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000273435:exon_150280344_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000490505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000462221:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000477551:exon_150280329_150280447:EIF2A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 154018887 G/C 1 2 7 9 0.936116802452206 3.72359119141728 -2.78747438896507 C:G G C 10 0.531941598773897 0.0926560584503697 ENSG00000174953:ENST00000496811:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000308361:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000329463:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000481941:exon_154018776_154018916:DHX36 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 156266774 C/T 1 39 41 80 18.254277647818 21.8096055497298 -3.55532790191176 T:C C T 10 0.531941598773897 0.435107317084762 ENSG00000114850:ENST00000265044:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467789:exon_156266655_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000476217:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000498205:exon_156266694_156266888:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000478842:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000464138:exon_156266594_156266786:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000463503:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000496050:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467733:exon_156266694_156266792:SSR3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 158384489 G/A 1 14 6 20 6.55281761716544 3.19164959264338 3.36116802452206 A:G G A 10 0.531941598773897 0.178417023545079 ENSG00000079257:ENST00000264265:exon_158384203_158384533:LXN HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 160131347 A/G 1 25 27 52 11.7014600306526 14.3624231668952 -2.66096313624264 A:G A G 10 0.531941598773897 0.489171346191312 ENSG00000113810:ENST00000357388:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000360111:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000468653:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000469762:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000469858:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000489573:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000462787:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000344722:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000392788:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000487747:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000465563:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000494612:exon_160131261_160131371:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000467263:exon_160131261_160131542:SMC4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 160150859 G/A 1 19 14 33 8.89310962329596 7.44718238283456 1.4459272404614 A:C:G G A 10 0.531941598773897 0.727901086312476 ENSG00000113810:ENST00000357388:exon_160150814_160150997:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000360111:exon_160150814_160150997:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000469762:exon_160150814_160150997:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000462787:exon_160150814_160150997:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000344722:exon_160150814_160150997:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000462668:exon_160150814_160150997:SMC4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 160227606 A/G 1 13 16 29 6.08475921593934 8.51106558038235 -2.42630636444301 A:G A G 10 0.531941598773897 0.457380459449149 ENSG00000186432:ENST00000334256:exon_160227588_160227659:KPNA4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 169492101 C/T 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000085274:ENST00000349841:exon_169492053_169492349:MYNN;ENSG00000085274:ENST00000356716:exon_169492053_169492349:MYNN;ENSG00000085274:ENST00000392733:exon_169492053_169492349:MYNN HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 170784372 C/T 1 7 12 19 3.27640880858272 6.38329918528676 -3.10689037670404 T:C C T 10 0.531941598773897 0.172695126179914 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170784365_170784524:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000496492:exon_170784365_170784524:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170784365_170784524:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170784365_170784524:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170784365_170784524:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170784365_170784524:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170784365_170784524:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170784365_170784524:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170784365_170784524:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000484051:exon_170784163_170784524:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000487846:exon_170784259_170784524:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000459881:exon_170784276_170784524:TNIK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 170825920 G/A 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170825854_170825951:TNIK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 171087469 G/A 1 9 22 31 4.21252561103493 11.7027151730257 -7.49018956199081 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0105126308748068 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000465393:exon_171087409_171087474:TNIK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 174951756 T/C 1 5 18 23 2.34029200613052 9.57494877793015 -7.23465677179963 T:C T C 10 0.531941598773897 0.00283410859831133 ENSG00000177694:ENST00000454872:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000485853:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000473253:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000316366:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000489299:exon_174951721_174951994:NAALADL2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 178952020 C/T 1 11 7 18 5.14864241348713 3.72359119141728 1.42505122206985 T:C C T 10 0.531941598773897 0.638380509834863 ENSG00000121879:ENST00000263967:exon_178951882_178957881:PIK3CA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 182755209 T/G 1 19 25 44 8.89310962329596 13.2985399693474 -4.40543034605147 T:G T G 10 0.531941598773897 0.226575266167611 ENSG00000078070:ENST00000265594:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000492597:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000497830:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000392616:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000495767:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000476176:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000448585:exon_182755202_182755222:MCCC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 182853670 T/C 1 19 16 35 8.89310962329596 8.51106558038235 0.382044042913604 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182853505_182853675:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182853505_182853675:LAMP3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 182871962 C/T 1 47 24 71 21.9987448576268 12.7665983705735 9.23214648705331 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0318779879643587 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000476015:exon_182871689_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000470251:exon_182871728_182872179:LAMP3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 183558402 C/G 1 38 45 83 17.7862192465919 23.9373719448254 -6.15115269823345 C:G C G 10 0.531941598773897 0.187745743720147 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000311101:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000450375:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000417784:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000418450:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000435888:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000449306:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183558358_183558428:PARL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 183560195 A/G 1 18 20 38 8.42505122206985 10.6388319754779 -2.21378075340809 A:G A G 10 0.531941598773897 0.517564006907111 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183560086_183560235:PARL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 183861243 A/G 1 49 63 112 22.934861660079 33.5123207227555 -10.5774590626765 A:G A G 10 0.531941598773897 0.047021990397117 ENSG00000145191:ENST00000491144:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000273783:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000444495:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000481054:exon_183860840_183862012:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000465218:exon_183860840_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000484154:exon_183861230_183861497:EIF2B5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 183899832 C/T 1 114 87 201 53.3586577397757 46.278919093329 7.0797386464467 T:C C T 10 0.531941598773897 0.323360287875251 ENSG00000161203:ENST00000382456:exon_183899700_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000411763:exon_183899700_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000292807:exon_183899700_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000439647:exon_183899700_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000432591:exon_183899700_183899842:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000461733:exon_183899700_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000476434:exon_183899700_183899868:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000463935:exon_183899700_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000480260:exon_183899407_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000442686:exon_183899803_183899835:AP2M1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 183901281 G/A 1 98 106 204 45.8697233201581 56.3858094700331 -10.516086149875 A:G G A 10 0.531941598773897 0.141358964663692 ENSG00000161203:ENST00000382456:exon_183901270_183901879:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000411763:exon_183901270_183901450:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000292807:exon_183901270_183901879:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000439647:exon_183901270_183901836:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000461733:exon_183901270_183901853:AP2M1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 184429414 C/A 1 11 14 25 5.14864241348713 7.44718238283456 -2.29853996934743 A:C C A 10 0.531941598773897 0.424506026287143 ENSG00000177383:ENST00000317897:exon_184428156_184429836:MAGEF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 184766301 T/C 1 6 10 16 2.80835040735662 5.31941598773897 -2.51106558038235 T:C T C 10 0.531941598773897 0.221856598747246 ENSG00000156931:ENST00000287546:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000436792:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000446204:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000437079:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000492449:exon_184766267_184766347:VPS8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 185331165 C/A 1 8 8 16 3.74446720980882 4.25553279019118 -0.511065580382352 A:C C A 10 0.531941598773897 0.80799969147761 ENSG00000163904:ENST00000296257:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000427465:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000437107:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000413407:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000473760:exon_185331133_185331299:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000478001:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000476011:exon_185331133_185331432:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000444509:exon_185331143_185331196:SENP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 186509517 G/A 1 58 35 93 27.147387271114 18.6179559570864 8.52943131402758 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0781703184071514 ENSG00000163918:ENST00000433496:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000479307:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000392481:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000296273:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000417876:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000494047:exon_186509112_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000460408:exon_186509479_186509639:RFC4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 187088812 C/T 1 3 9 12 1.40417520367831 4.78747438896507 -3.38329918528676 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0789092376202323 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 187088903 C/A 1 4 14 18 1.87223360490441 7.44718238283456 -5.57494877793015 A:C C A 10 0.531941598773897 0.0091549395617982 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 187089031 C/A 1 11 12 23 5.14864241348713 6.38329918528676 -1.23465677179963 A:C C A 10 0.531941598773897 0.678419761183294 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 189713205 T/C 1 8 11 19 3.74446720980882 5.85135758651287 -2.10689037670404 T:C T C 10 0.531941598773897 0.365044702459487 ENSG00000090530:ENST00000319332:exon_189713079_189713231:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000427335:exon_189713079_189713231:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000444866:exon_189713079_189713231:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000426003:exon_189713079_189713231:LEPREL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 193334991 G/A 1 7 1 8 3.27640880858272 0.531941598773897 2.74446720980882 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0747852262017061 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000419435:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392436:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000487986:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000434811:exon_193334967_193335074:OPA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 193374964 T/C 1 18 13 31 8.42505122206985 6.91524078406066 1.50981043800919 T:C:G T C 10 0.531941598773897 0.719547030730488 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000482865:exon_193374869_193375021:OPA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 195800811 C/T 1 32 31 63 14.9778688392353 16.4901895619908 -1.51232072275551 T:C C T 10 0.531941598773897 0.707051043776247 ENSG00000072274:ENST00000360110:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000420415:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000392396:exon_195800801_195800996:TFRC HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 196281208 T/C 1 8 12 20 3.74446720980882 6.38329918528676 -2.63883197547794 T:C T C 10 0.531941598773897 0.267702187700883 ENSG00000185798:ENST00000332629:exon_196281056_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000429115:exon_196281059_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000433160:exon_196281065_196281678:WDR53 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 196381434 C/T 1 11 11 22 5.14864241348713 5.85135758651287 -0.702715173025734 T:C C T 10 0.531941598773897 0.832492408246346 ENSG00000174004:ENST00000328557:exon_196381398_196381518:LRRC33;ENSG00000174004:ENST00000461791:exon_196381398_196381864:LRRC33;ENSG00000163964:ENST00000426755:exon_196381398_196381518:PIGX HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 196435534 T/C 1 2 6 8 0.936116802452206 3.19164959264338 -2.25553279019118 T:C T C 10 0.531941598773897 0.158093130392085 ENSG00000174007:ENST00000409690:exon_196435399_196435598:C3orf34;ENSG00000174007:ENST00000311566:exon_196435399_196435598:C3orf34 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 196792163 C/T 1 4 6 10 1.87223360490441 3.19164959264338 -1.31941598773897 T:C C T 10 0.531941598773897 0.530535902085358 ENSG00000075711:ENST00000346964:exon_196792147_196792319:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000357674:exon_196792147_196792319:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000381807:exon_196792147_196792319:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000314062:exon_196792147_196792319:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000359922:exon_196792147_196792319:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000469371:exon_196792147_196792319:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000419354:exon_196792147_196792319:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000452595:exon_196792147_196792319:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000422288:exon_196792147_196792319:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000448528:exon_196792147_196792319:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000443183:exon_196792147_196792319:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000392382:exon_196792147_196792319:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000450955:exon_196792147_196792319:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000475394:exon_196792147_196792680:DLG1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 3 197495334 G/A 1 14 12 26 6.55281761716544 6.38329918528676 0.169518431878677 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000122068:ENST00000428738:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000494309:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000415708:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000241502:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000392374:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000412924:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000418169:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000426031:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000424384:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000428395:exon_197495306_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000463136:exon_197495310_197495458:FYTTD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 86798 C/T 1 18 13 31 8.42505122206985 6.91524078406066 1.50981043800919 T:C C T 10 0.531941598773897 0.719547030730488 ENSG00000197701:ENST00000339368:exon_85622_88099:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000507368:exon_85622_87412:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000512065:exon_85622_87410:ZNF595 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 87113 T/C 1 21 25 46 9.82922642574816 13.2985399693474 -3.46931354359926 T:C T C 10 0.531941598773897 0.375564870489553 ENSG00000197701:ENST00000339368:exon_85622_88099:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000507368:exon_85622_87412:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000512065:exon_85622_87410:ZNF595 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 759872 T/C 1 13 9 22 6.08475921593934 4.78747438896507 1.29728482697427 T:C T C 10 0.531941598773897 0.6717023671041 ENSG00000185619:ENST00000362003:exon_759820_764428:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000505655:exon_759820_764428:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000521023:exon_759820_764428:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000470161:exon_759820_760396:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000430644:exon_759823_760387:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000440452:exon_759820_760193:PCGF3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 887698 G/A 1 5 5 10 2.34029200613052 2.65970799386948 -0.31941598773897 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_887662_887797:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_887662_887797:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_887662_887797:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504435:exon_887662_888615:GAK;ENSG00000178950:ENST00000505819:exon_887662_887797:GAK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 951773 G/A 1 20 16 36 9.36116802452206 8.51106558038235 0.850102444139708 A:G G A 10 0.531941598773897 0.86790453569009 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515740:exon_951612_952363:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000508204:exon_951612_952297:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000510493:exon_951612_951867:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505148:exon_951612_952427:TMEM175 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 1165130 G/T 1 8 5 13 3.74446720980882 2.65970799386948 1.08475921593934 T:G G T 10 0.531941598773897 0.591209044900214 ENSG00000159674:ENST00000290902:exon_1165051_1165274:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000431380:exon_1165051_1165274:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000507466:exon_1165051_1165413:SPON2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 1244879 A/G 1 6 7 13 2.80835040735662 3.72359119141728 -0.915240784060662 A:G A G 10 0.531941598773897 0.782547085779911 ENSG00000196810:ENST00000514984:exon_1244684_1244975:C4orf42;ENSG00000196810:ENST00000357591:exon_1244177_1246616:C4orf42 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 1305802 C/T 1 21 31 52 9.82922642574816 16.4901895619908 -6.66096313624264 T:C C T 10 0.531941598773897 0.071087925564116 ENSG00000090316:ENST00000303400:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505177:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000513301:exon_1305767_1306026:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000512308:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503653:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000264750:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000382947:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000452175:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000509254:exon_1305767_1306026:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000502558:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000514708:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000508634:exon_1305767_1306374:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503693:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000509531:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000510794:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000512842:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505839:exon_1305767_1305949:MAEA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 1701317 G/A 1 68 85 153 31.827971283375 45.2150358957812 -13.3870646124062 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0348732101336178 ENSG00000163950:ENST00000429429:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000489418:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000460392:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000318386:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000483348:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000488267:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000480936:exon_1701291_1701428:SLBP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 1730215 C/G 1 83 52 135 38.8488473017665 27.6609631362426 11.1878841655239 A:C:G C G 10 0.531941598773897 0.0577261173194107 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1730131_1730514:TACC3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 1730254 A/G 1 93 36 129 43.5294313140276 19.1498975558603 24.3795337581673 A:G A G 10 0.531941598773897 1.29373813805968e-05 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1730131_1730514:TACC3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 1730299 A/G 1 95 36 131 44.4655481164798 19.1498975558603 25.3156505606195 A:G A G 10 0.531941598773897 6.65884614133308e-06 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1730131_1730514:TACC3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 1737502 C/T 1 17 21 38 7.95699282084375 11.1707735742518 -3.21378075340809 T:C C T 10 0.531941598773897 0.3312378750863 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1737458_1737554:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1737458_1737561:TACC3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 1746229 G/T 1 7 8 15 3.27640880858272 4.25553279019118 -0.979123981608455 T:G G T 10 0.531941598773897 0.617504794360634 ENSG00000013810:ENST00000484264:exon_1746166_1746351:TACC3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 2743999 A/G 1 112 77 189 52.4225409373235 40.9595031055901 11.4630378317335 A:G A G 10 0.531941598773897 0.108573200476048 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 2744087 G/A 1 70 73 143 32.7640880858272 38.8317367104945 -6.06764862466727 A:G G A 10 0.531941598773897 0.315774821797212 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 2746285 A/C 1 10 2 12 4.68058401226103 1.06388319754779 3.61670081471324 A:C A C 10 0.531941598773897 0.0432053960157470 ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2746114_2746590:TNIP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 2822467 G/T 1 3 6 9 1.40417520367831 3.19164959264338 -1.78747438896507 T:G G T 10 0.531941598773897 0.320650472569791 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000389838:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512131:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510074:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511237:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513095:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503393:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000509677:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000506932:exon_2822396_2822480:SH3BP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 2826400 T/C 1 9 10 19 4.21252561103493 5.31941598773897 -1.10689037670404 T:C:G T C 10 0.531941598773897 0.651315646573759 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512131:exon_2826340_2826644:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510074:exon_2826340_2826641:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511237:exon_2826340_2826509:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513095:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503393:exon_2826340_2826429:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000509677:exon_2826340_2826828:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000506932:exon_2826340_2826509:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2826392_2826486:SH3BP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 2831383 T/G 1 20 16 36 9.36116802452206 8.51106558038235 0.850102444139708 T:G T G 10 0.531941598773897 0.86790453569009 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2831220_2831461:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000505941:exon_2831220_2831532:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510204:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515802:exon_2831220_2831874:SH3BP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 2906707 G/T 1 58 56 114 27.147387271114 29.7887295313382 -2.64134226022426 T:G G T 10 0.531941598773897 0.639715254433896 ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503169:exon_2906491_2907448:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000514940:exon_2906491_2906835:ADD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 2916762 C/G 1 36 44 80 16.8501024441397 23.4054303460515 -6.55532790191176 T:C:G C G 10 0.531941598773897 0.146717242580111 ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000514940:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513762:exon_2916611_2916767:ADD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 2933271 G/A 1 5 5 10 2.34029200613052 2.65970799386948 -0.31941598773897 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000109736:ENST00000508276:exon_2933102_2933663:MFSD10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 2943361 T/C 1 23 24 47 10.7653432282004 12.7665983705735 -2.00125514237316 T:C T C 10 0.531941598773897 0.562904715352254 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000507120:exon_2943309_2943443:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2943309_2943456:NOP14 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 2951804 A/G 1 64 45 109 29.9557376784706 23.9373719448254 6.01836573364523 A:G A G 10 0.531941598773897 0.251478839140070 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2951661_2951940:NOP14 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 3213832 G/A 1 6 10 16 2.80835040735662 5.31941598773897 -2.51106558038235 A:G G A 10 0.531941598773897 0.221856598747246 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3213656_3213869:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3213656_3213869:HTT;ENSG00000197386:ENST00000509751:exon_3213639_3213869:HTT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 3215835 T/C 1 25 21 46 11.7014600306526 11.1707735742518 0.530686456400737 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3215685_3215862:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3215685_3215862:HTT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 3227419 A/G 1 30 22 52 14.0417520367831 11.7027151730257 2.33903686375736 A:G A G 10 0.531941598773897 0.579274779305336 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3227388_3227470:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3227388_3227470:HTT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 3234980 G/A 1 20 21 41 9.36116802452206 11.1707735742518 -1.80960554972978 A:G G A 10 0.531941598773897 0.63968648210344 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3234890_3235080:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3234890_3235080:HTT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 4322570 G/A 1 5 7 12 2.34029200613052 3.72359119141728 -1.38329918528676 A:G G A 10 0.531941598773897 0.56545794539378 ENSG00000168826:ENST00000355834:exon_4322367_4323512:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000515012:exon_4322367_4323125:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000337872:exon_4322367_4323513:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000503703:exon_4322367_4323513:ZBTB49 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 4322665 T/C 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 T:C T C 10 0.531941598773897 0.486426237614014 ENSG00000168826:ENST00000355834:exon_4322367_4323512:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000515012:exon_4322367_4323125:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000337872:exon_4322367_4323513:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000503703:exon_4322367_4323513:ZBTB49 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 4322770 T/C 1 8 4 12 3.74446720980882 2.12776639509559 1.61670081471324 T:C T C 10 0.531941598773897 0.3994437340124 ENSG00000168826:ENST00000355834:exon_4322367_4323512:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000515012:exon_4322367_4323125:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000337872:exon_4322367_4323513:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000503703:exon_4322367_4323513:ZBTB49 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 5830296 C/T 1 6 13 19 2.80835040735662 6.91524078406066 -4.10689037670404 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0676157669394294 ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5830246_5830772:EVC;ENSG00000072832:ENST00000506216:exon_5830216_5830395:CRMP1;ENSG00000072832:ENST00000324989:exon_5830216_5830395:CRMP1;ENSG00000072832:ENST00000397890:exon_5830216_5830395:CRMP1;ENSG00000072832:ENST00000511535:exon_5830216_5830395:CRMP1;ENSG00000072832:ENST00000512574:exon_5830216_5830395:CRMP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 5830393 C/T 1 15 27 42 7.02087601839154 14.3624231668952 -7.34154714850367 T:C C T 10 0.531941598773897 0.029419726024781 ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5830246_5830772:EVC;ENSG00000072832:ENST00000506216:exon_5830216_5830395:CRMP1;ENSG00000072832:ENST00000324989:exon_5830216_5830395:CRMP1;ENSG00000072832:ENST00000397890:exon_5830216_5830395:CRMP1;ENSG00000072832:ENST00000511535:exon_5830216_5830395:CRMP1;ENSG00000072832:ENST00000512574:exon_5830216_5830395:CRMP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 6302519 G/A 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000506362:exon_6302384_6302644:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000513395:exon_6302384_6302534:WFS1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 6302707 C/T 1 8 8 16 3.74446720980882 4.25553279019118 -0.511065580382352 T:C C T 10 0.531941598773897 0.80799969147761 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 6303022 C/T 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 6303955 G/A 1 10 5 15 4.68058401226103 2.65970799386948 2.02087601839155 A:G G A 10 0.531941598773897 0.438857439709851 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 6304087 A/G 1 7 5 12 3.27640880858272 2.65970799386948 0.616700814713236 A:G A G 10 0.531941598773897 0.779881793407808 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 6304242 T/C 1 8 9 17 3.74446720980882 4.78747438896507 -1.04300717915625 T:C T C 10 0.531941598773897 0.635405848599126 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 8228948 T/C 1 3 12 15 1.40417520367831 6.38329918528676 -4.97912398160846 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0166918725543361 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000514274:exon_8228707_8229196:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000508438:exon_8228688_8229000:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000509553:exon_8228707_8229272:SH3TC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 13605040 C/T 1 19 15 34 8.89310962329596 7.97912398160846 0.913985641687501 T:C C T 10 0.531941598773897 0.863994683994008 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 17503382 C/T 1 17 4 21 7.95699282084375 2.12776639509559 5.82922642574816 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0142418035457720 ENSG00000151552:ENST00000513615:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000507439:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000281243:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000428702:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000508623:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000514300:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000505710:exon_17503342_17503482:QDPR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 17503433 C/T 1 7 14 21 3.27640880858272 7.44718238283456 -4.17077357425184 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0809103045789491 ENSG00000151552:ENST00000513615:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000507439:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000281243:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000428702:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000508623:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000514300:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000505710:exon_17503342_17503482:QDPR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 24578097 C/T 1 69 66 135 32.2960296846011 35.1081455190772 -2.8121158344761 T:C C T 10 0.531941598773897 0.666585918705992 ENSG00000109606:ENST00000336812:exon_24577866_24578301:DHX15;ENSG00000109606:ENST00000511553:exon_24578092_24578301:DHX15 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 36069805 G/A 1 8 10 18 3.74446720980882 5.31941598773897 -1.57494877793015 A:G G A 10 0.531941598773897 0.487247762768628 ENSG00000047365:ENST00000303965:exon_36067620_36069900:ARAP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 37857342 G/C 1 21 21 42 9.82922642574816 11.1707735742518 -1.34154714850368 C:G G C 10 0.531941598773897 0.75774903675093 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37857229_37857362:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000512556:exon_37857229_37857362:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000510084:exon_37857229_37857362:PGM2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 37903669 A/G 1 6 2 8 2.80835040735662 1.06388319754779 1.74446720980882 A:G A G 10 0.531941598773897 0.297069782823554 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 37904082 T/C 1 12 3 15 5.61670081471324 1.59582479632169 4.02087601839154 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0406404092414402 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 37904089 C/T 0 10 0 10 4.68058401226103 0 4.68058401226103 C C 10 0.531941598773897 0.00231867125731154 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 38016395 T/G 1 8 5 13 3.74446720980882 2.65970799386948 1.08475921593934 T:G T G 10 0.531941598773897 0.591209044900214 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000446803:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38016130_38016594:TBC1D1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 38023302 C/G 1 6 3 9 2.80835040735662 1.59582479632169 1.21252561103493 C:G C G 10 0.531941598773897 0.515798041804277 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000446803:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000510573:exon_38023207_38023339:TBC1D1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 38776107 T/G 1 25 20 45 11.7014600306526 10.6388319754779 1.06262805517463 T:G T G 10 0.531941598773897 0.76770953708645 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 38776303 T/C 1 14 14 28 6.55281761716544 7.44718238283456 -0.894364765669117 T:C T C 10 0.531941598773897 0.850300347768159 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 38776491 T/G 1 20 28 48 9.36116802452206 14.8943647656691 -5.53319674114706 T:G T G 10 0.531941598773897 0.113865449652384 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 38777173 A/T 1 20 23 43 9.36116802452206 12.2346567717996 -2.87348874727757 A:T A T 10 0.531941598773897 0.445428322775795 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000502321:exon_38776887_38777176:TLR10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 38777236 T/G 1 21 30 51 9.82922642574816 15.9582479632169 -6.12902153746875 T:G T G 10 0.531941598773897 0.0929927326937413 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 38829163 A/C 1 8 7 15 3.74446720980882 3.72359119141728 0.0208760183915446 A:C A C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 39302029 T/C 1 18 19 37 8.42505122206985 10.106890376704 -1.68183915463419 T:C T C 10 0.531941598773897 0.623318092187015 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000505077:exon_39301936_39302034:RFC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 39303925 A/G 1 16 14 30 7.48893441961765 7.44718238283456 0.0417520367830893 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39303898_39303996:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39303898_39303996:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000505077:exon_39303898_39303996:RFC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 39458051 A/G 1 38 6 44 17.7862192465919 3.19164959264338 14.5945696539485 A:G A G 10 0.531941598773897 5.29823863959159e-06 ENSG00000163682:ENST00000295955:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503277:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000449470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000508595:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000514842:exon_39458026_39459301:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503040:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000504470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000511075:exon_39457431_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000437992:exon_39457948_39458158:RPL9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 40440215 T/C 1 5 7 12 2.34029200613052 3.72359119141728 -1.38329918528676 T:C T C 10 0.531941598773897 0.56545794539378 ENSG00000163694:ENST00000319592:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381793:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381795:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000510871:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000295971:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000514014:exon_40439788_40440814:RBM47 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 44682465 T/C 1 8 5 13 3.74446720980882 2.65970799386948 1.08475921593934 T:C T C 10 0.531941598773897 0.591209044900214 ENSG00000151806:ENST00000281543:exon_44682458_44682569:GUF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 44705125 T/C 1 21 19 40 9.82922642574816 10.106890376704 -0.277663950955882 T:C:G T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000163281:ENST00000507917:exon_44703885_44705159:GNPDA2;ENSG00000163281:ENST00000295448:exon_44704156_44705159:GNPDA2;ENSG00000163281:ENST00000507534:exon_44704805_44705159:GNPDA2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 48147309 T/C 1 13 7 20 6.08475921593934 3.72359119141728 2.36116802452206 T:C T C 10 0.531941598773897 0.371872863862178 ENSG00000135605:ENST00000381501:exon_48147096_48147312:TEC;ENSG00000135605:ENST00000506752:exon_48147096_48147312:TEC;ENSG00000135605:ENST00000505452:exon_48147096_48147312:TEC;ENSG00000135605:ENST00000511471:exon_48147095_48147312:TEC HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 57204777 A/C 1 6 4 10 2.80835040735662 2.12776639509559 0.68058401226103 A:C A C 10 0.531941598773897 0.758887050232993 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57204771_57204957:AASDH HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 57273840 C/G 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 C:G C G 10 0.531941598773897 0.730998912113487 ENSG00000128059:ENST00000264220:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000507648:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000510643:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000507724:exon_57273816_57273882:PPAT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 57333822 G/T 1 7 5 12 3.27640880858272 2.65970799386948 0.616700814713236 T:G G T 10 0.531941598773897 0.779881793407808 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57333081_57333910:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57333783_57333910:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000504757:exon_57333784_57333910:SRP72 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 68374597 C/T 1 8 13 21 3.74446720980882 6.91524078406066 -3.17077357425184 T:C C T 10 0.531941598773897 0.192501336721756 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000507196:exon_68374532_68374637:CENPC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 68380215 G/A 1 9 9 18 4.21252561103493 4.78747438896507 -0.574948777930146 A:G G A 10 0.531941598773897 0.81714898933323 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68379792_68380405:CENPC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 68384008 C/T 1 5 6 11 2.34029200613052 3.19164959264338 -0.851357586512867 T:C C T 10 0.531941598773897 0.764860318695721 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68383874_68384086:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68383874_68384086:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68383874_68384086:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68383874_68384086:CENPC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 76720885 T/C 1 15 26 41 7.02087601839154 13.8304815681213 -6.80960554972978 A:T:C T C 10 0.531941598773897 0.040987785762863 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76720775_76720885:USO1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 76730195 A/G 1 26 14 40 12.1695184318787 7.44718238283456 4.72233604904412 A:G A G 10 0.531941598773897 0.1547218742267 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76730106_76730204:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76730106_76730204:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76730106_76730204:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76730106_76730204:USO1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 76836137 A/G 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 A:G A G 10 0.531941598773897 0.486426237614014 ENSG00000138744:ENST00000286733:exon_76836021_76836138:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000513045:exon_76836021_76836138:NAAA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 76878716 G/C 1 28 41 69 13.1056352343309 21.8096055497298 -8.70397031539889 C:G G C 10 0.531941598773897 0.04006363128623 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76878671_76878861:SDAD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 76881233 G/T 1 29 21 50 13.573693635557 11.1707735742518 2.40292006130515 T:G G T 10 0.531941598773897 0.571507118281637 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76881219_76881345:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76881219_76881345:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76881219_76881345:SDAD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 77045806 A/G 1 6 6 12 2.80835040735662 3.19164959264338 -0.383299185286765 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000138750:ENST00000508604:exon_77045802_77045909:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77045802_77045909:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77045802_77045909:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000502850:exon_77045802_77045909:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000508465:exon_77045802_77045909:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77045802_77045909:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77045802_77045909:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77045802_77045909:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000504173:exon_77045733_77045909:NUP54 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 83776087 A/G 1 20 12 32 9.36116802452206 6.38329918528676 2.9778688392353 A:G A G 10 0.531941598773897 0.376146745723152 ENSG00000138674:ENST00000395310:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000348405:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000513858:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000509142:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000443462:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000432794:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000311785:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000448323:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000326950:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505472:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000500777:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000355196:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508502:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000264405:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505984:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508479:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000507828:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000512664:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000510167:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000503226:exon_83776059_83776182:SEC31A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 84374480 C/T 1 8 7 15 3.74446720980882 3.72359119141728 0.0208760183915446 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000163312:ENST00000508591:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000295488:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000510985:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000422434:exon_84374384_84375098:HELQ HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 102751076 G/A 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 A:G G A 10 0.531941598773897 0.486426237614014 ENSG00000153064:ENST00000504592:exon_102750965_102751363:BANK1;ENSG00000153064:ENST00000322953:exon_102750965_102751363:BANK1;ENSG00000153064:ENST00000444316:exon_102750965_102751363:BANK1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 103555992 A/G 1 8 8 16 3.74446720980882 4.25553279019118 -0.511065580382352 A:G A G 10 0.531941598773897 0.80799969147761 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103555945_103556202:MANBA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 108641317 G/A 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108641276_108641608:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108641276_108641378:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000514489:exon_108641276_108641382:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000504987:exon_108641160_108641369:PAPSS1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 110603784 T/C 1 20 23 43 9.36116802452206 12.2346567717996 -2.87348874727757 T:C T C 10 0.531941598773897 0.445428322775795 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110603738_110603898:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000472310:exon_110603738_110604350:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110603738_110603898:CCDC109B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 110605744 A/T 1 202 137 339 94.5477970476728 72.8759990320239 21.6717980156489 A:T:C A T 10 0.531941598773897 0.0192034859508461 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000494604:exon_110605596_110606523:CCDC109B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 113362316 A/G 1 7 8 15 3.27640880858272 4.25553279019118 -0.979123981608455 A:G A G 10 0.531941598773897 0.617504794360634 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 144135718 G/A 1 13 8 21 6.08475921593934 4.25553279019118 1.82922642574816 A:G G A 10 0.531941598773897 0.514430539711333 ENSG00000170185:ENST00000510377:exon_144134734_144136730:USP38;ENSG00000170185:ENST00000307017:exon_144134734_144136096:USP38;ENSG00000170185:ENST00000511739:exon_144134734_144136096:USP38 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 144442611 T/C 1 18 11 29 8.42505122206985 5.85135758651287 2.57369363555699 T:C T C 10 0.531941598773897 0.35905385704836 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 147108469 G/A 1 60 49 109 28.0835040735662 26.065138339921 2.01836573364523 A:G G A 10 0.531941598773897 0.773550361122163 ENSG00000164167:ENST00000296581:exon_147108426_147108539:LSM6;ENSG00000164167:ENST00000515311:exon_147108426_147108539:LSM6;ENSG00000164167:ENST00000502781:exon_147108426_147108539:LSM6;ENSG00000164167:ENST00000504181:exon_147108426_147108539:LSM6;ENSG00000164167:ENST00000507449:exon_147108426_147108703:LSM6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 148944467 A/G 1 10 7 17 4.68058401226103 3.72359119141728 0.956992820843751 A:G A G 10 0.531941598773897 0.809031865435945 ENSG00000071205:ENST00000336498:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000414545:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000506054:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000507661:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000506020:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000513548:exon_148944205_148944564:ARHGAP10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 154525458 C/T 1 38 36 74 17.7862192465919 19.1498975558603 -1.36367830926838 T:C C T 10 0.531941598773897 0.816030344850575 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154524954_154525534:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154524954_154525582:KIAA0922 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 156276289 C/T 1 3 6 9 1.40417520367831 3.19164959264338 -1.78747438896507 T:C C T 10 0.531941598773897 0.320650472569791 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156276223_156276312:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156276223_156276312:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156276223_156276312:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000433024:exon_156276223_156276312:MAP9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 159601676 C/T 1 7 7 14 3.27640880858272 3.72359119141728 -0.447182382834558 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000171503:ENST00000511912:exon_159601619_159601759:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000355672:exon_159601619_159601759:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000436096:exon_159601619_159601759:ETFDH HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 159631991 G/T 1 15 28 43 7.02087601839154 14.8943647656691 -7.87348874727757 T:G G T 10 0.531941598773897 0.0209208613452354 ENSG00000171497:ENST00000307720:exon_159631914_159632000:PPID;ENSG00000171497:ENST00000512699:exon_159631914_159632000:PPID HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 166021811 G/C 1 12 11 23 5.61670081471324 5.85135758651287 -0.234656771799632 C:G G C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000170088:ENST00000306480:exon_166021780_166022044:TMEM192;ENSG00000170088:ENST00000506087:exon_166021780_166022044:TMEM192;ENSG00000170088:ENST00000505095:exon_166021780_166022044:TMEM192 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 166263047 G/A 1 19 12 31 8.89310962329596 6.38329918528676 2.50981043800919 A:G G A 10 0.531941598773897 0.472209331224685 ENSG00000052802:ENST00000261507:exon_166262903_166264312:SC4MOL;ENSG00000052802:ENST00000426682:exon_166262903_166264224:SC4MOL;ENSG00000052802:ENST00000393766:exon_166262903_166264181:SC4MOL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 170663235 C/T 1 8 8 16 3.74446720980882 4.25553279019118 -0.511065580382352 T:C C T 10 0.531941598773897 0.80799969147761 ENSG00000056050:ENST00000393381:exon_170663108_170663258:C4orf27 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 177249533 A/G 1 8 8 16 3.74446720980882 4.25553279019118 -0.511065580382352 A:G A G 10 0.531941598773897 0.80799969147761 ENSG00000129128:ENST00000264597:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000503362:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000507678:exon_177249349_177249557:SPCS3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 183815688 A/G 1 25 26 51 11.7014600306526 13.8304815681213 -2.12902153746875 A:G A G 10 0.531941598773897 0.576796488483639 ENSG00000129187:ENST00000500813:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000357067:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000312820:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000452807:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000438320:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507543:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507631:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510370:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000503182:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510307:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000512766:exon_183815646_183815758:DCTD HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 184612553 G/C 1 2 6 8 0.936116802452206 3.19164959264338 -2.25553279019118 C:G G C 10 0.531941598773897 0.158093130392085 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184612469_184612624:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000357207:exon_184612469_184612624:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184612469_184612624:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000505676:exon_184612469_184612624:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000512476:exon_184612469_184612624:C4orf41 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 185310218 C/T 1 46 36 82 21.5306864564007 19.1498975558603 2.38078890054044 T:C C T 10 0.531941598773897 0.658468679391544 ENSG00000168310:ENST00000393593:exon_185308867_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000505067:exon_185310176_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000502750:exon_185310194_185310220:IRF2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 185687863 A/G 1 2 9 11 0.936116802452206 4.78747438896507 -3.85135758651287 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0302737640849297 ENSG00000151726:ENST00000454703:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000451433:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000515030:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000281455:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000507295:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000437665:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000506733:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504342:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000513317:exon_185687776_185687910:ACSL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 185701549 G/T 1 9 3 12 4.21252561103493 1.59582479632169 2.61670081471324 T:G G T 10 0.531941598773897 0.155839710778340 ENSG00000151726:ENST00000454703:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000451433:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000515030:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000281455:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000506733:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504342:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000513317:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504900:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000509038:exon_185701486_185701587:ACSL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 186294198 C/T 1 6 2 8 2.80835040735662 1.06388319754779 1.74446720980882 T:C C T 10 0.531941598773897 0.297069782823554 ENSG00000109771:ENST00000362004:exon_186294010_186294233:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000328559:exon_186294010_186294233:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000510776:exon_186294010_186294233:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000505916:exon_186294010_186294233:LRP2BP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 186299260 A/G 1 22 28 50 10.2972848269743 14.8943647656691 -4.59707993869485 A:G A G 10 0.531941598773897 0.204424034235794 ENSG00000109771:ENST00000362004:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000328559:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000510776:exon_186298063_186300172:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000505916:exon_186299235_186299361:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000511404:exon_186299235_186299361:LRP2BP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 186339620 T/C 1 13 24 37 6.08475921593934 12.7665983705735 -6.68183915463419 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0318671437310554 ENSG00000109775:ENST00000514247:exon_186339595_186339661:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000264689:exon_186339595_186339661:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000510755:exon_186339595_186339661:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000511485:exon_186339595_186339667:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000502428:exon_186339595_186339661:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000502282:exon_186339595_186339661:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000505357:exon_186339595_186339661:UFSP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 4 187113041 C/G 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 C:G C G 10 0.531941598773897 0.486426237614014 ENSG00000145476:ENST00000378802:exon_187112674_187113191:CYP4V2;ENSG00000145476:ENST00000274118:exon_187112978_187113097:CYP4V2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 205939 C/T 1 14 16 30 6.55281761716544 8.51106558038235 -1.95824796321691 T:C C T 10 0.531941598773897 0.583880929092300 ENSG00000164366:ENST00000296824:exon_204872_206073:CCDC127 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 434067 G/A 1 8 8 16 3.74446720980882 4.25553279019118 -0.511065580382352 A:G G A 10 0.531941598773897 0.80799969147761 ENSG00000063438:ENST00000505113:exon_433968_434972:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_433968_435008:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_433968_435225:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000511487:exon_433968_434524:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000507048:exon_433968_435224:AHRR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 1466919 G/A 1 18 26 44 8.42505122206985 13.8304815681213 -5.40543034605147 A:G G A 10 0.531941598773897 0.130064908483984 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 1467004 A/G 1 17 13 30 7.95699282084375 6.91524078406066 1.04175203678309 A:G A G 10 0.531941598773897 0.719368372691395 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 1494909 C/T 1 4 6 10 1.87223360490441 3.19164959264338 -1.31941598773897 T:C C T 10 0.531941598773897 0.530535902085358 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000514484:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000507282:exon_1494815_1495043:LPCAT1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 5462148 G/A 1 6 4 10 2.80835040735662 2.12776639509559 0.68058401226103 A:G G A 10 0.531941598773897 0.758887050232993 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 6604787 C/T 1 47 40 87 21.9987448576268 21.2776639509559 0.721080906670959 T:C C T 10 0.531941598773897 0.914716362022048 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6604718_6604995:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000514127:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000502932:exon_6604718_6604821:NSUN2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 6633779 C/G 1 19 13 32 8.89310962329596 6.91524078406066 1.97786883923529 C:G C G 10 0.531941598773897 0.595907192228062 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6633456_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000513117:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6633569_6633982:SRD5A1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 6651970 A/G 1 12 8 20 5.61670081471324 4.25553279019118 1.36116802452206 A:G A G 10 0.531941598773897 0.65611601649275 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6651955_6652121:SRD5A1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 6652009 G/A 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 A:G G A 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6651955_6652121:SRD5A1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 7878179 C/T 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 T:C C T 10 0.531941598773897 0.730998912113487 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510279:exon_7878057_7878262:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514220:exon_7878057_7878348:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000505257:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514369:exon_7878062_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508890:exon_7878057_7878188:MTRR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 7897319 G/A 1 6 6 12 2.80835040735662 3.19164959264338 -0.383299185286765 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7897178_7897360:MTRR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 32400266 A/G 1 7 4 11 3.27640880858272 2.12776639509559 1.14864241348713 A:G A G 10 0.531941598773897 0.55795959209382 ENSG00000056097:ENST00000265069:exon_32400112_32400308:ZFR;ENSG00000056097:ENST00000382126:exon_32400112_32400308:ZFR HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 33881252 G/A 1 22 21 43 10.2972848269743 11.1707735742518 -0.873488747277571 A:G G A 10 0.531941598773897 0.878828782939674 ENSG00000151388:ENST00000504830:exon_33881224_33881585:ADAMTS12;ENSG00000151388:ENST00000352040:exon_33881224_33881585:ADAMTS12;ENSG00000151388:ENST00000515401:exon_33881224_33881585:ADAMTS12;ENSG00000151388:ENST00000509762:exon_33880969_33881585:ADAMTS12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 34908877 T/C 1 17 13 30 7.95699282084375 6.91524078406066 1.04175203678309 T:C T C 10 0.531941598773897 0.719368372691395 ENSG00000113456:ENST00000382038:exon_34905369_34909053:RAD1;ENSG00000113456:ENST00000341754:exon_34908277_34909053:RAD1;ENSG00000113456:ENST00000325577:exon_34908659_34909053:RAD1;ENSG00000113456:ENST00000513914:exon_34908760_34909053:RAD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 34915948 A/G 1 19 17 36 8.89310962329596 9.04300717915625 -0.149897555860294 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000113456:ENST00000382038:exon_34915521_34916871:RAD1;ENSG00000113460:ENST00000336767:exon_34915481_34916002:BRIX1;ENSG00000113460:ENST00000510960:exon_34915782_34916002:BRIX1;ENSG00000113460:ENST00000515798:exon_34915815_34916002:BRIX1;ENSG00000113460:ENST00000510834:exon_34915821_34916002:BRIX1;ENSG00000113460:ENST00000506023:exon_34915857_34916002:BRIX1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 34945122 A/G 1 49 68 117 22.934861660079 36.172028716625 -13.237167056546 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0158029438665369 ENSG00000168724:ENST00000342382:exon_34944972_34945130:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000382021:exon_34944972_34945130:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000303525:exon_34944972_34945130:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000514237:exon_34944972_34945130:DNAJC21 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 34954079 C/G 1 39 49 88 18.254277647818 26.065138339921 -7.81086069210293 C:G C G 10 0.531941598773897 0.108836304499231 ENSG00000168724:ENST00000342382:exon_34954031_34954106:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000382021:exon_34954031_34954106:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000303525:exon_34954031_34954106:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000506762:exon_34954031_34954296:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000509626:exon_34953631_34954106:DNAJC21 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 40835288 C/G 1 3897 3662 7559 1824.02358957812 1947.97013471001 -123.946545131887 A:T:C:G C G 10 0.531941598773897 0.00441350111427619 ENSG00000145592:ENST00000274242:exon_40835285_40835437:RPL37;ENSG00000145592:ENST00000509877:exon_40835285_40835314:RPL37;ENSG00000145592:ENST00000504562:exon_40835121_40835288:RPL37;ENSG00000145592:ENST00000315577:exon_40835285_40835312:RPL37;ENSG00000145592:ENST00000508493:exon_40835285_40835314:RPL37 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 43609272 T/C 1 4 8 12 1.87223360490441 4.25553279019118 -2.38329918528676 A:T:C T C 10 0.531941598773897 0.247137734070613 ENSG00000112992:ENST00000505678:exon_43609245_43609448:NNT;ENSG00000112992:ENST00000512422:exon_43609245_43609448:NNT;ENSG00000112992:ENST00000264663:exon_43609245_43609448:NNT;ENSG00000112992:ENST00000344920:exon_43609245_43609448:NNT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 43656024 T/C 1 5 9 14 2.34029200613052 4.78747438896507 -2.44718238283456 T:C T C 10 0.531941598773897 0.283917011510726 ENSG00000112992:ENST00000264663:exon_43655942_43656175:NNT;ENSG00000112992:ENST00000344920:exon_43655942_43656175:NNT;ENSG00000112992:ENST00000512996:exon_43655942_43656175:NNT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 64064943 G/A 1 11 8 19 5.14864241348713 4.25553279019118 0.893109623295957 A:G G A 10 0.531941598773897 0.819320657489995 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64064757_64065015:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64064773_64065015:CWC27 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 64267595 T/C 1 21 9 30 9.82922642574816 4.78747438896507 5.04175203678309 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0693659470402082 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64267530_64267639:CWC27 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 64273018 G/A 1 34 25 59 15.9139856416875 13.2985399693474 2.61544567234008 A:G G A 10 0.531941598773897 0.516976141363729 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64272962_64273065:CWC27 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 64881936 A/G 1 19 8 27 8.89310962329596 4.25553279019118 4.63757683310478 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0837468527196273 ENSG00000113593:ENST00000261308:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000510930:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000511908:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000513773:exon_64881826_64882008:PPWD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 66478626 T/C 1 25 18 43 11.7014600306526 9.57494877793015 2.12651125272243 T:C T C 10 0.531941598773897 0.544547944297771 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 66478729 A/G 1 20 11 31 9.36116802452206 5.85135758651287 3.50981043800919 A:G A G 10 0.531941598773897 0.280029533205116 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 66480374 G/C 1 7 2 9 3.27640880858272 1.06388319754779 2.21252561103493 C:G G C 10 0.531941598773897 0.187705653333192 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180;ENSG00000134061:ENST00000515027:exon_66480350_66480413:CD180 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 74017499 C/T 1 30 19 49 14.0417520367831 10.106890376704 3.93486166007905 T:C C T 10 0.531941598773897 0.316472929575982 ENSG00000164347:ENST00000296805:exon_74017029_74017608:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000345239:exon_74017031_74017608:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000509430:exon_74017083_74017608:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000515125:exon_74017098_74017608:GFM2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 74063154 C/G 1 89 162 251 41.6571977091232 86.1745390013713 -44.5173412922481 A:C:G C G 10 0.531941598773897 1.90854636107742e-08 ENSG00000164347:ENST00000296805:exon_74062763_74063196:GFM2;ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74062817_74063188:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000514918:exon_74063073_74063188:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000513356:exon_74063088_74063188:NSA2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 74069863 A/G 1 133 193 326 62.2517673630717 102.664728563362 -40.4129612002904 A:G A G 10 0.531941598773897 8.21001558185629e-06 ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74069693_74069885:NSA2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 75003678 T/C 1 6 10 16 2.80835040735662 5.31941598773897 -2.51106558038235 T:C T C 10 0.531941598773897 0.221856598747246 ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000514838:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000446329:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000510798:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000282199:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000503835:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000504862:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000515285:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000512125:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000508467:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000507421:exon_75003309_75003700:POC5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 76349900 T/C 1 5 6 11 2.34029200613052 3.19164959264338 -0.851357586512867 T:C T C 10 0.531941598773897 0.764860318695721 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76349790_76349955:AGGF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 76359024 C/A 1 8 18 26 3.74446720980882 9.57494877793015 -5.83048156812132 A:C C A 10 0.531941598773897 0.0290707701029405 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76358877_76361059:AGGF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 80149981 A/G 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 A:G A G 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_80149949_80150135:MSH3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 80168937 G/A 1 23 12 35 10.7653432282004 6.38329918528676 4.3820440429136 A:G G A 10 0.531941598773897 0.174979343497450 ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_80168935_80169106:MSH3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 80736444 A/G 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000145687:ENST00000320672:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000509053:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000514493:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000504985:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000512923:exon_80736357_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000510060:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000505980:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000515395:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000380182:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000504136:exon_80736377_80736455:SSBP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 81549240 C/A 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 A:C C A 10 0.531941598773897 0.486426237614014 ENSG00000152348:ENST00000282185:exon_81549133_81549248:ATG10;ENSG00000152348:ENST00000458350:exon_81549133_81549248:ATG10;ENSG00000152348:ENST00000504770:exon_81549133_81549250:ATG10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 82648977 T/G 1 24 26 50 11.2334016294265 13.8304815681213 -2.59707993869485 T:G T G 10 0.531941598773897 0.48144383909983 ENSG00000152422:ENST00000282268:exon_82648950_82649577:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000338635:exon_82648944_82649530:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000396027:exon_82648950_82649530:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000511817:exon_82648944_82649606:XRCC4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 89703641 C/G 1 17 22 39 7.95699282084375 11.7027151730257 -3.74572235218198 C:G C G 10 0.531941598773897 0.262456063529319 ENSG00000153140:ENST00000283122:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522083:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522864:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000518458:exon_89703516_89703647:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522565:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522842:exon_89703516_89703651:CETN3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 95152313 A/G 1 94 84 178 43.9974897152537 44.6830942970074 -0.685604581753672 A:G A G 10 0.531941598773897 0.94021101775575 ENSG00000173221:ENST00000508780:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507605:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000237858:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000379979:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507412:exon_95152211_95155206:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000505427:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000512469:exon_95152114_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000448201:exon_95152217_95152329:GLRX HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 95234350 A/G 1 11 8 19 5.14864241348713 4.25553279019118 0.893109623295957 A:G A G 10 0.531941598773897 0.819320657489995 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 96031569 A/G 1 9 10 19 4.21252561103493 5.31941598773897 -1.10689037670404 A:C:G A G 10 0.531941598773897 0.651315646573759 ENSG00000153113:ENST00000505143:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000338252:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508830:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511097:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395812:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000359176:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000325674:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395813:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000515160:exon_96031540_96031998:CAST;ENSG00000153113:ENST00000507487:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000421689:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510756:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512355:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512620:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000514845:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000506811:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000514055:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508608:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000341926:exon_96031489_96031611:CAST HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 96086334 G/C 1 31 28 59 14.5098104380092 14.8943647656691 -0.384554327659924 C:G G C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000153113:ENST00000338252:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508830:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395812:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000359176:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000325674:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395813:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510756:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512355:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508608:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000341926:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000361634:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511049:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000309190:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510156:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000509903:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511782:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000504465:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000513666:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000348386:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510500:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000437034:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508579:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000515663:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000283095:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000484552:exon_96086291_96086386:CAST HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 96118852 G/C 1 7 3 10 3.27640880858272 1.59582479632169 1.68058401226103 C:G G C 10 0.531941598773897 0.3537387028518 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96118755_96118939:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96118755_96118939:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96118755_96118939:ERAP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 96231000 G/T 1 8 1 9 3.74446720980882 0.531941598773897 3.21252561103493 T:G G T 10 0.531941598773897 0.0425222470212816 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000508077:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96230950_96231063:ERAP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 96232142 T/A 1 18 1 19 8.42505122206985 0.531941598773897 7.89310962329596 A:T T A 10 0.531941598773897 0.000121899743087120 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96232107_96232208:ERAP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 96237326 G/A 0 14 0 14 6.55281761716544 0 6.55281761716544 G G 10 0.531941598773897 0.000169464527040000 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96237210_96237385:ERAP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 96245343 C/T 1 17 1 18 7.95699282084375 0.531941598773897 7.42505122206985 T:C C T 10 0.531941598773897 0.000220760484442127 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 96245439 C/T 1 37 2 39 17.3181608453658 1.06388319754779 16.254277647818 T:C C T 10 0.531941598773897 1.43953031109005e-08 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 96249115 C/T 1 27 3 30 12.6375768331048 1.59582479632169 11.0417520367831 T:C C T 10 0.531941598773897 2.54029265289312e-05 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000512869:exon_96249042_96249161:ERAP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 96498783 G/A 1 6 15 21 2.80835040735662 7.97912398160846 -5.17077357425184 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0281796668922795 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96496571_96498929:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000511293:exon_96498640_96498929:RIOK2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 96503523 C/T 1 27 24 51 12.6375768331048 12.7665983705735 -0.129021537468748 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96503171_96503695:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96502450_96503695:RIOK2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 96512865 T/A 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 A:T T A 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96512708_96512995:RIOK2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 96512871 T/A 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 A:T T A 10 0.531941598773897 0.730998912113487 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96512708_96512995:RIOK2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 96513471 G/C 1 10 6 16 4.68058401226103 3.19164959264338 1.48893441961765 C:G G C 10 0.531941598773897 0.61793977257828 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96513436_96513552:RIOK2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 110456704 A/T 1 8 4 12 3.74446720980882 2.12776639509559 1.61670081471324 A:T A T 10 0.531941598773897 0.3994437340124 ENSG00000134987:ENST00000506538:exon_110456694_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000323652:exon_110456694_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000513710:exon_110456697_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505840:exon_110456694_110456839:WDR36 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 112257908 T/C 1 8 12 20 3.74446720980882 6.38329918528676 -2.63883197547794 T:C T C 10 0.531941598773897 0.267702187700883 ENSG00000129625:ENST00000379638:exon_112257770_112258236:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000513339:exon_112257770_112257924:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000511865:exon_112257770_112257927:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000504247:exon_112257770_112257986:REEP5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 112926755 G/A 1 9 9 18 4.21252561103493 4.78747438896507 -0.574948777930146 A:G G A 10 0.531941598773897 0.81714898933323 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112926738_112926941:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112926738_112926941:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000512600:exon_112926738_112926941:YTHDC2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 115428334 G/T 1 10 3 13 4.68058401226103 1.59582479632169 3.08475921593934 T:G G T 10 0.531941598773897 0.100839397920929 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115428242_115428392:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000506589:exon_115428242_115428397:COMMD10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 115428381 T/G 1 6 10 16 2.80835040735662 5.31941598773897 -2.51106558038235 T:G T G 10 0.531941598773897 0.221856598747246 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115428242_115428392:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000506589:exon_115428242_115428397:COMMD10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 115469773 C/T 1 11 10 21 5.14864241348713 5.31941598773897 -0.170773574251837 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115469765_115469875:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115469765_115469875:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115469765_115469875:COMMD10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 121355961 G/A 1 6 9 15 2.80835040735662 4.78747438896507 -1.97912398160846 A:G G A 10 0.531941598773897 0.316481765113816 ENSG00000151304:ENST00000339397:exon_121355783_121356497:SRFBP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 122682348 A/G 1 7 2 9 3.27640880858272 1.06388319754779 2.21252561103493 A:G A G 10 0.531941598773897 0.187705653333192 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122680697_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122681952_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122682094_122682447:CEP120 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 128430757 T/C 1 9 9 18 4.21252561103493 4.78747438896507 -0.574948777930146 T:C:G T C 10 0.531941598773897 0.81714898933323 ENSG00000066583:ENST00000506986:exon_128430529_128430768:ISOC1;ENSG00000066583:ENST00000173527:exon_128430444_128430768:ISOC1;ENSG00000066583:ENST00000513879:exon_128430530_128430768:ISOC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 131822055 T/C 1 27 24 51 12.6375768331048 12.7665983705735 -0.129021537468748 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000125347:ENST00000245414:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000405885:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000459982:exon_131821815_131822378:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000458069:exon_131822033_131822065:IRF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 132437531 C/T 1 73 74 147 34.1682632895055 39.3636783092684 -5.19541501976286 T:C C T 10 0.531941598773897 0.409116826915447 ENSG00000170606:ENST00000304858:exon_132437451_132437570:HSPA4;ENSG00000170606:ENST00000514825:exon_132437288_132437570:HSPA4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 133956668 G/A 1 10 6 16 4.68058401226103 3.19164959264338 1.48893441961765 A:G G A 10 0.531941598773897 0.61793977257828 ENSG00000152700:ENST00000402673:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000507419:exon_133956623_133956691:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000394992:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000282606:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000439578:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000503318:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000505758:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000502286:exon_133956623_133956742:SAR1B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 137500665 G/A 1 16 8 24 7.48893441961765 4.25553279019118 3.23340162942647 A:G G A 10 0.531941598773897 0.222052970761321 ENSG00000112983:ENST00000254900:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000230901:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000454473:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000418329:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000441656:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000402931:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000411594:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000239899:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000455658:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000512140:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000506167:exon_137500403_137500855:BRD8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 137733891 A/G 1 7 3 10 3.27640880858272 1.59582479632169 1.68058401226103 A:G A G 10 0.531941598773897 0.3537387028518 ENSG00000120733:ENST00000314358:exon_137733867_137734081:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000510866:exon_137733867_137734081:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000394866:exon_137733867_137734081:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000507996:exon_137733867_137734081:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000504095:exon_137733567_137734081:KDM3B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 137754695 T/C 1 9 12 21 4.21252561103493 6.38329918528676 -2.17077357425184 T:C T C 10 0.531941598773897 0.386440894347250 ENSG00000120733:ENST00000314358:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000510866:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000394866:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000507996:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000508386:exon_137754642_137754921:KDM3B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 137892170 G/A 1 286 305 591 133.864702750665 162.242187626039 -28.3774848753731 A:T:G G A 10 0.531941598773897 0.0209159062819324 ENSG00000113013:ENST00000297185:exon_137892141_137892281:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000524109:exon_137892141_137892281:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000512328:exon_137892141_137892262:HSPA9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 138773090 A/G 1 10 5 15 4.68058401226103 2.65970799386948 2.02087601839155 A:G A G 10 0.531941598773897 0.438857439709851 ENSG00000170464:ENST00000302060:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000507405:exon_138773061_138773249:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000506870:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515581:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515277:exon_138773061_138773247:DNAJC18 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 138856982 C/T 1 13 7 20 6.08475921593934 3.72359119141728 2.36116802452206 T:C C T 10 0.531941598773897 0.371872863862178 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138856953_138857100:TMEM173 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 138857925 C/G 1 9 7 16 4.21252561103493 3.72359119141728 0.488934419617648 C:G C G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138857855_138858789:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000509573:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511886:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502825:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138857855_138858093:TMEM173 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 138861078 C/T 1 12 9 21 5.61670081471324 4.78747438896507 0.829226425748162 T:C C T 10 0.531941598773897 0.828237202108702 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138860375_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138861063_138861214:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514119:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000515507:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511850:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502362:exon_138860831_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514348:exon_138861004_138861289:TMEM173 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 138861146 C/G 1 8 10 18 3.74446720980882 5.31941598773897 -1.57494877793015 C:G C G 10 0.531941598773897 0.487247762768628 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138860375_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138861063_138861214:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514119:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000515507:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511850:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502362:exon_138860831_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514348:exon_138861004_138861289:TMEM173 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 139574050 G/A 1 107 65 172 50.082248931193 34.5762039203033 15.5060450108897 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0178897643434776 ENSG00000120306:ENST00000261811:exon_139574031_139574237:C5orf32;ENSG00000120306:ENST00000509589:exon_139574031_139574237:C5orf32;ENSG00000120306:ENST00000504227:exon_139574031_139574237:C5orf32 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 139931779 T/A 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 A:T T A 10 0.531941598773897 1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 140023238 C/G 1 6 5 11 2.80835040735662 2.65970799386948 0.148642413487133 C:G C G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000113119:ENST00000394671:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000252100:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000510336:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000509605:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000515265:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000509269:exon_140022948_140023260:TMCO6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 140048209 T/C 1 4 9 13 1.87223360490441 4.78747438896507 -2.91524078406066 T:C T C 10 0.531941598773897 0.162564563323673 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000403979:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140048197_140048376:WDR55 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 140048544 C/T 1 11 17 28 5.14864241348713 9.04300717915625 -3.89436476566912 T:C C T 10 0.531941598773897 0.184263926200264 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000403979:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140048476_140048833:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511364:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000520764:exon_140048506_140048575:WDR55 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 140057535 G/A 1 45 55 100 21.0626280551746 29.2567879325643 -8.1941598773897 A:G G A 10 0.531941598773897 0.109050601514790 ENSG00000170445:ENST00000504156:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000457527:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000431330:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000504366:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000307633:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000448240:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000438307:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000415192:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000512655:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000506579:exon_140057240_140058712:HARS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 141307833 T/C 1 24 25 49 11.2334016294265 13.2985399693474 -2.06513833992095 T:C T C 10 0.531941598773897 0.569952387388795 ENSG00000081791:ENST00000432126:exon_141307716_141307863:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000194118:exon_141307716_141307863:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000508751:exon_141307716_141307863:KIAA0141 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 141309265 C/T 1 24 26 50 11.2334016294265 13.8304815681213 -2.59707993869485 T:C C T 10 0.531941598773897 0.48144383909983 ENSG00000081791:ENST00000432126:exon_141309147_141309305:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000194118:exon_141309147_141309305:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000508751:exon_141309147_141309305:KIAA0141 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 145506100 G/A 1 18 9 27 8.42505122206985 4.78747438896507 3.63757683310478 A:G G A 10 0.531941598773897 0.180522865991152 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145505998_145506108:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145505998_145506108:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145505998_145506108:LARS;ENSG00000133706:ENST00000506231:exon_145505998_145506108:LARS;ENSG00000133706:ENST00000508709:exon_145505998_145506108:LARS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 145650597 A/G 1 18 9 27 8.42505122206985 4.78747438896507 3.63757683310478 A:G A G 10 0.531941598773897 0.180522865991152 ENSG00000091009:ENST00000506502:exon_145650517_145650621:RBM27;ENSG00000091009:ENST00000265271:exon_145650517_145650621:RBM27 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 147805120 T/C 1 3 11 14 1.40417520367831 5.85135758651287 -4.44718238283456 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0283658467048123 ENSG00000145868:ENST00000340253:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000296701:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000394370:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000513826:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000514832:exon_147805085_147805264:FBXO38 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 148747902 G/C 1 9 7 16 4.21252561103493 3.72359119141728 0.488934419617648 C:G G C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000145882:ENST00000274569:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000511945:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000505669:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000503240:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000514349:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000507621:exon_148747556_148749216:PCYOX1L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 149374932 T/C 1 5 5 10 2.34029200613052 2.65970799386948 -0.31941598773897 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000164296:ENST00000296736:exon_149372681_149375992:TIGD6;ENSG00000164296:ENST00000515406:exon_149374291_149375992:TIGD6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 149754991 C/T 1 20 14 34 9.36116802452206 7.44718238283456 1.9139856416875 T:C C T 10 0.531941598773897 0.607120734276307 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149754946_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149754180_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149754902_149755117:TCOF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 149755421 A/G 1 30 53 83 14.0417520367831 28.1929047350165 -14.1511526982335 A:G A G 10 0.531941598773897 0.00197835147128758 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149755284_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149755284_149755472:TCOF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 149755744 G/C 1 25 45 70 11.7014600306526 23.9373719448254 -12.2359119141728 C:G G C 10 0.531941598773897 0.00383386810693901 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149755284_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149755645_149755893:TCOF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 149759096 T/C 1 40 50 90 18.7223360490441 26.5970799386949 -7.87474388965073 T:C T C 10 0.531941598773897 0.1127127279507 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149759095_149760422:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000506063:exon_149759095_149759207:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000506767:exon_149759095_149759295:TCOF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 149772280 C/G 1 24 22 46 11.2334016294265 11.7027151730257 -0.469313543599263 C:G C G 10 0.531941598773897 0.883994147438566 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149771520_149774479:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000506630:exon_149772268_149772454:TCOF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 149772954 T/A 1 43 24 67 20.1265112527224 12.7665983705735 7.3599128821489 A:T T A 10 0.531941598773897 0.0859693084756458 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149772935_149773115:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149772935_149773115:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149772935_149773115:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149772935_149773115:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149772935_149773115:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149772935_149773115:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149772935_149773115:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149772935_149773115:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149772935_149773115:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149772935_149773115:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149771520_149774479:TCOF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 149907533 T/G 1 6 2 8 2.80835040735662 1.06388319754779 1.74446720980882 T:G T G 10 0.531941598773897 0.297069782823554 ENSG00000070614:ENST00000523767:exon_149907366_149907860:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000261797:exon_149907366_149907860:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000424060:exon_149907366_149907860:NDST1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 150425467 G/A 1 70 83 153 32.7640880858272 44.1511526982335 -11.3870646124062 A:T:G G A 10 0.531941598773897 0.0744120946322739 ENSG00000145901:ENST00000520931:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000389378:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000315050:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523338:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000417127:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522226:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000519339:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521591:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000518977:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000524280:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523200:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521782:exon_150425422_150425922:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522100:exon_150425427_150425511:TNIP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 150512740 G/A 1 116 130 246 54.2947745422279 69.1524078406066 -14.8576332983787 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0637424570685414 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150512655_150512748:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150512655_150512748:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150512655_150512748:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517707:exon_150512655_150512884:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517677:exon_150512655_150512748:ANXA6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 150518988 G/A 1 111 96 207 51.9544825360974 51.0663934822941 0.888089053803313 A:G G A 10 0.531941598773897 0.944507666636699 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517486:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000519644:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517677:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521749:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517757:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000520378:exon_150518239_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523164:exon_150518914_150519008:ANXA6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 150565008 C/T 1 6 11 17 2.80835040735662 5.85135758651287 -3.04300717915625 T:C C T 10 0.531941598773897 0.152165296741825 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150565008_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000522964:exon_150564983_150565102:CCDC69 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 150578574 A/G 1 18 11 29 8.42505122206985 5.85135758651287 2.57369363555699 A:G A G 10 0.531941598773897 0.35905385704836 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000524344:exon_150578403_150578645:CCDC69 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 150647012 A/G 1 27 26 53 12.6375768331048 13.8304815681213 -1.19290473501654 A:G A G 10 0.531941598773897 0.784009164648988 ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150646857_150650001:GM2A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 159520661 T/C 1 7 2 9 3.27640880858272 1.06388319754779 2.21252561103493 T:C T C 10 0.531941598773897 0.187705653333192 ENSG00000170234:ENST00000456329:exon_159520108_159521072:PWWP2A;ENSG00000170234:ENST00000523662:exon_159520108_159521072:PWWP2A;ENSG00000170234:ENST00000307063:exon_159518349_159521072:PWWP2A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 159835658 A/G 1 26 38 64 12.1695184318787 20.2137807534081 -8.04426232152941 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0456817279582368 ENSG00000164609:ENST00000297151:exon_159835657_159835704:SLU7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 167943827 G/A 1 50 41 91 23.4029200613051 21.8096055497298 1.59331451157537 A:G G A 10 0.531941598773897 0.753862804734237 ENSG00000113643:ENST00000231572:exon_167943783_167943955:RARS;ENSG00000113643:ENST00000520013:exon_167943783_167943955:RARS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 169021610 C/T 1 14 15 29 6.55281761716544 7.97912398160846 -1.42630636444301 T:C C T 10 0.531941598773897 0.710526726608856 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000510751:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000505977:exon_169021575_169021685:CCDC99 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 169028481 T/C 1 19 16 35 8.89310962329596 8.51106558038235 0.382044042913604 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169028284_169029025:CCDC99 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 169031150 T/C 1 18 22 40 8.42505122206985 11.7027151730257 -3.27766395095588 T:C T C 10 0.531941598773897 0.342865080172527 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 169031218 G/T 1 19 12 31 8.89310962329596 6.38329918528676 2.50981043800919 T:G G T 10 0.531941598773897 0.472209331224685 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 169127097 C/A 1 13 10 23 6.08475921593934 5.31941598773897 0.765343228200368 A:C C A 10 0.531941598773897 0.836065752858423 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169127018_169127143:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169127018_169127143:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169127018_169127143:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523684:exon_169127018_169127143:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519223:exon_169127018_169127143:DOCK2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 169267784 G/A 1 22 19 41 10.2972848269743 10.106890376704 0.190394450270222 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520836:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520181:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519628:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169267761_169267856:DOCK2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 169435713 A/C 1 34 26 60 15.9139856416875 13.8304815681213 2.08350407356618 A:C A C 10 0.531941598773897 0.607581999578829 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169435692_169435750:DOCK2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 169504743 T/C 1 31 18 49 14.5098104380092 9.57494877793015 4.93486166007905 T:C T C 10 0.531941598773897 0.197237402071828 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520450:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519868:exon_169504714_169504841:DOCK2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 171533629 A/G 1 25 25 50 11.7014600306526 13.2985399693474 -1.59707993869485 A:G A G 10 0.531941598773897 0.672871060346848 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 171533656 C/T 1 22 24 46 10.2972848269743 12.7665983705735 -2.46931354359926 T:C C T 10 0.531941598773897 0.555014626360537 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 171533782 T/C 1 22 21 43 10.2972848269743 11.1707735742518 -0.873488747277571 T:C T C 10 0.531941598773897 0.878828782939674 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000519710:exon_171533666_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000521322:exon_171533714_171534038:STK10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 172359509 G/T 1 20 11 31 9.36116802452206 5.85135758651287 3.50981043800919 T:G G T 10 0.531941598773897 0.280029533205116 ENSG00000113719:ENST00000393784:exon_172359439_172359539:ERGIC1;ENSG00000113719:ENST00000523650:exon_172359439_172359539:ERGIC1;ENSG00000113719:ENST00000521392:exon_172359439_172359514:ERGIC1;ENSG00000113719:ENST00000520399:exon_172359439_172365010:ERGIC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 176370402 A/G 1 10 10 20 4.68058401226103 5.31941598773897 -0.63883197547794 A:G A G 10 0.531941598773897 0.825252984872384 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176370328_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176370336_176370489:UIMC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 176382995 G/A 1 7 6 13 3.27640880858272 3.19164959264338 0.0847592159393384 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176382960_176383036:UIMC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 176830627 G/A 1 3 6 9 1.40417520367831 3.19164959264338 -1.78747438896507 A:G G A 10 0.531941598773897 0.320650472569791 ENSG00000131187:ENST00000502854:exon_176830482_176831091:F12;ENSG00000131187:ENST00000504406:exon_176830255_176830751:F12;ENSG00000131187:ENST00000510358:exon_176830482_176831473:F12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 176863519 G/C 1 73 81 154 34.1682632895055 43.0872695006857 -8.91900621118014 C:G G C 10 0.531941598773897 0.169662947260752 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000507633:exon_176863394_176863686:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176863394_176863531:GRK6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 176867943 A/G 1 44 28 72 20.5945696539485 14.8943647656691 5.70020488827942 A:G A G 10 0.531941598773897 0.194806859827427 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176867920_176868054:GRK6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 176885499 T/C 1 60 66 126 28.0835040735662 35.1081455190772 -7.02464144551103 T:C T C 10 0.531941598773897 0.212748343312383 ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000512501:exon_176884368_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000467054:exon_176885298_176885708:DBN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 176894756 C/T 1 54 60 114 25.2751536662096 31.9164959264338 -6.64134226022426 T:C C T 10 0.531941598773897 0.223230437404419 ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176894482_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000477391:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000506117:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000514833:exon_176894744_176894818:DBN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 176915143 C/T 1 17 28 45 7.95699282084375 14.8943647656691 -6.93737194482537 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0509693895156853 ENSG00000196923:ENST00000493815:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000359895:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000356618:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355841:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000460994:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000486828:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393551:exon_176914898_176915249:PDLIM7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 176916516 C/T 1 21 19 40 9.82922642574816 10.106890376704 -0.277663950955882 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000196923:ENST00000493815:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000359895:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000356618:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355841:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000460994:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000486828:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393551:exon_176916394_176916628:PDLIM7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 176940384 G/A 1 45 46 91 21.0626280551746 24.4693135435993 -3.40668548842463 A:G G A 10 0.531941598773897 0.528791362610186 ENSG00000183258:ENST00000330503:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507955:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000505081:exon_176940354_176940848:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000503078:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507900:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000504807:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000512027:exon_176940003_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000511040:exon_176940354_176940485:DDX41 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 176958397 G/A 1 7 5 12 3.27640880858272 2.65970799386948 0.616700814713236 A:G G A 10 0.531941598773897 0.779881793407808 ENSG00000146067:ENST00000510479:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000506955:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000329540:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000510163:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000524677:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000442143:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000443375:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000513502:exon_176958283_176958835:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000506064:exon_176958339_176958522:FAM193B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 177022428 C/T 1 144 158 302 67.4004097765588 84.0467726062757 -16.6463628297169 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0570966065009627 ENSG00000184840:ENST00000332598:exon_177022268_177023125:TMED9;ENSG00000184840:ENST00000513799:exon_177022268_177022578:TMED9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 177031348 T/C 1 13 14 27 6.08475921593934 7.44718238283456 -1.36242316689522 T:C T C 10 0.531941598773897 0.700745604151725 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000502420:exon_177031280_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000510761:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505468:exon_177031067_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000507061:exon_177031313_177031542:B4GALT7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 177637627 C/T 1 321 305 626 150.246746793579 162.242187626039 -11.9954408324595 A:T:C:G C T 10 0.531941598773897 0.336817857004749 ENSG00000197451:ENST00000358344:exon_177637554_177638164:HNRNPAB;ENSG00000197451:ENST00000506339:exon_177637554_177638156:HNRNPAB;ENSG00000197451:ENST00000355836:exon_177637554_177638143:HNRNPAB;ENSG00000197451:ENST00000514633:exon_177637554_177638120:HNRNPAB;ENSG00000197451:ENST00000515193:exon_177637554_177638156:HNRNPAB;ENSG00000197451:ENST00000506259:exon_177637554_177638150:HNRNPAB;ENSG00000197451:ENST00000504898:exon_177637554_177638143:HNRNPAB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 178140090 C/T 1 8 3 11 3.74446720980882 1.59582479632169 2.14864241348713 T:C C T 10 0.531941598773897 0.23704105185636 ENSG00000169131:ENST00000335815:exon_178138593_178140622:ZNF354A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 179036457 G/C 1 21 23 44 9.82922642574816 12.2346567717996 -2.40543034605147 C:G G C 10 0.531941598773897 0.54624699205029 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179036377_179037027:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179036377_179036520:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179036377_179037019:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179036377_179037012:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179036377_179037013:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000503583:exon_179036377_179036473:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000508797:exon_179036377_179036971:RUFY1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 179228377 G/A 1 32 27 59 14.9778688392353 14.3624231668952 0.615445672340076 A:G G A 10 0.531941598773897 0.896950747663544 ENSG00000161013:ENST00000337755:exon_179228334_179228467:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000292591:exon_179228334_179228467:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000519836:exon_179228334_179228467:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000429098:exon_179228334_179228467:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000523382:exon_179228334_179228389:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000523108:exon_179228334_179228467:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000521305:exon_179228334_179228467:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000523329:exon_179228334_179228467:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000518168:exon_179228334_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520134:exon_179228375_179228467:MGAT4B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 179228893 G/C 1 13 21 34 6.08475921593934 11.1707735742518 -5.0860143583125 C:G G C 10 0.531941598773897 0.0873779889613261 ENSG00000161013:ENST00000337755:exon_179228784_179229998:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000292591:exon_179228784_179228969:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000519836:exon_179228784_179228909:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000429098:exon_179228784_179228969:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000523108:exon_179228784_179228969:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520918:exon_179228784_179229115:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000521305:exon_179228784_179228969:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000523329:exon_179228784_179228969:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000518168:exon_179228784_179228969:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520134:exon_179228784_179228969:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000519616:exon_179228807_179228969:MGAT4B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 179260153 C/T 1 123 104 227 57.5711833508107 55.3219262724853 2.24925707832537 A:T:C C T 10 0.531941598773897 0.790426786163704 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 179260213 G/A 1 173 154 327 80.9741034121158 81.9190062111801 -0.944902799064337 A:G G A 10 0.531941598773897 0.955820413818644 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 179290845 T/G 1 38 30 68 17.7862192465919 15.9582479632169 1.827971283375 T:G T G 10 0.531941598773897 0.716066882090836 ENSG00000197226:ENST00000518085:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179289738_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520794:exon_179289743_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000524222:exon_179290404_179291128:TBC1D9B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 5 180218668 A/G 1 54 42 96 25.2751536662096 22.3415471485037 2.93360651770589 A:G A G 10 0.531941598773897 0.609399827227737 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 104 45 149 48.6780737275147 23.9373719448254 24.7407017826893 A:G G A 10 0.531941598773897 4.96176244361464e-05 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 564145 A/G 1 10 6 16 4.68058401226103 3.19164959264338 1.48893441961765 A:G A G 10 0.531941598773897 0.61793977257828 ENSG00000112685:ENST00000230449:exon_564033_564154:EXOC2;ENSG00000112685:ENST00000448181:exon_564033_564154:EXOC2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 599209 T/C 1 4 6 10 1.87223360490441 3.19164959264338 -1.31941598773897 T:C T C 10 0.531941598773897 0.530535902085358 ENSG00000112685:ENST00000230449:exon_599080_599225:EXOC2;ENSG00000112685:ENST00000448181:exon_599080_599225:EXOC2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 2784571 G/A 1 13 7 20 6.08475921593934 3.72359119141728 2.36116802452206 A:G G A 10 0.531941598773897 0.371872863862178 ENSG00000124535:ENST00000380773:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380771:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380769:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380764:exon_2784558_2784637:WRNIP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 4031998 A/G 1 60 46 106 28.0835040735662 24.4693135435993 3.61419052996692 A:G A G 10 0.531941598773897 0.497251877440904 ENSG00000112739:ENST00000480058:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000337659:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000489943:exon_4031793_4032335:PRPF4B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 4116262 G/A 1 50 49 99 23.4029200613051 26.065138339921 -2.6622182786158 A:G G A 10 0.531941598773897 0.615479134625771 ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4115923_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4115927_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4115934_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4115936_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000478266:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4115941_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4115942_4116263:PECI HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 4999011 A/G 1 4 7 11 1.87223360490441 3.72359119141728 -1.85135758651287 A:G A G 10 0.531941598773897 0.36707898879345 ENSG00000124787:ENST00000380051:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000319533:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000380053:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000464646:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000468105:exon_4998922_4999075:RPP40 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 8413890 A/G 1 11 4 15 5.14864241348713 2.12776639509559 3.02087601839155 A:G A G 10 0.531941598773897 0.129673765714287 ENSG00000124786:ENST00000379660:exon_8413301_8413932:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000437942:exon_8413303_8413932:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000413108:exon_8413303_8413932:SLC35B3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 11185533 G/A 1 9 15 24 4.21252561103493 7.97912398160846 -3.76659837057353 A:G G A 10 0.531941598773897 0.152424127615418 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11183539_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11185051_11185904:NEDD9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 11213832 T/C 1 7 12 19 3.27640880858272 6.38329918528676 -3.10689037670404 T:C T C 10 0.531941598773897 0.172695126179914 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000379433:exon_11213514_11213960:NEDD9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 12124587 C/G 1 7 3 10 3.27640880858272 1.59582479632169 1.68058401226103 C:G C G 10 0.531941598773897 0.3537387028518 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 12296255 G/T 1 3 9 12 1.40417520367831 4.78747438896507 -3.38329918528676 T:G G T 10 0.531941598773897 0.0789092376202323 ENSG00000078401:ENST00000379375:exon_12296195_12297427:EDN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 13794147 C/T 1 24 22 46 11.2334016294265 11.7027151730257 -0.469313543599263 T:C C T 10 0.531941598773897 0.883994147438566 ENSG00000050393:ENST00000379170:exon_13794126_13794179:CCDC90A;ENSG00000050393:ENST00000488770:exon_13794126_13794179:CCDC90A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 14118034 G/A 1 26 21 47 12.1695184318787 11.1707735742518 0.998744857626839 A:G G A 10 0.531941598773897 0.88400076579589 ENSG00000112149:ENST00000379153:exon_14117872_14118079:CD83 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 15524866 G/A 1 19 30 49 8.89310962329596 15.9582479632169 -7.06513833992095 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0457048345668063 ENSG00000047579:ENST00000344537:exon_15524757_15524900:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000462989:exon_15524757_15524900:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000510395:exon_15524757_15524900:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000355917:exon_15524757_15524900:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000397306:exon_15524757_15524900:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000515875:exon_15524757_15524898:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000513680:exon_15524757_15524898:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000509674:exon_15524757_15524900:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000511762:exon_15524776_15524900:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000338950:exon_15523794_15524900:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000506844:exon_15524216_15524900:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000514651:exon_15524343_15524900:DTNBP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 16145149 C/T 1 11 5 16 5.14864241348713 2.65970799386948 2.48893441961765 T:C C T 10 0.531941598773897 0.316542725286372 ENSG00000007944:ENST00000356840:exon_16145128_16145548:MYLIP;ENSG00000007944:ENST00000349606:exon_16145128_16145548:MYLIP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 16145325 A/G 1 9 13 22 4.21252561103493 6.91524078406066 -2.70271517302573 A:G A G 10 0.531941598773897 0.288586288224940 ENSG00000007944:ENST00000356840:exon_16145128_16145548:MYLIP;ENSG00000007944:ENST00000349606:exon_16145128_16145548:MYLIP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 16306751 G/A 1 12 4 16 5.61670081471324 2.12776639509559 3.48893441961765 A:G G A 10 0.531941598773897 0.130296081303923 ENSG00000124788:ENST00000244769:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000436367:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000450222:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000379065:exon_16306534_16307090:ATXN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 17665479 G/C 1 1 9 10 0.468058401226103 4.78747438896507 -4.31941598773897 C:G G C 10 0.531941598773897 0.00805407978646269 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17665470_17665616:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17665470_17665616:NUP153 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 17675246 T/C 1 9 9 18 4.21252561103493 4.78747438896507 -0.574948777930146 T:C T C 10 0.531941598773897 0.81714898933323 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17675136_17675264:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17675136_17675264:NUP153 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 17688798 G/A 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 A:G G A 10 0.531941598773897 0.730998912113487 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17688627_17688849:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17688627_17688849:NUP153 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 24403455 C/T 1 8 5 13 3.74446720980882 2.65970799386948 1.08475921593934 A:T:C C T 10 0.531941598773897 0.591209044900214 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24403153_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24403153_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24403420_24403464:MRS2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 24418348 G/A 1 6 4 10 2.80835040735662 2.12776639509559 0.68058401226103 A:G G A 10 0.531941598773897 0.758887050232993 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24418312_24418395:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24418312_24418464:MRS2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 24418786 T/C 1 7 6 13 3.27640880858272 3.19164959264338 0.0847592159393384 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24418689_24419469:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24418689_24418791:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24418689_24418789:MRS2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 24653273 G/C 1 8 11 19 3.74446720980882 5.85135758651287 -2.10689037670404 C:G G C 10 0.531941598773897 0.365044702459487 ENSG00000111802:ENST00000378198:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000478507:exon_24653211_24653381:TDP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 24666739 C/T 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24666347_24666819:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000480495:exon_24666215_24666839:TDP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 24780892 A/C 1 17 15 32 7.95699282084375 7.97912398160846 -0.0221311607647046 A:C A C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000112312:ENST00000356509:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000230056:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378054:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000476555:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378059:exon_24780891_24780968:GMNN HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 26157100 C/T 1 5 7 12 2.34029200613052 3.72359119141728 -1.38329918528676 T:C C T 10 0.531941598773897 0.56545794539378 ENSG00000168298:ENST00000304218:exon_26156559_26157343:HIST1H1E HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 26205059 C/T 1 11 2 13 5.14864241348713 1.06388319754779 4.08475921593934 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0259151954441924 ENSG00000198518:ENST00000360441:exon_26204858_26206266:HIST1H4E HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 26370605 T/C 1 15 4 19 7.02087601839154 2.12776639509559 4.89310962329596 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0358055876553866 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 26413368 T/G 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 T:G T G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000026950:ENST00000476549:exon_26412933_26413474:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000513047:exon_26412933_26413445:BTN3A1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 26446209 C/T 1 6 5 11 2.80835040735662 2.65970799386948 0.148642413487133 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000111801:ENST00000244519:exon_26445932_26446213:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000361232:exon_26445932_26446213:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000496719:exon_26445932_26446211:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000480110:exon_26444185_26446213:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000457225:exon_26445932_26446213:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000339789:exon_26445932_26446213:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000396921:exon_26445932_26446213:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000487272:exon_26445932_26446213:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000483179:exon_26445766_26446213:BTN3A3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 28270047 C/G 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 C:G C G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28268501_28270326:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28268501_28270325:PGBD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 29523952 A/G 1 15 15 30 7.02087601839154 7.97912398160846 -0.958247963216911 A:G A G 10 0.531941598773897 0.85523751660529 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 29640951 T/C 1 8 4 12 3.74446720980882 2.12776639509559 1.61670081471324 T:C T C 10 0.531941598773897 0.3994437340124 ENSG00000204644:ENST00000488757:exon_29640169_29641535:ZFP57;ENSG00000204644:ENST00000376883:exon_29640260_29641535:ZFP57;ENSG00000204644:ENST00000376881:exon_29640277_29641402:ZFP57 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 29691582 C/A 1 265 253 518 124.035476324917 134.581224489796 -10.5457481648787 A:C C A 10 0.531941598773897 0.355543551275604 ENSG00000204642:ENST00000376861:exon_29691435_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000414333:exon_29691435_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29691435_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29691580_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29691435_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000334668:exon_29691435_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29691435_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000462777:exon_29691169_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29691435_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000482257:exon_29691547_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29691219_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000434407:exon_29691435_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000433607:exon_29691435_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000486194:exon_29691281_29691704:HLA-F HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 29910663 G/A 1 44 744 788 20.5945696539485 395.764549487779 -375.169979833831 A:G G A 10 0.531941598773897 1.70047052626727e-185 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 29910801 C/A 0 0 89 89 0 47.3428022908768 -47.3428022908768 A C A 10 0.531941598773897 4.53632321885437e-30 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 29911356 G/A 1 8 16 24 3.74446720980882 8.51106558038235 -4.76659837057353 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0646356762041263 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 30154199 T/C 1 15 16 31 7.02087601839154 8.51106558038235 -1.49018956199081 T:C T C 10 0.531941598773897 0.595424051385011 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000480999:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30152234_30154335:TRIM26 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 30313268 G/A 1 22 18 40 10.2972848269743 9.57494877793015 0.72233604904412 A:G G A 10 0.531941598773897 0.874959579214964 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30313268_30313350:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30313268_30313350:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30313244_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000466327:exon_30313268_30313706:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30313075_30314334:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30313075_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30313268_30313350:RPP21 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 30514924 G/A 1 67 78 145 31.3599128821489 41.491444704364 -10.1315318222151 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0963258741920632 ENSG00000204590:ENST00000376621:exon_30514889_30515051:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000429126:exon_30514889_30515051:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000426875:exon_30514889_30515051:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000376602:exon_30514889_30515051:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430946:exon_30514889_30515051:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430441:exon_30514889_30515051:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000462708:exon_30514889_30515051:GNL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 30647005 C/G 1 78 59 137 36.508555295636 31.3845543276599 5.12400096797611 C:G C G 10 0.531941598773897 0.393122118390228 ENSG00000146112:ENST00000274853:exon_30646956_30647166:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000399199:exon_30646956_30647166:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000488324:exon_30646956_30647166:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000467662:exon_30646956_30647166:KIAA1949 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 30671989 G/C 1 21 28 49 9.82922642574816 14.8943647656691 -5.06513833992095 C:G G C 10 0.531941598773897 0.154586770372788 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 30672463 G/A 1 22 11 33 10.2972848269743 5.85135758651287 4.4459272404614 A:G G A 10 0.531941598773897 0.16197606612851 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000420817:exon_30672237_30672602:MDC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 30864829 T/C 1 7 2 9 3.27640880858272 1.06388319754779 2.21252561103493 T:C T C 10 0.531941598773897 0.187705653333192 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000361741:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000482873:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000417521:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000514434:exon_30864791_30864918:DDR1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 30867106 C/T 1 12 12 24 5.61670081471324 6.38329918528676 -0.766598370573529 T:C C T 10 0.531941598773897 0.83900902365855 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30866933_30867931:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30866933_30867617:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30866933_30867930:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30866933_30867209:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30866933_30867195:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30866665_30867181:DDR1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 30877760 A/C 1 4 9 13 1.87223360490441 4.78747438896507 -2.91524078406066 A:C A C 10 0.531941598773897 0.162564563323673 ENSG00000213780:ENST00000259895:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000376316:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000453897:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000487746:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30877709_30877840:VARS2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 30881103 C/A 1 19 19 38 8.89310962329596 10.106890376704 -1.21378075340809 A:C C A 10 0.531941598773897 0.746422583726184 ENSG00000213780:ENST00000259895:exon_30881086_30881164:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000376316:exon_30881086_30881164:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000483318:exon_30880887_30881164:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000475845:exon_30881086_30881164:GTF2H4;ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30881086_30881164:VARS2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 30893728 C/T 1 26 31 57 12.1695184318787 16.4901895619908 -4.32067113011213 T:C C T 10 0.531941598773897 0.288669287323157 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893657_30893785:VARS2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 30893941 G/A 1 29 39 68 13.573693635557 20.745722352182 -7.17202871662499 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0891607682178193 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893886_30894236:VARS2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31116210 G/A 1 4 7 11 1.87223360490441 3.72359119141728 -1.85135758651287 A:G G A 10 0.531941598773897 0.36707898879345 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31122500 G/A 1 13 11 24 6.08475921593934 5.85135758651287 0.233401629426472 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31122333_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31122349_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31122371_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31122388_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31122460_31122576:CCHCR1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31130292 C/T 1 19 16 35 8.89310962329596 8.51106558038235 0.382044042913604 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31130254_31130784:TCF19 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31237124 T/C 1 1596 858 2454 747.02120835686 456.405891748004 290.615316608857 A:T:C:G T C 10 0.531941598773897 1.72830578421189e-32 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31237162 C/G 1 1654 572 2226 774.168595627974 304.270594498669 469.898001129305 A:C:G C G 10 0.531941598773897 4.70839014613674e-93 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31239417 C/T 1 1152 557 1709 539.203278212471 296.291470517061 242.91180769541 T:C C T 10 0.531941598773897 1.03235002022718e-32 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31239449 C/G 1 745 1033 1778 348.703508913447 549.495671533436 -200.792162619989 A:T:C:G C G 10 0.531941598773897 1.69832058481946e-21 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31239506 C/G 1 699 339 1038 327.172822457046 180.328201984351 146.844620472695 C:G C G 10 0.531941598773897 2.53308975229176e-20 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31239821 G/T 1 680 33 713 318.27971283375 17.5540727595386 300.725640074211 T:G G T 10 0.531941598773897 4.56644669536877e-141 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239776_31239882:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239776_31239850:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239776_31239846:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31239776_31239867:HLA-C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31322911 C/T 1 2264 713 2977 1059.6842203759 379.274359925789 680.409860450109 A:T:C C T 10 0.531941598773897 4.17629911442547e-146 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31322899_31323000:HLA-B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31323353 G/A 1 406 210 616 190.031710897798 111.707735742518 78.3239751552794 A:T:C:G G A 10 0.531941598773897 1.87073154416740e-10 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31323094_31323579:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000426590:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000498007:exon_31323168_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000434333:exon_31323284_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000474381:exon_31323299_31324219:HLA-B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31431403 C/T 1 28 18 46 13.1056352343309 9.57494877793015 3.53068645640074 T:C C T 10 0.531941598773897 0.30602653954237 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31431757 A/G 1 33 36 69 15.4459272404614 19.1498975558603 -3.70397031539889 A:G A G 10 0.531941598773897 0.399601780965290 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31477668 T/C 1 5 9 14 2.34029200613052 4.78747438896507 -2.44718238283456 T:C T C 10 0.531941598773897 0.283917011510726 ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31477559_31478901:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31477559_31478901:MICB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31540784 C/A 1 148 116 264 69.2726433814632 61.7052254577721 7.56741792369119 A:C C A 10 0.531941598773897 0.355704574398137 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540705_31540810:LTA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31548451 A/G 1 212 224 436 99.2283810599338 119.154918125353 -19.9265370654191 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0611461836601039 ENSG00000227507:ENST00000483972:exon_31548302_31548940:LTB;ENSG00000227507:ENST00000429299:exon_31548332_31548940:LTB;ENSG00000227507:ENST00000446745:exon_31548332_31548940:LTB;ENSG00000227507:ENST00000482429:exon_31548401_31548940:LTB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31556922 C/T 1 31 33 64 14.5098104380092 17.5540727595386 -3.04426232152941 T:C C T 10 0.531941598773897 0.455184547726811 ENSG00000204475:ENST00000495600:exon_31556672_31557008:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000491161:exon_31556672_31557008:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000340027:exon_31556672_31556953:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376073:exon_31556672_31557008:NCR3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31595882 C/A 1 20 26 46 9.36116802452206 13.8304815681213 -4.46931354359926 A:C C A 10 0.531941598773897 0.236894498951614 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31595542_31596016:BAT2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31598489 A/G 1 17 12 29 7.95699282084375 6.38329918528676 1.57369363555699 A:G A G 10 0.531941598773897 0.582816143128388 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31598368_31598578:BAT2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31601344 T/C 1 95 85 180 44.4655481164798 45.2150358957812 -0.749487779301468 T:C T C 10 0.531941598773897 0.940521476805242 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31601156_31601424:BAT2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31602967 G/A 1 91 106 197 42.5933145115754 56.3858094700331 -13.7924949584577 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0537383425846829 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000484787:exon_31602909_31603093:BAT2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31603770 A/G 1 216 227 443 101.100614664838 120.750742921675 -19.6501282568364 A:T:G A G 10 0.531941598773897 0.0633761281264265 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603137_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603359_31603826:BAT2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31604591 C/T 1 176 153 329 82.3782786157941 81.3870646124062 0.991214003387881 T:C C T 10 0.531941598773897 0.955954999945598 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31604510_31604913:BAT2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31609272 T/C 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 T:C T C 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000204463:ENST00000462875:exon_31608602_31609369:BAT3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31627523 C/T 1 25 17 42 11.7014600306526 9.04300717915625 2.65845285149632 T:C C T 10 0.531941598773897 0.442766555360741 ENSG00000204439:ENST00000375911:exon_31626075_31628549:C6orf47 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31630241 C/T 1 42 37 79 19.6584528514963 19.6818391546342 -0.0233863031378654 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31632134 C/A 1 37 32 69 17.3181608453658 17.0221311607647 0.296029684601105 A:C C A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000440842:exon_31631660_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000458083:exon_31631762_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000445768:exon_31631800_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000432291:exon_31631935_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000456540:exon_31631987_31632354:BAT4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31639979 C/T 1 39 29 68 18.254277647818 15.426306364443 2.82797128337501 T:C C T 10 0.531941598773897 0.544253640388285 ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31639641_31641323:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31639641_31640059:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409691:exon_31639641_31641323:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375864:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375875:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000519488:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000530877:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409525:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000483905:exon_31639641_31641323:LY6G5B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31655438 G/A 1 20 9 29 9.36116802452206 4.78747438896507 4.57369363555699 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0965142656149156 ENSG00000204427:ENST00000395952:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000468205:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000475742:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000492084:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000375842:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000495769:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000440843:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000490209:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000474007:exon_31655352_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000471644:exon_31655430_31655517:BAT5;ENSG00000204422:ENST00000461287:exon_31655419_31655517:XXbac-BPG32J3.20 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31657413 T/C 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000204427:ENST00000395952:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000475742:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000492084:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000375842:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000495769:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000440843:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000471644:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000477016:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000498420:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204422:ENST00000461287:exon_31657358_31657481:XXbac-BPG32J3.20 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31729359 A/G 1 19 11 30 8.89310962329596 5.85135758651287 3.04175203678309 A:G A G 10 0.531941598773897 0.279377137902125 ENSG00000204410:ENST00000375755:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000534153:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375750:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528100:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375742:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395817:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000383401:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375703:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375740:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528640:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375696:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000423982:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000463144:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395853:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000431848:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000484309:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000429846:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000491552:exon_31729249_31729392:MSH5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31762843 G/C 1 9 4 13 4.21252561103493 2.12776639509559 2.08475921593934 C:G G C 10 0.531941598773897 0.279590414707516 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000440048:exon_31762608_31763276:VARS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31762844 G/T 1 8 4 12 3.74446720980882 2.12776639509559 1.61670081471324 T:G G T 10 0.531941598773897 0.3994437340124 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000440048:exon_31762608_31763276:VARS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31937318 A/G 1 54 52 106 25.2751536662096 27.6609631362426 -2.38580947003308 A:G A G 10 0.531941598773897 0.697276503860638 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31937292_31937530:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31937292_31937532:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31937057_31937528:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31937292_31937525:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000483553:exon_31937057_31937528:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000471818:exon_31937292_31937528:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000491994:exon_31937057_31937528:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000470453:exon_31937292_31937364:SKIV2L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31938072 T/C 1 6 15 21 2.80835040735662 7.97912398160846 -5.17077357425184 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0281796668922795 ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31938107 A/G 1 6 9 15 2.80835040735662 4.78747438896507 -1.97912398160846 A:G A G 10 0.531941598773897 0.316481765113816 ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31938412 G/T 1 24 15 39 11.2334016294265 7.97912398160846 3.25427764781802 T:G G T 10 0.531941598773897 0.337551815433964 ENSG00000204348:ENST00000491327:exon_31938120_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000485557:exon_31938383_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000477826:exon_31938383_31940029:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000337523:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375349:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000495340:exon_31938370_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000478221:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375356:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000480240:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000474587:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000492946:exon_31938219_31939458:DOM3Z HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 31938451 T/C 1 25 15 40 11.7014600306526 7.97912398160846 3.72233604904412 T:C T C 10 0.531941598773897 0.269296966874486 ENSG00000204348:ENST00000491327:exon_31938120_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000485557:exon_31938383_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000477826:exon_31938383_31940029:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000337523:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375349:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000495340:exon_31938370_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000478221:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375356:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000480240:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000474587:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000492946:exon_31938219_31939458:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000487914:exon_31938420_31938529:DOM3Z HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32097290 C/T 1 6 4 10 2.80835040735662 2.12776639509559 0.68058401226103 T:C C T 10 0.531941598773897 0.758887050232993 ENSG00000204315:ENST00000375156:exon_32096484_32097631:FKBPL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32122472 C/A 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 A:C C A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000221988:ENST00000414204:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000361568:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000478521:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000395523:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000428388:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000445576:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000324816:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000437001:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000375137:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000375143:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000424499:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000493548:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000422437:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000436118:exon_32122243_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000453656:exon_32122255_32122554:PPT2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32147696 G/A 1 26 1 27 12.1695184318787 0.531941598773897 11.6375768331048 A:G G A 10 0.531941598773897 1.58978273068595e-06 ENSG00000204308:ENST00000375094:exon_32147654_32147708:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000427134:exon_32147654_32147708:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375087:exon_32147654_32147708:RNF5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32148031 A/G 1 71 49 120 33.2321464870533 26.065138339921 7.16700814713236 A:G A G 10 0.531941598773897 0.201028233303407 ENSG00000204308:ENST00000375094:exon_32148006_32148570:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375085:exon_32148006_32148541:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375087:exon_32148006_32148541:RNF5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32151934 A/G 1 6 6 12 2.80835040735662 3.19164959264338 -0.383299185286765 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000204305:ENST00000484849:exon_32151658_32152023:AGER HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32157639 C/T 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000204304:ENST00000375050:exon_32157472_32157963:PBX2;ENSG00000204304:ENST00000478678:exon_32157472_32157719:PBX2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32407709 C/A 1 439 480 919 205.477638138259 255.331967411471 -49.8543292732114 A:T:C C A 10 0.531941598773897 0.00105689779141660 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32407619_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32407647_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000462200:exon_32407649_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32407655_32407809:HLA-DRA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32410941 T/C 1 6 4 10 2.80835040735662 2.12776639509559 0.68058401226103 T:C T C 10 0.531941598773897 0.758887050232993 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32411035 A/C 1 2373 2408 4781 1110.70258610954 1280.91536984754 -170.212783738002 A:T:C:G A C 10 0.531941598773897 8.88808665543264e-07 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32410962_32411243:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32410962_32411122:HLA-DRA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32411523 T/C 1 16 8 24 7.48893441961765 4.25553279019118 3.23340162942647 T:C T C 10 0.531941598773897 0.222052970761321 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32411646 T/G 1 3600 2695 6295 1685.01024441397 1433.58260869565 251.427635718318 A:T:C:G T G 10 0.531941598773897 2.07124343126164e-10 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32411533_32411698:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32411533_32411698:HLA-DRA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32411712 G/A 1 3 15 18 1.40417520367831 7.97912398160846 -6.57494877793015 A:G G A 10 0.531941598773897 0.00322052514194748 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32781554 G/A 1 54 55 109 25.2751536662096 29.2567879325643 -3.98163426635477 A:G G A 10 0.531941598773897 0.444758443999302 ENSG00000241106:ENST00000488325:exon_32781500_32781610:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32781500_32781610:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32781500_32782378:HLA-DOB;ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32781544_32781610:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32781544_32781610:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32783086 A/G 1 37 48 85 17.3181608453658 25.5331967411471 -8.21503589578125 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0820097380778988 ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32782821_32783090:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32782821_32783090:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000447394:exon_32782821_32783090:HLA-DOB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32797297 T/C 1 24 42 66 11.2334016294265 22.3415471485037 -11.1081455190772 T:C T C 10 0.531941598773897 0.00653180459879292 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32797177_32797313:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32805967 A/G 1 2 10 12 0.936116802452206 5.31941598773897 -4.38329918528676 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0169762852174207 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32805518_32806014:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32805518_32806014:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32805518_32806014:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32805518_32806010:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32805518_32806014:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32806029 G/C 0 0 13 13 0 6.91524078406066 -6.91524078406066 C G C 10 0.531941598773897 5.17488356924175e-05 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32809887 A/G 1 9 3 12 4.21252561103493 1.59582479632169 2.61670081471324 A:G A G 10 0.531941598773897 0.155839710778340 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32810792 G/T 1 161 89 250 75.3574025974026 47.3428022908768 28.0146003065258 A:T:G G T 10 0.531941598773897 0.000372569327424639 ENSG00000204264:ENST00000395339:exon_32810719_32810866:PSMB8;ENSG00000204264:ENST00000374882:exon_32810719_32810866:PSMB8;ENSG00000204264:ENST00000374881:exon_32810719_32810866:PSMB8;ENSG00000204264:ENST00000484003:exon_32810449_32810866:PSMB8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32810794 T/A 1 162 86 248 75.8254609986287 45.7469774945551 30.0784835040735 A:T:C T A 10 0.531941598773897 0.000126649560070751 ENSG00000204264:ENST00000395339:exon_32810719_32810866:PSMB8;ENSG00000204264:ENST00000374882:exon_32810719_32810866:PSMB8;ENSG00000204264:ENST00000374881:exon_32810719_32810866:PSMB8;ENSG00000204264:ENST00000484003:exon_32810449_32810866:PSMB8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32811629 G/T 1 106 171 277 49.6141905299669 90.9620133903364 -41.3478228603695 T:G G T 10 0.531941598773897 6.78372156192093e-07 ENSG00000204264:ENST00000395339:exon_32811627_32811797:PSMB8;ENSG00000204264:ENST00000374882:exon_32811627_32811824:PSMB8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32811752 C/T 1 63 26 89 29.4876792772445 13.8304815681213 15.6571977091232 T:C C T 10 0.531941598773897 0.000901945986540251 ENSG00000204264:ENST00000395339:exon_32811627_32811797:PSMB8;ENSG00000204264:ENST00000374882:exon_32811627_32811824:PSMB8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32814975 T/C 1 120 105 225 56.1670081471324 55.8538678712592 0.313140275873167 A:T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000487296:exon_32814845_32815452:TAP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32816402 T/G 0 9 0 9 4.21252561103493 0 4.21252561103493 T T 10 0.531941598773897 0.00448836920646731 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32818774 T/C 1 93 86 179 43.5294313140276 45.7469774945551 -2.21754618052757 T:C T C 10 0.531941598773897 0.764750249975405 ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32818721_32818926:TAP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32903412 T/C 1 131 137 268 61.3156505606195 72.8759990320239 -11.5603484714044 A:T:C T C 10 0.531941598773897 0.159627966062912 ENSG00000242574:ENST00000487996:exon_32903313_32904663:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000477537:exon_32903119_32904678:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000414017:exon_32903313_32903429:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32903309_32903429:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32903313_32903429:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32903313_32903429:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000440643:exon_32903313_32903429:HLA-DMB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32905086 G/T 1 120 89 209 56.1670081471324 47.3428022908768 8.82420585625552 T:C:G G T 10 0.531941598773897 0.238761078167972 ENSG00000242574:ENST00000438510:exon_32904949_32905216:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000414017:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000440643:exon_32904949_32905233:HLA-DMB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32916555 G/A 1 106 165 271 49.6141905299669 87.770363797693 -38.1561732677261 A:G G A 10 0.531941598773897 4.34891054923339e-06 ENSG00000204257:ENST00000480785:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000395305:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000395303:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000477541:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000374843:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000532100:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000341486:exon_32916391_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000473725:exon_32916518_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000464392:exon_32916548_32916645:HLA-DMA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32917042 A/C 1 4 22 26 1.87223360490441 11.7027151730257 -9.83048156812132 A:C A C 10 0.531941598773897 9.87537273815312e-05 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32944746 G/A 1 13 22 35 6.08475921593934 11.7027151730257 -5.6179559570864 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0631501463112631 ENSG00000204256:ENST00000464592:exon_32944339_32945347:BRD2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32946133 T/C 1 164 165 329 76.7615778010809 87.770363797693 -11.0087859966121 T:C T C 10 0.531941598773897 0.224800280223787 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000463639:exon_32945903_32946578:BRD2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32948426 C/T 1 335 296 631 156.799564410744 157.454713237074 -0.655148826329025 T:C C T 10 0.531941598773897 0.968194173777189 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32948359_32949281:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32948359_32949281:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000469132:exon_32948359_32949063:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482838:exon_32948359_32948543:BRD2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 32975257 C/T 1 21 17 38 9.82922642574816 9.04300717915625 0.786219246591912 T:C C T 10 0.531941598773897 0.871549817766073 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000485901:exon_32974857_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000495532:exon_32975222_32975654:HLA-DOA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 33048640 A/G 0 73 0 73 34.1682632895055 0 34.1682632895055 A A 10 0.531941598773897 1.27025149322777e-20 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000469120:exon_33048449_33049009:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000488575:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000471184:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33048220_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33048466_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 33052950 T/C 1 715 129 844 334.661756876664 68.6204662418327 266.041290634831 T:C T C 10 0.531941598773897 1.11484235758162e-83 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 33052958 C/T 1 807 109 916 377.723129789465 57.9816342663548 319.74149552311 T:C C T 10 0.531941598773897 6.11335689036158e-114 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 33052986 T/C 1 775 83 858 362.74526095023 44.1511526982335 318.594108251996 T:C T C 10 0.531941598773897 2.57060416137720e-123 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 33053577 G/A 1 858 214 1072 401.594108251996 113.835502137614 287.758606114382 A:G G A 10 0.531941598773897 7.32342660952668e-75 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33053556_33053683:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33053556_33053683:HLA-DPB1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 33235755 G/A 1 11 12 23 5.14864241348713 6.38329918528676 -1.23465677179963 A:G G A 10 0.531941598773897 0.678419761183294 ENSG00000223501:ENST00000482399:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000445902:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000478934:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000418054:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000495755:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000463486:exon_33235647_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000464425:exon_33235648_33235774:VPS52 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 33258443 G/A 1 10 7 17 4.68058401226103 3.72359119141728 0.956992820843751 A:G G A 10 0.531941598773897 0.809031865435945 ENSG00000204220:ENST00000395134:exon_33258103_33258652:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000491382:exon_33257951_33258645:PFDN6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 33261446 A/G 1 3 8 11 1.40417520367831 4.25553279019118 -2.85135758651287 A:G A G 10 0.531941598773897 0.128574530340517 ENSG00000237441:ENST00000491168:exon_33261381_33261476:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000483151:exon_33261190_33261476:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000437840:exon_33261381_33261476:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000466866:exon_33261381_33261476:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000497454:exon_33261381_33261476:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000421215:exon_33261381_33261476:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000471319:exon_33261190_33261476:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000476616:exon_33261381_33261476:RGL2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 33287183 T/C 1 146 108 254 68.336526579011 57.4496926675809 10.8868339114302 T:C T C 10 0.531941598773897 0.186662607527057 ENSG00000204209:ENST00000266000:exon_33287157_33287631:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000374542:exon_33287157_33287631:DAXX HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 33288271 A/G 1 60 58 118 28.0835040735662 30.852612728886 -2.76910865531985 A:G A G 10 0.531941598773897 0.64504326064489 ENSG00000204209:ENST00000266000:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000374542:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000468536:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000477162:exon_33288157_33288368:DAXX HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 33359716 G/C 1 11 20 31 5.14864241348713 10.6388319754779 -5.49018956199081 C:G G C 10 0.531941598773897 0.0701524103535984 ENSG00000237649:ENST00000428849:exon_33359313_33359774:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000453530:exon_33359313_33359774:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000450504:exon_33359638_33359774:KIFC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 33653448 C/T 1 10 8 18 4.68058401226103 4.25553279019118 0.425051222069854 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33653420_33653604:ITPR3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 33659472 C/G 1 16 5 21 7.48893441961765 2.65970799386948 4.82922642574816 C:G C G 10 0.531941598773897 0.0469670617854448 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33659392_33659496:ITPR3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 35260503 C/T 1 13 8 21 6.08475921593934 4.25553279019118 1.82922642574816 T:C C T 10 0.531941598773897 0.514430539711333 ENSG00000065029:ENST00000229405:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000373953:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000417184:exon_35260331_35260504:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000339411:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000440666:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000479226:exon_35260100_35260564:ZNF76 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 35260530 C/T 1 12 7 19 5.61670081471324 3.72359119141728 1.89310962329596 T:C C T 10 0.531941598773897 0.492334878036868 ENSG00000065029:ENST00000229405:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000373953:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000339411:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000440666:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000479226:exon_35260100_35260564:ZNF76 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 36336764 G/A 1 5 8 13 2.34029200613052 4.25553279019118 -1.91524078406066 A:G G A 10 0.531941598773897 0.405859977542485 ENSG00000010030:ENST00000339796:exon_36336706_36336848:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000340181:exon_36336706_36336848:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000373737:exon_36336706_36336848:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000373738:exon_36336706_36336848:ETV7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 36446975 G/C 1 6 3 9 2.80835040735662 1.59582479632169 1.21252561103493 C:G G C 10 0.531941598773897 0.515798041804277 ENSG00000112078:ENST00000373731:exon_36446898_36447000:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000481911:exon_36446898_36447000:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000265344:exon_36446898_36447000:KCTD20 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 36824399 C/T 1 22 14 36 10.2972848269743 7.44718238283456 2.85010244413971 T:C C T 10 0.531941598773897 0.404843859004633 ENSG00000137168:ENST00000373699:exon_36824362_36824430:PPIL1;ENSG00000137168:ENST00000483552:exon_36824362_36824430:PPIL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 36882353 A/G 1 6 5 11 2.80835040735662 2.65970799386948 0.148642413487133 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000198663:ENST00000359359:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000480824:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000355190:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000373685:exon_36882330_36882469:C6orf89 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 36887476 C/T 1 11 7 18 5.14864241348713 3.72359119141728 1.42505122206985 T:C C T 10 0.531941598773897 0.638380509834863 ENSG00000198663:ENST00000359359:exon_36887354_36887477:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000355190:exon_36887354_36887477:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000373685:exon_36887354_36887477:C6orf89 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 36936640 G/A 1 120 102 222 56.1670081471324 54.2580430749375 1.90896507219486 A:G G A 10 0.531941598773897 0.840182785570574 ENSG00000137409:ENST00000373616:exon_36935917_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373627:exon_36935917_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373565:exon_36935918_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373550:exon_36936513_36936727:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000337855:exon_36936513_36936725:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000471737:exon_36936536_36936750:MTCH1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 36979583 C/T 1 7 10 17 3.27640880858272 5.31941598773897 -2.04300717915625 T:C C T 10 0.531941598773897 0.341802442613557 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36979482_36979630:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000459781:exon_36979482_36979809:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36979482_36979630:FGD2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 36988364 C/T 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000470273:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000394459:exon_36988314_36988396:FGD2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 37280744 C/A 1 5 8 13 2.34029200613052 4.25553279019118 -1.91524078406066 A:C C A 10 0.531941598773897 0.405859977542485 ENSG00000065491:ENST00000373491:exon_37280694_37280800:TBC1D22B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 38650588 T/A 1 42 24 66 19.6584528514963 12.7665983705735 6.8918544809228 A:T T A 10 0.531941598773897 0.108257332556633 ENSG00000124767:ENST00000470973:exon_38650584_38650991:GLO1;ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38650584_38650651:GLO1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 38670837 G/A 1 27 18 45 12.6375768331048 9.57494877793015 3.06262805517463 A:G G A 10 0.531941598773897 0.374799055523718 ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38670747_38670917:GLO1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 41652604 T/C 1 114 95 209 53.3586577397757 50.5344518835202 2.82420585625552 T:C T C 10 0.531941598773897 0.72911477917597 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 41658889 C/T 1 29 44 73 13.573693635557 23.4054303460515 -9.83173671049448 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0253216755373710 ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41658739_41659214:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000394283:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419396:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000416140:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419574:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000424495:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000445214:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419788:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000425401:exon_41658854_41658973:TFEB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 41895150 G/A 1 15 13 28 7.02087601839154 6.91524078406066 0.105635234330883 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000112578:ENST00000230340:exon_41895112_41895274:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000494032:exon_41895112_41895382:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000489290:exon_41895112_41895274:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000475702:exon_41895112_41895274:BYSL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 41900406 C/T 1 69 43 112 32.2960296846011 22.8734887472776 9.42254093732354 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0878985662836408 ENSG00000112578:ENST00000230340:exon_41900099_41900784:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000372996:exon_41900099_41900734:BYSL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 41903798 C/A 1 37 30 67 17.3181608453658 15.9582479632169 1.3599128821489 A:C C A 10 0.531941598773897 0.806969595565653 ENSG00000112576:ENST00000372991:exon_41902671_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511642:exon_41902672_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372987:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000414200:exon_41902723_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000510503:exon_41903173_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511686:exon_41903634_41903845:CCND3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 42906384 G/T 1 156 175 331 73.0171105912721 93.089779785432 -20.0726691941599 A:T:C:G G T 10 0.531941598773897 0.0276242982837509 ENSG00000137161:ENST00000372836:exon_42906306_42907025:CNPY3;ENSG00000137161:ENST00000394142:exon_42906306_42907007:CNPY3;ENSG00000137161:ENST00000336842:exon_42906306_42906445:CNPY3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 42932202 C/T 1 25 21 46 11.7014600306526 11.1707735742518 0.530686456400737 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42931608_42932209:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42932073_42932209:PEX6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 42932835 C/T 1 23 29 52 10.7653432282004 15.426306364443 -4.66096313624264 T:C C T 10 0.531941598773897 0.212499590704363 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42932813_42932890:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42932813_42932890:PEX6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 42933526 C/T 1 20 15 35 9.36116802452206 7.97912398160846 1.3820440429136 T:C C T 10 0.531941598773897 0.735667946819423 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42933419_42933527:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42933419_42933527:PEX6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 42981051 C/G 1 116 99 215 54.2947745422279 52.6622182786158 1.63255626361214 C:G C G 10 0.531941598773897 0.837854876546516 ENSG00000124733:ENST00000244711:exon_42980853_42981127:MEA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 43014022 G/A 1 9 1 10 4.21252561103493 0.531941598773897 3.68058401226103 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0240156507488693 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43013974_43014145:CUL7;ENSG00000044090:ENST00000478630:exon_43013974_43014145:CUL7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 43023371 T/C 1 6 2 8 2.80835040735662 1.06388319754779 1.74446720980882 T:C T C 10 0.531941598773897 0.297069782823554 ENSG00000112651:ENST00000485654:exon_43023283_43023455:MRPL2;ENSG00000112651:ENST00000491898:exon_43023354_43023934:MRPL2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 43029288 G/A 1 9 6 15 4.21252561103493 3.19164959264338 1.02087601839154 A:G G A 10 0.531941598773897 0.79696986700649 ENSG00000137171:ENST00000467906:exon_43029049_43029331:KLC4;ENSG00000137171:ENST00000347162:exon_43029049_43029331:KLC4;ENSG00000137171:ENST00000453940:exon_43029049_43029331:KLC4;ENSG00000137171:ENST00000418069:exon_43029049_43029331:KLC4;ENSG00000137171:ENST00000470728:exon_43029049_43029331:KLC4;ENSG00000137171:ENST00000458460:exon_43029049_43029331:KLC4;ENSG00000137171:ENST00000259708:exon_43029049_43029331:KLC4;ENSG00000137171:ENST00000479388:exon_43029049_43029331:KLC4;ENSG00000137171:ENST00000472792:exon_43029049_43029321:KLC4;ENSG00000137171:ENST00000460283:exon_43029049_43029325:KLC4;ENSG00000137171:ENST00000481499:exon_43029049_43029331:KLC4;ENSG00000137171:ENST00000394056:exon_43029049_43029331:KLC4;ENSG00000137171:ENST00000394058:exon_43029049_43029331:KLC4;ENSG00000137171:ENST00000481888:exon_43028800_43029331:KLC4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 43184132 A/C 1 9 8 17 4.21252561103493 4.25553279019118 -0.0430071791562492 A:C A C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000112659:ENST00000252050:exon_43183896_43184241:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000515773:exon_43183896_43184241:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000354495:exon_43183896_43184241:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000372647:exon_43183896_43184241:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000508656:exon_43183896_43184241:CUL9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 43273604 A/G 1 3 6 9 1.40417520367831 3.19164959264338 -1.78747438896507 A:G A G 10 0.531941598773897 0.320650472569791 ENSG00000146215:ENST00000372569:exon_43273210_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000451294:exon_43273251_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000477866:exon_43273455_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000274990:exon_43273563_43273862:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000449267:exon_43273563_43273862:CRIP3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 43481121 C/T 1 45 36 81 21.0626280551746 19.1498975558603 1.91273049931434 T:C C T 10 0.531941598773897 0.738685176653365 ENSG00000137207:ENST00000372422:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000510102:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000259737:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000504851:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000506469:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000490447:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000503972:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000514627:exon_43480807_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000460547:exon_43480204_43481371:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000455768:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000416380:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000372417:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000500090:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000488966:exon_43480952_43481189:YIPF3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 43488836 C/T 1 4 6 10 1.87223360490441 3.19164959264338 -1.31941598773897 T:C C T 10 0.531941598773897 0.530535902085358 ENSG00000171453:ENST00000481352:exon_43488670_43489217:POLR1C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 43488894 G/T 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 T:G G T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000171453:ENST00000481352:exon_43488670_43489217:POLR1C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 43496662 A/C 1 33 33 66 15.4459272404614 17.5540727595386 -2.1081455190772 A:C A C 10 0.531941598773897 0.62346038978909 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000436943:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372250:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000398835:exon_43496566_43496663:XPO5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 43581935 A/G 1 21 10 31 9.82922642574816 5.31941598773897 4.50981043800919 A:G A G 10 0.531941598773897 0.109331858257390 ENSG00000170734:ENST00000372236:exon_43581397_43583397:POLH;ENSG00000170734:ENST00000372226:exon_43581468_43583397:POLH HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 43590408 G/A 1 8 9 17 3.74446720980882 4.78747438896507 -1.04300717915625 A:G G A 10 0.531941598773897 0.635405848599126 ENSG00000172432:ENST00000307114:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000416243:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000393882:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000476510:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000478872:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000419497:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000432918:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000484748:exon_43590370_43590422:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000307126:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000372177:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000434548:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000435398:exon_43590370_43590541:GTPBP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 43608048 C/T 1 25 26 51 11.7014600306526 13.8304815681213 -2.12902153746875 T:C C T 10 0.531941598773897 0.576796488483639 ENSG00000124688:ENST00000451025:exon_43607758_43608656:MAD2L1BP;ENSG00000124688:ENST00000372173:exon_43607758_43608656:MAD2L1BP;ENSG00000124688:ENST00000372171:exon_43607758_43608689:MAD2L1BP;ENSG00000124688:ENST00000426254:exon_43607758_43608686:MAD2L1BP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 43968814 A/G 1 14 12 26 6.55281761716544 6.38329918528676 0.169518431878677 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000181577:ENST00000442114:exon_43968317_43968880:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000336600:exon_43968754_43968880:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000439969:exon_43968711_43968880:C6orf223 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 43970827 G/A 1 11 10 21 5.14864241348713 5.31941598773897 -0.170773574251837 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000181577:ENST00000442114:exon_43970418_43972887:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000336600:exon_43970418_43972877:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000439969:exon_43970418_43972845:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000448947:exon_43970418_43971142:C6orf223 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 44081718 G/A 1 244 201 445 114.206249899169 106.920261353553 7.28598854561582 A:C:G G A 10 0.531941598773897 0.506191312431421 ENSG00000180992:ENST00000372014:exon_44081194_44081946:MRPL14 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 44217910 A/G 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 A:G A G 10 0.531941598773897 0.486426237614014 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 44219710 A/C 1 2 7 9 0.936116802452206 3.72359119141728 -2.78747438896507 A:C A C 10 0.531941598773897 0.0926560584503697 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 44223010 G/T 1 51 54 105 23.8709784625313 28.7248463337904 -4.85386787125919 T:G G T 10 0.531941598773897 0.379020071675549 ENSG00000157593:ENST00000495706:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393810:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393812:exon_44221843_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000341553:exon_44222931_44223381:SLC35B2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 44269193 C/T 1 6 2 8 2.80835040735662 1.06388319754779 1.74446720980882 T:C C T 10 0.531941598773897 0.297069782823554 ENSG00000124608:ENST00000244571:exon_44269118_44269201:AARS2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 49412433 C/T 1 7 9 16 3.27640880858272 4.78747438896507 -1.51106558038235 T:C C T 10 0.531941598773897 0.465195872310583 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49412352_49412467:MUT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 49439805 G/A 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000031691:ENST00000335783:exon_49439776_49439896:CENPQ;ENSG00000031691:ENST00000371200:exon_49439776_49439896:CENPQ HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 52129484 C/T 1 138 116 254 64.5920593692022 61.7052254577721 2.88683391143017 T:C C T 10 0.531941598773897 0.753348843458589 ENSG00000112118:ENST00000229854:exon_52128807_52129584:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000419835:exon_52128812_52129584:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000340349:exon_52128812_52129584:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000421471:exon_52129419_52129584:MCM3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 56917520 T/C 1 3 8 11 1.40417520367831 4.25553279019118 -2.85135758651287 T:C T C 10 0.531941598773897 0.128574530340517 ENSG00000168116:ENST00000370733:exon_56917484_56920023:KIAA1586;ENSG00000168116:ENST00000488682:exon_56917484_56917844:KIAA1586 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 57244780 G/A 0 10 0 10 4.68058401226103 0 4.68058401226103 G G 10 0.531941598773897 0.00231867125731154 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57244745_57244794:PRIM2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 9 9 0 4.78747438896507 -4.78747438896507 A:C G A 10 0.531941598773897 0.00107820267156602 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 57512510 T/G 0 0 9 9 0 4.78747438896507 -4.78747438896507 G T G 10 0.531941598773897 0.00107820267156602 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 57512529 C/A 0 9 0 9 4.21252561103493 0 4.21252561103493 C C 10 0.531941598773897 0.00448836920646731 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 57512565 T/C 0 0 9 9 0 4.78747438896507 -4.78747438896507 C T C 10 0.531941598773897 0.00107820267156602 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 70407465 A/T 1 21 20 41 9.82922642574816 10.6388319754779 -0.809605549729778 A:T A T 10 0.531941598773897 0.876041715677551 ENSG00000168216:ENST00000370577:exon_70407455_70407533:LMBRD1;ENSG00000168216:ENST00000370570:exon_70407455_70407533:LMBRD1;ENSG00000168216:ENST00000472827:exon_70407455_70407533:LMBRD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 76369054 A/G 1 11 9 20 5.14864241348713 4.78747438896507 0.36116802452206 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000112701:ENST00000370010:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000370014:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000327284:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000447266:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000483859:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000424947:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000436928:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000485497:exon_76368978_76369123:SENP6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 79656562 A/T 1 11 2 13 5.14864241348713 1.06388319754779 4.08475921593934 A:T A T 10 0.531941598773897 0.0259151954441924 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 79675701 A/G 1 5 8 13 2.34029200613052 4.25553279019118 -1.91524078406066 A:G A G 10 0.531941598773897 0.405859977542485 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79675662_79675773:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79675662_79675773:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79675662_79675773:PHIP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 79688366 T/C 1 10 13 23 4.68058401226103 6.91524078406066 -2.23465677179963 T:C T C 10 0.531941598773897 0.406199961903517 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79688309_79688428:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79688309_79688428:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79688309_79688428:PHIP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 83880167 C/T 1 11 13 24 5.14864241348713 6.91524078406066 -1.76659837057353 T:C C T 10 0.531941598773897 0.541790058951456 ENSG00000083097:ENST00000484282:exon_83880008_83881069:DOPEY1;ENSG00000013375:ENST00000504780:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000513973:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000512866:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000369731:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000283977:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000416472:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000506587:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000509219:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000503356:exon_83880092_83880197:PGM3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 87969480 G/A 1 13 22 35 6.08475921593934 11.7027151730257 -5.6179559570864 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0631501463112631 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 88231226 T/C 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 T:C T C 10 0.531941598773897 0.486426237614014 ENSG00000146282:ENST00000369536:exon_88231182_88231242:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000392851:exon_88231182_88231242:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000369523:exon_88231182_88231242:RARS2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 96053922 T/A 1 7 4 11 3.27640880858272 2.12776639509559 1.14864241348713 A:T T A 10 0.531941598773897 0.55795959209382 ENSG00000172469:ENST00000358812:exon_96053624_96057333:MANEA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 97339078 A/G 1 35 33 68 16.3820440429136 17.5540727595386 -1.172028716625 A:G A G 10 0.531941598773897 0.808681480526202 ENSG00000123545:ENST00000316149:exon_97337189_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000478382:exon_97338888_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000489477:exon_97339027_97339267:NDUFAF4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 99374400 G/A 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000112234:ENST00000369244:exon_99374353_99374936:FBXL4;ENSG00000112234:ENST00000229971:exon_99374353_99374936:FBXL4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 99825348 T/C 1 5 9 14 2.34029200613052 4.78747438896507 -2.44718238283456 T:C T C 10 0.531941598773897 0.283917011510726 ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000479163:exon_99825262_99825361:COQ3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 105726036 C/T 1 51 42 93 23.8709784625313 22.3415471485037 1.52943131402758 T:C C T 10 0.531941598773897 0.835512552646175 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105725440_105726313:PREP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 105776866 A/C 1 18 18 36 8.42505122206985 9.57494877793015 -1.14989755586029 A:C A C 10 0.531941598773897 0.740298639827591 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105776704_105776901:PREP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 105821449 A/G 1 7 13 20 3.27640880858272 6.91524078406066 -3.63883197547794 A:G A G 10 0.531941598773897 0.119222790648670 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105821244_105821453:PREP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 106987370 A/C 1 7 7 14 3.27640880858272 3.72359119141728 -0.447182382834558 A:C A C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106987278_106987404:AIM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 106992464 A/G 1 17 7 24 7.95699282084375 3.72359119141728 4.23340162942647 A:G A G 10 0.531941598773897 0.101874345613790 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106992446_106992572:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000457437:exon_106992446_106992572:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000285105:exon_106992446_106992572:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000487681:exon_106992459_106992572:AIM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 107076783 A/T 0 8 0 8 3.74446720980882 0 3.74446720980882 A A 10 0.531941598773897 0.00871435563033556 ENSG00000130347:ENST00000369063:exon_107076623_107077362:RTN4IP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 107088231 C/T 1 5 7 12 2.34029200613052 3.72359119141728 -1.38329918528676 T:C C T 10 0.531941598773897 0.56545794539378 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107088224_107088383:QRSL1;ENSG00000130348:ENST00000467262:exon_107088224_107088383:QRSL1;ENSG00000130348:ENST00000369044:exon_107088224_107088383:QRSL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 108214694 C/T 1 28 25 53 13.1056352343309 13.2985399693474 -0.192904735016542 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000025796:ENST00000369002:exon_108214686_108214859:SEC63;ENSG00000025796:ENST00000437345:exon_108214686_108214859:SEC63;ENSG00000025796:ENST00000423697:exon_108214687_108214782:SEC63 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 109762332 C/T 1 16 11 27 7.48893441961765 5.85135758651287 1.63757683310478 T:C C T 10 0.531941598773897 0.568089830889223 ENSG00000185250:ENST00000440797:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000185250:ENST00000521072:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000185250:ENST00000368958:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109761966_109762374:SMPD2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 109762600 A/C 1 14 15 29 6.55281761716544 7.97912398160846 -1.42630636444301 A:C A C 10 0.531941598773897 0.710526726608856 ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109762560_109762656:SMPD2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 109767931 C/T 1 40 11 51 18.7223360490441 5.85135758651287 12.8709784625313 T:C C T 10 0.531941598773897 0.00034442131432554 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 109775366 C/T 1 12 18 30 5.61670081471324 9.57494877793015 -3.95824796321691 T:C C T 10 0.531941598773897 0.199554631640645 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109775142_109775442:MICAL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 110146303 G/A 1 18 19 37 8.42505122206985 10.106890376704 -1.68183915463419 A:T:G G A 10 0.531941598773897 0.623318092187015 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110146291_110146631:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110146291_110146634:FIG4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 111628597 C/G 1 4 8 12 1.87223360490441 4.25553279019118 -2.38329918528676 C:G C G 10 0.531941598773897 0.247137734070613 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000462119:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111628564_111628773:REV3L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 111901453 G/T 1 11 9 20 5.14864241348713 4.78747438896507 0.36116802452206 T:G G T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000056972:ENST00000368761:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392555:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392556:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000359831:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000340026:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000532708:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000528599:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 116574455 G/A 1 16 13 29 7.48893441961765 6.91524078406066 0.573693635556986 A:G G A 10 0.531941598773897 0.85485877023254 ENSG00000187189:ENST00000420283:exon_116571151_116575261:TSPYL4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 116599665 T/C 1 16 16 32 7.48893441961765 8.51106558038235 -1.0221311607647 T:C T C 10 0.531941598773897 0.726993262697186 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 116600453 C/T 1 19 32 51 8.89310962329596 17.0221311607647 -8.12902153746875 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0246799996539566 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 116600774 C/G 1 21 27 48 9.82922642574816 14.3624231668952 -4.53319674114706 T:C:G C G 10 0.531941598773897 0.196297306113487 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 116600810 G/A 1 14 22 36 6.55281761716544 11.7027151730257 -5.14989755586029 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0957634101996178 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 116973182 T/C 1 7 12 19 3.27640880858272 6.38329918528676 -3.10689037670404 T:C T C 10 0.531941598773897 0.172695126179914 ENSG00000153975:ENST00000368576:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000368573:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000471919:exon_116973167_116973355:ZUFSP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 126249914 T/G 1 9 5 14 4.21252561103493 2.65970799386948 1.55281761716544 T:G T G 10 0.531941598773897 0.437286823633092 ENSG00000111912:ENST00000368357:exon_126249782_126252257:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000392477:exon_126249782_126252266:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000368353:exon_126249782_126252266:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000438495:exon_126249782_126252257:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000444128:exon_126249782_126252257:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000229634:exon_126249782_126252266:NCOA7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 131190838 G/A 1 16 4 20 7.48893441961765 2.12776639509559 5.36116802452206 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0226972394764801 ENSG00000079819:ENST00000337057:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000257986:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000368128:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000527411:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000524581:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000529208:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000527423:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000456097:exon_131190799_131191266:EPB41L2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 131277390 G/A 1 8 2 10 3.74446720980882 1.06388319754779 2.68058401226103 A:C:G G A 10 0.531941598773897 0.116548632110931 ENSG00000079819:ENST00000528282:exon_131277134_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000530481:exon_131277134_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000445890:exon_131277134_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000337057:exon_131277134_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000357633:exon_131277134_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000425439:exon_131277134_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000257986:exon_131277134_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000392427:exon_131277134_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000368128:exon_131277134_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000527411:exon_131277134_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000525271:exon_131277134_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000525193:exon_131277134_131277625:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000527659:exon_131277134_131277625:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000529208:exon_131277134_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000529709:exon_131277134_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000532499:exon_131277138_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000526983:exon_131277165_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000531356:exon_131277244_131277639:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000530707:exon_131277272_131277639:EPB41L2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 133072571 C/T 1 6 2 8 2.80835040735662 1.06388319754779 1.74446720980882 T:C C T 10 0.531941598773897 0.297069782823554 ENSG00000112303:ENST00000418593:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000326499:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000335846:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000422400:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000392389:exon_133072284_133072653:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525270:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525674:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000533835:exon_133072284_133072657:VNN2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 133135886 A/G 1 967 524 1491 452.612473985642 278.737397757522 173.87507622812 A:G A G 10 0.531941598773897 9.21332862442625e-20 ENSG00000112306:ENST00000230050:exon_133135871_133135921:RPS12;ENSG00000112306:ENST00000484616:exon_133135871_133135921:RPS12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 133138010 T/C 1 6 11 17 2.80835040735662 5.85135758651287 -3.04300717915625 T:C T C 10 0.531941598773897 0.152165296741825 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 140 0 140 65.5281761716544 0 65.5281761716544 T T 10 0.531941598773897 6.00183795792589e-39 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 156 0 156 73.0171105912721 0 73.0171105912721 A A 10 0.531941598773897 1.8665002454835e-43 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 154 0 154 72.0809937888199 0 72.0809937888199 A A 10 0.531941598773897 6.71588227832538e-43 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 65 0 65 30.4237960796967 0 30.4237960796967 G G 10 0.531941598773897 2.54238207898137e-18 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 64 0 64 29.9557376784706 0 29.9557376784706 T T 10 0.531941598773897 4.97593538290258e-18 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 137519127 C/T 1 285 302 587 133.396644349439 160.646362829717 -27.2497184802776 A:T:C C T 10 0.531941598773897 0.0254769567486611 ENSG00000027697:ENST00000367739:exon_137518621_137519776:IFNGR1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 137519780 T/C 1 10 13 23 4.68058401226103 6.91524078406066 -2.23465677179963 T:C T C 10 0.531941598773897 0.406199961903517 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 137540370 A/G 1 6 3 9 2.80835040735662 1.59582479632169 1.21252561103493 A:G A G 10 0.531941598773897 0.515798041804277 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 143074700 T/C 1 10 3 13 4.68058401226103 1.59582479632169 3.08475921593934 T:C T C 10 0.531941598773897 0.100839397920929 ENSG00000010818:ENST00000367604:exon_143072604_143075068:HIVEP2;ENSG00000010818:ENST00000367603:exon_143072605_143075068:HIVEP2;ENSG00000010818:ENST00000012134:exon_143072606_143075068:HIVEP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 149700491 G/A 1 11 7 18 5.14864241348713 3.72359119141728 1.42505122206985 A:G G A 10 0.531941598773897 0.638380509834863 ENSG00000055208:ENST00000286332:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000392282:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000367456:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000470466:exon_149699154_149700654:TAB2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 149730846 G/A 1 15 17 32 7.02087601839154 9.04300717915625 -2.02213116076471 A:G G A 10 0.531941598773897 0.484705211465766 ENSG00000055208:ENST00000286332:exon_149730713_149732748:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000367456:exon_149730713_149732749:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000470466:exon_149730713_149732652:TAB2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 151336656 G/A 1 20 18 38 9.36116802452206 9.57494877793015 -0.213780753408086 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000120254:ENST00000367321:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000367310:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000392243:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000420192:exon_151336652_151336829:MTHFD1L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 151336739 C/G 1 7 5 12 3.27640880858272 2.65970799386948 0.616700814713236 C:G C G 10 0.531941598773897 0.779881793407808 ENSG00000120254:ENST00000367321:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000367310:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000392243:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000420192:exon_151336652_151336829:MTHFD1L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 151766822 C/A 1 7 7 14 3.27640880858272 3.72359119141728 -0.447182382834558 A:C C A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000491268:exon_151766443_151766960:RMND1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 151789868 G/A 1 22 18 40 10.2972848269743 9.57494877793015 0.72233604904412 A:G G A 10 0.531941598773897 0.874959579214964 ENSG00000146476:ENST00000367294:exon_151789478_151791236:C6orf211 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 158927651 A/G 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 A:G A G 10 0.531941598773897 0.486426237614014 ENSG00000130338:ENST00000367097:exon_158927610_158932860:TULP4;ENSG00000130338:ENST00000367094:exon_158927610_158929408:TULP4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 159184507 C/T 1 11 8 19 5.14864241348713 4.25553279019118 0.893109623295957 T:C C T 10 0.531941598773897 0.819320657489995 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159184336_159184541:SYTL3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 159185563 T/A 1 15 17 32 7.02087601839154 9.04300717915625 -2.02213116076471 A:T T A 10 0.531941598773897 0.484705211465766 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159185527_159185754:SYTL3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 160113872 A/G 1 7 12 19 3.27640880858272 6.38329918528676 -3.10689037670404 A:G A G 10 0.531941598773897 0.172695126179914 ENSG00000112096:ENST00000367055:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000444946:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000367054:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000337404:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000452684:exon_160112027_160113895:SOD2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 160174456 T/G 1 5 6 11 2.34029200613052 3.19164959264338 -0.851357586512867 T:G T G 10 0.531941598773897 0.764860318695721 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 160196343 A/G 1 61 61 122 28.5515624747923 32.4484375252077 -3.89687505041544 A:G A G 10 0.531941598773897 0.525603284458813 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160196202_160196345:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160196318_160197304:ACAT2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 160198359 C/T 1 46 52 98 21.5306864564007 27.6609631362426 -6.13027667984191 T:C C T 10 0.531941598773897 0.225488033593100 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 160198395 G/A 1 46 62 108 21.5306864564007 32.9803791239816 -11.4496926675809 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0334236160716999 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 166736362 C/T 1 59 66 125 27.6154456723401 35.1081455190772 -7.49269984673713 A:T:C:G C T 10 0.531941598773897 0.180292657941104 ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166736345_166736374:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166736345_166738083:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000479490:exon_166736345_166738176:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166736345_166736374:SFT2D1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 166779464 G/A 1 39 41 80 18.254277647818 21.8096055497298 -3.55532790191176 A:G G A 10 0.531941598773897 0.435107317084762 ENSG00000060762:ENST00000360961:exon_166779462_166779594:BRP44L;ENSG00000060762:ENST00000341756:exon_166779462_166779594:BRP44L;ENSG00000060762:ENST00000392123:exon_166779462_166779594:BRP44L;ENSG00000060762:ENST00000487218:exon_166779462_166779594:BRP44L;ENSG00000060762:ENST00000366868:exon_166779462_166779594:BRP44L;ENSG00000060762:ENST00000475708:exon_166779462_166779594:BRP44L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 168349011 C/T 1 8 2 10 3.74446720980882 1.06388319754779 2.68058401226103 T:C C T 10 0.531941598773897 0.116548632110931 ENSG00000130396:ENST00000344191:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000351017:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392108:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392112:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366806:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000341575:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366809:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000400822:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000447894:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366805:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000511637:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000509296:exon_168348709_168349158:MLLT4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 170626943 T/C 1 7 12 19 3.27640880858272 6.38329918528676 -3.10689037670404 T:C T C 10 0.531941598773897 0.172695126179914 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 170627586 G/T 1 14 6 20 6.55281761716544 3.19164959264338 3.36116802452206 T:G G T 10 0.531941598773897 0.178417023545079 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 170627614 T/C 1 14 8 22 6.55281761716544 4.25553279019118 2.29728482697427 T:C T C 10 0.531941598773897 0.395573885710113 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 170627651 G/A 1 7 11 18 3.27640880858272 5.85135758651287 -2.57494877793015 A:G G A 10 0.531941598773897 0.245484874120372 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 170627761 A/G 1 19 16 35 8.89310962329596 8.51106558038235 0.382044042913604 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 6 170628009 T/G 1 21 26 47 9.82922642574816 13.8304815681213 -4.00125514237316 T:G T G 10 0.531941598773897 0.246617128352813 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 4822985 C/T 1 18 14 32 8.42505122206985 7.44718238283456 0.977868839235295 T:C C T 10 0.531941598773897 0.859785955880876 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4822947_4823091:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4822947_4823091:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4822947_4823091:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4822947_4823091:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4822947_4823091:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000491375:exon_4822954_4823429:KIAA0415 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 5257573 G/A 1 20 13 33 9.36116802452206 6.91524078406066 2.4459272404614 A:G G A 10 0.531941598773897 0.486111407071718 ENSG00000157954:ENST00000288828:exon_5257553_5257645:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000401525:exon_5257553_5257645:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000404704:exon_5257553_5257645:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000466014:exon_5257553_5257645:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000382384:exon_5257553_5257645:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000496867:exon_5257553_5257644:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000475309:exon_5256721_5258662:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000484262:exon_5257553_5257645:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000315176:exon_5257553_5257645:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000465102:exon_5257553_5257645:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000480238:exon_5257553_5257645:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000488359:exon_5257553_5257645:WIPI2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 5391702 C/G 1 21 24 45 9.82922642574816 12.7665983705735 -2.93737194482537 C:G C G 10 0.531941598773897 0.455542336849185 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5391450_5391725:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5391450_5391725:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5391450_5391725:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5391450_5391725:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5390919_5391725:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000440081:exon_5391633_5391725:TNRC18 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 5410425 G/C 1 6 9 15 2.80835040735662 4.78747438896507 -1.97912398160846 C:G G C 10 0.531941598773897 0.316481765113816 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5410020_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5410006_5410995:TNRC18 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 5427369 C/A 1 6 3 9 2.80835040735662 1.59582479632169 1.21252561103493 A:C C A 10 0.531941598773897 0.515798041804277 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000413081:exon_5427303_5427660:TNRC18 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 5427517 G/A 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 A:G G A 10 0.531941598773897 0.730998912113487 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000413081:exon_5427303_5427660:TNRC18 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 5569327 G/A 1 28 29 57 13.1056352343309 15.426306364443 -2.32067113011213 A:G G A 10 0.531941598773897 0.596169539439912 ENSG00000075624:ENST00000484841:exon_5569166_5569364:ACTB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 5643145 T/C 1 106 140 246 49.6141905299669 74.4718238283456 -24.8576332983787 T:C T C 10 0.531941598773897 0.00169627248753589 ENSG00000075618:ENST00000382361:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000340250:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000444748:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000447103:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000405801:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000473330:exon_5643127_5643248:FSCN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 5645116 T/C 1 259 324 583 121.227125917561 172.349078002743 -51.121952085182 T:C T C 10 0.531941598773897 2.65019389721402e-05 ENSG00000075618:ENST00000382361:exon_5644903_5646286:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000340250:exon_5644903_5646285:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000473330:exon_5644903_5646285:FSCN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 6026708 C/A 1 13 15 28 6.08475921593934 7.97912398160846 -1.89436476566912 A:C C A 10 0.531941598773897 0.57093826541044 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 6026942 G/T 1 11 16 27 5.14864241348713 8.51106558038235 -3.36242316689522 T:G G T 10 0.531941598773897 0.247282153550661 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 6026988 G/A 1 14 14 28 6.55281761716544 7.44718238283456 -0.894364765669117 A:G G A 10 0.531941598773897 0.850300347768159 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 6063283 C/T 1 65 52 117 30.4237960796967 27.6609631362426 2.76283294345405 T:C C T 10 0.531941598773897 0.643812190756211 ENSG00000106305:ENST00000223029:exon_6062934_6063465:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000400479:exon_6062934_6063326:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000395236:exon_6062934_6063378:AIMP2;ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6061881_6064432:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000422786:exon_6062807_6063377:EIF2AK1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 6066450 T/C 1 42 33 75 19.6584528514963 17.5540727595386 2.10438009195772 T:C T C 10 0.531941598773897 0.6453716075426 ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6066359_6066592:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000490523:exon_6066359_6066592:EIF2AK1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 6066461 T/C 1 32 27 59 14.9778688392353 14.3624231668952 0.615445672340076 T:C T C 10 0.531941598773897 0.896950747663544 ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6066359_6066592:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000490523:exon_6066359_6066592:EIF2AK1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 6194274 T/C 1 10 11 21 4.68058401226103 5.85135758651287 -1.17077357425184 T:C T C 10 0.531941598773897 0.665565590544789 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193813_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 6370144 G/A 1 10 17 27 4.68058401226103 9.04300717915625 -4.36242316689522 A:G G A 10 0.531941598773897 0.121756299423964 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 6370575 C/T 1 9 3 12 4.21252561103493 1.59582479632169 2.61670081471324 T:C C T 10 0.531941598773897 0.155839710778340 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70;ENSG00000178397:ENST00000524898:exon_6370426_6370866:C7orf70;ENSG00000178397:ENST00000530143:exon_6370459_6370866:C7orf70 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 6631447 G/A 1 9 6 15 4.21252561103493 3.19164959264338 1.02087601839154 A:G G A 10 0.531941598773897 0.79696986700649 ENSG00000146576:ENST00000344417:exon_6631277_6631498:C7orf26;ENSG00000146576:ENST00000359073:exon_6631334_6631498:C7orf26;ENSG00000146576:ENST00000472693:exon_6631388_6631498:C7orf26 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 8008970 C/G 1 7 2 9 3.27640880858272 1.06388319754779 2.21252561103493 C:G C G 10 0.531941598773897 0.187705653333192 ENSG00000106415:ENST00000456919:exon_8008423_8009438:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000223145:exon_8008425_8009438:GLCCI1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 8125964 C/T 1 20 20 40 9.36116802452206 10.6388319754779 -1.27766395095588 T:C C T 10 0.531941598773897 0.752231127320461 ENSG00000106415:ENST00000456919:exon_8125823_8126968:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000223145:exon_8125823_8128710:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000489405:exon_8125823_8126569:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000482540:exon_8125823_8128707:GLCCI1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 21940823 A/G 1 69 35 104 32.2960296846011 18.6179559570864 13.6780737275147 A:G A G 10 0.531941598773897 0.00776468099069496 ENSG00000105877:ENST00000409508:exon_21940625_21941186:DNAH11;ENSG00000105877:ENST00000328843:exon_21940625_21941457:DNAH11;ENSG00000105877:ENST00000424253:exon_21940625_21941457:DNAH11;ENSG00000164649:ENST00000356195:exon_21940518_21941970:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000488845:exon_21940519_21941970:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000406877:exon_21940519_21941970:CDCA7L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 21946061 A/G 1 5 11 16 2.34029200613052 5.85135758651287 -3.51106558038235 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0854588261300405 ENSG00000164649:ENST00000356195:exon_21945907_21946074:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000406877:exon_21945907_21946074:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000373934:exon_21945907_21946074:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000405437:exon_21945907_21946074:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000465490:exon_21945907_21946074:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000396561:exon_21946048_21946074:CDCA7L HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 23240263 G/A 1 45 41 86 21.0626280551746 21.8096055497298 -0.746977494555143 A:G G A 10 0.531941598773897 0.914132211639715 ENSG00000136243:ENST00000258742:exon_23239787_23240628:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000485250:exon_23239787_23240574:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000438012:exon_23239787_23240625:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000413919:exon_23239787_23240324:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000437140:exon_23239787_23240586:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000477844:exon_23239787_23240630:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000489145:exon_23239787_23240443:NUPL2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 24703298 G/A 1 7 5 12 3.27640880858272 2.65970799386948 0.616700814713236 A:G G A 10 0.531941598773897 0.779881793407808 ENSG00000105926:ENST00000222644:exon_24703209_24703340:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000409761:exon_24703209_24703340:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000396475:exon_24703209_24703340:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000430180:exon_24703209_24703340:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000409253:exon_24703209_24703340:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000472674:exon_24703093_24703340:MPP6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 24742436 T/C 1 43 93 136 20.1265112527224 49.4705686859724 -29.34405743325 T:C T C 10 0.531941598773897 4.438108954834e-07 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000479636:exon_24742379_24745656:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000430096:exon_24742046_24742452:DFNA5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 24758753 C/T 1 66 14 80 30.8918544809228 7.44718238283456 23.4446720980882 T:C C T 10 0.531941598773897 5.82021513863755e-08 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000414428:exon_24758694_24758837:DFNA5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 24758818 G/T 1 47 26 73 21.9987448576268 13.8304815681213 8.16826328950552 T:G G T 10 0.531941598773897 0.060593975998418 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000414428:exon_24758694_24758837:DFNA5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 26235536 G/C 1 7 5 12 3.27640880858272 2.65970799386948 0.616700814713236 C:G G C 10 0.531941598773897 0.779881793407808 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 29980471 C/T 1 9 3 12 4.21252561103493 1.59582479632169 2.61670081471324 T:C C T 10 0.531941598773897 0.155839710778340 ENSG00000136193:ENST00000242059:exon_29980298_29980492:SCRN1;ENSG00000136193:ENST00000416113:exon_29980298_29980492:SCRN1;ENSG00000136193:ENST00000426154:exon_29980298_29980492:SCRN1;ENSG00000136193:ENST00000425819:exon_29980298_29980492:SCRN1;ENSG00000136193:ENST00000409497:exon_29980298_29980492:SCRN1;ENSG00000136193:ENST00000434476:exon_29980298_29980492:SCRN1;ENSG00000136193:ENST00000421434:exon_29980300_29980492:SCRN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 30544360 G/A 1 48 41 89 22.4668032588529 21.8096055497298 0.657197709123164 A:G G A 10 0.531941598773897 0.915752844282897 ENSG00000006625:ENST00000275428:exon_30544185_30544460:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000440082:exon_30544185_30544445:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000005374:exon_30544185_30544418:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409144:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000447901:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409390:exon_30544185_30544415:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409436:exon_30544185_30544432:GGCT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 30634630 G/C 1 71 64 135 33.2321464870533 34.0442623215294 -0.812115834476096 C:G G C 10 0.531941598773897 0.93134007614959 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30634297_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000454308:exon_30634457_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000478124:exon_30634500_30634759:GARS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 37298800 C/T 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000155849:ENST00000361912:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000310758:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442573:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442504:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000474832:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000448602:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455119:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455879:exon_37298786_37298955:ELMO1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 38796570 G/A 1 5 6 11 2.34029200613052 3.19164959264338 -0.851357586512867 A:G G A 10 0.531941598773897 0.764860318695721 ENSG00000006715:ENST00000310301:exon_38796438_38796582:VPS41;ENSG00000006715:ENST00000395969:exon_38796438_38796582:VPS41 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 40027484 A/G 1 6 8 14 2.80835040735662 4.25553279019118 -1.44718238283456 A:G A G 10 0.531941598773897 0.594012234271892 ENSG00000065883:ENST00000181839:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000326351:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000340829:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000484589:exon_40027435_40027857:CDK13 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 40127767 G/A 1 11 11 22 5.14864241348713 5.85135758651287 -0.702715173025734 A:G G A 10 0.531941598773897 0.832492408246346 ENSG00000065883:ENST00000181839:exon_40127725_40127930:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000340829:exon_40127725_40127930:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000478563:exon_40127725_40127930:CDK13 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 43622806 T/C 1 54 49 103 25.2751536662096 26.065138339921 -0.789984673711391 T:C T C 10 0.531941598773897 0.921459698936911 ENSG00000164543:ENST00000319357:exon_43622664_43623048:STK17A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 43647879 C/T 1 50 38 88 23.4029200613051 20.2137807534081 3.18913930789706 T:C C T 10 0.531941598773897 0.522894871977884 ENSG00000164543:ENST00000462448:exon_43647855_43647999:STK17A;ENSG00000164543:ENST00000319357:exon_43647855_43647999:STK17A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 43664198 A/G 1 52 55 107 24.3390368637574 29.2567879325643 -4.91775106880698 A:G A G 10 0.531941598773897 0.383410694006826 ENSG00000164543:ENST00000319357:exon_43664117_43666385:STK17A;ENSG00000164543:ENST00000474211:exon_43664117_43664783:STK17A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 43846603 A/G 1 123 80 203 57.5711833508107 42.5553279019118 15.0158554488989 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0350029585453042 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43846576_43846938:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43846576_43846939:BLVRA HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 43906513 A/G 1 114 96 210 53.3586577397757 51.0663934822941 2.29226425748162 A:G A G 10 0.531941598773897 0.782286615045271 ENSG00000062582:ENST00000317534:exon_43906157_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000083014:exon_43906157_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000418740:exon_43906161_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000483330:exon_43906377_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000467084:exon_43906404_43906581:MRPS24 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 43916727 T/G 1 15 10 25 7.02087601839154 5.31941598773897 1.70146003065257 T:G T G 10 0.531941598773897 0.551956894105179 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 43917013 G/A 1 9 10 19 4.21252561103493 5.31941598773897 -1.10689037670404 A:G G A 10 0.531941598773897 0.651315646573759 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 43917109 C/T 1 5 6 11 2.34029200613052 3.19164959264338 -0.851357586512867 T:C C T 10 0.531941598773897 0.764860318695721 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 44099664 T/C 1 85 137 222 39.7849641042188 72.8759990320239 -33.0910349278051 T:C T C 10 0.531941598773897 1.0728215902175e-05 ENSG00000136279:ENST00000441840:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000448521:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000456905:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000440166:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000490734:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000498733:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452943:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000429716:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000468694:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000494774:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000411855:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000497184:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000432854:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000449997:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452661:exon_44099647_44099752:DBNL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 44112873 G/T 1 11 14 25 5.14864241348713 7.44718238283456 -2.29853996934743 T:G G T 10 0.531941598773897 0.424506026287143 ENSG00000122678:ENST00000335195:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000242248:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000435068:exon_44111849_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000395831:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000458246:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000430942:exon_44111861_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000467607:exon_44112817_44112976:POLM HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 44121936 C/A 1 5 5 10 2.34029200613052 2.65970799386948 -0.31941598773897 A:C C A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000122678:ENST00000335195:exon_44121850_44122063:POLM;ENSG00000122678:ENST00000242248:exon_44121850_44122139:POLM;ENSG00000122678:ENST00000435068:exon_44121850_44122089:POLM;ENSG00000122678:ENST00000395831:exon_44121850_44122084:POLM;ENSG00000122678:ENST00000458246:exon_44121850_44122110:POLM;ENSG00000122678:ENST00000430942:exon_44121850_44122113:POLM;ENSG00000122678:ENST00000434229:exon_44121850_44122082:POLM;ENSG00000122678:ENST00000492605:exon_44121850_44122077:POLM;ENSG00000122678:ENST00000492312:exon_44121850_44122083:POLM;ENSG00000122678:ENST00000492321:exon_44121850_44122110:POLM;ENSG00000122678:ENST00000497300:exon_44121850_44122076:POLM;ENSG00000122678:ENST00000445616:exon_44121850_44122099:POLM;ENSG00000122678:ENST00000414235:exon_44121850_44122110:POLM;ENSG00000122678:ENST00000452049:exon_44121850_44122129:POLM;ENSG00000122678:ENST00000483644:exon_44121850_44122081:POLM HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 44800176 G/T 1 30 26 56 14.0417520367831 13.8304815681213 0.211270468661766 T:G G T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000122515:ENST00000413916:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000439149:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000309315:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000441627:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000433667:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000265346:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000414051:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000478045:exon_44799333_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000463056:exon_44799550_44800192:ZMIZ2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 50514833 G/T 1 6 4 10 2.80835040735662 2.12776639509559 0.68058401226103 T:G G T 10 0.531941598773897 0.758887050232993 ENSG00000132436:ENST00000395556:exon_50511831_50514995:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000356889:exon_50511831_50514995:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000451252:exon_50511834_50515055:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000451735:exon_50511834_50515078:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000433017:exon_50512175_50514995:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000419119:exon_50512840_50514995:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000435566:exon_50514830_50514995:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000436590:exon_50514610_50514995:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000422854:exon_50514679_50514995:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000440350:exon_50514693_50514995:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000420829:exon_50514826_50514995:FIGNL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 55459563 A/G 1 7 10 17 3.27640880858272 5.31941598773897 -2.04300717915625 A:G A G 10 0.531941598773897 0.341802442613557 ENSG00000132434:ENST00000254770:exon_55459486_55459603:LANCL2;ENSG00000132434:ENST00000452107:exon_55459486_55459603:LANCL2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 55540707 G/A 1 6 12 18 2.80835040735662 6.38329918528676 -3.57494877793015 A:G G A 10 0.531941598773897 0.102335500706016 ENSG00000154978:ENST00000285279:exon_55538306_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000428648:exon_55538307_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000433959:exon_55538307_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000428097:exon_55539630_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000418904:exon_55539896_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000454227:exon_55540402_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000453256:exon_55540447_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000427700:exon_55540470_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000455023:exon_55540578_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000414113:exon_55540610_55540738:VOPP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 56136194 C/T 1 40 27 67 18.7223360490441 14.3624231668952 4.3599128821489 T:C C T 10 0.531941598773897 0.327809173828925 ENSG00000129103:ENST00000395436:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000418349:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000434526:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000395437:exon_56136175_56136340:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000275607:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000395435:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000420966:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000413952:exon_56136175_56136340:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000342190:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000436782:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000442826:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000437307:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000413756:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000483327:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000423763:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000498777:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000438133:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000447501:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000451338:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000529457:exon_56136175_56136331:SUMF2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 56174115 A/C 1 523 337 860 244.794543841252 179.264318786803 65.5302250544486 A:C:G A C 10 0.531941598773897 7.33622802512265e-06 ENSG00000106153:ENST00000395422:exon_56174057_56174269:CHCHD2;ENSG00000106153:ENST00000473095:exon_56174057_56174124:CHCHD2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 56174140 G/T 1 155 122 277 72.549052190046 64.8968750504154 7.65217713963052 T:G G T 10 0.531941598773897 0.36697155204237 ENSG00000106153:ENST00000395422:exon_56174057_56174269:CHCHD2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 72300332 G/A 1 8 2 10 3.74446720980882 1.06388319754779 2.68058401226103 A:G G A 10 0.531941598773897 0.116548632110931 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 72717933 C/T 1 41 15 56 19.1903944502702 7.97912398160846 11.2112704686618 T:C C T 10 0.531941598773897 0.00292073920629372 ENSG00000130305:ENST00000428206:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000471461:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000438747:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000252594:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000446455:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000310326:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000478977:exon_72717928_72718033:NSUN5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 73097654 C/T 1 19 17 36 8.89310962329596 9.04300717915625 -0.149897555860294 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30;ENSG00000071462:ENST00000464615:exon_73097355_73097713:WBSCR22 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 73097948 G/C 1 20 16 36 9.36116802452206 8.51106558038235 0.850102444139708 C:G G C 10 0.531941598773897 0.86790453569009 ENSG00000071462:ENST00000265758:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000420399:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000457629:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000423166:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421304:exon_73097899_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000432522:exon_73097901_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421744:exon_73097903_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000478670:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000496153:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000441822:exon_73097931_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000428163:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000436944:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000463307:exon_73097939_73098003:WBSCR22 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 73151644 A/G 1 4 7 11 1.87223360490441 3.72359119141728 -1.85135758651287 A:G A G 10 0.531941598773897 0.36707898879345 ENSG00000106077:ENST00000497897:exon_73151551_73152065:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437775:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000357419:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000222800:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437891:exon_73151551_73151690:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000462381:exon_73151551_73151832:ABHD11 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 73249165 T/A 0 8 0 8 3.74446720980882 0 3.74446720980882 T T 10 0.531941598773897 0.00871435563033556 ENSG00000165171:ENST00000297873:exon_73248920_73249332:WBSCR27;ENSG00000165171:ENST00000434654:exon_73248926_73249332:WBSCR27 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 73814749 G/C 1 21 18 39 9.82922642574816 9.57494877793015 0.254277647818016 C:G G C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73814700_73814885:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73814700_73814885:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73814700_73814885:CLIP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 74489486 T/C 1 21 9 30 9.82922642574816 4.78747438896507 5.04175203678309 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0693659470402082 ENSG00000174374:ENST00000329959:exon_74489250_74489629:WBSCR16;ENSG00000174374:ENST00000478352:exon_74489250_74489626:WBSCR16 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 75695613 A/G 1 648 614 1262 303.301843994515 326.612141647173 -23.3102976526581 A:G A G 10 0.531941598773897 0.19445134633803 ENSG00000146701:ENST00000315758:exon_75695597_75696826:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000443006:exon_75695597_75696824:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000432020:exon_75695597_75696385:MDH2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 76984572 G/A 1 9 5 14 4.21252561103493 2.65970799386948 1.55281761716544 A:G G A 10 0.531941598773897 0.437286823633092 ENSG00000186088:ENST00000449779:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000257626:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000455630:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000334003:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000434084:exon_76984530_76984601:PION HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 77256713 A/G 1 26 21 47 12.1695184318787 11.1707735742518 0.998744857626839 A:G A G 10 0.531941598773897 0.88400076579589 ENSG00000127947:ENST00000248594:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000415482:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000435495:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000407343:exon_77256473_77256992:PTPN12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 87537177 A/G 1 30 26 56 14.0417520367831 13.8304815681213 0.211270468661766 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000006634:ENST00000413643:exon_87536503_87537691:DBF4;ENSG00000006634:ENST00000265728:exon_87536503_87538856:DBF4;ENSG00000006634:ENST00000431138:exon_87536503_87537688:DBF4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 91503228 C/T 1 15 9 24 7.02087601839154 4.78747438896507 2.23340162942647 T:C C T 10 0.531941598773897 0.417145388014034 ENSG00000127989:ENST00000419292:exon_91500243_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000351870:exon_91502205_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000406735:exon_91502636_91504078:MTERF HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 91630620 G/T 1 36 51 87 16.8501024441397 27.1290215374687 -10.278919093329 T:G G T 10 0.531941598773897 0.0312900214818684 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493453:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394565:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91630162_91632549:AKAP9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 91712698 A/G 1 9 10 19 4.21252561103493 5.31941598773897 -1.10689037670404 A:G A G 10 0.531941598773897 0.651315646573759 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91712484_91713009:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91712484_91712969:AKAP9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 91713972 C/T 1 7 5 12 3.27640880858272 2.65970799386948 0.616700814713236 T:C C T 10 0.531941598773897 0.779881793407808 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000435423:exon_91713954_91714017:AKAP9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 91715662 C/T 1 9 3 12 4.21252561103493 1.59582479632169 2.61670081471324 T:C C T 10 0.531941598773897 0.155839710778340 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000435423:exon_91715542_91715730:AKAP9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 91726927 A/C 1 9 9 18 4.21252561103493 4.78747438896507 -0.574948777930146 A:C A C 10 0.531941598773897 0.81714898933323 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487258:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487692:exon_91726900_91727108:AKAP9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 91743150 A/G 1 31 34 65 14.5098104380092 18.0860143583125 -3.57620392030331 A:G A G 10 0.531941598773897 0.386770251711389 ENSG00000001630:ENST00000003100:exon_91741465_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000450723:exon_91742726_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000422867:exon_91742899_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000482924:exon_91743008_91743157:CYP51A1;ENSG00000240720:ENST00000422722:exon_91741473_91743157:AC000120.8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 92028039 C/A 1 15 14 29 7.02087601839154 7.44718238283456 -0.426306364443014 A:C C A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 92163855 G/A 1 7 12 19 3.27640880858272 6.38329918528676 -3.10689037670404 A:G G A 10 0.531941598773897 0.172695126179914 ENSG00000127993:ENST00000265732:exon_92163716_92164284:C7orf64;ENSG00000127993:ENST00000481551:exon_92163716_92167319:C7orf64 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 97863145 G/A 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 A:G G A 10 0.531941598773897 0.730998912113487 ENSG00000205356:ENST00000447648:exon_97862733_97863223:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000490842:exon_97862139_97863154:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000379795:exon_97862733_97863223:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000471397:exon_97862739_97863223:TECPR1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 97922851 C/T 1 5 17 22 2.34029200613052 9.04300717915625 -6.70271517302574 T:C C T 10 0.531941598773897 0.00477317999885122 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97920963_97922908:BAIAP2L1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 97933601 C/T 1 7 11 18 3.27640880858272 5.85135758651287 -2.57494877793015 T:C C T 10 0.531941598773897 0.245484874120372 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97933508_97933688:BAIAP2L1;ENSG00000006453:ENST00000480580:exon_97933508_97933677:BAIAP2L1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 99171036 G/A 1 7 9 16 3.27640880858272 4.78747438896507 -1.51106558038235 A:G G A 10 0.531941598773897 0.465195872310583 ENSG00000197343:ENST00000252713:exon_99169868_99172029:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000425063:exon_99169868_99174062:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000493277:exon_99169868_99171344:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000424881:exon_99169868_99174072:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000394163:exon_99169868_99174076:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000494357:exon_99169868_99173159:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000419215:exon_99169868_99174076:ZNF655 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 99654600 A/G 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 A:G A G 10 0.531941598773897 0.730998912113487 ENSG00000166529:ENST00000292450:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000456748:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000438937:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000477297:exon_99654534_99655028:ZSCAN21 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 99654689 G/A 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000166529:ENST00000292450:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000456748:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000438937:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000477297:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000379635:exon_99654630_99654872:ZSCAN21 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 99693078 G/A 1 155 146 301 72.549052190046 77.663473420989 -5.11442123094301 A:G G A 10 0.531941598773897 0.56395615057043 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000491245:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000493352:exon_99693010_99693287:MCM7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 99747130 G/A 1 111 108 219 51.9544825360974 57.4496926675809 -5.49521013148345 A:G G A 10 0.531941598773897 0.457390983868137 ENSG00000188186:ENST00000341942:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000460732:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000474831:exon_99747122_99747188:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000494136:exon_99747122_99747510:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000441173:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000468582:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000488241:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000473459:exon_99746980_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000466498:exon_99746982_99747202:C7orf59 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 99751017 A/G 1 4 9 13 1.87223360490441 4.78747438896507 -2.91524078406066 A:G A G 10 0.531941598773897 0.162564563323673 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 99757612 G/A 1 3 9 12 1.40417520367831 4.78747438896507 -3.38329918528676 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0789092376202323 ENSG00000197093:ENST00000426974:exon_99756866_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000413800:exon_99756867_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000495882:exon_99756867_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000360039:exon_99756868_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000423751:exon_99757269_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000411994:exon_99757439_99758582:GAL3ST4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 99799845 T/A 1 10 7 17 4.68058401226103 3.72359119141728 0.956992820843751 A:T T A 10 0.531941598773897 0.809031865435945 ENSG00000066923:ENST00000426455:exon_99799795_99799963:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000394018:exon_99799795_99799963:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000379577:exon_99799795_99799963:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000317296:exon_99799795_99799963:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000491498:exon_99799795_99799963:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000440830:exon_99799795_99799963:STAG3;ENSG00000160844:ENST00000436886:exon_99798283_99800226:GATS;ENSG00000160844:ENST00000292369:exon_99798283_99800226:GATS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 99817859 A/G 1 24 37 61 11.2334016294265 19.6818391546342 -8.44843752520772 A:C:G A G 10 0.531941598773897 0.0392292314516391 ENSG00000066923:ENST00000451963:exon_99817737_99818296:STAG3;ENSG00000213413:ENST00000317271:exon_99817737_99818087:PVRIG HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 99821685 C/T 1 6 2 8 2.80835040735662 1.06388319754779 1.74446720980882 T:C C T 10 0.531941598773897 0.297069782823554 ENSG00000160844:ENST00000436886:exon_99821505_99821698:GATS;ENSG00000160844:ENST00000292369:exon_99821505_99821698:GATS;ENSG00000160844:ENST00000435519:exon_99821505_99821698:GATS;ENSG00000160844:ENST00000328453:exon_99821505_99821698:GATS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 100160264 T/C 1 11 10 21 5.14864241348713 5.31941598773897 -0.170773574251837 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000106351:ENST00000430857:exon_100160217_100160305:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000300176:exon_100160217_100160305:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000262935:exon_100160217_100160305:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000474713:exon_100160217_100160305:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000429987:exon_100160217_100160305:AGFG2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 100281768 T/C 1 13 10 23 6.08475921593934 5.31941598773897 0.765343228200368 T:C T C 10 0.531941598773897 0.836065752858423 ENSG00000146830:ENST00000275732:exon_100281643_100281780:GIGYF1;ENSG00000146830:ENST00000472105:exon_100281643_100281960:GIGYF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 100285888 C/T 1 5 6 11 2.34029200613052 3.19164959264338 -0.851357586512867 T:C C T 10 0.531941598773897 0.764860318695721 ENSG00000146830:ENST00000275732:exon_100285827_100287071:GIGYF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 100460331 G/A 1 13 8 21 6.08475921593934 4.25553279019118 1.82922642574816 A:G G A 10 0.531941598773897 0.514430539711333 ENSG00000146828:ENST00000428758:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000275729:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000415287:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000354161:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000475687:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000474019:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000467972:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000487651:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000482184:exon_100460303_100460449:SLC12A9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 100466441 G/A 1 45 37 82 21.0626280551746 19.6818391546342 1.38078890054044 A:G G A 10 0.531941598773897 0.825109005993522 ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000417475:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000437505:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000463125:exon_100465918_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000429658:exon_100466433_100466488:TRIP6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 100856462 G/A 1 10 5 15 4.68058401226103 2.65970799386948 2.02087601839155 A:G G A 10 0.531941598773897 0.438857439709851 ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100856388_100856485:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000421736:exon_100856388_100856485:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000478082:exon_100856123_100856485:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000478264:exon_100856388_100856836:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000424135:exon_100856388_100856485:PLOD3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 100875772 T/G 1 4 11 15 1.87223360490441 5.85135758651287 -3.97912398160845 T:G T G 10 0.531941598773897 0.0664564097903981 ENSG00000106404:ENST00000308344:exon_100875373_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000401528:exon_100875373_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000305064:exon_100875374_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000433833:exon_100875686_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000414035:exon_100875769_100875796:CLDN15 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 101837149 G/A 1 6 4 10 2.80835040735662 2.12776639509559 0.68058401226103 A:G G A 10 0.531941598773897 0.758887050232993 ENSG00000160967:ENST00000292538:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000419439:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000360264:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000425244:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000393824:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000338990:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000437600:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000292535:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000412016:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000415720:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000436903:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000431850:exon_101837122_101837170:CUX1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 101916647 A/G 1 10 4 14 4.68058401226103 2.12776639509559 2.55281761716544 A:G A G 10 0.531941598773897 0.191981298637752 ENSG00000160967:ENST00000292538:exon_101916637_101916764:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000419439:exon_101916637_101916764:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000437600:exon_101916637_101916764:CUX1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 101917521 G/A 1 12 4 16 5.61670081471324 2.12776639509559 3.48893441961765 A:G G A 10 0.531941598773897 0.130296081303923 ENSG00000160967:ENST00000292538:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000419439:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000437600:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000487284:exon_101917445_101917581:CUX1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 102087202 T/C 1 36 20 56 16.8501024441397 10.6388319754779 6.21127046866177 T:C T C 10 0.531941598773897 0.108340803603219 ENSG00000160991:ENST00000495936:exon_102086960_102087422:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000488996:exon_102086960_102087495:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000356387:exon_102086960_102097268:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000478730:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000468241:exon_102086960_102087371:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000403646:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000473939:exon_102086960_102089179:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000458233:exon_102086960_102087661:ORAI2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 102112980 G/A 1 13 10 23 6.08475921593934 5.31941598773897 0.765343228200368 A:G G A 10 0.531941598773897 0.836065752858423 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102110189_102113613:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000488689:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000468175:exon_102112901_102113056:LRWD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 102114087 C/T 1 77 11 88 36.0404968944099 5.85135758651287 30.1891393078971 T:C C T 10 0.531941598773897 9.53006108219839e-12 ENSG00000005075:ENST00000292614:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000306744:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000393794:exon_102113910_102114131:POLR2J HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 103838221 T/C 1 6 5 11 2.80835040735662 2.65970799386948 0.148642413487133 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000164815:ENST00000297431:exon_103838173_103838247:ORC5;ENSG00000164815:ENST00000422497:exon_103838173_103838247:ORC5;ENSG00000164815:ENST00000447452:exon_103838173_103838247:ORC5;ENSG00000164815:ENST00000485726:exon_103838173_103838247:ORC5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 106826381 C/T 1 7 5 12 3.27640880858272 2.65970799386948 0.616700814713236 T:C C T 10 0.531941598773897 0.779881793407808 ENSG00000105856:ENST00000468410:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000222574:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000485846:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000463202:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000417005:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000498408:exon_106826246_106826387:HBP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 107002806 A/G 1 3 8 11 1.40417520367831 4.25553279019118 -2.85135758651287 A:G A G 10 0.531941598773897 0.128574530340517 ENSG00000164597:ENST00000347053:exon_107002753_107002865:COG5;ENSG00000164597:ENST00000297135:exon_107002753_107002865:COG5;ENSG00000164597:ENST00000393603:exon_107002753_107002865:COG5;ENSG00000164597:ENST00000484237:exon_107002753_107002865:COG5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 117825681 A/G 1 4 10 14 1.87223360490441 5.31941598773897 -3.44718238283456 A:G A G 10 0.531941598773897 0.104830012761555 ENSG00000128534:ENST00000422760:exon_117824210_117825748:NAA38 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 128034629 C/T 1 28 30 58 13.1056352343309 15.9582479632169 -2.85261272888603 T:C C T 10 0.531941598773897 0.511174979037986 ENSG00000106348:ENST00000469328:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000484496:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000419067:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000338791:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000496200:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000354269:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000348127:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000378717:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000416064:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000343214:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000470772:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000480861:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000460045:exon_128034510_128035052:IMPDH1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 128388648 G/A 1 9 10 19 4.21252561103493 5.31941598773897 -1.10689037670404 A:G G A 10 0.531941598773897 0.651315646573759 ENSG00000128595:ENST00000249364:exon_128388627_128388858:CALU;ENSG00000128595:ENST00000449187:exon_128388627_128388858:CALU;ENSG00000128595:ENST00000479257:exon_128388627_128388858:CALU;ENSG00000128595:ENST00000342367:exon_128388627_128388858:CALU HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 129663496 C/T 1 12 8 20 5.61670081471324 4.25553279019118 1.36116802452206 T:C C T 10 0.531941598773897 0.65611601649275 ENSG00000091732:ENST00000358303:exon_129663351_129663563:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000467642:exon_129663351_129663563:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000311873:exon_129663351_129663563:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000481503:exon_129663351_129663563:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000435129:exon_129663351_129663563:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000477578:exon_129663404_129663563:ZC3HC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 129664312 T/C 1 9 14 23 4.21252561103493 7.44718238283456 -3.23465677179963 T:C T C 10 0.531941598773897 0.211539426770348 ENSG00000091732:ENST00000358303:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000360708:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000467642:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000311873:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000435129:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000477578:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000471022:exon_129664103_129664346:ZC3HC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 129813738 T/C 1 15 13 28 7.02087601839154 6.91524078406066 0.105635234330883 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000146842:ENST00000397622:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000336804:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000462753:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000473456:exon_129813665_129813779:TMEM209 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 131347009 T/C 1 458 1 459 214.370747761555 0.531941598773897 213.838806162781 T:C T C 10 0.531941598773897 6.50636844102185e-124 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 133749164 G/A 1 16 17 33 7.48893441961765 9.04300717915625 -1.5540727595386 A:G G A 10 0.531941598773897 0.605214107466076 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133749044_133750512:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000459626:exon_133749044_133749211:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000466000:exon_133749044_133749363:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000468932:exon_133749071_133749339:EXOC4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 134849213 G/A 1 10 7 17 4.68058401226103 3.72359119141728 0.956992820843751 A:G G A 10 0.531941598773897 0.809031865435945 ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140;ENSG00000146859:ENST00000456488:exon_134849194_134849481:TMEM140 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 134849577 A/C 1 18 9 27 8.42505122206985 4.78747438896507 3.63757683310478 A:C A C 10 0.531941598773897 0.180522865991152 ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 135292080 G/A 1 8 4 12 3.74446720980882 2.12776639509559 1.61670081471324 A:G G A 10 0.531941598773897 0.3994437340124 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135291995_135292119:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000472132:exon_135291995_135292119:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000463247:exon_135291995_135292119:NUP205 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 135292098 G/A 1 7 6 13 3.27640880858272 3.19164959264338 0.0847592159393384 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135291995_135292119:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000472132:exon_135291995_135292119:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000463247:exon_135291995_135292119:NUP205 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 135304215 C/T 1 11 11 22 5.14864241348713 5.85135758651287 -0.702715173025734 T:C C T 10 0.531941598773897 0.832492408246346 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135304171_135304438:NUP205 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 135329690 T/C 1 37 36 73 17.3181608453658 19.1498975558603 -1.83173671049448 T:C T C 10 0.531941598773897 0.725357246655055 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000477620:exon_135329643_135329726:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000461255:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000490439:exon_135329647_135329766:NUP205 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 135333172 C/T 1 83 67 150 38.8488473017665 35.6400871178511 3.20876018391544 T:C C T 10 0.531941598773897 0.624117742766808 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135333152_135333505:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000477620:exon_135333152_135333472:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000461255:exon_135333152_135333505:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000490439:exon_135333152_135333473:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000491089:exon_135333152_135333497:NUP205 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 138732457 G/A 1 5 7 12 2.34029200613052 3.72359119141728 -1.38329918528676 A:G G A 10 0.531941598773897 0.56545794539378 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 139415775 G/C 1 2 9 11 0.936116802452206 4.78747438896507 -3.85135758651287 C:G G C 10 0.531941598773897 0.0302737640849297 ENSG00000064393:ENST00000406875:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000263551:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000428878:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000342645:exon_139415731_139416814:HIPK2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 139415943 G/A 1 7 9 16 3.27640880858272 4.78747438896507 -1.51106558038235 A:G G A 10 0.531941598773897 0.465195872310583 ENSG00000064393:ENST00000406875:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000263551:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000428878:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000342645:exon_139415731_139416814:HIPK2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 139416294 G/A 1 6 3 9 2.80835040735662 1.59582479632169 1.21252561103493 A:G G A 10 0.531941598773897 0.515798041804277 ENSG00000064393:ENST00000406875:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000263551:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000428878:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000342645:exon_139415731_139416814:HIPK2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 140394587 C/T 1 26 29 55 12.1695184318787 15.426306364443 -3.25678793256434 T:C C T 10 0.531941598773897 0.418589280950767 ENSG00000133597:ENST00000072869:exon_140394463_140394921:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000473512:exon_140394463_140394881:ADCK2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 142494606 C/G 1 10 6 16 4.68058401226103 3.19164959264338 1.48893441961765 C:G C G 10 0.531941598773897 0.61793977257828 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 142495126 G/A 1 12 5 17 5.61670081471324 2.65970799386948 2.95699282084375 A:G G A 10 0.531941598773897 0.223519240246810 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 142495127 G/T 1 12 5 17 5.61670081471324 2.65970799386948 2.95699282084375 T:G G T 10 0.531941598773897 0.223519240246810 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 142498813 G/A 1 122 107 229 57.1031249495846 56.917751068807 0.185373880777583 A:G G A 10 0.531941598773897 1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 0 248 0 248 116.078483504074 0 116.078483504074 T T 10 0.531941598773897 1.48642806464675e-68 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 142991361 G/C 1 4 6 10 1.87223360490441 3.19164959264338 -1.31941598773897 C:G G C 10 0.531941598773897 0.530535902085358 ENSG00000106144:ENST00000310447:exon_142991323_142991417:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000392923:exon_142991323_142991417:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000493642:exon_142991323_142991417:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000481483:exon_142991323_142991574:CASP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 148506396 A/C 1 3 11 14 1.40417520367831 5.85135758651287 -4.44718238283456 A:C A C 10 0.531941598773897 0.0283658467048123 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 148979323 C/T 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000204946:ENST00000434415:exon_148978596_148982082:ZNF783 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 149152906 G/A 1 5 8 13 2.34029200613052 4.25553279019118 -1.91524078406066 A:G G A 10 0.531941598773897 0.405859977542485 ENSG00000196453:ENST00000247930:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000314683:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000440594:exon_149152268_149153128:ZNF777 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 150034184 T/C 1 8 25 33 3.74446720980882 13.2985399693474 -9.5540727595386 T:C T C 10 0.531941598773897 0.00128561758300119 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 150034378 A/G 1 6 14 20 2.80835040735662 7.44718238283456 -4.63883197547794 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0439672704170584 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 150068371 T/C 1 43 32 75 20.1265112527224 17.0221311607647 3.10438009195772 T:C:G T C 10 0.531941598773897 0.489849721132146 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000522266:exon_150068317_150068481:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 150068605 G/A 1 52 39 91 24.3390368637574 20.745722352182 3.59331451157537 A:G G A 10 0.531941598773897 0.464184949178023 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 150068620 C/T 1 43 37 80 20.1265112527224 19.6818391546342 0.444672098088237 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 150068933 T/C 1 70 47 117 32.7640880858272 25.0012551423732 7.76283294345405 T:C T C 10 0.531941598773897 0.164817872279956 ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 150093701 A/C 1 17 21 38 7.95699282084375 11.1707735742518 -3.21378075340809 A:C A C 10 0.531941598773897 0.3312378750863 ENSG00000196456:ENST00000478789:exon_150093601_150094003:ZNF775;ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775;ENSG00000196456:ENST00000490973:exon_150093601_150094067:ZNF775 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 150171710 T/C 1 10 5 15 4.68058401226103 2.65970799386948 2.02087601839155 T:C T C 10 0.531941598773897 0.438857439709851 ENSG00000171115:ENST00000307271:exon_150171100_150171726:GIMAP8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 150217089 G/A 1 11 11 22 5.14864241348713 5.85135758651287 -0.702715173025734 A:G G A 10 0.531941598773897 0.832492408246346 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 150324825 C/T 1 29 16 45 13.573693635557 8.51106558038235 5.06262805517463 T:C C T 10 0.531941598773897 0.137823616055446 ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000493969:exon_150324764_150325376:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000438845:exon_150324807_150325810:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000435189:exon_150324807_150325376:GIMAP6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 150389677 G/C 1 31 23 54 14.5098104380092 12.2346567717996 2.27515366620956 C:G G C 10 0.531941598773897 0.586749221200611 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 150439381 G/A 1 19 19 38 8.89310962329596 10.106890376704 -1.21378075340809 A:G G A 10 0.531941598773897 0.746422583726184 ENSG00000196329:ENST00000498181:exon_150439271_150439470:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000493304:exon_150439271_150439605:GIMAP5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 150439500 C/T 1 40 31 71 18.7223360490441 16.4901895619908 2.23214648705331 T:C C T 10 0.531941598773897 0.635449714720201 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000493304:exon_150439271_150439605:GIMAP5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 150440043 C/T 1 25 43 68 11.7014600306526 22.8734887472776 -11.172028716625 T:C C T 10 0.531941598773897 0.00729788485816725 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 150733025 T/A 1 10 4 14 4.68058401226103 2.12776639509559 2.55281761716544 A:T T A 10 0.531941598773897 0.191981298637752 ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482309:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000470645:exon_150732668_150733257:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000466514:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477719:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477092:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000491920:exon_150732969_150733054:ABCB8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 150761680 C/A 1 5 8 13 2.34029200613052 4.25553279019118 -1.91524078406066 A:C C A 10 0.531941598773897 0.405859977542485 ENSG00000164889:ENST00000483786:exon_150761613_150761831:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000494125:exon_150761289_150761784:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000490898:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000482950:exon_150761613_150761778:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000463414:exon_150761613_150761847:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150761613_150761854:SLC4A2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 150768786 G/A 1 20 18 38 9.36116802452206 9.57494877793015 -0.213780753408086 A:T:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000493040:exon_150768564_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000460010:exon_150768752_150769223:SLC4A2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 150773807 A/T 1 59 78 137 27.6154456723401 41.491444704364 -13.8759990320239 A:T A T 10 0.531941598773897 0.0205064544100755 ENSG00000164896:ENST00000483105:exon_150773679_150773888:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000489884:exon_150773711_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000465272:exon_150773713_150774114:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000467237:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000353841:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297532:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482571:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297530:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000460980:exon_150773716_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000469237:exon_150773725_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482806:exon_150773733_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000483953:exon_150773742_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000466855:exon_150773803_150773919:FASTK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 150916228 G/A 1 35 31 66 16.3820440429136 16.4901895619908 -0.108145519077201 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000473874:exon_150916150_150916245:ABCF2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 150921950 A/G 1 15 8 23 7.02087601839154 4.25553279019118 2.76534322820037 A:G A G 10 0.531941598773897 0.298803195708385 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150921862_150922074:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150921862_150922074:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000468073:exon_150921862_150922074:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000441774:exon_150921862_150922074:ABCF2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 150931268 C/G 1 36 34 70 16.8501024441397 18.0860143583125 -1.23591191417279 C:G C G 10 0.531941598773897 0.811184886230967 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150931172_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150929585_150931360:CHPF2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 150934975 C/G 1 65 53 118 30.4237960796967 28.1929047350165 2.23089134468015 C:G C G 10 0.531941598773897 0.712724846571786 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150934460_150935905:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150934460_150935359:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150934460_150935908:CHPF2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 151074296 A/G 1 20 14 34 9.36116802452206 7.44718238283456 1.9139856416875 A:G A G 10 0.531941598773897 0.607120734276307 ENSG00000013374:ENST00000413040:exon_151074133_151075535:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000355851:exon_151074133_151075535:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000460712:exon_151074133_151074367:NUB1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 151856004 C/T 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000055609:ENST00000360104:exon_151855948_151856157:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000262189:exon_151855948_151856157:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000355193:exon_151855942_151856157:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000424877:exon_151855948_151856157:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000473186:exon_151855942_151856157:MLL3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 154738409 T/C 1 17 13 30 7.95699282084375 6.91524078406066 1.04175203678309 T:C T C 10 0.531941598773897 0.719368372691395 ENSG00000214106:ENST00000411526:exon_154738350_154738546:AC093726.6;ENSG00000214106:ENST00000449486:exon_154738303_154738501:AC093726.6;ENSG00000157212:ENST00000404141:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000457196:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000464717:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000397192:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000323199:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000357094:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000473219:exon_154738389_154738523:PAXIP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 156742749 G/A 1 3 16 19 1.40417520367831 8.51106558038235 -7.10689037670404 A:G G A 10 0.531941598773897 0.00101603384325911 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156742417_156743418:NOM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 156742796 A/C 1 3 13 16 1.40417520367831 6.91524078406066 -5.51106558038235 A:C A C 10 0.531941598773897 0.00972425323890866 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156742417_156743418:NOM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 156742965 G/C 1 10 13 23 4.68058401226103 6.91524078406066 -2.23465677179963 C:G G C 10 0.531941598773897 0.406199961903517 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156742417_156743418:NOM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 156762224 G/C 1 12 15 27 5.61670081471324 7.97912398160846 -2.36242316689522 C:G G C 10 0.531941598773897 0.441519696755844 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 156762248 G/A 1 11 15 26 5.14864241348713 7.97912398160846 -2.83048156812132 A:G G A 10 0.531941598773897 0.326715412920753 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 7 157000176 T/C 1 14 16 30 6.55281761716544 8.51106558038235 -1.95824796321691 T:C T C 10 0.531941598773897 0.583880929092300 ENSG00000009335:ENST00000348165:exon_157000092_157000249:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000435332:exon_157000092_157000249:UBE3C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 381344 C/G 1 8 2 10 3.74446720980882 1.06388319754779 2.68058401226103 C:G C G 10 0.531941598773897 0.116548632110931 ENSG00000147364:ENST00000518240:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000350302:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000447233:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000352684:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000276326:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000382824:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000524125:exon_381341_381444:FBXO25 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 618728 A/G 1 16 29 45 7.48893441961765 15.426306364443 -7.93737194482537 A:C:G A G 10 0.531941598773897 0.0239874353078982 ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000523415:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000523053:exon_618598_619277:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000522893:exon_615992_618792:ERICH1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 623593 G/A 1 65 52 117 30.4237960796967 27.6609631362426 2.76283294345405 A:G G A 10 0.531941598773897 0.643812190756211 ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000522893:exon_623289_623657:ERICH1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 681206 G/C 1 6 6 12 2.80835040735662 3.19164959264338 -0.383299185286765 T:C:G G C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_681140_681239:ERICH1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 10689212 C/T 1 6 2 8 2.80835040735662 1.06388319754779 1.74446720980882 T:C C T 10 0.531941598773897 0.297069782823554 ENSG00000254093:ENST00000354846:exon_10689175_10689253:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10689175_10689253:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10689175_10689253:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000524114:exon_10689175_10689253:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000523559:exon_10689175_10689253:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000517607:exon_10689175_10689253:PINX1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 11406593 T/C 1 30 33 63 14.0417520367831 17.5540727595386 -3.51232072275551 T:C T C 10 0.531941598773897 0.380235250864166 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000533828:exon_11406533_11406612:BLK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 11418773 C/T 1 20 20 40 9.36116802452206 10.6388319754779 -1.27766395095588 T:C C T 10 0.531941598773897 0.752231127320461 ENSG00000136573:ENST00000526097:exon_11417842_11418961:BLK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 11660362 T/C 1 79 91 170 36.9766136968621 48.4066854884246 -11.4300717915625 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0905987694071552 ENSG00000079459:ENST00000530337:exon_11660268_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11660120_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11660152_11660419:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11660248_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11660250_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11660250_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529464:exon_11660255_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11660275_11660419:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525571:exon_11660277_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000527045:exon_11660293_11660440:FDFT1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 11706581 T/G 1 5 9 14 2.34029200613052 4.78747438896507 -2.44718238283456 T:G T G 10 0.531941598773897 0.283917011510726 ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532409:exon_11706555_11707087:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533110:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534636:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533572:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530296:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525076:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526195:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527243:exon_11706570_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534149:exon_11706571_11706673:CTSB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 11710174 T/C 1 2 9 11 0.936116802452206 4.78747438896507 -3.85135758651287 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0302737640849297 ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11710119_11710204:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11710119_11710204:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11710119_11710204:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11710119_11710204:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11710119_11710204:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000415599:exon_11710119_11710204:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531551:exon_11710119_11710204:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11710119_11710204:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11710119_11710204:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11710119_11710204:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534636:exon_11710119_11710204:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533572:exon_11710119_11710204:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530296:exon_11710119_11710204:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525076:exon_11710119_11710204:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526195:exon_11710119_11710204:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527243:exon_11710119_11710204:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534149:exon_11710119_11710204:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526645:exon_11710119_11710204:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525315:exon_11710119_11710204:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530573:exon_11710119_11710204:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532370:exon_11710119_11710204:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000505496:exon_11710119_11710204:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000524500:exon_11710119_11710204:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531502:exon_11710119_11710204:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527215:exon_11710119_11710204:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532656:exon_11710119_11710204:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534382:exon_11710119_11710204:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000528965:exon_11710165_11710204:CTSB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 11710888 G/C 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 C:G G C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11710838_11711023:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000415599:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531551:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534636:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533572:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530296:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525076:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526195:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527243:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534149:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526645:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525315:exon_11710838_11710971:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530573:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532370:exon_11710838_11711328:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000505496:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000524500:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531502:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527215:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532656:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534382:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000528965:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000524654:exon_11710867_11710988:CTSB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 23290451 C/T 1 5 6 11 2.34029200613052 3.19164959264338 -0.851357586512867 T:C C T 10 0.531941598773897 0.764860318695721 ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23286665_23290667:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000522255:exon_23290159_23290667:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23290439_23290667:ENTPD4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 23423669 A/G 1 4 9 13 1.87223360490441 4.78747438896507 -2.91524078406066 A:G A G 10 0.531941598773897 0.162564563323673 ENSG00000147454:ENST00000519973:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000417331:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000290075:exon_23423621_23424326:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518881:exon_23423621_23425891:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518300:exon_23423621_23424326:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000520654:exon_23423621_23426478:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523930:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523883:exon_23423621_23425891:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000517923:exon_23423621_23423898:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000520949:exon_23423621_23423891:SLC25A37 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 25364194 A/G 1 16 11 27 7.48893441961765 5.85135758651287 1.63757683310478 A:G A G 10 0.531941598773897 0.568089830889223 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 27255080 A/G 1 54 26 80 25.2751536662096 13.8304815681213 11.4446720980882 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0132067916012485 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 27255128 T/C 1 40 15 55 18.7223360490441 7.97912398160846 10.7432120674357 T:C T C 10 0.531941598773897 0.00416827830264413 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 27255146 G/A 1 36 19 55 16.8501024441397 10.106890376704 6.74321206743566 A:G G A 10 0.531941598773897 0.078761795105573 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 27255263 A/G 1 47 44 91 21.9987448576268 23.4054303460515 -1.40668548842463 A:G A G 10 0.531941598773897 0.833757529852887 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 27277537 G/A 1 13 10 23 6.08475921593934 5.31941598773897 0.765343228200368 A:G G A 10 0.531941598773897 0.836065752858423 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27277412_27277590:PTK2B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 27293865 C/T 1 74 66 140 34.6363216907316 35.1081455190772 -0.471823828345585 A:T:C C T 10 0.531941598773897 0.93278480021485 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27293768_27293865:PTK2B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 27301725 C/G 1 84 70 154 39.3169057029926 37.2359119141728 2.08099378881986 C:G C G 10 0.531941598773897 0.747463278637796 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27301723_27301788:PTK2B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 27308585 A/C 1 125 128 253 58.5073001532629 68.0885246430588 -9.58122448979594 A:C A C 10 0.531941598773897 0.231849703379443 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27308560_27308595:PTK2B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 27401964 A/C 1 5 11 16 2.34029200613052 5.85135758651287 -3.51106558038235 A:C A C 10 0.531941598773897 0.0854588261300405 ENSG00000120915:ENST00000521400:exon_27401961_27403081:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000517536:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000521780:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000380476:exon_27401961_27402430:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000458037:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000415449:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000518379:exon_27401961_27402409:EPHX2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 28384712 A/G 1 6 6 12 2.80835040735662 3.19164959264338 -0.383299185286765 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000104290:ENST00000240093:exon_28384664_28385681:FZD3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 30209945 G/A 0 236 0 236 110.46178268936 0 110.46178268936 G G 10 0.531941598773897 2.09023321833291e-65 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 30999280 G/T 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 T:G G T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_30999197_30999291:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_30999197_30999291:WRN HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 31024654 T/C 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_31024538_31024746:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_31024538_31024746:WRN HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 33356074 A/G 1 6 4 10 2.80835040735662 2.12776639509559 0.68058401226103 A:G A G 10 0.531941598773897 0.758887050232993 ENSG00000198042:ENST00000360128:exon_33355950_33358687:MAK16;ENSG00000198042:ENST00000518389:exon_33355950_33356164:MAK16 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 33369944 T/C 1 10 7 17 4.68058401226103 3.72359119141728 0.956992820843751 T:C:G T C 10 0.531941598773897 0.809031865435945 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 33369994 A/G 1 13 5 18 6.08475921593934 2.65970799386948 3.42505122206985 A:G A G 10 0.531941598773897 0.154890143333981 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 37635649 A/G 1 16 16 32 7.48893441961765 8.51106558038235 -1.0221311607647 A:G A G 10 0.531941598773897 0.726993262697186 ENSG00000147471:ENST00000328195:exon_37635491_37637283:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000437582:exon_37635491_37637285:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000521494:exon_37635491_37635880:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000517377:exon_37635491_37635918:PROSC HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 37728017 A/G 1 9 2 11 4.21252561103493 1.06388319754779 3.14864241348713 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0713639747063953 ENSG00000156675:ENST00000287263:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000330843:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522727:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000523182:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522774:exon_37727938_37730796:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000524118:exon_37727905_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000343853:exon_37727905_37728046:RAB11FIP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 37728019 T/G 1 10 2 12 4.68058401226103 1.06388319754779 3.61670081471324 T:G T G 10 0.531941598773897 0.0432053960157470 ENSG00000156675:ENST00000287263:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000330843:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522727:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000523182:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522774:exon_37727938_37730796:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000524118:exon_37727905_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000343853:exon_37727905_37728046:RAB11FIP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 38458696 T/C 0 33 0 33 15.4459272404614 0 15.4459272404614 T T 10 0.531941598773897 1.40595103192644e-09 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 38677932 A/G 1 18 27 45 8.42505122206985 14.3624231668952 -5.93737194482537 A:G A G 10 0.531941598773897 0.099319351048208 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520340:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518415:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522904:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520973:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38677348_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521866:exon_38677439_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38677850_38678153:TACC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 38684853 T/C 1 4 7 11 1.87223360490441 3.72359119141728 -1.85135758651287 T:C T C 10 0.531941598773897 0.36707898879345 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521642:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521050:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000330691:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000348567:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000523239:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000276520:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38684686_38685585:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520611:exon_38684686_38684893:TACC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 38695996 T/C 1 9 8 17 4.21252561103493 4.25553279019118 -0.0430071791562492 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520340:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518415:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522752:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000330691:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000348567:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000523239:exon_38695988_38696025:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000276520:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520973:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38695988_38696028:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521866:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520611:exon_38695988_38696064:TACC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 41399554 G/A 1 6 9 15 2.80835040735662 4.78747438896507 -1.97912398160846 A:G G A 10 0.531941598773897 0.316481765113816 ENSG00000147536:ENST00000276533:exon_41399510_41402565:GINS4;ENSG00000147536:ENST00000520354:exon_41399510_41399758:GINS4;ENSG00000147536:ENST00000428802:exon_41399510_41399898:GINS4;ENSG00000147536:ENST00000518671:exon_41399510_41399921:GINS4;ENSG00000147536:ENST00000523277:exon_41399328_41402521:GINS4;ENSG00000147536:ENST00000518430:exon_41399510_41399928:GINS4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 53537316 A/G 1 3 11 14 1.40417520367831 5.85135758651287 -4.44718238283456 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0283658467048123 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000519912:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53537277_53537347:RB1CC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 53555069 A/G 1 14 19 33 6.55281761716544 10.106890376704 -3.5540727595386 A:G A G 10 0.531941598773897 0.226687187410749 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53554911_53555151:RB1CC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 53569680 C/T 1 19 21 40 8.89310962329596 11.1707735742518 -2.27766395095588 T:C C T 10 0.531941598773897 0.527548606333378 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53568568_53570468:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53568568_53570468:RB1CC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 61654685 C/A 1 12 10 22 5.61670081471324 5.31941598773897 0.297284826974265 A:C C A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000171316:ENST00000307121:exon_61653818_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000423902:exon_61653818_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000453098:exon_61653818_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000524602:exon_61653924_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000525508:exon_61653992_61655656:CHD7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 63938764 G/A 1 17 16 33 7.95699282084375 8.51106558038235 -0.554072759538601 A:G G A 10 0.531941598773897 0.863259581534653 ENSG00000137563:ENST00000518466:exon_63938717_63938792:GGH;ENSG00000137563:ENST00000260118:exon_63938717_63938855:GGH;ENSG00000137563:ENST00000520609:exon_63938717_63938855:GGH;ENSG00000137563:ENST00000518113:exon_63938717_63938855:GGH;ENSG00000137563:ENST00000517622:exon_63938717_63938855:GGH HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 63951237 C/T 1 5 12 17 2.34029200613052 6.38329918528676 -4.04300717915625 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0547442983897815 ENSG00000137563:ENST00000260118:exon_63951219_63951730:GGH;ENSG00000137563:ENST00000520609:exon_63951219_63951360:GGH;ENSG00000137563:ENST00000517622:exon_63951219_63951268:GGH;ENSG00000137563:ENST00000518966:exon_63951219_63951360:GGH;ENSG00000137563:ENST00000523788:exon_63951219_63951361:GGH HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 66525548 T/C 1 4 15 19 1.87223360490441 7.97912398160846 -6.10689037670404 T:C T C 10 0.531941598773897 0.00535339280470612 ENSG00000104442:ENST00000276569:exon_66525479_66525668:ARMC1;ENSG00000104442:ENST00000518908:exon_66525479_66525668:ARMC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 71550832 T/C 1 14 7 21 6.55281761716544 3.72359119141728 2.82922642574816 T:C T C 10 0.531941598773897 0.275620410755652 ENSG00000147592:ENST00000522447:exon_71550783_71550864:LACTB2;ENSG00000147592:ENST00000276590:exon_71550783_71550864:LACTB2;ENSG00000147592:ENST00000517601:exon_71550786_71550864:LACTB2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 72965973 G/A 1 7 5 12 3.27640880858272 2.65970799386948 0.616700814713236 A:G G A 10 0.531941598773897 0.779881793407808 ENSG00000235531:ENST00000457356:exon_72964774_72968547:RP11-383H13.1;ENSG00000104321:ENST00000520788:exon_72965624_72966102:TRPA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 72966002 G/A 1 3 8 11 1.40417520367831 4.25553279019118 -2.85135758651287 A:G G A 10 0.531941598773897 0.128574530340517 ENSG00000235531:ENST00000457356:exon_72964774_72968547:RP11-383H13.1;ENSG00000104321:ENST00000523582:exon_72965988_72966102:TRPA1;ENSG00000104321:ENST00000262209:exon_72965988_72966102:TRPA1;ENSG00000104321:ENST00000520788:exon_72965624_72966102:TRPA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 87497176 G/A 1 14 19 33 6.55281761716544 10.106890376704 -3.5540727595386 A:G G A 10 0.531941598773897 0.226687187410749 ENSG00000176623:ENST00000519789:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519639:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523911:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000520719:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000518390:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000524172:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87496920_87497190:FAM82B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 87520894 C/A 1 5 8 13 2.34029200613052 4.25553279019118 -1.91524078406066 A:C C A 10 0.531941598773897 0.405859977542485 ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87520721_87521009:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87520721_87521009:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519966:exon_87520721_87520910:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000430676:exon_87520721_87520904:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87520721_87520913:FAM82B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 90770315 C/T 1 14 13 27 6.55281761716544 6.91524078406066 -0.36242316689522 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000104312:ENST00000220751:exon_90769975_90770461:RIPK2;ENSG00000104312:ENST00000522965:exon_90770034_90770461:RIPK2;ENSG00000104312:ENST00000517696:exon_90770045_90770461:RIPK2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 90958422 T/C 1 11 13 24 5.14864241348713 6.91524078406066 -1.76659837057353 T:C T C 10 0.531941598773897 0.541790058951456 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000520325:exon_90958368_90958853:NBN HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 90967711 A/G 1 24 18 42 11.2334016294265 9.57494877793015 1.65845285149632 A:G A G 10 0.531941598773897 0.645434913074799 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90967511_90967783:NBN HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 90990479 C/G 1 9 10 19 4.21252561103493 5.31941598773897 -1.10689037670404 C:G C G 10 0.531941598773897 0.651315646573759 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000452387:exon_90990448_90990542:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517772:exon_90990448_90990551:NBN HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 94746698 G/T 1 5 6 11 2.34029200613052 3.19164959264338 -0.851357586512867 T:G G T 10 0.531941598773897 0.764860318695721 ENSG00000183808:ENST00000399300:exon_94741584_94748666:RBM12B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 95888307 C/T 1 24 19 43 11.2334016294265 10.106890376704 1.12651125272243 T:C C T 10 0.531941598773897 0.762055335482114 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000521155:exon_95888302_95888370:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523998:exon_95888179_95888513:INTS8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 98788261 G/T 1 6 6 12 2.80835040735662 3.19164959264338 -0.383299185286765 T:G G T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000104341:ENST00000445593:exon_98787285_98788336:LAPTM4B;ENSG00000104341:ENST00000220781:exon_98787285_98788336:LAPTM4B;ENSG00000104341:ENST00000378722:exon_98787935_98788336:LAPTM4B;ENSG00000104341:ENST00000517924:exon_98788077_98788336:LAPTM4B;ENSG00000104341:ENST00000521545:exon_98788238_98788336:LAPTM4B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 99057150 C/A 1 16 9 25 7.48893441961765 4.78747438896507 2.70146003065257 A:C C A 10 0.531941598773897 0.320325695215138 ENSG00000156482:ENST00000518850:exon_99057055_99057316:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000520998:exon_99056661_99057316:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521112:exon_99057096_99057627:RPL30 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 99057526 G/A 0 8 0 8 3.74446720980882 0 3.74446720980882 G G 10 0.531941598773897 0.00871435563033556 ENSG00000156482:ENST00000517489:exon_99057171_99057627:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521112:exon_99057096_99057627:RPL30 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 99057609 G/A 1 2076 2101 4177 971.68924094539 1117.60929902396 -145.920058078568 A:T:G G A 10 0.531941598773897 6.38001650337436e-06 ENSG00000156482:ENST00000518164:exon_99057575_99057627:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521291:exon_99057575_99057742:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000396070:exon_99057575_99057627:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000518850:exon_99057575_99057627:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000287038:exon_99057575_99057627:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000523172:exon_99057575_99057627:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521726:exon_99057575_99057627:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000517489:exon_99057171_99057627:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000520998:exon_99057575_99057627:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521112:exon_99057096_99057627:RPL30 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 104432545 A/G 1 20 27 47 9.36116802452206 14.3624231668952 -5.00125514237316 A:G A G 10 0.531941598773897 0.147139923874276 ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521716:exon_104432492_104432876:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521971:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000388778:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000519682:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000518554:exon_104432492_104432691:DCAF13 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 110301998 T/C 1 7 4 11 3.27640880858272 2.12776639509559 1.14864241348713 T:C T C 10 0.531941598773897 0.55795959209382 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000521439:exon_110301980_110302162:NUDCD1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 117864217 A/G 1 27 34 61 12.6375768331048 18.0860143583125 -5.44843752520772 A:G A G 10 0.531941598773897 0.199115101820117 ENSG00000164754:ENST00000297338:exon_117864187_117864335:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000523986:exon_117862857_117864491:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000518055:exon_117864187_117864490:RAD21 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 121528385 T/C 1 5 5 10 2.34029200613052 2.65970799386948 -0.31941598773897 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000172167:ENST00000305949:exon_121528165_121528431:MTBP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 123966085 G/A 1 15 8 23 7.02087601839154 4.25553279019118 2.76534322820037 A:G G A 10 0.531941598773897 0.298803195708385 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000520211:exon_123965567_123966268:ZHX2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 123966159 G/C 1 8 9 17 3.74446720980882 4.78747438896507 -1.04300717915625 C:G G C 10 0.531941598773897 0.635405848599126 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000520211:exon_123965567_123966268:ZHX2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 124448736 A/G 1 6 5 11 2.80835040735662 2.65970799386948 0.148642413487133 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124448693_124448841:WDYHV1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 124448804 T/A 1 12 7 19 5.61670081471324 3.72359119141728 1.89310962329596 A:T T A 10 0.531941598773897 0.492334878036868 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124448693_124448841:WDYHV1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 124449466 C/T 1 9 9 18 4.21252561103493 4.78747438896507 -0.574948777930146 T:C C T 10 0.531941598773897 0.81714898933323 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000518125:exon_124449450_124449574:WDYHV1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 125498332 C/A 1 8 4 12 3.74446720980882 2.12776639509559 1.61670081471324 A:C C A 10 0.531941598773897 0.3994437340124 ENSG00000170881:ENST00000303545:exon_125498072_125500155:RNF139;ENSG00000170881:ENST00000517684:exon_125498072_125498475:RNF139 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 126033096 T/C 1 53 49 102 24.8070952649835 26.065138339921 -1.25804307493749 T:C T C 10 0.531941598773897 0.842960487195622 ENSG00000104549:ENST00000523430:exon_126033026_126033113:SQLE;ENSG00000104549:ENST00000265896:exon_126033026_126033113:SQLE;ENSG00000104549:ENST00000518931:exon_126033026_126033179:SQLE HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 126034052 C/T 1 70 49 119 32.7640880858272 26.065138339921 6.69894974590626 T:C C T 10 0.531941598773897 0.233074052409856 ENSG00000104549:ENST00000523430:exon_126033995_126034523:SQLE;ENSG00000104549:ENST00000265896:exon_126033995_126034525:SQLE HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 131124559 T/C 1 7 3 10 3.27640880858272 1.59582479632169 1.68058401226103 T:C T C 10 0.531941598773897 0.3537387028518 ENSG00000153317:ENST00000524124:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000357668:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000521075:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000518721:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000343135:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000519483:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000520189:exon_131124340_131124660:ASAP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 133844508 C/T 1 3 7 10 1.40417520367831 3.72359119141728 -2.31941598773897 T:C C T 10 0.531941598773897 0.205442831458325 ENSG00000129292:ENST00000395386:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000220847:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000395390:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000460236:exon_133844480_133844644:PHF20L1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 135602581 A/G 1 9 4 13 4.21252561103493 2.12776639509559 2.08475921593934 A:G A G 10 0.531941598773897 0.279590414707516 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000517307:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135602511_135602598:ZFAT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 135612745 A/G 1 7 3 10 3.27640880858272 1.59582479632169 1.68058401226103 A:G A G 10 0.531941598773897 0.3537387028518 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000522974:exon_135609787_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000398946:exon_135609787_135612911:ZFAT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 141310644 G/A 1 6 2 8 2.80835040735662 1.06388319754779 1.74446720980882 A:G G A 10 0.531941598773897 0.297069782823554 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000520857:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000521167:exon_141310568_141310713:TRAPPC9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 142200467 G/A 1 6 8 14 2.80835040735662 4.25553279019118 -1.44718238283456 A:G G A 10 0.531941598773897 0.594012234271892 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520571:exon_142200383_142200723:DENND3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 142204326 C/G 1 21 23 44 9.82922642574816 12.2346567717996 -2.40543034605147 C:G C G 10 0.531941598773897 0.54624699205029 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 144102747 C/T 1 341 299 640 159.607914818101 159.050538033395 0.557376784705895 T:C C T 10 0.531941598773897 0.968430880477007 ENSG00000160932:ENST00000517503:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000292494:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000429120:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000521699:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000520531:exon_144102731_144103057:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000520466:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000521003:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000522971:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000519611:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000519546:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000523847:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000522024:exon_144102731_144102850:LY6E HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 144589985 G/A 1 9 5 14 4.21252561103493 2.65970799386948 1.55281761716544 A:G G A 10 0.531941598773897 0.437286823633092 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144589916_144590069:ZC3H3;ENSG00000014164:ENST00000528401:exon_144589916_144590010:ZC3H3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 144643169 C/T 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144641947_144643593:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526469:exon_144642798_144643593:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526051:exon_144643031_144643593:GSDMD HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 144671244 C/A 1 3 6 9 1.40417520367831 3.19164959264338 -1.78747438896507 A:C C A 10 0.531941598773897 0.320650472569791 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530616:exon_144671161_144671392:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000525223:exon_144670998_144671486:EEF1D HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 144671922 G/A 1 11 1 12 5.14864241348713 0.531941598773897 4.61670081471324 A:G G A 10 0.531941598773897 0.00755148197348677 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526710:exon_144671351_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531281:exon_144671481_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532596:exon_144671681_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524883:exon_144671710_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531670:exon_144671715_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528519:exon_144671780_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529832:exon_144671814_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530306:exon_144671865_144672251:EEF1D HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 144687092 T/C 1 19 13 32 8.89310962329596 6.91524078406066 1.97786883923529 T:C T C 10 0.531941598773897 0.595907192228062 ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144686083_144688052:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144686083_144688052:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144687077_144687127:PYCRL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 144689289 C/T 1 8 4 12 3.74446720980882 2.12776639509559 1.61670081471324 T:C C T 10 0.531941598773897 0.3994437340124 ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000447926:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000433751:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000495276:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000462036:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000482616:exon_144688638_144689302:PYCRL HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 144697041 A/G 1 38 42 80 17.7862192465919 22.3415471485037 -4.55532790191176 A:G A G 10 0.531941598773897 0.315474427310367 ENSG00000104522:ENST00000529064:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000531473:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000425753:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000360125:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000529048:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000532308:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000533817:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000530474:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000525274:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000433984:exon_144696810_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000527549:exon_144696817_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000526290:exon_144696991_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000527006:exon_144697033_144697085:TSTA3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 144893084 G/A 1 15 13 28 7.02087601839154 6.91524078406066 0.105635234330883 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144893076_144893242:SCRIB HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 144990528 A/G 1 23 13 36 10.7653432282004 6.91524078406066 3.85010244413971 A:G A G 10 0.531941598773897 0.242733478252642 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 144991176 T/C 1 35 35 70 16.3820440429136 18.6179559570864 -2.23591191417279 T:C T C 10 0.531941598773897 0.632734796861813 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 144992103 T/C 1 23 21 44 10.7653432282004 11.1707735742518 -0.405430346051469 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 144992361 T/C 1 10 17 27 4.68058401226103 9.04300717915625 -4.36242316689522 T:C T C 10 0.531941598773897 0.121756299423964 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 144992862 A/G 1 21 12 33 9.82922642574816 6.38329918528676 3.4459272404614 A:G A G 10 0.531941598773897 0.295354237162159 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 144993324 C/T 1 19 9 28 8.89310962329596 4.78747438896507 4.10563523433088 T:C C T 10 0.531941598773897 0.132797874949751 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 144993377 A/G 1 16 13 29 7.48893441961765 6.91524078406066 0.573693635556986 A:G A G 10 0.531941598773897 0.85485877023254 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 144994888 G/A 1 12 3 15 5.61670081471324 1.59582479632169 4.02087601839154 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0406404092414402 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 144995494 C/T 1 16 14 30 7.48893441961765 7.44718238283456 0.0417520367830893 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 144995736 G/A 1 2 12 14 0.936116802452206 6.38329918528676 -5.44718238283456 A:G G A 10 0.531941598773897 0.00519093444205818 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 144996029 A/G 1 9 4 13 4.21252561103493 2.12776639509559 2.08475921593934 A:G A G 10 0.531941598773897 0.279590414707516 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 144996408 T/G 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 T:G T G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527303:exon_144996100_144996563:PLEC HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 144997656 C/T 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 144998169 C/T 1 6 8 14 2.80835040735662 4.25553279019118 -1.44718238283456 T:C C T 10 0.531941598773897 0.594012234271892 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 144998190 A/G 1 5 9 14 2.34029200613052 4.78747438896507 -2.44718238283456 A:G A G 10 0.531941598773897 0.283917011510726 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 144999621 C/T 1 9 3 12 4.21252561103493 1.59582479632169 2.61670081471324 T:C C T 10 0.531941598773897 0.155839710778340 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 144999642 A/C 1 10 3 13 4.68058401226103 1.59582479632169 3.08475921593934 A:C A C 10 0.531941598773897 0.100839397920929 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 144999684 A/G 1 6 2 8 2.80835040735662 1.06388319754779 1.74446720980882 A:C:G A G 10 0.531941598773897 0.297069782823554 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 145001588 C/T 1 6 5 11 2.80835040735662 2.65970799386948 0.148642413487133 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145001578_145001934:PLEC HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 145057868 A/G 1 33 38 71 15.4459272404614 20.2137807534081 -4.76785351294669 A:C:G A G 10 0.531941598773897 0.285017159200355 ENSG00000178685:ENST00000526007:exon_145057335_145058526:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145057480_145057979:PARP10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 145058037 A/G 1 8 8 16 3.74446720980882 4.25553279019118 -0.511065580382352 A:G A G 10 0.531941598773897 0.80799969147761 ENSG00000178685:ENST00000526007:exon_145057335_145058526:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528963:exon_145058010_145058272:PARP10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 145058758 T/A 1 15 20 35 7.02087601839154 10.6388319754779 -3.6179559570864 A:T T A 10 0.531941598773897 0.238889316028833 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528963:exon_145058712_145058807:PARP10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 145058986 A/G 1 19 21 40 8.89310962329596 11.1707735742518 -2.27766395095588 A:G A G 10 0.531941598773897 0.527548606333378 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313059:exon_145058896_145059496:PARP10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 145060112 G/A 1 36 22 58 16.8501024441397 11.7027151730257 5.14738727111397 A:G G A 10 0.531941598773897 0.189846184371533 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000533665:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000526985:exon_145059660_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525879:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528625:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525486:exon_145059886_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531537:exon_145059892_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529842:exon_145059893_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528914:exon_145059918_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528136:exon_145059939_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529311:exon_145060005_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528580:exon_145060017_145060401:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000530478:exon_145060059_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000532311:exon_145060076_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531707:exon_145060082_145060143:PARP10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 145661675 G/A 1 6 2 8 2.80835040735662 1.06388319754779 1.74446720980882 A:G G A 10 0.531941598773897 0.297069782823554 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145661041_145661801:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145661041_145661801:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145661041_145661801:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145661041_145661801:NFKBIL2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 145665761 G/A 1 4 6 10 1.87223360490441 3.19164959264338 -1.31941598773897 A:G G A 10 0.531941598773897 0.530535902085358 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000388808:exon_145665734_145665812:NFKBIL2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 8 145737373 C/T 1 25 30 55 11.7014600306526 15.9582479632169 -4.25678793256434 T:C C T 10 0.531941598773897 0.280482227625744 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145737294_145737450:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145737294_145737450:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145737294_145737450:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145737294_145737450:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145737285_145737450:RECQL4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 377111 G/C 1 4 7 11 1.87223360490441 3.72359119141728 -1.85135758651287 C:G G C 10 0.531941598773897 0.36707898879345 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_376977_377211:DOCK8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 390512 C/T 1 12 4 16 5.61670081471324 2.12776639509559 3.48893441961765 T:C C T 10 0.531941598773897 0.130296081303923 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_390471_390566:DOCK8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 421032 C/G 1 7 5 12 3.27640880858272 2.65970799386948 0.616700814713236 C:G C G 10 0.531941598773897 0.779881793407808 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000493666:exon_420949_421078:DOCK8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 2192727 G/A 1 159 153 312 74.4212857949504 81.3870646124062 -6.96577881745587 A:G G A 10 0.531941598773897 0.460879784323236 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2192704_2193624:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2192704_2193624:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2192704_2193624:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2192704_2192971:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2192704_2193577:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000302401:exon_2192704_2193621:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382186:exon_2192704_2192752:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382185:exon_2192704_2193571:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382183:exon_2192704_2193040:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000324954:exon_2192704_2193588:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382182:exon_2192704_2193577:SMARCA2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 2804393 A/G 1 51 47 98 23.8709784625313 25.0012551423732 -1.13027667984191 A:G A G 10 0.531941598773897 0.840065854700316 ENSG00000080608:ENST00000490444:exon_2804257_2804465:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2804164_2804463:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000382032:exon_2804167_2804463:KIAA0020 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 2811505 G/A 1 43 33 76 20.1265112527224 17.5540727595386 2.57243849318382 A:G G A 10 0.531941598773897 0.567888971018482 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2811361_2811583:KIAA0020 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 2828765 C/G 1 34 35 69 15.9139856416875 18.6179559570864 -2.70397031539889 C:G C G 10 0.531941598773897 0.547541176894151 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2828675_2828778:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000469168:exon_2828475_2828778:KIAA0020 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 4576680 T/C 1 4 4 8 1.87223360490441 2.12776639509559 -0.255532790191176 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000106688:ENST00000262352:exon_4576569_4576763:SLC1A1;ENSG00000106688:ENST00000381910:exon_4576569_4576763:SLC1A1;ENSG00000106688:ENST00000422398:exon_4576569_4576763:SLC1A1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 4860300 A/G 1 32 33 65 14.9778688392353 17.5540727595386 -2.57620392030331 A:G A G 10 0.531941598773897 0.536590507435753 ENSG00000120158:ENST00000381750:exon_4860125_4861064:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000381730:exon_4860125_4860472:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000448872:exon_4860125_4861064:RCL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 5762600 G/A 1 7 3 10 3.27640880858272 1.59582479632169 1.68058401226103 A:G G A 10 0.531941598773897 0.3537387028518 ENSG00000107036:ENST00000251879:exon_5762541_5762660:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000414202:exon_5762541_5762660:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000381532:exon_5762541_5762660:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000449720:exon_5762541_5762660:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000418622:exon_5762541_5762660:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000276898:exon_5762541_5762660:KIAA1432 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 5774225 T/G 1 7 10 17 3.27640880858272 5.31941598773897 -2.04300717915625 T:G T G 10 0.531941598773897 0.341802442613557 ENSG00000107036:ENST00000414202:exon_5773958_5776552:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000449720:exon_5773958_5774298:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000418622:exon_5773958_5776557:KIAA1432 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 5969249 A/G 1 8 12 20 3.74446720980882 6.38329918528676 -2.63883197547794 A:G A G 10 0.531941598773897 0.267702187700883 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 6007500 G/A 1 6 3 9 2.80835040735662 1.59582479632169 1.21252561103493 A:G G A 10 0.531941598773897 0.515798041804277 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_6007195_6008003:KIAA2026 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 6506038 C/T 1 10 13 23 4.68058401226103 6.91524078406066 -2.23465677179963 T:C C T 10 0.531941598773897 0.406199961903517 ENSG00000147854:ENST00000468435:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000276893:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000485617:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000492853:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000481243:exon_6506033_6506112:UHRF2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 6984236 G/A 1 6 8 14 2.80835040735662 4.25553279019118 -1.44718238283456 A:G G A 10 0.531941598773897 0.594012234271892 ENSG00000107077:ENST00000438023:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_6984166_6984404:KDM4C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 19116543 G/A 1 53 70 123 24.8070952649835 37.2359119141728 -12.4288166491893 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0297279014689874 ENSG00000147872:ENST00000464326:exon_19116357_19116647:PLIN2;ENSG00000147872:ENST00000411567:exon_19115760_19116647:PLIN2;ENSG00000147872:ENST00000276914:exon_19115768_19116647:PLIN2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 19119674 A/G 1 27 54 81 12.6375768331048 28.7248463337904 -16.0872695006857 A:G A G 10 0.531941598773897 0.000478263296436497 ENSG00000147872:ENST00000276914:exon_19119648_19119829:PLIN2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 19376255 A/C 1 14 498 512 6.55281761716544 264.906916189401 -258.354098572235 A:T:C A C 10 0.531941598773897 7.831551265569e-142 ENSG00000137154:ENST00000380394:exon_19375713_19376386:RPS6;ENSG00000137154:ENST00000498815:exon_19376253_19376386:RPS6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 19376258 G/C 1 13 512 525 6.08475921593934 272.354098572235 -266.269339356296 T:C:G G C 10 0.531941598773897 1.38796548669657e-147 ENSG00000137154:ENST00000380394:exon_19375713_19376386:RPS6;ENSG00000137154:ENST00000498815:exon_19376253_19376386:RPS6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 26978259 A/G 1 6 4 10 2.80835040735662 2.12776639509559 0.68058401226103 A:G A G 10 0.531941598773897 0.758887050232993 ENSG00000096872:ENST00000519968:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000433700:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000517444:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000443698:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000380062:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000518614:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000429045:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000517866:exon_26978126_26978261:IFT74 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 32450187 T/C 1 4 6 10 1.87223360490441 3.19164959264338 -1.31941598773897 T:C T C 10 0.531941598773897 0.530535902085358 ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32449996_32450834:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32449996_32450834:ACO1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 32457189 T/C 1 1 8 9 0.468058401226103 4.25553279019118 -3.78747438896507 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0155166247889208 ENSG00000107201:ENST00000379882:exon_32455300_32457416:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379883:exon_32455703_32457416:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379868:exon_32455703_32457416:DDX58 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 32552462 C/G 1 38 40 78 17.7862192465919 21.2776639509559 -3.49144470436397 C:G C G 10 0.531941598773897 0.430010537694026 ENSG00000197579:ENST00000360538:exon_32552432_32552551:TOPORS;ENSG00000197579:ENST00000379858:exon_32552432_32552551:TOPORS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 33026572 T/C 1 133 122 255 62.2517673630717 64.8968750504154 -2.64510768734373 T:C T C 10 0.531941598773897 0.753974316128749 ENSG00000086061:ENST00000330899:exon_33026473_33026614:DNAJA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 33469289 C/T 1 6 9 15 2.80835040735662 4.78747438896507 -1.97912398160846 T:C C T 10 0.531941598773897 0.316481765113816 ENSG00000165271:ENST00000455041:exon_33469205_33469339:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000353159:exon_33469205_33469339:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000297990:exon_33469205_33469339:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000379471:exon_33469205_33469339:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000464829:exon_33469205_33470189:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000325914:exon_33469205_33469339:NOL6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 33675816 G/C 0 247 0 247 115.610425102847 0 115.610425102847 G G 10 0.531941598773897 2.88336773835975e-68 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 33941759 T/C 1 7 6 13 3.27640880858272 3.19164959264338 0.0847592159393384 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379239:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000431417:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379225:exon_33941647_33941860:UBAP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 34017106 C/T 1 2 6 8 0.936116802452206 3.19164959264338 -2.25553279019118 T:C C T 10 0.531941598773897 0.158093130392085 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379239:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000431417:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000351580:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000412543:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000480885:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000459988:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000418786:exon_34017048_34017146:UBAP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 34107504 C/T 1 3 6 9 1.40417520367831 3.19164959264338 -1.78747438896507 T:C C T 10 0.531941598773897 0.320650472569791 ENSG00000198876:ENST00000361264:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396989:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396990:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000450964:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000463286:exon_34107359_34107563:DCAF12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 34649442 A/G 1 16 12 28 7.48893441961765 6.38329918528676 1.10563523433088 A:G A G 10 0.531941598773897 0.709170099536473 ENSG00000213930:ENST00000378842:exon_34649407_34649561:GALT;ENSG00000213930:ENST00000450095:exon_34649407_34649561:GALT;ENSG00000213930:ENST00000489643:exon_34648995_34650279:GALT;ENSG00000213930:ENST00000488412:exon_34649174_34649561:GALT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 35091520 A/C 1 6 5 11 2.80835040735662 2.65970799386948 0.148642413487133 A:C A C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000165282:ENST00000474436:exon_35088687_35093577:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000378617:exon_35091237_35092764:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000465745:exon_35091237_35094356:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000341666:exon_35091237_35092764:PIGO HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 35660990 A/G 1 37 29 66 17.3181608453658 15.426306364443 1.8918544809228 A:G A G 10 0.531941598773897 0.711822505039494 ENSG00000159884:ENST00000378407:exon_35660771_35661183:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378406:exon_35660554_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000426546:exon_35660743_35661508:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378409:exon_35660937_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000327351:exon_35660937_35661174:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000421582:exon_35660398_35661400:CCDC107;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35660091_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35659341_35661999:C9orf100 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 35662251 T/C 1 11 6 17 5.14864241348713 3.19164959264338 1.95699282084375 T:C T C 10 0.531941598773897 0.467371914131112 ENSG00000137135:ENST00000490638:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000490970:exon_35662176_35662264:C9orf100 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 35712003 G/A 1 29 21 50 13.573693635557 11.1707735742518 2.40292006130515 A:G G A 10 0.531941598773897 0.571507118281637 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35712002_35712121:TLN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 36651762 C/T 1 5 8 13 2.34029200613052 4.25553279019118 -1.91524078406066 T:C C T 10 0.531941598773897 0.405859977542485 ENSG00000165304:ENST00000298048:exon_36651743_36651874:MELK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 37492679 G/T 1 29 15 44 13.573693635557 7.97912398160846 5.59456965394853 T:G G T 10 0.531941598773897 0.0980028322350485 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000421959:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37492654_37492712:POLR1E HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 37493588 C/T 1 13 15 28 6.08475921593934 7.97912398160846 -1.89436476566912 T:C C T 10 0.531941598773897 0.57093826541044 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37493556_37493700:POLR1E HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 37493650 G/A 1 10 11 21 4.68058401226103 5.85135758651287 -1.17077357425184 A:G G A 10 0.531941598773897 0.665565590544789 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37493556_37493700:POLR1E HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 37500895 T/C 1 47 17 64 21.9987448576268 9.04300717915625 12.9557376784706 T:C T C 10 0.531941598773897 0.00104831806656337 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37500837_37500918:POLR1E HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 37503087 G/A 1 55 38 93 25.7432120674357 20.2137807534081 5.52943131402758 A:G G A 10 0.531941598773897 0.255357030253362 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37503040_37503694:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37503040_37503693:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37503040_37503694:POLR1E HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 37537557 G/A 1 3 7 10 1.40417520367831 3.72359119141728 -2.31941598773897 A:C:G G A 10 0.531941598773897 0.205442831458325 ENSG00000147912:ENST00000276960:exon_37537107_37537940:FBXO10;ENSG00000147912:ENST00000432825:exon_37537107_37537940:FBXO10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 37782111 C/T 1 11 12 23 5.14864241348713 6.38329918528676 -1.23465677179963 T:C C T 10 0.531941598773897 0.678419761183294 ENSG00000107371:ENST00000327304:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000489414:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000482614:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000465860:exon_37781801_37782134:EXOSC3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 37886429 G/A 1 24 3 27 11.2334016294265 1.59582479632169 9.63757683310478 A:G G A 10 0.531941598773897 0.000133470310610055 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 37888101 C/T 1 9 5 14 4.21252561103493 2.65970799386948 1.55281761716544 T:C C T 10 0.531941598773897 0.437286823633092 ENSG00000122696:ENST00000377716:exon_37887601_37888589:MCART1;ENSG00000122696:ENST00000242275:exon_37887648_37888589:MCART1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 71549847 G/A 1 6 6 12 2.80835040735662 3.19164959264338 -0.383299185286765 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000107242:ENST00000377290:exon_71549806_71549961:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000265382:exon_71549806_71549961:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000419747:exon_71549806_71549961:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000478500:exon_71549806_71549961:PIP5K1B HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 71843023 C/A 1 11 9 20 5.14864241348713 4.78747438896507 0.36116802452206 A:C C A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71842897_71843030:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71842897_71843030:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71842897_71843030:TJP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 74975136 T/C 1 19 1 20 8.89310962329596 0.531941598773897 8.36116802452206 T:C T C 10 0.531941598773897 6.72430779561224e-05 ENSG00000107372:ENST00000437241:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000237937:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000456474:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000376960:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000376962:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000488164:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000343431:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000471197:exon_74975026_74975201:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000376956:exon_74975026_74975137:ZFAND5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 77752510 C/T 1 14 11 25 6.55281761716544 5.85135758651287 0.701460030652575 T:C C T 10 0.531941598773897 0.843014210420399 ENSG00000134996:ENST00000346234:exon_77752454_77752532:OSTF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 79986057 A/G 1 8 5 13 3.74446720980882 2.65970799386948 1.08475921593934 A:G A G 10 0.531941598773897 0.591209044900214 ENSG00000197969:ENST00000360280:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376646:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376636:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000355766:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376634:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000423463:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000357409:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000477107:exon_79985942_79986065:VPS13A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 80912115 G/C 1 7 9 16 3.27640880858272 4.78747438896507 -1.51106558038235 C:G G C 10 0.531941598773897 0.465195872310583 ENSG00000135069:ENST00000421149:exon_80911992_80912186:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000376588:exon_80912059_80912186:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000347159:exon_80912059_80912186:PSAT1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 82006446 G/A 0 13 0 13 6.08475921593934 0 6.08475921593934 G G 10 0.531941598773897 0.000324792060879682 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 86258685 A/C 1 30 19 49 14.0417520367831 10.106890376704 3.93486166007905 A:C A C 10 0.531941598773897 0.316472929575982 ENSG00000148057:ENST00000533522:exon_86258344_86259045:C9orf103;ENSG00000148057:ENST00000277124:exon_86258344_86259045:C9orf103;ENSG00000148057:ENST00000405990:exon_86258344_86259038:C9orf103;ENSG00000148057:ENST00000376419:exon_86258344_86258819:C9orf103;ENSG00000148057:ENST00000454393:exon_86258344_86259038:C9orf103 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 86278817 C/A 1 32 21 53 14.9778688392353 11.1707735742518 3.80709526498346 A:C C A 10 0.531941598773897 0.336205581962333 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000527373:exon_86278790_86278958:UBQLN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 86278913 C/T 1 26 31 57 12.1695184318787 16.4901895619908 -4.32067113011213 T:C C T 10 0.531941598773897 0.288669287323157 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000527373:exon_86278790_86278958:UBQLN1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 90322023 G/A 1 16 33 49 7.48893441961765 17.5540727595386 -10.065138339921 A:C:G G A 10 0.531941598773897 0.00409861474788805 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90321047_90323546:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90321047_90323545:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90321047_90323543:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90321047_90322296:DAPK1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 91994101 G/A 1 47 51 98 21.9987448576268 27.1290215374687 -5.13027667984191 A:G G A 10 0.531941598773897 0.312621459473517 ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_91991301_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_91992306_91994544:SEMA4D HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 91994433 C/T 1 22 15 37 10.2972848269743 7.97912398160846 2.31816084536581 T:C C T 10 0.531941598773897 0.511489396344633 ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_91991301_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_91992306_91994544:SEMA4D HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 93641151 T/C 1 8 7 15 3.74446720980882 3.72359119141728 0.0208760183915446 T:C T C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 95077691 A/G 1 10 4 14 4.68058401226103 2.12776639509559 2.55281761716544 A:G A G 10 0.531941598773897 0.191981298637752 ENSG00000198000:ENST00000360868:exon_95076549_95078418:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000375594:exon_95076549_95078431:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000442668:exon_95076549_95078420:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000358855:exon_95076549_95078431:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000434228:exon_95076549_95078418:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000433029:exon_95077625_95078418:NOL8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 95078123 T/G 1 15 7 22 7.02087601839154 3.72359119141728 3.29728482697427 T:G T G 10 0.531941598773897 0.200805512516808 ENSG00000198000:ENST00000360868:exon_95076549_95078418:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000375594:exon_95076549_95078431:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000442668:exon_95076549_95078420:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000358855:exon_95076549_95078431:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000434228:exon_95076549_95078418:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000433029:exon_95077625_95078418:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000467230:exon_95077971_95078420:NOL8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 95738781 C/A 1 8 7 15 3.74446720980882 3.72359119141728 0.0208760183915446 A:C C A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000468206:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000494669:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95738490_95738991:FGD3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 95782667 C/T 1 6 7 13 2.80835040735662 3.72359119141728 -0.915240784060662 T:C C T 10 0.531941598773897 0.782547085779911 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95782599_95782706:FGD3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 95838070 G/C 1 10 8 18 4.68058401226103 4.25553279019118 0.425051222069854 C:G G C 10 0.531941598773897 1 ENSG00000157303:ENST00000375472:exon_95838066_95838254:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000375469:exon_95838066_95838254:SUSD3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 95840256 A/G 1 17 12 29 7.95699282084375 6.38329918528676 1.57369363555699 A:G A G 10 0.531941598773897 0.582816143128388 ENSG00000157303:ENST00000375472:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000465709:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000375469:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000471462:exon_95840125_95840275:SUSD3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 95875381 G/C 1 12 2 14 5.61670081471324 1.06388319754779 4.55281761716544 C:G G C 10 0.531941598773897 0.0154240748469178 ENSG00000165233:ENST00000375464:exon_95875274_95875564:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000466409:exon_95875274_95875564:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000468781:exon_95875274_95875489:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000490488:exon_95875274_95875554:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000488630:exon_95875274_95875565:C9orf89 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 95887320 G/T 1 21 32 53 9.82922642574816 17.0221311607647 -7.19290473501654 T:G G T 10 0.531941598773897 0.0538472622516433 ENSG00000131669:ENST00000375446:exon_95887181_95887344:NINJ1;ENSG00000131669:ENST00000489274:exon_95887181_95888472:NINJ1;ENSG00000131669:ENST00000470314:exon_95887181_95887344:NINJ1;ENSG00000131669:ENST00000461162:exon_95887181_95887344:NINJ1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 97055327 G/A 1 8 3 11 3.74446720980882 1.59582479632169 2.14864241348713 A:G G A 10 0.531941598773897 0.23704105185636 ENSG00000175787:ENST00000319451:exon_97055256_97055476:ZNF169;ENSG00000175787:ENST00000395395:exon_97055256_97055351:ZNF169;ENSG00000175787:ENST00000375354:exon_97055256_97055351:ZNF169;ENSG00000175787:ENST00000340911:exon_97055256_97055351:ZNF169;ENSG00000175787:ENST00000481550:exon_97055256_97056736:ZNF169;ENSG00000175787:ENST00000480716:exon_97055256_97055351:ZNF169 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 97221463 G/A 1 12 11 23 5.61670081471324 5.85135758651287 -0.234656771799632 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000148110:ENST00000375344:exon_97221443_97223324:HIATL1;ENSG00000148110:ENST00000277183:exon_97221443_97223324:HIATL1;ENSG00000148110:ENST00000428393:exon_97221443_97223201:HIATL1;ENSG00000148110:ENST00000447692:exon_97221442_97221525:HIATL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 100819070 T/G 1 23 6 29 10.7653432282004 3.19164959264338 7.57369363555699 T:G T G 10 0.531941598773897 0.00477322881703914 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100819050_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100819052_100819222:NANS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 100823084 T/C 1 46 39 85 21.5306864564007 20.745722352182 0.784964104218755 T:C T C 10 0.531941598773897 0.913657284461182 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 100823135 G/C 1 43 36 79 20.1265112527224 19.1498975558603 0.976613696862135 C:G G C 10 0.531941598773897 0.910337594825404 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 103064530 G/A 1 12 9 21 5.61670081471324 4.78747438896507 0.829226425748162 A:G G A 10 0.531941598773897 0.828237202108702 ENSG00000136891:ENST00000374902:exon_103064366_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000477648:exon_103064368_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000444730:exon_103064372_103064586:TEX10 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 104324545 G/A 1 11 21 32 5.14864241348713 11.1707735742518 -6.0221311607647 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0346310148879634 ENSG00000155827:ENST00000389120:exon_104324528_104325622:RNF20 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 111727670 C/G 1 23 21 44 10.7653432282004 11.1707735742518 -0.405430346051469 C:G C G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000119326:ENST00000325551:exon_111727658_111727808:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374595:exon_111727658_111727808:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000325580:exon_111727658_111727808:CTNNAL1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 112900199 T/C 1 9 15 24 4.21252561103493 7.97912398160846 -3.76659837057353 T:C T C 10 0.531941598773897 0.152424127615418 ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000480388:exon_112898407_112900706:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 112900785 A/G 1 18 23 41 8.42505122206985 12.2346567717996 -3.80960554972978 A:G A G 10 0.531941598773897 0.273815427799817 ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000482335:exon_112900451_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 113006420 A/G 1 155 169 324 72.549052190046 89.8981301927886 -17.3490780027426 A:G A G 10 0.531941598773897 0.0582598095146769 ENSG00000136810:ENST00000374517:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000374515:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000487892:exon_113006299_113006499:TXN HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 114173287 G/A 1 21 18 39 9.82922642574816 9.57494877793015 0.254277647818016 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114173260_114173422:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114173260_114173422:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114173260_114173422:KIAA0368 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 114174415 T/C 1 15 6 21 7.02087601839154 3.19164959264338 3.82922642574816 T:C T C 10 0.531941598773897 0.124993329418103 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114174294_114174428:KIAA0368 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 114411891 C/T 1 10 7 17 4.68058401226103 3.72359119141728 0.956992820843751 T:C C T 10 0.531941598773897 0.809031865435945 ENSG00000059769:ENST00000313525:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000463589:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000447096:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000436202:exon_114411733_114412203:DNAJC25 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 115931692 A/G 1 28 34 62 13.1056352343309 18.0860143583125 -4.98037912398162 A:G A G 10 0.531941598773897 0.251868210721629 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 115941046 T/C 1 7 8 15 3.27640880858272 4.25553279019118 -0.979123981608455 T:C T C 10 0.531941598773897 0.617504794360634 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115940910_115941081:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115940910_115941081:FKBP15 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 115950706 A/C 1 4 7 11 1.87223360490441 3.72359119141728 -1.85135758651287 A:C A C 10 0.531941598773897 0.36707898879345 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115950669_115950771:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115950669_115950771:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000489645:exon_115950669_115950841:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000414250:exon_115950669_115950771:FKBP15 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 116044998 A/G 1 13 12 25 6.08475921593934 6.38329918528676 -0.298539969347426 A:G A G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000136875:ENST00000374199:exon_116044926_116045013:PRPF4;ENSG00000136875:ENST00000374198:exon_116044926_116045013:PRPF4;ENSG00000136875:ENST00000488937:exon_116044926_116045456:PRPF4 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 116346516 C/T 1 19 15 34 8.89310962329596 7.97912398160846 0.913985641687501 T:C C T 10 0.531941598773897 0.863994683994008 ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000474719:exon_116346484_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000462143:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000488620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374134:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000485822:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000487344:exon_116343916_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000467805:exon_116346462_116346707:RGS3 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 125920376 G/A 1 8 4 12 3.74446720980882 2.12776639509559 1.61670081471324 A:G G A 10 0.531941598773897 0.3994437340124 ENSG00000165209:ENST00000447404:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000348403:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000360998:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000407982:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000373638:exon_125920291_125920402:STRBP HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 126220114 C/T 1 6 3 9 2.80835040735662 1.59582479632169 1.21252561103493 T:C C T 10 0.531941598773897 0.515798041804277 ENSG00000119522:ENST00000373624:exon_126220072_126220176:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394219:exon_126220072_126220176:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373620:exon_126220072_126220176:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000491650:exon_126220072_126220176:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000497135:exon_126220072_126220176:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373618:exon_126220072_126220176:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000479305:exon_126220072_126220176:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394215:exon_126220072_126220176:DENND1A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 127975654 C/T 1 33 35 68 15.4459272404614 18.6179559570864 -3.172028716625 T:C C T 10 0.531941598773897 0.467388482445798 ENSG00000136933:ENST00000373544:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394125:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394124:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000373538:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000416065:exon_127975649_127975801:RABEPK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 127982839 C/A 1 43 38 81 20.1265112527224 20.2137807534081 -0.087269500685661 A:C C A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000136933:ENST00000373544:exon_127982818_127984666:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000259460:exon_127982818_127982979:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394125:exon_127982818_127982979:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394124:exon_127982818_127982979:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000373538:exon_127982818_127982979:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000416065:exon_127982818_127982937:RABEPK HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 128246786 G/A 1 25 24 49 11.7014600306526 12.7665983705735 -1.06513833992095 A:G G A 10 0.531941598773897 0.776433754395787 ENSG00000119487:ENST00000350766:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373503:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373498:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000529322:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000265960:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000394063:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373505:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373497:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000497932:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000496063:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000420643:exon_128246722_128246862:MAPKAP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 130206762 C/T 1 14 4 18 6.55281761716544 2.12776639509559 4.42505122206985 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0558351933659058 ENSG00000196152:ENST00000342483:exon_130206308_130207651:ZNF79 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 130210946 A/G 1 5 3 8 2.34029200613052 1.59582479632169 0.744467209808824 A:G A G 10 0.531941598773897 0.730998912113487 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 130219669 C/T 1 4 5 9 1.87223360490441 2.65970799386948 -0.787474388965073 T:C C T 10 0.531941598773897 0.742432836227916 ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130219595_130219672:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130219595_130219672:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130219595_130219672:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000485704:exon_130219595_130219692:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130219595_130219672:LRSAM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 130242166 A/G 1 11 5 16 5.14864241348713 2.65970799386948 2.48893441961765 A:G A G 10 0.531941598773897 0.316542725286372 ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000498513:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000483302:exon_130242118_130242257:LRSAM1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 130504070 G/A 1 15 20 35 7.02087601839154 10.6388319754779 -3.6179559570864 A:G G A 10 0.531941598773897 0.238889316028833 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000420366:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373274:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130504067_130504238:SH2D3C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 130513469 A/G 1 14 16 30 6.55281761716544 8.51106558038235 -1.95824796321691 A:G A G 10 0.531941598773897 0.583880929092300 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000420366:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373274:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000471939:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000440630:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000464239:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000488685:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000414380:exon_130513451_130513579:SH2D3C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 130523904 T/C 1 10 6 16 4.68058401226103 3.19164959264338 1.48893441961765 T:C T C 10 0.531941598773897 0.61793977257828 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130523890_130523931:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000440630:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000464239:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000488685:exon_130523890_130523929:SH2D3C HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 130550819 C/T 1 11 10 21 5.14864241348713 5.31941598773897 -0.170773574251837 T:C C T 10 0.531941598773897 1 ENSG00000136807:ENST00000498339:exon_130550701_130550971:CDK9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 130550917 G/A 1 76 62 138 35.5724384931838 32.9803791239816 2.59205936920221 A:G G A 10 0.531941598773897 0.670758826716234 ENSG00000136807:ENST00000373265:exon_130550823_130550971:CDK9;ENSG00000136807:ENST00000373264:exon_130550823_130550971:CDK9;ENSG00000136807:ENST00000498339:exon_130550701_130550971:CDK9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 130566668 G/A 1 44 42 86 20.5945696539485 22.3415471485037 -1.74697749455514 A:G G A 10 0.531941598773897 0.746309380477659 ENSG00000136877:ENST00000479147:exon_130566564_130566672:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000479375:exon_130566564_130566692:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373247:exon_130566564_130566692:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373245:exon_130566564_130566692:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000393706:exon_130566564_130566692:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373244:exon_130566564_130566692:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000488307:exon_130566564_130566692:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373228:exon_130566564_130566692:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000460181:exon_130566564_130566692:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000475765:exon_130566564_130566692:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000496586:exon_130566564_130566692:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373225:exon_130566564_130566692:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000431857:exon_130566564_130566692:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000469468:exon_130566564_130566681:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000423577:exon_130566564_130566692:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000469310:exon_130566565_130566692:FPGS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 130572046 G/A 1 11 28 39 5.14864241348713 14.8943647656691 -9.74572235218198 A:G G A 10 0.531941598773897 0.00200452043407622 ENSG00000136877:ENST00000373247:exon_130571963_130572113:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373245:exon_130571963_130572113:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000393706:exon_130571963_130572113:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373244:exon_130571963_130572113:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373228:exon_130571963_130572113:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000460181:exon_130571963_130572113:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373225:exon_130571963_130572113:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000488506:exon_130571963_130572113:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000489522:exon_130571963_130572113:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000467826:exon_130571963_130572113:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000473536:exon_130571963_130572113:FPGS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 130588920 G/A 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000106991:ENST00000373203:exon_130588789_130588951:ENG;ENSG00000106991:ENST00000344849:exon_130588789_130588951:ENG;ENSG00000106991:ENST00000462196:exon_130588789_130588951:ENG HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 130884753 C/T 1 24 41 65 11.2334016294265 21.8096055497298 -10.5762039203033 T:C:G C T 10 0.531941598773897 0.00899247525820288 ENSG00000148334:ENST00000338961:exon_130884641_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000277462:exon_130884641_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000423319:exon_130884641_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000492057:exon_130884641_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000496594:exon_130884641_130885413:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000476811:exon_130884641_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000476655:exon_130884641_130884925:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000493205:exon_130884641_130885413:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000487063:exon_130884725_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000474124:exon_130884727_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000449878:exon_130884745_130884758:PTGES2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 131027963 A/G 1 8 8 16 3.74446720980882 4.25553279019118 -0.511065580382352 A:G A G 10 0.531941598773897 0.80799969147761 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000450617:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000490257:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000468488:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000458730:exon_131027864_131027970:GOLGA2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 131287573 G/A 1 7 2 9 3.27640880858272 1.06388319754779 2.21252561103493 A:G G A 10 0.531941598773897 0.187705653333192 ENSG00000119392:ENST00000309971:exon_131287471_131287702:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000372770:exon_131287471_131287702:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000494417:exon_131287471_131287702:GLE1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 131483551 T/A 1 93 83 176 43.5294313140276 44.1511526982335 -0.621721384205877 A:T T A 10 0.531941598773897 0.939901229039821 ENSG00000160446:ENST00000372663:exon_131483148_131483781:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000372667:exon_131483149_131483781:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000467312:exon_131483159_131483759:ZDHHC12 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 131515547 G/T 1 4 8 12 1.87223360490441 4.25553279019118 -2.38329918528676 T:G G T 10 0.531941598773897 0.247137734070613 ENSG00000160445:ENST00000291900:exon_131515443_131515879:ZER1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 131857687 C/G 1 8 2 10 3.74446720980882 1.06388319754779 2.68058401226103 C:G C G 10 0.531941598773897 0.116548632110931 ENSG00000095321:ENST00000351352:exon_131857075_131857891:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000372536:exon_131857075_131857891:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000440434:exon_131857075_131857891:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000318080:exon_131857089_131857891:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000455396:exon_131857485_131857891:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000458362:exon_131857676_131857891:CRAT HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 132585058 G/A 1 47 29 76 21.9987448576268 15.426306364443 6.57243849318383 A:G G A 10 0.531941598773897 0.136541465709831 ENSG00000136827:ENST00000437532:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000427355:exon_132585004_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000351698:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000473604:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000473084:exon_132583655_132585125:TOR1A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 132590431 C/G 1 49 34 83 22.934861660079 18.0860143583125 4.84884730176655 C:G C G 10 0.531941598773897 0.322580295292022 ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132589565_132590531:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132589569_132590531:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132590247_132590531:C9orf78 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 132591509 A/G 1 63 49 112 29.4876792772445 26.065138339921 3.42254093732354 A:G A G 10 0.531941598773897 0.570232981753926 ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132591484_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132591484_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461762:exon_132590707_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000480023:exon_132590721_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132591507_132591560:C9orf78 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 132597021 C/T 1 40 18 58 18.7223360490441 9.57494877793015 9.14738727111397 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0175138641785566 ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132596991_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136878:ENST00000491053:exon_132596977_132597357:USP20 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 132637712 G/A 1 9 9 18 4.21252561103493 4.78747438896507 -0.574948777930146 A:G G A 10 0.531941598773897 0.81714898933323 ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000474895:exon_132637589_132637758:USP20 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 132662786 C/T 1 76 78 154 35.5724384931838 41.491444704364 -5.91900621118014 T:C C T 10 0.531941598773897 0.374495181914088 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000443566:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000478129:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000462766:exon_132662705_132662812:FNBP1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 133346226 C/T 1 10 6 16 4.68058401226103 3.19164959264338 1.48893441961765 T:C C T 10 0.531941598773897 0.61793977257828 ENSG00000130707:ENST00000334909:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000352480:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000372394:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000344866:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000372393:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000422569:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000443588:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000467695:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000493984:exon_133346221_133346291:ASS1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 134136248 G/A 1 27 24 51 12.6375768331048 12.7665983705735 -0.129021537468748 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000126882:ENST00000247295:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000372269:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000372271:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000464831:exon_134136176_134136737:FAM78A HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 134350458 C/T 1 7 8 15 3.27640880858272 4.25553279019118 -0.979123981608455 T:C C T 10 0.531941598773897 0.617504794360634 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 134351343 C/T 1 5 7 12 2.34029200613052 3.72359119141728 -1.38329918528676 T:C C T 10 0.531941598773897 0.56545794539378 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000451855:exon_134351317_134351922:BAT2L1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 135139901 T/C 1 38 45 83 17.7862192465919 23.9373719448254 -6.15115269823345 T:C T C 10 0.531941598773897 0.187745743720147 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000477049:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135136827_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135136827_135140372:SETX HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 135172412 A/G 1 4 8 12 1.87223360490441 4.25553279019118 -2.38329918528676 A:G A G 10 0.531941598773897 0.247137734070613 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135172274_135172441:SETX HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 135173685 T/C 1 8 12 20 3.74446720980882 6.38329918528676 -2.63883197547794 T:C T C 10 0.531941598773897 0.267702187700883 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135173467_135173699:SETX HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 135202829 T/C 1 16 3 19 7.48893441961765 1.59582479632169 5.89310962329596 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0094370302691683 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 135203231 C/T 1 7 9 16 3.27640880858272 4.78747438896507 -1.51106558038235 T:C C T 10 0.531941598773897 0.465195872310583 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 135203409 A/C 1 9 10 19 4.21252561103493 5.31941598773897 -1.10689037670404 A:C A C 10 0.531941598773897 0.651315646573759 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 135203838 G/A 1 8 4 12 3.74446720980882 2.12776639509559 1.61670081471324 A:G G A 10 0.531941598773897 0.3994437340124 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 135273607 C/G 1 11 10 21 5.14864241348713 5.31941598773897 -0.170773574251837 C:G C G 10 0.531941598773897 1 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135273528_135273713:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135273528_135273713:TTF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 135277341 C/A 1 34 44 78 15.9139856416875 23.4054303460515 -7.49144470436397 A:C C A 10 0.531941598773897 0.111595462844605 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135276842_135278215:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135276842_135278215:TTF1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 135772923 C/T 1 3 5 8 1.40417520367831 2.65970799386948 -1.25553279019118 T:C C T 10 0.531941598773897 0.486426237614014 ENSG00000165699:ENST00000298552:exon_135772810_135772997:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000440111:exon_135772810_135772997:TSC1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 135974079 G/C 1 22 28 50 10.2972848269743 14.8943647656691 -4.59707993869485 C:G G C 10 0.531941598773897 0.204424034235794 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135973608_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135974025_135974149:RALGDS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 135976976 C/T 1 8 10 18 3.74446720980882 5.31941598773897 -1.57494877793015 T:C C T 10 0.531941598773897 0.487247762768628 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135976907_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135976907_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135976907_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135975883_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135976907_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135976907_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135976907_135977301:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372062:exon_135976686_135977526:RALGDS HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 136340200 T/G 1 15 15 30 7.02087601839154 7.97912398160846 -0.958247963216911 T:G T G 10 0.531941598773897 0.85523751660529 ENSG00000160326:ENST00000371897:exon_136340083_136340235:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000485978:exon_136340083_136340235:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000371899:exon_136340083_136340235:SLC2A6 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 136629177 C/T 1 31 22 53 14.5098104380092 11.7027151730257 2.80709526498346 T:C C T 10 0.531941598773897 0.492475523279906 ENSG00000160293:ENST00000371850:exon_136627016_136629231:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000371851:exon_136627016_136629231:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000406606:exon_136627016_136629231:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000343203:exon_136627017_136629231:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000325440:exon_136627017_136629231:VAV2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 136633699 G/C 1 21 26 47 9.82922642574816 13.8304815681213 -4.00125514237316 C:G G C 10 0.531941598773897 0.246617128352813 ENSG00000160293:ENST00000371850:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000371851:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000406606:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000343203:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000325440:exon_136633564_136633718:VAV2 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 139265324 G/A 1 9 18 27 4.21252561103493 9.57494877793015 -5.36242316689522 A:G G A 10 0.531941598773897 0.0521107384373036 ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139265293_139265597:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371734:exon_139265293_139265597:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000489932:exon_139265293_139265597:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371732:exon_139265293_139265597:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000485975:exon_139265293_139265345:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000315908:exon_139265293_139265597:CARD9 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 139326304 G/A 1 5 4 9 2.34029200613052 2.12776639509559 0.212525611034927 A:G G A 10 0.531941598773897 1 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139326276_139326437:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139326276_139326437:INPP5E HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 139621120 A/G 1 8 5 13 3.74446720980882 2.65970799386948 1.08475921593934 A:G A G 10 0.531941598773897 0.591209044900214 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 139744524 C/T 1 145 153 298 67.8684681777849 81.3870646124062 -13.5185964346213 T:C C T 10 0.531941598773897 0.117458978850129 ENSG00000054148:ENST00000371661:exon_139744465_139744589:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000492540:exon_139744465_139745012:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000247665:exon_139744465_139744589:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000462205:exon_139744465_139744589:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000497413:exon_139744465_139744589:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000463215:exon_139744231_139744589:PHPT1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 139836694 C/T 1 40 41 81 18.7223360490441 21.8096055497298 -3.08726950068566 T:C C T 10 0.531941598773897 0.505914912013191 ENSG00000159069:ENST00000325285:exon_139836498_139836918:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000459905:exon_139836552_139836918:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000483559:exon_139836498_139837147:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000487794:exon_139836207_139836918:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000433269:exon_139836498_139836918:FBXW5 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 139973820 C/T 1 2 7 9 0.936116802452206 3.72359119141728 -2.78747438896507 T:C C T 10 0.531941598773897 0.0926560584503697 ENSG00000197355:ENST00000409858:exon_139973708_139973901:UAP1L1;ENSG00000197355:ENST00000360271:exon_139973708_139973901:UAP1L1;ENSG00000197355:ENST00000474787:exon_139973708_139975326:UAP1L1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 140006202 G/A 1 191 213 404 89.3991546341857 113.30356053884 -23.9044059046544 A:T:G G A 10 0.531941598773897 0.0190197426290885 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000470766:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006142_140006206:DPP7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 140006491 C/T 1 10 12 22 4.68058401226103 6.38329918528676 -1.70271517302573 T:C C T 10 0.531941598773897 0.525263941191058 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 140008934 A/G 1 27 20 47 12.6375768331048 10.6388319754779 1.99874485762684 A:G A G 10 0.531941598773897 0.66150718766382 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140008915_140009165:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140008915_140008944:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000472306:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000485456:exon_140008915_140009170:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000478597:exon_140008915_140009178:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000497375:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473703:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000491807:exon_140008695_140009028:DPP7 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 140150427 G/T 1 14 9 23 6.55281761716544 4.78747438896507 1.76534322820037 T:G G T 10 0.531941598773897 0.534173096135566 ENSG00000188986:ENST00000343053:exon_140150359_140150522:COBRA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 140167022 G/A 1 41 41 82 19.1903944502702 21.8096055497298 -2.61921109945956 A:G G A 10 0.531941598773897 0.581473193948072 ENSG00000188986:ENST00000343053:exon_140166959_140167067:COBRA1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 140446806 C/T 1 219 214 433 102.504789868517 113.835502137614 -11.3307122690974 T:C C T 10 0.531941598773897 0.289447041753129 ENSG00000182154:ENST00000371443:exon_140446526_140447007:MRPL41 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 140611436 T/C 1 14 11 25 6.55281761716544 5.85135758651287 0.701460030652575 T:C T C 10 0.531941598773897 0.843014210420399 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000492232:exon_140611078_140611502:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460486:exon_140611078_140611631:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140611078_140611634:EHMT1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 140638416 G/A 1 13 14 27 6.08475921593934 7.44718238283456 -1.36242316689522 A:G G A 10 0.531941598773897 0.700745604151725 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000495657:exon_140638354_140638471:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000478940:exon_140638354_140638542:EHMT1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . 9 140638461 T/C 1 12 19 31 5.61670081471324 10.106890376704 -4.49018956199081 T:C T C 10 0.531941598773897 0.148746581952776 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000495657:exon_140638354_140638471:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000478940:exon_140638354_140638542:EHMT1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . X 295135 G/A 0 33 0 33 15.4459272404614 0 15.4459272404614 G G 10 0.531941598773897 1.40595103192644e-09 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00258_parsed_pileup.txt . X 1531648 C/T 1 68 70 138 31.827971283375 37.2359119141728 -5.40794063079779 T:C C T 10 0.531941598773897 0.393766885627773 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1531625_1531747:ASMTL HGDP00258_parsed_pileup.txt . X 1537002 C/G 1 54 42 96 25.2751536662096 22.3415471485037 2.93360651770589 C:G C G 10 0.531941598773897 0.609399827227737 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1536866_1537009:ASMTL HGDP00258_parsed_pileup.txt . X 1546792 G/A 1 61 40 101 28.5515624747923 21.2776639509559 7.2738985238364 A:G G A 10 0.531941598773897 0.162881474359056 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP00258_parsed_pileup.txt . X 1546876 A/G 1 71 48 119 33.2321464870533 25.5331967411471 7.69894974590625 A:G A G 10 0.531941598773897 0.168677531062022 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP00258_parsed_pileup.txt . X 1554649 T/C 1 13 23 36 6.08475921593934 12.2346567717996 -6.14989755586029 T:C T C 10 0.531941598773897 0.0451085133356793 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1554587_1554651:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1554587_1554651:ASMTL HGDP00258_parsed_pileup.txt . X 1584352 C/G 1 16 10 26 7.48893441961765 5.31941598773897 2.16951843187868 C:G C G 10 0.531941598773897 0.436884592808153 ENSG00000182162:ENST00000381297:exon_1581465_1585475:P2RY8 HGDP00258_parsed_pileup.txt . X 1719999 G/A 1 60 70 130 28.0835040735662 37.2359119141728 -9.15240784060661 A:G G A 10 0.531941598773897 0.113966115837265 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1719552_1721407:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1719552_1721395:AKAP17A HGDP00258_parsed_pileup.txt . X 2139186 C/T 1 19 10 29 8.89310962329596 5.31941598773897 3.57369363555699 T:C C T 10 0.531941598773897 0.197855708173124 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2137557_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2138809_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2138809_2139270:DHRSX HGDP00258_parsed_pileup.txt . X 2161129 C/G 1 6 11 17 2.80835040735662 5.85135758651287 -3.04300717915625 C:G C G 10 0.531941598773897 0.152165296741825 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000412516:exon_2161103_2161271:DHRSX HGDP00258_parsed_pileup.txt . X 2161244 G/A 1 29 24 53 13.573693635557 12.7665983705735 0.807095264983458 A:G G A 10 0.531941598773897 0.890898781610489 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000412516:exon_2161103_2161271:DHRSX HGDP00258_parsed_pileup.txt . X 2408194 G/A 1 22 21 43 10.2972848269743 11.1707735742518 -0.873488747277571 A:G G A 10 0.531941598773897 0.878828782939674 ENSG00000214717:ENST00000381222:exon_2404477_2408810:ZBED1;ENSG00000214717:ENST00000381218:exon_2406227_2408813:ZBED1;ENSG00000214717:ENST00000461691:exon_2407946_2408813:ZBED1 HGDP00258_parsed_pileup.txt . X 2408437 G/A 1 9 10 19 4.21252561103493 5.31941598773897 -1.10689037670404 A:G G A 10 0.531941598773897 0.651315646573759 ENSG00000214717:ENST00000381222:exon_2404477_2408810:ZBED1;ENSG00000214717:ENST00000381218:exon_2406227_2408813:ZBED1;ENSG00000214717:ENST00000461691:exon_2407946_2408813:ZBED1